グアヤキル
しかし、黄熱病の流行によってロジャーズらは身代金を諦め、グアヤキルを去った。
1820年10月9日、「Granaderos de Reserva」の軍人やグアヤキルに野営していた大隊の軍人に支援された市民グループが、スペイン王国の衛兵による抵抗に勝利して、ほとんど流血なしに、スペインの統治機関職員を捕らえた。グアヤキルはスペインからの独立を宣言し、Libre de Guayaquil 州となり、ホセ・ホアキン・デ・オルメドが街の首長 (Jefe Civil) に指名された。このことは、エクアドル独立戦争での決定的な勝利を意味した。
1822年7月26日、ホセ・デ・サン=マルティンとシモン・ボリバルは、スペイン領南アメリカの独立を計画するために、グアヤキルで有名な会議を開いた。
1829年、街はペルー軍に侵攻され7か月間占領された。1860年、街はグアヤキルの戦い(スペイン語版、英語版)の舞台となった。1896年、大火により街の大半の部分が破壊された。