ミンダナオ島
6つの地方と26の州からなっている。
ミンダナオには6つの地方と28の州がある。うち、4州は離島部にある。これら地方は2001年に大きく再編されている。
サンボアンガ半島地方 (Zamboanga Peninsula, Region IX) サンボアンガ・デル・ノルテ州 サンボアンガ・デル・スル州 サンボアンガ・シブガイ州
もと西ミンダナオ地方と呼ばれていた地域で、ミンダナオ島の西側に突き出たサンボアンガ半島に位置する。上記の3州と、これらから独立したサンボアンガ市、イサベラ市からなる。イサベラ市はバシラン州を形成するバシラン島にあるが、ここだけはサンボアンガ半島地方に属している。サンボアンガ半島地方の行政的中心はパガディアン市にある。
北ミンダナオ地方 (Northern Mindanao, Region X) ミサミス・オリエンタル州 ミサミス・オクシデンタル州 カミギン州 ラナオ・デル・ノルテ州 ブキドノン州
ミンダナオ島中央部の北海岸を占める地方。カミギン州はミンダナオ島の北海岸沖の離島である。このほか、州に属さない街としてカガヤン・デ・オロ市があり、地方の行政的中心都市である。
ダバオ地方 (Davao Region, Region XI) ダバオ・デ・オロ州 ダバオ・デル・ノルテ州 ダバオ・デル・スル州 ダバオ・オリエンタル州 ダバオ・オクシデンタル州
ミンダナオ島の東南部、太平洋(フィリピン海)に面した地方であり、南から北へダバオ湾(英語版)が入り込んでいる。もとは南ミンダナオ地方の一部であった。
21世紀に入り、中東やアフガニスタンでの紛争と結びついたイスラム教原理主義系のテロ組織の勃興により、ミンダナオ島やスールー諸島ではフィリピン国軍やアメリカ軍による共同軍事作戦、掃討作戦が行われている。特にミンダナオ島西部はアブ・サヤフやジェマ・イスラミアといった東南アジア全域で活動するとされる国際的テロ組織が拠点を置き、MILFなど伝統的な分離独立運動と連携しつつ、これら比較的主張が穏やかな民族主義的独立派の基盤を奪いかねないほど勢力が広がっているとされていたが、米比両軍による掃討によりほぼ壊滅・弱体化したと思われる。しかしMILFは根強い支持基盤を持つためまだ危険な地域も多く、渡航には注意が必要である。
2017年、ミンダナオ島でイスラム派過激組織ISILに呼応したアブ・サヤフの活動が活発化。同年5月25日、ロドリゴ・ドゥテルテ大統領は、島全域に戒厳令を発令。マラウィ市内に攻撃ヘリコプターを展開し、武装組織に対してロケット弾などによる攻撃を加えている。10月23日に終結宣言が出され5カ月間に及ぶ政府軍の掃討作戦が終了している。
戦闘終結宣言以降も治安の回復に時間がかかっていることから、大統領はミンダナオ島全域に出している戒厳令の1年間延長を議会に要請。12月13日、フィリピン上・下両院は戒厳令の延長を認めた。