Ngày 13 tháng 5 năm 2008, ông bị công an khởi tố vì tội ""lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ"" trong vụ PMU18. Ông bị khởi tố cùng với thượng tá Đinh Văn Huynh, điều tra viên cao cấp, trưởng phòng 9 C14 và 2 nhà báo của báo Thanh Niên, và báo Tuổi Trẻ . Kết quả, ông bị kết tội ""Cố ý làm lộ bí mật công tác"" và bị phạt mức ""cảnh cáo"", Đinh Văn Huynh bị phạt mức 1 năm tù cùng về tội danh trên .Ngoài ra, ông còn bị vu khống đã sàm sỡ với vợ của bị can trong vụ PMU 18, có hành vi trái với tư cách đạo đức nghề nghiệp. Trong số các phóng viên bị truy tố về tội “Lợi dụng các quyền tự do dân chủ xâm phạm lợi ích nhà nước, quyền, lợi ích hợp pháp của tố chức, công dân”, Hội đồng xét xử tuyên phạt bị cáo Nguyễn Việt Chiến (báo Thanh Niên), mức án 2 năm tù; Nguyễn Văn Hải (báo Tuổi Trẻ), bị phạt mức 24 tháng cải tạo không giam giữ.