パルヴェーズ・ムシャラフ
ムシャラフは1999年10月12日に無血クーデターを行い、行政長官に就任。事実上、パキスタンの国家元首となった。その日、ナワーズ・シャリーフ首相はムシャラフを解任し、軍統合情報局(ISI)の局長フワージャー・ズィヤーウッディーンを参謀総長に据えようとした。ムシャラフは外遊中であったが、民間航空機によって急ぎパキスタンに帰国した。陸軍の副官はムシャラフの解任の受諾を拒否したが、パキスタンの法律では参謀総長の解雇は首相の権限であった。シャリーフはムシャラフの乗った機の着陸を阻止するためカラーチー空港の閉鎖を指示したため、機はカラーチー上空を旋回し待機した。クーデターによって軍部はシャリーフの指揮権を剥奪し、空港を奪還した。機は燃料切れの数分前にようやく着陸し、ムシャラフは政府の掌握に取りかかった。シャリーフは自宅軟禁され、後に国外に亡命した。以降、シャリーフやその他複数の民主化運動指導者はパキスタン帰国を阻まれている。情報筋によれば、ムシャラフとシャリーフの確執は、カルギル紛争(英語版)を外交的に解決しようとするシャリーフの意図を巡るものだと言う。
その後、ムシャラフは国会および州議会を解散した。インド政府との対話のためのアーグラー訪問のぎりぎり数日前、2001年6月20日にムシャラフは形式的存在となっていたターラル大統領を事実上解任し、正式に大統領に就任した。
ブットー暗殺事件に関してはパキスタン当局が事情聴取を求めたが応じなかったとされ、2011年2月12日に拘束令状が出された。2013年3月に逮捕猶予を認められたために帰国し、パキスタン総選挙で国政復帰を目指したが、立候補申請が認められなかった。
さらに2013年4月18日には、イスラマバードの高等裁判所から2007年に最高裁長官らを不法に解任、拘束した疑いで警察に逮捕命令が出され、翌19日逮捕された。2014年3月に国家反逆罪で起訴されたが闘う姿勢を示した。病気療養のため2016年からはドバイに滞在し、事実上の亡命生活に入った。2017年7月には日本のマスコミの取材を受け、写真撮影にも応じている。2019年12月17日、大統領時代の2007年に憲法を停止したことが国家反逆罪にあたるとし、本人は亡命中で不在のまま死刑判決を言い渡された。しかしこの裁判が法に則って行われなかったことを理由に、2020年1月13日、ラホールの高等裁判所は死刑判決を破棄し、裁判をやり直すよう命じた。