FC琉球の年度別成績一覧
太字はリーグ、カップ戦優勝
表中の略記・着色セルの内訳は以下の通り

J2:J2リーグ J3:J3リーグ 天皇杯:天皇杯 JFA 全日本サッカー選手権大会 JFL:日本フットボールリーグ 九州:九州サッカーリーグ 沖縄県:沖縄県社会人サッカーリーグ