東海道本線
尼崎駅 (0.0 km) - 尼崎市場駅 (1.5 km)
115系 : 静岡地区などで2007年まで運用。 *117系 : 京阪神地区新快速、名古屋地区快速用として投入され、京阪神快速では1999年、名古屋地区では2013年3月15日まで運用。2023年までJR西日本の草津線・湖西線直通列車で運用。現在は臨時特急「WEST EXPRESS 銀河」でのみ運用。 119系 : 静岡地区で「するがシャトル」として1986年から1989年まで運用。 *211系 : 静岡地区でJR東海独自仕様の5000・6000番台車が運用。首都圏および名古屋地区では2012年まで運用されていた。 213系 : 名古屋地区で2012年まで運用。
気動車 キハ40系・キハ58系 : 武豊線直通列車とその関連運用で1999年まで使用。
雑形客車(下等)
スハ32系客車
オハ35系客車
52系
80系
113系
115系
117系
119系
211系
この節では、当路線上に設置されている停車場(駅・信号場)を会社ごとに列挙する。本項目では全停車場の名称と主要な停車場(主に支線・他路線の分岐点や運行上の拠点駅)のキロ程のみを記し、詳細は地域ごとの路線記事・系統記事に記載する。また過去に存在した停車場についても触れる。
(貨)は貨物専用駅。◆・◇・■を付与した駅は貨物取扱駅を表す(◇は定期貨物列車発着なし、■はオフレールステーション)。(臨)は臨時駅を表す。支線・貨物線の名称は通称。
明治政府は当初、幹線ルートを海路との競合を避けるために中山道沿いにすると決定したものの、山岳地帯への敷設が困難なことから東海道ルートに変更した経緯がある。東海道ルートに変更した際に、すでに開業していた区間は最大限に活用する形で早期に東西両京を結ぶことを目指したため、中山道ルートを前提として路線が当時までに開業していた熱田駅 - 草津駅間のルートは旧東海道から外れている。元来の東海道筋である三重県側(旧・伊勢国)には、私設鉄道の関西鉄道によって関西本線・草津線が敷設されている。
海岸沿いを通る区間は少なく、早川駅 - 熱海駅間および蒲原駅 - 興津駅間が海沿いに敷設されているほかは、国府津駅・吉原駅・用宗駅・弁天島駅付近でわずかに海岸沿いを通る程度である。また品川駅や横浜駅の近辺は元々海岸線に近いところに敷設され、用地が取得できなかった品川駅は造成した埋立地の中に、横浜駅の手前の区間は遠浅の海の中に盛り土をして作られたが、どちらも後の埋め立てで海岸沿いからは離れている。
海岸線から離れた所に敷設されているのは、軍部が他国艦隊による鉄道への艦砲射撃を恐れて山間部に敷設することを要請したからという説がある。明治期に鹿児島本線の八代駅 - 鹿児島駅間(八代駅 - 川内駅間は現在の肥薩おれんじ鉄道線)を当初海岸沿いではなく山間ルート、現在の肥薩線のルートで敷設したのと同様である。
このときの路線は、伊豆・箱根、伊吹山、逢坂山という交通の難所において、ルートが異なっていた。
最初のころは、「宿場にお客が来なくなる」「汽車が火事を起こす」などと宿場から反対された結果、市街地に用地を取得できず多くのルートが郊外に建設されたため、宿場から離れた地点に設けられた駅も多かったとも言われている(鉄道忌避伝説)。ただし、当時の新聞記事や県の記録などには、東海道各宿が積極的な誘致運動を行っていた記録はあるが、反対運動を行っていたという記録が見つからないことから、これを否定する見解もある。
