本願寺鷺森別院
天正8年(1580年)3月、織田信長と石山合戦の和議に応じた本願寺門主顕如が、大坂本願寺を退出して当寺へ入っている。それにより、当院は名称を鷺ノ森御坊から鷺ノ森本願寺とし、浄土真宗本願寺派の中心寺院となった。しかし、天正11年(1583年)7月に顕如が貝塚本願寺(現・願泉寺)へ移ると、再び名称は鷺ノ森御坊に戻された。
天正13年(1585年)に行われた羽柴秀吉による紀州征伐の後、当院は急速に衰退した。
江戸時代には紀州門徒の支援によって、享保8年(1723年)3月に本堂が再建され、明和5年(1768年)に再興がなされたが、太平洋戦争中の1945年(昭和20年)7月9日の和歌山大空襲によって焼失した。
1948年(昭和23年)に本堂が再建されるが老朽化したため、1994年(平成6年)10月に現在の本堂が建てられた。