tags
sequencelengths 5
204
| tokens
sequencelengths 5
204
|
---|---|
[
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"The",
"GM-kappa",
"B",
"sequence",
"is",
"recognized",
"by",
"NF-kappa",
"B",
",",
"which",
"is",
"mainly",
"induced",
"by",
"PMA",
"."
] |
[
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
0,
3,
4,
0
] | [
"The",
"CLE0",
"sequence",
"interacts",
"with",
"factors",
",",
"related",
"to",
"a",
"PMA-induced",
"AP-1",
"and",
"a",
"PMA/A23187-induced",
"NF-AT",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
5,
6,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0
] | [
"We",
"examined",
"whether",
"signal",
"transducing",
"components",
"in",
"T",
"cells",
"can",
"activate",
"transcription",
"of",
"the",
"GM-CSF",
"gene",
"."
] |
[
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
0,
7,
8,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0
] | [
"Cotransfection",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"(",
"p50/p65",
")",
"-",
"or",
"AP-1",
"(",
"c-Jun/c-Fos",
")",
"-",
"expression",
"vectors",
"into",
"Jurkat",
"cells",
"with",
"a",
"luciferase",
"reporter",
"containing",
"the",
"GM-CSF",
"promoter",
"did",
"not",
"stimulate",
"transcription",
"from",
"the",
"GM-CSF",
"promoter",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
1,
0,
3,
0,
0
] | [
"In",
"contrast",
",",
"cotransfection",
"with",
"a",
"combination",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"and",
"AP-1",
"significantly",
"augmented",
"transcription",
"from",
"the",
"GM-CSF",
"promoter",
"containing",
"the",
"GM-kappa",
"B/GC-box",
"and",
"the",
"CLE0",
"(",
"AP-1/NF-AT",
")",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
3,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
3,
0
] | [
"Expression",
"of",
"a",
"constitutively",
"active",
"calcineurin",
"(",
"CN",
")",
",",
"a",
"Ca2+/calmodulin-dependent",
"protein",
"phosphatase",
",",
"potentiated",
"by",
"two",
"fold",
"the",
"transcriptional",
"activation",
"by",
"NF-kappa",
"B",
"/AP-1",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
3,
4,
4,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0
] | [
"Both",
"constitutively",
"active",
"forms",
"of",
"CN",
"and",
"protein",
"kinase",
"C",
"(",
"PKC",
")",
"synergistically",
"activated",
"transcription",
"from",
"the",
"GM-CSF",
"promoter",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"These",
"results",
"suggest",
"that",
"cooperation",
"among",
"NF-kappa",
"B-",
",",
"AP-1-",
"and",
"NF-AT-binding",
"sequences",
"is",
"required",
"for",
"induction",
"of",
"the",
"GM-CSF",
"gene",
"through",
"PKC-",
"and",
"Ca2+-",
"signaling",
"pathways",
"downstream",
"of",
"T",
"cell",
"activation",
"."
] |
[
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
5,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"Nonpituitary",
"human",
"prolactin",
"gene",
"transcription",
"is",
"independent",
"of",
"Pit-1",
"and",
"differentially",
"controlled",
"in",
"lymphocytes",
"and",
"in",
"endometrial",
"stroma",
"."
] |
[
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
5,
6,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2,
0,
0,
1,
2,
2,
0
] | [
"Expression",
"of",
"the",
"human",
"PRL",
"(",
"hPRL",
")",
"gene",
"in",
"extrapituitary",
"sites",
"such",
"as",
"the",
"uterus",
"(",
"decidualized",
"endometrial",
"stroma",
"and",
"myometrium",
")",
"and",
"cells",
"of",
"the",
"hematopoietic",
"lineage",
"is",
"directed",
"by",
"an",
"alternative",
"promoter",
"which",
"is",
"located",
"approximately",
"6",
"kilobases",
"(",
"kb",
")",
"upstream",
"of",
"the",
"pituitary-specific",
"start",
"site",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
0
] | [
"In",
"order",
"to",
"delineate",
"the",
"tissue-specific",
"mechanisms",
"governing",
"the",
"control",
"of",
"nonpituitary",
"PRL",
"gene",
"expression",
",",
"we",
"have",
"cloned",
"and",
"sequenced",
"3",
"kb",
"5'-flanking",
"DNA",
"of",
"the",
"upstream",
"decidual/lymphoid",
"(",
"dPRL",
")",
"promoter",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
3,
0,