日清戦争終戦後の1895年(明治28年)10月には、神戸駅から西へ伸びる山陽鉄道(現在の山陽本線)との直通運転が始まった。翌1896年(明治29年)には新橋駅 - 神戸駅間の急行列車の運行が開始され(急行料金は不要、所要時間は約4時間短縮の17時間22分)、1900年(明治33年)には寝台車、1901年(明治34年)には食堂車の連結も開始されている。1906年(明治39年)には最急行が登場し、1909年(明治42年)には新橋駅 - 神戸駅間が12時間50分にまで短縮。明治最後の年である1912年(明治45年)に最急行が特別急行(特急)に変更され、新橋駅 - 山陽本線下関駅間で運行された。
京都駅からは淀川の北側を東海道新幹線・阪急京都本線とともに大阪に向かって南西へ進み、また吹田市までは名神高速道路も近くを通る。一方、国道1号と京阪本線は淀川の対岸を経由する。この区間は民営化後「JR京都線」の愛称で案内されている。京都駅から向日町駅までは複々線に単線の貨物線を加えた5線区間となる。山陰本線(嵯峨野線)が北側へ離れた後、右側には京都鉄道博物館(元の梅小路蒸気機関車館)が、さらに先には京都貨物駅がある。同貨物駅からはかつて山陰本線丹波口駅への東海道本線貨物支線(山陰連絡線)が分岐し、山陰本線・東海道本線と合わせてデルタ線を形成していた。左隣に並行する東海道新幹線の線路が下り外側線の直上を通る区間に西大路駅が位置する。桂川を渡ると南方向へと向きを変え、貨物線が本線右側から左側へ移り桂川駅へ。京都市を出て向日町駅を過ぎると、左側には車両基地である吹田総合車両所京都支所(旧・向日町運転所→京都総合運転所)がある。この車両基地からの連絡線と合流すると長岡京駅に至る。
名神高速道路の天王山トンネル入口付近をくぐると、天王山と男山に挟まれた隘路に入り、左側から阪急京都本線が寄り添う。この山崎は古来から京都と大阪の交通路の隘路であり、狭い平地の中に東海道本線・阪急京都本線のほか、東海道新幹線・国道171号(西国街道)、淀川をはさみ京街道・京阪本線が寄り添う。
この地区の東海道線中距離列車(電車列車の導入以来民営化までは「湘南電車」と呼ばれていた)は、後述する各系統と並行する東京駅 - 大船駅間においては一部の駅にのみホームがある列車線で運転される。横須賀線との線路分離後から民営化後にかけては列車本数の増発や定員の増加による輸送力増強、快速列車や通勤ライナー(2021年に特急に置き換え)の設定などの輸送改善が行われた。2001年から湘南新宿ライン(後述)の乗り入れで渋谷・新宿・池袋の副都心地区へ1本の列車で結ばれるようになり、1973年以来となる高崎線への直通列車も設定された。また、1973年に廃止となった東京駅以北の上野駅および東北本線(宇都宮線)・高崎線との直通運転が上野東京ラインの愛称にて2015年3月改正から復活し、併せて常磐線(近距離快速電車含む)から品川駅までの乗り入れが開始された。一方でJR東海管内へ直通する普通列車は民営化後に徐々に削減され、現在では沼津駅発着の列車が朝夕夜に残るのみで、国府津駅から御殿場線への直通は2012年に廃止。また伊東線直通列車も朝夕夜が中心となった。
日中は、東京駅経由列車は1時間あたり普通6本が運転される。半数の列車は平塚駅または小田原駅以東での運転となり、小田原駅 - 熱海駅間は毎時3本の運転となる。
平塚駅 (0.00 km) - 駅名不詳(1.61 km 駅名は「平塚荷扱所」とも)
