ゴエモンインパクト
『宇宙海賊アコギング』での新機能。獅子重禄兵衛と物知りじいさんが共同で開発した宇宙戦闘用追加ユニット。背中にサスケの頭部を模したユニットが組み込まれ、くない型ウイングを搭載している。このグレードアップによって、インパクトの正確な制御のために膨大な演算処理能力が急遽必要となり、オリジナルのサスケの頭部がコックピットの中央制御装置に組み込まれた。
落とし穴にはまったり地形に引っかかったりするとインパクトが大破し、ミス扱いにならない代わりに油の残量が大幅に減ってしまい、油が0になった時点でミスとなる。
後半の「巨大からくりメカ戦闘ステージ」ではコックピットからの主観視点による擬似3D戦闘となり、十字キーとボタンによって攻撃と防御を使い分けつつ敵の撃破を目指す。2Pプレイ時には照準が二つ表示され、協力プレイが可能。また、前述の設定通り、高速アクションステージ同様、時間経過でも油の残量が減少してしまい、時間経過によって油が0になった時点で強制的に敗北になってしまう。
エリア5のクリアデモにおいて、上空に滞空するマッギネスの空中要塞に向かうためにハイジャンプを繰り出すものの、勢い余って空中要塞の本体に激突して突き刺さったため動けなくなってしまい、その場に乗り捨てていかなくてはならなくなってしまう。その後、マッギネス将軍の影武者との闘いに気を取られている隙に本物のマッギネス将軍に乗っ取られて最終ボスとして立ちはだかることになり、激闘の末、機能停止する。 エンディングでは中に乗ったまま放置されたおみつがマッギネス将軍のアドバイスに従って真ん中の赤いボタンを押したことで暴走を始めてしまい、街を破壊しつつ爆走した後、頭部がもげ落ちて大破してしまう。この件に関してはクリア後にものしり爺さんに話しかけることで暴走の理由が判明する。
敵を空高く蹴り上げる。この時の「ぼよよん」という効果音が名前の由来。
声優は松本保典。ゲーム版のようにほら貝を吹いて呼ぶのではなく、小型の人形形態からゴエモンの吹くほら貝の音によって巨大化するという設定になっている。人形形態時ののインパクトは表情が違い、頭身も小さい。ゴエモンがパワー不足の場合、ほら貝をしっかり吹けずインパクトにパワー不足と警告される場面もある。口調は基本的にゲーム版基準。基本的に笑っている顔で戦闘するのだが、話が進むに連れて表情が豊かになっている。
主にパンチで攻撃し、時には敵の武器を利用して攻撃したりする。キック技やキセルなどはあまり使わず、ハナ小判は装備されていない。唯一ゲーム版から名前を流用している技は百烈パンチとキセルボムだけだが、キセルボムはゲーム版とは異なる機能である。コックピットはアニメ版オリジナルで、コックピットに入る描写は基本的にゲーム版と一緒。ゴエモンが中央に座って操縦し、敵に止めを指す際は鈴を鳴らす。定員は中央と左右の3名、後1名の4名で、椅子を使わない場合は少なくとも5名は搭乗可能だが、2人は立っていることになる。椅子は左右連動しているらしく、2人だけで乗った際は空席でもコックピットに出ている。中央にいなくても左右の2人で操作は可能。
搭乗方法は描写されておらず不明である。逆に脱出描写はいくつかあり、セップク丸に空から落とされ故障した際は口から出てきており、宇宙から地球に落ちてくる際には頭が割れて脱出カプセルが飛び出している。
デザインはほぼ従来通りだが、足がローラーブレードという相違点がある。最終決戦において「サスケユニット」を中心とした宇宙戦特化型「ゴエモンインパクト・ゴージャス」に改良された。
インパクト戦関連における仕様はSFC版『3』のシステムを踏襲しており、戦闘開始前の前哨戦ステージは「激震インパクトステージ」となっている。また3D作品で省略されたコクピット側のパイロット描写が復活(旧作では2人までだったが、本作では4人全員が描写されている)しており、戦闘開始前の敵とのやり取りや戦闘の状況に応じてキャラクターがリアクションを取るようになっている。インパクト戦はSFC版同様の2D構成であり、技構成や戦闘システムを『3』からほぼそのまま踏襲しているため、照準カーソル移動時の視点変化は存在しない。一方、ハードをプレイステーションに移したことにより、敵キャラクターやインパクトの技のエフェクト等は全てポリゴンモデルによる3D演出が施されている。
本作では「ネオ桃山幕府」におけるシステムを流用しているため、搭乗方法やコックピットのデザイン、一部の武器や必殺技もそちらを踏襲している。定員は中央2名、左右2名の4名で、デモシーンにおけるコックピットのデザインがアニメ版に近いデザインになっている。搭乗方法は緑のビームによる吸引で口からとなっており、SFC版『3』『アコギング』同様に4人揃って搭乗する。
『ネオ桃山幕府』から『でろでろ道中』の説明書で語られた話の流れを引き継いでいるのか、おかまバーらしきところで働いているらしく、エンディングではバニーガール姿で現れた。(この時のしゃべり方もなぜかおかまっぽくなっている)
足に付いたローラーを駆動させ、ローラースケートの要領で目的地までの高速移動を行う。前述の通り、高速移動中は装甲が極端に脆くなり、大型建造物に当ったり足が障害物に引っかかると簡単にバラバラになる。『獅子重禄兵衛のからくり卍固め』では、このローラー駆動装置の起動ボタン「たーぼ・すいっち」が故障していたため、徒歩での低速移動を余儀無くされた。