© (2015) Program Pascasarjana Universitas Airlangga, Indonesia
JBP Vol. 17, No. 1, April 201—Anindita Riesti Retno Arimurti

## IDENTIFIKASI DNA DARI SWAB EARPHONE

## DENGAN TEKNIK STR ( SHORT TANDEM REPEAT ) UNTUK KEPENTINGAN FORENSIK
Anindita Riesti Retno Arimurti* 1 , Ahmad Yudianto 2 , Sri Puji Astuti W. 3 1,2,3 Universitas Airlangga; Jl. Airlangga, Surabaya; (031) 5041566, 5041536
1,2,3 Program Studi S2 Ilmu Forensik, Sekolah Pascasarjana, Universitas Airlangga, Surabaya e-mail: * 1 aninditariesti@yahoo.com, +62 819890405

## Abstrak
Pemeriksaan  DNA  dalam  dunia  forensik  dapat  menggunakan  cairan  tubuh  antara  lain yaitu  saliva,  darah,  sperma,  semen,  dan  urine.  Selain  cairan  tubuh,  dapat  juga  menggunakan jaringan otot, gigi, dan tulang. Analisis DNA selain berasal dari tubuh manusia itu sendiri, dapat juga  berasal  dari  benda  –  benda  yang  ditemukan  di  Tempat  Kejadian  Perkara  (TKP)  yang digunakan  sebagai  bahan  pembanding.  Contoh  benda  yang  dapat  digunakan  sebagai  barang bukti  antara  lain  pakaian  bekas  dipakai,  sprei,  bahkan  earphone.  Dari  benda  –  benda  tersebut dapat  diisolasi  sel  dan  dianalisis  DNA  untuk  mendapatkan  keterangan  lebih  lanjut  (Andarini, 2011).  Sejauh  ini  pemeriksaan  swab  DNA  yang  berasal  dari  earphone  dengan  menggunakan teknik  STR  belum  banyak  dilakukan  di  Indonesia.  Penelitian  ini  bertujuan  untuk  menganalisis DNA  yang  berasal  dari  swab  earphone  dengan  metode  STR  dan  perlakuan  perbedaan  waktu swab  earphone.  Lokus  yang  diperiksa  pada  penelitian  ini  D18S51  dan  D21S11,  karena  lokus  – lokus  tersebut  memiliki  daya  deskriminasi  besar  pada  populasi  di  Indonesia  (Untoro,  et  al., 2009).  Adanya  perbedaan  waktu  swab  earphone  menyebabkan  penurunan  kadar  DNA  dan kemurniannya.  Sedangkan  untuk  hasil  elektroforesis,  lokus  D18S51  bagus  untuk  analisis  DNA dari  swab  earphone,  sedangkan  lokus  D21S11  kurang  cocok  karena  hasil  yang  didapat  pita DNAnya  sangat  tipis,  hal  ini  disebabkan  karena  beberapa  faktor  salah  satunya  lokus  D21S11 sudah terdegradasi.
Kata kunci : DNA, earphone, STR, lokus, D18S51, D21S11

## Abstract
Examination  of  DNA  in  forensic  can  use  fluids  from  a  body  which  are,  saliva,  blood, sperm, semen, and urine.  Aside from body fluids, it can also come from muscle tissues, teeth, and bones and besides from a human body, the objects which founded at the crime scene (TKP) can also be analyzed.
Thus,  we  can  use  them  as  a  comparison.  The  examples  of  objects  that  can  be  use  as evidences are used clothes, bed linen, or even earphones.
Mentioned  objects  could  be  isolated  and  DNA  analyzed  to  obtain  further  information (Nadarini, 2011), until now swab examination of the DNA coming from earphones with an STR method has not been widely practiced in Indonesia.
The aim of this research is to analyze the DNA derived from earphones swab with an STR method and the handling of earphones swab time differences.
Locus  examined  in  this  research  are  D18S51  and  D21S11,  because  these  locus  has  a major discrimination to Indonesian population (Untoro, et al., 2009).
