ブルーシティー
襲撃グループで唯一、生き残ったジュンはロゴス司令官の前で水棲人のように変身し、取り乱したロゴスに射殺される。ロゴスはドクター・ジェノサイドのファイルを持ってこさせる。解剖されたジュンの胎児は完全に水棲人に変身しており、母体はそれに耐えられなかったことが明かされる。また、ドクター・ジェノサイドの細菌兵器は強い紫外線との相乗効果により、一部の人類を水棲人類に変身させたことも明らかにされる。
ベテランの潜水艦艦長イェルマークの息子は、新型潜水艦アクエリアス号に初任務として乗り込んだが、アクエリアス号は海底で何者かの襲撃を受けて座礁を起こした。
イェルマーク艦長は旧式潜水艦ユーラクロン号でアクエリアス号の救助に向かうが、そこへ「BC計画」の責任者を名乗る車椅子の男・ロゴスが乗り込んでくる。
アクエリアス号を沈めたのは、潜水艦と同等サイズまで巨大に成長したシャコであった。一時はユーラクロン号も巨大シャコに襲われ身動きが取れなくなるが、シャコの本能を利用して撃退に成功、海上へと戻るがユーラクロン号も航海不能と判断され、廃棄された。
ロゴスは自身のBC計画にイェルマークを誘うために声をかけようとするが、息子にもっと海の脅威を教えておけばよかったと悔みながら海面に酒を注ぐイェルマークの姿を見て、声をかけるのを後にした。
『週刊少年ジャンプ』(集英社)にて、1976年2号から同年21号まで連載された。全18話。1979年の『週刊少年ジャンプ1/25増刊』(同社)には前日譚となる「海の牙」が掲載され、『週刊ヤングジャンプ』(同社)に続編となる『バトル・ブルー』が1984年10号から同年12号に掲載された。
単行本はジャンプスーパーコミックス(創美社)から全2巻で発売された他、スコラ漫画文庫、MF文庫からも再刊されている。2010年には光文社から、『BLUE CITY CHRONICLE』として雑誌掲載時カラーページや「バトルブルー」を収録したシリーズ完全収録版が販売されている。
2004年2月の『BSマンガ夜話』(NHK-BS2)では本作が採り上げられた。
2010年に発売された光文社版『BLUE CITY CHRONICLE』2巻では、帯で本作を「海洋SF冒険譚の到達点」と呼ぶと共に、『復活の日』(小松左京)、『わが赴くは蒼き大地』(田中光二)といったSF小説の血脈であると呼んでいる。