ハルツーム包囲戦
飢えと病、度重なる戦闘によりもはや守備隊に抗戦能力はなく、アンサールは一気に市街になだれ込んだ。ゴードン以下守備隊全員と市民4,000人が殺戮され、最終的にアフマドによって殺戮は中止された。
ゴードンの戦死については明らかではないが大きく分けて二つの説がある。一つは、ゴードンは赤いフェズに儀礼用の軍服を身に着け、リボルバーと軍刀で抵抗し、死闘の末に殺害されたというもので英国の人々から広く支持されている。
もう一つの説がゴードンはオーストラリア領事館へ逃れようとしたところをアンサールに発見され、通りで殺されたというものである。ゴードンについてはアフマドが生け捕りを命じていたが、命令は守られなかった。どちらにせよ、ゴードンの遺体は首を刎ねられてアフマドに届けられ、体は井戸に投げ込まれた。
救援隊がハルツームに到着したのはそのわずか2日後であった。マフディー軍はハルツーム陥落の勢いに乗って救援隊を攻撃したが撃退された。しかし任務の失敗を悟った救援隊はエジプトへ撤収した。
しかし秋が進むにつれて状況は悪化した。消耗品は減り、有能な将校が次々と戦死していった。ゴードンは包囲中、幾度か別動隊を組織してスーダンの町をいくつか奪還することに成功していたがそんな最中の9月4日、敵の町を襲っていた別動隊がマフディーの待ち伏せに遭い、ゴードンの従者を含むおよそ千人弱が戦死した。さらに9月9日(16日とも)、ゴードンの造らせた砲艦の1隻が輸送中にマフディーに拿捕され、乗員全員が殺害された。更に悪いことに、乗組員の中には彼の右腕のスチュアート大佐も含まれていた。数日後、ゴードンはスチュアートの死をマフディーの降伏勧告で初めて知った。アフマドも苦戦を打開するために動き始めた。彼はナイル川沿岸に大量の大砲を並べた。これにより砲艦がナイルを航行することが極めて困難になり、これはゴードンにとっては大きな痛手となった。
1884年末になると食料も底を突き始めた。徐々に餓死者が出始め、馬や猫、ロバなどは既に食い尽くされた。ゴードンは民間人にマフディーに降伏して命を守ることを提案し、人口のおよそ半数がそれを受け入れた。12月にアフマドはゴードンと守備隊の命の保証と名誉ある撤退を条件として街の明け渡しを求めたが彼はこれを丁重に拒絶している。
1882年のウラービーの乱以降、イギリスはエジプトを事実上保護国化していたが、スーダンはこの時エジプトの行政下にあったため、イギリス政府はあくまでスーダンにおける反乱はエジプト国内の問題であると考えていた。よって当初反乱はエジプト政府が対応していたが、それは1883年11月のエル・オベイドの戦い(英語版)におけるエジプト軍の全滅という最悪の結果を招く事態となった。この勝利によりマフディー軍は膨大な量の装備品を鹵獲し、ダルフール、コルドファンを含むスーダンの広域に勢力を広げた。
自らをマフディーと宣言するムハンマド・アフマドは自分がイスラーム国家の救済者であると主張し、エジプト支配からの独立を望むスーダンの多くの人々の支持を得た。
ここにきてようやく事態の深刻さに気づいたイギリス政府は動き出した。時の首相ウィリアム・グラッドストンと陸軍大臣ハーティントン侯爵はエジプトの財政的な理由、また北部のアラブ人反乱への対処などからスーダンの鎮圧はしばらく困難と判断し、エジプト政府に対し全守備隊をスーダンから撤退させることを命じた。そこで撤退を成功させるために任命されたのが1876年から1879年までスーダン総督を務め、現地での人気も高かったチャールズ・ゴードンであった。