中沢岩太
1897年(明治30年)5月初、蜂須賀文部大臣に呼び出された岩太は、新大学の理工科大学長就任を相談され、これを受諾した。推薦したのは濱尾総長、古市工科大学長であった。同年9月から土木・機械両学科を開校し授業を行うことが決まっていたため、岩太は内命と同時に京都へ出張し、急いで準備にあたった。1897年(明治30年)6月28日、京都帝国大学理工科大学の創設に伴い初代学長に就任した。就任に伴い、7月には工手学校の校長を辞任した(なお、工手学校とは顧問として継続した)。京都帝大理工科大学長としては、それまで東京帝国大学のみしかなかったところに新たに設立されたということで、特色ある学風を育てたいという人々の要望に応え、制度の制定等に独自の工夫を凝らして思い切った革新の気鋭で進めた。中でも岩太が行った大きな功績は、東京帝国大学で採用されていた学年制を改めて、現在多くの大学で採用されている講座制を率先して採用し、在学年限の最短と最長を定めたことにある。これは、学生の人格を認め、個性を尊び、真理愛好の精神を高めようとする岩太の考えによって制定されたものである。1907年(明治40年)3月31日、京都帝国大学名誉教授の称号を授けられた。
1900年(明治33年)4月に第三高等工業学校(後に京都高等工芸学校と改称)の創立委員となり、7月にはパリ万国博覧会の出品調査と実業学校視察のためフランスへ派遣され、翌年2月帰国した。