ペラゴニアの戦い
これに伴い、エピロス専制侯ミカエル2世はアルバニアで発生したニカイア帝国に対する反乱を支援しニカイア帝国に侵攻を開始した。彼はプレリプの砦やニカイア帝国の地方統治者、またのちのち有名な歴史家となるゲオルギオス・アクロポリテスを拘束した 。しかしシチリア国王マンフレーディが自身の軍勢を引き連れてアルバニアに上陸しケルキラ島を含むアルバニアの大部分を制圧したことで、ミカエル2世はテッサロニキ侵攻の中断を余儀なくされた。(マンフレーディはかつてのノルマン人シチリア王のように、バルカン半島並びにコンスタンティノープルを征服するという野望を持っていたため侵攻したとされる。)マンフレーディはギリシア侵攻のおり、彼の妹でヴァタツェスの未亡人、コンスタンスが侵攻に強く反対したとされたことで侵攻を一時停止したとされる。又、ミカエル2世は自身の長女ヘレナ・アンゲリナ・ドゥーカイナをマンフレーディに嫁がせ、ケルキラ島・アルバニアをその持参金としてマンフレーディに差し出すことで、マンフレーディと軍事同盟を締結した。続いてミカエル2世は自身の次女Anna Komnene Doukainaをラテン人アカイア公ギヨーム2世・ド・ヴィルアルドゥアンに嫁がせて南バルカンからギリシア半島にかけて、広く反ニカイア同盟を構築した。
13世紀の歴史家アクロポリテスはペラゴニアの戦いはボリルの森で行われたと書き記している。ニカイア軍は反ニカイア連合軍より数的に劣勢だったため、戦術で巻き返すしか方法がなかった。そこでニカイア軍は、反ニカイア連合軍の弱点である『連携の弱さ』に目をつけた。というのも、反ニカイア連合の一翼を担っていたエピロスは他のギリシャ人と同様、フランク人らを信用せず、憎んでいた。そもそもこの戦乱は、第4回十字軍でフランク人・ラテン人主体の十字軍がギリシャ人の帝国を滅ぼしビザンツ領に十字軍国家を乱立させたのが原因であり、またエピロス専制侯国・ニカイア帝国は共にビザンツ帝国の亡命政権である。そのエピロスとニカイアの両亡命国家は両者ともに正当なビザンツ帝国の継承国家であると自負し対立していたがためにエピロスは渋々周辺のフランク人らと同盟しただけであり、完全・強固な同盟とは言い難いものであった。また、エピロス・ニカイアはギリシャ正教、ラテン人・フランク人はカトリック教を信奉しており、宗教の違いからも対立が生まれていた。それゆえフランク人らも両者の信仰する宗教間の対立によりギリシャ人の国であるエピロス専制侯国(無論ニカイア帝国もだが。)を毛嫌いしていた。それゆえ反ニカイア連合はあまり盤石なものではなかったとされる。