Sekretariat Badan, ingkang gadhah tugas paring pelayanan teknis lan administratip dhateng sadaya ékan organisasi ing lingkungan BPHN. Déné kanggé nindakaken tugasipun, Sekretariat Badan gadhah fungsi ing antawisipun kanggé nindakaken koordinasi lan nyusun rencana, program lan anggaran; ngemunah urusan kepegaweyan, ngemunah urusan kauangan, ngemunah barang milik nagara; nindakaken evaluasi lan nyusun lapuran BPHN, saha ngemunah urusan umum. Déné sekretariat Badan kapérang dados, pérangan program dan pelaporan, pérangan kepegawaian, pérangan keuangan, pérangan pengelolaan barang milik nagara, pérangan umum, lan golongan kalungguhan fungsional.