自己スプライシング
菌類のミトコンドリアmRNA(シトクロムのいくつかの遺伝子)や、葉緑体mRNA に存在する。グループIとは異なった構造を持ち、スプライスサイトの配列に保存性が認められる。反応過程の中間体としてラリアット構造イントロンができることなど、pre-mRNA スプライシングと同様の反応様式を持つ。このことから、スプライセオソーマルイントロンはグループIIイントロンから由来したという説が提案されている。