日本の重要湿地500
松山地区のオオイタサンショウウオの生息地
四万十川下流・河口域
中村市トンボ自然公園
土佐清水鵜碆、平碆、見残し周辺沿岸
龍河洞の地下水系
横碆周辺沿岸
浦ノ内湾
室戸岬周辺沿岸
夜須町地先沿岸
静狩湿原
大沼と周辺湿地(大沼、小沼、じゅんさい沼)
横津岳湿原群(雲井沼湿原、前沼湿原、烏帽子沼湿原、アヤメ湿原など)
汐首岬周辺沿岸
函館湾周辺沿岸
初島周辺沿岸
伊豆半島南東部(白浜~田牛)沿岸
逢瀬が浜
伊豆ヒリド、トナイ、中木港付近
伊豆半島西部沿岸
柿田川
麻機湿地
大井川中流域
御前崎周辺沿岸
桶ヶ谷沼・鶴ヶ池
浜名湖
遠州灘海岸(静岡県、愛知県)
葦毛湿原・湖西地方の湿地(静岡県、愛知県)
然別湖
十勝海岸湖沼群(十勝川河口湿原、長節沼、湧洞沼、キモントウ、生花苗沼、当縁湿原、ホロカヤントウ沼など)
十勝川下流域湖沼群(三日月沼、育素多沼、池田キモントウ、幌岡大沼など)
更別湿原