VatsaDev commited on
Commit
f39b3c6
1 Parent(s): 7c55986

Upload 1a9n_MC with huggingface_hub

Browse files
Files changed (1) hide show
  1. 1a9n_MC +621 -0
1a9n_MC ADDED
@@ -0,0 +1,621 @@
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
+ Residue conformations -------------------------------------------
2
+ Q0 : C C3p_endo anti
3
+ Q1 : C C3p_endo anti
4
+ Q2 : U C1p_endo anti
5
+ Q3 : G C2p_exo anti
6
+ Q4 : G C3p_endo anti
7
+ Q5 : U C3p_endo anti
8
+ Q6 : A C3p_endo anti
9
+ Q7 : U C3p_endo anti
10
+ Q8 : U C2p_endo anti
11
+ Q9 : G C3p_endo anti
12
+ Q10 : C C3p_exo anti
13
+ Q11 : A C3p_endo anti
14
+ Q12 : G C2p_endo syn
15
+ Q13 : U C2p_endo anti
16
+ Q14 : A C1p_endo anti
17
+ Q15 : C C3p_endo anti
18
+ Q16 : C C1p_exo anti
19
+ Q17 : U C3p_endo anti
20
+ Q18 : C C3p_endo anti
21
+ Q19 : C C3p_endo anti
22
+ Q20 : A C3p_endo anti
23
+ Q21 : G C3p_endo anti
24
+ Q22 : G C3p_endo anti
25
+ Q23 : U C2p_exo anti
26
+ R0 : C C3p_endo anti
27
+ R1 : C C3p_endo anti
28
+ R2 : U C1p_endo anti
29
+ R3 : G C2p_exo anti
30
+ R4 : G C3p_endo anti
31
+ R5 : U C3p_endo anti
32
+ R6 : A C3p_endo anti
33
+ R7 : U C3p_endo anti
34
+ R8 : U C2p_endo anti
35
+ R9 : G C3p_endo anti
36
+ R10 : C C3p_exo anti
37
+ R11 : A C3p_endo anti
38
+ R12 : G C1p_exo syn
39
+ R13 : U C2p_endo anti
40
+ R14 : A C1p_endo anti
41
+ R15 : C C3p_endo anti
42
+ R16 : C C2p_endo anti
43
+ R17 : U C3p_endo anti
44
+ R18 : C C3p_endo anti
45
+ R19 : C C3p_endo anti
46
+ R20 : A C3p_endo anti
47
+ R21 : G C3p_endo anti
48
+ R22 : G C3p_endo anti
49
+ R23 : U C1p_endo anti
50
+ A2 : VAL
51
+ A3 : LYS
52
+ A4 : LEU
53
+ A5 : THR
54
+ A6 : ALA
55
+ A7 : GLU
56
+ A8 : LEU
57
+ A9 : ILE
58
+ A10 : GLU
59
+ A11 : GLN
60
+ A12 : ALA
61
+ A13 : ALA
62
+ A14 : GLN
63
+ A15 : TYR
64
+ A16 : THR
65
+ A17 : ASN
66
+ A18 : ALA
67
+ A19 : VAL
68
+ A20 : ARG
69
+ A21 : ASP
70
+ A22 : ARG
71
+ A23 : GLU
72
+ A24 : LEU
73
+ A25 : ASP
74
+ A26 : LEU
75
+ A27 : ARG
76
+ A28 : GLY
77
+ A29 : TYR
78
+ A30 : LYS
79
+ A31 : ILE
80
+ A32 : PRO
81
+ A33 : VAL
82
+ A34 : ILE
83
+ A35 : GLU
84
+ A36 : ASN
85
+ A37 : LEU
86
+ A38 : GLY
87
+ A39 : ALA
88
+ A40 : THR
89
+ A41 : LEU
90
+ A42 : ASP
91
+ A43 : GLN
92
+ A44 : PHE
93
+ A45 : ASP
94
+ A46 : ALA
95
+ A47 : ILE
96
+ A48 : ASP
97
+ A49 : PHE
98
+ A50 : SER
99
+ A51 : ASP
100
+ A52 : ASN
101
+ A53 : GLU
102
+ A54 : ILE
103
+ A55 : ARG
104
+ A56 : LYS
105
+ A57 : LEU
106
+ A58 : ASP
