zipped dumy_data files

dummy/BORING/0.0.1/dummy_data.zip

@@ -0,0 +1,3 @@
+version https://git-lfs.github.com/spec/v1
+oid sha256:6e6338b3aff19c6f2057c908a1c6c5d38b7de76a72f3f0faa69c9d54e27bbbd0
+size 3249

dummy/BORING/0.0.1/eval.jsonl

@@ -1 +0,0 @@
-{"tokens": ["<s>", "X", "BP", "-", "1", "S", "\u0120expression", "\u0120was", "\u0120determined", "\u0120by", "\u0120I", "HC", "\u0120of", "\u0120a", "\u0120ne", "oad", "ju", "vant", "\u0120hormone", "\u0120therapy", "\u0120(", "N", "HT", ")", "\u0120tissue", "\u0120micro", "array", "\u0120containing", "\u0120samples", "\u0120from", "\u0120hormone", "\u0120na\u00c3\u00afve", "\u0120(", "unt", "reated", ")", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u012025", "),", "\u0120patients", "\u0120that", "\u0120received", "\u0120N", "HT", "\u0120for", "\u01201", "-", "6", "\u0120months", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u012033", "),", "\u0120and", "\u0120patients", "\u0120that", "\u0120received", "\u0120N", "HT", "\u0120for", "\u01207", "-", "12", "\u0120months", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u012050", "),", "\u0120as", "\u0120indicated", ".", "\u0120Representative", "\u0120images", "\u0120are", "\u0120shown", ".", "\u0120Scale", "\u0120bars", ":", "\u0120100", "\u0120\u00ce\u00bc", "m", ".", "Quant", "itative", "\u0120presentation", "\u0120of", "\u0120the", "\u0120data", "\u0120from", "\u0120(", "C", ").", "\u0120*", "P", "\u0120=", "\u01200", ".", "006", "\u0120in", "\u0120unp", "aired", "\u0120Student", "'s", "\u0120t", "-", "test", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 1000, 21792, 12, 134, 104, 8151, 21, 3030, 30, 38, 13459, 9, 10, 3087, 20657, 7488, 21454, 20940, 5804, 36, 487, 14469, 43, 11576, 5177, 30766, 8200, 7931, 31, 20940, 39300, 36, 5973, 34381, 43, 36, 282, 5457, 564, 238, 1484, 14, 829, 234, 14469, 13, 112, 12, 401, 377, 36, 282, 5457, 2357, 238, 8, 1484, 14, 829, 234, 14469, 13, 262, 12, 1092, 377, 36, 282, 5457, 654, 238, 25, 4658, 4, 10308, 3156, 32, 2343, 4, 33256, 5692, 35, 727, 46911, 119, 4, 44572, 26709, 5209, 9, 5, 414, 31, 36, 347, 322, 1009, 510, 5457, 321, 4, 38049, 11, 23089, 35016, 9067, 18, 326, 12, 21959, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}

dummy/BORING/0.0.1/test.jsonl

@@ -1 +0,0 @@
-{"tokens": ["<s>", "B", ".", "\u0120Representative", "\u0120images", "\u0120of", "\u0120a", "\u0120time", "\u0120course", "\u0120analysis", "\u0120of", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", "\u0120redistribution", "\u0120to", "\u0120SG", "s", ".", "\u0120Cells", "\u0120were", "\u0120treated", "\u0120The", "\u0120graph", "\u0120(", "B", "')", "\u0120shows", "\u0120quant", "ification", "\u0120of", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", "\u0120localization", "\u0120at", "\u0120SG", "s", "\u0120over", "\u0120time", "\u0120as", "\u0120the", "\u0120ratio", "\u0120between", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", "\u0120(", "mean", "\u0120flu", "orescence", "\u0120intensity", ")", "\u0120in", "\u0120SG", "\u0120punct", "a", "\u0120and", "\u0120cyt", "os", "olic", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", ".", "\u0120Mean", "\u0120\u00c2\u00b1", "\u0120s", ".", "e", ".", "m", ".", "\u0120n", "\u0120=", "\u012050", "\u0120cells", "\u0120per", "\u0120experiment", ",", "\u0120N", "\u0120=", "\u01203", ".", "\u0120Scale", "\u0120bar", ",", "\u012010", "\u0120\u00c2\u00b5", "m", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 387, 4, 10308, 3156, 9, 10, 86, 768, 1966, 9, 5758, 591, 4794, 176, 37531, 7, 16324, 29, 4, 42920, 58, 3032, 20, 20992, 36, 387, 27645, 924, 24934, 5000, 9, 5758, 591, 4794, 176, 45005, 23, 16324, 29, 81, 86, 25, 5, 1750, 227, 5758, 591, 4794, 176, 36, 43348, 6626, 45094, 10603, 43, 11, 16324, 15760, 102, 8, 44193, 366, 12589, 5758, 591, 4794, 176, 4, 30750, 46710, 579, 4, 242, 4, 119, 4, 295, 5457, 654, 4590, 228, 9280, 6, 234, 5457, 155, 4, 33256, 2003, 6, 158, 44200, 119, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-EXP_ASSAY", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-EXP_ASSAY", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "B-SUBCELLULAR", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}

