正義と平等運動
AUによる停戦監視団の派遣に対しても不審を表明しており、和平交渉の内容を巡って2005年10月9日分派が停戦監視団を襲撃したとみられたものの、翌日のその解放に協力した。
2008年5月11日、JEMがスーダンの首都ハルツームとオムドゥルマンの政府・軍関連施設を急襲し、スーダン国軍と激しい戦闘となった。JEMが首都まで攻撃を仕掛けるのは初めてである。スーダンのバシール大統領は国営テレビの演説で、首都近辺にいるJEMの軍勢を壊滅させたと発表、またチャドが攻撃を支援したとして、同国に対する報復までちらつかせて非難した。 しかし、JEMの指導者ハリール・イブラーヒームは、AFP通信のインタビューにスーダン政府の発表を否定し、オムドゥルマンに潜伏しながら攻撃を続けているとしている。また、スーダン政府内部や軍、警察、学生運動団体などにJEMの協力者がいるとも語っている。
2011年12月25日、スーダン軍はハリール・イブラーヒームが南スーダンに入ろうとした際、政府軍と交戦になり、ほかの司令官とともに死亡したと発表した。