万有製薬
2006年 - 週一回服用タイプ骨粗鬆症治療薬「フォサマック®35mg」発売
2006年 - 血圧降下剤「プレミネント®」発売。日本初のARB-サイアザイド系利尿薬の配合剤
2006年 - 肺炎球菌ワクチン「ニューモバックス®NP」発売
2007年7月 - 2008年1月に社名を「メルク万有株式会社」とする事を発表(その後、関連の追加調査が確定するまで延期すると追加発表されたが、シェリング・プラウとの合併によりMSDとなった為にこの社名は幻となった。)
2007年9月 - 平手晴彦社長の辞任を発表(後任は、米国メルク社のデビッド・W・アンスティス)
2008年1月 - マーク・ティムニーが社長に就任
2008年10月 - つくば研究所(茨城県つくば市)を2009年末に閉鎖することを発表。
2009年8月 - つくば研究所を大鵬薬品工業に売却。
2009年12月 - 糖尿病治療薬「ジャヌビア®」発売
2010年8月 - トニー・アルバレズが社長に就任
2010年10月1日 - 2009年11月の米国メルク社のシェリング・プラウ社買収に伴い、シェリング・プラウ日本法人と事業統合した。同時に社名も、米国メルク社のアメリカ、カナダ以外の地域での名称、「MSD (Merck Sharp & Dohme)株式会社」に変更された。これ以降は米国メルク参照。
ニューロタン® (ロサルタン, アンジオテンシンII受容体拮抗薬:高血圧治療薬、2型糖尿病性腎症治療薬)
リポバス® (シンバスタチン, HMG-CoA還元酵素阻害剤:高脂血症治療剤)
レニベース® (エナラプリル, アンジオテンシン変換酵素阻害剤:血圧降下剤)
チエナム® (カルバペネム系抗生物質製剤)
シングレア® (モンテルカスト, ロイコトリエン受容体D4拮抗薬:気管支喘息治療薬)
フォサマック® (ビスフォスフォネート:骨粗鬆症治療薬)
プレミネント® (アンジオテンシンII受容体拮抗薬/サイアザイド系利尿薬 配合剤:血圧降下剤)
プロペシア® (5α還元酵素阻害剤:AGA(男性型脱毛症)治療薬)
チモプトール®/チモプトール®XE (β2ブロッカー:緑内障・高眼圧症治療剤)
トルソプト®/コソプト® (炭酸脱水酵素阻害剤/β-遮断剤配合剤:緑内障・高眼圧症治療剤)
ニューモバックス®NP (肺炎球菌ワクチン)
ヘプタバックス®-II (B型肝炎ワクチン)
ジャヌビア® (シタグリプチン、DPP-4阻害剤、糖尿病治療薬)
トリプタノール® (アミトリプチリン塩酸塩、抗うつ薬)...2010年末より、日医工が製造販売の権利を継承し、継続販売中。