GTPアーゼ活性化タンパク質
このときも、無制御に細胞が増殖するがん状態となる。
GAPの機能不全の例は臨床的には至る所で見られる。いくつかのケースではGAPの遺伝子発現の減少が関与している。例えば、近年の甲状腺乳頭がんの例では、がん細胞でRap1GAPの発現が減少しており、qRT-PCR実験によるとmRNAの発現減少が原因のようである。他の例では、いくつかのがんでRasGAPの発現が喪失しており、それは遺伝子のエピジェネティックなサイレンシングによるものであった。これらの細胞では遺伝子近傍でCpGメチル化が起きており、遺伝子の転写がサイレンシングされていた。
他のがんでは、Gタンパク質がGAPへの感受性を喪失していた。これらのGタンパク質には、GTPアーゼ活性を破壊するようなミスセンス変異が生じていた。GAPは変異型Gタンパク質にも結合したが、GAPによるGTPアーゼ活性の促進効果はGタンパク質自体のGTPアーゼ活性が失われているため無意味である。例を挙げると、T24膀胱がん細胞株では、G12Vのミスセンス変異によってRasタンパク質が恒常的に活性化されている。この場合、Gタンパク質の調節因子は存在しているものの、Gタンパク質自体の機能喪失によって調節は失われている。
このようにGAPとGタンパク質との相互作用は、臨床的に極めて重要であり、がん治療の潜在的な標的である。