新見錦
しかし、5月25日に容保に差し出された名簿には、新見の名前は記されておらず、同月入隊の島田魁が記した『英名録』にも記載がない。
新見の最期について、永倉の『新選組顛末記』によると、遊蕩先であった祇園新地の料亭「山緒」に近藤一派が押しかけ、悪行の数々を突きつけられた上で「切腹せねば法度に照らして斬首する」と詰め寄ったため、切腹させられたという。間もなく芹沢と平山五郎も試衛館派に暗殺され、新選組の水戸派は壊滅した。しかし、一方で永倉は『浪士文久報国記事』においては、一同相談のうえ切腹と決まったが、その内にまたも四条木屋町に旅宿する水戸浪人吉成常郎(吉成勇太郎の弟恒次郎と推定されている)に乱暴を働いたため、8月14日もしくは15日に梅津某の介錯で切腹させられたと記しており、どちらが正しいのかは分かっていない。
明治維新後、長州派の志士を祀るため作られた霊山招魂社に、本来敵であるはずの新見が祀られていること、元新徴組の暮地義信(早川文太郎)が、維新時に活躍した志士を記した『近世高名一覧勤王為皇国』に名前がある事などから、切腹の理由は素行不良や試衛館派との対立だけではなく、水戸や長州、土佐などの尊王攘夷派との親密な関係を咎められたという説もある。