ウ科
旧ペリカン目は本科が半数以上を占めていた。英名cormorant は、corvus marinus(「海のカラス」の意)およびそこから転じた初期フランス語cor marinに由来する。
ただしヘビウ科・カツオドリ科・グンカンドリ科とともにウ目 Phalacrocoraciformes に分離する説もある。
姉妹群はヘビウ科であり、カツオドリ科を加えた3科をカツオドリ亜目に分類する説もある。
Sibley分類では、コウノトリ目コウノトリ下目カツオドリ小目(カツオドリ亜目に相当)ウ上科 Phalacrocoracoideaの唯一の科であり、カツオドリ上科(カツオドリ科+ヘビウ科)の姉妹群と考えられていた。
2016年現在IOC World Bird ListではPhalacrocorax、Leucocarbo、Microcarboの3属に分割している。一方で2015年現在Clements Checklistsでは本科はウ属Phalacrocoraxのみで構成される。
しかし、ウ科内部の系統に未解明な箇所が多いことから、すべてを1属ウ属 Phalacrocorax にまとめるべきだとする説もある。
Microcarbo はおそらく、ウ科の中で最初に分岐した単系統である。しかし Phalacrocorax は Leucocarbo を内包する側系統であり、Phalacrocorax に Leucocarbo を統合する説もある。