PC98-NXシリーズ
また初期型の付属マウスはPS/2接続で、付属のUSBキーボードにマウス用のPS/2コネクタがあった。その後、デスクトップ型ではPS/2などのレガシーインタフェースは企業向けを中心に復活し、21世紀に入ってもMateシリーズでは一部のモデルで装備され続けている。なおUSBキーボード・マウスはMS-DOS環境などではBIOSでPS/2接続に見えるようエミュレーションされる(USBレガシー・サポート)。またシリアルポート(RS-232C準拠)・パラレルポート(セントロニクス規格準拠)は当初より主なモデルには装備されている。
なお、デスクトップ型とは逆に、初期のノート型では本体や付属のポートバーにレガシーインタフェースがついていたが、その後のノート型の主なモデルではシリアルポート・パラレルポートを含めた(PCカードスロット以外の)レガシーインタフェースは完全消滅し、ポートバーは別売でUSBタイプになっている。
過去には、PC-98X1シリーズから移行したユーザーのために、オプションとして98配列USBキーボード(PK-KB002=PS/2マウス接続ポート付、PK-KB011=USBポート付)が発売されていた。
初期のデスクトップ機種では電源とマザーボードにNLX規格のものが使用されていた。BIOSのメニューは初期のデスクトップ機では日本語で表示していた。
NXシリーズ向けとしてM式配列のエルゴノミクスキーボード(USB接続)も発売されたが普及には至らなかった。