1988年-1989年のJSL
上位リーグ

下位リーグ・東ブロック

下位リーグ・西ブロック

下位リーグの成績は前期からの累計
下位リーグ順位決定戦

東芝と日立がJSL1部昇格。
NTT関西と藤枝市役所が地域リーグ降格。
マツダオート広島サッカー部(地域リーグ優勝)と京都紫光サッカークラブ(地域リーグ準優勝)がJSL2部昇格。
↑ 試合数・ゴール数は、下位リーグ順位決定戦はカウントしていない