南福岡車両区
2021年5月から9月にかけてCM1・31・32編成と、CM3・5編成のモハ783が廃車され、CM3・5編成は4両編成となった。 2022年1月から2月にかけてCM15編成と、CM2編成のモハ783が廃車され、CM2編成も4両編成となっている。
787系電車(BM編成) 8両編成6本 (BM1, 3, 6 - 8, 10)、6両編成8本 (BM2, 4, 5, 11 - 14, 363) の計96両が配置されている。 8両編成は「リレーかもめ」「かささぎ」「きらめき」に、6両編成は「かささぎ」「きらめき」「にちりん」「にちりんシーガイア」「ひゅうが」「かいおう」に使用されている。BM363は36ぷらす3に運用される編成。 2022年9月23日のダイヤ改正以前は6・7両編成で主に「かもめ」「みどり」の運用に就いており、7両編成で運転される列車には、サハ787形1両を増結していた。 一時は全編成が当所に所属していたが、2011年(平成23年)に4両編成11本が大分車両センターに転属した。
885系電車(SM編成) 6両編成11本 (SM1 - 11)、計66両が配置されている。 「リレーかもめ」「みどり」「かささぎ」「ソニック」で運用される。長崎本線列車は、以前は「かもめ」のみの運用であったが、2022年9月23日のダイヤ改正により、「みどり」での運用も開始した。 以前は「かもめ」用が黄帯、「ソニック」用が青帯とデザインが分けられ、運用も分けられていたが、予備車が少ないことから運用上の自由度を高めるため、帯色の青色への統一が進められ、運用が事実上統一された。