みなとじま駅
相対式ホーム2面2線を持つ高架駅である。分岐器や絶対信号機を持たないため、停留所に分類される。一部時間帯で駅員が配置されている。
駅舎は、1階がコンコース、2階がプラットホーム。2番線ホームにはポートアイランド病院と直結する改札口があり、軌道切替工事前は改札口はここのみであった。改札内にはエレベーター、エスカレーター、多目的トイレ、AEDなどがある。1階の改札前から道路を挟んだ駅東側の住宅地まで歩道橋によって結ばれている。
開業当初は、現在の2番線にあたるホーム(当時は番線表記なし)のみの片面1面1線で、北埠頭方向のみ(案内は三宮行き)の一方通行であった。神戸空港延伸事業による複線化で現在の1番線ホームにあたるホームが増設されている。