太湖汽船
大津港 - 大津町(→大津市)に所在。南隣には、湖南汽船が使用する紺屋関港があった。
長命寺港
八幡港
常楽寺港
能登川港
松原港 - 支社が設けられていたが1884年廃止。
彦根港 - 1884年、支社を設ける。
米原港 - 支社が設けられていたが1883年廃止。1889年、改めて支社を設ける。
長浜港 - 長浜町に所在。支社が設けられていた。
片山港 - 支社が設けられていたが1883年廃止。
飯浦港
塩津港
海津港
竹生島港
堅田港
和邇港 - 1924年、江若鉄道の延伸にともない寄港を開始。
勝野港(大溝港) - 1889年、勝野支社を大溝支社に改称。
船木港
今津港