大和神社
当初の鎮座地は、現在の鎮座地の東方の山麓大市の長岡崎(現・桜井市穴師および箸中の付近)であるとみられ、後に現在地に遷座したとされるが、遷座の時期ははっきりしない。一説には現在の長岳寺の位置であるという。長岡崎が長岳寺付近の丘陵を指す可能性もある。
朱鳥6年(692年)、持統天皇は藤原京の造営にあたって、伊勢・住吉・紀伊の神とともに当社に奉幣し伺いを立てている。寛平9年(897年)には最高位である正一位の神階が授けられた。『延喜式神名帳』には「大和国山辺郡 大和坐大国魂神社 三座」と記載され、名神大社に列し、月次・相嘗・新嘗の幣帛に預ると記されている。後に十六社に、白河天皇の時代には二十二社の一社ともなった。
平安時代初期までには諸国に神封327戸という天照大神を祀る伊勢神宮に次ぐ広大な社領を得、朝廷の崇敬を受けて隆盛した。しかし、平安京への遷都や藤原氏の隆盛、永久6年(1118年)の火災などにより衰微していき、天正11年(1583年)の火災によって神領の書類をすべて焼失した。こうして中世には社領を全て失ってしまった。
1871年(明治4年)、官幣大社に列せられた。江戸時代に社殿が寺院様のものに作り変えられていたので、官幣大社列格の際に新たに社殿が造営された。
1948年(昭和23年)に神社本庁の別表神社に加列されている。