## SELEKSI FENOTIPE DAN MOLEKULER GALUR GALUR

## PADI ( Oryza sativa L.) LOKUS PUP1 DAN ALT PADA LARUTAN HARA YOSHIDA
( Selection Phenotype and Molecular of Rice Lines (Oryza sativa L .) Containing Pup1 and Alt Loci in Yoshida Nutrient Solution )
Tri Lestari Novelia 1 , Joko Prasetiyono 2 , Sulastri Isminingsih 1 , Samsu Hilal 1 .
1 Jurusan Agroekoteknologi, Fakultas Pertanian, Universitas Sultan Ageng Tirtayasa,
Jl.Raya Jakarta KM. 4 Kampus Pakupatan, Serang, Banten, Telp. (0254) 280330; Fax 281254. e-mail: trilestarinovelia@gmail.com
2 Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumber Daya Genetik Pertanian (The Indonesian Center for Agricultural Biotechnology and Genetic Resources Research and Development),
Jl. Tentara Pelajar 3A, Bogor 16111 Indonesia
Telp. (0251) 8337975; Fax. (0251) 8338820.

## ABSTRACT
This research aimed to selection the phenotype and molecular of rice lines ( Oryza sativa L.) containing Pup1 and Alt loci at various concentrations of Al and P elements in yoshida nutrient solution. This research was conducted from November 2018 to February 2019 at The  Indonesian  Center  for  Agricultural  Biotechnology  and  Genetic  Resources  Research and Development Bogor. The phenotype study used a Split Plot Design with two factors and  repeated  three  times.  The  first  factor  was  the  variation  of  Al×P  concentrations consisting of eight levels and the second factor was the variation of rice lines consisting of twenty levels. The molecular study used three primers to detect the rice lines with Pup1 and Alt loci. The results of the Yoshida nutrient solution showed that the A4 level of Al×P concentrations (0 ppm of Al×15 ppm of P) had the best average of other levels. In rice lines with Pup1 loci  G4  [10B  (B4-SK4)]  showed  the  highest  average  on  the  root  dry-weight parameters. In rice lines with Pup1 and Alt loci G11 [35(21(B15)-3] showed the highest average on the root dry-weight parameters at the A2 level of Al×P concentrations (0 ppm of Al×5 ppm of P) for Pup1 loci and A6 level of Al×P concentrations (60 ppm of Al×5 ppm of P) for Alt loci. In the molecular study, three primers can detect the rice lines that contained Pup1 and Alt loci.  K46-2  specific  primer  detected  the Pup1 loci  with  the comparison of Kasalath rice variety. RM12031 and RM1361 primers detected the Alt loci with the comparison of Dupa rice variety.
Keyword:  aluminum, P deficiency, Pup1 dan Alt loci, yoshida nutrient solutions

## PENDAHULUAN
Indonesia  adalah  salah  satu wilayah  di  Asia  yang  memiliki potensi besar untuk pertanian di lahan marginal, permasalahan umum khususnya  Indonesia  adalah  adanya defisiensi  unsur  P.  Akibat  tingginya kapasitas pengikat P oleh unsur-unsur seperti Al, Fe, dan Ca sehingga unsur P  tidak  tersedia  cukup  bagi  tanaman (Prasetiyono, 2010).
Permasalahan budidaya tanaman  padi  selain  defisiensi  P adalah  keracunan  terhadap  mineral Al.  Pada  tanah  masam,  unsur  P berikatan dengan mineral Al sehingga tidak  dapat  diserap  secara  maksimal oleh  tanaman.  Tingginya  kandungan mineral Al terlihat pada pertumbuhan akar  dan  bagian  tanaman  lainnya terhambat serta menurunkan
produktivitas tanaman di  tanah mineral masam (Huang dan Violante, 1997; Rengel, 2000).
Larutan  hara  Yoshida    adalah larutan hara yang mengandung nutrisi lengkap  (unsur  makro  dan  mikro) yang  dibutuhkan  oleh  tanaman. Menurut    Wu et  al .  (2000),  larutan hara Yoshida ini menggunakan unsur Al   pada  konsentrasi  tinggi di  atas 1  mM  dalam  bentuk  AlCl 3 yang
terbukti menyebabkan penghambatan pertumbuhan pada akar.
