カスティーリャ戦争
スペインは、ブルネイの征服に成功した場合、ペンギラン・セリ・レラはスルタンとなり、ペンギラン・セリ・ラトナは新たなベンダハラとなることに同意した。
スルタン・サイフル・リジャルとパドゥカ・スリ・ベガワン、スルタン・アブドゥル・カハールは、メラガン、次いでジェルドンへと逃げ込み、ブルネイから征服軍を追い払う計画を立てていたが、その間、スペインはコレラや赤痢の発生により大きな損失を被った。1578年6月26日、スペインはわずか72日後にブルネイを放棄してマニラに戻ることを決定した。
ペンギラン・セリ・レラは1578年8月から9月にかけて死亡した。スペインの同盟者を苦しめたのと同じ病気だったと考えられるが、スルタンに毒殺されたとの説もある。セリ・レラの娘でブルネイの皇女であるプトリは、王位継承権を持っていたが、スペインの一行に同行、王位と富を捨て、キリスト教徒のタガログ人と結婚することを決めた。タガログ人はマニラ出身で、スルタン・ボルキアが彼の国を征服したことでブルネイのスルタンの奴隷にされていたため、スペイン人に加勢した。このキリスト教徒のタガログ人は、騎士として戦闘で勇猛さを発揮し、トンドのアグスティン・デ・レガスピと呼ばれていた。皇女プトリとタガログ人は、非イスラム教徒と結婚したイスラム教徒の女性を石打ちの刑で死なせるというコーランの刑罰にもかかわらず結婚をし、二人は深く愛し合い、フィリピンで子供が生まれ、マニラで質素な生活を送った。
ブルネイからは撤退したが、スペインはブルネイがルソン島で再び足場を固めることを阻止できた。 数年後、関係が改善され、スペインはスルタン国との交易を開始した。1599年にマニラ総督のドン・フランシスコ・デ・テッロ・デ・グスマンが正常な関係の回復を求める手紙を出している。カスティーリャ戦争が終わったことで、スペインはスペイン・モロ戦争に集中できるようになった。