列車特定区間
1947年(昭和22年)に上野駅 - 金沢駅間に上越線経由の列車が設定された際に、当時の信越本線(高崎駅 - 長野駅 - 直江津駅間)経由の運賃の適用を認めたことが、最初の制定とされる。輸送力が不足していた時代(戦後復興期)に、最短ルート以外の列車に旅客を誘導する(最短ルートの列車を利用できない旅客を救済する)ことを主な目的としていた。代表的なものとしては、福島駅 - 青森駅間(奥羽本線経由でも東北本線経由で計算)、大宮駅 - 秋田駅間(上越線・羽越本線経由でも奥羽本線経由で計算)などがあり、小倉駅 - 西鹿児島駅(現・鹿児島中央)のように料金のみ列車特定適用の区間もあった。
しかし、ミニ新幹線を含む新幹線の開業などにより、該当していた在来線長距離列車の運転区間が大幅に削減され、その結果、制度の対象は大きく減少した。
中には天北線と宗谷本線や、大宮 - 青森間のように、片方のルートの全部ないし一部が廃止(第三セクター鉄道への転換でJR路線でなくなった場合も含む)で消滅したケースもある。