Add new SentenceTransformer model
Browse files- 1_Pooling/config.json +10 -0
- README.md +528 -0
- config.json +32 -0
- config_sentence_transformers.json +10 -0
- model.safetensors +3 -0
- modules.json +14 -0
- sentence_bert_config.json +4 -0
- special_tokens_map.json +7 -0
- tokenizer.json +0 -0
- tokenizer_config.json +58 -0
- vocab.txt +0 -0
1_Pooling/config.json
ADDED
@@ -0,0 +1,10 @@
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
1 |
+
{
|
2 |
+
"word_embedding_dimension": 768,
|
3 |
+
"pooling_mode_cls_token": false,
|
4 |
+
"pooling_mode_mean_tokens": true,
|
5 |
+
"pooling_mode_max_tokens": false,
|
6 |
+
"pooling_mode_mean_sqrt_len_tokens": false,
|
7 |
+
"pooling_mode_weightedmean_tokens": false,
|
8 |
+
"pooling_mode_lasttoken": false,
|
9 |
+
"include_prompt": true
|
10 |
+
}
|
README.md
ADDED
@@ -0,0 +1,528 @@
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
1 |
+
---
|
2 |
+
tags:
|
3 |
+
- sentence-transformers
|
4 |
+
- sentence-similarity
|
5 |
+
- feature-extraction
|
6 |
+
- generated_from_trainer
|
7 |
+
- dataset_size:1868
|
8 |
+
- loss:MultipleNegativesRankingLoss
|
9 |
+
base_model: DeepPavlov/rubert-base-cased
|
10 |
+
widget:
|
11 |
+
- source_sentence: Синтетический аналог природного ГнРГ. Бусерелин конкурентно связывается
|
12 |
+
с рецепторами клеток передней доли гипофиза, вызывая кратковременное повышение
|
13 |
+
уровня половых гормонов в плазме крови. Дальнейшее применение лечебных доз препарата
|
14 |
+
приводит (в среднем через 12–14 дней) к полной блокаде гонадотропной функции гипофиза,
|
15 |
+
ингибируя, таким образом, выделение ЛГ и ФСГ. В результате наблюдается подавление
|
16 |
+
синтеза половых гормонов в гонадах, что проявляется снижением концентрации эстрадиола
|
17 |
+
в плазме крови до постклимактерических значений у женщин и снижением содержания
|
18 |
+
тестостерона до посткастрационного уровня у мужчин.
|
19 |
+
sentences:
|
20 |
+
- Глубокие мышцы спины участвуют в акте дыхания?
|
21 |
+
- При приеме бусерелина происходит стойкое повышение концентрации половых гормонов
|
22 |
+
в плазме крови?
|
23 |
+
- Антитела к меполизумабу могут вырабытываться в организме после введения первой
|
24 |
+
дозы меполизумаба?
|
25 |
+
- source_sentence: Этилметилгидроксипиридина сукцинат является ингибитором свободнорадикальных
|
26 |
+
процессов, мембранопротектором, обладающим антигипоксическим, стресспротекторным,
|
27 |
+
ноотропным, противосудорожным и анксиолитическим действием. Этилметилгидроксипиридина
|
28 |
+
сукцинат повышает резистентность организма к воздействию различных повреждающих
|
29 |
+
факторов (шок, гипоксия и ишемия, нарушения мозгового кровообращения, интоксикация
|
30 |
+
алкоголем и антипсихотическими средствами — нейролептиками).
|
31 |
+
sentences:
|
32 |
+
- Эту болезнь относят к острым заболеваниям?
|
33 |
+
- Этилметилгидроксипиридина сукцинат повышает устойчивость организма к интоксикации
|
34 |
+
алкоголем?
|
35 |
+
- Компонент положительно влияет на клетки печени?
|
36 |
+
- source_sentence: Аторвастатин в дозе 80 мг/сут уменьшает риск развития повторного
|
37 |
+
фатального или нефатального инсульта у пациентов, перенесших инсульт или транзиторную
|
38 |
+
ишемическую атаку (ТИА) без ИБС в анамнезе (исследование по профилактике инсульта
|
39 |
+
при интенсивном снижении концентрации Хс (SPARCL), на 16% по сравнению с пациентами
|
40 |
+
группы плацебо. При этом значительно снижается риск развития основных сердечно-сосудистых
|
41 |
+
осложнений и процедур реваскуляризации. Сокращение риска сердечно-сосудистых нарушений
|
42 |
+
при терапии аторвастатином отмечается у всех групп пациентов, кроме той, куда
|
43 |
+
вошли пациенты с первичным или повторным геморрагическим инсультом.
|
44 |
+
sentences:
|
45 |
+
- Клинические исследования препарата аторвастатин не проводились?
|
46 |
+
- Споры бактерии попадают в организм человека через лёгкие?
|
47 |
+
- Феринжект содержит большое количество свободного железа?
|
48 |
+
- source_sentence: 'При нанесении геля на обширные участки кожи не исключено развитие
|
49 |
+
системных побочных реакций: изжога, тошнота, рвота, диарея, гастралгия, изъязвление
|
50 |
+
слизистой ЖКТ, повышение активности печеночных трансаминаз; головная боль, головокружение;
|
51 |
+
задержка жидкости, гематурия; аллергические реакции (анафилактический шок, кожная
|
52 |
+
сыпь); тромбоцитопения, лейкопения, анемия, агранулоцитоз, удлинение времени кровотечения.'
