過去に存在した長崎屋の店舗
前橋店(前橋市千代田町5-9-8、1964年(昭和39年)3月19日開店 - 1984年(昭和59年)閉店) 店舗面積約1,551m。 前橋ヒカリ座跡に出店していた。 跡地は前橋市に譲渡され、広場になっている。
(初代)桐生店(桐生市本町6丁目372、1963年(昭和38年)10月1日開店 - 1982年(昭和57年)閉店、桐生市営本町6丁目団地) 店舗面積約1,518m。
沼田店(2003年(平成15年)6月13日開店 - 2008年(平成20年)5月25日閉店) 沼田サティ跡地のショッピングセンターグリーンベル21にAコープとともに出店していた。「生活衣料サンバード」としての出店であった。
伊勢崎店(伊勢崎市本町2-52、1962年(昭和37年)9月19日開店)
店舗面積825m
第二次世界大戦前から営業していたが閉店となった大型店日野屋跡に出店していた。
長崎屋ホームセンター高崎緑町店(高崎市、1986年(昭和61年)10月開店) 店舗面積約2,000m。
(初代)宇都宮店(宇都宮市睦町、1986年(昭和61年)11月開店 - 2002年(平成14年)1月閉店) 売場面積約5,395m → 約7,739m。 ラパーク宇都宮店とは違い、郊外に所在した。2000年代になってから郊外店舗が市街地へ移転することは極めて異例なことである。
小山店(小山市中央町3-3-22、1973年(昭和48年)9月20日開店 - 1994年(平成6年)12月閉店) 売場面積約12,540m(1980年現在)→約12,064m 小山市内で2番目の大型総合スーパーとして開業した店舗。小山駅西口にあり、ディスカウントストアのディスカウンタも併設していた。 シティーホテル建設が計画されるも頓挫、跡地は小山都市開発管理を経て現在は民間の駐車場。
今市店(今市市今市455(現:日光市)、1983年(昭和58年)4月開店 - 2001年(平成13年)1月閉店) 売場面積約6,333m。 店舗跡にはかましんと今市市の市民サービスセンターが開設された。老朽化により第2駐車場に新築移転し、2021年(令和3年)に日光ランドマークが開業。旧店舗は取り壊しの上、今市病院が新築移転する予定である。
入居していたテナントスペースは、30代の家族向けや 若者向けなどの店舗を招致し、家電や書籍の売り場を大幅に増やすなどの大規模な改装を行い、2010年(平成22年)4月22日に 新装開店している。
千城台店(千葉市若葉区千城台北3丁目21-1、1995年(平成7年)3月23日開店 - 2015年(平成27年)1月25日閉店) 店舗面積約20,788m、延べ床面積約47,899m。長崎屋の売場面積は約11,867m(千葉日報では11,866m)。 千葉県都市公社(現:千葉県まちづくり公社)が、1984年(昭和59年)に出店のため事業を開始したものの、住民への日照権に対する話し合いが長引き、1994年(平成6年)2月に着工するまで更地となっていた。 千葉都市モノレール2号線千城台駅に隣接して開業した「ラパーク千城台」の核店舗として開店。食品売り場は京成ストアのリブレ京成千城台店が店舗面積2,299mで出店。 長崎屋閉店後も、リブレ京成や一部専門店は引き続き営業。 千城台店の閉店により、「ドン・キホーテ」「MEGAドン・キホーテ」を核テナントとして入れていない長崎屋単独店舗は本州から消滅し、長崎屋単独のラパーク店舗も消滅した。 ラパーク千城台としても2020年までに契約が満了し、営業を終了した。建物は同年、まちづくり公社より新たに委託を受けたJLLモールマネジメント(当時、現:JLLリテールマネジメント)に管理が移管され、老朽化した設備を更新。「イコアス千城台」としてリニューアルオープンした
