高田藩
戦国時代の越後は織田信長や武田信玄と並ぶ名将として名高い上杉謙信の領国であった。謙信の跡を継いだ景勝は慶長3年(1598年)1月、豊臣秀吉の命を受けて会津120万石に加増移封された。この時秀吉は景勝に対し、上杉家中の侍は中間・小者に至るまで一人も残さず召し連れよ。しかし検地帳に記載され年貢を負担する百姓はすべて残していけ、という朱印状を出しているが、これは兵農分離を徹底させて、精強な上杉軍の根幹を成す地侍を検地帳記載の農民として家臣団から切り離すことが目的だったとされている。
入れ替わる形で松代より元和5年(1619年)、松平忠昌が25万9000石で入る。忠昌は結城秀康(家康の次男で忠輝の異母兄)の次男である。元和9年(1623年)5月、長兄松平忠直が不行跡を理由に改易されたため、幕命により忠昌は北ノ庄50万石を継承することとなる。
寛永元年(1624年)、高田には忠直の嫡男仙千代(のちの松平光長)が26万石を与えられて新規に立藩し、傍目には叔父と甥が入れ替わるという形となった。仙千代は第3代将軍家光から偏諱を拝領し光長と名乗り、越後守と従三位に列せられた。寛文5年(1665年)12月26日に大積雪を記録し、翌27日には寛文の大地震が発生し、これにより本丸が崩れ、家中男女合わせて120名が死亡、家老2名(小栗正重・荻田長磐)が死亡した。光長自身は江戸にいて無事だったが、翌正月に緊急帰国した。この地震の災害復興として、小栗正矩ら重臣たちは城下町の区画整理などを行い、震災で損壊した高田城の修復も行った。
稲葉家と入れ替わる形で、先年に寺社奉行を辞職した佐倉藩主戸田忠真が6万7000石で入る。しかし高田藩の歴代藩主家で最も小藩のため、行政や城下町建設では消極的な政策が採られた。宝永7年(1710年)に下野宇都宮藩へ移封となる。