賊軍
幕府軍が「賊軍」に認定された衝撃は大きく、その多くが戦意を喪失し、慶喜も幕府軍を置き去りにして6日に江戸へと逃亡した。鳥羽・伏見での幕府軍の崩壊を見た諸藩は、反薩長派・親薩長派を問わずその多くが幕府を見限り、朝廷に勤王証書を提出して薩長新政府へ恭順の意を示した。その後慶喜は江戸城を無血開城し降伏したが、これを不服とする旧幕府軍の一部との戦闘が発生し、また新政府により朝敵に指定された会津藩・庄内藩(薩摩藩邸焼き討ちの主力)などは明治天皇への叛意は無いが薩長の要求に屈する謂れはないとして抗戦の構えを見せていた。新政府は仙台藩主伊達慶邦ら奥羽諸大名に会津藩・庄内藩の討伐を命じたが、その際に奥州へ派遣された薩摩藩士大山綱良と長州藩士世良修蔵は仙台藩ら奥羽諸藩が仲介した会津藩の降伏条件を一蹴したうえ、世良が大山に宛てた「奥羽皆敵ト見テ逆撃之大策ニ至度候ニ付」が発見されたことで、当初は「薩長が帝を擁している以上、その指示に従うことはやむを得ない」と判断していた仙台藩も世良を殺して諸藩(奥羽越列藩同盟)と共に新政府軍と戦争状態に入った(戊辰戦争)。これら反薩長の諸勢力はみな幕府軍と同様に「賊軍」と認定された。
白村江の戦い
承久の変
大東亜戦争