巣鴨拘置所
このため1946年12月半ばにA級戦犯とBC級戦犯の分離が行われ、それぞれ別個の雑居房に収容するよう扱いが改められるまで、A級戦犯とBC級戦犯の間のトラブルが絶えなかった。
占領軍の主体であるアメリカ軍は情報戦の一環として、監房に装置を密かに取り付け、戦犯たちの会話を盗聴していた事が後年明かされている。
1947年(昭和22年)2月、既決囚の労働が本格化し、A級戦犯・60歳以上の高齢者・病人以外は全て就労を命じられた。プリズン周辺の道路整備や運動場、農園、兵舎・将校用宿舎建設等の重労働を命じられ、午前と午後に1回ずつある5分の休憩と昼食時の休憩時にしか休めない。私物は一切禁止で、全て制服着用で行わなければならない。長い拘禁生活と裁判の疲労で、体力の落ちた戦犯達には重労働であり、「こんなことならいっそ死んでしまえばよかった」との声もあった。
この重労働が2年続き、建設を命じられた施設の完成に至ると、戦犯たちは信頼を勝ち取り、減刑などの恩恵を受けた。新聞・雑誌・本などの閲覧、上野図書館からの書籍借り出しも許可された。ラジオも定期聴取でき、映画も週に1回鑑賞できた。
1948年(昭和23年)12月23日には、極東国際軍事裁判により死刑判決を受けた東條英機ら7名のA級戦犯の死刑も執行された。
1950年(昭和25年)から始まった朝鮮戦争で多数の米兵が出征するため、1950年8月、日本人刑務官が着任。米軍の監理下で警備にあたった。なお、最も収容者数が多かったのは1950年1月時点で、1862人の戦犯が収容されていた。
田嶋隆純編『わがいのち果てる日に 巣鴨プリズン・BC級戦犯者の記録』新版・講談社エディトリアル、2021年
花山信勝 『平和の発見 巣鴨の生と死の記録』 方丈堂出版、新版2017年
上坂冬子 『巣鴨プリズン13号鉄扉 裁かれた戦争犯罪』 新潮社、1981年。新潮文庫、中公文庫、PHP研究所で再刊
吉村昭 『プリズンの満月』 新潮社、1995年。新潮文庫、1998年 - 小説
『巣鴨プリズン未公開フィルム』 織田文二撮影/茶園義男監修・解説 小学館文庫、2000年 - 看守により密かに撮られた写真集。
『C級戦犯がスケッチした巣鴨プリズン』飛田時雄 画、岡村青構成、草思社、2011年
平野英雄『学徒戦犯たちのスガモ・プリズン-『巣鴨版画集』にみるBC級戦犯の戦後』桜美林大学北東アジア総合研究所、2015年
大杉栄『獄中記』土曜社、2012年。大正期の記録