2010年代のJRダイヤ改正
吹田貨物ターミナル駅の開業および百済駅のリニューアルによって、梅田駅が営業終了となった。隅田川駅は全荷役ホームが20両編成のコンテナ列車対応となった。
JR東日本田端運転所配置のEF510形牽引による常磐線などの貨物列車はEH500形に置き換えられたことで委託が解消となった。
紀勢本線鵜殿駅発着の貨物列車が廃止され、この路線における定期貨物列車が全廃となった。
山陽本線・瀬野駅 - 八本松駅間(通称「瀬野八」)の勾配後押機関車・EF67形の後継機としてEF210形(300番台)が新製され、営業運転を開始した。
在来線特急列車 「サンダーバード」は、一部列車の運転時刻を変更して金沢駅における北陸新幹線との接続が改善されたほか、朝の金沢行き4本、夜の大阪行き4本が新たに高槻駅に停車するようになった。
京阪神地区 琵琶湖線・JR京都線・JR神戸線(東海道本線・山陽本線)の新快速が、米原 - 姫路間で平日の一部列車(朝の京都発米原行きと夕方の大阪始発)を除いて全列車が12両編成で運転されるようになった。 嵯峨野線(山陰本線)では、京都 - 嵯峨嵐山間で日中時間帯に普通を7往復増発し、この時間帯の普通電車は1時間に4本となった。 一部路線で運転本数・区間の見直しが行われた。
山陰(米子)地区 昼間の木次線と境線土休日の早朝の一部列車の列車時刻を見直し、列車同士の接続性の向上を図った。 2014年のダイヤ改正で気動車(キハ120系)に置き換えられた2往復のうち1往復が電車による運転に戻った。
山陽(広島)地区 可部線の可部駅 - あき亀山駅間が延伸開業し(実質的には2003年12月1日に廃止された区間が復活)、途中に河戸帆待川駅が設けられた。JR化後の廃線区間の復活は全国で初めてとなった。 山陽本線に寺家駅が開業した。 芸備線では、三次駅 - 広島駅間で平日ダイヤと土休日ダイヤの2本立てとなり、土休日ダイヤでは普通列車3本が快速「みよしライナー」に格上げされた。 最も長い距離を走っていた山陽本線岡山発下関行きの369M列車だったが、371M列車の岡山発緑井行き(土休日は岩国行き)に短縮された。
北陸地区 北陸本線敦賀駅 - 金沢駅間でワンマン運転が開始された。
その他の地区
東日本大震災で一部区間が不通になっていた仙石線が全線復旧(東名駅・野蒜駅は移転)し、仙石東北ラインが開業。東北線と仙石線を結ぶ直通列車が設定された。またこれに関連して、以下の変更も行われた。 石巻線経由の直通快速が廃止された。 東北本線・仙台駅 - 松島駅間の運行本数の見直しが行われた。
常磐線にJヴィレッジ駅が開業した。開業当初は臨時駅だった。
武蔵野線の「むさしの号」では、運転時刻の見直しが行われたほか、土曜・休日の夕方に八王子発大宮行きが1本増発された。また中央線内の国立駅・日野駅・豊田駅にも新たに停車するようになった。 南武線では、日中の快速運転区間が登戸駅から稲城長沼駅まで延長され、この時間帯の登戸駅発着の各駅停車は稲城長沼駅発着に延長された。 常磐緩行線では綾瀬駅 - 我孫子駅間において、日中の本数が1時間に5本から6本に増発された。なお、相互直通先の東京メトロ千代田線でも線内における日中の本数が1時間に10本から12本に増発され、このダイヤパターンの変更により小田急電鉄からの直通列車(特急ロマンスカーを除く)は日中はすべて我孫子駅の発着(3社直通運転)となった。 211系の宇都宮線・高崎線での定期運用が消滅し、211系のグリーン車の運用も消滅した。 宇都宮線宇都宮駅 - 宝積寺駅間と烏山線では、国内初の営業用蓄電池駆動電車であるEV-E301系の営業運転を開始した。 久留里線では久留里駅 - 上総亀山駅間の普通列車が削減された。 水戸線では、小田林駅・東結城駅ですべての列車が停車するようになり、線内で一部の駅を通過する普通列車は消滅した。 水郡線では、上菅谷駅 - 常陸太田駅間で日中に1往復が増発された。
