極秘指令 ドッグ×ドッグ
そんな中、エリックの前任者で「戦車」の親友だった「力」が死に至るきっかけとなったヘマを犯した下請け工作員がエリックであることが判明する。そんなエリックが何故ファクトリーにやって来たのか、謎を残したまま、エリックと「節制」は協力することで何とか生き残り、2人は爆破ギリギリで脱出に成功する。
一方、警備・監視ルームでは「悪魔」が死ぬ直前に残したボイスメールが再生され、ファクトリーが行なって来た悪事の全てを明らかにする証拠のファイルが、「悪魔」の古くからの恋人である人事担当のスーザンに託されていたことが明らかになる。実はそのファイルを回収するためにスーザンが送り込んだのがエリックだったのだ。エリックは「節制」を殺害すると回収の成功をスーザンに伝え、スーザンの手引きで高飛びする。スーザンは全てを知ってしまった監視役のニールとカールを射殺する。
2009年1月20日、オバマ新大統領の就任に全米が沸き立つ中、旧政権下で極秘ミッションに関わって来た「ファクトリー」と呼ばれる非合法工作組織にエリックが着任する。地下の秘密オフィスに初出勤した彼には「愚者」のコードネームが与えられ、ファクトリーの2つのチーム「オメガ」と「アルファ」のうち、オメガに配属される。そこでエリックはアルファのメンバーで「節制」と名乗る元恋人キャシーと再会する。そんな中、2チームを統括する「悪魔」が何者かに殺害され、ファクトリーのメンバーを秘密オフィスごと爆破する「終末計画」が作動する。メンバーらは秘密の脱出口を探すために、オメガとアルファのメンバーで1人ずつコンビを組んで互いに監視し合うことにする。ところが、アルファのメンバーには密かにオメガのメンバーを殺害する命令が下されていたことから、メンバーらは血みどろの激しい殺し合いをすることになり、次々にメンバーは死んで行く。