学校法人皇學館
長谷外余男(1961年9月8日 - 1963年10月7日)
井野碩哉(1964年6月12日 - 1980年5月16日)
浜地文平(1980年6月18日 - 1982年)
篠田康雄(1982年8月25日 - 1990年)
櫻井勝之進(1990年8月26日 - 1998年)
岡田重精(1998年8月27日 - 2001年)
上杉千郷(2001年8月1日 - 2008年8月28日)
佐古一洌(2008年8月27日 - 2020年3月26日)
小串和夫(2020年3月26日 - )
現在の皇學館の起源は、1882年に設立された神宮皇學館、およびそれ以前に置かれていた神宮教院に遡る。伊勢神宮が近代以前に担っていた神職養成や神道研究の分野を学校として整備したもので、明治時代から昭和時代前期にかけて、内務省が管轄する官立の旧制専門学校、次いで旧制大学に発展・昇格したが、第二次世界大戦終結後、連合国軍最高司令官総司令部による日本の民主化政策の一環として出された神道指令を受けて、官立大学であったが故に神宮皇學館大學は廃止された。
しかしその後、1952年には神宮皇學館大學再興期成会が立ち上げられ、卒業生や元教職員などの関係者らによって再興活動が続けられた。1962年2月17日、文部省より大学設置認可が下り、同年4月25日に開学式が挙行された。 1963年には皇學館高等学校、1979年には皇學館中学校も設置され、現在に至る。
なお、本記事では私立の学校法人としての説明に集中する。戦前の官立学校時代については皇學館大学を参照のこと。