牟岐線
1990年(平成2年) 11月3日:二軒屋駅 - 地蔵橋駅間に文化の森駅開業。 11月21日:高速化(最高運転速度110km/h)工事が完成し、特急「うずしお」3往復乗り入れ開始、海部駅までは下り1本、上り2本の運転となる。急行「阿波」廃止。
1992年(平成4年)3月26日:阿佐海岸鉄道阿佐東線との直通運転開始。
1998年(平成10年)3月14日:特急「剣山」が牟岐線および阿佐海岸鉄道阿佐東線乗り入れ開始。
1999年(平成11年)3月13日:特急「うずしお」を系統分割し特急「むろと」運転開始。
2002年(平成14年)7月1日:「阿波室戸シーサイドライン」の愛称使用開始。
2005年(平成17年)7月23日:牟岐線初のトロッコ列車運転。
2007年(平成19年)10月21日:牟岐線初のリバイバル列車「急行むろと」号が運転される。
2008年(平成21年)3月15日:阿佐海岸鉄道阿佐東線への直通運転を中止。特急「ホームエクスプレス阿南」運転開始。
2009年(平成21年)12月1日:阿佐海岸鉄道阿佐東線への直通運転を再開。
2010年(平成22年)3月13日:ホーム嵩上工事完成。全線で1500・1200型気動車の運転が可能となる。
2011年(平成23年)3月12日:特急「剣山」の阿佐海岸鉄道阿佐東線への直通運転が廃止される。
2014年(平成26年)3月15日:特急「剣山」の系統分割により、牟岐線の牟岐発着特急3往復が全て徳島発着「むろと」になる。
牟岐線(むぎせん)は、徳島県徳島市の徳島駅から徳島県海部郡海陽町の阿波海南駅に至る四国旅客鉄道(JR四国)の鉄道路線(地方交通線)である。阿波室戸シーサイドライン(あわむろとシーサイドライン)の愛称が付けられている。
徳島県東部の徳島市・小松島市・阿南市を結び、さらに南東部の海岸沿いに走り県南部とを結ぶ。鉄道敷設法(大正11年法律第37号)別表第107号により「高知県後免ヨリ安芸、徳島県日和佐ヲ経テ古庄附近ニ至ル鉄道」として室戸・後免方面への延伸が計画されていたが国鉄(→JR四国)線としては海部駅までの延伸で終わった。1992年に海部駅 - 甲浦駅間が阿佐海岸鉄道阿佐東線として開業している。その後、2021年12月25日運行開始の阿佐海岸鉄道DMV導入に伴い、2020年に阿波海南駅(阿波海南信号場) - 海部駅間が阿佐海岸鉄道阿佐東線に編入されている。