守矢氏
神氏の入諏とともに新しい体制が生まれた。この体制においては、新来の神氏が出す大祝は政権を握る首長であるのに対し、守矢氏は祭祀権を持つ神官である。こうした「二重王権」制は世界各地に見られるもので、日本でもヤマト王権が出雲を征服した後に祭祀権を出雲側に保証するという事例がある(出雲国造家を参照)。大祝の就任儀式(即位式)は守矢氏の手で行われたが、これは先住の守矢氏の儀式的承認を得ることによって新来の神氏・大祝が権威を手に入れると意味する。
大祝は建御名方神の依り代、すなわち現人神として信仰の対象となったが、これを原始信仰の名残とする説や、鎌倉時代に発展したものという説がある。この大祝信仰においては、守矢氏の祭司は大祝を祀る存在と解釈された。
『古事記』とそれを参考した『先代旧事本紀』には建御名方神が天照大御神・高御産巣日神らに遣わされた建御雷神との力比べに負けて諏訪まで逃亡した大国主神の御子神として描かれている。追いつめられた建御名方神が諏訪から出ないと約束する場面は、大祝は在位中に諏訪を出てはならないという掟、もしくは進入者に敗れた守矢氏の祭祀権が諏訪上社地域に限定されたことを表しているという。