新関駅
相対式ホーム2面2線を有する地上駅。両ホームは跨線橋によって連絡している。一線スルー方式となっており、列車の行き違いがない場合は両方向の列車とも、駅舎(西側)に面する1番線から発着する。
新津駅管理の無人駅。駅舎は待合スペースとしての機能のみで、簡易Suica改札機(入場用・出場用各1台)、乗車駅証明書発行機、飲料自動販売機、トイレなどが設置されている。
1番線に面して西口が、2番線に面して東口が設けられている。駅舎は西口側にのみ設けられており、それぞれのホーム入口に簡易Suica改札機(入場用・出場用各1台)が設置されている。東口側の駅前には駐輪場と定期利用者専用の駐車場が設置されている。
2番線は行違いを行う場合の上り列車と、対向通過列車を待避する下り列車が使用する。
駅舎内(2023年4月)
ホーム(2022年7月)
東口(2022年7月)
ホームから見た東口(2023年4月)