ネオカリマスチクス綱
ネオカリマスチクス類は、ウシ、ヒツジ、シカ、キリン、カバ、ラクダ、ウマ、サイ、ゾウ、マーラ、カンガルー、イグアナ、リクガメなど植食動物の消化管内に生育し、セルロースなど難分解性の細胞壁成分を分解している(図5)。ただし、ほとんどの研究は家畜を対象としており、野生動物に共生するネオカリマスチクス類の研究例は多くない。動物の消化管内には酸素がほとんどなく、ネオカリマスチクス類は酸素呼吸能を欠く絶対嫌気性生物である。植食動物の消化管には、ネオカリマスチクス類に加えて、細菌、古細菌、原生動物などの微生物が生育し、特徴的な微生物群集を形成している。反芻類の消化管微生物群集の中で、ネオカリマスチクス類の生物量は最大20%を占めることが報告されている。宿主動物は自身のみでは植物片を分解することができないが、これらの微生物と共同することで分解して栄養を得ており、ネオカリマスチクス類は特に植物片の初期分解に重要な役割を担っていると考えられている。
消化管内のネオカリマスチクス類の密度や種組成は、食べている餌の質や摂食頻度、及び宿主動物の分類群によって影響される。例えば、飼料の繊維成分が多いと密度が高くなり、また Khoyollomyces はウマ科から、Oontomyces はラクダ科から特異的に見つかる。