名古屋車両区
3両編成2本、計6両が所属している。
検査車両としてJR東海各線や樽見鉄道などの施設を検査している。
0+100番台の2両編成が6本(1+101 - 6+106)、200+300番台の2両編成が2本(201+301・202+302)、計16両が所属している。
快速「みえ」と参宮線内の普通列車で運用されている。
2006年3月18日のダイヤ改正までは急行「かすが」としてJR西日本管内(関西本線の亀山 - 奈良間)に乗り入れていた。
かつては400+500番台2両編成6本(全編成3400+3500番台に改造)と200+300番台の2両編成5本(うち2本は3200+3300番台に改造)、3200+3300番台の2両編成1本の計24両を含めた全40両が配置され、1999年からは武豊線でも運用されていた。2015年3月に武豊線での運用が終了したことに伴い、16両を残して美濃太田車両区に転出した。
2017年3月3日付で1200+1300番台の2両編成1本が美濃太田車両区から再転入したが、2019年3月11日付で美濃太田車両区に戻っている。