2017年11月9日，行政院會通過勞基法部分條文修正草案，賴清德表示一例一休實施以來「企業反映經營困難」，勞工也喪失加班機會，政府面對這些問題不該繼續視而不見，秉持蔡英文總統「既保障勞工權益，也給予資方經營彈性」的指示進行修法。賴清德指出修法的兩重點「四個不變」（正常工時不變、週休二日不變、加班總工時不變、加班費率不變）、「四個彈性」（加班彈性、排班彈性、輪班間區隔彈性、特休運用彈性）。