dummy/BORING/0.0.1/train.jsonl

@@ -1 +0,0 @@
-{"tokens": ["<s>", "(", "F", ")", "\u0120RNA", "i", "\u0120of", "\u0120all", "\u0120tested", "\u0120genes", "\u0120in", "\u0120the", "\u0120TOR", "-", "PI", "3", "K", "\u0120pathways", "\u0120had", "\u0120a", "\u0120statistically", "\u0120significant", "\u0120effect", "\u0120on", "\u0120LT", "G", "\u0120flu", "orescence", "\u0120levels", ".", "\u0120Known", "\u0120negative", "\u0120regulators", "\u0120of", "\u0120aut", "oph", "agy", "\u0120are", "\u0120shown", "\u0120with", "\u0120gray", "\u0120bars", ";", "\u0120positive", "\u0120regulators", "\u0120are", "\u0120shown", "\u0120with", "\u0120white", "\u0120bars", ".", "\u0120(", "P", "ten", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "007", ";", "\u0120T", "sc", "1", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "027", ";", "\u0120T", "sc", "2", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "025", ";", "\u0120R", "he", "B", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "005", ";", "\u0120Tor", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "016", ";", "\u0120and", "\u0120S", "6", "k", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "012", ").", "\u0120d", "s", "RNA", "\u0120corresponding", "\u0120to", "\u0120a", "\u0120human", "\u0120gene", "\u0120(", "H", "s", ")", "\u0120was", "\u0120used", "\u0120as", "\u0120a", "\u0120negative", "\u0120control", "\u0120in", "\u0120E", "\u0120and", "\u0120F", ".", "\u0120Results", "\u0120represent", "\u0120the", "\u0120mean", "\u0120value", "\u0120\u00c2\u00b1", "\u0120SD", "\u0120from", "\u0120at", "\u0120least", "\u0120three", "\u0120independent", "\u0120experiments", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 1640, 597, 43, 34062, 118, 9, 70, 4776, 14819, 11, 5, 22331, 12, 11337, 246, 530, 25019, 56, 10, 27697, 1233, 1683, 15, 23614, 534, 6626, 45094, 1389, 4, 21575, 2430, 5904, 9, 7241, 6673, 37263, 32, 2343, 19, 12339, 5692, 131, 1313, 5904, 32, 2343, 19, 1104, 5692, 4, 36, 510, 3869, 6, 221, 5457, 321, 4, 35723, 131, 255, 3866, 134, 6, 221, 5457, 321, 4, 40819, 131, 255, 3866, 176, 6, 221, 5457, 321, 4, 36453, 131, 248, 700, 387, 6, 221, 5457, 321, 4, 31866, 131, 6623, 6, 221, 5457, 321, 4, 36192, 131, 8, 208, 401, 330, 6, 221, 5457, 321, 4, 37524, 322, 385, 29, 43612, 12337, 7, 10, 1050, 10596, 36, 725, 29, 43, 21, 341, 25, 10, 2430, 797, 11, 381, 8, 274, 4, 12499, 3594, 5, 1266, 923, 46710, 12723, 31, 23, 513, 130, 2222, 15491, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}

dummy/NER/0.0.1/dummy_data.zip

@@ -0,0 +1,3 @@
+version https://git-lfs.github.com/spec/v1
+oid sha256:74a2a650f70f011162768a9a686b0544cdb0142840ba0eb23f35b1adba77a580
+size 3249

dummy/NER/0.0.1/eval.jsonl

@@ -1 +0,0 @@
-{"tokens": ["<s>", "X", "BP", "-", "1", "S", "\u0120expression", "\u0120was", "\u0120determined", "\u0120by", "\u0120I", "HC", "\u0120of", "\u0120a", "\u0120ne", "oad", "ju", "vant", "\u0120hormone", "\u0120therapy", "\u0120(", "N", "HT", ")", "\u0120tissue", "\u0120micro", "array", "\u0120containing", "\u0120samples", "\u0120from", "\u0120hormone", "\u0120na\u00c3\u00afve", "\u0120(", "unt", "reated", ")", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u012025", "),", "\u0120patients", "\u0120that", "\u0120received", "\u0120N", "HT", "\u0120for", "\u01201", "-", "6", "\u0120months", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u012033", "),", "\u0120and", "\u0120patients", "\u0120that", "\u0120received", "\u0120N", "HT", "\u0120for", "\u01207", "-", "12", "\u0120months", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u012050", "),", "\u0120as", "\u0120indicated", ".", "\u0120Representative", "\u0120images", "\u0120are", "\u0120shown", ".", "\u0120Scale", "\u0120bars", ":", "\u0120100", "\u0120\u00ce\u00bc", "m", ".", "Quant", "itative", "\u0120presentation", "\u0120of", "\u0120the", "\u0120data", "\u0120from", "\u0120(", "C", ").", "\u0120*", "P", "\u0120=", "\u01200", ".", "006", "\u0120in", "\u0120unp", "aired", "\u0120Student", "'s", "\u0120t", "-", "test", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 1000, 21792, 12, 134, 104, 8151, 21, 3030, 30, 38, 13459, 9, 10, 3087, 20657, 7488, 21454, 20940, 5804, 36, 487, 14469, 43, 11576, 5177, 30766, 8200, 7931, 31, 20940, 39300, 36, 5973, 34381, 43, 36, 282, 5457, 564, 238, 1484, 14, 829, 234, 14469, 13, 112, 12, 401, 377, 36, 282, 5457, 2357, 238, 8, 1484, 14, 829, 234, 14469, 13, 262, 12, 1092, 377, 36, 282, 5457, 654, 238, 25, 4658, 4, 10308, 3156, 32, 2343, 4, 33256, 5692, 35, 727, 46911, 119, 4, 44572, 26709, 5209, 9, 5, 414, 31, 36, 347, 322, 1009, 510, 5457, 321, 4, 38049, 11, 23089, 35016, 9067, 18, 326, 12, 21959, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}

