上野市駅
1916年(大正5年)8月8日:開業。上野駅連絡所(現・伊賀上野駅) - 上野町駅間開通に伴う開業で、当時の駅名は上野町駅であった。この時点の路線名は「伊賀軌道」であった。
1917年(大正6年)12月20日:社名変更により伊賀鉄道(旧)の駅となった。
1922年(大正11年)7月18日:伊賀鉄道の上野町駅 - 西名張駅間の開業により途中駅となった。
1926年(大正15年)12月19日:社名変更により伊賀電気鉄道の駅となった。
1929年(昭和4年)3月31日:会社合併により大阪電気軌道伊賀線の駅となった。
1931年(昭和6年)9月26日:路線譲渡により、当駅も参宮急行電鉄へ譲渡。
1941年(昭和16年) 3月15日:大阪電気軌道が参宮急行電鉄を合併、新発足した関西急行鉄道へ移管。 9月10日:上野市駅に改称。
1944年(昭和19年)6月1日:太平洋戦争下の戦時合併により関西急行鉄道が近畿日本鉄道に改組され、同社へ移管。
1973年(昭和48年)10月1日:貨物営業廃止。
2002年(平成14年):第4回中部の駅百選に選定された。
2007年(平成19年)10月1日:経営分離により伊賀鉄道(新)へ移管。
2017年(平成29年)4月1日:伊賀線の公有民営化により近鉄から伊賀市へ譲渡。
2019年(平成31年) 2月22日:伊賀市が「忍者市駅」を愛称として駅舎に併記。 2月27日:多言語対応の自動券売機を導入。
2020年(令和2年)7月17日:駅舎が国の登録有形文化財に答申される。
2021年(令和3年)2月4日:駅舎が国の登録有形文化財に登録される。
■伊賀線 西大手駅 - 上野市駅 - 広小路駅
近年における当駅の1日乗降人員の調査結果は以下の通りで、伊賀鉄道の駅では伊賀神戸駅に次いで利用者数は2番目に多い。
2015年11月10日:1,718人(乗車:998人、降車:720人)
2015年11月10日:1,828人(乗車:1,018人、降車:810人)
2012年11月13日:1,760人(乗車:847人、降車:913人)
2010年11月9日:1,901人
2008年11月14日:2,065人
2005年11月8日:2,540人(当時近鉄伊賀線)