自家蛍光
自家蛍光は蛍光顕微鏡観察において問題になる。光を発する染色剤(蛍光ラベルされた抗体など)は特定の構造を可視化するために試料に加えられる。
自家蛍光は興味のあるシグナルが非常に弱い時に特に特定の蛍光シグナルの検出を妨げる。
一部の顕微鏡(主に共焦点顕微鏡)では、自家蛍光のほとんどを除外するために加えた蛍光マーカーと内因性分子の励起状態の異なる寿命を利用することができる。
少数例ではあるが、自家蛍光によって興味のある構造が実際に光ったり、診断上の有用な指標として機能することもある。
例えば、蛍光マーカーを加えることなく、細胞の自家蛍光は細胞毒性の指標として使用することができる。
ヒトの皮膚の自家蛍光は終末糖化産物 (AGEs) の量を測定するために使用することができる。
マルチスペクトルイメージングを利用する光学イメージングシステムは、多重化機能を追加することによって自家蛍光が原因のシグナル劣化を低減することができる。
超解像顕微鏡SPDMによって、従来の蛍光イメージング条件では検出できなかった自家蛍光細胞オブジェクトが明らかにされた。