元住吉検車区
各停・急行(東横線本線系統)運用 5050系:8両編成25本(200両) 5155Fは元住吉駅追突事故で2017年7月に廃車となった。なお、5156Fは同様に廃車されたY500系Y516Fの補填として横浜高速鉄道に譲渡されているが、引き続き当区に在籍している。 5173Fは中間に後から追加製造した4611+4711を組み込み、既存8両も改番した上で10両化し4111Fとして4000番台に編入した。 Y500系:8両編成6本(48両・横浜高速鉄道受託車) Y516Fが元住吉駅追突事故で廃車となったため、補填用に5050系5156FがY517Fに改造された。 5000系:8両編成4本(32両) ※5118F・5119F・5121F・5122Fのみ 田園都市線用として製造されたが、東横線用に改造の上、元住吉検車区に配置された。
急行(本線系統及び東急新横浜線直通系統)・特急運用 5050系4000番台:10両編成15本(150両)
一部、西武鉄道が管理している小手指車両基地や武蔵丘車両基地、および相模鉄道の星川駅と相模大塚駅にある電留線と西谷駅構内など、他社の路線で昼間留置や夜間滞泊をする編成がある(東武鉄道の森林公園検修区や相模鉄道のかしわ台車両センターへの留置があるかについては不明。