思春期遅発症
体重の少ない子供や病気の子供が思春期遅滞を呈した場合、思春期の一時的かつ可逆的な遅滞を引き起こす病気を探すべきであろう。鎌状赤血球症やサラセミア、嚢胞性線維症、HIV/AIDS、甲状腺機能低下症、慢性腎臓病、慢性消化器疾患(セリアック病や炎症性腸疾患など)等の慢性疾患では、脳の視床下部領域の活性化が遅れ、思春期を開始する信号を送る事が出来なくなる。
小児がん生存者は、がん治療による二次的な思春期遅延を示す事もあり、特に男子でその傾向が強い。治療の種類、薬剤の曝露量/投与量、および治療中の年齢によって、生殖腺にどの程度の影響を及ぼすかが決まり、若い患者ほど生殖への悪影響のリスクが低くなる。
また、過度の運動や身体的ストレス、特にスポーツ選手は思春期の開始を遅らせる可能性がある。神経性過食症や神経性無食欲症などの摂食障害も、栄養不足の為に思春期を損う場合がある。
体重を減らす為に炭水化物を制限した食事は、インスリンの刺激を減少させ、その結果、思春期開始ホルモンの放出に不可欠なキスペプチン(英語版)ニューロンを刺激しない事が示されている。この事から、炭水化物制限のある子供や1型糖尿病の子供は、思春期が遅れる可能性がある事が判明した。
卵巣や精巣(生殖腺)の一次障害では、HPG軸の最終受容体によるホルモン反応がない為、思春期が遅れる事になる。このシナリオでは、脳は多くのホルモンシグナル(高ゴナドトロピン)を送るが、生殖腺はそのシグナルに反応できず、高ゴナドトロピン性性腺機能低下症(英語版)を引き起こす。高ゴナドトロピン性性腺機能低下症は、先天性の欠陥または後天性の欠陥が原因となる。