dummy/NER/0.0.1/test.jsonl

@@ -1 +0,0 @@
-{"tokens": ["<s>", "B", ".", "\u0120Representative", "\u0120images", "\u0120of", "\u0120a", "\u0120time", "\u0120course", "\u0120analysis", "\u0120of", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", "\u0120redistribution", "\u0120to", "\u0120SG", "s", ".", "\u0120Cells", "\u0120were", "\u0120treated", "\u0120The", "\u0120graph", "\u0120(", "B", "')", "\u0120shows", "\u0120quant", "ification", "\u0120of", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", "\u0120localization", "\u0120at", "\u0120SG", "s", "\u0120over", "\u0120time", "\u0120as", "\u0120the", "\u0120ratio", "\u0120between", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", "\u0120(", "mean", "\u0120flu", "orescence", "\u0120intensity", ")", "\u0120in", "\u0120SG", "\u0120punct", "a", "\u0120and", "\u0120cyt", "os", "olic", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", ".", "\u0120Mean", "\u0120\u00c2\u00b1", "\u0120s", ".", "e", ".", "m", ".", "\u0120n", "\u0120=", "\u012050", "\u0120cells", "\u0120per", "\u0120experiment", ",", "\u0120N", "\u0120=", "\u01203", ".", "\u0120Scale", "\u0120bar", ",", "\u012010", "\u0120\u00c2\u00b5", "m", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 387, 4, 10308, 3156, 9, 10, 86, 768, 1966, 9, 5758, 591, 4794, 176, 37531, 7, 16324, 29, 4, 42920, 58, 3032, 20, 20992, 36, 387, 27645, 924, 24934, 5000, 9, 5758, 591, 4794, 176, 45005, 23, 16324, 29, 81, 86, 25, 5, 1750, 227, 5758, 591, 4794, 176, 36, 43348, 6626, 45094, 10603, 43, 11, 16324, 15760, 102, 8, 44193, 366, 12589, 5758, 591, 4794, 176, 4, 30750, 46710, 579, 4, 242, 4, 119, 4, 295, 5457, 654, 4590, 228, 9280, 6, 234, 5457, 155, 4, 33256, 2003, 6, 158, 44200, 119, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-EXP_ASSAY", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-EXP_ASSAY", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "B-SUBCELLULAR", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}

dummy/NER/0.0.1/train.jsonl

@@ -1 +0,0 @@
-{"tokens": ["<s>", "(", "F", ")", "\u0120RNA", "i", "\u0120of", "\u0120all", "\u0120tested", "\u0120genes", "\u0120in", "\u0120the", "\u0120TOR", "-", "PI", "3", "K", "\u0120pathways", "\u0120had", "\u0120a", "\u0120statistically", "\u0120significant", "\u0120effect", "\u0120on", "\u0120LT", "G", "\u0120flu", "orescence", "\u0120levels", ".", "\u0120Known", "\u0120negative", "\u0120regulators", "\u0120of", "\u0120aut", "oph", "agy", "\u0120are", "\u0120shown", "\u0120with", "\u0120gray", "\u0120bars", ";", "\u0120positive", "\u0120regulators", "\u0120are", "\u0120shown", "\u0120with", "\u0120white", "\u0120bars", ".", "\u0120(", "P", "ten", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "007", ";", "\u0120T", "sc", "1", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "027", ";", "\u0120T", "sc", "2", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "025", ";", "\u0120R", "he", "B", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "005", ";", "\u0120Tor", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "016", ";", "\u0120and", "\u0120S", "6", "k", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "012", ").", "\u0120d", "s", "RNA", "\u0120corresponding", "\u0120to", "\u0120a", "\u0120human", "\u0120gene", "\u0120(", "H", "s", ")", "\u0120was", "\u0120used", "\u0120as", "\u0120a", "\u0120negative", "\u0120control", "\u0120in", "\u0120E", "\u0120and", "\u0120F", ".", "\u0120Results", "\u0120represent", "\u0120the", "\u0120mean", "\u0120value", "\u0120\u00c2\u00b1", "\u0120SD", "\u0120from", "\u0120at", "\u0120least", "\u0120three", "\u0120independent", "\u0120experiments", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 1640, 597, 43, 34062, 118, 9, 70, 4776, 14819, 11, 5, 22331, 12, 11337, 246, 530, 25019, 56, 10, 27697, 1233, 1683, 15, 23614, 534, 6626, 45094, 1389, 4, 21575, 2430, 5904, 9, 7241, 6673, 37263, 32, 2343, 19, 12339, 5692, 131, 1313, 5904, 32, 2343, 19, 1104, 5692, 4, 36, 510, 3869, 6, 221, 5457, 321, 4, 35723, 131, 255, 3866, 134, 6, 221, 5457, 321, 4, 40819, 131, 255, 3866, 176, 6, 221, 5457, 321, 4, 36453, 131, 248, 700, 387, 6, 221, 5457, 321, 4, 31866, 131, 6623, 6, 221, 5457, 321, 4, 36192, 131, 8, 208, 401, 330, 6, 221, 5457, 321, 4, 37524, 322, 385, 29, 43612, 12337, 7, 10, 1050, 10596, 36, 725, 29, 43, 21, 341, 25, 10, 2430, 797, 11, 381, 8, 274, 4, 12499, 3594, 5, 1266, 923, 46710, 12723, 31, 23, 513, 130, 2222, 15491, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}

