NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
最もよく知られている複合体Iの阻害剤はロテノン(有機殺虫剤として使われる)である。ロテノンおよびロテノイドはアントニア(マチン科)、デリスおよびロンコカルプス(マメ科マメ亜科)などの植物で生成するイソフラボノイドである。17世紀という早い段階からロテノン含有植物はインディアンによってその魚毒性が用いられたという報告がなされている。ロテノンの他、ピエリシジンAもユビキノンの類縁化合物であり、複合体Iのユビキノン結合部位に強力に結合する。ロテノンまたはピエリシジンのような疎水性阻害剤は、終端の鉄硫黄クラスターN2とユビキノンとの間の電子移動を阻害していると考えられている。ロテノンによる複合体Iの長期組織的阻害はドーパミン作動性ニューロンの選択的変性を誘発することが分かっている。
また、酵素はアデノシン二リン酸リボースでも抑制される。これは酵素のヌクレオチド結合部位での拮抗的阻害である。したがって、NADHの親水性類縁体とユビキノンの疎水性類縁体はこの酵素の最初と最後で電子の伝達を阻害している。
最も有力な複合体Iの阻害剤はアセトゲニン類である。アセトゲニンは、キノンの結合に不可欠であることが提唱されているND2サブユニットに交差結合することが示されている。アセトゲニンの一つ、ロリニアスタチン2は、ロテノンと結合部位が異なることが分かった最初の阻害剤である。
NADH デヒドロゲナーゼ (ユビキノン) フラボタンパク質1 NDUFV1 – NADH デヒドロゲナーゼ (ユビキノン) フラボタンパク質1, 51kDa NDUFV2 – NADH デヒドロゲナーゼ (ユビキノン) フラボタンパク質2, 24kDa NDUFV3 – NADH デヒドロゲナーゼ (ユビキノン) フラボタンパク質3, 10kDa
ミトコンドリアエンコードNADH デヒドロゲナーゼ サブユニット MT-ND1 - ミトコンドリアエンコード NADH デヒドロゲナーゼ サブユニット1 MT-ND2 - ミトコンドリアエンコードNADH デヒドロゲナーゼ サブユニット2 MT-ND3 - ミトコンドリアエンコードNADH デヒドロゲナーゼ サブユニット3 MT-ND4 - ミトコンドリアエンコードNADH デヒドロゲナーゼ サブユニット4 MT-ND4L - ミトコンドリアエンコードNADH デヒドロゲナーゼ サブユニット4L MT-ND5 - ミトコンドリアエンコードNADH デヒドロゲナーゼ サブユニット5 MT-ND6 - ミトコンドリアエンコードNADH デヒドロゲナーゼ サブユニット6