ソリッド・スネーク
隠しキャラクターとして登場。『スマブラX』のゲスト出演は、小島がディレクターの桜井政博に直々に嘆願したことから実現したもの。『メタルギアシリーズ』本編での特徴が再現されているが、台詞や武器にネイキッド・スネークの特徴もいくつか取り入れられている。攻撃手段はCQCでの格闘、体術を主とし、ナイフ、刃物や銃器は日本国外における対象年齢のレーティング規制により使用しない。RPG-7やグレネード、地雷などの爆発物も使用し、桜井ディレクターは「豊富な重火器」という個性をつけている。しかし動きが遅い。また、基本的に短いセリフか掛け声だけである参戦キャラクターの中において、スネークは無線中のやり取りがあるためセリフが最も多い。
かつて自身が破壊したメタルギアREXに搭乗してオタコンのサポートを受けながら戦い、リキッドが操るメタルギアRAYを撃破した。
最終決戦では通常の人間なら数秒で死亡、蒸発してしまうほどのマイクロ波の中を進み、リキッド・オセロットと激しい格闘を演じるなど、衰えた老体を極限まで酷使することになったが、リキッドによる核の発射を辛うじて阻止することに成功。オタコンがMk.IIIを使って打ち込んだFOXALIVEによって「J.D.」を含む愛国者達のA.I.ネットワーク全体を(インフラ・ライフライン部分を残して)破壊したことで、全てを終わらせた。
戦争終結後は、これによって真の目的を果たしたリキッド・オセロットとの最後の私闘に挑み、苦戦しながらも最後は彼を打ち倒し個人的な決着をつけた。直後、オセロットからは「いいセンスだ」というかつて自分がビッグボスに贈られたのと同じ賞賛の言葉を遺言として贈られた。