dummy/PANELIZATION/0.1.1/dummy_data.zip

@@ -0,0 +1,3 @@
+version https://git-lfs.github.com/spec/v1
+oid sha256:bf7875cc7d1d74018d1b215ce3b158b2e7c62fbc613641e82cb3107659c3171a
+size 4475

dummy/PANELIZATION/0.1.1/eval.jsonl

@@ -1 +0,0 @@
-{"tokens": ["<s>", "Figure", "\u01205", ".", "\u0120Figure", "\u01205", ".(", "B", "-", "D", ")", "\u0120Surface", "\u0120bi", "ot", "inyl", "ation", "\u0120ass", "ays", "\u0120verified", "\u0120increased", "\u0120surface", "\u0120expression", "\u0120of", "\u0120\u00ce\u00b1", "V", "\u0120and", "\u0120\u00ce\u00b2", "3", "\u0120upon", "\u0120appl", "i", "\u00c2\u0143", "cation", "\u0120of", "\u0120E", "7", "\u0120but", "\u0120not", "\u0120Fn", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u01203", ";", "\u0120one", "-", "way", "\u0120AN", "OVA", ")", "\u0120(", "E", "-", "G", ")", "\u0120Surface", "\u0120expression", "\u0120of", "\u0120\u00ce\u00b1", "5", "\u0120and", "\u0120\u00ce\u00b2", "1", "\u0120was", "\u0120found", "\u0120increased", "\u0120upon", "\u0120treatment", "\u0120with", "\u0120E", "7", "\u0120or", "\u0120Fn", "\u0120and", "\u0120was", "\u0120further", "\u0120enhanced", "\u0120by", "\u0120combination", "\u0120of", "\u0120both", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u01203", ";", "\u0120one", "-", "way", "\u0120AN", "OVA", ")", "\u0120(", "H", ")", "\u0120E", "ct", "opic", "\u0120expression", "\u0120of", "\u0120mur", "ine", "\u0120EG", "FL", "7", "\u0120(", "m", "E", "7", ")", "\u0120in", "\u0120GL", "261", "\u00c2\u0142", "mouse", "\u00c2\u0142", "g", "li", "oma", "\u0120cells", "\u0120followed", "\u0120by", "\u0120intr", "ac", "ran", "ial", "\u0120implant", "ation", "\u0120into", "\u0120the", "\u0120stri", "atum", "\u0120of", "\u0120immune", "-", "comp", "et", "ent", "\u0120mice", "\u0120reduced", "\u0120overall", "\u0120survival", "\u0120but", "\u0120was", "\u0120rescued", "\u0120upon", "\u0120treatment", "\u0120with", "\u0120an", "\u0120integ", "rin", "\u0120\u00ce\u00b1", "5", "\u00ce\u00b2", "1", "-", "in", "hib", "iting", "\u0120antibody", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u01206", ";", "\u0120log", "-", "rank", "\u0120test", ").", "\u0120Data", "\u0120presented", "\u0120as", "\u0120mean", "\u0120\u00c2\u00b1", "\u0120SEM", ".", "\u0120T", "CL", "-", "total", "\u0120cell", "\u0120l", "ys", "ate", ",", "\u0120AU", "-", "ar", "bit", "rary", "\u0120units", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 40683, 195, 4, 17965, 195, 21154, 387, 12, 495, 43, 17111, 4003, 1242, 47253, 1258, 8446, 4113, 13031, 1130, 4084, 8151, 9, 47188, 846, 8, 47743, 246, 2115, 45432, 118, 5514, 41684, 9, 381, 406, 53, 45, 47377, 36, 282, 5457, 155, 131, 65, 12, 1970, 5102, 44320, 43, 36, 717, 12, 534, 43, 17111, 8151, 9, 47188, 245, 8, 47743, 134, 21, 303, 1130, 2115, 1416, 19, 381, 406, 50, 47377, 8, 21, 617, 9094, 30, 4069, 9, 258, 36, 282, 5457, 155, 131, 65, 12, 1970, 5102, 44320, 43, 36, 725, 43, 381, 3894, 18137, 8151, 9, 22802, 833, 40999, 7613, 406, 36, 119, 717, 406, 43, 11, 12209, 32972, 50141, 45052, 50141, 571, 3572, 4982, 4590, 1432, 30, 19567, 1043, 3917, 2617, 26574, 1258, 88, 5, 28213, 15368, 9, 9161, 12, 11828, 594, 1342, 15540, 2906, 1374, 7967, 53, 21, 8262, 2115, 1416, 19, 41, 20590, 5719, 47188, 245, 47328, 134, 12, 179, 25068, 2838, 34517, 36, 282, 5457, 231, 131, 7425, 12, 40081, 1296, 322, 5423, 2633, 25, 1266, 46710, 39703, 4, 255, 7454, 12, 30033, 3551, 784, 2459, 877, 6, 16778, 12, 271, 5881, 35073, 2833, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "B-TISSUE", "I-TISSUE", "I-TISSUE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-TISSUE", "I-TISSUE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}

