アイソフォーム
複数のアイソフォームが作り出される主要な機構は、選択的スプライシングとプロモーター利用の差異であるが、変異や多型といった遺伝的変化による修飾も異なるアイソフォームとして認識されることもある。
選択的スプライシングはmRNA転写産物のアイソフォームを作り出す主要な転写後修飾過程であり、タンパク質の多様性に寄与する主要な分子機構である。巨大リボヌクレオタンパク質であるスプライソソームは、核内でRNAの切断と連結を担う分子装置であり、タンパク質をコードしない領域(イントロン)を除去する。
スプライシングは転写と翻訳の間に起こる過程であり、スプライシングが及ぼす主要な影響はゲノミクスの技術を用いて研究が行われてきた。例えば、マイクロアレイ解析やRNAシーケンシング(英語版)が選択的スプライシングを受けた転写産物の同定やその量の測定に利用されてきた。各転写産物の存在量は各アイソフォームのタンパク質レベルでの存在量の代替的な指標としてしばしば用いられるが、ゲル電気泳動や質量分析を用いたプロテオミクス実験からは、転写産物量とタンパク質量の相関はしばしば低く、通常はいずれか1つのタンパク質アイソフォームが大部分を占めていることが示されている。このRNAレベルとタンパク質レベルの相違は翻訳後の段階で起こっているようであることが2015年の研究で示されているが、その機構は基本的には解明されていない。