神護寺
大師堂
絹本著色十二天像 六曲屏風
絹本著色真言八祖像 8幅
絹本著色真済僧正像
絹本著色足利義持像(寺伝足利義満像)
絹本著色文覚上人像
木造日光菩薩・月光菩薩立像(金堂安置)
乾漆薬師如来坐像
木造毘沙門天立像(毘沙門堂安置)
板彫弘法大師像(大師堂安置)
木造愛染明王坐像 康円作(東京国立博物館寄託)
紺紙金字一切経(神護寺経)2,317巻・経帙(きょうちつ)202枚(附:黒漆塗経箱45合)
文覚上人書状案(六月十一日)
後宇多天皇宸翰寄進状(嘉元四年十二月十日)
神護寺略記
二荒山碑文
寺領絵図 4幅(主殿寮御領小野山与神護寺堺相論指南図、紀伊国桛田庄図、紀伊国神野真国庄図、足守庄図)
神護寺絵図
高山寺絵図
神護寺文書 23巻、1幅
典拠:2000年(平成12年)までに指定の国宝・重要文化財の名称は、『国宝・重要文化財大全 別巻』(所有者別総合目録・名称総索引・統計資料)(毎日新聞社、2000)による。
国宝・重要文化財の大部分は普段は京都国立博物館・東京国立博物館に寄託されており、毎年5月(1日 - 5日頃)の「寺宝虫払い」行事の際に書院で公開される。