土讃線
1987年(昭和62年) 4月1日:国鉄分割民営化により四国旅客鉄道に承継。日本貨物鉄道が多度津駅 - 多ノ郷駅間の第二種鉄道事業者となる。
1988年(昭和63年) 4月10日:土佐山田駅 - 窪川駅間でワンマン運転開始。 6月1日:線路名称改正により土讃線に改称。
1989年(平成元年) 3月11日:多度津駅 - 阿波池田駅間・土佐山田駅 ー 高知駅間を高速化(最高速度120km/h)。 7月1日:阿波池田駅 - 土佐山田駅間を高速化(最高速度120km/h)。
1990年(平成2年) 3月10日:阿波池田駅 - 土佐山田駅間でワンマン運転開始。 11月21日:高知駅 - 窪川駅間高速化(最高速度120km/h、一部区間110km/h)。
1992年(平成4年) 3月14日:琴平駅 - 阿波池田駅間でワンマン運転開始。 10月1日:日本貨物鉄道の第二種鉄道事業(高知駅 - 多ノ郷駅間)を廃止。
1993年(平成5年)3月18日:多度津駅 - 琴平駅間でワンマン運転開始。
1998年(平成10年) 9月24日:台風7号や高知豪雨による記録的大雨に伴う盛土崩壊で、繁藤駅 - 高知駅間が不通となる。 10月5日:土佐山田駅 - 高知駅間が運転再開。 12月25日:軽量盛土工法を用いて復旧を行い、繁藤駅 - 土佐山田駅間が運転再開。
2000年 (平成12年) 10月14日:特急「南風」アンパンマン列車が運行開始
1997年より行楽シーズンに阿波池田駅 - 大歩危駅間でトロッコ列車「大歩危トロッコ」の運転を開始した。その後、2015年にリニューアルを行い、3月21日より「絶景!土讃線秘境トロッコ」となった。運転区間は琴平駅 - 大歩危駅間に変更され、途中坪尻駅・阿波池田駅に停車する。使用車両はキハ185系とキクハ32形。2017年4月よりこの区間で新観光列車「四国まんなか千年ものがたり」の運転が開始されるのに伴い、「絶景!土讃線秘境トロッコ」の運転は2016年11月27日限りで終了した。