クリスタルエクスプレス トマム & サホロ
気動車列車では日本初の2階建て車両である。台車間に1階部分を落とし込む構造で、走行用機関を搭載しない付随車となっている。 台車は廃車発生品の電車用TR69D形を装着する。これはJR北海道が日本国有鉄道(国鉄)から継承しながら、一度も営業運転に就かずに廃車になったサハネ581-15から流用したものであり、以下の改造が実施された。
冬期での走行中に車体下部に氷雪が当たらないように、車端側に雪かき装置を装備。レール面上から145 mmの位置に設置しており、台車枠に溶接で取り付けられているが、その際にひずみや熱が台車枠に加わるため、その処理技術を持つ車両製造メーカーの日立製作所に委託契約して取り付けが実施された。 ブレーキシリンダとブレーキテコを785系と同じタイプに取替え。 ブレーキ管装置と空気ばねの取替え。 踏面清掃装置の取り付けと同配管の設置、781系を参考にしている。 車軸速度発電機の取り付け。 その他の付属機器の改造
2階客席は4人用のボックスシート(普通席)を7組配置し、1階には4人用のグリーン個室を3室設置する。シートはソファタイプである。2階部分と平屋部分車端部の2か所にラウンジを設け、平屋部に設けられたラウンジには、妻面にかかる曲面ガラスを設けて斜め方向の展望を確保している。
なお、2010年時点ではグリーン個室は普通個室扱いとなっており、山陽新幹線の700系E編成「ひかりレールスター」で運行される列車と同様な利用制度になっているが、形式はキサロハのままで個室はフルムーン夫婦グリーンパスでも利用可能である。
登場当時の車内にはオーディオサービス・TVモニター・大型テーブル・デラックスソファーなどを備えていた。