キャプテンコマンドー
ハードの制約のため、乗り物であるロボットが登場しない他、敵キャラクターやアイテムの同時出現数がかなり制限されており、アーケード版とはプレイ感覚が異なる内容となっている。また、女性キャラクターの肌の露出が控えめになっている。アーケード版と同じエンディングを見るには難易度ハードでゲームをクリアする必要がある。
外見こそ大柄で筋肉質な女のようだが、その筋力は常人の10倍の力がある。普段は長い髪に隠れている素顔を見せないが、戦闘時には鬼のような素顔を見せる。つかみ技と体内に生成している溶解液(ジェネティのナイフから検出された溶液を基に開発された)が武器。動きは遅い。スーパーファミコン版では溶解液を吐くかわりに爆弾を投げる。
青い服を着た戦闘員で、帽子を被っている。他の戦闘員とは違い、銃器のエキスパートをさらって改造した者たち。それゆえ武器を手放してしまうと戦えなくなってしまう。スーパーファミコン版には登場しない。
翔のライバルだった忍者の頭領。薙刀を持った歌舞伎役者のような姿をしている。ムサシにプレイヤーを部屋の奥に引き込ませ、ムサシと共に戦う。中央寄りに移動して、繰り返し忍者を召喚するパターンがある。翔と戦うだけの理由で組織に属しており、ジェノサイドに忠誠を誓っていない。
漫画版では本名が「御神楽大和」とされている。