荻野直正
これに対し山名祐豊は織田信長に救援を求め、信長は内藤・宇津氏誅伐のため丹波に入っていた明智光秀に直正討伐を命じた。この時、直正は竹田城(朝来市)を攻めていたが(『吉川家文書』)、光秀の出陣を知ると黒井城へと戻る。天正3年(1575年)11月、光秀は12、3か所に陣城を築いて黒井城を包囲したが、翌天正4年(1576年)1月、光秀方に付いていた多紀郡八上城主の波多野秀治が突如離反したことで、光秀は退却した(黒井城の戦い)。同年4月には、直正・忠家は信長に詫言を伝えて赦免されている。織田氏の実力を知って衝突を避けることを選んだとみられるが、黒井城の戦い以前より明智光秀が帰順交渉を行ってきたことが実を結んだものとも考えられる。
天正6年(1578年)3月9日、直正は50歳で死去した。一説では首切り疔の病(首の腫瘍)だったという。黒井城を継いだ嫡男の直義は僅か9歳であったため、叔父の赤井幸家が後見した。この後、赤井氏・荻野氏は、明智光秀と再び敵対し、翌天正7年(1579年)8月、黒井城は落城した。