日本学生野球憲章
また社会人野球のチームでもプロ野球選手経験者、あるいはタレントが関与しているチームとの対戦も禁じられている(その項参照)。
なお、高等専修学校や専門学校は、学生野球憲章における学校に定義付けられていない。
全国高等学校定時制通信制軟式野球大会を開催する全国高等学校定時制通信制軟式野球連盟・東京六大学野球連盟所属大学の通常の野球部への参加が困難な理工系学部などの大学生によって組織されている東京六大学理工系野球連盟・女子による学生野球の統括団体(全日本大学女子野球連盟・全国高等学校女子硬式野球連盟)は、日本学生野球協会の傘下に入らず、学生野球憲章の適用も受けていない。
関西独立リーグ (2代目)(旧・BASEBALL FIRST LEAGUE)が下部組織として高等学校・大学に組織している野球部は日本学生野球協会に非所属のため、学生野球の試合に参加できない代わりに、元プロ選手による直接指導が行われているが、このことが原因で、社会人野球の統括団体である日本野球連盟との間で軋轢が生じ、同連盟との協定書が締結できず、日本独立リーグ野球機構にも加盟できなかった。このため、退団選手の取り扱いについても、機構加盟リーグとの格差が設けられている。
広島東洋カープが、一時球団としての直接的な地域貢献活動に消極的な姿勢を取り、広島県における地域密着型異競技連携組織『トップス広島』への加入が他競技の団体より遅れたことも、球団の財政状況の他に憲章が関係したとされている。