東大紛争
11月から12月にかけて民主化行動委と無党派グループは共同して各学部の学生大会に代表団を選挙させ、統一代表団を形成。
1969年(昭和44年)1月10日、全学集会で加藤代行と統一代表団は「確認書」を取り交わした。確認書は10項目からなり、医学部処分の白紙撤回や自治活動の自由化、今後の大学改革の方向性などを定めていた。全学集会に前後して各学部・院系のストは相次いで解除され、東大生の多数派が警視庁を相手とする紛争から離脱した。
一方、少数派となった全共闘は闘争継続を主張して安田講堂等校舎の占拠・封鎖を続けたため、1969年1月18日から19日にかけて、警視庁の出動要請を受けた機動隊が、安田講堂の封鎖解除と共闘派学生の大量検挙を行った(東大安田講堂事件)。これで全共闘は大きな打撃を受け、紛争は収拾された。さらに1969年(昭和43年度)の東大入試は、佐藤内閣が中止を決定。全共闘は安田講堂事件以後、急速に退潮し1969年中には東大紛争は完全に収束するに至った。
安田講堂事件を含めた東大紛争では、767人が逮捕され、616人が起訴された。一審判決で133人に実刑判決、400人超が執行猶予付き有罪判決、無罪判決12人であった。
1968年(昭和43年) 1月29日 東大医学部の学生がインターン制度に代わる登録医制度に反対し、無期限ストに突入。 3月12日 医学部は、2月19日の医局長缶詰事件で17人の処分を発表。 3月26日 処分された学生のうち1人につき、東大側の誤認の可能性があると教授懇談会で医学部講師2名が報告。 3月28日 医学部全闘委の学生が安田講堂での卒業式実力阻止を図った為、大学側は卒業式を中止。 4月12日 入学式強行。 6月15日 医学部全闘委の学生が安田講堂を占拠。 6月17日 大河内総長の要請で、警視庁機動隊1200人が同大学構内に出動し、学生らは退去。 6月18日 全学闘争連合(全斗連)が結成。(大学院生を中心とした組織) 6月20日 警察導入に抗議して、法学部を除く9学部が一斉に一日スト。1960年の安保闘争時以来初。 6月26日 東大文学部無期限ストに突入。 6月28日 大河内一男総長出席の安田講堂での「総長会見」。約3000人が参加し、溢れた2000人もの学生はテレビ中継した別の教室集会に参加という形式を採った。 7月2日 反日共(反共産党)の日本の新左翼系の学生ら、250人が安田講堂をバリケードで封鎖。 7月5日 東大闘争全学共闘会議(東大全共闘)結成(全共闘議長・山本義隆)。教養学部も無期限ストに突入。 7月9日 テント村開設 7月16日 全共闘、七項目要求確認。