吉村虎太郎
本隊の中山忠光は、紀州新宮に出て海路で四国や九州へ向かい再起を図ることを提案するが、天の辻に留まった吉村は自らが負傷していながらもこれに従わず、本隊と別行動を取って天の辻付近で追討軍を迎え撃つこととした。 9月に入り諸藩の追討軍が迫ると、吉村らの別働隊は天の辻を根拠として周辺でゲリラ戦を展開し、数では勝るが戦意に乏しい追討軍相手に善戦した。 再び合流した本隊とともに奮戦し追討軍を撃退する局面もあったが、多勢の追討軍に抗しきれず各地で退却を余儀なくされた。また、統率力を失った主将・忠光の元から去る者も出始めて天誅組の士気は低下し、追討軍が迫ると十津川郷へ退却する。
天誅組は十津川に籠城し天険を頼りに決戦しようとするが、天誅組を逆賊とする詔が下ったことが伝わると十津川郷士も離反、主将・中山忠光は天誅組の解散を決定した。殿軍の後続隊を率いて遅れて本隊に合流した吉村はそこで初めて天誅組の解散を知らされたが、この時既に傷が悪化して歩行困難となっていた吉村もその決定に従うほかなかった。一同は河内方面に向けて脱出すべく山中を彷徨うが、筵で作った即席の駕籠に乗った吉村は一行に遅れをとってしまう。
9月24日、一行は鷲家口(奈良県東吉野村)付近に到達、血路を開くため、那須信吾らが決死隊となって紀州・彦根藩兵に攻撃を仕掛けた。遅れて進んでいた吉村は戦闘開始を知って本隊の後を追おうとするが、銃声に恐怖した人夫が吉村の駕籠を放置して逃亡してしまった。付き添っていた隊士が付近の村で人夫を雇って再び駕籠を進め、鷲家口を迂回し木津川村の堂本家に潜伏した。