牧氏事件
時政はその後、二度と政界に復帰することなく建保3年(1215年)、腫物のため北条の地で死去した。また、牧の方も夫の死後は朝雅の元妻で公卿の権中納言・藤原国通に再嫁した娘を頼って上洛し、京都で余生を過ごした。そして、北条氏の第2代執権には義時が就任(ただし、承元3年(1209年)就任説もある)、義時のもとで北条氏は幕府内における地位を確固たるものとしていくのである。
ただし、この事件は、後に北条氏内部で起こる執権職をめぐっての内紛の先駆けにもなった。
同年閏7月19日、時政と牧の方が実朝を廃して、頼朝の猶子で京都守護として京に滞在していた平賀朝雅を新将軍として擁立しようとしているとの噂が流れた。政子は長沼宗政・結城朝光・三浦義村・三浦胤義・天野政景らを遣わして、時政邸にいた実朝を義時邸に迎え入れた。時政側についていた御家人の大半も実朝を擁する政子・義時に味方したため、陰謀は完全に失敗した。なお、時政本人は自らの外孫である実朝殺害には消極的で、その殺害に積極的だったのは牧の方であったとする見解もある。だが最も同時代に近い『愚管抄』では事件の首謀者を一貫して時政としており、『吾妻鏡』は北条氏の祖である時政を擁護するために牧の方を事実以上の悪役に仕立てているとする見解もある。幕府内で完全に孤立無援になった時政と牧の方は出家し、翌20日には鎌倉から追放され伊豆国の北条へ隠居させられることになった。
この事件に関して『明月記』元久2年閏7月26日条では「時政の嫡男相模守義時、時政に背き、将軍実朝母子に同心し、継母の党を滅ぼす」「時政朝臣、頼家卿の如く伊豆の山に幽閉され出家」との伝聞情報を記している。『愚管抄』では、陰謀を聞いて驚いた政子が三浦義村を呼び相談したところ、義村が実朝を義時の館に連れていき、まだ何も事件は起こっていないのに郎党を招集して陣を張り、将軍の仰せとして時政を呼び出し故郷の伊豆国に送ってしまったと記している。さらに政子は実朝の母で頼朝の後家であるから親に対しても躊躇しない。義時にとっても時政は親であるが今の妻(牧の方)との関係で悪事をすればやはり容赦はしない。そのうえ孫の実朝は母方の祖父が自分を殺そうとしたのだから時政が幽閉されたのも当然だとも記している。