京都総合運転所
2005年(平成17年)4月25日に発生したJR福知山線脱線事故の影響により、福知山線(JR宝塚線)で運用されていた宮原総合運転所の編成がATS-Pの対応改造を受けないまま2005年6月18日限りで同線の運用から離脱、その後2006年に当区へ転入してきた。2010年までに全編成へのATS-P取り付けが完了している。 S03編成は300番台車4両に100番台の電動車ユニットを組み入れた編成。 草津線と湖西線(京都駅 - 永原駅間)で運用されている。8両編成は嵯峨野線での運用実績もある。 S06編成は地域色となっている。 M117編成は寝台特急「WEST EXPRESS 銀河」用の車両となっている。
221系電車(96両) 4両編成(K編成)24本が所属している。山陰本線(嵯峨野線)・湖西線・草津線に残る113系電車を置き換えるため、2008(平成20年)1月から網干総合車両所より4両編成(C編成)が転入し、3月15日のダイヤ改正より営業運転を開始している。また、奈良電車区からも4両編成転入している。転入後霜取りパンタを取り付けた編成もある。 嵯峨野線では福知山電車区の223系5500番台との併結運用がある。
223系電車(8両) 4両編成(R01編成、R02編成)の2本が所属している。2021年2月に網干総合車両所より転入し、3月15日のダイヤ改正より山陰本線(嵯峨野線)にて営業運転を開始している。 網干総合車両所V56編成→京都総合車両所R01編成、網干総合車両所V57編成→京都総合車両ところR02編成と編成番号も変更されている。
元々は京都駅構内にあった京都客車区を前身とする。東海道新幹線の建設時に、客車区の場所に新幹線京都駅が建設されることが決定し、さらに新幹線開業後は東京と山陽方面を結ぶ列車がほぼ全て京都・新大阪駅発着に短縮されるため、より多くの列車を収容する設備が必要になったこともあって、現在地に移転した。