網干総合車両所
12系客車(5両) 臨時列車用の原型車5両が配置されている。「SL北びわこ号」などにも使用されていた。2022年7月9日付でオハ12 352が廃車された。
14系客車(7両) ジョイフルトレイン「サロンカーなにわ」7両編成1本が配置されている。
近ミハ(電車・客車) 宮(機関車)
滋賀県米原市の米原駅に隣接している車両基地。かつての京都総合運転所米原派出所を継承している。電留線のみ設けられている。
兵庫県加古川市にある車両基地で、加古川線厄神駅北隣に位置している。2009年(平成21年)7月の組織改正で加古川鉄道部が廃止されたのに伴い、基地機能(厄神基地)が統合されて、網干総合車両所加古川派出所となった。
構内配線は、仕業・電留線2本、洗浄線1本、電留線5本となっている。
滋賀県野洲市の東海道本線(琵琶湖線)篠原 - 野洲間に位置している車両基地。かつての野洲電車区で、京都総合運転所野洲派出所を継承している。