ストーンウォールの反乱
店内を照らすために火をつけようとする者や、パーキングメーターを引き抜いてドアの隙間から振り回し、警察官を店の外に出そうとする者もいた。時折開くドアの隙間からは、火炎瓶や煉瓦が投げ込まれた。暴動が起きていることはすぐに広まり、駆けつけた住民や他のゲイバーの客らで現場は騒然となった。
ようやく警察に応援が到着し、初日の暴動は発生から45分程で終息した。騒動が収まった時、ストーンウォール・インはサイクロンが直撃したかのような惨状であったと表現されている。その夜のうちに13名の逮捕者と、4名の警察官を含む多数の負傷者が出た。負傷者のうち少なくとも2名は重傷であった。マーシャ・P・ジョンソンを含め、2000人を超えると見られるLGBTQ当事者らが400人の警察官と戦ったのである。
この踏み込みは、それまでストーンウォール・インに対して行われていたものと、いくつもの点で異なっていた。それまでの踏み込みでは、一般的に第六分署がストーンウォール・インの経営者に内報した後で、家宅捜査に入っていた。加えて、通常、踏み込みは早い時間に行われ、書き入れ時の時間帯には店は通常の営業に戻れた。しかし、この夜の踏み込みは、第一分署が主体となり、いつもより遅い書き入れ時に行われている。
また、この捜索中、警察官はハンマーで店のレジを壊している。この行為について、後日、居合わせた客の一人は警察官が金を盗んだと新聞記者に証言したが、警察は店とマフィアとの繋がりを裏付ける証拠を押収するために行ったと反論した。