バイキンメカ
初登場回 - TV第484話A「ばいきんまんとかびるんるん」
家出をしたかびるんるんの代わりとして作られた、かびるんるん型のメカ。ラジコン操作で動き、口からカビを吐き出す。ラジコンが壊れて暴走してしまうが、アンパンマンとかびるんるんに退治された。
メカカミキリ虫(メカカミキリむし)
初登場回 - TV第1599話B「アンモナイトくんとさばくのバラ」
バイキンUFOからの変形ロボット。バイキンUFOを円盤部分が分厚くなった胴体で大型化し、巨大な腕部と脚部をつけたような外見をしている。「バイキンUFOロボ」と呼称されることもある。腕部をドリルや巨大な刀、ハンマーなどに換装させたり、腕部の代わりに側面部からマジックハンドを出すなど、多くのバリエーションがある。
1号(1ごう) 初登場回 - TV第424話A「ばいきんまんとちびぞうくん」 球型の手の先から水鉄砲を出して攻撃する。パワーはあるが足が弱い。
2号(2ごう) 初登場回 - TV第503話A「ユッキーとSLマン」 手の先を改造して物がつかめるようになったロボット。手がペンチ型と、マジックハンドと同じ五本指のパターンがある。バイキンマッチョロボの中では登場頻度が多い。「バイキンロボ」と呼称されることもある(TV『どんぶりまんトリオとドクダミ夫人』『アンパンマンとローズヒップちゃん』など)。大砲型の水鉄砲や大型ハンマーなど、バイキンUFO同様の武装を用いることもある。
宇宙船アンパンマン号を攻撃するための宇宙飛行用のバイキンUFO。鼻から『バイキンスペースパンチ』を発射する。バイキンUFO同様、マジックハンドやバイキンハンマーで攻撃することもできる。
改造UFO・バイキングII世(かいぞうユーフォー・バイキングにせい)
1号(1ごう) 初登場回 - TV第600話「メロンパンナとオーロラの子馬」 アンパンマンを倒すために改造されたバイキンUFO。通常時よりもパワーアップしており、海賊を模した追加装甲を施されている。スペシャルエアバッグ『アンパンチトメルンダー』でアンパンチの衝撃を吸収・無効化してはじき返し、テニス用ラケットで打ち落とす。新しい顔に取り替えたアンパンマンをも苦戦させたが、ユニコーンの子供・スピカの角でエアバッグを引き裂かれ、トリプルパンチに敗北した。
2号(にごう) 初登場回 - TV第611話A「アンパンマンとますずしまん」 ばいきんまんを模した頭部とバイキンロボット型の胴体をつけたバイキンUFOからの変形ロボット。ノーズパンチでアンパンマンを吹き飛ばし、反転して新しい顔を叩き落とすなど善戦したが、ますずしまんの笹の葉手裏剣で視界を遮られたところにアンパンマンが新しい顔に取り替えたため、破壊された。
バイキンプリン型UFO(バイキンプリンがたユーフォー)
初登場回 - TV第666話B「プリンちゃんとプリンセス・プリン」
絵バイキンUFO(えバイキンユーフォー)
初登場回 - 映画第21作同時上映「ばいきんまんVSバイキンマン!?」
絵バイキンマンが作った継ぎ接ぎ付きのUFO。見た目はオンボロだが、本物のバイキンUFOよりも強い。
初登場回 - TV第1232話A「うなどんまんと鉄火のコマキちゃん」
セミ型の小型メカ。てんとう虫メカやバイキンクモメカと同様偵察に使われる。
初登場回 - TV第345話A「コーヒーパンマンとかいじゅうモカ」
口の中がコーヒーショップになっているロボット。尻尾のホースでコーヒー湖からコーヒーを吸い上げて、右手の水鉄砲からコーヒーを噴射し、だだんだん型の両足で踏み潰し攻撃を行う。最後はコーヒーパンマンになったアンパンマンのコーヒーパンチに破壊された。なお、バイキン城に戻ったドキンちゃんはコーヒーの飲みすぎで眠れなくなる羽目となった。
初登場回 - TV第713話B「クリームパンダとたのしい夏まつり」
頭が和太鼓、体がだだんだん型のロボット。夏祭りを乗っ取るために作った。
初登場回 - TV第110話A「カッパラスをやっつけろ!」
川や湖を汚すための巨大な河童型の巨大ロボット。河童の皿の部分からゴミをまき散らすほか、レーザー光線銃やマジックハンドなどの武器を出す。水中では素早く動けるが、陸上ではすぐにオーバーヒートしてしまう。ただし、この弱点は後に克服されたのか、再登場後は陸上でも問題なく動いている。水色で、口から水を噴射する同型機も登場した。
