嘉吉の乱
この頃、幕府の最長老格となっていた赤松満祐は義教に疎まれる様になっており、永享9年(1437年)には播磨、美作の所領を没収されるとの噂が流れている。義教は赤松氏庶流の赤松貞村(持貞の甥)を寵愛し、永享12年(1440年)3月に摂津の赤松義雅(満祐の弟)の所領を没収して貞村に与えてしまった。
このため、5月頃に満祐は病気と称して出仕しなくなった。 同じ頃、大和出陣中の守護・一色義貫と土岐持頼が義教の命により誅殺された(大和永享の乱)。満祐は出仕しなくなったため、9月22日に侍所別当の職を罷免させられた。
義教と満祐の不和に関しては、以下のような説がある。満祐は弟の中でも乱暴者で知られた則繁と特に仲が良く、満祐は常に則繁を伴って行動していた。かつて、則繁が細川邸で暴挙に及び、将軍の義持から切腹命令が出ても、満祐は弟をかばったとされており、このため、義持・義教の2代にわたって満祐は信頼されず、むしろ温和で有能な庶流家が厚遇されたという。
嘉吉元年(1441年)4月、持氏の遺児の春王丸と安王丸を擁して関東で挙兵し、1年以上にわたって籠城していた結城氏朝の結城城が陥落した(結城合戦)。捕えられた春王丸、安王丸兄弟は、護送途中の美濃垂井宿で斬首される。これより先の3月、出奔して大和で挙兵し、敗れて遠く日向へ逃れていた義教の弟の大覚寺義昭も島津忠国に殺害されており、義教の当面の敵はみな消えたことになった。