## EVALUASI KETAHANAN DAN ANALISIS QUANTITATIVE TRAIT LOCI YANG TERPAUT DENGAN KETAHANAN TERHADAP PENYAKIT UTAMA PADA TANAMAN KARET

## Resistance Evaluation and Quantitative Trait Loci Analysis Linked to Main Disease
Resistance on Rubber Plant
Fetrina OKTAVIA* dan Alchemi Putri Juliantika KUSDIANA
Pusat Penelitian Karet. Jl. Raya Palembang – Pangkalan Balai Km. 29, Sembawa, Banyuasin, Sumatera Selatan, 30953 *Email: fetrina_oktavia@yahoo.com
Diterima : 9 November 2020 / Disetujui : 24 Februari 2021
Jurnal Penelitian Karet, 2021, 39 (1)  : 37 - 50 Indonesian  J.  Nat. Rubb. Res. 2021, 39 (1) : 37 - 50 Doi : 10.22302/ppk.jpk.v39i1.757

## Abstract
The  development  of  plant  resistance selection  methods  against  major  diseases needs  to  be  done,  one  of  which  is  selection assisted by molecular markers. The aim of the study was to evaluate the resistance of rubber plants to the main diseases that attack rubber plants, namely Corynespora, Colletotrichum, and Oidium leaf fall disease, as well as white root  disease  (WRD),  furthermore,  to  identify QTLs  associated  with  these  diseases. Analyzed population were 201 F1 progenies obtained  from  crosses  of  PB  260  x  SP  217 clones.  Observation  of  symptomps  each disease carried out every three months until immature period 2. The genetic link maps of population  were  compiled  by  using  263  of selected  SSR  markers.  QTLs  identification were  done  by  joint  the  disease  observation data  on  two  years  old  of  plant  and  genetic linkage  map  using  Map  QTL  software.  The observations  showed  that  there  were variations of resistance level of F1 progenies to attack of each pathogen. Resistance of F1 to Corynespora  and  Colletotrichum  leaf  fall disease as well as to white root disease had a normal distribution with disease severity level of  0-9%,  0-22.5%,  and  0-7%  respectively. Otherwise to Oidium leaf fall disease, all of F1 progenies had a high resistance level which the  disease  severity  less  than  1.5%.  Three QTLs related to Corynespora leaf fall disease resistance were identified in LG 10, 14, and 15 with LOD range 3.1 to 5.19 and the highest QTL effect was 17.7%. Four  QTLs related to Colletotrichum  leaf  fall  disease  resistance were found in LG 1, 3, 10, and 16 with LOD 3 to 4.44 and the highest QTL effect was 11.2%. On LG 8 LOD 2.9, there was a putative QTL
related  to  WRD  resistance,  while  a  QTL related  to  Oidium  leaf  fall  disease  had  not been  identified.  QTLs  that  have  been identified with LOD above 3 are expected to be stable  and  will  be  analyzed  periodically  so that they can be used as a tool for resistance selection.
Keywords: Colletotrichum;  Corynespora; Hevea  brasiliensis;  Oidium; QTL; white root disease

## Abstrak
Pengembangan  metode  seleksi ketahanan  tanaman  terhadap  penyakit utama  perlu  dilakukan,  salah  satunya adalah  seleksi  dengan  bantuan  marka m o l e k u l e r .   P e n e l i t i a n   b e r t u j u a n mengindenfikasi  evaluasi  ketahanan tanaman  karet  terhadap  penyakit  utama yang  menyerang  tanaman  karet  yaitu penyakit  gugur  daun  Corynespora, Colletotrichum, dan Oidium, serta penyakit jamur akar putih (JAP) dan identifikasi QTL yang  terpaut  dengan  penyakit  tersebut. Populasi yang digunakan adalah 201 progeni F1 hasil persilangan klon PB 260 x SP 217. Pengamatan  gejala  setiap  penyakit dilakukan  setiap  tiga  bulan  sekali  sampai TBM 2. Peta pautan genetik yang digunakan adalah peta yang dihasilkan dari penelitian sebelumnya  dengan  menggunakan  263 marka  SSR  terseleksi.  Identifikasi  QTL dilakukan  dengan  menggabungkan  data pengamatan  penyakit  tanaman  umur  dua tahun  dengan  peta  pautan  genetik m e n g g u n a k a n   p r o g r a m   M a p   Q T L . Pengamatan menunjukkan bahwa terdapat
variasi  tingkat  ketahanan  progeni  F1 terhadap  serangan  setiap  patogen. Ketahanan  F1  terhadap  penyakit  gugur daun Corynespora dan Colletotrichum serta jamur  akar  putih  menyebar  secara  normal dengan  tingkat  keparahan  serangan berkisar  0-9%,  0-22,5%,  dan  0-7%  secara berturut-turut.  Sebaliknya  terhadap penyakit gugur daun Oidium, semua progeni F1  memiliki  ketahanan  yang  tinggi  dimana keparahan penyakit kurang dari 1,5%.  Tiga QTL  yang  terpaut  dengan  ketahanan terhadap penyakit gugur daun Corynespora berhasil diidentifikasi pada LG 10, 14, dan 15  dengan  LOD  berkisar  3,1  -  5,19  dan pengaruh  QTL  tertinggi  sebesar  17,7%. Empat  QTL  yang  terpaut  ketahanan t e r h a d a p   p e n y a k i t   g u g u r   d a u n Colletotrichum ditemukan pada LG 1, 3, 10, dan 16 dengan LOD 3 – 4,44 serta pengaruh tertinggi  terhadap  ketahanan  sebesar 11,2%.  Pada  LG  8  LOD  2,9  berhasil diidentifikasi  putatif  QTL  yang  terpaut ketahanan  terhadap  JAP,  sedangkan  QTL yang  terpaut  dengan  ketahanan  terhadap penyakit gugur daun Oidium belum berhasil d i i d e n t i f i k a s i .   Q T L   y a n g   b e r h a s i l diidentifikasi  dengan  LOD  di  atas  3 diharapkan stabil dan akan dianalisis secara berkala  sehingga  dapat  digunakan  sebagai alat bantu seleksi ketahanan.
Kata kunci : Colletotrichum ; Corynespora ; Hevea brasiliensis ; jamur akar putih; Oidium ; QTL

