行徳湿地
行徳湿地では夏場に成層化が起こり、暗渠水門付近では低層に貧酸素水塊が発生しやすくなっている。行徳湿地連携検討調査(影響予測調査)によれば、成層化そのものの解消のためには浚渫で作られた深みそのものを埋め戻すことが必要であるとしている。また、同検討調査では、海水交換を増大させるには千鳥水門の増設が効果的であり、増設により海水交流量は2倍、干潟面積も3倍程度に増大するとしている。なお、海水交換率は千鳥水門が95%暗渠水路が5%程度(総量1潮汐で33万トン)、水位変動幅は最大A.P.+0.8m~+1.7mとなっており、水門増設時には最大A.P.+1.9m程度を想定している。
しかしながら、暗渠水路が直径が1.8mでA.P.0の位置に管の中心があるなど、暗渠水路や千鳥水門は高い位置でしか外と繋がっておらず、重たい塩水が一旦湿地内に流入すると表層水と混ざりにくく、成層化が起こりやすい構造にある。上層水と下層水が混ざるような策を講じなければ、成層化そのものの解消には繋がらないが、実現可能な具体策は見出されていない。