水島昇
2001年 - 日本生化学会奨励賞
2005年 - 日本分子生物学会三菱化学奨励賞
2006年 - 文部科学大臣表彰若手科学者賞
2007年 - フェブスレター若手科学者賞
2008年 - 日本学術振興会賞
2008年 - 塚原仲晃記念賞
2009年 - 井上学術賞
2010年 - 日本生化学会柿内三郎記念賞
2011年 - 武田医学賞
2013年 - トムソン・ロイター引用栄誉賞『オートファジーの分子メカニズムおよび生理学的機能の解明』
2015年 - 上原賞
2016年 - 持田記念学術賞
2020年 - 藤原賞
2020年 - 日本医療研究開発大賞 文部科学大臣賞