1958年開始恢復返哈爾濱到牡丹江之間嘅複綫，到1988年底完成。而家條鐵路從哈爾濱到牡丹江、以及代馬溝到穆棱呢兩段係複綫，其餘都係單綫。爲咗擴大鐵路運能，亦整過杜草隧道。原先嘅杜草隧道長3849公里，1949年之前係中國最長嘅鐵路隧道，到1961年4月，開工整上行隧道，不過遞年停咗，直到1975年5月1號重新開工，1978年底整完，整完後長3900公里，係濱綏鐵路最長嘅隧道；而下行隧道喺1985年9月開整，1988年12月21號整掂。同時從1950年代開始到1990年，將成條鐵路嘅鋼軌換成50型。1993年8月1號，高嶺子綫停運，所有列車都運魚池綫（開道繞行綫）行，1996年高嶺子綫嘅鐵軌拆曬，啲站都廢咗。2004年，中國鐵路第五次提速，當年8月舍利屯站、白帽子站停用。2006年，鐵道部同黑龍江省發佈嘅十一五規劃入邊，濱綏鐵路牡丹江到綏芬河段嘅擴能改造納入到國家規劃，計劃縮短路程49公里，兼且複綫化、電氣化。