日本の車両基地一覧
尼崎工場・尼崎車庫(兵庫県尼崎市、尼崎駅東)
石屋川車庫(兵庫県神戸市東灘区、石屋川駅西)
秋田臨海鉄道(日本貨物鉄道のグループ会社であるが、便宜上ここに表記)
秋田港機関区(秋田県秋田市、秋田港駅構内)
寝屋川車両工場(大阪府寝屋川市、萱島駅 - 寝屋川市駅間)
寝屋川車庫(大阪府寝屋川市、萱島駅 - 寝屋川市駅間)
淀車庫(京都府京都市伏見区、石清水八幡宮駅 - 淀駅間)
四宮車庫(京都府京都市山科区、四宮駅構内)
錦織車庫(滋賀県大津市、近江神宮前駅北)
青い森鉄道
運輸管理所(青森県青森市、青森信号場構内)
IGRいわて銀河鉄道
運輸管理所(岩手県盛岡市、JR東日本盛岡車両センター隣接)
三陸鉄道
運行本部(岩手県宮古市、宮古駅構内)
運行本部久慈派出所(岩手県久慈市、久慈駅構内)
運行本部大船渡派出所(岩手県大船渡市、盛駅構内)
秋田内陸縦貫鉄道
阿仁合運転区(秋田県北秋田市、阿仁合駅構内)
由利高原鉄道
矢島運転車両基地(秋田県由利本荘市、矢島駅構内)
山形鉄道
荒砥運転所(山形県西置賜郡白鷹町、荒砥駅構内)
阿武隈急行
梁川車両基地(福島県伊達市、梁川駅 - 新田駅間東側)
会津鉄道
会津田島車両基地(福島県南会津郡南会津町、会津田島駅構内)
筑紫車両基地(福岡県筑紫野市、筑紫駅南東)
柳川車両基地(福岡県柳川市、西鉄柳川駅 - 徳益駅間東側)
多々良車両基地(福岡県福岡市東区、貝塚駅北側)
※は、過去(1987年〈昭和62年〉4月1日以降)車両配置があり、2022年(令和4年)4月1日現在で、車両無配置で留置などを行っている車両基地
北海道支社 五稜郭機関区〈五〉:北海道函館市(五稜郭駅北) 苗穂車両所:北海道札幌市東区(苗穂駅構内) 輪西車両所:北海道室蘭市(東室蘭駅 - 輪西駅間)
東北支社 仙台総合鉄道部〈仙貨〉(旧・仙台機関区〈仙貨〉←旧・長町機関区〈長〉):宮城県仙台市宮城野区(東仙台信号場構内) 青森総合鉄道部:青森県青森市(青い森鉄道青森信号所内) ※盛岡総合鉄道部(旧・盛岡機関区〈盛〉):岩手県盛岡市(盛岡貨物ターミナル駅構内) 郡山車両所:福島県郡山市(JR東日本郡山総合車両センター内)