スクミリンゴガイ
天敵として、カルガモやスッポン、コイなどが知られている。大量発生地域ではスッポンの大量放流による駆除が行われているが、これら駆除のために放流した天敵を食用に捕らえる人間もいるため、問題となっている。
先述のように卵は有毒であり、原産地の南アメリカでもヒアリ以外の天敵が存在しない。よって、そのほとんどが幼貝へ無事に孵化することから、本種が爆発的に個体数を増やしているという指摘もある。しかし卵は水中では孵化できない(イネの株や水路の壁のような濡れない場所に産みつけられる)ため、卵塊を見つけ次第水中へ掻き落とすのは、個体数を減らすのに有効な駆除方法(便)である。
稲苗よりも野菜に誘引されやすいという性質から、野菜トラップで誘引しスクミリンゴガイの捕獲効率を向上させたという報告もある。尚、スクミリンゴガイが好む野菜はメロン、スイカ、レタス、ナスであり、これらを投入することによって, スクミリンゴガイによるイネの被害を回避できる可能性のあることが示唆されている。
水田など静止水域では、石灰窒素やリン酸第二鉄やメタアルデヒドが、有効な駆除用薬剤である。