初登場回 - TV第922話B「ばいきんまんとなだれおに」
口がドライヤーになっているだだんだん。雪遊びを邪魔するために作った。熱風を吐き出して、雪を溶かす。
初登場回 - TV第1319話「ジャムおじさんとブラックロールパンナ」
カラス型のスパイロボットで、ロールパンナを捜すために使用された。野球をしていたカバオくんのホームランが命中し半壊してしまう。
メカこおり鬼(メカこおりおに)
初登場回 - TV第853話A「カレーパンマンとひなた村」
メカちょうちょ / ちょうちょロボ
初登場回 - TV第724話A「ダテマキマンとあかちゃんまん」
チョウ型のロボット。あかちゃんまんやポッポちゃん等の好奇心旺盛な幼い子供を誘き寄せるために使う事が多い。
メカパクパク竜(メカパクパクりゅう)
初登場回 - TV第761話B「めいけんチーズとパクパク竜」
パクパク竜を模したロボット。たまごの国を乗っ取るために発明された。たまご姫やパクパク竜を除く住人全員とアンパンマンやジャムおじさんたちをアンパンマン号ごと(チーズは飲み込まれる寸前ハッチから転落したため助かった)飲み込んで監禁する。
初登場回 - 2013年TVスペシャル「かがやけ!ブリキッドのクリスマスツリー」
ブリキロボットの体にばいきんまんを模した頭部を付けた巨大ロボット。胸元には青・黄・赤の電飾がつき、また両手は鋏型になっている。背中の2本のロケットエンジンで空を飛ぶ事が出来る。ブリキッドが持ってきたブリキのおもちゃ(実際はブリキのクリスマスツリー)を奪うために作ったが、最後はトリプルパンチで破壊された。
初登場回 - 映画第30作『かがやけ!クルンといのちの星』
ばいきんまんが開発した、バイキンメカの残骸などのゴミを廃棄するためのワープホールで、通った生物を記憶喪失にしてしまう副作用がある。開発当時はばいきんまんもどこに繋がっているか分からなかったが、後にいのちの星の故郷に繋がっていたことが判明する。ばいきんまんのミスで逆流してしまい、いのちの星の故郷にいたクルンをバイキン城にワープさせてしまった。さらにいのちの星の故郷にゴミを撒き散らした事でアンパンマンワールドに黒い星を降らせた原因にもなったが、最終的にはバイスターやゴミと共に消滅した。
初登場回 - TV第219話B「アンパンマンとびっくりカメラ」
初登場回 - TV第56話「アンパンマンとまいごのマイマイ」
ヒトデに怪物のような顔と手足がついたような潜水型のロボット。海底のマイマイ王国を襲い、海を汚すために作ったのが初登場。先が二股に分かれた長い舌と全身から生える大量のトゲが武器。口から渦潮や水流を放出して攻撃することや、回転して空を飛ぶことも可能。頭部の切れ目から、潜望鏡や地震発生装置などを出す。潜水型のバイキンメカとしてはよく利用される。バイキンメカの中ではかなり巨大で、舌でアンパンマン号を絡めとるほどのサイズである。装甲もかなり厚い(初登場時はアンパンチが効かず、再登場時もダブルパンチで吹き飛ばされている)。 オニヒトデメカ 初登場回 - TV第717話「ポッカリ島のしんじゅ姫」 オニヒトデのバリエーション。操縦システムにばいきんまんの動きを反映する機能を搭載しているのが最大の特徴(ダメージもばいきんまんにフィードバックされる)。頭部の切れ目から、鑿や掘削機などを取りだすことができる。脚部の装甲を筋肉のように寄せ上げてパワーを増すこともできるが、その分耐久力は下がっているようで、アンパンチ一発で壊された。
声 - 山寺宏一→三ツ矢雄二
初登場回 - 映画第15作『ルビーの願い』
ブラックロック島のオーロラのしずくを奪うための鳥型のロボット。すいこみどりに似ている。口から相手の首から下をコウモリの翼の黒い小鳥に変える煙型の光線を吐き出す。ウイングと脚部のジェット噴射で空を飛ぶことが出来る。
火口でアンパンマンたちと戦い、カレーパンマンたちを小鳥に変え、尻尾から泥水を発射して、アンパンマンの顔を汚すが、途中でばいきんまんがレバーを壊してしまい暴走を始め、ばいきんまんたちもジャムおじさんたちも小鳥に変えられてしまう。アンパンマンを窮地に追いやるが、オーロラのしずくの力で赤い鳥に変身したルビーの助けで逆転。空中戦の果てに、アンパンチで破壊され、爆風を浴びたみんなは元の体に戻った。『クルンといのちの星』ではバイスターによってよみがえったメカの一体として登場。鳴き声はそれぞれ違っており、前者は「バババ」、後者は「バード!」となっている。
