第4局
第4局に属する各課は、次に掲げる検査を担当する。
文部科学検査第1課 文部科学省 独立行政法人国立特別支援教育総合研究所、独立行政法人国立女性教育会館、独立行政法人国立科学博物館、独立行政法人国立美術館、独立行政法人教職員支援機構、独立行政法人日本スポーツ振興センター、独立行政法人日本芸術文化振興会、独立行政法人国立青少年教育振興機構、独立行政法人国立文化財機構
文部科学検査第2課 文部科学省高等教育局、科学技術・学術政策局、研究振興局 日本学士院、科学技術・学術政策研究所、日本私立学校振興・共済事業団、独立行政法人大学入試センター、国立研究開発法人科学技術振興機構、独立行政法人日本学術振興会、独立行政法人日本学生支援機構、独立行政法人国立高等専門学校機構、独立行政法人大学改革支援・学位授与機構、国立大学法人、大学共同利用機関法人