萬松寺
本堂 1994年(平成6年)4月に建てられた地下1階、地上5階建ての鉄骨鉄筋コンクリート造の建物の1階が本堂になっている。2階は開山堂と位牌堂である。地下1階は納骨堂「逢恩閣」、3階は納骨堂「水晶殿」・「氣昇閣」、4階は納骨堂「瑞雲閣」、5階は納骨堂「天聚閣」、屋上は鐘楼堂となっている。
織田信秀供養塔
不動堂 2017年(平成29年)に建てられた白龍館の1階にある。加藤清正が命名したと伝えられている身代わり不動明王石像が祀られている。その命名の由来は元亀元年(1570年)5月、千種街道を通っていた織田信長を杉谷善住坊が狙撃したところ、玉は信長が萬松寺の和尚から貰い受けていた干し餅に当たり助かった。信長は日頃信仰していた萬松寺の不動明王の加護のおかげであると深く感謝した、という話からきている。
白雪稲荷堂 白龍館の1階にある。鎮守社。祀られている白雪枳尼真天は、当寺がここに移転してくる以前から現在地に祀られていたものである。
寺務所 白龍館の1階にある。
2017年(平成29年)の建替工事では、将棋のタイトル戦の開催を見据え、テレビカメラの配線や天井カメラへの対応など対局中継に対応したカスタマイズが加えられた。当時の若住職が将棋ファンで「愛知の将棋界を盛り上げたい」として誘致に踏み切ったという。2018年(平成30年)に名人戦を開催したのを皮切りに、以後棋聖戦・叡王戦・竜王戦の開催実績がある。寺でも「将棋タイトル戦特設サイト」を開設するなど、将棋関連の情報発信に力を入れている。
また向かいの万松寺ビルでは、2020年(令和2年)度より日本将棋連盟・東海研修会の例会も開かれている。