ウクライナダービー
シャフタールが台頭した2000年代のディナモもまずまずの成績を残しており、ウクライナサッカーのリーダーのひとつであり続けた。1998-99シーズンのUEFAチャンピオンズリーグではアンドリー・シェフチェンコなどを擁して準決勝に進出した。1974年から1990年、1997年から2002年にかけて指揮を執ったヴァレリー・ロバノフスキー監督が2002年に死去すると、ヨーロッパの舞台での活躍は影をひそめた。2008-09シーズンのUEFAカップでは準決勝に進出し、準決勝ではヨーロッパの舞台で初めてシャフタールと対戦したが、シャフタールに敗れてベスト4に終わった。
1996年に富豪リナト・アフメトフがシャフタール会長に就任すると、積極的な投資によってシャフタールが急成長を見せた。2000年代初頭になるとこの対戦は真のウクライナダービーという地位を手に入れ、シャフタールがディナモの難敵となってディナモの1強時代は終わりを告げた。シャフタールは1996-97シーズンから5シーズン連続でディナモに次ぐ2位となり、2001-02シーズンにリーグ初優勝を飾った。2004年にはルーマニア代表やインテルなどを率いたミルチェア・ルチェスクを監督に迎え、2度の2連覇を果たすなど、1996-97シーズンから2010-11シーズンまで15シーズン連続で2位以上の成績を収めている。2008-09シーズンにはウクライナのクラブとして初めてUEFAカップで優勝した。