三船殉難事件
上記三船を攻撃した潜水艦について公式には今もって「国籍不明」とされているが、当時南樺太にはソ連軍が侵攻していた上、アメリカ海軍やイギリス海軍の潜水艦は日本政府のポツダム宣言受諾の放送を受けて戦闘行動を停止し、同海域において軍事活動を行っていなかったために、事件直後からソ連の潜水艦であると推測されていた。
戦後、当時のソ連海軍の記録から旧ソ連太平洋艦隊第一潜水艦艦隊所属のL-19とL-12の2隻の潜水艦が留萌沖付近の海上で作戦行動に就いていた事が判明した。
1992年(平成4年)、拓殖大学教授秦郁彦がソ連国防省戦史研究所を訪問、V・ジモーニン所長代理に当時のソ連海軍の動向につき調査を依頼、9月上旬に届いた回答で、ソ連太平洋艦隊の潜水艦による攻撃であったことが確認された。なお、回答には事件前日の21日にも潜水艦SHCH126号が浮上中に小型船を発見して撃沈したとの記述もあった。これに関して、日本政府は「私人が独自に行った調査であり、政府として見解を述べることは差し控えたい」としている。
2018年(平成30年)3月29日の第196回国会において、逢坂誠二衆議院議員の「本事件は、ソ連太平洋艦隊所属の潜水艦による攻撃であるとの理解でよいか。」との質問に対して、当時の内閣総理大臣安倍晋三は「事実関係を直接確認する手段がないことから、お答えすることは困難である。」と答弁している。
北海道留萌市立図書館の所有する、1945年8月19日ソビエト海軍艦隊人民委員部発の「ソ連太平洋艦隊第一潜水艦隊司令官宛命令書」では「艦隊には次の任務が課せられる。