Kawasan suaka alam meliputi cagar alam lan suaka margasatwa. Saat iki Jawa Timur terdapat 17 cagar alam dam 2 suaka margasatwa. Suaka Margasatwa Dataran Tinggi sing terdapat nang Bondowoso, Probolinggo, lan Jember. Sementara Suaka Margasatwa Pulau Bawean berada nang Pulau Bawean.