基部系統
有根系統樹には、「基部 (base)」が生じる。系統樹において、分岐する枝はそれぞれ同等であり、回転(相互に交換)可能である。そのため、最も分岐の基部に位置する枝の左右両方が「基部系統群」である。そのため、1つのクレードのみが最も基部とはなり得ない。ある姉妹群において、一方のクレードを基部系統だとすると、他方のクレードは「派生的なクレード」となる。種数が多い方の群が「より派生的な」クレードだとすると、確かにより多くの種が含まれるが、これは本質的には意味がない。系統樹の各枝に含まれる分類群の数はそのデータの集め方によって変わり、現生で種数が少ない基部のクレードでも、絶滅したより多くの種を含んでいたかもしれないためである。系統分類学や分岐学においては、系統樹の各クレードに重みづけをする理由はない。