ロシア連邦保安庁
取調局 レフォルトヴォ取調拘置所:欧州評議会加盟国の基準に従い、2006年から法務省の管轄下になったが、実際はFSBの職員が法務省に「出向」することにより、引き続きFSBが事実上管理している。
総務局 FSB受付
契約・法務局
通信保安センター
通信手段無線電子諜報センター:旧FAPSIの部署
特殊局:暗号
ライセンス・証明・国家秘密保護センター
特殊技術センター 犯罪学研究所
国境作戦研究センター
捜索局
協力プログラム局 社会関係センター
登録・公文書フォンド局 公文書センター
無線防諜局(R局)
航空局
特殊通信局
軍事医療局
軍事建設局
警備局
当直局
軍事動員課
FSBアカデミー
産業企業防諜保障局(P局)
輸送機関防諜保障局(T局)
金融・財政システム防諜保障局(K局)
内務省・非常事態省・法務省防諜保障局(M局)
組織分析局
密輸・麻薬不法流通対策局
行政局
防諜作戦部
防諜活動調整・分析局
特殊措置局
施設防諜局
捜査活動情報保障局
情報セキュリティ・センター
軍事防諜部:スメルシの後継機関