長崎県立長崎東中学校・高等学校
田中道雄(03回生) - 国文学者、佐賀大学名誉教授
宮川俊行(03回生) - 哲学者・神学者、長崎純心大学教授
脇山徳雄(03回生) - 物性物理学者、東北大学名誉教授、紫綬褒章
高瀬暢彦(04回生) - 基礎法学者、日本大学名誉教授
平山祐次(05回生) - 経済学者、信州大学名誉教授、元長崎県立大学学長
佐々治寛之(06回生) - 昆虫学者、福井大学名誉教授
井上晃(08回生) - 原子力工学者、東京工業大学名誉教授
小野信輔(09回生) - 機械工学者、九州大学名誉教授、元北九州市立大学教授
古賀允洋(09回生) - ドイツ語学者、熊本大学名誉教授
畑地正憲(09回生) - 東アジア史学者、山口大学名誉教授、山口福祉文化大学学長
正木晴彦(09回生) - 仏教学者、長崎大学副学長・名誉教授
田中克佳(10回生) - 教育史学者、慶應義塾大学名誉教授
由佐悠紀(11回生) - 地球物理学者、京都大学名誉教授
水田祥代(12回生) - 小児外科学、九州大学副学長・名誉教授・九州大学病院長、福岡歯科大学理事長
前田三男(12回生) - レーザー科学者、九州大学名誉教授、久留米工業高等専門学校校長・名誉教授
森光昭(12回生) - ドイツ文学者、熊本大学副学長・名誉教授
雨谷昭弘(14回生) - 電気工学者、モントリオール理工科大学教授、同志社大学名誉教授
嶌洪(14回生) - 生物学者、九州大学名誉教授、日本昆虫学会長
江頭和彦(15回生) - 農芸化学者、九州大学農学部長・名誉教授
林功(21回生) - 英語講師・著述家
新聞文芸部
理学部
英語部
茶道部
生け花部
郷土史部
写真部
書道部
美術部
吹奏楽部
ダンス部(高のみ)
放送部
図書部
応援部
JRC(青年赤十字)(高のみ)
囲碁・将棋部
東龍部 - 体育祭や離任式等で龍踊りを披露。
旧制県立長崎中学校の出身者・卒業生は長崎県立長崎中学校を参照。 長崎県立長崎高等女学校の出身者・卒業生は長崎県立長崎高等女学校を参照。