Patent ES-2930419-T3 (ES)
Title: Un método o sistema para la identificación de una mutación causante que provoca un fenotipo de interés en una muestra de ensayo
Inventor: CHAMPION CLEMENT
IPC: G16B30/10
Filed: 2019-09-05
Granted: 2022-12-12
Abstract: Un método para identificar una mutación asociada con un fenotipo de interés en una planta no vascular, en el que el método comprende (a) alinear la secuencia de ADN de una secuencia de ADN de referencia e identificar un primer conjunto de desajustes de secuencia entre las dos secuencias; donde la muestra de prueba es de una planta no vascular mutagenizada; (b) alinear la secuencia de ADN de al menos una muestra de comparación con la secuencia de ADN de referencia e identificar un segundo conjunto de desajustes de secuencia entre las dos secuencias; (c) filtrar el primer conjunto de desajustes con respecto al segundo conjunto de desajustes para identificar un subconjunto de desajustes que son exclusivos del primer conjunto de desajustes, en el que el subconjunto de desajustes son mutaciones candidatas para la mutación causante; donde la muestra de prueba es de una planta no vascular que exhibe el fenotipo de interés y donde al menos una muestra de comparación es de una planta no vascular independiente del mismo género que no exhibe el fenotipo de interés; y donde la secuencia de ADN de referencia es una secuencia de referencia conocida para una planta no vascular del género. Además, un método para identificar una mutación asociada con un fenotipo de interés en una planta no vascular, en el que el método comprende a) alinear la secuencia de ADN de una secuencia de ADN de referencia e identificar un primer conjunto de desajustes de secuencia entre las dos secuencias; donde la muestra de prueba es de una planta no vascular mutagenizada; (b) alinear la secuencia de ADN de al menos una muestra de comparación con la secuencia de ADN de referencia e identificar un segundo conjunto de desajustes de secuencia entre las dos secuencias; (c) filtrar el primer conjunto de discrepancias con respecto al segundo conjunto de discrepancias de secuencia para identificar un subconjunto de discrepancias que son comunes al primer y segundo conjuntos de discrepancias de secuencia en el que la muestra de prueba y la muestra o muestras de comparación son de muestras independientes plantas no vasculares que presentan el fenotipo de interés y en las que las plantas no vasculares independientes son del mismo género; y donde la secuencia de ADN de referencia es una secuencia de referencia conocida o una planta no vascular del género o una planta no vascular del género. (c) filtrar el primer conjunto de discrepancias con respecto al segundo conjunto de discrepancias de secuencia para identificar un subconjunto de discrepancias que son comunes al primer y segundo conjuntos de discrepancias de secuencia en el que la muestra de prueba y la muestra o muestras de comparación son de muestras independientes plantas no vasculares que presentan el fenotipo de interés y en las que las plantas no vasculares independientes son del mismo género; y donde la secuencia de ADN de referencia es una secuencia de referencia conocida o una planta no vascular del género o una planta no vascular del género. (c) filtrar el primer conjunto de discrepancias con respecto al segundo conjunto de discrepancias de secuencia para identificar un subconjunto de discrepancias que son comunes al primer y segundo conjuntos de discrepancias de secuencia en el que la muestra de prueba y la muestra o muestras de comparación son de muestras independientes plantas no vasculares que presentan el fenotipo de interés y en las que las plantas no vasculares independientes son del mismo género; y donde la secuencia de ADN de referencia es una secuencia de referencia conocida o una planta no vascular del género o una planta no vascular del género.  (Traducción automática con Google Translate, sin valor legal)