同人誌印刷所
スクリーントーンがしっかり貼られていない。トーンの不適切な重ね貼りやベタにムラがある。薄墨を使用している等。またトーン自体の品質が悪い場合や、しっかりとトーンが貼られていない場合、トーンが浮いて白く印刷される、或は剥がれ落ちて再現が不可能となる原因となる。後者はモアレや線が飛ぶ(かすれる)などの現象を引き起こし、印刷の品質を維持できない原因となる。
同人誌印刷所に入稿された原稿は、面付(4面付か8面付。大台印刷の場合は16面付や32面付)され、製版される。これまで広く使われていたダイレクト製版に変わり、ほとんどの印刷所で紙原稿をスキャナーで読み取り、CTP製版で印刷版を出力する印刷所が主流である。ダイレクト製版では、印刷版は紙をベースにしたもので、版の色からシルバー版と呼ばれているものを使用する。主に大部数印刷の場合は、CTPでアルミプレート(PS版)を製版する事が多い。
カラー原稿の場合、原稿をスキャナーで読み取ってCTPで出力し、印刷版にレーザーで焼き付ける行程である。印刷には正確な位置合わせが必要なため、印刷版はアルミニウムを支持体にしたPS版が使用される。
デジタル原稿の場合、白黒原稿でもカラー原稿でも、原稿データから直接印刷版を出力できるCTPシステムで製版される。
かつて同人誌印刷で広く使われていたダイレクト製版は、デジタル化の浸透によりほとんど廃れていっている。また、原稿のデジタル化も進んだため、コスト削減のために紙原稿の製版設備を備えない印刷所も2017年現在では少なくなく、紙原稿を入稿する時は追加で製版料金を請求したり、紙原稿の入稿をそもそも受け付けない印刷所も現れている。
印刷版に出力する作業が行えない。またファイルネームも印刷所によって指示、推奨がされている場合があり、ファイル名がページを示すことによって乱丁、落丁の原因となる可能性がある。
入金トラブル
原則として前金の業者が多く、締切に原稿が間に合っていても入金がされていない場合に印刷にとりかかれない、最悪納品日までに入金がないために商品の引渡しがされないといった事態につながる。また、入金の控えを保存していないために、入金の確認をとるのに時間を要し、その間、作業が滞る事態も見受けられる。
日本の税法上、主たる収入の他に、副収入が一定額以上であると、確定申告をして納税する必要がある。同人誌の売り上げで、この収入が一定額以上になった(と思われる)同人作家に対し、税務署が事情を聞く事がある。1997年、共信印刷が税務署から申告漏れを指摘された。これにより、税務調査で顧客名簿を入手した税務署が、同人誌の売り上げで一定額以上の副収入を上げている(と思われた)同人作家に対し、同人誌の在庫数や収支記録の提出を求めた事例があった。
1970年代から1980年代初頭の同人活動で作成されていた同人誌は、主にガリ版や青焼で作成されていた。これは、当時オフセット印刷の価格が高く、また印刷所からは最低でも1000部は発注することを要求されていたからだった。これに対し、1980年代から、50部や100部からの少部数を対象に、比較的低価格で、なおかつ高品質なオフセット印刷で同人誌を印刷する業者が登場した。これが現在の同人誌印刷所の原型である。
同人活動の拡大とともに、同人誌印刷所の数も増加していったが、バブル経済崩壊後は不況のアオリを受けて撤退、あるいは廃業した業者も少なくない。
印刷料金を入金する。基本的に前払い。事前にメールやFAXで見積もりを出してもらうと良い。印刷料金は窓口で払う、銀行振込、ゆうちょ銀行の普通為替を送る、クレジットカード決済などの方法がある。
締切を守って入稿したのに、納品された同人誌の品質が低い。ベタムラ、インクの濃度が低くグレーで印刷されたようになっている、印刷面を指でこするとインクの色が移るなど。また、表紙に著しい傷がついている、製本がしっかりされておらず、本文などが剥がれ落ちてバラバラになってしまう等といった場合もある。また指定と異なる商品が納品される事例も存在する。ただし、こうした劣悪な品質の本が少数で余部でまかなえる場合はこの限りではない。
防水加工された印刷物による手提げ袋も一部のサークルで販売されている。使用時に宣伝効果が見込まれるので必要以上に大きい手提げ袋を用意するなど、力を入れている業者もある。