半蔵門駅
都03系統:晴海埠頭行き・東京駅丸の内北口行き/四谷駅行き
宿75系統:三宅坂行き/新宿駅西口行き
島式ホーム1面2線を有する地下駅である。コンコースおよび改札階は地下2階、ホーム階が地下3階にそれぞれ位置し、エレベーター・エスカレーターが設置されている。改札口は3か所あり、うち1か所はエレベーター利用の際の専用改札となっている。ホームの駅名標周りには、国立劇場の定式幕(緞帳)をイメージした緑色・柿しぶ色・黒色のデザインパネルを配置している。半蔵門方面改札の改札内には歌舞伎の鏡獅子壁画レリーフを、改札外には半蔵門付近の地上風景をイメージした壁画レリーフを配置した。
1982年(昭和57年)12月の開業当初、2番線は降車専用ホームであった。押上方には引き上げ線1線(折り返し用)と開業前の本線2線が留置線として運用された。この開業に伴い、青山一丁目 - 永田町間で実施されていた変則な単線運転は解消された。この引き上げ線は現在も残されており、現行ダイヤでは朝ラッシュ時に渋谷駅方面からの列車の1本が当駅で折り返す。また、夜間にも引き上げ線に留置される車両がある(回送入庫、翌朝の当駅始発の押上行きとなる)。