上越市立水族博物館
2013年3月の定期点検で劣化の進行が確認され、5月の精密検査で建築基準法を満たしておらず改修に4,000万円かかる見通しとなったためその後解体撤去された。
改修・修繕しながら供用を継続していた各施設は老朽化が進行し、上越市では2006年(平成18年)に「新水族博物館整備検討委員会」を発足させて改築を検討したものの、翌2007年(平成19年)に当時の財政見直しから整備を見合わせることとなって計画は一旦凍結された。なお同年発生した新潟県中越沖地震では大水槽「マリンジャンボ」が破損する被害があり、修復工事が行われた。
しかし、耐震基準を充足していない上に大規模な改修も行われておらず、2015年(平成27年)春には北陸新幹線の開通を控え、集客効果を考慮する必要から2011年(平成23年)11月から再度検討作業を開始し、計画を進めることとなった。
1933年7月23日、上越地方で初めての水族館となる能生水族館が、新潟県能生町(現在の糸魚川市)で旅館を営んでいた瀧榮六郎によって開設された。施設は1928年の横浜水族館などに関わった平田包定によるもので、14の水槽で約40種の淡水・海水魚や甲殻類を展示していたという。しかしながら、この施設は冬季閉館中の翌1934年に波浪によって破壊されてしまう。
1934年(昭和9年) - 瀧栄六郎により、直江津の八坂神社前(西本町4丁目)に私立の水族館が設置される(初代)。
1936年(昭和10年) - 五智国分寺の北側(五智4丁目)に移転(2代目)。
1943年(昭和18年) - 太平洋戦争の影響で閉館。
1949年(昭和24年) - 中田松三が本砂山(中央4丁目)に個人経営の水族館を開館(3代目)。
1951年(昭和26年) - 『財団法人直江津水族館』と改称。
1953年(昭和28年) - 博物館として登録され、『直江津水族博物館』と改称。
1954年(昭和29年)7月 - 上越市の前身である直江津市(当時)に移管され、『直江津市立水族博物館』と改称。
1957年(昭和32年) - 海浜公園内(西本町4丁目17-28)に移転(4代目)。延床面積は626.91平方メートル。
1971年(昭和46年)4月29日 - 市町村合併による直江津市の廃止に伴い、上越市に承継される。
1979年(昭和54年)10月31日 - 4代目水族館閉館。
1980年(昭和55年)7月18日 - 現在の所在地付近(西本町4丁目19-27)に移転する(5代目)。敷地面積21,287.49平方メートル、本館(地下1階、地上2階建て)延床面積4,698.63平方メートル。
1993年(平成5年)7月17日 - 改築・増築(当時館内最大の水槽となるマリンジャンボ(730 t)を始めとしたペンギンランド・マリンスタジアムなどの施設を増築)。