九州産交バス
かつては上述の通り、現在の一般路線塗装が採用され、尚且つ車体には飛行機のイラストが描かれたステッカー(1985年頃からは飛行機のデザイン+「空港専用」の文字を大きく表示)が貼られていたが、1989年導入車より白を基調に裾部をグレー、境目にオレンジのラインを通し、矢の模様が入ったデザインで、車体の前・後面と側面に『AIRPORT LIMOUSINE』と表記された専用カラーリングとなっている。かつては「あまくさ号」の一部便が阿蘇くまもと空港まで乗り入れていた関係上、同路線の一部車両にもこのカラーリングが適用されていたが、現在は空港への乗り入れが廃止された事もあって、経年式車においてはこのカラーリング自体は残されつつ『AIRPORT LIMOUSINE』のロゴを消去された状態で運用されていたが、現在は全廃となっている。
この項では、運行撤退・廃止・休止・運行終了した路線について記す。高速・特急・快速・急行・準急バスほか空港線その他特殊路線のみ述べる(一般路線バスについては各営業所記事を参照)。
熊本都市圏を運行する車両においては、TO熊カード導入に合わせて従来のRX-FA-I型からRX-FA2型に変更された。九州のバス事業者では長崎バスに次ぐ2番目の導入である。整理券には、感熱紙にバーコードが印字されていて、バーコード式整理券を運賃箱に投入すると運賃が表示され、硬貨や回数券等を運賃箱に挿入すると、投入額が表示される。運賃と投入額が合わなければ警告音が鳴り、不正防止に役立っている(運賃と投入額が合えば精算完了音が鳴る)。なお熊本都市圏を運行しない一部車両にも導入されている。筐体色は白と茶色。2000年代後半頃からはRX-FAN型の導入も見られるようになり、さらには2015年4月1日に熊本地域振興ICカード(くまモンのIC CARD)の導入にあわせ、これまでのRX-FA2型からRX-FAN型に順次変更している。筐体色は青と青紫色。
空港リムジンバスは、窓に「空港線」「空港専用」の表示がされた車両。ベース車は前述の長距離用路線車と同じ観光バスタイプ車で、一般路線シャーシのトップドア車やハイデッカー車が使用される。過去においては前から7列目より最後列までコの字型にロングシートが採用され(別称:サロンバスとも呼ばれていた)、尚且つ車内はビデオ放送(テレビフォトCM)も流されていたが、後に全て廃止され、現在では当初からの車内左前方に荷物置き場が設置されている以外は一般観光車両と同じ全席リクライニングシートとなっている。その中でも特異車として、2002年式車である標準床車両の日野ブルーリボンシティ(セレガマスク)が2台存在したが、この2台は新製当時はトイレが設置され天草 - 空港線「あまくさ号」専用車として天草営業所に配置された。だが、2年ほどで「あまくさ号」の運用を離れ中央営業所(現:高速営業所)に転属し、トイレを撤去ならびに荷物置き場新設などの改造が施された上で空港リムジンバスとして転用されたものである。その後、2台の内1台は熊本港オーシャンアローシャトルバスとして再転用されたのち、現在は白ナンバーに変更され教習車(社員用教育車)となった。
65歳以上が対象のフリー定期券。一部都市間バスでは本券を提示することにより、「ひのくに号」においては半額にて、「りんどう号」においては30%割引きにて乗車できる(共同運行会社便にも適用)。
準急バスは区間急行のものも存在した。
急行: 熊本 - 山鹿 - 久留米 - 福岡(西日本鉄道との共同運行、ビジネス特急ひのくに号の急行版) ※一部に久留米折返し便あり
準急: 熊本駅 - 日置 - 山鹿線
急行: 熊本駅 - 阿蘇 - 杖立線( 快速かじか号の急行版、大観峰経由と瀬の本経由とがあった。大観峰経由は準急もあった。1往復であるが産山行き急行もあった。)
