亀ノ瀬トンネル
しかし地盤の悪さは変わることがなく、1932年(昭和7年)1月に大規模な地すべりが発生し、亀ノ瀬トンネルを含め周辺の路盤は土砂に飲み込まれて地形が変わり、復旧の見通しが全く立たない状況に陥った。同年2月、鉄道省では亀ノ瀬トンネルの使用を中止し、開業時のように「亀ノ瀬西口駅」「亀ノ瀬東口駅」という仮駅をトンネルの両側に設置し、徒歩連絡とすることで暫定輸送を開始した。同年4月にはトンネルはほぼ完全に崩壊したものとされた。
なおこの年発行された内務省地理調査所(現在の国土地理院)の地図では、復旧工事の計画が全くまとまらない状態であったことから、通常なら復旧後の形で描かれる不通区間に関して、仮駅設置時の状況がそのまま描かれた。
また同年6月にはよりスムーズな接続を行えるようにするため、関西本線が大阪電気軌道(大軌)桜井線(後の近鉄大阪線)の安堂駅付近を通る箇所に柏原仮乗降場を設置、大軌桜井線下田駅(現在の近鉄下田駅)と和歌山線下田駅(現在の香芝駅)の間を徒歩連絡として、天王寺 - 柏原(仮)...安堂 - (大軌)下田...(国鉄)下田 - 王寺 - 奈良という代替ルートを形成した。
その後、復旧工事については北側通過案など、様々な案が出た。しかし結局は不安定な地盤を避けるため、大和川を2回またぎ南側対岸の明神山にトンネルを開削する案が採択され、1932年7月に着工、同年大晦日に開通した(新年の伊勢神宮参拝客輸送に合わせるように工事が行われたといわれている)。これに伴い亀ノ瀬トンネルは完全に放棄されることとなり、柏原 - 法隆寺間で6回も大和川をまたぐという線形が形成された。