阿蘇駅
相対式ホーム2面2線を有する地上駅である。互いのホームは構内踏切で連絡している。国鉄末期の1982年(昭和57年)11月から交換設備の使用が停止され1面1線で運用していた頃があった。
JR九州サービスサポートが駅業務を受託する業務委託駅であり、きっぷうりばが設置されている。また、駅レンタカー営業所がある。楽チャリ設置駅。
2013年(平成25年)10月より運行を開始した団体専用列車・ななつ星 in 九州の停車駅である。またななつ星in九州の運行開始と同時に、同列車の利用客に朝食を提供するレストラン「火星」が2番のりばホーム上にオープンした。ななつ星in九州の利用客以外も、有効な乗車券または入場券を所持していれば利用可能である。
また、駅構内には産交バス阿蘇営業所の事務所も併設されバスの待合施設や案内窓口・自動券売機なども設置されており、阿蘇市内より発着する路線バスの結節点としたバスターミナルとしての機能も持っている(車庫は駅舎とは別の場所にある)。
駅舎内には観光案内所と食堂がある。
改札口(2015年12月)
ホーム(2020年9月)