十五歳の船長
彼らは不漁の埋め合わせとして、その鯨を獲ることにした。彼らは十五歳の船員ディック・サンドをピルグリム号に残してディンギーに乗った。しかし、捕鯨者が銛を撃つ前にディンギーが沈められ、サンドとポルトガル人の料理長ネゴロを除く乗組員全員が死亡してしまった。
サンドは乗客の支持を得て船長の職務を引き継いだ。ネゴロだけはそれに同意しなかったが、しぶしぶ従う。それまでの乗客は船員となり、南アメリカの海岸に向かう途中、ピルグリム号は嵐に遭遇する。
しばらくして、サンドはネゴロが船の羅針盤をいじっているところを捕まえた。すでに第2羅針盤も壊され、測定ログの接続ケーブルが切断されて針路と位置が測定できなくなっていた。
彼らはイースター島と思われる島を通り過ぎる。長い航海の末に陸地が見えてくると、彼らは船を接岸させようとする。ピルグリム号はサンゴ礁に乗り上げ、砂浜でサンドとその仲間たちはハリスというアメリカ人に会う。ハリスは彼らにボリビアの海岸にいることを告げる。ハリスは彼らをアシエンダに導き、ここから旅を続けることを勧め、彼らは提案を受け入れた。
一方、ネゴロは以前から彼らと距離を置いていた。少年の心を持ったベネディクトは小さな眼鏡をかけたユーモアがある男で、彼は昆虫のこと以外は考えておらず、虫眼鏡と胴乱を常に持ち歩いている、いわゆる利口な愚者である。
内陸へ進んでいくと、一行はボリビアでは見られないキリンやカモシカなどの動物と出くわす。一行は疑いを持つが、ハリスによってなだめられる。
ブリガンティンの捕鯨船「ピルグリム号」(巡礼の意味)は、ハル船長の指揮のもと、母港のサンフランシスコに向かっていた。これまでのところ、期待したような成果は得られず、ピルグリム号は帰港の途中で、オークランドのワイテマタ港(フランス語版)に停泊していた。
ハルはより良い人材を求め、乗組員の入れ替えを予定している。しかし、有能な船員はすでに他の船で乗務していた。ハルはチリのバルパライソに行きたいと考えており、プリシラ・ウェルドン、幼い息子のジャック、変わり者の昆虫学者であるベネディクト、そしてジャックの乳母ナンという面々を乗せ、ピルグリム号でオークランドを発った。プリシラはピルグリム号の船主であるジェームズ・W・ウェルドンの妻で、ニュージーランドからカリフォルニアへの帰郷を希望している。
ピルグリム号の乗組員は海上で難破船のヴァルデック号から5人のアメリカ黒人、ヘラクレス、トム、バット、オースティン、アクテオンと大型犬のディンゴを救助した。ディンゴは乗船するやいなや、船の料理長であるネゴロの喉元に跳びかかった。
ジャックがアルファベットの積み木で遊んでいると、ディンゴはSとVの2個の積み木をくわえて行ってしまう。 ハルはSVが大西洋のコンゴ川の河口からインド洋のデルガドまでのアフリカ横断に挑んだが遭難してしまった探検家、サミュエル・ヴァーノン (Samuel Vernon) のイニシャルかもしれないと思った。
しばらくして、ピルグリム号は重さ100トンに及ぶアカボウクジラの仲間に遭遇する。