神護寺
翌天慶3年(940年)、乱の平定後に朱雀天皇は寛朝が帰京しようとしたが不動明王像が動こうとしないとの報せを聞き、公津ヶ原に東国鎮護の霊場を拓くべきとの考えのもと、神護新勝寺の寺名を下賜し勅願寺として創建させた。扁額「明王堂」は五代目市川海老蔵(七代目市川團十郎)による筆。
五大堂 - 元和9年(1623年)の建立。金堂へと上る石段の下に建つ。入母屋造の三間堂。
毘沙門堂 - 元和9年(1623年)の建立。五大堂の南に建つ。入母屋造の五間堂。金堂が建つ前はこの堂が金堂であり、本尊の薬師如来像もここに安置されていた。内部の厨子に平安時代の毘沙門天立像(重要文化財)を安置する。
大師堂(重要文化財) - 毘沙門堂の西側に建つ入母屋造、杮(こけら)葺きの住宅風の仏堂。空海の住房であった「納涼房」を復興したもので、現存するものは近世初期の再建である。内部の厨子に正安4年(1302年)作の板彫弘法大師像(重要文化財)を安置する(大師像は秘仏で、11月1日 - 15日のみ開帳)。
地蔵院 - かわらけ投げが出来る。
和気公霊廟 - 和気清麻呂を祀る。1934年(昭和9年)に山口玄洞の寄進により再建。
宝蔵
本坊 庫裏 書院 庭園 茶室 - 1934年(昭和9年)に山口玄洞の寄進により築。
文覚上人の墓
性仁法親王の墓
和気清麻呂の墓
楼門 - 元和9年(1623年)の再建。清滝川畔から石段の参道を上りつめた先に建つ正門。両脇に二天像を安置する。
五大堂
毘沙門堂
楼門