ヘテロロボサ
Pharyngomonadidae と Tetramitia の2群に分かれる。これを Pharyngomonada と Tetramitia の2亜門とすることもある。
それらはさらに8科:
Pharyngomonada Pharyngomonadidae Cavalier-Smith and Nikolaev, 2008
Tetramitia Acrasidae Van Tieghem, 1880 Vahlkampfiidae Jollos, 1917 Stephanopogonidae Corliss, 1961 Gruberellidae Page and Blanton, 1985 Psalteriomonadidae Cavalier-Smith, 1993 Lyromonadidae Cavalier-Smith, 1993 Percolomonadidae Cavalier-Smith and Nikolaev, 2008
に分かれるが、Vahlkampfiidae は側系統で、Tetramitia 内の他の6科を内包するため、分割される必要がある。また、いずれの科にも含まれない属も多い。
Guttulinopsis と Rosculus を第9の科 Guttulinopsidae として加える説もあるが、これらをそもそもヘテロロボサとみなさない者も多い。