メアリー・セレスト
また、同船唯一の救命ボートは故意に降ろされ、無理矢理引き離されたようであった。3つの手すりに謎めいた血痕があり、1つの手すりには説明のできない引っかき傷があった。また、刀剣(血にまみれているように見えたが、実際はただの赤錆だった)が船長の寝台の下に隠されていた。
積荷の1,700樽のアルコールは、後にジェノヴァで降ろされた際に9樽が空であった以外は無事で、6か月分の食料と水も残されていた。しかし、船内の書類は、船長の航海日誌を除いて全く見つからなかった。日誌の最後は11月24日付で「アゾレス諸島の西方100マイルの海上にいる」と書かれており、11月25日にはアゾレスのサンタマリア島に到着できる位置にあった。船内には人が全くおらず、乗員10名は発見できなかった。
デイ・グラツィアの乗組員はメアリー・セレスト号をジブラルタルまで曳航し、判事は審理の中で彼らの勇気と技術を賞賛した。しかし英領ジブラルタル司法長官(英語版)で、海事案件の女王代訴人も兼ねていたフレデリック・ソリー・フラッド(英語版)は何らかの謀計を疑っていた。そのため、海難救助の申請をデイ・グラツィアの乗組員に対する事実上の裁判として扱った。結局、裁判所は乗組員に船体と積荷の価格の15%に相当する賞金を与えはしたが、相場の額よりはかなり低かった。これは疑いがあるものの証明できない不正行為に対する罰として相殺されたためであった。
1873年初めに、スペイン沿岸に2隻の救命ボートが漂着したと報じられた。1隻には1人の遺体とアメリカ合衆国の国旗が、もう1隻には5人の遺体があった。これがメアリー・セレストの乗組員の残留物であるか否かについては全く調査されなかったと言われているが、未確認情報である。
修復されたメアリー・セレストはその後、複数の所有者の元を転々とし、主に西インド諸島とインド洋の航路を往来した。最後の船長であるギルマン・C・パーカーは1885年、保険金詐取のためにブーツやネコの餌などほとんど価値のない貨物を積んだ上で積荷目録には30,000ドル(現在の価値に換算すると約840,000ドル)と虚偽の記載をし、船をハイチのポルトープランスに向かうと見せかけ、途中でゴナーブ島付近のロシュロワ・リーフで座礁させたものの、最終的に詐欺が露見しパーカーらは逮捕された。メアリー・セレストはそのまま放棄され廃船となった。
メアリー・セレストの残骸は、2001年8月9日に海洋冒険作家のクライブ・カッスラー(ナショナル・アンダーウォーター・アンド・マリーン・エージェンシー代表)とカナダの映画プロデューサーのジョン・デービス(カナダECO-NOVA Productions社長)が率いる調査隊によって発見された。
1935年、ベラ・ルゴシが出演するイギリス映画「メアリー・セレストのミステリー」 (The Mystery of The Mary Celeste) が作られた。
1954年、イギリスのラジオ番組グーン・ショウでは、「マリー・セレスト事件―解決編!」と題して同番組らしい説明を放送した。
ドクター・フーのエピソード The Chase (1965年)の中では、ダレックが時間旅行で現れたためクルーが船外に逃げ去ったとした。
SF作家フィリップ・ホセ・ファーマーの小説 The Other Log Of Phileas Fogg では、ジュール・ヴェルヌの小説に登場する有名なキャラクター八十日間世界一周の主人公フィリアス・フォッグ (en:Phileas Fogg) と海底二万里のキャプテン・ネモがメアリー・セレストで出くわすシーンがある。
半村良のSF短編『誕生 ― マリー・セレスト号への挑戦』(1979年)では、羽田空港に着陸した国際便の機内は完全に無人だったという事件が発生し、乗客の中に、マリー・セレスト号関係者の子孫が3人も乗り合わせていたことが判明する。結末は涅槃に達するような壮絶なハッピーエンドとなる。
この他映画・小説など多くのフィクション上のモチーフとして登場する。