施明徳
同年3月第1回総統直接選挙における民進党候補(彭明敏)落選の責任を取り、民進党主席を辞任(後任は許信良)。
その後も民進党の長老格として活動を続けるが、政権党となった後次第に現実化路線へと軌道修正を図る陳水扁との路線対立から2000年に民進党を離脱、2002年12月に行われた高雄市長選挙において国民党(連戦主席)と親民党(宋楚瑜主席)に推輓される形で無所属として立候補した。現職の民進党系市長である謝長廷(現:行政院長)との一騎討ちということもあり一時注目を集めたが、野党側が統一候補者絞込みに失敗し、それぞれ別の候補者推薦に流れた結果、最終的には泡沫候補なみの得票に終わり落選した。2003年米国ジョージ・メイソン大学客員教授に就任。第5期立法委員落選以後は国政等の要職には就いていない。
陳水扁の家族や側近による金銭スキャンダルが発覚すると、それに抗議し、「倒扁運動」(陳水扁退陣要求運動)を主導した。2006年9月9日より台北市の総督府前で無期限の座り込みを開始。辞任要求運動中、肝臓癌の手術を行っていたことが明らかになった。
2015年5月、2016年の総統選挙に無所属で出馬する意向を表明した。2014年に初めて提案した、中国と台湾が1つの法的な主体(政府)を別々に統治するという「広義の1つの中国」という枠組み(「大一中」架構、Broad One China Framework)を再び強調した。両政府は国際機関への加盟を認められ、他方に対して軍事力を行使せず、その代わりに「合意によって問題を解決する」。しかし総統選挙に立候補するために必要な中央選挙管理委員会の要件を満たすことができなかったため、9月に選挙運動を終了した。