アニメショップ
同人誌・同人ゲーム - 同人サークルからの委託によるもので"委託販売"という。これを中心とする形態の店舗に関しては同人ショップの項も参照のこと。
キャラクターグッズ - ファングッズやファンアイテムと呼ばれることもある。キャラクターの絵柄入りの商品をさす。 文房具 - 下敷き・メモ帳など。 携帯ストラップ ラミネートカード ピンバッジ マグカップ テレホンカード・図書カード - ポイントサービスのポイント交換の景品となっていることも多い。 トレーディングカード ぬいぐるみ フィギュア カプセルトイ 食玩 ポスター・カレンダー - 店頭POP用のポスターも使用後に販売していたり、抽選等でもらえることがある。 Tシャツ 抱き枕
ケミカルライト・ペンライト - 声優のコンサートやアニメ関連イベントで使用が増えているため取り扱う店舗が多くなっている。
店舗の系列や規模によって、以下に挙げていても扱わない商品もある。また、系列独自開発の商品を販売していることや、一般の書店やレコード店等の他の店ではつかない限定特典がつくことも多い。大きく分けてキャラクターグッズやフィギュアなどを中心に取り扱うホビーショップ(英語版)形態の店舗と書籍や映像ソフトなどを中心に取り扱う書店形態の店舗がある。
漫画雑誌・漫画単行本・漫画情報誌
アニメソフト (DVD・BD) ・アニメ雑誌
小説単行本・ライトノベル
コンピュータゲームソフト - ゲーム機本体およびオプション品・中古ソフト・ゲーム雑誌・攻略本は扱わないことが多い。
ドラマCD
アニメ・ゲーム作品の主題歌CD・サウンドトラック
声優関連の音楽CD
作品関係や業界関係のムック本
漫画制作用具 - 漫画用原稿用紙・ペン・インクなど。
コスプレ衣装・小道具
大規模な同人誌即売会やガレージキットイベントのパンフレット、アニメ・ゲーム関連イベントのチケット等
アニメイト● - 全都道府県に店舗がある。最新作品関連を全般的に取り扱っているが、特に女性向けグッズに強みがある。 ゲーマーズ● - アニメイト系列。ブロッコリーにより設立された経緯からブロッコリー作品関係の商品が多い。男性向けグッズに強みがある。 らしんばん● - アニメイト系列。中古専門店。 メロンブックス● - アニメイト系列。基本的に同人誌に強いが、アニメショップに準じた品揃えの店が多い。 書泉● - アニメイト系列。サブカルチャーに強い書店。
まんだらけ● - 中古専門店。東京・中野にある中野ブロードウェイを本拠とし、新旧ジャンル問わずあらゆるグッズを取り扱っている。
とらのあな● - 基本的に同人誌に強いが、アニメショップに準じた品揃えの店が多い。
ジーストア● - タブリエ&コスパ・グループ。 コスパ● - コスプレ関係とキャラクターアパレルが中心。運営している株式会社コスパはブロッコリーとも縁が深い。
ソフマップ● - 元々パソコンショップのためゲームを中心にホビー類の取り扱いがあったが、ヤマギワソフトを傘下にしてからはキャラクターグッズも専門店に準じる程多く取り扱うようになった。
マルゲ屋● - 新声社が運営していたゲームのキャラクターグッズ専門店。後に同名の小売子会社を設立し移管。当初は本社のあった神保町で営業し、その後急激に店舗網を拡大する。通信販売はゲーメストなどの誌上で行っていた。1999年9月、新声社の倒産に伴い閉店。
マグマニ● - 千葉市に店舗を構えていた地場系ショップ。他に川崎市、次いで秋葉原にも店舗を構えたが、2010年までに全店舗が閉店し廃業。
キャラ● - 秋葉原にて営業。イメージキャラクターとしてここまひによるデザインで声は南央美が担当していた「キャラちゃん」がいた。
メルヘン・ボックス● - 西武池袋線・大泉学園駅前にて営業。狭い店舗にグッズや段ボールが所狭しと積み上げられており、レアアイテムが発掘されることがあった。
ペーパームーン● - 岐阜県の地場系ショップ。等身大フィギュアの製作でも知られていた。業績不振に伴い2015年4月で閉店し同年5月破産手続きを開始。
アニメランド - 西武新宿線・上石神井にて営業。占有していたフロアの約半分を利用していた。もう半分は当時、タツノコプロ等の作品の背景を描いていたスタジオだった。
キャスフ - 西武池袋線・桜台にて営業。和光プロダクション制作の『アンデス少年ペペロの冒険』や『激走!ルーベンカイザー』等のセル画や『妖怪伝 猫目小僧』の素材を販売していた。
Anibox● - エターナルアミューズメントが運営していた。2020年3月に全店舗が閉店。
アニマップ - 福岡にて営業。店長は九州朝日放送のアニラジ『平成アニメっ娘倶楽部』のパーソナリティをしていた。
O-TRAP● - 和歌山県の地場系ショップ。2001年-2005年頃まで和歌山放送の『痛快! アニメジオ』のスポンサーを務めていた。
TOWERanime - タワーレコードのアニメソングを中心としたアニメショップで2013年10月にLALAガーデンつくばの既存店舗を改装してオープン。合わせてヤスダスズヒトデザインによる店員キャラ「田和 玲子(タワ レイコ)」を発表。2014年5月には新宿店の、2015年7月には名古屋近鉄パッセ店の、それぞれのアニメ取り扱いフロアを改装してTOWERanimeとしている。
あみあみ● - フィギュアや模型を主力にしているが、キャラクターグッズもそれに並ぶ規模で取り扱っている。元々は通信販売を主体にしていたが、2015年相模原市に実店舗を出店、2016年には秋葉原に出店している。
駿河屋● - 中古総合ホビーショップ。競合するまんだらけやらしんばん同様に新旧ジャンル問わずあらゆるグッズを取り扱っている。元は通信販売・通信買取を主体にしていたが、2015年高槻市に実店舗を出店、2016年には秋葉原や静岡市に出店している。
eeo Store● - 池袋にて営業。