エクスキューショナー
ストーリー中盤で突如現れる、神の断罪人を名乗る勢力。大部分が反物質以上のエネルギーを生むクォドラティックスフィアとクォドラティック・キーによるエネルギー生成システムを持つ。
その正体はFD人によって高度に構築された仮想空間「エターナルスフィア」用に開発された、対バグ用の破壊プログラム。FD人達からの愛称はパッチやワーム。
宇宙歴772年(西暦2858年)に突如執行者と代弁者が宇宙全域に多数出現。さらに本格的な侵攻の前に高度文明を持つ惑星に超遠距離攻撃を行い、アールディオン帝国壊滅。
その後高い文明を持つ惑星を攻撃しながら侵攻を開始、銀河連邦の軍事基地である第9宇宙基地、第31基地、第36基地、第42基地などを粉砕していく。
銀河連邦以上の科学力を有するバンデーン本星も滅ぼし、その後地球に到達。惑星に張られたシールドをクラス4.5以上エネルギーで突き破り、地球の主要都市を消滅させ、宇宙の三大勢力をほぼ壊滅に持ち込む。
惑星ストリーム付近で執行者の群れと戦闘専用艦アクアエリーと交戦。一体撃破されるも、直後アクアエリーを消滅させる。ちなみに大型の執行者はゲーム中では、最新鋭戦闘専用艦インディペンデンスが半ば偶然で量子魚雷を全弾命中させた事によって撃破した一体と、この一体以外は撃破された描写は無い。
惑星ストリームで主人公達が起動させたアンインストーラーの起動により執行者と代弁者は一時的に消滅。しかし直後、仕掛けられたトラップにより、強化型エクスキューショナー断罪者を追加して復活する。
狂乱したルシファーの手により、エターナルスフィアに関連する全データ消去。全てのエクスキューショナーは消滅する。