核内低分子RNA
真核生物では、snRNAは多くの2'-O-メチル化(英語版)修飾とシュードウリジン化を含むことが観察されている。これらの修飾はsnoRNAの活性と関連している。snoRNAは典型的にはrRNAの修飾を行うが、snRNAなど他のRNAを標的として修飾を行うことが観察されている。
オリゴアデニル化(短いポリ(A)テールの付加)がsnRNA(通常はポリ(A)テールを持たない)の運命を決定し、自身のRNA分解を誘導する。このsnRNAの量の調節機構は、選択的スプライシングの幅広い変化と共役している。