アスガルド古細菌
ロキ古細菌の命名は2015年、アスガルド古細菌の命名は2017年だが、この系統に属すDNA配列の報告は1999年まで遡る。伊豆諸島の明神礁近傍の水深1330mにあるブラックスモーカーから検出された16S rRNA配列が最初の例で、この時は既知の古細菌2界(当時)のうちユーリ古細菌よりもクレン古細菌に近縁と考えられたことから、DHV(deep-sea hydrothermal vent) Crenarchaeotic group 1(深海熱水噴出孔クレン古細菌群1)と呼ばれた。
その後も時折検出例が有り、いわゆるDSAG(Deep Sea Archaeal Group)やMBG-B(Marine Benthic group-B)も、後にアスガルド古細菌と呼ばれる系統の一部であった。このため2019年現在でもDSAG/MGB-Bと呼ばれることが稀にある。培養が極めて困難なため、これらの報告は大半が16S rRNA配列であった。2008年に、よりクレン古細菌のコアグループに近いタウム古細菌がクレン古細菌から分離されるまでは、クレン古細菌の一部と認識されていた。
2015年には、ロキ古細菌が提唱された。これは、2010年に北極海のガッケル海嶺にあるロキの城と呼ばれる熱水噴出口の付近から採取されたサンプルからゲノムを再構築したもので、これにより一気に研究が進んだ。