イネ
いもち病(稲熱病)
白葉枯病
縞葉枯病
立枯細菌病
馬鹿苗病
籾枯細菌病
紋枯病
イネシンガレセンチュウ
イネミズゾウムシ
セジロウンカ
ヒメトビウンカ
トビイロウンカ
ツマグロヨコバイ
ニカメイチュウ
イネツトムシ
フタオビコヤガ
カメムシ類(斑点米を作る)
日本国内に稲の祖先型野生種が存在した形跡はなく、栽培技術や食文化などと共に伝播したものと考えられている。日本列島への伝播については、いくつかの説があり、概ね以下のいずれかの経路によると考えられている。
江南地方(長江下流域)から九州北部への直接ルート、
江南地方(長江下流域)から朝鮮半島南西部を経由したルート、
南方の照葉樹林文化圏から黒潮に乗ってやって来た「海上の道」ルートである。
ただし、多様な伝播経路を考慮すべきとの指摘もある。
本格的に稲作が始まった時期は地域によって差があり、一説では最も早いのは九州西北部で弥生時代早期にあたる紀元前9世紀からとされ、初期の稲作は用水路などの栽培環境が整備された水田ではなく、自然地形を利用する形態で低湿地と隣接する微高地を利用していたとされている。杉田浩一編『日本食品大事典』によれば、水稲作の日本への伝来は縄文時代後期にあたる紀元前11世紀頃であり、本格的な栽培が始まるのは近畿地方では紀元前2世紀頃、関東地方では2世紀頃、本州北端では12世紀頃、北海道では明治時代以降であるとされている。