函館基地隊
掃海部隊が配備されており、津軽海峡および宗谷海峡の海峡警備の拠点である。北海道における海上自衛隊の代表的な基地隊である。基地に「艦」規模の艦艇の係留能力はないが、函館港へのアメリカ海軍艦船の寄港は多い。交通の便や、大湊地方隊は北海道との関係がより重要であることから、大湊地方隊創設時に、地方隊総監部を、すでに航路啓開隊があった函館に設置する案があったが、結局、造修所など大日本帝国海軍以来の設備が残る大湊基地が総監部になった。それ以降も、何度か総監部の移転案が浮上しては、青森県やむつ市の猛反対により立ち消えという流れを繰り返している。