木ノ本駅
1882年(明治15年)3月10日:官設鉄道の長浜駅 - 当駅 - 柳ヶ瀬駅間開業により、一般駅として設置される。
1895年(明治28年)4月1日:線路名称制定にともない、東海道線の所属となる。
1902年(明治35年)11月1日:線路名称が改定され、所属が北陸線に変更される。
1909年(明治42年)10月12日:線路名称が制定され、所属が北陸本線となる。
1957年(昭和32年)10月1日:当駅 - 敦賀駅間が近江塩津駅経由の新線に切り替わる。なお、柳ヶ瀬駅経由の旧線は柳ヶ瀬線として分離し存続する。
1964年(昭和39年)5月11日:柳ヶ瀬線が廃止される。
1984年(昭和59年)2月1日:貨物の取り扱いを廃止、旅客駅となる。
1985年(昭和60年)3月14日:荷物の取り扱いを廃止する。
1987年(昭和62年)4月1日:国鉄分割民営化により、西日本旅客鉄道の駅となる。
1992年(平成4年)11月1日:みどりの窓口の営業を開始する。
1995年(平成7年)8月19日:当駅を終着駅とする「SL北びわこ号」の運行を開始(2021年に運行終了)。
2003年(平成15年)10月26日:北陸本線・湖西線の直流電化工事が開始される。
2006年(平成18年)10月21日:北陸本線の長浜駅 - 敦賀駅間の直流電化により、新快速の乗り入れを開始する。橋上駅舎に改築するとともに北寄りへ移動する。ICカード「ICOCA」の利用が可能となる。ICカード専用簡易改札機で対応。ホームのかさ上げ工事が完成。
2018年(平成30年)3月17日:駅ナンバリングが導入され、使用を開始。
2023年(令和5年)7月31日:みどりの窓口の営業を終了。
「滋賀県統計書」によると、1日平均の乗車人員は以下の通りである。
木之本田村線(※2022年9月30日まで「木之本米原線」として運行)は「木之本バスターミナル」停留所を発着する。同停留所は当駅を発着する一部路線も経由する。