ヨハン・ヴィルヘルム (ザクセン＝アイゼナハ公)
ヨハン・ゲオルク1世とその妻でアルテンキルヒェンの女領主であるヨハネッテ・ツー・ザイン=ヴィトゲンシュタイン=ザイン(1632年 - 1701年)の間に第4子、三男として生まれた。1685年に両親の取り計らいにより、兄ヨハン・ゲオルク2世がアイゼナハ公爵領を相続するのに対し、ヨハン・ヴィルヘルムにも王侯としての生活が保障されるべく、母からザイン=アルテンキルヒェン伯爵領を受け継ぐことになった。
ヨハン・ゲオルク2世が1698年に子供のないまま死ぬと、公爵領を継承した。文化人気質で、ゲオルク・フィリップ・テレマンらの音楽家を宮廷の聖楽隊に参加させている。
アントン・グスタフ(1700年 - 1710年)
シャルロッテ・ヴィルヘルミーネ・ユリアーネ(1703年 - 1774年)
ヨハネッタ・ヴィルヘルミーネ・ユリアーネ(1704年 - 1705年)
カール・ヴィルヘルム(1706年)
カール・アウグスト(1707年 - 1711年)
1708年7月28日にザクセン=ヴァイセンフェルス公ヨハン・アドルフ1世の娘マグダレーネ・ジビッレ(1673年 - 1726年)と3度目の結婚をし、間に1男2女をもうけた。
ヨハンナ・マグダレーネ・ジビッレ(1710年 - 1711年)
クリスティアーネ・ヴィルヘルミーネ(1711年 - 1740年) - 1734年、ナッサウ=ウジンゲン侯カールと結婚
ヨハン・ヴィルヘルム(1713年)
1727年5月29日にライニンゲン=ダークスブルク=ファルケンブルク=ハイデスハイム伯ヨハン・カールの娘マリー・クリスティーネ・フェリーツィタス(1692年 - 1743年)と4度目の結婚をしたが、間に子供をもうけることなく死別した。