Datasets:

sia-precision-education

/

sia_pile_sample

like 0

Follow

Sia Precision Education 5

[ "Processes", "and", "saves", "a", "subset", "of", "images", "as", "TFRecord", "files", "in", "one", "thread", ".", "Args", ":", "thread_index", ":", "Integer", "thread", "identifier", "within", "[", "0", "len", "(", "ranges", ")", "]", ".", "ranges", ":", "A", "list", "of", "pairs", "of", "integers", "specifying", "the", "ranges", "of", "the", "dataset", "to", "process", "in", "parallel", ".", "name", ":", "Unique", "identifier", "specifying", "the", "dataset", ".", "images", ":", "List", "of", "ImageMetadata", ".", "decoder", ":", "An", "ImageDecoder", "object", ".", "vocab", ":", "A", "Vocabulary", "object", ".", "num_shards", ":", "Integer", "number", "of", "shards", "for", "the", "output", "files", "." ]

[ "def", "_process_image_files", "(", "thread_index", ",", "ranges", ",", "name", ",", "images", ",", "decoder", ",", "vocab", ",", "num_shards", ")", ":", "# Each thread produces N shards where N = num_shards / num_threads. For", "# instance, if num_shards = 128, and num_threads = 2, then the first thread", "# would produce shards [0, 64).", "num_threads", "=", "len", "(", "ranges", ")", "assert", "not", "num_shards", "%", "num_threads", "num_shards_per_batch", "=", "int", "(", "num_shards", "/", "num_threads", ")", "shard_ranges", "=", "np", ".", "linspace", "(", "ranges", "[", "thread_index", "]", "[", "0", "]", ",", "ranges", "[", "thread_index", "]", "[", "1", "]", ",", "num_shards_per_batch", "+", "1", ")", ".", "astype", "(", "int", ")", "num_images_in_thread", "=", "ranges", "[", "thread_index", "]", "[", "1", "]", "-", "ranges", "[", "thread_index", "]", "[", "0", "]", "counter", "=", "0", "for", "s", "in", "range", "(", "num_shards_per_batch", ")", ":", "# Generate a sharded version of the file name, e.g. 'train-00002-of-00010'", "shard", "=", "thread_index", "*", "num_shards_per_batch", "+", "s", "output_filename", "=", "\"%s-%.5d-of-%.5d\"", "%", "(", "name", ",", "shard", ",", "num_shards", ")", "output_file", "=", "os", ".", "path", ".", "join", "(", "FLAGS", ".", "output_dir", ",", "output_filename", ")", "writer", "=", "tf", ".", "python_io", ".", "TFRecordWriter", "(", "output_file", ")", "shard_counter", "=", "0", "images_in_shard", "=", "np", ".", "arange", "(", "shard_ranges", "[", "s", "]", ",", "shard_ranges", "[", "s", "+", "1", "]", ",", "dtype", "=", "int", ")", "for", "i", "in", "images_in_shard", ":", "image", "=", "images", "[", "i", "]", "sequence_example", "=", "_to_sequence_example", "(", "image", ",", "decoder", ",", "vocab", ")", "if", "sequence_example", "is", "not", "None", ":", "writer", ".", "write", "(", "sequence_example", ".", "SerializeToString", "(", ")", ")", "shard_counter", "+=", "1", "counter", "+=", "1", "if", "not", "counter", "%", "1000", ":", "print", "(", "\"%s [thread %d]: Processed %d of %d items in thread batch.\"", "%", "(", "datetime", ".", "now", "(", ")", ",", "thread_index", ",", "counter", ",", "num_images_in_thread", ")", ")", "sys", ".", "stdout", ".", "flush", "(", ")", "writer", ".", "close", "(", ")", "print", "(", "\"%s [thread %d]: Wrote %d image-caption pairs to %s\"", "%", "(", "datetime", ".", "now", "(", ")", ",", "thread_index", ",", "shard_counter", ",", "output_file", ")", ")", "sys", ".", "stdout", ".", "flush", "(", ")", "shard_counter", "=", "0", "print", "(", "\"%s [thread %d]: Wrote %d image-caption pairs to %d shards.\"", "%", "(", "datetime", ".", "now", "(", ")", ",", "thread_index", ",", "counter", ",", "num_shards_per_batch", ")", ")", "sys", ".", "stdout", ".", "flush", "(", ")" ]

[ "Processes", "a", "complete", "data", "set", "and", "saves", "it", "as", "a", "TFRecord", ".", "Args", ":", "name", ":", "Unique", "identifier", "specifying", "the", "dataset", ".", "images", ":", "List", "of", "ImageMetadata", ".", "vocab", ":", "A", "Vocabulary", "object", ".", "num_shards", ":", "Integer", "number", "of", "shards", "for", "the", "output", "files", "." ]

[ "def", "_process_dataset", "(", "name", ",", "images", ",", "vocab", ",", "num_shards", ")", ":", "# Break up each image into a separate entity for each caption.", "images", "=", "[", "ImageMetadata", "(", "image", ".", "id", ",", "image", ".", "filename", ",", "[", "caption", "]", ")", "for", "image", "in", "images", "for", "caption", "in", "image", ".", "captions", "]", "# Shuffle the ordering of images. Make the randomization repeatable.", "random", ".", "seed", "(", "12345", ")", "random", ".", "shuffle", "(", "images", ")", "# Break the images into num_threads batches. Batch i is defined as", "# images[ranges[i][0]:ranges[i][1]].", "num_threads", "=", "min", "(", "num_shards", ",", "FLAGS", ".", "num_threads", ")", "spacing", "=", "np", ".", "linspace", "(", "0", ",", "len", "(", "images", ")", ",", "num_threads", "+", "1", ")", ".", "astype", "(", "np", ".", "int", ")", "ranges", "=", "[", "]", "threads", "=", "[", "]", "for", "i", "in", "range", "(", "len", "(", "spacing", ")", "-", "1", ")", ":", "ranges", ".", "append", "(", "[", "spacing", "[", "i", "]", ",", "spacing", "[", "i", "+", "1", "]", "]", ")", "# Create a mechanism for monitoring when all threads are finished.", "coord", "=", "tf", ".", "train", ".", "Coordinator", "(", ")", "# Create a utility for decoding JPEG images to run sanity checks.", "decoder", "=", "ImageDecoder", "(", ")", "# Launch a thread for each batch.", "print", "(", "\"Launching %d threads for spacings: %s\"", "%", "(", "num_threads", ",", "ranges", ")", ")", "for", "thread_index", "in", "range", "(", "len", "(", "ranges", ")", ")", ":", "args", "=", "(", "thread_index", ",", "ranges", ",", "name", ",", "images", ",", "decoder", ",", "vocab", ",", "num_shards", ")", "t", "=", "threading", ".", "Thread", "(", "target", "=", "_process_image_files", ",", "args", "=", "args", ")", "t", ".", "start", "(", ")", "threads", ".", "append", "(", "t", ")", "# Wait for all the threads to terminate.", "coord", ".", "join", "(", "threads", ")", "print", "(", "\"%s: Finished processing all %d image-caption pairs in data set '%s'.\"", "%", "(", "datetime", ".", "now", "(", ")", ",", "len", "(", "images", ")", ",", "name", ")", ")" ]

[ "Creates", "the", "vocabulary", "of", "word", "to", "word_id", ".", "The", "vocabulary", "is", "saved", "to", "disk", "in", "a", "text", "file", "of", "word", "counts", ".", "The", "id", "of", "each", "word", "in", "the", "file", "is", "its", "corresponding", "0", "-", "based", "line", "number", ".", "Args", ":", "captions", ":", "A", "list", "of", "lists", "of", "strings", ".", "Returns", ":", "A", "Vocabulary", "object", "." ]

[ "def", "_create_vocab", "(", "captions", ")", ":", "print", "(", "\"Creating vocabulary.\"", ")", "counter", "=", "Counter", "(", ")", "for", "c", "in", "captions", ":", "counter", ".", "update", "(", "c", ")", "print", "(", "\"Total words:\"", ",", "len", "(", "counter", ")", ")", "# Filter uncommon words and sort by descending count.", "word_counts", "=", "[", "x", "for", "x", "in", "counter", ".", "items", "(", ")", "if", "x", "[", "1", "]", ">=", "FLAGS", ".", "min_word_count", "]", "word_counts", ".", "sort", "(", "key", "=", "lambda", "x", ":", "x", "[", "1", "]", ",", "reverse", "=", "True", ")", "print", "(", "\"Words in vocabulary:\"", ",", "len", "(", "word_counts", ")", ")", "# Write out the word counts file.", "with", "tf", ".", "gfile", ".", "FastGFile", "(", "FLAGS", ".", "word_counts_output_file", ",", "\"w\"", ")", "as", "f", ":", "f", ".", "write", "(", "\"\\n\"", ".", "join", "(", "[", "\"%s %d\"", "%", "(", "w", ",", "c", ")", "for", "w", ",", "c", "in", "word_counts", "]", ")", ")", "print", "(", "\"Wrote vocabulary file:\"", ",", "FLAGS", ".", "word_counts_output_file", ")", "# Create the vocabulary dictionary.", "reverse_vocab", "=", "[", "x", "[", "0", "]", "for", "x", "in", "word_counts", "]", "unk_id", "=", "len", "(", "reverse_vocab", ")", "vocab_dict", "=", "dict", "(", "[", "(", "x", ",", "y", ")", "for", "(", "y", ",", "x", ")", "in", "enumerate", "(", "reverse_vocab", ")", "]", ")", "vocab", "=", "Vocabulary", "(", "vocab_dict", ",", "unk_id", ")", "return", "vocab" ]

[ "Processes", "a", "Chinese", "caption", "string", "into", "a", "list", "of", "tonenized", "words", ".", "Args", ":", "caption", ":", "A", "string", "caption", ".", "Returns", ":", "A", "list", "of", "strings", ";", "the", "tokenized", "caption", "." ]

[ "def", "_process_caption_jieba", "(", "caption", ")", ":", "tokenized_caption", "=", "[", "FLAGS", ".", "start_word", "]", "tokenized_caption", ".", "extend", "(", "jieba", ".", "cut", "(", "caption", ",", "cut_all", "=", "False", ")", ")", "tokenized_caption", ".", "append", "(", "FLAGS", ".", "end_word", ")", "return", "tokenized_caption" ]

[ "Loads", "image", "metadata", "from", "a", "JSON", "file", "and", "processes", "the", "captions", ".", "Args", ":", "captions_file", ":", "Json", "file", "containing", "caption", "annotations", ".", "image_dir", ":", "Directory", "containing", "the", "image", "files", ".", "Returns", ":", "A", "list", "of", "ImageMetadata", "." ]

[ "def", "_load_and_process_metadata", "(", "captions_file", ",", "image_dir", ")", ":", "image_id", "=", "set", "(", "[", "]", ")", "id_to_captions", "=", "{", "}", "with", "open", "(", "captions_file", ",", "'r'", ")", "as", "f", ":", "caption_data", "=", "json", ".", "load", "(", "f", ")", "for", "data", "in", "caption_data", ":", "image_name", "=", "data", "[", "'image_id'", "]", ".", "split", "(", "'.'", ")", "[", "0", "]", "descriptions", "=", "data", "[", "'caption'", "]", "if", "image_name", "not", "in", "image_id", ":", "id_to_captions", ".", "setdefault", "(", "image_name", ",", "[", "]", ")", "image_id", ".", "add", "(", "image_name", ")", "caption_num", "=", "len", "(", "descriptions", ")", "for", "i", "in", "range", "(", "caption_num", ")", ":", "caption_temp", "=", "descriptions", "[", "i", "]", ".", "strip", "(", ")", ".", "strip", "(", "\"。\").", "r", "e", "place('", "\\", "n', ", "'", ")", "", "if", "caption_temp", "!=", "''", ":", "id_to_captions", "[", "image_name", "]", ".", "append", "(", "caption_temp", ")", "print", "(", "\"Loaded caption metadata for %d images from %s and image_id num is %s\"", "%", "(", "len", "(", "id_to_captions", ")", ",", "captions_file", ",", "len", "(", "image_id", ")", ")", ")", "# Process the captions and combine the data into a list of ImageMetadata.", "print", "(", "\"Proccessing captions.\"", ")", "image_metadata", "=", "[", "]", "num_captions", "=", "0", "id", "=", "0", "for", "base_filename", "in", "image_id", ":", "filename", "=", "os", ".", "path", ".", "join", "(", "image_dir", ",", "base_filename", "+", "'.jpg'", ")", "# captions = [_process_caption(c) for c in id_to_captions[base_filename]]", "captions", "=", "[", "_process_caption_jieba", "(", "c", ")", "for", "c", "in", "id_to_captions", "[", "base_filename", "]", "]", "image_metadata", ".", "append", "(", "ImageMetadata", "(", "id", ",", "filename", ",", "captions", ")", ")", "id", "=", "id", "+", "1", "num_captions", "+=", "len", "(", "captions", ")", "print", "(", "\"Finished processing %d captions for %d images in %s\"", "%", "(", "num_captions", ",", "len", "(", "id_to_captions", ")", ",", "captions_file", ")", ")", "return", "image_metadata" ]

[ "Initializes", "the", "vocabulary", ".", "Args", ":", "vocab", ":", "A", "dictionary", "of", "word", "to", "word_id", ".", "unk_id", ":", "Id", "of", "the", "special", "unknown", "word", "." ]

[ "def", "__init__", "(", "self", ",", "vocab", ",", "unk_id", ")", ":", "self", ".", "_vocab", "=", "vocab", "self", ".", "_unk_id", "=", "unk_id" ]

[ "Returns", "the", "integer", "id", "of", "a", "word", "string", "." ]

[ "def", "word_to_id", "(", "self", ",", "word", ")", ":", "if", "word", "in", "self", ".", "_vocab", ":", "return", "self", ".", "_vocab", "[", "word", "]", "else", ":", "return", "self", ".", "_unk_id" ]

[ "Sets", "the", "default", "model", "hyperparameters", "." ]

[ "def", "__init__", "(", "self", ")", ":", "# File pattern of sharded TFRecord file containing SequenceExample protos.", "# Must be provided in training and evaluation modes.", "self", ".", "input_file_pattern", "=", "None", "# Image format (\"jpeg\" or \"png\").", "self", ".", "image_format", "=", "\"jpeg\"", "# Approximate number of values per input shard. Used to ensure sufficient", "# mixing between shards in training.", "self", ".", "values_per_input_shard", "=", "2300", "# Minimum number of shards to keep in the input queue.", "self", ".", "input_queue_capacity_factor", "=", "2", "# Number of threads for prefetching SequenceExample protos.", "self", ".", "num_input_reader_threads", "=", "1", "# Name of the SequenceExample context feature containing image data.", "self", ".", "image_feature_name", "=", "\"image/data\"", "# Name of the SequenceExample feature list containing integer captions.", "self", ".", "caption_feature_name", "=", "\"image/caption_ids\"", "# Number of unique words in the vocab (plus 1, for <UNK>).", "# The default value is larger than the expected actual vocab size to allow", "# for differences between tokenizer versions used in preprocessing. There is", "# no harm in using a value greater than the actual vocab size, but using a", "# value less than the actual vocab size will result in an error.", "self", ".", "vocab_size", "=", "20000", "# Number of threads for image preprocessing. Should be a multiple of 2.", "self", ".", "num_preprocess_threads", "=", "4", "# Batch size.", "self", ".", "batch_size", "=", "32", "# File containing an Inception v3 checkpoint to initialize the variables", "# of the Inception model. Must be provided when starting training for the", "# first time.", "self", ".", "inception_checkpoint_file", "=", "None", "# Dimensions of Inception v3 input images.", "self", ".", "image_height", "=", "299", "self", ".", "image_width", "=", "299", "# Scale used to initialize model variables.", "self", ".", "initializer_scale", "=", "0.08", "# LSTM input and output dimensionality, respectively.", "self", ".", "embedding_size", "=", "512", "self", ".", "num_lstm_units", "=", "512", "# If < 1.0, the dropout keep probability applied to LSTM variables.", "self", ".", "lstm_dropout_keep_prob", "=", "0.7" ]

[ "Sets", "the", "default", "training", "hyperparameters", "." ]

[ "def", "__init__", "(", "self", ")", ":", "# Number of examples per epoch of training data.", "self", ".", "num_examples_per_epoch", "=", "586363", "# Optimizer for training the model.", "self", ".", "optimizer", "=", "\"SGD\"", "# Learning rate for the initial phase of training.", "self", ".", "initial_learning_rate", "=", "2.0", "self", ".", "learning_rate_decay_factor", "=", "0.5", "self", ".", "num_epochs_per_decay", "=", "8.0", "# Learning rate when fine tuning the Inception v3 parameters.", "self", ".", "train_inception_learning_rate", "=", "0.0005", "# If not None, clip gradients to this value.", "self", ".", "clip_gradients", "=", "5.0", "# How many model checkpoints to keep.", "self", ".", "max_checkpoints_to_keep", "=", "5" ]

[ "Basic", "setup", "." ]

[ "def", "__init__", "(", "self", ",", "config", ",", "mode", ",", "train_inception", "=", "False", ")", ":", "assert", "mode", "in", "[", "\"train\"", ",", "\"eval\"", ",", "\"inference\"", "]", "self", ".", "config", "=", "config", "self", ".", "mode", "=", "mode", "self", ".", "train_inception", "=", "train_inception", "# Reader for the input data.", "self", ".", "reader", "=", "tf", ".", "TFRecordReader", "(", ")", "# To match the \"Show and Tell\" paper we initialize all variables with a", "# random uniform initializer.", "self", ".", "initializer", "=", "tf", ".", "random_uniform_initializer", "(", "minval", "=", "-", "self", ".", "config", ".", "initializer_scale", ",", "maxval", "=", "self", ".", "config", ".", "initializer_scale", ")", "# A float32 Tensor with shape [batch_size, height, width, channels].", "self", ".", "images", "=", "None", "# An int32 Tensor with shape [batch_size, padded_length].", "self", ".", "input_seqs", "=", "None", "# An int32 Tensor with shape [batch_size, padded_length].", "self", ".", "target_seqs", "=", "None", "# An int32 0/1 Tensor with shape [batch_size, padded_length].", "self", ".", "input_mask", "=", "None", "# A float32 Tensor with shape [batch_size, embedding_size].", "self", ".", "image_embeddings", "=", "None", "# A float32 Tensor with shape [batch_size, padded_length, embedding_size].", "self", ".", "seq_embeddings", "=", "None", "# A float32 scalar Tensor; the total loss for the trainer to optimize.", "self", ".", "total_loss", "=", "None", "# A float32 Tensor with shape [batch_size * padded_length].", "self", ".", "target_cross_entropy_losses", "=", "None", "# A float32 Tensor with shape [batch_size * padded_length].", "self", ".", "target_cross_entropy_loss_weights", "=", "None", "# Collection of variables from the inception submodel.", "self", ".", "inception_variables", "=", "[", "]", "# Function to restore the inception submodel from checkpoint.", "self", ".", "init_fn", "=", "None", "# Global step Tensor.", "self", ".", "global_step", "=", "None" ]

