משרד הביטחון . פעילות משרד הביטחון להצגה ולהנחלה של מורשת הקרב של צה_ל ושל כוחות המגן שקדמו לו - ממצאי מעקב על אף זאת, לא נמצאו סימוכין לכך, שהנהלת מוזיאון "בתי האוסף" והנהלת היחידה העלו בפני הנהלת המשרד את הצורך בהקצאת אמצעים לשימור ולשיקום המוצגים. לדברי מנהל היחידה, פניות כאלה נעשו בעל פה בלבד. משרד מבקר המדינה רואה בחומרה מצב שבו המשרד, שקיבל על עצמו את האחריות "לרכז את הממצאים הקשורים בהתפתחות כוח המגן של היישוב בארץ ישראל, ובהתפתחות הכוח הצבאי של צה"ל; להמחיש את מלחמתו של עם ישראל על קיומו העצמאי בארצנו, ולהנחיל את מורשת הקרב של כוחות המגן ושל צה"ל, לנו ולדורות הבאים"9 - ,"אינו ממלא כראוי, לפחות בנוגע למוזיאון "בתי האוסף את חובתו. כתוצאה מכך, מוצגים בעלי ערך היסטורי אינם זוכים לטיפול משמר ולשיקום ועלולים להיהרס כליל. לדעת משרד מבקר המדינה, על המשרד, ובעיקר על המנכ"ל העומד בראשו, לוודא שיקודם הפרויקט להקמתו של מוזיאון צה"ל, שחשיבותו ברורה ושהוגדר כאמור באפריל 2011 על ידי מנכ"ל המשרד דאז כ"פרויקט לאומי בעל חשיבות רבה לצה"ל ולמדינה". זאת ועוד, כל עוד המשרד לא שינה את עמדתו בנוגע לתפקידו בשימור מורשת הקרב של צה"ל, על סמנכ"ל וראש אמו"ן, בתוקף אחריותו על יחידת המוזיאונים, לפעול ללא דיחוי נוסף לשיקום ולשימור הפריטים בעלי הערך ההיסטורי הנמצאים במוזיאון "בתי האוסף". זאת ועוד, הפריטים שבמוזיאון "בתי האוסף" אמורים להיות משולבים במוזיאון הצבאי-ממלכתי המתוכנן, ואלה שלא ישולבו יישמרו במוזיאון לשם "מחקר ולתצוגות עתידיות" (הדגש במקור) 11 . משמעות הדבר, שבכל מקרה יהיה צורך לשקם ולחדש את הפריטים. על כן, על המשרד לעצור את הליך התפ וררותם, ולנקוט כבר עתה את הפעילות הדרושה לשימורם. התיאור דלעיל מצביע על כך, שאמנם הוועדה גיבשה תפיסה מוזיאונית ומדיניות להפעלת המוזיאונים, ומנכ"ל המשרד דאז קיים דיון בנושא, אך לא נמצאו סימוכין לכך שהוא אישר אותן. יתרה מכך, הן לא שולבו בהוראות המשרד. כמו כן, במצב הקיים ייעודה של יחידת המוזיאונים, תפקידיה, ואף פירוט המוזיאונים שהיא מפעילה אינם מוגדרים בהוראות המשרד. לדעת משרד מבקר המ דינה, על מנכ"ל המשרד, אלוף (מיל ') דן הראל, לדון בהמלצות הוועדה ולקבוע תפיסה ומדיניות, ולתת להן ביטוי בהוראות המשרד. לכך חשיבות יתרה מאחר שבשונה מיתר יחידות המשרד, לפעילות היחידה הנגזרת מהתפיסה המוזיאונית ומהמדיניות להפעלתם השפעה על קהל היעד המתעניין במורשת הביטחונית של תקופת היישוב ושל צה"ל. .ועדת היגוי לבחינת הקמה של מוזיאון צבאי -ממלכתי ראתה חשיבות רבה לקיום מוזיאון צבאי-ממלכתי שישקף את ההיסטוריה הביטחונית ויציין את תרומתה של המערכת הביטחונית לביטחון המדינה. בין המסקנות של הוועדה:
.יחידת המוזיאונים במשרד הביטחון אחראית להפעלתם של 12 מוזיאונים של המשרד הפרוסים ברחבי הארץ, והמציגים את התפתחות הכוח הצבאי של היישוב בארץ ישראל ושל צה"ל. לפעילות יחידת המוזיאונים, הנגזרת מהתפיסה המוזיאונית ומהמדיניות ל הפעלתם, השפעה על קהל היעד המתעניין במורשת הביטחונית של תקופת היישוב ושל צה"ל. לכן, לדעת משרד מבקר המדינה, על מנכ"ל המשרד, אלוף (מיל') דן הראל, לאשר תפיסה מוזיאונית וארגונית כוללת ומדיניות להפעלתה, ולתת להן ביטוי בהוראות המשרד. הפרויקט להקמתו של מוזיאון צה"ל הוא פרויקט לטווח הארוך, לא רק עקב הצורך בתכנון ועיצוב התצוגה ולאחר מכן הבנייה, אלא, ואולי בעיקר, כיוון שהסיפור של צה"ל עדיין מתפתח, ואין תמימות דעים בנוגע לאופן ההצגה של פרקים שונים בהיסטוריה שלו. על כן, מעיר משרד מבקר המדינה, כי על אף שמאז 2010 החל המשרד לנקוט פעילות להגשמת ההחלטה על הקמת מוזיאון צבאי -ממלכתי, על מנכ"ל המשרד לפעול לקבלת ההחלטות בסוגיות שטרם הוחלט בעניינן, דוגמת מיקומו של המוזיאון ואופן ההצגה של פרקים שונים בהיסטוריה של צה"ל.