男鹿駅
JR東日本によると、2022年度(令和4年度)の1日平均乗車人員は247人である。
2000年度(平成12年度)以降の推移は以下のとおりである。
島式ホーム1面2線を有する地上駅。
2012年4月20日に、JR東日本は2013年に開催される秋田デスティネーションキャンペーンと、それに向けて2012年に開催されるプレデスティネーションキャンペーンを見据えて、秋田を訪れる観光客を綺麗な駅舎で迎えることを目指した駅舎の整備を行うことを発表した。当駅の駅舎は同年10月1日にリニューアルされた。男鹿半島は「なまはげ」で知られることから、「なまはげの訪れる古民家」というコンセプトを設定している。入口屋根を従来より高くして迫力をもたせ、一部の壁に男鹿石を配して重厚感を持たせた。また待合室の腰壁には地元企業が提供した秋田杉を使用している。
2017年10月31日には男鹿市とJR東日本が、男鹿線の活性化を目的として、当駅を南側に移設し、リニューアルすることを発表した。その後、2018年7月1日に、移設した駅舎の供用が開始された。旧駅舎は、2021年9月より、「稲とアガベ醸造所」として酒蔵に転用された。
1番線にはEV-E801系電車(愛称「ACCUM(アキュム)」)用の地上充電設備があり、ACCUMは当駅に到着後に、収納されたパンタグラフを上げて充電を開始する。充電完了後はパンタグラフを下げて収納した後、折り返し非電化区間を蓄電池電車として走行する。
土崎駅管理の業務委託駅(JR東日本東北総合サービスが受託)。直営駅時代は管理駅でもあり、船越駅・脇本駅・羽立駅を管理していた。駅舎内には指定席券売機、自動券売機、簡易Suica改札機と待合室がある。