AEKアテネFC
ヨアンニス・オッカス 2003-2004
ニコス・リベロプーロス 2003-2008
リバウド 2007-2008
モハメド・カロン 2008
ネーメト・クリスティアーン 2009-2010
タクシアルヒス・ファウンタス 2011-2013
エルデル・バルボーザ 2014-2016
ラザロス・フリストドゥロプーロス 2016-
ウーゴ・アルメイダ 2016-
トマーシュ・ペクハルト 2016-2017
↑ “OPAP Arena” (English). aekfc.gr (2022年10月11日). 2023年4月4日閲覧。
↑ “ΑΠΟΚΑΛΥΨΗ: Στην Ένωση Φίλων ΑΕΚ, το 45% των μετοχών της ΠΑΕ!”. aek-live.gr. 2017年1月4日閲覧。
2012-13シーズンは、外国人選手を大量放出し、国内選手中心としたチーム編成が裏目となり、開幕から低迷を続けた。2013年4月14日に行われたパンスラキコスFC戦では終了間際にゴールを奪われたことに腹を立てたサポーターが暴動を起こし、試合が中断。後日、没収試合となるとともに、3ポイントの勝ち点減点処分も下された。その結果、残留圏内と5ポイント差となり、クラブ史上初の降格が決定した。本来であれば2部である「ギリシャ・フットボールリーグ」に降格するところであるが、クラブの財政面の問題から、2階級降格となり、2013-14シーズンは「ギリシャ・フットボールリーグ2」に降格となった。
3部からの再出発となった2013-14シーズンは23勝3分1敗の成績を収め2部に昇格。続く2014-15シーズンも22勝2分けで優勝を果たし、最短の2年でトップリーグへと復帰を果たした。
1部復帰の2015-16シーズンにはカップ戦を制覇し、2017-18シーズンは24年ぶり12度目となるギリシャ・スーパーリーグ制覇を果たし、オリンピアコスのリーグ8連覇を阻止した。