遊☆戯☆王デュエルモンスターズ エキスパート2006
2006年世界大会公式ソフト。ゲームボーイアドバンスでは最後の作品。デュエルシミュレーター的なソフトであり、シナリオモードは存在しない。初期デッキは第4期ストラクチャーデッキ6種から選択できる。またそれ以外にもスターターデッキ2006のカードを最初から所持している。
レギュラーパック「SHADOW OF INFINITY」までのカードがほぼ収録されており、総数は約2000枚。通常のデュエルの他に、1ターンで勝利の手を見つける「詰めデュエル」、様々な制限の元にデュエルを行う「制限デュエル」、課題をこなす「テーマデュエル」、LP持ち越しで勝ち抜く「LPサバイバル」などが存在する。パッケージには遊城十代が描かれているが、ゲーム中に原作やアニメのキャラは登場せず、「カードのモンスターが、自分自身と仲間のカードを使用したデッキ」とデュエルをすることになる。
今作には2005年9月1日の禁止・制限リストが収録されているが、公式ホームページ、Vジャンプに掲載されていたパスワードを入力することで、2006年3月1日、2006年9月1日、2007年3月1日のリストに更新することができる。
ゲーム本体に加え、ストラクチャーデッキ(魔法使いの裁き、戦士の伝説)、特典カード4枚、遊☆戯☆王ONLINEゲームディスク、デュエルパス Phase3を豪華6点セットとした「ワールドチャンピオンシップ2006セット」も同時発売された。
テーマデュエルの「大革命」は、バグのためクリアすることができない。そのため、チャレンジ達成率は99%が最高となっている。
ダンディライオンが戦士族となっていたり、ハイドロゲドンがトークンを戦闘で破壊しても効果を発動できる等OCGとは異なるバグ・設定ミスも存在する。