九州平定
病死とも毒殺ともいわれているが、家久の嫡子島津豊久には日向の都於郡(西都市)と佐土原が安堵された。
秀吉は秀長に、大友宗麟に日向一国を与えて伊東祐兵をその与力とし、大隅のほぼ一国(伊集院忠棟領一郡を除く)を戸次川の戦いで嫡男信親を失った長宗我部元親に与える計画を伝えた。
これは、秀吉が秀長に充てた天正15年5月13日付の書状に残されているが、宗麟と元親はともに固辞したため実行にうつされなかった。なお、宗麟はこの年の5月23日、隠居の地とした豊後津久見(大分県津久見市)において死去している。その結果、新恩として島津義弘に大隅国(秀吉蔵入地・伊集院忠棟領一郡を除く)と日向諸県郡が与えられた。義弘の子島津久保には諸県郡のうち真幸院があたえられた。
宗麟の子大友義統には豊後一国と豊前の内で宇佐半郡が安堵された。日向国の縣(延岡)と宮崎には高橋元種が移された。肥後国は大半が佐々成政に与えられ、肥後国人衆がその家臣団として旧領を安堵された。肥後人吉(人吉市)は相良氏家臣深水長智の交渉により相良頼房に安堵された。
そして、小早川隆景には筑前・筑後・肥前1郡の約37万石、黒田孝高には豊前国のうち6(5.5)郡(京都・仲津・築城・上毛・下毛・宇佐半郡)の約12万5,000石、森吉成には豊前企救郡・田川郡の約6万石、大友義統の家臣であった立花宗茂を大名に取り立てて筑後柳川城(福岡県柳川市)に13万2,000石、毛利勝信には豊前小倉(福岡県北九州市)約6万石をそれぞれあたえた。
豊臣秀吉は西国平定を果たし、朝鮮や琉球に対し服属を求めた接触を始めることとなった。また、目標を東国平定に定め、関東の北条氏、奥州の伊達氏へと矛先を移した。
佐々成政は肥後の領国化を急ぐあまり、領地を与えられたその翌月に検地を推し進める。そのために国人衆の反発を招き肥後国人一揆をもたらした。結果、成政は失策を咎められ切腹、国人らも殆どが処刑された。その後は肥後の北半分を加藤清正、人吉を除く南半分を小西行長が領することとなった。
日向高千穂(宮崎県西臼杵郡高千穂町)の領主である三田井氏には秀吉から領地を安堵するとも没収するとも沙汰がなく、そのため高橋元種は三田井氏を従わせようと欲して進軍、これを攻め滅ぼした。
島津氏では所領を失ったことによる財政問題が生じ、伊集院久治、上井覚兼ら給地を失った家臣らへの補填がかなわず、京都市中の商人や過船からの借銀、蔵入地の入質および売買によってこれを克服しようと試みている。また、この財政の窮乏は公儀からも難詰されている。この財政難の克服のため検地が行われるが、これらの施策に対する不満がのちの梅北一揆へと繋がったものと考えられる。
秀吉は4月25日に肥後佐敷(熊本県葦北郡芦北町)、26日に肥後水俣(熊本県水俣市)と進み、4月27日には島津方の予想を上回る速さで秀吉が薩摩国内に進軍すると、出水城(出水市)の城主島津忠辰、宮之城(鹿児島県薩摩郡さつま町)の城主島津忠長らが降伏した。先鋒の小西行長、脇坂安治、九鬼嘉隆、加藤嘉明は海路から24日出水に、25日には川内(鹿児島県薩摩川内市)に入っていた。秀吉は、薩摩の浄土真宗勢力を利用するために本願寺(当時は摂津国天満に本拠を移転)の顕如をともなっていた。これにより獅子島(鹿児島県出水郡長島町)の一向門徒の協力を得て、島津方の意表を突く迅速さで出水・川内の地に達したのである。4月28日、小西・脇坂・九鬼勢は平佐城(薩摩川内市平佐町)に攻撃を仕掛けたが、ここで城主桂忠詮の反撃にあった(平佐城の戦い)。このとき、平佐城の井穴口を守る原田帯刀が寄手大将小出大隅守の弟九鬼八郎を弓で射とめ、また、城内の女たちや子どもたちも懸命にはたらくなど善戦して、双方、相当数の犠牲者を出した。これが島津方の最後の抵抗となった。