Pikmin Bloom
ピクミンと共に歩き花植えをすることが本作の主な目的である。花びらをセットして歩くことでマップ上に花が咲く。この花は数日間咲き続け、他のプレイヤーからも見えるようになる(咲いた花を任意に消すことも可能)。花は様々な種類が存在する。
またマップ上のあらゆる場所は「ビッグフラワー」や「キノコ」になっている。「ビッグフラワー」は周辺に植えた花の数が一定数を越えると咲く大きな花で、一定時間で枯れて再びサイクルを迎える。「ビッグフラワー」も花の種類と同種存在する。
任天堂の直営店(「Nintendo TOKYO」など)やイベントが実施されている場所は「スペシャルスポット」として、特別な苗が手に入る。
「キノコ」は「おつかい」を頼んで壊すことができる。様々な大きさや色が存在し、その色に対応したピクミンがより速く壊すことができる。大きいほど難易度が高い。