新宿区立牛込第三中学校
男子 - 黒の詰襟学生服、白のワイシャツ。学生服は金ボタン5個。
女子 - 紺色のセーラー服。スカートは紺色のプリーツスカート。夏冬とも襟に白の3本線が入り、胸当てに校章の刺繍が入る。夏服は身頃が白になる。夏服の袖カフスはない。
近隣の牛込第一中学校、牛込第二中学校も同様にセーラー服であるが、牛込一中・二中のセーラー服は紺色のスカーフであるのに対し、牛込三中では夏冬とも紺のタイになる。いずれも新宿区内の同じ制服業者が製造販売している。