飛騨川
人家や事業所が集まる旧萩原町や旧下呂町の川沿いの地域は飛騨川の氾濫原にあたり、たびたび洪水被害に見舞われてきた。1958年7月、総雨量700mmに達する豪雨により、下呂大橋下流左岸が破堤、益田橋・朝霧橋・円通橋が流失、死者1人・家屋流失28件などの被害があった。1983年9月、昭和58年台風第10号にともなう豪雨で溢水や破堤が発生、旧下呂町で床上浸水36戸・床下浸水173戸などの被害が出た。2020年7月8日、下呂市萩原町中呂(左岸)付近で氾濫した。氾濫の数時間前に岐阜県と長野県に大雨特別警報が発表されていた。