Z-DNA
Z-DNAは一般的に転写中のねじれひずみ(torsional strain)の解消をもたらすと考えられており、負の超らせんの形成と関係している。超らせんはDNAの転写と複製の双方と関係しているが、Z-DNAの形成は主に転写率と関係している。
ヒトの22番染色体の研究からは、Z-DNA形成領域とNFI(英語版)転写因子が結合するプロモーター領域には相関があることが示された。このことは、ヒトの一部の遺伝子の転写はZ-DNAの形成とNFIの活性化によって調節されている可能性を示唆している。
プロモーター領域の下流に存在するZ-DNA配列は、転写を促進することが示されている。転写活性の増加が最大となるのは、Z-DNA配列がプロモーター配列から3ターン分だけ下流に位置しているときである。さらに、Z-DNAはヌクレオソームを形成しにくいため、多くの場合ヌクレオソームはZ-DNA形成配列の後から配置される。この性質のため、Z-DNAはヌクレオソームの配置をコードしているという仮説が立てられている。ヌクレオソームの配置は転写因子の結合に影響を与えるため、Z-DNAは転写率を調節すると考えられている。