Ants Nummerti uurimisvaldkonnad on udara- ja nisakirurgia, koduloomade seedefüsioloogia, adaptatsioon biotehnoloogias ja ensüümpreparaatide kasutamine farmakoteraapias. ENSV riiklik preemia (1987; kollektiivi juht). 70 teadustrükist, 35 aimeartiklit.