久大本線
この区間は由布院駅 - 大分駅間直通を1時間に1本(日中2時間ほど開く場合あり)、向之原駅 - 大分駅間の区間運転列車を1時間に1本、交互に運行するダイヤをベースとして、朝に豊後国分駅 - 大分駅間、夕方以降に庄内駅・向之原駅 - 大分駅間の区間運転列車を1-2時間に1本設定し、合わせて1時間に1本 - 2本の列車が運行されている。また、豊後森駅・日田駅 - 大分駅間を直通する列車も運行されている。
ワンマン運転の場合、向之原駅 - 大分駅間では駅員配置の有無に関係なく車内精算を行わない(都市型ワンマン運転)。なお、この区間はSUGOCAでの運賃支払いができる。
2015年3月14日のダイヤ改正からは亀川発向之原行きとして日豊本線からの直通列車が設定されたが、2018年3月17日のダイヤ改正で再び廃止されている。
また、ワンマン列車に限り湯平駅・由布院駅において、車内での次駅放送・到着放送時に英語放送が流れる。
キハ40形・キハ140形・キハ47形・キハ147形 - 普通列車用。2020年3月12日をもって運用終了。
客車 1990年代にJR他社が快速「海峡」を除いて定期運行の普通客車列車をすべて廃止したあとも50系・12系を使用した客車普通列車を運行していたが、豊肥本線熊本駅 - 肥後大津駅間の電化に伴う気動車の玉突き転配により、1999年12月4日のダイヤ改正で気動車に代替され消滅した。
機関車 前記の客車列車の牽引用にDE10形ディーゼル機関車が使用されていた。1956年から1970年までD60形蒸気機関車が多く使用されていた。
キハ58・65による急行「由布」
「TORO-Q」キハ65
大分駅に到着したキハ31
キハ183「ゆふDX」旧塗色
キハ183「ゆふDX」新塗色
久大本線普通列車用として車掌室設置改造が施された12系オハ12形客車
キハ147(善導寺駅)、2017年九州北部豪雨に伴い久留米-光岡間で充当された。
1928年(昭和3年)12月24日:久大線として久留米駅 - 筑後吉井駅間が開業。南久留米駅・御井駅・善導寺駅・筑後草野駅・田主丸駅・筑後吉井駅が開業。
1931年(昭和6年)7月11日:筑後吉井駅 - 筑後大石駅間が延伸開業。筑後千足駅・筑後大石駅が開業。
1932年(昭和7年)3月12日:筑後大石駅 - 夜明駅間が延伸開業し、夜明駅が開業。
1934年(昭和9年) 3月3日:夜明駅 - 日田駅間が延伸開業し、日田駅が開業。 6月25日:光岡駅が開業。 11月15日:日田駅 - 天ケ瀬駅間が延伸開業。豊後三芳駅・豊後中川駅が開業。大湯線(大分駅 - 天ケ瀬駅間)を久大線に編入。
1937年(昭和12年)6月27日:宮原線の開業により久大線が久大本線となる。
1950年(昭和25年)1月1日:北由布駅が由布院駅に改称。
1953年(昭和28年)6月26日:昭和28年西日本水害により壊滅的な被害を受け運休、8月8日復旧。
1957年(昭和32年)3月15日:杉河内駅が開業。
1970年(昭和45年):久大本線での蒸気機関車の運用が廃止され無煙化。
1984年(昭和59年) 1月20日:天ケ瀬駅 - 大分駅間に列車集中制御装置 (CTC) を導入。 2月15日:久留米駅 - 豊後三芳駅間にCTCを導入。
1987年(昭和62年)4月1日:全線の貨物営業が廃止、国鉄分割民営化により九州旅客鉄道が承継。
1988年(昭和63年) 3月13日:古国府駅が開業。 3月15日:路線愛称を「ゆふ高原線」とすることが発表される。
1989年(平成元年)3月11日:豊後国分駅が開業。
1990年(平成2年)5月1日:筑後千足駅がうきは駅に改称。
普通列車はすべての駅に停車。特急列車の停車駅については「ゆふ (列車)」を参照。
線路(全線単線) ... ◇・∨・∧:列車交換可、|:列車交換不可