ミシシッピ川流域戦線
多くの戦いはミズーリ州住民の異なる党派の間で戦われ、どちらも市民に対して大規模な残虐行為を行い、強制退去から殺人まであった。歴史家達の推計では、戦争中の州内の人口は3分の2まで落ちた。生き残った者も逃亡するか、敵対する者に追い出された。ブッシュワッカーの最も残酷な指導者、ウィリアム・クァントリルやウィリアム・"ブラッディビル"・アンダーソンは国民的悪人になった。彼らに従った者達は、ジェシー・ジェイムズやその弟フランク・ジェイムズ、およびコール・ヤンガー兄弟が首領となって、戦後16年間も武装したまま強盗や殺人を続けた(ジェイムズ=ヤンガー・ギャング)。
南北戦争の終盤1864年9月から10月、スターリング・プライスの率いる騎兵を中心としたミズーリ軍12,000名がミズーリ州とカンザス州を襲って回ったが、1ヶ月にわたる一連の戦闘でプライス軍は疲弊し無力化された(プライスの襲撃)。