東京帝国大学農学部実科
1925年(大正14年)には今度は松戸にある千葉県立高等園芸学校に委譲する問題が噴出し、翌年文部省の省議で敷地を東京府府中町の演習林を充てる決定を行う。1927年(昭和2年)10月農学博士鈴木梅太郎が農学部長に就任するが、1928年(昭和3年)10月農学博士岩佐良治が農学部長就任。独立問題は、1930年(昭和5年)の古在総長退官によって、翌年に自らが大蔵省と折半し予算計上がなされ、新学校が設立の方向となる。1931年(昭和6年)1月農学博士麻生慶次郎農学部長就任。1933年(昭和8年)1月林学博士諸声北郎農学部長就任。1934年(昭和9年)3月農学博士高橋傾造農学部長就任。さらに東京帝国大学実科建物新宮費45万円が第61回議会を通過成立し実科の独立が決定する。4月には、東京府府中町の演習林を切り拓き、新校舎の建設が開始される。
1935年現在の府中に移転し、東京高等農林学校開講。東京帝国大学から独立する。こうして明治の農学校以来の駒場の地には、農学校の教員を学生にして教育人材を育成する東京農業教育専門学校のみが残ることとなった。
もともと駒場の寮に暮らす学生のうちで賄征伐を行うのは入学年齢が若い実科の学生であったという。また駒場の運動会も東京名物と化していた。グランドの広さは当時日本一であり、また当時お見合いの場としても著名であった。
東京高等農林学校はその後1944年には東京農林専門学校へ改称し、1949年に新学制が施行されると東京農工大学の農学部となる。