熊毛支庁
熊毛支庁本庁舎 - 〒891-3192西之表市西之表7590番地 総務企画部・保健福祉環境部・農林水産部・建設部 熊毛教育事務所
熊毛支庁屋久島庁舎 - 〒891-4311屋久島町安房650番地 屋久島事務所 熊毛教育事務所屋久島駐在
2001年 - 支庁土木課に管理係、屋久島事務所総務課に農林係を設置し、支庁農林水産課屋久島駐在を廃止。
2002年 - 支庁土木課の道路建設係を、道路建設一係と道路建設二係に改組。
2006年 - 支庁土木課に空港係と建設係を設置し、同課空港建設室を廃止。
2006年 - 屋久島事務所総務課の会計係を廃止。
2007年 - 県の組織機構改革(振興局及び支庁の設置)の一環として、これまでの熊毛支庁及び屋久島事務所を再編し、新たな熊毛支庁と屋久島事務所を設置。支庁総務課と財務課を再編し、総務企画部を設置(部内に総務企画課と県税課を設置)。支庁福祉課と西之表保健所を再編し、保健福祉環境部を設置(部内に健康企画課と地域保健福祉課を設置)。支庁農林水産課、土地改良課、種子島農業改良普及センターを再編し、農林水産部を設置(部内に農政普及課、農村整備課、林務水産課を設置)。支庁建設課を再編し、建設部を設置(部内に建設課を設置)。熊毛支庁屋久島事務所、屋久島保健所、屋久島農業改良普及センターを再編し、熊毛支庁屋久島事務所を設置(所内に総務企画課、保健福祉環境課、農林普及課、建設課を設置)。
2007年 - 上屋久町と屋久町が合併し屋久島町となる。
2009年 - 支庁総務企画部県税課の会計係を廃止。