京都大学霊長類研究所
2006年(平成18年)10月1日現在、814頭のサルを飼育している。
コモンマーモセット:22
ワタボウシタマリン:27
ヨザル:16
リスザル:4
フサオマキザル:11
ケナガクモザル:1
ミドリザル:2
ミドリザル × パタスザル:1
ニホンザル:348
ニホンザル(NBR): 73
ヤクシマザル:4
アカゲザル:218
タイワンザル:7
ブタオザル:1
ボンネットザル:9
カニクイザル:46
スラウェシマカク:1
マントヒヒ:6
アジルテナガザル:3
チンパンジー:14
2006年(平成18年)から2012年(平成24年)まで所長を務めた松沢哲郎が、同研究所などの設備工事に絡み、国からの研究資金を不正に使用していたとして、京大が内部調査していることが、2019年(令和元年)12月6日に一部新聞で報じられた。2020年4月22日、京都大学の調査委員会は、教員4人が入札前に業者に予算額を伝えたり、入札にすべき発注を随意契約にするなどにより、研究費約5億円が不正支出されていたとする報告書を取りまとめた。
この不祥事を受けて、大学は研究所を2022年3月で解散、「ヒト行動進化研究センター(仮称)」に改める組織改編を2021年10月に発表した。