電脳学園
1980年代後半、ガイナックスはアニメーション制作の赤字で悪化していた経営を立て直すため、ゲーム業界へ進出することを決定した。その第1弾として制作されたのが、本シリーズである。
当時のアダルトゲーム市場は一流メーカーの撤退により、グラフィックのレベルが低下していた。また、MacintoshのHyperCardで遊んでいた岡田斗司夫と赤井孝美は、アドベンチャーゲーム程度であれば自分たちでも制作することが可能であると知っていた。こうした状況から、システムが単純なクイズゲームにアニメ制作スタッフによるグラフィックを組み合わせることで、ゲーム制作は可能であり売上も見込めると判断され、本作が制作される。
PC-8801版で岡田と赤井はプログラムとBGMの作曲以外を全て2人でこなし、角川書店の『コンプティーク』にヨイショ同然の記事を書いてもらうという癒着ギリギリのバックアップを受け(最終的にはガイナックスから『コンプティーク』にライターを派遣し、自分たちでヨイショ記事を書くまでになる)、本作を発売した。大きな反響を呼んだが、1990年11月に発売した『電脳学園シナリオI Ver2.0』は宮崎県で青少年保護育成条例による有害図書指定を受けてしまう。ガイナックスは本指定に対して憲法第21条等の違反で無効であるとして宮崎県を提訴するが、1999年12月に最高裁判所で敗訴した(詳細は#宮崎県有害図書指定に対する訴訟を参照)。
1999年12月23日、電脳学園シリーズの新作となる『電脳学園ミレニアム』がナインライブスより通販・イベント直販(コミックマーケット/ワンダーフェスティバル)限定で発売された。Windows 95/98(XP非対応)・Macintosh(Classic Mac OS)両対応ハイブリッド版(英語版)CD-ROMでリリースされた同作は1作目のリメイク版に相当し、新キャラクター2名が追加されている。なお、1999年12月に発売したバージョンに不具合が発見されたため、バグを修正した完全版を制作し、購入者全員に無料で送付されている。
その翌年の2000年8月23日には『電脳学園ミレニアム2~紅の女王~』が、ナインライブスより通販・イベント直販限定で発売された。同作は主人公・日の本リリカとその助手・御堂マコトが電脳学園に潜入し、国家の存亡を揺るがす陰謀を暴くという内容になっている。こちらも2000年9月7日に数々の修正を施した新バージョン(Ver.2)がリリースされ、旧バージョンの購入者には無料で送付されている。