トウキョウサンショウウオ
以前はカスミサンショウウオの亜種とされたり、愛知県に隔離分布するとされたりしていた。現在のあきる野市域では、カスミサンショウウオの亜種ではなく新種と確認される前は、魚類のカジカに顔つきが似ているため「ヤマカジ」と呼ばれていた。
1987年に発表されたアロザイムの分子系統解析では、本種はトウホクサンショウウオに近縁で、愛知県の隔離個体群はカスミサンショウウオに近縁とする解析結果が得られた。2001年に発表されたミトコンドリアDNAの分子系統解析でもこの結果が支持された。2006年の時点では、愛知県の隔離個体群とされていたのはカスミサンショウウオとする説が有力とされる。2019年にはカスミサンショウウオの、東海地方南部から近畿地方東部個体群を、ヤマトサンショウウオH. vandenburghiとして分割する説が提唱されている
種内ではミトコンドリアDNAの分子系統解析から、北部個体群(茨城北部、福島南部)と南部個体群(神奈川、埼玉、千葉、東京、栃木)の2つのグループに大きく分かれると推定されている。2022年7月21日、北部個体群はイワキサンショウウオという新種であることが確認された。
宅地開発、ゴルフ場や道路の建設による生息地の破壊により生息数が減少し、1990年代以降は谷津田(谷間の水田)の耕作放棄地化による繁殖地の乾燥化、人為的に移入されたアライグマやアメリカザリガニによる捕食、ペット用の乱獲などによっても生息数は減少している。 2020年に種の保存法によって国内希少野生動植物種のうち特定第二種国内希少野生動植物種に指定され、販売・頒布目的での捕獲や譲渡が禁止されている。
絶滅危惧II類 (VU)(環境省レッドリスト)
東京都下では、あきる野市が2018年に独自で策定したレッドリストで環境省より危機の度合いが1ランク高い絶滅危惧IB類に位置付けたほか、日の出町が町の天然記念物に指定している。
研究・保護団体としてトウキョウサンショウウオ研究会がある。生息地では、自治体職員や有志により、アライグマ駆除やビオトープ造成といった保護が行なわれている地域もある。
茨城県、神奈川県、埼玉県、千葉県、東京都、栃木県および福島県の一部に分布する。模式標本の産地(模式産地)は東京都西多摩郡。種小名tokyoensisは「東京産の」の意。