転移RNA
tRNA由来フラグメント(tRNA-derived fragments、tRF)は、成熟tRNAまたは前駆体転写産物が切断された後に出現する短い分子である。細胞質tRNAもミトコンドリアtRNAもフラグメントを生成することができる。成熟したtRNAに由来すると考えられているtRFには、比較的長いtRNAの半分と、短い5'-tRF、3'-tRF、およびi-tRFの少なくとも4種類の構造型が存在する。前駆体tRNAは切断され、5'リーダー配列や3'トレイル配列から分子を生成することができる。切断酵素としては、アンジオゲニン(英語版)、Dicer、RNase Z、およびRNase Pがあげられる。特にアンジオゲニンの場合、tRFは、その3'末端に環状リン酸、5'末端にヒドロキシル基という特徴的な構造を持っている。tRFは、RNA干渉、特にtRNAをプライマーとして複製を行うレトロウイルスやレトロトランスポゾンの抑制に関与しているように思われる。アンジオゲニンによって切断されたハーフtRNAは、tiRNAともいう。piRNA(英語版)として機能するものも含む、より小さな断片の生合成については、あまり理解されていない。