卵菌
菌体の体制はさまざまであり、単細胞で全実性(全体が遊走子嚢など生殖器官になる)のものから、発達した菌糸を形成するもの(下図2)まである。全実性のものでは、単純な球状の種から、菌糸状に細長いものや、分岐・分節化した種まである。卵菌の中で初期分岐群は全実性・寄生性であるが、ミズカビ目やツユカビ目など派生的な群では発達した菌糸をもつものが多い。ただし派生的な群の中にも、全実性・寄生性である種が含まれる。菌糸の太さはさまざまであり、直径2マイクロメートル (μm) 程度のものから、150 μm に達するものまである。菌糸は先端成長を行い、ときに分枝し、ふつう隔壁を欠く無隔菌糸であるが(下図2)、古くなった部分や生殖器を区切る隔壁が形成されることもある。菌糸性で絶対寄生性の種の多くは、宿主細胞間に菌糸を伸ばし、宿主細胞内に吸器を挿入する(下図2c)。
菌体はふつう細胞壁に包まれるが、寄生性の初期分岐群の中には、栄養体(通常時の体)が宿主内で細胞壁を欠く多核細胞(変形体)として生きている例もある。卵菌の細胞壁はおもにセルロースとβ-グルカンからなる。ただし一部の種からはキチンも報告されており、またゲノムの調査からは全ての卵菌類がキチン合成酵素をもつことが示唆されている。フシミズカビ目では、菌糸のくびれ部分にキチンを含むセルリン顆粒が存在することがある。