核脚亜目
この問題についての最初の主要な現代的かつ包括的な分析 (Spaulding et al., 2009) は、これを支持している。 いくつかの分類群は伝統的にこの亜目に属していると考えられてきたが(そのうちいくつかは反論されているが)、このグループを取り巻く状況は、その広範な化石記録にもかかわらず(またはそのために)、依然として大きな議論となっている。
現在(ある程度の信頼性をもって)核脚亜目に分類されているグループは以下のとおり。和名は遠藤・佐々木(2001) および冨田(2011) に従う。
基盤的またはincertae sedis †Gobiohyus属? †Homacodontidae科
†アノプロテリウム上科 Anoplotherioidea †アノプロテリウム科 Anoplotheriidae †カイノテリウム科 Cainotheriidae – カイノテリウム属など †Dacrytheriidae科
ラクダ上科 Cameloidea †オロメリクス科 Oromerycidae ラクダ科 Camelidae – ラクダ属、リャマ属、ビクーニャ属、ティタノティロープス属、アエピカメルス属など
†メリコイドドン上科 Merycoidodontoidea (=Oreodontoidea) †アグリオコエルス科 Agriochoeridae (側系統) †メリコイドドン科 Merycoidodontidae
†Xiphodontoidea上科 †ジフォドン科 Xiphodontidae