夜明駅
1932年(昭和7年)3月12日:久大線の筑後大石駅 - 当駅間の開通に伴い、開業。
1934年(昭和9年)3月3日:久大線の当駅 - 日田駅間が開通。
1937年(昭和12年)8月22日:彦山線の当駅 - 宝珠山駅間が開通。
1962年(昭和37年)10月1日:貨物取扱廃止。
1971年(昭和46年)2月20日:業務委託駅となる。
1984年(昭和59年) 2月1日:荷物扱い廃止。 2月15日:駅員無配置駅となる。
1987年(昭和62年)4月1日:国鉄分割民営化により、九州旅客鉄道に継承。
2010年(平成22年)4月18日:新駅舎が落成。
2012年(平成24年) 7月14日:平成24年7月九州北部豪雨の影響で日田彦山線・久大本線ともに休止。 7月16日:筑後吉井駅 - 日田駅間にて、代行バスの運行開始。 7月27日:日田彦山線の運行再開。久大本線の筑後吉井駅 - 日田駅間は、引き続き代行バスにて運行。 8月25日:久大本線の筑後吉井駅 - 日田駅間の運行再開。
2017年(平成29年) 7月5日:平成29年7月九州北部豪雨の影響で日田彦山線・久大本線ともに休止。 7月18日:久大本線うきは駅 - 光岡駅間の運転を再開。日田彦山線は引き続き運休。 7月31日:大行司駅 - 日田駅間で代行バス輸送を開始。
2022年(令和4年)8月29日 - 3番線を廃止。
2023年(令和5年)8月28日:日田彦山線の添田駅 - 久大本線の日田駅間で日田彦山線BRT(BRTひこぼしライン)の運行を開始。駅舎下のバス停に乗降場が設けられた。
旧駅舎
改築時の仮駅舎
1965年(昭和40年)度には乗車人員が134,596人(定期外:36,114人、定期:98,482人)、降車人員が133,947人で、手荷物(発送:384個、到着:213個)や小荷物(発送:1,643個、到着:545個)も取り扱っていた。
2013年(平成25年)度の乗車人員は13,498人(定期外:5,493人、定期:8,005人)、降車人員は14,915人である。
※1日平均乗車人員の数値は各年度版「大分県統計年鑑」による年間乗車人員の値を各年度の日数で割った値。
* 一日平均乗車人員は年間乗車人員の値を各年度の日数で割った値。