第5地対艦ミサイル連隊
特筆なければ健軍駐屯地駐屯。
第5地対艦ミサイル連隊本部
本部管理中隊「5地対艦-本」
第1射撃中隊「5地対艦-1」
第2射撃中隊「5地対艦-2」
第3射撃中隊「5地対艦-3」
第4射撃中隊「5地対艦-4」
第301地対艦ミサイル中隊「301地対艦」(瀬戸内分屯地)
第302地対艦ミサイル中隊「302地対艦」(宮古島駐屯地)
第303地対艦ミサイル中隊「303地対艦」(石垣駐屯地)
第304地対艦ミサイル中隊「304地対艦」
対艦ミサイルを運用し、脅威となる敵艦艇に対して対艦ミサイルをもって排除することを任務とする。
1998年3月に西部方面隊直轄部隊として編成され、2003年3月、廃止となった第3特科群を母体として新編された西部方面特科隊の隷下部隊となり、現在に至る。 部隊は主に本土に駐屯するナンバー中隊(第1中隊~第4中隊)と、南西諸島に展開する独立地対艦ミサイル中隊(第301~第304地対艦ミサイル中隊)により編成されている。
連隊長は1等陸佐が充てられおり、警備隊区は本土部隊が熊本県天草地域の1市2町。第301地対艦ミサイルが奄美大島全域。
なお、陸上自衛隊に5個編成される地対艦ミサイル部隊のうち唯一となる12式地対艦誘導弾を装備・運用する部隊である。