Earphone swab time difference causes decreased levels of DNA and its purity. As for the electrophoresis  results  D18S51  locus  is  good  for  earphone  swab  DNA  analysis,  while  locus D21S11 is less suitable because the DNA tape is very thin, this was due to several factors; and one of the cause is degraded D21S11 locus.
Keywords : DNA, earphone, STR, locus, D18S51, D21S11

## 1. PENDAHULUAN
Pemeriksaan  DNA  banyak  macamnya,  antara lain  yaitu  RFLP  ( Restriction  Fragment  Length Polymorphism ), VNTR ( Variable Number Tandem Repeat ),  mt-DNA  ( Mitochondrial  DNA ),  SNP ( Single  Nucleotide.  Polymorphisms ),  STR  ( Short Tandem  Repeat ).  Dalam  dunia  forensik,  teknik pemeriksaan  DNA  yang  paling  sering  dilakukan adalah  STR,  yaitu  suatu  metode  biologi  molekuler yang  digunakan  untuk  membandingkan  lokus tertentu  pada  DNA  dari  dua  atau  lebih  sampel. Short  Tandem  Repeat merupakan  teknik  DNA profiling yang  sering  digunakan  karena  teknik  ini cukup  mudah,  hanya  memerlukan  minimal  13 lokus sebagai pembanding. Ketigabelas lokus yang dianjurkan  FBI  antara  lain  yaitu  TH01,  TPOX, CSF1P0, vWA, FGA, D3S1358, D5S818, D7S820, D13S317,  D16S539,  D8S1179,  D18S51,  D21S11, dan  ditambah  dengan  penanda  amelogenin  yang digunakan  untuk  analisis  jenis  kelamin  (Butler et al., 2003).
Ukuran fragmen STR biasanya tidak lebih dari 500  bp,  oleh  karena  itu  STR  dapat  diamplifikasi dengan  menggunakan  jumlah  DNA template yang relatif  sedikit  (+1ng)  dan  juga  dapat  digunakan untuk  menganalisa  sampel  DNA  yang  sudah terdegradasi (Kusumadewi, 2012).
Analisis  DNA profiling dapat  menggunakan bagian  tubuh  korban,  antara  lain  yaitu  darah, sperma,  rambut,  otot,  gigi,  bahkan  tulang.  Akan tetapi  selain  dari  bagian  tubuh  manusia,  sampel DNA bisa berasal dari barang – barang yang ada di TKP,  contoh  :  baju  bekas  pakai,  sikat  gigi  bekas pakai, earphone, dll.  Akhir  –  akhir  ini  semakin banyak  orang  yang  menggunakan earphone, oleh karena  itu earphone dapat  digunakan  sebagai alternatif barang bukti untuk dianalisis DNA.
Sejauh  ini  pemeriksaan  swab  DNA  yang berasal dari earphone dengan menggunakan teknik STR  belum  banyak  dilakukan  di  Indonesia. Penelitian  ini  bertujuan  untuk  menganalisis  DNA yang  berasal  dari  swab earphone dengan menggunakan metode STR dan perlakuan perbedaan  waktu  swab  sampel  DNA.  Lokus  yang diperiksa  pada  penelitian  ini  antara  lain  D18S51
dan  D21S11,  karena  kedua  lokus  tersebut  yang memiliki daya deskriminasi besar pada populasi di Indonesia (Untoro, et al ., 2009).
Waktu pengambilan swab DNA yang digunakan  yaitu  1,  3,  dan  5  hari,  dengan  alasan karena  sel  –  sel  apitel  yang  berada  di  earphone sangat sedikit, apabila terlalu lama tidak didapatkan  DNA  karena  DNA  telah  terdegradasi seluruhnya.  Adanya  rentang  waktu  pengambilan swab  DNA  karena  untuk  mengetahui  dengan berkurangnya kadar DNA, tetap bisa dianalisis dan diidentifikasi.

