長野工藤氏
晴具の没後まもなく、尾張の織田信長が伊勢に侵攻してくる。晴具の後を継いだ具教と、長野氏の当主である長野具藤は織田軍に抵抗したが、信長の攻勢の前に敗れ、北畠氏は信長の次男・茶筅丸を、長野氏は信長の弟・信包を養嗣子として迎えた上で家督を譲ることを余儀なくされ、北畠・長野両家は今度は織田氏によって傘下に置かれたのである。
一族の長野左京亮は織田方に積極的に接近し、1576年11月、信長の命令で北畠具教が暗殺に関わった。一説に具教を槍で殺害したのは長野左京亮であるという。前当主である長野具藤は田丸城で北畠一族もろとも殺された(三瀬の変)。左京亮は、豊臣秀吉と織田信雄との間で争いがおこると、当初は信雄方に付き後に秀吉方に寝返ったが、後に同じ長野工藤氏の一族である家所氏に殺された。
その後、当主である信包も後に織田姓に復したことで、国人領主としての長野氏は滅亡した。その後も長野氏の一族や家臣団は信包に仕え続けたため、旧長野氏一派による伊勢中部の支配体制自体は継続したが、1594年に信包が豊臣秀吉に改易されたため、それに伴い長野氏の一族や家臣団は離散した。 なお一族の分部光嘉は改易されることなく、その後も伊勢上野城主として秀吉に仕えた。分部氏はのちに水口藩主家となるが、養子を度々迎え江戸時代中頃には血縁的に断絶した。そして昭和期に入り家自体も断絶した。