enoriega/GENIA-Term-Corpus · Datasets at Hugging Face

[ "Little", "is", "known", "about", "how", "the", "very", "early", "events", "induced", "by", "CD40", "cross-linking", "link", "to", "cellular", "responses", "." ]

[ "little", "is", "known", "about", "how", "the", "very", "early", "events", "induced", "by", "cd40", "cross-linking", "link", "to", "cellular", "responses", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "study", ",", "we", "demonstrate", "that", "nuclear", "factor", "(", "NF", ")", "-kappa", "B", "and", "NF-kappa", "B-like", "transcription", "factors", "are", "activated", "after", "cross-linking", "CD40", "on", "resting", "human", "tonsillar", "B", "cells", "and", "on", "B", "cell", "lines", "." ]

[ "in", "this", "study", ",", "we", "demonstrate", "that", "nuclear", "factor", "(", "nf", ")", "-kappa", "b", "and", "nf-kappa", "b-like", "transcription", "factors", "are", "activated", "after", "cross-linking", "cd40", "on", "resting", "human", "tonsillar", "b", "cells", "and", "on", "b", "cell", "lines", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "The", "activation", "is", "rapid", "and", "is", "mediated", "through", "a", "tyrosine", "kinase-dependent", "pathway", "." ]

[ "the", "activation", "is", "rapid", "and", "is", "mediated", "through", "a", "tyrosine", "kinase-dependent", "pathway", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "The", "complexes", "detected", "in", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", "contain", "p50", ",", "p65", "(", "RelA", ")", ",", "c-Rel", ",", "and", "most", "likely", "other", "components", "." ]

[ "the", "complexes", "detected", "in", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", "contain", "p50", ",", "p65", "(", "rela", ")", ",", "c-rel", ",", "and", "most", "likely", "other", "components", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_subunit", "O", "B-protein_subunit", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_subunit", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "By", "using", "transient", "transfection", "assays", ",", "we", "found", "that", "cross-linking", "CD40", "supports", "NF-kappa", "B", "-dependent", "gene", "expression", "." ]

[ "by", "using", "transient", "transfection", "assays", ",", "we", "found", "that", "cross-linking", "cd40", "supports", "nf-kappa", "b", "-dependent", "gene", "expression", "." ]

[ "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "results", "define", "the", "NF-kappa", "B", "system", "as", "an", "intermediate", "event", "in", "CD40", "signaling", "and", "suggest", "that", "the", "CD40", "pathway", "can", "influence", "the", "expression", "of", "B", "cell-associated", "genes", "with", "NF-kappa", "B", "consensus", "sites", "." ]

[ "our", "results", "define", "the", "nf-kappa", "b", "system", "as", "an", "intermediate", "event", "in", "cd40", "signaling", "and", "suggest", "that", "the", "cd40", "pathway", "can", "influence", "the", "expression", "of", "b", "cell-associated", "genes", "with", "nf-kappa", "b", "consensus", "sites", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O" ]

[ "Multiple", "proteins", "interact", "with", "the", "nuclear", "inhibitory", "protein", "repressor", "element", "in", "the", "human", "interleukin-3", "promoter", "." ]

[ "multiple", "proteins", "interact", "with", "the", "nuclear", "inhibitory", "protein", "repressor", "element", "in", "the", "human", "interleukin-3", "promoter", "." ]

[ "O", "B-protein_N/A", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "T", "cell", "expression", "of", "interleukin", "3", "(", "IL-3", ")", "is", "directed", "by", "positive", "and", "negative", "cis-acting", "DNA", "elements", "clustered", "within", "300", "base", "pairs", "of", "the", "transcriptional", "start", "site", "." ]

[ "t", "cell", "expression", "of", "interleukin", "3", "(", "il-3", ")", "is", "directed", "by", "positive", "and", "negative", "cis-acting", "dna", "elements", "clustered", "within", "300", "base", "pairs", "of", "the", "transcriptional", "start", "site", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "A", "strong", "repressor", "element", ",", "termed", "nuclear", "inhibitory", "protein", "(", "NIP", ")", ",", "was", "previously", "mapped", "to", "a", "segment", "of", "the", "IL-3", "promoter", "between", "nucleotides", "-271", "and", "-250", "." ]

[ "a", "strong", "repressor", "element", ",", "termed", "nuclear", "inhibitory", "protein", "(", "nip", ")", ",", "was", "previously", "mapped", "to", "a", "segment", "of", "the", "il-3", "promoter", "between", "nucleotides", "-271", "and", "-250", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "Functional", "characterization", "of", "this", "element", "demonstrates", "that", "it", "can", "mediate", "repression", "when", "linked", "in", "cis", "to", "a", "heterologous", "promoter", "." ]

[ "functional", "characterization", "of", "this", "element", "demonstrates", "that", "it", "can", "mediate", "repression", "when", "linked", "in", "cis", "to", "a", "heterologous", "promoter", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "DNA", "binding", "experiments", "were", "carried", "out", "to", "characterize", "the", "repressor", "activity", "." ]

[ "dna", "binding", "experiments", "were", "carried", "out", "to", "characterize", "the", "repressor", "activity", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Using", "varying", "conditions", ",", "three", "distinct", "complexes", "were", "shown", "to", "interact", "specifically", "with", "the", "NIP", "region", ",", "although", "only", "one", "correlates", "with", "repressor", "activity", "." ]

[ "using", "varying", "conditions", ",", "three", "distinct", "complexes", "were", "shown", "to", "interact", "specifically", "with", "the", "nip", "region", ",", "although", "only", "one", "correlates", "with", "repressor", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Complex", "1", "results", "from", "binding", "of", "a", "ubiquitous", "polypeptide", "that", "recognizes", "the", "3'", "portion", "of", "this", "sequence", "and", "is", "not", "required", "for", "repression", "." ]

[ "complex", "1", "results", "from", "binding", "of", "a", "ubiquitous", "polypeptide", "that", "recognizes", "the", "3'", "portion", "of", "this", "sequence", "and", "is", "not", "required", "for", "repression", "." ]

[ "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "B-peptide", "I-peptide", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O" ]

[ "Complex", "2", "corresponds", "to", "binding", "of", "transcription", "factor", "(", "upstream", "stimulatory", "factor", ")", "to", "an", "E-box", "motif", "in", "the", "5'", "portion", "of", "the", "NIP", "region", "." ]

[ "complex", "2", "corresponds", "to", "binding", "of", "transcription", "factor", "(", "upstream", "stimulatory", "factor", ")", "to", "an", "e-box", "motif", "in", "the", "5'", "portion", "of", "the", "nip", "region", "." ]

[ "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "DNA", "binding", "specificity", "of", "complex", "3", "overlaps", "with", "that", "of", "upstream", "stimulatory", "factor", "but", "is", "clearly", "distinct", "." ]

[ "dna", "binding", "specificity", "of", "complex", "3", "overlaps", "with", "that", "of", "upstream", "stimulatory", "factor", "but", "is", "clearly", "distinct", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "determine", "which", "of", "the", "latter", "two", "complexes", "represents", "NIP", "activity", ",", "we", "incorporated", "small", "alterations", "into", "the", "NIP", "site", "of", "an", "IL-3", "promoter", "-linked", "reporter", "construct", "and", "examined", "their", "effects", "on", "NIP", "-mediated", "repression", "." ]