dummy/PANELIZATION/0.1.1/test.jsonl

@@ -1 +0,0 @@
-{"tokens": ["<s>", "Figure", "\u01207", ".", "\u0120Figure", "\u01207", ".", "A", ".", "\u0120Expression", "\u0120of", "\u0120run", "x", "1", "/", "c", "-", "my", "b", "\u0120in", "\u0120the", "\u0120V", "DA", "\u0120after", "\u0120treatment", "\u0120with", "\u0120D", "MS", "O", "\u0120vehicle", "\u0120control", "\u0120(", "left", "),", "\u0120the", "\u0120PI", "3", "K", "/", "AK", "T", "\u0120inhibitor", "\u0120W", "ort", "mann", "in", "\u0120(", "WM", ",", "\u0120middle", ")", "\u0120and", "\u0120after", "\u0120joined", "\u0120treatment", "\u0120with", "\u0120WM", "\u0120and", "\u0120enforced", "\u0120NIC", "D", "\u0120expression", "\u0120via", "\u0120HS", "\u0120at", "\u012014", "\u0120hp", "f", "\u0120in", "\u0120T", "g", "(", "5", "x", "U", "AS", "-", "E", "1", "b", ":", "6", "x", "MY", "C", "-", "not", "ch", "1", "a", ";", "-", "1", ".", "5", "h", "sp", "70", "l", ":", "Gal", "4", ")", "\u0120embryos", "\u0120(", "right", ").", "\u0120Graph", "\u0120displays", "\u0120quant", "itation", "\u0120of", "\u0120results", ".", "\u0120Sh", "own", "\u0120are", "\u0120the", "\u0120percentages", "\u0120of", "\u0120embryos", "\u0120with", "\u0120normal", "\u0120or", "\u0120decreased", "\u0120run", "x", "1", "/", "c", "-", "my", "b", "expression", "\u0120for", "\u0120each", "\u0120condition", ".", "\u0120B", ".", "\u0120Expression", "\u0120of", "\u0120notch", "1", "b", "\u0120after", "\u0120treatment", "\u0120with", "\u0120D", "MS", "O", "\u0120vehicle", "\u0120control", "\u0120(", "left", ")", "\u0120or", "\u0120W", "ort", "mann", "in", "\u0120(", "WM", ",", "\u0120middle", ").", "\u0120Graph", "\u0120displays", "\u0120quant", "itation", "\u0120of", "\u0120results", ".", "\u0120Sh", "own", "\u0120are", "\u0120the", "\u0120percentages", "\u0120of", "\u0120embryos", "\u0120with", "\u0120normal", "\u0120or", "\u0120decreased", "\u0120notch", "1", "b", "\u0120expression", "\u0120for", "\u0120each", "\u0120condition", ".", "\u0120C", ".", "\u0120W", "ISH", "\u0120for", "\u0120run", "x", "1", "/", "c", "-", "my", "b", "\u0120in", "\u0120control", "\u0120injected", "\u0120embryos", "\u0120(", "upper", "\u0120left", "),", "\u0120ev", "i", "1", "\u0120morph", "ants", "\u0120(", "upper", "\u0120right", ")", "\u0120or", "\u0120respectively", "\u0120ev", "i", "1", "\u0120MO", "\u0120with", "\u0120my", "r", "-", "AK", "T", "\u0120injected", "\u0120embryos", "\u0120with", "\u0120HS", "\u0120at", "\u012014", "\u0120hp", "f", "\u0120(", "lower", "\u0120right", ")", "\u0120and", "\u0120ev", "i", "1", "\u0120MO", "\u0120with", "\u0120U", "AS", "-", "my", "r", "-", "AK", "T", "\u0120injected", "\u0120trans", "genic", "\u0120T", "g", "(", "fl", "i", ".", "1", ":", "Gal", "4", "FF", "ubs", "3", ";", "\u0120U", "AS", ":", "R", "FP", ")", "r", "k", "\u0120embryos", ".", "D", ".", "\u0120Quant", "itation", "\u0120of", "\u0120results", "\u0120from", "\u0120(", "C", ").", "\u0120Sh", "own", "\u0120are", "\u0120the", "\u0120percentages", "\u0120of", "\u0120embryos", "\u0120with", "\u0120normal", "\u0120or", "\u0120decreased", "\u0120run", "x", "1", "/", "c", "-", "my", "b", "\u0120expression", "\u0120for", "\u0120each", "\u