便微生物移植
安全性が確認された便を希釈して投与する方法と、目的とする腸内細菌を純粋培養して投与する方法がある。経口直接投与は行わない。大腸内視鏡を使用して鉗子孔から消化管に散布したり、カプセルとして内服したり、浣腸用具を使用して移植が行われる。また、移植効果を高めるために、予め抗菌剤により腸内細菌を減少させておく「抗菌薬併用糞便移植」も行われる事もある。投与回数は1回のみの場合や、継続的に4週間実施するなど様々である。