名探偵コナン 黒鉄の魚影
声 - 小山茉美
組織の幹部。組織で唯一、コナンと灰原の正体を知っている。コナンが「知人を騙せる程の声色と変装術を兼ね揃えた女はたった一人しかいない」と断言するほどの変装の達人。本作では冒頭でスマホを操作中、掲載された広告に目を向けており、灰原を助けたワケはブローチを譲ってくれたからというものだった。
コナンやFBIが追っている、世界規模の犯罪組織。本作では2016年公開の劇場版第20作『純黒の悪夢』以来の登場、2001年公開の劇場版第5作『天国へのカウントダウン』、2009年公開の劇場版第13作『漆黒の追跡者』と合わせて第4作目の登場になる。
声 - 林原めぐみ
本作のヒロインでキーパーソン。本名は「宮野 志保(みやの しほ)」だが、元黒の組織の一員で在籍当時のコードネームは「シェリー(Sherry)」。APTX4869の開発者で、コナンの正体を新一と知る数少ない人物の1人。自殺目的でAPTX4869を自ら飲むが、コナン同様小学生の姿になり、組織から離脱する。
本作では、直美が持っていたUSBメモリのデータから、ウォッカ達にシェリーが子供の姿になって生き延びていたと思われ、拉致されてしまう。
作詞・作曲 - 草野マサムネ / 歌 - スピッツ
声 - 池田秀一
連邦捜査局 (FBI) の捜査官。かつて「諸星 大(もろぼし だい)」と名乗って「ライ(Rye)」のコードネームで黒の組織に潜入していた。現在は組織に対して自らの死を偽装し、変装して「沖矢昴」と名乗っている。コナン本人には告げていないが、コナンの正体を新一と知る数少ない人物の1人でもある。