[ "to", "determine", "which", "of", "the", "latter", "two", "complexes", "represents", "nip", "activity", ",", "we", "incorporated", "small", "alterations", "into", "the", "nip", "site", "of", "an", "il-3", "promoter", "-linked", "reporter", "construct", "and", "examined", "their", "effects", "on", "nip", "-mediated", "repression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "O" ]

[ "Functional", "specificity", "for", "repression", "matches", "the", "DNA", "binding", "specificity", "of", "complex", "3", ";", "both", "repressor", "activity", "and", "complex", "3", "binding", "require", "the", "consensus", "sequence", "CTCACNTNC", "." ]

[ "functional", "specificity", "for", "repression", "matches", "the", "dna", "binding", "specificity", "of", "complex", "3", ";", "both", "repressor", "activity", "and", "complex", "3", "binding", "require", "the", "consensus", "sequence", "ctcacntnc", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "B-polynucleotide", "O" ]

[ "Cellular", "redox", "status", "influences", "both", "cytotoxic", "and", "NF-kappa", "B", "activation", "in", "natural", "killer", "cells", "." ]

[ "cellular", "redox", "status", "influences", "both", "cytotoxic", "and", "nf-kappa", "b", "activation", "in", "natural", "killer", "cells", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "The", "role", "of", "cellular", "redox", "status", "in", "both", "cytotoxic", "activity", "and", "NF-kappa", "B", "activation", "in", "natural", "killer", "(", "NK", ")", "cells", "was", "investigated", "." ]

[ "the", "role", "of", "cellular", "redox", "status", "in", "both", "cytotoxic", "activity", "and", "nf-kappa", "b", "activation", "in", "natural", "killer", "(", "nk", ")", "cells", "was", "investigated", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O" ]

[ "The", "results", "indicate", "that", "stimulation", "of", "NK", "cells", ",", "either", "freshly", "isolated", "from", "peripheral", "blood", "lymphocytes", "(", "PBL", ")", "or", "long-term", "cultured", "NK", "clones", ",", "with", "specific", "cell", "targets", "results", "in", "an", "increased", "binding", "activity", "of", "NF-kappa", "B", "and", "AP-1", "transcription", "factors", "measured", "by", "gel", "retardation", "." ]

[ "the", "results", "indicate", "that", "stimulation", "of", "nk", "cells", ",", "either", "freshly", "isolated", "from", "peripheral", "blood", "lymphocytes", "(", "pbl", ")", "or", "long-term", "cultured", "nk", "clones", ",", "with", "specific", "cell", "targets", "results", "in", "an", "increased", "binding", "activity", "of", "nf-kappa", "b", "and", "ap-1", "transcription", "factors", "measured", "by", "gel", "retardation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Pretreatment", "of", "NK", "cells", "with", "the", "antioxidant", "pyrrolidine", "dithiocarbarmate", "(", "PDTC", ")", "leads", "to", "the", "inhibition", "of", "NF-kappa", "B", "activation", "but", "the", "AP-1", "binding", "to", "DNA", "was", "superinduced", "." ]

[ "pretreatment", "of", "nk", "cells", "with", "the", "antioxidant", "pyrrolidine", "dithiocarbarmate", "(", "pdtc", ")", "leads", "to", "the", "inhibition", "of", "nf-kappa", "b", "activation", "but", "the", "ap-1", "binding", "to", "dna", "was", "superinduced", "." ]

[ "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "inhibition", "of", "NF-kappa", "B", "by", "PDTC", "paralleled", "with", "an", "inhibition", "of", "spontaneous", "cytotoxicity", "mediated", "by", "NK", "cells", "." ]

[ "the", "inhibition", "of", "nf-kappa", "b", "by", "pdtc", "paralleled", "with", "an", "inhibition", "of", "spontaneous", "cytotoxicity", "mediated", "by", "nk", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Moreover", ",", "the", "inhibitors", "of", "serine", "proteases", ",", "N-alpha-tosyl-L-lysine", "chloromethyl", "ketone", "and", "N-alpha-tosyl-L-phenylalanine", "chloromethyl", "ketone", ",", "also", "blocked", "the", "cytolytic", "activity", "of", "NK", "cells", "against", "the", "sensitive", "target", "K562", "." ]

[ "moreover", ",", "the", "inhibitors", "of", "serine", "proteases", ",", "n-alpha-tosyl-l-lysine", "chloromethyl", "ketone", "and", "n-alpha-tosyl-l-phenylalanine", "chloromethyl", "ketone", ",", "also", "blocked", "the", "cytolytic", "activity", "of", "nk", "cells", "against", "the", "sensitive", "target", "k562", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "NK", "activity", "was", "not", "affected", "by", "pretreatment", "of", "the", "effector", "cells", "with", "the", "proteasome", "inhibitor", "N-acetyl-leu-leu-norleucinal", "which", "selectively", "inhibits", "NF-kappa", "B", "activation", "." ]

[ "in", "contrast", ",", "nk", "activity", "was", "not", "affected", "by", "pretreatment", "of", "the", "effector", "cells", "with", "the", "proteasome", "inhibitor", "n-acetyl-leu-leu-norleucinal", "which", "selectively", "inhibits", "nf-kappa", "b", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O" ]

[ "Altogether", ",", "these", "results", "support", "the", "hypothesis", "that", "the", "activation", "of", "NK", "cells", "involved", "transcriptional", "and", "post-transcriptional", "events", ",", "and", "that", "reactive", "intermediates", "may", "play", "an", "important", "role", "in", "the", "molecular", "processes", "related", "with", "the", "generation", "of", "a", "cytotoxic", "response", "by", "NK", "cells", "." ]

[ "altogether", ",", "these", "results", "support", "the", "hypothesis", "that", "the", "activation", "of", "nk", "cells", "involved", "transcriptional", "and", "post-transcriptional", "events", ",", "and", "that", "reactive", "intermediates", "may", "play", "an", "important", "role", "in", "the", "molecular", "processes", "related", "with", "the", "generation", "of", "a", "cytotoxic", "response", "by", "nk", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Selection", "of", "a", "diverse", "TCR", "repertoire", "in", "response", "to", "an", "Epstein-Barr", "virus", "-encoded", "transactivator", "protein", "BZLF1", "by", "CD8+", "cytotoxic", "T", "lymphocytes", "during", "primary", "and", "persistent", "infection", "." ]

[ "selection", "of", "a", "diverse", "tcr", "repertoire", "in", "response", "to", "an", "epstein-barr", "virus", "-encoded", "transactivator", "protein", "bzlf1", "by", "cd8+", "cytotoxic", "t", "lymphocytes", "during", "primary", "and", "persistent", "infection", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "investigated", "the", "CD8+", "cytotoxic", "T", "lymphocyte", "(", "CTL", ")", "repertoire", "to", "an", "HLA", "B8-restricted", "peptide", ",", "RAKFKQLLQ", ",", "located", "in", "the", "Epstein-Barr", "virus", "(", "EBV", ")", "immediate-early", "protein", ",", "BZLF1", "." ]

