シャコ目
雌雄異体で他の軟甲類と同様、腹面1対の生殖孔(gonopore)は雌で第6胸節、雄で第8胸節に開口する。胸部の生殖孔から1対の生殖腺(雌は第6胸節から卵巣、雄は第8胸節から精巣)が背面の心臓と腹面の消化管の間で腹部まで長大に伸ばし、末端は尾節で会合する。
雌の場合、生殖孔は第6胸節の腹板に集約し、その間の内部は精子を貯蔵する袋状器官(seminal receptacle, female vaginal pouch)に連結される。第6-8胸節の腹面には(卵をねばつく物質を分泌する)3つのセメント線(cement gland)が腹板ごとに並んで、その唯一の開口(cement-gland pore)は第6胸節の腹板で生殖孔の直後に開く。
雄の場合、それぞれの生殖孔に当たる部分は細いペニス(penis, testes、生殖脚とも)として第3歩脚(第8胸肢)の付け根内側から突出し、末端に大小2つの開口があり、大きい方(genital orifice)は精巣、小さい方(accessory gland orifice)は雌の生殖孔を塞ぐ物質を分泌する腺(accessory gland)の開口となる。また、雄の第1腹肢(遊泳肢)の内肢はやや特化した構造をもつ。
上述の生殖器以外では、ほとんどの種類の性的二形は不明瞭である。ごく一部の種類のみ顕著な性的二形が見られ、例えばトラフシャコ属(Lysiosquilla)とホントラフシャコ属(Lysiosquillina)は雄に比べて雌の第1捕脚が華奢で、体色もやや異なる。
前述の視覚に対応するように、一部の種類に見られる捕脚の眼状紋、または蛍光・紫外線・偏光などを反射する部分は、個体の種類や闘争能力(後述参照)などの情報を伝える信号として用いられたことも示される。
上述の特徴を踏まえて、シャコ類はかつて他の動物よりも優れた色覚をもつと考えられていたが、ヒトなどの3色型色覚よりも可視光を区別する能力が劣っていることが後に判明した(ヒトは波長差1-5nmでも区別できるが、実験対象のシャコ類 Haptosquilla trispinosa は波長差を12-25nmに狭まると区別できなくなる)。これは、シャコ類は複数の光受容体から受け取った信号を中枢神経系(脳)が処理して混合色を作るわけではなく、各種の光受容体がそれぞれ特定の色を直接的に感じ取ったからだと推測される。この仕組みは色覚が劣る代わりに、脳に負荷がかかる比較作業を必要としないため、光学的信号を素早く見分ける必要のあるシャコ類の様々な生態行動(特に超高速の打撃を用いた打撃型の捕食と闘争)に適したものだと考えられる。
本項目では3亜目の分類体系を基に記述する。
形態上では、トゲエビ亜綱は背甲と関節した額角(コノハエビ亜綱に共通、真軟甲亜綱の額角は背甲と一体化)・6節の腹部(真軟甲亜綱に共通、コノハエビ亜綱の腹部は7節)などの性質を兼ね備える同時に、第1触角の3本の鞭状部・4節以下の胸肢内肢・腹肢由来の鰓をあわせもつことで他の軟甲類から区別される。そのうちシャコ目は、短い第2小顎・背甲に癒合しない第5-8胸節・鎌状(亜鋏状)の第2-5顎脚(捕脚)をもつことで奇游目(第2小顎は長い歩脚型・頭部と胸部全体が背甲に覆われる・胸肢は全て同形の歩脚で顎脚に分化しない)から区別される。
トゲエビ亜綱はかつては古口脚目(ここうきゃくもく、Palaeostomatopoda)という第3の目があったが、これは後にシャコ目の1亜目(古口脚亜目、後述)として内包されるようになった。
シャコ目を十脚目に近縁とする説もあったが、上述と後述の絶滅群の形態に支持されず、広く認められる見解ではない。
シャコ類の代表的な特徴である捕脚(ほきゃく、raptorial claw, raptorial appendage, raptorial limb)は採餌用に特化した顎脚で、シャコ類の英名「mantis shrimp」に現れるように、カマキリの鎌(前脚)を逆さまにしたような造形をもつ。単楯亜目の現生種の場合は一般に第2顎脚のみ捕脚と呼ばれているが、基盤的な絶滅群(古口脚亜目・昔口脚亜目・Sculdidae科)まで範囲を広げると、分化程度(後述)により第3-5顎脚をも含め、第2-5顎脚を「第1-4捕脚」と呼ぶ。
Sculdidae科以外の単楯亜目(狭義の単楯亜目)では第2顎脚(第1捕脚)のみ飛び抜けて強大な捕脚(ballistic claw, ballistic thoracopod)で、最終肢節(鎌の刃)の外骨格の強化が進み、第3肢節は肥大化して大きな伸展筋(第4肢節を展開する筋肉)を格納される。第3肢節の前半部は所々に外骨格の硬化程度が異なり、鎌を射出する際に第4肢節(鎌の付け根)の展開速度を増幅する精密な機構をなしている。第4肢節の基部に関節した第3肢節前方側面は、Vの字型に分かれた硬い「meral-V」で、腹面を軸にして前後わずかに動ける。