23SリボソームRNA
リボソームのペプチジルトランスフェラーゼ活性中心はこのrRNAのドメインVに存在し、このドメインは、翻訳を阻害する抗生物質の最も一般的な結合部位である。このような抗生物質でよく知られたものにはクロラムフェニコール、リネゾリド及びキヌプリスチン-ダルホプリスチンがあり、これらはペプチド結合形成を阻害することによって抗生作用を発現する。16S rRNA遺伝子と比較して、23S rRNA遺伝子では通常、挿入及び/又は欠失を含む配列変異がより高頻度で起こる。
23S LSU rRNAは真核生物の28SリボソームRNAのホモログであり、5.8SリボソームRNAに相当する領域も含まれる。
23S rRNA上の位置G2252、A2451、U2506、及びU2585は、リボソームの大サブユニット(50Sサブユニット)のP部位でのtRNA結合に重要な機能を持つ。