形態音韻論
形態音韻論が使われる典型的な場合に、英語の規則的な名詞複数形や動詞過去形がある。名詞複数形は単数形の語末が歯擦音ないし破擦音ならば /ɪz/、それ以外の無声音ならば /s/、有声音(有声子音および母音)ならば /z/ を加えることによって作られるが、これを音韻論によって扱うことはできない。なぜならば複数語尾と無関係な場合には母音のうしろに /s/ が続くことは珍しくないためである(house /haʊs/ など)。このように(音韻的でなく)形態的な条件のもとで規則的に異なった音が現れる場合、形態音韻論では同じ形態音素の列(英語の複数形の場合は、たとえば {z} とする)が先行する音によって複数の異形態 (allomorph) として現れると考える。
別の例として、ドイツ語では語末の有声破裂音は無声化するため、Lied /liːt/(歌)の語末子音は Gebiet /ɡəbiːt/(地域)の最後の音と同じになり、音韻論的には /t/ としか解釈できない。しかし複数形では Lieder /liːdər/ と有声音があらわれる。この場合も Lied は形態音素表記で {liːd} と表され、d が語末という条件で無声化されると考える。
音声表記が [......]、音素表記が /....../ で囲むことにより示されるのに対し、形態音素は波括弧 {......} で囲むことによって表記する(縦棒 |......| で囲む流儀も存在する)。
形態音韻論が対象とする代表的な現象には、ほかに以下のようなものがある。
フランス語のリエゾン
母音調和
連音現象一般(日本語の連濁など)