アーディド
アーディドの後継者のダーウード・アル=ハーミド(イマーム位:1171年 - 1208年)は、ハーフィズ派(英語版)(カリフのハーフィズとその子孫をイマームとして認めるファーティマ朝が公認していたイスマーイール派の一派)の信徒たちから正当なイマームとして認められたが、ダーウード・アル=ハーミドの息子でその後継者のスライマーン・バドルッディーン(英語版)(イマーム位:1208年 - 1248年)と同様に捕らわれの身のまま死去した。1170年代にはファーティマ朝の支持者や僭称者たちによる一連の陰謀や反乱が起きたが、これらの運動は失敗に終わった。その後も同様の運動が12世紀末まで散発的に続いたものの、イスマーイール派の影響力は急速に衰えていった。そして13世紀末までにイスマーイール派はエジプトから事実上一掃された。
1262年にマムルーク朝の支配者のバイバルス(在位:1260年 - 1277年)が没収されたファーティマ朝の財産の目録を作成するように命じたが、その目録の中に王朝の最後の3人の生き残りについての証言が残されている。その3人はアーディドの息子の1人のカマールッディーン・イスマーイールと2人の孫のアブル=カースィム・ブン・アビル=フトゥーフ・ブン・アル=アーディドとアブドゥルワッハーブ・ブン・イスマーイール・ブン・アル=アーディドである。この3人について名前以外に知られていることはなく、恐らく3人ともカイロの城塞(シタデル(英語版))で幽閉されたまま死去したとみられている。
アーディドは儀礼的な役割へ追いやられ、サラーフッディーンが騎乗したまま宮殿に入ることで公然とした辱めさえ受けた(それまでこの行為はカリフの特権であった)。さらにサラーフッディーンはシリア軍をあからさまに優遇し始め、軍隊の維持のために兵士に領地を与える一方でファーティマ朝の軍司令官から同様の領地を取り上げた。また、ヤーコフ・レフは、この頃までにスンナ派が文民官僚の中で多数を占めるようになっていたものの、多くの者は政権から疎外されていたと指摘している。このような状況の中で、アル=カーディー・アル=ファーディルを始めとする文民官僚の多くはサラーフッディーンと協力する道を選び、ファーティマ朝政権を効率的に弱体化させようとするサラーフッディーンの試みに手を貸した。
サラーフッディーンとシリア軍が優位に立つ状況に反発したファーティマ朝の支持派はムウタミン・アル=ヒラーファ・ジャウハルの下に結集した。そして新たな十字軍の侵攻によってサラーフッディーンをカイロから引き離し、再び首都の支配を取り戻すことを期待して躊躇することなく十字軍の支援を求めた。しかし、支援を求める書簡はサラーフッディーンの手に落ち、サラーフッディーンはカイロの敵対者たちを容赦なく迅速に粛清する機会をつかんだ。ムウタミンは殺害され、1169年8月21日にはこの殺害に激しく反発したアフリカ系黒人軍団が反乱を起こした。サラーフッディーンは2日間にわたる市街戦(バイナル・カスラインの戦い(英語版))の末に黒人軍団を打ち破り、カイロから放逐した。
さらに黒人軍団はトゥーラーン・シャーによる追撃を受けて敗走し、郊外のアル=マンスーリーヤに存在した黒人軍団の兵舎は焼き払われた。この反乱の余波の中でサラーフッディーンは腹心のバハールッディーン・カラークーシュ(英語版)をムウタミンの後任に指名し、カリフとその宮廷に対する支配力を確保した。
忠実な軍隊を奪われ、自分の宮殿でカラークーシュに厳重に監視されていたアーディドは、今や完全にサラーフッディーンの言いなりとなっていた。1169年10月から12月にかけてビザンツ帝国と十字軍が共同でダミエッタに攻撃を仕掛けたとき、アーディドは侵略者に対抗する遠征軍の資金として1,000,000ディナールを拠出した。歴史家のマイケル・ブレットは、この行為について、カリフが新しい状況に適応するための方策であったとする見解を示しているが、ヤーコフ・レフは、アーディドに対するサラーフッディーンの露骨な「恐喝」によるものだったと指摘している。さらに、カリフは実質的な軟禁状態にあり、このような莫大な資金の拠出はアーディドの立場を弱めるだけであったと述べている。1170年3月にサラーフッディーンの父親であるナジュムッディーン・アイユーブがカイロに到着すると、カリフは直々にサラーフッディーンを伴って出迎え、前例のないアル=マーリク・アル=アウハド(唯一の王)の称号を与えた。
自分の地位が安定したサラーフッディーンは、あらゆる公職にエジプト人に代えてシリア人を任命することでエジプトの行政機構に対する支配を固めた。