イノダコーヒ
本店: 京都市中京区堺町通三条下ル道祐町、全205席 創業の地にあり、本社を併設する。創業時の木造店舗は1967年に増築されて用いられていたが、1999年4月9日に開店準備中の失火で半焼した。準防火地域に立地するためそのまま再建する事はできなかったが、佐川美術館を手がけた内海慎介(竹中工務店社員)が設計し、アルミの外壁は木目調に塗装して一部を紅殻色に塗るなど、京都の町屋の雰囲気を出している。また、2階部はモルタル金ゴテ仕上げとして墨色に塗り、鉄筋コンクリート造りながら味わいある建物となった。また、この改築に伴って新たに2階の客席が作られ、1階にも5mのガラス窓が設けられた。2000年3月16日より営業を再開し、全店舗中で客席数が最大である。
三条支店: 中京区三条通堺町東入ル桝屋町、全58席 1970年に開店し、本店に最も近い。また特徴的な円形カウンターがあり、目の前でコーヒーを漉す様子が見える。多くの常連がこの円形カウンターに座る。
本格派の品質を維持するために比較的高価格路線で運営を行なっており、スターバックスやタリーズコーヒーなどの大手チェーンの倍程度の価格帯でコーヒーなどの飲料を提供している。以前は必ず砂糖とミルクの入った状態でコーヒーが提供されていたが、近年はこれらを分けるか事前に質問される。一方、サンドイッチなどの軽食はボリュームがあり本店等で食べられる「京の朝食」はボリュームたっぷりの朝食である。自社の焙煎工場とケーキ工場を有し、特にコーヒー豆や挽いた粉については店頭だけでなく全国各地の百貨店、スーパーマーケット、茶葉店などでも販売されている。「アラビアの真珠」と名付けたブレンドのコーヒーが特に有名。自社の店頭やオンライン通信販売ではコーヒー以外にも、コーヒーカップなど食器類・アクセサリといった商品を取り扱っている。
イノダコーヒのベイクドチーズケーキ
イノダコーヒのフォンダンショコラ
イノダコーヒのレモンパイ
名物のフレンチトースト