トンブクトゥ
2012年4月1日、トゥアレグ人によるアザワド解放民族運動が市域を掌握したと発表した。4月6日にマリ反政府勢力アザワド解放民族運動(MNLA)が一方的に独立宣言したアザワド(国際的に未承認)に含まれていたが、アザワドは同年6月中にイスラム武装勢力同士の対立で事実上崩壊した。
マリ北部を制圧したアル=カーイダ系の武装組織「イスラーム・マグリブ諸国のアル=カーイダ(AQIM)」が、トンブクトゥの聖墓を破壊したと2012年5月5日、明らかにした。こうした状況を踏まえ、2012年の第36回世界遺産委員会において、世界遺産「トンブクトゥ」はアスキアの墓とともに、危機にさらされている世界遺産(危機遺産)リストに登録された。
2012年6月30日に西アフリカ・マリの北部を支配しているイスラーム主義組織「アンサール・アッ=ディーン」が、世界遺産都市トンブクトゥでイスラーム指導者の聖廟を破壊した(詳細は#イスラム過激派による聖廟の破壊節を参照のこと)。
AQIMは、リビアのカダフィ大佐がトンブクトゥに所有していた住居を占拠。マリ北部における活動拠点の一つとしていたが、2013年1月20日、フランス空軍の空爆により破壊されたことから、1月24日までにトンブクトゥから撤退している。1月28日にはフランス軍とマリ軍が市内に進駐。翌日には、イスラム武装勢力を支持していた商店に対し、地域住民による襲撃、略奪が発生した。2月2日には、フランスのフランソワ・オランド大統領が市内を訪問し、市民から歓迎を受けている。