吉祥寺駅
JR東日本の中央本線と、京王電鉄の井の頭線が乗り入れ、接続駅となっている。
JR東日本:各線(後述)
京王電鉄: 井の頭線 - 駅番号「IN17」
JR東日本の駅に乗り入れている路線は、線路名称上は中央本線のみであるが、一般列車の運転系統としては、急行線を走る中央線快速電車および緩行線を走る中央・総武線各駅停車の2系統が停車する。加えて成田空港駅へ直通する特急「成田エクスプレス」が停車する。
中央線(快速):急行線を走行する中央本線の近距離電車。八王子駅・高尾駅方面の列車の他に、立川駅から青梅線へ直通する列車も運行 - 駅番号「JC 11」
中央・総武線(各駅停車):緩行線を走行する中央本線の近距離電車。新宿駅を経由する中央・総武線の他に、中野駅から地下鉄東西線へ直通する列車も運行。東京メトロ東西線直通列車は西船橋駅から東葉高速線への直通運転を行っている他、平日の朝夕ラッシュ時のみ津田沼駅まで総武線(各駅停車)への直通も行っている。 - 駅番号「JB 02」
京王井の頭線は当駅を終点としている。
南北に自由通路があり、行き来ができる。
以下のバスの発着以外にも路線バスの降車専用停留所にもなっている。停車するのは小田急バスと京王バスの公園口から発車する便で、吉03は終日、宿44の一部の便、また、それ以外の便でも夕方以降はすべて中央口に到着する。なお、小田急バスの中央口に到着するバスの行先は「吉祥寺駅中央口」に設定されている。
井の頭線 ■急行 久我山駅 (IN14) - 吉祥寺駅 (IN17) ■各駅停車 井の頭公園駅 (IN16) - 吉祥寺駅 (IN17) 沿線でのイベントなどの開催時には、通常の隣の停車駅との間にある以下の駅に停車することがある。 花見シーズンの土曜・休日には、一部の急行が井の頭公園駅に臨時停車する。