エルンスト・ホーエンベルク
1936年5月25日にウィーンにおいて、イギリス人のマリー・テレーズ・ウッド(Marie Therese Wood, 1910年 - 1983年)と結婚し、間に2人の息子をもうけた。
フランツ・フェルディナント・マクシミリアン・ゲオルク・エルンスト・マリア・ヨーゼフ・ツァハリウス・イグナツ(1937年 - 1978年)
エルンスト・ゲオルク・エレメール・アルベルト・ヨーゼフ・アントニウス・ペレグリヌス・ルーペルトゥス・マリア(1944年 - 2023年)
フランツ・フェルディナント大公とその妻のゾフィー・ホテク伯爵夫人(結婚によりホーエンベルク公爵夫人)の間の第3子、次男として生まれた。両親の貴賤結婚により、エルンストと兄姉は二重帝国の帝位継承権はおろかハプスブルク家の正式な成員とすら認められなかった。
1914年に両親がボスニア訪問中に民族主義者のテロにより暗殺されると(サラエヴォ事件)、姉弟は母方の親族に引き取られた。大伯父の皇帝フランツ・ヨーゼフ1世は姉弟をただ1度王宮に呼び寄せたきりで、孤児たちを引き取ろうとはしなかった。エルンストは成長すると、ブルック・アン・デア・ムールで林学を学んだ。エルンストは兄のマックスとともにハプスブルク家の復位を目指す運動に熱心に協力し、従甥の元皇太子オットー・フォン・ハプスブルクとも親しく連絡を取り合っていた。兄弟は1930年代には護国団にも加入していた。