立教大学大学院理学研究科・理学部
1953年(昭和28年)には、シカゴ大学原子核科学研究所(エンリコ・フェルミ研究所)で研究員を務めていた田島英三が教授に就任する。田島は1956年(昭和31年)に教授職と兼務で、原子放射線の影響に関する国連科学委員会(UNSCEAR)初代科学担当官に就き、日本人初の国連職員となった。
藤原松三郎(日本の数学界の泰斗)
矢部長克(日本の地質学・古生物学の創始者)
武谷三男(日本の理論物理学の泰斗)/息子とともに
1957年(昭和32年)に、総長であった松下正寿が米国聖公会の平和利用を目的とする提案により誘致した原子力研究所(2001年原子炉運転停止、廃止措置中)を開設するが、設立には武谷が尽力した。遡ること1954年(昭和29年)には、武谷、中川、田島らは原子力に関するわが国最初の教科書である『原子力―教養の科学』を出版している。田島は、放射能汚染調査や原子力安全委員会委員を務めるなど、長く原子力と平和利用の研究に従事したが、学内では1967年(昭和42年)から学部長を務めた。
1963年(昭和38年)頃から、当時助教授であった会津晃が、 武谷を相談役として銀河の研究を開始し、理論研に宇宙物理グループを立ち上げる。 1971年(昭和46年)には蓬茨霊運が着任し、理論研に現在に繋がる素粒子・宇宙の2大グループ体制が作り上げられた。
2002年(平成14年)に生命理学科が設置され、現在の理学部に至る。1949年(昭和24年)に新制大学として認可された際には、聖路加病院と合併することによる医学部の開設が決定されており、理学部はその前段階の教育を担うものとして設置されたという経緯がある。
近年では、物理学科の研究グループでは、JAXAのプロジェクトに参画し、小惑星探査機「はやぶさ2」に搭載した光学航法カメラの開発・運用や、2023年9月に打ち上げられたX線分光撮像衛星(XRISM)の観測装置を開発するなど宇宙関連の研究開発を進めている。 化学科の研究グループでは、2020年に日本曹達株式会社との共同研究で、温室効果ガスとして知られる二酸化炭素を選択的に吸着する新規の多孔性物質(MOF:Metal-organic Frameworks)を開発し、燃料電池車などに搭載する水素貯蔵ボンベにも応用が可能な、世界的に高い評価を受ける研究を行っている。2023年には、神戸大学との共同研究で、人工光合成技術において希少金属を使用しないCO2変換法を開発し、カーボンニュートラル実現に向けてブレイクスルーとなる技術革新の成果を上げている。 生命理学科では、教授の末次正幸が2017年に開発した、細胞を使わずに長いDNAを効率的に合成する世界初の技術「セルフリー長鎖DNA合成技術」が、バイオ医薬の分野で革新的変化をもたらす研究として、「バイオインダストリー奨励賞」を受賞した。本技術を実用化する目的で大学発バイオベンチャー企業のオリシロジェノミクス社が設立された。2023年1月には、同社をCOVID-19ワクチンを扱うバイオ医薬企業世界トップの米Moderna社が評価し、買収すると発表。買収金額は8500万ドル(約110億円)となった。