在アフガニスタン日本国大使館
1996年9月、首都カーブルを含む国土の大半を掌握したターリバーンがアフガニスタン・イスラム首長国の建国を宣言し、反タリバン勢力のアフガニスタン救国・民族イスラム統一戦線(北部同盟)が結成されたが、日本はタリバン政権と北部同盟のどちらにも肩入れせず。
2001年10月7日、北部同盟に肩入れするアメリカ合衆国が不朽の自由作戦を発動してタリバン政権に対する戦争を仕掛け、米軍の作戦開始から数週間でターリバーン政権を崩壊させる。
2001年12月22日、米軍占領下のカーブルでハーミド・カルザイ暫定政権が誕生し、日本からは植竹繁雄外務副大臣が暫定政権設立式に立ち会い、カルザイ暫定大統領との会談で暫定政権の承認と復興支援を約束する。
2002年2月19日、駒野欽一臨時代理大使により約13年ぶりに在アフガニスタン日本国大使館が再開される。
2002年4月26日、駒野臨時代理大使が特命全権大使に昇格し、約22年ぶりに日本の大使がアフガニスタンに駐在する。
2021年8月15日、日本国政府は、タリバンによるカーブル侵攻を筆頭とするアフガニスタン情勢の緊迫化を受け、大使館職員を退避させる方針を固めた。
2021年8月17日、ターリバーンによるカーブル制圧を受けて大使館職員12名がアラブ首長国連邦のドバイに退避した(大使館は15日に閉鎖済)。トルコ・イスタンブールの日本国総領事館に在アフガニスタン日本国大使館臨時事務所(英語: Temporary Office of the Embassy of Japan in Afghanistan)を設置し、邦人保護などの業務を継続。
2021年9月1日、大使館臨時事務所がイスタンブールからドーハに移転し、在カタール日本国大使館内で業務を継続する。
2022年9月末、約1年1ヶ月ぶりにカーブルの大使館での業務が一部再開される。