アマゾン川
水生爬虫類ではカメが豊富で、大きな種類は1m程になりタルタルーガと呼ばれて珍重された。クロカイマンなども生息している。哺乳類ではマナティー(アマゾンマナティー)が知られ、カメ同様に乱獲の影響で数を減らしたため現在では捕獲が禁止されている。イルカ類(アマゾンカワイルカやコビトイルカ)も代表的な水生哺乳類だが、インディオはこれを「ボート」と呼んで魔術的・超自然的な力を持つ生き物と考えたため乱獲されなかった。逆に美男子に変化して人間の女性を惑わすとか、魔力を宿した左の眼球を通して意中の人を見れば想いが叶うといった迷信がつくられた。
ブラジル北部のソリモンエス川とネグロ川流域を含むアマゾン盆地とギアナ楯状地の移行地域一帯は2001年にユネスコの生物圏保護区に指定された。また、本流近傍のコロンビア最南端のタラポト湖沼群(スペイン語版)、ブラジルのマミラウア持続可能な開発保護区(ポルトガル語版)および河口部のマラジョ島を含むマラジョ諸島(ポルトガル語版)と一帯のマングローブ群はラムサール条約登録地である。
1749 km – グアポレ川、ブラジル/ボリビア(マデイラ川の支流)
1575 km – プトゥマヨ川(スペイン語名)/イサ川(ポルトガル語名)、南アメリカ
1415 km – マラニョン川(スペイン語名)/ソリモンエス川(ポルトガル語名)(白)、ペルー
1370 km – テレスピレス川(ポルトガル語版、スペイン語版、英語版)(スペイン語名)/サン・マヌエウ川(ポルトガル語名)、ブラジル(タパジョース川の支流)
1300 km – イリリ川、ブラジル(シングー川の支流)
1240 km – ジュルエナ川、ブラジル(タパジョース川の支流)
1130 km – マドレ・デ・ディオス川、ペルー/ボリビア(マデイラ川の支流)
1100 km – ワジャガ川(スペイン語版、英語版)、ペルー(マラニョン川の支流)
1050 km – ジャバリ川(白)、ペルー/ブラジル
さらに、アマゾン川の流路は複雑であり、より長い支流が存在するとして、アマゾン川が世界一長い河川であるという主張も存在する。例えば、2007年6月22日に共同通信は、ミスミ山の奥深くで新たな源流が発見されアマゾン川の全長は 400 km も伸びて 6,800 km となりナイル川を超えると報道した 。
2008年7月3日には、アマゾン川とナイル川の衛星写真を比べてアマゾン川の長さは 6,992 km になりナイル川よりも長いと報道された。
アマゾン川の上流部分はアンデス山脈の奥深く入り込んでいる。ナショナルジオグラフィック協会などによる調査では、ペルー南部のボリビアやチリ国境近くにあるミスミ山 (Nevado Mismi, 5597 m) が最も遠い水源と考えられ。主要な支流全体の長さは延べ 50,000 km にもなり、赤道を一周した長さよりも長い。