台湾総督府軍務局
1897年11月に設置された海軍幕僚の組織は次のように定められた。
海軍幕僚 参謀長 参謀(出師準備・作戦計画担当) 副官(人事・庶務担当) 機関長 軍医長 主計長
1901年(明治34年)7月4日、組織が縮小され、参謀長、参謀(事務担当)、副官、主計長が置かれた。さらに、1903年(明治36年)11月6日、主計長を廃止し、参謀長、参謀(事務担当)、副官を置き、1919年8月20日に廃止されるまで存続した。
1919年(大正8年)8月20日に台湾総督への軍事権の委任が廃止され、それに伴い陸軍部、海軍幕僚も廃止された。陸軍部は台湾軍に改編され、総督は台湾軍司令官に兵力の使用を請求できるものとされた。