志賀高原
志賀高原地域周辺では、オコジョやツキノワグマ、カモシカといった哺乳類から、ヒガラ、ビンズイといった森林性鳥類、河川や湖沼に生息する両生類・爬虫類や魚類・昆虫類等まで、複雑な山岳環境下に多種多様な生物の生息が見られる。特に、国内希少野生動植物種に指定されているイヌワシは、本地域内に複数個体の生息が確認されており、本地域の豊かな自然環境の指標であるといえる。また、雑魚川及び魚野川源流域に生息する在来イワナ個体群は、志賀高原漁業協同組合の長年の保全活動により、現在でも流域単位の遺伝的固有性を保持している。岩菅山の高山帯及び雪崩草地、魚野川源流域のブナ林内のギャップ等に成立する草地には、ベニヒカゲ等の高山性蝶類、オオゴマシジミ等の希少なシジミ類の生息域となっている。
ホンドオコジョ(準絶滅危惧(NT)) 長野県の天然記念物である。志賀高原のマスコット的存在である。
ホンドタヌキ
ニホンツキノワグマ
ホンドテン
ニホンカモシカ(国の特別天然記念物)
ニホンザル(ホンドザル) 日光などと同様に、食料を狙った強奪などが問題になっている。
トウホクノウサギ
ホンドリス
ホンドギツネ
ヤマネ(準絶滅危惧(NT))
ユネスコは、志賀高原エコパーク(生物圏保存地域)の核心地域として上信越高原国立公園の特別保護地区の一部である志賀山、鉢山、大沼池、四十八池周辺の691haを指定し、その周辺部にあたる上信越高原国立公園の特別地域・普通地域のうち山ノ内町、高山村の一部と群馬県の中之条町、草津町、嬬恋村の一部をあわせた17,569haを緩衝地域に指定しており核心地域と緩衝地域を合わせた面積は18,260ha、さらに周辺の移行地域を加えると30,281haに及ぶ。 志賀高原漁業協同組合が管理する指定河川の流域(漁場)は、雑魚川および中津川の切明より上流部分(魚野川)の流域をさし、東はエラクボ平や群馬県境の苗場山湿原の南端を含んだ地域(流域面積約21,230ha)である。よって本流域面積は、高天ヶ原以南となる角間川流域の志賀山や横手山などの区域面積を含んでいない。 山ノ内町観光連盟は、山ノ内町内を「湯田中渋温泉郷」「志賀高原」「北志賀高原」の三つの区域に分け、このうち志賀高原の区域をホームページ上の地図で青色(面積約17,500ha)で示している。
北志賀高原は、一般的に志賀高原には含まれず、竜王山山頂から東側部分などの一部区域を除き、上信越高原国立公園の志賀高原区域、志賀高原エコパークの緩衝地域、志賀高原漁業協同組合の水利権域のいずれの区域にも属していない。
南志賀高原は、高山村の上高井山田、七味、五色一帯の名称であり、志賀高原には含まれない。
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