ナフダトゥル・ウラマー
発足以来、社会団体として政治から距離を置いていたNUが政治に参与するきっかけとなったのは、1943年、日本軍政下で新たに結成されたマシュミにNUが加入したことであった。マシュミは、保守的なNUと近代派のムハマディヤをはじめとする、既存のイスラーム系諸団体を一元化して、インドネシアのムスリムを動員するために軍政当局が結成した組織だった(ただし、政治的イスラーム団体の参加は見送られた)。これによって、ウラマーなどイスラームの指導者は中央・地方の行政府や各種官製組織のポストを与えられ、公的な発言力を得ることになった(倉沢、1992年、第9章を参照)。
1945年の日本敗戦後、新たに結成されたマシュミ党では、NUとムハマディヤの指導者層は後退し、戦前のイスラーム政治運動の中心部(サレカット・イスラーム党など)がその指導部の実権を握った。
日本軍政期、独立戦争期を通じて、マシュミのNU派からも各政権への入閣を果たしたが、その数はムハマディヤ派からの入閣者数を下回った。このことがNUの積年の不満となり、1952年には、宗教相のポストを失ったことに端を発する組閣人事での対立で、NUはマシュミを脱退した。
1955年、インドネシアで初めて実施された総選挙で、NUは18.4%の得票率(45議席)を確保し、国内4大勢力の一つに数えられた(永井、1986年、202頁)。1958年のスマトラ反乱に関与したマシュミとは一定の距離を置いた(その後、マシュミは、スカルノによって非合法化された)。