## PENDAHULUAN
Tanaman  karet  ( Hevea  brasiliensis ) merupakan  penghasil  utama  karet  alam. Hingga  saat  ini,  Indonesia  merupakan negara terbesar kedua penghasil karet alam yang menyumbang lebih dari 90% produksi karet  alam  dunia  bersama  dengan  negara- negara  penghasil  karet  lainnya  di  Asia Tenggara. Terjadinya perubahan iklim global yang  dapat  memengaruhi  fisiologi  dan ekologi  tanaman  serta  sistem  ketahanan tanaman  terhadap  serangan  patogen sehingga  terjadi  penurunan  potensi produksi tanaman karet.
Hingga  tahun  2018,  terdapat  lima penyakit  utama  yang  paling  berpengaruh terhadap  produksi  tanaman  karet  yaitu penyakit  gugur  daun South  American  Leaf Blight (SALB)  yang  disebabkan  oleh
cendawan Microcyclus  ulei ,  penyakit  gugur daun  (PGD)  Corynespora  yang  disebabkan cendawan Corynespora  cassiicola, penyakit gugur daun Colletotrichum yang disebabkan o l e h   c e n d a w a n C o l l e t o t r i c h u m gloeosporioides ,  penyakit  gugur  daun Oidium  yang  disebabkan  oleh  cendawan Oidium  heveae, dan  penyakit  jamur  akar putih  (JAP)  yang  disebabkan  cendawan Rigidoporus  microporus .  Di  daerah  asal tanaman  karet  seperti  Brazil  dan  negara- negara  Amerika  Selatan,  SALB  merupakan penyakit  utama  yang  menyerang  hampir semua  klon  sehingga  budidaya  karet  tidak terlalu  berkembang  di  daerah  tersebut.  Di Asia  Tenggara  yang  merupakan  sentra produksi karet alam dunia, SALB juga tidak berkembang,  namun  PGD  Corynespora, Colletotrichum,  Oidium,  dan  JAP  menjadi ancaman  utama  terhadap  penurunan produksi (Situmorang et al., 2007; Manju et al.,  2015;  Mazlan  et  al.,  2019).  Kondisi tersebut diperparah oleh terjadinya outbreak PGD baru pada tahun 2018 yang menyerang semua  klon  karet  yang  mengakibatkan penurunan  produksi  lateks  mencapai  45% (Febbiyanti  &  Fairuzah,  2019).  Penyakit gugur daun yang disebabkan oleh cendawan Pestalotipsis  microspora (Kusdiana  et  al., 2 0 2 0 )   m e n y e r a n g   h a m p i r   s e l u r u h perkebunan karet di Indonesia dan negara- negara  penghasil  karet  lainnya  di  Asia Tenggara.  Meskipun  demikian,  serangan penyakit  baru  tersebut  bersifat  kompleks, dimana  diduga  menyerang  tanaman  karet secara  bersamaan  dengan  PGD  lainnya, s e h i n g g a   t i n g g i n y a   s e r a n g a n   P G D Pestalotiopsis  sering  diikuti  dengan tingginya serangan PGD lainnya.
Berbagai  upaya  pengendalian  PGD telah  dilakukan,  baik  dengan  cara penggunaan  pestisida  kimia  maupun dengan aplikasi pestisida nabati (Ogbebor & Adekunle,  2005;  Evueh  et  al.,  2011)  serta peningkatan  kesehatan  tanaman  melalui pemberian  pupuk  ekstra  (Febbiyanti  et  al., 2020). Berbagai kendala sering dihadapi di lapangan, terutama terkait dengan tingginya tanaman  karet  yang  lebih  dari  10  meter sehingga  menyulitkan  dalam  aplikasi pestisida  serta  biaya  yang  cukup  besar. Salah satu solusi yang cukup efektif adalah dengan  menggunakan  klon-klon  tahan sebagai  bahan  tanam,  sehingga  seleksi ketahanan  terhadap  penyakit  utama merupakan salah satu SOP dalam perakitan klon-klon unggul baru tanaman karet.
P r o g r a m   p e m u l i a a n   u n t u k menghasilkan  klon-klon  unggul  baru membutuhkan  waktu  seleksi  yang  cukup lama yaitu lebih dari 15 tahun karena karet memiliki  siklus  hidup  yang  panjang. Pengembangan  metode  seleksi  ketahanan yang efektif dan efisien melalui pendekatan marka  molekuler  perlu  dilakukan  untuk mempercepat program pemuliaan tanaman karet.  Pengembangan  marka  molekuler suatu  karakter  pada  tanaman  dilakukan melalui  identifikasi  bagian  genome  yang terpaut  kuat  dengan  karakter  tersebut melalui  identifikasi  QTL  ( Quantitative  Trait Loci ).
Identifikasi  QTL  yang  terpaut  kuat dengan  suatu  karakter  dilakukan  melalui analisis  penggabungan  data genotyping dengan phenotyping . Genotyping merupakan penyusunan  peta  pautan  genetik  dari p o p u l a s i   b e r s e g r e g a s i ,   s e d a n g k a n phenotyping merupakan  pengamatan fenotipe  dari  suatu  karakter  yang diinginkan.  Peta  pautan  genetik  tersebut dapat  digunakan  untuk  analisis  QTL berbagai karakter berbeda yaitu dengan cara melakukan  pengamatan  fenotipe  berbagai karakter  pada  populasi  yang  sama  yang digunakan  untuk  menyusun  peta  pautan genetik.  QTL  berhasil  diidentifikasi  apabila terdapat  pautan  yang  kuat  antara  fenotipe dengan  genotipe.  Tingkat  kepercayaan keakuratan QTL akan ditentukan oleh nilai LOD  ( logarithmic  of  odds ),  dimana  QTL dianggap  terpaut  kuat  dengan  suatu karakter  pada  LOD  3,  dan  semakin  tinggi nilai LOD akan semakin kuat pautan antara karakter  dengan  genetik.  QTL  dengan  LOD tinggi  dan  jarak  genetik  yang  dekat  dapat digunakan  sebagai  alat  bantu  seleksi  atau MAS  ( marka  asissted  selection )  (Collard  et al., 2005; Semagn et al., 2006; Khan, 2015; Chandra & Pandey, 2017).
Penyusunan  peta  pautan  genetik dari berbagai populasi tanaman karet untuk identifikasi  QTL  berbagai  karakter  telah banyak dilaporkan diantaranya adalah QTL yang  terpaut  ketahanan  terhadap  penyakit gugur daun SALB (Le Guen et al., 2003; Le- Guen et al., 2007; Le Guen et al., 2011; Le Guen et al., 2013) dan penyakit gugur daun Corynespora  (PGDC)  (Tranh  et  al.,  2016; Oktavia et al., 2020). Pertumbuhan tanaman karet (Rattanawong et al. 2009; Novalina & Sagala, 2013; Souza et al., 2011; Souza et al., 2013;  Conson  et  al.,  2018;  Oktavia  2020),
dan  QTL  yang  terpaut  produksi  lateks (Chanroj et al., 2017; Rosa et al., 2018; An et al., 2019).
Dalam  penelitian  sebelumnya  telah dihasilkan peta pautan genetik dengan 201 progeni F1 hasil persilangan PB 260 x SP 217 sebagai mapping  population (populasi p e m e t a a n )   u n t u k   m e n g i d e n t i f i k a s i pertumbuhan awal tanaman karet (Oktavia, 2020).  Peta  genetik  yang  sama  digunakan dalam penelitian ini untuk identifikasi QTL yang  terpaut  dengan  ketahanan  terhadap penyakit  gugur  daun  Corynespora, Colletotrichum, dan Oidium, serta penyakit jamur  akar  putih.  Tujuan  penelitian  ini adalah mendapatkan marka molekuler yang terpaut  kuat  dengan  ketahanan  terhadap empat penyakit utama pada tanaman karet yang  termasuk  ke  dalam  penyakit  gugur daun dan jamur akar putih.

