週刊ヤングサンデー
ヤングサンデーコミックスのワイド版。
1分16秒08(村生ミオ)
いらっしゃ〜せ(よしだゆうすけ)
いぬ(柏木ハルコ)
部屋においでよ(原秀則)
海猿(佐藤秀峰)
NG(山田玲司)
ANGEL(遊人)
おカマ白書(山本英夫)
おかわり飯蔵(原作:魚柄仁之助 作画:大谷じろう)
おしゃれ手帖(長尾謙一郎)
小田原ドラゴンくえすと!(小田原ドラゴン)2003年7・8合併号 - 2008年34号、後期にはケニー笹原(元アシスタント)の「おまけマンガ」も掲載
Odds -オッズ-(石渡治)第一部:2006年14号 - YSSP VOL.1、番外編:YSSP VOL.2 - VOL.5→『漫画アクション』にて『Odds GP!』のタイトルで続編を連載
同じ月を見ている(土田世紀)
オーバーレブ!(山口かつみ)
おやすみプンプン(浅野いにお)2007年15号 - 2008年35号→『BCSpi』に移籍
お笑いの神様(原作:ダンカン 作画:松浦聡彦)
SURF SIDE HIGH-SCHOOL(澤井健)
最強野球部リベンジャーズ(平松真)
桜通信(遊人)
さくらんぼシンドローム クピドの悪戯II(北崎拓)2006年34号 - YSSP VOL.5
SOMEDAY(原秀則)
THE 山田家(阿部潤)
ザ・ワールド・イズ・マイン(新井英樹)
G(原作:武論尊 作画:原秀則)
シーソーゲーム(原秀則)
資格救世主てつんど(高橋のぼる)
事務員A子(西森博之)2006年14号 - (不定期連載)
下北GLORY DAYS(大谷じろう)
純ブライド(吉田聡)
JULIET(遊人)
ショートカッツ(古屋兎丸)
すくすく(コージィ♡城倉)
Stopナデシコさん(本多健志)
SPEED(原作:金城一紀 作画:秋重学)
青春くん(とがしやすたか)1989年11号 - 2006年53号 新 青春くん 2007年1号 - 2008年35号→終了扱いながら『ビッグコミックスペリオール』で「大人の青春くん」が開始され実質的に移籍
SIREN(村上もとか)
せかいイチ!(国友やすゆき)
SEX(上條淳士)
絶望に効くクスリ(山田玲司)2003年38号 - 2008年35号:休刊に先駆け、『BCSpi』2008年34号より『ココナッツピリオド -地球温暖化を止めるウサギ-』の連載を開始。
ソラニン(浅野いにお)
そして、退任後に人気となったのは『RAINBOW-二舎六房の七人-』『クロサギ』『土竜の唄』など、やはり不良性感度高めの作品であった。
2008年5月19日、小学館は『ヤングサンデー』について将来的な経営判断に基づいて休刊を視野に入れていることを明らかにし、同年35号をもって休刊することを正式に発表した。そして7月31日発売の2008年35号(22巻33号、通巻1162号)を持って休刊。『マンガくん』時代から数えて31年に及ぶ歴史に幕を下ろした。連載作品の半数は『週刊ビッグコミックスピリッツ (BCSpi) 』に移籍し、残り半数を『BCSpi』の増刊号として発行される『YSスペシャル(YSSP)』に移籍させた。またアイドルグラビア写真の有料サイト『ヤングサンデービジュアルウェブ』は『ビジュアルウェブS』(2021年9月30日サービス終了)に改名された。
「創刊○○周年記念号」等の記念号は通常『ヤングサンデー』になってからの起算で発行されたが、上述の通り通巻は『マンガくん』から継続されているため「通巻○○号記念号」については『マンガくん』創刊からの起算で発行された。そのため、創刊記念号は『ヤングサンデー』の歴史しか振り返らないのに対し、通巻記念号は『マンガくん』や『少年ビッグコミック』時代の歴史も振り返ることがあった(大きな節目の場合に限る)。