ペシャワール会
1993年 - 第1回福岡県文化賞(福岡県主催)の交流部門受賞。
2002年 - 第1回沖縄平和賞(沖縄県主催)受賞。
2003年 - マグサイサイ賞・平和国際理解部門受賞。
2004年 - イーハトーブ賞(宮沢賢治学会主催)受賞。
2009年 - 福岡市市民国際貢献賞(福岡市主催)受賞。
2020年 - 第6回食の新潟国際賞大賞(公益財団法人食の新潟国際賞財団主催)受賞。
マグサイサイ賞及びイーハトーブ賞は中村の個人的な業績に対する受賞である。2003年時点で、ペシャワールの病院と4カ所にある診療所を合わせての年間の総診療数は15万人超である。