マグノリアベーカリー
2003年にはマグノリアベーカリーのストアマネジャーだった店員を中心に、また別のカップケーキ店であるビリーズ・ベーカリーが立ち上げられた。ビリーズ・ベーカリーはトム・クルーズ夫妻やリンジー・ローハンが訪れる人気店となった。マグノリアベーカリーはやがて『セックス・アンド・ザ・シティ』の観光ツアーにカップケーキを提供するだけの余裕がなくなってツアーから降りることになり、ツアー向けのカップケーキ提供はビリーズ・ベーカリーが行うようになった。同じく2003年にはバターカップベイクショップの元店員がシュガー・スウィート・サンシャインを立ち上げ、さらにクラムス・ベイク・ショップも開店するなど、カップケーキを主力とする店が多数作られた。この時期にニューヨークで流行したカップケーキはおおむね「ふわっとクリーミーなアイシング」が特徴であった。
1号店の外観とカップケーキは2005年12月の『サタデー・ナイト・ライブ』オンライン短編 "Lazy Sunday" にも登場した。2006年の映画『プラダを着た悪魔』にも登場している。
2006年にアリッサ・トリイはマグノリアベーカリーをスティーヴ・エイブラムズに売った。その後、マグノリアベーカリーは1号店をはじめとして、アメリカ合衆国の内外に支店を拡大した。2011年にCEOのエイブラムズは、1年に3店ほど新規開店を行う計画があると述べ、海外への事業拡大のためフランチャイズ加盟者と協働するつもりだと付け加えた。
アメリカ合衆国においては2022年5月22日時点でニューヨーク、シカゴ、ロサンゼルスに店舗がある。2015年にハワイ州のホノルルのフランチャイズ店がアメリカで初めて座ってテーブルでフルサービスを受けられるマグノリアベーカリーレストランを作った。この店は2016年に閉店した。
マグノリアベーカリーのアメリカ国外における最初の店は2010年にオープンしたアラブ首長国連邦のドバイ店である。ドバイ・モールに出店した。
2014年には東アジアの1号店として日本の表参道に支店ができた。6月16日、神宮前5-10-1のGYRE地下1階にて開店した。2010年代前半は原宿・表参道地域にアメリカに本店を有するスイーツチェーンの支店が多数出店して人気を博しており、マグノリアベーカリーもそのうちのひとつであった。日本支店についてはフード・プラネットのグループ会社であるスイートスターが運営を行っていた。表参道のマグノリアベーカリーは「N. Y.のセレブ御用達」という触れ込みであり、ニューヨーク本店のレシピを使用して全て店内で作っていた。オーブンやミキサーなどの調理器具もアメリカと同じものを使用していた。ただし材料については日本のものを使用しているところがあり、そのため日本に支店を開店するまでに時間がかかったという。「見た目のかわいさと、片手でも食べられる手軽さが売り」であった。「アメリカの家庭的な味」が女性を中心に人気を博した一方、カップケーキを「職人が目の前で美しくデコレーションする姿」も人目を引いた。9席からなるイートインスペースもあったが、テイクアウトでの販売をメインとしていた。開店からしばらくの間は行列ができる大人気ぶりであった。