ガラパゴス諸島
フェルナンディナ島(西: Fernandina, ナーボロウ島、英: Narborough) - 諸島の西端に位置し、もっとも火山活動が活発な島。
トルトゥガ島(スペイン語版)(西: Tortuga)
ピンタ島(西: Pinta, アビンドン島、英: Abingdon)
マルチェナ島(英語版)(西: Marchena, ビンドロー島、英: Bindloe)
ヘノベサ島(西: Genovesa, タワー島、英: Tower)
セイモア・ノルテ島(スペイン語版)(西: Seymour Norte, ノース・セイモア島、英: North Seymour)
バルトラ島(スペイン語版)(西: Baltra, サウス・セイモア島、英: South Seymour) - 本土と結ぶ主要空港がある。
ピンソン島(スペイン語版)(西: Pinzón, ダンカン島、英: Duncan)
ラビダ島(スペイン語版)(西: Rábida, ジャーヴィス島、英: Jervis)
ダーウィン島(英語版、スペイン語版)(西: Darwin, カルペッパー島、英: Culpepper) - ウォルフ島とともに他の島々から離れた北西端に位置する島。
ウォルフ島(西: Wolf, ウェンマン島、英: Wenman)
他
北プラザ島(スペイン語版)と南プラザ島(スペイン語版) - サンタ・クルス島東端にある南北2つの小島。
など
各大陸とは隔絶された独自の進化を遂げた固有種が多く存在する。天敵になるような大型の陸棲哺乳類が存在しない。
ガラパゴスゾウガメ - 大型のリクガメ。甲羅がドーム型のものと鞍型のものに分けられる。島ごとに多くの亜種に分かれるが、それを独立種とする説もある。おもに果実や木の実などを食べる。
ガラパゴスペンギン - 世界で3番目に小さく、唯一の熱帯性種であるペンギン。フンボルト海流から流れる魚類を餌にしているが、近年のエルニーニョ現象により餌が減り、個体数も減少した。
ガラパゴスリクイグアナ(Conolophus subcristatus) - サンタ・フェ島には別種サンタフェリクイグアナ(英語版)(Conolophus pallidus)が生息しており、その他の島には本種が生息していたが、すでに絶滅した島もある。主にウチワサボテンを食べるが、移入されたヤギによって食料が奪われ、存続が危ぶまれている。
ウミイグアナ - 海岸に生息し、海草などを食べる。
ヨウガントカゲ(英語版) - 各島に1種、全部で7種が生息する。
ガラパゴスアシカ
ガラパゴスオットセイ
ガラパゴスコバネウ
ガラパゴスペンギン
ダーウィンフィンチ類
ガラパゴスマネシツグミ
その他の鳥類はガラパゴス諸島の野鳥一覧を参照