アクア・トトぎふ
長良川上流から中流エリア
郡上市、美濃市周辺の瀬・淵をイメージしたエリア。サツキマス、オオサンショウウオ、シュレーゲルアオガエル、アユ、アオダイショウ、コツメカワウソなど。
長良川下流エリア
羽島市、海津市の水田、用水路、河口域、汽水域をイメージしたエリア。ニホンウナギ、ナマズ、モツゴ、テナガエビ、ボラ、トビハゼ、クサガメ、カルガモ、コサギなど。岐阜県レッドデータブックに取り上げられた県内絶滅危惧種(イタセンパラ、ハリヨなど)も展示。