第18回日本フットボールリーグ
レギュレーションが2016年11月17日に発表された。
第1戦はファーストステージ1位、第2戦はセカンドステージ1位のホームゲームとする。
1試合は90分(前後半各45分)とする。第1戦は延長戦を実施しない。
以下の順序で勝者を決め、勝者が第17回JFLの優勝、敗者が第17回JFLの準優勝となる。 2試合終了時点で勝利数の多いチーム 2試合合計の得失点差 以上で決着のつかない場合に、2試合目終了後に30分(前後半各15分)の延長戦を実施し、その勝者 延長戦でも決着が付かない場合はPK戦(各チーム5人、6人目以降サドンデス方式)の勝者
なお、アウェーゴール方式はJFLチャンピオンシップでは採用しない。
最終更新: 2016年6月5日出典: 第18回日本フットボールリーグ(2016) ステージ順位表
最終更新は2016年11月13日の試合終了時出典: 第18回日本フットボールリーグ(2016) ステージ順位表順位の決定基準: 1.勝点 2.得失点差 3.総得点 4.当該チーム間の対戦成績(勝点、得失点差、総得点数の順に比較)5.勝利数 6.反則ポイント 7.順位決定戦(必要な場合のみ).
J3への加盟については、「J3スタジアム要件」「J3クラブライセンス基準」に関する審査および入会審査に合格したうえで、JFLでの年間順位が4位以内、かつ、JFLに属するJリーグ百年構想クラブのうち上位2クラブに入っていることが条件となる。なお、2016年度のJFLに参加する百年構想クラブは、八戸・沼津・奈良・武蔵野・栃木Uの5クラブである。このうち栃木Uを除く八戸・沼津・奈良・武蔵野4クラブがJ3クラブライセンスの申請を行い、同年9月24日に公表された新規J3昇格を希望するクラブに対してのJ3ライセンス審査 で、4クラブに対してライセンスの交付判定が行われた。武蔵野については本拠地として申請した武蔵野市立武蔵野陸上競技場がJ3スタジアム要件を満たさないとの理由でライセンス不交付との判定となりJ3加盟は見送りとなったが、そのほかの3クラブについてはJ3ライセンスの交付が認められた。
その後、2016年11月13日に行われたセカンドステージ第15節で沼津の「年間順位4位以内」(年間3位)が確定し、2016年11月16日のJリーグ理事会で沼津のJリーグ入会が正式に承認 された。