浅島誠
日本動物学会賞1990年度(「両生類の胚誘導と細胞分化に関する研究」)
井上学術賞 1990年度(「両生類の胚誘導と細胞分化に関する基礎的研究」)
Man of the Year 1991 (USA. ABI)
木原記念財団学術賞1994年度(「両生類の胚誘導と細胞分化に関する研究」)
ジーボルト賞(ドイツ政府)
東レ科学技術賞 1998年度(「試験管内での幼生の形づくりと臓器形成の制御」)
持田記念学術賞 1999年度(「試験管内での臓器形成の基礎研究とその応用」)
内藤記念科学振興賞 1999年度(「試験管内での臓器形成と遺伝子発現の制御の基礎的研究」)
有馬啓バイオインダストリー協会賞 2000年度(「アクチビンの発見と細胞分化および臓器形成における基礎的研究」)
上原賞 2000年度(脊椎動物の臓器形成と形づくりの基礎的研究に対し)
恩賜賞・日本学士院賞 2001年(「初期発生における形態形成の基礎的研究」)
紫綬褒章 2001年
比較腫瘍学常陸宮賞 2002年
日本宇宙生物科学会功績賞 2007年
エルビン・シュタイン賞 2008年
文化功労者 2008年度
日本再生医療学会功績賞 2013年
リトアニア共和国大統領勲章 2017年
リトアニア科学アカデミー外国人会員 2017年(「発生生物学の発展とリトアニアとの学術への貢献」)
瑞宝重光章 2017年