松本空港
2009年9月、経営再建中の日本航空(JAL)は松本空港からの撤退を表明した。これにより、松本空港からは定期便が消滅する可能性が生じた。10月には、日本航空から2010年6月以降の早い時期に松本空港から撤退する意向が長野県に伝えられた。それを受け、長野県は路線存続に向けた活動を開始した。11月には、県側と前原誠司国土交通大臣と会談し、路線存続を要請した。その後、村井仁長野県知事から、静岡空港をハブ空港とするフジドリームエアラインズ(FDA)と、福岡便及び新千歳便について、ジェット機による毎日運航の実現を目指し、協議を行っているという発表があった。
村井知事は11月30日、松本空港への乗り入れを協議していたFDAが、就航を正式決定したと発表した。その際、FDAへの財政支援や利用促進策について支援を検討するとした。一方でFDA側は、JAL撤退直後に就航することが目標としているが、便数などは「静岡空港利用客の利便性を考慮しながら検討したい」としている。松本空港への就航は、機材繰りの関係から、静岡空港から撤退するJALの静岡 - 福岡便の引き継ぎが前提としている。
2005年(平成17年)3月:初の国際チャーター便が香港へ香港ドラゴン航空A320型機で運航。
2007年(平成19年) 9月:ジェット化以来使用されてきたMD-87型機が引退、当空港からジェット機定期運用消滅。 10月:札幌、福岡便を日本エアコミューターのQ400型機により隔日運航開始。
2010年(平成22年) 5月:日本航空グループ撤退に伴い、日本航空グループによる大阪、札幌、福岡便廃止。 6月:フジドリームエアラインズにより札幌、福岡便がエンブラエル170・エンブラエル175型機により毎日運航開始。3年ぶりのジェット機定期運用。 10月:静岡便運航開始。
2011年(平成23年)3月:静岡便廃止。
2014年(平成26年)8月:日本航空(ジェイエアにて運航)のエンブラエル170による大阪便が1ヶ月間限定運航。以来毎年8月に運航される。
2015年(平成27年)3月:福岡便が複便化。
2018年(平成30年)8月:フジドリームエアラインズにより札幌丘珠空港への夏季季節便が運航。
2019年(令和元年)10月:神戸便の運航開始。
2020年(令和2年)7月:RNP- AR設置、運用開始。
2021年 (令和3年)8月:運航可能時間延長に伴い、神戸線が増便され複便化。
2022年 (令和4年)4月1日:管制が新千歳空港事務所からのリモート運用に変更。副用波が廃止される