クレメント・ゴットワルト
同年6月7日、ベネシュが大統領を辞任し、これを受けて6月14日にゴットワルトが大統領に就任する。ゴットワルトの政府は、工業や農業の国有化を積極的に進めた。
ゴットワルトはスターリン主義者であった。このため、政府内からソ連に反対する勢力を排除するために、まず非共産主義者を排除し、続いて共産主義者の粛清も行うようになった。ゴットワルトにより粛清された人物は、元共産党書記長のルドルフ・スラーンスキーや元外務大臣のヴラジミール・クレメンティス、グスターフ・フサークにまで及んだ。スラーンスキーとクレメンティスは絞首刑に処された。フサークは終身刑ですんだが、後に名誉回復され、第一書記をつとめた。
1953年3月9日のスターリンの葬儀から戻った5日後に肺炎で亡くなった。心臓病に加え、深酒と梅毒が原因だと言う。遺体は防腐処理されてそれを納める霊廟が建てられたが、1962年に撤去され、遺体は火葬された。