恵那郡
明治5年4月9日(1872年6月10日) - 大区小区制の施行により、恵那郡は岐阜県第十二大区とされた。郡内には63ヶ村があったが、11の小区に分けられた。
第一小区 竹折村、藤村、久須見村、中野村、正家村、永田村、大井村、東野村、佐々良木村、野井村、椋實村
第二小区 馬坂村、馬木村、高波村、峯山村、小杉村、落倉村、明知村
第三小区 杉平村、門野村、野志村、吉良見村、大船村、小泉村、大栗村、田良子村、上田村、阿妻村、猿爪村、大川村、水上村、 原村、釜屋村、田代村、下手向村
第四小区 野原村、一色村、浅谷村、須淵村、土助村、才坂村、安主村、岩竹村、柏尾村、颪村
第五小区 澤中村、串原村、小田子村、漆原村、下村、上村
第六小区 馬場山田村、久保原村、上手向村、飯羽間村、富田村、岩村
第七小区 阿木村、飯沼村
第八小区 千旦林村、茄子川村、駒場村、手賀野村、落合村、中津川村
第九小区 日比野村、上地村、瀬戸村、坂下村、上野村、川上村、下野村、田瀬村、福岡村
第十小区 高山村、蛭川村、中野方村、毛呂窪村、姫栗村
第十一小区 加子母村、付知村
明治11年(1878年)7月22日 - 地方三新法の一つである郡区町村編制法の制定により大区小区制は廃止された。
1879年(明治12年)に行政区画として発足した当時の郡域は、以下の区域にあたる。
恵那市の大部分(飯地町・笠置町河合を除く)
中津川市の大部分(山口・馬籠・神坂を除く)
瑞浪市の一部(陶町)
愛知県豊田市の一部(須渕町・浅谷町・三分山町・上切町・下切町・上中町・下中町・島崎町・一色町)
なお、701年(大宝元年)に制定された大宝律令で、日本国内は国郡里制の三段階の行政組織に編成された時には、現在の長野県木曽郡の全域も含んでおり、美濃国内で最大の面積を有する郡であったが、下記の区域は含まれていなかった。
中津川市加子母の一部(小郷・小和知)
恵那市中野方町と、笠置町(河合・姫栗・毛呂窪)(正保年間(1645年~1648年) - 姫栗村と毛呂窪村の所属が加茂郡から恵那郡に変更。)
愛知県豊田市の一部(上切町・下切町・上中町・下中町・島崎町・三分山町・一色町)