東日本旅客鉄道
急行列車 奥只見 とがくし 南越後 赤倉 かもしか 妙高 ちくま(JR東海の車両) 八甲田 津軽 アルプス 月山 よねしろ 陸中 銀河(JR西日本の車両) 能登(JR西日本の車両) きたぐに(JR西日本の車両) はまなす(JR北海道の車両)
JR東日本発足以降に同社の路線で運行されている、もしくはかつて運行されていた愛称付きの列車を挙げる(2023年6月12日時点、廃止列車は廃止時点)。種別が変更された列車は変更後のもので記載し、他社の車両による運行のものはその会社名も記載する。詳細は各列車の記事を参照。
青森駅 青い森鉄道と共用。JR東日本が管轄している。
大鰐温泉駅 弘南鉄道(大鰐駅)と改札内を共用している。改札口は別れており、各社が管轄している。
五所川原駅 津軽鉄道(津軽五所川原駅)と改札内を共用している。改札口は別れており、各社が管轄している。
釜石駅 三陸鉄道と改札内を共用している。改札口は別れており、各社が管轄している。
久慈駅 三陸鉄道と改札内を共用している。改札口は別れており、各社が管轄している。
宮古駅 三陸鉄道と共用。三陸鉄道が管轄している。
羽後本荘駅 由利高原鉄道と改札内を共用している。改札口は別れており、各社が管轄している。
鷹ノ巣駅 秋田内陸縦貫鉄道(鷹巣駅)と改札内を共用している。改札口は別れており、各社が管轄している。
赤湯駅 山形鉄道と共用。改札口ごとに各社が管轄している。
今泉駅 山形鉄道と共用。JR東日本が管轄している。
勝田駅 ひたちなか海浜鉄道と共用。JR東日本が管轄している。
下館駅 関東鉄道・真岡鐵道と共用。改札口ごとにJR東日本と関東鉄道が管轄している。
水戸駅 鹿島臨海鉄道と共用。