107
+ A59 : GLY
108
+ A60 : PHE
109
+ A61 : PRO
110
+ A62 : LEU
111
+ A63 : LEU
112
+ A64 : ARG
113
+ A65 : ARG
114
+ A66 : LEU
115
+ A67 : LYS
116
+ A68 : THR
117
+ A69 : LEU
118
+ A70 : LEU
119
+ A71 : VAL
120
+ A72 : ASN
121
+ A73 : ASN
122
+ A74 : ASN
123
+ A75 : ARG
124
+ A76 : ILE
125
+ A77 : CYS
126
+ A78 : ARG
127
+ A79 : ILE
128
+ A80 : GLY
129
+ A81 : GLU
130
+ A82 : GLY
131
+ A83 : LEU
132
+ A84 : ASP
133
+ A85 : GLN
134
+ A86 : ALA
135
+ A87 : LEU
136
+ A88 : PRO
137
+ A89 : ASP
138
+ A90 : LEU
139
+ A91 : THR
140
+ A92 : GLU
141
+ A93 : LEU
142
+ A94 : ILE
143
+ A95 : LEU
144
+ A96 : THR
145
+ A97 : ASN
146
+ A98 : ASN
147
+ A99 : SER
148
+ A100 : LEU
149
+ A101 : VAL
150
+ A102 : GLU
151
+ A103 : LEU
152
+ A104 : GLY
153
+ A105 : ASP
154
+ A106 : LEU
155
+ A107 : ASP
156
+ A108 : PRO
157
+ A109 : LEU
158
+ A110 : ALA
159
+ A111 : SER
160
+ A112 : LEU
161
+ A113 : LYS
162
+ A114 : SER
163
+ A115 : LEU
164
+ A116 : THR
165
+ A117 : TYR
166
+ A118 : LEU
167
+ A119 : CYS
168
+ A120 : ILE
169
+ A121 : LEU
170
+ A122 : ARG
171
+ A123 : ASN
172
+ A124 : PRO
173
+ A125 : VAL
174
+ A126 : THR
175
+ A127 : ASN
176
+ A128 : LYS
177
+ A129 : LYS
178
+ A130 : HIS
179
+ A131 : TYR
180
+ A132 : ARG
181
+ A133 : LEU
182
+ A134 : TYR
183
+ A135 : VAL
184
+ A136 : ILE
185
+ A137 : TYR
186
+ A138 : LYS
187
+ A139 : VAL
188
+ A140 : PRO
189
+ A141 : GLN
190
+ A142 : VAL
191
+ A143 : ARG
192
+ A144 : VAL
193
+ A145 : LEU
194
+ A146 : ASP
195
+ A147 : PHE
196
+ A148 : GLN
197
+ A149 : LYS
198
+ A150 : VAL
199
+ A151 : LYS
200
+ A152 : LEU
201
+ A153 : LYS
202
+ A154 : GLU
203
+ A155 : ARG
204
+ A156 : GLN
205
+ A157 : GLU
206
+ A158 : ALA
207
+ A159 : GLU
208
+ A160 : LYS
209
+ A161 : MET
210
+ A162 : PHE
211
+ A163 : LYS
212
+ C2 : VAL
213
+ C3 : LYS
214
+ C4 : LEU
215
+ C5 : THR
216
+ C6 : ALA
217
+ C7 : GLU
218
+ C8 : LEU
219
+ C9 : ILE
220
+ C10 : GLU
221
+ C11 : GLN
222
+ C12 : ALA
223
+ C13 : ALA
224
+ C14 : GLN
225
+ C15 : TYR
226
+ C16 : THR
227
+ C17 : ASN
228
+ C18 : ALA
229
+ C19 : VAL
230
+ C20 : ARG
231
+ C21 : ASP
232
+ C22 : ARG
233
+ C23 : GLU
234
+ C24 : LEU
235
+ C25 : ASP
236
+ C26 : LEU
237
+ C27 : ARG
238
+ C28 : GLY
239
+ C29 : TYR
240
+ C30 : LYS
241
+ C31 : ILE
242
+ C32 : PRO
243
+ C33 : VAL
244
+ C34 : ILE
245
+ C35 : GLU
246
+ C36 : ASN
247
+ C37 : LEU
248
+ C38 : GLY
249
+ C39 : ALA
250
+ C40 : THR
251
+ C41 : LEU
252
+ C42 : ASP
253
+ C43 : GLN
254
+ C44 : PHE
