OncoGAN-syntheticVCFs / CNS-PiloAstro /CNS-PiloAstro_sim35.vcf
anderdnavarro's picture
Upload folder using huggingface_hub
817e9cb verified
##fileformat=VCFv4.2
#CHROM POS ID REF ALT VAF MUT
1 45285815 sim35 G T 0.29 SBS5
1 47330362 sim35 T A 0.28 SBS5
1 80591420 sim35 T G 0.49 SBS5
1 84209740 sim35 G GT 0.08 INS
1 104978789 sim35 C A 0.16 SBS5
1 171700323 sim35 C T 0.29 SBS5
1 174918454 sim35 A T 0.51 SBS5
1 186400489 sim35 A C 0.36 SBS5
1 188274625 sim35 TTATTT T 0.47 DEL
1 191567686 sim35 CT TA 0.17 DNP
1 196057130 sim35 T A 0.14 SBS5
2 16978528 sim35 G T 0.48 SBS1
2 17597461 sim35 C T 0.12 SBS1
2 34624069 sim35 A G 0.22 SBS5
2 34799317 sim35 C T 0.36 SBS5
2 69488049 sim35 G T 0.07 SBS5
2 86876226 sim35 C T 0.1 SBS5
2 145435569 sim35 A G 0.43 SBS5
2 148352858 sim35 T A 0.39 SBS1
2 180382060 sim35 A G 0.35 SBS5
2 183421531 sim35 C T 0.19 SBS1
2 205650899 sim35 G A 0.24 SBS5
2 212671670 sim35 A G 0.17 SBS5
2 217871146 sim35 T C 0.25 SBS5
2 221175731 sim35 G T 0.36 SBS5
3 22044637 sim35 G T 0.02 SBS5
3 101887388 sim35 C T 0.12 SBS5
3 104507538 sim35 T A 0.29 SBS5
3 104978459 sim35 C T 0.36 SBS5
3 146425056 sim35 C CG 0.39 INS
3 192881935 sim35 T C 0.43 SBS5
4 6564640 sim35 C T 0.47 SBS1
4 16631618 sim35 C G 0.09 SBS5
4 19145539 sim35 A G 0.36 SBS1
4 23474778 sim35 C T 0.27 SBS1
4 34927158 sim35 T C 0.41 SBS5
4 36162872 sim35 A C 0.28 SBS5
4 45662100 sim35 T C 0.27 SBS5
4 48514549 sim35 G A 0.46 SBS1
4 55826334 sim35 A C 0.09 SBS5
4 58926275 sim35 G A 0.23 SBS5
4 59116053 sim35 G A 0.34 SBS1
4 96700024 sim35 C T 0.36 SBS5
4 124668036 sim35 C G 0.3 SBS5
4 135923063 sim35 T C 0.16 SBS5
4 163176107 sim35 T C 0.14 SBS5
4 163697420 sim35 C A 0.46 SBS5
4 168488805 sim35 T A 0.41 SBS5
4 181603365 sim35 A T 0.06 SBS5
5 5507949 sim35 A C 0.21 SBS5
5 17868139 sim35 A G 0.24 SBS5
5 18564846 sim35 G C 0.52 SBS5
5 31785758 sim35 G A 0.2 SBS1
5 32104571 sim35 G T 0.48 SBS5
5 40675050 sim35 C T 0.11 SBS1
5 46338365 sim35 T A 0.09 SBS5
5 50552248 sim35 A G 0.44 SBS5
5 50985948 sim35 A G 0.52 SBS5
5 72537716 sim35 T C 0.34 SBS5
5 85327896 sim35 AG A 0.2 DEL
5 101047145 sim35 G A 0.18 SBS5
5 170187853 sim35 A G 0.25 SBS5
6 7384269 sim35 C T 0.65 SBS5
6 27596799 sim35 C A 0.34 SBS5
6 38250832 sim35 C T 0.21 SBS1
6 49707944 sim35 C T 0.11 SBS5
6 78173019 sim35 G A 0.27 SBS1
6 78656823 sim35 A C 0.12 SBS5
6 121326476 sim35 G T 0.34 SBS5
6 132524878 sim35 G A 0.16 SBS5
7 15002221 sim35 AGTGCTT A 0.32 DEL
7 23806071 sim35 C T 0.0 SBS1
7 37521027 sim35 C A 0.22 SBS5
7 43190538 sim35 G A 0.38 SBS1
7 50937378 sim35 G A 0.06 SBS1
7 74668107 sim35 T A 0.13 SBS5
7 84585378 sim35 G T 0.29 SBS5
7 95848540 sim35 G C 0.35 SBS5
7 113869768 sim35 A G 0.24 SBS5
