Come on Stand up!
』(2001年 - 2009年)にて生放送された。7月1日には霧島市にて新極真会空手の新保道場開きに際してライブを敢行、翌7月2日には南日本放送ラジオの第二スタジオにてスタジオライブを敢行、司会はスマイリー園田、ゲストミュージシャンには般若が参加し、観客は抽選で選ばれた約50名が参加、公開生放送された。8月30日には山本寛斎がプロデュースする『日本元気プロジェクト KANSAI SUPER SHOW「太陽の船」』のテーマソング「太陽の船」を制作する事が発表され、同年11月15日にシングルとしてリリースされた。10月9日、10月16日にはテレビ朝日系バラエティ番組『くりぃむナントカ』(2004年 - 2008年)内の企画「第2回長渕ファン王決定戦」にサプライズゲストとして出演、「愛してるのに」、「お家へかえろう'04」、「激愛」、「KAGOSHIMA中央STATION」、「ろくなもんじゃねえ」、「COME BACK TO MY HERAT」、「東京青春朝焼物語」、「Myself」、「夕焼けの歌」、「STAY DREAM」を演奏した。バラエティ番組への出演は2003年の『おしゃれカンケイ』(1994年 - 2005年)以来3年ぶりとなり、また深夜帯のバラエティ番組では初出演となった。この出演に関しては「第1回長渕ファン王決定戦」のスペシャル再放送を見た長渕本人が「最後に(俺が)出たら面白いだろう」という要望を番組側に提示した事で実現した。また、この翌週には長渕のベスト・アルバムなどの数作品がオリコンチャートにて急上昇した。
ベストアルバム『YAMATO』(2005年)を2005年10月19日にリリース後、長渕は2005年10月6日の横須賀芸術劇場より11月9日の日本武道館に至るまで、全国6都市全9公演におよぶライブツアー「LIVE TOUR 2005 YAMATO」を開催した。
2006年、2月8日に東芝EMI所属時代のオリジナルアルバムが「24bitリマスタリングアルバムシリーズ」として再リリースされ、さらに3月8日には東芝EMI所属時代のライブアルバム、ベストアルバムが同シリーズとして再リリースされた。2月21日には立正大学付属立正中学校・高等学校の創立100周年を記念して全14曲、およそ2時間に渡るライブを開催。3月19日には「桜島オールナイトライブ」を記念したモニュメント「叫びの肖像」を桜島ライブ跡地に建立、除幕式に参加し約15000人を動員、全6曲を演奏した。また、「桜島オールナイトライブ」による経済効果は50億円に上ったと言われている。
4月23日、長渕の作品にもテーマとして度々登場していた父、長渕邦治が他界する(享年77)。5月31日には「LIVE TOUR 2005 YAMATO」よりツアーファイナルとなった日本武道館の模様、また桜島モニュメントの除幕式の模様を収録したライブDVD『YAMATO 大和魂』をリリース、6月29日には鹿児島中央駅アミュ広場にてゲリラライブを敢行し約7000人を動員、このライブの模様はエフエム鹿児島『MUSIC POWER STATION feel the μzic DA!!