ユートピア (マーベル・コミック)
この他にストーリーラインの補完として全3号のアンソロジー・リミテッドシリーズ『ダークX-MEN: ビギニング』がジェームズ・アスムス(英語版)とポール・コーネル(英語版)の脚本で製作された。ストーリーはダークX-MENに加入した面々のそれぞれの理由を説明するものである。
他にマイク・カリー(英語版)脚本の『X-MEN: レガシー』第226-227号ではX-MENとダークアベンジャーズの戦闘の際のローグ(英語版)とガンビットの視点が描かれる。これは『X-MEN: レガシー アニュアル』で始まるシリーズの新たな方向性の序幕である。
メインストリーラインは同じくマット・フラクション脚本の『Dark Reign: The List - Uncanny X-Men』に繋がり、さらにその後『アンキャニィX-MEN』のアークへと続く。ワンショット『ダークX-MEN: コンフェッション』は『X-フォース』のクリス・ヨストとクレイグ・カイル(英語版)が脚本を執筆した。
「メサイア・コンプレックス」でサイクロップス(英語版)はウルヴァリンに強行専門の分隊X-フォースを極秘のうちに結成させ、彼はこれを他のX-MENはおろか共同リーダーで恋人のエマ・フロスト(英語版)にすら伝えなかった。一方でワンショット『シークレット・インベージョン: ダークレイン』で、ノーマン・オズボーンはカバル(英語版)の初会合でフロストに彼女が従順にするならばサンフランシスコのミュータントコミュニティに手を出さないと約束する。フロストはサイクロップスに自身がカバルに所属したことを話さなかった。これらの秘密のせいで2人の関係に亀裂が入りかけたが、最終的には真実を話し合い、今後隠し事をしないことを約束した。
一方で「メサイア・コンプレックス」の冒頭で新しいミュータントの子供(英語版)が生まれたアラスカのクーパーズタウンは、それを巡るマローダーズ(英語版)とピュリフィアーズ(英語版)の争いにより壊滅する。その後、オリジナルのセンチネルの発明者でボリバー・トラスク(英語版)の兄弟で自身も過激な反ミュータント活動家であるサイモン・トラスクはミュータントの出産を制限する法律の成立を呼びかける。トラスクの影響は反ミュータント法を支持する多くの州に広がり、そして次第にミュータントコミュニティに混乱を引き起こし始めた。