新幹線400系電車
車体形状 試作車は量産車と車体断面のRが若干異なっていたほか、16・17号車の窓寸法・間隔が12 - 15号車と同一だったためシートピッチの関係上座席と窓の位置が必ずしも合っていなかった。また、試作車は側面客扉にプラグドアを使用していた。なお1995年に製造され組み込まれた429-1(15号車)は量産車と同じ車体断面・客扉となっていた。また、試作車は側面窓下の緑帯も配されていなかった。
運転台側面部の楕円窓 試作車は設置していたが、量産化改造の際に埋められた。量産車は当初から設置していない。
分割併合装置 試作車は両先頭車に搭載しているが、量産車は411形(11号車)にのみ搭載している。
床下カバー 試作車は取り付けられている。量産車と試作車編成に組み込まれていた429-1(15号車)には取り付けられていない。
行先表示器 試作車の行先表示器は当時としては珍しいLED式となっていた。試作車は行先のほかに自由席 / 指定席を独立して表示させる表示器を設けているが、後者の表示部分は実際には使用されていない。なお、行先部分についてはLED式が採用された。量産車では行先表示部分のみを設置し字幕式となっている。試作車においても2003年(平成15年)に量産車と同様の字幕式に変更された。
車内 試作車のグリーン車には座席に液晶モニターが備えられていたが、量産車では装備されず試作車も量産化改造の際に撤去された。 試作車の普通車ではリクライニングシート以外に転換式(405-1)や固定式(406-1)の座席も試作されたが、量産化改造で全てリクライニングシートに統一された。 このほか仕切り壁や扉の形状も量産車と若干異なっていたが、これらは量産化改造後もそのまま残された。
また同じく山形新幹線区間を走行するE3系1000・2000番台とは共通運用が組まれていた。
2007年(平成19年)7月にE3系をベースとした新型車両を導入することが発表され、翌2008年(平成20年)12月から順次置き換えが開始された。
L1編成は2008年12月16日に定期運用から離脱し小山新幹線車両センターに疎開していたが、2009年(平成21年)1月9日に小山新幹線車両センターから新幹線総合車両センターへ廃車回送された。廃車となった車両は廃車手続と同時に所有者の山形ジェイアール直行特急保有株式会社に返却している。これが400系最初の廃車編成となった。
2010年(平成22年)に営業運転を終了することが発表。同年4月に引退記念列車が運行され(詳細は後述)、これをもって400系は正式に引退した。同年4月30日付けでL3編成が廃車となり、本系列は消滅し、E3系に道を譲った。 L3編成のうち先頭車1両は引退後しばらくの間福島駅構内の福島総合運輸区に保管されていた。