そごう柏店
2016年(平成28年)3月8日、運営会社であるそごう・西武は同店を約半年後の2016年(平成28年)9月30日をもって閉店することを同社の取締役会で決定した。人件費などコスト削減を断行しても収益改善するまでには至らず、売上高はピーク時の約2割まで減少していた。同年4月にはそごう・西武と柏市の間で意見交換が行われ、さらに同年5月には柏市と商工会議所、商店会連合会からそごう・西武に要望書が提出されたが、閉店の決定が覆ることは無かった。2016年(平成28年)7月12日からは各フロアで閉店売り尽くしセールが行われ、多くの人が訪れた。
最終日には開店後5分間で約2千人が来店するなどし、店内は別れを惜しむ人々で終日ごった返した。本館(タワー館)14階の回転レストランは終日満席となり、店外も外観を写真に収めようとする人々で賑わった。本館(タワー館)2階では「『そごう柏店と東口の歩み』とメッセージ展」が開催され、そごう出店以前の柏駅前の写真や開店当日の空撮写真、1977年(昭和52年)の新春初売り案内などが展示された。また、メッセージ展においてはサンプラザ中野くんをはじめとする有名人や常連客など、約200人の思い出と別れの言葉が書き込まれた紙が掲示された。
レストラン街(かつては「名店食堂街」と呼称)は10階以上だったものを12階・14階のみとし、空いた10階・11階をそごうの売り場にし、スカイプラザの建物でそごうが営業していた売り場がいくつか本館(タワー館)に移動した。
2003年(平成15年)6月1日、運営会社であった株式会社そごうは、株式会社十合並びに株式会社西武百貨店と百貨店グループ「ミレニアムリテイリンググループ」を発足。
2008年(平成20年)4月15日、装置の老朽化及び東京ディズニーリゾートとの「イッツ・ア・スモールワールド」「ドックサイドステージ」のスポンサー契約終了に伴い、正面玄関前に設置されていた、毎正時に「イッツ・ア・スモールワールド」が演奏される「世界の人形時計」の運用を終了した。翌日より時計および鐘のみとなる。
2009年(平成21年)8月1日、運営会社であった株式会社そごうは、株式会社西武百貨店と株式会社ミレニアムリテイリング(旧株式会社十合)を吸収合併し、株式会社そごう・西武に社名変更。
スカイプラザは、そごうとは別の扱いであり、元々そごうがあった場所の地権者によるテナントが主に入居して営業している(そごう大宮店内にある「OSS24」と同様)。元々は「スカイプラザ柏」の名称で営業していた。当時はファミリかしわと比較してスカイプラザのほうが賃料が高く設定されていたため、比較的財力の高い地権者がスカイプラザに入居し、それ以外はファミリかしわに入居し現在に至っている。
前述の2003年のそごうリニューアルに伴い、スカイプラザで空きができた場所は、2005年(平成17年)3月10日にビックカメラに継承され、ビックカメラ柏店となった。ビックカメラに関してはスカイプラザの一部としての扱いであり、4階から6階はそごうからスカイプラザに移管されたため、前述のそごうとしての売場面積縮小となった。
2015年(平成27年)3月にはスカイプラザもリニューアルが行われ、地権者テナントは基本的に1階に集約され、2階はビックカメラの携帯電話・スマートフォン売り場の拡大および洋服の青山が新規開業した。