西九州新幹線
列車内で駅到着時の案内放送で流される車内メロディや、各駅の発車メロディは九州新幹線と同じく向谷実作曲のものが使用される。
JR九州の公式YouTubeチャンネルにて、車内メロディ・各駅の発車メロディが開業に先行して公開された。
整備計画上の路線名と実際に旅客案内等で用いられる路線名の関係は下表の通り。なお、これは原則として、旅客列車の運行形態とは無関係である。
2008年(平成20年)3月26日には、同省内で新幹線の採算性などについての精査が終わり工事着工が認可された。佐賀・長崎両県は、2007年度内に着工認可が下りることを前提に2007年度補正予算案並びに2008年度本予算案に建設費を計上した。
これに対し、2008年(平成20年)2月24日に投開票された江北町長選挙では、新幹線着工反対を訴えた現職の田中源一が、新幹線容認派で新人の元県職員を破って5選を果たし、「選挙結果が(町民による)最大の意思表示」として町として改めて新幹線の着工に反対を表明した一方で、「着工が決まれば現実的に受け止めなければならない」と現実的対応も示唆した。2008年(平成20年)3月には、佐賀県議会において、民主・社民系会派等の共同提案により長崎新幹線の建設賛否を問う県民投票を実施する条例案が提出されたが、最大会派の自民党・公明党ならびに保守系会派の反対多数で否決された。田中はその後のシンポジウムの席上で「本格着工までは(新幹線建設への)反対を続ける」と明言した。着工後も、田中は「今も個人的には反対だ」とした。
一方、鹿島市長の桑原允彦はJR長崎本線経営分離反対運動を終息させるとした。そのため、2011年(平成23年)9月時点、関係する自治体の首長で公式に長崎新幹線建設反対の立場を取っているのは江北町長の田中ただ一人となった。また、民主党政権への交代後にフリーゲージトレインへの国費投入についてもいわゆる「事業仕分け」の対象となり、検討が行われたが、条件付きで継続となった。
かもめ 従前の在来線特急「かもめ」は博多駅 - 武雄温泉駅間の「リレーかもめ」に改称した。 全列車が「かもめ」であるため、N700Sの行先表示器の識別カラーについては列車名としての特定の色ではなく、3種類に分かれている。開業当初はブルーが各駅停車の場合に使用、レッドが1駅でも通過する場合に使用、イエローは未使用(未定義)となっていたが、後にレッドが嬉野温泉駅のみ通過する場合に使用、イエローが嬉野温泉・新大村駅を通過する場合に使用となった。 かつて新八代駅で接続していた「つばめ」「リレーつばめ」と同様、武雄温泉駅で博多方面の「リレーかもめ」等のリレー特急に接続する上り列車は「博多行き」と行先を表示する。武雄温泉駅で門司港行きリレーかもめ64号に接続する長崎22時10分発のかもめ64号も、車両側では「博多行き」と表示する(これに接続するリレーかもめ64号は「門司港行き」と表示する)。 熊本総合車両所大村車両管理室(大村車両基地)に入出庫するため、101 - 103号は新大村駅発着となる。それ以外の全列車は武雄温泉駅発着となり、いずれもリレー特急に接続するので行先を「武雄温泉行き」と表示する列車は存在しない。 「かもめ」と「リレーかもめ」は事実上の同一列車となっている。このため、遅れが発生した場合は接続先列車の発車も遅らせることで接続するようになっている(大幅な遅れ発生時は接続しない場合がある)。