暗黒星団帝国
過去の地球の軍事組織(現実の世界の各国軍隊)で使用されていた尉官などから構成される、階級制度と同じものを採用している。暗黒星団帝国軍人の制服(サイボーグ化された身体)は、『新たなる旅立ち』では肌の色と同じで全裸のような外観であるが、『永遠に』では基本的に黒色に変更されている。また、両作とも階級に関係なく黒色のマントを羽織っている。
兵器や艦艇、デザリアム星自体も超硬合金の外殻を持ち通常兵器では駆逐/撃退不能(内部が露呈する開口部を狙った反撃が効果を挙げているが、精密さと迅速さが求められる)。さらに重核子爆弾はガミラスが技術を保有せずガトランティスも行使が限定的だったバリアを装備していた。
『永遠に』では、ヤマトを味方のゴルバ型浮遊要塞ごと撃破しようと目論むなど、任務遂行のためにはいかなる犠牲もいとわない冷酷な面が見受けられる。
艦艇や兵器の機体色は濃紺色とオレンジ。
光線兵器の色は、『新たなる旅立ち』では緑がかった黄色。『永遠に』では、ピンク色だったゴルバ型浮遊要塞を除き、橙色に統一されている。
暗黒星団帝国の艦隊は、地球側から「黒色艦隊」と呼ばれていた。
しかし、ヤマトが在留を希望するサーシャを残して地球へ飛び立ったため、スカルダートは戦艦グロデーズ5隻をヤマトへ差し向けて先述の歴史通りに葬ろうとするが、相原義一や徳川太助が偽装を看破して士気を取り戻したヤマトの新波動砲により、新黒色艦隊を殲滅された爆発の余波がデザリアム星にまでおよぶ。この光景から、波動エネルギーがデザリアム星のエネルギーと融合して大爆発を引き起こすことを真田は確信するが、デザリアム星は表面の偽装が焼失したのみで本体は無傷だった。その炎の中でスカルダートも暗黒星団帝国人としての正体や本性を現し、重核子爆弾を起爆させると脅してヤマトに降伏を強要する。
だが、同刻に地球で森雪を中心としたパルチザンによって重核子爆弾本体の起爆装置を解体されたうえ、サーシャによってデザリアム星の起爆装置を破壊されたため、一時的に重核子爆弾が起爆不能にされる。さらには、本星外部の攻撃をかいくぐってサーシャの手引きを受けたヤマトに中心核にまで侵入されたため、水晶都市のミサイルで迎撃する。その後、サーシャを発見して射殺したスカルダートは自身も相討ちで虫の息になりながら脱出口を閉じようとするが、ヤマトに新波動砲を発射されて消滅する。中心核と波動エネルギーが融合したデザリアム星は爆炎に包まれ、二重銀河も崩壊するほどの大爆発となり、新たな銀河が誕生した。
母星崩壊後、地球占領軍がどうなったかは不明である。