SCF複合体
植物ホルモンのオーキシンはTir1(Transport Inhibitor Response 1)タンパク質に結合する。Tir1はAFB(Auxin Signaling F-box Protein)であり、オーキシン受容体として機能する。オーキシンが結合したTir1はSCF-Tir1のAUX/IAAリプレッサーへの結合を促進する。その後のリプレッサーの分解によって、AUX/IAA遺伝子(オーキシン応答性遺伝子)が活性化される。
植物ホルモンのジャスモン酸は、FBPであるCoi1タンパク質に結合する。SCF-Coi1はJAZ転写因子に結合し、分解標的とする。JAZ転写因子の分解によってジャスモン酸応答性遺伝子の転写が行われる。
SCF複合体の発見を導く最初の手がかりは、出芽酵母Saccharomyces cerevisiaeの遺伝的スクリーニングから得られた。cdc4、cdc34、cdc53などの細胞周期の進行に異常がみられる温度感受性変異体は、DNA複製が起こっていない状態でG1期に細胞周期が停止し、複数の出芽がみられる。この表現型はS期サイクリン-CDK複合体の阻害因子であるSic1(英語版)を分解できないことが原因であった。これらの発見から、G1/S期の移行にタンパク質分解が重要であることが示された。
続いて、生化学的研究によりCdc34(英語版)がE2酵素であり、Cdc34はSkp1、Cdc4(英語版)といくつかのタンパク質が含まれるE3ユビキチンリガーゼ複合体と物理的に相互作用することが明らかにされた。Skp1の既知の結合パートナー、具体的にはSkp2、サイクリンF(英語版)、Cdc4は約40残基からなる共通したモチーフを持つことが判明し、F-boxモチーフと名付けられた。これらの発見に続いて提唱されたF-box仮説では、F-boxタンパク質が分解標的となる基質をリクルートし、Skp1がF-boxタンパク質とコアユビキチン化複合体を関連付けているとされた。
その後の線虫Caenorhabditis elegansでの遺伝学的研究により、他のSCF複合体の構成要素が解明された。