## DOI: 10.30644/rik.v8i2.381
Perbandingan hasil pemeriksaan Mycobacterium tuberculosis dengan GeneXpert dan pewarnaan Ziehl Neelsen
Ni’matul Murtafi’ah 1* , Fitri Rahmi Fadhilah 1 ,Rizka Krisdaryani 1
1 Program Studi DIV Teknologi Laboratorium Medik, Sekolah Tinggi Ilmu Kesehatan Rajawali, Bandung, Indonesia
* Email korespondensi: nimatul.murtafiah@yahoo.co.id
Accepted: 30 April 2020; revision: 24 Desember 2020; published: 31 Desember 2020

## Abstrak
Latar  Belakang :  Tuberkulosis  paru  (TB)  merupakan  penyakit  infeksi  yang  menjadi  masalah kesehatan pada masyarakat. Penyakit  TB paru merupakan suatu penyakit infeksi disebabkan oleh bakteri Mycobacterium  tuberculosis. Pemeriksaan  TB  Paru  dapat  dilakukan  dengan  pemeriksaan menggunakan  alat  GeneXpert  dan  Pewarnaan  BTA  yang  dilihat  langsung  dibawah  mikroskop. Penelitian  ini  bertujuan  untuk  mengetahui  perbandingan  hasil  pemeriksaan Mycobacterium tuberculosis pada  pasien  TB  paru  dengan  menggunakan  alat  GeneXpert  dan  Pewarnaan  BTA metode Ziehl-Neelsen.
Metode. Penelitian  ini  bersifat  deskriptif  dengan  distribusi  hasil  perbandingan  30  sampel interpretasi  hasil  pemeriksaan    mikroskopik    BTA  pewarnaan    Ziehl  Neelsen  dan  hasil pemeriksaan GeneXpert .
Hasil. Pemeriksaan  mikroskopik  BTA  dengan  pewarnaan  Ziehl  Neelsen  didapatkan  hasil  negatif 74%  dan  positif  26%  dari  total  30  sampel.  Pemeriksaan  GeneXpert didapatkan hasil 67% negatif dan  33%  positif  dari  total  30  sampel.  Dari  data  tersebut  dapat  dilihat  GeneXpert  memiliki  nilai positif yang lebih tinggi dibandingkan dengan pewarnaan Ziehl Neelsen.
Simpulan. Perbandingan  pemeriksaan Mycobacterium  tuberculosis menunjukkan  bahwa pemeriksaan  GeneXpert  lebih  unggul  dibandingkan  dengan  pemeriksaan  BTA  pewarnaan  Ziehl Neelsen .
Kata   kunci : Mycobacterium  tuberculosis ,  GeneXpert, pewarnaan Ziehl Neelsen

## Abstract
Background: Pulmonary tuberculosis (TB) is an infectious disease that is still a health problem in the  community.  Pulmonary  tuberculosis  (TB),  meaning  an  infectious  disease  caused  by  the bacterium  Mycobacterium  tuberculosis.  examination  of  pulmonary  TB  can  be  done  in  two  ways, namely examination using the GeneXpert tool and smear staining which is seen directly under the microscope.  This  study  aims  to  compare  the  results  of  the  examination  of  Mycobacterium tuberculosis in Tuberculosis patients using the GeneXpert tool and smear staining using the Ziehl- Neelsen method.
Method: This  research  used  in  this  study  is  descriptive  with  the  distribution  of  the  results  of  30 sample comparison of BTA Ziehl Neelsen's microscopic examination and GeneXpert's examination results.
Result: Microscopic examination of smear with Ziehl Neelsen staining was 74% negative and 26% positive from a total of 30 samples. The GeneXpert examination obtained 67% negative results and 33%  positive  from  a  total  of  30  samples.  From  these  data,  it  can  be  seen  that  GeneXpert  has  a higher positive value compared to Ziehl Neelsen's coloring.
