ラフィド藻
シャットネラ目 Chattonellales Throndsen in Tomas 1993 バクオラリア科 Vacuolariaceae Luther 1899 シャットネラ Chattonella(海産) Chlorinimonas(海産・底生) Fibrocapsa(海産) Gonyostomum(淡水産) Haramonas(海産・底生) ヘテロシグマ Heterosigma(海産) Merotricha(淡水産) Vacuolaria(淡水産)
分子系統解析によるとFibrocapsaが最も祖先に近い位置から分岐しており、ラフィド藻の祖先は黄褐色の海産プランクトンであったことが想定される。淡水産3属は単系統で海産種から一度だけ進化したものである。また砂地で底生生活を営む2属は独立にその生活様式を獲得しており、強光条件への適応として収斂的に補助色素の組成を変化させたものと考えられる。
なおOlisthodiscus(スベリコガネモ)もラフィド藻に含めることが多いが、微細構造に異なる特徴を持っており、分子系統解析でもラフィド藻でないことが示唆されている。