影の政府
クーパーは、地球外生物が密かにアメリカ政府と関係しているという考えからイルミナティとつながりを持ったが、後にこの主張を撤回している。彼は、ドワイト・D・アイゼンハワーが1954年に地球外生物と条約を締結し、イルミナティの内部に彼らとの関係を管理し、彼らの存在を一般大衆に知られないようにするための排他的小集団を設立したことを告発した。クーパーは、宇宙人が「様々な秘密結社、宗教、儀式、魔術、オカルトを通じて人類を操作し支配している」とし、イルミナティまでもが知らない内に彼らに操作されていると考えていた。
クーパーは、イルミナティはビルダーバーグ・グループによって支配されている秘密の国際組織であるとし、コロンブス騎士団(英語版)、フリーメイソン、スカル・アンド・ボーンズやその他の組織と共謀していると述べている。その究極の目的は、新世界秩序の実現であると彼は述べている。クーパーによると、イルミナティの陰謀者たちは自らの利益のために宇宙人の脅威を作り出しただけでなく、世界を乗っ取るために地球外生物と積極的に共謀してきた。クーパーは、ベセスダ海軍病院(英語版)の16階の窓から落下して死亡したジェームズ・フォレスタルは秘密の委員会とされているマジェスティック12と関係があり、JASON諮問機関の科学者たちはイルミナティの高位メンバーである三極委員会のエリート集団と外交問題評議会の執行委員会のメンバーに直属していると考えていた。