キリスト教民主運動
2000年にズリンダが新たにスロバキア民主・キリスト教連合(SDKU)を結成すると、SDKに参加していたKDH出身議員の多くがSDKUに移籍した。2002年国民議会選挙の後に発足した第2次ズリンダ政権でもKDHは引き続き与党に加わった。しかし2006年国民議会選挙でスロバキア民主キリスト教連合・民主党(SDKU-DS)を中心とする連立与党が敗北し、方向・社会民主主義(Smer-SD)を中心とするロベルト・フィツォ政権が発足した結果、KDHも野党に転じた。
4年後の2010年に行われた2010年国民議会選挙では連立政権与党であるスロバキア国民党(SNS)と人民党・民主スロバキア運動(LS-HZDS)が共に惨敗し過半数を下回ったため、SDKU-DSのイヴェタ・ラジチョヴァーを首班とする政権が発足し、KDHも与党入りした。任期を前倒しするかたちで2012年3月に行われた2012年国民議会選挙では前回より1議席増となったが、SDKU-DSなど他の連立与党は前年10月の政変(イヴェタ・ラジチョヴァー政権の崩壊)と政権スキャンダル報道が影響したことで惨敗、政権の座をSmer-SDに明け渡した。
選挙後の5月には議員2名が離党して「新しい多数派」(Nová väčšina)を結成した他、2013年2月にも議員1名が離党して市民グループを結成するなど、分裂が相次いだ。その結果、2016年3月の国民議会選挙では得票率4.94%で、結党以来初めてすべての議席を失う結果となった。この敗北を受けて、アロイズ・ヒルナが新しい総裁に選出された。