多号作戦
11月5日、日本海軍は第四航空戦隊(司令官:松田千秋少将)を第二遊撃部隊に編入する。第四航空戦隊の航空戦艦2隻(日向・伊勢)は第三十一戦隊(五十鈴・霜月・桑・槇・杉・桃・梅)各艦と共に内地を出撃、南西方面にむかった。
11月10日夜、隼鷹輸送隊(空母隼鷹・巡洋艦2隻〈利根・木曾〉・第30駆逐隊〈夕月、卯月〉)がマニラに到着、隼鷹は搭載していた陸軍パラシュート部隊や特攻ボート・震洋・第31特別根拠地隊(司令官:有馬馨少将、17日より岩淵三次少将)向けの物資を陸揚げした。 第一水雷戦隊(司令官:木村昌福少将)はレイテ沖海戦で旗艦阿武隈を失っていたので、木曾がマニラに残り第一水雷戦隊旗艦として多号作戦に参加することになった。隼鷹隊には、スリガオ海峡夜戦から生還したものの損傷の大きい白露型駆逐艦時雨が加わる。11月12日、隼鷹隊(隼鷹・利根・時雨・夕月・卯月)はマニラを出港、内地に向かった。
大本営がレイテ決戦方針を示した11月13日、アメリカ軍機動部隊(第38任務部隊)はマニラを襲撃した。 マニラに到着したばかりの軽巡洋艦木曾は大破着底する。駆逐艦4隻(初春・沖波・秋霜・曙)は沈没するか大破着底し、給油艦隠戸が大破、駆逐艦潮が損傷した。輸送船の被害は甚大だった。唯一の優速船だった金華丸を含め、輸送船15隻(約7.3万トン)が沈没、ミンドロ島付近の輸送船2隻が沈没した。
志摩長官は「このままでは健在の駆逐艦も全滅する」と南西方面艦隊(司令長官:大川内傳七中将、参謀長:有馬馨少将)に進言し、水雷戦隊のマニラ脱出を意見具申した。13日午後の時点で、大川内中将は木村第一水雷戦隊司令官に水雷戦隊のボルネオ島西北部ブルネイへの回航を命じた(NSB電令作第749号)。
輸送船:神祥丸・神悦丸
護衛艦艇:駆潜艇45号・53号・哨戒艇105号
11月27日、戦時標準型貨物船の神祥丸(2,880トン)と神悦丸(2,211トン)を、護衛艦艇3隻(哨戒艇105号・駆潜艇〈45号・53号〉)が護衛し、マニラを出撃した。途中空襲を受けたが大きな損傷無く、日本軍の空挺部隊の陽動作戦(飛行場制圧作戦)の支援をうけ、28日19時0分にオルモックに突入した。弾薬250m、糧食1100mを揚陸した。 しかし夜間に敵魚雷艇の攻撃を受け駆潜艇53号、哨戒艇105号が沈没した。 翌30日朝の空襲で揚陸の遅れていた神悦丸が炎上し、接岸したまま擱座する。残った神祥丸と駆潜艇45号はマニラを目指したが、30日にセブ島東方で遭難沈没。船団は全滅した。 だが軍需品の一部揚陸に成功したことは、日本軍各部にレイテ作戦遂行への希望を抱かせた。
第2船団:せれべす丸・泰山丸・三笠丸・西豊丸・天照丸
護衛部隊:掃海艇第30号・駆潜艇46号
警戒部隊:島風・浜波・初春・竹
糧食・弾薬など6,000トン、兵站部隊および第26師団(泉兵団)の一部を輸送する。計画では第4次輸送部隊がマニラ帰港後に出港する予定だったが、フィリピン周辺の天気予報は悪天候が続き「連合軍側は航空機の攻撃が出来ない」と予想された。南西方面艦隊司令部は「八日菲島中部東方海面ニ出現セル低気圧ノ影響及目下敵機動部隊菲島ヨリ離隔セル算アルコト並ニ第一遊撃部隊出動ノ好機ヲ利用スルタメ」と報告している。大本営海軍部も「通信情報ニ依レバ五、六日菲島ニ来襲セシ敵機動部隊ハ『パラオ』東方海面ニテ補給中ナルモノノ如ク」と判断した。
以上の判断により南西方面艦隊司令部は、悪天候が続くうちに輸送を終了させようと、第三次輸送部隊の11月9日出撃を決定した。低速船5隻の内訳は、せれべす丸(5,863トン)・泰山丸(3,587トン)・三笠丸(3,143トン)・西豊丸(4,639トン)・天照丸(4,982トン)である。 午前3時に出港後まもなく、せれべす丸がポンドク半島(ルソン島南部)で座礁し、駆潜艇46号が現場に残った。 しかし予報は外れ、天候は回復しつつあった。 10日、本隊は途中で第四次輸送部隊とすれ違い(上述)、警戒部隊の艦を一部交換する形となった。初春と竹は第四次輸送部隊に編入されマニラに引き返し、駆逐艦3隻(長波・朝霜・若月)が第四次輸送部隊から第三次輸送部隊に編入された。
この日に第4航空軍が護衛機として準備できたのは、飛行第200戦隊(通称「皇戦隊」)の四式戦闘機「疾風」わずか8機であり、しかも途中からは、僚機の7機とはぐれてしまった吉良勝秋曹長機1機となってしまった。吉良機は途中で酸素ボンベが破裂してしまったため高度を下げるため降下していると、そこで船団を攻撃に来た「P-38」10数機と鉢合わせになり、吉良機は単機で10数機の「P-38」から船団を護ることとなった。しかし、経験豊富な吉良は、「P-38」が高空では優速で手強いが、低空では旋回性能が劣るために戦いやすいことを熟知しており、低空の空戦に持ち込んで2機を返り討ちにして、見事に船団を護りきり、第26師団の兵員は無事にレイテ島に上陸できた。司令官の富永恭次中将は輸送船団に乗船していた部隊からこの報告を聞くと、とても喜んで、すぐに吉良を司令部に呼んで自ら面談し「船団前で、敵10数機と単機よく戦い、2機を撃墜、友軍の士気を高めること大であった。吉良、よくやった。只今より准尉に進級させる」と熱く語りかけ、すぐさま青鉛筆で「赫々たる武勲を賞し、特に准尉に進級せしむ」という階級の特進状を書いて吉良を感激させている
11月9日、第四次輸送部隊はオルモック湾口で空襲をうけた。被害は輸送船2隻小破で、18時15分にオルモック着、揚陸を開始した。30分後には第四船団の輸送艦3隻もオルモックに到着した。ところが、オルモックはすでにアメリカ軍重砲隊の射程にはいっており、船団は沖合に停泊せざるを得なかった(揚陸地点をイビルに変更)。