BS-TBS
BS-iとしての開局から間もない2001年10月期に『まほろまてぃっく』を放送して以降、長年に渡り深夜アニメを放送している。2006年10月期・2007年1月期の『Kanon』まではTBSテレビで放送しない独自の作品もあった。それ以降も過去にTBSテレビが製作した旧作の新作エピソードを特別番組として独占放送することがある。2012年4月期から2013年1月期までの一部の作品には本局も製作協力として参加した。かつてBS-i時代には現在のBS11の『ANIME+』枠の様なCM明けのロゴアニメーションの表示が一部作品を除いて実施されていた。
TBS系列局のMBSが製作した深夜アニメについては、2012年1月期の『妖狐×僕SS』よりネットを開始した。翌4月期より、製作局のMBSに準じて『アニメイズム』の枠名称が導入された。本局の公式サイト内の「アニメ」のページには2016年1月期から2023年4月期までのMBS製作の作品は掲載されていない。
2019年7月期以降はTBSテレビで旧作の再放送を行う場合があるが、本局では遅れネットを行わない。また同年10月期以降はTBS製作の深夜アニメ枠(旧『アニメリコ』枠)の一部の作品にBS11が関与する様になった関係で、該当する作品が本局ではなくBS11でネットされており、2021年以降は、時期によって本局でTBS製作の作品が一切放送されないことがある。
TOKYO MXなどの独立局を中心に放送されるアニメ番組群(いわゆるUHFアニメ)については放送に消極的で、TBSテレビが製作委員会に参加している一部の作品と2022年10月期の『悪役令嬢なのでラスボスを飼ってみました』を放送したのみに留まっている。