伊賀国
おおむね仁木氏が伊賀守護をつとめたが、支配力は緩く、地侍による自治が進むが、織田氏により制圧された(天正伊賀の乱)。
第二次天正伊賀の乱ののち、伊賀3郡を織田信雄が、残りの1郡を織田信包が領することになった。
この頃に600を越える土塁付の屋敷が作られ、忍者の発生へとつながった。徳川家康が「神君伊賀越え」を実行したことでも知られる。
1337年~1339年 - 仁木義直
1339年~? - 千葉貞胤
1340年 - 桃井直常
1342年~1343年 - 千葉貞胤
1346年~1347年 - 仁木義長
1347年~1350年 - 高師冬
1351年 - 千葉氏胤
1351年~? - 仁木義長
1352年~1353年 - 細川清氏
1353年~1360年 - 仁木義長
1365年~1380年 - 中条元威
?~1433年 - 仁木国行
1433年~? - 山名時熙
1470年~1477年 - 仁木氏
?~1487年 - 仁木貞長
1491年 - 仁木氏
『中世諸国一宮制の基礎的研究』に基づく一宮以下の一覧。
総社:不詳 伊賀市府中に府中神社があるが、若宮八幡宮が明治以後に他神社と合祀されて改称したもので、総社ではないとされる。
一宮:敢國神社(伊賀市一之宮、北緯34度47分14.52秒 東経136度9分50.18秒 / 北緯34.7873667度 東経136.1639389度 / 34.7873667; 136.1639389 (伊賀国一宮、式内大社:敢國神社)) 史料初見は『源平盛衰記』で、源範頼・源義経入京の際に伊賀国の「一宮南宮大菩薩」を拝したという。それより以前の1165年の史料には伊賀国の神社の筆頭として南宮社の記載が見え、これらが敢國神社に比定される。
二宮:小宮神社 (伊賀市服部町、北緯34度46分46.78秒 東経136度8分31.08秒 / 北緯34.7796611度 東経136.1419667度 / 34.7796611; 136.1419667 (伊賀国二宮:小宮神社)) 中世に小宮神社が二宮を称した記録はなく、近世以後の比定。伊賀国に二宮があったことは確かと見られる。
三宮:波多岐神社 (伊賀市土橋、北緯34度47分55.93秒 東経136度8分49.02秒 / 北緯34.7988694度 東経136.1469500度 / 34.7988694; 136.1469500 (伊賀国三宮:波多岐神社)) 『伊賀記』(伝・北畠親房著)に「里人称之三宮。又号波太伎社之宇都可明神説見于上」とあるのが初見。