インスレーター (遺伝学)
インスレーターには2つの主要な機能が存在する。
エンハンサー遮断活性(enhancer blocker) - 離れた位置にあるエンハンサーが遺伝子に隣接するプロモーターに作用するのを防ぐ。
バリア活性(barrier insulator)- 隣接するヘテロクロマチン領域の拡大によるユークロマチンのサイレンシングを防ぐ。
エンハンサー遮断活性は染色体間でも起こる相互作用であるとされているが、バリア活性は同一染色体内に限られる。染色体上で隣接する2つの遺伝子が非常に異なる転写パターンを持つ場合、一方の遺伝子の誘導や抑制機構が隣接遺伝子に影響することを防ぐためにインスレーターが必要となる。インスレーターはトポロジカルドメイン(TAD)の境界に密集していることも発見されており、発現調節の基本的な構造単位である"chromosome neighborhoods"へとゲノムを区画化する役割を持っている可能性がある。
CTCFを調節する機構の1つは、DNA配列のメチル化である。CTCFタンパク質は非メチル化部位に選択的に結合することが知られているため、CpGアイランドのメチル化によってエピジェネティックな調節が行われていると考えられる。その一例はIgf2-H19インプリンティング遺伝子座でみられ、父親由来のインプリンティング制御領域(imprinting control region、ICR)はメチル化されることでCTCFの結合が防がれる。2つ目の調節機構は、CTCFインスレーターが完全に機能するために必要なタンパク質を調節するものである。こうした調節の標的となるタンパク質には、コヒーシン、RNAポリメラーゼ、CP190などが含まれるが、これらに限定されるものではない。