長崎市立長崎商業高等学校
野球部 - 春の甲子園出場2回、夏の甲子園出場8回
柔道部
剣道部
弓道部
陸上部
ソフトテニス部
バスケットボール部
バレーボール部(女子)
水泳部
卓球部
バドミントン部
ソフトボール部(女子) - 選抜大会出場9回(3位1回)、高校総体出場18回(優勝1回、3位1回)。
ハンドボール部
応援部