ミルキィホームズ 探偵学院放送室4
なお、類似する名称のラジオ番組として、2011年から響にて放送されている『キルミーベイベー殺し屋ラジオ』が挙げられる。名称が類似しているとともに、同じ響にて同時期に放送されていたことから、両番組とも積極的なコラボレーションを展開した。Project MILKY HOLMESと『キルミーベイベー』の公式サイトが、それぞれお互いのキャラクターに入れ替わるなどの試みが行われた。また『キルミーベイベー殺し屋ラジオ』第4回では当番組のパーソナリティ4人がコメントのみで出演。逆に当番組の第1回に『キルミーベイベー殺し屋ラジオ』のパーソナリティである赤﨑千夏と田村睦心もコメントのみで出演した。
また、2011年まで響にて放送されていた『ミルキィホームズ 探偵学院放送室3』とは、入れ替わりで当番組が放送されることになったものの、番組内容自体には共通点は全くない。同様に、2010年から2011年にかけて大阪放送にて放送されていた『ミルキィホームズ 探偵学院放送室2』も名称が類似しているが、『ミルキィホームズ 探偵学院放送室2』は大阪放送で放送される地上波ラジオであるのに対し、当番組はインターネットラジオという形式を採っている。