ニホントカゲ
在来個体群;日本(本州西部、四国、九州、大隅諸島)。模式標本の産地(基準産地・タイプ産地・模式産地)は長崎。 正確には若狭湾から琵琶湖を通り三重県内で中央構造線沿いに西走して和歌山県に抜けるライン以西。
外来個体群:八丈島(伊豆諸島)九州からの移入個体群が定着している。
八丈島には九州方面からの移入個体群が定着しており、在来種のオカダトカゲとの競合もしくは交雑が懸念されている。
かつては、本種の学名として下田(伊豆半島)を模式産地とするEumeces latiscutatusが用いられていた(Eumecesは旧トカゲ属)。2003年に発表されたアロザイムの分子系統推定から、本種の伊豆半島個体群とされていたのが伊豆諸島のみに分布するとされていたオカダトカゲだったことが判明したため、E. latiscutatusはオカダトカゲの学名となった。そのため、長崎を模式産地とするEumeces japonicusが、本種の学名として復活した。
2012年に東日本およびロシア沿海地方の個体群が、外部形態やミトコンドリアDNAのCOI遺伝子の分子系統推定から、新種ヒガシニホントカゲ Plestiodon finitimusとして分割された。