海草
日本産の海草類のうち、5科17種が2007年に公表された環境省の維管束植物レッドリストに掲載されている(このうちネジリカワツルモは上記の大場・宮田(2007)のリストでは認めていない)。保全対策として泡瀬干潟などで行われている大規模な埋立事業の代替措置として海草群落の移植が行われている。
アマモ科(4種) オオアマモ - 絶滅危惧II類 タチアマモ - 絶滅危惧II類 エビアマモ - 準絶滅危惧 スゲアマモ - 準絶滅危惧
ベニアマモ科(5種) ベニアマモ - 準絶滅危惧 リュウキュウアマモ - 準絶滅危惧 マツバウミジグサ - 準絶滅危惧 ウミジグサ - 準絶滅危惧 シオニラ - 準絶滅危惧
トチカガミ科(4種) ウミショウブ - 絶滅危惧II類 ヒメウミヒルモ - 絶滅危惧II類 ウミヒルモ - 準絶滅危惧 リュウキュウスガモ - 準絶滅危惧
イトクズモ科(1種) イトクズモ - 絶滅危惧II類
カワツルモ科(3種) ネジリカワツルモ - 絶滅危惧IA類 ヤハズカワツルモ - 絶滅危惧IA類 カワツルモ - 準絶滅危惧