メルク・アンド・カンパニー
その際、日本メルク萬有(NMB)は萬有製薬に経営統合するかたちで清算されている。
2003年(平成15年)1月、米国メルクは萬有製薬(万有製薬)を完全子会社化する方針を発表、日本MSDが同月から同年3月上旬にかけてTOBを実施し、上場している萬有製薬の株式の80%以上の買い付けに成功した。翌2004年(平成16年)3月、日本MSDと萬有製薬が合併することで、米国メルク(メルクグループ)の100%出資の日本法人としての新生「万有製薬株式会社」が設立されることとなった。
2008年(平成20年)7月、万有製薬は翌年1月に新社名、「メルク万有株式会社 (Merck-Banyu Co.Ltd)」に変更することを発表した。しかしながら、その後に関連の追加調査が確定するまで変更を延期することが追加され、実際にはシェリング・プラウとの合併を機にMSD株式会社となった為にこの社名は幻となった。
本社・グローバル研究開発本部(東京都千代田区)
大阪オフィス(大阪府大阪市)
妻沼工場(埼玉県熊谷市)
営業支店:東京、大阪など全国15か所
営業所・課:全国158か所
東日本、西日本物流センター
※滋賀工場(滋賀県甲賀市)は2012年10月にキョーリン製薬グループ工場株式会社(キョーリン製薬ホールディングス株式会社の子会社)に譲渡。譲渡後もMSD株式会社が販売する製品の製造(委託製造)が行われている。