パワプロクンポケットR
仲間評価はイベントの影響のみに変更され、チームメイトの能力アップは下記の仕様に変更された(発売当時は能力アップがなかった)。 2022年3月15日のアップデートで、チームメイトの初期能力が強化され、『1』の極亜久高校編と同様、試合後に能力アップするようになった。
2022年4月15日のアップデートで、戦争編にゲームレベルが追加された。本作用に遊びやすくなったノーマル(アップデート以前はこの難易度のみ)、『2』よりも難易度が上がったクラシックを選択できる。 ノーマルでは、ツキの初期値が30→50に、4週ごとに司令部に帰還した際の体力回復とツキの上昇が増加、呪い島のミニゲームの難易度低下などで、難易度が多少下がっている。 クラシックは、『2』をベースにしつつ、ランダムイベントの発生率が上昇、「爆撃でポン」のミニゲームの発生率が上昇、ダイジョーブ島での手術の成功率が低下、任務による死亡でのゲームオーバー(『2』と『1・2』と同様、運が悪いと1週目でゲームオーバーになる)になりやすいなど、『2』よりも難易度が非常に高い。代わりに、取得できる経験点が上昇、呪い島のミニゲームで得られる能力アップが増加など、運が良ければノーマルよりも強い選手を作ることが可能。
戦争編では、ダイジョーブ島もランダムイベントとしての「爆雷でポン」のミニゲームが発生されるようになり、難易度が上がった。
戦争編の呪い島のミニゲームで、『8』の昭和冒険編および『パワプロアプリ』のパワポケコラボイベントの「ウキウキ地雷パニック」と同様、地雷のないマスの場所で、周囲8マスを一気に掘ることが出来る「回転掘り」のボタンが追加された。
これまでパワポケシリーズでのマイナス特殊能力の除去は、イベント経由か、能力アップで必要経験点を2倍消費して上書きで習得することで除去可能であったが、パワプロシリーズと同様、能力アップで除去するための必要経験点を消費するだけで、いつでも簡単にマイナス特殊能力を除去できるようになった。 特殊能力の「回復」は、習得しても「休む」コマンドとイベントの体力回復の回復量が増加されなくなった。これに伴い、体力回復が重要な『2』の戦争編が有利に進めることができなくなった。
イベントで特殊能力を直接習得することがなくなり、代わりに特殊能力のコツ(該当特殊能力習得の必要経験値が軽減される)を習得する形になった。ただし、アイテムの獲得や戦争編の呪い島のミニゲームでは、当時と同じように対応する特殊能力を直接習得する。
『1・2』以降の作品とパワプロシリーズの作品同様、当時実装されなかった特殊能力や特殊変化球の追加に伴い、イベントで当時習得機会のなかった能力(のコツ)が追加された。 「ローボールヒッター」と「ハイボールヒッター」などのように、パワポケシリーズでは同時に習得可能だった特殊能力は、パワプロシリーズと同様、いずれか1つしか習得できないように変更された(別のものを習得すると、上書きする形で元々習得していたものが除去される)。
各シナリオの中断データは1つずつになり、再開時に読み込むと中断データが消去される仕様に変更された。これに伴い、表サクセス(極亜久高校編とドリルモグラーズ編、以下同)では4回まで可能だったリセットとやり直しがなくなり、リセットした場面やゲームオーバーになった直前の場面から再開することができなくなった。
武田剛の初期能力が調整され、最初から「カットボール」の変化球を習得している状態に変更された。 これに伴い、『7』以降のアレンジチームで最初から「SFF」の変化球を習得している状態ではなくなり、上記の変化球に変更された。
『1・2』にあった味方の能力アップでパワーが全く伸びないバグがなくなり、正常にパワーが伸びるようになった。 その代わり、捕球は一切伸びず、味方の投手には野手能力が一切伸びなくなった。 投手での平山で、ランダムイベントで習得可能だった「シュート」の変化球は、本作では習得できなくなった。
