土岐頼徳
同兵食談では「森(森林太郎)軍医監が真正な方法で行った兵食試験の結果、米飯が最も養兵に適する。米飯は何の害があるのか、米飯に比べて消化に悪く腐りやすい麦飯は何の益があるのか、これを学問上実験上確定しなければ貴重な我が国軍隊の食料を変更できない。」とし、脚気問題から敢えてずれた意見を述べている。
しかし、海軍を始めとする批判は続き、台湾軍内部で麦飯支給により脚気が仮に収まることは医務局として重大な責任問題に繋がることから、脚気問題自体の有耶無耶化を石黒は図り、2代目総督府陸軍局軍医部長石阪惟寛は罷免後陸軍省医務局付けを命じられていたが1896年(明治29年)5月4日付けで休職を命じ、土岐頼徳に対しては罷免の日付すら資料上明確でなく同年5月10日に帰京したことが確認され、すぐに休職扱いとされた。また、台湾兵站軍医部長であった伍堂卓爾はマラリアに罹り内地転送となっていたがあらためて同年4月1日付けで休職扱いとされた。以後、台湾からの報告上も脚気報告は除かれ、陸軍医務局内では石黒が編纂委員長を勤めた日清戦争(明治二十七八年役)における「陸軍衛生事蹟」において土岐の台湾勤務は記載すらなく、また土岐台湾総督府陸軍軍医部長時代の兵站軍医部長を勤めた藤田嗣章の記録では「(石坂)台湾総督府陸軍軍医部長の後任は暫く欠員で、私(藤田)が前職の儘部長職を代行した」と記され、土岐の台湾での存在自体が抹消された。
1885年(明治18年)1月、東京大学医学部教授緒方正規は脚気病原菌説を発表したのに対して、海軍軍医の高木兼寛は脚気の原因が食事にあると反論したのに対し、当時陸軍軍医監であった石黒忠悳は緒方による脚気病原菌説を支持した。同年3月28日、高木は『大日本私立衛生会雑誌』に脚気原因説(たんぱく質の不足説)と麦飯優秀説を発表したが、細菌学全盛の時において理論法則の構築優先のドイツ医学を範とする東大・陸軍省医務局は高木説など歯牙にもかけていなかった。
日清戦争当時、陸軍では脚気の流行が大きな問題となっていた。とりわけ日清戦争後新領土となった台湾に派遣された軍内部で脚気が大流行していた。その様なおり、初代台湾総督府陸軍局軍医部長には森林太郎が就いたが、森は石黒同様にドイツ医学を範とする東大・陸軍閥の中枢におり、高木の説には一切耳を傾けず陸軍主食を麦飯を排除した米食至上主義を貫いていた。その結果台湾軍内部の脚気病は更に蔓延の一途を辿り、世間の批判も大きく1895年(明治28年)9月僅か在任3ヶ月余りで更迭され、後任には陸軍医務局で石黒に継ぎ序列第2位の石阪惟寛が就任した。石阪は実践に加え、海軍で脚気が麦飯給与により大幅に減ったことも知っており、石黒の「兵食の基本は従来通り『白米飯と貧質きわまる副食』」とする命令に従いつつも、内密に麦飯を給与する部隊があっても目を瞑り見てみぬ振りをしていたが、軍全体の脚気流行を止めることはできなかった。