ADAR
ADAR1は細胞のHIV感染を撃退する能力に対し、有益とも障壁ともなりうることが研究からは示されている。ADAR1タンパク質の発現レベルはHIV感染時に上昇することが示されており、HIVゲノムのAをGへ変異させて複製を阻害することが示唆されている。この研究の著者らは、ADAR1によるHIVゲノムの変異は一部の場合では、ウイルスに有益な、薬剤耐性に寄与する変異をもたらす可能性もあることも示唆している。
哺乳類では、ADARファミリーには1から3の3つのタイプが存在する。ADAR1とADAR2(英語版)は体中の多くの組織に存在しているが、ADAR3(英語版)は脳にのみ存在する。ADAR1とADAR2は触媒活性を有することが知られているが、ADAR3は不活性であると考えられている。ADAR1にはADAR1p150とADAR1p110という2つのアイソフォームが存在する。ADAR1p110は通常核にのみ存在し、ADARp150は核と細胞質を往来し、大部分は細胞質に存在する。ADAR1とADAR2は多くの共通のドメインを持ち、発現パターン、タンパク質構造、二本鎖RNAという基質要求性も共通であるが、その編集活性には差異が存在する。
ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC16382/.
“Crystal structure of the Zalpha domain of the human editing enzyme ADAR1 bound to left-handed Z-DNA”. Science 284 (5421): 1841–5. (June 1999). doi:10.1126/science.284.5421.1841. PMID 10364558.
“The solution structure of the Zalpha domain of the human RNA editing enzyme ADAR1 reveals a prepositioned binding surface for Z-DNA”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 96 (22): 12465–70. (October 1999). doi:10.1073/pnas.96.22.12465. PMC 22950. PMID 10535945. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC22950/.
“The HIV-1 gp120 inhibits the binding of adenosine deaminase to CD26 by a mechanism modulated by CD4 and CXCR4 expression”. FEBS Letters 477 (1–2): 123–8.
ADARは加水分解的脱アミノ化によるAからIへの変換反応を触媒する。求核攻撃には活性化された水分子が利用される。アデノシンのC6位に水分子が付加され、水和中間体からアンモニアが脱離することでイノシンが形成される。
“The interferon-inducible, double-stranded RNA-specific adenosine deaminase gene (DSRAD) maps to human chromosome 1q21.1-21.2”. Genomics 30 (2): 372–5. (November 1995). doi:10.1006/geno.1995.0034. PMID 8586444.
“Functionally distinct double-stranded RNA-binding domains associated with alternative splice site variants of the interferon-inducible double-stranded RNA-specific adenosine deaminase”. The Journal of Biological Chemistry 272 (7): 4419–28. (February 1997). doi:10.1074/jbc.272.7.4419. PMID 9020165.
“Adenosine deaminase binding to human CD26 is inhibited by HIV-1 envelope glycoprotein gp120 and viral particles”. Journal of Immunology 158 (8): 3721–9. (April 1997). PMID 9103436.
“A Z-DNA binding domain present in the human editing enzyme, double-stranded RNA adenosine deaminase”.