源氏将軍
しかし、朝廷は信忠譲渡は無視し、正親町天皇は、その後も天正9年3月7日、信長に左近衛大将に就任するよう勧めたり律令制官職体制に戻そうと努める。そして京都所司代の村井貞勝に相談したところ「征夷大将軍、太政大臣、関白」の案が信長の相談なしに勇み足的に出されたと言われ、そのまま、安土城に勅使を出したが、信長は突然の申し出に戸惑い、返事をしないままとなった(三職推任問題)。だが信長は平氏が本姓だが、朝廷内に征夷大将軍に推すことに何らの疑問や議論もなく、源氏でなければ将軍にしないという認識はまるでなかった。
本能寺の変での信長横死の後で、羽柴秀吉は公卿に任じられた際、征夷大将軍を兼任するように推されたが断っている(『多聞院日記』天正12年(1584)10月16日条)。その後天下統一し、近衛前久の猶子となって関白に任ぜられ豊臣政権を開く。なお江戸時代になり江戸幕府の儒者の林羅山が、「秀吉が将軍職を欲し、室町幕府15代将軍の足利義昭に猶子とするよう要請し断られた」と書いたが何の史料もないことであり、単なる豊臣家を貶め、徳川将軍の体制を高める宣伝に過ぎないと言われている(『豊臣秀吉譜』)。
豊臣政権の後、藤原姓を称したこともある徳川家康が源氏として征夷大将軍に任ぜられ、日本史上3人しかいない幕府開府者がいずれも源氏だと、源氏でなければ将軍になれないという源氏将軍神話、源氏将軍信仰が徳川幕府から広められたと考えられている。