黒ずくめの組織
声 - 緑川光
かつて降谷零と共に潜入していた公安警察官で、警視庁公安部に所属していた。組織内では赤井や零と3人で行動を共にしていた。3年前に正体が露見し、組織が名前を聞き出す前に赤井の目の前で拳銃自殺した。
40年前、余命幾ばくもない烏丸は「黄昏の館」に隠された財宝を一目見るために、大勢の考古学者を雇って調査させる。だが、考古学者達はなかなかその手掛かりを見つけられず、死期が迫って業を煮やした烏丸は見せしめとして考古学者を1人ずつ殺害。その後、結局財宝を発見するに至らず、それから20年のうちに烏丸は死去したとされる。館も衰退した烏丸家の手を離れ、至る所に飛び散った血飛沫を残し、この惨劇は人知れず闇に葬られた。財宝の正体については、当初はコナンが千間恭介が残した暗号をもとに発見した純金の壁掛け時計を指しているものと思われたが、実際にはその時計を取り外すことで館の外壁が剥がれる仕掛けになっており、館自体が1000億以上の純金でできていることが明らかとなった。 17年前の羽田浩司の殺害現場に残されていた手鏡の「PUT ON MASCARA」という文字を見て、当初コナンと秀一は「ラム」の正体に繋がる手掛かりとされる「ASACA RUM」が隠されていると推理していた。しかし、後に優作と秀一が「ASACA」と「RUM」の2つの単語に分けるのではなく、「CARASUMA」の8文字で1つの名称になると推理し、烏丸が組織のボスの名であることが明らかとなった。 2017年12月13日に『サンデーうぇぶり』アプリ版で公開された動画内で、作者・青山剛昌によってボスの正体が初めて公式に明言された。
テレビアニメ版では当初、放送開始直後ということやまだ黒ずくめの組織を登場させられないと判断されたことと、途中で打ち切りになったとしても収拾が付けられるよう、組織が絡む第5話「新幹線大爆破事件」と第13話「奇妙な人捜し殺人事件」では組織を登場させず、別の犯人に置き換えてその者が逮捕される内容に変更された。やがてテレビアニメ版が軌道に乗ると、後者の事件は灰原の登場に当たって必要不可欠な重大事件となったため、原作の本筋だけを残して大幅にアレンジした別エピソードの第128話「黒の組織10億円強奪事件」が制作された。しかし、前者の事件での重要点は「ジンとウォッカのコードネームが発覚する」ことのみだったため、代替エピソードが制作されなかった。このため、テレビアニメ版ではジンとウォッカのコードネームは第52話「霧天狗伝説殺人事件」において、これまでのあらすじを振り返る形で初めて紹介され、その流れでコナンがジンとウォッカのコードネームだけはすでに突き止めていたように描写された。
なお、それ以降で組織が絡む事件は、第13話のように原作との矛盾が生じるとその後の辻褄合わせが困難になるといった理由から、原作通りに作られるようになっている。また、2016年放送のスペシャルアニメ『エピソード“ONE” 小さくなった名探偵』以降は前述のアニメオリジナル設定ではなく、原作の設定で描かれている。
この時の蘭の行動と新一の「人が人を助ける理由に論理的な思考は存在しない」という言葉がきっかけで、2人に肩入れするようになった。このような経緯から、新一(コナン)を"Cool Guy"(クールガイ)、蘭を"Angel"(エンジェル)と名付けた。新一(コナン)のことは『ベルモット編』ラストからは"シルバーブレット"で、「長い間待ち望んだシルバー・ブレット」「組織(われわれ)の心臓を射抜けるシルバー・ブレット」などと評している。バーボンとの協力において「何があっても2人に危害を加えないこと」を条件にしているが、「この世でたった2つの宝物」の1つが新一(コナン)だとは明言されていない。 一方、シェリー(灰原)については「彼女だけはこの世にいてはならないのよ...」と2度ほど抹消に動いている。「ベルツリー急行殺人事件」後の「赤井秀一の消息」の際は、灰原はベルモットが近くにいたのに何の反応も示さなかった。劇場版第26作『黒鉄の魚影』でも同様。本作では灰原を助ける行動を取っているが、これは作者発案で「ブローチを譲ってくれた灰原を助けたというエピソードは、先生が初期の頃に足してくれたアイデア」と監督が言及している。有希子とは、共に盗一に弟子入りしていた時期に仲良くなった。有希子が女優になりたての頃からの親友であるが、ベルツリー急行で対峙してからは決別した状態にある。
「世界遺産の謎」に登場。組織に所属する2人組の男。聖遺物を対象に狙うハンターだが、大した成果を挙げていなかった。
スイスで名門・ハプスブルク家を狙って行動していた。ロンギヌスの槍を手に入れるとハプスブルクの一族を殺そうとするが、小五郎に敗れて失敗する。その後、刑務所に収容されてまもなく組織に抹殺される。
声 - 紗ゆり
走行中の新幹線内でジンたちが取引を行った、キャリアウーマン風の女性。本名は不明。
「金()に関する情報」が入ったケースをジンたちから4億円で買い取ったが、まもなく名古屋にて降車した彼らには用済みと見なされており、ケースに爆弾を仕掛けられていたため、走行中の新幹線もろとも爆殺されそうになったところ、コナンの活躍によって間一髪で命拾いする。その後は京都府警察に逮捕されて洗いざらい話したが、組織に深く関わった人物ではなかった。
なお、アニメでの取引相手はジンたちではなく、彼らと容姿がよく似た上田(うえだ、声 - 梁田清之〈ジンに相当〉)と下田(しもだ、声 - 巻島直樹〈ウォッカに相当〉)という2人組であり、最後にはこの2人も逮捕された。