長崎本線
2018年(平成30年)9月28日 【ラインカラー・路線記号・駅ナンバリング制定】鳥栖 - 佐賀。
2020年(令和2年)3月28日 【高架化】浦上 - 長崎。
2021年(令和3年)4月1日 肥前山口(江北) - 諫早間の鉄道施設を管理する「一般社団法人佐賀・長崎鉄道管理センター」設立。
2022年(令和4年) 1月31日 一般社団法人佐賀・長崎鉄道管理センターに第三種鉄道事業許可。 9月23日 西九州新幹線(武雄温泉 - 長崎間)開業に伴い、以下の通り変更。 江北 - 諫早間を上下分離方式に移行。JR九州が第二種鉄道事業者、一般社団法人佐賀・長崎鉄道管理センターが第三種鉄道事業者となり、同区間におけるJR九州の第一種鉄道事業を廃止。 JR貨物による鍋島 - 長崎間の第二種鉄道事業を廃止。 【駅名改称】肥前山口→江北。 【電化廃止】肥前浜 - 長崎。
2024年(令和6年)春 鍋島 - 江北でICカード「SUGOCA」を導入(予定)。
長崎駅 - 長崎港駅(1.1 km。1982年11月14日廃止)
日本貨物鉄道(JR貨物)の第二種鉄道事業区間である鳥栖駅 - 鍋島駅間で貨物列車が運行されている。2022年3月改正時点では、コンテナ車で編成された高速貨物列車が2往復(鹿児島本線福岡貨物ターミナル駅発鍋島駅行きが2本、鍋島駅発東海道本線東京貨物ターミナル駅行きが1本、鍋島駅発関西本線百済貨物ターミナル駅行きが1本)設定されている。牽引機関車は、ED76形およびEF81形電気機関車。さらに農産物流通のピークである4 - 6月は、EF81形牽引の臨時高速貨物列車(通称タマネギ貨物)が1往復増発される。
線内の貨物列車の発着駅は鍋島駅のみだが、このほか長崎駅には近接して「長崎オフレールステーション」があり、コンテナを積載したトラックが鍋島駅との間を結んでいる。
停車駅 普通・快速...すべての旅客駅に停車(表中省略) 区間快速...●印の駅は全列車停車、▲印の駅は上りのみ運転で全列車停車、△印の駅は営業日のみ停車、|印の駅は通過 鳥栖駅 - 江北駅間の区間快速は、鳥栖駅から鹿児島本線へ直通 諫早駅 - 長崎間の区間快速は、諫早駅から大村線へ直通する「シーサイドライナー」 特急(かもめ・みどり・ハウステンボス)...各列車記事参照
↑ 唐津線の列車は佐賀駅まで乗り入れる
中原駅 - 吉野ケ里公園駅間で三養基郡上峰町を通過するが、駅はない。
JR九州の直営駅:鳥栖駅、佐賀駅、諫早駅、長崎駅
簡易委託駅:肥前浜駅
上記以外の駅はJR九州サービスサポートの業務委託駅もしくは無人駅である。
2011年3月改正までは当形式2編成に813系1編成をつないだ7両、2018年3月改正までは3編成繋いだ6両で運転される列車があり、2022年9月改正までは長崎まで乗り入れていたほか、近年ロングシート化改造された500番台(同改正で全車鹿児島車両センターに転属)も使用されていた。
キハ47形(佐世保車両センター、唐津車両センター) - 佐世保所属車は江北 - 長崎間、唐津所属車は佐賀 - 久保田間で唐津線直通列車に限り使用。
キハ125形(唐津車両センター) - 佐賀 - 久保田間で唐津線直通列車に限り使用。
YC1系(佐世保車両センター) - 小長井 - 長崎間で使用。2-4両で運用される。この形式に限り両数にかかわらずワンマン運転となる。
鳥栖 - 江北間では、南福岡車両区所属の817系3000番台と821系(2022年9月改正で全車が熊本車両センターに転出後は不明)も813系の代走として運用されることがある。
しかし、2014年にFGTの試作車両の鹿児島ルート及び鹿児島本線での走行試験中に重大な問題が発覚し、開発が長期に渡りストップした。これにより、仮にFGTが実用化されても、2022年度の開業までに運行に必要な数の車両の生産が間に合わないことが判明した。新幹線建設は計画通り進んでおり、完成した設備を年単位で放置できないこと、新幹線沿線自治体では2022年度の開業に合わせて大規模再開発が行われており開業の遅れは許されない状況であり、開業の前倒しを計画していただけに大きな問題となった。結果、2015年12月に2022年度開業のあり方として国やJR九州、長崎・佐賀両県の間で次の合意がなされた。
開業時期は現計画通り2022年度
フル規格で整備中の長崎駅 - 武雄温泉駅間については新幹線車両での運行、武雄温泉駅 - 博多駅間は在来線特急車両での運行とし、FGT営業用車両の生産完了(2025年度予定)まではリレー方式(2004年の九州新幹線鹿児島ルート暫定開業と同じ方式)とする。一部の列車においてFGT先行導入車両での運転を行う。
リレー方式での開業に伴い武雄温泉駅を新幹線と在来線が対面乗り換えできる構造に改造。
キロシ47形(佐世保車両センター) - 「或る列車」で使用。
DF200形ディーゼル機関車(大分車両センター) - 7000番台が「ななつ星 in 九州」牽引用に使用。
77系客車(大分車両センター) - 「ななつ星 in 九州」用の客車として使用。