霧島神宮駅
島式ホーム1面2線を有する地上駅。駅舎は道路と同じ高さだがホームは築堤上に存在する。駅本屋からホームへは地下道を通る。
駅本屋は鉄筋コンクリート造ながら神社を意匠したものである。床面積は約280平方メートルである。九州新幹線の部分開業時に駅舎外観をリニューアルし、鳥居が設置された。駅内装も2023年(令和5年)7月からリノベーションが行われており、同年9月7日から9日にかけて工事の中核となる駅舎内の骨格造りがあった。なお、駅前駐車場の一角に温泉を引湯した足湯がある。
JR九州サービスサポートが駅業務を行う業務委託駅であり、きっぷうりばが設置されている。