ヤブノウサギ
2種の遺伝的な違いは種分化というよりも地理的な分断によっている可能性がある。近東では遺伝子流動が原因で中間型が見られると考えられている。2008年の別の研究では、種複合体になっているかを結論付けるにはさらなる研究が必要であるとしており、反証が出るまではヤブノウサギ1種として扱われる。
分岐分類学的研究では、現在のヤブノウサギは更新世の最終氷期にイタリア半島やバルカン半島、小アジアにいたヤブノウサギの子孫とされる。中央ヨーロッパへの進出は人類による環境変化によって始まったと考えられている。現在の集団では遺伝的多様性が高く、近親交配の兆候は見られない。遺伝子流動は雄に対してより大きいが、集団は母系的に構成されている。遺伝的多様性はドイツのノルトライン=ヴェストファーレンで特に高いが、遺伝子流動の制限によって孤立した集団内での遺伝的多様性が減少する可能性がある。