1999年の鉄道
1月11日 井原鉄道 (新線開業) 井原線 総社駅 - 神辺駅 (41.7km) (新駅開業) 総社駅、清音駅、川辺宿駅、吉備真備駅、備中呉妹駅、三谷駅、矢掛駅、小田駅、早雲の里荏原駅、井原駅、いずえ駅、子守唄の里高屋駅、御領駅、湯野駅、神辺駅(井原線)
10月1日 九州旅客鉄道 特急「有明」の豊肥本線直通が再開。
10月2日 東海旅客鉄道・西日本旅客鉄道詳細は「1980年代・1990年代のJRダイヤ改正」を参照
5月7日 南海電気鉄道 (新駅開業) 交通センター前駅(貴志川線 竈山駅 - 岡崎前駅間)
5月10日 名古屋鉄道 特急の「指定席券」を「特別車両券(μ(ミュー)チケット)」に、「指定席車」を「特別車」に、「一般席車」を「一般車」に名称を変更。
3月7日 大井川鐵道 (運転再開) 井川線 接岨峡温泉駅 - 井川駅(災害のため前年10月18日から不通だった)