座席指定席
通勤・通学輸送向け車両はすべて自由席かつ運賃のみで利用できるが、リクライニングシート車では全席指定制をとり、運賃以外に名鉄では1乗車360円の特別車料金(ミューチケット)が、南海では500円の座席指定料金が、京阪では区間により400円または500円のプレミアムカー券が必要になる。なお、名鉄ではこの他に全車特別車特急「ミュースカイ」と全車一般車特急も運行されており、ミュースカイでは自由席が、全車一般車特急には指定席が連結されていない。ミュースカイは常滑線に、全車一般車特急は河和線・知多新線系統に多く設定されている。また、従来発売していなかった特急用車両を充当する急行列車においても2021年から特別車の設定を開始した。
また、京浜急行電鉄の一部の快特では、ウィング・シートと称する座席指定制度が導入されている。土休日日中の京急線内で完結する一部の列車のうち2号車だけが座席指定となり、発駅と座席を指定して発売される。特定の駅からのみ発売され、下り三崎口行きでは泉岳寺~上大岡、上り泉岳寺行きでは三崎口~上大岡の間で乗車可能である。降車駅に制限はない。以前は快特停車駅ながら津久井浜、京急長沢、YRP野比、堀ノ内、金沢八景から上り列車のウィング・シートを利用することは不可能だったが、2022年11月のダイヤ改正後はこれらの駅からも利用可能になった。
日本では、高速路線バスの長距離(概ね150km以上)路線においては、多くの路線で座席定員制の自由席あるいは指定席となっている。夜行便は乗客名簿への登録と乗車の照合のため、全事業者の全便が全席指定制であり、乗車券に日時・便名・座席番号が記載されている。
昼行便の空港連絡バスでは、空港発は先着順の座席定員制による自由席、市街地発は予約制の座席定員制あるいは座席指定制としている路線もある(ONライナー号、マロニエ号成田線等)。
座席位置(窓側、通路側など)の希望はできない事業者が多いが、JRバスの高速バスでは直営窓口や高速バスネットで可能な路線もある。