特殊作戦執行部
SOE部長は、しばしば「CD」のイニシャルで呼ばれた。初代部長フランク・ネルソン(英語版)はかつてインドの貿易商社で社長を務めたほか、保守党の国会議員やスイスのバーゼル駐在領事を務めた事もある人物であった。1942年2月、戦時経済相がラウンデル・パルマー(英語版)に交代する。パルマーは病気を理由に退職したネルソンの後任者としてハンブロズ・バンク(英語版)の頭取チャールズ・ジョセリン・ハンブロ(英語版)を部長に任命した。ハンブロはチャーチルの古くからの親友で、また第一次世界大戦における戦功十字章(英語版)(MC)の受章者でもあった。パルマーは戦時経済省にてSOEとの連絡を担当していた上級職員グラッドウィン・ジェブも解任し、外務省勤務へ復帰させている。
1943年8月、パルマーとハンブロはSOEはこのまま単独で活動し続けるのか、それとも陸軍に接近して共同を図っていくべきなのかという問題について対立した。ハンブロは自主・自律性の欠如はやがてSOEの活動に大きな問題を引き起こすと考え、単独での活動を主張していた。この対立の結果として部長職を解任されたハンブロは、のちにワシントンD.C.における原材料購入委員会の議長となった。以後、SOE部長は参謀総長委員会(英語版)にこそ出席しなかったものの帝国参謀総長(英語版)との関係を深めていくことになる。
1943年9月、SOE副部長だったコリン・マクヴェイン・ガビンズ少将がハンブロの後任者として部長に就任する。彼は各種特殊作戦の経験が豊富で、初期のMI Rにも参加していた。彼もまたアイルランド独立戦争におけるIRAの活動を評価し、その戦訓をSOEの活動に取り入れていった。
保安上の理由から、SOEの各部局は「合同技術委員会」(Joint Technical Board)や「相互勤務調査局」(Inter-Service Research Bureau)といった曖昧な秘匿名称が与えられていたり、場合によっては航空省(空軍省)や海軍本部(海軍省)、戦争省(陸軍省)などの部局に偽装されていた。
SOEは英国の主要な同盟国であったアメリカ合衆国およびソビエト連邦の合意の元、これらの同盟国が特別に定める場合を除き、基本的に枢軸国および被占領国全域での展開が認められており、任務によっては中立国領内で活動する場合もあった。SOEが直接雇用していた構成員は13,000名ほどで、そのうちおよそ3,200名が女性であった。
第二次世界大戦終結後の1946年1月15日、SOEの解散が公的に宣言された。
1940年初頭、SOEは東南アジアでの活動に向けた準備を開始した。ヨーロッパと同様、SOEは連合国軍撤退後の地域で現地住民による抗日組織の設置を支援した。フォース136は中国大陸における様々な品物および金銭の秘密取引を行っていた。この取引による利益は77,000,000ポンドにもなり、捕虜への支援および解放に関する取引、あるいは戦後のいくつかの処理における費用として利用された。