マンチェスター・ボストン地域空港
その12年後、空港は再び「マンチェスター空港」という名に戻された。
1990年代にも大規模な拡張が行われた。1994年には14,680m2の広さを有する新ターミナルビルが完成し、より大型のジェット機の発着に対応できるようになった。また、駐車場の増設や滑走路・誘導路の拡張も行われた。その結果、メトロジェット、ノースウエスト航空、サウスウエスト航空がマンチェスター空港に乗り入れた。2003年には、滑走路17/35が7,001フィートから現在の9,250フィートに延長され、ラスベガスのマッカラン国際空港への直行便が発着できるようになった。
ボストン都市圏内の都市・町村はマサチューセッツ・ニューハンプシャー両州政府とのパートナーシップの下、ボストンの第2空港を新たに建設するのを避け、マンチェスター空港とT・F・グリーン空港をローガン国際空港を補完する空港として利用していくことを決定した。2006年4月には、ボストン都市圏の空港として全米の旅行者にアピールするため、マンチェスター市は空港名をマンチェスター・ボストン地域空港と改めた。