id
stringlengths 1
5
| tokens
sequence | ner_tags
sequence |
---|---|---|
3201 | [
"This",
"study",
"was",
"designed",
"to",
"determine",
"the",
"potential",
"cis",
"-",
"elements",
"involved",
"in",
"transcriptional",
"regulation",
"of",
"the",
"mouse",
"perforin",
"gene",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
3202 | [
"The",
"six",
"5",
"'",
"upstream",
"and",
"one",
"intronic",
"DHS",
"were",
"detected",
"in",
"only",
"perforin",
"-",
"expressing",
"lymphocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3203 | [
"A",
"construct",
"termed",
"PFP5a",
"containing",
"-",
"795",
"bp",
"exhibited",
"the",
"highest",
"CAT",
"activity",
",",
"and",
"PFP9a20",
"containing",
"only",
"-",
"73",
"bp",
"also",
"produced",
"significantly",
"high",
"CAT",
"activity",
"in",
"CTLL",
"-",
"R8",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3204 | [
"The",
"proximal",
"region",
"in",
"PFP9a20",
"contained",
"two",
"potential",
"Sp1",
"binding",
"sites",
"(",
"GC",
"box",
"and",
"GT",
"box",
")",
"and",
"one",
"Ets",
"binding",
"site",
"(",
"EBS",
")",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O"
] |
3205 | [
"Electrophoretic",
"mobility",
"shift",
"assay",
"showed",
"that",
"each",
"of",
"the",
"cis",
"-",
"elements",
"bound",
"specific",
"protein",
"factors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
3206 | [
"To",
"confirm",
"the",
"importance",
"of",
"the",
"three",
"cis",
"-",
"acting",
"elements",
"in",
"the",
"perforin",
"gene",
"expression",
",",
"point",
"mutation",
"was",
"introduced",
"again",
"to",
"each",
"proximal",
"GC",
"box",
",",
"EBS",
",",
"and",
"GT",
"box",
"of",
"PFP5a",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"O"
] |
3207 | [
"The",
"point",
"mutations",
"resulted",
"in",
"a",
"2",
".",
"5",
"-",
"to",
"3",
"-",
"fold",
"reduction",
"of",
"CAT",
"activity",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O"
] |
3208 | [
"The",
"Oct",
"-",
"2",
"transcription",
"factor",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
3209 | [
"The",
"Oct",
"-",
"2",
"transcription",
"factor",
"is",
"a",
"member",
"of",
"the",
"POU",
"(",
"Pit",
"-",
"Oct",
"-",
"Unc",
")",
"family",
"of",
"transcription",
"factors",
"and",
"is",
"expressed",
"only",
"in",
"B",
"lymphocytes",
"and",
"in",
"neuronal",
"cells",
"but",
"not",
"in",
"other",
"cell",
"types",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3210 | [
"The",
"primary",
"RNA",
"transcript",
"of",
"the",
"gene",
"is",
"subject",
"to",
"alternative",
"splicing",
"to",
"yield",
"different",
"variants",
"which",
"can",
"either",
"activate",
"or",
"repress",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3211 | [
"The",
"forms",
"produced",
"in",
"B",
"lymphocytes",
"have",
"a",
"predominantly",
"activating",
"effect",
"on",
"gene",
"expression",
"whereas",
"those",
"produced",
"in",
"neuronal",
"cells",
"have",
"a",
"predominantly",
"inhibitory",
"effect",
"and",
"can",
"repress",
"the",
"expression",
"of",
"both",
"the",
"herpes",
"simplex",
"virus",
"immediate",
"-",
"early",
"genes",
"and",
"the",
"cellular",
"tyrosine",
"hydroxylase",
"gene",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
3212 | [
"Cell",
"-",
"type",
"-",
"specific",
"regulation",
"of",
"the",
"human",
"tumor",
"necrosis",
"factor",
"alpha",
"gene",
"in",
"B",
"cells",
"and",
"T",
"cells",
"by",
"NFATp",
"and",
"ATF",
"-",
"2",
"/",
"JUN",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
3213 | [
"The",
"human",
"tumor",
"necrosis",
"factor",
"alpha",
"(",
"TNF",
"-",
"alpha",
")",
"gene",
"is",
"one",
"of",
"the",
"earliest",
"genes",
"transcribed",
"after",
"the",
"stimulation",
"of",
"a",
"B",
"cell",
"through",
"its",
"antigen",
"receptor",
"or",
"via",
"the",
"CD",
"-",
"40",
"pathway",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3214 | [
"In",
"both",
"cases",
