ジャクソン砦・セントフィリップ砦の戦い
ファラガットは砦下を通り過ぎるという決断をし、ベイリー大佐の第1砲艦部隊に2隻の艦船を加え、それによって自身の部隊のシップを無くすという修正を加えた。この変更後、艦隊の配置は次のようになった。
第1部隊、セオドラス・ベイリー大佐: USSカユガ、USSペンサコーラ、USSミシシッピ、USSオネイダ、USSバルナ、USSカターディン、USSキネオ、USSウィサヒッコン
第2部隊、艦隊司令デヴィッド・ファラガット: USSハートフォード、USSブルックリン、USSリッチモンド
第3部隊、ヘンリー・H・ベル大佐: USSサイオタ、USSイロコイ、USSケネベック、USSピノラ、USSイタスカ、USSウィノナ
シップのUSSポーツマスは臼砲スクーナー隊を守るために残された。
砦下を過ぎるとき、艦隊は2列になった。右列はセントフィリップ砦に向かって砲撃し、左列はジャクソン砦に砲撃することにした。砦に対して止まったりノロノロ行ったりすることは無く、できる限り速く通り過ぎることとした。ファラガットは、暗闇と煙の組み合わせで砦の砲手の照準を狂わせることを期待した。各艦船は比較的無傷で通り過ぎられるはずだった。
4月24日午前3時頃、艦隊は前進を開始し、水路を遮っていた鎖の隙間に向かった。この障害物を過ぎると間もなく、砦の哨兵が艦隊を視認し、即座に使える限りの火力を使って砲撃を開始した。ファラガットが期待していたように、その狙いが定まらず、艦隊にはほとんど損傷が与えられなかった。もちろんファラガットの方の砲手も狙いが悪く、砦の方にも損傷はほとんど無かった。隊列の後方にいた砲艦3隻が引き返した。
ジャクソン砦とセントフィリップ砦はミシシッピ川下流の南軍防衛にとって中核だったので、南軍がそれらを喪失したことは、メキシコ湾とメンフィスの間で立ち塞がるものが無くなったことを意味していた。ファラガットはこの戦闘で艦船が受けた損傷を修繕させるのに数日を費やした後、川沿いにある他の都市に降伏を要求するために遠征隊を派遣した。バトンルージュとナチェズの町が有効な防御手段も無いまま、要求に従った。しかし、ヴィックスバーグでは、崖の上にある南軍の要塞に艦砲が届かず、遠征隊に同道した小さな陸上部隊のみでは降伏を強制できなかった。ファラガットは包囲戦を始めたが、川の水位が減り始めて喫水の深い艦船に脅威となったので、後退を強いられた。ヴィックスバーグを落とすにはさらに1年の日月を要した。
この戦闘によってニューオーリンズ市が落ちたことは、ヨーロッパ列強、特にイギリスとフランスが、外交的にアメリカ連合国を認知することを思いとどまらせた。海外にあったアメリカ連合国代理人はニューオーリンズ市が落ちたという知らせが入った後、応対があるとしても概して冷やかに受け止められたと述べていた。