Conclusion: The  comparison  of  the  examination  of  Mycobacterium  tuberculosis  shows  that GeneXpert's examination is superior compared to the examination of Ziehl Neelsen's smear. Keywords : Mycobacterium tuberculosis, GeneXpert, examination Ziehl Neelsen

## PENDAHULUAN
Penyakit
tuberkulosis paru
merupakan  penyakit  infeksi  yang  menjadi masalah  kesehatan  pada  masyarakat. Penyakit  tuberkulosis  paru  diawali  dengan infeksi  yang  disebabkan  oleh  bakteri Mycobacterium  tuberculosis. Tuberkulosis (TB) menular dari satu orang ke orang lain melalui  droplet  batuk  atau  bersin  dari seseorang  yang terinfeksi.  TB menginfeksi paru-paru,  kelenjar,  tulang,  dan  sistem saraf. Mycobacterium tuberculosis memiliki struktur berbentuk  batang  lurus  atau sedikit  melengkung,  tidak  berspora  dan tidak berkapsul. Mycobacterium tuberculosis berukuran  lebar  0,3-0,6  mm dan  panjang  1-4  mm.  Dinding  sel  bakteri Mycobacterium tuberculosis sangat kompleks,  terdiri  dari  lapisan  lemak  tinggi (60%).  Bakteri M.  tuberculosis tumbuh lambat  dan  tumbuh  pada  suhu  optimum 37ºC (1)
Diagnosis TB paru dilakukan dengan pemeriksaan klinis terlebih dahulu, dilanjutkan pemeriksaan foto toraks, pemeriksaan laboratorium klinis dan pemeriksaan  penunjang  lainnya.  Salah satu pemeriksaan laboratorium yang digunakan  untuk  mendiagnosa  TB  Paru yaitu  pemeriksaan  Basil  Tahan  Asam (BTA)  metode Direct  Smear. Pemeriksaan mikroskopis  BTA  dari  spesimen  saluran nafas atau sputum masih berperan penting dalam diagnosis awal  sebagai  gold standart  dan  pemantauan  pengobatan  TB
Paru (2). Teknik pewarnaan bakteri tuberkulosis adalah Ziehl Neelsen,
Pewarnaan Ziehl Neelsen dapat mendeteksi adanya  BTA  dengan  mikroskop  biasa.
Metode  pemeriksaan  mikroskopis  BTA menggunakan  sediaan  yang  dibuat  secara langsung dari spesimen sputum. Pemeriksaan  mikroskopik  BTA  pada  3 spesimen  sputum  penderita  diambil  3  kali; sewaktu,  pagi,  dan  sewaktu  (SPS)(2).
Pemeriksaan
mikroskopis memiliki kekurangan dan kelebihan. Kelebihan
pemeriksaan  mikroskopis  BTA  yaitu  biaya relative  lebih  murah,  dapat  dikerjakan  di laboratorium sederhana yang memiliki mikroskop. Kekurangan pemeriksaan mikroskopis  BTA  metode Direct  Smear adalah waktu yang  diperlukan untuk pemeriksaan  cukup  lama.  Sampel  yang digunakan merupakan dahak pagi membutuhkan waktu 2 hari hingga prosedur pengerjaan pembuatan sediaan dan pewarnaan  sampai  pemeriksaan  di  bawah mikroskop  memerlukan  waktu  yang  cukup lama.
GeneXpert      MTB/RIF  merupakan alat  uji  alternatif  untuk  diagnosis  TB menggunakan catridge berdasarkan Nucleic  Acid  Amplification  Test (NAAT) secara  otomatis  diperoleh    hasil  dalam kurun waktu kurang lebih 2 jam. Pemeriksaan  GeneXpert  untuk  diagnosis TB  menggunakan  metode Real  Time Polymerase  Chain  Reaction  Assay (RT- PCR)  secara  otomatis  mendeteksi M. tuberculosis dan  mendeteksi  resisten M. tuberculosis terhadap rifampisin(3).
Pemeriksaan GeneXpert memiliki kekurangan dan kelebihan. Banyak keuntungan dari
pemeriksaan menggunakan  GeneXpert  yaitu  :  pelatihan sederhana  untuk  menggunakan    alat, waktu    pemeriksaan    yang    cepat    kurang lebih  2  jam,  dapat digunakan sebagai alat skrining  diagnosis  TB  dan  penanganan cepat  dokter  dengan  pemberian  obat sesuai  dengan  diagnosis.  Kekurangan  dari alat  ini  yaitu  biaya  yang  dikeluarkan  lebih mahal  dari  pemeriksaan  pewarnaan  BTA (4).
