Nakon zločina u Stupnom Dolu koji su počinile jedinice HVO-a, brigada kojom je komandovao Nesib Malkić je dobila zadatak da ovlada Varešom. Poginuo je tokom pripreme ovog zadatka, za vrijeme komandantskog izviđanja 25. oktobra 1993. godine na Crnoriječkoj visoravni. Ukazom Predsjedništva RBiH, 6. decembra iste godine dodijeljen mu je zlatni ljiljan. 1994. godine, za herojski doprinos u odbrambeno-oslobodilačkom ratu, izuzetno junaštvo i samoprijegor, Nesib Malkić je posthumno odlikovan ordenom heroja oslobodilačkog rata. 1996. godine posthumno je unaprijeđen u čin brigadira Armije RBiH. Jedna ulica u Tuzli nosi naziv po njemu, i gradski bulevar u Živinicama, takođe.