カスパーゼ-9
カスパーゼ-9は活性化の前にプロセシングが必要である。まず、カスパーゼ-9は一本鎖の酵素前駆体として合成される。プロセシングはアポトソームがカスパーゼ-9前駆体に結合した際に行われ、Apaf-1が酵素前駆体の自己分解によるプロセシングを補助する。プロセシング後もカスパーゼ-9のアポトソーム複合体への結合は維持され、ホロ酵素が形成される。
活性型のカスパーゼ-9はイニシエーターカスパーゼとして機能し、下流のエフェクターカスパーゼを切断して活性化することでアポトーシスを開始する。カスパーゼ-9は活性化されるとカスパーゼ-3、-6(英語版)、-7(英語版)を切断してカスパーゼカスケードを開始し、これらが他のいくつかの細胞標的を切断する。
不活性状態のカスパーゼ-9は細胞質基質に単量体の酵素前駆体として存在する。その後、Apaf-1のCARDによってカスパーゼ-9のCARDが認識され、リクルートされて活性化される。
カスパーゼ-9はLeu-Gly-His-Asp↓Xの配列を選択的に切断する。