辺野古弾薬庫
辺野古弾薬庫の両側に「辺野古断層」と「楚久断層」の断層2本の存在があることが指摘されている。それはまた新基地建設予定地の真下にも伸びている可能性があるとして調査が進められている。またがけ崩れなどもおきており、海底のマヨネーズ上の琉球石灰岩の地層とともに地質的な脆弱性が危惧されている。
1971年10月27日、日本の米国大使館から国務省へのテレグラムの記録。米国立公文書記録管理局(NARA)によると、日本国参議院予算委員会で、沖縄の辺野古にある核兵器ポセイドン (潜水艦弾道ミサイル) が、辺野古弾薬庫の1060ビルに存在するという話が取りざたされたと記されていた。
2009年に公開された「1969年11月21日のリチャード・ニクソン米合衆国大統領と佐藤栄作日本国総理大臣との共同声明についての合意議事録」について、翌年「いわゆる密約問題に関する有識者委員会報告書」が検証した。その中に辺野古(弾薬庫)が核兵器貯蔵施設であることが明記されている。しかしながら、日本を含む極東諸国の防衛のため米国が負っている国際的義務を効果的に遂行するために、米国政府は、極めて重大な緊急事態が生じた際、日本政府との事前協議(A)を経て、核兵器の沖縄への再持ち込みと、沖縄を通過させる権利を必要とするであろう。米国政府は、その場合に好意的な回答を期待する (B)。米国政府は、沖縄に現存する核兵器貯蔵地である、嘉手納、那覇、辺野古、並びにナイキ・ハーキュリーズ基地を、何時でも使用できる状態に維持しておき、極めて重大な緊急事態が生じた時には活用できるよう求める。 — リチャード・ニクソン米合衆国大統領こちらも参照 → 沖縄の核