フアン・デ・パラフォクス・イ・メンドーサ
1642年には現副王がポルトガルと結託していたと批判して解任してスペインに送り返し、後任の副王が赴任するまで半年の間自分自身が臨時(第18代)の副王として働いた。第19代副王のサルバティエラ伯爵 (García Sarmiento de Sotomayor, 2nd Count of Salvatierra) とも激しく対立した。パラフォックスはメキシコをスペインから独立させようとしたアイルランド人ウィリアム・ランポート(英語版)の裁判を行った。
宗教面ではフランシスコ会ほかによる当時の教区が世俗の人間によって運営されていることを批判した。彼はフランシスコ会の31の教区を廃止し、フランシスコ会と激しく衝突した。
その後パラフォクスはイエズス会と対立し、イエズス会が十分の一税を支払っていないことを批判した。1647年にはローマ教皇インノケンティウス10世に対してイエズス会を非難する書簡を送っている。副王とメキシコ大司教フアン・デ・マニョスカはこの問題についてイエズス会の方を持ったが、パラフォクスはイエズス会批判を止めなかった。
1649年5月にフェリペ4世はパラフォクスをスペインに呼び戻した。同時に副王のサルバティエラ伯爵はペルー副王に転任になった。