生物多様性の観点から重要度の高い湿地
苗場山周辺湿原
白馬岳周辺湿地群
志賀高原周辺湿原群
黒姫山湖沼・湿原群
逆サ川
茶臼山周辺のため池群
霧ケ峰湿原群
諏訪湖および流入河川
仁科三湖および周辺湖沼・湿地群
乗鞍岳湿原
安曇野蓼川周辺湧水河川
伊那谷南西部湧水湿地群
弥陀ヶ原湿原および大日平湿原を含む立山周辺湿原群
白木峰山頂周辺
富山湾
氷見市周辺の湿地群
奥能登・中能登の湿地群
雲津沖
七尾湾
旧内浦町地先沿岸
舳倉島,七ッ島周辺沿岸
能登半島西部沿岸
能登半島西海岸から加賀北部海岸および口能登の湿地群
白山の湿原・雪田草原
片野鴨池
柴山潟
木場潟
南加賀地方のアベサンショウウオの生息湿地
北潟湖
九頭竜川下流域および流域湖沼
陣ヶ岡丘陵地域
大野市の湧水
越前町の周辺湿地
越前市(旧武生市)の湧水
越前市(旧武生市)のアベサンショウウオ生息地
夜叉ヶ池および周辺湿地
中池見湿地
池河内湿原
三方五湖および周辺湿地
小浜市田烏の小湾
天生湿原
東濃・中濃地域湿地群
津保川流域の農業用水系
養老地域の湧水群
新堀川(伊自良川支流)の上・下流域
木曽三川合流域の河川・水路およびため池群
長良川・木曽川水系のサツキマス,ネコギギの生息河川
遠州灘海岸
伊良湖岬周辺沿岸
三河湾
豊川水系鳳来寺山から鞍掛山周辺の細流群
作手中間湿原群
田之士里湿原および周辺の中間湿原
東三河・渥美半島湧水湿地群
西三河地域湧水湿地群
小堤西池
尾張丘陵・知多半島地域湧水湿地群
濃尾平野外縁部のため池群
伊勢湾
北勢地域湧水湿地群
北勢・伊賀地域のため池群
祓川
志摩半島南部沿岸
熊野灘リアスの汽水域
船越大池