AutoDock
AutoDockは、Linux、Mac OS X、SGI IRIX、Microsoft Windows上で動作する。Debian、Fedora、Arch Linuxなど、いくつかのLinuxディストリビューションでパッケージとして提供されている。
Microsoft Windows上でネイティブ64ビットモードでアプリケーションをコンパイルすることで、より高速な浮動小数点演算が可能になっている。