과거에 수산, 해운, 항만의 건설·운영, 해양 조사, 선박·선원의 관리, 해양 환경 보전, 해양 과학 기술, 해양 자원 및 해난 심판에 관한 사무를 관장하는 중앙행정기관인 해양수산부가 존재했었다. 1996년 8월 8일 수산청과 해운항만청을 통합하여 발족하였으며 2008년 2월 28일 국토해양부로 개편되어 폐지되었다.