頂妙寺
日蓮宗は1941年(昭和16年)に本末を解体したため、現在では、旧本山、旧末寺と呼びならわしている。
慈光山善性院(京都市左京区大菊町)塔頭
慈雲山善立院(京都市左京区大菊町)塔頭
霊鷲山真浄院(京都市左京区大菊町)塔頭
妙相山本立院(京都市左京区大菊町)塔頭
法光山大乗院(京都市左京区大菊町)塔頭
松林山妙雲院(京都市左京区大菊町)塔頭
聞法山法輪院(京都市左京区大菊町)塔頭
法性山真如院(京都市左京区大菊町)塔頭
一樹山宗柏寺(新宿区榎町)
佛坐山玉淵寺(京都市上京区姥ケ北町)
放光山瑞芳寺(京都市北区鷹峰南鷹峰町)
実相山妙行寺(京都府船井郡京丹波町井尻コハケ谷)
妙法山蓮城寺(東大阪市若江南町)
法性山常徳寺(奈良市北向町) 常徳寺末:長久山妙福寺(宇陀市大宇陀区平尾) 常徳寺末:寂而山常照寺(奈良県高市郡高取町大字清水谷)
妙光山法蓮寺(神戸市兵庫区神明町)
日出山本妙寺(丹波市春日町東中)
一龍山妙長寺(福山市駅家町万能倉)
橋照山慈運院(倉吉市関金町安歩)
彼岸山積善寺(松山市鹿峰)
天高山妙國寺(高知市塩屋崎町) 妙國寺末:若一山本正寺(南国市田村甲) 妙國寺末:天高山細勝寺(南国市田村乙) 妙國寺末:天王山蔵福寺(南国市田村乙) 妙國寺末:宮地山中道寺(室戸市浮津)
金銀山大願寺(香南市香我美町徳王子)
荘厳山妙正寺(久留米市寺町) 妙正寺末:霊亀山寂光寺(北九州市戸畑区沢見) 妙正寺末:長久山常清寺(大川市大字酒見中原)
大雲山妙善寺(久留米市寺町)
金納山瑞泉院(柳川市大字金納)
長寿山福王寺(筑後市溝口)
本宮山常妙寺(大分市大字葛木)
竹林山法音寺(臼杵市二王座)
円明山妙光寺(大分県速見郡日出町)