国民社会主義地下組織
この運動には、「イェーネンジア(独: Jenensia)」のようなブルシェンシャフトや、1999年に同団体から派生した「ノルマニア・イェーナ(ドイツ語版)」、「東プロイセン青年同郷会(ドイツ語版)」との繋がりがあった。チェーペとベーンハルトとムントロースの3人は、アンドレ・カップケとラルフ・ヴォールレーベン、ホルガー・ゲルラッハ(ドイツ語版)と一緒に、チューリンゲン郷土保全運動の「イェーナ親交会」に属していた。これはのちに「セクション・イェーナ」と呼ばれるようになった。ベーンハルトは、ムンドロスと並んで、セクションの副リーダーになった。チューリンゲン郷土保全運動は、1997年に約120人のメンバー、2001年に約170人のメンバーを擁し、その設立者は、ドイツ国家民主党のチューリンゲン支部副議長であるティノ・ブラント(ドイツ語版)である。彼は、1994年から2001年までチューリンゲン州憲法擁護庁のVメン(ドイツ語版)であったことが暴露されている。すでに1995年2月にチェーペは、「チューリンゲンのアイデンティティを守ろう。欧州共同体による国際化に反対」というスローガンを掲げた「チューリンゲン郷土保全運動利益共同体」のデモを行おうと当局に申請したが、イェーナ市は禁止した。1995年3月25日、ムントロースは、トリップティス(ドイツ語版)のスキンヘッドの集会に参加した際に、拘禁された。チェーペ、ムントロース、ベーンハルトとカップケは、1995年5月3日に「1945年5月8日と1995年5月8日を我々は祝わない。解放という嘘で終わる!
事件そのものだけでなく、捜査当局(連邦憲法擁護庁や軍事保安局、警察)にも多くの問題があり、2012年7月には連邦憲法擁護庁の長官、チューリンゲン州憲法擁護庁(ドイツ語版)およびザクセン州憲法擁護庁(ドイツ語版)の長官、ベルリン内務省の憲法擁護部部長がそれぞれ辞任した。ドイツ連邦議会のNSU調査委員会(ドイツ語版)と各州はこの件に関して調査にあたり、怠慢な調査、事件記録の破棄、情報員Vメン(ドイツ語版)の動員、捜査の締め付け、組織的な欠陥があったことを明らかにした。NSU訴訟(ドイツ語版)にあたっているミュンヘン上級地方裁判所(ドイツ語版)は、犯行グループの2人、ウーヴェ・ムントロスとウーヴェ・ベーンハルトが死んだことでNSUは自己解散したと思うのが自然であると説明している。ミュンヘン上級地方裁判所での裁判は2013年5月6日から始まっている。
警察の発表によると、この事件とNSUとの繋がりは、2011年にアイゼナッハの彼らのキャンピングカーで殺された警官の武器が偶然に見つかったことからようやく判明した。
殺害された女性機動隊員のキーゼヴェッターは、チューリンゲンにあるNSUが運営する右翼集会用ゲストハウスの向かい側に数年間住んでいたことがあったため、両者には何らかのつながりがあったのではないか、と連邦捜査局局長イェルク・チールケ(ドイツ語版)は主張したが、南ドイツ新聞のニュースで反論された。女性機動隊員の継父も、東チューリンゲン新聞(ドイツ語版)で、自分の家族は誰もNSUと接触したことはないと否定した。連邦捜査局は、その件について修正し、しかしミシェレ・キーゼヴェッターは、ゲストハウスからは遠くない学校に通っていたことを確認したが、これも女性機動隊員の祖父に再び否定された。2012年7月に、殺された女性警察官と同僚だった2人の女性警察官が、クー・クラックス・クランのメンバーだったことが明らかになった。当局は、このことがNSUと人種差別的秘密結社のあいだに関係があるということを証明するヒントにはならないと否定した。それとは別件で、その女性警察官たちに今でもまだ公務員を辞職させていないことが批判されている。