上田原駅
島式1面2線のホームを持つ地上駅。駅舎があり、出札窓口・待合室・トイレが設置されている。駅舎から構内踏切を渡ってホームに進入する。
上田原車両基地があった頃は駅員が配置され、切符を販売していた。駅が現在の場所に移転されて以降も駅員が配置されていたが、当駅に代わって下之郷駅に中間駅としての役割が移され、更に当駅に自動券売機(1機)が設置されると平日朝夕のみ配置となった。
別所線では全線でワンマン運転を実施しているため当駅では通常は進行方向1番前のドアしか開閉しないが、朝6時30分から8時30分の間の上田行きの電車は土日祝日年末年始を除きすべてのドアが開閉する。