プロテオーム解析
プロテオミクスには次のような様々な技術が用いられる。
一次元、または二次元電気泳動は、タンパク質を分子量、また等電点によって分離する。
X線回折、核磁気共鳴分光法ではペプチドやタンパク質の三次元構造を決定するために用いられる。しかし二次構造の決定には円偏光二色性、フーリエ変換赤外分光、X線小角散乱などの方法も用いられる。
タンデム質量分析は、逆相クロマトグラフィーまたは二次元電気泳動と合わせて、データベースを用いたタンパク質の同定のために使われる。
タンデム質量分析の結果を分かりやすく表示するために、Scaffoldというソフトウェアが用いられる。
タグと組み合わせたタンデム質量分析によって、タンパク質の定量が可能となる。
MALDI法による質量分析で、ペプチドマスフィンガープリントによってタンパク質を同定できる。
タグを用いた誘導結合プラズマ質量分析法によって、アトモルレベルの超高感度の定量が可能となる。
アフィニティークロマトグラフィーやTwo-hybrid 法、蛍光共鳴エネルギー移動、表面プラズモン共鳴によって、タンパク質間、またはタンパク質-DNA間相互作用の研究ができる。
X線トモグラフィーは、生細胞中で標識したタンパク質がどこに局在するか調べるのに用いられる。
画像分析によって、ゲル上のスポットの濃度から自動的に定量ができる。