都営バス巣鴨営業所
以前は足立流通センター終点までの運行だったが、2003年より一部を埼玉県との県境に近い舎人二ツ橋へ2代目里48乙系統として延伸し、2005年に需要の高さから足立流通センター経由に変更・増発、江北六丁目団地折返し以外のほぼ全てを舎人二ツ橋発着とした。この舎人二ツ橋発着便は方向幕をオレンジ色に、LEDの場合は系統番号を反転表示としており、これは舎人二ツ橋停留所の見沼代親水公園駅前への改称後も続けられた。
出入庫便は、巣鴨駅 - 西日暮里駅を草63系統の経路(団子坂下経由)ではなく不忍通り経由(上富士前・動坂下経由)で運行し、西日暮里駅 - 日暮里駅間は回送となる。方向幕は往復共に緑色で、系統番号の表示はなかった。LEDの表示器では、特に変わった色ではない。この出入便はみんくるガイドに記載されていない。なお、出入庫便は2014年3月31日をもって廃止となった。
足立区郊外と都電荒川線・山手線・千代田線の駅を直結する路線のため、終日需要が高く、全線に於いて高頻度運行がされていた。深夜バス(深夜04系統)の運行も平日の下り便は日暮里駅発基準で24:30以降まで運行されていた。
2008年3月30日に当系統とほぼ同一区間を並行して結ぶ日暮里・舎人ライナーが開通し、見沼代親水公園駅が舎人二ツ橋停留所付近に開業、停留所名も見沼代親水公園駅前となった。
その後1971年3月に滝野川営業所へ移管され、滝野川営業所および同昭和町分車庫の統合・移転で1980年4月に北営業所へと引き継がれたものの、志村営業所廃止の1982年3月には巣鴨営業所の担当に落ち着く。一部の便は西巣鴨で乗務員が交代する。
草63系統は43系統として運行していた路線を、1972年の系統番号整理で、草63系統となった路線である。当初は大塚営業所の管轄であった。西巣鴨から巣鴨駅前・西日暮里駅前を経由、荒川区役所前付近で草64系統と合流し、大関横丁で再び別経路を辿って浅草寿町を終点とする(復路は雷門一丁目始発)。池袋駅東口 - とげぬき地蔵前は特に需要が多く、巣鴨営業所の最寄であることから出入庫便も存在するため、当区間の折返し便が早朝を除く全日に多数運行されている。浅草側からも巣鴨駅発着の出入庫便が一部で運行される。池袋駅東口における乗り場の位置の都合上、池袋駅東口10番乗り場は経由せず、次はHareza池袋である。
草64系統も同じく池袋駅東口と浅草を結ぶ路線だが、草63系統が巣鴨駅 - 荒川四丁目で比較的狭い道を走行するのに対して、明治通り(尾久駅・新三河島駅)経由で走る。また、一部出入庫運用として浅草雷門南 - とげぬき地蔵前系統便が設定されている。
このため、2000年12月12日の大江戸線全線開業を機に王子駅 - 駒込駅南口および御茶ノ水駅 - 東京駅丸の内北口(東22乙系統の所管も江東営業所に変更となった。後に東20乙系統として臨海支所に移管)の両端の運行を廃止し、駒込駅南口 - 御茶ノ水駅間の運行となった。
2007年3月26日より、秋葉原駅中央口ロータリーへの乗り入れを開始(このときに万世橋停留所が復活している)。当初は日中のみであったが、後に夕方以降の乗り入れも開始した(朝は従来通り御茶ノ水駅発着)。湯島一丁目、神田明神前の両停留所は朝の御茶ノ水駅行きのみ経由し停車する。
なお、かつての茶51甲系統は外神田二丁目 - 東京駅八重洲口(→東京駅丸の内北口)間で歩行者天国実施区間を通るため、歩行者天国実施時間帯は小川町駅・日本銀行前経由で運行していた。一部区間は1990年まであった東71(現・高71)系統と同一だった。
2008年4月には2000年12月に廃止された区間のうち、茶51乙系統が運行されていた駒込駅 - 王子駅間に北区コミュニティバス「Kバス」(王子・駒込ルート)が開業、茶51甲系統が運行されていた須田町・万世橋 - 東京駅丸の内北口間にS-1が開設され、曲がりなりに廃止区間が復活している。