知恩院
そのため法然の死後、大谷禅房の隣に法然の廟が造られ弟子が守っていたが、嘉禄3年(1227年)、延暦寺の衆徒によって破壊されてしまった(嘉禄の法難)。しかし、文暦元年(1234年)に法然の弟子である紫野門徒の勢観房源智が再興し、四条天皇から「華頂山知恩教院大谷寺」の寺号を下賜されるなどすると、次第に紫野門徒の拠点となっていった。
建治2年(1276年)、鎮西義の弁長の弟子良忠が鎌倉からやってくると、間もなくして紫野門徒の百万遍知恩寺3世信慧は東山の赤築地(あかつじ)において良忠と談義を行った。そこで両流を校合してみたところ、相違するところが全くなく符合したので、以後源智の門流は別流を立てずに、鎮西義に合流することとなった(「赤築地の談」)。
これにより、紫野門徒の拠点であった知恩院と百万遍知恩寺は鎮西義の京都での有力な拠点となった。
永享3年(1431年)に火災にあって焼失するが、間もなくして再興されている。
応仁元年(1467年)に始まった応仁の乱の際には、知恩院22世周誉珠琳が近江国伊香立(現・大津市伊香立)の金蓮寺に避難し、法然御影や仏像、宝物類を付近にあった庵に避難させ、この庵を改めて新知恩院とした。そして、文明10年(1478年)に知恩院を再興するが、永正14年(1517年)に焼失する。
大永3年(1523年)、知恩院25世超誉存牛(ちょうよぞんぎゅう)と百万遍知恩寺25世慶秀との間で本寺争いとなったが知恩院が勝利し、鎮西義で第一の座次となり本山となった。
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崇泰院 - かつて浄土真宗本願寺派本山の大谷本願寺があった所。元大谷ともよばれる。
光玄院
樹昌院
既成院
源光院
信重院
保徳院
良生院
先求院
浩徳院
松宿院 - 松風天満宮とも呼ばれる。洛陽天満宮二十五社順拝第15番札所の「梅宿菴天満宮」であるともされている。
入信院
光照院
阿弥陀堂
権現堂
方丈庭園
山亭と庭園
法然上人御廟
多宝塔
濡髪大明神
方丈庭園 二十五菩薩の庭
友禅苑
千姫の墓
大鐘楼(重要文化財)
梵鐘(重要文化財)
経蔵(重要文化財)