日本道路公団
伊勢湾岸道路(伊勢湾岸自動車道、A' - 第二東海自動車道、近畿自動車道名古屋神戸線)
京都第二外環状道路(京滋バイパス、京都縦貫自動車道)
京都丹波道路(京都縦貫自動車道)
京奈道路(京奈和自動車道)
湯浅御坊道路(A' - 近畿自動車道紀勢線)
米子道路(山陰道、A' - 山陰自動車道)
安来道路(山陰道、A' - 山陰自動車道)
江津道路(山陰道、A' - 山陰自動車道)
広島岩国道路(A' - 山陽自動車道)
今治小松道路(今治小松自動車道)
高松東道路(高松自動車道、A' - 四国横断自動車道)
椎田道路(A' - 東九州自動車道)
宇佐別府道路(A' - 東九州自動車道)
武雄佐世保道路(西九州自動車道)
佐世保道路(西九州自動車道)
延岡南道路(A' - 東九州自動車道)
隼人道路(A' - 東九州自動車道)
八代日奈久道路(南九州西回り自動車道)
鹿児島道路(南九州西回り自動車道)
南風原道路(那覇空港自動車道の一部区間)
2005年、元公団職員が発注先に天下りし、OBによる談合組織「かずら会」を組織しての官製談合を行なっていた橋梁談合事件が発覚。 2004年度公団発注の新東名高速道路の橋梁工事について、公団副総裁と理事は分割発注を職員に指示し、これにより公団に損害を負わせた背任行為が摘発された。
内田道雄公団副総裁 - 2005年7月、東京地検特捜部は公団発注の橋梁工事について独占禁止法違反容疑で副総裁を逮捕。2010年9月に最高裁は上告を棄却、懲役2年6か月・執行猶予4年の一審判決が確定。
公団理事 - 2010年7月、最高裁は金子恒夫公団元理事の上告を棄却、懲役2年執行猶予3年の一審判決が確定 。
公団元理事 - 神田創造元理事、横河ブリッジ顧問。独禁法違反罪で有罪確定。
橋梁メーカー 横河ブリッジ・三菱重工業・石川島播磨重工業 を 公正取引委員会が独占禁止法違反の疑いで刑事告発。国土交通省は8か月以上の指名停止処分を下した。
東京管理局(2005年(平成17年)7月1日から民営化前日までは関東第二支社) 東局(岩槻IC内)(2005年(平成17年)7月1日から民営化前日までは関東第一支社) 西局(2005年(平成17年)7月1日から民営化前日までは関東第二支社八王子管理局)
高速自動車国道の設計・建設、有料道路の管理のほか、以下の業務を行うものとされていた。
有料の自動車駐車場の建設・管理
高速自動車国道のサービスエリア・パーキングエリアなどにおける道路サービス施設の建設・管理
関連するトラックターミナルなどの建設・管理
旧道路整備特別措置法によると、国土交通大臣は日本道路公団のみに対し、高速自動車国道法に規定する整備計画に基く高速自動車国道の新設又は改築を行わせ(施行命令)、料金を徴収させることができた。したがって、高速自動車国道を有料道路として管理できるのは日本道路公団だけだった。
公団は、これらをふまえて策定した工事実施計画書や料金及び料金の徴収期間につき、あらためて国土交通大臣の認可をうけ、建設・管理した。
また、一般国道等については国土交通大臣の許可があれば一般有料道路として管理ができた。
1998年、公団の外債発行に対し野村證券からの収賄を受け取ったとして、公団の経理担当理事(大蔵省OB)が野村證券の元副社長らと共に逮捕された。