Mass Effect
リーパーは5万年前に繁栄していたプロセアンという種族を滅ぼした機械生命体と噂されているがその存在を示す証拠は何もなく、評議会も伝説の存在として重要視しなかった。ベネジアには娘のリアラがいることがわかった為、シェパードはリアラに協力を依頼する。プロセアンの研究者であるリアラはアサリ族のもつ精神感応の力でシェパードの頭に流れ込んだビーコンの情報を読み取る。その結果ビーコンからの情報は警告であることが分かるが何に対しての警告かまでははっきりとわからなかった。
ベネジアを発見したシェパード達は戦闘になるが、戦闘が終わるとベネジアは「自分はサレンに洗脳されており、その力はエデンプライムを襲ったサレンの旗艦であるソヴリンから出ている」と伝える。すでに抵抗できないところまで洗脳が進んでしまったベネジアは自分を倒すようシェパードに伝え、やむを得ずシェパードはベネジアを倒す。サレンが軍事基地で戦力を育てていることをつかんだシェパードは基地を破壊するため惑星ヴァーマイアへ向かう。そこでシェパードはソヴリンがただの宇宙船ではなくリーパーそのものだという事を知る。ソヴリンの目的は5万年前と同じ銀河系にいる有機生命体の根絶であり、黒幕と思われていたサレンも操られているだけであった。サレンはコンジットと呼ばれる何かを探すため、惑星アイロスに向かっていた。
声:セス・グリーン
ノルマンディー号の操縦士である人間の男性。先天性の骨の病気により歩行困難だったが、両親が軍人であったことから宇宙船操縦士の道を選んだ。肉体のハンデを他で補い、軍学校を首席卒業した努力の人。腕前は一級で、困難な操船もやってのける。皮肉屋で、どんな苦境にあってもシニカルな態度を取る。なお、クルー間での呼び名「ジョーカー」は、訓練生時代に笑顔をほとんど見せず訓練に打ち込む彼の姿を見た上官から付けられたあだ名。
声:Mark Meer/ジェニファー・ヘイル(女性版)
本編の主人公。過酷な任務を生き抜いてきた事から軍内部での評価は高く、シタデル評議会へ人類初のスペクター候補として推薦されている。その試験であるエデン・プライムでの任務においてビーコンに接触、脳内へ未知のメッセージを流し込まれたことで、銀河を揺るがす陰謀を防ぐ大役を背負わされる。戦争の英雄という過去の経歴は共通だが、その人柄はプレイヤーの選択如何によって大きく異なることになる。
ファーストネームは自由に設定可能であり、男性選択時の初期設定名はジョン・シェパード、女性の場合はジェーン・シェパードとなっている。