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サンフランシスコの科学博物館であるエクスプロラトリアムは、1990年代に.eduドメインを取得している。当時、.eduドメインを保有していた組織は約600あったが、博物館は1つだけだった。博物館は、当時存在していたドメイン命名規則を回避し、学術機関ではないにもかかわらず.eduドメインを使用することと、12文字を超える名前を使用することができた。1993年以降、いくつかのコミュニティ・カレッジが.eduドメインを取得したと報告されている。1999年、『マザーアースニュース』の記事で、遠隔教育に関する権威が 「70ドルを持っている人なら誰でも、.eduドメインを取得して、インターネット上のあらゆる種類の企業をアーカイブするのに使うことができる」と述べている。
2001年、.eduドメインの取得は、アメリカ合衆国が認定する高等教育機関に限定された。その後の変更により、.eduドメインの取得資格は拡大され、認定されたコミュニティカレッジや大学システム、コミュニティカレッジ地区、および同様の団体による登録が可能になった。
2004年から2011年の間、.eduドメインの登録数は7,000から8,000の間で比較的一定のままであった。