本八幡駅
当駅に乗り入れている路線は線路名称上の総武本線と、東京都交通局の都営地下鉄新宿線が乗り入れ、接続駅となっている。都営地下鉄新宿線は当駅が始発駅・終着駅となっている。
総武本線の運転系統としては緩行線を走る中央・総武緩行線(総武線各駅停車)のみが停車する。
中央・総武緩行線(総武線各駅停車):緩行線を走行する総武本線の近距離電車。駅番号はJB 28。
都営地下鉄新宿線:新宿駅から当駅までを結ぶ東京都交通局の運営する鉄道路線(都営地下鉄)。駅番号はS 21。
島式ホーム1面2線を有する地下駅である。
用地取得の遅れや交通量の多い国道14号が駅中程に横断していたことから、工期短縮を図ったものの完成が間に合わず、開業当初は新宿方の55 mに仮設ホームを設けて営業していた。1991年9月1日にコンコースを拡幅し、本設駅として営業を開始した。
都営地下鉄最東端、かつ東京都外に所在する唯一の駅である。東京都シルバーパスが都外の鉄道駅では唯一使用可能。また、都営まるごときっぷ(1日乗車券)など都営交通限定の企画乗車券類を都外で唯一発売している駅でもあり、都営地下鉄を使えるものであれば当駅も乗降が可能である。
馬喰駅務管区本八幡駅務区として、船堀駅 - 篠崎駅間を管理している。2018年度には、ホームドアが設置・使用開始された。
総武線(各駅停車) 市川駅 (JB 27) - 本八幡駅 (JB 28) - 下総中山駅 (JB 29)