常陸川水門
常陸川水門はこうした事情を受けて着工されるが、霞ヶ浦と海とのつながりを断絶してしまうため、当初から汽水性のヤマトシジミが生息できなくなることなどから特に漁業者の強い反対を招いてきた。しかし、塩害は水門竣工後も発生しつづけ、1974年には水門の完全閉鎖(正確には潮汐や増水による下流からの流入を完全に止めること)が決定する。これにより、霞ヶ浦の淡水化は決定的になる。
それ以降、長年、水質汚染の解消や漁業振興のために逆水門の開放や、海水の遡上をある程度容認する柔軟運用、自然条件に逆らわないかたちでの水位の操作などの要望が出されてきたが、当初は農業および工業用水の確保を理由にこれらの要望は受け入れられてこなかった。しかし、近年では鹿島臨海工業地帯における工業用水の余剰が問題となったり、人口予測の下方修正に伴う水需要の過大予測が明らかになったりするなどによって状況が変化し、2002年10月16日の参議院決算委員会の審議において水位操作(水門の操作)について円卓会議を設けて合意形成を計る旨を国土交通大臣が答弁するなど、常陸川水門をめぐる環境は変化の兆しを見せている。