函館市企業局交通部
50系統:北高校前-花園町-人見町-千代台-五稜郭電停前 1978年(昭和53年)11月1日廃止
区間は系統最長のもの。廃線による区間短縮や、途中止まりなども存在した。
1894年(明治27年)1月 - 亀函馬車鉄道株式会社設立。
1897年(明治30年)12月12日 -亀函馬車鉄道が弁天町(後の函館どつく前) - 東川町(後の東雲町)間の馬車鉄道を開業。
1898年(明治31年) 1月9日 - 十字街 - 鶴岡町(後の函館駅前) - 東川町間を開業。 8月19日 - 函館鉄道(函館 - 湯川間未開業)と合併し函館馬車鉄道に改称。 9月29日 - 鶴岡町 - 海岸町間が開業。 10月21日 - 海岸町 - 亀田間が開業。 12月12日 - 東川町 - 湯川間が開業。
1903年(明治36年)7月8日(1904年(明治37年)4月29日とも) - 海岸町 - 亀田間が廃止。
十字街 - 谷地頭 (1.4 km)
41系統グループ 41系統:昭和営業所前 - 亀田病院前 - 高台坂下 - 五稜郭駅前 - 亀田町 - ガス会社前 - 宮前町 - 西武テーオー前 - 五稜郭電停前 - 深堀町 - 競馬場前 - 湯の川温泉電停前 - 湯倉神社前 - 湯川中学校前 - 学園前 - 花園町 - 日吉町4丁目 - 日吉営業所前 1978年(昭和53年)11月1日、市電本線の一部(ガス会社 - 五稜郭駅前)の廃止に伴う代替バスとして新設。当初は花園町折り返し便、五稜郭公園電停前折り返し便の設定もあった。 41-急系統:五稜郭駅前 → 花園町 1978年(昭和53年)11月1日、市電本線の一部(ガス会社 - 五稜郭駅前)の廃止に伴う代替バスとして新設。朝のラッシュ時に2便設定。
42系統:昭和営業所前 - 五稜郭駅前 - ガス会社前 - 五稜郭電停前 - 五稜郭公園裏 - 北富岡 - 昭和営業所前 1978年(昭和53年)11月1日、市電本線の一部(ガス会社 - 五稜郭駅前)の廃止に伴う代替バスとして新設。循環線で日中のみの運転。
43系統:昭和営業所前 - 昭和 - 佐々木病院前 - ガス会社前 - 市民会館前 - 花園町 - 日吉営業所前 1993年(平成5年)4月1日廃止
函館水電時代に高木荘治のバス事業を買収、函館乗合自動車合資会社を設立(のちに函館水電の後身の帝国電力が吸収する)。帝国電力時代に旭自動車株式会社を合併し、道南電気軌道時代に函館市に譲渡された。
戦後、1952年(昭和27年)に公営企業としての函館市交通局となると、1955年(昭和30年)にかけて貸切バス、観光(函館山登山バス、定期観光バス)にも参入していった。
1954年(昭和29年)から函館バスの労使関係が悪化、1954年は21日間、1955年は51日間のストにより運行ができず、ハイヤー会社であった相互自動車とともに郊外への臨時バス運行やバス路線開設を行い住民を救済した。下海岸線の運行区間は函館から銭亀沢村石崎までである。
1956年(昭和31年)に高砂町にバスセンターを開設、従来の深堀町バス車庫と連携しながら函館駅を中心とした路線網を構築する。
1991年(平成3年)に策定された函館市交通事業健全化計画(目標:平成9年度に経営収支均衡、平成12年度に不良債務解消)が上手くいかず、バス事業を順次函館バスに移管し、経営主体の一元化を図ることになった。 1999年(平成11年)4月にはバス事業の一元化を公約に掲げる井上博司が函館市長に当選する。
函館バスへの移管のほかに函館市交通局への一元化、第三セクターや南北海道の広域連合等による一元化も検討されていた。