ワリオランドアドバンス ヨーキのお宝
ピラミッドを乗っ取った悪霊で、本作のラストボス。体力は20。ショコラ姫のアクセサリーを全て持っている。
弱点は顔だが、扇や能面で防御している。最初は扇で顔を隠し、四つに分裂させた能面をぶつけてくる。能面に捕まるとタイムロスとなるので、踏みつけて扇にぶつけ返す。
扇を壊すと、四つのつうろのボスを模した四種の攻撃を、身につけているアクセサリーから順番に繰り出してくる。緑のトゲの生えた敵を落としたら、踏みつけてボールにしてぶつける。爆発する大きいボールを落としたら、アタックでぶつける。黒い爆発するタマゴを落としたら、地面に落ちる前に受けとり、爆発する前にぶつける。トゲの生えたトンカチを落としたら、トゲが消えるのを待ち、頭上に放り投げてボヨヨーンワリオとなり攻撃する。最初は順番が決まっているが、ライフが減ると、順番が崩れ、繰り出すスピードも上がる。
能面が壊れると不気味な白塗りの素顔となり、体当たり攻撃をしかけてくる。地面を壊してトゲ床にしてしまうので、素早く倒さないといけなくなる。地面に落ちた瞬間は振動で動けなくなるのでその前に飛び上がらないといけない。トゲ床が増えるとそれだけ不利になり、トゲ床が増えすぎると実質倒すことが不可能になる。トゲ床でダメージを受けると笑われる。
残りライフが1になると、唇だけになり逃げ回る。この際は床が全て崩れてトゲ床も無くなるため、ダメージを受けることはない。これに何らかの攻撃をすると完全に倒せる。
スイッチを踏むと絵画の世界が崩壊するカウントダウンが始まり、カウントダウンが0になると今度はコインが減り始め、ステージ全体が白黒になる。コインも0になるとタイムオーバーとなり、最後にそのステージで入手したアイテムも全て無くなり、ステージから追放されて最初からやり直しになる。
また、数分間操作せずに放置するとワリオがトレーニングや縄跳びをする。
しかし、ただクリアしただけでは先に進めず、次のステージに進むために必要な「カギのはし」、ボスへの扉を開くために必要な4つの「宝石のかけら」をステージ中で入手する必要がある。ゲームではコインを支払う事で遊べる3種類のミニゲームが存在し、ある一定の回数をクリアするごとにメダルを1つもらえる。 ボス戦では、直前にショップがありメダルを支払うことにより、購入したアイテムでダメージを与えることができる。
ボス戦では、制限時間内に倒すのが目的。ライフが無くなるか制限時間が0になるとミスとなり、ボスステージから追放されてやり直しになる。
今作はボーカル入りの曲があるなど音楽が非常に独特で、マリオシリーズに見られるような曲とは一線を画している。本作の音楽を担当した吉冨亮二は2003年発売の『メイド イン ワリオ』でも登板している。
遺跡に眠っていた古代の姫で、ピラミッドの本来の主。ヨーキにピラミッドを乗っ取られ、前述の黒猫に姿を変えられていた。エンディングで元の姿を取り戻し、ワリオにお礼のキスをした後、天使とともに昇天していった。
ワリオが最終的に獲得した宝箱の数によって姿が変化する。12個はショートカットの大人の女性、6 - 11個はロングヘアの少女、2 - 5個はワリオにそっくりな顔、0 - 1個は赤ちゃんの姿となる。公式イラストでは6 - 11個の姿をしている。
しばらくの間ダッシュ位の速度で走る。ジャンプ以外はできないが、変身中は敵の攻撃を受け付けない。壁にぶつかると向きが変わる。
3回壁にぶつかると火だるまになり、炎のブロックを破壊できる。一定時間経つと焦げて元に戻るが、水に入るだけでも戻れる。
ゾンビ(ゾンビワリオ)
スケルトンバードの出す息やフラワナの涎などで変身。動きは遅くブロック半分の高さまでジャンプできなくなるが、常に無敵状態で空中に浮くトゲに接触してもすり抜ける。
下からスルーできる床の場合はその床の上でジャンプするだけでくぐりぬけられる。水に入るか光に当たると元に戻る。
顔が膨らむ(バルーンワリオ)
ハッチの尻にある針やボウバルーンの矢などに触れると変身。方向キーで方向調整、Bボタンで加速。天井にぶつかると元に戻るが、決して無敵状態ではないのでトゲにあたるとダメージを受けてしまう。
なお、公式サイト内「ワリオ様の部屋」の質問コーナーでは、ハッチの針で顔が膨れる理由については、「ハチアレルギーなのだ」と語っている。
跳ねる(ボヨヨーンワリオ)
メンハンマーにより変身。バネのようになり、本作はタイミングよくジャンプすると天井にぶつかるまで上に跳んでいける。
さいしょのつうろ以外でのボスとの戦いで3個ずつ得られる。ただし制限時間が少なくなると宝箱は一つずつ消えていく。最終的に入手した宝箱の数によってエンディングが変わる。
黒い甲羅のハリメン。普通にヒップアタックをしてもひっくり返らずこちらに方向転換するだけで、高いところからのヒップアタックでないとひっくり返せない。
物を投げてもひっくり返るがハリメンとは異なり倒すことはできない。しかしハリメンと同様に下から頭突きしてもひっくり返すことができる。
シルバーコインを3枚も落とす敵で、全ての敵キャラの中で最も多い。ただしぶつかるとゴールドコインを落としてしまう。
水中の穴にいて、近づくと顔を出す。あたるとダメージを受ける。「なぞのちていこ」で登場。
「すごろくのくに」で双六の特定のマスに止まると出現する3体のサイコロ兵。ヤリを前に構える。倒してもアイテムは出さない。これを利用してダイヤモンドを取る場所がある。