Datasets:

chintagunta85

/

ncbi_disease

like 0

[ "The", "deduced", "protein", "sequence", "shows", "significant", "sequence", "identity", "to", "a", "peroxisomal", "membrane", "protein", "of", "M", "(", "r", ")", "70K", "that", "is", "involved", "in", "peroxisome", "biogenesis", "and", "belongs", "to", "the", "ATP", "-", "binding", "cassette", "superfamily", "of", "transporters", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Targeted", "modification", "of", "the", "apolipoprotein", "B", "gene", "results", "in", "hypobetalipoproteinemia", "and", "developmental", "abnormalities", "in", "mice", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 5, 6, 0, 0, 0 ]

[ "Familial", "hypobetalipoproteinemia", "is", "an", "autosomal", "codominant", "disorder", "resulting", "in", "a", "dramatic", "reduction", "in", "plasma", "concentrations", "of", "apolipoprotein", "(", "apo", ")", "B", ",", "cholesterol", ",", "and", "beta", "-", "migrating", "lipoproteins", "." ]

[ 5, 6, 0, 0, 5, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "benefit", "of", "hypobetalipoproteinemia", "is", "that", "mildly", "affected", "individuals", "may", "be", "protected", "from", "coronary", "vascular", "disease", "." ]

[ 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 0 ]

[ "We", "have", "used", "gene", "targeting", "to", "generate", "mice", "with", "a", "modified", "Apob", "allele", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Mice", "containing", "this", "allele", "display", "all", "of", "the", "hallmarks", "of", "human", "hypobetalipoproteinemia", "they", "produce", "a", "truncated", "apoB", "protein", ",", "apoB70", ",", "and", "have", "markedly", "decreased", "plasma", "concentrations", "of", "apoB", ",", "beta", "-", "lipoproteins", ",", "and", "total", "cholesterol", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "addition", ",", "the", "mice", "manifest", "several", "characteristics", "that", "are", "occasionally", "observed", "in", "human", "hypobetalipoproteinemia", ",", "including", "reduced", "plasma", "triglyceride", "concentrations", ",", "fasting", "chylomicronemia", ",", "and", "reduced", "high", "density", "lipoprotein", "cholesterol", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "An", "unexpected", "finding", "is", "that", "the", "modified", "Apob", "allele", "is", "strongly", "associated", "with", "exencephalus", "and", "hydrocephalus", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 5, 0 ]

[ "These", "mice", "should", "help", "increase", "our", "understanding", "of", "hypobetalipoproteinemia", ",", "atherogenesis", ",", "and", "the", "etiology", "of", "exencephalus", "and", "hydrocephalus", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 5, 0, 0 ]

[ "A", "novel", "disease", "with", "deficiency", "of", "mitochondrial", "very", "-", "long", "-", "chain", "acyl", "-", "CoA", "dehydrogenase", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0 ]

