機動戦士ガンダム ガンダムvs.Ζガンダム
本作には『機動戦士ガンダム 連邦vs.ジオン』や『機動戦士Ζガンダム エゥーゴvs.ティターンズ』(及び各DX)に登場するモビルスーツや戦艦のモデルや登場人物の説明などを鑑賞できるコレクションモードも存在する。
各ゲームモードのプレイ後(宇宙世紀モードにおいてはデータセーブ時)に、獲得した得点(宇宙世紀モードでは戦果ポイントとして計算される際に機体による倍率をかける前の値)がポイントとして加算され、各種アイテムはこのポイントと交換で購入するという形となっている。登場するアイテムは以下の通りで、宇宙世紀モードの進行など様々な条件で追加されていく。
モビルスーツ モビルスーツのモデルを鑑賞することができる。可変モビルスーツの場合は変形モーションも確認できる。なお、地球連邦軍及びエゥーゴと、ジオン公国軍及びティターンズで別カテゴリとなっており、鹵獲モビルスーツは後述するシークレットコンテナでなければ入手できない。なお、モビルスーツによっては複数の武装を選択できる物があるが、モデルは武装ごとに用意されており別々に購入する必要がある。 (例:ガンダム...ビームライフル装備、ハイパーバズーカ装備、ガンダムハンマー装備、ハイパーハンマー装備の4種類)
モビルアーマー モビルアーマーのモデルを鑑賞できる。
本作にはシリーズ過去作品(家庭用移植版)のミッションモードに相当するモードとして"宇宙世紀モード"がある。ただし、本作では従来の作品と異なり、各陣営に属する一将兵の追体験という設定ではなく、一年戦争やグリプス戦役の著名パイロット(つまり原作キャラクター)の視点でプレイする内容となった。
戦争の歴史に沿った内容のミッションが出現し、クリアすることで歴史が進行していく。ただし、ミッションによっては特定の条件を満たすことで原作とは異なるパラレルストーリーが出現する。分岐点となるミッションには「〇〇戦死」などのヒントが表記され、条件には以下のような物が存在する。
ミッションをクリアする 本来途中で戦死する者について、その戦死するはずの時点のミッションをクリアすることで、そのキャラが生きていた場合にどのようにその先を戦っていくかというストーリーが出現する。
特定のキャラが乗ったMSを撃破する 本来そのミッションの時点では撃破されていないキャラを撃破することにより戦局が大きく変化し、その上でどうなるかという形のストーリーが出現する。この条件は同じミッションを通る複数のキャラでフラグを共有し、誰か1名がその条件を満たしてクリアすればよいという物が多い。
特定のキャラが生き残った状態でクリアする 前述の物とは逆に、本来そのミッションで撃墜され戦死するはずの者が生存した状態でミッションをクリアすることによる変化が発生する。これも先述の「特定キャラ撃破」同様、同じミッションを通る複数のキャラでフラグを共有しているケースがある。
出撃時に特定のキャラクター名を入力することにより、原作に登場したキャラクターを使うことができる。過去作と同様に基本的にファーストネームのみでも可能なのだが、複数の作品にわたって登場するキャラクターはフルネームか名前の一部かでどの作品に準じたものかが変化するため別キャラクター扱いになっているものが多い。余談だが、「シャア・アズナブル」とシャアをフルネームで入力すると「クワトロ・バジーナ」扱いとなる他、過去作同様に「パプテマス・シロッコ」は「パプテマス」ではなく「シロッコ」とファミリーネームを入力しなければ適用されない。 アーケード版との違いとして陣営に関係なくキャラクターを使用可能。ただし、作中で離反したエマ・シーン、およびレコア・ロンド以外のキャラクターに変化はない。他にもゲーツ・キャパや『機動戦士ガンダムΖΖ』のキャラクターが追加されている。また、「宇宙世紀モード」では本来所属している陣営とは別の陣営のパイロットとして出撃するミッションが用意されたキャラクターが存在し、その陣営のノーマルスーツを着用したカットインも用意されている。