上智福岡中学校・高等学校
上智大学(東京都千代田区)
上智大学短期大学部(神奈川県秦野市)
エリザベト音楽大学(広島県広島市)
栄光学園中学校・高等学校(神奈川県鎌倉市)
六甲学院中学校・高等学校(兵庫県神戸市)
広島学院中学校・高等学校(広島県広島市)
上記の学校は全て、上智福岡と同じくイエズス会を経営母体としている。
上智大学は設立の経緯から、自らの附属中学校・高等学校を持たない。このため、イエズス会が経営する高等学校には内部進学制度が存在しないが、同大学への指定校推薦枠を持っている。上智福岡の上智大学への推薦枠は、教育提携後の2010年(平成22年)に最大20名に拡大され、さらに法人合併後の2016年(平成28年)からは最大30名に拡大されている。