皇居の生物相
平成8年度(1996年度)から平成11年度(1999年度)にかけての調査で、73科738種の甲虫類が確認された。東京都区内ではごく少なくなったノコギリクワガタが多数採集されたり、オオミズスマシなど東京都区内では絶滅した可能性が指摘されている水生甲虫類の生息も確認されたりしており、また湿地性の甲虫や、ゴミムシ類やコガネムシ類の中で低地ではまれである種も確認されるなど、高い生物多様性が見られることがわかった。
皇居の甲虫相の特徴としては伊豆諸島や三浦半島との関連性が高いと考えられる種が複数見つかっていることなど、武蔵野のクヌギやコナラ中心の落葉広葉樹林に分布する種よりも、カシやタブノキなど照葉樹林に分布する種が中心となっている。また海岸性の甲虫であるチャイロチビゲンゴロウが確認され、これはかつて皇居がある地は海のそばであったことを示す可能性も指摘されている。
皇居からは2科39種のカミキリムシが確認された。
野村周平、村木朝陽、佐藤尊「皇居における大型甲虫の発生状況と高度分化」『国立科学博物館専報』第50号、国立科学博物館、2014年3月、311-323頁、NAID 40020056857。 小島弘昭、亀澤洋、鈴木亙、鶴智之、後藤秀章、野村周平「皇居における衝突誘引式トラップで得られた甲虫」『国立科学博物館専報』第50号、国立科学博物館、2014年3月、325-358頁、NAID 40020056864。 友国雅章「皇居のカメムシ類(昆虫綱・半翅目)」『国立科学博物館専報』第50号、国立科学博物館、2014年3月、359-369頁、NAID 40020056869。 松本嘉幸、寺内優美子、石井智陽、西野文貴「皇居のアブラムシII」『国立科学博物館専報』第50号、国立科学博物館、2014年3月、371-384頁、NAID 40020056879。 河合省三「皇居のカイガラムシ相 第II期調査(昆虫綱:半翅目)」『国立科学博物館専報』第50号、国立科学博物館、2014年3月、385-406頁、NAID 40020056883。 別府桂「皇居内で新たに記録されたショウジョウバエおよびショウジョウバエ群集の生態的構造の季節変化―附:皇居のショウジョウバエリスト(三訂版)」『国立科学博物館専報』第50号、国立科学博物館、2014年3月、407-434頁、NAID 40020056893。 篠永哲「皇居で採集された有弁ハエ類の記録(2009~2013)」『国立科学博物館専報』第50号、国立科学博物館、2014年3月、435-445頁、NAID 40020056898。
皇居内の調査の結果、淡水性の貝類は13種、カタツムリの仲間である陸産貝類は40種確認された。淡水貝類の中には外来種も見られるが、ドブシジミ、マルタニシ、モノアラガイなど、かつては日本各地の水田などで見られた普通種であったものが、現在は激減して都市部ではほとんど見ることができなくなった種も確認された。ただし淡水貝類は魚や水草などの移動に伴って人為的に持ち込まれることが多く、皇居の場合ではホタルの繁殖のためにカワニナが持ち込まれていることが確認されているため、皇居内の現在の淡水貝類分布が自然分布であるかどうかははっきりとしない。
陸産貝類は、宮内庁が管理する盆栽の下など、人工的な環境に生息する外来種や撹乱された環境を好む在来種と、樹林帯に生息する主に在来種の2グループに分けられた。人工的な環境に生息する種からは、新たに外国から移入してきたと考えられる2種の新種が発見された。
皇居では3科16種のカマアシムシ類が確認された。皇居で確認されたカマアシムシ類は日本の暖温帯、温帯に広く分布している種であったが、これまでの東京都区内で行われたカマアシムシ類の調査で確認された種の数を上回っており、やはり皇居の森の環境が豊かな自然を保っていることを示している。
また皇居のカマアシムシ類には、安定した湿潤な環境を好むカマアシムシ科は少なく、乾燥した環境に適応できるクシカマアシムシ科が多く見られるという特徴が見られる。これは大都市である東京都区内の中心部にある皇居の環境によるものである可能性が指摘されている。そして皇居内で採集されたカマアシムシ類の中には個体内に同一の種としては大きな差異が見られる種が複数見られる。これは皇居内に外部から移植された樹木に伴い、異なった場所から同一種が持ち込まれたことによって、皇居内のカマアシムシ類の中に同一種としては大きな差異が見られるようになった可能性がある。