新世紀エヴァンゲリオン劇場版 Air/まごころを、君に
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リリスからアンチA.T.フィールドが世界中に放たれ、これによって個体の生命体としての姿を保てなくなった人類は次々と液状(L.C.L.)化し、その魂は黒き月に集められていく。
初号機はロンギヌスの槍と融合してリリスに取り込まれ、シンジは人類が補完された世界で、自他の内面と向き合う。最後にレイとカヲルに再会し、サードインパクトの行く末を委ねられたシンジは、人類が単体の生命となることを望まず、個々として存在する従来の世界を望む。 サードインパクトは中断され、崩壊していくリリスから出現した初号機は、ロンギヌスの槍と共に宇宙の彼方へ飛び去っていく。レイは、誰もがヒトの形に戻れる可能性があることをシンジに告げる。 シンジは初号機の核に宿るユイの存在を知り、別れを告げる。
その後、赤い海が広がる世界の白い砂浜に一切の反応を示さないアスカと共に横たわっていたシンジは、補完された世界で最後まで自分を拒絶したアスカの首を絞めていくが、その最中に彼女から頬を撫でられる。アスカの真意に気づき、首を絞めるのを止めて嗚咽するシンジに、アスカは「気持ち悪い」と言い放つのであった。
ミサトはシンジに、使徒と人類の戦いは「アダム」から生まれた生命と「リリス」から生まれた生命の生存競争であったという真実を話し、EVA初号機へ彼を送り届けようとするが、戦自の銃撃からシンジをかばって致命傷を負い、シンジに後悔の残らないようしっかり生きろと諭して力尽きる。
一方、戦自から逃れるために病室からEVA弐号機のコクピットに移されていた廃人状態の惣流・アスカ・ラングレーは死の恐怖に震えていたが、弐号機のコアに母の魂が取り込まれていることに気付き、復活を遂げて弐号機で戦自部隊を壊滅させる。続いてゼーレの送り込んだEVA量産機9体にも善戦して全機を倒すが、弐号機は再生・復活を遂げた量産機が投擲した擬似ロンギヌスの槍で頭部を串刺しにされたうえ、活動限界を迎えたところへ群がった量産機により、鳥葬のように貪られていく。弐号機はアスカの憎悪と憤怒を糧に暴走を始めるが、量産機がさらに投擲した8本の槍によって完全に沈黙する。
一度はミサトの遺言に心を動かしたシンジであったが、戦自によって分厚い硬化ベークライトに固められ動かしようがなくなっていた初号機を見て再度意気消沈し、アスカと弐号機の危機を知らされても何もできずにいた。その時、あたかもシンジを叱咤するかのように無人の初号機がベークライトを割って起動する。初号機に導かれるままに出撃し、意を決して戦場を見据えたシンジの目に映ったものは、弐号機の肉片をついばみながら宙を飛び回る量産機の群れであった。凄惨な光景を目の当たりにしたシンジは、錯乱し絶叫する。