Waduk Penjalin kiye enggone nang tengah-tengah desa Winduaji, kira-kira 2,4 km arah kidul ibu kota Kecamatan Paguyangan, Brebes. Sekang ibu kota kecamatan meng arah kidul jurusan Purwokerto, nek wis tekan nang desa Winduaji mbelok tengen meng lokasi waduk. Sekang kota Paguyangan adoeh kira-kira 6 km, nek sekang kota Bumiayu 12 km. Angger sekang Purwokerto ± 30 km.