信州大学医学部附属病院
呼吸器・感染症内科
循環器内科
消化器内科
血液内科
腎臓内科
神経内科
リウマチ・膠原病内科
糖尿病・内分泌代謝内科
精神科神経科
小児科
皮膚科
放射線科
消化器外科
移植外科
小児外科
心臓血管外科
呼吸器外科
乳腺内分泌外科
整形外科
脳神経外科
特殊歯科・口腔外科
泌尿器科
眼科
耳鼻咽喉科
産科婦人科
麻酔科蘇生科
形成・再建外科
2005年10月、中部地方の国立大学としては岐阜大学医学部附属病院に続き、2番目に救命救急センターの指定を受けた。平成17年度中には、救命救急センターから高度救命救急センターへの移行が決定し、2007年4月に移行が完了した。中部地域では、愛知医科大学附属病院(1996年3月)、岐阜大学医学部附属病院(2006年2月)に続く3施設目。
脳死肝移植の実施施設として、日本では京都大学医学部附属病院に次ぐ手術実施数を有する。当時の衆議院議員であった河野洋平は、ここで息子の河野太郎から生体肝移植手術を受けている。