牧野富太郎
「利尻山とその植物」(『山岳 一の二』、1906年6月) 「利尻山とその植物」(岩波書店『山の旅 明治・大正篇』、岩波文庫、2003年9月)
『野外植物の研究.〔正〕』(共同刊行:参文社・積文社、1907年) ※編者:博物学研究会、校閲:牧野富太郎
『野外植物の研究 続』(共同刊行:参文社・積文社、1907年) ※編者:博物学研究会、校閲:牧野富太郎
『普通植物検索表』三好学、牧野富太郎 編(文部省、1911年)
『児童野外植物のしをり』(成美堂、1912年) ※共著
『植物学講義』(大日本博物学会、1913年 第7巻のみ1914年) 第1巻「植物記載学. 前編」 第2巻「植物記載学. 後篇」 第3巻「植物採集標品製作並整理貯蔵法」 第4巻「羊歯及種子植物ノ形態. 正」 第5巻「羊歯及種子植物ノ形態. 続篇」 第6巻「植物自然分科検索表」 第7巻「植物分類学 巻1」
『雑草の研究と其利用』(白水社、1919年)
『植物ノ採集ト標品ノ製作整理』(中興館、1923年)
『日本植物総覧』牧野富太郎, 根本莞爾 編(日本植物総覧刊行会、1925年)
『趣味の植物採集』(三省堂、1935年)
『草木志 : 随筆』(南光社、1936年)
『趣味の草木志』(啓文社、1938年)
『植物記』(桜井書店、1943年)
『植物記. 続』(桜井書店、1943年) 復刻版→『植物記』正・続の2巻(バベル社、2019年)
『牧野植物混混録』(鎌倉書房、1号(1946年5月) - 10号(1949年3月))
『牧野植物随筆』(鎌倉書房、1947年)
高知県佐川町の佐川町総合文化センター内にある展示室で、富太郎の眼鏡や絵の具、所蔵本、手紙や墨書など遺品を多く収蔵している。
だがこれも松村の妨害により、4巻で中断してしまった。
1916年(大正5年)には個人で『植物研究雑誌』(英語版、wikidata)を創刊(3号までは自己負担による発刊)。発刊間隔が空いたり、池長孟からの援助が打ち切られたりするなど、その刊行継続は必ずしも順調ではなかった。支援者であった中村春二の死去により再び行き詰まった後、1926年(大正15年)に津村重舎(後には会社としての津村順天堂→ツムラ)の財政的援助を得て復刊にこぎ着けている。
1912年(明治45年)1月30日(牧野49歳)から1939年(昭和14年)5月31日(77歳)まで東京帝国大学理科大学講師を勤める。この間、学歴を持たず、権威を理解しない牧野に対し、松村教授など学内から何度も圧力があったが、学長の箕作佳吉の庇護もあり結局牧野は帝大に必要な人材とされ、助手時代(1893年(明治26年)9月11日)から計約46年間、大学に留任している。
1927年(昭和2年)4月、65歳で藤井健次郎や池野成一郎たちの推薦により、東京帝国大学から理学博士を受ける。論文の題は「日本植物考察(英文)」。同年に発見した新種の笹に、翌年死去する妻の名をとって「スエコザサ」(学名:la ramosa var. suwekoana)と名付けた。
1928年(昭和3年)、牧野壽衛が病没、死因は子宮癌と推察される。行年55歳。
1937年(昭和12年)、朝日文化賞を受賞。
1939年(昭和14年)、東京帝国大学講師を辞任。