# Korespondensi:  Balai  Riset  Perikanan  Budidaya  Air  Tawar  dan Penyuluhan  Perikanan,  Bogor E-mail:  sripudjisinarni@gmail.com
Tersedia  online  di:  http://ejournal-balitbang.kkp.go.id/index.php/jkpt
EVALUASI  KUALITAS  GENETIK  IKAN  NILA  ( Oreochromis  niloticus )  DI  BEBERAPA SENTRA  BUDIDAYA  DI  INDONESIA

## EVALUATION  OF  GENETIC  QUALITY  OF  TILAPIA  (Oreochromis  niloticus)  IN SOME  FARMING  CENTERS  IN  INDONESIA
Raden  Roro  Sri  Puji  Sinarni  Dewi 1# ,  Lies  Emmawati  Hadie 2 ,  Bambang  Priono 2
1 Balai Riset Perikanan Budidaya Air Tawar dan Penyuluhan Perikanan
Jl. Sempur I, Bogor
2 Pusat Riset Perikanan
Jl. Ragunan no. 20, Pasar Minggu, Jakarta Selatan
E-mail:  sripudjisinarni@gmail.com
(Diterima: 3 Desember 2020; Diterima setelah perbaikan: 14 September 2021; Disetujui: 19 September 2021)

## ABSTRAK
Studi ini dilakukan untuk mengevaluasi tingkat keragaman genetik ikan nila ( Oreochromis niloticus ) unggul di sentra budidaya ikan nila yang berada di Lombok, Nusa Tenggara Barat dan Purwakarta, Jawa Barat.  Analisis Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) digunakan untuk mengestimasi heterosigositas dan polimorfisme tiga strain ikan nila unggul yang banyak digunakan di dua sentra budidaya tersebut yaitu ikan nila Nirwana I, Nirwana III, dan Anjani. Hasil  penelitian menunjukkan bahwa ikan nila strain Anjani  dan strain Nirwana III memiliki nilai polimorfisme (>60%) dan heterosigositas yang tinggi yang mengindikasikan tingginya keragaman genetik dan kemampuan adaptasi pada kedua strain tersebut. Ikan nila strain Anjani dan Nirwana III, masih memiliki  karakter  unggul  sebagai  induk  ataupun  benih  dan  penggunaannya  di  masyarakat  dapat  terus dilanjutkan. Adapun pada ikan nila strain Nirwana I, menunjukkan nilai polimorfisme yang rendah (<60%) dan heterosigositas yang rendah, diduga sebagai akibat tingginya tingkat inbreeding pada strain tersebut. Dampak dari rendahnya tingkat keragaman genetik diantaranya adalah penurunan kecepatan tumbuh strain ikan nila tersebut sehingga tidak direkomendasikan digunakan sebagai induk unggul di masyarakat.
KATA  KUNCI: Evaluasi  genetic; Oreochromis  niloticus ;  RAPD;  sentra  budidaya

## ABSTRACT
This study was conducted to evaluate the level of genetic diversity of superior tilapia (Oreochromis niloticus) in tilapia aquaculture centers located in Lombok, West Nusa Tenggara and Purwakarta, West Java. Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) analysis was used to estimate the heterozygosity and polymorphism of the three strains of superior tilapia that are widely used in the two farming centers, namely Nirwana I, Nirwana III, and Anjani tilapia. The results showed that the tilapia strain Anjani and Nirwana III strains had high polymorphism (>60%) and heterozygosity values which indicated high genetic diversity and adaptability in both strains. Tilapia, strain Anjani and Nirwana III, still have superior character as broodstock or seed and their use for aquaculture can be continued. As for the Nirwana I strain of tilapia, it showed a low polymorphism value (<60%) and low heterozygosity, presumably as a result of the high level of inbreeding in this strain. The impact of the low level of genetic diversity, among others, is a decrease in the growth rate of the tilapia strain so that it is not recommended to be used as superior broodstock for the aquaculture.
