畠山政長
応仁元年(1467年)1月、畠山義就勢に破れた後、政長は摂津国太田(現・大阪府茨木市太田)に落ち延び、細川勝元の庇護を受けていた。同年6月、政長は幕府から赦免され、逆に義就が謀反人の扱いを受け、「凶徒」の烙印を押されることになる。勝元率いる東軍に属して宗全・義就ら西軍と戦った。政長本人はほとんど出陣しておらず、10月の相国寺の戦いで相国寺の西軍を急襲、文明2年(1470年)12月6日に南朝の末裔を称する人物を討ち取った程度で、河内・紀伊は赦免と同時に政長方が奪還、大乱中は大和国人の筒井順永・十市遠清らが西軍の攻撃を防いだ。一方の義就は、文明元年(1469年)に山城西部を制圧(西岡の戦い)、河内・摂津に進軍したが奪取出来なかった。
文明5年(1473年)に宗全・勝元が死去、12月19日に義政が息子の義尚に将軍職を譲って隠居した時、義尚の元服式のため1週間、2度目の管領を務めた。この時期管領に権力はほとんどなく、勝元の死去から政長の管領就任まで半年余り空席だった。