ネムロコウホネ
絶滅危惧II類 (VU)(環境省レッドリスト)
日本では生育環境の減少などによって少なくなり、基変種である狭義のネムロコウホネ (Nuphar pumila var. pumila) および変種のオゼコウホネ (Nuphar pumila var. ozeense) はいずれも絶滅危惧II類に指定されている (2022年現在)。また下記のように、個々の都道府県でも絶滅危惧種に指定されている。以下は2022年現在の各都道府県におけるレッドデータブックの統一カテゴリ名での危急度を示している。
ネムロコウホネ
絶滅危惧I類: 青森県、秋田県
絶滅危惧II類: 北海道、福島県
情報不足: 宮城県
オゼコウホネ
絶滅危惧I類: 秋田県、山形県
絶滅危惧II類: 福島県、群馬県
準絶滅危惧種: 北海道