Jリーグクラブライセンス制度
ACL参加に当たってAFCがクラブライセンス制度を導入した影響は日本以外のAFC加盟の各国に及んでおり、このうち韓国では最上位リーグであるKリーグに所属している尚州尚武フェニックスについて、大韓サッカー協会 (KFA) は同クラブが兵役服務中の選手が在籍する大韓民国国軍体育部隊(尚武)のサッカー部であり、選手はクラブとプロ契約を結ぶことが出来ないことを理由に、2012年の成績に関わらず2013年以降はKリーグチャレンジ(ディビジョン2)への降格となった。
なお、上述の通りJリーグのクラブライセンス制度はAFC主催・主管大会に対する「AFCライセンス」互換ライセンスとして始まっており、J3リーグ向けには別途ローカルライセンス制度が導入されている(後述)が、2022年1月1日から従来のクラブライセンス交付規則をJ1リーグ向けに絞った「J1クラブライセンス交付規則」に改め、J2リーグ向けにはAFCライセンスとの互換性に関する条項を省いた「J2クラブライセンス交付規則」を定めた(内容については従前と大きく変化はない)。この改定は「(J1とJ2で)AFCの要求と差をつけるほうがより実態に合わせた」ためとされており、多くのJ2クラブがJ1ライセンスを取得していることから影響は軽微であると言及されている。
J1ライセンス (45クラブ) - 札幌、仙台、秋田†、山形、鹿島、水戸†、栃木、群馬、浦和、大宮、千葉、柏、FC東京、東京V、町田、川崎F、横浜FM、横浜FC、湘南、甲府、松本、新潟、富山、金沢、清水、磐田、名古屋、岐阜、京都、G大阪、C大阪、神戸、岡山、広島、山口、徳島、愛媛、福岡、北九州、鳥栖、長崎、熊本、大分、鹿児島†、琉球†
J2ライセンス (9クラブ) - 八戸†、岩手†、YS横浜†、相模原†、長野、藤枝†、鳥取、讃岐、今治†(解除条件付きJ2ライセンス)
また併せて、B等級の「トイレ・屋根の敷設率」の未充足にあたるスタジアムについても以下の通り公表された。トイレ数のみが未充足であるクラブはない。
屋根のカバー率のみ不足 - 八戸、岩手、山形、栃木、群馬、大宮、柏、横浜FC、YS横浜、湘南、相模原、甲府、松本、富山、清水、磐田、鳥取、岡山、広島、讃岐、愛媛、今治、鹿児島、琉球
トイレ・屋根のいずれもが不足 - 秋田、金沢
なお、2021年度まで制裁対象の扱いとされていた次のクラブは、制裁が解除されている。
名古屋 - パロマ瑞穂スタジアムの改築工事により2021年度から試合に使用しないため
C大阪 - ヨドコウ桜スタジアムの改築工事完了による
町田 - 町田GIONスタジアムのバックスタンドの増築工事完了による
全体のJ3ライセンス審査結果公表を前に、Jリーグは2019年9月25日に「J3入会を希望するクラブ」を対象としたJ3ライセンス申請の審査結果を公表した。前年申請した奈良と今治に加え、2年前まで申請を行っていた武蔵野と、同年にJリーグ百年構想クラブとなったばかりのラインメール青森FC・テゲバジャーロ宮崎が新たに申請を行った。しかし宮崎は児湯郡新富町に建設中の新本拠地となるスタジアムについて、2020年3月に予定していた完成が大幅に遅れ、2020年の開幕に間に合わないことから今回の申請を取り下げており、最終的には申請を行った4クラブ全てにJ3ライセンス交付判定となった。なお、武蔵野については、2018年改定で新たに加わった「施設基準の例外規定(5年以内のスタジアムの新設)」適用申請を提出しており、この要件に基づくライセンス発給となったが、J3昇格の当時の必要案件の一つだった「JFLにおけるホームゲーム1試合平均2000人以上」をクリアできなかったため(成績案件はJFL4位、かつ百年構想クラブの内輪で2番目だったのでクリアしていたが)、J3昇格を断念している。
2019年10月24日には、J3リーグ参戦中のクラブに対するJ3ライセンス申請の審査結果 が公表され、J2以上のライセンスを取得した8クラブを除く7クラブ全てにJ3ライセンス交付判定が行われた。
J3ライセンス交付(11クラブ) - 青森、八戸、盛岡、福島、武蔵野†、YS横浜、相模原、藤枝、沼津、奈良、今治
全体のJ3ライセンス審査結果公表を前に、Jリーグは2016年9月20日に「J3入会を希望するクラブ」を対象としたJ3ライセンス申請の審査結果を公表した。前年まで不交付となった八戸を含む3クラブがJ3ライセンス交付判定となったが、東京武蔵野シティFCについては、本拠地となる武蔵野陸上競技場が、J3ライセンス基準を満たしていないとして、J3ライセンス不交付とした。
2016年10月12日にはJ3リーグ参戦中のクラブに対するJ3ライセンス申請の審査結果 が公表され、J2以上のライセンスを取得した5クラブを除く8クラブのうち、「経営状況を中心に引き続き事実確認を行っている」として次回(11月)の理事会まで継続審議となった盛岡を除く7クラブ(J2ライセンス不交付の鹿児島を含む)にJ3ライセンス交付判定が行われた。その後11月の理事会で盛岡に対するJ3ライセンス交付が承認された。
J3ライセンス交付(11クラブ) - 八戸、秋田、盛岡、福島、YS横浜、相模原、藤枝、沼津、奈良、鹿児島、琉球
ライセンス不交付(1クラブ) - 武蔵野
なお、ホームスタジアムのトイレの数および屋根のカバー率に関するB等級基準を満たしていないクラブが34クラブあるが、このうち10クラブは「60%ルール」、または「スタジアム新設ルール」の制裁基準 に基づいて制裁対象外、他14クラブは制裁対象(書類提出他)となった。
制裁対象クラブ トイレ数不足 - 岐阜、C大阪 屋根のカバー率不足 - 栃木、群馬、大宮、柏、町田、湘南、甲府、富山、磐田、徳島、愛媛 トイレ数・屋根のカバー率不足 - 山形、横浜FM、横浜FC、松本、金沢、清水、名古屋、鳥取、岡山、広島、讃岐
経営事項については、東京V、鳥取、福岡、長崎の4クラブがクラブ運営上の是正通達を受けた。
また、練習所の確保が2015年6月のライセンス申請時までに確保できない場合、2016年度はJ2ライセンス判定とすると予告されたクラブが9クラブ(栃木、群馬、讃岐、長崎、松本、愛媛、町田、金沢、岐阜)あった。
2023年度のJ2ライセンス審査結果は、2022年10月25日に発表され、9クラブに対してJ2ライセンス発給が承認された。
このうち、新規にJ2ライセンスを取得したのは、スタジアムの施設基準例外規定を準用して申請していた福島、いわき、今治の3チームとなった。なお、2022年度のJ2ライセンス取得クラブのうち、Y.S.C.C.横浜に関しては財務状況をより詳細に確認する必要があると判断、継続審議とされ同年11月22日の理事会で改めて審議を行ない、J2ライセンスが交付された。
J2ライセンス(10クラブ) - 八戸☨、福島☨、いわき☨、YS横浜、相模原☨、長野、藤枝☨、鳥取、讃岐、今治☨