クロックタワーゴーストヘッド
本作のシナリオは、エンディング分岐が存在するもののストーリー自体は一本道であり、前作と異なりシナリオ展開次第で探索する場所が変化する要素はない。
主人公を追い掛ける敵キャラクター。今作では章ごとに異なる敵が登場する。
鷹野家の納屋にしまわれていた像で、鷹野家の惨劇の元凶。才堂家の秘法が隠されているとされているが、それは崇のついた嘘であり、実際は人間の自我を崩壊させる幻覚剤が仕込まれている。才堂家の墓を掘り起こした事について初の口封じをするべく渡したが、呪いを信じきっていた初は納屋にしまい続けていた。しかし幻覚剤は16年を経ても効果が消えず、像をたまたま納屋から発見して持ち出した千夏を狂わせる結果となった。また、優を復讐に利用する事を躊躇った崇は才堂にも像を送り狂わせた。像を燃やしたことで千夏は正気に戻ったが、これは幻覚剤が燃えた化学反応によるものであり、超常的な力が働いた訳ではない。この際に千夏から怨霊のようなものが抜け出る演出が入るが、これも幻覚剤の影響を受けた優が見た幻に過ぎない。
研究所奥で会った藤香は優への怨嗟の言葉を吐き、彼女の首を絞める。優はなすすべもなく息絶え、倒れた優を見下ろしながら藤香は「馬鹿な娘」と嘲笑う。
クローゼットやロッカーの中など、隠れて敵をやり過ごせるクリックポイント。「隠れポイント」とも。前作まではポイントによっては隠れても発見されてしまう場合があったが、今作では見つかる事はまず無い。
優とは対照的に残酷な性格で障害となるものを排除することに躊躇しない。他人に対して排他的かつ攻撃的な一方、優には優しさや気遣いも見せている。冷酷な性格とはいえ自分から率先して残虐行為に手を染めることはなく、ぶっきらぼうながらも弥生に逃げるように促したり、剛元や礎に対しても態度は粗暴ながら研究所から早く立ち去るように忠告するなど、他人に対する気遣いが皆無なわけではない。 どのような過程で生まれたのか、なぜ優に宿り続けるのかなどの謎については作中で一切触れられておらず、彼自身も事件の根幹には関わりは無い。クリア特典のGUIDEでは、優と共に生き埋めにされた双子の片割れの意識、或いは才堂家に恨みを持つ者の怨念という可能性が提示されているが、最終的な結論は「不明」とされている。 ゲーム内での撃退方法は拳銃による発砲のみ。弾切れなどで攻撃手段がなくなった場合は優に戻る必要がある。 機械関係や理数系に強く、事件の真相をいち早く理解するなど、頭の回転が速い。死体などに耐性がある。 興味のある事以外には関心が無いため、クリックポイントは優に比べて少ない。その分、トラップに引っ掛かる事は無い。 同じ人物に話しかける場合でも、優で話すのか翔で話すのかで、会話の内容は大きく異なってくる。場合によってはシナリオ進行やエンディングにも影響を及ぼす。 海外版では「ベイツ(Bates)」という名前で、日本版と違って男性声優が担当している。
狂気に取り憑かれた初は、自分を含む才堂家に関わった全ての人間を殺す事で呪いを終わらせようと錯乱状態で襲い掛かり、翔は抵抗するも呆気なく絞め殺されてしまう。
声 - 大塚明夫 / 松尾銀三
弁天病院の院長。名医として知られていたが、患者が行方不明になるなど、病院に関する悪い噂が立っていた。
これは彼が才堂不志人に病院の患者を599計画の実験台として提供していたことが原因である。
シナリオ開始時点ではすでに発狂しており、話しかけると優を感染者の餌にしてその隙に逃げようと襲い掛かってくる。通常では優をそのまま絞殺してしまうが、条件を満たしていると優ともみあいになった末に藤香に射殺される。
声 - 大塚明夫 / 西脇保
弁天製薬研究所を徘徊する謎の殺人鬼。般若の仮面を被っており、素顔は不明。
「総ての人間に死を...」という謎めいた言葉を呟きながら、巨大な鉈を使い殺人を行う。
その正体は優の実の父。かつては天才的頭脳を持つ科学者だったが、「双子が生まれたら呪われた子と看做して生き埋めにしなければならない」という才堂家の習わしに従い、我が子を生き埋めにした後、HU599菌という狂気の研究に取り憑かれることになる。弁天病院から提供される患者を何人も実験台にして非道な研究を進めていたが、最後は崇に幻覚剤を投与されて自我が崩壊し、大鉈を引きずって殺人を繰り返すようになってしまった。自我は崩壊したものの、墓が暴かれて赤ん坊が奪われたことやその真相について知っているらしく、訪れてきた優を呪われた娘と呼び、執拗に抹殺しようとする。
没になった第一期シナリオでは藤香の別人格という設定だった。
才堂が開発した細菌兵器。投与された人間の体内で成長し「寄生脳」を形成する。それと同時に本来の脳は機能を停止して投与者は脳死状態となり、肌は緑色、血液は黄色に変化し、生ける屍と化し、寄生脳を破壊しない限り活動を停止することは無くなる。また、寄生脳が存在する部位を切り落とすとその部分だけが生き続ける。