生物有機化学
有機化学プロセスにおける反応論的過程は大抵のものが明確になっている。一方で酵素の反応論的過程については、近年では計算化学によるシミュレーションや放射光X線解析、タンパク質NMR解析などの進歩により酵素反応の遷移状態も含めて解明が進んできたとはいえ、それらがいまだに不明の酵素も数多く存在する。
上述したような生化学と一般有機化学の鬩ぎ合いの中で、新しい有機化学の方法論を見出してゆくのが生物有機化学の主要なテーマとなる。近年ではこの学問領域のことを、ケミカルバイオロジーと呼ばれることもある。