長岡線
中央インター前停留所を新設(新潟行の降車停留所は当初、現高美町停留所に設置されていたが、その後上沼交差点付近へ移設)。
1999年4月1日 - 栃尾・見附線廃止。
2005年10月1日 - ビジネス特急(高速道内ノンストップ便)廃止。
2008年6月1日 - 運賃改定を実施。
2009年4月1日 - 新潟交通の路線バス・空港線に「エアポートリムジン」(新潟駅南口 - 新潟空港間)が新設されたのに伴い、新潟駅前 - 新潟空港間の運行を休止。北長岡車庫前停留所を「チャレンジャー北長岡店前」に改称。
2010年4月1日 - ダイヤ改正。平日4往復、土曜・休日5往復を減便。
2010年12月6日 - 社会実験の一環で、新潟駅前21時45分発・長生橋経由を1本増発(平日のみ運行)。実験は「深夜便増発」として実施されたが運賃の割増等は無く、通常運賃で乗車可能であった。
2011年4月1日 - ダイヤ改正。前掲の新潟駅前21時45分発・長生橋経由1本を定期運行化(引き続き平日のみ運行)。
2012年3月25日 - ダイヤ改正。新潟県の社会実験に伴い、長生橋経由1日2往復を新潟空港へ延長運行。
2013年4月1日 - ダイヤ改正。社会実験終了に伴い、新潟空港への延長運行を終了。
2015年3月14日 - ダイヤ改正。