車軸藻類
緑色植物の中で、ストレプト植物に属する。ストレプト植物の中では、陸上植物、接合藻、コレオケーテ類とともに単系統群を形成しており、この単系統群はフラグモプラスト植物 (隔膜形成体植物、Phragmoplastophyta) とよばれる。
かつては、フラグモプラスト植物の中でも、陸上植物がシャジクモ類の姉妹群であると考えられることが多かった。ストレプト植物の中で、陸上植物とシャジクモ類のみが共有する特徴として、多細胞の生殖器、らせん状にねじれた精子と後方へ伸びる鞭毛、ピレノイドを欠く多数の葉緑体、中心小体の欠如などがある。一部の分子系統学的研究も、この関係を支持している。
しかし2010年代以降の分子系統学的研究からは、シャジクモ類よりもコレオケーテ類および接合藻 (特に後者) が、陸上植物により近縁であることが示されている。もしこの関係が正しいのならば、上に記したシャジクモ類に見られる陸上植物との共通点は、収斂進化によるもの、またはコレオケーテ類や接合藻で二次的に失われた結果であることを意味する。
シャジクモ類は石灰化するものが多く化石記録が比較的豊富であり (特に卵胞子に由来するジャイロゴナイト; 図4a, b)、最古の化石記録はシルル紀後期に遡る。化石種としてはおよそ100属数百種が知られ、ふつう3目12科に分類されている (下表)。中生代以降はシャジクモ目が残り、白亜紀に最も多様性が高かったが、現在ではシャジクモ科のみが生き残っている。シャジクモ目では生卵器の管細胞は左上回りだが、モエレリナ目やシキジウム目では右上回りや直線状である (図4b)。以下に化石種を含むシャジクモ綱の科までの分類体系の一例を示す。