鴨川 (淀川水系)
賀茂川の流路は元々堀川の筋を流れ、都の建設予定地を南北に貫いていたため、堤を築いて平安京を避けるように東へ川筋を変更したのではないか、という『平安通志 巻乃一』(湯本文彦、1895年〈明治28年〉)の推論をもとに、これを支持発展させた自然科学者の塚本常雄が1932年(昭和7年)に提唱した学説である。
現在高野川と合流している地点から上流約3.3 kmと下流2.7 kmの二つの直線状の部分が、平安京の造成時に人工的に掘削して作られたものとし、おもに地勢・地形学的根拠、地質学的根拠、歴史的根拠の三つの根拠を挙げてつけかえ説を展開した。
すなわち、上賀茂付近の地形から、鴨川上流部=賀茂川が南東に流路を取っているのは不自然で、もともと賀茂川はまっすぐ南下、分流し扇状地形を形成しつつ堀川・西洞院方向に流れていたと考えられ、よって上賀茂から高野川との合流地点=出町までは人工河川であるとした。一方高野川については「京都市地質図」を示してそこに現れる扇状地に含まれる花崗岩質の砂礫の存在を以て、現在の出町合流地点からやはり扇状に分流しながら南西方向に流れていて、新町姉小路付近で北から流れてきた賀茂川と合流していたとし、現在鴨川が出町から南に流路を取っているのは平安京建都のさいに付け替えられたためとした。つまり塚本の「鴨川つけかえ説」は、出町から上流部の「賀茂川つけかえ」と下流部の「鴨川つけかえ(古高野川つけかえ)」の二つの主張により成り立っている。
御手洗川(みたらしがわ)
明神川ともいう。北区上賀茂で賀茂川から分かれ、上賀茂神社境内を流れた後、再び賀茂川に合流する。境内では御物忌川、楢の小川とも呼ばれる。なお、下鴨神社境内にも同名の川があるが、こちらの水源は湧水であり、高野川を経て鴨川に注ぐ。
この水は葵祭の神事に用いられる。
みそそぎ川
加茂大橋下流で鴨川から分かれ、西岸の河川敷(鴨川公園の地下川道、丸太町橋下流で地上へ)を鴨川本流と並行する。二条大橋の下流で高瀬川を分けた後、五条大橋付近で再び鴨川に合流する。もともとは高瀬川の水源を得るために設けられたもので、鴨川の河床が河川改修により低くなるにしたがって、水源を求めて上流部へ延長された。江戸時代の御所再建の際には、この水流を使って丸太町付近まで資材の運搬が行われた。夏の納涼床はこの川にまたがる形で設けられる。
高瀬川
出町柳川