星口動物
フクロホシムシ科 Golfingiidae - 触手は枝分かれせず、腎管は2本ある。 マキガイホシムシ科 Phascolionidae - 触手は枝分かれせず、腎管は1本のみ。 エダホシムシ科 Themistidae - 触手は枝分かれし、腎管は2本ある。
サメハダホシムシ綱 Phascolosomatidea - 触手は口を囲まず、吻の鉤は輪状に配列する。 サメハダホシムシ目 Phascolosomatiformes - 体幹に盾状部を持たない。 サメハダホシムシ科 Phascolosomatidae タテホシムシ目 Aspidosiphoniformes - 体幹に硬い盾状部を持つ。 タテホシムシ科 Aspidosiphonidae
上記の分類体系は、形態による系統推定の結果とほぼ一致するが、分子系統学に基づき、一部見直す必要があるとする研究者もいる。2012年にはやはり分子系統に基づいて科レベルの分類を再編する論文が発表された。それによると、星口動物は以下の6科に分類される。
スジホシムシ科 Sipunculidae
フクロホシムシ科 Golfingiidae
タテホシムシ科 Aspidosiphonidae
サメハダホシムシ科 Phascolosomatidae
Siphonosomatidae
Antillesomatidae
ホシムシ類はリンネの『自然の体系(英語版)』第12版(1767年)に記載されているが、雑多な無脊椎動物とともに蠕虫綱(英語版)の一員とされていて、独立した分類群にはなっていない。ラマルクやキュビエは、ホシムシ類はナマコに近いと考えていた。1828年にブランヴィルは、ホシムシ類を「Sipunculida」と名付けたが、このグループには一部の寄生性蠕虫も含まれていた。カトルファージュ(英語版)は、ホシムシとユムシ、エラヒキムシが環形動物と棘皮動物の中間形であると考え、これらの動物をまとめて擬環虫類(Gephyrea、ギリシャ語で橋を意味するgephyraに由来)と呼んだ。1959年、ハイマン(英語版)は星口動物を独立の動物門とした。
ハイマンは星口動物門を綱や目に分けていなかったが、その後の研究により、以下の2綱4目6科に分類されている。属以下の分類は各科の記事を参照のこと。各分類群の特徴は西川、ブルスカとブルスカによる。
スジホシムシ綱 Sipunculidea - 触手は口を囲むように配列する。吻の鉤は輪状に並ばない。 スジホシムシ目 Sipunculiformes - 縦筋は分離する。腎管は2本ある。 スジホシムシ科 Sipunculidae フクロホシムシ目 Golfingiiformes - 縦筋は分離しない。