クレナルカエオール
アンモニア酸化は窒素循環(様々な生物学的および無機的形態を通して窒素を循環させる生物地球化学的循環)の重要な部分である。AOAは海洋におけるアンモニア酸化の大半を占めることが示されており、したがって(AOA、特にタウム古細菌によって排他的に生産されると一般的に考えられている)クレナルカエオールはAOAおよびアンモニア酸化についての特異的バイオマーカーとして提唱されている。クレナルカエオール存在量はAOAの季節性大発生の跡を追うことが明らかにされており、AOA密度のための、そしてさらに広く見ればアンモニア酸化のための指標としてクレナルカエオール存在量を使うことが適切かもしれないことを示唆している。しかしながら、偏性アンモニア酸化菌ではないタウム古細菌の発見はこの結論を込み入らせており、ある研究はクレナルカエオールがMarine Group II ユーリ古細菌によって生産されているかもしれないことを示唆している。