ナノダイバー
タイプごとに様々な形状、行動を行う非常に凶暴で巨大なウイルス。各患者の体内に1体ずつ存在しており、これを倒すと患者を救うことができる。脚など、体の一部を攻撃し続けることで数秒間転倒させ、行動不能にすることができる。また、タイプによっては体の一部を破壊でき、それによって特定の攻撃をできなくさせたり、転倒時間を伸ばしたり、獲得できる素材の重要度や数を上げることができる。
LOSTウイルスにはボスレシオ(活性度)があり、感染が進行すると徐々に高まっていく。ボスレシオはそのままLOSTウイルスの攻撃力等に反映されるため、戦いを挑む時は動きを見切って隙が発生したらダメージを与えていき、後述の治療等を駆使して戦いやすいボスレシオを維持する。低いボスレシオで戦えば駆逐しやすくなるが、高いボスレシオで倒すと報酬が増える。