バイキンメカ
設計・開発が計画されていたものの、諸事情で実現に至らなかった存在しないバイキンメカ。
初登場回 - TV第476話B「ばいきんまんとワッフルちゃん」
ワッフルちゃんに対抗して作ったロボット。リモコンで操作するようになっている。ワッフルを製造するように作られていて、ワッフルちゃんにワッフルを食べさせたが、最後は壊れてしまった。
初登場回 - TV第376話B「アンパンマンとアップリケちゃん」
カニを模した小型メカ。胴部分はばいきんまんの顔をモチーフにしている。両手のハサミで、アンパンマンたちのマントや木の枝などを即座に切り取ってしまう。アップリケちゃんにマントを縫い直してもらったアンパンマンと再度戦うが、UFOの周りをアンパンマンが回るうちに、バイキンUFOを粉々にしてしまい、アンパンチで壊された。
初登場回 - TV第897話B「かまめしどんとちゅうかどんまん」
顔が丼鉢になっているだだんだん型のロボット。頭の中に敵を閉じ込めることができる。蓋をブーメランのように飛ばして攻撃できる。
初登場回 - TV第164話B「ベビーアンパンと赤ちゃんばいきん」
あかちゃんスプレーの効果を無力化する青い薬のスプレー。薬を作る際にばいきんまんが漫画を読んでいたために薬の材料のベビーパウダーの分量が分からなくなっている。
1号(1ごう) 初登場回 - TV第82話B「アンパンマンとあかちゃんスプレー」 相手を赤ちゃんに変える赤い薬のスプレー。アンパンマンを赤ちゃんにするために作った。バタコさんとチーズを赤ちゃんに変えてしまうが、元々赤ちゃんのあかちゃんまんには通用しなかった。スプレーの容器(英語版)が割れると赤ちゃんにされた者が元に戻る。ドキンちゃんが香水と間違えて浴びてしまった事がある。昆虫や植物にも効き目がある。しょくぱんまんもばいきんまんを倒す際にスプレーが暴発し、浴びてしまったことがある。
2号(2ごう) 初登場回 - TV第164話B「ベビーアンパンと赤ちゃんばいきん」 1号の改良版。一度スプレーを浴びると永久に赤ちゃんの状態が維持されるが、さかさまスプレーを使うことで元に戻ることができる。
3号(3ごう) 初登場回 - TV第815話B「アンパンマンとパン工場」 効果は1号と同じだが液体の色が異なる。
初登場回 - TV第1029話A「クリームパンダとホッチンワニ」
ホッチンワニを模して作った大型のロボット。ホッチキスの針を飛ばして攻撃する。また、尻尾や手足も武器。
ランドセル島を占領するために使われた。
初登場回 - TV第367話「アンパンマンとてつの星」
ばいきんまんによると「最大最強のロボット」(1996年時点)。さまざまなバイキンメカの意匠が取り入れられており、胴体と脚部はだだんだんで、トリプルヘッドの首が伸び、3つ首それぞれの先端に通常サイズのもぐりんが結合されている(操縦席は中央のもぐりんの内部にある)。街やパン工場の鉄製品を強奪したうえ、雨に弱いてつの星の住民を脅迫し、公害が起こるほど工場をフル稼働させて作らせた。通常のアンパンチを弾き返すほどの装甲で、指先から発射するドリルミサイルと、溶けた高温の鉄(アンパンマンを銅像のように固めてしまった)を武器にしている。その上、新しい顔に替えて100%以上の力をこめたアンパンチ対策として、自動修復装置も備えている。
新しい顔に取り替えたアンパンマンすら追い詰めたが、こてつちゃんたちに太陽光線を浴びせてもらったことで元気300倍にパワーアップしたアンパンマンのジャイアントスイングを食らい、ドキンUFOを巻き込んでバイキン巨大UFOに衝突し、大爆発した。
バイキンロボット型(バイキンロボットがた)
声 - 渡部建(映画・かがやけ!クルンといのちの星)
初登場回 - TV第442話B「カレーパンマンとクルミちゃん」
前述のように顔の繋ぎ目が無く、脚が細いタイプのだだんだん。映画第17作『ハピーの大冒険』で登場したバズーカになる番傘を装備して口や胴体から巨大な鉄球を発射するタイプ、映画第19作目同時上映『ホラーマンとホラ・ホラコ』で登場したバイキンUFOの武装を多数装備したタイプなどの武装バリエーションも存在する。
お掃除だだんだん(おそうじだだんだん)
初登場回 - TV第3話A「アンパンマンとはみがきまん」
はみがきまんに変装したばいきんまんがカバオくん達に配った歯ブラシ。これで歯を磨くとたちまち虫歯になってしまう。柄の色は最初は黄色だが磨くと毛ごと黒に変色する。バイキンUFOにも武器として搭載されており、底部の側面からマシンガンの如く撃ち出される。弱点ははみがきまんの歯磨き粉で触れると消滅してしまう。はみがきまんはこの歯ブラシの存在を初登場以前から知っていた。
