ベニミドロ綱
古くは原始紅藻綱または紅藻綱原始紅藻亜綱の独立目またはチノリモ目に分類されていた。その後、分子系統学的研究などに基づき、独立の綱とされた。また紅藻の中では、チノリモ綱、ロデラ綱、オオイシソウ綱に比較的近縁であることが示唆されており、合わせて"原始紅藻亜門" (Proteorhodophytina) に分類することが提唱されている。綱内ではルフシア属が最も初期に分岐したことが示されており、それ以外がベニミドロ目にまとめられている。
以前はゴニオトリクム目 (Goniotrichales)、ゴニオトリクム科 (Goniotrichaceae) という学名が使われていたが、その基となる Goniotrichum の実体が不明確であることから、現在ではベニミドロ目 (Stylonematales)、ベニミドロ科 (Stylonemataceae) の名が使われている。
2019年現在、約50種が知られ、2目2科15属に分類されている。2019年現在の一般的な属までの分類体系を以下に示す。