天武天皇
陵(みささぎ)は、宮内庁により奈良県高市郡明日香村大字野口にある檜隈大内陵(桧隈大内陵:ひのくまのおおうちのみささぎ)に治定されている。持統天皇との合葬陵で、宮内庁上の形式は上円下方(八角)。遺跡名は「野口王墓古墳」。
古代の天皇陵としては珍しく、治定に間違いがないとされる。文暦2年(1235年)に盗掘に遭い、大部分の副葬品を盗まれた。棺も暴かれたが遺骸はそのままの状態で、天皇の頭蓋骨にはまだ白髪が残っていた。持統天皇の遺骨は火葬されたため銀の骨壺に収められていたが、骨壺だけ奪い去られて遺骨は近くに遺棄された。藤原定家が『明月記』に盗掘の顛末を記す。また、盗掘の際に作成された『阿不幾乃山陵記』に石室の様子がある。
上記とは別に、奈良県橿原市五条野町にある宮内庁の畝傍陵墓参考地(うねびりょうぼさんこうち)では、天武天皇と持統天皇が被葬候補者に想定されている。遺跡名は丸山古墳(五条野丸山古墳)。
また皇居では、皇霊殿(宮中三殿の1つ)において他の歴代天皇・皇族とともに天皇の霊が祀られている。
夫人:大蕤娘 - 蘇我赤兄女 第五皇子:穂積皇子(? - 715年) 皇女:紀皇女(? - ?) 皇女:田形皇女(675年 - 728年) - 六人部王室、伊勢斎宮
嬪:額田王 - 鏡王女 第一皇女:十市皇女(653年? - 678年) - 大友皇子(弘文天皇)妃、葛野王母 平安時代の一条天皇は、十市皇女の12世孫(天武天皇の女系13世孫)にあたる。
嬪:尼子娘 - 胸形徳善女 第一皇子:高市皇子(654年 - 696年) - 長屋王・鈴鹿王父、高階真人・高階朝臣等祖
嬪:かじ媛娘(かじは木偏に穀。※歴史的仮名遣いでは「かぢ」) - 宍人大麻呂女 第四皇子:忍壁皇子(? - 705年) - 龍田真人祖、のち知太政官事 皇子:磯城皇子(? - ?) - 三園真人・笠原真人・清春真人祖 皇女:泊瀬部皇女(? - 741年)- 川島皇子妃 皇女:託基皇女(? - 751年) - 志貴皇子妃