新選組始末記
第1話:壬生残留十三名
第2話:狼たちの掟
第3話:粛清はじまる
第4話:土砂降りの夜
第5話:隊士絶叫
第6話:天神橋事件
第7話:壬生心中
第8話:見廻組騒動
第9話:池田屋事件(その一)
第10話:池田屋事件(その二)
第11話:池田屋事件(その三)
第12話:残党狩り
第13話:壬生の嵐
第14話:近藤江戸下り
第15話:総長脱走
第16話:山南切腹
第17話:床伝の娘
第18話:わたしは侍じゃない
第19話:参謀脱隊
第20話:油小路の惨劇
第21話:墨染の難
第22話:開戦前夜
第23話:鳥羽・伏見の戦い
第24話:江戸の落日
第25話:さらば友よ
第26話:男たちの終章
これらは、中公文庫では「新選組三部作」として3冊別に出版されている。
本作は、娯楽的な時代小説というよりも、随筆・記録・史談ともつかないものであり、また子母澤自ら取材して集めた幕末の一級資料と捉えられている。ただし、子母澤が自ら後書きで「生き残りの老人のはなしは、疑わしいものもあったが、私は『歴史』というのではなく現実的な話そのもののおもしろさをなるべく聞きもらすまいと心がけた」と述べているように、学術的な意味での史実とは言い難い。また、司馬遼太郎は1967年(昭和42年)に最晩年の子母澤と対談し、その対談「幕末よもやま」によれば、司馬は20歳くらいの時に『新選組始末記』を読んで、どうしてもこれは超えられないと思い、子母澤に会いに行って教えを請うたという。
子母澤が独自に取材した話としては、新選組の屯所として使われた八木家の息子・為三郎から話を聞いた「八木為三郎老人壬生ばなし」、新選組隊士の最後の生き残りだった「稗田利八翁思出話」、などがある。