ミマ11船団
ミマ11船団は、9月15日にミリを出港した。日本海軍はレーダーが不備で夜間の索敵能力が劣ることから、敵潜水艦の奇襲を避けるために昼間航行に限定し、夜間は適当な湾に仮泊する戦術を採用した。そのため、沿岸伝いの小刻みなゆっくりとした航海になった。それでも敵潜水艦の攻撃を避けきることはできず、パラワン島沖でタンカーの橘丸(日本油槽船:6539総トン)が魚雷の命中を受けたが、不発弾で助かった。また、貨客船の今治丸(拿捕船:1986総トン)は、出航直後の16日に日本側資料によれば潜水艦の攻撃、アメリカ側資料によれば空襲で沈没した。同船には移動中の陸軍関係者162人のほか、占領地で募集した労働者956人と慰安婦92人が乗船しており、うち陸軍軍属1人と労働者308人、慰安婦26人が死亡した。
9月21日、アメリカ第38任務部隊は、ミマ11船団の目的地であるマニラを初空襲した。第38任務部隊はルソン島周辺を遊弋して空襲を続け、24日にはコロン湾に退避していた日本の船団を襲って壊滅させるなど猛威をふるった。
こうした状況に日本側は、ミマ11船団に対して、マニラ地区の情勢が不良であると警告を発した。25日朝にバキット湾を出たところで警報に接した篠田大佐は、船団を分割し、タンカー主体の約半数だけでマニラを通過して高雄へ直行することにした。護衛艦はすべて高雄行きで続行し、燃料や水が不足する小型タンカーと一般貨物船など7隻は第32号海防艦の護衛でバキット湾に引き返した。安全地帯までマニラ行き船団を護衛した第32号海防艦は反転して船団を追及し、やがて合流した。
10月7日午前6時頃、退避中の船団をさらに分割し、神威と橘丸が第8号海防艦と駆潜艇1隻の護衛を受けて先行することになった。しばらくは何事もなかったが、9日午前1時42分、橘丸は北緯19度33分東経116度38分の南シナ海上において、アメリカ潜水艦ソーフィッシュの雷撃により爆発沈没した。
一方、船団本隊の輸送船5隻は湖北丸(大阪商船:2578総トン)を基準船として隊形を組み、海防艦2隻と第20号掃海艇・第41号駆潜艇の護衛で航行を続けた。10月8日午後4時半に高雄の警戒警報解除を知らされたため、同日午後6時に反転して高雄へと針路を変えた。同日午後11時25分頃、北緯18度31分東経116度00分の南シナ海上で、船団は右舷前方からアメリカの潜水艦ホーの攻撃に遭った。船団の右列先頭に位置していた湖北丸は魚雷の航跡に気付いて緊急回避を試みたが、1発が命中して沈没した。被雷から1分半の短時間で沈んだため、乗船者762人中417人(遭難船員を中心とした民間人および船舶砲兵等)が死亡した。なお、アメリカ側はホーが第8号海防艦も損傷させたと判定している。
その後、10月9日になって高雄には再び警戒警報が発令されたため、船団本隊は高雄入港を断念、同日午後4時に針路を香港へと変えた。翌10日に沖縄がアメリカ機動部隊の十・十空襲に見舞われたことからも、続けて高雄が空襲を受ける危険は大きいと判断され、第一海上護衛隊より船団に香港行きが命じられている。11日午前10時過ぎに、輸送船4隻と護衛艦は香港へと入港した。なお、高雄を含む台湾一帯には、翌12日にアメリカ機動部隊が来襲し台湾沖航空戦が発生している。