小分子干扰核糖核酸

**小分子干擾核糖核酸**（英語：**small interfering RNA**，縮寫為 **siRNA**），又譯為**小干擾核糖核酸**，又稱**短干擾核糖核酸**（**short interfering RNA**）或**沉默核糖核酸**（**silencing RNA**），是長度 20 到 25 個核苷酸的雙股 RNA，在生物學上有許多不同的用途。目前已知 siRNA 主要參與 RNA 干擾（RNAi）現象，以帶有專一性的方式調節基因的表達。此外，也參與一些與 RNAi 相關的反應途徑，例如抗病毒機制或是染色質結構的改變。不過這些複雜機制的反應途徑目前尚未明瞭。
siRNA 最早是由英國的戴維・鮑爾庫姆（David Baulcombe）團隊發現，是植物中的後轉錄基因沉默（post-transcriptional gene silencing；PTGS）現象的一部分，其研究結果發表於《科學》。2001 年，湯瑪士・塗許爾（Thomas Tuschl）團隊發現合成的 siRNA，可誘導哺乳動物體內的 RNAi 作用，結果發表於《自然》。這項發現引發了利用可控制的 RNAi，來進行生物醫學研究與藥物開發的方法。

## 結構

siRNA 通常是一段長 21 個核苷酸的雙股 RNA（dsRNA），其兩股分別在 RNA 的兩端超出另一端 2 個核苷酸，圖示如下：

每一股各有一個 5' 磷酸基末端與一個 3' 羥基末端。此結構經 dicer 作用而得，dicer 這種酶將較長的雙股 RNA 或小髮夾 RNA（small hairpin RNA）切成 siRNA。此外，siRNA 也可經由多種不同轉染（transfection）技術導入細胞內，並對特定基因產生具專一性的基因敲落（knockdown）效果。本質上，任何已知序列的基因都可以、也因此是經過適當剪裁而具有序列互補性的 siRNA 的作用對象。這使 siRNA 成為研究基因功能與藥物目標的一項重要工具。

## 參考文獻

### 引用

### 來源

**概觀**

* Hannon G, Rossi J. Unlocking the potential of the human genome with RNA interference. Nature. 2004, **431** (7006): 371–8 [2007-11-24]. PMID 15372045. （原始內容存檔於 2017-05-06）.
* Fire A, Xu S, Montgomery M, Kostas S, Driver S, Mello C. Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans. Nature. 1998, **391** (6669): 806–11. PMID 9486653.  The original paper by Fire et al. describing RNAi
* Elbashir S, Lendeckel W, Tuschl T. RNA interference is mediated by 21- and 22-nucleotide RNAs. Genes Dev. 2001, **15** (2): 188–200 [2007-11-24]. PMID 11157775. （原始內容存檔於 2008-05-16）.
* Zamore P, Tuschl T, Sharp P, Bartel D. RNAi: double-stranded RNA directs the ATP-dependent cleavage of mRNA at 21 to 23 nucleotide intervals. Cell. 2000, **101** (1): 25–33. PMID 10778853.
* Hamilton A, Baulcombe D. A species of small antisense RNA in posttranscriptional gene silencing in plants. Science. 1999, **286** (5441): 950–2. PMID 10542148.  First description of siRNAs.

**非專一性效用**

* Zhang Z, Weinschenk T, Guo K, Schluesener H. siRNA binding proteins of microglial cells: PKR is an unanticipated ligand. J Cell Biochem. 2006, **97** (6): 1217–29. PMID 16315288.
* Kim D, Behlke M, Rose S, Chang M, Choi S, Rossi J. Synthetic dsRNA Dicer substrates enhance RNAi potency and efficacy. Nat Biotechnol. 2005, **23** (2): 222–6 [2007-11-24]. PMID 15619617. （原始內容存檔於 2017-03-22）.
* Sledz C, Williams B. RNA interference and double-stranded-RNA-activated pathways. Biochem Soc Trans. 2004, **32** (Pt 6): 952–6. PMID 15506933.
* Pebernard, Stephanie; Iggo, Richard D. Determinants of interferon-stimulated gene induction by RNAi vectors. Differentiation; research in biological diversity (Elsevier BV). 2004, **72** (2-3): 103–111. ISSN 0301-4681. PMID 15066190. doi:10.1111/j.1432-0436.2004.07202001.x.
* Sledz C, Holko M, de Veer M, Silverman R, Williams B. Activation of the interferon system by short-interfering RNAs. Nat Cell Biol. 2003, **5** (9): 834–9 [2007-11-24]. PMID 12942087. （原始內容存檔於 2016-03-05）.

## 外部連結

**設計與定性工具**

* Deqor: A web-based tool for the design and quality control of siRNAs
* siDirect: a web-based online software system for designing siRNA sequences （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
* siSearch: a siRNA design tool using a number of popular design methods
* SpecificityServer: a tool for checking the specificity of a given siRNA
* miRacle: tool for prediction of siRNA and microRNA targets using an algorithm which incorporates RNA secondary structure

**資料庫**

* HuSiDa: Human siRNA Database （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
* siRNAdb: a database of siRNA sequences
* Nature: RNAi gateway （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）

**siRNA 關聯企業**

* Alnylam Pharmaceuticals （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
* Anadys Pharmaceuticals （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
* ArmaGen Technologies,Inc （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
* Benitec （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
* BD Biosciences （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
* Bionomics （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
* BioSpring （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
* Celera Genomics （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
* Cenix BioScience （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
* Ceptyr （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
* Finnzymes Oy （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
* Ingenium Pharmaceuticals
* Isis Pharmaceuticals
* Nucleonics Inc （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
* Pfizer Inc （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
* RNAi Co.Ltd （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
* Sigma-Aldrich （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
* Sirna Therapeutics, Inc.

## 參見

* RNA 干擾
* 微 RNA（miRNA）
* 小髮夾 RNA（shRNA）