ジョヴァンナ・ダ・モンテフェルトロ
ジョバンニは1495年1月20日に作成した遺言書の中でジョヴァンナを摂政に任命し、ジョヴァンナが未亡人である場合、フランチェスコ・マリーアが16歳になるまで使徒座代理区を保持できるとしており、ジョヴァンナは1501年11月の夫の死後1506年まで一族の領地を管理した。1502年、子供のいなかった弟のウルビーノ公爵グイドバルドは甥のフランチェスコ・マリーアを後継者に選んだが、同年、チェーザレ・ボルジアがウルビーノを占領したため、グイドバルドはマントヴァに避難した。ジョヴァンナも修道士の姿に扮して要塞とアドリア海をつなぐ桟橋に停泊しているボートに乗り込み、セニガッリアから脱出したという。チェーザレ・ボルジアの権勢は長くは続かず、フランチェスコ・マリーアは1504年にウルビーノに帰還して正式にグイドバルドの養子となり、1508年にウルビーノ公爵を継承した。さらに2年後に彼がエレオノーラ・ゴンザーガと結婚した際はジョヴァンナも息子の結婚式に出席した。1511年、フランチェスコ・マリーアがフランチェスコ・アリドーシ(英語版)枢機卿を暗殺したとき、教皇ユリウス2世は甥に対する不満を隠さなかったが、ジョヴァンナの調停によって無罪となった。
1513年11月25日、ジョヴァンナは教皇シクストゥス4世が夫に与えたローマのパラッツォ・デッラ・ローヴェレ(英語版)で死去し、シクストゥス4世の甥のジローラモ・バッソ・デッラ・ローヴェレ(英語版)枢機卿が創設したサンタ・マリア・デル・ポポロ教会(英語版)のバッソ・デッラ・ロヴェーレ礼拝堂に埋葬された。