シデロホア
在最近的一项研究中,研究人员探索了铜绿假单胞菌中一种名为吡咯菌素(PVD)的铁载体的产生。这项研究专注于通过系统性方法对PVD生物合成(一种毒力因子)进行构建、建模和动态模拟。这种方法认为PVD合成的代谢途径受到菌群感应(QS)现象的调控,这是一种细胞通信系统,允许细菌根据其种群密度协调其行为。
研究表明,随着细菌生长的增加,QS信号分子的细胞外浓度也会增加,从而模拟了铜绿假单胞菌PAO1的自然行为。为了进行这项研究,研究人员基于iMO1056模型、铜绿假单胞菌PAO1菌株的基因组注释以及PVD合成的代谢途径,构建了铜绿假单胞菌的代谢网络模型。这个模型包括了PVD的合成、运输反应、交换以及QS信号分子。
最终的模型,被称为CCBM1146,显示了QS现象如何直接影响铜绿假单胞菌向PVD生物合成的代谢,这取决于QS信号强度的变化。这项工作是首次以硅报告的一种整合模型,包括QS基因调控网络和铜绿假单胞菌的代谢网络,为如何通过菌群感应现象影响铜绿假单胞菌中吡咯菌素和铁载体的产生提供了详细的视角。