鳥羽天皇
また、白河法皇の側近であった藤原長実・家保兄弟らを排除して院の要職を自己の側近で固める。有力な院司として、藤原顕頼や藤原家成がいる。また、伊勢平氏の平忠盛の内昇殿をゆるし、政権に近づけた。さらに白河法皇の後ろ盾を失った待賢門院璋子にかわり、長承2年(1133年)頃より藤原得子(美福門院)を寵愛した。
永治元年(1141年)、23歳であった崇徳天皇を譲位させ、得子所生の第九皇子の躰仁親王(近衛天皇)を3歳で即位させた。
康治元年(1142年)、東大寺戒壇院で受戒し、法皇となる。
久寿2年(1155年)、近衛天皇が早世すると、第四皇子で崇徳上皇の同母弟である雅仁親王(後白河天皇)を即位させた。これにより崇徳上皇が院政を敷く可能性は失われる。間もなく病に倒れ崩御したが、この後後白河天皇即位が保元の乱勃発の原因となった。
紀家子(美濃局) - 石清水八幡別当光清女 第六皇子:道恵法親王(1132年 - 1168年) 第七皇子:覚快法親王(1134年 - 1181年) 皇女:阿夜御前(? - 1195年)
三条局(? - 1138年) - 藤原家政女 皇女:妍子内親王(吉田斎宮)(? - 1161年) - 伊勢斎宮
春日局 - 藤原実能女 皇女:頌子内親王(五辻斎院)(1145年 - 1208年) - 賀茂斎院
橘俊綱女(藤壺女御) 皇子:真誉
土佐局 - 源光保女
藤原実衡女 皇女:高松宮
未詳 皇子:最忠法親王 皇子:道果親王
中宮・藤原璋子(待賢門院)は、幼少より白河院の養女となって溺愛されており、『古事談』では、鳥羽院が崇徳天皇を「叔父子」(祖父の白河院の子、叔父である子の意)と呼んでいたとしている。
嘉承 - 嘉承2年7月19日(1107年8月9日)践祚、嘉承3年8月3日(1108年9月9日)即位により改元
天仁 - 天仁3年7月13日(1110年7月31日)彗星出現により天永に改元
天永 - 天永4年7月13日(1113年8月25日)天変・怪異・疫病・戦乱により永久に改元
永久 - 永久6年4月3日(1118年4月25日)天変・疫病により元永に改元
元永 - 元永3年4月10日(1120年5月9日)御厄運御慎により保安に改元
保安 - 保安4年1月28日(1123年2月25日)譲位