朝堂
宮の内部は、朝堂院中域に朝堂が12堂あり、東と西のそれぞれ6堂ずつ対称的に配置されていた。難波長柄豊碕宮朝堂の14堂以上にくらべると殿舎の数は少ないが、それぞれの規模は、
一堂 ... 桁行9間(約36メートル)、梁行4間(約14メートル)、四面庇、入母屋または寄棟
二堂~四堂 ... 桁行15間(約62メートル)、梁行4間(約12メートル)、二面庇、切妻造
五堂・六堂 ... 桁行12間(約50メートル)、梁行4間(約12メートル)、二面庇、切妻造
であり、難波よりはるかに大きい。
また、難波長柄豊碕宮と藤原宮では、第一堂の規模・構造が他と異なり、桁行は最短でありながらも梁行は最も広くとられ、四面庇で、屋根構造でもひとつ格上の入母屋もしくは寄棟が採用されていることから、朝堂の殿舎のなかでは特別に扱われていたことがわかる。この傾向は平城宮の前半までつづいている。
いずれも基壇をもつ礎石建物であり、また、宮としては日本で初めての瓦葺の殿舎であった。