賀古鶴所
1896年(明治29年)には日本の精神科の開拓者で東京帝国大学医科大学(明治20年学制改制により東京大学医学部より変更)教授であった榊俶(さかき はじめ)が食道癌に罹った際、賀古が東京慈恵医院医学校教授金杉英五郎と共に日赤病院部長として手術を執刀した。なお、この間1894年(明治27年)歩兵第三連隊付き軍医として日清戦争に従軍した。
優秀な医師が不足していた当時、軍医の個人医院開業は1899年(明治32年)に正式に開業禁止されるまで許されており、1892年(明治25年)賀古も東京市神田区小川町に「賀古耳科院「を開いた。1896年(明治29年)、第5師団軍医部長を命じられたが東京を離れることを嫌い休職、陸軍武官官等表改正により陸軍二等軍医正に改定。45歳の1901年(明治34年)、依願退職によって予備役に編入し正五位を叙勲、賀古耳科院の経営に専心した。ただし、1904年(明治37年)日露戦争に際しては山県有朋の申し出により軍医に復し、従軍中に陸軍一等軍医正に昇格した。第一師団司令部付の50歳で召集が解除され陸軍軍医監に昇進、58歳で退役。
1931年(昭和6年)1月1日脳溢血により急逝、享年75歳。墓所は駒込吉祥寺、法名は翠厳院玄雲鶴所居士。軍医としての最終階級は軍医監(明治30年軍制改革前の階級で大佐相当)であった。
賀古は上総の軽井沢と呼ばれる日在村(現千葉県いすみ市)に別荘「鶴荘」を持っていたが、その隣に鷗外の別荘「鷗荘」があり、同地には野間清治・石井菊次郎・与謝野晶子等の別荘もあったと伝えられる。