リトル ノア
人型木製機動兵器兼住居に住まう人間の姿をしたキャラクターで、防衛施設の破壊を優先する。遠距離から範囲攻撃ができるが、移動速度が遅いのが難点。 砲撃兵チュロス チュロスの進化体で、煉瓦製の機動兵器兼住居になった。
本作のキャラクターデザインは『タクティクスオウガ』や『ファイナルファンタジーXII』の吉田明彦が手掛けた。 本作は対戦を主体としたゲームであることから、キャラクターのデザインはおもちゃや童話の世界をイメージしたかわいらしいものとなっている。 ノアが召喚するキャラクターの命名は、キャラクターの生みの親であるノアが行ったという設定である。
主人公であるノアはビジュアル展開のためにメインキャラクターが必要ということで開発の中盤で生み出された。この時点におけるノアは召喚や補助魔法を行うサポートキャラクターという位置づけだっただったが、それだとありきたりになってしまうため、少しひねったキャラクター付けが施され、吉田のアイデアによりノアが巨大化して施設を荒らしまわるという役割が追加された。
本作はステージとなる方舟を斜めから見るという構図をとっており普通のモーションではキャラクターの顔が見えにくいため、顔をやや見上げながらも少々のけぞったようなモーションが採用された。 また、プレイヤーが最初に戦う巨大ボスである鉄巨人は、元々『グランブルーファンタジー』の鉄巨人の没デザインから頭をとったものが基になっている。
開発当初の解像度は現在配信されているものよりも1段階高かったものの、端末の許容量を超えてしまったため下げざるを得なかった。 このため、デザインに2か月かかり、デザインを基にしたモデル制作には1か月半かかり、さらにその後微調整を重ねた結果、総合して半年以上も費やす結果となった。
壁のようなキャラクター。攻撃力は殆どないが、膨大な体力を持つ。 軍曹ブロッカ ブロッカの進化体で、チェスのルークのようなシルエットになっている。 将軍ブロッカ 軍曹ブロッカの進化体。よりHPが増え、鉄壁の守りを展開する。
炎属性のブレスを吐く小さなドラゴン。飛行能力はない。 ノヴァドラゴン フレアドラゴンの進化体。ブレスの威力は上がったが、飛行能力はない。
錬精学院時代のノア・エルシャ・マシロの担当教官で、弟子たちを全員落第させてきたことから“皆殺しのシャローム”の異名を持つ。幼い見た目をしているが大人。
風の槍を構え、颯爽と敵陣に切り込んでいくユニット。リーチが少し長いことが特徴。 疾風の槍術士ロン 風の槍使いロンの進化体。もともと早かった移動速度がさらに上がった。ある時助けたエンジェラに貰った四葉の髪飾りを大切にしている。
プレイヤーが最初に使用できるキャラクター。武器はおもちゃの剣。投入可能数が大きい。 剣士ラッテ ラッテの進化体。片耳が欠けているのが特徴。
火属性がついたルータス。火炎攻撃を得意とする。 フレイムルータス ファイアルータスの進化体。気性が激しく好戦的。 フレアルータス フレイムルータスの進化体。落ち着いた性格になった。
スリング四兄弟三男。左目が渦巻きになっており、少々とぼけたところがある。風をまとわせたパチンコ玉を飛ばす。 ブラストスリング ウィンドスリングの進化体。パチンコ玉の威力が上がっている他、頭部の角が扇風機に変化しているのが特徴。
一部のキャラクター・施設には火・氷・風のいずれかの属性が割り振られており、それぞれ火>風>氷>火で三すくみの関係となっている。また属性を持たないキャラクター・施設は、全ての属性に対して弱い。
ライオンの仔の姿をしたキャラクター。防衛施設の破壊を優先する。 獣王ライオネル 戦士ライオネルの進化体。雄ライオンのようないでたち故怖がられるが、実際は優しい性格。 百獣の王ライオネル 獣王ライオネルがレジェンド化した姿。金髪のたてがみを持つ勇ましい戦士に生まれ変わった。自身が受けるメガトン砲のダメージを軽減する。またHPが50%以下になると巨大化し、移動速度が1.5倍、攻撃力が5倍になるスキル「百獣の雄たけび」を持つ。ただし、回復によってHPが50%以上になると元の大きさに縮んでしまう。