細川藤孝
また、『永禄六年諸役人附』にも御供衆と記されている藤孝が外様衆の家格である和泉守護家を継いだとすることの不自然さを指摘する見解もあり、近年有力視されている。伊豆守高久の父細川政誠は近江源氏佐々木一族の大原氏の出身であり、8代将軍足利義政が政誠を近臣に加えるために足利一門の細川名字を名乗らせるべく淡路守護細川氏の養子となるよう命じたという。この指摘によるならば、幽斎が養子となって継いだのは、和泉守護家とは系統の異なる淡路守護家の支流ということになる。
なお、幽斎の実父三淵晴員についても細川元常の弟とする説を疑問視して、播磨国に下向していた幕臣の三淵孫三郎(現在の系譜には記載されていないが、当時の文書から天文年間の三淵氏当主であった可能性が高い)の弟であったとする説もある。この指摘が事実ならば、幽斎は実方においても和泉守護細川氏には繋がらない可能性がある。
父母 実父:三淵晴員(1500 - 1570) 実母:智慶院 - 清原宣賢の娘 養父:細川晴広 養母:細川家室(後に清原枝賢に再嫁)
兄弟姉妹 宮川尼(武田信高 (若狭武田氏)室) 三淵藤英(? - 1574) 佐々木越中守室 玉甫紹琮(高桐院開山) 梅印元冲 長岡好重 土御門久脩室
妻 正室:沼田麝香(1544 - 1618) - 光壽院、沼田光兼の娘
子女 長男:細川忠興(1563 - 1646) 次男:細川興元(1566 - 1619) 女子:伊也 - 一色義有のち吉田兼治室 三男:細川幸隆(1571 - 1607) 女子:千 - 長岡孝以のち小笠原長良室 男子:細川孝之(1585 - 1647) 女子:加賀 - 木下延俊正室 女子:栗 - 長岡好重(幽斎実弟)室 女子:仁伊 - 夭逝
剣術等の武芸百般、和歌・茶道・連歌・蹴鞠等の文芸を修め、さらには囲碁・料理・猿楽などにも造詣が深く、当代随一の教養人でもあった。剣術は塚原卜伝に学び、波々伯部貞弘、吉田雪荷から弓術の印可を、弓馬故実(武田流)を武田信豊から相伝されるなど武芸にも高い素質を示した。膂力も強く、京都の路上で突進してきた牛の角をつかみ投げ倒したという逸話もある。また、息子・忠興と共に遊泳術にも優れたという。
三条西実枝から天正2年(1574)6月に勝龍寺城の天主で古今伝授を受け、その子三条西公国とさらにその子(実枝の孫)三条西実条に返し伝授するまでの間、二条派正統を一時期継承した。当時唯一の古今伝授の伝承者であり、関ヶ原の戦いの際、後陽成天皇が勅命により幽斎を助けたのも古今伝授が途絶える事を恐れたためだといわれる。
門人には後陽成天皇の弟八条宮智仁親王、公家の中院通勝、烏丸光広などがおり、また松永貞徳、木下長嘯子らも幽斎の指導を受けた。島津義久は幽斎から直接古今伝授を受けようとした一人であり、幽斎が足利義昭に仕えていた頃から交流があった。
八条宮が幽斎から古今伝授を受けた「古今伝授の間」は、江戸時代に八条宮家の領地であった長岡天満宮に「開田御茶屋」として移築され、明治4年(1871)に桂宮家から細川家に下賜されるまで長岡天満宮境内にあった。その後、幽斎の孫で熊本藩主となった細川忠利が造営した水前寺成趣園(熊本市)に大正元年(1912)に移築され、平成22年(2010年)には熊本で幽斎没後四百年祭が開催された。また翌平成23年(2011年)には水前寺成趣園内に銅像が建てられている。
足利義昭が後に幕府を追われ、死去した後葬儀を執り行う者もいなかったため、見かねた幽斎が葬儀を主催した。