京都市美術館
館内にある、開館以来の装飾などはほぼそのまま残り、美術館の歴史を継承する。南北にある中庭が設備機器に占拠され非公開になっていたのを改め、南中庭を復元し「天の中庭」とし、北中庭はガラス天井を張った吹き抜け空間「光の広間」にした。ここはパーティーやイベント等に使用される。美術館の北東側にあった、川崎清による設計の収蔵棟は、新たな設備室および現代美術に対応する1,000平方メートル規模の新展示室、収蔵庫、オフィス等を収容した新館「東山キューブ」として改装され、屋上庭園が設けられている。その外側に広がる日本庭園は、第4回内国勧業博覧会会場跡の岡崎公園に、明治42年(1909年)に作られた京都市商品陳列所の庭園として七代目小川治兵衛(植治)が作庭したもので、京都市美術館建設のために京都市商品陳列館が撤去された際に庭園は残されて現在に至っている。
一方、新館建設などリニューアルを実施するのに合わせ、京都市は2016年9月1日から30日にかけ、費用の獲得と愛称を決める目的で命名権の募集を実施したが、市民団体や有識者などからは「公共の文化財に一企業の名称が被るのは相応しくない」などの異論が出ている。同年10月6日、京都市は同市伏見区に本社を置く京セラに命名権を売却すると発表した。再オープン時から「京都市京セラ美術館」の名称が用いられる。
命名権料は、再オープン時から50年契約の総額50億円(消費税別)で、2017年度から2019年度に3回に分けて支払われる。これによりリニューアルにかかる整備事業費のおよそ半額が賄われる。