高知運転所
31両 (1001, 1002, 1010 - 1028, 1033, 1034, 1036 - 1043) が配置されている(一部の車両は徳島運転所からの転属車)。
土讃線・土佐くろしお鉄道阿佐線(ごめん・なはり線)で運用される。
検車庫
転車台
キハ54形に記された略号(現在は松山運転所に転属)
2100形4両(2103,2118,2121,2123)・2150形3両(2153,2155,2156)の計7両が配置されている。
特急「あしずり」で運用される。