بالرغم من ورعه إلا إن البابا يوساب كان ضعيف الشخصية و ماوقفش سكرتيره الخاص عن بيع الرتب الكنسية لغير المستحقين. نتيجة للفساد بعض الشباب القبطي المنتمي لجماعة الامه القبطيه خطف البابا من مقره واحتجزوه فى دير مارجرجس للراهبات واجبروه يوافق على مطالبهم الإصلاحية.