日本貨物鉄道
札幌貨物ターミナル駅 1棟 隅田川駅 2棟 東京貨物ターミナル駅 11棟 梶ヶ谷貨物ターミナル駅 1棟 新座貨物ターミナル駅 1棟 京都貨物駅 1棟
ジェイアールエフ商事 ジェイアール貨物・不動産開発 東京貨物開発 - ジェイアール貨物・不動産開発に吸収合併 北九州貨物鉄道施設保有 運送保証協会
グループ会社 ではないがJR貨物が出資している。 青い森鉄道 名古屋臨海高速鉄道 肥薩おれんじ鉄道 東京液体化成品センター
ダイヤ改正については3月に実施することが多く、他のJR各社に合わせて実施される。