アルバロ・アルス
内戦終結後も軍部による残虐行為や政治的な殺人が完全になくなったわけではなかった。1998年4月、カトリックのキチェ教区元司教でグアテマラ大司教区人権局(ODHAG)の活動家であったフアン・ヘラルディ (Juan José Gerardi Conedera) が暗殺される事件が発生した。グアテマラ軍情報部がマヤ人に対して行った残虐行為に関する報告書の作成に関与したために殺されたとされる。先住民(主にマヤ人)の利益を守るため、憲法を改正してグアテマラを多民族・複文化・多言語の国家と規定することが1999年5月に議会を通過したが、国民投票で否決された。
長期にわたった内戦の結果、グアテマラ国内の安全性はひどく損なわれており、銀行強盗・殺人・身代金目的の誘拐などの犯罪率はきわめて高く、当時は誘拐事件が世界で4番目に多い国だった。ODHAGによるとアルスの任期中の犯罪による死者数は13000人を越えた。内戦終結とともに、評判の悪かった国家警察にかわって国家文民警察(Policía Nacional Civil)が設立されたが、安全性はあまり向上しなかった。司法が役に立たないと考える人々によって地方では私刑が横行した。
経済的にアルスは新自由主義的な政策を取り、自由市場における民間企業の発達を重視していた。アルスは電気・電話・航空・鉄道など多数の国営企業を民営化した。