東京都立富士高等学校・附属中学校
山岳部
新聞部
将棋部(1989年まで)
園芸部
体操部
男子ハンドボール部
女子ハンドボール部
漫画研究同好会
アニメックス
社会科学研究会
落語部
柔道部
地歴部
ラグビー部
卓球部
語学部
ソフトテニス部
ソフトボール部
英語教育に重点を置いている。中高一貫校用の検定外教科書である『トレジャー』を使用している。また、多読、TOEIC・トレーニングを行い、中3で英検準2級合格、高3でTOEIC700点を目標とする。
附属中学校では、年間18回の土曜日授業などを通じて多くの英文を読み、中学の3年間で2200語の語彙習得を目指す。夏季休業期間に「短期集中英語講座」(夏季休業中に行われる母語話者による集中授業)を開講し、英語力を磨いている。
また、ブリティッシュヒルズ(福島県)宿泊学習(中2)、英文書写も行う。
男子はスラックスおよび詰襟型、女子はスラックスおよびスカート男女にかかわらず着用できる。
準制服として夏季の制服に青のワイシャツ、ポロシャツ、男子はチェックのズボン、女子はチェックのスカートが導入された(必須ではない)。