マニラ大虐殺
諸君の義務は事実の発見を助けることで、起訴事実を論破することではない」と突っぱねている。
弁護団の懸命な弁護活動の甲斐なく、山下はそれまでに判例もなかった、部下がおこなった行為はすべて指揮官の責任に帰するという「指揮官責任論」で死刑判決を下された。マッカーサーは判決に対して「この将校は彼の部隊、彼の祖国及び人類に対する義務を裏切った。彼は軍人としての彼の信条にそむいた」「彼の生涯は軍職に身をおく者の汚辱である」との苛烈な言葉を追加し、山下から一切の軍装を剥がした上での絞首刑を命じた。山下はその屈辱的な死刑判決を受け入れ、最後の言葉として「死に際し、神の前に立っても自分の行いを恥じないだろう。もし日本軍司令官として能力がなかったと言われるなら、それは私の生来の能力のためであり、なんとも言えない」「諸君(アメリカ人弁護団)の親切な扱いを受けられたことはうれしかった。死んでも諸君の親切は忘れないし、刑の執行を非難しようとも思わない」と述べた。同じくマッカーサーの復讐裁判でバターン死の行進の責任を問われて死刑となった前司令官の本間雅晴は、「戦争に負けたのだから致し方ないと諦めるより外ありません」と述べた。
マッカーサーは日本軍が行ったゲリラ討伐を「強力で無慈悲な戦力が野蛮な手段に訴えた」「軍人は敵味方問わず、弱き者、無武装の者を守る義務を持っている......(日本軍が犯した)犯罪は軍人の職業を汚し、文明の汚点となり」と激しく非難したが、その無武装で弱き者を武装させたのはマッカーサーであった。
フィリピン人は日本軍を嫌っている。そのフィリピン人と一緒にいる人間はドイツ人であろうがなんであろうがやっちまえ、となったのでは?理性なんてものは全く失われていた」と回顧し、当時の日本兵の状況を「人間性(の喪失)」「自暴自棄・死に物狂い」であったと指摘している。
大虐殺事件の主犯とされたマ海防は、戦闘前にマニラから退去していたり戦闘中にマニラから脱出できた兵士もおり、終戦時には1,611人が生存していた。アメリカ軍に投降したマ海防の兵士たちは、一部の兵士がゲリラ容疑者を処刑した以外に性的暴行や大量虐殺など身に覚えが全くなく、アメリカ軍がマニラに侵攻してからは毎日ひたすら戦い続けていたので、このような容疑をかけられるのは殆どの兵士にとって全く意外なことであった。そして、司令官の岩淵の人柄を知る兵士たちにとって、岩淵に浴びせられている「海軍の名誉や自分の死に場所探求という自己満足のために多くの将兵やマニラ市民を巻き添えにした」「所詮は不要な戦いであった。10,000人が死んで得たものは苛酷な汚名だけであった」などという厳しい非難も受け入れがたいものであったという。
アメリカは自国の植民地のフィリピンに対してフィリピン独立法を成立させ、表向きの独立を約束していた。1935年11月に独立準備政府が発足、マニュエル・ケソンが大統領に就任したがその後、太平洋戦争が勃発した。アメリカ本国は在フィリピンのアメリカ軍とフィリピン軍を統合しアメリカ極東陸軍が編成すると、フィリピンの軍事顧問であったダグラス・マッカーサーを現役復帰させて司令官に任命した。やがて、フィリピンには本間雅晴中将率いる第14軍が上陸、フィリピンの戦いによってマニラも日本軍に占領され、マッカーサーはオーストラリアに脱出、ケソンはアメリカに亡命した。
フィリピンを占領した日本軍は軍政を開始した。フィリピンでは独立準備のためにフィリピン行政委員会(比島行政府)が組織されており、日本はこの行政府をそのまま利用しようと考えて、ホルヘ・B・ヴァルガスを行政府議長に任命すると、軍司令官の下に置かれた軍政監がヴァルガスを指揮し、そしてフィリピン人で構成された行政府が実際の行政をおこなうという間接統治の形式としたが、実際には、その行政府を“指導”するためとし、行政府と並立して軍政監部という組織も作って、そこに軍からの要請で日本から官僚や経済人が送り込まれた。そのため、形式上は並列で“指導”する立場であった日本人で構成された軍政監部が、実際の行政の指揮を行う直接統治のような形式となり、ヴァルガスは傀儡も同然であった。
日本は開戦の目的通り、フィリピンから資源を確保しようと計画しており、以下の方針で軍政が施行されることとなった。
軍が現地自活するため、兵を養う物資を確保する。
フィリピン国内の軍需物資を確保し、内地に送る。
マニラ早期攻略の目論見が外れたマッカーサーであったが、空爆は「友好国及び連合国市民がいる市街に対する空襲は論外である。この種の爆撃の不正確さは、非戦闘市民数千人の死を招くことに疑念の余地はない」と許可しなかった。しかし、このマッカーサーが言う“非戦闘市民”のなかには、マニラにいた数千人の日本人住民は含まれていなかった。マッカーサーは当然にマニラに多数の日本人住民がいることを知ってはいたが、ルソン島上陸直後に「死んだジャップだけが良いジャップだ」と言明したように日本人住民の安全について全く考慮することはなかった。そのため、マニラで犠牲となった日本人住民の人数すらわかっておらず、7,000人もの避難民がいたフィリピン総合病院ですら日本人の生還者は、フィリピン人看護婦フェ・ロンキーヨに看護されていたマニラの貿易商大沢清のただ一人であった。
