常陸川水門
その副作用として、銚子の利根川河口から溯上する海水の量が増大し、その水を使った霞ヶ浦下流域の農地で頻繁に塩害が発生するようになった(霞ヶ浦はこのころにもっとも汽水化している)。特に1958年には干ばつによって大規模な塩害が発生し、その防止のための施設として位置づけられている。
当初、常陸川水門はあくまでこうした治水と塩害防止という目的で建設されたとされ、現在の常陸川水門が持つ、霞ヶ浦の水位を操作して水源を確保するという利水上の目的は、公式にはその後の経済成長による水源開発の必要性から付け加えられたと説明されている。しかし、
1937年、東京市長の諮問機関「水道水源調査委員会」によって、「霞ヶ浦案」が検討されており、この当時から霞ヶ浦への利水上の要請があったこと(なお、現在霞ヶ浦開発事業の竣工により、東京都は霞ヶ浦の水利権を有している。)。
水門竣工以前の1962年に、工業用水の水源開発が前提となるはずの鹿島臨海工業地帯の建設が正式発表されていること(構想そのものはそれ以前からあった)。
1964年に計画が決定し1971年に竣工する利根川河口堰と連動できるように設計が配慮されていたと言われていること。
などの点から、建設当初から常陸川水門が利水上の目的を意識して作られていた可能性は高いという指摘もある。