[ "we", "investigated", "the", "cd8+", "cytotoxic", "t", "lymphocyte", "(", "ctl", ")", "repertoire", "to", "an", "hla", "b8-restricted", "peptide", ",", "rakfkqllq", ",", "located", "in", "the", "epstein-barr", "virus", "(", "ebv", ")", "immediate-early", "protein", ",", "bzlf1", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-peptide", "I-peptide", "I-peptide", "O", "B-peptide", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Repertoire", "selection", "was", "monitored", "by", "determining", "the", "TCR", "beta", "chain", "sequences", "of", "RAKFKQLLQ", "-specific", "CTL", "established", "from", "primary", "infected", "and", "healthy", "virus", "carriers", "." ]

[ "repertoire", "selection", "was", "monitored", "by", "determining", "the", "tcr", "beta", "chain", "sequences", "of", "rakfkqllq", "-specific", "ctl", "established", "from", "primary", "infected", "and", "healthy", "virus", "carriers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "B-peptide", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "I-multi_cell", "I-multi_cell", "I-multi_cell", "I-multi_cell", "O" ]

[ "PCR", "analysis", "of", "spontaneous", "EBV", "-transformed", "lymphoblastoid", "cell", "lines", "(", "LCL", ")", "from", "three", "individuals", "with", "primary", "infection", "showed", "that", "two", "were", "infected", "with", "type", "A", "and", "one", "with", "type", "B", "EBV", "." ]

[ "pcr", "analysis", "of", "spontaneous", "ebv", "-transformed", "lymphoblastoid", "cell", "lines", "(", "lcl", ")", "from", "three", "individuals", "with", "primary", "infection", "showed", "that", "two", "were", "infected", "with", "type", "a", "and", "one", "with", "type", "b", "ebv", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-cell_line", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Polyclonal", "and", "clonal", "CTL", "that", "were", "generated", "by", "stimulating", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "with", "an", "HLA", "B8+", "homozygous", "LCL", "lysed", "T", "cell", "blasts", "pulsed", "with", "the", "peptide", ",", "RAKFKQLLQ", ";", "lysis", "of", "certain", "HLA", "B8+", "LCL", "targets", "was", "associated", "with", "the", "abundance", "of", "BZLF1", "transcripts", "." ]

[ "polyclonal", "and", "clonal", "ctl", "that", "were", "generated", "by", "stimulating", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "with", "an", "hla", "b8+", "homozygous", "lcl", "lysed", "t", "cell", "blasts", "pulsed", "with", "the", "peptide", ",", "rakfkqllq", ";", "lysis", "of", "certain", "hla", "b8+", "lcl", "targets", "was", "associated", "with", "the", "abundance", "of", "bzlf1", "transcripts", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "B-peptide", "O", "B-peptide", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "TCR", "beta", "analysis", "showed", "that", "while", "there", "was", "loop", "length", "restriction", "in", "the", "putative", "peptide", "contact", "site", "of", "all", "responding", "beta", "chains", ",", "diverse", "and", "unique", "(", "non-recurrent", ")", "TCR", "beta", "clonotypes", "were", "selected", "in", "individuals", "during", "primary", "infection", "and", "continued", "to", "emerge", "after", "long-term", "virus", "exposure", "." ]

[ "tcr", "beta", "analysis", "showed", "that", "while", "there", "was", "loop", "length", "restriction", "in", "the", "putative", "peptide", "contact", "site", "of", "all", "responding", "beta", "chains", ",", "diverse", "and", "unique", "(", "non-recurrent", ")", "tcr", "beta", "clonotypes", "were", "selected", "in", "individuals", "during", "primary", "infection", "and", "continued", "to", "emerge", "after", "long-term", "virus", "exposure", "." ]

[ "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "I-protein_subunit", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "TCR", "-contact", "site", "heterogeneity", "was", "excluded", "as", "the", "selective", "force", "in", "diversity", "generation", "since", "the", "epitope-encoded", "sequences", "were", "found", "to", "be", "identical", "within", "endogenous", "virus", "isolates", "." ]

[ "tcr", "-contact", "site", "heterogeneity", "was", "excluded", "as", "the", "selective", "force", "in", "diversity", "generation", "since", "the", "epitope-encoded", "sequences", "were", "found", "to", "be", "identical", "within", "endogenous", "virus", "isolates", "." ]

[ "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "O" ]

[ "In", "this", "first", "study", "of", "TCR", "repertoire", "selection", "for", "an", "EBV", "lytic", "antigen", ",", "a", "BZLF1", "-reactive", "component", "of", "diverse", "clonotypes", "was", "identified", "in", "primary", "type", "A", "or", "type", "B", "EBV", "infection", "which", "was", "sustained", "in", "the", "EBV", "-specific", "memory", "response", "throughout", "life-long", "infection", "." ]

[ "in", "this", "first", "study", "of", "tcr", "repertoire", "selection", "for", "an", "ebv", "lytic", "antigen", ",", "a", "bzlf1", "-reactive", "component", "of", "diverse", "clonotypes", "was", "identified", "in", "primary", "type", "a", "or", "type", "b", "ebv", "infection", "which", "was", "sustained", "in", "the", "ebv", "-specific", "memory", "response", "throughout", "life-long", "infection", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "This", "diversity", "selection", "is", "likely", "to", "play", "a", "critical", "role", "in", "maintaining", "a", "balanced", "viral", "load", "throughout", "EBV", "persistence", "." ]

[ "this", "diversity", "selection", "is", "likely", "to", "play", "a", "critical", "role", "in", "maintaining", "a", "balanced", "viral", "load", "throughout", "ebv", "persistence", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-virus", "O", "O" ]

[ "Activation", "of", "nuclear", "factor-kappa", "B", "by", "beta-amyloid", "peptides", "and", "interferon-gamma", "in", "murine", "microglia", "." ]

[ "activation", "of", "nuclear", "factor-kappa", "b", "by", "beta-amyloid", "peptides", "and", "interferon-gamma", "in", "murine", "microglia", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "B-peptide", "I-peptide", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "An", "increasing", "body", "of", "evidence", "suggests", "that", "amyloid-beta", "(", "A", "beta", ")", "peptides", "and", "microglia", "are", "crucially", "involved", "in", "the", "pathogenesis", "of", "Alzheimer's", "disease", "." ]

[ "an", "increasing", "body", "of", "evidence", "suggests", "that", "amyloid-beta", "(", "a", "beta", ")", "peptides", "and", "microglia", "are", "crucially", "involved", "in", "the", "pathogenesis", "of", "alzheimer's", "disease", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-peptide", "I-peptide", "I-peptide", "I-peptide", "I-peptide", "I-peptide", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "In", "an", "effort", "to", "further", "elucidate", "the", "biological", "effects", "of", "A", "beta", "towards", "microglia", ",", "we", "investigated", "the", "ability", "of", "A", "beta", "peptides", "to", "activate", "nuclear", "factor", "(", "NF", ")", "-kappa", "B", "in", "the", "N9", "murine", "microglial", "cell", "line", "." ]

