挿入配列
個別の挿入配列はISn(nは数字)という形式にしたがって命名される(例: IS1、IS2、IS3、IS10、IS50、IS911、IS26など)。しかしながら、これが使用されている唯一の命名体系ではない。挿入配列は大抵原核生物ゲノムとの関連で議論されるものの、Tc1/mariner転移因子のファミリーに属する任意の真核生物DNA配列は挿入配列であると見なすことができる。
自律的に存在することに加えて、挿入配列は複合トランスポゾン(英語版)の一部としても存在しうる。複合トランスポゾン中で、2つの挿入配列は抗生物質耐性遺伝子(例: Tn10(英語版)、Tn5)といった1つ以上のアクセサリー遺伝子の側面に位置する。にもかかわらず、端に挿入配列を持たないユニットトランスポゾンと呼ばれる別の種類のトランスポゾンも存在する(例: Tn7)。
複合トランスポゾンはレゾルバーゼのために側面に位置している挿入配列に頼らない。レゾルバーゼはtnsゲノムの一部であり、側面に位置する逆向き反復配列の位置で切断する。
IS因子の転移頻度は、培養物の増殖期や培地組成、酸素圧、増殖スケール、標的部位の構造形態(例えば湾曲、任意のモチーフの存在、DNA組成)を組む複数のパラメータに左右される 。