チョルーラ
大ピラミッドの第4段階の拡張が中断されたように見えること、祭壇の中庭の多数の石碑が倒されたり破壊されたりしていることは、トルテカ=チチメカ人の侵入を反映していると考えられる。
1200年以後は祭祀の中心地は大ピラミッドの北西にある今のサン・ペドロ・チョルラのソカロ(中央広場)へ移動し、新たなケツァルコアトルのピラミッドが造られた。この時期にも引きつづきチョルーラは繁栄し、面積は10平方キロメートル、人口は3万人から5万人に増加したと推定される。チョルーラはアステカから独立しており、花戦争でしばしばトラスカラやウェショツィンゴと同盟してアステカと戦った。
この時期のチョルーラはケツァルコアトル信仰の巡礼地となり、スペイン人の年代記作家はチョルーラをローマやメッカと比較している。エルナン・コルテスらのスペイン人は同盟していたトラスカラ人に連れられてチョルーラを訪れたが、集まった町の貴族たちを虐殺し、ケツァルコアトルのピラミッドを破壊した。大ピラミッドは当時すでに半ば放棄されて人工の山のようになっており、スペイン人はその上に教会 (Iglesia de Nuestra Señora de los Remedios, Cholula) を建設した。しかしチョルーラは神聖な都市であり続け、スペイン人はこの地のキリスト教化に意を用いた。
後古典期からスペイン人による植民地支配の時代にかけて、チョルーラには多数の民族誌学的な記録が残っている。
チョルーラは形成期初期以来の集落が確認される。遅くとも紀元前1000年ごろには湖の岸に集落があった。確認される最古の祭祀センターは形成期後期のものである。初期の大ピラミッドの建設も形成期終末期にはじまったと考えられている。古典期になると何度も大ピラミッドは拡張または再建され、また他にも多数のピラミッドが建設された。
700年ごろにテオティワカンが崩壊すると中央メキシコでは権力の空白が生じ、マヤ人を含むさまざまな民族の移動が起きた。近くのカカシュトラの壁画は、メキシコ湾岸南部の勢力との婚姻による同盟関係を示す。チョルーラはこのような民族移動の中心地であったかもしれず、実際にマヤ文明式の頭蓋変形や翡翠による歯の装飾を持つ墓葬が発見されていることは、この時期のチョルーラにマヤ貴族が住んでいた可能性を示す。
伝承の上ではメキシコ湾岸からオルメカ=シカランカ人がやってきてそれまでの住民を征服したとされるが、遺物の上では断絶があった証拠は見出されておらず、もっとゆるやかな変化を示す。祭壇の中庭の壁画にはこの時期に羽毛を持つ蛇の彩色された壁画が見られるようになる。この時期にも再びテオティワカン風のタルー・タブレロ様式が使われたが、それに加えてオアハカ・メキシコ湾岸・マヤ地域の要素もあり、国際的な様相を帯びる。
『トルテカ・チチメカ史』によれば1200年ごろにトルテカ=チチメカ人がチョルーラのオルメカ=シカランカ人を征服したとされ、後古典期のチョルーラの歴史はそれ以前(西暦700-1200年)と以後に二分される。