",",
"induction",
"of",
"TNF",
"-",
"alpha",
"gene",
"transcription",
"can",
"be",
"blocked",
"by",
"the",
"immunosuppressants",
"cyclosporin",
"A",
"and",
"FK506",
",",
"which",
"suggested",
"a",
"role",
"for",
"the",
"NFAT",
"family",
"of",
"proteins",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"the",
"gene",
"in",
"B",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3215 | [
"Furthermore",
",",
"in",
"T",
"cells",
",",
"two",
"molecules",
"of",
"NFATp",
"bind",
"to",
"the",
"TNF",
"-",
"alpha",
"promoter",
"element",
"kappa",
"3",
"in",
"association",
"with",
"ATF",
"-",
"2",
"and",
"Jun",
"proteins",
"bound",
"to",
"an",
"immediately",
"adjacent",
"cyclic",
"AMP",
"response",
"element",
"(",
"CRE",
")",
"site",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
3216 | [
"Here",
",",
"using",
"the",
"murine",
"B",
"-",
"cell",
"lymphoma",
"cell",
"line",
"A20",
",",
"we",
"show",
"that",
"the",
"TNF",
"-",
"alpha",
"gene",
"is",
"regulated",
"in",
"a",
"cell",
"-",
"type",
"-",
"specific",
"manner",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3217 | [
"In",
"A20",
"B",
"cells",
",",
"the",
"TNF",
"-",
"alpha",
"gene",
"is",
"not",
"regulated",
"by",
"NFATp",
"bound",
"to",
"the",
"kappa",
"3",
"element",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
3218 | [
"This",
"new",
"site",
"plays",
"a",
"critical",
"role",
"in",
"the",
"calcium",
"-",
"mediated",
",",
"cyclosporin",
"A",
"-",
"sensitive",
"induction",
"of",
"TNF",
"-",
"alpha",
"in",
"both",
"A20",
"B",
"cells",
"and",
"Ar",
"-",
"5",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3219 | [
"Two",
"other",
"previously",
"unrecognized",
"NFATp",
"-",
"binding",
"sites",
"in",
"the",
"proximal",
"TNF",
"-",
"alpha",
"promoter",
"were",
"also",
"identified",
"by",
"this",
"analysis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3220 | [
"Activation",
"of",
"Stat",
"5b",
"in",
"erythroid",
"progenitors",
"correlates",
"with",
"the",
"ability",
"of",
"ErbB",
"to",
"induce",
"sustained",
"cell",
"proliferation",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3221 | [
"Self",
"renewal",
"of",
"normal",
"erythroid",
"progenitors",
"is",
"induced",
"by",
"the",
"receptor",
"tyrosine",
"kinase",
"c",
"-",
"ErbB",
",",
"whereas",
"other",
"receptors",
"(",
"c",
"-",
"Kit",
"/",
"Epo",
"-",
"R",
")",
"regulate",
"erythroid",
"differentiation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3222 | [
"Activation",
"of",
"the",
"erythropoietin",
"receptor",
"caused",
"specific",
"DNA",
"-",
"binding",
"of",
"Stat",
"5b",
",",
"but",
"failed",
"to",
"induce",
"reporter",
"gene",
"transcription",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O"
] |
3223 | [
"These",
"biochemical",
"findings",
"correlate",
"perfectly",
"with",
"the",
"selective",
"ability",
"of",
"c",
"-",
"ErbB",
"to",
"cause",
"sustained",
"self",
"renewal",
"in",
"erythroid",
"progenitors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3224 | [
"Defective",
"transcription",
"of",
"the",
"IL",
"-",
"2",
"gene",
"is",
"associated",
"with",
"impaired",
"expression",
"of",
"c",
"-",
"Fos",
",",
"FosB",
",",
"and",
"JunB",
"in",
"anergic",
"T",
"helper",
"1",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3225 | [
"Anergic",
"CD4",
"+",
"Th",
"cells",
"do",
"not",
"produce",
"IL",
"-",
"2",
"when",
"challenged",
"with",
"Ag",
"-",
"pulsed",
"accessory",
"cells",
"because",
"of",
"a",
"transcriptional",
"defect",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3226 | [
"In",
"this",
"work",
",",
"we",
"report",
"that",
"these",
"anergic",
"T",
"cells",
"are",
"defective",
"in",
"their",
"ability",
"to",
"up",
"-",
"regulate",
"protein",
"binding",
"and",
"transactivation",
"at",
"two",
"critical",
"IL",
"-",
"2",
"DNA",
"enhancer",
"elements",
":",
"NF",
"-",
"AT",
"(",
"nuclear",
"factor",
