清和源氏
仮冒・伝説の可能性が高いとされる氏族。
松平氏(徳川氏)
三河国の豪族。信光の代には賀茂氏を名乗っていたという。家康が徳川氏に改姓するにあたって仮冒した氏は藤原氏であった。そのため、慣例で源氏がなるとされていた征夷大将軍に任官されるために、新田氏の末裔となるべく系図を借り受けて「源朝臣」を仮冒するようになったという解釈がされることが多い。しかし、笠谷和比古らの研究によると、1588年の後陽成天皇聚楽第行幸の際には、家康はすでに源朝臣を名乗っていたという。また、家康の祖父の松平清康の代には既に世良田氏の子孫を名乗っていたという説もある。いずれにしても、徳川氏は清和源氏を仮冒したとされる。その後家康は慶長8年(1603年)に征夷大将軍と源氏長者に任じられ、幕府を開いた。
島津氏
薩摩国の大名(鎌倉時代は守護、室町時代は守護大名、戦国時代は戦国大名、江戸時代は薩摩藩主)。元来は中国からの渡来人の末裔である惟宗氏の出で、島津家の祖・忠久は惟宗広言の子とされてきた(近年では惟宗忠康の子という説が有力)。だが忠久が源頼朝により抜擢・厚遇されたことからその理由付けとして「忠久は頼朝の庶子」という系図を自作し「源朝臣」を称するようになったとされている。故に島津氏も徳川氏同様清和源氏を仮冒したとされる。
大友氏 - 源頼朝の落胤を祖と称した
結城氏 - 同上
舜天王統 - 王朝の祖・舜天が源為朝であるという伝説がある
滋野氏 - 源姓ではないが、清和天皇の第5皇子貞保親王の後裔とも称する
また経基・貞純親王・元平親王などの年代で論じるものもある。ただし赤坂によって、史料性の上で問題ないといえない系図資料が使用されていると指摘されている。 赤坂は、当時の皇族の叙位例・氏爵などから清和源氏説が妥当とする。また『権記』に引用されている天暦7年(953年)の王氏爵不正事件に現れる、清和天皇の子孫でありながら陽成天皇子孫を詐称したとして罰せられた源経忠を経基あるいはその兄弟と推定し、頼信が願文で陽成天皇の子孫であることは真実であると主張して名誉回復を図ったと解釈する。
写本であり告文の裏面に校正したと但書きがあることから、宝賀寿男はその信憑性を疑っている。一方、安田元久は星野説の考証を肯定する、ただし一層厳密な史料批判が必要とする。義江彰夫も今考証する余裕はないが源頼信の作に間違いないとする。赤坂は先行研究から後世の偽作でないことは確実だが源頼信による作為があり実際と異なるとしている。
なお経基が清和源氏でも陽成源氏でも、武士の家となった系統の性質に違いはない。また既に『清和源氏』として広く名が知られていることから、『陽成源氏』へ名称を変える必要はないとする意見もある。
河内源氏(満仲の三男の系統) 源為義の子孫 - 志田氏、比志島氏、小山田氏、八田氏、宍戸氏など 源頼清の子孫(信濃源氏) - 村上氏、河内氏、出浦氏など 源頼季の子孫(信濃源氏) - 井上氏、高梨氏など 源義家の子孫(石川源氏・上野源氏・下野源氏・美濃源氏・三河源氏ほか) - 対馬氏、新田氏、山名氏、里見氏、岩松氏、田部井氏、足利氏、斯波氏、大崎氏、桃井氏、畠山氏、仁木氏、細川氏、戸崎氏、一色氏、石塔氏、広沢氏、石橋氏、今川氏、吉良氏、稲沢氏、飯富氏、野長瀬氏、石川氏、二条氏、杭全氏、源姓毛利氏、森氏、木曾氏、新宮氏、愛智氏、吉見氏、徳田氏など多数 源義光の子孫(常陸源氏) - 佐竹氏、山入氏など 源義光の子孫(甲斐源氏・信濃源氏) - 逸見氏、武田氏、小笠原氏、伴野氏、大井氏、板垣氏、一条氏、平賀氏、大内氏、金津氏、伊沢氏、石禾氏、南部氏、大倉氏、駒井氏など 源義綱の子孫(美濃源氏) - 石橋氏、服部氏、宮氏など 源義光の子孫(近江源氏) - 山本氏など
源満政(満仲の弟)の子孫(美濃源氏・尾張源氏・三河源氏) - 八島氏、木田氏、山田氏、足助氏、水野氏など
源満季(満仲の弟)の子孫(近江源氏) - 高屋氏、平井氏など
源満快(満仲の弟)の子孫(信濃源氏) - 伊奈氏、泉氏、依田氏、夏目氏、片切氏(片桐氏)、三刀屋氏など
その他の源氏 - その他柏原氏、など多数