爬虫類
竜弓類 Sauropsida 中竜類 Mesosauria 爬虫綱 Reptilia 無弓類 Anapsida - 絶滅 ミレレッタ類 Millerettidae パレイアサウルス類 Pareiasauridae Procolophonoidea 双弓類 Diapsida 細脚類 Araeoscelida - 絶滅 魚竜類 Ichthyosauria - 絶滅 竜類 sauria 鱗竜形類 Lepidosauromorpha 鰭竜類 Sauropterygia - 絶滅 板歯類 Placodontia 偽竜類 Nothosauria 首長竜類 Plesiosauria 鱗竜類 Lepidosauria ムカシトカゲ類 Sphenodontia 有鱗類 Squamata 主竜形類 Archosauromorpha プロラケルタ類 Prolacertiformes - 絶滅 リンコサウルス類 Rhynchosauria - 絶滅 トリロフォサウルス類 Trilophosauria コリストデラ類 Choristodera 主竜類 Archosauria クルロタルシ類 Crurotarsi 偽鰐類 Pseudosuchia 植竜類 Phitosauria - 絶滅 ワニ類 Crocodilia 鳥頸類 Ornithodira 翼竜類 Pterosauria - 絶滅 恐竜類 Dinosauria - 鳥類以外絶滅 鳥盤類 Ornithischia 竜盤類 Saurischia 竜脚類 Sauropodomorpha 獣脚類 Theropoda 鳥綱 Avialae
爬虫類の取り扱いは、上の分類にしたがっている。
爬虫類の分類上の取り扱いには、難しい問題がある。これは、生物の分類を「共通の祖先を持つグループごとの単位」(単系統群)に分類していくべきであるとする考え方に対応して発生した。地球の歴史の中で爬虫類の祖先を考えたり、現生種の遺伝子を分析しそれぞれの種がどのぐらい離れているか(遺伝的距離)を推定する研究から、爬虫類の一部のグループ(恐竜)から鳥類が分かれたことが明らかになってきている。これを根拠に鳥綱とそこに含まれる全ての目を廃止し、その全てを竜盤目獣脚亜目に分類し直す説が出てきている。