|
53 |
+
sentences:
|
54 |
+
- Гель не следует наносить на обширные участки кожи во избежание развития побочных
|
55 |
+
эффектов?
|
56 |
+
- Миоглобин тождественен гемоглобину?
|
57 |
+
- Туберкулезный плеврит является сердечным заболеванием?
|
58 |
+
- source_sentence: 'Эндометрит — воспаление слизистой оболочки матки. Возникает в
|
59 |
+
результате проникновения в матку патогенных микроорганизмов: стрептококков, стафилококков,
|
60 |
+
гонококков, кишечных палочек, микобактерий туберкулеза, трихомонад, бактероидов,
|
61 |
+
хламидий, вирусов и др. Инфицирование может происходить восходящим (из влагалища,
|
62 |
+
канала шейки матки), гематогенным и лимфогенным путем. Возбудители инфекции могут
|
63 |
+
попадать в полость матки извне — при несоблюдении правил асептики и антисептики
|
64 |
+
во время проведения внутриматочных диагностических и лечебных манипуляций. Чаще
|
65 |
+
эндометрит рязвивается после родов, аборта.'
|
66 |
+
sentences:
|
67 |
+
- Эндометрит может случиться при попадании бактерий кишечной палочки в желудок?
|
68 |
+
- Применение эпидуральной анестезии к детям сопряжено с риском осложнений?
|
69 |
+
- Проникающее ранение грудной клетки может привести к удушью?
|
70 |
+
pipeline_tag: sentence-similarity
|
71 |
+
library_name: sentence-transformers
|
72 |
+
metrics:
|
73 |
+
- cosine_accuracy@1
|
74 |
+
- cosine_accuracy@3
|
75 |
+
- cosine_accuracy@5
|
76 |
+
- cosine_accuracy@10
|
77 |
+
- cosine_precision@1
|
78 |
+
- cosine_precision@3
|
79 |
+
- cosine_precision@5
|
80 |
+
- cosine_precision@10
|
81 |
+
- cosine_recall@1
|
82 |
+
- cosine_recall@3
|
83 |
+
- cosine_recall@5
|
84 |
+
- cosine_recall@10
|
85 |
+
- cosine_ndcg@10
|
86 |
+
- cosine_mrr@10
|
87 |
+
- cosine_map@100
|
88 |
+
model-index:
|
89 |
+
- name: SentenceTransformer based on DeepPavlov/rubert-base-cased
|
90 |
+
results:
|
91 |
+
- task:
|
92 |
+
type: information-retrieval
|
93 |
+
name: Information Retrieval
|
94 |
+
dataset:
|
95 |
+
name: Unknown
|
96 |
+
type: unknown
|
97 |
+
metrics:
|
98 |
+
- type: cosine_accuracy@1
|
99 |
+
value: 0.5144230769230769
|
100 |
+
name: Cosine Accuracy@1
|
101 |
+
- type: cosine_accuracy@3
|
102 |
+
value: 0.6778846153846154
|
103 |
+
name: Cosine Accuracy@3
|
104 |
+
- type: cosine_accuracy@5
|
105 |
+
value: 0.7115384615384616
|
106 |
+
name: Cosine Accuracy@5
|
107 |
+
- type: cosine_accuracy@10
|
108 |
+
value: 0.7740384615384616
|
109 |
+
name: Cosine Accuracy@10
|
110 |
+
- type: cosine_precision@1
|
111 |
+
value: 0.5144230769230769
|
112 |
+
name: Cosine Precision@1
|
113 |
+
- type: cosine_precision@3
|
114 |
+
value: 0.22596153846153846
|
115 |
+
name: Cosine Precision@3
|
116 |
+
- type: cosine_precision@5
|
117 |
+
value: 0.1423076923076923
|
118 |
+
name: Cosine Precision@5
|
119 |
+
- type: cosine_precision@10
|
120 |
+
value: 0.07740384615384616
|
121 |
+
name: Cosine Precision@10
|
122 |
+
- type: cosine_recall@1
|
123 |
+
value: 0.5144230769230769
|
124 |
+
name: Cosine Recall@1
|
125 |
+
- type: cosine_recall@3
|
126 |
+
value: 0.6778846153846154
|
127 |
+
name: Cosine Recall@3
|
128 |
+
- type: cosine_recall@5
|
129 |
+
value: 0.7115384615384616
|
130 |
+
name: Cosine Recall@5
|
131 |
+
- type: cosine_recall@10
|
132 |
+
value: 0.7740384615384616
|
133 |
+
name: Cosine Recall@10
|
134 |
+
- type: cosine_ndcg@10
|
135 |
+
value: 0.6458227834531023
|
136 |
+
name: Cosine Ndcg@10
|
137 |
+
- type: cosine_mrr@10
|
138 |
+
value: 0.6046646062271062
|
139 |
+
name: Cosine Mrr@10
|
140 |
+
- type: cosine_map@100
|
141 |
+
value: 0.6106374762191299
|
142 |
+
name: Cosine Map@100
|
143 |
+
---
|
144 |
+
|
145 |
+
# SentenceTransformer based on DeepPavlov/rubert-base-cased
|
146 |
+
|
147 |
+
This is a [sentence-transformers](https://www.SBERT.net) model finetuned from [DeepPavlov/rubert-base-cased](https://huggingface.co/DeepPavlov/rubert-base-cased) on the json dataset. It maps sentences & paragraphs to a 768-dimensional dense vector space and can be used for semantic textual similarity, semantic search, paraphrase mining, text classification, clustering, and more.
