ドミニオン戦争
カーデシアが加入してからドミニオンはガンマ宇宙域からカーデシアにジェムハダー大船団を送り続け、カーデシアに造船工場や軍需工場、ジェムハダーやボルタ人を作るクローン工場などを建設した。そして、ドミニオンがロミュラン帝国と不可侵条約を締結したという知らせを聞いたシスコはもはやドミニオンとの戦争は避けられないと悟る。シスコはこれ以上ドミニオンがカーデシアに船団を送れないようにするため、機雷を設置しワームホールを事実上閉じる作戦を立案、機雷を設置し始める。これを察知したドミニオンはウェイユンを大使としてDS9に派遣し機雷設置を辞めるよう要求するが拒否され、その後は終始社交辞令に終わり戦争が避けられなくなった。シスコは翌日にもドミニオンが攻めてくると予測し機雷設置を急ピッチで進める。ドミニオン軍が来襲し総攻撃するが、間一髪で機雷設置が完了し、シスコ以下宇宙艦隊はDS9から撤退する。だがシスコはDS9陥落は間違いないと判断し、事前にベイジョー政府にドミニオンと不可侵条約を結ぶように進言していたため、ベイジョーは戦火から免れ、ドミニオン軍占領後のDS9にもキラ少佐やオドーなどは残ることとなる。ガル・デュカットはDS9(カーデシア名:テロック・ノール)の司令官として再び赴任した。ドミニオンのDS9への攻撃がドミニオン戦争の開戦とされている。
ドミニオン戦争(ドミニオンせんそう、英: Dominion War)は、アメリカのSFテレビドラマ『スタートレック:ディープ・スペース・ナイン』で描かれた架空の戦争の名称。シーズン5のラストからシーズン7(最終シーズン)のシリーズ最終話までの長期間に渡る、スタートレックシリーズで初めて描かれた大規模な宇宙戦争であり、各シリーズ作品にも影響を及ぼす重大な出来事として描かれている。 惑星連邦とクリンゴン帝国の同盟軍と、盟主ドミニオンとカーデシア連合を中心とするドミニオン軍とのアルファ宇宙域を戦場にした戦争である。後に同盟軍にはロミュラン帝国が加わり、ドミニオン連合にはブリーン連合が加わる。戦争末期、ブリーンが連合が加わった直後、カーデシアの指導者だったレガート・ダマールがドミニオンから離反。後に彼の呼びかけに応じたカーデシアの一般市民たちが蜂起し、カーデシア軍もドミニオン戦争の終盤に行なわれたカーデシア・プライムの戦いの最中、ドミニオンから離反し、同盟軍に加わった。しかし、この裏切り行為に激怒した創設者の命令でジェムハダーとブリーンによりドミニオン戦争終結までに8億人のカーデシア人が虐殺されることになった。