ZOIDS 帝国VS共和国 メカ生体の遺伝子
開戦時にミッション名と勝利条件(敵の殲滅など)が表示される。作戦ごとに出撃可能な小隊数は異なり、第1小隊の部隊長が総司令機、小隊番号はそのままターンごとの操作順となる。操作自体はユニット単位であり、各機ごとに移動・攻撃をするかアイテムの使用が可能。
戦闘で破壊されたゾイドは残骸となる。敵ゾイドの残骸を獲得することで資金・アイテム・稀に敵のゾイドなどを取得できる。味方ゾイドも撃破されると残骸となるため、他の味方で回収しておく必要がある。敵に残骸を回収されるとそのゾイドは喪失する。
部隊長に指定されているゾイドが撃破されると、小隊単位で退却する。味方の部隊長機が撃破されないようにすることはもちろんだが、敵ゾイドの全滅を狙う(軍資金や経験値の獲得のため)場合は、敵の部隊長機を倒すタイミングを考える駆け引きも必要となる。
ゾイドには経験値とレベルが存在し、レベルアップごとに一定値のポイントを獲得できる。これを格闘、範囲などのスキルに割り振ることでゾイドを強化できるほか、精神集中、再生など特殊能力を覚えさせられる。
イグアンよりも強力なゴリラ型ゾイド。
射程が長く、攻撃力も高いが回避率は低いので格闘攻撃されると弱い。
ステルス能力をもつ。回避・命中が高く山の移動適正が高い。
回避率は高いがHPが少ない。
長射程で高い命中率のビームガトリングを持つが回避は低い。
ウルトラザウルスをのぞけば最強の水中専用ゾイド。ステルス能力を持ち、範囲攻撃も可能。