高千穂丸
日中戦争初期の1937年8月から1938年2月には瑞穂丸とともに陸軍使用船として徴用されたが、高千穂丸はのちに航路に復帰。1941年7月26日、日本の仏印進駐に抗議する形で、いわゆるABCD包囲網が形成。アメリカ、イギリス、オランダとその属領で在外資産凍結を行ったため、海外在留の日本人は総引き揚げのやむなきに到った。9月から11月にかけて日本人引き揚げが行われ、高千穂丸は日昌丸(南洋海運、6,526トン)、富士丸(日本郵船、9,138トン)とともにオランダ領東インド在留の日本人引き揚げ船として活動した。
1942年5月、船舶運営会が設立。大阪商船の神戸・基隆航路は、ハイフォン直航線を除いた他の航路とともに運営会に移管された。また、高千穂丸の3年後に就航した高砂丸(9,315トン)は病院船として徴用されたが高千穂丸は徴用されず、同じく徴用されなかった富士丸や大和丸(日本郵船、9,655トン)とともに神戸・基隆航路に就航し続けた。