松本電鉄バス
松本、白馬、大町、浅間、新島々(5拠点)
松本上田線(現在は、錦部口 - 上田が廃止され、残存区間は四賀線に編入されている) (含保福寺線) 松本駅 - 錦部口 - 召田 - 会吉 - 上田駅
1984年(昭和59年)9月1日現在の時刻表では、松本バスターミナル - 会吉間に短縮されていた。
現在は途中のルートや途中の停留所が完全に違うものの上田松本直行バスが運行している。
美ヶ原高原線 松本バスターミナル - 美ヶ原温泉 - 浅間温泉 - 美鈴湖 - 武石峠 - 美ヶ原高原
アルピコ交通のHPに時刻表の掲載がされていない。
現在は松本市内にあるタクシー会社が松本駅アルプス口発着でほぼ同じルートで運行している。
林・橋倉線【全廃】 松本駅 - 林 - 橋倉
1984年(昭和59年)9月1日現在の時刻表には、掲載されていない。
入山辺・扉温泉線(大和合 - 扉温泉間が廃止され、残存区間は入山辺線と呼ばれていたが、2017年3月末をもって廃止) 松本バスターミナル - 三反田 - 大和合 - 扉温泉
駒越線【全廃】 松本駅 - 入山辺出張所 - 駒越
入山辺線
[→大和合行き51・三反田行き52] [←50](2009年12月15日までは[→大和合行き71・三反田行き72] [←70]) 松本バスターミナル - 東町 - 惣社(そうざ) - 入山辺出張所前 - 美ヶ原高原口 - 三反田組合前 - 大和合
[→53] [←50] 松本バスターミナル - 東町 - 惣社(そうざ) - 入山辺出張所前 - 美ヶ原高原口 - 舟付橋 2009年12月16日から舟付橋折り返し便が新設され、美ヶ原高原口 - 大和合間は土休日全便運休となった。2017年3月31日の運行を最後に廃止。
[→75] [←10] 松本バスターミナル - 鎌田 - 高宮南 - 大久保工場公園 - 管理会館
松本バスターミナルから高宮南まで空港・今井線と同じルートを通り(実際の分岐は石芝町バス直前の交差点)、自衛隊松本駐屯地の横を通って大久保工場団地内の管理会館に至る路線。運行本数は1日2往復、土曜休日運休。
独立した路線ではあるが途中まで経路を同じくする空港・今井線の支線的な位置付けとなっており、同路線と一体で運行されている。
朝は大久保工場団地線として管理会館まで運行し、管理会館からは空港・今井線として神林高速バス停を経由し松本駅方面へ戻る変則的な環状路線である。
夕方はこの逆方向で運行するが、空港・今井線の神林高速バス停行きとして運行したあとそのまま管理会館まで運行、大久保工場団地線として大久保工場公園を経由して松本駅方面へ向かう。このときバス側面の案内表示には管理会館が表示されている。尚、神林高速バス停とはいうものの降車ボタンが押されなければそのまま管理会館へ直行する。
2008年12月15日までは、 松本バスターミナル - 鎌田 - 高宮南 - 石芝町- 下二子 - 下神東 - 水代橋
アルペン長野号
アルペン松本号 阪急観光バス(大阪営業所)と共同運行
アルペン諏訪号
大阪 - 新宿・渋谷・池袋線 USJ - 阪急梅田 - 新大阪 - バスタ新宿 - 渋谷マークシティ - 池袋駅東口(京王バスと共同運行)
さわやか信州号 大阪 - 上高地線 大阪 - 白馬線
スノーマジック号 大阪 - 白馬線
利用客の減少に伴う路線網の縮小と共に、拠点の統廃合が断続的に行われている。
運賃は200円(2014年3月31日までは190円)の均一運賃となっている。 以前は東回り・西回り共にバスターミナル北(当時は松本駅前)発着で、2012年3月16日のダイヤ改正時に東回り・西回り共に松本駅(お城口)発着に変更されている。 2014年10月1日から西回りの経路が一部変更され、信大病院玄関前を経由するようになった。これとともに、西回りは全便が松本駅止になり、松本駅(お城口)を跨いでの乗車はできなくなった。(東回りは、アルピコ交通の公式ウェブサイトに掲載されている時刻表において、行先欄に「駅止」と記載されている便以外は松本駅(お城口)を跨いでの乗車は可能である。かつて(90年代後半ころまで)は前面方向幕に「[北市内]東回り駅止」と記載されており、バスを見ただけでわかるようになっていたが、現在のLED表示は駅止の便もそうでない便も共通である。)北市内線とは別に南部へ向って戻ってくる南市内線もあった。 平均乗車密度:5.35人、損益分岐点:6.56人。
塩尻市内は山塩線を除く廃止バス路線は塩尻市が引き継いだ。
小曽部線【全廃】 塩尻(営) - 塩尻駅口 - 原口 - 学校前 - 金山 - 大沢口
平成8年6月15日限りで廃止。
塩尻御馬越線【全廃】 塩尻(営) - 塩尻駅 - 小野沢 - 御馬越
1984年(昭和59年)9月1日現在の時刻表には、掲載されていない。
岩垂・今井線【全廃】 塩尻(営) - 塩尻駅 - 岩垂 - 下今井 - 松本駅
1984年(昭和59年)9月1日現在の時刻表では、下今井 - 塩尻(営)間に短縮されていた。1988年(昭和63年)3月31日限りで廃止。
奈良井線【全廃】 塩尻(営) - 塩尻駅口 - 洗馬駅前 - 本山上町 - 日出塩 - 贄川駅前 - 贄川役場前 - 奈良井駅前 - 栃窪 - 薮原駅
1984年(昭和59年)9月1日現在の時刻表では、塩尻(営) - 塩尻駅 - 日出塩間に短縮され、日出塩線と呼ばれていた。