シグマ ハーモニクス
音使いであるシグマが人の会話や状況から重要な音を聞き分け、深層下に刻み込んだ情報の塊。ゲーム上では、事件を解くための手掛かりをアイテムとして視覚化したようなものとして扱われ、これらを使って超推理を進める。「○○と××が会話をした」「○○が△△をしていた」と言った事実そのものや、見つけた証拠品などは全て刻印として入手する。隠された重要な刻音も相応に存在するため、そういったものも隈なく探して発見しなければ真相は暴けない。
それは世界の存在そのもの否定し、再構成するというものだった。麟は再構築に呑まれて消滅し、シグマは館で目を覚ます。しかしそこに居た少女はネオンではなく、世界はやはり逢魔によって荒れ果てていた。
やがてシグマの前にあの黒衣の男が現れる。その素顔は麟によく似た青年だった。青年は調律者・法水シグマを名乗り、困惑するシグマの様子を見て彼の記憶が無い事を訝しむも、そのまま去っていった。残されたシグマは50年前からほぼ姿の変わらない佳子と、先程出会った少女...ねねの孫である美巫女と対面する。佳子から、現在の黒上家頭首がゆうである事、彼が「調律者」と戦い続けてきた事を聞かされ、守人乱歩の案内でゆうの元を目指す。歳を重ねたゆうは父・静馬にそっくりな姿になっていた。シグマの事情を知ったゆうは真実を話す。「調律者」とは、歴史の改変が行われた際にその修正のために時間そのものが生み出す存在であり、「シグマ」とは調律者を指す言葉であった。本来、この世界は逢魔によって滅ぼされるのが正しい歴史であり、黒上家を始めとする使い人が歴史を改変して平和な世界を作り上げていた。法水はその改変を修正し、本来の滅びた世界に戻すべく生み出された。しかし麟が逢魔人と結託して今回の事件を起こし、平和な世界の上に更に「黒上家滅亡」という改変を上書きしてしまったため、法水は自身の使命を果たすべくシグマが歴史を修正するように仕向けていた。黒上シグマもまた、麟による黒上家滅亡の歴史を修正するために生み出された調律者だったのだ。真実を聞かされたシグマは、先程の再構成の影響で霊体として留まっていたネオンと精神世界で対話する。
札使いの術の一種。契約した神霊を自らの肉体と同化させ、超人的な戦闘力を得る。しかし神霊は術者自身にはコントロールが出来ない為、音使いが奏でる神楽によって制御し且つ式札によって導く必要がある上、術者自身も神霊の影響で外見や性格が変化する場合がある
神霊は時を超越した存在であり、神降ろしを行う事は自分の在り方が時間軸を含めて別次元の存在となる事を意味する為、「変化した」と言う認識は本人はほぼ無い。一方、魂そのものは同一である為、思想や行動と言った根本的な本質は元のままである。
そんなシグマとネオンの前にディクソンとクリスティという男女が現れる。彼らは逢魔を統べる存在「逢魔人」。本来は大時計に厳重に封印されていたのだが、何者かによって封印を解かれたらしい。彼らこそが黒上家滅亡の歴史を作り上げた過去の変革者であった。ディクソンとクリスティは大逢魔を嗾けてまた新たな事件を起こすが、シグマとネオンも調査と超推理を繰り返し、歴史を修正していく。歴史が改変され、被害者、加害者として、時には根本の境遇すら変えて翻弄されていく過去の黒上家の面々。事件が進むにつれ、ねねの弟・ゆう、譲葉の頭首・芙蓉、その息子の麟と、事件の「役者」も増えていく。一方、シグマはネオンが死ぬという不吉なビジョンを見るようになる。それがこの歪んだ時間の未来なのかと考えたシグマは時を戻す決意をより強固にする。そしてついにシグマ達は自ら出向いてきたディクソンを撃破する。怒りに燃えるクリスティが引き起こした事件も解決し、とうとうクリスティをも倒す。二人の逢魔人はまた寄り添って大時計へと封印されていった。
