牟岐線
2022年3月3日に前述の独占禁止法特例法を適用した共同経営について申請が行われ、3月18日に認可されたとJR四国および徳島バス両者から発表され、4月1日から導入されることになった。対応する駅と停留所については駅時刻表へのバス時刻の表示が行われた5駅に加え、阿波橘駅・橘営業所停留所を含めた6駅・停留所でなされる。なおJR運賃での利用は「事前に有効なJRの乗車券類を購入していること」が条件となり、現金での利用およびJR乗車券の有効区間外への乗り越し区間の運賃は徳島バスの運賃が適用される。
さらに2023年5月20日に阿波海南駅至近の位置に海部高校前バス停が新設されたことに伴い、共同経営区間が阿南 - 阿波海南(海部高校前)間に拡大された。
このほか徳島バスが那賀町方面(川口営業所)へ運行する丹生谷線について、那賀町方面から徳島駅へ直通する運行を阿南市内までの運行へ短縮する代わりに阿南駅前へ乗り入れ、徳島市方面へは阿南駅で牟岐線への乗り換えを促すなどの動きが見られるようになっている。