DNA結合タンパク質
タンパク質とDNAの相互作用は、タンパク質がDNAに結合する際に発生し、多くの場合、 DNAの生物学的機能、通常は遺伝子発現を調節する。転写因子はDNAモチーフおよびヒストンに結合することにより遺伝子発現を活性化または抑制する。また、ウラシルDNAグリコシラーゼなどのDNA修復を担うタンパク質は密接に相互作用する。
一般的に、タンパク質は主溝でDNAに結合するが、例外もある。DNA結合タンパク質は標的部位を認識するために、結合後に急速に再結合して自身の方向を修正する。