Berdasarkan  latar  belakang  di  atas, pemeriksaan  TB  Paru  dapat  dilakukan dengan  dua  cara,  yaitu  pemeriksaan menggunakan alat GeneXpert dan Pewarnaan  BTA    yang  dilihat  langsung dibawah mikroskop. Maka dari itu, penelitian dilakukan untuk membandingkan kedua  metode  tersebut  dilihat  dari  segi kekurangan  dan  kelebihan  masing-masing jenis pemeriksaan.

## METODE
Bentuk rancangan penelitian ini adalah  deskriptif.  Penelitian  dilakukan  di Laboratorium  Laboratorium  Rumah  Sakit Mitra  Anugrah  Lestari  (RS  MAL).  Jumlah sampel yang digunakan 30 sampel. Sampel yang  diambil  adalah  sampel  pasien  TB  di ruang   paru dan sampel pasien rujukan RS MAL. Penelitian ini menggunakan jenis data primer  yaitu  data  yang  diperoleh  setelah pemeriksaan  langsung  terhadap  sampel pewarnaan  BTA  dan  data  sekunder  yaitu dengan pengambilan data hasil pemeriksaan  pasien  TB  dengan  alat GeneXpert di RS MAL.
Bahan  penelitian  yang  digunakan sputum,  volume  sputum  lebih  dari  1  mL, tidak  terdapat  sisa  makanan  pada  sputum, dan  pasien  yang  belum  pernah  menerima terapi  OAT  sebelumnya.  Pengumpulan sputum  ditampung  dalam  pot  dahak  tutup berulir,  satu  sampel  sputum  digunakan untuk  2  pemeriksaan  yaitu  pembuatan preparat BTA dan pemeriksaan menggunakan GeneXpert. GeneXpert yang digunakan merk Cepheid. GeneXpert merupakan alat diagnosis TB yang menggunakan metode
Real
Time Polymerase  Chain  Reaction  Assay (RT- PCR)  semikuantitatif  yang  menargetkan wilayah hotspot gen rpoB pada M. tuberculosis. Gen ropB sebagai  pengkode subunit  β  berfungsi  dalam  pengikatan nukleotida dan mengikat senyawa penghambat transkripsi seperti pada antibiotik rifampisin.
Pemeriksaan  sampel  dilakukan  pada hari  yang  sama  ketika  sampel  datang,  dari satu  sediaan  dibuat  2  apusan  sputum masing-masing  diberi  kode  pemeriksaan. Sampel  reagen  disimpan  dalam  lemari  es dan dikeluarkan ketika pemeriksaan sputum agar stabilitas reagen tetap terjaga. Catridge  disimpan  pada  suhu  ruang  dan  di tempat  yang  bersih  agar  tidak  terjadi kontaminasi.  GeneXpert  dikalibrasi  rutin oleh  seorang ahli  dari  dinas kesehatan  dan cek  berkala  untuk  pemeliharaan alat.
Penyimpanan  reagen  Ziehl  Neelsen  pada suhu  ruang  untuk menjaga stabilitasnya.
Pengecekan tanggal kadaluarsa sebelum  pemeriksaan  sputum.  Sirkulasi udara yang cukup untuk mencegah penularan  melalui  udara.  Pemeriksaan sputum  dengan  pewarnaan  Ziehl  Neelsen dan  GeneXpert  dilakukan  sesuai  dengan standar  pemeriksaan.  Hasil  pemeriksaan dari  kedua  metode  dibandingkan,  bila terdapat perbedaan maka dilihat dari rekam medis  pasien  dan  pemeriksaan  lainnya. Perbedaan  hasil  dianalisis  dan  didiagnosis sesuai dengan analisis yang ada.

## HASIL
Penelitian ini mendeskripsikan gambaran keseluruhan sampel yang diambil dalam  penelitian  di  Laboratorium  RS  Mitra Anugrah  Lestari.  Sampel  yang  digunakan pada  penelitian  sebanyak  30  sampel sputum  yang  telah  diperiksa  baik  secara mikroskopis  maupun  menggunakan  alat GeneXpert.  Berikut  adalah  data  sampel sputum  dari  hasil  pemeriksaan  mikroskopik BTA dengan Pewarnaan Ziehl Neelsen dan GeneXpert  yang  dilakukan  di  RS  MAL. Gambaran  hasil  sampel  penelitian  dilihat dari  interpretasi  hasil  pemeriksaan  negatif, scanty ,  +1  (positif  1),  +2  (positif  2),  dan  +3 (positif  3).  Distribusi  hasil  sampel  disajikan dalam Tabel 1.