[ "Palmitoyl", "-", "CoA", "dehydrogenase", "activity", "in", "skin", "fibroblasts", "from", "seven", "patients", "with", "unidentified", "defects", "of", "fatty", "acid", "oxidation", "was", "measured", "in", "the", "presence", "and", "absence", "of", "antibodies", "against", "medium", "-", "chain", ",", "long", "-", "chain", ",", "and", "very", "-", "long", "-", "chain", "acyl", "-", "CoA", "dehydrogenases", "(", "VLCAD", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Two", "of", "the", "patients", ",", "4", "-", "5", "month", "old", "boys", ",", "were", "found", "to", "have", "a", "novel", "disease", ",", "VLCAD", "deficiency", ",", "as", "judged", "from", "the", "results", "of", "very", "low", "palmitoyl", "-", "CoA", "dehydrogenase", "activity", "and", "the", "lack", "of", "immunoreactivity", "toward", "antibody", "raised", "to", "purified", "VLCAD", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Molecular", "characterization", "of", "glucose", "-", "6", "-", "phosphate", "dehydrogenase", "(", "G6PD", ")", "deficiency", "in", "patients", "of", "Chinese", "descent", "and", "identification", "of", "new", "base", "substitutions", "in", "the", "human", "G6PD", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "underlying", "DNA", "changes", "associated", "with", "glucose", "-", "6", "-", "phosphate", "dehydrogenase", "(", "G6PD", ")", "-", "deficient", "Asians", "have", "not", "been", "extensively", "investigated", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "To", "fill", "this", "gap", ",", "we", "sequenced", "the", "G6PD", "gene", "of", "43", "G6PD", "-", "deficient", "Chinese", "whose", "G6PD", "was", "well", "characterized", "biochemically", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "DNA", "samples", "were", "obtained", "from", "peripheral", "blood", "of", "these", "individuals", "for", "sequencing", "using", "a", "direct", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "PCR", ")", "sequencing", "procedure", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "From", "these", "43", "samples", ",", "we", "have", "identified", "five", "different", "types", "of", "nucleotide", "substitutions", "in", "the", "G6PD", "gene", "at", "cDNA", "1388", "from", "G", "to", "A", "(", "Arg", "to", "His", ")", ";", "at", "cDNA", "1376", "from", "G", "to", "T", "(", "Arg", "to", "Leu", ")", ";", "at", "cDNA", "1024", "from", "C", "to", "T", "(", "Leu", "to", "Phe", ")", ";", "at", "cDNA", "392", "from", "G", "to", "T", "(", "Gly", "to", "Val", ")", ";", "at", "cDNA", "95", "from", "A", "to", "G", "(", "His", "to", "Arg", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "These", "five", "nucleotide", "substitutions", "account", "for", "over", "83", "%", "of", "our", "43", "G6PD", "-", "deficient", "samples", "and", "these", "substitutions", "have", "not", "been", "reported", "in", "non", "-", "Asians", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "substitutions", "found", "at", "cDNA", "392", "and", "cDNA", "1024", "are", "new", "findings", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "substitutions", "at", "cDNA", "1376", "and", "1388", "account", "for", "over", "50", "%", "of", "the", "43", "samples", "examined", "indicating", "a", "high", "prevalence", "of", "these", "two", "alleles", "among", "G6PD", "-", "deficient", "Chinese", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 0, 0 ]

[ "Our", "findings", "add", "support", "to", "the", "notion", "that", "diverse", "point", "mutations", "may", "account", "largely", "for", "much", "of", "the", "phenotypic", "heterogeneity", "of", "G6PD", "deficiency", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0 ]

[ "Identification", "of", "mutations", "in", "Danish", "choroideremia", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0 ]

[ "We", "have", "searched", "for", "mutations", "in", "the", "choroideremia", "gene", "(", "CHM", ")", "in", "patients", "from", "12", "Danish", "families", "in", "which", "CHM", "is", "segregating", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0 ]

[ "Employing", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "PCR", ")", ",", "single", "strand", "conformation", "polymorphism", "(", "SSCP", ")", "analysis", ",", "and", "direct", "DNA", "sequencing", ",", "different", "mutations", "have", "been", "identified", "in", "6", "patients", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "All", "the", "mutations", "will", "interfere", "with", "the", "correct", "translation", "of", "the", "mRNA", "predicting", "a", "truncated", "protein", "or", "no", "gene", "product", "at", "all", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Structure", "and", "genomic", "sequence", "of", "the", "myotonic", "dystrophy", "(", "DM", "kinase", ")", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 5, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "mutation", "causing", "myotonic", "dystrophy", "(", "DM", ")", "has", "recently", "been", "identified", "as", "an", "unstable", "CTG", "trinucleotide", "repeat", "located", "in", "the", "3", "untranslated", "region", "of", "a", "gene", "encoding", "for", "a", "protein", "with", "putative", "serine", "-", "threonine", "protein", "kinase", "activity", "." ]

