Sa buong kasaysayan nito, ang unibersidad ay sumailalim sa pagbabago ng pangalan: Indochinese University (itinatag noong 1906); Vietnam National University (Nobyembre, 1945); at Unibersidad ng Hanoi (Hunyo, 1956). Noong 1993, nilikha ang Pambansang Unibersidad ng Vietnam, Hanoi sa pamamagitan ng pagsasanib ng Unibersidad ng Hanoi, Hanoi University of Education at Kolehiyo ng mga Banyagang Wika (College of Foreign Languages).