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会社の創業時からのビジネスであるLinuxサーバーを中心としたLinuxハードウェアビジネスは、Dell、HPなどのサーバーベンダーがLinux対応を進めるに従い、2000年頃には厳しい競争に晒され始め、営業損失を記録するようになった。結局、2001年6月26日に、売上のほとんどを占めていたLinuxハードウェアビジネスの事業から撤退し、多くの人員削減を行い、新たにソフトウェア事業を立ち上げることになった。
2001年12月6日には、VA Linux Systems社はその名前をVA Softwareに変更した。しかし、VA Linux Systems社の唯一の海外法人であり、住友商事と合弁で立ち上げたVA Linux Systems Japan株式会社はその一連の事業変更へ追従せず、2002年1月には住友商事が筆頭株主となり、VA Software社から独立した動きを取るようになった。VA Linux Systems Japanは、現在もLinuxソフトウェアのビジネスを独自に行っている。
ハードウェアビジネスから撤退したVA Software社では、SourceForge.netを模したプロプライエタリソフトウェアの開発と販売を行っていたが、2007年4月24日にCollabNet社にソフトウェア事業の売却を行った。この事業売却によって、VA Softwareとしての全ての事業が消滅し、2007年5月24日にはSourceForge, Inc.へ社名を変更した。
1993年にスタンフォード大学の大学院生であったラリー・オーガスティンとジェームス・ベラによって、VA Research社として創業される。彼等は、当時に高価であったUNIXワークステーションの代替として、安価なPCにLinux OSをプリインストールして販売するという事業を開始した。Linuxを提供するハードウェアベンダーとしては、最も初期に出現したベンダーの一つである。このLinuxハードウェアの事業は急速な成長を遂げ、1998年には1億ドル以上の売上と10%の利益をもたらし、Linuxハードウェア市場の20%のシェアを握る最大手のベンダーとなった。
1999年の前半には、当時の競合企業であったLinux Hardware Solutions社を買収し、この買収を契機として社名をVA ResearchからVA Linux Systemsへの変更し、株式公開の準備を開始した。また、この同時期には、Linux.comドメイン譲渡のコンペに競り勝ち、Linux.comドメインを所有することになった。