南方特別留学生
戦局悪化にしたがって留学生も戦災に遭うようになり、神奈川県相武台の陸士に入学したジャワ出身留学生の一人はアメリカ軍機の機銃掃射により死亡した。1945年に入って東京での空襲が本格化すると、戦災を避けて留学生を順次地方都市に移す措置がとられ、特に大学の場合、京都帝大が集中的に受け入れることとなった。しかし東京が空襲で壊滅した後には地方都市への空襲が激化したため、各地で留学生寮や受け入れ学校、国際学友会の施設が破壊され、行き場を失った留学生は再び焼け跡の東京に戻らざるを得なくなった。
特に1945年8月6日の広島への原爆投下においては、この時点でインドネシア出身者4名、マラヤ出身者3名が広島文理大・高師で学んでいた。彼らのうちある者は講義中の教室、あるいは市内大手町の萬代橋東詰付近にあった留学生寮(興南寮)において被爆した。行方不明になったマラヤ出身のニック・ユスフ(後に避難先の五日市での死亡が判明し、同町に墓がある)を除く留学生たちは元安川岸に避難し、比較的軽傷であった者は他の被爆者の救援に当たった。彼らは8月末に列車で東京に向かったが、サイド・オマール(マラヤ出身)が体の不調を訴え途中下車して京大病院に入院するも9月初めに死去、京都市内に埋葬された。
1942年初頭から半ばにかけて開始された日本軍政のもと、東南アジアの各占領地では日本語教育が実施された。このような状況の中で日本への留学生が募集され、試験により選抜された候補生たちは、来日に先立って各軍政当局により軍隊式訓練を受けた(インドネシア(オランダ領東インド)の場合、軍政開始にともない3大学すべてが閉鎖されたため、日本留学は高校卒業後の教育を受けられる唯一の機会であった)。
そして第1期生は1943年5月、第2期生は1944年4月頃に来日した(第2期生の来日時、既に日本軍は制空権・制海権を奪われていたため、日本渡航は非常な危険をともなっていた)。彼らは最初の1年間、東京の目黒にあった国際学友会(大東亜省管轄)の日本語学校で語学研究を受け、2年目(第1期生は1944年4月、第2期生は1945年4月から)は指定された専門学校・高等師範学校で大学入学のための予備教育を受けた。