ジョンソン郡 (ケンタッキー州)
ローレンス郡 - 北
マーティン郡 - 東
フロイド郡 - 南
マゴフィン郡 - 南西
モーガン郡 - 北西
南北戦争が終わると、トマス・ジェファーソン・メイヨーがペインツビルに移住してきて、天分と才能がある教師としての役割を果たした。メイヨーの子がジョン・C・C・メイヨーであり、東部ケンタッキー州の発展に重要な人物となった。郡民はメイヨーに関する記憶について賛否が分かれている。ペインツビル、ひいてはジョンソン郡の発展に寄与した貢献者だと言う者がいる。メイヨーは銀行、教会、公共事業、鉄道輸送を発展させた。一方でこの郡の莫大な石炭資源についてその石炭会社が大きな影響を直接与えた責任があり、そのためにこの地域が今日まで経済的に落ち込んだのだと言う者もいる。
石炭はジョンソン郡や東部ケンタッキー州にとって南北戦争前でも重要だったが、その発展は戦争の開始時点で止まってしまった。東部ケンタッキー州の石炭産業に資金が戻ってくるのが遅く、これがジョンソン郡の発展を阻害した。人々は部外者に懐疑的だった。学校の教師であるメイヨーは人に良く知られており、仲間の一人とみられた。メイヨーは石炭産業が東部ケンタッキー州の炭田や工業化された北部にしっかりとした地盤を築くために貢献し、それが地域に鉄道を引かせることになった。北部から移ってきたカーペットバッガーがこの地域でも見られるようになった。ジョンソン郡の多くの市民が誤った情報を与えられ、その土地の鉱業権を二束三文で売り払ったのはこの時期だった。ある場合には新しい猟銃と引き換えだった。
ジョンソン郡は1843年にフロイド郡から分離して設立された。当時、郡庁所在地のペインツビル市は既に9年前から認定都市だった。1810年代には既に家屋が建てられ始めていた。
ジョンソン郡設立時の住人の大半はスコットランド、アイルランド、イングランドあるいはドイツからの移民の子孫だった。その多くはアメリカ独立戦争に参加した後にノースカロライナ州、ペンシルベニア州、バージニア州から移住してきた。
初期の25年くらいの間、ジョンソン郡もペインツビル市も大変な時代だった。道路もハイウェイも無いようなものだった。郵便や物資はブルーグラス地域から馬の背に乗せてまた蒸気船で送られてきた。時代が下がって、駅馬車が州東部とジョンソン郡からブルーグラス地域や他の文明地域とを結ぶようになった。