杵築駅
単式ホーム1面1線と島式ホーム1面2線、合計2面3線のホームを持つ地上駅。木造駅舎を有する。
待合室にはキヨスクがあったがすでに閉店している。キヨスクのあったスペースはその後改装され、2015年に杵築市観光協会の観光案内所が設置された。JR九州サービスサポートが駅業務を受託する業務委託駅であり、みどりの窓口が設置されている。ICカードSUGOCAを自動券売機、窓口にて購入できる。
改札口には関所風の木製の門が設置されている。