バート・メルゲントハイム
彼らは1815年に城内教会で礼拝を行っている。この組織は1825年に独自の教区となった。この組織は、初めプロテスタントのヴュルテンベルク地方教会の一員であった。バート・メルゲントハイムは当時、行政上はオーバーアムト所在地であったが、教会運営を司る教区監督官事務所はヴァイカースハイムにあった。バート・メルゲントハイムは現在もヴァイカースハイム教会管区に属している。バート・メルゲントハイムの中核市区以外にも、アルトハウゼン、エーデルフィンゲン、ヘルプストハウゼン、マルケルスハイム、ノインキルヒェン、ヴァルバッハの各市区にそれぞれ独立したプロテスタント教会および教会組織がある。ヴァルバッハの教会はハハテルをも管轄している。ダインバッハのプロテスタント教会は現在もバーデンのプロテスタント地方教会(ボックスベルク教会管区)に属している。
二大キリスト教会の他、バート・メルゲントハイムには自由教会も存在している。セブンスデー・アドベンチスト教会や1991年に設立された福音派自由教会(バプテスト教会)がそれである。バート・メルゲントハイムには新使徒派教会の組織もある。この他にバハイ教の施設やアルトピーティスティシャー(古敬虔派教会)の組織もある。
バート・メルゲントハイムには中世からユダヤ人がいた。彼らはドイツ騎士団によって定住を許され、その経済的関心を満たしていた。20世紀前半には人口の約5%がユダヤ人であったが、これはドイツ帝国全体の平均(1%弱)を大きく上回る。国家社会主義者によるユダヤ人社会破壊(迫害と殺害)の歴史は、イギリスに亡命した画家ヘルマン・フェッヒェンバッハの著書『メルゲントハイム最後のユダヤ人』に詳述されている。