千鳥ケ淵戦没者墓苑
六角堂の中央部の地下には、主な戦域ごとに「本土周辺」、「満州」、「中国」、「フィリピン」、「東南アジア」、「太平洋・ソ連」の6部屋に分けた納骨室が設けられている。その中には、遺族に引き渡すことができなかった第二次世界大戦の戦没者の遺骨が、鋳鉄製の納骨壺に納められ安置されている。納骨壺については、工業技術院の産業工芸試験所が意匠を手掛け、老子製作所が製造を手掛けた。
2013年5月の時点で、35万8260柱の遺骨が安置されている。遺骨の収集は今なお継続されており、のちに納骨室の収容能力に限界が生じることとなった。そのため、1991年と2000年に、六角堂の奥正面に納骨室が新たに増設されることとなった。それ以降、遺骨は増設された納骨室の方に納められることとなった。ただ、増設納骨室の地上部には、六角堂のような施設や設備は特に設けられていなかったが、増設納骨室の直上にビニールシートを敷いて花見に興ずるなどの暴挙に及ぶ者が現れたため、国会でも施設改善が主張された。