JR東海313系電車
行先表示器は前面・側面とも従来の幕式に代わり、LED式(フルカラー)に変更された。側面のものは一定の速度を超えると消灯する。また、前照灯は白熱灯(黄白)から、窓下のものはHIDランプ(青白)に、貫通扉上のものは超高輝度白色LEDに変更された。
2011年3月改正から同年9月までは211系0番台との併結運用が、2015年3月14日ダイヤ改正までは300番台との併結で中央線中津川駅までの運用が存在していた。
300番台2両編成(Y30編成)
300番台は、増結用として0番台および1100番台・5000番台、311系と併結して運用されるほか、本番台または3000番台・5300番台を2・3本併結した列車や、0番台・5000番台の代走運用にも用いられる。また、代走として、2両単独編成で、飯田線豊橋駅 - 本長篠間などでも運用される。
登場時から2006年ダイヤ改正までは特別快速として東海道線と飯田線の豊川駅・新城駅・本長篠駅までの運用が、2012年3月17日のダイヤ改正までは大垣駅 - 美濃赤坂駅間での運用が、2015年3月14日ダイヤ改正までは0番台との併結で中央本線中津川駅までの運用があった。なお、2015年3月14日ダイヤ改正で電化された武豊線では0番台代走時以外では運用されない。
3両編成以上の初期車では容量2 kl/minの空気圧縮機(CP)をクハ312形に搭載していたが、増備車ではシステムの冗長性を確保するため、クハ312形、サハ313形および3両編成のモハ313形に1 kl/minのものを分散搭載する(形式の項を参照)。また、純電気ブレーキを採用し、ほぼ回生ブレーキのみで停止させることが可能となった。ただし、発電ブレーキと併用する場合は、従来通り約5 km/hで電気ブレーキは失効となる。
そのほか、細かな変更点として以下のものが挙げられる。
列車無線アンテナ、前面ワイパーの位置変更。
運転席への電流計、非常通報装置の設置。
運転席右手の透明仕切りの追加。
車内案内表示器の英語表示の文字間隔の変更。
ドアチャイムの音色の若干の変更。
座席番号ステッカーをN700系新幹線に準じたものに変更。また3次車のみの特徴として「窓」「通路」の文字が大きくなっている。
非常ドアコックや消火器などのステッカーを蓄光タイプのものに変更。
4次車の第一陣として2010年6月18日にB401編成とB402編成、同年6月25日にB403編成とB404編成が日本車輌製造豊川製作所を出場した。なお、このグループはワンマン運転対応への準備工事が行なわれた仕様となっている。
身延線・御殿場線用の車両で、2021年4月1日現在、静岡車両区に2両編成2本(4両、V13 - V14編成)が配置されている。3100番台と称し、御殿場線・身延線で運用される。
上述の増備車共通事項と、製造当初からパンタグラフを2基搭載する以外は3000番台初期車とほぼ同一仕様である。