幽霊駅
博物館動物園駅、寛永寺坂駅(京成電鉄本線)博物館動物園駅はのちに整備され、2018年11月よりギャラリーとして出札口までが公開されている(ホームに降りる事は出来ない)。
表参道駅旧ホーム(東京メトロ銀座線)※表参道駅は現在も営業中
新橋駅・東京高速鉄道ホーム(東京メトロ銀座線)※施設自体は留置線並びに東京メトロ事務所として現在も使用中
初台駅(京王電鉄京王線)※初台駅自体は京王新線の駅として営業中
万世橋駅(中央本線・東京メトロ銀座線)※2路線ともに駅遺構が現存する珍しい例
本山駅(鶴見線)
平沼駅(京浜急行電鉄本線)
楓駅(石勝線)※現在においても信号場として現存
大阪ビジネスパーク駅(Osaka Metro長堀鶴見緑地線)現ホーム直上にビル側が準備工事をあらかじめ行っていたものの、法改正やルート変更で使用されなくなっていた例。
別所駅(現在は大津市役所前駅、京阪石山坂本線)兵営前駅として開業した当時のホームのうち片方が移転前の位置に残っている
この他、厳密には幽霊駅ではないが似たような例に以下のものがある。
飯田橋駅旧ホーム (中央本線) ※飯田橋駅は現在も営業中であるほか、旧ホームの一部は現在も東口連絡通路として利用可能
阪神・淡路大震災で被災した神戸市営地下鉄西神・山手線の三宮駅・上沢駅・新長田駅や、神戸高速鉄道東西線大開駅は、運転再開後もしばらく通過扱いになっていた。
そのほかの風変わりな駅としては、ヴォランクシュトラーセ駅(ドイツ語版)がある。ボルンホルマー・シュトラーセ駅(ドイツ語版)と同じように、西ベルリンにより運行されていたSバーンの駅だが国境線すぐ外側の東ベルリン域に位置していた。しかし、ヴォランクシュトラーセ駅は出入口の片側が西ベルリンの通りにあったため、西ベルリン市民が普通に利用することができた。この出入口はちょうど国境上に位置しており、すぐ隣に掲げてある警告掲示が乗客にその事実を知らしめていた。東ベルリンに通じていたこの駅の反対側の出入口は、完全に封鎖されていた。