ユーグレナ藻
ユーグレナ藻の研究は、エーレンベルクが1830年にユーグレナ属 (Euglena) を記載したのが端緒である。ユーグレナという名前は eu- '真の、美しい'+glena '眼点' に由来するが、この名前は若干の語弊を含んでいる(後述)。
より上位の分類群としてのユーグレナは、1884年、ドイツの動物学者 オットー・ビュッチュリ により、鞭毛虫の目「Euglenida」として設立された。一方、植物学者たちはユーグレナを藻類の分類群「Euglenophyta」として門レベルの位置付けを行っており、当時から既に動植物双方の特徴を併せ持つユーグレナの分類を巡っては混乱が生じていた。この分類の競合は、動物界、植物界に加えて原生生物界が設立される1つの契機となったが、ユーグレナの二重分類はその後も続き、今でも両方の名称がしばしば用いられる。
ユートレプティア属 Eutreptia ユートレプティエラ属 Eutreptiella Euglenea - 旧 ユーグレナ亜目の主要部からなる。 ウチワヒゲムシ科 Phacaceae Discoplastis ニセウチワヒゲムシ属 Lepocinclis ウチワヒゲムシ属 Phacus ミドリムシ科 Euglenaceae アスコグレナ属 Ascoglena コラキウム属 Colacium クリプトグレナ属 Cryptoglena シクリディオプシス属 Cyclidiopsis ミドリムシ属 Euglena Euglenaria ユーグレノプシス属 Euglenopsis モノモルフィナ属 Monomorphina ストロンボモナス属 Strombomonas トックリヒゲムシ属 Trachelomonas Aphagea - 浸透栄養性(学名は「捕食しない」の意)。旧 ラブドモナス亜目と、ユートレプチア亜目・ユーグレナ亜目のそれぞれ一部からなる。 アスタシア属 Astasia ディスティグマ属 Distigma ディスティグマ属 Distigmopsis メノイディウム属 Menoidium ラブドモナス属 Rhabdomonas