男女群島
国産み神話では、イザナギとイザナミの二柱の神がまず大八島を産み、続いて6島を産んでいるが、通説では男女群島が6島の最後に産んだとされる両児島(ふたごのしま)に比定される。
8世紀後半から9世紀にかけて南路をとった遣唐使船の航海の目印となり五島列島と寄港地になった。中世になると源定茂が島を所領して海外貿易の中継地として利用した。室町期から戦国時代にかけては松浦水軍の松浦党に属した宇久氏の勢力下に入り、男島や女島から当時の遺物が出土している。
江戸時代の承応年間(1652年-1655年)には漁場として最盛期を迎え、島在住の地元漁師はもちろん四国や九州各地から多くの漁船が集まり、福江藩の職制に「女島奉行」が設置されるほどになった。
1886年(明治19年)には周辺海域でサンゴ漁が始められ、1889年(明治22年)には300隻を超える船が操業した。1902年(明治35年)頃からは日本全国から仲買人が島を訪れるようになり、明治末年には外国人も参加して、島に居住するイタリア人の仲買人もいた。海難事故も多く、1905年(明治38年)に約1200人、その翌年に約1000人がサンゴ漁の途中に台風に遭って遭難して命を落としている。
1889年(明治22年)4月1日に、町村制施行により南松浦郡富江村に属するとされた。