バイキンメカ
初登場回 - TV第1209話B「コキンちゃんとクロワッサン星」
クロワッサン星へ向かうために作られたスペースシャトル。航行中にブルー・ティアーズ号が衝突し穴を空けられたせいで爆発してしまった。
青龍刀やフライパン、ハンマーなどを装備しており、バイキンメカの中では重装甲。胡椒を振りかけ、隠れている者をくしゃみで見つけ出す事も可能。ナガネギマンと戦う中、ひげで彼の剣を奪い取り追い詰める。しかし、チャーハン王子のお玉を武器にされ、大ダメージを負った。
バイキン中華ロボ(バイキンちゅうかロボ)
初登場回 - TV第697話「ナガネギマンとちゅうかの国」
バイキン中華UFOが変形し、二足歩行型のロボットになった姿。両手のなると型の回転のこぎりを武器にする。しかし、中華UFOに比べて戦力がダウンし、ナガネギマンに一刀両断され、アンパンマンのアンパンチであっさり破壊されてしまった。
バイキン提灯鮟鱇ロボ(バイキンちょうちんあんこうロボ)
初登場回 - TV第760話B「チビマリンとイルカのベソ」
巨大なチョウチンアンコウ型の潜水艦。大口で吸い込み、捕まった人を提灯部分の中に閉じ込めて、アンパンマンを倒すための人質にする。細長い舌でアンパンマンを捕まえ、海底に引きずり込む。操縦席は左目部分にある。
初登場回 - TV第1067話B「おむすびまんとアリンコキッド」
自律行動するクワガタムシ型のメカ。おむすびまんを倒すために使われた。バイキンクモメカなどと同様偵察にも使われることもある(その時は違うデザイン)。
初登場回 - TV第603話A「おひなちゃんとバイキンひなまつり」
ひなの里を襲ってバイキンひなまつりを開くために作られた、菱餅(ひしもち)形の胴体にバイキンUFOのキャノピー部がついた二足歩行型のバイキンロボット。シャボン玉や雛あられ玉を発射して攻撃する。
バイキンひな祭りロボ(バイキンひなまつりロボ)
初登場回 - TV第1116話B「鉄火のコマキちゃんとひなの里」
バイキンUFOからの変形ロボットてバイキンひしもちロボのバリエーション。バイキンひしもちロボとは違い、菱餅に2本の手がある。相手を拘束する雛あられ玉を発射するほか、色々な仕掛けがある扇で攻撃する。また、足から水噴射機が出て水をかける。
初登場回 - TV第155話B「アンパンマンとクリスケさん」
栗の形の頭部と体色を除くとだだんだんにそっくりなロボット。栗の木山から栗を盗むためにバイキンUFOから変形した。毬栗の殻を被ってイガグリロボ1号にも変形する。 イガグリロボ 1号(1ごう) 初登場回 - TV第155話B「アンパンマンとクリスケさん」 クリクリロボから変形した巨大な毬栗型のメカ。球体状で無数の棘を纏っている。転がりながら突き進み、クリスケさんを崖まで追い詰めた。毬栗の殻を破りながらバイキンUFOに変形することも可能。 2号(2ごう) 初登場回 - TV第1240話B「カレーパンマンとクリ・キン・トン」 頭が金色の毬栗の形をした、クリクリロボの改造ロボット。いがぐり山の栗を奪う為に使用した。毬栗型のロケットパンチ「イガイガ弾」や「イガグリハンマー」、頭突き技の「バイキンヘッドバット」が武器。クリ・キン・トンをピンチに追い込むが、アンパンマン・カレーパンマンのダブルパンチに敗れる。
初登場回 - TV第1217話A「ポッポちゃんとかしわもちまん」
黒いこいのぼり型のロボット。空を飛ぶ事もできるが、バイキンロボット型の巨大な足を生やす事で地上戦でも遺憾なく実力を発揮する。大きな口からは黒い雲型の弾丸を発射し、吸引機を兼ねる。ポッポちゃんやかしわもちまん達に襲いかかるが、柏の葉で目潰しを喰らったところをアンパンチで破壊された。
連獅子ロボット(れんじしロボット)
初登場回 - TV第523話「しろかぶくん、故郷へかえる」
だだんだんのボディをベースに作成した歌舞伎役者型のロボット。でんでん一座のおでんを盗むために作ったのが初登場。だだんだんの顔の上に隈取が施されており、パワーアップすると鬼面になる。真っ赤な長い髪の毛を触手のように操ってご馳走を横取りしたり、向かってくる相手を捕まえたりする。両腕のロケットパンチも強力。TV第641話「おむすびまんとどんぶりまんトリオ」では、アンパンマン、メロンパンナ、おむすびまんを苦戦させたが、おむすびまん直伝のおむすびを頭に入れてパワーアップしたどんぶりまんトリオの活躍で逆転された。
