長期欠席
一方、欠席状態からなかなか復学できず、長期化することになる原因も様々ある。それらは
過剰な登校要求
現状の学校制度(自動進級制度など)
周囲の反応
自学自習による学習形態に対する自信
学習の遅延
などである。
しかし原因が明確なことの方が珍しく、どれも全ての長期欠席者に対して当てはまるものではない。長期欠席は、あくまでも個々の異なった現象であり、全体としてはっきりと原因を定義できるものではない。
このように、特に小中学校段階では、年齢主義進級制に基づいた強制的進級・卒業が行われやすく、未履修の学年を飛ばして復学することとなってしまうため、学校ではなく家庭、塾、独学などで飛ばした学年の内容を補習しておかなければ、授業についていけなくなってしまう事態に陥ることが多い。
このように日本のほとんどの地域で、15歳までは年齢主義の影響が強いため、児童・生徒は自分の年齢に追われる形にならざるをえず、学齢期を終えた時点では本来の中学卒業レベルの学力水準に到達できないまま、中学を卒業または退学してしまうケースも多い。こうしてやり直し学習の機会が閉ざされた状況に置かれた本人が、小学校や中学校に再度入学しようとしても、学齢超過者を受け入れる小中学校は数少ないため、ほとんどのケースで大きな転居や夜間中学への入学が必要となる。このような事態に対し、現状は、小中学校と特別支援学校の中間の位置付けの公立の公的教育施設が皆無に等しいため、サポート校などの営利的な教育機関の需要が高く、本来あるべき学校制度の姿からはかけ離れてしまっている。また、高等学校では、定時制高校や通信制高校が長期欠席生徒の受け皿になっていることが多い。