Tabel 1. Data Hasil Pewarnaan Ziehl Neelsen Hasil Pemeriksaan Jumlah Negatif 22 1+ 1 2+ 4 3+ 3 Total 30 Keterangan: Negatif :  tidak  ditemukan  BTA  dalam  100  lapang pandang 1+ :  ditemukan  10 –  99  BTA  dlm  100  lapang pandang 2+ :  ditemukan  1 –  10  BTA  setiap  1  lapang pandang  (periksa  minimal  50  lapang pandang) 3+ :  ditemukan ≥  10  BTA  dalam  1  lapang pandang  (periksa  minimal  20  lapang pandang)
Berikut  ini  hasil  pemeriksaan  BTA pewarnaan Ziehl Neelsen dengan interpretasi hasil 1+ (positif 1), 2+ (positif 2), dan 3+ (positif 3) dapat dilihat pada Gambar 1, 2, dan 3.
Positif 1
Gambar  1 .  Hasil  Pemeriksaan  BTA  1+  dengan Pewarnaan Ziehl Neelsen
Positif 2
Gambar  2. Hasil  Pemeriksaan  BTA  2+  dengan Pewarnaan Ziehl Neelsen

## Positif 3
Gambar  3. Hasil  Pemeriksaan  BTA  3+  dengan Pewarnaan Ziehl Neelsen
Selain  itu,  gambaran  hasil  sampel penelitian  dilihat  dari  interpretasi  hasil pemeriksaan negatif, Low RIF Sensitif (1+), Medium RIF Sensitif (2+), High RIF Sensitif (3+). Distribusi hasil sampel disajikan dalam (Tabel 2).
Tabel 2. Hasil Pemeriksaan GeneXpert Hasil Pemeriksaan Jumlah Negatif 20 Low RIF Sensitif 4 Medium RIF Sensitif 2 High RIF Sensitif 4 Total 30 Tabel  3. Perbandingan  pemeriksaan  dengan pewarnaan Ziehl Neelsen dan GeneXpert Kode sampel Hasil Pemeriksaan Ziehl  Neelsen Hasil Pemeriksaan GeneXpert A1 - - A2 - - A3 3+ 3+ A4 - - A5 2+ 2+ A6 - - A7 - - A8 - - A9 - 1+ A10 - - A11 - 1+ A12 - 1+ A13 - - A14 - - A15 - - A16 - - A17 3+ 3+ A18 2+ 2+ A19 - - A20 - - A21 2+ 3+ A22 2+ - A23 - - A24 - - A25 1+ 1+ A26 - - A27 3+ 3+ A28 - - A29 - - A30 - -
Berdasarkan  Tabel  3  penelitian  yang dilakukan  di  Rumah  Sakit  Mitra  Anugrah Lestari  terhadap  30  sampel  penelitian, didapatkan  hasil  dari  30  sampel  penelitian ditemukan 22 sampel negatif pada BTA dan 20 sampel negatif pada GeneXpert. Kemudian ditemukan 4 sampel  positif High RIF sensitive pada GeneXpert dan 3+ pada BTA  sebanyak  3,  2  sampel  positif Medium RIF sensitive pada GeneXpert dan 2+ pada BTA  sebanyak  4,  4  sampel Low  RIF sensitive pada GeneXpert dan 1 sampel 1+. Grafik  perbandingan  hasil  pemeriksaan M.tuberculosis dengan  GeneXpert    dan Pewarnaan Ziehl Neelsen dapat dilihat pada Gambar 4.
