バルト語派
しかし最近の研究では、統一されたバルト祖語の段階はなく、両祖語はそのまま3つのグループに分かれたと考えられている。すなわち、スラブ語・東バルト語・西バルト語である。この見解では、バルト語族は側系統群であり、スラブ語以外のすべてのバルト・スラブ祖語から構成されるとしている。このことは、すべてのバルト諸語の最後の共通祖先である原バルト語は、バルト・スラブ祖語と同一のものであることを意味する。1960年代、ウラジーミル・トポロフとヴャチェスラフ・イヴァーノフは、バルト語派とスラブ語派の関係について以下のような結論を出している。
スラブ祖語はバルト語派の方言から形成された
スラブ語の言語構造はバルト諸語の構造モデルから後に形成された
スラヴ語の構造モデルは、バルト諸語の構造モデルからの変容の結果である
これらの学者の論文は、バルト語とスラブ語の近接性を否定するものではなく、歴史的な観点からバルト語とスラブ語の進化を特定したものである。
また、バルト語はバルト・スラブ祖語の中間段階を経ずに、印欧祖語から直接派生したと主張する学者も少数派ながら存在する。彼らは、バルト語とスラブ語の間の多くの類似点や共通点は、共通の遺産というよりも、むしろグループ間の数千年にわたる言語接触によるものだと主張している。