## 2. Tinjauan Pustaka
2.1. Anatomi Telinga
Telinga  merupakan  organ  penting  bagi  manusia dan  termasuk  dalam  panca  indra.  Telinga  merupakan organ  yang  berperan  terhadap  pendengaran  kita  untuk mendeteksi suara atau bunyi, hal ini dapat terjadi karena telinga  memiliki reseptor  khusus  yang berfungsi  untuk mengenali  getaran  suara.  Namun  telinga  memiliki batasan frekuensi suara yang dapat didengar, yaitu yang frekuensinya  20  Hz  –  20.000  Hz.  Telinga  berfungsi sebagai  indra  pendengaran  dan  organ  yang  menjaga keseimbangan (Mills et al. , 2006).
Pada  bagian  eksterior  telinga,  kanalis  auditorius eksternal  memiliki  beberapa  helai  rambut  halus  dan kelenjar  minyak  yang disebut ceruminous glands  yang mensekresi  earwax  atau  serumen.  Rambut  –  rambut halus  dan  serumen  ini  mencegah  masuknya  debu  dan benda asing masuk kedalam telinga. Serumen biasanya mengering  dan  keluar  dari  kanal  telinga  (Tortora  & Derrickson, 2009).
Serumen  adalah  sekret  kelenjar  sebasea  dan apokrin  yang  terdapat  pada  bagian  kartilago  telinga yang  memiliki  fungsi  sebagai  pelindung  kanalis auditorius  eksternal  dari  kerusakan  oleh  air,  infeksi, trauma  dan  benda  asing.  Jumlah  serumen  yang terbentuk  dan  konsistensinya  sangat  bervariasi. Serumen  juga  berfungsi  sebagai  pelumas  dan  dapat mencegah  kekeringan  didalam  telinga.  Pada  keadaan normal serumen tidak akan tertumpuk di liang  telinga, tetapi  akan  keluar  sendiri  pada  waktu  mengunyah  dan
JBP Vol. 17, No. 1, April 201—Anindita Riesti Retno Arimurti
setelah  sampai diluar liang  telinga akan  menguap oleh panas.  Penumpukan  serumen  yang  berlebihan  akan menimbulkan gangguan pendengaran (Dinces, 2012).
2.2. Earphone
Earphone atau  dalam  bahasa  Indonesia dikenal  dengan  nama  penyuara  kuping  (bidang fisika dan elektronika) atau  piranti dengar (bidang komunikasi  massa)  atau  pelantang  telinga  (bidang umum)  adalah  sepasang  pengeras  suara  kecil  yang digunakan  sangat  dekat  dengan  telinga.  Alat  ini biasanya  dihubungkan  dengan  alat  komunikasi seperti handphone.  Earphone digunakan  sebagai alat bantu dengar telinga untuk telepon sebenarnya sudah ada sejak abad ke-20 (Alten, 2011).
Earphone dapat  dijadikan  salah  satu  barang bukti karena pada earphone yang telah digunakan, terdapat  sel–sel  epitel  dari  telinga  dan  serumen. Didalam  sel–sel  epitel  dan  serumen  tersebut mengandung informasi genetik yang dapat dianalisis dan diidentifikasi.
2.3. DNA ( Deoxyribo Nucleic Acid ) DNA  ( Deoxyribo  Nucleic  Acid )  adalah  senyawa kimia  yang  membawa  informasi  genetik  pada  tiap individu  dan  akan  diturunkan  ke  keturunannya. Deoxyribo  Nucleic  Acid berbentuk  untaian  ganda ( double  helix ).  DNA  di  dalam  sel  mempunyai  fungsi autokatalitis,  yaitu  DNA  dapat  mensintesis  dirinya sendiri,  proses  ini  biasa  disebut  replikasi.  Fungsi  lain DNA  adalah  heterokatalitis  yang  terdiri  dari  proses transkripsi,  dan  translasi.  Ketiganya  tersebut  biasa disebut dogma sentral aliran genetik (Suryo, 2004).
