シャドウ・ザ・ヘッジホッグ
軍の歩兵、ブラックアームズの歩兵やエッグボーンより戦闘力が低い。
ソニック達を敵視する悪の科学者。世界中で破壊の限りを尽くすブラックアームズに対し、自らが世界征服できる場所が無くなってしまうという理由で戦いに挑む。ステージ上では、ヒーロー(またはダーク)サイドのミッションキャラクターとして登場。また、ルートによっては自らが搭乗するメカに乗ってボスとして立ちはだかる。
エッグマンが古城を改造して造った基地。パンプキンヘッドのようなものがたくさんある。 ヒーロー(エミー)・・・ステージ内にいるクリームとチーズを探す。 ノーマル・・・ゴールリングを目指す。 ダーク(エッグマン)・・・ステージ内にある5つの巨大ランタンに火をつける。
ブラックアームズ(バキュームポッド)
スペシャル(バキュームエッグ)