フィリピン国鉄
バラグタス - カバナトゥアン支線
ブラカン州バラグタス(英語版)からヌエヴァ・エシハ州カバナチュアンまでを結ぶ。第二次世界大戦時に一時的に廃止になる。1969年に再開。1980年代に全線廃止。
アラヤット - カルメン支線
パンパンガ州アラヤット(英語版)からフロリダブランカ(英語版)までを結ぶ。本線とはサンフェルナンドで接続されている。
フォート・ストッツェンバーグ - ダウ支線
パンパンガ州マバラカットとアンヘレスを結ぶ。
ダウ - マガラン支線
パンパンガ州マバラカットとマガラン(英語版)を結ぶ。
タルラック - サンホセ支線
タルラック州タルラックからヌエヴァ・エシハ州サンホセ(英語版)までを結ぶ。イサベラ州およびカガヤン州への延伸が計画されていた。
タユグ支線
タルラック州パニキ(英語版)からパンガシナン州サン・キンティン(英語版)までを結ぶ。タユグ(英語版)は経由する町。
サン・ファビアン - キャンプ・ワン支線
パンガシナン州サン・ファビアン(英語版)とラウニオン州ロサリオ(英語版)を結ぶ。バギオを目指した路線であったが1914年に廃止。
アリンガイ - バギオ支線
ラウニオン州アリンガイ(英語版)とベンゲット州バギオを結ぶ。山岳地帯のため複数のトンネルがスペイン植民地時代に建設されたが、第二次世界大戦時に廃止。アリンガイの三角線とトンネルが残っているのみである。
サンタ・メサ - アンティポロ支線
マニラからリサール州アンティポロまでを結ぶ。サンタ・メサ駅からグアダルーペ駅までの6kmの区間はグアダルーペ線とも呼ばれた。また、パシッグにあったロサリオ駅はロサリオ - モンタルバン支線と分岐する。
ロサリオ - モンタルバン支線
パシッグからリサール州モンタルバン(英語版)までを結ぶ。
パコ - ナイク支線
マニラからカビテ州ナイク(英語版)までを結ぶ。
レガスピ - タバコ支線
アルバイ州レガスピからタバコまでを結ぶ。
サン・パブロ - マルバール支線
ラグナ州サン・パブロからバタンガス州マルバール(英語版)までを結ぶ。かつての本線であったが、ロス・バニョス - サン・パブロ間の開通に伴い廃止。