アニメシャワー
2000年代に入るとUHFアニメを筆頭に深夜アニメ番組の市場規模が拡大し、同じTBS系列のTBSテレビ(TBS)や中部日本放送→CBCテレビ(CBC)においてもUHFアニメ及び深夜アニメ事業に乗り出したことで1週間で放送する作品数そのものが急増した。
そんな中、本局の日曜未明(土曜深夜)帯は音楽番組も放送していたので深夜アニメは最大4枠(2006年10月より放送開始した木曜深夜自社製作枠を含めても5枠)までしか確保出来ない状態が続き、放送番組を賄い切れない状態に陥り出す。
その結果、TBSや中部日本放送→CBCテレビ製作の深夜アニメ番組の一部を本局が放送しない事態となり、独立局(サンテレビ・KBS京都)での放送がTBS製作については現在でも続いている。中には関西圏での放送自体が無い作品もある。
放送開始当初から放送休止等による遅れ放送が目立った。放送開始は10月第3週からだったこと、本局では日曜未明(土曜深夜)に特番を放送することが多かったこと、年末年始と春休みに映画を放送していた事など放送休止が多く、休止分だけ放送日が遅れそのまま次回作品に持ち越していた。その結果、他の放送局と比べての遅れ日数の差が拡大することが恒常化した。
例えば全26話放送した第1作『フォーチュン・クエストL』は1997年10月19日に第1話を放送し、1998年5月24日に最終回となる第26話を迎えた。2000年10月からの第2部『デビルマンレディー』の再放送は全26話(6か月)の放送に7か月半(2000年10月22日 - 2001年6月3日)も掛かっている。2003年・2004年の第2部はUHFアニメを中心に放送したが、2年間(8クール)で7クール分の作品しか放送していない。
さらに2019年7月期には全国ネット向けの『スーパーアニメイズム』枠を1本新設し、2020年1月には『アニメイズム』枠が設置された木曜深夜に深夜アニメ枠を再設置したことにより『アニメ特区』3本、木曜深夜枠1本、『スーパーアニメイズム』1本・『アニメイズム』2本・関連枠1本、本枠4本と2023年現在では最大で12本まで賄える体制となっている。
また、放送休止を見越して連続放送を行うことで遅れを最小限に留めている。一例として2009年8月の世界陸上中継で2週間休止した為に6月 - 9月にかけて随時2話連続放送を実施し、放送終了を30分遅らせて5:28までとした。Jリーグ中継では後続の『Channel-a』(2009年9月放送終了)を日曜に振り替えた。2010年9月26日には『ザ・プロ野球』が深夜に編成されたが、『COUNT DOWN TV』を休止させて当枠の放送を維持した。TBS系列の大型音楽特番『音楽の日』が放送される日も振替放送などで対応している。以下はその具体例である。