井上哲次郎
「井上哲次郎日記 一八八四-九〇 : 『懐中雑記』第一冊」(『東京大学史紀要』第11号、東京大学史史料室、1993年3月)、「井上哲次郎日記 一八九〇-九二 : 『懐中雑記』第二冊」(同誌第12号、1994年3月)
『井上哲次郎集』 島薗進、磯前順一編纂、クレス出版〈シリーズ日本の宗教学〉、2003年3月-2003年4月(全9巻)、ISBN 4877331727
磯前順一, 高橋原「資料 井上哲次郎の「比較宗教及東洋哲学」講義--解説と翻刻(1)」(PDF)『東京大学史紀要』第21号、東京大学史史料室、2003年3月、1-55頁、ISSN 03867684、NAID 40005817263。
『巽軒日記 : 自明治三三年至三九年』 東京大学史史料室、2012年3月 「巽軒日記」は87冊(1893年-1944年)が現存しており、3冊が文京区立小石川図書館に、残りが東京大学文書館に保存されている。 村上こずえ, 谷本宗生「井上哲次郎『巽軒日記 : 明治二六~二九、四〇、四一年』」(PDF)『東京大学史紀要』第31号、東京大学史史料室、2013年3月、67-162頁、ISSN 0386-7684、NAID 40019651585。 村上こずえ, 谷本宗生「井上哲次郎『巽軒日記 : 明治四三年』」(PDF)『東京大学史紀要』第33号、東京大学文書館、2015年3月、61-114頁、ISSN 0386-7684、NAID 40020427621。