国道389号
九州の大牟田から有明海を挟んで対岸の島原半島へ、島原半島から天草諸島の下島と長島を巡り再び九州の阿久根へと結ぶため3ケ所の海上区間があり、海上区間の数では国道58号(鹿児島 - 那覇)に次ぐ多さである。
長洲町・長洲港 - 雲仙市・多比良港(有明フェリー)
南島原市・口之津港 - 天草市・鬼池港(島鉄フェリー)
天草市・牛深港 - 長島町・蔵之元港(三和商船) 長崎市を終点としていたころは、苓北町富岡港 - 長崎市茂木港が国道389号の海上区間(国道324号と重複)となっていた。
大牟田 - 荒尾(通称:十三間道路) 2009年(平成21年)4月1日、大牟田市白金町2交差点 - 荒尾市四ツ山交差点において、当国道の旧道(2車線)と福岡県道・熊本県道126号大牟田荒尾線(4車線)との間で道路の区域変更(交換)が行われた。さらに、2010年(平成22年)3月31日には旧道の県道指定が解除され、十三間道路が国道389号と県道126号の重複となった。
大江バイパス - 崎津バイパス 天草市下島の天草町高浜南 - 天草町大江 - 河浦町崎津の区間。天草下島大江バイパスとも呼ばれる。2車線、総延長8.6 km。天草灘に近い山地を通り、旧道は急カーブや幅の狭い個所が多かったが、2004年(平成16年)に橋やトンネルも用いて線形を改良したバイパスが完成した。