核小体形成域
UBFに加えて、NORはATRXタンパク質、Treacleタンパク質、 サーチュイン7および他のタンパク質にも結合する。UBFは、発現していたrDNAに対する有糸分裂中の「しおり」として見なされており、有糸分裂後すぐに転写を再開することを可能にする。NORの遠位近接接合部(distal flanking junction、DJ)は、核小体の周縁部と会合することが示されている。大腸菌のrDNAオペロンも、真核生物の核小体と同様に、互いに近接して集合することがわかっている。