週刊少年サンデー
この前後から長期連載や人気作が次々と終了し、部数が低迷。1990年代以上に積極的なメディア展開を行うようになり、『リベロ革命!!』(田中モトユキ、2000年)、『トガリ』(夏目義徳、2000年)、『金色のガッシュ!!』(雷句誠、2001年)、『うえきの法則』(福地翼、2001年)、『KATSU!』(あだち充、2001年)、『焼きたて!!ジャぱん』(橋口たかし、2002年)、『史上最強の弟子ケンイチ』(松江名俊、2002年)、『美鳥の日々』(井上和郎、2002年)、『D-LIVE』(皆川亮二、2002年)、『ワイルドライフ』(藤崎聖人、2003年)、『MÄR』(安西信行、2003年)、『結界師』(田辺イエロウ、2003年)、『クロザクロ』(夏目義徳、2004年)、『ハヤテのごとく!』(畑健二郎、2004年)、『最強!都立あおい坂高校野球部』(田中モトユキ、2005年)、『ブリザードアクセル』(鈴木央、2005年)『クロスゲーム』(あだち充、2005年)、『絶対可憐チルドレン』(椎名高志、2005年)、『GOLDEN★AGE』(寒川一之、2006年)、『ダレン・シャン』(原作:ダレン・シャン・漫画:新井隆広、2006年)、『ギャンブルッ!
2020年夏、新型コロナウイルスの影響で、作家への新型コロナ対策として、2020年27・28臨時合併号、31・32臨時合併号を発行すると発表した。
『葬送のフリーレン』(原作:山田鐘人・作画:アベツカサ、2020年〜)がヒット。マンガ大賞2021大賞、第25回手塚治虫文化賞新生賞などを受賞するなど一躍話題作になった。ほかには、『龍と苺』(柳本光晴、2020年〜)、『かけあうつきひ』(福井セイ、2021年〜)などが連載を始めた。
2022年7月、『週刊少年ジャンプ』と『週刊少年サンデー』 の共同企画として、『ONEPIECE』の尾田栄一郎と『名探偵コナン』の青山剛昌のスペシャル対談が行われ、これを記念としたコラボレーション企画として、同年発売の『週刊少年ジャンプ』34号の表紙に名探偵コナンの登場人物である安室透の、同じく同年発売の『週刊少年サンデー』35号の表紙にONE PIECEの登場人物であるロロノア・ゾロのイラストが掲載されている。
ロボコン』(1974年)、永井豪/石川賢『ゲッターロボ』(1974年)などの特撮・SFアニメ作品のコミカライズを大挙掲載し、新規子供層を押えようとするなど、「親と子が安心して読める」誌面の展開を目指した。
しかし、サンデー、マガジンともすでに青年(あるいはそれ以上)向け雑誌に転じていたため、本来の読者層であるはずの少年の多くが『週刊少年ジャンプ』に流れることになり、1973年にはサンデー、マガジンともに発行部数で追い抜かれることになり、再び少年向けに方向転換(ただし、一部の劇画は残った)。
当時の小学館は路線転換の煽りで離れつつあった少年読者層の再度獲得を目指すべく、まず1974年6月に単行本レーベルの「少年サンデーコミックス」(「漂流教室」などが第一弾として刊行)、8月に同じく児童向け単行本レーベルの「てんとう虫コミックス」(学年別学習雑誌に連載されていた「ドラえもん」が第一弾だが、サンデー連載の「ゲッターロボ」も刊行された)をそれぞれ創刊する。続いて、サンデーから特撮・SFアニメ作品の部分を引き継いだ『てれびくん』(1976年)、てんとう虫コミックスを母体に児童向けへ特化した『コロコロコミック』(1977年)、学年誌とサンデーの中間の『マンガくん』(1976年)(1979年に『少年ビッグコミック』に改称)、新人作家育成のための『週刊少年サンデー増刊号』(1978年)など次々と新雑誌を創刊。
特撮ドラマ化されたものや、メディアミックスとして漫画化された作品群。
伊賀の影丸
仮面の忍者 赤影
キャプテンウルトラ
ジャイアントロボ
人造人間キカイダー
サンダーマスク
ウルトラマンタロウ
イナズマン
がんばれ!!ロボコン
秘密戦隊ゴレンジャー
仮面ライダーBlack