アスパラギン酸プロテアーゼ
BACE1、BACE2
カテプシンD(英語版)
カテプシンE(英語版)
キモシン(レンニン)
ナプシンA(英語版)
ネペンテシン
ペプシン
プラスメプシン(英語版) – マラリアの原因となるマラリア原虫に存在するアスパラギン酸プロテアーゼ
プレセニリン
レニン
HIV-1プロテアーゼ(英語版) – HIVの治療の主要な薬剤標的