多号作戦
旗艦那智を喪失していた第二遊撃部隊司令部(志摩清英第五艦隊司令長官など)も、各駆逐艦に便乗して撤退することになった。 同日夜半、木村少将指揮下の駆逐艦5隻(霞〈木村司令官〉・初霜〈志摩長官〉・朝霜・潮・竹)はマニラを出発し、ブルネイにむかった。 11月14日、ふたたびアメリカ軍機動部隊艦載機がマニラを襲撃し、曙・駆潜艇116号・輸送船3隻などが沈没した。 アメリカ軍機動部隊の一連の空襲と情報分析により、先の台湾沖航空戦やレイテ沖海戦で日本海軍が主張した大戦果は誤報であることが確実となった。
11月15日、豊田連合艦隊長官は栗田中将に対し第一遊撃部隊所属の戦艦3隻(大和・長門・金剛)、軽巡洋艦矢矧、第17駆逐隊(浦風・雪風・磯風・浜風)の内地回航と修理を、シンガポールで修理中の2隻(高雄・妙高)を除く3隻(戦艦榛名、巡洋艦〈羽黒・大淀〉)を大川内傳七中将(南西方面艦隊司令長官)の指揮下に編入するよう命じた(GF電令作第419号)。 大川内長官は、3隻(榛名・羽黒・大淀)を第二遊撃部隊指揮官志摩清英中将指揮下の支援部隊に編入したが、榛名はリンガ泊地到着直前に座礁し、高速航行と長期航海に支障をきたすようになった。 同日夜、大川内長官は多号作戦警戒部隊(第二遊撃部隊)に部署されていた第一水雷戦隊と第二水雷戦隊を支援部隊に編入、17日には支援部隊の待機位置をスマトラ島のリンガ泊地に指定した。
11月20日、日本海軍は水上艦艇の兵力を再編する。島風沈没時に全滅した第二水雷戦隊を再建するため、第一水雷戦隊を解隊して二水戦に転用する(木村昌福少将が第二水雷戦隊司令官に就任)。
1944年(昭和19年)10月17日、連合軍はレイテ湾に集結して上陸作戦を開始(ダグラス・マッカーサー将軍によるレイテ島上陸は20日)、フィリピンの戦いにおけるレイテ島地上戦がはじまる。 日本軍は捷一号作戦を発動し、日本海軍は連合艦隊の大部分を投入したが大損害を受けた(レイテ沖海戦)。 一方、台湾沖航空戦で日本海軍が発表した大戦果を信じた日本陸軍は、従来のルソン島地上決戦の方針を転換し、レイテ島地上決戦に切りかえた。 日本陸軍(中央・現地軍)は海上決戦に期待しておらず、独力でレイテ地上決戦を進めることにした。10月27日、昭和天皇は第四航空軍の奮闘を誉めると共に、「地上戦で連合軍を撃滅しなければ勝ったとはいえない」と強調した。
レイテ島への最初の増援輸送は、第35軍(司令官:鈴木宗作陸軍中将)が10月19日に発動した鈴二号作戦にともない、第16戦隊司令官左近允尚正海軍中将の指揮で行われた。 だが、作戦開始前の10月23日にマニラ沖合で重巡洋艦青葉(第16戦隊旗艦)がアメリカ軍潜水艦の雷撃で大破する。残る2隻(軽巡洋艦鬼怒(第16戦隊旗艦)・駆逐艦浦波)と輸送艦5隻による第二遊撃部隊警戒部隊は、ミンダナオ島カガヤンからレイテ島西岸オルモックへの増援作戦を行う。輸送部隊は10月26日朝に到着、揚陸に成功した。だが帰路でアメリカ軍機動部隊艦載機の攻撃を受け、鬼怒と浦波が沈没した。また鬼怒救援のため派遣された駆逐艦不知火(第18駆逐隊)も、空襲で撃沈された。
第四護衛部隊 第一輸送戦隊司令官 駆逐艦3隻
第八船団 第一輸送戦隊司令官所定 陸軍SS艇・輸送艦2隻(11月7日マニラ着予定)、第68旅団
輸送船:有馬山丸・和浦丸・日昌丸
駆逐艦:清霜
12月7日にレイテ島西岸のアルベイラにアメリカ軍が上陸し、レイテ島の日本軍は揚陸地点(オルモック)と最前線部隊の連絡が遮断される事態になった。南西方面部隊指揮官の大川内傳七南西方面艦隊司令長官は、戦艦と戦闘行動に支障があるものを除く第二遊撃部隊のブルネー進出待機を命じた。だが該当する艦艇は足柄と大淀のみで、ブルネイも頻繁に空襲をうける状態であった。最終的に第二遊撃部隊(指揮官:志摩清英第五艦隊司令長官)のカムラン湾回航と待機が命じられる。 12月12日、第二遊撃部隊はリンガ泊地を出発し、14日にカムラン湾に到着する。第二水雷戦隊司令官木村昌福少将は、旗艦を駆逐艦朝霜から軽巡洋艦大淀に変更した。カムラン湾集結時の兵力は、重巡洋艦足柄(第五艦隊旗艦)・第四航空戦隊(日向〈旗艦?〉・伊勢)・第二水雷戦隊(軽巡洋艦大淀・駆逐艦〈朝霜・霞・初霜〉)・給油艦日栄丸であった。
一方、大本営陸軍部・海軍部はタマ35船団(高雄~マニラ行)としてルソン進出中の陸軍歩兵部隊(第10師団の歩兵第39連隊・第23師団の歩兵第79連隊)を、輸送船4隻(有島丸・日昌丸・和浦丸・鴨緑丸)に乗船のままカリガラ湾に突入させることに決め、これを「決号作戦」と呼称、第十次多号作戦として実施することになった。
この事態に、陸軍潜水艦まるゆもレイテ輸送作戦に投入された。海軍側の甲標的(特殊潜航艇)も、少数艇が偵察や襲撃をつづけた。
第3次輸送船団の全滅前、大本営は第23師団(満州)、第10師団(台湾)、第19師団(朝鮮半島)を、レイテ地上戦に投入することを企図していた。第23師団は11月末頃、第10師団は12月上旬、第19師団は12月下旬以降、現地に進出する計画であった。 第23師団はヒ81船団でフィリピンへ移動中、11月15日から17日にかけてアメリカ軍潜水艦に襲撃され、大損害をうける。レイテ地上決戦継続は不可能となったが、大本営はレイテ決戦と増援作戦(多号作戦)を続行した。
11月23日以降の第5次作戦は、第一梯団(駆潜艇46号・輸送艦3隻)、第二梯団(駆逐艦竹・輸送艦3隻)とも空襲をうけて失敗した。25日にはアメリカ軍機動部隊艦載機の空襲で、軽巡洋艦八十島(輸送戦隊旗艦。輸送艦3隻とともに一式砲戦車を内地からマニラへ輸送任務中)と重巡洋艦熊野が沈没した。 同時期のアメリカ海軍機動部隊も長期間の行動による疲労と、日本軍特別攻撃隊(陸軍機・海軍機)による損害に悩まされており、補給と休養のために後退する。連合軍は航空攻撃と共に魚雷艇や水雷戦隊を投入し、日本軍を迎撃した。 第6次作戦は陸軍輸送船2隻と護衛艦艇3隻をもって実施され、一部揚陸に成功するも船団は帰路で全滅した。 第7次作戦は機動艇5隻・輸送艦3隻・駆逐艦2隻をもって行われた。連合軍水雷戦隊の迎撃により、日本側は駆逐艦桑を失う。