荃灣站與西鐵綫的荃灣西站並非為正式的轉車站，乘客若在兩站間轉乘，無論使用八達通還是單程車票，均需當作兩段車程處理，並繳納再入閘收費。雖然荃灣站與西鐵綫荃灣西站並非轉乘車站，但是兩站之間有專線小巴 95K（八達通或屯門－南昌全月通可免費轉乘西鐵綫）及 301M（八達通轉乘西鐵綫優惠）連接，而步行全程大概需要30分鐘。現在荃灣行人天橋的擴建計劃以建成，將把荃灣西站及荃灣站直接以天橋接駁，預計可將步行時間縮短至15至20分鐘，於2013年4月29日全線開放。惟因荃灣運輸大樓的拆卸，現時此通道連接荃灣西站的用途變得有名無實（詳見荃灣行人天橋網絡）。