忍 -SHINOBI-
スラム街が舞台となっている。
下記要素はプレイ前にオプションでON/OFFが可能。
「時間戻し」を搭載。ゲームプレイ中ボタン一つで即座に数秒前の状態に戻せる。忍術的な名称だが本来のゲームデザインに組み込まれたものではなく、オプション機能のひとつ(他の「SEGA AGES」シリーズ作品の幾つかにも名前は違うが同様の機能がある)。
このほか、「忍ボーナス」チャレンジプレイをし易くする近接攻撃専用ボタンや、あるステージのボスキャラ攻略に絶大な効果を発揮するボタン連射機能が追加された他、「Joy-Con」の基本機能である「HD振動」連動プレイも実装。
「画面モード」には新たに「キャビネット」が追加。本作稼働開始当時に使われていたセガの汎用ゲーム筐体「エアロシティ 」のモニタ部分に映像が映るようになっている。「キャビネット」でプレイする時のみ、往時のゲームセンター店内の雰囲気をイメージした環境音がゲーム音楽にミックスされる。
アレンジモードにあたる「AGESモード」ではジョー・ムサシが白装束に変わり、『ザ・スーパー忍』版(以下TSS版)ムサシの印象に近づけている(後述する「Switch版開発エピソード」からの流れで、このような衣装になっている模様)。このモードではムサシの攻撃力が常にパワーアップ状態となり敵が倒し易い。また敵攻撃を受けると一発でムサシ(自機)が失われるオリジナル版の仕様を2ライフ制に変更、二発まで耐えられる(ちなみに一度ダメージを受けるとライフアイテム で回復するかステージクリアするまで装束が赤くなる)。