దీనిని ఇంతకు ముందు, నగర రైల్వే స్టేషనును కేవలం మంగళూరు రైల్వే స్టేషనుగా పిలిచినప్పుడు, కంకనాడి రైల్వే స్టేషను అని పిలిచేవారు. తరువాత రెండు స్టేషనులు మధ్యన అస్పష్టతను నివారించడానికి వరుసగా మంగుళూరు జంక్షన్, మంగళూరు సెంట్రల్ అనే పేరులతో మార్చబడ్డాయి.