Wntシグナル経路
初期胚発生において、体軸の形成は個体の全体的なボディープランの決定の重要な段階である。体軸には前後軸、背腹軸、左右軸があり、Wntシグナルは前後軸と背腹軸の形成への関与が示唆されている。前後軸形成におけるWntシグナルの活性は、哺乳類、魚類やカエルで観察される。哺乳類では、原始線条(原条)やその他の周囲の組織は原腸形成の後期にWnt、BMP、FGF、Nodal(英語版)、レチノイン酸など形態形成を誘導する分子を産生して後部を決定する。これらの分子は濃度勾配を形成し、最も高濃度の領域が後部、最も低濃度の領域が前部として決定される。魚類やカエルでは、古典的Wntシグナルによって産生されるβ-カテニンがorganizing centerの形成を引き起こし、BMPとともに後部の形成を引き起こす。背腹軸の形成へのWntの関与はオーガナイザー(英語版)の形成時に観察され、背側を決定に関与する。古典的Wnt経路によるβ-カテニンの産生はtwinやsiamoisといった遺伝子の活性を介してオーガナイザーの形成を誘導する。同様に、鳥類の原腸形成時には、コラーの鎌(英語版)の細胞がさまざまな中胚葉マーカー遺伝子を発現し、原条形成時のさまざまな細胞の移動を可能にする。
Wntシグナルは、まだ大規模な解析が行われていない他の多数のシグナル伝達経路も調節している。その一例として、WntとGSK3の相互作用が挙げられる。細胞成長時には、Wntはβ-カテニン非依存的にGSK3を阻害してmTORを活性化する。筋形成(英語版)時には、WntはPKAとCREBを利用してMyoD(英語版)とMyf5(英語版)の遺伝子を活性化する。WntはRykやSrcと共に作用して軸索誘導時の神経の反発を調節する。Wntは原腸形成時にCK1を介してRap1(英語版)を調節し、細胞骨格を調節する。原腸形成のさらなる調節はWntがROR2を利用した際にも行われ、CDC42とJNK経路とともに、PAPC(英語版)の発現の調節が行われる。DshはaPKC、Par3、Par6、LGIと相互作用して細胞極性と微小管骨格の発生を制御する。こうした経路の構成要素はPCP経路やWnt/カルシウム経路の構成要素と重複しているが、異なる応答を生み出すため異なる経路であると考えられている。