国際 HapMap 計画
一般的に、集団間でハプロタイプは共有されているが、その頻度となると違いにはかなり幅がある。 HapMapプロジェクトでは4つの集団が対象となった。ナイジェリアのイバダンのヨルバ人の30トリオ(30組の両親と子)、 ユタ州の北ヨーロッパ及び西ヨーロッパ由来の30トリオ、日本の東京の血縁関係の無い個人44人、中国の北京の漢民族由来の 血縁関係のない個人45人である。これらの集団から得られたハプロタイプの情報は他の集団を研究する上でも 有用ではあるが、他の集団も含めた場合の有用性についても平行して検討が進められていた。
フェーズIIIでは11の共通祖先のグループのサンプルが集積された。内訳は、以下の通り。
ASW (African ancestry in Southwest USA)
CEU (Utah residents with Northern and Western European ancestry from the CEPH collection)
CHD (Chinese in Metropolitan Denver, Colorado)
GIH (Gujarati Indians in Houston, Texas)
LWK (Luhya in Webuye, Kenya)
MEX (Mexican ancestry in Los Angeles, California)
MKK (Maasai in Kinyawa, Kenya)
TSI (Tuscans in Italy)
YRI (Yoruba in Ibadan, Nigeria)