ジェイアールバス関東土浦支店
君島線 (系統は全便土浦駅直通)阿見坂下 - 曙町 - 竹来 - ガーデンシティ湖南(南平台) - 追原辻 - 君島 - 布佐橋 - 稲敷市役所 - 合同庁舎前 - 吹上 - 江戸崎総合高校前 - 江戸崎 1996年(平成8年)10月 - 区間新設(阿見 - 東京医大 - 曙町)。 2000年(平成12年)7月25日 - 区間新設(ガーデンシティ湖南(南平台)- 追原 - 追原辻)。 2016年(平成28年)5月6日 - バス停の廃止(江戸崎西高前)・新設(稲敷市役所)。 2018年(平成30年)9月9日 - 関東鉄道共通札式回数券「1,000円券、2,000円券」が発売終了。 時期不明 - 布佐橋 - 土屋間にバス停の新設(上土屋)。 2023年(令和5年)8月1日 - 減便に伴い土浦駅発東京医大経由江戸崎行きの運行廃止。江戸崎発東京医大経由土浦駅行きは運行継続。 2023年(令和5年)10月1日 - ダイヤ改正を実施し、東京医大病院前経由、工業団地前経由、美浦トレセン始発を廃止。
ひたち野うしく線 ひたち野うしく駅東口 - 牛久栄進高校 - (イオンモールつくば) - 二の宮中央 - つくばセンター(TXつくば駅)※関東鉄道と共同運行。 1998年(平成10年)3月14日路線開業。一般路線ではJR化後初の新路線であった。もともと発着地ともにJRバス関東の一般路線バス営業エリアではなかったが、ピーク時と閑散時の利用者数の格差が大きく、共同運行することでリスクが分散されるという理由で共同運行に踏み切った。
国鉄時代のメイン路線は常磐線土浦駅から成田線佐原駅を結ぶ霞ヶ浦線と東北本線古河駅を結ぶ南筑波線で、いずれも鉄道線の短絡・先行という使命を持っていた路線であった。1985年(昭和60年)には国際科学技術博覧会(つくば万博)開催に伴い、古河駅 - 博覧会会場の臨時路線として「エキスポ号」を運行した。
1987年(昭和62年)4月1日のJR発足と同時に高速バス「つくば号」が運行開始され、同年9月から当時の土浦営業所も担当することになる。
1999年(平成11年)以降も、常総ニュータウン向けの常総ルート、東京駅 - 江戸川台駅、東京駅 - 江戸崎線など、次々と近距離高速路線を開設した。また、「ドリーム号」や「昼特急」の一部についても運行を担当するようになっている。
2005年(平成17年)のつくばエクスプレス線 (TX) 開業により、メイン路線であった「つくば号」などの大半の乗客が同線に移行する。「さいたま・つくば号」は3カ月程度で廃止された。また常総ルートからも2007年(平成19年)1月9日限りで撤退した。
なお、「つくば号」で使用されていたネオプラン・メガライナーの運行には当支店も携わっていたことから、「青春メガドリーム号」の一部の運行を当支店が受け持っていた。
一般路線は、民営化後一時期はガーデンシティ湖南(南平台)や東京医大病院、テクノパーク桜乗り入れなど積極策もみられたが、その後は削減傾向が続き、2008年(平成20年)3月末現在で、南筑波線の大半、山ノ荘線、浮島線、霞ヶ浦線の佐原駅乗り入れが廃止となったが、その一方で1998年(平成10年)にはひたち野うしく駅 - つくばセンター間の新規路線を関東鉄道と共同で開設している。
茨城県稲敷市江戸崎465 最寄のバス停:江戸崎車庫前