アンノ2世
しかし、1066年にアーダルベルトが失脚するといくらか権力を取り戻し、同年には甥コンラート1世フォン・プフリンゲンをトリーア大司教に据えることに成功する。1072年までに帝国での指導的な地位を取り戻して皇帝に次ぐ権力者となり、ハインリヒ4世に対してザクセン貴族が起こした反乱では仲裁に入っている。
12世紀から13世紀にかけて、ケルンは地元産の織物 (特に羅紗) や染物、金細工や刀剣、鎧が帝国内で重用されるようになって大きく発展した。また、ケルンを除くアルプスより北の都市には大教会や聖地、聖遺物などはほとんどなかったため「ドイツのローマ」と呼ばれるようになり、ケルン市民の自立意識は大きく高まった。このため、市民は次第に大司教の統治に不満を爆発させるようになり、2世紀の間に渡って大司教と市民の間で激しい対立が繰り広げられた。この萌芽となったのがアンノ2世在位中の1074年のイースターに起きた蜂起である。この蜂起は3日とかからず鎮圧され、参加した者は厳しく罰せられたが、一方でアンノ2世は皇帝を差し置いてイングランド王ウィリアム1世と同盟を結んだとして告発された。アンノ2世はこれをなんとか乗り切ったものの宮廷からは遠ざかり、1075年12月4日にジークブルク修道院で亡くなり同地に埋葬された。