カモメ亜科
伝統的に、カモメ科の3亜科(あるいは3科・3族)の1つとされてきた。狭義のカモメ科として独立科とする説もあるが、基底的な属がありいずれかの科が側系統となるため避けられる。
Noddies と総称されるクロアジサシ属 Anous・ハイイロアジサシ属 Procelsterna・シロアジサシ属 Gygis の3属またはその一部を含める説もあるが、これらはいずれの亜科とも別系統である。
系統樹は Baker et al. (2007)より。ただしカモメ科内の系統関係については不確実な異論もある。彼らがサンプリングしていない属には ? をつけた。そのうちハイイロアジサシ属は Thomas et al. (2004)より。カモメ亜科内の数属は Pons et al. (2005)によるが、彼らが確度の高い結果を出していない Chroicocephalus は、Thomas et al. (2004) が ((Chroicocephalus, Hydrocoloeus), Rhodostethia) としていることからこの位置とした。
カモメ属および近年それから分離(ないし再分離)された属には☆をつけた。