Scarponi läks 2017. aasta 22. aprilli hommikul oma Itaalias Marches Filottranos asuvast kodust jalgrattaga treeningsõidule. Ristmiku ületades sai ta veoauto löögi tagajärjel surma, kuna 57-aastane kohalik veoauto juht ei märganud teda.