魔法少女イスカ
この世界とは別の次元に存在する異世界、フィオルシカアジルにて猛威を振るっていた存在である魔王が、その世界の魔法使い達の手によって滅ぼされた。
奇跡的な幸運によって魔王の恐怖は消え去ったかに思われたものの、魔王の魂は完全には滅んでおらず、魔法使い達はその魂を細かく砕いて魔石として形にし、その魔石を魔王復活を目論む魔王の配下である魔族達に奪われぬよう人型の存在=魔女の内に隠し、こことは別の世界に逃げるよう仕向けた。
こうして様々な世界や時代の人間社会にまぎれた魔女の一人であるイスカは、魔族とのある戦いで自分にこの世界での暮らし方を教えてくれた先輩魔女の魔石を見つける。
魔女にとって魔石は命と同義であり、それを見つけたことの意味するものは、姉と慕った先輩魔女の死であった。
自分一人で生きていくことになったイスカは、ある街で偶然一人の少女と出会う。その少女、柏木つみきとの出会いから、この物語は始まる。