金丸事件
一方、東京国税局は、1991年に金丸の妻が死亡した際に受け取った遺産に着目、日本債券信用銀行(現:あおぞら銀行)の割引金融債「ワリシン」の一部が、確定申告されていないという事実を突き止めた(日債銀では、金丸を“蟷螂紳士”のコードネームで呼び、国税庁の税務調査に協力していた)。1993年3月6日、東京地方検察庁特別捜査部は金丸信と第一秘書Iを任意に呼び出して聴取を行い、同日に脱税容疑で逮捕した。後に、自宅へ家宅捜索を行ったところ、数十億の不正蓄財が発覚する。捜索の中、時価1千万円相当の金の地金が発見された。“金丸が訪朝の際、金日成から受領した無刻印のもの”と風評され、日朝首脳会談が行われる約三か月前の2002年平成14年6月12日の第154回国会での外務委員会第19号では北朝鮮を巡る国際情勢に関する参考人として出頭した佐藤勝巳は金丸が国税庁の強制捜査を受けその様子が放映される一か月ぐらい前に金丸先生に非常に近い国会議員から「金丸先生から、実はこれは金日成さんからもらってきた金の延べ棒だ」と言われて一枚を見せられた体験を語り、あの金の延べ棒には刻印がないんですと続けて話した。後年には実際には刻印のあるフォーナイン(純度99.99%の金)であったとされる。これらは建設会社からの闇献金を金丸が個人的に蓄財したものが原資になっていると検察当局に判断された。
検察は金丸が1987年から1989年にかけて約18億4230万円の所得を隠し、10億3775万円を脱税したとされた(1987年と1989年は金丸単独の犯行、1988年は金丸と第一秘書Iとの共同の犯行とされた)。