メタモナス
ヒストモナス Histomonas など。 クリスタモナス綱 Cristamonadea = クリスタモナス目 Cristamonadida トリコニンファ綱 Trichonymphea = トリコニンファ目 Trichonymphida。ケカムリ Trichonympha など。 Spirotrichonymphea = スピロトリコニンファ目 Spirotrichonymphida
プレアクソスティラ Preaxostyla オキシモナス類 Oxymonadida トリマスティクス Trimastix - トリマスティクス目 Trimastigida を置くことも。
このうち (フォルニカータ + パラバサリア) はどうやら単系統であるらしい(2つあわせた系統をトリコゾア Trichozoa ともいう)。この2つとプレアクソスチラとの関係についてはまだ強い証拠がないが、生態が似ており、大規模な系統解析では弱いながらも支持されている。そこでメタモナス類が単系統でその祖先でミトコンドリアの退化が起きたという魅力的な仮説が考えられている。しかしここにはまだ議論の余地がある。
メタモナス類の特徴として、典型的なミトコンドリアを欠いていることが挙げられる。このことから、ミトコンドリアを獲得する前に分岐した最も原始的な真核生物だと考えられ、このようなミトコンドリアを欠く生物を集めたアーケゾア界の一員とされたこともある。しかし21世紀に入ってからは、メタモナス類を含め全てのアーケゾア生物が、一旦獲得したミトコンドリアを二次的に失ったものだと考えられている。実際にメタモナス類の細胞には、ミトコンドリアが変化したと考えられるヒドロゲノソームや、痕跡と考えられるマイトソームが見付かることが多い。
もう一点の特徴は、例外もあるが細胞核と2対4個の基底小体 (basal body) が組になって核鞭毛系(カリオマスティゴント、karyomastigont)を構成する点である。基底小体からはそれぞれ鞭毛が出ており、そのうち1本が後曳鞭毛 (recurrent flagellum) となっている。したがって多くの生物では鞭毛の本数が4の倍数になっている。