パーヴェル・スホーイ
1940年前半にこの移転は完了した。
1942年の冬にはスホーイは新たな問題に直面した。独ソ戦の最中に当たり、スホーイは独自の生産ラインを持っていなかったので、何もすることが無かったということである。彼は新しい対地攻撃機Su-6を開発したが、スターリンはIl-2の方を好み、Su-6の生産を開始しないことを決断した。他の機種を製造することは航空機生産のペースダウンを招き、戦時には好ましくないことと、またスターリンがスホーイのことをあまり好ましく思っていなかったということが理由として挙げられる。そればかりか戦後はスホーイの手によるジェット戦闘機の試作品をスターリンに「ドイツの真似だ」と根拠も無く酷評され、科学者刑務所(シャラーシカ、Sharashka、Шарашка)に収容されたこともあった。
第二次世界大戦後、スホーイによって開発された戦闘爆撃機としては、Su-17・Su-24などが挙げられる。スホーイによって設計された最後の戦闘機はT-10(後のSu-27)であるが、彼自身は実際にT-10が飛行するのを見ることはできなかった。1975年9月15日にモスクワにて、80歳で死去した。同年12月25日にソビエト連邦科学アカデミー総裁により、彼の深い学識を記念して死後に金メダルが贈呈された。