遺伝的多様性
遺伝的多様性は、生態系の多様性や種多様性と比べて目で見て理解することが難しく、この概念の認知度も低いことから、環境保全活動の中で十分考慮されているとは言い難い事例がある。例えば、河川環境活動として魚を放流する事業で、在来個体群が存在するにもかかわらず近縁の別個体群を放流するなど、遺伝的多様性を損なう例があり問題となっている(遺伝子汚染、錦鯉の放流と生態系の破壊問題、メダカ#絶滅危惧と保護活動を参照)。
集団の遺伝的多様性の尺度をいくつか記す。
解析した遺伝子座における多形型遺伝子座の割合
遺伝子座あたりの対立遺伝子の数
遺伝子座当たりの有効な対立遺伝子数
ヘテロ接合度(Heterozygosity):集団中のヘテロ接合体の割合
nucleotide diversity
これらの尺度は、アロザイム分析、PCR-RFLP分析、AFLP分析、RAPD分析、マイクロサテライト分析、塩基配列分析(オルガネラマーカー、核マーカー)などどのような遺伝的マーカーを用いるかで特性が変わる。