全国新制大学野球連盟
一方、戦前から続いていた全国高等専門学校野球大会も、終戦による再開後、1948年まで行なわれていたが、1947年から1949年の間に行なわれた学制改革の結果、旧制大学と旧制専門学校の全てが新制の大学として統合整理された。それを受けて学生野球界でも全国高等専門学校野球大会に代わる全国大会を実施する為に、全国新制大学野球連盟を1949年に発足。同年から全国新制大学野球選手権が開始された。なおこの大会と連盟には先の全国大学野球連盟を組織した、東京六大学、東都、旧関六は参加していない。
以後この全国大会は1949年から1951年まで3年に渡って行なわれたが、全国大学野球連盟と全国新制大学野球連盟を合併して真の大学日本一を決定しようという動きが徐々に大きくなった結果、1952年には統一された全国大会を開催する運びとなり、全国新制大学野球連盟を発展的に改称し、新しい全国大会を主催する為に1952年1月に全日本大学野球連盟が発足し、同年8月には、全国から8連盟(3大学連盟と5地区連盟)の春季の優勝校が出場し第1回の全日本大学野球選手権大会が明治神宮野球場で開催された。
こうして1949年に誕生した全国新制大学野球連盟は3年間の短い期間ながら、次のステップへの橋渡しとして歴史的を役割を終えて1951年に発展的な解散をした。
以下に、少ないながら確認出来ている当時の情況を示すものを記す。