"of",
"activated",
"T",
"cells",
";",
"a",
"sequence",
"that",
"binds",
"a",
"heterotrimeric",
"NFATp",
",",
"Fos",
",",
"and",
"Jun",
"protein",
"complex",
")",
"and",
"Activator",
"Protein",
"-",
"1",
"(",
"AP",
"-",
"1",
")",
"(",
"that",
"binds",
"Fos",
"and",
"Jun",
"heterodimers",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O"
] |
3227 | [
"Western",
"blot",
"analysis",
"of",
"nuclear",
"extracts",
"showed",
"that",
"the",
"impaired",
"DNA",
"-",
"protein",
"interactions",
"in",
"anergic",
"T",
"cells",
"were",
"associated",
"with",
"poor",
"expression",
"of",
"the",
"inducible",
"AP",
"-",
"1",
"family",
"members",
"c",
"-",
"Fos",
",",
"FosB",
",",
"and",
"JunB",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
3228 | [
"However",
",",
"the",
"reduced",
"expression",
"of",
"these",
"proteins",
"was",
"not",
"the",
"result",
"of",
"a",
"global",
"TCR",
"/",
"CD3",
"-",
"signaling",
"defect",
"because",
"CD3",
"cross",
"-",
"linking",
"induced",
"an",
"equivalent",
"increase",
"in",
"intracellular",
"-",
"free",
"calcium",
"ions",
",",
"as",
"well",
"as",
"NFATp",
"dephosphorylation",
",",
"translocation",
"to",
"the",
"nucleus",
",",
"and",
"DNA",
"binding",
"in",
"both",
"normal",
"and",
"anergic",
"T",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3229 | [
"Thus",
",",
"defective",
"IL",
"-",
"2",
"gene",
"transcription",
"appears",
"to",
"be",
"due",
",",
"at",
"least",
"in",
"part",
",",
"to",
"a",
"selective",
"block",
"in",
"the",
"expression",
"of",
"the",
"AP",
"-",
"1",
"Fos",
"and",
"Jun",
"family",
"members",
"in",
"anergic",
"T",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3230 | [
"B",
"-",
"cell",
"-",
"specific",
"transcription",
"of",
"immunoglobulin",
"genes",
"is",
"mediated",
"by",
"the",
"interaction",
"of",
"a",
"POU",
"domain",
"containing",
"transcription",
"factor",
"Oct",
"-",
"1",
"or",
"Oct",
"-",
"2",
",",
"with",
"the",
"B",
"-",
"cell",
"-",
"specific",
"coactivator",
"OCA",
"-",
"B",
"(",
"Bob",
"-",
"1",
",",
"OBF",
"-",
"1",
")",
"and",
"a",
"prototype",
"octamer",
"element",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"I",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
3231 | [
"We",
"find",
"that",
"OCA",
"-",
"B",
"binds",
"DNA",
"directly",
"in",
"the",
"major",
"groove",
"between",
"the",
"two",
"subdomains",
"of",
"the",
"POU",
"domain",
",",
"requiring",
"both",
"an",
"A",
"at",
"the",
"fifth",
"position",
"of",
"the",
"octamer",
"element",
"and",
"contact",
"with",
"the",
"POU",
"domain",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
3232 | [
"An",
"amino",
"-",
"terminal",
"fragment",
"of",
"OCA",
"-",
"B",
"binds",
"the",
"octamer",
"site",
"in",
"the",
"absence",
"of",
"a",
"POU",
"domain",
"with",
"the",
"same",
"sequence",
"specificity",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3233 | [
"Coactivator",
"OCA",
"-",
"B",
"may",
"undergo",
"a",
"POU",
"-",
"dependent",
"conformational",
"change",
"that",
"exposes",
"its",
"amino",
"terminus",
",",
"allowing",
"it",
"to",
"recognize",
"specific",
"DNA",
"sequences",
"in",
"the",
"major",
"groove",
"within",
"the",
"binding",
"site",
"for",
"Oct",
"-",
"1",
"or",
"Oct",
"-",
"2",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
3234 | [
"The",
"recognition",
"of",
"both",
"the",
"POU",
"domain",
"and",
"the",
"octamer",
"sequence",
"by",
"OCA",
"-",
"B",
"provides",
"a",
"mechanism",
"for",
"differential",
"regulation",
"of",
"octamer",
"sites",
"containing",
"genes",
"by",
"the",
"ubiquitous",
"factor",
"Oct",
"-",
"1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
3235 | [
"Uneven",
"X",
"inactivation",
"in",
"a",
"female",
"monozygotic",
"twin",
"pair",
"with",
"Fabry",
"disease",
"and",
"discordant",
"expression",
"of",
"a",
"novel",
"mutation",
"in",
"the",
"alpha",
"-",
"galactosidase",
"A",
"gene",
"."
