視交叉上核
哺乳類の多くの生命機能(睡眠、活動、注意力、ホルモン分泌、体温、免疫機能、消化機能など)は約24時間のリズムを持っている。SCNはこのような全身のさまざまなリズムを統率していて、SCNが破壊されるとこれらのリズムも失われてしまう。例えば、ラットではSCNを破壊すると下垂体ホルモン分泌のリズムが失われる(Machida, 1972)。また合計の睡眠時間は変わらないが、一回の睡眠の長さとタイミング、睡眠エピソードがバラバラになってしまう。また、ハムスターでは、通常の周期を持つ個体のSCNを破壊し、周期の短い個体のSCNを移植すると、その個体の活動周期が短くなる。心臓、肝臓、肺など臓器がそれぞれの従属的な時計(slave oscillator)を持っているが、これらのリズムは、SCN、中枢時計(master oscillator)が、神経系、内分泌系、体温変化などを通じて増強、統合している。