乗り継ぎ料金制度
以下のものについては、利用する全区間の営業キロによる料金でグリーン料金が計算される。
新幹線特急料金の通算が適用される場合(北陸新幹線で上越妙高駅をまたぐ場合を除く)
在来線の特急・急行料金の通算が適用される場合
東北新幹線と山形・秋田新幹線とを乗り継ぐ場合 3.の場合は、東京駅方面から福島駅を経由して山形新幹線へ乗り継ぐ場合と、東京駅・仙台駅方面から盛岡駅を経由して秋田新幹線に乗り継ぐ場合に限る(いずれの場合も、直通列車で直通して乗車する場合を含む)。
例:東京駅 -(東北新幹線)- 福島駅 -(山形新幹線)- 山形駅 東京駅 - 山形駅間の営業キロでグリーン料金を計算する。 例:仙台駅 -(東北新幹線)- 福島駅 -(山形新幹線)- 米沢駅 仙台駅 - 福島駅間のグリーン料金と福島駅 - 米沢駅間のグリーン料金を合算する(方向が異なるため福島駅で一旦計算を打ち切る)。 例:八戸駅 -(東北新幹線)- 盛岡駅 -(秋田新幹線)- 秋田駅 八戸駅 - 盛岡駅間のグリーン料金と盛岡駅 - 秋田駅間のグリーン料金を合算する(方向が異なるため盛岡駅で一旦計算を打ち切る)。
また、特急・急行列車が途中駅で快速・普通列車に変わる場合に、両者をまたがってグリーン車に乗車する場合のグリーン料金は、特急・急行列車の区間のみで計算する。「快速・普通列車の区間内についてはグリーン券を必要としない」のではないので注意が必要。
東海道・山陽新幹線と他の在来線特急・急行列車の乗り継ぎについて東海道・山陽新幹線と在来線の乗り継ぎ制度により乗継割引を適用し、「リレーつばめ」については、「リレーつばめ」と九州新幹線を通しての特定の特急料金を適用し、「リレーつばめ」には乗継割引を適用しない。
例:益田駅 -(特急「スーパーおき」)- 新山口駅 -(山陽新幹線)- 博多駅 -(特急「リレーつばめ」)- 新八代駅 -(九州新幹線)- 新水俣駅 益田駅 - 博多駅については山陽新幹線との乗継割引を適用し、「スーパーおき」の特急料金を割引とした。博多駅 - 新水俣駅間については「リレーつばめ」と九州新幹線を通しての特定の特急料金を適用された。
奥羽本線の新青森駅以南の乗車が必要なので、以下の場合は適用されない。
例:新青森駅 - (特急「白鳥」) - 函館駅 - (特急「北斗」) - 苫小牧駅
津軽海峡線と函館本線
津軽海峡線を経由する特急・急行列車と函館本線を経由する特急・急行列車を函館駅または五稜郭駅で乗り継ぐ場合、北海道内の特急・急行列車の特急料金、急行料金、及び指定席料金。ただし、上記の新青森駅または青森駅での東北新幹線との乗継割引との重複適用に限る。
例:東京駅 - (東北新幹線) - 新青森駅 - (特急「スーパー白鳥」) - 函館駅 - (特急「スーパー北斗」) - 札幌駅 「スーパー白鳥」号の特急料金、及び「スーパー北斗」号の特急料金共に割引にする(新幹線→在来線、津軽海峡線(経由)→函館本線)。
新青森駅または青森駅での新幹線との乗継割引の条件を満たすことが必要なので、前項同様、新青森駅または青森駅を発駅(着駅)とする場合は適用されない。
北海道新幹線の開業(2016年3月26日)に伴い、上記「本州と北海道」の乗継割引の取り扱いは終了した。