BASEBALL HEROES
対戦相手は実在12球団で、監督・選手編成も製品稼動開始年度のものである(カード化されていない選手が登場することもある)。レベルが設定されており、全国ペナントモードよりは少ないもののレベルに応じた経験値が獲得できる。
キャンプ - BBH2014で追加。試合をプレイせずに選手を成長させるモード。
全国大会 - 期間限定で行われるイベントモード。詳細は後述。
VSチャレンジモード - BBH2010で追加されたモード。プレイヤーは打順を編成し、後述のVSによる対戦を3アウトになるまで行い、スコアを競う。守備側としてプレイすることはできない。 1球団ごとにノルマとなるスコアが用意されており、ノルマクリアやスコアに応じて選手デジカが獲得できる(スコアによっては獲得なしもある)。
BBHチャレンジリーグ - BBH2013で追加。通常は高速試合で消化し、得点圏にランナーが進んだ場合や、最終回などの要所をプレイするCPU対戦モード。規定試合数までにCLボール(勝利時に3個+ボーナス、引き分け時に1個獲得。ボーナスは戦力差により変化)を昇格基準までためるとリーグ昇格。規定試合消化しても降格基準を超えられなければ降格。このモードではサインとSサインの使用回数が無限となっている。
チュートリアル - BBH2011のみの初心者専用モード。ガイド役のマネージャーキャラクター「芝姫 翠」(しばひめ みどり)の指示に従ってプレーし、BBHの基本的な操作方法を身に付けていく。
ビクトリーロード - BBH2011のみのCPU対戦モード。主に初心者向け。様々なCPUチームと対戦して勝ちあがっていき、BBHの基本的な知識や勝ち方を身に付けていく。また、ストーリー仕立てで進行していることも特徴である。
参加できるチームに「1軍登録選手のうち、BBH2009における他球団所属選手(球団所属選手以外の選手)が5人以下」という条件が加わる。
以下、標準設定時のプレイについて述べる。プレイ料金(公式サイト内で表示されている料金を表記)と選手カードの排出枚数は店舗側で設定変更できる。
大会専用モードはなく、全国ペナントレースモードを使用する。カテゴリ分けはペナントレースに準ずる(ランキングはカテゴリ分けなし)。
参加特典はKAC2013第1回予選ラウンドは試合中に獲得できる経験値が+25%、KAC2013第2回予選ラウンド以降は試合を最後までプレイした場合に全選手(2軍・不出場選手含む)に経験値+1500。
対戦相手の球団または所属地域ごとにポイント集計を行う。ポイントは試合ポイントのハイスコア+☆ボーナス(勝敗に応じて獲得。1球団・地域あたり最大15個)で算出。
OB選手には以下の特徴がある。 基本的に永久欠番の番号に選手の背番号を設定することはできないが、OB選手は登録チームも一致する場合に限り、本人の永久欠番を設定できる(例:長嶋茂雄を巨人に登録した場合は、背番号を3に設定できる)。 「支配下登録から外れた選手は使用不可能」の規則(#使用できる選手参照)が適用されず、使用可能かどうかは個別に設定される。 1チームにつき制限人数(現在は3人)しか登録できない。 ランキング集計から除外される。 選手レベル・選手アビリティが設定されていない。 どのチームで使用しても球団所属選手にならない。 能力値は『SECRET』表記(BBH2014でも能力は公開されない)。 BB2010のホームランキャンペーン第2弾カードとして配布されたランディ・バース、ウォーレン・クロマティ2選手とBBH2011のホームランキャンペーン第3弾カードのOB12選手はOB選手扱い。
BBH2008・2009では、試合開始前に1選手にミッション(課題)を与え、成功することで能力を上昇させることができるようになった。課題は上げたい選手能力と選手の能力値によって変化する。1選手に付けられるミッションスキルは1つのみで、すでにミッションスキルを持っている選手に新しいミッションスキルを獲得させると上書きされる。また、一定期間経過するとミッションスキルは削除される。BBH2009では、さらにミッションをクリアすることでミッションスキルを強化できる。
BBH2013の時点でデジタルカード(以下デジカ)は3種類あったが、BBH2014ではシステムの変更によりデジカの名称がなくなった。