भिन्न कृषि जलवायु परिस्थितियों को को कवर करने वाले प्रत्येक कॉफ़ी उत्पादक क्षेत्र के लिए अनुसंधान हेतु निम्नलिखित पांच अनुसंधान स्टेशन हैं जो केन्द्रीय कॉफ़ी अनुसंधान परिषद संस्थान के नियंत्रण में कार्य करते हैं। कर्नाटक के कूर्ग जिले में, कॉफ़ी अनुसंधान उप-स्टेशनम, शेताली की स्थापना 1946 में की गयी। एस उप स्टेशन एमिन एक सुसज्जित प्रयोगशाला है, जो 131 हेक्टेयर (320 एकड़) का क्षेत्रफल कवर करती है, जिसमें से 80 हेक्टेयर (200 एकड़) कॉफ़ी अनुसंधान गतिविधियों के लिए निर्धारित है। आन्ध्र प्रदेश के विशाखापट्नम जिले में आर वी नगर में क्षेत्रीय कॉफ़ी अनुसंधान स्टेशन पूर्वी तट पर उड़ीसा को भी कवर करता है। इस अनुसंधान स्टेशन की स्थापना 1976 में की गयी थी, यह गैर-पारंपरिक शेत्रों में कॉफ़ी के विकास में अपनी सेवाएं प्रदान करता है, इसके पास कॉफ़ी बागवानी के लिए 30 हेक्टेयर (74 एकड़) का क्षेत्रफल है। इस क्षेत्र में कॉफ़ी की शुरुआत का उदेश्य था, वन क्षेत्र में 'पोडू' विकास के तहत फसलें उगाने के लिए आदिवासी आबादी को हटाना. इससे न केवल वन पारिस्थितिकी का सरंक्षण होगा बल्कि इससे क्षेत्र की आदिवासी जनसंख्या की आर्थिक स्थिति में सुधार होगा. क्षेत्रीय कॉफ़ी अनुसंधान स्टेशन, चुनदाले गांव, वायनाड जिला, केरल की स्थापना प्राथमिक रूप से क्षेत्र में उचित तकनीक के विकास के लिए की गयी, जहां रोबस्टा प्रमुख फसल है। केरल को कॉफ़ी की रोबस्टा किस्म के लिए देश का दूसरा सबसे बड़ा कॉफ़ी उत्पादक राज्य माना जाता है। स्टेशन 116 हेक्टेयर (290 एकड़) का क्षेत्रफल कवर करता है, जिसमें से फार्म के 30 हेक्टेयर (74 एकड़) क्षेत्रफल में एक प्रयोगशाला है, जहां अनुसंधान किया जाता है। तमिल नाडू के डिंडीगुल जिले में थान्दिगुदी में क्षेत्रीय कॉफ़ी अनुसंधान स्टेशन (RCRS) अनुसंधान केन्द्र की स्थापना का उद्देश्य था तमिल नाडू में कॉफ़ी बागानों के क्षेत्र में बागवानी की उचित प्रथाओं का विकास करना. जहां देश के अन्य क्षेत्रों के विपरीत उत्तर पूर्वी मानसून के दौरान काफी वर्षा होती है। यह स्टेशन 12.5 हेक्टेयर (31 एकड़) क्षेत्रफल में फैला है, जिसमें प्रयोगशाला सुविधाओं से युक्त एक 6.5 हेक्टेयर (16 एकड़) का अनुसंधान फार्म है। आसाम के कार्बी एंग्लोन जिले में दिफू, क्षेत्रीय कॉफ़ी अनुसंधान स्टेशन की स्थापना 1980 में उत्तरपूर्वी क्षेत्र में की गयी। जो कॉफ़ी की बागवानी में शिफ्टिंग और झूम प्रथा के लिए आर्थिक विकल्प उपलब्ध कराता है। इस प्रथा का उपयोग वनों की पहाड़ियों में आदिवासियों के द्वारा बड़े पैमाने पर किया जाता है। जो इस क्षेत्र की अर्थव्यवथा के संरक्षण के लिए एक चिंता का विषय था। यह क्षेत्रीय स्टेशन 25 हेक्टेयर (62 एकड़) के क्षेत्रफल में फैला है।