ハーディー・ワインベルクの法則
フィッシャーの正確確率検定をハーディ・ワインベルク平衡検定に用いることもできる。これはアリル頻度pとqが与えられたとき、 そのヘテロ接合体数が観測される確率はいくらかという条件付き確率の問題と見なすことができるためである。 もし観察されたヘテロ接合体の数が期待値より顕著に多かったり、少なかったりした場合には条件付き確率は小さくなりHWPの仮説は棄却される。
Emigh (1980)は与えられたアリル頻度において、あるヘテロ接合体数を与える確率は以下の式で表されるとした。
p r o b [ n 12 | n 1 ] = ( n n 11 , n 12 , n 22 ) ( 2 n n 1 ) 2 n 12 , {\displaystyle \mathrm {prob} [n_{12}|n_{1}]={\frac {{n} \choose {n_{11},n_{12},n_{22}}}{{2n} \choose {n_{1}}}}2^{n_{12}},}