週刊ポケモン放送局
2002年12月よりサトシと関わりがある人物を主役とした『ポケットモンスター サイドストーリー』という新作アニメが全18話放送された。同時期に放送されていた『アドバンスジェネレーション』シリーズとリンクしている部分が見られる。
主役となるキャラクターはタケシ(1話)、カスミ(2話、5話、11話、16話)、ムサシ・コジロウ・ニャース(3話、12話)、オーキド博士(4話、14話、15話)、ケンジ(4話、8話、14話、15話)、ヒロシ(8話、13話、18話)、シゲル(15話)、ナナコ(17話)。6話、7話、9話、10話はピチュー兄弟が住んでいるミレニアムタウンが舞台になっている。ムサシ・コジロウ・ニャースがホウエン地方に赴いているため、ヤマトとコサブロウが悪役として高頻度で登場する。本編の主人公であるサトシやピカチュウなどがほとんど登場しないのは本作が初となる。