Beberapa  penelitian  mengenai defisiensi  unsur  P  pada  larutan  hara Yoshida  untuk  keperluan  pemetaan QTL  defisiensi  P  dan  keracunan  Al pada padi telah dilaporkan oleh Ni et al. (1998), Hu et al. (2001), Ming et al. (2001), dan Shimizu et al. (2004).
Sejak  ditemukannya  marka- marka molekuler pada padi, beberapa peneliti  mulai  melakukan  kegiatan pemetaan  genetik  sifat  toleransi terhadap  defisiensi  P  yang  biasa digunakan dalam kegiatan pemuliaan tanaman.
Menurut  Tasliah et  al. (2011), mekanisme  toleransi  genotipe  padi terhadap  defisiensi  P  kemungkinan tidak  saling  terkait  dengan  toleransi keracunan Al. Lokus Pup1 dipetakan oleh  Wissuwa et  al. (1998)  sebagai QTL  ( Quantitative  Trait  Locus ) utama dan alat deteksi akurat terhadap ketahanan  defisiensi  P.  Kombinasi antara  lokus Pup1 dan Alt pada  padi akan  memberikan  korelasi  positif. Keberadaan lokus Pup1 dan lokus Alt pada    tanaman  padi  dibudidayakan pada lahan masam diharapkan ekspresi karakter agronomi yang baik dan produksi yang tinggi.

## METODE PENELITIAN
Penelitian ini dilaksanakan pada  bulan  November  2018  sampai
Februari  2019  bertempat  di  Rumah
Kaca  BB  Biogen  dan  Laboratorium
Biologi Molekuler BB Biogen
Cimanggu, Bogor.
Genotipe padi yang diuji berjumlah dua puluh galur padi yang terdiri  dari  varietas  padi  Kasalath, Situ  Bagendit,  Dupa,  Situ  Bagendit- Pup1 , ITA131, Hawara Bunar,
Kencana  Bali,  Cabacu,  Inpago  8, Inpari  40,  lima  galur  turunan  Situ Bagendit × Kasalath  dan  lima  galur turunan Situ Bagendit- Pup1 × Dupa.
Penelitian  ini  terdiri  dari  uji fenotipe  dan  uji  molekuler.  Uji fenotipe  menggunakan larutan  hara Yoshida,  dirancang  menggunakan Rancangan Petak Tebagi ( Split Plot  Desaign )  terdiri  dari  2  faktor.
Faktor  pertama  atau  petak  utama adalah  delapan  taraf  Al×P  (Al  =  0 ppm Al × 0 ppm P, A2= 0 ppm Al × 5 ppm P, A3= 0 ppm Al × 10 ppm P, A4= 0 ppm Al × 15 ppm P, A5= 60 ppm Al × 0 ppm P, A6= 60 ppm Al × 5 ppm P, A7= 60 ppm Al × 10 ppm P,  A8=  60  ppm  Al  ×  15  ppm  P). Faktor kedua atau anak petak adalah variasi galur padi yang terdiri dari 20
taraf dan diulang sebanyak tiga kali. Uji  molekuler  menggunakan  tiga primer yaitu  primer  K46-2  untuk mendeteksi  lokus Pup1 ,  primer RM12031 dan primer RM1361 untuk mendeteksi lokus Pup1+Alt .
Analisis sidik ragam dilakukan untuk mengetahui pengaruh perlakuan P dan Al terhadap karakter yang diamati.
Pada  uji  fenotipe,  benih  yang telah  berkecambah  normal  berumur dua  hari  dipindahkan  ke  media percobaan  yang  ditempatkan  pada styrofoam yang  diberi  lubang  dan diapungkan  pada  larutan  hara  dalam bak  plastik  berukuran  38  ×  35  ×  15 cm.  Setiap bak berisi  10 liter larutan hara  dan  dipasang  aerator  agar distribusi Al merata dan tidak terjadi penggumpalan  Al  dalam  media tumbuh.
Pengamatan  parameter  tinggi tajuk,  jumlah  ankaan,  panjang  akar, dilakukan  pada  3  MST  sedangkan pengamatan  parameter  bobot  kering akar,  bobot  kering  tajuk,  dan  bobot kering  total  dilakukan  1  minggu setelah dioven.
