珍無腸動物
1870年、Uljaninにより無腸目 Acoela Uljanin, 1870が設立された。1940年、Karlingにより皮中神経目 Nemertodermatida Karling, 1940が設立された。これらは1986年まで扁形動物門の渦虫綱の中に含められていたが、Smithらにより、扁形動物の伝統的な分類は否定され、無腸動物(無腸目+皮中神経目)、小鎖状類 Catenulida、そして有棒状体類 Rhabditophora(残りの渦虫綱+寄生性扁形動物)の3系統に分かれることが示唆された。そして1985年、Ehlersにより無腸動物門 Acoelomorpha Ehlers, 1985が設立された。1999年にRuiz-Trilloらにより報告された分子系統の結果、扁形動物には含まれず、初期に分岐した左右相称動物であることが示唆された。
2011年の報告では、脊椎動物や棘皮動物と同じ新口動物(後口動物)とされた。2016年のRouseらによる研究結果では、ゲノム解析によっても無腸動物と珍渦虫動物は類縁にあることが示されたが、その位置は左右相称動物の基部であり、上記と矛盾する。
系統的位置は定まっていないが、珍渦虫動物と無腸動物の類縁性は分子系統解析から強く支持され、その共通祖先は両者の共通した性質を持っていたと推測される。