鋏角類
節口類は一般にクモガタ類より早期に分岐した群とされるが、前述のクモガタ類非単系統説により、特定のクモガタ類(特に蛛肺類)に近縁とされる場合もある。化石群であるウミサソリ類は、主に生殖器官の形質に基づいてカブトガニ類よりもクモガタ類に近縁であるとされる。こうして節口類はクモガタ類に対して側系統群である説が一般的になり、「節口類」を廃止させる見方もある。また、従来ではカブトガニ類の一部としてまとめられた化石群ハラフシカブトガニ類(Synziphosurina)は、他のカブトガニ類(狭義のカブトガニ類)に類縁せず、むしろ他の真鋏角類全般に対して非単系統である説が後に有力視される。ウミサソリ類によく似たカスマタスピス類に関しては、カブトガニ類とウミサソリ類に対して多系統群、もしくはそのいずれに内包されるなどの説はあったが、単系統群で、ウミサソリとクモガタ類に近縁である説の方が後に広く認められる。詳細は「節口綱#分類」、「カブトガニ類#系統関係」、「Chasmataspidida#系統関係」、および「ウミサソリ#分類」を参照
それに次いて多様なクモガタ類はザトウムシ(約6500種)・カニムシ(約3400種)・サソリ(約2000種)・ヒヨケムシ(約1100種)が挙げられており、残りのクモガタ類は種数が少なく、多くても数百種程度である。
綱階級以上の分類群は太字、絶滅群は「†」で示される。
鋏角亜門 Chelicerata - 鋏角類。第1体節の付属肢は祖先形質としてはさみ型の鋏角/鋏肢。 †ハベリア目 Habeliida - ハベリア類。基盤的な鋏角類/真鋏角類。前述参照。 †モリソニア目 Mollisoniida - モリソニア類。基盤的な鋏角類/真鋏角類。前述参照。 ウミグモ綱(皆脚綱) Pycnogonida - ウミグモ類。体節は円筒状、吻と担卵肢をもつ。 †パレオイソプス目 Palaeoisopoda †ムカシウミグモ目 Palaeopantopoda †(目和訳なし)Nectopantopoda 皆脚目 Pantopoda 真鋏角類 Euchelicerata - 第8-13体節(後体第2-7節)の付属肢は祖先形質として蓋板状。 節口綱(腿口綱) Merostomata(クモガタ類を除いた側系統群とされる)- 節口類。背甲は付属肢の基部以降を覆うほど発達し、脚の基節に顎基をもつ。 カブトガニ目(剣尾目) Xiphosura - †ハラフシカブトガニ類 Synziphosurina を含む場合、次の全ての分類群を除いた側系統群とされる) †カスマタスピス目 Chasmataspidida †ウミサソリ目(広翼目) Eurypterida クモガタ綱 (蛛形綱、クモ綱) Arachnida - クモガタ類。背甲は付属肢を覆わず、発達した顎基と前胃を欠き、口は前腹側方向に開く。 ダニ亜綱 Acari - ダニ類。
鋏角類の中でウミグモ類は真鋏角類より早期に分岐した説は形態学・分子系統学の両方に最も広く認められる。しかし、基盤的な鋏角類とされるハベリア類などとの系統関係(どっちの方が基盤的なのか)ははっきりしておらず、2000年代の分子系統解析ではウミグモ類はクモガタ類に含まれ、もしくは残り全ての現生節足動物より早期に分岐した群とされる。特に後者の場合、真鋏角類は大顎類と幹性類 Cormogonida をなし、鋏角類(鋏角亜門)は多系統群として解体され、代わりにウミグモ類と真鋏角類を亜門(ウミグモ亜門、真鋏角亜門)へと昇格させる見方もある。ウミグモ類自体の単系統性は確実であるが、その内部系統は分子系統解析によって再編成されつつある。詳細は「ウミグモ綱#系統関係」を参照
2010-2020年代にかけて、真鋏角類の単系統性は確実であり、ウミグモ類と単系統群の鋏角類になる通説も再び広い支持を得られている。真鋏角類の中でカブトガニ類は基盤的で、ウミサソリ類は一般にクモガタ類の近縁と見なされる。蛛肺類以外のクモガタ類の系統関係は、未だに議論の余地がある。
2010年代時点では、11万種以上の鋏角類が記載される。百万種に及ぶ六脚類ほどではないが、節足動物の中で鋏角類は2番目に種数の多い亜門である。ウミグモ類は約1300種以上、カブトガニ類は80種以上(現生種は4種のみ)、カスマタスピス類は10種以上、ウミサソリ類は250種以上が知られる。10万種以上を含んだクモガタ類の中でダニとクモは大半を占め、それぞれ5万5000種以上と4万3000種以上が知られる。