君川丸 (特設水上機母艦)
「君川丸」は厚岸に戻っていたが、米機動部隊策動への懸念から「君川丸」にも哨戒が命じられ、室蘭経由で八戸へ移り同地で1942年1月7日に飛行機を収容(小笠原へ派遣の飛行機が八戸付近に不時着していた)後、哨戒線に向かった。敵は発見されず、「君川丸」は1月18日に厚岸に帰着。続いて1月19日に厚岸から出航すると幌筵方面の飛行哨戒やアバチャ湾方面の飛行偵察を行い1月29日に厚岸に帰着した。2月2日からは横須賀で整備。その後、2月22日にオリガ湾、2月27日にはカムチャッカ半島のボルシェレックの飛行偵察を行った。3月7日には松輪島、天寧の航空基地調査を行い、3月10日から3月16日までは厚岸にあって飛行哨戒を実施。その後は大湊で整備を行ない、完了後厚岸に戻った。4月11日、射出機故障のため厚岸から舞鶴へ向け出発。修理完了後、5月3日に厚岸に戻った。
アリューシャン作戦発動後は水上機部隊を編成し、第四航空戦隊の空母龍驤、隼鷹が第五艦隊指揮下にあった時期を除いて、北方で唯一の艦隊航空戦力だった。7月3日にアガッツ島沖で爆撃を受けて損傷し、横浜にて修理が行われた。以後も横須賀とアリューシャン方面を往復して哨戒行動や航空機輸送で活躍する。第五艦隊時に施されていた迷彩塗装は、福井静夫の手による相良丸(日本郵船、7,189トン)の迷彩塗装と並び、残されている写真の多さもあり有名である。