卵菌
卵菌の中で生活環における核相変化が知られているものでは、栄養体が複相(染色体を2セットもつ)であり、配偶子形成時に減数分裂を行う。ただし初期分岐群では、核相変化・有性生殖が報告されていないものが多い。卵菌の有性生殖では、鞭毛をもつ配偶子の合体は見られず、不動状態の配偶子嚢が直接接着する(配偶子嚢接合 gametangial conjugation)ことで起こる。この結果形成される接合子は卵胞子 (oospore) とよばれ、ふつう休眠細胞となり、発芽して遊走子嚢を形成、または菌糸など栄養体となる。
Eurychasma(ユーリカスマ目)や Anisolpidium(サカゲフクロカビ目)、Lagenisma(フシミズカビ目)では、鞭毛細胞が着生してシスト化したものが受精管 (fertilization tube) でつながり、一方の原形質がもう一方へ送り込まれ、細胞質・核融合が起きて接合子が形成される。Lagenisma coscinodisciでは、減数分裂によって形成された遊走子が着生して接合することが報告されている。このような雌雄の分化がない同型の配偶子嚢接合が卵菌における原始形質であると考えられている。
ミズカビ亜綱やツユカビ亜綱の多くでは、配偶子嚢の雌雄の分化が見られる。雌雄配偶子嚢内では、減数分裂が起こり、単相(染色体を1セットのみもつ)の核を形成する。雌性配偶子嚢である生卵器 (oogonium) は、1個から数個の単相の卵(卵球 oosphere ともよばれる)を形成する。