デストロイア
ジュニアのDNAと、品川火力発電所から吸収したエネルギー、ジュニアの熱線の影響で進化が異常促進した結果、変化した形態。出現地点は品川・火力発電所→羽田空港→国際展示場。
甲殻類のようであった集合体までと異なり、直立二足歩行で両腕があり、背中には巨大な翼を持った姿になっている。顔は飛行体に似ている。
集合体と同様、全身の至る所からガスのようなものを噴射している。大幅な変身を経ずに陸海空を活動できるようになり、頭部の角や先端が鋏状の尻尾、鋭い爪などを武器としてゴジラに戦いを挑む。口から吐くオキシジェンデストロイヤーレイ(オキシジェン・デストロイヤー・レイ)はより強力なものに変わり、長時間照射すればゴジラを一撃でダウンさせられる。また、角からミクロオキシゲンを放出して形成した刃で敵を切り刻むヴァリアブル・スライサー(ヴァリアヴル・スライサー)を用い、尻尾を獲物の身体に絡めて体内のエネルギーを吸収することもできる。
燃え盛る品川火力発電所の炎の中から出現し、羽田空港に飛来してジュニアを攫った後、有明上空で空中から落として瀕死の重症を負わせ、その光景に怒り狂ったゴジラと対峙する。
肉弾戦でゴジラを圧倒し、尾で引きずり回したまま海に突き落とすなど優位に戦いを進めるが、核エネルギーが暴走していたゴジラに対してはオキシジェン・デストロイヤーすら決定打となりえず、ゴジラの猛攻も重なって徐々に劣勢となり、胸の開口部を熱線の集中攻撃で破砕され、大量の出血と吐血に至り、四散する。その直後、複数の分裂体に分裂してゴジラを攻撃するが、全滅させられてなおも再生し、ゴジラへの三度目の戦いを挑む。
メルトダウン寸前のゴジラから放たれたこれまで以上に強力なハイパー熱線や、ゴジラ自身から放たれる猛烈な熱量によって全身を焼かれたうえ、熱線を連続で受けて顔面や胸部を砕かれるほど追い詰められる。たまらず空中へ逃走を図るが、スーパーXIIIの超低温レーザー砲や冷凍メーサー戦車の集中攻撃によって傷口から内部を超低温に晒されたうえ、翼を破壊されて力を失い地上に墜落し、爆散した。
スーツアクターは播谷亮。ゴジラから煙を吹く演出で炭酸ガスを用いているため、播谷もレギュレータを装着して演じた。また、翼のバランスが取りづらいため、着用時はスーツを上から吊った状態で入っている。
書籍『ゴジラVSデストロイア超全集』では、完全体でのミクロオキシゲン噴出量は幼体の500倍としている。
この完全体がデストロイアの一応の最終形態とされているが、映画パンフレットには、この状態で進化が止まる保証はないと書かれている。