DNA再複製
こうした損傷が生じる機構は未解明である。1つの可能性としては、複製起点の活性化が低下していることで不完全なDNA複製が行われることが挙げられる。大きな影響を与えるような再複製は、全てのCDK調節経路が阻害されたときのみ観察される。
哺乳類細胞では、再複製の調節におけるCdt1とCdc6の重要性ははるかに高い。Cdt1とCdc6の過剰発現は非小細胞肺癌(英語版)75症例のうち43症例で観察されている。哺乳類細胞において、Cdc6やORCの過剰発現では多くの再複製は引き起こされない。一方、Cdt1の過剰発現はそれだけで致死的なレベルでの再複製が引き起こされる。こうした応答はがん細胞でのみ観察される。E2Fファミリーのメンバーの過剰発現はCdt1とCdc6の発現の増加に寄与する。Cdt1またはCdc6を過剰発現している細胞株では、p53による調節の喪失も高頻度で観察される。
DNAの複製は常に複製起点で開始される。酵母では、複製起点にはARS(autonomously replicating sequence)と呼ばれる配列が含まれ、染色体上約30 kbごとに分布している。ARSはどこに配置されても複製を開始することができる。長さは100–200 bpで、Aエレメントと呼ばれる領域が最も保存性が高い。Aエレメントは他の保存性エレメントであるBエレメントと共に、複製起点認識複合体(ORC)の組み立てと複製開始のための部位を形成する。複製起点の認識にはこうした配列が反復して存在することが最も重要である可能性がある。
動物細胞では、複製起点は染色体上で均等ではなくランダムに分布しているようである。動物細胞の複製起点は時にはARSのようにふるまうものの、複製が起こるかどうかに関しては局所的なクロマチン構造がより大きな役割を果たしているようである。S期には、20–80か所の複製起点を含むレプリコンクラスターが同時に活性化される。複製起点は全てS期の間に活性化されるものの、ヘテロクロマチン領域はユークロマチン領域よりもアクセスが困難であるため、より後期の段階で複製が開始される傾向がある。また、複製がいつ、どこで開始されるかにはエピジェネティックな因子も大きな影響を及ぼしている。