ゆうしお型潜水艦
「ゆきしお」が登場。国連Gフォースの潜水艦としてGフォース海軍に参加しており、鹿児島湾を侵攻するゴジラの映像を、司令室に送信する。
「もちしお」が登場。
装備面での最大の特徴が、潜水艦指揮管制装置(SCDS)の導入である。これは、うずしお型最終型で採用された魚雷発射指揮装置のディスプレイ機能を発展させたもので、測的機器や航海計器からのデータを受信して目標の運動解析を行い、戦術情報の提供、攻撃兵器の発射と航法の支援、有線誘導魚雷の管制などの機能を備えている。1〜6番艦で搭載されたZYQ-1はAN/UYK-20電子計算機を用いたデジタル化システムであり、複数目標への対処を実現した。また7〜10番艦ではZYQ-2に更新され、システム化が更に進展したほか、潜水艦用慣性航法装置(SINS)も導入された。
ソナーについては、当初はうずしお型最終型で採用された、艦首装備のZQQ-3統合ソナーとセイル中段前縁装備のSQS-36J探信儀の組み合わせが踏襲されたが、6番艦「はましお」(56SS)以降では、統合ソナーは完全デジタル式のZQQ-4に更新され、またSQS-36Jの装備位置も潜舵の下方に変更されたほか、セイル後部に魚雷警報装置が装備されて、コブ状の突起ができている。
架空の1番艦「せとしお」が登場。防衛庁長官(当時)直轄部隊(実際はDAIS指揮下)として、反乱を起こした架空のはたかぜ型護衛艦「いそかぜ」を追撃する。なお映画版では、おやしお型潜水艦「たかしお」が「せとしお」を演じている。