ユニクロン
本作品では、諸般の理由によりアニメ本編では「ユニクロン」という言葉は全く登場しないが(本編では第33話での説明にて邪神と表現されている)、設定上ではユニクロンの存在が大きくこの世界に関わっている。DVD第9巻のブックレットでは、本編では伏せられた本来の設定が掲載されており、グランドブラックホールはユニクロン消滅の影響により発生したものと明言されている。また、プラネットX(エックス)はマスターメガトロン(後のマスターガルバトロン)によりスパークを吸収されたユニクロンの肉体の再生機能のみが時空を超えた世界で暴走し生まれたものと明言されており、そのプラネットX(エックス)のトランスフォーマーであるノイズメイズとサウンドウェーブも実はユニクロンの配下で、彼らもまたユニクロン復活を画策していたとされる。
海外版『TRANSFORMERS CYBERTRON(トランスフォーマー サイバートロン)』では、名を伏せることはなく、本来の設定に近い形で放送された。
『トランスフォーマー ザ・ムービー』『戦え!超ロボット生命体トランスフォーマー2010』
この作品時点での設定ではユニクロン独自の部下はまだ持っておらず、裏切りの行為を繰り返していたスタースクリームに宇宙に遺棄されたメガトロンも含むデストロン兵をユニクロンの力で転生された姿となっている。 ガルバトロン/Galvatron サイクロナス/Cyclonus スカージ/Scouge スウィープス/Sweeps 『トランスフォーマー (マーベルコミック版)』 ガルバトロンII/Galvatron II フック/Hook ライン/Line シンカー/Sinker 『トランスフォーマー:ウォー・フォー・サイバトロン・トリロジー』 ガルバトロン/Galvatron ネメシスプライム/Nemesis Prime(※海外版でのブラックコンボイ/Nemesis Primeの名称) 『ビーストウォーズネオ 超生命体トランスフォーマー』
独自の部下を持つようになったのはこの作品のころからである。玩具では海外のみ発売された『メタルス』のフューザー戦士の色替え。
上述のように各作品に登場するユニクロンは全て同一人物という解釈がよく行われていたが、現在ではこの設定は変更されている。
これにより全て同一人物のはずのユニクロンが各シリーズ毎にそのオリジンから異なる設定となっている、という矛盾は解消されている。
戦え!超ロボット生命体トランスフォーマー2010第26話「原始の呼び声」の劇中では、ロボット生命体を創造した大天才プリマクロン/Primacronによって創造されたが、その後プリマクロンに反逆し勝手に行動するようになったと語られている。
アメコミ版ではセイバートロン星に憑依した光と秩序の神プライマス/Primusと善悪の対になる暗黒の神にして、またの名をカオス・ブリンガー(混沌をもたらす者)の異名を持つ闇の神霊的存在の実体化とされている。