東京医科歯科大学
2012年4月 大学院医歯学総合研究科を改組(2専攻)(大学院生命情報科学教育部を統合)。 女性研究者支援室を設置。 スポーツ医歯学センターを設置。
2013年 2月 疾患バイオリソースセンターを常設センターに変更。 4月 再生医療研究センターを設置。 学生支援・保健管理機構を設置。 職員健康管理室を設置。 広報部を設置。
2016年4月 学長特別顧問に出井伸之、井上孝美、渡辺恒雄の3名が就任する。
2019年12月2日 - 2020年4月に「M&Dデータ科学センター」、2022年4月に新学部として「メディカルデータサイエンス学部」を設置する計画を明らかにした(後に、2022年4月の時点でメディカルデータサイエンス学部新設は実現に至らず)。
2020年4月 M&Dデータ科学センターを設置。 日本初の、次世代型ロボット支援下手術(ダ・ヴィンチ手術)、次世代PET(canon製)等を導入する機能強化棟を着工した。
2020年10月 指定国立大学法人に指定。
2021年9月現在 東京医科歯科大学医学部附属病院、東京医科歯科大学歯学部附属病院共に厚生労働省指定の特定機能病院である。
2021年10月1日 東京医科歯科大学病院開設(東京医科歯科大学医学部附属病院、東京医科歯科大学歯学部附属病院を統合)。
2024年10月1日 国立大学法人東京医科歯科大学は解散し、権利及び義務並びに業務が国立大学法人東京科学大学に承継される(予定)。
生体材料工学研究所
難治疾患研究所
駿河台臨床研究棟
レジデンス茗芳
パートナーズ・ハーバード・メディカル・インターナショナル (PHMI)
ハーバード大学( アメリカ合衆国)と医学教育提携契約を締結している。
海外の医学部との交換留学プログラム
インペリアル・カレッジ・ロンドン( イギリス)、オーストラリア国立大学(オーストラリア)との交換留学プログラムが行われている。
放送大学学園と単位互換協定を結んでおり、放送大学で取得した単位を卒業に要する単位として認定することができる。
研究棟に一年中深夜まで煌々と明かりが灯っているのが、湯島・駿河台キャンパスがある御茶ノ水地域の風景の一つになっている。柳田邦男の『ガン回廊の朝』に、国立がんセンターの創成期に、同センターの研究者が深夜の帰宅時に電車の車中から本学の研究室に煌々と灯りが灯っているのを見てショックを受け、その対抗心から同センターの研究者達も終電ぎりぎりまで研究に打ち込むようになったエピソードが記されている。
アニメ『ソードアート・オンラインII』の第3話〜13話において「都立中央病院」として登場している。