長尾氏
兄弟の伯父(実の伯母の夫)にあたる上杉定実の調停で、晴景が隠居して景虎が長尾家を継承した。越後の統一に成功した景虎は、永禄4年(1561年)に山内上杉家の上杉憲政から上杉氏の家督を譲られるが、府中長尾氏(三条長尾氏)の名跡の後継者は立てなかったため府中長尾氏(三条長尾氏)は断絶した。
為景の婚姻政策により、謙信の姉は古志長尾家の出自で、姉は上田長尾家の政景の妻となった。上田長尾家は政景が永禄7年(1564年)に事故死するが、その子顕景は謙信の養子になって上杉景勝と名を改め、謙信死後の家督争いに勝利して上杉氏を継承した。景勝も上田長尾家の名跡の後継者は立てていないため、断絶した形になっている。一方、古志長尾家の景信は謙信が上杉の名跡を継いだとき、ともに上杉に改姓して上杉十郎景信と名乗り、長尾上杉一門の重鎮となったが、謙信死後の家督争いで景勝と敵対したため息子で当時の党首だった信虎とともに滅ぼされた(なお、景信が上杉に改姓した際に古志家の家督は謙信の側近の河田長親に譲られたが、彼は長尾姓に改姓することを辞退したという)。 こうして越後長尾家は三家とも消滅した。
景長の孫・長尾当長は、同族である長尾景虎の越山に参陣し、要地・館林城を与えられたが、上野長野氏が武田信玄に滅ぼされると後北条氏に降り、越相同盟の成立に由良成繁と共に大いに貢献した。
長尾当長の婿養子・長尾顕長は、沼尻の合戦の前に兄の由良国繁と共に北条方から離反するが、北条氏直に敗れ、小田原合戦で後北条氏と運命をともにした。
白井・総社長尾氏
山内上杉家の祖上杉憲顕に仕えて上野国と越後国の守護代を兼ねて長尾氏を中興させた長尾景忠の子孫。代々上野国に土着し、景忠の孫のとき白井(群馬県渋川市)を本拠地とする白井長尾家と総社(群馬県前橋市)を本拠地とする総社長尾家(惣社長尾家)とに分かれた。ただし、両長尾家とも白井城・蒼海城(総社城)を拠点にしていたのは戦国期のこととみられ、それがいつまでさかのぼるのかは不明である。
白井長尾家は、景仲とその子景信のとき、上野守護代、武蔵守護代、山内上杉家家宰職を兼ねて重きをなしたが、景信の死後、家宰職を総社長尾氏に奪われた景信の子長尾景春が山内上杉家に反乱を起こした(長尾景春の乱)。 この乱で景春は太田道灌に攻められ鉢形城を失い、続く長享の乱では白井城を失うが、永正の乱では越後の長尾為景、相模の北条早雲と連携し勢力を盛り返す。その後も白井長尾家は、上野国で勢力を保持し、山内上杉氏に対抗し続けた。
総社長尾家は、白井長尾家に代わって長尾忠景が家宰となったが、忠景の孫・顕方の代に家宰職を足利長尾氏に奪われてしまう(永正の乱)。
丸数字は歴代家宰職。
丸数字は歴代家宰職。
景広系の江戸時代以降は米沢藩#分領家(14戸)参照。
丸数字は越後守護代
古志・上田長尾家当主には異説あり
古代にあっては渡来系の東漢氏の後裔の氏族として長尾氏は起こった。「坂上系図」によれば、東漢氏(漢氏)の祖阿智使主(阿智王)の子・都加使主の長男・山木直からは民氏、檜原氏、平田氏、粟村氏、小谷氏、軽氏、夏身氏、韓口氏、新家氏、門氏、蓼原(たてはら)氏、高田氏、田井氏、狩氏、東文部氏、檜前氏、谷氏、文部谷氏、文部岡氏、路氏とともに長尾氏が出た。また、同系図によれば、阿智王の次男・志努直の三男・阿良直から郡氏、榎井、河原氏、忍坂、与努、波多氏らとともに長尾氏が出た。飛鳥時代の人物には長尾真墨がいる。