KEYWORDS:  Genetic  evaluation;  Oreochromis  niloticus;  RAPD;  aquaculture  centre
Evaluasi Kualitas Genetika Ikan Nila (Oreochromis niloticus)....  (Raden Roro Sri Pudji Sinarni Dewi)

## PENDAHULUAN
Komoditas ikan nila menjadi salah satu komoditas utama dalam pembangunan perikanan budidaya dan ditargetkan  dapat  mendorong  tercapainya  program industrialisasi  perikanan.  Ketetapan  tersebut didasarkan  atas  posisi  Indonesia  sebagai  eksportir ikan nila pada peringkat kedua setelah Cina. Kebutuhan nila dalam bentuk fillet di pasar Amerika cukup besar, dan pasar potensial lainnya untuk ikan nila adalah Uni Eropa, Iran dan Rusia (Fitzsimmons, 2012; FAO, 2017).
Pasok  ikan  nila  masih  terkendala  oleh produktivitas yang belum optimal dalam budidayanya. Oleh  karena  itu  faktor  kualitas  perlu  menjadi  fokus yang  layak  untuk  diperhatikan.  Selain  faktor  itu, perbenihan  ikan  di  tingkat  nasional  masih membutuhkan pembenahan secara sistematis. Faktor penting perbenihan akan berkembang dengan adanya strain-strain  unggul  ikan  nila  hasil  pemuliaan  yang dirilis secara resmi oleh Pemerintah. Beberapa strain yang telah dirilis antara lain ikan nila Nirwana I, nila Nirwana II, nila Nirwana III, nila Srikandi, nila Anjani, nila  BEST, nila Larasati, nila Jatimbulan, dan semua strain  ini  merupakan  hasil  pemuliaan.  Ikan  strain unggul  pada  umumnya  memiliki  sifat-sifat  yang menonjol dalam hal potensi hasil yang tinggi sehingga dapat meningkatkan produktivitas perikanan budidaya. Rilis  jenis,  introduksi,  strain,  maupun  hibrida, merupakan rangkaian kegiatan formal dan merupakan tahapan  penyerahan  hasil  dari  pemulia  kepada pemerintah dan masyarakat untuk dimanfaatkan secara optimal (Hadie et al., 2016).
Mengingat urgensi kualitas ikan nila yang berperan penting dalam produksi perikanan di tingkat nasional, maka diperlukan evaluasi kualitas genetik pasca rilis. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi kualitas genetik beberapa strain ikan nila setelah dimanfaatkan oleh masyarakat pembudidaya pada beberapa sentra produksi  budidaya.  Pendekatan  genetik  merupakan alat  yang  efektif  untuk  mengevaluasi  status  terkini dari  sebuah  populasi  atau  strain.  Metode Random Amplified Polymorphic Dna (RAPD) merupakan teknik analisis berdasarkan amplifikasi reaksi rantai polimer pada  daerah  genom  tertentu  menggunakan  primer oligonukelotida  pendek.  RAPD  merupakan  metode yang sederhana, cepat, dan sensitif dalam mengidentifikasi keragaman genetik tanpa harus terlebih dahulu mengetahui sekuens DNA nya (Almeida et al . 2001; Ganaie & Ali, 2016) dan metode  yang cocok untuk studi biologi DNA individu maupun populasi (Yoon & Kim, 2004).

## BAHAN  DAN  METODE
Koleksi  Sampel
Sampel ikan uji diperoleh dari sentra budidaya ikan
nila di Lombok, Nusa Tenggara Barat dan Purwakarta, Jawa Barat. Strain yang digunakan oleh pembudidaya ikan nila di Lombok adalah ikan nila Anjani dan ikan nila  Nirwana  I.  Sedangkan  strain  ikan  nila  yang digunakan oleh pembudidaya di Purwakarta adalah ikan nila Nirwana III. Jumlah sampel untuk strain Nirwana III adalah 10 ekor, Nirwana I sebanyak 10 ekor, dan Anjani sebanyak 8 ekor. Sampel diambil dari potongan sirip  ekor.