ラーメン大王(ラーメンだいおう)
初登場回 - TV第556話「しょくぱん王子とてんどん姫」
ラーメンの麺やスープを発射させる装置を両手に付けた、だだんだんの改造ロボット。顔がラーメンの丼鉢になっている。両手をパンチ用の球型に換装したり、背中からロケットエンジンを展開して空を飛ぶことも可能。
初登場回 - TV第253話B「アンパンマンとにんぎょのサニー姫」
自律行動するサメ型の潜水メカ。ギザギザの歯でアンパンマンの潜水ヘルメットを噛砕してしまうが、カメ吉くんの頑丈な甲羅によって破壊された。
3倍鋼鉄マシーン(3ばいこうてつマシーン)
初登場回 - TV第1236話「ぼくらはヒーロー!」
3倍マシーンのように3人に分裂させるのではなく、鋼鉄でできた巨大ロボットのような体に変身できるメカ。見た目は鉄骨マシーンに似ている。アンパンマンを倒そうとしても次々に仲間が現れると倒せなくなる事に気付いたばいきんまんが、自身をパワーアップさせる為に開発した。
3倍マシーン(3ばいマシーン)
初登場回 - TV第494話A「しょくぱんまんと3ばいドキンちゃん」
何でも3人に分裂するメカ。元のキャラクターに加えて色と人格の異なる2人が作り出される。作り出される2人は、本人が持つ性格や素質の両極端を強調したものが多い。元に戻るときは3人がもう一度マシーンに入るか、マシーン自体が壊れる必要があるが、鉄骨ホラーマンズだけはひとりでに元に戻った。初登場時はおやつを3倍に増やそうとしたが、2回目以降はばいきんまんが自身を3人に増やしアンパンマンを倒すために入ろうとする(ただし入ろうとする度に毎回邪魔が入り、他のキャラクターが代わりに入ってしまうため未遂に終わる)。長らくマシーンに入れずにいたばいきんまんだったが、TV第1591話B「3ばいばいきんまんとフランケンロボくん」で実現した。
たまごの国を乗っ取るための卵型のロボット。
1号(1ごう) 初登場回 - TV第645話「クリームパンダとパクパク竜」 鼻の大砲から相手を黒い卵に変える卵爆弾を発射する。飛び跳ねることで地響きを発生させることもできる。アンパンマンやアンパンマン号すら卵型に変えてしまうが、パクパク竜に突進されてはじき返したところで、アンパンマン号から新しい顔が飛び出し形勢逆転された。
2号(2ごう) 初登場回 - TV第1055話A「パクパクりゅうとたまごの国」 黒たまごUFOからの変形ロボット。卵にばいきんまん風の顔と角、恐竜の手足と尻尾が付いたような外見をしている。頭から攻撃用の小さなたまごメカ(正体はかびるんるん)を出す。長い舌も武器。たまごの国の倉庫を狙い、卵を強奪する。パクパク竜には「新しい仲間だ」と勘違いされていた。
くしゃみのスイッチが付いており、パクパク竜に押し倒された弾みでばいきんまんがうっかり押してしまったため、アンパンマンたちをアンパンマン号ごと解放してしまった。
餅つきマシーンロボ(もちつきマシーンロボ)
初登場回 - TV第1060話A「アンパンマンとモッチーくん」
石臼型のロボット。両手に持った兎杵で攻撃する。「ペッターン!」と唸り声を上げる。ばいきんまんの遠隔操作で動く。
餅つきロボット(もちつきロボット)
初登場回 - TV第164話A「アンパンマンともちつきまん」
木製の臼を模したロボット。手足が杵型になっており、バイキンUFOと合体して暴れる。なべこさんの水蒸気で視界が遮られたところを、脚部をもちつきまんが破壊し、倒れたところをどんぶりまんトリオとアンパンマンに破壊された。
物忘れスプレー(ものわすれスプレー)
初登場回 - TV第74話A「アンパンマンとブックマン」
浴びると頭が空っぽになってしまうスプレー。ばいきんまんがブックマンに浴びせようとするも扇ぎ返されて自身が浴びてしまったが、気絶しただけで記憶に異常は見られなかった。
声 - 小林和矢
初登場回 - TV第305話「ゴミラとバイキンゴミラ」
