水戸線
水戸線は、1889年(明治22年)に水戸鉄道(初代)により小山駅 - 水戸駅間が開業した。水戸に到達した最初の鉄道である。水戸鉄道は1892年(明治25年)に日本鉄道に買収されてその支線となったが、1895年(明治28年)に土浦駅から友部駅まで海岸線(現在の常磐線)が延伸され、友部駅 - 水戸駅間は実質的にその一部となった。
日本鉄道は、1906年(明治39年)に鉄道国有法によって買収・国有化され、旧水戸鉄道区間も官設鉄道に編入された。1909年(明治42年)の線路名称制定時に、旧水戸鉄道区間のうち友部駅 - 水戸駅間が常磐線に編入され、小山駅 - 友部駅間は水戸鉄道の名を取り水戸線となった。以来、水戸線は区間の表示及び線名の変更などが一切行われていない。
小山駅に乗り入れる水戸線の線路は、東北本線の上野方面とは直接行き来できない配線となっている。かつて上野方面と水戸線を直通する貨物列車の運行に支障が出ていたため、1950年(昭和25年)に東北本線の間々田駅方面から小山駅を経由せずに水戸線方面に直通可能な短絡線(小山駅の構内扱い)が敷設された。この短絡線は貨物列車だけでなく、上野方面と水戸方面・真岡方面を水戸線経由で結んでいた急行「つくばね」などの旅客列車にも活用された。また短絡線の東方にはデッドセクションも設けられていたため、東急車輛で新製された交直流用車両の交直切替の試運転も行われていた。しかし1986年(昭和61年)11月のダイヤ改正後、この短絡線は実質的に使用停止状態となり、2006年(平成18年)には設備が撤去された。
1960年代まで設定されていた、常磐線日立駅から筑波線筑波駅まで直通する列車。