天正地震
震源断層は判明しておらず、以下の通り幾つかの説がある。岡田 (2011)によって、2010年以前の本地震に関する地震像研究がまとめられている。
飛騨の庄川断層または阿寺断層とする説
養老断層及び伊勢湾断層とする説
これらの断層が連動したとする説
養老-桑名-四日市断層帯などの三つの大断層が動いたとする説
1998年に行われた地質調査では、岐阜県にある養老断層における2つの活動歴が確認され、最新の活動は15世紀以降であることから745年天平地震と共にこの断層が震源断層のひとつであった可能性が高くなったとされている。
松浦 (2011)は明確に被害が大きかったと推定されるのは、庄川沿いの谷筋(帰雲城)から越中西部(木船城)と、濃尾平野の南西部(長島城・大垣城)から琵琶湖北東岸(長浜城)と分かれているとして、1586年1月16日に庄川断層帯北部でM7.0±0.2の地震が、翌々日18日に養老断層とその周辺の断層帯の一部でM7.
尾張国 - 昭和63年(1988年)度に実施された五条川河川改修に伴う清洲城下の発掘調査で、天正大地震による可能性の高い液状化の痕跡が発見されている。天正14年(1586年)に織田信雄によって行われた清洲城の大改修は、この地震が契機だった可能性が高いと考察された。また蟹江城が壊滅した。
伊勢国 - 織田信雄の居城であった長島城が倒壊、桑名宿は液状化により壊滅するなど甚大な被害を受けた。そのため信雄は居城を清洲城に移した。亀山城も被害を受けた。
京都 - 東寺の講堂、灌頂院が破損、三十三間堂では仏像600体が倒れた。
琵琶湖 - 下坂浜千軒遺跡(しもさかはませんけんいせき)となる現長浜市の集落が液状化現象により、水没した。秀吉の築いた近江長浜城を山内一豊(妻は見性院)が居城としていたが全壊し、一人娘与祢(よね)姫(数え年6歳)と乳母が圧死した(『一豊公記』)。また家老の乾和信夫妻も死亡したが、見性院は無事であった。
若狭湾・伊勢湾での大きな津波被害もあった(後述)。