瀬戸内海区水産研究所
旧・内海区水産研究所を広島庁舎、旧・南海区水産研究所を高知庁舎とした。
1970年: 広島庁舎を現在地に移転(現・廿日市庁舎)。
1979年: 社団法人瀬戸内海栽培漁業協会が社団法人日本栽培漁業協会に改組。
1987年: 高知庁舎を移転。
1998年: 広島庁舎を改組して瀬戸内海区水産研究所とし、高知庁舎は中央水産研究所へ移管した。
2001年: 独立行政法人化により水産総合研究センター瀬戸内海区水産研究所となる。
2003年: 日本栽培漁業協会の水産総合研究センターへの統合により、伯方島・百島・屋島・玉野事業場は伯方島・百島・屋島・玉野栽培漁業センターと改称。
2006年: 伯方島・百島栽培漁業センターを統合。
2011年: 屋島・玉野栽培漁業センターを統合。
2015年: 玉野庁舎を廃止。
2016年: 独立行政法人水産総合研究センターが水産大学校を統合し、国立研究開発法人水産研究・教育機構となる。
2020年:水研機構の体制改革により、水産技術研究所の一拠点となる。