スコアリング関数 (分子)
スコアリング関数は、創薬や他の分子モデリングアプリケーションで広く使用されている。これらには以下のようなものがある。
バーチャル・スクリーニング - リガンド候補の低分子データベースのバーチャル・スクリーニングにより、興味のあるタンパク質標的に結合する新規の低分子を特定し、創薬の出発点として有用であることを確認する。
De novo デザイン (スクラッチからのデザイン) - タンパク質標的に結合する新規低分子をゼロから設計する。
リード最適化 - スクリーニングヒットの親和性と選択性を最適化する。
スコアリング関数よりも潜在的に信頼性が高く、しかし計算量の多い可能性がある代替策として、自由エネルギー摂動計算がある。