ぷよぷよ通
『す〜ぱ〜ぷよぷよ通』として1995年12月8日発売。前作と同様に画面解像度が異なる事情から、画面レイアウトがスーパーファミコン版独自のものとなっており、『ひとりでぷよぷよ』における対戦相手のグラフィックはCPU側のフィールド内に表示される。「おぷしょん」での独自要素として、下の方に字幕で設定項目の解説が流れるようになっている。従来のモードに加え、セガサターン版とは内容が異なる新規デモ付きの練習モード「やさしいぷよぷよ」も用意されており、それぞれに新規のエンディングデモも用意された。マルチタップを使用することで「みんなでぷよぷよ」での4人対戦が可能であり、ゲームギア版のような小さなグラフィックを使用した独自のレイアウトを採用している。さらに、「おぷしょん」の隠し項目で2人以下でもコンピュータとの擬似対戦が可能で、この場合はコンピュータが操作するキャラクター(思考ルーチン)を選択できる。 ボイスは基本的にセガサターン版の流用だが、6体のキャラクターのみアーケード版のボイスを使用している。「とことんぷよぷよ」では設定によりおじゃまぷよを降らせることも可能で、前作同様のお助けアイテム(びっぐぷよ、カーバンクル)の有無と共にそれぞれ変更することができる。「ふたりでぷよぷよ」のハンディキャップ設定は、アーケード版に準拠している。 サテラビューにて体験版(おためしバージョン)も配信され、こちらは製品版の「ふたりでぷよぷよ」をベースに1人で対CPU戦か2人対戦をプレイすることができた。 また、2019年9月6日配信開始の『スーパーファミコン Nintendo Switch Online』(Nintendo Switchのオンラインサービス特典ソフト)にも本作が収録された。
2015年12月23日に発売されたニンテンドー3DS用オムニバスソフトセガ3D復刻アーカイブス2には、収録ソフトの1つとしてアーケード版『ぷよぷよ通』の3D立体視化移植版が収録されている。 内容は基本的にアーケード版準拠だが、『セガ3D復刻プロジェクト』(S3DRP)シリーズでおなじみとなっているキーコンフィングや難易度設定などを変更できるようになり、ソフトと3DS本体を2セット持ち寄ってのローカルプレイによる対戦も可能となっている。本作はオリジナルにあった乱入機能が削除されており、これに伴いルール説明から「乱入のひみつ」の部分がカットされている。さらに、モードの選択も新たに追加されたメニューで選べるようになったことに伴って、ゲーム開始時のエントリー画面もカットされている。 欧米版『Sega 3D Classics Collection』ではゲーム選択時のみ「PuyoPuyo2通」の専用ロゴで表示されているが、ゲーム本編自体は日本版と同じく日本語表示のままの移植となっている。操作説明パネルは英訳されており、電子説明書のキャラクター紹介などは独自に英語で書かれたものとなっている。
また、『セガ3D復刻アーカイブス2』収録版をベースにした単体販売版『3D ぷよぷよ通』が2016年8月3日に日本国内のみで配信。同作では、他機種の「通モード」に相当する「かちぬき」モードが収録されている。こちらもローカルプレイに対応しており、『復刻アーカイブス2』版と単体版での対戦も可能。
各階層の規定点はアーケード版と同様だったセガサターン版とは異なりゲームギア版をベースに3階と5階のみ若干引き下げられた仕様に変更され、6階でマスクドサタンを出現させるための規定経験値が23万EXPに上げられている。BGMはPSアレンジ版とアーケード版を「おぷしょん」で切り替えることが可能。映像特典として、本作のCMと「ハイテク攻略法」を収録。
2000年3月30日には廉価版「PlayStation the Best」として再発売された。また、2017年9月27日にはセガゲームスからPlayStation StoreよりゲームアーカイブスとしてPlayStation 3・PlayStation Portable・PlayStation Vita向けに配信が開始された。PSP・PS Vitaでは一人プレイ専用となる。
SEGA AGESの一環としてアーケード版をNintendo Switchへ移植するにあたり、色覚異常のあるユーザーでも楽しめるよう、セガ社内の当事者の監修を受けた上で、ぷよの色を変更できるモードや、背景の明度のみを下げる機能が追加されたほか、ぷよごとに形状を設定することも可能となった。Game Watchとのインタビューの中で、SEGA AGESのリードプロデューサー兼ディレクターの小玉理恵子は「レトロゲームの復刻という性質上、パレットは大きな課題であり、例えばグラフィックの赤い部分を違う色に置き換えたくても、置き換えたい色がパレットに含まれていないということがあった」と説明しており、同プロジェクトのシニアプロデューサーである奥成洋輔も「(Switchは)アーケード版の基板であるC2ボードやメガドライブよりもパレット数が多いハードだからこそ、パレットの課題を克服できた」と述べている。また、本作のスタッフロールは映像を含めてコンパイルの関係者の協力を得て新規に作られた。
基本的に全機種でプレイ可能な標準のモード。機種によってモード名が「ふつうのぷよぷよ」「アーケードモード」など異なる場合がある。6階建ての塔の中にいる33体のキャラクターと対戦していき、塔の頂上を目指すという設定となっている。セガサターン版とAndroid版を除き1-5階の対戦相手はルーレットによる選択制だが、6階は下の表の左から順に3人全てと戦う。
各階のキャラクター群にはそれぞれ名称が存在し、塔の最下層から順に「八部衆」、「六歌仙」、「五人囃子」、「四天王」、「噂の二人」、「例の三人」となっている。「例の三人」以外はすべてのキャラクターと対戦する必要は無く、敵に勝利した時点で経験値(実際の総得点とは異なり、ボーナス点や切り捨てによる補正から求められる値)が決められた数値に達すると、その階層はクリアとなる。これに伴い、当モードをクリアするために必要なステージ数(対戦回数)はプレイヤーの実力によって変化し、最短で8ステージ、最長で33ステージとなる。
「例の三人」以外の階層において、階層中のすべての敵を倒しても経験値がノルマに達しなかった場合は「延長戦」に突入し、各階に用意されている延長戦用の隠しキャラクターと対戦する。