瑞泉寺 (京都市)
文禄4年(1595年)7月、秀次は叔父豊臣秀吉から謀反を疑われ関白の職を剥がれて高野山に追放され、7月15日(8月20日)に賜死を命じられて切腹して果てた。山本主殿、山田三十郎、不破万作など家臣5人もまた殉死した。
秀吉は伏見で首実検をすると、8月2日(9月5日)に秀次の首を三条河原で梟首とした。その時に秀次の妻妾と子供など合わせて39名を打ち首にしている。彼女らの遺体は秀次の首とともに河原に埋められ、塚、石塔が建てられた。秀次の首が納められた石櫃は塚の上に置かれ、「秀次悪逆塚文禄四年七月十四日」と刻まれたという。この塚は、殺生塚、関白塚、摂政塚、畜生塚などと称され、かえりみる者は無かったが、慶順という行者が、そのかたわらに草庵を結び、菩提を弔った。
慶順の死後、鴨川の洪水で塚が荒れた後、角倉了以が石櫃を発見した。了以はその際に石櫃の「秀次悪逆」の4文字を削り取ると、その上に六角形の無縁塔を建てた。このような経緯から秀次供養塔は「秀次悪逆塚」ともいうが、現在も碑銘の削られた姿で残る。
豊臣秀次と母とも(智、法名日秀)の墓所は、善正寺にある。瑞泉寺は秀次の首塚の跡の供養と、その一族・家臣の墓所である。また三条河原で処刑された側室らは大雲院でも供養されたという記述があり、2014年(平成26年)に石材の一部が発見された。
毎年命日の7月15日に、善正寺とかつて秀次の居城・八幡山城があった滋賀県近江八幡市の八幡山にある瑞龍寺の住職により、瑞龍寺で秀次の供養が行われている。