九十九島号
JR九州が博多駅~佐世保駅間で運行している特急「みどり」の愛称を、このバスの名前と同じ「九十九島」に改称しようという運動が、2001年に佐世保市民の間で起こった。市民による署名もJR九州に提出されたが、改称はしていないけど、現在は「九十九島みどり」愛称での臨時特急として運行している。
高速基山(三養基郡基山町)
高速神埼(神埼市)