DNA依存性プロテインキナーゼ触媒サブユニット
DNA-PKcsは以下の生体分子と相互作用する。
ATM
C1D
CDC5L
CHEK1
CHUK
CIB1
DCLRE1C
ILF2
ILF3
Ku80
NCOA6
P53
RPA2
WRN
DNA損傷が癌の主な根本要因であると見られており 、DNA修復遺伝子の欠損が多くの形態の癌の根底にあると考えられる 。DNA修復が不十分な場合、DNA損傷が蓄積する傾向がある。過剰なDNA損傷は、損傷乗り越え合成のエラーの頻出による突然変異や、DNA修復中の誤謬によるエピジェネティックな変化を増加させ得る。このような突然変異やエピジェネティックな変化は、癌を引き起こす可能性がある。
PRKDC(DNA-PKcs)の変異は、子宮内膜症に関連する卵巣癌患者の10人中3人から発見された。さらに、乳癌及び膵臓癌患者の10%にも見られた。
下記の表は、6種類の癌についてDNA-PKcsの発現が23%から57%減少することを示す。
癌におけるDNA-PKcsの発現低下の原因は明らかにされていない。MicroRNA-101はDNA-PKcsコーディングmRNAの3'-UTRへの結合を介してDNA-PKcsを標的とし、DNA-PKcsのタンパク質レベルを効率的に低下させることが知られている。ただし、miR-101は、癌ではしばしば増加するのではなく減少する。
HMGA2タンパク質は、二本鎖切断部位からのDNA-PKcsの放出を遅らせ、非相同末端結合によるDNA修復を妨害し、染色体異常を引き起こす 。通常、let-7a miRNAによってHMGA2遺伝子は抑制され、成人の正常な組織ではHMGA2タンパク質はほとんど存在しない。多くの癌ではlet-7 miRNAが抑制されており、一例として、乳癌では、let-7a-3 / let-7b miRNAを制御するプロモーター領域が高メチル化によって頻繁に抑制される。エピジェネティックなlet-7a miRNAのレベル低下又は欠如により、HMGA2タンパク質の高発現が起こるようになり、これによりDNA-PKcsの発現に欠陥が生じる。