嵯峨野線
同時に太秦駅が開業し、単線区間であった並河駅と吉富駅に行き違い施設を設置したほか、一部の駅では一線スルー化が行われ、翌1990年3月には京都駅 - 園部駅間が電化された。しかし、国鉄再建法・国鉄分割民営化の影響等により、他の区間の複線化工事は延期された。
その後1996年に二条駅 - 花園駅間が高架化され、その地上線跡地を活用して2000年9月23日に同区間が複線化され、同時に円町駅が開業し、同日のダイヤ改正で朝ラッシュ時を中心に快速17本、普通14本を増発した。また始終着駅である京都駅のホームも1997年の駅ビル開業に合わせて改良された。
2003年からは、京都駅 - 園部駅間の全線複線化および、周辺道路の混雑解消と安全確保のために花園駅 - 嵯峨嵐山駅間の高架化工事と、嵯峨嵐山駅・亀岡駅の改良工事も同時に行われた。工事の進捗に合わせて段階的に複線化が行われ、2008年12月14日に馬堀駅 - 亀岡駅間、2009年3月14日に八木駅 - 園部駅間、同年7月20日に京都駅 - 丹波口駅間、同年9月6日には並河駅 - 八木駅間、同年11月1日には亀岡駅 - 並河駅間、2010年1月31日に丹波口駅 - 二条駅間の工事が完了し、先行して供用された。
5月25日:太秦駅 - 嵯峨嵐山駅間が高架化。 8月11日:223系5500番台の使用を開始。 12月14日:馬堀駅 - 亀岡駅間が複線化。
2009年(平成21年) 3月14日:八木駅 - 園部駅間が複線化。 7月1日:ホーム上の喫煙コーナーを廃止して全面禁煙化。 7月20日:京都駅 - 丹波口駅間が複線化。 9月6日:並河駅 - 八木駅間が複線化。 11月1日:亀岡駅 - 並河駅間が複線化。
2010年(平成22年) 1月31日:丹波口駅 - 二条駅間が複線化。 3月7日:花園駅 - 嵯峨嵐山駅間が複線化。これにより、京都駅付近除き嵯峨野線全区間が複線化。 3月13日:快速・普通の使用車両を221系に統一。 12月1日:組織改正により、京都支社の管轄から近畿統括本部の管轄に変更。
2011年(平成23年) 1月19日:京都駅 - 園部駅間でATS-P(拠点P方式)が使用開始。 3月:特急「きのさき」「はしだて」の一部で287系電車を使用開始。
2013年(平成25年)9月16日:台風18号により京都府に特別警報が発表、亀岡駅周辺で浸水、終日運休。
2015年(平成27年)3月14日:路線記号が本格導入開始。
2018年(平成30年)3月17日:各駅に駅ナンバリングが導入され、使用を開始する。
2019年(平成31年)3月16日:梅小路京都西駅が開業。
2021年(令和3年)3月:223系6000番台運行開始。「森の京都QRトレイン」も運行開始。
2022年(令和4年)6月以降:新たに223系6000番台が順次投入。
2023年(令和5年)3月18日:223系2500番台が運用開始。
JR西日本のアーバンネットワークの路線の一つである。起点の京都駅から京都市内を縦貫し、京都府中部(南丹)へと伸びている。ラインカラーは紫(■)であり、選定理由は「京の優雅さをイメージ」とされている。路線記号は E 。
観光地として人気のある嵯峨野・嵐山方面へのアクセスルートの一つで、玄関口である嵯峨嵐山駅を中心に、春・秋の行楽シーズンに多くの利用がある。保津峡の保津川下りや、保津川沿いの山陰本線(当路線)の旧線を活用した嵯峨野観光鉄道線(トロッコ嵯峨駅 - トロッコ亀岡駅)へのアクセス路線であり、保津峡駅→馬堀駅間においては、保津川でのラフティング客の帰路の足として重宝されている。さらに沿線には多くの高校・大学を抱えているほか、近年は外国人観光客等の増加により年間を通して利用客は増加傾向にある。
嵐山方面へのアクセスの競合路線としては、京都市内では京福電気鉄道(嵐電)嵐山本線や阪急嵐山線などがある。当路線の嵯峨嵐山駅に対して、京福電気鉄道の嵐山駅の方が、天龍寺や渡月橋などの嵐山の主要な観光地へのアクセスに優れる。阪急嵐山線の嵐山駅は桂川の対岸に位置していているものの、徒歩圏内である。一方で、当路線はこれらの競合路線の中で唯一、ターミナル駅である京都駅に直接乗り入れている。嵯峨野線区間全体の競争相手としては京阪京都交通(旧 京都交通)による国道9号を経由して京都市内(京都駅、阪急京都線桂駅)と亀岡およびその以西とを結ぶ路線バスなどがある。
全区間が旅客営業規則上の大都市近郊区間の「大阪近郊区間」、およびIC乗車カード「ICOCA」エリアに含まれている。