[ "in", "an", "effort", "to", "further", "elucidate", "the", "biological", "effects", "of", "a", "beta", "towards", "microglia", ",", "we", "investigated", "the", "ability", "of", "a", "beta", "peptides", "to", "activate", "nuclear", "factor", "(", "nf", ")", "-kappa", "b", "in", "the", "n9", "murine", "microglial", "cell", "line", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-peptide", "I-peptide", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-peptide", "I-peptide", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "Co-stimulation", "of", "microglia", "with", "suboptimal", "concentrations", "of", "A", "beta", "(", "25-35", ")", "and", "100", "U/ml", "IFN", "gamma", "resulted", "in", "the", "detection", "of", "a", "specific", "NF-kappa", "B", "DNA-binding", "activity", "in", "nuclear", "extracts", ",", "as", "determined", "in", "gel", "mobility", "shift", "assays", "." ]

[ "co-stimulation", "of", "microglia", "with", "suboptimal", "concentrations", "of", "a", "beta", "(", "25-35", ")", "and", "100", "u/ml", "ifn", "gamma", "resulted", "in", "the", "detection", "of", "a", "specific", "nf-kappa", "b", "dna-binding", "activity", "in", "nuclear", "extracts", ",", "as", "determined", "in", "gel", "mobility", "shift", "assays", "." ]

[ "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-peptide", "I-peptide", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-cell_component", "I-cell_component", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "This", "response", "required", "at", "least", "120", "min", "to", "be", "evident", "and", "supershift", "experiments", "revealed", "that", "the", "NF-kappa", "B", "complex", "contains", "both", "RelA", "and", "p50", "." ]

[ "this", "response", "required", "at", "least", "120", "min", "to", "be", "evident", "and", "supershift", "experiments", "revealed", "that", "the", "nf-kappa", "b", "complex", "contains", "both", "rela", "and", "p50", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "O", "B-protein_subunit", "O" ]

[ "Accordingly", ",", "immunoblot", "experiments", "showed", "that", "amongst", "NF-kappa", "B", "/Rel", "proteins", ",", "RelA", "and", "p50", "are", "mobilized", "to", "the", "nucleus", "following", "microglial", "cell", "stimulation", "with", "A", "beta", "(", "25-35", ")", "plus", "IFN", "gamma", "." ]

[ "accordingly", ",", "immunoblot", "experiments", "showed", "that", "amongst", "nf-kappa", "b", "/rel", "proteins", ",", "rela", "and", "p50", "are", "mobilized", "to", "the", "nucleus", "following", "microglial", "cell", "stimulation", "with", "a", "beta", "(", "25-35", ")", "plus", "ifn", "gamma", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_subunit", "O", "B-protein_subunit", "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-peptide", "I-peptide", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]

[ "Higher", "concentrations", "of", "A", "beta", "(", "25-35", ")", "were", "effective", "by", "themselves", "in", "inducing", "NF-kappa", "B", "activation", ",", "both", "in", "the", "N9", "microglial", "cell", "line", "and", "in", "rat", "primary", "microglia", ",", "as", "well", "as", "in", "human", "monocytes", "." ]

[ "higher", "concentrations", "of", "a", "beta", "(", "25-35", ")", "were", "effective", "by", "themselves", "in", "inducing", "nf-kappa", "b", "activation", ",", "both", "in", "the", "n9", "microglial", "cell", "line", "and", "in", "rat", "primary", "microglia", ",", "as", "well", "as", "in", "human", "monocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-peptide", "I-peptide", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "For", "purposes", "of", "comparison", ",", "microglia", "were", "also", "stimulated", "with", "bacterial", "LPS", ",", "a", "known", "NF-kappa", "B", "inducer", "." ]

[ "for", "purposes", "of", "comparison", ",", "microglia", "were", "also", "stimulated", "with", "bacterial", "lps", ",", "a", "known", "nf-kappa", "b", "inducer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O" ]

[ "As", "expected", ",", "LPS", "strongly", "induced", "the", "formation", "of", "two", "NF-kappa", "B", "DNA-binding", "activities", ",", "one", "of", "which", "was", "identified", "as", "RelA", "/p50", "." ]

[ "as", "expected", ",", "lps", "strongly", "induced", "the", "formation", "of", "two", "nf-kappa", "b", "dna-binding", "activities", ",", "one", "of", "which", "was", "identified", "as", "rela", "/p50", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_subunit", "B-protein_subunit", "O" ]

[ "The", "LPS", "response", "was", "also", "more", "rapid", ",", "as", "it", "was", "already", "evident", "by", "40", "min", "and", "remained", "sustained", "for", "up", "to", "3", "h", "." ]

[ "the", "lps", "response", "was", "also", "more", "rapid", ",", "as", "it", "was", "already", "evident", "by", "40", "min", "and", "remained", "sustained", "for", "up", "to", "3", "h", "." ]

[ "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Collectively", ",", "these", "findings", "indicate", "that", "NF-kappa", "B", "activation", "might", "constitute", "one", "of", "the", "mechanisms", "underlying", "the", "inducible", "expression", "of", "kappa", "B-dependent", "genes", "in", "microglia", "stimulated", "by", "A", "beta", "peptides", "and", "IFN", "gamma", ",", "or", "by", "LPS", "." ]

[ "collectively", ",", "these", "findings", "indicate", "that", "nf-kappa", "b", "activation", "might", "constitute", "one", "of", "the", "mechanisms", "underlying", "the", "inducible", "expression", "of", "kappa", "b-dependent", "genes", "in", "microglia", "stimulated", "by", "a", "beta", "peptides", "and", "ifn", "gamma", ",", "or", "by", "lps", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-peptide", "I-peptide", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-lipid", "O" ]

[ "Natural", "variants", "of", "the", "HIV-1", "long", "terminal", "repeat", ":", "analysis", "of", "promoters", "with", "duplicated", "DNA", "regulatory", "motifs", "." ]

[ "natural", "variants", "of", "the", "hiv-1", "long", "terminal", "repeat", ":", "analysis", "of", "promoters", "with", "duplicated", "dna", "regulatory", "motifs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "Sequence", "variation", "in", "the", "long", "terminal", "repeat", "(", "LTR", ")", "region", "of", "HIV-1", "was", "analyzed", "in", "viral", "isolates", "of", "17", "infected", "individuals", "." ]

[ "sequence", "variation", "in", "the", "long", "terminal", "repeat", "(", "ltr", ")", "region", "of", "hiv-1", "was", "analyzed", "in", "viral", "isolates", "of", "17", "infected", "individuals", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O" ]

[ "Two", "classes", "of", "LTR", "size", "variants", "were", "found", "." ]

[ "two", "classes", "of", "ltr", "size", "variants", "were", "found", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "I-virus", "O", "O", "O" ]

[ "One", "HIV-1", "variant", "was", "detected", "containing", "an", "additional", "binding", "site", "for", "the", "transcription", "factor", "Sp1", "." ]

[ "one", "hiv-1", "variant", "was", "detected", "containing", "an", "additional", "binding", "site", "for", "the", "transcription", "factor", "sp1", "." ]

[ "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_N/A", "O" ]

[ "Another", "LTR", "size", "variation", "was", "observed", "in", "four", "patients", "in", "a", "region", "just", "upstream", "of", "the", "NF-kappa", "B", "enhancer", "." ]

[ "another", "ltr", "size", "variation", "was", "observed", "in", "four", "patients", "in", "a", "region", "just", "upstream", "of", "the", "nf-kappa", "b", "enhancer", "." ]

[ "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "This", "variation", "was", "the", "result", "of", "a", "duplication", "of", "a", "short", "DNA", "sequence", "(", "CTG-motif", ")", "." ]

