大和本草
本来の本草学とは薬用植物を扱う学問であるが、この大和本草に於いて日本の本草学は博物学に拡大された。「大和本草」には漢名のない品目も多数収載されている。
小野蘭山の著書に『大和本草』の講義録にあたる『大和本草批正』や『大和本草会識』がある。蘭山は『大和本草批正』で問題点を批判しており、例えば「海鰌(くじら)」について「海鰌 泥鰌と形似と云は誤なり」「おさ のどの下にありとは誤なり」としている。ただし、クジラ(鯨)とドジョウ(泥鰌)の形状が似ているとする同様の記述は『和漢三才図会』にもみられる。
益軒は自序で「本草学は以つて民生日用に切なりとなす」と述べている。諸品の名称が各地で異なることが「もの」の認識を難しくしていると考え、『大和本草』には方言名も調査して記しているが、このことは江戸時代の方言研究の源流となった(名物学も参照)。また、益軒による日本での本草学の確立は江戸時代に飢饉に備える救荒書が多く成立する要因になった。