[ 0, 0, 0, 5, 6, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "this", "report", "we", "present", "the", "genomic", "sequences", "of", "the", "human", "and", "murine", "DM", "kinase", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0 ]

[ "A", "comparison", "of", "these", "sequences", "with", "each", "other", "and", "with", "known", "cDNA", "sequences", "from", "both", "species", ",", "led", "us", "to", "predict", "a", "translation", "initiation", "codon", ",", "as", "well", "as", "determine", "the", "organization", "of", "the", "DM", "kinase", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0 ]

[ "Several", "polymorphisms", "within", "the", "human", "DM", "kinase", "gene", "have", "been", "identified", ",", "and", "PCR", "assays", "to", "detect", "two", "of", "these", "are", "described", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "complete", "sequence", "and", "characterization", "of", "the", "structure", "of", "the", "DM", "kinase", "gene", ",", "as", "well", "as", "the", "identification", "of", "novel", "polymorphisms", "within", "the", "gene", ",", "represent", "an", "important", "step", "in", "a", "further", "understanding", "of", "the", "genetics", "of", "myotonic", "dystrophy", "and", "the", "molecular", "biology", "of", "the", "gene", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Autosomal", "recessive", "transmission", "of", "hemophilia", "A", "due", "to", "a", "von", "Willebrand", "factor", "mutation", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0 ]

[ "The", "differential", "diagnosis", "of", "the", "genetic", "bleeding", "disorders", ",", "hemophilia", "A", "and", "von", "Willebrand", "disease", ",", "is", "occasionally", "confounded", "by", "the", "close", "molecular", "relationship", "of", "coagulation", "factor", "VIII", "and", "von", "Willebrand", "factor", "(", "vWF", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 0, 5, 6, 0, 5, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "This", "report", "describes", "the", "autosomal", "inheritance", "of", "a", "hemophilia", "A", "phenotype", "due", "to", "a", "mutation", "of", "vWF", "that", "results", "in", "defective", "factor", "VIII", "binding", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "proband", "was", "a", "female", "patient", "with", "low", "levels", "of", "factor", "VIII", "activity", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Polymerase", "chain", "reaction", "(", "PCR", ")", "amplification", "and", "DNA", "sequencing", "were", "employed", "to", "examine", "exons", "encoding", "the", "putative", "factor", "VIII", "binding", "domain", "of", "vWF", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "patient", "was", "found", "to", "be", "homozygous", "for", "a", "single", "point", "mutation", "causing", "a", "Thr", "-", "-", ">", "Met", "substitution", "at", "amino", "acid", "position", "28", "in", "the", "mature", "vWF", "subunit", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "phenotypic", "expression", "of", "the", "mutation", "was", "determined", "to", "be", "recessive", "because", "heterozygous", "family", "members", "were", "clinically", "unaffected", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Recombinant", "vWF", "containing", "the", "observed", "amino", "acid", "substitution", "was", "expressed", "in", "COS", "-", "1", "cells", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "mutant", "vWF", "was", "processed", "and", "secreted", "normally", ",", "and", "was", "functionally", "equivalent", "to", "wild", "-", "type", "vWF", "in", "its", "ability", "to", "bind", "to", "platelets", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "However", ",", "the", "mutant", "failed", "to", "bind", "factor", "VIII", ",", "demonstrating", "that", "the", "mutation", "was", "functionally", "related", "to", "the", "observed", "hemophilia", "phenotype", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0 ]

[ "The", "family", "we", "describe", "demonstrates", "the", "recessive", "inheritance", "of", "a", "recently", "recognized", "class", "of", "genetic", "bleeding", "disorders", ",", "we", "call", "\"", "autosomal", "hemophilia", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0 ]

