アイメリア科
胞子虫のなかでも代表的な一群で、古典的には原生動物門胞子虫綱球虫目に所属させていた。アイメリア科はおよそ1500種を擁する巨大な分類群であるが、分子系統解析によっても比較的安定なクレードを形成している。
下位分類は「胞子」(オーシストやスポロシスト)の構造に注目して以下の各属に分ける。
この分類体系が生物の系統を反映しているかははっきりしないが、少なくともイソスポーラ属やサイクロスポーラ属はアイメリア属に内包されることが判明している。