東急目黒線
乗り入れ先を含めた各駅に停車する。一部列車は武蔵小山駅で急行と接続する他、奥沢待避列車もある。終日において日吉駅から南北線・三田線に直通するがラッシュ時間帯は新横浜駅発着列車および相鉄線直通列車が、早朝と夜間を中心に奥沢駅・武蔵小杉駅発着区間列車が数本設定されており、一部列車は目黒駅 - 日吉駅間のみ運転の線内折り返しとなる。東急新横浜線開業と同時に早朝に武蔵小山駅始発の日吉方面が設定された。また、新横浜駅周辺でコンサートやサッカーなどの大規模イベント開催時には三田線系統を中心に新横浜駅まで延長運転される。
「みなとみらい号」は、2006年8月運転分まで各駅停車で運転していた。
フルカラーLEDは青色、3色LEDは緑色で表記される。