Deus Ex
声 - リチャード・ゴーベール
UNATCOの電子機器の総合的管理担当。またハッキングなどの敵の機密情報を探る技も持っている。J.C.が見ている光景を常時監視しており、状況に応じて指示をしてくれる。
また弾薬がフルに入っているので、現在所持している武器を捨てて、同じ武器をもう一度入手して弾薬補給することも可能(その場合、古い武器は消える)。弾薬はマップ内の弾薬箱から補給する。一回の補給で1マガジン分の補給が可能。ただし従来のものより所持弾薬数が大幅に制限されているので、補給率も低い。
ベース戦に関しては、自分の基地に添えつけてある自動砲台が敵を攻撃してくれたり、またMultiToolで敵の警備装置を解除したりも出来る。ただし一定時間でリセットされる。またGrenade系の武器で自分の基地を守ったりも出来る。また一部のマップではMedical BotやElectric Botなどが用意されているが、大概はLockPickやMultiToolで解除して使う仕様になっている。これらのBotは殆ど採用されないことが多い。
オーグメンテーションに関してはサーバによって異なる。大体は使えない場合が多い。逆にEnergy Shieldが最初から効果が付いているという場合もある。
環境抵抗。発動中、持続的な毒攻撃(敵の吐く毒やトランキライザーの矢による筋弛緩剤の攻撃)や放射能、毒ガスやハザードガスにおけるダメージを軽減する。レベルを上げることによってその効果は増大し、レベル4であれば90%ものダメージを軽減する。ある敵が強力な放射能を身に纏っているので、それによるダメージを防げるので便利。またレベル4の場合、弱性の放射能におけるダメージが一切入らないようになる。
催涙ガスをばら撒き、敵味方関係無く人間の動きを一時的に封じる。その効果時間はスキルに比例し、レベルによってはかなりの時間動きを封じることも可能。ただし自分が効果範囲にいた場合、視界が悪くなるのと同時にダメージを受ける。日本語版では、呻き声は出るがガスに当たっても一切ダメージが入らないよう修正されているが、水中では英語版同様ダメージを受ける。よく仕掛けられているため、ゲーム全体でかなり多く手に入る。
声 - ジョン・ウィリアム・ガルト
UNATCOに所属するステルスヘリコプターの操縦士。元はエリア51で働いていたらしい。バーでJ.C.と知り合って以後、行動を共にするようになる。香港在住。
声 - ジェイ・アンソニー・フランケ
主人公。国連の反テロリスト組織“UNATCO”に所属しているエージェント。“J.C. Denton”という名前はコードネームであり、本名は自分で決められる。肉体と機械が細胞レベルで融合するサイボーグ技術「ナノ・オーグメンテーション」が施されており、身体の至るところに特殊な機能を発動させる装置が備え付けてある。頭脳明晰で、プレイヤーの選択によって思いやり深くも冷血漢にもなりうるが、表面的には感情をあらわすことは滅多になく、一匹狼的な性格をしている。彼の視覚情報はリアルタイムでオペレーターに転送される。両親は交通事故により死去したと聞かされている。ファーストネームの「J.C.」はJesus Christを意味する。
微小繊維筋。発動中、通常では持つことの出来ない重いものを持ち上げることが可能になる。レベルを上げることにより、より重いものを持ち上げられるようになり、バリケードなどを作ることも可能になる。
Riot Control Batonの強化版。使うにはProd Chargerのバッテリーを使用する。当て方が悪く一発で仕留められなくても相手の動きを封じることが出来る。また攻撃対象も大幅に増え、スキルが4の場合、後ろから狙えばオーグメンテーションを使う敵やモンスター、Bot以外はこれで倒せる。Riot Control Baton同様、敵を気絶させた場合音が立たないため他の敵が警戒しづらい。40発まで所持可能で、連続使用は4回まで。4回使うと充電に入る。なお、これとRiot Control Batonは頭より腰付近を狙った方が気絶させやすい。
人工心臓。発動中、他のオーグメンテーションのレベルを1上昇させる(最大でレベル4であり、レベル5にすることは出来ない)。このオーグメンテーションはレベル1で固定。