門跡
法親王、または入道親王が住職として居住する13の寺院。十三門跡とも称する。実際には親王家に限って入寺するのは輪王寺・仁和寺・大覚寺の3門跡で、その他は摂家や足利将軍家からも入寺することができた。6代将軍義教が青蓮院から、15代将軍義昭が一乗院からそれぞれ還俗して将軍となったほか、足利義視(10代将軍義稙の父)が浄土寺から還俗して8代将軍義政の養子となっている。
東叡山輪王寺(寛永寺)
日光山輪王寺
南叡山妙法院
聖護院
照高院
青蓮院
魚山三千院
曼殊院
護法山 安國院 出雲寺(毘沙門堂)
圓満院
大内山 仁和寺
嵯峨山 大覺寺
龜甲山 勸修寺
蕐頂山 知恩敎院 大谷寺(知恩院)