アクリジンオレンジ
環境の pHが 3.5の場合、アクリジンオレンジは青色光 (460nm) によって励起される。 アクリジンオレンジが青色光で励起されると、蛍光色素はヒト細胞を緑色に、原核細胞をオレンジ (600nm) に区別して染色できるため、蛍光顕微鏡で迅速に検出できる。アクリジンオレンジの異なる染色能力は、1000倍の倍率で操作するグラム染色と比較して、400倍の低倍率で標本塗抹標本の迅速なスキャンを提供する。細胞の分化は、着色された微生物を簡単に検出できるようにする暗い背景によって強調される。シャープなコントラストによって、サンプルに存在する微生物の数が数えられるようになる。アクリジンオレンジが DNA に結合すると、色素は 502nmで最大励起を示し、525nmの最大発光を生成する。RNA に結合すると、アクリジンオレンジは 650nmの最大発光値と460nmの最大励起値を示す。アクリジンオレンジが RNA に結合したときに発生する最大の励起および発光値は、静電相互作用と、RNA および DNA 内に存在するアクリジン分子と核酸-塩基対の間のインターカレーションの結果である。