佐世保鎮守府
中村良三 中将:1931年12月1日 - ※連合艦隊演習の際に仮想敵軍の役を任じられ、連合艦隊を完膚なきまでに撃破した。
左近司政三 中将:1932年12月1日 -
米内光政 中将:1933年11月15日 - ※戦時統合のために発足した佐世保の銀行に「親和銀行」の名を授けた。
今村信次郎 中将:1934年11月15日 -
百武源吾 中将:1935年12月2日 - ※百武三郎の弟。佐賀県出身の縁で、佐賀県人の参拝者が多い早岐神社二の鳥居の扁額を揮毫した。
松下元 中将:1936年3月16日 -
塩沢幸一 中将:1936年12月1日 -
豊田貞次郎 中将:1937年12月1日 - ※任期中に山本五十六海軍次官から後任候補に挙げられたが、傲慢な返答をして撤回された。
中村亀三郎 中将:1938年11月15日 -
平田昇 中将:1939年11月15日 -
住山徳太郎 中将:1940年10月15日 -
谷本馬太郎 中将:1941年11月20日 - ※歴代長官でただ一人、任期半ばに病没した。世知原小学校に伝わる優勝旗の揮毫者である。
南雲忠一 中将:1942年11月11日 -
小松輝久 中将:1943年6月21日 -
杉山六蔵 中将:1944年11月4日 -
石井敬之 少将:1945年11月15日 - 11月30日
昭和17年(1942)、鎮守府庁舎地下に完成。地下2階、総面積約700平方メートルの規模があり、軍港周辺の見張所からの情報を統括し、高射砲台の砲戦指揮を行った。
昭和20年6月の佐世保空襲の際に鎮守府庁舎は全焼したが防空指揮所は被害を免れた。戦後に不審火により内装は焼失したものの、堅牢に造られた地下壕本体は健在である 。