ガンダム無双
チャージ攻撃やSP攻撃で止めを刺すことで、ピンクの爆発を起こし爆発した周囲の機体にもダメージを与える「誘爆システム」が追加。
フィールドに占拠することで特殊な効果を発揮する様々な施設が追加された。 施設の一種として「カタパルト」が追加。離れたフィールドに直接移動できる。飛び先は特定の1-2箇所から選択する。
宇宙空間のマップが廃止され、全て地面があるマップになった。また、フィールドが全体的に狭くなり、全てのエリアが細く曲がりくねった通路で区切られ、屋外マップでも前作の屋内のような構造になった。
機体開発は部位ごとのパーツを集めるのではなく、機体の全身の設計図がドロップするようになり、設計図1枚で機体が完成するようになった。機体の開発にはミッションクリアで入手できるゴールド(ゲーム内通貨)が必要。
特殊装備はモビルスーツ研究所で購入、スキルはショップで購入して取得する形式に変更された。品揃えは条件を満たすと増える。また、ショップではトレーニングという名目で経験値も購入できる。
ライセンスもショップで購入する形式に変更され、1回購入すれば全パイロットが使用できるようになった。
ガランシェール
ガルダ
アークエンジェル
ミネルバ
ライセンスは条件を満たせばショップに並ぶ。
友好度は「共感レベル」に名前が変更され、パイロットごとではなく全員で共有されるようになった。僚機として出撃するか自分で使用すると共感レベルが上昇する。また、相手を撃墜しても下がることがなくなった。 メインシナリオの進行で共感対象になり、共感レベルが上がるとパートナーとして選択可能、プレイヤーキャラとして使用可能、MSに固有のパーツが付く(メインMSのみ)、スキルの取得、オペレーターとして選択可能なるなどの機能が段階的に解放される。
戦況を報告するオペレーターを選択可能になった(ストーリーなど一部ミッションでは固定)。選択可能なキャラは条件を満たすと増えていく。非戦闘員のオペレーター専用キャラだけではなく、共感レベルを上げるとパイロットもオペレーターに選択可能になる。
有料ダウンロードコンテンツを利用することで、機体とそのパイロットとパイロットのミッションを入手できる。ダウンロードキャラクターはメインのストーリーには絡まず、購入した時点でプレイヤーとして使用可能で搭乗機体のライセンスも入手済みになる。オンラインモードでは参加する全員がそのキャラクターを購入していなければ使用不能。
コンビネーションSP攻撃 - 近くに2Pまたは特定のパイロットがいる時に○ボタン。使用可能な時は自分と相手の間にスパークが走る。
ブーストダッシュ - チャージ2〜4ヒット中に×ボタン(体当たり攻撃。ダッシュ攻撃に連携可能)
ダッシュ攻撃 - ダッシュ中に□ボタン(連続で押すことにより3回まで可能)
変形飛行 - ジャンプ中に×ボタン(変形可能な機体のみ。変形不可能な機体はジャンプダッシュとなる)
マップ切替え - R2ボタン
つばぜり合い - 固有パイロット同士の攻撃が重なった時に発生(SP攻撃の場合はSP攻撃を当てると発生)。演出と共にお互いの攻撃力が一定時間アップし、間合いが離れて仕切り直しとなる。
PS2版でも操作法に大差はない。Xbox 360版もボタンの名称こそ違うが配置は同じ。
他の無双シリーズの無双乱舞にあたるSP攻撃は、従来のシステムと違い、途中で攻撃を中断することはできず、使用後は全SPゲージを消費するが、シリーズの中ではSPゲージがたまりやすい方であるため不便さは感じにくい。
チャージ攻撃は4種類存在しており、おもにビームライフルなどでの牽制が中心となるチャージ1を除き、ダッシュでキャンセル可能。