掛川藩
井伊氏はもともと遠江国井伊谷の国衆であったため、かつての本拠に近い所へ入部した形になる。直好は寛文12年(1672年)正月6日に死去し、跡を継いだ井伊直武も元禄7年(1694年)6月8日に死去。その跡を継いだのは井伊直朝であるが、宝永2年(1705年)に直朝は発狂して参勤交代をも怠る有様となった。本来なら改易されてもおかしくはなかったが、幕府は祖先である井伊直政の功績などを配慮して、本家の彦根藩から井伊直矩が養嗣子として迎えられて跡を継ぐことで存続を許された。ただし同年12月3日、直矩は養父発狂を名目に越後与板藩に移封を命じられた。これにより井伊家分家は城主から無城大名へ降格させられた。
代わって信濃飯山藩より松平忠喬が4万石で入るが、正徳元年(1711年)に摂津尼崎藩へ移され、代わって武蔵岩槻藩より小笠原長煕が6万石で入る。長煕は元文4年(1739年)4月21日に隠居し、跡を継いだ小笠原長庸は延享元年(1744年)7月6日に死去。そしてその跡を継いだ小笠原長恭は延享3年(1746年)9月、陸奥棚倉藩へ移封を命じられた。
代わって上野館林藩より5万石で太田資俊が入り、ようやく藩主家が安定した。以後、藩主は太田家により幕末まで7代にわたって続き、慶応4年(1868年)9月、最後の藩主である太田資美が上総柴山藩(松尾藩)に移ることで掛川藩は廃藩となり、その所領は徳川家達の駿河府中藩領となった。
3万5000石 譜代
井伊直好
井伊直武
井伊直朝
井伊直矩
7万石 譜代
本多忠義
太田家が入るまで激しく藩主家の交代が続いたため、藩政に見るべきところは太田家に至るまではほとんどないが、主要な点だけを述べておく。
松平定勝には、嫡男に松平定吉がいた。定吉は智勇兼備で特に弓術に優れ、性格においても温厚篤実なことから家臣団の信頼も厚かった。しかしある日、徳川家康が定勝の屋敷を訪れたときのことである。定吉は家康に自分の力量を見てもらおうと、空に飛翔していた一羽の鷲に向けて矢を放ち、これを見事に命中させた。家臣団はさすがに武芸達者と賞賛したが、家康はこれを褒めるどころか、家臣など多くの人がいる前でこのような軽率なことをすべきではない、成功すればいいが、失敗すれば物笑いの種になると叱りつけた。定吉は家康に嫌われていたらしいが、19歳であった定吉の精神に大きなショックを与え、このまま父の跡を継いでも嫌われている自分ではしようがないとまで思い、自殺した。このとき、定吉の後を追って多くの家臣が殉死している。定勝は期待していた我が子の死を悲しみ、その菩提を弔うために遠江塚を築いたと言われている。この遠江塚は、江戸時代を通じて主に若者の信仰を集めていたと言われている。
小笠原長煕は、幕命により大井川下流域の治水工事、新田開発などで功績を挙げている。