リトアニア臨時政府
臨時政府発足後は党派間の争いが深刻化した。
臨時政府における人材不足は深刻で、例えば元国防相のヴィータウタス・ブルヴィチュス(リトアニア語版)は6月2日にソ連軍に逮捕されており、国防相には代わりにスタシース・ラシュティキス(リトアニア語版)将軍が就いた。1941年6月21日(ドイツ軍侵攻開始の前日)、臨時政府のメンバーがソビエトの当局に逮捕された。逮捕されたのは、ヴラダス・ナセヴィチュス、ヴィータウタス・スタトクス、ヨナス・マシリューナス(リトアニア語版)で、彼らはモスクワの刑務所に収容された。彼らに対する裁判は11月26日に行われ(当時のリトアニアはまだナチス・ドイツ占領下)、28日に刑が言い渡された。ブルヴィチュスは死刑、マシリューナス、ナセヴィチュス、スタトクスはシベリア送りとされた。
臨時政府は、ソ連占領前に施行されていたリトアニアの法律を復活させることを決議。また、司法制度も占領以前のものに戻された。そして、財産の私有も再び認められるようになり、土地や家屋、資産、企業などが本来の所有者に返還されたが、ユダヤ人や「リトアニア民族の利益に反する行為に活発に関わった」者はその対象外とされた。
軍事組織を必要としていた臨時政府は、6月28日に各地のリトアニア人軍事組織を武装解除し、翌29日に民族防衛労働大隊(リトアニア語版) (TDA) を組織した。TDAを管轄するカウナス軍司令官にはユルギス・ボベリス(リトアニア語版)大佐を任命した。