チザルピーノ
バーゼル - ベルン - ミラノ - ヴェネツィア - トリエステ(CIS57/52、1往復/日)
<ゴッタルド峠系統>
チューリヒ - ルガーノ - ミラノ - フィレンツェ(CIS13/24、1往復/日)
チューリヒ - ルガーノ - ミラノ(CIS15/19/23/14/18/22、3往復/日)
ルガーノ - ミラノ(CIS17/21/25/151/12/16/20/158、4往復/日)
上記の列車は、振り子式電車によるものであるが、チザルピーノ社はこれらとは別にスイスとイタリアを結ぶインターシティ(IC)・ユーロシティ(EC)の運営も行っていた。こちらは電車ではなく、電気機関車(スイス連邦鉄道の貨物部門であるSBBカーゴのRe484形を借用)+客車の編成であった。特に2005年12月以降は、シンプロン峠またはゴッタルド峠を越える全ての国際昼行列車(即ち、全てのCIS・EC列車)が、チザルピーノ社によって運営されていた。
2009年夏ダイヤ(2009年6月14日~12月12日)における、客車列車の運転系統は以下の通り。種別名は全て"EC"(ユーロシティ)。
<シンプロン峠系統>
ジュネーブ - ミラノ(EC125/127/129/120/122/124、3往復/日)
<ゴッタルド峠系統>
ベッリンツォーナ - ルガーノ - ミラノ(EC131/171/175/132/172/174/178、3往復/日、EC174は平日運転、EC178は土日曜運転、EC131はビアスカ発)