腺相关病毒

**腺相關病毒**（Adeno-associated viruses，常縮寫為 AAV），是一種隸屬細小病毒科依賴性細小病毒屬、能夠感染人類以及其他部分靈長類動物的病毒。腺相關病毒直徑約 20 奈米、無被膜，無法自主完成複製，全基因組長約 4.8 千鹼基對（kb）。

尚無已知的疾病與腺相關病毒有關。腺相關病毒一般只能引發輕度的免疫反應。加之腺相關病毒須在其他病毒同時感染宿主的前提下才能複製，使研究者認為腺相關病毒適合用於改造用作人基因治療的載體，以及體外等基因人類疾病模型的構建。由腺病毒改造而成的基因治療載體能夠同時感染分裂中和分裂不活躍的細胞，並將載體 DNA 以一種不整合入染色體的方式導入到細胞中（不過在自然條件下，也有腺相關病毒攜帶的 DNA 在感染後插入染色體的報導）。目前，一部分使用腺相關病毒的基因治療臨床試驗已取得正面的結果。

## 研究歷史

腺相關病毒最初被認為是腺病毒製備過程中混入的污染物之一。20 世紀 60 年代，匹茲堡大學的鮑勃・艾奇遜（Bob Atchison）與美國國立衛生研究院的華萊士・羅（Wallace P. Rowe）實驗室的工作最初確定腺相關病毒是一種依賴性細小病毒。後來的血清學研究表明，腺相關病毒不能造成任何已知的人類疾病，且只能在腺病毒、疱疹病毒等輔助病毒存在的前提下才能感染人類。

## 複製周期

絕大部分情況下，腺相關病毒需要輔助病毒的存在才能完成完整的生命周期。腺相關病毒在感染細胞後，需要輔助病毒的幫助（例如，腺相關病毒的輔助病毒疱疹病毒能為其提供 DNA 聚合酶和解旋酶以及一些對腺相關病毒轉錄的早期啟動必要的蛋白）才能進入裂解期，進行病毒複製。在沒有輔助病毒的前提下，腺相關病毒基因的表現將會受限，一部分腺相關病毒 DNA 會在這種情況下插入至人 19 號染色體 q13.4 區域，即 AAVS1 位點。

## 基因組

腺相關病毒的基因組由一條長約 4.8 千鹼基對（kb）的正義或反義單鏈 DNA 構成，其兩端是序列對稱的反向重複序列（ITR），對腺相關病毒的複製、衣殼化、以及插入宿主染色體的過程有重要作用
，中間則有 _rep_ 與 _cap_ 兩個開放讀框，前者包括四個序列相互重疊的基因，編碼 Rep78、Rep68、Rep52 與 Rep40 等四種參與病毒基因複製的蛋白；後者包括三個序列重疊的基因，編碼 VP1、VP2 與 VP3 等三種組成病毒衣殼的蛋白。腺相關病毒本身不編碼 DNA 聚合酶，僅仰賴宿主細胞或輔助病毒的 DNA 聚合酶合成自己的基因組。

### 反向重複序列

腺相關病毒基因組兩端的反向重複序列（ITR）序列對稱，長 145 鹼基，可各自形成一莖環結構，使病毒利用其 3' 活性端開始 DNA 複製，無需由引子酶合成引子即可複製自身的 DNA，形成相互連結的雙股 DNA 中間產物，再以缺口酶將兩股 DNA 切開。除 DNA 複製外，反向重複序列也參與病毒插入宿主 DNA 的過程，且為病毒顆粒正常組裝所需。

### _rep_ 基因

腺相關病毒基因組中上游的 _rep_ 讀框可由左側的 _p5_ 或 _p19_ 兩個啟動子開始轉錄，產生長度不一的兩種 RNA，這兩種 RNA 中皆含有一個內含子，可能在轉錄後被切除，依使用啟動子的不同與內含子被切除與否，_rep_ 基因可轉錄出四種 mRNA，進而產生四種蛋白質變體：Rep78、Rep68、Rep52，以及 Rep40（Rep 後面的數字代表這種蛋白的分子量為多少千道爾頓），前兩者是由 _p5_ 啟動子轉錄產生，可與反向重複序列形成的莖環結合，參與病毒 DNA 的複製，後兩者則是由 _p19_ 啟動子轉錄產生。四種 Rep 蛋白皆可與 ATP 結合，且皆具解旋酶活性，它們可抑制自身的啟動子（_p5_ 和 _p19_）轉錄，並可活化轉錄 _cap_ 基因蛋白的 p40 啟動子。

