九州号
2000年(平成12年)12月21日 - 増便によるダイヤ改正が行われ、スーパー便が1時間1本に増便、新たに福岡空港経由便が運行開始。
2001年(平成13年)6月1日 - 福岡~長崎間4枚綴り回数券を9,900円→8,000円に値下げ、スーパー便が1時間2本に増便。各停便しか停車していなかった諫早インターに嬉野インター経由便と福岡空港経由便が新たに停車するようになった。
2002年(平成14年) 2月1日 - 福岡~長崎間の片道運賃を2,900円→2,500円に、往復運賃を5,100円→4,500円にそれぞれ値下げ。 3月1日 - 各停便廃止。高速筑紫野~嬉野インター間の停車地に停車しなくなる。嬉野温泉経由のノンストップ便を新設。
2004年(平成16年) 3月28日 - 長崎自動車道延伸、ながさき出島道路の開通により、新系統「出島道路経由」運行開始。それにより、長崎市内の停車地に大波止が加わる。また東そのぎインター、高速松原、大村木場の停車地には停車しなくなる。 9月1日 - ノンストップ便および嬉野インター経由便が出島道路経由だったが、スーパーノンストップ便に変更となった。ただし便数は改正前と同じである。
2005年(平成17年)9月1日 - ダイヤ改正で長崎市内の停車地に松山町が加わり、昭和町経由便の全便が停車する。あわせてノンストップ便は全便嬉野インター経由となった。また、スーパーノンストップ便も改正され、全体の便数は同じながらも昭和町経由が若干増やされた。
方向幕時代は黄地に黒文字。3往復(平日・土日祝日とも)運転。