モダン・ジャズ・カルテット
『プラスティック・ドリーム』 - Plastic Dreams (1971年)
『ウィズ・ポール・デスモンド』 - Paul Desmond with The M.J.Q. (1972年) ※アルトサックス奏者ポール・デスモンドとの協演
『ブルース・オン・バッハ』 - Blues on Bach (1973年) ※ジョン・ルイスにとっての重要なテーマであったバロック音楽の巨匠・J.S.バッハに題材を求めた作品集
『レジェンダリー・プロフィール』 - The Legendary Profile (1972年) ※結成20周年記念盤
『ラスト・コンサート』 - The Complete Last Concert (1974年)
『リユニオン・アット・武道館1981』 - Reunion at Budokan (1981年) ※日本武道館での再結成ライブ
『モントゥルー・コンサート'82 トゥゲザー・アゲイン!』 - Together Again: Live at the Montreux Jazz Festival '82 (1982年)
『エコーズ』 - Echoes (1984年)
『ジス・ワンズ・フォー・ベイシー』 - Topsy: This One's for Basie (1985年)
『スリー・ウィンドウズ』 - Three Windows (1987年) ※結成35周年をきっかけに実現したアトランティックへの復帰第1弾アルバム。ニューヨーク室内交響楽団との共演
『デュークに捧ぐ』 - For Ellington (1988年)
『結成40周年記念』 - MJQ & Friends: A 40th Anniversary Celebration (1994年)
『モダン・ジャズ・カルテット&オーケストラ』 - M.J.Q. and Orchestra (1960年) ※「3rd Stream Music」を探ったドイツ(シュトゥットガルト)での現地交響楽団との協演
『ヨーロピアン・コンサート』 - European Concert (1960年) ※スウェーデン(ストックホルム、イエテボリ)でのコンサート実況録音
『ロンリー・ウーマン』 - Lonely Woman (1962年) ※旧邦題『淋しい女』
『コメディ』 - The Comedy (1962年)
『シェリフ』 - The Sheriff (1963年)
『ア・カルテット・イズ・ア・カルテット・イズ・ア・カルテット』 - A Quartet is A Quartet is A Quartet (1963年)
『コラボレーション』 - Collaboration (1964年) ※ギタリスト・ローリンド・アルメイダとの協演
『ポギーとベス』 - Porgy & Bess (1966年) ※ジョージ・ガーシュウィンのミュージカルからの曲想
『ヴァンドーム』 - Place Vendome (1966年) ※スキャット・コーラスグループ「スウィングル・シンガーズ」との協演
『コンサート・イン・ジャパン'66』 - Concert in Japan (1966年) ※東京厚生年金会館でのライブ公演(日本盤のみ)
『ライヴ・アット・ザ・ライトハウス』 - Live at the Lighthouse (1967年)
『アンダー・ザ・ジャスミン・トゥリー』 - Under the Jasmin Tree (1968年)
『スペース』 - Space (1969年)