百合が原駅
1987年(昭和62年)4月1日:国鉄分割民営化に伴い、JR北海道の駅となる。同時に旅客駅に昇格し、百合が原駅となる。
1991年(平成3年)3月16日:札沼線に「学園都市線」の愛称を設定。
1995年(平成7年)3月16日:札沼線(学園都市線)のうち、当駅を含む太平駅 - 篠路駅間が複線化。同時にホームが増設され、跨線橋が設置される。
2000年(平成12年):札沼線(学園都市線)のうち、当駅を含む桑園駅 - 石狩月形駅間に自動進路制御装置 (PRC) を導入。
2007年(平成19年)10月1日:駅番号設定(G07)。
2008年(平成20年)10月25日:ICカード「Kitaca」使用開始。
2012年(平成24年)6月1日:札沼線(学園都市線)のうち、当駅を含む桑園駅 - 北海道医療大学駅間が電化(交流20,000V・50Hz)。