ミクソゾア
ミクソゾア類は1990年頃までは原生動物だと考えられていたが、ミクソゾア類が後生動物だとする考え方は、19世紀末にはすでにあった。放線胞子虫の研究者であるシュトルク (Štolc) は1899年の論文で、粘液胞子虫や放線胞子虫の胞子が多細胞性であり、原生動物とは言えないことを指摘している。またヴァイル (Weill) は1938年に、極嚢が刺胞動物の刺胞に良く似ており、また粘液胞子虫がポリポジウム (Polypodium hydriforme) の寄生生活期とよく似た症状を示すことから、極端に退化した刺胞動物であると主張している。しかしこうした考え方は分子系統解析が行われるまでは軽視されていた。
ミクソゾア類で初めて分子系統解析が行われたのは1994年のことで、これにより確かに後生動物の系統に属し、特に刺胞動物ではなく線形動物に近縁であるという結果が得られた。線形動物との近縁性は意外なものだったため、すぐにポリポディウムの配列も含めた追試が行われ、ミクソゾア類はポリポジウムに近縁であり、デスモソームやタイトジャンクションの存在からも後生動物起源だと認められるようになった。