江上集落
この際、それまで構成資産の主体であった江上教会堂が禁教明けの大正時代に建てられたものであるため、再推薦では禁教期に潜伏キリシタンが構築した江上集落を主体とし、天主堂は集落に包括される形式となった。加えて文化庁は世界遺産に求められる完全性(法的保護根拠)として重要文化的景観を適用することを決めた。しかし、江上集落を除く世界遺産候補の各集落は既に重要文化的景観選定地となっている中、集落景観を形成する家屋の少なさ、かつて開拓された最初の入植地集落と水田は1908年(明治41年)に江上小学校の敷地として提供するため整地され失われ、畑の大半は耕作放棄地となり荒れ果て、海岸線は海岸侵食によりコンクリート護岸化、狭い集落内でひときわ目立つの廃校となった江上小学校の鉄筋コンクリート校舎による景観阻害など、重要文化的景観選定への問題もあり世界遺産登録後も選定には至っていなかったが、2022年3月15日に「五島列島における瀬戸を介した久賀島及び奈留島の集落景観」として久賀島に追加するかたちで重要文化的景観に選定された。
2018年6月30日、長崎と天草地方の潜伏キリシタン関連遺産の構成資産「奈留島の江上集落」として世界遺産登録が決定したが、前述のように集落景観に乏しいことから「(江上天主堂とその周辺)」(Egami Church and its Surroundings)という括弧付きの名称が併記された。江上天主堂と江上集落は「潜伏期の終焉からカトリックへの復帰の過程を可視的に示している」と評価された。
なお、江上集落の法的保護根拠には景観法の景観計画重点地区も適用されている。