脂肪酸の合成
炭素数は通常12-17個程度で、生成する分岐脂肪酸の組成は個々の細菌に固有な場合が多い。
バリン -> 2-メチルプロパニルCoA ->
偶数炭素数のイソ型脂肪酸(例えば14-メチルペンタデカン酸)
ロイシン -> 3-メチルブチリルCoA ->
奇数炭素数のイソ型脂肪酸(13-メチルテトラデカン酸)
イソロイシン -> 2-メチルブチリルCoA ->
奇数炭素数のアンテイソ型脂肪酸(12-メチルテトラデカン酸)
2つ目のグループでは、プライマーとして分岐のある短鎖脂肪酸を用いる。例えば、3-メチルブタン酸(イソ吉草酸)、2-メチルブタン酸、2-メチルプロパン酸(イソ酪酸)などが用いられる。例えば2-メチルプロパン酸からはイソパルミチン酸が生成する。3-メチルブタン酸はヘミテルペノイドであり、テルペン生合成経路で合成される。
奇数炭素数の脂肪酸(odd-chain fatty acid; OCFA)は、FASにより偶数炭素数の飽和脂肪酸と同様の機構で合成される。一部の反芻動物や植物に見つかっているが、自然界における分布は少ない。プライマーにアセチルCoA(C2)ではなくプロピオニルCoA(C3)を用いることで、奇数炭素数の飽和脂肪酸が合成される(主にC15ペンタデカン酸とC17ヘプタデカン酸)。プロピオニルCoA自体は、すでにある奇数炭素数の脂肪酸のβ酸化、もしくはいくつかのアミノ酸(メチオニン、バリン、イソロイシン、トレオニン)の分解、コレステロールの分解によって生成する。