門司機関区
下関駅 - 門司駅間を走行する客車列車の牽引を九州旅客鉄道(JR九州)から受託しており、同社所属のEF81形400番台の2両も門司機関区に常駐していた。同区間を走行するブルートレインやムーンライト九州などの客車列車には、門司機関区の運転士が乗務していた。
過去に九州旅客鉄道(JR九州)が運行していた12系客車/24系客車を使用した夜行急行 かいもん・日南については分割民営化後も運行を委託され門司機関区所属のED76形を使用し、全区間門司機関区の運転士が乗務していた。
2009年(平成21年)3月14日ダイヤ改正でのはやぶさ・富士廃止による九州ブルトレ全廃、また同年8月にはムーンライト九州に使用されていた14系客車が廃車となり、同列車が事実上の運転終了となったため、この受託業務は解消されている。
現在、団体列車としてJR西日本の客車列車が下関駅 - 門司駅間を走行して九州入りすることがあるが、JR九州が電気機関車を淘汰・全廃したため、その場合は下関駅においてJR九州のDE10による重連で牽引され、九州上陸後もそのまま牽引する。2001年(平成13年)10月までは筑豊本線の客車列車の牽引も受託しており、当機関区に所属していたDD51形が担当していた。
その他、客車列車が大幅に遅延した場合や機関車運用が乱れた際などは、本来のJR九州所属のEF81形に代わって当機関区の機関車がピンチランナーとして牽引することもあった。
山陽本線:幡生操車場 - 北九州貨物ターミナル駅間
鹿児島本線:門司駅 - 鳥栖駅間、千早操車場 - 福岡貨物ターミナル駅間
日豊本線:小倉駅 - 西大分駅
長崎本線: 鳥栖駅 - 鍋島駅