No 1990. līdz 1992. gadam Miķelsons strādāja AS ""Vanga"" par autoservisa vadītāju. 1992. gadā sāka strādāt ""Latvija Statoil"" par Biznesa attīstības departamenta vadītāju. 1996. gadā kļuvis par uzņēmuma izpilddirektoru, no 1998. gada bija arī valdes loceklis. 2000. gada aprīlī kļuva par VAS ""Latvenergo"" valdes priekšsēdētāju. Būdams ""Latvenergo"" priekšnieks, bija arī vairāku ar enerģētiku saistītu organizāciju dalībnieks. Pēc atlaišanas Miķelsons paziņoja, ka plāno uzsākt pats savu uzņēmumu.