三淵氏
三淵氏は戦国期に入って11代将軍義澄の代にも幕臣として活動していたが、永正5年(1508年)に前将軍義稙が復権して義澄が逐われた後の幕府の記録では確認できなくなる。義澄の遺児義晴は幼少時に播磨守護赤松氏の庇護の下にあり、大永元年(1521年)の義稙の再度の没落により12代将軍として京都に迎えられた。三淵晴員は和泉上守護細川元有の次男として生まれ、母方の伯父にあたる晴恒の養子となったとされるが、義晴に仕えて訴訟の取次や使者を務め、姉の清光院(佐子局)は義晴の側近女房中随一の存在として幕政に深く関与した。晴員には現存する三淵氏の諸系図には見えない「三淵孫三郎」という兄もいて、義晴の上洛後も播磨に在国して赤松氏との取次を務めている。伊賀入道正運の所領が播磨国内にあったことも考え合わせると、三淵氏は義晴が播磨に流遇していた頃から共に在国してその養育に深く関わり、清光院・晴員姉弟が孫三郎に代わって義晴に供奉して上洛し、その功労によって急速に将軍側近としての地位を高めたとみられる。
晴員の長男の藤英、次男の細川藤孝(幽斎)は13代将軍義輝に仕え、永禄の変後は義輝の弟の義昭を将軍に擁立するため織田信長の協力を得るなど奔走した。義昭が15代将軍になってからは幕政の運営に携わり幕府軍の将としても活躍したが、義昭と信長が不和になった後も、信長に属した弟の藤孝と異なり藤英は義昭に仕え続け、義昭が信長に追放された後に長男の秋豪と共に信長から自刃を命じられていったん滅亡した。
藤英の次男で、叔父の藤孝に養育されていた光行は徳川家康に仕えて家を再興し、近江国神崎郡1,000石(子の藤利(尚正)の代に所領を美濃国安八・本巣・山県三郡に移されて上総国山辺郡200石を加増される)を領して子孫は江戸幕府旗本として続いた。