0120condition", ".", "\u0120E", ".", "\u0120W", "ISH", "\u0120for", "\u0120notch", "1", "b", "\u0120in", "\u0120ev", "i", "1", "\u0120Morph", "ol", "ino", "\u0120injected", "\u0120(", "left", ")", "\u0120and", "\u0120ev", "i", "1", "\u0120plus", "\u0120U", "AS", ":", "my", "r", "-", "AK", "T", "\u0120injected", "\u0120trans", "genic", "\u0120T", "g", "(", "fl", "i", ".", "1", ":", "Gal", "4", "FF", "ubs", "3", ";", "\u0120U", "AS", ":", "R", "FP", ")", "r", "k", "\u0120embryos", "\u0120(", "right", ").", "\u0120Graph", "\u0120displays", "\u0120quant", "itation", "\u0120of", "\u0120results", ".", "\u0120Sh", "own", "\u0120are", "\u0120the", "\u0120percentages", "\u0120of", "\u0120embryos", "\u0120with", "\u0120normal", "\u0120or", "\u0120decreased", "\u0120notch", "1", "b", "\u0120expression", "\u0120for", "\u0120each", "\u0120condition", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 40683, 262, 4, 17965, 262, 4, 250, 4, 43819, 9, 422, 1178, 134, 73, 438, 12, 4783, 428, 11, 5, 468, 3134, 71, 1416, 19, 211, 6222, 673, 1155, 797, 36, 6960, 238, 5, 32546, 246, 530, 73, 7140, 565, 34496, 305, 2723, 4621, 179, 36, 29395, 6, 1692, 43, 8, 71, 1770, 1416, 19, 30355, 8, 17910, 33420, 495, 8151, 1241, 21499, 23, 501, 29886, 506, 11, 255, 571, 1640, 245, 1178, 791, 2336, 12, 717, 134, 428, 35, 401, 1178, 25518, 347, 12, 3654, 611, 134, 102, 131, 12, 134, 4, 245, 298, 4182, 3083, 462, 35, 32302, 306, 43, 32293, 36, 4070, 322, 20919, 8612, 24934, 12257, 9, 775, 4, 840, 3355, 32, 5, 30839, 9, 32293, 19, 2340, 50, 8065, 422, 1178, 134, 73, 438, 12, 4783, 428, 42819, 13, 349, 1881, 4, 163, 4, 43819, 9, 16046, 134, 428, 71, 1416, 19, 211, 6222, 673, 1155, 797, 36, 6960, 43, 50, 305, 2723, 4621, 179, 36, 29395, 6, 1692, 322, 20919, 8612, 24934, 12257, 9, 775, 4, 840, 3355, 32, 5, 30839, 9, 32293, 19, 2340, 50, 8065, 16046, 134, 428, 8151, 13, 349, 1881, 4, 230, 4, 305, 14849, 13, 422, 1178, 134, 73, 438, 12, 4783, 428, 11, 797, 22993, 32293, 36, 34849, 314, 238, 7630, 118, 134, 38675, 3277, 36, 34849, 235, 43, 50, 4067, 7630, 118, 134, 11757, 19, 127, 338, 12, 7140, 565, 22993, 32293, 19, 21499, 23, 501, 29886, 506, 36, 29668, 235, 43, 8, 7630, 118, 134, 11757, 19, 121, 2336, 12, 4783, 338, 12, 7140, 565, 22993, 6214, 44131, 255, 571, 1640, 4825, 118, 4, 134, 35, 32302, 306, 7389, 19424, 246, 131, 121, 2336, 35, 500, 9763, 43, 338, 330, 32293, 4, 495, 4, 28256, 12257, 9, 775, 31, 36, 347, 322, 840, 3355, 32, 5, 30839, 9, 32293, 19, 2340, 50, 8065, 422, 1178, 134, 73, 438, 12, 4783, 428, 8151, 13, 349, 1881, 4, 381, 4, 305, 14849, 13, 16046, 134, 428, 11, 7630, 118, 134, 44550, 1168, 1696, 22993, 36, 6960, 43, 8, 7630, 118, 134, 2704, 121, 2336, 35, 4783, 338, 12, 7140, 565, 22993, 6214, 44131, 255, 571, 1640, 4825, 118, 4, 134, 35, 32302, 306, 7389, 19424, 246, 131, 121, 2336, 35, 500, 9763, 43, 338, 330, 32293, 36, 4070, 322, 20919, 8612, 24934, 12257, 9, 775, 4, 840, 3355, 32, 5, 30839, 9, 32293, 19, 2340, 50, 8065, 16046, 134, 428, 8151, 13, 349, 1881, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-TISSUE", "I-TISSUE", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "I-SMALL_MOLECULE", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}

