JR三山木駅
1952年(昭和27年)12月1日:日本国有鉄道片町線の祝園駅 - 田辺駅(現在の京田辺駅)間に上田辺駅(かみたなべえき)として新設(隣の下狛駅も同日開業)。1面1線の無人駅。
1987年(昭和62年)4月1日:国鉄分割民営化で、西日本旅客鉄道(JR西日本)の駅となる。
1988年(昭和63年)3月13日:路線愛称の制定により、「学研都市線」の愛称を使用開始。
1997年(平成9年)3月8日:JR三山木駅に改称。
1999年(平成11年)12月:高架化工事に着手。
2002年(平成14年)3月16日:木津方へ200m移転し高架化。同時に、島式1面2線の行き違い可能駅となる。
2003年(平成15年)11月1日:ICカード「ICOCA」の利用が可能となる。
2007年(平成19年)3月20日:駅前広場が一部完成し、暫定的に使用開始。
2008年(平成20年)3月17日:駅前広場が完成。
2010年(平成22年) 3月13日:7両編成での運転を開始。これに伴いホームを7両編成対応に延長。 12月1日:エレベーターの使用を開始。
2018年(平成30年)3月17日:駅ナンバリングが導入され、使用を開始。