Jawa Timur uga dikenal sebagai propinsi sing memiliki sejumlah pondok pesantren ternama. Sedikitnya terdapat 1.500 pondok pesantren sing menyebar nang hampir semua kabupaten. Pondok pesantren Gontor adalah sebuah pondok pesantren (ponpes) modern sing terdapat nang Ponorogo. Kabupaten Jombang dikenal sebagai kota santri, karena memiliki pondok pesantren sing cukup banyak, nang antaranya Ponpes Tebuireng lan Ponpes Darul Ulum.