相変異 (細菌)
上述の他のメカニズムとは異なり、エピジェネティック修飾による相変異では、DNA配列(遺伝子型)の変更を伴わずに表現型のみが変更される。すなわち、ゲノムの完全性は損なわれず、DNA化学修飾の変化により転写因子の結合が変化される。その結果、転写が調節され、遺伝子発現が切り替わる。大腸菌の外膜タンパク質抗原43(Ag43)は、DNAメチル化酵素(デオキシアデノシンメチルトランスフェラーゼ;Dam)と酸化ストレスレギュレーターOxyRの2つのタンパク質によって媒介される相変異によって制御される。細胞表面にあるAg43は、Agn43遺伝子(以前はfluと呼称されていた)によってコードされており、バイオフィルムの構築や感染症の理解に重要である。Agn43の発現は、レギュレータータンパク質OxyRの結合に依存している。OxyRがプロモーターと重複するAgn43の調節領域に結合すると、転写を阻害する。転写のONフェーズは、 Agn43遺伝子(OxyR結合部位と重複する)の最初のGATC配列をDamがメチル化することに依存している。DamがGATC部位をメチル化すると、OxyRの結合が阻害され、Ag43の転写が可能になる。