マヌエル・デ・ゴドイ
10月21日、フランスとスペインの艦隊は、トラファルガーの海戦で屈辱的な敗北を喫し、スペインの世界制覇再興の夢は遂に絶たれた。1807年、ゴドイはナポレオンとフォンテーヌブロー条約を交渉した。第1条により「アルガルヴェ王」としてポルトガルの南半分がゴドイに与えられることになり、この規定で王位継承者で後のフェルナンド7世から嫌われスペインでの立場が危うくなっていた将来を保証することになるはずであった。しかし、フォンテーヌブロー条約は空文句であった。12月、フランス軍はスペインに侵攻した。1808年3月、ゴドイ、カルロス4世、マリア・ルイサら宮廷の人々は、エスコリアルから追い出され、メキシコに逃げるつもりでアランフエスに逃れた。
フェルナンド支持者は(時に父親に対するクーデターを起こしたとされる)、ゴドイがスペインをナポレオンに売り渡したとする話を広めた。3月18日、アランフエス暴動として知られる民衆蜂起が勃発した。暴徒はゴドイの家に押し寄せたが、愛人のペピータしかいなかった。2日後にゴドイは発見され、カルロスはゴドイの財産を没収し、ビリャビシオサ・デ・オドーン城に収監した。3月21日、フランスはアランフエスを占領し、ナポレオンはゴドイをバイヨンヌに召喚し、ゴドイはナポレオンの求めに応じてカルロス4世が退位する様を目の当たりにした。
ゴドイは続く数年をカルロス、マリア・ルイサ、娘のカルロッタ・ルイサ、ペピータとその息子と亡命生活を送った(妻のマリア・テレサは長く別居していた)。数ヶ月をフォンテーヌブローで、それからコンピエーニュ、更にエクス=アン=プロヴァンスで過ごした。1808年10月、マルセイユに到着し、その後4年間ここで暮らした。1812年7月、ローマに移り、バルベリーニ宮殿で暮らした。1814年4月、フェルナンド7世はスペイン王に復位した(フランスで6年間暮らしていた)。フェルナンドは両親やゴドイの帰国を拒否し、ローマ教皇ピウス7世がゴドイと愛人をペーザロに亡命させることさえ拒んだ。百日天下でカルロス4世とマリア・ルイサはフランスからヴェローナに逃げ、そこでゴドイとペピータに合流した。ゴドイはフランツ2世にウィーンで保護を申し出たが、フェルナンドは禁止した。
ナポレオンが決定的な敗北を喫すると、カルロス4世とマリア・ルイサはローマに戻ったが、教皇はゴドイにはペーサロに留まるよう命じた。1815年9月、カルロスとマリア・ルイサは、ゴドイとマリア・テレサの結婚を無効とするよう教皇に申し出たが、体面を保つためにペピータと息子は、ジェノヴァに移った。フェルナンドはペピータ親子をジェノヴァから追い出そうと警察に賄賂を贈り、同じことをリヴォルノで行った。ペピータはやっとピサで住まいを見付けられた。