アメリカ連合国の国旗
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Preble, George Henry (1872). Our Flag: Origin and Progress of the Flag of the United States of America, with an Introductory Account of the Symbols, Standards, Banners and Flags of Ancient and Modern Nations. Albany: Joel Munsell. p. 414. OCLC 612597989. https://archive.org/details/ourflagoriginan00prebgoog.
与野党の政治家たちも南軍旗に対する批判をネット上などで述べており、バラク・オバマ大統領も南軍旗について「抑圧と人種差別の過去を想起させる」と述べている。 7月9日未明、サウスカロライナ州議会で南軍旗を撤去する法律が94対20の賛成多数で可決され成立し、翌10日に撤去された。
2020年、黒人男性が警官に殺される事件をきっかけに広がったジョージ・フロイド抗議運動を受けて、南軍旗に対する撤去の動きはますます進んだ。アメリカ南部に起源を発するモータースポーツ統括団体のNASCARでは観客が南軍旗を持ち込むことが多かったが、1993年と2009年に「連合国軍退役軍人の息子たち」(SCV)がチームのスポンサーとなって車体に南軍旗をあしらおうとしたのを阻止しているほか、2015年のチャールストン乱射事件後は観客に対し、南軍旗を振らずに星条旗を振ってくれるよう要請している。2020年6月10日には、ジョージ・フロイド抗議運動を受けて、大会での南軍旗使用を全面的に禁止するという発表を行った。ドナルド・トランプ大統領はNASCARの南軍旗使用禁止を「NASCARの評価は最低ランクに落ちた」と批判した。
アメリカ軍内でも非白人が4割を占めるまでになっており、秩序と各人の威厳を保ち人種間の分断を避けるためにも南軍旗の放置ができなくなっていた。マーク・エスパー国防長官は2020年7月17日、アメリカ軍施設における南軍旗の使用を禁止する内部文書を発表した。ドナルド・トランプ大統領の抵抗を避けるために南軍旗の禁止という表現は取り下げたが、掲揚を許可される旗(国旗や州旗)を列挙することにより南軍旗を実質的に禁止した。
ミシシッピ州では1894年、州旗の一部に南軍旗があしらわれたが、以後奇妙な事態が発生した。1906年、州旗法は新しい州法典のミスから省略されてしまい、ミシシッピ州には公式な旗が存在しない事態になった。この省略は1993年、全国有色人種向上協会 (NAACP) が州旗に関して起こした訴訟で州最高裁が再審するまで判明しなかった。2000年、州知事はこの旗を公式に州旗とする命令を出した。さらに議論のあと決定は州民の側に戻され、2001年4月17日の州民投票で南軍旗をあしらった旗を州旗にし続けることとなる。その後も論争が続いたが、ジョージ・フロイド抗議運動後の2020年6月28日に州議会は州旗変更の法案を決定。7月1日に州知事が同法案に署名したことで、南軍旗をあしらった州旗は消滅することとなった。
ほかにもアラバマ州の州旗とフロリダ州の州旗は赤いX字型を含み、南軍旗の青いX型十字の名残とみなす人もいる。テネシー州の州旗の旗の配色やアーカンソー州の州旗も、赤地に青い菱形の帯をあしらい、白い星を並べたデザインが南軍旗との類似性を指摘されるときがある。