0,
1,
0,
3,
4,
4,
0,
3,
0,
0,
0
] | [
"Based",
"on",
"sequence",
"homology",
"we",
"identified",
"two",
"binding",
"motifs",
"for",
"Pit-1",
"and",
"seven",
"half-sites",
"for",
"glucocorticoid",
"receptor/progesterone",
"receptor",
"(",
"PR",
")",
"binding",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
3,
0,
0,
3,
4,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0
] | [
"We",
"focused",
"our",
"studies",
"on",
"the",
"role",
"of",
"Pit-1",
"and",
"of",
"PR",
"as",
"potential",
"transcriptional",
"regulators",
",",
"since",
"the",
"POU",
"domain",
"protein",
"Pit-1",
"is",
"essential",
"in",
"the",
"control",
"of",
"pituitary",
"PRL",
"expression",
",",
"and",
"progesterone",
"induces",
"decidual",
"transformation",
"of",
"the",
"endometrial",
"stroma",
",",
"a",
"differentiation",
"process",
"during",
"which",
"the",
"decidual",
"PRL",
"gene",
"is",
"activated",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
5,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
1,
2,
2,
2,
0
] | [
"We",
"demonstrate",
"in",
"a",
"variety",
"of",
"cell",
"types",
",",
"including",
"lymphocytes",
"and",
"endometrial",
"stroma",
",",
"that",
"Pit-1",
"is",
"not",
"involved",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"dPRL",
"promoter/reporter",
"gene",
"constructs",
"carrying",
"3",
"kb",
"5'-flanking",
"DNA",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0
] | [
"Our",
"experiments",
"also",
"show",
"that",
"activated",
"PR",
"does",
"not",
"confer",
"direct",
"transcriptional",
"control",
"on",
"the",
"dPRL",
"promoter",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
5,
6,
6,
6,
6,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
5,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0
] | [
"When",
"we",
"compared",
"the",
"activity",
"of",
"the",
"transfected",
"dPRL",
"promoter",
"in",
"PRL-secreting",
"and",
"nonsecreting",
"lymphoid",
"cells",
",",
"we",
"found",
"that",
"the",
"3",
"kb",
"5'-flanking",
"region",
"of",
"the",
"dPRL",
"promoter",
"did",
"not",
"contain",
"elements",
"restricting",
"expression",
"to",
"only",
"those",
"lymphocytes",
"that",
"produce",
"PRL",
"but",
"allowed",
"expression",
"of",
"fusion",
"reporter",
"genes",
"irrespective",
"of",
"the",
"status",
"of",
"the",
"endogenous",
"PRL",
"gene",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
5,
6,
6,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
5,
6,
6,
6,
0
] | [
"This",
"was",
"in",
"sharp",
"contrast",
"to",
"endometrial",
"cells",
"where",
"3",
"kb",
"5'-flanking",
"DNA",
"conferred",
"strong",
"transcriptional",
"activation",
"on",
"the",
"dPRL",
"promoter",
"in",
"decidualized",
"endometrial",
"stromal",
"cells",
"actively",
"secreting",
"PRL",
",",
"but",
"did",
"not",
"allow",
"transcription",
"in",
"undifferentiated",
"non-PRL-secreting",
"endometrial",
"stromal",
"cells",
"."
] |
[
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0
] | [
"Activation",
"of",
"the",
"dPRL",
"promoter",
"construct",
"in",
"these",
"undifferentiated",
"cells",
"could",
"however",
"be",
"induced",
"by",
"the",
"addition",
"of",
"cAMP",
",",
"in",
"the",
"absence",
"of",
"progesterone",
",",
"suggesting",
"that",
"a",
"signal",
"transduced",
"through",
"the",
"cAMP",
"signaling",
"pathway",
"is",
"a",
"primary",
"inducer",
"of",
"decidual",
"PRL",
"gene",
"expression",
"."
] |
[
0,
0,
3,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
5,
6,
6,
0
] | [
"Signals",
"and",
"nuclear",
"factors",
"that",
"regulate",
"the",
"expression",
"of",
"interleukin-4",
"and",
"interleukin-5",
"genes",
"in",
"helper",
"T",
"cells",
"."
] |
[
7,
8,
8,
8,
8,
0,
3,
0,
0,
3,
4,
4,
4,
4,
0,
3,
0,
3,
0,
3,
0,
0,
3,
4,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"Mouse",
"thymoma",
"line",
"EL-4",
"cells",
"produce",
"cytokines",
"such",
"as",
"interleukin",
"(",
"IL",
")",
"-2",
",",
"IL-3",
",",
"IL-4",
",",
"IL-10",
",",
"and",
"granulocyte-macrophage",
"colony-stimulating",
"factor",
"in",
"response",
"to",
"phorbol",
"12-myristate",
"13-acetate",
"(",
"PMA",
")",
"."
