松本零士999 〜Story of Galaxy Express 999〜
声:麻生美代子
劇場版に登場したトチローの母親で、キャストも劇場版と同じく麻生が担当している。鉄郎に戦士の銃を渡す。トチローの帰還を望む反面、それが適わぬことを知っている。
ゲームでは記憶喪失となっていた鉄郎を保護しており、記憶をとりもどした鉄郎に「息子が帰ってきたようで楽しかった」と語るほか、息子の友人であるハーロックと会話するイベントもある。
声:井上真樹夫
劇場版に近い風貌で登場。アルカディア号(劇場版の艦首髑髏型)で宇宙を駆けめぐる宇宙海賊。劇場版と同じく、親友の墓を立てた鉄郎を救うべく機械化人や、原作の敵であるマゾーンと戦う。
ゲームでは宇宙五大頭脳の足立博士と雨森博士の扱いに手を焼くことになるほか、親友トチローの死を看取った鉄郎からの頼みということもあり、マゾーンの襲撃を受けるラーメタルの救援に向かうこととなる。
ハーロックを主役にしたシナリオ「我が夢は星の彼方」では、プレイヤーキャラクターとして操作可能。
アルカディア号で宇宙の海を航行中のハーロックに、親友トチローからの連絡が入った。ハーロックはトチローから彼の学者仲間である雨森博士と足立博士の安全を確保して欲しいと頼まれる。タイタンで雨森博士に会い、火星で足立博士に会ったハーロックは二人をアルカディア号に乗せる。
その後999号からSOSの連絡が入った。ハーロックは、マゾーンからの襲撃を受けているラーメタルを救援すべくアルカディア号の舵を切るのだった。
声:八奈見乗児
999号に乗り込んでいた医者。友人を守ったプライダーの心意気に打たれ、アルカディア号で治療する。
原作作品からのキャラクターは、大まかな役柄ポジションは基本的に原作と同じだが、ゲームオリジナル設定が与えられている場合が多い。
キャスティング協力は青二プロダクションが中心となって行い、千葉繁が音響監督を手がけている。ナレーションは銀河万丈。
声:金月真美
おいどんの片思いの相手。下の名前は本作で設定されたもの。
恋人の青木耕一から銀河鉄道のことを聞かされ、それに乗って他の星に行くことに乗り気だった。
声:青野武
宇宙五大頭脳の一人で、シェイド卿の手によって命を落とす。真田志郎の祖父にあたる。声は真田志郎役の青野が担当している。
声:松尾銀三
銀河鉄道管理局のタイタン支局長。機械化人の顔色をうかがっている弱気な性格で、乗客安否の調査を申し出た車掌の剣幕に圧されていた。