ロタウイルス
VP1はウイルス粒子のコア内に存在するRNAポリメラーゼである。感染細胞内でVP1はウイルスタンパク質の合成や新しく合成されたウイルス粒子のゲノムとなるRNA分節の複製に用いられるmRNAを合成する。
VP2はウイルス粒子のコアを形成し、RNAと結合する。
VP3はコアの成分の1つで、グアニリルトランスフェラーゼと呼ばれる酵素である。VP3はキャップ形成酵素であり、mRNAの転写後修飾として生じる5'キャップの付加反応を触媒する。キャップ構造は核酸を分解する酵素であるヌクレアーゼからウイルスmRNAを保護することで、mRNAの安定化に寄与する。
VP4はスパイク状の突起としてウイルス粒子の表面に存在する外殻タンパク質である。VP4は細胞表面の受容体と呼ばれる分子に結合し、ウイルスの細胞への侵入を引き起こす。VP4は腸管に発現しているプロテアーゼであるトリプシンによって処理を受け、VP5*とVP8*に開裂する。VP4はウイルスの病原性を決定する因子であり、またロタウイルスのP型を決定する因子でもある。人の場合、ノロウイルスと同様に、血液型抗原の分泌の有無とロタウイルスに対する感受性は相関関係にある。血液型抗原を分泌しない人はP[4]型とP[8]型に抵抗性である様で、このことは前述の2つの遺伝子型のロタウイルスが血液型抗原を受容体として利用することを示唆する。
VP6はカプシドの主成分で内殻を構成する。抗原性が高く、ロタウイルスの種の同定に用いられる。また、VP6はA群ロタウイルス感染における検査に使用される。
VP7はウイルス粒子の外殻を形成する糖タンパク質である。構造に関わる他、VP7はG型を決定し、VP4と共にロタウイルス感染に対する免疫に関係する。