国際学生科学技術フェア
ゴードン・E・ムーア賞 - 7万5千ドルの奨学金。特定の分野や世界全体に影響を与える可能性のある、革新的な研究やプロジェクトとして選出された「ベスト・オブ・カテゴリー」賞の上位受賞者に贈られる。
インテル財団若手科学者賞 - インテルとSSPからの5万ドルの賞金。「ベスト・オブ・カテゴリー」賞の次点の2つのプロジェクトに贈られる。
ダドリー・R・ハーシュバックSIYSS賞- 受賞者には、ストックホルム国際青年科学セミナーへの全費用負担と、ノーベル賞授賞式に出席する権利が与えられる。
インテル・ベスト・オブ・カテゴリー賞 - 部門賞受賞者には5千ドルの奨学金、受賞者の学校および受賞者が代表するフェアには1千ドルの助成金が授与される。
Intel International Excellence in Teaching Award
このほか、一般見学者が好きな作品に投票する「People's Choice Award」も行われている。
2001年以降、MITのリンカーン研究所では、セレス・コネクション(英語版)の一環として、ISEFの受賞者の名前を小惑星につけている。
また、複数の組織が、それぞれの基準に従って特別賞を後援している。特別賞を後援している組織には、アメリカ国家安全保障局(NSA)、Association for Computing Machinery(ACM)、IEEE財団などがある。