根戸城
2つのどちらの郭にも空堀がめぐらされていたものの、現在は西側の郭を囲う空堀は半壊している。東側の郭は南側以外の3方向にめぐらされているが、北西部の空堀が厚くなっており、その角に落とし穴遺構が存在する。なお、南側は腰郭に抜けている。
上で紹介したようにこの根戸城の遺構には、「折邪」や「逆乙字型堀切」、「異比高面二重土塁」や「帯状腰郭」、さらには「腰郭」などなど、戦国期の防御系の城郭によくみられる遺構が数多く残っており、それも臨時的な城郭などではなくある一定の期間、機能したと推察できる長期防衛用の要塞の形をとっていたことから、戦国期に防御系の城郭として半長期的に機能していたことは確かであると考えられている。また、空堀の中から後述の発掘調査で見つかった瀬戸産の鉢で、15世紀から16世紀のものと比定されている鉢が複数見つかっていることなどからも、この根戸城が戦国時代に半長期的に機能した城であるということが裏付けられている。また、太田道灌の没後は、高城氏の勢力範囲内に入っていた時期もあったことから、高城氏傘下に組み込まれたのではないかと考えられているが、高城氏が後北条氏下に参入し、牛久城・椎津城などの城の勤番や葛西城などの城の構築・整備にあたり始めると、その勢力範囲は根戸城のある所まで届いていたか不明であり、根戸城と高城氏との関係についても未だ謎のままである。なお、同じ我孫子市内の我孫子城には、我孫子氏という氏族が入城していたとみられており、その名前の傾向から高城氏の一族ではないかという説も存在する。
1985年(昭和60年)には我孫子市教育委員会が発掘調査を行っている。