初登場回 - TV第1230話A「ばいきんまんとロールケーキちゃん」
一人乗りの乗用車。バイキン城内を逃げ回るロールケーキちゃんを捕まえる為にばいきんまんが使用した。
ミニミニUFO(ミニミニユーフォー)
初登場回 - TV第1240話A「ハロウィンマンとプリンちゃん」
ばいきんまんがハロウィンマンに変装する際に使用した小型のバイキンUFO。変装した状態でこのUFOに跨り、本物のハロウィンマンのように空中浮遊しているように見せかける。通常のバイキンUFOと同様、マジックハンドを搭載しており水鉄砲を使う事ができる。
初登場回 - 映画第28作「おもちゃの星のナンダとルンダ」
厳密に言えばメカではなく、ばいきんまん本人がおもちゃスティックの力で変身した姿で、ばいきんまんとおもちゃの集合体によって出来たもの。見た目はだだんだんそっくりだが、ボディは真っ黒でピエロを扮した衣装を着ている。アンテナから発射される「バイキンビーム」を浴びたものはおもちゃと化してしまう。最後はルンダのゼンマイの力でパワーアップしたアンパンマンのアンパンチで元に戻り、ドキンちゃんやホラーマン共々吹っ飛んでいってしまった。それと同時におもちゃ化された人々も元に戻った。
初登場回 - TV第1512話B「からくりぐんない海へ行く」
ばいきんまんの触覚のついた頭部に、大量の黒い触手と、4本の吸盤の付いた触手があるロボット。イルカのべソのお気に入りの場所を自分達だけの物にするために用意された。吸盤からのミサイルが武器。触手でべソを捕まえるが、からくりぐんないの潜水艦に取り返されてしまった。今度は潜水艦の方を捕まえるものの、反撃に合いまたもや取り逃がしてしまい、駆けつけたアンパンマンに負けてしまった。
初登場回 - TV第651話A「アンパンマンとコロッケキッド」
バイキンUFOから変形したサボテン型のロボット。力任せのパンチ、キック、踏みつぶしなどで戦う。
初登場回 - TV第52話B「アンパンマンとコロリン谷」
自律行動する鳥型のロボット。コロリン谷の虫たちを大きな口ばしで捕まえる。
虫歯りんご(むしばりんご)
初登場回 - TV第47話B「アンパンマンとくろゆきひめ」
虫歯菌入りの毒薬が仕込んでいるリンゴ。食べると誰でも虫歯になってしまう。
虫ロボット(むしロボット)
初登場回 - TV第229話「ぶんぶん島の大冒険」
ぶんぶん島のレインボー蜂蜜を盗むためのロボット。両手のはさみが武器。
紫ピーマンロボ(むらさきピーマンロボ)
初登場回 - TV第636話B「キャロットぼうやとピーマントリオ」
バイキンUFOが付いた頭部が巨大な紫色のピーマン状になっているロボット。口から泥水やかびるんるんを吐き出して攻撃する。
初登場回 - TV第253話B「アンパンマンとにんぎょのサニー姫」
自律行動するカニ型の潜水メカ。外見はシーボーズ3号に似ている。両手のはさみでカメ吉くんとくじらのクータンを襲ったが、ジャムおじさんの作戦で誤ってサニー姫を脱出させてしまった。
バイキンしょくぱんまん号(バイキンしょくぱんまんごう)
初登場回 - 映画第9作同時上映『しょくぱんまんとにせしょくぱんまん号 - ぼくらはヒーロー(Bパート)』
しょくぱんまん号にそっくりなメカ。ばいきんまんがしょくぱんまんの評判を落とすために造った。本物との違いは、ばいきんまん型の角とヘッドライト、脚の形など。かびるんるんやべろべろまんなどを打ち出す。本物のしょくぱんまん号とすり替え、しょくぱんまんを乗せたまま遠隔操作で暴れさせたが、しょくぱんまんが運転席から脱出。その後正体を現して攻撃を始めたが、ドキンちゃんが持ってきた本物によって踏み潰された。
バイキン人工太陽(バイキンじんこうたいよう)
初登場回 - TV第1041話A「しょくぱんまんとみずうみ姫」
しょくぱんまんたちに仕返しをするために作ったメカ。前は顔のついている太陽、後ろは、多彩なバリエーションで構成されている。かびるんるんが後ろの飛行機のような浮いている台に乗って、その上にある棒に捕まり、横にあるペダルを漕ぐと、顔が回ってオレンジ色になり、太陽のように熱く照らすことができる仕組みになっている。みずうみの国を干上がらせるために使用された。