পূর্ব ছাতনাই ইউনিয়নের উত্তর ও পূর্বে ভারত, দক্ষিণে খগাখড়িবাড়ী ইউনিয়ন এবং পশ্চিমে বালাপাড়া ইউনিয়ন ও পশ্চিম ছাতনাই ইউনিয়ন অবস্থিত। এ ইউনিয়নের পূর্ব পাশ দিয়ে বাংলাদেশ - ভারত সীমান্ত রেখা বরাবর তিস্তা নদী বহমান।