ゲルミシジン
ゲルミシジンA、BおよびCの生合成は、ゲルミシジンシンターゼ (Gcs) と呼ばれるIII型ポリケチド合成酵素によって行われる。スルガピロンAも、同様にGcsホモログによって合成されると考えられている。Gcsは基質の柔軟性が高く、補酵素Aまたはアシル輸送タンパク質 (ACP) のいずれかのチオエステル結合を介して転位される様々なアシル基を受け入れる。ACPがアシル基のキャリアである場合、触媒効率は10倍高くなる。Gcsの結晶構造は、二量体の相互作用面に余計な40残基の挿入がある以外は、特徴的なIII型の構造を示す。
ゲルミシジンの生合成経路はまだ完全には解明されていないが、実験的証拠から、脂肪酸の合成に由来する出発物質から、以下のような経路を通ると考えられている。
ACPは、補酵素AとACPシンターゼにより、アポ酵素からホロ酵素に変換される。(アシル輸送タンパク質) S-マロニルトランスフェラーゼ (FabD) によって、ホロ型のACPはマロニルCoAとともにマロニル-ACPへ変換される。イソブチリルCoAまたは2-メチルブチリルCoAを用いて、β-ケトアシル-(アシル輸送タンパク質)シンターゼIII (FabH) は脱炭酸重合によりマロニルACPをアシルACP中間体に変換する。アシル中間体はその後、GcsによってメチルマロニルCoAかエチルマロニルCoAともに重合、環化されてゲルミシジンが生成される。