井戸の魔女
脚本家ニール・クロス(英語版)は『ドクター・フー』のファンであったが、これまでエピソードを執筆する時間はなかった。第7シリーズから就任した新しいエグゼクティブ・プロデューサーのキャロライン・スキナーは彼を知っており、エピソードの執筆を依頼した。彼は依頼を快諾した。エグゼクティブ・プロデューサー兼筆頭脚本家のスティーヴン・モファットはドラマ『刑事ジョン・ルーサー』の製作総指揮者であるクロスが参加することを喜んだ。プロデューサーはクロスの執筆した「井戸の魔女」を楽しみ、それを受けて第7シリーズ第7話「時の女王」の執筆も彼に依頼した。「井戸と魔女」の脚本執筆の際にクロスはニュージーランドに居たため対面での製作はなかったが、撮影を見るために家族と共にイギリスへ戻ってきた。
クロスは9歳から12歳の頃に『ドクター・フー』を怖ろしい番組として記憶しており、それゆえ特に同年齢の子どもを対象にした古い怖ろしい『ドクター・フー』のエピソードを執筆しようと考えた。彼はタイムトラベルと幽霊が呼応すると考え、幽霊が時間の流れに捕らわれた断片ではないかと主張した。
彼はサスペンスと緊張感の方がゴア表現や血飛沫よりも怖ろしいと考え、それらを演出することを目指した。The Quatermass Experiment とその続編にインスパイアされたクロスは当初ドクターをバーナード・クォーターマス(英語版)に会わせるつもりであったが、著作権上の理由で不可能であった。また、クロスは The Quatermass Experiment の作者ナイジェル・ニール(英語版)の The Stone Tape にもインスパイアされ、1970年代を物語の舞台に選んだ。「井戸の魔女」は非常に小規模で非常に限定的な幽霊の物語として意図されていたが、もっと大きな展開にするよう依頼された。元々の脚本にも異世界は存在していたが単なる煙と鏡として描写され、クライマックスの部分もカリバーン邸内で完結していたが昼間の屋外と代替世界に変更された。曲がった生物のアイディアはクロスの想像の中から取り出されたものであった。怪物を具体化する必要があると感じたモファットの意見と、エマと教授の愛を鏡映しにすることを考えたクロスにより、後に怪物の恋愛事情が物語に追加された。
クロスは可能な限り少ないロケ地と少ないキャストで物語を勧めようと考えた。エマ・グレイリングの役を打診されたジェシカ・レイン(英語版)はセットに到着するまで『ドクター・フー』が何の団体であるか気づかなかった。また、製作の様子も彼女主演のドラマ『コール・ザ・ミッドワイフ 〜ロンドン助産婦物語(英語版)』と大きく違ったという。彼女はマット・スミスと舞台で共演したことがあった。クロス曰く脚本だけで登場人物たちの間にあるかなり複雑な関係の歴史を完全に呼び起こすことは難しかったが、レインとその共演者ダグレイ・スコットは自分の演じるキャラクターの背景を埋めるのに長けていたという。本作への出演の後、レインは50周年記念エピソード An Adventure in Space and Timeで『ドクター・フー』のオリジナルプロデューサーバーティ・ランバート(英語版)の役を演じた。
「井戸の魔女」はジェナ・ルイーズ・コールマンが初めてクララ役で撮影に臨んだエピソードでもあった。台本の読み合わせは2012年5月21日に行われ、撮影はそれから3日後の5月24日に開始された。カリバーン邸のシーンは6月にマルガム・カントリー・パーク(英語版)で撮影され、ティンツフィールドがロケ地に使用された。森のシーンは人工の霧を加えてウェールズの Gethin Forest で撮影された。曲がった生物の動きは不自然な印象を与えるために逆再生が使用された。監督ジェイミー・ペインは撮影現場を訪れていたクロスの子どもたちに怪物卯の感想を聞き、それが十分怖いか否かの判断材料にした。