[ "\"", "We", "conclude", "that", "vWF", "mutation", "may", "be", "an", "under", "recognized", "cause", "of", "hemophilia", ",", "especially", "in", "cases", "where", "the", "inheritance", "pattern", "is", "not", "consistent", "with", "X", "-", "linked", "transmission", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Somatic", "von", "Hippel", "-", "Lindau", "mutation", "in", "clear", "cell", "papillary", "cystadenoma", "of", "the", "epididymis", "." ]

[ 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 0 ]

[ "Papillary", "cystadenoma", "of", "the", "epididymis", "is", "an", "uncommon", "benign", "lesion", "that", "may", "occur", "sporadically", "or", "as", "a", "manifestation", "of", "von", "Hippel", "-", "Lindau", "(", "VHL", ")", "disease", "." ]

[ 5, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0 ]

[ "Neither", "immunohistochemical", "studies", "nor", "molecular", "genetic", "analyses", "of", "the", "VHL", "gene", "have", "been", "reported", "previously", "for", "this", "lesion", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "authors", "describe", "two", "cases", "of", "clear", "cell", "papillary", "cystadenoma", "of", "the", "epididymis", ",", "both", "of", "which", "were", "initially", "confused", "with", "metastatic", "renal", "cell", "carcinoma", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0 ]

[ "Both", "lesions", "showed", "positive", "immunohistochemical", "staining", "for", "low", "and", "intermediate", "molecular", "weight", "keratins", "(", "Cam", "5", ".", "2", "and", "AE1", "/", "AE3", ")", ",", "EMA", ",", "vimentin", ",", "alpha", "1", "-", "antitrypsin", ",", "and", "alpha", "1", "-", "antichymotrypsin", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Each", "was", "negative", "for", "CEA", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Because", "clear", "cell", "papillary", "cystadenoma", "is", "similar", "to", "renal", "cell", "carcinoma", "histologically", ",", "and", "because", "both", "occur", "as", "components", "of", "the", "von", "Hippel", "-", "Lindau", "disease", "complex", ",", "the", "authors", "analyzed", "both", "cases", "for", "the", "presence", "of", "mutations", "in", "the", "VHL", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0 ]

[ "A", "somatic", "VHL", "gene", "mutation", "was", "detected", "in", "one", "of", "the", "two", "tumors", "by", "polymerase", "chain", "reaction", "followed", "by", "single", "-", "strand", "conformation", "polymorphism", "analysis", "." ]

[ 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Direct", "sequencing", "revealed", "a", "cytosine", "to", "thymine", "transition", "at", "nucleotide", "694", ",", "resulting", "in", "the", "replacement", "of", "an", "arginine", "with", "a", "stop", "codon", "after", "the", "sixth", "amino", "acid", "of", "exon", "3", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "As", "the", "VHL", "gene", "is", "believed", "to", "function", "as", "a", "tumor", "suppressor", "gene", ",", "VHL", "gene", "mutations", "may", "play", "a", "role", "in", "the", "initiation", "of", "tumorigenesis", "in", "sporadic", "cystadenomas", "of", "the", "epididymis", "." ]

[ 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0 ]

[ "Identification", "of", "WASP", "mutations", "in", "patients", "with", "Wiskott", "-", "Aldrich", "syndrome", "and", "isolated", "thrombocytopenia", "reveals", "allelic", "heterogeneity", "at", "the", "WAS", "locus", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0 ]

[ "Mutation", "in", "the", "gene", "encoding", "the", "recently", "isolated", "WASP", "protein", "has", "now", "been", "identified", "as", "the", "genetic", "defect", "responsible", "for", "the", "X", "-", "linked", "Wiskott", "-", "Aldrich", "syndrome", "(", "WAS", ")", ",", "a", "primary", "immunodeficiency", "disease", "associated", "with", "extensive", "phenotypic", "variability", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 6, 6, 6, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "To", "elucidate", "the", "range", "of", "WASP", "mutations", "responsible", "for", "WAS", ",", "we", "used", "PCR", "-", "SSCP", "analysis", "to", "screen", "for", "WASP", "gene", "mutation", "in", "19", "unrelated", "boys", "with", "the", "diagnosis", "of", "classical", "or", "attenuated", "WAS", "or", "isolated", "thrombocytopenia", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 5, 6, 0 ]

