南西方面艦隊
直属:第16戦隊:青葉・鬼怒・大井・北上 第19駆逐隊:浦波・敷波・天霧 神威 第3連合通信隊
第一南遣艦隊
第二南遣艦隊
第三南遣艦隊
第四南遣艦隊(東インドネシア担当)
第九艦隊(西部ニューギニア担当。1944年3月25日に南東方面艦隊より編入)
第十三航空艦隊(南西方面艦隊の航空支援を担当)
附属:勝力・聖川丸 第36設営隊