忍者列車
また201号の運転台側乗務員用出入口のドア横に松本零士の直筆サインが書かれている。。200系はステンレス鋼製であるため、フィルムによるラッピングとなった。
カーテンには手裏剣柄のデザインが施されており、網棚には忍者のマネキン人形が設置されている。
2016年(平成28年)、緑色の忍者列車の内部が三重県産の木材を使用して改装された。これは伊賀線開業100年の記念事業として行われたものであり、総額2,400万円が改装に費やされた。そのうちの1,800万円には「みえ森と緑の県民税」が活用された。カエデやヒノキなど、合計5種類の木材が車内の壁や吊り輪などに使われており、一部の吊り輪は手裏剣の形状に加工されている。木材を使うことが難しいドアや床には木目調のシートが貼られている。12月11日に運行が開始された。
860系(1997年 - 2011年) 861編成(青色→緑色) 866編成(ピンク色)
200系(2009年 - ) 201編成(青色) 202編成(ピンク色) 205編成(緑色)