アレッポの大モスク
2012年10月13日に、モスクは武装した自由シリア軍とシリア軍の武装集団間との戦闘において深刻な損傷を受けた。バッシャール・アル=アサド大統領は、2013年末までにモスクの修復委員会を設ける大統領令を発布した 。
モスクは2013年初頭に反乱軍により掌握され、2013年4月には激しい戦闘域内にあって、政府軍は200メートル(660フィート)離れて駐留していた。
2013年4月24日、モスクのミナレットは、シリア内戦において政府軍と反政府勢力の間で激しく銃火が交錯するなか瓦礫と化した。シリア・アラブ通信社(英語版) (SANA) は、アル=ヌスラ戦線のメンバーがミナレット内で爆薬を爆発させたと報じたが、反体制派は、ミナレットはシリア軍の戦車砲火による攻撃の一環に破壊されたと伝えた。アル=ヌスラ戦線の関与とする国営メディアによる主張に対して、反対派の報道はそれらをモスク周辺で政府軍と交戦中であったタウヒード旅団(英語版)からの反乱者と説明した。反体制派の主要な政治集団であるシリア国民連合 (SNC) は、ミナレットの破壊を非難し、それを「消すことのできない恥」であり「人類の文明に対する犯罪」と非難した。