ボラー連邦
やがてガルマン星を発見したアベルト・デスラーから交渉を持ちかけられ、ボラーの発展への貢献を見返りに星の譲渡を求められるが、ボラー側はガミラスもガルマンと同じ立場に貶めようとしたため、交渉決裂を見たガミラス側は武力をもってガルマン星を制圧し、ボラーは支配権を失うこととなる。しかし、ボラーがこのまま黙って引き下がるはずがないとガミラスは考えており、両国間には緊張状態が続いている。
また、『宇宙戦艦ヤマト」という時代 西暦2202年の選択』で描かれた前史において、第一次内惑星戦争時に火星側が開発した戦闘艦が過去に火星へ漂着した異星文明の宇宙船を技術的ルーツにしているという設定が語られる(「証拠が抹消されているため真偽不明」という体裁を取っているが)。この異星船がボラー連邦の戦闘艦であり、火星艦およびその設計コンセプトを真似た地球艦がボラー連邦の艦をルーツとしていることが示唆されている。
第15〜18話でガルマン・ガミラス帝国とヤマトが一応の和解を果たしたため、この時期を境にヤマトから見た敵味方が逆転する格好となった。
第22話において、惑星ファンタムに流刑していたシャルバート星の王女ルダがヤマトに乗り込んだと知ると、その身柄を確保するために艦隊を派遣。しかし出撃したハーキンス艦隊・バルコム艦隊のいずれも壊滅し、最終的にゴルサコフ艦隊がヤマトを追尾して辿り着いたシャルバート星の占領を企むも、デスラー艦隊によって防がれる。
最終話ではベムラーゼ自ら機動要塞を以て出陣し、デスラーを誘い出すという目論見の下、太陽系に置いてヤマトを襲撃する。デスラーを誘き出すこと自体には成功し、その艦隊をほぼ壊滅へと追いやるも、ヤマト艦載機(揚羽武)が要塞に特攻し、その隙に発射されたデスラー艦のハイパーデスラー砲によってベムラーゼもろとも要塞は葬られた。
直後にヤマトが暴走する太陽の制御を成功させて地球を救った物語が締めくくられるため、ガルマン・ガミラスとボラーの銀河系大戦の顛末は描かれずに終了する。
宇宙艦艇の塗装は基本的に紫色で、旗艦のみ赤色である。戦艦の形状は、紡錘状とイモムシ状の中間の形態で水色のA、B 2タイプがある。装備されている光線砲には、ボラーチウム100という放射線が含まれており、光弾色は黄緑。砲は平時は艦内に格納されており、戦艦Aタイプなどの板状の無砲身のものと、戦艦Bタイプなどの有砲身のものとがある。固定式の大口径砲は特に「ボラー砲」と呼称されている。
格納式砲塔は使用する時にのみ外部へ展開するが、基本的に左右に旋回できないため、上下方向以外へ発射角度を変えるには艦体ごと傾ける必要がある(そのため正確には「砲塔」と言うより「砲郭」である)。
本国艦隊には、高級幹部専用旗艦や惑星破壊ミサイルを搭載する大型戦艦、ミサイル「スペース・ロック」を装備するデストロイヤー艦などの新鋭艦が配備されている一方、植民星に配備されている艦船の規模は本国艦隊より劣っているような描写がある。なお、演出上の都合もあり、個艦性能の描写に関しては各話ごとにばらつきが見られる(これはボラー艦に限った話でもない)。
メカデザインは主にサブマリンが担当しており、直線を好む板橋克己がデザインしたガルマン・ガミラスのメカとは対照的な曲線を主体としたメカが多い。しかし、ガルマン・ガミラスのメカデザインが一段落して以降ボラー側のメカも板橋が担当したため、シリーズ後半から登場したメカは直線主体のものが多くなっている。