爆ボンバーマン
雲のような姿の敵。ゆっくり空中を移動し、ボンバーマンが近くを通ると真下に雷を落とす。この雷はボムを誘爆させる。レインボーパレスはパズル難易度が高く、丁寧にボムを設置していく必要があるため、設置したボムを次々と誘爆させるこの敵の雷は極めて危険。
爆弾に体当たりする従来の方法に加え、爆弾を設置するAボタンを置いたその場でもう1度押すことでもキックできる。また、これまでの作品では爆弾が2個以上列になって設置されていた場合は蹴っても奥のボムが動かず全てその場に留まっていたが、本作ではビリヤードのように奥のボムを飛ばせる。手前のボムは飛ばずにその場に留まるため、自爆に注意する必要がある。
アルタイルの部下の落ちこぼれ戦闘員。カラーリングは緑色で、服が黄色と黒の縞模様となっている。つるはしを持ってマウンテンの至る所で何かを採掘している。通常は採掘作業に従事して動かないが、ボンバーマンを見つけるとつるはしを振り回して襲ってくる。攻撃時の速度が早く、一般戦闘員のレッドやブルーに比べ耐久力もある。
ボンバー星を支配しようとする黒幕、アルタイルを倒すことが本作の目的である。しかしゲーム開始時点では彼の居る要塞「ブラックシティ」には4つの、惑星の一部をくり抜いて作られたエリアが鎖で繋がれており、これらのエリアから鎖を通して供給されているエネルギーによってバリアが形成され、ブラックシティへの侵入を阻んでいる。そこで、まずは4つのエリアから攻略していくことになる。一つのエリアをクリアすると繋がれた鎖が破壊され、エネルギーの供給がストップされる。4つのエリアを攻略する順番は自由で、全てクリアすればブラックシティへの侵入が可能となる。
一度だけミスとなるダメージを回避することができる。わくわくでは飛び出したハートを回収すれば再利用が可能だが、どきどきではダメージを受けると消滅する。
互いに爆弾で攻撃をして、倒された者から脱落し、最後まで生き残れば勝ち。詳細設定によっては、残り1分以下になるとステージに火球が降り注いだり、左右両側から壁が押し寄せてきたりするサドンデスや、倒された者が半透明の姿でフィールドに残ってまだ生き残っている者に触れることにより、操作権を奪い取れるゴーストボンバーの要素もある。ゴーストボンバーに取り付かれた場合は気絶したときと同じく、スティックを素早く入力することで速く振りほどくことができる。
アルタイルの支配する要塞都市にして本拠地。巨大ボスであるアブソリュートはステージ2に現れ、最終ボスのアルタイルがステージ4で待ち受けている。 ステージ1 しょうめんとっぱ ステージ2 キリングタイム ステージ3 アルタイル タワー ステージ4 VS アルタイル