トラファルガー戦役
11月の始めには、連合艦隊は壊滅同然となった。2隻の戦列艦がフィニステレで失われ、トラファルガーの海戦とその後の嵐で21隻を失い、オルテガル岬でも4隻が失われた。これらの海戦では、イギリス艦は1隻たりとも失われなかった。フランスやスペインの手中に残された多くの艦は損傷が激しく、しばらくは任務に用をなさなかった。イギリスは勝利によって、この19世紀のほとんどにおいて、海上の確固たる支配権を獲得し、イギリスの貿易を確実なものとし、大英帝国を維持することができた。ナポレオンが、陸軍同様に自ら先導したフランス海軍の相次ぐ失敗は、フランスによるイギリスへの侵攻を実現させなかった。すでに侵攻計画は何度か先送りされてはいたが、フィニステレでのヴィルヌーヴの完敗、ロシュフォールとブレストの艦隊の連携の決定的な失敗は、ナポレオンに計画を破棄させ、東への遠征の方を選ばせた。双方合わせて74艦を動員したトラファルガーの海戦は、ナポレオン戦争では最後の大規模な海戦であった。これ以降は、一番大きな規模の戦闘であっても、12隻以上の規模での戦闘はなかった。1805年以後、フランス海軍の士気は崩壊し、一方でイギリスにより継続中の港の封鎖は、彼らから能力と意志とを奪い去ったその何年か後、ナポレオンは再びイギリス侵攻計画の可能性を持ち出しはしたものの、誰の関心も惹かず、何の決定もなされなかった。作戦遂行に失敗した海軍の存在はナポレオンを幻滅させ、同時にフランスの指揮官の臆病さと、このフランスに対抗するイギリスの決断力、この2つが、トラファルガー戦役の間中、様々な部分で浮上し、この作戦でフランス海軍は目的も方向性も失ったまま置き去りにされてしまった。
イギリス海軍の様々な艦と司令官たちとによって、フランス海軍は大規模な封鎖を受けており、一方で主力侵攻軍である9万3000人の陸軍4部隊は、ブローニュで待機していた。オランダには、9隻の戦列艦から成るフランスとオランダの戦隊が駐留していたが、こちらはジョージ・エリフィンストーン提督の、11隻の戦列艦から成るダウンズ戦隊が見張りをしていた。両艦隊はいずれも、作戦には参加していなかった。海峡艦隊の主力部隊は15隻の戦列艦で構成されていて、ウィリアム・コーンウォリス提督と副官であるチャールズ・コットン(英語版)中将の指揮の下、ロシュフォール封鎖中のトマス・グレーブズ少将の分遣した5隻の戦列艦の戦隊、また、フェロール封鎖中のロバート・カルダー中将が分遣した8隻から成る戦隊と共に、ウェサン島からアイルランド沿岸までを巡回していた。イギリス艦隊は、21隻の戦列艦を擁したガントーム提督下のブレスト艦隊、3隻または4隻から成るロシュフォール艦隊、そしてグルドン提督下の4隻と、フェロールのグランダリャナ提督下の8隻の戦列艦から成るフランスの大西洋艦隊に対して、かなり厳しい封鎖を続けていた。
またその後、全軍をヨーロッパに引き上げさせ、ブレストでガントームと合流して侵攻部隊を守るようにとも記されていた。他に、ネルソンがガントームの偵察のためエジプトに向かったともあったが、実際にはその時ネルソンの艦隊はバルバドスまであと2日の位置におり、6月4日にはバルバドスに入港した。ヴィルヌーヴは部隊を召集し、北のアンティグアへと艦隊を推し進めた。6月7日にヴィルヌーヴは軽装備で護送されていたイギリスの商船団を見つけて、翌日その一部の船を拿捕した。乗員の話から、ネルソンがバルバドスに到着していたのを知り、これに憤慨したヴィルヌーヴは作戦の遂行をやめて、もう一度北東をめざし、ヨーロッパに戻ることを決めた。艦隊が出発したのは6月11日で、このことに関して、艦隊に乗艦していた陸軍士官のオノレ・シャルル・レイユ(英語版)はこう書いている。
我々は7000人から8000人もの部隊を連れて海を制覇していたのに、たった一つの島すら攻撃できなかった。
ヴィルヌーヴと、次席指揮官のピエール・デュマノワール・ル・ペレイ(英語版)は、トゥーロンの艦隊に戦闘準備をさせるべく急いだ。ネルソン艦隊はバルセロナの近くに配置されており、ヴィルヌーヴは巡回中のイギリス艦隊に遭わないことを願った。ヴィルヌーヴはトゥーロンから真南に下って、バレアレス諸島の東を通過する予定だったのだ 。ところが、ネルソンは罠を準備していたのである。スペイン沖で自分の艦隊を目撃させておいた後、サルデーニャ南部まで撤退し、ヴィルヌーヴがイギリス艦隊がいると思われる場所を避けようとすると、ネルソン自身のの艦隊にまっすぐ突っ込む仕掛けになっていたのである。
ヴィルヌーヴは3月30日に艦隊を出港させ、イギリス艦アクティブとフィービに監視されており、そしてネルソンの思惑通りに、バレアレス諸島とサルデーニャの間に針路を取った 。しかしこのイギリスのフリゲート艦2隻は、4月1日にフランス艦隊を見失い、同じ日にヴィルヌーヴは偶然出会ったスペイン商船から、ネルソンがサルデーニャ沖にいるのを目撃したと聞かされた。自分が待ち伏せに遭うことを知ったヴィルヌーヴは、バレアレス諸島の西に針路を変えた。