ガロ (雑誌)
しばらくして山中が体調を崩したため、1997年、山中と旧知の仲であるコンピュータ業界の先輩・福井源が社長代行となったが、元々山中体制に不満を抱えていた手塚能理子(当時青林堂取締役)以下の社員が申し合わせ、事前連絡も無いまま保管してあった作家の原稿を持ち去り、FAXにてツァイト宛に同1997年7月7日付で、副編の手塚を筆頭に青林堂編集部員全員の辞表が送られ、一斉に集団退社するという事件が発生する。同時に彼らはマスコミや取引先を通じ各方面へ「青林堂は版元として終わった」との声明を広く流布した。マスコミはその内容を詳細に検証する事なく報道を行なったため、青林堂と経営母体であるツァイトには大きな風評被害が及んだ。
退職した手塚能理子ら元青林堂編集部員達は長井勝一が生前に「何かあった時にこの名前を使え」と遺した「青林工芸舎」を社名とした新出版社「青林工藝舎」を青林堂の後継と称して立ち上げた。内紛騒動の顛末は、青林堂と青林工藝舎との間で訴訟継続中であったが和解で終了した旨が『ガロ』2002年2月号に掲載された。しかし、休刊騒動の取材を受けた元青林堂社員らは「当時のことは思い出したくもない」と取材を拒否しており、休刊騒動の真相をついに語ることはなかった。
安部慎一 - 『やさしい人』『美代子阿佐ヶ谷気分』
池上遼一
泉昌之 - 『夜行』『かっこいいスキヤキ』
内田春菊 - 『南くんの恋人』
蛭子能収 - 『地獄に堕ちた教師ども』『私はバカになりたい』
勝又進 - 『勝又進作品集』
川崎ゆきお - 『悪いやつほどよく走る』
楠勝平 - 『おせん』『彩雪に舞う』
逆柱いみり(望月勝広) - 『象魚』『马马虎虎』『赤タイツ男』『はたらくカッパ』
佐々木マキ
白土三平 - 『カムイ伝』
杉浦日向子 - 『合葬』『百日紅』
鈴木翁二 - 『オートバイ少女』
滝田ゆう - 『寺島町奇譚』
つげ義春 - 『ねじ式』(『ガロ増刊・つげ義春特集』)
つりたくにこ - 『六の宮姫子の悲劇』『フライト つりたくにこ作品集』
永島慎二 - 『フーテン』『漫画家残酷物語』
ねこぢる - 『ねこぢるうどん』
根本敬 - 『生きる』『天然』『タケオの世界』『因果鉄道の旅』『豚小屋発犬小屋行き』『未来精子ブラジル』
花輪和一 - 『刑務所の中』
林静一 - 『赤色エレジー』
福満しげゆき - 『まだ旅立ってもいないのに』『僕の小規模な失敗』
古川益三 - 『紫の伝説』
ますむらひろし - 『ヨネザアド物語』
丸尾末広 - 『少女椿』
みうらじゅん - 『単になんぎなうし』『アイデン&ティティ』
水木しげる - 『鬼太郎夜話』『星をつかみそこねる男』
村野守美 - 『さんささかやの』『だめ鬼』
山田花子 - 『神の悪フザケ』『嘆きの天使』『花咲ける孤独』
やまだ紫 - 『性悪猫』『しんきらり』
山野一 - 『四丁目の夕日』
淀川さんぽ - 『少年』『たこになった少年』『墓ない男の物語』
長井勝一
山ノ井靖
谷田部周次
手塚能理子
白取千夏雄
香田明子
1997年に退社した手塚能理子ら元社員達は青林堂の後継を称した青林工藝舎を設立。旧ガロの漫画家や新人などによる『ガロ』の事実上後継雑誌『アックス』を隔月で刊行しており、ガロ時代の青林堂の気風を現在に伝えている。