スーパーサイエンスハイスクール
指定期間は2004年(平成16年)度 - 2006年(平成18年)度までの3年間で、既に終了済み。
なお、山口県立山口高等学校以外の高等学校は2007年(平成19年)度に新規指定もしくは終了経過措置校に指定されている。
北海道 公立 北海道札幌啓成高等学校
埼玉県 公立 埼玉県立春日部高等学校
神奈川県 公立 神奈川県立厚木高等学校
京都府 公立 京都府立桃山高等学校
大阪府 公立 大阪府立生野高等学校
大阪府 公立 大阪府立豊中高等学校
兵庫県 公立 兵庫県立明石北高等学校
奈良県 国立 国立大学法人奈良女子大学附属中等教育学校
岡山県 公立 岡山県立倉敷天城高等学校
山口県 公立 山口県立徳山高等学校
徳島県 公立 徳島県立脇町高等学校
香川県 公立 高松第一高等学校
福岡県 公立 福岡県立城南高等学校
長崎県 公立 長崎県立長崎西高等学校
大分県 公立 大分県立大分舞鶴高等学校
神奈川県 横浜市 公立 横浜市立横浜サイエンスフロンティア高等学校
愛知県 名古屋市 公立 名古屋市立向陽高等学校