トカラ馬
奄美諸島へは中世以降、日本在来馬が九州からもたらされた。古くから九州との交流拠点でもあった喜界島が飼育の中心で、昭和時代まで続いた。島嶼での飼育が長期に続いたなどが原因で次第に小型となり、農業では使いやすかった。
2020年、競走馬理化学研究所とネブラスカ大学などのチームが日本在来馬8品種と世界の32品種のDNAを比較した結果、日本在来馬は、モンゴル在来馬の祖先が対馬を経由して輸入され、木曽馬や北海道和種馬(道産子)の北上するグループと、御﨑馬やトカラ馬など南下するグループに分かれ、南西諸島経由で与那国馬まで全国に広がったという。
最後の奄美諸島の日本在来馬としては、1952年当時、徳之島、沖永良部島、与論島に合わせて数頭残っていた。
なお喜界島では明治以降も育馬が盛んだったが、中期以降、外来種との混血を進め、1952年当時は、既に全て雑種となり日本在来馬は絶えていた。