セガ3D復刻プロジェクト
移植スタッフには本プロジェクト以前、PlayStation 2で展開された過去作移植ソフトシリーズ・セガエイジス2500シリーズに携わっていた人物も多く、その際に好評を博した「完全移植」や「移植元作品をリスペクトしつつ、別の遊び方が出来る新要素」などが本プロジェクトでも積極的に採り入れられている(移植時に付け加えられた新要素などの詳細はタイトルリンク先を参照)。
2014年10月には「デジタルコンテンツEXPO2014」のシンポジウムに参加、12月には、「国際3D先進映像協会 グットプラクティス・アワード 2014 本賞」を受賞した。
当初、プロジェクトは2014年8月に配信開始された『3D サンダーブレード』および、後述する『~アーカイブス(1)』をもって「完了」とされていたが、日本でのリリース後に海外展開を開始する際、「かつて世界規模で評価を得たジェネシス(メガドライブ/MD)ソフトも追加リリースしたい」というオファーがあったため、「第2期の追加」という名目で開発・リリースが決定された。
2015年、このオファーを受けMDソフト移植作のリリースを開始、同年7月には『3D ソニック・ザ・ヘッジホッグ2』をリリースした。
また、シリーズ展開当初は、背景とキャラクターの階層を分けているスクロール面が少なく、3D立体視化に手間がかかるという理由から、セガ・マークIII作品の移植はしないつもりだったが、最終的には手作業で3D立体視化を行う形で、『ファンタジーゾーンII』といったマークIII作品もラインナップに加えられた。
『セガ3D復刻アーカイブス3 FINAL STAGE』には下記4タイトルが新規収録される。
アーケード版の移植 ターボアウトラン エイリアンシンドローム
メガドライブ版の移植 コラムス サンダーフォースIII 『サンダーフォースIII』は元々「テクノソフト」社のゲームだったが、2016年9月にセガがテクノソフトの全ゲーム版権を取得、クレジット表記も「©SEGA」となっている。
これに加え、セガ・SG1000用2作品がシークレットボーナス収録される。
チャンピオンボクシング 初作『セガ3D復刻アーカイブス』のプレイ履歴を読み取るとロックが解除され遊べるようになる。
ガールズガーデン 第2作『セガ3D復刻アーカイブス2』のプレイ履歴を読み取るとロックが解除され遊べるようになる。