馬ヘルペスウイルス1型
検体別(サンプル別)に検査目的や方法が異なる。検査先へ検体を送るにあたっては国連規格容器によって行われなければならない。 鼻汁ぬぐい液検体からはPCR法を実施しウイルスの遺伝子DNAポリメラーゼを検出する。流産胎子を含む臓器検体からは免疫組織検査(免疫染色)である直接蛍光抗体法(FA)が行われ、組織中のウイルス存在の有無が確認される。馬または牛腎細胞を使用した組織培養によってウイルスを分離し、制限酵素を利用して電気泳動を行って1型であることを同定する。また、1型の遺伝子検出にLoop-mediated isothermal amplification(LAMP)法を行った報告がなされている。
EHMが疑われる場合の診断は神経組織検体の免疫組織検査ないしPCR法により行う。なお、PCR法によってD/N752鎖が検出された場合、同じ1型でもEHMを発生させる神経病原性が高いという報告がある。 血清検体の場合、2-3週間隔をおいてペア血清による抗体検査を行う。血清検体からの補体結合反応(CF)は日本では馬ヘルペスウイルスの診断としてよく実施されている方法であるが、同様に血清を用いるウイルス中和テスト(The viral neutralization test, Serum neutralization test,SN)とともに、1型か他の型感染なのかを鑑別できない。
日本ではエライザ法(ELISA)が血清検体から馬ヘルペスウイルスの型を鑑別するため実施されている。海外では簡易検査キットViral glycoprotein gG(Svanovir)が利用されている。なお、症状をもとに他の疾患(馬パラチフスなど)との類症鑑別のための検査を必要とする。