モスラ2 海底の大決戦
クライマックスのミクロ化したモスラがダガーラの体内に入る展開は脚本にはなく、特技監督の川北紘一が前作との差別化のために撮影中に発案した。この描写は『ゴジラvsキングギドラ』の次作として企画されていた『ミクロスーパーバトル ゴジラvsギガモス』や『マイクロユニバース イン ゴジラ』および『ゴジラvsメカゴジラ』の準備案『ゴジラvsメカゴジラ メタリック・バトル』などで検討されていた怪獣の体内での戦いを実現させたものである。『ゴジラvsギガモス』でゴジラの体内に存在するという設定のG抗体は、イメージイラストでは本作品のベーレムを彷彿とさせるデザインであった。ミクロモスラとベーレムはCGで表現された。
8月14日から26日にかけては、第9ステージで擬似海底などの撮影が行われた。海底のセットでは、実際の沖縄の海を意識して背景や照明は緑色となっている。26日に特撮班はクランクアップした。
ニライカナイのピラミッドがダガーラとともに消滅するシーンで、脚本および絵コンテでは「ニライカナイへ!」のユナ王女の言葉とともにその意思で消滅したとように描写しているが、書籍の解説ではモスラの技で水に替えられて消滅したことになっている。川北は、モスラが水のピラミッドを打ち破るという意図であったが、あまり伝わらなかった旨を語っている。