] |
[
7,
8,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0
] | [
"EL-4",
"cells",
"also",
"produce",
"low",
"levels",
"of",
"IL-5",
"when",
"stimulated",
"by",
"PMA",
"alone",
";",
"however",
",",
"cAMP",
"greatly",
"augments",
"PMA-dependent",
"IL-5",
"production",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0
] | [
"A",
"transient",
"transfection",
"assay",
"revealed",
"that",
"two",
"signals",
",",
"PMA",
"and",
"cAMP",
",",
"are",
"required",
"for",
"optimal",
"activation",
"of",
"the",
"IL-5",
"promoter",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0
] | [
"In",
"contrast",
",",
"cAMP",
"almost",
"completely",
"inhibited",
"the",
"PMA-dependent",
"activation",
"of",
"the",
"endogenous",
"IL-2",
"gene",
",",
"as",
"well",
"as",
"the",
"transfected",
"IL-2",
"promoter",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0
] | [
"These",
"results",
"indicate",
"that",
"the",
"IL-5",
"gene",
"is",
"positively",
"regulated",
"by",
"cAMP",
"in",
"a",
"manner",
"opposite",
"to",
"that",
"for",
"the",
"IL-2",
"gene",
"."
] |
[
0,
0,
0,
3,
4,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
5,
6,
6,
0
] | [
"One",
"of",
"the",
"nuclear",
"factors",
"(",
"NFs",
")",
"that",
"regulates",
"the",
"response",
"of",
"the",
"IL-5",
"promoter",
"to",
"cAMP",
"and",
"PMA",
"has",
"properties",
"similar",
"to",
"NF",
"for",
"activated",
"t",
"cell",
"."
] |
[
0,
1,
2,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
0
] | [
"The",
"P",
"sequence",
"of",
"the",
"IL-4",
"gene",
",",
"defined",
"as",
"a",
"responsive",
"element",
"for",
"PMA",
"and",
"calcium",
"ionophore",
"(",
"A23187",
")",
",",
"shares",
"sequence",
"similarity",
"with",
"the",
"NF",
"kappa",
"B",
"and",
"the",
"NF-activated",
"T",
"cell",
"binding",
"sites",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
3,
4,
4,
4,
4,
4,
0,
3,
0,
0
] | [
"We",
"attempted",
"to",
"determine",
"whether",
"NF",
"(",
"P",
")",
",",
"a",
"nuclear",
"factor",
"specific",
"for",
"the",
"P",
"sequence",
",",
"is",
"related",
"to",
"NF-kappa",
"B",
"and",
"nuclear",
"factor",
"for",
"activated",
"T",
"cell",
"(",
"NF-AT",
")",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
3,
0,
3,
4,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
1,
2,
0
] | [
"In",
"electromobility",
"shift",
"assays",
"both",
"NF-kappa",
"B",
"(",
"P65",
"or",
"P65/P50",
"heterodimer",
")",
"and",
"NF-AT",
"bound",
"to",
"the",
"P",
"sequence",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
4,
0
] | [
"However",
",",
"sequence",
"specificity",
"of",
"NF-AT",
"was",
"more",
"similar",
"to",
"that",
"of",
"NF",
"(",
"P",
")",
",",
"and",
"only",
"a",
"small",
"amount",
"of",
"P65",
"was",
"detected",
"in",
"NF",
"(",
"P",
")",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
4,
0,
0,
3,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
4,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"These",
"results",
"indicate",
"that",
"a",
"component",
"or",
"components",
"of",
"NF-AT",
"have",
"the",
"potential",
"to",
"reconstitute",
"NF",
"(",
"P",
")",
",",
"whereas",
"NF-kappa",
"B",
"alone",
"does",
"not",
"account",
"for",
"NF",
"(",
"P",
")",
"in",
"Jurkat",
"crude",
"extract",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0
] | [
"Taken",
"together",
",",
"these",
"results",
"suggest",
"that",
"NF-AT-like",
"factors",
"are",
"involved",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"IL-4",
"and",
"IL-5",
"genes",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
3,
0
] | [
"Solution",
"structure",
"of",
"a",
"POU-specific",
"homeodomain",
":",
"3D-NMR",
"studies",
"of",
"human",
"B-cell",
"transcription",
"factor",
"Oct-2",
"."
] |
[
0,
3,
4,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"The",
"POU",
"DNA-binding",
"motif",
"defines",
"a",
"conserved",
"family",
"of",
"eukaryotic",
"transcription",
"factors",
"involved",
"in",
"regulation",
"of",
"gene",
"expression",
"."
] |
[
0,
3,
4,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
0,
3,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
0,
3,
0,
0
] | [
"This",
"bipartite",
"motif",
"consists",
"of",
"an",
"N-terminal",
"POU-specific",
"domain",
"(",
"POUs",
")",
",",
"a",
"flexible",
"linker",
",",
"and",
"a",
"C-terminal",
"POU-specific",
"homeodomain",
"(",
"POUHD",
")",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0
] | [
"Here",
"we",
"describe",
"the",
"solution",
"structure",
"of",
"a",
"POU-specific",
"homeodomain",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
3,
4,
4,
4,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0
] | [
"An",
"NMR",
"model",
"is",
"obtained",
"from",
"Oct-2",
",",
"a",
"human",
"B-cell",
"specific",
"transcription",
"factor",
"which",
"participates",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"immunoglobulin",
"genes",
"."
