日本の哺乳類一覧
p.giliacus 【北】
ヒメネズミ Apodemus argenteus 【北・本・島(対・屋・種・佐・隠)/固】
セスジネズミ(セスジアカネズミ) Apodemus agrarius 【島(尖)/絶滅危惧IA類 (CR)(環境省レッドリスト)】 2例のみ。海外には広く分布。
カヤネズミ Micromys minutus 【本・島(対・隠)】 日本で最小のネズミ類。
ハツカネズミ Mus musculus 【ほぼ全国】 史前帰化動物。
オキナワハツカネズミ Mus caroli 【島(南)】
オキナワトゲネズミ Tokudaia muenninki 【島(沖)/絶滅危惧IA類 (CR)(環境省レッドリスト)/固】 沖縄島。本種とアマミトゲネズミ・トクノシマトゲネズミは、以前は一括してトゲネズミ(リュウキュウトゲネズミ)Tokudaia osimensis として扱われていたが、奄美大島・徳之島・沖縄島の個体群でそれぞれ染色体数などが異なることは、従来から知られていた。オキナワトゲネズミ(沖)・アマミトゲネズミ(奄・徳)の2亜種に分類されていたが、2001年に別種として扱うことが報告された。その後、2006年に徳之島産のアマミトゲネズミが新種として記載され、3種となる。
(チビトガリネズミ Sorex minutissimus ) トウキョウトガリネズミ(亜種) S. m. hawkeri 【北/絶滅危惧II類 (VU)(環境省レッドリスト)】 世界最小の哺乳類の1つ。
ヒメトガリネズミ(カラフトヒメトガリネズミ) Sorex gracillimus 【北】
アズミトガリネズミ Sorex hosonoi 【本/準絶滅危惧(NT)(環境省レッドリスト)/固】
(バイカルトガリネズミ(トガリネズミ) Sorex caecutiens ) エゾトガリネズミ(亜種) S. c. saevus 【北】
(シントウトガリネズミ Sorex shinto) 【固】 バイカルトガリネズミ S. caecutiens の亜種とする説もある。 ホンシュウトガリネズミ(亜種) S. s. shinto 【本】 シコクトガリネズミ(亜種) S. s. shikokensis 【本/準絶滅危惧(NT)(環境省レッドリスト)/固】 サドトガリネズミ(亜種) S. s. sadonis 【島(佐)/固】 独立種 S. sadonis とする説もある。
オオアシトガリネズミ Sorex unguiculatus 【北】
(ジャコウネズミ Suncus murinus ) 【移】 ジャコウネズミ Suncus murinus 【本】 長崎県・鹿児島県。15世紀以前の熱帯アジアからの移入種か。 リュウキュウジャコウネズミ(亜種) S. m. temmincki 【島(南)】
(キタナキウサギ Ochotona hyperborea) エゾナキウサギ(亜種) O. h. yesoensis 【北/準絶滅危惧(NT)(環境省レッドリスト)】
〔在来6科(迷行の1科除く)・移入3科:計9科〕
(クビワオオコウモリ Pteropus dasymallus ) エラブオオコウモリ(亜種) P.d.dasymallus 【島(南)/絶滅危惧IA類 (CR)(環境省レッドリスト)】 天然記念物。 ダイトウオオコウモリ(亜種) P.d.daitoensis 【島(南)/絶滅危惧IA類 (CR)(環境省レッドリスト)/希少】 天然記念物。 オリイオオコウモリ(亜種) P.d.inopinatus 【島(南)】 ヤエヤマオオコウモリ(亜種) P.d.yayeyamae 【島(南)】
オガサワラオオコウモリ Pteropus pselaphon 【島(小)/絶滅危惧IB類 (EN)(環境省レッドリスト)/固/希少】 天然記念物。
オキナワオオコウモリ Pteropus loochoensis 【島(沖)/絶滅(環境省レッドリスト)/固】 19世紀に3-4頭の採取記録。