GODZILLA ゴジラ
演 - タイ・オルソン、日本語吹替 - 丸山壮史
MONARCHに所属する科学者。
演 - 渡辺謙、日本語吹替 - 渡辺謙
特別研究機関MONARCH(モナーク)に所属する生物科学者。放射線が生物に与える影響を調査しており、フィリピンで発見された謎の巨大生物の化石と、それに寄生する蛹の謎を追っている。父が広島の原爆投下で被爆しており、劇中では触れられていないが被爆2世であることがうかがえる。
劇中では父の形見である壊れた懐中時計を見せるだけにとどまっているが、渡辺によれば、当初は父の広島での体験をステンツ提督に語るシーンが企画されており、撮影も行われていた。しかし、製作に協力していたアメリカ国防総省がこのシーンに抗議したため、最終的にカットされた。
名前は、1954年版に登場した平田昭彦演じる芹沢大助博士とゴジラシリーズの監督を務めた本多猪四郎に由来する。
ゴジラと同じく、古代ペルム紀に棲息していた巨大生物。名前は、Massive Unidentified Terrestrial Organism(未確認巨大陸生生命体)の略である。三角形の長い頭部、紅く輝く単眼、1対の脚に2対の巨大な腕と、胸部のものより小さい1対の副腕の計4対8本の肢を持つ。
放射線(放射性物質)をエネルギー源とし、核物質に卵を産む性質や、天然の原子炉といえるゴジラの体内に産卵する習性を持つ。ゴジラとは太古の昔から敵対しているが、現代ではゴジラよりも容易にエネルギー源となる核兵器や原子力発電所などが豊富に存在するため、そちらを優先して狙う。肉体はゴジラと比較すれば脆弱であるが、銃火器や戦車砲、対戦車兵器程度では傷一つ付かない。
劇中に登場するつがい2頭のうち、オスはメスよりも体が小さいが、腕の1対が翼となっており、飛行能力を有しており、メスよりも残忍な性質で人間にも攻撃を加える。メスはオスより大柄で、登場時点では腹部に卵を抱えており、四足歩行を行う。互いが遠く離れていてもエコロケーションによって交信できるほか、周辺の軍用機の電子機器や大都市を一時的に無力化させるほどの電磁パルスを体内から発生させる。