内生菌
内生真菌は多くの門に存在するが、子嚢菌門に属するものが一般的である。例えば、フンタマカビ綱(核菌類)のヒポクレア目とクロサイワイタケ目などである。小房子嚢菌類の綱にも内生真菌はいる。内生真菌は現行の分類体系において多くの分類階級に存在しており、形態・機能に基づく新たな内生真菌の分類体系が提案されている。下表に代表的な内生真菌を示す。