蝦夷共和国
旧幕府軍は陸軍と海軍に分かれ、以下のような組織となっていた。なお「列士満(レジマン)」と言うのは、フランス語で連隊を意味する Régiment をそのまま当て字にしたものである。
陸軍(陸軍奉行:大鳥圭介、陸軍奉行並:土方歳三) 第一列士満:第一大隊(瀧川充太郎、4個小隊、伝習士官隊、小彰義隊、神木隊)、第二大隊(伊庭八郎、7個小隊、遊撃隊、新選組、彰義隊) 第二列士満(本田幸七郎):第一大隊(大川正次郎、4個小隊、伝習歩兵隊)、第二大隊(松岡四郎次郎、5個小隊、一聯隊) 第三列士満:第一大隊(春日左衛門、4個小隊、春日隊)、第二大隊(星恂太郎、4個小隊、額兵隊) 第四列士満(古屋佐久左衛門):第一大隊(永井蠖伸斎、5個小隊、衝鋒隊)、第二大隊(天野新太郎、5個小隊、衝鋒隊) 砲兵隊:関広右衛門 工兵隊:小管辰之助、吉沢勇四郎 器械方:宮重一之助 病院掛:高松凌雲
海軍(海軍奉行:荒井郁之助) 開陽(澤太郎左衛門、1868年11月江差沖にて沈没) 回天(甲賀源吾、のち根津勢吉、1869年5月箱館港にて自焼) 第二回天(小笠原賢蔵、1869年3月九戸港にて自焼) 蟠竜(松岡磐吉、1869年5月箱館港にて自焼) 千代田形(森本弘策、1869年4月箱館港にて座礁) 神速(西川真蔵、1868年11月江差沖にて沈没) 輸送船:太江丸、長鯨丸、鳳凰丸、長崎丸、美賀保丸、回春丸