SARSコロナウイルス2の変異株
現在、「調査中の変異株」(VUI) と見なされているが、さらなる調査次第では「懸念される変異株」(VOC) となる可能性がある。ケンブリッジ大学のRavindra Gupta(英語版)教授がBBCへ伝えたところによると、B.1.525は、すでに他の新しい変異株の一部に見られるものの、その効果の可能性が高い程度で予測可能であり部分的に安心な「重要な突然変異」を持っているようだと語った。
系統 P.3(シータ株)
WHOは「注目すべき変異株」(VOI) として格付けし、ラベルではシータ株(Theta variant)に分類していたが、2021年7月にVOIから除外された。
2021年2月18日、フィリピン保健省(英語版)は、ゲノム配列解析のため中部ビサヤ地方(「地域7」として知られる)から送られた患者からのサンプルから、COVID-19の2つの突然変異を検出した。後に「E484K」および「N501Y」と名付けられたこの変異は、50サンプルのうち37サンプルで検出され、両方同時の変異は29サンプルから検出した。この時点では亜種の正式な名前はなく、完全な配列も未特定であった。
2021年3月13日、フィリピン保健省は変異を確認し「P.3系統株(P.3 variant)」と命名した。同日、同国内で最初となる系統 P.1によるCOVID-19症例も確認された。変異株P.1とP.3はどちらも系統B.1.1.28に由来するが、同省は、ワクチンの有効性と伝染性に対する系統 P.3の影響はまだ確定していないと述べた。フィリピンにおける系統 P.3による発症は、2021年3月13日時点で98症例であった。同月中に、系統 P.3は日本国内でも確認された。
系統 B.
これは、英国でのCOVID-19感染率の有意な増加と相関しており、N501Y変異に部分的に関連する。この変種では伝達率が40%から80%増加するという証拠がいくつかあり(ほとんどの推定値はこの範囲の中間から上限付近にある)、初期分析では致死率の増加が示唆されている。
B.1.1.7 with E484K(VOC-21FEB-02)
イングランド公衆衛生庁(英語版) (PHE) によって"B.1.1.7 with E484K"と記述されている、「懸念される変異株」のVOC-21FEB-02(旧称VOC-202102/02)は、Rambaut分類系と同じ系統だが、E484K突然変異が追加されている。 2021年2月18日の時点で、英国では26件のVOC-21FEB-02が確認されている。2021年3月4日、米国オレゴン州でE484K変異を伴うB.1.1.7が報告された。分析された13のテストサンプルのうち1つが、この組み合わせを持っていた。これは、取り込まれたのではなく、自発的かつ局所的に発生したものとみられる。
系統 B.1.351(ベータ株)
WHOは「懸念される変異株」(VOC) として格付けし、ラベルではベータ株(Beta variant)に分類していたが、2022年4月時点でVOCから除外されている。
2020年12月18日、501.V2変異株(501.V2、20H/501Y.V2(以前の20C/501Y.V2)、VOC-20DEC-02(旧称VOC-202012/02)、または系統 B.1.351としても知られる)は南アフリカ共和国で最初に検出され、共和国保険局(英語版)により報告された。
B.1.1.317は懸念される変異株 (VOC) とは見なされないものの、クイーンズランド保健局(英語版)は、オーストラリアのブリスベンでホテルの検疫を行う2人がこの変異株に感染していることを受け、義務である14日の隔離期間に加えて追加5日間の検疫を強制した。
452番目のアミノ酸位置でロイシン(L)がアルギニン(R)に置換したことを示す。
L452Rは、最初にインドで流行したがその後世界中に広まった系統 B.1.617.2(デルタ株)と系統 B.1.617.1(カッパ株)の両方の変異株に見られる。L452RはACE2受容体結合能を増強し、ワクチン刺激抗体がこの変化したスパイクタンパク質に付着するのを減らすことができる、この株の関連する変異である。
いくつかの研究によれば、L452Rはウイルスに感染した細胞を標的にして破壊するために必要な細胞のクラスであるT細胞に対して、コロナウイルスの耐性を作る可能性さえあるとする。それらは、コロナウイルス粒子をブロックし、増殖するのを防ぐのに役立つ抗体とは異なる。