255
+ C45 : ASP
256
+ C46 : ALA
257
+ C47 : ILE
258
+ C48 : ASP
259
+ C49 : PHE
260
+ C50 : SER
261
+ C51 : ASP
262
+ C52 : ASN
263
+ C53 : GLU
264
+ C54 : ILE
265
+ C55 : ARG
266
+ C56 : LYS
267
+ C57 : LEU
268
+ C58 : ASP
269
+ C59 : GLY
270
+ C60 : PHE
271
+ C61 : PRO
272
+ C62 : LEU
273
+ C63 : LEU
274
+ C64 : ARG
275
+ C65 : ARG
276
+ C66 : LEU
277
+ C67 : LYS
278
+ C68 : THR
279
+ C69 : LEU
280
+ C70 : LEU
281
+ C71 : VAL
282
+ C72 : ASN
283
+ C73 : ASN
284
+ C74 : ASN
285
+ C75 : ARG
286
+ C76 : ILE
287
+ C77 : CYS
288
+ C78 : ARG
289
+ C79 : ILE
290
+ C80 : GLY
291
+ C81 : GLU
292
+ C82 : GLY
293
+ C83 : LEU
294
+ C84 : ASP
295
+ C85 : GLN
296
+ C86 : ALA
297
+ C87 : LEU
298
+ C88 : PRO
299
+ C89 : ASP
300
+ C90 : LEU
301
+ C91 : THR
302
+ C92 : GLU
303
+ C93 : LEU
304
+ C94 : ILE
305
+ C95 : LEU
306
+ C96 : THR
307
+ C97 : ASN
308
+ C98 : ASN
309
+ C99 : SER
310
+ C100 : LEU
311
+ C101 : VAL
312
+ C102 : GLU
313
+ C103 : LEU
314
+ C104 : GLY
315
+ C105 : ASP
316
+ C106 : LEU
317
+ C107 : ASP
318
+ C108 : PRO
319
+ C109 : LEU
320
+ C110 : ALA
321
+ C111 : SER
322
+ C112 : LEU
323
+ C113 : LYS
324
+ C114 : SER
325
+ C115 : LEU
326
+ C116 : THR
327
+ C117 : TYR
328
+ C118 : LEU
329
+ C119 : CYS
330
+ C120 : ILE
331
+ C121 : LEU
332
+ C122 : ARG
333
+ C123 : ASN
334
+ C124 : PRO
335
+ C125 : VAL
336
+ C126 : THR
337
+ C127 : ASN
338
+ C128 : LYS
339
+ C129 : LYS
340
+ C130 : HIS
341
+ C131 : TYR
342
+ C132 : ARG
343
+ C133 : LEU
344
+ C134 : TYR
345
+ C135 : VAL
346
+ C136 : ILE
347
+ C137 : TYR
348
+ C138 : LYS
349
+ C139 : VAL
350
+ C140 : PRO
351
+ C141 : GLN
352
+ C142 : VAL
353
+ C143 : ARG
354
+ C144 : VAL
355
+ C145 : LEU
356
+ C146 : ASP
357
+ C147 : PHE
358
+ C148 : GLN
359
+ C149 : LYS
360
+ C150 : VAL
361
+ C151 : LYS
362
+ C152 : LEU
363
+ C153 : LYS
364
+ C154 : GLU
365
+ C155 : ARG
366
+ C156 : GLN
367
+ C157 : GLU
368
+ C158 : ALA
369
+ C159 : GLU
370
+ C160 : LYS
371
+ C161 : MET
372
+ C162 : PHE
373
+ C163 : LYS
374
+ C164 : GLY
375
+ C165 : LYS
376
+ C166 : ARG
377
+ C167 : GLY
378
+ C168 : ALA
379
+ C169 : GLN
380
+ C170 : LEU
381
+ C171 : ALA
382
+ C172 : LYS
383
+ C173 : ASP
384
+ C174 : ILE
385
+ C175 : ALA
386
+ B6 : ILE
387
+ B7 : ARG
388
+ B8 : PRO
389
+ B9 : ASN
390
+ B10 : HIS
391
+ B11 : THR
392
+ B12 : ILE
393
+ B13 : TYR
394
+ B14 : ILE
395
+ B15 : ASN
396
+ B16 : ASN
397
+ B17 : MET
398
+ B18 : ASN
399
+ B19 : ASP
400
+ B20 : LYS
401
