三河牧野氏
柴田晴廣 『穂国幻史考』第三話の「牛窪考」で、牧野氏は、愛知県豊川市砥鹿神社神主・草鹿砥氏と同族ではないかとしている。ただし草鹿砥氏自身が穂国造同族と見られるため、この場合上記穂国造末裔説と同趣である。
このほか、郷土史家などから、牧野氏は、神官・神職が土豪化・地侍化したものではないかと指摘されている。三河山本氏、堀田氏、諏訪氏などは、神官・神職の出身者が土豪化した例である。
最後の長岡藩主牧野忠毅は、明治2年(1869年)に諸藩に先立って版籍奉還を願い出、6月22日に長岡藩知事に任じられたが、明治3年(1870年)10月22日に願いにより藩知事を免官された。
明治2年(1869年)6月17日の行政官達で公家と大名家が統合されて華族制度が誕生すると忠毅も大名として華族に列した。忠篤の代の明治17年(1884年)7月7日の華族令の施行で華族が五爵制になると、同月8日に旧小藩知事として子爵に列せられた。
忠篤は明治30年(1897年)以来貴族院の子爵議員に6回当選して務め、院内会派研究会の頭目の一人として活躍した。また長岡市長、 實田石油会社社長、帝國農会会長、日本中央蚕糸会会長、華族世襲財産審議会議員などを歴任。
忠永の代に長岡牧野子爵家の邸宅は東京市淀橋区西大久保にあった。
また天文13年(1544年)に連歌師谷宗牧が東三河に訪れた際に牧野平三郎・平四郎兄弟が牛久保より出迎えた記事が「牛久保密談記」に見え、またこの牧野平三郎は宝飯郡南端の伊奈に居住したといい、永禄年間(1558年~1570年)に一時は伊奈本多氏に代わり伊奈城主であったともいう。
成種の系は牧野出羽守保成が継ぎ、戦国大名今川義元の庇護のもとに牧野一族の実質的な惣領となったが、義元戦死後は今川氏の衰退とともに徳川家康に屈して滅亡。また、その弟・牧野貞成(民部丞)は牛久保城主の牧野成勝(氏勝)の系を継いだとされ、天文年間初期(6年頃)には牛久保城主になったと推定される。
しかし今川氏の支配を嫌った民部丞貞成は、弘治2年(1556年)には今川義元に城主の地位から追放された。永禄4年(1561年)には徳川氏(当時は松平氏)に転属、養嗣子の成定(右馬允)も永禄9年5月には岡崎で家康に謁見を受け徳川氏に服属した(「松平家康判物」『牧野文書12』(永禄9年5月9日(1566年5月27日)付け牧野右馬允成定宛))。こうして、家康との関係を強めたこの系統より、徳川譜代大名家の牧野氏が生ずることになった。