アリス・マーガトロイド
満月が欠落している。月の力さえも打ち負かされたことで、多くの魔物がこの件に深い不安を抱くようになったのは、誰もが突然変異に対して無関心な態度を示したためである。普段は外出しないアリスは、自分で調査する必要があった。熟慮の末、霧雨魔理沙の元へ行くことを決めたアリスは、報酬として魔導書で変異を解くよう魔理沙に働きかけた。 月の欠片を見つけて幻想郷の満月を取り戻すため、二人は夜を止めて作戦を開始した。二人は途中で失われた竹林の中で永遠亭を見つけ、月の交換の背後にある首謀者である八意永琳と蓬莱山輝夜に会った。月の使者を避けるために、二人は交換を実現するつもりだ。地球と月のコミュニケーションの鍵となる満月を偽月に置き換えることを目的とした秘法"地上の密室"。 結局、呪文は解かれ、かぐやと永琳は罰せられたが、月の使者は来なかった。 彼らの住む場所は、遥か昔に博麗結界で隔てられ「幻想郷」となったのだから、これも当然だ。
幻想郷の異常気象、緋色の雲、大粒の雹、地震の前兆と思い博麗霊夢を探しに行くアリスだったが、博麗神社は既に地震で倒壊していた。 地震を手がかりに調査を行ったアリスは、パチュリーの記憶をもとに異常気象から調査を始めることにした。 真っ赤な雲をたどって、アリスは雲のてっぺんまでたどり着き、舞台裏の首謀者である比那名居天子を見つけた。 幻想郷で能力を使って突然変異を起こした妖怪たちに嫉妬した天子は、アイテム「緋想の剣」を天から奪い、自ら幻想郷に突然変異を起こし、怒りを覚えたアリスは彼女に教訓を与えることにした。 地震を防ぐため、神社に戻ったアリスは、霊夢に神社を壊した囚人が雲の上にいることを思い出させた。