宇宙科学研究所
2003年に当研究所と、宇宙開発事業団(NASDA)、航空宇宙技術研究所(NAL)が統合され宇宙航空研究開発機構(JAXA)が発足し、それに伴う改組とともに宇宙科学研究本部という名称となった。しかし2010年には、同機構の一部という位置などに変更はないが、宇宙科学研究所という名称に復帰した。なお1981年以来の「ISAS」という略称は一貫して使われてきている。
大学の共同利用機関でもあり、東京大学大学院理学系研究科・工学系研究科や総合研究大学院大学(物理科学研究科宇宙科学専攻)他の大学院教育としての研究教育活動を展開している。
今後予定しているミッションとして、金星探査ミッション、水星探査ミッション、次期月探査ミッション、次期小惑星探査ミッションなどがある。共同ミッションとしては、国立天文台などと共同で実施しているスペースVLBI計画がある。その他、共同研究ミッションとしては宇宙望遠鏡計画の実現に向けた技術開発や深惑星探査ミッションなども国際共同研究ミッションとして提案を実施した。
ペンシルからミューに至る本流以外にも、多くの小型の技術試験ロケットや観測ロケットが存在する。
アルファロケット(1956年) - カッパに向けた地上燃焼試験機。ロックーンとして飛翔。
シグマロケット(1957年〜1961年) - ロックーン。Σ-4が高度105キロを達成。
パイロケット(1957年) - 全面的に構造にプラスチックを採用。πTが高度2.5キロに到達。
OT-75(1962年) - 鹿児島宇宙空間観測所で初めて打ち上げられたロケット。
HT-110(1965年〜1966年) - 小型高性能観測ロケットの基礎技術研究の為の試験機。
MT-135(1964年〜2001年) - 気象観測を目的とした観測ロケット。1,000機以上が飛翔。
S-160(1964年〜1972年) - MT-135を基に開発された単段式小型汎用観測ロケット。
S-210(1969年〜1982年) - 廉価な観測ロケットを目的としたIX計画において開発された、単段式観測ロケット。
S-310(1975年〜現用) - 南極用観測ロケットとして開発されたS-300の後継機。40機近くが飛翔。
S-520(1980年〜現用) - 単段式観測ロケット。K-9Mの2倍のペイロード能力をもつ。20機以上が飛翔。
MT-110 (1984年) - 南極用観測ロケット。小型高性能を目指したが、要求性能を満たせず2機の飛翔試験のみで計画終了。
SS-520 (1998年〜現用) - S-520にCFRP製の第2段を加えた2段式観測ロケット。小型人工衛星打ち上げの技術実験機。
秋田ロケット実験場 - K-8-10の事故によって使用中止。施設は撤去されて現在は記念碑のみ。
内之浦宇宙空間観測所
能代ロケット実験場 - 宇宙3機関統合に伴い宇宙輸送ミッション本部の管轄となり、名称が能代多目的実験場へ変更されたが、2011年4月1日より宇宙科学研究所へ移管され、名称も戻された。
臼田宇宙空間観測所(直径64メートル東洋一の巨大パラボラアンテナ)
パース、サンティアゴ、マスパロマス、キルナのJAXA追跡局 - 科学衛星打ち上げ時の追跡に使用。
三陸大気球観測所 - 2007年の大気球実験をもって使用停止。
大樹航空宇宙実験場 - 2008年から大気球実験を実施。
ペンシルロケットの炸薬を束にして使った2段式ロケット。全長1.8メートル、直径8センチ。
ベビーS - 発炎筒を組み込んで航跡を追尾できるようにした。高度4キロに到達。
ベビーT - テレメーターを搭載して機械的に追尾できるようにした。
ベビーR - 回収用にパラシュートを搭載した。