札樽線 (ジェイ・アール北海道バス)
琴29:JR琴似駅 - 地下鉄琴似駅前 - 山の手3条8丁目 - 西野3条4丁目 - 宮の沢3条3丁目 - 宮の沢3条5丁目 - 西宮の沢5条1丁目 - 宮の沢駅前 案内上は琴似エリアの路線として案内される。 1999年(平成11年) 2月25日、札幌市営地下鉄東西線の宮の沢駅延伸に伴い、以下の路線を新設。 JRバス:循環51 発寒駅→宮の沢駅前→宮の沢3条3丁目→上手稲神社前→宮の沢駅前→発寒駅および、循環52 宮の沢駅前→宮の沢3条3丁目→上手稲神社前→宮の沢駅前 札幌市営バス:西29 琴似西野線 地下鉄琴似駅前 - 山の手橋 - 上手稲神社前 - 宮の沢駅前および、環10 宮の沢環状線 宮の沢駅前 - 上手稲神社前 - 宮の沢3条3丁目 - 宮の沢駅前 10月1日、JRバスが循環54 発寒駅→宮の沢3条3丁目→上手稲神社前→宮の沢駅前→発寒駅を新設。 2000年(平成12年)4月1日、札幌市営バスの環10がJRバスへ移譲され、循環51・循環52・循環54の系統も環10に一本化。
57・宮57:札幌駅前 - 宮の沢駅前 - 手稲駅南口 - 手稲営業所前 - 手稲鉱山通 - 手稲金山1条1丁目 - 星置の滝 - 手稲鉱山 2015年(平成27年)4月1日、57の一部を宮の沢駅で分割、宮57と61新設。
民営化後も高速バスの増強は続き、1992年10月からは札幌北インターチェンジ経由で「高速つばめ号」を運行開始、同時にこれまでの円山経由便は「うしおライナー」という愛称となった。2001年に高速バスは北海道中央バスと共同運行という形態となり、愛称も「高速おたる号」に揃えられている。一部に利用制限は残るものの、札樽間高速バス共通カードの発行や停留所の統一などにより、北大経由便と円山経由の高速おたる号、高速よいち号、高速しゃこたん号、高速いわない号、高速ニセコ号を合わせた運行回数は120往復(一部時間帯を除き1時間あたり8本)の高頻度輸送となり、利便性は格段に向上した。このときから、「高速おたる号」に運用されるJRバス車両には運行管理のため北海道中央バスの無線が搭載されるようになった。
一方、札幌都市圏輸送についても増強が続けられ、特に手稲駅にはエリア内の多数の路線が集中し、エリアの拠点となっている。1999年2月25日に札幌市営地下鉄東西線が宮の沢駅まで延伸された際には、地下鉄のフィーダー輸送の需要が高まることに対応し、宮の沢駅を新たな拠点に加えて大幅な路線の再編を行う一方で、快速便や区間便の設定を行うことでバスの快適性をアピールする方策を採った。
2004年4月からは北海道内の一般路線では初の試みとして、「55-1」系統(平日朝にJR札幌駅行き2本)において、車両の中に芳香剤と化粧直し用の鏡を数個設置した「女性専用バス」の運行を開始した。
札幌ターミナル・札幌駅前ターミナル - (高速) - キロロリゾート(中央バスと共同運行) 2014 - 2015年シーズンまで運行。2015 - 2016年シーズンより中央バス単独運行となり、2018 - 2019年シーズンをもって廃止。