聖剣伝説 〜ファイナルファンタジー外伝〜
レベルアップの時に戦士、モンク、魔道士、賢者の4つから選択することができ、パラメータの上がり方が変化する。レベルアップするまで他の職業に変更できなくなる。
エンディングでは母の精神体が現れ、消滅してしまったマナの樹を復活させる方法として自身が「種」になる道を示される。悩んだ末にマナの種になることを決意し、主人公に別れの言葉を告げた。
GB版の攻略本では芽になったヒロインが主人公から水をあげられて世話をされ、戸惑っている。 新約での設定 女性主人公として登場し、ルートは一部のボス戦などがなくグランス公国関係などの絡みが多めである。また、マナの一族の娘で、隠れ村にて義母・イリスと二人暮らしをしていたが、邪教徒として迫害するシャドウナイトによって村を焼き払われた後にボガードと共に隠れ住むという設定に変更されている。武器はロッド(仲間時)、魔法はウィル・オ・ウィスプ(仲間時)。 一部攻略本や小説版などでは「エレナ」という名前が設定されており、『聖剣伝説 CIRCLE of MANA』でも使用された。
ゲームボーイ版の設定に加えて、ストーリー設定の追加とキャラクターの生い立ちなどに変更が加わっている。
主人公はヒーローとヒロインを選択する方式となっており、選択した主人公によって仲間となるキャラなどが異なる。ヒーローは原作同様に奴隷剣士となるが、グランス公国の大臣の息子という設定に変更されている。また、ヒロインが単純なNPCでなくなっていて、原作とはかけ離れた行動派として描かれている。しかし、性格が大幅に変わっているもののラストは原作通りのままとなっている。
他にも、ゲームボーイ版でストーリー上死亡するキャラが生存していることや追加で与えられている設定も数多くある。
そして怪物の姿となったジュリアスを打ち倒しヒロインを取り戻すが、直後、復讐鬼となり完全に人の姿を捨てたジュリアスが現れ最後の戦いを繰り広げ、今度こそジュリアスを討ち滅ぼし勝利した。しかし、マナの樹は消えてしまったため、ヒロイン自身がマナの樹となることで世界の平和のための犠牲になってしまう。ヒロインの母から「ジェマの騎士としてマナの樹になったヒロインを見守ってほしい」と頼まれ、心苦しそうにしながらも承諾した。
GB版の攻略本では最後の戦いの後、マナの樹の芽となったヒロインの側にいる姿が描かれている(水をあげて育てている)。 新約での設定 男性主人公として登場し、ルートはGB版・リメイク版と同じである。また、グランス公国大臣・エルマンの一人息子で、邪教徒であるヒロインを庇ったという理由で5年前に両親をシャドウナイトによって殺されたという設定に変更されている。武器はソード(仲間時)で、魔法はサラマンダー(仲間時)。 一部攻略本や小説版などでは「デューク」という名前が設定されており、『聖剣伝説 CIRCLE of MANA』でも使用された。
武器での攻撃は武器ごとに固有の動作が設定されており、特定の設置物を破壊することもできる。ただし、剣のみ「斬り」と「突き」の2種類あり、必殺技も同様である。また、武器ごとに必殺技が設定されており、画面下部のゲージが満タンになったときに武器で攻撃すると通常とは違う動作を行う。ゲージの溜まるスピードは精神の数値によって決まり、数値が高いほど速く溜まる。
魔法での攻撃は攻撃魔法ごとに設定された動作を行う。中には近くの敵を自動追尾したり、十字キーの入力で方向を指示したりするものもある。
防具を装備することで防御力を高めたり特定の攻撃に強くなったりするのはRPGと同じである。盾を装備している時には、主人公が向いている方向から来た攻撃を無効化することができる。ただし、装備している盾によっては無効化できないものもある。
プレイ感覚は『ゼルダの伝説』に似ている、というムックの評価もある。
画面をフルカラー用に一部調整。
空になった宝箱を攻撃した後、GB版では撃破エフェクトがなかったが本作では撃破エフェクトが追加された。
全てのアイテム・武器・防具・魔法に最大2行のヘルプ文が追加された。
アイテム・装備を整頓可能になった。ただし整頓基準を自分で変えることはできない。
GB版でスタートボタン・セレクトボタンで表示されるメニューが分割されていたが、本作では統合。新たにコンフィグの項目が追加された。
武器の攻撃判定が少し広くなり、攻撃したときの武器の見た目も若干大きくなった。また、一部の武器系統では青い残像が表現されている。
剣の突き攻撃は方向キーを素早く2回押す操作に変わり、剣の切りMAX攻撃はボタンを押し続けなくても回転が続く。
レベルアップの効果音が終わってもBGMのリセットはされなくなった。
経験値の獲得タイミングが変更、GB版は敵の撃破エフェクトが表示されるときであったが本作では攻撃が当たり敵のHPが0になった瞬間に獲得されている。
モーグリ状態に陥った際、GB版では一切のアイテムを使用できなかったが、本作ではモーグリ状態を治癒するアイテム「モグラのひげ」を使用できるようになった。なお、このアイテム自体はGB版から存在していたが効果が変更された。
追加武器として「マンティスのかま」が追加された。
ゲームに支障があるバグは改善されているが、ウェアウルフを用いた経験値取得や、アイテム欄をいっぱいにしてのレアアイテム入手、ブラッドソードを町人に使用しての回復といったものは仕様として修正されずそのまま残っている。
インターフェース面では、『聖剣伝説2』以降のシステムであるリングコマンドを採用した。
戦闘システムでは必殺技ゲージをヒット数でカウントするタイプに変更した。また、シリーズでお馴染みとなっている精霊を登場させ、特定の魔法を作らず、武器ごとに異なる動きをするように変更した。また、ゲームボーイ版では自動で行動していたNPCを操ることができるようになっており、パーティ人数は主人公として選んだキャラを含めて最大二人までとなっている。
ステータスには武器・魔法(精霊)の種類に応じた熟練度レベルを追加。武器レベルの上昇は必殺技ゲージのたまりやすさに直結するようになった。魔法(精霊)レベルの上昇は、魔法攻撃の威力上昇などに直結するようになった。また、レベルアップの時には、5つの職業タイプおよびランダム上昇タイプから選択することになるように変更となった。選択によって、ステータスの上がり方が変わってくるのは同じであるが、タイプの選択の回数によって得ることができる称号を追加したりしている(称号の中には『3』に登場したクラス名も多く含まれている)。
新たな要素として、『聖剣伝説 LEGEND OF MANA』からあった武器・防具を作成したり強化したりする工房、種を植えて果実を作る果樹園を追加。また、サボテン君のぼやきを聞くことができるサボテンハウスを追加。工房と果樹園はサボテンハウス内にある。
同社開発の『マジカルバケーション』から引き継がれたシステムとして、ゲームボーイアドバンス専用通信ケーブルを使用することで、他のカートリッジと通信(アミーゴシステム)を行うことができる。これにより、七賢者を用いた召喚魔法などができるようになった。