膜融合タンパク質
クラスIII融合タンパク質は、IやIIとは異なる。それらは通常5つの構造ドメインから構成されており、C末端側に局在するドメイン1と2にはしばしばβシートが多く、N末端側に近いドメイン2~5にはαヘリックスが多く含まれている。融合前の状態では、後続のドメインが入れ子になってドメイン1を保護する(つまりドメイン1はドメイン2で保護され、ドメイン2はドメイン3に入れ子状になり、ドメイン4で保護される)。ドメイン1には膜融合の触媒部位が含まれている。
真核生物ゲノムには、宿主やウイルスに由来するいくつかの遺伝子ファミリーが含まれており、膜融合の促進に関わる産物をコードしている。成体体細胞は通常、正常条件下で膜融合を起こさないが、配偶子や胚細胞は、胎盤形成、合胞体栄養膜形成、神経発生(英語版)など、非自発的(英語版)に膜融合を促進する発生経路をたどる。融合経路は、筋骨格系や神経系組織の形成にも関与している。神経伝達物質の輸送に関わる小胞融合イベントも、融合タンパク質の触媒活性に依存している。