ゴジラ (ミレニアムシリーズ)
武器は放射能熱線、引力放射能熱線(対キングギドラ最終攻撃時)。
1954年に出現した個体以来50年ぶりに出現したゴジラ。民俗学者の伊佐山嘉利は、ゴジラは太平洋戦争で犠牲になった人々の残留思念の集合体だと主張する。日本を襲う理由は、戦争犠牲者の叫びと無念を現代人が忘れ去ってしまったからだという。本作品のゴジラはずる賢く残忍な性格で、一度受けた攻撃を覚え、二度目はすべてかわすため、バラゴンとモスラは二度目の奇襲に失敗する。また、逃げ惑う群衆を目がけて熱線を吐く、患者の入院中の病院を通過すると思われた直後に尻尾で破壊するなど、人間を憎悪しているような描写が散見される。
グアム島沖でアメリカの原子力潜水艦を沈め、小笠原諸島の孫の手島を壊滅させると、静岡県焼津市焼津港に上陸し、付近一帯の人間を殺戮する。その後、箱根山大涌谷でバラゴン(婆羅護吽)と遭遇するが、これを一蹴して東京へ向かう。横浜での戦いでは、防衛軍の陸上部隊と水上部隊、モスラ(最珠羅)、キングギドラ(魏怒羅)を相手に数的不利な戦いを強いられるが、圧倒的な戦闘能力ですべてをねじ伏せた。
しかし、キングギドラを撃破した際に護国三聖獣の霊的エネルギーを浴びせられ、金縛りに遭って海底へ沈む。
別名:GMMGゴジ
造型は引き続きモンスターズが担当。スーツは新規造形で、陸用と海用の2着が制作された。機龍ゴジの型を流用しており、歯の原型が新規に作られ、背びれも尾のつなぎ目や全体のボディバランスが不自然にならないよう修整している。唇の皮は本体に接着しておらず、『モスラ対ゴジラ』での揺れる頬の再現を試みている。
胸は傷跡を表現するため、ラテックスの皮を重ねてみみず腫れのように盛り上がっている。この部分のみ、西川によるラフデザインが描かれている。完成直後のスーツでは傷の塗装が生々しいものであったが、手塚から目立ちすぎると指摘され、抑えた色合いに塗り直された。しかし、今度は地味になりすぎてしまい、これをフォローするために本編で傷についての言及やスキャン映像などが追加された。
メインスーツは、以前のものより大きくなったとされ、喜多川は居住性が高く動きやすくなったと述べている。