モティア包囲戦
ディオニュシオスは艦隊を出撃させたが、水深が十分でないため、南のカルタゴ艦隊に向かえたのは一部でしかなかった。このため、ヒミルコは数でもまた機動性においてもギリシア艦隊に対して優位を得た。
しかしながら、ディオニュシオスは出撃する船に多数の弓兵と投擲兵を乗せており、また陸上からは大型弩弓で支援した。乗船した弓兵や投擲兵がカルタゴ軍の三段櫂船と戦ったが、これによってカルタゴ艦隊が停泊中のギリシア艦隊に接近することを阻止できた。シケリア本島とルンガ島(現在のグランデ島)北部の間は軍船が通過できない浅瀬であったが、ディオニュシオスはそこに急遽木製の人力牽引用の足場を作らせ、80隻の三段櫂船を外洋に脱出させた。これら艦隊はルンガ島を回って南下を開始した。このためカルタゴ艦隊には南北から挟撃される危険が生じた。ヒミルコは数に勝る敵との二正面戦闘を避け、モティアを撤退してカルタゴに向かった。
モティアは現在のマルサーラ沖のサン・パンタレオ島にフェニキア人が建設した都市で、周辺は浅いラグーンである。周囲は城壁で囲まれており、20以上の監視塔があり、城壁はしばしば海岸の直ぐ側に建設されていた。城壁の厚さは6メートル、高さは8-9メートルあった。サン・パンタレオ島は小さな島であり、その人口を収容するために、ときには6階建ての住居も建築され、その高さは城壁を越えていた。モティアは常設の海軍は持っていなかったようで、カルタゴ軍の守備兵が駐屯していたと思われる。島の北部とシケリア本島とは長さ1,500メートル、幅10メートルの突堤でつながっており、島側には2つの監視塔で守られた城門があった。都市にはフェニキア人、ギリシア人双方が住んでいた。ディオニシュオス軍が接近すると、モティア市民は突堤を破壊し、篭城に備えた。
紀元前402年からは、大きくエピポライ台地を囲むように城壁を拡大し、紀元前399年に完成した城壁は全長27キロメートル、14の塔と6つの城門があった。数千人の労働者が多くの部署に分かれて工事を行ったが、ディオニュシオス自身も作業に参加し、最高の労働者には賞金を出して、工事を迅速に進めさせた。結果、ギリシア世界の中ではシュラクサイは最高の防御力を有する城塞都市となり、さらにディオニュシオスは自身の内城(オルティジャ島)を忠実な傭兵に守らせることにより安全を確保した。
軍事の効率化:ディオニュシオスは傭兵を継続的に雇用し、新しい軍船を建造することによって陸海軍兵力を拡大した。ギリシアの伝統では、市民兵は自弁で武器や防具を揃えるが、ディオニュシオスはイタリア半島、ギリシア本土およびアフリカから男達を募集し武装させた。140,000組以上の武器、兜、甲冑が作製された。装備を標準化し、また社会のあらゆる階層から兵士を募集したことで、ディオニュシオスは陸軍の規模を拡大できた(それまでは軍の中心は傭兵と上級市民のみであった)。また、大型弩弓と五段櫂船も開発したが、これら新兵器はしばらくの間戦場での優位をもたらした。ディオニュシオスは軍船200隻を新造し、既存の110隻を再艤装し、輸送船160隻を就役させた。ラクシウムには遮蔽物で隠された、三段櫂船60隻を収容できる秘密の港が作られた。
シュラクサイの領土拡大:ディオニュシオスは紀元前404年にシケル人の都市であるヘルベッススを攻撃することによって、平和条約を破った。