コイ科
カネヒラ・タナゴ・イタセンパラ・アカヒレタビラ・ニッポンバラタナゴ・アブラボテなどのタナゴ類を含む。
カマツカ亜科 Gobioninae - 約200種。ユーラシア全域に産するが、 タイリクスナモグリ属 Gobio 以外のほとんどの属は東南アジアおよび日本に限局する。ニゴイ・スゴモロコ・カワヒガイ・モツゴ・カマツカ・ツチフキなど。
ウグイ亜科 Leuciscinae - 約700種。コイ科で北アメリカに自然分布する唯一のグループである。インドおよび東南アジアには分布しない。ウグイ・アブラハヤなど。
クセノキプリス亜科 Oxygastrinae - 約150種。東アジアから東南アジアに分布する。カワムツ属・ハス属などはかつてダニオ亜科に含まれていたが、他のダニオとは系統が異なるため分離された。
所属未定 Araiocypris - 1種 Tanichthys - 3種 アカヒレ Tinca - 1種 テンチ Capoetobrama - 2種 Leucalburnus - 1種 Placogobio - 2種 Atrilinea - 3種 Rasborichthys - 1種