ウイリアム・ハーベー
1645年からは国王の推挙によりオックスフォード大学マートン・カレッジの学長(Warden)を務めた。しかし王党派の敗北が決定的になると、翌1646年4月にチャールズ1世がオックスフォードを脱出した後、6月にオックスフォードは議会派に落とされた。そのため学長職を解かれ、2000ポンドの罰金を科せられた。学長就任前の1644年には聖バーソロミュー病院からも解任され、ロンドンに戻った時には自宅に残した原稿が失われるなど、いくつも精神的打撃を受ける羽目に陥った。私生活でも妻や弟たちを次々と亡くし、子供もいなかったため、この時期は生き残った弟のエリアブの家に身を寄せたと推定される。
1650年、イングランド共和国のランプ議会は国王に与した人物をロンドンから追放したため、周囲20キロ以内に入ることができなくなった。ハーベーは70歳を超えていたが、王党派の残党として不遇であり、痛風の発作に悩まされるなど、意気消沈して過ごす。
そうした頃、ハーベーは発生学でも大きな足跡を残した。1651年公刊の『動物の発生』で彼はシカの交尾前後からの発生の段階を観察し、アリストテレスの『胎児は月経血から生じる』という説を否定した。哺乳類の卵を発見することはできなかったが、他の動物との比較からその存在を確信し、「すべては卵から」との言葉を残した。
その後、これら医学への功績が認められてロンドンに戻り、医師会にも復帰し、名誉回復された。この頃には血液循環説は広く受け入れられるようになり、友人たちに慰められたり若い研究者に囲まれ、満ちたりた晩年を過ごした。1657年6月3日、79歳で脳溢血で死去。遺体はロンドンのエリアブの家へ安置された後、彼がエセックスに持っていた家族礼拝堂に葬られた。