ハマギギ科
本科内の系統関係は未だ明確ではない。本科に属していた属のうち、Gogo 属とAncharius 属の2属は新たに独立のAnchariidae科に移されている。ハマギギ科は二つの亜科に分けられる。ひとつはGaleichthys 属のみを含むGaleichthyinae亜科であり、もうひとつがその他の全ての属を含むハマギギ亜科(Ariinae)である。
Nelson(2006)は、本科をパンガシウス科やギギ科とともにギギ上科(Bagroidea)に分類した。ただし、前述のAnchariidae科と本科をまとめて、Arioidea上科に分類する分類も提唱されている。