SARSコロナウイルス2の変異株
1.526(イオタ株)
WHOは「注目すべき変異株」(VOI) として格付けし、ラベルではイオタ株(Iota variant)に分類していたが、2021年9月にVOIから除外された。
2020年11月、米国ニューヨーク市で新しい変異株が発見され、B.1.526と命名された。2021年4月11日時点で、この変異株は少なくともアメリカ48の州と18か国で検出されている。
系統 B.1.617.1(カッパ株)
WHOは「注目すべき変異株」(VOI) として格付けし、ラベルではカッパ株(Kappa variant)に分類していたが、2021年9月にVOIから除外された。
系統 C.37(ラムダ株)
WHOは「注目すべき変異株」(VOI) として格付けし、ラベルではラムダ株(Lambda variant)に分類していたが、2022年4月時点でVOIから除外されている。
2020年12月にペルーで最初に同定された。2021年6月14日、WHOは本株をラムダ株と命名、「注目すべき変異株」(VOI) に加えた。
本株は南米を中心に最低でも世界30か国に広がり、アルファ株やガンマ株より感染力が強い可能性や他の株に比べCOVID-19ワクチンへの耐性が強い可能性がある。
系統 B.1.621(ミュー株)
WHOは「注目すべき変異株」(VOI) として格付けし、ラベルではミュー株(Mu variant)に分類していたが、2022年4月時点でVOIから除外されている。
ミュー株は、2021年1月にコロンビアで初めて検出され、2021年8月30日にWHOによって「注目すべき変異種」(VOI) に指定された。南米とヨーロッパで流行が起きている。
2021年1月、査読前論文において、系統 B.1.1.7(アルファ株)と系統 B.1.1.207(ナイジェリアで最初に確認)で検出された重要な新規SARS-CoV-2変異株の特徴である変異「P681H」が報告された。この変異株の出現は、現在世界的に普及している「D614G」と同様に、世界中での大幅な指数関数的増加の可能性を示した。
2つのBA.2亜系統の組み換え株であるXBBの亜系統である。通称「アークトゥルス」。
WHOの2023年4月21日時点でのリスクアセスメントにおいて、感染者増加についての優位性が高いとされている。感染した児童は結膜炎や高熱といった症状を呈する。
2023年3月にはインドで検出されたウイルスの50%を超えたほか、アメリカ、シンガポール、オーストラリア等でも感染が拡大している。
2020年11月初旬、デンマーク国家血清研究所(英語版) (SSI) によってΔFVIスパイクとも呼ばれる Cluster 5 がデンマークの北ユラン地域で発見された。ミンクからミンク農場(英語版)を経由して人間に拡散したと考えられている。2020年11月4日、デンマークのミンクの個体数(英語版)を淘汰して、この突然変異が広がる可能性を防ぎ、新しい突然変異が発生するリスクを減らすことが発表された。突然変異が広がるのを防ぐために、封鎖と旅行制限が北ユトランドの7つの自治体に導入された。これは、COVID-19パンデミックに対するデンマーク国内(英語版)または国際的な対応に適合する。2020年11月5日までに、214人のミンク関連のヒトの症例が検出された。
世界保健機関 (WHO) は、Cluster 5 は「中和抗体に対する感受性が中程度に低下している」と述べた。SSIは、突然変異によって開発中のCOVID-19ワクチン効果が低下する可能性があるものの、役に立たなくなる可能性は低いことを警告した。ロックダウンと大規模な検査の結果、SSIは2020年11月19日に、Cluster 5 がおそらく絶滅したと発表した。2021年2月1日の時点で、すべてSSIの査読付き論文の著者は、Cluster 5 がヒト-ヒト間で流行していないと評価した。
701番目のアミノ酸位置でアラニン(A)がバリン(V)に置換したことを示す。
SARS-CoV-2の出現は、コウモリのSARS様コロナウイルスとセンザンコウコロナウイルスとの間の組換えの結果である可能性があるが(異種間伝播による)、突然変異は進行中の進化と新しいSARS-CoV-2の変異株の出現に重要な役割を果たすことが示されている。
中華人民共和国(中国)で最初にサンプリングされ同定された変異株は、研究者により「3つの変異株」によって元のゲノムと異なるとみなされている。したがって、SARS-CoV-2には多くの系統が存在する。
次の表はリスクが高い、または高い可能性がある変異株の情報とリスクレベルを示す。信頼区間は特に明記されていない限り、95%の信頼度を仮定している。
現在の状況については後節「#WHOによる分類」も参照