マッカーサーは、空襲は許可しなかったものの、重砲による砲撃は許可しており、結局はマニラの破壊が進むこととなった。歩兵第129連隊が苦戦した警察署ビルにも容赦なく砲弾が降り注ぎ、最後にはビルは完全に倒壊して平地化してしまったのちにアメリカ軍の手に落ちた。アメリカ軍はL-4 グラスホッパーを弾着観測のために飛ばして、驚くほど正確な砲撃をマニラ都心に浴びせてきた。重砲の榴弾に加えて、ロケット弾、神経攪乱を狙った音響砲弾などありとあらゆる砲弾が、一定の距離間隔を置いてあたかも市街に絨毯を敷くように撃ち込まれてきたので、日本軍の虐殺を逃れたフィリピン人はおろか、エルミタ地区に居住していたスペイン人、ドイツ人、ユダヤ人といった白人たちも砲雨にさらされながら、「家は燃えてしまった。
けだもののように振舞っていました」と振り返っている。他の被害者によれば、日本兵は彼女をホテルの窓際に連れて行くと川の対岸を指さして「川の向こうにはアメリカ人がおるが、俺もお前も奴らを見ることはない。俺たちはみんな死ぬのだ」と言ったとのことであり、死を決意した男が、文明の一切の抑制を脱ぎ捨てた様子が赤裸々に語られている。日中は日本兵らは戦闘に行くのか、女性らが逃げないよう若干の警備兵が玄関等にいただけで、女性らはフロア内を動くことも話をすることも比較的自由であったが、夜になると日本軍の将兵らがやって来て性的暴行をしたという。
娘が被害を被った何人かの母親たちは、ベルビューホテルの日本軍の責任者テラモト(漢字不明)に兵士の性的暴行を止めさせるように泣きついたが、テラモトは「自分にできることは何もない」と答え、日本兵による性的暴行は止まらなかった。しかし、なかには他の日本兵が女性を連れて行こうとするのを止めようとした日本兵もいたという。
戦後のアメリカ軍の捜査によって、ベイビューホテル周辺で日本兵により性的暴行を受けた被害者は40人、未遂が36人の合計76人が特定された。ただし、自らが性的な被害を被ったと証言する女性は少なく、また、ヨーロッパ系の被害者はアメリカ軍の捜査が開始される前に多くが帰国してしまったため、実際には被害者はもっと多かったものと推定されている。
親日感情が国民のなかに定着するにしたがって、「日本軍で悪いことしたのは朝鮮人や台湾人だった」などと誤った認識を持つ国民も現れた。フィリピンの若い世代の間では、フィリピンの戦禍について認知・共有が進んでない側面もあり、戦争末期のマニラなどにおける惨禍について、『インクワイアラー(英語版)』をはじめとするフィリピン国内の大手新聞社が若い世代を対象とした特集記事を組むようになった。
一方で、犠牲者の多くを占めたアメリカ軍の砲撃について批判することはタブーとされて、フィリピン人は受忍せざるを得なかったが、犠牲者については、当初の推計よりは遥かに多く、30万人を超えたとの推計もなされるようになり、独立後にフィリピン政府はアメリカ軍に対して「日本軍に殺害された市民よりアメリカ軍の砲火にやられた市民の方が遥かに多い」と苦言を呈したこともあった。近年では、アメリカ軍がフィリピン人の生命よりもアメリカ兵の生命を優先させたことが批判的に言及されるようになっている。元フィリピン外務省の国際連合顧問で、フィリピン大学法学部名誉博士で歴史家のレナト・コンスタンティーノは、多大なフィリピン人の被害を振り返って「西洋の植民地帝国(アメリカ)とアジアの植民地帝国(日本)の戦争であった」「フィリピン人は他人の戦争に巻き込まれ犠牲になった」「我々(フィリピン人)は不幸にもこの戦争に巻き込まれ、飢え死にし討伐の犠牲となり国土を踏みにじられた」と述べている。
フィリピン奪還を目指していたマッカーサーは、この日本軍に対するフィリピン人の反感を巧みに利用することとした。日本軍の捕虜にはならずミンダナオ島に潜伏していたウェンデル・フェルティグ(英語版)大佐など、フィリピンに潜伏していたアメリカ兵たちに指示して、潜水艦で大量の武器を送り込むとゲリラとして組織化した。アメリカ統治時代からフィリピンには多数のゲリラ組織があったが、国家意識が希薄で全部が祖国愛で活動していたというわけではなく、マッカーサーが帰ってきたときの自分たちの立場を考えて、ゲリラ活動をやっていれば得するだろうという打算で活動している組織も多かった。なかには、アメリカに反感を持っているが打算で抗日活動を行っている組織もあった。
フィリピンの対日武装勢力は二つに大別できる組織からなり、ともに大きな団体となっていた。ひとつは、かつてのアメリカ極東陸軍の将兵ら(通称をアメリカ極東陸軍の頭字語USAFFEからユサッフェ・ゲリラという)であり、他方は、フクバラハプと呼ばれるフィリピン国内の農民革命運動や労働運動者たちであった。この2組織は必ずしも協力関係にあったわけではなく、あるときフクバラハプ側がユサッフェに対して同盟を組もうと迫ったが、逆にユサッフェはこれを拒絶してフクバラハプに攻撃を仕掛けたりもしていた。ユサッフェは、アメリカ極東陸軍の正式区分だった全10管区を引き継ぐ形で軍管区司令部を設置し、総兵力約22000名によるゲリラ戦を展開した。ユサッフェ・フクバラハプの2集団とは別に中小のゲリラ集団が各地に点在しており1943年に大本営陸軍部がまとめた「最近ニ於ける比島事情」には100以上の組織と27万人のゲリラが報告されている。