ビーダマン
2005年12月31日発売。機構的な変化としては、指で押し出す棒状だったトリガーが銃のような引き金状になった点と、クラッシュウエポンと呼ばれる発射ユニットを両腕に取り付けられる点が上げられる。また機体は、バレル、コア、トリガーの3ブロック構造になっており、初めてバレルがシリーズを通して標準で機体の一部とされた。さらに言えばトリガー上部にはサーバーの役割を果たすレールが設けられており、本体がひとつあれば何も追加パーツが無くとも十分な性能が発揮できる。それに加えて、銃の引き金のような形状のトリガーゆえに片手撃ちがメインとなっており、競技全般で見ると片手撃ち有利の競技が多いことから、機能的にはかなり実用的な方面に打ち出された機体のシリーズと言える。また、アダプターパーツの使用によりバトルビーダマンのパーツが一部使用可能となっている。
1997年3月10日 コロタン文庫147 ボンバーマンビーダマン全百科 ISBN 4-09-281147-0
1996年8月 ボンバーマンビーダマン爆全集 ISBN 4-04-853806-3
1997年8月 ボンバーマンビーダマン爆全集2 ISBN 4091025900
1998年8月 ボンバーマンビーダマン爆全集3 ISBN 4091026370
1999年7月 ボンバーマンビーダマン超爆全集 ISBN 4091028071
2004年6月 バトルビーダマンゼロ爆全集 ISBN 4091061699
1996年12月20日 ボンバーマンビーダマン(ハドソン、スーパーファミコン)
1997年7月11日 スーパービーダマン ファイティングフェニックス(ハドソン、ゲームボーイ)
1997年12月19日 爆球連発!!スーパービーダマン(ハドソン、スーパーファミコン)
1998年7月24日 スーパービーダマン バトルフェニックス64(ハドソン、NINTENDO64)
1999年1月29日 ボンバーマンビーダマン爆外伝 〜ビクトリーへのみち〜(メディアファクトリー、ゲームボーイカラー)
2000年2月4日 ボンバーマンビーダマン爆外伝V ファイナルメガチューン(メディアファクトリー、ゲームボーイカラー)
2000年3月24日 爆球連発!!スーパービーダマン 激誕!ライジングヴァルキリー!!(タカラ、ゲームボーイカラー)
2004年8月5日 B-伝説! バトルビーダマン 〜燃えろ!ビー魂!!〜(アトラス、ゲームボーイアドバンス)
2005年8月4日 B-伝説! バトルビーダマン ファイヤースピリッツ 炎魂(アトラス、ゲームボーイアドバンス)
1997年発売。『II』まで続いてきたゲームのボンバーマンシリーズとのリンクがなくなり、うって変わって宇宙劇風な世界観になった。BB弾を発射する小型のビービーダマンが主人公で、ビー玉を撃ちだすのは乗り物の「ボンバーファイター」である。全ての機体はビービーダマンをコクピットに乗り込ませて遊ぶことができ、メイン商品となる「ボンバーファイター」は追加パーツの換装や「ボンバーアタッカー」二種など一部の機体との連携を楽しむことができる。ビービーダマンのセットや、ビーダマンを使ったスゴロク形式のボードゲームなども発売された。
アニメ『Bビーダマン爆外伝』の1話と2話は本作品をアニメ化したものであり、アニメ版においては「伝説編」(フィルムコミックなど一部媒体では「プラネットエンブレム編」)と呼ばれる。また、漫画版では「伝説の紋章編」とされていた。本作品ではくろボンが敵側のキャラクターとして登場している。アニメ版と漫画版では、きいろボンの性格や紋章およびそれを継承するキャラクターの数、オリジナルの機体など数々の相違点がある。また、いずれも説明書に記載の正式なストーリーとも展開や設定が異なる。
2011年4月発売。本体の構造を大きく変更した新シリーズ。外見は再びロボット風に戻り、ヨロイは廃止された。ビー玉発射機構(コア)を交換することが可能になった。ペンビーシリーズのチューンナップギアを取り付けることも可能。B-太1号にも引き続き対応している。ほとんどの機構はコアに集中しており、頭・腕・脚のパーツはギミックよりも着せ替え的な要素が強い。以前の競技用ビーダマンシリーズから歳月が経ったこともあり、コアは過去のシリーズの機構をリメイクしたものが多い。
アニメ版『爆球連発!!スーパービーダマン』において、主人公たちがOSビーダマンの入手前に使用していた旧型のビーダマン、という設定のシリーズ。デザインはボンバーマン型ではないオリジナルのもの。OSビーダマンの旧型という設定のため、ビーダマン本体のデザインは1種類のみで、カスタムパーツもスーパーボンバーマンからの流用である。スーパーボンバーマンより構造は合理化されており、組立てやすさや強度は向上している。玩具においてはOSギアの装着も可能。
このシリーズは『爆球連発!!スーパービーダマン』のアニメ化に伴い、ボンバーマン型ビーダマンが版権上の問題で使用することができないために登場することになった。また、後のバトルビーダマンゼロの素体がこの構造に酷似している。
1999年7月発売。単に「EXビーダマン(エックス-)」とも。機構に強い個性がある反面、互換性に乏しかったPIシリーズの欠点を改良し、あらゆる部品を交換可能とすることを目指した。EXフレームと呼ばれる内骨格を中心に、EXヘッド、EXアーム、EXトリガー、EXコア、EXフットの各パーツで構成されており、これらのパーツをEXビーダマン同士で換装することができる。PIシステムの発展型であり、マガジンやトリガーなど一部パーツはPIとも互換性がある。また、ビーダマン本体に特定の別売りEXパーツを組み合わせることで「パーフェクトモード」となる販売形態が用いられた。EXフレーム各機体共通ランナーであり、今後頻繁に行われる共通ランナーを用いたシリーズ構成の先駆けとなった。
2001年5月発売。PI-EXビーダマンのように互換性が復活した。コアユニットを核に、ヘッド、ブレスト、アーム、レッグの各ユニットをRリベットで接合しており、機体同士で換装が可能。従来のビーダマンではホールドパーツとトリガーが連動する機構が多かったことなどから、ホールドパーツ、トリガー、マガジン基部が一体化したコアユニットを採用することで、発射機構の独創性と互換性の両立を目指した。しかし、発売予定パーツを多数残してシリーズは終了する。本体も4機しか発売されなかった。
E-Unitシリーズが半ば打ち切り状態となったのは、人気の低下以外にも、「スーパービーダマン」の版権が自社のみのものでなかったこと、「新型は旧型より強い」というストーリーのパワーインフレを脱出するため、開発者の交代、子どもの世代交代、ホビーの流行の変化など、数多くの要因からシリーズを完全新規の対戦形式へ変更するための準備期間であったと考えられる。実際、バトルビーダマンの初期シリーズは大きさや印象こそ違えど、構造的にはEユニットシステムを引き継いだ物である。