ウプサラの神殿
研究者が神殿に関して主に論争し確定しようとするのは、神殿が現在のガムラ・ウプサラのどの辺りに位置していたか、そしてそれが建物であったかどうかといった点である。 研究者の一部は、神殿がスウェーデンの王の住居と混同されていると考えている(しかしそれは北方に何十メートルも離れている)。 その異教の儀式活動の場になった神殿や他の遺跡の上に、しばしばそうであるように、キリスト教の教会が建設された。
12世紀に現在ある石造りのガムラ・ウプサラ教会が建ったが、それ以前の、11世紀には木造の教会が、10世紀には何か建築物があった。1926年、スーネ・リンドクヴィストが、現在ある教会の床下を調査したところ、まず木造教会の址を発見した。さらにその下のヴァイキング時代の地層に柱の穴(en)の列を発見し、推定できた建造物址の独特の形状から、この穴の列がウプサラの神殿の址だと推測した。しかし1967年、シェル・クムリエンが、過去に火災によって失われた史料を断片的な情報から復元したところ、12世紀前半から13世紀後半における、現在の教会とそれ以前にあった木造の教会、およびウプサラの神殿の位置関係が判明した。その史料によると、現在の教会はウプサラの神殿址の上にあるのではないと考えられた。そのためリンドクヴィストは、自分が発見した穴の列が別の神殿の址である可能性も挙げた。しかし、クムリエンが根拠にした史料もリンドクヴィストの調査結果も、研究者からその信頼性を疑問視されることがある。
2003年と2004年に、地中レーダー探査装置を使った科学的調査が行なわれた。そして、現在建っている教会のちょうど真下に、11世紀にあった3つの木造のフェイスティング・ホール(en)の少なくとも1つの残骸を発見している 。