非相同末端結合
DNA末端の結合はLigIV、XRCC4、XLFで構成されるリガーゼ複合体によって行われる。これらの複合体はそれぞれのタンパク質がDNA-PKと相互作用することでDNA末端に招集される。LigIV単体でDNAリガーゼとして機能するが、XRCC4無しではタンパク質レベルで不安定であり、in vivoにおいて常にLigIV/XRCC4複合体として存在していると考えられている。またXLFはミスマッチDNAのライゲーションやLigIVの再アデニル化の活性化などの補佐的な役割持つことが知られている。