Replikasi  adalah  proses  penggandaan  DNA  dari DNA  yang  telah  ada,  sehingga  masing  –  masing  dari dua  sel  anak  mewarisi  genom  lengkap  dari  sel  induk. Proses  transkripsi  adalah  pembentukan  molekul  RNA dari  DNA.  Rantai  ganda  DNA  diubah  menjadi  rantai tunggal  kemudian  hanya  satu  rantai  DNA  yang  akan menjadi  template  untuk  pembentukan  RNA.  Setelah proses  transkripsi  dilanjutkan  proses  translasi,  yaitu penyusunan  protein  dari  sequence  asam  amino berdasarkan  urutan  basa  nukleotida  yang  dibaca  dari mRNA (Sutarno, 2010). Dalam proses translasi,  setiap tiga  basa  nitrogen  akan  diterjemahkan  sebagai  satu molekul  asam  amino  penyusun  protein,  contoh  :  start codon  dikode  ATG  merupakan  kode  penyandi  asam amino Metionin (MET), stop codon dikode TAA, TGA, dan TAG, asam amino Leusin (LEU) dikode CTT, dsb (Neto and Lapis, 2009).
Kode genetik berlaku universal, artinya kode yang sama berlaku untuk semua organisme. Oleh karena itu, urutan  kode  genetik  mendefinisikan  banyak  hal,  mulai dari  jenis  organisme  sampai  ciri  –  ciri    fisik  (fenotip) khusus  tiap  individu.  Selain  itu,  kode  genetik  tersebut digunakan juga dalam analisis mutasi yang
menyebabkan  penyakit  –  penyakit  genetik  serta pengobatan  yang  tepat,  rekayasa  genetika  untuk mendapatkan individu dengan sifat pilihan (Robinson 1 , 2003).
Dalam  dunia  forensik,  kode  genetik  digunakan untuk  analisis  hubungan  kekerabatan  dan  identifikasi individu. Selain itu sekarang ini sedang dikembangkan prediksi  usia  dari  sekuens  kode  genetik  DNA  metilasi (Frumkin et al ., 2011).
2.4. Short Tandem Repeats (STRs)
STRs ( Short Tandem Repeats ) adalah salah satu metode analisis yang berdasarkan pada  metode Polymerase  Chain Reaction (PCR).  STRs    adalah  suatu  analisis  genetik  yang digunakan untuk menggambarkan urutan DNA pendek (2 – 7 pasangan basa) yang diulang – ulang. Genom setiap manusia mengandung  ratusan  STRs.  Metode  ini  paling  banyak dikembangkan  karena  metode  ini  cepat,  otomatis  dan memiliki kekuatan diskriminasi yang tinggi (Butler, 2015).
Dengan  metode STRs dapat memeriksa sampel DNA yang rusak atau dibawah standar karena ukuran fragmen DNA yang  diperbanyak  oleh  PCR  berkisar  antara  200  –  500 pasangan basa.
Interpretasi data STR biasanya dimulai dengan melihat profil  DNA  secara  keseluruhan  dan  didalam  dunia  forensik lokus yang diperiksa yaitu 13 lokus (Alonso, 2012  dan Butler, 2012).  Lokus  yang  telah  ditetapkan  FBI  sebagai  acuan identifikasi forensik antara lain yaitu : CSF1P0, FGA, TH01, TPOX,  vWA,  D3S1358,  D5S818,  D7S820,  D8S1179, D13S317,  D16S539,  D18S51,  D21S11,  dan  penanda amelogenin  yang  digunakan  dalam  analisis  jenis  kelamin (Butler et al., 2003).
Setiap lokus  STR  mempunyai ciri – ciri khusus (Tabel 2.1.).  Dan  setiap  lokus  STR  tersebut,  tiap  –  tiap  individu mempunyai  dua  fragmen  DNA  yang  masing  –  masing diturunkan  dari    orang  tuanya.  Oleh  karena  itu,  semakin banyak  lokus STR yang  diperiksa  maka semakin spesifik mengarah  pada  satu    individu  (Notosoehardjo    dan Pudjiwitomo, 2009).
