とある魔術の禁書目録のゲーム
一方通行を主人公とするシナリオ。本編との時系列の関係は不明。パートナーは打ち止め、土御門。
ある日、打ち止めが何者かの視線を感じると伝えるが、一方通行は取り合わずに軽くあしらう。しかし、突然襲撃を受け打ち止めを木原数多にさらわれてしまう。一方通行は土御門と協力し、打ち止めを救い出そうと木原の足取りを追って奔走する。
声 - 勝杏里
イギリス清教「必要悪の教会」に所属する魔術師。魔術・科学両サイドにまたがる多角スパイ。
9月10日、ステイルに会い、学園都市にアグニの祭火が仕掛けられているという話を聞く。翌日、いてもたってもいられなくなった上条は、アグニの祭火の調査を始める。その調査中に、ソーズティとぶつかる。逃げていったソーズティを、追いかける。上条は、口封じで負傷させられたソーズティを病院に連れて行く。病院を抜け出した上条は、漫画喫茶に寝泊りする。翌日、ステイルから、連絡を受けた上条たちは、23学区へ急行する。そこで、ウレアパディーと対峙する。
声 - 伊藤かな恵
科学(裏)編の主人公。柵川中学1年生で、初春の親友。無能力者(レベル0)。
声 - 柚木涼香
「追跡封じ」の異名を持つフリーの女性魔術師。
BGM、SE、VOICEのボリュームを変更できる。テキストの設定やコンピューターの強さも変更できる。
『とある魔術と科学の謎解目録』(とあるまじゅつとかがくのパズデックス)は、2014年3月16日に配信開始したパズルアクションゲーム。 2016年6月30日にサービス終了。