長岡駅
島式の乗り場であり、長岡駅からは横断歩道、地下道、ペデストリアンデッキで連絡している。乗り場は1番線から13番線まである。下記は特記なき場合全て越後交通の運行路線。
上越新幹線 浦佐駅 - 長岡駅 - 燕三条駅
■信越本線 特急「しらゆき」・臨時快速「越乃Shu*Kura」「柳都Shu*Kura」停車駅 ■快速 宮内駅 - 長岡駅 - 見附駅 ■普通 宮内駅 - 長岡駅 - 北長岡駅
■上越線(宮内駅 - 当駅間は信越本線) 臨時快速「越乃Shu*Kura」「ゆざわShu*Kura」停車駅 ■普通 宮内駅 - 長岡駅 → (信越本線) 上越線から信越本線の長岡駅以北に直通する列車は下り1本のみ。 当駅と宮内駅の間に(貨)南長岡駅がある。
1998年にはテナントの撤退が相次いだ丸専は娯楽主体に転換して物販を縮小し2007年までに閉館・解体され、2000年(平成12年)8月には丸大がかつての本店をディスカウント店に転換していたザ・プライス丸大長岡店が閉店するなどまず大手口側の駅から少し距離のある大手通り西部の店舗から閉鎖や縮小が進み、2005年には 東口側で唯一の大手総合スーパーだったダイエー長岡店も経営不振の為の社内大規模閉店の対象となり閉店し、さらには現在のフェニックス大手周辺で最後まで残っていた長岡大和が2010年に閉館し、建物はカーネーションプラザやNaDeC BASEに転用された。最後まで残っていたイトーヨーカドー丸大も親会社の経営不振の為2019年2月11日をもって閉店し、長岡駅付近の大型商業施設は駅ビルの「CoCoLo長岡」を除いて完全に消滅した。また、ダイエー閉店後は2年以上に渡ってキーテナントが決まらなかったが、2007年に計13店舗のテナントで構成される専門店複合型商業施設「E・PLAZA」としてリニューアルオープンした。
都市間ツアーバスから転換した高速路線バスは、いずれも大手口側の大手通り周辺から発車する。