太陽虫
二界説の時代には原生動物門形走亜門肉質虫綱軸足虫亜綱太陽虫目、五界説では有毛根足虫(肉質鞭毛虫)門肉質虫亜門軸足虫上綱太陽虫綱として分類されていた。しかし電子顕微鏡を用いた微細構造観察や分子系統解析が進んだことで、全く異なった生物から収斂的に生じたことが明らかになっている。そこで分類学上は内質太陽虫類の一部のみを残し、それ以外の群はストラメノパイル類やケルコゾア門などの中にばらばらに所属させるという扱いになっている。
以下は伝統的な分類体系であり、現在の所属は矢印で示してある。
カラタイヨウチュウ目 Centrohelida(内質太陽虫類、→有中心粒類)
タイヨウチュウ目 Actinophyrida(無殻太陽虫類、→ストラメノパイル)
カゴメタイヨウチュウ目 Desmothoracida(有殻太陽虫類、→ケルコゾア)
キリオフリス目 Ciliophryida(→ストラメノパイルおよび→ケルコゾア)
スチコロンケ目 Taxopodida(→放散虫)
ロトスファエリダ目 Rotosphaerida(→オピストコンタ)
スチコロンケ目は一般的な太陽虫とはやや異なっていて、外に類似のものがいないのでここに含めた、という気配の強いものであった。詳しくは下記のそれぞれの説明を参照のこと。