|
148 |
+
|
149 |
+
## Model Details
|
150 |
+
|
151 |
+
### Model Description
|
152 |
+
- **Model Type:** Sentence Transformer
|
153 |
+
- **Base model:** [DeepPavlov/rubert-base-cased](https://huggingface.co/DeepPavlov/rubert-base-cased) <!-- at revision 4036cab694767a299f2b9e6492909664d9414229 -->
|
154 |
+
- **Maximum Sequence Length:** 512 tokens
|
155 |
+
- **Output Dimensionality:** 768 dimensions
|
156 |
+
- **Similarity Function:** Cosine Similarity
|
157 |
+
- **Training Dataset:**
|
158 |
+
- json
|
159 |
+
<!-- - **Language:** Unknown -->
|
160 |
+
<!-- - **License:** Unknown -->
|
161 |
+
|
162 |
+
### Model Sources
|
163 |
+
|
164 |
+
- **Documentation:** [Sentence Transformers Documentation](https://sbert.net)
|
165 |
+
- **Repository:** [Sentence Transformers on GitHub](https://github.com/UKPLab/sentence-transformers)
|
166 |
+
- **Hugging Face:** [Sentence Transformers on Hugging Face](https://huggingface.co/models?library=sentence-transformers)
|
167 |
+
|
168 |
+
### Full Model Architecture
|
169 |
+
|
170 |
+
```
|
171 |
+
SentenceTransformer(
|
172 |
+
(0): Transformer({'max_seq_length': 512, 'do_lower_case': False}) with Transformer model: BertModel
|
173 |
+
(1): Pooling({'word_embedding_dimension': 768, 'pooling_mode_cls_token': False, 'pooling_mode_mean_tokens': True, 'pooling_mode_max_tokens': False, 'pooling_mode_mean_sqrt_len_tokens': False, 'pooling_mode_weightedmean_tokens': False, 'pooling_mode_lasttoken': False, 'include_prompt': True})
|
174 |
+
)
|
175 |
+
```
|
176 |
+
|
177 |
+
## Usage
|
178 |
+
|
179 |
+
### Direct Usage (Sentence Transformers)
|
180 |
+
|
181 |
+
First install the Sentence Transformers library:
|
182 |
+
|
183 |
+
```bash
|
184 |
+
pip install -U sentence-transformers
|
185 |
+
```
|
186 |
+
|
187 |
+
Then you can load this model and run inference.
|
188 |
+
```python
|
189 |
+
from sentence_transformers import SentenceTransformer
|
190 |
+
|
191 |
+
# Download from the 🤗 Hub
|
192 |
+
model = SentenceTransformer("TrungKiencding/Medbert-based-RuBert")
|
193 |
+
# Run inference
|
194 |
+
sentences = [
|
195 |
+
'Эндометрит — воспаление слизистой оболочки матки. Возникает в результате проникновения в матку патогенных микроорганизмов: стрептококков, стафилококков, гонококков, кишечных палочек, микобактерий туберкулеза, трихомонад, бактероидов, хламидий, вирусов и др. Инфицирование может происходить восходящим (из влагалища, канала шейки матки), гематогенным и лимфогенным путем. Возбудители инфекции могут попадать в полость матки извне — при несоблюдении правил асептики и антисептики во время проведения внутриматочных диагностических и лечебных манипуляций. Чаще эндометрит рязвивается после родов, аборта.',
|
196 |
+
'Эндометрит может случиться при попадании бактерий кишечной палочки в желудок?',
|
197 |
+
'Проникающее ранение грудной клетки может привести к удушью?',
|
198 |
+
]
|
199 |
+
embeddings = model.encode(sentences)
|
200 |
+
print(embeddings.shape)
|
201 |
+
# [3, 768]
|
202 |
+
|
203 |
+
# Get the similarity scores for the embeddings
|
204 |
+
similarities = model.similarity(embeddings, embeddings)
|
205 |
+
print(similarities.shape)
|
206 |
+
# [3, 3]
|
207 |
+
```
|
208 |
+
|
209 |
+
<!--
|
210 |
+
### Direct Usage (Transformers)
|
211 |
+
|
212 |
+
<details><summary>Click to see the direct usage in Transformers</summary>
|
213 |
+
|
214 |
+
</details>
|
215 |
+
-->
|
216 |
+
|
217 |
+
<!--
|
218 |
+
### Downstream Usage (Sentence Transformers)
|
219 |
+
|
220 |
+
You can finetune this model on your own dataset.