[ "Returns", "true", "if", "the", "model", "is", "built", "for", "training", "mode", "." ]

[ "def", "is_training", "(", "self", ")", ":", "return", "self", ".", "mode", "==", "\"train\"" ]

[ "Decodes", "and", "processes", "an", "image", "string", "." ]

[ "def", "process_image", "(", "self", ",", "encoded_image", ",", "thread_id", "=", "0", ")", ":", "return", "image_processing", ".", "process_image", "(", "encoded_image", ",", "is_training", "=", "self", ".", "is_training", "(", ")", ",", "height", "=", "self", ".", "config", ".", "image_height", ",", "width", "=", "self", ".", "config", ".", "image_width", ",", "thread_id", "=", "thread_id", ",", "image_format", "=", "self", ".", "config", ".", "image_format", ")" ]

[ "Input", "prefetching", "preprocessing", "and", "batching", "." ]

[ "def", "build_inputs", "(", "self", ")", ":", "if", "self", ".", "mode", "==", "\"inference\"", ":", "# In inference mode, images and inputs are fed via placeholders.", "image_feed", "=", "tf", ".", "placeholder", "(", "dtype", "=", "tf", ".", "string", ",", "shape", "=", "[", "]", ",", "name", "=", "\"image_feed\"", ")", "input_feed", "=", "tf", ".", "placeholder", "(", "dtype", "=", "tf", ".", "int64", ",", "shape", "=", "[", "None", "]", ",", "# batch_size", "name", "=", "\"input_feed\"", ")", "# Process image and insert batch dimensions.", "images", "=", "tf", ".", "expand_dims", "(", "self", ".", "process_image", "(", "image_feed", ")", ",", "0", ")", "input_seqs", "=", "tf", ".", "expand_dims", "(", "input_feed", ",", "1", ")", "# No target sequences or input mask in inference mode.", "target_seqs", "=", "None", "input_mask", "=", "None", "else", ":", "# Prefetch serialized SequenceExample protos.", "input_queue", "=", "input_ops", ".", "prefetch_input_data", "(", "self", ".", "reader", ",", "self", ".", "config", ".", "input_file_pattern", ",", "is_training", "=", "self", ".", "is_training", "(", ")", ",", "batch_size", "=", "self", ".", "config", ".", "batch_size", ",", "values_per_shard", "=", "self", ".", "config", ".", "values_per_input_shard", ",", "input_queue_capacity_factor", "=", "self", ".", "config", ".", "input_queue_capacity_factor", ",", "num_reader_threads", "=", "self", ".", "config", ".", "num_input_reader_threads", ")", "# Image processing and random distortion. Split across multiple threads", "# with each thread applying a slightly different distortion.", "assert", "self", ".", "config", ".", "num_preprocess_threads", "%", "2", "==", "0", "images_and_captions", "=", "[", "]", "for", "thread_id", "in", "range", "(", "self", ".", "config", ".", "num_preprocess_threads", ")", ":", "serialized_sequence_example", "=", "input_queue", ".", "dequeue", "(", ")", "encoded_image", ",", "caption", "=", "input_ops", ".", "parse_sequence_example", "(", "serialized_sequence_example", ",", "image_feature", "=", "self", ".", "config", ".", "image_feature_name", ",", "caption_feature", "=", "self", ".", "config", ".", "caption_feature_name", ")", "image", "=", "self", ".", "process_image", "(", "encoded_image", ",", "thread_id", "=", "thread_id", ")", "images_and_captions", ".", "append", "(", "[", "image", ",", "caption", "]", ")", "# Batch inputs.", "queue_capacity", "=", "(", "2", "*", "self", ".", "config", ".", "num_preprocess_threads", "*", "self", ".", "config", ".", "batch_size", ")", "images", ",", "input_seqs", ",", "target_seqs", ",", "input_mask", "=", "(", "input_ops", ".", "batch_with_dynamic_pad", "(", "images_and_captions", ",", "batch_size", "=", "self", ".", "config", ".", "batch_size", ",", "queue_capacity", "=", "queue_capacity", ")", ")", "self", ".", "images", "=", "images", "self", ".", "input_seqs", "=", "input_seqs", "self", ".", "target_seqs", "=", "target_seqs", "self", ".", "input_mask", "=", "input_mask" ]

[ "Builds", "the", "image", "model", "subgraph", "and", "generates", "image", "embeddings", "." ]

[ "def", "build_image_embeddings", "(", "self", ")", ":", "inception_output", "=", "image_embedding", ".", "inception_v3", "(", "self", ".", "images", ",", "trainable", "=", "self", ".", "train_inception", ",", "is_training", "=", "self", ".", "is_training", "(", ")", ")", "self", ".", "inception_variables", "=", "tf", ".", "get_collection", "(", "tf", ".", "GraphKeys", ".", "GLOBAL_VARIABLES", ",", "scope", "=", "\"InceptionV3\"", ")", "# Map inception output into embedding space.", "with", "tf", ".", "variable_scope", "(", "\"image_embedding\"", ")", "as", "scope", ":", "image_embeddings", "=", "tf", ".", "contrib", ".", "layers", ".", "fully_connected", "(", "inputs", "=", "inception_output", ",", "num_outputs", "=", "self", ".", "config", ".", "embedding_size", ",", "activation_fn", "=", "None", ",", "weights_initializer", "=", "self", ".", "initializer", ",", "biases_initializer", "=", "None", ",", "scope", "=", "scope", ")", "# Save the embedding size in the graph.", "tf", ".", "constant", "(", "self", ".", "config", ".", "embedding_size", ",", "name", "=", "\"embedding_size\"", ")", "self", ".", "image_embeddings", "=", "image_embeddings" ]

[ "Builds", "the", "input", "sequence", "embeddings", "." ]

[ "def", "build_seq_embeddings", "(", "self", ")", ":", "with", "tf", ".", "variable_scope", "(", "\"seq_embedding\"", ")", ",", "tf", ".", "device", "(", "\"/cpu:0\"", ")", ":", "embedding_map", "=", "tf", ".", "get_variable", "(", "name", "=", "\"map\"", ",", "shape", "=", "[", "self", ".", "config", ".", "vocab_size", ",", "self", ".", "config", ".", "embedding_size", "]", ",", "initializer", "=", "self", ".", "initializer", ")", "seq_embeddings", "=", "tf", ".", "nn", ".", "embedding_lookup", "(", "embedding_map", ",", "self", ".", "input_seqs", ")", "self", ".", "seq_embeddings", "=", "seq_embeddings" ]

[ "Builds", "the", "model", "." ]

[ "def", "build_model", "(", "self", ")", ":", "# This LSTM cell has biases and outputs tanh(new_c) * sigmoid(o), but the", "# modified LSTM in the \"Show and Tell\" paper has no biases and outputs", "# new_c * sigmoid(o).", "lstm_cell", "=", "tf", ".", "contrib", ".", "rnn", ".", "BasicLSTMCell", "(", "num_units", "=", "self", ".", "config", ".", "num_lstm_units", ",", "state_is_tuple", "=", "True", ")", "if", "self", ".", "mode", "==", "\"train\"", ":", "lstm_cell", "=", "tf", ".", "contrib", ".", "rnn", ".", "DropoutWrapper", "(", "lstm_cell", ",", "input_keep_prob", "=", "self", ".", "config", ".", "lstm_dropout_keep_prob", ",", "output_keep_prob", "=", "self", ".", "config", ".", "lstm_dropout_keep_prob", ")", "with", "tf", ".", "variable_scope", "(", "\"lstm\"", ",", "initializer", "=", "self", ".", "initializer", ")", "as", "lstm_scope", ":", "# Feed the image embeddings to set the initial LSTM state.", "zero_state", "=", "lstm_cell", ".", "zero_state", "(", "batch_size", "=", "self", ".", "image_embeddings", ".", "get_shape", "(", ")", "[", "0", "]", ",", "dtype", "=", "tf", ".", "float32", ")", "_", ",", "initial_state", "=", "lstm_cell", "(", "self", ".", "image_embeddings", ",", "zero_state", ")", "# Allow the LSTM variables to be reused.", "lstm_scope", ".", "reuse_variables", "(", ")", "if", "self", ".", "mode", "==", "\"inference\"", ":", "# In inference mode, use concatenated states for convenient feeding and", "# fetching.", "tf", ".", "concat", "(", "initial_state", ",", "1", ",", "name", "=", "\"initial_state\"", ")", "# Placeholder for feeding a batch of concatenated states.", "state_feed", "=", "tf", ".", "placeholder", "(", "dtype", "=", "tf", ".", "float32", ",", "shape", "=", "[", "None", ",", "sum", "(", "lstm_cell", ".", "state_size", ")", "]", ",", "name", "=", "\"state_feed\"", ")", "state_tuple", "=", "tf", ".", "split", "(", "value", "=", "state_feed", ",", "num_or_size_splits", "=", "2", ",", "axis", "=", "1", ")", "# Run a single LSTM step.", "lstm_outputs", ",", "state_tuple", "=", "lstm_cell", "(", "inputs", "=", "tf", ".", "squeeze", "(", "self", ".", "seq_embeddings", ",", "squeeze_dims", "=", "[", "1", "]", ")", ",", "state", "=", "state_tuple", ")", "# Concatentate the resulting state.", "tf", ".", "concat", "(", "state_tuple", ",", "1", ",", "name", "=", "\"state\"", ")", "else", ":", "# Run the batch of sequence embeddings through the LSTM.", "sequence_length", "=", "tf", ".", "reduce_sum", "(", "self", ".", "input_mask", ",", "1", ")", "lstm_outputs", ",", "_", "=", "tf", ".", "nn", ".", "dynamic_rnn", "(", "cell", "=", "lstm_cell", ",", "inputs", "=", "self", ".", "seq_embeddings", ",", "sequence_length", "=", "sequence_length", ",", "initial_state", "=", "initial_state", ",", "dtype", "=", "tf", ".", "float32", ",", "scope", "=", "lstm_scope", ")", "# Stack batches vertically.", "lstm_outputs", "=", "tf", ".", "reshape", "(", "lstm_outputs", ",", "[", "-", "1", ",", "lstm_cell", ".", "output_size", "]", ")", "with", "tf", ".", "variable_scope", "(", "\"logits\"", ")", "as", "logits_scope", ":", "logits", "=", "tf", ".", "contrib", ".", "layers", ".", "fully_connected", "(", "inputs", "=", "lstm_outputs", ",", "num_outputs", "=", "self", ".", "config", ".", "vocab_size", ",", "activation_fn", "=", "None", ",", "weights_initializer", "=", "self", ".", "initializer", ",", "scope", "=", "logits_scope", ")", "if", "self", ".", "mode", "==", "\"inference\"", ":", "tf", ".", "nn", ".", "softmax", "(", "logits", ",", "name", "=", "\"softmax\"", ")", "else", ":", "targets", "=", "tf", ".", "reshape", "(", "self", ".", "target_seqs", ",", "[", "-", "1", "]", ")", "weights", "=", "tf", ".", "to_float", "(", "tf", ".", "reshape", "(", "self", ".", "input_mask", ",", "[", "-", "1", "]", ")", ")", "# Compute losses.", "losses", "=", "tf", ".", "nn", ".", "sparse_softmax_cross_entropy_with_logits", "(", "labels", "=", "targets", ",", "logits", "=", "logits", ")", "batch_loss", "=", "tf", ".", "div", "(", "tf", ".", "reduce_sum", "(", "tf", ".", "multiply", "(", "losses", ",", "weights", ")", ")", ",", "tf", ".", "reduce_sum", "(", "weights", ")", ",", "name", "=", "\"batch_loss\"", ")", "tf", ".", "losses", ".", "add_loss", "(", "batch_loss", ")", "total_loss", "=", "tf", ".", "losses", ".", "get_total_loss", "(", ")", "# Add summaries.", "tf", ".", "summary", ".", "scalar", "(", "\"losses/batch_loss\"", ",", "batch_loss", ")", "tf", ".", "summary", ".", "scalar", "(", "\"losses/total_loss\"", ",", "total_loss", ")", "for", "var", "in", "tf", ".", "trainable_variables", "(", ")", ":", "tf", ".", "summary", ".", "histogram", "(", "\"parameters/\"", "+", "var", ".", "op", ".", "name", ",", "var", ")", "self", ".", "total_loss", "=", "total_loss", "self", ".", "target_cross_entropy_losses", "=", "losses", "# Used in evaluation.", "self", ".", "target_cross_entropy_loss_weights", "=", "weights" ]

[ "Sets", "up", "the", "function", "to", "restore", "inception", "variables", "from", "checkpoint", "." ]

[ "def", "setup_inception_initializer", "(", "self", ")", ":", "if", "self", ".", "mode", "!=", "\"inference\"", ":", "# Restore inception variables only.", "saver", "=", "tf", ".", "train", ".", "Saver", "(", "self", ".", "inception_variables", ")", "def", "restore_fn", "(", "sess", ")", ":", "tf", ".", "logging", ".", "info", "(", "\"Restoring Inception variables from checkpoint file %s\"", ",", "self", ".", "config", ".", "inception_checkpoint_file", ")", "saver", ".", "restore", "(", "sess", ",", "self", ".", "config", ".", "inception_checkpoint_file", ")", "self", ".", "init_fn", "=", "restore_fn" ]

[ "Sets", "up", "the", "global", "step", "Tensor", "." ]

[ "def", "setup_global_step", "(", "self", ")", ":", "global_step", "=", "tf", ".", "Variable", "(", "initial_value", "=", "0", ",", "name", "=", "\"global_step\"", ",", "trainable", "=", "False", ",", "collections", "=", "[", "tf", ".", "GraphKeys", ".", "GLOBAL_STEP", ",", "tf", ".", "GraphKeys", ".", "GLOBAL_VARIABLES", "]", ")", "self", ".", "global_step", "=", "global_step" ]

[ "Creates", "all", "ops", "for", "training", "and", "evaluation", "." ]

[ "def", "build", "(", "self", ")", ":", "self", ".", "build_inputs", "(", ")", "self", ".", "build_image_embeddings", "(", ")", "self", ".", "build_seq_embeddings", "(", ")", "self", ".", "build_model", "(", ")", "self", ".", "setup_inception_initializer", "(", ")", "self", ".", "setup_global_step", "(", ")" ]

[ "Builds", "an", "Inception", "V3", "subgraph", "for", "image", "embeddings", "." ]

[ "def", "inception_v3", "(", "images", ",", "trainable", "=", "True", ",", "is_training", "=", "True", ",", "weight_decay", "=", "0.00004", ",", "stddev", "=", "0.1", ",", "dropout_keep_prob", "=", "0.8", ",", "use_batch_norm", "=", "True", ",", "batch_norm_params", "=", "None", ",", "add_summaries", "=", "True", ",", "scope", "=", "\"InceptionV3\"", ")", ":", "# Only consider the inception model to be in training mode if it's trainable.", "is_inception_model_training", "=", "trainable", "and", "is_training", "if", "use_batch_norm", ":", "# Default parameters for batch normalization.", "if", "not", "batch_norm_params", ":", "batch_norm_params", "=", "{", "\"is_training\"", ":", "is_inception_model_training", ",", "\"trainable\"", ":", "trainable", ",", "# Decay for the moving averages.", "\"decay\"", ":", "0.9997", ",", "# Epsilon to prevent 0s in variance.", "\"epsilon\"", ":", "0.001", ",", "# Collection containing the moving mean and moving variance.", "\"variables_collections\"", ":", "{", "\"beta\"", ":", "None", ",", "\"gamma\"", ":", "None", ",", "\"moving_mean\"", ":", "[", "\"moving_vars\"", "]", ",", "\"moving_variance\"", ":", "[", "\"moving_vars\"", "]", ",", "}", "}", "else", ":", "batch_norm_params", "=", "None", "if", "trainable", ":", "weights_regularizer", "=", "tf", ".", "contrib", ".", "layers", ".", "l2_regularizer", "(", "weight_decay", ")", "else", ":", "weights_regularizer", "=", "None", "with", "tf", ".", "variable_scope", "(", "scope", ",", "\"InceptionV3\"", ",", "[", "images", "]", ")", "as", "scope", ":", "with", "slim", ".", "arg_scope", "(", "[", "slim", ".", "conv2d", ",", "slim", ".", "fully_connected", "]", ",", "weights_regularizer", "=", "weights_regularizer", ",", "trainable", "=", "trainable", ")", ":", "with", "slim", ".", "arg_scope", "(", "[", "slim", ".", "conv2d", "]", ",", "weights_initializer", "=", "tf", ".", "truncated_normal_initializer", "(", "stddev", "=", "stddev", ")", ",", "activation_fn", "=", "tf", ".", "nn", ".", "relu", ",", "normalizer_fn", "=", "slim", ".", "batch_norm", ",", "normalizer_params", "=", "batch_norm_params", ")", ":", "net", ",", "end_points", "=", "inception_v3_base", "(", "images", ",", "scope", "=", "scope", ")", "with", "tf", ".", "variable_scope", "(", "\"logits\"", ")", ":", "shape", "=", "net", ".", "get_shape", "(", ")", "net", "=", "slim", ".", "avg_pool2d", "(", "net", ",", "shape", "[", "1", ":", "3", "]", ",", "padding", "=", "\"VALID\"", ",", "scope", "=", "\"pool\"", ")", "net", "=", "slim", ".", "dropout", "(", "net", ",", "keep_prob", "=", "dropout_keep_prob", ",", "is_training", "=", "is_inception_model_training", ",", "scope", "=", "\"dropout\"", ")", "net", "=", "slim", ".", "flatten", "(", "net", ",", "scope", "=", "\"flatten\"", ")", "# Add summaries.", "if", "add_summaries", ":", "for", "v", "in", "end_points", ".", "values", "(", ")", ":", "tf", ".", "contrib", ".", "layers", ".", "summaries", ".", "summarize_activation", "(", "v", ")", "return", "net" ]

