一つの中国
1990年以降、基本方針は大きく変化していく。1990年には行政院大陸委員会と海峡交流基金会と国家統一委員会が設置され、1991年に国家統一綱領を定める。「一つの中国」の意味を曖昧にしつつ、「法統」を放棄して事実上の法理独立、つまり憲法改正と民主化へ歩みだした。しかし「一つの中国」を原則として否定もできなかったため、中華民国憲法増修条文には「統一前の需要により、憲法を以下のように修正する」との一文を前文に挿入した。
1999年の李登輝総統による「特殊な国と国の関係」発言に至ると、中華人民共和国側はこれを「両国論(二国論)」と呼び、「一つの中国」を放棄したものと解釈して強く反発した。 1990年には「一國兩府(一国二政府)」 1991年には「一個中國,兩個對等政治實體(中国語版)(一つの中国、二つの対等な政治実体)」 1993年には「一個中國指向的階段性兩個中國政策(中国語版)(一つの中国に向けた段階的な二つの中国政策)」 1999年には「特殊的國與國關係(中国語版)(特殊な国と国の関係)」