小山田氏
続く伊豆における源頼朝の挙兵において重能の子重忠、有重の子稲毛重成らとはじめ平家方に属していたが、畠山重忠は治承4年10月に秩父氏の家督を継いでいた河越重頼ら秩父一族とともに頼朝方に降伏しており、有重の動向は不明であるが頼朝に帰服したと考えられている。
治承・寿永の乱において有重は頼朝に従い東国に下向したと見られ、有重の子息は一ノ谷の戦いなど西国へも出陣している。畠山重能の動向は不明であるが、重能子息の重忠、有重子息の稲毛重成、榛谷重朝が頼朝に仕えている。こうして小山田一党は秩父党の重鎮とし頼朝の鎌倉幕府創立に功を立て、本領である小山田荘は有重の子息により分割相続されたと見られているが、稲毛荘や重朝の入部した榛谷御厨、比定地未詳の「出田」の地や武蔵小沢郷に進出していたと見られている。
『吾妻鏡』によれば、文治元年(1185年)10月には頼朝の弟義経が後白河法皇と結び頼朝に背き、同年11月11日には義経の舅である河越重頼が所領を没収され、殺害されている。これにより秩父氏の家督は畠山重忠が継承し、重忠や重成・重朝兄弟ら秩父一族は義経を匿った奥州藤原氏の討伐にも参陣している(奥州合戦)。
奥州合戦により治承・寿永の乱は集結し、頼朝による鎌倉幕府が開創されるが、『吾妻鏡』によれば幕府儀礼において重成・重朝兄弟が重用されていることが確認される。元久2年(1205年)、一族の畠山重忠の乱に巻き込まれてほとんどが粛清された。
鎌倉時代初期にその粛清から逃れた生き残りが甲斐に入府したと言い、承久の乱においては同地から幕府方の東山道軍に加わっている。