フローラ・マクドナルド
1884年、サー・ハロルド・ボルトン(英語版)(後の第2代準男爵)が既存のメロディーに歌詞を付け、ザ・スカイ・ボート・ソング(英語版)(The Skye Boat Song。若僭王が小舟で逃げるときの経歴を描写した作品で、フローラも言及されている)と曲名をつけた。直後にはハイランド・ダンス(英語版)の『フローラ・マクドナルドの空想』(Flora MacDonald's Fancy)が初演され、1896年にはフローラの銅像がインヴァネス城に立てられた。米国ノースカロライナ州レッド・スプリングス(英語版)のフローラ・マクドナルド・カレッジ(英語版)(1896年にレッド・スプリングス・セミナリーとして開校、1914年にフローラ・マクドナルド・アカデミーに改名、1961年閉校。1974年に同地でフローラ・マクドナルド・アカデミーが開校)はフローラを記念して名付けられたものである。また、スコットランド郡ハイランドゲームズ(英語版)は2009年まで同校舎で開催された。
スコットランドの肖像画家アラン・ラムゼイはフローラの肖像画を数度描いたが、その多くは現存しない。この記事の冒頭で使われている肖像画はフローラがロンドン塔から釈放された後の1749年から1750年頃に描かれたものであり、2015年にはそれまで知られていないフローラの肖像画がフロリダ州で発見された。この新しく発見された肖像画もラムゼイの作品とされ、フローラがノースカロライナに移住したときに肖像画を持って行ったという説が唱えられた。