RecA
RecAはDNAでの維持と修復に重要な38kDaのタンパク質である。RecAの構造的・機能的相同体はDNA修復タンパク質が発見されている全ての種から見つかっている。相同タンパク質は真核生物ではRad51、古細菌ではRadAと呼ばれている。
RecAには多くの活性があるが、その全てがDNA修復に関するものである。細菌のSOS応答(英語版)でリプレッサーLex Aとリプレッサー λ(英語版)の自触媒開裂においてプロテアーゼ活性を促進する機能を持つ。
RecAとDNAの会合の多くは相同組換え(英語版)によって起こる。RecAタンパク質はssDNA(一本鎖DNA)に長いクラスターの形で強く結合して核タンパク質タンパク繊維(英語版)を作る。そのタンパク質は1つ以上のDNA結合部位をもち、一本鎖DNAと二本鎖DNAを両方抱え込むことができる。これによりDNAの二重らせんと一本鎖の相補部位の対合 (生物学)(英語版)反応を触媒できるようになる。RecAとssDNAの繊維は配列相同性(英語版)を持つ二重らせんDNAを探す。その探索プロセスによりDNAの二重らせんが引き伸ばされ、相補的配列の認識に至る。このプロセスは配座選択と呼ばれる。反応によって2つのDNAのらせんの組換えが始まる。対合が終わると、ヘテロ二本鎖(英語版)領域で分岐点移動という反応が始まる。分岐点移動は対になっていない領域の一本鎖DNAが対になっている領域の片方の塩基鎖を置き換え、全体の塩基数を変えることなく分岐点のみを動かす反応である。