スクウェアのトム・ソーヤ
隣町のリバーウエストに住む少年。ベッキーを巡ってトムと対決するが、負けて子分になる。最終的に全ての能力が最低。メニュー画面などでは“アル”と表記されている。ちなみに仲間になる場所は最初は彼の自宅だが、それ以降はリバ〜ウエストの森にいる。(他のキャラは大概ずっと同じ場所で仲間になる。)スペシャルコマンドは「せっとく」。
町以外のフィールドでは敵が出現する(イベントにおいて、会話から戦闘に突入する場合もある)。ランダムエンカウント制で、歩いていると効果音と共にトムが敵に驚く演出が入り、その後戦闘画面に切り替わる。この作品における、最も特異な箇所が戦闘システムである。画面手前にパーティの後姿とHP表示があり、画面後方に敵が存在するという形式である(スクウェア・エニックスのサイトでは、これを3Dタイプの戦闘としている)。敵は赤いシルエットで表示され、判別できるのは、敵の大小やタイプの違いである。よって、その時点では敵の名前は分からない。攻撃のコマンドは仲間によって異なるが、「ひっさつ(必殺技)」は統一されている。ちなみに、攻撃した時点でも敵の名前は確認することができない。敵からの攻撃を受けると、人物のユーモラスな描写(顔面を殴られたような顔)と一緒に、ようやくここで敵が出現し、風貌などを確認することができる。主人公達のHPがゼロになると、「コテッ」という効果音と、両脚が空中に突き出された描写がなされる。各人物ごとに異なった、細かい演出である。
ノースフィールドの町の人々を困らせている狼。ずるがしこい性格。
ハンニバルの町にいる走り屋。いつも寝ているが、勝負を挑むと凄まじい足の速さを発揮する。
19世紀に活躍したアメリカの小説家、マーク・トウェインの『トム・ソーヤーの冒険』(1876年)をモチーフにしたロールプレイングゲームである。トムやジムなど、登場人物や地名をそのまま原作から引用しており、『ハックルベリー・フィンの冒険』(1885年)でお馴染みのハックも登場する。
タイトルに『スクウェアの〜』とあるのは、同年2月6日にセタより同じファミコン用ソフトとして『トム・ソーヤーの冒険』が発売されていたためにこのタイトルとなった。
ゲーム画面において、制作はスクウェアの「Bチーム」と強調するように記載されている。同社発売の『ファイナルファンタジーI』(1987年)ではオープニングスタッフロールでファイナルファンタジーIの製作が「Aチーム」であるが、スタッフは『ファイナルファンタジー』と一部重複している。
植松伸夫によると、本作は開発終了後も発売までに時間がかかっており、本作の曲は前年発売の半熟英雄やFFIIと同時期に手掛けているとしている。また本作にクレジットされている田中弘道、時田貴司も『ファイナルファンタジー』と同時期、ないしそれ以前に本作の開発をしていたことを語っている。また時田は本作のチームがFF2と同時期に存在していたことも述べている。
トムの住む町。ゲームの開始地点となる。
トムの伯母。休むと回復アイテムであるべんとうを渡してくれる。
ある場所にいるモンスター。なぜかハックの姿をしており、話しかけると戦いに突入する。本編中では語られなかった真実を教えてくれるが、会うためには裏技を使用する必要があり、最終的にはリセットボタンを押されてしまう。