マリオストーリー
ビッグな男を目指すツッパリジュゲム。一人称は「オレ」。初登場時は「ジョナサン」と名乗っていた(理由は本人曰く「ポコピーはポコっとしたピーってイメージがあるから」らしい)。見た目によらずロマンチストな面もあり、マリオとの勝負を「男同士の戦い」として楽しむ。ポコナ(英: Lakilulu)という彼女がおり、フライトという友達もいる。ほかのジュゲム(オズモーンの手下)を裏切ったことになるが、本人はさほど気にしていない。パイポを投げて戦うが、トゲゾーを作り出す事は出来ない。少ないFPで全体攻撃を可能とする。仲間キャラの中で唯一、敵に触れないで相手に攻撃するので相手を選ばないが、突出して強力な攻撃技は使えず、「みだれなげ」はコマンドが失敗するとダメージが0になる。名前の由来は種族名のジュゲムと同じく落語の寿限無の一部からであり、ポコナも同様である。
また、これらの8体の仲間は『スーパーペーパーマリオ』のカードとして登場している。
サムイサムイ村の東にある雪原で、前述のノコブロスのとりでの真北にある。ここにいる雪だるまに秘密が隠されている。
フラワーランドに咲くバラ。スイレーンの池を元通りにすることができる水の石を持つが、性格が悪く素直に渡してくれない。フラワーランドで一番美しいのは自分と主張しており、それが理由でスイレーンと張り合っているとのこと。フラワーランドの危機に関してはあまり気に留めていなかった。
キノコタウン北西部にある、クリボー達が住む村。ただし、家を建てて定住しているのはクリオ一家だけ。ほかにあるのはキノピオハウスのみ。裏にはコワッパの遊び場がある。
全てがドガボンサイズに作られた城。中にはキャッチャンという警備員がおり、捕まると外に放り出されてしまう。ガボン達も警備をしているが、ほとんどが居眠りをしている。ドガボンを倒すと、マップでの説明が「不死身のドガボンがいる城」から「不死身だったドガボンがいた城」に変更され、廃墟となりほぼ無人の状態になる。ガボンが1人だけ残っているが、やはり居眠りをしている。
また、原則として頭に棘をつけている敵・炎に包まれている敵にジャンプ攻撃をしようとすると、ダメージを与えられず逆にマリオがダメージを受ける(先制攻撃も同様)。電気を帯びている状態の敵に対してジャンプ攻撃をすると、その敵にダメージを与えられるがマリオもダメージを受ける(このタイプの敵への先制攻撃は存在しない)。
ハンマー攻撃は地上の最前列にいる敵にしかできない(複数の敵が最前列にいるとみなされる場合もある)。ただし、先制攻撃は空中の敵に対しても可能である。前方にトゲなどを構えた敵に対してハンマー攻撃をしようとすると、ダメージを与えられず逆にマリオがダメージを受ける。
後述する「バッジ」の中には、ジャンプ時のトゲや炎によるダメージをなくしたり、より強力なジャンプやハンマー攻撃ができるようになったりするものもある。なお、敵キャラによってはマリオたちから受けた攻撃や自身の特定の攻撃により、位置が空中から地上、あるいは天井から空中や地上に移るものがいる。
また、ハンマーやジャンプには、それぞれハンマーには「スーパーハンマー」、「ウルトラハンマー」、ジャンプには「スーパーブーツ」、「ウルトラブーツ」とグレードアップさせられるアイテムが登場し、入手することで攻撃力アップのほか、通常のハンマーでは壊せないブロックを壊せるようになったり、通常のジャンプでは探索やアイテム入手が出来なかったものが出来るようになったりと、フィールド上での行動範囲を広げられるようになっている。
ステージ5のボス。ヨッシーアイランドのビッグパックンに似た非常に長い蔓の体をしており、全身に炎をまとっている。グツグツ火山の最深部で星の精を守っている。グツグツ火山の温度を上げようとしていたため、撃破後火山が噴火してしまう。
フラワーランドにある井戸に住んでいる謎の人物。井戸に「あおいみ」を投げ入れると、喜んでバッジ「フラワーセツヤク」をくれるが、それ以外の色の実を投げ入れるとハッチーやパンジーさんなど敵キャラが井戸から出てくる。
下記のN64シェーダーに対応していないため、どのバージョンでも一貫して描画されていない。
星の国、テレサのおやしきなど特定のステージの床が変化しない。
一部のエフェクトの挙動が、例え杖の魔法エフェクトが紫のみになっているほどオリジナル版とは異なる。
ヘイホーの紙の積み重ねが正しく描画されていない。
キノコタウンに住む物知りで情報を提供してくれるキノピオ。攻略情報やちょっとした裏話などを教えてくれる。ただし、ヘイホーに辞書を盗まれた時は辞書が戻るまで情報を聞くことができない。
おなじみのラスボスで、今作では正真正銘の悪役。クッパ軍団を指揮し、スターの杖を悪用してピーチ姫を自分のものにしようと企んでいる。
様々な過去作品でマリオに邪魔をされてきた経験からか、本作ではストーリーの序章にて星の国を襲撃し「スターのつえ」を手に入れてパワーアップしている。また、その際スターのつえを守る星の精達をカードに封印し、キノコワールド各地のボスに守らせている。スターのつえを手に入れたため、かなり慢心している様子が見られる。
プロローグにてキノコ城の地下に潜ませていたクッパ城を遙か天空に浮上させ、ピーチ姫をキノコ城ごとさらう。その日、行われていたパーティに出席していたマリオに妨害をうけるも、前述のスターの杖でパワーアップしたことでマリオを圧倒し、地上に落とす。その後、ピーチ姫と何度も仲良くなろうとするが、毎回断られる。
ステージ1のボス。4人組のノコノコで、それぞれレッド、イエロー、グリーン、ブラックのカラーがついている。ぽかぽかロードの先にあったボム兵の砦を乗っ取り「ノコブロスのとりで」として根城にしている。変装や落とし穴、クッパに似せた戦闘マシーンを用いてマリオを妨害する。
戦闘時は4人が積み重なった状態で戦う。必殺技は4人一組で繰り出される「ノコブロス・スクリューアタック」。POWブロック等を使うと崩れてしまい、通常のノコノコと同じようにひっくり返ってしまう。ピンキーの爆発攻撃を使うと1発でひっくり返せる。
ボム兵をかなりこき使っていた様子で、反抗したボム兵を牢屋に閉じ込めていた。ボム兵曰く「1日25時間働かせられる」とのこと。その反動か、自分達が負けて牢屋に閉じ込められた際は誰も助けてもらえなかった。撃破後、しばらく牢屋に閉じ込められている様子を見られるが、途中でいなくなり、ステージ8のクッパ城で再登場を果たす。しかし再戦は叶わず、代わりに乱入してきたコワッパとの戦闘となる。
漫画版では1巻に彼らとよく似たコンセプトの敵が登場している。
(英: )と書かれている名前は北米版での表記。