日本基督教団の教会・伝道所一覧
富山県・石川県・福井県・愛知県・岐阜県・三重県。中部教区事務所が管轄。
日本基督教団金沢長町教会
日本基督教団金沢教会
日本基督教団金沢元町教会
日本基督教団東中通教会
日本基督教団新潟教会
日本基督教団名古屋教会
日本基督教団名古屋中央教会
日本基督教団岡崎茨坪伝道所(おかざきばらつぼでんどうしょ) - 市民運動家として知られる地理学者の森山昭雄らが立ち上げ、長年統一教会(現・世界平和統一家庭連合)信者の脱会支援に関わり多数の脱会者を出す。
日本基督教団西尾教会 - 統一教会(現・世界平和統一家庭連合)信者の脱会ならびに救出活動を長年にわたり行った杉本誠が牧師を務める。
日本基督教団中濃教会
福岡県・佐賀県・長崎県・熊本県・大分県・宮崎県・鹿児島県。九州教区事務所が管轄。
日本基督教団福岡警固教会
日本基督教団佐賀教会
日本基督教団長崎教会
日本基督教団長崎銀屋町教会
日本基督教団熊本白川教会
日本基督教団八代教会
日本基督教団大分教会
日本基督教団指宿教会
日本基督教団鹿児島教会
日本基督教団鹿児島加治屋町教会
香川県・愛媛県・徳島県・高知県。四国教区事務所が管轄。
日本基督教団高知教会
日本基督教団今治教会
日本基督教団松山教会
沖縄県。沖縄教区事務所が管轄。
米軍統治下の沖縄で1969年2月25日に、日本基督教団と沖縄キリスト教団が「合同」して「日本基督教団沖縄教区」となる(合同のとらえなおし問題も参照)。
日本基督教団コザ教会