意識
野口は、脳内の情報の意味の流れ「そのもの」が意識であると言う。脳内の情報の意味とは、例えばリンゴを見た時目からの形状信号だけで出来上がるのではなく、記憶情報の柿・ミカン・柿の木・種・赤いとかの色彩・丸い・甘酸っぱい味・リンゴ園・青森・信州・アップルパイ・リンゴの値段・リンゴという言葉・藤村の初恋の詩、等々リンゴの周囲情報があって初めてリンゴの意味が脳神経活動の中に生まれてくる。この様に外界世界の情報の意味は要素単体からではなく要素相互の依存により創生される。つまりコンピュータ内の意味とは異なり与えられたものではない。脳内には依存関係による外界情報世界が出来上がる。(モザイクボール情報世界仮説)見た目は神経発火現象に過ぎない中に潜む意味を理解出来るのは、ただ次段に繋がる神経系である。意味は外界を把握し「私」の次の行動を決める。そして意味は、明るい・痛いではなく、明るく感じる・痛く感じるとする。つまり意味の主体がそこに隠れていると考える。この主体が「私」の原型となる。(組み込み主体情報仮説)この物的意味の流れは、単なる信号情報の流れで生命維持の目的だけに寄与しているのだろうか?そうではなくそこには「私」が存在し、リンゴを見て赤く感じ、あの時の甘酸っぱい味を思い出し、藤村の詩が思いだす。この一連の複雑で繊細な情報の意味の流れが「意識」となり、「私」だけが感じられる。これは「意味の流れそのもの」が自立した意識となるのではないか。すると「意識」は随伴現象ではなく、脳内の神経系情報の「意味の流れそのもの」が自立したものであると言える。。
意識には、気づいている、または知っている、といった意味がある(英:awareness)。たとえば今あなたがこの文章を室内で読んでいるとしたら、エアコンの稼動音、パソコンのファンのうなり、冷蔵庫が動く音、蛍光灯の音、窓に吹き付ける風の音、外を通過する車の音等々、何らかの音が常に鳴っていると思われる。しかしそうしたことは恐らく今言われてみて気づいただろうが、それまでは特に考えていなかったと思われる。このようなとき「たしかに色々な音がなっているね。でも今まで特に意識していなかった」などと言う。このような用法が「意識」という言葉にはある。他にも例を挙げると、あなたはこの文章を読んでいる間、何度も瞬きをしている(人間はおよそ数秒ごとに一回、目を閉じる動作を繰り返す)。これも言われてみばそうだと思うかもしれないが、しかし言われるまでは恐らくそうしたことは考えていなかったはずである。このようなときも「たしかに瞬きはしている。でも普段は特に意識していないね」などと言う。意識する、意識しない、という言葉でこのようなことが表現されている。この意味での意識は「○○を意識している」「△△について意識していなかった」などと、目的語を取って表現されるため transitive consciousness (トランジッティブ・コンシャスネス、他動詞的意識)と呼ばれることもある。
茂木は、基本的な立場としてはデイヴィッド・チャーマーズと同じ路線を歩んでおり、クオリアまでをも含んだ全ての現象を扱いうる「拡張された物理学」を志向している。茂木の著書『クオリア入門』も「心も自然法則の一部である」という表題から始められており、「意識のほんとうの科学を目指す」という自身の方向性をはっきりと明示している。また茂木は「脳内でのニューロンの時空間的な発火パターンに対応してクオリアが生起している」という独自の作業仮説をとり、そこからクオリアが持つ(であろう)何らかの数学的構造を見つけることが出来るのではないか、として研究を行っている。具体的には発火しているニューロンの時間的・空間的パターンをミンコフスキー空間内で幾何学的または位相幾何学・グラフ理論的に抽象化し、そこに群論的な数学的構造を見出そうとしている、ともされる。