サン・ピエトロ多翼祭壇画
金属尖筆で描かれた2点の使徒の頭部準備素描が現存している。うち1点は大英博物館に所蔵されている。もう1点は右から3番目の使徒の頭部習作で、ジュネーヴのジャン・ボナ(Jean Bonna)のコレクションに属していたが、2020年1月にニューヨークのクリスティーズで85万5,000ドル(ペルジーノ作品の過去最高額)で落札された。
複製としては、ペルジーノの工房による1505年の『サンセポルクロの祭壇画』(Sansepolcro Altarpiece)が知られている。これは現在サンセポルクロ大聖堂(英語版)に所蔵されている。
また祭壇の基壇部側面を飾る11点の大小のプレデッラ「聖マウルス」(San Mauro)、「聖スコラスティカ」(Santa Scolastica)、「聖フラウィア」(Santa Flavia)、「東方三博士の礼拝」(Adorazione dei Magi)、「聖ヘラクラヌス」(Sant'Ercolano)、「キリストの洗礼」(Battesimo di Gesù)、「聖コンスタンティウス」(San Costanzo)、「キリストの復活」(Risurrezione di Gesù)、「聖プラキドゥス」(San Placido)、「聖ピエトロ・ヴィンチョリ」(San Pietro Vincioli)、「聖ベネディクトゥス」(San Benedetto)を制作した。完成した絵画は1500年1月13日に主祭壇に設置された。