飛騨山脈
この隆起は、マグマの熱によって地殻が脆性になったところに東西の水平圧縮応力が加わり、そこを力学的弱点として座屈変形した結果されている。水平圧縮応力の起源は日本海東縁変動帯(300万年前~)や、伊豆地塊の本州への衝突(約100万年前~)に関連する可能性がある。この第二段階では100万年前ごろをピークに急激な隆起が生じ、3000m級の山々が形成された。この第二段階の急激な隆起により、地下で固結した珪長質マグマの一部である約120万年前の滝谷花崗閃緑岩、約80万年前の黒部川花崗岩などが地表に露出している。これらの花崗岩の年代は世界で最も新しい。また、第一段階で形成されたカルデラが座屈変形により東側に傾動し、カルデラ西側の構造が浸食により失われている。第二段階でも約60万年前に上宝火砕流、約35万年前に奥飛騨火砕流などの大規模火砕流や、焼岳、立山などの火山活動が現在完了進行形で存在しているが、噴出したマグマの総量は300 km DRE程度で、第一段階ほどの量ではない。これは水平圧縮応力によってマグマの地殻内上昇が妨げられていることが原因とされる。
飛驒山脈は南北方向の開析や、崩壊地形が発達している。これは、隆起速度が速いため浸食されやすいこと、花崗岩が断層運動により破砕し真砂化して崩れやすくなっていること、60万年前以降の氷期に氷食作用を反復して受けたなどが原因とされている。