センチモルガン
センチモルガンに対応する塩基対数はゲノムによって大きく異なり(染色体の領域によって乗換え頻度が異なる)、また、乗換えの起こる減数分裂が卵子形成(英語版)(女性配偶子の形成)か精子形成(男性配偶子の形成)のいずれであるかによっても変化する。
1センチモルガンはヒトにおいて平均しておよそ100万塩基対に対応する。1センチモルガンに対応する染色体の物理的距離はゲノム上の位置によって異なり、また女性においては配偶子形成の過程で男性に比べ組換えが顕著に多く起こることから、関係はあくまでおおざっぱなものにすぎない。Kong らは女性のゲノム長が4460 cMである一方、男性ゲノム長は2590 cMにすぎないと計算している。熱帯熱マラリア原虫(英語版)では1センチモルガンあたりおよそ15 kb以下の組換え距離となる。すなわち、15 kbのDNA(15,000ヌクレオチド)で隔たれた遺伝子マーカーどうしは1世代あたりの乗換えが起こる期待値が0.01となるということである。非シンテニー(英語版)遺伝子(異なる染色体上にある遺伝子)は本質的に無関係であるから、cM距離は適用できないことに注意。