終末のハーレム
世界各地に存在するさまざまな反UW勢力のうち、日本にて蜂起した集団。絵理沙や光らの派閥と輝奈らの派閥に分かれており、後者は2045年終盤に開始したイザナギ(善)との乱交を経て、2049年現在では何人もの子供たちを得ている。
周防美来 - あべみほ 黒田マリア - 四葉杏果 片桐麗亜 - 伊東みつき 龍造寺朱音 - 山本有紗 東堂晶 - 南沙羽
牡丹と百合愛が陸との混浴を意識する中、陸は同棲先を訪れた桜との再会を経て、彼女へ募らせてきた思いを回想する。陸を思いやる牡丹は百合愛と共に彼と同衾し、怜人・マリア・朱音・翠・ちふゆは、捜索に応じたミキや怜人を思う桜を連れ、NOSEXへの対策に必要な薬草を求めて九州へ向かう。
怜人たちはミキを連れてきたために輝奈から歓迎され、善との子供たちを披露される。薬草の入手は許可されたものの善の解放は許可されず、怜人はイザナミに馴染んでいた善から定住を提案されるが、それを断る。その夜、MWによる襲撃を経て善を守ろうと残ったミキを怜人たちは心配しながら、東京へ帰還する。激務で翔太が消耗する関東からクロエとポープは日本近海の艦船へ帰還するが、極秘に復帰していた花蓮に拘束される。一方、怜人は陸と対面して比較実験用のデータを入手し、朱音は非公式に来日したアナスタシアを出迎え、陸は桜から怜人への愛情を告げられる。
クロエは、幸福から絶望に叩き落とされた出自の記憶を花蓮によって呼び覚まされ、その真相を確かめようと彼女に誘われる。怜人は美来への思いも新たに花蓮を糾弾し、彼女の怒りを買う。真相を把握したクロエは三賢者のもとへ赴き、その元凶だった彼女たちを殺害する。花蓮は三賢者が孤島にて稼働させようとしていた単性生殖システム「聖母の子宮」を横領し、クローンの製造にアナスタシアを伴って着手する。
冰冰は花蓮の陰謀を感じ取った呂から、改めて怜人のために動くよう命じられる。怜人が対NOSEX試薬を完成させる一方、アナスタシアは花蓮のもとで何者かとのメイティングに臨む。桜は怜人に好意を告白するが失恋に終わり、彼は美来と改めて思いを交わそうとしていたところを、政府職員を偽った女性たちに襲撃される。同時期に襲撃されていた朱音と共に監禁された怜人は、彼女の看病によって高熱から回復するが、監禁先の施設の女性から朱音とのメイティングを命じられたうえ、美来の死亡を告げられる。
翔太は女子生徒たちの存在に動揺しながらも柚希に夜の自室へ招かれ、導かれるまま結ばれる。翌日、翔太は一条奈都や柊春歌と打ち解け始め、体育館で黒田・レイン・ちふゆと東堂晶のバレーボール対決に立ち会うが、ボールで額を負傷する。翔太を心配した柚希が音楽室にて再び身体を開く一方、花蓮は怜人と恭司への対抗心を燃やす。
1週間後、それまで柚希と日々愛し合った翔太は自室で奈都の突然の来訪に動揺するが、柚希と会えない状況に際して奈都とも結ばれる。その後、柚希の態度から自分の環境を察した翔太に花蓮はメイティングの詳細を明かし、欲情した女子生徒たちは翔太の目の前で制服を脱いでいく。その光景に満足した首脳陣は、美来を解任する。
怜人は特効薬の開発難航に苦悩していたが、新たな専属担当官として現れた研究者・黒田マリアや美来の旧友・片桐麗亜と共に、日本で最初にMKウイルスの犠牲者が出た慶門市へ向かう。
翔太は晶にとあることを依頼し、怜人たちは香港の反UW勢力のボス・呂からMKウイルスの結晶を託されてヨーロッパへ発つが、彼女の裏ではクロエが暗躍する。ジェット機内では冰冰が絵理沙の覚悟を試し、メイティングセンターではエリカが翔太に覚悟を示す。ロスアニア公国では到着した怜人たちに王女・アナスタシアが対面し、怜人との婚礼を宣言する。
怜人はアナスタシアを説得して絵理沙と共にMKウイルスの特別研究施設を訪れるが、そこを使いこなせる博士・ラギーニ・シンはかつての失敗から山中にて隠遁生活を送っており、彼女に会った怜人は特効薬の開発に際して命と童貞を捨てる覚悟を問われる。ラギーニの協力を得られないまま、怜人は童貞を捨てる相手として絵理沙・マリア・朱音・冰冰・アナスタシアだけでなく日本にいる美来のことも意識するが、絵理沙には辞退されたうえ、マリアから求愛される。一方、朱音は怜人への求愛の順番を待ちながら、彼を「楽しませる」一計を案じる。
晶と結ばれた翌日、翔太は保健室にて春歌・奈都・晶に流されるままメイティングに励むが、花蓮から柚希の「転任」を知らされた結果、進んで女子生徒を求める自棄に至る。そこへ、翔太をかつて無視していた元級友・星野汐音が「転校」してくる。翔太はタレントになり損ねていた汐音が年下の女子生徒たちから蔑視される姿を嘲笑して花蓮の勧めに応じ、UW日本支部による後ろ盾を求める汐音に昼休みの校舎屋上でのメイティングを強要する。
