制度的革命党
しかし、2000年の大統領選挙で右派のPAN出身のビセンテ・フォックスが当選し、同時に行われた国会議員選挙でも、上過半数を失い、下院では第1党の座もPANに明け渡し、71年間与党であった制度的革命党は野党に転落した。
2006年の大統領選挙では選挙連合「中道連合」(緑の党<PVEM>が参加)を結成、前党首のロデルト・マドラッソを擁立したが、PANのフェリペ・カルデロンと左派連合(PRDを主体とする選挙連合)のアンドレス・マヌエル・ロペス・オブラドール候補の狭間で伸び悩み、3位に留まった。同時に行われた下院選挙でもPANとPRDに次ぐ第3党に転落した。
しかし2018年7月の総選挙では、新興左派政党の国民再生運動(国家再生運動、MORENA)のロペス・オブラドールが当選し、国民再生運動および連携する労働党(PT)・社会結集党(PES)の3党の合計得票率が上下両院とも40%を上回り最大勢力となった一方、制度的革命党は得票率が両院とも20%を下回り地方首長選挙でも左派候補が躍進するなど低迷し6年ぶりに野党へと転落した。