北海道旅客鉄道函館支社
2023年3月18日現在

長万部駅の被管理駅である黒松内駅は、2007年3月31日を以って無人化(2002年3月31日までは管理駅であった)。
2014年5月12日で廃止となった江差駅は木古内ブロックに所属し、湯ノ岱駅は江差駅の被管理駅であった。
2016年3月26日に道南いさりび鉄道へ移管された七重浜駅・上磯駅は函館ブロックに所属し、五稜郭駅の被管理駅であった。
大沼駅は2023年3月18日で無人駅となった。
※本社と支社の境界はいずれも閉塞区間上にあるため、境界線の内側の停車場(駅・信号場など)を記載している。なお、◇が付いた路線は全線が管理区間内に入っている路線である。
国鉄青函船舶鉄道管理局時代は、JR化後に開業した海峡線を除き、青函連絡船(青森桟橋を含む)、松前線、瀬棚線(JR化直前に路線廃止)2016年3月25日までは 江差線(現道南いさりび鉄道線)を加えた区間が管理路線であった。
函館新幹線工務所
木古内管理室
奥津軽管理室