## BAHAN DAN METODE

## Waktu dan Tempat Penelitian
Phenotyping ketahanan  progeni  F1 terhadap  penyakit  utama  tanaman  karet dilakukan  di  Kebun  Percobaan  Pusat Penelitian  Karet,  Sembawa,  Banyuasin, Sumatera Selatan dari tahun 2016-2018.

## Materi Tanaman
Populasi  tanaman  yang  digunakan dalam penelitian adalah 201 progeni F1 yang dihasilkan dari persilangan klon PB 260 x SP 217. Selain itu digunakan kedua klon tetua dan enam klon kontrol yaitu AVROS 2037, GT  1,  IRR  112,  IRR  39,  PR  261,  dan  RRIC 100. Populasi dan klon kontrol ditanam pada b u l a n   N o v e m b e r   2 0 1 6 .   P e n e l i t i a n menggunakan  rancangan  acak  kelompok (RAK) dimana setiap progeni terdiri atas dua pohon dengan lima ulangan, sehingga total tanaman  yang  dianalisis  adalah  2.090 pohon. Seluruh populasi tanaman ditanam pada areal seluas 5 ha.

## Tahapan Penelitian
Terdapat tiga tahapan utama dalam kegiatan analisis QTL yaitu penyiapan peta pautan  genetik  ( genotyping )  yang  telah dilakukan  sebelumnya  (Oktavia,  2020), evaluasi  parameter  ketahanan  setiap progeni  terhadap  penyakit  utama  yang
Evaluasi Ketahanan dan Analisis Quantitative Trait Loci yang Terpaut dengan

## Ketahanan terhadap Penyakit Utama pada Tanaman Karet
menyerang tanaman karet di lapangan yaitu penyakit  gugur  daun  Corynespora, Colletotrichum,  Oidium,  dan  jamur  akar putih  ( phenotyping ),  serta  identifikasi  QTL yang  terpaut  ketahanan  terhadap  penyakit utama  tanaman  karet  dengan  cara menggabungkan  kedua  data phenotyping dan genotyping menggunakan software Map QTL.
Evaluasi  Ketahanan  Tanaman  F1 terhadap  Penyakit  Utama  di  Lapangan ( Phenotyping )
Pengamatan  penyakit  dilakukan secara  visual  dengan  melihat  tingkat serangan  penyakit  pada  setiap  pohon.
Pengamatan  dilakukan  setiap  tiga  bulan sekali. Pengamatan perkembangan penyakit gugur  daun  Corynespora,  Colletotrichum, dan  Oidium  dilakukan  dengan  mengamati bagian  tajuk  setiap  progeni  dan  melihat tingkat gejala serangan penyakit pada daun. P e n g a m a t a n   d i l a k u k a n   d e n g a n menggunakan  skala  serangan  yang dikelompokkan pada Tabel 1.
P e n g a m a t a n   p e r k e m b a n g a n penyakit jamur akar putih dilakukan secara visual  dengan  cara  membongkar  bagian pangkal  akar  lalu  mengamati  gejala  yang muncul.  Gejala  yang  diamati  ditentukan berdasarkan  skala  serangan  seperti  yang tercantum pada Tabel 2.

## Tabel 1. Klasifikasi skala serangan penyakit gugur daun pada tanaman karet
Table 1. Classification of leaf fall disease scale on rubber plants
Skala serangan Attack scale Klasifikasi Classification 0 tidak terdapat daun yang bergejala penyakit 1 < 20% tajuk tanaman bergejala penyakit gugur daun
2
21% - 40% tajuk tanaman bergejala penyakit gugur daun 3 41% - 60% tajuk tanaman bergejala penyakit gugur daun 4 61% - 80% tajuk tanaman bergejala penyakit gugur daun 5 > 80% tajuk tanaman bergejala penyakit gugur daun
Tabel 2. Klasifikasi skala serangan penyakit jamur akar putih pada tanaman karet Table 2. Classification of white root disease scale on rubber plants
Skala serangan Attack scale Klasifikasi Classification 0 tidak ada miselium JAP menempel pada perakaran 1 terdapat miselium JAP menempel pada perakaran 2 terdapat miselium JAP menempel pada perakaran dan telah penetrasi ke dalam jaringan 3 jaringan dalam akar berwarna hitam dan membusuk 4 akar busuk atau tanaman mati
Oktavia Kusdiana dan Selanjutnya keparahan penyakit dari semua  penyakit  ditentukan  dengan  rumus
sebagai  berikut  (Townsend  dan  Heuberger, 1943 dalam Sinaga, 2006):
% 100 . . 1 x N Z v n n i å = = KP (1)
dimana: KP : keparahan penyakit v : skala ke-i N : jumlah tanaman yang diamati
n : jumlah tanaman berskala v
Z : nilai skor tertinggi.
Data  skala  serangan  dianalisis menggunakan  histogram  pada  program microsoft  excel untuk  mengetahui  sebaran keparahan  penyakit  dari  semua  genotipe dan klon pembanding yang ditanam.
Identifikasi QTL yang terpaut Ketahanan terhadap Penyakit Utama Tanaman Karet
Identifikasi  QTL  dilakukan  dengan melakukan penggabungan data phenotyping tingkat  serangan  penyakit  utama  pada seluruh anggota populasi hasil persilangan PB  260  x  SP  217  dan genotyping m e n g g u n a k a n s o f t w a r e M a p   Q T L . Berdasarkan  metode  yang  dijelaskan  oleh Lander & Botstein (1989), identifikasi posisi QTL  dilakukan  menggunakan  analisis interval  mapping  (IM)  dilanjutkan  dengan multiple QTL mapping (MQM) menggunakan marker  cofaktor  yang  memiliki  nilai  LOD tertinggi  yang  ditemukan  pada  analisis  IM. Segregasi  setiap  lokus  dilakukan  melalui test  nonparametrik  Kruskal-Wallis  (KW) (Ooijen,  2004).  Tingkat  signifikansi keberadaan  QTL  berdasarkan  nilai  LOD, dimana  semakin  tinggi  nilai  LOD  maka pengaruh  QTL  akan  semakin  signifikan, sedangkan  QTL  di  bawah  LOD  3  dianggap
sebagai putative QTL yang memiliki tingkat signifikansi yang masih rendah.

