ウィキソフトウェア
そのほかに、個人用に特化されたウィキソフトウェアもある。ウェブベースのものにはあまり見られない機能としては、画像などのドラッグ・アンド・ドロップに対応していることがあげられる。
VoodooPad はmacOS用の個人用ウィキソフトウェアで、無料で使える「ライト」バージョンもある。また、VoodooPadと共に利用できる簡易ウェブサーバも提供されている。
ZuluPad はWindowsとmacOSに対応した個人用ウィキソフトウェア。オープンソース版と有償版が存在する。
StoneNotes はWindows用の個人用ウィキソフトウェアで、直感的なリンクインタフェースが特徴的である。語を単にダブルクリックすると、そのタイトルで新しいページが作られリンクされる。StoneNotesには無料のデモ版もある。
ConnectedText はWindows用のプロプライエタリなウィキソフトウェアで、多くの高度な機能をもつ。全文検索、視覚的なリンクツリー、カスタマイズ可能なインタフェース、ファイルの取り扱い、プラグイン、などである。デモ版も存在する。
Zim はPythonで書かれた、フリーでクロスプラットホームなウィキソフトウェアである。操作はシンプルなものになっている。プラグインで機能を拡張することも可能。
このほかにも、いくつもの個人用ウィキソフトウェアが存在する。