亞硫酸鹽定序
亞硫酸鹽定序（英語：bisulfite sequencing）是一種利用亞硫酸鹽處理，測定 DNA 甲基化情形的方法。DNA 甲基化是最早被發現的表觀遺傳標記，也是被研究最為深入的表觀遺傳改變。原理在於亞硫酸鹽可使 DNA 上的胞嘧啶（C）轉變為尿嘧啶（U），同時已受甲基化的 5 - 甲基胞嘧啶則不受影響。如此一來，就可以使實驗者得知 DNA 序列上甲基化的情形 (Figure 2)。 對動物而言，DNA 甲基化主要是指對 CpG 位點中胞嘧啶的五號碳上增加一個甲基的過程。DNA 位點的甲基化可能對該基因的轉錄活性起到抑制作用。
使用亞硫酸鹽處理 DNA 會將胞嘧啶殘基轉化成尿嘧啶，但被甲基化的胞嘧啶殘基則不受影響；因此，被亞硫酸鹽處理後的 DNA 片段只保留甲基化的胞嘧啶。基於此原理，亞硫酸鹽能在單個核苷酸水平上揭示 DNA 的甲基化情況。有多種檢測方法可以實現對亞硫酸鹽處理後 DNA 序列的分析，分析的實際問題就是亞硫酸鹽使鹼基從 C 到 U 最終到 T 造成的區別（Figure 1）。