牟岐線
徳島駅 - 中田駅間は、海運会社の阿波国共同汽船が小松島港に発着する船との連絡線として1913年に開業させた徳島駅 - 小松島駅間の一部である。開業当初から鉄道院が借り上げて小松島軽便線として運営していた。なお、中田駅 - 小松島駅間は1985年に廃止されている。
中田駅 - 羽ノ浦駅間は、私鉄の阿南鉄道が1916年に開業させた中田駅 - 古庄駅間の路線の一部である。鉄道敷設法では以南の建設線の終点を阿南鉄道の終点である古庄駅付近としていたが、羽ノ浦駅から分岐して延伸されることとなった。羽ノ浦駅 - 古庄駅間は阿南鉄道国有化後も貨物線として残っていたが1961年に廃止されている。
羽ノ浦駅 - 海部駅間は当初から国有鉄道として建設され、特に牟岐駅以南の区間は日本鉄道建設公団により阿佐線として工事が行われた。現在の終点である阿波海南駅、およびのちに阿佐海岸鉄道に移管されることになる海部駅まで開業したのは1973年である。
廃止区間のものを除く。1961年以前は小松島線だった区間も含む。
富田浦駅:1934年9月20日開業、1941年8月10日休止、徳島 - 二軒屋間
丈六駅:1934年9月20日開業、1941年8月10日休止、地蔵橋 - 中田間
金磯駅:1916年12月15日開業、1962年7月18日廃止、南小松島 - 阿波赤石間