細菌の翻訳
細菌の翻訳開始では、次に挙げる翻訳システム構成要素が集合して組み立てられる。リボソームの2つのサブユニット(50Sと30Sサブユニット)、翻訳される成熟mRNA、N-ホルミルメチオニン(新生鎖の1番目のアミノ酸)が付加された開始tRNA (fMet-tRNAi)、エネルギー源としてグアノシン三リン酸 (GTP)、そして翻訳開始複合体の形成を助ける3つの翻訳開始因子IF1、IF2、IF3である。その組み立てのメカニズムにはいくつかバリエーションが存在すると予想される。
リボソームはA部位、P部位、E部位の3つの活性部位を持っている。A部位はアミノアシルtRNAの入口である。ただし、1番目のアミノアシルtRNAは例外的にP部位に結合する。P部位はリボソームでペプチジルtRNA(ペプチド鎖が結合したtRNA)が形成される場所である。そしてE部位は、伸長するペプチド鎖にアミノ酸を移し終えたtRNAの出口である。
トランスロケーション (translocation) と呼ばれる伸長の最終ステップでは、P部位のデアシルtRNAとA部位のジペプチジルtRNAが、それぞれに対応するコドンとともにE部位、P部位へ移動し、新しいコドンがA部位へ入ってくる。この過程は翻訳伸長因子EF-Gによって触媒される。再びEF-Tuによって次のアミノアシルtRNAがA部位に入ってくると、E部位のデアシルtRNAはリボソームから出てゆく。この過程を繰り返すことで、ペプチド鎖は成長してゆく。
リボソームは、アミノアシルtRNAがA部位に結合する限り、mRNA上の終止コドン(UAA、UGA、UAG)に到達するまで、残りのコドンを翻訳し続ける。
翻訳装置は、DNA複製の触媒システムと比較してゆっくりとはたらく。細菌のレプリソーム (replisome) が毎秒1000ヌクレオチドのDNAを合成するのに対し、原核生物のタンパク質は毎秒18アミノ酸残基ずつしか合成されない。この速度の差は、部分的には、核酸が4種類のヌクレオチドから合成されるのに対し、タンパク質は20種類のアミノ酸から合成されるという違いを反映している。正しくないアミノアシルtRNAをテストし、はじくという過程で時間がかかり、タンパク質の合成は遅くなる。細菌では、mRNAの5'末端の合成後すぐに翻訳開始が起こっており、翻訳と転写は共役している。真核生物では転写と翻訳は細胞内の異なる区画(核と細胞質)で行われるため、このような共役は不可能である。