水俣駅
鹿児島本線時代の2004年3月12日までは特急停車駅であり、3番線や中線も使用され当駅折り返しの列車も数多く設定されていた。また、当駅と博多駅・小倉駅の間を結ぶ特急有明が朝晩に1往復(10号・49号)設定され、中線を使って夜間滞泊も行われていた。改札口に行先発車標(反転フラップ式案内表示機)や行灯式の座席案内標が設置されていた。なお廃止された山野線は主に3番線で発着していた。また、駅舎内にはみどりの窓口、待合室にキヨスクがあり駅弁や水俣名物の蜂楽饅頭、三太郎餅も販売されていた。さらにジョイロード(現 JR九州旅行)水俣旅行センターが隣接して設置されていたがどちらも経営移管時に閉店した。当駅のみどりの窓口はマルスが撤去され、隣の新水俣駅に機能を移転したが現在も出札窓口として使用されている。キヨスクも同じく新水俣駅に移転し当駅のキヨスクを含むかつての待合室跡は、パン工房「風季のとう」に改装された後2015年から水俣屋に、旅行センター跡は待合室にそれぞれ改装されている。
シンガーソングライターの村下孝蔵の出身地であり、かつて待合室の一部に「村下孝蔵ミニ博物館」が設置され、生前に使われていた楽器など数多くの遺品が多く展示されていたが駅舎リニューアルの際に撤去された。
肥薩おれんじ鉄道に経営移管された際に使用停止となった発車標や座席案内標は撤去された。開業時はJR線時代の名残として八代方面から当駅折り返しの区間列車が3本設定されていたが、2005年3月1日のダイヤ改正で八代方面からの列車は全て出水方面に延長されたため早々に消滅した。それ以降は当駅始発終着の定期列車は設定されていない。