エクスパンション・ドラフト
2010年は秋田ノーザンハピネッツ、島根スサノオマジック、宮崎シャイニングサンズの3球団が加盟。秋田は大阪の仲西淳と新潟の水町亮介、島根は東京アパッチの仲西翔自、宮崎は滋賀の小島佑太を指名。
2017年から栃木ゴールデンブレーブスと滋賀ユナイテッドベースボールクラブが加入するのに際して2016年10月21日に実施し、栃木は分配ドラフト指名のみで吉田えり(石川)ら5人、滋賀は地元枠移籍のみで西野颯(信濃)1人をそれぞれ指名した。
まず、既存球団はプロテクトする選手を選定し、リストを提出する。 外国人選手(外国籍かつ外国在住者)、アーリーエントリー適用選手及びFA権を行使する選手はエクスパンション・ドラフトの対象外であり、プロテクトも不可。 プロテクトされた選手については、所属球団とA契約を結ばなければならない(トレードによる仮保有権の譲渡は可)。また、基準値(2006年は共通で3名。2007年以降はプレイオフ出場回数に応じて決められる。)を超えてプロテクトした球団は、ドラフト会議において超過した人数分指名巡が後になる。2012年からはドラフトの制度が変更されたのに伴い、各球団ともプロテクトは3名までとなった。
次に、ドラフト会議と合わせてエクスパンション・ドラフトが行われ、新規参入球団がプロテクトされなかった対象選手から指名する。指名順は抽選で決定する。2012年からは各球団の指名は3名までとなった。
新規参入球団に指名されなかった選手については、元の球団が1週間以内に仮保有権を保持するかどうかを判断し、リストとして提出。保持されない場合は他球団との交渉が可能になる。
既存球団の解散・休止・他連盟転籍があった場合、当該球団の選手は当初エクスパンション・ドラフトの対象となっていたが、2013年からはFA扱いとなるため除外。