ガンダムMk-II
漫画『機動戦士ガンダム エコール・デュ・シエル』でも同様の塗装の1号機が登場し、月面都市アンマンのAE社工場にて解析および性能テストがおこなわれている。テスト・パイロットはエゥーゴのジャック・ベアードや、宇宙海賊マリー一味のアスナ・エルマリートが務めている。
漫画『機動戦士ゼータガンダム1/2』では、ジェリドたちに引き渡される前の本機(何号機かは不明)と、初代ガンダムを復元したハーフガンダムとの模擬戦の様子が描かれている。パイロットはエドガー・エドモンド・スミス。連戦連敗する本機に業を煮やしたフランクリン・ビダンは、ビーム・ライフルの携行による実戦装備での模擬戦を強行し、本機はハーフガンダムのコックピットを撃ち抜いて勝利する。ただし、本作は宇宙世紀での創作が疑われる「エドガー・エドモンド・スミスの日記」という体裁となっている。
漫画『機動戦士ガンダム MSV-R ジョニー・ライデンの帰還』では、シャア・アズナブルとの戦闘で乗機であるジム・ナイトシーカーが大破してしまったヴァースキ大尉の代替機としてゴップ議長がAE社から調達してくる。ヴァースキは冗談が過ぎると苦言を呈しているが、早急な状況な事もあって仕方ないと受諾した。機体はブルーとグリーンで塗装されており、海ヘビを装備している。開発が凍結されていたフルアーマー用のパーツもアナハイムに発注したものが用意されている。
漫画『機動戦士ガンダムUC 獅子の帰還』では、宇宙世紀0096年12月にバナージ・リンクスの帰還を確かめる為、MSでジオン共和国に匿われていたメガラニカを訪れたリディ・マーセナスの前にバナージ本人が操縦する機体が姿を現わす。
脚本・漫画『機動戦士ガンダムUC 獅子の帰還』に登場。
サイド3に秘匿されているメガラニカが所有する機体であり、バナージ・リンクスが搭乗する。0096年12月8日、バナージの帰還を確かめようとリゼルに搭乗して領海侵犯を経て訪れたリディ・マーセナスの前に現れる。右肩から先がドーベン・ウルフ系列のものに変更されており、ビーム・マグナムに対応している。また、カラーリングについては、コミカライズを担当した玉越博幸がユニコーンカラーのイメージであると自身のTwitterにて述べている。
なお、玉越は本機のデザインについて、当初は化け物感を出したくてクシャトリヤの装甲無しの右腕を装着してみたが、ガンダム感がないので取り止めて本編のものに変更したほか、機体の出自については新造ではなくサイド3に残っていた機体を運用しているようだとも自身のTwitterにて述べている。
このうち、内田のラフ稿に彩色したものが準備稿として、『Ζ』製作決定の報に合わせて模型情報などの各媒体にて公開された。また、近藤和久によるコミックボンボン版『Ζ』では、準備稿のうち2案(うち1案は、上記のモデル化されたもの)がガンダムMk-IIの1号機および2号機として登場した。
準備稿発表の裏で作業は続けられ、残された大河原と永野のラフ稿を基に藤田一己が手を加えたものが番組制作発表や宣伝パンフレットに使用された。そして、藤田はさらにデザインを煮詰め、決定稿を描いた。藤田は、『月刊ホビージャパン』1988年5月号で「どんなデザインを描いても誰も納得しないのではないか」と感じていたと明かしている。
なお、決定稿でも手の細部までは描かれていなかったため、2005年公開の劇場版『Ζ』の新作パートでは、メカニカル作画監督の仲盛文や原画マンの阿部邦博が新たにアップ用の設定を起こして描いており、後のOVA版『機動戦士ガンダムUC』でも参考にされたという。