## Ekstraksi  DNA  dan  Analisis  RAPD
Ekstraksi  DNA  dilakukan  dengan  menggunakan GSYNC-TM DNA Kit. Amplifikasi DNA dilakukan dengan metode PCR. Primer yang digunakan adalah OPA03, OPB06,  OPZ09.  Amplifikasi  DNA  dilakukan  dengan menggunakan thermalcycler . Sampel yang sudah dibuat premix (hasil preparasi reagen) dimasukkan ke dalam mesin thermalcyler  gradient karena  menggunakan lebih  dari  1  primer  maka  sampel  diletakkan  sesuai dengan suhu annealing setiap primernya. Amplifikasi DNA dilakukan pada kondisi pre-denaturasi pada suhu 94 °C selama 120 detik sebanyak 1 siklus; denaturasi pada suhu 94 °C selama 60 detik sebanyak 35 siklus; annealing untuk OPA 03 (5’- AGTCAGCCAC-3’),  OPB 06  (5’-  TGCTCTGCCC-3’),  dan    OPZ  09  (5’- CACCCCAGTC -3’) adalah 34, 40, dan 42 °Cselama 60 detik sebanyak 35 siklus, ekstension pada suhu 72°C selama  120  detik  sebanyak  35  siklus,  dan  final ekstension pada suhu 72°C selama 420 detik sebanyak 1  siklus.  Hasil  PCR  kemudian  dielektroforesis menggunakan gel agarose 2% dalam Tris-Boric-EDTA (TBE) buffer. Hasil elektroforesis dimasukkan ke dalam GelDoc untuk divisualisasikan dan didokumentasikan. Foto  hasil  elektroforesis  selanjutnya  di-skoring menggunakan software AlphaView SA untuk mengukur berat  molekul.  Hasil  skoring  selanjutnya  diubah  ke data  biner  kemudian  dilakukan  analisis  RAPD menggunakan software TFPGA ( Tools for Population Genetic Analysis ).

## HASIL  DAN  BAHASAN
Profil amplifikasi DNA tergantung pada homologi sekuens nukleotida antara DNA  templat dan primer oligonukletida pada setiap produk amplifikasi. Variasi nukleotida  antara  DNA  templat  yang  berbeda  akan menghasilkan  ada  atau  tidaknya  pita  DNA  karena perubahan situs penempelan primer. Oleh karena itu, produk amplifikasi dari alel yang sama dapat berbeda ukuran  panjangnya  dan  akan  dideteksi  dengan  ada/ tidaknya  pita  DNA  pada  profil  RAPD  (Ganaie  &  Ali, 2016).  Pada  penelitian  ini  amplifikasi  DNA  yang menggunakan tiga primer (OPA-03, OPB-06, dan OPZ- 09) pada ikan nila strain Nirwana I, Nirwana III, dan Anjani  menunjukkan bahwa DNA teramplifikasi pada setiap  lokus  dan  bervariasi,  masing-masing
ditampilkan  pada  Gambar  1,  2,  dan  3.  Berdasarkan analisis  RAPD  didapatkan  kisaran  jumlah  fragmen, ukuran fragmen, dan jumlah lokus per primer seperti tertera  pada  Tabel  1.  Keragaman  profil  RAPD
menunjukkan  jumlah  fragmen  pada  ketiga  populasi berkisar  0-14  pita  dengan  ukuran  fragmen  DNA teramplifikasi berkisar antara 200 – 3000 bp.
Gambar 1. Hasil amplifikasi DNA ikan nila strain Nirwana I, Anjani, dan Nirwana III menggunakan  PCR-RAPD menggunakan primer OPA-03(Keterangan: M = Marker; N11 – N110 = sampel ikan nila Nirwana I; A1 – A8 = Anjani 1-8; N31-N310 = Nirwana III).
