佐久医療センター
救命救急センター
脳卒中・循環器病センター
がん診療センター
周産期母子医療センター
高機能診断センター
設備の老朽化、陳腐化が進んだ佐久総合病院を再構築するにあたり、高度医療、先端医療を担う基幹高度医療センターを新設して、従来の本院は健康管理、リハビリ、精神医療、福祉と一体化した医療を担う地域医療センターとして改築することとなった。その中で基幹高度医療センターとして新設されたのが本センターである。
救命救急センター(20床)が本院から移転しており、集中治療室 (GICU) 16床、高度治療室 (HCU) 20床、新生児集中治療室 (NICU) 6床、新生児治療回復室 (GCU) 12床など急性期患者、高リスク患者に対応する設備を有する。長野県ドクターヘリの信州ドクターヘリ佐久についても基地病院を本センターに移行している。