筒石駅
その後の詳細なルート選定に際し、当初筒石駅は付近がトンネルとなるためいずれの案でも廃止となる計画であったが、能生町内では筒石駅がなくなることへの反発が強く、1965年(昭和40年)に入り国鉄は筒石駅のトンネル内設置を決定、1969年(昭和44年)9月29日に新駅に移転、10月1日付で書類上の貨物営業を廃止し、旅客駅となった。
1984年(昭和59年)2月1日には荷物の取扱を廃止し、1987年(昭和62年)4月1日に国鉄分割民営化が実施されると、北陸本線は西日本旅客鉄道(JR西日本)の所属となり、筒石駅もJR西日本に承継された。1日の乗車客数は20人前後であったが、特殊な立地条件から監視要員を兼ねて、業務委託駅としてジェイアール西日本金沢メンテック(現:JR西日本金沢メンテック)の社員5名が交替で24時間、年中無休で常駐して窓口業務のほか列車到着ごとにホームでの安全確認や乗降客への案内、地上駅舎への連絡を行っていた(JR時代の管理元は糸魚川地域鉄道部)。また、普通列車の到着時は、必ず地上の駅員がホームまで降りて客の乗降に立ち会い、ホームから客が全員退去したことを確認していた。
2015年(平成27年)3月14日、北陸新幹線長野 - 金沢間開業に際して、並行在来線としてこの区間の北陸本線は経営分離され、筒石駅もえちごトキめき鉄道の所属となった。2019年、1日の平均利用客数が20人前後と落ちこんでいることを受け、同年3月16日に無人駅となった。