薬師寺 (曖昧さ回避)
下野薬師寺跡 - 栃木県下野市にあった奈良時代の寺院
岩瀬薬師寺遺跡 - 大阪府河内長野市岩瀬にあった寺院
野作薬師寺 - 大阪府河内長野市野作町にあった寺院
本薬師寺跡 - 奈良県橿原市にあった藤原京時代の寺院跡
薬師寺 (因幡国) - 鳥取県鳥取市にあった寺院