日本の哺乳類一覧
大陸からの迷行と思われる。
チチブコウモリ Barbastella leucomelas 【北・本/絶滅のおそれのある地域個体群(環境省レッドリスト):本州、四国】
ニホンウサギコウモリ Plecotus sacrimontis 【北・本/絶滅のおそれのある地域個体群(環境省レッドリスト):近畿地方以西/固】 かつてはウサギコウモリ Plecotus auritus の亜種 P.a.sacrimontis とされた。
リュウキュウユビナガコウモリ(コユビナガコウモリ) Miniopterus fuscus 【島(南)/絶滅危惧IB類 (EN)(環境省レッドリスト)】 かつては本州にも生息していたと考えられる。1933年、紀伊半島での記録あり。
ユビナガコウモリ Miniopterus fuliginosus 【本・島(対)】
(コテングコウモリ Murina ussuriensis ) ニホンコテングコウモリ(亜種) M.u.silvatica 【北・本・島(対)】
(テングコウモリ Murina leucogaster ) ニホンテングコウモリ(亜種) M.l.hilgendorti 【北・本】M. hilgendorti として独立種とする説もある(2007年版レッドリストでは M. hilgendorti で掲載)。
クチバテングコウモリ Murina tenebrosa 【島(対)/情報不足(DD)(環境省レッドリスト)/固】 1962年に対馬で発見、1970年新種記載。標本は1点のみ。
リュウキュウテングコウモリ Murina ryukyuana 【島(南)/絶滅危惧IB類 (EN)(環境省レッドリスト)】 1997年発見、1998年新種認定。
〔在来11科(迷行の1科除く)〕
〔在来2科〕
【移】 ヌートリア Myocastor coypus 【本】 中部以西。南米原産の毛皮獣が戦後野生化。農作物被害大。「日本の侵略的外来種ワースト100」に選定。
(ニホンジカ Cervus nippon ) エゾシカ(エゾジカ)(亜種) C. n. yesoensis 【北/固】 ホンシュウジカ(亜種) C. n. centralis 【本/固】 奈良(奈良県奈良市一円)のシカは天然記念物。 キュウシュウジカ(亜種) C. n. nippon 【本/固】 ケラマジカ(亜種) C. n. keramae 【島(慶)/固/国内移入種】 1600年代に薩摩(鹿児島県)から移入されたキュウシュウジカが島嶼の環境に適応して特異化したものとされる。農林資源への食害あり。個体数が少なく絶滅が危惧されるが、(国内)移入種としての側面を併せ持つためか、環境省レッドリストには記載がない。なお、IUCNレッドリストではCR(絶滅寸前)、日本哺乳類学会のレッドリスト(1997年)では危急亜種。ケラマジカおよびその生息地は天然記念物。 ツシマジカ(亜種) C. n. pulchellus 【島(対)/固】 独立種とする説もある。 ヤクシカ(ヤクジカ、ヤクシマシカ)(亜種) C. n. yakushimae 【島(屋)/固】 マゲジカ(マゲシカ、マゲシマジカ)(亜種) C. n. mageshimae 【島(馬)/固】 環境省第4次レッドリストでは「馬毛島のニホンジカ」として絶滅のおそれのある地域個体群(環境省レッドリスト)に記載。 【移】 タイワンジカ(亜種) C. n. taiouanus 【本】 観光用に放され和歌山県友ヶ島などで野生化。本土に渡れば在来亜種と交雑の恐れあり。
【移】 キョン Muntiacus reevesi 【本】 1980年ごろ、房総半島で野生化。
カグラコウモリ Hipposideros turpis 【島(南)/絶滅のおそれのある地域個体群(環境省レッドリスト):与那国島、波照間島】 ほぼ固有種だが、タイ南部にも飛び地的に分布。
〔移入(家畜種)1科〕