[ "this", "variation", "was", "the", "result", "of", "a", "duplication", "of", "a", "short", "dna", "sequence", "(", "ctg-motif", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O" ]

[ "Cell", "culture", "experiments", "demonstrated", "that", "the", "natural", "variant", "with", "four", "Sp1", "sites", "had", "a", "slightly", "higher", "promoter", "activity", "and", "viral", "replication", "rate", "than", "the", "isogenic", "control", "LTR", "with", "three", "Sp1", "sites", "." ]

[ "cell", "culture", "experiments", "demonstrated", "that", "the", "natural", "variant", "with", "four", "sp1", "sites", "had", "a", "slightly", "higher", "promoter", "activity", "and", "viral", "replication", "rate", "than", "the", "isogenic", "control", "ltr", "with", "three", "sp1", "sites", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_N/A", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_N/A", "O", "O" ]

[ "No", "positive", "effect", "of", "the", "duplicated", "CTG-motif", "could", "be", "detected", "." ]

[ "no", "positive", "effect", "of", "the", "duplicated", "ctg-motif", "could", "be", "detected", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "order", "to", "measure", "small", "differences", "in", "virus", "production", "more", "accurately", ",", "equal", "amounts", "of", "a", "size", "variant", "and", "the", "wild-type", "plasmid", "were", "cotransfected", "into", "T-cells", "." ]

[ "in", "order", "to", "measure", "small", "differences", "in", "virus", "production", "more", "accurately", ",", "equal", "amounts", "of", "a", "size", "variant", "and", "the", "wild-type", "plasmid", "were", "cotransfected", "into", "t-cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O" ]

[ "The", "virus", "with", "four", "Sp1", "sites", "did", "outgrow", "the", "three", "Sp1", "virus", "in", "35", "days", "of", "culture", "and", "CTG-monomer", "virus", "outcompeted", "the", "CTG-dimer", "virus", "in", "42", "days", "." ]

[ "the", "virus", "with", "four", "sp1", "sites", "did", "outgrow", "the", "three", "sp1", "virus", "in", "35", "days", "of", "culture", "and", "ctg-monomer", "virus", "outcompeted", "the", "ctg-dimer", "virus", "in", "42", "days", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_N/A", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Based", "on", "these", "results", "we", "estimate", "a", "5-10%", "difference", "in", "virus", "production", "of", "the", "LTR", "variants", "when", "compared", "to", "that", "of", "wild-type", "." ]

[ "based", "on", "these", "results", "we", "estimate", "a", "5-10%", "difference", "in", "virus", "production", "of", "the", "ltr", "variants", "when", "compared", "to", "that", "of", "wild-type", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O" ]

[ "The", "C-terminus", "of", "the", "B", "cell", "activator", "Oct-2", "functions", "as", "an", "activation", "domain", "in", "yeast", "." ]

[ "the", "c-terminus", "of", "the", "b", "cell", "activator", "oct-2", "functions", "as", "an", "activation", "domain", "in", "yeast", "." ]

[ "O", "B-protein_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "B-mono_cell", "O" ]

[ "Oct-1", "and", "Oct-2", "are", "human", "transcriptional", "activators", "that", "bind", "to", "the", "same", "DNA", "element", "but", "activate", "distinct", "sets", "of", "genes", "." ]

[ "oct-1", "and", "oct-2", "are", "human", "transcriptional", "activators", "that", "bind", "to", "the", "same", "dna", "element", "but", "activate", "distinct", "sets", "of", "genes", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "expressed", "these", "factors", "in", "S", ".", "cerevisiae", "and", "observed", "greater", "than", "5-fold", "stimulation", "of", "a", "lacZ", "reporter", "gene", "only", "with", "Oct-2", "." ]

[ "we", "expressed", "these", "factors", "in", "s", ".", "cerevisiae", "and", "observed", "greater", "than", "5-fold", "stimulation", "of", "a", "lacz", "reporter", "gene", "only", "with", "oct-2", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-mono_cell", "I-mono_cell", "I-mono_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "I-DNA_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Transfer", "of", "the", "Oct-2", "C-terminal", "domain", "onto", "either", "Oct-1", "(", "Oct1", ".", "2", ")", "or", "a", "nonactivating", "DNA-binding", "domain", "from", "GAL4", "created", "activators", "capable", "of", "greater", "than", "15", "and", "10-fold", "stimulation", "of", "activity", ",", "respectively", "." ]

[ "transfer", "of", "the", "oct-2", "c-terminal", "domain", "onto", "either", "oct-1", "(", "oct1", ".", "2", ")", "or", "a", "nonactivating", "dna-binding", "domain", "from", "gal4", "created", "activators", "capable", "of", "greater", "than", "15", "and", "10-fold", "stimulation", "of", "activity", ",", "respectively", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "the", "C-terminus", "of", "Oct-2", "is", "sufficient", "to", "confer", "activation", "potential", "to", "nonactive", "DNA-binding", "fragments", "in", "yeast", "." ]

[ "thus", ",", "the", "c-terminus", "of", "oct-2", "is", "sufficient", "to", "confer", "activation", "potential", "to", "nonactive", "dna-binding", "fragments", "in", "yeast", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "B-mono_cell", "O" ]

[ "[", "The", "effect", "of", "24", ",", "25-dihydroxyvitamin", "D3", "(", "dioxyvit", ")", "on", "Ca", "metabolism", "and", "immune", "status", "during", "chronic", "kidney", "failure", "]" ]

[ "[", "the", "effect", "of", "24", ",", "25-dihydroxyvitamin", "d3", "(", "dioxyvit", ")", "on", "ca", "metabolism", "and", "immune", "status", "during", "chronic", "kidney", "failure", "]" ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "I-lipid", "I-lipid", "I-lipid", "O", "B-lipid", "O", "O", "B-atom", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Active", "metabolite", "of", "vitamin", "D3", ",", "24R", ",", "25", "(", "OH", ")", "2D3", "(", "dioxyvit", ")", "was", "used", "at", "a", "daily", "dose", "of", "100", "micrograms", "in", "treatment", "of", "children", "affected", "with", "tubulointerstitial", "disease", "of", "kidney", "and", "with", "chronic", "glomerulonephritis", "under", "conditions", "of", "kidney", "insufficiency", "." ]

[ "active", "metabolite", "of", "vitamin", "d3", ",", "24r", ",", "25", "(", "oh", ")", "2d3", "(", "dioxyvit", ")", "was", "used", "at", "a", "daily", "dose", "of", "100", "micrograms", "in", "treatment", "of", "children", "affected", "with", "tubulointerstitial", "disease", "of", "kidney", "and", "with", "chronic", "glomerulonephritis", "under", "conditions", "of", "kidney", "insufficiency", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-lipid", "I-lipid", "O", "B-lipid", "I-lipid", "I-lipid", "I-lipid", "I-lipid", "I-lipid", "I-lipid", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-body_part", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-body_part", "O", "O" ]

[ "The", "drug", "exhibited", "distinct", "normalizing", "effect", "on", "patterns", "of", "calcium", "metabolism", ":", "increase", "of", "total", "and", "ionized", "Ca2+", "and", "of", "25-OHD", ",", "decrease", "in", "concentration", "of", "parath", "hormone", "and", "osteocalcine", "in", "blood", "serum", "as", "well", "as", "on", "immunological", "parameters", ":", "restoration", "of", "decreased", "content", "of", "T-", "and", "0-", "lymphocytes", "." ]

