目賀田氏
綱清の孫と見られる貞政は永禄11年(1568年)に六角氏が没落すると、近江を支配した浅井長政に仕えた。天正元年(1573年)に浅井家が織田信長に滅ぼされた後は織田家に仕えて目賀田城を安堵された。しかし天正4年(1576年)に信長により目賀田城は接収され、代わりに愛知郡の愛知川、中宿、沓掛の3か村2万石を与えられた(この後目賀田山は安土山と改称され、安土城が建設されている)。
貞政はこの地の光明寺野(目加田)に新たな目賀田城を建設した。天正10年(1582年)の本能寺の変で織田信長は明智光秀に討たれ、さらに光秀も羽柴秀吉に討たれたが、貞政の孫堅政は、伯父池田伊代守が光秀の部下だった関係から連座して所領を没収され、丹羽長秀お預かりの身となり、後に摂津国に移り、有馬郡三田城主山崎家盛に身を寄せるようになった。
慶長5年(1600年)に山崎家が備中国成羽に転封となると堅政も成羽へ移住。堅政の嫡男守成は、備後国を経て紀伊国へ移住し、その子守政は「内藤幸右衛門」と称して紀州藩主徳川頼宣に250石で仕えるようになり、その子守咸は目賀田に復姓し、正徳5年(1715年)に紀州藩主徳川吉宗が将軍家に養子に入った際に江戸に随従して幕臣となり、はじめ300石、後に300石を加増されて都合600石の旗本となった。
幕末時の当主幸助守文の所領は武蔵国埼玉郡台村、今泉村、下手子林村、下三田ヶ谷村、上野国邑楽郡石打村、野辺村の6カ村691石であった。この守文の長男が目賀田種太郎守正(明治以降、通称の種太郎の方を名前にして戸籍登録したので守正の諱はなくなる)である。種太郎は、文久元年(1861年)の父の死で10歳にして家督相続して旗本となった。