井芹川
流域の大部分が田園地帯であるが、熊本市北区釜尾町付近から西区谷尾崎町付近までは住宅地を通る。
木留川 - 熊本市北区植木町木留付近に源を発し、やがて鐙田川に合流する。
西谷川 - 熊本市西区河内町大多尾付近に源を発し、北区立福寺町付近で立福寺川と合流し、硯川町付近で井芹川に合流する。 立福寺川 - 熊本市西区河内町東門寺付近に源を発し、北区立福寺町付近で西谷川に合流する。
和泉川
豆尾川
西浦川 - 熊本市北区貢町付近に源を発し、釜尾町と貢町の境界から井芹川に合流する。
成道寺川
前川 - 熊本市西区花園付近に源を発している。
大井手川 南迫川
小山田川
麹川
谷尾崎川
平川
池上川