ぐるぐるナインティナイン
人間ドックで不健康対決
岡村労働組合
芸能人限定 ぐるナイ派遣
戦国!団結武将
幕末!イッパツ勝負伝
プライベートフォトサミット
10日間ダイエット企画
みんなでモテボディになろう 2週間シェイプアップ計画
口コミバトル企画
岡村、矢部、出川の3人が街頭モニターで1回のみ○○会場でイベントを行うと告知。3人の中で誰が1番多く人数が集まるかを競う企画。3回ほど行われたが全て岡村が1位となり、岡村は「岡村隆史ソロコンサート」を披露して1000人近く口コミだけで人を集めた。この成功で気をよくした岡村が岡村バンドを結成し、無理やり矢部、出川をメンバーに入れた。
矢部の催眠術企画
夕方時代に山の麓でキノコを収穫して食べる企画を放送した際、食べ過ぎて下痢を訴えて以降矢部はキノコ嫌いになったため、複数回に分けて克服企画を実施。催眠術で克服したのを機に、ゴールデン移転後も催眠術にかかった矢部のために大型イベントをするなど成功した。
フィンガー5 - このコーナーで岡村がズル行為を何度も起こしたため収録時間が予定よりもかなり長引き、撮影終了後岡村がお詫びに出演者とスタッフ分のジュース類の差し入れをするシーンが放送された。
ナイナイ幕府の世界制覇
ザ・スカウト綱引き
なぞなぞ企画
顔面運動会
原始人ピッグ
クイズ眼力王
グルメクイズ上手いもの好き!
不良小坊主一九さん
岡村脚本ドラマ「何も言えなくて夏」
恋人選びの旅
ピッタンコチョイス+
オールスター家族対抗○○バトル
綾瀬はるかとデート企画
金星相撲部
クイズ!あの日のテレビ欄
釣りバトル
新日本正直!フィルハーモニーオーケストラ
お絵描きして当てろ この子は誰の三世さん
1998年10月23日放送分からスタート。番組最長企画シリーズでもある。
やば荘
冷蔵庫マン
ロリィタ族。(『エンタの神様』では『ZOXYDOLL』として出演した)
ゴー☆ジャス
花咲林(キャサリン)
GO!皆川
ファインピース
小林アナ
ラブ守永
原田17才
マリア
熊本慎吾
50音ネタ決定戦(2020年)
Yes!アキト(優勝)
カカロニ・栗谷
松浦景子
オシントン・坂本
コネオ・インターナショナル
カラダパーツ芸メドレー(2021年)
ディスコザムーン・ケビン
ノボせもんなべ(優勝)
キャツミ
くまりえ
ポメラン・手塚ジャスティス
男スペシャル・井服
おもしろ荘歌謡祭(2022年)
ねこ屋敷
シマッシュレコード(優勝)
衝撃デリバリー
片倉ブリザード
エキシビションコーナー(2023年)
未来土偶よしき
サク。
久保遥
おちもり森(優勝)
シャルロット
2022年4月以降のスペシャル放送では日本テレビを除く一部系列局では日本テレビの放送終了の6分前に飛び降りる場合がある。
山田ルイ53世(「かぶっちゃや〜YO!」(2010年 - 2011年)を担当)
茶風林(「脳林寺」)
バッキー木場(「オカムラビューティークラブ」)
太田真一郎
延友陽子(2020年9月末で異動したため降板)
多比良健
中井和哉
そら(「ゴチになります!」内コーナー「ヤベチャンマン」を担当(パート20のみ。パート21では「ダイゴチャンマン」として不定期で担当))
2001年から2005年に渡り、ぐるぐるナインティナインの企画として年越しカウントダウン番組が行われており、ぐるナイにおいてもこの特別番組に向けての修行が放送された。
2001年の大晦日には翌年の平和を願い、年明けの数分後に岡村が自ら炎に突っ込む儀式を行う「ナイナイの皆さーんご一緒にバカヤロースッキリ年越しスペシャル!!」を23:00から年明け後の0:53にかけて放送している。この儀式は2004年が最後とされていたが、岡村は続行を希望し結局2005年の年越しも放送されることになった。2006年以降は『ダウンタウンのガキの使いやあらへんで!!』の『笑ってはいけないシリーズ』を放送することになったので、2006年に岡村は『第57回NHK紅白歌合戦』にサプライズ出演した。また、年越しではないが2008年以降の年明けは「おもしろ荘へいらっしゃい!」のコーナーのスピンオフ拡大版が放送されている。
2018年3月22日放送分からスタート。 ルールは3つのルーレット特徴・食感・味・食材を組み合わせて作る料理のお題を決める。3人ずつ2つのブロックに分かれて制限時間30分以内で調理を行う。それを味の専門家3人が誰が作ったか分からない状態で食べて審査。トーナメントを勝ち上がった人が優勝となる。司会は矢部と羽鳥が担当し、岡村はBブロックで出場する。
2016年以降から番組への出演権を懸けた最終オーディションが行われている(2016年のみヨシモト∞ホールで開催され、2017年以降は都内のスタジオで開催されている)。オーディションでは観客が5点満点でネタの審査が行われる。
太字は番組出演権を獲得した出場者(年数は最終オーディションが行われた時点での年)。
ペンギンズ
アイロンヘッド
もりせいじゅ
やわら
フレンチぶる
錦鯉
なおよし
見取り図
空気階段
バッドナイス
シューマッハ
XXCLUB
脳みそ夫
しゃもじ
たぬきごはん
セルライトスパ
ランジャタイ
キサラギ
大自然
ヤングウッズ
新作のハーモニカ
イヌコネクション
おとぎばなし
ネコニスズ
インディアンス
モダンタイムス
ロングロング
オーストラリア
すっきりソング
ハナコ
ぷらんくしょん
LOVE
ブルゾンちえみ
カミナリ
マルコ
晴天サンティ
ギャルズ
廣瀬優
ダークホース
プーケットマーケット
桐野安生
東京ホテイソン
シロたろし
ニッポンの社長
ゼスト
吉住
ロングアイランド
アントワネット
フレンチぶる
サルエル
シャイニングスターズ
やさしいズ
虹孔雀
くりおね
まんぷくフーフー
ピュアピュアズ
完熟フレッシュ
ウドントミカン
ひょっこりはん
世間知らズ
真空ジェシカ
レインボー
宮下草薙
江戸っ子ファミリー
キラキラ関係
そいつどいつ
タイーク
かにゃ
きしたかの
ジャンゴ
シンプル
シュテンドウジ
アユチャンネル
なおよし
イタリアンカサマツ
パリのくまさん
ネイチャーバーガー
フェー
ジョウダンアオナナテンパイ
ペコリーノ
いい塩梅
タイーク
そいつどいつ
ダイヤモンド
ゼスト
村民代表南川
ヤマメ
喜楽
納言