逢魔人を倒し、これで全てが終わったと思った矢先、あのビジョンの通りシグマの目の前でネオンが貫かれ、消滅してしまう。そして彼の前に現れた真の過去の変革者。それは麟であった。本来の歴史における彼の名は法水麟。自身を封印した黒上家への復讐のためにディクソンとクリスティを解放し、歴史改変を行っていた。彼は変革した時の中に存在し続けられるシグマを何者かと問う。次々と不可解な言葉を口にする麟を前に混乱するシグマだが、麟の口にした「音音(ねおん)が既に死んでいる」という言葉からネオンがいないこの世界を拒絶し、無意識のうちに調律とはまた違う力を発動する。
この世界には、人の心を乱す「逢魔(おうま)」と呼ばれる魔物が存在していた。しかし「使い人(つかいびと)」と呼ばれる人々によって時の狭間に封印され、世界は平和を保っていた。その使い人の一族・黒上家の次期頭首である黒上シグマは、幼馴染の月弓ネオンと共に使い人としての鍛錬に勤しみながらも、学生として平穏な日常を送っていた。
しかし、その平穏は突如として終わりを告げる。世界は廃墟と化し、逢魔が空を覆い、シグマとネオンを除く人々の存在が消えていた。何者かが黒上家が滅亡するように過去を改変し、その結果、使い人の血が途絶え、このような世界と化してしまったのだった。困惑する二人は大時計から時の狭間に飛ばされ、その目の前に黒衣を纏った謎の男が現れる。彼は無数の死を解き明かし、世界をあるべき形に戻すように告げて消えて行った。シグマ達は、真実を解き明かし、未来を取り戻す事を決意。そして時の狭間は、元凶となった時代、時間、場所を再現するのだった。
そこは現在から約50年前の黒上家邸宅だった。当時の黒上家の頭首・静馬、その妻・佳子、娘のねね、大婆の梅、メイドのユリ子、そしてシグマの家の執事に連なる当時の執事・守人。シグマの先祖にあたる彼らは使い人の一族として逢魔と戦いつつ暮らしていたのだが、ある日の夕食で梅が毒殺される。それは、この中の誰かに「大逢魔」が憑依して行わせた犯行であり、黒上家滅亡の発端であった。シグマとネオンは事件の真相を突き止めるべく調査を行い、シグマの特殊能力「超推理」と「時の調律」によって大逢魔の力を削ぎ、「神降ろし」で神霊を宿したネオンがその撃破に成功する。それより事件は無かった事になり、歴史は修正されるはずだったが、世界は元に戻らなかった。
館の中を逃げ回る特殊な神霊。接触すると戦闘になり、勝てば式札を回復したり隠しシナリオ解禁に必要な刻音が貰える。
最終章。ネオンの消失、調律者の出現、滅びゆく世界で全ての真実を知ったシグマは、自身の望む世界を取り戻すべく最後の戦いに挑む。
事件の調査パートは無く、一本道のラストダンジョンをストーリーに沿って進んでいく。この章の超推理は冒頭から物語全体を取り巻いていた謎を整理して解き明かすものであり、これまでの事件を正しく解決していなければ配置する刻音が分からない場合も。
以下は本編のストーリーとは連続性を持たないエクストラシナリオ。条件を満たすと解禁される。
声 - 小林ゆう
静馬の妻であり、黒上家頭首夫人。30代半ばだが年齢を感じさせない若々しさと、落ち着いた雰囲気を持つ。しかしその佇まいからは想像も出来ないほど静馬と共に数々の修羅場を潜り抜けてきた。裁縫が趣味。逢魔人の歴史改変に巻き込まれ、幾度となく事件の関係者となる。殺害される際は決まって密室殺人の被害者となる。
旧姓は「九条」で、家系の持つ力は「風使い」である。その力によって新陳代謝のコントロールが可能であり、老化を抑える事が出来る。物語終盤、現代にてシグマと対面した時にも、齢80を超える高齢でありながら50年前と殆ど変わらない若々しさを保っていた。外見だけではなく実力も健在で、最後の戦いでは館を襲撃する逢魔の群れをたった一人で食い止めていた。
