本門宗
上行寺[小本寺](西山本門寺)※神奈川に移転
妙縁寺(上条大石寺)
常在寺(上条大石寺)
常泉寺[中本寺](上条大石寺) 本種坊(上条大石寺)※本行坊と統合 本行坊(上条大石寺)※本種坊と統合、後に本行寺になる。
妙典寺[小本寺](下条妙蓮寺)※妙行寺と統合。
蓮華寺(北山本門寺)
本住寺(北山本門寺)※蓮華寺と統合
法輪寺(北山本門寺)
信行寺(上条大石寺)
浄圓寺(上条大石寺)
蓮行寺(上条大石寺)
伊豆實成寺[本山]
妙泉寺(伊豆實成寺)
本成寺(伊豆實成寺
上行院(西山本門寺)
光榮寺(西山本門寺)
廣宣寺(西山本門寺)
蓮正寺(北山本門寺)
行蓮寺(伊豆實成寺)
蓮慶寺(伊豆實成寺)
蓮行寺(北山本門寺)※後に伊豆国分寺と改称
上条大石寺[本山] 蓮蔵坊(上条大石寺) 寂日坊(上条大石寺) 理境坊(上条大石寺) 久成坊(上条大石寺) 蓮東坊(上条大石寺) 観行坊(上条大石寺) 了性坊(上条大石寺) 南之坊(上条大石寺) 本住坊(上条大石寺) 百貫坊(上条大石寺) 本境坊(上条大石寺) 浄蓮坊(上条大石寺) 石之坊(上条大石寺) 蓮成坊(上条大石寺)
下条妙蓮寺[本山] 本正坊(下条妙蓮寺)※廃坊 蓮光坊(下条妙蓮寺) 心境坊(下条妙蓮寺) 本妙坊(下条妙蓮寺) 蓮蔵坊(下条妙蓮寺)※廃坊 善應坊(下条妙蓮寺)※廃坊
法善寺(下条妙蓮寺)
妙行寺(下条妙蓮寺)※妙典寺と統合。
下之坊(上条大石寺)
北山本門寺[本山] 行泉坊(北山本門寺) 養運坊(北山本門寺) 西之坊(北山本門寺) 養仙坊(北山本門寺) 東陽坊(北山本門寺) 蓮行坊(北山本門寺)
妙興寺[小本寺](京都要法寺)
菩提寺(京都要法寺)
本妙寺[小本寺](京都要法寺)
通圓寺(京都要法寺)
薬師寺(京都要法寺)※後に古平田寺に寺名変更
東満寺[小本寺](京都要法寺)
為久寺(京都要法寺)
多寶寺(京都要法寺)
中林寺(京都要法寺)
妙蔵寺(京都要法寺)
本壽寺(京都要法寺)
妙福寺(京都要法寺)
延福寺(京都要法寺)
妙傳寺[小本寺](京都要法寺)
浄福寺(京都要法寺)
妙蓮寺(京都要法寺)
本覺寺(京都要法寺)
妙雲寺(京都要法寺)
慈眼寺(京都要法寺)
祐宗寺(京都要法寺)
妙仙寺(京都要法寺)
妙行寺(京都要法寺)
本住寺(京都要法寺)
本要寺(京都要法寺)
松久寺(京都要法寺)※廃寺
光明寺(京都要法寺)
法泉寺(京都要法寺)
妙吉寺(京都要法寺)※廃寺
成蓮寺(京都要法寺)
安養寺[小本寺](京都要法寺)
八槙寺(京都要法寺)
妙綱寺(京都要法寺)
金言寺(京都要法寺)
南枝寺(京都要法寺)
法蔵寺[小本寺](京都要法寺)
妙経寺(京都要法寺)※廃寺
蓮昌寺(京都要法寺)※廃寺
妙船寺(京都要法寺)
本経寺(京都要法寺)※大田市大森より大田市大国に移転
本法寺(京都要法寺)※埼玉に移転、後に北山本門寺末へ
妙蓮寺(京都要法寺)
定善寺(保田妙本寺)※後に上条大石寺末
本建寺(保田妙本寺)※後に上条大石寺末
本善寺(保田妙本寺)※後に上条大石寺末
妙國寺(保田妙本寺)
本東寺[小本寺](保田妙本寺)
法蔵寺(保田妙本寺)※後に上条大石寺末
本照寺(保田妙本寺)※後に上条大石寺末