日本独立リーグ野球機構
日本に存在する他の独立リーグのうち関西独立リーグ(通称・さわかみ関西独立リーグ、旧・BASEBALL FIRST LEAGUE)および北海道ベースボールリーグ(2020年創設)、日本海オセアンリーグ→ベイサイドリーグ(2022年創設)は加盟していない。このうち、関西独立リーグについて2020年9月に広尾晃が、代表者が同年2月にIPBLの会議に出席して加入の意向を伝えた(まずは準加盟を目指す)こと、IPBL会長の馬郡健も「独立リーグの仲間が増えることは非常に頼もしく、うれしいことです」と基本的には歓迎する姿勢を示し「新しく加盟を目指すリーグには運営体制や運営ルール、また契約ルールなど条件を確認させていただくこと、また機構の理念などに共感いただき、新しい独立リーグの形を一緒につくっていくことを確認させていただきたい」と述べていることを報じている。2022年の申請時には加盟を容認する意見も出たとされるが、同年の加盟は見送られた。2023年9月発行の雑誌インタビューでリーグ代表の仲木威雄は、2023年に至るまで申請を提出しながら加盟承認に至っていないことを認め、機構側が示した加盟への課題対応を意識しながらシーズンを過ごしていると述べるとともに、選手の雇用形式について「(引用者注:次回の)加盟申請までに(中略)まとめて、提示をする予定」と話し、2024年の加盟を目指す意向を示した。