1499年
1月9日 - ヨハン・ツィーツェロ、ブランデンブルク選帝侯(* 1455年)
3月13日(明応8年1月23日)? - 山名政豊、室町時代、戦国時代の守護大名(* 1441年)
3月20日(明応8年1月30日) - 畠山義豊、室町時代、戦国時代の守護大名、戦国大名(* 1469年)
3月27日(明応8年2月16日) - 杉武明、室町時代、戦国時代の武将(* 生年未詳)
5月5日(明応8年3月25日) - 蓮如、室町時代、戦国時代の浄土真宗の僧、本願寺第8世(* 1415年)
5月26日(明応8年4月17日) - 小早川敬平、室町時代、戦国時代の武将、沼田小早川氏の当主(* 1452年)
6月8日 - オットー2世、プファルツ=モスバッハ=ノイマルクト公(* 1435年)
10月1日 - マルシリオ・フィチーノ、イタリアのルネサンス期の人文主義者、哲学者、神学者(* 1433年)
11月26日(明応8年10月24日) - 大宮長興、室町時代、戦国時代の官人(* 1412年)
11月28日 - エドワード・プランタジネット、イングランドの貴族、ウォリック伯、ソールズベリー伯(* 1475年)
12月15日(明応8年11月13日) - 斎藤又四郎、室町時代、戦国時代の武将、斎藤氏持是院家の第4代当主(* 1482年)
パウロ・ダ・ガマ、ポルトガルの航海者、探検家(* 1465年)