日本選手権水泳競技大会
400m平泳ぎ
4×50mフリーリレー
4×100mフリーリレー
4×200mフリーリレー
3×100mメドレーリレー
4×100mメドレーリレー
自由形(50m, 100m, 200m, 400m, 800m, 1500m)
平泳ぎ(50m, 100m, 200m)
背泳ぎ(50m, 100m, 200m)
バタフライ(50m, 100m, 200m)
個人メドレー(200m, 400m)
大会は競泳・飛込競技・水球・アーティスティックスイミング、オープンウォータースイミングの5部門からなる。日程・会場それぞれの部門別に別日程・別会場で行われる。各競技会の正式名称は、「第○回日本選手権水泳競技大会○○競技」となる(第○回は競泳25m以外は共通)。
競泳競技には、第81回大会(2005年)よりJAPAN SWIM(ジャパンスイム)という呼称が取り入れられている。アーティスティックスイミング競技は、JAPAN SYNCHRO CHAMPIONSHIP OPEN(ジャパンオープン)も兼ねており、海外招待選手も交えて実施されている。
2011年よりそれまでの日本短水路選手権水泳競技大会も日本選手権水泳競技大会競泳競技 (25m)(現在の正式名称は日本選手権(25m)水泳競技大会)と改められ、水泳の「日本選手権」は6部門となった。競泳(25m)のみ他の部門と会次が異なる。