dummy/PANELIZATION/0.1.1/train.jsonl

@@ -1 +0,0 @@
-{"tokens": ["<s>", "Figure", "\u01203", ".", "\u0120Figure", "\u01203", ".", "B", ".", "\u0120Pl", "ots", "\u0120showing", "\u0120the", "\u0120distribution", "\u0120and", "\u0120relationship", "\u0120between", "\u0120the", "\u0120fractions", "\u0120of", "\u0120deposited", "\u0120or", "\u0120free", "\u0120U", "ra", "3", "p", ",", "\u0120its", "\u0120magnitude", "\u0120of", "\u0120effect", "\u0120on", "\u0120fitness", "\u0120(", "\u00ce\u00b1", "/", "\u00ce\u00b2", "/", "\u00ce\u00b3", ")", "\u0120and", "\u0120the", "\u0120selection", "\u0120coefficient", "\u0120(", "S", ")", "\u0120in", "\u0120different", "\u0120environments", ".", "\u0120C", ".", "\u0120Average", "\u0120of", "\u0120the", "\u0120selection", "\u0120coefficient", "\u0120(", "left", ")", "\u0120and", "\u0120average", "\u0120of", "\u0120the", "\u0120cyt", "os", "olic", "\u0120flu", "orescence", "\u0120(", "equ", "ivalent", "\u0120to", "\u0120the", "\u0120fraction", "al", "\u0120abundance", "\u0120of", "\u0120the", "\u0120free", "\u0120protein", "\u0120in", "\u0120U", "RA", "3", "agg", ",", "\u0120right", ").", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 40683, 155, 4, 17965, 155, 4, 387, 4, 3037, 5992, 2018, 5, 3854, 8, 1291, 227, 5, 44807, 9, 24232, 50, 481, 121, 763, 246, 642, 6, 63, 11259, 9, 1683, 15, 5704, 36, 44721, 73, 47328, 73, 48381, 43, 8, 5, 4230, 45979, 36, 104, 43, 11, 430, 11534, 4, 230, 4, 8317, 9, 5, 4230, 45979, 36, 6960, 43, 8, 674, 9, 5, 44193, 366, 12589, 6626, 45094, 36, 8198, 32995, 7, 5, 13484, 337, 18225, 9, 5, 481, 8276, 11, 121, 4396, 246, 7165, 6, 235, 322, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PANEL_START", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}

dummy/ROLES/0.0.1/dummy_data.zip

@@ -0,0 +1,3 @@
+version https://git-lfs.github.com/spec/v1
+oid sha256:7636bfc7fc4306b518f9b7fe8e211dd19649a04d382e49a5e6cf4f5fcee3b67c
+size 3249

dummy/ROLES/0.0.1/eval.jsonl

@@ -1 +0,0 @@
-{"tokens": ["<s>", "X", "BP", "-", "1", "S", "\u0120expression", "\u0120was", "\u0120determined", "\u0120by", "\u0120I", "HC", "\u0120of", "\u0120a", "\u0120ne", "oad", "ju", "vant", "\u0120hormone", "\u0120therapy", "\u0120(", "N", "HT", ")", "\u0120tissue", "\u0120micro", "array", "\u0120containing", "\u0120samples", "\u0120from", "\u0120hormone", "\u0120na\u00c3\u00afve", "\u0120(", "unt", "reated", ")", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u012025", "),", "\u0120patients", "\u0120that", "\u0120received", "\u0120N", "HT", "\u0120for", "\u01201", "-", "6", "\u0120months", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u012033", "),", "\u0120and", "\u0120patients", "\u0120that", "\u0120received", "\u0120N", "HT", "\u0120for", "\u01207", "-", "12", "\u0120months", "\u0120(", "n", "\u0120=", "\u012050", "),", "\u0120as", "\u0120indicated", ".", "\u0120Representative", "\u0120images", "\u0120are", "\u0120shown", ".", "\u0120Scale", "\u0120bars", ":", "\u0120100", "\u0120\u00ce\u00bc", "m", ".", "Quant", "itative", "\u0120presentation", "\u0120of", "\u0120the", "\u0120data", "\u0120from", "\u0120(", "C", ").", "\u0120*", "P", "\u0120=", "\u01200", ".", "006", "\u0120in", "\u0120unp", "aired", "\u0120Student", "'s", "\u0120t", "-", "test", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 1000, 21792, 12, 134, 104, 8151, 21, 3030, 30, 38, 13459, 9, 10, 3087, 20657, 7488, 21454, 20940, 5804, 36, 487, 14469, 43, 11576, 5177, 30766, 8200, 7931, 31, 20940, 39300, 36, 5973, 34381, 43, 36, 282, 5457, 564, 238, 1484, 14, 829, 234, 14469, 13, 112, 12, 401, 377, 36, 282, 5457, 2357, 238, 8, 1484, 14, 829, 234, 14469, 13, 262, 12, 1092, 377, 36, 282, 5457, 654, 238, 25, 4658, 4, 10308, 3156, 32, 2343, 4, 33256, 5692, 35, 727, 46911, 119, 4, 44572, 26709, 5209, 9, 5, 414, 31, 36, 347, 322, 1009, 510, 5457, 321, 4, 38049, 11, 23089, 35016, 9067, 18, 326, 12, 21959, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "B-SMALL_MOLECULE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-ORGANISM", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}

