バラタナゴ
地域の農家と協力し、稲作にため池の水を活用する環境のもとで外来生物の影響を排除し、ニッポンバラタナゴ・ドブガイ類・ヨシノボリ類を毎年安定的に再生産させることに成功している。ほかに、「かがわタナゴ倶楽部」は木田郡三木町内に16区画の飼育池を造成し、香川県産のニッポンバラタナゴ3集団を繁殖させているとともに、当地で繁殖池を活用した環境学習やため池に侵入したタイリクバラタナゴの防除活動にも取り組んでいる。「香川県環境森林部みどり保全課」は、ニッポンバラタナゴ保護事業計画を2009年に策定した。
長崎県では、「佐世保市環境部環境保全課」が、県内唯一の生息地の保護に地域住民と協同して取り組んでいる。生息個体数推定の結果、2008年度は約6,700個体、2009年度は約23,000個体の生息が認められたという。あわせて、佐世保市内の2河川でニッポンバラタナゴの生息が新たに確認された。九十九島水族館「海きらら」では、佐世保市の個体の人工繁殖に取り組んでいる。
天皇は、2007年12月20日の記者会見で「ニッポンバラタナゴは日本の淡水魚の中で最も絶滅の危機にあるものと思います。」と述べた。その上で、タイリクバラタナゴとの交雑を避けるため、大阪府八尾市産の個体群を赤坂御用地で、福岡県多々良川水系産の個体群を常陸宮邸内の池で、それぞれ1983年以来飼育・研究に供していることに触れた。
なお、ニッポンバラタナゴを系統保存している主な施設は以下の通りである。
さいたま水族館
新江ノ島水族館
三重大学大学院生物資源学部水圏資源生物学研究室
滋賀県立琵琶湖博物館
近畿大学農学部環境管理学科水圏生態学研究室
大阪府水生生物センター
神戸市立須磨海浜水族園
姫路市立水族館(2011年7月2日に再オープン)
マリンワールド海の中道
Rhodeus ocellatus kurumeus Jordan and Thompson, 1914 ニッポンバラタナゴ
Rhodeus ocellatus ocellatus (Kner, 1866) タイリクバラタナゴ
2001年、両亜種は遺伝的に大きく異なることが明らかになったため、両者の分類学的再検討が必要であると指摘されている。
絶滅の危機に直面しているニッポンバラタナゴを保護する取り組みが、各生息地で始まっている。
保護にあたって考慮すべき条件として、指摘されているものを列挙する。
保護活動は、ニッポンバラタナゴの生息地で行う。
ニッポンバラタナゴが産卵する、ドブガイ類などのイシガイ科の二枚貝が繁殖できる環境にする。二枚貝の生息には、餌となるケイソウ類が豊富に含まれ、溶存酸素量が十分確保された水質と、砂泥底から泥底の底質が必要である。なお、二枚貝の他水域からの移殖は、貝内仔魚の残存による国外・国内外来種のタナゴ類(タイリクバラタナゴ・オオタナゴ・カネヒラ等)の非意図的な侵入を招く恐れがあるので、原則行わない。
ドブガイ類は幼生(グロキディウム)期に、ヨシノボリ(トウヨシノボリなど)属などの底生魚の鰭に寄生し成長する。したがって、ドブガイ類の繁殖には、これら底生魚の存在が不可欠である。
前2項をまとめると、「ニッポンバラタナゴ・ドブガイ類・ヨシノボリ類が、同じ場所で繁殖できる環境」が要求されるのである。
オオクチバス、ブルーギル(ニッポンバラタナゴを捕食)・タイリクバラタナゴ(ニッポンバラタナゴと交雑)・アライグマ(ニッポンバラタナゴ・ドブガイ類を捕食)・アメリカザリガニ、ヌートリア(ドブガイ類を捕食)などの外来生物の侵入を防止する。生息している場合は、適切な方法で防除する。コイもドブガイ類やニッポンバラタナゴの稚魚を捕食するため、生息状況を調査し、適切な管理を行う。
サギ類やカワウによる、ニッポンバラタナゴ・ドブガイ類の捕食に注意する。サギ類は水位減少時の魚類・二枚貝の捕食が、カワウは魚類の捕食がそれぞれ多く見られる。