小里氏
その後、逆に御嵩城は囲まれ落城し小栗重則は自害したという。その結果、御嵩城までが武田氏の勢力下に入った。後藤庄助は討死したが、土岐郡の)|高山城には平井光行・頼母親子が入り城主となった。(濃州小里記)
弘治3年(1557年) この頃より神箆城主の延友信光(土岐三兵衛)と不和になる。
永禄8年(1565年)には高野口(神篦城付近)で織田方(森長可)・武田方(秋山虎繁)両軍の軍事衝突が起こった(高野口の戦い)。その際に光忠・光次は信長に従い、秋山虎繁の軍を撃退した。
元亀元年(1570年)には小里光忠は、稲葉山城を攻略した織田信長に通じており、武田信玄は「小里については隣邦からの助勢により、すでに逆心露顕のように見える。やむを得ず、残念に思うが、とりあえす許すというのを承った。その上で時期を待って成敗してほしい」と遠山景任(岩村遠山氏)と遠山直廉(苗木遠山氏)に書状を送っている。
しかし、同年11月、武田信玄の西上作戦が本格化し、11月15日 織田信長が、小里内作宛に書状を送っている 「岩村之城取候由注進公候、然は人数一騎係ニ申付候、猶一左右次第可出馬候、委曲三良五良・河尻可申届候、恐々謹言、十一月十五日 信長(朱印) 小里内作とのへ」(小里家譜)
同年12月27日に、武田重臣の秋山虎繁の軍勢が遠山氏の領地である東美濃を通って、徳川氏の領地三河国へ攻め込もうとして上村合戦が勃発した。小里光忠は、姻戚関係にあった遠山氏と共に戦うことになり遠山景行(明知遠山氏)、遠山友勝(苗木遠山氏)、遠山友忠(飯羽間遠山氏)らと共に合戦に及んだがこれに敗れ、嫡子の小里内記、遠山景行らと共に討死した。。
父親の小里光明はその労いにより、徳川家康から相模国に300石を賜った。
慶長5年(1600年)の関ヶ原の戦いの前哨戦の東濃の戦いで光明と嫡孫の小里光親は、遠山利景とともに家康配下の東軍に参加し、8月下旬に遠山利景と共に明知城を攻めて奪還した。岩村城は田丸主水が、土岐砦は田丸直昌の娘婿の福岡長左衛門と嵐彦兵衛が守っていたが、妻木頼忠が高山口の戦い・妻木城の攻防戦・土岐口畷の戦いにおいて勝利した。
9月2日には、土岐高山城の田丸勢は土岐砦勢と合し、東軍の東濃諸氏と、西軍(田丸勢)との戦となった。(妻木戦記・老人物語)
9月3日には小里光親が西軍から小里城を奪還し入城した。
9月5日に小里光親と妻木家頼は土岐砦を、遠山友政と遠山利景は岩村城と相対し、小里勢は中島(市原)に陣取り、妻木勢は寺河戸村に陣取った。
5~6日にかけて十三河原にて清水・一日市場の戦いが行われ、小里一族の和田太郎左衛門ら多くの者が戦死した。瑞浪市土岐町清水には、その供養塔と伝わる小里勢戦死塚という五輪塔がある。
最後に、小里光親と遠山の両氏は、西軍が籠っていた神篦城と岩村城を攻め田丸主水を降伏させた。
9月10日には徳川家康が尾張清洲城へ到着したので、光親と遠山利景が出掛けて仔細を報告した。(小里家譜)
その功によって小里光親は土岐、恵那郡の旧領を再び与えられ、3,620石の旗本となり小里城近くに小里陣屋を構えた。その後、大坂の陣でも活躍した。
元和7年(1621年)1月8日に光親は死去した。親子3代は小里村の興徳寺に葬られた。
元和9年(1623年)4月29日に、光親の子・小里光重は嗣子がないまま死去したため、小里氏は断絶し知行所は没収されて幕府領となった。