水産研究・教育機構
2001年4月1日: 水産庁研究所9つを統べる独立行政法人として水産総合研究センターを設立、水産大学校は単独の独立行政法人に改組。
2003年10月1日: 認可法人海洋水産資源開発センター(開発調査センター)及び社団法人日本栽培漁業協会(栽培漁業センター)の業務を継承。
2006年4月1日: 独立行政法人さけます資源管理センターと統合(さけますセンター)。
2011年4月1日: 各地の栽培漁業センターを各研究所に、さけますセンターを北海道区水産研究所に改組統合。養殖研究所を増養殖研究所へ改称。
2011年9月1日: 遠洋水産研究所を国際水産資源研究所へ改称。
2015年4月1日: 水産総合研究センターを国立研究開発法人に変更。
2016年4月1日: 水産総合研究センターと水産大学校を統合し、国立研究開発法人水産研究・教育機構が発足。
2020年7月20日: 9研究所を水産資源研究所と水産技術研究所に再編
海洋水産資源開発促進法(昭和46年法律第60号)に関連した調査と、情報・資料の収集・提供。この業務のみ別勘定で行われる。