第三高等学校 (旧制)
京都大学吉田寮それ自体は京都帝国大学学生寄宿舎として設立されたものであり、第三高等学校とは直接の関係はないが、現存する寮の建物の一部は、現在の吉田キャンパス本部構内に立地していた第三高等中学校寄宿舎の部材を転用して建設されたことが分かっている。
吉田寮食堂は1889年(明治22年)7月に、山口半六と久留正道の設計により、山本治兵衛の現場管理の下、第三高等中学校寄宿舎の食堂として建設された。現在の本部構内、知恩院の向かいに存在していた。1894年(明治27年)からは第三高等学校(旧制三高)寄宿舎の食堂として、1897年(明治30年)からは旧・京都帝国大学寄宿舎の食堂として使用され、1913年(大正2年)には吉田寮の竣工に合わせて、吉田南構内・吉田寮の西隣に移築され、吉田寮食堂になった。ゆえに吉田寮食堂は第三高等中学校の遺構にして、京都大学最古の大学建築である。この事実は2012年4月に七灯社建築研究所の山根芳洋により明らかにされたが、丁度その時、京大は寮食堂を取り壊そうとしていた。結局、学生の反発と山根の発見により取り壊しは見送られ、補修が施された。