バイキンメカ
初登場回 - TV第744話A「カレーパンマンとしらたまさん」
しらたまさんのお芝居に芝居用小道具として持ち込んだメカ。その名の通りドラゴンの形をしており、全体が深緑色になっている。

バイキンメカバト
初登場回 - TV第1180話B「ゆず姫とちょうちんへいじ」
初登場回 - TV第163話「ふしぎなふしぎなジングルベル」
かびるんるんがトナカイとサンタクロース役をしているばいきんまんのソリ。ジングル山から奪った金と銀の二つの鈴で空を飛べる。バイキンベルロボットにも変形できる。
初登場回 - TV第429話B「かびるんるんとチビもぐりん」
かびるんるん専用の地底戦車。もぐりんを小型にしたメカで、サイズが小さい以外はもぐりんと同じ性能。ドリルを発射することもできる。
氷上タイプ(ひょうじょうタイプ)
初登場回 - TV第1066話B「クリームパンダとドン・キ・ホタテ」
スケート靴のように刃を出して氷上を滑走するように改良されたもぐりん。鼻のドリルで氷を割り、敵を水中に落とす。
初登場回 - TV第1109話A「つららちゃんと氷のスワン」
氷のスワンを捕まえるためのコクチョウ型のロボット。足がスキー板になっている。翼を羽ばたいて強風を起こし、黒い羽を飛ばしたり、口から相手を凍らせる吹雪を吐き出したりして攻撃する。
バイキン潜水艇(バイキンせんすいてい)
初登場回 - TV第531話「いくら姫とおすしの国」
おすしの国へ行くためのタコ型の潜水艇。頭の上に1本の潜望鏡が付いている。
バイキン戦闘機(バイキンせんとうき)
初登場回 - TV第502話A「アンパンマンとつばさくん」
ばいきんまんの顔を模した機首が特徴である戦闘機。チェーンソーを装備している。
バイキン掃除機メカ(バイキンそうじきメカ)
初登場回 - TV第1005話A「ドキンちゃんとアリンコキッド」
モグラ型の地底戦車。TV第19話「アンパンマンともぐりん」で初登場。設計図の完成まで後一歩の所で行き詰まっていたが、ドキンちゃんが当てずっぽうに描き加えた落書きが奇跡的にヒントとなり完成した。四足歩行で地中を潜って移動し、鼻のドリルでどこにでも穴を掘ることができる。舌を伸ばして相手を捕まえたり、物を盗むことも可能。マジックハンドを装備したり、ドリルを射出するといった武装バリエーションも存在する。胴体側面部の爪を伸縮させて攻撃することも可能で、また、ドリルを外すことで水流を放射したり、かびるんるんを放出したりできる。地下の空洞や落下に備えたパラシュートも装備している。かびるんるんが歯車の上を走ることで動力源となっている。また、『キャラクター大全集6』のビデオによるもぐりんの紹介や、TV第679話A「アンモナイトくんとぎんいろの湖」ではやみるんるんが動かしていた。初登場したTV「アンパンマンともぐりん」では燃料を必要としていた。映画『虹のピラミッド』では、めいけんチーズやあめふりアメちゃんが操縦した。カバオくん達やドリアン王女が盗んで乗り込んだせいで壊されたこともある。バイキンUFOから変形する場合や、バイキンUFOを格納している場合もある。映画『よみがえれバナナ島』では、だだんだんから変形した。
初登場回 - TV第21話A「アンパンマンとバイキンロボット」
二足歩行ロボットの新型。頭部の4本のアンテナは操縦桿になっている。ペンチ型の両手と、口から吐き出す光線を装備したり、空飛ぶ円盤に変形したりする。初登場したときは、ばいきんまんの命令で動く自律歩行タイプだった。その後は大型化し、ばいきんまんが中で操縦するようになった。だだんだん2号に似ているが、こちらは顔のつなぎ目がなく、脚が細身である。こちらもだだんだんとして扱われることが多い。TV第500話の中編「アンパンマンのひみつ」では、背中にロケットエンジンを取り付けて空を飛んだことがある。漫画『とべ!アンパンマン』では、黒いタイプのバイキンロボットが登場し、アンパンマンが操縦したことがある。 ばいきんまんロボット 初登場回 - 映画第1作『キラキラ星の涙』 バイキンロボットのバリエーションで、もぐりんを改造して作った踏み潰しロボット。内部には脱出用のバイキンUFOやドキンUFOが隠されている。ドロンコ魔王にそそのかされてアンパンマンたちを襲うが、おむすびまんにコントロールを奪われドロンコ魔王に攻撃し、魔王の反撃でバラバラにされた。