] | [
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
3236 | [
"We",
"describe",
"two",
"female",
"monozygotic",
"(",
"MZ",
")",
"twins",
"heterozygous",
"for",
"Fabry",
"disease",
",",
"an",
"X",
"linked",
"disorder",
"resulting",
"from",
"the",
"deficient",
"activity",
"of",
"alpha",
"-",
"galactosidase",
"A",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
3237 | [
"Enzymatic",
"assay",
"of",
"alpha",
"-",
"galactosidase",
"in",
"blood",
"leucocytes",
",",
"skin",
"fibroblasts",
",",
"Epstein",
"-",
"Barr",
"virus",
"transformed",
"lymphoid",
"cell",
"lines",
",",
"and",
"hair",
"follicles",
"of",
"the",
"twins",
"and",
"their",
"parents",
"confirmed",
"the",
"heterozygous",
"status",
"of",
"the",
"twins",
"and",
"indicated",
"that",
"Fabry",
"disease",
"had",
"occurred",
"as",
"a",
"result",
"of",
"a",
"de",
"novo",
"mutation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3238 | [
"The",
"son",
"of",
"the",
"unaffected",
"twin",
"sister",
"was",
"shown",
"to",
"be",
"hemizygous",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3239 | [
"Molecular",
"analysis",
"of",
"the",
"alpha",
"-",
"galactosidase",
"A",
"gene",
"permitted",
"the",
"identification",
"of",
"an",
"as",
"yet",
"undescribed",
"point",
"mutation",
"at",
"position",
"10182",
"of",
"exon",
"5",
"which",
"causes",
"an",
"Asp",
"to",
"Asn",
"substitution",
"at",
"codon",
"231",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
3240 | [
"Single",
"strand",
"conformation",
"polymorphism",
"(",
"SSCP",
")",
"analysis",
"again",
"showed",
"the",
"heterozygous",
"status",
"of",
"the",
"twins",
"and",
"a",
"normal",
"pattern",
"in",
"their",
"parents",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3241 | [
"The",
"basis",
"for",
"the",
"discordant",
"expression",
"of",
"this",
"d",
"novo",
"mutation",
"in",
"the",
"twins",
"was",
"investigated",
"by",
"studying",
"their",
"X",
"inactivation",
"status",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3242 | [
"Analysis",
"of",
"the",
"inactive",
"X",
"specific",
"methylation",
"at",
"the",
"androgen",
"receptor",
"gene",
"showed",
"unbalanced",
"inactivation",
"in",
"the",
"twins",
"'",
"fibroblasts",
"and",
"in",
"opposite",
"directions",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3243 | [
"While",
"the",
"maternally",
"derived",
"X",
"chromosome",
"was",
"preferentially",
"active",
"in",
"the",
"asymptomatic",
"twin",
",",
"the",
"paternal",
"X",
"chromosome",
"was",
"active",
"in",
"the",
"other",
",",
"affected",
"twin",
"and",
"was",
"found",
"in",
"her",
"hemizygotic",
"nephew",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3244 | [
"These",
"data",
"suggest",
"that",
"the",
"paternal",
"X",
"chromosome",
"carries",
"the",
"de",
"novo",
"alpha",
"-",
"galactosidase",
"A",
"mutation",
"and",
"that",
"uneven",
"X",
"inactivation",
"is",
"the",
"underlying",
"mechanism",
"for",
"disease",
"expression",
"in",
"this",
"novel",
"female",
"MZ",
"twin",
"pair",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3245 | [
"We",
"tested",
"the",
"necessity",
"for",
"appropriate",
"spatial",
"alignment",
"of",
"these",
"elements",
"by",
"using",
"mutated",
"enhancers",
"with",
"altered",
"spacings",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3246 | [
"A",
"4",
"-",
"or",
"10",
"-",
"bp",
"insertion",
"between",
"muE3",
"and",
"muB",
"inactivated",
"the",
"mu",
"enhancer",
"in",
"S194",
"plasma",
"cells",
"but",
"did",
"not",
"affect",
"in",
"vitro",
"binding",
"of",
"Ets",
"-",
"1",
",",
"PU",
".",
"1",
",",
"or",
"the",
"muE3",
"-",
"binding",
"protein",
"TFE3",
",",
"alone",
"or",
"in",
"pairwise",
"combinations",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3247 | [
"Circular",
"permutation",
"and",
"phasing",
"analyses",
"demonstrated",
"that",
"PU",
".",
"1",
"binding",
"but",
"not",
"TFE3",
"or",
"Ets",
"-",
"1",
"bends",
"mu",
"enhancer",
"DNA",
"toward",
"the",
"major",
"groove",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3248 | [
"We",
"propose",
"that",
"the",
"requirement",
"for",
"precise",
"spacing",
"of",
"the",
"muA",
"and",
"muB",
"elements",
"is",
"due",
"in",
"part",
"to",
"a",
"directed",
"DNA",
"bend",
"induced",
"by",
"PU",
".",
"1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
3249 | [
"[",
"Cortisone",
"-",
"resistant",
"bronchial",
"asthma",
"]"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3250 | [
"There",
"is",
"general",
"agreement",
"on",
"the",
"inflammatory",
"pathogenesis",
"of",
"bronchial",
"asthma",
":",
"an",
"accumulation",
"of",
"activated",
"eosinophils",
",",
"degranulated",
"mast",
"cells",
",",
"T",
"lymphocytes",
"and",
"in",
"very",
"severe",
"forms",
",",
"granulocytes",
"has",
"constantly",
"been",
"found",
"in",
"the",
"bronchial",
"mucosa",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3251 | [
"Although",
"corticosteroids",
"are",
"the",
"most",
"potent",
"therapeutic",
"agents",
"used",
"for",
"this",
"disease",
",",
"their",
"anti",
"-",
"inflammatory",
"effect",
"differs",
"from",
"patient",
"to",
"patient",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3252 | [
"This",
"review",
"analyzes",
"various",
"molecular",
"alterations",
"responsible",
"for",
"the",
"deficient",
"response",
"to",
"corticosteroid",
"treatment",
"observed",
"in",
"steroid",
"-",
"resistant",
"bronchial",
"asthmatic",
"subjects",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3253 | [
"New",
"knowledge",
"on",
"the",
"mechanism",
"of",
"steroid",
"resistance",
"may",
"have",
"important",
"implications",
"for",
"the",
"treatment",
"of",
"chronic",
"asthma",
"and",
"other",
"diseases",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3254 | [
"We",
"have",
"defined",
"the",
"mechanisms",
"of",
"transactivation",
"by",
"NFAT1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
3255 | [
"NFAT1",
"possesses",
"two",
"transactivation",
"domains",
"whose",
"sequences",
"are",
"not",
"conserved",
"in",
"the",
"other",
"NFAT",
"-",
"family",
"proteins",
",",
"and",
"a",
"conserved",
"DNA",
"-",
"binding",
"domain",
"that",
"mediates",
"the",
"recruitment",
"of",
"cooperating",
"nuclear",
"transcription",
"factors",
"even",
"when",
"it",
"is",
"expressed",
"in",
"the",
"absence",
"of",
"other",
"regions",
"of",
"the",
"protein",
"."
