あいの風とやま鉄道線
県境区間である泊駅 - 市振駅間については、直通先のえちごトキめき鉄道車両による泊駅 - 糸魚川駅・直江津駅間の折り返し運転を基本としている。ただし、1日1往復に限り、あいの風とやま鉄道の車両が糸魚川駅まで乗り入れるほか、えちごトキめき鉄道車両は1日1本のみ泊駅から妙高はねうまライン新井駅へ直通する。えちごトキめき鉄道の車両の泊駅以西への乗り入れは通常実施されない。泊駅 - 市振駅間は、運行車両の所属会社ごとの乗務員が担当している。
この区間におけるワンマン運転は、えちごトキめき鉄道の方式となるため、自社のワンマン列車と方式が異なり、車内精算方式で乗車時に整理券を受け取り、降車時に乗車券または運賃を車内の料金箱に投入する。なお、越中宮崎駅で下車する際、ICOCAで利用している場合は、運転士にカードを提示した後、駅のICOCA専用改札機にタッチする。自社車両の列車についてはワンマン運転は実施せず、車掌が乗務しているため、全てのドアから乗り降りができる。