桜本坊
伝承によれば、天智天皇から逃れた弟の大海人皇子(後の天武天皇)は、日雄(ひのお)離宮にとどまっていた。ある冬の日に桜が咲き誇っている夢を見た皇子が役行者の高弟・日雄角乗(ひのおのかくじょう)に訊ねたところ、「桜の花は花の王と云われ、近々皇位に着くよい知らせです」と答えた。その後、壬申の乱に勝利し皇位に着いた天武天皇は、夢で見た桜の木(夢見の桜)が立っていた場所に、天武天皇2年(673年)に寺を建立したとされる。
文禄3年(1594年)に行われた豊臣秀吉の吉野の花見の際には、関白豊臣秀次の宿舎となった。
もとは金峯山寺蔵王堂の前にあって密乗院と称していたが、明治初年の神仏分離と廃仏毀釈にあって大打撃を受け、後に現在地に移転して「桜本坊」と改称した。現在は宿坊も営む。
木造役行者倚像 - 鎌倉時代。本尊。全国の修験系寺院に祀られている数多い役行者像の中でも、鎌倉彫刻として最も優れた像とされる。
銅造釈迦如来坐像 - 飛鳥時代・白鳳時代。
木造地蔵菩薩坐像 - 平安時代。