新宿高速バスターミナル
京王との共同運行路線については#京王電鉄バスグループを参照。
ツアーバスとして運行していた「さわやか信州号」が、新高速乗合バス制度の施行に伴い2013年より高速路線化、同時に新宿乗り入れを開始。2015年よりアルピコ交通東京営業所の分社化に伴い、上高地発着路線の運行はアルピコ交通東京へ移管。
新宿 - 上高地「さわやか信州号」 4月下旬 - 11月上旬までの季節運行。京王バス東も増発便を運行。
新宿・渋谷 - 裾野・三島・沼津(富士急シティバスと共同運行)
新宿・渋谷 - 清水・静岡「渋谷・新宿ライナー静岡号」(JR東海バスと共同運行)
新宿・渋谷 - 浜松「渋谷・新宿ライナー浜松号」/「渋谷・新宿イーライナー」(JR東海バス・遠州鉄道と共同運行)
新宿 - 東京スカイツリータウン - 千葉・鎌取・誉田・土気(千葉中央バスと共同運行)
富士急シティバス 新宿 - 沼津線
京王バス東 新宿 - 沼津線
新宿 - 沼津線 富士急便と京王の増発便
JR東海バス 渋谷・新宿ライナー静岡号
京王バス東 渋谷・新宿 - 大阪梅田線
阪急バス 渋谷・新宿 - 大阪梅田線
神姫バス プリンセスロード号