横浜シーサイドライン金沢シーサイドライン
早朝・深夜 ... 10 - 15分間隔 朝 ... 7分間隔 日中 ... 10分間隔
新杉田駅 - 金沢八景駅間の列車のほか、朝と夜に車両基地最寄りの並木中央駅発着列車がある。毎年大晦日から元日にかけては、横浜・八景島シーパラダイスへの観光客や称名寺への初詣客の輸送のため、終夜運転を行う(2011年度は23時00分から1時30分まで10分間隔運転・1時30分から5時00分まで30分間隔運転)。また、ゴールデンウィーク期間中は特別ダイヤが適用され、本数が増える。
車内信号閉塞方式の自動列車制御装置(ATC)と、自動列車運転装置(ATO)による無人運転を行っており、運転士と車掌は乗務していない。開業当初は運転士が乗務するワンマン運転が行われており、車両前面(運転台付近)に「ワンマン」の表示と鉄腕アトムのキャラクターステッカーが貼られていた。また、開業告知のポスターでは「鉄腕アトムのシーサイドライン」などと記されていた。その後、1992年(平成4年)より一部列車において自動運転が開始され、1994年(平成6年)から訓練車、試運転車を除く全列車が無人運転となっている。