音使いの能力の一つで、過去の修復を行う。逢魔は過去に干渉し、その改変を固定させる事で歴史の再構築(過去改変)を行う。
使い人はその逢魔が干渉した一部始終を調べ上げ、その推理に基いて時の調律を行う事で、逢魔が過去改変の固定に割いていた力を奪う事が出来る。その為、逢魔の干渉内容に近い調律を行う(=真相に近い推理を行う)ほど、逢魔の力を削ぐ事が出来る。
調律を行わずとも元凶の逢魔さえ倒してしまえば簡単に歴史は修正できるが、作中で事件を起こしている大逢魔や逢魔人は通常ではとても太刀打ち出来ない力を持っているとされる為、超推理による時の調律が必要となる。
声 - 小山力也(壮年期)
静馬と佳子の息子であり、次期黒上家頭首となる少年。黒上家の血筋として強大な力を秘めている。幼いながらも頭脳明晰だが、性格は年相応。義理の姉であるねねとは仲が良い。平行世界において不安定な存在であり、時には存在そのものが消える事もある。
本来の歴史では交通事故で死ぬ運命にある。しかし最後の事件の際、ねねによって未来へと送られて不確かな存在となったことにより、平行世界においても運命が変わり、本来死ぬ運命に無いねねの犠牲によって生き残る事となる。その延長線上である最後の世界では成長して黒上家の頭首となり、50代の頃には父・静馬に瓜二つの男性となっていた。その力は全盛期の父すら遥かに凌ぎ、大時計を介する事無く時の狭間を作り出す事も可能。滅びつつある世界にて、最強の調律者である法水シグマと互角の戦いを続けている。また、青年時代は自身がベースとなって生み出された黒上シグマに瓜二つであった。
終盤、法水に襲われたシグマと守人の危機を救う。シグマに真実を話した後、彼が自分をベースに生まれた調律者である事と、姉をベースに生まれたネオンが共に在る事を悟る。その後、「自分がするべき事をする」為に館に戻り、美巫女に未来へ時を紡がせ、自身の命と引き換えに異なる可能性の未来から対逢魔決戦兵器オルトゴールを召喚。シグマとネオンを勝利へと導いた。
殺人事件の舞台となる洋館を捜索を行う。AVGパートの操作は同社の『ファイナルファンタジーVII』などのように、見下ろし型RPGと同スタイル。事件が起きた前後の時間帯を行き来する事で、証拠やどのような出来事や起きていたのかを調べていく。
主人公達が居るのはあくまで時空の狭間であって実際の現場に居る訳ではなく、過去の光景を見ているに過ぎない。その為、現場に直接干渉したり関係者の聞き込みを行う事は無く、現場に残された魂の影と呼ばれるオブジェクトを調べて時の再演(その時間帯にその場所で起きた出来事を見る)を行う事で情報を集める。一部の証拠品などは、現場に残されているものを直接発見する場合もある。
音使いの術の一つ。時の狭間に音使いの力によって時間軸という方向性を与え、他の時代への道を紡ぎ、安定させる。黒上と月弓の秘中の秘とされる技。
作中ではシグマ達は式札を使って他人の紡いだ時を繋げ直している。
莫大な神力と「あるもの」を必要とし、殆どの使い人は使う事はできない。その「あるもの」とは使い人の血と魂であり、また、狭間で失われる魂は輪廻から外れて逢魔人を生むと言われ、使い人にとっては最大のタブーとされる。
人に干渉し過ぎた為に、その人間の負の感情や業の影響を強く受けた逢魔。
意識や思考はほぼ無く、決まったルートを徘徊したり感知した人間に近づくだけの存在だが、その力は個体差はあれど、大逢魔以上とも言われる。しかし消滅する際には奇跡を起こすとされる。