Parapija įkurta 1865 m. ir be pertraukų egzistavo iki pat II pasaulinio karo. Iš naujo parapija oficialiai užregistruota 1947 m., tuo metu parapijoje buvo 350 narių. Postsovietiniais laikais stačiatikių Druskininkuose sumažėjo tačiau cerkvė vis dar lankoma negausių parapijiečių.