特殊警備隊
前述の通り、SSTは第五管区海上保安本部の大阪特殊警備基地として設置されているが、運用は本庁警備課特殊警備対策室が行っている。第一特殊警備隊から第七特殊警備隊までの7個隊で編成され、各隊は8名ずつ、隊長は二等海上保安正、副隊長は三等海上保安正で、隊員の中には救急救命士や危険物取扱の有資格者も配属されている。また7個隊のうち、2個隊は爆発物処理・化学防護能力を備えている。
SSTは、ヘリコプターからのリペリング降下、巡視艇、高速艇などによる強行接舷、気泡が出ない循環式潜水器を使用した潜水による接近などによって対象船舶に乗り込み、下記装備等を使用して犯人を制圧する。突入に際しては、公開されている限り自動小銃4名、拳銃4名の編成をとることが多いようである。また任務によっては特別警備隊の支援を受ける場合もある。基本的に2人一組で行動する。機密保持は極めて厳しく、隊員は海上保安庁職員名簿にも掲載されず、人事記録からも名前を消される措置を受けている。