国鉄キハ31形気動車
6両(6・9 - 11・17・22)が配置され、鹿児島本線(熊本 - 宇土間)、三角線で使用されていた。
以前は豊肥本線や肥薩線での運用があった。長らく使用されてきた肥薩線への運用は2016年3月31日に消滅した。これは2016年3月26日のダイヤ改正で肥薩線の普通列車の運用の一部に熊本 - 人吉間の快速列車が組み込まれ、運行時間が1時間30分と長く、トイレ設置車が使用されるようになったためである。またこれまでも肥薩線の八代 - 人吉間など運行時間が1時間を超える運用についていたが、同区間のうち八代 - 球泉洞間の途中の駅にトイレの設置がないため、肥薩線の普通列車の運用にはトイレ設置車であるキハ40形やキハ220形を使用することになり肥薩線から撤退した。なお、肥薩線・豊肥本線ともに代走等で走行することがあった。
かつて運行されていた肥薩線の観光列車「九千坊号」に使用される車両は一部座席の背もたれを向かい合わせに固定し、その座席の座布団を取り外して畳敷きの床板をはめ込む簡易お座敷化されていた。