本線料金所
現在は、基本的に大阪方面は堺本線料金所で、和歌山方面は岸和田本線料金所での料金収受となる。
和歌山本線料金所(阪和自動車道) 以前は海南ICに料金所はなく、和歌山ICおよび和歌山本線料金所にて海南ICの役割をしていた。和歌山IC - 大阪方面の通行は一般的な入口発券方式だったが、和歌山IC - 海南IC方面は和歌山ICで料金の収受(海南ICへは当ICで前払い、海南ICからは当ICで後払い)を行っていた。海南湯浅道路の開通によって海南ICに料金所が新設されたため本線料金所は廃止。
海南東本線料金所(阪和自動車道) 以前は本線上に料金所はなく、海南東ICへの出入りのみ料金所が存在していたが、当IC - 大阪方面は一般的な入口発券方式、海南湯浅道路は前払い方式であったため、海南湯浅道路の各ICが入口発券方式に切り替わるまでの間、暫定的に設置されていた。
南郷本線料金所(京滋バイパス) 大山崎ジャンクションまでの開通に伴う料金収受方法変更(単純支払い方式→高速国道と共通の入口発券方式)により廃止。
尼崎集約料金所(阪神高速3号神戸線) 料金制度の変更に伴い、料金を収受する対象が武庫川入口からの車のみとなっていたため、武庫川入口に料金所を設置した上で、2016年11月の集中工事に合わせて廃止。
南芦屋浜本線料金所(阪神高速5号湾岸線) 2017年1月、甲子園浜出入口の入口料金所設置に伴い廃止。
徳島本線料金所(初代)(徳島自動車道) 徳島IC - 藍住IC間開通の際に徳島ICを利用する車両の通行料を収受するために設置されたが、四国横断自動車道徳島IC - 徳島JCT - 鳴門JCT延伸に先立ち廃止、徳島ICに料金所が移設された。