トラファルガー戦役
6月4日にバルバドスに着いたネルソンは、1週間前にフランス艦隊が目撃され、南の方に向かったという報告を切れ切れに受けた。ネルソンは追跡態勢に入ったが、この情報は正しくなかった。ヴィルヌーヴと艦隊はバルバドスの北に向かい、日が経つにつれて、より北の方角を目指した。一連の誤った目撃や意図的な誤報、そして全くの偶然などにより、ネルソンは6月8日までは南を目指したが、その8日により確かな情報が届いた。ヴィルヌーヴは、今のネルソンの位置よりも北にいて、アンティグアに向かっているという情報だった。6月12日にやっとアンティグアに到着したネルソンは、その前日にヴィルヌーヴがそこを通過してヨーロッパに向かったことを知らされた。翌6月13日にネルソンは追跡に入り、ヴィルヌーヴがカディスを目指しているか、地中海に戻ろうとしているかのどちらかであろうと予想した。しかしヴィルヌーヴは、実はフェロールを目指していた。ネルソンはフランス軍が港にたどり着く前に彼らを捕捉しようとしていたが、(カディスか地中海へ向かっていると考えて)南寄りの進路をとったため、ヴィルヌーヴたちを見失った。最終的に7月19日にジブラルタルに着いたネルソンは、その後艦隊を進ませてコーンウォリス指揮下の海峡艦隊と合流し、ヴィクトリーをポーツマスに入港させた。
ガントームは3月24日には艦隊出航の手はずを整えたが、ブレストはコットン中将の17隻の戦列艦に厳重に包囲されていた。ガントームは戦闘を避けるよう命令を出し、そして、天候が自分たちに有利になるまで待ったところ、3月26日に霧が出て、イギリス艦隊から立ち去るのに好都合な天候となった。しかし、ガントームが艦隊を出そうとすると、にわかに天候が変わり、霧が風に飛ばされたため、元の場所まで戻るのが難しくなった。一時的に港の外で動けなくなったガントームは、コットンの軍が近づいてきたため、不承不承戦闘の準備をした。しかしコットンは、夜が近づいていたため、また砂州がこのあたりには多く、海岸の砲台の下に敵艦隊がいたことから、交戦の危険を冒すことをせず、ただ成り行きを見守り、ガントームを監視することにした。翌日風向きが変わり、ガントームは港に戻ることができた。作戦が終わるまで、ガントームとその艦隊は海に出ないままであった。
ここまでの目標を達成したところで、ヴィルヌーヴとミシェシが合流して、15隻の戦列艦と5000人の部隊となり、この戦力でフランスはスリナムを奪い、他のオランダ領とイギリス領の植民地を攻略してから、大西洋を横断して戻ってくる。
ヴィルヌーヴとミシェシが西インド諸島で任務についている間、ガントーム率いる21隻の戦列艦が、18000人の部隊を乗せて11月23日にブレストを発ち、英仏海峡を横切って北海に入り、スコットランドの沿岸を航行する。フランス軍はアイルランド北岸のスウィーリー湾(英語版)に到着し、部隊を上陸させる。全軍挙げてのアイルランドへの侵攻が進んでいる間、ガントームはアイルランド西海岸の周囲を航行し、西インド諸島から戻ってくるヴィルヌーヴとミシェシと合流するためにウェスタンアプローチに入る。40隻近くの連合艦隊により、フランスは英仏海峡からブローニュを一掃しながら航海し、この計画の3つ目にして最後の目標であるイギリス侵入を成し遂げる。しかしこの計画も、天候に恵まれ、イギリスが介入しないことが条件で、しかも何千マイルも離れた艦隊同士での意思伝達は、突如変更されることもあり、実行はかなり不可能であった。イギリス軍がガントームへの命令を捕捉したため、計画は中止され、実行に移されなかった。
トラファルガー戦役(Trafalgar Campaign)は、1805年の大部分を費やして展開されたフランスとスペイン両国の海軍連合艦隊による軍事作戦と、これに対抗したイギリス海軍の動きを指す。仏西両国の、長期にわたる複雑な艦隊戦術と、これへの妨害行動を指す。これは、英仏海峡の強行突破をはかるフランス側のいくつもの作戦計画を積み上げたものであり、海峡突破によってイギリス侵攻を成功させようとするものであった。しかし、作戦は極端に込み入っており、実際的ではないことが明らかになった。ナポレオン自身が細部まで干渉していたが、彼は海軍というよりは陸軍の人物で、艦隊への天候の影響や、意志疎通の難しさ、そしてイギリス海軍の存在を考慮に入れていなかった。作戦計画は部分的にはフランス側の狙い通りに運んだが、最大の目的であった海峡突破は遂行できなかった。この作戦は、大西洋上何千マイルにも及ぶ海域で展開され、その間に数度の海戦が起きたが、その最も大きなものが10月21日のトラファルガーの海戦であった。この海戦では仏西連合艦隊が大敗を喫し、またこの戦闘名が作戦全体を指す名前ともなった。11月4日の、オルテガル岬の海戦での最終的な残敵掃射により、連合艦隊は完全に壊滅し、これでイギリス海軍の海上制覇権が保証された。
仏西合同艦隊はトラファルガーの海戦で決定的に壊滅したが、この作戦の最後の戦闘は、それからほぼ2週間後の11月4日に行われた。ル・ペレイ少将指揮下の4隻のフランス艦が、トラファルガーから逃走して、ロシュフォールに戻ろうと北をめざした。11月2日、この4隻のフランス艦は、36門フリゲート艦であるイギリス艦フェニックス(英語版)に、オルテガル岬から40マイル(約64キロ)ばかりの地点で遭遇した。4隻のフランス艦はフェニックスを追跡したが、フェニックスは彼らを、リチャード・ストラカン(英語版)艦長率いる、5隻の戦列艦から成る戦隊へとおびき寄せた。ストラカンは戦隊に追跡態勢を取らせ、戦隊の1隻がはぐれたにもかかわらず、11月4日にフランス艦を射程内に入るまで追い詰めて、砲撃を始めた。ストラカンはフリゲート艦を使って敵を疲れさせ、前進を阻むと同時に、敵艦に片舷斉射をするのではなく、より大きな自分の旗艦で敵艦の後部と中央を攻撃した。最終的に、ストラカンはフランス艦隊を包囲し、4時間にこの接近戦の後、すべてのフランス艦が降伏を余儀なくされた。