駿府城
1601年(慶長6年) 家康の異母弟ともいわれる内藤信成が駿府城主に任ぜられる。
1606年(慶長11年) 内藤信成が長浜城主に移封される。
1607年(慶長12年) 2月 駿府城拡張工事開始。 3月 家康、入る。 12月 失火により御殿・天守など本丸の全てを焼失。直ちに再建にかかる。
1608年(慶長13年) 本丸御殿・天守等完成。家康、18年ぶりに駿府城へ移る。
1609年(慶長14年) 家康の第十子・徳川頼宣が駿府城主となる。
1610年(慶長15年) 天守完成。
1614年(慶長19年) 家康、二条城に移る。
1616年(元和2年) 家康、駿府城で死去(75歳)。
今川領国が武田領国化されると支配拠点のひとつとなるが、武田氏は1582年(天正10年)に織田・徳川勢力により滅亡し、駿河の武田遺領は徳川家康が領有した。
天正13年(1585年)から徳川家康により、駿府城は近世城郭として築城し直された。この時に初めて天守が築造されたという。そして翌天正14年(1586年)に家康が、自身が17年過ごした遠江国浜松城から駿府城に移った。その後天正18年(1590年)、豊臣政権による後北条氏滅亡に伴う家康の関東移封が行われ、徳川領国と接する駿府城には豊臣系大名の中村一氏が入城。一氏は関ヶ原の戦いの直前に死去する前、徳川方の東軍につくことを決め、戦いの後に嫡子の中村一忠が伯耆に転封されたため、駿府は内藤信成が治めた。
駿府城には、定置の駿府城代・駿府定番を補強する軍事力として駿府在番が置かれた。江戸時代初期には、幕府の直属兵力である大番が駿府城に派遣されていたが、1639年(寛永16年)には大番に代わって将軍直属の書院番がこれに任じられるようになった。その後約150年間、駿府在番は駿府における主要な軍事力として重きをなすとともに、合力米の市中換金などを通じて駿府城下の経済にも大きな影響を与えたとされる。
しかし1790年(寛政2年)に書院番による駿府在番が廃止され、以降は常駐の駿府勤番組頭・駿府勤番が置かれて幕末まで続いた。この駿府勤番組頭・駿府勤番は駿府城代支配の役で、それぞれ御役高500石・御役料300俵と御役高300俵であった。