ミクロイドS
声 - 岡本敏明
第8話に登場したムカデ型ロボット。ギドロンの世界から脱走したミクロイド・オルガを始末するために、人間界に追って来た(しかし、実はそれ自体がオルガをヤンマたちに近づけるための偽装であった)。全身に並んだ球体は触手として伸ばすことで打突武器になるほか、接触したものに電撃を流せる。終始、奇声を発しながら襲ってくるその声が「クイール」と聞こえたことから、ヤンマは(それが名前であろうと解釈して)クイールと名付けた。ムカデの姿をしているものの、最後尾のブロックからロケット噴射して空を飛ぶこともできる。オルガを追って美土路邸にまで襲撃に現れるが、ヤンマと空中戦の末、湯沸かし中のポットを倒して熱湯を浴びてしまい爆散した。
ほかにヘルメットには発光機能があり、暗闇では全体が光って周囲を照らすことができる(第1話)。TVアニメ版においては、体を休めていれば傷ついた羽が自然に治るらしき描写(第7話)のほか、ミクロイドショックを使ったマメゾウや、ミクロイドビームなどでエネルギーを使い果たしたヤンマが疲労困憊になったこと(第19話)などから、ヘルメットやスーツの機能にはミクロイド自身の体から何らかの原理でエネルギーが供給されていると思われる。
一方、手塚治虫による漫画版では、頭部のナイフも背中の羽もヘルメットやユニフォームに依存しておらず、生身の状態でも使用できるミクロイド自身の能力となっている。何よりアゲハやマメゾウのユニフォームは手製であることから、ヤンマのものも含めさほど特殊なものではないと思われる(ただし、ヤンマのヘルメットには戦闘時にゴーグルが下りる、TVアニメ版にない機能が描かれており、ヤンマはこれをギドロン兵〈?〉から強奪して手に入れている)。TVアニメ版のアゲハの能力であった触角の探知機能は、漫画版では3者のヘルメット共通の装備であった(触角には通信機能も備わっているらしい)。
声 - 八奈見乗児
第3話に登場する。かつてヤンマたちと同じS班に属していた老人。アゲハやマメゾウと親しい間柄であったらしい。事故で負傷したことで、奴隷として役に立たなくなったと判断され、ギロルによって分解処分されて砂となってしまう。なぜヤンマたちからも番号でよばれているのか、名前が無いのかといった事情は不明。
オープニングテーマ1 - 「ミクロイドS」(キー局のみ第1話 - 第5話) 作詞 - 阿久悠 / 作曲 - 三沢郷 / 歌 - ヤング・スターズ 第1話では挿入歌としても使用されている。 オープニングテーマ2 - 「ヤンマだ アゲハだ マメゾウだ」(キー局のみ第6話 - 第26話) 作詞 - 阿久悠 / 作曲 - 三沢郷 / 歌 - ヤング・スターズ キー局では第6話からOPが「ヤンマだ アゲハだ マメゾウだ」に変更された。上述のとおり、再録音されたアップテンポバージョンである。
エンディングテーマ - 「ヤンマだ アゲハだ マメゾウだ」 作詞 - 阿久悠 / 作曲 - 三沢郷 / 歌 - ヤング・スターズ ローカル局のみ(キー局ではエンディングが無いため使用されていない)。 エンディング用としてTVサイズが別に録音されていたが、実際のフィルムにはレコード用のフルサイズが採用されている。 上述のとおり、キー局で第6話からOPが「ヤンマだ アゲハだ マメゾウだ」に変更されたことに伴い、アップテンポで再録音されたものが正規版とされて、シングルレコードの音源までも差し替えられたが、ローカル局のエンディングはアップテンポバージョンに変更されることなく、そのまま最終話まで使用された。
声 - 大竹宏
第4話に登場する。ギドロンの世界ではA-2(エーツー)と呼ばれる、ヤンマたちを追ってきた刺客。その名からガガンボがモチーフのミクロイドと思われる。ルリボシの監視役としてコンビを組まされている、ギドロンの忠実な下僕。口から目つぶしや催眠作用、隠密効果のあるガスを吐く。ルリボシの体内に仕掛けられた自爆装置のスイッチを持っており、その裏切り行為を見抜いて彼を爆殺した後、カメムシロボットに乗って逃走を図るも、ヤンマによって開けられたダム湖の放水口に吸い込まれて果てる。