ドラガン・ストイコビッチ
1999年には呂比須ワグナー(ベルマーレ平塚より)、山口素弘、楢﨑正剛(いずれも横浜フリューゲルスより)の3人の日本代表クラスの選手が加入し、リーグ戦初優勝が期待された。3月6日、アビスパ福岡との開幕戦では3年ぶりにヘディングで得点を決め、幸先の良いスタートを切ったが、3月24日には北大西洋条約機構(NATO)による母国ユーゴスラビアへの空爆が開始され、それが6月10日まで続いた。それまではできる限り政治的な発言は控えて来たが、3月27日の神戸戦後に「NATO STOP STRIKES」(NATOはユーゴスラビアへの空爆を止めよ)というアンダーシャツを見せて空爆への抗議行動をとり、Jリーグより注意を受けた。
優勝候補筆頭に挙げられた1stステージは7勝7敗の8位に終わったが、2ndステージ途中にジョアン・カルロスが監督に就任するとチームは息を吹き返し、クラブ記録を更新する10連勝で2ndステージは11勝3敗の2位と巻き返した。フランスやオーストリアのクラブからのオファーもあったが、約3割の減額を飲んだ年俸1億3000万円で契約を1年間延長した。この年のリーグ戦ではアシストランキングで1位となる16アシストを決めた。天皇杯決勝のサンフレッチェ広島戦では1得点1アシストの活躍を見せ、2度目のタイトルを手にした。UEFA EURO 2000予選は政治的理由からユーゴスラビア代表に不利な日程を余儀なくされ、最終節までユーゴスラビア、アイルランド、チェコの3ヶ国が首位を争ったが、最終戦でクロアチアに引き分けて本大会出場を決めた。
1stステージは開幕から5試合で4勝1分と好調な出だしだったが、6節で磐田との直接対決に敗れたことがきっかけとなり、磐田に優勝をさらわれた。1stステージの最終節を前にした7月14日のサンフレッチェ広島戦で試合終了間際にJリーグラストゴールとなった決勝ゴールを決め、3-2での勝利に貢献、最終節7月21日の東京V戦でグランパスの選手として最後の公式戦出場を果たした、2001年4月25日には2002 FIFAワールドカップ予選のロシア戦に18分間出場した。キリンカップの日本との親善試合でユーゴスラビア代表のユニフォームを脱いだ。この試合後にはユニフォーム交換の依頼が殺到し、彼の人気の高さを改めて実感させた 。名古屋ではリーグ戦178試合に出場し、55得点を記録した。そのうちの14得点はペナルティキックによるものであり、6得点はフリーキックを直接決めたものであり、1得点はコーナーキックを直接決めたものである。木村元彦によればアシスト数は95を数え、アシストした回数が最も多いのは岡山哲也である。7年間の間にもらったイエローカードは69枚、退場処分回数は13回(そのうち一発退場回数は3回)に上った 。この退場処分数は2015年に抜かれるまでリーグ最多記録となっていた。
ドラガン・ストイコビッチ『セブン・イヤーズ・イン・ジャパン』祥伝社、2001年7月12日。ISBN 4396312563。
天皇杯優勝:2回 (1995, 1999)
愛知トヨタグランパスランクル賞:2回(1995、2000)
Jリーグベストイレブン:3回 (1995, 1996, 1999)
Jリーグ最優秀選手賞:1回 (1995)
日本年間最優秀選手賞:1回 (1995)
FUJI XEROX SUPER CUP優勝:1回 (1996)
Jリーグチャンピオンシップ最優秀選手:1回 (1996)
Jリーグオールスターサッカー最優秀選手:3回 (1996, 1998, 2000)
サンワバンクカップ優勝:1回 (1997)
Jリーグ功労選手賞 (2001)