ミスティックアーク
青いずきんの女の子。少し話が長い。おままごとが好き。
クルの森にいたライオン。勇気をもらうためにワズの塔を探しており、方向を間違ってクルの森に迷い込んだ。出典は『オズの魔法使い』のライオン。
北側、黒い海賊船の軍。回復薬が底をつきかけている。 クリブト ガンボス号船長。昔から船乗りの家系であるらしい。フルネームはクリブト・デ・チャベス。
目立つ箇所や調度品など、特定の場所を調べると挿絵のような画面に切り替わり、その部分に注目することができる。触る、動かす、アイテムやアークを使うなど、様々な手法を駆使して謎解きに挑むことになる。初期に訪れる場所でも、ある程度シナリオが進行していないと解けなくなっているものも存在する。
物語を進めるうちに手に入る七つのアーク(精霊のようなもの)は様々な探索に使用するほか、武具に宿らせることによって属性が備わり、攻撃・防御効果を変化させる。また。当初は主人公一人で行動するが、力もしくは知恵のアークを入手した後は、主人公が目覚めた部屋に置かれたフィギュアを持ち運び、そのアークを宿らせることによって仲間として生身の姿を実体化させることができ、主人公を含めて最大3人までのパーティを組むことが出来る。ただし、戦闘中倒れた仲間はフィギュアとなり神殿に戻されるため、取りに戻る必要がある。捕えたモンスターにアークを宿らせると特殊アイテムになったりもする。
敵が出現するエリアでは、画面左上に“クリスタル”の効果として自分を中心としたレーダーが表示される。中央の青い点が敵の反応である白い点に触れることで戦闘に入る。地形に阻まれない限り、敵反応を避けて逃げ続けることも可能。また、敵も常に移動しているので、こちらが移動していなくてもエンカウントする。クリスタルが使用不能になるダンジョンも存在する。
入手アーク:水のアーク
異様に広い、魔物が徘徊する無人の洋館。世界とは名ばかりで、舞台はこの洋館内部のみである。数々の世界で主人公の妨害をしてきた怪物“闇”が生まれ、そして育った場所だが、本人も思い出したくないと語っている。この世界は主人公一人で進まねばならず、また一度クリアしたら二度と入ることが出来ない。
主人公を教え導く存在。女神の姿をした像を介してのみ声を届けることができるらしい。