羽後本荘駅
羽後交通の路線バスが、西口側において連絡する。実質的なバスターミナルは、当駅からやや離れた場所にある、羽後交通本荘自動車営業所となっている(循環バスも、「羽後交通前」の停留所名で停車する)。なお、西口駅前広場の整備期間中、待合所は仮設のプレハブ小屋となっていた。また、バス停の位置も暫定的なものとなっていたが、一部整備終了に伴い、乗り場はこれまでの位置に戻り、降り場は仮バス停の位置になった。
本荘市内線
本荘・伏見線
福祉エリア線
県立大学線
岩谷線
東由利線 / 本荘・横手線
本荘高校線
急行 本荘・秋田線
高速バス:東京方面(エクスプレス鳥海号)、仙台方面(仙台 - 酒田・本荘線)
由利本荘市循環バス