飯塚事件
「西の飯塚、東の足利」と言われてきた通り、本件と足利事件の両事件はMCT118型検査法によるDNA型鑑定が同じ時期に同じ方法で、同じ鑑定技官によって実施されていた。
2008年10月16日、足利事件の再鑑定が行われる旨の報道がされた。その12日後の10月28日、本件での久間の死刑が執行された。2009年6月4日、足利事件で服役中であった人物が最新のDNA型鑑定などによって事実上の無実釈放となる。足利事件は、当時の123塩基マーカーで計測したMCT118型の鑑定結果を、アレリックラダーマーカーで再計測したところ、犯人と服役中であった人物のDNA型が一致しないことが明らかになったものであり、また有罪判決に足る証拠はDNA型鑑定と血液型の結果以外になかった事件である。
それに対して、本事件は、第2審でアレリックラダーマーカーでの検証がなされているほか、新たに開発されたTH01型とPM型の検査法(2万3000人に1人の精度)によって久間所有の車の血痕と被害者のDNAが一致したとの結果が出ている点で異なる。
久間のアリバイを直接に裏付ける証拠はなく、間接的ものとして久間自身と妻の供述が、捜査段階と公判段階で変遷しており、証拠として成立しないこと。 当日のアリバイについて、久間は、捜査段階で、妻を職場に送って一度帰宅した後に実母宅に向かったと述べていたが、捜査官の再現によって女児が行方不明になった時間に久間が現場を通過する結果になったところ、公判段階で、妻を送った後まっすぐ実母方に向かったと供述を変更した。また、事件当日の行動を思い出した時期ときっかけも、捜査段階では、3月20日に「刑事が帰った後で、あの日は何をしていたのかなあと思って思い出した。妻とは事件の話をしていないので、妻と話し合っているうちに思い出したということはない」と供述していたが、公判段階では、2月25日ごろに妻が事件当日のことではないかと挙げた話を聞いて思い出した、と供述を変更した。そのため、「アリバイに関する供述は......信用できない」と判示された。 久間の妻の供述は、久間が実母方に行った日について、捜査段階では「事件当日の前後ごろだったと思う」と曖昧な記憶であったのに、公判段階では事件当日であると特定するようになっており、「たやすく信用できない」と判示された。