八神隆之
そのため、細川は、八神と町や人々との強いつながりがあるため、『JUDGE EYES』の続編の舞台も神室町にしなければならないと考えている。これまでの『龍が如く』の主人公は神室町への単なる訪問者であることが多かったのに対し、八神は神室町に住む一般市民として描かれており、彼の社会生活をより深く掘り下げることができた。
ローカライゼーションプロデューサーのスコット・ストリチャートは、ファンに対して、桐生や真島吾朗のようなこれまでの『龍が如く』のキャラクターが恋しくなるかもしれないが、「超頭脳明晰で、鋭いウィットを持っていて、自分の欠点も抱えている人間、彼自身」と表現する八神を受け入れてくれることを期待していると語った。八神と元恋人の藤井真冬の関係は、そのロマンスは『JUDGE EYES』のスリルを損なうと名越が判断したため、開発中に変更された。また、名越は、木村拓哉が欧米では人気がないため、英語圏でのこのゲームの人気に疑問を呈している。発売後、セガのスタッフは、もし『JUDGE EYES』の続編が出るとしたら、引き続き、八神と相棒の海藤正治が主役を務め、神室町を舞台にしていいのではないかと考えた。
前作より3年後の2021年12月。横浜の伊勢佐木異人町にて新たに探偵事務所を開業した杉浦と九十九の依頼により、とある仕事を引き受けることとなる。
早速、杉浦と九十九の事務所『横浜九十九課』を訪れると、異人町にある私立誠稜高校でのいじめ調査への協力を要請される。依頼主はその高校の理事長で、校内でいじめがないかどうかを徹底的に調べてほしいというものであった。八神は理事長から詳しい話を聞く中で、誠稜高校に来ていた教育実習生が2か月前から失踪しているという話を耳にする。翌日、八神達は理事長の了解を取り、学校中に小型の隠しカメラを仕掛け、生徒達の様子を監視する。すると早速、2年2組の教室でいじめの様子が捉えられた。そこでは、バスケ部の香田真美という女子生徒が、同じ部のメンバーから陰湿ないじめを受けている様子が映し出されていた。翌日、八神は一計を案じ、いじめを傍観していた同じクラスの生徒達に声を上げさせ、松井らの香田へのいじめを止めることに成功する。
その後、理事長室で今後のことを協議していると、城崎さおりから電話が入る。さおりによると、異人町の廃ビルで腐乱死体が発見され、その身元が2か月前に失踪していた誠稜高校の教育実習生・御子柴弘だったという。今後の調査を有利に進めるため、理事長が顧問を務めるミステリー研究会の顧問として潜入することとなる。
そのような中、八神は異人町を拠点とするマフィア「横浜流氓」に襲撃され、便利屋を営む謎の男、桑名仁に窮地を救われる。この出来事を機に、両者は誠稜高校の事件に協力関係を築いていく。
一方、八神はいじめ事件の調査の過程で、江原敏郎の担任である澤陽子および江原明弘の痴漢に関わった全ての人間が同じ学校(黒河学園)の卒業生であることを知り、痴漢事件と御子柴殺害事件は密接に関係しているのではないかと疑い始める。