武藤章
山下に共に切腹することを提案するが、説得され、現地で降伏。
1945年(昭和20年)9月3日、バギオで山下、大川内、有馬とともに降伏文書調印式に臨む。
山下らが起訴されたマニラ軍事裁判では、逮捕起訴されず、弁護人補佐として出廷し山下らの弁護につとめた。マニラで起訴されなかったのは長く東京の軍務局で活動していたため、開戦に至る状況を東京裁判で証言させる為、南方での捕虜虐待も含めて東京裁判で起訴する事が決まっていたからと言われる。
しかし、マニラでは戦犯容疑者と同じキャンプに収容され、日本軍将兵一同に、皆は特攻隊員となり裁判による被害を最小限に止めよ、日本陸軍乃至日本の名誉のためにも部隊長や兵団長が捕虜殺害の命令を出したというようなことは絶対に言ってはならない、祖国は諸君やその家族を絶対に見捨てない、と訓示したという。このときは敗戦直後でまだ軍紀が維持され連合国軍への敵愾心も旺盛で、武藤の言葉は素直に受止められ、一同はそうすることを誓い合ったという。その結果、とくに初期に裁判を受けた者はこれを通したという。ところが、このために上級者は命令を出したことを一切否定し、実行した下級者は情状酌量を得られる可能性もなくし、下級者ばかりが死刑になったという(ただし、後には、これも崩れて、孰れか一方が犠牲になって法廷に争いを持ち込まなかった一部の将兵が居はしたものの、得てして醜い争いを演じるようになったという。)。
1936年(昭和11年)12月内蒙古の分離独立工作(いわゆる「内蒙工作」)に従事する。
当初は田中隆吉中佐が対応していたが、田中が神経衰弱にかかってしまったため武藤が田中に代わり対応することになったという。
武藤たち関東軍が進めていた内蒙工作に対し、石原莞爾が中央の統制に服するよう説得に来た際に、「本気でそう申されるとは驚きました。 私はあなたが満州事変で大活躍されました時分、この席におられる、 今村[ 関東軍参謀]副長といっしょに、 参謀本部の作戦課に勤務し、よくあなたの行動を見ており、 大いに感心したものです。 そのあなたのされた行動を見習い、その通りを内蒙で、実行しているものです」と 反論。若い参謀たちが口を合わせて哄笑したとのことである。
1936年11月徳王の内蒙軍による華北綏遠省侵攻作戦が失敗。内蒙軍内の反乱によって、上級佐官を含む二九人の日本人特務機関員らが殺害された。事件後、 武藤は関東軍第二課長(情報担当)として現地で事態の収拾にあたった。その時、 随行した松井忠雄徳化特務機関補佐官に武藤は次のような言葉を残している。
「政党政治の時代は去った。しかし軍が肩代わりするのは好ましくない。これは過渡的便法だ。...... この過渡的時代に日本が国際的危機に追いこまれるのは日本の不幸だ。しかしこれは日本の運命だ。」
1937年(昭和12年)3月、参謀本部第一部長石原莞爾の希望で、参謀本部第一部作戦第三課長に異動(抜擢)。二二六事件処理で見せた手腕を評価したとされる。
当時第三課長は石原が兼務していた。しかし武藤は3月1日の訓示には姿を見せず、2週間以上も経った16日、東條英機と一緒に石原に挨拶をしに行く。