恵比寿駅
12月1日:JR東日本の西口に自動改札機を設置。 12月21日:カートレインの発着駅が浜松町駅に変更される。
1996年(平成8年)3月16日:埼京線運転区間が当駅まで延長。ただし当駅でそのまま折り返すことが出来なかったため、4番線到着の列車は大崎駅構内(当時はホーム未設置)まで行き、そこで折り返すという形態だった。
1997年(平成9年)10月1日:駅ビル「アトレ恵比寿」が開業。
2001年(平成13年) 11月18日:JR東日本でICカード「Suica」の利用が可能となる。 12月1日:湘南新宿ラインの運行開始。
2002年(平成14年)12月1日:埼京線運転区間を大崎まで延長し、同時にりんかい線と相互直通運転開始。同時に当駅始発・終着の定期列車が消滅した。
2004年(平成16年)4月1日:帝都高速度交通営団(営団地下鉄)民営化に伴い、日比谷線の駅は東京地下鉄(東京メトロ)に継承される。
2005年(平成17年)6月6日:サッポロビール「ヱビスビール」のテレビCMで使用されている、映画『第三の男』のテーマ曲が発車メロディとなる。1・2番線と3・4番線のパートで一つのサビ(各番線で異なるタイプ)。
山手線 目黒駅 (JY 22) - 恵比寿駅 (JY 21) - 渋谷駅 (JY 20)
埼京線( 相鉄線直通含む) ■通勤快速・■快速・■各駅停車 大崎駅 (JA 08) - 恵比寿駅 (JA 09) - 渋谷駅 (JA 10)
湘南新宿ライン ■特別快速 通過 ■快速・■普通 大崎駅 (JS 17) - 恵比寿駅 (JS 18) - 渋谷駅 (JS 19)