歴史地理学
戦後の日本の歴史地理学には、小牧実繁の門下生を中心とした「京都学派」と、内田寛一を祖とする「大塚学派」が存在する。「大塚」とは、筑波大学の前身である東京教育大学(旧東京文理科大学)の所在地であった文京区大塚を指す。内田寛一は京都帝国大学において小川琢治や石橋五郎に学び、文部省での職務を経たのちに近世農村研究を開始した。内田は徹底した史料実証主義に基づき、熱海初島や武蔵野新田の研究を行った。その後、彼は1933年に東京文理科大学に着任し、1946年まで教授を務めた。内田の門下生には喜多村俊夫や浅香幸雄、菊地利夫らがおり、彼らによって「大塚学派」が形成された。「京都学派」が先史や古代を主な研究対象としたのに対し、「大塚学派」は近世を中心に研究を展開した。1958年には、菊地らが中心となって「日本歴史地理学研究会(現歴史地理学会)」が設立され、浅香幸雄が初代会長となった。また、菊地は歴史地理学の方法論についても著作を残した。
1978年に東京教育大学が筑波に移転したのち、1981年に『歴史地理学調査報告』が創刊された。これは筑波大学人文社会科学研究科の授業として行われる歴史地理学実習(巡検)の調査成果をまとめたものである。実習では那須野原、秩父、銚子、三浦半島など関東縁辺の地域を対象とした野外調査が行われ、その成果は書籍としても刊行されている。2009年からは『歴史地理学野外研究』に改称され、隔年での刊行が続けられている。
農業、林業、漁業、工業、商業、流通など。
社会経済史において扱われるような対象を空間的に分析する。みかん栽培、ニシン漁業、薬種問屋、電力事業など、さまざまな対象が扱われる。食文化や地域資源など、横断的なテーマによるシンポジウムが開催されることもある。
日本の歴史地理学においては、戦後に入るまで歴史学や経済学が主流の社会経済史との接点は希薄であった。東京帝国大学経済学部を卒業後、ソルボンヌ大学地理学教室で学んだ飯塚浩二は、長らく理学部系が強かった関東の地理学界において、地理学を歴史学や経済学と結びつける役割を果たした。その後、黒崎千晴は明治期の統計資料を用いて、計量的な歴史地理学研究を行った。また、経済地理学においても歴史的観点からの研究が蓄積されている。
先史、古代、中世、近世、近代、現代
歴史地理学においては、一般的に広く用いられる歴史学的な時代区分を踏襲することが多い。かつては中世以前の研究が多かったが、徐々に新しい時代の研究が多くなる傾向にある。人文地理学会による雑誌『人文地理』には、1年ごとに前年の研究動向を概観する「学界展望」が設けられており、2009年以降、歴史地理学の動向は「先史・古代」・「中・近世」・「近・現代」の3区分から解説されていた。しかし、中世以前の研究が減少してきたことを受け、2016年の学界展望からは「近世以前」と「近・現代」の2区分に再編成された。
歴史地理学では、主に考古学が扱ってきた考古資料を用いることもある。また、過去の自然環境を扱う分野では、ボーリング資料、花粉、放射性炭素、プラント・オパールなども用いられる。そのほか、対象地に残る建築物や石造物といった景観要素の分析や、聞き取り調査なども行われる。