ワリオランドシェイク
面白いことしか考えていないシェイキングの子分。ワリオに一撃で倒されたことがある。
エリア1〜5の全てのボスを倒すと行ける。シェイキング海賊団の船であり本拠地。エリアはボス戦であるVSシェイキングのみ。 ボス:シェイキング シェイキング海賊団のリーダーであり、黒幕にして、今作のラスボス。 頭の角で突進したり、火の玉を5つ2回、合計10個降らせたり、地震パンチでワリオを怯ませ、掴んで振ったりして攻撃する。突進攻撃を踏みつけると壁に頭が刺さり、そこをタックルで攻撃すると5回までダメージを与えられる。さらに5回ダメージを与えて頭が抜けた後の気絶中は掴むことができ、振るとコインが大量に出現し、投げると大ダメージを与えられる。地震パンチの予備動作中に地震パンチをすると上に吹っ飛び気絶する。また地震パンチ以外の攻撃でも予備動作中にこちらが地震パンチを放つことで、攻撃を中断させる事が出来る。 体力が減少すると大ジャンプして床を壊し、下の階に移動。突進攻撃を踏みつける回数が2回に増え、ヒップアタックで衝撃波を発生させたる攻撃が追加される。 さらに体力が減少すると大ジャンプで床を壊してクイーン メルフルとデルデルのサイフがある最深部へ移動、体力が全回復し最終段階になる。宙に浮くようになり、突進攻撃への踏み付けが3回に増え、雷を10発落とす、壁や地面で反射する電気の球を3つ出す、画面の端に移動して、移動にあわせて回転する電気の球を周囲に放ち、発動直後が太く、少しして細くなるレーザーを打ちながら、そのまま反対方向へ移動を3回繰り返し、3回目で中央に移動し、電気の球とレーザーを放射状に放つ攻撃が追加される。 倒すと断末魔を上げながらスローモーションで吹っ飛んだあと、光に包まれる。
オーストラリア大陸がモデルの、大樹海や空中神殿のエリア。 ボス:フランティ 巨大な鉢植えに生えた花の怪物。 花びらをプロペラのように回転させ、突風を起こし、ワリオを吹き飛ばしたり吸い込んだりするのが主な攻撃手段。ジャンプで地震を起こしつつ地面からイバラ状の植物を生やす、つぼみのように窄ませた花からザコ敵を吐き出すといった攻撃も持つ。 顔に敵を投げつけると一時的に気絶状態になり、その間にタックルで鉢植えを押して動かすことでダメージを与えられる。体力をゼロにすると右側の崖から転落、水没しワリオの勝利となる(つまり、ボスの体力=右側の崖までの距離となる)。そのため後半戦になるほど戦闘フィールドは広くなるのだが、左側の崖とフランティの目の前に常にイバラ状の植物が生え、ザコ敵の持ち上げやワリオの攻撃を妨害する他、より複雑なザコ敵、イバラ、突風のコンビネーションを仕掛けるようになる。
雪だまりの下でワリオが地面パンチをすると雪をかぶって雪だるま状態となる。坂の上で雪球になり転がれば、雪だるまブロックも壊せる。