+ B21 : ILE
402
+ B22 : LYS
403
+ B23 : LYS
404
+ B24 : GLU
405
+ B25 : GLU
406
+ B26 : LEU
407
+ B27 : LYS
408
+ B28 : ARG
409
+ B29 : SER
410
+ B30 : LEU
411
+ B31 : TYR
412
+ B32 : ALA
413
+ B33 : LEU
414
+ B34 : PHE
415
+ B35 : SER
416
+ B36 : GLN
417
+ B37 : PHE
418
+ B38 : GLY
419
+ B39 : HIS
420
+ B40 : VAL
421
+ B41 : VAL
422
+ B42 : ASP
423
+ B43 : ILE
424
+ B44 : VAL
425
+ B45 : ALA
426
+ B46 : LEU
427
+ B47 : LYS
428
+ B48 : THR
429
+ B49 : MET
430
+ B50 : LYS
431
+ B51 : MET
432
+ B52 : ARG
433
+ B53 : GLY
434
+ B54 : GLN
435
+ B55 : ALA
436
+ B56 : PHE
437
+ B57 : VAL
438
+ B58 : ILE
439
+ B59 : PHE
440
+ B60 : LYS
441
+ B61 : GLU
442
+ B62 : LEU
443
+ B63 : GLY
444
+ B64 : SER
445
+ B65 : SER
446
+ B66 : THR
447
+ B67 : ASN
448
+ B68 : ALA
449
+ B69 : LEU
450
+ B70 : ARG
451
+ B71 : GLN
452
+ B72 : LEU
453
+ B73 : GLN
454
+ B74 : GLY
455
+ B75 : PHE
456
+ B76 : PRO
457
+ B77 : PHE
458
+ B78 : TYR
459
+ B79 : GLY
460
+ B80 : LYS
461
+ B81 : PRO
462
+ B82 : MET
463
+ B83 : ARG
464
+ B84 : ILE
465
+ B85 : GLN
466
+ B86 : TYR
467
+ B87 : ALA
468
+ B88 : LYS
469
+ B89 : THR
470
+ B90 : ASP
471
+ B91 : SER
472
+ B92 : ASP
473
+ B93 : ILE
474
+ B94 : ILE
475
+ B95 : SER
476
+ B96 : LYS
477
+ B97 : MET
478
+ B98 : ARG
479
+ B99 : GLY
480
+ D6 : ILE
481
+ D7 : ARG
482
+ D8 : PRO
483
+ D9 : ASN
484
+ D10 : HIS
485
+ D11 : THR
486
+ D12 : ILE
487
+ D13 : TYR
488
+ D14 : ILE
489
+ D15 : ASN
490
+ D16 : ASN
491
+ D17 : MET
492
+ D18 : ASN
493
+ D19 : ASP
494
+ D20 : LYS
495
+ D21 : ILE
496
+ D22 : LYS
497
+ D23 : LYS
498
+ D24 : GLU
499
+ D25 : GLU
500
+ D26 : LEU
501
+ D27 : LYS
502
+ D28 : ARG
503
+ D29 : SER
504
+ D30 : LEU
505
+ D31 : TYR
506
+ D32 : ALA
507
+ D33 : LEU
508
+ D34 : PHE
509
+ D35 : SER
510
+ D36 : GLN
511
+ D37 : PHE
512
+ D38 : GLY
513
+ D39 : HIS
514
+ D40 : VAL
515
+ D41 : VAL
516
+ D42 : ASP
517
+ D43 : ILE
518
+ D44 : VAL
519
+ D45 : ALA
520
+ D46 : LEU
521
+ D47 : LYS
522
+ D48 : THR
523
+ D49 : MET
524
+ D50 : LYS
525
+ D51 : MET
526
+ D52 : ARG
527
+ D53 : GLY
528
+ D54 : GLN
529
+ D55 : ALA
530
+ D56 : PHE
531
+ D57 : VAL
532
+ D58 : ILE
533
+ D59 : PHE
534
+ D60 : LYS
535
+ D61 : GLU
536
+ D62 : LEU
537
+ D63 : GLY
538
+ D64 : SER
539
+ D65 : SER
540
+ D66 : THR
541
+ D67 : ASN
542
+ D68 : ALA
543
+ D69 : LEU
544
+ D70 : ARG
545
+ D71 : GLN
546
+ D72 : LEU
547
+ D73 : GLN
548
+ D74 : GLY
549
+ D75 : PHE
550
+ D76 : PRO
551
+ D77 : PHE
552
+ D78 : TYR
553