] |
[
0,
0,
0,
3,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"A",
"fragment",
"of",
"Oct-2",
"containing",
"POUHD",
"and",
"an",
"adjoining",
"linker",
"was",
"expressed",
"in",
"Escherichia",
"coli",
"and",
"characterized",
"by",
"three-dimensional",
"nuclear",
"magnetic",
"resonance",
"(",
"3D-NMR",
")",
"spectroscopy",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
0,
0
] | [
"Complete",
"1H",
"and",
"15N",
"resonance",
"assignment",
"of",
"the",
"POUHD",
"moiety",
"is",
"presented",
"."
] |
[
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0
] | [
"The",
"POUHD",
"solution",
"structure",
",",
"as",
"calculated",
"by",
"distance",
"geometry",
"and",
"simulated",
"annealing",
"(",
"DG/SA",
")",
",",
"is",
"similar",
"to",
"that",
"of",
"canonical",
"homeodomains",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
3,
4,
0,
0,
3,
4,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"A",
"salient",
"difference",
"between",
"solution",
"and",
"crystal",
"structures",
"is",
"observed",
"in",
"the",
"C-terminal",
"segment",
"of",
"alpha-helix",
"3",
"(",
"the",
"HTH",
"recognition",
"helix",
")",
",",
"which",
"is",
"not",
"well",
"ordered",
"in",
"solution",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
3,
0
] | [
"Because",
"this",
"segment",
"presumably",
"folds",
"upon",
"specific",
"DNA",
"binding",
",",
"its",
"flexibility",
"in",
"solution",
"may",
"reduce",
"the",
"intrinsic",
"DNA",
"affinity",
"of",
"POUHD",
"in",
"the",
"absence",
"of",
"POUs",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
7,
8,
8,
8,
8,
0
] | [
"NF-kappa",
"B-dependent",
"and",
"-independent",
"pathways",
"of",
"HIV",
"activation",
"in",
"a",
"chronically",
"infected",
"T",
"cell",
"line",
"."
] |
[
7,
8,
8,
8,
0,
0,
0,
0,
7,
8,
8,
8,
8,
0,
0,
0,
0,
7,
8,
8,
8,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
1,
0,
3,
4,
0,
0
] | [
"J",
"delta",
"K",
"cells",
"were",
"isolated",
"as",
"a",
"chronically",
"infected",
"survivor",
"cell",
"line",
",",
"following",
"infection",
"of",
"Jurkat",
"CD4+",
"T",
"cells",
"with",
"dl-NF",
",",
"a",
"mutated",
"strain",
"of",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"(",
"HIV-1",
")",
"containing",
"a",
"deletion",
"of",
"the",
"long",
"terminal",
"repeat",
"(",
"LTR",
")",
"NF-kappa",
"B",
"sites",
"."
] |
[
7,
8,
8,
8,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"J",
"delta",
"K",
"cells",
"exhibited",
"very",
"low",
"levels",
"of",
"constitutive",
"HIV",
"production",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
7,
8,
8,
8,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
4,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"HIV-1",
"expression",
"was",
"activated",
"from",
"J",
"delta",
"K",
"cells",
"by",
"treatment",
"with",
"phorbol",
"myristate",
"acetate",
"(",
"PMA",
")",
",",
"sodium",
"butyrate",
"(",
"NaB",
")",
",",
"or",
"hexamethylene",
"bisacetamide",
"(",
"HMBA",
")",
",",
"but",
"not",
"tumor",
"necrosis",
"factor",
"alpha",
"(",
"TNF-alpha",
")",
",",
"confirming",
"the",
"role",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"in",
"mediating",
"TNF-alpha",
"induction",
"of",
"HIV",
"transcription",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
7,
8,
8,
8,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
5,
6,
6,
0
] | [
"The",
"strong",
"induction",
"of",
"HIV",
"expression",
"by",
"NaB",
"or",
"HMBA",
"in",
"J",
"delta",
"K",
"cells",
"clearly",
"demonstrates",
"the",
"existence",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"-independent",
"mechanisms",
"of",
"HIV",
"activation",
"in",
"chronically",
"infected",
"cells",
"."
] |
[
7,
8,
8,
8,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0
] | [
"J",
"delta",
"K",
"cells",
"may",
"provide",
"a",
"useful",
"model",
"for",
"characterizing",
"NF-kappa",
"B",
"-independent",
"transcriptional",
"activation",
"of",
"the",
"HIV",
"LTR",
"."
] |
[
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
5,
6,
0
] | [
"JNK",
"is",
"involved",
"in",
"signal",
"integration",
"during",
"costimulation",
"of",
"T",
"lymphocytes",
"."
