Fukuoka ei ole läheskään niin seismisesti aktiivinen kuin monet muut Japanin osat, mutta Fukuokassakin koetaan maanjäristyksiä toisinaan. Voimakkain järistys sataan vuoteen tapahtui 20. maaliskuuta 2005 kello 10:53, jolloin järistyksen teho japanilaisella skaalalla oli heikko 6, kun maksimi olisi 7. Järistyksen seurauksena yksi ihminen kuoli jäätyään romahtavan seinän alle ja yli 400 ihmistä loukkaantui. Järistyksen keskipiste oli Genkain meressä, Fukuokan keskustan halki kulkevan Kegon halkeaman ennen tuntemattomassa haarassa. Genkain saari, Nishi-kun osa, vaurioitui kaikista raskaimmin, ja kaikki sen asukkaat siirrettiin turvaan Fukuokan Fukuoka Kokusai Centeriin. Jälkijäristykset jatkuivat ajoittain seuraavien viikkojen aikana samaan aikaan, kun rakentajat työskentelivät vaurioituneiden rakennusten korjaamiseksi. Perinteiset japanilaiset talot kärsivät raskaita vaurioita, erityisesti Daimyōn ja Imazumin alueilla, joissa useita taloja purettiin. Vakuutuskorvausten arvioitiin nousseen noin 15,8 miljardiin jeniin (noin 100 miljoonaa euroa).