[ "the", "drug", "exhibited", "distinct", "normalizing", "effect", "on", "patterns", "of", "calcium", "metabolism", ":", "increase", "of", "total", "and", "ionized", "ca2+", "and", "of", "25-ohd", ",", "decrease", "in", "concentration", "of", "parath", "hormone", "and", "osteocalcine", "in", "blood", "serum", "as", "well", "as", "on", "immunological", "parameters", ":", "restoration", "of", "decreased", "content", "of", "t-", "and", "0-", "lymphocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-atom", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-atom", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "B-peptide", "I-peptide", "O", "O", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Concentration", "of", "receptors", "of", "hormonal", "form", "of", "1", ",", "25", "(", "OH", ")", "2D3", "was", "found", "to", "be", "minimal", "in", "lymphocytes", "under", "conditions", "of", "chronic", "kidney", "insufficiency", ",", "while", "their", "expression", ",", "after", "the", "dioxyvit", "action", ",", "was", "detected", "only", "in", "patients", "with", "glomerulonephritis", "." ]

[ "concentration", "of", "receptors", "of", "hormonal", "form", "of", "1", ",", "25", "(", "oh", ")", "2d3", "was", "found", "to", "be", "minimal", "in", "lymphocytes", "under", "conditions", "of", "chronic", "kidney", "insufficiency", ",", "while", "their", "expression", ",", "after", "the", "dioxyvit", "action", ",", "was", "detected", "only", "in", "patients", "with", "glomerulonephritis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "I-lipid", "I-lipid", "I-lipid", "I-lipid", "I-lipid", "I-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-body_part", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "B-other_name", "O" ]

[ "Specific", "calcitropic", "effect", "of", "dioxyvit", "with", "simultaneous", "correction", "of", "vitamin", "D", "deficiency", "were", "apparently", "responsible", "for", "high", "efficacy", "of", "the", "drug", "in", "treatment", "of", "calcium", "metabolism", "and", "immunity", "impairments", "in", "children", "with", "renal", "deteriorations", "at", "the", "step", "of", "chronic", "kidney", "insufficiency", "." ]

[ "specific", "calcitropic", "effect", "of", "dioxyvit", "with", "simultaneous", "correction", "of", "vitamin", "d", "deficiency", "were", "apparently", "responsible", "for", "high", "efficacy", "of", "the", "drug", "in", "treatment", "of", "calcium", "metabolism", "and", "immunity", "impairments", "in", "children", "with", "renal", "deteriorations", "at", "the", "step", "of", "chronic", "kidney", "insufficiency", "." ]

[ "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-atom", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-multi_cell", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-body_part", "O", "O" ]

[ "Vitamin", "D3-", "and", "retinoic", "acid-", "induced", "monocytic", "differentiation", ":", "interactions", "between", "the", "endogenous", "vitamin", "D3", "receptor", ",", "retinoic", "acid", "receptors", ",", "and", "retinoid", "X", "receptors", "in", "U-937", "cells", "." ]

[ "vitamin", "d3-", "and", "retinoic", "acid-", "induced", "monocytic", "differentiation", ":", "interactions", "between", "the", "endogenous", "vitamin", "d3", "receptor", ",", "retinoic", "acid", "receptors", ",", "and", "retinoid", "x", "receptors", "in", "u-937", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "Retinoic", "acid", "(", "RA", ")", "and", "1", ",", "25", "alpha-dihydroxycholecalciferol", "(", "VitD3", ")", "are", "potent", "regulators", "of", "hematopoletic", "differentiation", "." ]

[ "retinoic", "acid", "(", "ra", ")", "and", "1", ",", "25", "alpha-dihydroxycholecalciferol", "(", "vitd3", ")", "are", "potent", "regulators", "of", "hematopoletic", "differentiation", "." ]

[ "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-lipid", "I-lipid", "I-lipid", "I-lipid", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Yet", ",", "little", "is", "known", "as", "to", "how", "the", "RA", "and", "VitD3", "receptor", "network", "operates", "in", "hematopoietic", "cells", ",", "and", "whether", "receptor", "interactions", "can", "explain", "the", "interplay", "between", "the", "RA", "-and", "VitD3", "-signaling", "pathways", "during", "differentiation", "." ]

[ "yet", ",", "little", "is", "known", "as", "to", "how", "the", "ra", "and", "vitd3", "receptor", "network", "operates", "in", "hematopoietic", "cells", ",", "and", "whether", "receptor", "interactions", "can", "explain", "the", "interplay", "between", "the", "ra", "-and", "vitd3", "-signaling", "pathways", "during", "differentiation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-lipid", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O" ]

[ "Therefore", ",", "we", "analyzed", "the", "expression", ",", "DNA", "binding", ",", "and", "transcriptional", "activity", "of", "the", "endogenous", "RA", "and", "VitD3", "receptors", "[", "retinoic", "acid", "receptors", "(", "RARs", ")", ",", "retinoid", "X", "receptors", "(", "RXRs", ")", ",", "and", "VitD3", "receptor", "(", "VDR", ")", "]", "in", "the", "U-937", "cell", "line", ",", "in", "which", "RA", "and", "VitD3", "induce", "distinct", "monocytic", "differentiation", "pathways", "." ]

[ "therefore", ",", "we", "analyzed", "the", "expression", ",", "dna", "binding", ",", "and", "transcriptional", "activity", "of", "the", "endogenous", "ra", "and", "vitd3", "receptors", "[", "retinoic", "acid", "receptors", "(", "rars", ")", ",", "retinoid", "x", "receptors", "(", "rxrs", ")", ",", "and", "vitd3", "receptor", "(", "vdr", ")", "]", "in", "the", "u-937", "cell", "line", ",", "in", "which", "ra", "and", "vitd3", "induce", "distinct", "monocytic", "differentiation", "pathways", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "B-other_organic_compound", "O", "B-lipid", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-lipid", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "VitD3", "induction", "resulted", "in", "the", "formation", "of", "VDR", "/RXR", "DNA-binding", "complexes", "on", "both", "VitD3", "response", "elements", "and", "RA", "response", "elements", "(", "RAREs", ")", "." ]

[ "vitd3", "induction", "resulted", "in", "the", "formation", "of", "vdr", "/rxr", "dna-binding", "complexes", "on", "both", "vitd3", "response", "elements", "and", "ra", "response", "elements", "(", "rares", ")", "." ]

[ "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O" ]

[ "However", ",", "transcriptional", "activation", "was", "only", "observed", "from", "a", "VitD3", "response", "element-driven", "reporter", "construct", "." ]

[ "however", ",", "transcriptional", "activation", "was", "only", "observed", "from", "a", "vitd3", "response", "element-driven", "reporter", "construct", "." ]

[ "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Several", "DNA-binding", "complexes", "were", "detected", "on", "RAREs", "in", "undifferentiated", "cells", "." ]

[ "several", "dna-binding", "complexes", "were", "detected", "on", "rares", "in", "undifferentiated", "cells", "." ]

