本村港
直島港は直島の東側に位置する。小型船のみが発着する港湾で、自動車や二輪車での乗船はできない。常駐するスタッフはおらず、船内で船員から乗船券を購入する。島の名前を冠しているが、直島の西側にある宮浦港のほうが便数も多く規模も大きい。
簡素な待合所とトイレのみの施設だったが、老朽化を受けて待合・トイレ等を一体で整備することになり、2016年にターミナルビルが改築された。