アルフォンソ・ポルティージョ
1999年11月の大統領選挙 (1999 Guatemalan general election) においてグアテマラ共和戦線はふたたびポルティージョを候補に立てた。ポルティージョは政治倫理の確立、汚職との戦い、先住民の擁護、市民の安全性の確保などを公約に掲げて勝利し、2000年1月14日に大統領に就任した。議会でもグアテマラ共和戦線が絶対多数を占めた。リオス・モントはグアテマラ議会の議長に選出された。
ポルティージョ大統領は2001年5月に日本を訪問した。グアテマラ内戦の和平合意後、アメリカ合衆国とならんで日本はグアテマラに対する最大の援助国になっていた。
公約とは裏腹に、ポルティージョ政権では汚職がかつてない規模に拡大した。2000年8月には酒造業界と癒着したリオス・モントらの議員がひそかに酒税を引きさげる事件が発生した。この事件はスキャンダルになったが、議員らが有罪判決を受けることはなかった。
和平合意の結果、付加価値税が12%にあげられることになり、このために経済界・市民団体と対立した。2001年には選挙公約違反に対する抗議が起きた。大統領就任後2年後の世論調査では、政権を「支持しない」と答えた回答者の割合が82%にのぼった。
2002年2月のアムネスティ・インターナショナルの報告では、1996年のグアテマラ内戦和平協定から5年以上たっているにもかかわらず協定の人権に関する部分が実現されていないとして批判した。