津軽海峡フェリー
※航路継承前に東日本フェリーで運航され引退した船舶については、東日本フェリー#船舶を参照。
恵山丸 - 699総トン。1972年から1985年に就航。「第五恵山丸」就航に伴い引退。
第三恵山丸 - 999総トン、全長97.6m、航海速力18ノット、旅客12名、車両積載数:大型車34台。1979年から1988年に就航。「えさん」就航に伴い引退。
第五恵山丸
1,734総トン。全長98.5m。車両積載数:トラック42台、ドライバー定員20名。1985年から2000年に就航。「えさん2000」就航に伴い引退。
ばにあ(VANIR、函館 - 青森航路に就航。船籍港:函館)
5,193総トン。全長126.2m、航海速力20.9ノット。1984年7月から2008年12月5日に就航。
旅客定員520名。車両積載数:トラック98台、乗用車15台。内海造船瀬戸田工場建造。
船名の由来は、北欧神話のヴァン神族(豊穣と平和をつかさどる神)より。
2008年12月までは東日本フェリーで運航されていた。同年12月5日朝便をもって引退。しばらくは函館市の港町埠頭に係船されていたが、「PT. Jemla Ferry」(インドネシア)に売却され、「JAGANTARA」として就航。
えさん(Esan、函館 - 青森航路に就航、船籍港:函館)
1,998総トン。全長104m、航海速力19ノット。1988年10月1日から2010年7月11日に就航。
旅客定員78名。車両積載数:トラック25台(または乗用車70台)内海造船瀬戸田工場建造。
天塩町で創業し函館を拠点に木材・石炭輸送を行っていた「吉野谷海運」を経営する吉野谷義徳が中心となり、吉野谷と戦前に樺太航路で競合し交友のあった蔦井與三吉が経営する東日本フェリーとの共同出資で、東日本フェリーの内航船事業の近代化や吉野谷海運の貨物船「歓栄丸」の更新、トラック航送事業による体質改善を目的として1972年に東日本フェリーグループの「道南自動車フェリー」として創立。函館 - 青森間の自動車航走貨物定期航路事業を展開し、その後2000年10月の海上運送法の改正により一般旅客定期航路の許可を得て旅客航路事業も開始した。
2008年に東日本フェリーの事業不振に伴うグループ内の事業再編に伴い、同社が最後まで運航していた3航路の譲渡が検討された。しかし、道南自動車フェリーが従来から運航する函館 - 青森航路以外の2航路(函館 - 大間航路、青森 - 室蘭航路)については航路の維持にあたり、採算性の点から地元自治体の支援措置を待つ形となった。
2008年9月8日、燃料費の高騰や利用者の伸び悩みにより同年11月末で北海道と青森を結ぶ航路から撤退する東日本フェリーの函館 - 青森航路と、2隻の船舶(びなす・びるご)を継承する計画を発表するとともに、道南自動車フェリーは東日本フェリーの親会社であるリベラホールディングスの傘下に入った。