リンネ式階層分類体系
リンネは1753年、著作『植物種誌』において植物界を「綱」・「目」・「属」・「種(および変種)」の4つの階級を用いて組織化した。そして体系分類とは、最小階級であるどの変種も種も、属として、目として、そして綱としての何れの位置も与えられることであるとした。なお、リンネの分類体系ではこのうち「属」を基礎として体系化した。種は属に分類されるものであり、体系の議論では属を単位とした。この認識はリンネ以前から続くもので、リンネ以前の多名法において種名は属名とそれに続く複数の形容語の羅列により構成されるように、従属の意識が強かった。二名法もこれを踏襲し、種名を「属名 + 種形容語」で表している。
現在では、上から界(kingdom)・門 (phylum, division)・綱 (class)・目 (order)・科 (family)・属 (genus)・種 (species)といった7つの基本的な分類階級(植物ではこれを一次ランクと呼ぶ)を基本とした階層的な分類がなされる。種は属に、属は科に、科は目に、目は綱に、綱は門に、門は界に含められ、入れ子状の構造となっている。最近では界をドメインでまとめる階層構造も一般的である。必要に応じて動物であれば綱と目の間に区 (cohort)、科と属の間に族 (tribe)をおくことができ、植物でも科と属の間に連、属と種の間に節 (section) および列 (series)、種より下位に変種 (variety) や品種 (form) といった二次ランクを置くことができる。
リンネは1751年の著作Philosophia Botanica『植物学論』において、体系分類の創始者はアンドレア・チェザルピーノ(1519年 - 1603年)であるとし、他26人の植物の体系分類学者を列挙している。リンネはそうした分類学者を標識として重視した構造によって、チェザルピーノのような「果実主義者 fructist」やジョゼフ・ピトン・ド・トゥルヌフォールのような「花冠主義者 corollist」などとし、「性」を標識としたのは自身がはじめであるとした。
古代ギリシアのテオプラストスは Περὶ φυτῶν ἱστορία『植物誌』において、480種の植物を取り扱ったが、体系分類への試みはなされていない。ヨーロッパでは紀元1世紀のディオスコリデスの Περὶ ὕλης ἰατρικῆς 『薬物誌』の分類が長い間重視され、ヨーロッパ外から導入された植物も増えた中世であっても、ルネサンス期に至るまで新たな分類体系は生まれなかった。
リンネに影響を与えたのはギャスパール・ボアン(1560年 - 1624年)が兄ジャン・ボアン(1541年 - 1612年)の記述をもとに著したPinax theatri botanici(1620年)であり、リンネの『植物種誌』の先駆的著作と見なされる。