DNAメチルトランスフェラーゼ
m6Aメチル基転移酵素(N6アデニン特異的DNAメチル基転移酵素、A-MTase)はDNAのアデニンのN6位を特異的にメチル化する酵素である。A-MTaseは細菌の制限修飾系の3つのタイプでみられる。これらの酵素は対応する制限酵素と同じ配列特異性を持ち、DNA配列をメチル化することで自身のゲノムを制限酵素による分解から防いでいる。N末端部分にAsp/Asn-Pro-Pro-Tyr/Pheからなる保存されたモチーフを含んでおり、この領域は基質結合または触媒活性に関与している可能性がある。m6AメチルトランスフェラーゼTaqI(M.TaqI)の構造は 2.4 Åの分解能で解かれており、分子は2つのドメインへ折りたたまれている。N末端の触媒ドメインには触媒部位と補酵素結合部位が含まれ、中心部の9つのストランドからなるβシートが5本のαヘリックスで囲まれた構造をしている。C末端のDNA認識ドメインは4つの小さなβシートと8つのαヘリックスによって形成される。N末端ドメインとC末端ドメインによって、基質DNAを収容する溝が形成される。
タイプIの制限修飾系はR、M、Sの3つのポリペプチドから構成される。MサブユニットとSサブユニットはメチル基転移酵素を形成し、DNA認識配列の相補鎖の2つのアデニン残基をメチル化する。
DNAメチル基転移酵素は、触媒する化学反応によって3つの異なるグループに分類される。
m6Aメチル基転移酵素 - N6-メチルアデニンを形成(EC 2.1.1.72)
m4Cメチル基転移酵素 - N4-メチルシトシンを形成(EC 2.1.1.113)
m5Cメチル基転移酵素 - C5-メチルシトシンを形成(EC 2.1.1.37 )
m6A修飾を行うm6Aメチル基転移酵素(英語版)とm4C修飾を行うm4Cメチル基転移酵素(英語版)は、主に原核生物においてよく知られているが、m6Aメチル基転移酵素については真核生物にも豊富に存在することが近年示唆されている。一方で、m5C修飾を行うm5Cメチル基転移酵素は真核生物の一部、具体的には一部の下等真核生物や高等植物の大部分、棘皮動物以降の動物に存在している。