ヤーセル・アラファート
インティファーダの主流となった非PLO系のハマースの上級幹部マフムード・アル=ザハール(英語版)はイスラエルとの交渉が停滞したことからアラファートが指示したと述べた。イスラエルのシャロン首相は「アラファトがいる限り和平交渉はできない」として、イスラエル政府からの信頼を失っていった。アメリカのジョージ・W・ブッシュ大統領も、アラファートがテロを放置していると考えるようになった。イスラエルはアラファートをテロ蔓延の原因とみなし、2001年よりヨルダン川西岸地区のラマッラー(ラマラ)にあるパレスチナの議長府(大統領府)は長らくイスラエル軍によって包囲され、アラファートは軟禁状態に置かれた。
2003年3月19日にアラファートはアメリカ・イスラエルの圧力のもと和平推進派のマフムード・アッバースを初代首相に任命し、アッバース内閣はテロ抑制と治安の回復を掲げ、テロ抑制に対するアメリカ・イスラエルや自治政府の民主化改革に対する国際社会の期待を担い、同年6月にブッシュ大統領、シャロン首相とヨルダンのアカバで会談し、アメリカの発表した平和のためのロードマップ(英語版)を実行することで合意した。しかし、ハマスらによるテロは一向にやまず、事態は一層混迷を深めた。アラファートは警察や憲兵など複数の治安部隊を相争わせながら配下に置いており、懸案の治安回復について改革を望む首相の代表する行政機関に自らが牛耳る安全保障部門を明渡すことを拒否した。この結果、同年9月6日にアッバース首相はアラファートに辞表を提出、アッバース内閣は半年に満たない短命に終わった。これ以降、和平交渉は再び停滞した。