Figure 1. The  result of DNA amplification for three strain of  tilapia (Nirwana I,  Anjani, and Nirwana  III) analyzed by RAPD-PCR, using primer OPA-03 (M = marker; N11 – 110 = Nirwana I; A1 – A8 = Anjani 1-8; N31 – N310 = Nirwana III).
Gambar 2. Hasil amplifikasi DNA ikan nila strain Nirwana I, Anjani, dan Nirwana III menggunakan  PCR-RAPD menggunakan primer OPB-06 (Keterangan: M = Marker; N11 – N110 = sampel ikan nila Nirwana I; A1 – A8 = Anjani 1-8; N31-N310 = Nirwana III).
Figure 2. The  result of DNA amplification for three strain of  tilapia (Nirwana I,  Anjani, and Nirwana  III) analyzed by RAPD-PCR method, using primer OPB-06 (M = marker; N11 – 110 = Nirwana I; A1 – A8 = Anjani 1-8; N31 – N310 = Nirwana III).
Evaluasi Kualitas Genetika Ikan Nila (Oreochromis niloticus)....  (Raden Roro Sri Pudji Sinarni Dewi)
Polimorfisme dihitung berdasarkan skoring pada keberadaan pola amplifikasi fragmen pita DNA pada posisi  spesifik  yang  diekspresikan  dari  beberapa polimer  dekamer  (Yoon  &  Park,  2002).  Pita polimorfisme yang dihasilkan dari proses RAPD-PCR dengan  menggunakan beberapa  jenis primer  secara acak  bermanfaat  untuk  mendeteksi  similaritas  DNA dan keragaman diantara organisme (Geng et al ., 2002). Tingkat keragaman genetik suatu populasi ditentukan berdasarkan  situs  penempelan  primer  yang menghasilkan  perbedaan  polimorfisme  pita  DNA (Gusmiati et  al .,  2012;  Gustiano et  al .,  2013). Perbedaan jumlah fragmen dan kisaran situs fragmen sangat menentukan tingkat polimorfisme. Persentase
polimorfisme secara lengkap disajikan pada Tabel 2. Persentase polimorfisme pada stain ikan nila Nirwana I, Nirwana III, dan Anjani secara berturut-turut adalah 47,06%; 67,65%; dan 70,59%. Berdasarkan hasil yang diperoleh, populasi ikan nila strain Anjanidan Nirwana III  memiliki  nilai  polimorfisme  lebih  dari  60%, sedangkan  strain  Nirwana  I  menunjukkan  nilai polimorfisme kurang dari 60%. Menurut Kabir et al . (2017),  tingkat  polimorfisme  yang  kurang  dari  60%, seperti halnya pada strain Nirwana I, mengindikasikan rendahnya  variasi  genetik  pada  populasi  tersebut, sehingga  apabila  akan  dilakukan  perbaikan  kualitas genetik  melalui  program  seleksi  perlu  ditambahkan sumber  genetik  baru  untuk  menghindari  tekanan
Gambar 3. Hasil amplifikasi DNA ikan nila strain Nirwana I, Anjani, dan Nirwana III menggunakan  PCR-RAPD menggunakan primer OPZ-09 (Keterangan: M = Marker; N11 – N110 = sampel ikan nila Nirwana I; A1 – A8 = Anjani 1-8; N31-N310 = Nirwana III).
Figure 3. The  result of DNA amplification for three strain of  tilapia (Nirwana I,  Anjani, and Nirwana  III) analyzed by RAPD-PCR method, using primer OPZ-09 (M = marker; N11 – 110 = Nirwana I; A1 – A8 = Anjani 1-8; N31 – N310 = Nirwana III).
