営団07系電車
第01編成は、2008年(平成20年)9月11日より12月までの間、予備車として一時的に千代田線で営業運転を行っていた。短期間の走行のため、小田急線への乗り入れ改造は行われず、改造も最小限として減速度が有楽町線の常用3.5km/h/s・非常4.5km/h/sから千代田線の常用3.7km/h/s・非常4.7km/h/sへ変更された程度であった他、ラインカラーも東西線のままで使用された。
運用区間
千代田線 綾瀬駅 - 代々木上原駅間
東日本旅客鉄道(JR東日本)常磐緩行線 綾瀬駅 - 取手駅間
2008年(平成20年)6月14日に有楽町線新線を延伸して開業した副都心線では、自動列車運転装置(ATO)を使用したワンマン運転を行うとともに、小竹向原 - 渋谷間の各駅にホームドアを採用し、引き続き有楽町線と一体的に運行されることになった。副都心線開業前から本系列とともに運用されている7000系は同線各駅のホームドアに対応するが、本系列は7000系や10000系とはドア位置が異なり、小竹向原駅のホームドアに対応出来ないことから副都心線渋谷方面への運用が不可能となった。
そのため、2006年(平成18年)9月1日から有楽町線に10000系を投入して2次車の4本を順次東西線へ転籍させ、残存していた5000系を置き換えた。これらの転籍改造工事は座席モケット以外は深川工場の車体更新修繕場で実施された。
転用に際して車体色は05N系と同様のカラーとし、スカイブルー(水色)を主体に、細い白と紺色の3色のラインを配している。先頭車連結器のブレーキ接続用の空気配管、空気栓受が不要となるために撤去するとともに、排障器の切り欠き部をやや大きくしている。前面にはフロントガラスの車掌台側に編成番号(71 - 76)が貼り付けされている。
一方、1次車2本は引き続き有楽町線での運用が行われたが、2007年(平成19年)9月、小竹向原駅の全ホームにホームドアを設置することから、同年10月より運用から外され、転用先が決まらず和光検車区にて休車扱いとされていた。その後、2009年(平成21年)3月に東西線において快速列車を通勤快速へ格下げする輸送改善を目的としたダイヤ改正を行うことが決定され、その際の運用補填用として1次車2本も同線に転用された。後に東西線でもホームドア設置が開始されたが、こちらは15000系、05系ワイドドア車に対応した大開口可動式ホーム柵を供用することで解決している。
なお、千代田線においてJR列車無線のデジタル化と改正技術基準の対応工事施工のため、同線で一時的に予備車を確保するために第01編成を2008年(平成20年)9月 - 12月の間千代田線に転籍させ、その後東西線へと転籍させた。これにより第01編成は、東京メトロでは珍しい3路線での営業運転実績を持つこととなった。
2008年6月14日に公式ホームページの有楽町線車両図鑑から07系の記載が削除され、一時的に本系列は営業列車で唯一掲載されていなかったが、2009年7月から東西線の車両図鑑に掲載されている。