肥前浜駅
単式ホーム1面1線と島式ホーム1面2線、計2面3線のホームを有する地上駅。互いのホームは跨線橋で連絡している。下り線(2番のりば)を通過線とする一線スルー配線構造となっている。下り側に向かって右側(西側)に駅舎が設置されている。木造駅舎を有する。
2022年9月23日の西九州新幹線開業に伴うダイヤ改正で当駅は電化区間と非電化区間の境界となり、当駅 - 長崎駅間が非電化区間となった。これにより、当駅に停車する普通列車は、一部列車を除いて当駅で電車と気動車を乗り換えることになる関係上、基本的に対面乗り換え可能な2・3番のりば発着となった。2022年9月22日までは当駅 - 長崎駅間も電化区間であり、当駅での乗り換えは発生しなかったため、上下とも基本的に駅舎に直接つながる1番のりば発着とし、乗降客ができるだけ跨線橋を渡らずに済むように配慮されていた。
鳥栖方面からの電車が当駅で折り返すため、817系電車に合わせて2両分のホームがかさ上げされている。2・3番ホームは1番のりばより若干鳥栖寄りにずれている。