メタン菌
メタン生成菌の分類に関しては国際メタン生成菌分類小委員会によって1988年に基準が設定されている。以下に最小基準を列記する。
分離生成の確認(純粋性の証明)
形態
界面活性剤感受性
グラム染色
運動性
コロニー形態
メタン生成基質
メタン生成の確認
増殖速度
増殖条件(培地の条件:温度、pH、NaCl濃度等)
GC含量
これら以外にも、推奨される基準としては以下のようなものがあげられている。
電子顕微鏡写真
免疫蛍光
脂質分析
全タンパク質(二次元電気泳動)
16S rRNA系統解析あるいはDNA-DNA分子交雑法
メタン生成菌より構成されるのは、メタノバクテリウム綱、メタノコックス綱、メタノミクロビウム綱、メタノピュルス綱の4綱である。2013年にはテルモプラズマ綱の中にメタン生成を行うものが発見された。いずれもユーリ古細菌である。
一方、2015年には、オーストラリアの海底炭層帯水層に含まれていたバチ古細菌門のゲノムから、メタン生成経路が発見された。バチ古細菌門はTACK上門やプロテオ古細菌界と呼ばれるグループに属しており、メタン生成菌の起源がユーリ古細菌分岐以前にさかのぼる可能性が出ている。