ヤマハ・SR
この時、同時にフューエルタンクのサイドが丸みを帯びて大きくなり、容量が公称12Lから公称14Lへと変わり、航続可能距離がより長くなった。またハンドルがやや低くなり、ステップの位置が100mmほど後ろに変更された。
2001年に各種の保安基準が強化され、フロントブレーキが16年ぶりにディスクブレーキに回帰(再変更)となった。また自動車排出ガス規制の強化を受け、「A.I.S(エアインダクションシステム)」を採用することで自動車排出ガス規制をクリアした。またこの年式以降、ステップの位置が1978年発売当初の位置に近付けられ、リアブレーキのタッチも適正化された。
2008年に販売30周年を迎え記念モデル(SR400 30th アニバーサリー・リミテッドエディション)を500台限定で販売したが、翌年から適用される自動車排出ガス規制強化に対応できなかったことから生産を終了した。
SR400およびSR500は2008年の生産終了までに累計12万7千台が販売された人気車種であったことから、購買層から規制への対応による復活が期待され、SRの今後をうかがう内容が雑誌などで話題になっていた。生産停止の間にフューエルインジェクションを搭載した環境規制対応モデルが開発され、 2009年の第41回東京モーターショーにおいてSR400(F.I.)として参考出品された後、2010年モデルの SR400 として2009年12月21日に発売された。
2010年モデルの希望小売価格は550,000円(税抜)であったが、2013年の発売35周年記念モデルは塗装などを変更した特別仕様にもかかわらず謝恩価格として510,000円(税抜)で発売され、2014年モデルからは通常仕様も510,000円(税抜)で発売されている。