青苧座
さらに永正の乱によって長尾氏が守護上杉氏を完全に傀儡化すると、青苧座に対しても支配を及ぼすようになった。大永年間には長尾氏は越後苧座の頭人であった蔵田氏に青苧の公事徴収・流通統制権を認め、三条西家に対してもこれまで天王寺苧座などが納めていた苧課役を50貫に減額させた上で越後苧座による京都への青苧搬入を認めさせた。この傾向は長尾景虎(上杉謙信)が上杉氏宗家を継承した後も強化され、この時代には各地から青苧購入のために訪れる諸国の船に対しても課税を行って、越後-畿内間の青苧流通の支配権を獲得していった。この際に活躍したのが前述の蔵田氏であり、越後の苧商人を統括するとともに長尾氏(上杉氏)の御用商人として景虎(謙信)の軍事活動を経済的な面から支えていた。
青苧座は織豊政権による座の撤廃と上杉氏の移封によって力を失うことになる。そして皮肉なことに、越後の青苧が江戸時代の元禄年間に没落した最大の理由は、上杉氏の移封とともに青苧栽培技術が伝来された会津・米沢両藩産の青苧との競争に敗北した影響が大きかったという。