EdMax
EdmaxからWindows標準メーラーであるOutlook Expressへのメール移行は標準機能では出来ず、いったんUNIX Mbox形式で出力したものを外部ツール等でEML形式に変換する必要がある。
Outlookの場合は新規にメールを作成する場合は新しいウィンドウが開くが、フリーウェア版のEdMaxの場合はタブとして開くため、一見何か起こったのかどうか初心者には把握しにくい(但しシェアウェア版のEdmaxでは、ウィンドウに表示させることも選択できるようになっており、この問題は設定により対処できる。)
アドレス帳を左ペインに常駐させることができない。
フリーウェア版のVer2.86.1Fでは、起動時にアフィリエイトリンク付きのポップアップウインドウが強制的に表示されるようになった。設定で非表示にする事が出来ないので、電子メールクライアントを起動するたびにウインドウを閉じる手間がかかるようになってしまった(なお、2.86.2Fでは起動時にポップアップが表示されなくなった)。
Unicode版は従来シリーズと設定に互換性がない。また、プラグインはカスタムアカウントプラグインのみ互換性がない。