姉小路頼綱
白川郷の内ヶ島氏とも長年争っていたが、内ヶ島氏理を同盟者として自治を認めた。内ヶ島氏もまた、越中の佐々氏と同盟関係にあった。
最後まで戦った子息の姉小路秀綱・姉小路季綱兄弟や小島時光・小島基頼など、一族郎党の多くは討死や自害もしくは行方不明となったが、当主の頼綱と生き残った一族は朝廷からの命があり、姉小路氏という公家として、また秀吉から見た場合“織田信長の親族”として助命され、京都へ護送され幽閉された。
京都に赴いた後の幽閉中は、親族である公卿の近衛前久に庇護され、近衛家と共に娘婿の遠藤氏・遠藤慶隆と本家筋姉小路氏である娘婿の向氏・向宣政に生活を援助された。
その後、家督と居城の松倉城を息子の秀綱に譲り、自らは北方の高堂城を中心に居を移した。
織田家の北陸方面担当であった柴田勝家や越中国の佐々成政と行動を共にし、上杉氏に対抗した。越中斎藤氏である斎藤信利・斎藤信吉兄弟は本能寺の変後は上杉氏につくが、佐々成政や神保氏張に攻められ本拠の城生城を失い、義兄の姉小路頼綱を頼って飛騨に落ち延びた。その後、兄弟は頼綱の仲介により佐々成政と和睦し、佐々傘下に下った。南方の美濃国方面に対しては、織田信孝の老臣となっていた親族の斎藤利堯と連絡を取り、互いに敵対しないように努めていた。