自衛隊前駅
当駅の南側(真駒内方)から南車両基地への出入庫線が分岐している。このため、麻生発当駅止まりの列車が平日の朝8時台に1本、9時台に4本運行されており、乗客を降ろした後に回送列車として同基地へ入庫する。駅構造の都合上、真駒内駅〜南車両基地間を出入庫する車両は当駅のホーム上で折り返す。かつては当駅発麻生行きの列車も運行されていたが、現在は非常時および臨時列車を除く全ての列車が南車両基地から出庫後、真駒内駅まで回送されてから麻生行きとして営業運転に入る。2014年9月14日までは「南北線乗務区」が併設されていて、当駅で乗務員の交代が行われていた。(現在「南北線乗務区」は、大通駅に移転しており、乗務員交代は大通駅で行われている。)
駅名は、近隣に所在する陸上自衛隊真駒内駐屯地に由来する。同駐屯地は2005年(平成17年)までさっぽろ雪まつりの真駒内会場として開放されており、当駅はその最寄駅としての役割も持っていた。そのため、雪まつり期間中は真駒内会場の出入口に同駅の臨時券売所が設けられていた。
駅スタンプは自衛隊前駅のイニシャルJの中に札幌市交通資料館が描かれている。
当駅から真駒内駅間は1.7kmとなっており、札幌市営地下鉄の駅間では最も長くなっている。