転移RNA
合成サプレッサー伸長tRNAは、遺伝子のコード配列に配置されたナンセンスコドンに非天然アミノ酸(英語版)を組み込むために用いられる。アンバー終止コドンUAGで翻訳を開始するために、合成開始tRNA(metY遺伝子がコードするCUAアンチコドンを持つtRNA)が用いられている。この種の合成tRNA(engineered tRNA)は、UAGコドンで通常起こる翻訳停止シグナルを抑制することから、ナンセンスサプレッサー(英語版)tRNAと呼ばれている。アンバー開始tRNAは、強力なシャイン・ダルガノ配列が先行するUAGコドンに、メチオニンとグルタミンを挿入する。このアンバー開始tRNAの研究により、この系は通常のAUG開始コドンと直交しており、ゲノム再コード化された大腸菌株でオフターゲット翻訳開始イベントが検出されないことが示された。
tRNAの構造は、一次構造、二次構造(通常クローバー葉構造(cloverleaf structure)として視覚化)、および三次構造(すべての種類のtRNAは、リボソームのP部位(英語版)およびA部位(英語版)に適合するように、同様のL字型の三次元構造を持っている)に分解することができる。クローバー葉構造は、一般的なRNAの三次構造モチーフであるヘリックス(らせん)の同軸的スタッキングによって、L字型の三次元構造に折り畳まれる。 tRNA分子の各アーム(腕)の長さ、およびループの直径は、生物種によって異なる。tRNAの構造は次のものからなる。