東海道本線
羽沢横浜国大駅が開業しJR東日本と相鉄との境界駅となる。
2020年(令和2年)3月14日: 【東】高輪ゲートウェイ駅(山手線・京浜東北線)が開業。 【海】御厨駅が開業。
2023年(令和5年) 2月13日:【西】梅田貨物線の新大阪駅 - 福島駅間が地下化。梅田信号場は前日の2月12日を以って廃止とし、新駅(大阪駅地下ホーム)の開業までは同駅構内を信号場と同じ扱いで運用。 3月18日:【西】梅田貨物線 旧・梅田信号場の地点に大阪駅地下ホームが開業。 8月5日:【東】大船駅 - 藤沢駅間で21時24分ごろ、線路上に垂れ下がっていた架線が小田原発横浜行きの臨時列車(15両編成)の先頭車両に引っかかり、架線に引っ張られて折れた電柱がぶつかって先頭車両前部が破損。停電が発生し熱中症の疑いなどでこの列車と後続列車の乗客計9人が病院に搬送。翌6日8時に運転を再開。
2024年(令和6年)4月1日:【貨】名古屋港線(山王信号場 - 名古屋港駅間全線)が廃止される。
2031年(令和13年)頃:【東】東京駅 - 田町駅間列車線、大汐線の田町駅 - 東京貨物ターミナル駅間(営業再開)及び新設支線東京貨物ターミナル駅 - 羽田空港新駅(仮称)間の3区間を運行する羽田空港アクセス線東山手ルート(仮称)開業。
2032年(令和14年)頃:【東】大船駅 - 藤沢駅間に村岡新駅(仮称)が開業。
※現在の日時より未来の日時で記されている事項は予定である。
2003年(平成15年) 3月31日:【海】西名古屋港線 名古屋駅 - 名古屋貨物ターミナル駅間改キロ(3.9 km→7.0 km)。 12月1日:【貨】神戸港臨港線 東灘信号場 - 神戸港駅間 (3.4 km) が廃止。神戸港駅が廃止。
2004年(平成16年)10月6日:【海】西名古屋港線 名古屋駅 - 名古屋貨物ターミナル駅間が名古屋臨海高速鉄道に転換。
2006年(平成18年)4月1日:【貨】第二種鉄道事業(梅小路駅 - 丹波口駅間 3.3 km)が廃止。
2007年(平成19年)3月18日: 【海】野田新町駅が開業。 【西】さくら夙川駅が開業。西ノ宮駅を西宮駅に改称。
2008年(平成20年) 3月15日:【西】島本駅が開業。 10月18日:【西】桂川駅が開業。
2009年(平成21年)3月14日:【海】南大高駅が開業。
2010年(平成22年) 3月13日:【東】品鶴線に武蔵小杉駅横須賀線ホームが開業。 月日不明:【貨】新興駅が廃止。
2011年(平成23年)3月12日:【貨】梅小路駅を京都貨物駅に改称。
2012年(平成24年) 3月17日:【海】相見駅が開業。 10月8日:【西】営業開始前の吹田貨物ターミナル駅を信号場に準じた扱いで供用開始。北方貨物線 吹田駅 - 尼崎駅間の起点を吹田貨物ターミナル駅に変更 (JR西日本のみ+1.5 km)。
2013年(平成25年) 3月16日:【貨】吹田貨物ターミナル駅が正式開業し、貨物駅としての営業を開始。
東京駅 (0.0 km) - 有楽町駅 - 新橋駅 - 浜松町駅 - 田町駅 - 高輪ゲートウェイ駅 - 品川駅◇ (6.8 km) - 大井町駅 - 大森駅 - 蒲田駅 - 川崎駅 (18.2 km) - 鶴見駅 (21.7 km) - 新子安駅 - 東神奈川駅 (27.0 km) - 横浜駅 (28.8 km) - 保土ケ谷駅 - 東戸塚駅 (36.7 km) - 戸塚駅 - 大船駅 (46.5 km) - 藤沢駅 - 辻堂駅 - 茅ケ崎駅 (58.6 km) - 平塚駅 - (貨)相模貨物駅◆ - 大磯駅 - 二宮駅 - 国府津駅 (77. 7km) - (貨)西湘貨物駅◇ - 鴨宮駅◇ - 小田原駅◇ (83.9 km) - 早川駅 - 根府川駅 - 真鶴駅 - 湯河原駅 - 熱海駅 (104.6 km)
