長崎運輸支局
佐世保自動車検査登録事務所:長崎県佐世保市沖新町5-5 ここで交付される自動車のナンバープレートは「佐世保」になる。
佐世保海事事務所:長崎県佐世保市干尽町4-1 佐世保港湾合同庁舎
厳原自動車検査登録事務所:長崎県対馬市厳原町久田645-8 ここで交付される自動車のナンバープレートは「長崎」になる。