モプスエスティアのテオドロス
これに対しローマ帝国では、アレクサンドリア派の流れをくむ非カルケドン派を優遇するゼノ帝やアナスタシウス帝の統治(エデッサからニシビスへの神学校の移動は前者の治世に起ったと考えられている)の後、カルケドン派のユスティニアヌス1世が即位した。
このころ非カルケドン派論者、例えばアンティオキアのセウェロスは、タルソスのディオドロスやモプスエスティアのテオドロス、キュロスのテオドレトスなどアンティオキア派の教理をネストリオス派異端として激しく攻撃していた(その考え方ではカルケドン公会議も「ネストリオス派」に染まっているため異端とされる)。
ユスティニアヌスは非カルケドン派を取り込もうと考え、第2コンスタンティノポリス公会議(553年)でカルケドン信条を正統であるとしつつも、モプスエスティアのテオドロスとその全著作、キュロスのテオドレトスの『キュリロスのネストリオスに対する十二異端宣告に対する駁論』、エデッサのヒーバー(イーバス)の『マリ宛書簡』に対する異端宣告を下させた(後者二人は著作の一部のみだが、テオドロスは本人も含めて異端とされた)。