古細菌
古細菌(archaebacteria)発見の歴史は細菌(eubacteria)発見の歴史に並行している。今日知られているような枠組みが完成する以前は、高度好塩菌、メタン菌、好熱菌それぞれ別々の枠組みで研究が進められていた。古細菌という枠組みができたのは1977年以降である。
古細菌(こさいきん) または アーキア(羅: archaea、アルカエア、単数形: 羅: archaeum、archaeon)は、生物の主要な系統の一つである。細菌(バクテリア)、真核生物(ユーカリオタ)と共に全生物界を3分している。古細菌は形態や名称こそ細菌と類似するが、細菌とは異なる系統である。高度好塩菌、メタン菌、好熱菌などが良く知られている。
日本語では「古細菌」または「アーキア」が呼称されることが多い。「始原菌(しげんきん)」も使われる。「古細菌」という名称は、「菌」および「細菌」を名前に含むが、菌類(真菌)や細菌(真正細菌)とは異なる。
分類はNCBIによる。門、綱における太字は記載種を含む系統を表す。各系統の概略もリストの下に記す。
ユーリ古細菌界 / Euryarchaeota ユーリ古細菌門 / Euryarchaeota テルモコックス綱 / Thermococci メタノマダ / Methanomada(クラスI メタン菌) メタノバクテリウム綱 / Methanobacteria メタノコックス綱 / Methanococci メタノピュルス綱 / Methanopyri アルカエオグロブス綱 / Archaeoglobi テルモプラズマ綱 / Thermoplasmata ステノス古細菌 / Stenosarchaea メタノミクロビウム綱 / Methanomicrobia(クラスII メタン菌) メタノナトロナルカエウム綱 / Methanonatronarchaeia ハロバクテリウム綱 / Halobacteria
クレン古細菌に寄生する。ゲノムサイズが非常に小さい。最初に発見され、Ignicoccus hospitalisに寄生する"Ca. Nanoarchaeum equitans"は、ゲノムサイズが古細菌最少の49万0885塩基対しかない。
詳細は「タウム古細菌」を参照2021年現在6種が記載。2008年にクレン古細菌から分けられた系統。中温性の亜硝酸古細菌などを含む。クレン古細菌同様にESCRT複合体で分裂する。クレン古細菌より低温に適応している。