アトレティコ・マドリードB
ロベルト・マリナ 1980-1982
ルベン・バラハ 1996-1999
パブロ・ガルシア 1997-2000
ズヴォニミル・ヴキッチ 1998-2000
ガビ 2002-2004
マリオ・スアレス 2004-2006
イグナシオ・カマーチョ 2007-2008
コケ 2008-2011
サウール・ニゲス 2010-2013
トーマス・パーテイ 2012-2013
ケイディ・バレ 2016-2018
パブロ・バリオス 2022-2023
母体となるクラブは、1963年9月17日にCDレイフラとCAヘタフェの2つのクラブが合併してレイフラ・アトレティコOJEという名前で設立された。1970年にはアビアコ・マドリレーニョCFというアマチュアクラブを吸収している。同年、アトレティコ・マドリードに経営や選手の派遣などを行う契約を結び、アトレティコ・マドリレーニョCFにクラブ名を改称。運営は独立したクラブとして行われたため、コパ・デル・レイには出場していた。1991年、1991-92シーズンからアトレティコ・マドリードのリザーブチームとして活動することが決定し、これ以降はアトレティコ・マドリードの下部組織に組み込まれ、コパ・デル・レイにも出場が出来なくなった。
1998-99シーズンは2位と非常に好成績を残し、プリメーラ・ディビシオンの昇格圏内へと入ったこともあった。そして翌1999-2000シーズンはトップチームのアトレティコ・マドリードが不振に陥って降格したため、実際に降格圏内ではなかったBチームも影響を受けセグンダ・ディビシオンBへ降格した(トップチームと下部チームは同時に同じリーグにいることができないため)。
2020-21シーズン、スペインリーグ再編の影響を受けて5部相当にあたるテルセーラ・ディビシオンRFEF降格が決まった。クラブが5部相当のリーグでシーズンを戦うことは、クラブ史上初のことだった。