野猫
また、奄美大島は国連教育科学文化機関(ユネスコ)の世界自然遺産に登録される見通しとなり、環境省・鹿児島県・奄美大島5市町村は2018年3月に同島独自の在来生態系の保全に資することを目標とした「奄美大島における生態系保全のためのノネコ管理計画」を策定し、連携して対策に取り組んでいる。さらに奄美大島5市町村で構成する「奄美大島ねこ対策協議会」では計画に基づき、環境省が捕獲した野猫の譲渡を希望する飼い主を募集している。
また野猫による脅威とは別に、奄美大島ではアマミノクロウサギなど希少種動物の交通事故件数が増加しており、国際自然保護連合 (IUCN) から事故減少へ取り組むよう要請を受けた。専門家からは、野生生物を襲うマングースの駆除が進んだことでアマミノクロウサギの分布域が拡大し、動きが活発化したことが一因と指摘されている。
ネコの排除にほぼ成功した小笠原諸島でも、天敵のネコがいなくなったことで外来種のネズミが増え、食害により固有種の植物が数を減らす結果ともなった。天売島でもネコへの対策を始めてからドブネズミによる島民生活への被害が出始めたとして、因果関係は判明していないもののネズミへの対策も行われるようになった。このように、有害とされる野生動物の駆除・排除については生態系のバランスを保つ面からも注意が必要とされる。