初登場回 - TV第409話「アンパンマンとブラッククリスマス(後編)」
トナカイの骸骨を模した自律行動型のロボット。2台でサンタクロース姿のばいきんまんが乗るソリを引いて、ブラッククリスマスを運んでくる。
海賊バイキング号(かいぞくバイキングごう)
初登場回 - TV第178話B「アンパンマンとかいぞくバイキング」
ナンドバットから奪った空飛ぶじゅうたんとバイキンUFOを組み込んで作った空飛ぶ海賊船。かびるんるんが入っている樽を撃ちだす大砲を装備している。
かき氷マシーン(かきごおりマシーン)
初登場回 - TV第950話A「あかちゃんまんとランドセル島」
巨大なかき氷機。見た目は手回し式だが、マシーン自身がマジックハンドでハンドルを回し氷を削るため全自動式である。ばいきんまんが暑さに耐えかねて使ったが、ショートして爆発し、ドキンちゃんの絵日記帳をボロボロにしてしまった。
その後も頭の上半分をアンパンマンにもぎ取られてブラックノーズの攻撃を受け止める盾にされるなど、散々な目に遭う。
お天気だだんだん(おてんきだだんだん)
初登場回 - 2010年TVスペシャル「赤鼻チャッピー 勇気のクリスマス」
気象を自由に制御する能力を持っただだんだん。口から黒雲を発生させ、背中のランドセル型のエンジンには、空を飛ぶためのジェットエンジンや気象を変化させる機能を持ったパラボラアンテナが組み入れられている。腕部を伸縮させたり、回転させたりして攻撃する。ホラーマンがボタンを押すと、雷に直撃されてしまう。吹雪でサンタクロースをクリスマスの谷に釘付けにし、プレゼントを奪う作戦に使用された。赤鼻のトナカイ・チャッピーとクリームパンダにプレゼントを奪還され、さらにロールパンナのローリングハリケーンで黒雲を取り払われた挙句、アンパンマン・カレーパンマン・しょくぱんまんのトリプルパンチでバラバラにされてしまった。
新型(しんがた)
初登場回 - TV第1082話B「プリンちゃんとだだんだん」
股の部分の設計が異なる事以外は2号の外見をしているだだんだん。相手をおびき寄せる為の人形を胸部の中に装備したり、カメレオンのように体色を自由に変えたりする事が出来る。プリンちゃんとエクレアさんが操縦した事があり、彼女らにおもちゃと勘違いされていた。映画第24作『よみがえれ バナナ島』では、頭部が回転したり、おやつの入った隠し扉が存在したり、平泳ぎで海中を進んだり、バイキンUFOからではなく直接もぐりんに変形したりという数々のギミックが搭載されている。しかし、バナナの皮だけですべって転び大破してしまったこともある。
初登場回 - TV第734話B「クリームパンダとやっこだこくん」
カイトくんの形をした、空飛ぶ凧型メカ。正面がばいきんまんを模した顔になっており、下にあるジェットエンジンで空を飛ぶ。また、口からハンググライダーのかびるんるんが出て攻撃する。

バイキンカスタネット
初登場回 - TV第1177話A「みみせんせいとカスタネットくん」

バイキン型カプセル(バイキンがたカプセル)
初登場回 - TV第1114話A「クリームパンダとみずうみ姫」
みずうみの国をどろみずまんと襲っている時にもぐりんから放出されたカプセル。王冠を奪って眠らせたみずうみ姫を中に入れてみずうみの国の外に向かって流した。中には枕、クッションが置いてある。
初登場回 - 映画第30作『かがやけ!クルンといのちの星』
