BSフジ
フジテレビ制作の作品 Dr.スランプ アラレちゃん 空想科学世界ガリバーボーイ 銀河鉄道999 新竹取物語 1000年女王 ひみつのアッコちゃん タイムボカン ゲゲゲの鬼太郎(第3期シリーズ) ドラゴンボールZ 金色のガッシュベル!! デジモンセイバーズ 蟲師 二十面相の娘(DO!深夜枠内) 恋時雨
ピポパポパトルくん(BSフジ初のオリジナルアニメ)
ねぇみんな... ふーちゃんの福島民話館(福島中央テレビ〔日本テレビ系〕制作)※2本立て
銀河鉄道物語
魔豆奇伝パンダリアン(TOKYO MXでも放送)
ネポスこどもCLUB(キッズステーションでも放送)
別冊ネポスこどもCLUB
チップとデールの大作戦レスキュー・レンジャーズ
リトル・マーメイド
ラマだった王様 学校へ行こう!
夢使い
キム・ポッシブル
クリスタル ブレイズ
ストレイシープ ポーのちっちゃな大冒険
ドーラといっしょに大冒険
体育倉庫〜ジムくんとゆかいな仲間たち〜 ※フジテレビ地上波で2009年7月〜8月に放送
天体戦士サンレッド
世界名作劇場 レ・ミゼラブル 少女コゼット ポルフィの長い旅 こんにちは アン 〜Before Green Gables 母をたずねて三千里
ネリーとセザール
ぐんまちゃん(第1期は未放送)
以下は、BSフジが製作委員会に参加した作品。
暗殺教室(フジテレビ、関西テレビと共同で参加)
俺がお嬢様学校に「庶民サンプル」としてゲッツされた件 その他の深夜アニメは、アニメギルドを参考。
海外で制作された作品(カートゥーン)やキッズアニメにおいては、全てのエピソードの放送完了後、すぐ翌週に第1話にさかのぼって再放送を繰り返し行うヘビーローテーション形式が採られることが多い。
深夜アニメに関しては、開局から散発的に放送が続いていた(フジ地上波系の深夜アニメについては後述)。2014年1月期、地上波独立局系アニメ(UHFアニメ)『スペース☆ダンディ』で初めて製作委員会に参加したのを皮切りに、深夜アニメの放送や製作委員会への参加にも積極的な姿勢を取るようになる。2017年4月からは平日に『アニメギルド』というアニメ放送枠を新設。以後、現在に至るまで枠の曜日・数を毎期ごとに微妙に変えながら放送中(現在は月・木・金 0:00 - 0:30、火・水 0:00 - 1:00、BSフジで非ネットだった『こちら葛飾区亀有公園前派出所』はBS12トゥエルビで放送)。
なお、かつてはフジ地上波系列を主軸として展開している深夜アニメ枠『ノイタミナ』枠も放送していたが、2013年1月期を最後に放送休止(現在は新作や旧作を不定期で放送)。約5年後となる2018年10月期からはフジ地上波系列において新設された深夜アニメ枠『+Ultra』を、アニメギルド枠扱いで同時期放送開始。
2018年には、さいたまスーパーアリーナで毎年8月に行われる世界最大のアニメソングのライブイベント『Animelo Summer Live』の主催者となった。
FUN!FUN!RUN!ランナーズTV
フォーミュラ・ニッポン
Fナビ!
D1 KING!
グッドウッド・フェスティバル(西暦)
GOLFING WORLD
増田オートサロン
F1グランプリ(2012年 - 2015年)
bjリーグ中継
日清オイリオ Presents『アスリートの食卓 - Beautiful ENERGY -』
日清オイリオ Presents『アスリートのチカラ〜one secret piece〜』
First RIDE 〜Surf&Sup
INAC TV
全米プロゴルフ選手権(2017年 - 2018年。予選ラウンド2日間の模様を生中継。また大会期間中は夕方にダイジェストを放送)
ハル常住のゴルフトランスポーター
全日本スーパーフォーミュラ選手権大会
スーパーフォーミュラGOON!
お台場バドミントン学園
Attest 〜WEEKLY GOLF NEWS〜
青い森の国から(青森テレビ制作)※2005年3日まではBS-i(現・BS-TBS)で放送していた。 京のいっぴん物語(KBS京都制作) お伊勢さん(三重テレビ放送制作) 熊野古道〜お伊勢さんからもうひとつの聖地へ〜(三重テレビ放送制作) 芭蕉が詠む 祈りのこころ(三重テレビ放送制作) 東京号泣教室 〜ROAD TO 2020〜 料理昔ばなし 〜再現!江戸時代のレシピ〜 アニソンCLUB!(TOKYO MX製作) お伊勢参り(三重テレビ制作) 祈り〜神と仏と〜(三重テレビ制作)
※一部の番組はフジテレビワンツーネクストの各チャンネルでも放送中。
HEY!HEY!HEY! MUSIC CHAMP 料理の鉄人(※2本立て) Iron Chef America 料理の鉄人USA版 僕らの音楽2 ニューデザインパラダイス 今宵ひと皿 ヤサイ、サイタ いただき+ そこが聞きたい!ニッポンの明日 Asian Muse Vメシ!→Vメシ!DREAM→Vメシ!DREAM2 ザ・ノンフィクション(現在も不定期で主に「BSフジサタデースペシャル枠」でザ・ノンフィクション特別編として放送している。) スパイストラベラー
2022年1月23日午前(22日深夜)放送のアニメ番組『電脳コイル』1~6話一挙放送で、画面の中央付近が圧縮され、左右端は引き延ばされるような歪みが生じた。視聴者から「顔が縦長」「中央付近と両サイドで縦横比が違う」などと指摘を受けて、BSフジは同月26日「アスペクト比(画角比)変換の不具合による放送上の不体裁があった」と認め、視聴者に不快な思いをさせたとして謝罪。その上で放送済みの回を後日再放送すると明らかにした。