高松港
通常の貨物トラックのフェリー輸送のみならず、フェリー無人航走(無人シャーシをフェリーで輸送し、発着港から荷主のところまではトラクターヘッドによる輸送を行う一貫輸送形態のこと)も行っており、近年のトラックドライバー不足によって、フェリー無人航走が増加している。利用企業は四国地域のみならず、全国に広く分布しており、神戸港と高松港は広域物流の拠点となっている。 フェリー無人航走の中には、神戸港にあるコンテナターミナルを経由して、欧米に製品を輸出するものが含まれている。 フェリーは、上甲板・下甲板に車両を搭載することができ、上下甲板から同時に車両の乗降船作業を実施することで、フェリーの港での着岸時間短縮化が図られている。
フェリー ジャンボフェリー(りつりん2、あおい):高松東港 - 坂手港(小豆島) - 神戸港・新港第三突堤
2020年現在、すべてのフェリー会社が運航を休止している。乗り場はサンポート高松から東側に離れて会社別に設置されていた。 ※宇高航路も参照。
フェリー 宇高国道フェリー:高松港 ~ 宇野港(2012年10月18日より休止) ※国道30号海上区間 四国フェリー:高松港 ~ 宇野港 (2019年12月16日より休止)(玉高丸)
高松港の東側に位置し、物流拠点である朝日地区にある。神戸港との間で一日4往復のフェリー航路が運航されている。1969年にフェリーターミナルが整備されているが、近年のトラックドライバー不足の深刻化により取扱量が増加している。2020年度から、国の直轄事業として1万トン級の大型フェリーにも対応する新たなフェリーターミナルを整備することが決定しており、現在、高松港湾空港整備事務所により事業が進められている。新ターミナルは地震の揺れに強い耐震強化岸壁を含むターミナルとなり、発生が懸念されている南海トラフ地震発生時には緊急物資輸送の拠点となる重要なターミナルである。