IRいしかわ鉄道
津幡駅(JR西日本との共同) 倶利伽羅駅(あいの風とやま鉄道との共同)
その後は3社がそれぞれ指令システムを整備し、自社で業務を行っている。
あいの風とやま鉄道との間で金沢駅 - 倶利伽羅駅 - 富山駅間において相互直通運転を実施している(一部列車はえちごトキめき鉄道日本海ひすいラインの一部区間にも直通するが、これはあいの風とやま鉄道の車両を使用しているため、IRいしかわ鉄道所属車両はえちごトキめき鉄道日本海ひすいラインには入線しない)。また金沢駅 - 津幡駅間を直通するJR西日本の七尾線の普通列車については、2020年秋から2021年春にかけて後述の新型車両をJR西日本とIRいしかわ鉄道の両社が導入して旧車両を置き換え、同区間の運行業務をJR西日本が受託する方式で運行している。また同線の特急列車として、大阪駅 - 和倉温泉駅間の特急「サンダーバード」1往復、金沢駅 - 和倉温泉駅間の特急「能登かがり火」4往復の、1日計5往復が乗り入れている。また、2015年10月より観光列車として金沢駅 - 和倉温泉駅間の特急「花嫁のれん」が土曜・休日など多客期を中心に1日2往復運行されている。
自社各駅(自社窓口)からの連絡運輸区間は以下の通りとなっている。
凡例
○...自社窓口・券売機で取り扱い可能 但し、無人駅設置の券売機では、連絡運輸範囲内かつ設置駅から到着駅までの累計営業キロが合計100km以内の乗車券のみを取り扱っている。
△...自社線を通過しないが接続駅のみ窓口・券売機で発券可能。
※...自社線を通過しないため、自社各駅での取り扱いなし。他社で取り扱いあり。
×...取り扱いなし。