RNA誘導サイレンシング複合体
RISCの最もよく解明されている機能は、標的mRNAの分解によってリボソームによる翻訳に利用される転写産物の量を減少させることである。Argonauteによる、RISCのガイド鎖に相補的なmRNAのエンドヌクレアーゼ的切断は、RNAiの開始に重要である。mRNAの分解が行われるためには、2つの重要な要求事項が存在する。
ガイド鎖と標的mRNA配列とのほぼ完全な相補性
「スライサー」(slicer)と呼ばれる標的mRNA切断活性を持つArgonauteタンパク質の存在
mRNAの切断が行われた後の分解には、2つの主要な経路が存在する。どちらもmRNAのポリ(A)テールの分解によって開始され、mRNAの5'キャップの除去が行われる。
転写産物の5'から3'方向への分解は、P-body(英語版)と呼ばれる細胞質の構造体中でXRN1(英語版)エキソヌクレアーゼによって行われる。
転写産物の3'から5'方向への分解は、エキソソームとSki複合体(英語版)によって行われる。
RNase III(英語版)ファミリーに属するDicerは、二本鎖のsiRNAや一本鎖のmiRNAを産生することでRNAi過程を開始する、RISCの重要なメンバーである。細胞内でのdsRNAの酵素的切断によって、長さは21–23ヌクレオチドで3'末端に2ヌクレオチドのオーバーハングを持つ、短いsiRNA断片が形成される。また、Dicerはヘアピンループ構造を形成してdsRNAを模倣しているpre-miRNAに対しても同様のプロセシングを行う。dsRNA断片はRISCにロードされるが、asymmetry ruleと呼ばれる現象により、熱力学的安定性に基づいて一方の鎖がガイド鎖として選択される。こうして形成されたmiRNAやsiRNAは、RISCがmRNAを分解標的とする際の一本鎖のガイド配列として作用する。
熱力学的安定性の低い5'末端を持つ鎖がArgonauteタンパク質によって選択され、RISCに取り込まれる。この鎖はガイド鎖と呼ばれ、mRNAを分解標的とする。
もう一方の鎖はパッセンジャー鎖と呼ばれ、RISCによって分解される。
RISCの主要なタンパク質であるAgo2(英語版)、SND1(英語版)、AEG-1は、遺伝子サイレンシング機能に重要な役割を果たす。
RISCはmiRNAまたはsiRNAのガイド鎖を用いて、ワトソン・クリック型の塩基対形成によってmRNA転写産物の3' UTRの相補的領域を標的とし、さまざまな方法によるmRNA転写産物からの遺伝子発現の調節を可能にする。