ソマリア暫定連邦政府の歴史
2009年1月29日、エチオピア軍の撤退を受けてイスラム勢力アル・シャバブがTFGの根拠地バイドアを占領した。そのためTFGのほとんどのメンバーが隣国ジブチに避難した。1月31日、そのジブチでTFGの大統領選が行われ、ICUの元メンバーでハウィヤ氏族出身、44歳のシャリフ・アハメドが選ばれた。なお対立候補は首相だったヌル・ハッサン・フセインだった。アハメド大統領は首相にオマル・アブディラシド・アリ・シルマルケを指名し、2月には首都モガディシュで大統領就任を宣言した。シルマルケは1960年代にソマリア大統領を務めたアブディラシッド・アリー・シェルマルケの息子であり、アハメド大統領と異なる大氏族ダロッド出身でもあったことなどから選ばれた。
アハメド大統領はICUでも穏健派であり、TFGとイスラム勢力との橋渡しが期待された。しかしICUでアハメドと並んで幹部を務めたハッサン・ダヒール・アウェイスはTFGへの協力を拒否した。アウェイスのアル・シャバブに対する影響は不明であるが、TFGとイスラム勢力との和解は困難となった。
アルカーイダの指導者ウサーマ・ビン=ラーディンは3月19日アハメド政権の打倒を呼びかけている。アウェイスも5月3日にイスラム勢力に対し、TFGとの戦闘続行を呼びかけている。
2009年6月18日には中部ベレトウェインで自爆テロが発生、アデン治安相 (Omar Hashi Aden) を含む5人が死亡した。アル・シャバブによるものと見られる。
また同じ1月1日、ゲーディ首相は「首都モガディシュの軍閥支配時代はすでに終わった」と発表した。ゲーディ首相は非政府組織の武装解除を実行し、集めた武器を港に集め、モガディシュの大統領官邸 (Villa Somalia) で管理すると発表した。イスラム勢力への恩赦も実施された。
2007年1月17日、大統領、首相と並んでTFGのトップであるアデン国会議長 (Sharif Hassan Sheikh Aden) が賛成183、反対8、棄権1で解任された。その理由はアデンがICUに便宜を図り、さらに長期間議会を休んだためとされた。2007年1月31日、新国会議長にアダン・モハメド・ヌール・マドベが選ばれた。275票の内、マドベが154票、イブラヒム・ハッサン(Ibrahim Adan Hassan)が54票だった。
2007年2月7日、ゲーディ首相は閣僚3名の解任を発表した。厚生長官アブディアジズ・ユスフ (Abdiaziz Sheikh Yusuf) 、高等教育・文化長官のフセイン・モハマド(Hussein Mohamud Sheikh Hussein)の2名は横領と能力不足とされた。鉱物・水資源担当長官のモハマド・ヌール(Mohamud Salad Nuur)は長官指名後に宣誓に応じなかったためだった。