敦賀地域鉄道部
EF81形電気機関車(3両) 0番台3両が所属している。 3両とも寝台特急「トワイライトエクスプレス」の牽引に使用されていた。「トワイライトエクスプレス」牽引用であった4両(2017年廃車の1両を含む)は、塗色を同列車の緑2号に黄色を配したものに改め、連結器を密着自動連結器に交換、緩衝器も交換し、乗り心地の向上を図っている。また、2015年(平成27年)4月30日付で京都鉄道博物館への展示保存として103号機は廃車扱いになっている。2017年(平成29年)3月31日付で「トワイライトエクスプレス」牽引用であった43号機と一般機の106号機・108号機は廃車された。 東日本旅客鉄道(JR東日本)管内で使用されるATS-Ps型を装備している車両もある。
かつては敦賀運転センター車両管理室を設置していたが、2021年4月に金沢総合車両所に移管して金沢総合車両所敦賀支所となっているため車両の配置はない。
2021年4月1日時点の所属車両は以下のとおりであった。