] |
[
5,
6,
0,
0,
3,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
0,
3,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
0
] | [
"T",
"lymphocyte",
"activation",
"and",
"interleukin-2",
"(",
"IL-2",
")",
"production",
"require",
"at",
"least",
"two",
"signals",
",",
"generated",
"by",
"phorbol",
"ester",
"(",
"TPA",
")",
"and",
"Ca2+",
"ionophore",
"or",
"costimulation",
"of",
"the",
"T",
"cell",
"receptor",
"(",
"TCR",
")",
"and",
"the",
"CD28",
"auxiliary",
"receptor",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
4,
4,
4,
4,
0
] | [
"We",
"investigated",
"how",
"these",
"stimuli",
"affect",
"mitogen",
"activated",
"protein",
"(",
"MAP",
")",
"kinases",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
0,
3,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
5,
6,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
3,
0
] | [
"Full",
"activation",
"of",
"the",
"MAP",
"kinases",
"that",
"phosphorylate",
"the",
"Jun",
"activation",
"domain",
",",
"JNK1",
"and",
"JNK2",
",",
"required",
"costimulation",
"of",
"T",
"cells",
"with",
"either",
"TPA",
"and",
"Ca2+",
"ionophore",
"or",
"antibodies",
"to",
"TCR",
"and",
"CD28",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"Alone",
",",
"each",
"stimulus",
"resulted",
"in",
"little",
"or",
"no",
"activation",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
3,
0,
1,
2,
0,
0
] | [
"Similar",
"to",
"its",
"effect",
"on",
"IL-2",
"induction",
",",
"cyclosporin",
"A",
"(",
"CsA",
")",
"inhibited",
"the",
"synergistic",
"activation",
"of",
"JNK",
",",
"and",
"a",
"competitive",
"inhibitor",
"of",
"Jun",
"phosphorylation",
"by",
"JNK",
"inhibited",
"IL-2",
"promoter",
"activation",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
3,
4,
3,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"By",
"contrast",
",",
"the",
"MAP",
"kinases",
"ERK1",
"and",
"ERK2",
"were",
"fully",
"activated",
"by",
"TPA",
"or",
"TCR",
"stimulation",
"and",
"were",
"not",
"affected",
"by",
"Ca2+",
",",
"CD28",
",",
"or",
"CsA",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0
] | [
"Hence",
",",
"integration",
"of",
"signals",
"that",
"lead",
"to",
"T",
"cell",
"activation",
"occurs",
"at",
"the",
"level",
"of",
"JNK",
"activation",
"."
] |
[
0,
0,
5,
6,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"Inhibition",
"of",
"rat",
"splenocyte",
"proliferation",
"with",
"methylprednisolone",
":",
"in",
"vivo",
"effect",
"of",
"liposomal",
"formulation",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
5,
6,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"The",
"effect",
"of",
"a",
"liposomal",
"formulation",
"of",
"methylprednisolone",
"(",
"MPL",
")",
"on",
"the",
"inhibition",
"of",
"lymphocyte",
"proliferation",
"in",
"spleen",
"cells",
"was",
"investigated",
"following",
"IV",
"dosing",
"in",
"rats",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
7,
8,
0
] | [
"Liposomes",
"do",
"not",
"alter",
"the",
"suppressive",
"action",
"of",
"MPL",
"when",
"placed",
"in",
"lymphocyte",
"culture",
"."
] |
[
5,
6,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
5,
6,
6,
6,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"Rat",
"splenocytes",
"were",
"found",
"to",
"have",
"greater",
"sensitivity",
"to",
"MPL",
"(",
"EC50",
"=",
"7.9",
"nM",
")",
"than",
"do",
"human",
"peripheral",
"blood",
"lymphocytes",
"(",
"EC50",
"=",
"28",
"nM",
")",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"In",
"vivo",
"studies",
"in",
"rats",
"utilized",
"2",
"mg/kg",
"IV",
"bolus",
"doses",
"of",
"liposomal",
"MPL",
"compared",
"to",
"drug",
"in",
"solution",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
5,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"Animals",
"were",
"sacrificed",
"at",
"various",
"times",
"post-dosing",
"until",
"120",
"h",
",",
"spleen",
"was",
"excised",
"and",
",",
"after",
"incubation",
"of",
"lymphocytes",
"with",
"PHA",
",",
"splenocyte",
"blastogenic",
"responses",
"were",
"assessed",
"by",
"measuring",
"cellular",
"incorporation",
"of",
"3H-thymidine",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"The",
"suppressive",
"effect",
"of",
"liposomal",
"MPL",
"in",
"comparison",
"with",
"free",
"drug",
"was",
"significantly",
"prolonged",
"(",
">",
"120",
"h",
"vs",
"<",
"18",
"h",
")",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
5,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"Inhibition",
"effects",
"versus",
"time",
"were",
"described",
"by",
"a",
"pharmacodynamic",
"model",
"using",
"MPL",
"concentrations",
"in",
"plasma",
"as",
"an",
"input",
"function",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
5,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
0,
0
] | [
"A",
"nonlinear",
"relationship",
"was",
"found",
"between",
"suppression",
"of",
"splenocyte",
"proliferation",
"and",
"the",
"concentration",
"of",
"bound",
"glucocorticoid",
"receptors",
"in",
"spleen",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"Only",
"partial",
"receptor",
"occupancy",
"accompanied",
"complete",
"lymphocyte",
"suppression",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
5,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"The",
"suppression",
"of",
"endogenous",
"corticosterone",
"in",
"plasma",
"for",
"both",
"treatments",
"was",
"similar",
"with",
"values",
"from",
"L-MPL",
"rats",
"returning",
"to",
"baseline",
"after",
"24",
"h",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"These",
"results",
"demonstrate",
"enhanced",
"efficacy",
"of",
"local",
"immunosuppression",
"by",
"targeting",
"spleen",
"with",
"liposomal",
"MPL",
"."
