日本エアシステムの就航路線
(太字は国内幹線、斜字は国内準幹線)
札幌ー女満別
札幌ー釧路
札幌ー青森
札幌ー三沢
札幌ー秋田
札幌ー花巻
札幌ー山形
札幌ー松本
札幌ー出雲(夏季限定季節運航便)
札幌ー徳島(夏季限定季節運航便)
札幌ー広島
札幌ー福岡
仙台ー岡山
仙台ー高松
東京ー女満別
東京ー釧路
東京ー帯広
東京ー札幌
東京ー青森
東京ー三沢
東京ー小松
東京ー南紀白浜
東京ー大阪(伊丹・関西)
東京ー徳島
東京ー高松
東京ー高知
東京ー広島
東京ー出雲
東京ー北九州
東京ー福岡
東京ー大分
東京ー長崎
東京ー熊本
東京ー宮崎
東京ー鹿児島
東京ー奄美大島
東京ー那覇
大阪ー女満別
大阪ー帯広
大阪ー札幌
大阪ー旭川
大阪ー釧路
大阪ー帯広
大阪ー青森
大阪ー三沢
大阪ー秋田
大阪ー花巻
大阪ー山形
大阪ー仙台
大阪ー新潟
大阪ー松本
大阪ー松山
大阪ー出雲
大阪ー福岡
大阪ー長崎
大阪ー熊本
大阪ー宮崎
大阪ー鹿児島
大阪ー奄美大島
大阪ー那覇
名古屋ー釧路
名古屋ー札幌
名古屋ー青森
名古屋ー花巻
名古屋ー仙台
名古屋ー高知
名古屋ー長崎
名古屋ー熊本
福岡ー青森
福岡ー花巻
福岡ー仙台
福岡ー松本
福岡ー松山
福岡ー宮崎
福岡ー鹿児島
鹿児島ー奄美大島
鹿児島ー徳之島
那覇ー青森(季節運航便)
那覇ー秋田(季節運航便)
那覇ー花巻(季節運航便)
那覇ー出雲(季節運航便)
複合免許路線
東京ー旭川
注:東京→東京国際空港 大阪→大阪国際空港・関西国際空港