雲居寺 (京都市)
『蔭涼軒日録』同年7月28日条に、大仏の光背と光背の仏像の製作は、京都の諸仏師に配分して製作させる旨の伺いがなされたとあり、同年10月15日条「雲孤寺脇尊二本、柱前如旧可安之由被仰出」とあり、新しく造像した脇侍2体を、焼失前と同じ位置に安置するよう義教が命じたとある(上記の記述から、雲居寺大仏は初代・2代目共、阿弥陀如来[大仏]一尊、脇侍二尊の阿弥陀三尊形式であったことが分かる)。新しく造像された仏像には、脇侍のほか、仁王像や、日本では珍しい涅槃像も造像されていたことが『蔭涼軒日録』から確認できる。『蔭涼軒日録』嘉吉元年(1441年)6月14日条には雲居寺の再建が完了し、義教に披露されたとある。しかしその10日後の6月24日に、義教は赤松氏に謀殺された。
なお京都の十念寺の阿弥陀如来像は、雲居寺から移したものとの伝承があるが、雲居寺には大仏殿とは別に極楽堂という堂があり、それも焼失したので、そこに安置されていた阿弥陀如来像を足利義教が遷座させた可能性を、歴史学者の川勝政太郎は指摘している。
義教の再建した2代目大仏は、落慶から二十数年後に発生した応仁の乱で焼失した。『応仁記』には、応仁の乱で焼失した寺院が記述されているが、雲居寺も名が挙がっており、「雲孤寺と申すは奈良半仏尊の像、雲を穿つ大伽藍」と記されている。
応仁の乱から約130年後の京都には、豊臣氏によって方広寺大仏(京の大仏)という別の大仏が造立された。雲居寺の旧境内には秀吉の正室高台院の意向で、高台寺が創建された。