由利高原鉄道YR-2000形気動車
釣りキチ三平号
由利本荘市でロケが行われた映画「釣りキチ三平」のPRのため2009年(平成21年)3月20日から2011年(平成23年)3月20日まで運行された。
宇宙戦艦ヤマト号
2011年(平成23年)5月1日から2014年(平成26年)3月19日まで「宇宙戦艦ヤマト」のラッピングを施して運行された。版権を持つ東北新社の植村伴次郎最高顧問が沿線の出身であることから、無料での使用許諾を得て実現した。
由利高原鉄道xゆりてつラッピング列車
2014年(平成26年)4月19日から2016年(平成28年)4月18日まで漫画「ゆりてつ 私立百合ヶ咲女子高鉄道部」とのコラボ企画として運行された。
池田修三作品ラッピング
2016年(平成28年)4月25日から、秋田県にかほ市象潟出身の木版画家池田修三の作品のラッピングが施されて運行されている。