長崎連隊区
1888年(明治21年)5月14日、大隊区司令部条例(明治21年勅令第29号)によって長崎大隊区が設けられ、陸軍管区表(明治21年勅令第32号)により長崎県・佐賀県の一部が管轄区域に定められた。第6師管第12旅管に属した。この時、長崎県の残り区域は五島警備隊区・対馬警備隊区に属していた。
1890年(明治23年)5月20日、管轄区域の変更が行われた。
1896年(明治29年)4月1日、長崎大隊区は連隊区司令部条例(明治29年勅令第56号)によって大村連隊区に改組され、旅管が廃止となり引き続き第6師管に属した。1898年11月10日、司令部は長崎県東彼杵郡大村町の新築庁舎に移転した。
1903年(明治36年)2月14日、陸軍管区表が改正され、再び旅管が採用され連隊区は第12師管第23旅管に属した。