アルゴノート (タンパク質)
アルゴノート(AGO)遺伝子ファミリーは、N末端(N)、Linker-1(L1)、PAZ、Linker-2(L2)、Mid、およびC末端PIWIドメイン(英語版)の6つの特徴的なドメインをコードする。
PAZドメインの名称は、このドメインが保存されていることが最初に認識されたショウジョウバエのpiwi、シロイヌナズナのargonaute-1、シロイヌナズナのzwille(poinheadとも呼ばれ、後にargonaute-10と改名)の遺伝子名から作られた頭字語である。PAZドメインは、siRNA、miRNA、piRNA(英語版)の一本鎖3′末端を、配列に依存せずに認識するRNA結合モジュールである。
ショウジョウバエのPIWIタンパク質は、この特徴的なモチーフにその名前を与えた。構造的にはRNaseHに似ており、PIWIドメインは標的の切断に不可欠である。アスパラギン酸-アスパラギン酸-グルタミン酸の三徴候がある活性部位は、触媒作用に必要な2価金属イオンを内部に持つ。進化の過程でこの保存された特徴を失ったAGOファミリーメンバーは切断活性を持たない。ヒトのAGOでは、PIWIモチーフはPIWIボックスでタンパク質間相互作用も媒介し、RNase IIIドメインの1つでDicerに結合する。
PIWIドメインとMidドメインの境界には、機能的に不可欠であることがわかっているsiRNA、miRNA、piRNAの5′リン酸が存在する。Midの中にはMCモチーフがあり、これはeIF4Eに見られるキャップ結合構造モチーフを模倣するために提案されたホモログ構造である。その後、MCモチーフがmRNAのキャップ結合には関与していないことが判明した。