オニゼンマイ
本種の胞子形成部が栄養葉と同じ形の葉の中程の羽片に集中する、いわゆる部分2形を示すのに対して、ヤマドリゼンマイでは胞子葉は栄養葉と完全に区別され、栄養葉より早くに出て先に枯れる。ただし栄養葉のみでは判別が難しい場合があるといい、牧野原著(2017)ではその記述(12行)の半分以上(8行)をその違いを説明するのに使っている。加藤(1997)ではこの2種の違いとして羽片の先端が本種では急に狭まり、ヤマドリの方は徐々に狭まる点をあげている。
2016年現在の系統的な判断では日本産ゼンマイ属の内で本種は一番基底で分岐したことになっているが、ヤマドリゼンマイはそのさらに下で分岐したこととなっている。
ゼンマイと本種の雑種と疑われるコゼンマイ O. nipponica が群馬県赤城山で採集されているが、一度採集されたのみで標本は栄養葉のみと、検証の難しい状況にある。