松本地域
松本市山形村朝日村中学校組合 - 松本市、山形村、朝日村で構成。朝日村内にある鉢盛中学校を共同で設置・運営する。
塩尻市辰野町中学校組合 - 塩尻市と上伊那地域に属する辰野町で構成。塩尻市内にある両小野中学校を共同で設置・運営する。
辰野町塩尻市小学校組合 - 塩尻市と辰野町で構成。辰野町内にある両小野小学校を共同で設置・運営する。
麻績村筑北村学校組合 - 麻績村、筑北村で構成。麻績村内にある筑北中学校を共同で設置・運営する。