第三八一海軍航空隊
3月上旬 第九三四海軍航空隊の戦闘機隊廃止により、元水上戦闘機操縦士を編入。
3月26日 濠北方面に敵機動部隊接近、ケンダリに集結命令。
3月31日 パラオ大空襲を受け、フィリピン防空のためダバオへ移動。4月9日、原隊復帰。
4月21日 バリクパパンへの航空機による機雷散布開始、迎撃に従事。
5月5日 編制変更。防空専念のため十三航艦附属に転籍(このため二三航戦を主力とする「渾作戦」には参加していない)。
5月15日 ケンダリを放棄。本隊はバリクパパンへ撤退し、スラバヤ派遣隊を新編。
以後、バリクパパン本隊・スラバヤ派遣隊・ワインガップ分遣隊は拠点を中心に防空に従事。
9月30日 バリクパパン大空襲。60機のB-24を全力で迎撃。
10月1日 第二十八航空戦隊を新編。
この頃、払底した零戦に代わり、実用化を達成した雷電を投入する。
12月 ハルマヘラ島の拠点に連日敵機襲来。ケンダリに進出し、防空に従事。
12月17日 タラカン島に敵機襲来、3機のB-24を撃墜。
昭和20年(1945年)
1月 マレー半島ジョホール飛行場に逐次撤退。
3月10日 第一南遣艦隊駐留地の航空隊を大幅改編。すべての戦闘機を編入。
4月 すべての戦闘機を台湾へ移送。翌月までに62機が撤退完了。
以後、十三航艦所属機の編入を受け、維持・保全に従事。
終戦後解隊
終戦時は、シンガポールの戦闘機隊30機弱、ペナン島の練習機隊15機前後、スマトラ島の陸攻10機ほどを指揮下に置いていたが、活動できる状態ではなかった。