東映アニメーション
発足から4ヵ月後の1956年12月、まだ武蔵野の面影が残る閑静な東京都練馬区の東映東京撮影所南側に隣接してスタジオが完成。延建坪330坪。東映動画は1957年1月9日、この新スタジオに移転。日本に於ける本格的アニメーションの製作が開始された。スタジオ完成とともに新たに採用された東映動画第一期生の中には大塚康生、楠部大吉郎らがいた。スタジオ竣工時就業人員80人。また1958年から手塚治虫が『西遊記』の製作のために嘱託として参加している。1958年延建坪500坪。この時のノウハウが旧虫プロダクションで活かされることとなる。東映動画の遺伝子は後の日本のアニメーションの歴史に大きな影響力を持った。岡田茂は「東映が日本のアニメーターを養成したようなもの」と述べている。
新スタジオでは『白蛇伝』制作のためのスタッフ急増とCMフィルムの需要の増加に対応して同年末に第1次増設工事に着工して同年4月10日に竣工し、その2年後の1959年6月15日には第2次増設工事竣工。延建坪850坪に拡大され。さらに『狼少年ケン』などのテレビアニメーション(テレビ漫画)の制作に対応するため1964年6月2日には第3次増設工事が竣工して現在のスタジオに成長した。
スタジオの完成によって長編アニメーション制作の体制が整い、まず手慣らしとして旧日動映画スタッフの指導の下で1957年5月、初の短編作品『こねこのらくがき』を制作した。続いて1958年10月には『白蛇伝』を完成した。日本でテレビ放送が始まって5年8ヵ月後のことで、当時としては破格の製作費4000万円、製作期間9ヶ月を費やした。東映動画は「日本でもここまでできる」と後進を刺激し、家内制手工業の動画制作を近代産業に発展させ、同時に日本アニメーションの戦後を終わらせた。
東映株式会社
株式会社テレビ朝日
株式会社バンダイナムコエンターテインメント(兄弟会社としての扱い)
株式会社アニュータ(音楽配信サービス、発足時に東映アニメーション音楽出版が参画)
株式会社TENH ANIMATION MAGIC(SOLA DIGITAL ARTSとサンジゲンの共同設立によるCGアニメーションスタジオ、東映アニメーションも経営に参画)
株式会社ダンデライオンアニメーションスタジオ(2018年8月に資本業務提携)
株式会社アナライズログ(インフルエンサーエージェント事業、2019年12月に資本業務提携)
株式会社FLARE CREATORS(オリジナルコンテンツの企画・プロデュース、東映との折半出資で2023年6月に設立)