シナプス小胞
輸送に必要なプロトン勾配はV-ATPase(英語版)によって形成され、エネルギーはATPの分解によってもたらされる。小胞の輸送体は細胞質からシナプス小胞へ神経伝達物質を移動させる。例えば、小胞型グルタミン酸トランスポーターはこの過程によって小胞へグルタミン酸を隔離する。
トラフィッキングタンパク質はより複雑であり、内在性膜タンパク質、表在性膜タンパク質、そしてSNAREなどのタンパク質から構成される。これらのタンパク質はシナプス小胞タンパク質として同定できるだけの共通した特徴は持っていないため、これらがどのようにシナプス小胞へ特異的に送られるのかについはほとんど解明されていない。既知のシナプス小胞タンパク質は全てではないものの多くが非小胞タンパク質と相互作用しており、こうした相互作用はそれらの特異的機能と関係している。
さまざまな神経伝達物質が小胞へ移動する際の量比を下の表に示す。
近年、シナプス小胞にはtRNA断片、Y RNA断片、miRNAを含む低分子RNAも含まれていることが発見された。