2006年の鉄道
9月1日 京王電鉄・東京都交通局 京王線系統・井の頭線・都営地下鉄新宿線ダイヤ改正
9月25日 東京急行電鉄・東京地下鉄・東京都交通局・埼玉高速鉄道・横浜高速鉄道 東急東横線・目黒線系統で乗り入れ線区を含めてダイヤ改正。目黒線に急行列車の運転を開始。
9月28日 東武鉄道 小泉線 館林駅 - 西小泉駅間でワンマン運転開始。
1月5日 東日本旅客鉄道秋田支社 (終日運休) 雪の影響で除雪が間に合わず、奥羽本線(新庄駅 - 大館駅間)、羽越本線(酒田駅 - 秋田駅間)と男鹿線、五能線、田沢湖線、北上線のすべての区間で終日運休した。
1月7日 西日本旅客鉄道広島支社・九州旅客鉄道鉄道事業本部 (事件)未明に下関駅放火事件が発生。下関駅舎・下関乗務員センターなどが全半焼した。線路設備の焼失により、山陽本線(小月駅 - 門司駅間)・山陰本線(幡生駅 - 滝部駅間)で終日運休。下関駅を経由する寝台列車は7日の下り列車は新下関駅で打ち切り、7日の上り列車と8日の上下の列車が運休。ダイヤ乱れは翌8日まで続いた。
1月19日 東日本旅客鉄道 (運転再開) 羽越本線 鶴岡駅 - 酒田駅間(2005年12月25日の脱線転覆事故以来不通だった)
1月22日 神戸電鉄 (事故) 有馬線 唐櫃台駅 - 有馬口駅間で、上り回送電車が脱線する事故が発生。
1月24日 西日本旅客鉄道 (事故) 伯備線 根雨駅 - 武庫駅間で、保線作業中の係員4名が下り特急「スーパーやくも9号」にはねられて、3名が死亡する事故が発生。
2月4日 神戸電鉄 (事故) 有馬線 有馬口駅構内で、下り三田行普通電車が脱線する事故が発生。 現場近くでは、1月22日にも上り回送電車が脱線する事故が発生したばかりであった。
4月11日 三岐鉄道 (事故) 北勢線 東員駅 - 大泉駅間の橋梁付近で下り西桑名発楚原(本来の行き先は阿下喜行きだったが、大雨のため楚原止めで運転)行き電車が脱線事故。
4月13日 三岐鉄道 (運転再開) 北勢線 大泉駅 - 阿下喜駅間
ブルーリボン賞:小田急50000形電車
ローレル賞:名鉄2000系電車、愛知高速交通100形電車、広島電鉄5100形電車、福岡市交通局3000系電車
グッドデザイン賞:台湾高速鉄道700T型電車(商品デザイン部門)、富山ライトレール(建築・環境デザイン部門)
4月14日 ゆりかもめ (事故) 東京臨海新交通臨海線 船の科学館駅付近でタイヤ脱落のため車両が突然停止。
4月17日 ゆりかもめ (運転再開) 東京臨海新交通臨海線(全線)
5月23日 三岐鉄道 (運転再開) 北勢線 東員駅 - 大泉駅間
6月13日 東京都交通局 (事故) 都電荒川線 梶原電停 - 栄町電停間で、下り線に停車中の試運転電車に三ノ輪橋発早稲田行電車が追突。乗客26人が負傷(うち1人が骨折)した。
6月27日 東海旅客鉄道 (事故、不通) 名松線 伊勢大井駅 - 井関駅間で、10時30分頃、伊勢奥津駅発鳥羽駅行きの2両編成の列車が線路上の落石に衝突。乗客14人と運転士に怪我はなし。列車は自力走行出来ず、伊勢奥津駅 - 松阪駅間の全線で運転を見合わせ。17時以降に伊勢奥津駅 - 松阪駅間でバスによる代行輸送を実施。28日運転再開。
7月4日 甘木鉄道 (不通) 甘木線 大板井駅 - 松崎駅間(雨による橋梁の一部が傾斜したため)
7月19日 西日本旅客鉄道 (災害・不通) 三江線、芸備線備後落合駅 - 備後西城駅間(大雨の影響による災害が発生)
9月17日 九州旅客鉄道 (事故) 日豊本線 南延岡駅付近で、別府発南延岡行(所定は宮崎空港行)特急にちりん9号が脱線事故。
11月19日 西日本旅客鉄道 (事故) 津山線 玉柏駅 - 牧山駅間で脱線事故。
12月15日 西日本旅客鉄道 (運転再開) 三江線 浜原駅 - 三次駅間(大雨の影響による災害で7月20日から不通だった)
12月20日 甘木鉄道 (運転再開) 甘木線 大板井駅 - 松崎駅間(雨による橋梁の一部が傾斜したため7月4日から不通だった)