[ "Perform", "random", "distortions", "on", "an", "image", "." ]

[ "def", "distort_image", "(", "image", ",", "thread_id", ")", ":", "# Randomly flip horizontally.", "with", "tf", ".", "name_scope", "(", "\"flip_horizontal\"", ",", "values", "=", "[", "image", "]", ")", ":", "image", "=", "tf", ".", "image", ".", "random_flip_left_right", "(", "image", ")", "# Randomly distort the colors based on thread id.", "color_ordering", "=", "thread_id", "%", "2", "with", "tf", ".", "name_scope", "(", "\"distort_color\"", ",", "values", "=", "[", "image", "]", ")", ":", "if", "color_ordering", "==", "0", ":", "image", "=", "tf", ".", "image", ".", "random_brightness", "(", "image", ",", "max_delta", "=", "32.", "/", "255.", ")", "image", "=", "tf", ".", "image", ".", "random_saturation", "(", "image", ",", "lower", "=", "0.5", ",", "upper", "=", "1.5", ")", "image", "=", "tf", ".", "image", ".", "random_hue", "(", "image", ",", "max_delta", "=", "0.032", ")", "image", "=", "tf", ".", "image", ".", "random_contrast", "(", "image", ",", "lower", "=", "0.5", ",", "upper", "=", "1.5", ")", "elif", "color_ordering", "==", "1", ":", "image", "=", "tf", ".", "image", ".", "random_brightness", "(", "image", ",", "max_delta", "=", "32.", "/", "255.", ")", "image", "=", "tf", ".", "image", ".", "random_contrast", "(", "image", ",", "lower", "=", "0.5", ",", "upper", "=", "1.5", ")", "image", "=", "tf", ".", "image", ".", "random_saturation", "(", "image", ",", "lower", "=", "0.5", ",", "upper", "=", "1.5", ")", "image", "=", "tf", ".", "image", ".", "random_hue", "(", "image", ",", "max_delta", "=", "0.032", ")", "# The random_* ops do not necessarily clamp.", "image", "=", "tf", ".", "clip_by_value", "(", "image", ",", "0.0", ",", "1.0", ")", "return", "image" ]

[ "Decode", "an", "image", "resize", "and", "apply", "random", "distortions", "." ]

[ "def", "process_image", "(", "encoded_image", ",", "is_training", ",", "height", ",", "width", ",", "resize_height", "=", "346", ",", "resize_width", "=", "346", ",", "thread_id", "=", "0", ",", "image_format", "=", "\"jpeg\"", ")", ":", "# Helper function to log an image summary to the visualizer. Summaries are", "# only logged in thread 0.", "def", "image_summary", "(", "name", ",", "image", ")", ":", "if", "not", "thread_id", ":", "tf", ".", "summary", ".", "image", "(", "name", ",", "tf", ".", "expand_dims", "(", "image", ",", "0", ")", ")", "# Decode image into a float32 Tensor of shape [?, ?, 3] with values in [0, 1).", "with", "tf", ".", "name_scope", "(", "\"decode\"", ",", "values", "=", "[", "encoded_image", "]", ")", ":", "if", "image_format", "==", "\"jpeg\"", ":", "image", "=", "tf", ".", "image", ".", "decode_jpeg", "(", "encoded_image", ",", "channels", "=", "3", ")", "elif", "image_format", "==", "\"png\"", ":", "image", "=", "tf", ".", "image", ".", "decode_png", "(", "encoded_image", ",", "channels", "=", "3", ")", "else", ":", "raise", "ValueError", "(", "\"Invalid image format: %s\"", "%", "image_format", ")", "image", "=", "tf", ".", "image", ".", "convert_image_dtype", "(", "image", ",", "dtype", "=", "tf", ".", "float32", ")", "image_summary", "(", "\"original_image\"", ",", "image", ")", "# Resize image.", "assert", "(", "resize_height", ">", "0", ")", "==", "(", "resize_width", ">", "0", ")", "if", "resize_height", ":", "image", "=", "tf", ".", "image", ".", "resize_images", "(", "image", ",", "size", "=", "[", "resize_height", ",", "resize_width", "]", ",", "method", "=", "tf", ".", "image", ".", "ResizeMethod", ".", "BILINEAR", ")", "# Crop to final dimensions.", "if", "is_training", ":", "image", "=", "tf", ".", "random_crop", "(", "image", ",", "[", "height", ",", "width", ",", "3", "]", ")", "else", ":", "# Central crop, assuming resize_height > height, resize_width > width.", "image", "=", "tf", ".", "image", ".", "resize_image_with_crop_or_pad", "(", "image", ",", "height", ",", "width", ")", "image_summary", "(", "\"resized_image\"", ",", "image", ")", "# Randomly distort the image.", "if", "is_training", ":", "image", "=", "distort_image", "(", "image", ",", "thread_id", ")", "image_summary", "(", "\"final_image\"", ",", "image", ")", "# Rescale to [-1,1] instead of [0, 1]", "image", "=", "tf", ".", "subtract", "(", "image", ",", "0.5", ")", "image", "=", "tf", ".", "multiply", "(", "image", ",", "2.0", ")", "return", "image" ]

[ "Parses", "a", "tensorflow", ".", "SequenceExample", "into", "an", "image", "and", "caption", "." ]

[ "def", "parse_sequence_example", "(", "serialized", ",", "image_feature", ",", "caption_feature", ")", ":", "context", ",", "sequence", "=", "tf", ".", "parse_single_sequence_example", "(", "serialized", ",", "context_features", "=", "{", "image_feature", ":", "tf", ".", "FixedLenFeature", "(", "[", "]", ",", "dtype", "=", "tf", ".", "string", ")", "}", ",", "sequence_features", "=", "{", "caption_feature", ":", "tf", ".", "FixedLenSequenceFeature", "(", "[", "]", ",", "dtype", "=", "tf", ".", "int64", ")", ",", "}", ")", "encoded_image", "=", "context", "[", "image_feature", "]", "caption", "=", "sequence", "[", "caption_feature", "]", "return", "encoded_image", ",", "caption" ]

[ "Prefetches", "string", "values", "from", "disk", "into", "an", "input", "queue", "." ]

[ "def", "prefetch_input_data", "(", "reader", ",", "file_pattern", ",", "is_training", ",", "batch_size", ",", "values_per_shard", ",", "input_queue_capacity_factor", "=", "16", ",", "num_reader_threads", "=", "1", ",", "shard_queue_name", "=", "\"filename_queue\"", ",", "value_queue_name", "=", "\"input_queue\"", ")", ":", "data_files", "=", "[", "]", "for", "pattern", "in", "file_pattern", ".", "split", "(", "\",\"", ")", ":", "data_files", ".", "extend", "(", "tf", ".", "gfile", ".", "Glob", "(", "pattern", ")", ")", "if", "not", "data_files", ":", "tf", ".", "logging", ".", "fatal", "(", "\"Found no input files matching %s\"", ",", "file_pattern", ")", "else", ":", "tf", ".", "logging", ".", "info", "(", "\"Prefetching values from %d files matching %s\"", ",", "len", "(", "data_files", ")", ",", "file_pattern", ")", "if", "is_training", ":", "filename_queue", "=", "tf", ".", "train", ".", "string_input_producer", "(", "data_files", ",", "shuffle", "=", "True", ",", "capacity", "=", "16", ",", "name", "=", "shard_queue_name", ")", "min_queue_examples", "=", "values_per_shard", "*", "input_queue_capacity_factor", "capacity", "=", "min_queue_examples", "+", "100", "*", "batch_size", "values_queue", "=", "tf", ".", "RandomShuffleQueue", "(", "capacity", "=", "capacity", ",", "min_after_dequeue", "=", "min_queue_examples", ",", "dtypes", "=", "[", "tf", ".", "string", "]", ",", "name", "=", "\"random_\"", "+", "value_queue_name", ")", "else", ":", "filename_queue", "=", "tf", ".", "train", ".", "string_input_producer", "(", "data_files", ",", "shuffle", "=", "False", ",", "capacity", "=", "1", ",", "name", "=", "shard_queue_name", ")", "capacity", "=", "values_per_shard", "+", "3", "*", "batch_size", "values_queue", "=", "tf", ".", "FIFOQueue", "(", "capacity", "=", "capacity", ",", "dtypes", "=", "[", "tf", ".", "string", "]", ",", "name", "=", "\"fifo_\"", "+", "value_queue_name", ")", "enqueue_ops", "=", "[", "]", "for", "_", "in", "range", "(", "num_reader_threads", ")", ":", "_", ",", "value", "=", "reader", ".", "read", "(", "filename_queue", ")", "enqueue_ops", ".", "append", "(", "values_queue", ".", "enqueue", "(", "[", "value", "]", ")", ")", "tf", ".", "train", ".", "queue_runner", ".", "add_queue_runner", "(", "tf", ".", "train", ".", "queue_runner", ".", "QueueRunner", "(", "values_queue", ",", "enqueue_ops", ")", ")", "tf", ".", "summary", ".", "scalar", "(", "\"queue/%s/fraction_of_%d_full\"", "%", "(", "values_queue", ".", "name", ",", "capacity", ")", ",", "tf", ".", "cast", "(", "values_queue", ".", "size", "(", ")", ",", "tf", ".", "float32", ")", "*", "(", "1.", "/", "capacity", ")", ")", "return", "values_queue" ]

[ "Batches", "input", "images", "and", "captions", "." ]

[ "def", "batch_with_dynamic_pad", "(", "images_and_captions", ",", "batch_size", ",", "queue_capacity", ",", "add_summaries", "=", "True", ")", ":", "enqueue_list", "=", "[", "]", "for", "image", ",", "caption", "in", "images_and_captions", ":", "caption_length", "=", "tf", ".", "shape", "(", "caption", ")", "[", "0", "]", "input_length", "=", "tf", ".", "expand_dims", "(", "tf", ".", "subtract", "(", "caption_length", ",", "1", ")", ",", "0", ")", "input_seq", "=", "tf", ".", "slice", "(", "caption", ",", "[", "0", "]", ",", "input_length", ")", "target_seq", "=", "tf", ".", "slice", "(", "caption", ",", "[", "1", "]", ",", "input_length", ")", "indicator", "=", "tf", ".", "ones", "(", "input_length", ",", "dtype", "=", "tf", ".", "int32", ")", "enqueue_list", ".", "append", "(", "[", "image", ",", "input_seq", ",", "target_seq", ",", "indicator", "]", ")", "images", ",", "input_seqs", ",", "target_seqs", ",", "mask", "=", "tf", ".", "train", ".", "batch_join", "(", "enqueue_list", ",", "batch_size", "=", "batch_size", ",", "capacity", "=", "queue_capacity", ",", "dynamic_pad", "=", "True", ",", "name", "=", "\"batch_and_pad\"", ")", "if", "add_summaries", ":", "lengths", "=", "tf", ".", "add", "(", "tf", ".", "reduce_sum", "(", "mask", ",", "1", ")", ",", "1", ")", "tf", ".", "summary", ".", "scalar", "(", "\"caption_length/batch_min\"", ",", "tf", ".", "reduce_min", "(", "lengths", ")", ")", "tf", ".", "summary", ".", "scalar", "(", "\"caption_length/batch_max\"", ",", "tf", ".", "reduce_max", "(", "lengths", ")", ")", "tf", ".", "summary", ".", "scalar", "(", "\"caption_length/batch_mean\"", ",", "tf", ".", "reduce_mean", "(", "lengths", ")", ")", "return", "images", ",", "input_seqs", ",", "target_seqs", ",", "mask" ]

[ "Initializes", "the", "vocabulary", "." ]

[ "def", "__init__", "(", "self", ",", "vocab_file", ",", "start_word", "=", "\"<S>\"", ",", "end_word", "=", "\"</S>\"", ",", "unk_word", "=", "\"<UNK>\"", ")", ":", "if", "not", "tf", ".", "gfile", ".", "Exists", "(", "vocab_file", ")", ":", "tf", ".", "logging", ".", "fatal", "(", "\"Vocab file %s not found.\"", ",", "vocab_file", ")", "tf", ".", "logging", ".", "info", "(", "\"Initializing vocabulary from file: %s\"", ",", "vocab_file", ")", "with", "tf", ".", "gfile", ".", "GFile", "(", "vocab_file", ",", "mode", "=", "\"r\"", ")", "as", "f", ":", "reverse_vocab", "=", "list", "(", "f", ".", "readlines", "(", ")", ")", "reverse_vocab", "=", "[", "line", ".", "split", "(", ")", "[", "0", "]", "for", "line", "in", "reverse_vocab", "]", "assert", "start_word", "in", "reverse_vocab", "assert", "end_word", "in", "reverse_vocab", "if", "unk_word", "not", "in", "reverse_vocab", ":", "reverse_vocab", ".", "append", "(", "unk_word", ")", "vocab", "=", "dict", "(", "[", "(", "x", ",", "y", ")", "for", "(", "y", ",", "x", ")", "in", "enumerate", "(", "reverse_vocab", ")", "]", ")", "tf", ".", "logging", ".", "info", "(", "\"Created vocabulary with %d words\"", "%", "len", "(", "vocab", ")", ")", "self", ".", "vocab", "=", "vocab", "# vocab[word] = id", "self", ".", "reverse_vocab", "=", "reverse_vocab", "# reverse_vocab[id] = word", "# Save special word ids.", "self", ".", "start_id", "=", "vocab", "[", "start_word", "]", "self", ".", "end_id", "=", "vocab", "[", "end_word", "]", "self", ".", "unk_id", "=", "vocab", "[", "unk_word", "]" ]

[ "Returns", "the", "integer", "word", "id", "of", "a", "word", "string", "." ]

[ "def", "word_to_id", "(", "self", ",", "word", ")", ":", "if", "word", "in", "self", ".", "vocab", ":", "return", "self", ".", "vocab", "[", "word", "]", "else", ":", "return", "self", ".", "unk_id" ]

[ "Returns", "the", "word", "string", "of", "an", "integer", "word", "id", "." ]

[ "def", "id_to_word", "(", "self", ",", "word_id", ")", ":", "if", "word_id", ">=", "len", "(", "self", ".", "reverse_vocab", ")", ":", "return", "self", ".", "reverse_vocab", "[", "self", ".", "unk_id", "]", "else", ":", "return", "self", ".", "reverse_vocab", "[", "word_id", "]" ]

[ "Builds", "the", "model", "for", "inference", "." ]

[ "def", "build_model", "(", "self", ",", "model_config", ")", ":", "tf", ".", "logging", ".", "fatal", "(", "\"Please implement build_model in subclass\"", ")" ]

[ "Creates", "a", "function", "that", "restores", "a", "model", "from", "checkpoint", "." ]

[ "def", "_create_restore_fn", "(", "self", ",", "checkpoint_path", ",", "saver", ")", ":", "if", "tf", ".", "gfile", ".", "IsDirectory", "(", "checkpoint_path", ")", ":", "checkpoint_path", "=", "tf", ".", "train", ".", "latest_checkpoint", "(", "checkpoint_path", ")", "if", "not", "checkpoint_path", ":", "raise", "ValueError", "(", "\"No checkpoint file found in: %s\"", "%", "checkpoint_path", ")", "def", "_restore_fn", "(", "sess", ")", ":", "tf", ".", "logging", ".", "info", "(", "\"Loading model from checkpoint: %s\"", ",", "checkpoint_path", ")", "saver", ".", "restore", "(", "sess", ",", "checkpoint_path", ")", "tf", ".", "logging", ".", "info", "(", "\"Successfully loaded checkpoint: %s\"", ",", "os", ".", "path", ".", "basename", "(", "checkpoint_path", ")", ")", "return", "_restore_fn" ]

[ "Builds", "the", "inference", "graph", "from", "a", "configuration", "object", "." ]

[ "def", "build_graph_from_config", "(", "self", ",", "model_config", ",", "checkpoint_path", ")", ":", "tf", ".", "logging", ".", "info", "(", "\"Building model.\"", ")", "self", ".", "build_model", "(", "model_config", ")", "saver", "=", "tf", ".", "train", ".", "Saver", "(", ")", "return", "self", ".", "_create_restore_fn", "(", "checkpoint_path", ",", "saver", ")" ]

[ "Builds", "the", "inference", "graph", "from", "serialized", "GraphDef", "and", "SaverDef", "protos", "." ]

[ "def", "build_graph_from_proto", "(", "self", ",", "graph_def_file", ",", "saver_def_file", ",", "checkpoint_path", ")", ":", "# Load the Graph.", "tf", ".", "logging", ".", "info", "(", "\"Loading GraphDef from file: %s\"", ",", "graph_def_file", ")", "graph_def", "=", "tf", ".", "GraphDef", "(", ")", "with", "tf", ".", "gfile", ".", "FastGFile", "(", "graph_def_file", ",", "\"rb\"", ")", "as", "f", ":", "graph_def", ".", "ParseFromString", "(", "f", ".", "read", "(", ")", ")", "tf", ".", "import_graph_def", "(", "graph_def", ",", "name", "=", "\"\"", ")", "# Load the Saver.", "tf", ".", "logging", ".", "info", "(", "\"Loading SaverDef from file: %s\"", ",", "saver_def_file", ")", "saver_def", "=", "tf", ".", "train", ".", "SaverDef", "(", ")", "with", "tf", ".", "gfile", ".", "FastGFile", "(", "saver_def_file", ",", "\"rb\"", ")", "as", "f", ":", "saver_def", ".", "ParseFromString", "(", "f", ".", "read", "(", ")", ")", "saver", "=", "tf", ".", "train", ".", "Saver", "(", "saver_def", "=", "saver_def", ")", "return", "self", ".", "_create_restore_fn", "(", "checkpoint_path", ",", "saver", ")" ]

[ "Feeds", "an", "image", "and", "returns", "the", "initial", "model", "state", "." ]

[ "def", "feed_image", "(", "self", ",", "sess", ",", "encoded_image", ")", ":", "tf", ".", "logging", ".", "fatal", "(", "\"Please implement feed_image in subclass\"", ")" ]

