マツモトキヨシ
5月22日 - 株式会社ラブドラッグス(岡山県岡山市)とのフランチャイズ契約を締結。 6月27日 - 長崎県佐世保市のクロスガーデン広田に長崎県1号店(クロスガーデン広田店)を開店。 7月1日 - 仕入れ事業をマツモトキヨシホールディングスへ継承。北関東以北の同社店舗のほとんどの運営(70店舗)を、エムケイ東日本販売(現在のマツモトキヨシ東日本販売)へ譲渡。 9月18日 - 株式会社保健堂(東京都練馬区)とのフランチャイズ契約を締結。 9月30日 - シミズ薬品株式会社との業務提携を解消(その後、同社はイオン系列のハピコムへ加盟、2015年3月にウエルシアホールディングス株式会社の傘下となる)。 11月14日 - 滋賀県草津市のエイスクエア内に滋賀県1号店(草津エイスクエア店)を開店。 11月17日 - モリス株式会社(兵庫県高砂市)とのフランチャイズ契約を締結。
2009年 2月28日 - 株式会社オージョイフルとの業務提携を解消。翌3月1日に同社はダイキ株式会社(現:DCM株式会社)へ吸収合併される。 7月13日 - 医薬品に特化した新業態のコンビニ型ファーマシー「Medi+マツキヨ」1号店(都営五反田店)を開店。 8月24日 - 大手コンビニエンスストアのローソンと業務提携。共同の新型店を、今後5年間で1000店舗の展開を発表(ローソンで医薬品販売が可能になる)。 10月1日 - 株式会社イシヰ(岐阜県)とのフランチャイズ契約を締結。
店頭で申し込めば即日発行ができ、現金での支払いでポイントが付与される「マツキヨココカラポイントカード(ポイントサービス統合に伴い、「マツモトキヨシ現金ポイントカード」からカードデザインと名称を変更)」と、商品券の進呈やクレジット支払い時にも「クレジットカードポイント」としてポイントが付与されるなどの特典を付与したクレジットカード一体型の「マツモトキヨシメンバーズクレジットカード」(発行や審査はオリエントコーポレーションが担当)の2種類がある。
なお、同社以外にもグループ会社のマツモトキヨシ東日本販売(ダルマ)、マツモトキヨシ甲信越販売(ファミリードラッグ・中島ファミリー薬局・シメノドラッグ)、マツモトキヨシ九州販売(ミドリ薬品)、マツモトキヨシ中四国販売(ラブドラッグス)、ぱぱすからも同じ機能を持つ現金ポイントカードを発行しており、同社・グループ会社運営・フランチャイズ運営の「マツモトキヨシ」を含め、対象となるグループ内の全店舗で相互利用が可能である。