フシジン酸
フシジン酸に対する耐性獲得のメカニズムは、黄色ブドウ球菌でのみ詳細な研究がなされている。最も重要なメカニズムは、染色体上で EF-G をコードする fusA 遺伝子中の点変異である。変異によって EF-G は、フシジン酸が結合できないよう変化する。フシジン酸が単独で用いられている場合、耐性は容易に獲得され、多くの場合治療中に獲得される。他のほとんどの抗生物質と同様、フシジン酸への耐性は他の薬剤と併用時には頻繁には発生しない。これが深刻な黄色ブドウ球菌感染の治療にフシジン酸を単独で用いるべきではない理由である。しかしながら、少なくともカナダの病院で1999年から2005年にかけて集められたデータからは、MRSA やメチシリン感受性黄色ブドウ球菌が耐性を獲得する確率はむしろ低く、局所的に用いられる抗生物質としてはムピロシンのほうがより問題であることが判明した。
また、細菌は「fusB型」の耐性を示すこともある。耐性は、プラスミド上に見つかる fusB、fusC、fusD 遺伝子によるものである。fusB型耐性遺伝子の産物は213残基のタンパク質で、EF-G に 1:1 の比で相互作用する。 FusB型タンパク質はフシジン酸とは異なる領域に結合し、EF-G のコンフォメーション変化を引き起こす。これによって EF-G はフシジン酸から解放され、別のリボソームのトランスロケーションに参加できるようになる。
FusB型の耐性は MRSA の臨床分離株によく見られ、いくつかのコホートでは70%以上で観察されている。