東京都交通局日暮里・舎人ライナー
開業してから数か月後の自動放送の改修の際、足立小台のアクセントを「あだちおだい」から「あだちおだい」、舎人のアクセントを「とねり」から「とねり」としている。また、駅到着前に広告放送が導入された。
2008年7月24日の「足立の花火」に併せ、初の貸切列車が運転されたが、臨時列車の増発は行わなかった。2009年7月23日の同催事では臨時列車の増発が行われた。
2009年3月28日には、開業1周年を記念して、日暮里駅から舎人公園駅まで走行し、途中で舎人車両基地を折り返して舎人公園駅まで「1周年記念号」が運転された。
2021年10月7日22時41分ごろ発生した千葉県北西部地震により、舎人公園 - 舎人間を走行中の日暮里駅発見沼代親水公園駅行き2265A列車が、緊急停止した際に先頭から3両が脱輪する事故が起き、さらに脱輪を確認しないまま送電を再開させて火花が散り車内に煙が入り込み、乗客3人が負傷する事態となった。脱輪した車両の搬出作業や、地上設備等の点検と復旧作業が行われ、同年10月11日始発から運転を再開した。復旧までの間は代行バス運行のほか、並行する都営バスの里48系統を大幅に増便するなどの措置がとられた。これについて2023年2月16日、運輸安全委員会が、地盤や橋脚の揺れによって揺れが増幅して脱輪したとする調査報告書をまとめた。
日暮里・舎人ライナーのみの定期券のほか、都電・都バスとの連絡定期券も発売されている。なお、連絡定期券は、都営地下鉄と都電・都バスとの連絡定期券と同様に日暮里・舎人ライナーの乗車キロにより運賃が異なる。また、乗り換え他社線との連絡定期券も発売されている。
路線建設と同時に見沼代親水公園・江北・足立小台の3駅に交通広場が整備され、タクシーと路線バスの乗降場が設置されている。
開業時に足立区西部地区を中心とした大規模な路線バスの再編が行われ、以下の路線が交通広場への乗り入れもしくは駅周辺のバス停経由に経路変更されている。
都営バス
東43系統
王45系統
王46系統 - 2012年4月1日廃止
里48系統
東武バスセントラル
竹03・07系統
北05系統
見21系統
国際興業バス
見01系統 - 2011年3月16日廃止
川14系統
川15系統
赤23系統
はるかぜ(足立区コミュニティバス)
第3弾(国際興業バス西11系統)
第4弾(東武バスセントラル西05・西06系統)
第6弾(新日本観光自動車鹿02系統)
第8弾(同宮03系統)
第11弾(同椿04系統) - 2008年9月27日開業
第10弾(日立自動車交通) - 2009年4月の経路変更により扇大橋駅・高野駅乗り入れ開始
なお、開業後の2008年9月に新設されたはるかぜ第11弾も経路の一部が日暮里・舎人ライナーと同じとなっている。
新造車両増備および一部ロングシート改造工事完了に伴い、平日の見沼代親水公園駅発の列車を6 - 9時台に1時間あたり2 - 3本増発し、最小運転間隔を3分30秒間隔に短縮。日暮里駅発夜間帯(平日18時台以降、休日19時台以降)に増発するとともに、土曜・休日の日暮里駅発21時以降をわかりやすい発車時刻(00・10・20・30・40・50分)とする。
2008年2月14日に東京都交通局の公式サイトで発表された開業時の運行ダイヤは、以下のとおりであった。
平日 早朝:7 - 15分間隔 朝ラッシュ時:5分間隔 日中:7分30秒間隔 夕ラッシュ時:6分間隔 夜間:7 - 20分間隔
土休日 早朝:11 - 15分間隔 朝ラッシュ時:7分30秒間隔 日中・夕ラッシュ時:10分間隔 夜間:11 - 20分間隔
開業日から「都営まるごときっぷ」を大人700円・小児350円で発売している。なお、開業日以前に「都電・都バス・都営地下鉄一日乗車券」として発売された前売り券でも、有効期限内であれば日暮里・舎人ライナーでの利用が可能であった。日暮里・舎人ライナーおよび都営地下鉄各駅券売機や都電車内で購入した当日券はそのまま自動改札機での入出場ができる。なお、自動改札機に対応していない乗車券(スクラッチ式の前売り券)による無人の駅・時間帯での乗り降りは、改札口付近のインターホンを用いて乗降する旨を伝えなければならない(「駅集中管理システム」を参照)。なお、多客期には改札付近にサービススタッフが配置されることがあるが、その場合はスタッフが磁気券(当日券)に交換の上で自動改札を利用することになる。
日暮里・舎人ライナー開業記念の「都営まるごときっぷ」が開業日から各駅ごとに1,000枚限定で発売された。