古田重二良
日大の学生たちは「打倒古田」「古田を倒せ」とプラカードをもって叫び、激しい抗議活動を行った。
この日大紛争では警察官が死亡し、その責任で永田菊四郎・日大総長は辞職した。
日大会頭の古田重二良は、秋田明大率いる日本大学全学共闘会議から攻撃の標的とされた。
古田重二良は両国日大講堂(旧両国国技館)における「大衆団交」の大学当事者として出席したが、日大全共闘から激しい糾弾を受けて、古田は会頭を辞任した。
後任総長は教職員の公選によって歯学部長の鈴木勝が日大総長となった。日大理事長には新たに高梨公之が理事長となるが、古田重二良は新たに日大会長となり、かねてから親交があった佐藤栄作からも唆されて、結果的に闘争学生を警察力で鎮圧した。
闘争の最中、古田重二良は駿河台日本大学病院にて日大全共闘の学生に分からないように偽名で「古田二郎」の名義で入院加療していたものの、1970年(昭和45年)に肺ガンで死去した。日大紛争の学生の反乱や自身の会頭としての経営が正しかったのかを悔やみながら死去した。
さらに、大学全体の教育充実と学生教職員の福利施設の拡充、育英制度の導入と学生会館・国際会館の建設、組織の近代化・合理化と産学協同の推進が謳われた。
この改善案をめぐって、日大の商経学部第二部(現・日本大学経済学部)自治会で共産党の活動家などの反対派の学生たちは古田重二良の改善案反対デモを起こした(日大改善案闘争)。
10月23日、商経学部二部自治会学生大会の時に勤務評定反対闘争(教育労働運動)に参加した自治委員の不当処分撤回と、日大改善案・警察官職務執行法改正案反対のストを決行。24日に全学授業を放棄し、ピケットを張り学内デモを起こした。
日大当局は25日に臨時休校を発令した。反対派の学生たちは高木学部長との会見を27日に日大側に要求したが、日大当局側は学部長との会見の要求に応じなかった。
日大当局は28日、29日の教授会で、スト決行の責任者7名を退学処分にする旨を発表した。
11月22日、この大学の退学処分の決定に不服に思った反対学生たちが学内抗議集会を日大職員に要求したが、日大の職員は学生に暴行を加えて抑止した。警職法改正案反対中央集会に参加してデモをしていた他大学の学生も、大学キャンパス内で巻き込まれ暴行を受けた。
日大当局側は事態を重く受け、高木学部長名で機動隊2000名を学内に導入し、大量の退学者・処分者を出して日大改善案闘争は終結した。これにより古田体制とその後の日大の学内体制が確立された。