5-メチルシトシン
亜硝酸等により5-メチルシトシンから-NH2基を除去(脱アミノ化)するとチミンを生ずる。同じ条件下でシトシンが脱アミノ化するとウラシル(U)を生じる。
シトシンは重亜硫酸処理で脱アミノ化されるが、5mCは脱アミノ化されない。この性質を利用して、重亜硫酸塩シークエンス(英語版)技術により、ゲノム中のシトシンのメチル化パターンを解析することができる。