ばいきんまんがいのちの星の故郷に行く時に使った紫と金色の巨大なUFO。中にバイキンUFOやドキンUFOをしまっておける。バイキンUFOのようなアンテナがあり、アームも使う事が出来る。映画第31作『きらめけ!アイスの国のバニラ姫』では、潜水艇やだだんだんに変形出来る事が判明し、さらにはバイキンアイスロボのコアとしてアンパンマン達と対決もした。
人食い花メカ(ひとくいばなメカ)
初登場回 - 映画第4作同時上映「あかちゃんまんの大冒険 - アンパンマンとゆかいな仲間たち(Aパート)」
食虫植物を参考にして作ったロボット。通常のメカと違い、自律行動。頭の上の複数の花でアンパンマンたちを捕らえた。
初登場回 - TV第44話B「アンパンマンとカレーまつり」
バイキンUFOの装備で、ばいきんまんの顔を模した野球用のボールを投げて攻撃するメカ。様々な球種を投げることができ、ストレートや変化球で相手を翻弄する。カレーパンマンには撃ち返されて反撃されることが多い。
バイキン風車ロボ(バイキンふうしゃロボ)
1号(1ごう) 初登場回 - TV第248話B「ドン・キ・ホタテの宝さがし」 バイキンUFOからの変形ロボット。手足はバイキンロボット型で、球体の胴体に風車を装備し、強風を起こす。風車はドリルにも変形する。
2号(2ごう) 初登場回 - TV第615話「ホラーマンとドン・キ・ホタテ」 漆黒の風車型のロボット。カニバサミ型アームで相手を捕えたり、強風を起こして攻撃する。アンパンマンとしょくぱんまんを苦戦させたが、ドン・キ・ホタテに騎士道精神を仕込まれたホラーマンのホネブーメランで動きを止められ、ダブルパンチを喰らい破壊された。
大型の二足歩行ロボットで、バイキンメカの中ではもぐりんと並んで代表的な存在。丸い顔の真ん中につなぎ目があって、胴体は縦長。体色は全体的に灰色。複数のバリエーションや強化型がある。1号は腕が無く踏みつぶしやカビ攻撃しかできなかったが、2号以降はペンチ状の両腕がつくようになり戦闘技術も増えた。脚部が太いものが基本形だが、バイキンロボット型の脚が細いタイプのロボットも「だだんだん」とばいきんまん自身が呼んでいる。ばいきんまん(声 - 中尾隆聖)が歌う『ダ ダン ダン!』というテーマソングもある。映画『だだんだんとふたごの星』以降、「ダダンダーン!!」とうなったり、ダメージを受けた際に「ダ...ダ...」と言うなど、しゃべる(または起動音を上げる)ことが多くなった。地響きを立てて進む効果音から命名された「だだんだん」というネーミングは、やなせの自信作であり、戦闘用ロボットにしては愛嬌があるデザインもやなせのお気に入りである。香美市立やなせたかし記念館のアンパンマンミュージアムには、ジャイアントだだんだん(『だだんだんとふたごの星』より)の像が建てられている。
1号(1ごう)
声 - 中尾隆聖
初登場回 - TV第16話A「アンパンマンとだだんだん」
口の中の大砲からカビの花だらけにして固める黒い液体を放射する。森をカビだらけにして支配しようとするが、カバオくん達の作戦によって転倒し頭部のみとなってしまい、最後はジャムおじさんが作ったカビ取りマシーンによって破壊された。なお、ばいきんまん自身が乗っていた事を秘密にして無人メカだと思わせていたが、「カビパンパン」や「ペチャンコパンパン」と言ったことでアンパンマンやカバオくん達に正体がばれてしまっている。
初登場回 - TV第1276話B「ロールパンナとリンゴの国」
巨大なコウモリ型のロボット。口の中の大きなストローからリンゴを吸い取ったり、強風やボールを出したりする。大きな羽で強風を起こしたり、空も飛べる。コウモリの王様だとストローこうもりに嘘をつき、りんごの国からリンゴを取って来させるが、最後はアンパンマンとロールパンナに倒された。
初登場回 - TV第174話A「アンパンマンとフワフワ光線」
ばいきんまんが作ったピストル。当たるとなんでも重さを自由に変えられるフワフワ光線を発射する。
初登場回 - TV第578話A「ほたる姫とほたる王子」
