マツモトキヨシ
10月22日 - 岐阜県岐阜市JR岐阜駅高架下の商業施設アスティ岐阜に岐阜県1号店となるアスティ岐阜店を開店。 10月 青森県青森市の青森駅ビルに青森県1号店となる青森駅ビルラビナ店を開店。 大分県大分市のパークプレイス大分に大分県1号店となるパークプレイス大分店を開店。 12月13日 - 三重県津市の津駅ビルCHUMに三重県1号店となる津駅ビルチャム店を開店。 12月20日 - 京都府京都市下京区に京都府1号店となる京都四条通り店を開店。
2004年 2月10日 - 福岡に本社を持つ株式会社ドラッグイレブンと業務提携。 3月 岩手県盛岡市の盛岡駅ビルフェザンに岩手県1号店となる盛岡駅ビルフェザン店を開店。 副社長の国行清が退任(創業以来の大番頭。「マツキヨ」のもう一人の「キヨシ」)。 5月24日 - 長野県1号店となる長野駅店を開店。 8月6日 - 株式会社藤越(福島県いわき市)と業務提携。
2005年 4月18日 - 福井県福井市の福井駅高架下の商業施設PRISM FUKUIに福井県1号店となるプリズム福井店を開店。 8月24日 - 外部企業FC1号店となる京急ハウツ店を開店。 9月5日 - 株式会社オージョイフル(大阪府豊中市)と業務提携。 10月17日 - スカイパーフェクTV!110(現・スカパー!e2)に生活情報発信チャンネル「ジャスト・アイ インフォメーション」を開局。 12月 - 鳥取県鳥取市に鳥取県1号店となるトリニティモール店を開店。
App StoreやGoogle Playで提供されているスマートフォン向けアプリ。従来提供されていた「マツキヨポイントアプリ」からの移行、カード型(マツキヨココカラポイントカード(旧マツモトキヨシ現金ポイントカードを含む)・マツモトキヨシメンバーズクレジットカードどちらでも可)との紐づけ、アプリ単体での会員登録により利用が可能となる。
カード型とアプリでそれぞれ付与されたポイントを一括管理し、ポイントをまとめて利用することも可能。会員証機能を備えているため、カード型に代わってアプリのバーコードが表示されている画面を提示してポイントを付与することが可能となる。このほか、クーポンの配信やアクティブリワード、処方せん送信機能(処方せん送信は機能は調剤併設店舗のみ対応)なども備えている。
2023年6月1日からは電子お薬手帳機能や処方せん送信機能がココカラファインの調剤薬局(ココカラファイン薬局及びココカラファインの調剤併設店舗など)でも利用可能となった(これに伴い、「ココカラファインお薬手帳アプリ」は2023年9月末をもってサービス終了となるため、引き続きサービスを利用する場合は「マツモトキヨシ公式アプリ」をダウンロードし、「ココカラファインお薬手帳アプリ」からデータを移行する必要がある)。
1932年12月26日 - 千葉県東葛飾郡小金町(現在の千葉県松戸市小金)に「松本薬舗」(現・小金店)を開業。
2000年3月 - 大阪府大阪市北区の大阪駅地下1階のショッピングフロア「クロスト」に近畿地方以西、および大阪府1号店となるクロスト大阪駅店を開店(680号店)。
2001年 3月 - 500店舗達成。 5月30日 - 業務提携第1号として、静岡県に本社を置く高田薬局と提携。 2月 - 松本南海雄(現・マツキヨココカラ&カンパニー代表取締役会長)が社長に就任。 8月4日 - 福岡県福岡市に九州および福岡県1号店となる天神マツヤレディス店を開店(790号店、現・ミーナ天神店)。
2002年 4月 - マツモトキヨシポイントカードスタート。 7月 - 岡山県に中国地方および岡山県1号店となる岡山駅B-1店(840号店)を開店。 11月 - 静岡県浜松市に静岡県1号店となる浜松Part1店(865号店)を開店。
2003年 3月18日 - 兵庫県西宮市の商業施設エビスタ西宮に、兵庫県1号店となるエビスタ西宮店を開店(880号店)。 4月7日 - シミズ薬品株式会社(京都府京都市)と業務提携。 4月25日 - 広島県福山市に広島県1号店となる福山ロッツ店を開店。 4月 奈良県奈良市に奈良県1号店となる近鉄奈良駅店を開店。 5月29日 - 秋田県秋田市のおしゃれかんアルスに秋田県1号店となる秋田駅ビルALS店を開店。 10月10日 - 北海道札幌市中央区に北海道1号店となる札幌南1条店を開店。