ダライアス=サーガイア
登場人物から世界観に至るまで、原作ゲームと大きく異なる独自設定に基づいた内容変更が行われている。
原作において自機であった戦闘機シルバーホークは基本設定・デザインとも大きな相違があり、独自の意志を持ち、先端(艦首部)に顔が付いた扇型形状の宇宙船となっている。原作ゲームの鋭角なフォルムの戦闘機から進化した結果という位置づけであり、顔の部分のペイントと隈取り部分に原作戦闘機との共通するようなデザインラインが残されている。
原作において2プレイヤーであるティアットが女性から男性に変更されている。
敵勢力であるベルサーは、「エーテル界」という異次元に棲息しそこから襲来する水生生物型戦闘生命体である。
ベルサー軍団には人類に似た姿の幹部が存在し、アル=アジフという首領が配下の七神官を率いる体制となっている。
当時流行だったバーコードバトラーの影響からか、各登場キャラクターの設定や強さをバーコードによりデータ化する表現も用いられていた。ただし、それらデータはあくまでも世界観的な「飾り」であり、実際にゲーム等にて活用するなどの企画は行われていなかった。
七神官を率いるベルサー軍団首領の少年。神秘的なカリスマに満ちているが、その実体はニバスによって古文書をコアに生み出された人形。本編終盤ではニバスに用済みと判断され、背後から胸を剣で貫かれて致命傷を負う。自分の正体であった古文書をめくりながら、リリスの膝の上で息を引きとる。
MADARA天使編は、MADARA転生編の最後にメギドの丘における最終決戦にて七神官を率いるアガルタの王としてアル=アジフが登場して転生戦士たちの敗北で幕を閉じた後の物語とされている。