長崎水族館
1963年(昭和38年)5月23日 - 高松宮宣仁親王が来館。1965年7月30日には高松宮妃とともに再び来館。
1964年(昭和39年)3月29日 - 大洋漁業の捕鯨船より提供されたコウテイペンギン1羽が初入館。のちに「フジ」と命名される。
1964年(昭和39年)4月20日 - 閉館する福岡水族館より寄贈されたコウテイペンギン1羽が入館。
1964年(昭和39年)6月16日 - 海水浴場(10,000m)が開設。
1964年(昭和39年)11月20日 - 猿舎・鳥舎・小獣舎などの動物飼育場(3,300m)が開設。長崎近辺に所在しない動物園の機能も備えた。
1965年(昭和40年)6月10日 - 大食堂(550m)、海水浴場桟敷(980m)が開設。
1965年(昭和40年)7月2日 - 三笠宮崇仁親王・三笠宮妃が来館。
1965年(昭和40年)9月2日 - オウサマペンギン「ペギー」誕生。オウサマペンギンの国内初の繁殖成功例となる。翌年5月31日に繁殖賞を受賞。
1965年(昭和40年)11月12日 - 長崎国際文化センター建設計画の全事業が完成。翌13日には秩父宮妃が月桂樹を記念植樹。
1966年(昭和41年)8月12日 - オウサマペンギン「ペル」誕生。(オウサマペンギンの国内繁殖2例目)
1967年(昭和42年)8月19日 - オウサマペンギン「エンビ」誕生。(オウサマペンギンの国内繁殖3例目)
1968年(昭和43年)4月27日 - 海洋探検館(400m)が開設。
1982年(昭和57年)7月23日の長崎大水害では浸水や停電の被害を受けた。
夕刻からの集中豪雨で園内が浸水し、周囲より低地にある本館1階も午後7時40分頃に浸水。屋外池では錦鯉などが流失した。午後8時頃には停電し、直後に本館1階の水位が1.2mに達した。1階・電気室の自家発電機も冠水で24時間後まで稼働不能となり、水系循環が停止して水槽で飼育中の魚類が多数死亡した。1階・水産科学展示室でも展示品が水没、散乱した。1階・ペンギン室にも排水逆流による浸水が生じ、ペンギンたちは暗闇の中濁水を泳いでいた。真夏の長時間に渡る停電により室温は上昇し、コウテイペンギンなど極地性ペンギンの健康への影響が懸念されたが、国道34号や長崎バイパスの不通で長崎市街方面との交通が途絶した中、諫早方面の隣町で確保した角氷を手押し車でリレーするなどして運び込ぶことで凌いだ。
7月24日には水が引いたものの、園内および本館内に残された膨大な泥土の除去作業に追われ、7月31日まで臨時休館した。水族館駐車場の一部が復旧作業用の資材置場として利用された。長崎バイパスは8月3日に、国道34号は8月20日に復旧した。8月中の入場者数は過去3年間平均の31%に落ち込んだ。