クレン古細菌
テルモプロテウス綱/Thermoprotei
ニトロソスパエラ綱/Nitrososphaeria(NCBI分類のタウム古細菌/Thaumarchaeotaに相当)
コラルカエウム綱/Korarchaeia(NCBI分類のコル古細菌/Korarchaeotaに相当)
バテュアルカエイア綱/Bathyarchaeia(NCBI分類のバテュ古細菌/Bathyarchaeotaに相当)
メタノメテュリクス綱/Methanomethylicia(NCBI分類のウェルストラエテ古細菌/Verstraetearchaeotaに相当)
GTDB分類は全原核生物の分類を分岐距離で再評価したもので、古細菌はTACKが統合されるとともに、ユーリ古細菌は分割された。具体的には、NCBI分類においてTACKに含まれていた門が綱や目に格下げされてクレン古細菌に吸収されている。うちゲオ古細菌は目にまで格下げされ、テルモプロテウス綱に吸収、アイグ古細菌も同様に目に格下げされニトロソスパエラ綱に吸収される。元々クレン古細菌は、上記のうちコラルカエウム綱以外をすべて含んでいたが、その後の分割でユーリ古細菌に比べ細分化が進んでいた。
NCBI分類に基づく各目の系統関係は以下のようになる。
データベースにより分類が異なる。NCBI/LPSNの場合、2008年ごろまでは現在のTACK上門(除くコル古細菌)やアスガルド古細菌と呼ばれている系統の全てを含んでいたが、徐々に分割が進み、現在はテルモプロテウス綱のみを含む範囲に縮小している。
テルモプロテウス綱 テルモプロテウス目(超好熱菌。桿菌。主に熱水鉱床に分布) スルフォロブス目(好気性、好酸性。不定型球菌。生育温度は比較的低く、陸上温泉などに分布) デスルフロコックス目(超好熱菌。球菌又はディスク状。生育温度が異常に高く、熱水噴出孔などに分布) アキディロブス目(超好熱菌) フェルウィディコックス目(好熱性。Fervidicoccus fontis 1種のみ。陸上温泉から分離)
以前、海洋性クレンアーキオータと呼ばれていたニトロソプミルス目、ケナルカエウム目は、現在タウム古細菌門に分離されることが多い。この他、クレン古細菌に近接するゲオ古細菌と呼ばれる系統が存在し、門相当か、あるいはクレン古細菌に属す新綱とされている。未培養のメタン菌であるウェルストラエテ古細菌も綱として編入される場合がある。
一方、全原核生物の分類を分岐距離で再評価したGTDB分類(The Genome Taxonomy Database)では、TACKを再度吸収して6綱(うち未記載綱4つを含む)となっている。