アーケアメーバ
分子系統解析によりアメーボゾアのうちコノーサの所属とされている。リンネ式階級分類では、たとえばアメーバ動物門コノーサ綱アーケアメーバ亜綱、あるいはアメーバ動物門コノーサ亜門アーケアメーバ綱とする。内部分類については分子系統解析による整理が進められているところである。ここでは2016年時点で提唱されている体系を示す。
エントアメーバ目 Entamoebida Cavalier-Smith, 1993 動物の腸管内に寄生(または片利共生)している。 エントアメーバ科 Entamoebidae Chatton, 1925 鞭毛を完全に欠いている。病原体として赤痢アメーバ(Entamoeba histolytica)がある。
ペロミクサ目 Pelobiontida Page, 1976 淡水環境の堆積物中で自由生活を送るものが多い。 ペロミクサ亜目 Pelomyxina Starobogatov, 1980 ペロミクサ科 Pelomyxidae Schulze, 1877 いずれも自由生活性で、細胞質内に放線菌ロドコッカス(Rodococcus)などの原核生物を共生させている。
アーケアメーバはミトコンドリアを欠き嫌気的環境に適応したアメーバ様生物からなる群。動物の腸管内に寄生または片利共生する生物を含み、赤痢アメーバのような病原体も知られている一方で、淡水環境に棲息するものもいる。分類学的にはアーケアメーバ綱またはアーケアメーバ亜綱があてられている。名前は、真核生物がミトコンドリアを獲得する以前に分岐した生物群だと当初考えられた(現在は否定されている・アーケゾア参照)ことに由来しており、そのため古アメーバ類という訳語がある。