アルフォンス・エルリック
キーパーソンとして活躍するが、エドと同じ道を歩みつつも精神面で自立している漫画と違い、ブラザーコンプレックスが濃く描かれている。原作と違い、女性との恋に興味を見せている面はほぼない。性格は非常に穏やかで優しく、その優しさゆえか少々騙されやすくもある。父が失踪中であるため、ほとんど唯一の家族である兄を非常に気遣っており、また自分たち兄弟を支えてくれる周囲も気遣う言動が多い。そのため、原作のような容赦の無いツッコミはほぼない。母の人体錬成は、漫画では兄弟の合意の上で行われたが、アニメ2003年版のアルは錬成直前になって初めてエドから錬成の説明を受けており、錬成についてはその瞬間まで躊躇し続けていた。原作とは鎧の設定が異なり、グラトニーに四肢全てを喰われるなど原作であればほぼ修復不可能な損傷も、他の金属を錬成して修復することも可能。また、キンブリーに爆弾へと錬成されたり、傷の男(スカー)に賢者の石へと錬成されたりと、魂の定着方法を知らない者でもアルの鎧の錬成が可能だった。
一方で弟という共通点からスカー(傷の男)にシンパシーを抱いており、彼がエドを殺そうとした張本人でありながら親交を深め、「さん」付けで呼んでいた。エドが傷の男と衝突しそうになったとき、人となりを知ってきていたせいか、スカー(傷の男)を庇おうとすることもあった。