アイメリア亜目
脊椎動物の組織中にたくさんの休眠体を含んだシストをつくり、これが摂食によって他の宿主に移行する。有性生殖は終宿主の消化管上皮細胞内でおこなわれ、この時だけオーシストを作る。トキソプラズマ属、肉胞子虫属、シストイソスポーラ属など9属が知られている。
以下の2科はアイメリア科に近縁である。