2のみの変更点
ドリルモグラーズ編(『1・2』では解禁が必要)と戦争編は最初からプレイ可能になった。
作った選手を引き継いで有利な状態で遊べる「転生」が1台の本体だけで行えるようになった。『2』と『1・2』と同様、2台の本体で通信するローカル通信に対応しており、ローカル通信ではボーナスが大きくなる。 「転生」を行うと、初期設定のゲームレベルは「ノーマル」で固定される。
「ドリルモグラーズ」の所属リーグがゲームスタート時にプレイヤーが選択した球団と異なるリーグからランダムに変更されている。 また、ゲームスタート時に選択した球団に関係なく、すべての試合は指名打者制を採用しない仕様に変更された。
リーグ優勝決定戦で登場した阿畑きよしが登場しなくなり、代わりにパワプロシリーズのレギュラーキャラ阿畑やすしが登場する。
これまで隠しパラメータ扱いであったマニアポイントが、データコマンドの評価画面に表示され、いつでも確認できるようになった。
ランダムイベントやうろつきイベントで発生する神奈川光のクイズは、NPB12球団・選手が未収録となったことに伴い、野球知識に関連したクイズに変更された。
発売当時では本作からオリジナル変化球を持った選手を作成することが不可能だったため、阿畑やすしと『パワプロ2020』から移動された選手限定のものだったが、2022年1月6日のアップデートで、サイバーバルでオリジナル変化球を持った野球人形のパーツが手に入るようになり、オリジナル変化球を持った選手を作成できるようになった。 「内野安打◎」、「シンキングファスト」などの『11』以降に追加されたパワメジャシリーズに登場する特殊能力、特殊変化球は削除された。 超特殊能力はパワプロシリーズに準拠したため、「豪力」や「緊縛」などのパワポケシリーズにのみ実装された超特殊能力は削除された。 選手のグラフィックがパワポケシリーズのパワプロくんからパワター(似顔絵)に変更された。かわりに、オーダー画面のミニ顔は表示されなくなった。 パワターはパワプロシリーズからの完全流用というわけではなく、猪狩守などパワポケとパワプロでデザインが異なる一部のキャラのパワターは、本作で新たに作られたものである。 『1・2』当時はまだ顔データが実装されなかった狩村正己、木村庄之助のパワターも追加された。なお、狩村正己のパワターは『11』以降のデザインではなく、髪が生えているなどの若い頃をイメージした本作用に新たにデザインされたものになっている。 パワプロくんも極亜久高校編とドリルモグラーズ編専用のデザインを用意される(デザインはそれぞれ若干異なる)。
『10』以降のパワポケシリーズの定番にあったカード野球、ペナント、キャンプ、ホームラン競争、試合進行型育成モード(グッピー・トツゲキ甲子園)、パワポケ用語辞典、アルバムモードのサウンドテストなどは収録されていない。 2022年3月15日のアップデートで、『5』以降に搭載された俺のペナントモードが収録された。 本作からパワポケPも廃止された。特定ゲームモード進行で獲得したポイントによる解禁可能な要素はサイバーバルモードの仲間キャラのみ。 野球モードの1つのキャンプが未収録になっているため、野球操作の練習は対戦モードのCOM対戦しかできなくなった。 おまけモードにあったアルバムは、サクセスモード内に移行された。
野球システムは今までのパワポケシリーズのものではなく、本作発売時点のSwitch版のパワプロシリーズの最新作(『パワプロ2020』)のものを流用する。これに伴い、『14』発売以降のパワプロシリーズの要素・変更などが本作にも反映される。下記は主な変更点を記載する。 選手能力(基本能力、(超)特殊能力とも)は本作発売時点のSwitch版『パワプロ2020』のものに準拠している。 これに伴い、能力表記は従来のパワポケシリーズの絵形式から、パワプロシリーズの文字形式に変更された。 オリジナル変化球、および変化球エフェクトも搭載された。