ANSI.SYS
SYSに限らず、この種の高機能な端末制御機能一般に言えることであるが)便利な反面、悪質なシーケンスを仕込んだ、俗に「ANSI爆弾」と呼ばれる、一種のマルウェアとも言えるテキストファイルに悪用される危険もある機能である。多くのMS-DOS用アンチウイルスソフトウェアは、例えば、ファンクションキーF3がDEL *.*やFORMAT C:に書き換えられたり、(NOを意味する)NキーがYに書き換えられたり、というような危険な改変がされていないことを確認する。
ANSI.SYSはBIOSコールで実装されていたため、動作が非常に遅いこともあった。後継のソフトウェアには、BIOSを回避し、直接ビデオメモリにマッピングしてコンソールの機能を自分自身で提供しているものもあった(「MS-DOS用」だが、いわゆる「MS-DOS汎用」でなく「IBM PC専用」なプログラムがフルスクリーン表示を行った方法と同じである)。概してこれらの後継ソフトウェアはキーの再配置機能を削除し、「ANSI爆弾」による脅威を除去している。