RESISTANCE 3
1953年、ネイサン・ヘイル中尉の死をもってセンチネルのメンバーで唯一の生き残りとなったジョセフ・カペリ伍長は、上官のヘイル殺しで不名誉除隊処分となった。 4年後、スーザン・フェアリーという女性と結婚し子供をもうけていたカペリは、オクラホマ州ヘイブンで生存者のコミュニティと共に暮らしていた。ヘイルの体内から見つかった抗体で今や人類はキメラウイルスを治療できるようになっていた。彼らの最善の努力にもかかわらず、人間をキメラへと転化させる従来の方針を変更し人類に対する全面的な大虐殺を開始したキメラ軍によって発見された。カペリと彼の民兵組織はキメラ軍を撃退したが、撃退される前にキメラ軍は町を破壊するために巨大兵器「テラフォーマー」を呼び出していた。
避難の準備をしている最中にカペリはフィリップ・マリコフ博士と出会い、博士はキメラは恒久的に地球を凍結して人間が住めないようにする計画の一環として、ニューヨークのセントラルタワーでワームホールを開けたと説明した。カペリは彼への協力を一旦は拒否したが、妻のスーザンは子供が過酷な環境で生き残るには弱すぎるので、再考するように頼んだ。 盗んだ古いトロール船で2人はミシシッピ川を進み、船上から野生のキメラの群れと戦ったが、最終的に船はゴリアテによって破壊されてしまった。目覚めた後に彼らはミズーリ州セントルイスまで流れついたことを知った。