メタン生成経路
また、4.の反応だが、F420 を介さず、直接H2を付加する系も種によっては存在し、以下の式で表される。
メテニルH4MPT + H2 → メチルH4MPT
標準自由エネルギー変化は同じである。
これらの反応を行なう、酵素群の名前は以下の通りである。
ホルミルMFRデヒドロゲナーゼ
ホルミルMFR:H4MPTホルミルトランスフェラーゼ
メテニルH4MPTシクロヒドロラーゼ
F420依存性メチレンH4MPTデヒドロゲナーゼ
F420依存性メチレンH4MPTレダクターゼ
メチルH4MPT:SH-CoMメチルトランスフェラーゼ
CH3-S-CoMレダクターゼ
CoM-S-S-CoBレダクターゼ
また、F420とH2を結合させる反応(4.、5.の反応)はヒドロゲナーゼという水素を活性化できる酵素がになっている。
F420還元ヒドロゲナーゼ
また、F420に依存しない4.の反応(H2を直接メテニルH4MPTに付加する反応)は以下の酵素がになう。
H2生成メチレンH4MPTデヒドロゲナーゼ
これらの酵素系や補酵素は、メタノールや酢酸からのメタン生成系に共通するものも存在する。ただし、二酸化炭素を固定してしまう、炭酸固定反応を有するのは水素、二酸化炭素からのメタン生成系のみであり、他のメタン生成系では二酸化炭素を放出する。