在日米軍
沿岸警備隊は、空軍横田基地内に沿岸警備隊極東支部(U.S. Coast Guard Activities Far East)が置かれている。過去には南鳥島、硫黄島などにロラン局や通信所が置かれていた。
在日米海軍(US Naval Force Japan, USNFJ)は、横須賀海軍施設(神奈川県横須賀市)に司令部がある。日本に展開するアメリカ海軍部隊の部隊管理を管轄しているが、作戦指揮権はない。
横須賀海軍施設(Fleet Activities Yokosuka, FAC3099、神奈川県横須賀市):米第7艦隊空母機動群の事実上の母港
厚木航空施設(Naval Air Facility Atsugi, FAC3083、神奈川県綾瀬市・大和市)及び岩国基地(山口県岩国市):第5空母航空団(空母艦載機本拠)
佐世保基地(Fleet Activities Sasebo, FAC5029、長崎県佐世保市):第7艦隊の強襲揚陸艦群の事実上の母港