山城屋事件
この辞表を受け取った巡幸中の明治天皇は、供奉していた西郷隆盛・西郷従道に帰京を命じた。
隆盛は薩摩系軍人と山縣の調停を行い、山縣が近衛都督を、従道が副都督を辞任し、隆盛が陸軍元帥兼近衛都督に就任することで妥協した。
山縣は山城屋の帰国を要請し、至急の返済を求めたが、もはや返済は不可能であった。
11月29日、山城屋は陸軍省の応接室で割腹自殺を遂げた。その際、関係書類も焼き払われたため、事件の真相は解明されることがなかった。
山縣が明治6年3月付で鮫島駐仏公使に書いた書簡には、「(和助は)帰国後商法種々手違之故をもって旧臘(昨年の和暦12月)自刃におよび相果て、自首致候手代とも即今裁判所にて取糺中にこれあり」とあるように、山城屋の死後も司法省によって事件が追及されていた。
この事件と同時に陸軍省内で徴兵令導入への反発もあり、省内の混乱はなおも続いた。1872年(明治6年)4月10日、山縣は辞表を提出し、4月18日に陸軍大輔のみの辞職が認められた。
しかし、政府上層部は山縣の排斥を望んでおらず、太政大臣三条実美は山縣の腹心であった鳥尾小弥太らまで辞表を提出することがないよう、井上馨に調整を頼んでいる。また、西郷隆盛、大隈重信、井上馨が調停に動き、4月29日付で山縣は陸軍省御用掛として陸軍卿代理となり、事実上復帰を遂げた。さらに、6月8日には西郷の推薦で陸軍卿に任じられている。
他に処分を受けた者は陸軍大丞・会計監督長船越衛、陸軍中佐湯浅則和(建築家片山東熊の兄)がおり、湯浅は裁判で武官免職・位記剥奪の処分を受けて辞職している。