松山運転所
1両(トラ152462)が配置されている。「しまんトロッコ」(2012年度までは「清流しまんと号」)などのトロッコ列車で運用されている。
3両編成3本 (E1 - 3) ,2両編成4本 (E11 - 14) の計17両が配置され、松山駅側から3両+2両+2両の7両編成2本を組成して平常時は7両編成「しおかぜ」+「いしづち」の4往復すべて、早朝・深夜は2+2で4両編成「いしづち102・103号」、3両編成が「いしづち106号」と「モーニングEXP松山」で運用される。
予備車のない2両編成については、検査時は3両+2両+3両の8両編成で運転し、昼間のすべての電車特急を8両編成で運転する多客時は7両編成2本のうち1本は3両+3両+2両の8両編成に、もう1本は8000系8両編成に車両を変更しての運転となる(このとき余った2両編成は高松駅-宇多津駅・多度津駅のみ運転の「いしづち」に充当)。