イナズマイレブン3 世界への挑戦!!
オーガプレミアムリンク同様『ジ・オーガ』のみ。トーナメント形式の試合に出場することができる。優勝するとさまざまなアイテムが手に入り、ここでしか入手できないものもある。一部のトーナメントにはGP・TPの自動回復がされず、減った状態のまま次の試合に行ったり、必殺技を使用してもTPが一切減らないチームもある。トーナメント中はセーブができない。また、トーナメントは途中で棄権することも可能。
声 - 竹内順子
本作の主人公。ポジションはGK。雷門サッカー部の熱血キャプテン。どんな時でも絶対に諦めない心を持つ。本作では日本代表「イナズマジャパン」のキャプテンに任命され、仲間たちとともに旅立つ。
声 - 佐藤健輔
『ボンバー』で登場する、「魔界軍団Z」の主将。ポジションはFW。好物は「人間の魂」なのだという。得意技は「ダークマター」。
声 - 杉田智和
イギリス代表「ナイツオブクィーン」のキャプテン。ポジションはFW。紳士的だが、そのプレイはかなり攻撃的でダイナミックな攻めをする。「静かなる闘将」と呼ばれている。得意技は「エクスカリバー」。
声 - 下野紘
イタリア代表「オルフェウス」の副キャプテン。ポジションはFW。父はサッカー選手であり、自分もその後を追おうとしている。「イタリアの白い流星」の異名を持つ。得意技は「オーディンソード」。
物語冒頭のエピソードの主人公はフィディオ・アルデナ。 隠しチームはセイン率いる「天空の使徒」。 ストーリークリア後のオプションで「イナズマイレブン1の設定画」を見ることができる。 本バージョン限定の秘伝書として、「グランドファイア」や「ダブル・ジョー」などがある。
声 - 甲斐田ゆき
コトアール代表「リトルギガント」のキャプテン。ポジションはGK。円堂に似た雰囲気を持つ少年。実績は一切不明だが、相当な実力の選手。円堂の前によく現れる赤キャップの男が監督のようで、彼のことを「師匠」と呼び慕っている。得意技は「ゴッドハンドX」。
声 - 戸松遥
久遠の娘で、イナズマジャパンのマネージャー。大人しい性格。円堂とは知り合いらしいが、彼女自身は円堂のことを覚えていない。
世界各地の予選を勝ち上がってきた10チームで争われる。その10チームは5チームずつグループA、グループBに分かれてグループ内で総当たり戦を行う。勝利チームは3点、負けたチームは0点、引き分けの場合は両チーム1点ずつポイントが手に入る。最終的に両グループで点数が最も高い上位2チームが決勝トーナメントへと進出する。 グループA イナズマジャパン(日本)、ナイツオブクイーン(イギリス)、ジ・エンパイア(アルゼンチン)、ユニコーン(アメリカ)、オルフェウス(イタリア) グループB ザ・キングダム(ブラジル)、リトルギガント(コトアール)、ブロッケンボーグ(ドイツ)、ローズグリフォン(フランス)、レッドマタドール(スペイン)
出場する8チームがトーナメント形式で戦う。3連勝して1位になれば、世界大会への出場権が与えられる。
声 - 東地宏樹
響木が推薦したイナズマジャパンの監督。完璧に計算された指示をするタイプで、円堂たちに世界は「努力」や「熱血」だけでは勝てないと言い放つ。裏では「呪われた監督」と噂されているらしい。