カラハン朝
カラハン朝初期の時代、都市の事情に通じていなかった君主たちは征服した都市にそれまで存在していた行政組織に代えてマートゥリーディー派のウラマーに都市の統治を委任していた。各都市にはカーディー(イスラーム法の判事)が任命され、王族の利益の確保を進める一部のカーディーと都市民の権利の保護を図るウラマーの対立を経て、ウラマーは都市民の代表者としての地位を確立する。カラハン朝支配下の中央アジアには、多くのファトワーを発したムフティーのナジュムッディーン・ナサフィー、マートゥリーディー派の思想を体系化したアブー・アル=ムイーンらの学者も現れた。カラハン朝が衰退しカラ・キタイが台頭した後もウラマーはオアシス都市の代理統治者としてなおも権威と権力を保ち続け、西カラハン朝統治下のブハラの名家であるブルハーン家はサマルカンドの宮廷とは別にカラ・キタイに貢納を行い、サマルカンドの宮廷から独立した統治を行っていた。
西カラハン朝の首都のサマルカンドには宰相府が置かれ、行政に携わる書記(ウダバー)が高い社会的地位を有していた。カラハン朝の宮廷職に文官・武官の明確な区別は設けられておらず、騎兵隊長、軍司令官(スバシ)、侍従(ハージブ)、秘書官の順に昇進していった。宮廷職はテュルク諸部族出身の貴族が担い、ハンの一族は彼らの補佐を受けていた。サーマーン朝時代に没落したディフカーン(中央アジアの土豪)は短期間勢力を回復したが再び勢力を失い、12世紀から13世紀にかけての政治的事件の記録に現れなくなった。
アリーの跡を継いだアフマド1世はブハラに援軍を要請し、ブハラの宗教指導者ムハイディンら4人のイマームに率いられた40,000の志願兵によって于闐軍からカシュガルを奪回した。カラハン朝は1006年までにホータン、11世紀半ばにクチャを征服し、仏教徒が多数を占める地域のテュルク化・イスラーム化が促進される。于闐が滅亡した後もホータンでは長らく仏教徒の反乱が続いたが、最終的に仏教徒の抵抗は失敗し、イスラム教への改宗を拒否する人間の大部分は他の国に亡命した。
于闐を滅ぼした後、アフマド1世は天山ウイグル王国に改宗のための聖戦を数度にわたって実施する。1017年にカラハン軍はベラサグンから天山ウイグル王国に攻め込むが反撃に遭い、天山ウイグル王国の軍隊はベラサグン近郊に接近した。病床についていたアフマド1世は陣頭で指揮を執って天山ウイグル王国を破り、トルファンに進軍するが、帰国後に病没した。アフマド1世の死後にカラハン朝内部の抗争は激化し、ホータンを支配するユースフ・カディル・ハンがカシュガルのハン位を継いだ時代には中央アジアの支配権を巡ってガズナ朝と争った。