ピエール・ブヨヤ
内戦の激しさは収まったものの、依然として混乱は継続した。1998年6月、ブヨヤは正式大統領となった。
2000年にタンザニアのアルーシャでブルンジ政府、ツチ、フツの各勢力が和平協定に調印し、内戦終結を目指す暫定政府が2001年11月1日、3年の期限で発足。ブヨヤ大統領とドミシアン・ンダイゼイエ(副大統領、フツ)が1年半ずつの任期で大統領を務めることが決定した。1年半の任期を終えたブヨヤは2003年4月30日、大統領職をンダイゼイエに譲り渡した。
その後、アフリカ連合のマリ共和国とサヘルの特別大使を務めた。辞任の数週間後、2020年12月16日にマリ共和国の首都バマコにて入院。フランスの首都パリに移送され、翌12月17日に新型コロナウイルス感染症のため死去した。満71歳没。