ヤマタヌキラン
本種に関する分子系統の研究から、本種がコタヌキラン C. doenitzii に最も近縁で、この2種で1つのクレードを構成することが明らかになった。しかしそれ以上に興味深いのは、本種の遺伝的多様性がこの姉妹種に比べて遙かに低かったことで、確認された16の配列において、本種の大部分の標本で完全な一致が示された。つまりこの範囲では本種の遺伝的多様性はほぼ無い、との結果である。本種は上記のような特殊な土壌環境に適応して種分化した過程でその遺伝的多様性を大きく減じたものと考えられる。
本種は頂小穂雄性で側小穂雌性、苞に鞘がなく、果胞に毛があり、柱頭は2裂、といった特徴から勝山(2015)はタヌキラン節 Sect. Podogynae としている。この節には国内に本種を含めて4種が知られるが、本種は果胞に柄がないこと、果胞の嘴がごく短いこと、および果胞の縁沿いに毛があるもののそれ以外はほぼ無毛である点で他の種と区別できる。もっとも上記のような本種の生育環境の状況から他種と混同することはあまり考えがたい。