] |
[
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
0
] | [
"Function",
"of",
"NF-kappa",
"B/Rel",
"binding",
"sites",
"in",
"the",
"major",
"histocompatibility",
"complex",
"class",
"II",
"invariant",
"chain",
"promoter",
"is",
"dependent",
"on",
"cell-specific",
"binding",
"of",
"different",
"NF-kappa",
"B/Rel",
"subunits",
"."
] |
[
0,
1,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2,
0,
1,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"The",
"promoter",
"of",
"the",
"human",
"major",
"histocompatibility",
"complex",
"class",
"II-associated",
"invariant-chain",
"gene",
"(",
"Ii",
")",
"contains",
"two",
"NF-kappa",
"B/Rel",
"binding",
"sites",
"located",
"at",
"-109",
"to",
"-118",
"(",
"Ii",
"kappa",
"B-1",
")",
"and",
"-163",
"to",
"-172",
"(",
"Ii",
"kappa",
"B-2",
")",
"from",
"the",
"transcription",
"start",
"site",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
4,
0
] | [
"We",
"report",
"here",
"that",
"the",
"differential",
"function",
"of",
"each",
"of",
"these",
"NF-kappa",
"B/Rel",
"sites",
"in",
"several",
"distinct",
"cell",
"types",
"depends",
"on",
"cell-specific",
"binding",
"of",
"NF-kappa",
"B/Rel",
"transcription",
"factors",
"."
] |
[
1,
2,
2,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
7,
8,
0,
0,
0,
7,
8,
8,
0,
7,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
7,
8,
8,
8,
8,
0
] | [
"Ii",
"kappa",
"B-1",
"is",
"a",
"positive",
"regulatory",
"element",
"in",
"B-cell",
"lines",
"and",
"in",
"the",
"Ii-expressing",
"T-cell",
"line",
",",
"H9",
",",
"but",
"acts",
"as",
"a",
"negative",
"regulatory",
"element",
"in",
"myelomonocytic",
"and",
"glia",
"cell",
"lines",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
7,
8,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0
] | [
"In",
"vivo",
"protein-DNA",
"contacts",
"are",
"detectable",
"at",
"Ii",
"kappa",
"B-1",
"in",
"cell",
"lines",
"in",
"which",
"this",
"site",
"is",
"functional",
"as",
"either",
"a",
"positive",
"or",
"negative",
"regulator",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
0,
3,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
0,
3,
0,
3,
0,
3,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"Electrophoretic",
"mobility",
"supershift",
"assays",
"determine",
"that",
"members",
"of",
"the",
"NF-kappa",
"B/Rel",
"family",
"of",
"transcription",
"factors",
"can",
"bind",
"to",
"this",
"site",
"in",
"vitro",
"and",
"that",
"DNA-binding",
"complexes",
"that",
"contain",
"p50",
",",
"p52",
",",
"p65",
",",
"and",
"cRel",
"correlate",
"with",
"positive",
"regulation",
"whereas",
"the",
"presence",
"of",
"p50",
"correlates",
"with",
"negative",
"regulation",
"."
