GOTHAM/ゴッサム
孤立したゴッサムでは物資が不足し治安が悪化する。ゴードン、ブルース、GCPDは避難民を守る。重症を負ったセリーナはアイビーによって回復させられ、ジェレマイアを狙う。ラーズ・アル・グールの娘のナイッサは父を殺したブルース、バーバラ、そしてゴッサム全体に復讐を誓い、ニグマやリーを操ってテロを起こす。部下でゴードンの戦友のドランスをストレンジに改造させてベインとし、軍を操ってゴッサム壊滅を図る。バーバラはゴードンの子を産むが、ゴードンはリーと結婚する。ペンギンとニグマは潜水艦で脱出を図るが、残って軍と戦い街を守ることにする。軍がベインに刃向かってゴッサムは守られ、ナイッサは潜水艦を盗んで脱出する。ゴッサムは本土と再び繫がれ、ゴードンは警察本部長となり、自らの行動が多くの人々の死を招いたブルースは街を離れる。 10年後、ブルースはゴッサムに戻りバットマンのコスチュームでヴィランと戦い始める。