メディアステーションbanana
bananaとして改装された後も改札外からのみ利用できる構造となっていたため、JR線を利用しない来訪者も自由に出入りできるようになっていた。しかしJR線利用者から「ホーム内に待合室が無い」という指摘がかねてからJR新潟支社に寄せられていたことなどから2010年に改修を実施し、同年2月22日からパーティションを設けて南北に2分割し、南側の1番線沿いに出入口を新設してベンチ席部分は改札内からの利用者向けに振り分け、従来から設けられている改札外からの出入口がある北側にはレストバーベンチが設けられた。
新潟駅では、「新潟駅連続立体交差事業」および「新潟駅周辺整備事業」が進められている事もあり旧万代口駅舎は立体交差及び周辺整備の工程が進捗した段階で閉鎖・撤去されることが決定されていた。また新潟日報社は、万代口側に程近い万代シテイに隣接する同区万代三丁目1番1号の区画(ミナミプラザ・スターホテル新潟跡)において同社の本社機能を内包する複合施設「新潟日報メディアシップ」の建設事業を進め、2013年1月に竣工し、2月4日付で本社登記を移転し、機能移転が順次進められた。そして4月12日には一般向けのスペースも全面開業し、1階にはBSNのラジオ・テレビ兼用サテライトスタジオ「メディアシップスタジオ」が開設された。こうした動向に伴って、2017年3月31日をもって「メディアステーションbanana」としての運用を終了した。
2017年4月1日以降においては、待合スペースのみの新潟駅万代口待合室として運用されていたが前述の通り「新潟駅連続立体交差事業」の進行による万代口駅舎の解体に伴い2020年10月8日に待合室の運用を終了した。