ハプログループE (mtDNA)
ハプログループE (mtDNA)(ハプログループE (ミトコンドリアDNA)、英: Haplogroup E (mtDNA))とは、分子人類学で用いられる、人類のミトコンドリアDNAハプログループ(型集団)の分類のうち、「M9」を祖先に持ち、3027, 3705, 7598, 13626, 16390の変異により定義されるものである。
ハプログループEは海域東南アジアにおいて広く見られる。姉妹群のM9a(日本でも見られる)が分布する東アジア大陸部にはほとんど見られない。特にオーストロネシア語族話者によく見られ、他の語族の話者には稀である。台湾、フィリピン、インドネシア、マレーシア、パプアニューギニア沿岸部、太平洋諸島の特にチャモロ人でみられる。
下位系統のうち、E1bとE2aは海域東南アジアでみられ、E1aとE2bは台湾で見られる。