エンテロバクター・クロアカ
クラスC β-ラクタマーゼのセファロスポリナーゼの産生遺伝子を染色体に有する。この遺伝子は微生物にβ-ラクタム系抗生物質への耐性を与える。β-ラクタマーゼはin vitroで検出することができず、感染症の治療を困難にする要因となる。2004年、従来知られているものとは別の染色体上AmpC型β-ラクタマーゼ遺伝子が発見された。この新遺伝子はKlebsiella pneumoniaeのプラスミド由来MIR-1型β-ラクタマーゼ遺伝子と配列類似性が高く、プラスミドを介してエンテロバクター・クロアカが獲得したことが示唆される。また、この細菌はフルオロキノロン類に対する耐性も持つ。エンテロバクター・クロアカ以外のエンテロバクター属の多くも同様の多剤耐性を有する。
エンテロバクター・クロアカエはAcrR遺伝子の部分配列およびAcrA遺伝子とAcrB遺伝子の完全配列(AcrAB遺伝子)を有しており、薬剤の耐性に利用している。AcrAは膜融合タンパク質であり、多剤等異物の排出ポンプである。AcrBは内膜貫通型のトランスポーターであり、こちらも多剤の排出を行う。AcrR遺伝子はAcrA遺伝子のリプレッサーとして作用する。AcrAB遺伝子の発現は転写制御因子のRamA遺伝子によって制御されており、この遺伝子の制御が、チゲサイクリンに対する感受性の低下に関与する。
エンテロバクター・クロアカは中温性であり、最適生育温度は37°Cである。陸上および水圏環境(水中、泥中、土壌、食品、温水処理槽)において普遍的に存在する。ヒトおよび動物一般において腸内の菌叢にみられる共生微生物であり、植物や昆虫において重要な病原菌である。多様な生息環境は遺伝形質の多様性を反映している。
エンテロバクター・クロアカの薬剤耐性株は牛肉、食肉加工工場、医療施設からも検出される。2007年の調査で単離された菌株からはampC、ampDおよびampR遺伝子が見いだされた。ampC遺伝子はβ-ラクタム系抗生物質に、ampR遺伝子はアンピシリンやセファロチン、アモキシシリンに対する耐性を与える。また、ampCは農場や加工工場でのβ-ラクタマーゼ遺伝子の拡散に寄与する。
エンテロバクター・クロアカはグラム陰性で通性嫌気性の桿菌であり、周毛性で周鞭毛を持つ。細胞の大きさは0.3-0.6×0.8-2.0 μm。pH4から10までの広い範囲で生育が可能である。30°Cで寒天培地またはブイヨン培地が、あるいは35°Cでトリプチケースソイブイヨン培地が適切な生育条件である。各種試験の判定基準は以下の通りである。
エンテロバクター・クロアカの生化学的性状は同属のE. asburiaeと非常に近似している。遺伝子ではなく生化学反応や表現型による同定方法は判別不能か誤認定する。