Tabel  1.  Informasi  karakterisasi  lokus  STR  (Butler  &  Hill, 2012)
Keterangan  :  Tiap–tiap  lokus  terletak  pada  kromosom tertentu dan memiliki daerah repeat yang berbeda – beda. Oleh
JBP Vol. 17, No. 1, April 201—Anindita Riesti Retno Arimurti
karena itu, pemeriksaan analisis DNA dalam dunia forensik, menggunakan beberapa lokus agar semakin spesifik mengarah pada satu individu.
3. METODE PENELITIAN
3.1. Alat dan bahan
Alat  yang  digunakan  dalam  penelitian  ini dibedakan menjadi dua macam, yaitu :
a. Alat  untuk  mengambil  sampel  sel  epitel  dan serumen  telinga  manusia    antara  lain  earphone  untuk digunakan oleh probandus kemudian sel–sel epitel dan serumen  yang  menempel  di  earphone  diambil  dengan cara swab. Tabung untuk menyimpan hasil swab. Serta kertas label atau spidol permanen untuk melabel sample sesuai dengan identitas probandus tersebut.
b.  Sedangkan  untuk  analisis  DNA  digunakan, ultracentrifuge  (Gyrozen  Co.,  Ltd.),  vortex  mixer, refrigerator  untuk  menyimpan  sampel,  pipet    mikro (eppendorf  pippet)  P10,  P100,  dan  P1000,  Thermal cycler PCR Machine (Boeco), elektroforator (Mini Run Gel Electrophoresis System GE-100), UV transilluminator  (BioRad),  ice  box,  microwave, inkubator, autoclave dan kamera digital untuk memfoto hasil elektroforesis.
Bahan  yang digunakan  untuk penelitian ini antara lain  yaitu,  sel–sel  epitel  manusia  yang  berasal  dari telinga  probandus  manusia.  Sedangkan  bahan  yang digunakan  untuk  analisis  variasi  genetik  meliputi  :  Kit isolasi  DNA  ®Fermentas  :  GeneJET  Genomic  DNA Purification Kit,  gel akrilamid 1,75%, buffer TBE 1X, dan  etidium  bromide  (EtBr),  primer,  PCR  Kit ®Fermentas  (DreamTaq TM Green  PCR  Master  Mix (2x)), ethanol 70%, PBS, akuabides (water nukleasefree),  akuades  steril,  alumunium  foil,  dan ladder DNA (marker) 100 – 3000 bp ®Vivantis.
3.2. Cara kerja Earphone digunakan  oleh  sukarelawan  selama tiga  hari  berturut–turut.  Hari  berikutnya, earphone dimasukan kedalam amplop kertas kemudian dikembalikan  ke  peneliti.  Sehari  setelahnya  (dianggap sebagai  hari  ke-1),  sebanyak  6 earphone diswab kemudian diisolasi DNAnya. Setelah itu disimpan pada suhu - 20ºC. Dua hari berikutnya (dianggap sebagai hari ke-3), sebanyak 6 sampel earphone diswab dan diisolasi DNAnya. Kemudian hasil isolasi DNA disimpan pada suhu - 20ºC. Enam (6) sampel earphone terakhir diswab dan  diisolasi  DNAnya  pada  dua  hari  berikutnya (dianggap  sebagai  hari  kelima).  Hasil  isolasi  DNA disimpan pada suhu - 20ºC juga.
Hari berikutnya, semua sampel hasil isolasi DNA diuji kadar dan kemurniannya dengan spektrofotometer. Hasil  spektrofotometri  diurutkan  dari  DNA  dengan kadar  tertinggi  hingga  terendah  pada  tiap  kelompok hari,  kemudian  dari  tiap–tiap  kelompok  hari,  diambil dua sampel dengan kadar tertinggi dan  terendah  untuk dianalisis selanjutnya.
