肥前石井氏
以降、龍造寺隆信の副将鍋島直茂が登場してきたこともあり、隆信は肥前国の平定を進めた。隆信の版図は肥前国の他、筑後国、肥後国、筑前国、豊前国、対馬国、壱岐国まで及び、「五州二島の太守」を自称した。その一方で、龍造寺軍の中核部隊を担っていた石井氏からは、多くの戦死者を出した。隆信は、石井氏の忠節と犠牲に報い、飯盛村一帯に加え、佐留志領(現在の佐賀県杵島郡江北町)を与えて、石井氏に知行地の加増をたびたび行い、天正期には、1,180町歩(おおよそ11,800石)の広大な所領を有することとなった。この知行規模は、龍造寺一族、大身国衆の外様家臣を除き、家中第三位(一位は鍋島氏、二位は納富氏)の大身であった。
この頃、石井氏と鍋島氏の連携が一層強化される。元亀2年(1571年)、石井忠清の嫡男常延の次女彦鶴姫(後の陽泰院)が鍋島直茂の正室(継室)に迎えられた他、天正7年(1579年)には、直茂の長女伊勢龍姫(後の月窓院、母は前室高木氏)の婿養子として、石井信忠の嫡男で、彦鶴姫の大甥にあたる石井太郎五郎(後の鍋島茂里)が迎えられた。また、もともと直茂の従姉を祖母(鍋島清久の孫娘)に持つ石井茂利(直茂の従姪孫)が直茂の実兄鍋島信房の養女を娶るなど、石井氏と鍋島氏は一族化していった。
天正11年(1583年)になると、龍造寺隆信の威勢にも陰りが見え始める。筑後国柳河城主蒲池鎮漣の謀殺は、配下の家臣、とくに外様衆の顰蹙を買う結果になった。鎮漣の謀殺は、鍋島直茂、石井四郎左衛門(信忠)らに率いられた精兵が、龍造寺領内移動中の鎮漣一行を急襲した一件で、後に攻め手の大将の一人であった四郎左衛門は、臣従している他国衆への不信感から謀殺という挙に出た龍造寺氏の行く末を案じる言葉を残したという。
しかし、隆信の宗家相続に対し、宗家の重鎮土橋栄益が、豊後国の守護職大友宗麟の支持を得て、反旗を翻す。天文20年(1551年)、ときに大内義隆が家臣陶晴賢によって討たれた直後で、後ろ盾を失った隆信は筑後国に亡命する災難に遭う。2年後、隆信は復権することになるが、このときも、鍋島清房と石井兼清が、佐賀平野南部の土豪・地侍らと連携し、隠密に隆信帰還の準備を進めた。隆信は筑後国を出発し、海路、肥前国佐嘉郡河副郷に上陸した。河副郷には、他の土豪・地侍とともに石井忠清が一族を率いて参陣し、そのまま佐賀城に向けて進発した。途中、敵方である高木氏や八戸氏に占拠されていた石井氏の居城飯盛城において、石井義昌・忠晴父子が指揮する一隊が奮戦して、城を奪還する。石井氏ら龍造寺勢は、さらに進撃を続け、遂には佐賀城を回復した。さらに隆信は、間髪入れず小田政光が拠る蓮池城に攻め込み、またしても石井義昌が敵方の勇将江口源世入道を一騎討ちで戦いを挑み、これを討ち取るなど、石井氏は隆信復権に多大な功績を挙げた。