スター・ウォーズにおける戦いの一覧
ベインはメモリー・クリスタルを開錠するためロポルを拷問したが、途中で彼を死なせてしまった。しかし、彼は都合よく船にやってきたジェダイの師弟を利用することに決め、罠の準備を整えた。ベインはバトル・ドロイド部隊を率いて船のハンガーで共和国軍を迎え撃ち、重力装置を操作してクローン・トルーパーを足止めする。その後、ベインはタノをエアロックに閉じこめて人質にとり、スカイウォーカーにメモリー・クリスタルを開錠させた。その後、ジェダイとトルーパーは奪ったシーシピード級シャトルで爆発直前のフリゲートから脱出した。彼らはベインがフリゲートで死んだと思い込んでいたが、賞金稼ぎはトルーパー・デナルの装甲服を奪ってシャトルに紛れ込んでいた。アナキン・スカイウォーカーとアソーカ・タノが、惑星デヴァロンの軌道上で待機する<リゾリュート>に帰還した後。キャド・ベインに奪われたホロクロンの奪回任務は失敗に終わったが、ベインは死んだものと思われていた。アソーカはベインを殺したと思われるクローン・トルーパーに何度も質問をするが、彼からは一切返事がない。一方、アナキンはシャトル内に残っていたデュロスの緑色の血を調べ、危機を察知した。彼はアソーカに警告を叫ぶが、既に遅かった。クローン・トルーパーに変装していたキャド・ベインがアソーカの胸を蹴り倒し、もう1機の船へと逃走したのである。アナキンは船に飛びついて彼の逃走を阻止しようとするが、ベインは船を急発進させ、彼を振り落とした。アナキンはあわててユラーレン提督を呼び出し、ハイパースペース・リングを停止させるよう指示を出す。だが指示は間に合わず、キャド・ベインは脱出に成功したのだった。
賞金稼ぎによる誘拐
その直後、レンは激昂したチューバッカに脇腹を撃たれ、さらにオシレーター内部の爆弾が起爆された事で負傷した。
サーマル・オシレーターで爆弾が爆発したのを見たダメロンは単騎でオシレーターの内部に突入しこれを破壊する。既に超兵器の発射態勢に入っていたスターキラー基地は、オシレーターによって抑えられていた恒星から吸い上げたエネルギーが暴発したことで崩壊し始めた。
一方、オシレーターから脱出していたレイとフィンの前にカイロ・レンが現れる。レンはレイを吹き飛ばしてフィンとの1対1の対決に臨み、苦戦しながらもフィンの背中を斬り上げて勝利した。レンはフィンが手放したアナキンのライトセーバーを引き寄せようとするが、ライトセーバーは立ち上がったレイの手に渡った。レンはレイとの対決に臨むが、父を殺したことに対する心の迷いから決着をつけきれず、一瞬の隙を突いたレイに敗れた。
レイとフィンはチューバッカが操縦するファルコン号に乗って基地から脱出。レンもハックスに回収され、修行を終わらせるべくスノークの元へ連れて行かれた。程なくしてスターキラー基地は完全に崩壊し、新たな恒星となった。
その後ディカーの基地に帰ったレイは、完成したルーク・スカイウォーカーの地図を元に、最初のジェダイ・テンプルがある惑星オク=トーへと旅立った。
ガンレイはグリーヴァス将軍の指示で一度は脱出していたが、残した莫大な財宝が共和国軍の手に落ちる前になんとか回収したいという欲から引き返してきたところを襲撃され、辛くも逃走するもケイト・ニモーディアは陥落した。
ジェダイ達はガンレイ総督に逃げられるも、総督がダース・シディアスや分離主義勢力の他の幹部達との交信に使用していた、暗号化ホログラム送受信機付きのメクノ=チェアを発見したのだった。この発見はジェダイに、分離主義勢力の背景にシスの暗黒卿が実在するという確固たる証拠をもたらすことになる。
一方で、陥落後もケイト・ニモーディアでは残存勢力によって惑星各地で共和国軍へのゲリラ攻撃が行われ、定期的にクローン・トルーパーとジェダイ・マスタープロ・クーンによるパトロールと掃討戦が行われていた。やがてシディアスによってオーダー66が発令されると、多くのジェダイと同じようにプロ・クーンも配下の兵士に殺された。
クリストフシスの戦いと同じ頃、銀河外縁部の航路を支配するジャバ・ザ・ハットの息子、ロッタ・ザ・ハットが何者かに誘拐されるという事件が発生。ジャバは共和国にその救出を依頼した。この依頼に対し、パルパティーンとヨーダはハット族の信用を得る事で彼等が支配する宙域を新たな補給航路に出来ると考え、依頼を受諾。ヨーダは惑星クリストフシスでの戦いを終えたオビ=ワンとアナキン、そしてそのパダワン・アソーカにロッタ救出を指示した。
テスの戦い
オビ=ワンはジャバとの交渉に向かい、一方のアナキンとアソーカ率いるクローン部隊は惑星テスへ行き誘拐犯が立て篭ったという崖の上にある寺院に突入しようとしたが即座に交戦状態へ入った。だが、崖の上にある寺院と崖をのぼりながら戦闘する共和国軍はウォーカーを一機破壊されるもスカイウォーカーの見事な作戦で制圧。ロッタの確保に成功。しかし、これはジャバをも分離主義勢力に取り込む事を企図したドゥークーの計画であり、彼はオビ=ワンが立ち去った後にジャバと接触。息子を誘拐したのはジェダイであり、さらにそのジェダイがジャバの命をも狙っていると吹き込み、独立星系連合への加盟を要求した。
