都営バス港南支所
品98甲:品川駅東口 - 天王洲橋 - 品川清掃工場 - セントラルビル - 大田市場
品98乙:品川駅東口 → 天王洲橋 → 品川清掃工場 → セントラルビル → 大井埠頭バンプール(朝運行)
品98丙:品川駅東口 -(急行)- 大田市場(平日・土曜早朝1本のみ、市場定休日は運休)
品99:品川駅東口 → 港南四丁目 → 東京入国管理局 → 京浜運河 → 品川埠頭 → 品川駅東口(循環)
品99折返:品川駅東口 - 港南四丁目 - 東京入国管理局(平日のみ)
港南支所のはとバス委託化に伴い、品川営業所に再移管。
また道路の渋滞により徐々に平日は新橋駅折返しが多くなった。
長らく路線の変動がなかったが、都営地下鉄大江戸線全線開業に伴う路線再編成により2000年(平成12年)12月12日付けで新橋駅 - 日本橋三越が廃止された。なお、銀座通りが歩行者天国の場合は、新橋駅前から京橋まで外堀通りを迂回した。廃止時点で銀座通りを経由して銀座を縦断する唯一の路線でもあった。
2005年(平成17年)3月28日に目黒分駐所の廃止に伴い、品川営業所に移管。
2006年(平成18年)4月1日に目黒駅 - 東京タワー(橋86折返)を新設し、新橋駅行は平日土曜の朝夕のみの運行となった。
2010年(平成22年)3月28日、麻布十番駅前 - 赤羽橋駅間が都道環状三号線経由から都06系統本線と同じ旧道経由に変更となった。
2013年(平成25年)4月1日にはとバス委託路線となり、港南支所に移管された。
2018年(平成30年)4月1日に、日中の多くの便が目黒駅 - 赤羽橋駅間に区間短縮された。
出庫便である港南四丁目(港南車庫)→浜松町駅前行きは早朝2本のみ運行されている。港南車庫行きの入庫便は運行されていない。これはかつて運行されていた虹01出入系統が名称を変更して現在も運行されているものである。
港南に直接移管又は他営業所に移管後、港南に再移管された系統は記載しない。
反90出入・反96出入:目黒駅(目黒車庫前) - 五反田駅
目黒営業所時代に、五反田駅を起終点とする各系統のバスの出庫、入庫のためだけにあったもので、早朝の出庫の際などに一度にまとまって五反田駅行が出て行く時や、夜に五反田駅から団子状態で目黒駅行が運転される時、日中の乗務員交代・車両交換・燃料給油などの時に運転されていた。3台まとまって運転のあと2時間開くなど変則的に運行されてきていた。目黒駅(目黒車庫)の停留所は、駅前のターミナルではなく、五反田駅前の方へ坂を下る国鉄→JR山手線の線路と平行している道に面した目黒車庫の出入り口の脇に存在していた。目黒駅(目黒車庫前)の降車用停留所は標識が無く、車庫の構内へ入ったところで降ろされることになる。状況から利用しやすいダイヤではなく、鉄道があったり、1.2kmと近距離であるので徒歩で行く人もおり、乗客は少なくたまに高齢者が乗車するといった具合で、世間には知られておらず便数が多い割には幻の路線であった。路線の途中には停留所は設置されておらず、深夜長距離高速バスではないが、起点の停留所の次が終点であった珍しい路線であった。ちなみに反90甲 → 反96折返系統の御殿山ヒルズ行も八ッ山橋に停車せず(品川駅行は停車)、実質的にノンストップとなっていた。
東98:東京駅丸の内南口 - 経済産業省前 - 東京タワー - 赤羽橋駅 - 魚籃坂下 - 目黒駅 - 清水 - 都立大学駅北口 - 等々力七丁目 - 等々力駅 ← 等々力操車所(東京急行電鉄→東急バス目黒営業所と共同運行)
東98:東京駅丸の内南口 → 経済産業省前 → 東京タワー → 赤羽橋駅 → 魚籃坂下 → 目黒駅
東98:目黒駅 - 清水 - 都立大学駅北口 - 等々力七丁目 - 等々力駅 ← 等々力操車所(出入庫)
