越中島支線
1929年(昭和4年)に小名木川の水運との物流連絡のため、亀戸駅から小名木川駅まで開業し、その後越中島駅(現越中島貨物駅)まで延伸された。また、1989年(平成元年)までは東京都港湾局所有の専用線により豊洲や晴海までつながっていた。この専用線は鉄道による貨物需要が低下したため廃線になった。1972年(昭和47年)まで沿線(江東区南砂)に汽車製造東京製作所が存在し、製造された車両は専用線を経由して小名木川駅より各社へ向けて輸送されていた。
小名木川駅は2000年(平成12年)に廃止され、跡地は再開発によりマンションとショッピングモール「アリオ北砂」となった。また、これに先立つ1997年(平成9年)には越中島貨物駅発着の定期貨物列車も廃止されており、現在の貨物線の使用目的は非常に限定されている(後述)。
全線単線。用地はほとんどの区間で複線分確保されているが、一部は駐車場や「南砂線路公園」として転用されている。
葛西橋通りおよび永代通りとは踏切による平面交差(しかもすぐそばに明治通りとの交差点も存在する)のため、交通障害の要因になっている。
全駅東京都に所在。(貨)は貨物専用駅