第3施設団
第301坑道中隊(南恵庭駐屯地)は第13施設群隷下に編合。
北部方面施設隊
2008年(平成20年)3月26日:第3施設団を廃止し、北部方面施設隊に改編。
第13施設群(幌別駐屯地)を第13施設隊に改編。
第358施設中隊及び第359施設中隊(幌別駐屯地)は統合され、第383施設中隊「築城・障害」に改編。
第13施設群第301坑道中隊(南恵庭駐屯地)及び第13施設群第302水際障害中隊(幌別駐屯地)は北部方面施設隊直轄へ。
2016年(平成28年)3月26日:第361施設中隊(倶知安駐屯地)及び岩見沢駐屯地所在部隊の一部要員を上富良野駐屯地業務隊に転属させて第14施設群準備隊が編成完結。
第3施設団(再編)
2017年(平成29年)3月27日:北部方面施設隊を廃止し、第3施設団が再編。
第14施設群を上富良野駐屯地で新編。
第12施設群の施設中隊を機能別中隊に改編。
第13施設隊(幌別駐屯地)を第13施設群に改編。
第302水際障害中隊(幌別駐屯地)を第13施設群隷下へ異動。
第301坑道中隊が南恵庭駐屯地から上富良野駐屯地に移駐し、第14施設群隷下へ異動。
第12施設群第342施設中隊(釧路駐屯地)を廃止し、第14施設群第397施設中隊「交通」に改編。
第3施設団本部
第3施設団本部付隊「3施団-本」
第12施設群 第12施設群本部 本部管理中隊 第398施設中隊(築城・障害) 第399施設中隊(機動支援) 第400施設中隊(交通) 第302坑道中隊
第13施設群 第13施設群本部 本部管理中隊 第360施設中隊(機動支援) 第361施設中隊(交通) 第383施設中隊(築城・障害) 第302水際障害中隊
第14施設群 第14施設群本部 本部管理中隊 第395施設中隊(築城・障害) 第396施設中隊(機動支援) 第397施設中隊(交通) 第301坑道中隊
第105施設器材隊 第105施設器材隊本部 第105施設器材隊本部付隊「105施器-本」 特殊器材中隊 「105施器-特」 架橋中隊「105施器-架」
第303ダンプ車両中隊「303ダ」
南恵庭自動車教習所
1980年(昭和55年)3月25日:第105施設器材隊を第301架橋中隊を母体に南恵庭駐屯地で新編。
1982年(昭和57年)3月25日:第3施設団改編。
第303ダンプ車両中隊(南恵庭駐屯地)を団直轄へ。
第304ダンプ車両中隊(岩見沢駐屯地)を廃止。
第313ダンプ車両中隊(幌別駐屯地)を廃止。
1988年(昭和63年)3月25日:第3施設団改編
第3施設団直轄及び施設群隷下の5個地区施設隊を廃止。
各施設群隷下に各1個施設中隊が新編、各施設群は3個施設中隊から4個施設中隊に増強。
1991年(平成03年)3月:第301坑道中隊を南恵庭駐屯地で新編し、第1施設群に編合。
1996年(平成08年)3月29日:第302坑道中隊を岩見沢駐屯地で新編し、第12施設群に編合。
2000年(平成12年)3月28日:
第13施設群の施設中隊を機能別中隊に改編。
後方支援体制変換に伴い、整備部門を北部方面後方支援隊第101施設直接支援大隊に移管。
2004年(平成16年) 3月23日:第1施設群第341施設中隊と第12施設群第342施設中隊が統合し、新たに第12施設群第342施設中隊を釧路駐屯地において再編。第1施設群第341施設中隊は廃止。 3月29日:第1施設群(南恵庭駐屯地)を廃止。