函館市企業局交通部
ICAS nimoca:ICカード。このほかにもkitaca、Suica、PASMO、TOICA、manaca、ICOCA、PiTaPa、SUGOCA、はやかけんといった交通系ICカードが利用できる。 イカすカード(函館市交通局→函館市企業局発行)・バス・市電共通乗車カード(函館バス発行) 回数券(市電・函館バス共通) 市電一日乗車券 市電・函館バス共通一日/2日乗車券:バスの利用は函館市内中心部のみ。郊外域や旧戸井町・旧恵山町・旧南茅部町・旧椴法華村の区域では使用できない。 トワイライトパス:1月3日から3月31日のみ、車内のみで販売される18時から終電までの時間帯限定乗車券。冬期間の乗客数底上げや利便性向上を目的として2010年に初めて発売された。
第1回函館市交通事業経営計画検討会議にて交通局長(当時)が、「ニーズ的に人口の多い東部地区への延長、湯の川 - 函館空港間を延伸して観光客等をまっすぐ市内へと運ぶという市民要望があるが、データや事業運営の状況をみると非常に難しい。縮小は考えておらず、現状のままで事業を図っていきたいと考えている」としている。
函館駅前土地区画整理事業の整備の指針となった顔づくり計画の策定時に、駅前広場へのスイッチバック方式による乗り入れを検討したが、路線延長のための事業費、幹線道路における通行の流れ、交差点の信号処理の問題で見送っている。
下海岸線:函館駅前 - 千代台 - 湯倉神社前 - 根崎- 銭亀沢支所前 - 石崎 函館バスの長期ストライキによる運休に対して1956年(昭和31年)4月免許申請、同年6月1日運行開始したものである。同区間はハイヤー事業者の相互自動車(相互バス、函館 - 恵山 - 椴法華)も参入し、3社競合区間になり利便性が向上したものの全体の乗客数は伸び悩み、相互バスは1959年(昭和34年)3月1日撤退した。 1966年(昭和41年)12月1日、銭亀沢村の合併編入により全線が函館市内になる。 1978年(昭和53年)2月22日改正の時刻表には、平日函館駅前発7時6分、17時10分。平日石崎発7時55分、18時9分。休日函館駅前発7時6分、17時12分。休日石崎発7時55分、18時9分の1日2往復が設定されている。 1978年(昭和53年)11月1日廃止
大野線
上磯線
30系統:日吉営業所前 - 北中学校通 - 世界救世教前 - 本通農協前 - 鍛冶1丁目 - 西堀病院前 - 保健所裏 - 五稜郭電停前 - 千代台 - 函館駅前 1993年(平成5年)4月1日、市電ガス会社回り線(本線・函館駅前 - ガス会社前、宮前線・ガス会社前 - 五稜郭公園前)廃止の代替路線として新設。
32系統:日吉営業所前 - 団地通 - 白百合学園前 - 東山団地 - 亀田支所前 - 富岡 - 田家入口 - 五稜郭電停前 - 西武テーオー前 - 宮前町 - ガス会社前 - 大縄町 - 総合福祉センター前 - 函館駅前
37系統:昭和営業所前 - 亀田病院前 - 田家入口 - 渡島支庁前 - 堀川町電停前 - 旭町 - 宝来町
39系統:函館空港 - 湯川団地中央 - 戸倉町 - 湯倉神社前 - 湯の川温泉電停前 - 競馬場前 - 深堀町 - 五稜郭電停前 - 西武テーオー前 - 宮前町 - ガス会社前 - 総合福祉センター裏 - 函館駅前 1993年(平成5年)4月1日、市電ガス会社回り線(本線・函館駅前 - ガス会社前、宮前線・ガス会社前 - 五稜郭公園前)廃止の代替路線として新設。 移管後、2005年(平成17年)4月1日に函館バス93系統(ガス会社前・昭和・亀田支所前経由)と統合。函館駅前 - 五稜郭・亀田支所前を廃止し循環運行に変更。空港循環線とびっこ。系統番号廃止。
39-1系統:函館空港 - 湯川団地中央 - 戸倉町 - 湯倉神社前 - 湯の川温泉電停前 - 競馬場前 - 深堀町 - 五稜郭電停前 - 西武テーオー前 - 宮前町 - ガス会社前 - 総合福祉センター前 - 函館駅前 移管後、2005年(平成17年)4月1日をもって廃止。
函館市交通局への一元化案は人件費比率の違いから収支採算性に大幅な乖離がある上に渡島・檜山管内における路線運行のための施設とノウハウを有していない、第三セクターや南北海道の広域連合等による一元化案はバス事業のノウハウを有する企業が存在するにもかかわらず、それを廃止してまで別の経営主体を設置する必要はあるのかとの問題があった。関連事業の展開など経営感覚をフルに発揮出来る民間企業のうち、函館市域のみならず渡島 ・檜山管内における路線運行のための施設とノウハウを持っている函館バスへの移管案が選ばれた。その後、2000年(平成12年)4月7日に函館市が函館バスに対し申し入れをし、同年11月20日に基本協定を締結した。2001年(平成13年)4月に日吉営業所、翌年4月に昭和営業所を移管。乗務員の雇用の関係で1系統のみ残されていたが、2003年(平成15年)4月6番系統を移管。バス事業を廃止し、60年の歴史に幕を閉じた。
移管により函館市交通局への補助金の減少などにより平成13 - 17年度の5年間で約64億円が削減された。運輸政策研究機構の研究員(当時)である野口によると職員の転配費用も考慮すると年間1.6億円の負担増になり、必ずしも市の負担が減少したとは言い切れるものではないという。
旧市営バスの負債は一般会計だけでは処理できず、軌道事業のなかで市の補助により負債の処理を継続している。