Winny
当時の日本の著作権法では、ファイルの発信者のみが公衆送信権・送信可能化権の侵害に問われることから、開発者の意図がどうであれ、Winnyの匿名性は著作権侵害の主体を隠すことにつながった。金子がWinnyを最初に公開したのは「2ちゃんねる」のダウンロードソフト板であり、そこではWinMXなどのP2Pソフトが著作権侵害ファイルの流通用に普及していた。金子本人もWinny使用が著作権侵害に繋がることを認知しており、自身はダウンロード専用の特製Winnyを使用しており、直接的な著作権法違反となるアップロードはしておらず、警察は摘発逃れを謀っていたと疑った。
防衛大学校助教授の中村康弘は開発者の金子勇は著作権違反行為を意図する者の要望に応える形でWinnyの開発を行ったように見えると述べている。その理由としてFreenetのプロトコルにWinMXの転送効率の良さを加味する設計の良し悪しを検討するならば、「2ちゃんねる」ではなく、Freenetのプロジェクトで実験を行うのが適切なはずであるからと論じた。
2004年3月ごろより、Winnyを利用していたパソコンがWinnyなどで入手したファイルを閲覧したことにより、コンピュータウイルスの一種ともいえるワームに感染する事例が頻発し、その結果、そのパソコン内に保存されていた本来公開されてはならないファイルが、Winnyのネットワーク上に流出するという事件が多発した。
このワームは特に「暴露ウイルス」と言われ、流出したものとしては、一般企業の業務データ、個人のチャットログや電子メールデータなど様々なものがある。
これらのウイルスは「お宝画像(数行にわたる長い空白).exe」など、一見するとウイルスに見えないような細工をした上で、他のファイルに紛れ込ませてネットワーク上に放流された。一般にWinnyのユーザーは大量のファイルをダウンロードしクリックすることに慣れているためか、かなりの確率でこのような単純な罠にひっかかってしまったのである。
東京都立墨東病院の事務職員のPCから、患者の氏名、年齢、性別、疾患名等271人分を含む、640人分以上の個人情報が流出。