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検索の方式は、大まかに無指定方式、選択方式、コマンド方式の3つに分けることが出来る。
無指定方式は1つの検索ボックスに検索キーワードを入力し、書名・著者・出版社・出版年などの全てを対象に検索する方式であり、選択方式は検索したい条件を指定した上で検索する方式である。選択方式は、比較的平易な検索方式であるが、検索の度にメニュー画面を通して検索をしなければならないため、慣れた利用者からするといくらか冗長になってしまう恐れがある。対して、無指定方式はただ一つの検索ボックスに検索語を入力するのみで検索を行なうことができ、最も利用者に親切な方式となっており、無指定方式が2010年代以降の主流となっている。
コマンド方式は選択条件などをコマンドのみで指定する方式であり、ある程度の技量を持つ利用者であれば多彩な検索を行なうことができたが、初心者の利用が比較的難しいものとなっている。図書館によって提供されるコマンドの細部は異なっており、標準規格の策定を求める声も存在したが、日本では採用館の数を減らしている。