鳳凰丸
「鳳凰丸」は、竣工翌日の1854年6月7日(嘉永7年5月11日)に試験航海を無事に終えた。その後品川沖に回航され、1855年4月18日(安政2年2月30日)に老中阿部正弘らが船内や大砲発射、帆走などを見分した。その結果は良好で、乗組員に褒賞が出されている。その後も幕府高官らの訪問が続き、13日に浦賀に戻った。
軍艦として着工された本船であったが、すでに軍艦の主流は蒸気船に移っており、旧式であることは否めなかった。そのため、主に輸送船として使用された。幕府船として運用中の1866年(慶応2年)には、石川島造船所で大規模な修理工事を受けている。勝海舟によればこのときに豊島形へと改装されたというが、現存する絵図や公文書の記録からは豊島形とは別物と考えられる。
戊辰戦争時には「太江丸」とともに仙台藩に輸送船として貸し出され、榎本武揚率いる旧幕府海軍脱走艦隊が同地へ寄港した際に返却された。榎本艦隊に輸送船として加入した「鳳凰丸」は1868年12月1日(明治元年10月18日)に宮古湾を出航し、12月3日に僚艦7隻とともに蝦夷地(北海道)鷲ノ木へ到着、乗船した部隊を上陸させた。その後の箱館戦争を生き延び、五稜郭陥落後の1869年7月15日(明治2年6月7日)に室蘭駐屯の開拓方305名(乗員含む)を乗せて砂原村へ赴き、新政府軍に投降した。
明治政府では初めは軍務官直轄の運輸船だったが、明治2年9月24日(1869年10月28日)に兵部省では不要と報告され、大蔵省に交付、10月頃に引き渡された。