穴山氏
また、これに伴い大久保長安事件が発生している。同年12月3日に家康が江戸から駿府への帰還する途中の相模国中原で、浪人であった馬場八左衛門が家康に忠隣を訴え、家康は江戸へ戻り忠隣を改易させたという。
同年12月8日に家康は穴山衆の再編を行い、佐野兵左衛門・葦沢伊賀守・川北長左衛門ら33名を水戸へ残し、慶長8年11月に家康の子徳川頼宣が水戸徳川家を起こし水戸藩主となると、穴山遺臣の一部は水戸家臣となっている。その他のものは江戸へ召し寄せられた。
穴山信君正室の見性院は信吉の没後に家康・将軍徳川秀忠により保護され、武蔵国足立郡大間村木村500石を拝領し、江戸城田安門内の比丘尼邸で過ごした。慶長18年には秀忠の侍女・お静の方が懐妊し、男子幸松丸(保科正之)が誕生した。見性院は秀忠から幸松丸の養育を任せられ、元和3年に幸松丸は信濃高遠城主・保科正光の養子となる。見性院は元和8年(1622年)5月9日に死去。
信元は甲斐へ帰国すると、信濃守護・小笠原政康や信満の子信長の後援を受けて逸見氏に対抗した。さらに、信元は河内領にあたる下山・南部の奪還を試みている。
信元には実子の彦次郎がいたが早世しており、信元は武田信長を養子に迎えることを望むが、室町幕府では上杉禅秀の乱に加担した信長を後継とすることに難色を示し、信長の子・伊豆千代丸を信元の養子にすることを了承している。
三宝院満済『満済准后日記』応永24年(1417年)条や応永15年(1418年)足利義持御内書では信元の存命が確認されるが、応永28年(1421年)に室町幕府では信元の後任に信満の子に信重を据える動きを開始しており、この間に信元は死去したと考えられている。
穴山氏は信元が甲斐を離れた時期から当主不在であったと見られ、その間隙を衝いて在地の穴山一族が台頭し、鎌倉公方や逸見氏と協調していたと考えられている。信重帰国後は、信重の子信介(のぶすけ)が継承する。信介は信重の後援を受け下山・南部方面に攻勢を加えていたと見られるが、信重に先立ち宝徳2年(1450年)に死去している。
『甲斐国志』に拠れば、信重は宝徳3年(1450年)11月24日に小山城主の穴山伊豆守に襲われて戦死したという。穴山伊豆守は信元の次男とされ、当時勘気を受けて追放されていたため、信介が養子として穴山家を継ぐに至ったが、これを恨んだ伊豆守が信重を殺害したのだという。