リードジェネレーション (創薬)
ヒット確認に続いて、事前に定義されたテストの特性に従って、いくつかの化合物クラスターが選択される。理想的な化合物クラスターは、以下を有するメンバーを含む。
ターゲットに対する高い親和性(1μM未満)。
他のターゲットに対する選択性(英語版)
細胞アッセイでの有意な有効性固有活性(英語版)
薬らしさ(druglikeness) (通常、中程度の分子量と親油性は ClogP と推定される)。親和性、分子量、親油性は、リガンド効率(英語版)および親油性効率(英語版)のような単一のパラメータでリンクできる。
ヒト血清アルブミンへの低〜中程度の結合性
P450酵素やP糖タンパク質との干渉が少ない
低い細胞毒性
代謝安定性 (metabolic stability)
高い細胞膜透過性 (cell membrane permeability)
高い水溶性 (water solubility) (10 μM以上)
化学的安定性 (chemical stability)
合成作業性 (synthetic tractability)
特許性 (patentability)
プロジェクトチームは通常、さらに精査をするため、3~6種類の化合物シリーズを選択する。次のステップでは、類似化合物を試験して定量的構造活性相関 (QSAR) を決定できる。アナログは、内部ライブラリから迅速に選択するか、または市販のソースから購入できる (「カタログSAR」または「購入SAR」)。創薬化学者はまた、コンビナトリアルケミストリー、ハイスループットケミストリー、またはより古典的な有機化学合成などのさまざまな方法を用いて、関連化合物の合成を開始する。