Nëpërmjet komunikimit publik, intelektual dhe politik, FMSH synon të ruajë imazhin historik, kulturor dhe fetar të myslimanëve në Shqipëri dhe të fesë Islame dhe thyejë tabutë e politikës në Shqipëri dhe interesave te huaja qe operojnë ne vend, te cila në vitet e fundit e kane portretizuar Islamin si rrezik për Shqipërinë dhe integrimin e shqiptarëve në Evropë. FMSH refuzon dhe denoncon klithjet e racistëve dhe islamofobëve në Shqipëri të cilët kërkojnë të kthejnë myslimanët shqiptarë në të krishterë, grekë etj.