エルサレム王国
しかし、シャーワルは突然鞍替えし、アモーリー1世と同盟を締結し、1164年には両者はシール・クーフが立て篭もるビルベースを包囲した。その頃王国北部のアンティオキア公国がヌールッディーンの侵攻を受け、アンティオキア公ボエモン3世(英語版)・トリポリ伯レーモン3世がハリムの戦い(英語版)でヌールッディーンの軍勢に撃破されるという事件が起きたため、アモーリー・シャーワルはビルベースの包囲を解いた。ヌールッディーンはこの時アンティオキア公国を陥落させたものの、ビザンツ皇帝マヌエル1世が派遣した大規模なビザンツ軍の来襲によりアンティオキアから撤退したとみられる。1166年、ヌールッディーンは再びシール・クーフをエジプトに派遣した。この際もシャーワルは十字軍と同盟し、十字軍はアル・バベインの戦い(英語版)でシール・クーフ軍と戦った。そしてシール・クーフは十字軍を打ち負かした。しかし戦闘後シール・クーフ、十字軍ともども撤退し、シャーワルは依然十字軍と同盟を結んだまま、十字軍の駐屯兵とともにカイロに留まった。その後もアモーリーは先述のテオドラ・コムネノ(英語版)と結婚することでビザンツ帝国との同盟関係を強固なものとし、ギヨーム・ド・ティルス率いる使節団をコンスタンティノープルに派遣して軍事遠征の協力を求めて協議した。しかし協力を求めた当の本人であるアモーリーはビザンツ帝国の海軍支援を待つことなくエジプトに攻め込み、ビルベースを略奪した。
しかしカミールは、フリードリヒ帝の軍勢が小規模であることや、破門によって十字軍自体が分裂していることを認知していなかったと思われ、再び十字軍から自領を防衛することを回避したかったのだろう。フリードリヒ帝の存在だけで、十字軍は大して戦うこともなくエルサレム、ベツレヘム、ナザレとその周辺の城の奪還に成功した。そして1229年2月、フリードリヒ帝はアイユーブ朝との10年間の休戦とエルサレムのイスラム教徒の信仰の自由と引き換えに、これらの城を正式に取り戻した。しかし、エルサレム総主教ジェラルド・ローザンヌ(英語版)はこの条約を受け入れず、エルサレムに対して聖務禁止令(英語版)を発布した。3月、フリードリヒは聖墳墓教会でエルサレム王として戴冠されたが、破門と聖務禁止令の影響によりエルサレムは王国に再統合されることはなく、王国は引き続きアッコから統治された。
一方その頃イタリアでは、ローマ教皇がフリードリヒ帝が破門宣告を受けていることを口実に彼のイタリア領に侵攻を開始していた。そしてフリードリヒ帝のかつての義父ジャン・ド・ブリエンヌ率いる教皇軍がイタリア領に侵攻していたのだった。フリードリヒは自領防衛のために帰国を余儀なくされ、1229年聖地を離れた。フリードリヒ帝は 「凱旋という栄誉ではなく、アッコの市民らから投げ込まれた血肉を浴びて」 聖地を後にしたのだった。
ヨーロッパで窮地に追い込まれたフリードリヒであったが、1231年には リッカルド・フィランギェリ(英語版)を指揮官とする皇帝軍を聖地に派遣し(英語版)、ベイルートやティルスを占領させた。しかしアッコまでは制圧できなかった。ジャンの支援者はこれに対抗して、アッコにて防衛共同体(英語版)を結成し、1232年にはジャン自身を共同体の指導者に任命した。ジェノヴァ商人の協力を得たコミューンはベイルートを皇帝軍から奪還した。またジャンも1232年5月にティールを攻撃したが、カサル・インバートの戦いでフィランギェリ率いる皇帝軍に敗れ、奪還には到らなかった。
キプロスでは、キプロス王アンリ1世が1232年に成人し親政を開始できる年齢になった。そして同時に、ジャンとフィランギェリの2人は主導権を握るためにキプロスへ帰還し、同年6月15日、皇帝軍とキプロス軍はアジルディで全面衝突(英語版)した。この戦いにおいて、キプロス軍は皇帝軍を撃破し、アンリ1世は名実共にキプロス王となった。しかしイブラン家はその後もキプロス王の統治の支援を継続することとなった。その後、聖地本土ではフィランギェリがアンティオキア公ボエモン4世(英語版)、チュートン騎士団、ホスピタル騎士団、ピサ商人の支援を獲得し、対するジャンはキプロス貴族や自身の領地であるベイルート・カエサリアの住民に加え、テンプル騎士団、ジェノヴァ商人の支援を獲得して皇帝派勢力と対立した。両勢力は拮抗し、対立はその後も続いた。
元はランスやシャルトルの住民であった者はいまやティールやアンティオキアの住民になった。我々はすでに生まれ故郷を忘れ去った。我々の故地は既に我々に対して何の意味もなさない場所か、言及されない場所になり果てた
。
十字軍戦士や彼らの子孫たちはしばしばギリシャ語やアラビア語をはじめとする異国言語を習得し、ギリシャ人やシリア人・アルメニア人といった現地のキリスト教徒と結婚した。時には改宗したムスリムと結婚する者もいたという。このようにヨーロッパ人と現地民との融合は進んだものの、フランク人の公国はイスラム地域の中心にある独特の西洋植民地としてあり続けた。
