文章院
文章院の構造は中央部に講堂にあたる北堂が置かれ、左右に寄宿舎部分にあたる東曹・西曹が設置されていた。通常は北堂において授業が行われて、東西両曹及び大学院の外の大学別曹から文章生が集まって授業を受けていたとされている。また、関係者のための儀式・宴会も行われた。
当初は学生が東西いずれの曹に属するかという規定は定まっていなかったが、文章生が文章得業生となり対策を受ける際には所属する曹とは反対の曹の文章博士から出題を受けることとなっていたため、当然その頃にはいずれかの曹に属していなければならなかった。これは同じ曹を管理する博士が試験官になった場合に不正が行われる可能性があったためと考えられている。有名な例では、貞観12年(870年)に行われた西曹に属する菅原道真の対策の出題博士は東曹の都良香であった。逆に道真も文章博士就任後、元慶5年(881年)に東曹の三善清行、同7年(883年)には同じく東曹の紀長谷雄の対策に際して出題を行っている。
やがて、菅原・大江氏の分掌支配が確立するにつれて、氏族ごとに所属する曹が固定されるようになっていった。『二中歴』には「儒有七家」として以下の氏が挙げられている(カッコ内は『二中歴』には挙げられていないものの、著名な家を掲げる)。
東曹...大江氏・三善氏・紀氏・藤原南家・藤原式家(蔵下麻呂流)・藤原北家(魚名流)・高階氏(都氏・三統氏・小野氏など)
西曹...菅原氏・橘氏・藤原式家(清成流)・藤原北家(日野流)(平氏・滋野氏・善滋氏・菅野氏など)
東曹に属する諸家と西曹に属する諸家はそれぞれ連携して自派の勢力拡大に務めた。こうした傾向が学閥化を則し、結果的には他氏族の排除・家学化を促すことになる。