ロックマン6 史上最大の戦い!!
最終ステージのボス。前作に登場したワイリープレスをベースにした対ロックマン戦用兵器。プレス部分が強化されたほか、エネルギー弾による攻撃も可能となっている。しかし、エネルギー弾発射時に移動が出来ないという欠点がある。第一形態からドクロが破壊された第二形態に変形。更に破壊されると脱出装置として第三形態のワイリーカプセルが機能し、ワイリーマシーン敗北時にはこれによって戦う。
池原しげとの漫画版ではワイリーカプセルは起動しなかった。シリーズ通してどこに攻撃してもダメージを与えられるワイリーマシーンはこの作品だけである。
大砲を飛ばせたらよいのでは? という発想から作られた飛行メカ。空中を上下移動し、爆発する砲弾を撃ってくる。
データ:身長177cm / 体重87kg / 攻撃力157 / 防御力71 / 機動力149
戦闘目的に開発されたロボットで、ネイティブ・アメリカンの戦士がモデル。死をも恐れぬ勇猛な性格の持ち主。高い攻撃力を誇り、右手に装備された100メートル先のろうそくの火を消せる斧・特殊武器「シルバートマホーク」と、その死角を補う羽飾りが武器。斧は射出攻撃(投げ斧)に特化しているため、接近戦は苦手。ネイティブ・アメリカンらしく、嘘をつかれるのを嫌う。
原案ハガキでの名前は「ジェロニモマン」でトマホークは腕に装着型ではなく握っている。
高速回転する斧を発射する。僅かに沈み込んだ後、逆放物線状に飛んでいくという独特の軌道を描くため命中させるには工夫が必要だが、威力は高く2連射まで可能。
ラッシュと合体し、空中でBボタンを押し続けることでジェット飛行装置による浮上が可能になる。合体中は体力ゲージの隣にエネルギーゲージが表示され、浮上している間は徐々にエネルギーを消費し、エネルギーが切れるまで継続可能。消費したエネルギーは着地するか、梯子に掴まることで徐々に回復する。なおスライディングとチャージショットは使用不可になる。
スイッチを押すと3秒後に爆発する時限爆弾。スカルウォーカーが誤って起爆させてしまうことが多いらしい。
ライト博士が作ったカブトムシ型ロボットだったが、ワイリーに改造された。突然茂みから出てきてロックマンを追いかける。
大気中の水蒸気を結晶させた氷弾をロックマンの背後に出現させ、正面に2発と斜め上下方向にそれぞれ1発ずつ、計4発同時に発射する。攻撃範囲は広いが、燃費の割に威力は低い。特定の敵を破壊できる。
水域防衛メカ。近づくと突然天井から落下し、水面に着水後、自爆して破片を上3方向に飛ばす。
シリーズの中では唯一、この作品には次回作(『ロックマン7』)に続く意味で『TO BE CONTINUED』と完結していない事を告知している(結末による誤解を招かない為とみられる)。
この作品では、同一場面に対するパスワードが何故か2種類存在する。この仕様は同時期発売の『ロックマンX』にも引き継がれている。なお、この二つの同じ効力を持つパスワードはステージクリア・ゲームオーバー時に条件は不明であるが、どちらか一方が表示される。
エネルギーバランサーの発表は本作が先だが、『ロックマンワールド4』で発売時期の早さにより先に登場している。
『ロックマン』・『ロックマン4』と同じく、8ボスを撃破している状態でもボス決定デモが発生する。また、ステージセレクトの中心にロックマンが表示されている状態で、そこにカーソルを合わせて決定しようとするとエラー音が鳴る。
ボス部屋が2つ存在するステージでは、パワーもしくはジェットを駆使しないと進めないボス部屋のルートがある。通常ルートのボスを撃破しても、もう一方の部屋(BEATプレートが得られる)に進んだ際再び対決する仕様になっている。なお、初めからBEATプレートを持っているボス側のルートでクリアすると再戦は起こらない。
本作では、ボス登場時に雷鳴が轟く演出がなされる。その反面、ボスが戦闘開始前に決めポーズを取らなくなった(決めポーズは、『7』以降では復活)。
シリーズの中では唯一、ワイリー基地が日本の城にドクロを組み合わせた外観となっている。