在日特権を許さない市民の会
犬塚博英は、2013年10月31日に中野区内で開かれた「行動する保守運動の矜持とは何なのか?」というシンポジウムに出席して『在特会からは「これからの日本をどうするか」というビジョンが見えないし、それについて真剣に考察した跡がみうけられない』『これまで「在日特権」なるものについての、具体的かつ説得力のある説明を受けたことがない。』という趣旨のことを述べている。
朝鮮大学校は「テロ国家北朝鮮」の出先機関であるとして、解体を目的とした抗議活動を外国人参政権に反対する会・東京、排害社、日本侵略を許さない国民の会などの他の団体と共同で行っている。
2015年12月12日、神奈川県横浜市にある韓国総領事館の駐車場において、「姦酷塵による靖国爆破への報復です 在特会」と書かれた箱が見つかり、警察が出動する騒ぎになった件について、一切関与していないとの声明を発表した。また、「英霊を侮辱し、当会を著しく貶める事件」「在特会に対する名誉毀損」などとする抗議声明を発表した。
参加者が対立勢力の関係者と乱闘騒ぎを起こしたり、対立勢力に暴力を振るわれたりするという事態も起きている(#在特会に抗議する団体)。幹部・会員が活動に際して業務妨害や器物損壊などの行為に及び、刑事責任を問われたケースも複数存在する。さらに元会長である桜井誠はヘイトスピーチによって賠償命令を受けており、最高裁に上告したが敗訴している。
朝鮮学校が高校授業料無償化の対象になる可能性が菅直人内閣の総辞職の直前に再び出たため、無償化に対する抗議活動を行っている。桜井は抗議活動の際に「朝鮮学校無償化は日本国憲法第89条に違反している」と非難した。また無償化に対する抗議文を文部科学省に提出した。