第3新東京市
都市としての規模や人口・財政は、現在の東京23区よりかなり小さい。第3新東京市の中心市街地は仙石原周辺に限定されているが、行政範囲については明確にされていない。仙石原を中心とした半径3キロの地下にジオフロントが広がっており、箱根山外輪山を越えて一部は現在の御殿場市にまで達している。そのため、御殿場市の一部も第3新東京市に含まれていると思われる。ジオフロント内の地下居住区も、行政上は第3新東京市に所属する。なお、芦ノ湖南岸は神奈川県足柄郡旧箱根町となっている。第3新東京市の住人は、NERV勤務者とその家族などの関係者に限定されている。
元箱根児童公園 第3砲台 (艦載砲塔転用) この砲台は2つが(劇中では3つを確認)大和型戦艦に搭載されている46センチ主砲塔、1つが60口径三年式15.5センチ3連装砲に酷似しており、「艦載砲塔転用」の情報からもほぼ間違いなく、大和型の砲塔(もしくは史実でのそれと同じ設計の砲塔)を使用していると思われる。史実ではそれらは2艦に搭載され、全て沈没した。
第16火網一帯防御陣地
対電磁光波熱線防護跳開式装甲板 (路盤擬装型)
MABSS 『新劇場版:破』で、第8の使徒(サハクィエル相当)が落下コースを変えた際に、落下地点までの初号機のコース変更に伴って、第3新東京市の様々な場所に展開された。正式名称『Multipurpose Adjustable Blast Shield Structure』で、直訳で「多目的の調整可能な爆破シールド構造」。
旧東京再開発臨海部国立第3試験場 テレビシリーズ第七話で、JAの試験運転が行われた場所。