ヴィクトル・ユシチェンコ
しかし大統領就任後は政権内部に亀裂が生じ、ティモシェンコとも対立した。政権内部の亀裂が深刻化する中、2005年9月8日にユシチェンコはティモシェンコ首相以下全閣僚を解任する大統領令に署名した。ドニプロペトロウシク州知事代行のユーリー・エハヌロフを首相代行に任命し、組閣を要請した。2006年3月の議会選挙において、エハヌロフを1位候補とする「我らのウクライナ」が第3位の得票で惨敗するとその政治力も低下し、選挙後の多数派工作を巡る議会混乱で主導権を握ることなく、ヤヌコーヴィチ内閣の誕生を許すこととなった。
2007年9月の議会選挙後に「我らのウクライナ」と「ティモシェンコ・ブロック」が手を組み、議会の過半数を獲得。解任したティモシェンコを再び首相に任命した。しかし天然ガスの供給を受けるロシアとの関係を巡って再びティモシェンコと関係が悪化し、2008年9月16日に連立政権が解消された。
この政局の混迷を打開するため、10月8日にウクライナ議会を解散して12月7日に総選挙を実施するという大統領令を公布した。これに対し、ティモシェンコは総選挙後の議員就任から1年未満で大統領が議会を解散するのは憲法違反であるとして裁判所に提訴した。