ソマリア暫定連邦政府の歴史
8月7日、TFGを支えるゲーディ首相、ユスフ大統領、アデン国会議長 (Sharif Hassan Sheikh Aden) の3名が会談し、イスラム法廷会議(ICU)と和解できる新政権を作ることで合意した。ユスフ大統領はゲーディ内閣の一時解散を発表し、ゲーディには1週間以内に新内閣の長官を選ぶよう依頼された。
2006年8月21日、ゲーディ首相は閣僚メンバーを決定した。人数は31名と大幅に減らした。国家安全長官、防衛長官、財務長官、外交問題担当長官と重要ポストは一新したが、旧SRRC指導者のフセイン・アイディードは内務長官として留任させた。44名の準大臣も決められた。この内閣は8月26日の議会で承認される運びとなっていたが、不信任となる可能性もあったため遅れた。
2004年10月10日、プントランド大統領でダロッド氏族のアブドゥラヒ・ユスフが暫定連邦議会(TFP)で投票数275の内の189票を獲得して暫定大統領に選出され(プントランド大統領は辞任)、10月14日に大統領宣誓を行った。ただしソマリア本国では不可能だったため、ケニアのナイロビにあるスポーツセンターで行われた。ユスフは大統領に選ばれると、暫定連邦政府(TFG)の組閣に着手し、ハウィヤ氏族のアリー・ムハンマド・ゲーディを首相に指名した。以後、TFGは大統領、首相、国会議長の3名を中心に動くことになる。また、以後もソマリ族の大氏族であるダロッド、ハウィヤ、ラハンウェインのバランスを考えた人事となる。
2004年10月から翌1月にかけてはTNGとの統合も試みられたが、最終的にはTNGの勢力は排除された。2005年2月にはケニアから首都モガディシュ入りしている。しかし2005年3月には早くも大統領・首相派と、モガディシュ軍閥とに事実上分裂した。また、政府を置く場所について、ユスフ大統領はジョハールを、アデン国会議長は首都モガディシュを主張して意見が割れた。そのほかにも対立する事項があり、2006年1月5日、イェメンのアデンで会合が持たれ、大統領と国会議長の齟齬が無い様にすることなどが決められた「アデン宣言」が出された。
ただし、基本的にTFGは軍閥の集まりであり、港湾、漁業、林業などの利害でことごとく対立した。イスラム教を信奉する勢力もあれば、そうでない勢力もあり、海賊行為に手を染めるもの、それを禁止しようとするものなどさまざまであった。
この間にもTFGとエチオピア軍はイスラム勢力(ICUなど)と戦闘を続けており、TFG・エチオピア連合軍は概ね勝利を続け、2006年末までにバイドア、バンディラドリー (Bandiradley) 、ベレトウェイン、ジョハール、ジリブ(英語版)、モガディシュを取り返した。2007年1月1日にはキスマヨも取り返した。エチオピア軍はバイドア政府の防衛にも協力した。エチオピアは介入させた人数は1000にも満たず、主にTFG軍の訓練教官やアドバイザーであると主張しているが、ICUは介入したエチオピア軍は数万であると主張した。
TFGの中にもエチオピア軍の介入を快く思わない勢力もあった。2006年12月15日、議員オマール・ハシイ(Omar Hashii)ら60人のTFGメンバーが外国軍に抗議するため首都モガディシュに集まった。
2007年1月1日、TFGのユスフ大統領は、ヒーラン地区 (Hiiraan) の責任者ユスフ・ダバギード (Yusuf Ahmed Hagar Dabageed) を解任し、フセイン・モアリム(Hussein Mohamud Moalim)を責任者に、サレイマン・ヒラウル(Saleyman Ahmed Hilawle)を副責任者に任命した。