## HASIL DAN PEMBAHASAN
Evaluasi  Ketahanan  Tanaman  F1  Hasil Persilangan  PB  260  x  SP  217  terhadap Penyakit  Utama  pada  Tanaman  Belum Menghasilkan ( Phenotyping )
Evaluasi  ketahanan  201  progeni  F1 hasil  persilangan  klon  PB  260  x  SP  217 terhadap  penyakit  utama  tanaman  karet y a i t u   p e n y a k i t   g u g u r   d a u n   ( P G D ) Corynespora,  Colletotrichum,  dan  Oidium, serta penyakit jamur akar putih dilakukan di lapangan  selama  masa  tanaman  belum m e n g h a s i l k a n   ( T B M ) .   P e n g a m a t a n ketahanan  progeni  F1  terhadap  penyakit utama dilakukan setiap 3 bulan dengan cara mengukur  intensitas  serangan  setiap penyakit pada setiap progeni yang diamati. Pengamatan sampai tanaman berumur dua tahun  secara  umum  menunjukkan  bahwa progeni  F1  tumbuh  dengan  baik  (Gambar 1A)  dan  terdapat  variasi  ketahanan  setiap progeni  terhadap  serangan  penyakit  gugur daun (Gambar 1B).
Evaluasi Ketahanan dan Analisis Quantitative Trait Loci yang Terpaut dengan Ketahanan terhadap Penyakit Utama pada Tanaman Karet
Gambar 1. Pertumbuhan (A) dan variasi performa tajuk (B) populasi F1 hasil persilangan PB 260 x SP 217 TBM 2 tahun di lapangan
Figure 1. Growth  (A)  and  variation  of  canopy  performance  (B)  of  F1  population  obtained crossing of PB 260 x SP 217 on immature periode 2 year in the field
Setiap  progeni  F1  memiliki  tingkat ketahanan berbeda terhadap setiap penyakit utama  tanaman  karet.  Adanya  variasi tersebut  menandakan  terjadinya  segregasi gen ketahanan dari kedua klon tetua PB 260 dan  SP  217  terhadap  201  progeni  F1  yang diamati.  Sebaran  tingkat  keparahan  PGD Corynespora,  Colletotrichum,  dan  Oidium, serta  jamur  akar  putih  masing-masing progeni terlihat pada Gambar 2.

## Ketahanan  terhadap  Serangan  PGD Corynespora
Serangan  PGD  Corynespora  pada tanaman  karet  ditandai  dengan  gejala bercak  coklat/kelabu  yang  menyebar  pada tulang  daun.  Berdasarkan  pengamatan pada  tanaman  umur  dua  tahun  terlihat b a h w a   k e p a r a h a n   s e r a n g a n   P G D Corynespora terhadap progeni F1 berkisar 0- 9%  dengan  sebaran  jumlah  tanaman terbanyak pada keparahan penyakit kurang dari 4,54% (Gambar 2A).
Kondisi  tersebut  menunjukkan b a h w a   t a n a m a n   p r o g e n i   F 1   h a s i l persilangan  PB  260  x  SP  217  relatif  tahan terhadap  PGD  Corynespora.  Secara  umum pola sebaran ketahanan progeni F1 terhadap PGD  Corynespora  adalah  normal  sehingga terdapat  peluang  besar  teridentifikasinya QTL  yang  terpaut  dengan  ketahanan terhadap PGD Corynespora. Sebaran normal m e n g i n d i k a s i k a n   b a h w a   k a r a k t e r ketahanan terhadap PGD Corynespora pada tanaman  karet  diregulasi  oleh  banyak  gen (poligenik) yang bersifat aditif. Hal ini sejalan dengan yang dilaporkan oleh Hadi & Hartana (2004) serta Oktavia et al. (2020).

## Ketahanan  terhadap  Serangan  PGD Colletotrichum
PGD Colletotrichum menyerang pada saat tanaman karet membentuk daun muda s e l a m a   m u s i m   h u j a n .   P e n g a m a t a n keparahan penyakit dilakukan berdasarkan tingkatan gejala berupa bercak hitam yang mengakibatkan  daun  berlubang,  keriput, serta  bagian  ujungnya  mati.  Berdasarkan pengamatan  terhadap  gejala  tersebut  pada setiap F1, terlihat bahwa tingkat keparahan penyakit  PGD  Colletotrichum  pada  F1 bervariasi  yaitu  berkisar  0-22,5%  dengan sebaran  jumlah  tanaman  terbanyak  pada
keparahan  penyakit  antara  6,78%-18,07%. Hal  tersebut  menunjukkan  tingkat ketahanan progeni F1 hasil persilangan PB 260  x  SP  217  terhadap  serangan  PGD Colletotrichum  lebih  rendah  dibandingkan serangan PGD Corynespora.
Gambar  2B  menunjukkan  pola sebaran  ketahanan  progeni  F1  terhadap serangan  PGD  Colletotrichum.  Tidak berbeda  jauh  dengan  ketahanan  terhadap PGD Corynespora, ketahanan terhadap PGD Colletotrichum  menyebar  normal.  Hal  ini terkait dengan indikasi gen-gen pengendali ketahanan  terhadap  PGD  Colletotrichum yang  bersifat  poligenik  sehingga  peluang QTL  yang  terpaut  dengan  ketahanan terhadap PGD Colletotrichum teridentifikasi lebih tinggi.

## Ketahanan  terhadap  Serangan  PGD Oidium
Berdasarkan  pengamatan  gejala serangan  PGD  Oidium  pada  saat  tanaman berumur  dua  tahun  di  lapangan  terlihat bahwa  tingkat  serangan  penyakit  rendah yaitu kurang dari 1,5% (Gambar 2C). Kondisi tersebut  berbeda  dengan  kedua  PGD sebelumnya, dimana ketahanan progeni F1 terhadap  serangan  PGD  Oidium  sangat tinggi.  Adanya  perbedaan  tersebut disebabkan karena pengaruh kondisi iklim, kemungkinan  pada  saat  pengamatan kondisi  iklim  tidak  sesuai  dengan perkembangan  Oidium.  Tingkat  keparahan Oidium  akan  meningkat  pada  saat  kondisi hujan  rintik-rintik  yang  diikuti  oleh  panas dan kondisi tersebut terjadi berulang-ulang. Serangan  PGD  Oidium  ditunjukkan  oleh gejala  adanya  massa  spora  cendawan berwarna  putih  seperti  tepung  pada permukaan bawah daun.
Gambar 2C juga menunjukkan pola sebaran ketahanan terhadap serangan PGD Oidium terlihat tidak normal (deskrit) yang m e n u n j u k k a n   b a h w a   k e m u n g k i n a n ketahanan  tanaman  karet  terhadap  PGD Oidium  dikendalikan  oleh  satu  atau beberapa  mayor  gen  (monogenik).  Hal  ini akan  berpengaruh  terhadap  keberhasilan identifikasi  QTL  yang  akan  dilakukan. Banyak  faktor  yang  memengaruhi  kondisi tersebut  diantaranya  adalah  pengaruh kondisi  lingkungan  yang  besar  sehingga perlu pengamatan dan analisis lebih lanjut.

