Po roku 1918 sa jej činnosť prelínala s činnosťou novozaloženej Matice slovenskej a Slovenského národného múzea. V roku 1960 bola zrušená, pričom jej muzeálne zbierkové fondy prešli do fondov Slovenského národného múzea a archívne fondy a zbierky prevažne do Štátneho slovenského ústredného archívu v Bratislave, menšia časť do iných štátnych archívov.