朽木藩
一般的な定義(表高1万石以上の将軍直臣を「大名」とし、その領地・統治機構を「藩」とする)によれば、朽木家は大名ではなく交代寄合という家格の大身旗本であるが、朽木では交代寄合朽木家を「朽木藩」と見なす認識もある。たとえば自治体史である『朽木村史』では幕藩体制下の朽木谷を統治する領主の体制を「朽木藩」と叙述している。
朽木谷の朽木家は、鎌倉時代から明治維新まで同一地の領主として存在し続けた、数少ない事例の一つである。戦乱による断絶や転封に伴う散逸を免れた結果、朽木家には鎌倉時代以来の中世文書がよく伝えられた。もっとも、寛文2年(1662年)の震災によって文書を焼失するといった事件も経験している。朽木家は、所領の安堵・宛行に関する重要な文書の写しを複数作成し、正文の紛失に伴うリスクを最小限にしようとしていた。
朽木家文書は、畿内近国の領主が残した中世文書群としては随一の質と量とも評される。そのうち1066点は、1888年(明治21年)に内閣記録局が之綱から一括購入してその所有となった。この「朽木家古文書」は、現在は国立公文書館の所蔵となり、1989年(平成元年)に国の重要文化財に指定されている。このほか、朽木家に残った史料のうち427点が2008年(平成20年)に高島市の有形文化財に指定されている。
なお、朽木家の近世文書は中世文書に比べて残存が少なく、「領主としての在地支配に関わるものは何も残っていない」という。これについては、近世の朽木家の人々にとって、伝来の古文書と認識されていたのが江戸時代初期までの文書で、これらは朽木谷に保存されていたのに対し、近世の文書については江戸の屋敷で保管されていたと推測されていることに関連すると見られる。