## Oktavia Kusdiana dan

## Ketahanan  terhadap  Serangan  Penyakit Jamur Akar Putih
A n a l i s i s   k e t a h a n a n   t a n a m a n terhadap  serangan  penyakit  jamur  akar putih  dilakukan  dengan  cara  mengamati gejala  serangan  penyakit  pada  pangkal batang  dan  tajuk  daun  tanaman.  Pada kondisi stadia awal, jamur akar putih akan menyerang  pangkal  batang  yang  ditandai dengan tempelan hifa/rhizomorf putih pada pangkal  batang.  Namun  pada  kondisi terserang  parah,  daun  akan  menguning, ujung daun terlipat ke dalam, muncul buah di  luar  masa  pembungaan  dan  terjadi kebusukan pada pangkal batang yang dapat mengakibatkan  tanaman  roboh  dan  mati. Berdasarkan  pengamatan  tersebut  terlihat bahwa  terdapat  keragaman  keparahan serangan jamur akar putih pada progeni F1 hasil  persilangan  PB  260  x  SP  217  yang diamati di lapangan.
Gambar  2D  menunjukkan  sebaran keparahan  serangan  penyakit  jamur  akar putih pada progeni F1 hasil persilangan PB 260 x SP 217. Terjadi penyebaran keparahan serangan penyakit jamur akar putih pada F1 yang berkisar 0-7% dengan sebaran jumlah tanaman  terbanyak  pada  keparahan penyakit  kurang  dari  3,54%.  Hal  tersebut menunjukkan kejadian penyakit jamur akar putih  sampai  masa  TBM  2  di  lokasi pengamatan  cukup  rendah,  namun menyebar secara normal.
Hasil  penelitian  ini  menunjukkan adanya  keparahan  empat  penyakit  yang menyerang tanaman karet progeni F1 hasil persilangan  PB  260  x  SP  217.  Dengan demikian  diharapkan  terdapat  peluang teridentifikasinya  QTL  yang  terpaut ketahanan  terhadap  PGD  dan  JAP  pada populasi F1 tersebut.
Evaluasi Ketahanan dan Analisis Quantitative Trait Loci yang Terpaut dengan Ketahanan terhadap Penyakit Utama pada Tanaman Karet
Gambar 2. Sebaran  rata-rata  keparahan  penyakit  gugur  daun  Corynespora  (A), Colletotrichum (B), Oidium (C), dan penyakit jamur akar putih (D) pada populasi F1 hasil persilangan PB 260 x SP 217 selama 2 tahun pengamatan
Figure 2. Distribution  of  leaf  fall  disease  severity  of  Corynespora  (A),  Colletotrichum  (B), Oidium (C), and white root disease (D) of F1 population obtained crossing of PB 260 x SP 217 for 2 year of observation
16 44 57 36 30 5 12 4 2 3 0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 0.45 1.36 2.27 3.18 4.09 5 5.91 6.82 7.73 8.64 Jumlah Tanaman Keparahan Penyakit (%) Keparahan Penyakit Gugur Daun Corynespora 0 1 2 13 41 84 45 21 1 1 0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 1.13 3.39 5.65 7.91 10.17 12.43 14.69 16.95 19.21 21.47 Jumlah Tanaman Keparahan Penyakit (%) Keparahan Penyakit Gugur Daun Colletotrichum 165 28 16 0 20 40 60 80 100 120 140 160 180 0.25 0.76 1.27 Jumlah Tanaman Keparahan Penyakit (%) Keparahan Penyakit Gugur Daun Oidium 36 41 77 20 20 6 3 5 0 1 0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 0.35 1.06 1.77 2.48 3.19 3.9 4.61 5.32 6.03 6.74 Jumlah Tanaman Keparahan Penyakit (%) Keparahan Penyakit Jamur Akar Putih A B C D
Penyusunan  Peta  Pautan  Genetik Menggunakan  Marka  Molekuler  SSR ( Genotyping )
Peta pautan genetik yang digunakan dalam  analisis  QTL  yang  terpaut  penyakit gugur  daun  Corynespora,  Colletotrichum, Oidium  dan  penyakit  jamur  akar  putih adalah  sama  dengan  analisis  QTL  yang terpaut pertumbuhan tanaman karet seperti yang  telah  dilaporkan  oleh  Oktavia  (2020). Hal  ini  karena  populasi  yang  dianalisis adalah  sama,  progeni  F1  hasil  persilangan PB 260 x SP 217.
Pada  penelitian  tersebut  telah berhasil disusun 22 kelompok peta pautan genetik populasi hasil persilangan PB 260 x SP 217 menggunakan 263 marker SSR. Peta pautan tersebut memiliki jarak genetik yang berkisar  antara  1–119,2  cM.  Berdasarkan jumlah kromosom tanaman karet yaitu 18, maka  peta  pautan  yang  terbentuk  dapat dikembangkan  lagi  dengan  meningkatkan jumlah  marka  molekuler  yang  digunakan. D e n g a n   a d a n y a   m a r k a   t a m b a h a n diharapkan LG yang seharusnya bergabung dapat  disatukan  sehingga  nanti  dapat dihasilkan  18  LG.  Selain  itu,  dengan penambahan marka molekuler jarak genetik yang  dihasilkan  juga  akan  semakin  dekat (kecil) sehingga peluang untuk menemukan QTL  akan  meningkat  dan  keterpautan marka dengan karakter yang dianalisis akan semakin kuat.

## Identifikasi QTL
Analisis  keberadaan  QTL  yang terpaut  dengan  penyakit  utama  yang menyerang  tanaman  karet  dilakukan berdasarkan parameter keparahan penyakit di  lapangan  pada  tanaman  berumur  dua tahun.  Beberapa  serangan  penyakit  utama yang  diamati  di  lapangan  yaitu  penyakit gugur  daun  Corynespora,  Colletotrichum, Oidium, dan jamur akar putih (JAP).
QTL  Terpaut  Ketahanan  terhadap Penyakit Gugur Daun Corynespora (PGDC)
Gambar  3  menunjukkan  QTL  yang terpaut  dengan  ketahanan  tanaman  karet terhadap penyakit gugur daun Corynespora. Terdapat  tiga  QTL  yang  ditemukan  pada linkage group 14 LOD 5,19; linkage group 15 LOD 3,3; dan linkage group 10 LOD 3,1. QTL tersebut menginformasikan bahwa terdapat gen atau sekuen DNA pada kromosom no 14, 15,  dan  10  yang  memberikan  pengaruh terhadap  ketahanan  tanaman  karet terhadap penyakit gugur daun Corynespora.
K e t i g a   Q T L   y a n g   b e r h a s i l diidentifikasi  memiliki  tingkat  kepercayaan yang cukup tinggi, yaitu pada LOD di atas 3. Hal  ini  terlihat  juga  dari  persentase pengaruh  yang  diberikan  oleh  masing- masing  QTL  terhadap  sifat  ketahanan terhadap PGD Corynespora. QTL pada LOD tertinggi yaitu 5,19 yang ditemukan pada LG
Oktavia Kusdiana
dan
Gambar 3. Posisi QTL yang terpaut dengan ketahanan populasi F1 hasil persilangan PB 260 x SP  217  TBM  umur  2  tahun  terhadap  penyakit  gugur  daun  Corynespora  di lapangan pada linkage group 14 LOD 5,19 (A), linkage group 15 LOD 3,3 (B), dan linkage group 10 LOD 3,1 (C). Figure 3. Position of QTLs linked to resistance of F1 population obtained from crossing of PB 260 x SP 217 on immature periode 2 years old to Corynespora leaf fall disease in the field on linkage group 14 LOD 5.19 (A), Linkage group 15 LOD 3,3 (B), and linkage group 10 LOD 3.1 (C).
14  memberikan  pengaruh  terhadap keragaman  ketahanan  tanaman  karet terhadap  PGDC  sebesar  17,7%  (Tabel  3). QTL  tersebut  ditunjukkan  oleh  lokus g14A2423.  Pengaruh  ini  tergolong  cukup tinggi  sehingga  dapat  digolongkan  sebagai gen  mayor,  yang  biasanya  stabil  dan  tidak dipengaruhi  oleh  lingkungan  seperti  yang dijelaskan oleh Collard et al. (2005). Untuk melihat  kestabilan  QTL  tersebut,  akan dilakukan  pengamatan  ketahanan  F1 terhadap PGD Corynespora dan analisis QTL yang  terpaut  penyakit  tersebut  secara
bertahap  sesuai  dengan  pertumbuhan tanaman.  Semua  QTL  yang  stabil  tetap d i t e m u k a n   p a d a   s e m u a   t a h a p a n pertumbuhan  selanjutnya  dapat  dijadikan sebagai marka assisted selection .

