コミックボンボン
サイボーグクロちゃん
へろへろくん
ドテラマン
キャッ党忍伝てやんでえ
のらくろクン
平成天才バカボン
レレレの天才バカボン
おそ松くん(アニメ第2作)
もーれつア太郎(アニメ第2作)
ゲゲゲの鬼太郎(アニメ第3作)
ゲゲゲの鬼太郎(アニメ第4作)
ゲゲゲの鬼太郎(アニメ第5作)
悪魔くん
マシュランボー
ベムベムハンターこてんぐテン丸
RPG伝説ヘポイ
ゲンジ通信あげだま
デルトラ・クエスト
バンダイ ガンダムシリーズ、SDガンダム 超機甲爆走ロボトライ ハイパーレーサー4WD ウェブグランプリ バクシード 甲竜伝説ヴィルガスト スーパーバーコードウォーズ(バンダイ版バーコードバトラー。ボンボンはSDガンダム関連のみ) クラッシュギア 疾風!アイアンリーガー 棋神伝バトルコマンダー タカラトミー(トミー、タカラ) トランスフォーマー ミクロマン・マグネパワーズ すげゴマ(ベイブレードの前身にあたる) ロボレス戦士 コンボット 戦う男のウォーウォータンクス バトルスキッパー 韋駄天翔 サプリビンダーズ その他 大貝獣物語 THE MIRACLE OF THE ZONE(MOZ) ミラクルVマスター 仰天人間バトシーラー レスラー軍団シール(ベルフーズのガムラツイストとラーメンばあのおまけ) 秘伝忍法帳 マジャイネーション ダイノキングバトル
ガンプラブームで小学生以下にも火がつき始めたのに注目し、本誌でもガンプラをメインに扱う特集を組むようになる。プラモで戦う『プラモ狂四郎』や既存商品の改造テクニックなどと連動し、一大ガンプラブームを巻き起こし、パーフェクトガンダムを始めとした本誌からのガンプラが登場するなど、大きな影響を与えた。MSVの発展にも大きく貢献し、ガンダムの資料としての価値もあるといわれ、『エースパイロット列伝』は特に評価されている。以後本誌はガンダムと密接なつながりを持つようになった。またガンダムの影響でリアルロボットアニメが多数作られた中、『太陽の牙ダグラム』『装甲騎兵ボトムズ』も漫画版が連載され、プラモデルも『狂四郎』や特集記事に登場している。幼年向け漫画雑誌としては、これら模型関係の記事が長らく組まれていたことも特徴である。
ファミコンブームでは、『ファミコン風雲児』『ファミ拳リュウ』を連載。シールブームでは、コロコロの『ビックリマン』シールに、『ビックリマン』シールの情報を載せつつ『レスラー軍団』シール、『秘伝忍法帖』シールなどで対抗した。
スーパーボンボン - 隔月刊。1987年(昭和62年)5月号から1988年(昭和63年)7月号の計8刊。
デラックスボンボン
コミックボンボン増刊号
アブラカダブラ
ガンダムマガジン
月刊少年ライバル
2017年(平成29年)7月21日にpixivコミック内で、『ボンボン』で掲載されていた漫画の再連載を開始することが報道された。また再連載の他、『今日のこねこのチー』や『くつだる。』などの新作も掲載を行う。ボンボンTVとの連携で、それらに関する活動漫画(ボンボンTVのユーチューバーな日常、他)も掲載される。更新日は毎週金曜日。
これに合わせてyoutubeにて、『サイボーグクロちゃん』と『くつだる。』のアニメ版が期間限定で全話公開された。
新装版 SD武者ガンダム風雲録 天下統一編+地上最強編 - 『SD戦国伝 天下統一編』と『新SD戦国伝 地上最強編』を一つの単行本にまとめたもの。 新装版 SD武者ガンダム風雲録 伝説の大将軍編 新装版 超戦士ガンダム野郎(メカデザイン原案:大河原邦男)
藤異秀明 新装版 真・女神転生 デビルチルドレン - 全3巻(監修:ATLUS) 新装版 UMA大戦 ククルとナギ - 全3巻
ほるまりん 新装版 メダロット ヒカル編 - 漫画版『メダロット』の1巻から3巻を一冊にまとめたもの。 新装版 メダロット イッキ編 - 全4巻 新装版 メダロット コイシマル編 - 上下巻
