甲賀流
伊賀の影丸 - キャラクターに「甲賀七人衆」が登場する。
織田信長と岩室長門守 - 主人公「岩室長門守」が甲賀流忍者。
陰からマモル! - ヒロインの1人「雲隠ホタル」が甲賀忍者。
仮面の忍者 赤影 - 「甲賀幻妖斎」率いる金目教、まんじ党は甲賀忍群である。
隠の王 - 忍の五大勢力の一派として。
甲賀忍法帖/バジリスク 〜甲賀忍法帖〜
甲賀のピンキー - パチンコ台。シリーズ化されている。
甲賀流忍者!ぽんぽこ - バーチャルYouTuber。甲賀市に住むタヌキの忍者。
サスケ - 主人公「サスケ」が甲賀流の少年忍者。
サムライスピリッツ - キャラクターの1人「ガルフォード」が甲賀忍者。「アースクェイク」も修行者の一人である。
超電磁マシーン ボルテスV - ボルテスチームの紅一点「岡めぐみ」は甲賀流十七代目。
直撃! 地獄拳 - 主人公「甲賀龍一」は甲賀忍法宗家第二十四代の嫡子。
とある魔術の禁書目録 - キャラクターの一人「近江手裏」が甲賀忍者。
忍者ハットリくん - 主人公のライバル「ケムマキ・ケムゾウ」が甲賀流の少年忍者で他にも甲賀流のキャラが登場する。
忍者キャプター - 後半の敵が「甲賀忍衆」。
プロゴルファー猿 甲賀秘境!影の忍法ゴルファー参上!
魔法先生ネギま! - キャラクターの1人「長瀬楓」が甲賀中忍。
やじきた学園道中記 - キャラクターの「各雲斎小鉄」と、「剣望狭霧」が甲賀流忍者。特に剣望は傍流であるが「望月出雲守」の末裔とされている。
落第忍者乱太郎(忍たま乱太郎) - 忍術学園元教師「大木雅之介」が甲賀出身。
真田太平記 - 秀吉、家康に仕える山中長俊らが「甲賀山中忍び」