小谷部全一郎
すでに1899年(明治32年)年3月に北海道旧土人保護法が制定されていたが、11月に小谷部は北海道へ渡って胆振・日高方面のアイヌ集落を実態調査、その惨状を近衛篤麿ら政治家・教育関係者らに訴えた。翌1900年(明治33年)5月、「アイヌを救育し、工芸、技術、農事の智識を与え自営自活の道を教ゆる」(会則第一条)ことを目的として、北海道旧土人救育会(会頭は二条基弘)が東京で発足した。
アメリカ先住民教育をモデルとした中等教育施設の創設に向け、小谷部は救育会幹事の一人として北海道支部の設立、現地の用地調査・選定等の実務に従事。1901年(明治34年)8月には小谷部に共鳴した白井柳治郎とともに一家で北海道虻田郡虻田村へ移住し、アイヌの初等教育機関として翌1902年(明治35年)5月に開校した虻田第二尋常小学校の設置に尽力。1904年(明治37年)2月、北海道旧土人救育会虻田学園(全寮制の私立実業補習学校)の創立にこぎつけ、運営責任者兼教師を務めた。
東京に移った小谷部は、一度は拒絶された神道界に対し、国家的保護のもと「古風古習に拘泥して進取改良の士気」を欠くとしてその改革を試みる。家計事情も顧みず、独自の周旋と内務官僚の同志の働きかけにより、1912年(大正元年)内務大臣の推薦で国学院大学及びその母体である皇典講究所に講師として着任(大学学監杉浦重剛とも高島嘉右衛門を介して知己を得ていた)。数年後、神道興隆のための新組織設立を試みるも、神道界から再び拒否され、辞任した。
小谷部にとって年来の歴史的題材である「義経公入蒙」の実地調査の希望もあり、シベリア出兵時に陸軍省文官試験に合格、奏任待遇の通訳官として採用され、1919年(大正8年)に東シベリア南部チタの師団司令部付を命ぜられ赴任(のちオロワンナヤ守備隊司令部付)。許可を得ていわゆる満蒙・沿海州地域の古跡・口碑伝説を実地調査し、帰国後は高等官待遇で陸軍大学校教授補任を求められたが固辞、独自の歴史研究に専念する著述生活に入った。なお、1920年(大正9年)11月1日には他の通訳官とともに叙勲され、勲六等単光旭日章(及び賜金560円)を受章している。