尖閣諸島戦時遭難事件
守備隊としては陸軍の独立混成第45旅団(旅団長:宮嵜武之少将)が配備され、指揮下に海軍石垣島警備隊などが存在した。地上戦は無かったものの空襲は受けており、十・十空襲の際に4日間で延べ約40機が来襲したのを皮切りに、1945年3月末から6月下旬にかけてイギリス機動部隊を中心とした空襲が頻繁であった。アメリカ海軍のPB4Y-2(B-24爆撃機の海軍仕様)も占領した沖縄の飛行場等から作戦行動を行っていた。ただ、7月に入ってからは沖縄本島での組織的な地上戦が終わり、空襲も減少していた。八重山諸島では、島外疎開を選ばなかった住民に対し6月から山地への島内疎開が命じられており、波照間島などの住民は西表島へ移住させられていた。
石垣島の独混第45旅団では、沖縄本島にアメリカ軍が上陸して八重山諸島が孤立化した後、海上輸送用に徴用船や修理した沈没船を集めて「水軍隊」と称する船舶部隊を編成していた。水軍隊は長谷川小太郎少尉を指揮官に、軍呼称第一千早丸(原船名:一心丸)、第三千早丸、第五千早丸(原船名:友福丸)の3隻を装備していた。第五千早丸の機関長によれば第一千早丸、第二千早丸とも150トンの貝採取用の漁船、別の第五千早丸乗員の回想によれば第一千早丸は150トンの機帆船(石垣島の井上造船所製)、第五千早丸は200トンの機帆船(本土徴用)であったという。水軍隊は5月にも同じ尖閣諸島迂回航路で台湾へ往復しており、本事件は同航路での2度目の航海で起きた。3隻の保有船のうち第三千早丸は故障中のため参加しなかったが、別に長谷川少尉の指揮する小船が傷病兵を輸送するために同時出航したとも言われる。