アンナ・ヤギエロ
ヨーハン(1538年 - 1539年)
バルバラ(1539年 - 1572年) - フェラーラ公アルフォンソ2世妃
カール2世(1540年 - 1590年) - 内オーストリア大公、フェルディナント2世の父。
ウルスラ(1541年 - 1543年)
ヘレーナ(1543年 - 1574年) - 修道女
ヨハンナ(1546年 - 1578年) - トスカーナ大公フランチェスコ1世妃
長男マクシミリアンは、フェルディナント1世の祖父マクシミリアン1世にちなんで名付けられた。次男フェルディナントには、彼女が夫の名を付けることを熱望したためこの名となった。
ポーランド王国において国王自由選挙によって国王が選出されるようになると、アンナの息子マクシミリアン2世やその息子マクシミリアン大公が立候補している。さらに、アンナの血筋を根拠にしたかどうかは定かではないが、子孫であるカール・シュテファン大公が、第一次世界大戦中にドイツ帝国の衛星国であるポーランド摂政王国の国王候補者に推されている。
政略結婚であったが2人の結婚は幸福なものであり、フェルディナント1世との間に4男11女をもうけた。ハプスブルク家の多産の伝統の先駆けである。
エリーザベト(1526年 - 1545年) - ポーランド王ジグムント2世アウグスト妃
マクシミリアン2世(1527年 - 1576年) - 神聖ローマ皇帝マクシミリアン2世
アンナ(1528年 - 1590年) - バイエルン公アルブレヒト5世妃
フェルディナント2世(1529年 - 1595年) - 前方オーストリア大公、チロルの領主。フィリッピーネ・ヴェルザーとの貴賎結婚で知られる。
マリア(1531年 - 1581年) - ユーリヒ=クレーフェ公ヴィルヘルム妃
マグダレーナ(1532年 - 1590年) - ハル女子修道院長
カタリーナ(1533年 - 1572年) - マントヴァ公フランチェスコ3世妃、ポーランド王ジグムント2世アウグスト妃
エレオノーレ(1534年 - 1594年) - マントヴァ公グリエルモ妃
マルガレーテ(1536年 - 1566年) - 修道女