にゃんこ大戦争
勝利すればステージに設定された最高のお宝及びドロップアイテムを100%の確率で入手できる。一部のステージでは,トレジャーレーダー報酬がXPもしくはキャラクターである場合,1度報酬を入手している状態でトレジャーレーダーを使用しさらにクリアすると,トレジャーレーダーがドロップする。
統括者ネコマンダー率いるにゃんこ軍団は日本侵略を目指して北に向かって行った。主人公のノラはネコ缶2つでにゃんこ軍団にスカウトされる。やがて、模様の力を悪用しようとする「悪の帝王ニャンダム」との戦いへと発展する。
本作は、多種多様な作品、組織や団体とコラボレーションを行っている。本作のプロデューサーの石橋によると、最初のころは本作を気に入った他社の関係者から声がかかる形でコラボレーションが実現することが多かったとされている。
極道大戦争
2015年4月17日から6月19日の期間限定で、「極道にゃんこ」のシリアルコードが記載された『極道大戦争』のムビチケカードが発売された。 また、2015年5月25日から7月4日までの期間には本作内でのコラボレーションも実施され、にゃんこ側には映画をモチーフにした極道にゃんこが登場した。
特定の課題を達成することでメダルを入手することができる。入手したメダルはメニューの「にゃんこメダル」の画面に表示され、入手していないメダルのアイコン(一部を除く)をタップすると、名前と獲得条件が表示される。出陣スロットの拡張時ににゃんこメダルの獲得数が条件になることがある。
エヴァンゲリオン
2018年3月16日〜30日、2019年7月18日〜8月1日、2020年6月25日〜7月2日、2021年1月18日〜2月1日、2023年6月1日~6月15日の期間限定で実施され、にゃんこ側には各エヴァンゲリオン機体(零号機、初号機、弐号機→改弐号機コード777(獣化形態)にヱヴァンゲリオン新劇場版:Qの公開に合わせ進化、八号機)やネコヴンダー、超古代勇者ウルトラソウルズの破壊衛星カオスムーンの亜種であるゼロムーンオペレーターズ、ネコ化&ちびキャラ化したシンジらが登場した。にゃんこ&敵側には使徒達が登場。2023年の復刻コラボでは、シン・エヴァンゲリオン劇場版に合わせ初号機、ネコウンダー、ちびレイに第三形態が追加され、新キャラとして焦眼の少女アスカ、エヴァ第13号機が登場。さらに新ステージが2種類追加された。
ピコ太郎コラボ
2016年12月13日から12月26日までの期間限定で実施され、にゃんこ側には敵ユニットとしてピコ太郎が登場した。
『とびだす!』に続くコンシューマ向けタイトル第2弾となるNintendo Switch用ソフト。2018年12月20日配信。開発担当はトーセ。
おすそわけプレイに対応し、1つのソフトで2人協力プレイができることを売りにしている。アプリ版と比較すると、ゾンビやにゃんコンボなど一部の要素は非実装。レジェンドステージの数も少ない。一方、『ふたりで!にゃんこ大戦争』のみ漫画『コロコロ』などでの特典により取得できる特別なキャラクターなどがある。
『とびだす!』と同様に買い切り方式で、発売後のデータ追加の予定はないものとしていたが、2020年7月16日に対戦モードが追加された。対戦モードでは相手に任意の属性を付与できる「属性にゃんこ砲」が導入された。2023年7月14日、超高難易度ステージ「風雲にゃんこ塔」やゾンビ属性を持った敵キャラクターの追加、対ゾンビ属性を持つ「革命軍隊アイアンウォーズ」などの新キャラクターが追加された。
初音ミク
2020年3月9日から3月23日までの期間限定で実施。にゃんこ側には初音ミク、桜ミク、鏡音リン&レン、ネコミクが登場。敵側には上記(ネコミク除く)と、わんこ、ゴリさん、クマ先生の亜種が登場。 2020年8月7日〜8月21日の復刻ではにゃんこ側にネコルカ、MEIKO&ネコ、巡音ルカが追加され、8月31日にはミクの誕生日という事で一日限定で復刻コラボがなされた。 2020年12月11日〜12月26日の復刻ではにゃんこ側に初音ミク マジカルミライ2020大阪&東京が追加され、巡音ルカが敵として登場する強襲ステージが開催された。 2021年2月15日〜3月1日のコラボではにゃんこ&敵側に雪ミク 2021が、にゃんこ側にKAITO&ネコ、ネコリン、ネコレンが追加された。