博物館動物園駅
ホームの有効長が短いため、本線では最も短い4両編成しか停車することができず、その4両編成でさえも先頭車両の端の部分はホームからはみ出している状態だった。はみ出ている部分には列車と壁の隙間に台を設置して対応していた(それでもそこからの乗降は推奨されていなかった)が、このことが安全面で問題になっていた。
1981年(昭和56年)以降、普通列車の一部が6両編成になったことで、当駅を通過する普通列車が設定されたため、停車本数が減り、既存の乗降客の多くが南隣の京成上野駅を利用するようになった。当駅からの距離は0.9kmと比較的近い。
これにより営業時間が4両編成運転時間帯に限られることになり、休止直前は7時台から18時台までで、日中は停車する列車の間隔が1時間以上開く時間帯があった。そのため、駅構内に周辺施設から利用するための注意書きが掲出されていた。
京成本線では将来的に4両編成の列車の運行を取り止める計画もあり、上記の問題を解消するにはホーム延伸工事が必要であるが、地下駅のため多大な費用がかかり、1日乗降人員500人程度の当駅においての実施は費用対効果が低すぎた。
開業以来本格的な修繕がなされていないため、老朽化が進んでいた。
自動券売機や自動改札機が設置されておらず、改修や維持に大規模な投資が必要だった。
地下駅のため保安上の理由から無人化することができなかった。