堀越公方
政知には3人の男子がおり、長男の茶々丸は先妻の子で素行不良のため廃嫡されて牢に閉じ込められていた。二男の清晃、三男の潤童子は後妻の円満院の子であり、清晃は次期将軍候補となるべく出家して京都にいたため堀越公方の後継は潤童子と決まっていたが、閉じ込められていた牢から脱出した茶々丸によって母もろとも殺害され、2代目堀越公方には茶々丸が就任した。
明応4年(1495年)、堀越公方の居城であった堀越御所が今川氏の外戚で今川の軍勢を率いた伊勢宗瑞(北条早雲)に攻められ、茶々丸は追放された。これは従来は下剋上の典型と言われていたが、近年は明応の政変によって義澄が11代将軍に就任したことで、義澄の命により茶々丸が「将軍の生母と弟」殺害犯として討伐されたものであるというのが定説となっている(上杉定正の手引きがあったとも言われている)。ここに、堀越公方はわずか38年で滅びたのである。
その後、茶々丸は山内上杉家や武田氏を頼って伊豆奪回を狙うも、明応7年(1498年)8月に甲斐で盛時に捕捉されて自害した。堀越公方の滅亡時期には様々な説があるが、少なくとも15世紀後半には伊豆が後北条氏の前身である伊勢氏に奪われたことは確かであり、ここに堀越公方は滅亡し、鎌倉公方の系譜を引くのは古河公方のみとなった。
わずか2代(実質上1代)で滅んだ堀越公方ではあるが、その血統は京都の足利将軍家に受け継がれた。義澄から15代・足利義昭までの室町幕府の将軍は全て堀越公方の血筋であり、政知の子孫である。また、平島公方家を介して、現在も血筋は続いている。