ソニックトゥーン
声 - 金丸淳一
本作の主人公で、走る事なら誰にも負けない史上最速のハリネズミ。このシリーズのソニックは首にスカーフを巻き、頭のトゲの本数も少し増えている。腕の色も従来の肌色ではなく青色だが、これは従来のソニックとは異なる事を示し、差別化を図ったデザインだとされる。初期の企画段階では人間のような容姿のソニックもデザインされていたが、次第にモダンソニック(『ソニックアドベンチャー』以降の造形)に近い容姿に落ち着いたとの事。
『太古の秘宝』ではホーミングアタックやスピンダッシュなどのおなじみの能力や蹴りを使った攻撃スタイルを使い、『アイランドアドベンチャー』ではソニック固有の能力として空中で上下左右にダッシュする「エアーダッシュ」を使用でき、特定のブロックを破壊する事が出来る。
『ファイアー&アイス』でも『アイランドアドベンチャー』と同じくエアーダッシュを使用し、挙動が素早く、連続使用可能な技に変更された他、スピンダッシュの速度も大幅に強化されている。今作では異常気象の捜査の為にエミーと共にコディアック・フロンティアを訪れ、裂け目から噴出した謎のエネルギーを浴びた事で炎と氷を操る能力を手に入れ、仲間達と冒険を進めていく。
アニメ版では自分の小屋を所有しているものの、普段はテイルスの家に居候という形で一緒に生活している。テイルスの事は相棒として大切に思っているが為に、「相棒オーディション(1話)」では危険にあわせまいと一度相棒を解雇した事があった。
当シリーズオリジナルのキャラクターで、エッグマンがつくりあげた、物語に関わる小さな人型ロボット。オーボットとキューボットと違い、主人のエッグマンに忠実で敬愛している。ソニック達からは「チビロボ」と呼ばれている。
当初は「ラグナッツ」という名前で、ラグニウム鉱石のみを引き寄せるラグニウム収集マシンとしてつくられたが、ラグニウム鉱石以外のモノを引き寄せてしまう失敗作であったため、名前を「D-フェクト(Defect"不良品")」と改称させられた。ラグナ・ロックで力が制御出来なくなり暴走するもソニック達によって食い止められ、最後はエッグマンからスティックスへ譲渡された。
アニメではシーズン2にゲストキャラクターとして登場する。
アニメ版ではソニックと一緒に住んでいる。家の近くに専用の大きな工房があり、そこで造った様々な発明品でソニック達をサポートする。特にトルネード号(アニメ版では名前の言及はなく、単に「飛行機」と呼ばれている)には愛着を持っており、「エッグマンのトマトソース(26話)」ではメンテナンスや改造のみならず、マッサージやキャッチボールもしているらしい。さらにはメカフェチらしく工具や他の発明品にも深い愛情を注ぎ、難しい専門用語を用いて説明するあまりソニックやナックルズからもっと分かりやすく説明するよう頼まれることもあった。その一方、お菓子を欲しがったり野外遊びに興じる、悪ふざけを楽しむ、ゲーム本編同様に雷が苦手といった年相応の一面も見せ、チョコレートチャンクのクッキーが好物(「エッグマンの悪だくみ(11話)」英語版より)。また「テイルスの片思い(46話)」では紆余曲折あったものの、ゾーイという名前のガールフレンドが出来た。発明品が原因で騒動に発展したり、タコに丸呑みにされたりと不幸体質を窺わせる描写も見られる。
声 - 神奈延年
ソニックを常にライバル視する力自慢のハリモグラで、ヒーロー然とした性格。従来のソニックシリーズから容姿が大幅に変更され筋骨隆々な体格になり、これはアニメ版における見た目だけでどのようなキャラクターかが一目で分かるようにする事を重視されたため。
『太古の秘宝』、『アイランドアドベンチャー』共に体躯を生かした強力なパンチや格闘技を繰り出し、さらには地面の中も掘り進められる。『アイランドアドベンチャー』のスクラップ・ヤードにはトレーニング場があり、1日(24時間)に一度トレーニングに付き合うとメダルが入手可能。
『ファイアー&アイス』では空中から攻撃する「ダッシュパンチ」が追加され、地中を掘り進む制限時間が廃止された。また地中にいる際、敵を包み込むように軌道に円を描くと追加攻撃が可能。前作以上にコミカルでムードメーカーな性格で、シーサイド・アイランドの奥地で茂みに隠れたD-フェクトと間違われた事をきっかけに、ソニック達と行動を共にする。
声 - 遊佐浩二
ソニックと容姿が瓜二つの黒いハリネズミ。経緯は異なるが、『太古の秘宝』『アイランドアドベンチャー』では両作品共にリリックに洗脳され敵として登場する。
アニメ版は「ソニックが大ピンチ!?(52話)」で登場し、ソニックと激しい戦いを繰り広げるが、エッグマンのカメラによって盲目した後、ソニックの反撃を受けて敗北した。その後、ソニックへの復讐を宣言した際には激怒しテレポートして立ち去った。コミカルなキャラクターが多い中、従来のソニックシリーズに近い冷静沈着な性格に加えて非常に残忍かつ冷徹であり、ソニックに対して「ハリネズミの面汚し」と辛辣に評価する場面もあった。その為、ゲーム版の従来シリーズのようなライバル関係とは異なり、アニメ版におけるシャドウとソニックの関係は『ソニックアドベンチャー2』の頃や、『シャドウ・ザ・ヘッジホッグ』のダークルートに近い。エッグマン曰く、「公式で二番人気のキャラクター」との事。
エピソード「The Biggest Fan」に登場。当シリーズオリジナルのキャラクターで、シーサイドアイランドに住むソニックの熱狂的ファンのバク。
『太古の秘宝』はテーマである「絆」を強く反映させ、従来のスピードアクションに加えて探索・謎解き要素が強い内容となっている。ステージは大きく分けて村を探索するアドベンチャーパートと、探索をしながら敵を倒し、時には高速コースを駆け抜けて目的を達成するアクションパートで構成されている。スキルはフィールドで集めたアイテムを使いアンロック、強化するものの他にも、「パワーグリフ」と呼ばれる不思議な石を装備する事で、各キャラクターに個別のスキルを付加する事が可能。また最大4人までのプレイヤーが4つのステージを舞台に、ストーリーモードで習得した能力やテクニックを駆使して対戦・協力しながら課題をこなすチームチャレンジが収録されている。
『アイランドアドベンチャー』では従来のソニックシリーズの要素を色濃く反映した2Dスクロールがメインのアクションゲームとなっており、個々の特徴や武器を持った仲間達をリアルタイムで切り替えながら、数々の障害を突破しステージを進んで行く。