ウィリアム・フィップス
1692年の5月14日にボストンに戻った時、フィップスは、マサチューセッツ湾直轄植民地が魔女裁判の興奮で手がつけられなくなっているのに気づいた。この年の2月に、125人以上の人々が魔女狩りで逮捕され、新政府の発足もまだなされないまま、牢につながれていた。5月27日、フィップスは、このたまりにたまった懸案を公聴するため、特別に刑事犯採決の場を設け、副総督のウィリアム・ストートンを主審判事に任命した 。この悪名高き裁判は幻覚による証拠を認め、法律顧問へ告訴するのを認めず、このような証拠により多くの人々が有罪の判決を受けた。
1692年の9月に裁判は終わったが、フィップスの妻を始め、かなり明確な態度を示す人々への非難を含む告発と逮捕が続いた。フィップスは最終的に、裁判を中断して審理に終止符を打ち、1693年の5月に魔女と思われて逮捕された人々約150名を釈放した。