開禧北伐，宋金勝敗有差，然杭城頗以為懼，旦夕若宮闈將不保，彌遠力主議和，寧宗卒聽之，遂誅侂胄於玉津園。事成，遷禮部尚書兼國史實錄院修撰。皇太子立，以彌遠為太子詹事，師也。奏請簡閱沿江士卒，勉厲將帥，繕城堡，葺器械，儲糗糧，居安思危，以備緩急。嘉定元年拜右丞相，主嘉定和議，金為叔，宋為侄。增歲幣至三十萬兩，絹三十萬匹。犒軍銀三百萬兩。初韓侂胄為相，斥理學為偽學，殺趙汝愚，彌遠作相，盡罷其舊政，召還故老被貶者，朱熹、周敦頤、程顥、程頤、張載諸先賢，悉加追崇。以理學為國學，實自彌遠始。寧宗崩，太子竑素忌彌遠，彌遠恐其異己，遂與鄭清之謀，擁立宗子貴誠為皇帝，是為理宗。太子竑出居湖州，旋賜死。紹定六年拜太師。旋薨，贈中書令，追封衛王，諡忠獻。彌遠作相二十六載，寧宗朝在閣十七載，理宗朝獨相九年，朝綱獨斷，國器廢立，決於其手，薛極、胡矩、聶子述、趙汝述為其黨，李知孝、梁成大、莫澤為其羽，有忤彌遠者，三人交相擊之，謂之三兇。故朝中異己殆盡，怨望固有焉。賴擁立理宗之功，薨後，猶有「公忠翊運，定策元勳」之譽。彌遠侄嵩之，端平中宰相。