アミノ酸
多くのタンパク質は上記の20種類のアミノ酸残基からなるが、ある種のタンパク質にはセレノシステイン残基、N-ホルミルメチオニン残基、ピロリシン残基、ピログルタミン酸残基などの特殊なものも含まれる。
上記のほかにタンパク質合成後に修飾を受けるアミノ酸残基も存在する。例えば以下のようなものである。
シスチン — システイン2分子が酸化されて生成する。
ヒドロキシプロリン、ヒドロキシリシン — ゼラチン、コラーゲンに含まれる。
チロキシン — 甲状腺タンパク質に含まれる。
O-ホスホセリン — カゼインなど、多くのリンタンパク質に含まれる。
デスモシン — エラスチンやコラーゲンに含まれる。
タンパク質に含まれないアミノ酸として、以下のようなものも存在する(こうしたアミノ酸を総称して異常アミノ酸と呼ぶこともあるが、必ずしも適切な命名ではないという批判もある)。
β-アラニン — 筋肉中に存在する。
サルコシン — ある種の抗生物質に含まれる。N-メチルグリシンに相当する。
オルニチン — 尿素回路の中間体。
シトルリン — 尿素回路の中間体。
γ-アミノ酪酸 — 神経伝達物質。GABA とも呼ばれる。
オパイン — アグロバクテリウムのエネルギー源に利用される。
トリメチルグリシン —