イラク航空
しかし、アメリカなどの多国籍軍によりサッダーム・フセインが追放(その後処刑)され、新政権が樹立された後に、イラク航空は政府の国営からエア・イラク社に経営が移管され、2004年10月には新体制下における第1便として、需要の高いバグダード-アンマン線の運航を開始した。
その後アメリカ政府などから資金援助を受けて2004年にボーイング767-200型機などの中古機材の提供を受けた他、これまでバグダード国際空港内に放置されていたボーイング737-200型機やイリューシンIL-76などいくつかの残存機が再び使用できるように整備を受けた。2005年6月には、イラク戦争後初の国内線である、バグダード-バスラ線の運航を再開しほか、バグダード-テヘラン線やバグダード-イスタンブール線などの国際線を開設した。
湾岸戦争以前はブラジル(リオネジャネイロ)や日本(成田)への運航もあった。
イラク国内
バグダッド
ナジャフ
バスラ
アルビール
モースル(季節運航)
スレイマニヤ
アフリカ
エジプト:カイロ
中東
バーレーン:マナーマ
イラン:エスファハーン、マシュハド、テヘラン
ヨルダン:アンマン
クウェート:クウェートシティ
レバノン:ベイルート
シリア:ダマスカス
トルコ:アダナ、アンタルヤ、イスタンブール(アタテュルク)
アラブ首長国連邦:ドバイ
アジア
インド:デリー、ムンバイ
マレーシア:クアラルンプール(2013年8月16日より正式運航開始・ボーイング777-200LRによる週1便での運航)
パキスタン:カラチ(季節運航)
中国:北京(2015年6月8日より正式運航開始・バスラ経由・ボーイング777-200LRによる週1便での運航)
中国:広州(2014年8月23日より正式運航開始・ボーイング777-200LRによる週1便での運航)
ヨーロッパ
ジョージア:クタイシ
イギリス:ロンドン(ガトウィック)(2013年3月5日より正式運航開始・A320で週1便運航)
北米
【再就航検討】
なお,EU域内乗り入れ禁止航空会社であるため,EU域内には就航していない。