横浜FC
キャッチフレーズ:「昇格~再び一緒にあの舞台に」
前年まで鳥栖監督を務めていた岸野靖之が監督に就任。鳥栖から高地系治、柳沢将之、武岡優斗、渡邉将基、鳥取からシュナイダー潤之介、韓国・釜山から金裕晋、仙台からFWサーレス、仙台や新潟に所属していたシルビーニョを完全移籍で、東京Vから元日本代表FW大黒将志をレンタル移籍で獲得。
開幕3連勝の後、第4節から1勝9敗と低迷し、一時は15位に沈んだが、第14節の鳥栖戦以降5試合負けなし。6月に大黒が退団(東京Vへ復帰後、FC東京へレンタル移籍)したが、元C大阪のカイオ、元大分のホベルトを獲得した。シーズン成績は前年度を上回る6位。天皇杯は3回戦で川崎に敗北した。岸野はシーズン途中の9月1日からGM兼任となった。
2001年9月、横浜フリエSCはソシオに代る新しいチームの後援組織「横浜FCクラブメンバー」を創設し、新社長に就任した奥寺保有の株式をソシオ会員ではなく、クラブメンバーに割り当てること、また会員には「サッカーをする・ふれるといった体験型のイベントを充実させる」ことや「個人情報の管理・責任をより徹底・明確にする」ことなどを提案。名称についてもソシオの名前が係争中だったことから別の名前に変更したという。これにはソシオ理事会側が遺憾の意を示す。
その後、ソシオは横浜フリエSCに対し、ソシオの会費の一部(740万円相当)と会員名簿の返還を求めるよう横浜地方裁判所に仮処分申請を行ったが、2002年1月に却下された。ソシオは東京高等裁判所に即時抗告を行ったが、これも2003年に却下された。その趣旨は「入会事務・会員名簿の作成は運営会社から委託された業者が行い、団体として内部的にも自立して運営されているとは認めがたいから、ソシオは(法人格を有しない団体でも例外的に当事者能力が認められる)民事保全法7条・民事訴訟法29条の『法人でない社団』とは認められない。よって、当事者能力がないから、申立ては不適法である」というものだった。
その間、横浜フリエSCが「ソシオの名称は横浜フリエSCに商標登録がある。このまま使用を続けるのなら法的な処置も辞さない」とソシオに通告を行い、2003年にソシオは「ソシオ・フリエスタ」から「ソシオ横浜」に名称を変更した。2003年9月、ソシオと横浜フリエSCは和解合意書に調印し、2年以上に及んだ横浜フリエSCとソシオの対立は区切りを迎えた。なお、ソシオ横浜の公式サイト は2008年1月を最後に更新が止まっている。
北海道コンサドーレ札幌でヘッドコーチを務めた四方田修平が監督に就任。前年まで監督だった早川はトップチームコーチに就任した。
この年にジュビロ磐田から入団した新エース・小川航基の活躍もあり、開幕戦で大宮アルディージャに3−2と勝利すると、その試合含めて開幕10戦負けなしで首位を快走する。その後、3試合はいずれもドローと勢いに陰りが見えると、14節・ロアッソ熊本戦と15節・ブラウブリッツ秋田戦を連敗し首位を一旦アルビレックス新潟に明け渡す。しかし、16節・徳島ヴォルティス戦は自分達のペースを取り戻して2−1で勝利し、すぐさま首位を奪い返した。その後は、勝ち負けを繰り返し前半戦を2位で折り返した。後半戦は一時期昇格圏内から外れる時期もあったが、新潟との首位争いを続け、40節・大分トリニータ戦を前に昇格を確定させられる状況になった(大分戦は、元横浜FCの野村直樹に終盤に勝ち越し点を許し2−3で敗れた)。
15試合 - 8敗7分(2005年4月9日J2第6節水戸ホーリーホック戦〜2005年7月9日J2第20節サガン鳥栖戦)