遺伝的相補性
これらのルールには例外がある。二つの対立遺伝子でない変異型が、ときおり相補性を示さないことがある(「非対立遺伝子的な非相補性」や「非連鎖的な非相補性」などと呼ぶ)。この状況は稀で、検定された変異型の特殊な性質に依存している。例えば、二つの変異は組み合わさったときだけドミナントネガティブになるのかもしれない。もう一つの例外はトランスベクションであり、このとき同じ遺伝子の異なる部分の変異に関する二つの対立遺伝子についてのヘテロ接合が、野生型表現型を示す。