李卓吾
官職引退後に刊行した詩文集『焚書(ふんしょ)』(1589年)には耿定向との往復書簡が納められ朱子学及びそれを信奉する道学者への厳しい批判が込められていた。そのため、周囲から危険思想と断定され、様々な圧力をかけられた。『焚書』を公刊した後からは、地方の郷紳や学者から迫害を受け、龍湖に住んでいた70歳の年(1596年)には巡道(地方の司法長官)史氏が「李卓吾はまだいるのか、この人物は大いに空気を汚している。もし立ち退かないなら法に照して処置しよう」(『続焚書』巻一、答来書)と郷紳たちに言ったという。
李卓吾への批判はその思想だけでなく生活習慣(僧形となったこと、剃髪、極度の潔癖症であったこと、女性にも学問を講義したこと)にまで及び、彼を悩ますことになる。62歳の時に落髪出家(剃髪)を行ったとされる。李卓吾自身は、儒書をまとめた『初潭集』を編集するなど儒者の精神を捨てたわけではなかったが、世間で剃髪は”世俗との訣別、儒者の放棄”と受け取られる行為として、役人などからも大きく批判され、迫害や逮捕につながるものとなった。また李卓吾への批判はその思想の特異性のみならず、彼の性格に拠るところも大きい。自ら狷介・偏狭と述べ憚らず、世と相容れないこと甚だしかった。
また73歳で南京で出版した歴史人物評論集『蔵書』も逮捕投獄の原因の一つともなった。結局、迫害を逃れたさきの北京近郊で逮捕された。そして獄中で自殺。享年76。
死後も弾圧は止まず、著作やその出版の版木は既刊、未刊問わず全て焼却、遺棄され、王朝が清に移り変わっても禁書目録にその著作は載せられることになる。また『明儒学案』(明代の学者を羅列して、その学問の系統を明らかにした書)にもその名は記されていない。