シクロチド
環状であり、3つものジスルフィド結合を持つことから、その三次構造は非常に安定である。表1に、幾つかのシクロチドのアミノ酸配列を示す。
シクロチドは次の3つの亜群に分けられる。
Bracelet cyclotides - 最も一般的な亜群。
Moebius cyclotides - Loop 5の部分に cis-プロリンを含む。これにより鎖が180°捩れ、メビウスの輪のような構造となっている。
Trypsin inhibitors - knottins として知られる非環状トリプシンインヒビターに類似した配列を持つ。
すべてのシクロチドは6個のシステイン残基を持つため、これを起点としてアミノ酸配列を6つに切り分けることができる。これらは Loop 1-6 と表現される。また、配列にはシステインの存在以外にもいくつかの共通点がある 。
Loop 1は最もよく保存されている部分であり、Bracelet・Moebius 両亜群共にグリシン/アラニン、グルタミン酸、セリン/トレオニンの順に残基が並ぶ。