セリム3世
ところが1798年のナポレオンのエジプト遠征(エジプト・シリア戦役)以降、両国の関係は急速に悪化、今度はニザーム・ジェディード軍を用いてフランスと戦うこととなった。1799年にフランス軍がシリア地方のアッコに侵攻して来たためニザーム・ジェディードとその地で衝突した。ニザーム・ジェディードは現地のアーヤーンの協力も得てフランス軍に勝利して、1801年までにエジプトのフランス軍を降伏させた。ナポレオンのエジプト侵攻以降セリムはフランスを敵視するようになり、1798年の対仏大同盟に参加、翌年にフランスと敵対するイギリスの商船に黒海通商権を与えた。
その一方で北方のロシアがコーカサス方面に進出してきたため、オスマン帝国はこれに危機感を抱いていたが、1805年にロシアと対仏防衛同盟を締結した。しかしこれはフランスという共通の敵がいたため成立したのであって翌年ロシアと再び開戦した。この戦争自体はニザーム・ジェディードが早期にモルドバからロシア軍を追い返したため、しばらく停戦状態が続いた。オスマン側はロシアに対抗、もしくは支援を得るため、開戦から3年後にイギリスと秘密同盟を締結した。