自由パプア運動
1986年2月14日にフリーポート・インドネシアは、再びこのエリアで自由パプア運動が活発になってきており、またフリーポートの従業員に自由パプア運動のメンバーあるいは共鳴者がいるとの情報を手に入れた。同月18日には「叛乱軍司令官」とサインされ「19日の水曜日にテンバガプラにある種の雨が降り注ぐ」と記された手紙が届いた。その日の夜、22時頃に何人かの人間がフリーポートの泥漿や石油のパイプラインを弓鋸で切断し、銅や銀、金の鉱石やディーゼル燃料が大量に失われた。加えて破壊者が燃料のラインに火を放ち、炎に迫ろうとする警察を銃撃した。4月14日にも再びパイプライン、電線を切断、錘重を破壊しタイヤを燃やした。修繕に向かった人員も銃撃を受けたため、フリーポートは警察と軍隊の出場を要請した。
1996年1月と8月にも散発的な攻撃が行われ、1月は研究グループのヨーロッパ人を人質に取り殺害、8月は伐採作業所のキャンプにいたインドネシア人の人質を取ったが解放した。
1998年5月に1968年以来のスハルト独裁が終了すると、7月に自由パプア運動はビアク島のコタ・ビアクにある水道塔に独立旗を掲げた。インドネシア軍がグループを解散させるまでの数日彼らはこの場所に止まり、フィレプ・カルマらが逮捕された。