子囊菌门
子囊菌門（學名：Ascomycota）是真菌界中種類最多的一個門。顧名思義，本門成員的共同特徵是在有性生殖相產生的後代孢子有一個保護囊，即子囊，這很像哺乳類胎兒都有一個羊膜囊保護一樣。無論是酵母亞門的單細胞有性生殖，還是其餘種屬的多細胞有性生殖，無有例外。但保護孢子的子囊可以是永久的（persistant asci），也可以是稍縱即逝的（evanescent asci），以致在標本準備過程中往往消失而很難看見。子囊菌門成員通常被稱為囊菌或子囊菌，是真菌界最大的門，超過 64,000 種 ，與擔子菌門（Basidiomycota）一起構成了雙核亞界（Dikarya）。
在有性生殖時，本門成員包括單細胞的酵母都能形成有蓋或無蓋的、棒狀或卵形的子囊，通常在子囊內進行減數分裂後再進行有絲分裂，最終生成八個子囊孢子。在多細胞真菌，所有子囊均分散於菌絲之中，形成子囊果。子囊果還可以有包被（peridium），作為第二道防線，將所有的子囊保護起來。根據子囊果與包被之間的關係，子囊果又可分為子囊盤（apothecia）、閉被子囊果（cleistothecia）、酒囊子囊果（perithecia）、假包被子囊果（psudothecia）與裸被子囊果（gymnothecium）。裸被子囊果是裸被子囊菌科（Gymnoascaceae）的特徵，他們的子囊成簇或散在分布於菌絲之中，沒有閉被子囊果那樣的全封閉式包被。舉世聞名的羊肚菌的子囊果呈蜂窩狀，每個蜂窩眼其實就是一個子囊盤。
單細胞的酵母的子囊沒有包被作第二道防線，總是裸露的，但它們仍然有子囊。
某些子囊菌門真菌也可以無性生殖，包括芽生、分裂或以分生孢子的方式，但這不是子囊菌門區別於其它真菌門的特徵。無性生殖期本門真菌依環境溫度不同還改變其形態，這一特性稱為雙態性，這些真菌稱為雙態性真菌。阿耶洛雙態菌科的許多成員、組織胞漿菌、隱球菌等都屬於這一類，它們在環境溫度下以絲狀真菌（黴菌）存在，吸入人體後在體內高溫環境下變成單細胞酵母繁殖，給人類或動物造成急性播散性真菌病或慢性機會性感染。
子囊菌門的真菌可寄生、共生、腐生或兼性腐生。對人類有益的種類包括酵母菌、冬蟲夏草、青黴菌、可以食用的羊肚菌等，也有很多種為植物致病菌。