ジェイアールバス関東
夢街道会津号では、会津バスの一般路線バスや会津タクシーとの乗継割引を実施。
しみずライナー、新宿・静岡号では、静鉄タクシーとの乗継割引を実施。
那須・塩原号、房総なのはな号では、JRバス関東の一般路線バスとの乗継割引を実施。
中央高速バス諏訪岡谷線では、京王電鉄バス・京王バスの一般路線バスとの乗継割引を実施。
みと号、ひたち号の上り便では、八潮PAにてつくばエクスプレスに乗り継ぐ際、乗継運賃100円大人こども同額(八潮駅~秋葉原駅までの各駅間)の乗継券が購入可能。
東京駅⇔名古屋地区を運行する夜行高速バス(全区間対象)では、よく使う路線をお気に入り路線に登録すると、それだけで割引が適用になる「会員限定割引」を実施。
東京・新宿⇔京阪神系統では、高速バスネットにて、ご利用回数やご利用金額に応じて更に割引が受けられるポイント制度もあり、使えば使うほど割引率が高くなる「利用回数割引」を実施。
その他、高速バスを利用すると、乗り場周辺の飲食店やマッサージ、サウナ等が割引となるサービス利用券の配布などの各種サービスも実施されている。
最新の安全装置を搭載した新型車両の導入を積極的に進めており、2022年3月現在、高速線車両の平均車齢は6.9年となっている。また、従来型車両にも安全装置を新たに備え、高速線車両の全車に安全装置を装備している。
会社発足直後に高速バス路線の増強が行われたため、続々と新車が投入され、その中でも三菱ふそう製はまとまった台数で購入され、同社製の比率が高くなった。特に夜行高速バスへの参入が多かった1988年(昭和63年)から1990年(平成2年)までの期間には、三菱ふそう・エアロクィーンMだけで41台が導入されている。1999年には西日本車体工業製車体を架装した日産ディーゼル(現・UDトラックス)製の夜行高速バス車両を導入し、2000年から2005年まで昼行高速バス車両でも同社製が導入された(夜行高速バス車両は2006年まで導入)。開設当初のスーパーニュードリーム号や青春ドリーム号、初期の楽座シート搭載車でも同メーカー製が選択された。S型ボディやC型ボディの車両を購入した支店もありバリエーションが豊富であった。
1997年から2004年までは車両調達価格の低廉化にも力を入れ、車内設備も簡略化されていた。常磐道や東関東道の近距離路線を中心に低馬力仕様のハイデッカー、ミドルデッカーも多く導入された。他のJRバスとの同一仕様車両による共同発注も実施している。また、貸切車に便所を追設の上、昼行高速車に転用した車両も存在した。
その一方で、定員が多く、乗客1人あたりのコスト低減を図ることができるダブルデッカーを導入している。
2017年3月末限りでJR東日本の駅窓口(白河・新白河・磐城棚倉・成田・佐原・土浦・軽井沢)での定期券委託発売を終了。
それと前後してスマートフォンアプリ「バスもり!コンシェルジュ」(現バスもり!)による「スマホ定期券」を日本で初めて導入した。スマホ定期券は千葉県館山地区、長野県長久保地区では未導入。Suicaなどの交通系ICカードの仕組みを使わず、従来の紙製定期券と同様の乗車方法をとる。
また、自社の二階建てバスや引退する車両などを使用したバスファン向けの参加者募集型ツアーも多く催行されている。
この他に駐車場・駐輪場やコインランドリー、物販、飲食など各種の関連事業も行っている。
子会社のジェイアールバステックは、当社支店での車両整備や清掃業務の他、自社運行や当社からの委託による高速バスの運行も行っているが、もともとは駅での窓口業務受託、バスターミナル業務、清掃業務などの関連事業を行っていた日本交通観光社を系列化したもので、2000年に社名変更した。
2013年6月に「安全研修センター」を栃木県佐野市に設立し、高速バス対応「訓練専用車」も導入し 安全教育の充実化を図っている。
2018年には長野県伊那市や福島県棚倉町で行われたバスの自動運転技術の実用化に向けた実証実験に協力している。佐野市や那須塩原市、伊那市、小諸市、新城市との間で公共交通や観光振興、定住促進などに関する包括連携協定を締結しており、コンパクトシティを志向し地域の活性化を目指す各市町村とともに、公共交通の活性化に積極的に取り組んでいる。
2018年7月の豪雨災害では、被災したJR西日本の広島地区の山陽本線や呉線のバス代行輸送に車両、乗務員を派遣した(9月10日から12月下旬まで)。また、中国ジェイアールバスの運行する夜行高速バス「ニューブリーズ号」(東京-広島線)を2018年8月2日から11月30日まで代替運行した(運行車両は同社から借用)。令和元年東日本台風(台風19号)の豪雨災害では、被災したJR東日本両毛線、八高線、吾妻線の鉄道代行バスに車両、乗務員を派遣するなどJR東日本の鉄道代行輸送に動員されることも多い。 2021年8月13日の大雨ではJR東海・飯田線の辰野~宮木間の横川橋梁が損傷したため、8月23日より岡谷~伊那新町間でバス代行輸送を実施する。
