天然記念物
植物では、30件が特別天然記念物に指定されている。
阿寒湖のマリモ : 北海道
野幌原始林 : 北海道
アポイ岳高山植物群落 : 北海道
早池峰山および薬師岳の高山帯・森林植物群落 : 岩手県
羽黒山のスギ並木 : 山形県
東根の大ケヤキ : 山形県
コウシンソウ自生地 : 栃木県
日光杉並木街道 附 並木寄進碑 : 栃木県
田島ヶ原サクラソウ自生地 : 埼玉県
牛島のフジ : 埼玉県
大島のサクラ株 : 東京都
白馬連山高山植物帯 : 長野県・新潟県・富山県
狩宿の下馬ザクラ : 静岡県
石徹白のスギ : 岐阜県
春日山原始林 : 奈良県
大山のダイセンキャラボク純林 : 鳥取県
加茂の大クス: 徳島県
宝生院のシンパク : 香川県
杉の大スギ : 高知県
古処山ツゲ原始林 : 福岡県
立花山クスノキ原始林 : 福岡県
相良のアイラトビカズラ : 熊本県
青島亜熱帯性植物群落 : 宮崎県
都井岬ソテツ自生地 : 宮崎県
内海のヤッコソウ発生地 : 宮崎県
喜入のリュウキュウコウガイ産地 : 鹿児島県
枇榔島亜熱帯性植物群落 : 鹿児島県
蒲生のクス : 鹿児島県
鹿児島県のソテツ自生地 : 鹿児島県
屋久島スギ原始林 : 鹿児島県