藻菌類
なぜなら、ミズカビ類は胞子に鞭毛を持つカビであり、これは菌類の中では原始的な特徴と見られ、それとフシナシミドロ類が、栄養体の形や、有性生殖の形等、実によく似ていたからである。栄養体は両者共に糸状で隔壁がなくて多核体である。
そこで、これを起源として菌類の進化を考えると、胞子が鞭毛を持つ鞭毛菌門と、鞭毛は持たないが、多核体の菌糸を形成する接合菌門がこれに該当する。そう言う訳で、この2つの菌類が、藻類に近い菌類と言う意味から、藻菌とよばれることになった。
しかしながら、その後鞭毛菌門は解体され、ミズカビ類は実は菌類ではない事が現在では確実視されている。そのため、藻菌類という言葉は成立する基盤を失った。
ただし、ミズカビを含む卵菌類は、現在では、実は菌類と別系統で、むしろ黄緑藻類と近縁である(ストラメノパイル)とされている。全てが間違っていた訳ではないと言えよう。