生物多様性の観点から重要度の高い湿地
利尻島湿地群
利尻島・礼文島周辺沿岸
久種湖
メグマ沼湿原,声問大沼・声問川
猿払原野
クッチャロ湖
サロベツ原野
天塩川
中峰の平湿原
松山湿原およびピヤシリ湿原
コムケ湖
シブノツナイ湖
サロマ湖
能取湖
網走能取岬周辺沿岸
網走湖
藻琴湖および濤沸湖
ガッタンコ湿原
知床半島サケ・カラフトマス遡上河川群
知床半島山稜湿原
知床半島東部沿岸
野付半島,野付湾,尾岱沼
標津湿原
茨散沼湿原,兼金沼・西別川湿原
根室半島湿原群
根室湾干潟
風蓮湖,春国岱,温根沼および周辺湿原群
ユルリ島湿原
霧多布湿原・幌戸湿原および地先沿岸
火散布沼および藻散布沼
厚岸湖
厚岸湾
別寒辺牛湿原
屈斜路湖周辺および釧路川源流域
阿寒湖と流入・流出河川
釧路湿原
然別湖
馬主来沼
キナシベツ湿原および音別川・尺別川
十勝海岸湖沼群
十勝川下流湖沼群
更別湿原
襟裳岬周辺沿岸
朱鞠内湖
浮島湿原
大雪山系旭岳周辺湿原群
大雪山系トムラウシ山周辺湿原群
雨竜沼湿原
原始ヶ原湿原
かなやま湖
石狩川流域湖沼群
美唄湿原
月ヶ湖湿原
幌向湿原
石狩川河口
旧長都沼
千歳川
勇払原野湿原群
厚真水田および鵡川水田
鵡川河口
ホロホロ湿原
倶多楽湖
ヨコスト湿原
キウシト湿原
篠路福移湿原
泊村盃地区地先沿岸
後志山地湿原群
ニセコ連山湿原群
朱太川水系
歌才湿原
静狩湿原
大沼と周辺湿地
横津岳湿原群
汐首岬周辺沿岸
函館湾周辺沿岸