生理学研究所
2017年5月現在、以下の4つの研究領域と4つの研究施設及び技術課を有している。
研究系 分子細胞生理研究領域 生体機能調節研究領域 基盤神経科学研究領域 システム脳科学研究領域
研究施設 研究連携センター 脳機能計測・支援センター 行動・代謝分子解析センター 情報 処理・発信センター 動物資源共同利用研究センター
また、動物実験センター、生命創成探究センターとも連携している。経理など管理業務は岡崎統合事務センターで行われている。 総合研究大学院大学の大学院生に対する教育も実施している。