美保飛行場
札幌/新千歳・ 茨城(神戸経由便)・東京/成田・名古屋/中部・名古屋/小牧・大阪/伊丹・大阪/関西・大阪/神戸・隠岐・福岡・那覇 日本エアシステム・日本エアコミューターが乗り入れていたが、現在JALグループの便は出雲空港(出雲縁結び空港)から就航している。 2013年12月から2015年8月までスカイマークが就航していた。 就航時の運航路線は成田便・神戸便・茨城便(神戸経由)。 2014年8月時点での運航路線は、羽田便・成田便・神戸便・札幌便・沖縄(那覇)便。 最終運航時は神戸便・沖縄(那覇)便。
美保基地の基地司令は第3輸送航空隊司令が兼務。
航空自衛隊美保基地の航空祭。近年は5月中旬〜6月初旬の日曜日に開催されている。一番の見所は美保基地に配備されているC-2輸送機やT-400練習機の展示飛行で、その他にも陸上自衛隊美保分屯地所属のCH-47輸送ヘリコプターや海上保安庁美保航空基地所属のAW139ヘリコプターの展示飛行も行われる。なかでも航空祭等のイベントにおいてC-2の物料投下を見ることができるのは美保基地のみである。ブルーインパルスが美保基地に展開し曲技飛行を実施する年がある他、戦闘機による展示飛行も築城や新田原などの基地からリモート形式で実施される。また陸海空自衛隊及び海上保安庁の固定翼機と回転翼機が中心の地上展示も行われる。
以下に定期便とチャーター便を合計した乗降客数を示す。マウスポインタを棒グラフに合わせると、該当年度の数値がポップアップする。
国内線
国際線