扁形動物
プラナリア、ヒラムシ、コウガイビルなど、自由生活の動物。
無腸目 Acoela:ムチョウウズムシの仲間。現在は無腸動物Acoelomorphaとして扁形動物から独立させることも多く、チンウズムシとともに珍無腸動物門Xenacoelomorphaという門を形成することもある。
小鎖状目 Catenulida
単咽頭目 Haplopharyngida
卵黄皮目 Lecithoepitheliata
多食目 Macrostomida
皮中神経目 Nemertodermata
新棒腸目 Neorhabdocoela
多岐腸目 Polycladida:ヒラムシ
原卵黄目 Prolecithophora
原順列目 Proseriata
三岐腸目(ウズムシ目) Tricladida:プラナリア、コウガイビル
サナダムシの仲間。
単節条虫亜綱 Cestodaria 両網目 Amphillinidea 褶吸盤目 Gyrocotylidea
多節条虫亜綱 Eucestoda 無門目 Aporidea 果頭目 Caryophyllidea 円葉目 Cyclophyllidea:エキノコックス 二葉目 Diphyllidea 二性目 Dioecotaeniidea 盤頭目 Lecanicephalidea 菱頭目 Litobothridea 日本条虫目 Nippotaeniidea 変頭目 Proteocephalidea 擬葉目 Pseudophyllidea:広節裂頭条虫 箆頭目 Spathebothriidea 四葉目 Tetraphyllidea 錐吻目 Trypanorhyncha
扁形動物は腹毛動物とともに吸啜動物を構成する。伝統的な渦虫綱は多系統群であり、渦虫綱に含める説もあった顎口動物や無腸動物は扁形動物とは別系統に属する。扁形動物の中では小鎖状類が初期に分岐し、これら以外の渦虫類や新皮類(吸虫類・条虫類・単生類)を含む系統が有棒状体類としてまとめられる。
有棒状体類では多食形類が初期に分岐した系統とされ、続いて多岐腸類・原有吻頭からなる分岐群および錐咽頭類が有棒状体類からそれぞれ分かれた。この系統関係に従うと、原有吻頭・錐咽頭類からなる卵黄皮類は多系統群ということになる。残る系統については不確実であるものの、三岐腸類・フェカンピア類・原卵黄類からなる分岐群が不透明類Adiaphanidaとしてまとめられ、その姉妹群としてヒメヒラウズムシと新皮類からなる分岐群が位置付けられる。