ゴミラを模した巨大ロボット。何でも食い荒らし、食べた物をごみにして吐き出す。ばいきんまんの催眠術で操られたかんたんシスターズがパワーアップさせてしまった。TV第823話B「ドキンちゃんとゴミラ」では、操縦中に暴走して、ばいきんまんの操作を受け入れず、ドキンちゃんを襲ってしまう。ゴミラとアンパンマンの活躍で倒された(ばいきんまん自身もアンパンマンに「こんな言う事聞かない奴やっつけてしまえ!」と吹っ飛ばされるのを覚悟の上でバイキンゴミラの破壊を許可していた)。
初登場回 - TV第271話B「アンパンマンと金色のさかな」
ばいきんまん一人乗りのイルカ型の潜水艦メカ。アンパンマンたちより先に、願いを叶えるという「金色の魚」を捕まえるために作った。小型のドリルメカなどを搭載している。アンパンマンとともに津波に遭い、オーロラの輝く不思議な空間にたどり着く。そこで巨大な「金色の魚」に遭遇し、無事に帰り着いた。
バイキン色(バイキンいろ)
初登場回 - TV第101話A「アンパンマンとつみきまん」
黒色のペンキ。そのペンキを刷毛で生物やそのキャラクターのエネルギー源に塗ると体色がばいきんまんと同じになり、性格や口調もばいきんまんと同じになりばいきんまんの命令を聞くようになり、作中ではつみきまんのエネルギー源となるハートマークが付いたブロックにそれを塗装して、ばいきんまんと同じ体色になったつみきまんがアンパンマンを倒した。弱点は水で水にぬれると効果はなくなり、元に戻る。
3号(3ごう) 初登場回 - TV第421話A「アンパンマンとでかこ母さん」 1号の頭の上がバイキンUFOのキャノピー部でできたようなバイコング。体色はバイキンUFOと共通している。爆発すると水が出る爆弾が武器。初登場時はでかこ母さんのパンチにやられる。 スーパーバイコング 初登場回 - TV第862話「ばいきんまんとドクター・ヒヤリの島」 1号を改造して大型化、かつ強化したバイコング。ドクター・ヒヤリの島へきたアンパンマンたちを襲うために作った。ドラミングで敵を威嚇する。装甲やパワーが数段強化され、万力型の腕部でアンパンマンの顔を歪ませ、さらにしょくぱんまんのしょくパンチを食らってもビクともしない。トリプルパンチを食らい、爆破四散はしなかったものの、坂を転がされ、火口に落ちて爆発した。 バイキングコング 初登場回 - 映画第29作『ブルブルの宝探し大冒険』 オニツノ島でバイコングを破壊されたばいきんまんがコアのメカに塔の瓦礫を寄せ集め、合体させて作った最強のバイコング。バイキンUFOが頭部に合体する事で制御される。とてつもなく巨大かつ頑丈であり、通常のパンチは全く効かない。手に持った同じく塔の瓦礫から形成された棍棒や、目から出す当たった物を塔の姿にする光線で戦い、崩れた体を組みかえる事も出来る。序盤はアンパンマン達を塔に変えて追い詰めるが、勇気を手に入れたブルブルとカレーパンマンとの作戦で誤って操縦席のバイキンUFOを棍棒で潰してしまう。さらにいいかげんに城やしょくぱんまん達に光線と動きを封じられ、最後にはアンパンチでコアのメカを破壊されて大破した。
初登場回 - TV第255話「レインボー王子とにじのくに」
バイキンUFOから変形したロボットの一つ。胸に仕込んである大砲から爆弾を打ち出す。レインボー王子達を襲っている途中で登場し、顔の濡れたアンパンマンを後一歩の所まで追い詰めた。
初登場回 - 映画第11作『勇気の花がひらくとき』
鉄の星の人々を騙して作らせたもぐりん型の巨大な戦闘機。鉄球に変える砲弾やミニモグリンを打ち出す。機体下部の大砲からはレーザーを発射する。町を火の海にするなど大暴れするが、右目の装甲が薄いことをこてつちゃんたちにばらされ、カレーパンマン・しょくぱんまんが変えられた鉄球を、ロールパンナのローリングハリケーンで投げ入れられ、コックピットが破壊されて撃墜される。しかしすぐにジャイアントベアリングロボが出現した。
初登場回 - TV第1033話B「ちびぞうくんと空とぶベッドくん」
クリームパンダとちびぞうくんが空飛ぶベッドくんに乗せてもらえるのを聞きつけたばいきんまんが作り出した、空飛ぶベッドくんに似た飛行メカ。バイキンUFOからコントロールされて操作する。これを使ってクリームパンダとちびぞうくんを襲い、さらにアンパンマンを襲った。しかし、クリームパンダとちびぞうくんによって制御不能に陥り、最後はバイキンUFOに激突し大爆発。ばいきんまんもそのまま吹っ飛ばされた。