陵墓参考地
天皇を頂点とした政治体制を敷いた明治政府は、歴代陵墓を管理するようになる。一部を除く天皇の陵は近世の治定を引き継いだが、皇后の陵や皇族の墓にいたっては不明なものが多く、これらを決定していく必要が生じた。明治4年(1872年)に政府は「后妃 皇子 皇女等御陵墓」の取調べを全国府藩県に命じた。この調査の経過は不明であるが、1935年(昭和10年)の『陵墓参考地』には1873年(明治6年)3月に対馬の「安徳天皇御陵と称する場所」の保護を「村戸長」に命じたと記されている。
1881年(明治14年)には天武・持統天皇陵が現在の野口王墓古墳(現檜隈大内陵)に治定された。これに伴い従前の見瀬丸山古墳(現畝傍陵墓参考地)は指定を解かれたが、「見込みある場所」なので「そのまま差し置く」として引き続き宮内省の管轄下に置かれた。
1926年(大正15年)には、陵墓管理体制の規則として『皇室陵墓令』と『皇室陵墓令施行規則』た施行された。これらは宮内庁の陵墓管理の原型として、現在に至るまで影響のある法令である。このうち『皇室陵墓令施行規則』の第18条に「陵墓参考地」の文言が現れ、従前の「御陵墓伝説地」「御陵墓参考地」の2カテゴリーが統一された。ただし、内容は「台帳に登録し図面を添付する」とされているだけであり、具体的な規定については定められていない。この内容について外池は「とても法的な根拠と考えられない」としている。
また1927年(昭和2年)には、陵墓参考地の呼称について「すでに固有名称がある場合にはその名称を冠すること。固有名称が無いものは所在地の町村名を、同じ町村に2箇所以上ある場合には大字名を、同じ大字に2箇所以上ある場合は小字名までを冠すること」と決定された。
その後も陵墓の調査は継続したが、1882年(明治15年)時点で顕宗天皇はじめ13陵、皇后以下はヒメタタライスズヒメをはじめ多数の陵墓が依然として決定できずにいた。また陵墓の可能性がある土地は田畑になっている場所もあり、このまま放置すれば調査・治定までに墳墓が棄損される可能性があった。そこで宮内卿の徳大寺実則の上申により、陵墓の可能性のある土地を官有地であるなら地種の変更、民有地であるならば買い上げした上で「御陵墓見込地」とするようになった。
1883年(明治16年)には山口県豊浦郡地吉村(現西市陵墓参考地)・高知県高岡郡越知村(現越知陵墓参考地)・長崎県下県郡久根田舎村(現佐須陵墓参考地)の3か所を安徳天皇の御陵墓見込地に設定した。
さらに1885年(明治18年)には奈良県添上郡法華寺町宇和那辺(現宇和奈辺陵墓参考地・ウワナベ古墳)と同小那辺(現小奈辺陵墓参考地・コナベ古墳)の古墳が御陵墓見込地に設定された。両古墳は文久修陵では元明天皇と元正天皇の陵とされていたが、慶応年間に両陵が現在の添上郡奈良阪村養老ヶ峯に治定された事を受け、民有地となっていた。
なお、この時の記録に明記されていないが、御陵墓見込地には推定被葬者名が冠されていた。
1901年(明治34年)に内務大臣から埼玉県に充てた訓令によれば、埼玉県樋遣川古墳群にある御室塚古墳・浅間塚古墳・稲荷塚古墳について「御陵墓伝説地が内定されたので厳重取締」をするように指示が出されている。この3基の古墳は御諸別王とその子孫が被葬者と推測されており、これに立脚した見解であったと考えられる。しかし、現在に至るまで陵墓参考地には指定されていない。