熊本県立上天草高等学校
普通科 生徒一人ひとりの進路希望(進学・就職)に柔軟に対応し、習熟度別授業など個に応じた指導を行う。
グローカル文理コース(特進科) 国公立大学や難関私立大学への進学を目指す普通科の分岐コース。 2020年よりグローカル文理コースとなった。
情報会計科 松島商業高校の伝統を引き継ぎ、就職と進学の両方に対応している。レベルの高い資格取得・検定合格を目指す。
福祉科 介護福祉類型と地域福祉類型で分岐されており、県立高校としては3番目、天草地区としては初めて設置された学科。