|
221 |
+
|
222 |
+
<details><summary>Click to expand</summary>
|
223 |
+
|
224 |
+
</details>
|
225 |
+
-->
|
226 |
+
|
227 |
+
<!--
|
228 |
+
### Out-of-Scope Use
|
229 |
+
|
230 |
+
*List how the model may foreseeably be misused and address what users ought not to do with the model.*
|
231 |
+
-->
|
232 |
+
|
233 |
+
## Evaluation
|
234 |
+
|
235 |
+
### Metrics
|
236 |
+
|
237 |
+
#### Information Retrieval
|
238 |
+
|
239 |
+
* Evaluated with [<code>InformationRetrievalEvaluator</code>](https://sbert.net/docs/package_reference/sentence_transformer/evaluation.html#sentence_transformers.evaluation.InformationRetrievalEvaluator)
|
240 |
+
|
241 |
+
| Metric | Value |
|
242 |
+
|:--------------------|:-----------|
|
243 |
+
| cosine_accuracy@1 | 0.5144 |
|
244 |
+
| cosine_accuracy@3 | 0.6779 |
|
245 |
+
| cosine_accuracy@5 | 0.7115 |
|
246 |
+
| cosine_accuracy@10 | 0.774 |
|
247 |
+
| cosine_precision@1 | 0.5144 |
|
248 |
+
| cosine_precision@3 | 0.226 |
|
249 |
+
| cosine_precision@5 | 0.1423 |
|
250 |
+
| cosine_precision@10 | 0.0774 |
|
251 |
+
| cosine_recall@1 | 0.5144 |
|
252 |
+
| cosine_recall@3 | 0.6779 |
|
253 |
+
| cosine_recall@5 | 0.7115 |
|
254 |
+
| cosine_recall@10 | 0.774 |
|
255 |
+
| **cosine_ndcg@10** | **0.6458** |
|
256 |
+
| cosine_mrr@10 | 0.6047 |
|
257 |
+
| cosine_map@100 | 0.6106 |
|
258 |
+
|
259 |
+
<!--
|
260 |
+
## Bias, Risks and Limitations
|
261 |
+
|
262 |
+
*What are the known or foreseeable issues stemming from this model? You could also flag here known failure cases or weaknesses of the model.*
|
263 |
+
-->
|
264 |
+
|
265 |
+
<!--
|
266 |
+
### Recommendations
|
267 |
+
|
268 |
+
*What are recommendations with respect to the foreseeable issues? For example, filtering explicit content.*
|
269 |
+
-->
|
270 |
+
|
271 |
+
## Training Details
|
272 |
+
|
273 |
+
### Training Dataset
|
274 |
+
|
275 |
+
#### json
|
276 |
+
|
277 |
+
* Dataset: json
|
278 |
+
* Size: 1,868 training samples
|
279 |
+
* Columns: <code>positive</code> and <code>anchor</code>
|
280 |
+
* Approximate statistics based on the first 1000 samples:
|
281 |
+
| | positive | anchor |
|
282 |
+
|:--------|:------------------------------------------------------------------------------------|:----------------------------------------------------------------------------------|
|
283 |
+
| type | string | string |
|
284 |
+
| details | <ul><li>min: 12 tokens</li><li>mean: 98.81 tokens</li><li>max: 380 tokens</li></ul> | <ul><li>min: 7 tokens</li><li>mean: 14.66 tokens</li><li>max: 49 tokens</li></ul> |
|
285 |
+
* Samples:
|
286 |
+
| positive | anchor |
|
287 |
+
|:--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------|:-----------------------------------------------------------------------------------------------------------|
|
288 |
+
| <code>Белки обладают явно выраженными гидрофильными свойствами. Растворы белков имеют очень низкое осмотическое давление, высокую вязкость и незначительную способность к диффузии. Белки способны к набуханию в очень больших пределах. С коллоидным состоянием белков связан ряд характерных свойств, в частности явление светорассеяния, лежащее в основе количественного определения белков методом нефелометрии. Этот эффект используется, кроме того, в современных методах микроскопии биологических объектов. Молекулы белка не способны проникать через полупроницаемые искусственные мембраны (целлофан, пергамент, коллодий), а также биомембраны растительных и животных тканей, хотя при органических поражениях, например, почек капсула почечного клубочка (Шумлянского-Боумена) становится проницаемой для альбуминов сыворотки крови и последние появляются в моче.</code> | <code>Способность к набуханию является одним из свойств белков?</code> |
|
289 |
+
| <code>Пациентка, 32 года, обратилась к врачу общей практики по поводу общей слабости, утомляемости, сонливости днем. При осмотре обнаружена бледность кожи, ломкость ногтей, сухость кожи, выпадение волос, глоссит. Над легкими дыхание везикулярное, хрипов нет. Ритм сердечных сокращений правильный. ЧСС 96 в 1 минуту, АД 110/70 мм. рт. ст. На верхушке и в точке Боткина выслушивае��ся систолический шум. Живот при пальпации мягкий, безболезненный. Печень и селезенка не увеличены. Месячные по 6-7 дней, обильные. Общий анализ крови: гемоглобин 67 г/л, эритроциты 3.0х10^12/л, цветной показатель 0.7, тромбоциты 250х10^9/л, лейкоциты 5.2х10^9/л, СОЭ 18 мм/ч.</code> | <code>Предположительным диагнозом является хроническая постгеморрагическая железодефицитная анемия?</code> |
|
290 |
+
