圓山溟北
慶応4年(1868年)戊辰戦争が勃発すると、幕領だった佐渡では佐幕の機運が高まり、閏4月11日溟北は同盟記を草したが、11月20日参謀兼民政方奥平謙輔が来島して治めることとなった。溟北は奉行所に呼び出され、同盟記について問い質されたため、切腹を覚悟しつつ、薩摩藩が幕府を陥れたことに対して、貴藩長州藩が禁門の変を起こしたのと同じ精神で行ったものだと訴えたところ、難なく許され、またその文章を奇警と賞賛されたという。翌日、旧幕臣は新政府より面口を支給されることとなった。その後、学問や政治に関して謙輔と会話を交わすようになり、僧某の入獄、伊藤某の死刑実行に反対した。佐渡奉行所廃止時、その蔵書を尽く与えられた。
明治元年(1868年)11月22日、役所と共に修教館が河原田に移設されることとなり、12月河原田乗念寺に仮寓し、新校舎は翌年4月に落成した。明治2年(1869年)9月、新貞老が新知事として派遣されると、役所が相川に戻されることとなり、溟北も相川に戻り、旧奉行所内に修教館を仮設した。
明治3年(1870年)1月、知事の勧告により士分を失い、「飲水百姓軒記」を記した。明治4年(1871年)新政府に出仕し、以降神職を歴任した。明治11年(1878年)6月、京都に行き、菊池三渓、菊池九江、草場船山等と交わり、また湊川神社を訪れた。
明治8年(1875年)7月16日、豪雨による洪水で自宅が浸水した。明治10年(1877年)5月、一町目裏町松永邸撫孤松園を買い取り、転居した。自邸の庭に国花桜3本を植え、日本花園と名付けた。
明治11年(1878年)6月、坪井雲仙に描かせた松窓読書図をもって京都詩仙堂を訪れた。