ヤルカンド・ハン国
マフムード(クルチ)(在位:1632年/33年 - 1635年/36年) - アフマドの兄弟
アフマド(プラド)(第二治世、在位:1635年/36年 - 1638年/39年)
アブドゥッラー(在位:1638年/39年 - 1667年/68年) - シュジャーウッディーン・アフマドとクライシュの従兄弟
ヨルバルス(在位:1667年/68年 - 1669年/70年) - アブドゥッラーの子
アブドゥッラティーフ(在位:1669年/70年) - ヨルバルスの子
イスマーイール(在位:1670年 - 1680年) - アブドゥッラーの兄弟
アブドゥッラシード・ハン2世(在位:1680年 - 1682年) - アブドゥッラーとイスマーイールの甥
ムハンマド・アミーン(在位:? - 1692年) - アブドゥッラシード2世の兄弟
アクバシュ・ハーン(ムハンマド・ムミーン)(在位:1692年 - 1700年)
スルタン・アフマド (在位:1700年 - 1700年以降)- アクバシュ・ハーンの子
アブドゥル・カリームの治世に、スーフィーのアフマド・カーサーニー(マフドゥーミ・アーザム)の子のホージャ・イスハークがカシュガルを訪れた。アブドゥル・カリームの帰依を受けられなかったイスハークはホータン、アクス、クチャを歴訪し、アブドゥル・カリームの弟のムハンマドに道統を授けてサマルカンドに帰還した。
1591年にアブドゥル・カリームが没した後、ムハンマドがハンの位に就いた。ムハンマドは東トルキスタンにおけるイスハークの筆頭弟子でもあり、イスハークの遺児であるホージャ・ムハンマド・ヤフヤーはカシュガルのムハンマドを頼り、彼を通して父の道統を継承した。ヤフヤーはムハンマドを含む7人のハンの師父となり、ハン位の継承問題にも介入した。主要なオアシス地帯を支配する王族のハン位を巡る争いはヤフヤーの政治への介入を容易にし、7人のハンの中には彼に毒殺された者もいた。
ヤフヤーの従弟のムハンマド・ユースフもカシュガルを訪れたが、ヤフヤーと対立したために東の粛州・西寧で布教活動を行った。イスハークの子孫であるイスハーキーヤ(黒山党)とムハンマド・ユースフの子ヒダーヤット・アッラー(ホージャ・アファーク)の子孫であるアーファーキーヤ(白山党)はヤルカンド・ハン国の主導権を巡って争い、ヒダーヤットも父と同様に明で布教を行った。
1636年にアブー・アル=アフマド・ハージ・ハンは清に入貢し、東トルキスタンの諸勢力と清との間の朝貢貿易が成立する。