総武本線
この節では、過去に総武本線全線及び成田線・鹿島線・外房線・内房線へ直通した列車を記述する。
1994年(平成6年)10月28日:千葉駅 - 佐倉駅間で ATS-P 使用開始。
1997年(平成9年)3月22日:成東駅 - 銚子駅間の普通列車がすべて禁煙となる。
1999年(平成11年) 5月29日:御茶ノ水駅 - 千葉駅間(緩行線)で東京圏輸送管理システム (ATOS) が導入される。 3月31日:佐倉駅 - 成東駅間の日本貨物鉄道の第二種鉄道事業廃止。
2000年(平成12年)9月30日:東京駅 - 幕張駅間で ATOS が導入される。
2001年(平成13年)2月4日:佐倉駅 - 成東駅間で ATS-P 使用開始。
2004年(平成16年)2月29日:東京駅 - 錦糸町駅間が ATC から ATS-P に変更。
2005年(平成17年)12月10日:183系、189系を置き換える関係から特急にE257系500番台が投入され、運用を開始。
2006年(平成18年)10月21日:211系3000番台が運用開始。
2009年(平成21年) 3月14日:成東駅 - 銚子駅間が東京近郊区間に組み込まれ、同時にICカード「Suica」サービス開始。 10月1日:113系の老朽化などの事由により、千葉駅 - 成東駅 - 銚子駅間に4ドア車の209系2000番台・2100番台が運用開始 10月4日:成東駅 - 銚子駅間で ATS-P 使用開始。
2010年(平成22年)3月12日:この日を最後に荷物列車廃止。
2011年(平成23年)3月12日:新小岩操駅が新小岩信号場駅に改称。
2020年(令和2年)2月16日:千葉駅で内房線・外房線・総武本線・成田線ホームに ATOS を導入。
1974年(昭和49年)には銚子駅までの電化が完成し、東京からの直通電車特急「しおさい」の運行が開始された。その後、1980年(昭和55年)には横須賀線との直通運転(SM分離及びSF直結)が開始され、1981年(昭和56年)には千葉駅まで複々線区間が延長されて、当初の計画は完成した。これにより、国鉄による輸送は高速化され、国鉄は東京 - 船橋・千葉の都市間輸送で京成電鉄より優位に立った。また、1969年(昭和44年)には営団地下鉄(現在の東京地下鉄)東西線が西船橋駅 - 津田沼駅間に乗り入れ、特に通勤輸送で総武本線(中央・総武緩行線)の負担を大きく軽減していた。さらに、紆余曲折を経て1978年(昭和53年)に新東京国際空港(現在の成田国際空港)が開港すると、総武本線と成田線は京成電鉄を補完する鉄道アクセスルートとなった。なお、複々線化にあたり、成田国際空港周辺整備のための国の財政上の特別措置に関する法律(成田財特法)による補助金のかさ上げの適用を受けている。このような状況で1987年(昭和62年)の国鉄分割民営化を迎え、総武本線は施設保有と旅客輸送がJR東日本、貨物輸送がJR貨物へ承継された。ただし、銚子漁港からの鮮魚・醤油輸送がトラックに切り替えられて銚子駅 - 新生駅の貨物線が廃止されたように、総武本線での貨物輸送量は減少していた。
道路事情の悪い千葉駅以東・以南の沿線への夕刊新聞輸送のための荷物列車。列車は、非電化時代は蒸気機関車牽引の荷物客車や貨車であったが、気動車化後はキユニ11・キユニ19が使用され、房総西線(現・内房線)が部分電化および外房線が全線電化された後はクモハユ74形・クモユニ74形100番台を使用、その後に長岡運転所(現・長岡車両センター)から転属したクモユニ143を使用、気動車は千葉気動車区から、電車は幕張電車区(現・幕張車両センター)からそれぞれ津田沼駅方面に単独で出区、両国駅まで回送後新聞を積み込み、折り返して両国駅 - 千葉駅間は荷物列車扱いで千葉駅まで運行、到着後各方面行きの列車に併結されて分かれていく、特異な列車であった。
運用は、気動車は千葉気動車区からの出区時は2両編成で運行、房総各線が全線電化後は、幕張電車区からの出区時は4両編成で、千葉駅で1両ずつ各方面への千葉ローカル運用の気動車または113系の後部に併結して運転され、各駅に新聞を配布していき、それぞれの線区の終点駅(北総方面は銚子駅、房総半島方面は安房鴨川駅)と、終点駅から折り返し荷物車両を先頭にして千葉駅まで運行され、千葉駅到着後は回送列車となり、併結した気動車および電車とともに帰区する運用であった。