箕作元八
箕作秋坪の四男で、母つねは箕作阮甫の三女。数学者の菊池大麓及び動物学者の箕作佳吉は元八の兄にあたる。異母妹の直子は人類学者の坪井正五郎に嫁いだ。法学者の箕作麟祥と統計学者の呉文聰は従兄、医学者の呉秀三は従弟。
妻・みつは進十六の三女。小出粲の弟子。
子は3男3女をもうけ、長男・秋吉は理学博士号を持つ化学者であると同時に作曲家としても活動し、次男・箕作豊三は夭折、三男・箕作洋輔は工業技術家として知られた。また長女・綾子は医学者で眼科の権威・甲野謙三(甲野勇の兄、乙骨太郎乙の養孫)に、次女・縫子は矢野矢に、三女・歌子は堀田嘉幸に嫁いだ。みつの姪・龍は外交官・政治家の松岡洋右に嫁いだ。
吉阪隆正(佳吉の孫で建築家)の妻・富久子は甲野謙三・綾子夫妻の娘である。