Katoppo ngrampungaké studi teologiné taun 1963 ing Sekolah Tinggi Téyologi Jakarta kanthi gelar Sarjana Muda Theologia, lan taun 1977 saka sekolah iku uga nampa gelar Sarjana Theologia. Tahun 1978 Marianne mèlu pendhidhikan ing Institut Ekumenis, ing Bossey, Swiss, lan taun 1992 nampa gelar theol.lic.