マルゴット・ホーネッカー
1989年に東欧革命が発生し東ドイツにも及ぶと、ヴィリー・シュトフ内閣の辞任とともにマルゴットも辞任した。SEDの支配体制が崩壊すると、マルゴットは西側亡命者の子女を強制的に養子縁組に出した罪で訴追された。しかしマルゴットが直接関与した証拠は出てこなかった。マルゴットは更なる刑事訴追を逃れてエーリッヒと共にモスクワに逃れた。1991年のソ連崩壊後は娘の嫁ぎ先であるチリに移った。
1992年以降、マルゴットはチリ人の夫と暮らす娘ゾニアと共にチリの首都サンティアゴに隠棲した。夫エーリッヒは1994年に81歳で肝臓がんのため死去した。夫の遺体はサンティアゴで火葬され、遺灰は自宅に置いてあるという。統一後のドイツではホーネッカー夫妻の私有財産に関する裁判が行われ、1999年に6万ドイツマルクに相当する追徴判決が下された。マルゴットは寡婦年金と老齢年金として毎月1500ユーロを受けて生活していた。2000年には元チリ共産党書記長のルイス・コルヴァラン(英語版)のインタビューを受け、東ドイツの歴史について回顧した書籍を出版した。
2008年7月、ニカラグアのサンディニスタ革命29周年にあわせ、同国大統領ダニエル・オルテガより文化独立勲章「ルーベン・ダリオ」を授与された。文盲を減らす運動への貢献によるものとされている。この授与式にマルゴットはベルリンの壁崩壊以後初めて公の場に姿を現したが、発言はしなかった。マナグアで行われた式典には中南米の左翼的指導者であるパラグアイ大統領フェルナンド・ルゴやベネズエラ大統領ウゴ・チャベスも出席した。
2016年5月6日、サンティアゴでがんのため死去。