ファーティマ朝海軍
これらの大失敗の後、ファーティマ朝は十字軍のエルサレム王国に対し如何なる行動も控え、1151年頃までファーティマ朝海軍の音沙汰も無くなった。1151年頃には、十字軍によるファラマ略奪への報復として、ワズィールのイブン・アル=サラー(英語版)はヤッファからトリポリまでのキリスト教の船舶輸送を襲撃するため、伝えられるところに拠れば300000ディナールの費用で艦隊を配備した。襲撃はどうやら成功し、複数のビザンツと十字軍の船舶が拿捕された。1153年、十字軍はアスカロン包囲戦(英語版)を仕掛けた。ファーティマ朝海軍はアスカロンに補給と増援を輸送するために動員されたが、これは8月22日の陥落を阻止できなかった。この重要な基地の喪失にも関わらず、ファーティマ朝海軍はその後数年間、レバント沿岸沖で活発なままだった。
レバントの十字軍国家は海軍を持たず、時にして緊張関係にあったビザンツ又は海洋共和国の海軍支援に依存していたが、十字軍に対するファーティマ朝海軍の有効性の制限には複数の要因が絡んだ。そのためファーティマ朝は単数ではなく、ビザンツ帝国、海洋共和国、西ヨーロッパの諸王国からの複数のキリスト教海軍に直面した。単独では、ファーティマ朝は彼らに打ち勝つに十分な常備海軍を支えるための物的手段や人員が足りず、数的劣勢の状況から海軍を運用することを余儀なくされた。歴史学者のウィリアム・ハンブリン (William Hamblin) は、例えファーティマ朝が年に一個艦隊を破ったと仮定しても、「次の年には同程度に強力なヴェネツィア、ノース人、又はビザンツ艦隊と対峙することを悟っただろう」とし、更に「ファーティマ朝にとっての海軍の敗北は、復旧するために数年と巨額の出費を要する大損失を意味した」と指摘する。ヤーコヴ・レヴも当時のビザンツとムスリム両方の海軍戦術が慎重を期したと強調し、そして今日の学識が認めるように、「今日においてガレー船艦隊が制海権を得ることはできない」。エジプトを拠点にしたファーティマ艦隊の作戦範囲も、船上に持ち込める物資、特に真水や、キリスト教国の近海で彼らの海軍力に反撃すること、或いはレバントに至る航路帯を首尾よく阻止することが決してできないことを意味した地中海の航法パターンにより制限を受けた。
マーディアとは別にトリポリも重要な海軍基地として台頭し、シチリアでは都のパレルモが最重要基地であった。イブン・ハルドゥーンやアル=マクリーズィーのような後の歴史学者は、600隻又は900隻を数えた膨大な艦隊建造はアル=マーディとその後継者によるものと見做したが、これは明らかな誇張表現であり、10世紀の現実よりもファーティマ朝がシーパワーを保持した次世代の印象を反映している。実際には、マーディアでの造船について同時代に存在した史料の中で唯一の言及は、造船を遅延又は停止すらさせた樹木の不足に関することであり、シチリアからだけでなくインドと同じくらい遠くから木材を輸入する必要があった。
948年頃から去勢された侍従やアル=ウスターズ(英語版)という管理責任者に支えられたマーディアの支配者は、一般に武器庫の管理と海軍業務も必然的に伴ったと見られる。フサイン・イブン・ヤアクーブ (Husayn ibn Ya'qub) という人物は、史料にてṣāḥib al-baḥr (海の権力者) やmutawallī al-baḥr (海の管理者) と呼ばれたが、彼の正確な役割は不明である。
ファーティマ朝のエジプト征服は迅速だった。969年6月までにはジャウハルのファーティマ朝陸軍がフスタートに立ち向かい、イフシード朝の部隊がファーティマ朝を止める最後の努力に失敗した後、フスタートとエジプトは降伏した。この征服中の海軍の活動や参戦についての記述はない。970年の春、ジャアファル・イブン・ファラー(英語版)のファーティマ軍はパレスチナにも同様に侵攻し、アル=ハサン・イブン・ウバイド・アッラー・イブン・トゥグジュ(英語版)のイフシード朝残党を倒した。
エジプト征服後の地中海東部における、ファーティマ朝海軍の活動についての最初の記述は971年後半、艦船15隻の艦隊がヤッファで包囲されたファーティマ軍を救出しようとした時である。カルマト派の海軍として史料が記録した部隊により13隻が沈められ、残り2隻はビザンツ帝国に拿捕されたので、この企図は失敗した。その後972年6月頃、イフリーキヤから30隻のファーティマ艦隊が着きシリア沿岸を攻撃した。凡そ同じ頃にも、ファーティマ艦隊はエジプトに向かうムイッズを護衛した。973年9月中旬、ファーティマ艦隊がカイロでムイッズによる視察を受けていた時に、カルマト派艦隊がティンニース(英語版)を襲撃したが彼らは艦船7隻と500名を失った。捕虜とその上官はカイロで見せしめに殺された。