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空港到着後はチェックインカウンターや自動チェックイン機に立ち寄る必要は基本的になく、手荷物を預けない場合はそのまま保安検査場に向かう。手荷物を預ける場合は手荷物カウンターでAMC-Edy類かQRコードを専用端末に読み取らせて手荷物を預け、引替証(→バゲージクレーム)を受領した後に保安検査場に向かう。
保安検査場では従来の搭乗券を保安員に提示する代わりに、専用の端末にAMC-Edy類またはQRコードをタッチまたは読み取らせて電子航空券データと照会し、便名や座席番号、搭乗口や搭乗グループなどがレシート状に印刷された「保安検査証」を受け取る。空港によっては、混雑防止等の理由により保安検査場入口より前に照会端末が設置され、先に照会を行った上で保安検査場に進ませる形式を採用している場合もある。搭乗口変更や遅延による出発時刻変更・使用機材変更時には、これらの事態発生以降に通過すると新しい搭乗口・出発時刻・座席番号が保安検査証で案内される。
搭乗口では自動改札機に再び同じカードなどをタッチして搭乗する。この際、便名や座席番号などがレシート状に印刷された「ご搭乗案内」を受け取る。
乗り継ぎがある場合は空港によってチェックインの取扱が異なる為、標識や地上係員の案内に従う必要がある。