オンタリオ湖での戦闘
8月7日、アメリカ軍戦隊はナイアガラ川河口沖でヨーの戦隊に遭遇した。両戦隊は慎重な操艦を繰り返して数日を費やした。チョウンシー側は長射程砲を持っている利点があり、長距離から交戦できる晴天を待ったが、ヨー側はカロネード砲を持っている利点があり、荒天での接近戦を望んだ。8月8日夜、突然のスコールでアメリカ軍のスクーナーハミルトンとスカージが転覆し、沈没した。これらスクーナーに乗船していた72名の内、53名が溺れた。
8月10日、イギリス戦隊が風上にあった。チョウンシーはその戦隊を2列に編成した。6隻のスクーナーをイギリス軍に近い戦列に、重量級の艦船を遠い風下の戦列に置いた。イギリス戦隊が接近すると艦砲の撃ち合いになった。午前11時半、チョウンシーは風上側の戦列に風下側に舵を切らせ、重量級艦船の風下に付くよう命令した。先頭を行っていたグロウラーとジュリアのスクーナー2隻が方向転換に失敗し、チョウンシー戦隊と切り離された。チョウンシーはこの2隻のスクーナーを救うために風上に向かうよりも風下に退くことを選択し、ヨーがチョウンシー本隊を追跡することを期待していた。しかし、ヨーは孤立した2隻に攻撃を集中し、両艦を捕獲した。
オンタリオ湖西端の占領に関わっている間に、ヨーがイギリス海軍の465名の水兵と士官を伴ってキングストンに到着し、イギリス戦隊の指揮官に着任した。公用と軍隊の事情でたまたまキングストンにいたプレボストとその指揮下の部隊を乗船させ、直後の5月29日には第二次サケッツ港の戦いでアメリカ軍基地を襲った。これは戦略的に大胆な攻撃だったが、ヨーもプレボストも慎重になり過ぎ、固い抵抗に遭って攻撃を中止した。アメリカ軍は捕獲していたデューク・オブ・グロスターと、建造中だった重スループ・オブ・ウォージェネラル・パイクに早手回しに火を付けていたが、イギリス軍が撤退したときに火を消すことができた。デューク・オブ・グロスターと大量の物資が破壊されたが、ジェネラル・パイクは救われた。
チョウンシーは急ぎサケッツ港に戻り、ジェネラル・パイクの完工を待ってそこに留まることになった。アメリカ軍がオンタリオ湖での動きを止めている間に、ヨーの戦隊はナイアガラ半島のアメリカ軍をジョージ砦まで追い返す動きを支援し、大量の物資を捕獲または破壊した。7月1日、ヨーは小さなボートでサケッツ港を襲うことで、艤装中のジェネラル・パイクを破壊しようとしたが、脱走兵がアメリカ軍に通報する可能性を怖れて攻撃を中止させた。
チョウンシーの戦隊は7月21日に完成した。まずオンタリオ湖の西端にあるイギリス軍の防衛拠点バーリントン・ハイツを襲おうと画策したが、守備隊の備えができていることが分かり、リスクを冒せなかったので、その代わりに再度ヨークを短期間占領したが、あまり損失を与えられなかった。先の攻撃で略奪した資産を返還することまでやった。
セオドア・ルーズベルト(およびその後の著作家達)はアメリカの全体的戦略が攻勢だったので、オンタリオ湖のアメリカ軍はキングストンに対して攻撃するリスクを取るべきだったのであり、あるいはチョウンシーは機会があればヨーの戦隊に対して総攻撃をかけるチャンスを求めるべきだったと論じた。チョウンシー(および陸軍のディアボーンやウィルキンソンなど指揮官)はその逆に繰り返しキングストン攻撃を避け、一方で1813年9月28日にヨーク湾で戦った後もヨー戦隊を破壊するまで追撃できなかった。イギリス戦隊がサケッツ港を攻撃した後、チョウンシーはヨーの艦船以外の標的に対する作戦を常に妨げていた。より多くの艦船ができるのを待って港の中に閉じこもるか、戦隊を使って他の場所(例えばナイアガラ半島)での陸軍の攻撃を支援しようとはしなかった。
対照的に、イギリス軍の郡政府長官プレボストによる戦略は、戦争の大半で防衛的であり、ヨーは敗北を避けるだけで良く、これには成功したと論じられてきた。しかし、C・S・フォレスターやJ・マッケイ・ヒッツマンのようなイギリス(およびカナダ)の歴史家は、他の作戦が縮小されたり、頓挫したりする犠牲のうえにヨーはこれを成したと論じている。例えば、ヨーが人員や物資を貯めこんだこと、エリー湖の戦隊に十分な資源を送らなかったことは、その完全な敗北に繋がった。同様にオンタリオ湖で戦艦を建造することに要したよりも、シャンプレーン湖でははるかに小さな努力しか払われていたが、それでもシャンプレーン湖でイギリス軍が勝利していたかもしれない。
戦争を終わらせたガン条約の後、別にラッシュ・バゴー条約と呼ばれる盟約が1817年に調印され、五大湖で維持される戦闘艦の数と戦力を制限した。オンタリオ湖では、イギリスもアメリカもそれぞれ1隻を就役させ、総トン数は100トン以下、大砲数は18ポンド砲1門とされた。他には武装艦を建造できず、既にある艦船は解体されることとされた。
実際に既存の艦船の中で僅かなものが解体された。イギリスは「石のフリゲート」と呼ぶ倉庫を建設してマスト索具など艤装を保管した。この建物はカナダ陸軍士官学校ハドソン戦隊の寄宿舎として現存し、現在もその名前で呼ばれている。理論的には数日の内に全戦隊を就役させることが可能だった。しかし、1827年までに全ての艦船が腐朽し、就役できなくなった。この倉庫は1834年に競売され、残っていた艦船はその後の数年間で廃棄処分となった。キングストン近くの海軍湾に沈められたものもあった。
アメリカの戦隊も直ぐに使えなくなった。建造されたときに生木を使い塗装も粗かったので、5年ないし6年しか使えないと認識されていた。1つだけ残ったのが未完成の戦艦ニューオーリンズであり、船台の大きな倉庫に隠されていた。この倉庫が1881年に崩壊し、船の残骸は1883年に売却された。