在スラバヤ日本国総領事館
1949年12月27日、4年以上にわたるインドネシア独立戦争を経て、オランダがオランダ領東インドの放棄を受諾してインドネシアの独立を承認する。
1952年4月28日、サンフランシスコ平和条約の発効により日本国が独立する。
1952年8月5日、在スラバヤ日本国領事館が再開され、同日に在ジャカルタ日本国総領事館も開設される。
1958年4月15日、日本国とインドネシア共和国との平和条約及び日本国とインドネシア共和国との間の賠償協定が発効し、日本とインドネシアの国交が樹立される。
1979年、スラバヤの領事館が在スラバヤ日本国総領事館に昇格する。
1980年、バリ島の州都デンパサールに在スラバヤ日本国総領事館所轄の在デンパサール出張駐在官事務所(在デンパサール駐在官事務所)が開設される。
2006年1月1日、デンパサールの出張駐在官事務所及びその管轄地域が在スラバヤ日本国総領事館の所轄から外れて、在デンパサール日本国総領事館に昇格する。
2009年1月1日、前年末に閉鎖された在マカッサル日本国総領事館に代わって、在スラバヤ日本国総領事館所轄の在マカッサル出張駐在官事務所が開設される。
2014年8月1日、在マカッサル出張駐在官事務所が在マカッサル領事事務所に改称される。