総合研究大学院大学
先端学術院 先端学術専攻 人類文化研究 - 大阪府吹田市 国際日本研究 - 京都市西京区 日本歴史研究 - 千葉県佐倉市 日本文学研究 - 東京都立川市 日本語言語科学 - 東京都立川市 情報学 - 東京都千代田区 統計科学 - 東京都立川市 素粒子原子核 - 茨城県つくば市 加速器科学 - 茨城県つくば市 天文科学 - 東京都三鷹市 核融合科学 - 岐阜県土岐市 宇宙科学 - 相模原市中央区 分子科学 - 愛知県岡崎市 物質構造科学 - 茨城県つくば市 総合地球環境学 - 京都市北区 極域科学 - 東京都立川市 基礎生物学 - 愛知県岡崎市 生理科学 - 愛知県岡崎市 遺伝学 - 静岡県三島市 統合進化科学 - 神奈川県三浦郡葉山町
大学本部事務局 - 神奈川県三浦郡葉山町 統合進化科学研究センター - 神奈川県三浦郡葉山町