ハイギョ
硬骨魚類は肉鰭類と条鰭類の2系統に分かれており、四足類は肉鰭類から進化したとされる。肉鰭類の魚類は現在シーラカンスとハイギョのみである。かつての総鰭類(肉鰭類から肺魚類を除いた群)は分岐学に基づいて妥当性が見直され、さらに、現生種に対して分子遺伝学手法が導入された結果、シーラカンスよりもハイギョが四足類に近縁とする考えや、それに基づいた分類が用いられるようになった。
もともと肺は海以上に酸欠になるリスクがはるかに高い淡水の川で発達して生まれたもの。進化生物学でヒトを含む現在の多くの脊椎動物の祖先と取り上げられることが多いユーステノプテロンも肺を持っていた。また、現在ハイギョ以上に地球に生息している肺を持たずに鰾を持っている魚の鰾は肺が進化して生まれた。
ハイギョには該当しないが、ピラルクやガーなどの鰾は肺としての機能を失っておらず、肺呼吸で他の魚以上に持久力を維持できるのも一億年以上絶滅を免れることができた理由の一つでもある。
化石目を含めるとポロレピス目Porolepiformes(ポロレピス下綱Porolepimorpha)に近縁と考えられており、肺魚形類Dipnomorphaとしてまとめる説もある。
現生種をオーストリアハイギョ目Ceratodontiformes(オーストリアハイギョ科1種)とミナミアメリカハイギョ目Lepidosireniformes(ミナミアメリカハイギョ科1種とアフリカハイギョ科4種)の2目に分ける説もある。