バイキンメカ
初登場回 - TV第1013話A「ばいきんまんとヘリコプタン」
かびるんるんが操縦するかびるんるん型の小型ヘリコプター。バイキンヘリコプター2号のサポートに従事する。
さらに、ピンチの場合の脱出用にも使われている。また、ゲストキャラクターなどに乗っ取られることも多々ある。映画『怪傑ナガネギマンとドレミ姫』では、瞬間接着剤で応急修理され、いつも通りに稼働している。
コックピットの上部は、全面ガラス張りのキャノピーになっており、キャノピーの上部にばいきんまんの2本の触覚をかたどったアンテナが付いている。アンテナからは光線が出るが、アンテナが変形していると正常に光線が飛ばず、自爆してしまうことがある。コックピットにはレバー1本と、ボタンが数個存在するだけである(まれにレバーが2本になったり、モニターが付いていることもある)。基本的に座席は存在せず、直立姿勢で操縦する(座席が付いていたり、座布団が敷かれている時期もあった)。アンテナと上の部分は紫色で下部分の色はピンク系か紫系。
全ての機能はばいきんまん一人で操作できるが、ドキンちゃんや人質を同乗させることもある(操縦は初心者が操作することが仇となり故障することもしばしばある)。リモコンによる遠隔操作も可能であるほか、ばいきんまんの呼びかけで飛んでくる音声認識システムや、自動的においしいものなどをサーチしてカーソルなどで表示するセンサー機能も備わっている。大気圏内外を自由に行き来できる。ボディは、ハードトップ形態。
初登場回 - TV第426話B「ほのおくんとキャンドルちゃん」
バイキンUFOからの変形ロボット。足のタイヤでとても早く移動することができる。手が何本もある。
初登場回 - TV第933話A「ばいきんまんとカレンの森」
カレンとハニーを閉じ込めて、カレンの森から遠くへ飛ばすためのモデルロケット。
初登場回 - TV第381話A「はみがきまんとバイキンスプレー」
歯磨きを面倒臭がっていたカバオくん達に配るために作ったスプレー。中の薬はムシバキンマンの虫歯菌が混ざっていて、それを歯に掛けた者は時間が経つと虫歯になってしまう。
三つ首ドラゴン(みつくびドラゴン)
初登場回 - TV第290話「アンパンマンとジグソーパズルの国」
3本のドラゴンの頭部が胴体に接続された巨大なロボット。ジグソーパズルの国を占領した。ジグソーマシーンと同じ機能を持ち、町や学校など、何でも吸いこんでジグソーパズルに変えてしまう。トリプルパンチを一度は弾き返したが、復活したアンパンマンに首を結びつけられてしまいアンパンチで吹き飛ばされた。
緑池のおばけ(みどりいけのおばけ)
初登場回 - TV第385話A「アンパンマンとおばけの池」
緑池の伝説を利用してアンパンマンを倒すために作られたもの。一見メカに見えるけど、実は着ぐるみで中にはバイキンUFOが隠れている。
最後は両翼に穴を空けられバランスを崩された所で、アンパンチで完全に破壊された。
小型(こがた) 初登場回 - TV第938話B「SLマンとタンポポちゃん」 タンポポちゃんを拉致するためにもぐりんから射出された小型のすいこみどり。タンポポちゃんを吸い込んだが駆け付けたアンパンマンによって破壊された。
スーパー俺様メカ(スーパーおれさまメカ)
声 - 中尾隆聖
初登場回 - TV第1264話B「プリンちゃんとクレヨンの国」
クレヨンの国のクレヨンでばいきんまんが描いたばいきんまん型の巨大ロボット。ばいきんまんの命令で動き「ハッヒフッヘホー!」と声を上げる。手からクレヨン型のミサイル、口からボールの弾を発射して攻撃する。アンパンマン達をピンチに追い込むが、偶然クレヨンの国に遊びに来ていたプリンちゃんとエクレアさんに洋服や花飾りを描き加えられてしまった。
初登場回 - TV第1169話A「ばいきんまんとスポンジマン」
スポンジマンへの復讐のためにだましてもらったスポンジを身体中に装着したロボット。泥水を染み込ませたスポンジで町やパン工場を汚す。背中の放水銃から泥水を噴出したり、スポンジを発射したりして攻撃もできる。
初登場回 - TV第202話A「アンパンマンとバイキンタイムマシン」
過去の世界に行けるタイムマシン。赤ちゃん時代のアンパンマンを倒すために作った乗り物。空を飛ぶこともできる。この時のばいきんまんは、タイムパラドックスの危険性も理解していた。赤ちゃんアンパンマンのアンパンチで吹き飛ばされ、現代に戻ったところで壊れ、現代に戻ったのは林道でたまたま道を歩いていたアンパンマン(とバタコさんとメロンパンナも)が来てアンパンマンと対面したばいきんまんとドキンちゃんはアンパンマンを見て逃げ回る羽目になった。
初登場回 - TV第862話「ばいきんまんとドクター・ヒヤリの島」
ばいきんまんを模した顔に、ロケットエンジンとマジックハンドを装備した空飛ぶ大型メカ。パン工場を持ち上げられるほどパワーがあり、ジャムおじさんたちを工場ごと、ドクター・ヒヤリの島へ連行するのに用いられた。
