日本の世界遺産
「神宿る島」宗像・沖ノ島と関連遺産群(福岡県宗像市、福津市)(2017年7月登録) 沖ノ島 小屋島 御門柱 天狗岩 宗像大社沖津宮遥拝所 宗像大社中津宮 御嶽山祭祀遺跡を含む 宗像大社辺津宮 新原・奴山古墳群
長崎と天草地方の潜伏キリシタン関連遺産(長崎県長崎市、佐世保市、平戸市、南島原市、五島市、北松浦郡小値賀町、南松浦郡新上五島町、熊本県天草市)(2018年6月登録) 原城跡 平戸の聖地と集落(春日集落と安満岳) 平戸の聖地と集落(中江ノ島) 天草の﨑津集落 外海の出津集落 外海の大野集落 黒島の集落 野崎島の集落跡 頭ヶ島の集落 久賀島の集落 奈留島の江上集落(江上天主堂とその周辺) 大浦天主堂
奄美大島、徳之島、沖縄島北部及び西表島(鹿児島県奄美市、大島郡宇検村、大和村 、瀬戸内町、徳之島町、天城町、伊仙町、沖縄県国頭郡 国頭村、大宜味村、東村、八重山郡竹富町)(2021年7月登録) 奄美大島 徳之島 沖縄島北部(やんばる) 西表島
現在、47都道府県中27都道府県(北海道、青森県、岩手県、秋田県、栃木県、群馬県、東京都、富山県、山梨県、岐阜県、静岡県、三重県、滋賀県、京都府、大阪府、兵庫県、奈良県、和歌山県、島根県、広島県、山口県、福岡県、佐賀県、長崎県、熊本県、鹿児島県、沖縄県)に世界遺産がある。
原爆ドーム(広島県広島市)(1996年12月登録)
厳島神社(広島県廿日市市)(1996年12月登録)
石見銀山遺跡とその文化的景観(島根県大田市)(2007年6月登録) 鉱山地域 銀山柵内 代官所跡 矢滝城跡 矢筈城跡 石見城跡 大森銀山 宮ノ前地区 熊谷家住宅 羅漢寺五百羅漢 銀山街道 鞆ヶ浦道 温泉津沖泊道 港町地域 鞆ヶ浦 沖泊 温泉津
明治日本の産業革命遺産 製鉄・製鋼、造船、石炭産業(山口県萩市)(2015年7月登録) 萩反射炉 恵美須ヶ鼻造船所跡 大板山たたら製鉄遺跡 萩城下町 松下村塾
2021年に登録された韓国の「ゲボル(韓国の干潟)」を、2019年に登録された中国の「黄海=渤海湾沿岸の渡り鳥保護区群(第1段階)」同様、渡り鳥のルートである東アジア・オーストラリア地域フライウェイとみなす東アジア・オーストラリア地域フライウェイ・パートナーシップ(EAAFWP)では、ルート上の飛来地を国境を越えて世界遺産として保護することを目指しており、その中には日本も含まれている。但し、世界遺産候補地として具体的な場所は示していない。
巨石記念物を重視する欧州考古学を支持するユネスコの方向性を踏まえ、韓国の世界遺産「高敞、和順、江華の支石墓群」に代表される東アジアの支石墓(ドルメン)の分布を顕彰すべきと指摘する見解がある。その中には国史跡である九州の志登支石墓群や新町支石墓群がある。支石墓が海を越えて日本に伝播したことを顕彰することはユネスコが重視する文化循環になる。但し、高敞、和順、江華の支石墓群を越境拡張登録するには、韓国側の理解が前提となり、政治的な日韓関係に加え、双方に存在する反日・嫌韓感情が障壁となる。