+ D79 : GLY
554
+ D80 : LYS
555
+ D81 : PRO
556
+ D82 : MET
557
+ D83 : ARG
558
+ D84 : ILE
559
+ D85 : GLN
560
+ D86 : TYR
561
+ D87 : ALA
562
+ D88 : LYS
563
+ D89 : THR
564
+ D90 : ASP
565
+ D91 : SER
566
+ D92 : ASP
567
+ D93 : ILE
568
+ D94 : ILE
569
+ D95 : SER
570
+ D96 : LYS
571
+ D97 : MET
572
+ D98 : ARG
573
+ Adjacent stackings ----------------------------------------------
574
+ Q0-Q1 : adjacent_5p upward
575
+ Q1-Q2 : adjacent_5p upward
576
+ Q3-Q4 : adjacent_5p upward
577
+ Q4-Q5 : adjacent_5p upward
578
+ Q6-Q7 : adjacent_5p upward
579
+ Q11-Q12 : adjacent_5p inward
580
+ Q14-Q15 : adjacent_5p upward
581
+ Q15-Q16 : adjacent_5p upward
582
+ Q17-Q18 : adjacent_5p upward
583
+ Q19-Q20 : adjacent_5p upward
584
+ Q20-Q21 : adjacent_5p upward
585
+ Q21-Q22 : adjacent_5p upward
586
+ Q22-Q23 : adjacent_5p upward
587
+ R0-R1 : adjacent_5p upward
588
+ R1-R2 : adjacent_5p upward
589
+ R2-R3 : adjacent_5p upward
590
+ R3-R4 : adjacent_5p upward
591
+ R4-R5 : adjacent_5p upward
592
+ R6-R7 : adjacent_5p upward
593
+ R11-R12 : adjacent_5p inward
594
+ R14-R15 : adjacent_5p upward
595
+ R15-R16 : adjacent_5p upward
596
+ R17-R18 : adjacent_5p upward
597
+ R19-R20 : adjacent_5p upward
598
+ R20-R21 : adjacent_5p upward
599
+ R21-R22 : adjacent_5p upward
600
+ R22-R23 : adjacent_5p upward
601
+ Non-Adjacent stackings ------------------------------------------
602
+ Q3-Q20 : outward
603
+ Q6-Q17 : outward
604
+ R3-R20 : outward
605
+ R6-R17 : outward
606
+ Number of stackings = 31
607
+ Number of adjacent stackings = 27
608
+ Number of non adjacent stackings = 4
609
+ Base-pairs ------------------------------------------------------
610
+ Q0-Q22 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
611
+ Q1-Q21 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
612
+ Q2-Q20 : U-A Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
613
+ Q3-Q19 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
614
+ Q4-Q18 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
615
+ Q5-Q17 : U-U Ws/Ww pairing antiparallel cis XVI
616
+ R0-R22 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
617
+ R1-R21 : C-G Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
618
+ R2-R20 : U-A Ww/Ww pairing antiparallel cis XX
619
+ R3-R19 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
620
+ R4-R18 : G-C Ww/Ww pairing antiparallel cis XIX
621
+ R5-R17 : U-U Ws/Ww pairing antiparallel cis XVI