コッズの日
しかし、パレスチナ難民の問題や国境の確定などについては、暫定自治の時期中に協議されるとして解決は先送りにされた。
1994年以降、ガザとヨルダン川西岸でパレスチナ自治が開始された。外国の援助による難民キャンプのインフラ整備も徐々に進み始んだが、細分化された「自治区」の多くは依然としてイスラエル軍の占領下にあった。そして、自治政府の腐敗や非効率性がパレスチナ経済の発展を阻害した。一向に変わらない状況への強い不満を背景に、武装組織によるイスラエルへの攻撃が続けられた。それらに対し、イスラエル側は激しい報復措置とさらなる自治区封鎖を行った。多くのパレスチナ人が刑務所に収容され、入植地の建設はさらに活発になっていった。
2000年、PLOのアラファト議長とイスラエルのバラク首相によるキャンプ・デービット会議が不調に終わり、パレスチナ人の間に失望感が広がる。同年、イスラエル右派のアリエル・シャロン元国防相が一団の武装集団を引き連れてエルサレムのイスラム教聖地を強行訪問し、パレスチナ人の怒りが再燃した(「第二次インティファーダ」のはじまり)。イスラエル側は重火器を投入して一般市民を攻撃し、パレスチナ側では自爆攻撃が相次いだ。
イスラエルで2001年にシャロン政権が誕生し、2002年4月にはパレスチナ自治区への武力攻撃がかつてない規模で開始される。戦車や戦闘機が大量投入され、多数の非武装市民が犠牲になった。2005年、ガザ地区からイスラエル軍・入植者が撤退した。
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