西谷藩
勝長に与えられた知行地は、能登国にあった幕府領(能登天領)61か村・約1万3000石のうちから割かれたもので、鹿島・鳳至・羽咋・珠洲4郡にまたがって散在する46か村であった。この能登天領は、もと陸奥窪田藩土方氏の飛び地領であったが、貞享元年(1684年)に窪田藩が改易された際に幕府領になったという経緯がある。元禄2年(1689年)から元禄8年(1695年)にかけては49か村が割かれて鳥居忠英領(能登下村藩)になっており、鳥居家の転出後ふたたび幕府領に復した。この能登下村藩も、譜代の名門の家名存続のための措置という成立事情があり、鳥居家領(能登下村藩領)と水野家領(西谷藩領)は大部分が重なっている。
「西谷」という藩名(居所名)は、羽咋郡釶内郷西谷(西谷内。現在の七尾市中島町西谷内)を居所としたことに由来する。西谷村には中世に西谷内城(西谷城、西ヶ谷城)が所在し、畠山氏の有力な一族(西谷内畠山氏)が在城していたとも伝えられる。
しかし、西谷村は加賀藩領であり、西谷村に水野家(西谷藩)の陣屋が置かれたという説明には疑問も呈されている。
郷土史・城郭史家の高井勝己は、水野家は幕府が鹿島郡下村(現在の七尾市下町)に設けていた下村陣屋を借り受けたのではないかと推測する。高井の説によれば、下村陣屋は鳥居家(能登下村藩)が設け、鳥居家の転出後に幕府が能登天領の支配拠点として使った陣屋であるが、水野家は幕府の陣屋との区別のため、異なる地名を居所として称したのではないかという。
水野勝長は元禄12年(1699年)より徳川綱吉に小姓として出仕し、のちには柳沢吉保邸に居住を命じられるなど、綱吉の寵臣の一人と言える存在であった。このため、勝長が藩主として領国に赴くことはなかった。元禄13年(1700年)10月28日、能登国から下総国結城郡および上総国武射郡・山辺郡の3郡内に領知を移された。これをもって結城藩が成立したとみなされる。西谷藩は廃藩となり、所領はふたたび幕府領に戻された。以後、能登国内に居所を置く藩は生まれていない。