WILLER EXPRESS
京都駅八条口・WBT大阪梅田 - 小倉駅(小倉駅新幹線口バスターミナル)・博多バスターミナル(日本高速)
WBT大阪梅田・USJ・神戸三宮 - 小倉駅(小倉駅新幹線口バスターミナル)・博多バスターミナル(日本高速)
USJ・WBT大阪梅田 → 小倉駅(小倉駅新幹線口バスターミナル)・西鉄天神高速バスターミナル・博多バスターミナル・基山PA・金立SA・佐賀駅バスセンター(祐徳)
USJ・WBT大阪梅田 ← 西鉄天神高速バスターミナル・博多バスターミナル・基山PA・金立SA・佐賀駅バスセンター(祐徳)
大崎駅 - 成田空港・芝山町役場(本社・千葉・京成バス(新習志野・千葉)・千葉交通(成田))【昼行】
大崎駅西口バスターミナルを起点とする路線であり、東京の西側と成田空港を結ぶバスである。2016年10月31日に運行を開始した。大崎 - 成田空港間の所要時間は最短75分で、運賃は片道1300円であるが、事前予約をすると1000円に割り引かれる。後述する池袋線の運行開始以降は「成田シャトル大崎線」とも称する。
同路線は、成田空港東側の芝山町にも乗り入れており、芝山町役場が終点となっている。開業にあわせ、WILLER EXPRESSは芝山町に営業所を開設して運用にあたっているほか、一部の便は京成バス、千葉交通が担当している。
成田シャトルを運行するWILLER EXPRESSは、開業と同時にエアロエースの専用車両を導入した。トイレは設置しておらず、座席レイアウトはかつての「東京シャトル」(現:エアポートバス東京・成田)と同じであるが、独自デザインのシートを装備している。
千葉営業所(芝山町)以外の運用においては、従来の都市間高速バス車両が使用され、「リラックス」と呼ばれるフード付き座席で運行される便がある。千葉交通は開業後にセレガのトイレ無し専用車両を2台導入している。
京成バス・千葉交通担当便に限り、交通系ICカード全国相互利用サービス対応のICカードが利用できる。
2020年12月現在、全便運休中。
新木場駅・東京駅(鍛冶橋) → 京都駅八条口・WBT大阪梅田・USJ・リーベルホテル アット ユニバーサル・スタジオ・ジャパン(桜島駅)(大阪)
バスタ新宿 ← WBT大阪梅田・USJ・リーベルホテル アット ユニバーサル・スタジオ・ジャパン(桜島駅)(大阪)
大手町フィナンシャルシティグランキューブ・バスターミナル東京八重洲・サンシャインシティ → 京都駅八条口・WBT大阪梅田・OCAT(大阪)
サンシャインシティ・大手町フィナンシャルシティグランキューブ ← WBT大阪梅田・OCAT(大阪)
サンシャインシティ・大手町フィナンシャルシティグランキューブ ← WBT大阪梅田・天王寺公園(大阪)
サンシャインシティ・バスタ新宿 ← 京都駅八条口・WBT大阪梅田・USJ・リーベルホテル アット ユニバーサル・スタジオ・ジャパン(桜島駅)(大阪)
西国分寺駅・バスタ新宿・高尾駅南口・甲府駅南口 ← 京都駅八条口・高速長岡京・桃山台駅・WBT大阪梅田・USJ・リーベルホテル アット ユニバーサル・スタジオ・ジャパン(桜島駅)(プリンス)
YCAT・バスタ新宿 - WBT大阪梅田・USJ・神戸三宮(ベイライン)
バスタ新宿 - 福島駅西口・仙台駅西口(仙台)【昼行】
バスタ新宿 - 仙台駅西口(仙台・東日本急行(本社))【昼行】
バスタ新宿・サンシャインシティ - 仙台駅西口(仙台)【昼行】
羽田空港・バスタ新宿 → 福島駅西口・仙台駅西口(仙台)【昼行】
新木場駅・バスタ新宿 → 福島駅西口・仙台駅西口(仙台)【昼行】
新木場駅・バスタ新宿 ← 仙台駅西口(仙台・東日本急行(本社))【昼行】
TDL・バスタ新宿 - 仙台駅西口(仙台)
TDL・バスタ新宿 → 福島駅西口・仙台駅西口(仙台)
TDL・サンシャインシティ ← 福島駅西口・仙台駅西口(仙台)
TDS・サンシャインシティ → 福島駅西口・仙台駅西口(仙台)
TDL・サンシャインシティ・さいたま新都心バスターミナル → 仙台駅西口(仙台)
TDS・サンシャインシティ・さいたま新都心バスターミナル ← 仙台駅西口(仙台)
TDS・大崎駅・バスタ新宿 ← 仙台駅西口(仙台)
TDL・大手町フィナンシャルシティグランキューブ・バスタ新宿 ← 仙台駅西口(仙台)
大手町フィナンシャルシティグランキューブ・バスタ新宿 → 福島駅西口・仙台駅西口(仙台)
東京駅(鍛冶橋)・バスタ新宿 ← 福島駅西口・仙台駅西口(仙台)
