クロアチアのカトリック
劣等人種であるとしてジプシーやユダヤ人を迫害する事は容認出来ない
彼は同様に1943年2月24日にパヴェリッチ本人に直接手紙を出した:
ヤセノヴァッツ収容所は正にクロアチア独立国の汚点です、ポグラヴニク閣下! 私を司祭や司教として見る人々に私はキリストが十字架の上で述べた様に言います、父よ彼らをお許し下さい。彼らは自分達が何をしているのかを知らないのです。
1941年12月には、チェトニックがゴラジュデ付近で五人の修道女(Drina Martyrs)を殺害した。1944年10月25日にユーゴスラビアのパルティザンがダクサ島(Daksa (island))でペタル・ペリツァ(Petar Perica)とマリヤン・ブラジッチを殺害した。パルチザンは1945年1月下旬にヴルゴラツ(Vrgorac)付近で平修士マクシミリヤン・ユルチッチを殺害した。
ユーゴスラビア王国では、クロアチアの司教たちはユーゴスラビア司教協議会(Bishops' Conference of Yugoslavia)の一員だった。
セルビア正教会はユーゴスラビア王国の事実上の国教として振る舞った。この頃に、一つのセルビア正教会系の教会が住民の殆どがカトリック教徒だったヴィス島に建てられ、住民の一部は正教会に改宗し始めた。
クロアチア人民解放国家反ファシスト委員会(ZAVNOH)は本来は同国においてより大きな宗教的自由の度合いを予見していた。1944年にZAVNOHは学校教育の場での宗教教育の可能性を開いていた。この発案はユーゴスラビアの指導者ヨシップ・ブロズ・ティトーがクロアチア共産党の中央委員会書記長アンドリヤ・ヘブラング(Andrija Hebrang)を取り除いて強硬派のヴラディミル・バカリッチ(Vladimir Bakarić)を据えた後に断念された。
1945年に、引退したドゥブロヴニク司教 (Roman Catholic Diocese of Dubrovnik)ヨシップ・マリヤ・ツァレヴィッチ (Josip Marija Carević)がユーゴスラビア当局によって殺害された。ヨシップ・スレブルニッチ(Josip Srebrnič)司教は二ヶ月間収監された。終戦後、ユーゴスラビアのカトリックの出版物の数は百から僅か三つまで減少した。