Γ-セクレターゼ
なお、初期の切断部位では46アミノ酸(ζ切断)や49アミノ酸(ε切断)のペプチドが産生される。
近年の研究では、γ-セクレターゼとγ-セクレターゼ活性化タンパク質との相互作用がAPPからAβへの切断を促進することが示されている。また、CD147が存在しないとγ-セクレターゼの活性が上昇するという研究結果から、CD147が非必須調節因子であることが示唆されている。
γ-セクレターゼによるAPPの切断によって生成されるAβは、線維型の異常なフォールディング(ミスフォールディング)によってアルツハイマー病患者に見られるアミロイド斑の主成分となるため、アルツハイマー病と関連が研究されている。早発型の家族性アルツハイマー病の発症は、APP自体の変異だけでなく、γ-セクレターゼを構成するプレセニリンの異常が因子となることが指摘されている。プレセニリン遺伝子の変異はアルツハイマー病の主要な危険因子であることが示されている。
このほか、γ-セクレターゼは、Notch、ErbB4(英語版)、E-カドヘリン(英語版)、N-カドヘリン、エフリンB2(英語版)、CD44など、他のI型膜タンパク質のプロセシングにも重要な役割を果たしていると考えられる。
また、ミトコンドリアではアポトーシスを促進する役割を果たしている可能性がある。