シクロチド
Loop 1はLoop 3・Loop 5と水素結合を作ることで、構造の安定化に重要な役割を果たしている。
Loop 2-6 にもいくつかの高度に保存された残基がある。
Loop 3 - 最後にグリシン残基を持つ
Loop 4 - ただ1つの残基からなり、側鎖-側鎖間水素結合に関与する
Loop 5 - 最後から1つ手前には、bracelet 亜群では塩基性アミノ酸、Moebius 亜群ではプロリン残基がある。
Loop 6 - アスパラギン/アスパラギン酸・グリシンが高度に保存されており、環化が起こる点である。環状ペプチドの場合、遺伝子配列を調べることで環化が起こる点を突き止めることができる。
また、主鎖・側鎖の配置もよく保存されている。
シクロチドは1000種以上存在すると見られており、その配列は、他の環状ペプチドと併せて CyBase で見ることができる。