セオドア・カジンスキー
この事件は当初、郵便監察局が捜査を担当しており、郵便爆弾に廃品が使われていることから捜査員は容疑者を「ジャンクヤード・ボマー」と呼んでいた。その後FBIの所管となり、テリー・D・ターチーがユナボム(UNABOM)の捜査責任者になった。1979年にFBIが主導するタスクフォースはFBI、アルコール・タバコ・火器及び爆発物取締局 (ATF)、郵便監察局の職員からなる125名のエージェントで構成されていた。その後このタスクフォースは常勤の捜査員が150名と増員されたが、回収された爆弾の部品に関する詳細な分析や、事件の生存者からの聞き取りによっては、容疑者の特定につながる情報はほとんど得られなかった。犯人が作る爆弾の主材料はほとんどどこにでも見つかるようなスクラップだった。後に分かったことだが、ターゲットは図書館での調査を通じて不規則に選ばれていた。
1980年に、主任捜査官ジョン・ダグラスはFBIの行動科学分析班のエージェントと捜査を行う中で、正体不明の爆弾犯の心理学的なプロファイリングを行った。この時の分析によれば、犯人は平均以上の知性であり学界ともつながりがあるとされた。この犯人像は後にさらに洗練されて、ネオ・ラッダイト的思想をもち自然科学の分野で学位を有する人間と推測された。しかしこの心理学をベースにしたプロファイリングは1983年に却下されてしまった。その代わりにFBIの分析班が着目したのは、回収された爆弾の破片に見られる物理的な特徴であった。
また別の手がかりは爆発しなかった爆弾に残されたメモで、「ウー、やったぜ!こうなるって言ったろ―RVより」("Wu—It works! I told you it would—RV") と書いてあった。箱を送るときに使われたユージン・オニールの1ドル切手を手がかりにしていることもあった。スローン・ウィルソンの小説『氷の兄弟』(Ice Brothers) の本に爆弾が埋め込まれている時もあった。FBIは容疑者が自分の犯罪に自然、樹木、木々といったテーマを盛り込んでいると考えた。彼の爆弾にはよく木の枝や樹皮の一部が入っており、ターゲットにはパーシー・ウッドやリロイ・ウッド教授といった名前も見受けられたからである。犯罪ライターのロバート・グレイスミスは容疑者が「木に執着している」ことは「大きな要素だ」と述べた。