鉱毒
鉱毒で汚染された場所では、表土の土質や水分量が大きく変化する可能性があり、その地域の植生の変化につながる。ほとんどの植物は土壌中の低濃度の金属に対する耐性を持っているが、その感受性は種によって異なる。地被類の多様性と総被覆率は、高濃度の汚染物質の影響を受けにくく、広葉草本や低木よりも影響を受けにくい。より抵抗力のある種は、これらのレベルを生き延びることができ、土壌中の金属に耐えることができる。また、生態学的な主導権を獲得するために外来種が鉱山の周辺の土地に移動することもある。
例えば、ヒ素の土壌含有量は蘚苔類の多様性を減少させ、化学的汚染による土壌の酸性化もまた、種の数の減少につながる 。 汚染物質は微生物を改変したり、撹乱したりして、栄養の利用可能性を変え、その地域の植生の損失を引き起こす。