厳島神主家
承久の乱の結果、承久3年(1221年)頃に中原親能の一族である藤原親実が新たな厳島神主となった。しかし藤原親実は幕府の要人でもあり、厳島に下向して神職を務めることはなく、他の御家人同様、代官派遣による支配であった。その後、厳島神社は安定した時代を迎えるが、鎌倉時代末期には中央情勢の変化もあり、徐々に社領に下向する一族が現れた。この頃より厳島神主家藤原氏は安芸国に土着し、永仁2年(1294年)から永仁6年(1298年)にかけて、厳島神主家藤原親宣は鎌倉幕府より社領として桑原新庄、志路原、平良庄、井原、京都、六波羅、鎌倉の屋敷地を安堵され、在地勢力として勢力を蓄えるのである。
建武の新政から南北朝時代の動乱では、最初鎌倉幕府軍として、千早城・赤坂城に籠もった楠木正成と戦う等の行動が見られる。時の当主の藤原親顕は騒乱に巻き込まれて南朝:建武3年、延元元年/北朝:建武3年(1336年)に討死した。親顕の不慮の死により藤原親直が神主職を継承した。南朝:建武3年、延元元年/北朝:建武3年(1336年)から南朝:元中4年/北朝:至徳4年、嘉慶元年(1387年)の50年もの長期に渡って厳島神主家の当主であった親直は、足利尊氏に接近し、その庇護を得た。そして南北朝の動乱が一定の安定した時代を迎えると、近隣の小早川氏と所領を巡って争いを起こし、周防国の太守・大内氏へと接近して、その庇護を得た。結果、大内氏に従属する形となり、応永4年(1397年)には大内満弘の要請により少弐氏への攻撃に参加し、九州で病没している。続いて当主となった藤原親胤も大内義弘に従って応永6年(1399年)の応永の乱にも加わり、足利幕府軍と干戈を交えた。義弘の討死に伴い幕府軍に降伏し、足利義満に赦されて帰国した。