ヴェネツィア領モレア
ヴェネツィアは住民との衝突を避けるため、現地のギリシャ正教会をほぼそのまま残した。しかしギリシャ正教の長であるコンスタンディヌーポリ総主教はオスマン帝国のスルターンの庇護下にあるため、ヴェネツィアはギリシャ正教会への不信を捨てられず、総主教への収入を制限したり、モレアの聖職者を総主教ではなく現地の教区で選出させるよう要求したりして総主教の影響力を弱めようとした。しかし、このモレア住民とコンスタンディヌーポリ総主教の関係を弱めようとする取り組みはうまくいかなかった。
一方でヴェネツィア当局は、カトリック教会の普及にも力を注いだ。領内のモスクを改修したり新築したりして教会を増やし、モレア内の様々な教派から修道僧を集めるなどした。1708年にはモドンにアルメニア・カトリック教会メヒタリスト派の教会が設立された。これはオスマン帝国による再征服後の1715年にヴェネツィア本国のサン・ラッザロ・デッリ・アルメニに移転した。モレアのカトリック教会は、コリントス大司教の管轄下におかれた。
ヴェネツィアとペロポネソス半島の関係は13世紀初頭の第4回十字軍までさかのぼる。この時ヴェネツィアは、ペロポネソス半島沿岸のモドン、コロン、ナフプリオ、アルゴスを獲得した。1460年にオスマン帝国がペロポネソス半島の大部分を征服した際にもヴェネツィア植民地は持ちこたえたが、第一次、第二次、第三次オスマン・ヴェネツィア戦争を経て順次奪われていった。またオスマン帝国は、キプロスやクレタなど他のヴェネツィア海外植民地も次々と奪取していった。
しかし1684年にオスマン帝国が第二次ウィーン包囲に失敗したことで風向きが変わった。ヴェネツィアは神聖同盟に加盟し、オスマン帝国に宣戦布告した(モレア戦争)。フランチェスコ・モロシーニの指揮のもとでヴェネツィアは優位に立ち、オスマン帝国の弱体化に付け込んで1684年のうちにレフカダ島を奪取した。翌年、モロシーニはペロポネソス半島に上陸し、2年のうちにギリシア人住民の支援を取り付け、半島とその中の要塞を制圧した。さらにヴェネツィア軍はギリシア中部に侵攻しアテネを制圧したが、ハルキス(ネグロポンテ)の城壁に阻まれた(ネグロポンテ包囲戦)。これ以降戦況は膠着状態に陥り、両陣営が互いの支配地を散発的に攻撃しあうにとどまった。1699年に神聖同盟とオスマン帝国の間でカルロヴィッツ条約が結ばれ、ペロポネソス半島(モレア)、レフカダ島、アイギナ島が正式にヴェネツィアのものとなった。