ズンガリプテルス
Dsungaripterus weii Young, 1964
本属の模式種。1964年に下顎・頭骨前部・大部分が保存された体骨格を基に記載された。種小名は化石を発見した新疆石油科学研究所の魏景明 (Wei Jingming) への献名である。その後1973年には新疆ウイグル自治区の烏爾禾近郊で、完全な頭骨・胸骨・骨盤などからなる化石が発見されている。模式標本は北京にある中国科学院古脊椎動物古人類研究所 (Institute of Vertebrate Paleontology and Paleoanthropology, IVPP) に所蔵されている。
Dsungaripterus brancai (Reck, 1931)
1931年にタンザニアのテンダグルから発見されてプテロダクティルスの一種Pterodactylus brancai と名付けられていた後期ジュラ紀の翼竜が、Peter Galtonによってズンガリプテルス属に属する種であるとされたもの。ただしこの見解は現在では一般的に受け入れられていない。
Dsungaripterus parvus Bakhurina, 1982
1982年にモンゴルから発見された一回り小型の標本に命名されたもの。後に記載者自身によって新属フォベトール ("Phobetor") に移されたが先行シノニムが存在したため無効となり、さらにノリプテルス属に移されて、現在ではNoripterus parvusとされている。