ヘキスト染色
ヘキスト色素は、BrdUとともに使用することで細胞周期の進行をモニターすることができる。
ヘキスト色素は次のような適用例でゲノムDNAの染色によく利用されている。
蛍光顕微鏡や免疫染色。しばしば他の蛍光色素とともに利用される。
フローサイトメトリーによる細胞の計数や分類。ヘキスト色素は、細胞集団の細胞周期状態の分析に利用される。
アガロースゲル中で、RNA存在下でのDNAの検出
自動的なDNA量の決定
染色体ソーティング
また、ヘキスト色素の排出も造血幹細胞や胚性幹細胞の研究に利用される。これらの幹細胞は効率的に色素を排出することができるため、フローサイトメトリーでside population (SP) と呼ばれる細胞集団として検出される。検出は、励起されたヘキスト色素から放出される蛍光を赤色 (Hoechst Red)と青色 (Hoechst Blue) のフィルターを通過させ、それらを互いにプロットすることで行われる。