阪神大学野球連盟
各部のリーグ戦の終了後に、東西2部リーグの優勝校は入れ替え戦出場決定戦を行い、その勝者は1部リーグの最下位校と入れ替え戦を行う。勝者チームを次シーズンの1部リーグの所属とし、もし1部最下位チームが2部に所属替えになる場合は、チームの所在地により東西2部のどちらのリーグに所属するかが決まる。対戦方法は入れ替え戦出場決定戦・入れ替え戦ともに2戦先勝方式。
なお、関西連合時代の阪神大学リーグでは、当該リーグを含めた下部リーグの優勝校は、関西六大学リーグとの入れ替え戦を行なう為に下部3連盟間との出場校決定戦に出場していた。実施状況については近畿学生野球連盟記事の入れ替え戦の節に詳細についての記述があるので参照の事。