神領車両区
5000番台4両編成20本(K1 - K20編成)と3両編成17本(K101 - K117編成)、計131両が所属していた。3両編成は全編成トイレなし、4両編成は全編成がトイレ付きのクハ210形5300番台を連結している。
中央本線名古屋 - 南木曽間)の普通・快速列車として多数運用されており、一部は愛知環状鉄道・愛知環状鉄道線に乗り入れていた。さらに、ラッシュ時には関西本線(名古屋 - 亀山間)でも運用された。関西本線で213系が運用を撤退したため、2011年10月以降、4両編成が代替して運用を開始し、2012年の改正以降、211系の3両編成は単独で運用されることはなくなった。
ごく稀に大垣車両区の予備編成が不足した際に、同区へ貸出され東海道本線で運用に入ることがあったほか、臨時増発列車としても東海道本線を走ることもある。また、1999年12月のダイヤ改正までは同線での定期運用が存在した。
3両編成単独(2本併結による6両編成を含む)では瑞浪駅以遠へは乗り入れない。同駅以遠へは、必ず313系や211系4両編成と併結して運用される。
313系との併結列車の場合は基本的に211系が中津川寄りに連結されるが、一部の列車や代走では例外も見られる。
武豊線での定期運用はないが、臨時列車として運用されたことがある。
2022年度より315系の投入に伴い、余剰となった車両から順次廃車となった。
牽引車(救援車兼用)。2008年4月まで1両 (112) が所属していた。
1986年11月改正時に松本運転所より1000番台を中心とした3両編成7本が転入、中央本線・篠ノ井線(中津川 - 松本間)で運用された。Mc・M'車(電動車)は1000番台であったが、Tc車(制御車)は1両を除きこの当時に余剰となった0番台T車(付随車)から改造された600番台であった。そのためTc車は1000番台タイプの運転台構造でありながら車内および側面は初期車(側窓は非ユニット窓・クロスシート部のシートピッチが狭い等)という特殊な形態となっているのが特徴であった。
JR東海移行後の1987年から冷房改造を受けるが、1000番台はAU75集中式冷房装置の搭載準備がなされている屋根上にC-AU711集約分散式冷房装置2基搭載となったためAU75取り付け台座のみがそのまま残る少々変な印象となった。転入に際し、Tc車を名古屋向きにするため編成ごと方向転換が実施され、松本運転所所属車とは向きが反対になった。
1988年3月改正で中央本線・篠ノ井線(中津川 - 松本間)のJR東海受け持ちの運用が大垣電車区の165系に置き換えられたため、当区の115系は全車静岡運転所に転出し、東海道本線・御殿場線・飯田線で使用された。中央本線・篠ノ井線・関西本線運用の165系は1989年3月に当区に再配置された(後述)。
以下の計68両が所属している。 1100番台4両編成1本( B6編成のみ) 1300番台2両編成32本(B401 - B408編成・B501 - B524編成)
上記以外の編成や過去の概要は下記の過去の所属車両を参照。
1100番台は関西本線(名古屋 - 亀山間)にて運用されている。2022年3月以降、中央本線や東海道本線での定期運用は行われていないが、まれに211系の代走で同系と併結して中央線で旅客扱いを行うことがある。過去に所属した1000番台とは運用区分がなく、共通運用されていた。
1300番台B500編成はワンマン運転に対応しているため、中央本線中津川 - 篠ノ井線松本間や関西本線・武豊線を中心に運用されている。
1300番台B400編成は、中央本線にて211系5000番台の3両編成と併結されており、中央本線(名古屋〜中津川)で運用されている唯一の313系となっていた。稀に関西本線などの代走も行っていた。中央本線では315系により置き換えられ、関西線専属となった。
2021年より順次ワンマン対応化させている。 315系