フェレドキシン
フェレドキシンはタンパク質であるために、遺伝子から転写・翻訳されて合成されるが、Fe-Sクラスター構築にはいくつかのケースにおいて他のタンパク質の関与している場合がある。これを、「タンパク質の翻訳後修飾」といい、他の金属タンパク質などは概して、こうした修飾を受けるといわれている。
フェレドキシンは窒素固定および硝酸還元にも関与する。
8 Fdred + N2 + 8 H + 16 ATP → 8 Fdox + 2 NH3 + H2 +16 ADP + 16 Pi (窒素固定)
6 Fdred + NO2 + 8 H → 6 Fdox + NH4 + 2 H2O (硝酸還元)
他に、2-オキソ酸(ピルビン酸など)の酸化にフェレドキシンを用いているケースも多い。この反応にはほとんどの真核生物や好気性真正細菌では電子受容体としてNADを用いているが、古細菌や一部の真正細菌、寄生生物や原生生物などでは比較的低分子の2-オキソ酸:フェレドキシン酸化還元酵素が用いられている。
2 Fe (酸化型) ⇄ {\displaystyle \rightleftarrows } Fe•Fe (還元型) ⇄ {\displaystyle \rightleftarrows } 2 Fe (超還元型*)
鉄および硫黄(不安定硫黄)が2つずつ結合している。植物や動物のフェレドキシンはこの形状のみである。真正細菌および古細菌(高度好塩菌)もこのフェレドキシンを有する。