ジェイアールバス関東土浦支店
土浦ナンバー 東京・成田空港便で使用する一部の高速バスでは東京2020オリンピック・パラリンピック競技大会特別仕様ナンバープレートに変更している(H657-14428、14429、15418、15419の4台)。 2019年度導入の高速バス新車(H657-19406~19408)では図柄入りナンバープレート、車番に合わせた希望ナンバー(19-**)を採用。
2007年(平成19年) 1月10日 - 常総ルートからJRバス関東が撤退。 3月24日 - 君島線(江戸崎西高 - 小角 - 江戸崎)廃止。 10月1日 - 【深夜バス】土浦リレー号、路線開業。
2008年(平成20年) 4月1日 山ノ荘線・南筑波線(下虫掛 - 篠崎転向場)廃止。 南筑波線(ユーセンター - 西町南)路線開業。 南筑波線(トウペ前 -ジャパンパイル前)路線開業。 君島線(土浦駅東口 - 工業団地前)廃止。 浮島線廃止。稲敷市内区間をブルーバスに路線移管。 【深夜バス】土浦リレー号で取手駅0:35発藤代行きを追加。 7月1日 - 東京 - 江戸崎線からJRバス関東が撤退。2011年4月1日に関東鉄道の運行も廃止。【深夜バス】土浦リレー号は新たに牛久駅に停車開始。
2009年(平成21年) 3月31日 -【深夜バス】土浦リレー号の取手駅0:35発藤代行きを廃止。 5月22日 -「土浦駅 - イオンモール土浦」「つくばセンター(TXつくば駅) - イオンモール土浦」路線開業。【深夜バス】土浦リレー号でSuica、PASMOでの支払いが可能に。 7月8日 -「荒川沖駅東口 - (直行) - あみプレミアム・アウトレット」路線開業。
以下の各系統は乗務員のみ。
昼特急号、ドリーム号(東京 - 新城間)
1987年(昭和62年)4月1日 - 国鉄分割民営化に伴い、東日本旅客鉄道関東自動車事業部土浦自動車営業所に改称。
1988年(昭和63年) 4月1日 バス部門分割子会社化により、ジェイアールバス関東土浦営業所に改称。 つくば号運行開始。 6月1日 - ひたち号運行開始。
1989年(平成元年)4月4日 - かしま号運行開始。
1990年(平成2年) 3月 君島線(布佐橋 - 大形)路線休止。 十余島線(神宮寺 - 高田須賀)路線休止。 7月17日 - いたこ・あそう号運行開始。
1991年(平成3年) 3月 君島線(布佐橋 - 大形)路線廃止。 十余島線(神宮寺 - 高田須賀)路線廃止。 安中線(大谷 - 安中)路線休止。 4月1日 - ニューつくばね号運行開始。
1992年(平成4年) 3月 - 安中線(大谷 - 安中)路線廃止。 10月1日 - 支店制度導入により、ジェイアールバス関東土浦支店に改称。