熊本県
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熊本県内市別人口ランキング(2021年(令和3年)現在) 熊本市(73.5万人) 八代市(12.5万人) 天草市(7.8万人) 玉名市(6.5万人) 合志市(6.3万人)
熊本市(県都・政令指定都市)
八代市
天草市
玉名市
合志市
熊本県内市別人口密度ランキング(2020年(令和2年)現在) 熊本市(1,892人/km) 合志市(1,161人/km) 荒尾市(886人/km) 宇土市(486人/km) 玉名市(421人/km)
熊本市(県都・政令指定都市)
合志市
荒尾市
宇土市
玉名市
人の流出先としては、関西や中京圏などが多い。
豊臣秀吉の九州征伐により佐々成政が肥後の国主を命じられるが、太閤検地に反対する国人たちによる一揆が起こった。秀吉は成政にその責任を負わせて切腹を命じる一方、一揆に参加した国人たちを徹底的に弾圧し、その勢力は一掃された。その後、秀吉は北半分を加藤清正、南半分を小西行長に分け与え、球磨郡においては相良氏の支配を認めた。
小西行長が関ヶ原の戦いで敗れ滅亡すると、加藤清正がその領地を併せ52万石の領主となった。清正は名城熊本城を築き、また河川・水路を改修して耕地を広げ生産力の向上に努めたため治水の名人として崇められた。しかし清正の死後、息子忠広の代に改易され、代わって細川氏が54万石の領主となった。(熊本藩)支藩として宇土藩、肥後新田藩がある。また、家老の松井家は八代城の城代として、3万石を与えられており、事実上の八代支藩の藩主であった。他に肥後国内には、相良氏が治める人吉藩があった。
天草は長崎に近く、また、キリシタン大名であった小西行長の領地になったこともあり、キリシタンの数が多かった。関ヶ原の戦い後、唐津藩12万石の領主である寺沢広高の領地となるが、寺沢はキリシタンを弾圧し、また過酷な徴税を行ったことから、寛永14年10月25日(1637年12月11日)に島原の乱が起こると、住民の半分がこれに参加し、全滅した。乱後、天草は天領となり、初代代官の鈴木重成の尽力によって天草は次第に復興していった。