国鉄バス
こうして、国鉄バスの高速バス路線は拡大されていった。しかし、1960年代半ば以降、国民経済の発展と自動車の大衆化、道路網の整備・拡大は、バス時代ではなくマイカー時代の到来という結果を生み出した。この時期を境に、バス利用者の減少が始まり、国鉄・公営・民営を問わずバス事業の経営は悪化していった。国鉄バスにおいては、その経緯から地域開発路線を多く抱えていたため、その影響も著しく、深刻なものとなっていた。このため、1968年には「国鉄自動車経営改善委員会」が設置され、不採算路線の削減を中心とする路線網の再編成を含めた大幅な合理化施策の方針を打ち出した。
また、国鉄自体の経営も悪化していたため、国鉄諮問委員会ではローカル線のあり方についての意見を提出し、「83線区2600キロ(俗に言う「赤字83線」)の鉄道線については、便益性を十分に確保する見通しを立てた上で自動車輸送に委ねるべきである」と勧告した。国鉄財政再建推進会議や財政制度審議会においても同様の指摘が行われたのを受け、1969年には赤字鉄道線のバス転換を図ることが閣議決定された。この方針に伴い、1972年には三国線・鍛冶屋原線など5線区の鉄道線が廃止され、国鉄バスによる代替輸送が実施されることになった。同年、経営改善計画をさらに発展させ、路線の役割を明確にし、都市間路線・観光路線については鉄道との一貫した輸送体制の整備等の積極的な営業施策、それ以外の路線では、沿線利用者の同意等の条件を勘案しつつ路線の再編成を行うこととされた。
白棚線
磐城南線
磐城北線(→福島交通)
塩原線
日塩線(→那須塩原市営バス)
矢板北線(→那須塩原市営バス、矢板市営バス)
矢板南線(→さくら市営バス)
常野線 茂木 - 芳賀黒田(廃止) 芳賀黒田 - 烏山(→那須烏山市営バス) 烏山 - 小川辻町 - 馬頭 - 藤沢(→那珂川町営バス・那須烏山市営バス) 藤沢 - 大内 - 盛泉(廃止) 盛泉 - 常陸大子(→茨交県北バス→茨城交通) 大内-五輪場(廃止)
馬頭線(廃止)
来目木線(廃止)
小貝線(→市貝町営バス)
水都西線 宇都宮一条町 (現・東武駅前) - 宇都宮 - 祖母井 - 茂木 茂木 - 長倉宿 - 赤沢(廃止、後に茂木 - ツインリンクもてぎが復活。)
山ノ内線(廃止)
板戸線(廃止)
桑島線(廃止)
道地線(廃止)
八ツ木線(廃止)
水都東線 水戸 - 赤沢(廃止) 水戸 - 赤塚(→関東鉄道) 赤塚 - 中丸 - 双葉台 - 三夜前 - 谷津三叉路 - 木葉下 - 常陸小松 - 石塚上町(廃止) 谷津三叉路 - 杉崎 - 内原(廃止)
飯沼線 赤塚 - 常陸高田(→茨城オート→茨城交通) 常陸高田 - 飯沼(廃止)
柿岡線(→関東鉄道→関鉄グリーンバス)
羽鳥線(廃止)
水戸南線(廃止)
涸沼線(廃止)
北常陸線(→椎名観光バス)
高萩線(→椎名観光バス)
南筑波線 土浦 - 下虫掛(廃止) 下虫掛 - 篠崎転向場 - 下妻上町 - 松本(廃止) 松本 - 古河(東古河妻線として運行を存続)
霞ヶ浦線 土浦 - 江戸崎 江戸崎 - 佐原(→桜東バス)
君島線
山ノ荘線(廃止)
浮島線(→ブルーバス)
十余島線(→桜東バス)
渋川線(→関越交通)
志賀草津高原線 長野原 - 草津温泉 - 白根火山 白根火山 - 湯田中(→長電バス) 花敷線(→六合村営バス)
鹿沢菅平線 万座・鹿沢口 - 新鹿沢温泉 - 鹿沢温泉(→嬬恋村(群北観光バス委託)) 新鹿沢温泉 - 真田(廃止) 上田駅 - 真田(→上田バス)