[ "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Stimulation", "by", "RA", "resulted", "in", "increased", "RAR", "beta", "/RXR", "DNA", "binding", ",", "activated", "RARE", "-dependent", "transcription", ",", "and", "increased", "expression", "of", "RAR-beta", "." ]

[ "stimulation", "by", "ra", "resulted", "in", "increased", "rar", "beta", "/rxr", "dna", "binding", ",", "activated", "rare", "-dependent", "transcription", ",", "and", "increased", "expression", "of", "rar-beta", "." ]

[ "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Concomitant", "stimulation", "by", "VitD3", "inhibited", "the", "RA", "-stimulated", "formation", "of", "RAR", "beta", "/RXR", "heterodimers", ",", "favoring", "VDR", "/RXR", "binding", "to", "the", "RARE", "." ]

[ "concomitant", "stimulation", "by", "vitd3", "inhibited", "the", "ra", "-stimulated", "formation", "of", "rar", "beta", "/rxr", "heterodimers", ",", "favoring", "vdr", "/rxr", "binding", "to", "the", "rare", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "Also", ",", "VitD3", "inhibited", "the", "expression", "of", "CD23", "and", "CD49f", ",", "characteristic", "markers", "of", "retinoid-induced", "U-937", "cell", "differentiation", "." ]

[ "also", ",", "vitd3", "inhibited", "the", "expression", "of", "cd23", "and", "cd49f", ",", "characteristic", "markers", "of", "retinoid-induced", "u-937", "cell", "differentiation", "." ]

[ "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "neither", "the", "RA", "-stimulated", ",", "RARE", "-mediated", "transcription", "nor", "the", "induced", "RAR-beta", "expression", "was", "suppressed", "by", "VitD3", ",", "suggesting", "that", "VitD3", "selectively", "inhibited", "the", "retinoid-induced", "differentiation", "program", "but", "not", "the", "RARE", "-mediated", "signal", "." ]

[ "in", "contrast", ",", "neither", "the", "ra", "-stimulated", ",", "rare", "-mediated", "transcription", "nor", "the", "induced", "rar-beta", "expression", "was", "suppressed", "by", "vitd3", ",", "suggesting", "that", "vitd3", "selectively", "inhibited", "the", "retinoid-induced", "differentiation", "program", "but", "not", "the", "rare", "-mediated", "signal", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "demonstrate", "a", "complex", "role", "for", "VitD3", "in", "modifying", "the", "retinoid", "differentiation", "pathway", "and", "may", "have", "implications", "for", "differentiation-inducing", "therapy", "of", "hematopoietic", "tumors", "." ]

[ "these", "results", "demonstrate", "a", "complex", "role", "for", "vitd3", "in", "modifying", "the", "retinoid", "differentiation", "pathway", "and", "may", "have", "implications", "for", "differentiation-inducing", "therapy", "of", "hematopoietic", "tumors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-tissue", "I-tissue", "O" ]

[ "Phosphatidylinositol", "3-kinase", "couples", "the", "interleukin-2", "receptor", "to", "the", "cell", "cycle", "regulator", "E2F", "." ]

[ "phosphatidylinositol", "3-kinase", "couples", "the", "interleukin-2", "receptor", "to", "the", "cell", "cycle", "regulator", "e2f", "." ]

[ "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Cell", "cycle", "progression", "initiated", "by", "interleukin-2", "(", "IL-2", ")", "in", "T", "cells", "is", "critical", "for", "lymphoproliferation", "and", "an", "immune", "response", "." ]

[ "cell", "cycle", "progression", "initiated", "by", "interleukin-2", "(", "il-2", ")", "in", "t", "cells", "is", "critical", "for", "lymphoproliferation", "and", "an", "immune", "response", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Phosphatidyl", "inositol", "3-kinase", "(", "PI3K", ")", "is", "activated", "by", "IL-2", "." ]

[ "phosphatidyl", "inositol", "3-kinase", "(", "pi3k", ")", "is", "activated", "by", "il-2", "." ]

[ "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "However", ",", "nuclear", "targets", "for", "PI3K", "are", "not", "known", "." ]

[ "however", ",", "nuclear", "targets", "for", "pi3k", "are", "not", "known", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", "we", "identify", "the", "cell", "cycle", "regulator", "E2F", "as", "an", "IL-2", "target", "in", "T", "lymphocytes", "and", "PI3K", "as", "the", "critical", "signaling", "pathway", "." ]

[ "here", "we", "identify", "the", "cell", "cycle", "regulator", "e2f", "as", "an", "il-2", "target", "in", "t", "lymphocytes", "and", "pi3k", "as", "the", "critical", "signaling", "pathway", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "We", "eliminate", "both", "Stat5", "and", "Raf", "/MEK", "pathways", "from", "E2F", "regulation", "." ]

[ "we", "eliminate", "both", "stat5", "and", "raf", "/mek", "pathways", "from", "e2f", "regulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Protein", "kinase", "B", "(", "PKB", ")", "is", "activated", "by", "IL-2", "via", "PI3K", "." ]

[ "protein", "kinase", "b", "(", "pkb", ")", "is", "activated", "by", "il-2", "via", "pi3k", "." ]

[ "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "The", "expression", "of", "an", "active", "PKB", "is", "sufficient", "to", "induce", "E2F", "activity", "." ]

[ "the", "expression", "of", "an", "active", "pkb", "is", "sufficient", "to", "induce", "e2f", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Inhibition", "of", "PI3K", "inhibits", "phosphorylation", "of", "Rb", ",", "induction", "of", "cyclin", "D3", ",", "and", "degradation", "of", "p27kip1", "." ]

[ "inhibition", "of", "pi3k", "inhibits", "phosphorylation", "of", "rb", ",", "induction", "of", "cyclin", "d3", ",", "and", "degradation", "of", "p27kip1", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "These", "results", "establish", "a", "crucial", "PI3K", "/", "PKB", "-mediated", "link", "between", "the", "IL-2", "teceptor", "and", "the", "cell", "cycle", "machinery", "." ]

[ "these", "results", "establish", "a", "crucial", "pi3k", "/", "pkb", "-mediated", "link", "between", "the", "il-2", "teceptor", "and", "the", "cell", "cycle", "machinery", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Upregulation", "of", "bcl-2", "by", "the", "Epstein-Barr", "virus", "latent", "membrane", "protein", "LMP1", ":", "a", "B-cell-specific", "response", "that", "is", "delayed", "relative", "to", "NF-kappa", "B", "activation", "and", "to", "induction", "of", "cell", "surface", "markers", "." ]

[ "upregulation", "of", "bcl-2", "by", "the", "epstein-barr", "virus", "latent", "membrane", "protein", "lmp1", ":", "a", "b-cell-specific", "response", "that", "is", "delayed", "relative", "to", "nf-kappa", "b", "activation", "and", "to", "induction", "of", "cell", "surface", "markers", "." ]

[ "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "An", "ability", "of", "the", "Epstein-Barr", "virus", "latent", "membrane", "protein", "LMP1", "to", "enhance", "the", "survival", "of", "infected", "B", "cells", "through", "upregulation", "of", "the", "bcl-2", "oncogene", "was", "first", "suggested", "by", "experiments", "involving", "gene", "transfection", "and", "the", "selection", "of", "stable", "LMP1", "+", "clones", "(", "S", ".", "Henderson", ",", "M", ".", "Rowe", ",", "C", ".", "Gregory", ",", "F", ".", "Wang", ",", "E", ".", "Kieff", ",", "and", "A", ".", "Rickinson", ",", "Cell", "65", ":", "1107-1115", ",", "1991", ")", "." ]

