フアン・デ・カルタヘナ
憤慨したカルタヘナは以後、日没時の挨拶を代理人にやらせるようになり、やがては誰も出さなくなった。
マゼランはこの機に誰が艦隊の支配者であるか判然と示すことにした。しばらくして、トリニダード号に全艦長を集めた。ようやく協議に応じたのかと集まった艦長たちの前で、カルタヘナは即座に逮捕された。虚を突かれたスペイン人船長たちは困惑し、メンドーサが貴族に連なるカルタヘナを鎖で捕縛するのは勘弁してほしい、せめて自らの艦に監禁することで許してほしいと嘆願するのが精一杯だった。カルタヘナは船長を解任され、パタゴニアのサン・フリアン湾(英語版)に到着するまで虜囚の身であった。
1520年4月1日、サン・フリアン湾での冬越しによって士気が大きく低下していた艦隊において、いよいよメンドーサ、ケサーダ、そしてカルタヘナの後任艦長を解任されたコカはマゼランに対抗するべくスペイン人船員たちから同志を募り、40人ほどが呼応した。その中にはフアン・セバスティアン・エルカーノも含まれていた。彼らは手始めに、コカの手引でサン・アントニオ号を急襲。船長でマゼランの従兄弟であるアルバロ・デ・メスキータ(スペイン語版)を拘束し、抵抗した副長のフアン・デ・エロリアーガを殺してサン・アントニオ号を手中にする。こうして優位に立ったカルタヘナ一味は艦隊が自分たちの指揮下に入った旨の通告を旗艦にいるマゼランに送った。