千歳線
架線が130 km/h運転に対応していないため、電車の最高速度は従来のまま(120 km/h)であり、電車より気動車が速く走れる区間となっていた。 7月1日:北広島駅 - 上野幌駅間に西の里信号場(2代目)を新設。
2002年(平成14年)3月16日:札幌駅 - 旭川駅間の特急「スーパーホワイトアロー」が快速「エアポート」として新千歳空港駅 - 札幌駅間への直通運行を開始。同時に架線を改修し、電車でも南千歳駅 - 白石駅間で130 km/h運転が可能になる。
2007年(平成19年)10月1日:全線で駅ナンバリングを実施。
2008年(平成20年) 10月25日:全線でIC乗車券「Kitaca」を導入。 11月1日:長時間運転を見合わせる事象が発生した場合、JRの乗車券所持者に札幌市営地下鉄の乗車券を配布する代替輸送を開始。千歳線では新札幌駅で地下鉄東西線新さっぽろ駅からの乗車券を配布。
2009年(平成21年)3月14日:全線でIC乗車券「Kitaca」と「Suica」との相互利用開始。
2013年(平成25年) 3月23日:全線におけるIC乗車券「Kitaca」との相互利用サービスが、従来の「Suica」に加えて「PASMO」、「manaca」、「TOICA」、「PiTaPa」、「ICOCA」、「はやかけん」、「nimoca」、「SUGOCA」に拡大。
函館本線・室蘭本線とともに函館駅 - 札幌駅間を結ぶ幹線の一部で、特急「北斗」が1日11往復運転されており、これらを補完する形で札幌駅 - 室蘭駅間の特急「すずらん」が運転されている。またJR貨物の運行する貨物列車も多数運転されている。
また、札幌駅 - 南千歳駅間は石勝線・根室本線を経由して帯広・釧路方面を結ぶルートの一部で、特急「おおぞら・とかち」が運転される。
2020年3月13日までは、函館・釧路方面の列車と新千歳空港方面の列車を乗り継ぐ場合、一部を除き南千歳駅では同一ホームでの乗り換えとなっていた。
使用されている車両は以下の通り。
電車 785系 - 特急「すずらん」 789系1000番台 - 特急「すずらん」
気動車 キハ261系1000番台 - 特急「とかち」・「北斗」・「おおぞら」