長鯨 (潜水母艦)
5月28日 臨時の第三艦隊旗艦となる。6月4日、軽巡洋艦長良に戻る。 12月9日 カムラン湾で警泊。
1942年(昭和17年)1月4日 サマール島に陸戦隊を送る。 4月10日 第6潜水戦隊解隊。予備艦となり、呉鎮守府部隊編入。海軍潜水学校の訓練艦となる。
1943年(昭和18年)1月15日 第8艦隊・第7潜水戦隊の旗艦兼母艦となる。ラバウルに進出した。 4月1日 南東方面艦隊に編入。 11月25日 瀬戸内海に帰投。 11月29日 第6艦隊隷下の第11潜水戦隊に編入され、旗艦兼母艦となる。以後、内海で訓練に従事。
1944年(昭和19年)5月下旬 呉海軍工廠でレーダーを搭載。 8月11日 迅鯨型2隻は佐世保から沖縄への輸送任務を開始。 9月18日 迅鯨型2隻は第四回沖縄輸送を実施、翌19日に迅鯨が潜水艦の雷撃で大破、座礁する(10月10日空襲で沈没)。
1945年(昭和20年) 6月4日 舞鶴に回航。 6月8日 機雷により損傷。 7月30日 敵機の攻撃を受け中破、舞鶴で終戦を迎える。 10月15日 除籍、その後は復員艦として使用。
1946年(昭和21年)9月ころ 尾道の日立造船向島造船所で解体開始。
1947年(昭和22年)はじめころに解体完了。