ぽっぷんぽっぷ
声 - 松尾貴司(現・松尾まつお)
『レインボーアイランド』より登場。『バブルメモリーズ』(1996年)と同様に2段階に変身する。ぱずるモードの最終ボス。
家庭用移植版のストーリーモードでは、復活して悪の軍団を結成しポップンワールドを侵略したことが語られており、こちらでも最終ボスとなっている。
声 - 金子陽子(デザイナー)
『バブルボブル』(1986年)や『パズルボブル』(1994年)等の主人公。バビーが魔法で緑色のバブルドラゴンに変身した姿。なお、『バブルボブル』では後述のすーぱーどらんくによって変身させられた姿だったが、本作では本人がひみつの魔法で自ら変身したことが説明書に記載されている。本作ではキャラクター選択画面でバビーとは別個に登場している。アーケード版はバビーのスタート時にバブルンの姿で降りて登場するが、その際にすぐさま変身が解ける。なお、声優はバブルン・ボブルン共に当時のタイトーの女性社員である。
PS版のみのファミリーモードではバブルンが操作キャラクターに固定されている。 ボブルン 声 - 海野和子(ZUNTATA) 『バブルボブル』等の2Pキャラクターで、上記と同様、バビーの弟のボビーが青いバブルドラゴンに変身した姿。アーケード版のみ、ボビーのスタート時は体色が赤紫色になっている。
PS版のキャラクターは隠しだったものも含め全員最初から使用可能だが、ゲームシステムはAC版と同様に後付連鎖がない。モードは他機種より少なく、ストーリーモードのデモは全員共通の汎用のものになっているが、通信対戦ケーブルを使った「協力プレイモード」および「通信対戦モード」、オリジナルステージを制作できる「エディットモード」を収録している。他機種と違いソフト単体で2Pキャラクターを使用できず、通信時は最初に接続した方(ホスト)が1Pキャラクター、後から接続した方(クライアント)が2Pキャラクターとなる。
北米版は『Yogi Bear: Great Balloon Blast』として、アニメ『ヨギ・ベア』(邦題『クマゴロー』)のキャラクターに差し替えられている。使用できるキャラクターはヨギ(クマゴロー)、ブーブー、シンディの3匹のみ。一方で、欧州版はそのまま日本版を元にしたローカライズだが、どちらもエディットモードが削除されている。
声 - 小桜エツ子
『ミズバク大冒険』(1990年)の主人公。水と森の国ウッディレイクに暮らすカバのような謎の生き物。
PS版では一人で対戦モードクリア後、出現。 タマスン 声 - 小桜エツ子 『ミズバク大冒険』より登場。リボンを付けたヒポポの幼なじみでガールフレンド。ただし、ヒポポの方はあまりそれにこだわっていない模様。