特殊作戦・低強度紛争担当国防次官補
特殊作戦・低強度紛争担当国防次官補は、1987会計年度国防権限法 (公法第99号661、1986年11月14日成立) によって設置が義務付けられた。その後、1988年1月4日の国防総省令第5138.3号によって正式に設置された。なお、戦略的能力と部隊の再編に関する職責は、2006年にエリック・S・エデルマン政策担当国防次官による国防総省政策局の再編の結果として追加された。
特殊作戦・低強度紛争担当国防次官補を補佐するために、3人の国防副次官補が置かれている。
特殊作戦・対テロ戦闘担当国防副次官補
パートナーシップ戦略・作戦安定担当国防副次官補
麻薬対策・国際脅威担当国防副次官補
2020年11月、クリストファー・ C・ミラー国防長官代行は、国防総省のクリストファー・マイヤーISIL打撃任務部隊担当管理官が辞任し、同時にそのポストが廃止されると発表した。任務部隊担当管理官の任務と責任は、特殊作戦・低強度紛争担当国防次官補と政策担当国防次官の他の職員に吸収される。