富士氏
永禄9年(1566年)4月3日には今川氏真が富士氏の本拠である富士大宮の六斉市(神田市)を楽市化している。またこの楽市令については、富士氏側の要請によって今川氏がその権力を背景に楽市化を行ったとする見方が多い。
しかし武田氏の駿河侵攻における大宮城の戦いにおいて、戦は本格化していくこととなる。この時期は緊張状態にあり、永禄12年(1569年)2月25日の北条氏康からの書状では「昼夜御辛労令職察候」とある。このようにこの時期の富士氏は後北条氏の援助を得ており、北条氏政は大宮城中の給人領地の安堵や新領を宛行う約束などを行っている他、富士氏に対し城中城外に関する具体的な指示を出している。
しかし武田信玄本隊の攻撃に耐えられず、穴山信君を通し富士城は開城することとなる。その後も富士氏は後北条氏方として蒲原城の戦いに参戦するなどしているが、その後は今川氏真より暇を与えられ、武田氏に付くことを決断し武田氏に帰順する。また帰順後、信忠は武田家家臣の鷹野氏の能通に富士姓を与え、富士家の公文職に迎えるなどしている(富士能通)。武田氏に帰順後は富士氏の軍事的側面に関わる文書は急減しており、武田氏は富士氏の神職としての側面を重視し、社人の再編成を行っている。また武田氏の駿河侵攻後の発給文書全体として寺社に対して行われたものが多く、浅間大社に宛てたものは有意に多い。
富士大宮司職については、元亀3年(1572年)に信玄が富士家の末子を富士大宮司職に補任することを命じている。武田家当主が変わり武田勝頼の代になると、勝頼より富士信通が改めて富士大宮司に任命されている。このように武田氏帰順後は社中の法度が定められるなど武人としての活動は制限され、富士大宮司としての活動が主となった。