ড. ফারুক ১৯৮৪ সালে ঢাকা বিশ্ববিদ্যালয়ের প্রাণরসায়ন ও অণুপ্রাণবিজ্ঞান বিভাগে প্রভাষক হিসেবে যোগদান করেন। ১৯৮৮ সালে তিনি সহকারী অধ্যাপক হিসেবে পদোন্নতি পান। ২০১০ সাল থেকে তিনি নর্থ সাউথ বিশ্ববিদ্যালয়ে খন্ডকালীন শিক্ষক হিসেবে কাজ করেন।