一条兼定
一方、兼定の追放を知り憤慨した加久見城主の加久見左衛門は、平素から土佐一条氏老臣に反感を抱いていた大岐左京進、大塚八木右衛門、江口玄蕃、橋本和泉らと謀り、挙兵して中村を襲い、老臣らを討伐した。しかし、この混乱に乗じ、叛乱鎮定に名を借りた長宗我部氏によ、り中村を占領されることになった。
翌天正3年(1575年)に宣教師ジョアン・カブラルから洗礼を受け、キリスト教に入信した。霊名はドン・パウロ。
同年7月、兼定は再興を図って大友氏の助けを借り土佐国へ進撃したが、四万十川の戦いで大敗し敗走した。以降勢力を回復することはできず、土佐一条氏は滅亡した。
その後は宇和海の戸島に隠棲したが、旧臣であり、一条氏の縁者の入江左近に暗殺されかけ重傷を負った事件や、生活の苦心がアレッサンドロ・ヴァリニャーノの書簡などから窺える。天正9年(1581年)、ヴァリニャーノは京都から長崎への帰路の途上に兼定を見舞っているが、その際、兼定は熱心で信心深い信仰生活を送っており、ヴァリニャーノは感嘆したという。
天正13年(1585年)7月1日に死去。戸島の龍集寺にある墓は、宝篋印塔の形式で現在は、その一部が欠けている。戒名は天真院殿自得宗性家門大居士。
なお嫡男内政も翌7月2日に死去している
その後は長宗我部氏によって領土を侵食され、また御一門の血縁者である土居宗珊とその一族を無実の罪で殺害したために信望を失い、他の三家老である羽生監物、為松若狭守、安並和泉守などの合議によって天正元年(1573年)9月に隠居を強制された。土居一族殺害については、兼定の名を騙る長宗我部家臣の吉良親貞の密偵の仕業、三家老の合議による謀略、長宗我部側の謀略に気づいた三家老が、主君兼定を岳父である九州の大友氏の元へ逃がす策である、などの諸説があるがいずれも定説ではない。なお、この際に本家より義弟の一条内基(兼冬の弟)が訪れ、兼定の嫡子・万千代(吉房子とも)の元服を執り行い1字を与えて内政と名乗らせている。
天正元年(1573年)6月16日には中納言に任じられた。なおこの時、土佐に下向していた公家である町経光・白河富親・中御門経弘・飛鳥井雅量等も侍従に任じられている。
天正2年(1574年)2月に中村御所を出て九州へ渡った。豊後臼杵へ逃れ、大友氏を頼っている(佐伯に至り、佐伯惟教に迎えられたとする資料も存在する)。老臣達によって追放されたとされてきたが、実際は長宗我部元親と京都から下向した一条内基との協議、あるいは一条内基の了承により、元親が兼定を追放したとされている。数ヶ月の後には伊予高森城の城主で宇都宮氏旧臣でもある梶谷景則のもとに赴き、土佐国攻略のための兵を募っている。