ソニック ヒーローズ
ソニックがテイルス、ナックルズの二人がかりで発射され、一定範囲をライトアタックで暴れまわる。ブラストゲージが無くなるまで、スピードフォーメーション時のブルートルネードが敵に誘導して攻撃するライトアタックに変化し、ザコ敵を一掃できる。他チームとの対戦の場合、ダメージ効果に加えて痺れさせる。
三人で集まって空気抵抗を増やし、ゆっくり落下したり風を受けて上昇したりできる。
Team Chaotix
赤と白に彩られた海洋遺跡が立ち並ぶ、南国の海岸ステージ。最初のステージだけあって難易度はあまり高くない。チームカオティクスのミッションは「ヤドカリを10匹見つけろ!」。ソニックシリーズでは1作目のグリーンヒルゾーンに次いで使われることが多いステージである。『マリオ&ソニック AT ソチオリンピック』では巨大なファンで人工雪が吹き付けられており、ドリームアルペンスキーの会場として使われた。『ソニック ジェネレーションズ白の時空』『ソニックダッシュ』ではコースとして登場。『ソニック&セガ オールスターズ レーシング』、『ソニック&オールスターレーシング トランスフォームド』、『チームソニックレーシング』の3作でレースコースとして登場。『電撃文庫 FIGHTING CLIMAX』のバトルステージ『ソニック・ザ・ヘッジホッグ』ではこのステージの曲のリミックスを聞くことができる。
赤い鳥型メカ。サンダーシュートでしか追いつけないほど高速で飛行しエッグポーンなどを投下するが、非常に脆い。
エッグマンによってソニックに似せて造られた対ソニック用兵器で、本作の全ての黒幕。『ソニック・ザ・ヘッジホッグCD』以降、ソニックと何度も戦いを繰り広げた。独自のAIチップの発達により自我が芽生え、自身を改造して「ネオメタルソニック」となり、人型に近いボディを持つ様になった。カオスのデータをコピーしたことで自分の体を液状化させ、他の人物に姿を変える能力を手に入れている。自分を頂点としたロボットの世界を作り上げる為にエッグマンに反逆。彼を拘束し、彼自身に変身してソニック達に挑戦状を送り付け、さらにカエルくんやチョコラを誘拐してカオスのデータをコピーして影で計画を進めており、これによってエミー達はソニックを犯人として誤解するようになった。
本作の真の最終ボスであり、「ラストシナリオ」ではエッグマンの戦艦を一部破壊し、残骸を再構成することで怪物を思わせる様な巨大な改造形態「メタルマッドネス」、土台を無理矢理切り離し下半身から翼を生やした飛行形態の「メタルオーバーロード」となってソニック達との決戦に挑む。
本編後はエッグマンによって元の従順なロボットに戻されたとされる。
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お宝を求めてエッグマンの基地に潜入したルージュは、その宝の正体を見て驚いた。なんと、『ソニックアドベンチャー2』においてスペースコロニー・アークでの戦いで行方不明となっていたシャドウが封印されていたのだった。
すると、同じ部屋にいたオメガにエッグマンのロボットと誤解され、シャドウは攻撃を受ける。シャドウがオメガに攻撃しようとしたときルージュがそれを止め、二人に事情を聞き、シャドウは記憶を取り戻すため、オメガは復讐を果たすためチームダークを結成しエッグマンのもとに急ぐ。
ゲームはチームソニックをベースに、敵の配置数が多くなっていたり、少しコースが長くなっていたりと難易度が高くなっている。