茎葉体
苔類の茎は蘚類の茎に比べ構造が簡単で、何れも中心束(導束)を持たない。その中でも、ヒメクサリゴケ属 Cololejeunea の茎の横断面は等大の6細胞からなり、最も単純である。これよりも複雑なものでは、内外で細胞層が分化している。クサリゴケ属 Lejeuneaでは、外側は厚い褐色の細胞で構成される表皮、内側は小形の細胞からなる髄層に分化している。ハネゴケ属 Plagiochila の1種では、外側に厚壁で小型の細胞、中心に大型の細胞が分化している。
苔類は中心束を持たないものの、コマチゴケ目では、茎の中央にハイドロームに似た水通導組織を分化させている。コマチゴケ目は苔類の最基部で分岐し、蘚類もハイドロームを持つことから、蘚類と苔類の共通祖先で水通導組織を獲得したと考えられている。
苔類の葉は茎に規則正しく2–3列に付くため、左右相称となる。茎の頂端細胞の3分裂面からそれぞれ1枚の葉が作られるため、3列の葉序ができる。2列の場合は腹葉が退化し、側葉のみになることでできている。
また、苔類の茎葉体における葉の付き方は属や種の表徴形質となる。葉の基部が茎や枝と交わる線を付着線という。付着線と茎との関係は、茎に横につく、茎に斜めに付く、茎にほぼ縦につく、の大きく3つに分けられる。斜めに付く場合、更に葉の重なり方によって瓦状と倒瓦状の2つに分けられる。瓦状(かわらじょう、succubous)は匍匐茎の先端部を前にして上から見たとき、屋根瓦と同様に、基部側の葉の上部が頂端側の葉に覆いかぶさるようになっているもので、倒瓦状(とうかわらじょう、incubous)はその反対で、基部の葉に頂端側の葉が覆いかぶさるようになっているものである。
また、茎に対する開度は、扁向(偏向)および開出と表現される。また葉の間隔は接在、離在と表現される。
蘚類の茎の下部には1列に並んだ複数の細胞からなる糸状の仮根があり、基質に付着する。組織の分化は見られず、普通褐色でしばしば分枝する。またフェルト状に集まって茎の中部までを覆うことがあり、匍匐性の茎を持つもので頂端付近や葉の表面にも仮根を生ずる。細胞と細胞の間には斜めの仕切りがある。