亀の井バス
由布院駅前バスセンター - 大分空港(大分交通と共同運行) 2022年4月15日から運行再開
本社に併設される。自社のバスが所属。また西日本鉄道別府第二自動車営業所として西日本鉄道の車両の運行管理・整備も行う。西日本鉄道が同社に管理委託している車両は○亀と表記。
別府地獄めぐりコースは別府市内に多数存在する様々な奇観を呈する自然湧出の源泉「地獄」を観光名所化した別府温泉の定番観光コース。名勝「別府の地獄」に選定されているものも含め、7つの地獄を周遊する。
32:別府駅西口 - 霊泉寺 - 堀田 - ロープウェイ - 鳥居 - 志高湖畔 - 神楽女 - 枝郷
33:別府駅西口 - 霊泉寺 - 堀田 - ロープウェイ - 鳥居 - 城島 - 柚の木
34:別府駅西口 - 霊泉寺 - 堀田 - ロープウェイ - 鳥居 - 志高湖畔 - 椿 - 堺
大分駅-別府・湯布院線(急行)
38:大分駅 - (急行) - 別府駅 - 別府北浜 - 横断道路 - 鉄輪 - ロープウェイ - 鳥居 - 城島高原パーク - 由布院駅前バスセンター 現在の観光快速ゆふりんの元となった路線である。
47:由布院駅前バスセンター - 湯布院営業所 - 空想の森入口 - 塚原 - 川向 2007年1月4日休止。由布市コミュニティバスへ転換。