化学データベース
化学構造をデジタルデータベース上に実装する方法として、大別して2つの方式が存在する。
連結テーブル/接合マトリックス/リストを骨格として結合の様式(角度)や原子(節点)の属性を追加する方法 例) MDL 社の MOL, PDB, CML 記法等
深度優先あるいは幅優先リスト構造を基にした文字列化表現 例) SMILES 記法、SMARTS 記法、SLN 記法、WLN 記法
これらの方式を元に、立体化学の違いや有機金属化合物で見られるような特殊な原子価を表現し分けられる様に改良が加えられている。コンピュータが扱う表現形式で最も重要な評価すべき点はデータのサイズや検索時間の増加傾向とフレキシブル検索が可能であるか否かという点にある。