西武秩父線
長瀞行きの列車は直通開始当初から1992年3月30日までは野上駅まで、1992年3月31日から2007年3月5日までは寄居駅まで運行していた。運転区間が寄居駅まで延長されたのは東武東上線からの直通列車が廃止されたことに伴うものだが、年々利用が減っていたこともあり、2007年からは直通開始当初よりも一駅短い長瀞駅までとなった。
2020年4月13日から、新型コロナウイルス感染症(COVID-19)の流行に伴い、秩父鉄道との直通運転を中止し、三峰口行きは西武秩父駅発着、長瀞行きは御花畑駅発着として運行していた。2021年3月13日のダイヤ改正に合わせて直通運転を再開したが、改正後は平日の設定が無くなり土曜・休日ダイヤのみの運行となっている。
2023年3月18日からは上り(西武線方面)の設定が無くなったほか、三峰口行き直通列車が削減された。また長瀞行きは秩父本線内では急行運転を行うようになったほか、新たに分割を行わない横瀬始発・長瀞行きが設定された。