マヤノトップガン
11月5日、クラシック三冠競走最終戦の菊花賞(GI)に参戦する。これまでのクラシックは、皐月賞をジェニュインが、東京優駿をタヤスツヨシが制していた。どちらも故障離脱はしていなかったが、ジェニュインは天皇賞(秋)で古馬に挑み不在、タヤスツヨシはトライアルを連敗して信頼を失い、参戦していても存在感がなかった。おまけに、これといった上がり馬も出現していないと考えられていた。そのため、大本命不在の混戦となる。18頭立てとなる中、最有力視されたのは、マヤノトップガンでも、これまで鎬を削っていた牡馬たちでもなく、紅一点の牝馬ダンスパートナーだった。
ダンスパートナーは、桜花賞2着、優駿牝馬(オークス)を優勝した後、夏にフランス遠征して、帰国した直後の参戦だった。牝馬の菊花賞参戦は18年ぶり、牝馬クラシック優勝馬の参戦は28年ぶりであり、優勝は1947年ブラウニー以降、48年間遠ざかっていた。にもかかわらず、ダンスパートナーが、単勝オッズ4.9倍の1番人気となる。牡馬の最上位は、2番人気ナリタキングオーの6.0倍であり、次ぐ6.5倍の3番人気がマヤノトップガンだった。当日の誘導馬は、菊花賞参戦が叶わなかったマヤノペトリュースが務めていた。
1月のデビューから菊花賞まで12戦を走り、既に疲れが出ていたが放牧には出ず、この年の13戦目を目指した。13戦目には、暮れの有馬記念が選ばれる。ただ状態が悪いままに臨み、最高格のグランプリ競走で凡走することは、菊花賞優勝馬の面目を失いかねなかった。そこで坂口は、5着以内に入る見込みがあるなら、面目は保てるという考えに至っていた。そのため5着以内になるような状態を、直前まで慎重に見極め、有馬記念1週間前に参戦を決断した。
12月24日の有馬記念(GI)は、12頭立てとなり、一線級の古馬が立ちはだかった。人気の中心は、前年のワンツー、ナリタブライアンとヒシアマゾンだった。前年のクラシック三冠馬、有馬記念優勝馬であるナリタブライアンは、この年春に故障。秋に復帰し、天皇賞(秋)とジャパンカップに1番人気で臨んだが、それぞれ12着、6着敗退。それでも人気は根強かった。そしてGI2勝の牝馬ヒシアマゾンは、この年の秋、オールカマーと京都大賞典を連勝して、ジャパンカップでランドに次ぐ2着、日本調教馬最先着を果たしていた。
次いで天皇賞(秋)にてワンツーフィニッシュのサクラチトセオーとジェニュイン、そしてジャパンカップ4着のタイキブリザードが推され、マヤノトップガンはこれに続く6番人気、単勝オッズ13.0倍の6番人気に留まっていた。展開は、典型的な逃げ馬がおらず、タイキブリザードが逃げる形になると考えられた。
この活躍について田所は「死んだ弟が、あの世から後押してくれたんや」と感じたという。またこの年の日本プロ野球・パシフィック・リーグでは、神戸を本拠地とするオリックス・ブルーウェーブ(1995年のオリックス・ブルーウェーブ)が優勝しており、菊花賞を優勝した際には、杉本清は「今年は神戸だ!マヤノトップガン!!」と実況している。
震災は、兵庫県宝塚市にある日本中央競馬会の競馬場・阪神競馬場も破壊し、使用不能に追い込んでいる。阪神を欠いたことで、開催を他場に代替。例えば2着だった1995年の神戸新聞杯は、京都競馬場で代替、29年ぶりとなる京都開催となっていた。同年末には再開し、翌1996年には、マヤノトップガンが阪神大賞典で阪神に舞い戻り、ナリタブライアンと小差の2着となっている。そして夏、震災から1年半後に行われた「震災復興支援競走」宝塚記念を、マヤノトップガンが制していた。田所は「菊花賞も有馬記念も地元と違いましたやろ。ホンマ、よう阪神でGIを勝ってくれましたわ。これで神戸の皆さんが、ちょっとでも元気を出してくれたら...。そやけど馬って、不思議な生き物ですなあ」と述べている。
直線では、外からバブルガムフェローに並びかけよう、そして背後のサクラローレル、大外のマーベラスサンデーから逃れようとスパートし、先頭を奪取した。しかしすぐにバブルガムフェローに盛り返されて逆転、後ろ2頭を振り切ったものの、バブルガムフェローに半馬身後れを取る2着に敗れた。有利な位置のバブルガムフェローに競りかけて、終いで先を許す敗戦は、田原によれば「もしバブルガムフェローと枠順が逆だったら(中略)間違いなく主導権を握っていただろう(中略)そうなれば向こうが仕掛けるのを見てから追い出すことができたはず」と述べ、バブルガムフェローに騎乗した蛯名も少しの運を味方にしたことを勝因に挙げるほどの接戦だった。
続いてジャパンカップは見送り、暮れの有馬記念で連覇を目指した。サクラローレルに次ぐ、そしてマーベラスサンデー、ファビラスラフイン、ヒシアマゾンを上回る2番人気に推された。スタートから先行し2番手を追走。しかし途中で小休止する場面がなく、行ったっきりの追走となってしまった。
直線ではすでに余力がついて失速、サクラローレルなどにかわされて優勝を許した。さらに14番人気マイネルブリッジ、12番人気ダンスパートナーにも先着される7着、連覇はならなかった。この年は、大レースの優勝馬が悉く異なり、有馬記念がJRA賞年度代表馬の決定戦という側面もあった。宝塚記念優勝馬のマヤノトップガンにもその資格があったが、敗退。有馬記念とともに年度代表馬の座も、最優秀5歳以上牡馬も、サクラローレルにさらわれていた。