フィリピン総督領
18世紀後半まで、24つの州、19つのアルカルデ・マヨール、5つのコレヒミエントが存在した。
アカプルコ貿易では、ヌエバ・エスパーニャから持ってきた銀を、中国の絹、モルッカ諸島の香辛料、日本の漆器やフィリピンの綿織物といった、アジア商品の購入に使用した。これらの商品はやがてヌエバ・エスパーニャに輸出され、最終的にはヨーロッパに送られる。こうして、フィリピンはアカプルコ貿易を通じて利益を得た。スペインにとって、アカプルコ貿易は本国とフィリピンを結び付けるものであった。
貿易が確かにフィリピンにとって有益な結果をいくつかもたらした一方で、影響のほとんどは不利なものであった。しかし、貿易はトマト、アボカド、グアバ、パパイア、パイナップル、馬といった新たな作物や動物をフィリピンにもたらすことに繋がる、アジアとアメリカの間での文化的、商業的交換において結果を残した。これらは植民地に最初の実質所得を与えた。この貿易は200年に渡って続き、アメリカがスペイン植民地を受け継ぐより前の1815年に行われなくなった。
19世紀の後半まで、次のような行政区が存在した。
ルソン島(20行政区):トンド、ブラカン、パンパンガ、サンバレス、パターン、ヌエバ・エシハ、ラウニオン、カビテ、ラグナ、バタンガス、パンガシナン、北イロコス、南イロコス、Tayabas、アブラ、カガヤン(バブヤン諸島を含む)、ヌエバ・ビスカヤ、アルバイ、北カマリネス、南カマリネス
ミンドロ、マリンドゥケ、ルバン、イリン(1行政区):ミンドロ
バタン(1行政区):バタン
パナイ島(3行政区):カピス、イロイロ、アンティケ
ネグロス(1行政区):ネグロス
サマール(1行政区):サマール
レイテ(1行政区):レイテ
カラミアン(1行政区):カラミアン
セブ(1行政区):セブ
ミンダオ(4行政区):キャラガ、ミサミス、ザンボアンガ、ヌエバ・ギプスコア
スールー
ホロ
マリアナ(1行政区):マリアナ(グアム島のハガニアに首都)
パラオ
小笠原諸島
南沙諸島
カロリン諸島
マーシャル諸島
Special Districts (4): Benguet, ティカオ and マスバテ, Comandancia del Corregidor, Lower territories of Agno.
アメリカは米西戦争の後スペイン植民地のほとんどを併合し、フィリピンにおけるスペインの支配は1898年になくなったが、行政管轄は変わらず維持された。太平洋に残った領土のほとんどは、1899年のドイツ・スペイン条約でドイツに売り渡された。