ミクロマン200X
200X年7月30日に民営ミクロマン学園都市居住区 人為による強化ガラス破壊事件 通称『硝子の雨事件』から始まる3回のストーリー。
大橋豊
国立アクロイヤー疾病研究センターに入院した、硝子の雨事件を起こした患者の少年。アクロガルーラによるカリーの幻影に惑わされている。
ミクロマン・カリー
豊の進学校受験の為に住み込みの家庭教師として来たミクロマン。豊と仲良しになった事で受験が終わってからも住み込みを続けることを願い、勉強・遊び・学校にまで付いて行く困り者だった。体育倉庫に閉じ込められた際にはミクロルガーでドアを開けようと苦闘した。6月の雨の日にトラックから豊をかばって轢かれてしまう。
ミクロマン・セイゾウ
ハルが屋敷からの脱出を依頼し、一緒にミクロエドを離れる事になっていたミクロマン。だが彼には意外な結末が待っていた。
ミクロレディ・ハル
セイゾウの恋人。セツナの女中の一人として働いていた。ヒドウ達の手で屋敷に捕らわれアクロイヤーにされそうになるがユメ達に救出される。しかし理由は不明だが屋敷に戻り、セイゾウの裏切りにより命を落とす。
ミクロシスター・アンナ
ショウマをスポンサードしていて、自身のイメージソングを依頼したミクロシスターのお嬢様で、執事のミリタリーフォースを連れてラストに登場した。
非道敷島守、非道、刹那
ミクロマン居住区ミクロエドを統括していた奉行が謎の病死を遂げた後、責任者に就いたアクロイヤーXADOのミクロマンとしての偽名。
30年前、2人の若き科学者により人口増加に伴う食糧危機などに対応するための人体細胞の縮小化の研究の末に縮小化遺伝子の研究から「ミクロ細胞」が開発された。このミクロ細胞から培養・育成された「ミクロヒューマノイド」は高度な知能と高い身体機能を有していた。
2人のうちのDr.バーンズは悪用を危ぶみ研究中止と封印に及ぶが、もう1人のDr.シルバーはミクロ細胞を兵器開発に利用出来ると考え密かに研究所から細胞を持ち出し忽然と姿を消した。Dr.バーンズにより4人のミクロヒューマノイドにDr.シルバー探索の指示が出され、長期にわたる調査の末にメキシコ山岳部で彼等はDr.シルバーの研究所を発見するが、突如起きた爆発により彼等は音信不通となった。
そして30年後、謎の小型生命体を感染源とする悪性ウイルスが自らをこう名乗ったという。「アクロイヤーX」と。その生命体「アクロイヤーX」により撒き散らされる有害ウイルス「アクロウイルス」の免疫物質がミクロ細胞から発見された事で、国際機関M.I.C.Rに招聘されたDr.バーンズは自ら封印したミクロ細胞より新たに4人のミクロヒューマノイドを誕生させる。こうしてミクロマンとアクロイヤーの長きにわたる因縁の戦いが始まったのである。