東日本の東北・上越新幹線でダイヤ改正。
在来線特急列車 「成田エクスプレス」は、新宿・池袋方面発着列車が2往復増発されて10時台から18時台の新宿駅発着列車が約30分間隔になったほか、東京駅 - 成田空港駅間の3往復が6両編成から12両編成に増強された。 高崎線では、平日朝6時台に熊谷発上野行き「スワローあかぎ」1本が増発された。なお、平日夕方の「あかぎ」1本が廃止され、「あかぎ」は平日はすべて「スワローあかぎ」として運転されるようになった。 「草津」は、全列車の停車駅パターンが統一され、所要時間が最大13分短縮された。また「2号」の長野原草津口発が午前中から昼過ぎに繰り下がり、これに伴って「32号」(土曜・休日運転)の長野原草津口発も正午になった。 千葉地区では、「さざなみ1号」が姉ヶ崎駅にも停車するようになったほか、土曜・休日を中心に運転される「新宿さざなみ2号」の運転時刻が繰り下げられた。 中央線では、上野原駅・長坂駅において、すべての特急列車が通過となった。 首都圏在来線 中央線快速では、東京発22時台終わり(新宿発23時過ぎ)に快速を増発し、新宿始発の中央特快2本を東京始発に延長(東京発特別快速を0時まで拡大)、中野駅停車に統一した。また、18時台における高尾発大月方面行き列車の運転間隔が見直された。
「のぞみ」の定期列車のうち、山陽新幹線直通列車がすべてN700系に置き換えられ、新大阪駅折り返し列車も大半がN700系充当となった。
九州新幹線の博多駅 - 新八代駅間が開業し、鹿児島ルートの全線が開業した。途中駅として新鳥栖駅(新設)・久留米駅(既設駅併設)・筑後船小屋駅(在来線駅を移転して併設)・新大牟田駅(新設)・新玉名駅(新設)・熊本駅(既設駅併設)が設置された。
山陽新幹線と九州新幹線との直通運転が開始され、最速達タイプの「みずほ」、速達タイプの「さくら」が新設された。直通する列車のほか、博多駅でも「のぞみ」「ひかりレールスター」と接続するダイヤが組まれた。また、博多駅と小倉駅では特急料金の乗継割引が廃止された。
「さくら」の登場により、700系8両編成(レールスター編成)の「こだま」への運用が拡大された。これに伴い、100系は4両編成の運用が廃止され、6両編成も岡山駅 - 博多駅間および博多南線での運用となった。このダイヤ改正以降もN700系の増備が進み、700系(レールスター編成)使用の「ひかり」は順次削減された。
禁煙車が拡大され、300系・700系16両編成で運行される「こだま」と一部の「ひかりレールスター」をのぞき東海道・山陽新幹線の自由席は大半が禁煙となった。
東海道・山陽・九州新幹線 「N700A」の増備に伴い、東海道区間内および東海道区間と山陽区間を直通する定期の「のぞみ」「ひかり」はすべてN700Aタイプの車両での運転となり、また山陽区間での新型ATCの導入に伴って所要時間の短縮が図られ、東京 - 博多間は最速4時間46分で結ばれるようになった。 ほぼ毎日運転される臨時「みずほ」の運転開始。定期列車と合わせて8往復運転。 新大阪発20時過ぎ下り熊本止まりの「さくら」を新設(博多~熊本間は各駅に停車)。 朝7時台の熊本発博多行き「つばめ」1本を小倉行きに変更し、山陽新幹線区間に直通する「つばめ」が復活した。 2016年4月の熊本地震の影響で徐行運転が続いていた熊本 - 新八代間が所定の速度での運転となり、これで九州新幹線は全区間で通常の運行体制に戻された。
東北・北海道新幹線 「はやぶさ」が東京駅 - 仙台駅間で1往復増発された。
上越・北陸新幹線 「Maxたにがわ412号」の発着時刻を3時間ほど繰り上げた。
成田国際空港の営業時間拡大に伴い、成田線成田空港駅23:45発、空港第2ビル駅23:47発の毎日運転扱いの臨時快速千葉行きを設定。終点の千葉駅で各駅停車津田沼行きに接続する。