箱館丸
箱館形2隻は、箱館奉行所の下で航海練習船や輸送船、測量船などとして使用された。操縦法は、続豊治の息子である福士成豊が外国船員から筆談で学びとっていたのをはじめ、寄港する外国船船員から指導を受けていた。後には長崎海軍伝習所や築地軍艦操練所で教育を受けた者も乗船した。運用には箱館奉行配下の諸術調所教授役だった武田斐三郎が中心的役割を果たしていた。
「箱館丸」が安政4年7月(1857年9月頃)に竣工すると、津軽へ試験航海が行われた。安政4年11月24日(1858年1月8日)には江戸へ帰る奉行の堀利煕が試乗、船頭の陶山忠吉以下の操縦で翌月に無事に到着した。堀は、速力に優れ、暴風雨に遭っても船体が壊れず非常に堅牢な構造だったと高く評価している。性能面で君沢形を上回っていたともいう。2番船の「亀田丸」も、竣工翌月の安政6年11月(1859年12月頃)には竹内保徳の江戸帰還に使用された。その後、交代の新任奉行の派遣にも使われた。1858年4月頃に江戸を訪れていたオランダ商館長ヤン・ドンケル・クルティウス一行も「箱館丸」を目撃したようで、東京湾内に6隻の日本製二檣帆船が碇泊しているのを見かけたところ、これを箱館奉行も移動に使っているとの説明を受けている。
測量航海では日本各地を長期間かけて巡っている。前島密も「箱館丸」測量役として7ヶ月の日本一周航海を経験していた。
箱館形は交易用としても盛んに用いられた。測量や練習航海の際にも昆布などの蝦夷地の特産品を積んで各地で売り払い、収益を整備費用に充てていた。ある時に「亀田丸」は塩引き鮭3000両分を積んで出帆したところ、仙台で米に買い替えて江戸で7500両で売却、一航海で4500両もの利益を得たという。
黒船来航後、安政元年(1854年)の日米和親条約により、箱館湊は開港地とされ外国船の寄港が認められるようになった。幕府は、箱館奉行に外交・防衛問題の経験豊富な竹内保徳と堀利煕を充て、箱館の警備体制強化に乗り出した。竹内らは安政元年12月(1855年1月-2月)に奉行所への蒸気船配備を上申したところ、下田などで建造中の洋式帆船君沢形2隻の交付と箱館での同型船建造を認められた。しかし、君沢形の回航を待つのでは時間がかかり過ぎるので、箱館奉行所は洋式帆船を独自に設計することを決意した。
これより先の安政元年4月(1854年5月頃)、箱館奉行は船大工の続豊治を奉行所の異国船応接方従僕に任命しており、洋式船の調査を行わせていた。続は、碇泊中の外国船に近づいて洋式船の構造を無断調査しようとして捕縛されていた人物で、その熱意が認められたのである。続は奉行所の役人として外国船を訪れては調査し、安政2年(1855年)には辻松之丞の造船所で和洋折衷構造のボート2隻の試作に取り掛かった。安政3年6月(1856年7月)までに完成した試作船は性能良好と認められ、続は船大工頭取として本格的な洋式船建造を担当することになった。