都営バス南千住営業所
65:日暮里駅 - 上根岸 - 新谷町車庫 - 浅草寿町 - 浅草橋駅 - 橘町(現・東日本橋駅)- 浜町中の橋 - 西八丁堀 - 東京駅八重洲口
前述の11(→草41)系統から分離のうえ1966年(昭和41年)3月10日に誕生した。しかし中央区日本橋地区の人口減少により浅草以南の乗客が非常に少なかったため、都営地下鉄浅草線で代替できると判断され都電第6次撤去と同時の1971年(昭和46年)3月17日限りで廃止された。
分離元の草41系統は現在も千住営業所の管轄で運行中。
上26:亀戸駅 - 亀戸天神 - 押上 - 業平橋駅 - 言問橋 - 隅田公園 - 根津駅 - (←上野広小路)- 上野公園(江東営業所と共管)
1990年(平成2年)、それまでの上26系統(上野公園 - 今井)を亀戸駅で分断して発足。当初は大塚営業所と巣鴨営業所の共管だった。その後1999年(平成11年)に巣鴨担当分が江東へ移管。2007年(平成19年)3月に大塚営業所担当分を南千住に移管したが、江東担当分はそのまま残って共管は続いた。2009年(平成21年)にはとバス委託路線となった為青戸支所に再移管。その際、江東担当分も移管され、路線開設から20年目でようやく単独所管に落ち着いた。
里48:日暮里駅 - 西日暮里駅 - 熊野前 - 江北六丁目団地
里48:日暮里駅 - 西日暮里駅 - 熊野前 - 江北六丁目団地 - 足立流通センター - 中入谷 - 見沼代親水公園駅
里48-2:日暮里駅 - 西日暮里駅 - 熊野前 - 江北六丁目団地 - 加賀団地(循環)
2008年3月30日、巣鴨と共管として参入する。新交通システム日暮里・舎人ライナーの開業によって存続が危ぶまれたが、本数減の上運行を続けている。詳しくは巣鴨営業所を参照。
そのあと、2012年には担当営業所に北が加わり、3営業所体制の路線となった。この際、王46系統の運行区間の一部を編入した。2018年3月31日をもって、千住営業所に移管され撤退した。