厚生省研究所
人員については廃止統合時点での官制上の官吏定員を示し、嘱託、雇員、雇人を含まない。
栄養研究所 - 1920年(大正9年)9月17日設立 栄養学についての研究機関。所長佐伯矩、ほか技師7名、計24名。食品の分析や日本人の栄養生理の研究のみならず、食品貯蔵法や救荒食物の開発を行うほか、講習会を開催しラジオで日々献立表を公開していた。栄養療法を実践する療院が附属していた。
体育研究所 - 1924年(大正13年)10月25日設立 文部省所轄の体育についての研究教育機関。技師7名、計17名。このうち技師3名ほか計9名が厚生科学研究所へ移り、それ以外の学校体育に関する教育機能は東京高等体育学校へと分離された。
公衆衛生院 - 1938年(昭和13年)3月29日設立 公衆衛生学に関する大学院相当の研究教育機関。院長林春雄、ほか教授7名、計47名。医師、薬剤師、獣医師にたいし公衆衛生教育を行っていた。
人口問題研究所 - 1939年(昭和14年)8月24日設立 人口問題、当時では人口の増加と質の向上に関する研究機関。研究官12名、計29名。
産業安全研究所 - 1942年(昭和17年)1月30日設立 事業上での災害予防に関する研究および技術者養成機関。所長武田晴爾、ほか技師4名、計14名。独立の官制を持たない厚生省内部の研究所だった。
環境衛生部
国民栄養部(栄養研究所)
国民優生部(新設)
国民体力部(体育研究所)
小児衛生部
産業衛生部
疫学統計部
衛生獣医学部