あいの里教育大駅
相対式ホーム2面2線(ホーム長:138メートル)を持つ地上駅。双方のホームは2本の跨線橋(それぞれ、階段・エレベーター設置)で結ばれている。
開業当時は出入り口が北口1か所のみであったが、2002年に開発された南あいの里ニュータウン(分譲は2007年に開始)の人口の増加に伴い、南あいの里地区の要望も受けて、2012年(平成24年)10月13日に南口が新設された。
桑園駅管理の業務委託駅(北海道ジェイ・アール・サービスネット)。メインの北口駅舎は、当初あいの里の整備主体である住宅・都市整備公団(当時)の事務所と合築の駅舎として整備され、周囲の自然環境との調和を意識した外装となっている。北口駅舎内にはみどりの窓口、自動券売機(話せる券売機含む)、自動改札機、トイレが設けられている。南口は、自動券売機と改札機のみを設置している。
ホームは南口駅舎に面した上り本線が1番線、北口駅舎に面した下り本線が2番線である。1番線は上り列車専用であるが、2番線は下り列車のほか上り列車の入線も可能である。