ハカイジュウ
ナルミを取り込んだ武重の意志に地球が共鳴して出現させた生命の樹。地球の自浄作用である30年に及ぶ一連の特殊生物災害の総仕上げとして、大量破壊生物が実っている。
そのもとは地球自身が地中深くに生み出した生命の種であり、地球の害となった人間とその文明を滅ぼして新たな生態系を作る事が目的。今までの特殊生物も全てこの樹が生み出したものであり、武重により枯死した後は新たな特殊生物が生まれないようになった。
標準的な体形をしているが3本の腕を持つタイプと非常に長い首を持つタイプ。両者ともにグリップ付きのブレードを装備しており、トール型の頭部を吹き飛ばすほどの爆弾を装備している(3本腕は3発装備している)。作中では両者の分別がされていない。
ヘリから投下されたロケット重機関砲を持つタイプ、右腕がエネルギーソードになっているタイプ、両腕が大砲になっている二対、伸縮式の腕に巨大なドリルをもつタイプ、両足のジェットで空を飛び爪で攻撃するタイプ、巨大ガトリング砲を備えたタイプ、巨大な腕を持つタイプ、四本腕で剣とハンマーを持つタイプ、レーザーライフルを備えたタイプなど。総勢100体もの軍勢だったが、スカイツリーを襲撃するトール型の群れを半数も撃破できず壊滅した。
第一部のヒロイン。魅央の母親で第二開始時すでに故人。アイランドで2人の子をもうけるが、大規模特殊災害の際に魅央を瓦礫の倒壊から身を挺して守り、命を落とした。
変異すると全身が岩のように硬質化し、刃物を通さない頑強な体になる。その体質で強化した大型ナイフで戦う。
クローン陽が変身する。形態の見た目はエボル鷹代に酷似しているが、戦闘経験を積んでおらず、細胞の劣化コピー品のためか戦闘力はあまり高くない。大阪城のクローン達は武者鎧を着込み日本刀で戦う。
特殊生物の肉を食べ過ぎたことで変貌した元人間。特殊生物も食らうが、人間を好んで捕食する。フューズやエボルに近い存在だが、2種と比較すると戦闘能力はあまり高くなく、人間や特殊生物の肉を食べると傷が再生する。
作中で初めて出現した巨大生物。立川の生物の中では穴の下にいる存在を除いて最も巨大である。本作で最も怪獣のような姿をしている。6本の触手と尻尾を持っており、これらを攻撃に使う。目がない。当初はトール型かは不明だったが、後にトール型の一種と判明する。
第一部のヒロインであり陽の幼馴染。エボルではないので見た目も47歳相当に年を取っている。魅央が小さいころ、アイランド(北海道)で一緒に生活をしていた。現在は大阪のラボにいる。
新宿で絢士たちが出会ったホームレスの老人。常に酒を飲んで酔っ払っている。もともとは15・6年前まで地下鉄工事の責任者だったが、途中、特殊生物を目撃してしまったためクビを切られてしまう。その後は職に就かなかったようで妻と子に逃げられた。新宿を脱出できるルートを知っている唯一の人物。彼が工事を担当していた旧大江戸メトロの現場が彼の寝床であり、そこから現行の大江戸メトロに抜けることができる。作中でも屈指の幸運の持ち主で何度も怪物に襲われそうになるも無傷で生還している。
第一部における日本政府直属の特殊生物の研究及び対策措置を実行する組織。黒の軍隊(特殊生物対策部隊)を指揮している。スカイツリーの地上から455m地点、展望台の一つ上に本部司令室がある。
トール型の特殊生物とフューズとなった人間との融合体。トール型の頭部に下半身と両腕を接続するユニットのような物をつけ、それでフューズ(またはエボル)と接続する。トール型を自在に動かすことができるため、その戦力は全フューズシリーズをも上回る。 ファイナルフューズ武重 武重とはじまりのトール型とのファイナルフューズ体。その圧倒的な力でスカイツリーに集結した数多くのトール型を殲滅した。しかし、闘争本能が高められたことでより強い相手を欲し、帝王を復活させてしまう。両腕からブレードのようなものを出して戦う。帝王に両足と左腕を奪われたが、その身を楔にして帝王を活動停止に追い込んだ。 ファイナルフューズ早乙女 早乙女があらかじめ確保しておいたトール型と融合したファイナルフューズ体。うんこのオブジェの中からコクピットに入る。一つ目のエイを頭に被せたような姿で、全身から岩石を無数に発射して攻撃する。帝王の活動を停止させるためファイナルフューズ武重をサポートするが、武重を庇って帝王の煮えたぎる体液を浴びてしまい戦闘不能となった。 太陽の塔 大阪城がヴァリアント集合体に襲われた際、絢士が乗って助けに駆け付けた。太陽の塔に偽装されており、戦闘時は中のトール型により戦闘形態をとる。エネルギーをチャージして、目からビーム光線のような物を発射することができる。劣勢に陥った際に暴走状態になり、早乙女の強制終了を受けて三ヶ月再起動不能になった。