上甑島
甑島列島には約8000万年前の白亜紀の地層が残っている。1981年(昭和56年)には甑島列島が甑島県立自然公園に指定された。中甑島北部には巨大な正断層である鹿の子断層があり、北西-南東方向に発達した断層が露頭している。甑島列島は熱帯性の木生シダであるヘゴの自生北限地のひとつであり、「ヘゴ自生北限地帯」の名称で国の天然記念物に指定されている。島内に生息するカラスバトは種として国の天然記念物指定を受けている。薩摩川内市の市花はカノコユリであり、甑島列島はカノコユリの日本唯一の自生地とされている。
上甑島北端にある遠見山はかつて独立した島だったが、流砂によって上甑島本島と陸続きとなり、沿岸流と波の作用で海底の砂礫が水面上に現れたのが陸繋砂州(トンボロ)である。その上に形成された里集落は、陸繋砂州上にある集落としては日本国内最大規模である。砂州の全長は約1,400m、全幅は最狭部で250m、標高2.3mであり、半島のように突き出た遠見山と島の南側をつないでいる。この砂州は10cm×5cmほどの礫で構成されており、一般的な砂丘や砂嘴にみられる細砂礫が少ないが、西岸は西之浜海水浴場となっている。上甑島の里には小川氏の統治時代の名残である武家屋敷通りがあり、玉石垣が特徴である。2009年、国土交通省によって日本の有人離島にある優れた景観を選定する「島の宝100景」に、里の武家屋敷跡が選出された。
上甑島には長目の浜と呼ばれる、大小3つの池が砂州によって海と隔てられた景勝地がある。北からなまこ池(海鼠池)、貝池、鍬崎池(かざきいけ)であり、隣接しており似たような地形を持ちながらもそれぞれ塩分濃度や成層状態が異なっている。