בעונת 2006/2007 נחל לוי אכזבה בליגה ובגביע כאשר סיים את העונה במקום החמישי והודח מהגביע בשלב רבע הגמר, אך בגביע אופ""א נחל הצלחה כאשר הוביל את מכבי חיפה לשלב שמינית הגמר לאחר ניצחון מפתיע על צסק""א מוסקבה. בשמינית הגמר נכנע עם קבוצתו לאספניול הספרדית.