Fate/Grand Orderのメインストーリー
2016年7月25日配信。一行はダ・ヴィンチとともに第9回十字軍撤退後1273年のエルサレムに形成された特異点へ赴き、ルキウスという青年と出会う。ルキウスと別れた一行は、オジマンディアスとその側近ニトクリスが支配する古代エジプトの砂漠が広がることに困惑を覚える。一行はオジマンディアスから人理がすでに崩壊していることを聞かされ、その原因となる"獅子王"の存在を知らされる。エルサレムに来た一行は、獅子王が支配する聖都キャメロットにて、彼女の部下である円卓の騎士たちが戦争難民を虐殺する様子を目の当たりにする。途中、ダ・ヴィンチは敵陣に突っ込んで消息不明となり、その場にいたルキウスことベディヴィエールとともに何とか難民の一部を暗殺者"ハサン"(山の翁)たちが住む村へと避難する。そこで一行は"アーラシュ"や"玄奘三蔵"、"俵藤太"、初代・山の翁ら仲間たちを集め、生還したダ・ヴィンチとも合流する。
コヤンスカヤはブリテンでケルヌンノスから呪いを食らったことで暴走しかけたため、当初の予定を前倒して羽化の準備を進めるべく、自らの拠点があるロシア・ツングースカ川上流域、すなわちツングースカ大爆発が起きた現場に向かう。
一方、シオンは霊子演算装置「トリスメギストスII」で、特異点「ツングースカ・サンクチュアリ」の発生を知る。1908年を起点とするこの特異点は、数日の間に異聞帯並みの規模に拡大した。このままでは、人類が下等動物に成り下がってしまうおそれがあることから、シオンはコヤンスカヤが黒幕であると判断し、カルデアに討伐を依頼する。
ところが、現地ではヒト科のサーヴァントの召喚が困難であり、伊吹童子が召喚された。そこで、一行は妲己を追ってやってきたサーヴァントの"太公望"と出会い、次いでドブルイニャ・ニキチッチという別のサーヴァントと出会う。一行は生存領域から殺戮領域へと移動する。その中で、コヤンスカヤは妲己とは別人であることが判明する。
その後、一行はNFF(ナイン・フォックス・ファウンデーション)サービス本社ビルに到着し、人工生命体・PBに案内される形でコヤンスカヤと対面する。
彼女の正体は、ツングースカ大爆発によってえぐり取られた土地の痛みと、爆発に巻き込まれた動物たちの断末魔の集合体にして、特異点収束体と呼ばれる異聞帯並みの存在だった。そのことを太公望に暴露された彼女は、この土地ごと自爆を試みるが、太公望の説得により、最終的には宇宙に打ち上げられた。
異星の神はU-オルガマリーと名乗り、その姿はカルデア前所長のオルガマリーと似ていた。実はベリルの報告は偽りであり、キリシュタリアはベリルから不意打ちを受ける。そして、ベリルは異星の神への敵対を表明し、コヤンスカヤと共にブリテン異聞帯に戻る。キリシュタリアは、自らの命と引き換えに大令呪を使用し、U-オルガマリーに人類が脅威であると認識させたうえでその場から追い出す。
主人公一行に敗北したゼウスは、自らの母星を再生させるという悲願を達成するべく宇宙に向けて脱出するため、自分たちの源にして上位存在である原初神こと「天球型時空要塞カオス」に救援を要請する。汎人類史の存在であるカオスは、ゼウスの起こした時空断層を通じてこの状況を視認し、船団を維持するために必要な地球の資源を吸い取る形で滅ぼそうとする。そこへ、武蔵が自らの存在と引き換えにカオスを時空断層ごと切り伏せる形で撃退する。
カオスが撃退された後、一行は、共闘関係を終えたカイニスと対決する 。
一方、破神同盟への協力と並行して、キリシュタリアが隠している情報について探っていたカドックは、星の神の真実にせまり過ぎたとして道満に襲われ深手を負い、言峰によってノウム・カルデアまで搬送される。その道満も、ペペロンチーノからインド異聞帯の玩弄に対する報復として本体と式神の接続を断たれてしまい、これまでのように式神を用いた介入ができなくなる。気が済んだペペロンチーノは、キリシュタリアを手にかけたベリルにケジメをつけるためブリテン異聞帯へ向かう。
ほか登場サーヴァント:カリギュラ、アレス 、ディオスクロイ(カストル&ポルクス)ほか
また、この地には恐竜人類とは別に類人猿が存在しており、彼らはマィヤの加護を受けていない。 デイビットがサーヴァントとして召喚した「黒のテスカトリポカ」により、類人猿はオセロトルと名付けられ、モクテスマ2世の魂をもとに生み出された1年テスカトリポカことイスカリを通じて、ORT復活に協力させている。また、「青のテスカトリポカ」という別側面に当たる人物(以下:恐竜王)が脅される形で恐竜人類たちの王国であるチチェン・イツァーを治めている。 以上のことから、テスカトリポカに該当する人物が複数いるため、本項において単に「テスカトリポカ」とした場合は、デイビットが召喚した「黒のテスカトリポカ」を意味する。 また、ORT飛来の時点で、人類によって築かれたカーン王国があり、君主カマソッソは臣民たちを生贄とする形で自ら強化したことでORTの心臓を抜き取った。ORTの身体は地底世界の最下層に葬られた、その心臓はマィヤによって人工太陽として運用された。一方、カマソッソは改造の代償として死ぬこともできず正気を失い、恐竜人類たちの脅威となる。
かくして、一行はU-オルガマリーに先駆けて現地に向かうも、当の本人に見つかってしまった上、ストームボーダーの攻撃が大幅に弱体化するというアクシデントが発生する。そうこうしているうちに謎の第三者の介入を受け、主人公はストームボーダーから転落する。
死者の国に来てしまった主人公はテスカトリポカと会い、令呪と引き換えに生還する。その際、主人公は砂糖菓子の骸骨(英語版)を託される。気が付いた主人公の目の前にはネモマリーンの一人と、記憶の一部を失ったU-オルガマリーがいた。U-オルガマリーは2人をガイドに指名し、探索を開始した。そこへ恐竜人類が現れ、慌てふためいていたところへ、カルデアの者が現れる。彼はロマニ・アーキマンを自称したものの、主人公にとっては同一人物とは思えなかった。その後、主人公たちは現地住民のテペウに匿われ、その流れでマシュたちと再会する。
一方、テスカトリポカに預けられていたはずの主人公の令呪はカマソッソの手に渡っており、のちに主人公たちにとっての脅威となる。
インサイドの臥待 弦が2023年1月21日に投稿した記事によると、本シナリオの登場人物の一人であるカマソッソはカルデア側が召喚したサーヴァントをオルタ化させたりするといった行動ゆえに、ファンから「カマソッソ先生」や「オルタ職人」と呼ばれ人気を集めているという。また、テスカトリポカもポカニキという愛称で親しまれている。