ドロアワモチ
以下には日本近辺に見られるドロアワモチに類似したものを挙げたが、世界には外見の似た種類が更に多く知られる。
イソアワモチ類 (Peronia spp.)(「spp.」は「複数種」を示す略号)には大きさや背面突起などがドロアワモチに似たものがあるが、背面後部に表面の突起が伸びて樹枝状になった二次鰓が多数あることでドロアワモチと区別できる。この二次鰓は薬品固定で収縮した標本でも普通は明瞭に見える。生時の色合いはドロアワモチより緑がかるものが多い。生息環境も異なり、直接海水の影響がある礫地や岩礁などに棲むことが多い。
ヤベガワモチ(Onchidium sp. 2)は有明海や八代海などの九州沿岸域や朝鮮半島に分布するとされる大型種で、最初に有明海に注ぐ矢部川の河口で見つかったためにこの名がある。当初はヤベカワモチとされたが、2012年公表の第4次環境省レッドリストでヤベガワモチに変更された。ドロアワモチと同属に分類されていて、基本的な特徴はドロアワモチに良く似るが、より大型になり、背面は全体に黒く斑紋がなく頭部も黒っぽいことで区別される。環境省レッドリスト(2007・2012)では絶滅危惧I類とされている。
ジャコテンアワモチ(Onchidium sp. ?
以下には日本産のドロアワモチを Onchidium hongkongense と見做して記述しているが、実際には日本産のものは香港産のものとよく似た別種である可能性があることにも留意しなければならない。