地下茎
地上茎と同様に、地下茎の分枝も基本的に側方分枝である。ハラン (キジカクシ科) などでは、根茎が主軸となり、側枝として地上茎を生じていく。つまりこの場合、地下茎の分枝は単軸分枝である。レンプクソウ (ガマズミ科) でも同様であるが、この場合は前年分の地下茎が枯死する点で異なる。一方、アマドコロ (キジカクシ科) などでは、地下茎主軸の先端が地上茎となり、その基部の側枝が地下茎として伸長していく (図6a)。つまりこの場合、地下茎の分枝は仮軸分枝である。地下茎では仮軸分枝するものが多い。
例外的に、ヒカゲノカズラ植物の地下茎はその地上茎と同様、二又分枝をする。二又分枝は同等に分枝する場合もあるが、一方が明らかに優勢で主軸状になることもある (二又性仮軸分枝)。
多年生草本では、生育不適期 (冬など) に地上部は枯れてしまい、地下茎がその期間を耐えしのぎ、その後再び地上部を生じる生活史をもつものが多い。