瀬戸石ダム
2002年、国土交通省の定期検査で、堆砂の進行により「安全性及び機能への影響が認められ、直ちに措置を講じる必要がある」とされるA判定を受けた。熊本県は2014年(平成26年)の水利権更新時にその点に触れ、迅速かつ的確な対応を求めていた。しかし、その後も2017年までのべ8回連続して、定期検査で同じA判定が示された。
電源開発は瀬戸石ダムの堆砂に対し、毎年1回以上起こりうる2,000立方メートル毎秒以上の出水時においてダムの水位を低下させ、土砂を下流へと流す「通砂/排砂運用」や、河川流量が減少する冬に土砂の掘削・搬出(浚渫)を行うといった対策を講じているとしている。搬出した土砂は土木工事に用いられるなどされているが、地元ではダム下流の河床低下に対する懸念から、土砂を河川に還元すべきだとの声が上がっている。