熊本大学
教育学部附属幼稚園
教育学部附属小学校
教育学部附属中学校
教育学部附属特別支援学校
総合情報統括センター
グローバル教育カレッジ
政策創造研究教育センター
eラーニング推進機構
くまもと水循環・減災研究教育センター 合津マリンステーション(熊本県上天草市の天草上島)
先進マグネシウム国際研究センター
生命資源研究・支援センター
エイズ学研究センター
環境安全センター
埋蔵文化財調査センター