名探偵コナン 絶海の探偵
声 - 沢木郁也
京都府警捜査一課刑事。綾小路警部の部下でイージス艦にも随行。
本作のプレストーリーであるテレビアニメ「消えた老舗の和菓子」にも登場した。
声 - 鈴木清信
イージス艦「ほたか」体験航海中の艦内警備担当、砲雷科の運用員。海上自衛隊三等海尉。
我孫子三尉と共にニューナンブM60拳銃を携帯して衛星電波の調査に当たる。その後、発信現場に突入するが、コナンは電波を切って発見されるのを回避している。
声 - 麻生敬太郎
イージス艦「ほたか」砲雷科の砲雷長兼戦術行動士官。海上自衛隊三等海佐。
武器などの運用を担当する砲雷科のトップで、CICの実質的な責任者。有事の際は攻撃命令を発令、平時では艦内警備の指揮を執り、CICから艦長の補佐をする。
室内の通信機器を調べるために所持品を回収されそうになったコナンは、小五郎に盗聴器を付けてその場を立ち去る。
ヘリで京都府警の綾小路文麿とその部下・車折刑事が合流した。そのころ平次は阿笠博士と合流し、灰原が赤い塗料の鑑定をした結果、赤い塗料は船の塗料として用いられるTBTと分かり、笹浦の胴体は海流によって流されたわけではなかったことも分かる。また、コナンが送ったデータはイージス艦のデータの一部と分かり、そのデータは笹浦がネットのクラウドサービスに1度保存し、その後に携帯のデータカードにコピーしたものであることも分かる。コナンは、なぜ笹浦がイージス艦の情報を民間のクラウドサービスに保存したのか疑問を抱く。
コナンは小五郎に付けた盗聴器で拾った会話から、笹浦が今朝5時半頃日の丸の旗をふっているところを観光船の職員が目撃していたことを知る。また、笹浦がイージス艦のデータを流出させたことが分かった。
対空対潜戦闘の訓練が終了する直前に未確認物体が艦に接近する騒ぎで艦長がCICに来て、艦長室が無人だと推理したコナンは、勇気の父親がXだと気付き、直ちにXに会いに行く。コナンは、Xに船が揺れた時に艦長室に居たことと、雨宮さんと言った時すぐ振り向けなかったことや、勇気の薬は塗り薬ではなく飲み薬であること、そして勇気はアトピーではなく食物アレルギーであることを次々に言い当てXを追い詰める。コナンは、ボール射出ベルトからボールを出そうとするが、小五郎の名刺のせいで転んでしまう。
声 - 柴咲コウ
本作のキーパーソン。自衛隊情報保全隊所属。海上自衛隊一等海佐。
ミステリアスな雰囲気を漂わせる美女で、イージス艦「ほたか」に乗艦する唯一の女性自衛官。イージス艦における女性隊員の乗艦は前例がなかったため、コナンに怪しまれて質問された際、女性隊員も任務に参加するための計画の一環であり、担当は料理係だと答えるが、艦長室で証言の矛盾をコナンに指摘され、笹浦一等海尉の情報漏洩事件に関する工作員の捜査のために乗艦したと明かした。「X」との戦闘に備えH&K USP拳銃を携帯している。自衛官としての使命感から警察官や探偵を信用していなかったが、小五郎から「Xを逮捕する事すら出来ない」と諭される。
優れた洞察力の持ち主で、コナンの真の推理力を見抜き、その素性を疑問視する。