[ "Runs", "one", "step", "of", "inference", "." ]

[ "def", "inference_step", "(", "self", ",", "sess", ",", "input_feed", ",", "state_feed", ")", ":", "tf", ".", "logging", ".", "fatal", "(", "\"Please implement inference_step in subclass\"", ")" ]

[ "Initializes", "the", "Caption", "." ]

[ "def", "__init__", "(", "self", ",", "sentence", ",", "state", ",", "logprob", ",", "score", ",", "metadata", "=", "None", ")", ":", "self", ".", "sentence", "=", "sentence", "self", ".", "state", "=", "state", "self", ".", "logprob", "=", "logprob", "self", ".", "score", "=", "score", "self", ".", "metadata", "=", "metadata" ]

[ "Compares", "Captions", "by", "score", "." ]

[ "def", "__cmp__", "(", "self", ",", "other", ")", ":", "assert", "isinstance", "(", "other", ",", "Caption", ")", "if", "self", ".", "score", "==", "other", ".", "score", ":", "return", "0", "elif", "self", ".", "score", "<", "other", ".", "score", ":", "return", "-", "1", "else", ":", "return", "1" ]

[ "Pushes", "a", "new", "element", "." ]

[ "def", "push", "(", "self", ",", "x", ")", ":", "assert", "self", ".", "_data", "is", "not", "None", "if", "len", "(", "self", ".", "_data", ")", "<", "self", ".", "_n", ":", "heapq", ".", "heappush", "(", "self", ".", "_data", ",", "x", ")", "else", ":", "heapq", ".", "heappushpop", "(", "self", ".", "_data", ",", "x", ")" ]

[ "Extracts", "all", "elements", "from", "the", "TopN", ".", "This", "is", "a", "destructive", "operation", "." ]

[ "def", "extract", "(", "self", ",", "sort", "=", "False", ")", ":", "assert", "self", ".", "_data", "is", "not", "None", "data", "=", "self", ".", "_data", "self", ".", "_data", "=", "None", "if", "sort", ":", "data", ".", "sort", "(", "reverse", "=", "True", ")", "return", "data" ]

[ "Returns", "the", "TopN", "to", "an", "empty", "state", "." ]

[ "def", "reset", "(", "self", ")", ":", "self", ".", "_data", "=", "[", "]" ]

[ "Initializes", "the", "generator", "." ]

[ "def", "__init__", "(", "self", ",", "model", ",", "vocab", ",", "beam_size", "=", "3", ",", "max_caption_length", "=", "20", ",", "length_normalization_factor", "=", "0.0", ")", ":", "self", ".", "vocab", "=", "vocab", "self", ".", "model", "=", "model", "self", ".", "beam_size", "=", "beam_size", "self", ".", "max_caption_length", "=", "max_caption_length", "self", ".", "length_normalization_factor", "=", "length_normalization_factor" ]

[ "Runs", "beam", "search", "caption", "generation", "on", "a", "single", "image", "." ]

[ "def", "beam_search", "(", "self", ",", "sess", ",", "encoded_image", ")", ":", "# Feed in the image to get the initial state.", "initial_state", "=", "self", ".", "model", ".", "feed_image", "(", "sess", ",", "encoded_image", ")", "initial_beam", "=", "Caption", "(", "sentence", "=", "[", "self", ".", "vocab", ".", "start_id", "]", ",", "state", "=", "initial_state", "[", "0", "]", ",", "logprob", "=", "0.0", ",", "score", "=", "0.0", ",", "metadata", "=", "[", "\"\"", "]", ")", "partial_captions", "=", "TopN", "(", "self", ".", "beam_size", ")", "partial_captions", ".", "push", "(", "initial_beam", ")", "complete_captions", "=", "TopN", "(", "self", ".", "beam_size", ")", "# Run beam search.", "for", "_", "in", "range", "(", "self", ".", "max_caption_length", "-", "1", ")", ":", "partial_captions_list", "=", "partial_captions", ".", "extract", "(", ")", "partial_captions", ".", "reset", "(", ")", "input_feed", "=", "np", ".", "array", "(", "[", "c", ".", "sentence", "[", "-", "1", "]", "for", "c", "in", "partial_captions_list", "]", ")", "state_feed", "=", "np", ".", "array", "(", "[", "c", ".", "state", "for", "c", "in", "partial_captions_list", "]", ")", "softmax", ",", "new_states", ",", "metadata", "=", "self", ".", "model", ".", "inference_step", "(", "sess", ",", "input_feed", ",", "state_feed", ")", "for", "i", ",", "partial_caption", "in", "enumerate", "(", "partial_captions_list", ")", ":", "word_probabilities", "=", "softmax", "[", "i", "]", "state", "=", "new_states", "[", "i", "]", "# For this partial caption, get the beam_size most probable next words.", "words_and_probs", "=", "list", "(", "enumerate", "(", "word_probabilities", ")", ")", "words_and_probs", ".", "sort", "(", "key", "=", "lambda", "x", ":", "-", "x", "[", "1", "]", ")", "words_and_probs", "=", "words_and_probs", "[", "0", ":", "self", ".", "beam_size", "]", "# Each next word gives a new partial caption.", "for", "w", ",", "p", "in", "words_and_probs", ":", "if", "p", "<", "1e-12", ":", "continue", "# Avoid log(0).", "sentence", "=", "partial_caption", ".", "sentence", "+", "[", "w", "]", "logprob", "=", "partial_caption", ".", "logprob", "+", "math", ".", "log", "(", "p", ")", "score", "=", "logprob", "if", "metadata", ":", "metadata_list", "=", "partial_caption", ".", "metadata", "+", "[", "metadata", "[", "i", "]", "]", "else", ":", "metadata_list", "=", "None", "if", "w", "==", "self", ".", "vocab", ".", "end_id", ":", "if", "self", ".", "length_normalization_factor", ">", "0", ":", "score", "/=", "len", "(", "sentence", ")", "**", "self", ".", "length_normalization_factor", "beam", "=", "Caption", "(", "sentence", ",", "state", ",", "logprob", ",", "score", ",", "metadata_list", ")", "complete_captions", ".", "push", "(", "beam", ")", "else", ":", "beam", "=", "Caption", "(", "sentence", ",", "state", ",", "logprob", ",", "score", ",", "metadata_list", ")", "partial_captions", ".", "push", "(", "beam", ")", "if", "partial_captions", ".", "size", "(", ")", "==", "0", ":", "# We have run out of partial candidates; happens when beam_size = 1.", "break", "# If we have no complete captions then fall back to the partial captions.", "# But never output a mixture of complete and partial captions because a", "# partial caption could have a higher score than all the complete captions.", "if", "not", "complete_captions", ".", "size", "(", ")", ":", "complete_captions", "=", "partial_captions", "return", "complete_captions", ".", "extract", "(", "sort", "=", "True", ")" ]

[ "Change", "the", "module", "s", "cut", "and", "cut_for_search", "functions", "to", "the", "parallel", "version", "." ]

[ "def", "enable_parallel", "(", "processnum", "=", "None", ")", ":", "global", "pool", ",", "dt", ",", "cut", ",", "cut_for_search", "from", "multiprocessing", "import", "cpu_count", "if", "os", ".", "name", "==", "'nt'", ":", "raise", "NotImplementedError", "(", "\"jieba: parallel mode only supports posix system\"", ")", "else", ":", "from", "multiprocessing", "import", "Pool", "dt", ".", "check_initialized", "(", ")", "if", "processnum", "is", "None", ":", "processnum", "=", "cpu_count", "(", ")", "pool", "=", "Pool", "(", "processnum", ")", "cut", "=", "_pcut", "cut_for_search", "=", "_pcut_for_search" ]

[ "The", "main", "function", "that", "segments", "an", "entire", "sentence", "that", "contains", "Chinese", "characters", "into", "seperated", "words", "." ]

[ "def", "cut", "(", "self", ",", "sentence", ",", "cut_all", "=", "False", ",", "HMM", "=", "True", ")", ":", "sentence", "=", "strdecode", "(", "sentence", ")", "if", "cut_all", ":", "re_han", "=", "re_han_cut_all", "re_skip", "=", "re_skip_cut_all", "else", ":", "re_han", "=", "re_han_default", "re_skip", "=", "re_skip_default", "if", "cut_all", ":", "cut_block", "=", "self", ".", "__cut_all", "elif", "HMM", ":", "cut_block", "=", "self", ".", "__cut_DAG", "else", ":", "cut_block", "=", "self", ".", "__cut_DAG_NO_HMM", "blocks", "=", "re_han", ".", "split", "(", "sentence", ")", "for", "blk", "in", "blocks", ":", "if", "not", "blk", ":", "continue", "if", "re_han", ".", "match", "(", "blk", ")", ":", "for", "word", "in", "cut_block", "(", "blk", ")", ":", "yield", "word", "else", ":", "tmp", "=", "re_skip", ".", "split", "(", "blk", ")", "for", "x", "in", "tmp", ":", "if", "re_skip", ".", "match", "(", "x", ")", ":", "yield", "x", "elif", "not", "cut_all", ":", "for", "xx", "in", "x", ":", "yield", "xx", "else", ":", "yield", "x" ]

[ "Finer", "segmentation", "for", "search", "engines", "." ]

[ "def", "cut_for_search", "(", "self", ",", "sentence", ",", "HMM", "=", "True", ")", ":", "words", "=", "self", ".", "cut", "(", "sentence", ",", "HMM", "=", "HMM", ")", "for", "w", "in", "words", ":", "if", "len", "(", "w", ")", ">", "2", ":", "for", "i", "in", "xrange", "(", "len", "(", "w", ")", "-", "1", ")", ":", "gram2", "=", "w", "[", "i", ":", "i", "+", "2", "]", "if", "self", ".", "FREQ", ".", "get", "(", "gram2", ")", ":", "yield", "gram2", "if", "len", "(", "w", ")", ">", "3", ":", "for", "i", "in", "xrange", "(", "len", "(", "w", ")", "-", "2", ")", ":", "gram3", "=", "w", "[", "i", ":", "i", "+", "3", "]", "if", "self", ".", "FREQ", ".", "get", "(", "gram3", ")", ":", "yield", "gram3", "yield", "w" ]

[ "Load", "personalized", "dict", "to", "improve", "detect", "rate", "." ]

[ "def", "load_userdict", "(", "self", ",", "f", ")", ":", "self", ".", "check_initialized", "(", ")", "if", "isinstance", "(", "f", ",", "string_types", ")", ":", "f_name", "=", "f", "f", "=", "open", "(", "f", ",", "'rb'", ")", "else", ":", "f_name", "=", "resolve_filename", "(", "f", ")", "for", "lineno", ",", "ln", "in", "enumerate", "(", "f", ",", "1", ")", ":", "line", "=", "ln", ".", "strip", "(", ")", "if", "not", "isinstance", "(", "line", ",", "text_type", ")", ":", "try", ":", "line", "=", "line", ".", "decode", "(", "'utf-8'", ")", ".", "lstrip", "(", "'\\ufeff'", ")", "except", "UnicodeDecodeError", ":", "raise", "ValueError", "(", "'dictionary file %s must be utf-8'", "%", "f_name", ")", "if", "not", "line", ":", "continue", "# match won't be None because there's at least one character", "word", ",", "freq", ",", "tag", "=", "re_userdict", ".", "match", "(", "line", ")", ".", "groups", "(", ")", "if", "freq", "is", "not", "None", ":", "freq", "=", "freq", ".", "strip", "(", ")", "if", "tag", "is", "not", "None", ":", "tag", "=", "tag", ".", "strip", "(", ")", "self", ".", "add_word", "(", "word", ",", "freq", ",", "tag", ")" ]

[ "Add", "a", "word", "to", "dictionary", "." ]

[ "def", "add_word", "(", "self", ",", "word", ",", "freq", "=", "None", ",", "tag", "=", "None", ")", ":", "self", ".", "check_initialized", "(", ")", "word", "=", "strdecode", "(", "word", ")", "freq", "=", "int", "(", "freq", ")", "if", "freq", "is", "not", "None", "else", "self", ".", "suggest_freq", "(", "word", ",", "False", ")", "self", ".", "FREQ", "[", "word", "]", "=", "freq", "self", ".", "total", "+=", "freq", "if", "tag", ":", "self", ".", "user_word_tag_tab", "[", "word", "]", "=", "tag", "for", "ch", "in", "xrange", "(", "len", "(", "word", ")", ")", ":", "wfrag", "=", "word", "[", ":", "ch", "+", "1", "]", "if", "wfrag", "not", "in", "self", ".", "FREQ", ":", "self", ".", "FREQ", "[", "wfrag", "]", "=", "0", "if", "freq", "==", "0", ":", "finalseg", ".", "add_force_split", "(", "word", ")" ]

[ "Convenient", "function", "for", "deleting", "a", "word", "." ]

[ "def", "del_word", "(", "self", ",", "word", ")", ":", "self", ".", "add_word", "(", "word", ",", "0", ")" ]

[ "Suggest", "word", "frequency", "to", "force", "the", "characters", "in", "a", "word", "to", "be", "joined", "or", "splitted", "." ]

[ "def", "suggest_freq", "(", "self", ",", "segment", ",", "tune", "=", "False", ")", ":", "self", ".", "check_initialized", "(", ")", "ftotal", "=", "float", "(", "self", ".", "total", ")", "freq", "=", "1", "if", "isinstance", "(", "segment", ",", "string_types", ")", ":", "word", "=", "segment", "for", "seg", "in", "self", ".", "cut", "(", "word", ",", "HMM", "=", "False", ")", ":", "freq", "*=", "self", ".", "FREQ", ".", "get", "(", "seg", ",", "1", ")", "/", "ftotal", "freq", "=", "max", "(", "int", "(", "freq", "*", "self", ".", "total", ")", "+", "1", ",", "self", ".", "FREQ", ".", "get", "(", "word", ",", "1", ")", ")", "else", ":", "segment", "=", "tuple", "(", "map", "(", "strdecode", ",", "segment", ")", ")", "word", "=", "''", ".", "join", "(", "segment", ")", "for", "seg", "in", "segment", ":", "freq", "*=", "self", ".", "FREQ", ".", "get", "(", "seg", ",", "1", ")", "/", "ftotal", "freq", "=", "min", "(", "int", "(", "freq", "*", "self", ".", "total", ")", ",", "self", ".", "FREQ", ".", "get", "(", "word", ",", "0", ")", ")", "if", "tune", ":", "add_word", "(", "word", ",", "freq", ")", "return", "freq" ]

[ "Tokenize", "a", "sentence", "and", "yields", "tuples", "of", "(", "word", "start", "end", ")" ]

[ "def", "tokenize", "(", "self", ",", "unicode_sentence", ",", "mode", "=", "\"default\"", ",", "HMM", "=", "True", ")", ":", "if", "not", "isinstance", "(", "unicode_sentence", ",", "text_type", ")", ":", "raise", "ValueError", "(", "\"jieba: the input parameter should be unicode.\"", ")", "start", "=", "0", "if", "mode", "==", "'default'", ":", "for", "w", "in", "self", ".", "cut", "(", "unicode_sentence", ",", "HMM", "=", "HMM", ")", ":", "width", "=", "len", "(", "w", ")", "yield", "(", "w", ",", "start", ",", "start", "+", "width", ")", "start", "+=", "width", "else", ":", "for", "w", "in", "self", ".", "cut", "(", "unicode_sentence", ",", "HMM", "=", "HMM", ")", ":", "width", "=", "len", "(", "w", ")", "if", "len", "(", "w", ")", ">", "2", ":", "for", "i", "in", "xrange", "(", "len", "(", "w", ")", "-", "1", ")", ":", "gram2", "=", "w", "[", "i", ":", "i", "+", "2", "]", "if", "self", ".", "FREQ", ".", "get", "(", "gram2", ")", ":", "yield", "(", "gram2", ",", "start", "+", "i", ",", "start", "+", "i", "+", "2", ")", "if", "len", "(", "w", ")", ">", "3", ":", "for", "i", "in", "xrange", "(", "len", "(", "w", ")", "-", "2", ")", ":", "gram3", "=", "w", "[", "i", ":", "i", "+", "3", "]", "if", "self", ".", "FREQ", ".", "get", "(", "gram3", ")", ":", "yield", "(", "gram3", ",", "start", "+", "i", ",", "start", "+", "i", "+", "3", ")", "yield", "(", "w", ",", "start", ",", "start", "+", "width", ")", "start", "+=", "width" ]

[ "Extract", "keywords", "from", "sentence", "using", "TF", "-", "IDF", "algorithm", ".", "Parameter", ":", "-", "topK", ":", "return", "how", "many", "top", "keywords", ".", "None", "for", "all", "possible", "words", ".", "-", "withWeight", ":", "if", "True", "return", "a", "list", "of", "(", "word", "weight", ")", ";", "if", "False", "return", "a", "list", "of", "words", ".", "-", "allowPOS", ":", "the", "allowed", "POS", "list", "eg", ".", "[", "ns", "n", "vn", "v", "nr", "]", ".", "if", "the", "POS", "of", "w", "is", "not", "in", "this", "list", "it", "will", "be", "filtered", ".", "-", "withFlag", ":", "only", "work", "with", "allowPOS", "is", "not", "empty", ".", "if", "True", "return", "a", "list", "of", "pair", "(", "word", "weight", ")", "like", "posseg", ".", "cut", "if", "False", "return", "a", "list", "of", "words" ]

