出雲市駅
島式ホーム2面4線を有する高架駅で、駅舎北口のエントランスは出雲大社をイメージしている。直営駅でみどりの券売機プラス並びにみどりの券売機が設置されている。
駅北口側にはセブン-イレブン ハートイン JR出雲市駅店(2016年10月7日オープン)がある。
通路側に「出雲の国麺屋」がある。出雲市駅では合名会社黒崎が駅構内で蕎麦屋「出雲そば黒崎」を経営するとともに駅弁を販売していたが2018年9月に廃業し、その後、地元の「出雲の国麺屋」(スサノオラーメン・出雲そば等)がテナントに入って開業するとともに松江駅で駅弁を販売している一文字家の委託を受けて駅弁も販売している。
なお、駅南口側にレストラン「カフェレストいずも」があったが、2022年8月26日で閉店した。
駅構内中央部分の東側に接続して「アトネスいずも」があり、山陰のお土産物を中心に扱う西館、さらにその東側に専門店が入る東館が連続している。