今宮祭
創祀以来、今宮神社に対する朝廷・民衆・武家からの崇敬は厚く、平安時代から鎌倉時代にはもっぱら官祭として執り行われた。12世紀半ばには政情不安から祭りが衰えていき、やがて開催自体が途切れたが、13世紀半ばには復活し、その後は室町時代を通じておおむね毎年営まれたとされる。『康富記』の応永8年(1401年)5月9日条には、御旅所(おたびしょ)に関する記述が初めて登場し、また祭礼の費用は氏子地域の地口銭から捻出されていたとされる。同応永29年(1422年)5月14日条には、鉾に関する記述が初めて登場する。剣鉾は京都の祭礼に多く見られる、悪霊を鎮める目的がある御霊会でもっとも重要な祭具であり、坂本博司は祭礼に剣鉾が関わる神社として33社を紹介している。南北朝時代から室町時代には都市の民衆が主体となった都市祭礼に変化していき、郊外の本社から町中の御旅所に神輿を迎えると言う形態が成立したとされるが、祇園祭(八坂神社)、稲荷祭(伏見稲荷大社)、松尾祭(松尾大社)、御霊祭(上御霊神社・下御霊神社)に比べるとやや遅い成立といえる。
15世紀-16世紀には、京の町が応仁の乱や戦国の兵乱などに巻き込まれ、神社自体の荒廃もあって今宮社の祭礼が中止されることも多かった。
現在の今宮神社がある土地には、794年(延暦13年)の平安遷都以前から疫神を祀った社があったとされる。平安遷都後にはしばしば疫病や災厄が起こり、神泉苑、上御霊神社、下御霊神社、祇園社(八坂神社)などで疫病を鎮めるための御霊会が営まれた。994年(正暦5年)にも都で大規模な疫病がはびこったため、朝廷は神輿2基を造って船岡山に安置し、音楽奉納などを行った後、疫災を幣帛に依り移らせて難波江に流した。民衆主導で行われたこの「紫野御霊会」が今宮祭の起源とされ、京都の他の都市祭礼と同じく災厄忌避を祈願する御霊会として始まった。
1001年(長保3年)にも疫病が流行したことから、朝廷は疫神を船岡山から移し、疫神を祀った社に神殿・玉垣・神輿を造らせて今宮社と名付けた。大己貴命(おおなむちのみこと)、事代主命(ことしろぬしのみこと)、奇稲田姫命(くしなだひめのみこと)の三柱の神が創祀された。疫病が流行るたびに紫野御霊会が営まれ、やがて今宮社の祭礼として定着して毎年5月に行われることとなった。