| <code>Седалищная кость своим телом также участвует в образовании вертлужной впадины. Обе её ветви — верхняя и нижняя — замыкают запирательное отверстие снизу и сбоку. На месте перехода одной ветви в другую находится седалищный бугор, на который опирается туловище при сидении. Выше бугра на задней грани кости выступает седалищная ость, отделенная от него малой седалищной вырезкой.</code> | <code>В седалищной кости можно выделить 2 ветви?</code> |
|
291 |
+
* Loss: [<code>MultipleNegativesRankingLoss</code>](https://sbert.net/docs/package_reference/sentence_transformer/losses.html#multiplenegativesrankingloss) with these parameters:
|
292 |
+
```json
|
293 |
+
{
|
294 |
+
"scale": 20.0,
|
295 |
+
"similarity_fct": "cos_sim"
|
296 |
+
}
|
297 |
+
```
|
298 |
+
|
299 |
+
### Evaluation Dataset
|
300 |
+
|
301 |
+
#### json
|
302 |
+
|
303 |
+
* Dataset: json
|
304 |
+
* Size: 208 evaluation samples
|
305 |
+
* Columns: <code>positive</code> and <code>anchor</code>
|
306 |
+
* Approximate statistics based on the first 208 samples:
|
307 |
+
| | positive | anchor |
|
308 |
+
|:--------|:-------------------------------------------------------------------------------------|:----------------------------------------------------------------------------------|
|
309 |
+
| type | string | string |
|
310 |
+
| details | <ul><li>min: 24 tokens</li><li>mean: 103.32 tokens</li><li>max: 438 tokens</li></ul> | <ul><li>min: 8 tokens</li><li>mean: 14.84 tokens</li><li>max: 36 tokens</li></ul> |
|
311 |
+
* Samples:
|
312 |
+
| positive | anchor |
|
313 |
+
|:--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------|:----------------------------------------------------------------------------------------------------------|
|
314 |
+
| <code>Мышца, приводящая в движение сустав, производит определенную работу. Характер работы зависит от того, как расположена ось сустава, и какое положение в отношении этой оси занимает мышца. В связи с этим различают следующие мышцы: сгибатели и разгибатели (лежат впереди или позади поперечной оси сустава), приводящие и отводящие (изнутри или снаружи сагиттальной оси сустава), вращающие внутрь и вращающие наружу (изнутри или снаружи от продольной оси сустава).</code> | <code>Мышцы сгибатели расположены изнутри сагиттальной оси сустава?</code> |
|
315 |
+
| <code>Этилметилгидроксипиридина сукцинат является ингибитором свободнорадикальных процессов, мембранопротектором, обладающим антигипоксическим, стресспротекторным, ноотропным, противосудорожным и анксиолитическим действием. Этилметилгидроксипиридина сукцинат повышает резистентность организма к воздействию различных повреждающих факторов (шок, гипоксия и ишемия, нарушения мозгового кровообращения, интоксикация алкоголем и антипсихотическими средствами — нейролептиками).</code> | <code>Этилметилгидроксипиридина сукцинат повышает устойчивость организма к интоксикации алкоголем?</code> |
|
316 |
+
| <code>Пясть состоит из пяти трубчатых пястных костей, которые кроме первой лежат в одной плоскости и уменьшаются по длине от II-й к V-й. II–V пястные кости расположены в ряд так, что между ними остаются три межкостных пространства. В каждой пястной кости различают тело, основание, опирающееся на кости дистального ряда запястья, и головку, сочленяющуюся с основной фалангой пальца. I-ая пястная кость отставлена в сторону. Проксимальные концы всех костей пясти расширены у оснований. Основание первой пястной кости имеет седловидную поверхность. Тело ее широкое и уплощенное.</code> | <code>Пясть представлена трубчатыми костями?</code> |
|
317 |
+
* Loss: [<code>MultipleNegativesRankingLoss</code>](https://sbert.net/docs/package_reference/sentence_transformer/losses.html#multiplenegativesrankingloss) with these parameters:
|
318 |
+
```json
|
319 |
+
{
|
320 |
+
"scale": 20.0,
|
321 |
+
"similarity_fct": "cos_sim"
|
322 |
+
}
|
323 |
+
```
|
324 |
+
|
325 |
+
### Training Hyperparameters
|
326 |
+
#### Non-Default Hyperparameters
|
327 |
+
|
328 |
+
- `eval_strategy`: epoch
|
329 |
+
- `per_device_train_batch_size`: 16
|
330 |
+
- `per_device_eval_batch_size`: 16
|
331 |
+
- `gradient_accumulation_steps`: 16
|
332 |
+
- `learning_rate`: 2e-05
|
333 |
+
- `num_train_epochs`: 4
|
334 |
+
- `lr_scheduler_type`: cosine
|
335 |
+
- `warmup_ratio`: 0.1
|
336 |
+
- `bf16`: True
|
337 |
+
- `load_best_model_at_end`: True
|
338 |
+
- `optim`: adamw_torch_fused
|
339 |
+
- `batch_sampler`: no_duplicates
|
340 |
+
|
341 |
+
#### All Hyperparameters
|
342 |
+
<details><summary>Click to expand</summary>
|
343 |
+
|
344 |
+
- `overwrite_output_dir`: False
|
345 |
+
- `do_predict`: False
|
346 |
+
- `eval_strategy`: epoch
|
347 |
+
- `prediction_loss_only`: True
|
348 |
+
- `per_device_train_batch_size`: 16
|
349 |
+
- `per_device_eval_batch_size`: 16
|
350 |
+
- `per_gpu_train_batch_size`: None
|
351 |
+
- `per_gpu_eval_batch_size`: None
|
352 |
+
- `gradient_accumulation_steps`: 16
|
353 |
+
- `eval_accumulation_steps`: None
|
