Fate/Grand Orderのメインストーリー
機械生命体であるオリュンポス十二神が、1万4千年前に降臨した「巨人」に機械である真体を滅ぼされることなく神による人類支配が継続し、剪定が確定したとされる「大西洋異聞帯」のステージ。植えられた空想樹の名はマゼランだが、異聞帯の王であるゼウスから「アトラスの世界樹」と名付けられ、すでに地表の8割を覆う規模まで完成している。汎人類史の英霊は異聞帯の神々に対して抵抗を続け、一部の英霊は大西洋の海底に存在する首都オリュンポスに到達したという。"宮本武蔵"は"カルデアの者"との対話から、自身の旅の終わりを強く意識し、オリュンポス防衛軍の目をかいくぐり単騎でオリュンポスに向かう。
2015年7月30日配信。主人公らは逃亡するレフを追い、1世紀、“ネロ・クラウディウス“統治下の古代ローマに出現した特異点へとレイシフトする。ロムルスやカリギュラ、ユリウス・カエサルら歴代のローマ皇帝が率いる「ローマ連合帝国」がネロ統治下のローマと敵対しており、主人公一行はネロ本人に加え、サーヴァントとして現れた"ブーディカ"、"スパルタクス"、"荊軻""らとともに「ローマ連合帝国」に立ち向かう。
ロムルスを倒した一行の前に、レフが現れ、異形の姿―魔神柱フラウロスに変身する。主人公一行に追い詰められたフラウロスは大英雄"アルテラ"を召喚して形勢逆転を図る、そのアルテラに抹殺される。レフから奪った聖杯を取り込んだアルテラは膨大な魔力と引き換えに暴走状態にあり、ローマに向かいつつあった。アルテラの宝具により"呂布"と"スパルタクス"が犠牲になるものの、一行はアルテラを追う。
ほか登場人物:ステンノ、タマモキャット、エリザベート・バートリー、アレキサンダー、ロード・エルメロイ二世、レオニダス一世、ダレイオス三世
モルガン崩御から数日後、ソールズベリーにて次期女王であるノクナレアの戴冠式が行われるが、オーロラの陰謀によってノクナレアは毒殺され、その罪を着せられた主人公たちは混乱する街からの脱出を余儀なくされる。逃走中、モースの大量発生がブリテン中で起きていることを知った一行は、パーシヴァルとアルトリアを連れて機能を回復したストーム・ボーダーへと帰投する。
ボーダーが離陸したころには、ブリテンは厄災による滅びを迎えつつあった。そのうちの一つであるケルヌンノスをコヤンスカヤの助太刀で回避した一行は、幻術を通じて現れたマーリンの提案で聖剣の鋳造を行うことになり、霊墓アルビオンを通って星の内海にある楽園を訪れる。その儀式とは「楽園の妖精」であるアルトリアを材料として成されるものだったが、最後の仕上げを村正が己を犠牲にして代行したことで、「聖剣の管理者」の位置に納まったアルトリアは同行していた主人公とマシュと共にボーダーへ帰還する。
同じころ、オーロラは自分の元を訪れたメリュジーヌに、ここを捨てて2人で汎人類史へ行こうと誘う。だが、メリュジーヌはオーロラの「『自分の輝き』を守るべく、『より輝く者』(=他の指導者や主人公一行)を排除する」というあり方が汎人類史では受け入れられないことに気づき、彼女を殺す。そして、本来の姿であるアルビオンの竜骸へと回帰、「炎の厄災」と化してストーム・ボーダーを襲撃し、デッキ上でパーシヴァルと相討ちになる。
レジスタンスと別れた主人公、マシュ、エリザベート・バートリー、ナイチンゲール、ラーマは、ラーマの妻シータがいるとされるアルカトラズ島に向かう。一行はアルカトラズに配備されたベオウルフを退け、ラーマはシータと再会を果たす。だが、ラーマは生前掛けられた「離別の呪い」ゆえに聖杯戦争であってもシータと出会うことはかなわず、夫妻のどちらかが「ラーマ」として召喚される定めとなっていた。シータは夫に掛けられた呪いを引き受ける形で消滅する。
その後、主人公らは、エジソンらと協力し、ケルト陣営を撃破する。
ほか登場人物:シータ、ジェロニモ、エレナ・ブラヴァツキー、ニコラ・テスラ、アルジュナ、フェルグス・マック・ロイ、ネロ・ブライド、エリザベート・バートリー、李書文(ランサー)、スカサハ、ベオウルフ、マーリン、ロビンフッド、ビリー・ザ・キッドらがいた
奈須は、道満は異星の神からそれぞれの異聞帯の王をそそのかす役割を与えられており、本人もそれを理解したうえでふるまっていたが、追い詰められた際に「安倍晴明に勝ちたい」という目的を持ってしまったがために隙ができてしまったと説明している。また、当初「天覧聖杯戦争」で召喚されたサーヴァントとして、エレナ・ブラヴァツキーとカリオストロ伯爵も登場させる予定だったが、シナリオが長くなってしまうということで、担当ライターの判断により見送られた。
その際、「アーチャー」は何者かの命令を受けてメデューサを足止めするために攻撃する。メデューサは「アーチャー」に反撃するが、返り討ちに遭う。ただし、彼女の魔眼は「アーチャー」の位置を記録しており、今際の際に自分の魔眼という「概念」を主人公らに託す。
魔眼をたどった先にいたのは、職務優先のためにAI聖杯戦争への参加を見送っていたはずDXであり、その正体はアーチャーのサーヴァント・ドゥルガーだった。ドゥルガーのマスターでもあるラニ=XIIは、人理を救う戦いに向けた戦力増強のために、カルデア内のデータベースや呼び寄せたサーヴァントたちを利用してアルターエゴを量産するためにAI聖杯戦争を引き起こしており、この場にいる全員は人工アルターエゴであることを告げる。自分の正しさを信じ切っているラニ=XIIは、主人公たちの抗議にも耳を貸すどころか、仕切り直しのためにドゥルガーに主人公たちを排除させようとする。だが、真の黒幕はドゥルガーであり、彼女は別側面であるカーリーへと変貌し、シヴァを呼び寄せるために激しく舞う。これにより彼女と接続していたラニ=XIIは衰弱する。主人公たちがカーリーと激戦を繰り広げる中、ラニ=XIIはシオンの応急処置を受ける中で、自分の正体が人類を救うことに重きを置きすぎた「救済」のアルターエゴであることに気づき、やがてAI聖杯戦争は失敗であることを認める。ドゥリーヨダナはビーマと相打ちになり、AI聖杯戦争は勝者無しという幕切れを迎える。ラニ=XIIは筆頭AIたちの中で唯一生き残ったセレシェイラに権限を譲渡したあと、消滅する。
そして、主人公一行は現実世界に帰還する。