ルイス・キャロル
1850年の終りにチャールズはラグビー校を卒業し、休養期間をおいて、1851年1月に父の母校であるオックスフォード大学のクライスト・チャーチ・カレッジに入校したが、47歳だった母フランシスが髄膜炎か脳梗塞と思しき脳炎で死去し、入校の僅か2日後に実家に呼び戻された。
翌年、チャールズは文学士号第1次試験に合格し、父の旧友エドワード・ピュージー(英語版)から、スチューデントシップ(クライスト・チャーチにおける特別研究員)に指名された。
1854年にクライスト・チャーチを最優秀の成績で卒業した後、同校の数学講師となったチャールズは以降26年間にわたり仕事を続けた。実は卒業後は国教会の司祭職の資格を取ることが入学の条件であったのだが、表向きには「吃音が説教に支障をきたす」ことを主な理由として、背景には上記のようなチャールズ自身の宗教的葛藤を理由として聖職者の資格を取ることを拒み続けたのではないかと推測されている。
また、チャールズはオックスフォードでてんかんと診断された。これは当時の社会では非常に不名誉なことだった。しかし、近年のシカゴ・イリノイ大学てんかん診療所の理事ジョン・R・ヒューズは、チャールズのてんかんは誤診だった可能性を主張している。
マイケル・フィッツジェラルド(英語版)は、てんかんではなく、自閉症スペクトラム症であったとしている。