第6地対艦ミサイル連隊
2000年(平成12年)3月28日:第12特科連隊内に編成準備隊が編成される。
第6地対艦ミサイル連隊
2001年(平成13年)3月27日:第12特科隊に縮小された旧第12特科連隊の隊員を主力に東部方面隊直轄部隊として編成完結。宇都宮駐屯地司令職務担任部隊に指定。
2002年(平成14年)3月27日:東部方面隊の後方支援体制変換に伴い、直接支援隊を廃止し、整備部門を東部方面後方支援隊第301特科直接支援中隊へ移管。
2011年(平成23年)4月21日:自衛隊旗(連隊旗)を返還し廃止、駐屯地司令職務を第12特科隊へ移管。所属隊員は若手を中心に普通科への職種変換(第1師団3個普通科連隊及び東部方面混成団第31普通科連隊重迫撃砲中隊への転属)や、宇都宮駐屯地に所在する各部隊(主に中央即応連隊)へ分散配置換え。