まひるがメイティングを拒否し、首脳陣がUW世界本部の使者に備える中、朱音はマリアと共に怜人への暗殺計画を察して彼のもとを訪れ、自分が鬼原の娘であることや麗亜への不審を明かし、難民地区に隠れ家を構える。一方、自分でも暗殺計画を察した麗亜は配給に参加する怜人への狙撃を美来のために阻止し、その首謀者を推察する。マリアは渡米したはずの研究者たちの消息が病院跡で途絶えていたことを知り、怜人はそこがMKウイルスの製造場所かと疑う。
さらに、2020年7月22日に発売された雑誌『プレジデント』同年8/14号による細野へのインタビューでも、「『ファイアパンチ』や『終末のハーレム』の連載が始まると読者が一気に増え、やはり一番大切なのは作品の力だと痛感した」と述懐されている。
英語翻訳版の発売予定がドニカの海外向けメディアサイト「MANGA.TOKYO」によって報じられた際には、本作に先駆けて発売予定の『Yuuna and the Haunted Hot Springs』(原題:ゆらぎ荘の幽奈さん)と並んで読者アンケートで高評価を得た作品であることを、それらの翻訳・発売を担当するセブンシーズ・エンターテインメント社の編集長のアダム・アーノルドが、自社の公式サイトで述べている。
公式アプリ『マワシヨミジャンプ』の2019年で最も多くマワシヨミされた本が地域別に集計された結果、「日本は『鬼滅の刃』文化圏と『終末のハーレム』文化圏に分かれていた」ことが発表された。
ライター・ドラマ評論家の成馬零一は、本作について以下のように評している。
テレビアニメ版放送終了後の2022年4月19日には、WonderSpaceのウェブマガジン「TVマガ」にて実施されたアンケート「【男性100人に聞いた】ハーレム漫画おすすめ人気ランキングベスト15!」で、第1位を記録している。
声 - 浅川悠(ボイスドラマ・VRアニメ) / 大地葉
怜人の健康管理と同衾のために美来が選んだ、ナースの女性。UW日本支部の国務長官を務める鬼原()(声 - 斉藤貴美子)の娘でもある。
声 - 伊藤静(ボイスドラマ・VRアニメ) / 白石晴香
本作のメインヒロイン。怜人の専属担当官。怜人のメイティング成果を得られず上層部によって解任されるが、その後も彼に協力し続ける。正体は絵理沙のクローン。
キャラクターの色指定については、第1部ではモノクロでキャラクターデザインを上げていたため、単行本へ収録する際やカラーページを着色する段階になってから決めていたが、第2部では最初からおおむね決めているという。
モザイク処理については、女性の乳首が見える絵は配信では少し難しいと言われたために隠すこととなったが、一味変えたかったので『J+』編集部やデザイナーと相談しながら、デジタルノイズ風にしてもらった。なお、連載開始当初はアプリで読む漫画が後年ほど定着していなかったため、当時の『J+』編集部の方針から過激な表現も許容されていたという。
連載時の第1部第82話の柱コメントで同部がクライマックスであることが説明されていたことについて、LINKは今の物語が一旦終了することや第2部を予定していることを明かしており、「世界観を変えるようなことはせずに海外ドラマにおけるシーズン1からシーズン2のように続きを描いていく」と語っている。その後、休止期間を経て開始された第2部では、ドラマやアニメの脚本のようなシナリオ形式の原作だった第1部から一転し、脚本では表現できなかった面白さを入れようと、途中からネーム形式の原作へ移行している。
LINKは近未来における食料生産、人の移動、人口半減による科学力低下などの設定をなるべく細かく決めており、宵野は「今の科学と風景を残しつつ近未来を入れていくのがどこまで嘘臭くならないかという匙加減がとても難しい」と語っている。なお、LINKは連載を続けていくうちに当初から変更した設定も存在することを、テレビアニメ版のシナリオ会議中に明かしている。また、サスペンスの比重は企画段階から意図していたものであり、『J+』編集部には「明るくおバカでHに」とのアドバイスももらったが、世に山ほど存在するその要素ではいずれ埋もれてしまうことから、自分の意図を通したおかげで独自性を出せたという。なお、その要素は後に明るい兆しも出てきて「おねショタ」路線も描く第2部で活用されている。
物語の根幹に関わるメインヒロインたちはLINKが設定を宵野に渡してデザインを描いてもらうが、モブヒロインなどは彼女が自由に描く場合もあるという。その結果、モブヒロインの1人だった玲奈が読者人気が高かったことから出番を増やされたように、宵野の生み出したキャラクターの魅力が物語に大きく影響を与えることもあるという。また、宵野は1つの場面でヒロインの髪型や服装などが似通うと読者が混乱するので、なるべく似たようなものにならないよう注意したり、作中世界にまだまだ現れていない魅力的な内面を持った女性を登場させられることから、作画も負けないようにタッチを変えてみたり、瞳の描き方を変えたりと試行錯誤を重ねているという。