連合艦隊
第一艦隊(1903年12月28日新編~1944年2月25日解隊)
第二艦隊(1903年12月28日新編~1921年12月1日一時解隊、1922年12月1日再編~1945年4月20日解隊)
第三艦隊(初代)(1904年3月大本営直轄より編入~1905年12月20日解隊)
第三艦隊(二代)(1908年12月24日南清艦隊より改称~1915年12月25日解隊)
第三艦隊(三代)(1915年12月25日新編~1922年12月1日解隊)
第三艦隊(四代)(1932年2月2日新編~1939年11月15日第一遣支艦隊へ改称・支那方面艦隊隷下へ)
第三艦隊(五代)(1941年4月10日新編~1942年3月10日第二南遣艦隊へ改称)
第三艦隊(六代)(1942年7月14日新編~1944年3月1日第一機動艦隊隷下へ)
第四艦隊(初代)(1905年6月14日新編~同年12月20日解隊)
第四艦隊(二代)(1937年10月20日新編~1939年11月15日第三遣支艦隊へ改称・支那方面艦隊隷下へ)
第四艦隊(三代)(1939年11月15日新編~1944年3月4日、1944年7月8日~終戦)
第五艦隊(初代)(1938年2月1日新編~1939年11月15日第二遣支艦隊へ改称・支那方面艦隊隷下へ)
第五艦隊(二代)(1941年7月25日新編~1943年8月5日北東方面艦隊隷下へ)
第六艦隊(1940年11月15日新編~終戦)
第七艦隊(1945年4月15日新編~終戦)
第八艦隊(1942年7月14日新編~1942年12月24日南東方面艦隊隷下へ)
第一航空艦隊(初代)(1941年4月10日新編~1942年7月14日解隊) ※空母艦隊
鮫島員規大佐:1894年7月19日 -
出羽重遠大佐:1894年12月17日 -
上村彦之丞大佐:1895年7月25日 - 1895年11月16日
島村速雄大佐:1903年12月28日 -
加藤友三郎少将:1905年1月12日 - 1905年12月20日
(兼)山下源太郎大佐:1908年10月8日 - 11月19日
(兼)山中柴吉少将:1915年11月11日 - 30日
(兼)堀内三郎少将:1916年9月1日 - 10月13日
(兼)堀内三郎少将:1917年10月1日 - 20日
(兼)斎藤半六少将:1918年9月1日 - 10月14日
(兼)舟越楫四郎少将:1919年6月1日 - 10月27日
(兼)吉岡範策少将:1920年5月1日 - 10月30日
(兼)吉岡範策少将:1921年5月1日 - 10月30日
(兼)白根熊三少将:1921年12月1日 -
(兼)樺山可也少将:1923年12月1日 -
(兼)原敢二郎少将:1924年11月10日 - 1925年12月1日
(兼)大湊直太郎少将:1925年12月1日 -
(兼)高橋三吉少将:1926年11月1日 -