ベイズ法
ベイズ法は複雑な進化モデルを仮定しても最尤法よりも計算時間を必要としないという長所がある。ただし、近隣結合法や最大節約法と比較すれば時間を要する。また、事後確率が過大評価される点も懸念されている。