過去に存在したイトーヨーカ堂の店舗
韮崎店(韮崎市若宮1丁目2-50) 1984年(昭和59年)10月3日開店 - 2004年(平成16年)8月29日閉店 売場面積約5,852m。 JR韮崎駅前のショッピングセンター「ルネス」の核店舗として出店し、開店当初から1992年度までは売上高約55億円から56億円を上げていたが、郊外型大型店の進出などで競争が激化して売上が低迷して閉店となった。 店舗の跡には2004年9月にオギノルネス店が核店舗として出店したが、売り上げが伸び悩んだため2007年8月26日に閉店となった。(後に、オギノは隣接の田んぼ&工場跡地に再開発でで誕生したライフガーデンにらさきの核テナントとして事実上の再出店をしている。) 2009年3月末でショッピングセンタールネスも閉店となった。 ルネスの土地・建物は韮崎市が買収し、2010年10月から改修工事を行って2011年9月に韮崎市民交流センター「ニコリ」が開館した。
富士吉田店(富士吉田市上吉田2-5-1) 1975年(昭和50年)4月30日開店 - 2005年(平成17年)12月31日閉店 売場面積約8,148m。 他店の看板切換の時期には閉店が決まっていた為か、イトーヨーカドーの店舗としては、最後までセブン&アイホールディングスのロゴに塔屋が更新されなかった店舗である。 当店閉店後に、ビルの所有者である富士急行グループの富士急百貨店がテナント32店舗のうち23店舗を引き継ぐと共に新たにテナントを追加で入居させ、48店舗で構成される大規模核店舗のない複合商業施設Q-STAとして2006年(平成18年)3月31日に新装開店した。
各務原店 (岐阜県各務原市蘇原青雲町4丁目1-21) 1981年3月開店 - 2011年1月16日閉店 売り場面積約8,474m。 当社の岐阜県下1号店として開業し、最盛期の週末などには郡上市や飛騨地域からも集客して年間約350万人の来店客を集めたが、施設の老朽化と土地・建物の賃借契約の期間が満了したため閉店となった。 店舗跡には2011年11月24日にバロー各務原中央店、バローホームセンター各務原中央店が開店した。
- 2020年(令和2年)5月31日変更) ヨークフーズ(2020年6月1日 -) 店舗面積約1,190m 2023年1月現在、イトーヨーカドーとして営業していたかつ現存する最古の店舗である。(現在もイトーヨーカドーとして営業している店舗の場合は高砂店)
三ノ輪店(荒川区南千住1-9-1) イトーヨーカドー×(1968年(昭和43年)6月14日開店 - 2015年(平成27年)4月5日閉店) イトーヨーカドー食品館(2016年4月22日開店 - 2020年5月31日変更) ヨークフーズ(2020年6月1日 - ) イトーヨーカドー時代の延床面積約5,281m、売場面積約3,411m。 閉店後、店舗を建替の上2016年(平成28年)4月22日に「食品館イトーヨーカドー三ノ輪店」を開店。
阿佐谷店(杉並区阿佐谷北2丁目13-2) イトーヨーカドー食品館(2010年(平成22年)10月1日開店 - 2020年(令和2年)5月31日変更) ヨークフーズ(2020年(令和2年)6月1日 - )
練馬高野台店(練馬区高野台1丁目7-27) イトーヨーカドー食品館(2012年(平成24年)6月28日開店 - 2020年(令和2年)5月31日変更) ヨークフーズ(2020年(令和2年)6月1日 - )
早稲田店(新宿区早稲田町74) イトーヨーカドー食品館(2012年(平成24年)8月7日開店 - 2020年5月31日変更) ヨークフーズ(2020年(令和2年)6月1日 - )
