ポリリン酸
ポリリン酸イオンは弱塩基である。酸素原子の孤立電子対は典型的なルイス酸-ルイス塩基相互作用でプロトンまたは金属イオンに供与されることがある。これは生物学的に非常に重要である。例えば、ATP はpH 7の水溶液では25 %がプロトン化されている。
ATP + H ATPH, pKa ≈ {\displaystyle \approx } 6.6
それより低い pH ではさらにプロトン化が起こる。
ATP は金属イオンとキレート錯体を形成する。その平衡の安定度定数
ATP + Mg MgATP, log β ≈ {\displaystyle \approx } 4
は特に大きい。マグネシウムとの錯形成は、末端のリン酸基と他の部分との結合を弱めるため、ATP の加水分解過程で決定的な因子である。