ワフー (SS-238)
4月25日、「ワフー」は5回目の哨戒で千島列島方面に向かった。5月3日に松輪島を写真偵察した後、択捉島沖に移動。翌5月4日、北緯45度52分 東経149度07分 / 北緯45.867度 東経149.117度 / 45.867; 149.117の択捉島の南東で特設水上機母艦「君川丸」(川崎汽船、6,863トン)を発見し、魚雷3本を発射して1本が命中したと判断されるが、実際には被害はなく、「君川丸」は爆雷で反撃して去っていった。3日後の5月7日、北緯40度04分 東経141度57分 / 北緯40.067度 東経141.950度 / 40.067; 141.950の地点で、海岸線沿いに航行中の輸送船と護衛艦を発見して魚雷を計6本発射し、輸送船「第五多聞丸」(八馬汽船、5,260トン)には2本のうち1本が命中したものの、護衛艦には4本とも命中しなかった。「第五多聞丸」はまもなく沈没していき、「ワフー」は三陸海岸に沿って南下していった。翌5月8日午後にも北緯39度02分 東経142度02分 / 北緯39.033度 東経142.033度 / 39.033; 142.033の地点で金龍丸型特務艦と思しき輸送船を発見し、魚雷を3本発射したが命中しなかった。目標の発見は続く。5月9日未明、北緯38度57分 東経141度49分 / 北緯38.950度 東経141.817度 / 38.950; 141.817の気仙沼湾沖でレーダーにより「9,000トン級輸送船」と「10,000トン級タンカー」がいる事を探知。
1943年1月16日、「ワフー」は3回目の哨戒でニューギニア島近海に向かった。この哨戒ではウェワクを中心とする日本軍の補給路を探索するものだったが、一つ問題があった。「ワフー」はその地域に関する情報を持っていなかったのである。しかし、乗組員の一人が安物の学習地図帳を持っており、それによってウェワクの位置を知ることができた。
1月24日未明、「ワフー」は南緯03度23分 東経143度34分 / 南緯3.383度 東経143.567度 / -3.383; 143.567のカイリル島沖で駆逐艦「春雨」を発見する。「春雨」は空母「隼鷹」基地員および第二航空戦隊要員を収容のためウェワクを出港してきた所だった。13時45分頃、「ワフー」は「春雨」の左舷後方から魚雷を3本発射したが回避された。「ワフー」の魚雷発射に気づいた「春雨」は反転し、これを見た「ワフー」は「春雨」をできるだけひきつけて魚雷を1本発射するが、これも外れる。「ワフー」はもう2本の魚雷を発射し、うち1本が「春雨」の一番砲直下付近に命中した。「春雨」は手痛い損害を受けたものの、応急修理を行って沈没は免れた。モートン艦長は部下に「日本の駆逐艦は船体が二つに折れた」と言ったと乗組員のジョン・クラビーは記している。しかしこの発言は間違い、もしくは嘘で、「春雨」はのちに日本に帰還し、本格的修理後に復帰した。
翌日、「ワフー」は哨区をパラオ海域に移動させる。1月26日明け方、南緯01度55分 東経139度14分 / 南緯1.917度 東経139.233度 / -1.917; 139.233の地点で2隻の輸送船を発見する。約2時間後、先頭の7,000トン級輸送船に対して魚雷を2本発射し、2本とも命中させて7,000トン級輸送船を撃沈する。
過去3度の日本海への潜水艦侵入の報を受け、しかも「崑崙丸」撃沈、国会議員の殉職など目に見える被害が出たという事態を受けて津軽、宗谷両海峡付近の軍拠点である津軽要塞と宗谷臨時要塞は警戒を強化していた。10月7日には舞鶴鎮守府から「現ニ潜入中ノ敵潜ハ必滅シ生還セシメザル様此ノ際特ニ配慮アリ度(たし)」との通告も出された。しかし、10月9日には「ソーフィッシュ」が宗谷海峡へ侵入し、下記の第十五号駆潜艇などが爆雷攻撃を行ったが逃がしてしまうという失態を犯し、もう失敗は許されない状態であった。
10月11日8時30分頃、往路と同じように、宗谷海峡を浮上突破しようとした「ワフー」は、宗谷臨時要塞の陸上砲台九六式十五糎加農砲の砲撃を受け潜航避退した。
9時20分、稚内基地(水偵基地)から飛び立ち哨戒していた大湊航空隊分遣隊の零式水上偵察機(オミ19号機)は、北緯45度40分 東経142度10分 / 北緯45.667度 東経142.167度 / 45.667; 142.167の宗谷岬の42度12海里の地点で潜航中の「ワフー」を発見した。「ワフー」は油帯を引きつつ2ノットで航行中と判断された。
その後、同基地所属のオミ2号機(零式水上偵察機)、オミ20号機(九四式水上偵察機)も追跡および攻撃に加わり、大湊航空隊小樽派遣隊からオミ6号機(零式水上偵察機)、オミ12号機(零式水上偵察機)も応援に駆け付けた。
水上機の報告に接した宗谷防備部隊指揮官、砕氷艦「大泊」艦長の岡恒夫中佐は「第15号駆潜艇」および「第43号駆潜艇」「第23号掃海艇」「第17号掃海特務艇」「第18号掃海特務艇」を水上偵察機の誘導のもと発見海域に急行させた。
2つの目標に魚雷を3本ずつ計6本発射し、2隻の輸送船、「高雄丸」(川崎汽船、3,204トン)と「神武丸」(栗林商船、1,912トン)に命中させ両船を撃沈した。「ワフー」はさらに南下し、東京と幌筵島間の航路と思われる海域でパトロールし、5月12日夕刻に北緯38度40分 東経142度53分 / 北緯38.667度 東経142.883度 / 38.667; 142.883の地点で4,000トン級輸送船と9,000トン級貨客船を発見。2隻に対して魚雷を2本ずつ計4本発射し、9,000トン級貨客船に1本が命中したように感じられた。9,000トン級貨客船に対しては、さらに魚雷を1本ずつ計2本発射し命中させたが、無味乾燥な響きしか聞こえてこなかった。「ワフー」は浮上砲戦に持ち込んだが、2隻とも結局撃沈することはできなかった。5月4日からの10日間で8隻の目標に対し10回の雷撃を実施したが、魚雷の不調により満足すべき戦果は得られなかった。
5月21日、26日間の行動を終えて真珠湾に帰投。翌日、アメリカ太平洋艦隊司令長官チェスター・ニミッツ大将が来艦し、授章式が行われた。5月23日、オーバーホールのためメア・アイランド海軍造船所に回航され、7月20日まで修理と訓練に従事した。これに先立ち、副長のオカーン大尉が建造中の「タング (USS Tang, SS-306) 」艦長として転出していった(結果として、オカーンはワフー乗組員中唯一戦争を生き残ることとなる)。7月27日に真珠湾に戻り、8月2日にはミッドウェー島に進出した。