四次構造
沈降速度分析超遠心(並進拡散定数を測定)
動的光散乱(並進拡散定数を測定)
パルス勾配タンパク質核磁気共鳴(並進拡散定数を測定)
蛍光偏光(回転拡散定数を測定)
誘電緩和(回転拡散定数を測定)
MALDI-TOF質量分析法やSDS-PAGE法のように、変性条件(タンパク質の折り畳みがほどけた条件)下で質量や体積を測定する手法は一般的には使えない。変性条件は多くの場合、複合体を単量体に乖離させてしまうからである。しかし、時にはこれらの手法が用いられることもある。例えば、一旦架橋試薬で無傷の複合体を処理した後に、SDS-PAGEを適用することは可能である。