ヤングアニマル
2014年4月25日配信開始し、月1〜2作程度の割合で追加配信されていた。
やぶからぼう(あさりよしとお)
柔のミケランジェロ(カクイシシュンスケ)※隔号連載、2018年No.14 - 2018年18号 ※『ヤングアニマル嵐』より移籍
ヤン研(矢野稔貴×シゲ)、2015年No.3 - 2015年No.21
ゆびさきミルクティー(宮野ともちか)(ドラマCD)、2003年No.1 - 2010年No.6
夢の掟(原作:真刈信二、漫画:山本貴嗣)、1999年No.22 - 2000年No.22
ユリア100式(原作:原田重光、漫画:萩尾ノブト)、2006年No.4 - 2010年No.3
ゆりキャン 〜ゆりかのキャンパスライフ〜(原作:原田重光、漫画:瀬口たかひろ)、2010年No.10読切、No.20 - 22 集中連載を経て、2011年No.5 - 2013年No.2
4000倍の男(雁木万里)、2022年No.2 - 2023年No.9・10
最低!!(二宮ひかる)、1996年No.15 - 1996年No.20
砂漠の獅子(原作:中里融司、漫画:かたやままこと)、2009年No.3 - 2009年No.17 ※月1連載、原作者急逝のため絶筆
さゆき(有間一郎)、1994年No.19 - 1998年No.18
3月のライオン昭和異聞 灼熱の時代(とき)(原作:羽海野チカ、漫画:西川秀明)2015年No.9 - 2020年No.7 ※3月のライオンのスピンオフ作品
ジェネシスコード(原作:鷹野浪流、漫画:えりちん)、2019年No.17 - 2020年No.19 ※『マンガPark』に移籍
シグナル100(原作:宮月新、漫画:近藤しぐれ)、2015年No.15 - 2016年No.20
じけんじゃけん!(安田剛助)、2018年No.1 - 2020年No.2 ※『ヤングアニマル嵐』より移籍
事件屋征四郎(綾坂みつね)
死に至る病(原作:朝田光、漫画:瀬口たかひろ)、2009年No.6 - 2009年No.24
ジャパン(原作:武論尊、漫画:三浦建太郎)、1992年No.1 - 1992年No.8
重箱の隅(あさりよしとお)
自殺島(森恒二)、2008年No.22 - 2016年No.17 無法島 (森恒二)2019年No.4 - 2022年No.15 ※『自殺島』のスピンオフ作品
実況!!泉くんの恋模様(原作:原田重光、作画:大箕すず)、2018年No.15 ※『ヤングアニマル嵐』より移籍
邪道スナイパー(梶井裕)、2019年No.6 - 2020年No.1
出勤!!市役所ファイブ(稲田恭明)、2011年No.2 - 2012年No.19
女子小学生はじめましたP!
!CPU』などが人気を博している)。2000年には増刊の『ヤングアニマル嵐』が季刊としてスタート、2001年には隔月刊化した。同誌は過激な性描写で数々の有害図書指定を受けていたが、2018年6月に休刊した。一方、硬軟合わせたバランス重視の誌面となった『ヤングアニマル』本誌は、2020年現在、『ふたりエッチ』以外に直接的な性交シーンのある作品は存在せず、ラブコメ、エロコメ系作品の多くが「寸止め」程度に収まっている。
2000年代以降は数々のメディアミックスが行われている。既に1990年代に先述の『砂の薔薇』『ぶっとび!!CPU』などがOVA作品でアニメ化、また『ベルセルク』がTVアニメとして映像化されていたが、2000年代に入ってからは実写作品への進出が目立ち、2000年に『ふたりエッチ』、2004年に『ああ探偵事務所』、2005年に『ホーリーランド』が、それぞれTVドラマ化されている。また2006年には『ユリア100式』がオリジナルビデオ、2008年には『デトロイト・メタル・シティ』が実写映画として製作された。アニメに関しても、2002年・2003年に『藍より青し』がTVアニメ化、2002年 - 2004年に『ふたりエッチ』がOVA化される。
ふたりサッカーほぼブラジル(文・倉敷保雄、絵・あらゐけいいち)、2013年11月22日 -