学内神社
1998年、名張学舎の竣工時、名張学舎の鎮守として、本部研究棟屋上に創建(創建当初の名称は「神明社」)。2004年に大学会館東側に移転。その際に、「名張学舎神明宮」と名称が改められる。例祭も文学部助手の手によって恒例的に行われ、祝詞も奏上されていた。
学生数減少などに伴う名張学舎撤退・伊勢学舎への統合に伴い、2011年に「名張学舎神明宮遷座祭」をおこない廃される。遷座先は、名張学舎のあった同市内に鎮座する美波多神社の境内社三柱神社として遷座され今に至る。なお、大学本部の伊勢学舎には学内神社が存在しない。よって、現在の皇學館大学には学内神社は存在しない。