妹達
外見は美琴と瓜二つ(イラストやアニメでの目の描かれ方などは異なる)だが、能力は大幅に劣るため、電磁波を視覚化する軍用ゴーグルや多様な銃器を常備して戦力を補っている。衣服は研究機関から支給されている常盤台中学校の制服を基本としているが、学園都市外にいる個体は土地に合わせた服装をしている。また、下着は縞パンを着用している。作中の人物たちの多くは美琴と「妹達」を外見で判別できず、普段はゴーグルの有無や性格、美琴が常用している短パンを履いているか否かなどで判別している。
上記の面々以外、世界各地の研究機関には複数の「妹達」が預けられている。「残骸」事件や「原石」回収騒動に際し、ミサカネットワーク上に名前が登場している。
現状判明している個体の所在地は以下の通り。