DNAバーコーディング
DNAに使用される領域は標準化され、多数の配列データベースが利用可能である。また、ほとんどの種や分類群で、種特異的プライマーを利用することなく、短い配列でも、種内変異が少なく種間変異の大きい領域が提案されている(ユニバーサルプライマー)。多くの領域がDNAバーコーディング領域として提唱されているが以下の領域が一般的である。
ミトコンドリアのCOI遺伝子(動物界や多くの真核生物)
rbcLとmatKの組み合わせ(陸生植物)