[ "All", "19", "patients", "had", "WASP", "mutations", ",", "each", "of", "which", "localized", "to", "the", "initial", "three", "or", "terminal", "three", "exons", "of", "the", "gene", ",", "and", "the", "majority", "of", "which", "were", "unique", "in", "each", "case", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "However", ",", "a", "missense", "mutation", "which", "results", "in", "substitution", "of", "the", "arginine", "at", "WAS", "codon", "86", "was", "identified", "in", "three", "boys", "with", "severe", "WAS", "as", "well", "as", "in", "one", "boy", "presenting", "with", "thrombocytopenia", "alone", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0 ]

[ "While", "the", "three", "mutations", "found", "in", "the", "isolated", "thrombocytopenia", "patients", "leave", "the", "reading", "frame", "intact", ",", "about", "one", "-", "half", "of", "the", "gene", "alterations", "detected", "in", "both", "severe", "and", "attenuated", "WAS", "patients", "result", "in", "frameshifted", "transcript", "and", "premature", "translation", "termination", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "These", "findings", "therefore", "confirm", "the", "association", "of", "WAS", "with", "WASP", "mutation", "and", "identify", "WASP", "mutation", "as", "a", "cause", "for", "isolated", "congenital", "thrombocytopenia", "in", "males", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0 ]

[ "While", "the", "WASP", "gene", "defects", "responsible", "for", "isolated", "thrombocytopenia", "and", "other", "mild", "presentations", "of", "WAS", "do", "not", "appear", "distinct", "from", "those", "resulting", "in", "severe", "WAS", ",", "these", "data", "indicate", "that", "analysis", "of", "WASP", "gene", "mutation", "provides", "a", "valuable", "tool", "for", "distinguishing", "the", "spectrum", "of", "WAS", "patients", "and", "the", "subset", "of", "males", "with", "isolated", "thrombocytopenia", "who", "represent", "mild", "cases", "of", "WAS", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0 ]

[ "WASP", "gene", "mutations", "in", "Wiskott", "-", "Aldrich", "syndrome", "and", "X", "-", "linked", "thrombocytopenia", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 5, 6, 6, 6, 0 ]

[ "The", "WASP", "gene", "has", "been", "recently", "cloned", "from", "Xp11", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "23", "and", "shown", "to", "be", "mutated", "in", "three", "patients", "with", "the", "Wiskott", "-", "Aldrich", "syndrome", "(", "WAS", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 5, 0, 0 ]

[ "We", "have", "developed", "a", "screening", "protocol", "for", "identifying", "WASP", "gene", "alterations", "in", "genomic", "DNA", "and", "have", "identified", "a", "spectrum", "of", "novel", "mutations", "in", "12", "additional", "unrelated", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "These", "missense", ",", "nonsense", "and", "frameshift", "mutations", "involve", "eight", "of", "the", "12", "exons", "of", "the", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Two", "mutations", "creating", "premature", "termination", "codons", "were", "associated", "with", "lack", "of", "detectable", "mRNA", "on", "Northern", "blots", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Four", "amino", "acid", "substitutions", ",", "Leu27Phe", ",", "Thr48Ile", ",", "Val75Met", "and", "Arg477Lys", ",", "were", "found", "in", "patients", "with", "congenital", "thrombocytopenia", "and", "no", "clinically", "evident", "immune", "defect", "indicating", "that", "the", "WASP", "gene", "is", "the", "site", "for", "mutations", "in", "X", "-", "linked", "thrombocytopenia", "as", "well", "as", "in", "WAS", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 5, 0 ]

