奈古駅
1929年(昭和4年)4月24日:国有鉄道美禰線(当時)が東萩駅から延伸し、その終着駅として開業。客貨取扱を開始。
1931年(昭和6年)11月15日:美禰線が宇田郷駅まで延伸し、途中駅となる。
1933年(昭和8年)2月24日:当駅を含む美禰線の一部区間が山陰本線に編入され、山陰本線所属駅となる。
1979年(昭和54年)3月31日:貨物取扱を廃止。
1980年(昭和55年)8月31日:集中豪雨の影響により、奈古駅 - 長門大井駅間で斜面崩壊が発生し不通になる。10月9日にいったん復旧するが、10月24日に土砂崩壊が発生し再び不通になる。翌1981年(昭和56年)3月5日に厚さ2mの落石覆いを設置して、復旧する。
1984年(昭和59年)2月1日:荷物扱い廃止。
1985年(昭和60年)3月14日:駅員無配置駅となる。
1987年(昭和62年)4月1日:国鉄分割民営化により、西日本旅客鉄道(JR西日本)の駅となる。
2012年(平成24年)2月18日:上下線双方の列車が同一ホームに発着するようになる。
2013年(平成25年)7月28日:豪雨災害により線路が被災し、一時当駅を含む益田駅 - 長門市駅間が運休(※当駅 - 長門市駅間については同年8月4日に運行再開。須佐駅 - 当駅間は2014年8月10日に運行再開)。
2016年(平成28年)3月26日:当駅折り返しだった列車が隣の木与駅発着に変更となる。