The Flame in the Flood
本作のゲーム内容は、川下りのパートと陸地での探索パートの2つに大別される。前述のように、川の構成はプレイごとに変化する。
川下りのパートではいかだを操作し、基本的に画面手前から奥の方向へ進んでいく。川岸や川の中域の孤島には拠点の桟橋が点在しており、いかだを近づけると停泊してスカウトが陸地へ降り立つ。また、拠点の一種である整備場では特定の素材を用いていかだの機能を強化したり地形等にぶつかった際に減少するいかだの耐久力を回復させたりすることができる。なお、耐久力が0になるといかだが沈みスカウトが溺死する。
陸地での探索パートではスカウトを操作する。陸地では植物の採取や野生動物の捕獲、災害廃棄物の取得などで素材を集める。素材はそのまま使用できる物もあるが、複数の素材を組み合わせる「クラフト」で新たなアイテムを生成できる。焚き火や作業台でクラフトを行った時のみ生成可能なアイテムもある。アイテムはスカウトのリュックに収納されるほか、犬やいかだに預けることもできる。なお、犬の所持アイテムは、オプション設定の変更により次回の新規プレイ時に持ち越せるようになる。
スカウトには「空腹」「水分」「体温」「疲労」の4つの基本ステータスがあり、体温以外は常時、体温は気温低下時やずぶ濡れ状態の時にゲージが自然減少する。ゲージは各種アイテムの使用やシェルターでの休養で回復できるが、いずれかのゲージが尽きると死亡する。また、野生動物から攻撃を受けた際の裂傷・骨折や不衛生なものを口にした際の食中毒など、様々なステータス異常も存在する。一部は自然治癒するが、それ以外は放置すると悪化していき最終的に死に至る。