東トルキスタン共和国
1944年から1946年にかけて存在した第2次の東トルキスタン共和国は、第二次世界大戦期にソ連の支持を得て高揚した東トルキスタン独立運動によって、新疆省の北部のグルジャに樹立された政権である。中華人民共和国では、中国革命の一環として行われた反国民政府運動のひとつと見なされている。
彼らの政治運動は、当時10区あった新疆省の行政監察区のうち、第2(イリ)、第5(タルバガタイ)、第6(アルタイ)の三地区を支配したことから「三区革命」と呼ばれている。実際には中国からの独立政権を目指していた。
第2次東トルキスタン共和国の実効支配域
東トルキスタン共和国国旗
東トルキスタン共和国軍旗
1944年にイリ渓谷のグルジャ(伊寧市)で蜂起した独立軍が同年11月12日に建国した。反乱軍にはソ連軍(赤軍)が、装備、要員面で協力しており、12月までにイリ地区の全域が反乱軍の手に落ちた。
しかし、世界ウイグル会議の姿勢は独立の放棄だと考える亡命ウイグル人グループ、またトルコ・ヨーロッパ系初期ウイグル独立運動を指揮したアルプテキン派に含まれない亡命ウイグル人グループは2004年9月14日にアメリカワシントンD.C.で、世界ウイグル会議とは別の組織の東トルキスタン共和国亡命政府本部を設立した。初代大統領としてエフメット・イゲムベルディ(Ehmet Igemberdi)が選出された。
東トルキスタン共和国亡命政府は、中国を帝国主義、侵略者として、大量虐殺や人道に対する罪などの観点から批判するとともに、世界ウイグル会議を「独立運動を妨げ、中華帝国の統一維持に貢献するものであり、中華帝国の支配下に置かれた奴隷であることを目ざす」ものとして批判している。
同亡命政府は、政治的に東トルキスタンとされる地域、すなわち現在の中華人民共和国の植民地になっているウイグル自治区に相当する地域を東トルキスタン共和国の正統な領土であると主張し、似た立場に置かれたチベットや台湾の独立にも賛成を表明している。
1992年、トルコの退役将校であるリザ・ベキン(Mehmet Riza Bekin Pasha)らを中心に、トルコのイスタンブールで「東トルキスタン民族会議が開催された。1996年には、学生運動家のドルクン・エイサ(ウイグル語版、英語版)らを中心に、ドイツのミュンヘンに「世界ウイグル青年会議」が設立された。
2004年4月16日には、「東トルキスタン民族会議」と「世界ウイグル青年会議」が合流し、「平和的・非暴力的・民主的」な反対運動を行う世界ウイグル会議として再編された。初代議長は、ラジオ・フリー・ヨーロッパ元職員エルキン・アルプテキン(元新疆省幹部のエイサ・ユスプ・アルプテキンの子)が選出され、2006年11月には、ノーベル平和賞候補でもあるラビア・カーディルを第2代議長に選出した。
2012年5月18日には、ラビア・カーディル代表から東京都による尖閣諸島購入の資金が寄贈された。また、中国政府がどこの土地であっても「歴史的に我が国の領土」と主張していることを非難している。