SL-1
運転室フロアは比較的きれいで放射線場も管理しやすいため、手動式天井クレーンを使って原子炉容器を試験的に持ち上げた。クレーンにはダイヤル式の荷重計が取り付けられ、原子炉容器は数インチ持ち上げられた。この試験で、原子炉容器は推定23,000ポンド (10,000 kg)に未知の瓦礫を加えた重さ約26,000ポンド (12,000 kg)であることが判明した。原子炉容器の上にある建物の構造物の大部分を取り除いた後、60トンマニトワック3900型クレーンが原子炉容器を建物から取り出し、容量60トンのローボーイトレーラーと繋がったトラクタートレーラーに取り付けられた輸送キャスクに吊り下ろした。 45本の送電線、電話線、および支線を走行予定道路から引き上げまたは撤去した後、トラクタートレーラーは、多数の監視員と監督者を伴って、約35マイル (56 km) 離れたテストエリアノース(英語版)として知られるNRTSの遠隔地に位置するANPホットショップ(もともとは航空機用原子炉推進(英語版)プログラムに関連していた)へ時速約10マイル毎時 (16 km/h) で進んだ。廃棄物を埋設したことで、SL-1から放射性廃棄物処理施設まで16マイル (26 km)の一般道路を汚染瓦礫を運搬する際に生じる、一般市民や作業員の被曝を最小限に抑えることができた。
ゼネラル・エレクトリック社は、原子炉容器を撤去し、SL-1プロジェクトサイトの汚染された建物を解体・清掃するために雇われた 。敷地は1961年から1962年にかけて清掃され、汚染された瓦礫の大部分が取り除かれ、埋められた。この大がかりな清掃作業には、原子炉容器を近くの「ホットショップ」に運び、徹底的に分析することも含まれていた。その他の重要度の低いものは処分されるか、さまざまな洗浄のために除染場所に運ばれた。SL-1サイトの清掃には、米軍や原子力委員会のボランティアを含む約475人が参加した。
回収作業では、運転室フロアの放射性瓦礫の除去も行われた。原子炉容器とその真上にあるファンルームの周囲は放射線量が非常に高いため、原子炉容器の回収は困難を極めた。遠隔操作装置、クレーン、ブームトラック、安全対策を開発し、回収チームがテストする必要があった。放射線調査と写真分析によって、どのようなものを最初に建物から取り除く必要があるかが決定された。強力なバキュームクリーナーは、男性チームによって手動で操作され、大量の瓦礫を回収した。運転フロアの上にある手動の天井クレーンを使って、重さ19,600ポンド (8,900 kg)にもなる多数の重量物を移動させ、外の地面に投棄した。毎時400レントゲンに達するホットスポットが発見され、作業エリアから取り除かれた。