Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC9739791
Cytotoxicity of BODI-Pt 17 was studied on several cell lines, including MCF-7, MDA-MB-231, and A2780 (Table 6).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cytotoxicity", "of", "BODI-Pt", "17", "was", "studied", "on", "several", "cell", "lines", ",", "including", "MCF-7", ",", "MDA-MB-231", ",", "and", "A2780", "(", "Table", "6", ")", "." ] } ]
PMC11740573
The obtained results are preliminary and do not constitute direct evidence of the therapeutic efficacy of calcitriol in clinical settings.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "obtained", "results", "are", "preliminary", "and", "do", "not", "constitute", "direct", "evidence", "of", "the", "therapeutic", "efficacy", "of", "calcitriol", "in", "clinical", "settings", "." ] } ]
PMC10587429
Importantly, we believe this model is an improved model compared to the non-humanized model in evaluating the safety and efficacy of immunotherapy regimens as evidenced by the results of our investigation with CD47 blockade ( Figure 4 ).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Importantly", ",", "we", "believe", "this", "model", "is", "an", "improved", "model", "compared", "to", "the", "non-humanized", "model", "in", "evaluating", "the", "safety", "and", "efficacy", "of", "immunotherapy", "regimens", "as", "evidenced", "by", "the", "results", "of", "our", "investigation", "with", "CD47", "blockade", "(", "Figure", "4", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Aims: We aimed to explore the effect of G-CSF mobilization on the anti-GVHD or GVL effect of MAITs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Aims", ":", "We", "aimed", "to", "explore", "the", "effect", "of", "G-CSF", "mobilization", "on", "the", "anti-GVHD", "or", "GVL", "effect", "of", "MAITs", "." ] } ]
PMC5941560
Jurkat variants loci that have matches in dbSNP (short variants) and DGV (long variants) as percentage of total Jurkat variant sites for each type of variant.
[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Jurkat", "variants", "loci", "that", "have", "matches", "in", "dbSNP", "(", "short", "variants", ")", "and", "DGV", "(", "long", "variants", ")", "as", "percentage", "of", "total", "Jurkat", "variant", "sites", "for", "each", "type", "of", "variant", "." ] } ]
PMC9429973
Since hyperferritinemia was not expected in polycythemia vera and the patient was diabetic, he was examined for HH.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Since", "hyperferritinemia", "was", "not", "expected", "in", "polycythemia", "vera", "and", "the", "patient", "was", "diabetic", ",", "he", "was", "examined", "for", "HH", "." ] } ]
PMC10933092
et al., 2021; Zheng et al., 2021; Li et al., 2022; Mao et al., 2022).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "et", "al.", ",", "2021", ";", "Zheng", "et", "al.", ",", "2021", ";", "Li", "et", "al.", ",", "2022", ";", "Mao", "et", "al.", ",", "2022", ")", "." ] } ]
PMC11514418
Long-term survival: The long-term survival follow-up was conducted through outpatient visits, telephone calls, or online social media platforms.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Long-term", "survival", ":", "The", "long-term", "survival", "follow-up", "was", "conducted", "through", "outpatient", "visits", ",", "telephone", "calls", ",", "or", "online", "social", "media", "platforms", "." ] } ]
PMC9429973
Causes of death were PCNSL in 69% of the patients (both arms), complication of treatment (6% vs 5%), secondary malignancy (5% vs 2%) and other or unknown causes (20% vs 24%).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Causes", "of", "death", "were", "PCNSL", "in", "69", "%", "of", "the", "patients", "(", "both", "arms", ")", ",", "complication", "of", "treatment", "(", "6", "%", "vs", "5", "%", ")", ",", "secondary", "malignancy", "(", "5", "%", "vs", "2", "%", ")", "and", "other", "or", "unknown", "causes", "(", "20", "%", "vs", "24", "%", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Methods: Patients from 1 to 14 years of age who were diagnosed with higher-risk MDS and underwent allo-HSCT consecutively between February 2019 and August 2020 in Pediatric Blood Diseases Center were enrolled.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "Patients", "from", "1", "to", "14", "years", "of", "age", "who", "were", "diagnosed", "with", "higher-risk", "MDS", "and", "underwent", "allo-HSCT", "consecutively", "between", "February", "2019", "and", "August", "2020", "in", "Pediatric", "Blood", "Diseases", "Center", "were", "enrolled", "." ] } ]
PMC9688728
Only the hits whose forward and reverse similarity exceeded 700 were considered.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Only", "the", "hits", "whose", "forward", "and", "reverse", "similarity", "exceeded", "700", "were", "considered", "." ] } ]
PMC11507371
These encode stress response proteins and metabolic enzymes such as antioxidant phase II proteins (haeme oxygenase-1 (HMOX-1), NAD(P)H quinone dehydrogenase (NQO1), and CAT) .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "encode", "stress", "response", "proteins", "and", "metabolic", "enzymes", "such", "as", "antioxidant", "phase", "II", "proteins", "(", "haeme", "oxygenase-1", "(", "HMOX-1", ")", ",", "NAD(P)H", "quinone", "dehydrogenase", "(", "NQO1", ")", ",", "and", "CAT", ")", "." ] } ]
PMC11551844
Thus, it can be deduced that the biological activity observed with contignasterol and ansellone A and their conjugated AuNPs were cell line specific.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Thus", ",", "it", "can", "be", "deduced", "that", "the", "biological", "activity", "observed", "with", "contignasterol", "and", "ansellone", "A", "and", "their", "conjugated", "AuNPs", "were", "cell", "line", "specific", "." ] } ]
PMC11632064
This suggests that the sensitivity of A-375 cells to RSK/PLK inhibitors may not be fully explained by their mutated BRAF status.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "suggests", "that", "the", "sensitivity", "of", "A-375", "cells", "to", "RSK/PLK", "inhibitors", "may", "not", "be", "fully", "explained", "by", "their", "mutated", "BRAF", "status", "." ] } ]
PMC7154001
MetaboliteMetabolic PathwayEfficacy/Toxicity of MetaboliteAM6−36 (3-amino-6-(3′-aminopropyl)-5H-indeno[1,2-c]isoquinoline-5,11-(6H)dione)In vitroHLM, human hepatocyte–HPLC-QTOF-MS, HPLC-QqQ-MS1 Metabolite for HLM (4);7 Metabolites for hepatocyte (4–10)Reduction (4);Monoacetylation (5);Conversion of amino acid group to an alcohol (7);Reduction of the ketone to an alcohol +conversion of amino acid group to an alcohol (8);Reduction + acetylation (6);Monoacetylation + conversion of amino acid group to an alcohol (9);Glucuronidation (10)Metabolites 5: lower retinoid X receptor (RXR) homodimers bind to DNA response elements (RXRE) induction activity than parent compound AM6-36Metabolites 8: exhibited lower activity to inhibit NFƘB than AM6-36In vivoFemale Sprague−Dawley rats (PO: 40 mg/kg)Serum, liver, mammary tissues1 Metabolites for serum (5);5 Metabolites for liver tissue (4, 5, and 7–9);No metabolite in mammary tissueARQ 501 (synthetic β-lapachone)In vitroMouse, rat, dog, monkey, human whole blood–UPLC-QTOF-MS,HPLC-MS-ARC4 Metabolites for mouse and rat (M1, M2, M3, M5);5 Metabolites for dog (M1, M2, M3, M5, unidentified metabolite);5 Metabolites for monkey (M1, M2, M3, M5, M6);6 Metabolites for human (M1, M2, M3, M4, M5, M6);ARQ 501 disappeared after 60 min of incubation in human whole bloodOxidation (M1);Adding 2 oxygen and 2 hydrogen atoms (M2);Adding 1 oxygen and 2 hydrogen atoms (M3);Loss of 1 carbon atom (M4 and M6);Loss of CO group (M5)Not evaluatedARQ 501 (synthetic β-lapachone)In vivoMice (IP: 40 mg/kg), rats (IV: 40 mg/kg)PlasmaLC-QTOF-MS, HPLC-QqQ-MS3 Metabolites for all speciesGlucosylation + sulfation;Glucuronidation;SulfationNot evaluatedClinical trialCancer patients (140 mg/m)3 MetabolitesCabazitaxelPhase I clinical trialAdvanced solid tumor patients (IV: 25 mg/m of [C]-cabazitaxel (50 muCi, 1.85 MBq of [C]-cabazitaxel))Plasma, urine, fecesHPLC-RD-MS6 Metabolites in plasma (Major: RPR123142);10 Metabolites in urine (Major: M09b);13 Metabolites in feces (Major: RPR104943, RPR104952, RPR111026, RPR111059)7-O-demethylation + 10-O-demethylation + hydroxylation (RPR104952);10-O-demethylation (RPR123142);7-O-demethylation + 10-O-demethylation + di-hydroxylation (M09b);7-O-demethylation + di-hydroxylation + 10-O-demethylation (RPR111026, RPR111059);7-O-demethylation + di-hydroxylation + 10-O-demethylation + hydroxylation (RPR104943);Cleavage is minor pathway plasma and urineNot evaluatedCapecitabineIn vivoMale Wistar rats (PO: 80 mg/kg)Bile, urine, liver, kidneysHPLC-TIS-MS/MS, F-NMR and H-NMR3 Metabolites for liver (5ʹ-deoxy-5-fluorocytidine, α-Fluoro-β-alanine, 2ʹ-(β-D-glucuronic acid)-5ʹ-deoxy-5-fluorocytidine);2 Metabolites for bile (5ʹ-deoxy-5-fluorocytidine, 2ʹ-(β-D-glucuronic acid)–5ʹ-deoxy-5-fluorocytidine);2 Metabolites for kidney (5ʹ-deoxy-5-fluorocytidine, α-Fluoro-β-alanine);4 Metabolites for urine (5ʹ-deoxy-5-fluorouridine, 5.6-Dihydro-5-fluorouracil, α-Fluoro-β-alanine, 5ʹ-deoxy-5-fluorocytidine)Glucuronidation (2ʹ-(β-D-glucuronic acid)-5ʹ-deoxy-5-fluorocytidine);Not identified (5ʹ-deoxy-5-fluorocytidine, α-fluoro-β-alanine, 5ʹ-deoxy-5-fluorouridine, 5.6-Dihydro-5-fluorouracil)Not evaluatedCarbendazim (2-benzimidazolecarbamic acid methyl ester)In vitroRLM, HLM–HPLC-ESI-MS1 Metabolite (5(6)- or 4(7)-hydroxyl carbendazim)OxidationNot evaluatedIn vivoRats (PO: 1000 mg/kg)Serum1 Metabolite (2-aminobenzimidazole)HydrolysisCI941 (losoxantrone)In vitroRat hepatocyte, human hepatoblastoma (HepG2) cell lines–HPLC-UV, HPLC-QqQ-MS, H-NMR12 Metabolites (M2-M13) for rat hepatocyte;No metabolite in HepG2Hydroxylation (M2, M3);Hydroxylation + oxidation (M8);Hydroxylation + oxidation + glutathione conjugation (M10);Hydroxylation+ glucuronidation (M4, M9);Hydroxylation + sulfation (M5-M7);Oxidation (M11-M13)Not evaluatedCisplatinIn vivoMale Sprague-Dawley rats (IV: 3mg/kg)Kidney tissueHPLC-ESI-QTOF-MS31 Metabolites (M1-M31)Hydration (M1);Hydroxylation (M4);Dihydroxylation (M3);Methionine conjugation (M5);Di-methionine conjugation (M15, M29);Cysteine conjugation (M7, M8);Di-cysteine conjugation (M16, M31);Chlorination (M24, M26);Acetylcysteine conjugation (M9, M10);Di-acetylcysteine conjugation (M17);Glutathione conjugation (M11);Thioether conjugation (M13);Hydration+ hydroxylation (M2);Methionine conjugation + hydroxylation (M6);Methionine conjugation + chelation (M18, M20, M25);Methionine conjugation + chelation + hydroxylation (M19);Cysteine conjugation+ chelation (M21, M23, M27, M28, M30);Cysteine conjugation+ chelation + hydroxylation (M22);Glutathione conjugation +hydroxylation (M12);Thioether conjugation + hydroxylation (M14)Not evaluatedCP-31398 (N’-[2-[2-(4-methoxyphenyl)ethenyl)-4-quinazolinyl]-N,N-dimethyl-1,3-propanediaminedihydrochloride)In vivoMale and Female CD rats (PO: 0, 240, 480, or 960 mg/m/day) and beagle dogs (0, 200, 400, or 800 mg/m/day)PlasmaHPLC-QTOF-MS4 Metabolites for rat (II: hydroxy CP-31398, III: O-demethyl CP-31398, IV: N-demethyl