別府市立別府商業高等学校
吹奏楽部 - 第28、29回全国高校総合文化祭吹奏楽部門参加 バトン班
美術部
放送部 新聞部会
インターアクト部
書道部
会計科 - 2クラス80名
情報処理科 - 1クラス40名(2012年度(平成24年度)入学生までは2クラス80名)
野球部
サッカー部
バレーボール部
バスケットボール部
テニス部
陸上競技部
フェンシング部 - 世界大会へ出場
弓道部
バドミントン部
自転車競技部 - アジアジュニア選手権で2種目個人優勝
ボウリング部