アグネスデジタル
2頭のうちクロフネは特に注目を集め、前年春以来、芝の中・長距離戦線ではテイエムオペラオーとメイショウドトウが6度にわたって1、2着を占めており、ファンの間にも倦怠感が漂いつつあるなかで、そうした状況を打破する新勢力として期待されていたのである。しかし、獲得賞金で上回るアグネスデジタルの出走によりクロフネは天皇賞から除外され、一部ファンからはアグネスデジタル陣営に対して「どうせ勝てないくせに、クロフネの邪魔をするな」という旨の非難の声も上がった。クロフネの管理調教師の松田国英はこの時の心境について「『まさか』が正直な気持ちだった」と振り返っていたが、この時点でクロフネの翌年の予定にダートGI競走・フェブラリーステークスが入っていたことから、これを機会に一度ダートを走らせようと天皇賞前日に行われるGIII・武蔵野ステークスに出走することになった。
当日、アグネスデジタルは4番人気に支持されたが、オッズは上位で一桁台のテイエムオペラオー、メイショウドトウ、ステイゴールドからは大きく離れた20倍であった。午前中の降雨により馬場状態は重馬場となり、前座の各競走では馬場の内側を通った馬が伸びあぐねる様子が続いていた。白井は四位に対して「馬場の良いところを走らせるように」、「4コーナーを回ったら、観客席に向かって走れ」という指示を与えた。スタートが切られると、逃げ馬のサイレントハンターが出遅れ、レースを引っ張る馬がいなくなったことで前半1000メートル通過は62秒2と、重馬場を考慮しても遅いペースとなった。