シン・アスカ
本作ではアニメでは登場しなかったデスティニーのタイトルバックが登場している(但しオマケムービーだとストライクフリーダムもある)。
「P.L.U.S.モード」では「空にいた青い一機のMSが放った攻撃で家族を失ってしまったシン」という言葉から「フリーダムは、俺が倒す!」という言葉を発した後、プレイヤーはシンとしてコズミック・イラを戦うことになる。ストーリーやミッションはアニメ本編に沿いながらも、人間模様は最後までシンを主軸にして描かれている。また、アニメ本編後もオマケがあり前作のキャラクター達との絡みも存在する。
『SDガンダム GGENERATION』シリーズにおいては、『DESTINY』が初参戦となる『PORTABLE』で初登場。マスターセレクトの設定がある作品ではその候補としても登場する。
ステージ中では『DESTINY』後半の展開を中心にキラやオーブ側がゲスト軍となる場合も多く、歴代主人公の中では敵として登場する頻度が高くなっている。
『WORLD』のエクストラステージ「目覚めるとき」ではワールドシグナルの原因と思われるハルファスガンダムを止めようと現れたキラのストライクフリーダム(ゲスト軍)に対し、リボンズ・アルマークのリボーンズガンダムに協力する形でレイのレジェンドガンダムと共に第三軍として登場する。3対1の有利な戦況でキラを撃破寸前にまで追い詰めたが、刹那・F・セイエイのダブルオークアンタが介入したため失敗する。