JR東海の普通列車(快速含む)用車両は片側3扉の近郊型である。静岡地区(熱海駅 - 浜松駅間)と名古屋地区(豊橋駅 - 米原駅間)とで運用される車両が分かれているが、浜松駅 - 豊橋駅間では両地区の車両がどちらも運用されているほか、掛川駅 - 浜松駅間などでも名古屋地区用の車両の運用がある。静岡地区用の車両はロングシートで2両・3両単位で連結され、名古屋地区用の車両は転換式クロスシートでおおむね4両・6両・8両編成を組む。
複々線以上: JR東日本 : 東京駅 - 小田原駅間 東京駅 - 品川駅間は地上3複線+地下複線の計4複線(8線)、鶴見駅 - 横浜駅間と東戸塚駅 - 大船駅間は3複線(6線) JR東海 : 名古屋駅 - 稲沢駅間 JR西日本 : 草津駅 - 神戸駅間 京都駅 - 向日町駅間は5線 茨木駅 - 吹田駅間は6線 吹田駅 - 新大阪駅間は8線 複線: JR東日本 : 小田原駅 - 熱海駅間、品川駅 - 武蔵小杉駅 - 鶴見駅間、浜松町駅 - 東京貨物ターミナル駅 - 浜川崎駅間、鶴見駅 - 八丁畷駅間、鶴見駅 - 東高島駅間、鶴見駅 - 横浜羽沢駅 - 東戸塚駅間 JR東海 : 熱海駅 - 名古屋駅間、稲沢駅 - 米原駅間 JR西日本 : 米原駅 - 草津駅間、新大阪駅 - 梅田信号場間、吹田貨物ターミナル駅 - 宮原操車場 - 尼崎駅間 単線:単線区間はすべて支線 JR東日本 : 入江信号場 - 旧・新興駅間、東高島駅 - 桜木町駅間 JR東海 : 南荒尾信号場 - 美濃赤坂駅間、南荒尾信号場 - 旧・新垂井駅 - 関ケ原駅間(下り専用の勾配緩和別線) JR西日本 : 大阪駅(うめきたエリア)- 福島駅間 JR貨物 : 山王信号場 - 名古屋港駅間、吹田貨物ターミナル駅 - 大阪貨物ターミナル駅間
大阪駅 (0.00 km) - 安治川駅 (2.82 km)
東海道貨物線 品川駅 - 浜川崎駅間、鶴見駅 - 八丁畷駅間、鶴見駅 - 横浜羽沢駅 - 東戸塚駅間、高島線 高島駅 - 桜木町駅間、貨物支線 梅小路駅 - 丹波口、北方貨物線 吹田駅 - 尼崎駅間、梅田貨物線 吹田駅 - 梅田駅 - 福島駅間で旅客営業開始。品川駅 - 東京貨物ターミナル駅間の貨物営業廃止。 大垣駅 - (新垂井)駅 - 関ケ原駅間の下り専用線が本線であったのを、大垣駅 - 垂井駅 - 関ケ原駅間の下り線を本線扱いに変更。大垣駅 - (新垂井駅) - 関ケ原駅間は支線となる。 7月1日:【海】第二種鉄道事業が開業(山王信号場 - 名古屋港駅間 6.2 km)。(臨)ナゴヤ球場正門前駅が開業。
1988年(昭和63年) 3月13日:【海】西岡崎駅・三河安城駅・逢妻駅が開業。 11月16日:【海】三河塩津駅が開業。
1989年(平成元年) 3月25日:横浜博覧会開催中に、山下臨港線 横浜港駅 - 山下埠頭駅間の廃線跡を利用し、横浜博覧会協会臨港線として日本丸駅 - 山下公園駅間で列車運行(同年10月1日まで)。 7月9日:【海】金山駅に東海道本線ホーム開業。金山駅 - 名古屋駅間が中央本線との重複区間となる。
1990年(平成2年)3月10日: 【西】貨物支線 梅小路駅 - 丹波口駅間が電化。 【貨】塩浜操駅を川崎貨物駅に改称。
1991年(平成3年) 3月16日:【西】栗東駅が開業。 12月14日:【海】豊田町駅が開業。
1993年(平成5年)3月18日:【貨】東静岡駅を静岡貨物駅に改称。