南洋庁
南洋庁発足時には、長官官房、内務部、財務部、拓殖部が置かれた。
長官官房 - 秘書課、文書課、考査課
内務部 - 地方課、警務課
財務部 - 予算課、会計課、土木課、作業所
拓殖部 - 産業課、土地調査課、通信課
1924年には行財政整理の一環として部制を廃止し、組織を大幅に簡素化。
長官官房、総務課、拓殖課、警務課、通信課
のちに総務課を庶務課と財務課に分割。
1936年に部制を復活。
長官官房 - 秘書課、文書課、調査課(1937年新設)
内務部 - 地方課、財務課、警務課、土木課、税務課(1938年新設)
拓殖部 - 拓殖課(1937年から商工課と農林課)、水産課、交通課(1937年から交通課と逓信課)
1942年に交通部を新設。
長官官房 - 秘書課、文書課
内務部 - 企画課、地方課、財務課、税務課、警務課
拓殖部 - 総務課、農林課、商工課、水産課
交通部 - 交通課、逓信課、土木課
1943年に簡素化。
長官官房
内政部 - 行政課、財政課、警務課
経済部 - 企画課、商工水産課、農林課
交通部 - 交通課、逓信課、土木課
鎌田悌次郎:1922年4月1日 - 5月30日(ヤップ支庁長へ)
嶋倉孝之(事務取扱):1922年5月31日 - 1922年11月20日
嶋倉孝之:1922年11月20日 - 1924年12月12日(依願免本官)
只野安房:
高坂喜一:1929年
山口勇三郎:1932年1月 - 1937年8月4日(ヤルート支庁長へ)
山本繁蔵:1937年8月4日 -
依光重親:1938年4月2日 - 1941年4月22日(依願免本官)
高坂喜一:1941年4月22日 - 1943年11月5日(東部支庁総務課長兼経済課長となる)
日本人向け、尋常科と高等科を設置、1941年度より国民学校に改称、特に記載のないものは1922年設置。
パラオ支庁 - パラオ第一、パラオ第二(1940年設置)、アンガウル(1936年設置)、清水(旧称ガルドック、1936年設置、1939年改称)、瑞穂(旧称アイライ、1937年設置、1939年改称)、朝日(旧称ガルミスカン、1937年設置、1939年改称)、ペリリュウ(1938年設置)、ガラスマオ(1940年設置)、大和(1940年設置)、マルキョク(1941年設置)、ガスパン(1941年設置)
サイパン支庁 - サイパン第一、サイパン第二(1940年設置)、マタンシャ(旧称タナパコ、1939年改称)、アスリート(旧称ラウラウ、1924年設置、1931年改称)、チャッチャ(1929年設置)、チャランカノア(1932年設置)、タロホホ(1941年設置)、パガン(1941年設置)、テニアン(1929年設置)、カーヒー(1930年設置)、マルポ(1930年設置)、ハゴイ(旧称チューロ、1934年設置、1941年改称)、ロタ(1933年設置)、タルガ(1936年設置)、シナパール(1937年設置)