発酵
水素ガス(H2)は、NADHからNADを再生する手段として、多くの種類の発酵により作られる。電子はフェレドキシンに移動し、フェレドキシンはヒドロゲナーゼによって酸化されてH2を生成する。水素ガスはメタン生成菌や硫酸還元菌の基質となるため、水素濃度は低く保たれ、このようなエネルギーに豊む化合物の生成に有利になるが、腸内ガスのようにかなり高濃度の水素ガスが生成されることもある。
たとえば、細菌であるクロストリジウム・パストゥリアヌム(Clostridium pasteurianum)はグルコースを酪酸、酢酸、二酸化炭素、水素ガスに発酵させる。酢酸を生成する反応は次のとおりである。
C6H12O6 + 4 H2O → 2 CH3COO + 2 HCO3 + 4 H + 4 H2