膜貫通型ドメイン
膜貫通型ドメインには、さまざまな機能があることが知られている。たとえば次のような機能がある。
膜貫通型タンパク質を膜に固定する。 膜貫通型ドメイン(オレンジ色の範囲)によって膜に固定されたAMPA受容体。
イオンやタンパク質などの分子が生体膜を通過する際に、分子輸送を促進する。通常、TMDの親水性残基や結合部位がこのプロセスを補助する。
膜を通過するシグナル伝達を行う: Gタンパク質共役受容体などの多くの膜貫通タンパク質は、細胞外からのシグナルを受け取る。TMDは、これらのシグナルを膜上に伝播して細胞内に影響を及ぼす。
小胞融合を補助する: TMDの機能はよく理解されていないが、おそらくTMDが脂質二重層の張力に影響を与える結果として、融合反応に重要であることが示されている。
膜貫通型タンパク質の輸送と選別を仲介する: TMDは、細胞質ゾルの選別シグナルと協力して働くことが示されており、TDMの選別では長さと疎水性が主な決定要因となる。長くて疎水性の高いTMDは、タンパク質を細胞膜に選別するのに役立ち、一方、短くて疎水性の低いTMDは、タンパク質を小胞体やゴルジ装置に保持するのに用いられる。このプロセスの正確な機構は未だ不明である。