リボヌクレアーゼH
真核生物のRNase H2の特性解析は歴史的に困難なものであったが、その一因はその存在量の少なさである。酵素の精製に関する注意深い努力により、真核生物型酵素は大腸菌のRNase HIIとは異なり、複数のサブユニットから構成されることが示唆された。大腸菌タンパク質の出芽酵母ホモログ(すなわちH2Aサブユニット)は、酵母ゲノムの配列決定がなされた際にバイオインフォマティクスによって容易に同定されたが、対応するタンパク質は単独では酵素活性を示さなかった。最終的に、酵母のB、Cサブユニットが共精製によって単離され、酵素活性に必要であることが発見された。しかしながら、酵母のB、Cサブユニットと他の生物のホモログとの間の配列同一性は極めて低く、対応するヒトタンパク質が最終的に決定されたのは、これら3つのサブユニットの変異すべてがエカルディ・グティエール症候群の原因となることが判明してからであった。
リボヌクレアーゼH(英: ribonuclease H、略称: RNase H/RNH)は、配列非特異的エンドヌクレアーゼのファミリーであり、RNA:DNAハイブリッド基質中のRNAの加水分解による切断を触媒する。リボヌクレアーゼHファミリーのメンバーは、細菌や古細菌から真核生物までほぼすべての生物に存在する。
このファミリーはリボヌクレアーゼH1、H2と呼ばれる2つの進化的に関連したグループに分類され、両者は基質選択性がわずかに異なる。ヒトゲノムにはH1とH2の双方がコードされている。ヒトのリボヌクレアーゼH2は3つのサブユニットからなるヘテロ三量体型複合体であり、いずれのサブユニットの変異もエカルディ・グティエール症候群(AGS)と呼ばれる希少疾患の遺伝的原因となる。H1とH2は生命の全てのドメインに存在するのに対し、いくつかの原核生物にはH2と密接に関連した3番目のタイプが存在する。さらに、HIVなどのレトロウイルスにコードされる多ドメイン型逆転写酵素にはリボヌクレアーゼH1に類似したリボヌクレアーゼHドメイン(英語版)が存在し、ウイルスの複製に必要である。
真核生物では、リボヌクレアーゼH1はミトコンドリアDNAの複製に関与している。また、H1とH2の双方がRループのプロセシングなど、ゲノムの維持に関与している。