二ツ井駅
単式ホーム1面1線と島式ホーム1面2線、計2面3線のホームを持つ地上駅。互いのホームは跨線橋で連絡している。木造駅舎を有する。
東能代駅管理・能代市による簡易委託駅で、定期券・特急券も発売する。駅員の業務は出札のみで改札は行わないためワンマンカーは終日無人駅扱いとなる。簡易委託化までは自動券売機も設置されていた。乗車駅証明書発行機は簡易委託化後もそのまま残されている。
近くにあった二ツ井高校が県内初の定時制分校に転換され通学利用者の減少が予想されたことなどから、当初はJR東日本管内の現役特急停車駅では珍しい完全無人化が検討されていたが、市の協力のもと引き続き駅員が配置されることになった。