後花園天皇
この間、永享11年(1439年)6月には勅撰和歌集(二十一代集)の最後に当たる『新続古今和歌集』が成立。
天皇の治世、各地で土一揆が起こり、永享の乱(永享10年、1438年)、嘉吉の乱(嘉吉元年、1441年)などでは治罰綸旨を発給するなどの政治的役割も担って、朝廷権威の高揚を図った。永享の乱での治罰綸旨の発給は、足利義満の代より廃絶していた朝敵制度が60年ぶりに復活したものであった。以後、天皇の政治的権威は上昇し、幕府が大小の反乱鎮圧に際して綸旨を奏請したため、皇権の復活にもつながっていった。
嘉吉3年(1443年)9月、後南朝勢力が土御門東洞院殿に夜襲をかけ放火し、後花園天皇は左大臣・近衛房嗣邸に逃れるが、三種の神器の一部を奪われた(禁闕の変)。奪われた神器のうち、剣は清水寺で発見されるが、神璽(曲玉)は持ち去られた。
文安元年(1444年)2月、同母弟の伏見宮貞常親王に親王宣下を行い、文安4年(1447年)11月に父の貞成親王に太上天皇の尊号を奉っている。享徳4年(1455年)1月、後二条天皇の五世の孫にあたる木寺宮邦康王に親王宣下を行った。
長禄元年(1457年)12月、嘉吉の乱で没落した赤松氏の遺臣らが後南朝の行宮を襲って神璽を奪還し(長禄の変)、長禄2年(1458年)8月には朝廷へ返還された。ここに全ての神器が天皇の手中に帰することになる。
思へただ空にひとつの日の本に又たぐひなく生まれ来し身を(後花園院御集)
賎民争採首陽薇 處々閉盧鎖竹扉 詩與吟酸春二月 満城紅緑為誰肥(『天地根本歴代図』)
応永26年(1419年)6月18日、貞成親王の第一王子として生まれた。
応永29年(1422年)以降、先代の称光天皇は幾度か危篤状態に陥るなど病弱で皇子がなく、称光の同母弟で皇儲に擬せられていた小川宮も応永32年(1425年)に早世したため、その父で院政を敷いていた後小松上皇は、早急に皇嗣を決定する必要に迫られた。
正長元年(1428年)、称光天皇が危篤に陥ると、両統迭立を要求する後南朝勢力がにわかに活動の気配を見せたため、室町幕府将軍に就任することになっていた足利義宣(後の足利義教)は伏見御所にいた彦仁王を保護し、後小松上皇に新帝指名を求めた。
同年7月20日、称光天皇が崩御すると、彦仁王は後小松上皇の猶子となって親王宣下のないまま、7月28日に践祚し、永享元年(1429年)12月27日に即位した。天皇の即位は、崇光天皇以来、皇統の正嫡に帰ることを念願していた伏見宮家にとってはめでたいことであり、父の貞成親王もこれを「神慮」として喜んだ。
永享6年には清原業忠を侍講に、『孝経』『論語』『孟子』を学び、3月24日には貞成親王より『誡太子書』を献上されている。『誡太子書』とは、かつて花園上皇が後花園の高祖父にあたる皇太子量仁親王(光厳天皇)のために著した訓戒書であり、南北朝の動乱の中でも光厳が他多くの記録類とともに崇光皇統(伏見宮)に守り伝えたものであった。このように、豊富な記録類を保有する崇光皇統(伏見宮)を背後に置けたことは、後花園天皇の長所であった。
即位して以降も後小松上皇による院政は継続されたが、永享5年(1433年)10月に上皇が崩御した後は30年余りにわたって親政を行った。