大神駅
島式ホーム1面2線を有する地上駅。ホームへの行き来は駅舎から線路を横切って渡る構内通路となっている。そのため、電車が構内に入ってくると、駅舎側に設置している踏切が降りてきて渡れないようになる。駅舎は建坪24坪の平屋建てで外壁を薄ピンク色としている。
簡易委託駅であり、きっぷうりばが設置されている。以前はJR九州サービスサポートが駅業務を受託する業務委託駅であった。ICカードSUGOCAは出入場とチャージのみ対応。
大分駅方面から折り返しの列車が数本設定されている。