摩耶 (重巡洋艦)
副長以下769名(士官47名、下士官兵722名)が駆逐艦秋霜に救助され、午後4時前後に大和型戦艦武蔵に横付、摩耶の乗組員を移乗させた。武蔵主計長は永末英一摩耶主計長に「本艦は絶対に沈まないから安心せよ」と梅酒をすすめたという。摩耶航海長も武蔵運用長から同様の話を聞いている。
翌10月24日、栗田艦隊はアメリカ機動部隊艦載機に襲撃され、武蔵は集中攻撃を受けて航行不能となった。摩耶の生存者は自発的に戦闘配置に就き、また武蔵艦橋への命中弾で作戦室にいた摩耶副長・軍医を含む摩耶士官多数が死傷するなど、計117名が戦死した。午後6時30分、武蔵の舷後部に横付けした島風型駆逐艦島風に摩耶乗組員607名と連合艦隊司令部附法務士官4名が移乗したが、武蔵の応急修理作業に従事すべく摩耶士官4名・下士官兵41名が武蔵に残留した。午後7時40分、島風・摩耶乗組員は武蔵沈没時の火柱を目撃した。 翌日以降の戦闘においても摩耶乗組員は島風の水上・対空戦闘に参加し、5名が戦死、8名が戦傷。10月26日午後10時、島風はコロン島(コロン湾)に到着した。最終的な戦死者は470名だった。その後、摩耶の生存者は日本へ帰投する隼鷹輸送部隊(空母隼鷹、重巡利根、駆逐艦《卯月、夕月、時雨》)のうち利根に便乗して日本本土へ向かった。
12月20日、摩耶は帝国軍艦籍より除籍された。
4月18日、ドーリットル隊のB-25ミッチェル爆撃機によるドーリットル日本本土空襲を、本艦は三河湾西浦沖で迎えた。直ちに出撃し、深夜、観音崎沖で近藤長官指揮下の第二艦隊主力部隊と合流する。前進部隊(愛宕、高雄、摩耶、妙高、羽黒、祥鳳)等でアメリカ機動部隊を追撃するが、ウィリアム・ハルゼー提督指揮する第38任務部隊の米空母2隻(ホーネット、エンタープライズ)は既に避退した後だった。だが5月1日深夜、水上機母艦瑞穂が米潜水艦ドラム (USS Drum, SS-228) の雷撃で航行不能となった。重巡2隻(摩耶、高雄)は現場に急行し、沈没する瑞穂から乗組員を救助した。瑞穂生存者を横須賀で下したのち、摩耶、高雄は第6駆逐隊(響、暁、雷)と共に呉へ帰投した。
5月20日に第四戦隊第二小隊(「高雄」、「摩耶」)は北方部隊に編入され、第四航空戦隊(空母「龍驤」、「隼鷹」)と共に第二機動部隊を編成してAL作戦(西部アリューシャン攻略作戦)に参加した。第二機動部隊は5月25日に大湊(または5月26日に陸奥海湾)を出撃し、6月4日と6月5日にダッチハーバー空襲を行った。AL作戦と同時に行われたミッドウェー海戦で日本軍は敗北したがアッツ島とキスカ島の攻略は実施された。そして第二機動部隊などはアメリカ艦隊の来襲に備えた。その後、第二機動部隊などは6月24日までに一度大湊機戻り、6月28日にはキスカ島への輸送部隊掩護のため再び出撃した。