男鹿線
2021年3月13日のダイヤ改正以降、全ての列車が秋田総合車両センター南秋田センター所属の蓄電池電車EV-E801系「ACCUM」(アキュム)により運行されている。
EV-E801系は2017年3月4日のダイヤ改正から運用を開始した。2020年12月18日には、JR東日本秋田支社から本系列の追加投入が発表され、上掲2021年3月13日のダイヤ改正で、在来のキハ40系列(キハ40・48形)を全て置き換えた。また、同改正をもって連結車両数に関係なく全列車でワンマン運転を開始し、従来の先頭車両での車内精算型から、すべての車両のドアで乗降でき、運賃収受は駅で行う都市型ワンマンへと変更している。線内でのSuica(交通系ICカード)は追分駅(自動改札機設置)を除き各駅の簡易Suica改札機での入出場対応となる。
EV-E801系導入以前は同じく秋田総合車両センター南秋田センター所属のキハ40系列により運行されており、車外扉横付近にはなまはげのイラストが描かれていたが、これはEV-E801系にも踏襲されている。
EV-E801系導入後は、2両または4両で運転されている。キハ40系列時代は、最大5両での運転があった。
1994年7月19日まではDD51形ディーゼル機関車牽引による客車列車も運行されていた。
2017年に営業運転を開始したEV-E801系(2019年8月3日 秋田駅)
男鹿線用のキハ40系(2020年9月2日 天王駅 - 船越駅間)