京都交通 (舞鶴)
当社の収益の柱となっており、JR西日本の北近畿特急よりも安価で速いことが特徴。近距離ながら3列シート車を投入するなど快適性が高いことも特徴である。
詳細な運行案内および発券業務・共同運行に関する事項は、当該記事および#外部リンクの京都交通サイトを参照のこと。
〜海の京都〜舞鶴赤れんがエクスプレス号(舞鶴 - 京都線)
スーパーエクスプレス(舞鶴 - 大阪梅田線)
舞鶴 - 大阪なんば線
舞鶴 - 神戸三宮線
福知山 - 神戸三宮線
2004年(平成16年):日本交通 (大阪府)の子会社として新京都交通(本店登記は大阪府大阪市淀川区)を設立。
2005年(平成17年) 4月1日:京都交通 (亀岡)から京都府北部の路線(舞鶴支社運行路線で、綾部市内の路線の大部分を除く)を譲り受ける。京都交通に社名変更。東舞鶴営業所は舞鶴営業所に名称変更。 これにより、従来からの「京都交通」と日本交通 (大阪)の子会社の「京都交通」という、資本関係の全く異なる2つの京都交通というバス会社が存在することとなったが、京都交通 (亀岡)が2005年(平成17年)7月1日に路線バス事業を京阪京都交通に譲渡しバス事業から撤退したため、2つの京都交通の状態は3か月で解消された。 7月15日:舞鶴 - 大阪(なんば)間、舞鶴 - 神戸(三宮)間の高速バス2路線を運行開始。
2006年(平成18年) 3月20日:福知山地区の市内北循環線を廃止。 3月21日:市場車庫と市場車庫内にあった舞鶴営業所、京田事務所、愛宕車両整備工場を廃止し、本社機能と舞鶴営業所、車両整備工場、車庫を喜多工業団地内に移転竣工。併せて、路線バスダイヤを西舞鶴駅基点に一新。また、福知山 - 神戸(三宮)間の高速バスを運行開始。 11月26日:ミント神戸のオープンに併せ、高速バス「神戸三宮線」ダイヤを改正。
京都交通の車両には各営業所別に車両無線番号が割り振られている。これは日交グループ近畿地区各社(日本交通 (大阪府)・日交シティバス・京都交通)共通である。
京都交通 800番台 舞鶴営業所 800 - 860番台 福知山営業所 870 - 890番台
転属を行った場合は無線機の番号も変更される。