丹後魚っ知館
2016年(平成28年)3月8日には国指定天然記念物のアユモドキの飼育を開始した。2018年(平成30年)4月には日本一の海獣を決める「ヒレアシ甲子園」が開催され、ゴマフアザラシのゴン太が「腹筋」を披露して近畿1位となった。同年6月27日にはふくしま海洋科学館から1頭のゴマフアザラシを搬入した。
2019年(令和元年)8月26日には開館30周年を迎え、その前の同年6月1日には「うおっち館バッジ」の販売を開始した。2020年(令和2年)以後に新型コロナウイルス感染症の世界的流行が起こると、2020年(令和2年)3月3日から6月30日、2021年(令和3年)4月25日から6月20日、2021年(令和3年)8月20日から9月30日に臨時休館した。2021年(令和3年)7月には公式Twitterアカウントを開設した。2022年(令和4年)6月1日には海遊館からオオテンジクザメを搬入したが、これは丹後魚っ知館の飼育生物において最大級の個体である。
関西電力が約20年もの長期停止状態にあった宮津エネルギー研究所の敷地の再整備を決定したため、隣接する「丹後魚っ知館」も2023年(令和5年)5月30日をもって閉館した。研究所を含む跡地の約43ヘクタールの敷地は、脱炭素などの先進技術を備えた企業誘致エリアとして2028年度をめどに再整備する方針が示されている。