Pelabuhan Internasional Hub Tanjung Perak adalah pelabuhan utama sing berada nang Surabaya. Pelabuhan berskala nasional nang Jawa Timur meliputi Pelabuhan Gresik nang Kabupaten Gresik, Pelabuhan Tanjung Wangi nang Kabupaten Banyuwangi, Pelabuhan Tanjung Tembaga nang Kota Probolinggo, Pelabuhan Pasuruan nang Kota Pasuruan, Pelabuhan Sapudi nang Kabupaten Sumenep, Pelabuhan Kalbut nang Kabupaten Situbondo, Pelabuhan Sapeken nang Kabupaten Sumenep, Pelabuhan Paiton nang Kabupaten Probolinggo, Pelabuhan Bawean nang Kabupaten Gresik, serta Pelabuhan Kangean nang Kabupaten Sumenep