エンド・オブ・デイズ
教会の外には悪魔教の信者たちが迫っており、会社の車で駆けつけたボビーと共に逃げようとするが、彼はクリスティーンだけを乗せるとドアをロックした。残されたジェリコは信者たちから暴行を受けた後で磔にされ、クリスティーンはサタンに連れ去られてしまう。
12月31日。サタンの手から逃れていたコバック神父に助けられるジェリコだが、意識を取り戻すと時間は午後7時を迎えようとしていた。警備会社に向かったジェリコは満身創痍の体にありったけの武器や装備を纏うと、ボビーが乗ってきた車の位置を探り、地下で行われるサタン復活の儀式に潜入する。儀式を妨害しクリスティーンを奪還した後、逃げ込んだ地下鉄の車両ではサタンとの死闘になるが、なんとか撃退することができた。
年が明けるまで10分を切った頃、街角の教会に逃げ込んだジェリコはクリスティーンに隠れるよう告げると、銃を捨てて神に助力を乞う。そこに株屋の肉体を捨てたサタンが現れ、ジェリコに憑依すると彼の振りをして祭壇にクリスティーンを組み敷いてしまった。しかし、辛うじて自我を取り戻したジェリコは彼女を逃がし、倒れた天使像が持つ剣にその身を投げ出して自ら胸を貫く。
新年を迎えると同時にサタンは地の底へと戻り、ジェリコの目の前には愛する妻子が現れていた。家族と再会し安らかに息を引き取るジェリコを見届けたクリスティーンは、彼の手を取り心から感謝する。街では人々が2000年を迎えたことに沸き立っていた。
1979年のバチカンに「サタンの子を宿す運命を持った女が生まれる」という預言がもたらされる。その頃、ニューヨークでは1人の妊婦が奇妙な痣を持つ娘を出産していた。
20年後の1999年12月29日。ニューヨークの民間警備会社に勤める元刑事のジェリコ・ケインは、株屋と呼ばれる男を護衛するチームの一員になる。株屋は屋上からスナイパーの狙撃を受けるが、直前に気付いたジェリコによって難を逃れることができた。ジェリコがスナイパーの男を地下鉄の線路内に追い詰めると、男は突然「ミレニアムは終わり、サタンが復活する」と叫んで銃を構えたため、ジェリコは足を撃って男を気絶させる。しかし、間もなく駆けつけた女刑事マージによると男には舌がないという。
気になったジェリコは男の住処を突き止め、そこで彼がみずから切り取った舌と、若い女の写真を見つける。さらに、遅れて到着したマージから男がトマス・アキナスという元神父だと聞き出すと、トマスがいたという教会へ向かい情報を得ようとするが、対応したコバック神父は信仰心を捨てているジェリコに取り合わない。
12月30日。ジェリコはトマスから話を聞きだそうとするが、彼は入院先の病院で天井に括りつけられて死んでいた。トマスの体に刻まれた文字列から、写真の女がクリスティーン・ヨークだと突き止めるジェリコだったが、彼女は自宅で謎の男たちに殺されそうになっている。