成田空港支店の新型エルガの1台がユーグレナ社のバイオディーゼル燃料「サステオ」を使用して運行されている。
宇都宮支店のノンステップバス L537-03503
西那須野支店のノンステップバス L324-01504
東急バスから移籍したノンステップバス L537-97505
JR東海バスから移籍した土浦支店のハイブリッドノンステップバス L527-04506
復刻デザイン路線バス(東急バスから移籍したノンステップバス。画像は白河支店での運行時) L538-02503
過去の車両
長野原支店の「イエローバス」 641-7901→S671-87401
西那須野支店の「もみじバス」 M531-96411
棚倉支店(現:白河支店)の「だるまバス」(現在は一般色に変更) M527-94302
館山支店の一般路線車 M534-93301
一部支店では9m級大型車(4型)も継続して導入された(画像は八日市場支店所属車両) M427-93612
当時まだ関東では珍しかった西工車体製のワンステップバス 328-9902→L328-89602
国鉄バスからの引継ぎ車両(現在は廃車) 531-6451→M531-86251
長野原支店の高速バス格下げ車 H654-93403
国鉄復刻塗装車(中央道支店所属車両) L538-99206
JRバス関東では、営業エリア内に17の支店を有する。このうち、東京駅JR高速バス乗り場に併設されている東京営業支店と新城支店を除く各支店は車庫機能を有し、車両が配置されているほか、分車庫・出張所にあたる「営業所」を有する支店もある。
東京支店※
新城支店(旧三ヶ日宿泊所→東京支店三ヶ日営業所→東名三ヶ日支店)※
白河支店(旧棚倉支店白河車庫→東北道統括支店)
西那須野支店※ 塩原温泉駅(旧西那須野支店塩原営業所、那須塩原市が所有)
宇都宮支店※
佐野支店※ 佐野新都市バスターミナル(佐野支店に隣接、佐野市が所有) 古河営業所(旧土浦支店古河営業所→古河支店→古河駅前案内所) 大綱車庫(旧古河営業所大綱詰所→古河支店大綱営業所→古河支店)
いわき支店(旧常磐支店いわき基地→いわき営業所→いわき高速支店)
水戸支店※ JRバス水戸駅(水戸駅南口)
土浦支店※ 江戸崎車庫(旧江戸崎営業所) 江戸崎駅(稲敷市が所有)
成田空港支店※(旧八日市場支店→東関東支店) 多古台バスターミナル(成田空港支店に隣接、多古町が所有)
鹿嶋支店※
館山支店 安房白浜駅(旧館山支店安房白浜営業所、現在は南房総市が所有)※2023年9月25日をもって窓口営業を終了
長野原支店※ 草津温泉駅(草津バスターミナル株式会社が所有)
小諸支店 長久保営業所
伊那支店(旧伊那支店→中央道統括支店→中央道支店) 高遠駅(バス窓口の営業は終了)
諏訪支店
東京営業支店(JRバス東京駅)
新宿営業センター(新宿駅新南口)閉鎖 <バスタ新宿開業前のターミナル>
上野営業センター(上野駅入谷口)閉鎖 <貸切バスの営業拠点だった>
大宮営業センター(大宮駅西口)閉鎖 <ONライナー発着場の管理、発券を行っていた>
※=Suicaと相互利用カード(PASMO・Kitaca・TOICA・manaca・ICOCA・PiTaPa・SUGOCA・nimoca・はやかけん)が使える路線がある支店
最近では、その整備・施工のノウハウを土浦支店とも共有し、同支店でも中古購入車両の自社仕様への変更なども施工できるようになっている。
主な収益は高速バス事業であり、東京を拠点に関東地方・東北地方・中部地方・近畿地方・四国地方の各方面へ近距離から長距離(夜行)まで及び長野県内と京都・大阪を結ぶ長距離(夜行)にて5,654.8 km(2023年3月31日現在) の路線を持ち、車両数400両(2023年3月31日現在) を保有する。バス事業者としては大手に数えられる規模である。 2013年時点では、車両数440両で、高速路線車が270台、一般路線車が122台、貸切44台、特定4台(白河の連節車)となっており、台数の過半を高速路線車が占めることでも象徴されるように、名実ともに長距離高速バスの代表事業者であり、JRバスグループの中でも路線数、車両数ともに中心的存在である。
東京の主要ターミナルには東京駅とバスタ新宿がある。東京駅八重洲南口のJRハイウェイバスターミナルの管理・運営を行っており、同バスターミナルに乗り入れる他社路線の発券、案内などを代行している。バスタ新宿は日本バス協会および当社をはじめとする11社の出資による新宿高速バスターミナル株式会社によって運営されている。同社には元会長の万代典彦が初代社長に就任し バスタ新宿の運営の中核を担っている。自社管理のバスターミナルの他、栃木県佐野市から管理・運営を受託している佐野新都市バスターミナルのように地元自治体が設置して、当社のバスがメインに乗り入れているバスターミナルもある。
高速バスのインターネット座席予約システムは高速バスネットを採用しており、当社がジェイアール東海バス、西日本ジェイアールバスとともに開発し、中国ジェイアールバスを加えた4社共同で運営している。