日本の両生類一覧
キタサンショウウオ属 Salamandrella Dybowski, 1870 - 1種 キタサンショウウオ Salamandrella keyserlingii Dybowski, 1870 - 【北】 / 【LC】 / 【準絶】
【北】; 北海道、【本】: 本州、【四】; 四国、【九】; 九州、【島】;島嶼 / より詳細に分布を説明する場合には()内に記載
他にも興味深い分布をする種としては、中国に広く分布するアジアヒキガエルが最も近縁な群と考えられている宮古諸島固有亜種のミヤコヒキガエル や、奄美大島、徳之島、沖縄島、石垣島及び西表島に分布し、隔離された島嶼間における種分化(異所的種分化)の結果であると考えられているハナサキガエル類、ヤエヤマハラブチガエル やアイフィンガーガエル などの八重山諸島と台湾に分布する種などがあげられる。海水を苦手とする両生類が移動・分散するためには、大陸との陸橋の形成が不可欠であり、琉球列島の成り立ちを検討する上では欠かせない。その一例として、太田・高橋(2006)は、九州、琉球列島の島嶼群及び台湾、大陸に分布する両生類相の類似度を野村・シンプソン指数で求めているが、琉球諸島はまず「宮古諸島・八重山諸島グループ」と「奄美諸島・沖縄諸島グループ」にグルーピング化され、「宮古諸島・八重山諸島グループ」は「台湾」に類似し、ついで「宮古諸島・八重山諸島・台湾のグループ」と「大陸」が近似、さらに「宮古諸島・八重山諸島・台湾・大陸のグループ」と「奄美諸島・沖縄諸島」が近似し、最後に「奄美諸島から大陸のグループ」が「九州」と類似するという結果となった。爬虫類でも概ね同様な結果を得ており、この類似度が単純に地域間の歴史的関係を反映しているとの前提であれば、「九州」と「奄美諸島から大陸のグループ」の間が先に分断され、ついで上記と逆の順に、陸橋が分断されていった事を示唆している。
また、最大の両生類であり、国の特別天然記念物のオオサンショウウオ や、両生類の中では珍しく、陸上に産卵するという特徴をもったイボイモリ などの遺存種が、本州中部や琉球諸島に生息することも日本の両生類相の特徴として挙げられる。
カエル類(無尾目)では、北海道から本州、四国、九州にかけて生息するものは、分布域が広く、アカガエル類等の北方起源のものが多いとされている。個々の種を見てみると、本州から四国、九州に生息するものはアマガエルのように広く分布する種もいれば、ニホンヒキガエルとアズマヒキガエルのように亜種で日本の東西に分かれる分布を示すものもいる。また、カエルの代表格であるトノサマガエルに注目すると、近縁なダルマガエルの2亜種のうち関東地方に分布する亜種トウキョウダルマガエルとは異所的な分布を示すのに対し、瀬戸内地方に分布する亜種ナゴヤダルマガエルとは同所的に分布するという亜種間で異なった様相をみせる。タゴガエルは、本州に広く分布する亜種タゴガエルと、隠岐諸島固有のヤエヤマハラブチガエル、屋久島固有のヤクシマタゴガエルの3亜種に、島嶼間で区別される。このように種によって独特な分布パターンを示す。一方で琉球列島においては、渡瀬線より南のトカラ列島以南著しく分化しており、さらに、中琉球(トカラ海峡とケラマ海峡に挟まれた琉球列島中部。奄美諸島や沖縄諸島等が含まれる。)にしか分布しておらず、琉球列島南端の八重山諸島においても近縁なものが確認されていない種が多いことが特徴的である。