ニプロファーマ
大館工場(秋田県大館市)
鏡石工場(福島県岩瀬郡鏡石町) - 旧:東北ニプロ製薬株式会社
埼玉工場(埼玉県春日部市) - 旧:日本ジェネリック株式会社 春日部工場 第1プラント/第2プラント(埼玉県春日部市) - 第1プラントは旧:ニプロジェネファ株式会社、第2プラントは旧:ニプロパッチ株式会社
羽生工場(埼玉県羽生市) - 旧:ニプロパッチ株式会社
川越工場(埼玉県川越市) - 旧:マイラン製薬株式会社 川越工場
伊勢工場(三重県松阪市)
城北工場(大阪府大阪市旭区)
志紀工場(大阪府柏原市)
このほかに子会社による生産拠点として、岐阜県飛騨市に「ニプロファーマ飛騨工場株式会社(旧:田辺製薬吉城工場株式会社)」、ベトナム・ハイフォンに「ニプロファーマ・ベトナム」がそれぞれある。