鹿苑寺
絹本著色足利義満像(応永十五年六月足利義持賛)・絹本著色足利義満像(義満の和歌三首あり)
絹本著色達磨図
大書院障壁画 - 伊藤若冲筆。宝暦九年の年記がある。 紙本墨画葡萄図(葡萄之間)(一之間)15面 紙本墨画松鶴図(松鶴之間)(二之間)8面 紙本墨画芭蕉図(芭蕉之間)(三之間)12面 紙本墨画鶏及秋海棠図(四之間)11面 紙本墨画竹図(狭屋之間)4面
木造不動明王立像(不動堂安置) - 西園寺護摩堂旧本尊。
子元祖元高峰顕日問答語
慈聖院并寿寧院遺誡
伊藤若冲の障壁画をはじめ、大部分の指定文化財は本山である相国寺が管理しており、承天閣美術館で保管されている。