ブーサイード朝
1870年にザンジバルで流行したコレラによって奴隷の人口は激減し、1872年のハリケーンによる被害の復興のため、ザンジバルでは奴隷労働力の需要が高まっていた。1870年にマジードの跡を継いだ弟のバルガシュ・ビン・サイードはイギリスから奴隷貿易禁止条約の締結を迫られ、ドイツ、アメリカ、フランスに支援を求めるが援助は得られなかった。1873年6月5日にバルガッシュは奴隷貿易の禁止を含む条約に調印し、ザンジバルの首都ストーン・タウンの奴隷市場は閉鎖される。また、バルガッシュはベルギー、ドイツの意を受けた探検家や宣教師がアフリカ沿岸部の様子を探る状況を憂慮し、1882年にスワヒリ商人ティップー・ティプを内陸部に派遣した。しかし、タンガニーカ湖の西南部一帯はベルギーの支配下に置かれ、タンガニーカ湖東部ではドイツの進出が始まっていた。
1884年に開催されたベルリン会議でヨーロッパ列強によるアフリカ分割が策定された後、ドイツはザンジバルの対岸の内陸部一帯の領有を主張し、ザンジバルにはダルエスサラームの割譲を求めるドイツの軍艦が派遣された。イギリス、ドイツ、フランスで構成されたザンジバル領土策定委員会の巡察と協議の結果、1886年にザンジバル・スルターン国の領土はザンジバル、ペンバ島、ラムなどの島嶼部、ソマリアからタンザニア南部に至る幅16kmの沿岸部に限定され、東アフリカ内陸部の領土を喪失する。1888年4月にザンジバル・スルターン国とドイツ東アフリカ会社(DOAG)の間で締結された条約によって、ドイツにパンガニからキルワに至る地域の関税徴収権と行政権が付与された。
1840年頃からサイードは居住地をザンジバル島に移し、彼の治世でモガディシュからモザンビークとの国境に至る地域がブーサイード朝の支配下に入った。1856年にサイイド・サイードが没した後、ザンジバルはオマーンの政府から分離する。
マスカットに居住していたサイードの子スワイニーはマスカットとザンジバル両方の支配権を主張し、ザンジバルに居住していたスワイニーの兄弟マージドはマスカットからの独立を主張した。双方の緊張が頂点に達した1859年にスワイニーは艦隊をザンジバルに派遣するが、イギリスの仲裁で攻撃を取りやめた。1862年にイギリスのカニング裁定によってオマーンとザンジバルの分離が決定した。ザンジバルを喪失した損害を補填する補助金がイギリス領インド政府からオマーンの政府に支払われ、オマーンは事実上のイギリスの保護国となった。