CP-31398, V: hydroxy O-demethyl CP-31398);4 Metabolites for dog (II: hydroxy CP-31398, III: O-demethyl CP-31398, IV: N-demethyl CP-31398, VI: di-demethyl CP-31398)Hydroxylation (hydroxy CP-31398);O-demethylation (O-demethyl CP-31398);N-demethylation (N-demethyl CP-31398);Hydroxylation + O-demethylation (hydroxy O-demethyl CP-31398);Di-demethylation (di-demethyl CP-31398)Not evaluatedCPA (Cyproterone acetate)In vivoFemale Wistar-Han rats (PO: 50 mg/kg [H] CPA (0.42 MBq/mg))BileHPLC-MS, GC-MS, H-NMR2 Metabolites (M1: 3α-OH-CPA and M2)Sulfation and/or Glucuronidation3α-OH-CPA covalently bound to guanine which might be the major adduct formed of CPACrisnatolIn vitroHuman hepatoma (Hep G2) cells, HLM–GC-MS, H-NMR3 Metabolites for Hep G2 (M1 and M2: isomeric crisnatol dihydrodiol and M3: crisnatol 1,2-dihydrodiol);2 Metabolites for HLM (M4: crisnatol 1,2-dihydrodiol and M5: 1-hydroxycrisnatol)Di-hydroxylation + di-hydrogenation (M3, M4);Hydroxylation (M5)Not evaluatedCyclophosphamideClinical trialCancer patients (60 mg/kg)Plasma, urineGC-MS1 Active metabolite for both samples (N, N-bis(2-chloroethyl) phosphorodiamidic acid)Not identifiedNot evaluatedDFS (Trans-2,6-difluoro-4ʹ-(N, N)-dimethylamino) stilbene: Stilbene analog)In vitroPooled MLM, RLM, HLM–HPLC-ESI-MS/MS10 Metabolites for MLM (M1-10);7 Metabolites for RLM (M1, M3-6, M9-10);6 Metabolites for HLM (M1-3, M5, M7, M10)Demethylation (M1);Oxidation (M2-M4);Demethylation + Oxidation (M5);Oxidation + Defluorination (M6, M7);Bisoxidation (M8, M9);Isomerization (M10)Not evaluated5ʹ-dFUR (5ʹ-deoxy-5-fluorouridine)In vivoCancer patients (IV: 4 g/m)PlasmaGC-MS3 Metabolites (N-Methylated-5ʹ-dFUR, 5-fluorouracil, and 5,6-dihydro-5-fluorouracil)Methylation (N-Methylated-5ʹ-dFUR);Not identified (5-fluorouracil, and 5,6-dihydro-5-fluorouracil)Not evaluated5ʹ-dFUrd (5ʹ-deoxy-5-fluorouridine)Clinical trialCancer patients (IV: 10 g/m)Blood, plasma, urineF-NMR4 Metabolites in blood and plasma (5-fluorouracil, α-fluoro-β-ureidopropionic acid, α-fluoro-β-alanine, 5,6-dihydrofluorouracil);3 Metabolites in urine (5-fluorouracil, α-fluoro-β-ureidopropionic acid, α-fiuoro-β-alanine)Not identifiedNot evaluatedEAPB0203In vitroPooled RLM, DLM–HPLC-MS/MS (QqQ and QTOF),H-NMR, C-NMR4 Metabolites for DLM (EAPB0202, M7, M2, and M1);6 Metabolites for RLM (EAPB0202, M7, M6, M3, M2, M1)Hydroxylation (M1-M3, M6, M7);Demethylation (EAPB0202)Not evaluatedEAPB0503 (imiquimod analogs) and EAPB0502 (M’ 7) and EAPB0603 (M’5) (active metabolites of EAPB0503)In vitroMLM, RLM, DLM, HLM;Rat, dog, and human hepatocyte–LC-ESI-MS/MSEAPB0503:6 Metabolites for MLM (M’2-M’7);4 Metabolites for RLM (M’2, M’4, M’5, M’7);7 Metabolites for DLM (M’1-M’7);4 Metabolites for HLM (M’2, M’4, M’5, M’7);4 Metabolites for rat hepatocyte (M’2, M’4, M’5, and M’7);5 Metabolites for dog hepatocyte (M’1, M’2, M’4, M’6, M’7);4 Metabolites for human hepatocyte (M’2, M’4, M’5, M’7)EAPB0502:2 Metabolites for MLM (M’2 and M’3);2 Metabolites for RLM (M’2 and M’3);2 Metabolites for DLM (M’2 and M’3);1 Metabolite for HLM (M’2);1 Metabolite for rat hepatocyte (M’3)EAPB0603:2 Metabolites for MLM (M’1, M’2);1 Metabolite for RLM (M’2);2 Metabolites for DLM (M’1, M’2);1 Metabolite for HLM (M’2);1 Metabolite for dog hepatocyte (M’1)O-demethylation (M’5);N-demethylation (M’7); Hydroxylation (M’4, M’6);O- and N-demethylation (M’2);N-demethylation + hydroxylation (M’3);Hydroxylation + O-demethylation (M’1)Not evaluatedE-DE-BPH (E-3,4-bis (4-Ethylphenyl) hex-3-ene: stilbene derivatives)In vitroRLM (Aroclor 1254-treated), PLM–HPLC-UV, GC-MS, GC-IR5 Metabolites for Aroclor 1254-treated RLM (M1: 3,4-bis(4-(1-hydroxyethyl) phenyl) hex-3-ene, M2: E-3-(4-acetylphenyl)-4-(4-(1-hydroxyethyl) phenyl) hex-3-ene, M3: E-3,4-bis(4-acetylphenyl) hex-3-ene, M4: E-3-(4-(1-hydroxyethyl) phenyl)-4-(4-ethylphenyl) hex-3-ene, M5: E-3-(4-acetylphenyl)-4- (4-ethylphenyl) hex-3-ene);4 Metabolites for PLM (M1, M2, M4, M5)Hydroxylation (M4);Hydroxylation + oxidation (M5);Di-hydroxylation (M1);Hydroxylation + oxidation + hydroxylation or di-hydroxylation + oxidation (M2);Hydroxylation + oxidation + hydroxylation + oxidation or di-hydroxylation + di-oxidation (M3)Not evaluated2-F-araA (9-β-D-arabinofuranosyl-2-fluoroadenine)In vivoMale BDF1 mice (IV: 400 mg/m), female beagle dog (IV: 400 mg/m), female rhesus monkey (IV: 400 mg/m)Urine, bloodHPLC-MS1 Metabolite detected in dog blood (9-β-D-arabinofuranosyl hypoxanthine: 2-F-araH);2 Metabolites for urine of all species (2-fluoroadenine: 2-F-ad, 2-F-araH)Not identified2-F-araH: no antitumor activity, no toxicity in BDF1 mice bearing L1210 leukemia cells at 200 mg/kg (IP) for 9 daysFlutamideIn vitroMale human, male dog, and male rat liver microsomesMale pig liver and prostate microsomes–LC-ESI-QTOF-MSLiver microsomes:1 Metabolites for human (OH-Flu);4 Metabolites for dog (Flu-1, OH-Flu (2 isoforms), M1, M3);4 Metabolites for rat (Flu-1, OH-Flu (3 isoforms), M1, M3 (2 isoforms));4 Metabolites for pig (Flu-1, OH-Flu (2 isoforms), M1, M3)Prostate microsomes:2 Metabolites for pig (OH-Flu, Flu-5)Monohydroxylation (OH-Flu);Di-hydroxylation (M1);Tri-hydroxylation (M3);Sulfation (Flu-3 sulfate);Glucuronidation (Flu-3 glucuronide);Hydroxylation + mercapturic acid conjugation (hydroxyflutamide mercapturic acid);Hydroxylation + glucuronidation (hydroxyflutamide glucuronide); Di-hydroxylation + glucuronidation (M1 glucuronide)Formation of a mercapturic acid conjugate from flutamide in human urine, suggesting that thereported liver effects of flutamide are due to the molecular mechanismcaused by a reactive intermediateIn vivoProstate cancer patients) (Oral: 250 mg BID)Urine10 Metabolites (Flu-1, Flu-3, Flu-3 sulfate, Flu-3 glucuronide, OH-Flu, M1, M3, hydroxyflutamide mercapturic acid, hydroxyflutamide glucuronide, M1 glucuronide)4-HydroxyanisoleIn vivoMalignant melanoma patients (IA: 80 g)UrineGC-MS4 Metabolites (1: hydroquinone, 3: 3.4-dihydroxyanisole, 4: 3-methoxy-4-hydroxyanisol, and 5: 4-hydroxy-3-methoxyanisole)Methylated metabolites might be conjugated with glucuronic acid or sulphatesNot evaluatedIrinotecanIn vitroHLM, recombinant CYP enzymes (1A1, 1A2, 2C8, 2C9, 3A4, 3A5, and 3A7)–HPLC-Spectro-fluorometry, HPLC-MS4 Metabolites for cells expressing CYP3A4 (M1, NPC, M2, APC);5 Metabolites for microsomes containing CYP3A4 and CYP3A5 (M1, NPC, M2, APC, M4);1 Metabolite for cells expressing CYP3A5 (M4);No metabolite for cells expressing CYP2C8, CYP2C9, CYP1A1, CYP1A2, and CYP3A7Mono-hydroxylation (M1, M2);Loss of terminal piperidine (NPC);Di-oxidation (APC);De-ethylation (M4)Not evaluatedPhase I and II clinical trialsCavum carcinoma patient (IV: 300 mg/m), brain tumor patient (600 mg/m), glioblastoma patients (350 mg/m)Urine7 Metabolites (SN-38-G, M1, NPC, M2, M3, APC, SN-38)IxabepiloneClinical trialCancer patients (IV: 70 mg; 80 nCi)Plasma, urine, fecesHPLC-AMS, LC-MS3 Degradants and 4 metabolites for plasma and urine (Deg-1–Deg-3, M8, M16, M19, M41);3 Degradants and 3 metabolites for feces (Deg-1–Deg-3, M8, M19, M41)Dehydration (Deg-1-Deg-3);Dehydration + oxygenation (M41);Hydroxylation (M8);Oxygenation + dehydrogenation (M16);Oxygenation + dehydration (M19)Not evaluatedJM216 (bis (acetato) ammine-dichloro (cyclohexylamine)Platinum (IV))Phase I clinical trialCancer patients (PO: 120, 200, 300, 420, 540 mg/m)PlasmaHPLC-MS6 Platinum metabolites (A, JM383, JM559, D, JM118, F)Hydrolysis + declorination (JM518, JM559);Di-hydrolysis + di-declorination (JM383);Hydrolysis + declorination +reduction + clorination (JM118);Hydrolysis + declorination + reduction + glutathione conjugation + methylation (A)JM118: higher cytotoxic activity against 8 human ovarian carcinoma cell lines (HX 62, SKOV-3, CH1, CH1 CISR, 41M, 41M CISR, A2780 A2780 CISR) compared to JM216 and cisplatinJM518 and JM383: similar and less cytotoxic activity to JM216In vitroHuman plasmaPlasma5 Platinum metabolites (A, JM383, JM559, JM518, JM118)K02 (Morpholine-urea-Phe-Hphe-vinylsulfone)In vitroHLM, cDNA-expressed CYP3A4–HPLC-UV, LC-MS3 Major metabolites for both (M12, M19, M20)HydroxylationNot evaluatedLaromustineIn vitroRLM, DLM, HLM, MLM–HPLC-RD7 Similar metabolites for all species but in different quantity (C1-C7: C4 = major metabolite)Demethylsufoxidation.;Hydrolysis;OxidationNot evaluated2-MethoxyestradiolIn vitroPooled HLM–HPLC, HPLC-QqQ -MS4 Phase I metabolites (A, B, C, D);2 Phase II metabolites (G1, G2)Hydroxylation (A, B, C, D);Glucuronidation (G1, G2)Not evaluatedIn vivoCancer patients (PO: 800 mg or 2200 mg BID)Urine2 Phase II metabolites (G1, G2)Glucuronidation (G1, G2)Mitomycin CIn vivoMurine adenocarcinomas of the colon, MAC 16 (high DT-diaphorase activity) andMAC 26 (low DT-diaphorase activity) bearing mice (Intra tumor: 500 µg)TumorHPLC-UV4 Metabolites (trans-hydro, cis-hydro, 2,7-diaminomitosene (2,7-DM), decarbamoyl 2,7-DM)Hydrolysis (trans-hydro, cis-hydro);Reduction (2,7-DM);Reduction + decarbamoyl (decarbamoyl 2,7-DM)Not evaluatedNB-506 (6-N-formylamino-12,13-dihydro-1,11-dihydroxy-13-(b-D-glucopyranosil) 5H-indolo [2,3-a] pyrrolo [3,4-c] carbazole-5,7(6H)-dione)In vivoMale Sprague-Dawley rat (IV: 187.5 mg/m of [C] NB-506 (1.85 MBq/kg))BileHPLC-RD-MS, H NMR, C NMR3 Metabolites (RBM-1, RBM-2, ED501)Deformyl metabolite (ED501);O-glucuronidation (RBM-1);ED501 + glucuronidation (RBM-2)Not evaluated9NC (9-nitro-20(S)-camptothecin)In vivoWistar rats (IV: 8 mg/kg)Bile, urine, fecesLC-IT-MS, LC-QTOF-MS (M2, M5 and M7), H NMR5 Metabolites for bile (M1, M2, M3: 9-AC, M4: 9-AA-CPT, M5);3 Metabolites for urine (M1, M3, M6);3 Metabolites for feces (M4, M6, M7: 9-OH-CPT)Glucuronidation of 9-OH-CPT (M1);Loss of glutamic acid from M5 (M2);Reduction (M3);Acetylation (M4);Glutathione conjugate of 10-OH-CPT (M5);Mercapturic acid conjugate of 10-OH-CPT (M6);Aglycone of M1 (M7)Not evaluatedNSC 141549 (4ʹ-(9-Acridinylamino) methanesulfon-m-a nisidide (m -AMSA))In vivoMale Sprague-Dawley rats (IV: 60 mg/kg and IP: 40 mg/kg)Plasma (IV), bile (IP)HPLC-MS1 Major metabolite for plasma (4-amino-3-methoxymethanesulfonanilide);1 Major metabolite for bile (9-acridinyl thioether of glutathione)Methoxylation (4-amino-3-methoxy methanesulfonanilide);Glutathione conjugation (9-acridinyl thioether of glutathione)Not evaluatedNSC 652287 (2,5-bis(5-hydroxymethyl-2-thienyl) furan)In vitroDog liver S9 fraction–GC-MS1 Major metaboliteMethylation or oxidationNot evaluatedNSC 674495 (2-(4-Amino-3-methylphenyl) benzothiazole: DF 203)In vitroBreast cancer cell lines (MCF-7, T-47D, and MDA-MB-435) and renal cancer celllines (TK-10, A498, and CAKI-1)–HPLC-spectro-fluorometry, H NMR1 Major metabolite for sensitive cell lines (T-47D, MDA-MB-435): (6c: 2-(4-amino-3-methylphenyl)-6 hydroxybenzothiazole)Hydroxylation6c: low anti-cancer activity against MCF-7 cell lines (IC50>100 M)PAC-1 (4-benzyl-piperazin-1-yl)-acetic acid (3-allyl-2- Hydroxy-benzylidene)-hydrazineIn vivoMale Wistar rats (PO: 50 mg/kg)Urine, feces, bileHPLC-QTOF-MS, HPLC-IT-MS14 Metabolites for urine (M1-M7, M9-M11, M13-M16);3 Metabolites for feces (M1, M6, M13);4 Metabolites for bile (M4, M13, M14, M16)Debenzylation (M1);Hydroxylation (M2-M6);Dihydroxylation (M8–M12);Carboxylation (M7);Dihydrodiol formation (M13);Glucuronidation (M14);Hydroxylation + glucuronidation (M15-M16)Not evaluatedIn vitroRLM–12 metabolites (M1-M6, M8-M13)PaclitaxelIn vivoOvarian carcinoma patients (IV: 135 mg/m)Plasma, urineHPLC-MS2 Metabolites for plasma (P1: 6α-hydroxypaclitaxel, P3: 7-epipaclitaxel);3 Metabolites for urine (U1: 6α-hydroxypaclitaxel, U2: 10-deacetylpaclitaxel, U4: 7-epipaclitaxel)Not identifiedNot evaluatedPaclitaxelIn vitroLiver microsomes from:Sprague-Dawley & hairless rats (males, females), BALB/c & OF1 mice (males, females), male guinea-pigs, male rabbits, male dogs, male monkeys, and humans–HPLC-UV1 Metabolite for male & female SD and hairless RLM, male & female BALB/c MLM (3′p-hydroxypaclitaxel);2 Metabolites for male & female OF1 mice & male rabbits (6α hydroxypaclitaxel and 3′p-hydroxypaclitaxel);2 Metabolites for male dog (6α-hydroxypaclitaxel, 6α,3′p-dihydroxypaclitaxel) liver microsomes;3 Metabolites in male guinea-pigs, male monkey, human liver microsomes (6α-hydroxypaclitaxel, 3′p-hydroxypaclitaxel, 6α,3′p-dihydroxypaclitaxel)Mono-hydroxylation (3′p-hydroxypaclitaxel, 6α-hydroxypaclitaxel);Di-hydroxylation (6α,3′p-dihydroxypaclitaxel)Not evaluatedIn vivoMale Dunkin Hartley albino guinea-pigs (IV: 6 mg/kg)Bile2 metabolites (M1: 6α Hydroxypaclitaxel, M2: 3'p-Hydroxypaclitaxel)PhenylbutyrateClinical trialHuman (PO: 0.36 mmol/kg (5 g/75 kg))Plasma, urineGC-MS3 Metabolites for both samples (phenylacetate, phenylacetylglutamine, phenylbutyrylglutamine)Not identifiedNot evaluatedPhyllanthosideIn vivoMale CDF1 micePlasmaHPLC-UV1 Metabolite (M)AglyconeM: anticancer activity against human rhabdomyosarcoma cell lines (A204 cell lines) lower than parent compound with IC50 of 24 µM and 0.47 nMSepin-1In vitroMLM, RLM, HLM–UHPLC-QTOF-MS7 Metabolites for all species (M1-M7)Reduction (M1, M2);Dimer formation (M3-M5);Cysteine conjugation (M6);Glutathione conjugation (M7)Not evaluatedSN30000 (3-(3-Morpholinopropyl)-7,8-dihydro-6H-indeno[5,6-e] triazine 1,4-dioxide: tirapazamine analog)In vivoFemale NIH-III mice (IP: 186 mg/kg)Plasma, liver, HT29 tumorLC-MS/MS19 Metabolites for plasma (M1-M19);16 Metabolites for liver (M3-M7, M9, M10-M19);19 Metabolites for tumor (M1-M19)Reduction;Oxidation;GlucuronidationM14: acute toxicity (hypothermia) similarly to SN30000TamoxifenIn vivoAthymic mice (PO and SC: 200 mg/kg/day, 50 mg/kg/day, and 12.5 mg/kg/day), Breast cancer patients (10 mg BID)SerumHPLC-UV2 Metabolites for mouse serum after PO and SC of 200 mg/kg/day and 50 mg/kg/day and patient serum (4-Hydroxytamoxifen and N-desmethyl tamoxifen);Higher level of metabolites with higher dosesHydroxylation (4-hydroxytamoxifen);N-demethylation (N-desmethyltamoxifen)Not evaluatedTamoxifenIn vitroHuman liver homogenate, human hepatoblastoma (HepG2) cell lines–LC-ESI-MS6 Metabolites for human liver homogenate (M1-M5, M8);4 Metabolites for HepG2 (M2-M5)N-Di-desmethylation (M1);N-Desmethylation (M4);Hydroxylation (M2 and M3);N-oxidation (M5);N-Desmethylation + hydroxylation (M6, M7);N-oxidation + hydroxylation (M8)Not evaluatedIn vivoBreast cancer patients (PO: 60 mg OD or 30 mg OD > 6 months)Plasma8 Metabolites (M1-M8; M8 only in patients who received long term > 6 months)TamoxifenIn vivoFemale Rowett athymic nude rats (PO: 5 mg/kg/day or SC: 50 mg)Serum, liver, lung, retroperitoneal adipose tissue, kidneys, brain, muscle, heart, spleen, stomach, small intestine, uterus tissues2 Metabolites for all samples except adipose tissue (4-Hydroxytamoxifen, N-Desmethyltamoxifen) after 21 days PO;4-Hydroxytamoxifen for all samples except adipose tissue and uterus after 33 days PO;N-Desmethyltamoxifen for all samples except adipose tissue after 33 days PO;2 Metabolites for liver, lung, brain, heart, and kidney (4-Hydroxy tamoxifen and N-Desmethyltamoxifen) after 33 days SC;Level of metabolites detected in SC lower than POHydroxylation (4-Hydroxytamoxifen);Demethylation (N-Desmethyltamoxifen)Not evaluatedTamoxifenClinical trialBreast cancer patients (PO: 20–40 mg/day)PlasmaUHPLC-QqQ-Quantum-MS and UHPLC-Exactive Plus Orbitap-MS40 Metabolites (1–23, 25–27, 29–36, 38, 39, 42–45)Demethylation + hydroxylation + glucuronidation (1, 9, 13, 19);Hydroxylation + glucuronidation (2, 11, 15, 18);Carboxylation + glucuronidation (3);Di-hydroxylation + oxidation + glucuronidation (4, 21);Di-methylation + tetra-hydroxylation + glucosylation (5);Demethylation + carboxylation (6);Di-hydrodiol (7);Carboxylation (8);Demethylation + hydroxylation (10, 25, 27.32, 44);Hydroxylation (12, 29, 30, 33);Hydroxylation + carboxylation (14);Di-hydroxylation (16, 17, 31); Hydroxylation + sulfation (20);Di-demethylation + tri-hydroxylation + glucoside (22,26);Di-demethylation + hydroxylation (23);E-tamoxifen (34);Di-demethylation (35);Demethylation + desaturation (36);N-demethylation (38);Desaturation (39);Hydroxylation + desaturation (42, 45);Adding NO molecule (43)Not evaluatedTAS-102 (tipiracil hydrochloride (TPI) + trifluridine (FTD))Clinical trialAdvanced solid tumor patients (PO: 1000 nCi of [C]-TPI)Plasma, urine, fecesHPLC-QqQ-MS1 Major metabolite for plasma, urine, and feces (6-hydroxyme-thyluracil (6-HMU))Not identifiedNot evaluatedAdvanced solid tumor patients (PO: 200 nCi of [C]-FTD)1 Major metabolites for plasma (Trifluoromethyluracil (FTY));3 Major metabolites for urine (FTY, FTD Glu U3, FTD Glu U4)Glucuronidation (FTD Glu U3 and FTD Glu U4);Unidentified (FTY)TNP-470 (O-(chloroacetyl-carbamoyl) fumagillol)In vitroHuman hepatocyte, human liver, intestinal, kidney microsomes–HPLC-QqQ-MS6 Metabolites for cultured human hepatocytes (M1-M6: M2 and M5 = predominant metabolites of extracellular and intracellular, respectively);3 Metabolites for HLM (M1, M2, M4);2 Metabolites for intestine and kidney microsomes (M2, M4)Esterase (M4); Esterase + Epoxide hydrolysis (M2)Not evaluatedTW01003 ((3E,6E)-3-Benzylidene-6-[(5- hydroxypyridin-2-yl) methylene] piperazine-2,5-dione)In vivoPig (IV) and male Wistar rats (IV: 7 mg/kg and PO: 36 mg/kg)Plasma (rat) and urine (pig)HPLC1 Metabolite for pig urine (TW-01003 sulfate);2 Metabolites for rat plasma after IV (TW-01003 sulfate (major), TW-01003 glucuronide);2 Metabolites after PO (TW-01003 sulfate, TW-01003 glucuronide (major))Sulfation (TW-01003 sulfate);Glucuronidation (TW-01003 glucuronide)Not evaluatedAbbreviations: AMS, Accelerator Mass Spectrometry; ARC, Accurate Radioisotope Counting; DLM, Dog Liver Microsome; ESI, Electrospray Ionization; GC, Gas Chromatography; HLM, Human Liver Microsome; HPLC, High Performance Liquid Chromatography; IR, Infrared spectroscopy; IP, Intraperitoneal; IT, Ion trap; IV, Intravenous; LC, Liquid Chromatography; MLM, Monkey Liver Microsome; MS, Mass Spectrometry; NMR, Nuclear Magnetic Resonance spectroscopy; PLM, Pig Liver Microsome; PO, Per oral; QqQ, Triple quadrupole; QTOF, Quadrupole Time-of-flight; RD, Radio Detection; RLM, Rat Liver Microsome; SC, Subcutaneous; TIS, Turbo Ion Spray; UHPLC, Ultra-High Performance Liquid Chromatography; UPLC, Ultra Performance Liquid Chromatography; UV, Ultraviolet detection.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "MetaboliteMetabolic", "PathwayEfficacy/Toxicity", "of", "MetaboliteAM6−36", "(", "3-amino-6-(3′-aminopropyl)-5H-indeno[1,2-c]isoquinoline-5,11-(6H)dione)In", "vitroHLM", ",", "human", "hepatocyte", "–", "HPLC-QTOF-MS", ",", "HPLC-QqQ-MS1", "Metabolite", "for", "HLM", "(4);7", "Metabolites", "for", "hepatocyte", "(4–10)Reduction", "(4);Monoacetylation", "(5);Conversion", "of", "amino", "acid", "group", "to", "an", "alcohol", "(7);Reduction", "of", "the", "ketone", "to", "an", "alcohol", "+", "conversion", "of", "amino", "acid", "group", "to", "an", "alcohol", "(8);Reduction", "+", "acetylation", "(6);Monoacetylation", "+", "conversion", "of", "amino", "acid", "group", "to", "an", "alcohol", "(9);Glucuronidation", "(10)Metabolites", "5", ":", "lower", "retinoid", "X", "receptor", "(", "RXR", ")", "homodimers", "bind", "to", "DNA", "response", "elements", "(", "RXRE", ")", "induction", "activity", "than", "parent", "compound", "AM6", "-", "36Metabolites", "8", ":", "exhibited", "lower", "activity", "to", "inhibit", "NFƘB", "than", "AM6", "-", "36In", "vivoFemale", "Sprague−Dawley", "rats", "(", "PO", ":", "40", "mg/kg)Serum", ",", "liver", ",", "mammary", "tissues1", "Metabolites", "for", "serum", "(5);5", "Metabolites", "for", "liver", "tissue", "(", "4", ",", "5", ",", "and", "7–9);No", "metabolite", "in", "mammary", "tissueARQ", "501", "(", "synthetic", "β-lapachone)In", "vitroMouse", ",", "rat", ",", "dog", ",", "monkey", ",", "human", "whole", "blood", "–", "UPLC-QTOF-MS", ",", "HPLC-MS-ARC4", "Metabolites", "for", "mouse", "and", "rat", "(", "M1", ",", "M2", ",", "M3", ",", "M5);5", "Metabolites", "for", "dog", "(", "M1", ",", "M2", ",", "M3", ",", "M5", ",", "unidentified", "metabolite);5", "Metabolites", "for", "monkey", "(", "M1", ",", "M2", ",", "M3", ",", "M5", ",", "M6);6", "Metabolites", "for", "human", "(", "M1", ",", "M2", ",", "M3", ",", "M4", ",", "M5", ",", "M6);ARQ", "501", "disappeared", "after", "60", "min", "of", "incubation", "in", "human", "whole", "bloodOxidation", "(M1);Adding", "2", "oxygen", "and", "2", "hydrogen", "atoms", "(M2);Adding", "1", "oxygen", "and", "2", "hydrogen", "atoms", "(M3);Loss", "of", "1", "carbon", "atom", "(", "M4", "and", "M6);Loss", "of", "CO", "group", "(M5)Not", "evaluatedARQ", "501", "(", "synthetic", "β-lapachone)In", "vivoMice", "(", "IP", ":", "40", "mg/kg", ")", ",", "rats", "(", "IV", ":", "40", "mg/kg)PlasmaLC-QTOF-MS", ",", "HPLC-QqQ-MS3", "Metabolites", "for", "all", "speciesGlucosylation", "+", "sulfation;Glucuronidation;SulfationNot", "evaluatedClinical", "trialCancer", "patients", "(", "140", "mg/m)3", "MetabolitesCabazitaxelPhase", "I", "clinical", "trialAdvanced", "solid", "tumor", "patients", "(", "IV", ":", "25", "mg/m", "of", "[C]-cabazitaxel", "(", "50", "muCi", ",", "1.85", "MBq", "of", "[C]-cabazitaxel))Plasma", ",", "urine", ",", "fecesHPLC-RD-MS6", "Metabolites", "in", "plasma", "(", "Major", ":", "RPR123142);10", "Metabolites", "in", "urine", "(", "Major", ":", "M09b);13", "Metabolites", "in", "feces", "(", "Major", ":", "RPR104943", ",", "RPR104952", ",", "RPR111026", ",", "RPR111059)7-O-demethylation", "+", "10-O-demethylation", "+", "hydroxylation", "(RPR104952);10-O-demethylation", "(RPR123142);7-O-demethylation", "+", "10-O-demethylation", "+", "di-hydroxylation", "(M09b);7-O-demethylation", "+", "di-hydroxylation", "+", "10-O-demethylation", "(", "RPR111026", ",", "RPR111059);7-O-demethylation", "+", "di-hydroxylation", "+", "10-O-demethylation", "+", "hydroxylation", "(RPR104943);Cleavage", "is", "minor", "pathway", "plasma", "and", "urineNot", "evaluatedCapecitabineIn", "vivoMale", "Wistar", "rats", "(", "PO", ":", "80", "mg/kg)Bile", ",", "urine", ",", "liver", ",", "kidneysHPLC-TIS-MS/MS", ",", "F-NMR", "and", "H-NMR3", "Metabolites", "for", "liver", "(", "5ʹ-deoxy-5-fluorocytidine", ",", "α-Fluoro-β-alanine", ",", "2ʹ-(β-D-glucuronic", "acid)-5ʹ-deoxy-5-fluorocytidine);2", "Metabolites", "for", "bile", "(", "5ʹ-deoxy-5-fluorocytidine", ",", "2ʹ-(β-D-glucuronic", "acid)–5ʹ-deoxy-5-fluorocytidine);2", "Metabolites", "for", "kidney", "(", "5ʹ-deoxy-5-fluorocytidine", ",", "α-Fluoro-β-alanine);4", "Metabolites", "for", "urine", "(", "5ʹ-deoxy-5-fluorouridine", ",", "5.6-Dihydro-5-fluorouracil", ",", "α-Fluoro-β-alanine", ",", "5ʹ-deoxy-5-fluorocytidine)Glucuronidation", "(", "2ʹ-(β-D-glucuronic", "acid)-5ʹ-deoxy-5-fluorocytidine);Not", "identified", "(", "5ʹ-deoxy-5-fluorocytidine", ",", "α-fluoro-β-alanine", ",", "5ʹ-deoxy-5-fluorouridine", ",", "5.6-Dihydro-5-fluorouracil)Not", "evaluatedCarbendazim", "(", "2-benzimidazolecarbamic", "acid", "methyl", "ester)In", "vitroRLM", ",", "HLM", "–", "HPLC-ESI-MS1", "Metabolite", "(", "5(6)-", "or", "4(7)-hydroxyl", "carbendazim)OxidationNot", "evaluatedIn", "vivoRats", "(", "PO", ":", "1000", "mg/kg)Serum1", "Metabolite", "(2-aminobenzimidazole)HydrolysisCI941", "(losoxantrone)In", "vitroRat", "hepatocyte", ",", "human", "hepatoblastoma", "(", "HepG2", ")", "cell", "lines", "–", "HPLC-UV", ",", "HPLC-QqQ-MS", ",", "H-NMR12", "Metabolites", "(", "M2-M13", ")", "for", "rat", "hepatocyte;No", "metabolite", "in", "HepG2Hydroxylation", "(", "M2", ",", "M3);Hydroxylation", "+", "oxidation", "(M8);Hydroxylation", "+", "oxidation", "+", "glutathione", "conjugation", "(M10);Hydroxylation+", "glucuronidation", "(", "M4", ",", "M9);Hydroxylation", "+", "sulfation", "(M5-M7);Oxidation", "(M11-M13)Not", "evaluatedCisplatinIn", "vivoMale", "Sprague-Dawley", "rats", "(", "IV", ":", "3mg/kg)Kidney", "tissueHPLC-ESI-QTOF-MS31", "Metabolites", "(M1-M31)Hydration", "(M1);Hydroxylation", "(M4);Dihydroxylation", "(M3);Methionine", "conjugation", "(M5);Di-methionine", "conjugation", "(", "M15", ",", "M29);Cysteine", "conjugation", "(", "M7", ",", "M8);Di-cysteine", "conjugation", "(", "M16", ",", "M31);Chlorination", "(", "M24", ",", "M26);Acetylcysteine", "conjugation", "(", "M9", ",", "M10);Di-acetylcysteine", "conjugation", "(M17);Glutathione", "conjugation", "(M11);Thioether", "conjugation", "(M13);Hydration+", "hydroxylation", "(M2);Methionine", "conjugation", "+", "hydroxylation", "(M6);Methionine", "conjugation", "+", "chelation", "(", "M18", ",", "M20", ",", "M25);Methionine", "conjugation", "+", "chelation", "+", "hydroxylation", "(M19);Cysteine", "conjugation+", "chelation", "(", "M21", ",", "M23", ",", "M27", ",", "M28", ",", "M30);Cysteine", "conjugation+", "chelation", "+", "hydroxylation", "(M22);Glutathione", "conjugation", "+", "hydroxylation", "(M12);Thioether", "conjugation", "+", "hydroxylation", "(M14)Not", "evaluatedCP-31398", "(", "N’-[2-[2-(4-methoxyphenyl)ethenyl)-4-quinazolinyl]-N", ",", "N-dimethyl-1,3-propanediaminedihydrochloride)In", "vivoMale", "and", "Female", "CD", "rats", "(", "PO", ":", "0", ",", "240", ",", "480", ",", "or", "960", "mg/m/day", ")", "and", "beagle", "dogs", "(", "0", ",", "200", ",", "400", ",", "or", "800", "mg/m/day)PlasmaHPLC-QTOF-MS4", "Metabolites", "for", "rat", "(", "II", ":", "hydroxy", "CP-31398", ",", "III", ":", "O-demethyl", "CP-31398", ",", "IV", ":", "N-demethyl", "CP-31398", ",", "V", ":", "hydroxy", "O-demethyl", "CP-31398);4", "Metabolites", "for", "dog", "(", "II", ":", "hydroxy", "CP-31398", ",", "III", ":", "O-demethyl", "CP-31398", ",", "IV", ":", "N-demethyl", "CP-31398", ",", "VI", ":", "di-demethyl", "CP-31398)Hydroxylation", "(", "hydroxy", "CP-31398);O-demethylation", "(", "O-demethyl", "CP-31398);N-demethylation", "(", "N-demethyl", "CP-31398);Hydroxylation", "+", "O-demethylation", "(", "hydroxy", "O-demethyl", "CP-31398);Di-demethylation", "(", "di-demethyl", "CP-31398)Not", "evaluatedCPA", "(", "Cyproterone", "acetate)In", "vivoFemale", "Wistar-Han", "rats", "(", "PO", ":", "50", "mg/kg", "[", "H", "]", "CPA", "(", "0.42", "MBq/mg))BileHPLC-MS", ",", "GC-MS", ",", "H-NMR2", "Metabolites", "(", "M1", ":", "3α-OH-CPA", "and", "M2)Sulfation", "and/or", "Glucuronidation3α-OH-CPA", "covalently", "bound", "to", "guanine", "which", "might", "be", "the", "major", "adduct", "formed", "of", "CPACrisnatolIn", "vitroHuman", "hepatoma", "(", "Hep", "G2", ")", "cells", ",", "HLM", "–", "GC-MS", ",", "H-NMR3", "Metabolites", "for", "Hep", "G2", "(", "M1", "and", "M2", ":", "isomeric", "crisnatol", "dihydrodiol", "and", "M3", ":", "crisnatol", "1,2-dihydrodiol);2", "Metabolites", "for", "HLM", "(", "M4", ":", "crisnatol", "1,2-dihydrodiol", "and", "M5", ":", "1-hydroxycrisnatol)Di-hydroxylation", "+", "di-hydrogenation", "(", "M3", ",", "M4);Hydroxylation", "(M5)Not", "evaluatedCyclophosphamideClinical", "trialCancer", "patients", "(", "60", "mg/kg)Plasma", ",", "urineGC-MS1", "Active", "metabolite", "for", "both", "samples", "(", "N", ",", "N-bis(2-chloroethyl", ")", "phosphorodiamidic", "acid)Not", "identifiedNot", "evaluatedDFS", "(", "Trans-2,6-difluoro-4ʹ-(N", ",", "N)-dimethylamino", ")", "stilbene", ":", "Stilbene", "analog)In", "vitroPooled", "MLM", ",", "RLM", ",", "HLM", "–", "HPLC-ESI-MS/MS10", "Metabolites", "for", "MLM", "(M1", "-", "10);7", "Metabolites", "for", "RLM", "(", "M1", ",", "M3", "-", "6", ",", "M9", "-", "10);6", "Metabolites", "for", "HLM", "(", "M1", "-", "3", ",", "M5", ",", "M7", ",", "M10)Demethylation", "(M1);Oxidation", "(M2-M4);Demethylation", "+", "Oxidation", "(M5);Oxidation", "+", "Defluorination", "(", "M6", ",", "M7);Bisoxidation", "(", "M8", ",", "M9);Isomerization", "(M10)Not", "evaluated5ʹ-dFUR", "(5ʹ-deoxy-5-fluorouridine)In", "vivoCancer", "patients", "(", "IV", ":", "4", "g/m)PlasmaGC-MS3", "Metabolites", "(", "N-Methylated-5ʹ-dFUR", ",", "5-fluorouracil", ",", "and", "5,6-dihydro-5-fluorouracil)Methylation", "(N-Methylated-5ʹ-dFUR);Not", "identified", "(", "5-fluorouracil", ",", "and", "5,6-dihydro-5-fluorouracil)Not", "evaluated5ʹ-dFUrd", "(5ʹ-deoxy-5-fluorouridine)Clinical", "trialCancer", "patients", "(", "IV", ":", "10", "g/m)Blood", ",", "plasma", ",", "urineF-NMR4", "Metabolites", "in", "blood", "and", "plasma", "(", "5-fluorouracil", ",", "α-fluoro-β-ureidopropionic", "acid", ",", "α-fluoro-β-alanine", ",", "5,6-dihydrofluorouracil);3", "Metabolites", "in", "urine", "(", "5-fluorouracil", ",", "α-fluoro-β-ureidopropionic", "acid", ",", "α-fiuoro-β-alanine)Not", "identifiedNot", "evaluatedEAPB0203In", "vitroPooled", "RLM", ",", "DLM", "–", "HPLC-MS/MS", "(", "QqQ", "and", "QTOF),H-NMR", ",", "C-NMR4", "Metabolites", "for", "DLM", "(", "EAPB0202", ",", "M7", ",", "M2", ",", "and", "M1);6", "Metabolites", "for", "RLM", "(", "EAPB0202", ",", "M7", ",", "M6", ",", "M3", ",", "M2", ",", "M1)Hydroxylation", "(", "M1-M3", ",", "M6", ",", "M7);Demethylation", "(EAPB0202)Not", "evaluatedEAPB0503", "(", "imiquimod", "analogs", ")", "and", "EAPB0502", "(", "M", "’", "7", ")", "and", "EAPB0603", "(", "M’5", ")", "(", "active", "metabolites", "of", "EAPB0503)In", "vitroMLM", ",", "RLM", ",", "DLM", ",", "HLM;Rat", ",", "dog", ",", "and", "human", "hepatocyte", "–", "LC-ESI-MS/MSEAPB0503:6", "Metabolites", "for", "MLM", "(M’2-M’7);4", "Metabolites", "for", "RLM", "(", "M’2", ",", "M’4", ",", "M’5", ",", "M’7);7", "Metabolites", "for", "DLM", "(M’1-M’7);4", "Metabolites", "for", "HLM", "(", "M’2", ",", "M’4", ",", "M’5", ",", "M’7);4", "Metabolites", "for", "rat", "hepatocyte", "(", "M’2", ",", "M’4", ",", "M’5", ",", "and", "M’7);5", "Metabolites", "for", "dog", "hepatocyte", "(", "M’1", ",", "M’2", ",", "M’4", ",", "M’6", ",", "M’7);4", "Metabolites", "for", "human", "hepatocyte", "(", "M’2", ",", "M’4", ",", "M’5", ",", "M’7)EAPB0502:2", "Metabolites", "for", "MLM", "(", "M’2", "and", "M’3);2", "Metabolites", "for", "RLM", "(", "M’2", "and", "M’3);2", "Metabolites", "for", "DLM", "(", "M’2", "and", "M’3);1", "Metabolite", "for", "HLM", "(M’2);1", "Metabolite", "for", "rat", "hepatocyte", "(M’3)EAPB0603:2", "Metabolites", "for", "MLM", "(", "M’1", ",", "M’2);1", "Metabolite", "for", "RLM", "(M’2);2", "Metabolites", "for", "DLM", "(", "M’1", ",", "M’2);1", "Metabolite", "for", "HLM", "(M’2);1", "Metabolite", "for", "dog", "hepatocyte", "(M’1)O-demethylation", "(M’5);N-demethylation", "(", "M’7", ")", ";", "Hydroxylation", "(", "M’4", ",", "M’6);O-", "and", "N-demethylation", "(M’2);N-demethylation", "+", "hydroxylation", "(M’3);Hydroxylation", "+", "O-demethylation", "(M’1)Not", "evaluatedE-DE-BPH", "(", "E-3,4-bis", "(", "4-Ethylphenyl", ")", "hex-3-ene", ":", "stilbene", "derivatives)In", "vitroRLM", "(", "Aroclor", "1254-treated", ")", ",", "PLM", "–", "HPLC-UV", ",", "GC-MS", ",", "GC-IR5", "Metabolites", "for", "Aroclor", "1254-treated", "RLM", "(", "M1", ":", "3,4-bis(4-(1-hydroxyethyl", ")", "phenyl", ")", "hex-3-ene", ",", "M2", ":", "E-3-(4-acetylphenyl)-4-(4-(1-hydroxyethyl", ")", "phenyl", ")", "hex-3-ene", ",", "M3", ":", "E-3,4-bis(4-acetylphenyl", ")", "hex-3-ene", ",", "M4", ":", "E-3-(4-(1-hydroxyethyl", ")", "phenyl)-4-(4-ethylphenyl", ")", "hex-3-ene", ",", "M5", ":", "E-3-(4-acetylphenyl)-4-", "(", "4-ethylphenyl", ")", "hex-3-ene);4", "Metabolites", "for", "PLM", "(", "M1", ",", "M2", ",", "M4", ",", "M5)Hydroxylation", "(M4);Hydroxylation", "+", "oxidation", "(M5);Di-hydroxylation", "(M1);Hydroxylation", "+", "oxidation", "+", "hydroxylation", "or", "di-hydroxylation", "+", "oxidation", "(M2);Hydroxylation", "+", "oxidation", "+", "hydroxylation", "+", "oxidation", "or", "di-hydroxylation", "+", "di-oxidation", "(M3)Not", "evaluated2-F-araA", "(9-β-D-arabinofuranosyl-2-fluoroadenine)In", "vivoMale", "BDF1", "mice", "(", "IV", ":", "400", "mg/m", ")", ",", "female", "beagle", "dog", "(", "IV", ":", "400", "mg/m", ")", ",", "female", "rhesus", "monkey", "(", "IV", ":", "400", "mg/m)Urine", ",", "bloodHPLC-MS1", "Metabolite", "detected", "in", "dog", "blood", "(", "9-β-D-arabinofuranosyl", "hypoxanthine", ":", "2-F-araH);2", "Metabolites", "for", "urine", "of", "all", "species", "(", "2-fluoroadenine", ":", "2-F-ad", ",", "2-F-araH)Not", "identified2-F-araH", ":", "no", "antitumor", "activity", ",", "no", "toxicity", "in", "BDF1", "mice", "bearing", "L1210", "leukemia", "cells", "at", "200", "mg/kg", "(", "IP", ")", "for", "9", "daysFlutamideIn", "vitroMale", "human", ",", "male", "dog", ",", "and", "male", "rat", "liver", "microsomesMale", "pig", "liver", "and", "prostate", "microsomes", "–", "LC-ESI-QTOF-MSLiver", "microsomes:1", "Metabolites", "for", "human", "(OH-Flu);4", "Metabolites", "for", "dog", "(", "Flu-1", ",", "OH-Flu", "(", "2", "isoforms", ")", ",", "M1", ",", "M3);4", "Metabolites", "for", "rat", "(", "Flu-1", ",", "OH-Flu", "(", "3", "isoforms", ")", ",", "M1", ",", "M3", "(", "2", "isoforms));4", "Metabolites", "for", "pig", "(", "Flu-1", ",", "OH-Flu", "(", "2", "isoforms", ")", ",", "M1", ",", "M3)Prostate", "microsomes:2", "Metabolites", "for", "pig", "(", "OH-Flu", ",", "Flu-5)Monohydroxylation", "(OH-Flu);Di-hydroxylation", "(M1);Tri-hydroxylation", "(M3);Sulfation", "(", "Flu-3", "sulfate);Glucuronidation", "(", "Flu-3", "glucuronide);Hydroxylation", "+", "mercapturic", "acid", "conjugation", "(", "hydroxyflutamide", "mercapturic", "acid);Hydroxylation", "+", "glucuronidation", "(", "hydroxyflutamide", "glucuronide", ")", ";", "Di-hydroxylation", "+", "glucuronidation", "(", "M1", "glucuronide)Formation", "of", "a", "mercapturic", "acid", "conjugate", "from", "flutamide", "in", "human", "urine", ",", "suggesting", "that", "thereported", "liver", "effects", "of", "flutamide", "are", "due", "to", "the", "molecular", "mechanismcaused", "by", "a", "reactive", "intermediateIn", "vivoProstate", "cancer", "patients", ")", "(", "Oral", ":", "250", "mg", "BID)Urine10", "Metabolites", "(", "Flu-1", ",", "Flu-3", ",", "Flu-3", "sulfate", ",", "Flu-3", "glucuronide", ",", "OH-Flu", ",", "M1", ",", "M3", ",", "hydroxyflutamide", "mercapturic", "acid", ",", "hydroxyflutamide", "glucuronide", ",", "M1", "glucuronide)4-HydroxyanisoleIn", "vivoMalignant", "melanoma", "patients", "(", "IA", ":", "80", "g)UrineGC-MS4", "Metabolites", "(", "1", ":", "hydroquinone", ",", "3", ":", "3.4-dihydroxyanisole", ",", "4", ":", "3-methoxy-4-hydroxyanisol", ",", "and", "5", ":", "4-hydroxy-3-methoxyanisole)Methylated", "metabolites", "might", "be", "conjugated", "with", "glucuronic", "acid", "or", "sulphatesNot", "evaluatedIrinotecanIn", "vitroHLM", ",", "recombinant", "CYP", "enzymes", "(", "1A1", ",", "1A2", ",", "2C8", ",", "2C9", ",", "3A4", ",", "3A5", ",", "and", "3A7)–HPLC-Spectro-fluorometry", ",", "HPLC-MS4", "Metabolites", "for", "cells", "expressing", "CYP3A4", "(", "M1", ",", "NPC", ",", "M2", ",", "APC);5", "Metabolites", "for", "microsomes", "containing", "CYP3A4", "and", "CYP3A5", "(", "M1", ",", "NPC", ",", "M2", ",", "APC", ",", "M4);1", "Metabolite", "for", "cells", "expressing", "CYP3A5", "(M4);No", "metabolite", "for", "cells", "expressing", "CYP2C8", ",", "CYP2C9", ",", "CYP1A1", ",", "CYP1A2", ",", "and", "CYP3A7Mono-hydroxylation", "(", "M1", ",", "M2);Loss", "of", "terminal", "piperidine", "(NPC);Di-oxidation", "(APC);De-ethylation", "(M4)Not", "evaluatedPhase", "I", "and", "II", "clinical", "trialsCavum", "carcinoma", "patient", "(", "IV", ":", "300", "mg/m", ")", ",", "brain", "tumor", "patient", "(", "600", "mg/m", ")", ",", "glioblastoma", "patients", "(", "350", "mg/m)Urine7", "Metabolites", "(", "SN-38-G", ",", "M1", ",", "NPC", ",", "M2", ",", "M3", ",", "APC", ",", "SN-38)IxabepiloneClinical", "trialCancer", "patients", "(", "IV", ":", "70", "mg", ";", "80", "nCi)Plasma", ",", "urine", ",", "fecesHPLC-AMS", ",", "LC-MS3", "Degradants", "and", "4", "metabolites", "for", "plasma", "and", "urine", "(", "Deg-1–Deg-3", ",", "M8", ",", "M16", ",", "M19", ",", "M41);3", "Degradants", "and", "3", "metabolites", "for", "feces", "(", "Deg-1–Deg-3", ",", "M8", ",", "M19", ",", "M41)Dehydration", "(Deg-1-Deg-3);Dehydration", "+", "oxygenation", "(M41);Hydroxylation", "(M8);Oxygenation", "+", "dehydrogenation", "(M16);Oxygenation", "+", "dehydration", "(M19)Not", "evaluatedJM216", "(", "bis", "(", "acetato", ")", "ammine-dichloro", "(cyclohexylamine)Platinum", "(IV))Phase", "I", "clinical", "trialCancer", "patients", "(", "PO", ":", "120", ",", "200", ",", "300", ",", "420", ",", "540", "mg/m)PlasmaHPLC-MS6", "Platinum", "metabolites", "(", "A", ",", "JM383", ",", "JM559", ",", "D", ",", "JM118", ",", "F)Hydrolysis", "+", "declorination", "(", "JM518", ",", "JM559);Di-hydrolysis", "+", "di-declorination", "(JM383);Hydrolysis", "+", "declorination", "+", "reduction", "+", "clorination", "(JM118);Hydrolysis", "+", "declorination", "+", "reduction", "+", "glutathione", "conjugation", "+", "methylation", "(A)JM118", ":", "higher", "cytotoxic", "activity", "against", "8", "human", "ovarian", "carcinoma", "cell", "lines", "(", "HX", "62", ",", "SKOV-3", ",", "CH1", ",", "CH1", "CISR", ",", "41", "M", ",", "41", "M", "CISR", ",", "A2780", "A2780", "CISR", ")", "compared", "to", "JM216", "and", "cisplatinJM518", "and", "JM383", ":", "similar", "and", "less", "cytotoxic", "activity", "to", "JM216In", "vitroHuman", "plasmaPlasma5", "Platinum", "metabolites", "(", "A", ",", "JM383", ",", "JM559", ",", "JM518", ",", "JM118)K02", "(Morpholine-urea-Phe-Hphe-vinylsulfone)In", "vitroHLM", ",", "cDNA-expressed", "CYP3A4–HPLC-UV", ",", "LC-MS3", "Major", "metabolites", "for", "both", "(", "M12", ",", "M19", ",", "M20)HydroxylationNot", "evaluatedLaromustineIn", "vitroRLM", ",", "DLM", ",", "HLM", ",", "MLM", "–", "HPLC-RD7", "Similar", "metabolites", "for", "all", "species", "but", "in", "different", "quantity", "(", "C1-C7", ":", "C4", "=", "major", "metabolite)Demethylsufoxidation.;Hydrolysis;OxidationNot", "evaluated2-MethoxyestradiolIn", "vitroPooled", "HLM", "–", "HPLC", ",", "HPLC-QqQ", "-MS4", "Phase", "I", "metabolites", "(", "A", ",", "B", ",", "C", ",", "D);2", "Phase", "II", "metabolites", "(", "G1", ",", "G2)Hydroxylation", "(", "A", ",", "B", ",", "C", ",", "D);Glucuronidation", "(", "G1", ",", "G2)Not", "evaluatedIn", "vivoCancer", "patients", "(", "PO", ":", "800", "mg", "or", "2200", "mg", "BID)Urine2", "Phase", "II", "metabolites", "(", "G1", ",", "G2)Glucuronidation", "(", "G1", ",", "G2)Mitomycin", "CIn", "vivoMurine", "adenocarcinomas", "of", "the", "colon", ",", "MAC", "16", "(", "high", "DT-diaphorase", "activity", ")", "andMAC", "26", "(", "low", "DT-diaphorase", "activity", ")", "bearing", "mice", "(", "Intra", "tumor", ":", "500", "µg)TumorHPLC-UV4", "Metabolites", "(", "trans-hydro", ",", "cis-hydro", ",", "2,7-diaminomitosene", "(", "2,7-DM", ")", ",", "decarbamoyl", "2,7-DM)Hydrolysis", "(", "trans-hydro", ",", "cis-hydro);Reduction", "(2,7-DM);Reduction", "+", "decarbamoyl", "(", "decarbamoyl", "2,7-DM)Not", "evaluatedNB-506", "(", "6-N-formylamino-12,13-dihydro-1,11-dihydroxy-13-(b-D-glucopyranosil", ")", "5H-indolo", "[", "2,3-a", "]", "pyrrolo", "[", "3,4-c", "]", "carbazole-5,7(6H)-dione)In", "vivoMale", "Sprague-Dawley", "rat", "(", "IV", ":", "187.5", "mg/m", "of", "[", "C", "]", "NB-506", "(", "1.85", "MBq/kg))BileHPLC-RD-MS", ",", "H", "NMR", ",", "C", "NMR3", "Metabolites", "(", "RBM-1", ",", "RBM-2", ",", "ED501)Deformyl", "metabolite", "(ED501);O-glucuronidation", "(RBM-1);ED501", "+", "glucuronidation", "(RBM-2)Not", "evaluated9NC", "(", "9-nitro-20(S)-camptothecin)In", "vivoWistar", "rats", "(", "IV", ":", "8", "mg/kg)Bile", ",", "urine", ",", "fecesLC-IT-MS", ",", "LC-QTOF-MS", "(", "M2", ",", "M5", "and", "M7", ")", ",", "H", "NMR5", "Metabolites", "for", "bile", "(", "M1", ",", "M2", ",", "M3", ":", "9-AC", ",", "M4", ":", "9-AA-CPT", ",", "M5);3", "Metabolites", "for", "urine", "(", "M1", ",", "M3", ",", "M6);3", "Metabolites", "for", "feces", "(", "M4", ",", "M6", ",", "M7", ":", "9-OH-CPT)Glucuronidation", "of", "9-OH-CPT", "(M1);Loss", "of", "glutamic", "acid", "from", "M5", "(M2);Reduction", "(M3);Acetylation", "(M4);Glutathione", "conjugate", "of", "10-OH-CPT", "(M5);Mercapturic", "acid", "conjugate", "of", "10-OH-CPT", "(M6);Aglycone", "of", "M1", "(M7)Not", "evaluatedNSC", "141549", "(", "4ʹ-(9-Acridinylamino", ")", "methanesulfon-m-a", "nisidide", "(", "m", "-AMSA))In", "vivoMale", "Sprague-Dawley", "rats", "(", "IV", ":", "60", "mg/kg", "and", "IP", ":", "40", "mg/kg)Plasma", "(", "IV", ")", ",", "bile", "(IP)HPLC-MS1", "Major", "metabolite", "for", "plasma", "(4-amino-3-methoxymethanesulfonanilide);1", "Major", "metabolite", "for", "bile", "(", "9-acridinyl", "thioether", "of", "glutathione)Methoxylation", "(", "4-amino-3-methoxy", "methanesulfonanilide);Glutathione", "conjugation", "(", "9-acridinyl", "thioether", "of", "glutathione)Not", "evaluatedNSC", "652287", "(", "2,5-bis(5-hydroxymethyl-2-thienyl", ")", "furan)In", "vitroDog", "liver", "S9", "fraction", "–", "GC-MS1", "Major", "metaboliteMethylation", "or", "oxidationNot", "evaluatedNSC", "674495", "(", "2-(4-Amino-3-methylphenyl", ")", "benzothiazole", ":", "DF", "203)In", "vitroBreast", "cancer", "cell", "lines", "(", "MCF-7", ",", "T-47D", ",", "and", "MDA-MB-435", ")", "and", "renal", "cancer", "celllines", "(", "TK-10", ",", "A498", ",", "and", "CAKI-1)–HPLC-spectro-fluorometry", ",", "H", "NMR1", "Major", "metabolite", "for", "sensitive", "cell", "lines", "(", "T-47D", ",", "MDA-MB-435", "):", "(", "6c", ":", "2-(4-amino-3-methylphenyl)-6", "hydroxybenzothiazole)Hydroxylation6c", ":", "low", "anti-cancer", "activity", "against", "MCF-7", "cell", "lines", "(", "IC50>100", "M)PAC-1", "(4-benzyl-piperazin-1-yl)-acetic", "acid", "(", "3-allyl-2-", "Hydroxy-benzylidene)-hydrazineIn", "vivoMale", "Wistar", "rats", "(", "PO", ":", "50", "mg/kg)Urine", ",", "feces", ",", "bileHPLC-QTOF-MS", ",", "HPLC-IT-MS14", "Metabolites", "for", "urine", "(", "M1-M7", ",", "M9-M11", ",", "M13-M16);3", "Metabolites", "for", "feces", "(", "M1", ",", "M6", ",", "M13);4", "Metabolites", "for", "bile", "(", "M4", ",", "M13", ",", "M14", ",", "M16)Debenzylation", "(M1);Hydroxylation", "(M2-M6);Dihydroxylation", "(M8–M12);Carboxylation", "(M7);Dihydrodiol", "formation", "(M13);Glucuronidation", "(M14);Hydroxylation", "+", "glucuronidation", "(M15-M16)Not", "evaluatedIn", "vitroRLM–12", "metabolites", "(", "M1-M6", ",", "M8-M13)PaclitaxelIn", "vivoOvarian", "carcinoma", "patients", "(", "IV", ":", "135", "mg/m)Plasma", ",", "urineHPLC-MS2", "Metabolites", "for", "plasma", "(", "P1", ":", "6α-hydroxypaclitaxel", ",", "P3", ":", "7-epipaclitaxel);3", "Metabolites", "for", "urine", "(", "U1", ":", "6α-hydroxypaclitaxel", ",", "U2", ":", "10-deacetylpaclitaxel", ",", "U4", ":", "7-epipaclitaxel)Not", "identifiedNot", "evaluatedPaclitaxelIn", "vitroLiver", "microsomes", "from", ":", "Sprague-Dawley", "&", "hairless", "rats", "(", "males", ",", "females", ")", ",", "BALB/c", "&", "OF1", "mice", "(", "males", ",", "females", ")", ",", "male", "guinea-pigs", ",", "male", "rabbits", ",", "male", "dogs", ",", "male", "monkeys", ",", "and", "humans", "–", "HPLC-UV1", "Metabolite", "for", "male", "&", "female", "SD", "and", "hairless", "RLM", ",", "male", "&", "female", "BALB/c", "MLM", "(3′p-hydroxypaclitaxel);2", "Metabolites", "for", "male", "&", "female", "OF1", "mice", "&", "male", "rabbits", "(", "6α", "hydroxypaclitaxel", "and", "3′p-hydroxypaclitaxel);2", "Metabolites", "for", "male", "dog", "(", "6α-hydroxypaclitaxel", ",", "6α,3′p-dihydroxypaclitaxel", ")", "liver", "microsomes;3", "Metabolites", "in", "male", "guinea-pigs", ",", "male", "monkey", ",", "human", "liver", "microsomes", "(", "6α-hydroxypaclitaxel", ",", "3′p-hydroxypaclitaxel", ",", "6α,3′p-dihydroxypaclitaxel)Mono-hydroxylation", "(", "3′p-hydroxypaclitaxel", ",", "6α-hydroxypaclitaxel);Di-hydroxylation", "(6α,3′p-dihydroxypaclitaxel)Not", "evaluatedIn", "vivoMale", "Dunkin", "Hartley", "albino", "guinea-pigs", "(", "IV", ":", "6", "mg/kg)Bile2", "metabolites", "(", "M1", ":", "6α", "Hydroxypaclitaxel", ",", "M2", ":", "3'p-Hydroxypaclitaxel)PhenylbutyrateClinical", "trialHuman", "(", "PO", ":", "0.36", "mmol/kg", "(", "5", "g/75", "kg))Plasma", ",", "urineGC-MS3", "Metabolites", "for", "both", "samples", "(", "phenylacetate", ",", "phenylacetylglutamine", ",", "phenylbutyrylglutamine)Not", "identifiedNot", "evaluatedPhyllanthosideIn", "vivoMale", "CDF1", "micePlasmaHPLC-UV1", "Metabolite", "(M)AglyconeM", ":", "anticancer", "activity", "against", "human", "rhabdomyosarcoma", "cell", "lines", "(", "A204", "cell", "lines", ")", "lower", "than", "parent", "compound", "with", "IC50", "of", "24", "µM", "and", "0.47", "nMSepin-1In", "vitroMLM", ",", "RLM", ",", "HLM", "–", "UHPLC-QTOF-MS7", "Metabolites", "for", "all", "species", "(M1-M7)Reduction", "(", "M1", ",", "M2);Dimer", "formation", "(M3-M5);Cysteine", "conjugation", "(M6);Glutathione", "conjugation", "(M7)Not", "evaluatedSN30000", "(", "3-(3-Morpholinopropyl)-7,8-dihydro-6H-indeno[5,6-e", "]", "triazine", "1,4-dioxide", ":", "tirapazamine", "analog)In", "vivoFemale", "NIH-III", "mice", "(", "IP", ":", "186", "mg/kg)Plasma", ",", "liver", ",", "HT29", "tumorLC-MS/MS19", "Metabolites", "for", "plasma", "(M1-M19);16", "Metabolites", "for", "liver", "(", "M3-M7", ",", "M9", ",", "M10-M19);19", "Metabolites", "for", "tumor", "(M1-M19)Reduction;Oxidation;GlucuronidationM14", ":", "acute", "toxicity", "(", "hypothermia", ")", "similarly", "to", "SN30000TamoxifenIn", "vivoAthymic", "mice", "(", "PO", "and", "SC", ":", "200", "mg/kg/day", ",", "50", "mg/kg/day", ",", "and", "12.5", "mg/kg/day", ")", ",", "Breast", "cancer", "patients", "(", "10", "mg", "BID)SerumHPLC-UV2", "Metabolites", "for", "mouse", "serum", "after", "PO", "and", "SC", "of", "200", "mg/kg/day", "and", "50", "mg/kg/day", "and", "patient", "serum", "(", "4-Hydroxytamoxifen", "and", "N-desmethyl", "tamoxifen);Higher", "level", "of", "metabolites", "with", "higher", "dosesHydroxylation", "(4-hydroxytamoxifen);N-demethylation", "(N-desmethyltamoxifen)Not", "evaluatedTamoxifenIn", "vitroHuman", "liver", "homogenate", ",", "human", "hepatoblastoma", "(", "HepG2", ")", "cell", "lines", "–", "LC-ESI-MS6", "Metabolites", "for", "human", "liver", "homogenate", "(", "M1-M5", ",", "M8);4", "Metabolites", "for", "HepG2", "(M2-M5)N-Di-desmethylation", "(M1);N-Desmethylation", "(M4);Hydroxylation", "(", "M2", "and", "M3);N-oxidation", "(M5);N-Desmethylation", "+", "hydroxylation", "(", "M6", ",", "M7);N-oxidation", "+", "hydroxylation", "(M8)Not", "evaluatedIn", "vivoBreast", "cancer", "patients", "(", "PO", ":", "60", "mg", "OD", "or", "30", "mg", "OD", ">", "6", "months)Plasma8", "Metabolites", "(", "M1-M8", ";", "M8", "only", "in", "patients", "who", "received", "long", "term", ">", "6", "months)TamoxifenIn", "vivoFemale", "Rowett", "athymic", "nude", "rats", "(", "PO", ":", "5", "mg/kg/day", "or", "SC", ":", "50", "mg)Serum", ",", "liver", ",", "lung", ",", "retroperitoneal", "adipose", "tissue", ",", "kidneys", ",", "brain", ",", "muscle", ",", "heart", ",", "spleen", ",", "stomach", ",", "small", "intestine", ",", "uterus", "tissues2", "Metabolites", "for", "all", "samples", "except", "adipose", "tissue", "(", "4-Hydroxytamoxifen", ",", "N-Desmethyltamoxifen", ")", "after", "21", "days", "PO;4-Hydroxytamoxifen", "for", "all", "samples", "except", "adipose", "tissue", "and", "uterus", "after", "33", "days", "PO;N-Desmethyltamoxifen", "for", "all", "samples", "except", "adipose", "tissue", "after", "33", "days", "PO;2", "Metabolites", "for", "liver", ",", "lung", ",", "brain", ",", "heart", ",", "and", "kidney", "(", "4-Hydroxy", "tamoxifen", "and", "N-Desmethyltamoxifen", ")", "after", "33", "days", "SC;Level", "of", "metabolites", "detected", "in", "SC", "lower", "than", "POHydroxylation", "(4-Hydroxytamoxifen);Demethylation", "(N-Desmethyltamoxifen)Not", "evaluatedTamoxifenClinical", "trialBreast", "cancer", "patients", "(", "PO", ":", "20–40", "mg/day)PlasmaUHPLC-QqQ-Quantum-MS", "and", "UHPLC-Exactive", "Plus", "Orbitap-MS40", "Metabolites", "(", "1–23", ",", "25–27", ",", "29–36", ",", "38", ",", "39", ",", "42–45)Demethylation", "+", "hydroxylation", "+", "glucuronidation", "(", "1", ",", "9", ",", "13", ",", "19);Hydroxylation", "+", "glucuronidation", "(", "2", ",", "11", ",", "15", ",", "18);Carboxylation", "+", "glucuronidation", "(3);Di-hydroxylation", "+", "oxidation", "+", "glucuronidation", "(", "4", ",", "21);Di-methylation", "+", "tetra-hydroxylation", "+", "glucosylation", "(5);Demethylation", "+", "carboxylation", "(6);Di-hydrodiol", "(7);Carboxylation", "(8);Demethylation", "+", "hydroxylation", "(", "10", ",", "25", ",", "27.32", ",", "44);Hydroxylation", "(", "12", ",", "29", ",", "30", ",", "33);Hydroxylation", "+", "carboxylation", "(14);Di-hydroxylation", "(", "16", ",", "17", ",", "31", ")", ";", "Hydroxylation", "+", "sulfation", "(20);Di-demethylation", "+", "tri-hydroxylation", "+", "glucoside", "(22,26);Di-demethylation", "+", "hydroxylation", "(23);E-tamoxifen", "(34);Di-demethylation", "(35);Demethylation", "+", "desaturation", "(36);N-demethylation", "(38);Desaturation", "(39);Hydroxylation", "+", "desaturation", "(", "42", ",", "45);Adding", "NO", "molecule", "(43)Not", "evaluatedTAS-102", "(", "tipiracil", "hydrochloride", "(", "TPI", ")", "+", "trifluridine", "(FTD))Clinical", "trialAdvanced", "solid", "tumor", "patients", "(", "PO", ":", "1000", "nCi", "of", "[C]-TPI)Plasma", ",", "urine", ",", "fecesHPLC-QqQ-MS1", "Major", "metabolite", "for", "plasma", ",", "urine", ",", "and", "feces", "(", "6-hydroxyme-thyluracil", "(6-HMU))Not", "identifiedNot", "evaluatedAdvanced", "solid", "tumor", "patients", "(", "PO", ":", "200", "nCi", "of", "[C]-FTD)1", "Major", "metabolites", "for", "plasma", "(", "Trifluoromethyluracil", "(FTY));3", "Major", "metabolites", "for", "urine", "(", "FTY", ",", "FTD", "Glu", "U3", ",", "FTD", "Glu", "U4)Glucuronidation", "(", "FTD", "Glu", "U3", "and", "FTD", "Glu", "U4);Unidentified", "(FTY)TNP-470", "(", "O-(chloroacetyl-carbamoyl", ")", "fumagillol)In", "vitroHuman", "hepatocyte", ",", "human", "liver", ",", "intestinal", ",", "kidney", "microsomes", "–", "HPLC-QqQ-MS6", "Metabolites", "for", "cultured", "human", "hepatocytes", "(", "M1-M6", ":", "M2", "and", "M5", "=", "predominant", "metabolites", "of", "extracellular", "and", "intracellular", ",", "respectively);3", "Metabolites", "for", "HLM", "(", "M1", ",", "M2", ",", "M4);2", "Metabolites", "for", "intestine", "and", "kidney", "microsomes", "(", "M2", ",", "M4)Esterase", "(", "M4", ")", ";", "Esterase", "+", "Epoxide", "hydrolysis", "(M2)Not", "evaluatedTW01003", "(", "(3E,6E)-3-Benzylidene-6-[(5-", "hydroxypyridin-2-yl", ")", "methylene", "]", "piperazine-2,5-dione)In", "vivoPig", "(", "IV", ")", "and", "male", "Wistar", "rats", "(", "IV", ":", "7", "mg/kg", "and", "PO", ":", "36", "mg/kg)Plasma", "(", "rat", ")", "and", "urine", "(pig)HPLC1", "Metabolite", "for", "pig", "urine", "(", "TW-01003", "sulfate);2", "Metabolites", "for", "rat", "plasma", "after", "IV", "(", "TW-01003", "sulfate", "(", "major", ")", ",", "TW-01003", "glucuronide);2", "Metabolites", "after", "PO", "(", "TW-01003", "sulfate", ",", "TW-01003", "glucuronide", "(major))Sulfation", "(", "TW-01003", "sulfate);Glucuronidation", "(", "TW-01003", "glucuronide)Not", "evaluatedAbbreviations", ":", "AMS", ",", "Accelerator", "Mass", "Spectrometry", ";", "ARC", ",", "Accurate", "Radioisotope", "Counting", ";", "DLM", ",", "Dog", "Liver", "Microsome", ";", "ESI", ",", "Electrospray", "Ionization", ";", "GC", ",", "Gas", "Chromatography", ";", "HLM", ",", "Human", "Liver", "Microsome", ";", "HPLC", ",", "High", "Performance", "Liquid", "Chromatography", ";", "IR", ",", "Infrared", "spectroscopy", ";", "IP", ",", "Intraperitoneal", ";", "IT", ",", "Ion", "trap", ";", "IV", ",", "Intravenous", ";", "LC", ",", "Liquid", "Chromatography", ";", "MLM", ",", "Monkey", "Liver", "Microsome", ";", "MS", ",", "Mass", "Spectrometry", ";", "NMR", ",", "Nuclear", "Magnetic", "Resonance", "spectroscopy", ";", "PLM", ",", "Pig", "Liver", "Microsome", ";", "PO", ",", "Per", "oral", ";", "QqQ", ",", "Triple", "quadrupole", ";", "QTOF", ",", "Quadrupole", "Time-of-flight", ";", "RD", ",", "Radio", "Detection", ";", "RLM", ",", "Rat", "Liver", "Microsome", ";", "SC", ",", "Subcutaneous", ";", "TIS", ",", "Turbo", "Ion", "Spray", ";", "UHPLC", ",", "Ultra-High", "Performance", "Liquid", "Chromatography", ";", "UPLC", ",", "Ultra", "Performance", "Liquid", "Chromatography", ";", "UV", ",", "Ultraviolet", "detection", "." ] } ]
PMC11746942
Fig. 5Src mediates S1PR3-induced biphasic STAT3 activation in keratinocytes via Gαi/PKA signaling.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fig.", "5Src", "mediates", "S1PR3-induced", "biphasic", "STAT3", "activation", "in", "keratinocytes", "via", "Gαi/PKA", "signaling", "." ] } ]
PMC11766350
The backbone of this plasmid was then modified by inserting a U6 promoter-driven shRNA expression cassette, containing an anti-gfp shRNA sequence (Figure 1).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "backbone", "of", "this", "plasmid", "was", "then", "modified", "by", "inserting", "a", "U6", "promoter-driven", "shRNA", "expression", "cassette", ",", "containing", "an", "anti-gfp", "shRNA", "sequence", "(", "Figure", "1", ")", "." ] } ]
PMC11371627
There was no myalgia at rest, during or after exercise.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "There", "was", "no", "myalgia", "at", "rest", ",", "during", "or", "after", "exercise", "." ] } ]
PMC8777939
The slides were blocked and incubated with primary antibodies against AGR2 (1: 500, ab76473), CD31 (1: 200, ab76533), cleaved caspase-3 (1: 500, Asp175, 9664), and PCNA (1: 5000, D3H8P, 13110) overnight at 4 °C, followed by incubation with secondary antibodies, namely, goat anti-rabbit IgG-horseradish peroxidase (HRP 1:500; ADI-SAB-100; Enzo Life Sciences, Farmingdale, NY, USA) or goat anti-mouse IgG-HRP (1:500; ADI-SAB-100; Enzo Life Sciences), Alexa Flour 488 goat anti-rabbit IgG (A11008, Invitrogen), and Alexa Flour 647 goat anti-rabbit IgG (A32733, Invitrogen), for 1 h at room temperature.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "slides", "were", "blocked", "and", "incubated", "with", "primary", "antibodies", "against", "AGR2", "(", "1", ":", "500", ",", "ab76473", ")", ",", "CD31", "(", "1", ":", "200", ",", "ab76533", ")", ",", "cleaved", "caspase-3", "(", "1", ":", "500", ",", "Asp175", ",", "9664", ")", ",", "and", "PCNA", "(", "1", ":", "5000", ",", "D3H8P", ",", "13110", ")", "overnight", "at", "4", "°", "C", ",", "followed", "by", "incubation", "with", "secondary", "antibodies", ",", "namely", ",", "goat", "anti-rabbit", "IgG-horseradish", "peroxidase", "(", "HRP", "1:500", ";", "ADI-SAB-100", ";", "Enzo", "Life", "Sciences", ",", "Farmingdale", ",", "NY", ",", "USA", ")", "or", "goat", "anti-mouse", "IgG-HRP", "(", "1:500", ";", "ADI-SAB-100", ";", "Enzo", "Life", "Sciences", ")", ",", "Alexa", "Flour", "488", "goat", "anti-rabbit", "IgG", "(", "A11008", ",", "Invitrogen", ")", ",", "and", "Alexa", "Flour", "647", "goat", "anti-rabbit", "IgG", "(", "A32733", ",", "Invitrogen", ")", ",", "for", "1", "h", "at", "room", "temperature", "." ] } ]
PMC11337594
To gain further insight into the molecular mechanisms underlying these metabolic alterations, we examined the expression of pivotal enzymes involved in the pathway.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "gain", "further", "insight", "into", "the", "molecular", "mechanisms", "underlying", "these", "metabolic", "alterations", ",", "we", "examined", "the", "expression", "of", "pivotal", "enzymes", "involved", "in", "the", "pathway", "." ] } ]
PMC10994876
Furthermore, CHO cells can conduct post-translational modifications (PTM) on proteins derived from human sources (Pieper et al. 2017).