] |
[
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
7,
8,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
7,
8,
8,
0,
7,
8,
8,
8,
8,
8,
0
] | [
"Ii",
"kappa",
"B-2",
"is",
"a",
"site",
"of",
"positive",
"regulation",
"in",
"B-cell",
"lines",
"and",
"a",
"site",
"of",
"negative",
"regulation",
"in",
"H9",
"T",
"cells",
",",
"myelomonocytic",
",",
"and",
"glial",
"cell",
"lines",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
7,
8,
8,
0
] | [
"In",
"vivo",
"occupancy",
"of",
"this",
"site",
"is",
"observed",
"only",
"in",
"the",
"H9",
"T-cell",
"line",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
3,
0,
3,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"Again",
",",
"in",
"vitro",
"supershift",
"studies",
"indicate",
"that",
"the",
"presence",
"of",
"p50",
",",
"p52",
",",
"p65",
",",
"and",
"cRel",
"correlates",
"with",
"positive",
"function",
"whereas",
"the",
"presence",
"of",
"only",
"p50",
"and",
"p52",
"correlates",
"with",
"negative",
"function",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0
] | [
"This",
"differential",
"binding",
"of",
"specific",
"NF-kappa",
"B/Rel",
"subunits",
"is",
"likely",
"to",
"mediate",
"the",
"disparate",
"functions",
"of",
"these",
"two",
"NF-kappa",
"B/Rel",
"binding",
"sites",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
5,
6,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"Epstein-Barr",
"virus",
"(",
"EBV",
")",
"replicative",
"gene",
"expression",
"in",
"tumour",
"cells",
"of",
"AIDS-related",
"non-Hodgkin",
"'s",
"lymphoma",
"in",
"relation",
"to",
"CD4",
"cell",
"number",
"and",
"antibody",
"titres",
"to",
"EBV",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
5,
6,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
4,
0,
3,
0,
0,
3,
4,
0,
3,
0,
0,
3,
4,
4,
0,
3,
0,
0,
0
] | [
"OBJECTIVE",
":",
"To",
"determine",
"whether",
"activation",
"of",
"Epstein-Barr",
"virus",
"(",
"EBV",
")",
"replication",
"in",
"tumour",
"cells",
"of",
"AIDS-related",
"non-Hodgkin",
"'s",
"lymphoma",
"(",
"ARNHL",
")",
"is",
"correlated",
"with",
"CD4+",
"cell",
"counts",
"and",
"influences",
"antibody",
"response",
"to",
"EBV",
"[",
"anti-Z",
"Epstein-Barr",
"replicative",
"activator",
"(",
"ZEBRA",
")",
",",
"anti-early",
"antigen",
"(",
"EA",
")",
",",
"anti-viral",
"capsid",
"antigen",
"(",
"VCA",
")",
"]",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"DESIGN",
":",
"Retrospective",
"study",
"based",
"on",
"immunohistochemistry",
"and",
"in",
"situ",
"hybridization",
"to",
"detect",
"EBV",
"replicative",
"gene",
"products",
"in",
"tissue",
"samples",
"from",
"patients",
"affected",
"by",
"ARNHL",
"and",
"correlation",
"with",
"CD4+",
"cell",
"counts",
"and",
"results",
"of",
"EBV",
"serology",
"(",
"including",
"anti-",
"ZEBRA",
"activity",
")",
"in",
"sera",
"from",
"the",
"same",
"patients",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"METHODS",
":",
"Seventeen",
"out",
"of",
"22",
"cases",
"of",
"ARNHL",
"were",
"selected",
"for",
"the",
"presence",
"of",
"EBV",
"[",
"Epstein-Barr",
"early",
"region",
"(",
"EBER",
")",
"RNA-positive",
"]",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
3,
0,
3,
4,
4,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"Immunohistochemistry",
"was",
"performed",
"with",
"anti-ZEBRA",
",",
"anti-EA-restricted",
",",
"anti-VCA",
"antibodies",
"and",
"in",
"situ",
"hybridization",
"with",
"BHLF1/NotI",
"oligoprobes",
"on",
"tumour",
"samples",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
0,
0,
0,
0,
3,
0
] | [
"Results",
"were",
"statistically",
"correlated",
"with",
"those",
"of",
"CD4+",
"cell",
"counts",
"(",
"17",
"out",
"of",
"17",
")",
"and",
"with",
"anti-EBV",
"antibody",
"titres",
"(",
"13",
"out",
"of",
"17",
")",
"assessed",
"using",
"standard",
"immunofluorescence",
"method",
"and",
"enzyme-linked",
"immunosorbent",
"assay",
"procedure",
"using",
"recombinant",
"ZEBRA",
"protein",
"and",
"synthetic",
"peptides",
"as",
"antigens",
"."
] |
[
0,
0,
3,
0,
3,
0,
0,
3,
4,
4,
0,
3,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
5,
6,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"RESULTS",
":",
"BZLF1",
"(",
"ZEBRA",
")",
"or",
"early",
"gene",
"products",
"(",
"EA-R",
"and",
"EA-D/BHLF1/NotI",
")",
"were",
"detected",
"in",
"a",
"small",
"proportion",
"(",
"<",
"0.01-5",
"%",
")",
"of",
"tumour",
"cells",
"in",
"eight",
"of",
"these",
"17",
"cases",
"by",
"immunohistochemistry",
"and",
"in",
"situ",
"hybridization",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"Demonstration",
"of",
"replicative",
"gene",
"expression",
"did",
"not",
"correlate",
"with",
"either",
"low",
"CD4+",
"cell",
"counts",
"(",
"P",
">",
"0.05",
")",
"or",
"anti-EBV",
"antibody",
"titres",
"(",
"P",
">",
"0.05",
")",
"."
