齧歯目
兎形目の姉妹群と考えられており、現生ではこの2目でグリレス類(Glires)を構成する。以前は兎形目を本目に含めることもあった。
伝統的にはリス形亜目・ネズミ形亜目・ヤマアラシ形亜目の3亜目とする分類や、咬筋の発達の仕方による原齧歯型・リス型・ヤマアラシ型・ネズミ型の4分類、下顎の形態からリス顎亜目Sciurognathi(原齧歯形下目Protrogomorpha・リス形下目Sciuromorphaなどを含む)・ヤマアラシ顎亜目Hystricognathi(デバネズミ形下目Bathyergomorpha・テンジクネズミ形下目Caviomorphaなどを含む)の2亜目とする分類もあったが、2005年に発表された分類体系では以下の5亜目とされた。和名は、川田ほか (2018) に従う。
ウロコオリス形亜目 Anomaluromorpha
ビーバー形亜目 Castorimorpha