Fl-istaġun 1986-87, it-tim kien fortunat li jilagħab fl-ewwel diviżjoni mat-timijiet Għawdxin. Żebbuġ lagħbu tajjeb fl-ogħla diviżjoni meta rebħu 2-0 kontra St. Lawrence Spurs FC grazzi lil Frans Saliba għaż-żewġ gowls. Għaldaqstant, Frans Saliba kien l-ewwel plejer ta' Żebbuġ Rovers li skorja fl-ewwel diviżjoni. Madankollu, Żebbuġ kellhom jilagħbu fi Grupp B u lestew fir-raba post u kellhom jilagħbu fil-Grupp tar-relegazzjoni fit-tieni nofs tal-kampjonat. Fit-tieni Grupp, Żebbuġ kellhom riżultati tajbin, madankollu ma kinux biżżejjed biex jibqgħu fl-ewwel diviżjoni anki jekk daħlu fit-tielet post. Għal darb'oħra fit-tieni diviżjoni Żebbuġ Rovers, fl-istaġun 1987-88, kisbu ħames rebħiet u 5 telfiet. Fl-istess staġun, Żebbuġ bdew flimkien ma Munxar b'punt wieħed inqas, meta Victoria U. u St. Lawrence b'żewġ punti inqas, dejjem kif kienu kklassifikati fl-istaġun preċedenti.