フランケンシュタインの怪獣 サンダ対ガイラ
詳細は「ガイラ#『サンダ対ガイラ』のガイラ」を参照
ミニチュアは、前作に引き続き1/12スケールで制作された。
冒頭のガイラと大ダコの対決シーンは、『フランケンシュタイン対地底怪獣』の公開版では用いられなかった「大ダコ出現版」を仕切り直したものとされる。
羽田空港のセットは、東宝撮影所の大プールに設けられた。管制塔も建て込まれるなど広大なセットであったが、スクリプターの鈴木桂子はカット数が少なく、完成作品でも広さを感じられなかったと述べている。鈴木は、このころより製作期間が半分に減らされるなどしたため、特撮の質が目に見えて落ちていったと証言している。
ガイラが大木を引き抜くシーンでは、ヒムロ杉で作られたミニチュアの樹木に雑草から取られた根がつけられた。美術の青木利郎は、ガイラ役の中島春雄がどの木を抜くかわからないため周辺の木すべてに根をつけていったという。
崖から落ちたアケミが木に掴まるシーンは、特撮での人形とのつながりもあるため、水野が演じる部分も特撮班が撮影を担当した。