佐世保重工業
坪内は1999年(平成11年)12月に死去。
2005年(平成17年)11月 - 舶用クランクシャフト等を製造する機械工場において、旧佐世保海軍工廠から承継した1939年(昭和14年)製の鍛造プレス機とマニピュレーターの使用を終了し、新しい2,500トン鍛造プレス機とマニピュレーターに置き換え。
2010年(平成22年) - 鉄構事業廃止。白岳工場閉鎖。
2014年(平成26年)10月 - 名村造船所の完全子会社となる(後述)。
2021年(令和3年)2月 - 2022年1月限りでの新造船事業の休止を発表(後述)。
2022年(令和4年) 1月12日 - 休止前最後の新造船が竣工し、船主に引き渡し。 3月 - 名村造船所が佐世保重工業に対して有する債権105億円を普通株に振り替える金融支援を行った上で、佐世保重工業は増資後の資本金を1億円に減資。これにより債務超過を解消。
巡視船
タンカー 新造船事業休止前の自社開発の最終タイプは11万5千トン型アフラマックスタンカー。過去には、建造当時(1962年)世界最大の日章丸の建造も行った他、1967年から1977年にかけてVLCCの連続建造を行った。
バルクキャリア 1990年代後期以降は、7万-8万重量トン級中型バルクキャリアを主力として建造していた。新造船事業休止前の自社開発の最終タイプは幅広浅喫水型85BC。休止前の最終竣工船は、名村造船所と共同開発した82,000DWT型バルクキャリア。
その他の商船 1980年代の造船不況後は、高付加価値船の建造に進出し、コンテナ船やRO-RO船、自動車兼冷蔵運搬船などを手掛けた他、自社で開発したBS-SASEBOセミメンブレン型LPG船・LEG(液化エチレン)船(セミメンブレン方式タンクはブリヂストン液化ガスの開発)の建造も行った。