消滅した郡の一覧
2004年10月01日 島根県能義郡(広瀬町・伯太町が安来市と合併して安来市に)
2004年10月01日 岡山県川上郡(成羽町・川上町・備中町が高梁市、上房郡有漢町と合併して高梁市に)
2004年10月01日 徳島県麻植郡(鴨島町・川島町・山川町・美郷村が合併して吉野川市に)
2004年11月01日 福島県北会津郡(北会津村が会津若松市に編入)
2004年11月01日 茨城県多賀郡(十王町が日立市に編入)
2004年11月01日 富山県東礪波郡(庄川町が砺波市と合併して砺波市に、城端町・平村・上平村・利賀村・井波町・井口村・福野町が西礪波郡福光町と合併して南砺市に)
2004年11月01日 三重県阿山郡(伊賀町・島ヶ原村・阿山町・大山田村が上野市、名賀郡青山町と合併して伊賀市に)
2004年11月01日 三重県名賀郡(青山町が上野市、阿山郡伊賀町・阿山町・大山田村・島ヶ原村と合併して伊賀市に)
2004年11月01日 兵庫県氷上郡(柏原町・氷上町・青垣町・春日町・山南町・市島町が合併して丹波市に)
2004年11月01日 鳥取県気高郡(気高町・鹿野町・青谷町が鳥取市に編入)
2004年11月01日 島根県美濃郡(美都町・匹見町が益田市に編入)
2004年11月01日 島根県大原郡(大東町・加茂町・木次町が飯石郡三刀屋町・掛合町・吉田村と合併して雲南市に)
2004年11月01日 岡山県邑久郡(牛窓町・邑久町・長船町が合併して瀬戸内市に)
2004年11月01日 愛媛県周桑郡(小松町・丹原町が西条市・東予市と合併して西条市に)
2006年01月01日 岩手県稗貫郡(大迫町・石鳥谷町が花巻市、和賀郡東和町と合併して花巻市に)
2006年01月01日 新潟県中蒲原郡(村松町が五泉市と合併して五泉市に)
2006年01月01日 三重県安芸郡(河芸町・芸濃町・安濃町・美里村が津市・久居市、一志郡香良洲町・一志町・白山町・美杉村と合併して津市に)
2006年01月01日 三重県一志郡(一志町・香良洲町・白山町・美杉村が津市・久居市、安芸郡河芸町・芸濃町・美里村・安濃町と合併して津市に)
2006年01月01日 滋賀県神崎郡(能登川町が東近江市に編入)
2006年01月01日 京都府天田郡(三和町・夜久野町が福知山市に編入)
2006年01月01日 京都府加佐郡(大江町が福知山市に編入)
2006年01月01日 京都府北桑田郡(美山町が船井郡園部町・八木町・日吉町と合併して南丹市に)
2006年01月01日 香川県三豊郡(高瀬町・山本町・三野町・豊中町・詫間町・仁尾町・財田町が合併して三豊市に)
2006年01月23日 岐阜県土岐郡(笠原町が多治見市に編入)
2006年02月01日 福井県足羽郡(美山町が福井市に編入)
2006年02月11日 兵庫県津名郡(五色町が洲本市と合併して洲本市に)
2006年03月01日 広島県深安郡(神辺町が福山市に編入)
2006年03月01日 高知県香美郡(土佐山田町・香北町・物部村が合併して香美市に、赤岡町・香我美町・野市町・夜須町・吉川村が合併して香南市に)
2006年03月03日 福井県遠敷郡(名田庄村が大飯郡大飯町と合併して大飯郡おおい町に)