伊勢まぐろ
養殖に用いる種苗は、地元産のクロマグロの幼魚(ヨコワ)である。ヨコワの産地は三重外湾漁業協同組合(JF三重外湾)の管内である、南伊勢町の神前浦、志摩市の安乗・浜島、大紀町の錦、尾鷲市の須賀利の5港であり、1尾あたり100 - 400 g、体長20 - 30 cmである。これら各港にブルーフィン三重専用の生け簀を設置し、各港の曳縄(ひきなわ)漁師が漁獲したヨコワを納め、ブルーフィン三重は漁獲尾数に応じて対価を支払う。ヨコワの漁期は7 - 9月である。
入荷したヨコワは、陸側の拠点である南伊勢町河内(吉津港北岸壁)から作業船で10分の位置にある、南伊勢町神前浦の弁天島沖にあるブルーフィン三重の養殖漁場へ移し、直径50 mの生け簀へ入れる。弁天島沖は水深35 - 40 mで潮の通りが良く、台風の被害リスクが低く、河川水の影響を受けにくいため養殖地に選定された。生け簀1台には漁場の面積的には最大18台の生け簀を設置することができるが、2014年(平成26年)現在ヨコワの不漁のため、12台で養殖している。この漁場の漁業権は地元漁協を通さず、ブルーフィン三重が設立に際して直接三重県から新規に免許を取得した。日本のマグロ養殖地域の中では最北に位置するため、漁場の水温は低く、他産地に比べて成長速度が遅くなる。
出荷時はまず、養殖生け簀に作業船を横付けし、1尾ずつ釣り上げる。出荷する頃には1尾当たり50 - 60 kg(エラ・内臓を除去した状態での重量)に成長する。クロマグロが鈎針に食い付くと同時に電気ショックを与えて甲板へ引き上げ、速やかに延髄破壊、神経除去、鰓弓(さいきゅう)切除、血抜き、エラ・内臓除去を行う。ここまでの工程を3分で終え、氷水を張った船倉へ移し、魚体の芯温が5°C以下になるまで5時間ほど置く。次に船倉からクレーンで陸揚げし氷水を張った魚コンテナに移し替えて冷却室内に入れ、一夜を明かす。ここまでがブルーフィン三重の仕事で、翌朝に魚体を洗浄・計量し、発泡スチロール容器に詰めて卸売市場へ出荷する作業は、みえぎょれん鮮冷加工部が担当する。ただし、ブロック加工など小口販売はブルーフィン三重が手掛ける。
陸上での加工・出荷作業は、伊勢まぐろの加工のために建設された、みえぎょれん南伊勢水産流通センターで行う。センターには試験・研究開発室を設置し、伊勢まぐろを用いた新商品の開発を行っている。
出荷先は名古屋や大阪が中心で、初出荷から1年が経過した2014年(平成26年)に日本経済新聞は両都市の消費者に伊勢まぐろが認知されてきたと報じている。一方、首都圏では大型のマグロが好まれるため、小ぶりの伊勢まぐろは浸透していない。