下田本線料金所
第二みちのく有料道路の通行料金は上り線と同じ車種別の均一料金である。ETCレーンがない為にETC利用者は、ETCカードを抜き合わせて現金を用意して手渡しする必要がある。そのため二輪車でシート下に車載器を取り付けているETC利用者の場合、料金所脇の駐車スペースでETCカードを取り出したのちに精算する必要がある。ETCカードを抜き取る手間を省く為には、下田百石ICのETCレーンで一旦流出し、同ICの一般レーンから通行券を取り第二みちのくへ流入する方法がある。その場合、下田百石ICのETCレーンでネクスコ利用分の通行料金が一旦精算となる。下田百石IC以北が第二みちのく有料道路になるので、下田本線料金所へは通行券を持って行き、第二みちのく有料道路通行料金を現金もしくは回数券で支払いをする形となりETCカードは必要がない(管轄の境界かつ通しで通行した場合の割引は設定されていないため、一時流出による割り増し料金は発生しない)。
ネクスコ管轄の高速道路と直結している為、ネクスコ通行料金と第二みちのく通行料金を合併収受している。例えば郡山IC流入でそのまま第二みちのく有料道路を利用する場合は、ネクスコ管轄の郡山IC-下田百石ICまでの通行料金と青森県道路公社管轄の第二みちのく有料道路の通行料金を合わせて精算することになる。
ネクスコの通行料金はETC・クレジットカード・現金の支払いになるが、下田本線料金所にはETCレーンがない為、ETC流入の場合は徴収員にETCカードを手渡しする必要がある。さらに第二みちのく有料道路通行料金が現金か回数券のみの支払いとなるので、合わせて出さなければならない(ETCカード+現金など)。この際ETC各種割引(深夜割引・休日割引など)はETC車載器の有無を確認後に徴収員が割引処理をする。通行券を有している場合はネクスコ分と第二みちのく分を合算した金額で請求される。ネクスコ分と第二みちのく分の2枚の領収書(ETCの場合は利用証明書)が発行される。