堅田 (大津市)
また、この頃堅田に臨済宗が広まって武士階層が多い殿原衆の間で広く支持されて祥瑞寺が創建された。この寺は青年期の一休宗純が修行した寺としても知られている。一方、同じ頃浄土真宗の本福寺が堅田に創建された。その後一時期臨済宗に改まるものの、3代目にあたる法住(1397年 - 1480年)・明顕(4代目、1445年 - 1509年)父子が浄土真宗に復帰して本願寺に属すると、本願寺8世蓮如からの厚い信任を受けるようになった。やがて、蓮如が寛正の法難によって大谷本願寺を延暦寺によって破壊されると、堅田に逃亡する事になる。蓮如は全人衆からの強い支持を受けて後に「堅田門徒」と称せられるほどの勢力をこの地に築くことになった。
しかし、領主である延暦寺が「仏敵」とした蓮如を堅田が匿っているという事実は延暦寺を刺激した。更に延暦寺はかねてから殿原衆が勝手に上乗を請求していることに対しても不満を抱いていた。そんな最中の1468年、室町幕府御蔵奉行が花の御所再建のために調達した木材を運搬する船団が上乗を払わないことを理由に堅田衆が積荷を差し押さえた。激怒した室町幕府8代将軍足利義政は領主である延暦寺に堅田の処分を要求した。同年4月16日、延暦寺は堅田に対して焼き討ちを行った。これによって延暦寺を支持していた地域を含めて堅田の町のほぼ全域が焼失して住民は沖島に逃れ、1470年に講和となるまで帰還できなかったという。これを堅田大責(かたたおおぜめ)と言う。
それに対して信長は朝倉義景・浅井長政・本願寺に包囲された志賀の陣において1571年1月1日に堅田水軍の猪飼昇貞・居初又次郎・馬場孫次郎らが織田方に内通したので、坂井政尚を派遣して堅田を攻撃するが、義景の家臣前波景当に攻撃されて坂井政尚は戦死、猪飼昇貞らも逃亡して堅田占領は失敗した(堅田の戦い)。ところが、間もなく信長は方針を転換して、全人衆主導の自治に不満を抱く殿原衆を切り崩して支配下に置いて堅田船の船団の支配権を手に入れ、次いで1572年には殿原衆と結んで全人衆と真宗寺院を攻撃してこれを屈服させた。織田政権・豊臣政権・江戸幕府はいずれも経国在民的特権に関しては、基本的には大津代官従属のもとで以前のものを承認し続けた。
1698年、堀田正高が堅田1万石に封じられて堅田に陣屋を設置して堅田藩が成立する。途中1826年に下野佐野藩に加増転封されるものの、堅田領は従来通りとされ、以後内部問題は堅田藩が、大津など周辺港湾との折衝は大津代官が行うことになった。しかし、江戸時代後期彦根藩などの保護を受けた他の琵琶湖湖畔の諸港の台頭、船主・漁民と農民・商人との利害対立による内紛(堀田氏の佐野移封と前後として農民と漁民の対立が大規模暴動に発展している)などがあり、徐々にその影響力を低下させていった。
1889年、滋賀郡本堅田村・今堅田村・衣川村の合併により滋賀郡堅田村が成立し、1901年7月20日に堅田町に移行。1955年4月1日に周辺の仰木村・真野村・伊香立村・葛川村と合併して新生の堅田町となったが、1967年4月1日大津市に編入され、自治体名としての「堅田」は消滅した。
国勢調査による人口の推移。