横浜ダービー
2007年J1第19節(8月11日)の横浜F・マリノス主管(日産スタジアム)の試合前日(8月10日)深夜、同スタジアム南ゲート前で横浜FCサポーターの男性3人に暴行を加え怪我を負わせたとして、2008年1月に港北警察署は横浜F・マリノスのサポーターグループのリーダー、清義明を傷害容疑で逮捕した。
2008年8月、横浜FCのサポーターによる横浜F・マリノスの広告への意図的な破損、投棄行為が行われたため、横浜F・マリノスは神奈川警察署へ届け出た上で横浜FCに抗議を行った。後に横浜FCが事実関係を認定すると共に、破損、投棄行為を行ったサポーターグループが横浜F・マリノスに謝罪した。
2012年10月10日、日産スタジアムで行われた天皇杯3回戦の試合開始前、横浜FCサポーターが侮辱目的と思われる大型の横断幕を掲出した。10月13日、横浜FCは公式サイト上に横浜F・マリノス及び関係者に対する謝罪文を掲載し。10月17日、横浜FCは当該行為首謀者を無期限の入場禁止処分とした。
2018年7月11日、天皇杯3回戦で行われた試合にて、横浜FCサポーターが選手入場後に行われた平成30年7月豪雨による犠牲者への黙祷を無視しそのままチャントを歌い続けた事で世間によるバッシングを受け、後にクラブ側が声明文を発表し、2018年7月15日に行われた横浜FC対アルビレックス新潟の試合前にコールリーダーによる事情説明と謝罪がなされた。