ビッグコア
ステージ2に登場するボスで、全体が植物の蔓に覆われているのか緑色にカラーリングされている。中央のコアのレーザーと上下についている触手で攻撃する。しかしネメシス90改のボスは全体的に遮蔽版が多い代わりに簡単に破壊できるので、正直このボスの脅威となるのは遮蔽版からの打ち返しくらいである。
ステージ1~5のボス。上下に動き、一定間隔で停止しながらレーザーを1回撃ってくる。FC版、MSX版ではデザインが異なり、FC版についてはハード性能、カセットの容量の制約上、中型ザコキャラの「マザー」とほぼ同じ大きさに縮小されている。MSX版は遮蔽板がとても多く、メインスラスターが斜めではなく真後ろを向いている。
オリジナルのビッグコアが登場する作品は以下の通りである。
ステージ8に登場する中ボス。大きな1つのコアと7枚の遮蔽板に8門のレーザー砲、「VF-88Aダッカー」を出す2つのハッチを持つ。レーザーを乱射しながら一定時間にダッカーを放出する攻撃を繰り返す。レーザー砲は耐久力が高いが破壊可能である。ハッチは破壊できない。遮蔽板を破壊する度に1発の撃ち返し弾を放つ。登場シーンはかなり派手で、コアが自機の後ろから飛んで来て特定の位置で停止(浮遊)し、上下の床から2つに分割された機体が迫り出して合体し、遮蔽板でコアの前が塞がれるという演出である。この登場の仕方は後の要塞型コアにも引き継がれる。また、このボス専用のBGMも用意されている。
FC版ではデザインが異なっており、遮蔽板が5枚、レーザー砲が4門になっている。レーザー砲とハッチは数発攻撃すれば破壊できる。また、遮蔽板を破壊した時の撃ち返し弾の数が5発に増えている。
8面の要塞地帯に登場するボス。5個のコアとダッカーを出すハッチに加え、レーザー砲台、天井と床に移動式バーナーを装備しており、左右に移動する。遠距離で戦うとレーザーを撃ってくる上先ほどのバーナーが邪魔するため、プレイヤーは接近戦を余儀なくされる。安全地帯も存在するが装備によって場所が異なる場合がある。
アレキサンドリアステージのボス。
操縦者は「ティティ14世」。
最初は太陽の船を迎え撃ち、太陽の船を撃破するとそこからスカラベユニットが現れる。ただし難易度HARDの時だけはスカラベユニットとは交戦しない。
スカラベユニットはビッグコアと似た動き方で画面右端の上部、中部、下部と三箇所を俊敏に移動しながら弾を大量にばら撒いてくる。その激しい攻撃の代わりに防御力が無く、通常攻撃でもたやすく隔壁やコアを破壊でき、キャラによっては本作のボムの一種である「ドラマティックバースト」を上手く当てることで速く撃破することが可能である。正式名称は「ビッグコア・デルソル」。
更に撃破までに放ったミサイル(破壊不可)はこの作品のみ撃破後全て消滅する(※通常はそのまま飛んでいく)。また専用BGMがある。
PCE版『ときめきメモリアル』に収録されている『フォースギア』に、小型化された雑魚として複数登場する。 スクラップカバードコア 『グラディウス外伝』ステージ2下部ルートでは、ほぼ完全な形での残骸が放置されている。ミサイル発射機能やカバーの回転機能が生きており、更に他の雑魚による攻撃もあいまって同ルートの難所となっている。外装のみ破壊が可能で本体の破壊は不可能。 SDカバードコア 『極上パロディウス』ステージ5の中ボスとしてSDビッグコアMK-IIと共に3隻出現。SDビッグコアMk-IIの後ろでオリジナルと同じくミサイルを上下に放つ。動きはほとんど無いが耐久力が高い。『実況おしゃべりパロディウス』ステージ4終盤にも登場。こちらも耐久力が高く、槍を構えて突撃してくる。
ステージ1、13のボス。レーザー砲が6門になった他はほぼビッグコアと同じアルゴリズムである。: 『ネメシス90改』においても同様な扱いだが、コア系ボスの遮蔽版は耐久力が低い代わりにステージ1から大量の打ち返し弾が発生する。
詳しくは該当する項目を参照。
ステージ9に登場する中間要塞。2つのコアがあり、それぞれ5枚の遮蔽板で守られている。兵装は4門のレーザー砲台と、ダッカーを出すハッチを2つ持つ。レーザー砲台は破壊可能だが一定時間で無限に再生する。ハッチは破壊できない。また、名前が示す通り、全体が赤い色をしている。
前方のコア本体と天井・地上の壁の他、後方も壁に覆われており、四方を地形に囲まれた状態になっている。天井と地上、後方の壁は全て4等分されており、それらの壁が一定のアルゴリズムで上下、もしくは前方に突き出して攻撃してくる。壁が動く際は、壁の中心がオレンジ色に光る。
突き出る壁のアルゴリズムが空間を大きく狭める等かなり厄介な上、レーザー砲台からの攻撃もなかなか激しく、正面きって戦うとかなりの苦戦を強いられる。しかし、天井のハッチの真正面が安全地帯となっており、そこに入ってショットを撃ちっ放しにしていれば装備の有無にかかわらず時間切れまで耐えることができる。
オリジナルステージのボスで、機体を泡で覆覆っている。泡が遮蔽版を兼ねており、撃たれると凹むが、一定時間後経つと元に戻る。