佛教大学
同志社大学・龍谷大学・大谷大学・高野山大学・花園大学・種智院大学・皇學館大学とともに京都・宗教系大学院連合に加盟している。
立命館大学と教員養成プログラム提供に関する協定を締結している。教職課程で履修生を相互に受け入れるのは日本初となる。
近畿大学と包括連携協定を締結している。
龍谷大学・京都産業大学・京都外国語大学・ 京都文教大学・関西福祉科学大学・皇學館大学・愛知大学・九州産業大学・鈴鹿大学・同志社大学・同志社女子大学と小学校教諭免許状課程履修に関する協定を締結している。
奈良県立平城高等学校・奈良県立高田高等学校・京都府立清明高等学校・京都西山高等学校と教育連携協定を締結している。
大学コンソーシアム京都に加盟している。