Le Cerneux-Péquignot umfasst näb em glychnamige Dorf (1'070 m ü. M.) d Wyler Bas du Cerneux (1'078 m ü. M.), Le Gigot (1'080 m ü. M.) un dr sidli Dail vu Le Prévoux (1'077 m ü. M.). Dr Bann umfasst 61,3 % landwirtschaftligi Flechi, 31,9 % Wald un 6,7 % Sidligsflechi. Nochbergmaine vu Le Cerneux-Péquignot sin La Brévine, La Chaux-du-Milieu un Le Locle im Kanton Nöueburg un Villers-le-Lac, Montlebon un Grand’Combe-Châteleu z Frankrych.