釧路運輸車両所
2018年4月1日時点では700番台4両、1700番台26両の計30両が配置されていた。1700番台車は機関換装済み。 2018年5月には700番台の1両(781)が廃車となった。2019年度には1700番台の3両(1709・1723・1737)が旭川運転所へ転属された。2020年度には1700番台の1両(1772)が苫小牧運転所より転入されるとともに、1700番台の2両(1722・1797)が旭川運転所へ転属された。2021年度には700番台の3両(739・757・777)と1700番台の5両(1741・1754・1760・1765・1772)が廃車されたほか、1700番台の5両(1740・1751・1759・1775・1779)が旭川運転所へ転属された。2022年度には1700番台の6両(1738・1742・1752・1756・1768・1776)が廃車されたほか、1700番台の6両(1749・1755・1758・1766・1774・1778)が旭川運転所へ転属され、配置がなくなった。
キハ40形(700・1700番台)
24両(46 - 67・82・83)が配置されている。うち2両(82・83)は北海道高速鉄道開発保有車である。 2022年度に82・83が旭川運転所から転入し、68・69が旭川運転所へ転出している。
H100-82
171号機が配置されている。主に「SL冬の湿原号」に使用される。