ホタルエビ
上記のようにホタルエビの発光が発光細菌によるものであることは、大正時代から知られていた。矢崎は該当の細菌を同定して Microspira phosphoreum (Yasaki 1926) と命名し、和名として蝦発光菌と名付けた。ただし、現在では廃棄名とされている。彼はこの当時、この菌をコレラ菌に極めて類似したものとし、この菌2mgを自ら飲用して何らの発症もなかったことから、人体には無害であると述べた。
島田らは1994年に発見された琵琶湖のスジエビから原因菌を分離し、非O1型のコレラ菌 Vibrio cholerae non-O1 であると同定。前述の矢崎の記載から、ホタルエビの菌も同種だったと推測した。コレラを発症するための遺伝子を持たないことも確認し、またこれらのエビが生食されることもまずないことから、人体への影響はないものとされた。この菌は淡水魚にビブリオ病を起こすことがあり、それは往々にして高温と結びついていた。その上で、この年の琵琶湖においては水温がかなり高く、また水位が大きく下がったこと、それに加えて生け簀という特殊な環境でスジエビが感染を受け、それが大流行を起こしたのだろうと推定された。
この、エビの伝染性光り病はこの菌の感染によるものであり、感染したエビは長く生きられない。大正期の江崎は分離した菌を他のエビに感染させることでエビが敗血症を起こして死亡にいたり、その過程でエビがよく光ることを見いだした。
島田他は、スジエビの背甲下にこの菌を接種した。すると実験に使用した48個体中の41個体が3日以内に死亡し、その間に3個体の発光を確認した。この発光個体が少なかったことについては、エビの死後すぐに発光がやむことから、そのために見逃した可能性があるという。