Tabel 1. Kisaran  jumlah  fragmen DNA,  ukuran  fragmen    DNA, dan  jumlah  lokus  per  primer pada  ikan  nila strain Nirwana I, Nirwana III, dan Anjani menggunakan primer OPA-03, OPB-06,dan OPZ-09
Table 1. The range of DNA fragment number, DNA fragment size, and locus number for each primer on three strain of tilapia (Nirwana I, Nirwana III, dan Anjani) by using primer OPA-03, OPB-06,dan OPZ-09
Primer Kisaran jumlah fragmen Kisaran ukuran fragmen Jumlah lokus per primer
Nirwana
III Nirwana
I
Anjani Nirwana III Nirwana I Anjani OPA 03 0-14 0-13 0-14 200-2100 350- 2200 200- 2000 22 OPB 06 5-9 0-5 0-11 400-1900 650- 2400 350- 3000 23 OPZ 05 0-12 7-11 7-13 350-2200 450- 1800 400- 3000 23 Total kisaran 0-14 0-13 0-14 200-2200 350- 2400 200- 3000 68
inbreeding .  Ikan  nila  strain  Anjani  dan  Nirwana  III menunjukkan  tingkat  polimorfisme  yang  tinggi. Menurut  Kusmini et  al .  (2011),  tingginya  tingkat polimorfisme  pada  suatu  populasi  menunjukkan efektivitas  individu  dalam  proses  seleksi  ( random mating ) dan reproduksi di habitatnya.
Nilai  heterosigositas  pada  populasi  ikan  nila Nirwana  I,  Nirwana  III,  dan  Anjani  secara  berturut- turut  adalah  0,18;  0,24;  dan  0,25  (Tabel  2). Heterozigositas  merupakan  ukuran  keragaman genetik  berdasarkan  proporsi  jumlah  individu heterosigot populasi (Soewardi, 2007). Menurut Tave (1993), semakin tinggi heterosigositas maka semakin banyak  gen  yang  terlibat  dalam  menyumbangkan tingkat  kebugaran  suatu  populasi.Heterosigositas menunjukkan potensi kemampuan adaptasi terhadap
lingkungannya, karena semakin tinggi heterosigositas maka  semakin  banyak  gen  yang  terlibat  dalam menyumbangkan  tingkat  kebugaran  suatu  populasi. Kondisi keragaman genetik dipengaruhi oleh ukuran populasi  dan  sistem  pengembangbiakan  yang dilakukan. Ukuran populasi yang besar dan persilangan bebas  (acak)  dapat  mempertahankan  keragaman genetik  (Falconer  dan  MacKay,  1996).  Sebaliknya ukuran populasi yang terbatas dan silang dalam dapat menyebabkan  menurunnya  keragaman  genetik (Hallerman, 2003). Berdasarkan nilai heterigositas, ikan nila strain Nirwana I menunjukkan nilai terendah (0,18) yang  mengindikasikan  adanya  penurunan  variasi genetik  pada  strain  tersebut.  Penurunan  variasi genetik dapat disebabkan antara lain oleh penggunaan jumlah induk yang terbatas (Almeida et al . 2013).
