マーヴル・スーパーヒーローズ
声 - カハル・J・ドット
第二次世界大戦中、対ナチス・ドイツのために志願して特殊血清を投与され、超人兵士となった。ヒーローチーム「アヴェンジャーズ」のリーダーであると同時に、マーヴル・ユニバースの全てのヒーローたちのリーダー的存在である。
原作に登場する、無限の力を持つ「インフィニティ・ジェム」であるが、ゲーム中では使用キャラクターの性能を一定時間アップさせる効果がある。全ジェム共通のコマンドを入力することで使用可能で、キャラクターが複数のジェムを持っている場合は、事前に専用のボタン操作で使用順の入れ替えもできる。
存在するジェムは以下の6つ。
パワー - 攻撃力が上がり、通常技に削り効果が追加される
タイム - 移動速度が上昇する
スペース - スーパーアーマー(単発攻撃をくらってものけぞらない)状態になる
リアリティ - 攻撃ボタンを押すごとに、火の玉やつららなど、各ボタン対応の飛び道具を同時に飛ばす
ソウル - 体力が一定量、徐々に回復する
マインド - インフィニティ・ゲージ(後述)が一定量、徐々に増加する
これらの効果に加え、各キャラクター(隠しキャラクターを除く)には「得意ジェム」がそれぞれ1種類あり、通常の効果に加えてさらに特殊効果を得ることができる。ただし、パワージェムが得意ジェムの場合、攻撃力上昇の効果はなくなり、そのキャラクター固有の特殊効果のみが現れる。例えば、スパイダーマンの得意ジェムはパワーで、使用すると自分の分身を発生させる効果がある。
声:ローン・ケネディー
磁力を自在に操る最強のミュータント。ミュータントによる人類の支配を是とし、X-MENとしばしば対立する。前作では最終ボスとして登場し、アーケード版とセガサターン版共に使用はできなかったが、本作では初めて操作キャラクターとしての登場となった。『インフィニティ・ガントレット』原作に娘であるスカーレットウィッチが登場するが、マグニートーは登場しない。