コルポデラ目
アルベオラータのうち、アピコンプレックス門に対して姉妹群である。アピコンプレックス門に含めて扱う場合もある。コルポデラ目の内部は系統関係に応じて以下の4科に分類している。
ビトレラ科 Vitrellaceae Oborník & Lukeš, 2012 光合成性で多層の細胞壁をまとった不動性の細胞。多数の自生胞子(autospore)を含む自生胞子嚢(autosporangium)や、2本の不等長の鞭毛を持つ遊走子(zoospore)多数を含む遊走子嚢(zoosporangium)を形成する。Vitrella brassicaformis1属1種のみが知られている。
コルポデラ科 Colpodellaceae Adl et al., 2019 従属栄養性でColpodella, Chilovora, Voromonasの3属が知られている。
クロメラ科 Chromeraceae Oborník & Lukeš, 2012 光合成性で、不動性の球形の細胞が二分裂で増殖する。2本の不等長の鞭毛を持つ遊走子が生じる。Chromera velia1属1種のみが知られている。
アルファモナス科 Alphamonaceae Adl et al., 2019 従属栄養性でAlphamonas属のみが知られている。
従属栄養性のものはコルポデラ類(colpodellids)、光合成性のものはクロメラ類(chromerids)とよばれているが、これは系統を反映していない。またコルポデラ目には自由生活性の生物だけでなく、Piridium属のようにグレガリナ類に似た(広義の)共生体も含まれている。