U posljednjih nekoliko godina, svaka slijedeća generacija tehnologija za sekvenciranje već je postala dostupna alat za poznavanja i romana fuzije gena u širokim razmjerima genoma. Međutim, preduslov za otkrivanje velikih razmjera je okončanje uparenog sekvenciranje transkriptoma ćelije. Fokus u detekciji fuzije gena je uglavnom usmjeren prema analizi podataka i vizualizaciji. Neki istraživači već su razvili novi alat pod nazivom transkriptom Viewer (TViewer) koji direktno visuzlizira otkrivene fuzije gena na nivou transkripta.