らい菌
M. lepraeは倍加時間が長く、そのことが実験室での培養を難しくしていた。
1998年、M. leprae株の最初のゲノム配列決定が完了した。ついで、インドのタミル·ナードゥ州で単離された株のゲノム配列決定も2013年に完了した。この配列は、選択されたコスミド、および全ゲノムのショットガンクローンのDNA配列解析を採用したアプローチの組み合わせで得られた。
結果、全ゲノム配列は3,268,203塩基対(bp)、平均GC含有量が57.8%であった。これは結核菌ゲノムが4,441,529 bpおよび平均GC含有量65.6%であるの比べてはるかに低い値である。
M. lepraeと結核菌(M. tuberculosis )のゲノム配列を比較することで、倍加時間が長い性質について明確な説明が提供され、縮小進化の極端な事例が明らかになった。全ゲノムで機能的遺伝子が含まれるゲノム領域は半分以下だったのである。遺伝子の欠失により、シデロホア生産、酸化の一部、微好気性および嫌気性呼吸鎖、多数の異化作用システムとその制御系にかかわる多くの重要な代謝機能を失っていた。