ソニック ヒーローズ
赤い人型E-1000シリーズロボット。シールドで防御したり太いレーザーを撃ってくる強敵。時折小型に変形する。
空中に滞空しているエッグマンのE-1000シリーズロボット。エッグポーンと似た外見をしており、色によって機銃やレーザー、索敵、爆弾投下などの様々な種類がある。
長い腕が付いている敵。プレイヤーを捕獲し、倒すまで捕まったキャラクターをリーダーに出来なくなり、他のキャラクターをリーダーにしても捕まったキャラは付いてこない。
ナックルズ(オメガ)がソニックとテイルス(シャドウとルージュ)を玉のように投げつけ(オメガは弾丸の様に発射する)攻撃する。空中の敵でも攻撃出来る。チームメイトが武器になるため、一人になるとこの技は出せない。
三人が揃っており、リーダーが足場に立っている時に攻撃ボタンを押し続けるとリーダーの後ろにチームメイトが集まり、離すと高速でリーダーを射出する。風を起こす効果もある。
ソロアクション(スピード)
チームメイトを電気の球にして打ち出す攻撃。敵を痺れさせて足止めが可能であり、空中にいた場合は地面に墜落させてダメージを与えられる。敵が複数いる場合はまとめて攻撃できる。レベル1ではダメージを与えられないが、レベル2で直接ダメージが与えられるようになり、レベル3では飛ばした先にあるリングを吸い寄せることができる。
ソロアクション(フライ)