ゴジラ×メカゴジラ
本編は2002年6月3日にクランクイン、8月7日にクランクアップした。
特生自衛隊本部の外観および館山での戦車走行シーンは、陸上自衛隊富士学校で撮影が行われた。戦車が公道を走ることは自衛隊の許可が降りなかったため、敷地内に信号機やガードレールなどを持ち込んで市街地を表現している。コンビニも同校の購買部を装飾しており、大道具の自動販売機で本物の自衛隊員が誤って購入してしそうになったこともあったという。手塚は、プロデューサーや自衛隊から許可が降りなければ台風のシーンを諦めるつもりでいたが許可され、自衛隊員も雨に濡れる撮影に臨んでいる。ゴジラの骨を積み込むシーンは、海上自衛隊横須賀基地で撮影された。
そのほかにも本作品ではロケセットを多用している。首相官邸の外観は旧群馬県庁舎を使用しており、首相の執務室や国会議事堂の階段も同施設内で撮影している。科学技術庁の外観はソニー厚木テクノロジーセンターを用いており、特生自衛隊本部内の喫茶室も同社の設備を用いている。自衛隊資料科は神奈川県立図書館で、査問委員会のシーンも同館で撮影している。葉山(兄)の葬儀会場は東京薬科大学の体育館を用いており、実際の自衛隊葬儀のビデオを参考としているが、雰囲気のみを活かした独自のものとなっている。湯原の大学の研究室には、水産総合研究センターの研究室を使用しており、三葉虫の水槽以外は室内のものをそのまま用いている。湯原のマンションは都内のスタジオで撮影された。
DVDは2003年7月21日発売。 2005年4月22日発売の「GODZILLA FINAL BOX」に収録されている。 2014年5月14日には「ゴジラ60周年記念版」として期間限定の廉価版が発売。 2016年6月15日に東宝DVD名作セレクションで発売。
Blu-ray Discは2014年7月16日発売。
家城茜:釈由美子
湯原徳光|BOMG32:宅麻伸
富樫:高杉亘
葉山:友井雄亮
一柳:中原丈雄
菱沼:加納幸和
湯原沙羅:小野寺華那
土橋:上田耕一
赤松伸治:白井晃
菅野吾郎:六平直政
葉山(兄):森末慎二
山田薫:萩尾みどり
関根:水野純一
テレビ司会者:大城英司
しらさぎパイロット:海老原智彦、青木淳
分析部担当官B:坂田雅彦
航空自衛隊幹部:飯山弘章
自衛隊員:三浦武蔵
特自分析中隊本部担当官A:橋本和美
館山のテレビレポーター:佐藤陽子
NWKアナウンサー:井出勝己
90式メーサー殺獣光線車副搭乗員:山本剣
菱沼の部下:西岡生博
沙羅のクラスメイト:永井杏、苫篠ひとみ、高橋優希、西原信裕
TVアシスタント:松田瑞希
機龍隊員:中江寿、三宅法仁
釈由美子スタント:野川瑞穂
プレスセンターのマスコミ:ポール・カミンスキ、マリア・テレサ・ガウ
柘植真智子:水野久美
TVアナ(房総半島のアナウンサー、館山港のTVアナウンサー):吹越満
特自の幹部B:渡辺哲
特自の幹部A:江藤潤
警備の隊員(防衛技術研究所警備隊員):田中実
湯原の妻:北原佐和子
女学生A(湯原研究室の女学生):久遠さやか
避難民(避難する人、車で避難する男、避難車の運転手):杉作J太郎
家を壊される男:柳沢慎吾
避難する患者:藤山直美
コメンテーター(酉澤安施):中村嘉葎雄
看護婦(辻森、辻森桐子):田中美里
宮川:永島敏行
八景島の自衛隊員(工藤):谷原章介
コンビニの店員:村田雄浩
松井秀喜:松井秀喜(本人役)
五十嵐隼人:中尾彬