スーパーウィード
また専門家からは抑制は困難であるとの指摘も出ている。対策としては無農薬栽培を選ぶか、除草剤の量を更に増やして抑制の発現を待つかのどちらかとなる。
こうした中で2014年1月、同じく除草剤と遺伝子組み換え作物を手掛けるダウ・アグロサイエンス(英語版) が、新たな種子の登録と薬剤の規制緩和を米農務省に求めている。これはグリホサートに耐性を持つとされる種子であるが、新たに「2,4-D」の薬剤を除草剤として使用するものである。しかし、「2,4-D」の安全性を危惧する声や、新しい薬品を取り入れてもグリホサートのように、いずれ耐性を持つ新たなスーパーウィードの発生を懸念する声が挙がっている。
また、2015年3月には世界保健機関によりグリホサートの曝露による、非ホジキンリンパ腫発症増加の因果関係が発表されているが、アメリカ合衆国連邦政府は大豆の主要な輸出先である中華人民共和国に対して、遺伝子組み換え作物の禁輸措置に対する規制の撤廃を求めている。