ムスタアリー
アフマドにとって最年長の異母兄にあたるニザール・ブン・アル=ムスタンスィルは、従来の慣例に従って父の後継者として当時は確実視されていたとみられ、実際に現代の複数の歴史家もしばしばニザールが父の後継者に指名されていたと指摘している。しかし、ムスタンスィルの死の時点までにニザールが正式に後継者として指名されていたという記録はなく、バドル・アル=ジャマーリーとその息子で後継者のアル=アフダル・シャーハンシャーフ(英語版)はアフマドの即位を支持した。バドルは1094年6月21日に死去し、これを機に権力を取り戻そうとしたムスタンスィルはバドルの奴隷軍人の一人をワズィールに任命しようとしたが、この任命はバドル配下の軍団から拒絶され、軍団の恫喝に屈したカリフは最終的にアル=アフダルをワズィールに任命した。また、ムスタンスィルは死の直前にバドルの娘のシット・アル=ムルクとアフマドの結婚にも同意した。
ムスタンスィルはシーア派の最も重要な祝祭であるイード・アル=ガディール(英語版)の日にあたる1094年12月29日に死去した。マムルーク朝時代の歴史家のアル=マクリーズィーによれば、アル=アフダルはアフマドを即位させ、アル=ムスタアリー・ビッラーフ(神に育てられし者)の名とともにカリフの地位を宣言した。そしてムスタンスィルの息子たちの中で最も著名な人物であったと思われるニザール、アブドゥッラー、およびイスマーイールの3人を宮殿に呼び寄せ、弟に忠誠を誓うように求めた。しかし、3人とも父によって後継者に指名されていたと主張して忠誠の宣言を拒否した。アル=アフダルにとってこのような拒否反応は完全に想定外だったとみられ、宮殿から兄弟たちが立ち去ることすら為すがままに認めた。
ムスタアリーはその治世をアル=アフダルに対する従属の中で過ごした。13世紀のエジプトの歴史家であるイブン・ムヤッサルは、「アル=アフダルはワズィールというよりもスルターンや王のように国政を司ったため、ムスタアリーには特筆すべき事蹟がなかった」と記している。アル=アフダルは公的な儀式においてでさえカリフに取って代わり、ムスタアリーを人目に触れさせず宮殿に閉じ込めていた。
その一方でアル=アフダルは有能な統治者であり、その優れた統治によってムスタアリーの治世を通じてエジプトの継続的な繁栄を確かなものにした。ムスタアリーは同時代のスンニ派の歴史家であるイブン・アル=カラーニスィー(英語版)によってその公正な人格を賞賛されているが、他の中世の歴史家はムスタアリーのシーア派に対する狂信的なまでの宗教的情熱を強調しており、その治世におけるイスマーイール派の教宣活動は非常に活発であったとみられている。また、15世紀のイエメンのタイイブ派の宗教指導者で歴史家のイドリース・イマードゥッディーン(英語版)は、ムスタアリーとイエメンのイスマーイール派のダアワ(特にアルワー・アッ=スライヒーと現地のダーイーのヤフヤー・ブン・ラマク・ブン・マーリク・アル=ハンマーディー)の交流関係について多くの情報を伝えている。