卵菌
ミズカビ群とツユカビ群は単系統群を形成すると考えられており、この単系統群は core oomycetes とよばれる。
卵菌の初期分岐群の特徴から、卵菌の原始形質は海産で単純な全実性、内部寄生性であると考えられており、このような状態から、core oomycetes の共通祖先において淡水・陸上への進出、発達した菌糸体や腐生性の獲得が起こったとも考えられている。ただし、core oomycetes の中にも海産、全実性、内部寄生性の種は存在し、このような方向への進化および逆方向への進化が何度も独立に起こったことが示唆されている。また、有性生殖における配偶子嚢・配偶子の雌雄分化も core oomycetes に限られているが、同型配偶子嚢接合の種も知られており、このような雌雄分化はミズカビ群とツユカビ群で独立に起こった可能性も示唆されている。ツユカビ群の中では、陸上植物絶対寄生性への進化が、シロサビキン目とツユカビ目において独立に起こったと考えられている。
ツユカビ目は、植物絶対寄生性のツユカビ目(狭義)と腐生能をもつフハイカビ目に分けることもある。しかし分子系統学的研究によって両群は連続的て明瞭に分けられないことが示されており、2023年現在ではふつうツユカビ目(広義)にまとめられている。また、ツユカビ目の中でツユカビ科とフハイカビ科に分けられているが、分子系統学的研究に基づいて、後者から前者へ移された例(エキビョウキン属 Phytophthora など)も多い。
このように直接発芽する遊走子嚢は、分生子 (conidium) ともよばれる。
遊走子は、基本的に細胞腹面(側面)から生じて前後に伸びる2本の不等鞭毛をもつ(上図3d(b))。例外的に、サカゲフクロカビ属(Anisolpidium; サカゲフクロカビ目)では、細胞前端付近から前鞭毛のみが生じている。ストラメノパイルに属する他の生物と同様、前鞭毛には管状小毛(管状マスチゴネマ)が付随した羽型鞭毛であり、後鞭毛はこれを欠く尾型鞭毛である(上図3d)。遊走子が着生する際には、遊走子細胞内に存在する細胞壁物質を含んだ小胞がエクソサイトーシスされて細胞壁を形成してシスト化する。
ミズカビ亜綱の種は、2本の鞭毛が細胞前端付近から生じている遊走子と、細胞腹面から生じている遊走子をもつことがあり、前者を一次遊走子 (primary zoospore, auxiliary zoospore)、後者を二次遊走子 (secondary zoospore, principal zoospore) とよばれる(上図3d, 5)。このような遊走子の二形性は二回遊泳性 (diplanetism) ともよばれる。ミズカビ属(Saprolegnia; ミズカビ目)では、菌糸先端の遊走子嚢から放出された一次遊走子は着生、鞭毛を吸収して細胞壁を形成しシスト化し、そこから1個の二次遊走子が生じて再び遊泳する(下図5)。