[ "A", "T", "-", "cell", "line", "from", "a", "WAS", "patient", "contained", "two", "independent", "DNA", "alterations", ",", "a", "constitutional", "frameshift", "mutation", ",", "also", "present", "in", "peripheral", "blood", "leukocytes", "from", "the", "patient", ",", "and", "compensatory", "splice", "site", "mutation", "unique", "to", "the", "cell", "line", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "distribution", "of", "eight", "missense", "mutations", "provides", "valuable", "information", "on", "amino", "acids", "which", "are", "essential", "for", "normal", "protein", "function", ",", "and", "suggests", "that", "sites", "in", "the", "first", "two", "exons", "are", "hot", "-", "spots", "for", "mutation", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Evidence", "for", "inter", "-", "generational", "instability", "in", "the", "CAG", "repeat", "in", "the", "MJD1", "gene", "and", "for", "conserved", "haplotypes", "at", "flanking", "markers", "amongst", "Japanese", "and", "Caucasian", "subjects", "with", "Machado", "-", "Joseph", "disease", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0 ]

[ "The", "size", "of", "the", "(", "CAG", ")", "n", "repeat", "array", "in", "the", "3", "'", "end", "of", "the", "MJD1", "gene", "and", "the", "haplotype", "at", "a", "series", "of", "microsatellite", "markers", "surrounding", "the", "MJD1", "gene", "were", "examined", "in", "a", "large", "cohort", "of", "Japanese", "and", "Caucasian", "subjects", "affected", "with", "Machado", "-", "Joseph", "disease", "(", "MJD", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 5, 0, 0 ]

[ "Our", "data", "provide", "five", "novel", "observations", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "First", ",", "MJD", "is", "associated", "with", "expansion", "fo", "the", "array", "from", "the", "normal", "range", "of", "14", "-", "37", "repeats", "to", "68", "-", "84", "repeats", "in", "most", "Japanese", "and", "Caucasian", "subjects", ",", "but", "no", "subjects", "were", "observed", "with", "expansions", "intermediate", "in", "size", "between", "those", "of", "the", "normal", "and", "MJD", "affected", "groups", "." ]

[ 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0 ]

[ "Second", ",", "the", "expanded", "allele", "associated", "with", "MJD", "displays", "inter", "-", "generational", "instability", ",", "particularly", "in", "male", "meioses", ",", "and", "this", "instability", "was", "associated", "with", "the", "clinical", "phenomenon", "of", "anticipation", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Third", ",", "the", "size", "of", "the", "expanded", "allele", "is", "not", "only", "inversely", "correlated", "with", "the", "age", "-", "of", "-", "onset", "of", "MJD", "(", "r", "=", "-", "0", ".", "738", ",", "p", "<", "0", ".", "001", ")", ",", "but", "is", "also", "correlated", "with", "the", "frequency", "of", "other", "clinical", "features", "[", "e", ".", "g", ".", "pseudoexophthalmos", "and", "pyramidal", "signs", "were", "more", "frequent", "in", "subjects", "with", "large", "repeats", "(", "p", "<", "0", ".", "001", "and", "p", "<", "0", ".", "05", "respectively", ")", "]", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Fourth", ",", "the", "disease", "phenotype", "is", "significantly", "more", "severe", "and", "had", "an", "early", "age", "of", "onset", "(", "16", "years", ")", "in", "a", "subject", "homozygous", "for", "the", "expanded", "allele", ",", "which", "contrasts", "with", "Huntington", "disease", "and", "suggests", "that", "the", "expanded", "allele", "in", "the", "MJD1", "gene", "could", "exert", "its", "effect", "either", "by", "a", "dominant", "negative", "effect", "(", "putatively", "excluded", "in", "HD", ")", "or", "by", "a", "gain", "of", "function", "effect", "as", "proposed", "for", "HD", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0 ]

