HNF1A
HNF1Aタンパク質はHNF1ホメオボックスファミリーに属する。N末端の二量体化ドメイン(1–32番残基)、非典型的POUホメオドメインを含む二分節型DNA結合ドメイン(98–280番残基)、C末端のトランス活性化ドメイン(281–631番残基)の3つの機能的ドメインを持つ。また、二量体化ドメインとDNA結合ドメインを連結する柔軟なリンカー領域(33–97番残基)も存在する。結晶構造はいくつか解かれており、二量体化ドメインはターン構造で隔てられた2つのαヘリックスが二量体化することで4ヘリックスバンドルを形成している。DNA結合モチーフはヘリックスターンヘリックスを形成しており、モチーフには3本のαヘリックスからなるPOUホメオドメインが含まれている。このホメオドメインは、典型的ホメオドメインフォールドと比較して、2番目と3番目のヘリックスの間に伸長したループが挿入された非典型的構造をしている。この非典型的挿入部は相互作用面を安定化して転写効率を改善していると考えられている。二量体化ドメインはホモまたはヘテロ二量体化を担う。形成された二量体にはαヘリックス1と1′からなる固い「ミニジッパー」構造が含まれ、αヘリックス2と2′からなる柔軟なC末端部分とは非典型的な強固なターン構造で連結されている。