イスラエル賞
受賞者選定については、時折熱烈な政治的論争を引き起こすことがある。1993年、時の首相イツハク・ラビンは Yeshayahu Leibowitz が受賞候補となった際に強烈な反対を表明し、Leibowitz が賞を辞退することになった。2004年、時の文部大臣リモール・リブナットは、審査委員会から彫刻家 Yigal Tumarkin を受賞者候補とする決定が上がってきたとき、2度にわたって差し戻した。最高裁判所による裁定にまでもつれたケースとして、政治評論家 Shmuel Shnitzer、政治家 Shulamit Aloni、歴史学者 Zeev Sternhell、マッカビ・テルアビブBC会長 Shimon Mizrahi といった例がある。
受賞者が受賞を拒むこともある。例えば、首相ダヴィド・ベン=グリオンやコメディアンの Uri Zohar が受賞を辞退している。2003年、Moshe Gershoni は報道機関に対して首相や文部大臣と握手する気はないと述べ、彼の受賞は取り消された。
また別の面からの批判として、受賞者の大部分が男性ユダヤ人で俗人である点が指摘されている。イスラエルの人口の25%は非ユダヤ人だが、2010年時点で非ユダヤ人の受賞者は2%より少ない。アラブ人キリスト教徒が同時受賞すると知った物理学者ユヴァル・ネーマンが賞を辞退したこともある。