生物学の哲学
我々の人種やセクシャリティやジェンダーについての生物学的理解は、いかに社会的価値を反映しているか?
自然選択とは何か?それは一体どのように働くのか?
医者はどのように病気について説明するのか?
言語や論理はどこから生じてきたのか?
生態学は医学とどんな関係があるのか?
生物の哲学者の中でも、より哲学志向の強く経験的志向の弱い哲学者たちは、認識論や倫理学、美学や人類学、それに形而上学についてさえも、これらの抱える根本的な問題が、生物学によって自然科学的な解答を与えられることを望んでいる。 その上、生物学の進歩は社会に人間の生命のあらゆる側面に係わる伝統的価値について再考をせまっている。たとえば人間の幹細胞に遺伝子操作を行う可能性が生まれたことで、特定の生物学的技術が倫理的な合意をどのように侵害し得るのかについて、長い論争が生じた(生命倫理の項を参照)。もっと明確な哲学的問いが存在するが、生物学の哲学者たちが取り組んでいるものには次のような問いがある。
「生命とは、何か?」
「人間を、その独特な人間なるものにしているのは、何か?」
「道徳的思考の基礎は、何か?」
「審美的判断に私たちが用いている要因は、何か?」
「進化は、キリスト教やその他の宗教体系と両立するか」
形而上学と哲学分野における理論から得られる見解が、バイオインフォマティックスの分野で活躍する生物学者によりだんだんと使われ始めている。推測や調査をするのに論理的で使いやすいデータの体系を作るために、遺伝子オントロジーといったオントロジーの分野は、モデル生物を用いた生物実験の根拠を得るために用いられている。遺伝子オントロジー自体は、種間の関係を論理的に分類するものである。