] |
[
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"Anti-",
"ZEBRA",
"activity",
"was",
"not",
"significantly",
"increased",
"in",
"patients",
"affected",
"with",
"ARNHL",
",",
"the",
"cells",
"of",
"which",
"expressed",
"replicative",
"gene",
"products",
"(",
"P",
">",
"0.05",
")",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
5,
6,
0,
0,
0
] | [
"CONCLUSION",
":",
"The",
"degree",
"of",
"immunodeficiency",
"does",
"not",
"clearly",
"enhance",
"replicative",
"gene",
"expression",
"in",
"tumour",
"cells",
"of",
"ARNHL",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"EBV",
"serology",
",",
"including",
"anti-",
"ZEBRA",
"activity",
",",
"is",
"not",
"a",
"reliable",
"tool",
"for",
"predicting",
"the",
"occurrence",
"of",
"such",
"proliferations",
"."
] |
[
0,
0,
3,
4,
0,
7,
8,
8,
8,
8,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
0,
3,
0,
0
] | [
"Effects",
"of",
"prostaglandin",
"E2",
"on",
"Th0-type",
"human",
"T",
"cell",
"clones",
":",
"modulation",
"of",
"functions",
"of",
"nuclear",
"proteins",
"involved",
"in",
"cytokine",
"production",
"."
] |
[
0,
0,
0,
3,
4,
0,
3,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
7,
8,
8,
8,
8,
8,
8,
0,
0,
0
] | [
"The",
"effects",
"of",
"prostaglandin",
"E2",
"(",
"PGE2",
")",
"on",
"cytokine",
"production",
"and",
"proliferation",
"of",
"the",
"CD4+",
"human",
"helper",
"T",
"cell",
"clone",
"SP-B21",
"were",
"investigated",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0
] | [
"In",
"cells",
"stimulated",
"with",
"anti-CD3",
"mAb",
",",
"PGE2",
"inhibited",
"cell",
"proliferation",
"and",
"the",
"production",
"of",
"all",
"the",
"cytokines",
"examined",
"."
] |
[
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0
] | [
"Addition",
"of",
"rIL-2",
"fully",
"restored",
"the",
"proliferative",
"response",
"and",
"partially",
"restored",
"the",
"production",
"of",
"IL-4",
"and",
"IL-5",
",",
"but",
"not",
"that",
"of",
"other",
"cytokines",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0
] | [
"In",
"contrast",
",",
"in",
"cells",
"stimulated",
"with",
"phorbol",
"myristate",
"acetate",
"(",
"PMA",
")",
"/A23187",
",",
"PGE2",
"enhanced",
"the",
"production",
"of",
"IL-4",
"and",
"IL-5",
",",
"and",
"only",
"partially",
"inhibited",
"the",
"production",
"of",
"other",
"cytokines",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0
] | [
"Therefore",
",",
"the",
"effects",
"of",
"PGE2",
"vary",
"depending",
"on",
"the",
"mode",
"of",
"T",
"cell",
"activation",
",",
"and",
"the",
"IL-4",
"and",
"IL-5",
"are",
"regulated",
"differently",
"from",
"other",
"cytokines",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
4,
4,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"In",
"a",
"mobility",
"shift",
"assay",
",",
"only",
"the",
"NF-kappa",
"B",
"(",
"p50/p50",
")",
"homodimer",
"was",
"observed",
"in",
"a",
"complex",
"formed",
"with",
"the",
"kappa",
"B",
"sequence",
"in",
"unstimulated",
"SP-B21",
"cells",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
3,
3,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0
] | [
"When",
"cells",
"were",
"stimulated",
"with",
"anti-CD3",
"mAb",
"or",
"PMA/A23187",
",",
"a",
"complex",
"formation",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"(",
"p50",
"/p65",
")",
"heterodimer",
"with",
"the",
"kappa",
"B",
"sequence",
"was",
"induced",
"."
] |
[
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
4,
4,
4,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
0,
0,
0,
0
] | [
"Interestingly",
",",
"PGE2",
"or",
"di-butyryl",
"(",
"Bt2",
")",
"cAMP",
"abolished",
"the",
"binding",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"(",
"p50/p65",
")",
"heterodimer",
"to",
"the",
"kappa",
"B",
"sequence",
"in",
"cells",
"stimulated",
"with",
"anti-CD3",
"mAb",
"but",
"not",
"with",
"PMA/A23187",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
4,
0
] | [
"Our",
"results",
"suggest",
"that",
"the",
"target",
"of",
"PGE2",
"action",
"is",
"a",
"component",
"in",
"the",
"signal",
"transduction",
"pathway",
"leading",
"to",
"the",
"activation",
"of",
"protein",
"kinase",
"C",
"."
] |
[
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
0,
0,
0
] | [
"However",
",",
"the",
"inhibition",
"of",
"the",
"T",
"cell",
"activation",
"signals",
"by",
"PGE2",
"is",
"selective",
"."
] |
[
3,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
3,
4,
0,
0,
0,
0
] | [
"PGE2",
"enhanced",
"the",
"complex",
"formation",
"with",
"NF-AT",
",",
"AP-1",
"and",
"CLE0",
"sequences",
"when",
"the",
"cells",
"were",
"activated",
"by",
"either",
"anti-CD3",
"mAb",
"or",
"PMA/A23187",
"stimulation",
"."
] |