トウゴロウイワシ目
トウゴロウメダカ科(Phallostethidae)は2亜科5属22種で構成される。すべての種類は側扁し、ほぼ透明な体をもつ。デンタテリナ亜科はトウゴロウイワシ科に含められることもあったが、現在ではいくつかの骨学的な特徴から、トウゴロウメダカ亜科と近い関係にあることが強く示唆されている。
デンタテリナ亜科(Dentatherininae)1属1種。西部太平洋の熱帯海域に分布する。 デンタテリナ属 Dentatherina
トウゴロウメダカ亜科(Phallostethidae)4属21種。フィリピンからタイ、スマトラ島にかけての淡水・汽水域に分布する。雄は頭の下に、「プリアピウム」(priapium)と呼ばれる非対称で複雑な構造をした交尾器官をもつことが大きな特徴である。これは雄の腹鰭の骨格が変形したもので、雌では1種を除き骨格自体が消失している。雄は交尾時に雌の体を固定するためにプリアピウムを用いる。「左利き(sinistral)」と呼ばれる雄ではプリアピウムが体の左側に開口し、肛門は右側に開く。「右利き(dextral)」の雄ではその逆で、ほとんどの種類では「左利き」「右利き」がほぼ同数いるが、どちらかに偏った種類もある。雌は交尾を通じて体内受精を行うが卵生で、微細な突起に覆われた受精卵を産卵する。体は側扁し、半透明から透明。小型の魚類で、体長は最大で3.7cmほどである。 グラファルス属 Gulaphallus ネオステトゥス属 Neostethus トウゴロウメダカ属 Phallostethus フェナコステトゥス属 Phenacostethus
メラノタエニア科(Melanotaeniidae)は4亜科17属113種で構成される。本科以降の4科はトウゴロウイワシ下目としてまとめられる。科以下の分類には研究者によって異同が多く、アーン(1997)はプセウドムギル科とテルマテリナ科を独立させるなど計6科を置き、系統順位にも変更を加えている。
ほとんどが淡水魚で、オーストラリア・ニューギニア・インドネシア・マダガスカルなどに分布する。本科魚類の雄には鮮やかな色彩に富む種類が多く、レインボーフィッシュあるいはブルーアイと呼ばれ、観賞魚として水族館や個人のアクアリウムで飼育対象とされる。体は側扁し、2基の背鰭は比較的近い位置にある。腹鰭の最後部の鰭条が膜によって腹部とつながっており、他科との鑑別に有用な特徴となっている。多くの種類では、体色や鰭条の長さなどに性的二形がみられる。
ベドティア亜科
ベドティア亜科(Bedotiinae)2属16種からなる。すべてマダガスカル島に生息する淡水魚で、本科の中ではもっとも原始的な一群と考えられている。臀鰭の鰭条はないか、あっても脆弱。ベドティア科 Bedotiidaeとして、独立の科として扱われる場合もある。