アパラチン会議
このため、クロスウェルはバーバラを怪しみ、その邸宅を監視することを決めていた。州警察はバーバラ邸に多くの高級車が駐車されていることを発見するとナンバープレートの照会を始めた。これら車の多くが犯罪者登録された者たちのものと判明したため、州警察の応援も現場に到着し、バリケードの設置を行い始めた。
こうした外の動きに気づかず会議が開始されたが、カステッランマーレ・デル・ゴルフォ出身でバーバラの使用人であったバルトロ・グッチアが、バーバラの私有地から出る際に警察のバリケードに気がついた。後にグッチアは魚の注文を確認するためにバーバラ邸に戻ったと述べている。一部の出席者は車で強引に脱出を試みたが、バリケードで止められてしまった。他の者たちは高級なスーツを台無しにしながら野原や森を駆けた。多くのマフィアはバーバラの邸宅を囲む森を突破して脱出した。
最大で50人は脱出を果たしたが、コミッションのメンバーであるジェノベーゼ、カルロ・ガンビーノ、ジョセフ・プロファチ、ジョゼフ・ボナンノといった大物を含む60名以上が逮捕された。実質的に彼ら全員は、体調が悪いというバーバラの見舞いのために訪問したと弁明していた。逮捕された者たちは全員に最高10,000ドルの罰金を科され、3年から5年の懲役刑が科されたが、1960年の控訴によりすべての有罪判決が覆された。
1957年11月14日、マフィアのボスや顧問(コンシエーレ)、また護衛で構成される全部で約100人の男たちがニューヨーク州アパレイキンにある53エーカーのバーバラの所有地に集まった。アパレイキンはニューヨーク市の北西約200マイルにあるペンシルベニア州境近くのサスケハナ川の南岸に位置する町である。この会議の主要な議題は、賭博や麻薬に関するコーサ・ノストラの方針決めと、先月に暗殺されたアナスタシアの違法ビジネスの利権分配であった。アナスタシアとスカリーチェの暗殺は、彼らの体制に忠実であったアナスタシア・ファミリーのメンバーを考えれば対策が急務であった。ファミリーの幹部(カポ・レジーム)であるアニエロ・デラクローチェやアルマンド・"トミー"・ラヴァは、ジェノベーゼや彼の同盟者と抗争を起こそうとしていた。
国内でも特に強力なコーサ・ノストラのボス達である、フロリダのサント・トラフィカンテ・ジュニア、ペンシルベニア北東部ファミリーの副ボスであるラッセル・ブファリーノ、ロサンゼルスのフランク・デシモーネ、カルロス・マルセロ及びマイヤー・ランスキーらは、コミッションがアナスタシア暗殺を公認するよりも前から彼のハバナ(キューバ)における賭博利権について懸念していた。キューバ利権は主要な議題の1つであり、特に同地における賭博や麻薬から得られたコーサ・ノストラの収益の密輸についてであった。
裁判ではプエルトリコの麻薬売人であるネルソン・カンテロプがジェノベーゼに会ったと証言し、1959年4月、ジェノベーゼはニューヨークで連邦麻薬法違反で有罪判決を受け、アトランタ連邦刑務所に15年の懲役を言い渡された。ルチアーノらはカンテロプに10万ドルの一部を支払い、ジェノベーゼが麻薬取引に関与していたと偽証させたと言い、これらが事実であれば、ルチアーノがジェノベーゼを妨害する強い動機を持っていたことになる。
しかし、これらの説の正しさを立証する決定的な証拠はない。上記の多くの疑問点にも解消できる説明がある。例えばランスキーの不在はしばしば挙げられる論点であるが、彼はユダヤ系ギャングの大物であり、同様にユダヤ系の大物であるスタチャー、アブナー・ツヴィルマン、フィル・カステル、モー・ダリッツらも参加していなかった(実際にユダヤ系マフィアが招待されていたか否かはいくつかの論争がある)。また、ランスキーはその日は病気であったと述べている。出席しなかったイタリア系マフィアについても、例えばルチアーノは国外追放を受けた身であって、アメリカに入国すること自体を許可されていなかった。
ジェノヴェーゼの権力奪取を妨害するために、これら3人が協力して陰謀を企てたという一定レベルの根拠はある。