半矮性遺伝子
半矮性遺伝子および矮性遺伝子がどのように作用して、形態としての半矮性・矮性を示すのかは、多くの場合は明らかではない。しかしながら、先述のイネの半矮性遺伝子sd1および小麦農林10号の半矮性遺伝子Rht1,Rht2 の作用機構には植物ホルモンの一種であるジベレリンが関与することが明らかになっている。
ジベレリンはイネ馬鹿苗病による異常な苗の伸長の原因物質として同定されたことからも理解できるように、植物の伸長にかかわる植物ホルモンである(別の作用も持つ)。イネのsd1遺伝子は、ジベレリン生合成系のGA20酸化酵素の機能損失により、ジベレリン合成量を低下させる劣性遺伝子である。コムギの優性の半矮性遺伝子Rht1,Rht2は、ジベレリン量が正常であっても、その存在を正常に情報伝達することを妨げる作用を示す。どちらの場合であっても、ジベレリンによる成長促進作用が異状になるため、結果として半矮性の形態を示すことになる。
なお、植物の半矮性については、別の植物ホルモンであるブラシノステロイド(ブラシノライド)が関与するオオムギ渦性遺伝子などの例も知られている。