Pada  uji  molekuler,  benih ditumbuhkan pada pot berisi tanah di dalam  rumah  kaca  hingga  3  MST.
Lalu daun padi muda diisolasi dengan menggunakan  metode  Dellaporta
(1983) termodifikasi. Hasil isolasi DNA
menghasilkan  DNA  murni  dari masing-masing daun padi lalu dilanjutkan  dengan  uji  kuantitas dengan menggunakan alat Spektofotometer Nanodrop 2000 dan uji kualitas menggunakan elektroforesis gel agarosa 1%. Kemudian amplifikasi DNA menggunakan  alat  PCR.  Selanjutnya adalah  elektroforesis  hasil  PCR dengan menggunakan gel poliakrilamida 8%. Skoring
dilakuakan  untuk  melihat  pita  galur- galur  padi  yang  mempunyai  lokus Pup1 dan lokus Alt . Data hasil skoring dianalisis  menggunakan  program Microsoft Excel.

## HASIL DAN PEMBAHASAN
Uji Fenotipe
Pengaruh perlakuan konsentrasi unsur hara Al × P terhadap karakter  galur-galur  yang  diamati dapat dilihat Pada (Tabel 1).
Pada  Tabel  1  dapat  dilihat faktor  pertama  yaitu  konsentrasi unsur hara berpengaruh sangat  nyata terhadap  semua  parameter.  Faktor kedua yaitu variasi galur berpengaruh sangat nyata terhadap semua parameter pengamatan. Interaksi antara  konsentrai  unsur  hara  dan variasi  galur  hanya  pada  parameter bobot  kering  akar  yang  tidak memberikan pengaruh yang nyata.
Berdasarkan  hasil  penelitian Konsentrasi A4 (0 ppm Al × 15 ppm P)  memberikan  hasil  yang  terbaik pada  parameter  tinggi  tajuk,  jumlah anakan,  bobot  kering  akar,  bobot kering  tajuk  dan  bobot  kering  total dapat dilihat pada (Gambar 1).
Tabel 1. Rekapitulasi sidik ragam uji fenotipe pertumbuhan galur-galur padi dengan variasi konsentrasi unsur hara Al×P pada larutan hara Yoshida.
No. Parameter Pengamatan Perlakuan KK (%) Unsur hara Al×P (A) Galur (G) Interaksi (A*G) 1. Tinggi Tajuk ** ** ** 10,72 2. Panjang Akar ** ** ** 16,23 3. Jumlah Anakan ** ** ** 24,41 4. Bobot Kering Akar ** ** tn 7,10a 5. Bobot Kering Tajuk ** ** ** 27,02 6. Bobot Kering Total ** ** ** 28,90 Keterangan:  ** = Sangat nyata pada F<0,01; tn = tidak nyata;  KK= Koefisien Keragaman
a = data hasil transformasi √X sebanyak 1 kali
Penelitian menggunakan
laruan hara yoshida sebelumnya telah dilakukan  oleh  Prasetiyono  (2010) dalam tesisnya dengan menggunakan konsentrasi (0,5 dan 10 ppm P) dan (0 dan  45  ppm  Al)  hasil  percobaan menunjukkan  terjadi  peningkatan nilai  karakter  agronomis  (kecuali panjang akar) pada galur-galur BC 2 F 3 seiring  dengan  peningkatan  kadar  P. Sedangkan  pada  hasil  penelitian  ini menunjukan penambahan konsentrasi
unsur  P  menjasi  15  ppm  dapat meningkatkan  karakter  agronomi seperti  tinggi  tajuk,  jumlah  anakan, bobot kering akar, bobot kering tajuk dan  bobot  kering  total  (kecuali panjang  akar)  hal  ini  karena  unsur  P yang  tersedia  untuk  tanaman  yang salah  satunya  berfungsi  sebagai pembentukan  anakan  sehingga  dapat meningkatkan hasil produksi tanaman.
Gambar 1. Respon tanaman padi pada berbagai kondisi P dan Al dalam larutan hara Yoshida. Dari  kiri ke kanan: Perlakuan A1, A2, A3, A4, A5, A6, A7, dan A8.
