源氏将軍
元弘3年(1333年)に鎌倉幕府が滅亡し、後醍醐天皇の建武の新政をめぐる国内の動乱のさなか、足利尊氏が征夷大将軍に任ぜられ室町幕府を開いたことで、実朝の死から約120年ぶりに河内源氏出身の源氏将軍が復活することとなった。
『太平記』によれば、後醍醐天皇の親政下の建武2年(1335年)、幕府とともに滅亡した北条高時の遺児時行が叛旗を翻し鎌倉に攻め上った際、尊氏は「そもそも征夷将軍の任は代々の源平の輩、其の位に居するの例、計らず。此の一事、殊に朝の為、家の為、深き所なり」即ち、源氏平氏が征夷大将軍の任についた例は数えきれないとして、自らも将軍宣下を受けた上で北条討伐を行いたいと奏上したという。
足利将軍家がかつての源氏将軍と同族であり、徳川将軍家も源氏を称するなど、いわゆる幕府の将軍家による支配の歴史において、あたかも「武家政権の長は源氏であるべき」、あるいは「源氏でなければ将軍になれない」という誤解ともいえる観念が生じたものと考えられている。
しかし、戦国時代に室町幕府を実質的に滅ぼした織田信長が、権大納言と右近衛大将に就任し、天下人として公認された。当時の征夷大将軍足利義昭は近衛中将なので信長は朝廷内の近衛府では上官に当たる。しかし、天正6年(1578年)4月、天下統一(四海平定)がまだとの理由で突然いっさいの官職から辞任し、嫡男信忠に譲りたいと申し立てた。