境界戦機
大ユーラシア連邦、アジア自由貿易協商、オセアニア連合の3つの経済圏および八咫烏が協力し、北米同盟に対抗するために設立する組織。北陸地方を中心とした日本海側の一部を日本人に返還し、北米同盟に抱き込まれている日本政府に並ぶことを目指している。北米軍との決戦前には、アレクセイの提案で八咫烏とユーラシア軍、アジア軍、オセアニア軍の連合軍が「新日本軍」と呼称されることが決定する。
三澤ジンの専用機。外伝に登場するMAILeS「ビャクチ」をベースとした最新鋭の試作機。頭部には格納可能なブレードアンテナを持つ。局地戦における運用のため、各種装備や武装の付け替えが容易にできるようアタッチメントシステムが採用されている。I-LeSのラムダのサポートと歴戦の傭兵であるジンの操縦の腕により、戦闘では高い能力を発揮する。
武装は徹甲弾やキャニスター弾を発射する専用のアサルトライフル、ライフル下部に設置されたグレネードランチャー、3点バースト機構を備える専用ハンドガン、ジンがプロトゴウヨウ搭乗以前から使用している近接格闘用のマチェット、両膝のアーマー裏に収納されたダガーナイフ2本。また、選択式装備として大型のチェーンソーやハイドロジェットパックがある。
声 - 江口拓也
第2部に登場。第2新鋭部隊所属。チャーリーから強引に提供させた「プロトタイプ・ゼロ」のコピーAIを搭載したAMAIM部隊を率いて、ユーラシア勢力圏の日本人保護区を襲撃する。当初はアモウたちを相手に優勢に立ち回るが、ガイたちにAIのパターンを解析され形勢逆転、自身もシオンに撃破寸前まで追い詰められ敗走する。
声 - 大地葉
マシューと共にエリソン隊に招集された少尉。実戦経験は初となるため、「ヒヌカン」の歩兵相手に翻弄される。その後はエリソンからの命令を受け、孤島から撤退する。
声 - ボルケーノ太田
瀬戸内海方面の沿岸警備を担当する大尉。リウの不祥事により世論感情を悪くしたアジア軍の混乱に乗じて、敵の勢力圏に侵攻を開始するが、突如現れたレイキに部隊を壊滅させられ撤退する。
声 - 佐藤元
本作の主人公。通信制高校に通う16歳の少年。2045年4月25日生まれ。内向的で人付き合いが苦手だが、素直で人当たりのいい性格で、行く先々で出会う人々に気に入られている。3本の三つ編み状にまとめた後ろ髪が特徴。
死別した両親の遺産を崩しながら生活しており、被支配階級の日本人である自分の将来や生きる意味について悩みつつ、廃工場で見つけたケンブの整備とAMAIMの残骸漁りをしながら鬱屈した日々を過ごしていた。そんなある日にガイと出会ったことで世界が一変する。オセアニア軍との戦闘を経てテロリストとして指名手配され、逃亡中にガシンに救われたことをきっかけに「八咫烏」に保護されるが、ゴーストの襲撃でリサの死を目撃し、「八咫烏」から離脱する。リサの故郷の親類に彼女の遺品を届けようとおもむくが、そこを支配していたアジア軍の非道さを目の当たりにして奮起し、再び「八咫烏」に戻る。
一方、北米同盟を除いた各経済圏は、日本政府を抱き込んでいる北米同盟に対抗するために、北陸地方を中心とした日本列島の一部を日本人に返還し、第二の日本政府とも言える「新日本協力機構」を設立することを模索しており、八咫烏の代表・宇堂キリュウに交渉を持ちかける。宇堂がこれを受け入れたことにより機構は発足に至り、北米同盟との停戦交渉が行われる運びとなったが、交渉の場で北米同盟のロイ・ウォーカー議員狙撃事件が発生したことにより、停戦交渉は中止され、事態は北米同盟と新日本協力機構との全面戦争に発展する。北米同盟軍は総司令のエドガー・フリーマンが来日し、大軍を動員。一方、新日本協力機構は八咫烏と各国軍による「新日本軍」を結成し、北米軍を迎え撃とうとしていた。
新日本軍は3機のMAILeSの活躍と各国軍の奮戦で北米軍と互角に戦うも、ブラッドのブレイディファントムの参戦、そしてゴーストベースのAIを搭載した無人機群の物量により北米軍側が有利となっていく。しかし、ミスズがI-LeSベースのAIを無人機へインストールして戦況を巻き返し、アモウも激戦の末にブラッドを撃破する。そして背任行為をしていた北米軍のジョウ・スピアーズや彼の協力者のジェルマンが拘束され、戦闘は終結する。日本を取り戻す戦いは終わってはいないものの、アモウやガシン、シオンはそれぞれの道を歩むことを決める。
声 - 鈴村健一
元「八咫烏」隊員。同じ「八咫烏」隊員だった両親を亡くしたことでイッシンに引き取られ、ガシンとは実の兄弟のように育った。ガシンからは「ユウ兄(ユウにい)」と呼ばれ慕われている。現在はアジア協商圏内に建設された日本人自治区の区長を務めており、日本人の地位向上のために日々尽力している。戦いに身を置いているガシンのことを気にかけており、「八咫烏」を脱退してともに暮らすよう誘う。
自治区への便宜を引き出す目的でアジア軍と裏取引をしていたが、次第に提供する日用品の量を減らされ、量を元に戻す条件として無理難題を押し付けられる悪循環に陥っており、ついにはかつての仲間である「八咫烏」の内部情報に手を出そうとする。その事実を知ったガシンから糾弾されるが、あくまで自身の信念を優先し決別を告げる。
第2部ではガシンたちを裏切ったことを悔いており、水面下で「八咫烏」の支援に奔走していた。独自のネットワークを通じてユーラシア勢力圏内にある日本人保護区からの救援要請を受け、恥を忍んで「八咫烏」に協力を求める。