インド・ヨーロッパ祖語の音韻
もうひとつの説は、PIEに軟口蓋音は二系列(平音と唇軟口蓋音)しかなく、口蓋化軟口蓋音はサテム諸語での独自の変化であるというものである。
サテム諸語では口蓋化軟口蓋音(*ḱ, *ǵ, *ǵh)がそれぞれの言語で多様な破擦音、もしくは歯擦音になるのと同時に両唇軟口蓋音(*kw, *gw, *gwh)と平軟口蓋音(*k, *g, *gh)が合流するが、一部の音韻論的環境で非口蓋化が発生し、ケントゥム語の写映形がサテム語に見られることをもたらす。例えば、バルト・スラヴ語派とアルバニア語派では(後者は前舌母音が続かなければ)口蓋化軟口蓋音が共鳴音の前で非口蓋化される。サテム諸語においては一般的に平軟口蓋音と両唇軟口蓋音の写映形を区別することができないが、後続母音のu音化などによって、唇音化を喪失した痕跡を持つ単語がある。ケントゥム諸語はそれに対して口蓋化軟口蓋音が平軟口蓋音と合流する一方で両唇軟口蓋音の区別が保存されている。boukólos規則(英語版)として知られる音韻法則によればサテム諸語における非口蓋化と相似しケントゥム諸語は両唇軟口蓋音が *w(もしくはその異音 *u)に隣接したときに非唇音化を見せる。
ソーン連結(英: Thorn cluster、定訳を知らない)は歯破裂音が軟口蓋音に先行する全ての連結のことである。アナトリア語派とトカラ語派以外の印欧語の語派では、ソーン連結は音位転換を経験し、多くは、歯破裂音は歯擦音化する。例えば、名詞 *dhéǵh-ōm、属格 *dhǵh-m-és の場合、ヒッタイト語に tēkan, tagnās, dagān がありトカラ語Aに tkaṃ, tkan-があるが、これらの形態はサンスクリット語 kṣā́ḥ と古典ギリシア語 khthṓn として出現する。サンスクリット語は連結 *kt が kṣ になる歯擦音化を経験する一方で、ギリシア語は音位転換のみである。
以下の事例は一部の音位転換の可能な結果を例証する。
*h2ŕ̥tḱos 「熊(bear)」> ヒッタイト語 ḫartaggas /ḫartkas/, しかしラテン語 ursus, 古代ギリシア語 árktos, サンスクリット語 ṛ́kṣas.
*dhgwhítis 「衰える、傾く、滅ぶ(decaying, decline, ruin)」> 古代ギリシア語 phthísis, サンスクリット語 kṣítis, もしかしたら ラテン語 sitis
(詳細は「喉音理論」を参照)
音素 *h1, *h2, *h3と「どれか分からない喉音(“unknown laryngeal”、定訳を知らない)」(もしくは *ə1, *ə2, *ə3, /ə/)の意味でも使われる包括記号Hはともに「喉音」を表す。
「喉音」という術語は音声学的描写としてもはや時代遅れであるが、現在でも慣用的に使用されている。
喉音音素の実際の音価は議論の余地があり、*h2 が口腔内の非常に後ろで調音される摩擦音で、*h3が後の円唇化を齎していたということが確実に言えるだけであるという慎重な説から、たとえばMeier-Brüggerの *h1 = [h], *h2 = [χ], *h3 = [ɣ] もしくは [ɣw] が「すべての場合において正確である(“are in all probability accurate”)」という確実な説にいたるまで、正確な音価に関する多彩な提案がなされてきた。ほかの一般的な確実な根拠のない *h1, *h2, *h3 の推測は、 [ʔ ʕ ʕw](例:Beekes)である。Simon(2013)はヒエログリフ・ルウィ語の *19 を表す記号が /ʔa/(/a/ と区別される)を表しており、*h1 の写映形であると主張した。これはありえるが、三つすべての喉音は最終的に声門破裂音として一部の言語でおちつく。
(詳細は「セメレーニの法則」を参照)
語末において *s または *h2 が母音+共鳴音の連続に続いたとき、その *s または *h2 が脱落して代償延長を引き起こし、先行する母音が長くなった。 *-VRs, *-VRh2 > VːR。
*ph2tér-s 「父(father)」 > *ph2tḗr > 古代ギリシア語 patḗr, サンスクリット語pitā́。
この規則は後期印欧祖語の時点ではもはや機能しておらず、類推により復元されたと考えられる例が多々ある。例えば中性名詞 -men- の単数属格形は -mḗn ではなく -mén-s と再建される。これは単数主格が共鳴音で終わる男女名詞や、中性集合名詞の主対格において形態素化が行われていたためである。他の子音で終わる名詞であっても、類推によって単数主格で長母音となったものもあるが、それらは可能な限り語尾の -s を保った。例:*pṓd-s, *dyḗw-s。