フェルーシア医療ステーションが独立星系連合に攻撃される。医療ステーションからの通信が途絶えたためアナキン、オビ=ワン、アソーカがフェルーシアへ向かうが彼らが来た時には既に医療ステーションは破壊されており敵スターファイターの攻撃で彼らの乗るシャトルがフェルーシアに不時着する。そこでフェルーシアのスパイス農園の村にたどり着いた。ジェダイは民家の中の捜索を開始したが、突然、3人のジェダイは4人の重武装の賞金稼ぎに取り囲まれてしまう。スーギ率いる賞金稼ぎたちは数に物を言わせ、ジェダイに降伏を命じたのだった。武器を構える他の賞金稼ぎたちは、エンボ、ルーミ・パラミータ、セリパスだった。その後、村の長老ケイシスが賞金稼ぎたちを説得し、ジェダイを交えて村の窮状と彼らが助けを求めていることについて話し始めたのである。ケイシスはスパイスを狙う海賊に対応するため用心棒としてこの賞金稼ぎたちを雇っているのだと説明した。ケイシスはジェダイが現れたいま、賞金稼ぎも守りだけでなく、海賊たちと積極的に戦うことができるようになったと考えていた。だがオビ=ワンは、農民たちを助けたいが、自分たちの最優先任務は船を見つけ、医療ステーションの破壊についてコルサントに報告することだと告げる。その夜、海賊が村に来たが、スカイウォーカーとケノービは海賊の首領が旧知のホンドー・オナカーであることを知って驚く。ホンドーはジェダイに友好的に接したのだった。そして彼は賞金稼ぎの買収を試みるが、彼らは取り引きの放棄はできないしてそれを拒否する。
また、グリーヴァスを倒そうとしたARCトルーパー・コルトも、ヴェントレスのフォースにはかなわず、ライトセーバーで刺殺された。ヴェントレスは、グリーヴァスの前から立ち去り、入れ替わりにオビ=ワンがやって来た。
一方で、エコーとファイブスは、キャプテン・レックス、コマンダー・コーディ、戦闘要員ではないが力になりたいという99、さらには訓練生と共にドロイドを撃破したものの、この戦いで99が背後から撃たれて戦死した。
グリーヴァスはオビ=ワンと戦い、DNA保管室に向かったヴェントレスはアナキンと対決。グリーヴァスは逃走する。ヴェントレスもジャンゴ・フェットのDNAサンプルを盗もうとしたが、アナキンたちに止められ、作戦は失敗。シャク・ティと、ARCトルーパー・ブリッツの活躍もあり、共和国軍は、大勝利を収めたのだった。戦いの後、レックスとコーディはファイブスとエコーの活躍をたたえ、二人を正式にARCトルーパーに任命したのだった。
そしてケノービがマンダロアを脱出する前に、クライズは共和国の侵攻こそがモールの支配を打ち破ると信じて銀河共和国にマンダロアの現況を伝えるようケノービに要請する。
一方、モールは彼の以前のシス・マスターであるダース・シディアスからの急襲を受け捕縛されていた。しかし、モールはスーパー・コマンドーの協力の元、シディアスの拘束から脱走することに成功する。一方でマンダロリアンのレジスタンスは共和国に現首相のアルメックがシャドウ・コレクティブの傀儡となったことを伝える。ケノービやメイス・ウィンドゥといったジェダイの将軍はマンダロアが独立星系連合の手に落ちることを避けるという点で合意に達し、ケノービとウィンドゥはモールとシャドウ・コレクティブに対して攻撃を開始する。しかし、モールを捕獲することはできず、その存在は依然として大きいものであった。
その後もマンダロア内では民族内での紛争が続いていたが、戦争終結の数日前、ダース・モールがある目的のためにマンダロアの首都を占領したことにより共和国軍による「マンダロア包囲戦」が決行され、共和国は100年以上続いた和平条約を破棄して首都へ侵攻することになる。
ジェダイの助言のもと、チューチーは書記長の決定を覆すため母星パントラに連絡を取り、下院議長にオルトー・プルトニアの現状を報告した。
オルトー・プルトニアの戦闘
チョー書記長とレックスの率いるスピーダー部隊は、雪の降る峡谷でナーグラッチにまたがったタルズの戦士と相対した。チョーから攻撃を命じられたレックスは、スカイウォーカー将軍の指令は書記長の護衛だけだと反論したが、タルズの攻撃が激しさを増したため応戦を余儀なくされた。タルズは投げ槍を使ってチョーのグループを攻撃し、数名のクローンを殺害する。レックスがタルズのナーグラッチと衝突してフリーコ・バイクから降りると、チョーと他の兵士たちもレックスのリードに従って乗り物から降り、車両を並べて防衛用の円陣を形成した。しかし、タルズはバリケードの中に向けて次々と槍を投げ込み、チョー書記長を警護していた2名のパントラン・ガードの命を奪う。
タルズは投げ槍の攻撃を継続しつつ、ナーグラッチにまたがった戦士を円陣の中へ突撃させた。レックスはハンド・ブラスターで応戦し、数名の戦士を倒したが、彼ら全員を撃退することはできず、チョーと部下たちに退却を命じた。チョーは未開の部族に背を向けて逃げ出すのを拒んだが、その後すぐ投げ槍に胸を貫かれ、致命傷を負う。レックスはチョーに止めを刺そうとするタルズを倒し、書記長をBARCスピーダーの機体に乗せて戦場から走り去った。その頃、グリッド・ステーションから飛翔したLAAT/iガンシップの中では、ケノービ、スカイウォーカー、チューチーがパントラン議会のメンバーと連絡を取っていた。パントラン議会はタルズに宣戦布告したチョー書記長の行動を越権行為とみなし、彼を解任することに決めた。