只見線
2020年(令和2年)3月14日から運用開始。8両全車とも郡山総合車両センター会津若松派出所属。同所所属のキハ40系を全て置き換えた。2022年9月30日までは会津若松駅 - 会津川口駅間で、2022年10月1日以降は全線で運用されている。
新津運輸区(信越本線、磐越西線、白新線、羽越本線、米坂線)で運用されていた車両が転入したものである。
車体色はキハ40系の東北地域本社色のデザインを踏襲した緑色に変更されたが、キハE120-2は全線運転再開を記念した国鉄一般色風のカラーリングに再変更された。
只見線が国鉄再建法による廃止対象から除外された理由の一つが、只見町から魚沼市へ抜ける六十里越道路(国道252号)が積雪により長期間冬季通行止となることにあった(前述)。一方、長らく車両不通区間(点線国道)となっていた只見町から新潟県三条市へ抜ける国道289号八十里越が、2021年(令和3年)4月に今後5か年程度で直轄権限代行区間の全線開通との見通しが示された。この道路は冬季も通行可能とされており、只見町と中越地方の往来において冬季であっても大幅な迂回から解放されることになる。