ボーア人
植民地はかなり繁栄したが、多くのオランダ人農民が(苦情の根拠こそ同じではないものの)VOCによる支配と同じくらいイギリスの支配に不満を持っていた。1792年、コイコイ族を標的としたモラヴィア辺境伯領宣教会が創設され、1799年にロンドン宣教師協会がコイコイ族とバンツー族の両方で活動を開始した。宣教師によるコイコイ族の不平への擁護はオランダ入植者の大多数に多くの不満を生み出し、彼らの見解が一時的に広まると、1812年には殆ど奴隷制と変わらない条件でコイコイ族の子供達を丁稚奉公として拘束する権限を与える布告が発布された。同時期に、奴隷制度廃止運動がイギリスで強さを増して、宣教師たちは入植地から母国に訴えた。
ケープ植民地侵攻(ミューゼンバーグの戦い)とは、1795年に始まった喜望峰のオランダ領ケープ植民地に対するイギリス軍の遠征である。ホラント王国はフランス革命政府下に陥落し、ジェームズ・ヘンリー・クレイグ将軍率いる英国軍がケープタウンに派遣され、イギリスに亡命したウィレム5世 (オラニエ公) のために植民地をフランスから確保した。ケープタウンの総督は当初ウィレム5世からの指示に従うことを拒否したが、英国軍が陸路を占領して進軍したことで降伏した。彼の降伏行動は、かつての奴隷雇い主から逃れたコイコイ族が英国体制に群がった事実によって早まったとされる。グラーフ=ライネの開拓者は自分達に対して軍隊が派遣されるまで降伏せず、1799年と1801年に再び彼らは反乱蜂起した。1803年2月に、アミアンの和約の成果として同植民地はバタヴィア共和国に引き渡され、イギリスによる8年間の統治時期と同様に多くの改革が導入された。
ケープ植民地から南アフリカの東ケープ地域に入っていくトレックボーア達の移住だが、その場所には先住民のコサ人が既に居留地を作っていたため、ボーア人とコサ人の間で一連の紛争が勃発した。1775年、ケープ政府が川を挟んでトレックボーア達とコサ人との境界を確立したが、双方ともこの境を無視して境界からはみ出た場所に住居を建てた。ファン・プレッテンバーグ総督が境界線を尊重するよう双方に説得を試みたものの、上手くいかなかった。コサ人は牛を盗んだとして訴えられ、1779年に境界沿いで一連の小競り合いが勃発すると、第1次境界戦争(1st Frontier War)が始まった。
境界が不安定なまま、1789年に第2次境界戦争が勃発した。ボーア人とコサ人が境界の両側で行った襲撃はこの地域で多くの摩擦を引き起こし、その結果いくつかの部族が紛争に引き込まれた。イギリスによる1795年のケープ植民地侵攻(ミューゼンバーグの戦い)が政権交代をもたらした。政権奪取後にイギリスは境界を引く政策に着手し、グラーフ=ライネでボーアの反乱が起きる結果となった。この政策がコイサン族をコサ族に加担させてしまい、第3次境界戦争(1799-1803)中にイギリス軍に攻撃する原因となった。