新木曽川駅
快速特急、特急、快速急行、急行、準急、普通列車が停車する。待避設備を備えた2面4線の島式ホームを持つ、駅員配備の地上駅。岐阜側に片渡り線がある。駅舎は東側にあり、2つのホームとはエレベーター付きの跨線橋で繋がっている。橋上駅舎ではなく、西側に改札口もないため駅西側には直接出られない。ミュースカイは120km/h近くで通過する。ホームには駅自動放送装置の他に、通常のサイズを一回り小さくした小型のLED式列車案内も設置された。2016年(平成28年)頃に駅舎上のマンションが取り壊された。
ホーム(改良前)
駅名標