[ "def", "extract_tags", "(", "self", ",", "sentence", ",", "topK", "=", "20", ",", "withWeight", "=", "False", ",", "allowPOS", "=", "(", ")", ",", "withFlag", "=", "False", ")", ":", "if", "allowPOS", ":", "allowPOS", "=", "frozenset", "(", "allowPOS", ")", "words", "=", "self", ".", "postokenizer", ".", "cut", "(", "sentence", ")", "else", ":", "words", "=", "self", ".", "tokenizer", ".", "cut", "(", "sentence", ")", "freq", "=", "{", "}", "for", "w", "in", "words", ":", "if", "allowPOS", ":", "if", "w", ".", "flag", "not", "in", "allowPOS", ":", "continue", "elif", "not", "withFlag", ":", "w", "=", "w", ".", "word", "wc", "=", "w", ".", "word", "if", "allowPOS", "and", "withFlag", "else", "w", "if", "len", "(", "wc", ".", "strip", "(", ")", ")", "<", "2", "or", "wc", ".", "lower", "(", ")", "in", "self", ".", "stop_words", ":", "continue", "freq", "[", "w", "]", "=", "freq", ".", "get", "(", "w", ",", "0.0", ")", "+", "1.0", "total", "=", "sum", "(", "freq", ".", "values", "(", ")", ")", "for", "k", "in", "freq", ":", "kw", "=", "k", ".", "word", "if", "allowPOS", "and", "withFlag", "else", "k", "freq", "[", "k", "]", "*=", "self", ".", "idf_freq", ".", "get", "(", "kw", ",", "self", ".", "median_idf", ")", "/", "total", "if", "withWeight", ":", "tags", "=", "sorted", "(", "freq", ".", "items", "(", ")", ",", "key", "=", "itemgetter", "(", "1", ")", ",", "reverse", "=", "True", ")", "else", ":", "tags", "=", "sorted", "(", "freq", ",", "key", "=", "freq", ".", "__getitem__", ",", "reverse", "=", "True", ")", "if", "topK", ":", "return", "tags", "[", ":", "topK", "]", "else", ":", "return", "tags" ]

[ "Extract", "keywords", "from", "sentence", "using", "TextRank", "algorithm", ".", "Parameter", ":", "-", "topK", ":", "return", "how", "many", "top", "keywords", ".", "None", "for", "all", "possible", "words", ".", "-", "withWeight", ":", "if", "True", "return", "a", "list", "of", "(", "word", "weight", ")", ";", "if", "False", "return", "a", "list", "of", "words", ".", "-", "allowPOS", ":", "the", "allowed", "POS", "list", "eg", ".", "[", "ns", "n", "vn", "v", "]", ".", "if", "the", "POS", "of", "w", "is", "not", "in", "this", "list", "it", "will", "be", "filtered", ".", "-", "withFlag", ":", "if", "True", "return", "a", "list", "of", "pair", "(", "word", "weight", ")", "like", "posseg", ".", "cut", "if", "False", "return", "a", "list", "of", "words" ]

[ "def", "textrank", "(", "self", ",", "sentence", ",", "topK", "=", "20", ",", "withWeight", "=", "False", ",", "allowPOS", "=", "(", "'ns'", ",", "'n'", ",", "'vn'", ",", "'v'", ")", ",", "withFlag", "=", "False", ")", ":", "self", ".", "pos_filt", "=", "frozenset", "(", "allowPOS", ")", "g", "=", "UndirectWeightedGraph", "(", ")", "cm", "=", "defaultdict", "(", "int", ")", "words", "=", "tuple", "(", "self", ".", "tokenizer", ".", "cut", "(", "sentence", ")", ")", "for", "i", ",", "wp", "in", "enumerate", "(", "words", ")", ":", "if", "self", ".", "pairfilter", "(", "wp", ")", ":", "for", "j", "in", "xrange", "(", "i", "+", "1", ",", "i", "+", "self", ".", "span", ")", ":", "if", "j", ">=", "len", "(", "words", ")", ":", "break", "if", "not", "self", ".", "pairfilter", "(", "words", "[", "j", "]", ")", ":", "continue", "if", "allowPOS", "and", "withFlag", ":", "cm", "[", "(", "wp", ",", "words", "[", "j", "]", ")", "]", "+=", "1", "else", ":", "cm", "[", "(", "wp", ".", "word", ",", "words", "[", "j", "]", ".", "word", ")", "]", "+=", "1", "for", "terms", ",", "w", "in", "cm", ".", "items", "(", ")", ":", "g", ".", "addEdge", "(", "terms", "[", "0", "]", ",", "terms", "[", "1", "]", ",", "w", ")", "nodes_rank", "=", "g", ".", "rank", "(", ")", "if", "withWeight", ":", "tags", "=", "sorted", "(", "nodes_rank", ".", "items", "(", ")", ",", "key", "=", "itemgetter", "(", "1", ")", ",", "reverse", "=", "True", ")", "else", ":", "tags", "=", "sorted", "(", "nodes_rank", ",", "key", "=", "nodes_rank", ".", "__getitem__", ",", "reverse", "=", "True", ")", "if", "topK", ":", "return", "tags", "[", ":", "topK", "]", "else", ":", "return", "tags" ]

[ "Global", "cut", "function", "that", "supports", "parallel", "processing", "." ]

[ "def", "cut", "(", "sentence", ",", "HMM", "=", "True", ")", ":", "global", "dt", "if", "jieba", ".", "pool", "is", "None", ":", "for", "w", "in", "dt", ".", "cut", "(", "sentence", ",", "HMM", "=", "HMM", ")", ":", "yield", "w", "else", ":", "parts", "=", "strdecode", "(", "sentence", ")", ".", "splitlines", "(", "True", ")", "if", "HMM", ":", "result", "=", "jieba", ".", "pool", ".", "map", "(", "_lcut_internal", ",", "parts", ")", "else", ":", "result", "=", "jieba", ".", "pool", ".", "map", "(", "_lcut_internal_no_hmm", ",", "parts", ")", "for", "r", "in", "result", ":", "for", "w", "in", "r", ":", "yield", "w" ]

[ "Convert", "annotation", "JSON", "file", "." ]

[ "def", "load_annotations", "(", "anno_file", ",", "return_dict", ")", ":", "annotations", "=", "dict", "(", ")", "annotations", "[", "'image_ids'", "]", "=", "set", "(", "[", "]", ")", "annotations", "[", "'annos'", "]", "=", "dict", "(", ")", "annotations", "[", "'delta'", "]", "=", "2", "*", "np", ".", "array", "(", "[", "0.01388152", ",", "0.01515228", ",", "0.01057665", ",", "0.01417709", ",", "0.01497891", ",", "0.01402144", ",", "0.03909642", ",", "0.03686941", ",", "0.01981803", ",", "0.03843971", ",", "0.03412318", ",", "0.02415081", ",", "0.01291456", ",", "0.01236173", "]", ")", "try", ":", "annos", "=", "json", ".", "load", "(", "open", "(", "anno_file", ",", "'r'", ")", ")", "except", "Exception", ":", "return_dict", "[", "'error'", "]", "=", "'Annotation file does not exist or is an invalid JSON file.'", "exit", "(", "return_dict", "[", "'error'", "]", ")", "for", "anno", "in", "annos", ":", "annotations", "[", "'image_ids'", "]", ".", "add", "(", "anno", "[", "'image_id'", "]", ")", "annotations", "[", "'annos'", "]", "[", "anno", "[", "'image_id'", "]", "]", "=", "dict", "(", ")", "annotations", "[", "'annos'", "]", "[", "anno", "[", "'image_id'", "]", "]", "[", "'human_annos'", "]", "=", "anno", "[", "'human_annotations'", "]", "annotations", "[", "'annos'", "]", "[", "anno", "[", "'image_id'", "]", "]", "[", "'keypoint_annos'", "]", "=", "anno", "[", "'keypoint_annotations'", "]", "return", "annotations" ]

[ "Convert", "prediction", "JSON", "file", "." ]

[ "def", "load_predictions", "(", "prediction_file", ",", "return_dict", ")", ":", "predictions", "=", "dict", "(", ")", "predictions", "[", "'image_ids'", "]", "=", "[", "]", "predictions", "[", "'annos'", "]", "=", "dict", "(", ")", "id_set", "=", "set", "(", "[", "]", ")", "try", ":", "preds", "=", "json", ".", "load", "(", "open", "(", "prediction_file", ",", "'r'", ")", ")", "except", "Exception", ":", "return_dict", "[", "'error'", "]", "=", "'Prediction file does not exist or is an invalid JSON file.'", "exit", "(", "return_dict", "[", "'error'", "]", ")", "for", "pred", "in", "preds", ":", "if", "'image_id'", "not", "in", "pred", ".", "keys", "(", ")", ":", "return_dict", "[", "'warning'", "]", ".", "append", "(", "'There is an invalid annotation info, \\\n likely missing key \\'image_id\\'.'", ")", "continue", "if", "'keypoint_annotations'", "not", "in", "pred", ".", "keys", "(", ")", ":", "return_dict", "[", "'warning'", "]", ".", "append", "(", "pred", "[", "'image_id'", "]", "+", "' does not have key \\'keypoint_annotations\\'.'", ")", "continue", "image_id", "=", "pred", "[", "'image_id'", "]", ".", "split", "(", "'.'", ")", "[", "0", "]", "if", "image_id", "in", "id_set", ":", "return_dict", "[", "'warning'", "]", ".", "append", "(", "pred", "[", "'image_id'", "]", "+", "' is duplicated in prediction JSON file.'", ")", "else", ":", "id_set", ".", "add", "(", "image_id", ")", "predictions", "[", "'image_ids'", "]", ".", "append", "(", "image_id", ")", "predictions", "[", "'annos'", "]", "[", "pred", "[", "'image_id'", "]", "]", "=", "dict", "(", ")", "predictions", "[", "'annos'", "]", "[", "pred", "[", "'image_id'", "]", "]", "[", "'keypoint_annos'", "]", "=", "pred", "[", "'keypoint_annotations'", "]", "return", "predictions" ]

[ "Compute", "oks", "matrix", "(", "size", "gtN", "*", "pN", ")", "." ]

[ "def", "compute_oks", "(", "anno", ",", "predict", ",", "delta", ")", ":", "anno_count", "=", "len", "(", "anno", "[", "'keypoint_annos'", "]", ".", "keys", "(", ")", ")", "predict_count", "=", "len", "(", "predict", ".", "keys", "(", ")", ")", "oks", "=", "np", ".", "zeros", "(", "(", "anno_count", ",", "predict_count", ")", ")", "if", "predict_count", "==", "0", ":", "return", "oks", ".", "T", "# for every human keypoint annotation", "for", "i", "in", "range", "(", "anno_count", ")", ":", "anno_key", "=", "anno", "[", "'keypoint_annos'", "]", ".", "keys", "(", ")", "[", "i", "]", "anno_keypoints", "=", "np", ".", "reshape", "(", "anno", "[", "'keypoint_annos'", "]", "[", "anno_key", "]", ",", "(", "14", ",", "3", ")", ")", "visible", "=", "anno_keypoints", "[", ":", ",", "2", "]", "==", "1", "bbox", "=", "anno", "[", "'human_annos'", "]", "[", "anno_key", "]", "scale", "=", "np", ".", "float32", "(", "(", "bbox", "[", "3", "]", "-", "bbox", "[", "1", "]", ")", "*", "(", "bbox", "[", "2", "]", "-", "bbox", "[", "0", "]", ")", ")", "if", "np", ".", "sum", "(", "visible", ")", "==", "0", ":", "for", "j", "in", "range", "(", "predict_count", ")", ":", "oks", "[", "i", ",", "j", "]", "=", "0", "else", ":", "# for every predicted human", "for", "j", "in", "range", "(", "predict_count", ")", ":", "predict_key", "=", "predict", ".", "keys", "(", ")", "[", "j", "]", "predict_keypoints", "=", "np", ".", "reshape", "(", "predict", "[", "predict_key", "]", ",", "(", "14", ",", "3", ")", ")", "dis", "=", "np", ".", "sum", "(", "(", "anno_keypoints", "[", "visible", ",", ":", "2", "]", "-", "predict_keypoints", "[", "visible", ",", ":", "2", "]", ")", "**", "2", ",", "axis", "=", "1", ")", "oks", "[", "i", ",", "j", "]", "=", "np", ".", "mean", "(", "np", ".", "exp", "(", "-", "dis", "/", "2", "/", "delta", "[", "visible", "]", "**", "2", "/", "(", "scale", "+", "1", ")", ")", ")", "return", "oks" ]

[ "Evaluate", "predicted_file", "and", "return", "mAP", "." ]

[ "def", "keypoint_eval", "(", "predictions", ",", "annotations", ",", "return_dict", ")", ":", "oks_all", "=", "np", ".", "zeros", "(", "(", "0", ")", ")", "oks_num", "=", "0", "# Construct set to speed up id searching.", "prediction_id_set", "=", "set", "(", "predictions", "[", "'image_ids'", "]", ")", "# for every annotation in our test/validation set", "for", "image_id", "in", "annotations", "[", "'image_ids'", "]", ":", "# if the image in the predictions, then compute oks", "if", "image_id", "in", "prediction_id_set", ":", "oks", "=", "compute_oks", "(", "anno", "=", "annotations", "[", "'annos'", "]", "[", "image_id", "]", ",", "predict", "=", "predictions", "[", "'annos'", "]", "[", "image_id", "]", "[", "'keypoint_annos'", "]", ",", "delta", "=", "annotations", "[", "'delta'", "]", ")", "# view pairs with max OKSs as match ones, add to oks_all", "oks_all", "=", "np", ".", "concatenate", "(", "(", "oks_all", ",", "np", ".", "max", "(", "oks", ",", "axis", "=", "1", ")", ")", ",", "axis", "=", "0", ")", "# accumulate total num by max(gtN,pN)", "oks_num", "+=", "np", ".", "max", "(", "oks", ".", "shape", ")", "else", ":", "# otherwise report warning", "return_dict", "[", "'warning'", "]", ".", "append", "(", "image_id", "+", "' is not in the prediction JSON file.'", ")", "# number of humen in ground truth annotations", "gt_n", "=", "len", "(", "annotations", "[", "'annos'", "]", "[", "image_id", "]", "[", "'human_annos'", "]", ".", "keys", "(", ")", ")", "# fill 0 in oks scores", "oks_all", "=", "np", ".", "concatenate", "(", "(", "oks_all", ",", "np", ".", "zeros", "(", "(", "gt_n", ")", ")", ")", ",", "axis", "=", "0", ")", "# accumulate total num by ground truth number", "oks_num", "+=", "gt_n", "# compute mAP by APs under different oks thresholds", "average_precision", "=", "[", "]", "for", "threshold", "in", "np", ".", "linspace", "(", "0.5", ",", "0.95", ",", "10", ")", ":", "average_precision", ".", "append", "(", "np", ".", "sum", "(", "oks_all", ">", "threshold", ")", "/", "np", ".", "float32", "(", "oks_num", ")", ")", "return_dict", "[", "'score'", "]", "=", "np", ".", "mean", "(", "average_precision", ")", "return", "return_dict" ]

[ "The", "evaluator", "." ]

[ "def", "main", "(", ")", ":", "# Arguments parser", "parser", "=", "argparse", ".", "ArgumentParser", "(", ")", "parser", ".", "add_argument", "(", "'--submit'", ",", "help", "=", "'prediction json file'", ",", "type", "=", "str", ",", "default", "=", "'keypoint_predictions_example.json'", ")", "parser", ".", "add_argument", "(", "'--ref'", ",", "help", "=", "'annotation json file'", ",", "type", "=", "str", ",", "default", "=", "'keypoint_annotations_example.json'", ")", "args", "=", "parser", ".", "parse_args", "(", ")", "# Initialize return_dict", "return_dict", "=", "dict", "(", ")", "return_dict", "[", "'error'", "]", "=", "None", "return_dict", "[", "'warning'", "]", "=", "[", "]", "return_dict", "[", "'score'", "]", "=", "None", "# Load annotation JSON file", "start_time", "=", "time", ".", "time", "(", ")", "annotations", "=", "load_annotations", "(", "anno_file", "=", "args", ".", "ref", ",", "return_dict", "=", "return_dict", ")", "print", "'Complete reading annotation JSON file in %.2f seconds.'", "%", "(", "time", ".", "time", "(", ")", "-", "start_time", ")", "# Load prediction JSON file", "start_time", "=", "time", ".", "time", "(", ")", "predictions", "=", "load_predictions", "(", "prediction_file", "=", "args", ".", "submit", ",", "return_dict", "=", "return_dict", ")", "print", "'Complete reading prediction JSON file in %.2f seconds.'", "%", "(", "time", ".", "time", "(", ")", "-", "start_time", ")", "# Keypoint evaluation", "start_time", "=", "time", ".", "time", "(", ")", "return_dict", "=", "keypoint_eval", "(", "predictions", "=", "predictions", ",", "annotations", "=", "annotations", ",", "return_dict", "=", "return_dict", ")", "print", "'Complete evaluation in %.2f seconds.'", "%", "(", "time", ".", "time", "(", ")", "-", "start_time", ")", "# Print return_dict and final score", "pprint", ".", "pprint", "(", "return_dict", ")", "print", "'Score: '", ",", "'%.8f'", "%", "return_dict", "[", "'score'", "]" ]

[ "Compute", "m1_score" ]

[ "def", "compute_m1", "(", "json_predictions_file", ",", "reference_file", ")", ":", "m1_score", "=", "{", "}", "m1_score", "[", "'error'", "]", "=", "0", "try", ":", "coco", "=", "COCO", "(", "reference_file", ")", "coco_res", "=", "coco", ".", "loadRes", "(", "json_predictions_file", ")", "# create coco_eval object.", "coco_eval", "=", "COCOEvalCap", "(", "coco", ",", "coco_res", ")", "# evaluate results", "coco_eval", ".", "evaluate", "(", ")", "except", "Exception", ":", "m1_score", "[", "'error'", "]", "=", "1", "else", ":", "# print output evaluation scores", "for", "metric", ",", "score", "in", "coco_eval", ".", "eval", ".", "items", "(", ")", ":", "print", "'%s: %.3f'", "%", "(", "metric", ",", "score", ")", "m1_score", "[", "metric", "]", "=", "score", "return", "m1_score" ]

[ "The", "evaluator", "." ]

[ "def", "main", "(", ")", ":", "parser", "=", "argparse", ".", "ArgumentParser", "(", ")", "parser", ".", "add_argument", "(", "\"-submit\"", ",", "\"--submit\"", ",", "type", "=", "str", ",", "required", "=", "True", ",", "help", "=", "' JSON containing submit sentences.'", ")", "parser", ".", "add_argument", "(", "\"-ref\"", ",", "\"--ref\"", ",", "type", "=", "str", ",", "help", "=", "' JSON references.'", ")", "args", "=", "parser", ".", "parse_args", "(", ")", "json_predictions_file", "=", "args", ".", "submit", "reference_file", "=", "args", ".", "ref", "print", "compute_m1", "(", "json_predictions_file", ",", "reference_file", ")" ]

