プロウイルス
プロウイルスの状態は、ウイルス複製の段階、または不活性なウイルス感染、または内在性ウイルス様配列のいずれかとして長期間持続する状態であるかもしれない。不活性なウイルス感染では、ウイルスは宿主細胞の複製を除き、それ自体を複製することはない。この状態は、多くの宿主細胞世代にわたって続くことがある。
内在性レトロウイルスは常にプロウイルスの状態にある。これに対し、(非内在性)レトロウイルスは細胞に侵入すると、RNAが逆転写酵素によってDNAに逆転写され、その後、インテグラーゼによって宿主ゲノムに挿入される。
このように、プロウイルスは、宿主ゲノムに統合されている間は、それ自身の新しいDNAコピーを直接作成しない。その代わり、宿主ゲノムと一緒に受動的に複製され、元の細胞の子孫に受け継がれる。これは、溶原性ウイルス複製として知られている。統合は、潜伏感染または増殖感染を引き起こす可能性がある。増殖感染では、プロウイルスはメッセンジャーRNAに転写され、新しいウイルスを直接生成し、溶菌サイクル(英語版)を通じて他の細胞に感染する。