新ビックリマン
声 - 徳丸完
回想シーンにのみ登場。メディアの付き人。
声 - 佐藤浩之
パ巳ロの部下。サファイアンシップエリアにおいてマルコチームと格闘技のタッグマッチをおこなうが、戦いの途中で勢い余って火の海に落ちかけてしまう。その後、アメジアンスでマルコがブラックゼウスに敗北しかけた際に、蝶子良と共に救出に訪れてパワーを与える。
声 - 橋本晃一
ビックリ村の平和を守る(自称)愛と正義の英雄。周りと少しずれている。ヤマトウォーリアとの偶然の通信により、世界のおかしさに最初に気づく。
マルコら4人とブラックゼウスとスーパーゼウスはテレビシリーズと同じキャスト。ダークマターがテレビシリーズに先がけて登場するために、ダークマターのキャストは異なる。
マコト 声 - 山田栄子 現代の少年。かつて集めていたビックリマンシールと同じ姿のマルコらが現れたことに驚く。 マリ 声 - 鈴木砂織 マコトの妹。悪魔化した人間によりブラックゼウスの元に連れて行かれる。 メイドン遊使 声 - 上村典子 六聖球を導き、神帝たちのルーツ(子孫、生まれ変わりといった意味)であるメイドン天使5人が登場。マコトを促し、彼のルーツらしき「FuzzyMR.」を顕現させる。 ダークマター 声 - 飯塚昭三 TVアナウンサー 声 - 田中和実 タンゴ博士 声 - 田中秀幸 シール開発者、反後四郎をモチーフにしたキャラクター。原作シールの歴史の解説コーナーに登場。 東京の人々 ビックリマンのキャラクターによく似たデザインをしている。悪魔化し、暴徒となってしまう。
声 - 中島千里
アメジアンスの伝説の眠れる美女。「我(眠れる美女)を目覚めさせたものに願いを一つ叶える」という約束をする。
声 - 戸谷公次
この世の全てをつくり出した絶対神であるとともに、前作の天聖界と天魔界の抗争、ひいては次界が滅びるそもそもの原因を作った張本人でもある。スーパーゼウスに似たシルエットのみ登場。シリーズを通して謎の存在として描かれており、本作品でもその正体に触れられることはなかった。
オパザード編にて、ナディアとメディアがなぜ超聖神を挟んで確執を持つようになったのかというエピソードが描かれた。