] | [
"B",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3256 | [
"The",
"activity",
"of",
"the",
"NH2",
"-",
"terminal",
"transactivation",
"domain",
"is",
"modulated",
"by",
"an",
"adjacent",
"regulatory",
"region",
"that",
"contains",
"several",
"conserved",
"sequence",
"motifs",
"represented",
"only",
"in",
"the",
"NFAT",
"family",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
3257 | [
"Induction",
"of",
"activator",
"protein",
"(",
"AP",
")",
"-",
"1",
"and",
"nuclear",
"factor",
"-",
"kappaB",
"by",
"CD28",
"stimulation",
"involves",
"both",
"phosphatidylinositol",
"3",
"-",
"kinase",
"and",
"acidic",
"sphingomyelinase",
"signals",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O"
] |
3258 | [
"To",
"overcome",
"this",
"problem",
",",
"we",
"have",
"exploited",
"the",
"observation",
"that",
"activated",
"human",
"T",
"cell",
"blasts",
"can",
"be",
"stimulated",
"via",
"the",
"CD28",
"surface",
"molecule",
"in",
"the",
"absence",
"of",
"antigenic",
"challenge",
";",
"thus",
",",
"we",
"have",
"been",
"able",
"to",
"observe",
"the",
"response",
"of",
"normal",
"T",
"cells",
"to",
"CD28",
"activation",
"in",
"isolation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3259 | [
"Using",
"this",
"system",
",",
"we",
"observed",
"that",
"CD28",
"stimulation",
"by",
"B7",
"-",
"transfected",
"CHO",
"cells",
"induced",
"a",
"proliferative",
"response",
"in",
"T",
"cells",
"that",
"was",
"not",
"accompanied",
"by",
"measurable",
"IL",
"-",
"2",
"production",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O"
] |
3260 | [
"However",
",",
"subsequent",
"analysis",
"of",
"transcription",
"factor",
"generation",
"revealed",
"that",
"B7",
"stimulation",
"induced",
"both",
"activator",
"protein",
"-",
"1",
"(",
"AP",
"-",
"1",
")",
"and",
"nuclear",
"factor",
"-",
"kappaB",
"(",
"NF",
"-",
"kappaB",
")",
"complexes",
",",
"but",
"not",
"NF",
"-",
"AT",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
3261 | [
"In",
"contrast",
",",
"engagement",
"of",
"the",
"TCR",
"by",
"class",
"II",
"MHC",
"/",
"superantigen",
",",
"either",
"with",
"or",
"without",
"CD28",
"ligation",
",",
"resulted",
"in",
"the",
"induction",
"of",
"NF",
"-",
"AT",
",",
"AP",
"-",
"1",
",",
"and",
"NF",
"-",
"kappaB",
"as",
"well",
"as",
"IL",
"-",
"2",
"production",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O"
] |
3262 | [
"Using",
"selective",
"inhibitors",
",",
"we",
"investigated",
"the",
"signaling",
"pathways",
"involved",
"in",
"the",
"CD28",
"-",
"mediated",
"induction",
"of",
"AP",
"-",
"1",
"and",
"NF",
"-",
"kappaB",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
3263 | [
"In",
"contrast",
",",
"AP",
"-",
"1",
"generation",
"was",
"inhibited",
"by",
"wortmannin",
"and",
"was",
"also",
"variably",
"sensitive",
"to",
"chloroquine",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3264 | [
"These",
"data",
"suggest",
"that",
"in",
"activated",
"normal",
"T",
"cells",
",",
"CD28",
"-",
"derived",
"signals",
"can",
"stimulate",
"proliferation",
"at",
"least",
"in",
"part",
"via",
"NF",
"-",
"kappaB",