7 124501340 sim35 C T 0.14 SBS1
7 140489186 sim35 G C 0.24 driver_BRAF_Intron
7 142168663 sim35 G C 0.28 SBS1
8 9505627 sim35 G A 0.43 SBS1
8 29710974 sim35 G A 0.4 SBS1
8 35099278 sim35 A T 0.19 SBS5
8 39879564 sim35 C T 0.33 SBS5
8 42560059 sim35 A G 0.09 SBS5
8 112180687 sim35 A T 0.43 SBS1
8 112537827 sim35 C G 0.08 SBS5
9 22955553 sim35 G T 0.21 SBS5
9 25453661 sim35 A T 0.31 SBS5
9 76331192 sim35 A G 0.06 SBS5
9 84366906 sim35 AA A 0.25 DEL
9 110929034 sim35 G A 0.23 SBS1
9 113748347 sim35 G T 0.39 SBS5
10 21816361 sim35 C A 0.09 SBS5
10 22868160 sim35 C G 0.6 SBS5
10 35893625 sim35 G A 0.11 SBS1
10 53975217 sim35 C T 0.33 SBS1
10 109803237 sim35 A G 0.36 SBS1
11 1293823 sim35 C T 0.12 SBS1
11 23413869 sim35 C A 0.44 SBS5
11 28601930 sim35 G A 0.1 SBS1
11 49638364 sim35 A T 0.24 SBS5
11 50551942 sim35 C T 0.27 SBS1
11 122601964 sim35 T C 0.19 SBS5
12 16493902 sim35 C A 0.22 SBS5
12 38468564 sim35 T A 0.82 SBS5
12 38897237 sim35 C T 0.53 SBS1
12 79378854 sim35 T A 0.4 SBS5
12 94283391 sim35 C A 0.09 SBS5
12 97300837 sim35 C T 0.57 SBS5
12 99734202 sim35 A G 1.0 SBS5
12 108248082 sim35 C T 0.13 SBS5
13 22876112 sim35 A G 0.09 SBS5
13 57973481 sim35 T G 0.28 SBS5
13 59420597 sim35 T G 0.14 SBS5
14 20139530 sim35 T C 0.71 SBS5
14 31317520 sim35 G A 0.19 SBS1
14 38146061 sim35 A G 0.24 SBS5
14 44857692 sim35 A G 0.12 SBS5
15 22106598 sim35 T C 0.28 SBS5
15 36342362 sim35 T C 0.51 SBS5
15 59740854 sim35 G T 0.56 SBS5
16 76302955 sim35 T C 0.17 SBS5
17 29665134 sim35 C T 0.29 driver_NF1_Coding
17 41436576 sim35 G A 0.2 SBS1
17 59220909 sim35 G A 0.12 SBS1
18 2725797 sim35 AAGATAAACTT A 0.82 DEL
18 7253941 sim35 G A 0.37 SBS5
18 21526087 sim35 C T 0.71 SBS1
18 45016771 sim35 C T 0.35 SBS5
18 72158490 sim35 T C 0.38 SBS5
18 75352637 sim35 T A 0.42 SBS1
19 4191728 sim35 C A 0.18 SBS5
19 5901129 sim35 G C 0.38 SBS5
19 11706037 sim35 T C 0.3 SBS5
19 40573847 sim35 T G 0.12 SBS5
19 54226677 sim35 T A 0.5 SBS5
19 54284584 sim35 TT T 0.2 DEL
20 8895107 sim35 T TC 0.55 INS
20 9249300 sim35 C T 0.07 SBS1
20 47142271 sim35 T C 0.3 SBS5
20 62099664 sim35 C A 0.26 SBS5
21 23803022 sim35 A G 0.24 SBS5
21 27198863 sim35 C T 0.23 SBS5
21 35709183 sim35 C T 0.17 SBS1
22 31678666 sim35 T C 0.39 SBS5
22 34841208 sim35 G T 0.22 SBS5
22 37614089 sim35 C G 0.09 SBS5
X 39042894 sim35 G A 0.12 SBS5
X 45662900 sim35 C T 0.22 SBS1
X 52617655 sim35 C T 0.12 SBS5
X 54332816 sim35 T C 0.23 SBS5
X 90218991 sim35 A G 0.25 SBS5
X 95466165 sim35 G A 0.14 SBS5
X 99372291 sim35 G A 0.17 SBS1
X 113020801 sim35 T A 0.32 SBS5
X 127073768 sim35 T C 0.27 SBS5
X 144225025 sim35 C T 0.12 SBS5
X 152398648 sim35 C T 0.44 SBS1
Y 19244487 sim35 T A 0.16 SBS5