ケネディ大統領の検死
クラーク・パネルやロックフェラー委員会はどちらも、X線写真や検死写真が信憑性に値するのか評価できていなかった。長年にわたって検死写真やX線写真に生じている数多の問題を鑑みて、特別委員会は信憑性の評価こそ調査の最重要な点と考えていた。特別委員会は、法歯学者・法医人類学者・放射線科医などで構成された写真学的証拠パネルの手助けを得て、検死写真やX線写真の信憑性評価を実施した。これらの専門家からは2つの疑問が投げかけられた。
アメリカ国立公文書記録管理局に保存されている検死写真・X線写真は、明確にケネディのものと言えるのか?
これらの検死写真・X線写真が1枚でも改竄されたという証拠はあるのか?
検死写真の対象が本当に大統領であったのかどうか判断するため、法医人類学者たちは、生前の大統領の写真と検死写真を比較した。比較は測定学的側面と形態学的側面の両方から行われた。前者では、写真を通じて顔のあらゆる特徴を測定した。後者では身体的特徴の一貫性を検証したが、その中心は鼻の形や顔の輪郭線など、個人の特徴をよく表すとされるパーツであった(本人固有の特徴が特定されたところで、検死前後の写真を比較し、同一人物であることを確認した)。人類学者たちは更に、生前に撮られた大統領のX線写真と、検死時のものも比較した。
この銃弾は、右肺尖部壁側胸膜と、右上葉肺尖部の挫傷両方を作った。銃弾は右側の舌骨下筋を損傷し、気管を傷付け、頸部前面から出て行ったと考えられる。
ウォーレン委員会報告書で取られた「銃弾はひとつ」説では、弾丸1発が第6頸椎を損傷したと結論付けているが、この結果は耳(乳様突起)の下5.5インチという記述と合致する。ウォーレン報告書では第6頚椎の高さが銃弾の射入口だと結論付けてはいないが、1979年にアメリカ合衆国下院暗殺調査特別委員会(英語版)が作成した報告書ではこの結論が採られた。下院暗殺調査特別委員会の報告書では、ベセスダ海軍病院で撮られたレントゲン写真に第6頚椎の損傷が写っていたものの、ベセスダの検死医たちが見逃したことを指摘している(このレントゲンはアメリカ海軍の医療部隊司令官ジョン・H・エバーソール(英語版)によって撮られた)。
これらの見逃しはあったが、ウォーレン委員会報告書に含まれているベセスダ検死報告書の原典でも、弾丸は肩甲骨上のレベルから肺(壁側胸膜と肺尖部)を抜け、喉頭部下端から出る形で大統領の頸部を貫通したと結論付けている。
1998年7月に再評価委員会が発表したスタッフ報告書では、ベセスダ海軍病院で行われた検死の欠点について強調された。この中では「ケネディの暗殺に関する多くの悲劇の1つは、検死記録の不完全さと、現存している記録が秘密にされているために起こった疑いの目であると書いている。
再評価委員会のスタッフ報告書では、記録に残る頭部写真はケネディのものではなく、ケネディが受けた衝撃より損傷がはるかに少ないと主張している。検死に携わったJ・ソーントン・ボズウェルはこういった主張に反論した。委員会では更に、大きな欠損はなかったと示す写真と矛盾して、検死医やパークランド記念病院のスタッフも含めて大勢が、大統領の後頭部に大きな傷を診ていることを指摘している。委員会とそのメンバーであるJeremy Gunn は、目撃者たちの証言に関する問題として、ひとつの証言を様々な理論の「証拠」にするのではなく、全ての証拠を吟味し、ヒューマンエラーについても考えるよう求めている。
加えて、頭部前方から銃弾が入ったという証拠はなく、そのような銃弾がケネディに当たった可能性も、当たったが証拠を残さなかった可能性も乏しいと結論付けた。
この結論はザプルーダー・フィルムで捉えられていた大統領の動き(狙撃後、頭を後ろに反らしている)と矛盾していると考えられたため、特別調査委員会は創傷弾道学の専門家へ諮問し、弾丸が飛んできた方向とその後の頭部の動きに関係があるならばそれを鑑定してほしいと求めた。この専門家は、大統領の頭部を撃ち抜いた弾丸による神経損傷で背筋が収縮しうるほか、その結果頭部が後屈しうる、と結論付けた。さらにヤギの銃撃などの実験を行い、それを録画して証拠として示した。この結論を得て、特別調査委員会は、ケネディの頭が後屈した現象については、後方から狙撃された事実と根本的には矛盾していないと判断した。
下院暗殺調査特別委員会は、ベセスダ海軍病院で行われた検死そのものと、得られた証拠の扱いについていくつか批判を述べた。
「頭部創の射入口が不正確に記述されていた」こと。
検死報告が「不完全」であり、写真への参照がないまま作成されているほか、大統領背部の銃創の射入口を含め多くの「不正確性」が見られること。
「背部と頸部前面の射入口・射出口はきちんと場所が特定されておらず、互いの位置関係も表されていない」こと。