インフルエンザ菌
1892年にリヒャルト・プファイファーと北里柴三郎がインフルエンザ(当時流行していたロシアかぜ)の病原菌として独立に純粋培養に成功した。1918年にスペイン風邪が流行したとき、日本でインフルエンザ菌のワクチンを製造し、およそ500万人が接種したが、内務省衛生局はワクチンに効果なしと判断した。スペイン風邪でインフルエンザのウイルス説が研究され、山内保らは細菌濾過器で除去されない濾過性ウイルスであると結論した。1933年にウィルソン・スミスらがインフルエンザウイルスの継代に成功し、ウイルス説が広く認められ、細菌原因説は否定された。
1995年にインフルエンザ菌のH. influenzae Rd.株の全ゲノム配列が解析され、その後データが改定されることにより、本菌のゲノムは1,830,138塩基の環状染色体からなり、染色体上には1,657のタンパク質配列がコードされている事が明らかとなった。なお、インフルエンザ菌は、初めて全ゲノム配列が明らかとなった生物である。
一般にはペニシリン系抗生物質のアンピシリンなどが有効である。ただし、後述のとおり耐性菌の出現が問題となっている。
非莢膜株と莢膜株とで大きく異なる病原性を持つ。
非莢膜株は健康なヒト、特に乳幼児の上気道(咽頭、鼻腔)にも常在している。感染症としては中耳炎、副鼻腔炎、気管支炎、肺炎などの気道感染症が多い。小児では気道感染症の3大起炎菌のひとつ(他は肺炎球菌、モラクセラ・カタラーリス)とされている。
莢膜株も上気道に保菌されていることがあるが、気道感染症を起こすことは少なく、直接血流中に侵入して感染症を起こすものと考えられている。莢膜株の感染症ではほとんどの場合b型が起炎菌で、敗血症、髄膜炎、結膜炎、急性喉頭蓋炎、関節炎などを起こす。b型以外の莢膜株が人に感染症を起こすことは稀であるが、Hibワクチン(ヒブワクチン)の普及によりb型以外による感染症が目立つようになってきている。