全日本カッター連盟
以下が加盟校一覧である。ただし、過去の加盟校等も含む。☆のつく学校は女子部を持つ、もしくは過去に出場経験のある学校である。
防衛大学校短艇委員会 ☆
東京海洋大学品川水産(旧東京水産大学、東京海洋大学海洋科学部)
東京海洋大学海洋工学部(旧東京商船大学) ☆
日本大学
東海大学 ☆
神戸大学(旧神戸商船大学)☆
海上保安大学校 ☆
海上保安学校
三重大学 ☆
海技大学校
広島高等商船専門学校
水産大学校 ☆
長崎大学 ☆
九州看護福祉大学 ☆(女子部のみ)
鹿児島大学 ☆
京都府立京都海洋高校 ☆
国立館山海上技術学校 ☆
東京都立大島海洋高校
千葉県立館山総合高校(過去に東日本大会に参加)
静岡県立焼津水産高校(第60回全日本カッター競技大会に参加)
電気通信大学(休部)
神奈川歯科大学(休部)