九州旅客鉄道宮崎支社
以下は、2023年(令和5年)4月1日現在の配置車両である。
観光特急仕様車であるキハ125形を除き、日豊本線(宮崎 - 西都城間)・日南線(全線)・吉都線(全線)・肥薩線(吉松 - 隼人間)の普通列車で運用されている。
キハ40形 8000番台の10両 (8054, 8060, 8065, 8069, 8097 - 8100, 8104, 8128) が配置されている。 このうち、8097と8099の2両は日南線専用塗装車である。また、8060は保留車となっている。
キハ47形 8000番台 (8052, 8119) と9000番台 (9073, 9083) が各々2両ずつの計4両が配置されている。
キハ125形 臨時の観光特急「海幸山幸」の専用車である400番台の2両 (401, 402) が配置されている。日豊本線・日南線の宮崎 - 南郷間限定で運用されている。また、平日限定で貸切専用車両としても運用される。
構内こそ電化されているものの、検査設備が非電化のため、気動車のみの配置となっている。そのため、宮崎地区専用電車の713系はここが運用上の拠点となっており、常時配置されているものの、同様の理由で鹿児島所属であり、検査する時のみ鹿児島車両センターに入場する。なお、当センターの車両は全車がワンマン運転に対応しているほか、キハ40系は全車機関換装されている。 かつてはキハ140・147形も配置されていたが、上記のキハ40・47形(8000・9000番台車)と交換されて配置がなくなっている(該当車両は鹿児島へ転属)。