APOBEC3G
APOBEC3Gは対称構造を持っており、2つの相同な触媒ドメイン、N末端ドメイン(CD1)とC末端ドメイン(CD2)からなる。CD1、CD2のそれぞれに亜鉛イオンの配位部位が含まれている。また各ドメインは、シチジンデアミナーゼの典型的なHis/Cys-X-Glu-X23–28-Pro-Cys-X2-Cysモチーフを有している。しかし、典型的なシチジンデアミナーゼとは異なり、APOBEC3Gは触媒内の2つのβシートの間に固有のαヘリックスを有している。このαヘリックスが補酵素結合部位となる可能性がある。
CD2は触媒活性を持ち、脱アミノ化と基質結合部位(モチーフ)の構造的特異性に不可欠である。CD1は触媒的に不活性であるが、DNAおよびRNAへの結合にとって非常に重要であり、APOBEC3G脱アミノ化の3'→5'方向のプロセシビティを決定している。