遺伝的連鎖
χ 1 2 = ( | r − s | − 1 / 2 ) 2 n {\displaystyle \chi _{1}^{2}={\frac {(|r-s|-1/2)^{2}}{n}}}
これは自由度1のカイ二乗分布に従う。たとえばある遺伝性疾患を持った病気の家系において、100回の伝達が記録されており、そのうち45回において組換えが観察されているとする。 θ ^ = 0.45 {\displaystyle {\hat {\theta }}=0.45} であり、マクネマーの検定p値は0.34であるからこの遺伝マーカーは病気の原因遺伝子座と連鎖はなく、したがって原因遺伝子座の近傍にはない。いっぽう別の遺伝子座をみてみると、100回のうちたった30回でしか組換えが観察されなかったとする。このとき θ ^ = 0.30 {\displaystyle {\hat {\theta }}=0.30} 、検定p値は0.000078であるのでこの遺伝マーカーは原因遺伝子座と連鎖の関係にあって、原因遺伝子座の近傍に位置すると考えられる。
組み換えを直接観察できるという前提を満たすことは困難なので、この方法は実際的ではない。