根尾川
現在席田用水の取水口が設けられている本巣市山口付近で濃尾平野に出ると、本巣市海老・本巣市下真桑・北方町北方付近を末端とする面積30平方キロメートル、傾斜率5度の大規模で緩やかな扇状地が広がっており、根尾川は古くから洪水を起こしてはこの扇状地上で幾度も河道を変えて分流を繰り返した。現在の根尾川下流部はかつて藪川とも呼ばれた派川の1つで、本巣市山口からやや西寄りに南流して揖斐川へと合流する。
この揖斐川に合流する根尾川とは別に、岐阜市曽我屋付近には長良川支流の伊自良川に合流する「古根尾川」とも呼ばれるもう1つの根尾川が存在する。これは現根尾川以前の下流部河道の名残の1つであり、古根尾川が根尾川本流から切り離された後に席田用水や真桑用水の一部などに改修され、手付かずのままだった長良川への合流部が残ったものである。
下座倉大橋(岐阜県道92号岐阜巣南大野線)
根尾川大橋(岐阜県道53号岐阜関ケ原線)
真大橋(岐阜県道159号北方真正大野線)
薮川橋(国道303号)
大野橋(岐阜県道78号岐阜大野線)
万代橋(滋賀県道・岐阜県道40号山東本巣線)
谷汲山大橋(滋賀県道・岐阜県道40号山東本巣線)
日当大橋・城山橋(国道157号日当平野バイパス)
開運橋(岐阜県道255号根尾谷汲大野線)
かつての根尾川本流は本巣市山口から東に流れ、岐阜市西郷や黒野を経て長良川へと合流する流路をとっていた。この流れが前述した「古根尾川」に相当するが、この当時の犀川は山口で根尾川から分岐する派流であった。
古代に郡が制定されると本巣郡と大野郡が犀川によって分けられたことから、この頃までに根尾川本流は犀川筋に移ったとも推定され、奈良時代に発生したとされる洪水で根尾川本流は現在の糸貫川筋へと移る。
1530年(享禄3年)の大洪水で揖斐川が大きく河道を変えるが、この洪水によって根尾川では「藪川」が生じるとともに、犀川への分派口が塞がれるといった大きな変化があった。藪川はそのまま南進して揖斐川に合流し、糸貫川は依然として長良川へ合流していたため、根尾川は揖斐川・長良川両方の支流となった。なお、この藪川は真桑方面の用水路の取水口を破って生じたとも伝えられるが、正確には分かっていない。
藪川の出現により根尾川の本流は藪川へと移り、水量が減った糸貫川は扇状地中央部で水無川となることが増えたため、木曽川上流改修工事の付帯工事で1944年(昭和19年)に根尾川から糸貫川への分派口が締め切られた。また、1964年(昭和39年)に制定された河川法で建設省(現在の国土交通省)が一級河川を指定した際に、上流「根尾川」と下流「藪川」を揖斐川支流の「根尾川」に統一して指定し、現在では「藪川」の名称は使用されていない。