DNMT3A
DNMT3Aは、Pro-Trp-Trp-Pro(PWWP)ドメイン、ATRX-DNMT3-DNMT3L(ADD)ドメイン、そして触媒を行うメチルトランスフェラーゼドメイン、という3つの主要なタンパク質ドメインから構成される。ADDドメインはメチルトランスフェラーゼドメインの阻害因子として機能し、ヒストン H3のメチル化されていないリジン4番残基(H3K4me0)へ結合することで阻害が解除される。このように、このタンパク質にはヒストンを標的としたメチル化制御機構が存在するようである。メチルトランスフェラーゼドメインは高度に保存されており、原核生物との間でさえも保存性がみられる。