エウトレタウラノスクス
E. delfsi はエウトレタウラノスクス属で唯一認められている種である。ゴニオフォリス科の他の属には、アンフィコティルス、ゴニオフォリス、スノスクス、カルソヤスクス(英語版)がいる。
エウトレタウラノスクスの正確な系統的位置は曖昧なままである。Smith et al., 2010 の系統解析では、エウトレタウラノスクスとカルソヤスクスとスノスクスが近縁である証拠が提示された。しかし、多くの論文がエウトレタウラノスクスをゴニオフォリス科内に位置付けることを支持する一方で、ゴニオフォリスとスノスクスのどちらにより近縁なのかという点については議論がある。これとは別に、J.R. Foster, 2006 では、エウトレタウラノスクスはフォリドサウルス(英語版)やディロサウルス科(英語版)と最も近縁であるとされ、ゴニオフォリスやベルニサルティアや正鰐類を含むより包括的な系統群に属するとされた。
三畳紀末の大量絶滅事変と関連する進化史を再評価する研究もある。当該の研究では、ゴニオフォリス科のワニ形類である Calsoyasuchus valliceps が基盤的な系統的位置に就いていることから、ワニ形上目の基底となる数多くのゴーストリネージが存在するはずであると結論付けられている。
以下は、Marco Brandalise de Andrade et al., 2011 に基づくクラドグラム。