羽越本線
1993年から秋田車両センター(現・秋田総合車両センター南秋田センター)の701系電車を使用しており、一部列車ではワンマン運転が実施されている。全区間を直通する列車のほか、酒田駅 → 吹浦駅間と羽後本荘駅・新屋駅 - 秋田駅間の区間列車の設定があり、1 - 2時間に1本運行されている。秋田駅を跨いで乗車する学生が多い朝には奥羽本線との直通列車が存在し、新屋発大館行きが1本、東能代発酒田行きが1本、平日のみ八郎潟発新屋行きも1本運行されている。酒田駅を境に管轄支社が変わるため、同駅での村上方面と羽後本荘・秋田方面相互の列車接続(「いなほ」との接続を含む)はよくない。また、この区間に存在する女鹿駅、折渡駅、桂根駅については、通過する普通列車が一部設定されている。
1988年3月13日 - 2002年11月30日まで酒田駅・羽後本荘駅 - 秋田駅間を運行する快速列車に「こよし」の名称が与えられていた。2021年3月12日まで、朝1本のみ設定されていた羽後本荘発秋田行き快速列車は、かつて「こよし1号」として運転されていた列車のダイヤを引き継いだものである。
1920年(大正9年) 2月22日:秋田駅 - 道川駅間 (19.9km) が羽越北線として開業。新屋駅・下浜駅・道川駅が開業。 7月30日:道川駅 - 羽後亀田駅間 (8.1km) が延伸開業。羽後亀田駅が開業。
1921年(大正10年)7月31日:羽後牛島駅が開業。
1924年(大正13年)4月20日:羽後亀田駅 - 羽後岩谷駅間 (7.7km) が延伸開業。陸羽西線鼠ケ関駅 - 羽後岩谷駅間を編入して秋田駅 - 鼠ケ関駅が羽越線に改称。
2006年(平成18年) 1月19日:酒田駅 - 鶴岡駅間の運転再開(当分の間事故現場付近は45km/hの徐行運転)。 7月13日:大雨の影響で小岩川駅 - あつみ温泉駅間で土砂崩れが発生し、鼠ケ関駅 - あつみ温泉駅間が不通になる。これにより、村上駅 - 酒田駅間と鼠ケ関駅 - あつみ温泉駅間でバス代行輸送が行われ、「あけぼの」については、13 - 15日のみ奥羽本線・北上線・東北本線経由で迂回運転。 8月9日:応急復旧工事により同区間の運転再開、現場付近は完全復旧まで45km/hで徐行運転。 12月1日:脱線事故の現場付近で行っていた速度規制 (45km/h) が、防風柵設置に伴い解除。 12月5日:あつみ温泉駅 - 小波渡駅間に「強風警報システム」が導入。 12月27日:砂越駅 - 北余目駅間に「強風警報システム」導入。
2007年(平成19年) 1月29日:余目駅構内にドップラー・レーダー設置。 12月17日:藤島駅 - 西袋駅間に「強風警報システム」導入。
2008年(平成20年) 1月:新津駅 - 酒田駅間および白新線新潟駅 - 新発田駅間で、気象情報を活用した新運転規制が試行される。これは気象情報から突風が発生する恐れがあると予測された際、事前に列車の運転を中止するというもの。 3月15日:京ケ瀬駅 - 中浦駅間が「Suica」の利用エリアになる(新津駅・新発田の両駅では2006年1月21日から利用可能)。
5月15日:平林仮乗降場が駅に変更され平林駅が開業。
1953年(昭和28年)7月1日:中浦信号場が駅に変更され中浦駅が開業。
1955年(昭和30年)1月20日:神山信号場が駅に変更され神山駅が開業。
1957年(昭和32年) 4月27日:五十川駅 - 小波渡駅間の新津起点119.3km地点付近にて下り旅客列車(蒸気機関車C51形牽引)が崩れた岩石に衝突して転覆。26日後の5月23日に運転再開。 9月28日:折渡信号場が開設。 9月29日:北余目信号場(2代)が開業。余目駅 - 北余目信号場間が複線化。
1958年(昭和33年)12月25日:東酒田信号場が駅に変更され東酒田駅が開業。
1960年(昭和35年)10月1日:北余目信号場(2代)が廃止。北余目信号場駅 - 砂越駅間が複線化。
1961年(昭和36年) 2月9日:村上駅 - 間島駅間の新津起点63.1km地点付近で急行「日本海」が崩れた土砂に乗り上げ脱線転覆。蒸気機関車C57 1が大破。 8月29日:新津駅 - 京ケ瀬信号場間において下り旅客列車が踏切で衝突したトレーラーとともに阿賀野川橋梁に激突し、その衝撃で阿賀野川橋梁のトラス4連のうち新津方1連が破損し落橋。機関車C57 106と客車2両が脱線し、機関車は川に転落し大破。機関車乗務員2人が死亡、乗務員・乗客12人負傷。9月19日に仮復旧するまで不通となる。 10月1日:大阪駅 - 青森駅間(北陸本線・信越本線・羽越本線・奥羽本線経由)で特急「白鳥」が運転開始。羽越線を通る初めての特急列車。
特急「白鳥」:大阪駅 - 青森駅間(1965年から新潟駅経由)
特急「鳥海」:上野駅 - 青森駅間(1982年-1985年は昼行、1990年-1997年は夜行)
寝台特急「日本海」:大阪駅 - 青森駅間(2012年に定期運転を終了し臨時列車化、その後2013年3月で運転を終了)
寝台特急「あけぼの」:上野駅 - 青森駅間(2014年に定期運転を終了し臨時列車化)
寝台特急「トワイライトエクスプレス」:大阪駅 - 札幌駅間
特急「出羽」:上野駅 - 秋田駅間
急行「天の川」:上野駅 - 秋田駅間(新潟駅経由)
急行「鳥海」:上野駅 - 秋田駅間
急行「羽越」:新潟駅 - 秋田駅間
急行「きたぐに」:大阪駅 - 青森駅間(1982年から大阪駅 - 新潟駅間に短縮)
急行「しらゆき」:金沢駅 - 青森駅間(新潟駅経由)
急行「出羽」:上野駅 - 酒田駅間(東北・奥羽・陸羽西線経由)
急行「月山」:鼠ケ関駅・吹浦駅・酒田駅 - 山形駅・仙台駅間