高機動型ザクII
メカニックデザイン企画『M-MSV』で設定された(初出は『SD CLUB』第8号)。上記ザクIIIと同一の仕様であるかは明言されていないが、ザクとゲルググの中間的な外観であることは共通し、また本機の型式番号を同じ "MS-06R-3" であるとする資料も少なくない。
連邦のガンダムに対抗できる機動力を得るため、機構試作用にR-2型をもとにゲルググ用の部品を多用し短期間で開発される。ジェネレーター出力の大幅な向上により、試作が間に合ったジオン軍初のビーム・ライフルや、ビーム・サーベルへのエネルギー供給も可能となる(ただし本機にはビーム・サーベルではなくヒート剣が装備されている)。本機で得られたデータをもとに、新規にゲルググが設計される。
カードゲーム『ガンダムウォー』のイラストでは、本体はザクII FZ型、肩部はよりゲルググに近いアレンジがほどこされている。
黒い三連星専用機 書籍『SFプラモブック1 機動戦士ガンダム REAL TYPE CATALOGUE』が初出。黒い三連星がドムとともに地球に降りる直前まで使用した機体で、ザクII S型からチームカラーとなった黒、紫、グレーの3色で塗り分けられている。右肩のシールドには黄色いパーソナル・エンブレムが描かれているが、これは本来は突撃機動軍章であるものの、黒い三連星のMS以外には使用されていないといわれる。機体番号はガイアが「03」、マッシュが「02」、オルテガが「06」。グラナダ工廠でR-1型の基礎フレームを用いて製造されており、ほかの同型機とは細部の意匠が多少異なる。ガイア機は頭部にブレード・アンテナが装備されることもある。 ムック『HOW TO BUILD GUNDAM 2』に、のちに『MSV』に携わる小田雅弘と川口克己による改造作例が掲載された。武装は1機がザク・バズーカにジャイアント・バズの砲身を付けたもの、ほかは外付けの弾倉を追加したマゼラトップ砲を携行しているが、前者は『マスターグレード』として発売された際に320mm試作バズーカ「LB16K」として設定、立体化された。さらに後部もジャイアント・バズのものに差し替えることで「LB19K」となる。 漫画『機動戦士ガンダム C.D.A. 若き彗星の肖像』では、一年戦争終結後もジオン独立同盟によって3機とも保管されており、サイド3宙域でガイア機(ブレード・アンテナ装備)にシャア・アズナブル大佐、マッシュ機にカムジ准尉、オルテガ機にファビアン・フリシュクネヒト少尉が搭乗して「ホワイトベースII」のMS隊を撃退する。
みのり書房刊のムック『ガンダムセンチュリー』(1981年9月)で、ザクのバリエーションの一つとして記載された文字設定が初出である。シャア専用ザク(S型)を上回る機動性をもつ、黒い三連星が使用したエースパイロット専用の機体とされた。"MS-06R" の型式番号で紹介され、この時点では固有名称はなかった。
その後、講談社刊の『SFプラモブック1 機動戦士ガンダム REAL TYPE CATALOGUE』(1982年4月)に大河原邦男によるデザインが掲載された(詳細は後述)。さらにホビージャパン社刊の『HOW TO BUILD GUNDAM 2』に掲載されたストリームベースによる情景模型作例が大反響を呼び、プラモデルを中心としたメディアミックス企画『MSV』でも第1弾(1983年4月)として商品化された。『MSV』では詳細な設定が創作されるとともに、黒い三連星以外にも本機を駆るアニメ本編には登場しないエースパイロットや発展機であるR-2型なども設定され、プラモデルもバリエーション機やスケール違いで(1/144、1/100、1/60、さらに1/30のバブルキャスト(発泡スチロール製)モデルも)多数商品化された。
それまでゲーム内での映像としての登場はあったが、アニメ『機動戦士ガンダム THE ORIGIN』(2015年4月)で初めて映像作品への登場を果たした。ただし、同作品は原作アニメおよび『MSV』などとは一部異なる独自の解釈がなされており、黒い三連星がルウム戦役で本機に搭乗していることなど、それまでの設定とは相違点がある(詳細は後述)。
ホビージャパン発行の雑誌「ゲームぎゃざ」に登場する、ゲームオリジナルのMS(型式番号:MS-06R-1M)。
この数日後に彼は本機を降りキマイラ隊に転属となるが、ソロモン攻防戦直後のテキサス・コロニー付近で当初の塗装の本機が撮影されており、当時の連邦軍の作戦担当将校の間ではシャアの「ゲルググ」ではないかと推定されている。しかしシャアがテキサス・コロニーに入港したのはその後であると判明し、ジョニーの機体とされた。ただし当時の彼はキマイラ隊で高機動型ゲルググに乗り換えているはずであり、さらなる物議を醸している。 『MSV』の当時未発表の設定では、ジョニーがキマイラ隊に転属したあとの本機は、彼の部下であった女性パイロット、エマァ・ダイス少尉が受け継いだとされる。 ギャビー・ハザード専用機 『MSV』に登場。ギャビー・ハザード中佐のパーソナルカラーであるブラウンとブラックに塗装されている。 ロバート・ギリアム専用機 『MSV』に登場。ロバート・ギリアム大佐のパーソナルカラーであるスカイ・ブルーとクリーム・イエローに塗装されている。