自衛隊病院
海上自衛隊員の集中する主要な基地は、地方総監部の所在地となっているので、各地方総監部所在地に1つずつ、海上幕僚長を通じて指揮監督を受ける自衛隊地区病院が置かれていたが、2022年(令和4年)3月17日、横須賀、呉病院以外は地方隊隷下の衛生隊「診療所」に縮小改編された。
自衛隊横須賀病院 - 横須賀基地(神奈川県横須賀市):1956年(昭和31年)3月1日開設。
自衛隊呉病院 - 呉基地(広島県呉市):2005年(平成17年)3月1日開設。
かつて存在した病院
自衛隊江田島病院 - 江田島地区(広島県江田島市):1958年(昭和33年)4月1日開設、2005年(平成17年)3月1日、自衛隊呉病院の開院に伴い、海上自衛隊第1術科学校総務部衛生課医務室に縮小改編。
自衛隊大湊病院 - 大湊基地(青森県むつ市): 1960年(昭和35年)3月31日開設、2022年(令和4年)3月17日、大湊衛生隊診療所に縮小改編。
自衛隊舞鶴病院 - 舞鶴基地(京都府舞鶴市):1954年(昭和29年)12月1日開設、2022年(令和4年)3月17日、舞鶴衛生隊診療所に縮小改編。
自衛隊佐世保病院 - 佐世保基地(長崎県佐世保市):1980年(昭和55年)8月1日開設、2022年(令和4年)3月17日、佐世保衛生隊診療所に縮小改編。