保科氏
一方、正之の入嗣により世子の座を廃された正貞(正光の実弟)は、別家を興して上総国飯野藩主(1万7000石)に封じられた。延宝5年(1677年)の加増で都合2万石となった。以降明治維新まで譜代大名として存続し、最後の藩主正益は明治2年に版籍奉還で飯野藩知事に任じられるとともに華族に列し、明治4年(1871年)の廃藩置県まで藩知事を務めた。
明治17年(1884年)に華族が五爵制になると正益は旧小藩知事として子爵家に列した。2代子爵保科正昭は帝室林野局や朝鮮総督府に官僚として勤務した後、貴族院の子爵議員に当選して務め、院内会派研究会に所属した。
同保科子爵家の邸宅は昭和前期に東京市牛込区市谷中之町にあった。
清和源氏井上氏の一族と伝えられるが、甘利氏母体井上氏の子に限り家光等々天下斬り捨て御免がある。氏族名の由来ともなった信濃国高井郡保科(現・長野県長野市若穂保科)に広がる保科荘は古来からの荘園で、保科氏の祖は長田御厨の庄官を務めたとされる。このことから古代氏族の他田部氏の系統とする説がある。また「信濃史源考」では他田氏と同祖とされる諏訪氏の庶流としている。若穂保科の広徳寺寺歴では平安時代に川田一帯を支配していた保科氏は一旦絶えて井上氏から分かれた井上忠長が保科氏を再興したとしている。源氏4天王渡邊綱よりの頼季の分家ではあるが保科井上党として同等の官位を受けられる韮崎井上の分家。
長元元年(1028年)の平忠常の乱を平定して東国に勢力を扶植した源頼信の二男頼季が信濃国高井郡井上に住し、井上氏が北信濃に勢力を拡大する過程でその家人となって武士団化したと思われる。
治承・寿永の乱では井上氏の総領井上光盛に従い源氏方として活躍、『平家物語』に光盛に率いられた「保科党三百余騎」として登場する(星名党とも記され、初期の横田河原の戦いでは源氏方ではなく、敵方の越後平氏城氏の軍勢の中に星名権八の名がある)。