チャド湖
チャド湖及びシャリ川、ロゴーヌ川を利用した周辺諸国での大規模な灌漑が挙げられる。特にナイジェリアは移住を奨励して周辺人口も増大したが、水の利用効率は極めて低かった。こうした影響で、シャリ川からの流入量は1960年代以前の平均年間400億トンから150億トンに減少している。
加えて砂漠化の最前線に立地しており、近年の気候変動(地球温暖化による)の影響も無視できない。ただし、この点に関しては2001年に『The Journal of Geophysical Research』で発表された研究では否定されている。
また植生地域ができたことで、過放牧が行なわれ湖周辺の砂漠化も懸念されている。
このように消滅の危機に瀕しており、チャド湖流域委員会などによる監視が続けられている。しかし関連諸国の経済事情、政情が不安定などにより有効な対策はとられていない。また、残された水がどの国に帰属するかも問題の一つになっている。