長崎県立諫早高等学校・附属中学校
中心から3方向(上、左斜め下、右斜め下)に柏の葉が広がり、それぞれの葉にひらがなの「い」を重ね、3枚それぞれの葉が重なる部分をやじり(3カ所)がつなぎ、真ん中に「高」(俗字体のはしご高)の文字を置き、全体で「諫早高等学校」 を表している。なお、柏の校章の由来は旧制第一高等学校の校章を借用し、その生徒の様に知的であってほしいという願いがこめられていると言われている。
中学校の校章は上記の校章の中の「高」を「附中」(縦書き)に置き換えたものとなっている。
「文武両道」
4月1日 全日制、理数科を2学級新設(募集定員80名)、普通科を7学級とする(募集定員280名)。 文部科学省より、スーパーサイエンスハイスクール (SSH) に指定(期間は2005年(平成17年)度末までの3年間)。
2004年(平成16年) 2月26日 - 御書院を一般開放。 4月1日 全日制、募集定員を320名とする(普通科6学級、理数科2学級)。 長崎県立鳴滝高等学校の協力により、本来卒業には4年かかる定時制が、定通併修 制度を利用することで3年での卒業が可能となった。
2006年(平成18年)4月1日 - 文部科学省より、再度スーパーサイエンスハイスクールに指定(期間は2007年(平成19年)度末までの2年間)。
2007年(平成19年)3月31日 - 高来分校が閉校、31年の歴史に幕を下ろす。
2009年(平成21年) 3月19日 - 旧制諫早中学校出身者でノーベル化学賞受賞の下村脩博士が来校。 4月1日 - 長崎県立中学校開設準備室を設置。 10月3日 - 第33回全国育樹祭(皇太子徳仁親王臨席)が雲仙市国見町の百花台公園にて行われ、諫早高校1年生がメインアトラクションとして「のんのこ踊り」を披露。
2010年(平成22年) 4月6日 旧制諫早中学校出身者でノーベル化学賞受賞の下村脩博士の銅像を正門前に建立。 下村夫妻を招待し、銅像除幕式を挙行。