サーペント・マウンド
1885年、彼は、北米各地のマウンド遺跡をたずね、それらの遺跡が耕作によって徐々に破壊されていっているのをみた。そこで、彼は、1886年、ボストンで個人的に基金をつくって、募金を募った。そして1887年、サーペント・マウンドのある土地を購入し、その土地は、ピーボディ博物館の管理下に置かれることになった。パットナムは、1887~89年の3年間にわたり、サーペント・マウンドとその近くにある円錐形のマウンドの内容と埋葬形態を明らかにするために発掘調査を行った。調査が終了すると、調査成果に基づいてサーペント・マウンドを復元した。
このようなパットナムの努力が認められて、1888年、考古遺跡の保存についてのアメリカ最初の州法がオハイオ州の議会を通過した。1900年には、ハーバード大学から「オハイオ州歴史協会」にサーペント・マウンドの管理が委譲され、オハイオ州の最初の州立史跡となった。パットナムによるサーペント・マウンドの保存運動は、アメリカ国内において考古遺跡について国立、州立史跡を公園として整備する道すじをつけることになった。