第四艦隊 (日本海軍)
第17戦隊:千歳・神威
第18戦隊:多摩・常磐
第5潜水戦隊:由良 第9潜水隊:伊123・伊124 第13潜水隊:伊121・伊122 第21潜水隊:呂33・呂34
附属 第30駆逐隊:睦月・如月・弥生・望月 蒼鷹・能登呂 横浜海軍航空隊(2月以降)
独立旗艦:鹿島(12月1日より)
第18戦隊:天龍・龍田
第19戦隊:沖島・常磐・津軽・天洋丸
第6水雷戦隊:夕張 第29駆逐隊:追風・疾風・朝凪・夕凪 第30駆逐隊:睦月・如月・弥生・望月
第7潜水戦隊:迅鯨 第26潜水隊:呂60・呂61・呂62 第27潜水隊:呂65・呂66・呂67 第33潜水隊:呂63・呂64・呂68
第24航空戦隊(10月1日編入):千歳海軍航空隊・横浜海軍航空隊・神威・五州丸
第3根拠地隊(パラオ群島防衛。司令部はパラオ本島) 第4砲艦隊・福山丸 第13掃海隊・艦艇無し 第55駆潜隊・第1元日丸、昭和丸、第3昭和丸、第5昭和丸 第3防備隊・艦艇無し 第16航空隊・艦艇無し
第4根拠地隊(カロリン諸島防衛。司令部はトラック環礁) 第5砲艦隊・高栄丸 第14掃海隊・艦艇無し 第56駆潜隊・艦艇無し 第57駆潜隊・第15昭南丸 第4防備隊 第17航空隊
第5根拠地隊(マリアナ諸島防衛、司令部はサイパン島) 第7砲艦隊・勝泳丸 第15掃海隊 第59駆潜隊・第5昭南丸、第6昭南丸 第60駆潜隊・第8京丸、第10京丸 第5防備隊 第18航空隊
第6根拠地隊(マーシャル諸島防衛。司令部はクェゼリン環礁) 第8砲艦隊・八海山丸・光島丸・興津丸 第16掃海隊 第62駆潜隊・無し 第63駆潜隊・第3昭南丸、第3文丸 第64駆潜隊・第10昭南丸、第11昭南丸 第65駆潜隊・第6京丸、第7京丸、特設捕獲網艇宇治丸 第6防備隊 第51警備隊 第52警備隊 第53警備隊 第19航空隊
附属:聖川丸・松栄丸・山鳩丸・氷川丸・金剛丸・金龍丸 第4港務部・第4気象隊(トラック常駐)・舞鶴鎮守府第2特別陸戦隊(ソロモン諸島攻略部隊)
独立旗艦:足柄
第5戦隊:妙高・那智・羽黒
第9戦隊:天龍・北上・大井・木曾
第3水雷戦隊:鬼怒 第4駆逐隊:秋風・帆風・羽風 第23駆逐隊:菊月・三日月・望月・夕月 第30駆逐隊:睦月・如月・弥生・卯月
第4水雷戦隊:那珂 第7駆逐隊:曙・朧・潮 第8駆逐隊:夕霧・天霧 第11駆逐隊:白雪・初雪 第12駆逐隊:叢雲・薄雲・白雲
第3潜水戦隊:迅鯨 第19潜水隊:伊56・伊57・伊58 第27潜水隊:呂65・呂66・呂67 第30潜水隊:伊65・伊66・伊67
付属:神威・能登呂・鳴戸・間宮・第一航空隊 第26駆逐隊:栗・楡・栂・柿
1937年(昭和12年)10月20日に新編された支那方面艦隊は、日中戦争の激化にともない増強されていった(前述)。1938年(昭和13年)2月1日以降は麾下に第三艦隊・第四艦隊(2代目)・第五艦隊を擁し、連合艦隊に匹敵する外戦部隊となった。しかし支那事変(日中戦争)以外の第三国(アメリカ・イギリス・ソ連・他連合国)と開戦になった場合、支那方面艦隊に戦力が集中しているため不利であった。 1939年(昭和14年)4月頃、軍令部は第四艦隊と第五艦隊を支那方面艦隊から独立させることを研究し、その趣旨について「(前略)之ヲ要スルニ聯合艦隊ノ編制ヲ強化スルト共ニ 第三、第四、第五艦隊ヲ支那方面艦隊ヨリ除キ 戦時主任務ノ演練ニ専念セシムルノ要アリ(中略)第四、第五艦隊ハ其ノ任務ニ対スル演練並ニ行動海域ノ関係上 聯合艦隊ニ編入スルコトナク各独立艦隊トシ 所要ニ応ジ聯合艦隊ト聯合シテ諸訓練ヲ実施スル如クスルヲ適当ト認ム 又事変中ハ所要ノ場合支那方面艦隊ノ作戦警備ニ協力セシムルコトヲ考慮シ置クヲ要ス(支那方面艦隊略)」と説明している。
1939年(昭和14年)11月15日、前第四艦隊が第三遣支艦隊に改名すると同時に、日本海軍は南洋諸島の基地建設地調査と防衛を主任務とする第四艦隊を編制した(司令長官:片桐英吉中将)。名称こそ受け継いだものの、実際は新部隊である。
新編当初の第四艦隊は大本営直轄の独立艦隊であり、また連合艦隊にならぶ外戦部隊であった。
岸福治少将:1939年11月15日~
矢野志加三少将:1941年10月10日~
鍋島俊策少将:1942年11月1日~
澄川道男少将:1944年1月6日~
有馬馨少将:1944年3月30日~
澄川道男少将:1944年8月12日~(降伏)