藤原教通
ここで、教通は既に26歳になっていた生子入内の最後の機会と捉えたらしく、頼通の強い反対と妨害を押し切って暮れも押し迫った12月に入内を強行した。入内に際しては、頼通が最後まで反対して輦車を貸与せず、教通は自前で輦車を新しく作って準備せざるを得なかった。さらに頼通への遠慮から入内に随行した殿上人は僅か5名(藤原経通、藤原定頼、藤原信長、藤原経家、藤原顕家)という有様であった。後朱雀天皇と生子の仲は睦まじかったが、皇子女を儲けることはできなかった。また、天皇は生子を立后しようとしたが、頼通が摂関の娘でなく皇子を生んでもいないことを理由に反対したため、これも実現できなかった。
次代の後冷泉天皇に対しては、頼通に先んじて永承2年(1047年)に三女・歓子を入内させる。歓子は永承4年(1049年)に待望の皇子を出産するものの皇子は即日没し、永承6年(1051年)ごろからは兄・静円の僧坊がある洛北の小野に籠居してしまい、皇子女に恵まれなかった。
関白職を獲得するまでの教通の忍従、特に頼通に対して従順であることは、ほとんど卑屈の域に達したと評されることもある。頼通が太政大臣に昇進したことの祝賀に際して、左大臣教通は頼通にひざまづいて礼をしたという。これを聞きつけた異母兄・能信が「大臣ともあろう者がひざまづいて礼をするなど聞いたこともない」と批判した。これに対し教通は「自分は道長から『頼通を父と思え』と言われたのだ。