Menurut  Prasetiyono  (2010), bobot  kering  total  akar  pada  kondisi kurang  P  dapat  digunakan  sebagai peubah utama untuk seleksi toleransi terhadap defisiensi P. Pada penelitian ini perlakuan A2 (0 ppm Al × 5 ppm P)  yaitu  kondisi  kurang  P  dijadikan sebagai  perlakuan  untuk  penyeleksi galur padi yang memiliki lokus Pup1 , Kasalath  sebagai  pembanding  (tetua donor) yang memiliki lokus Pup1.
Hasil  penelitian  bobot  kering akar  perlakuan  A2  galur  G4  [10B (B4-SK4)] menunjukkan skor tertinggi  yaitu  0,115  g,  dibanding tetua  Kasalath  yang  memiliki  skor 0,114  g.  Karakter  panjang  akar perlakuan A2 dapat dapat dilihat pada (Gambar 2).
Percobaan  cek  toleran  Al dilakukan  untuk  melihat  galur  padi hasil  persilangan  Situ  Bagendit-
Pup1 (SB-2) × Dupa mana yang sudah mengikuti  tetua  pembanding  Dupa yang mempunyai lokus Alt. Cekaman Al  dapat  meracuni  tanaman  padi terutama  pada  akar  tanaman  padi sehingga  pertumbuhan  akar  menjadi lambat  dan  dapat  menurunkan  hasil produksi padi.
Pada percobaan cek toleran Al, penambahan  konsentrasi menjadi 60 ppm  Al  tanaman  padi  masih  tetap hidup  walaupun  terdapat  cekaman dari unsur Al. Perlakuan A6  (60 ppm Al × 5 ppm P) yaitu kondisi tercekam
Al  dan  kurang  P  dijadikan  sebagai perlakuan untuk penyeleksi galur padi yang  memiliki  lokus Alt ,  Dupa sebagai  pembanding  (tetua  donor) yang memiliki lokus Alt.
Hasil  penelitian  bobot  kering akar  perlakuan  A6  galur  G11 [35(21(B15)-3]  menunjukkan  skor yang  sama  tertinggi  yaitu  0,057  g, dibanding  tetua  Dupa  yang  memiliki skor  0,040  g.  Karakter  panjang  akar perlakuan A6 dapat dapat dilihat pada (Gambar 2).
Gambar 2.  Karakter panjang akar pada larutan hara Yoshida. Dari kiri ke kanan: perlakuan A2 (0 ppm Al × 5 ppm P) dan perlakuan A6 (60 ppm Al × 5 ppm P).
Tabel 2. Skoring panjang akar relatif (PAR) toleransi keracunan Al pada larutan hara Yoshida. Nomor Galur Padi Lokus Konsentrasi 10 ppm P G1 Kasalath 0,11 P G2 SB-1 0,48 M G3 8B (B1-SK1) Pup1 0,36 M G4 10B (B4-SK4) Pup1 0,48 M G5 13B (B7-SK7) Pup1 0,52 M G6 17B (B11-SN4) Pup1 0,47 M G7 19B (B14-SN7) Pup1 0,61 M
G8 Dupa 1,00 T G9 SB-2 0,54 M G10 29 (20(B8)-1) Pup1+Alt 0,86 T G11 35 (21(B15-3) Pup1+Alt 0,90 T G12 43 (24(B21-10) Pup1+Alt 0,76 T G13 52 (28(B35)-1) Pup1+Alt 0,95 T G14 55 (29(B45)-1) Pup1+Alt 0,73 T G15 ITA131 0,19 P G16 Hawara Bunar 1,02 T G17 Kencana Bali 0,56 M G18 Cabacu 1.27 T G19 Inpago 8 0.60 M G20 Inpari 40 0.48 M Keretangan: Skor <0,29=peka (P) , 0,30-0,69=moderat (M), > 0,70= oleran (T) Pada percobaan toleran Al ( Alt ) dapat  dihitung  dengan  rumus  yaitu rumus  panjang  akar  relatif  (PAR) yaitu  dengan  rumus  panjang  akar yang  tercekam  Al  dibagi  dengan panjang  akar  tanpa  adanya  cekaman Al (Suhartini, 2010). Pada percobaan ini yaitu berarti panjang akar 60 ppm Al dibagi dengan panjang akar 0 ppm Al. Hasil dari perhitungan ini terbagi menjadi 3 tipe yaitu peka dengan skor <  0,29,  moderat  dengan  skor  0,30- 0,69, dan toleran dengan skor > 0,70.
