全国スーパーマーケット協会
一方で1982年には、日本全国の各都道府県で設立された「スーパーマーケット協会」が合同して「全国スーパーマーケット協会」を発足させ、翌1983年には日本セルフ・サービス協会と同様に「社団法人全国スーパーマーケット協会」として法人化、通商産業省(当時、現:経済産業省)所管の公益法人として認可を受けた。
2009年2月には両協会が合併契約書に調印し、翌3月に両協会総会で合併を承認。同年8月3日に両協会が合併し、新団体の会長には株式会社アークス社長の横山清が就任した。また合併直後の同年11月には協会事務局のTwitter公式アカウントを開設している。
翌2010年に「社団法人新日本スーパーマーケット協会」へ改称。公益法人制度改革に伴い、2012年には一般社団法人へ移行し「一般社団法人新日本スーパーマーケット協会」となる。
2018年に現名称の「一般社団法人全国スーパーマーケット協会」へ再度改称した。