プロクロロン
プロクロロンは、世界中の熱帯から亜熱帯の海域に生育するウスボヤ科の4属(ウスボヤ属 Didemnum、ミスジウスボヤ属 Trididemnum、シトネボヤ属 Lissoclinum、ネンエキボヤ属 Diplosoma)、約30種以上に共生している(図1, 2, 3)。これらの種は、基本的に必ずプロクロロンを共生させている。一方で、ウスボヤ科の中には、プロクロロンが共生していない種も多く存在する。一般的に、プロクロロンとの共生はウスボヤ科の中で複数回独立に起こったと考えられている。
プロクロロンは、他のホヤ類やナマコ類、海綿からも報告されているが、これらの共生関係は安定しておらず、ふつう偶発的なものであると考えられている。
多くの場合、プロクロロンは群体ボヤの表面、総排泄腔、皮嚢に細胞外共生しているが、シトネボヤ属の一種 (Lissoclinum punctatum) ではプロクロロンのおよそ半数は被嚢の間葉系細胞中に細胞内共生している。ウスボヤ類は胚を群体内に保持し、幼生が放出される。幼生は、親群体から受け継いだプロクロロンを保持している(垂直感染)。プロクロロンが宿主であるホヤに捕食されることはない。
また緑色植物の起源となった原核藻類との共生(一次共生)は、灰色藻や紅藻の起源となった一次共生と同一の現象であったと考えられている。よって一般的に、その際の共生者はフィコビリンをもち、またクロロフィル b をもっていなかったと考えられている。そのため現在では、プロクロロンを含む原核緑藻と緑色植物は、独立にクロロフィル b を獲得したと考えられている(遺伝子水平伝播など)。
分子系統学的研究からは、プロクロロンは、藍藻の中でクレードB2(SPMクレード)とよばれる系統群(Pleurocapsa, Micerocystis, Synechocystis PCC 6803 などを含む)に属することが示されている。同心円状のチラコイドをもつためシネココックス目に分類されることがあるが、他のシネココックス目の多く(藍藻の中で初期分岐群が多い)とは系統的に近縁ではない。Büdel & Kauff (2012) における分類体系では、クロオコックス目プロクロロン科に分類されている。別のホヤ共生藻である Synechocystis trididemni(上記)はプロクロロンに近縁であることが示唆されている。
2023年現在、プロクロロン属には、ただ1種 Prochloron didemni のみが知られている。さまざまな宿主、地域からプロクロロンの分子情報が得られているが、プロクロロンの系統と、宿主または地理的分布との明瞭な関連は見つかっていない。