[ "an", "ability", "of", "the", "epstein-barr", "virus", "latent", "membrane", "protein", "lmp1", "to", "enhance", "the", "survival", "of", "infected", "b", "cells", "through", "upregulation", "of", "the", "bcl-2", "oncogene", "was", "first", "suggested", "by", "experiments", "involving", "gene", "transfection", "and", "the", "selection", "of", "stable", "lmp1", "+", "clones", "(", "s", ".", "henderson", ",", "m", ".", "rowe", ",", "c", ".", "gregory", ",", "f", ".", "wang", ",", "e", ".", "kieff", ",", "and", "a", ".", "rickinson", ",", "cell", "65", ":", "1107-1115", ",", "1991", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-virus", "I-virus", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "it", "was", "not", "possible", "to", "ascertain", "whether", "Bcl-2", "upregulation", "was", "a", "specific", "consequence", "of", "LMP1", "expression", "or", "an", "artifact", "of", "the", "selection", "procedure", "whereby", "rare", "Bcl-2", "+", "cells", "already", "present", "in", "the", "starting", "population", "might", "best", "be", "able", "to", "tolerate", "the", "potentially", "toxic", "effects", "of", "LMP1", "." ]

[ "however", ",", "it", "was", "not", "possible", "to", "ascertain", "whether", "bcl-2", "upregulation", "was", "a", "specific", "consequence", "of", "lmp1", "expression", "or", "an", "artifact", "of", "the", "selection", "procedure", "whereby", "rare", "bcl-2", "+", "cells", "already", "present", "in", "the", "starting", "population", "might", "best", "be", "able", "to", "tolerate", "the", "potentially", "toxic", "effects", "of", "lmp1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "We", "therefore", "reexamined", "this", "issue", "by", "using", "two", "different", "experimental", "approaches", "that", "allowed", "LMP1", "-induced", "effects", "to", "be", "monitored", "immediately", "following", "expression", "of", "the", "viral", "protein", "and", "in", "the", "absence", "of", "selective", "pressures", ";", "activation", "of", "the", "NF-kappa", "B", "transcription", "factor", "and", "upregulation", "of", "the", "cell", "adhesion", "molecule", "ICAM-1", "were", "used", "as", "early", "indices", "of", "LMP1", "function", "." ]

[ "we", "therefore", "reexamined", "this", "issue", "by", "using", "two", "different", "experimental", "approaches", "that", "allowed", "lmp1", "-induced", "effects", "to", "be", "monitored", "immediately", "following", "expression", "of", "the", "viral", "protein", "and", "in", "the", "absence", "of", "selective", "pressures", ";", "activation", "of", "the", "nf-kappa", "b", "transcription", "factor", "and", "upregulation", "of", "the", "cell", "adhesion", "molecule", "icam-1", "were", "used", "as", "early", "indices", "of", "lmp1", "function", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "In", "the", "first", "approach", ",", "stable", "clones", "of", "two", "B-cell", "lines", "carrying", "an", "LMP1", "gene", "under", "the", "control", "of", "an", "inducible", "metallothionein", "promoter", "were", "induced", "to", "express", "LMP1", "in", "all", "cells", "." ]

[ "in", "the", "first", "approach", ",", "stable", "clones", "of", "two", "b-cell", "lines", "carrying", "an", "lmp1", "gene", "under", "the", "control", "of", "an", "inducible", "metallothionein", "promoter", "were", "induced", "to", "express", "lmp1", "in", "all", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Activation", "of", "NK-kappa", "B", "and", "upregulation", "of", "ICAM-1", "occurred", "within", "24", "h", "and", "were", "followed", "at", "48", "to", "72", "h", "by", "upregulation", "of", "Bcl-2", "." ]

[ "activation", "of", "nk-kappa", "b", "and", "upregulation", "of", "icam-1", "occurred", "within", "24", "h", "and", "were", "followed", "at", "48", "to", "72", "h", "by", "upregulation", "of", "bcl-2", "." ]

[ "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "In", "the", "second", "approach", ",", "we", "tested", "the", "generality", "of", "this", "phenomenon", "by", "transiently", "expressing", "LMP1", "from", "a", "strong", "constitutively", "active", "promoter", "in", "a", "range", "of", "different", "cell", "types", "." ]

[ "in", "the", "second", "approach", ",", "we", "tested", "the", "generality", "of", "this", "phenomenon", "by", "transiently", "expressing", "lmp1", "from", "a", "strong", "constitutively", "active", "promoter", "in", "a", "range", "of", "different", "cell", "types", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "six", "B-cell", "lines", "tested", "showed", "NF-kappa", "B", "activation", "in", "response", "to", "LMP1", "expression", ",", "and", "this", "was", "followed", "in", "five", "of", "six", "lines", "by", "expression", "of", "ICAM-1", "and", "Bcl-2", "." ]

[ "all", "six", "b-cell", "lines", "tested", "showed", "nf-kappa", "b", "activation", "in", "response", "to", "lmp1", "expression", ",", "and", "this", "was", "followed", "in", "five", "of", "six", "lines", "by", "expression", "of", "icam-1", "and", "bcl-2", "." ]

[ "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "In", "the", "same", "experiments", ",", "all", "three", "non-", "B-cell", "lines", "showed", "NF-kappa", "B", "activation", "and", "ICAM-1", "upregulation", "but", "never", "any", "effect", "upon", "Bcl-2", "." ]

[ "in", "the", "same", "experiments", ",", "all", "three", "non-", "b-cell", "lines", "showed", "nf-kappa", "b", "activation", "and", "icam-1", "upregulation", "but", "never", "any", "effect", "upon", "bcl-2", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "We", "therefore", "conclude", "that", "Bcl-2", "upregulation", "is", "part", "of", "the", "panoply", "of", "cellular", "changes", "induced", "by", "LMP1", "but", "that", "the", "effect", "is", "cell", "type", "specific", "." ]

[ "we", "therefore", "conclude", "that", "bcl-2", "upregulation", "is", "part", "of", "the", "panoply", "of", "cellular", "changes", "induced", "by", "lmp1", "but", "that", "the", "effect", "is", "cell", "type", "specific", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "data", "also", "suggest", "that", "whilst", "NF-kappa", "B", "may", "be", "an", "essential", "component", "of", "LMP1", "signal", "transduction", ",", "other", "cell-specific", "factors", "may", "be", "required", "to", "effect", "some", "functions", "of", "the", "viral", "protein", "." ]

[ "our", "data", "also", "suggest", "that", "whilst", "nf-kappa", "b", "may", "be", "an", "essential", "component", "of", "lmp1", "signal", "transduction", ",", "other", "cell-specific", "factors", "may", "be", "required", "to", "effect", "some", "functions", "of", "the", "viral", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "Interleukin-10", "stabilizes", "inhibitory", "kappaB-alpha", "in", "human", "monocytes", "." ]

[ "interleukin-10", "stabilizes", "inhibitory", "kappab-alpha", "in", "human", "monocytes", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]