鰐淵寺
南北朝時代には鰐淵寺の北院と南院は、それぞれが北朝・南朝を支持して対立した。元弘2年、後醍醐天皇が隠岐に流された際、南院の頼源大師が御所に伺候し、宸筆の願文(倒幕の所願を遂げたら薬師堂を造営するというもの)を賜った。この願文は現存し、重要文化財に指定されている。頼源は後醍醐の隠岐脱出を助け、南朝に忠誠を尽くした。
南院・北院が和解したのは貞和3年(1347年)のことで、これを機に寺は唐川から別所に移り、北院の千手観音と南院の薬師如来をともに本尊として安置することになった。
絹本著色山王本地仏像 - 室町時代初期
絹本著色毛利元就像 - 室町時代後期
絹本著色一字金輪曼荼羅図 - 鎌倉時代初期
鰐淵寺根本堂 - 天正5年
2005年9月4日、重要文化財4件を含む6件13点の所蔵品が盗難被害に遭った。被害に遭い、所在が不明となっている指定文化財は以下の通りである。
絹本著色山王本地仏像
絹本著色一字金輪曼荼羅図
紙本墨書後醍醐天皇御願文
紙本墨書頼源文書
絹本著色釈迦三尊十六善神像
紺紙金泥妙法蓮華経 8巻