蜂屋頼隆
通説では頼隆に子はいないとされているが、吉田兼見の『兼見卿記』天正19年2月18日条に「蜂屋」の子として梅南丸という4歳の男子と5歳の女子の存在が記され、2人とも歩くことが出来なかったと記されており、同年10月20日条には「蜂屋後家」が息子のために祈祷を依頼したと記している。この後家は2年前に没した頼隆の未亡人とするのが有力な見方で、彼女が祈祷の対象とした梅南丸は頼隆の遺児で、体の障害によって蜂屋家の家督を継ぐことが許されなかったとみられている。
頼隆は義兄にあたる丹羽長秀の四男・直政を養子としていたが、頼隆に先立って死去しており、蜂屋氏は断絶した。その遺領である越前国敦賀(5万石)は、天正17年(1589年)10月8日に豊臣秀吉の甥である豊臣秀勝に与えられたが、秀勝が領知が少ないと不満を述べて加増を要求したので、秀吉が怒って没収したと言い、大谷吉継が継いだ。 のちに大谷が関ヶ原の戦いで敗死し、残された家臣により敦賀城は勝者の側へ明け渡しとなったが、その際の家臣の名が蜂屋将監であったことにより、大谷は旧領主の蜂屋氏の一族・家臣団の一部も引き継いだと推測することができる。
斯波義統の息子と言われる蜂屋謙入を頼隆の養子とする説がある。ただし、頼隆の死の直前である天正17年3月に謙入は秀吉の怒りを買って尾藤知宣・細川信良とともに捕らえられ、尾藤と願得寺顕悟(謙入の義兄弟で3人を匿っていた)は自害、謙入と信良は追放されているため、蜂屋氏を継げなかったとみられる。なお、謙入は天正20年には秀吉の御伽衆に復帰して文禄2年頃に没しているため、『兼見卿記』の「蜂屋後家」や梅南丸は謙入の妻子には該当しない。