Patent EP-2632445-A1 (EP)
Inventor: VINNIK ANDREY
IPC: G16C20/64
Filed: 2011-10-27
Abstract: La présent invention concerne un procédé de conception d'un inhibiteur de la liaison de la glycoprotéine (gp)120 du VIH (virus de l'immunodéficience humaine) à un récepteur CD4 ou à l'intégrine alpha4 beta7 (a4b7), le procédé comprenant le modelage moléculaire d'un composé de sorte que le composé modelé interagit in silico avec au moins deux résidus d'acide aminé constitués de six motifs dans la structure tridimensionnelle de ladite gp120 du VIH ou dans un composé peptidomimétique reflétant la structure tridimensionnelle de ladite gp120 du VIH, où ladite interaction entre ledit au moins deux résidus d'acide aminé et ledit composé est caractérisée par une distance interatomique de moins de 8 Angströms, un premier motif desdits six motifs comprenant la séquence d'acides aminés DIISLWDQSLKPCVKLT ou un variant de celle-ci; un second motif desdits six motifs comprenant la séquence d'acides aminés NVSTVQCTHGIRPWSTQLLLNGSLAE ou un variant de celle-ci; un troisième motif desdits six motifs comprenant la séquence d'acides aminés SGGDPEIVMHSFNCGGEFFYCN ou un variant de celle-ci; un quatrième motif desdits six motifs comprenant la séquence d'acides aminés CPKISFEP ou un variant de celle-ci; un cinquième motif desdits six motifs comprenant la séquence d'acides aminés FRPGGGDMRDNWRSELYKYKVV ou un variant de celle-ci; et un sixième motif desdits six motifs comprenant la séquence d'acides aminés CSS ou un variant de celle-ci, ladite gp120 du VIH comprenant ou étant constituée de (i) la séquence de SEQ ID NO: 2; (ii) la séquence codée par la séquence de SEQ ID NO: 1; (iii) une séquence étant au moins à 50% identique à la séquence de SEQ ID NO: 2 ou à la séquence codée par la séquence de SEQ ID NO: 1; ou (iv) une séquence codée par une séquence étant au moins à 50% identique à la séquence de SEQ ID NO: 1, où ladite séquence de (iii) ou (iv) comprend ou code lesdits motifs ou variants de celle-ci. De plus, l'invention concerne un procédé d'identification d'un inhibiteur de la liaison de la gp120 du VIH au CD4 ou l'intégrine a4b7, des composés qui inhibent la liaison de la gp120 du VIH au CD4 ou l'intégrine a4b7, un procédé de diminution du mouvement thermique d'un tunnel dans la gp120 du VIH, des composés pour l'utilisation dans la prévention ou le traitement d'une infection par le VIH et/ou d'une maladie associée à une infection par le VIH et une composition pharmaceutique comprenant n'importe lequel des composés ou inhibiteurs ci-dessus. Finalement, l'invention concerne aussi un tunnel dans la gp120. Dans cette spécification, on cite un certain nombre de documents dont des manuels des fabricants. La divulgation de ces documents, bien que non considérée comme pertinente pour la brevetabilité de cette invention, est incorporée ici à titre de référence dans sa totalité. Plus spécifiquement, tous les documents référencés sont incorporés à titre de référence dans la même mesure que si chaque document individuel était spécifiquement et individuellement indiqué pour être incorporé à titre de référence. Le virus de l'immunodéficience humaine (VIH) est un rétrovirus appartenant aux lentivirus des primates qui peut conduire lors de l'infection déclarée à une pathologie appelée le syndrome de l'immunodéficience acquise (SIDA). Ladite pathologie est caractérisé en ce que le système immun commence à ne plus bien fonctionner et par conséquent le corps du patient devient de plus en plus sensible aux infections secondaires et/ou récurrentes. L'infection par le VIH est transmise, par exemple, par la transfusion de sang, le sperme, le fluide vaginal et aussi le lait maternel. En raison de la présence de particules de virus infectieux non liées dans les fluides corporels, le taux d'infection est élevé. En particulier, les rapports sexuels et la transmission par des mères infectées à leurs bébés ainsi que l'alimentation avec le lait maternel sont les causes d'une majorité de nouveaux cas de VIH.