ザ・サード バースデイ
声:岡本玲
アヤの妹で、現在は行方不明となっている。正式な血縁関係はないが、家族同然に暮らしていた。アヤと同じく年を取っていない。事件との関わりなど、詳細は不明。ツイステッド出現以降行方不明となっている。ハイドは「クイーン」、カイルは「お姫様」と彼女を呼んでいる。
声:坂本真綾
主人公。日系のハーフブロンドの女性。ニューヨーク市警、FBIのMIST(ミトコンドリア調査・鎮圧班)を経て、現在はCTIという組織に所属している。自分が持つ特殊な能力により、唯一のオーバーダイブ適合者となった。また、現年齢は39歳だが、その能力故に未だに20歳前後の肉体を保っており、少女の弱さと大人の女性の強さを兼ね備えている。過去10年間の記憶を失っている。戦い慣れているわけではなく唯一のオーバーダイブ適応者のためツイステッド掃討任務を負うこととなる。
ある事件をきっかけに心を閉ざしており、失った過去を取り戻したいと強く願っている。そんな思いから彼女は、仲間のために戦うという意識ではなく、CTIの一部で、戦場にしか自分の居場所がないという苦悩を抱きながら戦いへと赴く。傷つき、恐怖し、足をすくませながらも、「行け」と命じられて立ち向かい、勇気を振り絞り必死に戦うひたむきさを持つ。
主人公のアヤは銃火器を使用して攻撃する。連射ができない単発のハンドガンの他、連射が可能なアサルトライフル、敵を竦ませる効果のあるショットガン、敵の弱点が見えるスナイパーライフル,一発の攻撃力が高く放射線を描いて飛ぶグレネードランチャー,ゲームをクリアしていくことで購入が可能になるスペシャルウェポンなどが存在する。戦闘中には4種類の武器を切り替えて戦うことができる。未所持の武器を装備している兵士にオーバーダイブすることで新たな武器が購入可能になる。また、銃器はカスタマイズパーツを取り付けることで性能を向上させることができる。
声:横島亘
CTI捜査本部を統率する人物で、通称「ボス」。ゆくゆくはFBIのトップを嘱望されるエリートコースを歩んでいたが、ツイステッド出現後、CTI局長に出向の形で就任した。
『パラサイト・イヴ』、『パラサイト・イヴ2』の流れを汲み「アヤ・ブレア」を主人公としたゲームの3作目。前2作で重要な役割を果たしたミトコンドリアの反乱は登場せず、新たな物語となっている。ゲームジャンルは「アクションRPG」とされているが、従来のシリーズ作に比べるとアクションシューティング的な要素が強く、「オーバーダイブ」という他のキャラクターに乗り移って戦うシステムが搭載されるなど、システム面も一新されている。前作までのユーザーだけでなく、新規のユーザーにも遊んでもらいたいとの考えから完全新規のタイトルとして制作された。また、今作からキャラクターに対して本格的に声優を起用している。
テーマは「時間」。2013年の絶望的な状況から過去の人間の肉体に「オーバーダイブ」することで、歴史を変えて行くのが目的となっている。連続サスペンスドラマのように1ミッションは1~2時間ほどで終了し、次の話に続くように展開する。
主人公のアヤ・ブレアは装備を変えることで「コスチュームチェンジ」を行うことができ、その中には『ファイナルファンタジーXIII』の主人公であるライトニングと同じコスチュームが存在する。
UMD版とPlayStation Storeで販売されるダウンロード版の2種類が発売された。UMD版には初回生産限定特典として2011年3月3日発売の『ディシディア デュオデシム ファイナルファンタジー』の登場キャラクターの一人であるライトニングがアヤ・ブレアと同じコスチュームを使用可能になるプロダクトコードカードと、2011年2月25日発売の『ファイナルファンタジー・トレーディングカードゲーム』のプロモーションカード「アヤ・ブレア」が同梱された。
ハチのようなツイステッド。ワッドとは違い一度に大量に出現し、空中から針のような弾を撃ってくる。スナイパー時に赤い体色をしたスティンカーを「ベーススティカー」と呼び、この個体を倒せば周囲の他のスティンカーが全滅する。また、一部は毒を生成する個体も存在し、真上にいると毒霧でジワジワとライフを奪っていく。
名前の意味は「非常にタチの悪いもの」。