怪獣自衛隊
隅田川の河口、タワーマンションが並ぶ月島では、やや成長した個体"怪獣"が不倫中のカップルを襲撃、2人は惨殺される。隅田川を遊泳する怪獣を目撃した月島警察署の鳥嶋警部補は、事件が怪獣の仕業であると主張するも相手にされなかった。テレビ局の美沙は、番組企画「隅田川のネッシーを追え」の撮影中、船員が怪獣に喰われてしまう。通報を受け、東京都はただちに「特殊生物災害対策本部」を立ち上げる。
緊急事態宣言が発令され2週間が経過しても怪獣は現れず、対策本部は怪獣の包囲網を狭め、あぶりだす作戦を実施。神田川の雨水分水路で壁に擬態していた怪獣が出現し、自衛隊と交戦。向井1等陸曹が腕を噛まれ、また民間人の少女楓が負傷した際に、以後怪獣は執拗に彼らを付け狙うことが判明する。