プロウイルス
潜伏感染は、プロウイルスが活性ではなく、転写的に無変化である場合に起こる。
潜伏感染は、宿主の環境条件や健康状態の変化に反応して増殖的になる可能性があり、プロウイルスは活性化され、そのウイルスゲノムの転写を開始することができる。これは、細胞のタンパク質合成機構が乗っ取られてより多くのウイルスを生成するため、宿主細胞の破壊につながる可能性がある。
プロウイルスは、遺伝性の内在性レトロウイルスの形でヒトゲノムの約8%を占める可能性がある。
プロウイルスはレトロウイルスを指すだけでなく、宿主の染色体に統合ができる他のウイルスを表すのにも使われる。別の例としては、アデノ随伴ウイルスがある。真核生物のウイルスが宿主のゲノムに統合するだけでなく、多くの細菌ウイルスや古細菌ウイルスもこの増殖戦略を採用している。環状の (一本鎖または二本鎖の) DNAゲノムを持つ、または環状の中間体を介してゲノムを複製する細菌ウイルスのすべてのファミリー (例えば、カウドウイルス(二本鎖DNA)) は、温和なメンバーを持っている。