衛星アニメ劇場
当初は民放で放送していたアニメなど他局の再放送が中心で、CS放送のアニメ専門局が普及するまでは貴重な再放送枠であった。1994年以降、商業ベースには乗りにくい(乗らなかった)国内製作アニメも新作として(但し、NHKによる製作又は製作会社からの放送権購入の扱い)放送するようになった。また、他ではほとんど見られる機会がなかった、海外製作作品を積極的に放送したのも特色の一つであった。2003年に枠が縮小されて以降は、新作中心の構成となっている。また、姉妹関係にある番組として「BS名作アニメ劇場」がある。日曜は「サンデーアニメ劇場」(1990年4月8日 - 1994年3月13日)として放送され、主に新作枠として使われた。
2007年3月31日放送分までのデジタル放送はスタジオ4:3、VTR16:9(1作品目と3作品目のみ)であったが、同年4月7日放送分からはオープニングアニメーションとスタジオも16:9(アナログ放送は14:9)サイズでの放送になった。
NHKの衛星放送チャンネル数再編により2011年3月27日放送分を以って21年の歴史に幕を降ろした。なおアニメ番組枠としての名称はNHK BSプレミアムのBS深夜アニメ館に引き継がれた。
ウォーターシップ・ダウンのうさぎたち
今日からマ王!★(第1〜2シリーズ、2005年度まで放送)
学園アリス☆(2005年度に再放送)
3月21日 岩男潤子(『カードキャプターさくら』大道寺知世役)
月曜日 ゴールFH☆ サッカーフィーバー
火曜日 超くせになりそう ひみつの花園、リトルツインズ
水曜日 白雪姫の伝説 ヤダモン
木曜日 おまかせスクラッパーズ★ ガジェット警部
金曜日 ふしぎの海のナディア(第21話から)、ハックルベリー・フィン物語、ぞうのババール 家なき子
赤胴鈴之助 第27話から、4月3日 - 5月3日
アタックNo.1 第27話から第52話まで、4月9日 - 5月10日
アイドル忍者タートルズ 5月6日 - 7月15日
未知の海へ ダーク・ウォーター 5月13日 - 5月17日
サスケ 5月22日 - 7月1日
スターカム 7月2日 - 7月17日
森の妖精ノーム 7月16日 - 8月20日
柔道讃歌 7月18日 - 8月26日
魔法少女レインボーブライト 8月21日 - 9月5日
宇宙伝説ユリシーズ31 8月27日 - 10月2日
キャッツ&カンパニー 9月6日 - 10月14日
レポーター・ブルース 10月3日 - 11月8日
ポールポジション 10月15日 - 11月1日
名探偵ホームズ 11月4日 - 12月9日
ガンバの冒険 11月11日 - 12月13日
未来少年コナン 12月10日 - 1992年1月20日
ガジェット警部 12月14日 - 1992年1月24日
トッポ・ジージョ 1992年1月21日 - 3月9日
ラビットイヤーズ 1992年1月27日 - 2月12日
わんぱくギャング大作戦 1992年2月13日 - 3月2日
ギャラクシー ハイ・スクール 1992年3月3日 - 3月19日
おはよう!スパンク 35話まで、1992年3月10日 - 4月28日
ニルスのふしぎな旅 1992年3月20日 - 5月29日