与那国空港
日本トランスオーシャン航空 (JTA) のYS-11は、当空港と石垣空港を結ぶ968便を最後に退役した。
2000年(平成12年)7月21日 - 琉球エアーコミューター (RAC) が那覇 - 与那国線、石垣 - 与那国線を開設する(いずれもDHC-8で週3日運航。これにより週3日ながら航空機による石垣島との日帰り旅行が再び可能になった。後に週4日に増便)。
2007年(平成19年) 3月15日 - 予定より5か月遅れで、滑走路延長が2,000メートルに延伸され供用を開始する。 10月4日 - 立栄航空による台北へのチャーター便が運航される。
2008年(平成20年)7月4日 - 復興航空による花蓮へのチャーター便が運航される。
2013年(平成25年)1月7日 - この日をもってJTAによる定期便の運航が終了。翌1月8日からRACが石垣線を増便するとともに、那覇線を開設。
2016年(平成28年)3月22日 - フジドリームエアラインズによる静岡空港からのチャーター便が運航される(2016年中に計3便運航)。同社はその後も日本各地からのチャーター便を運航している。