H3N2亜型
福建かぜは福建省で人に引き起こされたH3N2亜型インフルエンザか、鳥に引き起こされたH5N1亜型インフルエンザの流行を指している。台湾海峡の中国側の対岸である福建省にちなんで名づけられている。
H3N2亜型は2003年から2004年の流行期に人間に対して非常に猛威をふるった。これは2002年から2003年にかけての流行期に頒布したものにヘマグルチニンの遺伝子が供給されたクレードである。福建型は2004年からの流行期の際に3価のインフルエンザワクチンの一部を含むと、その子孫はH3N2の中で最も人間にとって一般的なインフルエンザウイルスとなっている。
ブタにおいてはA型インフルエンザウイルスの内、3つの亜型(H1N1、H3N2、H1N2)が世界中で豚インフルエンザを起こしている。米国では1998年までH1N1がブタの間で流行していたが、1998年後期からはH3N2が分離されている。
H3N2の多くは3重の遺伝子再集合を起こしており、ヒト(HA, NA, PB1)、ブタ(NS, NP, M)、トリ(PB2, PA)の3つの遺伝子領域を持っている。米国では、SIV(Swine Influenza Virus:ブタインフルエンザウイルス)のコントロールとブタへの感染予防のため、2価SIVワクチンの内の1つを使用している。近年分離された97株のH3N2の内、41株は3つのSIVワクチンに対して血清交差反応を起こした。インフルエンザワクチンは流行しているウイルスと一致しなければ効果がないため、H3N2が変異した場合は市販のブタに対するワクチンの効果がなくなる可能性がある。