宇治山田港
更に2009年(平成21年)1月には、費用節減のために浮桟橋に使われていた中古の台船の耐用年数が不明であることが発覚し、安全性を疑問視する声が上がった。三重県は浮桟橋の使用停止を指示し、住民団体による提訴も行われた。これと前後して長崎県の海運業者が就航を検討したものの、業者が伊勢市へ1億円の財政支援を求めたことから、交渉は打ち切られた。結局、森下市長は同年10月7日に海上アクセス事業の責任を取り辞任した。
出直し市長選挙の結果、海上アクセス事業の中止を公約とした鈴木健一が当選、ターミナルの撤去・譲渡・売却・有効活用という選択肢を提示した。そして2010年(平成22年)3月3日の伊勢市議会定例会で取り壊しが宣言され、撤去に8100万円かかるとの見通しが示された。そして同年7月14日の議会で撤去費用約8800万円を含む補正予算が可決された。そして2011年(平成23年)3月2日にターミナルの取り壊しが始まり、事実上旅客ターミナル問題は終幕を迎えた。
なお、中部国際空港と宇治山田港の間には、かつて神社みなとまち再生グループにより水上タクシー「伊勢1号」が就航していた。