フルメタル・パニック!
概ね原作同様のストーリーが展開されるが、原作に忠実なアニメ化ではなく、あくまでこれまでのアニメシリーズの続編扱いとなっており、ストーリー構成やキャラクター描写などがこれまでのアニメシリーズを踏まえたものになっている。
合計20機を超えるASが登場し、各話スタッフとして出渕裕や大張正己などロボットアニメへの参加経験を持つスタッフが名を連ねている。ただし、CGの比率は『TSR』よりさらに増えており、車両やASも基本的にはすべてCG(停止中の姿は『TSR』までと同様、アニメーターによる手描き)で描かれている。
また、原作初期から暗躍していた重要キャラクターにも関わらず、アニメ版ではこれまで全ての出番をカットされていたクラマは本作で初登場する事となった。
本作でもASのデザインの変更が行われており、本作ではほぼ全てのASがデザイン変更される事となった。
BD/DVDには特典として、原作小説第6巻を基にしたオーディオドラマ『踊るベリー・メリー・クリスマス』を収録したCDが付属するほか、『ふもっふ』の新作オーディオドラマが収録予定。また、本編映像は5.1ch仕様となっており、BD版はイヤフォン、ヘッドフォンでサラウンド音声を再生できる「DTS Headphone:X」に対応している。
2018年4月から7月まで第4作目『フルメタル・パニック! Invisible Victory』(フルメタル・パニック インビジブル・ヴィクトリー)が、AT-X・TOKYO MXほかにて放送された。アニメーション制作はXEBECが担当。公式略称は『IV(アイブイ)』。原作本編第7巻『つづくオン・マイ・オウン』以降のストーリーがアニメ化された。制作会社のトラブルにより第4話・第8話の放送翌週には、それぞれ総集編として「インターミッション」、「インターミッション2」を放送。それにより本来の枠では第11話・第12話を放送できなくなったため、両話は同年7月に別枠で放送された。
2015年10月24日に行われた「ファンタジア文庫大感謝祭2015」にて新作アニメの企画が進行中であることが発表された後、2016年10月22日に行われた「ファンタジア文庫大感謝祭2016」内のスペシャルステージにてプロジェクト初期タイトル『フルメタル・パニック! IV』とメインスタッフ・放送時期が発表され、2017年1月20日に正式タイトルが発表された。
短編はハードかつシリアスな長編とは正反対の陣代高校における宗介が引き起こす騒動を描いた作品であり、時系列がバラバラになっており、コミカルなシーンが多い。著者の賀東は「別物として楽しんでください」とコメントしている。各タイトルの中に含まれた漢数字が短編の巻数になる。なお、これのタイトル付けに作者は相当苦労していた模様。長編シリーズに集中するために2004年以降短編の展開は止まっていたが、未収録の短編を収録した短編集9巻が描き下ろしを加え2011年8月20日に発売された。最終巻の旧カバー版は長編と同様にドラゴンマガジンの付録となった。
賀東招二(著) / 四季童子(イラスト) 『フルメタル・パニック!』 KADOKAWA〈富士見ファンタジア文庫〉、全9巻 「放っておけない一匹狼?」1998年12月25日初版発行(12月17日発売)、ISBN 4-04-071124-6 「本気になれない二死満塁?
ストーリーは、対テロ軍事武装組織ミスリルの西太平洋戦隊に所属する相良宗介が、ソビエト連邦東部で一人の少女を保護する所から始まる。ウィスパードと呼ばれる能力を持った少年少女と、彼らがもたらしたブラックテクノロジーによって変わってしまった歴史を巡る相良宗介の戦いを書いたハードでシリアスな「長編」と他に、長編を補完するエピソードを収めた「サイドアームズ」、シリアスな長編とは打って変わった平和な日本社会の中で主人公が引き起こす騒動をコミカルに書いた「短編」の3つのシリーズに分かれる。
メインストーリーにあたる「長編」では、ブラックテクノロジーにより異なる歴史を歩んだ冷戦末期の1990年代の各国が舞台になっており、本編シリーズとも呼ばれる。SFとしての軸に当たるウィスパードの謎を巡る戦いの他、人間性にも焦点が当てられており、最終巻最終章のタイトル『人間の証明』は数々の出来事を通じ、人間らしさを手に入れた宗介とアルを示すダブル・ミーニングとなっている。
ハイジャック事件から約2か月。ミスリル内での様々な思惑が絡み、名目上は護衛という形で、相良宗介は千鳥かなめ護衛任務を全うしていた。そんな中、成田空港の税関で、奇妙な行動を繰り返して職員に襲いかかった少年が逮捕された。タクマと名乗る少年と謁見したテレサ・テスタロッサは、彼にラムダ・ドライバ搭載ASを操縦する資質を感じ取るが、直後テロリストによる爆破事故に巻き込まれる。
タクマを確保したテッサは宗介に助けを求めるが、かなめを巻き込んでしまい、陣代高校へと避難をする。しかし、タクマの策略により居場所をテロリスト達に突き止められ、テッサとかなめは捕虜となっていまう。テロ組織『A21』に捕まった2人を救出すべく、宗介らは有明に停泊する大型コンテナ船に侵入し、かなめ達を救出したものの、全長40メートルを超える超巨大AS「ベヘモス」の起動を許してしまう。
圧倒的な質量とラムダ・ドライバの障壁を持つベヘモスに、通常のASはまったくの無力で、宗介たちは軽トラックで逃走を試みる。無敵のベヘモスを倒すべく、テッサは国際展示場「ビッグサイト」にアーバレストを投下するよう指示。アーバレストの射撃により、ベヘモスの弱点であるラムダ・ドライバの冷却装置を破壊され、自重を支えきれなくなったベヘモスは崩壊。操縦していたタクマは、姉と思い込んだテッサに抱かれたまま息を引き取った。