南荒尾駅
相対式ホーム2面2線を有する地上駅。互いのホームは跨線橋で連絡している。
簡易駅舎を有する無人駅であるが、まれに管理駅である荒尾駅から社員が派遣され特別改札を実施する事がある。近距離きっぷの自動券売機が設置されている。
2018年10月頃、「ラムサール条約湿地 荒尾干潟駅」の愛称が付けられるとともに、荒尾干潟の最寄り駅であることをPRするリニューアルが行われた。駅舎入口・上下ホームにある駅名表示は夕暮れの干潟の上を飛ぶ野鳥の写真をデザインしたものとなり、駅前には干潟に関する案内板も新設された。
1950年(昭和25年)5月1日:日本国有鉄道が開設。
1971年(昭和46年)2月20日:荷物扱い廃止。無人駅となる。
1977年(昭和52年)11月 - 鉄骨造平屋建ての簡易駅舎に改築。
1987年(昭和62年)4月1日:国鉄分割民営化に伴い、JR九州の駅となる。
2012年(平成24年)12月1日:交通系ICカードSUGOCA対応。