レイジングストーム
正規軍でありながらテロリストと結託し暴動に参加した反乱部隊。 一般兵 ボディーアーマーとヘルメットを身に着けている。アサルトライフルで攻撃してくるが、一部の兵士は手榴弾を使用する。 ステージ3冒頭の狙撃シーンなど、遠方から攻撃してくる兵士はスナイパーライフルを装備している。 特殊兵 ストーリーモードで新たに登場。レーザー機銃を装備している。一般兵と比較し、軍服の色およびヘルメットの形状が異なり、耐久力が高い。 遠方から攻撃してくる兵士は、スナイパーライフルタイプのレーザー銃を装備するほか、ステージ2の中盤ではグレネードランチャーを使用する者もいる。
ストーリーモード ステージ4のジラソール工場跡地最下層にてパウロ・ゲラが操る兵器。ラプターを巨大化したような兵器で、機関銃とレーザー機銃に大量のミサイルが武装。空を飛ぶこともでき、一気に急降下して踏み潰し攻撃も仕掛けてくる。
今回の敵勢力で、前述の通りテロリストと正規軍の反乱部隊の混合。多くの兵器を使用しSCARに立ち向かう。なお、本作では人間のボスキャラクターは存在せず、ボスはすべて兵器である。敵兵についての公式発表がないため、外見などから判断した名称で紹介。
ストーリーモードのデルタチーム隊員の標準装備。ステージ1~2・4は開始時よりマシンガンとともに装備している。
射程は短いが近距離の敵に広範囲にダメージを与えることが可能。装弾数は16発。
アルマダ刑務所ステージ
南米某国、熱帯雨林の中にあるアルマダ刑務所。そこはパウロ・ゲラが収監されていた。刑務所をパウロ・ゲラを奪還すべく暴徒が急襲する。刑務官たちはパウロ・ゲラの脱獄を阻止すべく必死に撃退を試みる。
市街地ステージ
刑務官を圧倒的な火力と人数を用い全員倒し、刑務所から脱獄したパウロ・ゲラは瞬く間に首都を制圧。
制圧された首都から大統領を保護すべく、デルタチームはジープで現場に向かうも途中、暴徒に破壊されたため直ちに暴徒と応戦する。
途中、ブラボーチーム隊長のハントより、衛星ビーム砲を使用する際に必要なパスファインダーの輸送準備を司令部から命じられたとの連絡が入る。
ファベーラに現れる敵を倒しながら目的地に向かったデルタチームは、大統領が監禁されていると思わしき工事現場にて大統領らしき人物を発見するものの、その途端ラプターが2台現れる。
大統領を保護すべく、ラプターと熾烈な戦闘を繰り広げる。
パスファインダーをなんとか守り切り、アルファチームが衛星ビーム砲を発射。パウロ・ゲラのアジトを破壊するもデルタ・ブラボー両チームは暴徒の総攻撃を受け壊滅状態になりハントを始め数名がジラソール工場跡地へ拉致された。
ザックを始め両チームの拉致されずに生き残ったメンバーも戦闘中に気を失い、いつ止めを刺されてもおかしくない状況であったが、アルファチームがスーパーでの激戦(アーケードモードステージ4)を制し駆け付けたことにより、隊長キングらによって起こされ、九死に一生を得た。
アルファチームとデルタ・ブラボー両チームの生き残りは合流しハントを始め拉致されたメンバーを救助すべくジラソール工場跡へ乗り込む。
拉致された仲間がいると思われるジラソール工場跡の最下層を目指すが、貨物エレベーターで移動中に攻撃を加えられたり止められたりとさまざまな敵の罠を撃破しつつ最下層へ。
ハント以外のメンバーは途中で合流したが、ハントは最下層に設置されたアメリカを爆撃するためのミサイルに縛りつけられていた。
その横にいたのはなんと衛星ビーム砲で死んだはずのパウロ・ゲラ。
アジトのビルと一緒に吹き飛ばされたのは替え玉であった。
アルマドゥーラという名の兵器に乗り込んだ本物のパウロ・ゲラと最後の死闘を繰り広げる。