Fate/Grand Orderのメインストーリー
2017年2月24日配信。魔術王の計画が潰えた後に現れた最初の特異点。主人公は再び現れた異変の種を摘むべく、陸の孤島となった1999年の新宿へと単身送り込まれる。主人公は迷宮と化した新宿駅にて、アーチャーのサーヴァントである初老の男性(以下・新宿のアーチャー)と出会う。
主人公は新宿のアーチャーや、道中であったセイバー・オルタ、ジャンヌ・オルタとともに、様々なサーヴァントが支配する新宿を探索する。
新宿のアーチャーの真名はジェームズ・モリアーティであり、主人公への復讐心から幻霊と英霊の融合技術を確立した魔神柱の一体・バアルに協力していた。
その他登場サーヴァント:燕青、ヘシアン・ロボ、ファントム・オブ・ジ・オペラ
2017年10月14日配信。主人公は過去にも陥ったことのある現象で、睡眠中に意識を失ってしまう。目覚めたのは中世の日本のようなところで、史実とは微妙な違いを見せる関東の下総国だった。そこは血染めの月の下で悪しき宿業をもつように改造された“英霊剣豪”たちが、妖魔を率いて殺戮を繰り広げている。主人公はかつて夢の中で遭遇したことのある“宮本武蔵“を名乗る剣士の若い女性、カルデアからの単独のレイシフトに辛くも成功した“風魔小太郎“とともに英霊剣豪たちを倒していく。主人公一行は、道中で出会った幼い孤児の姉弟おぬいと田助から、彼らの保護者である刀匠の疑似サーヴァント“千子村正”を紹介される。村正は、姉弟を助けたお礼として、「岩だろうが金剛だろうがたやすく斬っちまう妖刀紛いの失敗作」とする「明神切村正」を武蔵に託す。激戦の末、主人公たちは、打倒徳川を掲げ英霊剣豪たちを率いていた天草四郎を撃破する。
ペペロンチーノはわざとベリルから致命傷を受け、自分の浴びていた大量のモースの呪いを転移させる。そのうえ、ペペロンチーノが呪詛返しを加えていたこともあり、モースに耐性があるはずのウッドワスの霊基も無意味なものとなった。ベリルはその場から退散し、主人公たちもペペロンチーノに促される形で崩れる建物から脱出する。ダ・ヴィンチらと合流した3人はオックスフォードへ行ってパーシヴァルと会い、オックスフォードの無血開城が実現したことを知る。そして、この流れでオックスフォードの鐘が鳴らされる。
だが、パーシヴァルら主力が不在のロンディニウムで内乱が起き、ガレスは奮戦するも力尽き、ロンディニウム内の非戦闘員は皆殺しにされる。また、グロスターに引き渡された牙の氏族の捕虜たちも、ムリアンが私怨から皆殺しにしてしまう。
オックスフォードから戻った一行は、ロンディニウムにある最後の鐘を鳴らした後、キャメロットへ向かう。一行が市街地に到着したところ、モルガンの攻撃でオベロンが倒される。一行はモルガンを撃破するも、このモルガンは数ある分身のひとつに過ぎず、本体はキャメロットの玉座にいた。多くの妖精たちが玉座に詰めかける中、ボロボロになったウッドワスが現れる。彼はモルガンとのやり取りから彼女が嘘をついたと判断し、襲い掛かる。だが、モルガンは返り討ちにした後、彼をいつくしむ。モルガンの愛が本当だと知った彼は、モースになるものの何もせずそのまま息絶える。その直後、妖精たちはオーロラに扇動されて、モルガンを惨殺する。また、霊基の複写魔術と失意の庭の副作用によってひどく衰弱していたバーヴァン・シーはケルヌンノスが封じられた大穴へ放り投げられ、後にケルヌンノスが活性化するきっかけとなる。