石垣 (海防艦)
11月25日、千島防備部隊は大湊警備府隷下に新編された千島方面特別根拠地隊指揮下となる。また、千島方面特別根拠地隊の旗艦に指定された特設砲艦「第二号新興丸」の旗艦設備工事と北千島進出が成るまで、石垣海防艦長が千島防備部隊の指揮を執ることとなった。12月29日、キスカ島行き船団を護衛し幌筵発。1943年(昭和18年)1月6日、幌筵に帰着。
1943年(昭和18年)1月25日-28日まで、幌筵島で座礁した特設運送船「第二号東光丸」の救難に従事。2月7日-13日まで、アッツ島行き第13船団(山百合丸)を護衛。22日-3月26日まで、大湊で入渠整備。 8月1日、日本軍のキスカ島撤退作戦は終了(ケ号作戦)。日本海軍は第十二航空艦隊と第五艦隊により8月5日附で北東方面艦隊(司令長官戸塚道太郎海軍中将、第十二航空艦隊長官兼務)を編成し、北太平洋方面海軍部隊の指揮を統一して北太平洋海域の防備強化を企図する。 同日、千島方面特別根拠地隊は千島方面根拠地隊に改編され、大湊警備府隷下から北東方面艦隊隷下となる。キスカ島から撤退した第五十一根拠地隊は解隊され、千島方面根拠地隊および第五十一警備隊に編入されている。 編成直後の千島方面根拠地隊(司令官新葉亭造海軍少将)は、第一駆逐隊(神風、沼風、野風、波風)、海防艦3隻(石垣、国後、八丈)、駆潜艇2隻(35号、36号)、第28掃海隊、各地警備部隊、附属4隻という戦力だった。その後、千島防備部隊(千島方面根拠地隊)の軍隊区分は、警備部隊、第一警戒部隊(石垣、八丈、国後)、第二警戒部隊(神風、沼風、波風、野風)となった。