X-49 ナイトレーベン
エースコンバット3では大筋で5つのシナリオに分岐する。そのいずれも、クーデター集団「ウロボロス」によって接収後、元のパイロットであった紘瀬玲名が搭乗。それぞれ異なった要因で撃墜されているが、一部で機体の全損を免れている。具体的には、
UPEOルート
クーデターを仕掛けるウロボロスに紘瀬玲名が侵入。疑念が渦巻くディジョンと対面する中、憧れであったナイトレーベンを見せられ搭乗、主人公たちの前に現れる。しかしすでにディジョンに心許さなかった玲名が逆に反抗。その結果、突然ナイトレーベンが謎の爆発を起こし墜落し最終的に不時着する。これはナイトレーベン本体への何らかの仕掛けへの起爆と思われる台詞が、ディジョンによる独白として吐きだされている。
ゼネラルリソースルート
同僚であるキース・ブライアンとともにナイトレーベンに徹底抗戦。ゼネラルリソースが管理する巨大地下都市ジオフロントの自壊による殲滅を目論むも巻き添えに失敗するが、大きな損害を与える。追跡の最中、主人公は紘瀬玲名に精神干渉を仕掛けるがこれも失敗。最終的に満身創痍となったナイトレーベンに対し直接戦闘で撃墜する。
ゼネラルリソース→ウロボロスルート
パイロットが脳神経を接続して操縦するという、特殊な操縦形態の機体に生じるセキュリティホールを突き、AIでもある主人公が紘瀬玲名の脳に侵入し、過去の記憶を抹消することで、思考出来ない状態に陥れる。その後の戦闘で介入してきたゼネラルリソース所属の元同僚であるキースの機体がナイトレーベンとの戦闘で被弾するも反撃。