Tahap selanjutnya yaitu amplifikasi DNA dengan metode  PCR  ( Polymerase  Chain  Reacton ).  Adapun
lokus yang diperiksa pada penelitian ini adalah D18S51 dan  D21S11.  Alasan  pemilihan  kedua  lokus  tersebut karena  kedua  lokus  tersebut  mempunyai  daya diskriminasi tinggi pada populasi di Indonesia (Untoro, 2009).  Suhu  yang  digunakan  pada  proses  PCR  ini sebagai berikut :
Predenaturasi : 96ºC – 2 menit Denaturasi : 94ºC – 1 menit Annealing : 60ºC – 1 menit Extension : 70ºC – 1,5 menit Denaturasi : 90ºC – 1 menit Annealing : 60ºC – 1 menit Extension : 70ºC – 1,5 menit Final extension : 60ºC – 30 detik Adapun komposisi PCR yang digunakan sebagai berikut : Primer :  2,5  µl  (menggunakan  2  primer, jadi total 5µl) PCR mix : 12,5 µl Sampel : 1 µl
Aquades steril  : 6 µl Total volume  : 25 µl
Selain  sampel  DNA  yang  diamplifikasi,  terdapat juga dua kontrol yang diamplifikasi juga, yaitu kontrol positif berupa K562 dan kontrol negatif berupa akuades steril.
Setelah PCR tahapan selanjutnya yaitu elektroforesis.  Pada  penelitian  ini  menggunakan  gel akrilamid  dan  marker  100bp.  Sebanyak  15  µl  sampel hasil  PCR  diambil  lalu  dimasukkan  pada  sumuran  gel akrilamid.  Kemudian  dirunning  selama  45  menit. Setelah  itu,  hasil  elektroforesis  direndam  dengan pewarna  silver  stain  selama  +  30  menit  kemudian diperiksa  dibawah  lampu  dan  hasilnya  difoto  dengan kamera digital.

## 4. HASIL DAN PEMBAHASAN
Hasil  pemeriksaan  kadar  dan  kemurnian  DNA, didapatkan hasil sebagai berikut :
Tabel 2. Kadar DNA hasil swab earphone Hari No. Sampel ID ng/µl 260/280 Hari ke-1 1 KA/ 23/ F 359.04 1.85 2 FP/ 21/ M 305.17 1.88 3 FAN/ 31/ M 200.4 1.76 4 KAE/ 23/ F 193.32 1.75 5 WDD/ 23/ F 190.44 1.76 6 AMF/ 23/ M 187.28 1.79 Hari ke-3 1 JA/ 44/ M 176.16 1.75 2 JRZ/ 27/ M 162.56 1.74 10x siklus 25x siklus
JBP Vol. 17, No. 1, April 201—Anindita Riesti Retno Arimurti
3 KP/ 22/ F 162.25 1.72 4 AHL/ 24/ F 160.92 1.74 5 ETSM/ 31/ F 155.81 1.76 6 RNF/ 28/ F 155.1 1.71 Hari ke-5 1 TP/ 22/ F 138.94 1.74 2 ARRA/ 25/ F 120.58 1.73 3 DB/ 25/ F 113.82 1.69 4 RAE/ 24/ F 99.63 1.65 5 AW/ 25/ F 97.11 1.65 6 FA/ 33/ F 74.76 1.61
Dari  hasil  diatas,  terlihat  adanya  penurunan kadar  dan  kemurnian  DNA  dari  hasil  swab earphone  dengan  perlakuan  perbedaan  hari  swab. Sehingga  dapat  dinyatakan  bahwa  semakin  lama waktu  perlakuan  diberikan  atau  dengan  kata  lain semakin  lama  earphone  terpapar  di  lingkungan, maka terdapat kecenderungan kadar dan kemurnian DNA mengalami penurunan.
Untuk  memastikan  apakah  ada  pengaruh perbedaan  waktu  swab  earphone    dengan  kadar DNA,  maka  dilakukan  uji  statistika  yaitu  Kruskal Wallis.  Alasan  digunakan  uji  statistika  Kruskal Wallis  karena  data  yang  didapat  tidak  memenuhi uji statistika Anova, yaitu data tidak homogen.
