伝説のポケモン (ポケットモンスターSPECIAL)
タイプ:エスパー
特性:ふゆう
第7章・第8章に登場。
『感情の神』と伝えられている。ダイヤは保育園児の頃、シンジ湖でパールとはぐれた際に、このエムリットの魂を見ている。
ギンガ爆弾の爆発に乗じてシンジ湖より出現しマーズに捕獲されるも、ダイヤのポケモン図鑑の代わりに解放される。その後やぶれた世界でダイヤに上級SHITAPPAから渡された図鑑を返し、ギラティナ・ダークライとの戦闘を経てシンジ湖へ帰っていった。
各地方において、伝説や神話上で語られる伝説のポケモンと、僅かな文献でしか語られず、存在さえも不確かとされている幻のポケモンは、作中の登場人物や悪の組織・勢力との戦いにおいて重要な立場に置かれている。デオキシス、ゲノセクト、コスモッグを除いて世界に1匹しか存在せず、ゲームでは作品をまたいで別個体で登場する伝説のポケモンも多いが、本作品では反映されない。
伝説のポケモンの力はいずれも強力であり、悪の組織の戦力にされたり、フロンティアブレーンのリラ・ジンダイ・クロツグといった実力派、またはレッド・ブルー・クリスタル・ルビー・エメラルド・ダイヤモンド・ブラック・ラクツ・ワイ・サン・ムーンなど、若くも図鑑所有者に選ばれる程の才能溢れる者でなければ、扱うのは極めて困難である。一方でスイクン・ラティオス・ラティアス等の様に高い知性を持ち自分の意思を人間に伝える事ができる者も多く、自ら人間に協力する例外もある。
幻のポケモンは上記とは別格であり、例として自分からトレーナーといる事を決めたり、特別な機械で制御するなどの僅かな場合を除きいずれのポケモンも並大抵の者には従わず、また制御する事もできない。
タイプ:エスパー
特性:シンクロ
第1章・第5章に登場。
第1章の第1話から登場するポケモンであり、タイトルのVS○○の○○に最初に名前の入ったポケモンである。
全ポケモンの遺伝子を持つとされる幻のポケモンで、かつて究極のポケモン製造計画を進めるロケット団から睫毛を採取され、その細胞を元にミュウツーが生み出された。
マサラタウン近くの森でグリーンのヒトカゲと対戦するがグリーンがミュウを強いと判断しヒトカゲを引っ込め、次にレッドがニョロゾで攻撃をしかけられるがニョロゾを簡単に倒して、どこかに消えてしまった。タマムシシティではミュウツー計画を進めるロケット団に狙われるが、レッドの活躍によって捕獲は阻止され、またどこかへ消えていった。その後は第1章のラストに登場し、第9回ポケモンリーグでのレッドとグリーンの試合を見物していた。
第5章では終盤で、暴走したロケット団の飛空艇の墜落を防いだ。滅多に姿を見せないが、第6章では普段は「さいはてのことう」にいることが言及された。
タイプ:むし / かくとう
特性:ビーストブースト
第14章に登場。
全身真っ白で、長い触角と、ベールのような翅を纏っているUB。多彩な足技と素早い動きが武器。
アローラ地方の各島のキャプテン達が「いかがわしきやしき」に乗り込んだ際にウルトラホールから現れ、キャプテン達だけでなくスカル団の下っ端達も見境なく襲う。カキのアローラガラガラやマオのアマイコを倒し、サンがジーナから貰ったばかりの通信用メカヤヤコマを破壊し、壁の外に出るとアーカラ島へと上陸。半年後には複数の個体がエーテル財団に利用されてラナキラマウンテンの警備を行っていたが、特訓を積んだカキとマオに撃破された。
タイプ:エスパー
特性:プレッシャー
技:"サイコブースト"・"じこさいせい"・"スキルスワップ(「個体・弐」)"
第5章・第13章に登場。「個体・壱」と「個体・弐」が存在している(「個体・壱」はブルーの両親とオーキド博士を攫うために登場)。
レーザー光線によって変化した宇宙ウイルスが、隕石グラン・メテオに付着して地球にやってきたという。トクサネ宇宙センターで保管されていたが、災害の混乱の最中ロケット団に盗み出された。ブラックホールによる空間転送が可能で、「個体・壱」はこの能力を使いブルーの両親をさらった。
状況に応じてノーマル・アタック・ディフェンス・スピードの4種類のフォルムを使い分ける。
フォルムチェンジはその土地の風土の影響を受け、ホウエン地方ではノーマル・スピード、カントー地方ではアタック・ディフェンスのフォルムのみ可能となる。ロケット団は紅色・藍色の宝珠の欠片である「ルビー」と「サファイア」の力でカントーにホウエンの風土を再現し、自由にフォルムチェンジできるようにした。
タイプ:でんき / フェアリー
特性:エレキメイカー
第14章に登場。
メレメレ島の守り神と言われているポケモン。強力な電気を操る。
突如としてサン・ムーンの前に出現してバトルを仕掛け、何かを感じたのかサンの元に「かがやくいし」を置いてどこかへ去っていった。その翌日、ほしぐもちゃんを助けようとして吊り橋から転落したムーンの前に再び姿を表し、今度は彼女の命を救う。
アローラ四島にUB(ウルトラビースト)が出現し暴れ回る中、他のカプ達とポニのさいだんを優先して現れ、サン・ムーンに「たいようのふえ」と「つきのふえ」を吹かせる。それから半年後、各地で暴れるUBを撃退するためしまクイーンのライチと共闘する。