リブロース1,5-ビスリン酸カルボキシラーゼ/オキシゲナーゼ
Form IIの特徴は以下のとおりである。
Form Iの大サブユニットに該当するサブユニットのホモ2量体からなる(全体の分子量は約100 kDa)
渦鞭毛藻類や紅色非硫黄細菌等が主として有している。渦鞭毛藻では核コードである。
CO2補償濃度、τ値はForm Iに比べて高酸素分圧に適応していない。
Form Iよりも古い系統に属すると考えられている。
立体構造が明らかになると同時に、サブユニットの機能についても明らかになった。Form Iにおける大サブユニットはカルボキシラーゼ/オキシゲナーゼ活性を有する触媒部位を有し、小サブユニットは機能未知な部分が多いが反応の調節を行なっているのではないかと考えられている。小サブユニットの無いForm I RubisCOでは活性が1%程度に落ち込むことが大腸菌発現系を用いた研究でわかっており、何らかの形でカルボキシラーゼ活性に関わっていることも示唆された。
Form II、IIIのサブユニットはForm I 大サブユニットと同様、触媒部位を有しており、基本的には以下に述べる基質の結合過程に従うと考えられる。触媒過程における最も多くの反応中間体が得られているのはホウレンソウのForm I RubisCOである。
RubisCOへの基質結合に際して、まずK201(大サブユニットアミノ酸配列201番目のリシン)が二酸化炭素によってカルバミル化される。
カルバミル化されたK201、D203(アスパラギン酸)、E204(グルタミン酸)によってマグネシウムイオンが水素結合により配位されRubisCOの活性型をとる。
2-カルボキシアラビニトール1,5-ビスリン酸(RuBPと構造の良く似た糖;CABP)は以下の水素結合によりRubisCOと結合する。