ザンジバル保護国
また、この年ケニア沿岸部のタカウングにてマズルイの乱が発生、6月にはザンジバル総督アーサー・ヘンリー・ハーディングによりザンジバルからも160人の出兵が行われた。
1896年8月25日、ハマド・ビン・スワイニーの没後ハーリド・ビン・バルガッシュが即位するも、直後のイギリス・ザンジバル戦争でその座を追われ、8月27日にはハムード・ビン・ムハンマドがスルターンとなった。1897年4月5日には、奴隷制度と奴隷貿易が終焉を迎えている。
ハムード・ビン・ムハンマドは1902年7月18日に没し、勉学のためイギリスに送られていた子のアリー・ビン・ハムードが後を継いだ。アリー・ビン・ハムードは旅行者として知られ、主にヨーロッパを旅したが病弱であり、1911年12月16日いとこのハリーファ・ビン・ハルーフに譲位した。
ハリーファ・ビン・ハルーフは、1913年に議長をスルターン、副議長を総督代理(Resident、領事もしくは総領事に相当)とする保護国議会を設立した。なお、1913年7月には、管轄が外務省から植民地省に移管されている。第一次世界大戦においてはザンジバルへの影響は微細なものにとどまったが、第二次世界大戦では物資の欠乏に悩まされることとなった。
1920年7月23日、イギリス領東アフリカの内陸部が直轄地に変更された。その一部がケニア植民地となったことでスルターンは地域に対する主権を喪失したが、沿岸部の10マイル幅の地域はなおスルターンとの合意によりザンジバルに属していた。