急行: 熊本駅 - 大津 - 高森線( 快速たかちほ号の急行版、1往復であるが馬見原行きもあった。)
急行: 杖立 - 阿蘇登山急行(内牧、阿蘇駅経由で阿蘇山西駅行きと瀬の本、宮地駅経由で阿蘇山東駅行きがあった。)
急行: 内牧 - 阿蘇駅 - 阿蘇登山急行(阿蘇山西駅行きと東駅行きがあった。)
急行: 高森 - 南阿蘇登山道 - 阿蘇山西駅(南阿蘇登山道が開通するまでは立野経由で運行)
急行: 熊本 - 大牟田線( 快速みいけ号の急行版、本村経由と長洲港経由とがあった。)
急行: 熊本 - 八代駅 - 日奈久線(八代市役所経由)
急行/準急: 熊本 - 赤瀬 - 三角港線( 快速みなと号の急行、準急版、宇土市役所経由、準急は宇土市役所まで急行、宇土市役所から普通)
急行: 三角港 - 松島 - 本渡線
準急: 熊本 - 松島 - 本渡線( 快速あまくさ号の準急版、熊本市内から岩谷入口まで急行、岩谷入口から本渡までは普通)
急行: 本渡 - 牛深線( 快速うしお号の急行版、ただし、快速ができたのは、急行がなくなった後)
急行: 本渡 - 下田温泉線
急行: 人吉 - 小林線( 宮崎交通との共同運行、1981年10月なんぷう号運行開始時に代替され廃止)
夜行高速 京都号: 熊本 - 枚方・京都(運行開始から1999年までは京阪バスと共同運行<撤退後は単独運行>)
高速特急 おおあそ号: 熊本 - 佐賀 - 嬉野・唐津(西日本鉄道・昭和自動車・祐徳バスと共同運行)
高速: 福岡 - 菊池線 - 福岡 - 山鹿 - 菊池(西日本鉄道、熊本電気鉄道との共同運行) 2007年4月1日 - 同年9月30日までの期間限定運行。運行期間終了により運行終了。特に愛称はつけられなかった。
高速: 人吉 - 鹿児島空港線 - 人吉 - 鹿児島空港(いわさきバスネットワーク、南国交通と共同運行)
夜行高速 トワイライト神戸号: 鹿児島・熊本 - 神戸・甲子園・尼崎(単独運行)
高速特急 ぎんなん号: 熊本 - 北九州(運行開始から2010年3月までは西日本鉄道と共同運行、その後単独運行) ※利用者低迷を理由に2018年11月30日を以って運行休止。
夜行高速 不知火号: 熊本 - 名古屋(名鉄バスと共同運行) ※利用者低迷と深刻な乗務員不足により2019年9月30日の運行を以って路線廃止。
高速特急 ひとよし号: 熊本 - 人吉(県内便、産交バス人吉営業所による運行)
高速特急 ASOエクスプレス号: 福岡・福岡空港 - 阿蘇(西日本鉄道と共同運行) ※新型コロナウイルスの世界的感染拡大の影響による利用客低迷により2020年10月11日の運行を以って終了
当社は2019年頃よりバス事業の他にも、フランチャイズ事業としてコンビニエンスストア大手のファミリーマートと締結し、以下の店舗を運営している。
上代店(西部車庫に隣接)
光の森店(光の森産交に隣接)
サクラマチ店(SAKURA MACHI Kumamoto2F総合案内所前) サクラマチS(サテライト)店 ※無人店舗
また、2020年に発生した新型コロナウイルスの世界的感染拡大による影響を受け、これを機会にバス車両の徹底的除菌作業を教訓に、抗菌の知識・技術を生かして、抗ウイルス・抗菌コーティングの施工及び除菌・抗菌商品の販売取り扱いを開始した。バス以外にも、病院・介護施設や学校・飲食店・宿泊施設・その他各商業施設など幅広く技術員を配置し施工に取り組んでいる。それに関連して、通信販売事業(オンラインショップ)「BUSMO(バスモ)」を運営し、富士フィルムと提携して同社が開発した除菌薬「Hydro Ag+(ハイドロ エージープラス)」の関連商品を取り扱っている。