カエル卵抽出液
上記のM期抽出液に、数百μM程度(抽出液中に残留するEGTAを上回る)のCaCl2を加えると、速やかなMPFの不活性化(プロテアソームによるサイクリンBの分解)が起こる。その結果、分裂中期から分裂後期、さらに、S期へと細胞周期が進行する(これをS期抽出液あるいは間期抽出液と呼ぶ)。このS期抽出液に精子クロマチンを加えると、膨潤したクロマチンの周囲に膜小胞が集合し、さらにそれらが融合することで核膜が形成され、細胞核が作られる。さらに、核と細胞質の間では能動的な物質輸送が起こり、核内のゲノムDNAが複製される。これらの抽出液には、大量のmRNAとリボソームが含まれているためタンパク質の翻訳も行われる。このように卵抽出液の無細胞系では、増殖細胞で起こる多くの現象を再現できるが、転写が起こらないことは唯一の例外といっても良い。これは、実際の卵や初期胚において(減数分裂の途中から受精後の胞胚期まで)転写が起こらないことを反映している。
S期抽出液に大量の精子クロマチンを加えて細胞核を形成させ(1 μLあたり、~10,000個)、その反応液を希釈せずに遠心すると核が最上層に分離される。この核成分のみを集めてさらに強い力で遠心すると、上澄と沈殿(核膜やクロマチンが含まれる)に分かれる。上澄は核の可溶性成分からなり、これを核質抽出液と呼ぶ。DNAをS期のHSSでインキュベーションした後に、NPEを加えると複製が起こる。通常のS期抽出液ではDNAの周辺に核が形成されることが複製開始の前提となるが、このプロトコルでは核形成なしに複製を誘導できることが大きな特長である。この方法を用いることによって、複製開始に至るプロセスを詳細に解析できるようになった。また、プラスミドDNAなど(精子由来ではないDNA)を用いた場合にも、高い効率でDNA複製を再現することができる。この特徴を活かし、損傷を導入したDNAを用いたDNA修復メカニズムの研究も行われている。