Dari 1998 hingga 2001, Indonesia mempunyai tiga presiden: Bacharuddin Jusuf (BJ) Habibie, Abdurrahman Wahid lan Megawati Sukarnoputri. Pada tahun 2004 pemilu satu hari terbesar di dunia diadakan lan dimenangkan oleh Susilo Bambang Yudhoyono.