ジョン・W・ジョンストン
ジョンストンは上院議員を辞任後、法律実務に戻った。1889年2月27日、70歳で、バージニア州リッチモンドで死亡した。死のときまで意識があり、死につつあることに気付いていた。3月1日、遺族が遺骸をリッチモンドからワイズビルに移し、セントメアリーズ墓地に埋葬した。
1903年5月11日、ワシントン郡庁舎でジョンストンの肖像画を掲揚する儀式が行われた。デイビッド・F・ベイリーが肖像画を提供する演説者となった。その演説では、ジョンストンのことを次のように述べていた。
妻のニケッティはジョンストンの死後も長生きし、1908年6月9日に、89歳で亡くなった。
ジョンストンが上院議員を務めている間に幾つかの問題が起こった。アーリントン記念碑に関わる論争のただ中に入らされた。遺骸を移すという当初の提案はジョンストンにとって不快なものだったが、それに続く議論でロバート・E・リーの記憶を守りたいと考えるようになった。しかし、民主党のために黙っておく必要性があり、それが決定要因になった。またテキサス・太平洋法案には先頭だって反対する者となった。これは南部の鉄道支配権を巡る派閥抗争であり、結果的に1877年妥協を生むことになった。さらにバージニア州の戦前の負債を州がどれだけ返済すべきかについて、バージニア州で議論が熱しているときに、負債を負うべきと言うファンダーの主導者にもなった。この議論は再編党の結成に繋がり、ウィリアム・マホーンがその指導者に指名された。このことでジョンストンの上院議員としての経歴が終わることになった。