Caruana rritorna ma Hibernians fl-istaġun 2006–07. Il-mixja tas-self kienet tħallset, Caruana ikkonsolida l-ewwel post fit-tim, li għamel 19-il apparenza, iżda ma skorjax gowl filwaqt li Hibernians lestew fil-ħames pożizzjoni tal-Premier League Malti. Huwa ma kiseb l-ewwel togħma tiegħu ta 'suċċess hekk if Hibernians assiguraw it-Tazza Maltija għat-tieni staġun konsekuttiv.