襟鞭毛虫
上位分類群は後生動物と同様にオピストコンタで、これは分子系統解析において強力に支持される区分である。このグループ共通の形態形質として、鞭毛を進行方向に対して後方へ向けて遊泳する点が挙げられる。この特徴はオピストコンタという分類群名の由来にもなっている(Opisthokonta; ギリシア語 opistho- '後方' + kontos '鞭毛')。
2015年に、襟鞭毛虫類は動物界と共に 当時は"Apoikozoa" と呼ばれていたコアノゾアの下位クレードに分類されることになった。かつては襟鞭毛虫綱の下に襟鞭毛虫目 Choanoflagellida を設けることもあった。
現在は2目3科に分けられる。それらが含む属は以下のとおり:
Craspedida サルピンゴエカ科(カラエリヒゲムシ科)Salpingoecidae Choanoeca コドノクラディウム Codonocladium コドシガ Codosiga (= Codonosiga) - 細胞は柄を持ち、固着性の群体を形成する。 デスマレラ Desmarella (= Codonodesmus = Kentrosiga) - 一列に繋がった遊泳性の群体を形成する。 モノシガ Monosiga - 単細胞遊泳性。 プロテロスポンギア Proterospongia - 平板状、杯状、球状など様々な形態の群体を形成する。 サルピンゴエカ Salpingoeca - S. amphoroideum カラエリヒゲムシ など。