七尾線
2022年3月12日現在、特急「サンダーバード」が大阪駅 - 和倉温泉駅間を1往復、特急「能登かがり火」が金沢駅 - 和倉温泉駅間を4往復、1日計5往復の特急が運行されている。また臨時列車として特急「花嫁のれん」が土曜日・休日など多客期を中心に金沢駅 - 和倉温泉駅間を1日2往復運行している。
北陸新幹線の金沢開業後は金沢駅以東に乗り入れる特急をすべて廃止する方針を示していたが、石川県の要請を受けて、2014年1月28日に6往復は維持したまま、うち1往復(特急「サンダーバード」)は大阪駅直通とし、残り5往復を金沢発着のシャトル列車とすることがJR西日本から発表され、同年10月7日に後者のシャトル列車の列車名を特急「能登かがり火」に決定したと発表され、2015年3月14日より運行を開始した。北陸新幹線の金沢開業直前までは特急「サンダーバード」が4往復、エル特急「しらさぎ」が1往復、特急「はくたか」が1往復運転され、北陸本線(当時)と直通運転していた。現行の6往復と運転本数に変動はないが、特急の運転間隔は見直され、和倉温泉駅を特急「サンダーバード」36号が発車した直後に特急「はくたか」21号が発車するダイヤは廃止されている。2022年3月12日のダイヤ改正により、特急「サンダーバード」が1往復、特急「能登かがり火」が4往復、1日計5往復の運行体制となった。
以前はラッシュ時に松任駅・美川駅・小松駅まで直通運転する列車が設定されていたが、2014年3月15日にはこれらすべての列車が系統分割され、普通列車は金沢駅発着に統一された。
全列車原則としてワンマン運転を行っており(まれに車掌・機動改札員が乗務して車内改札を行う場合あり)、2023年8月1日よりすべての駅ですべてのドアから乗り降りができるようになり、切符や運賃は駅の集札箱に投入しても運転士に手渡ししてもどちらでもよいこととなった。ICカードの利用方法に変更はなく、無人駅でも本津幡駅のように車載型IC改札機にタッチする駅と中津幡駅のように地上型IC専用改札機にタッチする駅がある。2021年3月13日から2023年7月31日までは、中津幡駅 - 徳田駅間の無人駅(早朝夜間無人駅になる駅も含む)においては後乗り前降りのワンマン運転が実施され、乗車時は車内で乗車整理券が発行され、降車時は2両編成の場合は切符や運賃の収受を運転士が行い、列車内の運賃箱に投入するが、4両編成の場合は全てのドアが開いて自由降車となり、切符や運賃は駅の集札箱に投入する方式を採用していた。
2010年3月13日のダイヤ改正までは、金沢駅 - 七尾駅間で快速列車も設定されていたが定期列車としては廃止された。廃止日前日時点での停車駅は次のとおりであった。
金沢駅 - (東金沢駅) - (森本駅) - 津幡駅 - 宇野気駅 - 高松駅 - 宝達駅 - 羽咋駅 - (千路駅) - (金丸駅) - 能登部駅 - 良川駅 - (能登二宮駅) - (徳田駅) - 七尾駅 ( )は一部の列車のみ停車
モントレー・ジャズフェスティバル・イン・能登開催日には臨時列車が運転される場合があり、快速列車として運転される年もある。
2004年(平成16年)3月13日:七尾発金沢行きで「おはようエクスプレス」が運転開始。
2010年(平成22年) 2月18日:「あかね色」の単色塗装に変更された415系電車が運行開始。 3月13日:七尾線内の快速と「おはようエクスプレス」が廃止。
2011年(平成23年) 3月12日:681系・683系の普通列車での運用が終了。 4月2日 - 4月7日:東日本大震災で福島県内の車両部品工場が被災し保守部品調達の見通しが立たなくなったため、日中の金沢駅 - 七尾駅間(北陸本線直通列車含む)において、普通列車の本数や車両数の削減や行先変更が実施される。 7月1日:電化20周年および能登ふるさと博に合わせ、沿線にちなんだキャラクターが描かれたラッピング電車が運行開始。
2014年(平成26年) 2月4日:金沢発七尾行き普通電車が車両故障のために停車したが、交直セクション内に停車したため自力走行できず気温0度の中2時間30分立ち往生する。 3月15日:ダイヤ改正により、普通列車を金沢駅で系統分割し全列車が金沢駅発着となる。特急を除き金沢以南(松任・美川・小松方面)へ直通する列車が消滅。
2015年(平成27年) 3月14日:特急「能登かがり火」運転開始。特急「しらさぎ」「はくたか」の七尾線乗り入れ廃止。普通列車に415系のほか413系が投入される。 10月3日:観光列車として特急「花嫁のれん」運転開始。
2020年(令和2年)10月3日:521系100番台電車を投入。
2021年(令和3年)3月13日:全線でICカード「ICOCA」の利用が可能となる。ワンマン運転を開始(両数に関わらず特急列車以外の全ての普通列車がワンマン化)。