祝園駅
1898年(明治31年)6月4日:関西鉄道長尾駅 - 新木津駅(廃止)間の延長により開業。
1907年(明治40年)10月1日:関西鉄道が国有化され、帝国鉄道庁の駅になる。
1909年(明治42年)10月12日:線路名称制定。桜ノ宮線の所属となる。
1913年(大正2年)11月15日:線路名称改定。桜ノ宮線が片町線に編入され、当駅もその所属となる。
1960年(昭和35年)10月1日:貨物の取り扱いを廃止。
1970年(昭和45年)10月1日:荷物扱い廃止。駅員無配置駅となる。
1987年(昭和62年)4月1日:国鉄分割民営化により、西日本旅客鉄道(JR西日本)の駅となる。
1988年(昭和63年)3月13日:路線愛称の制定により、「学研都市線」の愛称を使用開始。
1994年(平成6年)9月13日:橋上駅舎と近鉄新祝園駅を結ぶ連絡橋が完成。
2003年(平成15年)11月1日:ICカード「ICOCA」の利用が可能となる。
2007年(平成19年)2月2日:みどりの窓口営業開始。
2010年(平成22年)3月13日:7両編成での運転を開始。これに伴いホームを7両編成対応に延長。
2011年(平成23年)3月8日:JR宝塚・JR東西・学研都市線運行管理システム導入。接近メロディ導入。
2015年(平成27年) 4月30日:みどりの窓口の営業を終了。 5月1日:みどりの券売機プラス営業開始。
2018年(平成30年)3月17日:駅ナンバリングが導入され、使用を開始。
交換設備を有した相対式ホーム2面2線と木津方面ホーム東側に留置線2線を持つ地上駅で、橋上駅舎を有する。京橋側にも引き上げ線が1本設置されている。ホームとは跨線橋で結ばれている。
一部時間帯は無人となる。そのため改札機・券売機・精算機付近にはインターホンがあり、無人時間帯はコールセンターのオペレーターが対応し、各種機器を遠隔制御している。ホーム長は4両分だったが、2010年3月13日のダイヤ改正に伴い、木津駅 - 京田辺駅間でも7両編成の運行となったため、対応する改良工事を施した。これにより、かつての中線を上り本線として再整備し、7両対応の上りホームは従来の上り本線の敷地に新設した。1972年 - 1992年は無人駅扱いで出札業務は行わず、運転要員だけ配置されていた。
東側に近鉄京都線の新祝園駅が隣接し、両駅は改札外の橋上通路で結ばれて乗り換えができる。改札口は1ヶ所のみ。駅業務はJR西日本交通サービスが行う業務委託駅で、長尾駅が当駅を管理している。
ICOCA利用可能駅(相互利用可能ICカードはICOCAの項を参照)で、自動券売機および自動改札機を設置。自動改札機は設置当初、簡易型だった。