ファフナー (架空の兵器)
機体色は各パイロットの適性検査時に判明する心理的識色(心の色、あるいはイメージカラー)によって決まる。
各機体の左膝とスタビライザー左側にドイツ語読みと同じローマ数字で型番が書かれているが、これはかつて近藤彩乃がオーストリアでファフナーの研究をしていたため、各機体に割り振ったドイツ語のナンバーがそのまま定着したことによる。 ファフナー・Mk.I(マークアイン) 搭乗者:皆城総士(RIGHT OF LEFT)→日野道生(23話) マークツヴァイ・ドライ・エルフ(およびツヴォルフ)と同型の汎用格闘型。塗色はシルバーグレー。 一期第23話で、アクティビオンを投与してファフナーへの一体化を強化した道生が搭乗。イドゥンを道連れにするためフェンリルを起動し自爆。その時に道生は脱出をイドゥンに阻まれ戦死している。道生の搭乗時はガルム44とロングソードを使用する。 『RIGHT OF LEFT』では起動実験のため皆城総士が搭乗しているが、見えないはずの左目が見えてしまう事を総士が許容できず、実験は中止された。 ファフナー・Mk.II(マークツヴァイ) 搭乗者:蔵前果林 マークアイン・ドライ・エルフ(およびツヴォルフ)と同型の汎用格闘型。塗色は濃紺。 一期第1話で搭乗者が搭乗前に生死不明になり、大破したマークエルフ修復のためにパーツが流用されたため、「蒼穹のファフナー」本編では一度も戦闘に参加していない唯一のノートゥングモデルである。
ドイツ語のザイン (sein) 、ニヒト (nicht) はそれぞれ英語の"be", "not"に相当し、「 - である(存在)」「 - ない(否定)」を示す。
ザルヴァートル (Salvator) は“救世主”を表すラテン語、“salvātor”のドイツ語読み。
グノーシス (Gnosis) はギリシャ語で知恵の意。グノーシス主義の流布と共に各国の言語に取り入れられている。
メガセリオン (Mega Therion) 、ベイバロン (Babalon) は、共にヨハネの黙示録からの引用。
ノートゥング (Nothung) は「ニーベルングの指環」に登場する霊剣の名前。作品によってはグラム、バルムンクとも呼ばれる。
デュランダル (Durandal) は「ローランの歌」に登場する霊剣の名前。
リントヴルム (Lindwurm) はドイツやスカンディナヴィアに伝わる伝説上の竜から来ているが、機体形状から「ドイツの伝承に出てくる『二本足の翼竜』」にちなんでいる。
ファフナー(ファフニール、Fafnir)、イドゥン (Idun) とミョルニア(ミョルニル、Mjollnir)、ガルム (Garm) 、フェンリル (Fenrir) 、エインヘリヤル (Einherjar) は北欧神話からの引用。ファフニールは「ニーベルングの指環」では巨人ファフナー(Fafner)として登場し、英語表題はこれと同じ「Fafner in the azure」と綴られている。
ティターン (Titan) はギリシア神話、ローマ神話にある巨神族の名前。
しかし島にフェストゥムが来襲しジークフリード・システムが起動された際にパイロット未搭乗の状態でシステムにクロッシング要請信号を発するなど、不穏な行動を見せる。
『EXODUS』時点での人類軍ファフナーパイロットにも「まともに戦えば絶対に勝てない」と認知されているうえ、後発機体であるエインヘリアル・モデルをも凌ぐ最強の機体である。 ファフナー・Mk.Sein(マークザイン) 搭乗者:真壁一騎(無印15話 - EXODUS)→日野美羽(THE BEYOND)
日野洋治とミツヒロが開発した新型ファフナー。機体の特性から暴走した時の為にノートゥング・モデルの3倍の自爆用フェンリルを搭載されている。建造当初の塗色は緑がかった白。ミョルニアによって真壁一騎に託される。初期は背部に翼状のアンカーユニット(同化ケーブル)とホーミングレーザー発振器を装備していたが、コアの単独再生(ザルヴァートル化)に伴い背部の装備が消え、開発時よりもシンプルかつスリムな形状に変化した。それ以降、フェストゥムの同化に対する耐性や機体の自己修復、また手にした武器を同化することで莫大なエネルギー増幅とそれに耐える構造強化が可能になった。表面も光沢のある銀白色になっている。 主に手にした武器を同化し威力を大幅に上昇させることによって戦闘を行う。その際は武器を握る手首部分が結晶化する。 プレアデス型との戦闘後は、同化したルガーランスの二刀流を主に使用する。 従来のファフナー(ノートゥングモデル)は「違う自分になる」ことで操縦が可能であるが、この機体は「違うモノ」にならないと同化機能を発揮できない(たとえば「腕が銃になる感覚を受け入れられるか」といったところ)。
ゲーム版のみ登場。マークザインとゲームに登場するマークニヒトが装備している。使用時は緑に光り同化した状態の右拳から生えてくる。別の武器を選択すると収納される。デザインがあるがマインブレードやルガーランスとは決定的に異なる。
なお、一期第17話におけるカノンの説得時にマークザインが前腕部の装甲を鋭利な形状に変形・延長させているが、これと同一のものなのかは不明。