地域医療機能推進機構滋賀病院
保険医療機関
労災保険指定医療機関
指定自立支援医療機関(更生医療)
指定自立支援医療機関(育成医療)
身体障害者福祉法指定医の配置されている医療機関
生活保護法指定医療機関
結核指定医療機関
指定養育医療機関
戦傷病者特別援護法指定医療機関
原子爆弾被爆者医療指定医療機関
原子爆弾被爆者一般疾病医療取扱医療機関
公害医療機関
母体保護法指定医の配置されている医療機関
臨床研修病院(協力型)
特定疾患治療研究事業委託医療機関
DPC対象病院
救急告示病院
エイズ治療拠点病院
第二種感染症指定医療機関
このほか、各種法令による指定・認定病院であるとともに、各学会の認定施設でもある。