土御門家
遅くとも明治2年8月までには政府内で土御門家罷免で合意があったと見られる。明治2年10月6日に土御門晴雄が死去したことも土御門家罷免を更に推し進めたと考えられる。
明治3年2月10日に天文暦学は大学の所管となり天文暦道局が設立された。8月7日に京都の土御門家のもとに置かれていた天文暦道局は東京へ移され、星学局と改名された。京都の土御門家にも星学局京都出張所が残されたが、それも閏10月27日には閉鎖となった。12月9日に晴雄の養嗣子土御門晴榮に対して正式に大学御用掛からの罷免が申し渡され、土御門家は編暦の任から外され頒暦権も喪失した。明治6年(1873年)のグレゴリオ暦改暦にも土御門家は一切関与していない。陰陽寮と天社神道も明治3年(1870年)に廃止が布告され、土御門家の家業の陰陽道は終焉を迎えた。
土御門家は明治2年(1869年)に公家と大名家を統合した華族制度が成立すると土御門家も旧公家として華族に列し、明治17年(1884年)7月7日の華族令施行で華族が五爵制になると、同月8日に大納言直任の例がない旧堂上家として晴栄が子爵位を授けられた。その後貴族院の子爵議員に当選して務めた。3代子爵土御門晴善も貴族院の子爵議員に当選して務めている。
土御門子爵家の邸宅は昭和前期には東京市滝野川区西ヶ原町にあった