354 |
+
- `torch_empty_cache_steps`: None
|
355 |
+
- `learning_rate`: 2e-05
|
356 |
+
- `weight_decay`: 0.0
|
357 |
+
- `adam_beta1`: 0.9
|
358 |
+
- `adam_beta2`: 0.999
|
359 |
+
- `adam_epsilon`: 1e-08
|
360 |
+
- `max_grad_norm`: 1.0
|
361 |
+
- `num_train_epochs`: 4
|
362 |
+
- `max_steps`: -1
|
363 |
+
- `lr_scheduler_type`: cosine
|
364 |
+
- `lr_scheduler_kwargs`: {}
|
365 |
+
- `warmup_ratio`: 0.1
|
366 |
+
- `warmup_steps`: 0
|
367 |
+
- `log_level`: passive
|
368 |
+
- `log_level_replica`: warning
|
369 |
+
- `log_on_each_node`: True
|
370 |
+
- `logging_nan_inf_filter`: True
|
371 |
+
- `save_safetensors`: True
|
372 |
+
- `save_on_each_node`: False
|
373 |
+
- `save_only_model`: False
|
374 |
+
- `restore_callback_states_from_checkpoint`: False
|
375 |
+
- `no_cuda`: False
|
376 |
+
- `use_cpu`: False
|
377 |
+
- `use_mps_device`: False
|
378 |
+
- `seed`: 42
|
379 |
+
- `data_seed`: None
|
380 |
+
- `jit_mode_eval`: False
|
381 |
+
- `use_ipex`: False
|
382 |
+
- `bf16`: True
|
383 |
+
- `fp16`: False
|
384 |
+
- `fp16_opt_level`: O1
|
385 |
+
- `half_precision_backend`: auto
|
386 |
+
- `bf16_full_eval`: False
|
387 |
+
- `fp16_full_eval`: False
|
388 |
+
- `tf32`: None
|
389 |
+
- `local_rank`: 0
|
390 |
+
- `ddp_backend`: None
|
391 |
+
- `tpu_num_cores`: None
|
392 |
+
- `tpu_metrics_debug`: False
|
393 |
+
- `debug`: []
|
394 |
+
- `dataloader_drop_last`: False
|
395 |
+
- `dataloader_num_workers`: 0
|
396 |
+
- `dataloader_prefetch_factor`: None
|
397 |
+
- `past_index`: -1
|
398 |
+
- `disable_tqdm`: False
|
399 |
+
- `remove_unused_columns`: True
|
400 |
+
- `label_names`: None
|
401 |
+
- `load_best_model_at_end`: True
|
402 |
+
- `ignore_data_skip`: False
|
403 |
+
- `fsdp`: []
|
404 |
+
- `fsdp_min_num_params`: 0
|
405 |
+
- `fsdp_config`: {'min_num_params': 0, 'xla': False, 'xla_fsdp_v2': False, 'xla_fsdp_grad_ckpt': False}
|
406 |
+
- `fsdp_transformer_layer_cls_to_wrap`: None
|
407 |
+
- `accelerator_config`: {'split_batches': False, 'dispatch_batches': None, 'even_batches': True, 'use_seedable_sampler': True, 'non_blocking': False, 'gradient_accumulation_kwargs': None}
|
408 |
+
- `deepspeed`: None
|
409 |
+
- `label_smoothing_factor`: 0.0
|
410 |
+
- `optim`: adamw_torch_fused
|
411 |
+
- `optim_args`: None
|
412 |
+
- `adafactor`: False
|
413 |
+
- `group_by_length`: False
|
414 |
+
- `length_column_name`: length
|
415 |
+
- `ddp_find_unused_parameters`: None
|
416 |
+
- `ddp_bucket_cap_mb`: None
|
417 |
+
- `ddp_broadcast_buffers`: False
|
418 |
+
- `dataloader_pin_memory`: True
|
419 |
+
- `dataloader_persistent_workers`: False
|
420 |
+
- `skip_memory_metrics`: True
|
421 |
+
- `use_legacy_prediction_loop`: False
|
422 |
+
- `push_to_hub`: False
|
423 |
+
- `resume_from_checkpoint`: None
|
424 |
+
- `hub_model_id`: None
|
425 |
+
- `hub_strategy`: every_save
|
426 |
+
- `hub_private_repo`: None
|
427 |
+
- `hub_always_push`: False
|
428 |
+
- `gradient_checkpointing`: False
|
429 |
+
- `gradient_checkpointing_kwargs`: None
|
430 |
+
- `include_inputs_for_metrics`: False
|
431 |
+
- `include_for_metrics`: []
|
432 |
+
- `eval_do_concat_batches`: True
|
433 |
+
- `fp16_backend`: auto
|
434 |
+
- `push_to_hub_model_id`: None
|
435 |
+
- `push_to_hub_organization`: None
|
436 |
+
- `mp_parameters`:
|
437 |
+
- `auto_find_batch_size`: False
|
438 |
+
- `full_determinism`: False
|
439 |
+
- `torchdynamo`: None
|
440 |
+
- `ray_scope`: last
|
441 |
+
- `ddp_timeout`: 1800
|
442 |
+
- `torch_compile`: False
|
443 |
+
- `torch_compile_backend`: None
|
444 |
+
- `torch_compile_mode`: None
|
445 |
+
- `dispatch_batches`: None
|
446 |
+
- `split_batches`: None
|
447 |
+
- `include_tokens_per_second`: False
|
448 |
+
- `include_num_input_tokens_seen`: False
|
449 |
+
- `neftune_noise_alpha`: None
|
450 |
+
- `optim_target_modules`: None
|
451 |
+
- `batch_eval_metrics`: False
|
452 |
+
- `eval_on_start`: False
|
453 |
+
- `use_liger_kernel`: False
|
454 |
+
- `eval_use_gather_object`: False
|
455 |
+
- `average_tokens_across_devices`: False
|
456 |
+
- `prompts`: None
|
457 |
+
- `batch_sampler`: no_duplicates
|
458 |
+
- `multi_dataset_batch_sampler`: proportional
|
459 |
+
|
460 |
+
</details>
|
461 |
+
|
462 |
+
### Training Logs
|
463 |
+
| Epoch | Step | Training Loss | Validation Loss | cosine_ndcg@10 |
|
464 |
+
|:---------:|:------:|:-------------:|:---------------:|:--------------:|
|
465 |
+
| 1.0 | 8 | - | 0.6016 | 0.4718 |
|
466 |
+
| 1.2735 | 10 | 1.0977 | - | - |
|
467 |
+
| 2.0 | 16 | - | 0.4052 | 0.6168 |
|
468 |
+
| 2.5470 | 20 | 0.3832 | - | - |
|
469 |
+
| 3.0 | 24 | - | 0.3533 | 0.6451 |
|
470 |
+
| **3.547** | **28** | **-** | **0.3496** | **0.6458** |
|
471 |
+
|
472 |
+
* The bold row denotes the saved checkpoint.
