崇福寺跡
その所在地について文献資料には「大津宮の北西の長等山」(『三宝絵詞』『扶桑略記』『今昔物語集』)で「志賀の山越えの途中」(『大和物語』137段)などと記される。長等山は大津宮から南西の方角にあり矛盾があるが、9世紀頃には大津宮は粟津にあったと考えられていた事からの錯誤だと考えられている。
伽藍について『扶桑略記』(天智七年正月十七日条)と『延暦僧録』(近江天皇菩薩伝)の記述には若干の祖語があるものの、読み下すとおおよそ以下のようになる。
以上にあるように所在地や伽藍は文献資料と遺跡で良く対応しているとされる。 ただし、二つの史料が何時の姿を伝えたものかは不明である。中西常雄は『延暦僧録』は延暦年間、『扶桑略記』の内容は崇福寺縁起と伝わっているが10世紀から12世紀ごろの姿と推測している。あわせて『扶桑略記』には檜皮葺や板葺の記載があり、崇福寺が記録に残る最古の檜皮葺とされることもあるが、白鳳期の瓦が出土していることから創建時の姿であったか疑問視する説もある。なお文献資料にあるが未発見の堂宇として、燈籠、鐘楼、僧房、食屋、厨坊、器室、湯屋、法華堂などがある。また『延暦僧録』にある「造食屋厨坊器室高脚」の記述や『扶桑略記』にある「法華堂が南谷底に崩れ落ちた」の記載より一部の堂宇が懸造であった可能性が指摘されている。
貴重な遺物が素人により記録が残されないままに掘り出されてしまった事に驚いた梅原は、次善策としてAの立会のもとで塔心礎などの出土状況の検証を柴田らと行った。するとAが提示した出土品と出土状況が一致しないことが判明。Aと地元住民は警察に連行され、厳しい取り調べが行われた。地元住民は出土品の窃盗を認め、隠し持っていた銀貨2枚と鏡1枚が回収されたが、Aは否認しつづけ釈放される。
翌年にAは雲崗石窟の実測に従事するが、その際の酒宴で「崇福寺の秘宝はまだある」と口走り翌朝に逃亡。数日後に京城駅で捕まって再び警察署で取り調べを受ける。Aが銀銭を鴨川に平行する疎水に投棄したと証言したことから川底を100mほどさらったが何も発見できず、Aは再び釈放された。結局少なくとも銀貨1枚が行方不明のままに旧国宝に指定され現在に至っている。なお塔心礎の柱座の周囲には栗石の残骸があり心柱の柱脚を支えていたと考えられるが、これも破壊されて詳細は不明である。
延喜14年(914年) 崇福寺火災、地を払って残るなし(『扶桑略記』『日本紀略』)修理料五千束、伝法会料一万束(『延喜式』)
延長5年(927年) 崇福寺弥勒新像供養(『扶桑略記』『日本紀略』)
康保2年(965年) 崇福寺失火、堂塔仏像経蔵鐘楼僧房、悉く焼け落ちる。(『扶桑略記』『日本紀略』)
天延4年(976年) 崇福寺の法華堂が地震で谷底に落ち、弥勒堂の北西部が落石で損壊する(『扶桑略記』)
寛仁3年(1019年) 道長、崇福寺弥勒会に詣でる(『栄花物語』)
治安2年(1022年) 崇福寺が落雷によって焼失(『日本紀略』『左経記』)
長元9年(1036年) 後一条天皇六七日の斎を崇福寺にて修める(『左経記』)
天喜5年(1057年) 崇福寺供養(『扶桑略記』『園城寺伝記』)
承保3年(1076年) 志賀寺塔供養(『扶桑略記』)
永保元年(1081年) 崇福寺が園城寺と共に焼失する(『扶桑略記』『寺門伝記補録』)
久寿2年(1155年) 近衛天皇の六七日の御忌を崇福寺にて修める(『兵範記』)
長寛元年(1163年) 延暦寺が園城寺を焼き、崇福寺、梵釈寺も類焼する(『寺門伝記補録』『三井続燈録』)
寛喜2年(1230年) 崇福寺が園城寺中北両院に属する(『三井続燈録』)
永和3年(1377年) 法勝寺興行の為、崇福寺より毎年二貫文を出させる(『西教寺文書』)
享保19年(1734年) 寒川辰清が大津宮、崇福寺、梵釈寺の阯について推測する(『近江輿地志略』)
北尾根、中尾根の建築群の軸は南北軸に対し東に7度の偏りがあるが、南尾根の建築群の偏りは東に2度であり、異なる寺院であると考えられている。北尾根と中尾根の寺院の伽藍配置について、講堂が金堂の北東に位置するなど若干の相違があるものの、おおよそ川原寺式を踏襲しているとされる。
崇福寺跡の調査は近江大津宮(以下、大津宮)の所在地論争と不可分であった。天智天皇が遷都した宮殿について『今昔物語集』には粟津宮(大津市粟津町付近か?)と記載されるなど、遅くとも平安末期にはその所在が不明となっていたが、明治に至ると天智天皇のいわば聖蹟である大津宮の所在を明らかにしようという機運が高まっていた。この頃の考古学会では大津宮はわずか5年で廃された事や、当時の宮殿が礎石や瓦を用いないことからその痕跡を求めることは困難であり、大津宮から北西の山中にあるとされる崇福寺や、その近隣にあるとされる梵釈寺から間接的に位置を探ろうとする考えが主流であった。