ミクロイドS
声 - 千々松幸子
第6話から登場する、学の学校に転入してきたクラスメート。苗字は「かわち」ではなく「こうち」である。バレエを習っており、その発表会(演目は「赤い靴 」)を通じて学と親しくなった。ヤンマたちの存在を教えられても最初はなかなか信じなかったが、マメゾウに危機を救われたことをきっかけに良き友人となる(第7話)。性格は明るく活発で、間違っていると思えば番長やノラキュラにも食って掛かるほど気が強い。「学の恋人」とからかわれても否定せず、全く動じなかった(第16話)。当初、ミクロイドの存在は母親にも内緒にしていたが(第12話)、志津子の誕生パーティーにはヤンマたちも同席するなど(第19話)、いつの間にか打ち明けていた様子であった。父親は3年前に亡くなっており(第10話)、母子家庭ではあるが、裕福な暮らしである様子が窺える(第7、19話ほか)。
第17話に登場するクラゲ型ロボット。大群で行動し、近づく金属製の物体を全身から放つ磁力線で攻撃して破壊してしまう。海上の学やノラキュラたちのボートを狙って浮かび上がったところを、ヤンマたちの総攻撃を受け一網打尽にされる。
声 - 菊池紘子
第13話に登場。リッキーの恋人であった、リーマの姿を模した殺人ロボット。ギドロンによってリッキーに与えられ、ヤンマたちの暗殺に協力するよう仕向けることを任務とする。ミクロイドである本物のリーマはギドロンに殺されたらしいが、正気を失ってしまったリッキーはその現実を認められず、まったく喋らないリーマを失語症になっていると思い込んでいた。両腕を巨大な鎌に変形させてなんでも寸断することができ、これを超高速で使うことによって、あたかも身動きせずに攻撃を繰り出しているかのように見せる。潜水機能も持っており、海中からの攻撃でヤンマを翻弄するも、ミクロイドビームの直撃を受けて爆散する。その姿からカマキリ型ロボットと見られる。
大昔に昆虫から枝分かれして進化したアリの一種“ギドロン”は、世界中のサバクに潜んで高度な文明社会を構築しており、人類を抹殺して地球の王者になろうと計画していた。ギドロンの巣では、何百年も前にさらった人間の赤子を縮小して生み出された種族“ミクロイド”が奴隷として使役させられていたが、ギドロンの陰謀を人間たちに伝える使命を父・クロロクから託されたミクロイドのヤンマは、見せしめに処刑されそうになっていたアゲハとマメゾウを救って、ともに人間界へと脱出する。追っ手と戦いつつも、出会った人間たちにギドロンの脅威を警告するヤンマたちであったが誰もまともに取り合わず、国連での訴えも虚しく各国が紛糾するばかりで失望と徒労感に襲われてしまう。
ギドロンから逃れた末に日本へとたどり着いたヤンマたち3人は、世界的生物学者の美土路博士とその息子・マナブと知り合い、ようやく人類の危機についての理解を得るが、ヤンマの兄でありアゲハの婚約者であるジガーが暗殺部隊を率いて迫っていた。ギドロンに操られた虫の大群による東京大攻撃の日が近づくなか、美土路博士とヤンマたちはその惨劇に備えるために奔走するのだが...。
声 - 八奈見乗児
第16話から登場する。学年の途中で学のクラスに転任してきた担任教師。性格は陰湿そのもので、弱者をいたぶり強い者におもねる卑屈さと、普段から生徒を依怙贔屓をする態度から皆に毛嫌いされている。「(廊下に)立っとれ!」が口癖(第16、19、22、26話ほか)。ヤンマからは堕落してギドロン化しつつある人間の例として、「子供の頭にガラクタを詰め込むロボット」と酷評された(第18話)。頭が固く教科書や文部省の指導に無いことは信じない主義のため、ミクロイドを目の前にしても頑なに現実として認めず、マメゾウの存在も無視して振舞う(第16、18、19話ほか)。漫画版でも同様の人格を持った担任教師として登場し、何かにつけマナブに嫌がらせをする。“ノラキュラ”は生徒が付けたあだ名らしく、本人は不快に思っている模様(第16話)であるが、本名は不明。手塚作品には以後、ときおり登場するキャラクターとなる。
『ミクロイドS』(ミクロイドエス)は、1973年に発表された手塚治虫原作の日本のメディアミックス作品。漫画の連載とテレビアニメの放送が同時期に行われた。
第6話に登場したクモ型ロボット。口中から出す電波受信器を人に取り付けて操り、あたかも舞踏病にかかったかのように死ぬまで躍らせ続ける。標的として学を狙っただけでなく、無関係の被害者を続出させて社会に不安を招いた。尻からは針金状にもなる糸を出し(無数の針にして発射することもできる)、口からは溶解液を吐く。容易に接近を許さず、ヤンマの攻撃をことごとく躱して苦戦を強いらせるが、最後は(マメゾウと学の協力もあって)ミクロイドビームの直撃を受けて撃破される。
声 - 森功至
第24話に登場する。かつてはヤンマの親友だったが、ヤンマたちがギドロンの巣から脱出を図る以前に、頭脳改造機にかけられて徹底的に人間を憎むように洗脳され、さらに全身を三日月状のブーメランや回転ノコギリ、ドリルといった武器(ほかに玩具のロボット)に変身させることができるアンドロイドに改造されてしまっていた。その洗脳を解くことはかなわず、アゲハやマメゾウが捕えられていたセスナ機を守るために、止むを得ず放ったヤンマのミクロイドビームを受けて爆死する。特徴的な羽を持っているが、何の昆虫をモチーフとしているかはさだかでない。
ヘルメット正面の2つの球体は高性能レーダーの機能を持つ触角(アンテナ)であり、ギドロンのロボットやミクロイドが接近すると伸びて反応を示すほか、音波も検知できるらしい(漫画版ではヤンマやマメゾウのヘルメットにも同様の機能がある様子が描かれている)。ギドロンのロボットや敵のミクロイドのみに反応する(ヤンマやマメゾウには反応しない)ことから、検知対象を選択できるものと思われる。
漫画版ではヤンマの兄・ジガーの婚約者。ギドロンに見せしめとして処刑されそうだったところをヤンマに救われ、人間界への脱走に同行することになるが、それは仕組まれたことであり、実はジガーによって差し向けられたスパイであった。しかし正体が明らかになっても咎めなかったヤンマの優しさに触れ、また行動を共にするうちにその考えを理解し同調するようになる。そこに恋愛感情は無かったが、ジガーに邪推されてしまい悲劇に見舞われる。