原始キリスト教
日本では社会的な議論となった小学生の両親による輸血拒否死亡事件や、信徒の戸別訪問による伝道などによって広く知られる。キリストの磔刑について、十字架刑であったという考古学的証拠が多数発見されているにもかかわらず、十字架の形状を否定し「一本の杭(苦しみの杭)」であったとするなど、独自の教理を持つ。
イエス之御霊教会は日本発祥の教団である。キリスト教の三位一体説に依らず、唯一の神イエス・キリストの中にその父と聖霊が存在すると説き(これをワンネス(神学)と言う)、聖書絶対主義の立場からカトリックもプロテスタントも偽りの教会で、イエス之御霊教会こそ唯一の教会であると主張する。
その他の新興プロテスタント勢は伝統教会と同じく三位一体など基本信条を告白するため、異端とはされないものの、やはり伝統教団勢を堕落と見なすことが多い。結果として伝統教団とはあまり友好関係にはないことが多い。