奥羽越列藩同盟
秋田南部での戦いでは、薩長兵や新庄兵が守る新庄城を数で劣る庄内藩が激戦の末に撃破し、秋田に入った後も、列藩同盟側は極めて優勢に戦いを進めていた。特に、庄内藩の鬼玄蕃と呼ばれた家老・酒井吉之丞は二番大隊を率い奮戦した。彼は、最初から最後まで負け戦らしい戦闘を経験せず、同盟側の多くが降伏し、庄内領内にも敵が出没するという情勢を受けて、現在の秋田空港の近くから庄内藩領まで無事撤退を完了させて、その手腕を評価された。
秋田北部の戦いでは盛岡藩は大館城を攻略した後、きみまち坂付近まで接近するものの、新政府軍側の最新兵器を持った兵が応援に駆けつけると形勢は逆転し、多くの戦闘を繰り返しながら元の藩境まで押されてしまう。盛岡藩領内へ戻った楢山佐渡以下の秋田侵攻軍は、留守中に藩を掌握した朝廷側勢力によって捕縛され、盛岡藩は朝廷側へと態度を変更しはじめた。
結果として、久保田領内はほぼ全土が戦火にさらされることになった。
幕末期、会津藩主・松平容保は京都守護職、庄内藩主・酒井忠篤は江戸市中取締を命ぜられていた。特に会津藩は一会桑政権を構成し、長州藩、後に薩摩藩と対立していた。
仙台藩は62万石という、奥羽随一の石高を持ち、藩主である伊達慶邦は従四位上左近衛権中将という高い位階を持っていた。開国以来の政治的変化に対し、奉行の遠藤允信らは朝廷と接近し、積極的に中央に介入しようと主張し、藩に利益のない中央情勢への介入を嫌い、現状維持を主張する但木土佐らの勢力と対立していた。文久3年(1863年)1月には遠藤らが失脚、慶邦は幕府の政事総裁職就任も断り、政局から距離を置く方針を明確にしていた。