ゴジラ×メガギラス G消滅作戦
VFXスーパーバイザーの大屋哲男は、当初はミニチュアを合成する予定であったが、ミニチュアが大きすぎたため俯瞰には向かなかったと証言している。撮影の江口憲一は、動きのある空撮への合成が時間的に間に合うかどうか半信半疑で撮影していたが、映画祭で上映された際に歓声が上がり苦労した甲斐があったと述懐している。 パレットタウン空中展望台 パレットタウンの手前に建っている。 上空シーンからは、先述の空中庭園ビルと共にCGで合成されている。 渋谷国立科学技術研究所 渋谷に建てられている施設。杉浦の指示で密かにプラズマエネルギーを開発しており、最終的にゴジラに破壊される。 ゴジラによって破壊されるシーンに時間をかける必要があったため、横長のデザインとなった。同シーンの撮影では、カメラを3台設置し、3回に分けて撮影することで9カット使えるようにしている。 リニアモーターカー 原子力撤廃に伴う省エネルギー化の推奨により導入された交通機関。1990年代には全国に路線を広げており、東京-大阪間を1時間半で走行する。 車両はフルCGで描写され、秋葉原の実景に合成している。
ある日、特G対に所属する物理学者の吉沢佳乃により、プラズマエネルギーを利用した究極の対ゴジラ兵器として開発されたブラックホール砲「ディメンション・タイド」の試験機による試射実験が山梨県の廃校を目標にして行われる。試射は無事成功するが、それによって時空の亀裂が発生し、そこから太古の巨大昆虫メガニューラが現れ、実験場付近の山林に卵を産み落としていく。偶然その様子を目撃した小学生の早坂淳は、産み落とされた卵を持ち帰るが、その不気味さに恐怖を感じ、引っ越し先の東京・渋谷で下水道へとその卵を捨てた。
一方、ディメンション・タイドは、桐子により秋葉原でスカウトされた吉沢の教え子でマイクロマシンの天才・工藤元の手によって人工衛星に搭載可能なサイズにまで小型化され、衛星軌道上に打ち上げられる。Gグラスパーは、奇岩島にゴジラを誘導しディメンション・タイドで葬り去る「G消滅作戦」を立案し、作戦決行に移した。
しかし、淳が捨てた卵から孵化したメガニューラの幼虫・メガヌロンが人間を襲い、渋谷の地下水脈を崩壊させて渋谷一帯を水没させてしまう。繁殖した無数のメガヌロンは羽化してメガニューラとなると、ゴジラの体内の高エネルギーを狙って大群でG消滅作戦が行われている最中の奇岩島に飛来、Gグラスパーと航空自衛隊によって誘導されていたゴジラに襲いかかる。
いずれも東宝ビデオより発売。
VHSは2001年12月に発売。レンタルは2001年7月より開始。
DVDは2001年8月21日発売。 トールケース版DVDは2002年11月21日発売。 2005年4月22日発売の「GODZILLA FINAL BOX」に収録されている。 2014年5月14日には「ゴジラ60周年記念版」として期間限定の廉価版が発売。 2016年6月15日に東宝DVD名作セレクションにて発売
Blu-ray Discは2010年3月19日発売。
ゴジラミレニアムシリーズの第2作。シリアスなドラマ性よりも、空想科学映画としての娯楽性が重視されている。また、ヒロインがゴジラと直接戦う戦士として描かれているのが特徴であり、シリーズで初めて人間がゴジラの背中に乗る姿が描かれる。
本作品に登場するゴジラは1954年公開のシリーズ第1作『ゴジラ』に登場した初代個体であり、同じ個体が倒されずに続いて登場しているという設定である。そのため、1954年の東京襲撃シーンは新ゴジラを用いてシリーズ第1作を再現している。本作品でのゴジラは、巨大なエネルギーを操る人類を許さず、あらゆる攻撃に耐えながら、メガギラスと闘う姿に焦点が当てられている。
主要襲撃地点は東京(渋谷、お台場)。本作品の世界観は、ゴジラの襲撃により大阪が首都になり、原子力発電が放棄されたパラレルワールドである。
作品の評価は高かったが、興行的には振るわずシリーズの存続も危ぶまれ、既に企画が進行していた次作『ゴジラ・モスラ・キングギドラ 大怪獣総攻撃』の内容や興行形態に影響を及ぼすこととなった。