第三三一海軍航空隊
2月17日 二十八航戦はチッタゴン爆撃を計画。しかしトラック島空襲にともなう内南洋転属計画のため却下。
2月18日 全機サバンに集結。ペリリュー島への移動開始。
2月26日 全38機、ペリリュー到着。
3月4日 本隊は戦闘第603飛行隊に改編、第二五三海軍航空隊に編入。以後メレヨン島派遣隊となる。
岩国飛行場での再編が決定、三三一空は維持される。
ペリリューに向かった基地員は船便でバリクパパンに至ったが、新三三一空に復帰が決定し、引き返す。
3月15日 新三三一空(戦闘第309飛行隊・定数24機)に攻撃第253飛行隊を追加、岩国出撃。再びサバンに進出。
4月19日 サバン飛行場に敵機襲来。
5月27日 ペナン島に撤退。
以後、第三八一海軍航空隊と共同で蘭印の防空に従事。三三一空が西側・三八一空が東側を担当。
昭和20年(1945年)
1月11日 マラッカ海峡対潜掃討作戦(M5作戦)発動。哨戒・哨戒機護衛に従事。
1月29日 戦闘309飛行隊で特攻編成を実施、「神州隊」を編成。
3月2日 十三航艦の航空隊を改編。攻撃253飛行隊を第一三海軍航空隊に供出し、神州隊のみ残存。
4月下旬 特攻編成を解き、神州隊解散。九州に撤退。
5月15日 解隊
三八一空とともに、台湾・九州への引き上げが実施されたため、蘭印の防空力は消滅した。新三三一空は大規模な航空戦に投入されることはなかったが、フィリピン戦線の特攻作戦に際して、機体の供出を強いられている。特攻隊の神州隊は出撃の機会はなかった。偶然にも、回天特攻隊の神州隊も、終戦によって特攻を取りやめている。また、旧三三一空は絶海の孤島メレヨンに進駐し、戦闘を経験することはなかったものの、補給が途絶し、飢餓による死者が続出した。