国鉄バス
国鉄バス第1号車(リニア・鉄道館、愛知県名古屋市) (旧)交通博物館(東京都千代田区)→鉄道博物館(さいたま市)で展示後、リニア・鉄道館に移設。
日野RA900P型、1969年式、747-9901(さくら交通公園、茨城県つくば市) 東名高速線ドリーム号、国鉄専用型式
三菱B906R型、1969年式、744-9901(西日本JRバス京都営業所、京都市南区、非公開) 東名高速線ドリーム号、国鉄専用型式 交通科学博物館(大阪市港区)にて保存されていたが、閉館に伴い京都営業所へ移動し屋根付きの格納庫にて保管。京都へ移動後、2017年に京都鉄道博物館の機関庫にて期間限定で一般公開された。
三菱P-MS735SA型、1984年式、H654-84451(旧番744-4951)(日本バス友の会、通常非公開) 東名高速線、国鉄専用型式、最終配置:JRバス関東水戸支店
三菱W80型、1970年改造、434-0001(小樽市総合博物館、北海道小樽市、現在非公開) ボンネットバス フロンティア号(空知線:開拓の村 - 新札幌駅運行車)、最終配置:JR北海道バス厚別営業所
ボンネットバス(復元車、JRバス東北古川営業所、宮城県大崎市、イベント等で公開) 1992年、資料を基にトラックのシャーシを再利用して復元したもの。
いすゞP-LV314M型、1986年式、531-6460(汽車倶楽部、福岡県直方市) 直方線、最終配置:JR九州バス直方支店(現・福岡中部支店)
関門急行線
直方線 直方本線 内ヶ磯線(→西日本鉄道グループ(西鉄バス筑豊)) 鞍手線(→くらて町コミュニティバス) 日吉線(→宮若市乗合バス) 水町線(→宮若市乗合バス) 毛勝線(廃止) 飯塚線(→宮若市乗合バス) 福間線(→宮若市乗合バス) 粟島線(→ふくつミニバス)
山鹿線(→産交バス、熊本電気鉄道。福岡県内区間は廃止)
佐俣線(→産交バス)
北薩線
山川線(→鹿児島交通)
嬉野線
佐賀関線(→大分バス)
臼三線(→臼津交通・大野竹田バス)
宮林線(→宮崎交通)
都城線(→宮崎交通)
国分線(→大隅交通ネットワーク→鹿児島交通)
加治木線(→南国交通)
日肥線(→西米良村営バス、宮崎交通)