古プロイセン合同福音主義教会
プロイセン合同福音主義教会には、フリードリヒ・ヴィルヘルム3世王によって作成された礼拝式文が下賜された。その式文はニュルンベルクのルター派教会礼拝式に倣ったものであり、ローマ・カトリック教会のミサに準拠したものであった。ラテン語でおこなわれていた当時のローマ・カトリック教会のミサとは異なり、ドイツ語での礼拝式文(祝祭日にはラテン語式文も挿入することも容易だった)であったが、プロイセン領邦教会の礼拝は宗教改革以前のミサ様式に戻ってしまった。
合同派の領邦教会はフランクフルト、ヘッセン=カッセル、ヘッセン=ナッサウであり、ルター派教会はハノーファー、シュレースヴィヒ=ホルシュタインであった。併合されたハノーファー周辺には改革派教会共同体が散在していたが、1882年にドイツ皇帝ヴィルヘルム1世の仲介によって北西ドイツ福音主義改革派教会が設立され統合された。
1875年、古プロイセン領邦教会は公式には古プロイセン州福音主義領邦教会と改称することになった。この領邦教会は9つの教会州で構成されていた。すなわち、ブランデンブルク(ベルリンを含む)、東プロイセン、ポンメルン、ポーゼン、ラインラント(南シュヴァーベンのホーエンツォレルン地区を含む)、ザクセン、ヴェストファーレン、西プロイセンである。
第一次世界大戦末期の1918年、皇帝ヴィルヘルム2世は退位を強いられ、領邦教会統治権を失った。そのため、古プロイセン領邦教会は1922年に新教憲を制定し、古プロイセン合同福音主義教会(EKapUもしくはApU)と改称した。さらに教会州地区の組織は民主化された。1922年以降、9つのそれぞれの教会州地区は州教会常議員会の下で運営されるようになった。その常議員は教会州地区総会で投票によって選出された。教会宗務局は教会州地区の教会行政機関になり、高位聖職者である地区長と法律家によって構成された。 ナチス・ドイツの統治時代、告白教会において広範囲な抵抗運動がおこなわれた。しかし、告白教会は教会全体において少数派に過ぎなかったことは注意すべきである。1934年、バルメン宣言が発表され、合同教会では信仰告白文書として見なされた。
1817年、フリードリヒ・ヴィルヘルム3世の指示によって、プロイセン福音主義教会と呼ばれた合同教会が設立された。合同教会と言っても大部分はルター派教会であったが、ラインラント州のデュースブルク、ヴッパータール周辺では改革派教会が固まって存在しており、ベルリンにはユグノーの伝統を守るフランス改革派教会が少数派として存在していた。1840年、フリードリヒ・ヴィルヘルム4世が即位すると、教会合同を拒否していた古ルター派への弾圧が止められ、1845年には古ルター派のプロイセン福音ルター派教会も国家から許可された上で設立された。この古ルター派教会は領邦教会ではなく、教会塔の建設と鐘を鳴らすことを禁じられていたがプロイセン全土で活動を始めた。領邦教会ではないこの古ルター派教会との違いを明瞭にするために、プロイセン福音主義教会は1845年からプロイセン福音主義領邦教会という名称に変更している。 1850年には南シュヴァーベンにあったホーエンツォレルン=ヘヒンゲンとホーエンツォレルン=ジグマリンゲンが領土をプロイセン王国に譲渡したため、当地の福音主義教会はホーエンツォレルン教会地区としてプロイセン福音主義領邦教会に組み込まれた。1899年に、この教会地区はラインラント教会州地区に属することになった。
1866年にプロイセン王国は普墺戦争に勝利し、隣接する領邦を併合した。福音主義教会に関して、併合した地域の教会をプロイセンの領邦教会に組み込むことはせず、従来どおり旧領邦単位で存続させた。
ブランデンブルク、ポンメルン、ラインラント、プロヴィンツ=ザクセン、シュレージエン、ラインラント、ヴェストファーレンの教会指導部は1945年ヘッセン州トライザ(シュヴァルムシュタット東部)に新教憲を制定するために集まった。教会州地区ごとに独自の州教会を組織することになった。
ベルリン=ブランデンブルク福音主義教会(現在はベルリン=ブランデンブルク=シュレージシェ・オーバーラウジッツ福音主義教会に統合されている)
ポンメルン福音主義教会(1968年–1991年:グライフスヴァルト福音主義教会、現在は北ドイツ福音ルター派教会に統合されている)
ラインラント福音主義教会
キルヘンプロヴィンツ=ザクセン福音主義教会(2009年まで、現在は中部ドイツ福音主義教会に統合されている)
シュレージシェ・オーバーラウジッツ福音主義教会(1968年–1992年 ゲルリッツ福音主義教会)
ヴェストファーレン福音主義教会
上記の州教会の指導部は1949年、1950年、1954年に会合を持ち、最終的には福音合同教会 (EKU) という名称の上部組織を発足させた。この上部組織は傘下の州教会とは別にドイツ福音主義教会(EKD)にも加盟し、2003年まで存続した。1960年には合同教会であるアンハルト福音主義教会が加盟した。 1945年、ヴュルテンベルク福音主義州教会は暫定的に南シュヴァーベンのホーエンツォレルン地区の旧プロイセン合同教会を組織に組み入れた。南シュヴァーベンのホーエンツォレルン地区の教会は1950年になって正式にラインラント福音主義教会からヴュルテンベルク福音主義州教会へと所属を変更した。