Tabel 2. Nilai heterozigositas dan polimorfisme ikan nila strain Nirwana I, Nirwana III, dan Anjani Table 2. Heterozygosity and polymorphism of three strain of tilapia (Nirwana I, Nirwana III, dan Anjani)
Strain Heterozigositas Polimorfisme Nirwana III 0.24 67.65 Nirwana I 0.18 47.06 Anjani 0.25 70.59 Antar  populasi 0.30 88.24
Ikan  nila  Nirwana  I,  Anjani,  dan  Nirwana  III merupakan induk unggul yang dihasilkan dari program selective  breeding .  Ikan  nila  Nirwana  (Nila  Ras Wanayasa) ( Oreochromis sp. ) dirilis pada Tahun 2006 berdasarkan  SK  Menteri  Kelautan  dan  Perikanan Nomor KEP. 45/MEN/2006. Ikan nila Anjani dirilis pada Tahun  2012  berdasarkan  SK  Menteri  Kelautan  dan Perikanan Nomor KEP. 46/MEN/2012. Ikan nila Nirwana III  dirilis  pada  Tahun  2016  berdasarkan  SK  Menteri Kelautan dan Perikanan NOMOR 28/KEPMEN-KP/2016. Peredaran  ikan  nila  Nirwana  I  di  masyarakat pembudidaya relatif lebih lama dibandingkan dua strain lainnya,  dan  berdasarkan  estimasi  umur  reproduksi optimalnya, generasi ikan nila Nirwana I yang beredar saat ini sudah mencapai lebih dari 5 generasi. Pada beberapa unit pembenihan rakyat (UPR) ikan nila yang ada di Lombok, jumlah induk ikan nila Nirwana I yang digunakan di tingkat UPR umumnya terbatas. Selain itu induk yang digunakan juga merupakan keturunan tanpa melalui program seleksi, sehingga diduga terjadi inbreeding yang  menyebabkan  penurunan  kualitas genetik.  Pada  ikan  nila  Nirwana  III  dan  Anjani, manajemen induk masih dilakukan oleh institusi yang menghasilkannya yaituBalai Pengembangan Budidaya Ikan  Nila  dan  Mas,  Wanayasa,  Dinas  Perikanan  dan Kelautan  Propinsi  Jawa  Barat  dan  UPTD  Balai Pengembangan Budidaya Ikan Air Tawar, Aikmal, Nusa Tenggara  Barat. Penggunaan  jumlah  induk  yang
mencukupi  didukung  oleh  ketersediaan  sarana, prasarana, dan sumberdaya yang memadai, menjadi faktor  pendukung  terjaganya  keunggulan  kualitas genetik ikan nila Nirwana III dan Anjani.

## KESIMPUL AN
Tingkat heterosigositas dan polimorfisme ikan nila strain  Anjani  dan  Nirwana  III  yang  beredar  di masyarakat menunjukkan nilai yang tinggi, sehingga masih dapat digunakan sebagai induk/benih unggul. Adapun pada ikan nila strain Nirwana I menunjukkan nilai  heterosigositas  dan  polimorfisme  yang  rendah yang  mengindikasikan  adanya  penurunan  variasi genetik sebagai akibat adanya tekanan inbreeding atau manajemen  induk  yang  kurang  baik  sehingga direkomendasikan  untuk  tidak  digunakan  sebagai induk unggul di masyarakat.

## UCAPAN  TERIMA  KASIH
Penelitian  ini  dibiayai oleh  Anggaran  Pusat  Riset Perikanan,  Badan  Riset  Kelautan  dan  Perikanan, Kementerian Kelautan dan Perikanan. Ucapan terima kasih  disampaikan  kepada  Kepala  Dinas  Perikanan Nusa Tenggara Barat dan Kepala Balai Pengembangan Budidaya  Ikan  Wanayasa  Jawa  Barat,  atas  data  dan informasi yang diberikan.
Evaluasi Kualitas Genetika Ikan Nila (Oreochromis niloticus)....  (Raden Roro Sri Pudji Sinarni Dewi)

## DAFTAR  PUSTAKA
Almeida, F.S., Fungaro, M.H.P., Sodre, L.M.K. (2001). RAPD and isoenzyme analysis of genetic variability in  three  allied  species  of  catfish  (Siluriformes: Pimelodidae) from the Tibagi River, Brazil, Journal of Zoology, 253( 1), 113-120.
Almeida,  F.S.,  Lopes,  C.M.,  Orsi,  M.L.,  Sirol,  R.N., Sodre, L.M.K. (2013). Genetic monitoring by RAPD markers  for  repopulation  programs  of Salminus brasiliensis (Pices,  Characiformes).  2013, Acta Scientiarum, 35(2), 119-126.
FAO. (2017). International demand for tilapia steady, though  US  market  weak  with  discouraging prices.GLOBEFISH-Analysis  and  information  of world  fishtrade.http://www.fao.org/in-action/ globefish/market-report/resource-detail/en/c/ 107669.
