セント・キルダ
3番目の固有動物に分類されるのは、セントキルダイエネズミ(英語版)(Mus musculus muralis)の名で知られるハツカネズミの亜種であったが、このネズミは人の住む集落や建物と密接につながっていたため、住民の避難後に絶滅した。セントキルダイエネズミは、フェロー諸島のミキネス島で見つかった亜種(Mus musculus mykinessiensis)と共通の特徴を持っていた。ハイイロアザラシは現在ヒルタで繁殖しているが、1930年の全島避難以前は繁殖を行っていなかった。
セントキルダタンポポ(英語版)(Taraxacum pankhurstianum)は、タンポポのセント・キルダ固有種として2012年に認められた。
群島が他から隔絶していることが、生物多様性の欠如をもたらした。チョウとガの58種しか群島で生息していない。対照的に西部島嶼部では367種の存在が報告されている。植物の生態は、塩水が飛んでくること、強風、酸性の泥炭質土壌に大きな影響を受けている。樹木は群島では育たず、一方で130種の様々な草花、162種の菌類、160種のコケ植物がある。稀少な種が194種ある地衣類の中にある。ケルプ(昆布)が、多様性に富んだ海洋性無脊柱動物の生息する周辺海域で繁茂している。
ヴィレッジ湾の砂浜が、夏には短く砂が伸張するのに対し冬に後退し、島の本体をなす巨石が露出してしまうのは異常である。1953年に行われた浜の調査では、たった1つの種が存在することを確認した。甲殻類のワラジムシ目Eurydice pulchraである。
セント・キルダは最も近い陸地から64km離れている。およそ129km彼方にある、スカイ島のCuillinの山頂尾根からに限って見えるほどの遠さである。気候は、雨の多い海洋性気候である。雨は1400ミリに達し、湿度が高い。気温は総じて冷涼で1月の平均気温は5.6°C、7月の平均気温は11.8°Cである。冬には特に季節風が強く、南からと南西から吹く。風速は平均時速13kmになり、時間の85%吹き荒れる。さらに時速24km以上の風が時間の30%を占めている。強風は1年で時間のうち2%未満発生するが、時速185kmの突風や、さらに速い風が定期的に発生する。時速209kmの風が時折海面近くで記録されている。干満の差は2.9mで、海のうねりが5mにまで頻発する。このために一年中どんなときも上陸が困難であったり不可能であったりするのである。しかし、海洋の存在が島々を雪から守っている。降雪は年間わずか10日間ほどしかない。
セント・キルダが遠隔地であることと、海洋性気候は、イギリス国内にある数少ない離島、フラナン諸島、ノース・ロナ島、Sula Sgeir(en)、アウター・ヘブリディーズの南端にあるビショップ島と一致する。行政上、セント・キルダは歴史的なインヴァネス・シャイア、ハリス島のシビル・パリッシュに属する。現在はユニタリー・オーソリティー(en)であるComhairle nan Eilean Siarに属している。