性同一性
性同一性がどのように決定されるかについて単一の説明はできない。遺伝的影響や出生前ホルモンレベルなどの生物学的要因、思春期や成人期以降の経験など、各種の要因が複合的に寄与していると科学的に考えられている。米国内分泌学会(英語版)では、性同一性には生物学的な基盤を示す科学的根拠があり、施策にはこれを考慮すべきであるという見解をだしている。
性同一性の原因に関する研究は各所で行われているが、これらの理論は、トランスジェンダーの人々をシスジェンダーにするための「治療」へと接続する誤った方向の要求を増大させるだけではないかという指摘もある。なお、性同一性を強制的に変えようとする行為は「転向療法(コンバージョン・セラピー)」と呼ばれており、米国小児科学会やアメリカ医師会などは転向療法の危険性を指摘し、反対の立場を示している。転向療法はジェンダー・アファーミング・ケア(英語版)や性別移行(英語版)とは全く異なるものである。
「gender identity」という用語はロバート・ストーラー(英語版)という精神医学の研究者によって1964年に造語され、導入された。そして1960年代にジョン・マネーによって用語は普及し、ジョン・マネーはジョンズ・ホプキンズ大学にジェンダーアイデンティティ・クリニックを設立した。性科学者のジョン・マネーはジョンズ・ホプキンズ大学の同僚であったジョーン・ハンプソンとジョン・ハンプソンと共に、1950年代からインターセックスの状態をもって生まれた人々における性別のアイデンティティの発達に関する研究を行っていた。身体が物理的に曖昧で、性器が明確には男性形でも女性形でもないインターセックスの人々が自分自身を男性や女性と考えるようになるのはなぜなのか解明することを目的とし、当時は心理社会的なプロセスの結果だと推測していた。ただし、この時期の研究は倫理的な問題も多く指摘され、とくにデイヴィッド・ライマーの件は悲劇として語られることもある。
その後、「gender identity」はトランスジェンダーの人々を説明する際に利用される概念となった。
2006年にはジョグジャカルタ原則が採択され、2011年には国際連合人権理事会で「人権と性的指向・性自認」という決議が採択もされた。以降、国連が中心となって「United Nations Free & Equal(英語版)」という啓発キャンペーンが行われるようになり、性同一性は人権として認識されている。
性同一性は日本では一般的に「心の性別」と表現されることがあるが、性同一性とは自分がどの性別集団に属しているのかについての帰属意識に関係するものであり、ゆえに「心の性別」という表現は不正確である。
性同一性は性的指向とは異なる概念である。性同一性がなんであれ、どんな性別の人に惹かれるか(異性愛か、同性愛か、両性愛かなど)は個人で違ってくる。例えば、ゲイの男性は男性に惹かれるからといって「女性になりたい」というわけではない。同性愛者だったが後に性同一性を自覚してトランスジェンダーとして生きる人もごくわずかには出現するが、そうした人が大勢いるという事実はない。
人が自分のジェンダーを服装や髪形など外面的にどう表現するかはジェンダー表現(性表現)と呼ばれるが、人々の中には自分の性同一性とジェンダー表現を合わせる者もいれば、あまり気にせずに自己表現する人もいる。なので、ある女性がボーイッシュな格好をしていても性同一性が男性ということには必ずしもならない。社会における男女二元論的な規範とは異なるかたちで自分を表現したりする人の総称としてジェンダー・ノンコンフォーミング(英語版)という言葉もある。