美濃太田駅
島式ホーム2面4線を持つ地上駅。橋上駅舎を備える。改札口は1か所のみで、自由通路に面する。
駅長・駅員配置駅(直営駅)である。管理駅として、高山本線の坂祝駅 - 飛騨金山駅間の各駅および太多線の下切駅・可児駅・美濃川合駅の3駅を管理している。自動券売機、JR全線きっぷうりば、自動改札機(TOICAは2010年より利用可能)があり、トイレは2階改札内にある。自由通路北口エレベータ前、自由通路南口階段付近にもそれぞれトイレがある。1階部分の1番線・2番線のホーム上には売店が設けられていたが、現在は閉店し自販機コーナーのみになっている。同ホームの坂祝駅寄りには冷暖房装置のある待合室も設置されている。なお2階改札と1階とを結ぶエレベーターも設けられている。
越美南線の線路を越えた西側に、転車台がある。現在は、ディーゼルカーなどの方向転換に使われている。
「岐阜県統計書」「美濃加茂市統計書」によると1日平均乗車人員は以下のとおりとなっている。