ローマ字
日本の地方公共団体はその名称のローマ字表記にヘボン式に準じた表記が用いられているが、多く場合、長音符号は省略されている。また、旧ヘボン式と修正ヘボン式が混在しており混乱が見られる。
特に旧ヘボン式のmとnの区別は日本に於いては実用性に乏しい。海外でも国名のデンマーク(Danmark) やミャンマー(Myanmar) 、スコットランドの首都エディンバラ(Edinburgh)やオーストラリアの首都キャンベラ(Canberra)などが正式な英名表記として採用されているように、ことさらm, nの区別が普遍的とも言えない。
群馬県においては、県としての正式な表記は修正ヘボン式(訓令式)の「Gunma」であるが、日本国旅券には旧ヘボン式の「Gumma」が用いられる。群馬県のウェブサイトには、この件についての説明が記載されている。
市区町村では二本松市(Nihonmatsu)、紋別市(Monbetsu)などで修正ヘボン式が、丹波市(Tamba)、仙北市(Semboku)などでは旧ヘボン式が用いられている。
英国においてはアメリカ地名委員会およびイギリス地名常置委員会の1976年合意に基づく修正ヘボン式 が日本語仮名のローマ字表記法(Romanization System For Japanese Kana)として、2015年の改訂を経て今日まで用いられている。
米国においては1975年、様々な非ラテン文字言語のローマ字表記法を規定したアメリカ図書館協会およびアメリカ議会図書館のローマ字表記法において、日本語の場合のローマ字表記法が定められており、2012年の改訂を経て現在も用いられている。
その他には米国国家規格協会のANSI Z39.11-1972 規格が存在したものの、訓令式に基づくISO 3602の登場を受け、1994年に廃止された。
いずれも内容は修正ヘボン式と同一である。