近鉄12000系電車
1985年からは、本格的な車体更新工事が開始され、12000系同様に前面は方向幕を設置し、客室については内装を12400系などの「サニーカー」と同様の白系の明るい色調のものに、座席は未更新車も含め表地をオレンジ色のものに、座席のリクライニング方式は3段式からフリーストップ式に、床敷物も市松模様から長尺タイプに変更した。トイレのスリガラスを小型化、ないし撤去する改造は引き続き行われたが、屋上のベンチレーターの排気口が外向きから中央向きに変更された。
1990年からは室温と静寂性を保持するため、ク12300形の運転室直後の出入台と客室の間に仕切りを設ける工事を施工した。この際、仕切りのスペースを捻出するために座席を1列分撤去のうえ、その部分の窓も小窓に変更され、併せて衝立を設置のうえ荷物置き場を設けた。これにともなって屋上のユニットクーラー、及び行き先表示器も移設された。これにより定員が変更され、4名減の56名となった。また、モ12200形においても出入台と客室の間に仕切りが設けられたが、もともと設置されていたパーテーションを仕切設置のスペースに転用したため、定員の変更はない。また、運転台の窓は防曇対策として設置されていた長方形の枠(デフロスタ)と窓が撤去され、EWガラス(熱線入ガラス)に交換された。この更新工事にともない、先のスナックコーナー撤去スペースに8座席を設けた12218F・12219F・12220Fの3編成は、扉を運転台直後に配して仕切りを設け、12221F以降の車内見付と同様となった。
B更新対象外とされた初期車の廃車が2000年5月より開始され、2003年6月には本来であれば、B更新対象になりうる中間車S49とS51が需要減によって廃車となり、6両編成の12249Fと12251Fは4両編成となった。また、2004年8月にはS50が廃車となり、同じく6両編成の12250Fも4両編成化され、さらに中間車廃車により、2両編成に短縮された編成が発生した。
2005年には一部編成で団体専用列車への格下げ・形式変更および改番が行われ、この内S32が対象に含まれたことで、12256Fが4両編成化され、本系列から6両固定編成が消滅した。同様にS41が含まれたことで、12241Fは2両編成化された(後に形式が15400系に変更される)。
12000系のKD-68・KD-68Aを改良した近畿車輛KD-71(モ12200形)・KD-71A(ク12300形)を装着する。
当該系列は、18400系とほぼ同時期に製造されたものの、厳密には半月ほど早く18400系が竣工している。スペックにおいては両系列ともほぼ同一で、電動車の台車も同仕様の両抱き式踏面ブレーキだが、付随車については明確に違いが存在する。先行する18400系は、18200系や12000系と同様の両抱き式踏面ブレーキだが、当該系列は、10000系以来の制動力の高いディスクブレーキを採用した。電動車を両抱き式踏面ブレーキ、付随車・制御車をディスクブレーキとするこの組み合わせは、これ以降、近鉄特急では標準となっている。
KD-71台車(電動車用)山側
KD-71A台車(付随車用)山側
KD-71E台車(電動車用)海側
KD-71C台車(付随車用)海側
車両数の整理が一通り完了した2006年以降は12233F・12234F・12239F - 12242F・12249F - 12251F・12253F - 12256FにB更新が行われ、2008年2月の12255Fをもって完了した。なお、B更新工事は車体更新時のような車両単位ではなく、全て編成単位で行われている。
内装材はB更新前を踏襲するが、座席は従来のスライド式リクライニングシートから22000系や23000系、16400系に準じた固めのウレタン材質を採用したバケット型シートに交換された。背ずりは21020系に類似したタイプに変更された以外は22000系に準じ、リクライニング機構はレバー作動のメカ式からボタン作動の油圧式、座席の転換は背起こし式から足踏みペダル式に変更された(自動転換には非対応)。モケットは従来と同一のカクテルレッド(紅色系)である。テーブルはひじ掛け引き出し式からひじ掛け内蔵式に変更され、テーブルそのものも22000系と同一品に交換され、Tc車の空気清浄機設置や一部編成では車内販売準備室の撤去が行われた。
2006年から2013年にかけて12231F・12233F - 12256Fに車体連結部の転落防止幌設置が行われた。
2013年から一部編成で検査時に老朽化したトイレの内装改修工事が行われ、22600系に準じた室内に改修された。
バケット型シート
洋式を男性用化し、和式は洋式化のうえ真空化B更新車の一部に施工された
車内販売準備室の部材は撤去された
転落防止装置
更新後のクーラーキセ:下段が登場時
トイレの換気ベンチレーター:右が更新前(排気口が中央向きに変更されている)
1990年代半ばから特急利用客数が減少に転じ、このために特急車の保有数を暫時減らして対応した。そして車両新造を控えてコストを抑えつつ適正両数での特急運用を維持するために従来の特急車については新製後約30年程度で廃車としていたものを再度車体更新の上で実施し、耐用年数を約40年程度に延長することとした。更新対象は21000系に準じた車内改装が行われたグループとされ、初期車については対象外とした。こうして1998年から2回目の車体更新(B更新)が施工されることになった。
2002年までの更新内容は、まず乗降扉上部に雨樋を取り付け、屋上のクーラーキセを丸みを帯びた形状のものに交換され、機器更新と内装材の新品交換も行われた。
このB更新工事は1998年から2002年にかけて12235F - 12238F・12243F - 12248F・12252Fに行われた。
2011年12月15日に出発式が開催され、合わせて愛称名「かぎろひ」(万葉集でも詠まれ、朝日の美しい空を表す古語に因む)も発表された。
クラブツーリズムでは同年12月23日より当該編成を使用したツアーを開始した。ヘッドマーク(従来の前面方向幕装置を改造)は当初クラブツーリズムのロゴマークとしていたが、2012年3月に「かぎろひ」の愛称表示に取り替えられた。
基本的には他系列と併結せず、2両単独ないし2本連結の4両編成でしか運転されないが、2012年10月15日には、ほぼ同一行程のツアーが重複したことで、本系列2本と15200系15203Fを連結した6両編成が大阪上本町駅 - 伊勢市駅で運転され、2013年5月12日には本系列1本と18400系18409Fが併結した4両編成が運転された。2022年6月にもあおぞらIIと併結している
2019年4月時点の配置検車区は富吉検車区である。
ク15300形
モ15400形
クラブツーリズムのロゴタイプ
かぎろひのロゴタイプ
PNを使用する。
12200系と並ぶ行先・特急表示が撤去された
運転室直後に車内販売準備室があるPN03編成(元スナックコーナー設置車)
復刻塗装のPN04編成