東邦丸
太平洋戦争に入ると戦時標準船が制定された。飯野海運も例外ではなかったが、飯野海運が所有した戦時標準船25隻はタンカー運航会社としての実績が考慮されたのか、全てタンカーであった。このうち、大型のTL型は1TL型と2TL型合わせて9隻が割り当てられた。そのうちの6隻は上記の「東邦丸」にあやかって全て「邦」の字が入った船名が付けられ、残る3隻は、戦前に所有していた大型タンカーのうち、その時点で喪失していたタンカーの名前が付けられた。二代の「東邦丸」はその1隻であり、他は「東亜丸」(1TL型)と「富士山丸」(2TL型)である。二代の「東邦丸」は三菱重工業長崎造船所で建造され、1944年(昭和19年)5月15日に竣工した。建造日数は122日で、内訳は起工から進水までの日数が87日、艤装工事日数が35日である。
竣工後、ただちに南方からの石油輸送に投入される。わずか2週間後の5月29日には、門司出航のヒ65船団に加入して昭南に向かった。ヒ65船団は6月2日に火焼島近海でアメリカ潜水艦「ギターロ」 (USS Guitarro, SS-363) の攻撃により海防艦「淡路」が沈没し、陸軍輸送船「有馬山丸」(三井船舶、8,697トン)と陸軍特種船「神州丸」が回避行動中に衝突するという被害を受けたが、「東邦丸」は被害なく6月11日に昭南に到着した。帰途はヒ68船団に加入。ヒ68船団は7月20日にマニラに寄港して加入船の顔ぶれを一部改めた上で7月23日に出港。11.5ノットの速力で北上したが、7月25日に至ってアメリカ潜水艦「アングラー」 (USS Angler, SS-240) 、「フラッシャー」 (USS Flasher, SS-249) および「クレヴァル」 (USS Crevalle, SS-291) からなるウルフパックの攻撃を受ける。
MO機動部隊は珊瑚海海戦を戦って戦術的には勝利したものの、損害の大きさにポートモレスビー攻略という当初の作戦目標を放棄せざるを得なかった。5月16日、「東邦丸」は一連の支援を終えてトラックに帰投した。横須賀に回航された後、再び第一航空艦隊の補給部隊に配属され、ミッドウェー海戦に参加。ミッドウェー海戦に敗れた後は北方部隊に転じて、第二機動部隊(角田覚治少将・海兵39期)の補給部隊となる。第二次ソロモン海戦にも参加して、「東栄丸」とともに第三艦隊(南雲忠一中将)への補給を行った。その後は南方の産油地と日本海軍拠点との間の燃料輸送に従事した。
1943年(昭和18年)3月29日未明、昭南(シンガポール)に向かうためマカッサル海峡を単船で南下中の「東邦丸」は、北緯00度00分00秒 東経118度18分30秒 / 北緯0.00000度 東経118.30833度 / 0.00000; 118.30833の地点に差し掛かった所で、アメリカ潜水艦「ガジョン」 (USS Gudgeon, SS-211) に発見される。「東邦丸」は2門の備砲をもって、浮上したままの「ガジョン」に対して先制攻撃を行い、砲弾は「ガジョン」からわずか50ヤード離れたところに少なくとも2発は落下したと記録された。2時33分、「ガジョン」は浮上したまま魚雷を3本発射した後、間もなく潜航して様子をうかがった。やがて2本の魚雷が命中して「東邦丸」は航行不能となるも、沈む気配は見せなかった。1時間後、「ガジョン」は4本目の魚雷を発射して船橋下に命中させたが、「東邦丸」の様子はさほど変わらなかった。そこで、二度目の攻撃から約30分後に5本目の魚雷を発射して命中させ、「ガジョン」が浮上してから15分後に「東邦丸」は沈没した。5月1日に除籍および解傭。