ブルックリン・ラピッド・トランジット
1913年にBRTは、ニューヨーク・ミュニシパル鉄道 (New York Municipal Railway) という別の子会社を通じてニューヨーク市とデュアル・コントラクトを結び、この契約のもとに新たな地下鉄を建設・運営し、そのほかの都市鉄道路線を建設あるいは改良していくことになった。
BRTの初期には、ロングアイランド鉄道はBRTにとってブルックリンおよびクイーンズにおいて旅客輸送をめぐる競争相手であった。自社の近隣路線と競合しているにもかかわらず、BRTおよびその前身事業者は、線路使用権を通じてロングアイランド鉄道の旅客列車の乗り入れを許可し、また貨車のやり取りを行っていた。ロングアイランド鉄道の旅客列車のBRTブルックリン橋ターミナルへの乗り入れは、1895年に協定を結んで実施され、BRTの高架路線を利用していた。BRTの地下鉄およびウィリアムズバーグ橋を利用したロングアイランド鉄道のダウンタウン・マンハッタンへの乗り入れは、チェンバーズ・ストリート駅開業とともに開始された。ロングアイランド鉄道とBRTのどちらの運転士も、同じ組合が代表となっていた。こんにちでも、BRTの後継であるニューヨークシティ・トランジット・オーソリティ(ニューヨーク市地下鉄)は、ロングアイランド鉄道の貨物輸送部門の後継であるニューヨーク・アンド・アトランティック鉄道から、サンセットパークおよびリンデンヤードにおいて貨車の受け取りを行っている。