六花亭
下記店舗のほかに北海道内の百貨店や総合スーパー・スーパーマーケットなどにもテナント形式で出店している。また、直営店には一部の店舗を除いて「喫茶室」を併設しており、軽食などを提供している。
帯広地区
帯広本店 - 帯広市西2条南9丁目6
西三条店 - 帯広市西3条南1丁目1-1
六花亭ガーデン - 帯広市西22条南2丁目21-9
札幌・道央地区
札幌本店 - 札幌市中央区北4条西6丁目3-3
円山店 - 札幌市中央区南2条西27丁目
神宮茶屋店 - 札幌市中央区宮が丘474-48
福住店 - 札幌市豊平区福住2条5丁目1
真駒内六花亭ホール店 - 札幌市南区真駒内上町1丁目
札幌北店 - 札幌市北区北31条西4丁目2-1
森林公園店 - 札幌市厚別区厚別東5条4丁目
百合が原店 - 札幌市東区北50条東15丁目6-12
小樽運河店 - 小樽市堺町7-22
苫小牧店 - 苫小牧市しらかば町6丁目15-27
釧路地区
春採店 - 釧路市春採3丁目19-1
鶴見橋店 - 釧路市昭和町2丁目20
旭川・富良野地区
旭川豊岡店 - 旭川市豊岡12条6丁目62
神楽岡店 - 旭川市神楽岡8条2丁目1-15
カンパーナ六花亭 - 富良野市清水山
函館地区
五稜郭店 - 函館市五稜郭町27-6
漁火通店 - 函館市金堀町9番18号
小樽運河店(2011年11月)
カンパーナ六花亭(2010年7月)
かつて存在した店舗
新川店 - 札幌市北区新川3条7丁目 札幌北店開店のため2020年10月31日閉店。
北大エルム店 - 札幌市北区北21条西8丁目3-5 2022年11月7日閉店。