Protozoarët shumëzohen në dy mënyra , shumëzimi seksual dhe aseksual . Shumëzimi Aseksual bëhet me anë të ndarjes , por dallojmë disa mënyra të shumëzimit aseksual : Ndarja në dysh-binare , ndarja multiple apo e shumëfishtë te protozoarët njëbërthamorë , ndryshe quhet edhe Shizogonia . Plazmotomia ndarja e shumëfishtë e shumëbërthamorëve , si dhe bulimi(bulëzimi) Shumëzimi Seksual kryhet në këto mënyra : Kopulimi apo Singamia , me rast që nga një protozoa daling gametet femërore dhe nga një tjetër gametet mashkullore ,me bashkimin e tyre formohet zigoti.Formë tjetër është edhe Konjugimi i cili paraqitet te Ciliatët (Parameci).Gjatë këtij procesi dy papuçëza bashkohen në pjesët gojore të tyre. Në këtë vend formohet ura protoplazmatike dhe në këtë vend bëhet shkëmbimi i materialit gjenetik. Pas këtij procesi individët largohen mes tyre dhe pasojnë ndarjet e mëtejme në dysh.Konjugimi ndodhë në kushte të keqësuara.