Perguruan tinggi negeri termuda nang Jawa Timur adalah Universitas Trunojoyo, sing terdapat nang Kabupaten Bangkalan. Untuk perguruan tinggi kedinasan, nang Surabaya terdapat Akademi Angkatan Laut (AAL), lan nang Malang terdapat Sekolan Tinggi Akuntansi Negara (STAN). Malang dikenal dengan sebutan Kota Pelajar, karena banyaknya perguruan tinggi nang kota ini. Perguruan tinggi swasta terkemuka nang Jawa Timur antara lain Universitas Kristen Petra lan Universitas Surabaya nang Surabaya, serta Universitas Muhammadiyah lan Universitas Merdeka nang Malang.