日本の水族館
新潟市水族館 マリンピア日本海(旧・新潟市立新潟水族館、新潟県新潟市)★
ネイチャーアクアリウムギャラリー(新潟県新潟市、アクアデザインアマノ本社敷地内)
イヨボヤ会館(新潟県村上市)
寺泊水族博物館(新潟県長岡市)★
上越市立水族博物館うみがたり(新潟県上越市)★
あげしま水族館(新潟県佐渡市、尖閣湾揚島遊園内)
信濃川水系フィッシュハウス(新潟県魚沼市)
魚津水族館(富山県魚津市)
のとじま臨海公園水族館(石川県七尾市)★
越前松島水族館(福井県坂井市)★
山梨県立富士湧水の里水族館(山梨県南都留郡忍野村)★
国営アルプスあづみの公園 理科教育(長野県安曇野市)
蓼科アミューズメント水族館(長野県茅野市)
岐阜県世界淡水魚園水族館 アクア・トトぎふ(岐阜県各務原市、河川環境楽園・オアシスパーク内)
森の水族館(岐阜県高山市)
あわしまマリンパーク(旧・淡島海洋交園、静岡県沼津市)
東京タワー水族館(東京都港区、東京タワー内) - 1978年4月28日~2018年9月30日
浅草公園水族館(東京都台東区) - 1899年10月15日~1935年?
板橋区立淡水魚水族館(東京都板橋区) - 1983年4月~2004年3月31日
よみうりランド マリンドーム海水水族館(東京都稲城市)- 1969年3月19日~2000年11月5日
三笠水族館(神奈川県横須賀市) - 1949年~1959年
東大三崎臨海実験場付属油壺水族館(神奈川県三浦市) - 1932年~1971年8月
京急油壺マリンパーク(神奈川県三浦市)- 1968年~2021年9月30日
鎌倉水族館(神奈川県鎌倉市) - 1953年10月18日~1959年
真鶴水族館(神奈川県足柄下郡真鶴町)
柏崎水族館(新潟県柏崎市) - 1954年~1956年
糸魚川水族館(新潟県糸魚川市) - 1949年~1954年
明科フィッシングランド(長野県安曇野市) - 1967年~1972年
金沢水族館(石川県金沢市) - 1963年~1993年
伊東水族館(静岡県伊東市)
ペンギン博物館(静岡県伊東市)
八瀬海水水族館(京都府京都市左京区) - 1964年~1984年
※ 展示数は絶えず変動しているので、順位も流動的であることに注意。
※建物は大きく単棟型と分棟型(パビリオン型)、部分型(建物内の一部)に分けることができ、いずれをも含む。