函館新幹線総合車両所
認可時の車両基地本体の名称は函館総合車両基地(はこだてそうごうしゃりょうきち)であった。
2008年(平成20年)2月22日 - 路盤整備工事開始。
2012年(平成24年)3月15日 - 路盤整備工事完了。
2014年(平成26年) 10月1日 - 開業前の試験運転に備えた準備組織として、基地内にJR北海道新幹線準備運輸車両所(しんかんせんじゅんびうんゆしゃりょうしょ)を設置。 10月8 - 13日 - 北海道新幹線用車両(H5系)第1編成が川崎重工業兵庫工場から搬入。新幹線準備運輸車両所の所属となる。
2015年(平成27年) 6月 - 新青森 - 新函館北斗間開業時に使用するH5系4編成すべての陸揚げが完了。 7月31日 - JR北海道新幹線準備運輸車両所を函館新幹線総合車両所に名称変更。
2016年(平成28年)3月 - 北海道新幹線の新青森 - 新函館北斗間開業に合わせ供用開始。
• 2022年(令和4年)12月 - 本年3月に発生した仙台沖地震により被災し、9月に廃車となったH2編成の一部車両(10両中6両)が搬送された。同車両は今後社員教育用に使用される。