ケモゲノミクス
ケモゲノミクス(英: chemogenomics)または化学遺伝学(かがくいでんがく、英: chemical genomics)とは、小分子の化学ライブラリーを個々の創薬標的ファミリー(Gタンパク質共役受容体、核内受容体、キナーゼ、プロテアーゼなど)に対して系統的にスクリーニングすることであり、新薬や創薬標的を同定することを最終目的としている。一般的に、標的ライブラリーの一部のメンバーが十分に解明されるのは、機能が決定されて、かつ、それらの標的の機能を調節する化合物(受容体の場合はリガンド、酵素の阻害剤、イオンチャネルの遮断剤)が同定されている場合である。標的ファミリーの他のメンバーは、既知のリガンドを持たない未知の機能を持っている可能性があるため、オーファン受容体として分類される。
ケモゲノミクス・プロファイリングは、まったく新しい治療標的、たとえば新しい抗菌剤の同定に使用することができる。この研究では、ペプチドグリカン合成経路で使われるmurDと呼ばれる酵素の既存のリガンドライブラリーの有効性が利用された。研究者らは、ケモゲノミクスの相似性原理に基づき、murDリガンドライブラリーを他のmurリガーゼファミリー(英語版)のメンバー(murC、murE、murF、murA、murG)にマッピングし、既知のリガンドの新しい標的を同定した。ペプチドグリカン合成は細菌に固有であるため、同定されたリガンドは、実験的アッセイにおいて広域スペクトルのグラム陰性菌阻害剤であると予想される。構造および分子ドッキングの研究により、murCおよびmurEリガーゼのリガンド候補が明らかになった。