ニンテンドーeショップ
ニンテンドー3DSメニュー内のアイコンではなく、3DSメニュー内の左上のボタンを押して「テーマを変える」、「テーマショップを見る」の 順に押すことで見ることができるショップ「テーマショップ」から購入するもの。3DSメニューそのものの絵柄を変更できる「テーマ」を購入できる。テーマのダウンロード専用のダウンロードコードの入力もテーマショップから行う。
2014年10月より一部のオンラインショップ(楽天ブックス、ヨドバシ.com)で、ダウンロード版購入時にニンテンドーネットワークID(NNID)とパスワードを入力することにより、本体側でダウンロード番号を入力しなくても「いつの間に通信」を介して、ソフトが自動でダウンロードされるサービスが開始された。今後も対応ショップを拡大予定で、Amazon等でも導入される予定。
2015年には「あらかじめダウンロード」機能が追加された。これは発売日よりも前にダウンロード版を購入した場合、ソフトのデータの大部分を事前にダウンロードし、発売日に残りのデータをダウンロードしてプレイ可能となる。
なお、上記のダウンロード販売開始日以降に任天堂より発売されたパッケージソフトは、一部の例外を除き、同じ内容でダウンロード版も発売されている。
Wii UではWiiとの互換機能を応用して、2015年1月15日よりWiiパッケージソフトの一部がWiiディスクソフト ダウンロード版として販売開始された。
Switchをインターネットに接続し、Ver2.0.0に更新することで利用が可能になる。
SwitchはニンテンドーネットワークIDは使用せず、ニンテンドーアカウントを利用することになる。
配信はSwitch専用ソフトのダウンロード版とダウンロード専用ソフト。バーチャルコンソールのサービスは非対応だが、Nintendo Switch Online加入者向けにファミリーコンピュータやスーパーファミコン、NINTENDO64のゲームをSwitch上で遊べるサービスが提供されている。
3DSやWii Uとの残高共有は、ニンテンドーアカウントとニンテンドーネットワークIDを連携し、共有することで可能。その後に連携を解除した場合、残高は全てニンテンドーアカウントに残る。
ダウンロードしたソフトはDSiウェアのソフトのみ本体保存メモリに保存される。それ以外のソフトはSDカードに保存されるため、SDカードがないと購入したソフトをダウンロードできない。保存されたソフトはHOMEメニューの項目に追加される。DSiウェアまたはバーチャルコンソール、3DS用ダウンロードソフトのセーブデータはダウンロードしたソフト内に一緒に保存されており、ソフトを本体から削除するとセーブデータも一緒に削除される。一部の3DS用ダウンロードソフトまたは体験版、ムービーのソフトは追加データと別々になっているため、ソフトを削除しても追加データが消えることはない。
DSiウェアのソフトはSDメモリーカード・SDHCメモリーカードにコピーすることができるが、コピーしたソフトを直接起動したり、他のDSi本体にコピーしたりすることはできない。それ以外のソフトはSDカードに保存されているため、直接起動できる代わりにコピーすることはできない。ただし3DS関連のデータは基本的に「Nintendo 3DS」というフォルダに全て入っているため、SDカードを取り出して他のSDカードへ引っ越したり、PCに一括バックアップをすることは可能である。