国際子ども図書館
ここにおいて、上野図書館の施設はそれまで国立国会図書館ではそれほど重視されてこなかった児童書のナショナルセンターとして再活用されることになり、1996年には「国際子ども図書館基本計画」が策定され、1999年に国立国会図書館法が改正されて法的に国際子ども図書館の設置が定められた。
施設は上野図書館に改修が施され、2000年に一部を改修中のまま部分開館を行った。そして2002年になって全面開館し、児童書の保存・閲覧のほか、児童書関係の研究文献の提供や展示会などのサービスを行っている。2015年には中庭側に「アーチ棟」が新設され、従前からの建物は「レンガ棟」と呼ばれるようになった。
2020年3月5日より、新型コロナウイルス感染症(COVID-19)流行を受け臨時休館。当初の期間は同年3月16日までの予定だったが、6月10日まで延長されたのち、6月11日より児童書研究資料室のみ再開、7月1日より全面再開となった。