Gambar 4 . Grafik Perbandingan Hasil Pemeriksaan

## PEMBAHASAN
Penelitian ini dilakukan terhadap 30
sampel  yang  didiagnosis  suspek  TB  oleh dokter penanggungjawab. Penelitian menunjukkan  hasil  MTB  terdeteksi  dan Rimfapisin  sensitif  diartikan  bahwa  pasien
tidak  resisten  terhadap  rimfapisin,  masih sensitif terhadap rimfapisin OAT (Obat Anti Tuberkulosis) lini pertama. Perbedaan hasil pada  pemeriksaan  GeneXpert Low  RIF Sensitive pada  BTA  negatif  dan  hasil GeneXpert High  RIF  Sensitive pada  BTA 2+,  hasil yang diperoleh dikarenakan  terlalu sedikitnya  jumlah  bakteri  dalam  sputum. BTA  pada  sputum  secara  mikroskopis terlihat  bila  sputum  mengandung  paling sedikit  10.000  BTA/mL.  Sedangkan  batas deteksi  bakteri  TB  menggunakan  RT-PCR GeneXpert minimal 131 kuman/mL sputum. Pada kasus ini GeneXpert dapat mendeteksi  jumlah  bakteri  yang lebih sedikit dibandingkan dengan BTA sehingga  hasil  yang  didapatkan  berbeda antara GeneXpert dan BTA. Sesuai dengan penelitian-penelitian
sebelumnya,  pewarnaan  dengan  metode Ziehl Neelsen mempunyai sensitifitas yang tidak  setinggi  spesifitasnya.  Hal  ini  bisa terjadi  karena  terlalu  sedikitnya  jumlah bakteri  dalam  sputum.  BTA  dalam  sputum secara  mikroskopis  akan  terlihat  bila sputum  mengandung  paling  sedikit 10.000 BTA/mL  serta  hasil  pemeriksaan  tidak dapat  membedakan M.  tuberculosis dari
Mycobacterium sp yang lain (5). GeneXpert merupakan alat diagnosis TB yang menggunakan metode Real Time Polymerase  Chain  Reaction  Assay (RT- PCR)  semikuantitatif  yang  menargetkan wilayah hotspot gen rpoB pada M.
tuberculosis. Penelitian invitro menunjukkan  batas  deteksi  kuman  TB dengan metode RT-PCR GeneXpert minimal 131 kuman/mL sputum (6).
GeneXpert  MTB/RIF  berdasarkan prinsip  dasar,  RT-PCR  dengan  ampilifikasi gen  target rpoB dan  untuk  meningkatkan sensitivitas, bakteri dalam sputum dilisiskan  kemudian  DNA  bakteri  diisolasi. Fragmen  DNA  spesifik M.  tuberculosis diamplifikasi  jutaan  kali  menggunakan real time  polymerase  chain  reaction (RT-PCR). Primer dalam assai Xpert MTB/RIF memperbanyak bagian dari gen rpoB yang
mengandung  81  pasang  basa “ core ”. Probes dapat membedakan dengan resistensi terhadap RIF.
Teknik mengidentifikasi  gen rpoB  M.  tuberculosis dan  urutannya  secara  lebih  mudah,  cepat dan akurat (7),(8),(9)
Perbedaan  hasil  pada  GeneXpert negatif  dan  BTA  2+,  hal  ini  bisa  terjadi karena GeneXpert merupakan alat diagnosis  TB  dimana  alat  ini  hanya  dapat membaca bakteri M. tuberculosis sedangkan  pemeriksaan  BTA  dengan pewarnaan  Ziehl  Neelsen  tidak  dapat mendeteksi bakteri
golongan Mycobacterium sehingga  tidak  spesifik untuk  diagnosis M.  tuberculosis. Hasil GeneXpert  negatif  dan  BTA  yang  positif dapat dinyatakan sebagai MOTT ( Mycobacterium Other  Than Tuberculosis). MOTT  merupakan  bakteri Mycobacterium selain  bakteri  tuberkulosis,  bakteri  ini memiliki  125  spesies  kecuali  MTB  dan M. leprae ditularkan  dari  orang  ke  orang  lain. Hasil  MOTT  tersebut  ditunjang  dengan pemeriksaan  lainnya seperti radiologis.
Metode
RT-PCR telah dikembangkan  untuk  mendeteksi  bakteri M. tuberculosis. Sputum BTA pertama yang positif  dari  pasien  yang  sebelumnya  tidak terdiagnosis  penyakit  disebabkan  bekteri MOTT seharusnya diperiksa RT-PCR. Nilai PCR  positif  merupakan  indikator  yang dapat  dipercaya  untuk M.  tubercuosis dan sebaliknya  jika  nilai  RT-PCR  negatif menandakan  MOTT  (7).  Prinsip  dari pewarnaan  Ziehl  Neelsen,  Ziehl  Neelsen merupakan teknik pewarnaan Bahan Tahan  Asam  (BTA)  yang  digunakan  untuk mewarnai bakteri golongan Mycobacterium ( M. tuberculosis/ M. leprae) dan Actinomycetes sedangkan  metode  RT- PCR  pada alat GeneXpert merupakan  alat spesifik untuk pemeriksaan M. tuberculosis (8).
