イデ
ソロ・シップのクルー達は“イデ”をコントロールする方法を最後まで突き止められずに崩壊し、“イデ”は彼等を残滅してしまった。しかし、メシアの存在と彼が生まれるまでのルウの存在のおかげで、ただ全滅する事態は避けられた。次への再生のため第六文明人の意志(霊的な部分)は、自分が再生を何度繰り返してでも全部すくい取っておかなければ、“イデ”の保全性が侵される可能性があると判断していた。ギジェを大人の水先案内人にして、メシアを全人類の水先案内人に仕立てたのも、この『種』(第六文明人)の意志を継承させる為だったのである。
『アニメック』で「イデとは何か?」と聞かれた富野由悠季は「マジンガーZのジャパニウムと同じ、一口に言えば《知的生物の認識力の集中した場》と思ってください」と答えた。
劇中前半の“イデ”はイデオナイトのシステムから作られたエネルギーと提示されていた。しかし物語後半では、数億の第六文明人の意志(認識力)の集積して作り出された1個の意志集合体であり、“イデ”本体はシステムのラチ外に存在しながら精神エネルギーシステムを超えた知的生命体の最終進化の一つの可能性たる概念、純粋精神体とも称される。
具体的には第34話「流星おちる果て」において、イデはジョーダン・ベスに自らを「幾千、幾万、幾億の意識集合体」であると語りかけ、また「自分達にはなりゆきを作り出すような力はなく、我々は我々という1つのものに過ぎない」と回答し、心のありどころたるイデの場を守る権利があると主張。劇場版の接触篇では、カララ・アジバに輸血を受けて気を失ったユウキ・コスモの夢で、イデは「自らを守り生かすために新たな力を必要とし、そのために戦わせる」と主張した。コスモはイデを「俺たちは生贄じゃあないんだ!」と拒絶し、ベスは「共に苦しむべき立場なら全力を尽くし、善き道を探すべきと歩み寄って、そのような力を全力で示せば意志の力は時空さえ越えられるはずだ」と語るが、イデは答えを返していない。
メシアが受胎したことによって、メシアを媒介にして地球、バッフ・クラン間の戦争終結を図り、善き道を切り開くことを考えた“イデ”は、当初の「発動」タイミングをずらした。第39話で、“イデ”が強引にカララ・アジバをバッフ・クラン軍のドバ・アジバ総司令の元へテレポーテーションさせて対面させたのは、その意図の実践である。しかし、この和平交渉は失敗に終わり、“イデ”はもはやこれまでと諦めて「発動」した。
メシアはその純粋さから最も“イデ”に近い存在であるが故に、“イデ”が「発動」して、意志だけとなっても、地球、バッフ・クラン双方の全人類を率いて新しい星へ導く事となった。彼は、かつてパイパー・ルウが行ってきた“イデ”の代弁的な役割を引き継いで、双星人類の水先案内人となったわけである。