ジェイ・アール北海道バス琴似営業所
51:札幌駅前 - 時計台前 - 大通西4丁目(啓明発)/北1条西4丁目(啓明行) - 西11丁目駅前 - 医大病院前 - 南3条西16丁目 - 南8条西16丁目 - 南11条西16丁目 - 南14条西17丁目 - 啓明ターミナル 2006年(平成18年)9月1日開設。
53:札幌駅前 - 時計台前 - 大通西4丁目(啓明発・啓明行始発)/北1条西4丁目(啓明行) - 西11丁目駅前 - 中央区役所前 - 南3条西16丁目 - 南6条西20丁目 - 南7条西25丁目 - 南11条西22丁目 - 啓明ターミナル 大通西4丁目 - 啓明ターミナルの区間便あり。2004年(平成16年)4月1日に一部便をJR札幌駅に延長。 2006年(平成18年)4月1日、系統番号を札幌市営バス運行時の西53から53に変更。
50:札幌駅前 - (53と同経路) - 南11条西22丁目 - 南13条西22丁目 - (この間無停車) - もいわ山ロープウェイ 2019年(平成31年)4月1日、札幌駅からもいわ山ロープウェイの直通アクセスとして53を延長する形で新設。
循環円10・循環円11・循環円12:円山公園駅前 - 大通西25丁目 - 南7条西25丁目 - 界川 - 旭丘高校前 - 伏見町高台(←もいわ山ロープウェイ←) - 南19条西16丁目 - 南13条西22丁目 - 南11条西22丁目 - 南7条西25丁目 - 大通西25丁目 - 円山公園駅前 循環円10は界川先廻り、循環円11・循環円12は南11西22先廻り。循環円11はもいわ山ロープウェイ経由。 2006年(平成18年)4月1日、系統番号を札幌市営バス運行時の環12から循環円10・循環円11に変更。 ジェイ・アール北海道バスが旧来から運行する系統で「12」が存在しており、同一事業者での番号重複は従来利用者以外にはわかりにくいとの指摘があった。 2012年(平成24年)4月1日、循環円11の一部便をもいわ山麓駅経由に変更。 2021年(令和3年)3月1日、循環円11のもいわ山ロープウェイ非経由便を循環円12へ分離。
ジェイ・アール北海道バス琴似営業所(ジェイアールほっかいどうバスことにえいぎょうしょ)は、ジェイ・アール北海道バスが北海道札幌市西区二十四軒2条7丁目1番21号に設置する営業所である。
発43:発寒南駅前 - 西町北7丁目 - 西野3条2丁目 - 西警察署前 - 西野3条6丁目 - 西野6条8丁目 - 西野第二 - 中洲橋
琴43:JR琴似駅 - 地下鉄琴似駅前 - 西区役所前 - 山の手3条6丁目 - 北海道医療センター前 - 西野3条2丁目 - (発43と同経路) - 中洲橋 地下鉄琴似駅前 - 中洲橋の区間便あり。2004年(平成16年)4月1日、一部便をJR琴似駅に延長。 2006年(平成18年)4月1日、系統番号を札幌市営バス運行時の西43から発43・琴43・琴43-1に変更。琴43-1は2020年に廃止(後述)。
宮43:宮の沢駅前 - 上手稲神社前 - 西野4条9丁目 - 西野6条8丁目 - 西野第二 - 中洲橋 2006年(平成18年)4月1日、系統番号を札幌市営バス運行時の西33から宮43に変更。
西21・発41・発42・宮43の一部便は、2006年(平成18年)10月21日に宮の沢駅・発寒南駅からイオン発寒SC(2012年4月1日より「イオンモール札幌発寒」、2016年4月1日より「発寒8条12丁目」に改称)まで延長。2016年(平成28年)4月1日に延長区間を廃止。
2004年(平成16年)4月1日より運行開始した金曜深夜バス(琴41-1、琴42-1、琴43-1:JR琴似駅→発寒南駅→福井えん堤前、平和の滝入口、中洲橋)は2020年(令和2年)4月1日ダイヤ改正で廃止。最終運行は同年3月27日。