京都総合運転所
R02編成は「森の京都QRトレイン」ラッピング車両として運行されている。
クモヤ145形電車(2両) 2両(1051, 1201)が所属している牽引車。 主電動機をMT46からMT54へと交換したため1000番台(原番号+1000)となっている。
681系
289系
683系
113系(緑単色塗装)
117系(緑単色塗装)
117系(WEST EXPRESS 銀河)
221系
クモヤ145形
気動車
キハ189系気動車(21両) 3両編成(H編成)7本が所属している。キハ181系の老朽化にともなう置き換え用の車両で、山陰本線の特急「はまかぜ」を中心に運用される。最高速度は223系と同等の130km/hである。 京都線では通勤特急「びわこエクスプレス(2号)」の運用にも使用されている。
キヤ141系気動車(4両) 2両編成2本が所属している。軌道・信号通信試験車。
DEC741形気動車(2両) 2021年11月試運転が開始され2025年に実用化される。 443系電車の後継車両。443系の設備も移設搭載されている。 2両編成(DEC741-1+DEC741-101)1本が所属している架線検測車。 JR四国とJR九州の電化区間の検測にも使用される。
キハ189系気動車
キヤ141系気動車
DEC741形
貨車
チキ5500形貨車(30両) レール輸送用長物車で、常備駅は向日町駅である。
チキ6000形貨車(40両) レール輸送用長物車。常備駅は安治川口駅と向日町駅である。
チキ7000形貨車(12両) レール輸送用長物車。常備駅は向日町駅である。
ホキ800形貨車(7両) バラスト輸送用ホッパ車で、常備駅は尼崎駅と近江今津駅である。