但馬国分寺
伊能忠敬の『測量日記』では、文化11年(1814年)時点で伽藍の礎石3個が存在する旨が記載されている。現在は塔礎石2個が僧寺跡に、南大門礎石1個が但馬国分寺境内に残るほか、原位置不詳の礎石6個(または5個)が周辺各地に伝世されている。
そのほかの遺構としては、金堂の東方において回廊(南北70メートル以上か)を有する建物が見つかっている。主要伽藍以外に回廊が見つかったのは全国の国分寺跡で初めての例となり、「院」の墨書銘土器の出土から大衆院跡と推定する説がある。また東南隅では、寺域を区画する築地塀・雨落溝の跡が見つかっている。この溝からは木簡36点が出土したが、この木簡出土も全国の国分寺跡で初めての例であった。
以上に加えて、寺域内では井戸4基が認められている。うち1つは一辺1.7メートル・深さ2.7メートルと大規模なもので、その部材(ヒノキ材)の1つの伐採年は年輪年代法により763年と判明している。この井戸からは瓦・土器・釣瓶・鑰・木簡など多数の出土品が検出されている。
金堂跡
塔跡の礎石2個(奥が心礎)
国分寺境内に残る南大門礎石
僧寺跡出土瓦但馬国府・国分寺館展示。