బాలకృష్ణ భారతీయ పౌరసత్వానికి సంబంధించి, తన విద్యార్హతల నేపథ్యంలో అనేక వివాదాల్లో ఎదుర్కొన్నాడు. 2011 లో సీబీఐ అతని మీద ఫోర్జరీ, మరియు మోసం అభియోగాలు మోపింది. వారి అభియోగం ప్రకారం ఆయనకు జారీ చేసిన పాస్ పోర్టు నకిలీ హైస్కూల్ మరియు గ్రాడ్యుయేషన్ పత్రాల ఆధారంగా ఇచ్చారని, అతను అనుమతి లేకుండా పిస్టల్ ను కలిగి ఉన్నాడని పేర్కొంది. తరువాత ఎన్ ఫోర్స్ మెంట్ డైరెక్టరేట్ మనీ లాండరింగ్ కు సంబంధించి ఒక కేసు పెట్టింది, కానీ 2 సంవత్సరాల విచారణ తర్వాత ఆధారలేమీ దొరకకపోవడంతో 2014 లో కేసును మూసేసింది. ఇంకో కేను ఆయన మీద, ఆయనకు నకిలీ ధృవపత్రం ఇచ్చినట్టుగా చెప్పబడుతున్న ఒక సంస్కృత కళాశాల ప్రింసిపల్ నరేష్ చంద్ర ద్వివేది మీద నమోదు చేశారు. ఈ కేసులన్నీ 2014 లో మూసివేయబడ్డాయి.