BLUE GENDER
不治の病のために、未来に希望を託して冷凍睡眠に入った患者たちのこと。後に、その病の原因がB細胞にあることが判明し、BLUE殲滅の切り札とするため、セカンドアースから世界各地に向けて回収部隊が送り込まれた。B細胞の活動が活発になると身体能力・運動能力が劇的に向上するだけでなく、同じくB細胞を持つBLUEの行動を察知できるようになるなど、BLUEへの対抗手段として有力視されている。もっとも、B細胞が活発化しすぎるとBLUEと同様の獰猛な性格に変貌してしまうなど危険性もきわめて大きく、セノはその抑制手段を探っていた。
声 - 米本千珠
セカンドアース・教育ステーションの指揮官。部隊任務不適合とれたマリーンに再教育を施そうとする。脱走したマリーンを追いつめた際みぞおちに手拳を食らわせたり、クーデターの際には自ら銃を手に取って戦うなど、気性が荒くも勇敢な女性である。クーデター後は独房に幽閉されていたが、自分はBLUEと戦うために生きて来たとの自負から脱走を図り、輸送船を奪って単身地上へと去って行った。その後の消息は不明。
第二次降下作戦開始後、最高議会に懸念を抱いたセノはクーデターを起こし、マリーンは祐司を止めるために遅ればせながら地球に向かう。豹変した祐司は鼻歌を歌いながらBLUEを殲滅し、マリーンにすら平気で銃を向けるようにまでなっていたが、マリーンの決死の説得により自分を取り戻すことに成功する。
しかし宇宙に戻った祐司とマリーンを待っていたのは、BLUEを使って医療ステーションを占拠したトニーだった。トニーと仲間のアリシア・ウィッスルを止めるために祐司は奮闘するも、二人とも祐司の説得に耳を貸そうとはしなかった。医療ステーションを破壊したことで脅威は去ったものの、祐司は再び仲間を守れなかった悲しみを背負うこととなった。
やがてセノはBLUEに支配された地上に戻ることを諦め、セカンドアースに永住する考えを固める。これに賛同できない祐司はマリーンと数名の仲間と共に、ギアナ高地で起きた巨大ネストの捜索も兼ねて地上に降りる。ネスト内部において最強のBLUEと戦闘になるも、辛うじて撃退。そして祐司は地球の意志に触れるため、マリーンに地上に戻るように説得する。マリーンは危険を承知の上で祐司について行こうとするも、祐司に、宿した祐司の子の身を思われたことで帰還する。そして地球の意志に触れた祐司は、BLUEによるプランド・スーサイダルの終わりを知る。マリーンの元に帰った祐司は、マリーンと共に地球で生きていくことを決意したのであった。
声 - 安田美和
スリーパー部隊第1小隊に配属されたスリーパー。トニー同様にセカンドアースで目覚めたため、地球の惨状を全く知らない。スリーパーとしての能力を発揮し始めた祐司に好意を抱き、祐司にアプローチをかけてくる。マリーンをライバル視し、対抗意識を燃やす。スリーパーとしての能力は低く、作戦行動中でもあくびをしたりすぐに愚痴をこぼすなど子どもっぽい言動が目につき、部隊の足手まといになることが多い。第二次降下作戦の際にトニーの手引きでBLUEに親密感を覚えるようになり、共にセカンドアースにBLUEを持ち込んだ。祐司に対しては最後まで好意を抱いていたが、祐司とともに生きることはできないと悟り、トニーと共に医療ステーションの爆発に飲まれて宇宙に散った。
声 - 桑島法子
本作のヒロイン。スリーパー回収部隊チーム・グランザイルに所属するアーマーシュライクのパイロット。銃器の扱いに長けており、アーマーシュライク搭乗時は主に狙撃戦を得意とする。さらにトラックやスペースシャトルの操縦技術も有する。過去にBLUEによって家族を殺害されており、その時に遭遇したセカンドアースの人間に助けられ、戦闘部隊の一員として育てられた。彼女をはじめとするセカンドアースの人間は地上に残された人類とは違った感性を持っており、軍規に忠実で冷徹な態度をとっていたが、祐司と行動を共にする中で豊かな表情を見せるようになった。当初はあくまでも「任務の為に」祐司を守っていたが、共に戦ううちに少しずつ心境に変化が見え、自覚のない好意を抱くようになる。
二足歩行トルーパー。作中では下記の3種類が登場。対BLUE用の人型戦闘機械。動力は発動機または充電によって得る。機関銃やミサイルなどで武装しているが、コックピットは半分むき出しの状態で、防御面はあまり重視されていない。 ブルズアイ 1人のパイロットが搭乗して操縦する。 グラップル 2人のパイロットが搭乗して操縦する。 ダブルエッジ スリーパー専用のアーマーシュライク。シールドやカッターを新たに装備している。
祐司ら日本のスリーパーを回収するために派遣された部隊で、マリーンが所属していた。脱出予定地のスペースポートがBLUEの襲撃によって使用不可能となり、隊員の大半も戦死するなど大きな被害を受けたため、韓国を経由してユーラシア大陸の部隊との合流を目指すこととなった。途中の戦闘で生き残っていたジョーイ、ロバートが共に戦死し、最終的にセカンドアースに生還できたのはマリーンのみとなった。