四国開発フェリー
上り便乗船客、下り便下船客用無料連絡バスは次の通り。路線バス扱いとなっているのが特徴。停留所は路線バスのものを併用し、どの停留所でも乗降可能。フェリー利用客は運賃無料となる。フェリーを利用しない旅客も有料で利用できる。下り便接続バスは、乗船手続き時か船内案内所で前夜に配布される整理券が無いと乗車できない場合がある。
大阪南港行の便に接続
今治営業所・今治桟橋・今治駅前 - 東予港 上り便接続便のみ壬生川駅、小松総合支所前を経由する。
大阪南港発の便が接続
東予港 - 小松総合支所前・(伊予)西条駅前・住友病院前・新居浜駅前
上記のバスは、いずれもせとうちバスが運行する。
下り便下船客用のみ運行される無料連絡バスは次の通り。
東予港 → 壬生川駅(ノンストップ)(船内休憩終了時刻である7:00発)
東予港 → 今治駅(ノンストップ)(6:20頃に出発) 公式サイトには明記されていないが、せとうちバスによる路線バス扱いの便の他にも多客時を中心にオレンジフェリーの自社バスによる東予港発今治駅前行きの直行バスも運行される。運行される場合は東予港のターミナル出口で係員が案内を行っている。利用客が集まり次第出発する。
この他伊予鉄南予バスが運行する松山方面との有料連絡バスがある。
JR松山駅前・松山市駅・松山インター口バス停 - 東予港 上り便乗船客、下り便下船客用の1往復運行、予約制。 下り便のみ道後温泉駅前を経由する。