松本藩
堀田正盛の後は三河吉田藩より水野忠清が7万石で入封した。忠清は大坂の陣で先陣争いをして戦功を立てた古強者であったが、松本に在任してから5年後の正保4年(1647年)5月に死去している。なお、忠清は徳川家康の従弟に当たる。
第2代は息子の忠職が継ぎ、慶安検地を実施して財政基盤を確立し、この検地は明治時代の地租改正までの土地の基本台帳となった。この検地高は11万2000石余りになったが評判が悪く、検地のやり直しや検地が終了しない内から再検地の要請が相次ぐなど混乱し、場合によっては永引地として減税になるなど混乱が相次いでいた。また忠職は年貢納入制度を定め、稲の品種改革や川除普請、百姓訴訟法の制定など、民政の確立に勤めた。しかし寛文6年(1666年)から4年をかけて飢饉が起こり(寛永の飢饉)、忠職は酒造の制限や酒売買の禁止、雑穀売りの制限から7か条の倹約令、奢侈禁止令を出すなどして対応した。ただし一方では代官など支配する側の不正を許さず法令化して厳しく取り締まった。こうして松本藩政は忠職の下で確立した。また忠職の弟忠増に5000石が分知され旗本に列し、後に幕府から加増をうけて忠増の子忠位が1万2000石の大名となる。その子忠定は笹部に陣屋を置き信濃1万石、丹波2000石を領したが、北条藩に転封となる。
旗本水野忠増領が成立 - 筑摩郡5村、安曇郡6村(5000石)