コイ科
コイ科魚類はメキシコ南部までの北アメリカ・アフリカ大陸・ユーラシア大陸に幅広く分布する一方で、南アメリカやオセアニアには生息しない。ほぼすべてが淡水産であるが、ウグイ亜科のごく一部に汽水域に進出する種類が知られる。
主な種として以下のものが挙げられる。
コイ Cyprinus carpio
キンギョ Carassius auratus
ヨーロッパブナ Carassius carassius
チャブ Leuciscus cephalus
バーベル Barbus barbus
シルバーシャーク (Balantiocheilus melanopterus
ダニオ
ラスボラ
ローチ
デイス
パーカーホ Catlocarpio siamensis。本種はコイ目中の最大種で、最大で3mに達する
ニッポンバラタナゴ Rhodeus ocellatus kurumeus(タナゴ亜科)の雄個体。鮮やかな婚姻色が名前の由来となっている
コイ亜科の1種 Puntius denisonii (コイ科)
ニゴロブナ Carassius buergeri grandoculis(コイ亜科)。琵琶湖の固有亜種で、当地の郷土料理である鮒寿司の原料として利用される
ソウギョ Ctenopharyngodon idella。水生植物を主食とする東アジア原産のコイ類。日本には戦中戦後にかけて移植され、以来全国各地に分布範囲を広げている
オイカワ Opsariichthys platypus。関東以西に広く分布し、釣魚として人気のある種類
ゼブラフィッシュ Danio rerio(ダニオ亜科)。実験動物として汎用され、遺伝子改変モデルも作出されている
Psilorhynchinae - 2属6種を含み、体長8cm程度の小型魚類である。ネパールおよび隣接するインド・ミャンマーの山岳地帯に分布し、流れの速い渓流での生活に適応している。頭部腹面が平らで口は小さく、肉質の唇をもつ。口ヒゲはない。鰓の開口部は小さい。咽頭歯は1列4本。側線が発達する一方、浮き袋は退化的である。かつては独立科とされたこともある。
コイ亜科 Cyprininae - 約1300種。コイ・フナ(キンギョ)が一般的に知られているが、ドクターフィッシュ・プンティウス属・シルバーシャークのような熱帯魚も含まれる。
ダニオ亜科 Danioninae - 約300種。ラスボラなどの熱帯魚のほか、モデル生物として用いられるゼブラフィッシュも含む。
Leptobarbinae - 1属(Leptobarbus)に5種を含む。東南アジア産。
タナゴ亜科 Acheilognathinae - 4属に約80種が属する。中央アジアを除くユーラシア大陸、および日本列島に分布する。