Patent AR-065544-A1 (AR)
Title: Enzimas para el tratamiento de lignocelulosicos acidos nucleicos que las codifican y metodos para prepararlas y usarlas
Inventor: LUGINBUHL PETER
Filed: 2008-01-30
Abstract: La presente solicitud provee polipéptidos con actividad lignocelulítica, por ejemplo, una actividad de glicosilhidrolasa, celulasa, endoglucanasa, celobiohidrolasa, beta-glucosidase, xilanasa, mananasa, xilosidasa (por ejemplo alfa-xilosidasa),arabinofuranosidasa y/o glucosaoxidasa, polinucleotidos que codifican estos polipéptidos y métodos para preparar y usar estos polinucleotidos y polipéptidos. En un aspecto la presente solicitud provee polipéptidos capaces de procesar enzimáticamente(hidrolizar) bagazo de cana de azucar, por ejemplo, para la degradacion del bagazo de cana de azucar o para el procesamiento de biomasa, y polinucleotidos que codifican dichas enzimas, y la preparacion y el uso de estos polinucleotidos ypolipéptidos. En una forma de realizacion, se provee formas termoestables y termotolerantes de los polipéptidos de la presente. Dichos polipéptidos se pueden usar en diversos contextos farmacéuticos, agrícolas e industriales, por ejemplo, se proveeun sistema multienzimático capaz de hidrolizar los polisacáridos en un componente de bagazo de la cana de azucar procesada en molinos azucareros. La presente acta provee enzimas para la bioconversion de residuos lignocelulosicos en azucaresfermentables; y estos azucares se pueden usar como alimentacion química para la produccion de etanol y combustibles, incluso biocombustibles tales como bioetanol, biopropanol, biobutanol y biodiesel, Reivindicacion 1 Un ácido nucleico aislado,sintético o recombinante, que comprende (a) una secuencia de ácido nucleico (polinucleotido) que tiene al menos 50%, 51%, 52%. 53%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%,77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, o más o completa (100%) identidad de secuencia con SEQ ID N°:1, SEQ ID N°:3, SEQ ID N°:5, SEQ ID N°:7, SEQ ID N°:9, SEQ ID N°:11, SEQID N°:13, SEQ ID N°:15, SEQ ID N°:17, SEQ ID N°:19, SEQ ID N°:21, SEQ ID N°:23, SEQ ID N°:25, SEQ ID N°:27, SEQ ID N°:29, SEQ ID N°:31, SEQ ID N°:33, SEQ ID N°:35, SEQ ID N°:37, SEQ ID N°:39, SEQ ID N°:41, SEQ ID N°:43, SEQ ID N°:45, SEQ ID N°:47,SEQ ID N°:49, SEQ ID N°:51, SEQ ID N°:53, SEQ ID N°:55, SEQ ID N°:57, SEQ ID N°:59, SEQ ID N°:61, SEQ ID N°:63, SEQ ID N°:65, SEQ ID N°:67, SEQ ID N°:69, SEQ ID N°:71, SEQ ID N°:73, SEQ ID N°:75. SEQ ID N°:77, SEQ ID N°:79, SEQ ID