Z-DNA
DNA配列からZ-DNA構造の形成可能性を予測することは可能である。B型からZ型へ変換される傾向の予測を行うアルゴリズムZHuntはMITのP. Shing Hoによって書かれた。その後、Z-DNAのゲノムワイドマッピングへ向けたアルゴリズムの開発が行われた。
Z-DNAは右巻きの二重らせんとは大きく異なる。Z-DNAのらせんは左巻きであり、2塩基対を単位とするリピート構造を持っている。A-DNAやB-DNAとは異なり、主溝(major groove)と副溝(minor groove)の幅にはほとんど差がない。一般的にこの構造の形成はエネルギー的に不利であるが、プリンとピリミジンが交互に並んだ配列(特にGCが並んだ配列)、負のDNA超らせん、一部のカチオンを含む高塩濃度環境など、特定の状況下では促進される(これらはすべて37°C、pH 7.3–7.4の生理的条件下で起こる)。Z-DNAとB-DNAの接合部(B-Zジャンション)では、塩基対の突出を伴う構造が形成される。Z-DNAのコンフォメーションの研究は安定な二重らせんとして存在しないため困難なものとなっている。Z-DNAは生物学的活動によって時折誘導され、その後迅速に消失する一過的構造である。