ジュバランド
その後、イスラム法廷連合は消滅し、その残党がヒズブル・イスラムやアル・シャバブとなって活動を続ける。アル・シャバブは勢力を拡大し、ヒズブル・イスラムを吸収して、ジュバランドを中心としたソマリア南部を実効支配した。しかし、アル・シャバブと共闘関係にあり、2010年からはキスマヨを共同統治していたアフメッド・モハメッド・イスラム(英語版)(通称マドベ)を筆頭とするグループがラスカンボニ運動を名乗り暫定連邦政府側に寝返り、ソマリア政府軍とともにドブレー、アフマドゥ、ビルタ・デールを次々と奪還。そして2012年9月28日にソマリア政府軍(英語版)・ケニア軍(英語版)とともにキスマヨからアル・シャバブを撃退した。
ソマリ国民戦線がマレハン族とほかの勢力に分裂した後、モルガンはリーダーの地位を失う。彼はその後、ソマリ愛国運動(英語版)に加わる。ソマリ愛国運動はダロッド氏族民兵、ラハンウェイン抵抗軍と南部ソマリ国民運動 (SSNM) から構成されていた。
モルガンは自分がジュバランドと呼ぶ国の首長を1998年9月3日から1999年7月11日までつとめた。しかし1999年にアーメッド・ウォーサメのジュバ渓谷連合 (JVA) に領土を奪われ、2001年8月6日から7日にかけてキスマヨもあっさり占領されてしまう。キスマヨは2006年までJVAに占領される。