日本の黒幕
それで、監督が降さんになったんで、僕はチーフ助監督をやることになった」と話している。日下部は、大島は時間切れでさっさと京都から引き上げていった、封切に間に合わないため、急遽、大島に叩きつけられた高田に再び脚本の仕上げを頼んで、降旗康男に監督を交代させ何とか公開日に間に合わせた、などと話している。四方田犬彦は『大島渚著作集』の解説で、締め切り日になっても二人が納得のいくところまで脚本が完成せず、東映は「あと、五日、いや三日」という脚本家の要求を無下に拒絶した、そこで大島が旅館の卓をひっくり返し、すべての企画が中止になった、東映はただちに代打監督を起用したと書いている。『噂の眞相』は「大島の政治性の強いドラマ構想と、東映サイドの娯楽映画志向の対立が、一気に表面化した」と論じた。大島は『シナリオ』1983年10月の大森一樹との対談で、「その頃『戦場のメリークリスマス』の脚本が入ってきて、こちらも上手くいかず、それで(『日本の黒幕』の方を)やめたいと岡田社長に言ってくれと言っても誰も言わないから、それで非常手段で、昔だったらやっていた。でもやって『天草四郎時貞』になるんなら止めたほうがいいでしょ、と岡田社長に頼んで、結局やめた」と話している。四方田は「もし原案の企画通り大島作品として完成していれば、東映映画としても異色の大作として記憶されたであろうし、1980年代の大島の方向にも大きな変化がもたらされていたかと想像すると、実に残念である」と述べている。採用されなかった大島と内藤の共同脚本は内藤が長く保管し、2008年の『大島渚著作集』第三巻に掲載された。
大筋は大島があらかじめ拵えており、内藤は細部を埋めていく作業をした。この時点で美術は戸田重昌が、アクションは崔洋一というスタッフ配分が非公式に決まっていた。しかしラストシーンが決まらず、日下部がアドバイスしたが「その終わり方だとぼくの映画にはならない」と拒否した。脚本約300枚のうち、ラスト・シークエンスの50枚分が出来上がらなかったとされる。
大島が少年テロリストを一般公募する話は『読売新聞』夕刊1979年6月16日付けに掲載されたため、それを読んで当時17歳の三上博史が新聞社へ連絡して、三上が大島に直接売り込み、数回の面談を経て、大島は少年テロリスト役に三上の起用を決めていたという。
高田宏治が「フィクサーの暗殺を狙う足の悪い少年がフィクサー宅に侵入するが、監禁されやがて暗殺者に育てられていく」という構想を大島に伝えると大島も賛同したため、脚本を完成させ大島に見せたが、「こんなつまらんものができるか!」と脚本を投げつけられた。高田はこれに耐え、大島に「どんなものをやりたいのですか?」と聞いたら「精神を病んだ児玉誉士夫の娘が地下に監禁されて、赤い靴を履いた女の子と踊っているというイメージのようなものだ」と言われた。大島の構想は闘いのドラマではなく、児玉の話とは融合しないと高田は考え、大島が「高田の脚本ではやれない」というので高田が降板し、大島は内藤誠を京都に呼んで、大島と内藤の共同で脚本を書き始めた。