プロトマー
ヘモグロビンは、4つのサブユニット(2つのαと2つのβ)からなるヘテロ四量体である。ただし、構造的にも機能的にもヘモグロビンは(αβ)2と表現した方が適切なので、2つのαβプロトマーの二量体、つまりジプロトマーと呼ぶ。
アスパラギン酸カルバモイルトランスフェラーゼは、α6β6サブユニット構成を持っている。6つのαβプロトマーはD3対称に配置されている。
ウイルスカプシドはしばしばプロトマーで構成されている。
化学の例では、チロシンや4-アミノ安息香酸が挙げられる。前者は脱プロトン化されてカルボン酸アニオンおよびフェノキシドアニオンを形成してもよく、後者はアミノ基またはカルボキシル基でプロトン化してもよい。