北陸本線
また彦根駅 - 中ノ郷駅を連絡していた気動車列車は柳ヶ瀬線廃止後も米原駅 - 木ノ本駅間の区間列車を中心に、一部が彦根駅まで運転されていた。
一方で湖北地区は以前は北陸本線がローカル輸送を主にしていないことから、バス網が発達していた。国鉄バスが木ノ本に支所を置き、柳ヶ瀬線の列車廃止代替路線などのほか最盛期は名神米原や敦賀、近江今津まで路線を持っていた。また近江鉄道(バス)は米原 - 長浜 - 木ノ本間で20分おきの高頻度運転を行っていた。その後、長浜直流化を契機としてバス網の縮小・撤退が相次ぎ、多くが駅を起点とするコミュニティバスに衣替えされ残るのみである。
一部区間の直流化
1974年7月20日に湖西線が開業し、近江塩津駅 - 敦賀駅間で3往復の湖西線直通の普通列車が気動車で運転されるようになったが、本数が少なく、北陸線列車との接続も悪かった。多くの客車普通列車は1985年3月14日の改正で交直流電車の475・419系電車に置き換えられたものの、長らく電化方式の違いにより交直流電車をローカル用に新製することはできず、北陸線ローカル列車は本数も少なく、東海道線と米原駅で乗り換える必要があり不便であった。
気動車 キハ40・47形 - 普通列車 キハ58系 - 急行「ひだ」「のりくら」「こがね」「しろがね」「大社」 「ゆのくに」「きたぐに」「奥能登」「越後」「能登路」「白馬」 など キロ65形(ゆぅトピア) - 特急「ゆぅトピア和倉」 キハ80系 - 特急「白鳥」「はくたか」(1965-1969年) 「ひだ」
客車 20系 - 寝台特急「北陸」「つるぎ」「日本海」 12系 - 急行「きたぐに」「SL北びわこ号」 14系 - 寝台特急「北陸」「日本海」、急行「きたぐに」「能登」 24系 - 寝台特急「つるぎ」「日本海」「トワイライトエクスプレス」 一般形 - 急行、普通列車、夏季北海道向け貸出 など。 32系 35系 43系 10系 60系など。
413系
415系
471・475・457系
419系
485系
583系
683系2000番台(元「しらさぎ」編成)
キハ40・47形
おおむね、1時間に1 - 2本程度設定されている。敦賀駅に近づくほど列車の本数は少なく、日中は基本的に新快速のみ運転されている。
新快速・快速
北陸本線内では新快速・快速ともに各駅に停車する。
新快速の多くは敦賀駅・近江塩津駅・長浜駅から東海道本線・山陽本線(琵琶湖線・JR京都線・JR神戸線)を経由して、姫路駅・山陽本線網干駅・赤穂線播州赤穂駅まで直通運転している。日中の敦賀駅発着の新快速は湖西線経由で運転されている。ほかに、山陽本線上郡駅から近江塩津駅まで運転される新快速 や夜の大阪行きの新快速(いずれも土曜・休日ダイヤのみ)などがある。
日中時間帯は米原駅 - 近江塩津駅間で1時間に1本程度運行されており、朝夕は長浜駅折り返しも運行されている。また、近江塩津駅 - 敦賀駅間では湖西線系統の列車が運転されている。琵琶湖環状線構想の実現として、日中の新快速は湖西線経由の敦賀駅発着の列車と近江塩津駅折り返しの米原経由の列車同士で対面乗り換えができるようになっている。
快速は朝晩のみ運転されており、近江塩津駅 - 敦賀駅間では2006年10月21日から湖西線系統の快速列車が運転されている。
快速・普通
前記の新快速・快速を補完する形で朝晩を中心に運行される。