ジュゴン
1960年代からは、沖縄県での出現記録は、ほぼ沖縄島周辺(1965年 - 2004年の確実な出現記録は20例で、うち沖縄島が18例で東海岸に集中、宮古島が2例)に限られるとされてきた。また、沖縄島周辺以外でも、西表島、久米島、奄美大島等で、少数の目撃や死体漂着の報告があるが、2006年時点の環境省の報告書では、沖縄島周辺以外にも本種が生息しているのか、迷行・移動したのかは、不明とされた。ただし、2018年度の調査で、先島諸島でも2000年以降に多数の目撃情報があることが明らかになっている。
沖縄本島周辺
沖縄県では、沖縄島の大浦湾や古宇利島周辺でたびたび目撃されているが、2004年以降の確実な出現記録はない。目視観察により確実に個体識別されている個体は3頭であり、これらの個体は沖縄島東海岸の嘉陽周辺及び西海岸の古宇利島周辺の海域を生息地とし、両海域を北端の辺戸岬経由で往来することが確認されている。ただし、個体Aは2015年9月以降、個体Cは2018年9月以降発見されておらず、2019年3月には、個体Bとみられる死体が運天漁港で発見された。