ムシクイ科
系統樹の科間は Alström et al. (2006); Johansson et al. (2008)より、科内は主にJohansson et al. (2007)、補助的に Olsson et al. (2005); Olsson et al. (2005); Price (2010)より。Clade I は Johansson et al. (2008) による、clade 1–2, A–C は Olsson et al. による、数字は Price による仮の系統名(一部は Price の系統複数をまとめている)である。ムシクイ科内ではおよそ750万年以上の古さの系統を独立して記す(ただし確実な系統のみを記すために一部はずらしている)。種は著名なものか文中に現れるもののみ記す。
ムシクイ科は Alström et al. により新たに認識され命名された科であり、ウグイス科・エナガ科と近縁である。
強く支持される2つの単系統に分かれ、これらが分岐したのは1200万年前である。
一方、分類上は、メボソムシクイ属 Phylloscopus とモリムシクイ属 Seicercus の2属に分類されている(ただしモリムシクイはモリムシクイ属ではなくメボソムシクイ属である)。しかしこれらの2属はいずれも単系統ではない。モリムシクイ属は Clade 1 内の複数個所に分散した多系統で、側系統のメボソムシクイ属に内包される。