讃岐丸 (特設水上機母艦)
その後、12月1日付で特設運送艦に類別変更され、以後は輸送任務に従事する。ラバウルとトラック諸島で飛行隊関連物件を陸揚げしたのち、横須賀に回航された。「讃岐丸」を退艦して第九五八海軍航空隊に転属した飛行隊員18名のうち、飛行長以外の17名は末期に入っていたガダルカナル島の戦いで全員戦死した。
1943年1月から2月、「讃岐丸」は陸軍部隊の輸送(丙一号輸送と丙三号輸送)に参加した。「讃岐丸」などの丙一号輸送での任務は第二十師団主力の釜山からウェワクへの輸送、丙三号輸送での任務は第四十一師団主力の青島からウェワクへの輸送であった。「讃岐丸」は集合地の釜山に1月6日に着いた。丙一号輸送では「讃岐丸」は第六戦隊(「北上」、「大井」)、「相良丸」とともに第一輸送隊として1月9日に釜山を出発し、パラオを経由して1月19日にウェワクに到着した。「讃岐丸」と「相良丸」はパラオで南洋興発の農林部員50名と第二特別根拠地隊の設営隊員150名も乗せた。「讃岐丸」の輸送内容は人員1019名、車両17両、物件7200梱であった。次の丙三号輸送では「讃岐丸」は第九戦隊、「相良丸」、「護国丸」とともに第一輸送隊として2月4日に青島を出発し、パラオを経由して2月20日にウェワクに到着した。丙三号輸送では途中のパラオでも陸軍部隊を乗せた。「讃岐丸」の輸送内容は人員1298名、車両16両、物件8300梱であった。ウェワクへの輸送からの帰途についていた昭和18年3月21日、「讃岐丸」は北緯07度49分 東経139度48分 / 北緯7.
日本郵船のニューヨーク航路に投入されていた貨物船陣はこれまで、「対馬丸」(6,754トン)に代表されるT型貨物船などの旧式船が主力であったが、国内外の他社が優秀船を配船するにいたって劣勢に立たされた。さらに、国内船会社のライバルである大阪商船が畿内丸級貨物船を就航させ、横浜とニューヨーク間を25日17時間半で結ぶにいたり、貨物船の高速化に一層の拍車がかかって貨物船同士が速力のレコードを競う時代が到来した。出遅れた日本郵船は遅れを取り戻すべく、第一次船舶改善助成施設で長良丸級貨物船6隻、通称N型貨物船を建造してニューヨーク航路に投入した。続いてリバプール航路用貨物船として赤城丸級貨物船5隻、通称A型貨物船を建造。そしてニューヨーク航路向けの高速貨物船の第二陣として崎戸丸級貨物船、通称S型貨物船を7隻建造する事とした。
「讃岐丸」は1939年(昭和14年)5月1日に三菱重工業長崎造船所で竣工した。竣工後は東回り世界一周航路に就航し、横浜とロサンゼルスを11日と7時間、パナマ運河を経てロンドンとの間を32日と23時間で走破して新記録を打ち立てた。しかし、第二次世界大戦が勃発するなど国際情勢が厳しくなり、また1940年(昭和15年)9月27日に日独伊三国同盟が締結されると日米関係も微妙なものとなった。ニューヨーク航路からは保全のために優秀船を引き上げて旧型船を配し、世界一周航路自体も昭和15年5月以降は運休に追い込まれることとなった。