日本台湾交流協会
伊藤博教(初代、1972年12月 - 1974年11月)- 元駐南アフリカ大使
卜部敏男(1974年11月 - 1977年10月)- 元駐フィリピン大使
西山昭(1977年11月 - 1980年3月)- 元駐カナダ、韓国大使
人見宏(1980年4月 - 1983年3月)- 元駐南ベトナム、タイ大使
原富士男(1983年4月 - 1990年7月)- 元駐グアテマラ大使
梁井新一(1990年7月 - 1995年2月)- 元駐韓国大使
後藤利雄(1995年3月 - 1998年3月)- 元駐韓国大使
山下新太郎(1998年3月 - 2002年)- 元駐西ドイツ、タイ、ポーランド、韓国大使
内田勝久(2002年2月 - 2005年5月)- 元駐イスラエル、シンガポール、カナダ大使 退任後の著書(下記参照)で、「私は独断と偏見の謗りを甘んじて受けつつ、政治、経済、文化、人的交流その他あらゆる面で台湾が上記三カ国のいずれに較べても『大使』として、勤務しがいのある国であったことを断言したい」と述べている。
池田維(2005年5月 - 2008年7月)- 元駐オランダ、ブラジル大使
齋藤正樹(2008年7月 - 2009年12月)- 元駐カンボジア、ニュージーランド大使
今井正(2010年1月 - 2012年4月)- 元駐イスラエル、マレーシア大使
樽井澄夫(2012年4月 - 2014年7月14日)- 外務省中国課長、在中国日本国大使館公使、軍縮会議大使、沖縄担当大使などを歴任
沼田幹男(2014年7月15日 - 2019年10月24日)- 在香港日本国総領事館領事、外務省領事局長、在ミャンマー大使などを歴任
泉裕泰(2019年10月 - )- 元駐バングラデシュ大使
東京本部と台北事務所のそれぞれに日台交流センター(日台交流中心)、台北事務所内に日本語センター(日本語中心)が設置されている。
日台交流センターは、当時の内閣総理大臣村山富市が提唱した「平和友好交流計画」に基づき、1995年10月に設置され、日台間の学術交流・人的交流を支援している。「平和友好交流計画」は2004年度に終了したが、2005年度以降も「日台知的交流事業」として引き継がれている。
日本語センターは、台湾における日本語学習者の増加に伴い、2000年7月に設置され、台湾の日本語教育を総合的に支援している。
2003年12月12日:台北事務所が、断交以来32年ぶりとなる天皇誕生日祝賀会を主催。台湾側は亜東関係協会会長許水徳が祝辞を述べ、外交部長簡又新、中国国民党副主席蕭万長ら政財界関係者400人以上が参加。中華人民共和国側は日本に強く抗議。
2005年4月:断交以来初めて台湾人への叙勲が授与される(元東呉大学外国語学院院長・日本語教育学会初代理事長蔡茂豊に対して旭日中綬章)。
2007年12月12日:再開後5回目となる天皇誕生日祝賀会で、行政院外交部長黄志芳が外交部長(外務大臣)として初めて祝辞。所長池田を「大使」と呼び、「意義深い会合で台湾政府と人民を代表してあいさつし、天皇陛下を始め日本政府と国民に祝賀の意を表することができ光栄だ」と述べた。祝賀会は高雄でも高雄事務所主催で開催された。
2008年5月20日:馬英九の総統就任に際して、交流協会の理事長高橋雅二が福田康夫内閣総理大臣の公式の書簡を手交し、「我が国の台湾に関する立場は日中共同声明にあるとおりであり、日台関係を非政府間の実務関係として維持してきている、今後とも引き続き財団法人交流協会を通じ、できる限りの支持と協力をする方針である」旨のメッセージを伝達した。日本政府が台湾の総統就任にメッセージを送るのは、1972年の断交以来初めてとみられる。
神戸浩道(2006年12月 - 2010年4月)- 元外務省大臣官房人事課人事企画官 元在オーストラリア大使館領事
野中薫(2010年5月 - 2013年3月)- 元外務省大臣官房儀典官兼儀典外国訪問室長
中村隆幸(2013年4月 - 2016年3月)
中郡錦藏(2016年4月 - 2019年3月)
加藤英次(2019年4月 - 2022年2月)
小野一彦(2022年3月 -2023年4月 )
奥正史(2023年4月 - )