|
473 |
+
|
474 |
+
### Framework Versions
|
475 |
+
- Python: 3.10.12
|
476 |
+
- Sentence Transformers: 3.3.1
|
477 |
+
- Transformers: 4.47.0
|
478 |
+
- PyTorch: 2.5.1+cu121
|
479 |
+
- Accelerate: 1.2.1
|
480 |
+
- Datasets: 3.3.1
|
481 |
+
- Tokenizers: 0.21.0
|
482 |
+
|
483 |
+
## Citation
|
484 |
+
|
485 |
+
### BibTeX
|
486 |
+
|
487 |
+
#### Sentence Transformers
|
488 |
+
```bibtex
|
489 |
+
@inproceedings{reimers-2019-sentence-bert,
|
490 |
+
title = "Sentence-BERT: Sentence Embeddings using Siamese BERT-Networks",
|
491 |
+
author = "Reimers, Nils and Gurevych, Iryna",
|
492 |
+
booktitle = "Proceedings of the 2019 Conference on Empirical Methods in Natural Language Processing",
|
493 |
+
month = "11",
|
494 |
+
year = "2019",
|
495 |
+
publisher = "Association for Computational Linguistics",
|
496 |
+
url = "https://arxiv.org/abs/1908.10084",
|
497 |
+
}
|
498 |
+
```
|
499 |
+
|
500 |
+
#### MultipleNegativesRankingLoss
|
501 |
+
```bibtex
|
502 |
+
@misc{henderson2017efficient,
|
503 |
+
title={Efficient Natural Language Response Suggestion for Smart Reply},
|
504 |
+
author={Matthew Henderson and Rami Al-Rfou and Brian Strope and Yun-hsuan Sung and Laszlo Lukacs and Ruiqi Guo and Sanjiv Kumar and Balint Miklos and Ray Kurzweil},
|
505 |
+
year={2017},
|
506 |
+
eprint={1705.00652},
|
507 |
+
archivePrefix={arXiv},
|
508 |
+
primaryClass={cs.CL}
|
509 |
+
}
|
510 |
+
```
|
511 |
+
|
512 |
+
<!--
|
513 |
+
## Glossary
|
514 |
+
|
515 |
+
*Clearly define terms in order to be accessible across audiences.*
|
516 |
+
-->
|
517 |
+
|
518 |
+
<!--
|
519 |
+
## Model Card Authors
|
520 |
+
|
521 |
+
*Lists the people who create the model card, providing recognition and accountability for the detailed work that goes into its construction.*
|
522 |
+
-->
|
523 |
+
|
524 |
+
<!--
|
525 |
+
## Model Card Contact
|
526 |
+
|
527 |
+
*Provides a way for people who have updates to the Model Card, suggestions, or questions, to contact the Model Card authors.*
|
528 |
+
-->
|
config.json
ADDED
@@ -0,0 +1,32 @@
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
1 |
+
{
|
2 |
+
"_name_or_path": "DeepPavlov/rubert-base-cased",
|
3 |
+
"architectures": [
|
4 |
+
"BertModel"
|
5 |
+
],
|
6 |
+
"attention_probs_dropout_prob": 0.1,
|
7 |
+
"classifier_dropout": null,
|
8 |
+
"directionality": "bidi",
|
9 |
+
"hidden_act": "gelu",
|
10 |
+
"hidden_dropout_prob": 0.1,
|
11 |
+
"hidden_size": 768,
|
12 |
+
"initializer_range": 0.02,
|
13 |
+
"intermediate_size": 3072,
|
14 |
+
"layer_norm_eps": 1e-12,
|
15 |
+
"max_position_embeddings": 512,
|
16 |
+
"model_type": "bert",
|
17 |
+
"num_attention_heads": 12,
|
18 |
+
"num_hidden_layers": 12,
|
19 |
+
"output_past": true,
|
20 |
+
"pad_token_id": 0,
|
21 |
+
"pooler_fc_size": 768,
|
22 |
+
"pooler_num_attention_heads": 12,
|
23 |
+
"pooler_num_fc_layers": 3,
|
24 |
+
"pooler_size_per_head": 128,
|
25 |
+
"pooler_type": "first_token_transform",
|
26 |
+
"position_embedding_type": "absolute",
|
27 |
+
"torch_dtype": "float32",
|
28 |
+
"transformers_version": "4.47.0",
|
29 |
+
"type_vocab_size": 2,
|
30 |
+
"use_cache": true,
|
31 |
+
"vocab_size": 119547
|
32 |
+
}
|
config_sentence_transformers.json
ADDED
@@ -0,0 +1,10 @@
