フランシスコ・ロマン・アラルコン
2011年7月11日、出身地のクラブであるマラガCFと5年契約を結んで移籍した。移籍金は600万ユーロ。11月21日のラシン・サンタンデール戦(3-1)で移籍後初得点を挙げ、翌週のビジャレアルCF戦(2-1)でも得点した。2011-12シーズンは32試合に出場して5得点し、4位に入ったマラガはクラブ史上初めてUEFAチャンピオンズリーグ出場権を獲得した。2012年9月18日、FCゼニト・サンクトペテルブルク戦でUEFAチャンピオンズリーグ初出場を果たすと、この試合で2得点を挙げてチームを3-0の勝利に導き、マン・オブ・ザ・マッチに選出された。
マラガの上位進出に貢献したイスコには多くのクラブが獲得に動いた。レアル・マドリードへの移籍が秒読みとなった際、オーナーであるシェイク・アブドゥラ・ビン・ナッサル・アル・タニは、「イスコのために、背番号22は他のどの選手も着けることはできない」と敬意を表した。
コパ・デル・レイ:1回(2013-14)
UEFAチャンピオンズリーグ:5回(2013-14, 2015-16, 2016-17, 2017-18, 2021-22)
UEFAスーパーカップ:3回(2014, 2016, 2017)
FIFAクラブワールドカップ:4回(2014, 2016, 2017 , 2018)
プリメーラ・ディビシオン:3回(2016-17, 2019-20, 2021-22)
スーペルコパ・デ・エスパーニャ:3回(2017, 2019, 2021)
2022年8月7日、セビージャFCにフリーで移籍し、2年契約を結んだ。 12月21日、双方合意の上で契約を解除した。イスコはセビージャで公式戦19試合(リーグ戦12試合、UEFA CL6試合、コパ・デル・レイ1試合)に出場してFCコペンハーゲン戦で1得点を挙げていた。1.FCウニオン・ベルリンへの移籍が決まりかけていたが、直前で破談となり、2022-23シーズンは無所属のまま終えた。
2009年には2009 FIFA U-17ワールドカップに出場し、3得点を挙げてスペインを3位に導いた。2010年にはSBSカップ 国際ユースサッカーに出場した。2011年には、マラガでチームメイトのレシオとともにFIFA U-20ワールドカップに出場した。コロンビアで開催されたこの大会で1得点を挙げたが、スペインは準々決勝で敗退した。2012年2月28日、U-23スペイン代表に招集されてU-23エジプト代表との親善試合に臨んだが、この試合で出場機会はなかった。UEFA U-21欧州選手権2013では、3得点を挙げてブロンズブーツとなると共に、大会優秀選手に選ばれた。
2012年5月15日、セルビア戦と韓国戦に臨むスペインA代表に初選出された。2013年2月6日、カタールのドーハで行われたウルグアイ戦にて代表デビューを飾った。