遣支艦隊
第15戦隊 重巡洋艦鳥海 第5駆逐隊:朝風・春風・松風・旗風 第21駆逐隊:初春・子日・初霜・若葉
第3連合航空隊:第14航空隊・第15航空隊
附属:広東方面特別根拠地隊・厦門方面特別根拠地隊・海南島特別根拠地隊・第12掃海隊など
1939年(昭和14年)11月15日、第三艦隊は第一遣支艦隊に改称した。 第一遣支艦隊は、引き続き上海を拠点に揚子江流域で行動した。主な戦力は武漢に駐留する陸戦隊の漢口方面特別根拠地隊と、揚子江の航路確保のために全ての砲艦を集約した第11戦隊である。これに九江や南京に駐留する若干の陸上部隊が加わる。 1942年(昭和12年)1月15日、漢口方面特別根拠地隊は縮小のうえ漢口警備隊に降格した。 1943年(昭和13年)8月20日、第一遣支艦隊は解隊され、揚子江方面特別根拠地隊が新編された。任務の性格は降格前と変わりなく、陸上部隊は武漢・南京・九江など拠点の駐留、砲艦は揚子江の航路確保に従事した。末期には特攻艇震洋の部隊も配備された。ほとんどの砲艦を喪失したものの、揚子江特根は終戦まで陸上での戦闘を継続した。
谷本馬太郎中将:1939年11月15日 -
細萱戊子郎中将:1940年11月15日 -
小松輝久中将:1941年7月5日 -
牧田覚三郎中将:1942年2月14日 -
遠藤喜一中将:1943年3月9日 - 1943年8月20日(揚子江方面特別根拠地隊降格と同時に転出)