踊る大捜査線 THE GAME 潜水艦に潜入せよ!
本編をプレイする。各チャプタークリア後は、おまけシナリオ「スリーアミーゴスの日常」(それぞれのチャプターに応じたスリーアミーゴスのコント)を見ることが出来る。
本編は湾岸署の署員を捜査に派遣する「ミッション」が中心となっている。「ミッション」には取り調べ(相手の感情メーターを会話によってコントロールする)やハッキングといったものから、TVを修理するといったミニゲームで構成されている。
要所で登場する「ロジックモード」では室井慎次が捜査情報を整理、容疑者の絞り込みなどを行うことでストーリーが進行する。