常磐緩行線
旅客案内上は、東京メトロ千代田線の北千住駅 - 綾瀬駅間を含んだ北千住駅 - 取手駅間の運転系統名として「常磐線各駅停車」「常磐線(各駅停車)」と呼称されている。北千住駅 - 綾瀬駅間はJR線として運賃計算する場合と東京メトロ線として運賃計算する場合の2つに分かれる特殊な区間となっている。このような特例は目黒駅 - 白金高輪駅間(南北線・都営三田線の共用区間)や京成高砂駅 - 印旛日本医大駅間(北総線・京成成田空港線の共用区間)間でも見受けられるものであるが、JR東日本は北千住駅 - 綾瀬駅間の第二種鉄道事業者ではないため、厳密には東京メトロの単独区間である。そのため、北千住駅 - 綾瀬駅間のみを利用する場合は、東京メトロの特定運賃(150円・IC運賃146円)として扱われる(北千住駅 - 綾瀬駅間の運賃の取り扱いについては「運賃計算の特例」の節も参照)。
各駅停車は地下鉄千代田線との直通運転により一体的に運用されているため、各駅停車は地下鉄区間とあわせて「千代田線」と呼ばれる場合がある。市販されている地図にも千代田線と表記したものがあるほか、不動産物件にも「千代田線北松戸駅」「地下鉄千代田線北柏駅」等の案内がある。不動産ポータルサイトなどでは「(JR)千代田・常磐緩行線」などの表記も散見される。
早朝から朝方と深夜の主に出入庫に伴う一部の線内運転電車を除き、ほぼすべての電車が東京メトロ千代田線に、さらに一部の電車は小田急小田原線伊勢原駅まで直通運転する。実態としては千代田線とほぼ一体化した運転系統を形成している。
常磐快速線(上野東京ライン)の南千住駅 - 上野駅 - 品川駅方面へは乗り入れないので、途中の快速停車駅もしくは東京メトロ千代田線北千住駅・西日暮里駅での乗り換えが必要となる(北千住駅・西日暮里駅での乗り換えは特例が設定されている。詳しくは後述)。
我孫子駅 - 取手駅間は平日の朝夕の時間帯のみ運行されている。朝夕にはこのほかに、松戸駅・柏駅発着の電車もある。これ以外は、ほとんどが我孫子駅 - 綾瀬駅( - 千代田線代々木上原駅)間で運転されている。日中の運行がない我孫子駅 - 取手駅間は、新製車両の試運転や訓練などに供されることがあり、過去には901系や松戸車両センター所属のE231系・E233系2000番台の試運転が実施されている。2013年12月7日・8日、2014年11月8日・9日には、快速線の利根川橋梁改良工事に伴い我孫子駅 - 取手駅間で緩行線の増発・延長運転が行われた。
信号システムはATC-10(東京メトロでの呼称:新CS-ATC)で、東京メトロ千代田線と同一のシステムを用いている(車内信号式。快速線はATS-P)。2000年8月16日より、従来のATC-4(営団地下鉄(当時)での呼称:CS-ATC)から切り替えられた。
なお、JR東日本保有車両は、小田急小田原線・多摩線と直通運転ができなかった。
旅客案内で使用される本系統のラインカラーは、基本的にはエメラルドグリーン(緑 ■)であるが、快速電車と同一であるため区別のために異なる色を使うことがある。
東京近郊路線図(現在の路線ネットワーク)では快速電車が緑(■)、各駅停車が地下鉄千代田線、東西線など地下鉄直通に使用している、グレー(■)であり、これは快速線のE231系電車に掲出している停車駅案内と同じであり(E531系電車はこの配色ではない)、駅ナンバリングのラインカラーにもこれを採用している。なお、緩行線の車両(203系・207系900番台・209系1000番台)の停車駅案内では逆に快速をグレー、各駅停車を緑としていた。
他に、快速線に青(■)を用いて緩行線に緑を採用する例のほか、快速電車のカラーとして黄緑(■)を使用し、各駅停車のカラーに緑(■)を使用しているものもある(E233系2000番台や小田急4000形のLCD上の路線図などで採用されている)。
車両の塗装は、金属色の車体にエメラルドグリーン(青緑1号 ■)のラインとなっているが、快速線向けのE231系電車や他のE233系等とは違い、緩行線向けのE233系電車については、幕板部にはこの色のラインは入っていない。