Berdasarkan  Grafik  perbandingan hasil  pemeriksaan  (Gambar  2)  menunjukan hasil  yang  sesuai  apabila  pemeriksaan negatif  pada  pewarnaan  Ziehl  Neelsen
maka  negatif  pada  GeneXpert,  1+  pada pewarnaan  Ziehl  Neelsen  maka  Low  RIF sen  pada  GeneXpert,  2+  pada  pewarnaan Ziehl Neelsen maka Medium RIF Sen pada GeneXpert,  3+  pada  pewarnaan  Ziehl Neelsen  maka  High  RIF  Sen  pada GeneXpert.  Pada  grafik  diatas  menunjukan hasil  pemeriksaan  pada  GeneXpert  dan Pewarnaan Ziehl Neelsen. Hasil GeneXpert menunjukan  Negatif  67%,  Low  RIF  Sen 13%,  Medium  RIF  Sen  7%  dan  High  RIF Sen  13%.  Hasil  Pewarnaan  Ziehl  Neelsen menunjukan  Negatif  74%,  1+  3%,  2+  13% dan 3+ 10%.
Pada penelitian ini GeneXpert menunjukkan  positivitas  yang  lebih  tinggi dibandingkan  pemeriksaan  BTA  dengan pewarnaan  Ziehl  Neelsen.  Hasil  yang didapat  pada  pemeriksaan  GeneXpert menunjukan  hasil  negatif  sebanyak  20 sampel dan positif sebanyak 10 sampel dari total  30  sampel.  Pada  pemeriksaan  BTA pewarnaan Ziehl Neelsen menunjukan hasil negatif  sebanyak  22  sampel  dan  postif sebanyak  8  sampel  dari  total  30  sampel. Perbandingan  pemeriksaan Mycobacterium tuberculosis menunjukan
bahwa
pemeriksaan GeneXpert lebih unggul dibandingakan  dengan  pemeriksaan  BTA dengan pewarnaan Ziehl Neelsen.
Menurut hasil penelitian sebelumnya rentang  usia  penderita  TB    sekitar  25-49 tahun  48,2%  dengan  jenis  kelamin  56,9% serta perempuan sebanyak 43,1% 9 . Penderita TB terbanyak biasanya  penderita yang belum pernah mendapatkan terapi TB sebelumnya(10).  Pentingnya  screening  dini terhadap pasien TB  serta informasi riwayat pasien  mengkonsumsi  obat  TB  untuk kewaspadaan  terhadap  pemberian  obat  TB kategori 2 pada pasien MDR-TB ( Multidrug- resistent  tuberculosis ),  pasien  TB  yang kebal  terhadao  obat  antituberkulosis  paling kuat.
Pemeriksaan  TB-HIV  bagi  pasien tuberkulosis  dengan  HIV  positif  diperoleh hasil BTA negatif namun dengan hasil kultur sputum  positif,  didapatkan  pertumbuhan
bakteri MOTT 4 kali lebih banyak dari pada bakteri Mycobacterium  tuberculosis BTA pada kultur sputum(11). GeneXpert
MTB/RIF  merupakan  suatu  metode  untuk mendeteksi bakteri Mycobacterium tuberculosis lebih  cepat  daripada  inokulasi sampel pada medium kultur(12). Pemeriksaan menggunakan metode GeneXpert  MTB/RIF  dapat  menggunakan dua sampel yaitu dahak langsung dan pellet sputum.  Pellet  sputum  diperoleh  melalui tahap  pengenceran,  dekontaminasi  dengan N-acetyl-l-cysteine  dan  sodium  hydroxid (13).
Penambahan  reagen  pada  proses deteksi  bertujuan  untuk  mengencerkan sampel, mengurangi bahaya, serta menginaktivasi penghambat RT-PCR. Volume  reagen  yang  kurang  menyebabkan penghambat  proses  RT-PCR.  Pemberian OAT  mempengaruhi  rendahnya  spesifisitas penghambat  RT-PCR  dapat  menyebabkan probe  terlambat  menempel  pada  target menyebabkan  fluorosensi  probe  terganggu sehingga  mempengaruhi  kerja  dan  hasil RT-PCR (13) .
