井上氏
建治元年(1275年)5月六条八幡新宮の造営費用が全国の御家人に求められると、信濃国に住む井上太郎跡(後裔)が3貫文を納めている。
南北朝時代の井上氏に関しては史料が残されていないが、観応の擾乱では諏訪氏らとともに足利直義に属した。応永7年(1400年)の大塔合戦では井上左馬助光頼が高梨氏や須田氏、島津氏、小柳氏、布野氏、中俣氏などと共に大文字一揆衆の一翼として、守護小笠原長秀を破ったが、後に室町幕府から派遣された代官細川慈忠によって井上氏ら国人の反乱は鎮圧されている。
応仁2年(1468年)、隣接する須田郷に攻め入って逆に須田雅政によって討ち取られた記録がある。その翌年にも井上政家が隣接する高梨政高と狩田郷の領有を巡って争奪戦を展開している。そして室町時代後期には隣接する越後との関係を強め、越後守護家山内上杉氏と守護代長尾氏の争いに巻き込まれた。永正10年(1513年)高梨氏の支援を受けた長尾為景と対立する守護上杉定実を応援するため島津氏や栗田氏、海野氏らと越後に侵入しようとした。
戦国時代には北信濃に侵攻してきた甲斐の武田信玄に対して、井上清政(昌満)は越後の上杉謙信に属して対峙した。
信濃を占領した甲斐武田氏が織田氏の甲州征伐で滅亡した後、本能寺の変で織田政権も撤退した(天正壬午の乱)。この機に北信濃を支配下においた上杉景勝により、井上達満も帰住が叶ったが、上杉氏が豊臣政権下で会津へ転封されると井上氏も随行し、のちに米沢藩士となった。
この信濃の井上氏が嫡流であるが、播磨、安芸、三河などに同族と称する一族が存在する。また、時田氏(常田氏)、桑洞氏、保科氏、高梨氏、須田氏、佐久氏、関山氏、蘆田氏、赤井氏(丹波赤井氏)、荻野氏、内田氏などは系図上は井上氏の庶流である。