小眼球症関連転写因子
大部分の転写因子は、タンパク質間相互作用によって他の因子と協働して機能する。MITFと他のタンパク質との結合は、MITFを介した転写活性の調節の重要な段階である。MAZR(英語版)、PIAS3(英語版)、TFE3(英語版)、UBC9(英語版)、PKCI-1(英語版)、LEF1(英語版)などとの相互作用は広く研究されている。
MAZR(Myc-associated zinc-finger protein related factor)はMITFのLZドメインと相互作用する。共に発現した場合には、MAZRとMITFの双方がマウスのmMCP-6遺伝子のプロモーター活性を増加させる。MAZRとMITFは共にmMCP-6遺伝子をトランス活性化する。また、MAZRはMITFとともにマスト細胞の形質発現にも関与している。
PIAS3はSTAT3のDNA結合活性を阻害することで作用する転写阻害因子である。PIAS3はMITFと直接相互作用し、STAT3はこの相互作用には干渉しない。PIAS3はMITFの転写活性を抑制する重要な分子としても機能する。これはマスト細胞とメラノサイトの発生に重要である。
MITF、TFE3、TFEBは転写因子のbHLH-LZファミリーに属する。この転写因子ファミリーの各タンパク質はDNAに結合する。TFE3は破骨細胞の発生に必要であり、その機能はMITFとの冗長性があることが示唆されている。双方の遺伝子を喪失すると重度の大理石骨病が引き起こされ、MITFがこの転写因子ファミリーの他のメンバーと相互作用することが示されている。TFEBはリソソーム生合成とオートファジーの主要調節因子である。
MITFの翻訳調節(英語版)は、2019年時点でその重要性を示す査読済み論文は2報しかない未探索の領域である。メラノーマ細胞では、グルタミン枯渇時にATF4(英語版)の転写産物が増加するとともに、eIF2α(英語版)のリン酸化によってmRNAの翻訳も増加する。この分子イベントの連鎖は2つの階層でMITFを抑制する。まずATF4タンパク質はMITFに結合して転写を抑制し、さらにeIF2αはおそらくeIF2B(英語版)の阻害を介してMITFの翻訳を遮断する。
MITFはRNAヘリカーゼDDX3X(英語版)による直接的な翻訳調節も受ける。MITFの5' UTRには重要な調節エレメント(IRES)が存在し、DDX3Xによって認識、結合、活性化される。MITFの5' UTRはわずか123ヌクレオチドから構成されるが、この領域は複数の分岐を持つループや非対称的なバルジを持つ、エネルギー的に有利な二次構造へと折りたたまれることが予測されている。DDX3Xによるこのシス調節配列の活性化は、メラノーマ細胞でのMITFの発現を促進する。