スーパーボンバーマン R
声 - サウンドエフェクト
Ver.2.0より追加。ビックバイパーボンバーをサポートする為にグラディウス星で開発されたボンバーマン型追加兵装。
自我は希薄で融通が利かないが、その分命令には忠実。
モチーフはコナミのゲームシリーズ「グラディウスシリーズ」の「オプション」。
特殊能力の「トレース」は接触したキャラクターの性能と特殊能力をコピーする事が出来る。
使用できるキャラクターの追加。
残り時間が1分になると画面に「HURRY」の文字が表示され、4Pに近い位置からプレッシャーブロックが降る(設定が「あり」のとき)が、過去作とは異なり外側の壁の部分から降り始め、実質フィールドに降り出すのは残り時間40秒のときになる。プレッシャーブロックに潰されるとミスとなる。なお、今作ではプレッシャーブロックに爆弾が潰されても爆発しない。また、プレッシャーブロックに爆弾を蹴り入れると跳ねるが、アップデートにより、「従来仕様のステージ」(「バトルステージ」を参照)を始めとした一部ステージでは手前で止まるようになった。
みそボンをありにすると、先にやられたキャラクターでもHURRYと表示されるまで一つだけ爆弾を投げ入れることができ(Ver.1.3より、誘爆するように二個目を投げ入れられるようになった)、相手をやっつけることで復活が可能。ボタンによる加速はできない。また、今作ではみそボンドッジシステムを無効にできない。
バトルステージは8つ用意されており、それぞれ仕掛け等が異なる。また、ショップでジェムを用いてステージを追加購入することも可能。通常のものとはグラフィックの雰囲気が異なるスペシャルステージ(デフォルトの8つのみ)も存在する。
ストーリーモードとは異なり、同じキャラクターを選択することが可能。
Ver.1.4より、一定の条件を満たして優勝者が決まるとジェムが支給されるようになった。
声 - 中村浩太郎
宇宙制圧を企む悪の帝王。有機生命体とロボット生命体の両方の特徴を兼ね備えた存在とされており、自分自身を改造することで無限に強くなることが出来る。また、ポイポイスターに捨てられていた凶悪ボンバー五人衆を甦らせた張本人でもある。
これまでの世界観のプロフェッサーバグラーを比較して、どのような存在であるかの設定が全く異なっている。この他、髭と片眼鏡が付いていること以外は基本キャラクターのプロフェッサーバグラーと共通点はなく、額の「B」と書かれた赤いマークが無くなっているほか、四肢が機械化されている。また、肌の色が違うものに変更されていたり、顔の幅を覆うように口が描かれているといった差異が見受けられる。