ディメンション・ゼロ
「隊列召喚」や「挟撃」などの盤面を利用した能力が追加された。
セカンドセンチュリー・エキスパンションI〜暴走!機動要塞〜 2006年1月27日発売 発売型式 ブースター 全100種類 新能力「暴走」や合体能力を持つユニット、ユニットとベースを兼業するカード、新たな団結ユニットが登場した。 「ベース」が中心となっているセットで、ベースやそれに関係するカードが増量された。
セカンドセンチュリー エキスパンションII〜神竜の闘気(ドラゴン・バルク)〜 2007年4月28日発売 発売形式 ブースター 全100種類 新システム「闘気」が登場。それを利用するカードが多数盛り込まれている。 種族「ドラゴン」のユニットが、全色に収録されている。
セカンドセンチュリー エキスパンションIII〜新世界の呼声〜 2007年7月28日発売 発売形式 ブースター 全100種類 種族をメインとしたエキスパンション。「仲間たちの絆」とは違い、対抗色同士の種族がメインとされている。
サードセンチュリー・ベーシックパック 2007年10月27日発売 全200種類 新ブロックである「サードセンチュリー」の基本セット。 天野喜孝、安田朗らが新規イラストレーターとして参加。 カード枠変更が行われる。 新能力「連動」・「進撃」・「合成」や多色カード、これまで出たカードの強化版が登場する。