1596年
7月 - 日本の関東などで洪水が発生。荒川では100年に1度といわれる大洪水が起きた。浅草で死者約300人。
9月1日-5日(文禄5年閏7月9日-13日) - 慶長伊予地震、慶長豊後地震、慶長伏見地震(改元前の文禄5年の出来事、慶長大地震も参照)
10月19日 - サン=フェリペ号が四国土佐沖に漂着(サン=フェリペ号事件)
12月16日(文禄5年10月27日) - 日本、地震などの災異のため改元して慶長元年