東京大学大学院農学生命科学研究科・農学部
北海道演習林(北海道富良野市):1899年(明治32年)設置 千葉演習林(千葉県鴨川市):1894年(明治27年)設置 秩父演習林(埼玉県秩父市):1916年(大正5年)設置 田無演習林(東京都西東京市):1929年(昭和4年)田無苗圃として設置、1963年(昭和38年)改称 生態水文学研究所(愛知県瀬戸市)1922年(大正11年)設置 富士癒しの森研究所(山梨県南都留郡山中湖村)1925年(大正14年)設置 樹芸研究所(静岡県賀茂郡南伊豆町)1943年(昭和18年)設置
動物医療センター(ベテリナリーメディカルセンター)2007年(平成19年)家畜病院より改称
水産実験所(通称:水圏生物教育研究センター)(静岡県浜松市):1936年(昭和11年)設置、1970年(昭和45年)現在地に移転
牧場(通称:高等動物教育研究センター)(茨城県笠間市):1949年(昭和24年)設置
放射性同位元素施設:1982年(昭和57年)設置
技術基盤センター
食の安全研究センター:2006年(平成18年)設置
バイオトロン研究室:1957年(昭和32年)設置
放射線育種共同利用施設(茨城県常陸太田市):1965年(昭和40年)設置
小石川樹木園(小石川植物園北):1909年(明治42年)設置の樹木実験圃場を改組して2004年(平成16年)設置
戦前はこれらの他にも、日本統治時代の台湾や樺太、朝鮮などに演習林を保有していた。