ULK1
ULK1/2は哺乳類細胞におけるオートファジーに重要なタンパク質であり、酵母のAtg1(英語版)と相同である。オートファゴソーム生合成の初期段階に必要な、ULK1複合体の一部を構成する。ULK1複合体には、他にFIP200(英語版)(RB1CC)、HORMA(Hop/Rev7/Mad2)ドメイン含有タンパク質ATG13(英語版)とATG101(英語版)も含まれる。ULK1はオートファジーに最も必要不可欠であり、栄養素枯渇条件下においていくつかの上流シグナルによって活性化され、オートファジーの開始をもたらす。
ULK1には下流のリン酸化標的が多く存在し、膜の単離やオートファゴソームの誘導を補助する。活性化されたULK1はベクリン1(英語版)のセリン14番を直接リン酸化してオートファージ促進性クラスIII PI3キナーゼ(英語版)であるVPS34(英語版)複合体を活性化し、オートファジーの誘導と成熟を促進する、というモデルが提唱されている。
ULK1/2は、同化型の環境シグナル下で活性化されるmTORC1の活性によって負に調節される。対照的に、ULK1/2は飢餓シグナル下でAMPKの活性によって活性化される。
ULK1はAMPKによってセリン317番とセリン777番がリン酸化され、オートファジーが活性化される。一方、mTORはセリン757番に対して阻害的なリン酸化を行う。さらに、ULK1はスレオニン180番に対して自己リン酸化を行い、自身の活性化を促進する。
ウイルスはULK1を標的として、宿主のオートファジーを妨げているようである。コクサッキーウイルスB3型のプロテアーゼ3CはULK1をグルタミン524番の後で切断し、N末端のキナーゼドメインとC末端のEATドメインを分離する。