全日本民主医療機関連合会
みどり病院
総合病院水島協同病院
玉島協同病院
コープリハビリテーション病院
総合病院岡山協立病院
岡山東中央病院
林道倫精神科神経科病院
岡山ひだまりの里病院
西淀病院
耳原総合病院
コープおおさか病院
東大阪生協病院
2001年に民医連は自身の理念や行動について、「党派性を指摘する人もいるが、医療政策が一致すれば、どの政党とも協力する」(事務局長) としており、民医連が実行委員会を構成する集会 に於いては、与野党に関わらず国会議員の出席を要請している。民医連が行った看護師を増やすよう求める請願は、日本共産党・民主党・社民党の3党議員が紹介議員となっている。機関紙「民医連新聞」と公式サイトにて、立憲民主党と日本共産党が小選挙区での候補一本化させる野党共闘の支持表明している。
なお、2003年に肥田泰会長(当時)は、「民医連として特定政党の支持を職員に強制することはない」としており、「憲法の定める政治活動の自由を保障している」と主張している。同年に自民党は機関紙「自由民主」にて、共産党の議員の供給源の一つとなっていると述べている。
2005年に全日本民医連加盟の柳原病院を中心とした「職員と友の会有志でつくる日本共産党後援会」は総選挙のために「私たちにとっての課題、医療・福祉を守るために、総選挙で日本共産党への支持を大きく広げていこう」と決起集会を開いた。
2006年には地方選挙や参院選挙での日本共産党の躍進を目標とした「全日本民医連有志日本共産党後援会」の各県連・事業所代表者会議が開催された。