天領
西蝦夷地(北見国) 会津藩警固地 - 網走場所(網走郡) 秋田藩警固地(宗谷陣屋) - 宗谷場所サンナイ(宗谷岬周辺の柵内、宗谷郡の一部)
西蝦夷地(石狩国) 石狩役所(庄内藩警固) - 厚田場所(厚田郡)、石狩十三場所(石狩郡、札幌郡、夕張郡、樺戸郡、空知郡、雨竜郡、上川郡)
和人地(後志国) 石狩役所(庄内藩警固) - 小樽内場所(小樽郡)、高島場所(高島郡)、忍路場所(忍路郡)、余市場所(余市郡)、古平場所(古平郡)、美国場所(美国郡)、積丹場所(積丹郡) 庄内藩警固地 - 古宇場所(古宇郡)、岩内場所(岩内郡)、磯谷場所(磯谷郡)、歌棄場所(歌棄郡) 津軽藩警固地 - 瀬田内場所(瀬棚郡)、太櫓場所(太櫓郡)、奥尻場所(奥尻郡)、久遠場所など(久遠郡)
和人地(渡島国) 津軽藩警固地 - 西在(爾志郡のうち乙部村以北) 松前藩警固地(戸切地陣屋) - 東在(上磯郡、亀田郡のうち亀田半島以西) 南部藩警固地(砂原陣屋) - 東在(亀田郡東部、茅部郡(旧箱館六ヶ場所))
徳川の関東入国直後には、直轄領は関東総奉行や代官頭によって支配されていたが、慶長年間に関東総奉行や代官頭が消滅後は、その配下の代官・手代衆が昇格して天領支配を担当するようになった。天領の管轄は当初江戸(関東)と京都・大坂(上方)に二分されていたが、寛永19年(1642年)に勘定頭が設置されると、司法・行政区域が統一され、地方の支配組織は老中→勘定奉行→郡代・代官への系統へと整備されるようになった。また江戸時代の当初から遠隔地の都市・港・鉱山には遠国奉行が置かれていたが、これらも老中支配下に統合された。
これとは別に大名に支配を委ねた大名預地があった。豊臣政権の太閤蔵入地が形を変えたもので、徳川綱吉による幕府支配機構の整備と強化のもと、貞享4年(1687年)に廃止されたが、元禄4年(1691年)には復活した。さらに正徳2年(1712年)には財政立て直しのために再び新井白石により大名預地は廃止されて代官の直支配となったが、年貢収納率の低下を招いたため、享保7年(1722年)に再び徳川吉宗により大名預地は復活した。
天領は当初関東と上方の二分に分けられていたが、享保2年(1717年)以降、関東・海道・北国・東国・畿内・中国・西国の七筋に区分されるようになった。
18世紀以降の天領の石高における内訳の変遷は以下の通りである。
武蔵国 松村忠四郎 - 豊島郡52村、荏原郡72村、足立郡7村、多摩郡83村、久良岐郡11村、橘樹郡78村、都筑郡38村、埼玉郡14村、比企郡14村、高麗郡55村、入間郡67村、大里郡4村、新座郡19村、幡羅郡3村 佐々井半十郎 - 豊島郡14村、足立郡114村、葛飾郡202村、埼玉郡38村 大竹左馬太郎 - 豊島郡17村、足立郡176村、葛飾郡6村、埼玉郡90村 大河内金兵衛 - 足立郡1村 福田所左衛門 - 足立郡2村、埼玉郡1村、大里郡2村 小笠原甫三郎 - 葛飾郡70村、埼玉郡11村 韮山代官所(江川太郎左衛門) - 多摩郡159村、久良岐郡5村、比企郡4村、入間郡3村、榛沢郡1村、横見郡1村 古賀一平 - 橘樹郡2村、都筑郡1村 荒井清兵衛 - 埼玉郡1村 平岡忠次郎 - 埼玉郡1村 木村飛騨守 - 埼玉郡21村、比企郡15村、男衾郡25村、入間郡5村、榛沢郡23村、児玉郡5村、秩父郡23村、那珂郡2村、横見郡12村、大里郡2村、賀美郡8村、幡羅郡9村 大岡忠四郎 - 榛沢郡1村 中山誠一郎 - 榛沢郡1村 伊奈半左衛門 - 榛沢郡1村、児玉郡2村 川田玄蕃 - 児玉郡1村 大音竜太郎 - 賀美郡1村 神奈川奉行 - 久良岐郡1村 神奈川奉行預所 - 久良岐郡11村、橘樹郡13村
相模国 韮山代官所(江川太郎左衛門) - 三浦郡65村、鎌倉郡43村、高座郡37村、大住郡3村、愛甲郡3村、津久井郡15村 松村忠四郎 - 鎌倉郡4村 浦賀奉行預所 - 三浦郡10村、鎌倉郡1村