東京港
延長902m、水深7.5〜8.5m、VAA〜VAD の4バースがある。北海道・九州・四国とを結ぶフェリー航路と東京 - 北海道間の RO-RO船による定期航路が就航する。 東京港フェリーターミナル 第3バース(VAC):オーシャントランス「オーシャン東九フェリー」 - 徳島港 - 新門司港 ※第1バース、第2バース、第4バースからフェリーは発着しない。
沖縄・奄美航路 マルエーフェリー(RO-RO船) 琉球海運・近海郵船(RO-RO船・近郵は月曜日、琉球海運は水曜日と金曜日出港。荷役は近郵が日本通運東京海運支店、琉球海運が宇徳東京支社) 共勝丸 東京港・月島埠頭 - 東京港・10号地埠頭 - 小笠原・父島 - 小笠原・母島 ※不定期の貨物船だがキャビンを持つ(10号地埠頭での旅客扱いは行わない)
延長190m、水深11m、LA バースがあり、暫定的に北海道からの内貿を取り扱う。日本通運東京海運支店が管理する。
1号地: 中央区月島
2号地: 中央区勝どき1〜4丁目
3号地: 中央区勝どき5〜6丁目
4号地: 中央区晴海
延長879m、水深2.7m〜7.5m、内貿雑貨の B〜G と東海汽船の S2,S3バースがある。70年近くが経ち施設の老朽化が著しい為、再開発計画がある。