Pada  Tabel  2  menunjukkan hasil  skoring  panjang  akar  relatif (PAR)  toleransi  keracunan  Al  pada larutan hara Yoshida. Perhitungan ini menggunakan  data  pada  konsentrasi 10 ppm P yang merupakan konsentrasi standar.
Dupa sebagai tetua pembanding cek toleran Al menunjukkan skor 1,00
artinya > 0,70  yang  berarti  toleran, sedangkan  Situ  Bagendit- Pup1 (SB- 2)  menunjukkan  skor  0,54  yang berarti  moderat.  Pada  galur-galur hasil  persilangan  Situ  Bagendit- Pup1 (SB-2) × Dupa yaitu G10, G11, G12,  G13,  dan  G14  menunjukkan skor  >  0,70  yang  berarti  toleran artinya  galur-galur  tersebut  sudah mengikuti  tetua  donor  Dupa  yang mana  padi  ini  toleran  terhadap cekaman  Al  dan  mempunyai  lokus Alt.

## Uji molekuler
Pada pelaksanaan uji genotipe ini terdiri  dari  isolasi  DNA,  uji  kualitas dan  uji  kuantitas  DNA,  amplifikasi DNA,  elektroforesis  hasil  PCR,  dan analisis  data.  Isolasi  DNA  ini bertujuan  untuk  mendapatkan  DNA yang murni tidak tercampur komponen sel lain seperti protein dan
RNA,  uji  kualitas  untuk  melihat  pita DNA  dan  uji  kuantitas  untuk mendapatkan konsentrasi DNA.
Amplifiasi  DNA  dilakukan  dengan menggunakan  mesin  PCR  yang bertujuan untuk memperbanyak jumlah  untai  pita  DNA  dari  setiap sampel yang sudah didapatkan dengan  menggunakan  tiga  primer. Elektroforesis  hasil  PCR  dengan menggunakan  gel  agarosa  1,2%  dan gel  poliakrilamida  8%.  Analisis  data yaitu  untuk  melihat  alel  mana  yang mempunyai lokus Pup1 dan Alt .
Berdasarkan hasil visualisasi uji kualitas dengan
menggunakan
elektroforesis gel agarosa, pita mengalami smear yaitu  keadaan  pita DNA  tidak  muncul  tetapi  hanya  ada garis  cahaya  yang  menyerupai  pita atau disebut juga terdegradasi. Menurut  Solihah  (2014), smear pita DNA tersebut diduga disebabkan oleh
pemipetan DNA berulang-ulang sehingga  DNA  terpotong  sehingga hal ini dapat mengakibatkan terjadinya smear pada  pita-pita  yang
diuji.
Berdasarkan  hasil  uji  kuantitas dapat  diketahui  perhitungan  DNA yang  diuji  dari  20  sampel  tersebut yaitu  berkisar  antara  23,8  hingga 1,241 ng/µl. Tinggi rendahnya konsentrasi  DNA  disebabkan  oleh beberapa  faktor  pada  saat  isolasi DNA.
Identifikasi pola alel pada galur padi  ini  yaitu  pada  beberapa  galur hasil  persilangan  yang  mempunyai lokus Pup1 dan persilangan padi yang memiliki lokus Pup1+Alt dan varietas padi lainnya seperti ITA131, Hawara Bunar, Kencana Bali, Cabacu, Inpago 8, dan Inpari 40.
Primer  K46-2  adalah  primer yang  digunakan  untuk  mendeteksi pola alel galur padi apakah mengikuti tetua Kasalath yang mempunyai lokus Pup1 atau tidak . Pada marka spesifik ini menggunakan elektroforesis agarosa 1,2%.
Gambar 3. Hasil elektroforegram pada primer K46-2
Berdasarkan hasil elektroforegram pada Gambar 3, yaitu pada primer K46-2 telah
teridentifikasi galur padi yang mengikuti  pola  alel  padi  Kasalath, adapun  galur  yang  mengikuti  tetua Kasalath  yang  mempunyai  lokus Pup1 yaitu G3  [8B  (B1-SK1)],  G4
[10B (B4-SK4)], G5 [13B(B7-SK7)], G6 [17B(B11-SN4)], dan G7 [19B(B14-SN7)],  ITA131,  Hawara Bunar, Kencana Bali dan Cabacu.
