JR支社境
総武本線 中央・総武緩行線 浅草橋駅 - 秋葉原駅(首都圏本部管内) 横須賀・総武快速線 錦糸町駅 - 馬喰町駅(首都圏本部管内) 新金線 新小岩信号場駅 - 金町駅(首都圏本部管内)
※輸送指令は千葉駅から首都圏本部管轄
京葉線
潮見駅 - 越中島駅(首都圏本部管内)
※輸送指令は全線首都圏本部管轄
武蔵野線
新八柱駅 - 新松戸駅(首都圏本部管内)
※輸送指令は全線首都圏本部管轄
成田線我孫子支線
東我孫子駅 - 我孫子駅(首都圏本部管内)
中央本線
多治見駅 - 塩尻駅(関東支社管内)
飯田線
沢渡駅 - 辰野駅(関東支社管内)
御殿場線
下曽我駅 - 国府津駅(関東支社管内)
東海道本線
三島駅 - 熱海駅(関東支社管内)
近江長岡駅 - 米原駅(関西支社管内)
日豊本線
中津駅 - 吉富駅(本社直轄エリア内) : 山国川橋梁と中津駅下り場内信号機の間に支社境がある。
宗太郎駅 - 市棚駅(宮崎支社管内) : 第四宗太郎トンネルの延岡方出入口と県境の間に支社境がある。
久大本線
豊後中川駅 - 豊後三芳駅(本社直轄エリア内) : 小ヶ瀬トンネルの日田方出入口から0.5km手前に支社境がある。
豊肥本線
豊後荻駅 - 滝水駅(熊本支社管内) : 豊後荻駅から熊本寄り約1.8km先に支社境がある。