新木場駅・バスタ新宿 ← 仙台駅西口(仙台・東日本急行(本社))
大崎駅・バスタ新宿 → 仙台駅西口・泉中央駅(プリンス)
バスタ新宿・サンシャインシティ ← 仙台駅西口・泉中央駅(プリンス)
バスタ新宿・サンシャインシティ → 仙台駅西口(仙台・東日本急行(本社))
一部の便は東日本急行(本社)に運行を委託している。
バスタ新宿 → 米子駅(2023年12月1日から米子駅南口)・松江駅北口・出雲市駅南口・出雲大社(ベイライン)
バスタ新宿 ← 米子駅(2023年12月1日から米子駅南口)・松江駅北口・出雲市駅南口(ベイライン)
OCAT・京都駅八条口 - ナガシマリゾート(大阪)【昼行】
WBT大阪梅田 - 名古屋(大阪)【昼行】
WBT大阪梅田 → 名古屋・愛・地球博記念公園(大阪)
WBT大阪梅田 ← 愛・地球博記念公園・名古屋(大阪)
WBT大阪梅田 - ナガシマリゾート・名古屋(大阪)【昼行】
WBT大阪梅田・桃山台駅・高速長岡京 - 名古屋(大阪)【昼行】
OCAT・WBT大阪梅田 - 名古屋(大阪)【昼行】
OCAT・WBT大阪梅田・桃山台駅 - 名古屋(大阪)【昼行】
リーベルホテル アット ユニバーサル・スタジオ・ジャパン(桜島駅)・WBT大阪梅田 - 名古屋・東岡崎駅南口(西三)【昼行】
リーベルホテル アット ユニバーサル・スタジオ・ジャパン(桜島駅)・USJ・WBT大阪梅田 - 名古屋・新豊田駅東口(西三)【昼行】
リーベルホテル アット ユニバーサル・スタジオ・ジャパン(桜島駅)・USJ・WBT大阪梅田・桃山台駅 → 近鉄四日市駅・名古屋(名古屋)
リーベルホテル アット ユニバーサル・スタジオ・ジャパン(桜島駅)・USJ・WBT大阪梅田 ← 近鉄四日市駅・名古屋(名古屋)
リーベルホテル アット ユニバーサル・スタジオ・ジャパン(桜島駅)・USJ・WBT大阪梅田・桃山台駅・高速長岡京 → 栄・金山駅北口・名古屋(大阪)
WBT大阪梅田・桃山台駅・高速長岡京 ← 栄・金山駅北口・名古屋(大阪)
エグゼクティブ(EXECTIVE) - 三菱ふそう・エアロキングの1階部分に3席設置された独立2列シート。ビジネスクラス同様の枕・レッグレスト・電動リクライニング機能の他、テレビ・DVDプレイヤーを装備。2018年12月22日(関西→関東は前日の12月21日)でスリーパーと共に運行終了、同車両で運行していた便に関してはリラックス≪NEW≫での運行となる。このエクゼクティブ及びコクーンが運行終了になることで、WILLERからは2列シート車が消滅することになる。
コクーン(COCOON) - 進行方向に対して斜め内向きの独立2列シートで、旅客機のビジネスクラスを連想させるヘリンボーンレイアウトを採用する。シェル型パーティションなどが設置されており、個室感覚としたタイプ。天龍工業との共同開発。「都市間高速バスの客席ユニットとそのレイアウト」として2010年グッドデザイン賞受賞。シアター・リラックスプライベートモニター付きと同様のファントロシステムを搭載している。2018年9月30日(関東 - 関西。関東 - 名古屋は12月22日及び23日)から順次運行終了、同車両で運行していた便に関してはリラックス≪NEW≫での運行となる。
バリュープライベート(Value Private) - バリュー車の1階席に3席設定。独立席となっており、居住性が高い。2018年現在はバリュー共々運行終了。
上記の委託運行会社によって運行される格安便のブランド名であり、WILLERカラーの専用車両ではなく通常の観光バス車両が使用される。
但し、ベイラインエクスプレスでは、親会社である中日臨海バスの貸切車を転籍させた上で自社運行を行っているほか、日本高速バスも独自の専用車両を導入した上で自社運行を行っている(塗装は親会社の日本観光のカラーリングをアレンジしたもの)。
過去にははWILLER EXPRESS北信越による自社運行便も存在したほか(前身であるアリーナがツアーバス時代に使用していた車両を転用していた)、南部バス→岩手県北自動車南部支社による自社運行便も存在した。ツアーバス時代には元シリウス号用車両を転用した「STAR EXPRESS frontier」が運行されていた。
運用時は通常、WILLER EXPRESS便(所定便)ではワンマン乗務の便であっても、原則ツーマン運行(運転席側最前部2席が交代要員席として割り当てられている)。一部乗降地の予約が出来ないなどの制限がある。