初登場回 - TV第1022話B「メロンパンナとプリンちゃん」
ばいきんまんが広い草原に建設する予定だった新しい基地。完成予想図上の外見はバイキン城に似ており、本体の周囲を回転式の大砲に囲まれた構造になっている。大量の材料を持ち込んで設計に取り組むが、「メロンパンナへのお返しのプレゼントを作ってくれている」とプリンちゃんとエクレアさんに勘違いされ、途中で仮眠を取っている間、彼女らに遊園地に作り変えられてしまった。また、鉄球を投擲するカタパルトやばね式の砲台も開発予定だったが、いずれもプリンちゃん達には間違えてシーソーやジェットコースターを作られてしまっている。
尻尾と鋭い爪が決め手の『ニャンニャコパンチ』が武器。「ニャーゴ」と鳴く。かつぶしまんを倒す時によく登場する。
バイキンゆうれい船(バイキンゆうれいせん)
1号(1ごう) 初登場回 - 映画第7作『ゆうれい船をやっつけろ!!』 難破船をヒントに作ったメカ。大砲からドクター・ヒヤリが作ったお化けを打ち出す(実弾も)。メインマストから雨を降らすことができる。空も飛べる。内部には飛行船もぐりんが収納してあり、梶から入り込む。
2号(2ごう) 初登場回 - TV第1046話A「チビマリンとバイキンゆうれい船」 1号と同型のメカ。潜水や飛行が可能。船頭のドクロマークが1号より大きくなっている。海に来た人を驚かせ、食べ物を手に入れるために使用される。雷雲や渦潮を伴う。敵を捕らえる為のネットや、砲弾に擬態しマジックハンドでパンチ攻撃を繰り出す魚雷型メカを撃ち出す大砲を装備している。海底の岩の下に基地を構えていた。
初登場回 - TV第97話B「かつぶしまんと鉄火のマキちゃん」
ばいきんまんの姿を模した、野球選手型のロボット。阪神タイガースのようなユニフォームを着ており、野球用ボールに縛り付けた相手をバットで打って吹き飛ばす。鉄火のマキちゃんを簀巻きにして打つものの、アンパンマンとかつぶしまんに妨害され、マキちゃんに吹き飛ばされたばいきんまんが衝突して爆発した。
バイキンバッファロー号(バイキンバッファローごう)
巨大なバッファロー型の四足歩行ロボット。西部で戦うときにしばしば登場する。
1号(1ごう) 初登場回 - 映画第13作同時上映『怪傑ナガネギマンとやきそばパンマン』、TV第663話B「SLマンとコロッケキッド」(TVデビュー) 体当たり攻撃と鼻から出す汚れたガスが武器。
2号(2ごう) 初登場回 - TV第871話A「たたかえ!やきそばパンマン」 1号の頭部にバイキンUFOのキャノピー部が付いたようなロボット。西部を占領するために作った。角はミサイルのように発射が可能な上、何度でも再生する。強力な鼻息でアンパンマンを退けやきそばパンマンと戦うが、ヘラで頭部にヒビを入れられ装甲が脆くなった所でアンパンチで破壊された。
カブトムシ型の巨大ロボット。
1号(1ごう) 初登場回 - TV第393話「フルーツ島をすくえ!」 フルーツ島を乗っ取るためのメカ。大きな角で地中を掘って敵に近づいたり、角の先から刃を発射させて攻撃したりする。
2号(2ごう) 初登場回 - TV第1434話A「ドキンちゃんとマーガレット姫」 1号とは違って外見はかなり簡略化されており、頭にバイキンUFOのキャノピーが取り付けられている。空を飛んで突進したり、角を飛ばして攻撃する。一回修理されてからは、ハサミ型の手がバイキンUFOのアームに置き換えられ、物が掴めるようになった。
声 - 小林和矢
初登場回 - TV第241話A「アンパンマンといろえんぴつの島」
いろえんぴつ島を汚す鉛筆型のロボット。手先から墨を出す。オープニング・エンディングテーマで流れるアニメにもよく登場している。『アンパンマンとブラッククリスマス』では、ばいきんまんのソリから変形し、町を真っ黒にしてクリスマスをめちゃくちゃにする。腹部からサンタのかびるんるんとやみるんるんを出す。
絵本『アンパンマンとえんぴつじま』ではばいきんまんの製作ではなく、らくがきこぞうが作ったらくがきロボットとして登場。らくがきこぞうの筆で操縦できる。ばいきんまんとドキンちゃんに奪われ、ドキンちゃんが適当にスイッチを押したため暴走してしまう。
TV初登場時は単に「バイキンロボット」って呼んでいた(上記のバイキンロボットとは無関係)