[ { "tags": [ "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "CHO", "cells", "can", "conduct", "post-translational", "modifications", "(", "PTM", ")", "on", "proteins", "derived", "from", "human", "sources", "(", "Pieper", "et", "al.", "2017", ")", "." ] } ]
PMC11127909
However, the cell viability assay revealed that 143BR cells had a higher IC50 than 143B cells (Fig. S2E).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "the", "cell", "viability", "assay", "revealed", "that", "143BR", "cells", "had", "a", "higher", "IC50", "than", "143B", "cells", "(", "Fig.", "S2E", ")", "." ] } ]
PMC8584666
These results suggested that GPI-80 expression was not related to PC3 cell growth.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "results", "suggested", "that", "GPI-80", "expression", "was", "not", "related", "to", "PC3", "cell", "growth", "." ] } ]
PMC11737091
The p values and HRs of statistically significant factors are shown in the forest plot.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "p", "values", "and", "HRs", "of", "statistically", "significant", "factors", "are", "shown", "in", "the", "forest", "plot", "." ] } ]
PMC10936243
All data held locally in Edinburgh were securely destroyed at the completion of the PhD project.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "data", "held", "locally", "in", "Edinburgh", "were", "securely", "destroyed", "at", "the", "completion", "of", "the", "PhD", "project", "." ] } ]
PMC10652261
H and C NMR spectra were recorded on an NMR spectrometer (Bruker, Billerica, MA, USA).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "H", "and", "C", "NMR", "spectra", "were", "recorded", "on", "an", "NMR", "spectrometer", "(", "Bruker", ",", "Billerica", ",", "MA", ",", "USA", ")", "." ] } ]
PMC11705862
We have recently shown that CD59 is present intracellularly in pancreatic β-cells .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "have", "recently", "shown", "that", "CD59", "is", "present", "intracellularly", "in", "pancreatic", "β-cells", "." ] } ]
PMC11534035
Control cells formed colonies with a mean size of 24.49±0.4704 px.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Control", "cells", "formed", "colonies", "with", "a", "mean", "size", "of", "24.49±0.4704", "px", "." ] } ]
PMC11727145
This evokes evidence that the DED is particularly effective for tissue culture experiments, providing an ideal ex vivo environment to study keratinocyte adhesion and proliferation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "evokes", "evidence", "that", "the", "DED", "is", "particularly", "effective", "for", "tissue", "culture", "experiments", ",", "providing", "an", "ideal", "ex", "vivo", "environment", "to", "study", "keratinocyte", "adhesion", "and", "proliferation", "." ] } ]
PMC11680578
Carefully the aqueous phase was removed using a pipette and placed in another 1.5 ml Eppendorf tube.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Carefully", "the", "aqueous", "phase", "was", "removed", "using", "a", "pipette", "and", "placed", "in", "another", "1.5", "ml", "Eppendorf", "tube", "." ] } ]
PMC11474209
Medicines and dietary supplements that target mitochondria and drive cell death may be beneficial for protection .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Medicines", "and", "dietary", "supplements", "that", "target", "mitochondria", "and", "drive", "cell", "death", "may", "be", "beneficial", "for", "protection", "." ] } ]
PMC6450504
The nuclei stained by Hoechst allowed the quantification of total cellular DNA content and, based on nuclear area, single live cells were gated into G1, S, and G2 phases to categorize the cell cycle distribution.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "nuclei", "stained", "by", "Hoechst", "allowed", "the", "quantification", "of", "total", "cellular", "DNA", "content", "and", ",", "based", "on", "nuclear", "area", ",", "single", "live", "cells", "were", "gated", "into", "G1", ",", "S", ",", "and", "G2", "phases", "to", "categorize", "the", "cell", "cycle", "distribution", "." ] } ]
PMC11429241
We designed scaffolds with two different types of architectures to see which one mimicked the ECM better.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "designed", "scaffolds", "with", "two", "different", "types", "of", "architectures", "to", "see", "which", "one", "mimicked", "the", "ECM", "better", "." ] } ]
PMC11519583
not significant, d, f, g: Dunnett’s test, e, h–j: Holm’s test).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "not", "significant", ",", "d", ",", "f", ",", "g", ":", "Dunnett", "’s", "test", ",", "e", ",", "h", "–", "j", ":", "Holm", "’s", "test", ")", "." ] } ]
PMC11792888
According to gene expression analysis , MRC-5 and foreskin fibroblasts showed similar expression of most genes, with only a few being specific to each cell line .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "According", "to", "gene", "expression", "analysis", ",", "MRC-5", "and", "foreskin", "fibroblasts", "showed", "similar", "expression", "of", "most", "genes", ",", "with", "only", "a", "few", "being", "specific", "to", "each", "cell", "line", "." ] } ]
PMC10165258
The cells were cultured in a CO incubator (5% of CO , 37°C, C150, C150), on T-25, 25 cm cell-culture flask (Corning) in 5 mL of high glucose Dulbecco’s modified Eagle’s medium (DMEM + GlutaMAX, ThermoFisher), supplemented using 10% of Fetal Bovin Serum (FBS, ThermoFisher) and 1% of penicillin-streptomycin (ThermoFisher).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cells", "were", "cultured", "in", "a", "CO", "incubator", "(", "5", "%", "of", "CO", ",", "37", "°", "C", ",", "C150", ",", "C150", ")", ",", "on", "T-25", ",", "25", "cm", "cell-culture", "flask", "(", "Corning", ")", "in", "5", "mL", "of", "high", "glucose", "Dulbecco", "’s", "modified", "Eagle", "’s", "medium", "(", "DMEM", "+", "GlutaMAX", ",", "ThermoFisher", ")", ",", "supplemented", "using", "10", "%", "of", "Fetal", "Bovin", "Serum", "(", "FBS", ",", "ThermoFisher", ")", "and", "1", "%", "of", "penicillin-streptomycin", "(", "ThermoFisher", ")", "." ] } ]
PMC11611077
Briefly, SDS-PAGE was performed to CHO cells transfected with His-tagged prestin.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Briefly", ",", "SDS-PAGE", "was", "performed", "to", "CHO", "cells", "transfected", "with", "His-tagged", "prestin", "." ] } ]
PMC10421378
A 1 g sample was placed in each vial and sealed using airtight caps in one of three variants: with atmospheric air, with nitrogen, and under vacuum.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "1", "g", "sample", "was", "placed", "in", "each", "vial", "and", "sealed", "using", "airtight", "caps", "in", "one", "of", "three", "variants", ":", "with", "atmospheric", "air", ",", "with", "nitrogen", ",", "and", "under", "vacuum", "." ] } ]
PMC11451940
SI = the selectivity index expressed as IC50(MRC-5)/IC50(A2780).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "SI", "=", "the", "selectivity", "index", "expressed", "as", "IC50(MRC-5)/IC50(A2780", ")", "." ] } ]
PMC11066331
Fig. 2Expression of TUSC3 was downregulated by shRNA transduced into the SKOV3 cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "Fig.", "2Expression", "of", "TUSC3", "was", "downregulated", "by", "shRNA", "transduced", "into", "the", "SKOV3", "cells", "." ] } ]
PMC9429973
Novel treatments with durable responses and survival benefit are needed.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Novel", "treatments", "with", "durable", "responses", "and", "survival", "benefit", "are", "needed", "." ] } ]
PMC9341513
IGH-CCND1 is a common translocation observed in mantle cell lymphoma (MCL) and multiple myeloma (MM); when translocated together, the IGH super-enhancers drive CCND1 overexpression.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "IGH-CCND1", "is", "a", "common", "translocation", "observed", "in", "mantle", "cell", "lymphoma", "(", "MCL", ")", "and", "multiple", "myeloma", "(", "MM", ")", ";", "when", "translocated", "together", ",", "the", "IGH", "super-enhancers", "drive", "CCND1", "overexpression", "." ] } ]
PMC9429973
Two pts had IPI score 3, one had IPI score 2.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Two", "pts", "had", "IPI", "score", "3", ",", "one", "had", "IPI", "score", "2", "." ] } ]
PMC6160470
are representative of 2 independent experiments performed in duplicates.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "are", "representative", "of", "2", "independent", "experiments", "performed", "in", "duplicates", "." ] } ]
PMC11472639
Indeed, whilst daratumumab therapy combinations prior to a stem cell transplant achieves favourable overall response rates of 93% (Moreau et al., 2019), there is marked heterogeneity in responses.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Indeed", ",", "whilst", "daratumumab", "therapy", "combinations", "prior", "to", "a", "stem", "cell", "transplant", "achieves", "favourable", "overall", "response", "rates", "of", "93", "%", "(", "Moreau", "et", "al.", ",", "2019", ")", ",", "there", "is", "marked", "heterogeneity", "in", "responses", "." ] } ]
PMC11684269
To be precise, in antitumor immunity, canagliflozin could dramatically hinder PD-L1 expression, thus enhancing CD8 T cell-mediated cytotoxicity (121).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "be", "precise", ",", "in", "antitumor", "immunity", ",", "canagliflozin", "could", "dramatically", "hinder", "PD-L1", "expression", ",", "thus", "enhancing", "CD8", "T", "cell-mediated", "cytotoxicity", "(", "121", ")", "." ] } ]
PMC11055510
FISH analysis manifested that circMAN1A2 co-localized with miR-135a-3p in OC cells (Fig. 3G). (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "FISH", "analysis", "manifested", "that", "circMAN1A2", "co-localized", "with", "miR-135a-3p", "in", "OC", "cells", "(", "Fig.", "3", "G", ")", ".", "(" ] } ]
PMC8345486
Cell line authentication involving short tandem repeat profiling (STR) was performed by the European Collection of Authenticated Cell Cultures (ECACC) and Eurofins Genomics Services.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cell", "line", "authentication", "involving", "short", "tandem", "repeat", "profiling", "(", "STR", ")", "was", "performed", "by", "the", "European", "Collection", "of", "Authenticated", "Cell", "Cultures", "(", "ECACC", ")", "and", "Eurofins", "Genomics", "Services", "." ] } ]
PMC11767725
Lipid peroxidation products like malondialdehyde generated under oxidative stress further enhance inflammatory cascades.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Lipid", "peroxidation", "products", "like", "malondialdehyde", "generated", "under", "oxidative", "stress", "further", "enhance", "inflammatory", "cascades", "." ] } ]
PMC9509578
These green synthesized nanomaterials are prepared by using different plant parts, natural compounds, and microorganisms.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "green", "synthesized", "nanomaterials", "are", "prepared", "by", "using", "different", "plant", "parts", ",", "natural", "compounds", ",", "and", "microorganisms", "." ] } ]
PMC11757131
Additionally, the concentrations of unsaturated fatty acids such as C16:1, C18:2, C20:3, and C20:4 in the cells were higher in the 3-HIB-supplemented group compared than in the control group (p < 0.05).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "the", "concentrations", "of", "unsaturated", "fatty", "acids", "such", "as", "C16:1", ",", "C18:2", ",", "C20:3", ",", "and", "C20:4", "in", "the", "cells", "were", "higher", "in", "the", "3-HIB-supplemented", "group", "compared", "than", "in", "the", "control", "group", "(", "p", "<", "0.05", ")", "." ] } ]
PMC11297139
Nuclei were stained with DAPI.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nuclei", "were", "stained", "with", "DAPI", "." ] } ]
PMC10158546
Antibodies: rabbit-anti-NES (1:250, Abcam ab105389), mouse-anti-TUBB3 (1:300, Abcam ab78078), rabbit-anti-GFAP (1:1,000, DAKO Z0334), chicken-anti-PrP (1:300, Abcam ab178545), goat-anti-rabbit-Alexa488 (1:1,000, Abcam ab6150077), goat-anti-mouse-Alexa568 (1:250, ThermoFisher A11004), goat-anti-chicken-Alexa647 (1:250, ThermoFisher A32933).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Antibodies", ":", "rabbit-anti-NES", "(", "1:250", ",", "Abcam", "ab105389", ")", ",", "mouse-anti-TUBB3", "(", "1:300", ",", "Abcam", "ab78078", ")", ",", "rabbit-anti-GFAP", "(", "1:1,000", ",", "DAKO", "Z0334", ")", ",", "chicken-anti-PrP", "(", "1:300", ",", "Abcam", "ab178545", ")", ",", "goat-anti-rabbit-Alexa488", "(", "1:1,000", ",", "Abcam", "ab6150077", ")", ",", "goat-anti-mouse-Alexa568", "(", "1:250", ",", "ThermoFisher", "A11004", ")", ",", "goat-anti-chicken-Alexa647", "(", "1:250", ",", "ThermoFisher", "A32933", ")", "." ] } ]
PMC10243817
However, TGF-β2 has a low affinity for binding to TGF-βR2.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "TGF-β2", "has", "a", "low", "affinity", "for", "binding", "to", "TGF-βR2", "." ] } ]
PMC9429973
Results: The SLR identified 2997 citations, from which 148 studies were selected for investigation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "The", "SLR", "identified", "2997", "citations", ",", "from", "which", "148", "studies", "were", "selected", "for", "investigation", "." ] } ]
PMC11607764
Finally, the intersection of 100 bindings and 50 interacted genes was obtained using the Ugent web tool (https://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Finally", ",", "the", "intersection", "of", "100", "bindings", "and", "50", "interacted", "genes", "was", "obtained", "using", "the", "Ugent", "web", "tool", "(", "https://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Weighted Wald tests and 95% confidence intervals were computed for comparisons of categorical and continuous outcomes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Weighted", "Wald", "tests", "and", "95", "%", "confidence", "intervals", "were", "computed", "for", "comparisons", "of", "categorical", "and", "continuous", "outcomes", "." ] } ]
PMC11678448
Our data further indicate that the JAK-STAT signaling pathway is particularly active in our observations, highlighting its importance in the immune response to P. multocida.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "data", "further", "indicate", "that", "the", "JAK-STAT", "signaling", "pathway", "is", "particularly", "active", "in", "our", "observations", ",", "highlighting", "its", "importance", "in", "the", "immune", "response", "to", "P.", "multocida", "." ] } ]
PMC9429973
The accumulative incidence of III-IV aGVHD and severe cGVHD of patients in the MSCs group significantly decreased, which is 3.1% and 6.3%, while the control group is 25.6% and 18.8% (P=0.0089 and P=0.0260).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "accumulative", "incidence", "of", "III-IV", "aGVHD", "and", "severe", "cGVHD", "of", "patients", "in", "the", "MSCs", "group", "significantly", "decreased", ",", "which", "is", "3.1", "%", "and", "6.3", "%", ",", "while", "the", "control", "group", "is", "25.6", "%", "and", "18.8", "%", "(", "P=0.0089", "and", "P=0.0260", ")", "." ] } ]
PMC9164404
We continued to evaluate the killing effect of Abplatin.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "continued", "to", "evaluate", "the", "killing", "effect", "of", "Abplatin", "." ] } ]
PMC8557138
Elevated expression of angiocrine molecules in the tumor niche is often coupled with the downregulation of anti-angiogenic molecules such as endostatin, matrix metalloproteinases (MMP) inhibitors, tissue inhibitors of metalloproteinases (TIMPs), thrombospondin-1 and interferon-alpha (IFN-α) (Ren et al. 2006; Wong et al. 2009).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Elevated", "expression", "of", "angiocrine", "molecules", "in", "the", "tumor", "niche", "is", "often", "coupled", "with", "the", "downregulation", "of", "anti-angiogenic", "molecules", "such", "as", "endostatin", ",", "matrix", "metalloproteinases", "(", "MMP", ")", "inhibitors", ",", "tissue", "inhibitors", "of", "metalloproteinases", "(", "TIMPs", ")", ",", "thrombospondin-1", "and", "interferon-alpha", "(", "IFN-α", ")", "(", "Ren", "et", "al.", "2006", ";", "Wong", "et", "al.", "2009", ")", "." ] } ]
PMC11754094
Within the non-TC target, P = 0.0288 for ABE, P = 0.0685 for ABE-UGI and P = 0.0002 for AYBE compared to nCas9 (D10A).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Within", "the", "non-TC", "target", ",", "P", "=", "0.0288", "for", "ABE", ",", "P", "=", "0.0685", "for", "ABE-UGI", "and", "P", "=", "0.0002", "for", "AYBE", "compared", "to", "nCas9", "(", "D10A", ")", "." ] } ]
PMC7759933
Previously, in encapsulated 3D HepG2 aggregates, no necrotic core was observed up to three days of culturing, while with prolonged cultivation, the thickness of aggregates disabled the determination of necrotic cells in the centre of the 3D cell model .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Previously", ",", "in", "encapsulated", "3D", "HepG2", "aggregates", ",", "no", "necrotic", "core", "was", "observed", "up", "to", "three", "days", "of", "culturing", ",", "while", "with", "prolonged", "cultivation", ",", "the", "thickness", "of", "aggregates", "disabled", "the", "determination", "of", "necrotic", "cells", "in", "the", "centre", "of", "the", "3D", "cell", "model", "." ] } ]
PMC11680982
