カスパーゼ-3
カスパーゼ-3は、外因性(デスリガンド)経路か内因性(ミトコンドリア)経路かに関わらずアポトーシスを引き起こした細胞で活性化される。カスパーゼ-3が酵素前駆体として存在しているとは必要不可欠であり、そうした調節がなければカスパーゼ活性によって無差別に細胞死が引き起こされる。実行型(エフェクター)カスパーゼであるため、アポトーシスシグナル伝達イベントが発生して誘導型(イニシエーター)カスパーゼによって切断されるまで、カスパーゼ-3の酵素前駆体は事実上活性を持たない。そうしたイベントの1つがグランザイムBの誘導であり、細胞傷害性T細胞の標的となった細胞でイニシエーターカスパーゼを活性化させる。この外因性因子による活性化によってアポトーシス経路に特徴的なカスパーゼカスケードが誘導され、そこではカスパーゼ-3が主要な役割を果たす。内因性因子による活性化では、ミトコンドリアのシトクロムcが、カスパーゼ-9、Apaf-1、ATPと協働してプロカスパーゼ-3のプロセシングを行う。これらの分子はin vitroでカスパーゼ-3を活性化するのには十分であるが、in vivoでは他の調節タンパク質が必要である。