第1回十字軍に参加しボードゥアン1世の下で聖職者として仕えたフーシェは1127年まで年代記の編纂を続けた。フーシェの年代記は当時の西ヨーロッパ世界で非常に広く知れ渡っていたとされ、オルデリック・ビターリス(英語版)やマームズベリのウィリアムといった年代記編者が自身の著作を編纂する際の文献として彼の年代記を用いていた。エルサレムが十字軍に占領されるや否や、占領直後から12世紀中を通じて多くの巡礼者がエルサレムを訪れ、この新しい王国に関する記録を残した。
これに対しレーモン3世、ボードゥアン・ディブランなどの貴族派はイザベルを擁立してクーデターを企てたが、イザベルの夫オンフロワ4世が寝返って失敗に終わった。
反対派を排除して権力を握ったギーは、対イスラム強硬派のルノーと組み、サラディンとの対決姿勢を強めた。1186年、休戦条約を犯してルノーはメッカへの巡礼者やキャラバンを虐殺し、残りを捕虜に取った。サラディンの捕虜解放交渉はギーとルノーに無視され、ここに休戦は破れた。レーモン3世はサラディンの圧力もありイスラム勢力との融和を計っていたが、ギーたちはレーモン3世に対してサラディンとの同盟を結んだことを責め、大司教による破門もちらつかせた。レーモン3世は屈してギーと妥協し、1187年7月4日のヒッティーンの戦いでサラディンと激突したが、十字軍は大敗し、ギー、ルノー、テンプル騎士団総長ら多くが捕虜となった。
サラディンはモンフェラート侯コンラート1世が守るティールを除くアッコ、ナビュラス、ヤッファ、トロン、シドン、ベイルート、アスカロン等を次々と落し、エルサレムに迫った。エルサレムにはバリアン・ディブラン(英語版、フランス語版)の他、わずかな騎士しかいなかったが、「聖地を異教徒に渡すより全滅した方がましだ」「必ず、神の助けがある」といった強硬論が主流を占め、サラディンの降伏勧告に従わず、住民に武装させ抵抗を行った(英語版)。しかし衆寡敵せず、間もなく降伏、1187年10月2日に開城したが、サラディンは寛大な条件を示し、身代金を払うことで市民の退去を許し、払えず奴隷になった者も多くを買い戻して解放した。
エデッサ伯国の陥落という知らせはヨーロッパ中に衝撃を与え、結果的に第2回十字軍という新たな遠征が企図される原因となった。
1148年7月、アッコにて聖地に新たに馳せ参じた十字軍諸侯たちにより軍議(英語版)が開催された。この会議でフランス王ルイ7世・神聖ローマ皇帝コンラート3世はエルサレム王ボードゥアン3世・エルサレム王国摂政メリザンド・その他の十字軍諸侯らと会談し、ブーリー朝の本拠地ダマスカスを攻撃することが取り決められた。ザンギーの死後、ザンギー朝は彼の息子らにより分割されていたためにもはやブーリー朝の脅威ではなかった。それゆえにブーリー朝はエルサレム王国ではなく、ザンギーの息子でアレッポのアミールであるヌールッディーンと同盟を結んでいた。そんなブーリー朝は数十年前にエルサレムを攻撃したことがあったため、エデッサを陥落せしめた北方のイスラム諸王朝よりも、ブーリー朝の方が最良の攻撃対象と見做されたのかもしれない。アッコ会議での取り決め通り、1148年7月24日、十字軍はダマスカス攻城を開始した。十字軍のダマスカス包囲戦は失敗に終わり、7月28日には撤退した。十字軍内に裏切り・収賄の噂が立ち、コンラート3世がエルサレム諸侯の裏切りに遭っていると思い込んだのが原因とされる。如何なる理由であれ、フランス軍とドイツ軍は自国に帰還してしまい、数年後にはダマスカスはヌールッディーンの完全なる支配下に入った。
エデッサのアルメニア人コミュニティーからの支援を受けるためであった。しかし彼らの支援の必要がなくなると、ボードゥアンはアルダを脇に追いやった。そして1113年にはシチリア王国の摂政でシチリア伯ルッジェーロ1世の未亡人 アデライデ・デル・ヴァスト(英語版)と結婚(重婚)した。しかし貴族の反対などにより1117年ごろ離婚した。アデライデとルッジェーロの息子でのちにシチリア王となるルッジェーロ2世は、アデライデに対するボードゥアンの冷たい仕打ちを忘れることはなく、その後数十年にわたってエルサレム王国が必要としていた海上における軍事支援を一切行わなかったという。
1118年、エジプト遠征の最中にボードゥアンは亡くなった。ボードゥアンには息子がおらず、エルサレム王国は彼の兄であるウスタシュ3世に譲り渡された。ボードゥアン1世やゴドフロワ・ド・ブイヨンと共に十字軍に参加していたウスタシュ3世であったが、彼はエルサレム王位に関心がなく、ボードゥアン1世の縁戚(従兄弟とも)のボードゥアン・ドュ・ブュールがボードゥアン2世としてエルサレム王に就任した。ボードゥアン2世は有能な君主であり、ファーティマ朝やセルジューク朝の侵攻を良く食い止めた。しかし1119年、エルサレム王国の属国の1つであるアンティオキア公国が アジェ・サンギニスの戦い(英語版)でアルトゥク朝に敗れて弱体化し、1122年にはボードゥアン自身がアレッポのアミールによって身柄を拘束され、1124年まで捕虜生活を送った。