浅間白根火山線(→西武高原バス)
白樺高原線(旧信越地方自動車部管轄)
高峰高原線(旧信越地方自動車部管轄)
和田峠北線(旧信越地方自動車部管轄)
多古線
栗源線
成田空港線(廃止)
山武線(→芝山ふれあいバス)
南房州線 館山 - 安房神戸 - 安房白浜 千倉 - 安房白浜(→館山日東バス)
豊房線(→館山日東バス)
洲の崎線
東京湾岸線(廃止) ※路線免許はドリーム号運行のため存続)
上野湾岸線(廃止)
東名高速線
さらに同年12月には、「日本国有鉄道の再建基本方針」が閣議了解されたが、自動車部門については「高速線については需要に合わせた積極的な営業施策の展開、一般路線に対しては輸送量の変化に対応した路線の再編成、貨物輸送については縮減」との方針が示された。この計画に伴い、省営自動車初期より続けられたトラック輸送は1984年2月に全廃され、1985年までに2300キロに及ぶ路線の休廃止が行われた。
しかし、国鉄の経営状態はさらに悪化し、1983年には政府に「国鉄再建監理委員会」が設けられた。1983年には「乗車密度5人未満の路線の整理、民間バス並みの経営が行えるような行政措置」が求められた。さらに、分割民営化が確定した1985年には、再建監理委員会から「バス事業は一旦旅客鉄道会社に引継ぎ、分離・独立の内容は旅客鉄道会社設立の計画の中において明らかにする」と意見が示された。政府はこの意見を最大限尊重するとの閣議決定を行い、国鉄バスが地域ごとに分割されることが確定した。なお、国鉄の経営改善計画において、自動車部門に限っては目標より1年早い1984年に、その計画目標を達成している。
1984年、中央高速バス伊那・飯田線の運行開始前後に表面化した中央高速バス問題の際には、国鉄バスも東京と伊那地区を結ぶ高速バスに参入することで、身内での影響を食い止める案もあった。
両備線 両備本線 岡山駅 - 岡山駅前 - 天満屋バスステーション - 大雲寺前 - 大供 - 下撫川 - RSKバラ園 - 庄パークヒルズ(→両備ホールディングス、岡山電気軌道) 岡山駅 - 岡山駅前 - 天満屋バスステーション - 大雲寺前 - 大供 - 下撫川 - 松島西ノ口 - 中庄駅(→両備ホールディングス、岡山電気軌道、下津井電鉄) ※岡山駅前 - 松島西ノ口間の路線免許は高速バス運行のため存続 天満屋バスステーション - 岡山駅前 - 岡山駅 - 山陽新聞社前 - 大供 - 下撫川 - 松島西ノ口 - 中庄駅(→中鉄バス) 岡山駅 - 岡山駅前 - 天満屋バスステーション - 大雲寺前 - 大供 - 下撫川 - 松島西ノ口 - 幸町 - 倉敷駅(→両備ホールディングス) ※岡山駅前 - 松島西ノ口間の路線免許は高速バス運行のため存続 中庄駅 - 松島西ノ口 - 清心学園(一般路線バスの運行廃止後、路線免許は清心中学校・清心女子高等学校スクールバス運行のため存続していた。) 倉敷駅 - 中島口(→両備ホールディングス) 中島口 - 大橋 - 霞橋(→両備ホールディングス→廃止) 霞橋 - 上成(→両備ホールディングス) 上成 - 玉島中央町(廃止) 茶屋町線(→下津井電鉄) 矢掛線(→井笠鉄道→廃止) 倉敷駅 - 幸町(→両備ホールディングス) 幸町 - 浜ノ茶屋 - 北浜(→井笠鉄道→廃止) ※浜ノ茶屋 - 北浜間の路線免許は高速バス運行のため存続 倉敷駅北口 - 北浜 - 清音駅 - 矢掛(→井笠鉄道) ※倉敷駅北口 - 北浜 - 清音駅間の路線免許は高速バス運行のため存続