ワクチン耐性
同じ病原体に対しても、宿主によって異なる免疫応答が起こる可能性がある。
典型的な小児疾患(英語版)のように、曝露後に長期的な免疫が与えられる疾患では、ワクチンによって自然感染と同じ免疫応答が得られる可能性があるので、ワクチン耐性は発生しないと予想される。
ワクチン耐性が出現した場合でも、そのワクチンは、おそらく免疫病理(英語版)から距離をおいて宿主の免疫応答を改変することで、重篤な感染症に対してある程度の防御を維持できるかもしれない。
ワクチン耐性の最もよく知られた例は、次の疾患である。
動物の病気 マレック病では、ワクチンは感染や伝播を予防せず、重篤な形態の病気のみ予防したため、実際にはワクチン接種後により毒性が強い株が出現した。 エルシニア・ラッケリ(英語版)は、ただ1つの突然変異でワクチン耐性を獲得した。 トリメタニューモウイルス(英語版)。
人の病気 肺炎レンサ球菌は、ワクチンが標的としていない別の血清型と組み換えによる。 B型肝炎ウイルスは、9個のアミノ酸によって形成された単一の部位がワクチンの標的となったため。 百日咳菌は、すべての血清型を標的としたわけではなく、後の無細胞ワクチンが少数の抗原のみを対象としたため。
その他の記録が少ない例には、鳥インフルエンザ、トリオルトレオウイルス(英語版)、ジフテリア菌、ネコカリシウイルス、インフルエンザ菌、伝染性ファブリキウス嚢病ウイルス、髄膜炎菌、ニューカッスル病ウイルス、およびブタサーコウイルス(英語版)2型がある。