サムライガン
捨吉と行動を共にする女性メンバー。実は五十九号丸と一緒で二重スパイ。常に人をだます人生に嫌気がさしており、死への願望が強かった。
五十九号丸に不要人材の廃棄処分として撃たれ、最後は思いを寄せていた捨吉に見取られて死亡。
声 - 金尾哲夫
幕府と深く関係している謎の男。評議会構成員ヴィクター・ライノとして初期養成型サムライガンに施術を行った張本人。
市松の過去に関する重大な秘密を握っており、原作の最終回で全てが明かされることになる。
本名はヴィクトル・ライノ・フランケンシュタイン。さらには幕府評議会両者の背後に存在する「秩序機構」という謀略組織の一員であることが明かされる。
声 - てらそままさき
江戸城の深奥でバベッジ型と思わしき蒸気コンピュータ「大蒸気機関」の運用を統括する幕府の巨魁。一方の雄、西郷隆盛と異なり、その実像はかなり具体的に描かれている。ただし、史実において関係の深い坂本龍馬との接点は全くといってよいほど空白となっている。
父親である勝小吉が評議会構成員として牧兄弟を引き取っていたことを知っており、彼らがいなければ自分がサムライガンとなっていただろうと語っている。
終盤に評議会最高意思決定会議議長であること。さらには両者の背後に存在する「秩序機構」という謀略組織の一員であることが明かされる。
長州藩を代表する人物。幕府から命を狙われており、上海から日本への帰国に際して楓に護衛されている。