大徳寺
忠興が北野大茶湯の際に使用したという茶室「松向軒」、利休屋敷から移築したという座敷もある。明治11年泰勝庵と合併。なお、現在は、新型コロナウイルスの影響により公開休止中である。
玉林院 - 天皇や皇族の医師であった曲直瀬正琳が建立したのが始まり。戦国武将・山中鹿之介の位牌堂などがある。 大徳寺保育園
大光院 - 大和豊臣家の菩提寺。豊臣秀吉と豊臣秀保が豊臣秀長の冥福を弔う為に建立した。秀長の墓がある。明治11年清源庵と合併。
龍光院 - 非公開の塔頭。黒田長政が父・黒田如水菩提のため三回忌の折に建立。如水や正室光、長政の墓所があり、天下の三大茶室「密庵(みったん)」(国宝)が著名。福岡藩黒田氏歴代の位牌が祀られ京都に於ける同家の菩提所。茶道具など数多くの国宝・重文を有するが、完全非公開を貫いている塔頭である。他に有栖川宮家の墓所(初代・好仁親王~七代・韶仁親王)や吉川広家の墓所もある。明治11年寸松庵・看松庵と合併。
芳春院 - 加賀前田家の菩提寺。前田利家他歴代前田氏の京都における菩提寺。明治11年高林庵と合併。
孤篷庵 - 小堀遠州が龍光院内に建立。現在は移築し、茶室「忘筌(ぼうせん)」(重要文化財)が著名。境内の外、西側にある。
龍泉庵 - 明応年間創建。明治維新後廃絶したが、昭和33年(1958年)紹溪尼(佐々木ルース夫人)が日米第一禅協会日本支部を設立し、庵を復興。
門外塔頭2寺
来光寺 — 創建は不詳。
実翁叟著
大心義統
玉潭義浄(大達広智禅師)
月山紹珂
琢宗叟琱
海印宗珠
雲巌義端
南海宗琳
俊峯宗英
周山宗甫
桃林宗陽
龍淵義天
桂隠宗仙(海恵悟明禅師)
天柱義雪
久巌紹昌
龍巌宗棟(実際空真禅師)
梅堂義琇
亭山紹伝(大常妙用禅師)
雲秀宗台
江西宗寛(法恵通明禅師)
龍岫宗黄(法応仏眼禅師)
良堂宗温
瑚隠宗璉
玉仙宗斤
敬峯宗恭(宣耀聖燈禅師)
栢州宗貞
万拙宗庸
天菴宗篤(徳海無為禅師)
鶴洲宗寿
大梅宗円(法燈明宗禅師)
桂堂宗玉
寂水宗湛
瑞堂妙虔
桂洲宗嫩
祝峯宗融
密雲宗察(真寂悟空禅師)
孝嶽宗里
啓叔宗廸
錬了宗精
瑞麟宗玖
寛嶺宗量
任叔宗堯
竺嶺宗伍
月洲義印
太玄宗珊
少峯宗林
信叔義門
万了義般
江巌宗活
実参義諄
法厳宗律
璋隠宗瑾
鉄叟紹石
諶谷宗信
茂林宗植(徳光普照禅師)
月船宗三
虎峯宗雄
大嶺宗観(慧光無量禅師)
岐堂紹楊
性巌宗本
玉閑宗玖
太虚宗夃
円巌紹通
大渓宗徹
大寧宗兆
元叟宗厚
梁堂紹掄
真叟妙常
安禅紹賢
大龍宗丈(大乗正宗禅師)
藍谷義田
郁翁義蕙
文英紹典
大菴宗意
見道宗善
泰州義寧
江堂宗景
巨海宗如(真機広演禅師)
大方紹本
別巌宗轍
日寛宗舜
成巌宗就
心瑛宗悦
恭山宗良
大川義浚
大岫宗般
閑田義問
寛渓宗宏
謙叟紹彦
愚谷宗賢
愚堂宗哲
天洲紹中
実紋宗誠
英巌義俊
斗山宗枢
敬外宗信
梅峯宗常
特英宗卓
万輝宗旭
鼓山宗宜
陶嶺宗鉗
石峯宗柱
庭州義訓
海門宗音
非心義覚
一道宗等
無学宗衍(至聖大妙禅師)
堯州宗寛
雪峯宗台
徳隠宗薩
独翁紹慎
貫岑義文
粛巌宗敬
東天宗嶽
霊巌宗楞
別道紹伝(広燈慈明禅師)
端巌宗発(法雲真際禅師)
無価宗璵
真巌宗乗