転写因子
6 TEAドメイン 3.6.1 TEA
4 β-Scaffold因子(Minor Groove Contactを伴う) 4.1 RHR(Rel homology region) 4.1.1 Rel/ankyrin、NF-kB 4.1.2 ankyrinのみ 4.1.3 NF-AT 4.2 STAT 4.2.1 STAT 4.3 p53 4.3.1 p53 4.4 MADSボックス 4.4.1 分化調節因子(Mef2など) 4.4.2 細胞外シグナル応答因子(SRF) 4.5 β-Barrel α-helix 4.6 TATA結合蛋白(TBP) 4.6.1 TBP 4.7.1 SOX、SRY 4.7.2 TCF-1 4.7.3 HMG2関連因子、SSRP1 4.7.5 MATA 4.8 Heteromeric CCAAT factor 4.8.1 Heteromeric CCAAT factors 4.9 Grainyhead 4.9.1 Grainyhead 4.10 寒冷ショックドメイン 4.10.1 csd 4.11 Runt 4.11.1 Runt
0 他の転写因子 0.1 銅フィストタンパク質 0.2 HMGI(Y) 0.2.1 HMGI(Y) 0.3 ポケットドメイン 0.4 E1A類似因子 0.5 AP-2/EREBP関連因子
転写因子は生物の発生、細胞間シグナル伝達、細胞周期などで重要な役割を果たすため、その変異がヒトの疾患の原因となることがある。比較的よく研究されている例を以下に挙げる。
レット症候群(Rett syndrome)-MECP2(en)転写因子の変異による、神経発達疾患。
糖尿病-MODY(Maturity onset diabetes of the young)と呼ばれる糖尿病の稀なタイプが、肝細胞核因子(HNF)やインスリンプロモーター因子1(IPF1)の変異によって起こることがある。
発達性言語協調障害(developmental verbal dyspraxia)-FOXP2の変異によって起こる。正しく発声するための協調運動が困難になる疾患。
IPEX(immunodysregulation polyendocrinopathy enteropathy X-linked syndrome)-FOXP3(en)の変異によって起こる、稀な自己免疫疾患。
その他-がん遺伝子/がん抑制遺伝子として働く転写因子は多く、これらの変異や調節異常が発がんの原因となることがある。リー・フラウメニ癌症候群(Li-Fraumeni syndrome)はがん抑制因子であるp53の変異を原因とする。
最も細分化された転写因子の分類として、DNA結合領域をメインとしたものがある。ここではSuperclass・Class・Familyの3段階までを記すが、Subfamilyなどさらに下位分類を設ける場合もある。
1 基本ドメイン 1.1 塩基性ロイシンジッパー 1.1.1 AP-1類似構成要素(c-Fos、c-Junなど) 1.1.2 CREB 1.1.3 CCAATエンハンサー結合蛋白(C/EBP)類似因子 1.1.4 bZIP/PAR 1.1.5 植物G-box結合因子 1.1.6 ZIPのみ 1.2 塩基性ヘリックスループヘリックス 1.2.1 ユビキタス因子(class A) 1.2.2 筋原性転写因子(MyoD) 1.2.3 Achaete-Scute 1.2.4 Tal/Twist/Atonal/Hen 1.3 ヘリックスループヘリックス/ロイシンジッパー(bHLH-ZIP) 1.3.1 ユビキタスbHLH-ZIP因子(USF、SREBPなど) 1.3.2 細胞周期調節因子(c-Mycなど) 1.4 NF-1 1.4.1 NF-1(NFIC) 1.5 RF-X 1.5.1 RF-X(NFX) 1.6 bHSH
2 亜鉛配位DNA結合ドメイン 2.1 Cys4(核内受容体型) 2.1.1 ステロイドホルモン受容体 2.1.
重要な生物学的反応には多段階の調節・制御機構が設けられているが、転写もその例外ではない。転写レートの制御は遺伝子産物(RNAやタンパク質)の量を調節するだけでなく、転写の過程それ自身をも調節している。以下に、転写因子の活動を制御するシステムの簡潔な一覧を示す。
2 甲状腺ホルモン受容体類似因子 2.2 diverse Cys4 zinc fingers 2.2.1 GATA因子 2.3 Cys2His2ジンクフィンガードメイン 2.3.1 ユビキタス因子(TFIIIA、Sp1など) 2.3.2 発生/細胞周期調節因子(Kruppelなど) 2.3.4 NF-6B類似結合能を有する大型因子 2.4 Cys6 cysteine-zinc cluster 2.5 Class: 交互配置型ジンクフィンガー
3 ヘリックスターンヘリックス 3.1 ホメオボックス 3.1.1 ホメオドメインのみ(Ubx) 3.1.2 POU因子(Octなど) 3.1.3 LIM領域を持つホメオドメイン 3.1.4 ジンクフィンガーを持つホメオドメイン 3.2 Paired box 3.2.1 ホメオドメインを持つPaired box 3.2.2 Paired boxのみ 3.3 Fork head/Winged helix 3.3.1 発生調節因子(forkheadなど) 3.3.2 組織特異的調節因子 3.3.3 細胞周期調節因子 3.3.0 他の調節因子 3.4 熱ショック因子(HSF) 3.4.1 HSF 3.5 トリプトファンクラスター 3.5.1 Myb 3.5.2 Etsタイプ 3.5.3 インターフェロン調節因子 3.