毎日新聞社
カメラ毎日
毎日グラフ
一億人の昭和史
日本の肖像
毎日らいふ
わたしの食卓
アルバトロス・ビュー(1987年-2009年まで。プレジデント社に販売権移動)
埼玉西武ライオンズファンブック(1979年-2008年まで。2009年からベースボールマガジン社に版権移動)
FC東京ファンブック(1999-2009年まで。2010年から朝日新聞出版に版権移動)
Mainichi Daily News(毎日デイリーニューズ)(2001年3月で休刊、4月からWeb サイト単独メディアとなる。)
マチゴト(2014年3月休刊)
MAINICHI RT(2013年8月31日休刊、有料電子版&タブロイド朝刊<首都圏1都3県向け>)
毎日中学生新聞 (2006年3月31日限り休刊)
毎日こどもしんぶん(1976年創刊、2000年3月休刊)
毎日信用組合 - 職域金融機関
毎日書道会
毎日新聞社会事業団(東京・大阪・西部)
公益財団法人認知症予防財団
一般社団法人アジア調査会
一般社団法人総合デザイナー協会
日本ニュース時事能力検定協会
麻生久 - 1917年入社。退社後、衆院議員当選2回。社会大衆党委員長を歴任。
阿部真之助 - 1911年(明治44年)満洲日日新聞から移籍。学芸部長として実力制名人戦・順位戦・本因坊戦を企画。主筆を最後に定年退職し、NHK会長・経営委員長などを歴任。またNHK学園創立者・初代理事長。
伊東巳代治 - 1891年(明治24年)関から引き継いで社長。内閣書記官長(現・事務担当官房副長官)、枢密顧問官、貴族院議員などを歴任し政官界の重鎮格を務めた。
稲原勝治 - 1923年読売新聞から移籍。1931年、日本外事協会理事長就任のため退社。
岡本綺堂 - 1890年(明治23年)入社。中央新聞、やまと新聞など競合他紙を転々とした後復帰。1913年、退社して劇作家に転向した。
加藤高明 - 1904年(明治37年)伊東から引き継いで日報社社長。後に第24代首相。
川島正次郎 - 1918年入社。旧東京市商工課長を経て衆院当選14回。自由民主党副総裁、派閥会長などを歴任。
岸井寿郎 - 1919年入社。政治部長、営業局次長を経て翼賛選挙で衆議院議員当選1回。
久米正雄 - 作家。1933年(昭和8年)阿部に招聘され社友。1938年阿部の後任で学芸部長。
鹿倉吉次 - 1914年入社。専務取締役を経てラジオ東京(現・TBSホールディングス)専務、東京放送第2代社長。
子母澤寛 - 1926年読売新聞から移籍。社会部・学芸部を兼任し『新選組三部作』を上梓。1933年(昭和8年)城戸事件の際に退社独立。
近年、新聞社は出版機能を関連会社に移行させることが多くなっており、毎日新聞社も2015年4月1日に毎日新聞出版を設立し、出版部門を分社化した。
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このほかに関係出版社として株式会社マイナビ(旧毎日コミュニケーションズ)があるが、資本的・業務的関係は薄まっている。ただ、マイナビが出版する雑誌や新聞の一部を毎日新聞販売店で取り扱うこともある。