Berikut  hasil  uji  statistika  dengan  Kruskal Wallis :
Tabel 3. Hasil uji Kruskal Wallis kadar DNA
Tabel 4. Hasil uji Kruskal Wallis kemurnian DNA
Dari  Tabel  4.2.  diatas,  hasil  uji  Kruskal  Wallis untuk  kadar  DNA  diperoleh  nilai  p  (asymp.Sig.)  = 0.001. Oleh karena nilai p < 0,05, maka H0 ditolak dan Hi  diterima,  sehingga  dapat  disimpulkan  bahwa  ada pengaruh  perbedaan  waktu  swab  earphone  terhadap kadar DNA yang didapatkan.
Dari  Tabel  4.3.  diatas,  hasil  uji  Kruskal  Wallis untuk  kadar  DNA  diperoleh  nilai  p  (asymp.Sig.)  = 0.002. Oleh karena nilai p < 0,05 maka H0 ditolak dan Hi  diterima,  sehingga  dapat  disimpulkan  bahwa  ada pengaruh  perbedaan  waktu  swab  earphone  terhadap kemurnian DNA yang didapatkan.
Untuk  mengidentifikasi  individu  maka  diperlukan pemeriksaan pada beberapa lokus dengan metode Short Tandem  Repeat  (STR).  Pada  penelitian  ini  lokus  yang diperiksa antara lain yaitu D18S51 dan D21S11, karena ketiga  lokus  tersebut  memiliki  daya  diskriminasi  yang tinggi.  Sampel  yang  dianalisis  lokusnya  yaitu  sampel dengan  kadar  tertinggi  dan  terendah  pada  tiap  –  tiap perlakuan waktu. Sehingga untuk satu lokus ada enam (6) sampel yang diperiksa.
Lokus D18S51 Lokus  pertama  yang  diperiksa  pada  penelitian  ini adalah  D18S51.  Hasil  visualisasi  PCR  lokus  D18S51 sebagai berikut :

## 31
JBP Vol. 17, No. 1, April 201—Anindita Riesti Retno Arimurti
Gambar 1. Hasil visualisasi PCR lokus D18S51
Ukuran  produk  PCR  (bp)  untuk  lokus  D18S51  : 290  –  366.  Gambar  4.1.  diatas  menunjukkan  hasil amplifikasi  PCR  lokus  D18S51  terhadap  sampel  swab earphone  dari  hari  ke-1  sampai  hari  ke-5  terlihat  pita atau band DNA.
Lokus D21S11 Lokus  terakhir  yang  diperiksa  pada  penelitian  ini adalah  D21S11.  Hasil  visualisasi  PCR  lokus  D21S11 sebagai berikut :
Gambar 2. Hasil visualisasi PCR lokus D21S11
Ukuran  produk  PCR  (bp)  untuk  lokus  D21S11  : 203  –  259.  Gambar  4.2.  diatas  menunjukkan  hasil amplifikasi  PCR  lokus  D21S11  terhadap  sampel  swab earphone  dari  hari  ke-1  sampai  hari  ke-5  terlihat  pita atau band DNA.

## 5. KESIMPULAN DAN SARAN
Perbedaan waktu swab mengakibatkan penurunan kadar  dan  kemurnian  DNA  yang  signifikan.  Hasil visualisasi  kedua  lokus  100%  muncul  semua.  Akan tetapi untuk lokus  D21S11 hasilnya tidak sebagus lokus D18S51.  Hal  ini  karena  lokus  D21S11  lebih  banyak mengalami degradasi dari hasil swab earphone.

## ACUAN REFERENSI
Alonso,  A.  2012. DNA  Electrophoresis  Protocols For  Forensic  Genetics .  Spain:  Humana Press.
Alten,  S.  F.  2011. Cengage  Advantage  Books  : Audio  Basics  1st  Edition .  England: Wadsworth Publishing.
Andarini, M. 2011. Serologi Forensik . Yogyakarta: Gadjah Mada University Press. Butler,  J.  M.  2015. Advanced  Topics  In  Forensic DNA  Typing:  Interpretation .    San  Diego, USA: Academic Press, Elsevier.
Butler,  J.  M.  &  Hill,  C.  R.  2012.  Biology  and
Genetics  of  New  Autosomal  STR  Loci Useful  for  Forensic  DNA  Analysis . Forensic Science Review , Vol: 24, No. 1.
