馬込駅
島式ホーム1面2線を有する地下駅。改札口とホームの間にエスカレーターとエレベーターが設置されている。トイレはホームの中延寄り先端に設置されている。かつては定期券売り場が設置されていたが、2008年2月15日に営業を終了した。現在はピンク色の自動券売機が設置され、ここで定期券を購入できるようになっている。
2008年8月20日から2010年5月22日にかけて、エレベーターの新設を含むバリアフリー対応工事や防災対応工事のために、A3出入口が一時閉鎖されていた。工事開始前までは、中延寄りの改札前の空間に「パノラマオアシス」という名称が付けられ、5300形をあしらった本棚である「浅草線馬込文庫」が設置されていたが、改良工事などの関係で2009年に撤去された。さらに、2011年度にはホーム側壁の改装工事が行われ、白とピンクの壁面に改装された。
五反田駅務区が管轄し、業務を東京都営交通協力会に委託している。