トランシルヴァニア公国
しかし1604年から1606年にかけ、ハンガリー人貴族ボチュカイ・イシュトヴァーンは反乱を起こし、オーストリアの支配を排除した。ボチュカイは1603年4月5日にトランシルヴァニア公に選ばれ、2ヵ月後にはハンガリー君主を称した。彼は1606年6月23日にオーストリアとの間でウィーンの和約を結び、公国の信教の自由と政治上の自治権を認めること、公国から奪った全ての領土を回復すること、全ての「不正な」判決を撤回すること、王領ハンガリーに住む全てのハンガリー人に対する遡及的かつ完全な恩赦を与えること、自分をトランシルヴァニア公国の独立君主と認めさせた。
ボチュカイの後継者達、特にベトレン・ガーボルとラーコーツィ・ジェルジュ1世の治世にトランシルヴァニアは黄金期を迎えることになった。ベトレン・ガーボルは臣下を圧迫ないし取り込もうとする神聖ローマ皇帝達の全ての試みを妨害し、プロテスタント勢力を擁護したことでプロテスタント諸国から高い評判を受けることになった。また、ハプスブルク家の皇帝達と3度戦争を行ったが、そのうち2度はハンガリー王の称号をベトレンが名乗ったことに起因するものであった。