リボヌクレアーゼH
RNase HはRNA:DNAハイブリッド二本鎖中のRNAのみを特異的に分解するため、分子生物学における実験試薬として広く利用されている。大腸菌のRNase HIとHIIの精製試料は市販されている。RNase HIは、逆転写によるcDNA合成後のRNA鋳型の分解に利用されることが多い。また、短い相補性DNA断片の存在下でRNA配列特異的な分解を行うためにも利用される。切断の検出には表面プラズモン共鳴などの高感度技術が用いられる。RNase HIIは岡崎フラグメントのRNAプライマー部分の分解やリボヌクレオチドを含む部位への一本鎖ニックの導入に利用される。ホットスタートPCR(英語版)の一変種であるRNase H依存型PCR(英語版)(rhPCR)は、超好熱性古細菌Pyrococcus abyssi(英語版)由来の熱安定性RNase HIIを利用する。一般的に試薬として利用されるリボヌクレアーゼインヒビターは、HIやHIIの活性に対する阻害効果はないことに注意が必要である。