草津川
近年になると草津市が京阪神地区のベッドタウンとして発展した。そのため、市街地を南北に分断することになる。人口と資産の増大にともない被害も甚大なものとなっていった。この対策として現存河川の河底を掘り下げることよりも、新河川への切り替えが防災面コスト面とも有利であると判断され、2002年に草津川放水路による下流部の付け替えが行われた。金勝川と合流する草津市青地町から同市御倉町の7.2 kmを掘削し、その間の小規模な天井川を統合していく工事で、事業に必要な用地は約752 ヘクタールにのぼる。
既に確認されていた御倉遺跡・谷遺跡・中畑遺跡が河川用地となったほか、滋賀県教育委員会や草津市教育委員会が1981年(昭和56年)から行われた発掘調査によって北萱遺跡や襖遺跡の所在が新たに判明した。
草津川を平地化したことで浸水面積1280 ヘクタール、浸水戸数14900戸(それぞれ91%、92%)に減少し、旧草津川では堤防決壊のおそれがある洪水を防ぐことができた。また、新草津川通水後に行われた河川環境調査では生物の確認種数が旧草津川と比べ増加した。ゲンゴロウブナ、ツチフキ、スゴモロコといった種が確認されており、これは草津川放水路工事が完成したことで環境の多様性を備えたことに起因すると考えられる。新草津川の建設と並行して行われた草津川放水路浄化事業では、ヨシを用いた植生浄化施設や北川との合流部に土壌浄化施設を設けCOD・窒素・リンの削減に効果が見られた。