にゃんこ大戦争
にゃんこ大戦争が8周年を迎えたことを記念して2020年11月26日に配信されたスピンオフ作品。課金要素は非実装。日本の都道府県を模した形のパーツが画面上から降ってくるためそれを積み上げ新しい日本を作る、という題材のカジュアルゲームとなっている。
ステージクリア時に得られる経験値が1.5倍になる。※経験値のドロップ報酬は1.5倍にはならない。
魔法少女まどか☆マギカ
2016年10月17日よりにゃんこ大戦争の4周年記念イベントを記念して開催された。 にゃんこ側には鹿目まどか、暁美ほむら、巴マミ、美樹さやか、佐倉杏子、キュゥべえとネコまどか等それらのネコ版が登場した。 敵側にはキュウべえ、お菓子の魔女シャルロッテ、ハコの魔女キルステン、薔薇園の魔女ゲルトルート、舞台装置の魔女ワルプルギスの夜が登場した。このうち、シャルロッテは第一形態と第二形態の両方が登場した。再度コラボした際ににゃんこ側には百江なぎさが、降臨ステージにはくるみ割りの魔女ホムリリィが登場。 2021年9月13日~9月27日のコラボではステージが大幅リニューアルされた。
ビックリマン
2019年4月22日から5月6日までの期間限定で実施され、にゃんこ側にはブラックゼウス・スーパーゼウス・スーパーデビル・ヘラクライスト・サタンマリア・聖フェニックス・ヘッドロココ・ネロ魔身・ヤマト王子・十字架天使・ネコ若神子・ネコデビル・ネコの助が登場した。2020年7月13日に復刻し、シャーマンカーンと騎神アリババ、天子男ジャックが追加。
日本編第一章滋賀県をクリアすることで利用可能となる。探検に出すことで、経験値やネコカン、キャッツアイなど様々なものを手に入れることができる。ネコビタンを使用することで、所要時間を短縮することが可能。探検できるステージはガマトトのレベルとユーザーランクを上げることで行けるようになる通常ステージ、ねこの目洞窟などの期間限定ステージ、消滅都市(消滅都市コラボ)などのコラボステージなどがある。コラボ中はトト(メルクストーリアコラボ)などのアイテムの入手率を高めるキャラクターが探検に同行する場合もある。
ver9.9では、経験値を消費することでランダムにアイテムを一つ貰える「にゃんこ神社」が追加され、未来編三章クリア後に遊べるようになった。10万経験値を消費するとにゃんこ城の開発素材、100万経験値を消費するとマタタビ及びマタタビの種(1%の確率で金マタタビが貰える)、300万経験値を消費するとキャッツアイ、500万経験値を消費するとリーダーシップやレアチケットなどのその他アイテムを貰うことができる。それぞれ最大で5回ずつ経験値の消費ができるが、神社は基本的に数回で消えてしまう。また、金マタタビには天井が存在するため、一定以上の経験値を消費することで確実に金マタタビを手に入れることができる。
ver10.0では、にゃんこ神社に「にゃんこおみくじ」が追加された。にゃんこおみくじには神の使いとしてアイテムの入手率を高めるキャラクターであるいなりが一度だけ探検に同行したり、探検後に出現する袋が比較的良いものが出る大袋になったりなどのご利益を得られる。また、大吉や凶などの運勢は全く関係がない。
東京スカイツリー
2019年12月2日から12月26日までの期間限定で実施。にゃんこ側にはソラカラちゃんが登場。
城とドラゴン
2016年1月14日から2016年1月28日の限定で実施され、にゃんこ側にはアシュラなど計7体が登場した。コラボステージは19ステージ用意されており、「開眼の城とドラゴン」をクリアすると、すべてのコラボキャラクターを第3形態に進化させることが可能である。 また、復刻版が2017年1月16日から1月30日と2019年8月19日から8月29日と2020年9月1日から9月15日の期間限定で実施された。2020年からはチビクロプスネコタマゴが有料販売される。2022年1月17日から1月31日の期間限定でコラボした。 2023年では9月1日から9月15日までコラボが開催され新たな難易度となるステージ追加。限定キャラのチビクロプスネコタマゴが再販される。