Nadzemná stonková hľuza vzniká zhrubnutím nadzemnej stonky (napr. reďkovka, kaleráb). Stonkovými hľuzami sú aj zhrubnuté a dužinaté stonky niektorých sukulentov (kaktusy), ktoré vo svojom bohato vyvinutom pletive uchovávajú vodu aj niekoľko mesiacov.