アリ・マフディ・ムハンマド
統一ソマリ会議は首都モガディシュに侵攻し、1991年1月にバーレ大統領は国外に逃亡する。モガディシュに入ったアリは、1月28日にソマリア第4代大統領就任を宣言した。1991年7月に行われたジブチ会議において、2年間の暫定大統領の立場を承認された。これによりジブチ、エジプト、イタリア、サウジアラビアなどからも承認を受けたが、ソマリアの他の軍閥の多くからは認められなかった。アイディードもまたこの宣言を認めず、11月17日、アリ派とアイディード派の間に戦闘が勃発した。
国連は仲介のため、まず1992年2月にアリとアイディードをニューヨークに招き、その結果両者は3月に停戦協定に合意した。これを機として、4月に国際連合ソマリア活動(UNOSOM)が開始された。しかしアイディードがUNOSOMに協力的ではなかったため、アメリカ軍主体の多国籍軍統一タスクフォース(英語版)(UNITAF)が編成され、12月9日から「希望回復作戦」と呼ぶ作戦を開始した。その結果、12月28日にアリ派とアイディード派の休戦が成立。しかし結局戦闘は収まらず、第二次国際連合ソマリア活動も功を奏しなかった。1993年10月3日のモガディシュの戦闘をきっかけに国連の活動は衰退を見せる。まず、1994年3月にアメリカ軍がソマリアから撤退。