大塚ホールディングス
アース製薬(大塚製薬と大塚製薬工場が株式を保有) アース環境サービス
ネオス(大塚ウエルネスベンディングが株式を保有)
リボミック
ニチバン(大鵬薬品工業が株式を保有)
大塚HDの大株主である大塚エステート(本店:大塚化学本社内)、大塚アセット(本店:徳島県鳴門市)は大塚家の資産管理会社のためグループ会社には含まれない。
また、アース製薬は完全子会社としてバスクリンや白元アースを傘下に持っているが、これら2社については同社のグループ会社としてはカウントされていない(この2社は“持分法適用会社であるアース製薬の連結子会社”のため大塚ホールディングスの連結対象からは外れる)。