ザクセン選帝侯領
しかしモーリッツは神聖ローマ帝国のプロテスタント諸侯の頭目になる野心に突き動かされ、エルネスティン系からテューリンゲンを奪い取ることを許されなかった不満も手伝って、皇帝の陣営から離反した。
モーリッツは1551年にフランス王アンリ2世と同盟を結び、ロレーヌ地方のヴェルダン、トゥール、メッスの3司教領(英語版)をフランスに譲渡し、反皇帝派の諸侯達と結んでカール5世に対する陰謀を計画した。モーリッツの謀反で窮地に陥ったカール5世は翌1552年、パッサウ条約によりプロテスタント領邦に信教の自由を認めた。
モーリッツは1553年に32歳でブランデンブルク=クルムバッハ辺境伯アルブレヒト・アルキビアデスとの戦いで戦死(第二次辺境伯戦争)、弟で後継者のアウグストはメルゼブルク(英語版)、ナウムブルク及びマイセンの司教領を廃止し、自らの領土に組み込んだ。1561年に最後のカトリックのメルゼブルク司教が死ぬと、カール5世の弟フェルディナント1世は次の司教を任命することを要求した。アウグストはこれに対して自分の嫡男アレクサンダー(Alexander von Sachsen)を司教区監督者に任命し、息子の死後は自らが同司教区の監督者となった。アウグストは他の司教領でもカトリック信徒の司教が死ぬごとに、司教区を廃止してカトリック信徒の宗教活動を禁じた。