上伊集院駅
単式ホーム1面1線と島式ホーム1面1線、合計2面2線のホームを持つ地上駅。互いのホームは跨線橋で連絡している。かつては単式ホーム1面1線と島式ホーム1面2線の2面3線であったが、2018年(平成30年)9月からのバリアフリー化によるホーム嵩上げと新跨線橋設置工事に伴い島式ホームの旧2番のりばが廃止された。現2代目駅舎は1985年(昭和60年)3月に改築されたもの。
JR九州サービスサポートが駅業務を行う業務委託駅で、きっぷうりばが設置されている。早朝夜間は無人駅となる。
IC乗車カード「SUGOCA」の利用が可能で(相互利用可能ICカードはSUGOCAの項を参照)、簡易SUGOCA改札機が設置されている。SUGOCAは「無記名式」のみを券売機で販売しており、窓口では販売していない。また、定期券など「記名式」のSUGOCAは購入できない。
タッチパネル式のICカード対応自動券売機が設置されており、ICカードへのチャージやSUGOCAポイントのチャージなどが行える。ICカードチャージ機も設置されている。なお、トイレは改札内にある(男女別の水洗)。