日吉台遺跡群
これ以降、日吉台における弥生時代集落の調査・研究が始まった。なおこの際、日吉台4号墳と新発見の日吉台5号墳(K地区)も発掘調査された。これらと同じ時期に、陸上競技場建設地付近では鏡(八稜鏡)や室町時代の板碑など、古代~中世の遺物が出土したことが報告されている。
1936年(昭和11年)7月の慶應義塾大学三田史学会によるK地区の発掘調査では、多数の竪穴建物跡が検出された。この内の第111号建物は長径9.4メートルの隅丸方形建物で、発見当時は弥生時代建物跡として日本最大規模であり、当時話題となった。この第111号建物跡および第102~105号の5軒の建物跡は、遺構壁面をコンクリートで硬めて現地保存し野外展示されている。
1940年(昭和15年)7月から1941年(昭和16年)2月には、A地区での藤原工業大学(慶應義塾大学理工学部の前身)の仮校舎建設に伴い同大教員の清水潤三により大規模な発掘調査が実施され、10軒の竪穴建物が検出されるなど、慶應義塾大学の歴史学・考古学系教員によりキャンパスとその周辺での調査研究が進展した。当時、調査を主導した清水潤三は、成果報告の中で「日吉は我国考古学史上、不朽の名をとどめることとなった」と述べている。