大垣運輸区
1884年5月1日:長浜機関庫大垣分庫として開設。
1889年7月1日:大垣機関庫として独立。
1915年8月14日:名古屋機関庫大垣分庫となる。
1925年1月16日:米原機関庫大垣分庫となる。
1941年12月1日:大垣機関区となる。
1954年6月1日:現在地に移転。
1955年7月15日:東海道本線米原電化に併せて、大垣機関区が大垣電車区に変更され、電車が配置されるようになる。
1987年4月1日:国鉄分割民営化に伴い、東海旅客鉄道(JR東海)東海鉄道事業本部の管轄となる。
2001年4月1日:車両検修部門を大垣車両区に分離し、乗務員部門を大垣運転区に改称。
2002年3月23日:旧名古屋車掌区の一部業務の移管を受けて車掌を配置し、大垣運輸区に改称。