馬橋駅
島式ホーム1面2線を持つ地上駅(2番線は錆取り目的や、新車搬入等で1番線が使えない時に使う臨時ホーム)。ホーム上に自動券売機・改札口・駅事務室(券売・出札窓口)・待合室(改札内)があり、流山方のホーム先にトイレがある。なお、流山線ではどの駅でも改札が省略される。東京駅から最も近いICカード非対応駅である。また、階段を使わないとホームにいけないため、本駅からは車椅子や、足の不自由な人は利用できない(流鉄の駅では、小金城趾駅も階段のみでしか入れない)。
発車ベルは東京近郊の鉄道としては数少ない「ジリジリ」と鳴る電磁タイプを使用している。装置は流山線入口付近にある。音量が大きい。
待合室内には、かつて総武流山電鉄→流鉄時代に活躍していた車両の写真が飾られている。また、幸谷寄りには流山市の観光案内図が設置されている。
1898年(明治31年)8月6日:日本鉄道土浦線の駅が開業。
1906年(明治39年)11月1日:買収により国有化される。
1909年(明治42年)10月12日:線路名称制定により常磐線の所属となる。
1916年(大正5年)3月14日:流山線開業。
1949年(昭和24年)6月1日:日本国有鉄道発足。
1967年(昭和42年)10月1日:日立製作所専用線開設。
1970年(昭和45年)8月25日:橋上駅舎化。
1971年(昭和46年) 4月20日:国鉄線綾瀬 - 我孫子間複々線化に伴い、貨物扱いを廃止(北松戸駅に移転)。 5月:国鉄・流鉄共同使用を解消(改札分離)
1985年(昭和60年)3月14日:国鉄の荷物扱い廃止。
1986年(昭和61年)11月1日:国鉄の貨物の取り扱いを廃止。
1987年(昭和62年)4月1日:国鉄分割民営化に伴い、国鉄の駅は東日本旅客鉄道(JR東日本)の駅となる。
1992年(平成4年)6月4日:JR東日本で自動改札機の使用を開始する。
2001年(平成13年)11月18日:JR東日本でICカード「Suica」の利用が可能となる。
2006年(平成18年)5月:みどりの窓口が廃止され、指定席券売機を設置。
2021年(令和3年)7月4日:JR東日本でスマートホームドアの使用を開始。常磐線でのホームドア導入は当駅が初である。