国民社会主義地下組織
ムントロースとベーンハルトのキャンピングカーで多数の銃器が押収された。特に重要だったのは、2007年のハイルブロン警官殺人から盗んだ銃であった。焼失したチェーペの住協の残骸では9丁の拳銃とライフル、サブマシンガンが押収された。2011年11月11日、連邦検察局は記者会見で、ピストルのうちのひとつは、移民の連続殺人に使われたチェスカ製の銃であった。2000年から2006年まで続いた連続殺人事件で使われたチェスカ製CZ 82(ドイツ語版)と.32ACP弾は特別版であり、55丁しか製造されていない。そのうち24丁はスイスのゾロトゥルン州に、31丁はシュタージに納品されたものだった。
2004年に連邦刑事局は、スイスで珍しい弾薬と消音装置について調査していたが、しかし犯行に使われた凶器については調査されず、トルコ系の購入者だけが調べられた。2010年にまず、「スイス全土の銃器店の所在について解明する」ための行政間支援(ドイツ語版)というスイス当局の名目で、犯行に使われた凶器についての調査が行われた。起訴状によると、住宅にはたくさんの弾薬があり、そのうちのいくつかは、お菓子棒の袋のなかに保管されていた。合計では2.5kgの黒色火薬、20丁の銃火器(うち2丁はマシンガン)、1,600個のカートリッジおよび弾薬部品があった。
トルコ外務大臣アフメト・ダウトオールもそれを要求していた。トルコの日刊紙サバ(ドイツ語版)は、カールスルーエにある連邦憲法裁判所で傍聴席の件に対して憲法異議(ドイツ語版)の申請を行った。連邦憲法裁判所は、2013年4月12日に、ミュンヘン地方上級裁判所が「犠牲者に関係する外国メディアの代表に適切な数の傍聴席」を与えるよう命令を下した。どのように傍聴席を個別に調整するか、憲法裁判所は指定していない。その2日前にNSU裁判の傍聴席の配分がうまくいっていないことを認めていた。
2013年3月、殺されたEnver Şimşekの娘であるSemiya Şimşekは、父親が殺された後のドイツでの経験を描いた『辛い故郷』という本を出版した。ニュルンベルクでは2013年3月21日、NSU犠牲者の記念碑が建てられた。
2013年4月13日、NSU訴訟(ドイツ語版)が始まる予定の2日前に、数千人がレイシズムに対するデモを行うと同時に、連続殺人の被害者を追悼した。その日の夜に、バイエルン難民委員会(ドイツ語版)の建物で、おそらくネオナチによる犯行と思われる器物破損があった。その数日後にも再び、難民委員会の建物と被害者の弁護士アンゲリカ・レックスの事務所、ローザ・ルクセンブルク財団の建物で器物損壊があった。警察はそれぞれの事件には関連性があると話している。その数日後に、3人が一時的に逮捕された。2013年5月、フェイスブックで、NSUの犯行を賛美した「Paulchen Panther – NSU is watching you」という名前のNSUのファンページが作られた。
2011年12月1日に連邦検察局と連邦刑事局は、記者会見のかたちで公開捜査(ドイツ語版)を開始した。NSUの活動に関する情報、とくにNSUと結びつきのあった事件の黒幕や協力者の情報を得ることが目的であった。そのために連邦刑事局は無料電話相談窓口を設置し、ホームページに犯人や事件に関する写真も公開した。
2012年7月2日、連邦憲法擁護庁の長官ハインツ・フロム(ドイツ語版)は、捜査の失敗が続いたため、NSUについての情報を処分した責任を取って、辞任を申し出た。連邦内務大臣ハンス=ペーター・フリードリヒ(ドイツ語版)(CSU)は、その申請を受理した。
2012年7月3日、チューリンゲン州内務省のガイベルトは、チューリンゲン憲法擁護庁長官トーマス・ジッペル(ドイツ語版)を仮退職にしたと発表した。2012年7月、被害者の家族は、連邦憲法擁護庁とチューリンゲン州憲法擁護庁に対して公務執行妨害(Strafvereitelung)で刑事責任を追及した。
2012年7月11日、ザクセン州憲法擁護庁(ドイツ語版)の長官ラインハルト・ボース(ドイツ語版)は、NSUの捜査の失敗の責任を取り、辞任した。
2012年9月13日、ザクセン=アンハルト州憲法擁護庁長官フォルカー・リンブルク(ドイツ語版)も退任したことが明らかになった。
2012年11月、ベルリン州憲法擁護庁の長官クラウディア・シュミット(ドイツ語版)は、当局でも違法な文書破棄があったことを認めた。シュミットはその事実を公表した直後に辞任した。
当局は、余罪の捜査も始めている。とくに、2000年7月27日のデュッセルドルフ爆弾テロ(ドイツ語版)に関連している可能性がある。1998年12月19日に起きたハインツ・ガリンスキー(ドイツ語版)の墓への爆弾テロ事件にも、関与の疑いが掛けられている。1999年3月に起きたザールブリュッケンのドイツ国防軍展(ドイツ語版)への爆弾テロ事件、2002年3月16日に起きたベルリンのユダヤ人墓地軍用道路(ドイツ語版)への爆弾テロ事件の調査も始まった。2008年2月にルートヴィヒスハーフェン・アム・ラインで9人のトルコ系住民が火事で命を落としたが、その事件の調査も新たに始まった。当時は、外国人敵視のテロ行為であるという線は除外されていたので、捜査は中断となっていた。チューリッヒで2001年6月7日にラビのアブラハム・グリュンバウム(ドイツ語版)が殺害された事件にも関与の疑いが出たため、スイスでもこの事件に関する捜査が始まった。
検察局と警察は、いくつかの証言に基づいて、ザクセン州、テューリンゲン州、メクレンブルク=フォアポンメルン州で起きた12件の郵便局・銀行支店の強盗事件も捜査している。1999年10月6日から2011年9月7日に起こったアルンシュタット、ツヴィッカウ、ケムニッツ、シュトラールズントの強盗事件にも同様の疑いがかけられている。その際、犯人たちは従業員に重傷を負わせている。1998年12月18日、NSUはケムニッツのスーパーマーケットを襲撃した可能性がある。16歳の人が逃走中に頭部と胸を撃たれている。強盗で得た資金の一部は寄付された。NSUは特にファンマガジン誌(ファンツィーネ(ドイツ語版))『白い狼』と姉妹誌『旗手』を支持していた。