藤野恒三郎
1964年 第35回朝日賞(当時は「朝日文化賞」の名称であった。)(「腸炎ビブリオの発見と研究」により)共同受賞者 滝川巌 福見秀雄 坂崎利一
1966年 日本細菌学会浅川賞(「腸炎ビブリオの発見」により)
1971年 紫綬褒章 (学術の進歩に寄与)
1972年 武田医学賞(腸炎ビブリオの発見と研究により)
1977年 勲二等瑞宝章
1986年 大阪文化賞(腸炎ビブリオの発見による公衆衛生学への貢献と適塾を中心とした医学史への貢献により)