ツノトカゲ科
分子・系統双方の系統解析で、ツノトカゲ科の単系統性は強く支持されている。
9属に分類される。
ツノトカゲ亜科 Phrynosomatinae シマオトカゲ属 Callisaurus オオミミナシトカゲ属 Cophosaurus - オオミミナシトカゲ1種 ミミナシトカゲ属 Holbrookia ツノトカゲ属 Phrynosoma - サバクツノトカゲ、マルオツノトカゲなど クシユビトカゲ Uma
ハリトカゲ亜科 Sceloporinae イワバトカゲ属 Petrosaurus - ウミベイワバトカゲなど ハリトカゲ属 Sceloporus - イワハリトカゲ、サバクハリトカゲ、マラカイトハリトカゲなど ノボリユタトカゲ属 Urosaurus - ニシキノボリユタトカゲなど ユタトカゲ属 Uta - ワキモンユタトカゲなど