dummy/ROLES/0.0.1/test.jsonl

@@ -1 +0,0 @@
-{"tokens": ["<s>", "B", ".", "\u0120Representative", "\u0120images", "\u0120of", "\u0120a", "\u0120time", "\u0120course", "\u0120analysis", "\u0120of", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", "\u0120redistribution", "\u0120to", "\u0120SG", "s", ".", "\u0120Cells", "\u0120were", "\u0120treated", "\u0120The", "\u0120graph", "\u0120(", "B", "')", "\u0120shows", "\u0120quant", "ification", "\u0120of", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", "\u0120localization", "\u0120at", "\u0120SG", "s", "\u0120over", "\u0120time", "\u0120as", "\u0120the", "\u0120ratio", "\u0120between", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", "\u0120(", "mean", "\u0120flu", "orescence", "\u0120intensity", ")", "\u0120in", "\u0120SG", "\u0120punct", "a", "\u0120and", "\u0120cyt", "os", "olic", "\u0120TR", "AP", "PC", "2", ".", "\u0120Mean", "\u0120\u00c2\u00b1", "\u0120s", ".", "e", ".", "m", ".", "\u0120n", "\u0120=", "\u012050", "\u0120cells", "\u0120per", "\u0120experiment", ",", "\u0120N", "\u0120=", "\u01203", ".", "\u0120Scale", "\u0120bar", ",", "\u012010", "\u0120\u00c2\u00b5", "m", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 387, 4, 10308, 3156, 9, 10, 86, 768, 1966, 9, 5758, 591, 4794, 176, 37531, 7, 16324, 29, 4, 42920, 58, 3032, 20, 20992, 36, 387, 27645, 924, 24934, 5000, 9, 5758, 591, 4794, 176, 45005, 23, 16324, 29, 81, 86, 25, 5, 1750, 227, 5758, 591, 4794, 176, 36, 43348, 6626, 45094, 10603, 43, 11, 16324, 15760, 102, 8, 44193, 366, 12589, 5758, 591, 4794, 176, 4, 30750, 46710, 579, 4, 242, 4, 119, 4, 295, 5457, 654, 4590, 228, 9280, 6, 234, 5457, 155, 4, 33256, 2003, 6, 158, 44200, 119, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-EXP_ASSAY", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "B-EXP_ASSAY", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "B-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "I-EXP_ASSAY", "O", "O", "B-SUBCELLULAR", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "O", "B-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "I-SUBCELLULAR", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "I-MEASURED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}

dummy/ROLES/0.0.1/train.jsonl

@@ -1 +0,0 @@
-{"tokens": ["<s>", "(", "F", ")", "\u0120RNA", "i", "\u0120of", "\u0120all", "\u0120tested", "\u0120genes", "\u0120in", "\u0120the", "\u0120TOR", "-", "PI", "3", "K", "\u0120pathways", "\u0120had", "\u0120a", "\u0120statistically", "\u0120significant", "\u0120effect", "\u0120on", "\u0120LT", "G", "\u0120flu", "orescence", "\u0120levels", ".", "\u0120Known", "\u0120negative", "\u0120regulators", "\u0120of", "\u0120aut", "oph", "agy", "\u0120are", "\u0120shown", "\u0120with", "\u0120gray", "\u0120bars", ";", "\u0120positive", "\u0120regulators", "\u0120are", "\u0120shown", "\u0120with", "\u0120white", "\u0120bars", ".", "\u0120(", "P", "ten", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "007", ";", "\u0120T", "sc", "1", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "027", ";", "\u0120T", "sc", "2", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "025", ";", "\u0120R", "he", "B", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "005", ";", "\u0120Tor", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "016", ";", "\u0120and", "\u0120S", "6", "k", ",", "\u0120P", "\u0120=", "\u01200", ".", "012", ").", "\u0120d", "s", "RNA", "\u0120corresponding", "\u0120to", "\u0120a", "\u0120human", "\u0120gene", "\u0120(", "H", "s", ")", "\u0120was", "\u0120used", "\u0120as", "\u0120a", "\u0120negative", "\u0120control", "\u0120in", "\u0120E", "\u0120and", "\u0120F", ".", "\u0120Results", "\u0120represent", "\u0120the", "\u0120mean", "\u0120value", "\u0120\u00c2\u00b1", "\u0120SD", "\u0120from", "\u0120at", "\u0120least", "\u0120three", "\u0120independent", "\u0120experiments", ".", "\u0120", "</s>"], "input_ids": [0, 1640, 597, 43, 34062, 118, 9, 70, 4776, 14819, 11, 5, 22331, 12, 11337, 246, 530, 25019, 56, 10, 27697, 1233, 1683, 15, 23614, 534, 6626, 45094, 1389, 4, 21575, 2430, 5904, 9, 7241, 6673, 37263, 32, 2343, 19, 12339, 5692, 131, 1313, 5904, 32, 2343, 19, 1104, 5692, 4, 36, 510, 3869, 6, 221, 5457, 321, 4, 35723, 131, 255, 3866, 134, 6, 221, 5457, 321, 4, 40819, 131, 255, 3866, 176, 6, 221, 5457, 321, 4, 36453, 131, 248, 700, 387, 6, 221, 5457, 321, 4, 31866, 131, 6623, 6, 221, 5457, 321, 4, 36192, 131, 8, 208, 401, 330, 6, 221, 5457, 321, 4, 37524, 322, 385, 29, 43612, 12337, 7, 10, 1050, 10596, 36, 725, 29, 43, 21, 341, 25, 10, 2430, 797, 11, 381, 8, 274, 4, 12499, 3594, 5, 1266, 923, 46710, 12723, 31, 23, 513, 130, 2222, 15491, 4, 1437, 2], "label_ids": {"entity_types": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-GENEPROD", "I-GENEPROD", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "geneprod_roles": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "I-CONTROLLED_VAR", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "boring": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-BORING", "I-BORING", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"], "panel_start": ["O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"]}}