文部省
大臣官房 人事課、総務課、会計課、政策課、調査統計企画課、福利課 文教施設部 技術参事官 指導課、計画課、技術課 総務審議官 審議官(6人)
生涯学習局 生涯学習振興課、社会教育課、学習情報課、青少年教育課、男女共同参画学習課
初等中等教育局 幼稚園課、小学校課、中学校課、高等学校課、職業教育課、特殊教育課、教科書課、初等中等教育企画課
教育助成局 財務課、地方課、教職員課、海外子女教育課、施設助成課
高等教育局 科学官(3人) 企画課、大学課、専門教育課、医学教育課、学生課 私学部 私学行政課、学校法人調査課、私学助成課
学術国際局 科学官(12人) 学術課、研究機関課、研究助成課、学術情報課、国際企画課、国際学術課、留学生課
体育局 体育課、生涯スポーツ課、競技スポーツ課、学校健康教育課