フィリピン軍
しかしフクバラハップ支持の源泉であった農村問題に対する農地改革は不徹底に終り、1965年以降のフェルディナンド・マルコス大統領による独裁体制に対する反発もあり、1960年代末にはフィリピン共産党 (CPP) の武装部門である新人民軍(NPA)および民族民主戦線(NDF)、1970年にはモロ民族解放戦線(MNLF)が武装闘争を開始、フィリピン軍は再び対反乱作戦を余儀なくされることとなった。
この一方で、フィリピン軍は、国連軍の一員として朝鮮戦争に参戦した。韓国派遣フィリピン軍(PEFTOK)は、第2,10,14,19,20の計5個大隊戦闘団より編成され、兵力7,500名、国連軍で4番目に大きな勢力であった。
また、フィリピン軍は国際連合平和維持活動など、海外での戦争以外の軍事作戦にも積極的に参加している。主な参加活動は下記のとおりである。
国際連合コンゴ活動(1963年)
国際連合カンボジア暫定統治機構(1992〜1993年)
東ティモール国際軍→国際連合東ティモール暫定行政機構(1999年)
国際連合東ティモール支援団(2004〜2005年)
国際連合リベリア・ミッション(2003年〜)
国際連合ブルンジ活動(2004〜2006年)
国際連合ハイチ安定化ミッション(2004年〜)
国際連合コートジボワール活動(2004年〜)
国際連合インド・パキスタン軍事監視団(2009年〜)
国際連合兵力引き離し監視軍(2009年〜)
フィリピン軍の装備更新は遅れがちであり、アジア最弱の軍隊と指摘されることもあった。1999年10月、フィリピン国防省とアメリカ国防総省は、共同防衛評価(JDA)計画を開始した。2003年に発表された報告書(2003 JDA)は、フィリピン軍には、もっとも重要な任務であっても、部分的に遂行できる程度の能力しか備わっていないという、驚くべき指摘を行なった。
2003 JDAは、具体的に、下記の各領域での問題点を指摘した。
政策立案への体系的なアプローチ
人事管理とリーダーシップ
防衛費と予算
装備の取得
補給・整備
既存装備の品質保証
施設支援
2003年10月、ジョージ・W・ブッシュアメリカ合衆国大統領がフィリピンを訪問した際、グロリア・アロヨ大統領とともに、JDAにより指摘された問題点を解決するための施策の推進を発表した。これを受けて2004年、フィリピン軍は、フィリピン国防改革プログラム(Philippine Defense Reform, PDR)を発動した。これは、国防部門の短期的・長期的改革を目的としたもので、下記の10要件を備えている。
複数年度防衛計画システム(MYDPS)
情報・作戦・教育訓練の能力向上
兵站の能力向上
専門能力開発プログラムの改良
人事管理システムの改良
複数年度能力向上プログラム(CUP)
1946年7月、フィリピン第三共和国が成立し、正式に独立が達成された。しかしアメリカへの依存関係を脱却するには至らず、軍事的にも、1947年に締結された比米軍事基地協定によって冷戦構造の中で合衆国の反共主義の前線基地として位置づけられ、実質的な独立を達成できなかった。
大戦中、フィリピン軍・アメリカ極東陸軍を母体とするユサッフェ・ゲリラとともに、農民運動を母体とした抗日武装組織としてフクバラハップが結成されていた。大戦中は両者の関係は良好であり、しばしば協同して作戦行動を行なった。しかし戦後共和国政府は徹底してフクバラハップを敵対視し、1948年3月にはロハス政権によってフクバラハップと全国農民同盟は非合法化され、ルソン島では政府軍と地主の私兵とフクバラハップとの間で戦闘が繰り広げられた。フクバラハップは、一時は首都攻略まで噂されるほど勢力をのばしていたものの、アメリカからの軍事援助を受けたフィリピン軍が勢力を盛り返し、ラモン・マグサイサイ国防相による討伐作戦によって1950年10月には共産ゲリラの司令塔だったフィリピン共産党 (PKP)が壊滅し、翌1951年にはフクバラハップそのものも実質的に壊滅に追い込まれた。