藤森神社
創建年代や祭神には諸説ある。社伝では、神功皇后摂政3年(203年)、三韓征伐から凱旋した神功皇后が、山城国深草の里の藤森に纛旗(とうき = いくさ旗)を立て、兵具を納め、塚を作り、祭祀を行ったのが当社の発祥であるとしている。当初の祭神は、本殿中央に祀られる7柱で、本殿の東には纛旗を立てたといわれる旗塚がある。
本殿は正徳2年(1712年)に中御門天皇より下賜された宮中賢所(内侍所)であり、現存する賢所としては最も古く、東殿・中央・西殿の三座から成る。
本殿中央には、元からこの地に祀られていた三韓征伐にまつわる7柱を祭る。
東殿は、天平宝字3年(759年)に藤尾(京都市伏見区深草藪之内町・稲荷山の麓)の地に崇道尽敬皇帝(舎人親王)を祀る神社として創建されたもので、元は藤尾社と称していた。永享10年(1438年)に後花園天皇の勅により、室町幕府第6代将軍足利義教が稲荷山の山頂にあった稲荷神の社を麓の藤尾に遷座(現 伏見稲荷大社)した。そしてその地にあった藤尾社を藤森に遷座させて本殿の東殿として祀ったといわれている。そのため、伏見稲荷大社周辺の住民は現在でも当社の氏子となっている。その際、元々当地藤森にあった真幡寸神社は現在地に遷座(現 城南宮)させたという。
西殿は、延暦19年(800年)に早良親王を祀る神社として塚本(京都市東山区本町16丁目 現在の東福寺近辺)の地に創建され、文明2年(1470年)に当社に合祀された。