マーカー遺伝子
蛍光タンパク質・呈色反応を触媒する酵素の遺伝子 緑色蛍光タンパク質(GFP)遺伝子 ルシフェラーゼ遺伝子 β-グルクロニダーゼ(GUS)遺伝子(uidA) β-ガラクトシダーゼ遺伝子(lacZ)
薬剤耐性遺伝子 抗生物質耐性遺伝子 除草剤耐性遺伝子 変異型アセト乳酸合成酵素(ALS)遺伝子
発現すると致死的に働く遺伝子 チミジンキナーゼ(TK)遺伝子 ジフテリアトキシン(DT)遺伝子