奈良英和学校
米田庄太郎(京都大学教授、社会学)
木村重治(立教大学総長)
岡實(大阪毎日新聞社長)
大西良慶(清水寺官長)
大国弘吉(奈良市長)
西條八十(早稲田大学文学部教授、フランス文学者、詩人、作詞家)
生徒数は140名から150名に達し、米田庄太郎(京都大学教授、社会学)、木村重治(立教大学総長)、岡實(大阪毎日新聞社長)、大西良慶(清水寺官長)、大国弘吉(奈良市長)などの著名人はこの時代の出身であった。
1889年(明治22年)、校舎が新築となり、1894年(明治27年)10月に新校長として札幌農学校(現・北海道大学)第4期生であった河村九淵(前立教学院化学教授・農学士)が着任し、2年間滞在した。
また、1894年(明治27年)4月頃から、中学校制に改め、校名を「私立奈良尋常中学校」とすることとなり、同年12月に設立の認可がおりて正式に学校が発足。翌1895年(明治28年)1月に開校式が行われた。奈良県の古沢知事、参事官、尋常師範学校長など250人の来賓を迎えて、盛大に行われたという。こうした1892年(明治25年)~1894年(明治27年)頃に行われた組織改編により前身の「奈良英和学校」が廃校となった際に、姉妹校の立教学校(第2次)へ転学する学生もおり、木村重治はそうした学生の一人だった。
1896年(明治29年)には、札幌農学校(現・北海道大学)第1期生でクラーク博士から直接指導を受けて、クラークの「Boys, be ambitious (青年よ、大志を抱け)」の言葉を後世に残す上で大きな役割を担った大島正健が校長となり、当時の生徒数は80名であった。