秋田店(秋田市中通2-8-1) イトーヨーカドー(1980年(昭和55年)11月22日開店 - 2010年(平成22年)10月11日閉店) フォンテAKITA(2010年12月1日開業 - ) 秋田駅前南地区の再開発事業で建設された「秋田ショッピングセンター」の核店舗として出店しており、開業時には地権者などの地元業者80店も入居していた。 1992年をピークに売上が減少し、1998年以降は赤字が続いていることに加えて自動車社会になっている中で駅前で日用品などを売る業態が時代にそぐわないとして閉店となった。 店舗跡は商業施設「フォンテAKITA」として2010年12月1日にまず約40店舗で開業し、2011年4月1日に約60店舗が入居して全面開業した。 2階にロフトが入居して集客の核の一つとなっている。
(初代)新田店×(草加市旭町6-15-30) 1972年(昭和47年)12月13日開店 - 2019年(令和元年)2月24日閉店 売場面積5,039m。 閉店後は建物を解体し、同敷地に新田店(2代目)を2020年10月30日に開店。
上福岡東店×(上福岡市大原2-1-30(ふじみ野市)) 1999年(平成11年)10月1日開店 - 2019年8月25日閉店 ふじみ野市役所向かいの「上福岡東ショッピングプラザ」の核店舗として開店。 売場は2階建て、売場面積は16,393mで、立体駐車場を備えていた。 店舗跡にはヤオコーやサンドラッグがオープンし、西側にはマンション「ブリリアシティふじみ野」が完成予定。
(初代)春日部店(春日部市中央1丁目9-7) 1972年(昭和47年)4月22日開店 - 1996年(平成8年)11月24日閉店。 1996年(平成8年)12月4日に隣接地に新築移転した。 退店後の建物には1997年4月27日に大塚家具春日部ショールームとが開業したが、2018年5月27日に閉鎖。 なお、駅反対側の西武(元のロビンソン)春日部店跡地に大塚家具創業者の大塚勝久が創業した匠大塚が出店している。 大塚家具撤退後は空き店舗となっている。
加須店×(加須市大門町20-58) 1991年(平成3年)1月30日開店 - 2021年(令和3年)1月11日閉店 地上2階建て。加須片倉パーク(店舗面積約6,652m)の核店舗として出店していた。 店舗跡は解体され「ヤオコー加須店」となっている。
広畑店(兵庫県姫路市広畑区夢前町1-1) 2000年3月開店 - 2017年3月26日閉店 店舗跡には2018年2月16日にMEGAドン・キホーテ姫路広畑店が開店した
上福岡西店×(入間郡大井町(現:ふじみ野市)鶴ヶ舞2-2-17)) 1977年(昭和52年)11月開店 - 2004年(平成16年)11月上旬閉店) 開店当初の店舗名は「上福岡店」であった。 跡地には2005年3月19日にスカウントスーパーギガマート上福岡店が開店していたが、2013年(平成25年)8月閉店後に解体され、跡地にマミーマート鶴ケ舞店が開店した。
越谷店×(越谷市越ヶ谷1-16-6) 1969年(昭和44年)6月5日開店 - 2009年(平成21年)5月10日閉店 売場面積4,155mのヨークショッピングスクエア越谷店として開業し、後に増床し売場面積約10,707mとなる。 跡地には2010年(平成22年)12月16日にMrMax越谷ショッピングセンターが開業したが2017年(平成29年)1月15日をもって閉店し、その後2017年4月21日にフードスクエアカスミ アルコ越谷店がオープン。
坂戸店×(坂戸市日の出町5-30) 1976年(昭和51年)6月29日開店 - 2016年10月16日閉店 売場面積8,429m。 解体後、2018年(平成30年)3月30日にアクロスプラザ坂戸が開業。
(初代)川越店×(川越市新富町1-20) 1967年(昭和42年)11月15日開店 - 2016年(平成28年)10月閉店 売場面積4,300m。 埼玉県内では最古の店舗かつ東京都外本格進出1号店であった。 店舗跡は建て替えられ、2019年11月28日に食品館川越店(二代目)が開店した。