Соли 1991 барои идома додани таҳсил ба шаҳри Маскав омад ва ҳамон сол ба аспирантураи Донишгоҳи давлатии Маскав дохил шуд. Қобил ба ёдоварист, ки шарикдарсаш Олег Дерипаска буд. Соли 1994 рисолаи номзадӣ дифоъ карда, унвони номзади илмҳои физикаву математика гирифт ва дар Донишгоҳи давлатии Маскав ходими илмӣ шуд. Аммо музди меҳнаташ кам буд ва Молдаҷонова маҷбур шуд, ки аз чунин кор барояд. Дар ҳамин давра Олег Дерипаска корхонаи «Алюминпродукт» бунёд кард ва Молдаҷоноваро ба ин корхона даъват намуд. Молдаҷонова қарор дод, ки ба Дерипаска кор карда, аз безарӣ халос шавад. Молдаҷонова ба «Алюминпродукт» омаду аввал ба сифати котиба кор мекард. Лекин хеле зуд ӯро ба вазифаи баландтар гузарониданд. Соли 2004 Молдаҷонова вазифаи мудири иҷроияи ширкати “Базовий Элемент” ба ӯҳда гирифт. Солҳои 2005–2009 ӯ директори генералии ин ширкат буд. Моҳи маи соли 2009 аз барқарор шудани Ҳукумати Қазоқистон Молдаҷонова узви шӯрои мудирияти ширкати «Самрук-Казина» интихоб гардид.