Patent ES-2881474-T3 (ES)
Title: Composiciones, métodos y kits para el diagnóstico de una neoplasia neuroendocrina gastroenteropancreática
Inventor: MODLIN IRVIN MARK
IPC: C12Q1/6886
Filed: 2015-09-15
Granted: 2021-11-29
Abstract: Un método para detectar una neoplasia neuroendocrina gastroenteropancreática (GEP-NEN) en un sujeto que lo necesita, que comprende: determinar los niveles de expresión de al menos 22 biomarcadores de una muestra de ensayo del sujeto poniendo en contacto la muestra de ensayo con una pluralidad de agentes específicos para detectar la expresión de los al menos 22 biomarcadores, en el que los al menos 22 biomarcadores comprenden APLP2, ARAF, CD59, CTGF, FZD7, KRAS, MKI67/KI67, MORF4L2, NAP1L1, NOL3, PNMA2, RAF1, RSF1, SLC18A2/VMAT2, SPATA7, SSTR1, SSTR3, SSTR4, SSTR5, TPH1, TRMT112 y ZFHX3; normalizar los niveles de expresión de APLP2, ARAF, CD59, CTGF, FZD7, KRAS, MKI67/KI67, MORF4L2, NAP1L1, NOL3, PNMA2, RAF1, RSF1, SLC18A2/VMAT2, SPATA7, SSTR1, SSTR3, SSTR4, SSTR5, TPH1, TRMT112, y ZFHX3 con respecto al nivel de expresión de ALG9 para obtener niveles de expresión normalizados; clasificar el riesgo de la muestra de ensayo con respecto a la presencia o desarrollo de una GEP-NEN utilizando los niveles de expresión normalizados en un sistema de clasificación, en el que el sistema de clasificación es un sistema de aprendizaje automático que comprende cuatro algoritmos diferentes: máquina de vectores de soporte, análisis de discriminación lineal, K vecinos más cercanos, y Bayes naive; asignar una puntuación de clasificación de riesgo de analitos múltiples para NET (MAARC-NET) en base a un resultado de cada uno de los cuatro algoritmos diferentes; comparar la puntuación con un valor de corte predeterminado; determinar la presencia de una GEP-NEN en el sujeto cuando la puntuación MAARC-NET es igual o mayor que el valor de corte predeterminado, o determinar la ausencia de una GEP-NEN en el sujeto cuando la puntuación MAARC- NET está por debajo del valor de corte predeterminado, en el que el valor de corte predeterminado es 2 en una escala del sistema de puntuación MAARC-NET de 0-8, o 0% en una escala de 0-100%; y (a) determinar la presencia de una GEP-NEN progresiva en el sujeto cuando la puntuación MAARC-NET es igual o mayor que el valor de corte predeterminado, en el que el valor de corte predeterminado es 5 en una escala de 0-8, o menor que 55% en una escala de 0-100%; o (b) identificar un nivel de riesgo para que el sujeto desarrolle una GEP-NEN progresiva que comprende identificar un nivel bajo de riesgo de desarrollar una GEP-NEN progresiva cuando la puntuación MAARC-NET es menor que un valor de corte predeterminado de 5 en una escala de 0-8, o menor que 55% en una escala de 0-100%; identificar un nivel de riesgo intermedio de desarrollar una GEP-NEN progresiva cuando la puntuación MAARC-NET es igual o mayor que un valor de corte predeterminado de 5 y menor que un valor de corte predeterminado de 7 en una escala de 0-8, o igual o mayor que 55% y menor que 75% en una escala de 0-100%; o identificar un nivel de riesgo alto de desarrollar una GEP-NEN progresiva cuando la puntuación MAARC-NET es igual o mayor que un valor de corte predeterminado de 7 en una escala de 0-8, o igual o mayor que 75% en una escala de 0-100%.