日本の重要湿地500
犬吠埼周辺沿岸
小野川
はきだし沼
九十九里浜(栗山川~新川)
ジュンサイ池
北総地域の谷津田、水路、湧水
成東湿原
房総半島中部の谷戸(谷津)群
房総丘陵の谷津田、湧水地
一宮川ならびに夷隅川河口干潟
館山湾
館山波佐間、坂田
鵜原地先沿岸・鯛ノ浦
東京湾の干潟・浅瀬(盤洲干潟、富津干潟、三番瀬、谷津干潟、小櫃川河口、葛西、東京港野鳥公園、中央海浜公園、森ヶ崎、多摩川河口、野島海岸など)(千葉県、東京都、神奈川県)※(谷津干潟)
岩美地先沿岸
唐川湿原
菅野湿原
多鯰ヶ池
神戸ノ上湿地
中海(大橋川を含む)(鳥取県、島根県)※
南三陸海岸沿岸(御伊勢浜ほか)
志津川湾
万石浦
仙台湾および仙台海浜(松島湾、蒲生干潟、井戸浦潟、広浦、鳥の海など)
伊豆沼周辺湖沼群(伊豆沼、内沼、長沼など)※
蕪栗沼 ※
相野沼
化女沼 ※
旧品井沼周辺ため池群
北上川(河口域)・長面浦
田谷地沼・かば谷地・すげ沼湿地池沼群
蔵王山周辺湿原群(芝草平、イロハ沼湿原群、御田の神湿原、地蔵岳雪田、熊野岳雪田など)(宮城県、山形県)
知床半島山稜湿原(羅臼湖、二ツ池、知床沼高山湿原)
知床半島東部沿岸
野付半島・野付湾・尾岱沼 ※
標津湿原
茨散沼湿原、兼金沼・西別川湿原
根室半島湿原群(歯舞の台地、ホロニタイ・フレシマ湿原、丹根沼・オンネ沼、南部沼、長節沼、落石岬湿原、落石西湿原、落石湿原、ヒキウス沼、沖根辺沼)
根室湾干潟
知床半島サケ・カラフトマス遡上河川群
風蓮湖・春国岱・温根沼および周辺湿原群 ※
ユルリ島湿原
霧多布湿原・幌戸湿原および地先沿岸(琵琶瀬湾、浜中湾、琵琶瀬川)※
火散布沼および藻散布沼
厚岸湖 ※(「厚岸湖・別寒辺牛湿原」として登録)
厚岸湾
別寒辺牛湿原 ※(「厚岸湖・別寒辺牛湿原」として登録)
屈斜路湖周辺および釧路川源流域
阿寒湖と流入・流出河川(パンケトー、ペンケトーを含む)※
釧路湿原(赤沼、塘路湖、達古武沼、遠矢採草地、シラルトロ湖などを含む)※
馬主来沼
キナシベツ湿原および音別川・尺別川