ヒストンメチルトランスフェラーゼ
反応が進行するためには、まずS-アデノシルメチオニン(SAM)と基質のヒストンテールのリジン残基がSETドメインの触媒ポケットに結合して適切に配置される必要がある。続いて、近傍のチロシン残基がリジン残基のε-アミノ基を脱プロトン化する。その後、リジン側鎖はSAM分子の硫黄原子のメチル基に求核攻撃を行い、メチル基がリジン側鎖に転移される。
プロテインアルギニンメチルトランスフェラーゼ(PRMT)には3つの種類が存在し、ヒストンテールのアルギニン残基には3種類のメチル化が行われる。1つ目のタイプ(PRMT1(英語版)、PRMT3(英語版)、CARM1(英語版)/PRMT4、Rmt1/Hmt1)はモノメチルアルギニン(英語版)と非対称ジメチルアルギニン(英語版)(Rme2a)を作り出す。2番目のタイプ(PRMT5(英語版)/JBP1)はモノメチルアルギニンまたは対称ジメチルアルギニン(Rme2s)を作り出す。3番目のタイプ(PRMT7)はモノメチルアルギニンだけを作り出す。メチル化パターンの差異は、アルギン結合ポケット内の制限によるものである。