分子置換
我々は強度のパターソンマップを導き出すことができる。これは、構造因子の振幅を2乗し、すべての位相をゼロにして作成した原子間ベクトルマップである。このベクトルマップには、他のすべての原子に関連する各原子のピークが含まれており、0,0,0に大きなピークがあり、ここでは原子自身に関連するベクトルが「積み重なる」ことになる。このようなマップは、高解像度の構造情報を得るにはあまりにもノイズが多すぎる。しかし、未知の構造から得られたデータと、過去に解かれた同種の構造から得られたデータに対して、単位胞内の正しい方向と位置でパターソンマップを作成すると、2つのパターソンマップは密接に相関するはずである。この原理がMRの核心であり、未知の分子の単位胞内での向きや位置に関する情報を推論することができる。
歴史的に計算能力に限界があったため、MRの探索は通常、回転と並進の2つの段階に分けて行われる。
並進機能では,正しく配向された既知のモデルを,非対称ユニット内の正しい座標に並進させることで,正しく配置することができる.これは、モデルを移動させ、新しいパターソンマップを計算し、それを未知のパターソンマップと比較することで達成される。このような力まかせ探索は計算コストが高いため、現在では高速な並進関数が一般的に使用されている。相関性の高い位置は直交座標系で出力される。