ハイスクール・フリート
声 - 高橋李依
「時津風」の副長。あだ名は「きみちゃん」。常に周囲から笑いを取ることを考えている。
2016年9月24日には横須賀芸術劇場にて、アニメ出演声優やアーティストが登壇したイベントが行われた。Lynn(宗谷ましろ役)や黒瀬ゆうこ(納沙幸子役)、TrySailなどが参加している。
2016年5月14日より、「よこすか海軍カレー」の本作とのコラボレーション版が株式会社ヤチヨより発売されている。
近畿日本ツーリストは、2018年4月から9月までの間、横須賀市内の4か所の宿泊施設と協力し、オリジナルグッズや市内観光割引券などがセットになった宿泊プランをインターネット限定で販売した。
京急グループは、アニプレックス、NTT東日本、横須賀市と連携して、2020年1月より3月までスマートフォンの通信機能を利用したデジタルスタンプラリーを実施。また京浜急行バスでは同期間中に劇場版をイメージしたラッピングバス1台を横須賀駅や衣笠駅を走る路線で運行する。
声 - 利根健太朗
劇場版に登場する本作の悪役で、南太平洋を拠点に海賊行為を行っている海賊団のリーダー格。日本の海上防衛力の無力化を狙って海上要塞とプラント船を乗っ取り、さらにブルーマーメイドの戦力を削ぐためにスーを利用して横須賀港の閉塞作戦を行う。しかし真冬率いる突入部隊の活躍でプラント船を奪還され、最後は真冬に鼻フックをかけられてテアいわく「子供に見せられない」姿をさらされ、逮捕される。
それを踏まえ、シュペー救出作戦時において突入班は海水の入った水鉄砲を装備してシュペー艦内に突入、感染した乗員に海水を当てて気絶させ、鎮圧している。
事の起こりは、この実験体を乗せたまま、サルベージ不可能な水深1500mまで沈没した実験艦(潜水艦)が、西之島新島における海底火山活動によって海上に姿を現したことである。海洋実習でさるしま以下の横須賀女子海洋学校の教育艦隊が西之島新島近海を第一次集合場所として集結する情報をつかんだ研究機関は、関係者をさるしまに乗船させてRATtを秘密裏に回収し、実験艦は自沈させる計画を立てる。しかし関係者を含むさるしま乗員はウイルスに感染、同海域にいた武蔵をはじめとする他の艦艇にも感染が広がり、事件は大規模なものとなっていく。
上記の理由のため、機関部の故障で第一次集合場所への到着が遅れた晴風、そして実習後に別海域で合流予定だった明石・間宮およびその護衛の教育艦は感染を免れている。
本作の世界では、坂本龍馬が暗殺を免れたことで現実の歴史から分岐しており、日本や世界も史実とは異なる発展を遂げている。
龍馬の奮闘と西郷隆盛、中岡慎太郎をはじめとする海援隊士たちの活躍により、龍馬は近江屋事件における暗殺の危機を脱する。政治の世界にさほど興味がなかった龍馬は早々に日本の政治の表舞台から退場し、世界を相手にしての貿易事業を起こすことを決断する。その前段階として龍馬は海援隊士や姉の乙女、隊士の妻女たちを連れて世界を見聞するが、この時同行した乙女や隊士の妻女たちが中心となり、後にブルーマーメイドに繋がる「女子海援隊」が発足することになる。世界見聞を終えた龍馬は、五代才助や明治政府内での政策の違いから下野した西郷と共に日本初の海運会社「坂本商会」を設立。坂本商会は海運業を主軸として世界各国と貿易を展開して諸外国との関係を深めていき、日本最大の貿易会社となる。
一方、日本は日露戦争後の講和条約によって中国大陸進出の足掛かりを失ったばかりか、石油やメタンハイドレートの採掘に端を発する急激な地盤沈下で平野部が海に沈みつつあった。国土の縮小と大陸進出の芽を断たれたことで陸軍の規模は必然的に縮小されていく一方、代わりに海軍が増強されると同時に海上都市の整備が急激に進む。アメリカとイギリスが極東開発の拠点として日本との同盟を重視したことによってこの流れはさらに加速し、坂本商会を通じて資金や先端技術が導入され、日本は海洋立国として劇的な発展を遂げる。
このころ、ヨーロッパでは第一次世界大戦に相当する欧州動乱が勃発。日本が直接参戦することはなかったが、アメリカを含むヨーロッパの国々がことごとく戦火に巻き込まれて動乱は長期化。
声 - 優希知冴
宗谷家次女。ブルーマーメイド強制執行課保安即応艦隊所属で、二等保安監督官。
改インディペンデンス級沿海域戦闘艦「べんてん」の艦長を務める。体育会系の気質で髪はショートにし、マントを羽織っている。制服や帽子、マントなどは通常のブルーマーメイドの制服とは異なる黒色のものを着用している。「根性注入」と称し、相手の尻を揉むという行為を行う。身体能力が非常に高く、格闘戦に長けている。
不明艦の捜索活動をしていた折、トラック諸島で比叡発見の報を聞いて駆けつけ、ましろと再会。比叡の確保および収拾後、再びトラック諸島北方で不明艦の発見の報を聞き、同時期にアドミラルティ諸島で目撃された不明艦の調査を明乃とましろに依頼する。その後、3隻の不明艦を鎮圧し、それらに乗っていた生徒たちを救出する。「パーシアス作戦」では、武蔵以外の4隻の不明艦を救出する。