グラム陽性菌
ネガティウィクテス綱(外膜を保有)を除く4綱がグラム陽性) 放線菌門(外膜なし。6綱すべてグラム陽性。ただし抗酸菌は不定型) デイノコックス・テルムス門(外膜あり。2目のうちデイノコックス目がグラム陽性) クロロフレクサス門(リポ多糖が無く、外膜を欠くとする報告がある。系統的にグラム陰性菌とグラム陽性菌が混在する) テネリクテス門(外膜なし。細胞壁を欠損するためグラム陰性だが、フィルミクテス門にごく近縁でありグラム陽性菌とされることがある)
この5門に藍藻を加えた6門で、テッラバクテリアというクレードを形成する仮説がある。
また、古細菌の中にもグラム陽性に染色されるものがある。ただし、陽性に染色される原因や細胞壁の構造、抗生物質感受性などはこの記事に挙げる典型的なグラム陽性菌とは異なっている。グラム陽性に染色される古細菌の例としては、メタノバクテリウム綱とメタノピュルス綱、Methanosarcinaなどが挙げられる。