フィリピンの歴史 (1898年-1946年)
Agoncillo, Teodoro Andal (1990), “11. The Revolution Second Phase”, History of the Filipino People (Eighth ed.), University of the Philippines, pp. 187–198, ISBN 971-8711-06-6, https://archive.org/details/historyoffilipin00teod/page/187
Agoncillo, Teodoro Andal (1997), Malolos: The Crisis of the Republic, University of the Philippines Press, ISBN 978-971-542-096-9, https://books.google.com/books?id=LnxvAAAACAAJ
Beede, Benjamin R. (1994), The War of 1898, and U.S. interventions, 1898–1934: an encyclopedia, Taylor & Francis, ISBN 978-0-8240-5624-7, https://books.google.com/books?id=48g116X9IIwC
Blanchard, William H. (1996), “9. Losing Stature in the Philippines”, Neocolonialism American Style, 1960–2000, Greenwood Publishing Group, ISBN 0-313-30013-5, https://books.
1900年3月16日にマッキンリーが任命しウィリアム・タフトが委員長を務める第二次フィリピン委員会(タフト委員会)は、制限された権限同様に立法権を承諾した。9月1日、タフト委員会は立法機能を遂行し始めた。1900年9月から1902年8月にかけて499本の法律を公布し、最高裁判所などの司法制度を創設し、法典を作成し、公務員を組織した。1901年の地方自治法は、自治体首脳として勤める公に選出された大統領や副大統領、地方議員を定めた。自治体首脳は徴税し自治体の財産を維持し必要な建設事業を行うことに責任を負い、知事も選出した。
一部の出典は、ゲリラ部隊や準宗教武装集団、その他の抵抗集団が農村部を放浪し続けたために戦争は非公式には10年近く続きアメリカ軍やフィリピン保安部隊と衝突したことを示唆している。アメリカ軍とフィリピン保安部隊(英語版)は1913年までこのような抵抗組織との武力衝突を続けた。この抵抗の一部は、自称後継者(英語版)からフィリピン共和国まであった。1907年の法律は、「フィリピン群島における最近の反乱で用いられた」旗などの象徴を掲げることを禁止した。一部の歴史家は、この非公式の時代を戦争の一部とみなしている。
マニラ湾海戦は1898年5月1日に行われた。数時間の戦闘でデューイ提督の艦隊はパトリシオ・モントホ・イ・パサローン(英語版)将軍が指揮するスペインの艦隊を破った。アメリカ合衆国の艦隊は、カヴィテ州の工廠や海軍工場を占領した。デューイはワシントンに電報を打ち、マニラ湾を支配しているがマニラ自体を奪取するには追加で5000人が必要だと述べた。