江差線
函館駅 - 上磯駅 - 木古内駅 - 上ノ国駅 - 江差駅
津軽海峡線
五稜郭駅 - 木古内駅間は、1988年(昭和63年)3月13日から2016年(平成28年)3月21日まで、海峡線、東日本旅客鉄道(JR東日本)津軽線とともに津軽海峡線を形成し、定期旅客列車による青函連絡輸送が行われていた。
1988年(昭和63年)3月13日の海峡線開業時から、快速「海峡」・特急「はつかり」が運転されていたが、2002年(平成14年)12月1日の東北新幹線八戸駅延伸開業時に特急「白鳥」・「スーパー白鳥」に置き換えられる形で廃止された。また、本州と北海道を結ぶ夜行列車として、急行「はまなす」、寝台特急「日本海」・「北斗星」・「カシオペア」・「トワイライトエクスプレス」も運行されており、このうち、「日本海」が木古内駅に停車していた。
海峡線(青函トンネル)では特急列車が最高速度140 km/h で走行していたが、江差線では線形の関係から最高速度は100 km/h だった。前述の北海道新幹線建設を理由に、江差線の高速化は行われていない。これらの広域旅客輸送は、2016年(平成28年)3月26日に開業した北海道新幹線に受け継がれている。
1937年(昭和12年)8月16日:新七重浜仮乗降場を廃止。
1948年(昭和23年):中須田仮乗降場を新設。
1949年(昭和24年)6月1日:日本国有鉄道法施行に伴い、公共企業体日本国有鉄道(国鉄)に移管。
1955年(昭和30年)3月5日:中須田仮乗降場を駅に変更。
1956年(昭和31年)10月1日:清川口駅を新設。
1957年(昭和32年) 1月25日:神明駅を新設。 10月1日:全列車が気動車での運行となる。
1960年(昭和35年)10月1日:函館駅 - 江差駅間を運行する準急列車として「えさし」が単行(1両編成)で運行開始。臨時列車だったが、毎日運行していた。
1961年(昭和36年)10月1日:準急「えさし」が定期列車化。
1963年(昭和38年)12月1日:函館駅 - 江差駅間に準急「おくしり」・「ひやま」が、函館駅 - 松前駅間(松前線直通)に準急「松前」が、いずれも単行で運行を開始。
1964年(昭和39年)12月30日:渡島鶴岡駅・宮越駅を新設。
1966年(昭和41年)10月1日:函館駅 - 江差駅間を運行する準急列車の名称を3往復とも「えさし」に統一。