Walkerモチーフ
SGAGKT合成ヘキサペプチドは無機リン酸を強固に結合することが示されており、こうした短いペプチドはαヘリックスを形成しないことから、ヘリックスのN末端ではなくネストがリン酸結合のための主要な特徴であることが示唆される。
Walker AモチーフはATPやGTPを結合するタンパク質に存在することが最もよく知られているが、リン酸化された基質を結合するさまざまなタンパク質にも存在し、ATP合成酵素(α、βサブユニット)、ミオシン、トランスデューシン(英語版)、ヘリカーゼ、キナーゼ、AAAタンパク質(英語版)、Gタンパク質、RecA、プロテインチロシンホスファターゼ、システインシンターゼなどのピリドキサールリン酸を利用する酵素などに存在する。
プロテインチロシンホスファターゼはリン酸化チロシン残基から無機リン酸の加水分解(チロシンキナーゼ(英語版)による反応の逆)を触媒する酵素であり、Pループ様構造へフォールディングするモチーフを持つが、保存されたリジン残基の代わりにアルギニンが存在している。このモチーフの保存配列はC-x(5)-R-[ST]である(C:システイン、R:アルギニン)。