ニホンカワウソ
Waku et al. (2016) は、神奈川県産と高知県産の標本を用いたミトコンドリアDNAによる系統推定により、本州以南の個体群にはユーラシアカワウソの内部(L. l. chinensisやL. l. lutra)に属する系統と、初期に分岐した系統が存在することを指摘している。
Park et al. (2019) は、具体的な科学的証拠なしにニホンカワウソをユーラシアカワウソが別種であると分類することで、将来的にニホンカワウソを歴史的範囲に復元・再導入する計画や議論の可能性を排除しかねないため、望ましくないと指摘している。
1979年(昭和54年)6月の高知県での目撃以降発見例がなく、2012年に環境省は「カワウソのような中型の哺乳類が、人目に付かないまま長期間生息し続けていることは考えにくい」という理由で絶滅動物に指定した。しかし、近年四国を中心に日本各地で確証のない目撃例が断続的に続いている。これらの生存の可能性を指摘する専門家も多い。
1979年以降の四国での主な目撃例には、新荘川で1986年(昭和61年)10月にニホンカワウソの死体が発見されている。1989年(平成元年)に須崎市で撮影され、jiCC出版局レッドデータアニマルズに掲載された3枚の写真や、1996年(平成8年)3月20日に土佐清水市の海岸で撮影されたカワウソと思われる足跡の写真がある。なお、1993年(平成5年)には、新荘川の支流でフンと食べ残しの痕跡の報告例があるが、他の動物によるものとする可能性も排除できていない。2000年代以降でも2009年(平成21年)に高知県内で有力な目撃情報がある。
1989年(平成元年)6月27日、北海道旭川市神居古潭で車に轢かれたカワウソの死体が発見された。カワウソの死体は旭山動物園で各種調査が行われたが、調査の結果飼育下にあったユーラシアカワウソであると判明した。北海道ではこのほかにも、1997年(平成9年)に釧路総合振興局管内の厚岸湖に流れ込む別寒牛川でカワウソらしき動物が目撃されたとの報告もある。