原子力潜水艦浮上せず
アメリカ海軍の原子力潜水艦ネプチューン (USS Neptune) はニューロンドンの潜水艦基地に帰投中であった。ブランチャード艦長(チャールトン・ヘストン)はこの航海で退任し、小艦隊長として昇任、副長(ロニー・コックス)にその任を譲る予定であった。艦は濃霧の中浮上するが、レーダーの故障した大型貨物船と衝突、艦の後部を大破してしまう。直ちにベネット大佐(ステイシー・キーチ)を長とする救助チームが編成され、揚陸艦ナッソー (USS Nassau, LHA-4) を拠点として救助活動を開始する。
ネプチューンの沈没地点は1,450フィートの海底渓谷であり、救助には非常に困難が伴うものであった。特殊潜航艇スナークと開発者のゲイツ大佐(デビッド・キャラダイン)が救助作戦に参加、海底に沈むネプチューンを発見する。スナークはマジックハンドで砂で覆われたハッチを顕わにしたものの、地滑りが発生しネプチューンは大きく傾斜してしまう。