物質構造科学研究所
放射光科学研究施設 (PF: Photon Factory) 放射光科学第1研究系 放射光科学第2研究系
中性子科学研究施設 (KENS: KEK Neutron Science Laboratory) 中性子科学研究系
ミュオン科学研究施設 (MSL: Muon Science Laboratory) ミュオン科学研究系