ロックマンゼロ4
かつてのイレギュラー戦争時にスペースコロニー「ユーラシア」が墜落・衝突した場所。現在もエリア・ゼロの中心部には落下したシリンダー型コロニーの残骸が突き刺さっている。一般的にはコロニー衝突による甚大な被害によって不毛な地となっているとされ、荒廃しきった世界の中でも特に踏み込まざる場所とされていた。だが実は、コロニーに搭載されていた環境維持装置が破損することなく残っていたことと、人間が侵入しなかったことによりコロニー残骸を中心に自然環境が回復し、ネオ・アルカディア外部では唯一人間が生存できる地域となっていた。
声 - 古澤徹
イカ(クラーケン)型。かつてはネオ・アルカディア所属のミュートスレプリロイドであり、ファントムからの直接命令でネオ・アルカディア内部の内偵・反逆者の処分を担当していた。そのため、彼の存在自体が秘密とされており、ファントムの死後彼の存在を知る者がいなくなった。水中戦を得意とし、ファントムの仇であるゼロへの復讐を果たす為不本意ながらもバイルに仕える。ドリル付潜水艦をプレートにくいこませ、潜水艦に積載した爆発物を爆破させ発生させた地震でエリア・ゼロの自然破壊を狙った自爆テロを行おうとしている。
大型転送基地のボス。大型転送基地のセキュリティプログラム。侵入者を察知すると、排除プログラムを発動させて体当たりや拡散弾等といった精密な攻撃を行う。モチーフは『ロックマンX』のランダバンダ。
本作では、シナリオが進むにつれチップが強制的に手に入るのではなく、ザコ敵などからパーツを入手してパワーアップチップを作る。前作と同様ヘッド、ボディ、フットの3局部をカスタマイズでき、ボディの開発にはパーツとは別に「セラミカルチタン」という特殊合金が必要。チップの他に特定の組み合わせでキーアイテム「Sクリスタル」を生成でき、チップ・Sクリスタル開発の条件に至らない組み合わせでは「ガラクタ」が作られる。
なおガラクタのヘッド・ボディ・フットを装備し、エルフのレベルを0に引き下げると、ゼロのステータスに変化が現れる。攻撃力が2倍となり、通常の3段斬りだけでもボスにも対応できる威力を持つが、反面防御力が半分に劣化、ナックルで入手した武器など、一部の攻撃も威力が変化しない。
声 - 藤本たかひろ
電磁マスドライバー施設の一部だったミノタウロス型。金属や自分の体のパーツを磁力で操作する機能を持つ。最大出力で戦うとネオ・アルカディア都市一区画分の電力を消費し、電子頭脳にも会話が遅くなる副作用が起こっている。大規模な磁場区域を設置し、電磁パルスでエリア・ゼロの環境維持システムを壊そうとする。作戦志願理由は「腹いっぱい喰えそうだから」(バイルから出された無制限エネルギー供給という条件に乗ったため)。
バイルの支配から逃れるためにネオ・アルカディアから脱走する人間・レプリロイド達が増加し、レジスタンスも脱走者達の救助活動を始めていた。ゼロ達は自然が唯一残った場所である「エリア・ゼロ」を目指す人間達を助ける。バイルは既に「エリア・ゼロ」に目をつけており、新たな部下達に狙わせる。当然ゼロは全員の迎撃に応じる。最後の戦いになる事も露知らず...