MHCクラスII分子
小胞体(ER)でのMHCクラスII分子の合成中に、α鎖とβ鎖が産生され、不変鎖(英語版)として知られる特殊なポリペプチドと複合体を形成する。粗面小胞体内に存在する新生MHCクラスII分子は、そのペプチド結合溝が不変鎖(三量体)によって閉塞され、細胞性ペプチドや内因性経路からのペプチド(クラスI MHCにロードされるペプチドなど)が結合できないようになっている。
不変鎖はまた、MHCクラスII分子を小胞体からゴルジ体へ輸送し、次に、エンドサイトーシスされた分解タンパク質を含む後期エンドソームと融合させる。その後、不変鎖は、カテプシン(英語版)と呼ばれるプロテアーゼによって段階的に分解され、CLIP(英語版)として知られる小さな断片のみが残り、これはMHC分子上のペプチド結合溝の閉塞を維持する。MHCクラスIIに類似した構造体であるHLA-DMは、CLIPの除去を容易にし、より高い親和性を持つペプチドの結合を可能にする。そして、安定したMHCクラスII分子が細胞表面に提示される。
PIK3R2とPIP5K1Aは、ホスファチジルイノシトール(PIP)をリン酸化する2つのキナーゼで、PSD4にGTPローディング機能のための基質を提供する。PSD4はグアニンヌクレオチド交換因子としてARL14/ARF7にGTPをロードする。その後、ARF7EPはMYO1Eと相互作用し、MYO1Eは自身をアクチン筋線維に結合させる。この複合体は、未成熟な樹状細胞内でMHCクラスII分子をロードした小胞を維持し、細胞膜への移動を阻害することに寄与している。