Mae'r llyn, sydd ag arwynebedd o 11.1ha (29.8 acer), yn Safle o Ddiddordeb Gwyddonol Arbennig oherwydd presenoldeb rhai rhywogaethau prin o blanhigion dŵr. Fe'i rhennir yn ddau ran gan gob ar yr ochr ddwyreiniol. Mae Afon Cafnan yn tarddu yn y llyn.