フラワータウン駅
島式1面2線のホームを持つ駅。ホーム有効長は5両、ただし、通常は3両編成の運用のみである。緊急時の代替や、ウッディタウンサティ(現在のイオンウッディタウン店)開業など多客時に4両編成が入線したこともある。 ダイヤの関係により稀にこの駅ですれ違う。
駅ビルは7階建てで改札口が1階に見えるが、実際はホームが1階で改札口は2階の扱いになっている。 隣接するフローラ88ショッピングセンター(イオン三田店)2階と駅ビルの3階が連絡通路で接続されているが、その連絡通路の先には近隣のスーパー1階やホテル2階と段差なく行き来できる。
構内売店が設置されていた頃もあったが、2015年2月現在は撤退している。
ホームへのエレベーターが一つ設置されている。
神戸電鉄の方向幕には、当駅が中間駅になった現在でも『フラワータウン』の表示が残っている。