Ζガンダム
第二稿も変形できるとされてはいるものの具体的な変形方法は描かれていない。これらのデザインはのちに藤田一己によってクリンナップされ、百式となった。またΖガンダム(頭部)、リック・ディアス、ガンダムMK-II、ネモ(シールド)、小説版ガンダムMk-II(エプシィガンダム)、小説版百式などのデザインの基ともなっている。
大河原邦男が最初に描いたのはRX-78ガンダムのイメージを色濃く受け継ぐもので、それにMSVやMS-Xの流れも取り入れたデザインだった。次に永野のコンセプトデザインを参考に7点ほどのデザインを描いたが、初めはV字アンテナやツインアイといったガンダム的記号の無い頭部など新しいデザインを模索していた。しかし、ガンダムMk-IIの登場が決まったために途中からRX-78の延長線上にある後継機的なデザインの方へと移行して行った。
それ以外にも、様々なデザイナーにより、Ζガンダムという作品の方向性を模索するための特定のMSを意識しない、それまでのMSに代わる新しいコンセプトのデザインが提案された。藤田一己もいくつかデザインを提出し、Ζガンダムのデザイナーに起用された。
『機動戦士ガンダムΖΖ』では、テレビ版『Ζ』でのメールシュトローム作戦終了後、修理もままならない状態でアーガマに置かれている。同艦はサイド1コロニー「シャングリラ」に寄港するが、ジャンク屋を営むジュドー・アーシタとその仲間達が本機に目をつけ、盗んで売り払うために侵入、ジュドーは成り行きから本機に搭乗する。この際、彼は初陣とは思えぬ操縦でΖガンダムを動かし、ティターンズの残党ヤザン・ゲーブルを撃退する。その後、「シャングリラ」制圧を目論むネオ・ジオン軍のマシュマー・セロ率いる巡洋艦エンドラのMS隊に対抗するため、ファ・ユイリィ(第5、7話)やアストナージ・メドッソ(第6話)も一時的に搭乗するが、いずれもジュドーに操縦を交代し、撃退している。
そのうちにジュドーはアーガマの一員となり、本機のメイン・パイロットとなる。再びアーガマの主力として活躍し、エンドラのMS隊の襲撃を幾度も退ける。しかし、第11話でハンマ・ハンマの猛攻によって頭部を破壊されてしまい、以降ジュドーは入れ替わるように配備されたΖΖガンダムのメイン・パイロットとなる。第16話でアーガマはラビアンローズと合流、その際に頭部の修理が完了し戦線に復帰、第17話からはルー・ルカがメイン・パイロットを務める。ただし、大気圏突入時や地上ではΖΖガンダムより小回りが利くという理由で、ジュドーが本機に搭乗することも多い。
ほかの搭乗者としては、ビーチャ・オーレグが4回(第20、33、41、42話)ともっとも多く、初出撃時にはほかのMSとは違う本機のパワーに驚嘆している。
発射寸前のコロニーレーザー内でキュベレイとの戦闘時にはビームサーベルを投げ、回転するサーベルのビーム部分にビームライフルを撃つ(当てる)ことでビームを拡散させる技「ビーム・コンフューズ」を使い、キュベレイのファンネルをまとめて撃ち落としている。
ジ・Oに回し蹴りを仕掛けた直後、テレビ版と同様にWR形態での体当たりにて撃破。超常の力を発揮して呆然となったカミーユが我に返るのと同期するように、(破損した)シールドとフライングアーマー、ロングテールスタビライザーを切り離しつつMS形態へと緩やかに変形。ファがメタスで回収のために迎える。
なお、劇場版は3部の公開前に1〜2部がアニマックスにて放送されており、その際に福井晴敏、Gackt(現・GACKT)と対談した富野由悠季は「Ζガンダムの変形がゆっくり見られなかったのが残念」と発言した。これについては後に、「思い切りネタバレになってしまうためにこの結末(3部のこのシーン)について何も言えず悔しい思いをした」と語っている。
漫画『機動戦士ガンダム ジオンの再興』などに登場。Ζガンダムの本格量産型。部品を地球連邦軍の規格に変更、コストダウンと軽量化に成功したが、耐久性は低下している。主武装は実体弾を射出するEG-120 スマートガン(新ジオンの再興ではハイパーメガランチャー)。WRでの姿勢はアニメとは上下反対だが、大気圏突入時はアニメと同じ姿勢になる。フライングアーマーは宇宙用と大気圏内用があり、大気圏内用は翼の部分が可変後退翼になっており、かつてのF-14戦闘機を思わせる姿をしている。また、両フライングアーマーともハードポイントがあり、爆弾、ミサイル、増槽が搭載可能。
作中では、大気圏突入をしてスカンジナビア半島のジオン軍基地を攻撃、作戦終了後フライングアーマーなど装備を換装のうえ、地球上での長距離攻撃任務に就く汎用性を見せている。また、空挺師団の主力機として複数が運用されており、制空権確保のための制空戦闘も行っている。
漫画『機動戦士ガンダム 新ジオンの再興』では、大型のキャノン砲を装備した長距離射撃用Ζガンダムや、円盤状のレーダーを備えた早期警戒管制機リコン・ゼータも登場している。
非変形タイプの百式系列の機体とは異なり、設計をδ(デルタ)計画案本来の可変タイプまで差し戻し、再設計した試作機。百式 (ガンダムシリーズ)#デルタガンダム、百式 (ガンダムシリーズ)#デルタプラス、百式 (ガンダムシリーズ)#ガンダムデルタカイ
脚部の変形とほぼ同じタイミングで腰部左右のスカートアーマーがそれぞれ上下反転して前方へと移動、機体の側面部を保護するパーツとなる。
フライングアーマーから翼が引き出されてWRへの変形が完了。
非常に複雑なものであるが、設定では0.5秒ほどでMS形態からWR形態へ変形を完了する。アニメにおいても上記の行程が間断なく、多くが同時進行され瞬時に変形する様子が描かれており、後期オープニングのラストシーンでも本機はMS形態からWR形態へと一瞬で変形して飛び去る。しかしアーガマからの発進時など、変形シーンが見せ場となる場合はより時間を掛けて演出されており、初期はWRへの変形完了時に引き出される翼の表面にハイライトが走るなど作画も丁寧なものとなっている。
WR形態からMS形態への変形は先述とは逆の手順となり、同様に見せ場とされている。その際、変形を回転しながら行う演出がバンクシステムとして用いられた。『機動戦士ガンダムΖΖ』第1話「プレリュードΖΖ」では、その映像をクワトロ・バジーナが本機の変形シーンとして説明しており、シンタとクムがカミーユが目を回さないことに驚いている。
ムック『マスターピース ゼータ・ガンダム』に登場。ここで登場するものは性能評価試験用に2号機を換装した電子戦用テスト機であり、サブユニット(シールド)を大型ディスクレドーム装備のものに換装したアナハイム・エレクトロニクス社の機体。書籍『機動戦士Ζガンダム大事典』(ラポート)には中表紙の池田繁美によるイラストで「02」のマーキングが入った赤いΖガンダムが登場している。