N°:81, SEQ IDN°:83, SEQ ID N°:85, SEQ ID N°:87, SEQ ID N°:89, SEQ ID N°:91, SEQ ID N°:93, SEQ ID N°:95, SEQ ID N°:97, SEQ ID N°:99. SEQ ID N°:101, SEQ ID N°:103, SEQ ID N°:105, SEQ ID N°:107, SEQ ID N°:109, SEQ ID N°:111, SEQ ID N°:113, SEQ ID N°:115, SEQ IDN°:117, SEQ ID N°:119, SEQ ID N°:121, SEQ ID N°:123, SEQ ID N°:125, SEQ ID N°:127, SEQ ID N°:129, SEQ ID N°:131, SEQ ID N°:133, SEQ ID N°:135, SEQ ID N°:137, SEQ ID N°:139, SEQ ID N°:141, SEQ ID N°:143, SEQ ID N°:145, SEQ ID N°:147, SEQ ID N°:149,SEQ ID N°:151, SEQ ID N°:153, SEQ ID N°:155, SEQ ID N°:157, SEQ ID N°:159, SEQ ID N°:161, SEQ ID N°:163, SEQ ID N°:165, SEQ ID N°:167. SEQ ID N°:169, SEQ ID N°:171, SEQ ID N°:173, SEQ ID N°:175, SEQ ID N°:177, SEQ ID N°:179, SEQ ID N°:181, SEQ IDN°:183, SEQ ID N°:185, SEQ ID N°:187, SEQ ID N°:189, SEQ ID N°:191, SEQ ID N°:193, SEQ ID N°:195, SEQ ID N°:197, SEQ ID N°:199, SEQ ID N°:201, SEQ ID N°:203, SEQ ID N°:205, SEQ ID N°:207, SEQ ID N°:209, SEQ ID N°:211, SEQ ID N°:213, SEQ ID N°:215,SEQ ID N°:217, SEQ ID N°:219, SEQ ID N°:221, SEQ ID N°:223, SEQ ID N°:225, SEQ ID N°:227, SEQ ID N°:229, SEQ ID N°:231, SEQ ID N°:233, SEQ ID N°:235, SEQ ID N°:237, SEQ ID N°:239, SEQ ID N°:241, SEQ ID N°:243, SEQ ID N°:245, SEQ ID N°:247, SEQ IDN°:249, SEQ ID N°:251, SEQ ID N°:253, SEQ ID N°:255, SEQ ID N°:257, SEQ ID N°:259, SEQ ID N°:261, SEQ ID N°:263, SEQ ID N°:265, SEQ ID N°:267, SEQ ID N°:269, SEQ ID N°:271, SEQ ID N°:273, SEQ ID N°:275, SEQ ID N°:277, SEQ ID N°:279, SEQ ID N°:281,SEQ ID N°:283, SEQ ID N°:285, SEQ ID N°:287, SEQ ID N°:289, SEQ ID N°:291, SEQ ID N°:293, SEQ ID N°:295, SEQ ID N°:297, SEQ ID N°:299, SEQ ID N°:301, SEQ ID N°:303, SEQ ID N°:305, SEQ ID N°:307, SEQ ID N°:309, SEQ ID N°:311, SEQ ID N°:313, SEQ IDN°:315, SEQ ID N°:317, SEQ ID N°:319, SEQ ID N°:321, SEQ ID N°:323, SEQ ID N°:325, SEQ ID N°:327, SEQ ID N°:329, SEQ ID N°:331, SEQ ID N°:333, SEQ ID N°:335, SEQ ID N°:337, SEQ ID N°:339, SEQ ID N°:341, SEQ ID N°:343, SEQ ID N°:345, SEQ ID N°;347,SEQ ID N°:349, SEQ ID N°:351, SEQ ID N°: 353, SEQ ID N°:355, SEQ ID N°:357, SEQ ID N°:359, SEQ ID N°:361, SEQ ID N°:363, SEQ ID N°:365, SEQ ID N°:367, SEQ ID N°:369, SEQ ID N°:370, SEQ ID N°:372, SEQ ID N°:373, SEQ ID N°:375, SEQ ID N°:376, SEQ IDN°:378, SEQ ID N°:379, SEQ ID N°:381, SEQ ID N°:382, SEQ ID N°:384, SEQ ID N°:385, SEQ ID N°:387, SEQ ID N°:388, SEQ ID N°:390, SEQ ID N°:391, SEQ ID N°:393, SEQ ID N°:394, SEQ ID N°:396, SEQ ID N°:397, SEQ ID N°:399, SEQ ID N°:400, SEQ ID N°:402,SEQ ID N°:403, SEQ ID N°:403, SEQ ID N°:405, SEQ ID N°:406, SEQ ID N°:408, SEQ ID N°:409, SEQ ID N°:411, SEQ ID N°:412, SEQ ID N°:414, SEQ ID N°:415, SEQ ID N°:417, SEQ ID N°:418, SEQ ID N°:420, SEQ ID N°:421, SEQ ID N°:423, SEQ ID N°:425, SEQ IDN°:427, SEQ ID N°:429, SEQ ID N°:431, SEQ ID N°:433, SEQ ID N°:435, SEQ ID N°:437, SEQ ID N°:439, SEQ ID N°:441, SEQ ID N°:443, SEQ ID N°:445, SEQ ID N°:447, SEQ ID N°:449, SEQ ID N°:451, SEQ ID N°:453, SEQ ID N°:455, SEQ ID N°:457, SEQ ID N°:459,SEQ ID N°:461, SEQ ID N°:463, SEQ ID N°:465, SEQ ID N°:467, SEQ ID N°:469, y/o SEQ ID N°:471, SEQ ID N°:480, SEQ ID N°:481, SEQ ID N°:482, SEQ ID N°:483, SEQ ID N°:484, SEQ ID N°:485, SEQ ID N°:486, SEQ ID N°:487, SEQ ID N°:488, y todas las otrassecuencias impares numeradas entre SEQ ID N°:489 y SEQ ID N°:700, SEQ ID N°:707, SEQ ID N°:708, SEQ ID N°:709, SEQ ID N°:710, SEQ ID N°:711, SEQ ID N°:712, SEQ ID N°:713, SEQ ID N°:714, SEQ ID N°:715, SEQ ID N°:716, SEQ ID N°:717, SEQ ID N°:718, y/oSEQ ID N°:720, sobre una region de al menos aproximadamente 20, 30, 40, 50, 75, 100, 150, 200, 250, 300, 350, 400, 450, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 1000, 1050, 1100, 1150, o más residuos, o la longitud total de un cADN, transcripto(mARN) o gen, en donde el ácido nucleico (polinucleotido) codifica un polipéptido que tiene una actividad lignocelulosica, o codifica un polipéptido o péptido capaz de generar un anticuerpo que específicamente se une con SEQ ID N°:2, SEQ ID N°:4,SEQ ID N°:6, SEQ ID N°:8, SEQ ID N°:10, SEQ ID N°:12, SEQ ID N°:14, SEQ ID N°:16, SEQ ID N°:18, SEQ ID N°:20, SEQ ID N°:22, SEQ ID N°:24, SEQ ID N°:26, SEQ ID N°:28, SEQ ID N°:30, SEQ ID N°:32, SEQ ID N°:34, SEQ ID N°:36, SEQ ID N°:38, SEQ ID N°:40,SEQ ID N°:42, SEQ ID N°:44, SEQ ID N°:46, SEQ ID N°:48, SEQ ID N°:50, SEQ ID N°:52, SEQ ID N°:54, SEQ ID N°:56, SEQ ID N°:58, SEQ ID N°:60, SEQ ID N°:62, SEQ ID N°:64, SEQ ID N°:66, SEQ ID N°:68, SEQ ID N°:70, SEQ ID N°:72, SEQ ID N°:74, SEQ IDN°:76, SEQ ID N°:78, SEQ ID N°:80, SEQ ID N°:82, SEQ ID N°:84, SEQ ID N°:86, SEQ ID N°:88, SEQ ID N°:90, SEQ ID N°:92, SEQ ID N°:94, SEQ ID N°:96, SEQ ID N°:98, SEQ ID N°:100, SEQ ID N°:102, SEQ ID N°:104, SEQ ID N°:106, SEQ ID N°:108, SEQ IDN°:110, SEQ ID N°:112, SEQ ID N°:114, SEQ ID N°:116, SEQ ID N°:118, SEQ ID N°:120, SEQ ID N°:122, SEQ ID N°:124, SEQ ID N°:126, SEQ ID N°:128, SEQ ID N°:130, SEQ ID N°:132, SEQ ID N°:134, SEQ ID N°:136, SEQ ID N°:138, SEQ ID N°:140, SEQ ID N°:142,SEQ ID N°:143, SEQ ID N°:146, SEQ ID N°:148, SEQ ID N°:150, SEQ ID N°:152, SEQ ID N°:154, SEQ ID