樺太医学専門学校 (旧制)
越智貞見(1943年4月 - 1944年4月)
有馬英二(1944年4月 - 1946年、北海道帝国大学医学部教授と兼務し、大学を定年退官すると同時に辞任)
以後校長の座は空き、事務取扱(代行職)が就任する。
新保幸太郎 (1946年 – ) 校長事務取扱