第1輸送航空隊
1978年(昭和53年)3月31日 - 輸送航空団隷下で編成される(初代司令は後に航空幕僚長となる米川忠吉1等空佐)。
1989年(平成元年)3月16日 - 航空支援集団新編に伴い、航空支援集団隷下に隷属変更。
1990年(平成02年)3月31日 - 小牧基地業務を第5術科学校から移管。
2009年(平成21年) 3月26日 - 飛行群と第404飛行隊を新編。これにより編成完結する。 5月18日 - ソマリア沖の海賊対策のため、C-130H輸送機を使用してジブチへの人員や器材の輸送を行なう。
2010年(平成22年)2月25日 - KC-130Hが第401飛行隊に配備された。
2016年(平成28年)7月11日~7月26日 - 南スーダンの首都ジュバの治安悪化に伴う在外邦人等輸送任務のため、第401飛行隊のC-130H輸送機3機がジブチへ派遣される。