ETV6
下の表では、高頻度でETV6との融合が生じる遺伝子と、それらの機能、染色体上の位置、最も一般的な転座、転座によって生じる悪性腫瘍の一覧を示している。こうした転座変異は、さまざまな種類の血液細胞へ分化する多能性造血幹細胞に生じることが一般的である。したがって、ある特定の変異からさまざまな種類の血液腫瘍が生じる可能性がある。骨髄異形成症候群におけるETV6遺伝子変異の存在は、生存期間の短縮と関係している。
表に示された融合遺伝子形成転座の他にも、ETV6は非常に稀な症例(1件から10件の報告症例)で他の遺伝子との融合が報告されている。こうした転座では表に示されている血液腫瘍の1つまたは複数の種類が引き起こされる。転座によるETV6遺伝子との融合遺伝子の形成が報告されている遺伝子としては、受容体型チロシンキナーゼ遺伝子FGFR3(英語版)、非受容体型チロシンキナーゼ遺伝子ABL2(英語版)、NTRK3、JAK2(英語版)、SYK(英語版)、FRK(英語版)、LYN(英語版)、転写因子遺伝子MN1(英語版)、PER1(英語版)、ホメオボックス型転写因子遺伝子CDX2(英語版)、受容体型プロテインチロシンホスファターゼ遺伝子PTPRR(英語版)、核内ホルモン受容体コアクチベーター遺伝子NCOA2、免疫グロブリン重鎖遺伝子IGH@(英語版)、酵素遺伝子TTL(英語版)(α-チューブリンへのチロシンの付加と脱離)、GOT1(英語版)(アスパラギン酸トランスアミナーゼ)、ACSL6(英語版)(長鎖脂肪酸CoAリガーゼ(英語版))、トランスポーター遺伝子ARNT(リガンド結合型芳香族炭化水素受容体の核移行を促進し、生体異物代謝に関与する遺伝子の発現を促進する)、機能未知遺伝子CHIC2、MDS2、FCHO2(英語版)、BAZ2A(英語版)、未アノテーション遺伝子STL(長いオープンリーディングフレームを持たない)がある。
SYKまたはFRKチロシンキナーゼ遺伝子に対するETV6遺伝子融合と関係した血液腫瘍はチロシンキナーゼ阻害薬治療に対する感受性が示される可能性がある。一方、ETV6-RUNX1関連急性リンパ性白血病の小児は特に予後良好なサブグループであるため、ほぼ一様にスタンダードリスク群に対する化学療法プロトコルでの治療が行われている。
ETV6遺伝子と他の転写因子遺伝子との融合と関係した血液腫瘍は、ETV6や融合パートナーの転写因子の標的遺伝子発現調節機能の喪失または獲得を反映しているようである。こうした遺伝子融合は、細胞の成長、増殖や生存に影響を与える遺伝子産物の産生またはその喪失をもたらす。ETV6-RUNX、ETV6-MN1、ETV6-PER1、ETV6-MECOM融合遺伝子に関するin vitro研究はこの考えを支持している。ETV6-MECOM融合遺伝子はETV6由来のプロモーターに駆動されて過剰発現が行われるのに対し、ETV6-RUNX、ETV6-MN1、ETV6-PER1融合遺伝子はETV6の遺伝子発現抑制活性を欠いたキメラタンパク質の産生を引き起こす。ETV6遺伝子とARNT、TTL、BAZ2A、FCHO2、MDS2、CHIC2との融合も同様にETV6の転写因子活性の喪失をもたらす。ETV6遺伝子とホメオボックス遺伝子(CDX2、PAX5、MNX1など)との融合は、ETV6と融合パートナーのいずれかまたは双方の転写因子活性を欠くキメラタンパク質の産生をもたらす。いずれの場合も、こうした融合遺伝子と関係した血液腫瘍はその表現型に基づいて標準的な化学療法プロトコルによる治療が行われる。