金森赤レンガ倉庫
しかし、すぐに不燃質の建材を用いた倉庫再建の指示が下り、1909年(明治42年)5月には完成。翌1910年(明治43年)には収益をあげるまでに事業は回復し、復興の早さで再び函館市の倉庫業における中心的役割を担った。
昭和の後期にさしかかると、飛行機などの輸送形態が変化したことや、北洋漁業や造船業が縮小され、函館港の港湾機能も当地区から離れた北東部に移行するなどの社会的な変化を背景に、倉庫業は徐々にその規模を縮小せざるを得なくなった。一方、金森倉庫建物は「伝統的建造物」に指定されて注目され、メディアに取り上げられるようになった。1988年(昭和63年)には倉庫の一角が「函館ヒストリープラザ」として利用されることとなり、以降は「BAYはこだて」や「函館クリスマススクエア」など、様々な業態の店舗に生まれ変わった。
1989年(平成元年)、金森船具店に改装が施され、金森美術館がオープン。これはフランス国外において唯一のバカラミュージアムとなった(2009年閉館)。さらに、1994年(平成6年)に金森倉庫のおよそ35%にあたる部分を改装し、金森洋物館が開店。2003年(平成15年)に日本郵船からBAYはこだてを取得して一体的に運営されることとなり、現在に至る。