ゾイドインフィニティ
ゲームオリジナルのストーリーモードの主人公。『ゾイドVS.3』の主人公だったアローの生き別れの弟で、本当の家族の記憶がない幼い頃に開拓団に引き取られて育てられていた。Ziファイターになることを夢見ていたが、アローの紹介を受けたZOITEC社の令嬢アルマのスカウトを受け、彼女が設立してリーダーを務めるチーム・ゾディアックに入った。
他にもノーマルモードおよびキャラクターモードでは、他のアニメシリーズやゲームシリーズに登場したキャラクターが自機パイロットとして選択できたり、あるいはNPCの対戦相手として出現する。シナリオモードでは基本的にゲームオリジナルキャラ達との対戦になるが、中にはバトルストーリーに出てきたゾイドパイロットが名前のみで登場することもある。
アイテム取得で追加。准尉以上で選択可能。
ゴジュラス・ジ・オーガ
ブレードライガー
ディバイソン
ケーニッヒウルフ
ライガーゼロシュナイダー
ライガーゼロイエーガー
ライガーゼロパンツァー
ライガーゼロファルコン
アイアンコングPK
ジェノブレイカー
バーサークフューラーシュトゥルム
バスターフューラー
ダークスパイナー
レイズタイガー
ブラストルタイガー
ムラサメライガー