九九式襲撃機
試作機における試験結果は飛行性能および操縦性も良好であったが、機体の振動や着陸時の失速特性の悪さといった問題も指摘され、量産型では主翼前縁にスラットを設けることでその解決を図り、1940年(昭和15年)5月に九九式襲撃機として制式制定された。 当時、陸軍は 皇紀2600年制式の兵器の命名方針を定め切れていなかったため、前年度年式と同じ「九九式」とされた。
また本機は生産過程で一部仕様(艤装)を変更するだけで軍偵察機にする事もでき、この型は九九式軍偵察機として制式制定された。この派生型では後部座席の副操縦装置や防弾鋼板を取り外し、胴体下・横に開けられた小窓から外部を空中撮影するための写真機が設置された。この仕様変更に対応するため、胴体内に爆弾を収納するスペースは無くなり、爆弾は両翼下に搭載された(軍偵察機は司令部偵察機のような偵察専用機ではなく、時には爆装しての攻撃任務を行えることが求められている)。また視界を広げるために機体に比して風防・天蓋が大きく設計されている。ただし艤装以外は元の九九式襲撃機とほとんど同じものである。
生産数は三菱製が1,472機であり、1944年(昭和19年)以降は陸軍航空工廠でも1,000機近くが生産され、軍偵型も含めた総数は2,385機。
1941年(昭和16年)、性能向上のためにエンジンをハ112に換装し、固定脚を引込脚に変更したキ71が満州飛行機によって試作されたが、期待した程の性能向上が見られなかったため実用化には至らずに終わった。