藤子・F・不二雄プロ
藤本弘没後は、藤子・F・不二雄のライフワークを引き継ぐ形で所属漫画家による『大長編ドラえもん』の連載執筆等を行った。
2004年に漫画制作を取りやめ、当時所属していた漫画制作スタッフを全て独立させた。その後は著作権管理を主な業務とするようになった。
『ドラえもん』の長編漫画、学習漫画等の執筆は、外部の漫画家によりその後も活発に行われており、「藤子・F・不二雄プロ」はその著者としてクレジットされている。
2007年に神奈川県の生田緑地内に「川崎市 藤子・F・不二雄ミュージアム」(藤子・F・不二雄作品を展示する記念館)を設置することを発表し、建物の建設およびミュージアムの運営を委託する関連会社「株式会社藤子ミュージアム」を2008年に設立、2011年9月に開館している。
上記のほか、『ドラえもん』を中心としたキャラクターグッズの製作管理も行っている。