鹿児島鉄道事業部
※管轄境界駅については、鹿児島鉄道事業部が管理を担当している駅を記載している。
鹿児島本線(川内 - 鹿児島間)
日豊本線(財部 - 鹿児島間)
肥薩線(吉松 - 隼人間)
吉都線(全線。ただし、都城駅は宮崎支社の管轄)
日南線(福島高松 - 志布志間)
指宿枕崎線(全線)
1999年(平成11年)6月1日 - 鹿児島鉄道事業部発足。
2008年(平成20年)4月1日 - 霧島高原鉄道事業部および指宿鉄道事業部と統合。
2011年(平成23年)4月1日 - 鹿児島総合車両所の工場業務廃止に伴い、同所の車両基地部門が鹿児島車両センターとして本事業部の下部組織となる。
2022年(令和4年) 3月31日 - 吉松運輸センター廃止。 4月1日 - 鹿児島鉄道事業部廃止、支社本体に機能を統合。 9月22日 - ダイヤ改正に伴い、在来線での車掌業務を廃止。