名古屋市立大学
医学研究科・医学部附属機関 医学部附属病院(通称「市大病院」) 医学部附属みどり市民病院 医学部附属附属みらい光生病院 脳神経科学研究所(分子医学研究所から変更) 実験動物研究教育センター アイソトープ研究室 共同研究教育センター
薬学研究科・薬学部附属機関 創薬基盤科学研究所 臨床薬学教育連携センター 東海臨床薬学教育連携センター 薬工融合推進センター 東海薬剤師生涯学習センター
経済学研究科・経済学部附属機関 経済研究所
人間文化研究科・人文社会学部附属機関 人間文化研究所
芸術工学研究科・芸術工学部附属機関 環境デザイン研究所
理学研究科・自然科学研究教育センター附属機関 生物多様性研究センター
社会連携センター
総合情報センター 情報システム部門 学術情報部門(図書館) 川澄分館 山の畑分館 田辺通分館 北千種分館
キャリア支援センター
国際交流センター
教育支援センター
2012年(平成24年)3月19日、名古屋市立大大学院学医学研究科の教授らによる論文捏造問題が発覚し、不正を主導した原田直明准教授(当時44歳)を懲戒解雇処分にし、共同研究者の岡嶋研二教授(当時58歳)は直接不正を指示した証拠がないことで停職6カ月の処分をとった。岡嶋教授が責任著者となっている1997~2011年の論文19本に画像の捏造や流用があり、このうち8本で原田准教授が不正を主導したが「過失だった」と弁明し、岡嶋教授は「知らない」と答えたが、「すべての論文に関与しており、不正に気付いていなかったとは考えにくい」と大学側は判断した。岡嶋教授は2005年4月に、原田准教授は同年10月に熊本大学から移り、基礎医学の実用化を目指す展開医学の研究室に所属していた。戸苅創学長(当時66歳)は「研究機関としてあるまじきこと。再発防止に向け誠心誠意努力する」とコメントを出した。