ユビキチン
2004年度には「ユビキチンを介したタンパク質分解の発見」の功績により、アーロン・チカノーバー、アーウィン・ローズ 、アブラム・ハーシュコの3人がノーベル化学賞を受賞した。
ユビキチン同士はいくつかの結合の仕方があり、それによって機能が異なってくる。ユビキチンには7つのリシン残基(Lys, K)があり、ポリユビキチンを形成する際、このリシンと別のユビキチンのC末端にあるグリシンがアミド結合を作るが、どのリシンを結合に使うかでユビキチンの機能が異なってくる。また、N末端のメチオニンとC末端のグリシンが結合してポリユビキチンを形成することもある。以下に、主なユビキチン(ポリユビキチン)鎖を整理する。
K48ポリユビキチン鎖:48番目のリシン(K48, Lys48)を介したポリユビキチン。プロテアソームによる分解シグナルを伝える。
K63ポリユビキチン鎖:63番目のリシン(K63, Lys63)を介したポリユビキチン。このポリユビキチン鎖がタンパク質と相互作用してシグナル伝達やDNA修復を行う。
直鎖状ポリユビキチン鎖:1番目のメチオニン(M1, Met1)を介したポリユビキチン。NF-κBの活性化に関わる。
Lys48を介したテトラユビキチン(K48ポリユビキチン鎖)
Lys63を介したテトラユビキチン(K63ポリユビキチン鎖)