ゾイドバトルストーリー
そこには中央大陸を攻略し得る暗黒軍の最終兵器が示されており、これによってヘリックは暗黒軍との開戦を決意する。
強大な暗黒軍ゾイドの前に第一次暗黒大陸上陸作戦は失敗となった。そこで愛機レイノスを失っていたクルーガは、次の上陸作戦に参加しそこで戦果を挙げる。これを皮切りに暗黒大陸にて共和国軍と暗黒軍双方の攻防が繰り広げられるが、ある日、共和国部隊が敵の最終兵器であるギル・ベイダーの攻撃を受けて壊滅する。
続いて共和国首都に現れたギル・ベイダーはクルーガの駆るサラマンダーF2やクルーガの上官グラハム大尉の駆るガンブラスターとも交戦し、この戦いの成り行きでグラハムが命を落とす。そして、ギル・ベイダーは共和国首都の爆撃を敢行し、多くの死傷者を発生させる。
ギル・ベイダーの登場によって暗黒大陸の共和国軍も劣勢に陥っていった。さらには海戦においても大敗を喫し、その際に使用していた暗号が暗黒軍に解読されていたことから、共和国側もゼネバス皇帝の生存を知ることとなる。
またも共和国都市への攻撃に向けて飛び立つギル・ベイダー。それに対し、クルーガは新型ゾイド・オルディオスを駆り立ち向かう。