バルカン戦線
1944年10月4日にはギリシャにイギリス軍が上陸、エーゲ海の島々と一握りの都市がドイツ軍占領下に残るのみとなった。11月29日にはホッジャ率いるパルチザンがアルバニアを掌握し、ユーゴスラビアでもドイツ軍は敗走を重ねるばかりとなった。ドイツ軍がそれまでパルチザンの捕虜に何をしてきたかを考えれば、ドイツ軍もパルチザンの捕虜になった場合どうなるかは明白だった。
1945年春、チトーはドイツ軍を駆逐し内戦状態の国内の主導権を握ることにも成功し、ついに3月7日、ユーゴスラビア連邦を成立させた。ユーゴスラビアはソ連軍の力を借りずに現地パルチザンによって「解放」された珍しい国となり、戦後相次いで共産化され、ソ連の衛星国と化していった他のバルカン半島諸国とは違う政治路線を歩むことになった。
(コミンフォルム)、(チトー主義)
(ギリシャ内戦)も参照
ギリシャは共産党系ゲリラと政府軍の内戦が続いたが、1949年、イギリスとアメリカの支援により政府軍が勝利した。
トルコはドイツ、イギリス双方からの参戦の誘いを断り続けた後、大戦末期の1945年2月に形式的に連合国側で参戦。ギリシャと並び、戦後の東地中海における西側諸国の中核を担うことになった。
(ユーゴスラビア侵攻)
(ギリシャの戦い)、(クレタ島の戦い)も参照
ギリシャはメタクサス首相を失いつつも激しく抵抗したが、徐々に枢軸軍に圧倒されていった。そして1941年5月30日、最後の拠点となったクレタ島からイギリス軍が撤退し、バルカン半島は完全に枢軸国の勢力圏下となった。
ギリシャは政府と軍隊が国外に亡命し、国土はイタリア、ブルガリア、ドイツに分割占領された。またユーゴスラビアでも政府が亡命し、国内は半独立のクロアチアとセルビアに分割された上、ドイツとイタリアに直接占領される地域、さらにハンガリー、ルーマニア、ブルガリアに占領される地域までありと、国内に複雑な境界線が何本も引かれた。さらに悪いことには、ドイツ軍は直後にソ連侵攻を控えてバルカン半島にあまり戦力を割ける状況になかったため、この地域は圧倒的な軍事力を有する組織も、頭一つ抜けた政治力を持つ組織もいないという混沌とした状態に陥ってしまった。これは必然的に占領軍に従う者、抵抗する者、多様な主張を掲げる政治勢力と武装組織が乱立する事態を招いた。
また、降伏したイタリア軍の武器弾薬はあらゆるゲリラ、レジスタンス、パルチザンの手にも渡り、彼らの火力を増強した。そしてこれ以降、ドイツ軍はギリシャ、ユーゴスラビアとアルバニアで、より一層困難なゲリラ討伐戦を続けることを強いられるようになった。
1943年8月1日、連合国軍はドイツの最重要戦略拠点だったルーマニアのプロエスティ油田を空襲した。戦況が枢軸側に不利になっているのは明白だったが、どの国も、最初は自国に都合のいいように利用しようとしたはずのドイツに、もはや手を切ることなどできないほどに取り込まれてしまっていた。
この間、連合国軍首脳は会談を重ね戦後のヨーロッパの勢力分けを行っていた。1944年10月9日、モスクワでのチャーチルとスターリンの直接会談により、バルカン半島諸国はギリシャはイギリス、ユーゴスラビアは折半、他はソ連の勢力圏とする合意(パーセンテージ協定)がなされた。