クッパJr.
原作DS版には登場していなかったが、今作の追加モード「クッパJr.RPG」で主役となる。メインストーリーには原作同様登場しない。
前述のように父を心から尊敬しており、父クッパも『マリオカート ダブルダッシュ!!』公式サイトの説明で「目に入れても痛くない」と言うほど可愛がっている。なお、クッパJr.登場以前からクッパの息子たちとして存在していたクッパ7人衆は、クッパJr.登場以降は「クッパの手下」として扱われることが多く、2012年9月には、アメリカのゲーム誌『Game Informer』のインタビューにて、宮本茂が "Our current story is that the seven Koopalings are not Bowser's children. Bowser's only child is Bowser Jr., and we do not know who the mother is." (翻訳:我々の現在のストーリーでは、クッパ7人衆はクッパの子供ではない。クッパの唯一の子供はクッパJr.で、その母親が誰なのかは分からない。) と回答している。2015年9月に宮本は "Do you know who Bowser Jr.'s mother is?" (翻訳:クッパJr.の母親が誰か知っているか?)という質問に対して頷き、自身を指さしている。両者が初共演した『New スーパーマリオブラザーズ Wii』のプロローグやエピローグでは非常に息の合った連携プレイ、やり取りを見せており、厳密な関係は不明だが、少なくともJr.と7人衆の関係はかなり良好のようである。『マリオ&ルイージRPG ペーパーマリオMIX』ではロイから、『ペーパーマリオ オリガミキング』ではカメックから「ぼっちゃん」と呼ばれている。
プレイヤーキャラクターとして登場。ペルミタイプ。
隠しキャラクターとして参戦。
隠しキャラクターとして登場。メガストライクは「ソニックスクリーム」でスーパーアビリティは「ソニックボイス」のオフェンスタイプ。
プレイヤーキャラクターとして登場。