ストーンウォール・イン
!(Why don't you guys do something?!)」と叫んだのをきっかけに、群衆が暴徒化した。
警察は群衆の一部を制止しようとして数人を殴ったが、それにより暴動がエスカレートし、バーが放火されるまでに至った。ニューヨーク市警察の戦術警察部隊(Tactical Police Force; TPF)が到着し、バー内に立てこもった警察官たちを保護。この騒乱は午前4時まで続いた。
この事件は、「ゲイ解放戦線(Gay Liberation Front)」や街頭女装愛好家集団「ストリート・トランスベスタイト・アクション・レボリューショナリーズ(Street Transvestite Action Revolutionaries; STAR)」などのような、アメリカ合衆国における急進的なゲイ活動家グループの結成につながった。 事件の1年後、「クリストファー・ストリート解放デー(CHRISTOPHER STREET LIBERATION DAY)」が初開催された。この記念イベントでは、グリニッジ・ヴィレッジからセントラル・パークまでのパレードが行われた。このイベントはその後「NYC Pride March」となり、アメリカ合衆国や他の国々での プライド・パレードの原型となった。
クリストファーストリートの6番街と7番街の間のブロックは「ストーンウォール・プレイス(Stonewall Place)」と名づけられた。
事件後、店舗スペースは西側建物(53番地)と東側建物(51番地)に分割され、ベーグルサンドイッチショップ、中華レストラン、靴屋など、さまざまな業態が入居し営業していった。
1991年、初代店舗の西側にあたるクリストファー・ストリート53番地に「ストーンウォール」という新しいゲイバーがオープン。このクラブは人気を博したが、運営管理が行き届かず近隣住民からの騒音苦情のため、2006年に閉店した。
1999年6月、グリニッジ・ヴィレッジ歴史保存協会とレズビアンやゲイの建築家・デザイナーたちの努力により、ストーンウォールを含む地域はゲイとレズビアンにとっての歴史的重要性を理由に、アメリカ合衆国国家歴史登録財に登録された。登録地域は、ストーンウォール・イン、クリストファー・パーク、および周囲の道路と歩道の一部に及ぶ。この地域は、2000年2月にアメリカ合衆国国定歴史建造物に指定された。
2007年1月、実業家ビル・モーガン(Bill Morgan)とカート・ケリー(Kurt Kelly)、LGBT権利活動家で投資家のステイシー・レンツ(Stacy Lentz)により、ストーンウォール・イン(53番地側、初代店舗の西半分)の大規模な改修工事が行われた。