ネオカリマスチクス綱
2022年現在、ネオカリマスチクス類の確実な例は植食性哺乳類・爬虫類の消化管のみから見つかっているが、形態観察に基づいてウニの消化管から報告された例がある。また、環境DNAの調査からは、動物消化管外の植物遺体に富む嫌気的環境にもネオカリマスチクス類が自由生活している可能性が示唆されている。
ネオカリマスチクス類は、消化管内で動物が食べた植物片に着生し(図5)、仮根などをこれに侵入させ、植物片を物理的に分解するとともに、様々な酵素を分泌してセルロースや他の細胞壁成分を極めて効率的に分解する。ネオカリマスチクス類は、セルラーゼ(エンドグルカナーゼ、エクソグルカナーゼ)、キシラナーゼ、マンナナーゼ、セロデキストリナーゼ、アミラーゼ、グルコシダーゼ、エステラーゼ、プロテアーゼなどさまざまな酵素を分泌する。ネオカリマスチクス類のゲノムには、炭水化物分解酵素遺伝子が1,500–3,800個と極めて多いことが報告されている。また、ネオカリマスチクス類がもつ植物細胞壁分解酵素の一部は、細菌からの遺伝子水平伝播に由来すると考えられている。ネオカリマスチクス類の特徴として、さまざまな細胞壁分解酵素が互いに結合し、細胞外酵素複合体であるセルロソーム (cellulosome) を形成することが挙げられる。細菌のセルロソームとは異なり、ネオカリマスチクス類のセルロソームは、異なる種に由来する酵素が複合体を形成することができる。
ネオカリマスチクス類は、動物体内で植物片を効率的に分解することから、生物工学的な視点(セルロース分解やバイオ燃料の生産など)から注目されている。また、家畜の飼料利用効率を向上させる観点からも研究されている。
ネオカリマスチクス類は上記のような応用研究も含めた研究対象となり、植食動物の糞や消化管から単離され、嫌気的条件で純粋培養が可能である(図6)。