1506年
2月13日(永正3年1月21日) - 毛利弘元、室町時代、戦国時代の武将(* 1466年)
5月4日 - フサイン・バイカラ、ティムール朝ヘラート政権の君主(* 1438年)
5月20日 - クリストファー・コロンブス、ジェノヴァ出身の探検家、航海者、商人(* 1451年頃)
5月23日(永正3年5月1日) - 葛西政信、室町時代、戦国時代の戦国大名、奥州葛西氏の第13代当主(* 1433年)
7月26日 - アンヌ・ド・フォワ、ハンガリーとボヘミアの王ウラースロー2世の3番目の妃(* 1484年)
8月 - アレクサンダー・アグリコラ、フランドル楽派の作曲家(* 1445年/1446年)
8月19日 - アレクサンデル、リトアニア大公、ポーランド王(* 1461年)
9月13日 - アンドレア・マンテーニャ、イタリアの画家(* 1431年)
9月25日 - フェリペ1世、カスティーリャ王、ブルゴーニュ公(* 1478年)
10月5日(永正3年9月19日) - 長尾能景、室町時代、戦国時代の戦国大名、守護代。越後長尾家第6代当主(* 1464年)
11月20日 - 燕山君、李氏朝鮮の第10代国王(* 1476年)
ジョアン1世、コンゴ王国の国王(* 生年不詳)
雪舟、室町時代、戦国時代の水墨画家・禅僧(* 1420年)
張緑水、李氏朝鮮国王、燕山君の後宮(* 生年不詳)
天然浄祐、室町時代、戦国時代の浄土宗・浄土真宗の僧(* 1442年)
ベアトリス・デ・ポルトゥガル、ヴィゼウ公フェルナンドの妻(* 1430年)
牧野古白(成時)、戦国時代の武将(* 生年不詳)