亀の井バス
大分・別府 - 福岡「とよのくに号」(大分バス・大分交通・西日本鉄道と共同運行) 「とよのくに号」については、別府 - 福岡系統(ノンストップ便)を担当。同系統の西日本鉄道担当分も当社が管理を受託しており実質的に別府 - 福岡系統を一元的に当社が運行している。西鉄からの受託車両は営業所記号を「○亀」とし(当社所属車両には営業所記号・社番は無い)、他の高速バス車両と同様に本社(別府営業所)において「西日本鉄道自動車事業本部 別府第2営業所」として管理している。 2017年7月1日のダイヤ改正で別府発のみ鉄輪2で乗車扱いとなり、鉄輪口は通過となる。福岡発は変更なし。
湯布院 - 福岡「ゆふいん号」(西鉄高速バス・日田バスと共同運行)
17:別府駅 → 北浜 → 流川8丁目 → ビーコンプラザ → 明豊キャンパス → スギノイパレス → 霊泉寺 → 原 → 新別府口 → 鉄輪 羽室台高校発別府駅行は、羽室台高校閉校に伴い2017年4月1日のダイヤ改正で廃止となった。平日朝片道1便のみ運行
21:別府駅 - 北浜 - 餅ヶ浜 - 南石垣 - 中部中学校 - 鶴見原 - 九大別府病院 2012年3月17日廃止、28番に統合された。
別府医療センター - 亀川駅前 - 別府大学下 - 鶴高正門前 - 朝日橋 - 明豊キャンパス前(降車専用)/明豊下(乗車専用)
8:別府駅西口 → 総合体育館べっぷアリーナ → ビーコンプラザ → 明豊キャンパス前 → スギノイパレス 2016年3月26日のダイヤ改正でスギノイパレス発別府駅西口行が廃止され、平日朝片道1本のみ運行となった。
亀の井北浜ビル(別府北浜バスセンター) 西鉄イン別府などが入居。1階にはバスセンターを構える。旧本社ビル跡地。
マルショク餅ヶ浜店 旧亀の井パレスボウル跡の居抜き。長らく寿屋別府店として営業しており建て替え計画もあったが、寿屋の倒産に伴いマルショク餅ヶ浜店が入居している。
HIヒロセスーパーホームセンター別府店 旧若草整備工場跡地。
旧安心院バス停(安心院車庫)。2011年3月16日に路線が区間廃止したため、月極駐車場として再利用。