全国高等学校総合体育大会
すべての競技が高体連に参加しているわけではなく、さらに高体連参加競技であっても、インターハイに加わっていないものも存在する。これらはそれぞれインターハイとは別の独立した大会としてほとんどがインターハイと同時期に開催されている。
高体連自体に参加していない競技大会は下記の通り。ただし、日本スポーツ協会、日本オリンピック委員会、日本ワールドゲームズ協会の少なくともいずれかに加盟・準加盟している、あるいは独自の高校連盟を持つ競技のみ挙げる。
全国高等学校野球選手権大会(日本高等学校野球連盟)
全国高等学校軟式野球選手権大会(同上)
全国高等学校女子硬式野球選手権大会(全国高等学校女子硬式野球連盟)
全国高等学校女子軟式野球選手権大会
全国高等学校トランポリン競技選手権大会(全国高等学校トランポリン連盟)
全国高等学校ゴルフ選手権大会(日本高等学校ゴルフ連盟)
全日本高校ボウリング選手権大会
全国高校生チャレンジトライアスロン
全国高校生銃剣道大会
全国高等学校カーリング選手権大会(ただし青森県高体連が後援に加わっている)