南硫黄島原生自然環境保全地域
2007年の調査では、シロハラミズナギドリは標高400メートルから山頂付近まで、クロウミツバメは標高700メートル以上、セグロミズナギドリは標高800メートル 以上で確認された。1982年の調査ではシロハラミズナギドリとクロウミツバメは標高750メートルを境に住み分けがなされているとされており、シロハラミズナギドリの営巣地が25年の間に拡大した可能性が指摘されている。
シロハラミズナギドリは北西ハワイ諸島と小笠原諸島のみで繁殖が確認されており、戦前には小笠原諸島の5つの島、戦後は南硫黄島と北之島で繁殖が確認されているが、1978年以降北之島で確実な繁殖が報告されておらず、南硫黄島の繁殖地は全世界的に見ても貴重である。2007年の調査によれば南硫黄島では推定数万から数十万のつがいに及ぶ多数のシロハラミズナギドリの繁殖が確認されている。セグロミズナギドリは2007年の調査でも繁殖の実態がはっきりせず、繁殖数も6,000つがい程度ではないかとの推定がなされているのみであるが、ほかに確認されている繁殖地が父島列島の東島のみであり、南硫黄島の繁殖地はやはり貴重であると言える。そしてクロウミツバメは戦前、北硫黄島での繁殖が確認されているが戦後は繁殖が確認されていない。これはクマネズミによる食害の影響によるものと推定されている。そのため現在確認されているクロウミツバメの繁殖地は全世界で南硫黄島のみである。南硫黄島での繁殖つがいは数万から10万程度と推定されているが、確認されている全世界で唯一の繁殖地である南硫黄島の重要性はきわめて高い。
南硫黄島では生息する海鳥の数がきわめて多く、海岸部から山頂にかけて多くの海鳥に埋め尽くされている。
南硫黄島で生息が確認されている哺乳類は、オガサワラオオコウモリのみである。ほかに小型の翼手類やネズミ類の存在も想定されたが、1982年、2007年の調査ではオガサワラオオコウモリ以外の哺乳類の生息は確認されなかった。