ジェニファー・プリツカー
プリツカーは生涯に3人の女性と結婚している。最初の相手はアイェレット・プリツカー(Ayelet Pritzker)で、娘1人(Tal Hava Pritzker)をもうけた。2人目はリサ・I・ゴーレン(Lisa I. Goren)で、息子2人(アンドリューとウィリアム)をもうけた。いずれの結婚生活も離婚により終了している。
2013年8月16日、プリツカーはプリツカー軍事博物館・図書館を通して、自身がトランスジェンダーであり、世界初のトランスジェンダーのビリオネアとなったことを公表した。
2020年10月31日、プリツカーはエリン・E・ソラーロ(Erin E. Solaro)と結婚した。