深堀事件
深堀側も黙っているわけにはいかず、三右衛門の息子で17歳の嘉右衛門賢時以下10名が深堀領から長崎へ向かった。「昨日之相手出し可申候、打果し可申(昨日の相手を出せ、討ち果たしてくれる)」と詰め寄る三右衛門と武右衛門に対して、彦右衛門は屋敷の門前で低姿勢で謝罪し、佐賀本藩の長崎聞番(佐賀本藩と深堀領の間に立つ連絡役)である伊香賀(いかが)利右衛門も穏便に済ますよう働きかけたが、収まらなかった。
深堀藩士10人に三右衛門・武右衛門の2人を加えた合計12名が、翌20日未明に西浜町にあった高木彦右衛門屋敷へ討ち入った。門番を斬り殺して大門を開け、門内に侵入すると、外からの加勢を防ぎ内からの逃亡をさせないために再び門を閉め裏口も固めた。屋敷に準備してあった弓の弦は切断され、槍も投げ捨てられた。
彦右衛門も刀を持ち出し応戦したが、討ち取られ死亡。高木側では当主と事件当事者の惣内、屋敷にいた剣客ら合計9名が死亡。深堀衆は彦右衛門の首を切断し槍先に突き刺して、深堀屋敷へ引き上げた。城島次郎右衛門以下9名も後から駆けつけたが、既に彦右衛門は討たれていたため、戦闘には不参加であった。
なお、三右衛門は高木邸の玄関の式台で、武右衛門は中島川に架かる大橋(後の鉄橋(くろがねばし))で、それぞれ切腹した。しかし、死後2人の遺骸を検死したところ、腹部に切傷が無かったため、切腹したのではなく仲間の深堀衆から斬り殺されたとする説もある。
高木彦八郎はその後、大村で死去したとされる。
処罰が極めて軽いものに留まった主の鍋島茂久は、逆に武士の一分を示したということで称賛を受け、祝賀に訪れる者さえもあったという。
五島列島へ流された9名は、当地の五島藩主五島盛佳に割と手厚く処遇されたようであり、7名は現地で妻帯している。9年後の宝永6年(1709年)に綱吉が亡くなったことによる恩赦で深堀へ戻ることができた。現地では毎年、藩士の命日に法要が営まれている。この帰還時、先の妻帯が問題となった。流刑先で妻帯していたことが公となると当人たちはおろか、深堀鍋島家や鍋島本藩、五島氏にも迷惑をかけることになるため、彼らは妻子を五島に残して深堀へ帰還した。
この事件は江戸をはじめ全国でも大きな話題となり、その様子は『元禄世間拙風聞集』『鸚鵡籠中記』『葉隠聞書』などにも記されている。
深堀藩士たちの討ち入り手順を、のちの元禄赤穂事件の赤穂浪士たちが参考にしたとする伝承があり、関連して、深堀藩士たちが流刑となった五島列島の久賀島には、赤穂浪士の一人である寺坂吉右衛門の墓所とされるものが存在する。残り8人とは別に一人久賀島に流刑とされた志波原羽右衛門に、寺坂が討ち入りの際の聞き取りにやってきた、とする伝承であるが、あくまで伝承の域の話である。