ホシミドロ属
同じ科に含まれるアオミドロ属 Spirogyra やヒザオリ Mougeotia などは栄養体の葉緑体の形態が全く異なるので簡単に区別出来る。問題なのはホシミドロモドキ属 Zygnemopsis と Zygogonium の2属で、これらは栄養体の構造ではほとんど本属と区別出来ない。
ホシミドロモドキ属では、接合管はとても幅広くなり、両細胞の融合によって生じる接合胞子は接合管から両側の細胞内にまで広がり、ほぼ四角形になる。胞子壁の外層は透明で、中層の膜からはっきりと離れ、両細胞内に大きくはみ出すことがある。また、接合胞子形成の際に、一部の細胞質が残渣として外に残り、寒天状物質になる。水野(1964)には日本産の種として4種が挙げられている。他方で月井(2010)では種名不詳の1種だけが取り上げられており、その発見地が写真入りで掲載されていて、本属のものと確かめられたのはここだけ、とのこと。普通に見られるものではなさそうである。
Zygogonium は普通には不動胞子を形成する。有性生殖時にははしご状になるが、接合胞子は接合管から発達した接合胞子嚢に収まる。また、癒合した細胞から接合胞子が形成される際、細胞内に細胞質の残渣が残る特徴がある。かつてホシミドロ属のシノニムと判断されたこともある。
なお、分子系統の解析ではホシミドロ科は多系統の可能性があるとされているが、その中で本属とZygogonium は近縁の別属と判断されている。ホシミドロモドキ属は本属とかなり類縁が遠いとの判断である。