ザイン＝ヴィトゲンシュタイン
次男のヴィルヘルム3世(1569年 - 1623年)は、1591年にザイン=ザイン系の女子相続人アンナ・エリーザベト(Gräfin Anna Elisabeth von Sayn、1572年 - 1608年)と結婚してザイン伯爵領を相続し、ベンドルフ郊外のザイン城を居所とした。この家系はザイン=ヴィトゲンシュタイン=ザイン家(Sayn-Wittgenstein-Sayn)と呼ばれるようになった。この家系は17世紀半ばに女子相続を通じてザイン伯領を失い、1846年に最終的に男系が絶えた。家名のみは1861年より、18世紀にベルレブルク系から分かれたザイン=ヴィトゲンシュタイン=ルートヴィヒスブルク家(Sayn-Wittgenstein-Ludwigsburg)が受け継いでいる。
三男のルートヴィヒ2世(1571年 - 1634年)は、ヴィトゲンシュタイン伯爵領の南部を相続し、ラースフェのヴィトゲンシュタイン城を居所とした。そのためこの家系は当初ザイン=ヴィトゲンシュタイン=ヴィトゲンシュタイン家(Sayn-Wittgenstein-Wittgenstein)と呼ばれたが、後にザイン=ヴィトゲンシュタイン=ホーエンシュタイン家(Sayn-Wittgenstein-Hohenstein)と呼ばれるようになった。本家筋のベルレブルク系に遅れて、1801年に帝国諸侯に列せられた。
1806年の神聖ローマ帝国の解体に伴ってザイン=ヴィトゲンシュタインの諸侯領、伯爵領は近隣の大規模領邦に陪臣化され、いずれもシュタンデスヘル家門となった。