アルピコ交通上高地線
自動列車停止装置(ATS)、列車集中制御装置(CTC)(京三製作所製RCH6型)が導入されている。交換駅等には連動装置が設置されている。
閉塞信号機には2位式(緑・赤)が採用されている。
おおむね30 - 40分間隔で運転されている。定期列車は全列車が松本 - 新島々間の運転で、区間運転列車の設定はない。ただし松本大学で大学入試センター試験が実施される日に試験終了後に合わせて臨時列車として2013年に新村 - 松本間、2015年に北新・松本大学前 - 松本間の区間列車が運行されたことがある。
また定期列車は全列車各駅停車であるが、2022年には松本ぼんぼん開催にあわせて、臨時快速列車が運行された。
JRの「ムーンライト信州」などの夜行列車が運行されていた時期には、夏季に早朝松本駅でこれらの列車に接続し、新島々駅までノンストップの臨時列車が運行されていた。
ワンマン運転を実施しており、駅員のいない駅で乗降する場合は列車内で整理券をとり、運賃箱に運賃を投入する。なお、SuicaやPASMOなどのICカード乗車券での精算は一切不可である。乗車方法がJR等のワンマン列車と異なり、1, 2両目の中央ドアからの乗車となっている。そのため、無人駅での2両目のドアカットは行われない。
制限速度は、松本 - 渚間ではカーブが多く駅間隔が短いため40km/hで、渚 - 新島々間ではカーブが少なく駅間隔が長いため50km/hで走行している。
3000形電車
20100形電車
2011年(平成23年)4月1日 商号をアルピコ交通に改称。
2017年(平成29年)3月上旬 駅ナンバリング制度を導入。
2021年(令和3年)令和3年8月の大雨により被災した田川橋梁(2021年9月) 8月14日 令和3年8月の大雨の影響により河川が増水し、西松本 - 渚間にある田川橋梁の橋脚が傾くなど被災したため、同日夕刻より翌15日まで運休。その後、同月16日より松本 - 新村間については復旧の目処が立たず、バス代行輸送を開始(新村 - 新島々間は列車を運行)。 10月8日 渚 - 新村間で列車運行再開。代行バス運転区間を松本 - 渚間に短縮。なお、渚駅周辺にはバスの折返し設備がないため、近隣の企業の敷地を借用の上折返し場として使用。
2022年(令和4年)6月10日 松本 - 渚間で運転再開し、全線復旧。バス代行輸送は6月9日付で終了。
松本駅:松本電気鉄道浅間線(1964年4月1日廃止)