プロテインG
プロテインG B1ドメインに対する非経験的分子軌道法により、以前から提唱されていた以下のことが実証された。このタンパク質は、小さな調整が加えられた疎水性の中心残基において核生成が起こることにより折りたたみが始まる。折りたたみ過程は以下のように行われる。
βヘアピンが形成され、43番のトリプトファン(W43)、45番のチロシン(Y45)、52番のフェニルアラニン(F52)の各アミノ酸残基によって安定化される。
αヘリックス内にある残基30番のフェニルアラニン(F30)と、βヘアピン内の残基が接触して構造が強化される。
βシートの核形成が5番のロイシン(L5)とF52より始まる。
最後の核形成残基となる3番のチロシン(Y3)がβシート中央部分の形成を助け、球状タンパク質ができあがる。
プロテインG B1ドメイン(別名 GB1)は、NMRなど溶液を使った実験中において、他のドメインを溶液中で維持する目的で融合タンパク質の一部分にしばしば用いられる。これによりこれまで溶かすことができなかったドメインが、GB1と融合させることによって溶けるようになった。 このドメインは56残基のアミノ酸でできている。GB1の分子量は約8kDaだが、SDS-PAGE電気泳動では約13.5kDaを示す位置まで移動する。