علمائے دیوبند کے ایک طبقہ مولانا حسین احمد مدنی ، مولانا ابو الکلام آزاد رحمہ اللہ کو مسلم لیگ سے بھی سیاسی اختلاف کی ، انکاموقف یہ تھا کہ انگریز کے زیر سایہ ہونے والی تقسیم کم ازکم مسلمانوں کے لیے کبھی فاعدہ مند نہیں ہوسکتی۔ لیکن پاکستان بننے کے بعد ان میں سے کسی نے بھی پاکستان کی مخالفت نہیں کی۔ مولانا مدنی رحمہ اللہ فرمایا کرتے تھے کہ "" پاکستان کے قیام کے بعد اب اس کا حکم مسجد کا سا ہے، اس کے بنانے میں اختلاف ہوسکتا ہے، بننے کے بعد اسکی تقدیس فرض ہے"" مولانا ابوالکلام آزاد رحمہ اللہ فرمایا کرتے تھے کہ ""پاکستان وجود میں آگیا ہے تو اب اسے باقی رکھنا چاہیے، اس کا بگڑ جانا سارے عالم اسلام کے لیے شکست کے برابر ہوگا""۔ (بحث ونظر نوائے وقت۔ 23 مارچ 1973ء)