B&Sみやざき
予約発券は高速バスネット、JR九州のみどりの窓口でも取り扱う一方で、他の九州管内の高速バスのように「@バスで(ハイウェイバスドットコム)」や、九州産交バスや宮崎交通などの高速バス予約センターでの予約発券などは行えない点に注意が必要である(ただし、産交バス沿線の営業所(八代・人吉)窓口に限りバスのみ利用分の予約発券は可能)。高速バスネットの構築に関わったJRバス関東・JR東海バス・西日本JRバスが一切関わらない路線が同システムに参加するのは広島 - 高松線に次いで2例目であるが、広島 - 高松線が2013年3月に同システムから撤退したため、現在では通年運行する路線としては唯一となっている。概ね25%の割引となる新幹線と高速バスを組み合わせた割引切符「B&Sみやざき2枚きっぷ」を販売していたが、2022年3月31日限りで発売を終了した。このほか、SUNQパスも南部九州版・全九州+下関版のみ使用可能。2013年5月21日より2015年3月31日までの期間限定で、乗車日の3日前までに購入すると往復運賃が10000円になる「B&Sみやざき早特往復きっぷ」も販売していた。現在は、バス+新幹線の切符としては、B&Sみやざきネットきっぷ、B&Sみやざきネット早特7/早特14(「JR九州インターネット列車予約」で購入できるネット予約限定のきっぷであり、直接駅の窓口では購入できない。乗車の前に駅窓口できっぷを受け取ってから利用する。)を発売している。、
この路線の設定にあたっては、新幹線と高速バスの相乗効果を狙うJR九州グループと、「フェニックス号」の運行事業者のうち西鉄グループとの対立を招いたとされ、結果的に本路線の運行開始1ヶ月後の4月12日を以てJR九州バスが「フェニックス号」の運行から離脱(代替としてJR九州バス単独運行による高速バス「たいよう」の運行を開始)という事態を招く遠因になったと報じられている。
B&Sみやざき(ビーアンドエスみやざき)は、熊本県八代市の新八代駅と宮崎県宮崎市の宮崎駅とを結ぶ高速バスである。2011年3月12日より運行開始。