999号
牽引機はC62形蒸気機関車がモチーフとなっている。プレートには原作版や劇場版では48号機、TV版は50号機と描写される。また、エターナル編では多数のコンバージョンがつかず離れず併走しており、緊急時には複数の機関車が合体して出力を上げることがある。
人工知能には外宇宙の遺跡から発見された技術が採用されている。この人工知能は「銀河鉄道の規則に則り、正確に999号を運行するために存在する」とされているが、その割には鉄郎に対し咄嗟に嘘をつく(『C62の反乱』)、車掌と喧嘩した挙句すねて乱暴な牽引になる(『心やさしき花の都』)、自分の行動に後から疑問を抱き車掌に諭される(『ヤーヤボールの小さな世界』)など、感情的になる姿がしばしば見られる。TVアニメでは鉄郎の知人を助ける為に空中戦に介入したこともある(『キリマンジャロの鳥人』)。またプライドが高く、銀河鉄道で最も速いことを誇りとしており、劇場版2作目で幽霊列車(原作では機械超特急)に初めて進路を譲らされた際には、大きなショックを受けていた。
声優はTVアニメ版・山田俊司→戸谷公次、劇場版第2作『さよなら銀河鉄道999』・柴田秀勝、劇場版第3作『エターナル・ファンタジー』・山寺宏一。
ナンバーはC62 48、ヘッドマークが黒地に白(銀)の角の丸い999の文字。デフレクター・炭水車に特段のマーキングは施されていない。
第1作ではボイラ位置がやや低く煙突が長く描かれている。これらの特徴は当時中・大型旅客機で唯一の稼働機であり、スタッフが実車を参考にしたというC57形のものである。
第2作では砂撒管が三本から二本へと減らされてしまっている(砂捲管が二本のC62は現実には存在しない)。一方、シリンダー排気が右側(正面から見て左側)の方が多い。これはD51形以降の本省式密閉型給水温メ器を搭載した日本国鉄型蒸機に共通の特徴である。
アニメでは999号が実際に動輪を動かすため、その動きにも作品ごとに特徴がある。
テレビ版では空転はせず、ドレン排出(シリンダー内に溜まった水および低温低圧の蒸気を捨てる)の後にゆっくりと起動する。ただし、末期などには下記2.のような描写が急発進のシーンなどで描かれることがあった。
劇場版第1作・第2作では、同様にドレン排出後に起動した後、一度空転して再粘着(出力を絞って空転を止めること)させる。
劇場版第3作および「銀河鉄道物語」ではいきなり空転し、そのまま引き出しを行いながら再粘着させる。劇場版はCG処理で描かれた。
実際のC62の動きとして正しいのは1.と思われる。C62は動力逆転器(加減リンクと向心棒を動かす為に逆転機ハンドルが逆転棒の先で圧縮空気で作動するアクチュエーターと繋がっており逆転機ハンドルでそれを制御することにより釣りリンク腕と釣りリンクを経由して向心棒を動かし加減リンクも動かす)を装備しているため、乗員は比較的楽に出力を制御できたからである。ただし毎週放映のテレビアニメという性質上、実際の映像はセル画枚数の抑制もあり、必ずしも上出来とはいえない。2.はC58形等の中型機で起こしやすい現象だったが、C62でも全く起きなかったとは言えないため、おかしくはない。また、劇場版ということで描写を細かく行っており、クオリティはもっとも高いと言えよう。3.は、缶圧(蒸気、ひいては水と燃料)の無駄である上、動輪を傷める原因になるため絶対にやらない。