ボサンスカ・クライナ
1526年のモハーチの戦いでヨーロッパ諸国がオスマン帝国に敗れた後、クロアチアの貴族らはツェティン議会(Parliament on Cetin)を招集し、1527年にクロアチアはオーストリアの一部となり、オスマン帝国はその統治下に正式にボスニア州(英語版)(1580–1867、ボスニア・エヤレト)を発足させた。こうした中で、かつてクロアチアと呼ばれていた地域は大部分がオスマン帝国の領土となり、クロアチアと呼ばれる地域は大幅に縮小した。クロアチア人は、こんにちボサンスカ・クライナとよばれるこの地域の西の端で抵抗を続けるのみとなった。しかしオスマン帝国は、より北西への侵攻が容易なドナウ川流域などの平野部からヨーロッパ侵攻を続け、オシエク、モハーチ、ブダを経て1529年には第一次ウィーン包囲に至った。ボサンスカ・クライナ地域には、サヴァ川、ヴルバス川、ウナ川、サナ川などの河川や、プリェシェヴィツァ山(Plješevica)、シャトル山(Šator)、クレコヴァチャ山(Klekovača)、ラドゥシャ山(Raduša)、グルメチュ山(Grmeč)、コザラ山(Kozara)、ヴラシッチ山(Vlašić)などの山があり、天然の防壁となっていた。
オスマン帝国の伸張が更に続くと、オーストリアのカール2世は新たな要塞都市カルロヴァツ(カルロヴィッツ)を築く。1580年、オスマン帝国はこれに対抗して、この地のサンジャクを統合してボスニア州(ボスニア・パシャルク)とし、こんにちのクロアチア共和国領を含む一帯をその領域と宣言した。度重なる戦争と国境変動により、カトリック教徒のクロアチア人は北に脱出して数を減らし、替わって正教徒のセルビア人やヴラフ人が増加した。