土佐くろしお鉄道
以後6月11日を「土佐くろしお鉄道 事故防止の日」に定め、毎年訓練を実施。
2000年(平成12年)11月1日:運賃改定。通学定期旅客運賃および特別企画乗車券の割引率引き下げ。
2002年(平成14年)7月1日:阿佐線(ごめん・なはり線)後免 - 奈半利間開業。
2003年(平成15年) 11月1日:nextstations、NPO砂浜美術館、大方町役場とのコラボ企画「ぶらぶら」実施。 12月8日:中村線 荷稲駅 - 伊与喜駅間が土砂崩壊により不通に。
2004年(平成16年)1月10日:中村線 荷稲駅 - 伊与喜駅間運転再開。
2005年(平成17年) 3月2日:宿毛駅構内で特急列車が衝突事故。宿毛線宿毛 - 中村間が不通に。以後3月2日を「土佐くろしお鉄道 安全の日」と定め、毎年訓練を実施。 4月7日:宿毛線東宿毛 - 中村間営業運転再開(普通列車のみ。特急列車は6月13日から)。 11月1日:宿毛駅営業再開。宿毛線全線営業運転再開。
2006年(平成18年) 3月1日:全駅で路線記号・駅番号表示を開始。 3月:日本初の本格バー「SUNTORY PREMIUM SUNSET BAR」運転。
2010年(平成22年)3月20日:中村駅リノベーション工事完成(9月29日にグッドデザイン賞特別賞・中小企業庁長官賞、10月1日に国土交通省 日本鉄道賞 特別表彰 地方鉄道駅舎リノベーション賞を受賞)。
2015年(平成27年)9月26日:この日中村駅で開催された中村駅まつりにて行われた投票により、中村線・宿毛線の愛称が「四万十くろしおライン」に決定。