文保の和談
白河院以降院政が定着するとともに、当時貴族社会の中で徐々に一般化しつつあった家職観念のもと、天皇位と天皇家の家督が分離し、家督者(治天の君)となった者が本来の天皇の権限を執行し、皇位継承者を指名(譲国)するようになった。
しかし承久の乱以後、皇位継承に関しては鎌倉幕府の実質的承認が必要となった。仁治3年(1242年)幼帝四条天皇の予期せぬ崩御で後高倉院系の皇統が絶えて皇位に空きが生じてしまった。その際、朝廷は順徳上皇の第五皇子忠成王の即位でまとまっていたが、鎌倉方は承久の乱の首謀者の一人として佐渡国に配流の身である順徳の系統が皇位に即くを断固拒絶し、乱の責任は問われなかったにもかかわらず自ら進んで土佐国に流された土御門上皇の第六皇子邦仁王を即位させた(後嵯峨天皇)。このため後嵯峨は以後の皇位継承に際しても幕府の内諾を得てから決定した。
後嵯峨は、寛元4年(1246年)、皇子久仁親王(後深草天皇)に譲位した後、文応元年(1260年)に後深草の同母弟恒仁親王(亀山天皇)に譲位させた。その際、後嵯峨院は、亀山の皇子世仁親王を皇太子とした。このことは後嵯峨が後深草の皇位を本人一代限りのものとし、亀山の子孫を正統の王家とする意向を持っていたことを推測させる。