統合戦争
統合政府発足直前の2000年7月(2001年1月、2001年5月とも)、世界各地で紛争や内乱が勃発。以後、各地の反体制組織のネットワークは「反統合同盟」と呼ばれ、軍事的に圧倒的優位な統合軍に執拗なゲリラ攻撃を仕掛けた。戦局は長期化し、オーバーテクノロジーの優位を活かす統合軍に対し、反統合同盟もその秘密を奪わんと南アタリア島で修復中のSDF-1をたびたび襲った(第一 - 第三次南アタリア島防衛戦)。この戦闘では統合軍極東方面軍の司令官、早瀬隆司准将(早瀬未沙の父親)が前線指揮を執り侵攻部隊を撃退。准将はこれらの軍功が認められ、のちに統合軍総司令部の最高幹部(提督)にまで昇進する。