JR四国6000系電車
全車が高松運転所に配置されている。6000系単独の他、快速「サンポート」のうちの高松 - 伊予西条間運行の1往復は6100形側に7000系7100形を連結した4両編成で運行する。なお本系列は予備車がないため、故障・検査時は7000系3両あるいは7000系1両+7200系2両の3両で運用される。
以下の区間で普通列車や快速「サンポート」として使用されている。
予讃線(高松 - 伊予西条)
土讃線(多度津 - 琴平)
瀬戸大橋線の観音寺 - 岡山間で運用していた111系をそのまま置き換える形で運用を開始した。
2000年、JR東日本より譲受した113系が瀬戸大橋線の普通列車に充当されることとなり一旦本四備讃線での運用は消滅した。その後、長らく本州方面への運用は無かったが、2016年3月26日のダイヤ改正より再度岡山までの運用が復活した。
その後、2019年3月16日のダイヤ改正で観音寺・琴平 - 岡山間を直通する普通列車が全て廃止(本州側は児島折り返し、四国側は高松行きへ変更)となり、再び本四備讃線での運用は消滅した。
1999年(平成11年)春頃、当時のヒット曲『だんご3兄弟』にあやかって「3兄弟電車」として運転された。電車を3兄弟に見立てた絵を描いたヘッドマークを装着し、6000形には「力もちの長男」、6200形には「人にやさしい次男」、6100形には「ときには先頭三男」と、それぞれのキャッチフレーズを車体に掲示していた。