1948년 5월 병원 입원으로 인하여 일시적으로 이승만의 비서실장 직을 내놓았다. 이후 7월 22일 대한민국 정부수립 후 대통령비서실 실장이 되었고, 윤보선의 뒤를 이어 1949년 6월부터 1949년 8월까지 서울특별시 시장을 지냈다. 1949년 8월부터 1951년 5월 8일까지 다시 서울시장에 재선되었다.