[ "Takes", "a", "string", "as", "input", "and", "returns", "an", "object", "that", "can", "be", "given", "to", "either", "cook_refs", "or", "cook_test", ".", "This", "is", "optional", ":", "cook_refs", "and", "cook_test", "can", "take", "string", "arguments", "as", "well", ".", ":", "param", "s", ":", "string", ":", "sentence", "to", "be", "converted", "into", "ngrams", ":", "param", "n", ":", "int", ":", "number", "of", "ngrams", "for", "which", "representation", "is", "calculated", ":", "return", ":", "term", "frequency", "vector", "for", "occuring", "ngrams" ]

[ "def", "precook", "(", "s", ",", "n", "=", "4", ",", "out", "=", "False", ")", ":", "words", "=", "s", ".", "split", "(", ")", "counts", "=", "defaultdict", "(", "int", ")", "for", "k", "in", "xrange", "(", "1", ",", "n", "+", "1", ")", ":", "for", "i", "in", "xrange", "(", "len", "(", "words", ")", "-", "k", "+", "1", ")", ":", "ngram", "=", "tuple", "(", "words", "[", "i", ":", "i", "+", "k", "]", ")", "counts", "[", "ngram", "]", "+=", "1", "return", "counts" ]

[ "Takes", "a", "list", "of", "reference", "sentences", "for", "a", "single", "segment", "and", "returns", "an", "object", "that", "encapsulates", "everything", "that", "BLEU", "needs", "to", "know", "about", "them", ".", ":", "param", "refs", ":", "list", "of", "string", ":", "reference", "sentences", "for", "some", "image", ":", "param", "n", ":", "int", ":", "number", "of", "ngrams", "for", "which", "(", "ngram", ")", "representation", "is", "calculated", ":", "return", ":", "result", "(", "list", "of", "dict", ")" ]

[ "def", "cook_refs", "(", "refs", ",", "n", "=", "4", ")", ":", "## lhuang: oracle will call with \"average\"", "return", "[", "precook", "(", "ref", ",", "n", ")", "for", "ref", "in", "refs", "]" ]

[ "Takes", "a", "test", "sentence", "and", "returns", "an", "object", "that", "encapsulates", "everything", "that", "BLEU", "needs", "to", "know", "about", "it", ".", ":", "param", "test", ":", "list", "of", "string", ":", "hypothesis", "sentence", "for", "some", "image", ":", "param", "n", ":", "int", ":", "number", "of", "ngrams", "for", "which", "(", "ngram", ")", "representation", "is", "calculated", ":", "return", ":", "result", "(", "dict", ")" ]

[ "def", "cook_test", "(", "test", ",", "n", "=", "4", ")", ":", "return", "precook", "(", "test", ",", "n", ",", "True", ")" ]

[ "copy", "the", "refs", "." ]

[ "def", "copy", "(", "self", ")", ":", "new", "=", "CiderScorer", "(", "n", "=", "self", ".", "n", ")", "new", ".", "ctest", "=", "copy", ".", "copy", "(", "self", ".", "ctest", ")", "new", ".", "crefs", "=", "copy", ".", "copy", "(", "self", ".", "crefs", ")", "return", "new" ]

[ "singular", "instance" ]

[ "def", "__init__", "(", "self", ",", "test", "=", "None", ",", "refs", "=", "None", ",", "n", "=", "4", ",", "sigma", "=", "6.0", ")", ":", "self", ".", "n", "=", "n", "self", ".", "sigma", "=", "sigma", "self", ".", "crefs", "=", "[", "]", "self", ".", "ctest", "=", "[", "]", "self", ".", "document_frequency", "=", "defaultdict", "(", "float", ")", "self", ".", "cook_append", "(", "test", ",", "refs", ")", "self", ".", "ref_len", "=", "None" ]

[ "called", "by", "constructor", "and", "__iadd__", "to", "avoid", "creating", "new", "instances", "." ]

[ "def", "cook_append", "(", "self", ",", "test", ",", "refs", ")", ":", "if", "refs", "is", "not", "None", ":", "self", ".", "crefs", ".", "append", "(", "cook_refs", "(", "refs", ")", ")", "if", "test", "is", "not", "None", ":", "self", ".", "ctest", ".", "append", "(", "cook_test", "(", "test", ")", ")", "## N.B.: -1", "else", ":", "self", ".", "ctest", ".", "append", "(", "None", ")" ]

[ "add", "an", "instance", "(", "e", ".", "g", ".", "from", "another", "sentence", ")", "." ]

[ "def", "__iadd__", "(", "self", ",", "other", ")", ":", "if", "type", "(", "other", ")", "is", "tuple", ":", "## avoid creating new CiderScorer instances", "self", ".", "cook_append", "(", "other", "[", "0", "]", ",", "other", "[", "1", "]", ")", "else", ":", "self", ".", "ctest", ".", "extend", "(", "other", ".", "ctest", ")", "self", ".", "crefs", ".", "extend", "(", "other", ".", "crefs", ")", "return", "self" ]

[ "Compute", "term", "frequency", "for", "reference", "data", ".", "This", "will", "be", "used", "to", "compute", "idf", "(", "inverse", "document", "frequency", "later", ")", "The", "term", "frequency", "is", "stored", "in", "the", "object", ":", "return", ":", "None" ]

[ "def", "compute_doc_freq", "(", "self", ")", ":", "for", "refs", "in", "self", ".", "crefs", ":", "# refs, k ref captions of one image", "for", "ngram", "in", "set", "(", "[", "ngram", "for", "ref", "in", "refs", "for", "(", "ngram", ",", "count", ")", "in", "ref", ".", "iteritems", "(", ")", "]", ")", ":", "self", ".", "document_frequency", "[", "ngram", "]", "+=", "1" ]

[ "Main", "function", "to", "compute", "CIDEr", "score", ":", "param", "hypo_for_image", "(", "dict", ")", ":", "dictionary", "with", "key", "<image", ">", "and", "value", "<tokenized", "hypothesis", "/", "candidate", "sentence", ">", "ref_for_image", "(", "dict", ")", ":", "dictionary", "with", "key", "<image", ">", "and", "value", "<tokenized", "reference", "sentence", ">", ":", "return", ":", "cider", "(", "float", ")", ":", "computed", "CIDEr", "score", "for", "the", "corpus" ]

[ "def", "compute_score", "(", "self", ",", "gts", ",", "res", ")", ":", "assert", "(", "gts", ".", "keys", "(", ")", "==", "res", ".", "keys", "(", ")", ")", "imgIds", "=", "gts", ".", "keys", "(", ")", "cider_scorer", "=", "CiderScorer", "(", "n", "=", "self", ".", "_n", ",", "sigma", "=", "self", ".", "_sigma", ")", "for", "id", "in", "imgIds", ":", "hypo", "=", "res", "[", "id", "]", "ref", "=", "gts", "[", "id", "]", "# Sanity check.", "assert", "(", "type", "(", "hypo", ")", "is", "list", ")", "assert", "(", "len", "(", "hypo", ")", "==", "1", ")", "assert", "(", "type", "(", "ref", ")", "is", "list", ")", "assert", "(", "len", "(", "ref", ")", ">", "0", ")", "cider_scorer", "+=", "(", "hypo", "[", "0", "]", ",", "ref", ")", "(", "score", ",", "scores", ")", "=", "cider_scorer", ".", "compute_score", "(", ")", "return", "score", ",", "scores" ]

[ "Takes", "a", "string", "as", "input", "and", "returns", "an", "object", "that", "can", "be", "given", "to", "either", "cook_refs", "or", "cook_test", ".", "This", "is", "optional", ":", "cook_refs", "and", "cook_test", "can", "take", "string", "arguments", "as", "well", "." ]

[ "def", "precook", "(", "s", ",", "n", "=", "4", ",", "out", "=", "False", ")", ":", "words", "=", "s", ".", "split", "(", ")", "counts", "=", "defaultdict", "(", "int", ")", "for", "k", "in", "xrange", "(", "1", ",", "n", "+", "1", ")", ":", "for", "i", "in", "xrange", "(", "len", "(", "words", ")", "-", "k", "+", "1", ")", ":", "ngram", "=", "tuple", "(", "words", "[", "i", ":", "i", "+", "k", "]", ")", "counts", "[", "ngram", "]", "+=", "1", "return", "(", "len", "(", "words", ")", ",", "counts", ")" ]

[ "Takes", "a", "list", "of", "reference", "sentences", "for", "a", "single", "segment", "and", "returns", "an", "object", "that", "encapsulates", "everything", "that", "BLEU", "needs", "to", "know", "about", "them", "." ]

[ "def", "cook_refs", "(", "refs", ",", "eff", "=", "None", ",", "n", "=", "4", ")", ":", "## lhuang: oracle will call with \"average\"", "reflen", "=", "[", "]", "maxcounts", "=", "{", "}", "for", "ref", "in", "refs", ":", "rl", ",", "counts", "=", "precook", "(", "ref", ",", "n", ")", "reflen", ".", "append", "(", "rl", ")", "for", "(", "ngram", ",", "count", ")", "in", "counts", ".", "iteritems", "(", ")", ":", "maxcounts", "[", "ngram", "]", "=", "max", "(", "maxcounts", ".", "get", "(", "ngram", ",", "0", ")", ",", "count", ")", "# Calculate effective reference sentence length.", "if", "eff", "==", "\"shortest\"", ":", "reflen", "=", "min", "(", "reflen", ")", "elif", "eff", "==", "\"average\"", ":", "reflen", "=", "float", "(", "sum", "(", "reflen", ")", ")", "/", "len", "(", "reflen", ")", "## lhuang: N.B.: leave reflen computaiton to the very end!!", "## lhuang: N.B.: in case of \"closest\", keep a list of reflens!! (bad design)", "return", "(", "reflen", ",", "maxcounts", ")" ]

[ "Takes", "a", "test", "sentence", "and", "returns", "an", "object", "that", "encapsulates", "everything", "that", "BLEU", "needs", "to", "know", "about", "it", "." ]

[ "def", "cook_test", "(", "test", ",", "(", "reflen", ",", "refmaxcounts", ")", ",", "eff", "=", "None", ",", "n", "=", "4", ")", ":", "testlen", ",", "counts", "=", "precook", "(", "test", ",", "n", ",", "True", ")", "result", "=", "{", "}", "# Calculate effective reference sentence length.", "if", "eff", "==", "\"closest\"", ":", "result", "[", "\"reflen\"", "]", "=", "min", "(", "(", "abs", "(", "l", "-", "testlen", ")", ",", "l", ")", "for", "l", "in", "reflen", ")", "[", "1", "]", "else", ":", "## i.e., \"average\" or \"shortest\" or None", "result", "[", "\"reflen\"", "]", "=", "reflen", "result", "[", "\"testlen\"", "]", "=", "testlen", "result", "[", "\"guess\"", "]", "=", "[", "max", "(", "0", ",", "testlen", "-", "k", "+", "1", ")", "for", "k", "in", "xrange", "(", "1", ",", "n", "+", "1", ")", "]", "result", "[", "'correct'", "]", "=", "[", "0", "]", "*", "n", "for", "(", "ngram", ",", "count", ")", "in", "counts", ".", "iteritems", "(", ")", ":", "result", "[", "\"correct\"", "]", "[", "len", "(", "ngram", ")", "-", "1", "]", "+=", "min", "(", "refmaxcounts", ".", "get", "(", "ngram", ",", "0", ")", ",", "count", ")", "return", "result" ]

[ "copy", "the", "refs", "." ]

[ "def", "copy", "(", "self", ")", ":", "new", "=", "BleuScorer", "(", "n", "=", "self", ".", "n", ")", "new", ".", "ctest", "=", "copy", ".", "copy", "(", "self", ".", "ctest", ")", "new", ".", "crefs", "=", "copy", ".", "copy", "(", "self", ".", "crefs", ")", "new", ".", "_score", "=", "None", "return", "new" ]

[ "singular", "instance" ]

[ "def", "__init__", "(", "self", ",", "test", "=", "None", ",", "refs", "=", "None", ",", "n", "=", "4", ",", "special_reflen", "=", "None", ")", ":", "self", ".", "n", "=", "n", "self", ".", "crefs", "=", "[", "]", "self", ".", "ctest", "=", "[", "]", "self", ".", "cook_append", "(", "test", ",", "refs", ")", "self", ".", "special_reflen", "=", "special_reflen" ]

[ "called", "by", "constructor", "and", "__iadd__", "to", "avoid", "creating", "new", "instances", "." ]

[ "def", "cook_append", "(", "self", ",", "test", ",", "refs", ")", ":", "if", "refs", "is", "not", "None", ":", "self", ".", "crefs", ".", "append", "(", "cook_refs", "(", "refs", ")", ")", "if", "test", "is", "not", "None", ":", "cooked_test", "=", "cook_test", "(", "test", ",", "self", ".", "crefs", "[", "-", "1", "]", ")", "self", ".", "ctest", ".", "append", "(", "cooked_test", ")", "## N.B.: -1", "else", ":", "self", ".", "ctest", ".", "append", "(", "None", ")", "# lens of crefs and ctest have to match", "self", ".", "_score", "=", "None" ]

[ "return", "(", "bleu", "len_ratio", ")", "pair" ]

[ "def", "score_ratio", "(", "self", ",", "option", "=", "None", ")", ":", "return", "(", "self", ".", "fscore", "(", "option", "=", "option", ")", ",", "self", ".", "ratio", "(", "option", "=", "option", ")", ")" ]

[ "replace", "test", "(", "s", ")", "with", "new", "test", "(", "s", ")", "and", "returns", "the", "new", "score", "." ]

[ "def", "rescore", "(", "self", ",", "new_test", ")", ":", "return", "self", ".", "retest", "(", "new_test", ")", ".", "compute_score", "(", ")" ]

[ "add", "an", "instance", "(", "e", ".", "g", ".", "from", "another", "sentence", ")", "." ]

[ "def", "__iadd__", "(", "self", ",", "other", ")", ":", "if", "type", "(", "other", ")", "is", "tuple", ":", "## avoid creating new BleuScorer instances", "self", ".", "cook_append", "(", "other", "[", "0", "]", ",", "other", "[", "1", "]", ")", "else", ":", "assert", "self", ".", "compatible", "(", "other", ")", ",", "\"incompatible BLEUs.\"", "self", ".", "ctest", ".", "extend", "(", "other", ".", "ctest", ")", "self", ".", "crefs", ".", "extend", "(", "other", ".", "crefs", ")", "self", ".", "_score", "=", "None", "## need to recompute", "return", "self" ]

[ "Calculates", "longest", "common", "subsequence", "for", "a", "pair", "of", "tokenized", "strings", ":", "param", "string", ":", "list", "of", "str", ":", "tokens", "from", "a", "string", "split", "using", "whitespace", ":", "param", "sub", ":", "list", "of", "str", ":", "shorter", "string", "also", "split", "using", "whitespace", ":", "returns", ":", "length", "(", "list", "of", "int", ")", ":", "length", "of", "the", "longest", "common", "subsequence", "between", "the", "two", "strings" ]

[ "def", "my_lcs", "(", "string", ",", "sub", ")", ":", "if", "(", "len", "(", "string", ")", "<", "len", "(", "sub", ")", ")", ":", "sub", ",", "string", "=", "string", ",", "sub", "lengths", "=", "[", "[", "0", "for", "i", "in", "range", "(", "0", ",", "len", "(", "sub", ")", "+", "1", ")", "]", "for", "j", "in", "range", "(", "0", ",", "len", "(", "string", ")", "+", "1", ")", "]", "for", "j", "in", "range", "(", "1", ",", "len", "(", "sub", ")", "+", "1", ")", ":", "for", "i", "in", "range", "(", "1", ",", "len", "(", "string", ")", "+", "1", ")", ":", "if", "(", "string", "[", "i", "-", "1", "]", "==", "sub", "[", "j", "-", "1", "]", ")", ":", "lengths", "[", "i", "]", "[", "j", "]", "=", "lengths", "[", "i", "-", "1", "]", "[", "j", "-", "1", "]", "+", "1", "else", ":", "lengths", "[", "i", "]", "[", "j", "]", "=", "max", "(", "lengths", "[", "i", "-", "1", "]", "[", "j", "]", ",", "lengths", "[", "i", "]", "[", "j", "-", "1", "]", ")", "return", "lengths", "[", "len", "(", "string", ")", "]", "[", "len", "(", "sub", ")", "]" ]

[ "Compute", "ROUGE", "-", "L", "score", "given", "one", "candidate", "and", "references", "for", "an", "image", ":", "param", "candidate", ":", "str", ":", "candidate", "sentence", "to", "be", "evaluated", ":", "param", "refs", ":", "list", "of", "str", ":", "COCO", "reference", "sentences", "for", "the", "particular", "image", "to", "be", "evaluated", ":", "returns", "score", ":", "int", "(", "ROUGE", "-", "L", "score", "for", "the", "candidate", "evaluated", "against", "references", ")" ]

[ "def", "calc_score", "(", "self", ",", "candidate", ",", "refs", ")", ":", "assert", "(", "len", "(", "candidate", ")", "==", "1", ")", "assert", "(", "len", "(", "refs", ")", ">", "0", ")", "prec", "=", "[", "]", "rec", "=", "[", "]", "# split into tokens", "token_c", "=", "candidate", "[", "0", "]", ".", "split", "(", "\" \"", ")", "for", "reference", "in", "refs", ":", "# split into tokens", "token_r", "=", "reference", ".", "split", "(", "\" \"", ")", "# compute the longest common subsequence", "lcs", "=", "my_lcs", "(", "token_r", ",", "token_c", ")", "prec", ".", "append", "(", "lcs", "/", "float", "(", "len", "(", "token_c", ")", ")", ")", "rec", ".", "append", "(", "lcs", "/", "float", "(", "len", "(", "token_r", ")", ")", ")", "prec_max", "=", "max", "(", "prec", ")", "rec_max", "=", "max", "(", "rec", ")", "if", "(", "prec_max", "!=", "0", "and", "rec_max", "!=", "0", ")", ":", "score", "=", "(", "(", "1", "+", "self", ".", "beta", "**", "2", ")", "*", "prec_max", "*", "rec_max", ")", "/", "float", "(", "rec_max", "+", "self", ".", "beta", "**", "2", "*", "prec_max", ")", "else", ":", "score", "=", "0.0", "return", "score" ]

