東日本旅客鉄道新潟支社
支社管内ではこのほか、新潟近郊区間に含まれない主要駅にも自動改札機が導入されている。なお、下記の駅は現在Suicaのサービスエリア外であるため、Suica等は利用できない。
2005年 12月8日:羽越本線 酒田駅、鶴岡駅
2005年〜2015年 12月1日〜3月14日 信越本線(現えちごトキめき鉄道) 高田駅
2005年12月期の自動改札機導入に関しては、新幹線の停車駅である越後湯沢駅、浦佐駅、長岡駅、燕三条駅の在来線改札では見送られたが、その後長岡駅には自動改札機が、燕三条駅には簡易改札機が導入されている。未設置の越後湯沢、浦佐両駅の設置予定は決まっていない。なお、新幹線改札では前述の通り2008年3月からモバイルSuica特急券のサービスが、さらに2009年3月からは長岡 - 新潟間で定期券のサービスが開始されている。 なお北陸新幹線開業前の旧信越本線高田駅でも自動改札が設置されていたが北陸新幹線開業後第三セクター移行に伴い自動改札が撤去された。
2005年(平成17年)12月25日に羽越本線の北余目駅-砂越駅間(山形県だが新潟支社管内)で突風による脱線事故が発生し、5人の死者を出した。突風は予測できなかったものとされた。
管内の新潟駅・長岡駅・越後湯沢駅の3駅にある駅ビル「CoCoLo」のほか、スーパー、食料品店、酒店、駅構内駐車場の運営など、主に物販事業を展開。新潟支社管内に所在するJR東日本ホテルズ各店舗の運営を行っているほか、管内4駅の敷地内にあるコンビニエンスストア「デイリーヤマザキ」も同社のフランチャイジーとして運営を行っている。2020年9月までの社名は「トッキー」であった。
ローソン 山形・福島・新潟各県内の全店舗
ファミリーマート 新潟県内(新潟市、新発田市、阿賀町、加茂市、三条市、燕市、見附市、長岡市)の全店舗で利用可(2013年4月現在) 磐越自動車道・阿賀野川サービスエリア(下り・新潟方面)内の店舗も含まれる。 新潟県のうち下越北部・中越西部・南部、上越、佐渡は未出店。山形県内は置賜・村山地方の一部店舗のみ、福島県内はSuica仙台エリア周辺の店舗のみ利用可。
デイリーヤマザキ 新潟県内のうちSuicaエリア内の全店舗で利用可
サークルKサンクス 山形・福島県内のサンクス全店舗、新潟県内のサークルK全店舗で利用可
セブン-イレブン 山形・福島・新潟各県内の全店舗で利用可
佐渡汽船商事 新潟港・両津港の売店で利用可
弥彦駅 - 矢作駅 - 吉田駅* - 西燕駅 - 燕駅 - 燕三条駅 - 北三条駅 - 東三条駅*
※燕三条駅の弥彦線改札口は、簡易改札機設置。