ハナヤスリ亜綱
PPG I (2016)分類体系に基づく。
しかし、葉緑体DNAの構造解析の研究から、マツバラン類はコケ植物やヒカゲノカズラ類とは異なり、シダ類と同様の逆位を共有することが明らかとなった。
対するハナヤスリ類は、エングラーとプラントル (1902)による分類ではシダ類 Filicalesのもとに、薄嚢シダ目 Leptosporangiatae、リュウビンタイ目 Marattialesとともにハナヤスリ目 Ophioglossalesとして置かれた。Christensen (1938)では、リュウビンタイ目とともシダ類 Filicesのうちの真嚢シダ類 Eusporangiataeにハナヤスリ目として置かれた。以降、シダ類の中にコープランド (1947)、田川と岩槻 (1972)のように独立して置かれたり、Ching (1978)のように真嚢シダ類 Eusporangiopsidaの下に置かれたりした。
長谷部ら (1995)のrbcL分子系統解析により、マツバラン類とハナヤスリ類が近縁であり、真嚢シダ類は単系統ではないことが分かった。Wickett ら (2014)、Puttick ら (2018)による分子系統解析に基づく系統樹は以下の通りである。