宮畑遺跡
この時期のムラ跡からは、掘立柱建物が円形に配置されている遺構が検出されている。中には直径90センチメートルの掘立柱を立てたと思われる巨大な柱穴跡が長方形に区画された遺構も検出されている。おそらくは祭祀などのムラの行事の際に使用されていたと推定されている。円形に配置された掘立柱建物遺構群の外側には子供の墓と思われる埋甕(土器埋設遺構)を多数検出している。
宮畑遺跡の縄文後期のムラは、前述した中期のムラと連続性はなく、約4,000年前に新たにこの場所に移住してきた人々によって営まれたムラであると考えられる。この時期につくられた宮畑遺跡の建物の中には地表面に石を敷いて床とした「敷石建物」と呼ばれる遺構がいくつかある。敷石建物は関東地方にしばしば見られる建物跡で、また、この時期の遺構から出土した土器群は関東地方の土器群と同じ特徴をもつものが多く、この時期のムラは関東地方の影響を強く受けていたと思われる。このほか、この時期のものとしては竪穴建物や埋甕(土器埋設遺構)が検出されている。
宮畑遺跡の縄文中期のムラ跡からは約40棟の竪穴建物が検出されている。この時期の宮畑遺跡の建物は、屋根に土をのせ、複式炉を備えたものであった。また、建物遺構の半数は焼けた痕跡が見出された。このようなムラの半数の建物が焼かれているという現象は他の縄文中期の遺跡では確認されておらず、宮畑遺跡の謎であるとともに特徴の一つでもある。