龍が如く 維新!
その後、龍馬や土方らに伊東がもう一人の坂本龍馬(武市)と繋がっていたことや、近々「もう一人の坂本龍馬」と薩長のトップである西郷と桂が会談をするという情報をもたらし、それを基に龍馬が発案した武市をおびき寄せる計画に協力する。龍馬らは全員御陵衛士に顔が知られており、西郷や桂へ接触すれば計画がバレてしまうため、表向きは御陵衛士の一員である藤堂が桂への接触を担当することになる。桂への接触は成功したもののその後に武田に見つかってしまい、銃撃され致命傷を負う。瀕死の状態で寺田屋へ駆け込み、龍馬に武田の口を封じるように後を託すが、龍馬が武田と戦っている間に死亡してしまう。彼の遺体は本人の遺言に基づき、藤堂が間者であったことを悟られないようにするため、沖田らの手で武田と同じ場所に放置され、御陵衛士の一人として死亡したように偽装された。
『極』の追加キャラクター。京で借金取りを営む女性。龍の刺繡が施された羽織を着ていることから「タツ姐」と呼ばれる。客の事情を斟酌したり助言するなど借金取りのイメージとは裏腹な良心的な取り立てを行っており、人の弱みに付け込んで暴利を貪る金貸しを嫌悪している。戦闘ではライフルを使用する。
勤王志士。山崎に捕まり拷問を受け、勤王志士たちが池田屋に集まり京を焼こうとしていることを吐くことになる。
『極』の追加キャラクター。
『極』の追加キャラクター。伏見の飲み屋で他の客に気前よくおごり共に飲み明かしている英国人。飲み屋で龍馬と出会い、日本人の生活や文化を知るために手記を集めるよう依頼する。
主題歌は当時人気のあったロックバンドONE OK ROCKの「Clock Strikes」(A-Sketch)が起用された。これは名越の推薦であることに加え、今までにないことへの挑戦との意味合いもある。
レベルは99、4つの型にそれぞれ25までの段位を設定。全てのスタイルに反映される能力項目も用意され、シリーズ恒例の修行も『見参』のようなミニゲーム形式のものが多くなっている。
バトルダンジョンに連れていける隊士(カード)で本シリーズに登場したキャラクターのみを表記する。頭に*がついている隊士は『極』の追加キャラクター。
声 - 中村獅童
新選組副長。「鬼の副長」と称される通りに龍馬に敗北した山南に躊躇無く止めを刺すなどの冷徹な性格であるが、決して無情というわけではない。また、実質的に近藤不在の新選組の指揮を執っており、新選組に入った龍馬を気に掛ける一方、参謀である伊東の行動には目を光らせている。
近藤の死後は龍馬の正体とその目的を知るが、近藤が探していた「敵」が龍馬の追いかけるそれと同じであったこと、龍馬は近藤から既に新撰組の秘密を聞いている人物だったこと、近藤が今わの際に託した相手が龍馬であったことなどから引き続き龍馬の仲間として協力していく。その直後に開かれた幹部会では伊東を嵌める形で彼の本性を暴く。伊東に新撰組の隊士を大半持っていかれて新選組を実質無力化されてしまった後は、近藤が残した「最後の策」である間者として伊東側に潜り込んでいた藤堂を使い、龍馬らと共に近江屋の計画を立案し実行する。
声 - 石川英郎 / 楠見尚己
長州藩士。大勢の新選組隊士を斃した上に永倉をも手負いに追い込むほどの実力を持つ。戦闘では大型の金砕棒を用いる。桂から反対されていたにもかかわらず、帝を奪うために京の町に火をつける計画を立てていたが、桂と共にいた池田屋で対峙した龍馬に倒された(『ONLINE』で死亡したことが判明した)。
その後、近江屋で計画されたもう一人の坂本龍馬をおびき出す計画で直接相対し、それまで暗躍していた「もう一人の坂本龍馬」の正体が武市であったことが確定する。そこで龍馬に対し「土佐で待つ」と言い残してその場を後にする。
なお、近江屋での再会時は龍馬がショックを受けるほどの老人のような白髪の姿だったが、土佐・高知城での決闘時は元の若々しい黒髪に戻っている。このような変貌を遂げた理由は詳しく語られていないが、武市自身は「龍馬とまた闘えると思うだけで心が躍る、待ってる間に若返っちまった」と語っている。
土佐での最終決戦では佐々木、伊東、トーマス・グラバーらを従えて龍馬たちを迎え撃つ。高知城の吉田東洋が殺害された部屋で武市は龍馬を待ち構えており、吉田東洋を殺害した(覆面の男に殺害を依頼した)のは自分である事と、世の中を変える志を持ちながら血を流さない手段に拘ったがために足踏みし続けていた東洋をもどかしく思い、「東洋の意思を継ぐために東洋を殺した」事を龍馬に吐露する。そして血を流さずに世を変えることに拘った東洋および東洋と同じ志を持つ龍馬に対し、血を流してでも確実に世を変えようとした自分の方が正しいことを証明するため龍馬に決闘を挑む。
死闘の末に敗れた後は自らの行いを悔いて龍馬と和解し、「巨大兵器と化した土佐を壊すこと」と「真の黒幕である山内容堂のこと」を龍馬に話す。直後に龍馬を庇って容堂に撃たれるも何とか生存し、エピローグでは明治に入ってから「山内容堂」として土佐の再建に貢献したことが明かされた。
刀の蒐集を趣味とする集団「刀剣一家」の盟主。戦闘では居合などの様々な型の剣術を使用する。人柄のよい性格だったが、稲原から妖刀「村様」を購入した際に渡されたお香によって他の愛好家共々辻斬りへと変貌してしまう。龍馬に叩きのめられて我に返ったあとは橘組に保護される。事件解決後は橘組の一員となる。