チチカカ湖
魚類 チチカカ湖では、カダヤシ目キプリノドン科オレスティアス属のカラチ(スペイン語版)(Orestias agassissi Valenciennes,1846 など)やイスピ(スペイン語版)(O. pentlandii Valenciennes,1846 や O. ispi Lauzanne,1981 など)といった在来固有種の魚が捕獲でき、現在でも唐揚げなどにして食用にされている。このカラチと思われる図像が、ティワナク遺跡の出土遺物に描かれている。 また、南米に広く棲息する、ヒルナマズ科(英語版)(いわゆるカンディル類を含む科)の一種で、 現地でマウリと呼ばれるナマズ(Trichomycterus dispar(Tschudi,1846))がいる。チチカカ湖には、このヒルナマズ科のうちT. rivulatusおよびT. disparの2種が棲息していると言われている。マウリも食用にされ、ティワナク遺跡にある彫刻の中にも描かれている。
両生類 チチカカミズガエル(英語版)などの大型の水棲のカエルが生息し、他にヒキガエル属、フクロアマガエル属(英語版)、ヨツメガエル属(英語版)なども生息する。一部の種は周辺の地域では足などを唐揚げにして食べる。また、チチカカミズガエルの仲間などは、アイマラやケチュアの生殖儀礼などに用いられている。
爬虫類 全長40-50cmほどのヘビ、Tachymenis peruvianaも棲息している。