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
1 |
+
{
|
2 |
+
"__version__": {
|
3 |
+
"sentence_transformers": "3.3.1",
|
4 |
+
"transformers": "4.47.0",
|
5 |
+
"pytorch": "2.5.1+cu121"
|
6 |
+
},
|
7 |
+
"prompts": {},
|
8 |
+
"default_prompt_name": null,
|
9 |
+
"similarity_fn_name": "cosine"
|
10 |
+
}
|
model.safetensors
ADDED
@@ -0,0 +1,3 @@
|
|
|
|
|
|
|
|
|
1 |
+
version https://git-lfs.github.com/spec/v1
|
2 |
+
oid sha256:c506fe49dc7d4c1b13dedff818db4ff21a3a2f2ea9f170f65cd37ce633073866
|
3 |
+
size 711436136
|
modules.json
ADDED
@@ -0,0 +1,14 @@
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
1 |
+
[
|
2 |
+
{
|
3 |
+
"idx": 0,
|
4 |
+
"name": "0",
|
5 |
+
"path": "",
|
6 |
+
"type": "sentence_transformers.models.Transformer"
|
7 |
+
},
|
8 |
+
{
|
9 |
+
"idx": 1,
|
10 |
+
"name": "1",
|
11 |
+
"path": "1_Pooling",
|
12 |
+
"type": "sentence_transformers.models.Pooling"
|
13 |
+
}
|
14 |
+
]
|
sentence_bert_config.json
ADDED
@@ -0,0 +1,4 @@
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
1 |
+
{
|
2 |
+
"max_seq_length": 512,
|
3 |
+
"do_lower_case": false
|
4 |
+
}
|
special_tokens_map.json
ADDED
@@ -0,0 +1,7 @@
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
1 |
+
{
|
2 |
+
"cls_token": "[CLS]",
|
3 |
+
"mask_token": "[MASK]",
|
4 |
+
"pad_token": "[PAD]",
|
5 |
+
"sep_token": "[SEP]",
|
6 |
+
"unk_token": "[UNK]"
|
7 |
+
}
|
tokenizer.json
ADDED
The diff for this file is too large to render.
See raw diff
|
|
tokenizer_config.json
ADDED
@@ -0,0 +1,58 @@
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
1 |
+
{
|
2 |
+
"added_tokens_decoder": {
|
3 |
+
"0": {
|
4 |
+
"content": "[PAD]",
|
5 |
+
"lstrip": false,
|
6 |
+
"normalized": false,
|
7 |
+
"rstrip": false,
|
8 |
+
"single_word": false,
|
9 |
+
"special": true
|
10 |
+
},
|
11 |
+
"100": {
|
12 |
+
"content": "[UNK]",
|
13 |
+
"lstrip": false,
|
14 |
+
"normalized": false,
|
15 |
+
"rstrip": false,
|
16 |
+
"single_word": false,
|
17 |
+
"special": true
|
18 |
+
},
|
19 |
+
"101": {
|
20 |
+
"content": "[CLS]",
|
21 |
+
"lstrip": false,
|
22 |
+
"normalized": false,
|
23 |
+
"rstrip": false,
|
24 |
+
"single_word": false,
|
25 |
+
"special": true
|
26 |
+
},
|
27 |
+
"102": {
|
28 |
+
"content": "[SEP]",
|
29 |
+
"lstrip": false,
|
30 |
+
"normalized": false,
|
31 |
+
"rstrip": false,
|
32 |
+
"single_word": false,
|
33 |
+
"special": true
|
34 |
+
},
|
35 |
+
"103": {
|
36 |
+
"content": "[MASK]",
|
37 |
+
"lstrip": false,
|
38 |
+
"normalized": false,
|
39 |
+
"rstrip": false,
|
40 |
+
"single_word": false,
|
41 |
+
"special": true
|
42 |
+
}
|
43 |
+
},
|
44 |
+
"clean_up_tokenization_spaces": true,
|
45 |
+
"cls_token": "[CLS]",
|
46 |
+
"do_basic_tokenize": true,
|
47 |
+
"do_lower_case": false,
|
48 |
+
"extra_special_tokens": {},
|
49 |
+
"mask_token": "[MASK]",
|
50 |
+
"model_max_length": 1000000000000000019884624838656,
|
51 |
+
"never_split": null,
|
52 |
+
"pad_token": "[PAD]",
|
53 |
+
"sep_token": "[SEP]",
|
54 |
+
"strip_accents": null,
|
55 |
+
"tokenize_chinese_chars": true,
|
56 |
+
"tokenizer_class": "BertTokenizer",
|
57 |
+
"unk_token": "[UNK]"
|
58 |
+
}
|
vocab.txt
ADDED
The diff for this file is too large to render.
See raw diff
|
|