御陵駅
信号設備等トンネル内のすべての設備の水没により列車が運行できなくなった。復旧のため消防や民間から30台のポンプをかき集めて溜まった泥水を排水し、9月19日夜に運行を再開した。なお京津線の乗り入れは大谷駅 - 上栄町駅近傍の土砂撤去作業のため9月29日夕方にずれ込んだ。流入した雨水は推計で15600トンとされている。
京都市交通局と京阪電気鉄道は緊急対策として土のうを安祥寺川の線路敷流入箇所と地下への進入口とに配備し、御陵東中間ポンプ所には仮設ポンプを増設し毎分3.16トンに増強した。またポンプ所の浸水への抜本的対策として排水ポンプ制御盤の地上への移動を同年12月18日に完了した。また京阪と地上からトンネルへと流入する雨水防止策について議論したいとし、京阪は安祥寺川に近い地点に止水扉を設置することとなり、また河川氾濫の根本対策の一環として京都府において安祥寺川の堆積土砂の除去を行った。