1600年
2月17日 - ジョルダーノ・ブルーノ、イタリアの哲学者・天文学者(* 1548年)
3月22日(慶長5年2月8日) - 北条氏規、武将(* 1545年)
8月25日(慶長5年7月17日) - 細川ガラシャ、細川忠興室(* 1563年)
9月1日 - タデアーシュ・ハーイェク、天文学者・医師(* 1525年)
9月8日(慶長5年8月1日) - 鳥居元忠、武将(* 1539年)
9月25日 - アントワーヌ・デュ・ヴェルディエ、書誌学者(* 1544年)
10月21日(慶長5年9月15日) - 大谷吉継、武将(* 1559年/1565年?)
10月21日(慶長5年9月15日) - 島津豊久、武将(* 1570年)
10月21日(慶長5年9月15日) - 長寿院盛淳、武将(* 1548年?)
10月21日(慶長5年9月15日) - 肝付兼護、武将(*1563年)
11月3日 - リチャード・フッカー、神学者(* 1554年)
11月6日(慶長5年10月1日) - 安国寺恵瓊、僧侶(* 1539年)
11月6日(慶長5年10月1日) - 石田三成、武将(* 1560年)
11月6日(慶長5年10月1日) - 小西行長、武将(* 1555年?)
11月8日(慶長5年10月3日)- 長束正家、豊臣政権の五奉行(* 1562年?)
11月16日(慶長5年10月11日) - 伊東祐兵、武将(* 1559年)
11月17日(慶長5年10月12日) - 九鬼嘉隆、武将(* 1542年)
月日不明 - ホセ・デ・アコスタ、スペインのイエズス会・宣教師(* 1540年)