## QTL  Terpaut  Ketahanan  terhadap
Penyakit Gugur Daun Colletotrichum
Gambar  4  menunjukkan  QTL  yang terpaut  dengan  ketahanan  tanaman  karet t e r h a d a p   p e n y a k i t   g u g u r   d a u n
Evaluasi Ketahanan dan Analisis Quantitative Trait Loci yang Terpaut dengan

## Ketahanan terhadap Penyakit Utama pada Tanaman Karet
Nr Group Position Locus LOD # lter. mu_ac{00} mu_ad{00} mu_bc{00} mu_bd{00} Variance % Expl. GIC_1 GIC_2 GIC_m
1831 g14 26.571 5.19 1 0.177394 0.284313 0.152577 0.240406 0.0133468 13.0 0.944 0.769 0.857
1832 g14 27.571 5.19 1 0.176187 0.284289 0.153185 0.240814 0.0133472 13.0 0.972 0.765 0.868 1833 g14 28.382 g14A2423 5.16 1 0.175389 0.283827 0.154025 0.241053 0.0133581 12.9 1.000 0.765 0.883
1830 g14 25.571 5.15 1 0.178802 0.283741 0.152469 0.239880 0.0133610 12.9 0.924 0.779 0.851 1829 g14 24.571 5.08 1 0.180358 0.282609 0.152868 0.239248 0.0133889 12.7 0.911 0.794 0.852 Tabel 3. Persentase pengaruh QTL utama terhadap ketahanan progeni F1 hasil persilangan PB 260 x SP 217 TBM umur 2 tahun terhadap penyakit gugur daun Corynespora di lapangan
Table 3.  Percentage of main QTLs effect to resistance of F1 progenies obtained crossing of PB 260 x SP 217 immature periode 2 years old to Corynespora leaf fall disease in the field
Gambar 4. Posisi QTL yang terpaut dengan ketahanan populasi F1 hasil persilangan PB 260 x SP  217  TBM  umur  2  tahun  terhadap  penyakit  gugur  daun  Colletotrichum  di lapangan pada linkage group 10 LOD 4,44 (A), Figure 4. Position of QTLs linked to resistance of F1 population obtained from crossing of PB 260 x SP 217 on immature periode 2 years old to Colletotrichum leaf fall disease in the field on linkage group 10 LOD 4.44
Colletotrichum  yang  berhasil  diidentifikasi selama  masa  TBM  2.  Terdapat  empat  QTL yang ditemukan pada LG berbeda yaitu LG 1, 3, 10, dan 16 pada LOD 3–4,44. Ke empat QTL  tersebut  tergolong  memiliki  tingkat kepercayaan  yang  tinggi  dan  tergolong kepada gen mayor yang memiliki pengaruh di atas 10% (Tabel 4). Ke empat QTL tersebut perlu  diamati  kestabilannya  dengan  cara pengamatan  ketahanan  penyakit  secara
b e r k a l a   d i   l a p a n g a n   d a n   a n a l i s i s keterpautan  QTL  secara  berkala  sesuai perkembangan umur tanaman. Diharapkan ke  empat  QTL  tersebut  bersifat  stabil  dan tidak dipengaruhi oleh lingkungan sehingga dapat  digunakan  sebagai  marka  molekuler penanda  ketahanan  terhadap  penyakit gugur  daun  Colletotrichum  dalam  seleksi ketahanan tanaman karet.
Oktavia Kusdiana dan
Tabel 4. Persentase pengaruh QTL utama terhadap ketahanan progeni F1 hasil persilangan PB 260 x SP 217 TBM umur 2 tahun terhadap penyakit gugur daun Colletotrichum di lapangan
Table 4.  Percentage of main QTLs effect to resistance of F1 progenies obtained crossing of PB 260 x SP 217 immature periode 2 years old to Colletotrichum leaf fall disease in the field
Group Position Locus LOD % Expl. GIC_1 GIC_2   GIC_m g10 7.000 4.44 11.20 0.598 0.632 0.615 g10 8.000 4.43 11.20 0.564 0.600 0.582 g10 6.000 4.42 11.20 0.638 0.668 0.653 g10 5.000 4.39 11.10 0.683 0.710 0.696 g10 9.000 4.38 11.10 0.535 0.574 0.554 g10 4.000 4.34 11.00 0.734 0.756 0.745 g10 10.000 4.30 10.90 0.512 0.552 0.532 g10 3.000 4.28 10.80 0.791 0.808 0.800 g10 2.000 4.22 10.70 0.853 0.866 0.860 g10 11.000 4.18 10.60 0.494 0.536 0.515 g10 1.000 4.15 10.50 0.922 0.928 0.925 g10 0.000 g10A2425.L1 4.09 10.40 0.997 0.997 0.997 g10 12.000 4.02 10.20 0.481 0.524   0.502

## QTL  Terpaut  Ketahanan  terhadap Penyakit Jamur Akar Putih
H a s i l   a n a l i s i s   b e r d a s a r k a n pengamatan  intensitas  serangan  JAP  pada s e l u r u h   t a n a m a n   s e l a m a   T B M   2 menunjukkan  bahwa  ditemukan  satu putative QTL  yang  terpaut  dengan ketahanan terhadap serangan penyakit JAP pada linkage  group nomor  8  pada  LOD  2,9 (Gambar 5). Hal ini terkait dengan nilai LOD suatu  QTL,  dimana  LOD  merupakan  nilai b a t a s   y a n g   m e n u n j u k k a n   t i n g k a t kepercayaan  keberadaan  suatu  QTL. Semakin tinggi LOD teridentifikasinya suatu Q T L   m a k a   s e m a k i n   t i n g g i   t i n g k a t kepercayaan  kestabilan  QTL  tersebut. Secara umum LOD 3 dijadikan sebagai nilai suatu  QTL  memiliki  tingkat  kepercayaan tinggi, sedangkan QTL dengan LOD di bawah
3  dianggap  sebagai putative QTL  yang kestabilan  keberadaannya  dapat  berubah- ubah.  Keberadaan  QTL  menunjukkan bahwa terdapat gen atau sekuen DNA pada kromosom  nomor  8  yang  berpengaruh terhadap  ketahanan  tanaman  karet terhadap serangan JAP. QTL tersebut masih memiliki tingkat kepercayaan yang rendah, yaitu  LOD  di  bawah  3,  sehingga  masih bersifat putative dan  ada  kemungkinan bersifat  tidak  stabil  dan  terpengaruh  oleh lingkungan.  Hal  ini  kemungkinan  besar dipengaruhi oleh genetik dari batang bawah yang  digunakan  untuk  mendukung  sistem perakaran  pada  tanaman  karet  yang diperbanyak melalui okulasi, sehingga pada saat  JAP  menyerang  akar  tanaman,  yang berperan  besar  dalam  sistem  pertahanan adalah  ekspresi  gen-gen  pertahanan  pada batang bawah yang berasal dari seedling .

