旧制専門学校
長崎高等商業学校→長崎工業経営専門学校(併設)(1946年4月廃止)
横浜高等商業学校→横浜工業経営専門学校(併設)(1946年3月廃止)
名古屋高等商業学校→名古屋工業経営専門学校(併設)(1946年3月廃止)
1899年 東京外国語学校→東京外事専門学校(東京外国語大学)
1921年 大阪外国語学校→大阪外事専門学校(大阪外国語大学→大阪大学外国語学部)
京城薬学専門学校(ソウル大学校薬学大学)
1904年 同志社専門学校(同志社神学校・同志社高等学部文科学校・同志社高等学部波理須理科学校を合併→同志社大学に改称(1912年))→大学令による同志社大学に昇格(1920年)・専門学校令による大学は同志社専門学校に改編
1907年 立教大学(聖公会伝導局英語学校(1874年)を専門学校に認可)→大学令による立教大学に昇格(1922年)
1908年 関西学院神学校(南メソジスト監督教会神学校(1889年)を専門学校に認定)→大学令による関西学院大学に昇格(1932年)
1913年 上智大学(上智学院(1911年)を専門学校に認定)→大学令による上智大学に昇格(1928年)・上智大学専門部設置(1931年)
1945年以後に新制大学に昇格した学校
明治学院(1887年)
東北学院専門科(1904年・専門科は後に専門部、高等学部と改称)
青山学院高等科・神学部(1904年)
青山女学院英文専門科(1904年)
関東学院神学部・高等学部(1927年)
西南学院高等学部(1921年)
神戸女学院専門部(1909年)
宮城学院女子専門学校(1946年)
西南女学院専門学校(1946年)
神道系
皇典講究所(1882年)1946年に解散、事業・資産は國學院大學が継承。
1903年 東京慈恵会医院専門学校(東京慈恵会医科大学)
1912年 日本医学専門学校(日本医科大学)
1918年 東京医学専門学校(東京医科大学)
1927年 大阪高等医学専門学校(大阪医科大学→大阪医科薬科大学)
1928年 岩手医学専門学校(岩手医科大学)
1928年 昭和医学専門学校(昭和医科大学→昭和大学)
1928年 九州医学専門学校(久留米医科大学→久留米大学)
1943年 順天堂医学専門学校(順天堂医科大学→順天堂大学)
第一高等学校医学部薬学科→1901年千葉医学専門学校薬学科→→千葉医科大学附属薬学専門部(千葉大学薬学部)
第二高等学校医学部薬学科→医学科に吸収され一旦廃止→→東北大学医学部薬学科(東北大学薬学部)
第三高等学校医学部薬学科→医学科に吸収され一旦廃止→→岡山大学医学部薬学科(岡山大学薬学部)
第四高等学校医学部薬学科→1901年金沢医学専門学校薬学科→→金沢医科大学附属薬学専門部(金沢大学薬学部)
第五高等学校医学部薬学科→1918年長崎医学専門学校薬学科→→長崎医科大学附属薬学専門部(長崎大学薬学部)
詳細は当該項目を参照
大日本武徳会武道専門学校→京都文科専門学校(廃止)
国士舘専門学校→至徳専門学校(国士舘短期大学→国士舘大学)
日本体育専門学校→(日本体育大学→日本体育大学武道学科→日本体育大学スポーツ文化学部武道教育学科)
1894年 第三高等学校法学部→廃止(建物・設備・敷地を京都帝大に譲った)