松本藩
信濃国 安曇郡 - 179村(全域) 筑摩郡のうち - 79村
天領塩尻陣屋(5万3000石)廃止後、筑摩郡104村、伊那郡46村を預地として委託されたが、全域が伊那県に編入された。
貞享3年(1686年)には凶作、租税改悪、郷頭不正を原因として、安曇郡中萱村、楡村、南大妻村、氷室村、堀米村および筑摩郡梶海渡村、浅間村、笹部村の農民が中心となって藩庁へ直接強訴した貞享騒動が発生した。
文政8年(1825年)には凶作、物価高騰、富農商人による米価格の吊り上げを原因として、安曇郡小谷村、佐野村、沢渡村、飯田村、飯森村の農民が暴徒と化して千国街道大町宿、池田宿、穂高宿、成相新田宿を襲撃(打ちこわし)した赤蓑騒動が発生した。
弘化4年(1847年)には善光寺地震が発生し、松本領内でも被害が出た。
幕末には、本町の名主の家に生まれた近藤茂左衛門・山本貞一郎兄弟が上洛し尊王攘夷運動に身を投じた。その中で戊午の密勅の仲介役を担ったことが幕府の逆鱗に触れ、1858年9月5日、中山道大津宿で近藤が逮捕され安政の大獄が始まった。(それに先立つこと8月29日に山本が自害。)のちに近藤は中追放刑を言い渡され、1862年11月28日に松本へ帰還した。
また1861年5月28日には、英国仮公使館の警備にあたった江戸詰めの藩士伊藤軍兵衛が英国人水兵2名を殺害する第二次東禅寺事件が発生した。
西五千石を南北に分割し、北側(現在の松本市和田・今井地区、山形村)を幕府領とし、和田組・今井組を設置。