プラーカ新潟
西友の出店断念以降、不確定なままだった第二地区の再開発事業が1999年から計画見直しを経て再開し、2007年夏から建設工事が開始された。
「LEXN(レクスン)」と名付けられたこのエリアには高さ115m・31階建のタワーマンションを中心に、商業フロア・オフィスフロア・立体駐車場などを内包する3棟のビルから成る複合施設が建設され、2010年2月下旬から順次オープンしている。また、これまで駐車場等として暫定供用していた新潟駅南口の旧新潟運転所跡地は、南口駅前広場の拡張改修用地に充てられ、第1期改修は2009年9月に完工。これによって駅舎とロータリーが近接し利便性が大幅に改善された。
さらに駅前広場の改修と同時に「新潟駅ビルCoCoLo」の新フロアが相次いで竣工。1月には東側連絡通路とバスターミナルに面する「CoCoLo南館」が(竣工後順次オープンし、2月20日にビックカメラが開業しグランドオープン)、9月19日には中央広場に面する「CoCoLo中央」がそれぞれオープンした。これらは旧新潟運転所の閉鎖後に作られたため、駅直結で利便性が高く、プラーカからのさらなる流出を招いた。
また駅南側には2004年に低価格の駐車場を有するドン・キホーテ新潟駅南店が開業した。
プラーカはオープン当初こそ順調な滑り出しを見せたものの、周辺の商業地区から若干遠く回遊性が乏しい上、専門店のみでキーテナントが存在せず、無料駐車場を有する郊外店舗の台頭もあり、徐々に業績が悪化。南口側には長らく気動車の基地が残ったため駅舎から遠いという周辺施設の構造上の問題も響いた。
さらにセゾングループ(当時)の業績不振から1991年に西友の出店計画が取り止めとなった事を受けて第二地区の再開発計画は事実上凍結され、キーテナント不在のままでの営業を強いられるなど誤算が続いた。市は1990年10月、建物の所有権を駅南開発と地権者に譲渡して償却を図ったが、その後も市内には古町・西堀十字路角のNEXT21内にラフォーレ原宿が進出(1994年)、万代シテイにもビルボードプレイスがオープン(1996年)するなど、プラーカと同様の専門店主体の商業施設が次々とオープンした事でプラーカの存在意義は希薄となり、来館者数の減少から徐々にテナントも減少した。2002年FIFAワールドカップを控え新潟市道弁天線などの整備により駅南の開発が急速に進んでいく中、プラーカは取り残される形となった。
結局、市などは慢性的な赤字経営から抜け出せないことを理由に、商業フロアの閉鎖を決断。2004年2月28日を以って3棟のうち駅南開発が保有していたプラーカ1・2の2棟の商業フロアが営業を終了し、2棟とも競売によって売却され、所有権はプラーカ1のホテルフロアが明治安田生命保険に、1の商業フロアと2の全棟が木山産業に移り、3棟の商業フロアは同社が一括して管理することになった。
なお、駅南開発は2004年6月30日をもって解散。負債総額は約59億円であった。