京都大学霊長類研究所
1993年4月 - 9研究部門を4大研究部門(10分野)に改組、思考言語分野設置。
1995年3月 - 類人猿行動実験研究棟(新棟)完成。
1999年4月 - サル類保健飼育管理施設を人類進化モデル研究センターに改組し、3研究領域、1外国人客員研究領域にて設置。
2006年10月 - 寄附研究部門として比較認知発達(ベネッセコーポレーション)研究部門を設置。
2007年 4月 - リサーチリソースステーション (RRS) を設置。 8月 - 寄附研究部門として福祉長寿研究部門を設置。
2008年 3月 - 本棟の耐震工事竣工。 4月 野生動物研究センター設置に伴い、ニホンザル野外観察施設、福祉長寿研究部門を同センターへ移行。 国際共同先端研究センター設置。
2010年3月 - 寄附研究部門としてボノボ(林原)研究部門を設置。
2011年8月 - 京都大学野生動物研究センターの附属施設「熊本サンクチュアリ」発足。
2022年3月 - 後述の不正発覚により廃止。「ヒト行動進化研究センター」「野生動物研究センター」「生態学研究センター」「理学研究科生物科学専攻」に改編。