アルファゾーン
特捜6課課長。警視。目的のためには手段を選ばず、部下をも捨て駒にする非情な人物。ジーンネット社のコンラッドと深いパイプを持ち、それを後ろ盾として特捜6課に対する干渉を排除している。アルファの危険性を知り、隠蔽、抹殺しようとしている。
ジーンネット社会長。創立メンバーの一人。現在は研究からは身を引き、経営に専念している。深神のアルファ研究を支援しているが、あくまで研究成果をビジネス上の利益にするためと考えている。
自宅の黒姫の前に謎の女が現れる。女はアルファと名乗り、幻覚とも現実とも判断のつかない光景を黒姫に見せる。
古谷は大石の残したビデオメールの存在に気付くが、その古谷を刺客が襲う。刺客を撃退した黒姫は、命令を出した人物を刺客に吐かせようとするが、沢井の部下の常盤が「安全装置」を使用し刺客の口を封じる。常盤は古谷たちの殺害失敗を沢井に報告し、戻ろうとするところをアルファに襲われる。アルファは常盤から「ジーンネット」というキーワードを知る。
一方、黒姫は大石の残したビデオメールから、大石の視線が向かう彼女の手元に何らかの手がかりがあることを見抜く。京浜署内の監視カメラ映像には大石の手元が映っているはずだが、沢井に動きを封じられた黒姫たちにはその映像を確認できない。黒姫は旧知のハッカー・ヤンに京浜署の管理システムへのハッキングを依頼するため、古谷と共にR地区に向かう。
ジーンネット社所有の研究実験用宇宙ステーション。