メタファイトEX
前作と同様、メタル・アタッカーのオプションは各エリアのボスを倒すと入手できる。
ハイジャンプ - ジャンプの幅や高さが上がる。
エンジン - メタル・アタッカーのエンジンの馬力が上がる。特定の場所を走行して進む事ができるようになる。
ホバー - HOVメーターを消費してホバリング飛行する事ができる。ゲージが無くなるとホバリングできなくなる。
GUN1 - サイドビューステージでのレオナルドの銃攻撃のダメージと射程がアップする。また、サイドビューステージにある特定のブロックを壊す事ができるようになる。
ダイブ - メタル・アタッカーで水中を自由に移動できるようになる。
ウォール1 - 壁を吸着走行できるようになる。アイテム選択画面で着脱する事ができる。
ウォール2 - 天井を吸着走行できるようになる。ウォール1と同じく着脱する事ができる。