三都
大量の物資を安価に運ぶには陸路よりも河川、湖沼、海洋の水上交通が適していた。
海上交通では、大坂-江戸間の南海路には、すでに17世紀はじめに、大型の帆船を用いて木綿・油・酒・醤油など多様な日常消費物資を江戸に運ぶ菱垣廻船が就航し、ついで18世紀前半には西宮・灘の酒をおもに運ぶ樽廻船が就航した。江戸は武士の人口が多く、酒の需要が多かったのである。樽廻船は荷役が速く、酒以外の商品を上積み荷物として安価で運送し、菱垣廻船とのあいだで争いを繰り返した。これらは定期的に運航され、大坂から木綿・油・酒などの下り荷を大量に江戸へ運んだ。その後、菱垣廻船は衰退し、江戸時代後期になると樽廻船が圧倒的な優位に立った。
いっぽう、17世紀後半には、江戸の商人河村瑞賢によって出羽国酒田を起点として江戸に至る東廻り海運と北陸地方や山陰・瀬戸内地方を経由して大坂に至る西廻り海運が整備された。西廻り航路では、18世紀末以降、日本海で北前船が遠隔地輸送を担うようになり、昆布やニシンは上方にも運ばれた。
17世紀初頭、京の豪商角倉了以は京を流れる賀茂川・保津川を整備し、さらに高瀬川を開削して淀川の港町伏見との間に水路をひらいた。そこでは高瀬舟などの中型船や小舟が用いられ、京内の舟運が物資や人を輸送する手段として発展した。そして、伏見港と大阪の八軒家を結ぶ水運として淀川には三十石船を初め大小様々な船が行き交い、また、中程の枚方宿にも、枚方浜、樟葉浜、樋之上浜、渚浜、磯島浜などの船着場が設けられていた。