男女群島
その後、1928年(昭和3年)1月1日より大浜村の所属となる。
1925年(大正14年)には女島灯台の建設が開始され、1927年(昭和2年)に竣工、初点灯している。その後、女島の高崎山に日本海軍のレーダー基地が建設された。
1945年(昭和20年)6月8日に、戦火が迫り空襲が相次いでいたため、民間人引き上げ命令が出されて全島民、女島灯台職員および職員家族全員が退去した。11月5日、進駐軍が女島灯台施設を爆破。
1948年(昭和23年)3月1日に、女島灯台の戦災復旧にあわせて灯台職員および島民らが帰島した。
1957年(昭和32年)には、木下恵介監督の映画作品『喜びも悲しみも幾歳月』(1957年)の舞台の一つとなり、主に女島でロケーション撮影された。
1969年(昭和44年)8月18日に、国指定の天然記念物(天然保護区域)に指定される。総合学術調査の際、男島の林の中で中世の石垣群が発見されている。
近年は、近隣諸国からの密入国や密輸、密漁や不審船の監視のために海上保安庁の巡視船が近海をパトロールしている。
2006年11月から無人島になったが、日本でも屈指の磯釣り、ダイビングスポットになっており、全国からの観光客で賑わいをみせている。