"and",
"AP",
"-",
"1",
"generation",
",",
"and",
"that",
"this",
"response",
"uses",
"both",
"acidic",
"sphingomyelinase",
"and",
"phosphatidylinositol",
"3",
"-",
"kinase",
"-",
"linked",
"pathways",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3265 | [
"Presence",
"of",
"a",
"variant",
"form",
"of",
"the",
"estrogen",
"receptor",
"in",
"peripheral",
"blood",
"mononuclear",
"cells",
"from",
"normal",
"individuals",
"and",
"lupus",
"patients",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3266 | [
"Estrogen",
"may",
"participate",
"in",
"the",
"pathogenesis",
"of",
"systemic",
"lupus",
"erythematosus",
"(",
"SLE",
")",
"via",
"its",
"intracellular",
"receptor",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O"
] |
3267 | [
"Using",
"RT",
"-",
"PCR",
"we",
"were",
"able",
"to",
"identify",
"both",
"the",
"full",
"length",
"wild",
"-",
"type",
"form",
"and",
"an",
"isoform",
"of",
"the",
"ER",
"which",
"precisely",
"lacks",
"exon",
"V",
"in",
"both",
"patient",
"and",
"normal",
"individuals",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3268 | [
"Our",
"results",
",",
"although",
"limited",
",",
"suggest",
"that",
"normal",
"individuals",
"can",
"express",
"both",
"the",
"wild",
"-",
"type",
"and",
"truncated",
"version",
"at",
"the",
"same",
"time",
",",
"whereas",
"lupus",
"patients",
"only",
"express",
"either",
"the",
"wild",
"-",
"type",
"or",
"the",
"truncated",
"ER",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
3269 | [
"This",
"finding",
"may",
"lead",
"to",
"a",
"better",
"understanding",
"of",
"the",
"reasons",
"for",
"the",
"prevalence",
"of",
"lupus",
"in",
"females",
"and",
"of",
"the",
"estrogenic",
"effects",
"on",
"SLE",
"disease",
"activity",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3270 | [
"Regulation",
"of",
"sialoadhesin",
"expression",
"on",
"rat",
"macrophages",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3271 | [
"Induction",
"by",
"glucocorticoids",
"and",
"enhancement",
"by",
"IFN",
"-",
"beta",
",",
"IFN",
"-",
"gamma",
",",
"IL",
"-",
"4",
",",
"and",
"lipopolysaccharide",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3272 | [
"Sialoadhesin",
"is",
"a",
"macrophage",
"-",
"restricted",
"member",
"of",
"the",
"Ig",
"superfamily",
"that",
"mediates",
"adhesion",
"with",
"lymphoid",
"and",
"myeloid",
"cells",
"."
] | [
"B",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3273 | [
"We",
"have",
"studied",
"the",
"regulation",
"of",
"sialoadhesin",
"expression",
"in",
"vitro",
"and",
"show",
"that",
"glucocorticoids",
"(",
"GC",
")",
"induce",
"sialoadhesin",
"expression",
"on",
"freshly",
"isolated",
"rat",
"macrophages",
"and",
"the",
"rat",
"macrophage",
"cell",
"line",
"R2",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3274 | [
"The",
"cytokines",
"IFN",
"-",
"beta",
",",
"IFN",
"-",
"gamma",
",",
"IL",
"-",
"4",
",",
"and",
"LPS",
",",
"although",
"unable",
"to",
"induce",
"sialoadhesin",
"expression",
"by",
"themselves",
",",
"were",
"able",
"to",
"enhance",
"GC",
"-",
"mediated",
"induction",
"of",
"sialoadhesin",
"."