[ "Finally", ",", "Japanese", "and", "Caucasian", "subjects", "affected", "with", "MJD", "share", "haplotypes", "at", "several", "markers", "surrounding", "the", "MJD1", "gene", ",", "which", "are", "uncommon", "in", "the", "normal", "Japanese", "and", "Caucasian", "population", ",", "and", "which", "suggests", "the", "existence", "either", "of", "common", "founders", "in", "these", "populations", "or", "of", "chromosomes", "susceptible", "to", "pathologic", "expansion", "of", "the", "CAG", "repeat", "in", "the", "MJD1", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Evidence", "for", "inter", "-", "generational", "instability", "in", "the", "CAG", "repeat", "in", "the", "MJD1", "gene", "and", "for", "conserved", "haplotypes", "at", "flanking", "markers", "amongst", "Japanese", "and", "Caucasian", "subjects", "with", "Machado", "-", "Joseph", "disease", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0 ]

[ "The", "size", "of", "the", "(", "CAG", ")", "n", "repeat", "array", "in", "the", "3", "'", "end", "of", "the", "MJD1", "gene", "and", "the", "haplotype", "at", "a", "series", "of", "microsatellite", "markers", "surrounding", "the", "MJD1", "gene", "were", "examined", "in", "a", "large", "cohort", "of", "Japanese", "and", "Caucasian", "subjects", "affected", "with", "Machado", "-", "Joseph", "disease", "(", "MJD", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 5, 0, 0 ]

[ "Our", "data", "provide", "five", "novel", "observations", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "First", ",", "MJD", "is", "associated", "with", "expansion", "fo", "the", "array", "from", "the", "normal", "range", "of", "14", "-", "37", "repeats", "to", "68", "-", "84", "repeats", "in", "most", "Japanese", "and", "Caucasian", "subjects", ",", "but", "no", "subjects", "were", "observed", "with", "expansions", "intermediate", "in", "size", "between", "those", "of", "the", "normal", "and", "MJD", "affected", "groups", "." ]

[ 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0 ]

[ "Second", ",", "the", "expanded", "allele", "associated", "with", "MJD", "displays", "inter", "-", "generational", "instability", ",", "particularly", "in", "male", "meioses", ",", "and", "this", "instability", "was", "associated", "with", "the", "clinical", "phenomenon", "of", "anticipation", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Third", ",", "the", "size", "of", "the", "expanded", "allele", "is", "not", "only", "inversely", "correlated", "with", "the", "age", "-", "of", "-", "onset", "of", "MJD", "(", "r", "=", "-", "0", ".", "738", ",", "p", "<", "0", ".", "001", ")", ",", "but", "is", "also", "correlated", "with", "the", "frequency", "of", "other", "clinical", "features", "[", "e", ".", "g", ".", "pseudoexophthalmos", "and", "pyramidal", "signs", "were", "more", "frequent", "in", "subjects", "with", "large", "repeats", "(", "p", "<", "0", ".", "001", "and", "p", "<", "0", ".", "05", "respectively", ")", "]", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Fourth", ",", "the", "disease", "phenotype", "is", "significantly", "more", "severe", "and", "had", "an", "early", "age", "of", "onset", "(", "16", "years", ")", "in", "a", "subject", "homozygous", "for", "the", "expanded", "allele", ",", "which", "contrasts", "with", "Huntington", "disease", "and", "suggests", "that", "the", "expanded", "allele", "in", "the", "MJD1", "gene", "could", "exert", "its", "effect", "either", "by", "a", "dominant", "negative", "effect", "(", "putatively", "excluded", "in", "HD", ")", "or", "by", "a", "gain", "of", "function", "effect", "as", "proposed", "for", "HD", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0 ]

