新直轄方式
また、インターチェンジの間隔が短距離になったことから、ICの名称も従来に比べ、かなり地域的な物になり(地元周辺住民でなければ認知しないような地名など)、従来の遠隔地移動を目的とした高速道路から、地元住民の短距離の足としての用途転換を窺うことができる。
通常の高速道路では概ね15 km(北海道では25 km)ごとにパーキングエリア、概ね50 km(北海道では80 km)ごとにサービスエリアが設置されるが、新直轄方式では区間内のインターチェンジで入出場しても料金がかからない(新直轄方式区間内あれば無料)ことから設置が省略される(当初は設置予定であっても新直轄方式への転換により計画が白紙になる)。但し新直轄区間が長距離になる場合は代替施設として新直轄方式内のインターチェンジに隣接する形で道の駅が整備される。
新直轄方式での供用により有料区間と無料区間が同一道路において混在することから、2008年(平成20年)6月30日公布、同年8月1日施行の「道路標識、区画線及び道路標示に関する命令の一部を改正する命令」により、「入口の方向」及び「入口の予告」の各標識に無料区間及び有料区間を下図のように表示できるようになった。
有料区間
無料区間
東北中央自動車道相馬尾花沢線 福島JCT - 米沢八幡原IC 米沢八幡原IC - 米沢北IC
中部横断自動車道 八千穂高原IC - 佐久南IC 佐久南IC - 佐久小諸JCT
近畿自動車道 松原那智勝浦線 南紀白浜IC - すさみ南IC 尾鷲多気線 尾鷲北IC - 紀伊長島IC
中国横断自動車道 姫路鳥取線 佐用JCT - 西粟倉IC 智頭IC - 鳥取IC 岡山米子線 米子IC - 米子北IC ※2006年に建設凍結 尾道松江線 尾道JCT - 三次東JCT ※尾道JCTより先(山陽道方面)は有料区間のため、JCT手前に本線料金所があり、尾道北ICまでが無料で通行できる区間である。 三次東JCT - 三刀屋木次IC
四国横断自動車道 阿南四万十線 阿南IC - 小松島IC 須崎西IC - 四万十町中央IC 愛南大洲線 宇和島北IC - 西予宇和IC
九州横断自動車道 延岡線 嘉島JCT - 山都通潤橋IC
東九州自動車道 蒲江IC - 北川IC 清武JCT - 日南北郷IC 日南北郷IC - 日南東郷IC 志布志IC - 末吉財部IC