Vidič strelil svoj prvý gól 14. októbra 2006 proti Wiganu Athletic, United vyhrali 3:1. Svoj druhý gól strelil 4. novembra pri víťazstve 3:0 Portsmouthu na domácom štadióne Old Trafford. Svoj prvý gól v Lige Majstrov strelil 6. decembra Benfice Lisabon v zápase, ktorý Manchester vyhral 3:1.