小倉藩
交渉は困難を伴い、講和締結は翌慶応3年(1867年)1月20日となった。この講和条件の一つとして、企救郡については、長州征討の根拠の一つであった長州藩主父子の罪が解かれるまでの間、長州藩が「預り」として引き続き占領下に置くこととされたため、小倉藩は企救郡を回復することができなかった。その上、実際には長州藩主父子が朝敵の罪を赦免され、再び官位を得た後も企救郡は小倉藩に返還されず長州藩支配下に置かれ続け、明治2年(1869年)に至って日田県の管轄に移されることとなる。
慶応3年3月に藩庁を正式に香春へ移転。この香春に藩庁を置いている時期は、後年香春藩(かわらはん)と呼ばれるようになる。さらに明治2年12月24日には京都郡豊津(現みやこ町)に藩庁を移して豊津藩(とよつはん)となった。その際に藩庁として建設された豊津陣屋の遺構として藩校表門が現存している。