[ "Computes", "Rouge", "-", "L", "score", "given", "a", "set", "of", "reference", "and", "candidate", "sentences", "for", "the", "dataset", "Invoked", "by", "evaluate_captions", ".", "py", ":", "param", "hypo_for_image", ":", "dict", ":", "candidate", "/", "test", "sentences", "with", "image", "name", "key", "and", "tokenized", "sentences", "as", "values", ":", "param", "ref_for_image", ":", "dict", ":", "reference", "MS", "-", "COCO", "sentences", "with", "image", "name", "key", "and", "tokenized", "sentences", "as", "values", ":", "returns", ":", "average_score", ":", "float", "(", "mean", "ROUGE", "-", "L", "score", "computed", "by", "averaging", "scores", "for", "all", "the", "images", ")" ]

[ "def", "compute_score", "(", "self", ",", "gts", ",", "res", ")", ":", "assert", "(", "gts", ".", "keys", "(", ")", "==", "res", ".", "keys", "(", ")", ")", "imgIds", "=", "gts", ".", "keys", "(", ")", "score", "=", "[", "]", "for", "id", "in", "imgIds", ":", "hypo", "=", "res", "[", "id", "]", "ref", "=", "gts", "[", "id", "]", "score", ".", "append", "(", "self", ".", "calc_score", "(", "hypo", ",", "ref", ")", ")", "# Sanity check.", "assert", "(", "type", "(", "hypo", ")", "is", "list", ")", "assert", "(", "len", "(", "hypo", ")", "==", "1", ")", "assert", "(", "type", "(", "ref", ")", "is", "list", ")", "assert", "(", "len", "(", "ref", ")", ">", "0", ")", "average_score", "=", "np", ".", "mean", "(", "np", ".", "array", "(", "score", ")", ")", "return", "average_score", ",", "np", ".", "array", "(", "score", ")" ]

[ "Constructor", "of", "Microsoft", "COCO", "helper", "class", "for", "reading", "and", "visualizing", "annotations", ".", ":", "param", "annotation_file", "(", "str", ")", ":", "location", "of", "annotation", "file", ":", "param", "image_folder", "(", "str", ")", ":", "location", "to", "the", "folder", "that", "hosts", "images", ".", ":", "return", ":" ]

[ "def", "__init__", "(", "self", ",", "annotation_file", "=", "None", ")", ":", "# load dataset", "self", ".", "dataset", "=", "{", "}", "self", ".", "anns", "=", "[", "]", "self", ".", "imgToAnns", "=", "{", "}", "self", ".", "catToImgs", "=", "{", "}", "self", ".", "imgs", "=", "[", "]", "self", ".", "cats", "=", "[", "]", "self", ".", "image2hash", "=", "{", "}", "if", "not", "annotation_file", "==", "None", ":", "print", "(", "'loading annotations into memory...'", ")", "time_t", "=", "datetime", ".", "datetime", ".", "utcnow", "(", ")", "dataset", "=", "json", ".", "load", "(", "open", "(", "annotation_file", ",", "'r'", ")", ")", "print", "(", "datetime", ".", "datetime", ".", "utcnow", "(", ")", "-", "time_t", ")", "self", ".", "dataset", "=", "dataset", "self", ".", "createIndex", "(", ")" ]

[ "Print", "information", "about", "the", "annotation", "file", ".", ":", "return", ":" ]

[ "def", "info", "(", "self", ")", ":", "for", "key", ",", "value", "in", "self", ".", "datset", "[", "'info'", "]", ".", "items", "(", ")", ":", "print", "(", "'%s: %s'", "%", "(", "key", ",", "value", ")", ")" ]

[ "Get", "ann", "ids", "that", "satisfy", "given", "filter", "conditions", ".", "default", "skips", "that", "filter", ":", "param", "imgIds", "(", "int", "array", ")", ":", "get", "anns", "for", "given", "imgs", "catIds", "(", "int", "array", ")", ":", "get", "anns", "for", "given", "cats", "areaRng", "(", "float", "array", ")", ":", "get", "anns", "for", "given", "area", "range", "(", "e", ".", "g", ".", "[", "0", "inf", "]", ")", "iscrowd", "(", "boolean", ")", ":", "get", "anns", "for", "given", "crowd", "label", "(", "False", "or", "True", ")", ":", "return", ":", "ids", "(", "int", "array", ")", ":", "integer", "array", "of", "ann", "ids" ]

[ "def", "getAnnIds", "(", "self", ",", "imgIds", "=", "[", "]", ",", "catIds", "=", "[", "]", ",", "areaRng", "=", "[", "]", ",", "iscrowd", "=", "None", ")", ":", "imgIds", "=", "imgIds", "if", "type", "(", "imgIds", ")", "==", "list", "else", "[", "imgIds", "]", "catIds", "=", "catIds", "if", "type", "(", "catIds", ")", "==", "list", "else", "[", "catIds", "]", "if", "len", "(", "imgIds", ")", "==", "len", "(", "catIds", ")", "==", "len", "(", "areaRng", ")", "==", "0", ":", "anns", "=", "self", ".", "dataset", "[", "'annotations'", "]", "else", ":", "if", "not", "len", "(", "imgIds", ")", "==", "0", ":", "anns", "=", "sum", "(", "[", "self", ".", "imgToAnns", "[", "imgId", "]", "for", "imgId", "in", "imgIds", "if", "imgId", "in", "self", ".", "imgToAnns", "]", ",", "[", "]", ")", "else", ":", "anns", "=", "self", ".", "dataset", "[", "'annotations'", "]", "anns", "=", "anns", "if", "len", "(", "catIds", ")", "==", "0", "else", "[", "ann", "for", "ann", "in", "anns", "if", "ann", "[", "'category_id'", "]", "in", "catIds", "]", "anns", "=", "anns", "if", "len", "(", "areaRng", ")", "==", "0", "else", "[", "ann", "for", "ann", "in", "anns", "if", "ann", "[", "'area'", "]", ">", "areaRng", "[", "0", "]", "and", "ann", "[", "'area'", "]", "<", "areaRng", "[", "1", "]", "]", "if", "self", ".", "dataset", "[", "'type'", "]", "==", "'instances'", ":", "if", "not", "iscrowd", "==", "None", ":", "ids", "=", "[", "ann", "[", "'id'", "]", "for", "ann", "in", "anns", "if", "ann", "[", "'iscrowd'", "]", "==", "iscrowd", "]", "else", ":", "ids", "=", "[", "ann", "[", "'id'", "]", "for", "ann", "in", "anns", "]", "else", ":", "ids", "=", "[", "ann", "[", "'id'", "]", "for", "ann", "in", "anns", "]", "return", "ids" ]

[ "filtering", "parameters", ".", "default", "skips", "that", "filter", ".", ":", "param", "catNms", "(", "str", "array", ")", ":", "get", "cats", "for", "given", "cat", "names", ":", "param", "supNms", "(", "str", "array", ")", ":", "get", "cats", "for", "given", "supercategory", "names", ":", "param", "catIds", "(", "int", "array", ")", ":", "get", "cats", "for", "given", "cat", "ids", ":", "return", ":", "ids", "(", "int", "array", ")", ":", "integer", "array", "of", "cat", "ids" ]

[ "def", "getCatIds", "(", "self", ",", "catNms", "=", "[", "]", ",", "supNms", "=", "[", "]", ",", "catIds", "=", "[", "]", ")", ":", "catNms", "=", "catNms", "if", "type", "(", "catNms", ")", "==", "list", "else", "[", "catNms", "]", "supNms", "=", "supNms", "if", "type", "(", "supNms", ")", "==", "list", "else", "[", "supNms", "]", "catIds", "=", "catIds", "if", "type", "(", "catIds", ")", "==", "list", "else", "[", "catIds", "]", "if", "len", "(", "catNms", ")", "==", "len", "(", "supNms", ")", "==", "len", "(", "catIds", ")", "==", "0", ":", "cats", "=", "self", ".", "dataset", "[", "'categories'", "]", "else", ":", "cats", "=", "self", ".", "dataset", "[", "'categories'", "]", "cats", "=", "cats", "if", "len", "(", "catNms", ")", "==", "0", "else", "[", "cat", "for", "cat", "in", "cats", "if", "cat", "[", "'name'", "]", "in", "catNms", "]", "cats", "=", "cats", "if", "len", "(", "supNms", ")", "==", "0", "else", "[", "cat", "for", "cat", "in", "cats", "if", "cat", "[", "'supercategory'", "]", "in", "supNms", "]", "cats", "=", "cats", "if", "len", "(", "catIds", ")", "==", "0", "else", "[", "cat", "for", "cat", "in", "cats", "if", "cat", "[", "'id'", "]", "in", "catIds", "]", "ids", "=", "[", "cat", "[", "'id'", "]", "for", "cat", "in", "cats", "]", "return", "ids" ]

[ "Get", "img", "ids", "that", "satisfy", "given", "filter", "conditions", ".", ":", "param", "imgIds", "(", "int", "array", ")", ":", "get", "imgs", "for", "given", "ids", ":", "param", "catIds", "(", "int", "array", ")", ":", "get", "imgs", "with", "all", "given", "cats", ":", "return", ":", "ids", "(", "int", "array", ")", ":", "integer", "array", "of", "img", "ids" ]

[ "def", "getImgIds", "(", "self", ",", "imgIds", "=", "[", "]", ",", "catIds", "=", "[", "]", ")", ":", "imgIds", "=", "imgIds", "if", "type", "(", "imgIds", ")", "==", "list", "else", "[", "imgIds", "]", "catIds", "=", "catIds", "if", "type", "(", "catIds", ")", "==", "list", "else", "[", "catIds", "]", "if", "len", "(", "imgIds", ")", "==", "len", "(", "catIds", ")", "==", "0", ":", "ids", "=", "self", ".", "imgs", ".", "keys", "(", ")", "else", ":", "ids", "=", "set", "(", "imgIds", ")", "for", "catId", "in", "catIds", ":", "if", "len", "(", "ids", ")", "==", "0", ":", "ids", "=", "set", "(", "self", ".", "catToImgs", "[", "catId", "]", ")", "else", ":", "ids", "&=", "set", "(", "self", ".", "catToImgs", "[", "catId", "]", ")", "return", "list", "(", "ids", ")" ]

[ "Load", "anns", "with", "the", "specified", "ids", ".", ":", "param", "ids", "(", "int", "array", ")", ":", "integer", "ids", "specifying", "anns", ":", "return", ":", "anns", "(", "object", "array", ")", ":", "loaded", "ann", "objects" ]

[ "def", "loadAnns", "(", "self", ",", "ids", "=", "[", "]", ")", ":", "if", "type", "(", "ids", ")", "==", "list", ":", "return", "[", "self", ".", "anns", "[", "id", "]", "for", "id", "in", "ids", "]", "elif", "type", "(", "ids", ")", "==", "int", ":", "return", "[", "self", ".", "anns", "[", "ids", "]", "]" ]

[ "Load", "cats", "with", "the", "specified", "ids", ".", ":", "param", "ids", "(", "int", "array", ")", ":", "integer", "ids", "specifying", "cats", ":", "return", ":", "cats", "(", "object", "array", ")", ":", "loaded", "cat", "objects" ]

[ "def", "loadCats", "(", "self", ",", "ids", "=", "[", "]", ")", ":", "if", "type", "(", "ids", ")", "==", "list", ":", "return", "[", "self", ".", "cats", "[", "id", "]", "for", "id", "in", "ids", "]", "elif", "type", "(", "ids", ")", "==", "int", ":", "return", "[", "self", ".", "cats", "[", "ids", "]", "]" ]

[ "Load", "anns", "with", "the", "specified", "ids", ".", ":", "param", "ids", "(", "int", "array", ")", ":", "integer", "ids", "specifying", "img", ":", "return", ":", "imgs", "(", "object", "array", ")", ":", "loaded", "img", "objects" ]

[ "def", "loadImgs", "(", "self", ",", "ids", "=", "[", "]", ")", ":", "if", "type", "(", "ids", ")", "==", "list", ":", "return", "[", "self", ".", "imgs", "[", "id", "]", "for", "id", "in", "ids", "]", "elif", "type", "(", "ids", ")", "==", "int", ":", "return", "[", "self", ".", "imgs", "[", "ids", "]", "]" ]

[ "Display", "the", "specified", "annotations", ".", ":", "param", "anns", "(", "array", "of", "object", ")", ":", "annotations", "to", "display", ":", "return", ":", "None" ]

[ "def", "showAnns", "(", "self", ",", "anns", ")", ":", "if", "len", "(", "anns", ")", "==", "0", ":", "return", "0", "if", "self", ".", "dataset", "[", "'type'", "]", "==", "'instances'", ":", "ax", "=", "plt", ".", "gca", "(", ")", "polygons", "=", "[", "]", "color", "=", "[", "]", "for", "ann", "in", "anns", ":", "c", "=", "np", ".", "random", ".", "random", "(", "(", "1", ",", "3", ")", ")", ".", "tolist", "(", ")", "[", "0", "]", "if", "type", "(", "ann", "[", "'segmentation'", "]", ")", "==", "list", ":", "# polygon", "for", "seg", "in", "ann", "[", "'segmentation'", "]", ":", "poly", "=", "np", ".", "array", "(", "seg", ")", ".", "reshape", "(", "(", "len", "(", "seg", ")", "/", "2", ",", "2", ")", ")", "polygons", ".", "append", "(", "Polygon", "(", "poly", ",", "True", ",", "alpha", "=", "0.4", ")", ")", "color", ".", "append", "(", "c", ")", "else", ":", "# mask", "mask", "=", "COCO", ".", "decodeMask", "(", "ann", "[", "'segmentation'", "]", ")", "img", "=", "np", ".", "ones", "(", "(", "mask", ".", "shape", "[", "0", "]", ",", "mask", ".", "shape", "[", "1", "]", ",", "3", ")", ")", "if", "ann", "[", "'iscrowd'", "]", "==", "1", ":", "color_mask", "=", "np", ".", "array", "(", "[", "2.0", ",", "166.0", ",", "101.0", "]", ")", "/", "255", "if", "ann", "[", "'iscrowd'", "]", "==", "0", ":", "color_mask", "=", "np", ".", "random", ".", "random", "(", "(", "1", ",", "3", ")", ")", ".", "tolist", "(", ")", "[", "0", "]", "for", "i", "in", "range", "(", "3", ")", ":", "img", "[", ":", ",", ":", ",", "i", "]", "=", "color_mask", "[", "i", "]", "ax", ".", "imshow", "(", "np", ".", "dstack", "(", "(", "img", ",", "mask", "*", "0.5", ")", ")", ")", "p", "=", "PatchCollection", "(", "polygons", ",", "facecolors", "=", "color", ",", "edgecolors", "=", "(", "0", ",", "0", ",", "0", ",", "1", ")", ",", "linewidths", "=", "3", ",", "alpha", "=", "0.4", ")", "ax", ".", "add_collection", "(", "p", ")", "if", "self", ".", "dataset", "[", "'type'", "]", "==", "'captions'", ":", "for", "ann", "in", "anns", ":", "print", "(", "ann", "[", "'caption'", "]", ")" ]

[ "change", "by", "ZhengHe", "Load", "result", "file", "and", "return", "a", "result", "api", "object", ".", ":", "param", "resFile", "(", "str", ")", ":", "file", "name", "of", "result", "file", ":", "return", ":", "res", "(", "obj", ")", ":", "result", "api", "object" ]

