南魚沼郡
●は寺社領、○は寺社除地が存在。(178村)
慶応4年 5月 - 郷村からも兵が召集された閏4月21日から24日の三国峠の戦い、同27日の小出島の戦いの後、新政府軍の統治下に置かれる。小千谷民政府が治安維持に当たった。 7月27日(1868年9月13日) - 幕府領が柏崎県(第1次)の管轄となる。
明治元年 9月22日(1868年11月6日) - 会津戦争で会津藩が新政府軍に降伏して領地を没収され、領地が柏崎県の管轄となる。 11月5日(1868年12月18日) - 柏崎県を廃して新潟府に合併することが布達される(実行されず)。
明治2年 2月22日(1869年4月3日) - 再度柏崎県を廃止する布達が出され、越後府(第2次)に合併。 8月25日(1869年9月30日) - 旧・柏崎県の管轄地が柏崎県(第2次)の管轄となる。
明治初年 - 大倉新田・川棚新田が大倉村に合併。(176村)
明治4年 11月20日(1871年12月31日) - 第1次府県統合により全域が柏崎県の管轄となる。当郡域には第四大区が置かれ21の小区に分けられる。 奥村新田・蓑和島村が合併して奥村となる。(175村)
明治6年(1873年)6月10日 - 全域が新潟県の管轄となる。当郡域には第十三大区が置かれ九つの小区に分けられた。
明治5年(1872年) - 小栗山本新田・小栗山今新田が小栗山村に合併。(173村)
明治8年(1875年) - 干溝新田が干溝村に、明川新田が山口村にそれぞれ合併。(171村)
明治9年(1876年) - 泉孫新田が泉村に合併。(170村)
明治10年(1878年) - 思川新田が思川村に、中野新田が中野村にそれぞれ合併。(168村)