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このようにATF6はCHOPやXBP1の転写を活性化し、XBP1もまたCHOPの発現をアップレギュレーションする。
小胞体ストレスは膜貫通タンパク質IRE1αの活性も刺激する。IRE1αは活性化に伴ってXBP1のmRNAのイントロンをスプライシングすることで成熟型で活性型のXBP1タンパク質の産生をもたらし、CHOPの発現をアップレギュレーションする。IRE1αはASK1の活性化も刺激する。その後ASK1はJNKやp38MAPKといった下流のキナーゼを活性化し、CHOPとともにアポトーシスの誘導に参加する。p38MAPKファミリーのタンパク質はCHOPのSer78とSer81をリン酸化し、細胞のアポトーシスを誘導する。JNK阻害剤はCHOPのアップレギュレーションを抑制することが示されており、JNKの活性化もCHOP濃度の調節に関与していることが示唆される。
小胞体ストレス下では、CHOPは統合的ストレス応答(英語版)経路の活性化を介して誘導される。統合的ストレス応答では、翻訳開始因子eIF2α(英語版)のリン酸化、そして転写因子ATF4(英語版)の誘導が行われ、CHOPなど標的遺伝子のプロモーターに収束する。
統合的ストレス応答、そしてCHOPの発現は、次の因子によって誘導される。
アミノ酸枯渇(GCN2(英語版)を介して)
ウイルス感染(PKRを介して)
鉄の欠乏(HRI(英語版)を介して)
小胞体でのフォールディングしていない、または誤ってフォールディングしたタンパク質の蓄積によるストレス(PERKを介して)
小胞体ストレス下では、活性化された膜貫通タンパク質ATF6は核へ移行してATF/cAMP応答エレメント(ATF/cAMP response element)や小胞体ストレス応答エレメント(ER stress-response element)と相互作用し、UPR(unfolded protein response)に関与するいくつかの遺伝子(CHOP、XBP1(英語版)など)の転写を誘導する。