ジェームズ1世 (イングランド王)
以後スコットランドは遠隔支配することになり、複数の側近を派遣して「ロンドンに在ってスコットランドをペンで治める」旨を伝えた。権力集中を避けるため3人がスコットランドを治める体制を作り、議会で権力が制限されがちなイングランドよりは効果的な体制だったが、国王の目が届かないため圧政や腐敗が広がった。
特にジョージ・ヘリオット(英語版)、トマス・ハミルトン(英語版)、アーガイル伯爵アーチボルド・キャンベル(英語版)が権勢を振るい、ヘリオットはイングランドで浪費して金に困ったスコットランド貴族やジェームズ1世に土地と引き換えに金を工面し、スコットランド最大の地主に成り上がりジョージ・ヘリオット学校(英語版)設立など慈善事業に捧げた。ハミルトンはガウリ伯兄弟の遺体を裁判にかけ大逆罪を下したことで一族共々出世しハディントン伯爵(英語版)も与えられた。一方アーガイル伯は対立していたマクレガー氏族(英語版)を大勢惨殺したり、他の氏族にも強引にイングランド文明を押し付けたりしていた。
スコットランドでは宗教問題が未解決で、ジェームズ1世がイングランドに移ってからも監督制を支持する国王と長老制を堅持する長老派教会との対立が続いていた。ジェームズ1世は1606年にアンドリュー・メルヴィルを追放、1618年にはパースで監督制を強化したパース5箇条(英語版)を押し付けたが、後に一部緩和してそれ以上宗教に介入しなかった。またこの間の1617年にジェームズ1世は1度スコットランドへ帰国しているが、イングランド人廷臣を大勢連れて贅沢三昧と狩猟に明け暮れたためスコットランド人に不評だった。
一方、自分に同情的で優しいヤングの方は気に入り、後に結婚のためデンマークに派遣する使者に選んでいる。
1579年、ジェームズ6世が成人の統治者となったことを祝う式典が行われた。この時以降、主な居所をそれまでのスターリング城からエディンバラ城に移すようになった。
同年、13歳のジェームズ6世はフランス帰りのオウビーニュイ卿エズメ・ステュアートに魅了され、彼を寵愛した。邪魔になったモートン伯は、レノックス公の謀略でダーンリー卿殺害に関与したとして1581年1月に処刑されたが、ジェームズ6世の寵臣政治はスコットランド貴族達の反発を招いた。
翌1582年、エディンバラ市議会(英語版)は、聖マグナス教会(英語版)の聖職者ロバート・レイド(英語版)の遺言に基づきスコットランドで4つ目の大学の設立の請願を行い、ジェームズ6世は4月14日、エディンバラ大学設立を勅許し、また資金も拠出することになった。
しかし、8月、初代ガウリ伯ウィリアム・リヴァン(英語版)の計略によりジェームズ6世は誘拐され、リヴァン城(英語版)に軟禁された(リヴァンの襲撃(英語版))。レノックス公も逮捕され12月にフランスへ逃亡した。ガウリ伯はプロテスタント貴族で、宗教改革のなかで、ジェームズ6世に対するフランスやカトリックの影響、母のイングランドからの帰還を妨げようとしたとされている。