鉄道労働組合
しかしその後、鉄道総連・JR総連内で動労出身者と鉄労出身者による主導権争いが起きたことから、鉄労系のJR西労組・JR四国労組・JR九州労組の3組合はJR総連を離脱した。またJR東海労組は分裂し、多数派が現在の東海旅客鉄道労働組合(JR東海ユニオン)(JR連合系)となり、現在のJR東海労働組合はJR総連系で旧JR東海労組の中では少数派となっている。
これらJR総連から脱退した組織が、国労から分裂した日本鉄道産業労働組合総連合(鉄産総連)系の組合と合流して、1992年5月18日に日本鉄道労働組合連合会(JR連合)を結成した。これにより現在、JRグループの労働組合で最大の組織力を持つのがJR連合となっている。
JR東日本にも多数派ではないが、鉄労の影響力が強かった仙台・新潟地区の旧鉄労系組合員を中心にジェイアール東日本労働組合(JR東新労)(現:JR東日本ユニオン)が組織された。当初はJR連合に加盟申請していたが、2016年にJR連合を脱退している。