JR東日本209系電車
なお川崎重工業製の中間車は車体構造の都合で転用対象外となった。
外観では行先表示器のLED化、排障器を強化型へ交換している。併結運転のため、全ての先頭車に電気連結器と自動解結装置が搭載されている。また、2000番台の先頭車には蓄電池と整流装置が搭載されていなかったため、廃車となったモハ208形から流用された。
車内は先頭車両の客用ドア間の座席をセミクロスシートへ改造、「ドア3/4閉スイッチ」の設置、2号車に組成されるモハ208形への車椅子対応の大形トイレ(真空式)設置も行われている。さらにトイレ設置に伴い窓が埋められ、床下には汚物処理装置も搭載された。車内非常通報装置は警報式から乗務員と相互に通話が可能な通話式へと変更した。次に述べる機器更新などにより、特にトイレが取り付けられたモハ208形の自重は改造前の 29.9 t から 31.5 t に増加した。
このほか、転用改造に合わせてE217系と同じく主要機器の更新工事(機器更新)を実施した。内容としてはVVVFインバータ装置と補助電源装置(静止形インバータ)は、制御素子としてGTOサイリスタを用いたものからIGBTを用いた SC88A および SC92 に、制御伝送装置は MON19 に変更している。さらに、ブレーキ制御装置や戸閉制御装置など主要機器についても更新され、ATS-P装置や補助電源装置に関しては二重化により冗長性が確保されている。
前面は踏切事故対策として骨組を追加して強度を向上させたほか、前面排障器(スカート)を大形化、運転室の空間を拡大、運転台背面に非常救出口を設置した。空気圧縮機にはドイツ・クノール社製のスクリュー式を採用し、1 - 6次車は電動発電機 (MG) のような甲高い動作音が特徴である 動作音。運転席のマスター・コントローラーは左手操作のワンハンドル式を採用。ドアエンジンは量産初期ロットでは従来と同じ日本製の空気式が採用されたが、ウラ(浦和電車区の電略)16編成(3次車)から外国製の戸挟み安全装置付き電気式に変更された。ドア開閉時のチャイムと、扉上部に3色LEDディスプレイによる次駅表示などを行う旅客案内表示器を装備している。また、先頭車には車椅子スペースが設置されたほか、連結面に転落防止幌が設けられた。
ワンハンドルマスコンの採用については、901系での試行時に運転士から「時隔の短いところでは無理」、「操作は別々に行うもの」、「ブレーキはハンドルの角度で判断する」などの否定的な意見もあったが、最終的には量産車となる209系で正式な採用に至っている。
在来線用試験電車「MUE-Train」(ミュートレイン)は、在来線車両の技術革新試験用電車で、2008年10月に元ウラ2編成から7両が改造された。川越車両センターに配置され、10月より東北本線(宇都宮線)・高崎線などで各種試験を開始した。
形式のみ「ハ」→「ヤ」に変更されているものの、車両番号はすべて種車のままである。埼京線や川越線の車両と同じ向きになっているため、宇都宮線・高崎線などでの試験時は、他の編成の方向とは逆に、上野方先頭車が7号車となって運転されている。
当車両では高速データ通信「WiMAX」で使用するアンテナの形状や設置位置が試行され、「成田エクスプレス」用E259系や、2010年(平成22年)7月1日より営業運転を開始した京葉線E233系5000番台にも適用された。また、INTEROSと呼ばれる次世代の列車情報管理システムが当車両に導入され、試験結果をもとに山手線の新型車両であるE235系に導入された。
中央・総武線 運用線区:(立川) - 三鷹 - 御茶ノ水 - 錦糸町 - 千葉 運用期間:1998年 - 2019年 車体の帯の色:■黄1号 配置:習志野電車区→三鷹車両センター 投入車両数:10両編成17本(170両)
京葉線系統 運用線区: 京葉線...東京 - 南船橋 - 蘇我、西船橋 - 南船橋 内房線...蘇我 - 君津 - 上総湊 外房線...(千葉) - 蘇我 - 上総一ノ宮 運用期間:2008年 - 車体の帯の色:■ワインレッド 配置:京葉車両センター 投入車両数:10両編成4本(40両)
武蔵野線系統 運用線区: 武蔵野線...府中本町 - 西船橋、西浦和 - 別所信号場 - 与野、武蔵浦和 - 別所信号場、新小平 - 国立 東北貨物線...与野 - 大宮 京葉線...東京 - 西船橋、西船橋 - 海浜幕張 中央線快速...国立 - 八王子 運用期間:2010年 - (2010年12月4日「むさしの号」「しもうさ号」より営業運転開始) 車体の帯の色:■■オレンジ+白+茶(正面は■オレンジのみ) 配置:京葉車両センター 投入車両数:8両編成11本(88両)
中央・総武緩行線の103系を置き換えるために1998年(平成10年)11月に落成し、同年12月29日から中央・総武緩行線で営業運転を開始した。このグループはJR東日本新津車両製作所が初めて独自に設計から製造までを行った車両である (全車両が新津車両製作所製)。