第三十一戦隊
1944年(昭和19年)8月20日に創設された第三十一戦隊は、連合艦隊に直属部隊として編入された。時期をみてさらにもう一隊を新編し、海上護衛総司令部に編入する予定だったという。対潜任務であるにもかかわらず海上交通保護を任務とする海上護衛総司令部部隊に編入されなかった理由は、軍令部が「海上護衛総司令部は直接護衛を担当する、連合艦隊は海上交通要所における対潜掃蕩を担当する」と区別していた為である。 軍令部第12課の十川潔中佐の回想によれば、海上護衛総司令部に運用を委ねると護送船団の直接護衛に使用されてしまい、本来の意図である独立した対潜機動部隊としての活動ができないおそれがあること、花形部隊である連合艦隊所属としたほうが士気が高まることにあったという。
これについて、海上護衛総司令部参謀の大井篤大佐は、兵力不足の海上護衛総司令部では第三十一戦隊が船団護衛に使用できれば南方航路の護衛が3割増強できると期待していた。 第三十一戦隊編成直後の8月24日、軍令部総長官邸でおこなわれたルソン海峡緊急対潜方策の研究会で大井参謀は海上護衛部隊の戦力不足を訴え、第三十一戦隊の応援と活用を要求している。ただし、将来的にはルソン海峡対潜作戦専門の根拠地隊(機雷敷設の第18戦隊を基幹)の新編をもとめている。中澤佑軍令部第一部長は「第三十一戦隊の用法については別に研究を必要とする」と述べた。 戦後、大井は「第三十一戦隊が連合艦隊の大型艦の対潜護衛に回されてしまった」と考えて、不服だったと回想している。
1944年(昭和19年)8月20日 - 第三十一戦隊新編。連合艦隊付属。 8月25日 - 南西方面で行動中の駆逐艦「夕凪」(第30駆逐隊)、アメリカ潜水艦ピクーダに撃沈される(10月10日、削除)。 9月10日 - 第43号海防艦を編入する。 9月20日 - 駆逐艦「皐月」(第30駆逐隊)、マニラで米軍機動部隊艦上機の攻撃を受けて沈没する(11月10日、削除)。 9月14日 - 「五十鈴」の改造と修理が完成した。 9月30日 - 第43駆逐隊に駆逐艦「槇」を編入する。 10月4日 - 十一水戦の駆逐艦「桑」を敵潜掃蕩部隊に編入する。 10月10日 - 第43駆逐隊に駆逐艦「桐」を編入する。 10月13日 - 第29号海防艦と第31号海防艦を編入する。 10月20日 - 第三十一戦隊に所属していた海防艦4隻(満珠、干珠、笠戸、三宅)で第21海防隊を編制する。同海防隊はひきつづき第三十一戦隊に所属した。 11月3日 - 緊急輸送部隊(空母隼鷹、軽巡木曾、第30駆逐隊〈夕月、卯月、秋風〉)として南西方面へ移動中、アメリカ潜水艦ピンタドの雷撃で「秋風」が沈没する(翌1月10日、削除)。 11月19日 - マニラ沖合で第三十一戦隊旗艦「五十鈴」がアメリカ潜水艦の雷撃で大破、駆逐艦「桃」護衛下でシンガポールに回航される。 11月20日 - 第三十一戦隊は第五艦隊に編入される。 11月24日 - 第三十一戦隊司令部は旗艦を「五十鈴」から秋月型駆逐艦「霜月」に変更する。 11月25日 - シンガポール沖合で「霜月」がアメリカ潜水艦カヴァラの雷撃で沈没する。
駆逐艦:花月(旗艦)
第7駆逐隊:潮、響
第17駆逐隊:雪風、初霜
第41駆逐隊:冬月、涼月
第43駆逐隊:竹、桐、槇、榧
第52駆逐隊:杉、樫、楓