乗り継ぎ料金制度
山陽新幹線と九州新幹線を乗り継ぐ場合(「さくら」「みずほ」で直通する場合を含む) → 博多駅まで(から)の特急料金を合算 山陽新幹線内と九州新幹線を直通または乗り継ぐ場合は単純合算から割り引く特例措置が存在する。九州新幹線#特急料金・運賃を参照のこと。
東北新幹線と北海道新幹線を乗り継ぐ場合(「はやぶさ」「はやて」で直通する場合を含む) → 新青森駅まで(から)の特急料金を合算
なお、東海道・山陽新幹線で「のぞみ」・「みずほ」の指定席と「ひかり」・「こだま」・「さくら」とを乗り継ぐ場合、ならびに東北新幹線の大宮駅 - 盛岡駅間を含む区間で「はやぶさ」と「はやて」・「やまびこ」などとを乗り継ぐ場合 の場合は、原則として全区間の新幹線指定席特急料金に「のぞみ」「みずほ」または「はやぶさ」の乗車区間に応じた加算料金を加えることになる(一部例外あり。詳細はのぞみ (列車)#「のぞみ」「みずほ」とそれ以外の列車を乗り継ぐ場合を参照)。
次の項以後に挙げる場合について、次の二つの条件を満たすとき、特急・急行列車を乗り継ぐ場合、この書体の列車の特急料金、急行料金、及び急行列車の指定席料金 が半額になる。ただし、グリーン個室、設備定員が複数の寝台個室、及び別にJRが指定した個室を利用する場合は適用しない。
対象となる列車について、先に乗るもの(これを「先乗列車」という)と次に乗るもの(「後乗列車」という)の両方の列車の特急券等を乗車時までに同時に購入する。
後乗列車の特急・急行券の有効期間開始日(座席や列車を指定された特急券または立席特急券、急行券・指定席券の場合は「乗車日」)が、先乗列車の特急・急行券の有効期間開始日の当日または翌日である。 ただし、先乗列車が新幹線である場合は、双方の列車の特急・急行券の有効期間開始日が同一でなければならない。
「リレーつばめ」については東海道・山陽新幹線と在来線の乗り継ぎ制度により乗継割引を適用し、九州新幹線の特急券は無割引で発券する。
例:新大阪駅 -(山陽新幹線)- 博多駅 -(特急「リレーつばめ」)- 新八代駅 -(九州新幹線)- 川内駅 新大阪駅 - 新八代駅間については山陽新幹線との乗継割引を適用し、「リレーつばめ」の特急料金を割引にする。新八代駅 - 川内駅間については九州新幹線の特急券を別途発券する。
名古屋鉄道(名鉄)の特急列車で2008年12月27日のダイヤ改正から、特急の運転系統の新設によって本線と各支線の乗り換えが特急主体になり、特急同士の接続が増えることから、それまで「乗継割引ミューチケット」として2乗車500円で発売されていたのを、新たに「乗継ミューチケット」として、下記「乗継条件」に該当する2列車の「特別車」を乗り継ぐ場合、2枚1組の特別車両券「ミューチケット」を1乗車と見なして同額の360円で発売している。これにより、以前は使用できなかった回数券の引き換えも可能になった(回数券の発売は2019年5月17日で終了)。ただしJRや近鉄の場合と同様に、乗車前に窓口で2列車を同時購入することが適用条件となる。車内精算やネット予約サービス(2019年5月18日からサービス開始)では購入できないので注意。
料金:360円
乗継条件(対象区間・列車と指定駅) 名古屋本線国府宮駅以北(名鉄一宮駅方面)、または津島線須ヶ口駅以西(木田駅方面)の列車と犬山線岩倉駅以北(江南駅方面)の列車を名鉄名古屋駅で乗り継ぐ場合。
札幌市営地下鉄と市電、もしくはバス(ジェイ・アール北海道バス、じょうてつバス、北海道中央バス、ばんけいバス及び夕鉄バス)に乗り継ぐ場合、運賃が割り引きになる(一部路線を除く)。ただし、市電とバスを乗り継ぐ場合は適用されない。