ヤマトマルチチャーター
旧社名(京都ヤマト運輸)時代の2006年11月21日に元社員数名が同社の京都支店及び、大阪支店にてプロ野球の賭博行為を行った疑いで、逮捕、書類送検された。大阪府警では大阪支店では約3000万円が動いていたことを確認している。一部の収益は暴力団へ渡ったとみている。
ヤマト運輸の幹線集約輸送(運行)の受託。元々は、大和運輸(当時)が全国展開するに至って事業免許を取得するために買収した企業の一つである。1994年(平成6年)までは京都地区及び奈良地区にて宅急便事業と引越事業も展開する地域法人として機能していたが、それぞれ共に当時の親会社であるヤマト運輸に吸収されて以降はヤマト運輸の運行や京都地区でのJITBOXの集配などメインに活動している。他に、ヤマトグループ外の一般貨物などのチャーター輸送などを展開している。
本社は旧社名から指すように、京都府京都市伏見区に構えているが、一時期大阪府寝屋川市に置かれていた時期がある。本社敷地には京都支店及びヤマト運輸の横大路宅急便センター、ヤマトオートワークス京都工場、ボックスチャーター京都支店が入居していたが、平成29年7月より本社建て替えのためそれぞれ移転している。当敷地に以前あった「宅急便」の看板には「京都ヤマト運輸」と書かれていたが、社名変更後は京都の文字を消して「ヤマト運輸」となっていた。旧社名時代は制服もヤマト運輸と同じであったが、現在はまったく違う制服に変更されている。2014年再びヤマト運輸と同じ制服に戻された。長らくHPが開設されていなかったが、2012年(平成24年)6月からHPが開設された。