マカヒキ (競走馬)
休養を挟み、前年と同じ武の騎乗で天皇賞(秋)(東京芝2000メートル、GI)に出走。この競走は、前年の三冠牝馬・アーモンドアイなど10頭のGI馬が出走する豪華メンバーとなった。マカヒキは単勝8番人気で出走し、10着に敗れた(詳細は第160回天皇賞を参照)。
次走はジャパンカップ(東京芝2400メートル、GI)に出走。年下の東京優駿優勝馬・レイデオロやワグネリアンらとの対戦となったが、ここでも重賞未勝利のエタリオウやジナンボーより下の単勝12番人気に甘んじる。しかし、最後方からレースを進めると上がり3ハロンをメンバー最速で脚を伸ばし、4着に入った。前走に引き続き騎乗した武は「狙い通り。これしかないと思っていました。最後はしっかり脚を使って、復活の兆しが見えました」とコメントした。
ジャパンカップの後は同厩舎のワグネリアンらと同じく、年内は休養することが決まった。
天皇賞(秋)
2015年10月18日、京都競馬場芝1800メートルの新馬戦で、ミルコ・デムーロの騎乗でデビュー。単勝1番人気に応えて快勝した。直線半ばで勝利を確信したデムーロが、ゴールする前に馬の頭を撫でる余裕を見せた。次走に注目が集まったが、鼻出血を発症していたことがレース後に判明したため、止むを得ず放牧に出され次年に備えることとなる。
2016年の初戦は若駒ステークス。この競走からクリストフ・ルメールに乗り替わった。8頭と少頭数での競走となったが、中団後方待機から直線で抜け出し、2着に1馬身1/4差をつけて優勝した。
次走は、「強い相手とやりたい」という金子真人オーナーの意向も受け、重賞初挑戦となる弥生賞(中山芝2000メートル、GII)に出走した。この競走では、前年の朝日杯フューチュリティステークスの1着、2着馬であるリオンディーズ、エアスピネルとの対戦となった。単勝人気はリオンディーズ(1.9倍)、マカヒキ(2.6倍)、エアスピネル(4.2倍)の順で、4番人気は20.8倍であった。レースでは、リオンディーズ、エアスピネルを前に見る形で後方を進み、最後の直線で先に抜け出したリオンディーズにクビ差をつけて優勝、レースレコードで無傷の3連勝を飾った(詳細は第53回弥生賞を参照)。
クラシック三冠の1戦目となる皐月賞(中山芝2000メートル、GI)では、きさらぎ賞に優勝し3戦3勝で臨んできたサトノダイヤモンドと、リオンディーズ、マカヒキが新たに「3強」と評された。この競走ではルメールがサトノダイヤモンドに騎乗したため、マカヒキは川田将雅を鞍上に迎えた。