雲芸和議
義久はこれに同意したが、それは福屋氏やそれを支援していた尼子諸将・尼子方国人にとっては、自分たちの立場を失うことだった。これにより石見での尼子氏の戦線は一気に崩壊し、本城常光は離反、多胡辰敬も石見岩山城にて自害するという事態に発展した。
石見での形勢を逆転した毛利氏は和睦を破棄し、永禄5年(1562年)には出雲侵攻に乗り出し、西出雲国人の三沢氏・三刀屋氏・赤穴氏・米原氏が毛利氏に寝返り、優勢を招いた。しかし義久がこの対抗策として北九州の大大名である大友宗麟と同盟を結んだことや、東出雲・伯耆・備中・美作の尼子方が結束して毛利氏に反発したことから、毛利氏もこの遠征に4年を費やすこととなった。
その後も足利義輝は雲・芸に加えて豊(大友宗麟)を含めた3者の和議を模索しているが、月山富田城を目前とする元就は、この和議に消極的だった。そして月山富田城の攻防が間近になった以上、雲芸和議の再開は現実的ではないと見た義輝、同様に尼子との挟み撃ちは現実的ではないと見た宗麟の思惑により、雲芸和議は芸豊和議へと転換。毛利隆元の急死などもあって交渉は遅延したものの、永禄7年(1564年)7月に芸豊和議は成立。大友氏は毛利・尼子両氏の争いから手を引いた。
さらに伯耆・備中が失陥したことで、居城の月山富田城が孤立した義久は永禄9年(1566年)11月、毛利氏に降伏した。