熊本県立熊本農業高等学校
硬式野球部
陸上部
柔道部
剣道部
相撲部
バレーボール部
バスケットボール部
ソフトテニス部
卓球部
サッカー部
軟式野球部
馬術部 - 2023年度の部員数は51人となっており馬術部の部員数で全国一となっている。
ボクシング部
バドミントン部
ゴルフ部
ハンドボール部
水泳部