2015年の上野東京ライン開業で起点の東京駅から東北本線の宇都宮線区間・高崎線・常磐線と直通運転を開始したため、東海道本線はこれまで京浜東北線や山手線など電車線のみが繋がっていた東北本線とも本格的に繋がった。結果として起点・終点で本州の大動脈の東北本線、山陽本線と直通運転が行われるようになった。
JR東日本区間の東京駅 - 小田原駅間は山手線・京浜東北線・横須賀線・東海道貨物線などを含めて複々線以上(東京駅 - 品川駅間は8線)、JR東海区間の名古屋駅 - 稲沢駅間、JR西日本区間(琵琶湖線・JR京都線・JR神戸線)の草津駅 - 神戸駅間は複々線となっている。山陽本線の神戸駅 - 西明石駅を含めた草津駅 - 西明石駅間は日本最長の複々線区間 (120.9 km) であり、新快速の高速運転や速度の異なる列車を捌くのに活用されている。
なお、東海道新幹線(管轄はJR東海)は東海道本線の線増として建設されたため、その観点で同新幹線および山陽新幹線新大阪駅 - 新神戸駅間(JR西日本)を東海道本線に含め、新神戸駅を神戸駅とした場合、東海道本線は支線を除いて全区間複々線(以上)の路線となる。1982年の東北新幹線開業以前は、新幹線は完全な線増扱いであったが、JR線路名称公告では東海道新幹線および山陽新幹線新大阪駅 - 新神戸駅間を東海道本線の名無しの枝線として扱っている。一方、基本事業計画や『鉄道要覧』では別の路線として扱われている。
1959年からは155系電車などの専用車両を使用した「ひので」「きぼう」「こまどり」などの列車名を名乗る修学旅行列車が運転された。これらは1965年ごろにピークを迎えたが、やがて修学旅行輸送は新幹線へと移行し、在来線の修学旅行列車は1973年までに姿を消した。
JR東日本の車両はグリーン車を除き片側4扉である。東海道線・湘南新宿ラインではロングシートに加えて一部車両にセミクロスシートを装備しグリーン車2両を連結した近郊タイプの車両が使用されており、基本編成10両+付属編成5両の最長15両編成を組む。
並行する各系統の電車は、東海道線列車・湘南新宿ラインとは異なる車体色で色分けされた各系統専用の車両・編成が運用されている。
#廃止区間にある駅を除く。東海道貨物線・高島線・名古屋港線・神戸臨港線も参照。
呉服橋駅:1914年廃止、東京駅北方(-0.3 km付近)
神奈川駅:1928年廃止、東神奈川駅 - 横浜駅間(28.2 km付近)
平沼駅:1915年廃止、横浜駅南方(29.5 km付近)
興津川駅:1890年廃止、由比駅 - 興津駅間
清見寺仮乗降場:1907年廃止、興津駅 - 清水駅間
(臨)袖師駅:1971年廃止、興津駅 - 清水駅間 (166.7 km)
(貨)笹島駅:1986年廃止、名古屋駅同一地点扱い (366.0 km)
新垂井駅:1986年廃止、大垣駅 - 関ケ原駅間(下り専用線、大垣駅起点8.1 km)
大宮通仮停車場:1877年廃止、梅小路駅付近
戎仮乗降場:1915年廃止、西宮駅 - 芦屋駅間(574.5 km付近)
岡本仮乗降場:1915年廃止、摂津本山駅・甲南山手駅付近(初代・2代目は578.2 km付近、3代目は576.6 km付近)
(貨)東灘駅:1972年廃止、後の東灘信号場→摩耶駅 (583.7 km)