回民蜂起
1862年、太平天国と捻軍が陝西省に入ると、漢人は防衛のため団練を組織した。その結果漢人を恐れた回民も武装することとなった。こうして対立が深まった結果、回民が太平天国に呼応して蜂起した。初期の指導者には任武・赫明堂、馬生彦、馬振和、白彦虎らがいた。同時期に寧夏でも馬兆元と馬化龍の指導で回民が蜂起した。陝西省の回民軍は清朝が太平天国の対応に忙殺されている間に渭水流域の陝西中部に勢力を伸ばした。蜂起軍は西安を包囲したが、1863年秋に欽差大臣ドロンガ(多隆阿)に敗北した。
太平天国の崩壊後、左宗棠が率いる湘軍が陝西に入った。左宗棠は捻軍を先に討ってから回民軍を倒すという方針をとり、1866年に回民軍は甘粛省への撤退を余儀なくされた。左宗棠はまた綿や穀物などの農業を振興し、さらに他の地域からの財政援助を受けた。こうして補給を確保した左宗棠は、1869年に劉松山を派遣してもっとも重要なジャフリーヤのリーダー馬化龍への攻撃を開始し、甘粛省北部にある馬化龍の拠点の金積堡を包囲した。16箇月の包囲ののち、馬化龍は降伏して処刑された。何千ものイスラム教徒が中国を逃れた。
白彦虎率いる回民軍は、東トルキスタンのヤクブ・ベクのもとに逃れ、最後はロシアにまで逃れた。白彦虎に従った回民の子孫が現在のドンガン人である。
陸軍きっての中国通といわれた日野強少佐は、新疆を目指す途中の1907年12月に回民蜂起が起きた蘭州から粛州の間を通過したが、日野が訪れたところ、イスラム教徒だった村民たちが漢人に追われ、村落は荒れ果て廃屋が放置されているなどの漢人の進出によって故地を追われたイスラム教徒たちの惨状を目の当たりにしいる。それでも現地に住み続けるイスラム教徒の様子を見て日野は次のように語っている。