塩基性ヘリックスループヘリックス
系統学的な分析によって、bHLHタンパク質はAからFの6つのグループに分類されている 。酵母と植物のbHLHはすべてグループBに分類される。
塩基性ヘリックスループヘリックス (basic helix-loop-helix, bHLH) とは、二量体化転写因子に多くみられるタンパク質構造モチーフであり、二量体化転写因子の最も大きなファミリー1つである。
bHLH型転写因子はしばしば、成長や細胞活動に重要な役割を果たす。BMAL1-CLOCKは概日リズムの分子機構の中核をなす転写因子複合体である。他の遺伝子では、c-MycやHIF-1は細胞増殖や代謝に関与する遺伝子であり、がんとも関連付けられている。
ヘリックスターンヘリックスは似た名称であるが異なる構造である。
N-box (CACGCG もしくは CACGAG) と呼ばれる配列に結合する。OrangeドメインとWRPWペプチドと呼ばれる領域を持つ。
HEY1, HEY2