オニイトマキエイ
以前は本種のみで、オニイトマキエイ属Mantaを構成するとされていた。2009年にシノニムとされていたManta alfrediを復活する説が提唱された。2010年に本種およびM. alfrediはどちらも日本近海で確認例があること・日本国内の3施設(エプソン品川アクアスタジアム・沖縄美ら海水族館・海遊館)で飼育されていたオニイトマキエイ類8頭が全てM. alfrediであることが判明し、M. alfrediに対する和名としてナンヨウマンタが提唱された。2017年に発表されたミトコンドリアDNAと核DNAの分子系統解析ではイトマキエイ属がオニイトマキエイ属を含まない偽系統群という解析結果が得られたため、イトマキエイ属にオニイトマキエイ属を含む説が提唱された。一方でFishes of the world 5th editionではオニイトマキエイ属を認め、オニイトマキエイ属とイトマキエイ属をトビエイ科に分類している。
成体のオニイトマキエイは体格が大きいためほとんど天敵がおらず、ホホジロザメやヒラシュモクザメ、イタチザメなどの大型のサメや、オキゴンドウやシャチのような鯨類でも襲ってこない限り、捕食される心配はない。また、鰭に噛み付いたり群れの中でメスをオスが追いかけ回して求愛行動をするため鰭先にオスの噛み跡があるメス個体も多く確認されている。
他のイトマキエイ属と同様に繁殖は卵胎生で、一度に1 - 2尾の子どもを産む。 妊娠期間は13か月前後で、子は子宮内で未受精卵や脂質子宮液「ミルク」を栄養源に成長し、総排出腔から出産をする。産まれたときすでに体盤幅1m1.5m - 1.2m、体重50kg前後の大きさがある。その後も急激に成長し、およそ10年〜20年で成熟する。寿命は20年以上と見積もられているが50年以上、もしくは100年以上という主張もあるため詳しくはわかっていない。
脳化指数が高く、魚類の中では最も知能が発達した種の一つと考えられている。脳重量はジンベエザメのおおよそ10倍あり、魚類や変温動物の中では最大級の脳の質量と対比をしている。 2016年の実験で行われたミラーテストでは鏡に向かって回転や反復行動などの反応を示した。この事から鏡像を他の個体と識別していなかったとされ鏡像認知能力を持つ可能性が非常に高いとされている。