美通遺跡
A区では奈良・平安時代の建物跡8軒、掘立柱建物跡3棟、土坑93基、溝状遺構36条、旧河道1流、近世期の竪穴遺構5基、ため池遺構1基などを検出している。C区では縄文時代早期から前期の竪穴建物跡1軒、集石土坑6基、平安時代の建物跡3軒、土坑116基、溝状遺構51状、焼土跡24基、13世紀から14世紀の墓と考えられている遺構2基などを検出している。A区で発見された礎板石を持つ掘立柱建物跡は類例が少ない。
A区からの出土遺物は主に土師器・須恵器で、駿東型の甕破片が多い。弥生時代の遺物では磨製石鏃などの石器や短刀などの金属製品も出土している。A区2 - 1の遺構外からは県内で四例目となる猿型土製品が出土したほか、金属製品、陶磁器類が多く出土している。
C区からは縄文時代早期後半から前期にかけての建物跡や集石土坑、平安時代の建物跡、13盛期から14世紀頃の土坑、時期不明であるが平安時代以降の土坑・溝状坑遺構多数、焼土遺構が見られる。また、C区で発見された13世紀から14世紀の墓は人骨と短刀を伴うもので、歯の科学的分析から青年に達しない年代であると鑑定されている。
平安時代の建物跡はA区とC区の離れた場所で発見され、時期的にもずれるため別の集落であると考えられている。C区の平安時代の建物跡からはスモモの核が出土している。建物跡の年代を確定する土器は見られないが、C14年代測定では1号建物跡が11世紀前半から12世紀中頃という年代を示している。
山梨県立博物館では2010年(平成22年)から2013年(平成25年)にかけて「日韓内陸地域における雑穀濃厚の起源に関する科学的研究」を実施し、レプリカ・セム法により植物圧痕やプラント・オパールの分析を実施した。美通遺跡では、2011年(平成23年)に発掘調査が行われた遺跡北東端のD区に位置する縄文時代前期後半の環状配石から出土した諸磯a式土器をレプリカ・セム法により観察した。これによりシソ属の圧跡が検出され、エゴマである可能性が指摘されている。
山梨県を含む中部高地では山梨県北杜市大泉町西井出の天神遺跡、長野県南佐久郡南相木村の大師遺跡から検出されている。山梨県内では笛吹市御坂町竹居・八代町竹居の花鳥山遺跡から縄文前期後葉の炭化種実が検出されており、縄文中期では北杜市大泉町の寺所第2遺跡からの出土事例がある。シソ属は食用のほか灯用・漆製品の作製に用いる油としての利用も考えられている。
遺跡は南からA - C区に区分され、さらにB区は1 - 4など発掘年度による調査区が設けられた。