Falconer,F.S.  and  MacKay,  T.F.C.  (1996). Introduction to Quantitative Genetics , 464. Longman, England. Fitzsimmons, K. (2012). The success story of tilapia industry;  current  and  future  trends  of  the  US seafood  market.  Nong  Lam  University  –  Ho  Chi Minh. Vietnam presentation in 28 June 2012 . Ganaie,  H.A.  &  Ali,  M.N.  (2016).  Studies  on  the genetic variability of three fish species ( Cyprinus carpio specularis , Cyprinus carpio communis and Onchorhynchus mykiss )  collected  from  Kashmir (India) using random amplified polymorphic DNA (RAPD)  technique), Asian  Journal  of  Animal Sciences,  10(1), 59-67.
Geng, S. M., W. Shen, G. Q. Qin, X. Wang, S. R. Hu, Q. Wang  and  J.  Q.  Zhang.  (2002).  DNA  fingerprint polymorphism  of  3-goatpopulations  from  China Chaidamu  Basin.  Asian-Aust, Journal  of  Animal Science, 15 (8), 1076-1079 .
Gusmiati,  Restu,  M.,  &  Pongtuluran.  (2012).  Seleksi primer untuk analisa keragaman genetik jenis bitti (Vites coffassus), Jurnal Perennial, 8, 25-29. Gustiano,  R.,  Oktaviani,  T.,  Soelistyowati,  D.T., Kusmini, I.I., Wahyutomo, Huwoyon, G.H. (2013). Analisis  ragam  genotip  RAPD  dan  fenotip  truss
morfometrik pada tiga populasi ikan gabus [ Channa striata (Bloch,  1793)], Berita  Biologi,  12(3), 325- 333.
Hadie,  W.,  Rasidi,  Hadie,  L.E.  (2016).  Implementasi dan evaluasi dampak rilis varietas ikan terhadap peningkatan produksi perikanan, Prosiding Forum Inovasi Teknologi Akuakultur 2016, 69 – 80 . Hallerman, E.M. (2003). Population Genetics: Principles and  Applications  for  Fisheries  Scientist ,  458. American  Fisheries  Society.  University  of California,  USA.
Kabir,  Md.  A.,  Rahman,  M.S.,  Begum,  M.,  Faruque, Md., H. (2017). Genetic diversity by RAPD in four populations of rohu Labeo rohita , Croatian Journal of  Fisheries, 75, 12-17.
Kusmini,  I.I.,  Gustiano,  R.,  &  Mulyasari.  (2011). Karakterisasi  genetik  ikan  Kelabau  ( Osteochilus kelabau ) dari berbagai lokasi di Kalimantan Barat menggunakan analisis RAPD, Berita Biologi, 10(4), 449-454 . Soewardi, K. (2007). Pengelolaan keragaman genetik sumber daya perikanan dan kelautan. Departemen Manajemen  Sumberdaya  Perairan .  Institut Pertanian Bogor. Bogor. 153 hlm.
Tave, D. (1993). Genetics for Fish Hatchery Managers , 415. Kluwer Acad. Publ. Netherland.
Wasko, A.P. & Galleti Jr., P.M. (2002). RAPD analysis in the neutropical fish Brycon lundii: genetic diversity and  its  implications  for  the  conservation  of  the species, Hydrobiologia, 474, 131-137 .
Yoon, J. M. and H. Y. Park. (2002). Genetic similarity and variation in the cultured and wild crucian carp ( Carassius  carassius )  estimated  with  random amplified  polymorphic  DNA, Asian  -  Australian Journal of Animal Science, 15 (4), 470-476 .
Yoon,  J.M.  &  Kim,  J.Y.  (2004).  Genetic  differences within and between populations of Korean catfish (S.  Asotus)  and bullhead  (P.  Fulvidraco)  analysed by RAPD-PCR, Asian - Australian Journal of Animal Science, 17(8), 1053-1061 .