アピ事件
林建法は1943年12月29日にタウィタウィ島の米軍から得た武器を持ってアピ沖に戻ったが、郭の蜂起の失敗を知り潜伏していた。1944年2月に日本軍は、林がマンタナニ島に潜伏している、との情報を得て同島へ向かい、ほぼ全ての島民を逮捕した後で島を包囲した。その際に一隊が襲われたため、敵対行為への報復として全島民約80人を殺害した。
また1944年3月頃、日本軍はディナワン島(英語版)で島民50-60人を殺害したとされる。
戦後、日本の法務省がまとめた資料では、討伐隊は暴徒約420名を逮捕し、取調べの結果320名を軍律会議に送り、軍律会議で220名が死刑、残る100名が懲役刑となったとされた。
しかし、裁判を経ずに住民を処刑した事例が多数報告されていることから、事件に関連する被逮捕・処刑者数はこれよりも多かったとみられている。また、主謀者の裁判に関しても、死刑の判決を受けたのは郭益南以下数名とされ、他の170名余は判決によらず処刑されていたこと、最高刑者について処分に必要な陸軍大臣の認可を得たのは1944年1月下旬だったとされるが、処刑はこれに先立つ同月21日に執行されていたことが知られている。
1944年1月21日、アピ近郊プタガス(英語版)で、郭ら主犯格とされたメンバーは斬首され、残る170名余は機銃掃射により処刑された。また懲役刑となった者のうち、130余名がラブアン、100余名がアピの刑務所に収容され、重労働と悲惨な処遇の結果、戦後までの生存者はそれぞれ7名、13名だったとされる。