Fódele sijaitsee Kreetan pohjoisissa keskiosissa noin 27 kilometriä länsiluoteeseen Iraklionista, noin 50 kilometriä itään Réthymnosta ja noin 2,5 kilometriä sisämaahan saaren pohjoisrannikosta. Kylän nimi mainitaan ensimmäisen kerran vuonna 1248. Alue on ollut asuttua viimeistään minolaisella kaudella, jolta ajalta seudulta on tehty asutuslöytöjä. Jotkut tutkijat katsovat, että paikalla olisi ollut antiikin aikana kaupunki nimeltä Pantomatrion, joka olisi ollut Aksoksen kaupungin satama. Joskus paikan mainitaan kuitenkin olleen antiikin Astale. (Lisäksi sekä Astale että Pantomatrion sijoitetaan joskus eri paikkoihin.)