建仁寺
この楼門はもともと京都宇多野鳴滝にある建仁寺派妙光寺にあったもので、1885年(明治18年)に移築された。
洗鉢池
明星殿(楽神廟、楽大明神、京都府指定有形文化財) - 吉備津神社の末社である「楽の社」の神を楽大明神として祀る。江戸時代前期の建立。虚空蔵菩薩を本地仏とする。縁日は11月13日。
浴室(京都府指定有形文化財) - 寛永5年(1628年)三江紹益によって建立された。2002年(平成14年)に現在地に移される。湯気で身体を温める蒸し風呂である。
霊洞院(れいとういん) - 建仁寺の僧堂(専門道場)。元は建仁寺26世の慈照高山(法燈派)を追請開山とする塔頭で、弟子の海雲禅慧らが創建した。左辺亭竹田黙雷の時に禅堂が創建された。天文21年(1552年)に焼失し、天文23年(1554年)に再建された。その後嘉永6年(1853年)に改築される。
三門 - 「望闕楼」(ぼうけつろう)の別称がある。静岡県浜松市(旧浜名郡雄踏町)の安寧寺から1923年(大正12年)に移築したもので、江戸時代末期の建築である。
放生池
勅使門(重要文化財) - 寺の南側正面、八坂通に面した四脚門。平教盛もしくは平重盛の館門を応仁の乱後に移築したものと伝えるが定かでない。様式的には鎌倉時代末頃の建築である。柱や扉に矢が刺さった痕跡があり、「矢の根門」「矢立門」とも呼ばれる。
法堂(京都府指定有形文化財) - 仏殿(本尊を安置する堂)と法堂(はっとう、講堂にあたる)を兼ねている当寺の本堂。明和2年(1765年)再建。また、2002年(平成14年)創建800年を記念して天井に小泉淳作により「双龍図」が描かれた。方丈と渡り廊下で繋がっている。
庫裏(京都府指定有形文化財) - 本坊。文化11年(1814年)再建。
方丈(重要文化財) - 長享元年(1487年)の建立で、もと安芸国の安国寺にあり、安国寺恵瓊が慶長4年(1599年)に建仁寺に移築したもの。東側に設けられた大玄関を介して本坊と連結する。創建当初は杮葺であったが元文元年(1736年)に瓦葺きに改められた。建物の外周すべてに建具が入り壁が少ない構造のためか、1934年(昭和9年)の室戸台風で倒壊し、1940年(昭和15年)に創建当初の杮葺で復旧された。その後1962年(昭和37年)に銅板葺きに改められていたが、2013年(平成25年)に杮葺に復した。各室には桃山時代の画壇を代表する画家の一人である海北友松の水墨障壁画があったが、現在は襖から掛軸に改装され、京都国立博物館に寄託されている。台風被害の復旧後は、日本画家橋本関雪による障壁画『生生流転』(しょうじょうるてん)『伯楽』『深秋』『蕭條』『松韻(寒山子)』(計60面、1940年完成)が設置されている。
方丈前庭「大雄苑」 - 枯山水庭園。1940年(昭和15年)の作庭。