本経寺 (大村市)
日蓮宗は昭和16年に本末を解体したため、現在では、旧本山、旧末寺と呼びならわしている。
鍋冠山誠孝院(長崎市東山手町)
長昌山法妙寺(西彼杵郡長与町斉藤郷)
本住山自證寺(長崎市琴海戸根町)
法輪山妙経寺(西海市西彼町白崎郷)
不滅山實相寺(西海市西海町川内郷)
法華山本清寺(諫早市城見町)
深重山妙宣寺(大村市福重町)
要法山常在寺(東彼杵郡川棚町中組郷)
番守山妙法寺(東彼杵郡東彼杵町三根郷)
壽量山本地寺(東彼杵郡東彼杵町木場郷)