魚沼市
南越後観光バス(越後交通グループ)一社が市内外各路線を運行している。多区間制(整理券方式)で、後乗り前降り・後払い方式である。また、エリアによってフリーパス運転(バス停以外の場所からでも乗降が可能)を行っている。市内を含め南越後観光バスエリアでは、乗車カード等は導入されていないため、現金又は回数乗車券での支払いとなる。
旧小出町発着路線の一覧については、小出駅#バス路線を参照。その他の路線を以下に掲載する。
奥只見方面急行バス UD 浦佐駅東口 - シルバーライン - 大湯温泉 - 栃尾又温泉 - (銀山平) - 奥只見ダム 夏の観光シーズンのみ運行。尾瀬口方面の定期船へ連絡し、桧枝岐を経由して会津鉄道の会津高原尾瀬口駅まで周遊可能となっている。
コミュニティバス・乗合タクシー 市によって市内諸地域に乗合タクシーが設定されているほか、定期路線として小出まちなか循環線(コミュニティバス)が運行されている。なお、合併前から入広瀬村内では旧村内を循環する「循環バス(合併後は市営通学福祉バスとして)」がマイクロバス等を使用し運行されていた。
合併前から旧堀之内町・旧小出町では必要だったが、旧湯之谷村・旧広神村・旧守門村・旧入広瀬村では合併して魚沼市になった現在でも現住所・保管場所両方が旧村域であれば不要である(元々2000年6月1日時点で村であった地域は今後法改正が行われるまで不要。因みに旧小出町と旧湯之谷村、旧堀之内町と旧広神村のそれぞれ一部地域で旧町村境界線が入り組んでいるため、住民の中には保管場所が旧村域でも住居が旧町域であるため必要になる。また、合併前に車庫証明を申請・交付を受けている車両は、交付された保管場所標章の都道府県・市町名欄には旧村が記載されている)。
観光タクシー
さわやかタクシー(奥只見タクシー)
小出タクシー
ひかり交通(旧堀之内タクシー)
雪国タクシー
魚沼市立入広瀬幼稚園
学校法人竜谷学園めぐみ幼稚園
国道17号
国道252号 六十里越・六十里越トンネル
国道289号
国道290号
国道291号 中山隧道
国道352号 枝折峠
国道252号・国道352号は豪雪のために県境付近は冬季閉鎖される。この他、国道17号では浦佐バイパスが虫野地区から南魚沼市市野江甲まで建設計画され、一部(浦佐地区)で完成・供用されている。