武田耕雲斎等墓
処刑後間もない3月に、敦賀の永建寺・永賞寺・永厳寺・真禅寺は処刑者を弔う法要を行なった。その後、苛烈な処置に世間・諸藩からの批判が高まったためか、翌1866年(慶応2年)5月15日、小浜藩預かりとなっていた約110名が准藩士として罪を赦され、衣服や金子などの支給を受けて永厳寺に身柄を移され、同年5月26日から1867年(慶応3年)5月まで敦賀に滞在、その後美方郡佐柿に移された。彼らは、約8か月後の1868年(明治元年)1月に水戸藩への帰藩を許された。
1868年(明治元年)2月、北陸道鎮撫使が立ち寄った際、香華料を備え、墳墓の改修を命じた。また1875年(明治8年)には、刑死者353名に加え、戦死・戦病者も合わせた411名の水戸烈士を祀った松原神社の建立が許可された。1878年(明治11年)10月10日、明治天皇が北陸巡幸時に祭祀料金5百両を下賜したことから、以後10月10日を例祭の日としている。1896年(明治29年)、松原神社の本殿が墳墓前に竣工し、1914年(大正3年)に松原神社は、現在の位置である市道を挟んだ西側に移転した。なお、墳墓の階段を上がった入口に設けられていた鉄製の門扉は、戦時中の金属供出により失われたが、現在でも門柱は残っている。