リーディングフレーム
複数リーディングフレーム(multiple reading frames)を使用すると、オーバラップ遺伝子(英語版)(overlapping gene)が生じる可能性がある。このようなものはウイルス、原核生物、およびミトコンドリアのゲノムに多数存在する可能性がある。B型肝炎ウイルスやBYDV(英語版)などの一部のウイルスは、異なるリーディングフレームの中でいくつかのオーバーラップ遺伝子を使用している。オーバーラップ遺伝子を遺伝子重複(gene duplication)と混同しないよう注意すること。
まれに、mRNAの翻訳中にリボソームがあるフレームから別のフレームに移動することがあり、これを翻訳フレームシフト(英語版)(translational frameshift)と言う。これにより、mRNAの最初の部分は1つのリーディングフレームで翻訳され、後の部分は異なるリーディングフレームで翻訳される。これは、フレームシフト変異とは異なるもので、ヌクレオチド配列(DNAまたはRNA)は変更されず、読み取られるフレームのみが変更される。