トロイ・エイクマン
2005年9月19日のマンデーナイトフットボール、ワシントン・レッドスキンズ戦のハーフタイムに長年のチームメート、マイケル・アービン、エミット・スミスと共にRing of Honor に推薦された。
2006年8月5日にハリー・カーソン(英語版)、ジョン・マッデン、ウォーレン・ムーン、レジー・ホワイト、レイフィールド・ライト(英語版)と共にプロフットボール殿堂入りを果たした。表彰式で彼はカウボーイズの攻撃システムやアービン、スミスらへの感謝を述べた。
2009年2月7日、UCLAとノートルダム大学とのカレッジバスケットボールのハーフタイムにカレッジフットボール殿堂(英語版)入りを祝う式典が行われた。
2009年3月にサンディエゴ・パドレスのオーナーグループの一員となった。また同年7月2日にはヒューストン・アストロズ戦で始球式を務めた。その際、1984年にニューヨーク・メッツが彼の獲得に関心を持っていたことが明らかにされた。
2010年2月9日、ナショナル・フットボール財団(英語版)の取締役となった。
2022年よりジョー・バックと共にESPNに移籍、マンデーナイトフットボールの解説を務める。
エイクマンはスウィッツァーヘッドコーチがチームに規律をもたらせないからだと批判、このシーズン終了後スウィッツァーは解任された。
その後エイクマンは度重なる負傷に苦しめられた。これは(エイクマン自身を含めて)チームの一部のプレイヤーの年俸が高騰し、サラリーキャップ制度の中でオフェンスライン陣に良い選手を集めることが出来なくなったことがひとつの要因として指摘されている。
1998年、5試合に欠場したものの10勝6敗で地区優勝を果たしホームでアリゾナ・カージナルスを迎え撃ったが7-20で敗れた。
1999年、第1週のワシントン・レッドスキンズ戦では自己ベストの5タッチダウンをあげてオーバータイムの末勝利した。この年8勝8敗でシーズンを終えたがワイルドカードでプレーオフに進出、ミネソタ・バイキングスに10-27で敗れた。これが彼のプレーオフ最後の試合、またエイクマン、スミス、アービンの3人がそろった最後の試合となった。
2000年、この年彼は脳震盪に悩まされランドール・カニンガム(英語版)と併用して起用された。12月10日、ワシントン・レッドスキンズのラインバッカー(LB)ラヴァー・アーリントン(英語版)からヘルメットがへこむほどのハードヒットを受けて自身10度目となる脳震盪を起こし、これがキャリア最後の試合となった。この年チームは5勝11敗でシーズンを終えた。
2001年、エイクマンはチームから7年間7000万ドルの契約延長を提示されていた後、3月7日にウェーバーにかけられ、4月9日、現役引退を発表した。エイクマンはキャリア通算32,942ヤードのチーム新記録を樹立。通算94勝をあげ、その内、90勝を1990年代の10年間にあげてこれはNFL記録となった。