多足類
これによると、上述の多足類と六脚類の類似は、系統関係を示唆せず、単に収斂進化の結果だと見直さなければならない。
かつて多足類に類縁と考えられた昆虫類
鋏角類
汎甲殻類仮説が有力視されるようになった2010年代以降、節足動物における多足類の系統的位置については、大顎類(Mandibulata)仮説と多足鋏角類(Myriochelata、または矛盾脚類 Paradoxopoda)という2つの対立仮説が注目される。大顎類は多足類・甲殻類・六脚類という大顎と触角を有する3群からなる系統群で、その中で多足類は汎甲殻類と姉妹群をなす。多足鋏角類は多足類と鋏角類からなり、この2群が姉妹群をなし、もしくは鋏角類は側系統群の多足類から分岐したとされるて。この2説の中で、Myriochelataは支持が弱く、いくつかの不確かな分子系統解析と(単に節足動物の祖先形質かもしれない)神経発生的証拠のみに示唆される。大顎類は研究が進むほど広く認められ、多足類は単系統群で、汎甲殻類の姉妹群であることが数多くの分子系統解析とホメオティック遺伝子発現に示唆される。