[ "def", "loadRes", "(", "self", ",", "resFile", ")", ":", "res", "=", "COCO", "(", ")", "res", ".", "dataset", "[", "'images'", "]", "=", "[", "img", "for", "img", "in", "self", ".", "dataset", "[", "'images'", "]", "]", "res", ".", "dataset", "[", "'info'", "]", "=", "copy", ".", "deepcopy", "(", "self", ".", "dataset", "[", "'info'", "]", ")", "res", ".", "dataset", "[", "'type'", "]", "=", "copy", ".", "deepcopy", "(", "self", ".", "dataset", "[", "'type'", "]", ")", "res", ".", "dataset", "[", "'licenses'", "]", "=", "copy", ".", "deepcopy", "(", "self", ".", "dataset", "[", "'licenses'", "]", ")", "# str to hex int for image_id", "imgdict", "=", "{", "}", "def", "get_image_dict", "(", "img_name", ")", ":", "# image_hash = int(int(hashlib.sha256(img_name).hexdigest(), 16) % sys.maxint)", "image_hash", "=", "self", ".", "image2hash", "[", "img_name", "]", "if", "image_hash", "in", "imgdict", ":", "assert", "imgdict", "[", "image_hash", "]", "==", "img_name", ",", "'hash colision: {0}: {1}'", ".", "format", "(", "image_hash", ",", "img_name", ")", "else", ":", "imgdict", "[", "image_hash", "]", "=", "img_name", "image_dict", "=", "{", "\"id\"", ":", "image_hash", ",", "\"width\"", ":", "0", ",", "\"height\"", ":", "0", ",", "\"file_name\"", ":", "img_name", ",", "\"license\"", ":", "''", ",", "\"url\"", ":", "img_name", ",", "\"date_captured\"", ":", "''", ",", "}", "return", "image_hash", "print", "(", "'Loading and preparing results... '", ")", "time_t", "=", "datetime", ".", "datetime", ".", "utcnow", "(", ")", "anns", "=", "json", ".", "load", "(", "open", "(", "resFile", ")", ")", "assert", "type", "(", "anns", ")", "==", "list", ",", "'results in not an array of objects'", "# annsImgIds = [ann['image_id'] for ann in anns]", "# change by ZhengHe", "annsImgIds", "=", "[", "]", "for", "ann", "in", "anns", ":", "assert", "ann", "[", "'image_id'", "]", "!=", "''", ",", "'image_id must have a name'", "assert", "ann", "[", "'caption'", "]", "!=", "''", ",", "'caption must be a string'", "w", "=", "jieba", ".", "cut", "(", "ann", "[", "'caption'", "]", ".", "strip", "(", ")", ".", "replace", "(", "'。','", "'", "),", " ", "c", "t_all=F", "a", "lse)", "", "p", "=", "' '", ".", "join", "(", "w", ")", "ann", "[", "'caption'", "]", "=", "p", "ann", "[", "'image_id'", "]", "=", "get_image_dict", "(", "ann", "[", "'image_id'", "]", ")", "annsImgIds", ".", "append", "(", "(", "ann", "[", "'image_id'", "]", ")", ")", "assert", "set", "(", "annsImgIds", ")", "==", "(", "set", "(", "annsImgIds", ")", "&", "set", "(", "self", ".", "getImgIds", "(", ")", ")", ")", ",", "'Results do not correspond to current coco set'", "if", "'caption'", "in", "anns", "[", "0", "]", ":", "imgIds", "=", "set", "(", "[", "img", "[", "'id'", "]", "for", "img", "in", "res", ".", "dataset", "[", "'images'", "]", "]", ")", "&", "set", "(", "[", "ann", "[", "'image_id'", "]", "for", "ann", "in", "anns", "]", ")", "res", ".", "dataset", "[", "'images'", "]", "=", "[", "img", "for", "img", "in", "res", ".", "dataset", "[", "'images'", "]", "if", "img", "[", "'id'", "]", "in", "imgIds", "]", "for", "id", ",", "ann", "in", "enumerate", "(", "anns", ")", ":", "ann", "[", "'id'", "]", "=", "id", "elif", "'bbox'", "in", "anns", "[", "0", "]", "and", "not", "anns", "[", "0", "]", "[", "'bbox'", "]", "==", "[", "]", ":", "res", ".", "dataset", "[", "'categories'", "]", "=", "copy", ".", "deepcopy", "(", "self", ".", "dataset", "[", "'categories'", "]", ")", "for", "id", ",", "ann", "in", "enumerate", "(", "anns", ")", ":", "bb", "=", "ann", "[", "'bbox'", "]", "x1", ",", "x2", ",", "y1", ",", "y2", "=", "[", "bb", "[", "0", "]", ",", "bb", "[", "0", "]", "+", "bb", "[", "2", "]", ",", "bb", "[", "1", "]", ",", "bb", "[", "1", "]", "+", "bb", "[", "3", "]", "]", "ann", "[", "'segmentation'", "]", "=", "[", "[", "x1", ",", "y1", ",", "x1", ",", "y2", ",", "x2", ",", "y2", ",", "x2", ",", "y1", "]", "]", "ann", "[", "'area'", "]", "=", "bb", "[", "2", "]", "*", "bb", "[", "3", "]", "ann", "[", "'id'", "]", "=", "id", "ann", "[", "'iscrowd'", "]", "=", "0", "elif", "'segmentation'", "in", "anns", "[", "0", "]", ":", "res", ".", "dataset", "[", "'categories'", "]", "=", "copy", ".", "deepcopy", "(", "self", ".", "dataset", "[", "'categories'", "]", ")", "for", "id", ",", "ann", "in", "enumerate", "(", "anns", ")", ":", "ann", "[", "'area'", "]", "=", "sum", "(", "ann", "[", "'segmentation'", "]", "[", "'counts'", "]", "[", "2", ":", "-", "1", ":", "2", "]", ")", "ann", "[", "'bbox'", "]", "=", "[", "]", "ann", "[", "'id'", "]", "=", "id", "ann", "[", "'iscrowd'", "]", "=", "0", "print", "(", "'DONE (t=%0.2fs)'", "%", "(", "(", "datetime", ".", "datetime", ".", "utcnow", "(", ")", "-", "time_t", ")", ".", "total_seconds", "(", ")", ")", ")", "res", ".", "dataset", "[", "'annotations'", "]", "=", "anns", "res", ".", "createIndex", "(", ")", "return", "res" ]

[ "Decode", "binary", "mask", "M", "encoded", "via", "run", "-", "length", "encoding", ".", ":", "param", "R", "(", "object", "RLE", ")", ":", "run", "-", "length", "encoding", "of", "binary", "mask", ":", "return", ":", "M", "(", "bool", "2D", "array", ")", ":", "decoded", "binary", "mask" ]

[ "def", "decodeMask", "(", "R", ")", ":", "N", "=", "len", "(", "R", "[", "'counts'", "]", ")", "M", "=", "np", ".", "zeros", "(", "(", "R", "[", "'size'", "]", "[", "0", "]", "*", "R", "[", "'size'", "]", "[", "1", "]", ",", ")", ")", "n", "=", "0", "val", "=", "1", "for", "pos", "in", "range", "(", "N", ")", ":", "val", "=", "not", "val", "for", "c", "in", "range", "(", "R", "[", "'counts'", "]", "[", "pos", "]", ")", ":", "R", "[", "'counts'", "]", "[", "pos", "]", "M", "[", "n", "]", "=", "val", "n", "+=", "1", "return", "M", ".", "reshape", "(", "(", "R", "[", "'size'", "]", ")", ",", "order", "=", "'F'", ")" ]

[ "Encode", "binary", "mask", "M", "using", "run", "-", "length", "encoding", ".", ":", "param", "M", "(", "bool", "2D", "array", ")", ":", "binary", "mask", "to", "encode", ":", "return", ":", "R", "(", "object", "RLE", ")", ":", "run", "-", "length", "encoding", "of", "binary", "mask" ]

[ "def", "encodeMask", "(", "M", ")", ":", "[", "h", ",", "w", "]", "=", "M", ".", "shape", "M", "=", "M", ".", "flatten", "(", "order", "=", "'F'", ")", "N", "=", "len", "(", "M", ")", "counts_list", "=", "[", "]", "pos", "=", "0", "# counts", "counts_list", ".", "append", "(", "1", ")", "diffs", "=", "np", ".", "logical_xor", "(", "M", "[", "0", ":", "N", "-", "1", "]", ",", "M", "[", "1", ":", "N", "]", ")", "for", "diff", "in", "diffs", ":", "if", "diff", ":", "pos", "+=", "1", "counts_list", ".", "append", "(", "1", ")", "else", ":", "counts_list", "[", "pos", "]", "+=", "1", "# if array starts from 1. start with 0 counts for 0", "if", "M", "[", "0", "]", "==", "1", ":", "counts_list", "=", "[", "0", "]", "+", "counts_list", "return", "{", "'size'", ":", "[", "h", ",", "w", "]", ",", "'counts'", ":", "counts_list", ",", "}" ]

[ "Convert", "polygon", "segmentation", "to", "binary", "mask", ".", ":", "param", "S", "(", "float", "array", ")", ":", "polygon", "segmentation", "mask", ":", "param", "h", "(", "int", ")", ":", "target", "mask", "height", ":", "param", "w", "(", "int", ")", ":", "target", "mask", "width", ":", "return", ":", "M", "(", "bool", "2D", "array", ")", ":", "binary", "mask" ]

[ "def", "segToMask", "(", "S", ",", "h", ",", "w", ")", ":", "M", "=", "np", ".", "zeros", "(", "(", "h", ",", "w", ")", ",", "dtype", "=", "np", ".", "bool", ")", "for", "s", "in", "S", ":", "N", "=", "len", "(", "s", ")", "rr", ",", "cc", "=", "polygon", "(", "np", ".", "array", "(", "s", "[", "1", ":", "N", ":", "2", "]", ")", ",", "np", ".", "array", "(", "s", "[", "0", ":", "N", ":", "2", "]", ")", ")", "# (y, x)", "M", "[", "rr", ",", "cc", "]", "=", "1", "return", "M" ]

[ "pos", ":", "(", "x1", "x2", "y1", "y2", ")" ]

[ "def", "__init__", "(", "self", ",", "pos", ")", ":", "self", ".", "set_pos", "(", "pos", ")" ]

[ "Evaluate", "results" ]

[ "def", "eval_relations", "(", "gt", ":", "List", "[", "List", "]", ",", "res", ":", "List", "[", "List", "]", ",", "cmp_blank", "=", "True", ")", ":", "#TODO to know how to calculate the total recall and prec", "assert", "len", "(", "gt", ")", "==", "len", "(", "res", ")", "tot_prec", "=", "0", "tot_recall", "=", "0", "total", "=", "0", "# print(\"evaluating result...\")", "# for _gt, _res in tqdm(zip(gt, res)):", "# for _gt, _res in tqdm(zip(gt, res), total=len(gt), desc='eval'):", "idx", ",", "t", "=", "0", ",", "len", "(", "gt", ")", "for", "_gt", ",", "_res", "in", "zip", "(", "gt", ",", "res", ")", ":", "idx", "+=", "1", "print", "(", "'Eval %d/%d (%d%%)'", "%", "(", "idx", ",", "t", ",", "idx", "/", "t", "*", "100", ")", ",", "' '", "*", "45", ",", "end", "=", "'\\r'", ")", "corr", "=", "compare_rel", "(", "_gt", ",", "_res", ",", "cmp_blank", ")", "precision", "=", "corr", "/", "len", "(", "_res", ")", "if", "len", "(", "_res", ")", "!=", "0", "else", "0", "recall", "=", "corr", "/", "len", "(", "_gt", ")", "if", "len", "(", "_gt", ")", "!=", "0", "else", "0", "tot_prec", "+=", "precision", "tot_recall", "+=", "recall", "total", "+=", "1", "# print()", "precision", "=", "tot_prec", "/", "total", "recall", "=", "tot_recall", "/", "total", "# print(\"Test on %d instances. Precision: %.2f, Recall: %.2f\" % (", "# total, precision, recall))", "return", "precision", ",", "recall" ]

[ "Convert", "a", "Table", "object", "to", "a", "List", "of", "Relation", "." ]

[ "def", "Table2Relations", "(", "t", ":", "Table", ")", ":", "ret", "=", "[", "]", "cl", "=", "t", ".", "coo2cell_id", "# remove duplicates with pair set", "used", "=", "set", "(", ")", "# look right", "for", "r", "in", "range", "(", "t", ".", "row_n", ")", ":", "for", "cFrom", "in", "range", "(", "t", ".", "col_n", "-", "1", ")", ":", "cTo", "=", "cFrom", "+", "1", "loop", "=", "True", "while", "loop", "and", "cTo", "<", "t", ".", "col_n", ":", "fid", ",", "tid", "=", "cl", "[", "r", "]", "[", "cFrom", "]", ",", "cl", "[", "r", "]", "[", "cTo", "]", "if", "fid", "!=", "-", "1", "and", "tid", "!=", "-", "1", "and", "fid", "!=", "tid", ":", "if", "(", "fid", ",", "tid", ")", "not", "in", "used", ":", "ret", ".", "append", "(", "Relation", "(", "from_text", "=", "t", ".", "cells", "[", "fid", "]", ".", "text", ",", "to_text", "=", "t", ".", "cells", "[", "tid", "]", ".", "text", ",", "direction", "=", "DIR_HORIZ", ",", "from_id", "=", "fid", ",", "to_id", "=", "tid", ",", "no_blanks", "=", "cTo", "-", "cFrom", "-", "1", ")", ")", "used", ".", "add", "(", "(", "fid", ",", "tid", ")", ")", "loop", "=", "False", "else", ":", "if", "fid", "!=", "-", "1", "and", "tid", "!=", "-", "1", "and", "fid", "==", "tid", ":", "cFrom", "=", "cTo", "cTo", "+=", "1", "# look down", "for", "c", "in", "range", "(", "t", ".", "col_n", ")", ":", "for", "rFrom", "in", "range", "(", "t", ".", "row_n", "-", "1", ")", ":", "rTo", "=", "rFrom", "+", "1", "loop", "=", "True", "while", "loop", "and", "rTo", "<", "t", ".", "row_n", ":", "fid", ",", "tid", "=", "cl", "[", "rFrom", "]", "[", "c", "]", ",", "cl", "[", "rTo", "]", "[", "c", "]", "if", "fid", "!=", "-", "1", "and", "tid", "!=", "-", "1", "and", "fid", "!=", "tid", ":", "if", "(", "fid", ",", "tid", ")", "not", "in", "used", ":", "ret", ".", "append", "(", "Relation", "(", "from_text", "=", "t", ".", "cells", "[", "fid", "]", ".", "text", ",", "to_text", "=", "t", ".", "cells", "[", "tid", "]", ".", "text", ",", "direction", "=", "DIR_VERT", ",", "from_id", "=", "fid", ",", "to_id", "=", "tid", ",", "no_blanks", "=", "rTo", "-", "rFrom", "-", "1", ")", ")", "used", ".", "add", "(", "(", "fid", ",", "tid", ")", ")", "loop", "=", "False", "else", ":", "if", "fid", "!=", "-", "1", "and", "tid", "!=", "-", "1", "and", "fid", "==", "tid", ":", "rFrom", "=", "rTo", "rTo", "+=", "1", "return", "ret" ]

[ "Construct", "a", "Table", "object", "from", "json", "object" ]

[ "def", "json2Table", "(", "json_obj", ",", "tid", "=", "\"\"", ",", "splitted_content", "=", "False", ")", ":", "jo", "=", "json_obj", "[", "\"cells\"", "]", "row_n", ",", "col_n", "=", "0", ",", "0", "cells", "=", "[", "]", "for", "co", "in", "jo", ":", "content", "=", "co", "[", "\"content\"", "]", "if", "content", "is", "None", ":", "continue", "if", "splitted_content", ":", "content", "=", "\" \"", ".", "join", "(", "content", ")", "else", ":", "content", "=", "content", ".", "strip", "(", ")", "if", "content", "==", "\"\"", ":", "continue", "start_row", "=", "co", "[", "\"start_row\"", "]", "end_row", "=", "co", "[", "\"end_row\"", "]", "start_col", "=", "co", "[", "\"start_col\"", "]", "end_col", "=", "co", "[", "\"end_col\"", "]", "row_n", "=", "max", "(", "row_n", ",", "end_row", ")", "col_n", "=", "max", "(", "col_n", ",", "end_col", ")", "cell", "=", "Chunk", "(", "content", ",", "(", "start_row", ",", "end_row", ",", "start_col", ",", "end_col", ")", ")", "cells", ".", "append", "(", "cell", ")", "return", "Table", "(", "row_n", "+", "1", ",", "col_n", "+", "1", ",", "cells", ",", "tid", ")" ]

[ "Shapes", ":", "mask", ":", "[", "nodes", "/", "edges", "edges", "/", "nodes", "]", "q", ":", "[", "nodes", "/", "edges", "h", "]", "k", ":", "[", "edges", "/", "nodes", "h", "]", "v", ":", "[", "edges", "/", "nodes", "h", "]", "score", ":", "[", "nodes", "/", "edges", "edges", "/", "nodes", "]", "x_atten", ":", "[", "nodes", "/", "edges", "h", "]" ]

[ "def", "forward", "(", "self", ",", "x", ",", "y", ",", "mask", ")", ":", "q", "=", "self", ".", "linear_q", "(", "x", ")", "k", "=", "self", ".", "linear_k", "(", "y", ")", "v", "=", "self", ".", "linear_v", "(", "y", ")", "score", "=", "torch", ".", "mm", "(", "q", ",", "k", ".", "t", "(", ")", ")", "/", "math", ".", "sqrt", "(", "self", ".", "size", ")", "score", "=", "self", ".", "masked_softmax", "(", "score", ",", "mask", ",", "dim", "=", "1", ")", "x_atten", "=", "torch", ".", "mm", "(", "score", ",", "v", ")", "# dropout", "x_atten", "=", "self", ".", "dropout", "(", "x_atten", ")", "x", "=", "self", ".", "layer_norm_1", "(", "x", "+", "x_atten", ")", "x_linear", "=", "self", ".", "feed_forward", "(", "x", ")", "# dropout", "x_linear", "=", "self", ".", "dropout", "(", "x_linear", ")", "x", "=", "self", ".", "layer_norm_2", "(", "x", "+", "x_linear", ")", "return", "x" ]

[ "Args", ":", "vid", ":", "Vertex", "id", "chunk", ":", "the", "chunk", "to", "extract", "features", "tab_h", ":", "height", "of", "the", "table", "(", "y", "-", "axis", ")", "tab_w", ":", "width", "of", "the", "table", "(", "x", "-", "axis", ")" ]

[ "def", "__init__", "(", "self", ",", "vid", ":", "int", ",", "chunk", ":", "Chunk", ",", "tab_h", ",", "tab_w", ")", ":", "self", ".", "vid", "=", "vid", "self", ".", "tab_h", "=", "tab_h", "self", ".", "tab_w", "=", "tab_w", "self", ".", "chunk", "=", "chunk", "self", ".", "features", "=", "self", ".", "get_features", "(", ")" ]

[ "To", "patch", "the", "all", "chunk", "files", "of", "the", "train", "&", "test", "dataset", "that", "have", "the", "problem", "of", "duplicate", "last", "character", "of", "the", "last", "cell", "in", "all", "chunk", "files", ":", "param", "dataset_folder", ":", "train", "dataset", "path", ":", "return", ":", "1" ]

[ "def", "patch_chunks", "(", "dataset_folder", ")", ":", "import", "os", "import", "shutil", "from", "pathlib", "import", "Path", "shutil", ".", "move", "(", "os", ".", "path", ".", "join", "(", "dataset_folder", ",", "\"chunk\"", ")", ",", "os", ".", "path", ".", "join", "(", "dataset_folder", ",", "\"chunk-old\"", ")", ")", "dir_", "=", "Path", "(", "os", ".", "path", ".", "join", "(", "dataset_folder", ",", "\"chunk-old\"", ")", ")", "os", ".", "makedirs", "(", "os", ".", "path", ".", "join", "(", "dataset_folder", ",", "\"chunk\"", ")", ",", "exist_ok", "=", "True", ")", "for", "chunk_path", "in", "dir_", ".", "iterdir", "(", ")", ":", "# print(chunk_path)", "with", "open", "(", "str", "(", "chunk_path", ")", ",", "encoding", "=", "\"utf-8\"", ")", "as", "f", ":", "chunks", "=", "json", ".", "load", "(", "f", ")", "[", "'chunks'", "]", "chunks", "[", "-", "1", "]", "[", "'text'", "]", "=", "chunks", "[", "-", "1", "]", "[", "'text'", "]", "[", ":", "-", "1", "]", "with", "open", "(", "str", "(", "chunk_path", ")", ".", "replace", "(", "\"chunk-old\"", ",", "\"chunk\"", ")", ",", "\"w\"", ",", "encoding", "=", "\"utf-8\"", ")", "as", "ofile", ":", "json", ".", "dump", "(", "{", "\"chunks\"", ":", "chunks", "}", ",", "ofile", ")", "print", "(", "\"Input files patched, ready for the use\"", ")", "return", "1" ]