菌根
宿主植物と菌根菌との種特異性は低く、ある植物には複数のグロムス菌が共生可能であり、またあるグロムス類はさまざまな植物と共生する。
植物ホルモンであるストリゴラクトンはグロムス類を誘引し、グロムス類が分泌する Mycファクター(リポキチンオリゴサッカロイド, LCO)を植物側が認識する。グロムス類は植物からグルコースや脂質を取り込み、無機栄養分(特にリン)や水を供給する。また、病害や環境ストレスへの抵抗性を高めることもある。このようにアーバスキュラー菌根における植物と菌根菌の関係は基本的に相利共生であるが、ホンゴウソウ科やヒナノシャクジョウ科の植物は光合成能を欠く菌従属栄養植物であり、アーバスキュラー菌根菌を介して別の植物の光合成産物を得ている。また、ヒカゲノカズラ目(小葉類)の一部やマツバラン目、ハナヤスリ目(ハナヤスリ亜綱)の配偶体(前葉体)も光合成能を欠き、アーバスキュラー菌根菌を介して栄養を得る菌従属栄養性である。これらは胞子体になると自身で光合成を行うが、サクラジマハナヤスリでは光合成を行う胞子体になっても菌根菌から炭素源を得る部分的菌従属栄養植物であることが明らかとなっている。
アーバスキュラー菌根(arbuscular mycorrhiza, AM)では、根から菌糸が伸びているが、根の外見はほとんど変化していない(下図3b)。菌根菌は根の細胞内に侵入し、栄養交換用の構造として細かく分枝した樹枝状体(アーバスキュル、arbuscule)をつくる(下図3a, c)。また、ときに栄養貯蔵用の構造として丸く膨らんだ嚢状体(ベシクル、vesicle)を形成する(下図3a, c)。このため古くはVA菌根(vesicular-arbuscular mycorrhiza)とよばれていたが、嚢状体を形成しないこともあるため、2022年現在ではふつうアーバスキュラー菌根とよばれる。最も普遍的な菌根であり、維管束植物の約80%に見られるともされる。維管束植物の胞子体(通常時の体)だけではなく、シダ植物の配偶体(前葉体)やコケ植物もアーバスキュラー菌根に相当する構造が見られる。菌根菌は接合菌に分類されていたグロムス類(グロムス門またはケカビ門グロムス亜門)であり、この菌類は植物と共生しなければ生きられない絶対共生性である。ただし系統的にやや異なるケカビ亜門のアツギケカビ類も類似した菌根を形成することがあり、これと混同されていることもある(#ファインエンドファイトを参照)。