ミルキィホームズ 探偵学院放送室
名称が類似している番組である『ミルキィホームズ 探偵学院放送室2』は、地上波進出にあたり『ミルキィホームズ 探偵学院放送室』とは番組内容を大幅に変更している。具体的には、番組の構成やコーナーの内容などが見直されるなど、大幅な改変を行っている。『ミルキィホームズ 探偵学院放送室2』の公式サイトにおいても「内容一新」したと明記されている。
本番組はインターネットラジオであることから、ミルキィホームズや『探偵オペラ ミルキィホームズ』に対し、リスナーはそれなりに知識を持っているとの前提で放送している。そのため、番組内容も内輪ネタなどが散見され、ブシロードや『探偵オペラ ミルキィホームズ』などについて理解しているリスナーにとって、より楽しめる番組となっていた。しかし、『ミルキィホームズ 探偵学院放送室2』は、地上波ということもあり、ある程度ライトなリスナーにとっても楽しめる内容となっている。
たとえば、『ミルキィホームズ 探偵学院放送室2』では番組冒頭のレギュラーパーソナリティの挨拶は普通だが、『ミルキィホームズ 探偵学院放送室』では語尾に「○○みるきぃ」と付けて挨拶している。挨拶を変えた理由については、一般のリスナーにも受け入れてもらいやすいように配慮したためである。のちに、レギュラーパーソナリティにより、地上波を意識しての変更だったことが語られている。また、ゲストをほとんど呼ばないことでもしられていたが、『ミルキィホームズ 探偵学院放送室2』では積極的にゲストを招くなど、より幅広い番組内よとなっている。