モクレン目
モクレン目は分類群として古くから用いられていたが、そこに含まれる植物群(科)には大きな異動があった。古典的な分類体系の1つである新エングラー体系では、現在クスノキ目に分類される科など非常に多くの科を含んでいた(下表)。その後一般的となったクロンキスト体系では現在の範囲に近づいたが、やがて分子系統学的研究が行われるようになり、一部の科がカネラ目やアウストロバイレヤ目、コショウ目に移された(下表1)。
分子系統学的研究からは、モクレン目はクスノキ目の姉妹群であり、さらにこの系統群(モクレン目+クスノキ目)がカネラ目とコショウ目からなる系統群の姉妹群であることが示されている。この4目(モクレン目、クスノキ目、カネラ目、コショウ目)からなる系統群は、モクレン類(モクレン群、モクレン目群、magnoliids)とよばれている。モクレン類は、現生被子植物の中でアンボレラ目、スイレン目、アウストロバイレヤ目の後に分岐した植物群の1つであると考えられており、センリョウ目の姉妹群であるとされることが多い。
2022年現在、モクレン目の中には6科が認識されている(下表2)。分子系統学的研究からは、この6科の中でニクズク科が最初に分岐したこと、デゲネリア科+ヒマンタンドラ科とエウポマティア科+バンレイシ科がそれぞれ単系統群であることが示されることが多いが、モクレン科の位置についてはやや安定していない(下図4)。