パプア諸語
ニンボラン語族 (en:Nimboran languages) (5) ※
ユアト語族 (en:Yuat languages) (5) (以前はラム・セピク語族に分類されていた)
マイラシ語族 (en:Mairasi languages) (4) ※
東トランスフライ語族 (en:Eastern Trans-Fly languages) (4) (1つはオーストラリア トレス海峡諸島) ※ Wipi語(英語版) メリヤム・ミル語(英語版)
北ブーゲンヴィル語族 (en:North Bougainville languages) (4)
中央ソロモン語族 (en:Central Solomon languages) (4) - それぞれ孤立言語とする場合もある
イェレ・西ニューブリテン語族 (en:Yele-West New Britain languages) (仮説的) イェリ・ダニエ語(イェレ語) (en:Yélî Dnye, Yele) (孤立) アネム語 (en:Anêm) (孤立) アタ語(ペレアタ語、ワシ語) (en:Ata, Pele-Ata, Wasi) (孤立)
セナギ語族 (en:Senagi languages) (2) (おそらくセピク語族と関係あり) ※
ピアウィ語族 (en:Piawi languages) (2) (おそらくラム・低地セピク語族に含まれる) ※
※以前はトランスニューギニア語族に分類されていた
そのほか、数十の孤立した言語がある。
Sulka語(英語版) - 東パプア語族(英語版)という仮説の語族に含める場合もある
共通基礎語彙がないため系統関係は立証できないが、文法には多少の共通点がある。
語順はSOV。SVOのオーストロネシア語族、VSOのオーストラリア諸語と異なる。
動詞は複雑に格変化する。
ジョーゼフ・グリーンバーグは、アンダマン諸語(あるいは、少なくとも大アンダマン語族)がパプア諸語または西パプア語族(英語版)と関係があると提唱した。スティーヴン・ワームは、大アンダマン語族、西パプア語族および Timor–Alor 語派(英語版)については語彙の類似性が“極めて著しく、多くの事例から(中略)事実上正式に同定されたということになる”と言明した。しかしながら、ワームは、このことは(大)アンダマン諸語とトランス・ニューギニア語族の関連性を証明することにならないが、古い時代に西の地域からニューギニアへ移住があったことによる基層言語の影響は証明していると考えていた。
グリーンバーグはタスマニア諸語との関係についても提言した。