古河藩
永井家の後、下総国佐倉より16万2000石で入封した。利勝は徳川家康の落胤とする説がある人物で、家康の時代から徳川家に仕え、徳川秀忠・家光の時代に大老・老中として幕政を統括した人物である。古河では家康を縮小したような人物であるとして「小家康」と称された。利勝は家臣団編成と組織の構成に尽力し、天守閣(ただし江戸の将軍=天守様という事から「御三階櫓」と称して天守の呼称は使わなかった)の造営などを行なって藩政の基礎を固めた。
利勝の嫡男で第2代藩主の利隆は暗愚だったと伝わり、若年寄罷免に始まり、およそ藩主にふさわしくない不行跡が多かったという。
孫の土井利益のとき、志摩国鳥羽へ移封(本来ならば無嗣断絶のところであったが、利勝の功績などから許されて存続した)。
慶長7年(1602年)、上野白井より松平(戸田)康長が2万石で入った。康長は小牧・長久手の戦いから後には大坂の陣まで参戦した武功派重臣の1人で、久松俊勝の娘を正室にしていたことから松平姓を許されていた。古河藩では古河城の拡張(大手門等)、整備を行なっている。慶長17年(1612年)に常陸笠間へ移封となった。雀神社の社殿造営。
堀田家の後は大和郡山より藤井松平家の松平(藤井)信之が入る。信之は貞享2年(1685年)に老中となり、古河藩に移封されて従四位下に叙された。古河藩主になると幕政を批判して弾圧されて蟄居の処分を受けた陽明学者の熊沢蕃山の身柄を預かったが、入封した翌年に死去した。第2代藩主には長男の忠之が相続するが、元禄6年(1693年)に乱心して発狂したとして改易され、身柄は弟信通の大和興留藩に預けられて2年後に失意のうちに死去している。
この改易に関しては、忠之が罪人として預かっていた熊沢から農業政策の指導を受けて藩政に介入させ、熊沢の指導により「蕃山堤」と呼ばれる堤防を築くなど幕府の心証を著しく害してしまい、また忠之が熊沢の扱いをめぐり幕府と対立したため改易に追い込まれたとする説も存在する。