神川丸 (特設水上機母艦)
3月10日付で第四艦隊(司令長官井上成美中将・海兵37期)付属となり、南東方面に転じる。 4月から5月にかけてはツラギ攻略作戦協力 に続いて、ポートモレスビー攻略を目的とする珊瑚海海戦では、デボイネに前進水上機基地を設営し飛行機隊を移した後、ウッドラーク島(英語版)近海で基地航空隊や掩護部隊の指揮を執った。ポートモレスビー攻略作戦が中止になるとショートランドに帰投し、ラバウルを経てサイパン島に移動した。
5月20日附で「神川丸」は正式に第十一航空戦隊(司令官藤田頼太郎少将)に編入された。これは同月1日に水上機母艦瑞穂(十一航戦所属)が撃沈された為である。 5月下旬から6月上旬にかけてのミッドウェー作戦における「神川丸」は、第十一航空戦隊(司令官藤田類太郎少将)を基幹とする航空隊(千歳、神川丸、駆逐艦早潮、第35号哨戒艇〔旧駆逐艦蔦〕、海軍陸戦隊1個小隊)として参加する。航空隊は、ミッドウェー島占領に向かう輸送船団と護衛隊(指揮官田中頼三第二水雷戦隊司令官)の対潜・対空警戒およびキューア島(クレ環礁、ミッドウェー島北西方向)の占領、作戦成功後のミッドウェー島水上機基地建設という任務を与えられた。 5月28日、航空隊4隻は他部隊と共にサイパン島を出撃。6月4日、航空隊4隻(千歳、神川丸、早潮、35号哨戒艇)は事前の計画どおり攻略船団と分離してキューア島に向かった。 6月5日、第一航空艦隊の主力空母4隻(赤城、加賀、飛龍、蒼龍)は米海軍機の空襲により炎上、戦闘不能となる。