蛟龍丸
翌13日の戦闘で、ロシア艦隊は戦艦「ペトロパブロフスク」がルチン岩付近で触雷沈没してステパン・マカロフ司令長官が戦死、同「ポペーダ」が触雷大破する大損害を受けた。これらは「蛟龍丸」らの戦果とされ、「蛟龍丸」指揮官の小田中佐は新聞により功労者として大きく報じられた。「蛟龍丸」による成功を踏まえ、日本海軍は同年8月にかけて19回の仮装砲艦を用いた旅順への機雷敷設作戦を実施した。
その後の旅順作戦で「蛟龍丸」は主に大連湾根拠地の警備や水路誘導などの雑用へ充てられ、機雷敷設には加わらなかった。座礁した通報艦「龍田」や触雷沈没した三等海防艦「済遠」の救助に出動している。この間、同年5月10日には「太田川丸」(大阪商船:408総トン)など徴用船4隻が新たに武装されたのとあわせて仮装砲艦に類別され、第5号仮装砲艦と呼称された。
旅順攻囲戦が峠を越えた1904年12月に、「蛟龍丸」は仮装巡洋艦「台中丸」に従って佐世保軍港へ引き上げた。類別が二等仮装砲艦へ変わり、1905年(明治38年)1月に新設の特務艦隊へ編入された。3月23日付で仮装砲艦の番号が整理された関係で、第2号仮装砲艦へ呼称変更されている。同年3月、佐世保海軍工廠において、前年から装備予定だった簡易式魚雷である海防水雷の落射機を船橋前甲板両舷に1基ずつ追加された。それから日本海海戦頃までの間は連合艦隊の根拠地であった鎮海湾の湾口哨戒、同年7月以降は同年10月15日の終戦まで永興湾の警備に従事した。