エクオール
Lactobacillus sp Niu-O16(フィルミクテス門 ラクトバシラス属)
Lactococcus garvieae (Lc 20-92)(フィルミクテス門 ラクトコッカス属)
Ruminococcus productus(フィルミクテス門 ルミノコッカス属)
Slackia sp HE8(放線菌門)
Slackia equolifaciens (Strain DZE)
Streptococcus intermedius(フィルミクテス門 レンサ球菌属)
Veillonella sp(フィルミクテス門)
しかしながら、ビフィドバクテリウムによる産生はツァンガリス(Tsangalis)らによって1回しか報告されていない2002年以降再現されていない。混合培養物、例えばLactobacillus sp. Niu-O16およびEggerthella sp. Julong 732は、(S)-エクオールを産生することができる。エクオール産生菌は、Adlercreutzia equolifaciens、Slackia equolifaciensおよびSlackia isoflavoniconvertensのようにそれらの命名で暗示されている。