Mycobacteria other than tuberculosis atau MOTT yang ditemukan pada penelitian ini  kemungkinan  dapat  disebabkan  oleh infeksi  campuran  M.tuberculosis  complex dan MOTT. Hal lain yang dapat menyebabkan
MOTT yaitu terjadi kontaminasi karena MOTT ini dapat ditemukan  dalam  lingkungan  seperti  air, tanah,  dan  dapat  membentuk  kolonisasi pada  kulit  normal  (3).  Pada  penelitian  yang dilakukan  oleh  Yue  dkk(14)di  Cina  tahun 2003,  mendapatkan  dari  72  sampel  yang resisten  terhadap  Rif  dengan  pemeriksaan uji  kepekaan  pada  media  Lowenstein Jensen,  didapatkan  7  sampel  (9,7%) mengalami mutasi di luar regio hot spot gen rpoB .  Kemungkinan  lain  penyebab  negatif palsu didapatkan pada penelitian Lawn dan Nicol(15) tahun  2011  bila  terjadi  infeksi campuran M.tuberculosis yang masih sensitif  dengan  yang  resisten  RIF.  Jika M.tuberculosis yang sensitif jumlahnya lebih
banyak,  maka  resistensi  Rif  tidak  dapat dideteksi. Spesifitas GeneXpert MTB dibandingkan  dengan  baku  emas  kultur metode  proporsi  pada  media  Lowenstein Jensen  untuk  mendeteksi  MDR-TB  nilainya sampai  sebesar  75,0%.  Nilai  ini  berbeda dengan  beberapa  penelitian  serupa  yang pernah dilakukan diantaranya oleh Boehme dkk  (16)  yang  mendapatkan  spesifitas 98,0%.  Nilai  spesifitas  GeneXpert  MTB ditentukan  oleh  nilai  postif  palsu,  yaitu  bila hasil  pemeriksaan  PCR GeneXpert MTB menunjukkan  resisten  terhadap  Rif  namun hasil uji kepekaan metode proporsi menunjukkan hasil sensitif terhadap Rif dan INH.
Berdasarkan hasil perbandingan pemeriksaan metode GeneXpert dan pewarnaan  Ziehl  Neelsen  menggunakan bahan  pemeriksaan  sputum,  pemeriksaan metode  GeneXpert  memiliki  validitas  yang tinggi  terhadap  baku  emas  uji  kepekaan metode proporsi dengan metode pewarnaan Ziehl Neelsen. Metode ini dapat digunakan  sebagai  alat  skrining  karena mempunyai sensitivitas
yang
tinggi(17) , (18),(19),(20).

## KESIMPULAN
Pemeriksaan  GeneXpert  didapatkan hasil  67%  negatif  dan  33%  positif  dari  total 30  sampel.  Pemeriksaan  BTA  dengan Pewarnaan  Ziehl  Neelsen  didapatkan  hasil negatif    74%  dan  positif  26%  dari  total  30 sampel.  GeneXpert  memiliki  tingkat  positif yang  lebih  tinggi  dibandingkan  Pewarnaan Ziehl Neelsen. GeneXpert memiliki kemampuan yang lebih baik dalam mendiagnosis karena alat GeneXpert dirancang untuk
pemeriksaan
Mycobacterium yang  lebih  spesifik  yaitu Mycobacterium tuberculosis sedangkan pemeriksaan BTA ditujukan untuk pemeriksaan Bakteri Tahan Asam golongan Mycobacterium sehingga  tidak  spesifik untuk pemeriksaan MTB.

## DAFTAR PUSTAKA
1. Sholeh  NS.  Buku  panduan  lengkap llmu penyakit dalam. Jogjakarta: Diva Press; 2013. 2. Denrison P DB. Perbandingan pemeriksaan basil tahan asam metode  direct  smear  dan  metode imunochromatographi test pada tersangka penderita tuberkulosis
paru di Upt. Kesehatan Paru Masyarakat Dinas Kesehatan Provinsi  Sumatera  Utara.  J  Anal  Lab Med. 2016;Nov:32 –7.
