佐渡汽船
これに伴い前日をもって「こがね丸」が運航終了。
2018年 7〜9月 - 寺泊 - 小木で月1回ずつの試験運航。 9月27日 - 佐渡島観光PR用の公式ブログ「さどトリコ」開設。 10月 - 寺泊 - 小木でジェットフォイルを5日間試験運航。 10月31日 - 赤泊航路の廃止届を北陸信越運輸局へ提出。。
2019年 2月15日 - 北陸信越運輸局が寺泊 - 小木航路の不定期航路事業を認可。 5月1日 - 赤泊航路を廃止。
2021年 2月10日 - 2020年12月期で債務超過となったことを受け、佐渡市を割当先とする第三者割当増資を実施。佐渡市が主要株主となる。 2月25日 - チケットレス乗船サービス「佐渡汽船 Sチケット」を開始。 3月20日 - 高速カーフェリー「あかね」が運航終了。 6月25日 - 高速カーフェリー「あかね」のスペイン(Forde Reederei Seetouristik Iberia SL)への売却が決定。帳簿価格は2,409,000千円、譲渡価格は3,050,000千円。
2022年 3月31日 - みちのりホールディングスと第四北越銀行を割当先とする第三者割当増資を実施。同時にみちのりホールディングスが筆頭株主となる。 5月6日 - 東京証券取引所スタンダード市場上場廃止。 5月10日 - 株主併合により、株主がみちのりホールディングス、新潟県、佐渡市、佐渡農業協同組合、第四北越銀行のみとなる予定。
2023年 1月1日 - 佐渡汽船シップマネジメント、佐渡汽船シップメンテナンス、佐渡汽船観光、佐渡汽船商事の4社を吸収合併した。
こうした事から新潟県は2007年、直江津航路の存続について検討を開始した。議論は減便や季節航路化、さらには佐渡汽船の航路撤退や航路そのものの存廃にまで及んだ。だがその一方で、直江津航路は新潟航路とともに国道350号の海上区間を担っており、仮に廃止となった場合にはこのルートが断たれてしまうことになる。また2015年春には北陸新幹線の長野駅 - 金沢駅間の延伸開業が予定されており(その後開業)、直江津航路は新幹線利用者の観光二次交通の一つとして重要であるとの見地から、上越市と佐渡市は存続を強く主張してきた。これを受けて佐渡汽船は前述の通り、直江津航路を当面フェリー1隻体制で維持する方針を2008年1月18日に発表し、同年4月1日からは奇数日が直江津発1本・小木発2本、偶数日が直江津発2本・小木発1本という変則的な運航体制となった(但し第2・4の金・土曜は1日2往復、繁忙期は1日最大3往復、冬季は全面運休するが年末年始に限り1日1往復を運航)。
県と両市は直江津航路の2隻体制復帰に向け、同年春に「小木直江津航路二隻化戦略検討委員会」(のちに前述の「佐渡航路確保維持改善協議会」へ改組)を立ち上げ協議を進め、直江津航路を対象とした社会実験を相次いで実施した。同年8月には「アースセレブレーション」「小木港まつり」等の開催に合わせ、新潟 - 小木間・直江津 - 小木間の2経路でジェットフォイルの臨時運航を実施した。
おけさ丸 (3代) 1993年3月建造、全長134.7m、総トン数5862t、最大旅客定員1705名、車両積載台数:大型バスまたは大型トラック32台及び乗用車48台、乗用車のみの場合290台、最大速力23.4ノット 保有するカーフェリーの中で最大。 両津航路に就航する、カーフェリー「ときわ丸」
ときわ丸 2014年3月建造、4月8日定期就航。 全長125.0m、総トン数5300t、最大旅客定員1500名、車両積載台数:大型バスまたは大型トラック28台及び乗用車8台、乗用車のみの場合168台、最大速力19.1ノット
2008年 4月 - 小木航路のカーフェリー1隻体制となる(昭和58年就航と船歴の高かった「こさど丸」を廃止し、「こがね丸」1隻体制)。 5月 - 小木航路1隻体制で余剰となった「こさど丸」のいわさきコーポレーション系・新屋敷商事への売却が決定。帳簿価額は226,853千円、譲渡価額は600,000千円(消費税別)。引き渡し日は6月10日。
2009年 4月 - 事業会社を分割。船舶運航に関する業務を連結子会社の「佐渡汽船シップマネジメント」に移管し業務委託を開始。 10月 - 事業会社を分割。陸上業務を「佐渡汽船営業サービス」「佐渡汽船シップメンテナンス」に移管。
2012年 3月31日 - 新潟港・両津港両ターミナルにて自動改札機(QRコード・Felica併用型)の運用を開始。また6港とも乗船時の旅客名簿の提出が不要となる。 4月 - 佐渡汽船営業サービス株式会社を吸収合併。
2013年 3月23日 - 両津航路にてSuicaのサービスを開始(Suica電子マネーのシステムによる)。PiTaPaを除く全国9種類の交通系ICカードが利用可能となる。 4月 - 日本海内航汽船株式会社を吸収合併。貨物事業部を設置。
2014年4月8日 - カーフェリー「ときわ丸」が新潟 - 両津間に就航。これに伴い、「おおさど丸」が運航終了。
2015年 3月4日 - 固定資産(カーフェリー)の譲渡に伴い約8億7500万円の特別利益が発生する見通しだと発表。譲渡先はリベリアの海運企業。決算は2015年12月末。 4月21日 - 高速カーフェリー「あかね」が直江津 - 小木間に就航。
1890年代半ば以降、新潟 - 両津間の越佐航路は越佐汽船(1885年設立)のほぼ独占状態となっていたが、収益性の高い本土間の航路に注力していたため佐渡島民からの反発が高まっていた。1913年(大正2年)2月、佐渡商船(資本金15万円)が設立され、「国東丸」や「第二十二永田丸」などが就航し、1914年9月には「第一佐渡丸」が就航した。
越佐汽船の保有船に比べて佐渡商船の「第一佐渡丸」は船舶の性能が高かったため(所要時間4時間)、越佐汽船は運賃の値下げで対抗した。両社の競争が激化したため、佐渡出身の県会議員だった野沢卯市は新潟県知事の北川信従に斡旋を要請し、越佐航路で得た収益を合算して使用船舶の総トン数により両社へ配分する共同計算方式(佐渡商船が60%、越佐汽船40%)が成立した。その後、越佐汽船は1918年(大正7年)年に新潟汽船に改称した。
両社の共同計算方式は維持されていたが、前佐渡地域での佐渡商船の航路運営への不満から1923年1月に前佐渡汽船(資本金3万円)が設立された。前佐渡汽船は1927年(昭和2年)7月に新たに越佐商船(資本金10万円)を設立した。
1927年以降、新潟県議会では佐渡商船、新潟汽船、越佐商船の3社を県営に移管する議論が浮上し、新潟県知事の黒崎真也が県営化のための交渉に入ったが利害関係の調整に難航したため方針を転換して半官半民とすることで決着し、1932年(昭和7年)4月に佐渡商船が他の2社を買収する形で新会社の佐渡汽船が設立された。