北海道エアシステム
2011年6月4日午前11時26分頃、乗客乗員13名搭乗の函館発奥尻行き定期便サーブ340B-WT(機体記号JA03HC)が奥尻空港の手前約1.5km、高度200mで視界不良による着陸のやり直しを行った際機長の高度設定の失念により、操縦士が上昇しているつもりなのに機体は急降下し対地接近警報装置(GPWS)が鳴動、着陸後に地上約30mまで降下していたことが判明した。しかし、HACは大事故になりかねない重大インシデントとは認識せず、同年6月8日になって国土交通省に報告、筆頭株主である北海道知事には6月10日まで報告されなかった。さらにその間エンジンに問題を抱えたまま運用し続ける事態となった。
2013年11月30日 : 札幌/丘珠 - 函館 - 三沢線(1日1便)を運休。
2014年4月26日 : 札幌/丘珠 - 函館 - 三沢線(週2便 (土・日) ・祝日)を運航再開。
2014年10月23日 : 日本航空がHACを再子会社化。
2015年10月22・24日 : 丘珠 - ユジノサハリンスク間で初の国際チャーター便を運航。
2016年10月30日:運送の共同引受開始により全便JAL便としての運航開始(初便は丘珠発函館行きJAL2741便)。
2019年12月18日:ATR 42-600の初号機(JA11HC)を受領。
2020年4月12日:ATR 42-600の初号機(JA11HC)が運航開始(初便は丘珠発釧路行きJAL2863便)。当初は2020年3月29日から運航開始予定であったものの、受領遅延に伴い、同日に後ろ倒しした
2020年10月25日:国際航空連合(アライアンス)「ワンワールド」に加盟。
2020年10月27日:札幌/丘珠 - 女満別線(週3便 火・水・木)を運航再開。
2020年12月29日:函館発丘珠行きJAL2748便を最後にSAAB340Bの3号機(JA03HC)が退役。同社の運航機材に退役機が出るのはこれが初めて。
2021年4月6日:ATR 42-600の2号機(JA12HC)を受領。
2021年4月17日:ATR 42-600の2号機(JA12HC)が運航開始。