自由アチェ運動
アチェ州知事もユスフ・ハビビ大統領にDOM指定を解除するよう提言した。同年8月、DOM指定を解除しアチェ州外からの増援部隊を撤退させると発表された。だが、同年10月、北アチェ県(英語版)に活動中のGAMグループが存在するとの報告があった。これ以降アチェ州では治安の悪化が進み、12月には東アチェ県(英語版)で国軍兵士7名の拉致が発生、翌年1999年3月からは公立学校や郡役場への連続放火、5月には巡回中の治安部隊を標的とした襲撃も発生した。これに対し、軍と警察は治安維持・回復作戦を実施したものの、失敗に終わった。5月3日に北アチェ県クルン・グクー地区で住民への発砲事件が発生し46名が死亡するなど、DOM時代同様に軍と警察による人権侵害事件が続いた。軍と警察がGAMが煽動行為をし発砲につながったなどと説明する一方、GAMは犯行を否定する声明を出した。治安維持・回復作戦は住民の支持を得ることができず、インドネシア内外からの批判を受けて8月18日に停止された。これにより、従来はピディ県、北アチェ県、東アチェ県を拠点としていたGAMはアチェ全域に活動範囲を広めることとなった。12月4日にはGAM設立とアチェ独立宣言33周年を記念して、独立宣言記念式典がアチェ各地で開催された。