N°:156, SEQ ID N°:158, SEQ ID N°:160, SEQ ID N°:162, SEQ ID N°:164, SEQ ID N°:166, SEQ ID N°:168, SEQ ID N°:170, SEQ ID N°:172, SEQ ID N°:174, SEQ IDN°:176, SEQ ID N°:178, SEQ ID N°:180, SEQ ID N°:182, SEQ ID N°:184, SEQ ID N°:186, SEQ ID N°:188, SEQ ID N°:190, SEQ ID N°:192, SEQ ID N°:194, SEQ ID N°:196, SEQ ID N°:198, SEQ ID N°:200, SEQ ID N°:202, SEQ ID N°:204, SEQ ID N°:206, SEQ ID N°:209,SEQ ID N°:210, SEQ ID N°:212, SEQ ID N°:214, SEQ ID N°:216, SEQ ID N°:218, SEQ ID N°:220, SEQ ID N°:222, SEQ ID N°:224, SEQ ID N°:226, SEQ ID N°:228, SEQ ID N°:230, SEQ ID N°:232, SEQ ID N°:234, SEQ ID N°:236, SEQ ID N°:238, SEQ ID N°:240, SEQ IDN°:242, SEQ ID N°:244, SEQ ID N°:246, SEQ ID N°:248, SEQ ID N°:250, SEQ ID N°:252, SEQ ID N°:254, SEQ ID N°:256, SEQ ID N°:258, SEQ ID N°:260, SEQ ID N°:262, SEQ ID N°:264, SEQ ID N°:266, SEQ ID N°:268, SEQ ID N°:270, SEQ ID N°:272, SEQ ID N°:274,SEQ ID N°:276, SEQ ID N°:278, SEQ ID N°:280, SEQ ID N°:282, SEQ ID N°:284, SEQ ID N°:286, SEQ ID N°:288, SEQ ID N°:290, SEQ ID N°:292, SEQ ID N°:294, SEQ ID N°:296, SEQ ID N°:298, SEQ ID N°:300, SEQ ID N°:302, SEQ ID N°:304, SEQ ID N°:306, SEQ IDN°:308, SEQ ID N°:310, SEQ ID N°:312, SEQ ID N°:314, SEQ ID N°:316, SEQ ID N°:318, SEQ ID N°:320, SEQ ID N°:322, SEQ ID N°:324, SEQ ID N°:326, SEQ ID N°:328, SEQ ID N°:330, SEQ ID N°:332, SEQ ID N°:334, SEQ ID N°:336, SEQ ID N°:338, SEQ ID N°:340,SEQ ID N°:342, SEQ ID N°: 344, SEQ ID N°:346, SEQ ID N°:348, SEQ ID N°:350, SEQ ID N°:352, SEQ ID N°:354, SEQ ID N°:356, SEQ ID N°:358, SEQ ID N°:360, SEQ ID N°:362, SEQ ID N°:364, SEQ ID N°:368, SEQ ID N°:371, SEQ ID N°:374, SEQ ID N°:377, SEQ IDN°:380, SEQ ID N°:383, SEQ ID N°:386, SEQ ID N°:389, SEQ ID N°:392, SEQ ID N°:395, SEQ ID N°:398, SEQ ID N°:401, SEQ ID N°:404, SEQ ID N°:407, SEQ ID N°:410, SEQ ID N°:413, SEQ ID N°:416, SEQ ID N°:419, SEQ ID N°:422, SEQ ID N°:424, SEQ ID N°:426,SEQ ID N°:428, SEQ ID N°:430, SEQ ID N°:432, SEQ ID N°:434, SEQ ID N°:436, SEQ ID N°:438, SEQ ID N°:440, SEQ ID N°:442, SEQ ID N°:444, SEQ ID N°:446, SEQ ID N°:448, SEQ ID N°:450, SEQ ID N°:452, SEQ ID N°:454, SEQ ID N°:456, SEQ ID N°:458, SEQ IDN°:460, SEQ ID N°:462, SEQ ID N°:464, SEQ ID N°:466, SEQ ID N°:468, SEQ ID N°:470 y/o SEQ ID N°:472, SEQ ID N°:473, SEQ ID N°:474, SEQ ID N°:475, SEQ ID N°:476, SEQ ID N°:477, SEQ ID N°:478, SEQ ID N°:479, y todos los numeros de secuencias entre SEQID N°:490 y SEQ ID N°:700, SEQ ID N°:719 y/o SEQ ID N°:721, y/o sus subsecuencias (fragmentos) enzimáticamente activas, en donde opcionalmente la actividad l