九州旅客鉄道
特急列車の設定のない一部の区間(長崎駅 - 佐世保駅間、唐津駅 - 福岡市地下鉄空港線博多駅間など)では、普通列車用の「2枚きっぷ・4枚きっぷ」を発売している。
若者向けの割引商品として、1996年に16歳から29歳までの人が入会可能な会員制割引サービス「ナイスゴーイングカード」を開始し、2011年まで新規入会受付を継続した。2012年からは16歳から24歳までの人が購入可能で2枚きっぷ・4枚きっぷより割引率の高い割引きっぷ「ガチきっぷ」を長期休暇期間に発売している。
全線フリーの企画乗車券については以前「九州グリーン豪遊券」(2003年まで)・「九州レディースパス」(2002年まで)の発売が終了してから数年間存在しなかったが、2007年に入り特急列車・九州新幹線が利用可能な「九州特急フリーきっぷ」が発売開始され、以後使用期間を限定し、商品名を変更して発売されている。同年にはJR九州の普通列車と九州内の私鉄路線に乗車できる「旅名人の九州満喫きっぷ」が発売された。
このように割引きっぷを設定する一方、急行列車の特急格上げ、山陽新幹線と在来線の乗継割引の廃止など、負担増となった例もある。九州新幹線には新幹線と在来線の乗継割引が導入されていない。
特急列車 きらめき ソニック にちりん・にちりんシーガイア ひゅうが きりしま リレーかもめ かささぎ みどり・みどり(リレーかもめ) ハウステンボス・ハウステンボス(リレーかもめ) かいおう ゆふ・ゆふいんの森 九州横断特急 あそぼーい! あそ(2020年 -) A列車で行こう 海幸山幸 指宿のたまて箱 かわせみ やませみ 36ぷらす3 ふたつ星4047
快速列車 なのはな シーサイドライナー 日南マリーン号
観光列車・クルーズトレイン SL人吉 或る列車(団体専用列車) おれんじ食堂(肥薩おれんじ鉄道) ななつ星 in 九州(団体専用列車)
1987年(昭和62年)4月1日:国鉄が分割民営化され、九州旅客鉄道発足。社長に石井幸孝が就任。
1988年(昭和63年) 2月1日:山野線廃止。 3月13日:ダイヤ改正 特急「有明」に「ハイパーサルーン」783系電車を投入(JRグループ初の新形式特急車両)。 普通・快速列車分煙化。福岡・北九州地区の電車は指定車両、それ以外の地区の列車は進行方向先頭車両を喫煙車とする。 4月1日:松浦線廃止(松浦鉄道に転換)。 5月12日:沖縄事務所開設。 8月28日:豊肥本線で蒸気機関車58654(8620形)牽引による「SLあそBOY」運転開始。 9月1日:上山田線廃止。
1989年(平成元年) 3月11日:特急「ゆふいんの森」運転開始。 4月28日:高千穂線廃止(高千穂鉄道に転換)。 4月29日:世界初の電車と気動車による動力協調運転開始(「有明11号」「オランダ村特急」。1992年まで続いた)。 10月1日:伊田線・糸田線・田川線廃止(3線区とも平成筑豊鉄道に転換)。及び湯前線廃止(くま川鉄道に転換)。 12月23日:宮田線廃止。
1990年(平成2年) 3月12日:博多と小倉に電話予約センターを開設。 5月2日:高速船「ビートル」が博多港 - 平戸 - 長崎オランダ村間で運航開始。 6月5日:一般旅行業取扱開始。 7月2日:集中豪雨により、豊肥本線宮地駅 - 緒方駅間が不通になる(1991年10月19日に全線復旧)。 9月1日:長崎・熊本・大分・鹿児島の4支店を支社に改組。
1991年(平成3年) 3月1日:電話予約サービスを九州全域に拡大。 3月25日:博多 - 釜山(韓国)間に高速船「ビートルII」運航開始。 6月1日:唐津鉄道事業部発足。