シャドウ・ザ・ヘッジホッグ
GUN(ハンドガン、マシンガン、自動ライフル、重機関銃、バルカン砲)
ブラックアームズ(ライトショット、フラッシュショット、リングショット、ヘビーショット)
エッグマン軍団(エッグガン)
スペシャル(オモチャオガン、シャドウライフル)
すべてのルートのエンディングを見ることでメニューに「ラストストーリー」が追加され、そのストーリーでプレイする最終ステージ。ミッションのようなものはなく、10分以内にブラックドゥームのところへいけばクリア。ただし、途中行き止まりがあり、カオスコントロールを使わなければ、先に進めないところがある。なお、このステージは、"ステージ6 FINAL HAUNT"をベースにして作られている。