永劫の探究
アンドルーは、シュリュズベリイ博士と共にセラエノ図書館で研究をしていた。それから2年後の1940年、敵がインスマスで再動したことを察知する。単身地球に戻ったアンドルーはインスマスを探るが、敵に察知される。
一方で、失踪したアンドルーの部屋には、新たに神学生エイベルが入居していた。疲れていたアンドルーはエイベルに簡単な説明をすると眠ってしまい、エイベルはミスカトニック大学付属図書館でアンドルーについて調べる。エイベルがインスマスについて口にすると、ピーバディ老司書はやめておけと警告してくる。エイベルは荒廃したインスマスの町を偵察に行き、深入りせずに自宅に戻る。目覚めたアンドルーは詳細をエイベルに説明し、話を聞いたエイベルは仲間入りを申し出る。
アンドルーの標的は、インスマスを再興させた、マーシュ家の新当主エイハブ・マーシュである。2人は変装したうえでインスマスに赴き、絶えた旧名家ウィルキン家の遠縁であると素性を偽ってインスマス唯一のホテルに泊まる。その夜、2人は魔力石で屋敷を取り囲んで逃げ道を塞いだ上で放火し、エイハブ・マーシュを名乗る人外を焼き殺す。火は燃え広がり、港町の大部分を焼き尽くす大火災となる。2人は別れ、アンドルーはバイアクヘーを召喚して逃げ去る。
エイベルは単身帰宅し、数日は何もなかったが、何者かに尾行され始める。エイベルは手記を書き上げ、ミスカトニック大学付属図書館宛に送り、バイアクヘーを召喚してボストンを離れる。
ロンドン在住の小説家ネイランドは、資料調査や現地取材を経て、新作怪奇小説で成功を収める一方、誰かに身辺を嗅ぎ回られている気配を覚える。ネイランドを来訪してきたシュリュズベリイ博士は、ネイランドの作品がクトゥルフ崇拝を反映しているために目をつけられたと説明し、尾行者が非人間種族・深きものどもだと教える。ネイランドは蜂蜜酒の副次効果で尾行者たちの姿を視認し、異形の者たちが実在することを認め、博士への同行を申し出る。
失われたと言われている「アル・アジフ」を求め、博士とネイランドは、まず海路でアラビアに行き、続いて内陸入りして円柱都市アイレム=無名都市 を探す。護符の力で船旅は無事に終わり、深きものどもは砂漠まではやって来れないが、代わりに陸棲の爬虫類人が追跡してくる。2人は現地人を雇って砂漠をラクダで行進するが、ガイドが消えたり人夫が殺されたりしたことで、彼らは恐れて進行を拒むようになり、最終的には博士とネイランドの2人だけで無名都市に入る。