エリトリア独立戦争
また1955年の憲法においてアムハラ語のみが政府の公用語として定められるなど「アムハラ化政策」の下でエリトリア人の権利が制限されていくに従ってエリトリア・エチオピアは互いに反目するに至り、1958年には民族主義政党・エリトリア解放運動 (ELM) やエリトリア解放戦線が結成され、1960年にはELFの結成がカイロで公式に宣言された。1960年代は、エリトリア人の独立闘争においてはエリトリア解放戦線 (ELF) が指導的立場に立った。当初、独立運動に関わる集団は民族及び地理的条件によって分かれていた。ELFの当初の4つの地区別部隊は全て低地地域のものでイスラム教徒を中心にしていた。これらの部隊にはイスラム教徒に支配されることを怖れてキリスト教徒はごく少数しか参加していなかったが、エチオピアによる併合後、公民権が剥奪されるようになって高地のキリスト教徒もELFに参加するようになった。これらのキリスト教徒は上流階級かあるいは高等教育を受けた者が多かった。
一部はアラブ諸国に近いエリトリア解放戦線人民解放軍 (ELF-PLF) を形成し、一部は中国に近いEPLFに合流した。1970年代後半には、EPLFはエチオピア政府と戦うエリトリア人武装集団の中で指導的な地位を獲得するに至った。この時の指導者はラマダン・モハメッド・ヌール (Ramadan Mohammed Nur) EPLF書記長で、副書記長はイサイアス・アフェウェルキだった。1974年の革命の際にエチオピア陸軍から多くの装備を鹵獲した。
この間、帝政時代と同じようにデルグは自らの力だけでは民衆を抑えることができなかった。各地の守備隊への補給を確実に行うため、軍は民衆に恐怖を植え付ける戦術を行った。例としてエリトリア北部のバシク・デラでは1970年11月17日に全村民をモスクに軟禁した上でモスクを完全に破壊し、生存者を射殺した。こうした虐殺方法は主にエリトリアのイスラム教徒居住地域、シェエブ (メンシェブとも呼ばれる。She'eb、Mensheb)、ヒルギゴ (Hirghigo, Hirgigo)、エラベレド (Elabered, Elabared, Elabored, Ela Beridi)、オム・ハジェル (Om Hajer) 等で行われた。大量殺害はイスラム教徒居住地域に限らず別の方法でキリスト教徒居住地域や他の地域でも行われた。
エリトリアは1941年にイタリア領エリトリア(イタリア領東アフリカ)からイギリス軍政に移り、1950年に戦後の処遇を決めるための調査団が国際連合によって送られている。イギリス軍政期におけるエリトリア独立派勢力としては1946年結成のムスリム連盟 (Muslim League, ML)、1947年結成のエリトリア自由進歩党 (Eritrean Leberal Progressive Party, ELPP) 及びこれらが中心となって1949年に結成された独立派連合 (Independence Bloc) が挙げられる。これに対抗して正教会の聖職者や遊牧民の貴族階級を中心としたエチオピアへの統合派は統一党 (Unionist Party) が1947年に結成され、エチオピア政府の支援を受けた。国連の裁定により、1952年にエチオピア帝国とエリトリアは連邦制を布くこととなった。連邦制施行後、エリトリア独立勢力はエチオピアとの統合を行わない連邦制の堅持を目標としたエリトリア民主戦線 (Eritrean Democratic Front, EDF) を結成したが、主要メンバーの逮捕や暗殺、その他の迫害を受けての亡命が相次ぎ、ほどなく衰微した。