## KESIMPULAN DAN SARAN
Analisis  QTL  terhadap  penyakit utama tanaman karet menunjukkan bahwa terdapat  3  QTL  yang  terpaut  dengan ketahanan  terhadap  penyakit  gugur  daun Corynespora yang  berhasil  diidentifikasi pada LG 10, 14, dan 15 dengan LOD 3,1; 3,3; dan  5,19  dengan  pengaruh  QTL  tertinggi sebesar  17,7%.  Empat  QTL  yang  terpaut ketahanan  terhadap  penyakit  gugur  daun Colletotrichum berhasil  diidentifikasi  pada LG berbeda yaitu LG 1, 3, 10, dan 16 dengan LOD 3–4,44 dan pengaruh tertinggi terhadap ketahanan sebesar 11,2%. Putatif QTL yang terpaut  ketahanan  terhadap  JAP  berhasil diindentifikasi pada LG 8 dengan LOD 2,9, sedangkan  QTL  yang  terpaut  dengan ketahanan  terhadap  penyakit  gugur  daun Oidium belum  berhasil  diidentifikasi.  QTL yang  berhasil  diidentifikasi  dengan  LOD  di atas 3 diharapkan stabil dan akan di analisis secara berkala.

## UCAPAN TERIMA KASIH
Terima kasih diucapkan kepada Dr. Pascal  Montoro  dan  Dr.  Andre  Clement- Demange,  Cirad,  Perancis  atas  training, diskusi,  dan  masukan  yang  diberikan selama penelitian pendahuluan dilakukan.

