都久夫須麻神社
竹生島縁起(都久夫須麻神社および宝厳寺の縁起)は、現在4種が知られている。既知で最も早期のものとしては承平1年(931年、平安時代後期)の成立と伝えられる「竹生島縁起」を収録する護国寺本『諸寺縁起集』があり、便宜上はこれを「(竹生島)承平縁起」ともいう。また、『群書類従』本には、勧進帳の前文として著されたらしい、応永21年(1414年、室町時代後期)に普文が比叡山にて旧記を集めて撰したという奥書『智福島縁起』があり、便宜上はこれを「(竹生島)応永縁起」ともいう。3つ目は、文安3年(1446年、室町時代後期前半)成立の『岩金山太神宮寺儀軌』。4つ目は貞享元年(1684年)成立の前田家旧蔵・尊経閣文庫所蔵『竹生嶋縁起』(底本は応永2年〈1395年〉作成)である。
承平縁起には、キフキオノミコト(気吹雄命。伊吹山の神格。タタミヒコノミコトと同神)と、姪にあたるアサイヒメノミコト(浅井比売命)の勢力争いについての伝承が見られ、後代の史料もこれを旧記として採用していると考えられる。
明治時代になろうという時代、新政府は国家神道の成立を図って神仏分離を推し進め、廃仏毀釈運動に発展した。竹生島権現も影響を免れ得ず、大津県庁は竹生島権現宝厳寺を廃寺にして神社としたうえで、社名を『延喜式神名帳』から採った「都久夫須麻神社」に改めるよう命じた。この指摘があるまで、都久夫須麻神社はその存在が全く忘れられてしまうほど宝厳寺の一部と化していたのである。ただし、宝厳寺は日本全国の崇敬者の強い要望によって廃寺を免れ、寺院と神社が並存することとなった。1874年(明治7年)に都久夫須麻神社と宝厳寺の境界が決められ、これまでの本堂が都久夫須麻神社の本殿となった。1883年(明治16年)には寺の財産と神社の財産が区別されて今日に至っている。現状、宝厳寺と都久夫須麻神社は別法人であるが、宝厳寺観音堂と都久夫須麻神社本殿は渡り廊下で直接連絡しており、両者はもともと不可分の関係にあることがわかる。
竹生島
享徳4年(1455年、室町時代中期) - 火災に遭う。
永禄元年(1558年) - 本堂を火災で焼失。
永禄10年(1567年) - 本堂の再建。
慶長7年(1602年) - 豊臣秀頼が木幡山伏見城にあった勅使殿「日暮御殿」の一部を竹生島弁財天社に移築・寄進し、本堂の永禄10年再建分に追加する外周部として利用される。これにより現存する都久夫須麻神社本殿の形が完成した。