Wine
WineやアプリケーションのEXEファイルやレジストリなどはホームディレクトリ内の.wineディレクトリ下に保存される。保存先は環境変数WINEPREFIXを設定することで変更できる。かつてWineの設定ファイルとしてconfigというファイルがあったが、2005年に廃止され現在は拡張子がregのファイルに設定が保存されるようになっている。
アプリケーションのデスクトップエントリファイルやアイコンなどはホームディレクトリ下の
.config/menus/applications-merged
.local/share/applications/wine
.local/share/desktop-directories
.local/share/icons
にインストールされる。これらのディレクトリにインストールされるファイルはGNOMEやKDEなどでメニューに使われる。