国道41号
国道418号(岐阜県美濃加茂市山之上・美濃加茂IC - 加茂郡川辺町石神・新山川橋北詰交差点)
国道256号(岐阜県加茂郡白川町・河東橋西詰 - 下呂市金山町金山・下妙見町交差点)
国道257号(岐阜県下呂市小川・帯雲橋交差点 - 下呂市萩原町萩原・はぎわら大橋東詰)
国道472号(岐阜県高山市上岡本町・上岡本町南交差点 - 飛騨市古川町野口)
国道471号(岐阜県飛騨市古川町野口 - 飛騨市神岡町船津・船津北交差点)
国道360号(富山県富山市猪谷 - 富山市本丸・城址公園前交差点)
同年5月、婦負郡細入村(現・富山市)笹津 - 富山市大手町の区間が建設省の直轄指定区間となる。
1968年(昭和43年) 8月18日 - 白川町内で飛騨川バス転落事故が発生 11月23日 - 国道改修工事が全線で完了。同年12月に全線開通祝賀会。
1975年(昭和50年) - 名濃バイパス(名古屋市 - 岐阜県美濃加茂市)完成。これ以前は愛知県犬山市 - 岐阜県各務原市鵜沼の間においては名鉄犬山線の電車も道路上を通る犬山橋を通行し、各務原市鵜沼 - 美濃加茂市の区間は国道21号との重複区間であった。
1976年(昭和51年)3月31日 - 国道8号富山高岡バイパスが本線化されたことに伴い。国道8号旧道のうち金泉寺交差点 - 公会堂前(現・城址公園前)交差点間が国道41号に編入される。
2016年(平成29年)4月1日 - 美濃加茂市御門町(新太田橋交差点)から加茂郡川辺町石神(新山川橋北詰交差点付近)に至る区間(約7km )は美濃加茂バイパス開通により岐阜県道371号美濃加茂川辺線に降格。
2020年(令和2年)7月8日 - 令和2年7月豪雨の影響で、下呂市小坂町付近で路面が崩落する被害を受けた。
2021年(令和3年) 7月28日 - 上記の下呂市小坂町付近で路面が崩落する被害の災害復旧工事が完成、片側交互通行規制を解除。 8月15日 - 豪雨により飛騨川が増水し全面復旧が終わったばかりの下呂市小坂町付近の道路の土台となる護岸が崩落。