ホーボーケン-ワールド・トレード・センター線
ホーボーケン駅はニュージャージー・トランジットの再建計画により20世紀末から改修工事が行われている。
アメリカ同時多発テロ事件によりワールド・トレード・センター駅が破壊され、エクスチェンジ・プレイス駅も閉鎖されたことから、ホーボーケン-ワールド・トレード・センター線は運行休止となった。その代わりに、同じラインカラー(緑色)でホーボーケン駅 - ジャーナル・スクエア駅(英語版)間の運行が行われた。2003年6月29日にエクスチェンジ・プレイス駅が営業を再開すると、仮系統のホーボーケン-エクスチェンジ・プレイス線に緑色のラインカラーが与えられた。ホーボーケン-ワールド・トレード・センター線は同年11月23日に運行を再開した。2006年4月9日から、ワールドトレードセンターサイト(英語版)の建設工事のため週末の運行が中止された。