メラニン
イカ墨などの頭足類が吐く墨に含まれる。
細菌や真菌などの微生物が、紫外線や活性酸素などから身を守るのに用いる。そのほかにも、高温、重金属や酸化剤などの化学ストレス、微生物の侵入を防ぐための宿主の防衛機能から防ぐ役割も担う。
放射線をエネルギー源とする菌類であるRadiotrophic fungus(英語版)は、光合成色素(英語版)としてメラニンを使用する。
節足動物では、殻にメラニンの層を層状に形成することで構造色を形成する。また、節足動物においてメラニンは外骨格に傷がついた場所からカビやバクテリアが侵入しないようする役割も担う。