JR支社境
鹿児島本線
荒尾駅 - 大牟田駅(本社直轄エリア内) : 福岡県と熊本県の県境付近を支社境としている。
肥薩線
真幸駅 - 吉松駅(鹿児島支社管内) : 宮崎県と鹿児島県の県境付近を支社境としている。
豊肥本線
滝水駅 - 豊後荻駅(大分支社管内)
東海道本線
米原駅 - 近江長岡駅(東海支社管内)
えちごトキめき鉄道日本海ひすいライン
糸魚川駅 - 直江津駅(関東支社管内)
山陽本線
下関駅 - 北九州貨物ターミナル駅(九州支社管内)
ここでいう「本社直轄」は、本社鉄道事業本部の直轄であることを表している。
海峡線
木古内駅 - 中小国駅(東北支社管内)