新選組隊内において粛清された隊士
殿内義雄、家里次郎 - 主導権をにぎるため粛清。
新見錦 - 狼藉を詰められた末に切腹。ただし、脱隊の後預け先の長州で腹を切ったという説もある。
田中伊織 - 近藤の意に沿わない動きをしたため、彼の手により暗殺されたと言われる。
芹沢鴨、平山五郎 - 度重なる乱暴狼藉、酒乱のため寝込みを襲い暗殺。
野口健司 - 何らかの理由でとがめられ切腹(詳細不詳)。
平間重助 - 切腹こそ免れたが、立場上居場所がなくなり逐電。
佐々木愛次郎、佐伯又三郎 - 詳細不明。佐々木は巻き込まれ。芹沢に暗殺されたとの説がある。
荒木田左馬之助、御倉伊勢武、楠小十郎 - 斬殺。長州の間者として斬殺された。暗殺の罪をかぶせられたという説もある。
山南敬助 - 脱走の罪で切腹。
谷三十郎 - 暗殺説がある(病死説もあり確定していない)。