Pada 19 November 2007, selepas keluar dari hospital, Khieu Samphan telah ditahan oleh Tribunal Kemboja kerana jenayah perang dan hak asasi manusia. Beliau adalah pemimpin kanan ke-5 yang ditahan oleh Tribunal Kemboja kerana pembunuhan beramai-ramai Killing Field 1975-1979 yang menyebabkan kematian dan kebuluran seramai 1.7 juta penduduk.