登録記念物
大濠公園(福岡県福岡市中央区)- 2007年2月6日登録
平田氏庭園(福岡県小郡市)- 2018年2月13日登録
旧武雄邑主鍋島氏別邸庭園(御船山楽園)(佐賀県武雄市)- 2010年2月22日登録
平和公園(長崎県長崎市)- 2008年7月28日登録
旧伊東氏庭園(四明荘庭園)(長崎県島原市)- 2008年7月28日登録
小早川氏庭園(長崎県島原市)- 2014年3月18日登録
白水の滝(大分県竹田市、熊本県高森町)- 2007年7月26日登録
蝙蝠の滝(大分県豊後大野市)- 2007年7月26日登録
沈堕の滝(大分県豊後大野市)- 2007年7月26日登録
旧成清博愛別邸庭園(的山荘庭園)(大分県速見郡日出町)- 2015年1月26日登録
平田氏庭園(大分県中津市)- 2019年10月16日登録
真玉海岸(大分県豊後高田市)- 2021年3月26日登録
鍋山(南屏峡)(大分県豊後高田市)- 2022年3月15日登録
黒ヶ浜及びビシャゴ岩(大分県大分市)- 2023年3月20日登録
旧報恩寺庭園(宮崎県日南市)- 2015年1月26日登録
旧伊東伝左衛門庭園(宮崎県日南市)- 2015年1月26日登録
清水氏庭園(鹿児島県志布志市)- 2007年7月26日登録
鳥濱氏庭園(鹿児島県志布志市)- 2007年7月26日登録
仲本氏庭園(沖縄県石垣市)- 2012年1月24日登録
御神崎(沖縄県石垣市)- 2015年10月7日登録
旧仲宗根氏庭園(沖縄県宮古島市)- 2016年10月3日登録
津嘉山酒造所庭園(沖縄県名護市)- 2021年3月26日登録
ハナンダー(自然橋)(沖縄県島尻郡八重瀬町)- 2021年3月26日登録
田沢湖のクニマス(標本)(秋田県秋田市、仙北市)- 2008年7月28日登録
禅寺丸柿(神奈川県川崎市麻生区)- 2007年7月26日登録
震生湖(神奈川県秦野市・足柄上郡中井町)- 2021年3月26日登録
市川鉱物研究室収蔵標本(福井県越前市)- 2012年9月19日登録
マチカネワニ化石(大阪府豊中市)- 2014年10月6日登録
菊池川堤防のハゼ並木(熊本県玉名市)- 2007年2月6日登録
賀来飛霞標本(宮崎県宮崎市)- 2010年8月5日登録
増井氏庭園(雲門庵露地)(香川県高松市)- 2013年3月27日登録
四十島(ターナー島)(愛媛県松山市)- 2007年2月6日登録
八束氏庭園(愛媛県松山市)- 2019年10月16日登録