FC中津
1969年に大分県立中津工業高等学校のOBチームとして創立。1974年に九州サッカーリーグ(以下、九州リーグ)に昇格し、翌1975年から1980年までの6年間で5度のリーグ優勝を果たすが、その後は低迷し2度の大分県リーグへの降格も経験した。
2012年の大分県リーグ1部で優勝を果たし、九州各県リーグ決勝大会で2位となった。2013年1月20日に九州リーグ9位のMSU FCと入れ替え戦を行い、4-1で勝利。13年振りに九州リーグに昇格した。同年、クラブ名を「FC中津」に変更した。
以降6年に渡り九州リーグに在籍し続けたが、2018年はPK戦による4勝、90分間では未勝利と低迷し、リーグ戦最下位となり大分県リーグ1部への降格が決まった。
2019年の大分県リーグ1部では、8チーム1回戦総当たりの前期リーグを5勝1分1敗とし得失点の差で首位で折り返す。得失点差をリセットして行われた4チーム1回戦総当たりの後期上位リーグでは2勝1敗で、耶馬渓FCに勝点で並ばれたものの得失点差で優勝。大分県代表として出場した第43回九州各県リーグ決勝大会で優勝し、1シーズンで九州リーグ復帰を果たした。
2021年の九州リーグでは2勝16敗の10位に終わる。同年は日本製鉄大分が参加を辞退したため入替戦および自動降格は無しという規定であったが、翌2022年の開幕前に九州リーグを脱会したことが判明。同年は大分県リーグの最下部にあたる4部Aパートに所属。
2022年、大分県リーグ4部Aパートで全勝優勝。2023年は県リーグ2部に飛び級昇格となった。