Hasil  elektroforegram  pada primer  RM  12031  dan  RM  1361 dengan  menggunakan  elektroforesis gel  akrilamida    8%.  RM  12031  dan RM 1361 merupakan marka
mikrosatelit  yang  mempunyai  gen- gen yang dapat mendeteksi lokus Alt ( Aluminum tolerant ).
Pada Gambar 4 menunjukkan semua  sampel  DNA  teramplifikasi dengan baik. Pada pengujian identifikasi lokus Alt ini Dupa sebagai tanaman  pembanding  untuk  galur padi  yang  lainnya  dan  sebagai  tetua yang memiliki lokus Alt. Pada primer RM12031  galur-galur  padi  yang memiliki  ukuran  pita  yang  sama dengan  Dupa  yaitu  G10  [29(20(B8)- 1)],  G11  [35(21(B15)-3)],  G12 [43(24(B21)-10)],  G13  [52(28(B35)- 1)],  G14  [55(29(B45)]  dan  Hawara Bunar.
Gambar 4. Hasil elektroforegram pada primer RM12031
Gambar 5. Hasil elektroforegram pada primer RM12031 Gambar  5  adalah  hasil
elekroforegram
pada primer RM1361. Primer ini adalah pengujian untuk  galur-galur  padi  yang  alelnya mengikuti  ukuran  dari  pita  Dupa sebagai  pembanding  cek  toleran Aluminium. Pola alel pada galur G10 [29(20(B8)-1)],  G11  [35(21(B15)- 3)],  G12  [43(24(B21)-10)],  G13 [52(28(B35)-1)],  G14  [55(29(B45)], Hawara Bunar dan Cabacu mengikuti ukuran  dari  pola  alel  dari  galur pembanding  Dupa  yang  memiliki lokus Alt.

## SIMPULAN

## Uji Fenotipe
Perlakuan Konsentrasi A4 (0 ppm  Al  ×  15  ppm  P)  memberikan hasil  yang  terbaik  pada  parameter tinggi  tajuk,  jumlah  anakan,  bobot kering  akar,  bobot  kering  tajuk  dan bobot kering total.
Galur  G4  [10B  (B4-SK4)] menunjukkan  skor  tertinggi  yaitu 0,115  g  dibanding  tetua  donor
Kasalath yaitu 0,114 g yang memiliki lokus Pup1 dan Alt galur  G11 [35(21(B15)-3]  menunjukkan  skor yang  sama  tertinggi  yaitu  0,057  g, dibanding  tetua  Dupa  yang  memiliki skor 0,040 g yang memiliki lokus Alt pada parameter bobot kering akar.

## Uji Molekuler
Pada  uji  molekuler  pada primer K46-2 dapat mendeteksi galur yang  memiliki  lokus Pup1 seperti Kasalath  yaitu  yaitu G3  [8B  (B1-
SK1)],  G4  [10B  (B4-SK4)],  G5
[13B(B7-SK7)], G6 [17B(B11- SN4)],  dan  G7  [19B(B14-SN7)], ITA131,  Hawara  Bunar,  Kencana Bali dan Cabacu. Primer RM12031 dapat
mendeteksi  galur  yang  memiliki lokus Alt dengan  tetua  pembanding Dupa yaitu G10 [29(20(B8)-1)], G11 [35(21(B15)-3)],  G12  [43(24(B21)- 10)],  G13  [52(28(B35)-1)],  G14 [55(29(B45)] dan Hawara Bunar.
Primer  RM1361
dapat
mendeteksi  galur  yang  memiliki
lokus Alt dengan  tetua  pembanding Dupa yaitu G10 [29(20(B8)-1)], G11 [35(21(B15)-3)],  G12  [43(24(B21)- 10)],  G13  [52(28(B35)-1)],  G14 [55(29(B45)],  Hawara  Bunar  dan Cabacu.

