深夜アニメ
GAD GUARD(フジテレビ)
第7話(未放送回を含めると「EPISODE 8」に該当)の制作が遅延し、フジテレビへの「2003年5月28日16時」の納品予定に間に合わず、実際に納品されたのは翌日の「0時35分」となった。このため、局の判断で前週分の再放送に踏み切った。
第20話まで放送したところで改編期を迎え、翌週以降の番組枠の確保ができなくなったため放送が打ち切りとなった。後にアニマックスなどのアニメ専門チャンネルで全話放送された。
コードギアス 反逆のルルーシュ(毎日放送・TBS系)
制作スケジュールが逼迫していた影響で本放送は途中の第23話の段階で終了、約4ヶ月後に残り最終2話が特別編成で順次放送された。
同様のケースは同局製作『エウレカセブンAO』でも発生している。
されど罪人は竜と踊る(TBS)
TBS・BS-TBSで2017年10月から放送が予定されていたが、同年9月22日、制作上の都合により2018年4月開始予定への放送延期が発表された。
これを受け、TBSでは『中二病でも恋がしたい!』を、BS-TBSではその第2期『戀』をそれぞれ放送した。同作はTBSが製作委員会に参加する独立局系の深夜アニメとして放送されたが、TBSおよびBS-TBSではこれが初放送となった。
新型コロナウイルス感染症関連
2020年4月期以降、深夜アニメでも新型コロナウイルス感染症の流行・拡大により製作の中断や遅延が発生したことで放送スケジュールに影響が出ており、再放送への差し替えや次のクール以降への放送開始時期の延期などが多数発生した。
2020年4月からはEテレでも月曜22時50分 - 23時15分に深夜アニメのレギュラー放送枠が設定されていた。この枠は翌年8月をもって終了している。
『ソウルイーター』、『あにゃまる探偵 キルミンずぅ』、『ケロロ軍曹(7thシーズン)』 『おはスタ』コーナーアニメとしてショート版を深夜でのフル版と連動して放送 『斉木楠雄のΨ難』(第1期)、『古見さんは、コミュ症です。』(第1期)
深夜アニメを全日枠で再放送するパターン
『夏目友人帳』(第1期)、『神のみぞ知るセカイ』(第1期)、『ケロロ軍曹乙』(『ケロロ軍曹アンコール!』)、『けものフレンズ』(第1期)、『よりぬき銀魂さん ポロリ篇』、『IDOLY PRIDE』、『カードファイト!! ヴァンガード will+Dress』(Season1)、『BLEACH 千年血戦編』、『SPY×FAMILY』
独立局系深夜アニメの続編をキー局系列深夜アニメとして放送するパターン
『まりあ†ほりっく あらいぶ』(第2期)、『邪神ちゃんドロップキックX』(第3期)、『異世界はスマートフォンとともに。2』(第2期)、『B-PROJECT〜熱烈*ラブコール〜』(第3期)
独立局系深夜アニメをTXN系列局で(実質)再放送
『魔法少女リリカルなのはStrikerS』、『ガールズ&パンツァー』、『IDOLY PRIDE』(前述の様に夕方枠で放送)、『プラオレ!