マラリア原虫
まもなくイタリア・ローマ大学のマルキアファーバ(英語版)らがマラリア患者の赤血球中で増殖するアメーバ様の生物を見出し、1885年にPlasmodium malariaeと命名した。これがプラスモジウム属の起源であるが、彼らが観察したのもほとんどは熱帯熱マラリア原虫でわずかに三日熱マラリア原虫が混ざっていたと考えられている。現在Plasmodium malariaeは四日熱マラリア原虫の学名であるが、これは20世紀になってから生じた混乱の結果である。
この時期まで研究者たちはマラリアの病原体が複数種あることを想定していなかったが、イタリアの神経科医ゴルジが1885年から1889年にかけて、マラリアには発熱の周期性から三日熱と四日熱がありそれがマラリア原虫の生活環と関係していること、また三日熱にも春に多い良性のものと、夏から秋にかけて多い悪性のものがあり、それぞれ別種のマラリア原虫が関係していることを示している。また同じ時期にウクライナ・ハリコフ大学のダニレフスキー(英語版)が、鳥類や爬虫類の赤血球に寄生する様々な生物を記載しており、そこにはマラリア原虫も多く含まれていた。1891年にロマノフスキー染色が開発されると、様々な動物のマラリア原虫が見出されるようになった。
住血胞子虫目プラスモジウム科のうちコウモリに寄生する以下の生物は、赤血球中では無性生殖を行わず生殖母体のみを形成することからマラリア原虫とは区別されてきた。しかし分子系統解析ではマラリア原虫から特殊化した可能性が示されている。
ヘパトシスティス(Hepatocystis) コウモリの他にサルやリスなどを宿主とする。肝臓で増殖し嚢胞を生じる。
Nycteria 肝細胞で増殖する。
Polychromophilus 肝臓のクッパー細胞や肺の細網内皮系で増殖する。最新の研究ではマラリア原虫からの特殊化は否定されている。