ニピゴン湖
1763年パリ条約が締結された後、この地域はイギリスに渡され、ハドソン湾会社がその交易の範囲をニピゴン湖を含む範囲まで拡大した。イギリス領北アメリカに組み入れることも検討されたが、スペリオル湖に注ぐ流域が正式にオジブウェ族インディアンからカナダ植民地に譲渡されたのは1850年になってからだった(ロビンソン条約)。ミシェ・マックァ酋長のためにニピゴン湖に近いガル川の両岸に4平方マイル (10 km) の居留地が取っておかれた。1871年ニピゴン湖は新しいサンダーベイ地区に組み込まれた。
ニピゴンのタウンシップは1908年に法人化された。グリーンストーンの自治体は2001年に法人化され(人口5,662人)、オリエントベイ、マクディアミッド、ベアドモア、マキナ、ロングラック、カラマット、ジェリコー、ジェラルドトンを含んでいる。
1943年、カナダとアメリカ合衆国は、ジェームズ湾に流れてその後ハドソン湾に行く水を、スペリオル湖にかわすオゴキ迂回を行うことに合意した。この迂回路はオゴキ川の上流をニピゴン湖に接続する。この水はニピゴン川の水力発電所3基を支援するために使われる。迂回は1914年に国際合同委員会が設立した国際スペリオル湖制御委員会が管理している。
ニピゴン湖州立公園がニピゴン湖の東側にある。1999年この公園の面積が14.58 kmから9.18 km まで減らされるよう境界が修正された。その土地はサンドポイント・ファーストネーションのために保留するべくカナダ政府に戻された。
最終氷期が終わった時、当時のニピゴン湖はアガシー湖の排水経路の一部だった。
フランスのイエズス会クロード・アルーズが1667年5月29日にニピゴン川の傍で最初のミサを行った。アルーズは、1649年から1650年に起こったイロコイ族の襲来のときに、そこへ逃げてきたニピシング族インディアンの村を訪れた。イエズス会ではそこの湖が「ラク・アリミベグ」と呼ばれており、その後「アレミピゴン」あるいは「アレピゴン」と呼び方が変わった。この言葉は「連続した水」あるいは「水平線の向こうにのびる水」を意味するオジブウェー語の「アニムビイグーング」から派生した可能性がある。ある資料では、この名前が「深く、澄んだ水」とも訳されると言っているが、この記述はタマガミ湖のものである。今日、オジブワ族はニピゴン湖を「アニムビイグー・ザアガ・イガン」と呼んでいる。
1778年、ジョン・ミッチェルによる地図では湖を「ラゴ・ネピゴン」、その出口を「F・ネンピサキ」と記していた。1807年のジョン・キャリーによる「アッパー・カナダとローワー・カナダの新しい地図」では、湖は「レイク・セント・アンあるいはウィニンピグ」と呼ばれており、川の方は「レッドストーン川」となっていた。今日、ニピゴン川沿いに住むレッドロック・ファーストネーションは、レッドストーンという名前を持っている。1827年のフィリップ・バンダーメーレンによる地図「新しいブレターニュの部分」では、湖は「L・サンテアン」と呼ばれ、川の方は「ニピゲオン川」とされている。