COVID-19の検査
かかりつけの医者が検査が必要と判断した場合には、帰国者・接触者外来を紹介受診し、検査を行う。地域の検査能力に限界があるために断られるということがないようにするとし、同時に、検査時間を大幅に短縮できる新しい簡易検査機器の開発を進めていくと述べた。
また、厚生労働省は疑似症報告制度を採用している。この疑似症報告制度によるPCR検査実施人数には、退院時の確認検査や、疑似症報告に該当しない検査、クルーズ船やチャーター便に関する検査等は含まれておらず、実際の実施総数より少ないことに留意する必要がある。
3月27日現在のPCR検査実施人数の累計は27,005件、確認検査等を含む累計は46,869件(2月18日〜3月25日分)。
また、みなし陽性の制度が2022年より始まった。 更に、2022年より当分の間、東京都が濃厚接触者に抗原検査キットを無償で配布する取り組みを始めている。
国立感染症研究所が2020年2月5日に発表し、その後も改訂を続けている「病原体検出マニュアル 2019-nCoV」によれば、新型コロナウイルスの検出手順の概要は以下のようになる。
検体の取り扱いは、バイオセーフティーレベル(BSL)2+でおこなう。PCR検査法は2019-nCoVの遺伝子領域からオープンリーディングフレーム(ORF)1aとスパイクタンパク質(S)を検出する2-step RT-PCR 法(2ステップ逆転写ポリメラーゼ連鎖反応法)またはリアルタイム one-step RT-PCR 法(TaqMan プローブ法)が使用される。
キアゲン(QIAGEN)社のQIAamp Viral RNA Mini Kit (QIAGEN、Cat.No.52904)を用いるが、他のRNA抽出キットでもよい。
リアルタイムPCRでは、反応時間内に増幅曲線の立ちあがりが見られた場合に陽性となる。1つの検体から、プライマー濃度の異なる2サンプル(N、N2)を調整し、各2ウェルで反応させる。N2の一方あるいは両方で陽性の場合、陽性判定。N2が陰性でNのみ陽性だった場合は再試験推奨。N、N2ともに陰性だった場合は陰性判定。
QuantiTect Probe RT-PCR Kit (QIAGEN Cat#204443)
AgPath-ID One-step RT-PCR Reagents (Thermo Cat# AM1005)
TaqMan Fast Virus 1-Step Master Mix (Thermo Cat#4,444,432)
One Step PrimeScript RT-PCR Kit (Perfect Real Time)(タカラバイオ Cat# RR064A)
THUNDERBIRD Probe One-step qRT-PCR Kit (東洋紡 Cat# QRZ-101)
Reliance One-Step Multiplex Supermix(Bio-Rad Cat# 12010220)
2019-nCoV検出に利用できる各反応試薬と機器の組合せが示され、他試薬でも検出感度が担保できれば使用可能。