ドクターエッグマンのミーンビーンマシーン
対戦中の名前のアルファベット表示は、プレイヤー側は「1P(もしくは2P)」、敵キャラクターは「DR R」で統一されている。対戦BGMは4ステージ毎に切り替わる(ステージ5 - 8はステージ1 - 4と同じBGMだがテンポが速くなる)。最終ステージのDr. Robotnikは専用BGMとなる。対戦フィールドの背景は全ステージ共通で『ぷよぷよ』のふつう・前半ステージ(岩壁)と同じもの。
Arms
Frankly - 『ぷよぷよ』の「すけとうだら」と同じ積み方で、「ぞう大魔王」のように設置時に画面が揺れる。
Humpty
Coconuts - 『ぷよぷよ』の「ハーピー」と同じ積み方を行う。
Davy Sprocket
Skweel
Dynamight
Grounder
Spike
Sir F-Fuzzy Logik
Dragon Breath - 『ぷよぷよ』の「ぞう大魔王」のように設置時に画面が揺れる。
Scratch
Dr. Robotnik
彼はロボトニックの計画を阻止するため、悪のロボット軍団と闘いながら、改造マシーンに送り込まれるビーン達を大量に逃がして救出し、ロボトニックの野望を打ち砕く。ゲーム内ではストーリーデモで彼の姿は登場せず、対戦中は原作のカーバンクルと同じく画面中央で踊っている。
シナリオモードは、『ぷよぷよ』での「ひとりでぷよぷよ」とは異なりステージ選択や練習ステージが無く、全13ステージとなっている。その代わりにパスワード制を採用しており、コンピュータ戦で勝利した時に出現するパスワード(4つのビーンズを並べたもの)を入力することで続きからプレイが可能となる。このパスワードは、4種類の難易度設定によってそれぞれ異なる物が、ステージ2から13までの分で合計48パターン存在し、この他に特殊な効果を起こすパスワードも数種類存在する。
音楽の多くは独自のものが使われているが、『ぷよぷよ』のアレンジ楽曲も一部使用されている(ただし、使用される局面は原作と異なっている)。