怪獣自衛隊
非常に硬く耐久力があり、30mm機関砲でも有効なダメージを負わせることは困難である。ただし、生まれたばかりの幼獣であれば、30mm機関砲により殲滅することが可能である。
くれづき事件から4年後......。怪獣は尖閣諸島の南小島に現れる。海上保安庁の巡視船「やえやま」が姿を捉えるが、見守るしかない中、怪獣は南小島に上陸する。そこに中国の海警船が数隻現れ、30mm機関砲で応戦するも、怪獣の突進を受けて沈没する。海警船を襲う怪獣の映像は中国のテレビ局が報じ、世界は「怪獣の存在」を知ることになる。
そのころ、尖閣諸島の南方、西表島近海を航行していた豪華クルーズ船「富岳」は、多くの乗客を乗せていた事から怪獣の襲撃を受ける。政府は内閣対策本部を組織するが、国際協調路線の神谷総理大臣は自衛隊の出動をためらう。艦橋のスタッフは怪獣に喰われて指揮系統を失い、船底に張り付いた怪獣は複数の触手を出して乗客を次々に捕食していく。
一方、海上自衛隊の弘原海海将補は、特殊回線にて富岳に乗船している任官前の幹部候補生・防人このえに連絡を取り、富岳の情報収集・報告の任を受ける。人命救助の中で、このえは怪獣が"音"に反応していることを突き止め、乗客らを船内の映画館などに誘導する。
テレビ局の新人キャスター・佐都美沙は、乗客男性の動画配信を見て、親友のこのえに連絡し、その内容をテレビで中継する。世論が動くと判断した神谷総理は、ついに自衛隊に災害派遣として出動を要請。元くれづき砲雷長の大和2佐も乗艦する「あけづき」が現場に急行し、新型の18式魚雷を富岳の船底に張り付く怪獣に発射し、怪獣を粉砕・駆逐する。