陸上植物
現生では車軸藻類と姉妹群をなす。これらにさらに、いくつかの原始的な緑色藻類を含めた単系統が、ストレプト植物である。陸上植物に近縁なこれらの藻類は、かつては緑藻植物に含められていたが、現在は除かれることが多い。
陸上植物は蘚苔類(非維管束植物、かつてのコケ植物)と維管束植物(ヒカゲノカズラ類、大葉シダ植物、種子植物)を含む。しかし、蘚苔類はおそらく側系統で、苔類・蘚類・ツノゴケ類の3つの大きな系統からなる。これに維管束植物を加えた4系統の系統関係は不明な点が多い。
維管束植物は単系統であり、種子植物、ヒカゲノカズラ植物、大葉シダ植物の3群が含まれる。維管束植物のうち非種子植物はシダ植物と一括されることもある。トクサ類は、他のシダ類と形態が大きく異なることから従来独立門と扱われていたが、分子系統学からはシダ植物門内に含められる。
種子植物は、裸子植物と被子植物に分けられる。裸子植物の単系統性は、現在なお未確定である。被子植物は、伝統的に双子葉類と単子葉類とに分けられているが、分子系統学から、双子葉類は側系統群である(APG植物分類体系)。ただし、双子葉類のうち、30科程度を除いた残りの数百科は単系統の真正双子葉類である。
維管束植物 のうち 種子植物 でないものを シダ植物 ということがある。(この意味のシダ植物は側系統)

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