マヤノトップガン
秋からは幸英明が騎乗し、セントライト記念と菊花賞に臨むも12着、7着。続く12月の中日新聞杯(GIII)では、古馬相手に3番人気で臨み、後方から追い込んだが、同じ3歳の2番人気マイソールサウンドにクビ差届かず2着だった。
年をまたいで2004年1月、古馬初戦となる日経新春杯(GII)に参戦。四位洋文に乗り替わり、コイントスやファストタテヤマ、エアエミネムに次ぐ4番人気の支持だった。最後方の内側追走から、直線にて馬場の最も内をついて進出。1番人気コイントスが好位追走から抜け出していたが、それを差し切り、半馬身差をつけて優勝した。重賞初優勝、マヤノトップガン産駒初の重賞勝利を成し遂げている。この後は、天皇賞(春)で父仔優勝を目指す予定だったが、右前浅屈腱炎が判明して長期休養。1年半経過した2004年8月に復帰するも、2連敗して競走馬を引退した。通算成績11戦3勝、重賞1勝だった。競走馬引退後は、小倉競馬場で誘導馬を務め、2009年に引退し南九州市森林馬事公苑で乗馬となった。その後2011年6月24日に死亡している。
6歳となったマヤノトップガンは、この年限りでの引退が決定する。最後の春の目標は、天皇賞(春)となり、先立って3月16日、前哨戦の阪神大賞典に参戦した。相手は、サクラローレルやマーベラスサンデーなどはおらず、条件戦から連勝して成り上がってきたメジロランバダやビッグシンボルら新星候補だった。対するマヤノトップガンは、宝塚記念から半年間、勝利から遠ざかっていた。おまけに田原は、3月初旬までに1勝しか挙げられていなかった。マヤノトップガンの場合は、湿った馬場に脚を取られたこと、田原の場合は、風邪に伴う体調不良が長引き、騎乗数を確保できなかったことという明確な理由が存在したが、この二人は、共に一線級からは一枚落ちる立場にまで没落したと考えられた。当日は1番人気だったが、メジロランバダが2倍、ビッグシンボルが4倍まで肉薄してくる、1.9倍に留まっていた。前年は加減して臨み、ナリタブライアンと小差の2着となり、本番で仕上げて敗れるという失敗をしていたが、今回坂口は、掛かることなく、正しく順序を守って調教していた。
スタートから逃げや先行はせず、最後方を追走した。その後も、盛り返さず最後方に留まり、2周目の第3コーナーから、外をまくって進出した。最終コーナーまでに好位に上がり、直線に入ってまもなく先頭を奪取。後は他の抵抗なく独走となった。後方に3馬身半差をつけて決勝線を通過、半年ぶりの勝利を挙げた。
内から外に持ち出しながら、直線に向き、2頭の遥か外、大外から追い上げる形となる。2頭との差は8馬身あったが、田原に促されて末脚を発揮し、差を埋めていた。2頭の競り合いは、内側のサクラローレルが制して抜け出していたが、それを外からマヤノトップガンが、2頭まとめて差し切った。2頭には、抵抗する余力なく、かわしてからは差を広げる一方となる。サクラローレルに1馬身4分の1、マーベラスサンデーに1馬身半以上の差をつけて、決勝線を先頭で通過した。
天皇賞を戴冠する。シンボリルドルフ、ナリタブライアンに次ぎ、オグリキャップやメジロマックイーン、トウカイテイオーに並ぶGI競走4勝目を成し遂げた。また走破タイム3分14秒4は、1993年ライスシャワーの3分17秒1を2.7秒更新して、天皇賞(春)レコード樹立。さらに1993年、東京競馬場のダイヤモンドステークス(GIII)を優勝したマチカネタンホイザの3分16秒8を2.4秒更新し、日本レコードを樹立した。さらに田原は、14回目の騎乗での天皇賞(春)初勝利だった。
これまでのGI3勝は、額面通り受け入れられていなかった。牝馬が1番人気となる菊花賞、有力馬欠場多数の宝塚記念、そして意表を突いて逃げた有馬記念は、相手関係や田原の好判断の賜物だと考えられ、マヤノトップガンの実力を真正面から評価されていなかった。しかし天皇賞(春)での4勝目と、その勝ちっぷりにて実力証明を果たしている。坂口はこのように述べている。