さざなみ町
小佐々町は佐世保市との合併を申し入れており、佐々町との合併協議会廃止案可決から約1ヶ月後の2005年2月18日に『佐世保市・小佐々町合併協議会』を設置した。協議の結果、同時期に合併協議が行われていた宇久町とともに佐世保市への編入が決まり、2006年(平成18年)3月31日をもって自治体として消滅した。
一方、佐々町では町政の混乱を招いたとして、町長や町議会に対するリコールの動きが活発化した。こうした事態を受け、合併協議会解散から約1ヶ月後の5月、一連の責任をとって町長が辞職し、町議会が解散するに至った。その後江迎町と鹿町町が佐々町に対し合併を申し入れるが、財政面の問題などを理由に佐々町が拒否した。また、佐々町は佐世保市から合併協議会設置に関する再三の申し入れがあったが、態度を保留にする。2010年(平成22年)4月、住民発議による『佐世保市・佐々町法定合併協議会』設置の是非を問う住民投票が佐々町で行われ、「反対」が賛成を上回った。