遊☆戯☆王デュエルモンスターズ NIGHTMARE TROUBADOUR
」と連動させることで「ハネクリボー」が3枚手に入る。「ハネクリボー」はこの方法でしか入手できない。「遊☆戯☆王デュエルモンスターズGX Spirit Summoner」と連動しており、カードのトレードが可能。「遊☆戯☆王デュエルモンスターズ WORLD CHAMPIONSHIP 2007」(以下、WCS2007)と連動させることで、「衣装」「デュエルディスク」「デュエリスト」がWCS2007に追加されるが、本作には特典は存在しない。
2005年夏の全国5都市(東京、名古屋、大阪、福岡、札幌)で開催された「ジャンプゲームワールド」で、幻のカード「ワタポン」と「王宮の勅命」が配信された。「王宮の勅命」は本来ゲーム内で入手できるカードの予定であったが、設定ミスで入手できなくなっている。そのため、イベントが終わった現在ではカード入手率は99%が限度となっている。2005年12月17日、12月18日のジャンプフェスタ2006で「ワイトキング」が配信され、「王宮の勅命」が再度配信された。
Vジャンプ9月特大号(2005年7月21日発売)に、オリジナルジャケットが付録として付いていた。2006年6月29日に「コナミ ザ・ベスト版」が発売されたが、こちらでも「王宮の勅命」を入手することはできない。