河内風穴
鈴鹿プロジェクト後、未調査の支洞を多く残したまま10年程度河内風穴での未測量空間の測量調査は途絶えた。その間、各大学のサークルによる河内風穴への入洞はしばしば行われた。例えば、上記鈴鹿プロジェクトに参加していた大阪市立大学探検部は、1988年7月には新人合宿で、翌年10月にも鈴鹿洞窟合宿で河内風穴に入洞している。更に1990年4月には読売テレビのニュース番組の取材協力のため河内風穴に入洞し、その後も1991年1月、1992年12月、1993年6月、同年11月、と河内風穴で洞窟活動を行っている。1995年には7月の新人合宿および12月の洞窟活動で2度、1996年には5月、6月、10月、11月に各1回、9月に2回と1年に6回も入洞しており、翌年も1月、9月および10月に、その翌年は5月、1999年には10月のテレビ取材および11月に河内風穴に入洞している。ほかにも、近畿大学文化会探検部は1988年8月30日から9月4日まで河内風穴訓練合宿にて測量訓練を行っている。また、関西大学探検部は1992年5月および1993年に河内風穴洞窟合宿を行っている。
また、合同合宿も多く組まれ、1987年11月には京都府立大学および大阪市立大学が、1988年9月には大阪大学および大阪市立大学が、1989年5月には大阪芸術大学、大阪市立大学および神戸大学が、河内風穴で合同合宿を実施している。また1989年6月には江戸川ケイビングクラブと大阪市立大学が河内風穴で合同合宿を実施している。
哺乳綱 翼手目 キクガシラコウモリ科。縦長三角形の鼻葉をもち、前腕長は45 mm以下。河内風穴では第1水流付近で新しい全身骨格が観察されている。
洞内の気温は、洞口付近では外気の影響を受けやすく、季節によって大きく変化するが、洞奥では四季を通して一定で、平均気温は11.3°C、標準偏差0.15°C。そのことから、明治時代以前には天然の冷蔵施設として利用され、種芋や蚕種を保存していた。また、一年を通して93%–95%といった、90%以上の高い湿度が保たれている。また観光洞部分の滴下水および第0水流の水はpH 7.52–8.30で、中央値はpH 7.90である。エチレンジアミン四酢酸二ナトリウムを用いた硬度測定では、Ca濃度は81.2–121.1 ppmであった。水の導電率は石灰岩が溶蝕されている度合いの指標となるが、河内風穴の湧泉の導電率は93 μs/cmで、普通石灰岩帯で観察される数値に比べ極めて低い。
大広間の最低部にある水流は渇水期には水音が聞こえる程度で表出しないが、降雨直後の増水時には水面が上昇し、地下河川となって現れることがある。大雨の直後には水深1 m程度のプールとなる。時には洞口から水を吐出することもあるといわれる。
シアターホール (Theater Hall) はドンガラ南の間からボアパッセージを抜け、EW90°のクラックに沿って上った先にある、長さ60 m、幅15 m、天井高25 mの西に向かって傾斜したホールである。シアターホールの名は斜面の落盤礫が劇場のように見えることから名付けられた。走向N70°–75°Wの垂直に近いWNW-ESE系の割目に沿って細長くのび、これに平行する割目に沿って壁面が形成されている。西に向かって傾斜した斜面の最低部では観光洞部からの声が聞こえるため、直下は大広間最奥部に当たると考えられている。N15°E, 80°E, N70°–75°W60°の割目系が見られ、これらの交叉部が崩落して形成されたと考えられている。天井部のN65°–70°Wの大きな割目は、破砕された角礫や水平な条線が刻まれた鏡肌が見られる横ずれ断層で、後者に沿って均等に天井が崩落するパターンが見られる。WNW–ESE系の割目には溶蝕形態があり、割目に沿ってフレアティック・パッセージを形成している部分もあるのに対し、N–S系の割目には溶蝕形態は少ない。
シアターホールから観光洞部にかけて、構造支配がWNW–ESE系からN–S系へと大きく変わるが、この形状は2つの割目系による流路争奪があったことを示唆するか、WNW–ESE系の割目に沿って西方から流れてきた地下水流がこの場所で合流したのだろうと考えられている。
鈴鹿プロジェクトから12年経ち、2000年になると、大阪教育大学ケイビングクラブOBの杉林理雄をリーダーとして再びひみず会による河内風穴の調査合宿が組まれた。7月15日から16日に東京スペレオクラブの後藤聡ら、西日本洞窟潜水研究会、J.E.T.、亀戸ケイビングクラブ、明治大学地底研究部、地底旅団ROVER元老院が参加しベンチマークの確認、未測量部分の確認およびケイビングによる環境破壊の確認を目的に調査が行われた。
これがきっかけとなり、2001年に東京スペレオクラブ主催の調査プロジェクトが計画された。2001年11月3日から11月4日にかけて、東京スペレオクラブに加え、西日本洞窟潜水研究会および大阪市立大学探検部により調査が行われた。この活動は河内プロジェクトという仮称で呼ばれていたが、活動リーダーの本田幸雅により多賀大社の祭神である伊弉諾に因み「イザナギプロジェクト」という名称が提案され、これが第1回イザナギプロジェクトとなった。ベンチマークが設置され、新最奥部の測量が開始された。
2002年には後藤聡がリーダーとなってイザナギプロジェクトが開催され、洞内環境保護のため希少な鍾乳石のある範囲にトラロープが設置された。2003年頃には西日本洞窟潜水研究会によって、第二水流上流部に向けて試験的な潜水が行われ、河内風穴の第二水流は上流に空間が続いており、奥から大量の水が流れる大水脈であることが確認された。また蟻の巣の測量が開始された。
新最奥部はひみず会により発見されていたものの測量されていなかった部分で、イザナギプロジェクトにより初めて測量された空間である。イザナギホール、イザナミホール、龍の道、幻の滝などからなり、総延長686 mである。
イザナギホールは旧最奥部上層から南西に伸びるボアパッセージを抜けた空間である。イザナギプロジェクトにちなみ名付けられた。二次生成物に乏しい長径約10 mの落盤帯で、新最奥部各部に繫がるホールである。
イザナミホールはイザナギホール上部の西端から上方に伸びる竪穴から繋がるホールであり、同じく二次生成物や水流のない長径約10 mの落盤によって形成された空間である。イザナギホールの上層に当たり、対になるよう伊弉冉にちなみ名付けられた。
龍の道はイザナギホール最西端から続く泥床の支洞から接続し、北方に伸びる支洞である。水流痕がみられ、増水時には水が流れると考えられている。別の支洞により再びイザナギホール西端とループする。
幻の滝は西日本洞窟潜水研究会の安田浩一により発見された長径 4 m 、落差 -20 mの洞内竪穴である。増水時のみ水流が現れ滝となることから名付けられた。龍の道から下流に向かい匍匐する支洞を抜けた先にある。