[ "Finally", ",", "Japanese", "and", "Caucasian", "subjects", "affected", "with", "MJD", "share", "haplotypes", "at", "several", "markers", "surrounding", "the", "MJD1", "gene", ",", "which", "are", "uncommon", "in", "the", "normal", "Japanese", "and", "Caucasian", "population", ",", "and", "which", "suggests", "the", "existence", "either", "of", "common", "founders", "in", "these", "populations", "or", "of", "chromosomes", "susceptible", "to", "pathologic", "expansion", "of", "the", "CAG", "repeat", "in", "the", "MJD1", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "4", "-", "megabase", "YAC", "contig", "that", "spans", "the", "Langer", "-", "Giedion", "syndrome", "region", "on", "human", "chromosome", "8q24", ".", "1", ":", "use", "in", "refining", "the", "location", "of", "the", "trichorhinophalangeal", "syndrome", "and", "multiple", "exostoses", "genes", "(", "TRPS1", "and", "EXT1", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "have", "constructed", "a", "physical", "map", "covering", "over", "4", "Mb", "of", "human", "chromosome", "8q24", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "1", "and", "used", "this", "map", "to", "refine", "the", "locations", "of", "the", "genes", "responsible", "for", "Langer", "-", "Giedion", "syndrome", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0 ]

[ "The", "map", "is", "composed", "of", "overlapping", "YAC", "clones", "that", "were", "identified", "and", "ordered", "in", "relation", "to", "sequence", "tagged", "sites", "mapped", "to", "the", "Langer", "-", "Giedion", "chromosomal", "region", "on", "somatic", "cell", "hybrids", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "minimal", "region", "of", "overlap", "of", "Langer", "-", "Giedion", "syndrome", "deletions", ",", "previously", "identified", "by", "analysis", "of", "15", "patients", ",", "was", "placed", "on", "the", "map", "by", "analysis", "of", "2", "patients", "whose", "deletions", "define", "the", "endpoints", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "chromosome", "8", "breakpoint", "of", "a", "balanced", "t", "(", "8", ";", "9", ")", "(", "q24", ".", "11", ";", "q33", ".", "3", ")", "translocation", "from", "a", "patient", "with", "trichorhinophalangeal", "syndrome", "(", "TRPS", "I", ")", "was", "found", "to", "be", "located", "just", "within", "the", "proximal", "end", "of", "the", "minimal", "deletion", "region", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "deletion", "of", "8q24", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "11", "-", "q24", "." ]

[ 0, 0, 0, 0 ]

[ "3", "in", "a", "patient", "with", "multiple", "exostoses", "was", "found", "to", "overlap", "the", "distal", "end", "of", "the", "LGS", "deletion", "region", ",", "indicating", "that", "the", "EXT1", "gene", "is", "distal", "to", "the", "TRPS1", "gene", "and", "supporting", "the", "hypothesis", "that", "Langer", "-", "Giedion", "syndrome", "is", "due", "to", "loss", "of", "functional", "copies", "of", "both", "the", "TRPS1", "and", "the", "EXT1", "genes" ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "BRCA1", "mutations", "in", "a", "population", "-", "based", "sample", "of", "young", "women", "with", "breast", "cancer", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0 ]

[ "BACKGROUND", "." ]

[ 0, 0 ]

[ "Inherited", "mutations", "in", "the", "BRCA1", "gene", "are", "associated", "with", "a", "high", "risk", "of", "breast", "and", "ovarian", "cancer", "in", "some", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 6, 6, 0, 0, 0, 0 ]

[ "However", ",", "little", "is", "known", "about", "the", "contribution", "of", "BRCA1", "mutations", "to", "breast", "cancer", "in", "the", "general", "population", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "analyzed", "DNA", "samples", "from", "women", "enrolled", "in", "a", "population", "-", "based", "study", "of", "early", "-", "onset", "breast", "cancer", "to", "assess", "the", "spectrum", "and", "frequency", "of", "germ", "-", "line", "BRCA1", "mutations", "in", "young", "women", "with", "breast", "cancer", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 6, 0 ]