大垣藩
寛永12年(1635年)、摂津国尼崎藩より戸田氏鉄が10万石で入って、以後は戸田家の支配で安定する。初代藩主・戸田氏鉄は寛永14年(1637年)の島原の乱で戦功を挙げる一方、地方知行制の廃止と俸禄制度の採用から新田開発、治水、治山、家臣団編成などに尽力して大垣藩政の基礎を固めた。また氏鉄は大垣城の整備を行い、明治に至る姿としている。このほか、氏鉄は文化事業でも儒学書を自ら著作するなどして発展させている。
第2代藩主・戸田氏信は明暦元年(1655年)、弟の戸田氏経、戸田氏好らに各4000石、戸田氏利に5000石を新田で分与した。
第3代藩主・戸田氏西は延宝2年(1674年)2月に弟の戸田氏広に新田2000石を分与した。延宝8年(1680年)からは延宝の大暇と称された藩政改革を行ったが、貞享元年(1684年)6月に死去したため、改革は失敗した。
第4代藩主・戸田氏定は貞享5年(1688年)7月、弟の戸田氏成に新田3000石を分与し、氏成は養父の氏利の知行と合わせて1万石を領する大名となり、大垣藩の支藩・大垣新田藩が立藩された。
元禄14年(1701年)3月、氏定の従弟である浅野長矩が吉良義央に刃傷を起こし切腹となる。長矩切腹を聞いた江戸の町人や浪人が、赤穂藩邸に忍び込んだり押し入ったりして暴れる者が続出し、人数は四、五十人にも及んだ。大垣藩からも取り締まりと警護のものが派遣されている。なお、氏定は連座により老中の命で5月まで出仕停止とされた。
第6代藩主・戸田氏英は延享4年(1747年)から延享の永御暇と称された藩政改革に着手したが、年貢増徴を行ったため明和3年(1766年)に百姓一揆が起こって失敗した。