病原性遺伝子島
移動性遺伝子エレメントの1種であるPAIは10〜200 kbであり、微生物の病原性に寄与する遺伝子をコードする。PAIは1つ以上の病原性因子を保有する。例えば、アドヘシン、分泌装置(III型分泌装置など)、毒素、インベイシン、モジュリン、エフェクター、スーパー抗原、鉄取り込み系、o-抗原合成、血清耐性、免疫グロブリンAプロテアーゼ、アポトーシス、莢膜合成、A. tumefaciensの場合は植物腫瘍形成などがある。
PAIの調節にはいくつかのパターンがある。第1に、PAI自体に病原性遺伝子を制御する遺伝子が内包されている。第2に、病原性遺伝子がPAIの外に存在し、その制御遺伝子がPAIにあることである。第3に、PAIの外側に調節遺伝子があり、PAI内の病原性遺伝子を調節することもある。典型的なPAI内調節遺伝子には、AraC様タンパク質や2成分応答調節因子がある。
PAIは欠失あるいは転移の影響を受けやすいので、不安定なDNA領域とみなすことができる。直接反復、挿入配列、並びにより高い頻度での欠失および転移を引き起こすtRNAとの会合を伴うPAIの構造に起因していると考えられている。ゲノムに挿入されていたPAIを欠失することは、tRNAの破壊を招き、続いて細胞の代謝に影響を及ぼすことがある。