Orbi Yokohama
2018年4月のリニューアルで、実際の動物を観察したり直接触れ合うことができる「アニマルコンテンツ」が拡充された。所要時間はアニマルスタジオが1回最大30分、アニマルヴィレッジが約10分(ウォークスルー型)で他は15分に設定(いずれも各回定員制〈一部、時間指定券も導入〉、他のエリアよりも早く20時前には営業終了)されており、フリーパスが付属するパスポート入館の場合、追加料金なし入場可能となっているが、フリーパスを持っていない場合でも1回500円で入場できる。
アニマルガーデン
森を再現(イメージ)した「アニマルガーデン」を散策しながら、ミーアキャットやカピバラ、タランチュラ、モリフクロウなど約20種類の様々な動物(展示動物は変更となる場合あり)を間近で観察したり、一部の動物と直接触れ合うことができる。また、カーペットパイソンの首巻きもゾーン内で体験可能である。
エントランス(入口)近くの等身大図鑑「アニマルペディア」があった場所を改装し、2018年4月に新設された。
同会場では他に自然写真家・松本紀生の写真展(アラスカをテーマとした作品を展示)も併設開催していた。当館におけるコラボレーションとして、「シアター23.4」では第1弾プログラム『ICE WORLDS(氷の世界)』を期間限定上映、またカフェでも前述のとおりコラボレーション・メニューが販売されていた。
『キモい展』(2016年7月16日〜8月31日開催) - 世の中の気持ち悪い生き物(通称キモアニ)を集めて展示するイベントで、実際に生き物に触れることができる「ふれあいゾーン」も週2回、時間限定で開設。なお、これまでに『ぞくぞく!ふしぎ動物キモだめし』や『ごきぶり展』といったイベントの開催実績がある山口県の「周南市徳山動物園」が制作協力を行なっている。その後、2018年の秋(9月14日〜11月25日)には『キモい展リターンズ』として2年ぶりに復活開催している。
『ねこ休み展 in 横浜みなとみらい』 - 猫にまつわる写真や作品を手がける人気クリエイターらによる合同写真展・物販展で、2017年から2018年の年末年始(12月15日〜1月14日)に初開催(初の横浜開催)。さらに翌年以降も年末年始の恒例イベントとなっている。
『におい展』(2019年9月14日〜12月8日開催) - 「悶絶」から「美臭」まで、世の中の様々な“におい”を体感できるイベント。
セガは当館でノウハウを蓄積し、今後の世界での展開(フランチャイズ化)も視野に入れており、2016年1月29日には国内第2号店となる「Orbi Osaka」(オービィ大阪)が大阪府吹田市の複合施設「EXPOCITY」内に開業、さらに2017年5月7日には海外1号店となる「Orbi Dubai」(オービィドバイ)がアラブ首長国連邦ドバイの複合施設「City Centre Mirdif」内(2階)に開業したが、前者は2018年9月30日に、後者は2019年4月30日にそれぞれ閉館している。各施設内のコンテンツ(エキシビション)については先行展開していた「Orbi Yokohama」をベースとしており、共通のものも多かった(エキシビションの詳細は「#館内施設・サービス」も参照)。