愛媛FC
2001年 1月:全国社会人サッカー連盟の推薦によりJFL昇格が決定。 社会人チームを本体から切り離し、任意団体として「愛媛FC」が発足。 学校教員の仕事もある総監督の石橋を補佐するため、大西が現役を引退して監督に就任。また、1998年に愛媛FCで1シーズンプレーした友近が入団した。 JFL初年度は16チーム中12位の成績。
2003年:新たな運営法人として株式会社愛媛FCが設立。
2005年
Jリーグが愛媛FCのヒアリングを実施
サッカーJリーグ理事会、愛媛FCのJ2加盟を承認
大西が監督を退任し(後に愛媛FCユース監督に就任)、ジュビロ磐田元ユース監督の望月一仁が監督に就任。 6月28日:Jリーグ加盟の仮申請を提出。 9月11日:リーグ加盟の予備申請を提出。