つくば市役所
研究学園交番
HOTEL BESTLAND
iiasつくば 筑波銀行つくば副都心支店
とりせん研究学園店
ケーズデンキつくば研究学園店
トステムショールーム
サイバーダイン株式会社
研究学園駅前公園
この要請は同年11月20日までの合併を迫るもので、知事が示したスケジュールは4か月で合併協議から自治省(当時)による告示まで持ち込む、という慌ただしいものであった。この慌ただしさは多数の混乱を招き、谷田部町と大穂町の2町による先行合併が取り沙汰されると、大穂町議会に反対派住民が乱入して筑波警察署から警察官が駆け付けるという騒動が発生した。更に筑波町でも反対派住民が議会に乱入、筑波町長が辞意を表明するに至った。
以上を踏まえ、法定の「筑波研究学園都市関係町村合併協議会」は1987年(昭和62年)10月26日に谷田部町・大穂町・豊里町・桜村の3町1村で設立され、10月31日には合併協定書の調印が土浦市で行われた。短期の議論の中で協議会はつくば市役所について次のように決定した。
こうしてつくば市は1987年(昭和62年)11月30日に誕生し、各町村役場はほぼそのままの機能を維持して新市の支所となった。また、各支所には副市長が置かれ、旧町村単位で予算も付けられた。翌年1月31日には筑波町を編入、筑波町役場は、そのまま筑波支所となった。
しかし、これでは合併のメリットである「行政の効率化」は図れないとして、早くも1988年(昭和63年)12月には機構が見直され、統合庁舎設置を目指した「庁舎建設準備室」が設置されたほか、一部の組織の本庁への統合が実施された。