ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤
HDAC阻害剤はヒストンに対するアセチル化反応のみを阻害するわけではない。広範囲の非ヒストン転写因子や転写コレギュレーターがアセチル化修飾を受けることが知られている。HDAC阻害剤はこうした非ヒストン型のエフェクター分子に対してもアセチル化の程度の変化を引き起こし、遺伝子転写の増加や抑制を引き起こす。影響受けるものとしては、ACTR、c-Myb(英語版)、E2F1(英語版)、EKLF(英語版)、FEN1(英語版)、GATA(英語版)、HNF-4(英語版)、HSP90(英語版)、Ku70、MKP-1(英語版)、NF-κB、PCNA、p53、RB、Runx、SF1(英語版)、Sp3(英語版)、STAT、TFIIE(英語版)、TCF、YY1などがある。