がんばれゴエモン2 奇天烈将軍マッギネス
エリア3のボス。娯楽用に作られたロボだが、欠陥を理由に戦闘用に改造された。
常に口をパクパクしながらゴエモンたちを待ち構えるが、約100秒の茶番に耐えると降参し、マーブルイエローによって爆破処分される。茶番中はダメージを与えることが出来ない。
ボーナスキャラ。触れると50両もらえるが、間違って攻撃すると罰金として100両失う上に役人が現れる。
最初の丸太街道は初の強制スクロールステージとなる。続く吉備峠と因幡峠の分岐は片方をクリアすれば進めるが両方クリアしても良い。こなみ町は手形を購入しなければ通過できない。城ステージは歌舞伎をテーマとした「歌舞伎城」。インパクトステージは存在しない。こなみ町で隠し通路を発見すると紀州峠へのルートが解禁され、クリアするとからくりワールドに行けるようになる。 からくりワールド 紀州峠をクリアすると行ける遊園地。前作のからくりアイランドに相当するが、淡路島にあった前作に対して今作では四国にある。作中のミニゲームが一堂に会する他、ゲームクリア後に条件を満たすと「バーチャ地獄」に挑戦できる。
最初のステージのみ琉球リゾートを舞台とし、以降は九州に渡る。さつま村で物知りじいさんからほら貝を受け取り、ばってん街道を通る。城ステージは相撲をテーマとした「相撲城」。クリア後はゴエモンインパクトに乗ってマッギネス軍の前線基地を破壊し、どすこい平野にて千秋楽との対決となる。