マンモス・ケーブ国立公園
アカコウモリ(英語版)(Lasiurus borealis)は森に住んでおり、地下で見つかることは滅多にない。
マンモス・ケーブには14種の固有種を含む130種以上の洞穴生物と好洞穴性生物が生息している。コウモリ以外にコオロギ(Hadenoecus subterraneus(英語版)とCeuthophilus stygius(英語版)(Ceuthophilus latens(英語版)))、洞窟有尾目(Eurycea lucifuga(英語版))、盲目洞窟魚類(Typhlichthys subterraneus(英語版)とノーザンケイブフィッシュ(英語版))、洞窟ザリガニ(Orconectes pellucidus(英語版))および洞窟小エビ(Palaemonias ganteri(英語版))といった動物が挙げられる。
地表に生息する動物はマンモス・ケーブの入口に避難することはありうるが、一般に洞窟群の深部まで進入することはない。
マーテルは、1906年のブラウンズヒルでのダムの建設によってかれの水理学的研究を完成させることが不可能となったことを示して嘆いた。彼のマンモス・ケーブ内での水理についての精密な説明によれば、マーテルはマンモス・ケーブはソルト・ケーブとコロッサル・ケーブにつながっているという結論を提供した。これはマーテルの訪問の60年後まで正しいと証明されないのである。
1920年代の初頭に、ジョージモリソンはクロウアン地所によって所有されなかった土地の上のマンモス・ケーブへの多くの入口を爆破した。ケンペルやビショップや他の人によって秘密の調査が行われたようだが、洞窟の地理的な延長を決定するのに適した形で出版はされていない、その存在はしたはずのデータと言うものが見つからない。これは、今の時点で振り返ると、クロウアンは年々に渡って自分の所有しているのではない土地の下にある洞窟も観光に使っていたことが決定的である。この時期訴訟も年々に渡って続けられ、洞窟の入り口をどちらが使うのかという、文字通り洞窟の入り口を争う戦いが行われた。
20世紀の初頭、フロイト・コリンズ(英語版)は1925年に砂の洞窟で死亡するまでの10年間を、フリントリッジ洞窟群の探求をしながら過ごした。(水晶の洞窟と塩の洞窟の発見はその調査にまつわる最も重要な伝説である。)砂の洞窟の這って進むような狭い通路で彼は、足元に落ちた岩での自由を奪われてしまったのである。コリンズを救えという試みはメディアで大きく話題になった。結果として生まれた注目が、このマンモス・ケーブを国定公園にする運動を始めようという意見を、ケンタッキーの著名な人物から引き出すことになる。
この分析から、狩猟採集文化から栽培、農業文化への時系列変化の様子がわかる。
マンモス・ケーブで用いられた考古学研究の別の手法として「実験考古学」(experimental archaeology)があり、それは、洞窟内の多くの場所に打ち捨てられている道具のように古代の文化で用いられた技術を用いて、現代の探検家に洞窟内に入ってもらうという手法である。 この手法の目的は、研究者を当時と同様の状況に置くことにより、洞窟を探索していた古代の人々がどのような問題に直面していたかに対する知見を得ることである。
洞窟内に残る古代の人々の遺物や美術品は、さまざまな連邦法や州法によって保護されている。新しく発見された遺骨と遺物について、決定されるべき最も基本的な事実はその位置と状況である。先史時代の美術品を少しでも動かしただけで、研究的な価値を損なってしまう。探検家たちは、考古学的な証拠を損ねないように適切に訓練されており、洞窟の一部の場所は、その地域が考古学研究の対象とされない限り、ベテランの探検家でも入れないように進入が禁止されている。
マンモスケーブを通して通じている洞窟の一部で発見された遺骨に加え、ネイティブアメリカンが使用した松明、図面、ひょうたんの断片などといった遺物もまたフリントリッジの群のサルツ洞窟部において発見された。