三船殉難事件
なお、もちろん民間船への無差別攻撃は全くの国際法違反であるが、当時はそれまで既に太平洋戦線では米軍による無差別攻撃が宣言され、日本海を含め実施されていた。また、終戦のはずながら、南樺太では、事実上札幌の第5方面軍樋口中将の指令により、ソ連軍との戦闘が続いていた。三船とも武器には覆いをしていたとの主張がなされることもあるが、三船とも武装していて全くの民間船とも言い難く、とくに遭難時の証言について、混乱のなかでの民間人の証言とはいえ矛盾や食違いがあまりに多かったり、後年の出版物に先行出版を都合よく自己解釈した末の叙述ではないかと思われるものも多く、日本側に有利なような歪曲はないとも言いきれない状況がある(例えば、後の出版物では第二新興丸は砲に覆いをかけていたとしばしば書かれているが、初期の出版物には竹囲いで「擬装していた」と表現しているものがある。)。秦郁彦らの調査により発見された資料からはソ連側はどのみち無差別攻撃を行う予定であったようであるが、三船側の対応にも問題があったのではないかと見る向きもある。
事件時、L-19潜水艦(コノネンコ艦長)、L-12潜水艦(シェルガンツェフ艦長)の2隻は留萌付近海上で偵察と敵艦攻撃の任務に就いていた。この作戦行動において3隻の船を攻撃、2隻を撃沈したと記録されている。また、21日にモーターボートを撃沈したことも記されており、当時樺太からは対岸の北海道に小舟を仕立てて脱出する者もいたため、こちらについては、そのような舟ではないかと見られている。作戦後、L-12潜水艦はウラジオストク軍港に帰還したが、L-19潜水艦は礼文島沖での、これから宗谷沖に入るとの通信を最後に行方不明となった。
続いて午前5時13分頃、大泊からの疎開者約3,400名を乗せ小樽へ向っていた特設砲艦第二号新興丸(2,700トン)が留萌沖北西33キロの海上で、ソ連の潜水艦L-19からの魚雷を右舷船倉に受け縦約5m・横約10mの穴が開いた。さらにこの直後に浮上した潜水艦により銃撃や砲撃を受けたため、これに応戦した。同艦は1941年(昭和16年)に海軍に徴用され特設砲艦として宗谷海峡付近で機雷敷設の任務に就いていた艦であるため、12センチ砲2門と25mm対空機銃の装備があった。なお、二隻ないし三隻の潜水艦が浮上してきて攻撃されたという証言も多い。乗員・乗客らの証言によれば、新興丸も、2門の砲で各1発だけ撃ったとも、なかなかあたらず何発も撃ったともいうが、激しく応戦し、新興丸の砲撃が敵潜水艦の一隻に当たって確かに撃沈したように乗船者らには見えたという。一方で、この砲撃戦は近くの鬼鹿の監視哨からも見えたが、そこからの目撃者の話では当たったのかどうかは、はっきりしない。