音楽取調掛
音楽取調掛では、音楽教員の養成や学校教育用の楽器の検討も行っていた。そして、日本音楽の教育には箏が、西洋音楽の教育にはオルガンがそれぞれ適しているとの結論に達した。また、日本音楽は和声を持たないこと、詞章が淫媚なものが多いのでそれを改良すべきとし、箏曲、長唄の改良を提唱した。このうち箏曲については実際に改良が行われた。
1884年9月、初めて府県派出音楽伝習生19人の入学を許可した(この伝習生が卒業後、各府県師範学校音楽科教員となる)。
1885年2月9日の文部省に於ける局課掛の改正により、「音楽取調所」と改称される。同時に本郷から上野公園博物館となりに移転した。12月にふたたび音楽取調掛と改称し、大臣官房付属となった。
1885年7月20日、音楽取調所第1回卒業演習会があり、全科卒業生、幸田延・遠山甲子・市川道の3人、ウェーバーのポラッカプリランテ、舞踏への勧誘などを演奏した。 1887年2月19日、第2回があり、卒業生一同、ベートーヴェン第1交響曲の一部を演奏した。
1886年、伊沢は同僚らとともに文部大臣森有礼あてに「音楽学校設立ノ儀ニ付建議」を提出。11月に矢田部良吉・外山正一らと提出した。これを受けて音楽取調掛は翌1887年10月5日に東京音楽学校として改組され、校長に文部省編輯長伊沢が任命された(兼任)。開校式には、山勢松韻の『都の春』が演奏された。
伊沢は、1880年3月2日に合衆国からメーソンを招いた。メーソンは1882年7月に帰国するまで、西洋音楽の日本への移入を指導した。『小學唱歌集』の編纂にも関わった。メーソンの後任はしばらく空席であったが、海軍軍楽隊教師として1879年より来日していたプロイセン王国のフランツ・エッケルトが1883年2月から1886年3月まで、オランダ出身のギヨーム・ソーヴレーが1886年4月から東京音楽学校に改組後の1889年1月まで指導を行った。
明治のはじめ、日本の音楽教育については、西洋音楽を日本に移植してそれのみを教育する、日本固有の音楽を育成発展させる、西洋音楽と東洋音楽の折衷、の3つの意見があった。伊沢は、折衷案をとり、その実現のための準備事業として、東西の音楽を折衷した新曲の作曲、将来の国楽(国民音楽)を興すべき人物を育成するための教育、諸学校に音楽を実施し、その適否を確かめるための実験の3つを挙げた。そのため、洋楽、雅楽、俗楽、清楽の調査研究を行い、それらをすべて五線譜に採譜すべきものとした。この研究は、日本の音楽が野蛮で劣るものとされた当時において、西洋音楽の直輸入により日本音楽が抹殺されるのを危惧し、特に日本の音楽と西洋の音楽に違いのないことを証明するのが目的であったといわれている。