山形大学
Accel Link 米沢
JAZZ研究会
アカデミーストリングス合奏団
アカペラサークルLien
吾妻祭実行委員会【大学祭】
囲碁・将棋部
音楽サークル 青い空
ギターマンドリンクラブ
競技麻雀研究会
グリークラブ
軽音楽研究会
劇団スピリッツ
国際交流サークルYUICY
茶道部
ジャグリングサークル
書道部工学部支部
人力飛行機研究会(クラフト・パル)
吹奏楽団
聖書研究会
ソフトウェア開発研究会
地学研究会
文芸部
編入生サークル
マイクロコンピュータ研究会
漫画研究会
無線研究会
模型サークル
ゆきんこ
ロボタスティクス
技術開発系サークルMOT!
写真サークルTAKE!
折り紙同好会「山折」
SCITAcenter@米沢
鶴岡キャンパス
前述のように、山形県内各地にキャンパスを有する。小白川キャンパスと鶴岡キャンパスはおよそ100km離れており、国公立大学の中では北海道教育大学や信州大学に次ぐ距離がある。医学部・工学部・農学部は1年次は小白川キャンパス、2年次は各々のキャンパスへ移動する。留年や教養科目を規定単位以上修得できない場合は半期留年という形で残ることもある。
小白川キャンパスには人文学部と理学部の前身である山形高等学校 (旧制)があり、米沢キャンパスには工学部の前身である米沢工業専門学校、鶴岡キャンパスには農学部の前身である山形県立農林専門学校があった。山形師範学校は小白川キャンパスに近い、現在の山形北高等学校の場所にあったが、小白川キャンパスに移転している。医学部は新制大学になってから一県一医大構想により新設されたため前身となる旧制の学校は存在しない。
山形県の政治・経済の中心である山形市に旧制山形高校と山形師範学校、米沢織の歴史を持ち繊維産業が盛んだった米沢に米沢工専、農業が盛んな庄内地区に山形農専を設置するなど、地域の特性を活かした形で高等教育機関が設置されていた名残である。