アレックス・スミス
10月26日の記者会見でマイク・シングレタリーヘッドコーチから次週からの先発QBとなることが発表された。
2010年は第7週のカロライナ・パンサーズ戦で肩を痛めた後、トロイ・スミスに5試合先発QBの座を奪われ、11試合の出場でパス2370ヤード獲得、14タッチダウン、10インターセプト、QBレイティング82.1の成績を残した。
2011年、ロックアウト中に49ersの合同練習を主催した。7月29日、チームと1年490万ドルの契約延長を果たした。ドラフト2巡ルーキーのコリン・キャパニックと先発QBを争った結果、開幕先発QBに指名された。この年スミスは、3150ヤードを投げて17TD、5INTと堅実なプレーを見せて、13勝3敗での地区優勝に貢献した。またレギュラーシーズンの第4Qに5回逆転ドライブを達成している。ニューオーリンズ・セインツとのディビジョナルプレーオフでは残り2分あまりでの27ヤードのTDラン、残り9秒でのバーノン・デービスへの14ヤードのTDパスを決めて、36-32での勝利に貢献した。NFCチャンピオンシップゲームでニューヨーク・ジャイアンツに敗れスーパーボウル出場は後一歩のところで実現しなかった。第46回スーパーボウル直前にスーパーボウル開催地インディアナポリスで行われた「プレイ60」(ミシェル・オバマとNFLが取り組んでいる子供の肥満問題を解決しようとするプロジェクト)のイベントにコルツのドワイト・フリーニーと共に登場した。
2012年の第3週の途中までパス249回連続でインターセプトなしのナイナーズ記録を作っている。