立体配座選択
リボソームは複雑な分子機械であり、翻訳過程でタンパク質を合成するために、mRNAのコドンをそれに対応するtRNAの対を解読する必要がある。この解読には、多くの類似した競合相手の中から正しいtRNAを正確かつ迅速に選択する必要があり、適合度を決定する主要な要因となっている。ほとんどの結合イベントは不一致のtRNA(非同族tRNA)によるもので、リボソームはできるだけ早くそれらを拒否して結合部位を解放する必要があることを留意しておく必要がある。同時にリボソームはタンパク質合成プロセスを進めるために、適合するtRNAの結合を十分な時間維持する必要がある。tRNA解読は重要であるにもかかわらず、現代のリボソームが特に解読時に行う「大きな構造変化」が、解読器としての課題に適応した結果なのか、それとも他の制約による結果なのかは、最近まで不明であった。最近の研究では、競合するtRNA基質を最適に識別し、tRNAの解読を最適化するエネルギーランドスケープ(エネルギー地形)を導き出した。最適なランドスケープは「対称的」である(図の説明を参照)。この研究で、原核生物のリボソームで測定されたランドスケープが、実際に対称的であることが示された。このモデルは、解読中のリボソームとtRNAの構造変化が、このような最適なtRNA解読器を得るための手段であることを示唆している。このように、相同組換えとtRNA解読の両方が「立体配座選択」を利用していることから、この機構は分子認識系で広く利われている汎用的な機構であることが示唆される。
立体配座選択(りったいはいざせんたく、英: conformational selection)または立体構造校正(英: conformational proofreading)は、分子認識系の一般的な機構であり、分子認識系とその標的との間に構造的不一致またはエネルギー的障壁を導入することによって、認識の特異性と質を向上させる。立体配座選択はエネルギーを消費しないので、どのような分子認識系でも利用することができる。立体配座選択は、認識系が多くの類似した競合相手から適切な標的を選択しなければならない場合に特に有効である。