COPPELION
真奈を裏から操っていた迷砂を裏から操っていた自称「天才科学者」。本名は「伊丹又三郎(いたみまたさぶろう)」。名の由来は「動く人形」コッペリアの製作者でもある人形職人・コッペリウスから。
胎児になる前の人の胚を欲し、1995年(27歳時)に金で雇った女(伊丹刹那の生みの親)と親権を巡り裁判沙汰になっている。その名の通りコッペリオン計画の「産みの親」であったが、その研究があまりにも人倫を逸脱していると評されたために鴎外の手で計画から外され、行方不明となる。その後、自分の存在を世界に知らしめる計画を立て、迷砂たちを「体の不具合(バグ)を直してやる」と抱き込み、彼の理想の「成功例」である葵を狙わせ、そして葵の中のイザナミをも味方につける。そして後に葵のDNAデータを抽出し、それを各国に渡してカザフスタンへの核攻撃を行わせようと企む。完成したDNAデータを衛星の秘密のサーバーに送ったが、そのサーバーを迷砂に乗っ取られてしまい、彼女に説得したが聞き入れてもらえず計画はすべて台無しとなる。
そんな折、東京上空に鴎外が搭乗する飛行船が出現し、葵の連行を求める。鴎外は新興国には原発を売り込み、先進国にはコッペリオンを売り込むことを画策していた。渋谷の地下シェルターへ戻った荊たちは今度はシェルターの放射能漏れ修復に乗り出さなくてはならなくなる。Dr.コッペリウスはシェルターに葵たちが潜伏していることを知り潜入するが捕らわれてしまう。
小津詩音は政府の三教授に捕らわれてしまう。詩音救助のため、遥人は三教授の葵引き渡しの要求を受諾する。真奈は今や荊たちの側に付き、葵の超能力発現のためのトレーニングを急遽実行。こうして葵は三教授の飛行船内に乗り込んでいく。葵は大暴れし、詩音を救出するが、二人して船外から落下してしまう。そこへ真奈が現れ、無事救出される。政府は無人戦闘機を東京に送り込み、先進各国もコッペリオンの完成体である葵獲得のため、続々とフォッシロイドを投入してきていた。そして三島教頭はシェルター住民救出のため、密かに潜水艦の派遣さらにクーデター起こすことを決断する。
シェルター住民たちは、フォッシロイドに対抗して原発封印作業用の人型ロボット「エドン零式」を組み立てる。真奈は一旦迷砂のもとに戻るが、彼女はもはやDr.コッペリウスの操り人形と化していた。そしてエドン零式の起動と住民の脱出が開始される。だが、発電所で火災が発生し、遥人が修復に赴き発電機能は回復するが、高熱で体が燃え荊たちと連絡が取れなくなってしまう。
2013年10月から12月にかけてAT-X、BS11にて放送された。全13話。
2010年9月頃にアニメ化の決定が発表されたが、2011年3月の東北地方太平洋沖地震(東日本大震災)や福島第一原子力発電所事故の発生以降、読者のみならず井上智徳からも原作連載継続に不安の声が上がり、アニメ化に関する情報は公表されなくなっていた。その後、2013年7月に同年10月より放送されることが発表された。
監督・キャラクターデザインを鈴木信吾、シリーズディレクターを金澤洪充、そしてアニメーション制作をGoHandsがそれぞれ担当するなど、2012年のテレビアニメ『K』のメインスタッフが参加している。しかし、上記の経緯にもあるように制作順は本作の方が先であり、後述のBD / DVDのジャケット画も放送開始前の時点で最終巻まで発表済みとなっている。
2013年7月4日にはフランスのジャパン エキスポとアメリカのアニメ・エキスポで、第1話の先行上映会がそれぞれ開催された。また、同年9月10日に発売された『月刊ヤングマガジン』2013年10月号には、第1話Aパートを収録したDVDが付録として添付された。
アニメ化に際しては作中の時代設定が「西暦2036年」から「西暦20XX年」へ、舞台設定が「東京都」から「旧首都」へそれぞれ変更されたほか、「放射能汚染」が「汚染」へ、「原子力発電所で発生したメルトダウン」が「事故」へそれぞれ簡略かつ曖昧にされるなど、上記の現実情勢を考慮したアレンジが加えられている。それらに加え、全13話にまとめるために物語も短縮されており、第一師団の目的など一部の設定は不明のまま終了した。
政治や企業に対する風刺描写・女性陣のお色気描写も控えられている。