伊藤小左衛門
小左衛門と浅見七左衛門の2人は磔刑となり、40数人の者が斬首・獄門などの死刑、同じく40数人が在所からの追放に処され、百数十人が小呂島、姫島への流罪となった。長崎以外に居住する者はそれぞれの藩に引き渡された後に、幕府の指示どおりに処罰された。長崎関係者は、11月晦日に長崎の刑場の西坂で処刑された。小左衛門の子である2人の男児も縁座させられ、そのうち長崎にあった1人は父と同日に長崎で斬首。博多にいたもう1人は、長崎奉行から福岡藩に命じ、博多で斬首させた。博多の高木惣十郎は福岡藩当局の手で捕え、長崎に召し出して、ここで処刑。対馬の小茂田勘左衛門は、近江大津で捕えて京都の牢舎に入れ、ついで大坂に廻し、その後長崎に召し連れ、長崎奉行所で磔とする旨の判決を下した上で、対馬で刑の執行が行われた。
長崎で処刑された者の妻・子供は、斬罪にあった者以外は、町年寄・オランダ通詞・唐通事に「奴(やっこ)」として配分された。
小左衛門が実質的に密輸にかかわったのは2回だけだが、「金元」およびこの事件の「張本」と目されたのは、彼の出資によって密貿易が実現したからと考えられている。密貿易には福岡藩自身も関わっていたのではないかとも言われており、3代目藩主の黒田光之は小左衛門の命を救えなかったことを終生悔やんだ。なお、『通航一覧』では「その党人立花蔵本、同所須藤七左衛門、同休意、原左兵衛、長崎町年寄高木作右衛門、博多伊藤小左衛門、久留米之者一人、京都之者一人」とあるが、長崎奉行所の犯科帳に名前が記されているのは小左衛門だけで、町年寄の高木作右衛門は処罰されていない。