東三条殿
道隆の死後の具体的な伝領過程は明らかでないが、道隆の子供達が道長との政争に敗れた影響か、間もなく道長の所有となったらしい。
長保元年(999年)7月、居貞親王が東三条殿に入り、その御所となっているが、長保2年12月、ここで居貞親王の子敦明親王の読書始が行なわれた際に、藤原行成は「左大臣(道長)東三条第」と明記している。
一方、東三条院詮子は、長徳4年(998年)10月頃、土御門殿から道長が新しく購入した一条殿に移り、長保1年7月には再び土御門殿に戻っている。長保2年頃よりは病が重くなり、頻繁に御所を移しているが、長保3年閏12月、藤原行成の邸宅に移り、崩御した。
長保4年(1002年)8月、東宮妃藤原原子の薨去により居貞親王は大炊御門殿に移る。その後、道長は東三条殿を改築し、敷地の西側にあった泉の水を庭園に活用するために西対を廃した。寛弘2年(1005年)2月に完成し、道長の移徙の儀が行なわれたが、道長の主邸は引き続き土御門殿であった。同年11月末から約3ケ月は内裏の火災のため、一条天皇の里内裏となり、東宮居貞親王は南院に入った。寛弘3年3月、内裏が一条院に移った直後に、冷泉上皇が「三条院」に、次いで「南院」に移っており、10月の「南院」焼亡の際には東三条殿に避難している。この「南院」は再建の後、寛弘5年12月より再び冷泉上皇の御所となって、寛弘8年(1011年)10月に上皇はここで崩御した。