方形頬骨
方形頬骨は四肢動物を含む肉鰭類に起源を持つ可能性が高い。方形頬骨に似た位置にある小型の骨は板皮類のエンテログナトゥス(英語版)や初期の条鰭類(ミミピスキス(英語版)やケイロレピス)にも見られるものの、 当該の骨が方形頬骨と相同かは明らかでない。方形頬骨はコエラカントゥスやオニコドゥス科には存在しないが、現生のハイギョの遠縁にあたるポロレピス目(英語版)には明確に存在する。多くの古生物学者は方形頬骨が魚類のpreoperculumから派生して形成されたと主張しているが、preoperculumが形成される以前に方形頬骨が存在したと考える研究者もいる。全ての四肢動物型の魚類 (en) は方形頬骨を持ち、子孫である四肢動物に受け継がれている。パンデリクチスやティクタアリクなどのElpistostegalia (en) は初めて方形頬骨と頬骨が接した脊椎動物である。彼ら以前には、頬骨は小型の骨であり、上顎骨と鱗状骨により方形頬骨から隔てられていた。
広義の両生類は、典型的に長方形に類似する長い方形頬骨を持つ。彼らの方形頬骨は上顎骨・頬骨・鱗状骨・方形骨と接する。伝統的に爬形類と考えられていた複数の系統では、頬骨は下側に拡大し、方形頬骨および上顎骨との接触が小さくなる。これは爬虫類にも例が見られており、爬虫類においては完全に接触が失われている。大部分の有尾目は中新世のケロトリトン(英語版)を例外として方形頬骨を持たない。無足目に似た三畳紀のステレオスポンディリ(英語版)に属するキンレステゴフィス(英語版)、古生代の細竜目のグループであるリソロフィス目でも方形頬骨は失われている。