Butler,  J.  M.,  Shen,  Y.,  Bruce,  R.,  and  Mc.  Cord. 2003.  The  Development  of  Reduced  Size
STR Amplicons  As Tools for Analysis of Degraded DNA . Journal Forensic Science , Vol.  48 No. 5, pp: 1054 – 1064. Dinces, E. A. 2012. Cerumen. http:// androsma.5gbfree.com /contents/mobipreview.htm?12/33/12823? source=related_link. Diakses: 11 September 2015, Pukul 19.45 WIB.
Frumkin,  D.,  Wasserstrom,  A.,  Budowle,  B.,
Davidson,  A.,  2011.  DNA  Methylation- based  Forensic  Tissue  Identification. Forensic  Science  International:  Genetics . Vol. 5 : 517 – 524. Kusumadewi, A., Kusuma, S. E., dan Yudianto, A. 2012.  Analisis  DNA  Jaringan  Lunak Manusia  yang  Terpapar  Formalin  dalam Interval  Waktu  1  Bulan  Selama  6  Bulan pada  Lokus  D13S317  dengan  Metode STR-PCR. Jurnal Biosains Unair Vol. 14, No.2.
Keterangan : M : marker (100bp) K(+) : kontrol positif K(-)
: kontrol positif
S1a       : sampel hari ke-1 kadar tertinggi S1b       : sampel hari ke-1 kadar terendah S2a       : sampel hari ke-3 kadar tertinggi S2b       : sampel hari ke-3 kadar terendah S3a       : sampel hari ke-5 kadar tertinggi S3b       : sampel hari ke-5 kadar terendah : lokus D18S51
Keterangan :
M : marker (100bp) K(+) : kontrol positif K(-) : kontrol positif S1a       : sampel hari ke-1 kadar tertinggi S1b       : sampel hari ke-1 kadar terendah
S2a       : sampel hari ke-3 kadar tertinggi S2b       : sampel hari ke-3 kadar terendah S3a       : sampel hari ke-5 kadar tertinggi S3b       : sampel hari ke-5 kadar terendah : lokus D21S11
JBP Vol. 17, No. 1, April 201—Anindita Riesti Retno Arimurti
Mills,  J.  H.,  Khariwala,  S.  S.,  Weber,  P.  C.  2006.
Anatomy  And  Physiology  Of  Hearing  ; Head & Neck Surgery Otolaryngology 4th Ed  Vol.2.  Philadelphia:  J.  B.  Lippincot Co. Neto,  B.  A.  D.  and  Lapis,  A.  A.  M.  2009.  Recent
Developments  in  the  Chemistry  of Deoxyribonucleic Acid (DNA) Intercalators: Principles, Design, Synthesis, Applications and Trends.
Journal  of  Molecules .  Vol.  14:  1725  – 1746; doi : 10.3390/molecules14051725. Notosoehardjo,  I  dan  Pudjiwitomo,  K.  2009. Stabilitas  DNA  Post  Mortem, Majalah Ilmu  Kedokteran  Forensik ,  Vol.  VII  No.
1. Surabaya. Hal: 31 – 37.
Robinson 1 ,  R.  2003. Genetics Volume  IV.  New York,  USA:  Mac  Millan  Science  Library. Pp: 12, 68 – 71. Suryo.  2004. Genetika  Strata  1 .  Yogyakarta:
Gadjah  Mada  University  Press.  Pp:  57  – 66, 73 – 75.
Sutarno.  2010. Sintesis  Protein .  Surakarta:  UNS Press. Tortora,  G.  J.,  and  Derrickson,  B.  2009. Introduction  to  The  Human  Body:  The Essentials  of  Anatomy  and  Physiology . USA: John Wiley & Sons, Inc. Untoro,  E.,  Atmadja,  D.  S.,  Pu,  C.  W.,  Wu,  F.  C. 2009.  Allele  Frequency  Of  CODIS  13  In Indonesia  Population. Legal  Medicine 11: S203 – 205.