柏崎県
このように越後国内の統治機関は目まぐるしく変化するが、同年6月の版籍奉還後の府藩県三治制が整備される過程で、越後府の後身である水原県から上越・中越地方の頸城郡、刈羽郡、魚沼郡、三島郡、古志郡の管轄区域を分離して再び柏崎県(第2次)が設置された。その後、財政破綻のために政府に廃藩を願い出ていた長岡藩を編入している。
1871年(明治4年)の廃藩置県ではそのまま存続したが、同年に行われた第1次府県再編で上越・中越地方の旧藩を引き継いだ高田県、与板県、清崎県(旧糸魚川藩)、椎谷県を合併し、上・中越5郡全域を管轄する県となった。
しかし、1873年(明治6年)、第2次府県再編を待たずに下越地方の蒲原郡、岩船郡を管轄していた新潟県(第2次)に合併され、柏崎県(第2次)は廃止された。