消防救助機動部隊
化学機動中隊経験者で化学災害技術の有資格者などから選抜されており、NBC災害発生時にあらゆる分析装置や防護服、特殊災害対策車、除染車などを備え危険性の高いNBC災害現場の最前線で人命救助や除染、評価などを行う。機動科学隊は第九方面本部消防救助機動部隊の発隊と共に新設された部隊であり(後に第八方面本部に配置換え)、それに伴い第三方面本部消防救助機動部隊の機動特科隊も機動科学隊へと部隊名を変更した。大型(CS1)・除染車(CS2)・偵察車(CS3)の3種類の特殊災害対策車で都内や国内でのNBC災害に対応している。国内唯一の放射線災害に対応した特殊災害対策車(大型)や高踏破偵察車なども保有する。詳細は「日本の消防車#特殊災害対策車」を参照
三本部の旧特殊災害対策車(大型)
九本部の高踏破偵察車(現在は八本部に配置換え)
さらに第八本部と第二本部では隊員全員が全職務を行えるようにするため、毎月上記の三つの隊をローテーションするなどしている。また、第六本部では必ず2名の救急救命士を配置する体制をとっており、第三本部はNBC災害に対応する部隊であるため、部隊の隊員ほとんどが化学災害技術の有資格者で占められている。
このように各本部により部隊編成や運用形態が異なる。