牧野富太郎
『牧野植物随筆 続』(鎌倉書房、1948年)
『趣味の植物誌』(壮文社、1948年)
『四季の花と果実』(通信教育振興会、1949年) 『植物知識』(講談社学術文庫、1981年)(仮名遣い表記を改め改題、註を付した新版。伊藤洋(東京教育大学名誉教授)解説で、牧野富太郎の略歴説明がある)
『植物一日一題 : 随筆』(東洋書館、1953年)
『若き日の思い出』(旺文社、1955年1月)
『牧野植物一家言』(北隆館、1956年)
『草木とともに』(ダヴィッド社、1956年)
『牧野富太郎自叙伝』(長嶋書房、1956年) 『牧野富太郎自叙伝』(講談社学術文庫、2004年)
以下は没後刊
『牧野富太郎植物記』 全8巻(あかね書房、1973年 - 1974年) ※中村浩編
『牧野富太郎選集』 全5巻(東京美術、1981年 / 復刻:学術出版会、2008年)
『植物一日一題』(博品社、1998年 / ちくま学芸文庫、2008年)
『植物一家言 草と木は天の恵み』(北隆館、改訂版2000年) ※小山鐵夫監修、水島うらら脚注
『牧野植物随筆』(講談社学術文庫、2002年)
『植物記』(ちくま学芸文庫、2008年)
『花物語 続植物記』(ちくま学芸文庫、2010年)
『草木とともに 牧野富太郎自伝』(角川ソフィア文庫、2022年)
『わが植物愛の記』 (河出文庫、2022年)
『我が思ひ出 牧野富太郎〈遺稿〉』(北隆館、2022年)
『好きを生きる』(興陽館、2023年)
『随筆草木志』(中公文庫、2023年)
『牧野富太郎と、山』(山と溪谷社・ヤマケイ文庫、2023年)
『新撰日本植物図説』第2巻第2集(敬業社、1903年)
『日本高山植物図譜. 第1巻』三好学、牧野富太郎 共著(成美堂、1907年)
『日本高山植物図譜. 第2巻』三好学、牧野富太郎 共著(成美堂、1909年)
『日本植物図鑑』(北隆館、1940年)
『牧野日本植物圖鑑 : 學生版』(北隆館、1949年4月)
『原色日本高山植物図譜』 (誠文堂新光社、1953年)
『牧野新日本植物圖鑑』(北隆館、1961年6月30日 初版発行)
『普通植物検索図説』(高陽書院、1970年)
『原色牧野日本植物図鑑』(北隆館、1985年4月)
『牧野新日本植物図鑑』(北隆館、1996年) 『原色牧野日本植物図鑑』全3巻(北隆館、2000年) ※『牧野新日本植物図鑑』の植物図を着色したもの。
26歳でかねてから構想していた『日本植物志図篇』の刊行を自費で始めた。印刷工場に出向いて石板印刷技術を学び、絵は自分で描いた。これは当時の日本には存在しなかった、日本の植物誌であり、今で言う植物図鑑のはしりであり、マキシモヴィッチからも高く評価された。
この時期、富太郎は東京と郷里を往復しながら研究者の地位を確立していくが、その研究費は亡き祖母浪子に代わって猶が工面し、富太郎の求めるままに東京に送金したため、実家岸屋の経営は瞬くうちに傾いていった。
富太郎は佐川の実家に本妻の牧野猶がいたが、1887年(明治20年)12月頃、菓子屋の看板娘小澤壽衛(14歳)に一目惚れし、親の承諾を得ないまま下谷区根岸の御隠殿(輪王寺宮門跡の別邸)跡の離れ家で一緒に暮らしはじめ、翌年(明治21年)10月、第一子長女・園子(1888年 - 1893年)が生まれる。
1889年(明治22年)、27歳で新種の植物を発見。『植物学雑誌』に発表し、日本ではじめて新種のヤマトグサに学名をつけた。1890年(明治23年)、28歳のときに東京府南葛飾郡の小岩町で、分類の困難なヤナギ科植物の花の標本採集中に、柳の傍らの水路で偶然に見慣れない水草を採集する機会を得た。これは世界的に点々と隔離分布するムジナモの日本での新発見であり、そのことを自ら正式な学術論文で世界に報告したことで、世界的に名を知られるようになる。
しかし同年、植物学教室の蔵書の無断持ち出しなどが問題となり、矢田部教授から植物学教室の出入りを禁じられ、研究の道を断たれてしまう。