インド・ヨーロッパ祖語の音韻
20世紀中盤まで、PIEにはこれらのすべての母音が再構されていた。しかしながら現代的な再構は喉音理論を組み込んでおり、これらの母音はPIEの喉音 *h1, *h2, *h3 として再構され後に変化したものと見做される傾向がある。例えば、PIE *ā としてかつて再構された母音は現在 *eh2 として再構され、*ī, *ū は *iH, *uH と再構される。(喉音でも述べたが、*H は任意の喉音を指す)
*a には「成節」[H̥](任意の母音に隣接しない喉音)から「a音化する」喉音に続く *e (*h2e)の間のさまざまな起源が存在する。(これらについては音声的にはPIEで [a] を含んでいたかもしれないが、独立した音素ではなく、*e の異音であったろう)
しかし一部の研究者は、独立した音素 *a が再構されなければならないと主張していて、それはどの喉音にもさかのぼれない。
任意の共鳴子音は複雑な音節核の二番目の部分を形成することが可能であり、全ての母音(すなわち *e, *o, *ē, *ō)について二重母音を形成する(例:*ey, *oy, *ēy, *ōy, *ew, *ow, *em, *en、など)。
PIEが語頭の母音を禁じていたことは一般に合意を得ており、かつての再構で語頭の母音が想定されていた単語はすべて三つの喉音のどれかで始まる単語として再構されている。これらの喉音はヒッタイト語で母音の前を除いて(可能な環境であれば音変化を惹き起こしたあとに)すべての子孫言語で消滅した。