小木津駅
島式ホーム1面2線を有する地上駅で橋上駅舎を備えており、改札外は自由通路として機能している。また、バリアフリーの観点からホームと改札階および改札階と駅外の地上(東口側・西口側とも)を結ぶエレベーターが設置されている。
日立駅が管理し、JR東日本ステーションサービスが駅業務を受託する業務委託駅であり、指定席券売機、簡易Suica改札機が設置されている。
日立電鉄交通サービス
旭タクシー(有)