佛光寺
史実としての佛光寺は、了源が山科に建てた草庵を今比叡汁谷に移して寺格化したことをもって開創とする。なお、本願寺系寺院として再興された興正寺(後述)には、了源が五条西洞院にあった親鸞の住房を山科の草庵に再興したとする説も伝えており、江戸時代に『大谷本願寺通紀』を著した玄智も興正寺の親鸞建立説を斥けつつも、了源が親鸞の西洞院の住房を山科に再興したことをもって親鸞の開基としたのではないかと推測している。また、熊野恒陽は玄智の解釈を妥当としつつ(高田門徒が京都帰還説を採用していたとすれば、帰還先は西洞院の住房と認識していた可能性が高い)、興正寺は了源が山科に草庵を建てた時に形式的とは言え覚如から与えられた名であり、この今比叡汁谷移転によって覚如とは正式に決別したため、寺名を改める必要があったとする。
佛光寺の寺号は、後醍醐天皇が東南の方向から一筋の光が差し込むという夢を見たという場所に、興正寺の盗まれた阿弥陀如来の木像が出てきたという霊験に由来する。これにより「阿彌陀佛光寺」の勅号を賜り、それを縁に山科より京都渋谷に寺基を移したともいわれる。また、当時了源を頼っていた存覚の『存覚一期記』によれば、存覚の提案を了源が容れた寺名であったとする。
元亨元年(1321年)には、覚如により親鸞の廟堂である「大谷廟堂」は寺院化され、独立。「本願寺」と号する。ここに新たな浄土真宗の一派浄土真宗本願寺教団を立ち上げた。(〈大谷〉本願寺の成立)。
寺基の移転にともない佛光寺は多くの参詣者を迎え隆盛をきわめる。また、了源の妻であった了明尼が女性として初の佛光寺9世・法主に就任している。