葛城美里與碇真嗣有一些類似，雖然她的年紀大約是他的兩倍。她發現碇真嗣對她有安定與廣泛的影響。在漫畫中，當碇真嗣首次試圖逃離NERV時，葛城美里對他坦白說她帶他來這裡不是因為責任感，而是因為她感到寂寞。對她來說，碇真嗣與其它人相處之間的問題很明顯是自己的照鏡，雖然他們各自的心理狀態大部相同，而且似乎深陷在刺蝟兩難（Hedgehog's dilemma）當中。在惣流·明日香·蘭格雷搬進來以後，葛城美里發現自己經常必須擔任明日香與真嗣之間的和事佬。葛城美里與碇真嗣之間也有曖昧的關係存在，雖然這個部份都僅止於暗示。（除了在新世紀福音戰士劇場版：THE END OF EVANGELION中，葛城美里給于碇真嗣一個「成人之吻」。然而在當時的情況下，這個吻也可能有多重的涵意）。更明顯的是：葛城美里試圖同時成為碇真嗣的朋友及母親，並且在指揮EVA駕駛員之間取得平衡。在系列故事即將結束時，葛城美里與碇真嗣受到的創傷使他們之間漸行漸遠，導致碇真嗣無法安慰葛城美里的心情，而她也無法安慰真嗣的悲傷（在綾波零死去的隔天）。在這些努力之後，她感到後悔：她在最後都無法成為真嗣的母親。