ミュ〜コミ+プラス
月曜日 松井玲奈(2013年4月2日 - 2018年3月20日) - 卒業後は終身名誉アシスタントになった。 西井万理那(ZOC、2019年9月 - 終了)番組では「リベロ」 と呼ばれる。 2019年12月23日は諸般の事情により休演。
火曜日 田所あずさ(2013年4月10日 - 2020年4月1日) - 番組アシスタントとしては歴代最長。 2017年4月26日、5月3日、12月27日 は田所が体調不良のため、大橋彩香が代理出演。 2017年12月20日 も同様に木戸衣吹が代理出演。 末吉9太郎(CUBERS、2020年4月15日 - 終了)
木曜日:根岸可蓮(たこやきレインボー、2021年)
前回のスペシャルウィーク企画と同じ方法で集計したアイドルソングベスト40を全曲放送する。また、月曜日にはBiSH、木曜日には吉崎綾がゲスト出演した。全曲の順位は こちら を参照。1位を獲得した曲は、ベイビーレイズJAPAN「夜明けBrand New Days」であった。
2011年6月度スペシャルウィーク企画の続編として、「お前の好きな1都3県ランキング」で優勝した神奈川県をフィーチャーし、神奈川に関する日替わりテーマに対して、「どちらがより『イイネ!』と愛されているのか」を街頭アンケート、テキスト生放送分でのTwitter、メール、FAXで投票してもらう(各1票ずつ、1人最大4票まで)。番組内では、「PR大使」リスナーの生電話出演、神奈川にゆかりあるゲストタレント・アーティストによる応援メッセージで、リスナー投票を盛り上げる。聴取率調査週間の前週から実施。
この番組はニッポン放送で放送される番組とは別に、Twitterの番組公式アカウント(@mc1242)で行われる「Twitter上の番組」があり、「番組」同士が連動する「ダブルワイド方式」をとっている。
吉田は前番組「宇宙GメンEX」の中で、Twitterの機能をフル活用したTwitter大喜利を実施していた。この中で、「『話し言葉』がラジオを通して不特定多数の人に対して「放送する」ことができるように、『書き言葉』もTwitterを通すことで、不特定多数の人に対して「放送する」ことができる。毎日同じ時間につぶやき始め、リスナーと時間を共有すれば、それは「番組」である。」という吉田の考えを導き出し、当番組で、この考えを具現化した、「ダブルワイド方式」を採用した。
10年目を迎えたミューコミプラス、8月29日(木)に2000回を迎えるということで、8月20日から8月30日までの2週間2000回を記念して「ずっと出てくれてる人」「いつも出てくれる人」「最近めっちゃ仲良くなった人」などを呼んじゃおう!!というスペシャル。ゲストは20日はベッド・イン×ONIGAWARA、21日はCHiCO with HoneyWorksのCHiCO・黒沢ともよ、22日はせりざわーず(I☆Risの芹澤優、私立恵比寿中学の真山りか、夢みるアドレセンスの荻野可鈴)、23日はスフィア、27日はゴールデンボンバーの鬼龍院翔・松井玲奈(アシスタント)、28日はすとろべりーぷりんす・略 - すとぷり・ジェル、29日はフィッシャーズ、30日は竹達彩奈。
2014年10月30日に番組が「放送1000回」を迎えるため、リスナーに感謝の思いを還元するため、ゲストにアイドル・声優ユニットを迎えて、ゲーム・クイズ大会を開催し、ゲーム・クイズの勝者予想に参加したリスナー1000名にアニメ・アーティストグッツや吉田の私物などのプレゼントを行う。なお、スペシャルウィーク期間中では100〜200名分しかリスナープレゼントできなかったため、翌28日以降もプレゼント企画を実施した。
声優をゲストに招き、作品紹介をしながら、以下の企画を展開する。なお声優プラスを休止し、アニメ制作スタッフや通常ゲストを招くこともある。
もう! 私に何を言わせるの!?(女性)/おいおい!俺に何を言わせるんだ!(男性)
『宇宙GメンTAKUYA』『宇宙GメンEX』で行っていた「勝手に着声ランキング」の後継企画。変態音響監督・ヨシダ(吉田尚記)による演出の元、ゲスト声優にリスナーから寄せられたセリフを言ってもらう。セリフは、キャラのセリフをそのままでなければ、基本的に何でも良い(なお、直接的な下ネタの入ったセリフは読まれにくい)。ここのコーナー放送の際には、平均8000ツイート、最大で28000ツイートを超える人気コーナー。以前のタイトルは「勝手に着声リクエスト」。2010年4月30日放送分よりコーナー名が変更された。通称は「変態音響監督のコーナー」。なお、2020年8月7日よりアニマックスのサポーターズプラスに吸収される形で、「もう!私(たち)に何を言わせるの!? Supported by ANIMAX / おいおい!俺(たち)に何を言わせるんだ!? Supported by ANIMAX」とコーナー名が変更された上コーナー時間が若干延長され、放送終了後に吉田のTikTokアカウント「よっぴー/吉田尚記」にて生放送中の模様が配信されたり、アニマックスからのセリフが追加されたりしている。
質問コーナー(2010年4月19日 - 2011年1月21日)
ゲストにちなんだシチュエーションで、リスナーからの質問に答えてもらう。
ももいろクローバーZ主演の映画「幕が上がる」のスピンオフ・ラジオドラマを放送する。県立富士ケ丘高校高校内唯一の放送部員・美優の『ラジオドラマを作りたい』という夢をかなえるため、美優と同校演劇部所属の3年生5名が「ミューコミ+プラス」のラジオドラマコンテストに向けて、ラジオドラマ制作に打ち込んでいくする内容。なお、美優と演劇部5名が制作したラジオドラマは、劇中劇『走れJK』として最終日に放送された。原作は平田オリザ、主演を映画同様ももいろクローバーZが務める他、立木文彦、アルコ&ピース、吉田尚記、レギュラーアシスタントの田所あずさ、松井玲奈、応募で選ばれた番組リスナーが出演する。また、各話のあらすじ紹介を中村繪里子が担当する。
リスナーからの投票および街頭インタビューによってランキングしたアニソンベスト40をカウントダウン式に発表する。なお、4日間に渡ってゲストは呼ばず、吉田尚記とアシスタント(松井玲奈、田所あずさ、飯窪春奈)のみで放送した。
全曲の順位は こちら を参照。1位を獲得した曲は、どうぶつビスケッツ×PPP「ようこそジャパリパークへ」(『けものフレンズ』OP)であった。
スカパーJSAT、アニマックスブロードキャスト・ジャパン、ニッポン放送のコラボレーション番組として、2017年7月28日よりBSスカパー!にて本番組のテレビ番組版「ミュ~コミ+プラスTV presented by アニマックス」が放送されている。番組MCの吉田がゲストと一緒に、アニメカルチャーやアニメ音楽を様々な切り口の企画で楽しむ内容となっている。