東能代駅
2013年(平成25年)3月16日:トラック便の発着が無くなり、東能代オフレールステーション営業終了。JR貨物の駅は定期便設定なしの貨物駅となる。
2015年(平成27年)10月1日:鯉川駅および鹿渡駅の管理が土崎駅から当駅に変更となる。
2018年(平成30年)12月1日:大館駅業務委託化に伴い、前山駅 - 陣場駅間の管理が当駅に変更となる。
2020年(令和2年) 3月26日:1番線ホームの跨線橋階段に「天空の不夜城」のラッピングが行われる。 4月1日:能代駅業務委託化に伴い、能代駅 - 岩館駅間の管理が当駅に変更となる。 6月30日:みどりの窓口の営業を終了。 7月1日:話せる指定席券売機を導入。
2022年(令和4年) 2月24日:キオスクがこの日から無人化。営業時間が短縮された他、支払方法はキャッシュレスのみとなり、現金・商品券は使用不可となった。また、駅弁や酒・たばこ・カウンターコーヒーの取り扱いを終了した。 3月12日:東能代駅(県北地区連携室を含む)と東能代運輸区を統合した東能代統括センターを設置。東能代駅長は東能代統括センター所長(県北地区駅長兼務)となる。
仙台・東京方面への往復JRきっぷを購入した乗客が無料で利用できる「こまち駐車場」がある(46台分)。
待合室内にはかつて秋田車両センター(現・秋田総合車両センター南秋田センター)に所属していたキハ58-23の運転台が設置されている。以前は水槽も設置されており、地元の名産であるハタハタが飼育されていた。