サカゲツボカビ綱
珪藻細胞内に侵入する捕食者であるピルソニア類や、自由生活性鞭毛虫であるデヴェロパイエラ類は、サカゲツボカビ類(および卵菌類)に近縁であり、ピルソニア類をサカゲツボカビ綱に分類した例もある。しかし多量の分子データに基づく分子系統解析からは、ピルソニア類 + デヴェロパイエラ類がサカゲツボカビ類 + 卵菌の姉妹群であることが示唆されている。
わずか6属20種ほどが知られる小さなグループである。ただし環境DNAの研究からは、いまだ未知のサカゲツボカビ類が多く存在することが示唆されている。
ふつうサカゲツボカビ目 (Hyphochytriales) にまとめられ、分実単心性のサカゲカビ科 (Rhizidiomycetaceae) と分実多心性のサカゲツボカビ科 (Hyphochytriaceae) に分けられている(下表1)。全実性のサカゲフクロカビ属(Anisolpidium)もサカゲフクロカビ科としてサカゲツボカビ綱サカゲツボカビ目またはサカゲフクロカビ目に分類されていたが、分子系統学的研究からサカゲフクロカビ属は卵菌綱に属することが示され、サカゲツボカビ綱からは除かれている。このことは、単鞭毛化が複数の系統で独立に起こったことを示している。