ホタル型のロボット。ホタルがモチーフなため、羽で空を飛ぶ事ができる。ホース状の両手の先から噴射する汚いエキスが武器。TV第762話B「クリームパンダとほたる王子」では、ほたる王子を除くほたる池の住人を胸部の吸引機で吸い込んで攫ってしまう。
初登場回 - TV第716話B「クリームパンダとバナナ島」
エイ型の巨大メカ。「エイリマン」に変装したばいきんまんとドキンちゃんが操縦する。口から出す強風や尻尾を鞭のように操って攻撃する。バナナマンたちからバナナ料理を奪うために子供たちを人質にするが、クリームパンダの機転で制御を奪われてしまい、アンパンマンに敗れた。
エネルギー銃(エネルギーじゅう)
初登場回 - TV第48話B「アンパンマンととぶ木馬」
強いエネルギーを発射するバイキンUFOの装備。
初登場回 - TV第633話A「アンパンマンとガブリン」
もぐりんの改造メカ。ワニのような大きな口で何でもかじってしまう。学校や街中、チーズの犬小屋までもかじり取ってしまった。顎の力は非常に強く、アンパンマン号のノーズパンチすらも正面からなら受け止めてしまう。もぐりん同様、かびるんるんが動力源になっている。
サブマリンUFO(サブマリンユーフォー)
初登場回 - 映画第12作『人魚姫のなみだ』
厳密に言えばメカではなく、バイキンUFOの変形メカ。スクリューで動くもぐりん型の潜航艇。マジックハンドや、かびるんるんが乗る潜航艇を装備している。うずまき城を襲うが、ゴロンゴラにヒトデに変えられてしまい、尻尾で吹き飛ばされた。
新型バイキンUFO(しんがたバイキンユーフォー)
初登場回 - TV第169話B「アンパンマンとカンタンシスターズ」
ばいきんまんが改良したUFOで、V字型のアンテナをつけているのと側面部に装備が増えているのが特徴。飛行能力が向上しているほか、強化したマジックハンドで岩をも砕く「ハンマーパンチ」を繰り出す。しょくぱんまん号と対決するが、しょくぱんまん号のターボエンジンで吹き飛ばされ、湖に落とされた。
バイキンUFO改良型(バイキンユーフォーかいりょうがた) 初登場回 - TV第169話B「アンパンマンとカンタンシスターズ」 上記の新型バイキンUFOを、かんたんシスターズを騙して改造させたもの(この時、ばいきんまんとドキンちゃんは聖飢魔IIのような扮装をしており、演奏ツアー中に車が故障したと偽った)。アンテナはネジ型で、通常のバイキンUFOよりコクピットが広い。ターボエンジンを装備して高速飛行できる他、アンパンマンとしょくぱんまんのダブルパンチにもビクともしない装甲を誇る。しかし、ドキンちゃんが余計なボタンを押してしまったため、ジェットエンジンが誤作動し、地中深く潜り込んでしまった(ばいきんまんとドキンちゃんは緊急脱出装置で脱出した)。この回のラストは、ジャムおじさんとアンパンマンが視聴者に自転車の安全運転を促すものだった。
バイキンスプレーUFO(バイキンスプレーユーフォー)
初登場回 - TV第251話A「アンパンマンとスプレーくん」
バイキンUFOの改造の一つ。スプレー式になっている。「バイキン香水」というとても臭そうなにおいのする香水が、下の瓶に入っている。
初登場回 - TV第393話「フルーツ島をすくえ!」
トンボを模した偵察用の告げ口メカ。空を飛びながら見たり聞いたりしたことをばいきんまんに報告する。
どんぶりUFO(どんぶりユーフォー)
初登場回 - TV第422話B「アンパンマンとどんぶり山」
丼鉢型のUFO。どんぶり仙人に変装したばいきんまんが使用した。中にはかびるんるんが沢山詰まっている。
2号(2ごう)
初登場回 - TV第521話A「アンパンマンとどんぶり星人」
初登場回 - TV第38話A「かえってきたあかちゃんまん」
恐竜の骸骨を模した自律歩行タイプのロボット。肋骨が檻になっていて、口から吸い込んで閉じ込めてしまう。バラバラになってもすぐに再生するが、頭蓋骨が弱点。
バイキン三角ロボ(バイキンさんかくロボ)
