石垣空港
日本トランスオーシャン航空 (JTA) 東京国際空港(石垣発は沖縄/那覇経由) 関西国際空港(石垣発は沖縄/那覇経由) 那覇空港 宮古空港
琉球エアーコミューター (RAC) 那覇空港 宮古空港 与那国空港
全日本空輸 (ANA) (ANAウイングスの機材・乗務員で運航する便あり) 中部国際空港 関西国際空港 福岡空港(夏季のみ運航) 那覇空港 宮古空港
かつての就航路線
大阪国際空港・神戸空港・広島空港・多良間空港・波照間空港
かつて就航した会社
エア・アメリカ(1964年-1967年) - 南西航空(現日本トランスオーシャン航空)が就航する以前。
乗降客数が増加する予想は過大。
環境が自慢の観光資源の島で、環境を破壊する大きな開発を伴う。
現空港の拡張は可能。
基本計画では、石垣市庁舎の移転は市街地の空洞化を招くとして除外されていたが、2016年2月7日に行われた住民投票では、現在地での建て替えが18%(2,655票)であったのに対して、高台にある空港跡地への移転が81%(11,895票)を占め、同月中に市庁舎を空港跡地に移転することが正式に決定された。設計は隈研吾建築都市設計事務所と地元の洲鎌設計室の共同企業体が担当。新庁舎は2021年11月12日に完成し、11月15日に業務が開始された。