シャドウ・ザ・ヘッジホッグ
カオティクス探偵事務所の一員。ベクターの指示で、かつてシャドウが封印されていたプリズンアイランドでGUNの機密情報の捜索に向かう。ステージ上では、ヒーローサイドのミッションキャラクターとして登場。
ブラックドゥームが見せた50年前、軍がアーク制圧を実行した日のアーク内部。非常に入り組んでおり、迷いやすい。 ヒーロー(マリア)・・・10人の研究員にヒールユニットを与える。 ノーマル・・・ゴールリングを目指す。 ダーク(ドゥームズアイ)・・・ステージ内にいるGUNの兵隊・メカ60体倒す。
声のみの出演。大統領に「黒の軍団」などの情報を伝える。
マスターエメラルドの守護者。カオスエメラルドを奪ったブラックアームズを追って、今作の事件に巻き込まれる。ステージ上では、ヒーローサイドのミッションキャラクターとして登場。
ソニックを追いかける自称ソニックのガールフレンド。エッグマンの基地と思わしき城を調査していたところをクリームとはぐれてしまい、シャドウに助けを求める。ステージ上では、ヒーローサイドのミッションキャラクターとして登場。
エッグマンが世界中のリングを集めて(テイルスがいうには奪ったとのこと)建設したテーマパーク。ちょっとしたミニゲームがある。
上下に動く足場(側面が赤と白の物)は『ソニック・ザ・ヘッジホッグ3』のカーニバルナイトゾーンと同一のものが使われている。 ヒーロー(テイルス)・・・400枚以上リングを集める。 ノーマル・・・ゴールリングを目指す。 ダーク(エッグマン)・・・ステージ内にいるGUNのメカ20体倒す。
『黒い兵器達』という意味を持つ。通称『黒の軍団』。
周期彗星『ブラック彗星』を拠点に宇宙をさまよう戦闘民族。全員ブラックドゥームの血を引いているのでマインドコントロールされている。圧倒的な兵力と現代科学では解明できない未知の武器を操りこの星に飛来し、一瞬にして世界の主要6都市を壊滅に追い込んだ。戦闘員は皆、ブラックドゥーム(後述)譲りの漆黒と紅蓮のカラーリングをしている。
ブラックドゥームの命令に背いた罰として、シャドウが飛ばされた荒れた渓谷。大きな遺跡や神殿がそびえ立っている。 ヒーロー(ナックルズ)・・・ステージ内にいるブラックアームズ60体倒す。 ノーマル・・・ゴールリングを目指す。 ダーク(ドゥームズアイ)・・・遺跡にある5つの宝玉に触れる。
エッグマンの城の守護警備のハロウィン型ロボ。