メアリ・オブ・ギーズ
このため、1560年4月にメアリーとフランソワは、モンリュクト、ペルヴェンド、ブロスという3人の使者を遣わし、エリザベス1世と交渉をさせた。
結果、1560年7月6日、エディンバラ条約が締結された。その内容は、イングランド軍とフランス軍の即時撤退、メアリーとフランソワのイングランドの紋章使用禁止というものだった。8月11日にスコットランド議会は、プロテスタントの信仰告白書を公表し、ローマ教皇の管轄権撤廃、カトリック教会の財産没収、ミサの挙行を禁止する事を決定した。なお、3回禁を犯したものは死刑とされる事にし、こうして宗教改革が行なわれた。しかし、マリーはエディンバラ条約が締結される前に最後の賭けに出、ボスウェルにドイツで5000人の傭兵を募兵させ、デンマーク王フレゼリク2世に航海の援助を要請するため、デンマークにも派遣した。
しかし、カトリックの衰退を目の当たりにしながら、ボスウェルの帰りを待たずに、マリー・ド・ギーズは1560年6月11日に死去した。なお、この知らせを聞いたメアリーは、気がふれたのかと人々が心配するほど悲しみ、彼女がイングランドでの長い虜囚生活の末に処刑されるまで、ずっと母の肖像画を所持していたという。