クイズ$ミリオネア
スタジオで行われる本選では、センターシート(解答席)の周囲に座っている挑戦者で、4つの選択肢を順番に並べ替えるクイズに挑戦する。このクイズは手元のボタンで解答し、全員が回答した後に、正解者全員の名前と解答タイムを発表する。このときに、正解者の中で一番早く解答した挑戦者がセンターシートでのクイズの挑戦権を獲得する。全員不正解の場合は、違う問題を出題して仕切り直す。ごく稀なケースとして正解者の中で二人以上が最短解答タイムを叩き出した場合は、その挑戦者達だけに違う問題を出してタイブレークを行う。本選に出場することができても、放映時間終了までにこのクイズを通過しなければ、最後までセンターシートに座ることはできない。
番組中期には、一般出場者10人と著名人3人が参加する本編の時間が短縮され、著名人が早押し並べ替えクイズ無しでいきなりセンターシートで挑戦出来る「エキシビション・マッチ」に時間が割かれるようになり、その後2006年7月27日放送分をもって一般出場者の参加が終了した。
アクリル装飾:鳥居大吾
メイク:高梨由美子
スタイリスト:御法川靖子
TK(タイムキーパー):水野久美
広報:正岡高子(フジテレビ)
協力:ベルシステム24、iiyama/Format created by Celodor Productions Ltd.Coord by ECM Productions Ltd.
デスク:武内知子、石川未夏、兀下優子(兀下→以前はディレクター)(SP放送のみ)
AD(アシスタントディレクター):長谷川樹郎、水谷まなみ、河上良介、林さやか、岡崎大輔、水梨広崇(SP放送のみ)
AP(アシスタントプロデューサー):宇和川隆(SP放送のみ)
ディレクター:長沼昭悟(ベイビーディレクターズ)、若菜洋、馬場一彦、大谷卓、石川のりひさ、宮里直政(宮里→以前はAD)、指田博俊、亀田剛
CGディレクター:冨士川祐輔(フジテレビ)
演出:田中経一
プロデューサー:松尾利彦・麻生華子
制作協力:日本テレワーク
制作著作:フジテレビ
センターシートの後ろには応援席があり、そこにクイズの成り行きを見守る応援者を原則1名会場に呼ぶことができる。
放送初期は放送終了時刻になっても解答者の挑戦が続いていた場合、そこで中断し次回に続きを放送していたが、中期以降は行わなくなり、最後まで放送できるように編集で調整されていた。挑戦者一人のために後に完全版を放送したこともあった。
放送中期以降は答えを間違えない限り、難易度の低い序盤の問題はダイジェスト映像により大きく省略した形で放送されることが多かった。ダイジェストでなくとも、当番組の代名詞ともいえる、みのと挑戦者の[ファイナルアンサー]の掛け合いは省略されることも多い。
賞金限度額は私的独占の禁止及び公正取引の確保に関する法律(独占禁止法)第2条第7項(現第2条第9項)に基づく「オープン懸賞告示」と民放連の自主規制により一人につき200万円までと定めているが、この番組では前述のライフライン「テレフォン」のためのTB4人をあわせ5人で賞金上限1,000万円としている。また1,000万円獲得しても税金を差し引かれるので確実に手元に1,000万円を獲得出来るわけではない。
15問全てに正解すると、天井から銀色の紙吹雪が大量に降り(全世界共通)、賞金1000万円を獲得できる。獲得の瞬間、画面下に「○○○○(解答者名)(改行)MILLIONAIRE」のテロップが出る。ダブルスでミリオネアが誕生した際は、2名分の名前が表示された。
問題数が15問から10問に短縮。 最高賞金は第1回は2000万円だったが、第2回以降は1000万円に戻された。
5問目までは四択方式、6問目以降は二択方式。その為、ライフラインの「50:50」が6問目以降は強制的に使用出来なくなる。
「ドロップアウト」に関しては、8問目以降は問題が始まっている間の使用が禁じられる。たとえば、8問目の賞金額を獲得するには、9問目の問題が始まる直前までにドロップアウトをしなければならない。
賞金システムは最初の5問に連続正解しても保証金が0円に変更されたため、誤答すると0円退場となる。