1981年8月，上海市人民政府接获国务院个批文后，即成立上海铁路新客站工程指挥部。1983年10月，市政府调整指挥部成员，由上海铁路局、闸北区人民政府搭建工局总计4人担任指挥部个指挥搭副指挥，并常驻工地。1984年9月，上海市府确定工程指挥部是市政府个派出机构，全面负责车站施工。