日琉祖語
上代日本語の濁音b, d, z, gは語頭に来ることがほとんど無かった。濁音は鼻音+無声子音という子音連続に由来することが合意されている。ほとんどの場合、この子音連続は間に挟まっていた母音の脱落により発生したものである(連声濁)。
ゆづら「弓弦」< *jumtura < *jumi-tura「弓-弦」
あび1き1「網引」< *ampiki < *ami-piki「網-引き」
ぬすび1と2「盗人」< *nusumpitə < *nusumi-pitə「盗み-人」
むらじ「連」< *muransi < *mura-nusi「村-主」
いくつかの語では母音脱落が起きた証拠がないが、それらのケースで多くの研究者は無声阻害音の前の音節末鼻音を再建している。例えば、*tuNpu > tubu(粒)、*piNsa > pi1za(膝)などである。この *N は後代の日本語の撥音とは関係がない。撥音は語の縮約あるいは中国語のような他の言語からの借用に由来する。また、「櫓」yaguraを < *ja⹀nə kura「矢の倉」のように、連濁に対しては属格の助詞「の」の祖形や、「に」の祖形を挟んだ形からの母音の脱落が想定されることが多い。
日琉祖語の *s を破擦音だとする説は、古代日本語のサ行子音の音価に直接かかわっている。
古代日本語(上代日本語と中古日本語の総称)の /s/ が破擦音だったとする説は、悉曇学の音図に影響されて日本語の子音が並べられていると見られる平安時代の五十音図において、ちょうど破擦音である口蓋化音が置かれている位置にサ行が配置されていることに端を発する。ただ、この配列は口蓋化した歯擦音の [ɕ] のような音であった可能性を排除するものではない。
有坂秀世などの国内の研究者やミラーなどの20世紀の上代日本語研究者は /s/ にいくつかの環境での破擦音の異音を認めたが(「上代日本語」を参照)、アンガーは言語類型論的には殆ど全ての言語が通時的に [s] を持っており、ある言語が歯擦音を一つだけ持っている場合それは常に /s/ であることを指摘し、破擦音説を否定している。また、ミヤケは上代日本語の万葉仮名を推古期の用字と比較分析すると、声母の書き分けが存在するという仮定のもとでは考えにくい破擦音の変化が起こらなければならないこと、またサ行に使われている万葉仮名はそれ以前の体系を継承していることを指摘し、日本書紀α群に基づいた破擦音の異音説を否定している。