理化学研究所
2005年4月 - 「監査・コンプライアンス室」を設置。
2005年12月 - 「科学研究上の不正行為の基本的対応方針」を策定。
2014年8月 - 「研究不正再発防止をはじめとする高い規範の再生のためのアクションプラン」を発表。
2003年(平成15年)10月、独立行政法人化され、2001年(平成13年)にノーベル化学賞を受賞した野依良治を理事長に迎えた。
2005年(平成17年)8月、「感染症研究ネットワーク支援センター」発足。
2012年(平成24年)9月、計算科学研究機構のスーパーコンピュータ「京」運用開始。