大腸菌
1885年、ドイツとオーストリアの小児科医テオドールエシェリヒは、健康な人の糞便からこの微生物を発見した。それは結腸で発見されたので、彼はそれをバクテリア・コリ・コミューン(Bacterium coli commune)と呼んだ。原核生物の初期の分類では、形状と運動性に基づいてこれらを少数の属に分類していた(当時、モネラ界におけるエルンストヘッケルの細菌の分類が実施されていた)。
以前のタイプの種("Bacterium triloculare")が失われており、Bacterium coliは現在無効な属のタイプ種となっている。Bacteriumの改訂後、1895年にMigulaによってBacillus coliとして再分類され、その後新しく作成されたEscherichia属に再分類され、元の発見者にちなんで属名が名付けられた。