武田信重
そのため、任命は中止され、信重は四国への隠棲を余儀なくされた。杉山一弥は逸見氏や穴山氏の件は表向きの理由であり、本質的な拒否理由は在倉制にあったとみる。関東など鎌倉府管轄下の諸国の守護は鎌倉に出仕して鎌倉公方に奉仕する義務を負っていた。だが、それは同時に鎌倉公方が自分の敵対する可能性のある守護を粛清する好機でもあり、実際に幽閉・殺害された守護も存在した。信重は上杉禅秀の乱への加担者に対する報復を進めていた持氏によって自分の命を奪われることを危惧して帰国を拒否したが、室町幕府(足利義持)としては信重の拒否理由は情においては理解できたものの、在倉制は守護としての義務であり、これを拒絶した信重を幕府に対する抗命として京都から追放、事実上の配流にせざるを得なかったのである。この状況を見た足利持氏は応永33年(1426年)に甲斐国に出兵して、武田信長を降伏させて鎌倉に出仕させた。持氏は伊豆千代丸を守護と認めることで信長父子を懐柔する一方で、実質においては幼少の伊豆千代丸に代わって甲斐の直接統治に踏み切ったのである。
この流れが変わったのは、足利義教の征夷大将軍就任後である。義教は再度、信重に甲斐守護就任を命じ、更に隣接する駿河国駿東郡の佐野・沢田両郷を与える提案が出されるものの、信重は再度拒否するが、義教は信重を許して京都に呼び戻した上で摂津国溝杭荘の一部を与えたのである。これは持氏との対決が近いと考えた義教が信重を庇護する姿勢を示したものであった。永享5年(1433年)には跡部氏による輪宝一揆によって甲斐における勢力を失った武田信長が鎌倉を出奔し、永享6年(1433年)に入ると跡部氏が室町幕府と極秘に交渉を行い、管領細川持之や満済の説得を受け入れた跡部氏が信重を守護として迎える姿勢を示した。