えちごトキめき鉄道
以下の4種類はJR東日本の企画した特別企画乗車券であり、えちごトキめき鉄道が在来線を管轄する駅では、直江津駅ではみどりの窓口もしくは指定席券売機、春日山駅、高田駅、新井駅、妙高高原駅はマルス端末(MR51型)、糸魚川駅自社窓口はJR東日本ビジネスえきねっとを通じて発券される。ただし、糸魚川駅では※印を記した2種類のみ発売となり、発券時間が窓口営業時間のうち、8時30分 - 19時30分の間に制限される。
なお、上越妙高駅は自社窓口ではこれらの企画乗車券を扱わないが、JR東日本みどりの窓口で取り扱う。
えちごトキめき鉄道では申し込みができないが、上記の連絡運輸区間のほか、以下の条件に当てはまる場合、直江津駅みどりの窓口・指定席券売機を含むJR側でえちごトキめき鉄道線発着・経由の乗車券を申し込むことができる。
乗降駅のどちらかがJRの駅の場合
上記の区間と重複しない区間のみ示す。
乗降駅がともにJRの駅の場合
1993年(平成5年)8月23日 - 新潟県が運輸省(現:国土交通省)に対し、北陸本線の魚津駅 - 糸魚川駅間については新幹線開業時にJR西日本から経営分離を行うことに同意する旨を回答。
1998年(平成10年)1月14日 - 新潟県が運輸省(現:国土交通省)に対し、信越本線の長野駅 - 脇野田駅(現:上越妙高駅)間については新幹線開業時にJR東日本から経営分離を行うことに同意する旨を回答。
2001年(平成13年)4月18日 - 新潟県が国土交通省に対し、北陸本線の富山駅 - 直江津駅間については新幹線開業時にJR西日本から経営分離を行うことに同意する旨を回答。
2010年(平成22年)11月22日 - 新潟県並行在来線株式会社を設立。本店を新潟市中央区新光町の新潟県庁舎内に設置。
2012年(平成24年)7月1日 - 商号をえちごトキめき鉄道株式会社に変更。
2013年(平成25年)4月1日 - 本店を県庁舎内から上越市に変更、同市内の直江津駅北口付近に本社屋を開設。
2014年(平成26年) 2月28日 - 妙高高原駅(妙高市) - 直江津駅(上越市)間 37.7 kmと直江津駅 - 市振駅(糸魚川市)間 59.3 kmの合計 97.0 kmの第一種鉄道事業許可を取得。開業予定日を北陸新幹線 長野駅 - 金沢駅間開業日とした(その後、2015年3月14日に決定)。 10月27日 - 妙高はねうまライン 妙高高原駅 - 直江津駅間および日本海ひすいライン 市振駅 - 直江津駅間の上限運賃認可を、国土交通省北陸信越運輸局に申請。
えちごトキめき鉄道のトータルデザインは、川西康之が率いる株式会社イチバンセンが手掛けている。車両のエクステリアや駅名標などのカラーリングは、妙高はねうまラインでは妙高山のフレッシュグリーンと山並みをイメージしたもの、日本海ひすいラインでは日本海のブルーと荒波をイメージしたものが、それぞれ施される。
フレッシュグリーンが取り入れられた番線表示標(高田駅)
妙高はねうまラインの駅名標(直江津駅)
日本海ひすいラインの駅名標(糸魚川駅)
えちごトキめき鉄道では座席指定料金・グリーン料金を設定していない。
このため「しらゆき」やJR線に乗り入れる臨時列車の一部(「越乃Shu*kura」等)に設定された指定席に乗車する場合、えちごトキめき鉄道線区間に対する追加料金は不要(JR線区間部分のみ必要)である。但し、えちごトキめき鉄道線内各駅とJR線内各駅の相互間を発着駅とする指定席券(例:上越妙高駅 - 直江津駅)は発行されない。また、2017年(平成29年)3月4日まで運転された、日本海ひすいラインと信越本線の直通快速列車に連結されたグリーン自由席に乗車する場合、グリーン料金はJR線内乗車の場合のみ必要とされた。