エーコープ
単位農協直営店は山間地などに所在する比較的小規模の店舗が多く、一般企業の運営するスーパーマーケット同様、1990年代以降、不採算から閉店・撤退する地域が目立ちはじめた。中には、他社組織に運営委託させたり、コンビニエンスストアに転換した例もある。
かつて各単位農協の直営店が中心業態であった時代はエーコープと呼ばず「くみあいマート」・「くみあいマーケット」「くみあい生活センター」「農協購買部」と称したり、エーコープと「くみあいマート」・「くみあいマーケット」を併称している店舗が全国的に存在していたが、グループ企業によるチェーン店展開が進展するにつれ、店名はエーコープに統一されていった。現在も一部の農協ではエーコープと呼ばず「くみあいマーケット」、あるいは「Aマート」と称している店舗もある。これらの正式名称に関わらず、「生協」と同様、一般には単に「農協」と呼ばれている例も多い。
以下、2021年4月現在
JA全農本部 - 事務局を設置
株式会社ホクレン商事 - 北海道
株式会社エーコープ東日本 - 青森県・岩手県・秋田県・ 宮城県・山形県庄内地方(青森県は店舗展開は無し)・神奈川県・東京都・埼玉県・群馬県 ・ネットショップ
株式会社長野県A・コープ - 長野県
株式会社JAライフ富山 - 富山県・ネットショップ
株式会社ジャコム石川 - 石川県・ネットショップ
株式会社エーコープあいち - 愛知県
株式会社エーコープ近畿 - 京都府・奈良県・大阪府・兵庫県・和歌山県の一部地域・三重県
株式会社Aコープ西日本 - 島根県・岡山県・広島県・愛媛県・鳥取県
株式会社Aコープ九州 - 福岡県・佐賀県・大分県
株式会社エーコープみやざき - 宮崎県
株式会社エーコープ鹿児島 - 鹿児島県
株式会社JAおきなわAコープ - 沖縄県
ホクレン農業協同組合連合会 子会社ホクレン肥料が製造する一部の化成肥料に「エーコープ」の名前が冠されて供給されている。
全農物流 当社設立時の社名「エーコープライン」にちなみ、一部の所有船の船名に「エーコープ」の名を冠しており現在も継続。 一例として、当社と松村海運との共有船の船名に「第一エーコープ」と名付けられている。同船は、九州-沖縄・離島間を主航路とし飼料・肥料・木材チップ・砂糖等の輸送を担う。 なお、2016年進水の「第一エーコープ」は2代目。初代「第一エーコープ」の竣工は1995年7月。