二次代謝産物
アルカロイド(多くは低分子の高度に誘導体化されたアミノ酸〔真正アルカロイド〕): ヒオスシアミン (Hyoscyamine)、シロバナヨウシュチョウセンアサガオ (Datura stramonium) に含まれる アトロピン:ベラドンナ Atropa belladonnaに含まれる コカイン:コカ Erythroxylon cocaに含まれる スコポラミン:ナス科Solanaceae (nightshade) 植物に含まれる コデイン、モルヒネ:ケシ Papaver somniferumに含まれる テトロドトキシン:フグやいくつかの有尾目に含まれ、微生物が生産している ビンクリスチン、ビンブラスチン:ニチニチソウに含まれる細胞分裂阻害物質
テルペノイド(セミテルペンの重合により合成される): アザジラクチン:インドセンダン(ニーム)に含まれる アーテミシニン:クソニンジン Artemisia annuaに含まれる テトラヒドロカンナビノール:大麻Cannabis sativaに含まれる ステロイド(特定の環構造を有するテルペノイド) サポニン(植物ステロイド。多くはグリコシル化されている)
グリコシド(高度に誘導体化された糖): ノジリマイシン (Nojirimycin) グルコシノレート
フェノール: レスベラトロール
フェナジン: ピオシアニン (Pyocyanin) フェナジン-1-カルボン酸と誘導体