## DAFTAR PUSTAKAA
An, Z., Zhao, Y., Zhang, X., Huang, X., Hua, Y.,  Cheng,  H.,  Li,  X.,  &  Huang,  H. (2019).  A  high-density  genetic  map and  QTL  mapping  on  growth  and latex  yield-related  traits  in Hevea brasiliensis Müll.  Arg. Industrial Crops  Production ,  32,  440-448.  doi: doi.org/10.1016/j.indcrop.2019.03. 002.
Chandra,  K.,  &  Pandey,  A.  (2017).  QTL mapping  in  crop  improvement:  A basic  concept. International  Journal Current Microbiology Applied Science , 6(12), 835-842.
Chanroj, V., Rattanawong, R., Phumichai, T., Tangphatsornruang,  S.,  &  Ukoskit, K. (2017). Genome-wide association mapping  of  latex  yield  and  girth  in Amazonianaccessions  of Hevea brasiliensis grown  in  a  suboptimal climate  zone. Genomics ,  109,  475- 4 8 4 .   d o i :   h t t p : / / d x . d o i . o r g / 10.1016/j.ygeno.2017.07.005
Collard,  B.C.Y.,  Jahufer,  M.Z.Z.,  Brouwer, J.B.,  &  Pang,  E.C.K.  (2005).  An i n t r o d u c t i o n   t o   m a r k e r s , quantitative trait loci (QTL) mapping and  marker-assisted  selection  for crop  improvement:  The  basic concepts. Euphytica, 142, 169-196.
Gambar 5. Posisi QTL yang terpaut dengan ketahanan populasi F1 hasil persilangan PB 260 x SP 217 TBM umur 2 tahun terhadap penyakit jamur akar putih di lapangan pada linkage group 8 LOD 2,9
Figure 5. Position of QTLs linked to resistance of F1 population obtained from crossing of PB 260 x SP 217 on immature periode 2 years old to white root disease in the field on linkage group 8 LOD 2.9
Evaluasi Ketahanan dan Analisis Quantitative Trait Loci yang Terpaut dengan Ketahanan terhadap Penyakit Utama pada Tanaman Karet
Conson,  A.R.O.,  Taniguti,  C.H.,  Amadeu, R.R.,  Andreotti,  I.A.A.,  de  Souza, L.M.,  dos  Santos,  L.H.B.,  Rosa, J.R.B.F.,  Mantello,  C.C.,  da  Silva, C.C.,  José,  S.J.E.,  Ribeiro,  R.V.,  Le Guen,  V.,  Garcia,  A.A.F.,  de  Souza, G.P., & de Souza, A.P. (2018). High- resolution  genetic  map  and  QTL analysis  of  growth-related  traits  of Hevea  brasiliensis cultivated  under s u b o p t i m a l   t e m p e r a t u r e   a n d humidity  conditions. Front  Plant S c i e n c e ,   9 ,   1 2 5 5 .   d o i : 10.3389/fpls.2018.01255.
Evueh,  A.,  Okhuoya,  J.,  Osemwegie,  O., Attitalla,  I.,  &  Ogbebor,  O.  (2011). Evaluation  of  phylloplane  fungi  as biocontrol agent of Corynespora leaf fall  disease  of  rubber  ( Hevea brasiliensis Muell.  Arg.). World Journal Fungal Plant Biology, 2(1), 1- 5.
Febbiyanti,  T.R.,  &  Fairuzah,  Z.  (2019). Identifikasi  penyebab  kejadian  luar biasa penyakit gugur daun karet di Indonesia. Jurnal  Penelitian  Karet , 37(2), 193-206.
Febbiyanti, T.R., Stevanus, C.T., & Tistama, R.  (2020).  Peranan  pupuk  dan fungisida terhadap pemulihan tajuk a k i b a t   p e n y a k i t   g u g u r   d a u n Pestalotiopsis  pada  klon  GT  1  di kebun  percobaan  Pusat  Penelitian Karet  Sembawa. Jurnal  Penelitian
K a r e t ,   3 8 ( 2 ) ,   1 4 5 - 1 6 4 .   d o i : 10.22302/ppk.jpk.v2i38.705.
Hadi,  H.,  &  Hartana,  A.  (2004).  Analisis m a r k a   m o l e k u l e r   k e t a h a n a n terhadap penyakit gugur daun pada tanaman  karet. Jurnal  Penelitian Karet , 22(2), 47-56.
Khan,  S.  (2015).  QTL  mapping:  A  tool  for improvement  in  crop  plants.
Research Journal of Recent Sciences , 4, 7-12.
Kusdiana,  A.P.J.,  Sinaga,  M.S.,  &  Tondok, E.T.  (2020).  Diagnosis  penyakit gugur daun karet ( Hevea brasiliensis Muell. Arg.). Jurnal Penelitian Karet , 3 8 ( 2 ) ,   1 6 5 - 1 7 8 . d o i : 10.22302/ppk.jpk.v2i38.728.
Lander, E.S., & Botstein D. (1989). Mapping mendelian  faktors  underlying quantitative  traits  using  RFLP linkage  maps. Genetics ,  121,  185– 199.
Le Guen, V., Garcia, D., Doaré, F., Mattos, C., Condina, V., Couturier, C., & Seguin, M.  (2011).  A  rubber  tree's  durable resistance  to Microcyclus  ulei is conferred by a qualitative gene and a major quantitative resistance faktor. Tree Genetic Genome , 7, 877–889.
Le Guen, V., Garcia, D., Mattos, C., Doare, F., Lespinasse, D., & Seguin, M. (2007). By  passing  of  a  phyllogenic Microcyclus ulei resistance in rubber tree analyzed by QTL detection. New Phytologist , 173, 335-345.
Le  Guen,  V.,  Garcia,  D.,  Mattos,  C.,  Fouet, O., Doaré, F., Condina, V., & Seguin, M.  (2013).  A  newly  identified  locus controls  complete  resistance  to Microcyclus ulei in the Fx2784 rubber clone. Tree  Genetic  Genome ,  9(3), 805-812. doi: 10.1007/s11295-013- 0599-7.
Le  Guen,  V.,  Lespinasse,  D.,  Oliver,  G., Rodier-Goud,  M.,  Pinard,  F.,  & Seguin,  M.  (2003).  Molecular mapping  of  genes  conferring  field resistance  to  South  American  Leaf Blight  ( Microcyclus  ulei )  in  rubber tree. Theoritical  and  Applied Genetics ,  108(1),  160-167.  doi: 10.1007/s00122-003-1407-9.
Manju,  M.J.,  Benagi,  V.I.,  Shankarappa, T.H.,  Vinod,  K.K.  &  Jacob  C.K. (2015).  Major  Diseases  of Hevea brasiliensis in  Rubber  Growing Regions of South India. Environment & Ecology , 33(3A), 1299-1302. Oktavia Kusdiana dan
Mazlan,  S.,  Jaafar,  N.M.,  Wahab,  A., Sulaiman,  Z.,  Rajandas,  H.  & Zulperi, D. (2019). Major diseases of rubber  ( Hevea  brasiliensis )  in Malaysia. Pertanika  Journal  of Scholarly  Research  Reviews ,  5(2), 10-21.
Novalina & Sagala, A.D. (2013). Construction of Hevea brasiliensis genetic linkage m a p   a n d   i d e n t i f i c a t i o n   o f quantitative  trait  loci  using  RAPD markers. International  Journal  of Advance  and  Science  Engineering Information Technology, 3(1), 71-75.
Ogbebor,  N.  &  Adenkule,  A.  (2005). Inhibition  of  conidial  germination and mycelial growth of Corynespora cassiicola (Berk and Curt) of rubber ( Hevea brasiliensis muell. Arg.) using extracts  of  some  plants. African Journal  Biotechnology, 4(9),  996- 1000.
Oktavia,  F.  (2020).  Studi  pendahuluan konstruksi peta pautan genetic dan identifikasi  quantitative  trait  loci yang  terpaut  dengan  pertumbuhan a w a l   t a n a m a n   k a r e t . J u r n a l Penelitian Karet , 38(2), 121-132. doi: 10.22302/ppk.jpk.v2i38.733.
Oktavia, F., Sudarsono, & Dinarti, D. (2020). Preliminary  QTL  detection  for Corynespora  leaf  fall  disease r e s i s t a n c e   i n   r u b b e r   p l a n t . Nusantara  Bioscience ,  13(1),  53-61. doi: 10.13057/nusbiosci/n130108.
Ooijen, V.J.W. (2004). MapQTL® 5, Software for  the  mapping  of  quantitative  trait loci  in  experimental  populations . Wageningen,  the  Netherlands: Kyazma BV.
Rattanawong, R., Prapan, K., Lekawipat, N., Seguin,  M.,  Clement-Demange,  A. (2009). Detection of QTLs assotiation with  growth,  latex  production  and rubber quality for the development of Marker  Asissted  Selection  ( Hevea brasiliensis ). IRRDB  Workshop  on Genome and Transcriptome.
Rosa, J.R.B.F., Mantello, C.C., & Garcia, D. (2018). QTL detection for growth and latex production in a full-sib rubber tree  population  cultivated  under suboptimal climate conditions. BMC Plant  Biology ,  18(223),  1-16.  doi: doi.org/10.1186/s12870-018-1450- y.
Semagn, K., Bjornstad, A., & Ndjiondjop, M. N.  (2006).  Principles,  requirements and prospects of genetic mapping in p l a n t s . A f r i c a n   J o u r n a l   o f Biotechnology , 5(25), 2569-2587.
﻿ Sinaga,  M.S.  (2006). Dasar-Dasar  Ilmu Penyakit  Tumbuhan .  Jakarta: Penebar Swadaya.
Situmorang,  A.,  Sinaga,  M.,  Suseno,  R.,
H i d a y a t ,   S . ,   S i s w a n t o ,   & Darussamin,  A.  (2007).  Sebaran penyakit  gugur  daun  Corynespora d i   s e n t r a   p e r k e b u n a n   k a r e t Indonesia. Jurnal  Penelitian  Karet, 25(1), 76-82.
Souza, L., Gazaffi, R., Mantello, C., Silva, C., Garcia, D., & Le Guen, V. (2013). QTL mapping of growth-related traits in a full-sib family of rubber tree ( Hevea brasiliensis )  evaluated  in  a  sub- tropical  climate. PLoS  One ,  8(4),  1- 10.
Evaluasi Ketahanan dan Analisis Quantitative Trait Loci yang Terpaut dengan Ketahanan terhadap Penyakit Utama pada Tanaman Karet
Souza, L., Mantello, C., Suzuki, F., Rodrigo, G . ,   &   L e   G u e n ,   V .   ( 2 0 1 1 ) . Development  of  a  genetic  linkage map  of  rubber  ( Hevea  brasiliensis ) based  on  microsatellite  markers. Paper  presented  at  the IUFRO  Tree Biotechnology Conference .   26 Jun - 2 Jul 2011, Arraial D'Ajuda, Bahia, Brazil.
.
Tran, D. M., Cle´ment-Demange, A., De´on, M.,  Garcia,  D.,  Le  Guen,  V., Cle´mentVidal,  A.,  et  al.  (2016). Genetic Determinism of sensitivity to Corynespora  cassiicola exudates  in rubber  tree  ( Hevea  brasiliensis ). P L o S   O N E ,   1 1 ( 1 0 ) . d o i : 1 0 . 1 3 7 1 / j o u r n a l . pone.0162807.
Oktavia Kusdiana dan