京都鉄道博物館
交通科学博物館では鉄道運転シミュレータとして使用されていた実物大モックアップ。
京都鉄道博物館への移設に際し、運転シミュレータとしての機能はすべて撤去され、マイクによる車内アナウンス体験や、車内非常ボタンの体験コーナーとして活用されている。これに伴い客室部分を増設、車掌台側の乗務員室扉は撤去され、車内片側に乗降扉・戸袋窓・座席が設置されている。方向幕の表示は基本的に前面が「臨時」、側面が「京都」となっているが、前面については2020年9月の新快速50周年イベント以降「新快速」に変わっている。
EF66形電気機関車10号機 (先頭ボンネット部分のみのカットモデル)
京都鉄道博物館開館時に追加された機材であり、車体は運転席部分のみで前面窓や屋根が一切ない構造となっている。
他にもDD51形ディーゼル機関車・DE10形ディーゼル機関車・0系新幹線の運転席部分が展示されている。
19D形コンテナ 28901番(50周年記念コンテナ)
本館2階に扉を全開にして積み荷が見える状態で展示されている。このコンテナは実際に鉄道貨物輸送で使用されていたものではなく、開館に当たって総合車両製作所で展示用として特別に製作されたものである。
大阪駅時鐘
鉄道記念物。メインスペース1階に展示されている。鐘の前に人が立つと鐘の音色が流れる仕掛けとなっている。
C11形蒸気機関車324号機 (運転台部分のみのカットモデル)
旧二条駅舎内に保存。梅小路蒸気機関車館時代より展示。元は京都府田辺町で保存されていた車両だが、運転台や動輪(京田辺駅前に保存)を残して解体された。
JR四国キハ185系気動車(キロ185-26) JR四国キクハ32形気動車(キクハ32 502) 「瀬戸大橋アンパンマントロッコ」車両。JR旅客他社の車両の展示はこれが初。
オヤ31形客車31号車 建築限界測定用試験車。8月12日 - 8月14日は、DE10 1118と連結した形で展示。グッズ付き入館券、車両貸切見学&グッズ付き入館券が発売された。また、前述のマイテ49形2号車が展示に合わせて当館に輸送され、以降は扇型車庫の収蔵車両として保管されている。
JR四国キハ185系気動車(キハ185-20) JR四国キクハ32形気動車(キクハ32-501) 「志国高知 幕末維新号」車両。