国立科学博物館
所蔵品のうち、以下のものが国の重要文化財に指定されている。
天球儀・地球儀 渋川春海作(附:旧台座板2枚)
地球儀は1695年製、天球儀は1697年製。
万年自鳴鐘(万年時計) 田中久重作
東芝へとつながる田中製造所の創設者である田中久重によって製作された機械式の置時計。嘉永4年(1851年)作。所有者は東芝。1931年、東京科学博物館(国立科学博物館の前身)に寄託された。地球館2階で展示。詳細は万年自鳴鐘を参照のこと。
天体望遠鏡(8インチ屈析赤道儀)英国製
1880年(明治13年)、明治政府によりイギリスから輸入された天体観測用望遠鏡。トロートン&シムズ社製。日本に輸入された最初の本格的かつ最大の望遠鏡。1967年まで国立天文台で使用された。日本館1階南翼で展示。
ミルン水平振子地震計(附:地震記録41巻)
日本に現存する最古の地震計。1899年に東京帝国大学構内に設置されたもの。
コケ展(1971/05/16 - 06/06)
国産衛生展(1971/06/15 - 08/31)
日本列島展-その誕生から人間登場まで(1972/4/22 - 8/30) 東京小田急百貨店(4/22 - 5/21) 大阪あべの近鉄百貨店(6/01 - 6/13) 名古屋名鉄百貨店(6/01 - 6/27) 山口県立博物館(7/08 -8/06) 福岡市岩田屋(8/19 - 8/30)
規模の大きい本格的な移動展として全国の主要都市で開催されたもの。
1階南翼 生物の進化 第1室 ダンクルオステウスの頭骨標本(レプリカ) アロサウルスの全身骨格標本 キャンプトサウルスの全身骨格標本 シーラカンスの剥製
1階北翼 生物の進化 第2室 アルシノイテリウムの全身骨格標本 北京原人の生活ジオラマ アウストラロピテクスの想像復元像
1階中央 タルボサウルス全身骨格標本
2階南翼 適応と進化 第1室 海に帰った哺乳類 トド、クラカケアザラシ、オサガメ、タイマイの剥製 草原に出た哺乳類 グラントガゼルの剥製
蜂須賀正氏寄贈の蜂須賀コレクションの1つ。
2階北翼 適応と進化 第2室 ニホンジカの地理的変異 ヤマドリの地理的変異 ヒオウギガイの変異 フウチョウの種の目じるし 適応放散の展示 フクロオオカミ、フクロモモンガの剥製
3階南翼 太陽と宇宙 月の石 精密月球儀
3階北翼 日本の動植物 日本を特徴づける動物たち ナガコンブの標本
3階西 旧記念室/高林氏時計参考室 和時計、からくり時計
地下1階北翼 資料庫
地下1階南翼 団体休憩室
地下1階中央ホール 売店
1981年〜1995年にかけて1、2階フロアを「生物の進化」という共通のテーマで改修を行った。
球体内部の壁全面をスクリーンとした360度全天球型映像シアター。愛・地球博の長久手日本館で公開されていた「地球の部屋」を移設した。2006年12月21日から一般公開。
地球の大きさの約100万分の1である内径12.8メートルの球体内部の壁面全体に映し出される映像を、球体の中心を貫くように渡された橋の上に立って眺める。2009年12月13日までは愛・地球博映像から1本、国立科学博物館オリジナル映像(第1期作品)から1本のあわせて2本が、2か月ごとのローテーションで上映されていた。2009年12月22日からはオリジナル映像に新規映像が追加され、従来のオリジナル映像との組み合わせで上映されることとなった。また、愛・地球博映像については毎週金曜日の19時頃に3本まとめて上映されることとなった。
2019年3月18日、シアターのリニューアルと、イセ食品が命名権を獲得、4年間「イセ食品 THEATR36○」となることが発表された。3月19日、リニューアルオープン。同年7月26日、入場者が600万人を達成。
愛・地球博映像 「青の輝き」 「緑のささやき」 「生命(いのち)のきらめき」
絶滅した大哺乳類たち(1995/03/18 - 05/28)
人体の世界(1995/09/15 - 11/26、45万人)