SHIGA CITY FC
また、ホームタウンを「滋賀県全域」に拡大した。
2017年、滋賀県1部を2年ぶりに制覇し、関西府県サッカーリーグ決勝大会に進出、一次リーグを無敗で通過し決勝トーナメントに進出したが、1回戦で阪南パニックスFCに敗れ初の関西サッカーリーグ2部昇格は叶わなかった。
続く2018年も滋賀県1部を制し、2年連続で関西府県サッカーリーグ決勝大会に進出、この年も一次リーグを無敗で通過し決勝トーナメントまで進出、準優勝し入替戦にまで進出したが、ルネス学園甲賀サッカークラブに敗戦、2年連続で関西サッカーリーグ2部昇格はならなかった。この年は、運営法人の株式会社滋賀ユナイテッドが野球部門に重点を移してスタッフも野球関係者が大半を占めるようになり、スポンサー営業に関わっていた福重伯枝は目標の異なるサッカー部門の運営に限界を感じていたといい、入替戦敗戦より遂に解散話が浮上したことからサッカー部門の独立を決意、2019年2月1日を以て、社会人サッカー事業を株式会社滋賀ユナイテッドから独立させた。