ラハンウェイン抵抗軍
2000年、ジブチのアルタにて、ソマリアの有力軍閥代表が会合してソマリア暫定国民政府 (TNG)が成立する。しかし暫定国民政府は求心力が弱く、SNA、ラハンウェイン抵抗軍のいずれも参加しなかった。SNAを率いるフセイン・アイディードは、2001年、暫定国民政府に対抗してソマリア和解再生評議会(英語版) (SRRC) を結成した。
ラハンウェイン氏族は、単純な統一国家を目指すTNGへの参加に消極的だったが、一方でラハンウェイン居住地域を荒らしたフセイン・アイディードのSRRCへの参加もためらわれた。結局、リーダーのシャティガドゥドはSRRCへの参加を表明。2001年5月27日にはTNGの支配地域ワンラウェインを攻撃している。12月にTNGからジブチでの会談を提案されるが、シャティガドゥドは拒否。
シャティガドゥドは2002年2月のインタビューで、RRAの戦力が4,000名であると語っている。また、ソマリアを連邦制とすることを望んでいるとも語った。
9月、シャティガドゥドとマドベは休戦協定を結んだ。2003年10月にはバイドア近郊の戦闘で、数百名が避難している。
2004年にはソマリア暫定連邦政府(TFG)が成立。TFGは地方自治を大きく認める連邦制を標榜しており、南西ソマリアもこれに参加。2005年5月、シャティガドゥドとマドベの連合軍が、ハブサデの支配地域を攻撃。2006年、イスラーム武装勢力イスラム法廷会議が急速に力をつけ、ソマリア南部の多くの地域を支配。RRAの本拠地バイドアのすぐそばまで支配地域を広げるが、エチオピアの参戦によりイスラム法廷会議は衰退。
2008年、別のイスラーム武装勢力アル・シャバブが力を付け、RRAの支配地域を含むソマリア南部を占拠。RRAの本拠地バイドアも、2012年までアル・シャバブの支配下となった。2014年にはシャリフ・ハッサン・シェイハ・アデン(英語版)が南西ソマリアを再結成するが、RRAは関与せず。