藤原氏
鎌倉時代に入ると、藤原氏の嫡流は近衛家(後に首相となる近衛文麿の氏族)・鷹司家(松平信平の氏族)・九条家・二条家・一条家の五摂家に分立した。五摂家が交代で摂政・関白を(豊臣氏を除き)独占し続け、政治の中枢とは隔絶されるが公家社会では幕末に至るまで一定の影響力を持ち続ける。
五摂家以外にも、三条家・西園寺家(後に首相となる西園寺公望の氏族)・閑院家・花山院家・御子左家・四条家・勧修寺家・日野家(浄土真宗の宗祖・親鸞、足利義政の妻・日野富子の氏族)・中御門家など数多くの支流・庶流がある。
また公家の他に、北家の藤原道兼の子孫の宇都宮氏流や、同じく北家の藤原長家の子孫の那須氏流、同じく北家の藤原房前の子・藤原魚名の子孫の藤原利仁、藤原秀郷からは多くの武家も輩出した。
姓の代表的なものの一つとして源氏・平氏・橘氏とともに「源平藤橘」(四姓)と総称された。
中臣鎌足が大化の改新の功により天智天皇に賜った「藤原」の姓が、子の藤原不比等の代に認められたのに始まる。鎌足が中臣氏の出身であるため、祖は中臣氏と同じく天児屋命と伝える。
奈良時代に南家・北家・式家・京家の四家に分かれ、平安時代には北家が皇室と姻戚関係を結んで摂関政治を行った。北家の中でも権勢を誇った藤原道長の嫡流子孫(摂家)は院政期以降も摂政・関白をほぼ独占し、臣下としては最高の家格を保った。藤原氏の一族は、奈良時代から平安時代までは本姓の「藤原」を称したが、鎌倉時代以降は姓の藤原ではなく、「近衛」「鷹司」「九条」「二条」「一条」などの苗字に相当する家名(家格)を名のり、公式な文書以外では「藤原」とは名乗らなかった。これらをあわせると特に朝廷における比率は圧倒的であり、地方に散った後裔などもふくめ、日本においては皇室(およびその流れを汲む源平など)に次いで大きな広がりと歴史を持つ家系である。
十六藤 (じゅうろくとう) - 以下の16の苗字の総称(読みは「とう」または「どう」、人口の多い順)
01佐藤 - 下野国安蘇郡佐野荘
02伊藤 - 弾正台尹
03加藤 - 加賀介
04斎藤 - 斎宮寮頭
05後藤 - 備後国/藤原氏後裔
06近藤 - 近江掾
07遠藤 - 遠江守
08工藤 - 木工助
09安藤 - 信濃国安曇郡
10内藤 - 内舎人
11須藤 - 下野国那須郡
12武藤 - 武者所
13進藤 - 修理少進
14新藤 - 武蔵国新座郡
15神藤 - 諏訪神家
16春藤 - 大和国添上郡春日
十六藤以外で、藤原氏由来とされる苗字。藤を「とう」と読まない場合もある。
江藤 - 肥後国飽託郡大江
衛藤 - 衛府
海東(海藤) - 尾張国海東郡、羽前国西田川郡温海村
紀藤 - 紀伊国
岡藤 - 駿河国志太郡岡部
左藤 - 左衛門尉
信藤 - 信濃国埴科郡
首藤 - 主馬首
周藤 - 周防国
尾藤 - 尾張守
兵藤 - 兵衛府