ミュ〜コミ+プラス
この番組にゲストに来てくれた時に、ガチのアニメオタクだったことが明らかになった、日テレジェニック2010出身の内田理央が、リスナーの家にコスプレで来てくれる企画。なお、8月14日から17日と21日から24日には、21日からの4日間のスペシャルウィークで「内田理央に、どんなコスプレをしてほしいか」について、街頭アンケートを実施。吉田と番組スタッフが、リスナーや通行人に対してアンケート用紙を配る。
2009年3月まで同時間帯で放送していた『ミュ〜コミ』をパワーアップさせた形でスタート。2010年1月1日に年始特別番組として放送された『吉田尚記のオールナイトニッポン feat.ミュ〜コミ+(プラス)』にて、番組開始が発表された。
番組は前身番組の『ミュ〜コミ』同様、音楽と、漫画、アニメ、声優などのサブカルチャーの話題を中心に、日替わりのランキングコーナーとゲストコーナーで構成されている。『知ってる?24時。』から実施されていた「サポーターズパーティー」は『宇宙GメンEX』の終了と同時に2009年12月でいったん終了し、3か月の中断を経て、2010年4月より『宇宙GメンEX』放送時のコーナータイトルである「サポーターズラボ」として復活。2010年5月より「サポーターズプラス」として継続している。
『ミューコミ』『宇宙GメンEX』時代を含め10年間、放送する局がニッポン放送のみの関東ローカル番組だったが、2016年4月4日からはSTVラジオ(北海道域)が『アタックヤング』の後継番組としてネット受けを開始。これに伴い、ワイドFM開始の2015年12月7日から使用開始ジングルから「ニッポン放送」や周波数「HAPPY FM93」「AM1242」を繰り返すコーラスを2016年3月31日放送で削除。また、『オールナイトニッポン』と同様にCMフィラーが復活した。
2017年7月24日、7月21日「Hint」ラジオプレイヤーが発送し始める。Hintの機能を使う為DTMFの音を使い放送を開始。
FRESH! by AbemaTV(フレッシュ バイ アベマティーヴィー)にて木曜日に配信。時間放送開始から放送終了(一部は終了直後)のスタジオの様子をそのまま生配信した。放送後のアーカイブは非公開。
2016年1月28日 - 2016年9月29日
月曜日はアライグマ(アライ)役の小野早稀・イワトビペンギン(イワビー)役の相羽あいな、火曜日はコウテイペンギン(コウテイ)役の根本流風・ジェンツーペンギン(ジェーン)役の田村響華、水曜日はサーバル役の尾崎由香・フェネック役の本宮佳奈、木曜日はロイヤルペンギン(プリンセス)役の佐々木未来・フンボルトペンギン(フルル)役の築田行子。
日替わりテーマで、混ぜて食べると美味しい「チョビたしクッキング」を街頭アンケート、テキスト生放送分でのTwitter、メール、FAXで募集し、その中から番組が候補を5つ選出。さらに5候補の中で、どれが美味しいかを、生放送時にメール、Twitterでリスナー投票してもらい、その結果をランキング形式で発表する。番組内では、「チョビたしクッキング」推薦リスナーの生電話出演やゲストアーティスト・声優が「チョビたしクッキング」5候補を試食し、番組を盛り上げた。
ニッポン放送の野外イベント「THE ラジオパーク 2015 in 日比谷 みどりと、エコと、音楽と」の1日目の番組ブースで開催された、吉田によるトークイベント。
ニッポン放送の野外イベント「THE ラジオパーク 2015 in 日比谷 みどりと、エコと、音楽と」の一環で開催された、ゲストにチームしゃちほこ、竹達彩奈、カラスは真っ白、CHiCO With HoneyWorksを迎えてのライブイベント。
イベントの模様は2015年5月4日に放送。
番組終了後のアフタートークである。もともとニコ生関連の仕事が増えてきたという吉田が 吉田尚記(よっぴー)本人です! というアカウントを自ら作ったのがきっかけ。
ニコ生がリスナーにも好評を得ているため徐々に配信回数を増やし、2012年4月以降、番組が終了してから概ね1時間近く配信している。
番組タイトルは特に決まっていないが、その日の出来事に絡めた一言がつく。サブ作家のイロカワが担当するときは、「『ミュ〜コミ+プラス』イロカワ奈津子の今夜はHearty Party!」がタイトルになる。
2012年4月2日 - 2012年内 月曜 - 木曜 25:00頃 -
TOKYO IDOL FESTIVALに出演しているアイドルがトーク力を競って勝者を決するイベント。MCを吉田アナが務める。2015年から開催されている。
「吉田尚記のオールナイトニッポン feat.ミュ~コミ+(プラス)」を皮切りに、2010年以降「吉田尚記のオールナイトニッポン」の年末年始特別番組として放送している。なお、ネット局は、ニッポン放送以外はオールナイトニッポン0(ZERO)やオールナイトニッポンRのネット局に準じる。
サポーターズプラス
この番組は、番組スポンサーのことをサポーターと呼んでおり、サポーターからの依頼(プラスアルファ)に応えるため、リスナーのアイデアを元に企画を盛り上げていく。
平成メモリアルタイム
ニッポン放送に残る報道ニュース、スポーツ実況、過去の番組等の音源を使用して、平成30年間の事件、政治、災害、スポーツ、エンタメ史を1年ずつコンパクトにまとめた5分間のミニ番組。
『アニコボ』( - 2010年4月2日)
毎日24:30頃から放送される10分間のフロート番組。吉田アナウンサーと吉野紗香が出演。アニメや漫画に関する研究を行っている、『宇宙GメンEX』から続けてきた番組。