箱崎パーキングエリア
箱崎ジャンクション直下の箱崎ロータリーに接続している(6号向島線上りからの合流後すぐに入口がある)。このため、施設は1箇所のみだが、6号向島線両方向および9号深川線から利用できるほか、箱崎・浜町各入口から本線に上がる途中での利用も可能である。また、PA利用後は箱崎ロータリーを介して6号向島線両方向・9号深川線下り方向に復帰できるほか、箱崎・浜町・清洲橋各出口やT-CAT専用出口から一般道へ降りることもできる。駐車場および公衆便所は、首都高速道路株式会社東京東局の建物3階部分にある。
首都高本線上には箱崎PAの案内表示がほとんど無い。これは箱崎PAの駐車場が極めて小さく、案内表示をすることで利用者が増え、駐車場が混雑することを避けるためである(PA内の掲示にもそのように書かれている)。このためPAの存在自体を知らない人も少なくなく、「幻のPA」とも呼ばれている。時間帯や交通状況によっては、一時閉鎖されることもある。箱崎PAから徒歩でT-CATや一般道に行くことはできない。