3. Sirait  N,  Parwati  I,  Dewi  NS  SN. Validitas  metode  Polymerase  Chain Reaction  GeneXpert  MTB/RIF  pada bahan  pemeriksaan  sputum  untuk mendiagnosis  Multidrug  Resistant
Tuberculosis.  MKB.  2013;45(4):234 – 9. 4. Susanty E, Amir Z, Siagian P, Yunita R  EP.  Uji  diagnostik  GeneXpert MTB/RIF di Rumah Sakit zzzzzUmum  Pusat  Haji  Adam  Malik Medan. J Biosains. 2015;1(2). 5. Karuniawati  A,  Risdiyani  E,  Nilawati S,  Prawoto,  Rosana  Y,  Alisyahbana
B, Parwati I, Melia W ST. Perbandingan  Tan  Thiam  Hok,  Ziehl Neelsen  dan  Fluorokrom  sebagai metode pewarnaan basil tahan asam untuk pemeriksaan mikroskopik sputum.  Kesehatan.  2005;9(1):29 –
33.
6. Kurniawan,  Raveinal,  Fauzar  AZ.
Nilai  diagnostik  metode “Real  Time” PCR  GeneXpert  pada  TB  Paru  BTA negatif. J Kesehat andalas. 2016;5(3).
7. Restiawati  NM  BE.  Diagnosis  dan penatalaksanaan Mycobacterium Other  Than  tuberculosis  (MOTT).  J Respirologi Indones. 2011;31(02):156 –64. 8. Azizah  ESN.  Perbandingan  tingkat kepositifan  antara  pewarnaan  basil tahan  asam  konvensional  metode ziehneelsen  dengan  penambahan
bleach 2% untuk mendiagnosis tuberkulosis  pada  spesimen  sputum.
2018. 9. Muñoz  L,  Moure  R,  Porta  N, Gonzalez L, Guerra R AF. GeneXpert®  for  smear  -  negative pulmonary  tuberculosis:  does  it  play a  role  in  lowburden  countries?  Diagn Microbiol Infect Dis. 2013;75:325 –6. 10. Tamhane A, Cheng P, Dobbs T, Mak S,  Sar  B  KM.  Predictors  of  smear- negative  pulmonary  tuberculosis  in HIV-infected  patients,  Battambang, Cambodia.  Int  J  Tuberc  Lung  Dis. 2009;13(3):347 –54.
11. World  Health  Organization  (WHO). Global  Tuberculosis  Report  2016. Geneva. 2016.
12. Dharan  NJ,  Amisano  D,  Mboowa  G, Ssengooba W,  Blakemore  R,  Kubiak RW  et al. Improving the sensitivity of the  Xpert  MTB/RIF  assay  on  sputum pellets  by  decreasing  the  amount  of added  sample  reagent:  A  laboratory and clinical evaluation. J Clin Microbiol. 2015;53(4):1258 –63. 13. Schrader  C,  Schielke  A,  Ellerbroek L JR.  PCR  inhibitors  -  occurrence, properties  and  removal.  J  Appl Microbiol. 2012;113(5):1014 –26. 14. Yue  J,  Shi  W,  Xie  J,  Li  Y,  Zeng  E WH.  Mutations  in  the  rpoB  gene  of multidrugresistant Mycobacterium
tuberculosis  isolates  from  China.  J Clin Microbiol. 2003;41(5):2209 –12. 15. Lawn  SD  NM.  Xpert®  MTB/RIF assay:  development,  evaluation  and implementation  of  a  new  rapid molecular  diagnostic  for  tuberculosis and  rifampicin  resistance.  Futur Microbiol. 2011;6(9):1067 –82. 16. Boehme CC, Nabeta P, Hillemann D,
Nicol  MP,  Shenai  S,  Krapp  F  D. Rapid molecular detection of tuberculosis  and  rifampin  resistance.
N Engl J Med. 2010;363:1005 –15.
17. World  Health  Organization  (WHO). Rapid  implementation  of  the  Xpert
MTB/RIF  diagnostic  test.  Geneva; 2011. 18. World  Health  Organization  (WHO). Multidrug and extensively drugresistant  TB  (M/XDR-TB)  2010 Global  report  on  surveillance  and response. Geneva; 2010. 19. World  Health  Organization  (WHO). Molecular  line  probe  assay  for  rapid
screening  of  patients  at  risk  of multidrug resistant tuberculosis (MDR-TB). Geneva; 2008.
20. O ’Grady  J,  Maeurer  M,  Mwaba  P,
Kapata  N,  Bates  M,  Holelscher  M dkk.  New  and  improved  diagnostics for detection of drug-resistant pulmonary  tuberculosis.  Curr  Opin Pulm Med. 2011;17(3):134 –41.