林原自然科学博物館
「生物の歴史から人間を考える」という目標の下 で古生物学分野の研究を行っており、モンゴル古生物研究所の設備と人材育成に協力し、モンゴル科学アカデミーと共同でのゴビ砂漠における恐竜化石発掘調査 や、モンゴル産古脊椎動物標本の日本国内での研究を行っていた。具体的な研究成果としては植物食性恐竜の営巣行動、大型獣脚類の個体発生、オルニトミムス科をはじめとした非鳥類型獣脚類の姿勢の解明、ハドロサウルス上科の恐竜ゴビハドロスの発見 などが挙げられる。また、2006年に始められた丹波竜(タンバティタニス)の発掘では同館が発掘の技術指導や技術移転を担当した。
約20年間の運営の間に博物館に収蔵された標本数は約1万点におよんだ。2011年に日本古生物学会の当時会長であった加瀬友喜は2001年に記載されたヘスペロサウルスのタイプ標本が特に保存すべきものの筆頭であると主張し、同館が脊椎動物化石研究の重要拠点であると述べた。
また、古生物学以外の学問分野においては京都大学霊長類研究所と連携した行動生物学や脳科学の分野の研究も行われていた。