フラボドキシン
フラボドキシンは様々な酵素と共役して、酸化還元反応に関わっているが、Nostoc sp.のようなシアノバクテリアでは、フラボドキシンは窒素固定を行う特殊な細胞であるヘテロシストに特異的に発現する。窒素固定反応において、フラボドキシンは光化学系Iで供給された電子により還元され、ニトロゲナーゼに電子を伝達する事でN2を還元し、アンモニアととH2を生成する。
フラボドキシンが活性を発揮するには、高い負の酸化還元電位が必要である。セミキノンのコンフォメーションは、フラビンのN-5位への水素結合によって安定化される。この結合は、結合部位の近くにあるトリプトファン残基と同様に、SQの反応性を低下させるのに役立っている。ヒドロキノン型は平面的なコンフォメーションを取る事で、不安定化する。電子移動はFMNのジメチルベンゼン環で起こる。