ב-6 בדצמבר 2013 חזר לוי לקדנציה שנייה בבית""ר ירושלים, וחתם בקבוצה עד סוף העונה עם אופציה לעונה נוספת. בתום אותה העונה סיים לוי את תפקידו כמאמן בית""ר.