初登場回 - TV第214話B「アンパンマンとさんかくまん」
バイキンUFOからの変形ロボット。口から発射する三角形の積木弾が武器。
初登場回 - TV第24話B「アンパンマンとかびるんるん」
怪獣型のぬいぐるみメカ。中にかびるんるんが入って動かしている。アンパンマンから顔のあんパンをもらって力を減らそうとする。
グレートバイキンZ(ぐれーとばいきんゼット)
初登場回 - TV第580話B「クリームパンダとおもちゃ天使」
巨大なねじ巻き動力式ロボット。口から泥水を吐き出すことが可能。完成してすぐにねじの巻きすぎでバラバラになってしまい、その後おもちゃ天使のタクトを奪って再生したが、ばいきんまんが「おもちゃを愛する心」を持っていなかったために暴走してしまう。アンパンマンに泥水を浴びせてダウンさせたが、ばいきんまんにも泥水を浴びせるなど暴走が止まらず、最終的にアンパンチでばいきんまんもろとも吹っ飛ばされてしまう。
口から光線を発射する。バイキンUFOからの変形、バイキンUFOへの変形も可能。序盤に登場し、メコイスの壺を奪うことに成功するが、壺を開けようとした際に腕が破損。以後はずっとバイキンUFOに変形していたため、アンパンマンとも戦わなかった。
『あかちゃんまんの大冒険』(『アンパンマンとゆかいな仲間たち』のAパート)に登場した3号は、素早く乗り込めるように操縦席が頭の上に付いている。両手に持っている2本の大きなハンマーが武器。アンパンマンたちをモグラ叩きにするがあかちゃんまんにだけは逃げられ、怒って鉄のハンマーに持ち替えたところ、あかちゃんまんがみるくぼうやのミルクでパワーアップ。ほぼ一方的に倒された。
4号(4ごう)
初登場回 - TV第598話B「プリンちゃんとめいけんチーズ」
全体の色が濃い群青色をしただだんだん。プリンちゃんとエクレアさんを捕まえるが、脱出装置のボタンを押されて操縦していたばいきんまんが逃げ出されてしまう。
飛行型(ひこうけい)
初登場回 - TV第423話A「アンパンマンとそらとぶだだんだん」
背中に付けたロケットエンジンで、自由に空を飛べるようになっただだんだん。体当たり、胴体の中の大砲、また足の裏で挟み込んで攻撃する。ロケットエンジンの推力はトリプルパンチをものともしない。アンパンマンたちを苦戦させたが、メロンパンナの挑発で隙ができたところで、片方のエンジンを破壊され制御できなくなり落下、最後の悪あがきとしてパン工場に墜落しようと特攻をかけるも三度目のトリプルパンチで破壊された。この機体の登場以降、だだんだん系統のロボットにはロケットエンジンが搭載されることが多くなる。
初登場回 - TV第58話B「アンパンマンとかつぶしまん」
猫型のロボット。かつぶしまんを倒すために作られた。魚の骨を投げて攻撃する。かつぶしまんとの初戦で、彼の気合声により故障してしまう。プロペラを装備した催眠メカにより、町の子供たちをネコそっくりに洗脳してかつぶしまんに再度挑むが、アンパンマンを洗脳するときに、かつぶしまん直伝の気合声で催眠メカが壊され、敗退した。
ネックレス爆弾(ネックレスばくだん)
初登場回 - TV第345話A「コーヒーパンマンとかいじゅうモカ」
ウサギの女の子に変装したばいきんまんがモカをコーヒー湖から追い出す為に使用した、大きなネックレス型の爆弾。モカの首にかけてから遠隔操作で炸裂させ、モカに縛り付けられたバルーンで遠くへ追いやってしまう。また、リモコン操作ではバルーンを割る事もできる。
ネバネバ銃(ネバネバじゅう)
初登場回 - TV第1051話B「たぬきおにとおむすびまん」
粘着性のある弾を打ち出す拳銃。おむすびまんを倒すのに時間がかかっているたぬきおにに痺れを切らしたばいきんまんが使用した。おむすびまんの動きを止めてしまう。
初登場回 - TV第528話B「アンパンマンとシューズマン」
シューズマンのスニーカー、スパイクさん、ブラックさんに作らせたブーツ型のメカ。踵にブーメラン、爪先に水鉄砲を装備している。