肥後国
小野貞樹(860年(貞観2年)1月16日 - )従五位上
藤原真数(860年(貞観2年)11月27日 - 864年(貞観6年))従五位上
紀夏井(865年(貞観7年)1月27日 - 866年(貞観8年)9月22日)従五位上
在原安貞(866年(貞観8年)11月29日 - )従五位上
(権守)藤原山蔭(879年(元慶3年)8月17日 - 880年(元慶4年)1月)従四位上
藤原房雄(880年(元慶4年)5月13日 - )従五位上
源直(881年(元慶5年)2月15日 - 882年(元慶6年)2月15日)正四位下
藤原時長(885年(仁和元年)1月16日 - )従五位上
(権守)藤原有実(885年(仁和元年)2月20日 - 886年(仁和2年)1月16日)正四位下
(権守)藤原門宗(886年(仁和2年)1月16日 - )従四位上
藤原是行(886年(仁和2年)6月19日 - )従五位上
(権守)平惟範(893年(寛平5年)3月15日 - )従四位下
多治是則(909年(延喜9年)1月 - )
藤原行直(926年(延長4年)頃)
藤原時佐(943年(天慶6年)3月7日 - )
(権守)藤原佐忠(946年(天暦元年)頃)
清原元輔(986年(寛和2年) - 990年(正暦元年)6月)従五位上
源為親(990年(正暦元年)8月30日 - )
藤原保昌(1005年(寛弘2年))
大江忠孝(1010年(寛弘7年)頃)
藤原致光(1023年(治安3年) - 1027年(万寿4年)頃)正五位下
高階成章(1028年(長元元年) - )
藤原定任(長元・長暦頃?)
高階章行(1053年(永承3年)頃)
藤原義綱(延久頃)
源時綱(承暦頃)
中原師平(1091年(寛治5年))
藤原盛房(1092年(寛治6年) - )従五位下
高階基実(1097年(承徳元年) - )
藤原為宣(1102年(康和4年) - 1106年(嘉承元年))
藤原忠兼(永久頃)従五位下
高階清泰
藤原公章(1127年(大治2年))
高階泰重(1128年(大治3年))
平清盛(1137年(保延3年) - )従四位上
清原信俊(1142年(康治元年))正五位下
源国能(俊国)(1144年(天養元年) - 1154年(久寿元年))
平貞能
源頼成
源頼房
南朝国司(肥後守) 菊池武重 菊池武士 菊池武光 菊池武政 菊池武朝(南北朝統一後は肥後守護代)
893年 - : 寛平の韓寇
1581年 : 響野原の戦い
1584年 : 阿蘇合戦
1587年 : 肥後国人一揆
1637年 - 1638年 : 島原・天草の乱