肯尼迪的一生都在与各种疾病做着斗争。在三岁生日前三天，他患上了恶性猩红热。1930年秋天开始，他患上了一种无法确诊的疾病，后来确诊为愛迪生氏病）。这种疾病使得他的内分泌发生紊乱，免疫力降低。由於担心自己的健康问题影响到政治前途，所以一直以来，肯尼迪都在严格保密着自己的医疗史，甚至在他遇刺之后也不为人知。他一直以類固醇类药物来抵御爱迪生氏症带来的身体虚弱的影响，并依赖大量的镇静剂、止痛药、睾丸素、抗生素和安眠药等来对付其他并发症。但另一方面，他的健康问题却一直是公众和媒体关注的话题之一。