金峯山寺
2月3日 節分会・鬼火の祭典 役行者が鬼を改心させて弟子にしたという故事から「福は内、鬼も内」と山伏が豆をまくと鬼がひれ伏して改心するという独特の節分会の行事が行われている。
4月11 - 12日 花供懺法会(はなくせんぽうえ)(花供会式大名行列)
7月7日 蓮華会・蛙飛び行事
銅鳥居
木造蔵王権現立像 3躯(附:願文・結縁交名(中尊像内納入)7通)
本堂内陣の巨大な厨子に安置される3体の秘仏。中尊像内に天正18年(1590年)南都大仏師宗貞、宗印等の銘がある。像高は中尊が728センチ、向かって右の像が615センチ、左の像が592センチである。寺伝では中尊が釈迦如来、向かって右の像が千手観音、左の像が弥勒菩薩を本地とし、それぞれ過去・現世・来世を象徴するという(「本地」は本来の姿である仏、「権現」は仏が姿を変えて現れたものの意)。通常は秘仏であるが、特別の行事の際などに開帳されることがある。
木造蔵王権現立像(安禅寺旧本尊) - 秘仏本尊とは別に本堂外陣東北隅に安置される。元は吉野山の奥の院と呼ばれた安禅寺(現・金峯神社付近にあった)の本尊で、同寺が明治の神仏分離で破却されてから金峯山寺に移された。像高459センチの巨像で、制作は秘仏本尊より古く、鎌倉時代後半とされている。
絹本著色千手千眼観音像 - 奈良国立博物館寄託。
板絵著色廻船入港図額 - 万治4年(1661年)に奉納された大型の絵馬。本堂内西側に置かれている。
木造聖徳太子立像 - 鎌倉時代。外陣東側に安置。
木造釈迦如来坐像 - 平安時代。
木造釈迦如来立像 - 鎌倉時代。
絹本著色吉野曼荼羅図 1幅 - 鎌倉時代。
平面構成は、桁行(正面)5間、梁間(奥行)6間の身舎(もや)の周囲に1間の裳階をめぐらした形式になる(ここでいう「間」は長さの単位ではなく、柱間の数を表す用語)。身舎の正面は5間とも板扉を設け、その手前(裳階部分)の1間通りは扉や壁を設けない吹き放ちとする。堂内は板扉で前後に仕切り、その前方を外陣、後方を内陣とする(平面図参照)。
蔵王権現本地堂 - 蔵王堂と渡り廊下で繋がっている。食堂の跡地に建てられている。
鐘楼
本坊 - 智泉閣と呼ばれる。1924年(大正13年)築。
仁王門(国宝) - 「二王門」ともいう。蔵王堂の北側に位置する入母屋造、本瓦葺きの二重門(二重門とは2階建て門で、1階と2階の境目にも屋根の出をつくるものを指す)。軒先に吊るしていた風鐸(ふうたく)の銘から室町時代の康正2年(1456年)の再興とわかる。本堂が南を正面とするのに対し、仁王門は北を正面とし、互いに背を向けるように建っている。これは、熊野から吉野へ(南から北へ)向かう巡礼者と吉野から熊野へ(北から南へ)向かう巡礼者の双方に配慮したためという。門の左右に安置する像高約5メートルの金剛力士(仁王)像は延元4年(1339年)、仏師康成の作で重要文化財に指定されている。2018年より2028年完成を目指して大修理が進められている。
観音堂 - 室町時代建立。本尊は十一面観音立像。
12月17日には僧坊の一つだった吉水院が後醍醐天皇社(現・吉水神社)として神社化している。
それでも、1879年(明治12年)には一旦神社となったいくつかの僧坊が再び寺院としての活動を始めている。その後余りに過激化した太政官政府の宗教政策が沈静化したことや、僧侶・修験道者らの嘆願により、1886年(明治19年)には「天台宗修験派」として修験道の再興が図られ、金峯山は寺院として復興存続が果たせた。その際、山下の蔵王堂は金峯山寺、山上の蔵王堂は大峯山寺として、別々の寺院として再興されて現在に至っている。
太平洋戦争後の1948年(昭和23年)に、天台宗から分派独立して大峯修験宗が成立し、1952年(昭和27年)には金峯山修験本宗と改称、金峯山寺は同宗総本山となった。
2004年(平成16年)に蔵王堂と仁王門が世界遺産「紀伊山地の霊場と参詣道」の一つとして登録された。