宇部線
2001年(平成13年)7月14日 - 9月30日:「山口きらら博」観客輸送のため、小郡駅 - 阿知須駅間に117系電車による臨時快速列車「きらら号」が運転。
2002年(平成14年)3月23日:ローカル線経営改善のため、保守工事運休導入とともに運行本数、車両を削減、深夜時間帯の列車が廃止。
2003年(平成15年)10月1日:小郡駅が新山口駅に改称。新山口駅 - 宇部新川駅間で快速「のぞみリレー号」が運転開始。
2006年(平成18年) 3月1日:快速「のぞみリレー号」の一部列車の運転区間が宇部駅まで延長(宇部新川駅 - 宇部駅間は普通列車)。 5月1日:貨物支線 居能駅 - 宇部港駅間 (2.2km) が廃止。
2009年(平成21年) 3月14日:快速「のぞみリレー号」が廃止。 6月1日:組織改正により宇部新川鉄道部が廃止され、全線(新山口駅・宇部駅の構内も含む)が山口地域鉄道部の管轄になる。 10月18日:重安駅 - 宇部岬駅間の石灰石貨物列車がこの日限りで廃止。
2014年(平成26年)4月1日:日本貨物鉄道の第二種鉄道事業(宇部岬駅 - 宇部駅間 9.5km)が正式に廃止される。
2019年(令和元年)6月1日:組織改正により山口地域鉄道部が廃止され、同日発足の山口エリア統括部(山口支社)の管轄となる。