泡瀬干潟
海草・藻類は、合計139種が確認されている。内訳は、海草が13種、緑藻類が52種、褐藻類が32種、黄緑藻類が1種、紅藻類が41種である。このように多くの海草・藻類が生育する理由として、海底環境の構造、底質等の多様さ、静穏でありながら外洋からの海水の供給が行われていることなどが挙げられる。
海草については、沖縄県内に生育する14種のうち、
アマモ科 アマモ属 コアマモ
イトクズモ科 ベニアマモ属 ベニアマモ リュウキュアマモ ウミジグサ属 ウミジグサ マツバウミジグサ シオニラ属 ボウバアマモ(シオニラ)
トチカガミ科 リュウキュウスガモ属 リュウキュウスガモ ウミヒルモ属 ホソウミヒルモ ヒメウミヒルモ ウミヒルモ トゲウミヒルモ オオウミヒルモ
ヒルムシロ科 カワツルモ属 カワツルモ
の計13種が確認されている。特に、ウミヒルモ属については、ホソウミヒルモが泡瀬干潟で発見され新種記載されたり、形態の違うウミヒルモの仲間が発見されたことにより、分類群の見直しが行われた。