コーヒーノキ
果実が赤い通常種に対し、黄色の変異種。ポルトガル語表記では品種名の後に「アマレロ」、英語表記では品種名の前に「イエロー」を付記する。変異種に対し通常種を相対的に「レッド」と呼ぶこともある。流通量が多いブルボンアマレロ(イエローブルボンとも表される)のほか、ティピカやカトゥーラ、カトゥアイなどが生産されている。
コスタリカで発見されたティピカの変異種。矮小な品種、風味は良いとされるが生産性は高くない。ホンジュラス、パナマ、グァテマラなどで少し栽培されている。
コーヒー生産国の養蜂家が、コーヒーノキだけから集めた蜂蜜を作って販売している。黒褐色で独特の風味を持っておりコーヒーとの相性がよく、コーヒーの持ち味を殺さないと言って珍重されている。生産量は多くはないものの、日本国内でも蜂蜜を専門に扱う店で入手が可能である。
栽培種
コンゴコーヒーノキ (C. congensis Froeh.) コンゴ原産で、地元で少量栽培されている。
ステノフィラコーヒーノキ (C. stenophylla G. Don)
エキセルサ (C. dewevewi var exelsa) 比較的高品位で、リベリカ種の変種(C. liberica var. dewevrei f. dewevrei)とされることもある。
ベンガルコーヒーノキ (Psilanthus bengalensis Roxb.) インド原産で果実は紫色、以前はCoffea属に含まれていた。
野生種
絶滅危惧種が多い。2001年の国際自然保護連合レッドリストでは、14種が絶滅寸前、34種が絶滅危惧に分類されている(危急23種、準絶滅危惧13種、軽度懸念13種)。
C. racemosa モザンビーク原産で、病害に強い性質が注目されている。
C. eugenioides, C. salvatrix カフェインをほとんど含まない。
C. anthonyi, C. heterocalyx カメルーン原産で、自家不和合性が無い(アラビカ種とこの2種のみ)。
C. mauritania Lam. モーリシャスで1785年、アラビカ種以外のコーヒーとして最初に発見された。
マダガスカル島にはCoffea亜属50種とBaracoffea亜属8種が分布し、全て固有種。
シャリエコーヒーノキ (Coffea charrieriana) 2008年にカメルーンで発見された新種。中央アフリカ原産の種で唯一カフェインを含有しない。
アラビカ種 (Coffea arabica L.、アラビカコーヒーノキ) はエチオピア原産で、最初に広まったイエメンにちなんだアラビカの名になった。コーヒーノキ属中、唯一染色体数が44(核相が2n=44。他の種は2n=22)の倍数体で、また自家不和合性も無いなどの特徴を持つ。200以上の栽培品種があり、さらに交配による新品種の育種も行われている。
最近の染色体DNAと葉緑体DNAの系統解析により、ユーゲニオイデス種(C. eugenioides)の花とカネフォーラ種(C. canephora)の花粉との自然交配による交雑種が、さらに倍数化して生じた複二倍体を起源とする事が明らかとなった。また、他種から孤立した分布は氷期の影響と考えられている。
高品質で収量も比較的高く、世界のコーヒー生産において7割から8割を占め主流となっている。主な栽培地は中南米とアフリカの一部で、高級品として取引される産地が多い。ただし高温多湿の環境には適応せず、霜害に弱く、乾燥にも弱い。レギュラーコーヒー用。