小倉藩
同年、播磨国明石藩より、忠利の義兄である小笠原忠真 が入部し、小倉城主として豊前北部15万石を領した。なおその際、支城の豊前中津城には忠真の甥長次が8万石で入部し中津藩が、同じく豊後杵築城には忠真の弟忠知が4万石で入部し杵築藩が成立した。
忠真の母は松平信康の娘で徳川家康の外曾孫にあたることから、以後小倉小笠原氏は西国譜代大名の筆頭として九州の玄関口を抑える、いわば「九州探題」の役割を果たし外様大名の監視にあたったが、これが幕末における小倉城落城の遠因ともなった。宮本武蔵の嗣子宮本伊織は、父ともに出陣した島原の乱の軍功などにより知行4000石の小倉藩筆頭家老となり忠真を支え、以後宮本家は代々その地位を世襲した。2代忠雄は寛文7年(1667年)藩主相続の際、弟の真方に小倉新田藩(千束藩)1万石を内分分知した。
慶長5年(1600年)関ヶ原の戦いで細川忠興は東軍に属して戦い、居城である丹後国田辺城は父細川幽斎が勅命により講和するまで西軍に頑強に抵抗した(田辺城の戦い)。その功により戦後細川氏は丹後田辺・豊後杵築合わせて18万石から、豊前一国と豊後国国東郡・速見郡都合39万9千石に大幅加増され、小倉藩を立藩した。当初は中津城に入城したが、すぐに毛利氏の旧小倉城の跡地に大大名の居城として相応しい規模の城郭と城下町の建設を開始し、慶長7年(1602年)小倉城に藩庁を移した。宮本武蔵と佐々木小次郎との決闘が当時は小倉藩領だった巌流島で行われたのはこの細川氏の時代である。
元和6年(1620年)、忠興は隠居し、三男忠利が第2代小倉藩主となる。その後、忠利は寛永9年(1632年)加藤忠広の改易に伴い、熊本藩54万石に加増・移封された。
豊前国 田川郡 - 64村 京都郡 - 71村 仲津郡 - 76村 築城郡 - 41村 上毛郡のうち - 31村