ロバート・フィッツロイ
フィッツロイは6000ポンド、現在の40万ポンド相当の財産をすべて公共のために使い果たして死んだ。これが明らかとなったとき、貧窮にあえぐ妻と娘を救うために友人で同僚(かつてのビーグル号の部下)バーソロミュー・サリヴァンが寄付を呼びかけ、政府から3000ポンドを拠出させることに成功した(ダーウィンは100ポンド寄付した)。ヴィクトリア女王は妻と娘にそれぞれが死去するまでハンプトン・コート宮殿の住居を自由に使うことを認めた。
南アメリカ大陸の最南端、マウントフィッツロイはアルゼンチンの科学者フランシスコ・モレノによって命名された。西オーストラリア北部のフィッツロイリバーはかつての部下ジョン・ロート・ストークスによって命名された。南米の針葉樹パタゴニアヒバ(Fitzroya cupressoides)とハラジロカマイルカの亜種 Lagenorhynchus obscurus fitzroyi(シノニム: Delphinus fitzroyi)はビーグル号航海の間にダーウィンによって発見された。フォークランド諸島のフィッツロイも彼の名にちなむ。2002年にBBCラジオの天気予報番組がスペインの同名の岬との混同を避けるためにフィニステレ海域の名前を変えたとき、イギリス気象庁は創設者の名前にちなんで「フィッツロイ」を選んだ。
フィッツロイは2度結婚した。1836年にメアリー・ヘンリエッタ・オブライエンと結婚し、間に4人の子供が生まれた。
エミリー=ウナ
ファニー
キャサリン
ロバート・オブライエン
最初の妻が死去した後、1854年にマリア・イザベラ・スマイスと結婚した。2人の間には1人の娘が生まれた。
ローラ・エリザベス