アラリペスクス
アラリペスクス属にはAraripesuchus、A. patagonicus、A. buitreraensis、A. tsangatsangana、A. wegeneri、A. rattoidesおよびタイプ種A. gomesiiの6種が認められている。最初に発見されたアフリカの種A. wegeneriの位置づけは様々な研究者により疑問視されてきた。Ortegaらは系統解析の結果に基づいて本種を別属に再分類することを主張した。第二のアフリカの種であるA. tsangatsanganaとさらなる研究により、A. wegeneriの属内での位置づけはより明確なものになった。アフリカの種を合わせて分析すると、最初に記載された5種すべてを本属に含めることが支持される。
1959年の原記載において、Priceは本属をウルグアイスクス科(英語版)と見なした。1981年にBuffetautがA. wegeneriを記載した際もアラリペスクスはウルグアイスクス科に置かれ続けた。しかし2000年のA. patagonicusの記載において、Ortegaらはアラリペスクスをウルグアイスクス科に分類せず、ウルグアイスクス(英語版)が本属に近縁である可能性を単に指摘するだけに留めた。
Ortegaらやその他の研究者の研究においてアラリペスクスはノトスクス亜目から除外されており、現生のワニを含む系統群である新鰐類に置く系統解析もある。しかし、より新しい系統解析では、アラリペスクスは基盤的なノトスクス亜目として位置づけられている。Soto et al. (2011)の系統解析ではアラリペスクスはウルグアイスクスと共にノトスクス亜目の基盤的なグループであるウルグアイスクス科に位置付けられた。以下はSoto et al. (2011)に基づくクラドグラム。
しかしながら、A. buitreraensisに焦点を当てた2020年の研究では、系統解析においてアフリカ産のA. wegeneriがアナトスクス(英語版)と近縁な位置に置かれ、その一方で南アメリカ産の種がウグルアイスクス科の最も基盤的な位置に置かれた。このため、本属の単系統性は否定されウルグアイスクス科の側系統群となった。全ての種を1つの属に纏めると、ウルグアイスクスの方に先取権があり、アラリペスクスはウルグアイスクスのジュニアシノニムとなる。