第1ヘリコプター団
災害派遣においては「自衛隊の災害派遣に関する達」内の「陸上自衛隊災害派遣実施要領」により、第1ヘリコプター団が所在する駐屯地の駐屯地司令の職にある部隊等の長は、陸上総隊司令官の承認を受け、第1ヘリコプター団の所要の部隊をその所在する警備区域以外の警備区域に派遣することができる、とされる。
木更津駐屯地には、AH-1Sコブラ対戦車ヘリコプターを主力とする、東部方面航空隊隷下の第4対戦車ヘリコプター隊も駐屯している。
丘珠駐屯地では、夏季の間だけ第1ヘリコプター団のCH-47J 2機が配置される北方運用配置が行われる。これは、同駐屯地にCH-47Jを収容できる格納庫がなく、雪の中に機体を置くのを避けるためである。
第1空挺団同様、「ヘリコプター団」は本団のみで、「第2――」「第3――」は存在しない。
2020年3月26日には、ティルトローター機のV-22オスプレイを運用し、水陸機動団を支援することを目的とした輸送航空隊が新編された。木更津駐屯地へは暫定配備となり、今後、佐賀空港への本配備を予定しているほか、隷下1個CH-47J輸送ヘリコプター飛行隊が高遊原分屯地に駐屯する。