エリーザベト・フランツィスカ・フォン・エスターライヒ＝トスカーナ
フランツ・ザルヴァトール大公と、その妻で皇帝フランツ・ヨーゼフ1世の末娘マリー・ヴァレリー大公女の間の第1子、長女として生まれた。洗礼名は母方の祖母である皇后エリーザベト・イン・バイエルンに因んでいる。家族からはエラ(Ella)の愛称で呼ばれた。幼少期は、後に教育学者・発達心理学者として著名になるエルザ・ケーラー(ドイツ語版)が養育係となった。1903年以降、弟フランツ・カールと一緒に、ウィーンのショッテン中等教育学校(ドイツ語版)に特別講義生として通学している。
祖父フランツ・ヨーゼフ1世は一時期、将来の皇位継承者であるカール大公(エラのはとこ、のちの皇帝カール1世)に嫁がせようと考えていた。皇位がかなりの傍系相続になってしまうことを補おうとするものであったが、血縁関係が近すぎることを不安視するカール大公の母マリア・ヨーゼファ大公妃の反対によって破談になった。