FS作戦
これは従来から大きな方針転換であり、これまでの5月18日の大本営指示による作戦方針では敵航空兵力を撃滅する主兵は機動部隊であったが、ミッドウェー海戦の戦訓から機動部隊をもって陸上航空基地へ攻撃するのは危険と認め、FS作戦は基地航空部隊の傘の下に作戦を進めようとした。この方法ではフィジー及びサモア諸島の攻略は困難であり、連合艦隊は取りやめを要望したが、軍令部は同意せず、両者とも再検討するとしてその打ち合わせを終えた。
7月1日、連合艦隊はFS作戦の取りやめを可とする意見に達した。以前から懸念していた航空機の生産状況が遂に消耗が補給量を上回り、これが所望高まで引き上げない限り実施するべきではないという結論に至ったからだった。7月5日、連合艦隊は軍令部に中止したい旨を伝え、6日に軍令部も中止に決して7日に三和参謀に正式に通告し、陸軍にも主として航空の関係から実施できない旨を伝えて了承を得た。11日、軍令部総長は中止を上奏。同日、大海令二十号を発令。「大海令第十八号に基く連合艦隊司令長官の「ミッドウェイ」島攻略及大海令第十九号に基く連合艦隊司令長官の「ニューカレドニア」「フィジー」諸島並に「サモア」諸島方面要地攻略の任務を解く」と発し、同作戦の中止が指示された。しかしポートモレスビーの攻略は将来FS作戦を実施するため、また南東方面航空戦激化の現状を改善するため、実施する必要があり、検討が続けられた。
陸海軍中央協定に定められた作戦目的は、「『ニューカレドニヤ』『フィジー』諸島及『サモア』諸島要地を攻略して米豪間の連絡遮断を強化すると共に該方面よりする敵の反撃企図を封殺するに在り」である。米豪遮断によってオーストラリア脱落を促進しようというものだった。
作戦は、まずニューカレドニアに奇襲上陸し、次いでフィジー諸島、サモア諸島に急襲上陸し、ヌウメア、スパ、パゴパゴなどの要地を攻略する。ニューカレドニア及びフィジー諸島の要地は攻略後確保し海軍の作戦基地を推進する。サモア諸島は要地攻略後は諸施設を破壊し、撤去あるいは確保する。連合艦隊が1942年4月13日に示した日程では、1942年7月8日ニューカレドニア攻略、18日フィジー攻略、21日サモア攻略であった。日本海軍の使用兵力は、第二艦隊、第一航空艦隊基幹と予定した。日本陸軍は、第17軍を編成し、ニューカレドニアに南海支隊(歩兵3大隊基幹)を、フィジーに軍司令官の指揮する歩兵5大隊基幹を、サモアに連隊長の指揮する歩兵1大隊をそれぞれ予定していた。日本軍は4月中旬ごろのこの方面の連合軍海上兵力を空母1~3隻、巡洋艦7隻(豪3、米4)基幹と推定していた。
1942年4月下旬にFS作戦を含む第二段作戦図演計画を作成配布して、5月1日から図上演習を行ったが、FS作戦計画立案の主担任であった連合艦隊航空参謀佐々木彰中佐は「第二期作戦であるミッドウェー作戦の研究に重点をおいた図演だったので、FS作戦はその概略だけを計画し、詳細はミッドウェー作戦後トラックに集結したとき、研究して決める予定であった」と戦後回想している。