## DAFTAR PUSTAKA
Atakora,  W.K.,  M.  Fosu,  S.O Abebrese,  M.,  Asante,  M. Wissuwa. 2015. Evaluation of Low Phosphorus Tolerance of Rice  Varieties  in  Northern Ghana. Sustainable Agricultue  Research.  Canada (CA)  :  Canadian  Center  of Science and Education. BPS.  2015.  Konsumsi  Rata-rata  per
Kapita  Seminggu  Beberapa Macam Bahan Makanan Penting, 2007-2014.
Dellaporta,  S.L.,  J.  Wood,  and  J.B.
Hick.  1983.  A  Plant  DNA Minipreparation . Version  II. Plant Mol. Biol. Rep . 4: 19-21. Hu,  B.,  P.  Wu,  C.Y.  Liao,  W.P. Zhang, J.J. Ni. 2001. Qtls And Epistasis  Underlying  Activity Of  Acid  Phosphatase  Under
Phosphorus  Sufficient  And
Deficient  Condition  In  Rice
( Oryza  sativa L.).  Plant  Soil 230:99-105.
Huang,  P.M.,  A.  Violante.  1997. Pengaruh Asam Organik Terhadap Kristalisasi  dan Sifat Permukaan Produk Pengendapan  Al.  hal.  242- 331. Ming, F., X. Zheng, G. Mi, L. Zhu, F. Zhang.  2001.  Detection  and
Verification  of  Quantitative Trait Loci Affecting Tolerance
to  Low  Phosphorus  in  Rice. J.Plant.
Ni,  J.J.,  P.  Wu,  D.  Senadhira,  N.
Huang.  1998.  Mapping  Qtls for Phosphorus Deficiency  Tolerance  in  Rice ( Oryza sativa L.). Theor Appl.
Genet . 97: 1361-1369.
Nugroho,  K.,  Slamet,  P.  Lestari. 2017.  Keragaman  Genetik  24
Varietas Padi  Sawah dan Padi  Gogo  ( Oryza  sativa L.) Indonesia Berdasarkan Marka ssr. Scripta Biologica . Nutr . 24:1399 1408 . Prasetiyono,  J.  2010.  Studi  Efek Interogasi Pup1 ( P Uptake1 ) untuk Meningkatkan Toleransi Padi  Terhadap  Defisiensi Fosfor. [Disertasi]. Institut Pertanian. Bogor.185hlm. Rengel, Z. 2000. Mineral Nutrition of Crops, Fundamental Mechanisms and Implications.  Food  Products Press. Binghamton: New York. Shimizu,  A.,  S.  Yanagihara,  S. Kawasaki,  H.  Ikehashi.  2004. Phosphorus Deficiency
Induced  Root  Elongation  and Its  Qtl  in  Rice  ( Oryza  sativa L.). Theor  Appl  Genet .  109: 1361-1368.
Sholihah,  S.M.  2014.  Hubungan Kekerabatan Beberapa Kultivar Pisang ( Musa sp.)  untuk  Sifat  Ketahanan Terhadap Penyakit Berdasarkan Resistance Gene Analog (RGA). [Skripsi].  Universitas  Islam Negeri Maulana malik Ibrahim: Malang. Suhartini,  T.  2010.  Pertumbuhan Akar  Dua  Puluh  Genotipe Padi Gogo pada Kahat
Fosfor dan Cekaman
Aluminium. Berita  Biologi. Vol. 10 (3). Tasliah,  T.  Suhartini,  J.  Prasetiyono, I.H. Somantri, M. Bustamam. 2011. Respon  Genotipe Padi Pogo Terhadap  Defisiensi P. J.  Pen.  Pert.  Tan.  Pangan 30 (3): 172181. Wissuwa,  M.,  M.  Yano,  N.  Ae.
1998.  Mapping  of  QTLs
Forphosphorus Deficiency Tolerancein Rice ( Oryza
sativa L.). Theor  Appl. Genet. 97: 777-783. Wu,  P.,  C.Y.  Liao,  B.  Hu,  K.K.  Yi,
W.Z. Jin, J.J. Ni, C. He. 2000. Qtls and Pistasis For Aluminium Tolerance In Rice
( Oryza sativa L.) at Different Seedling  Stages. Theor  Appl. Genet . 100: 1295-1303.