ウィリアム・ヘンリー・ムーディ
その後ムーディは、セオドア・ルーズベルト政権の1902年から1904年まで合衆国海軍長官を、1904年から1906年まで合衆国司法長官を務めた。ムーディは司法長官として、積極的にルーズベルト大統領の反トラスト運動政策に従った。ムーディはUSスチールなどを「良い」独占として折衝にあたった。その一方でスタンダード・オイルなどを「悪い」独占として訴追した。
ルーズベルト政権終了後、後任となったウィリアム・タフト大統領は、ムーディを合衆国最高裁判所の陪席裁判官に任命した。ムーディは1906年12月17日に議会の承認を受けた。
ムーディは陪席裁判官を1910年まで4年間務め、67件の主文理由および5件の反対意見を作成した。ムーディの見解において最も注目されたものは、1908年の雇用者責任を争った事件についての、少数派意見としての見解であった。ムーディは、連邦議会が雇用者―従業員間の雇用関係を法制化する権限について、州間通商を規制する権限の範疇にあるとの見解を示した。またムーディは基本的には合衆国政府が強い権限を有することを支持していたが、その一方で合衆国憲法の規定である自己負罪の拒否特権(修正第5条)について、その効力は連邦の手続きについてのみ及ぶものであり、各州の手続きにおいてはその適用はないとした。
ムーディは1908年頃から重度のリウマチを患った。ムーディは1909年5月7日に法廷を座ったのを最後に、療養のため第一線から離れた。そして1910年11月20日、ムーディは正式に最高裁判所陪席裁判官の座を退いた。
1895年、ムーディはマサチューセッツ州代表として合衆国下院議員に選出された。ムーディは1902年まで合衆国下院議員を務め、下院歳出委員会で精力的な活動を行った。