グループIIイントロン
グループIIイントロンのIEPは、オルガネラではドメインX、細菌では"GIIM"と呼ばれる保存されたドメインを共通して持つが、他のレトロエレメントはこうした配列を持たない。ドメインXは酵母のミトコンドリア内でのスプライシングに必要不可欠である。このドメインはイントロンRNAもしくはDNAの認識と結合を担っている可能性がある。