認可法人
日本障害者雇用促進協会 - 2003年(平成15年)10月1日に独立行政法人高齢・障害者雇用支援機構に改組。 医薬品副作用被害救済・研究振興調査機構 - 2004年(平成16年)4月1日に国立医薬品食品衛生研究所医薬品医療機器審査センター及び医療機器センターと統合し、独立行政法人医薬品医療機器総合機構に改組。
陸上貨物運送事業労働災害防止協会 - 1989年(平成元年)7月18日に民間法人化。 建設業労働災害防止協会 - 1989年(平成元年)7月18日に民間法人化。 林業・木材製造業労働災害防止協会 - 1989年(平成元年)7月18日に民間法人化。 港湾貨物運送事業労働災害防止協会 - 1989年(平成元年)7月18日に民間法人化。 中央職業能力開発協会 - 1998年(平成10年)7月1日に民間法人化。 中央労働災害防止協会 - 2000年(平成12年)6月19日に民間法人化。 厚生年金基金連合会 - 2002年(平成14年)4月1日に民間法人化(その後2005年(平成17年)10月1日に企業年金連合会に改称)。 石炭鉱業年金基金 - 2002年(平成14年)12月13日に民間法人化。 全国社会保険労務士会連合会 - 2003年(平成15年)3月31日に民間法人化。
民間法人として民営化されたもの。
通信・放送機構 - 2004年(平成16年)4月1日に独立行政法人通信総合研究所と統合し、独立行政法人情報通信研究機構に改組。
地方共同法人に改組されたもの。