のと鉄道七尾線
土日祝日は、全席要予約の座席指定制で、スイーツ、寿司御膳、地酒を提供する「飲食付きプラン」(旧「ゆったりコース」)が設定されている。飲食付きプランの内容と料金は列車によって異なり、乗車区間の運賃と乗車整理券に加えて料理の料金が必要である。2020年3月までの「ゆったりコース」は、飲食付きは運賃と料理の料金、飲食なしは運賃と指定席料金(大人1530円、子供1020円、2019年10月1日現在)が必要であった。2020年3月14日のダイヤ改正後は飲食なしで利用する場合、前述の「乗車プラン」として運賃と乗車整理券で利用できる。各駅に停車する列車もあるが、飲食付きプランは七尾駅- 穴水駅間または和倉温泉駅 - 穴水駅間を利用する場合に限られ、途中駅では乗降できない。
能登中島駅では午後の上りを除き10分前後一時停車し、駅構内に保存されているオユ10形郵便車を見学できるほか、能登中島駅 - 穴水駅間の七尾湾沿いの3か所で停車・徐行する。このため普通列車よりも全線の所要時間は長くなる。
運行開始当初ゆったりコースが下り3本・上り2本、カジュアルコースが3往復設定されていたが、2016年3月26日のダイヤ改正でダイヤが共通化され両コースとも下り3本・上り2本となっている。
普通列車は全列車各駅停車で、2022年3月改正時点ではすべて七尾駅 - 穴水駅間の運行となっている。おおむね1時間に1本程度の運行で、NT200単行(1両編成)が基本であるが、朝夕には2両編成も運転されている。以前は朝夕に3両編成や4両編成の運転もあった。「のと里山里海号」の運転日には、同列車の専用車両を併結したり、運休したりする普通列車がある。
2021年8月25日現在、穴水駅の始発は6時台、七尾駅の最終は22時である。七尾駅 - 和倉温泉駅間にはJRの普通列車は運行されず、同区間の普通列車はすべてのと鉄道が運行する。
穴水駅:のと鉄道能登線 - 2005年4月1日廃止
当路線は、地元の悲願であった1991年の七尾線津幡駅 - 和倉温泉駅間の電化に際して、西日本旅客鉄道(JR西日本)がその見返りとして石川県に和倉温泉以北の路線を引き受けることを要求したために、能登線の運営を行っていたのと鉄道がその営業を引き継いだものである。転換にあたり、この路線が転換時に交付金等の支援が受けられる特定地方交通線ではなかったため、JR西日本から路線を買い上げるよりも借用が妥当と判断された。そのため線路等の施設はJR西日本がそのまま所有し、七尾駅 - 和倉温泉駅間 (5.1km) はJR西日本との共用区間となっている。
当初は七尾駅 - 輪島駅間が移管されたが、2001年に乗客減少の著しい穴水駅 - 輪島駅間が廃止された。さらに2005年には能登線が廃止されたことにより、当路線はのと鉄道唯一の営業路線となった。なお、当路線の穴水以南は能登線と一体的に運行されていたにもかかわらず存続となったが、これは七尾線の輸送密度が能登線を上回っていたことのほかに、全線を廃止にした場合における職員の雇用先の確保が難しいこと・北陸新幹線の開業による並行在来線の第三セクター転換(後のIRいしかわ鉄道)に備えて県関連組織に鉄道運営のノウハウを確保することなどもその理由として挙げられている。
石川県の旅客鉄道で唯一の非電化路線である。