アムダリヤ川
コイテンダグ自然保護区(英語版)(トルクメニスタン) ケリフ禁猟区(英語版)(トルクメニスタン)
下流域には中央アジアで最大規模の河畔林のトゥガイ(英語版)があり、中央アジアの砂漠地帯にありながら生物多様性に富む。特に絶滅危惧種のタシケントアカシカ(英語版)にとっては重要な生息地である。
カラクーム運河の建設や下流部での無計画な灌漑により、流入量の激減したアラル海は急速に縮小し、周辺環境が大きく悪化している。また、下流での灌漑排水がサリカミシュ低地に流れ込み、新たに巨大な湖が誕生するという事態も発生している。
下流域の北部からアラル海の南東側一帯の地域は2021年にユネスコの生物圏保護区に指定された。
カラクーム運河
アム・ブハラ運河