鯖江店(1982年(昭和57年)4月開店 - 1989年(平成元年)1月23日閉店。跡地はホテルアルファーワン鯖江) JR鯖江駅前の再開発ビルのA棟が完成したものの空きビルとなっていたため、核店舗として1978年(昭和53年)5月に鯖江市長が平和堂の既存店舗の移転を打ち出したが、平和堂側が移転する意志が希薄だとして商調協で一旦拒絶されたが、空きビル状態が続くと鯖江市の金利支出は年1億円に上るとして審議を行うよう要求し続けたため、1980年(昭和55年)8月に平和堂の移転を認める答申が商調協で出されたが、平和堂が移転を拒絶して宙に浮く形となった。 平和堂の移転が実現しなかったため鯖江商工会議所と鯖江市、地元の商業者などで代替策の協議を進め、当店が1982年(昭和57年)4月に店舗面積約5,100mで出店したが、駐車場不足や約6万人という商圏人口の少なさなどが重なって僅か6年半ほどで撤退した。
京都三条店(京都市中京区新京極通三条下ル桜之町400松竹ビル、1964年(昭和39年)3月17日開店 - ?閉店) 店舗面積約2,277m。
四条店→Big-Off四条店(京都市下京区四条通柳馬場東人ル東立売町、1968年(昭和43年)4月24日開店 - 2001年(平成13年)11月30日閉店) 店舗面積約2,310m。 再建3年計画の一環として土地と建物を1994年(平成6年)7月に勧業不動産へ売却したが、その後も賃借に切替えて営業を継続した。 賃料引き下げ交渉を行って損益改善を目指したが所有者との協議が決裂したため閉店となった。売場面積約2,000mの小型店だった。
伏見店(京都市伏見区納屋町136-2、1968年(昭和43年)10月30日開店 - 2001年(平成13年)1月閉店) 店舗面積1,848m → 1,798m。
ラパークいわき店(いわき市中央台飯野、1996年(平成8年)3月28日開店) 直営部分は2009年(平成21年)3月1日から一時閉店し、3月27日にMEGAドン・キホーテラパークいわき店に業態転換 いわき市のいわきニュータウンにホームセンター・カスミや家電量販店のラオックス、生鮮食品専門店のダイナマート、酒類ディスカウントストアのジャパリカーなどの準核店舗を複数併設した同社初のパワーセンター型ショッピングセンターとして開業したコミュニティーパワーセンター・ラパークいわきの核店舗の総合スーパーとして開業した。
後に3階・4階をユザワヤに転換。ユザワヤは先行して2011年5月11日に閉店。この閉店で、長崎屋ブランドの店舗は神奈川県から完全に撤退した。 店舗のあった地区は「カミオ」や「ミオカ」が建設された地区と共に再開発をする構想が進められていたが、地権者の合意が成立しなかったことから3地区に分かれた形で再開発された。 店舗跡には2011年10月21日に4階にサカゼンが出店、翌週10月28日に3階にユザワヤが再出店した。1,2階部分は暫く閉鎖されていたが12月1日にしまむらが出店した。 店舗跡を含めた地区では、「上大岡C北地区市街地再開発準備組合」が2014年(平成26年)10月に約8,000mの土地に地下1階・地上32階建て延べ49,000mの商業施設と共同住宅が入る複合ビルを建設する構想を横浜市に提出した。
鎌倉店(鎌倉市御成町10-2、1958年(昭和33年)6月開店 - 1960年代後半に閉店) 売場面積38坪
茅ヶ崎駅前店(茅ヶ崎市、1953年(昭和28年)開店) 岩田孝八の弟・岩田喜八が開いた店で僅か2年ほどで売れ行き不振で不渡りを出して閉店となった。この店舗は同社の経営ではなかったが、同社へ信用不安が及ばぬように破綻後の決済は同社が行って処理することになった。
(初代)小田原店(小田原市緑町1-50、1962年(昭和37年)2月1日開店) 店舗面積300坪。