G.I.ジョー バック2リベンジ
※括弧内は日本語吹替
2011年12月12日、プレミア予告編がMachinima.comから公開された。予告編ではザ・ホワイト・ストライプスの楽曲「セヴン・ネイション・アーミー」をザ・グリッチ・モブ(英語版)リミックスしたものが使われた。2012年1月12日、『Interview』上にて「Thursday video Face-Off」と称して『Alter Egos』と共に特集された。第46回スーパーボウルではジェイ・Zの音楽を含む短い予告編が流された。日本ではイ・ビョンホンに焦点を当てた予告編が2012年4月に公開された。全長予告編第2弾は2012年4月24日に公開された。
G.I.ジョーチームの活躍によってナノマイトを使ったコブラの作戦は阻止され、彼らに逮捕されたコブラコマンダーとデストロはドイツ・ザルツブルクの刑務所に収監された。ある日新メンバー・ロードブロックやレディJ、フリントを加えたデューク率いるG.I.ジョーはパキスタンにて極秘任務に臨んでいたが、アメリカ合衆国大統領に変装したザルタンによって反逆者の汚名を着せられて攻撃され、デュークを始めとしたG.I.ジョーメンバーの殆どが戦死し、さらにはG.I.ジョー本部も壊滅させられてしまう。一方、コブラコマンダーは戦死したと思われていたストームシャドーと新たなるコブラの一員・ファイヤーフライの助力によって刑務所から脱獄した。
生き残ったロードブロック、レディJ、フリントの3人は何とかアメリカに戻ると、大統領がG.I.ジョーに代わる新たな特殊部隊「コブラ」を発表していた。3人は伝説のG.I.ジョー初代司令官・ジョー・コルトンに助力を求め、大統領が出席する募金イベントに潜入し、ザルタンが大統領に化けていることを突き止めた。その頃、G.I.ジョー本隊とは別行動を取り東京にいたスネークアイズも、師匠のブラインドマスターの命を受け自身の弟子である女忍者・ジンクスと共にストームシャドーを生け捕りにすべく出動。脱獄の際に負傷しヒマラヤの寺院で治療を受けていたストームシャドーの元に行き、攻防の末彼を捕らえることに成功する。スネークアイズ達によって東京に連行されたストームシャドーはそこで追われる原因となった自分の師匠の殺害嫌疑が冤罪で、師匠を殺したのがコブラだったと知る。