The primary antibodies used in this study included rabbit antibody HER2 (1:6000; 18299-1-AP, Proteintech, China), rabbit antibody Cyclin D1 (1:1000; 2922 S, Cell Signaling Technology, USA), rabbit antibody CDK4 (1:1000; sc-23896, Santa Cruz, USA), mouse antibody EGFR (1:1000; 66455-1-PBS, Proteintech, China), and mouse antibody GAPDH (1:1000; AF0006, Beyotime, China).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "primary", "antibodies", "used", "in", "this", "study", "included", "rabbit", "antibody", "HER2", "(", "1:6000", ";", "18299", "-", "1-AP", ",", "Proteintech", ",", "China", ")", ",", "rabbit", "antibody", "Cyclin", "D1", "(", "1:1000", ";", "2922", "S", ",", "Cell", "Signaling", "Technology", ",", "USA", ")", ",", "rabbit", "antibody", "CDK4", "(", "1:1000", ";", "sc-23896", ",", "Santa", "Cruz", ",", "USA", ")", ",", "mouse", "antibody", "EGFR", "(", "1:1000", ";", "66455", "-", "1-PBS", ",", "Proteintech", ",", "China", ")", ",", "and", "mouse", "antibody", "GAPDH", "(", "1:1000", ";", "AF0006", ",", "Beyotime", ",", "China", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Summary/Conclusion: Several barriers to and facilitators for implementation were identified, a clear overview was presented, and a unique comprehensive implementation guide was developed for lancing future digital care platforms in daily clinical practice.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Summary/Conclusion", ":", "Several", "barriers", "to", "and", "facilitators", "for", "implementation", "were", "identified", ",", "a", "clear", "overview", "was", "presented", ",", "and", "a", "unique", "comprehensive", "implementation", "guide", "was", "developed", "for", "lancing", "future", "digital", "care", "platforms", "in", "daily", "clinical", "practice", "." ] } ]
PMC11794588
Subramanian et al.found that cedryl acetate exhibited cytotoxic effects in brine shrimp assays, suggesting it may disrupt cellular integrity Cedryl acetate’s cytotoxic effects in brine shrimp may be related to its ability to induce apoptosis or cell membrane disruption.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Subramanian", "et", "al.found", "that", "cedryl", "acetate", "exhibited", "cytotoxic", "effects", "in", "brine", "shrimp", "assays", ",", "suggesting", "it", "may", "disrupt", "cellular", "integrity", "Cedryl", "acetate", "’s", "cytotoxic", "effects", "in", "brine", "shrimp", "may", "be", "related", "to", "its", "ability", "to", "induce", "apoptosis", "or", "cell", "membrane", "disruption", "." ] } ]
PMC9429973
There wasn’t transplantation related mortality.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "There", "was", "n’t", "transplantation", "related", "mortality", "." ] } ]
PMC11471176
To attain a 10-fold dilution of the designated test concentration, the solution was diluted using Assay Buffer XI/ACE2 Assay Buffer.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "attain", "a", "10-fold", "dilution", "of", "the", "designated", "test", "concentration", ",", "the", "solution", "was", "diluted", "using", "Assay", "Buffer", "XI/ACE2", "Assay", "Buffer", "." ] } ]
PMC11473750
Cells were washed with cold PBS after treatment and harvested.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "washed", "with", "cold", "PBS", "after", "treatment", "and", "harvested", "." ] } ]
PMC10568263
The other two peak values of 646.2 and 658.1 eV are attributed to Mn.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "other", "two", "peak", "values", "of", "646.2", "and", "658.1", "eV", "are", "attributed", "to", "Mn", "." ] } ]
PMC10470467
To further investigate the difference in response to immunotherapy between distinct risk groups, one immunotherapeutic cohort from the “IMvigor210” R package, which investigated the efficacy of anti-PD-L1 antibody in patients with advanced urothelial cancer, was also included in our study as an external validation dataset.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "further", "investigate", "the", "difference", "in", "response", "to", "immunotherapy", "between", "distinct", "risk", "groups", ",", "one", "immunotherapeutic", "cohort", "from", "the", "“", "IMvigor210", "”", "R", "package", ",", "which", "investigated", "the", "efficacy", "of", "anti-PD-L1", "antibody", "in", "patients", "with", "advanced", "urothelial", "cancer", ",", "was", "also", "included", "in", "our", "study", "as", "an", "external", "validation", "dataset", "." ] } ]
PMC11406030
Notably, most tumors (67.5%) exhibited strong nuclear LMTK3 staining (Table 1).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Notably", ",", "most", "tumors", "(", "67.5", "%", ")", "exhibited", "strong", "nuclear", "LMTK3", "staining", "(", "Table", "1", ")", "." ] } ]
PMC9014716
The cell clone formation assay (Figure 1I–K) showed that the number of clones in the combined treatment group was significantly lower than in the OXA group, indicating greater inhibition of cell proliferation in the PS-T + OXA group than the OXA group.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cell", "clone", "formation", "assay", "(", "Figure", "1I", "–", "K", ")", "showed", "that", "the", "number", "of", "clones", "in", "the", "combined", "treatment", "group", "was", "significantly", "lower", "than", "in", "the", "OXA", "group", ",", "indicating", "greater", "inhibition", "of", "cell", "proliferation", "in", "the", "PS-T", "+", "OXA", "group", "than", "the", "OXA", "group", "." ] } ]
PMC9878278
We also compared the effect of MDA5 knockout on ZIKV replication in A549 cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "also", "compared", "the", "effect", "of", "MDA5", "knockout", "on", "ZIKV", "replication", "in", "A549", "cells", "." ] } ]
PMC11515150
T-lymphoblastic lymphoma encompasses biological properties akin to T-ALL.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "T-lymphoblastic", "lymphoma", "encompasses", "biological", "properties", "akin", "to", "T-ALL", "." ] } ]
PMC10212663
The Kaplan–Meier method was applied to evaluate the relationship between different variables and survival if not specified, and differences between survival curves were judged by the log‐rank test.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "Kaplan", "–", "Meier", "method", "was", "applied", "to", "evaluate", "the", "relationship", "between", "different", "variables", "and", "survival", "if", "not", "specified", ",", "and", "differences", "between", "survival", "curves", "were", "judged", "by", "the", "log‐rank", "test", "." ] } ]
PMC11344246
The subgraphs that PCSF identifies aim to maximise the number of mutated genes covered while minimising the edge cost to promote sparsity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "subgraphs", "that", "PCSF", "identifies", "aim", "to", "maximise", "the", "number", "of", "mutated", "genes", "covered", "while", "minimising", "the", "edge", "cost", "to", "promote", "sparsity", "." ] } ]
PMC8140214
GPx is another enzyme responsible for dissociation of H2O2 into H2O via GSH in both cytoplasm and extracellular fluid of allhuman tissues.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "GPx", "is", "another", "enzyme", "responsible", "for", "dissociation", "of", "H2O2", "into", "H2O", "via", "GSH", "in", "both", "cytoplasm", "and", "extracellular", "fluid", "of", "allhuman", "tissues", "." ] } ]
PMC7762347
Three independent experiments were performed.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Three", "independent", "experiments", "were", "performed", "." ] } ]
PMC10747160
To do so, 1.7 μg of desired M, N, or E protein vector was added to the transfection mixture specified above: pcDNA3.1 SARS-CoV-2 M (Addgene Cat # 158078), pcDNA3.1 SARS-CoV-2 N (Addgene Cat # 158079), and pcDNA3.1 SARS-CoV-2 E (Addgene Cat # 158080), respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "do", "so", ",", "1.7", "μg", "of", "desired", "M", ",", "N", ",", "or", "E", "protein", "vector", "was", "added", "to", "the", "transfection", "mixture", "specified", "above", ":", "pcDNA3.1", "SARS-CoV-2", "M", "(", "Addgene", "Cat", "#", "158078", ")", ",", "pcDNA3.1", "SARS-CoV-2", "N", "(", "Addgene", "Cat", "#", "158079", ")", ",", "and", "pcDNA3.1", "SARS-CoV-2", "E", "(", "Addgene", "Cat", "#", "158080", ")", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC4369959
It has also shown that ginger extract synergistically increases the apoptotic efficacy of Gelam honey .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "has", "also", "shown", "that", "ginger", "extract", "synergistically", "increases", "the", "apoptotic", "efficacy", "of", "Gelam", "honey", "." ] } ]
PMC9429973
Obesity, renal failure and a high risk (according to the Sanz score) represented an indication for a DS prophylaxis prescription, using whether prednisone (LPA99) or dexamethasone (LPA2005).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Obesity", ",", "renal", "failure", "and", "a", "high", "risk", "(", "according", "to", "the", "Sanz", "score", ")", "represented", "an", "indication", "for", "a", "DS", "prophylaxis", "prescription", ",", "using", "whether", "prednisone", "(", "LPA99", ")", "or", "dexamethasone", "(", "LPA2005", ")", "." ] } ]
PMC11705862
Values are expressed as a mean ± SD.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Values", "are", "expressed", "as", "a", "mean", "±", "SD", "." ] } ]
PMC10547921
Michel O. Steinmetz's team found through the crystal structure that the binding site of eribulin to tubulin is shaped by the hydrophobic and polar residues of helices H1, H6, H7, loops H6–H7, S3–H3 (T3), and S5–H5 (T5) of β-tubulin (Fig. 5B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Michel", "O.", "Steinmetz", "'s", "team", "found", "through", "the", "crystal", "structure", "that", "the", "binding", "site", "of", "eribulin", "to", "tubulin", "is", "shaped", "by", "the", "hydrophobic", "and", "polar", "residues", "of", "helices", "H1", ",", "H6", ",", "H7", ",", "loops", "H6–H7", ",", "S3–H3", "(", "T3", ")", ",", "and", "S5–H5", "(", "T5", ")", "of", "β-tubulin", "(", "Fig.", "5B", ")", "." ] } ]
PMC11532793
We used the simulation framework from Baldoni et al. (13) to assess differences between bootstrap and Gibbs sampling in regard to DTE assessment.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "used", "the", "simulation", "framework", "from", "Baldoni", "et", "al.", "(", "13", ")", "to", "assess", "differences", "between", "bootstrap", "and", "Gibbs", "sampling", "in", "regard", "to", "DTE", "assessment", "." ] } ]
PMC9509578
Smart nanomaterials utilize the physiological characteristics of the tumor cells and respond according to the tumor microenvironment, thus offering more effective treatment than conventional chemotherapy.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Smart", "nanomaterials", "utilize", "the", "physiological", "characteristics", "of", "the", "tumor", "cells", "and", "respond", "according", "to", "the", "tumor", "microenvironment", ",", "thus", "offering", "more", "effective", "treatment", "than", "conventional", "chemotherapy", "." ] } ]
PMC11206251
This study analyzed the chemical constituents of the PEIM by LC-MS/MS and investigated the effect of the PEIM against HCC, showing that a total of 64 compounds were identified, including flavonoids, diterpenoids, triterpenoids, alkaloids, lignans, and sesquiterpenoids, which are believed to play a crucial role in treating HCC.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "study", "analyzed", "the", "chemical", "constituents", "of", "the", "PEIM", "by", "LC-MS/MS", "and", "investigated", "the", "effect", "of", "the", "PEIM", "against", "HCC", ",", "showing", "that", "a", "total", "of", "64", "compounds", "were", "identified", ",", "including", "flavonoids", ",", "diterpenoids", ",", "triterpenoids", ",", "alkaloids", ",", "lignans", ",", "and", "sesquiterpenoids", ",", "which", "are", "believed", "to", "play", "a", "crucial", "role", "in", "treating", "HCC", "." ] } ]
PMC11348300
Protoporphyrin IX (PpIX) is a molecular fluorophore that has been utilized effectively in skin lesion, bladder cancer, and glioma tissue resection guidance and is examined here as a tissue-oxygen contrast tool.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Protoporphyrin", "IX", "(", "PpIX", ")", "is", "a", "molecular", "fluorophore", "that", "has", "been", "utilized", "effectively", "in", "skin", "lesion", ",", "bladder", "cancer", ",", "and", "glioma", "tissue", "resection", "guidance", "and", "is", "examined", "here", "as", "a", "tissue-oxygen", "contrast", "tool", "." ] } ]
PMC11763111
Heat maps were generated based on DEGs filtered by [Log2FC] > 1 and FDR p-value < 0.05, with DEG heat maps constructed using TBtools (RRID:SCR_023018).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Heat", "maps", "were", "generated", "based", "on", "DEGs", "filtered", "by", "[", "Log2FC", "]", ">", "1", "and", "FDR", "p-value", "<", "0.05", ",", "with", "DEG", "heat", "maps", "constructed", "using", "TBtools", "(", "RRID", ":", "SCR_023018", ")", "." ] } ]
PMC11365427
RT-qPCR shows the mRNA expression levels of ATF3, DDIT3, and TNFRSF10B genes in NCI-H929 and RPMI-8226 cells after 48 h of phenylalanine deprivation with siATF3 transfection. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "RT-qPCR", "shows", "the", "mRNA", "expression", "levels", "of", "ATF3", ",", "DDIT3", ",", "and", "TNFRSF10B", "genes", "in", "NCI-H929", "and", "RPMI-8226", "cells", "after", "48", "h", "of", "phenylalanine", "deprivation", "with", "siATF3", "transfection", ".", "(" ] } ]
PMC9429973
These results were also mirrored in vivo on TPO Zebrafish (Danio rerio) model.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "results", "were", "also", "mirrored", "in", "vivo", "on", "TPO", "Zebrafish", "(", "Danio", "rerio", ")", "model", "." ] } ]
PMC9031474
Because of their cytotoxic activity, these sesquiterpenoids have received increasing attention as a source for new anticancer drugs and pharmacophores.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Because", "of", "their", "cytotoxic", "activity", ",", "these", "sesquiterpenoids", "have", "received", "increasing", "attention", "as", "a", "source", "for", "new", "anticancer", "drugs", "and", "pharmacophores", "." ] } ]
PMC4005030
PCA has been reported for its potential action such as antioxidant activity, antibacterial activity, anticancer activity, antiulcer activity, antidiabetic activity, antiageing activity, antifibrotic activity, antiviral activity, anti-inflammatory activity, analgesic activity, antiatherosclerotic activity, cardiac activity, hepatoprotective activity, neurological and nephro protective activity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "PCA", "has", "been", "reported", "for", "its", "potential", "action", "such", "as", "antioxidant", "activity", ",", "antibacterial", "activity", ",", "anticancer", "activity", ",", "antiulcer", "activity", ",", "antidiabetic", "activity", ",", "antiageing", "activity", ",", "antifibrotic", "activity", ",", "antiviral", "activity", ",", "anti-inflammatory", "activity", ",", "analgesic", "activity", ",", "antiatherosclerotic", "activity", ",", "cardiac", "activity", ",", "hepatoprotective", "activity", ",", "neurological", "and", "nephro", "protective", "activity", "." ] } ]
PMC9429973
Summary/Conclusion: These first data demonstrate that treatment with HD-MTX and Glucarpidase is feasible in pts with CNSL and impaired renal function.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Summary/Conclusion", ":", "These", "first", "data", "demonstrate", "that", "treatment", "with", "HD-MTX", "and", "Glucarpidase", "is", "feasible", "in", "pts", "with", "CNSL", "and", "impaired", "renal", "function", "." ] } ]
PMC9429973
D. M. Akkurd, H. Haydaroglu Sahin, E. Yilmaz, V. Okan Haematology department, Gaziantep University Sahinbey Research And Practice Hospital, Gaziantep, Turkey Background: Multiparametric flow cytometry-based immunophenotyping is a useful tool for the diagnosis and monitoring of multiple myeloma.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "D.", "M.", "Akkurd", ",", "H.", "Haydaroglu", "Sahin", ",", "E.", "Yilmaz", ",", "V.", "Okan", "Haematology", "department", ",", "Gaziantep", "University", "Sahinbey", "Research", "And", "Practice", "Hospital", ",", "Gaziantep", ",", "Turkey", "Background", ":", "Multiparametric", "flow", "cytometry-based", "immunophenotyping", "is", "a", "useful", "tool", "for", "the", "diagnosis", "and", "monitoring", "of", "multiple", "myeloma", "." ] } ]
PMC9429973
Overall response rate was 96%, including 92 % ≥ very good partial response.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Overall", "response", "rate", "was", "96", "%", ",", "including", "92", "%", "≥", "very", "good", "partial", "response", "." ] } ]
PMC11515150
In the study, the average % CAR transduction was 64.2% from three healthy donors with K562 feeder system (data not shown), this high transduction facilitates the clinical application of nanobody-derived CAR-NK cell derived from PB.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "study", ",", "the", "average", "%", "CAR", "transduction", "was", "64.2", "%", "from", "three", "healthy", "donors", "with", "K562", "feeder", "system", "(", "data", "not", "shown", ")", ",", "this", "high", "transduction", "facilitates", "the", "clinical", "application", "of", "nanobody-derived", "CAR-NK", "cell", "derived", "from", "PB", "." ] } ]
PMC6934009
Disturbance of equilibrium between anti-oxidants and ROS in the cells leads to oxidative stress (6).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Disturbance", "of", "equilibrium", "between", "anti-oxidants", "and", "ROS", "in", "the", "cells", "leads", "to", "oxidative", "stress", "(", "6", ")", "." ] } ]
PMC11627133
To ensure minimal interference between aptamer‐ and antibody‐based methods, we utilized GFP‐binding AP3‐RhoBAST, while an anti‐synaptophysin antibody directly targeted synaptophysin.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "ensure", "minimal", "interference", "between", "aptamer‐", "and", "antibody‐based", "methods", ",", "we", "utilized", "GFP‐binding", "AP3‐RhoBAST", ",", "while", "an", "anti‐synaptophysin", "antibody", "directly", "targeted", "synaptophysin", "." ] } ]
PMC11703992
The Uniform Manifold Approximation and Projection (UMAP) method was used for dimension reduction and cell clustering.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "Uniform", "Manifold", "Approximation", "and", "Projection", "(", "UMAP", ")", "method", "was", "used", "for", "dimension", "reduction", "and", "cell", "clustering", "." ] } ]