オットー・フランク
そのためキューバへの移住ビザを得ようと試みている。1941年12月1日、オットーはキューバへの単身ビザを認められているが、これが彼に届いたかどうかは不明である。いずれにしてもこの10日後、ドイツが米国に宣戦布告し、ビザはキューバ政府によりキャンセルされてしまった。また1942年1月20日にはイギリスへの移住も申請しているが、「申請は無期限に延期された」という通知を送り返されただけであった。
オットーは同じユダヤ人である相談役ファン・ペルスと話し合った結果、プリンセン運河通り263番地の建物の後ろの家に隠れることを決めた。しかしそのためには外部に協力者が必要であり、最も信頼する社員4人、クーフレル、クレイマン、ミープ、ベップにこのことを相談して協力をお願いした。ユダヤ人を匿えば彼ら自身も危険な立場になるにも関わらず、4人ともすぐさま同意してくれたとオットーは回顧している。会社の営業時間が終わった後、クリーニングないし修理のためという名目で少しずつ家具が隠れ家へ持ち込まれた。オットーは娘たちができるだけ不安少なく残されたわずかな期間の自由を楽しめるようにとアンネとマルゴーには隠れ家について何も言わなかった。
1942年6月12日(13回目のアンネの誕生日)にオットーはプレゼントとしてサイン帳をアンネに贈っている。表紙全体に赤と白のチェック模様が入っている女の子らしいサイン帳であった。アンネはこれを最初の日記帳として使用することとなる。
さらに1957年には20世紀FOXによって映画化されている(『アンネの日記』)。
1957年に隠れ家のある建物が取り壊されそうになった際に建物の保存のために「アンネ・フランク財団」(在アムステルダム)が設立された。財団は一般からの寄付に支えられて、この建物とその周辺を買収し、1960年5月3日に博物館「アンネ・フランクの家」として公開した。オットーは様々な民族や宗教の若者の交流を促進して不寛容や差別が防止されることを期待してアンネ・フランク教育センターの設立を支援し、1964年までその初代会長を務めた。
オットーはアンネの日記について「これは戦争文学ではありません。戦争はこの本の背景でしかないのです。同様にこれはユダヤ人の本でもありません。ユダヤ的世界やユダヤ人の心情・境遇が背景にはなっていますが。」と述べ、時代や人種を問わない普遍的なものであることを語っている。オットーは死ぬまで、アンネの残した寛容と思いやりのメッセージを世界中に広め続けた。
隠れ家生活は2年間続いたが、1944年8月匿名の密告によって、フランクと家族、同居していた4人、およびクーフレルとクレイマンはナチス親衛隊SS曹長カール・ヨーゼフ・ジルバーバウアーに逮捕された。
オットーら隠れ家メンバー8人はオランダ北東ヴェステルボルク通過収容所に1カ月弱収容された後、アウシュヴィッツ=ビルケナウ強制収容所へ送られた。9月5日から6日にかけての深夜にビルケナウ強制収容所に到着している。到着後すぐに男女に分けられ、アンネ、マルゴット、エーディトと引き離された。彼女らはビルケナウ収容所に、オットーは3キロ離れたアウシュヴィッツ収容所に収容された。この時がオットーが妻と娘の姿を見た最後となった。
オットーはファン・ペルス父子やプフェファーと一緒にアウシュヴィッツ収容所の第2ブロックに収容された。過酷な野外労働と少ない食料により1.8メートルの身長のオットーの体重が52キロまで下がってしまった。ヘルマン・ファン・ペルスはやがてガス室に送られたが、その息子ペーター・ファン・ペルスはオットーの面倒を献身的に見たという。しかし比較的健康だったペーターは1945年1月17日に別の収容所へ移された。