シュードモナス属
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↑ Hassett D, Cuppoletti J, Trapnell B, Lymar S, Rowe J, Yoon S, Hilliard G, Parvatiyar K, Kamani M, Wozniak D, Hwang S, McDermott T, Ochsner U (2002).
1980年代半ば以降、農作物への病原菌の繁殖を防止するためシュードモナス属の特定の菌株が穀物種子または農耕地に散布されている。このような行為は一般的に生物防除と呼ばれている。P. fluorescensやP. protegens(CHA0株やPf-5株など)の生物防除特性が現在のところ最もよく理解されている。ただし、P. fluorescensがどのように植物生長促進効果を実現しているかは明確になっていない。一つの理論として、宿主植物への全身抵抗性を誘導し、宿主植物が本当の病原体に対してより強い抵抗性を示すようになり、一方でP. fluorescensが生存競争で土壌病原微生物を抑えるためと考えられている。P. fluorescensが他の微生物よりも生存競争で優勢となる理由として、鉄キレート剤であるシデロホアを利用するため鉄分の獲得競争で有利になるためや、フェナジン系の抗生物質やシアン化水素のような他の土壌微生物を抑制する化合物を生産するためと考えられている。2005年に行われた研究結果はこの理論を支持している。
生物防除特性で注目すべきその他のシュードモナス菌種として、特定の植物病原性真菌に対して働くフェナジン系の抗生物質を産生するP. chlororaphisや、その近縁種であり、グラム陽性微生物に対して働く抗生物質di-2,4-diacetylfluoroglucylmethaneを産生するP. aurantiacaがある。
↑ ヒュー・レイフソンテスト(Hugh and Leifson test)とは、炭水化物(ブドウ糖、乳糖、ショ糖など)の分解形式が酸化か発酵かを判別する酸化対発酵試験(O/Fテスト)法である。炭水化物を最終濃度1%になるようにOF基本培地に加えた半流動培地を2組用意する。試験細菌を穿刺培養したあと、一方の組を好気的に培養し、他方の組を滅菌流動パラフィンの重層で嫌気的に培養する。炭水化物が分解されると産生される酸をpH指示薬で検出し、検出される場所が空気(酸素)に触れる場所ならばその分解は酸化または発酵、触れない場所ならば発酵のみと判断する。Rudolph Hugh; Einar Leifson (1953). “The taxonomic significance of fermentative verus oxidative metabolism of carbohydrates by various Gram-negative bacteria”.
“Cloning and characterization of a Pseudomonas mendocina KR1 gene cluster encoding toluene-4-monooxygenase”. J. Bacteriol. 173 (17): 5315–27. PMC 208241. PMID 1885512. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC208241/.
↑ Huertas MJ; Luque-Almagro VM; Martínez-Luque M; Blasco, R.; Moreno-Vivián, C.; Castillo, F.; Roldán, M.-D. (2006). “Cyanide metabolism of Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5344: role of siderophores”. Biochem. Soc. Trans. 34 (Pt 1): 152–5. doi:10.1042/BST0340152. PMID 16417508.
↑ Nojiri H; Maeda K; Sekiguchi H; Urata, Masaaki; Shintani, Masaki; Yoshida, Takako; Habe, Hiroshi; Omori, Toshio (2002). “Organization and transcriptional characterization of catechol degradation genes involved in carbazole degradation by Pseudomonas resinovorans strain CA10”.
シュードモナス属に感染するバクテリオファージの例として以下がある。
英: Pseudomonas phage Φ6(英語版)
Pseudomonas aeruginosa phage EL
英: Pseudomonas aeruginosa phage ΦKMV(英語版)
英: Pseudomonas aeruginosa phage LKD16(英語版)
英: Pseudomonas aeruginosa phage LKA1(英語版)
英: Pseudomonas aeruginosa phage LUZ19(英語版)
Pseudomonas aeruginosa phage ΦKZ