セントラル・リーグ
その後1951年から1959年にかけて、水原茂監督率いる読売ジャイアンツの第2次黄金期だった。日本シリーズでも1951年から1953年、1955年において、鶴岡一人監督率いる南海ホークスを圧倒し、4度の日本一を達成した。しかし、1956年から1958年ではかつて巨人を指揮した三原脩監督率いる西鉄ライオンズに3年連続で敗退。さらに1959年でも杉浦忠擁する南海ホークスに0勝4敗と敗退した。なお、日本シリーズでストレートでの4連勝を決めたのは南海が史上初だった。
1951年1月10日に開催が予定されたセ・リーグ代表者会議を前に、経営危機に直面していた広島と西日本を整理する構想が浮上したものの、当日の会議では問題を先送りされたが、結局シーズン開始直前に西日本パイレーツがパ・リーグの西鉄クリッパース(現:埼玉西武ライオンズ)と合併し脱退。1952年シーズン終了後には大洋ホエールズと松竹ロビンスが合併して「大洋松竹ロビンス」を結成し、6球団になる。
初代:安田庄司(1949年 - 1951年/読売新聞副社長兼編集主幹)
2代目:松島鹿夫(1951年 - 1952年/元外務事務次官)
3代目:鈴木龍二(1952年 - 1984年/元日本野球連盟会長)
4代目:川島廣守(1984年 - 1998年/元内閣官房副長官)
5代目:高原須美子(1998年 - 2000年/経済評論家、元経済企画庁長官)
6代目:豊蔵一(2001年 - 2008年/元建設事務次官、元住宅・都市整備公団総裁)【リーグ会長職廃止により退任】
2006年・2008年にもシーズン2位ながら80勝を突破した。
しかし、横浜ベイスターズ(現:横浜DeNAベイスターズ)は森祇晶・山下大輔・牛島和彦・大矢明彦(第2期)・田代富雄(代行)・尾花高夫と政権を継いだが、2001年末に筆頭株主がマルハからTBSに交代して以降は、2002年から2011年にかけて最下位が8度という暗黒時代に突入し、結果を残せなかった。(なお、2011年末から筆頭株主はDeNAに変更。)
また、広島東洋カープは2002年以降は5位が指定席であり、1998年から2012年にかけての15シーズンでは5位が11度で、全てBクラスであった。その一方で、長年の本拠地だった広島市民球場の老朽化もあり、2009年に新球場への移転に成功するなど、大きなターニングポイントを迎えた。
インターネット社会の到来による娯楽・嗜好の多様化により、プロ野球のTV中継の視聴率が大きく低下した時期でもあり、プロ野球TV中継の主体は、地上波からBS・CSに移行した。
2005年からは育成選手制度がスタートした。セ・パ交流戦(2005年より導入)、クライマックスシリーズ(2007年より導入)も参照。
2009年1月1日の改定日本プロフェッショナル野球協約発効に伴い、連盟事務局と直下の審判部・記録部はコミッショナー事務局、パシフィック・リーグ事務局と統合され、コミッショナー直属の『セントラル・リーグ運営部』『審判部』『記録部』となり、リーグ会長職は廃止された。
中日の場合は親会社である中日新聞社がブロック紙という台所事情により、西日本地域では広島、横浜DeNA、ヤクルトと比べてファンの分布で大きく水を開けられているが、発行地域である東海地方や北陸地方、関東地方では熱狂的なファンを抱えているという特徴をもつ。また、他都市間への移動が容易な地理的事情からビジターでの対戦カードは人気が高い。
以上のことから、対巨人戦や対阪神戦以外の一部の対戦カードにおいても人気カードになることがある(PayPayドームでのソフトバンク対広島戦、北陸地方開催での対中日戦、坊ちゃんスタジアムでの対ヤクルト戦等)。
ファンサービスとしては、広島がジェット風船を始めたのを皮切りに多くの球団が取り入れている。阪神はプロ野球では初めてチアリーディングチームを導入しており(但し、現在のタイガースガールズは2代目となっている)、2023年現在では広島を除く5球団がチアリーディングチームを持つ。過去にはセ・リーグオールスター東西対抗(1979-1999)が秋季に地方球場で行われていた。