スタンゲロチャンプサ
Wu らは系統解析を用い、スタンゲロチャンプサをブラキチャンプサ(英語版)と最も近縁な位置に置いた。これに次いでアルバートチャンプサ(英語版)やハイラエオチャンプサが近縁とされ、これら4属と早期に枝分かれした3属にアログナトスクス(英語版)とケラトスクス(英語版)およびワンナガノスクス(英語版)があり、中生代から暁新世にかけてのアリゲーター亜科の大多数がひとまとまりの系統群を亜科内に構築する結果となった。Brochu (1999) でのアリゲーター上科の系統解析では、スタンゲロチャンプサとブラキチャンプサはアリゲーター科から除外されることになり、またスタンゲロチャンプサとアルバートチャンプサは同属異名であることが示唆された。Brochu (2004)と Hill and Lucas (2006)では、スタンゲロチャンプサはアリゲーター亜科から除外され、アルバートチャンプサはスタンゲロチャンプサの姉妹群とされた。
以下は形態・分子・層序情報を用いた Lee & Yates (2018) の研究結果に基づくクラドグラムであり、グロビドン類におけるスタンゲロチャンプサの系統的位置を示す。
一方で Bona et al. (2018) の系統解析ではスタンゲロチャンプサはアリゲーター科として位置付けられており、特に以下のクラドグラムで示すようにステムカイマンに置かれている。