アルバート・W・ワイリー
ワイリーが移動や逃走の際に頻繁に使用する一人乗りの小型UFO。『2』で登場した上半分が青い饅頭型のタイプがシリーズ中では多く使用されている。
基本的に戦闘に用いることは無いが、『2』では脱出装置としてワイリーマシン2号にドッキングしており、『11』では搭載されたスピードギアによる超加速機能でブロックマン達を捕獲した。
世間を騒がせていたロボットに感染する病原体「ロボットエンザ」のワクチンを開発するが暴走したロボット達に奪われ、これを取り戻すためにライトに共闘を申し込む。だが、今回の事件もワイリーが仕組んだもので、ロボットエンザは彼が造り出したものであり、ロックマンとブルース(フォルテモードでは加えてフォルテ)がワクチン製造装置を取り戻した後に本性を現し、ロールが持っていた試作品以外のワクチンと製造装置を奪い、自分に従うのならばワクチンを提供すると世界中に宣言する。その後自身の基地にてワイリーマシン10号で戦い、マシンが破壊された後もウイルスを宇宙からばら撒いていた軌道エレベーター頂上に撤退しワイリーカプセルで迎え撃つが、10度目の敗北を迎えた上に、高熱を出して倒れてしまう(何かの病気だったようだが、詳細は不明。なお、ロボットエンザはロボットしか感染しないのでワイリー自身は感染を否定している)。ロックマン達に情けをかけられる形で保護され助けられることとなり、後日に病室から脱走して姿を消すが、借りを返すかのように大量のワクチンを置いていった。
『エクゼ』シリーズ自体が他のシリーズと繋がっていないが、これまでのシリーズとは全くの別人としてワイリーが登場する。ネットワーク犯罪を行う悪の組織・WWW(ワールドスリー)の首領であり、デザインなどはこれまでのシリーズを踏襲しているがモノクルを着用しているなどの差異もある。
元々はニホン国の科学省に所属する科学者であり、ロボット工学の権威である天才科学者である。かつてはその才知を社会発展に使うことを何よりも誇りとし、人格的にも優れていた、科学者の鏡ともいえる存在であった。同シリーズの主人公・光熱斗の祖父である科学者・光正博士(劇中ではすでに故人。『エクゼ』シリーズにおけるライト博士で、名前はライト〈Light:英語で「光」〉を日本語にしたもの)とは親友同士であり、彼と共に同作のネットワーク社会の基礎を築き上げた(ロボット工学者ゆえにコンピュータやプログラムなどの電子工学にも非常に長けていた)。
だがしかし、それによってニホンおよび世界はネットワーク開発に力を入れるようになり、ワイリーは研究の場を失ってしまう。自分を追いやったネットワーク社会を恨み、失意の中で新たな活動の場を求めていた中、大国アメロッパ(アメリカに相当する国家)の軍から軍事ロボットの開発を行うことを依頼されて、そこで出会った軍人であるバレルの父と親友になる。
度重なる敗因は、ライトによるロックマンのパワーアップとブルースの妨害にあると考えたワイリーは、変身能力を持つダークマン4号を使ってライトを誘拐し、これをブルースの仕業に仕立て上げロックマンとブルースの仲違いを画策する。しかし、本物のブルースがロックマンと対峙するダークマン4号(偽ブルース)の前に現れた事によって、ライトを誘拐したブルースが偽物だとバレてしまい、その後は自分の城でロックマンを迎え撃つがまたしても敗北。ライトも取り返され、追い詰められたが、城の崩壊によって落ちてきた天井をロックマンが支えている隙に逃亡する。
ローバート工科大学工学部電子工学科に所属する学生だった頃から異彩を放っており、大学の教授達にとって理解し難いワイリーは「異端児」と呼べる存在であった。優等生だったライトとはこの頃からの腐れ縁であり、彼らが目指す「ロボットが真の意味で人間のパートナーとなり共存できる社会」の実現に情熱を注ぎ切磋琢磨し合う同志でもあった。漫画作品『ロックマンギガミックス』では作者オリジナルの大学時代が描写されており、「ロボットに“心”を持たせる」ことを夢見る中で「“力”への安全のため、ロボットに心を持たせる必要性」を大学の教授達に説いたライトに自分も同様の考えを持つことを明かし、共同で「心あるロボット」の人工知能の開発をしたとされている。なお、シリーズ生みの親の一人であり初期設定を担当したA.Kは、この漫画作品を「ライトとワイリーの過去の描写は、自分がイメージしていたものとほぼ同じ」と感心している。
しかし、「ロボットの心」を重視し平和利用を主張するライトとは対照的に、「ロボットが“人間の道具”から完全に脱却するには、“力”が必要」と主張するワイリーの理論は常に独自性が極めて強くなおかつ急進的な物ばかりであり、ワイリーの暴走を危惧したライトによって幾度も研究に容喙されるなど、やがて二人の間に溝が生じ始める事になり、後述の「ダブルギアシステム」の一件で対立が決定的になってしまう。
ゲームにおいて最終ボスまたは終盤のボスとして登場する、ワイリー自身が乗り込み操縦する巨大な戦闘メカ(一部媒体では「ワイリーマシーン」とも表記される)。各作品ごとに「ワイリーマシン○号(○には作品のナンバリング数が入る)」という名称が付けられ、いずれの機体も非常に攻撃力及び防御力が高い。
ワイリーが自身の技術の粋を注ぎ込み製作した決戦兵器であるが、第1作『ロックマン』ではロックマンの存在及び彼が基地に攻め入り自分の元までたどり着くというのは完全な想定外であり、追い詰められ慌てた末に急造した戦闘メカだったとされている(2号以降は対ロックマン戦を見込んだ上で事前に製作しており、外装や脱出装置などもしっかり施されている)。また、前述のように4号以降はドクロを模したデザインになるとともに、機体を破壊されても脱出装置ワイリーカプセルによって戦闘を継続することが可能になった。
ワイリーマシンの多くは飛行メカとなっており、一定の間隔を浮遊移動しながら火器による攻撃を行うというのが主だが、歩行して移動する3号や7号、戦車型の5号、飛行型でも恐竜を模した9号やドクロ繋がりで海賊のような意匠となった10号など様々なバリエーションがあり、『ロックマンワールド』シリーズなど外伝作品ではナンバリング作品とはまた異なったデザイン・性能のワイリーマシンも製作している。詳しくは各作品のページを参照。
自身に万一の事が起こった際に秘密研究所から起動するようになっていた4体のロボットが破壊活動を開始し、この騒動のどさくさに紛れて刑務所から脱獄。その後はロボット博物館に展示されていたガッツマンを盗み、さらに4体のロボットを起動させる一方で、フォルテをライトの研究所に潜入させてロックマンのパワーアップ設計図を奪わせる(フォルテをスーパーフォルテにするのに使用した)。しかしフォルテはロックマンに敗北し、自身もワイリーマシン7号に搭乗して交戦するがまたしても敗北。度重なる悪行に怒り心頭に発したロックマンからチャージ状態のロックバスターの銃口を丸腰状態で向けられる事態にまで陥るも、彼を説得することで未遂に終わり、フォルテとゴスペルによって助け出され逃亡する。