Qeliza e Protozoarëve është e përbërë nga protoplazma e cila nga jashtë është e mbështjellë me një membranë , kurse brenda saj gjendet së paku një bërthamë . Pjesa jashtme e protoplazmës është më e dendur dhe quhet Ektoplazmë , ndrësa pjesa e brendshme është më e hollë dhe quhet Endoplazmë. Disa Protozoa nuk kanë fare membranë , pra mund ta ndryshojnë formën vazhdimisht. Mbulesa e trupit te këto është cipë e hollë plazmatike , pos cipës së hollë , kanë edhe membarnë të hollë dhe elastike dhe quhet Pelikulë. Shumica e Protozoarëve në sipërfaqe të trupit tajojnë guaskë.Poashtu janë të veçuara organelet qelizore . Organelet për tretje të ushqimit - vakuola tretëse , organelet që rregullojnë sasinë e ujit brenda qelizës - Vakuolat Kontraktile , si edhe organelet për lëvizje - Pseudopodet , Ciliet dhe Kërbaçët.