国立国際医療研究センター
1949年 6月1日、敷地内に病院管理研修所(現・国立保健医療科学院)が開所。病院長が所長を併任する。7月1日、国立病院特別会計開始
1950年 4月、小諸分院が国立小諸療養所として分離独立。7月、熱海分院が国立熱海病院として分離独立
1954年 3月、第五福竜丸被爆、乗組員16人が入院。7月12日、日本初の人間ドック開始。9月23日、入院中の第五福竜丸無線長、久保山 愛吉が死去
1955年 12月、日本医療団の清算財産の一部により病院管理研修所建物竣工
1961年 病院管理研修所、病院管理研究所と改称(病院長の所長併任解除)
1965年 4月、国立小児病院発足に伴い、二宮分院を国立小児病院二宮分院に組織再編
1971年 臨床研修指定病院に認定、中央棟(地上16階地下2階)竣工
1972年 2月、グアム島から帰還した横井庄一が入院
1974年 3月、ルバング島から帰還した小野田寛郎が入院。4月15日、国立病院医療センターと改称、臨床研究部設置
1977年 看護学校の大型化(定員120名→300名)
1986年 「国立病院・療養所の再編成について」(再編成計画)により、国立療養所中野病院との統合、「国立国際協力医療センター(仮称)」の設置が公表される。10月、国際医療協力部設置
1988年 4月、エイズ医療情報センター設置
1990年 7月、病院管理研究所、国立医療・病院管理研究所に改称
1992年 8月、国立医療・病院管理研究所、厚生省戸山研究庁舎(東京都新宿区戸山1-23-1)に移転する
2003年の冬、元運営部長が業者への物品納入に便宜を図った見返りに現金50万円を受け取ったことが判明している。元運営部長は2004年7月22日に収賄の疑いで逮捕され、12月24日に東京地方裁判所で懲役1年6月執行猶予3年の有罪判決を受けた。なお元運営部長は国立病院東京医療センターに在籍当時、別の収賄事件を起こした当時の会計課長の上司であった。
2014年4月、国立国際医療研究センター病院において、コンピュータ断層撮影時に造影剤の誤投与があり、検査入院していた都内の女性患者が死亡した。整形外科の研修医が、本来使用してはいけない薬剤を脊髄に投与、患者はショック性多臓器不全を起こした。この研修医は2014年12月に業務上過失致死傷罪で送検され、2015年3月に在宅起訴された。東京地方裁判所は2015年7月、禁錮1年、執行猶予3年(求刑・禁錮1年)の判決を言い渡した。
2022年6月3日、物品納入をめぐって便宜を図り賄賂を受け取ったなどとして、収賄容疑でセンターの総務課係長が逮捕された。2019年3月~21年11月、センターが発注するパソコンの納入などに関する入札や随意契約で便宜を図った見返りに、現金約270万円やソファなど4点(計約50万円相当)を受け取ったほか、旅行や飲食の接待(計約60万円相当)を受けた疑いがある。贈賄容疑で再逮捕されたのは、2022年5月、国立病院機構下志津病院企画課長への贈賄容疑で逮捕(その後起訴)された小松電器(千葉県船橋市)の社長である。同年11月1日、東京地方裁判所は、元係長に懲役2年、執行猶予3年、追徴金約300万円の判決を言い渡した。
内科部門診療部
外科部門診療部
精神科部門診療部
肝炎診療部
免疫診療部
消化器光学診療部
手術部
救急診療部
放射線診療部
中央検査部
外来診療部
医療教育部
臨床栄養管理部
薬剤部
看護部
2006年(平成18年)、旧陸軍軍医学校に勤務していた元看護師が、これまでに判明している以外にも人骨を埋めたことを証言した。埋めた場所のうちの1カ所が、現在のセンターの宿舎敷地だったという。
このことを含め、衆議院議員郡和子が質問主意書を提出している。同じ若松町内に731部隊(関東軍防疫給水部)の創設者である石井四郎が居住しており、また同部隊の責任者であった内藤良一が、センター敷地内に所在した陸軍軍医学校において、日本の降伏時に大日本帝国陸軍医教官として勤務していた。
派遣協力第一課・第二課から常時20名ほどの職員(医師、看護師、助産師など)がアフリカや南アメリカ、東南アジアなどの発展途上国に1-3年程度派遣され、医療指導、保健指導などを行なっている。国際協力機構のプロジェクトに協力している。