ストーンウォール・ジャクソン
ジャクソンの遺体はリッチモンドへ移送された後、レキシントンのストーンウォール・ジャクソン記念墓地に埋葬された。南部ではジャクソンは大変な尊敬を受け、多くの人がその死を悲しんだ。戦後、妻のマリー・アンナはジャクソンに関する本を出版し、彼の人柄が世に知られることになった。マリー・アンナは「南部連合の未亡人」とも呼ばれ、1915年に亡くなった。
ジョージア州のストーンマウンテンにはデービス、リーと共にジャクソンのレリーフが彫られ、他にも多くの場所に像が建てられている。ウェストバージニア州にはジャクソンの名を冠したストーンウォール・ジャクソン州立公園がある。付近にはジャクソンが少年時代を過ごした農場の一部が現在も保存されており、ジャクソンズミルと呼ばれている。
アメリカ海軍は「ストーンウォール・ジャクソン」という名の艦を3代目まで保有していた。第二次世界大戦中には「T.J.ジャクソン」というリバティ船も建造された。南部連合がフランスに発注して建造された装甲艦「ストーンウォール」は、南北戦争では活躍することができなかったが、その後明治政府へ売却され、戊辰戦争の宮古湾海戦などで活躍している。
ジャクソンの誕生日は、現在バージニア州では「リー・ジャクソン・デー」という州の祝日となっている。
M36ジャクソン駆逐戦車の名前の由来でもある。
アーネスト・ヘミングウェイの小説『河を渡って木立の中へ(英語版)』は、ジャクソンの最後の言葉からタイトルを取っている。