御香宮神社
本殿(重要文化財) - 慶長10年(1605年)に徳川家康の命令で板倉勝重が普請奉行となって再建。平成2年(1990年)の修理で極彩色の彫刻が復元された。
伏見の御香水 - 徳川義直、徳川頼宣、徳川頼房はこの水を産湯として使用したという。
拝殿(割拝殿、京都府指定有形文化財) - 寛永2年(1625年)に徳川頼宣の寄進によって再建。中国の登龍門の故事に基づいた極彩色彫刻が唐破風元にある。
絵馬堂
九社殿
能舞台
社務所
庭園「遠州ゆかりの石庭」 - 元和9年(1623年)に伏見奉行に就任した小堀遠州が伏見奉行所内に作庭した庭を、昭和32年(1957年)に中根金作が当地に再現したもの。
神馬舎
稲荷社 - 祭神:菊姫大明神
弁天社
松尾社
東照宮 - 祭神:徳川家康 本殿 拝殿
北門
北合祀社 - 春日社、天満社、新宮社、熊野社、那智社、金札社
大神宮 - 祭神:天照皇大神、豊受大神
豊国社 - 祭神:豊臣秀吉
東合祀社 - 若宮八幡社、恵比須社、八坂社、住吉社
土蔵
神輿蔵
九香軒
参集館
貴賓館
大杉社 - 祭神:大杉大明神
表門(重要文化財) - 元和8年(1622年)、徳川頼房が伏見城の大手門を貰い受け、当社に寄進したもの。中国の二十四孝の蟇股がある。