ハナヤスリ亜綱
分子系統解析により系統関係が明らかになるまでは様々な系統関係が類推されてきた。
マツバラン類はエングラーとプラントル (1902)による分類では、ヒカゲノカズラ類とともに小葉類 Lycopodialesの中の無舌類 Eligulataeに分類されていた。その後、Verdoorn (1938)などでは独立した群として分けられ、様々な分類体系で独立したマツバラン綱 Psilotopsidaに置かれた。デボン紀の化石植物での研究によりリニアやクックソニアなどが古生マツバラン類と呼ばれ、マツバラン類はその生き残りだと考えられた。その後、その直接的な系統関係は否定されたが、依然他の群との類縁関係は分からなかった。加藤 (1983)では、ヒカゲノカズラ綱の根が二又分枝することから二又分枝する地下茎を持つマツバラン類と近縁としてヒカゲノカズラ亜門にヒカゲノカズラ綱とマツバラン綱を置き、岩槻 (1992)などでも再びヒカゲノカズラ類、イワヒバ類、ミズニラ類からなるヒカゲノカズラ亜群とともにマツバラン亜群として小葉植物群の下に置かれた。