ラム酒の反乱
1807年、ブライは植民地政府にこの方針を通達したが、抗議されるだろうと忠告された。本国の陸軍・植民地大臣であるロバート・ステュワートはブライに、1807年12月31日に彼の指示を受け入れたという旨の手紙を送った。ブライの指示は、酒による物々交換を禁止するものであり、ハーバート・エバットは、ラム酒の反乱についてこう結論付けている「ブライは無税輸入を禁止する権限を与えられた。彼の全権のもとで取引を維持するため、不法な輸入への罰則を強制するため、そして、酒の販売について、彼の思うままに規則を設けるためであった」
エバットは、植民地内の独占主義者の対立が、酒が通貨になっていること、それ例外にも、富裕な者の権力に対抗したり、貧しい移民たちの福祉を推進したりするやり方に根差していると主張している。ブライは、植民地内の有力者に大規模な土地を分配する習慣をやめさせた。彼の任期中に許可されたのは、ほんの1600ヘクタールを越える土地だけで、その半分は自分と娘のものだった。
いっぽうで1807年の10月、ジョージ・ジョンストンは、イギリス陸軍の総司令官に正式な苦情の手紙を書いた。それにはブライが軍団を侮辱し、干渉すると書かれていた。ブライが、植民地内の影響力を持つ人々の一部を敵に回しているのは明らかだった。
また、シドニーで、政府の所有地を金を払って借りている者の家を取り壊すように命令し、裕福でないものの一部とも敵対していた。
ブライはまた、アイルランド系の犯罪者が暴動に関与した件で、告発人を含めた裁判委員にこの件を裁かせ、8人中6人が無罪放免されたものの、彼らを拘留したため一部の人々を怒らせた。また、植民地の軍医助手のダーシー・ウエントワース(英語版)を有無を言わさずに解雇し、3人の商人を1か月投獄する判決を下し、ある手紙が攻撃的であるとして罰金を課した。ブライは治安判事のトマス・ジェイミソン(英語版)も解雇した。
ジェイミソンは、ウエントワースがブライから軍法会議にかけられた際に、ウエントワースを支持し、またマッカーサーも擁護していた。ブライは、植民地政府に、ジェイミソンは不正直な男で、政府と反目し合っている、同様に不当な売買にも関与していると不満を漏らした。ジェイミソンは腕のいい軍医でもあったため、ブライは、代わりがいないと言うだけの理由で、軍医の仕事を続けさせた。後にジェイミソンは、1808年1月マッカーサーに加担してブライを退任させ、彼自身は、反乱軍による政府により治安判事と海軍士官に就任し、ブライの支持者を取り調べ、私文書に目を通し、反乱の最中に総督が植民地から離れることを禁じた1人だった。
マッコーリーは、ジョンストンとマッカーサーに解雇された官僚を復職させ、ブライの官職剥奪以来行われてきた、土地と貯蔵物の払い下げを撤回したが、ことを穏便に進めるため、自身が適切な資金援助を行って、払い下げ撤回への報復を起こさせないようにした。マッコーリーの到着を知ったブライはシドニーへ向かい、1810年1月17日に到着して、予定されているジョンストンの軍法会議の証拠を集めた。ジョンストンは5月12日に裁判のためイギリスに発ち、1810年10月25日にヒンドスタンに乗艦して戻ってきた。
ニューサウスウェールズとイギリス双方の非公式な主張によれば、イギリスの政府筋は、マッカーサーとジョンストンがブライを告発したことも、ブライの、植民地での重要人物の容認できない行為を告発した、苛立ちをかくせない手紙も痛感してはいなかった。ジョンストンは軍法会議で有罪となり、懲戒免職された。可能な限りの一番軽い罰則だった。これでジョンストンは自由市民として、自分の地所である、シドニーのアナンデールに戻ることができた。