統合特殊作戦コマンド
デルタフォース、グレイフォックス(ISA部隊が当時使用していたカバーネーム)、第160特殊作戦航空連隊、DEVGRU、CIA特殊作戦要員、イギリス陸軍第22SAS連隊のAおよびG中隊、イギリス海兵隊SBSのC中隊などから編成されるタスクフォース11(別名:タスクフォース・ソード)を指揮。主にアフガニスタン南部のパキスタン国境付近で活動し、ウサーマ・ビン・ラーディンやムハンマド・オマルをはじめとするアルカーイダおよびターリバーンの指導者層に対する追跡捕獲作戦に従事。なお、タスクフォース11はイラク戦争開戦に近付くにつれて規模縮小され、タスクフォース5へと改称された後、イラクで活動していた同種のタスクフォース20と統合され、タスクフォース121となった。(⇒アメリカ同時多発テロ事件)
JSOCの直接指揮下で運用される部隊は以下のとおりである。
デルタフォース - Army Compartmented Elements : ACE
情報支援活動 - Intelligence Support Activity : ISA
連隊偵察中隊 - 75th Ranger Regiment's Regimental Reconnaissance Company : RRC
海軍特殊戦開発グループ - Development Group : DEVGRU
第24特殊戦術飛行隊 - 24th Special Tactics Squadron : 24th STS
統合通信隊 - Joint Communications Unit : JCU
統合航空隊(飛行概念部) - Joint Aviation Unit
技術情報隊 - Technical Intelligence Unit
信号諜報課
戦術支援チーム(TST)
戦闘支援グループ
航空戦術評価グループ(AVTEG)
また、場合によっては以下の部隊から支援を受ける。
第75レンジャー連隊
第160特殊作戦航空連隊
第55特殊作戦飛行隊
デルタフォース、第1および第2レンジャー大隊、タスクフォース160、SEALチーム6およびチーム4、第16特殊作戦飛行隊、戦闘航空管制チーム(CCT)などから編成される統合タスクフォース123(JTF-123)を指揮。