ダーウィンフィンチ類
ただし、ガラパゴスフィンチ属・ダーウィンフィンチ属内部の系統が不確定なため、これらの分類が系統的かどうかも不確定である。
ダーウィンフィンチ類のうち最も祖先の特徴を残しているのはムシクイフィンチ属で、アメリカムシクイに似た(類縁性はない)虫食性の小鳥である。ムシクイフィンチ属はそれ以外のフィンチと最も早く分岐し、その後間もなくハシブトダーウィンフィンチが分かれ、ガラパゴスフィンチ属とダーウィンフィンチ属が分かれた。ただし、ハシボソガラパゴスフィンチがガラパゴスフィンチ属とは別系統で比較的初期に分岐したとする説もある。またダーウィンフィンチ属のマングローブフィンチがムシクイフィンチの近縁種だとする説もあった。ココスフィンチの系統位置については諸説あったが、ダーウィンフィンチ属と姉妹群であり共通祖先がココ島に移住し分岐したという結果が出ている。他に、ダーウィンフィンチ属に内包される、あるいはダーウィンフィンチ類の比較的初期に分岐したとする説もある。
ダーウィンフィンチ類は、以前は14種とされてきたが、ムシクイフィンチ属が居住環境の異なる2種に分化していることが判明し (Tonnis et al. 2005)、15種となった。しかし、特にガラパゴスフィンチ属内で種間の交雑が頻繁に見られることから、14種以下あるいは16種以上に分類する研究者もいる。オオガラパゴスフィンチおよびハシボソガラパゴスフィンチとして所蔵されている古い標本の中に、現生標本とは遺伝的に区別できる絶滅種が混在しているという指摘もある。
Camarhynchus ダーウィンフィンチ属 Camarhynchus psittacula, Large Tree Finch, オオダーウィンフィンチ, LC Camarhynchus pauper, Medium Tree Finch, ダーウィンフィンチ, CR Camarhynchus parvulus, Small Tree Finch, コダーウィンフィンチ, LC Camarhynchus pallidus, Woodpecker Finch, キツツキフィンチ, VU Camarhynchus heliobates, Mangrove Finch, マングローブフィンチ, CR
Certhidea ムシクイフィンチ属 Certhidea olivacea, Green Warbler‐Finch (分離前の旧名 Warbler Finch, ムシクイフィンチ, VU) Certhidea fusca, Grey Warbler‐Finch, ハイイロムシクイフィンチ(C. olivacea から分離)
Pinaroloxias Pinaroloxias inornata, Cocos Finch, ココスフィンチ, VU