千々石川
主な支流は3本で、全て右岸(東側)から合流する。
清水川 - 妙見岳西側・雲仙盆地の外側を流れ、上岳で合流する。
飯岳川 - 九千部岳(標高1,062m)の南側斜面を流れ、木場名で合流する。
上峰川(かんみねがわ) - 最大の支流。九千部岳北側斜面から千々石断層に沿って流れ、河口付近で合流する。
上流・中流域には明治43年(1910年)から水力発電所が作られ、今も九州電力により5基が稼動している。長崎県内の水力発電所は、千々石川以外では福江島の鰐川にある。