ヤマアラシ科
以前は形態からフサオヤマアラシ亜科とヤマアラシ亜科の2群に分けられていたが、のちの分類体系では認められておらず、2017年に発表された分子系統解析でも支持されていない。
ボルネオヤマアラシなど3種からなるインドネシアヤマアラシ属Thecurusを認める説もあるが、ヤマアラシ属の亜属とする説もある。ミトコンドリアDNAシクロトムb遺伝子の分子系統解析では、ボルネオヤマアラシがヤマアラシ属の内群に含まれるという結果が得られている。