目黒駅
目黒線 ■急行 (南北線・三田線) - 目黒駅 (MG01) - 武蔵小山駅 (MG03) ■各駅停車 (南北線・三田線) - 目黒駅 (MG01) - 不動前駅 (MG02)
1990年(平成2年)6月2日:JRの駅に自動改札機を設置。
1991年(平成3年) 4月23日:目蒲線目黒駅地下化の起工式を実施。 4月:東急目蒲線の地下化工事に着手。 11月15日:目蒲線のダイヤ改正により、当駅の折り返し用分岐器を約500 m不動前駅寄りに移設。当駅 - 不動前駅間の大部分が単線並列区間となる。
1992年(平成4年) 3月18日 - 3月19日:山手線ホームで可動式ホーム柵の試験を実施。 7月17日:仮設駅舎等の設置スペース確保のため、目蒲線ホームを不動前駅寄りに延伸(仮設ホーム)。目蒲線ホームの停車位置を不動前駅寄りに約30 m移動。 8月24日:目蒲線の2番線と山手線連絡改札口を結んでいた連絡地下道を閉鎖。 10月31日:東急の駅が仮駅舎となり、出入口は目黒通り側から2番線ホーム側(西側)に移設。
1993年(平成5年) 4月26日:目蒲線の1番線を仮設桁(仮線路・仮ホーム)に移設。 8月2日:目蒲線の2番線を仮設桁(仮線路・仮ホーム)に移設。
1994年(平成6年)2月28日:東急⇔山手線の連絡改札口を閉鎖。このため、山手線側に仮設の改札口が設置された。
1997年(平成9年)7月27日:東急の駅が地下駅となる。
以下の4社局4路線が乗り入れ、相互間の接続駅となっている。
JR東日本: 山手線 - 電車線で運行される環状線としての山手線電車のみが停車し、線路名称上は山手線である山手貨物線を走行する埼京線・湘南新宿ラインの列車は停車しない。また、特定都区市内制度における「東京都区内」および「東京山手線内」に属している。駅番号「JY 22」
東急電鉄: 目黒線 - 当駅が起点。下記2路線および2023年より相模鉄道各線と相互直通運転が行われている。かつては「目蒲線」と称していた。駅番号「MG01」
東京メトロ: 南北線 - 当駅が起点。開業当初から多くの列車が赤羽岩淵駅から埼玉高速鉄道線への直通運転を実施している。駅番号「N 01」
都営地下鉄: 三田線 - 当駅が起点。駅番号「I 01」
東急・東京メトロ・都営地下鉄の駅は、目黒線と南北線および三田線の間で相互直通運転を行っている。3社局の路線が乗り入れる共同使用駅で東急の管轄となっている。3者の乗り入れで1者が管轄する珍しい事例の共同使用駅である。
また、南北線と三田線は、当駅から白金高輪駅までの区間で駅・線路設備を共用している。当該区間については、南北線を運行する東京メトロが第一種鉄道事業者として施設を保有しており、三田線を運行する東京都交通局は第二種鉄道事業者となる。