アレクサンドロス3世の死
アンドリュー・チャッグは、アレクサンドロス3世が湿地を進んでバビロンの水を用いた防衛体制を調べている間にマラリアに感染し、2週間後に死亡したのだと主張している。チャッグの説はエペメリデスや詳細不明のエリュトラエのディオドトゥスという人物の記録に基づいているが、これらの史料の確実性については疑義が呈されている。また熱帯熱マラリア原虫が引き起こす急激な高熱の症状がみられないのも、マラリア説の弱点となっている。それでもなお、マラリア説はポール・カートリッジなどに支持されている。
伝染病学者のジョン・マーとチャールズ・カリッシャーは、ウエストナイル熱がアレクサンドロス3世の死因である可能性を提唱している。ロードアイランド大学の伝染病学者トーマス・メイザーは、このウエストナイル熱説を「実に説得力がある」と評価しつつも、この伝染病のウイルスで死亡するのは高齢者か免疫系が弱い患者であることが多い点を指摘している。ウィンスロップ大学病院の Burke A. Cunhaは、マーとカリッシャーのウエストナイル熱説を批判している。またほかにも、ウエストナイル熱は8世紀以前には人間への感染力を持たなかったはずだとする指摘もなされている。