同志社英学校
高畠素之(国家社会主義者)
高安月郊(劇作家、詩人)
高柳松一郎(大阪商業会議所理事)
竹田俊造(日本伝道隊の創始者のひとり)
竹友藻風(詩人、英文学者)
田崎健作(本郷教会牧師)
千葉昌雄(牧師)
津下紋太郎(実業家、同志社理事)
中瀬古六郎(ハリス理化学校卒、化学者)
永井柳太郎(早稲田大学教授、政治家)
永代静雄(小説家、新聞記者)
秦孝治郎(実業家、同志社理事長)
八浜徳三郎(社会事業家)
馬場恒吾(ジャーナリスト)
樋口貫(ヒロ教会(ハワイ)牧師)
日野真澄(同志社神学校中興の祖)
古谷重綱(外交官)
古谷久綱(衆議院議員)
松岡荒村(詩人、評論家)
水崎基一(経済学者、浅野綜合中学校初代校長)
三宅驥一(植物学者)
三輪源造(国文学者)
山川均(社会主義者)
山室軍平(救世軍日本軍国司令官)
山室武甫(山室軍平の長男、救世軍士官)
山本宣治(衆議院議員)
山本美越乃(経済学者)
湯浅十郎(ブラジル福音ホーリネス教団牧師)
湯浅八郎(昆虫学者、同志社第10・12代総長、国際基督教大学初代学長)
湯谷磋一郎(讃美歌作者)
渡瀬主一郎(聖書翻訳者)
1895年 キリスト教義と教育勅語の精神との全国的論争が同志社内部にも波及する。
1896年 同志社普通学校を同志社高等普通学校と改称。アメリカン・ボードとの関係悪化により外国人宣教師団が同志社から引き上げる(1900年復帰)。
1897年 高等普通学校・政法学校・波理須理科学校を高等学部文科学校・高等学部政法学校・高等学部波理須理科学校に改制。
1898年 「同志社綱領」改訂をめぐって反対運動起こる(翌年に綱領復元)。
1900年 同志社財団寄付行為制定。社員会を理事会と改称。
1904年 専門学校令による同志社専門学校と同志社神学校を開校。政法学校、理科学校などは廃止もしくは統合。
1906年 同志社病院・京都看病婦学校閉館。
1907年 故・新島襄、帝国教育会から六大教育家の一人として顕彰される。
1909年 同志社カレッジソング制定。帝国教育会から「教育上功績上顕著なる私学の一」として慶應、早稲田、明治、中央、専修とともに表彰される。
1912年 専門学校令による同志社大学を開校(社長・原田助)。神学部、政治経済部、英文科を設置。
1913年 英文科卒業生に中等教員無試験検定資格を認定。
1916年 学長を置き、社長がこれを兼任する(翌年兼任制を廃止)。
1917年 図書館に愛山文庫(大原孫三郎の寄贈)を設置。
1918年 社長を総長と改称する。予科の修業年限を2年に延長する。
1919年 英文科を文学部、政治経済部を法学部と改称。
1920年 キリスト教系の私学で最初に大学令に基づいた大学に昇格(総長・海老名弾正)。文学部(神学科・英文学科)、法学部(政治学科・経済学科)、大学院、予科を開校。
1922年 専門学校令による大学を同志社専門学校に改組。