深夜アニメ
1989年に『小松左京アニメ劇場』を製作し、1995年に参入したTBSに先鞭を就けた。深夜アニメ黎明期の1997年には早くも『アニメシャワー』枠を設置し、深夜アニメの放送に本格的に参入。2006年10月期の『コードギアス 反逆のルルーシュ』でTBSへの逆ネットも果たしている。その後も番組数や放送日が拡大し、『アニメイズム』・『アニメ特区』の両枠が相次いで制定され、近畿地方の地上波では独立局のサンテレビと並び、多くの深夜アニメを放送している。
自社制作の番組や独立局系の番組を優先する傾向があり、TBS製作の番組は2015年以降ほとんどネットを見送っている。これらは独立局のサンテレビやKBS京都が代わりにネットしていたが、2017年4月期以降は先述の通り関東ローカルでの放送が主体となっていることから、近畿地方の地上波では視聴できない番組が増えている。
2019年6月をもって終了した『アニメサタデー630』の自社制作枠と入れ替わる形で、2019年7月期からはTBS系列全28局での全国同時ネットとなる『スーパーアニメイズム』枠がスタート。2022年4月期に復活した日5枠と並行して、週2本のアニメ番組を全国ネットで放送している。
なお、原作を有する作品をアニメ化することが多いTBSと異なり、同局は『魔法少女まどか☆マギカ』や『TIGER & BUNNY』のようなオリジナル作品の製作にも意欲的である。
テレビ朝日(テレ朝)は1997年10月期に初の深夜アニメ『深海伝説MEREMANOID』を放送した。
同局は古くから深夜に自社制作のバラエティ番組を多数放送していることから、2010年代末期までの長年にわたり、深夜アニメは不定期に1番組ずつ放送されるのみだった(2000年代半ばには、一時的に番組数が毎クール2本程度まで増えた時期があった)。
2020年4月より、同局の深夜帯では初となる深夜アニメの番組枠名称として『NUMAnimation』を制定。同年10月からは、後続に新設された朝日放送テレビ・ABCアニメーション製作の『ANiMAZiNG!!!』とセットで、系列全24局での全国同時ネットで放送されている。
日本の深夜番組ではいわゆるお色気番組が古くから一定数放送されており、おおむね1990年代前半頃までは人間の裸体が放送されることもしばしばあったが、深夜アニメに関しては黎明期から厳しい表現の自主規制がなされている。ただし、概要で述べたようにテレビ放送時になされていた自主規制をビデオソフトでは外すことで、ビデオソフトの販売促進の手段として活用している作品も珍しくない。
特にテレビ東京では、1997年にポケモンショックを起こした経験を機に放送基準に厳格な姿勢を敷いており、2002年に放送された『フィギュア17 つばさ&ヒカル』では小学生相当の年齢の女子キャラクターの誕生や入浴により裸体が映るシーン(エロティックなものではなく、作劇上必要かつ自然なもの)に対して大幅な修正が入った内容で放送され、物議を醸した。2010年代以降は『トリニティセブン』や『チェンソーマン』のように、お色気や残虐な描写に対して規制を最小限に抑えた作品も放送されるようになっている。