藤原育子
そして、育子の兄基実が関白から摂政に転じて、幼主を輔佐した。
仁安元年(1166年)には基実も亡くなり、ほかの大臣達も死没したり鞍替えしたりして、実権は二条の生前から対立していた後白河院に移った。後白河院は治天の君として二条死後の政治を牛耳り、寵愛する平滋子所生の憲仁親王(高倉天皇)を東宮に押し込んだ。仁安元年(1166年)10月10日に行われた立太子の儀は、天皇が3歳、しかも甥であるのに対し、6歳の叔父が東宮に立ったわけで、非常な異例と評された。
仁安三年(1168年)2月19日、六条天皇は、連携する後白河院・平清盛によって高倉天皇に譲位させられた。その後は、元服も行われず、異例の「童形の上皇」として、安元2年(1176年)7月17日、13歳で崩御した。
六条天皇の養母である育子は、天皇退位の同年10月9日に出家した。承安2年(1172年)2月10日、新たに高倉天皇の妃平徳子が中宮に冊立されたため、称号を皇后宮に改められた。六条天皇の死去に先立つこと3年、承安3年(1173年)8月15日に28歳で没した。