札沼線
全列車が普通列車である。運転系統としての「札沼線(学園都市線)」に路線の起点である桑園駅を始終着とする列車はなく、一駅先の函館本線札幌駅を起点として、桑園駅までは函館本線上下線の北側に並行して敷設された、札沼線系統専用の単線(通称:北線)を走行する。
2022年(令和4年)3月19日時点のダイヤでは、札幌駅 - 北海道医療大学駅間を運転する列車のほか途中のあいの里公園駅・当別駅で札幌駅へ折り返す列車が設定されている。日中時間帯は札幌駅基準で上下とも1時間に3本(20分間隔)が運転され、うちあいの里公園駅発着が1 - 2本、そのほかが当別駅または北海道医療大学駅発着となっている。札幌駅以遠への直通は早朝に上り当別始発千歳線新千歳空港行き(千歳線内は快速「エアポート」として運転)の1本のみ設定されている。札幌駅以遠との直通列車を含め、線内はほとんどの列車が各駅停車であるが、ごく一部の列車はロイズタウン駅のみ通過する。
線内の駅では車両の夜間滞泊は行われておらず、最終列車は札幌駅到着後に札幌運転所まで回送される。