南スーダンの歴史
アザンデ族はナイロートではなかったが、16世紀にスーダン南部に移って国をつくり、地域大国といえるほどの規模となった。アザンデ族は現代の南スーダンでも人数で3位であり、主にマリディ(英語版)、イッバ(Ibba)、ヤンビオ(英語版)、ンザラ(英語版)、エゾ(英語版)、タムボラ(英語版)、ナジェロ(Nagero)など現西エクアトリア州やバハル・アル・ガザール地方の熱帯雨林地帯に居住する。しかし、18世紀にアヴンガラ族(Avungara)が侵入するとアザンデ族は支配下に置かれ、19世紀末にイギリス人に征服されるまでその支配は揺るがなかった。
地理上の障礙により南部スーダンはイスラム教徒の侵攻を免れ、社会、政治制度、文化、宗教などの伝統を保った結果となった。このうちディンカ族はスッド湿原に留まったため外界の影響が排除され、大規模な兵隊がなかったにもかかわらず安全に過ごした。これに比べるとシルック族、アザンデ族、バリ族(英語版)は近隣諸民族との争いが絶えなかった。
1821年、ムハンマド・アリー朝エジプトの侵攻で北のセンナール・スルターン国が崩壊した。北部スーダンの支配を固めた後、エジプト軍は南へ進軍した。1827年、アリー・クルシド・パシャ(Ali Khurshid Pasha)率いる軍勢がディンカ族の領地を通過し、1830年にはナイル川とソバト川の合流点へ遠征した。遠征のうち最も成功したのがサリム・カブダン提督(Salim Qabudan)による1839年から1842年の遠征であり、彼は白ナイル川を下って現ジュバまでたどり着いた。
南スーダンの地域は独立以前の2度の内戦によって広範囲の破壊を被り、基本的施設が全く整っていないという状況が続いた。内戦による死者は250万以上に上り、さらに500万人以上が国外へ逃亡していわゆる難民になった。
エジプト軍は城塞の建築と軍隊の駐留を試みたが、疫病と脱走兵の問題で諦めた。このため、エジプトのヘディーヴ(英語版)(副王)は領有権を主張したが実態を伴わなかった。1851年、エジプト政府は諸外国の圧力でスーダン地域をヨーロッパ人商人と宣教師に開放することを余儀なくされた。
ヨーロッパ人はスーダン地域が象牙の大量供給元になれることを発見したが、現地のバリ族がヨーロッパ人の売り物に全く興味を示さなかった。そのため、ヨーロッパ人商人は象牙の武力奪取を試みたが、コストに見合わず、失敗に終わった。キリスト教宣教師もスーダンでの活動を開始、ローマ・カトリック教会は中央アフリカ代牧区(英語版)を設立したが、19世紀初期にはその影響力が少なかった。