鞘甲亜綱
1950年代から2000年代にかけて、鞘甲類は鰓尾類やカイアシ類など数多くの小型甲殻類の亜綱と共に、顎脚類(顎脚綱 Maxillopoda)としてまとめられてきた。しかし2000年代以降では、主に分子系統解析の進展により、顎脚類は他の汎甲殻類(甲殻類+六脚類)に対して多系統で解体され、そのうち鞘甲類とカイアシ類は、むしろ軟甲類と単系統群(多甲殻類 Multicrustacea)になることが支持される。多甲殻類の中で、鞘甲類は軟甲類(共に共甲類 Communostraca をなす)とカイアシ類(共に六幼生類 Hexanauplia をなす)のいずれかの姉妹群とされるが、2010年代中期以降では、六幼生類説の方が相対的に有力である。それ以外では、ヒメヤドリエビ類(Tantulocarida)との類縁関係も示唆され、これが鞘甲類の内部系統に含まれる可能性もある。