ガラパゴス諸島
したがって、その意味では小笠原をこう呼ぶ方がより理にかなっていると言えるが、南西諸島の琉球列島、奄美群島も島毎に異なる進化を遂げた固有種や亜種が多種棲息しているという点ではガラパゴス諸島と共通している。が、最近の調査ではウミイグアナとガラパゴスリクイグアナの共存関係が崩れだし、ウミイグアナとガラパゴスリクイグアナの交尾によって生まれた子供は、両方の遺伝子を持ち、ガラパゴスリクイグアナにはない鋭い爪が生えている。これをハイブリッドイグアナと呼ぶが、繁殖力はない。また前記にあるエルニーニョ現象の影響で、体長が25%も短いイグアナが発見され問題視されている。
ガラパゴス諸島には木本のキク科の植物であるスカレシア属(英語版)の樹木も生えており、以下の固有種のほかに陸上にはカタツムリ、海域にはサメ、ジンベエザメ、エイ、鯨類、海鳥などが生息している。1984年にユネスコの生物圏保護区に指定された。