1948年(昭和23年)11月に東京駅丸の内南口 - 自由が丘(現・八雲三丁目)間の113系統として営業を開始した路線で、当初の都営は渋谷営業所が担当だったが、目黒営業所の復旧により移管された。東京駅丸の内南口を起点に、日比谷、赤羽橋駅前、白金台駅前、目黒駅前、都立大学駅北口経由で等々力駅前に至る。東急バスとの共同運行で長距離路線であったことから、警視庁と共同で行っているPTPSの導入路線となっている。地下鉄網が現在よりも恵まれなかった頃は、この路線以外にも都心・郊外直通型の相互乗り入れ路線が数多く存在したが、交通事情により大部分が分割・短縮され、1984年(昭和59年)2月16日以降は都営と東急が共同運行を行う唯一の路線となっただけではなく、大手民営バスが都心部まで乗り入れる光景が見られる唯一の路線ともなっていた。
東急バスは途中の清水停留所にある目黒営業所が運行を担当。目黒駅以南では目黒通りを通る多数の東急バス路線(東98系統のほか、黒01、黒02、黒06、黒07系統など)があり、運行本数も東急バスの方が圧倒的に多いが、都営バスの運賃は目黒駅以南でも運行終了当時200円と東急バスより10円安くなっていた(目黒駅以南で東急バスを利用する場合は、東98系統利用の場合を含め運賃が当時210円であった。
(534→橋85→)都06:渋谷駅 - 渋谷車庫 - 天現寺橋 - 古川橋 - 麻布十番駅 - 赤羽橋駅 - 金杉橋 - 大門駅 - 新橋駅
(534→橋85→)都06:渋谷駅 - 渋谷車庫 - 天現寺橋 - 古川橋 - 麻布十番駅 - 赤羽橋駅
(534出入→橋85出入→)都06出入:渋谷駅 - 渋谷車庫 - 天現寺橋 - 東大医科研病院西門 - 白金台五丁目 - 目黒駅
1969年(昭和44年)10月26日の都電第4次撤去で廃止された都電34系統(渋谷駅前 - 金杉橋)の代替バスである橋85系統が、1990年(平成2年)3月に都市新バス化された路線である。当初は目黒営業所単独だったところに1999年(平成11年)7月から渋谷営業所が参入のうえ共管化。その後段階的に移管され、2003年(平成15年)4月に渋谷営業所の単独所管となる。移管と共に目黒車庫への出入庫として運行されていた目黒駅前着発便が廃止となった。その後2008年度の1年間だけ品川本所と渋谷営業所の共管が行われた。
速01:東京駅八重洲口 - 銀座四丁目 -(レインボーブリッジ)- お台場海浜公園駅 - 船の科学館駅 - パレットタウン(循環)
レインボーブリッジ経由で東京駅八重洲口と臨海副都心を結んでいた。当初は都市新バス(都03・05系統)の経年車(日野・ブルーリボン、S201-203・205-207号車)を使用して東京駅八重洲口 - ホテル日航東京(現・ヒルトン東京お台場)・東京ビッグサイト間を運行していたが、1998年(平成10年)夏には貸切車(ガイドが乗務、車両は各営業所から寄せ集め)を使用、2000年(平成12年)からは貸切車(いすゞ・スーパークルーザー、X001 - 003・005-007号車)を転用し、経路も東京駅丸の内南口発着、有楽町駅・銀座四丁目経由に変更され、専用車はアクアシティお台場・デックス東京ビーチ・ヴィーナスフォートいずれかのラッピング装飾が施された。
座席定員制で、運賃は大人300円・小児150円、2000年(平成12年)からは誕生日に乗ると身分証明書の提示で運賃が無料になる特典が設けられた。その後、車両の老朽化等を理由に2003年(平成15年)3月31日をもって廃止となった。
貸切車導入当初の仕様(C-X002)
貸切転用車導入当初の暫定仕様(M-X005)
ヴィーナスフォートの広告装飾後(M-X005)