白亜紀と古第三紀の間の大量絶滅
主竜類に属さない爬虫類である鱗竜形類(ヘビ、トカゲ、ムカシトカゲなどを含む)は、系統としてはK-Pg境界を生き延びた。
ムカシトカゲ目は、中生代初期には広い地域に分布し、比較的繁栄していた。しかし、中生代中期になると、南アメリカで非常に繁栄した例を除いて衰退していき、現在ではニュージーランドに1属が生息するのみである。
一方でトカゲやヘビ、ミミズトカゲに代表される有鱗目は、ジュラ紀に適応放散して様々な生態的地位を占めるようになり、白亜紀を通して繁栄し続けた。これらはK-Pg境界以降も生存し、現代の爬虫類では最も多様で成功した系統となり、6000を超える種が生息している。陸生有鱗目では、モンスターサウリア類(英語版)やポリグリファノドン類(英語版)などで絶滅した科も多く、化石記録によれば、この被害から回復するのに1000万年ほどがかかったとされる。
de Palm has found strong evidence that the dinosaurs—and nearly all other life on Earth—were indeed wiped out 66 million years ago by the Chicxulub asteroid"
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