ポリアデニル化
多くのコード遺伝子は複数のポリアデニル化部位を持つため、3' 末端が異なる複数のmRNAをコードしているといえる。代替ポリA化は3' 非翻訳領域の長さを変更するため、それが含むmiRNA結合部位も変更される。転写産物を安定化するmiRNAもあるが、miRNAは翻訳を抑制し、それが結合したmRNAの分解を促進する傾向がある。代替ポリA化はコーディング領域を短縮し、別のタンパクを作ることもあるが、3' 非翻訳領域の短縮よりは珍しい。
ポリA化部位の選択は細胞外からの刺激に影響される他、ポリA化酵素の発現にも依存する。例えば、マクロファージのリポ多糖(免疫応答を起こす細菌分泌物)への反応として、切断刺激因子(CstF)(英語版)のサブユニットCstF-64の発現が上昇する。この結果ポリA化部位が変更され、防御タンパクmRNA(例えばリゾチームやTNF-α)の3' 非翻訳領域の調節エレメントが除去される。このようなmRNAは長い半減期を持ち、より多くのタンパクを作る。ポリA化機構以外のRNA結合タンパクもポリA化部位の選択に影響し、例えばポリA化シグナルの近くをDNAメチル化する、などの方法で行われる。