ゼルダの伝説 神々のトライフォース2
ハイラル、およびロウラルの各地に小型のダンジョンがあり、宝箱を開けることでルピーが入手できる。宝箱に到達するためには、アイテムやテクニックを駆使する必要がある。
カカリコ村にある。50ルピーを支払って、2つの宝箱のうちどちらかを開ける。一方は1ルピー、もう一方は100ルピー。
忘れ物の剣 ハイラルの兵士長が鍛冶屋に置き忘れた剣。誰にでも扱えるよう設計されており、威力は低め。 マスターソード 迷いの森奥深くに眠っていた退魔の剣。ハイラル城を封じている魔力を打ち破ることができる。また、ハートが全快の時に振ると剣ビームが出せる。 マスターソードLV2 マスターソードを強くできる特殊鉱石『マスターストーン』をある人物に渡すことで入手できる。刀身が赤くなり、威力が向上する。 マスターソードLV3 マスターソードLV2を所持した状態で、ある人物に『マスターストーン』を渡すことで入手できる。刀身が黄金色に輝き、剣ビームの威力も上昇する。
本作の発売日には、表面にトライフォースが描かれたニンテンドー3DS LL本体と本作のダウンロード版のセット『ゼルダの伝説 神々のトライフォース2 パック』が同時発売された。
テレビCMでは『神々のトライフォース』の時と同じくスチャダラパーの曲が使用された。
『ゼルダ無双』では、本作のユガとラヴィオがプレイヤーキャラクターとして登場している。また、ニンテンドー3DS版『ゼルダ無双 ハイラルオールスターズ』のモードの一つ「アドベンチャーモード」では、本作をモチーフにした「ロウラルマップ」が登場する。
ハイラルのダンジョンでの大きな宝箱は大きな扉の鍵が入ったもののみであったが、ロウラルのダンジョンからコレクトアイテム(服やマスターソード強化素材など)が入った大きな宝箱が追加されている。