加藤茂明
最終報告書には、加藤が国際的に著名な学術雑誌への論文掲載を過度に重視し、そのためのストーリーに合った実験結果を求める姿勢に甚だしい行き過ぎが生じ、それをJYとHKらのスタッフが助長し、特定の研究グループにおいて杜撰なデータ確認、実験データの取扱い等に関する不適切な指導、実施困難なスケジュールの設定、学生等への強圧的な指示・指導が長期にわたって常態化していたことが捏造・改竄を生んだというように記載されている。これに対して加藤は「強制的な態度や過度の要求などをしたことはない」と反論している。
中間報告書と最終報告書には、加藤研究室には実験結果の図をあらかじめ作製して論文の該当箇所に仮置きする習慣があり、その仮置きした図を実験データで差し替えなかったケアレスミスが原因であるとするような記述もあった。しかし、調査委員の一人は覆面でNHKの番組に出演し、実験ノートを見ても実験を行った形跡がないことから、ケアレスミスを否定している。
2012年12月11日、分子生物学会年会において、緊急フォーラム「研究不正を考える―PIの立場から、若手の立場から―」 が開催された。加藤に研究倫理の若手教育を担当させた分子生物学会の担当理事は、任命責任について謝罪を行った。
2013年上旬、桑島巖や由井芳樹が追及を行っていたディオバン事件(不正論文によって数千億円〜数百億円の医療費が無駄になったとされる事件)が毎日新聞によって報道され始め、研究不正問題がメディアに登場する頻度が増えていった。
2013年7月5日、東京大学は11jigenに予備調査の結果を郵送した。加藤研究室が発表した論文165本の全てを東京大学が調査していたことが記載されていた。
2013年7月25日、科学記者の瀬川茂子による調査経過のスクープ記事が、朝日新聞の一面トップに反転見出し付きの5段抜きで掲載された。これにより、事件の巨大さと深刻さが一般にも広く知られることとなった。
2013年7月26日、文部科学大臣下村博文は、記者会見で、「大学の先生というのは立派な先生方だからという、性善説が前提で物事が行われてきた部分があった...(中略)...不正は不正として事前にチェックできるような仕組みというのも、改めて考えていかなければならない時期に、残念ながら来ているのかなと。」と述べた。
加藤茂明『ウズラ輸卵管初代細胞培養系における卵白タンパク合成調節機構の解析』東京大学〈博士論文(甲第7787号)〉、1988年3月29日。https://iss.ndl.go.jp/books/R100000002-I000000211853-00。