TAR DNA結合タンパク質43
TDP-43は414のアミノ酸残基を持ち、4つのタンパク質ドメインからなる:
(1-76残基) 二量体またはオリゴマーとなることが示されているN末端ドメイン(NTD)
高度に保存された、それぞれ標的RNAとDNAを結びつけるのに必要な、2つの折りたたまれたRNA認識モチーフ RRM1: 106-176残基 RRM2: 191-259残基)
274-414残基を含む、構造化されていないC末端ドメイン。グリシンに富んだ領域を持つ。タンパク質間の相互作用に関連し、家族性筋萎縮性側索硬化症に関わるほとんどの変異がここで起きる。
最近、大きな可溶化タグがないタンパク質全体が精製された。全長タンパク質は二量体である。この二量体は2つのNTDの自己相互作用により形作られる。二量体化にとどまらず、多量体化(オリゴマー化)することもある。
タンパク質配列には、核局在化シグナル(NLS, 82-98残基)、核外搬出シグナル(NES, 239-250残基)も含まれている。また、3つのカスパーゼ-3切断部位が推定されている(残基13, 89, 219)。
後天性免疫不全症候群の原因であるHIV-1は複製過程で、染色体に組み込まれたDNAを生産するRNAゲノムを含む。トランス活性化因子「Tat」によるHIV-1遺伝子発現の活性化は、転写開始点の "下流" (時間的に後のほうで転写される) に位置するRNA調節エレメント(TAR)に依存する。
TARDBP遺伝子の変異は、前頭側頭葉変性症と筋萎縮性側索硬化症(ALS)を含む神経変性疾患に関連している。特に、M337V変異とQ331K変異はALSにおける役割を研究されている。
細胞質のTDP-43病理学は、多系統蛋白質症における組織病理学上の支配的な特徴である。C終端領域の凝集を促進するN終端ドメインは、負電荷を帯びた2つのループを持つ新しい構造を持つ。一部のALS患者で、TDP-43がどのようにして病気を引き起こすか調査した最近の研究では、細胞ストレスがin vivoの脊髄運動神経で、TDP-43の細胞質での誤配置を引き起こすトリガーとなる場合があることを示している。