### _cap_ 基因

_cap_ 基因位於 _rep_ 基因的下游，_p40_ 啟動子可調控其轉錄，產生序列重疊的 VP1、VP2、VP3 與 AAP（組裝活化蛋白）四種蛋白，VP1、VP2 與 VP3 的大小分別為 87、72 與 62 千道爾頓，可以 1:1:10 的比例組成腺相關病毒二十面體的衣殼，AAP 亦為衣殼組裝所需的蛋白。_cap_ 基因轉錄出的 RNA 可能將一段較長的內含子或一段較短的內含子切除，分別形成長 2.3kb 或長 2.6kb 的 mRNA，其中長內含子被切除的情況較為常見，因此 2.3kb 的 mRNA 為大宗，可轉譯產生 VP3 蛋白，但其起始密碼子（AUG）上游有一個 ACG 密碼子周邊亦形成可起始轉譯的 Kozak 序列，少數核糖體會自此開始轉譯，產生比 VP3 蛋白多出一 N 端延伸區域的 VP2 蛋白；而切除短內含子的 2.6kb 的 mRNA 則會轉譯產生 VP1 蛋白，也比 VP3 多了一 N 端延伸區。

由於 2.3mRNA 的數量較多，且其上游 ACG 密碼子啟動轉譯的能力比正常的起始密碼子弱，三種衣殼蛋白中 VP3 被轉譯生成的量遠多於 VP1 與 VP2，與其在衣殼中的組成比例相符。有研究顯示 VP1 蛋白的 N 端延伸區有磷脂酶 A2 活性，可能有助於病毒自細胞釋出，因而為病毒複製週期所需，相較之下 VP2 可能並非病毒組裝必須的蛋白。

## 分類

腺相關病毒在人類與其他靈長類中相當普遍，目前已知有 11 個血清型，其中 AAV-2、AAV-3、AAV-5 與 AAV-6 為自人類細胞發現，AAV-1、AAV-4 與 AAV-7 至 AAV-11 為自其他靈長類細胞發現，其中對 AAV-2 的研究最多，此血清型可能使用硫酸肝素蛋白多醣（HSPG）、aVβ5 整合素與成纖維細胞生長因子受體 1（FGFR-1）為受體感染細胞，其中前者為主要受體，後兩者為輔受體，可協助病毒以受質媒介內吞作用進入細胞，但學界對此尚有爭議。

2013 年起，國際病毒分類委員會（ICTV）將腺相關病毒分為 A 型與 B 型兩個物種，前者包含 AAV-1、AAV-2、AAV-3 與 AAV-4，後者即 AAV-5。

為提升在腺相關病毒在臨床與研究中作為載體的效率，研究人員研發了許多腺相關病毒的人工變型，以提升基因表現、適應不同的目標組織並使其更易逃避免疫系統的攻擊，例如 AAV-2 的基因組與 AAV-5 的衣殼蛋白基因融合組成的 AAV-2/5，以及由 8 型 AAV 序列融合組成的 AAV-DJ 等。

## 用於基因治療

腺相關病毒因毒性低、不能自主複製、不致病，且較少整合到宿主基因組中，因而被認為是一種較為理想的基因治療載體。將腺相關病毒改造為基因治療載體的具體操作方法是腺相關病毒基因組上的 _rep_ 與 _cap_ 區域替換為目的基因。腺相關病毒載體導入人體後，不分裂的細胞能夠一直保持輸入的目的基因片段，而持續分裂細胞則會逐漸隨細胞分裂丟失經由腺相關病毒導入的基因片段，因此腺相關病毒療法不太適合以持續分裂的細胞（如幹細胞）作為靶標。

腺相關病毒作為基因治療載體存在一些缺點。首先是容量低，最多只能容納 4.5kb 的插入片段，無法容納 _DMD_ 等較長的人類基因。其次，輸入的腺相關病毒載體可能被體內存在的針對天然腺相關病毒的抗體中和。此外，腺相關病毒也存在整合入宿主基因組的情況。

過去認為將腺相關病毒用於基因治療時，反向重複序列是病毒基因組中唯一需與轉入的基因順式（_in cis_）組裝的元件，_cap_ 與 _rep_ 蛋白皆可反式（_in trans_）導入，但有新研究結果顯示 _rep_ 基因編碼區域中有一稱為順式 rep 依賴型元件（cis-acting Rep-dependent element，簡稱 CARE）的序列與轉入的基因順式組裝時也可促進病毒的複製與組裝。

根據 2019 年的資料，全球範圍內共有超過 250 件使用腺相關病毒載體技術的臨床試驗，占基於病毒載體的基因治療臨床試驗總數的 8.3%。

## 參見

* 基因治療
* 基因編輯

## 參考文獻