スペイン・ブルボン朝
しかし、ルイ14世はフェリペがフランス王位を兼ねる可能性を示唆して行動を活発化させた。この動きに対し、イングランド、オランダ、オーストリア・ハプスブルク家は反ブルボン同盟を締結した(後にサヴォイア、ポルトガルが加わる)。同盟は1702年に宣戦布告を発し、スペイン継承戦争が勃発する。
同盟軍は国境を脅かすとともに切り崩し工作を行った。カトリック両王の時代に統一国家としてのスペインが成立したと一般に思われがちであるが、各地方では諸王国時代の制度がそのまま維持されており、一種の「連邦王国」とも言える同君連合体制だったのである(アブスブルゴ朝時代にはポルトガルもそうした形で併合されていた)。工作は成功し、最初にカタルーニャが、次にアラゴンとバレンシアが同盟に寝返った。そしてオーストリア大公カール(後の神聖ローマ皇帝カール6世)が「スペイン王カルロス3世」と称した。フェリペ5世に残されたのはカスティーリャのみとなり、それすらも危うい状況だった。
1868年9月17日に進歩派のプリム将軍の下に集結した進歩派の軍人たちはクーデター宣言を行い、これに応える形でセビーリャ、マラガ、アルメリアの守備隊たちが一斉に蜂起した。市民の間でも蜂起が広まり、革命評議会が結成されていく。そして9月28日にセラーノ将軍率いる反乱軍の前に政府軍が敗れたのが決定的になり、マドリードでも革命評議会が結成されてブルボン朝の打倒が宣言された。孤立無援状態になったイサベル2世は、フランスに亡命した。時のフランス皇帝ナポレオン3世の皇后ウジェニーがスペイン貴族出身だったからである。この9月革命によって、ブルボン朝は再び中断する。フランスに亡命したイサベル2世は、1870年に息子のアルフォンソ12世に王位を譲っている。
この危機的状況に対して、フェリペ5世はカトリック信仰を持ち出すことで打開を図った。同盟側のほとんどがプロテスタントだったからである。フェリペ5世の作戦は成功して、アラゴンとバレンシアは奪還できたが、カタルーニャはなおも抵抗を続けた。一方の同盟側も足並みが乱れ、結局1713年のユトレヒト条約と翌年のラシュタット条約によってフェリペ5世の王位は承認されたが、その代償は莫大なものであった。フランスとの連合を禁じられたのみならず、イギリス(1707年にグレートブリテン王国が成立)にはメノルカとジブラルタルを、サヴォイアにはシチリアを、そしてオーストリアには南ネーデルラント、ミラノ公国、ナポリ王国、サルディーニャをそれぞれ割譲することを強いられたからである。こうした犠牲を払って王位を認められたフェリペ5世は、抵抗を続けるカタルーニャを制圧してスペインを事実上掌握した。
1929年の世界恐慌の結果、スペインでは共和政を望む声が多くなった。そして1931年の総選挙の結果、左派共和政勢力が勝利を収め、アルフォンソ13世は退位して第二共和政が樹立された。左派政権樹立に対し、フランシスコ・フランコはモロッコで反乱を起こして内戦が勃発する(スペイン内戦)。内戦は1939年に反乱軍の勝利で終わり、フランコの独裁体制が確立された。