5-ヒドロキシメチルシトシン
5hmCは、2種の神経細胞の5-メチルシトシン(5mC)濃度を比較する過程で発見された。 5mCの代わりに大量に検出された未知の物質は、いくつかの定性試験の結果、5hmCと同定された。
これとは別に、Tetファミリー酵素は5mCを酸化するであろうことが予測されていた。 このことはin vitroならびにヒトおよびマウスの細胞内で実証された。
5hmCは1972年に哺乳類から検出されたと報告されたが、報告の信憑性は低いとされた。 しかしラットの脳および肝細胞から極めて高濃度の5hmCが検出され、それまでの哺乳類DNAに関する研究結果が全て覆された。
5hmCの発見により、重亜硫酸塩シークエンス(英語版)技術を用いたDNAメチル化の研究に重要な問題が提起された。 5hmCは重亜硫酸塩コンバージョンにおいて前駆物質である5mCと同様の挙動を示すので、重亜硫酸塩シークエンスデータで検出された塩基が5hmCであるか5mCであるかを確認する必要があると思われる。