フィコビリソーム
フィコビリソームの構造は生物によって様々なバリエーションがある。一般的には半円盤状(藍藻)もしくは半楕円状(紅藻)である。ロッドが束になったような形状のものもある。一方フィコビリタンパク質自体は、必要とされる機能(特定波長の光の吸収とエネルギー伝達)の維持のため強力な選択圧がかかることから、塩基配列の進化速度は小さく、保存性が高い。
フィコビリソームの組成は細胞の色を決定する主要因である。藍藻は赤色のフィコエリスリンの含量が相対的に小さく、細胞はフィコシアニンとクロロフィルにより青緑色を呈する。フィコエリスリンを多く含む種や、光適応でフィコエリスリンを増した藍藻は赤褐色に見える。また海洋の深所に適応した紅藻類は、青緑色光を効率的に吸収するため大量のフィコエリスリンを含有しており、一般に鮮やかな赤色である。紅藻ではフィコエリスリンが多様化しており、少なくとも5種類の吸収特性が異なるフィコエリスリンが報告されている。灰色藻はフィコエリスリンを欠くため青緑色を呈する。また紅藻の中でもイデユコゴメ綱の単細胞紅藻であるシアニジウム (Cyanidium) やシアニディオシゾンはフィコエリスリンを失っており、青緑色である。なおクリプト藻の仲間もフィコビリタンパク質の一部を持つが、フィコビリソームは形成しない。これはコアとなるアロフィコシアニンを欠くためであると考えられている。
藍藻 Oscillatoria(ユレモのなかま)
灰色藻 Glaucocystis
海産の紅藻 Chondrus crispus(ヤハズツノマタ)。
温泉性の単細胞紅藻 Cyanidium