靖国丸
関本織之助 大佐:1940年12月16日 - 1942年5月1日
毛利良 大佐:1942年5月1日 - 1943年5月13日
関禎 大佐:1943年5月13日 - 1944年1月31日 - 戦死。同日、海軍少将に特進。
「靖国丸」などの丙一号輸送での任務は第二十師団主力の釜山からウェワクへの輸送、丙三号輸送での任務は第四十一師団主力の青島からウェワクへの輸送であった。「靖国丸」は集合地の釜山に1月6日に着いた。丙一号輸送では「靖国丸」は「筥崎丸」、「新玉丸」、駆逐艦「初雪」とともに第二輸送隊として1月8日に釜山を出発し、1月15日にパラオに到着した。1月18日、「靖国丸」はパラオ出港直後に座礁。1月19日に離礁して翌日ウェワクへ向かい、1月22日に到着した。「靖国丸」の輸送内容は人員1313名、車両7両、物件3968梱であった。次の丙三号輸送では「靖国丸」は「聖川丸」、駆逐艦「磯波」とともに第三輸送隊となった。2月7日に青島を出発し、パラオ到着後に輸送部隊の編制替えが行われて、第三輸送隊には「浮島丸」と駆逐艦「秋雲」、「長月」が加わった。また、パラオでは追加で陸軍部隊が乗せられた。第三輸送隊は2月21日にパラオを出発し、2月24日にウェワクに到着した。「靖国丸」の輸送内容は人員1571名、車両6両、物件9660梱であった。
3月20日、「靖国丸」は呉を出港。同日、宿毛湾泊地からやってきた「第46号哨戒艇」と会合し、護衛を受ける。21日2130、「第46号哨戒艇」が護衛を終了し、佐伯へ向かう。26日、駆逐艦「清波」と会合。27日0830、2隻はトラックに到着。
「香取」とともに日本本土へ向かった後、4月25日に空路トラックに戻った第六艦隊司令長官は、翌日「靖国丸」に将旗を掲げた。「香取」がトラックに戻ると、5月12日に将旗はそちらへ移された。
9月15日、第三潜水戦隊の解隊に伴い、第六艦隊付属となる。