縦貫線 (北段)
区間車 基本的には基隆 - 新竹、苗栗間を運行し、七堵や樹林、彰化、斗六発着などもある。 一部列車はほぼ1時間おきに蘇澳駅へ直行運転。蘇澳新駅(発車のみ)、宜蘭駅、福隆駅、菁桐駅、瑞芳駅発着も設定し、縦貫線では概ね樹林発着である。
西部幹線対号列車 基本的には屏東、高雄~七堵、基隆間を運行。 一部列車は鳳山駅、嘉義駅、斗南駅、斗六駅、竹南駅(到着のみ)、沙鹿駅、彰化駅、新烏日駅、瑞芳駅(発車のみ)、双渓駅、蘇澳駅、花蓮駅、台東駅、知本駅発着もある。
万華から板橋の総延長15.3kmを地下化する事業は1992年9月14日に着工し、板橋調車場に代わる樹林調車場(中国語版)は1997年3月14日に、万華・板橋の両地下駅は1999年7月21日に供用された。