長州藩
弘前藩は「勤皇」を藩風とし奥羽越列藩同盟から早期に脱退、戦後に新政府より1万石を加増されている。
朝廷と天皇権威の回復を望む後西上皇・霊元天皇から高評価だった吉良義央には同情的であり(反対に義央は親幕府の近衛基熙とは不仲)、支藩の長府藩が赤穂浪士を厳しく扱ったのを容認している。
長州藩(主として浦上氏 )は弘前藩邸の近隣で産まれた葛飾北斎の作品を多数購入し、今も萩に多くが現存している。北斎は元禄赤穂事件で討たれた小林央通の曾孫であり、長府藩の毛利師就は享保10年(1725年)、江戸城の松の廊下にて乱心した水野忠恒に斬りつけられたが、吉良義央に倣い刀を抜かずに対応し、一命を取り留めている。
明倫館は享保3年(1718年)、毛利吉元により萩に開設された。山口に藩庁が移された際には、文化12年(1815年)に分館ができ並立することとなる。反朱子学を標榜する著作が多く、責任者として明倫館総奉行の職が設置された。萩明倫館は、敷地内に明倫小学校が建設され、跡地や遺構(「有備館」「聖賢堂」など)は昭和4年(1929年)12月17日、国の史跡に指定されている。
長門国 見島郡 - 2村 大津郡 - 20村 美祢郡 - 23村 厚狭郡 - 36村 阿武郡のうち - 55村 豊浦郡のうち - 6村
周防国 吉敷郡 - 35村 大島郡のうち - 19村 玖珂郡のうち - 28村 熊毛郡のうち - 38村 都濃郡のうち - 21村 佐波郡のうち - 39村
上記のほか、明治維新後に石狩国樺戸郡、雨竜郡、天塩国増毛郡、留萌郡を管轄した。