大矢駅
相対式ホーム2面2線の地上駅で無人駅。木造駅舎を有する。
現在は美濃市駅 - 郡上八幡駅間で唯一列車交換が可能な駅であるため、昔から列車の行き違いが行われている。双方のホームは構内踏切でつながっている。下りホームに駅舎があり、ここにはかつて使用された鉄道備品などの展示が行われている鉄道館を併設している(観光列車「ながら」運行日に開館)。また、2022年には駅スタンプが期間限定で駅舎内に設置された(金曜から日曜および祝日のみ)。
トイレは男女別のものが駅舎の南側にある。観光列車「ながら」は当駅での客扱いは行わないが、10分程度停車しトイレ休憩がとられる。