90-yillarning dastlabki yillarida film ishlab chiqarish birmuncha kamaydi. Ammo 1996 yil ""Oʻzbekkino"" davlat aksionerlik kompaniyasi tashkil etilgach, kinostudiya shu tashkilot tizimida yana faol ishlay boshladi. Kinostudiyada bir yilda 40 dan ortiq turli janr va mavzuda filmlar yaratiladi. Bundan tashqari, xalq taʼlimi vazirligi va turli tashkilotlarning buyurtmalariga binoan ham filmlar ishlab chiqariladi. Mustaqillik oʻzbek hujjatli kinochilari uchun avvallari norasmiy tarzda taqiqlangan bir qancha mavzularni yoritish imkonini berdi. Ayni shu yillarda ""Istiqlol fidoyilari"" rukni tashkil qilindi va ""Behbudiy"", ""Fitrat"", ""Munavvarqori Abdurashidxonov"", ""Said Ahroriy"", ""Istiqlolning buyuk yoʻli"", ""Abdulla Qodiriyning yurgan yoʻllari"" (hammasining rej.i Gʻ.Shodmonov), ""Choʻlpon"" (rej.i Sh. Mahmudov) kabi hujjatli filmlar yaratildi. Ayniqsa, kinostudiya ijodkorlari tomonidan yaratilgan ""Ruh"" (rej. B. Muzaffarov), ""Qorakoʻl"", ""Qogʻoz uycha"", ""Ular Germaniyada oʻqigan edilar"" (Sh. Mahmudov), ""Tashnalik"" (T.Yunus) va boshqalar filmlar turli festivallar sovriniga sazovor boʻldi. Milliy qadriyatlarimizni xalq ommasiga yanada keng tanishtirish maqsadida ""Ahmad Yassaviy"" (rej. J. Qosimov), Ahmad Fargʻoniyga bagʻishlangan ""Ikkinchi umr"" (J.Ishoqov), ""AlBuxoriy"" (F.Fayziyev), Margʻinoniyga bagʻishlangan ""Fikh olamining sultoni"" (X.Valiyev) kabi filmlar ishlandi.