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2度までも女になった学園生活も終わり、拓也は北ノ都大学で遺伝子関係のゼミに所属する大学生になっていた。明日香も同じ大学の獣医学部に所属し、2人の仲はそれなりに順調。ところがある日、拓也は弘二の企みに乗ってまたしても怪しげな薬を飲んで女になる。周囲の人々は3回目の女性化にすっかり慣れるか、もしくはあきれる。
しかし、呑気な事は言ってられなかった。今回はなんと、染色体などの問題によって、一週間以内に男に戻らないと、一生女の身体のまま生きていく事になってしまうという危険性が出てきたのである。はたして、拓也/たくやの明日はどっちだ...!?