ケーニヒスベルク (プロイセン)
野心的な学生はプラハやライプツィヒなどで高等教育を学ぶより、ケーニヒスベルクで教育を受けることを選ぶようになった。
騎士団はグルンヴァルトの戦いでひどい敗北を受けたが、ケーニヒスベルクはポーランド・リトアニア連合とドイツ騎士団との戦いの中でドイツ騎士団の支配下のままであった。リヴォニア騎士団はプロイセンの分団のケーニヒスベルクにおける駐屯軍と置き換えられ、ヨガイラの軍隊によって占領された街の奪回に参加することを許された。
1454年にプロイセン同盟はドイツ騎士団に対して反旗を翻し、ポーランドの助けを求めた。クナイプホーフは反乱を支持したが、ケーニヒスベルクのほかの地区は騎士団に対する忠義を再確認した。1457年に騎士団長ルートヴィッヒ・フォン・エルリックスハウゼンは騎士団国の首都をマリーエンブルクからケーニヒスベルクへと移した。街の判事は同情からビール樽をエルリックスハウゼンに贈った。第二次トルンの和約により、西プロイセンはポーランドに移譲され、十三年戦争は終結した。ケーニヒスベルクは縮小した騎士団国の新しい首都となり、騎士団国はポーランド王国の封土となった。騎士団長は元帥の4分の1を引き継いだ。ポーランド・チュートン戦争 (1519-1521)のときに、大ヘトマンミコワイ・フィルレイ率いるポーランド軍によりケーニヒスベルクは包囲されたが、攻城戦は失敗しケーニヒスベルクは守られた。
ロートは慈悲を請うことを拒否したため、1678年に死去するまでパイツ (Peitz) に収監された。
プロイセン貴族は、1663年10月18日にケーニヒスベルクでフリードリヒ・ヴィルヘルムへの忠誠を誓ったが、クリスティアン・ルートヴィヒ・フォン・カルクシュタインは選帝侯による軍の資金提供の要請を拒否し、ポーランドに援助を求めたが、選帝侯の工作員に誘拐された後、1672年に処刑された。プロイセン貴族のフリードリヒ・ヴィルヘルムへの服従により、1673年と1674年に選帝侯はプロイセン貴族が認めていない税を徴収し、また、同意なくケーニヒスベルクに駐屯軍を置いた。経済的、政治的に弱体化しつつあったケーニヒスベルクをプロイセンのユンカーの力で強化した。
ケーニヒスベルクは長らく、ブランデンブルク=プロイセンの中のカルヴァン主義に対するルター派の抵抗の中心地であったが、1668年フリードリヒ・ヴィルヘルムは市民に対してカルヴァン主義の市民と富裕層を受け入れることを強制した。
高度な自治と独自の通貨を持ち、優位にある言語はドイツ語だった。街は、小麦、材木、麻、毛皮に加え、ピッチ、タール、フライアッシュの輸出を通じて栄えた。ケーニヒスベルクは、ダンツィヒやリガと並び、16世紀後半において毎年100隻以上の船が訪れるバルト海の数少ない港のうちの1つであった。1544年にアルブレヒトによって設立されたケーニヒスベルク大学は、プロテスタントの教えの中心地となった。
有能な公爵アルブレヒトの後を精神を病んだ息子のアルブレヒト・フリードリヒが継いだ。彼の娘アンナはブランデンブルク選帝侯ヨーハン・ジギスムントと結婚した。ヨーハン・ジギスムントは1618年のアルブレヒト・フリードリヒの死によりプロイセン公国の継承権を与えられた。この時から、プロイセン公国はブランデンブルク=プロイセンの統治者であるブランデンブルク選帝侯の支配を受けることとなった。