隠岐騒動
4月1日、中西毅男は明治政府から、隠岐が天朝領であることの確認と自治の認定を受けようと京都へ向かったが、思うような回答がないまま時が過ぎた。
一方、松江藩は隠岐の早期の奪還を画策しており、1868年4月13日に新政府太政官から隠岐取締りの指令が出された。4月末から松江藩兵が次々と上陸し、5月10日の戦闘により松江藩は陣屋を奪還した(死者14人、負傷者8人)。しかし、新政府は島民の取締りに兵力が用いられたことや、その事件の経緯が鳥取藩(因州藩)によって間接的に伝えられたことなどを問題視し、隠岐に監察使を派遣して取り調べを行うことを指示した。鳥取藩は事件の収拾の名目で景山龍造を派遣した。このとき隠岐には会津討征のために長州藩の丁卯丸と薩摩藩の乾行丸が入港しており、景山と丁卯丸を率いる山田顕義に面識があったことから、鳥取藩のほか薩摩藩と長州藩も事態の収拾にあたった。5月28日には新政府から派遣された土肥謙蔵(鳥取藩出身)が隠岐に到着したため景山は隠岐を離れた。松江藩は土肥の取調べを受け、最終的に藩兵側から発砲したことを認めた。その後、明治元年11月6日に鳥取藩に対して隠岐取締りの指令が出され、鳥取藩に事務が引き継がれた。なお『隠岐島誌』では土肥の離島後に会議所や総会所などの機関が一時的に復活したとする一方、この一件により松江藩から鳥取藩の支配に帰したと記しており明治新政府は自治を公式には認めていなかったとされている。鳥取藩による管轄も隠岐県の設置により終了した。
明治4年、島民と松江藩双方の騒動に関係した者が罰せられ、一連の騒動は決着した。