別府港
路線バスによりJR別府駅と接続(所要時間約10分)している。
大分交通や亀の井バスの一般路線バスが乗り入れているほか、大分空港へ向かう特急バスや九州横断バスなどが発着する。構内に設置されているバス停は、「別府交通センター」「第3埠頭入口」「第3埠頭」の3つである。
なお、最寄り駅は徒歩約20分のJR別府大学駅である。すぐ近くを日豊本線が通っており、かつては観光港付近に新駅(新別府駅)を設置する計画があり、現在も駅施設や駅前ロータリー等を設置するためのスペースが確保されているが、具体的な設置予定はない。