ソニックトゥーン
前作の『アイランドアドベンチャー』からシステム面が大幅に見直され、より従来のソニックシリーズに近い爽快感とスピード感を重視した作りとなった他、バウンスパッドから従来のスプリングに戻されているなど、細かい部分での変更も見られる。さらにニンテンドー3DSの二画面を利用した巨大なボス戦や数々のミニゲームなど、前作以上にバラエティに富んだ内容に仕上がっている。
『アイランドアドベンチャー』同様に探索要素は存在するが、探索をするかしないかはプレイヤー次第となり、メインのアクションステージにおいては、そのほとんどがソニックのスピードアクションだけでもゴール可能な構成になっている。また前作におけるステージ内の切り替えにはギミックとロードを挟んでいたが、今作では巨大スプリングに乗るだけでシームレスに移動出来るため、爽快感を損なう事なくプレイが行えるようになった。
前作からのエナービームに引き続いてプレイヤー全員が炎(ファイアースタイル)と氷(アイススタイル)の能力を使う事ができ、氷の壁を炎で溶かす、水面を凍らせるなど、地形に応じてスタイルを使い分けてステージの攻略を行う。なおスタイルはLRボタンで瞬時に切り替えが可能。
ストーリーは前作のようなシリアス寄りな物語ではなくコミカル寄りな内容であり、一部のムービーがアニメ版の映像と同一であるなど、アニメ版の世界観でストーリーが展開される。物語の都合上、『太古の秘宝』でしか使用できなかったエミーがプレイアブルキャラクターとなった事で、操作可能なメインキャラクターは5人になった。
当シリーズオリジナルのキャラクターで、古代文明を発掘するチームに配属されている料理人。腕は一流だが、そのぶっきらぼうな見た目や言葉遣いから様々な誤解を受けやすい。
声 - 大塚周夫→中村浩太郎
ソニック達と敵対する悪の天才科学者。当シリーズでは軍服のような衣装を着用し、少し恰幅が良い体格になっている。またエッグモービルは立ったまま搭乗する乗り物に変更され、アニメ版ではさらにオーボット、キューボットが搭乗できる側車も用意されている。
『太古の秘宝』ではメタルソニックと共に当初復活したリリックと共同して世界征服しようとするも、リリックから「役立たず」と言われた挙げ句にメタルソニックを洗脳され、奪われてしまう。その後、リリックを邪魔な存在としてソニック共々倒そうと目論んで行動し、終盤でナックルズが投げ捨てたリリックの制御装置を拾い、私物化に成功した。
『アイランドアドベンチャー』では直接的に姿を見せず、映像を通じてのみの登場となる。
『ファイアー&アイス』では打倒ソニックを果たすためにロボットや兵器をより強くする目的で、膨大なエネルギーを秘めているラグニウム鉱石を見つけるシーンから物語が始まる。ラグニウム鉱石を採取する為に「ラグナッツ」を発明するも、鉱石以外の物体を引き付ける欠陥の為、「D-フェクト」と改称し蹴飛ばす程に邪見する様になり、最終的にはスティックスに譲った。ソニック・コレクションにあるオーボットの写真によればジェットコースターが苦手らしく、ただ一人叫び声を上げている姿が撮影されている(なおこの写真はアニメ版の「サイバースペースでジャンケン(13話)」で登場している)。
アニメ版では自身を卑劣で邪悪な科学者と称し、部下のオーボット、キューボットと共に沖の孤島に要塞を構えて暮らしている。