第1輸送隊
2002年(平成14年)3月12日:輸送艦「おおすみ」、「しもきた」により「第1輸送隊」が新編、自衛艦隊隷下に編入。
2003年(平成15年)2月26日:輸送艦「くにさき」が就役し隷下に編入。
2004年(平成16年)4月8日:「第1エアクッション艇隊」を新編。
2006年(平成18年)4月3日:第1輸送隊が護衛艦隊隷下に編成替え。
2016年(平成28年)7月1日:第1輸送隊が掃海隊群隷下に編成替え。