マンダリン航空
ボーイング747-SP型機
マクドネル・ダグラスMD-11型機
ボーイング747-400型機 (マンダリン航空唯一の自社発注機。チャイナエアラインに転籍し、同社にて運航中。)
エアバスA340-300型機 : 1機 (中華航空の所有する機体だが、マンダリン航空の塗装をしていた。)
ボーイング737-800型機
フォッカー 50型機
フォッカー 100型機 : 3機
ドルニエ 228型機
エンブラエル 190型機
ボーイング747SP
マクドネル・ダグラス MD-11
フォッカー50
フォッカー100
エンブラエル190
台北/桃園 - 福州、 長春、麗江、瀋陽、長沙、南京、寧波、廈門、鄭州
台北松山 - 福州、武漢
台中 - 香港
高雄 - 廈門、杭州、長沙、香港
2023年8月現在
台中 - 大阪/関西 (2014年3月29日をもって運休。親会社のチャイナエアラインへ翌30日から移管。詳細は下記)
2009年11月に、陸台路線の次に東京/成田への利用客が多いことなどから、2010年1月より初の台中-東京/成田線に週3便の定期チャーター便を運航する予定、2010年10月の東京国際空港(羽田空港)の拡張工事の状況次第では台中-東京/羽田線の就航も検討すると発表されたが、2012年2月現在実現されていない。2011年12月には日台間のオープンスカイにより、台北/桃園 - 石垣線、台中 - 沖縄/那覇線、高雄 - 大阪/関西線の定期国際線就航の申請を行った。2013年11月27日から台中 - 大阪/関西線が就航した。しかし2014年3月29日をもって運休し翌30日から親会社のチャイナエアラインに移管された。
台北/桃園 - 麗江 (2015年8月1日から)
高雄 - 沖縄/那覇 (2015年3月29日、夏期スケジュールより親会社のチャイナエアラインへ移管)
高雄 - ホーチミンシティ (2015年3月)
台北/桃園 - カリボ(パナイ島・ボラガイ島) (2015年10月25日、冬期スケジュールより親会社のチャイナエアラインへ移管)
台中 - ソウル/仁川(2018年6月16日から)
台北/松山 - 温州
台北/桃園 - 塩城
台中 - 寧波、杭州、梅県(中国語版)、無錫
高雄 - 梅県
台中 - 東京/成田、那覇、ハノイ