DNMT3A
DNMT3Aは次に挙げる因子と相互作用することが示されている。
DNMT1
DNMT3B
HDAC1(英語版)
Myc
PIAS1(英語版)
PIAS2(英語版)
SUV39H1(英語版)
UBE2I(英語版)
ZNF238(英語版)