伏見稲荷大社
この頃、地方領主や軍事貴族からの荘園の寄進の倣いが起こり、有力となった寺社が独自の僧兵や神人を持つようなると武家同士や寺社同士の争いに巻き込まれるようになる。社家一族のうち、羽倉氏はこの頃、南北朝の混乱時に荷田氏を仮冒して社家を継いだことが疑われているが、江戸期の国学の大家である荷田春満はこの氏族から出ている。
永享10年(1438年)、後花園天皇の勅命で、室町幕府6代将軍足利義教により、それまで山頂にあった稲荷の祠を山麓に移した、とする伝承が藤森神社に伝わっている。これによると、現在社地となっている稲荷山麓の当地に天平宝字3年(759年)から藤尾社という舎人親王、その父の天武天皇を祀る神社があったが、これを稲荷社地にするために藤尾社を南にある藤森神社境内の東殿へ遷座した、現在の藤森にあった真幡寸神社を藤森から西に移した(現在の城南宮)、という。つまりそれまで稲荷社は稲荷山山中(現在の一ノ峰、二ノ峰、三ノ峰)に限る狭い範囲にあった。
田中社 - 祭神:田中大神
大杉社 - 祭神:大杉大神、磐根大神
眼力社 - 祭神:眼力大神、石宮大神、常吉大神
傘杉社 - 祭神:傘杉大神
薬力社 - 祭神:薬力大神
長者社 - 祭神:加茂玉依姫
上社神蹟 - 祭神:大宮能売大神、末廣大神
大岩大神
中社神蹟 - 祭神:猿田彦、青木大神
荷田社御神蹟 - 祭神:伊勢大神
下社神蹟 - 祭神:宇迦之御魂、白菊大神
上末社 長者社(重要文化財) 荷田社(重要文化財) 五社相殿(重要文化財) 両宮社(重要文化財)
白狐社(重要文化財) - 稲荷大神の眷属を祀る。元禄7年(1694年)建立。一間社春日造、檜皮葺。
産婆稲荷 - 祭神:産婆大明神
熊鷹社 - 祭神:熊鷹大神
玉山稲荷社 - 祭神:玉山稲荷大神
一ノ峰(上之社神蹟) - 末広大神
二ノ峰(中之社神蹟) - 青木大神
三ノ峰(下之社神蹟) - 白菊大神
荒神峰(田中社神蹟) - 権太夫大神
間ノ峰(荷田社神蹟) - 伊勢大神
御膳谷遙拝所 - 往古に三ヶ峰に神供をした所と伝えられている。
釼石(長者社神蹟) - 社殿の後ろに御神体の剱石があり長者社には加茂玉依姫(かもたまよりひめ)を祀る。
間ノ峰(荷田社神蹟)
御膳谷遙拝所
釼石(長者社神蹟)
稲荷塚(稲荷山に数万カ所所在)
稲荷塚、稲荷信仰が窺える