マゴケ綱
亜綱以下の分類は以下の通り。
キセルゴケ亜綱(Buxbaumiidae) キセルゴケ目(Buxbaumiales) - キセルゴケ科キセルゴケ属のみ(1科1属)。
イクビゴケ亜綱(Diphysciidae) イクビゴケ目(Diphysciales) - イクビゴケ科イクビゴケ属のみ(1科1属)。
クサスギゴケ亜綱(Timmiidae) クサスギゴケ目(Timmiales) - クサスギゴケ科クサスギゴケ属のみ(1科1属)。
ヒョウタンゴケ亜綱(Funariidae) - 5科。 ハイツボゴケ目(Gigaspermales) ヤリカツギ目(Encalyptales) ヒョウタンゴケ目(Funariales)
シッポゴケ亜綱(Dicranidae) - 24科。