軽井沢蒸留所
8月に深井戸が完成し、同年秋にぶどうの収穫およびワインの仕込みが終わると、ウイスキーの製造が再開された。上述の通りモルトウイスキーの原酒確保が急務であったため、設備を補強しながらなんとか再開にこぎつけた、というのが実情であった。このとき、ニューメイクの不快な香味は仕込み水の鉄分濃度の高さが原因ではないかと考え、沸石フィルターが新たに設置された。
翌1953年の春頃になると、発酵がうまくいかないようになる。もろみの酸が増加して酸っぱい臭気を放つようになったのである。関根らは原因を雑菌の繁殖によるものだと考えて糖化槽や各種パイプ類を徹底して洗浄したほか、酵母を変更するなどの対策を行うが、問題は解決しなかった。1954年になると、仕込み水の影響で酵母が萎縮、アルコールの生産性が極度に低下していることがわかった。この当時使っていた深井戸の水量は1952年の半分程度にまで下がっており、多量の不純物が混ざっているため、臭気を感じるほどに水質が劣化していた。そこで雨水や泉水を運んできて発酵の実験をしたところ、発酵阻害が起こるのは井戸水を使った時だけだと判明したのだ。また、蒸留廃液を工場裏手に捨てていたことが水質汚染の原因であった。そのため、それ以降は蒸留所から2 km離れた奈良井川の下流に廃液を放流するようになった 。しかし、その後も井戸の水量は減り続け、日量3,000リットルほどにまで減少したため、濾過装置で濾過した水を使ってだましだまし仕込みを続けるような状況であった。1955年にはアメリカン・ウイスキー酵母とコペンハーゲン・ビール酵母を導入するなど品質改善に向けた試行錯誤を続けていたが、 ニューポットの品質改善は遅々として進まなかった。
1964年に糖化槽と濾過器を更新したほか、特に1978年から1981年にかけて生産能力の大幅な増強が行われ、具体的には麦芽の粉砕機、ボイラーの取り換え、各種タンクおよび1号蒸留器の更新、貯蔵庫の増設が行われた。加えて川崎蒸留所にグレーンウイスキーの熟成庫を新設し、山梨熟成庫でも樽架台を増設して貯蔵能力を上げている。また、この時期の設備更新はウイスキーの品質に対する明らかなこだわりが見て取れる。実際、1980年代初頭に蒸留された原酒は非常に品質が高いことで知られており、ステファン・ヴァン・エイケンは軽井沢で1981年から1984年に蒸留された原酒を「黄金期」と評している。
高級志向の流れを受けて、三楽オーシャンは1976年7月に日本で初めてのシングルモルトウイスキーである「軽井沢シングルモルト・ウイスキー」を発売した。これは1978年の夏に軽井沢へ来た皇太子時代の明仁夫妻に献上され、このボトルをいたく気に入った明仁殿下が追加のボトルを注文したという逸話がある。しかしこの当時は三楽オーシャンの原酒ストックが不十分であったため、軽井沢シングルモルトは年間1万本ほどしか製造することができなかった。そのため供給が追いつかなくなることを恐れた三楽オーシャンはこのボトルを大々的に宣伝することはなかった。また、1977年には高級ブレンデッドウイスキーの「浅間」を発売するなど、高価格帯のラインナップを揃えていった。
上述のとおりこの合併は両者にとって有意義なものであったが、ウイスキーの製造においては幾分かの合理化が必要であった。この当時の国産ウイスキーはモルト原酒を少量のみ使うものであり、モルト蒸留所はひとつあれば足りたのだ。そこで軽井沢と山梨のニューメイクおよび1年間熟成させた原酒を比較したところ、軽井沢に特に問題はなかったが山梨の原酒には問題があった。翌1963年に軽井沢の製造担当が山梨に赴いたところ、発酵までの過程に特に問題は見当たらなかったものの、蒸留室内は硫黄の刺激臭が立ち込め、各種器具やドアの取っ手が黒ずむような有様であったという。銅製のポットスチルはスワンネック部分が腐食するため定期的に取り替える必要があり、それを嫌った三楽は山梨のポットスチルにステンレス製を採用していたのである。銅はウイスキー製造過程で生じる硫黄成分を吸着する効果があるため、スコッチ・ウイスキーでステンレス製のポットスチルが使われることはないが、この当時の日本では銅と硫黄の関係についてはまったく知られていなかったのである。その後しばらくの間、山梨ではニューメイクに銅を浸すなどの手当を行ったり在庫の改善策を試すなどしたものの、やはり根本的な解決になるとは言いがたく、1964年に軽井沢の蒸留設備が増強されたことで山梨での生産は中止された。その後1967年から1969年にかけて一時的に生産を再開したものの、それ以降は一切稼働することなく、熟成庫へと改装されたことで山梨蒸留所は消滅した。これによって三楽オーシャンのモルト原酒は軽井沢に一本化されたことになる。山梨の原酒は1968年に「オーシャン・ブライト」という製品にブレンドされた。これは軽井沢と山梨の2種類のモルト原酒をブレンドしたことを売りにした製品であった。