秋田市立土崎南小学校
当校の学区には「将軍野」の住所が含まれている。このため、当校の名前に「土崎」が冠されているにもかかわらず、土崎港曳山祭りの参加町内に属しない児童が相当数いる(「将軍野」についての詳細は、記事「土崎神明社祭の曳山行事」の「用語」の項を参照)。また、当校の敷地から道路1本をはさんで北に隣接する土崎港中央四丁目は土崎小学校の学区になっており、当校と自宅が至近距離にあるにもかかわらず土崎小学校に通わなければいけない児童がいる。
一方で、将軍野南・土崎港南などで高清水小学校が近い地域でもこの学校が指定されていたり、さらに遠い外旭川小学校が指定されていて距離ねじれを起こしている町内もある。
令和8年度に土崎小学校との統合が予定されているが、統合校は当地への設置が決まっている。