高砂丸
収容患者を近在の小島に避難させ、陸上部隊の応援を得た懸命の排水作業の結果沈没は免れ、4月25日に機械室の排水が終わったのに続き、4月30日に全ての排水作業が終了して応急修理に取り掛かった。5月21日には全ての応急修理が完了し、患者および南洋庁関連の引揚者を乗せて5月26日にパラオを出港。6月3日に呉に帰投し、三菱重工業神戸造船所に回航されて本格的な修理が行われた。修理は9月16日までに終わり、9月16日に呉を出港してマニラに向かう。しかし、マニラ入港直前の9月21日午後にアメリカ第38任務部隊機の機銃掃射を受け、窓ガラスが破損するなどの被害を受けた。
また同じ9月21日の午前中には、海中からはアメリカ潜水艦「ハッド」が「高砂丸」を目撃しており、太平洋艦隊司令長官チェスター・ニミッツ大将の長男でハッド艦長のチェスター・W・ニミッツ・ジュニア少佐は、目撃した「高砂丸」のことを「美しい病院船」と戦時日誌に記した。ハッドは同日夜に測量艦「勝力」を撃沈しているが、「勝力」は「ハッド」に撃沈される前に「高砂丸」と同様に機銃掃射を受けて負傷者を出し、そのうち重傷者2名を行き逢った「高砂丸」に移送している。9月24日には北緯12度11分 東経119度48分 / 北緯12.183度 東経119.800度 / 12.183; 119.800の地点で未知の暗礁に触れて右舷側の推進軸と船底を破損した。10月7日に呉に帰投の後、再び三菱重工業神戸造船所で修理が行われた。この頃、「高砂丸」の船底に300トン容量の重油タンクが設置される工事が行われようとしていたが、「良識派の意見」が通って工事直前に中止になった。