新境川
那加バイパス付近から南は再び低地の堤防区間となる。境川に流れ込む三井川と三井山付近で立体交差する。
各務原市大佐野町付近の中屋大橋を過ぎると、新境川は木曽川上流改修工事以前の木曽川右岸堤防内に入る。この区間は現在木曽川分流の北派川の位置づけられており、新境川を管理する岐阜県および北派川を管理する国土交通省は河川管理上「新境川は北派川に合流する」と定義しており、岐阜県と国土交通省の管理境界柱が中屋大橋の北1メートル地点に設置されているが、木曽川から北派川への分岐部は出水時以外は水が流れ込まない越流堤となっている。そのため実態としては新境川は北派川へと合流せずに北派川河川敷内を流れており、平時は水は流れていない北派川河川敷には公園などが整備されており、河川敷にある自然共生研究センターの実験河川などは新境川の水が引き込まれている。そのため河川管理上「北派川」とされている区間は「北派川」とされることもあれば、必要に応じて「新境川」と説明や表記されることもある。