] | [
"O",
"B",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
3275 | [
"Comparison",
"of",
"the",
"different",
"combinations",
"of",
"GC",
"and",
"cytokines",
"/",
"LPS",
"revealed",
"differences",
"in",
"the",
"level",
"of",
"GC",
"-",
"dependent",
"enhancement",
"of",
"sialoadhesin",
"expression",
",",
"with",
"IFN",
"-",
"beta",
"and",
"IL",
"-",
"4",
"being",
"more",
"potent",
"than",
"IFN",
"-",
"gamma",
"and",
"LPS",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O"
] |
3276 | [
"Moreover",
",",
"the",
"effects",
"of",
"IFN",
"-",
"gamma",
"and",
"LPS",
"could",
"be",
"reproduced",
"by",
"priming",
",",
"whereas",
"IFN",
"-",
"beta",
"and",
"IL",
"-",
"4",
"were",
"required",
"simultaneously",
"with",
"GC",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3277 | [
"The",
"regulation",
"of",
"sialoadhesin",
"expression",
"was",
"mediated",
"by",
"the",
"GC",
"receptor",
",",
"and",
"not",
"by",
"mineralocorticoid",
"receptor",
",",
"as",
"shown",
"by",
"inhibition",
"experiments",
"with",
"specific",
"antagonists",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3278 | [
"Finally",
",",
"it",
"is",
"demonstrated",
"that",
"macrophages",
"in",
"the",
"adrenal",
"gland",
",",
"the",
"major",
"site",
"of",
"endogenous",
"GC",
"production",
",",
"express",
"sialoadhesin",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
3279 | [
"This",
"study",
"demonstrates",
"that",
"GC",
"act",
"as",
"a",
"primary",
"inducer",
"of",
"sialoadhesin",
"expression",
"on",
"rat",
"macrophages",
",",
"and",
"that",
"the",
"response",
"can",
"be",
"enhanced",
"by",
"IFN",
"-",
"beta",
",",
"T",
"cell",
"-",
"derived",
"cytokines",
",",
"or",
"LPS",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3280 | [
"Apoptosis",
"mediated",
"by",
"HIV",
"protease",
"is",
"preceded",
"by",
"cleavage",
"of",
"Bcl",
"-",
"2",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O"
] |
3281 | [
"Expression",
"of",
"the",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"(",
"HIV",
")",
"protease",
"in",
"cultured",
"cells",
"leads",
"to",
"apoptosis",
",",
"preceded",
"by",
"cleavage",
"of",
"bcl",
"-",
"2",
",",
"a",
"key",
"negative",
"regulator",
"of",
"cell",
"death",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3282 | [
"In",
"contrast",
",",
"a",
"high",
"level",
"of",
"bcl",
"-",
"2",
"protects",
"cells",
"in",
"vitro",
"and",
"in",
"vivo",
"from",
"the",
"viral",
"protease",
"and",
"prevents",
"cell",
"death",
"following",
"HIV",
"infection",
"of",
"human",
"lymphocytes",
",",
"while",
"reducing",
"the",
"yields",
"of",
"viral",
"structural",
"proteins",
",",
"infectivity",
",",
"and",
"tumor",
"necrosis",
"factor",
"alpha",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
3283 | [
"We",
"present",
"a",
"model",
"for",
"HIV",
"replication",
"in",
"which",
"the",
"viral",
"protease",
"depletes",
"the",
"infected",
"cells",
"of",
"bcl",
"-",
"2",
",",
"leading",
"to",
"oxidative",
"stress",
"-",
"dependent",
"activation",
"of",
"NF",
"kappa",
"B",
",",
"a",
"cellular",
"factor",
"required",
"for",
"HIV",
"transcription",
",",
"and",
"ultimately",
"to",
"cell",
"death",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3284 | [
"Purified",
"bcl",
"-",
"2",
"is",
"cleaved",
"by",
"HIV",
"protease",
"between",
"phenylalanine",
"112",
"and",
"alanine",
"113",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3285 | [
"Alpha",
"4",
"beta",
"1",
"(",
"CD49d",
"/",
"CD29",
")",
"integrin",
"costimulation",
"of",
"human",
"T",
"cells",
"enhances",
"transcription",
"factor",
"and",
"cytokine",
"induction",
"in",
"the",
"absence",
"of",
"altered",
"sensitivity",
"to",
"anti",
"-",
"CD3",
"stimulation",
"."
] | [
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O"
] |
3286 | [
"The",
"integrin",
"alpha",
"4",
"beta",
"1",
"can",
"provide",
"a",
"costimulus",
"to",
"induce",
"IL",
"-",
"2",
"secretion",
"and",
"IL",
"-",
"2R",
"expression",
"leading",
"to",
"enhanced",
"proliferation",
"of",
"purified",
",",
"peripheral",
"blood",
"T",
"cells",
"."
] | [
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3287 | [
"Similar",
"to",
"expression",
"of",
"IL",
"-",
"2",
",",
"we",
"demonstrated",
"that",
"recombinant",
"vascular",
"-",
"cell",
"adhesion",
"molecule",
"-",
"1",
",",
"when",
"co",
"-",
"immobilized",
"with",
"anti",
"-",
"CD3",
"mAb",
",",
"significantly",
"enhanced",
"the",
"induction",
"of",
"transcription",
"factors",
"NF",
"-",
"AT",
",",
"AP",
"-",
"1",
",",
"and",
"NF",
"-",
"kappa",
"B",
"as",
"determined",
"by",
"electromobility",
"shift",
"assays",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3288 | [
"alpha",
"4",
"beta",
"1",
"ligation",
"alone",
"had",
"no",
"effect",
"on",
"transcription",
"factor",
"binding",
"."
