円谷プロダクション
1992年、TBSへ期限付きで譲渡していた「ウルトラシリーズ」の販売権や窓口権が戻ってくると、これらの権利を担保に得た資金で、円谷プロダクションの株式を円谷皐が15%、皐が設立した円谷エンタープライズが45.5%を取得して東宝との資本関係を解消。皐が株の過半数を握るオーナー社長として円谷プロダクションを運営していた。
1995年6月11日、円谷皐が病気により退任し、円谷一夫が4代目社長に就任。その後、皐が死去したため、円谷プロダクションの株は一夫に相続された。
2001年、特撮テレビシリーズの本格的再開により、制作費は増加してしまった。しかし、その一方で大ヒットに恵まれなかったこと、東宝からの離反に伴いかつての後ろ盾であった三和銀行が抜けたため、経営基盤が弱体化してTBSとの関係が悪化してしまう。2002年2月、円谷プロダクションを退社していた円谷粲が再入社して副社長に就任。
かつて存在した東宝の撮影所の1つである。円谷プロダクションの所有施設ではないが「ウルトラシリーズ」の撮影場所として長年使用されていた。
1996年には円谷プロダクションの出資で改築が行われていたなど、関係性が深かった。
2003年、円谷一夫が辞任して円谷昌弘が5代目社長、円谷一夫が代表権を持つ会長、円谷英明が専務に就任。一方で専務取締役の高野宏一は、この過程でバンダイの乗っ取りに加担するクーデターを計画したとして、辞表を出すように要求され退社する事態となった。
2004年6月、円谷昌弘が女性社員へのセクハラ問題で辞任し、円谷英明が6代目社長に就任。経理の正常化を目指した英明も1年後に役員会で解任動議が出され、過半数の株を持つ会長の一夫の同意により解任。東宝不動産の取締役だった大山茂樹が7代目社長に就任。
2007年2月、期決算で売上高約56億円に対して当期純利益は約4400万円にとどまった。累積赤字の膨張による倒産を危惧した役員は、一夫から制作部の昌弘への社長交代を要求。6月、取締役会で大幅なリストラを主張していた大山の解任により、一夫が8代目社長に就任。