Mėslėnama, ka bažninčė Varniūs ėšbūdavuota aple 1416 m. Ana 1417 m. konsekrouta. 1524 m. parakvėnē bažninčē duovenuots Saušėlė suoda. Vielībesnė bažninčė statīta 1764 m. 1804 m. pakeistė anuos sėinuojē. Varniūs nu 1803 m. klebuonava poets Kėprėjuons Jūzaps Nezabėtauskis-Zabītis (1779–1837). Ėškielos ėš Varniū vīskopa, Šv. Aleksendra bažninčė 1864 m. patapa Senūju Varniū parakvėnė bažninčė. Anā priklausė Varnelės dešėniuo posie gīvenōs katalėkā. Bažninčė 1949 m. paversta sandielio, vieliau krautovė. 1991 m. grōžinta katalėkams.