] | [
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O"
] |
3289 | [
"The",
"requirements",
"for",
"induction",
"of",
"transcription",
"factors",
"reflected",
"the",
"requirements",
"for",
"the",
"secretion",
"of",
"multiple",
"cytokines",
",",
"including",
"IL",
"-",
"2",
",",
"TNF",
"-",
"alpha",
",",
"IFN",
"-",
"gamma",
",",
"and",
"granulocyte",
"macrophage",
"-",
"CSF",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
3290 | [
"Comparison",
"of",
"the",
"dose",
"response",
"to",
"anti",
"-",
"CD3",
"stimulation",
"demonstrated",
"that",
"half",
"-",
"maximal",
"induction",
"of",
"IL",
"-",
"2",
"was",
"achieved",
"using",
"the",
"same",
"dose",
"of",
"anti",
"-",
"CD3",
"for",
"both",
"freshly",
"isolated",
"and",
"cultured",
"T",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3291 | [
"Furthermore",
",",
"the",
"dose",
"of",
"OKT3",
"required",
"to",
"achieve",
"half",
"-",
"maximal",
"activation",
"was",
"the",
"same",
"using",
"PMA",
"or",
"different",
"concentrations",
"of",
"alpha",
"4",
"beta",
"1",
"ligands",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O"
] |
3292 | [
"Therefore",
",",
"costimulation",
"by",
"alpha",
"4",
"beta",
"1",
"ligands",
"was",
"not",
"due",
"to",
"stabilization",
"of",
"the",
"interaction",
"of",
"the",
"cells",
"with",
"its",
"substrate",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3293 | [
"We",
"conclude",
",",
"rather",
",",
"that",
"alpha",
"4",
"beta",
"1",
"in",
"freshly",
"isolated",
"T",
"cells",
"delivers",
"a",
"distinct",
"signal",
"that",
"synergizes",
"early",
"with",
"signals",
"initiated",
"by",
"TCR",
"/",
"CD3",
"ligation",
"to",
"induce",
"DNA",
"binding",
"of",
"multiple",
"transcription",
"factors",
"required",
"for",
"cytokine",
"gene",
"induction",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O"
] |
3294 | [
"Inhibition",
"of",
"T",
"lymphocyte",
"activation",
"by",
"cAMP",
"is",
"associated",
"with",
"down",
"-",
"regulation",
"of",
"two",
"parallel",
"mitogen",
"-",
"activated",
"protein",
"kinase",
"pathways",
",",
"the",
"extracellular",
"signal",
"-",
"related",
"kinase",
"and",
"c",
"-",
"Jun",
"N",
"-",
"terminal",
"kinase",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
3295 | [
"These",
"pathways",
"are",
"disrupted",
"by",
"agonists",
"that",
"utilize",
"adenylate",
"cyclase",
"and",
"cAMP",
"-",
"dependent",
"protein",
"kinase",
"A",
"(",
"PKA",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O"
] |
3296 | [
"We",
"found",
"that",
"the",
"adenylate",
"cyclase",
"activator",
",",
"forskolin",
",",
"inhibits",
"anti",
"-",
"CD3",
"-",
"induced",
"shift",
"in",
"Lck",
"electrophoretic",
"mobility",
",",
"suggesting",
"an",
"intervention",
"at",
"the",
"TCR",
"-",
"coupled",
"phosphoinositide",
"turnover",
"that",
"precedes",
"the",
"activation",
"of",
"PKC",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O"
] |
3297 | [
"The",
"shift",
"of",
"Lck",
"following",
"direct",
"PKC",
"activation",
"by",
"12",
"-",
"O",
"-",
"tetradecanoyl",
"phorbol",
"13",
"-",
"acetate",
",",
"which",
"bypasses",
"early",
"receptor",
"-",
"triggered",
"biochemical",
"events",
",",
"is",
"insensitive",
"to",
"forskolin",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3298 | [
"Nevertheless",
",",
"forskolin",
"also",
"inhibits",
"PKC",
"downstream",
"events",
",",
"such",
"as",
"c",
"-",
"jun",
"expression",
",",
"which",
"is",
"critical",
"for",
"the",
"activation",
"process",
"of",
"T",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
3299 | [
"To",
"further",
"analyze",
"potential",
"cross",
"points",
"between",
"positively",
"and",
"negatively",
"regulating",
"signaling",
"pathways",
"in",
"T",
"cells",
",",
"we",
"tested",
"the",
"effects",
"of",
"activators",
"of",
"the",
"adenylate",
"cyclase",
"or",
"PKA",
"on",
"two",
"parallel",
"mitogen",
"-",
"activated",
"protein",
"kinase",
"signaling",
"pathways",
"mediated",
"by",
"extracellular",
"signal",
"-",
"regulated",
"kinase",
"(",
"ERK",
")",
"and",
"c",
"-",
"Jun",
"N",
"-",
"terminal",
"kinase",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"I",
"O"
] |
3300 | [
"Using",
"a",
"PKC",
"-",
"specific",
"inhibitor",
",",
"GF109203X",
",",
"or",
"PKC",
"-",
"depleted",
"T",
"cells",
",",
"we",
"found",
"that",
"a",
"large",
"part",
"of",
"the",
"anti",
"-",
"CD3",
"-",
"induced",
"ERK",
"activation",
"is",
"PKC",
"dependent",
"."
] | [
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B",
"I",
"I",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O",
"B",
"O",
"O"
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.