ハンチンチン
ハンチンチンは少なくとも19種類のタンパク質と直接相互作用することが示されており、そのうち6種類は転写、4種類は輸送、3種類はシグナル伝達に関与し、その他の6種類(HIP5、HIP11、HIP13、HIP15、HIP16、CGI-125)は機能未知である。また酵母ツーハイブリッドスクリーニングによって発見され、免疫沈降によって確認されたものとして、HAP1(英語版)やHIPなど100種類以上の相互作用タンパク質が見つかっている。
ハンチンチンは次に挙げる因子とも相互作用することが示されている。
HIP2(英語版)
MAP3K10(英語版)
OPTN(英語版)
PRPF40A(英語版)
SETD2(英語版)
TRIP10(英語版)
ZDHHC17(英語版)
ハンチントン病はハンチンチン遺伝子の変異を原因とし、過剰な(36個以上の)CAGリピートの存在によって不安定なタンパク質が形成されることで引き起こされる。こうしたリピートの拡大の結果、N末端に異常に長いポリグルタミン配列が含まれたハンチンチンタンパク質が産生されるようになる。そのためハンチントン病は、トリプレット病もしくはポリグルタミン病と呼ばれる神経変性疾患群の一部を構成している。ハンチントン病において重要な意味を持つは、18番目のアミノ酸から始まるグルタミン配列の拡大である。発症していない人物ではこの配列には9個から35個のグルタミン残基が含まれ、この長さでは悪影響が生じることはない。36個から39個の場合、低い浸透率(英語版)で疾患の発症がみられる。
長いグルタミン配列を持つタンパク質は、細胞内の酵素によって断片へと切断されることが多い。こうしたタンパク質断片は神経細胞内部で神経核内封入体(neuronal intranuclear inclusions、NII)と呼ばれる異常な塊を形成し、また正常なタンパク質をこうした封入体へ引き込んでいる可能性もある。ハンチントン病患者でみられるこうした特徴的な封入体の存在が、疾患の発症に寄与していると考えられてきた。