スカベンジャー作戦
7月29日、松型駆逐艦1番艦松を旗艦とする第2護衛船団司令部(司令官:高橋一松少将)以下の横須賀鎮守府乙直接護衛部隊に守られた第3729船団が、硫黄島へ向け出航していた。 同船団を重視した軍令部は、マリアナ沖海戦後に応急出動用として待機していた軽空母瑞鳳まで護衛に投入した。日本の文献では、この瑞鳳出動が空母撃沈を狙ったアメリカ機動部隊の襲来を誘発してしまったと述べるものもある。船団の経由地父島到着までの間接護衛を命じられた瑞鳳は、931空の九七艦攻12機を載せ、第十戦隊所属の駆逐艦4隻(第4駆逐隊《山雲、野分》、第61駆逐隊《秋月、初月》)を随伴して出撃した。ほかにも父島や硫黄島には輸送艦船が在泊中であった。
小笠原方面の日本側防空戦力は、6月15日以来の度重なる空襲や輸送途中の被害から不十分な状態であった。海軍航空隊は新編の第三航空艦隊(司令長官:吉良俊一中将)が主力だったが、8月4日時点での稼動機数は、硫黄島に第二五二海軍航空隊(252空)所属の零戦16機を中心に、一式陸攻4機と天山艦攻・月光夜戦各2機がある程度だった。ほかに、父島には父島海軍航空隊(父島空)の水上戦闘機5機・水上偵察機4機が展開していた。対空砲も、父島方面特別根拠地隊に海軍防空隊4隊を編入するなど最優先で増強が図られていたが、第142防空隊と第151防空隊は人員のみで装備未到着だった。
スカベンジャー作戦の終了後、アメリカ太平洋艦隊の高速空母機動部隊は、第一高速空母任務部隊(指揮官:マーク・ミッチャー中将)と第二高速空母任務部隊(指揮官:ジョン・S・マケイン・シニア中将)に分割された。8月26日には中部太平洋方面のアメリカ艦隊司令官が、レイモンド・スプルーアンス大将(第5艦隊)からウィリアム・ハルゼー大将(第3艦隊)へ交代し、高速空母機動部隊の総称も第38任務部隊に改称した。
休養をとった第38任務部隊は、8月31日から9月2日にかけて、第4群である第38.4任務群(指揮官:ラルフ・デイヴィソン少将)を派遣して、再び小笠原諸島を攻撃した。空襲と艦砲射撃により、小笠原諸島の日本海軍航空部隊は零戦5機撃墜・8機地上撃破などの損害を受け、稼動機は水偵1機という壊滅状態となった。稼動艦艇も駆潜艇1隻・機帆船3隻に落ち込んだ。アメリカ側の損害は若干の航空機を失っただけであったが、被撃墜機の中には後に第41代大統領となるジョージ・H・W・ブッシュ中尉の乗機も含まれていた。
その後もアメリカ軍は、機動部隊やマリアナ諸島に展開したB-24爆撃機による攻撃を反復し1945年(昭和20年)2月の硫黄島の戦い直前にピークに達した。B-24は機雷敷設も行った。日本側は高速の輸送艦を多用するなどして輸送努力を続けたが、第3905船団が潜水艦に全滅させられるなど被害が続出し、小笠原諸島の日本軍は孤立化が進んだ。ただし、硫黄島以外に上陸作戦は行われないまま終戦の日を迎えた。
孤立した父島の日本軍守備隊では極度の飢餓から小笠原事件(父島事件)が発生した。