ジャフナ駅
1983年、スリランカ内戦が勃発するとノーザンラインは兵員輸送手段として活用された。そのためヤル・デヴィ号も反政府組織の攻撃対象となった。1985年1月19日、反政府組織タミル・イーラム解放機構(TELO)によってムッライッティーヴー県を走行中の列車が爆破され、兵員22名を含む34名が死亡した。そしてその翌年3月25日にもバブニヤ - プリヤンクラム間を走行中の列車が攻撃された。その後線路はインドから派遣されたインド平和維持軍(IPKF)によって再敷設され、1987年8月にはジャフナ - コロンボ間を結ぶ列車の運行が再開された。しかし、治安が悪化し続ける中で列車を利用する人はほとんどいなかった。1990年にIPKFが撤退すると、タミル・イーラム解放のトラ(LTTE)はジャフナを含むIPKF支配地域のほぼ全てを占領した。そして同年半ばにはLTTEとスリランカ政府の間で結ばれていた休戦が破られ、全面戦争となった。特に最重要奪還目標とされたジャフナ周辺はスリランカ軍の猛攻にさらされ、ジャフナ駅には数百名の民間人が避難した。しかし同年8月9日にはスリランカ空軍がジャフナ駅を爆撃し、列車6両が破壊され8名が死亡した。同年6月13日にジャフナへ到着した列車は線路が破壊されたためコロンボへと戻れなくなった。また8月16日にも駅舎への爆撃が行われた。その後数年間でカンカサントゥライ - バブニヤ間の線路は完全に破壊され、廃棄された客車はスリランカ軍、反政府軍それぞれの陣地として利用された。