新世紀エヴァンゲリオン (漫画)
A5判の愛蔵版が2021年に刊行された。通常版の2巻ずつが1巻に収録されている。
貞本義行(漫画)・カラー(原作)『【愛蔵版】新世紀エヴァンゲリオン』 KADOKAWA、全7巻 2021年1月26日発売、ISBN 978-4-04-109368-9 2021年1月26日発売、ISBN 978-4-04-109369-6 2021年1月26日発売、ISBN 978-4-04-109371-9 2021年3月26日発売、ISBN 978-4-04-109370-2 2021年3月26日発売、ISBN 978-4-04-109372-6 2021年4月26日発売、ISBN 978-4-04-109373-3 2021年4月26日発売、ISBN 978-4-04-109374-0
後日、EVA3号機のパイロットにトウジが選ばれ、彼の乗る3号機が突然使徒に取りつかれる。対決するシンジがトウジを案じて闘いを拒絶したため、ゲンドウは実験中のダミーシステムを作動させて初号機を動かし、使徒殲滅と同時にトウジは死亡する。
シンジはゲンドウに憤り、パイロットを辞してNERVを離れようとするが、その矢先新たな使徒が襲来する。シンジは加持に説得され再び初号機に乗るが、使徒を捕食して覚醒した初号機に取り込まれ戻れなくなる。その間、ゼーレはゲンドウに不信を抱き、計画の切り札となる少年タブリスこと渚カヲルを目覚めさせ、NERVに新たなパイロットとして送り込む。シンジは初号機内で母ユイと対話する夢をみたあと、レイたちの祈りに応えるように機外の世界へと戻る。一方で加持はスパイ活動の狭間で危機に陥り、ミサトに機密データを託して殺害される。やがて使徒による精神汚染で正気を失い、寝たきりとなったアスカに代わり、カヲルが正式なNERVのパイロットとなる。
ある日使徒との対戦でレイは精神を侵蝕され、心に秘めたシンジへの独占欲に向き合わされ苦悩する。