R-TYPE TACTICS II -Operation BITTER CHOCOLATE-
上記の三勢力に属さないユニット、勢力も登場する。
本作ではキャラクターが登場しており、それぞれの勢力の副官として行動する。副官のイラストは三つのタイプから選択が可能。 明確な姿を持ったキャラクターが登場するのは『R-TYPE COMPLETE CD』以来になる。
本作は開始時に機体特色の異なる「地球連合軍」編、「グランゼーラ革命軍」編からどちらかを選んでプレイしていく。ストーリーが進むにつれ、後編、番外編が登場する。前作のプレイデータをコンバートできるが、その場合前作のプレイデータで名付けた主人公名は使用できなくなる。
前作に比べて多数のユニットが追加されたほか、前作で登場したユニットの能力の微調整がなされた。また、ダウンロードコンテンツに対応しているが、攻略本に記載されていた大半のダウンロードコンテンツ配信予定のユニットは配信されず、アイレムソフトウェアエンジニアリングは本作を含む大半のコンテンツの配信を終了しているため、もう二度と配信される事はない。
本作での主な追加点は、自分と周囲にいる部隊を敵の索敵範囲から隠蔽するジャミング能力や、亜空間に隠れた敵の位置を探る亜空間ソナー、敵機を鹵獲して自軍として操る鹵獲弾、ステージ中で得た資源を使って基地を建設していくステージ、ステージ開始前、および終了後での日誌において発言の選択肢の追加などがある。ステージ開始前の時点で、戦艦や基地に艦載することも可能になっている。