東日本旅客鉄道新幹線統括本部
東京新幹線運輸区 - 2021年(令和3年)3月13日、上野新幹線第二運転所と丸の内車掌区の新幹線部門が合併し改称。
仙台新幹線運輸区
盛岡新幹線運輸区
新潟新幹線運輸区
新幹線・在来線双方に業務が跨る区所(長野総合運輸区、福島統括センター、山形統括センター、秋田運輸区)については、当面は従来通り在来線所管本部・支社の管轄。
大宮新幹線保線技術センター 東京レールオフィス
宇都宮新幹線保線技術センター
郡山新幹線保線技術センター
仙台新幹線保線技術センター
北上新幹線保線技術センター
八戸新幹線保線技術センター 青森派出
高崎新幹線保線技術センター
新潟新幹線保線技術センター 長岡派出
長野新幹線保線技術センター