青蓮院
本堂、宸殿、小御所、華頂殿、叢華殿、好文亭などがあるが、いずれも古いものではない。各建物(好文亭除く)は渡り廊下でつながれている。庭園は室町時代の相阿弥作と伝える築山泉水庭、江戸時代の小堀遠州作と伝える霧島の庭などがある。境内西側には京都市天然記念物のクスノキの巨木が5本ある。青蓮院では、例年春と秋に期日を区切って夜間拝観を実施し、庭園のライトアップを行っている。
熾盛光堂(しじょうこうどう、本堂) - 境内の南側に西面して建つ方三間、宝形造の堂。堂内の厨子には青蓮院の本尊である熾盛光如来の曼荼羅を安置するが、通常は公開していない(天台宗開宗1,200年を記念し、2005年(平成17年)9月28日から12月28日まで公開された)。熾盛光如来とは仏頂尊の一尊で、天台宗最大の秘法といわれる熾盛光法(国家鎮護、皇室の安泰などを祈る修法)の本尊であるが、この如来を寺院の本尊とするのは珍しい。寺伝では文禄5年(1596年)作の掛軸で、中央に種子「ボロン」(भ्रूं・bhruuM)で表した熾盛光如来、周囲に八大菩薩を表したものという。お前立ち像は2006年(平成18年)秋に篤志家より奉納された、本翡翠・プラチナ製の宝珠像となっている。本堂の東裏には国宝の青不動像の小さな複製が安置されている。
宸殿 - 小御所の西側に建つ入母屋造、桟瓦葺きの寺内で最も大きな建物。