妙法寺 (長岡市)
日蓮宗は昭和16年(1941年)に本末を解体したため、現在では、旧本山、旧末寺と呼びならわしている。
泰澄山金蔵寺(長岡市村田)塔頭
常徳山泉蔵寺(長岡市村田)塔頭
日現山信盛寺(長岡市村田)塔頭
本妙山大長寺(東京都府中市若松)
虎谿山円隆寺(長岡市入塩川)
永光山法立寺(長岡市与板町与板乙)
吉祥山日朝寺(上越市寺町)
吉尾山法興寺(柏崎市吉尾)
安國山東城寺(柏崎市中田)
南永山玉泉寺(新潟県刈羽郡刈羽村入和田乙)
月光山妙満寺(新潟県刈羽郡刈羽村入和田甲) 妙満寺末:妙音山顕本寺(上越市仲町)
正平寺(柏崎市小杉)
霊池山妙蓮寺(上越市柿崎区柿崎)
上輪山妙泉寺(柏崎市上輪)
常在山妙興寺(柏崎市米山町)
本住寺(柏崎市米山町)
蓮台山妙本寺(新潟県三島郡出雲崎町久田)
宝生山大慶寺(新潟県三島郡出雲崎町大寺)
佛立山蓮念寺(長岡市東保内)
興立山治暦寺(長岡市村田)
佛住山本行寺(長岡市城之丘)
佛生山乗光寺(長岡市両高)
高森山大栄寺(長岡市両高)
安倍山本立寺(新潟市中央区三和町)
清正寺(長岡市中之島中条丙)
唱題山妙孝寺(村上市上中島)
日栄山常昌寺(燕市地蔵堂本町)
法智山真如寺(五泉市村松甲)