落合博満
また、最高出塁率も獲得し、セ・リーグ移籍後初となるタイトル三冠を手中にした。この年のオールスターゲーム第2戦(平和台球場)では、鳴り物入りでプロ入りし快進撃を続けていた近鉄の野茂英雄が投じた高めのストレートを狙い打ち、本塁打を放った。
1991年2月、契約更改で合意せず、落合は日本人選手として初めて年俸調停を申請した。落合希望額は3億円→2億8000万円、球団提示額2億2000万円だったが、調停の結果、3月8日に2億2000万円で合意した。同年シーズンは前半戦に肉離れを起こし、打撃三部門のトップに立った時点で1か月程戦線を離脱した。打率.340、37本塁打、91打点で本塁打王を獲得したが、打率は古田敦也に3毛差(古田.3398、落合.3395)、打点は広沢克己に8打点差で及ばず、それぞれリーグ2位だった。古田のいるヤクルトとの最終戦では勝負を避けられ、1試合6四球の日本記録を作った。オフに年俸3億円で契約更改した。
1992年、プロ野球選手会を脱退。同年に同姓の落合英二が入団。巨人移籍までの2年間は基本的にスコアボード表記は、英二を「落合英」、博満を単に「落合」と表記された。しかし、一時期の東京ドームで博満が「落合博」となっていたことがある他、読売新聞など一部の活字メディアでは、博満に「落合博」を使用していた。同年は22本塁打、71打点の成績で、1984年以来の獲得タイトルなしに終わり、球団12年ぶり、自身2度目の最下位に終わった。
1993年5月7日の横浜戦で、史上初の両リーグ200本塁打を達成。
投手として入団した愛甲猛に打者転向を勧め、愛甲の打撃を指導した。愛甲は1981年に入団後、3年間投手としてプレーしたが、結果を残せず、1983年のシーズン終了後に監督の山本一義から「投手を続けるか、それとも打者に転向するか」と迫られるも即決できなかったが、落合から「タケシ、お前はバッターの方が稼げるぞ。甲子園を見ていたが、バッターの方が稼げるぞ」と声をかけられたことで打者転向を決意した。1984年の春季キャンプでは初日から、練習を終えた後に落合の部屋にて落合から打撃の指導を受けた。丸めた新聞紙をボール代わりにトスバッティングを繰り返した。愛甲はそれまで打撃で本格的な指導を受けたことがなかったが、落合の連日にわたる指導で上達した。落合は「家にいてもやることねえし」と言いながらも川崎球場でのファームの試合をバックネット裏から観戦し、愛甲の打撃を見ていたことがあったといい、愛甲は落合に対し、「オチさんに教わった打撃術は、我流とは違い、明らかにプロの打撃だった」と感謝している。ロッテ時代の落合は子供が出来ずに悩んでいたため、心底可愛がっていた愛甲と養子縁組することも本気で考えていたといい、愛甲は後に「ヘタすりゃ福嗣くんのお兄さんになってた」と語っている。愛甲はこれについて「落さんって、自分が見てバッティングとかが気に行った奴ってのが凄く可愛く感じるのよ」と自身の見解を述べている。
100本塁打:1983年8月31日、対阪急ブレーブス20回戦(阪急西宮球場)、9回表に山沖之彦から左越先制3ラン ※史上127人目
150本塁打:1985年5月5日、対南海ホークス4回戦(川崎球場)、5回裏に大久保学から ※史上75人目
200本塁打:1986年5月31日、対阪急ブレーブス8回戦(川崎球場)、2回裏に今井雄太郎から中越先制ソロ ※史上48人目
250本塁打:1987年5月19日、対読売ジャイアンツ7回戦(ナゴヤ球場)、6回裏に西本聖から中越2ラン ※史上27人目
1000安打:1987年6月2日、対横浜大洋ホエールズ9回戦(ナゴヤ球場)、7回裏に高橋一彦から左越ソロ ※史上148人目
1000試合出場:1988年5月14日、対読売ジャイアンツ7回戦(ナゴヤ球場)、4番・三塁手として先発出場 ※史上276人目
300本塁打:1988年10月2日、対阪神タイガース23回戦(ナゴヤ球場)、3回裏に仲田幸司から右越決勝ソロ ※史上19人目
350本塁打:1990年5月8日、対阪神タイガース3回戦(浜松球場)、3回裏に嶋尾慶一から左越先制3ラン ※史上14人目(歴代2位の1257試合で到達:当時史上最速、後にアレックス・カブレラが更新)
1000打点:1990年6月12日、対広島東洋カープ9回戦(広島市民球場)、9回表に高木宣宏から右越3ラン ※史上21人目(歴代最速の1284試合で到達)
1500安打:1990年9月5日、対読売ジャイアンツ22回戦(東京ドーム)、9回表に桑田真澄から左越3ラン ※史上59人目
3000塁打:1991年6月30日、対読売ジャイアンツ10回戦(ナゴヤ球場)、8回裏に香田勲男からソロ ※史上30人目
2012年4月19日、CBCテレビ制作の中日対巨人戦に出演) NHKプロ野球(2012年5月19日、NHK総合テレビで放送の巨人対ソフトバンク交流戦に出演) J SPORTS STADIUM(2012年のセントラル・リーグ クライマックスシリーズ ファーストステージ 中日対ヤクルト第1戦)
すぽると!(フジテレビ。2002年の日本シリーズ試合解説を全試合担当)
最強チームはこうして生まれた!~落合監督が語る 日本一への道~(NHK BS1、2007年12月。聞き手は梨田昌孝、与田剛)
サンデースポーツ(NHK総合テレビ。2012年から不定期でプロ野球解説として出演 2022年4月度の改編からは週替わりのレギュラーコメンテーターとして出場)
めざせ!会社の星(NHK Eテレ。2013年7月10日、7月17日他)
戦え!スポーツ内閣(毎日放送テレビ、2018年5月23日 以降定期的に出演)
クローズアップ現代+ 大谷翔平 驚異の進化の舞台裏(NHK総合テレビ、2021年6月15日、解説)
JA淡路日の出スポーツスペシャル ~MBSべ―スボールパーク番外編~落合博満×掛布雅之 THE・野球談議(2021年12月29日、MBSラジオ)