帯ひろ志 新装版 がんばれゴエモンゆき姫救出絵巻
池原しげと 新装版 ロックマン ロックマン 1&2編
原作:下田淳&レッド・エンタテインメント、作画:タモリはタル 新装版 ロボットポンコッツ グレイテスト編 - 上下巻 新装版 ロボットポンコッツ スペシャリスト編 - 上下巻
爆弾をモチーフにしたキャラクター。
1981年11月号 - 1982年10月号:『スパットマンX』(途中から『パットマスターX』に改題):ジョージ秋山
1981年11月号 - 1985年9月号:『レッツゴー!しゅんちゃん』:坂本しゅうじ
1981年11月号 - 1983年6月号:『ひみつ司令0059』:成井紀郎
1981年11月号 - 1983年6月号:『リトルフィッシャーマン』:蛭田充(原案・二階堂旭)
1981年11月号 - 1984年7月号:『スープーマン』:原作・永井豪、作画・はまだよしみ
1981年11月号 - 1983年4月号:『太陽の牙ダグラム』:森藤よしひろ
1981年11月号 - 1983年7月号:『ムサシと小次郎』:服部かずみ
1981年11月号 - 1982年3月号:『シャッターNo.1』:池原しげと
1981年11月号 - 1982年8月号:『はてさてナンダー』:とや邦行
1981年11月号 - 1982年7月号:『マキとキャル』:望月祐一
1981年11月号 - 1982年6月号:『星のピートン』:三浦みつる
1981年11月号 - 1984年6月号:『ほえろ!闘志』:井上コオ
1981年11月号 - 1982年1月号:『どんドコどん』:山根あかおに
1981年11月号 - 1982年1月号:『ホップステップチャンプ』:細井雄二
1981年11月号 - 1982年4月号:『バクちゃん』:こんどう洋介
1981年11月号 - 1982年8月号:『コスモそるじゃあ』:山口博史
1981年11月号 - 1982年4月号:『コンビニ園長』:槙村ただし
1982年1月号 - 3月号:『ハクリキ先生』:青木めだか
1982年2月号 - 1986年11月号:『プラモ狂四郎』:原作・クラフト団、作画・やまと虹一
作画:ほしの竜一(原作:矢立肇・富野由悠季、協力:バンダイカード事業部、キャラクターデザイン原案:横井孝二) 新装版 SDガンダム外伝 騎士ガンダム物語 - 全9巻 新装版 SDガンダム外伝 騎士ガンダム 機甲神伝説 - 上下巻 新装版 SDガンダム外伝 騎士ガンダム 魔龍ゼロの騎士伝 新装版 SDガンダム外伝 騎士ガンダム 黄金神話 - 上下巻 新装版 SDガンダム外伝 騎士ガンダム 鎧闘神戦記 新装版 SDガンダム聖伝 - 上下巻 新装版 SDガンダム列伝 ガンダム騎士団-パワーズ-
作画:神田正宏、原作:クラフト団(キャラクターデザイン原案:大河原邦男、横井孝二) 新装版 新武者ガンダム 七人の超将軍 新装版 新武者ガンダム 超機動大将軍 - 上下巻 新装版 超武者ガンダム 武神輝羅鋼 新装版 超武者ガンダム 刕覇大将軍 新装版 新武者ガンダム 天星七人衆 新装版 新武者ガンダム ムシャ戦記 光の変幻編 新装版 SDガンダム ムシャジェネレーション
作画:一式まさと、原作:矢立肇・富野由悠季(武者ガンダムシリーズ企画原案:やまと虹一、安井ひさし) 新装版 SD頑駄無 武者○伝 新装版 SD頑駄無 武者○伝2 新装版 SD頑駄無 武者○伝III - 上下巻 新装版 SDガンダムフォース絵巻 武者烈伝 武化舞可編 - 上下巻
作画:あずま勇輝(Layup)、原作:矢立肇・富野由悠季 新装版 SDガンダムフルカラー劇場 - 春やすみ、夏やすみ、冬やすみ
作画:ときた洸一、原作:矢立肇・富野由悠季 新・新装版 機動戦士ガンダム 逆襲のシャア 新装版 SDガンダム三国伝
じゅきあきら・T・ 海の大陸NOA - 上下巻