ハコボーイ!&ハコガール!
一定方向に発射され地面やハコに刺さる「ブロックミサイル」が登場するワールド。ブロックは一定時間経過後に消滅する。全7ステージ。
これまでのシリーズ本編作品はニンテンドー3DS向けに3作品が発売され、当初は前作の『さよなら! ハコボーイ!』で「三部作完結編」とされていたが、本作はそれから約2年ぶりの新作となる。
本作は、ハコ(箱)を出す能力を持つ正方形のキャラクター・キュービィまたはキューシィを操作する従来システム同様の「ひとり旅 編」のほか、キュービィ、キューシィ2体を共に操作する2人同時プレイ対応の「ふたり旅 編」、体が長方形のキャラクター・キューディを操作する「たてなが 編」の3編で構成され、シリーズ最多となる270ステージが収録されている。
ばねが配置されたワールド。全5ステージ。
操作キャラクターやハコを跳ね飛ばすばねが配置されたワールド。スイッチ切替時のみ作動するものもある。全7ステージ。