ベルリン中央駅
また1993年のICEのベルリン乗り入れの頃から、旧西ドイツ地域からベルリンに乗り入れる列車が急増するようになると、東西高架線の輸送力が早くも限界に達していた。1998年5月のベルリン市内の電化完成に伴うダイヤ改正では過密ダイヤを原因とする大混乱が発生し、混乱の収拾に数週間要するような事態となった。このため列車を分散させる必要性からも、南北ルートの整備が急がれることとなった。
一方で、首都をボンからベルリンに移すことがドイツ連邦政府によって決定され、ベルリンに新しいターミナル駅(中央駅)を建設することも決定した。建設場所は帝国議会議事堂に近く、移転する政府機関建設に併せて十分な土地が確保できる、旧レールテ駅跡地に決定した。東西高架線のSバーンの駅として「Sバーン・レールテ駅 (Lehrter Stadtbahnhof)」が存在したが、新中央駅の前後の区間は新たに高架線を作り直して駅を設置することになった。また1世紀近い懸案であった南北長距離線も、新中央駅を通る形で地下トンネルで建設されることになった。これに先立ち、初代「中央駅」は1998年に再び「東駅」に戻されている。
南北長距離線は、ベルリンの南方からズュートクロイツ駅(環状線との交差点に設置された駅で、「パーペ通り駅(Bahnhof Papestraße)」を改称)を通り、廃止されたアンハルト駅跡地付近から地下に入り、ポツダム広場の地下(ポツダム広場駅が設置されている)を通って新中央駅の地下に至る。ここから北上し地上に出て、東側方面と西側方面に分岐して、それぞれ環状線に合流する。東側方面にはSバーンのゲズントブルンネン駅に、従来のSバーン駅のほか長距離専用の駅が新設されている。
南北地下ホームに平行して、地下鉄のホーム(2009年8月8日開業)が併設されている。1面2線の地下駅。
ホーム
ICE (トリーア –) シュトゥットガルト – ルール地方 – ハノーファー – ベルリン
ICE (インスブルック –) ミュンヘン – シュトゥットガルト – フランクフルト・アム・マイン – ブラウンシュヴァイク – ベルリン
ICE (インターラーケン –) バーゼル – フランクフルト・アム・マイン – ブラウンシュヴァイク – ベルリン
ICE (キール –) ハンブルク (/ ロストック) – ベルリン – ライプツィヒ – ニュルンベルク – ミュンヘン
ICE コペンハーゲン – ハンブルク – ベルリン
ICE オーフス – ハンブルク – ベルリン
ベルリン-ワルシャワエクスプレス ワルシャワ - ポズナン - ベルリン
なお、この路線はシュレージエン駅、レールテ駅を通るように建設されたが、レールテ駅は高架線に対し直角に位置していたが、に対し、シュレージエン駅は東西高架線が貫通する形に改造されている。一方、南北方向の鉄道は、1910年代にレールテ駅を経由する地下線での構想が立案されていたが、技術的な問題や、第一次世界大戦とその敗戦・経済的混乱により頓挫した。なお第一次世界大戦後の1924年に、全国組織としての「ドイツ国営鉄道 (DRG: Deutsche Reichsbahn-Gesellschaft)」が発足し、ベルリンの鉄道も DRG の経営となった。
1930年代に入り、ヒトラー政権による社会資本の充実策、1936年のベルリンオリンピック開催に向けての都市整備の一環として、南北方向の地下線の建設が再開された。1936年から1939年にかけて、ポツダム駅、アンハルト駅から東西高架線のフリードリヒ通り駅を経由し、シュテティーン駅に至る現在のSバーン南北地下線が開通した。しかし長距離線のトンネルは、ヒトラー時代には大ゲルマニア構想に基づく東西南北の四大ターミナル駅整備計画が立案されたために、全く進展がなかった。
1939年に第二次世界大戦が勃発し、1943年のベルリン大空襲から1945年のドイツ降伏直前のベルリン市街戦にかけて、ベルリンの鉄道網は壊滅的打撃を受けた。ベルリン市街戦で被害が大きかったポツダム駅は、終戦後ターミナル駅としての機能を復活することなく、1945年に廃止された(ただし、Sバーン南北地下線が終戦直前に爆破されて水没したため不通となり、終戦後の一時期、Sバーン駅のみ暫定的に営業していた)。