十和田丸 (初代)
車両甲板下は11枚の水密隔壁で12水密区画に区分されていた。各区画は船首から、船首タンク、錨鎖庫、甲板部船員室区画、機関部船員区画、事務部船員区画、ボイラー室、発電機室、機械室、ポンプ室、車軸室、倉庫、操舵機室で、この3区画の船員室はいずれも第二甲板にあり、うち前2区画は第二甲板が水密で二重底の内底を兼ね、事務部船員区画では第二甲板下の船艙が倉庫で、その下の船底は高さ1m程度の区画式二重底であった。それより後方のボイラー室からポンプ室までは区画式二重底が連続し、車軸室は単底であった。ボイラー室から車軸室までの5区画4枚の水密隔壁の船艙レベルには、交通のための開口部があり、それぞれ前方から第1~4水密辷戸が設置され、非常時には閉鎖された。車軸室の後ろの倉庫区画は水密第二甲板で二重底とし、この第二甲板レベルを、車軸室から倉庫を通って操舵機室に至る通路があったが、通路自体がトンネル状に水密で倉庫とは隔絶しており、これにより倉庫は左右に隔絶され、左右いずれの倉庫へも車両甲板舷側船室からの階段でしか入れず。左舷側は郵便室とつながり、郵便係員、手荷物係員居室として使われた。この水密通路の車軸室側入り口に第5水密辷戸が設置されていたため、通路自体は操舵機室水密区画に属した。操舵機室は単底であった。操舵機室へは車両甲板右舷船室内後端から降りる階段も設置されていた。
ボイラー室、発電機室、機械室、ポンプ室、車軸室の両舷側には、それぞれ独立した車両甲板まで達する舷側タンクがあり、ポンプ室側面の舷側タンクはヒーリングタンクとして使われた。
車両甲板下の船体を、檜山丸型の10枚よりさらに多い11枚の隔壁で12区画に区切り、隣接する2区画に浸水しても沈まない“2区画可浸”構造とした。なお洞爺丸型では8枚の隔壁で9区画に区切られ、“2区画可浸”構造ではなかった。
青函連絡船で初代と2代目がある船は十和田丸(初代・2代目)など数多いが、初代から3代目まであるのは石狩丸(初代・2代目・3代目)のみである。
青函連絡船で改称が行われたのは、十和田丸(初代)→石狩丸(2代目)のみであるが、1905年(明治38年)竣工の元関釜連絡船壱岐丸(初代)は、1922年(大正11年)11月から1924年(大正13年)5月まで青函連絡船として運航され、その後、稚泊連絡船として運航された後、大阪商船に売却され樺太丸と改称、1945年(昭和20年)7月の空襲で壊滅した青函航路に傭船として1947年(昭和22年)9月まで助勤した例もある。
折からの北海道観光ブームで増加する旅客需要に対応した1963年(昭和38年)7月12日のダイヤ改正では、車載客船4隻で、多客時さらに日中1往復の臨時便を増発して旅客扱い便最大7往復とし、合計最大22往復とした。
1964年(昭和39年)5月10日には高速客載車両渡船 津軽丸が、8月12日には 八甲田丸が就航し、同年9月からは、遅延回復能力の高いこれら2隻のいずれかが、ほぼ毎日、下り「はつかり」・「白鳥」から「おおぞら」に接続する1便に充当された。
1964年(昭和39年)10月1日のダイヤ改正では、この時期就航していた津軽丸型2隻で運航される4往復の客扱い便が設定され、新設の上野発着の東北本線経由寝台特急「はくつる」と、函館 - 網走・釧路間に新設された道内2番目の特急「おおとり」とを連絡する3便・4便に限り3時間50分運航とし、残る3往復は在来船での代替も考慮し4時間20分運航とされ、旅客の集中する深夜の特急接続便の1便・2便も津軽丸型での運航便となった。また1便の続行便3001便、2便の先行便3002便はこれまで多客時のみの不定期運航であったが、この改正から、それぞれ11便(4時間30分運航)・12便(4時間40分運航)として定期化され、旅客扱い便は定期便だけで6往復となった。当初はこれら続行便1往復を含む2往復に、本船と摩周丸(初代)、羊蹄丸(初代)が充当されていたが、摩周丸(初代)は10月26日の11便で終航し、羊蹄丸(初代)も翌1965年(昭和40年)6月20日の11便で終航となる一方、津軽丸型の新造船が続々と就航し、当初計画6隻の最終船羊蹄丸(2代)が同年8月5日に就航した。
8月12日 - 第2船八甲田丸就航。 10月1日 - ダイヤ改正で深夜の特急接続便の1便・2便が共に4時間20分運航の津軽丸型運航便となり、深夜の続行便(11便 4時間30分運航)・先行便(12便 4時間40分運航)の運航が定期化した。 11月1日 - 津軽丸(2代)が左舷減速機過熱のため4時間20分運航の108便・501便の1往復に就航できず、本船が代走し、それぞれ20分延着の変108便と10分延着の変501便として運航し接続列車に遅れなし
1965年(昭和40年) 10月1日 - 津軽丸型当初計画6隻就航後初のダイヤ改正で、津軽丸型5隻で運航される12往復(うち9往復は旅客扱い便)が3時間50分運航となり、本船は4時間30分運航の旅客扱い便1往復のみの運航。 10月3日~19日 - 宇高連絡船の新造船伊予丸型にならい、両舷側のボイドスペースに硬質ウレタンフォームを注入し、外板損傷時の復原性低下防止を図った(函館ドック)。
1966年(昭和41年) 10月1日 – 青森第2岸壁0時10分発 函館第1岸壁4時40分着の変101便で十和田丸として終航、9時08分離岸し9時45分函館第4岸壁で物品陸揚げ後15時06分離岸、港内第4ブイに係船。