バイキン飛行船(バイキンひこうせん)
初登場回 - TV第250話「消えたジャムおじさん」
巨大な帆船型の移動要塞型メカ。もぐりんに似た顔をしている。バイキンUFOやもぐりんなど、多くのバイキンメカを格納できる。ジャムおじさんを救出するため乗り込んだアンパンマンに、マストを折られた上、装甲を貫かれて撃沈した。
初登場回 - TV第624話A「クリームパンダとくじらのクータン」
かびるんるんが乗るイルカ型の潜水メカ。網を発射して海の生き物を捕まえる。
初登場回 - TV第454話A「アンパンマンとグレートばいきんまん」
寒さに強いロボット。寒い中に盗んできたパンが凍り付いていたことから着想を得て、アンパンマンの苦手な寒冷地で戦うために作った。寒ければ寒いほどパワーが増す(製作したばいきんまんも、あまりのパワーに驚いていた)。持っている剣とすごい力のグレートパンチが武器。アンパンマンをノックアウトするが、「いつもよりも焼きたての新しい顔」のパンチを食らい、高熱でシステムが狂ってしまったため負けてしまう。
バイキン号(バイキンごう)
1号(1ごう) 初登場回 - TV第86話「おかしな自動車レース」 自動車レースに参加するためにばいきんまんが作ったレーシングカー。稲妻を模した装飾が特徴。賞品目当てに、ドキンちゃんとさまざまな妨害行為を行う。ミニアンパンマン号と熾烈なデッドヒートを繰り広げるが、エンジントラブルで大破してしまう。アンパンマン、どんぶりまんトリオに次いで3位でゴールしたはずが、反則・相次ぐ妨害行為が判明したため失格にされた。
2号(2ごう) 映画第22作同時上映「はしれ! わくわくアンパンマングランプリ」 覆面レーサー(ばいきんまん)が使用したレースカー。強力なパワーで黒煙を撒き散らす様子からマイクマンには「エコ逆行マシーン」といわれた。様々な走行妨害用のしかけがある他、地中を進む「ドリルモード」、海中を進む「サブマリンモード」がある。ゴール直前でのフラワー号とのデットヒートでエンジンが爆発してしまい車体が分解してしまった。ばいきんまんはなおもハンドルを持って走り、最後は舌まで突き出したが負けてしまった。
「バイキンロボパンチ」が得意技。 ローラータイプ 初登場回 - TV第979話B「ジャムおじさんとロールケーキちゃん」 足にローラースケートを取り付けて、素ばやく動けるようにしたバイキンマッチョロボ。ロケットパンチを飛ばして戦うが、転びやすいのが弱点。
バイキンマッチョUFOロボ(バイキンマッチョユーフォーロボ)
初登場回 - TV第946話A「おむすびまんとうなどんまん」
バイキンUFOからの変形ロボット。腕と膝が筋肉モリモリになっており、その力は非常に強く、巨大な岩を壊すほどの破壊力を持つ。
バイキン拳法ロボ(バイキンけんぽうロボ)
初登場回 - TV第458話B「アンパンマンとはるまきぼうや」
マジックハンドとマジックジダンダ、ヌンチャクを装備して攻撃するバイキンUFOからの変形メカ。通常のバイキンUFOより攻撃力が高い分、操縦しているばいきんまんにダメージがフィードバックされる(チーズがマジックハンドに噛み付いた際に痛がっていた)。春巻アンパンマンの拳法技に敗れる。
1号(1ごう) 初登場回 - TV第823話A「クリームパンダとリンゴの国」 りんごの国を襲うために造られたロボット。頭部がリンゴ型で、ゴロンゴロに似ている。矢を放って攻撃する。
2号(2ごう) 初登場回 - TV第1099話B「ホラーマンとリンゴの国」 りんごの国からリンゴを強奪するためのロボット。巨大なリンゴにばいきんまんを模した顔と角、手足がついているデザイン。リンゴをバキュームで吸い取る他、吸盤のついた矢を放って攻撃する。リンゴを守ろうとしたホラーマンをバキュームで吸いこんでしまったことで操縦系統が混乱し、新しい顔に交換されたアンパンマンに敗れた。
初登場回 - 2019年TVスペシャル「サンタになったちびおおかみくん」
サンタクロースの服を着た、顔はばいきんまんで体はだだんだんのロボット。口から冷気を吐いて攻撃する。また、プレゼント箱で相手を鈴に変え、リングベルにして振り回す攻撃もある。鼻にはちびおおかみをおおかみおばけに変える為の満月の模型が入っている。末路は不明。
初登場回 - TV第1187話B「ドキンちゃんとけむりいぬ」
初登場回 - TV第179話A「アンパンマンとふしぎドーム」
アンパンマン達を罠に誘うための建物。恐竜やお化けなどの立体映像で入ってきた人を驚かす。鏡や積み木など立体迷路も仕掛けられている。ジャムおじさん達にバレて装置を使われて出口を作り替えられた。
初登場回 - TV第145話A「忍者のニャンジャとフクラマスダコ」
自律行動するタコ型のロボット。8本の足で相手に取り付き、ガスを送って風船のように膨らませ、空に飛ばしてしまう。鼻から出す墨も武器。