講談社出版文化賞
第16回(2000年) - 小林一輔(『コンクリートが危ない』)
第17回(2001年) - 串田嘉男(『地震予報に挑む』)
第18回(2002年) - 宮治誠(『カビ博士奮闘記』)
第19回(2003年) - 林純一(『ミトコンドリア・ミステリー』)
第20回(2004年) - 粂和彦(『時間の分子生物学』)
第21回 - 第30回
第21回(2005年) - 桑村哲生(『性転換する魚たち』)
第22回(2006年) - 福岡伸一(『プリオン説はほんとうか?』)
第23回以降、講談社科学出版賞に賞名変更。
第23回(2007年) - 西成活裕(『渋滞学』)
第24回(2008年) - 佐藤克文(『ペンギンもクジラも秒速2メートルで泳ぐ ハイテク海洋動物学への招待』)
第25回(2009年) - 大河内直彦(『チェンジング・ブルー 気候変動の謎に迫る』)
第26回(2010年) - 柴田一成(『太陽の科学 磁場から宇宙の謎に迫る』)
第27回(2011年) - 近藤宣昭(『冬眠の謎を解く』)
第28回(2012年) - 大須賀健(『ゼロからわかるブラックホール』)