東京メトロ東西線
一部の時間帯をのぞき、快速1本(朝のみ2本・通快含む)に対して2本であり、朝と夕方は3 - 5分間隔、日中は約5 - 8分間隔で運行されている。日中は1時間に8本のうち4本が中央線に乗り入れて三鷹駅 - 西船橋駅間で運転、残りの4本が中野駅 - 西船橋駅間での運転となる。ラッシュ時には東葉高速線や総武線津田沼駅発着の列車も運行されるほか、九段下駅(着のみ)・東陽町駅・浦安駅(2019年3月18日以降発のみ新設)・妙典駅発着の列車もある。日中は快速に抜かれない列車もある反面、夕方に1本、葛西と妙典の2駅で快速に抜かれる列車もある。
霊岸橋 - 永代橋間(茅場町駅から門前仲町駅方面に約430 m向かった地点)ではトンネルを急速に浅くさせて「峠」を造り、その頂点にトンネルの全断面を閉鎖する「防水扉」(防水ゲート・新川防水扉)を設置。
隅田川以東の駅間トンネルならびに駅構内の換気は、歩道に通風口を設ける自然換気方式から地上用地に換気塔を設けて機械装置による機械換気方式に変更。
深川車庫及び南砂町駅付近のトンネル坑口周囲に東京湾平均海面 +4.5 mの防水壁を設置。
地上出入口を歩道より高くし、出入口に止水板および防水扉を設置(門前仲町 - 南砂町間の各駅)。
東陽町駅駅本屋(出口1番)の1階部の開口部にすべて防水扉を設置、駅間の換気塔にも防水扉を設置。
地上区間の高架下には葛西・行徳・西船橋の3か所の変電所を設置しているが、床面は約1.5 mの高床構造とし、機器搬入口には防水扉を設置、点検用の出入口は高所から出入りする構造とした。
12月23日:高田馬場 - 九段下間 (4.8 km) 開業。5000系営業運転開始。3両編成で終日5分間隔運転を行った。
1965年(昭和40年)6月9日:第5号線南砂町 - 山野町間(東陽町駅 - 西船橋駅間)の路線免許を取得。
1966年(昭和41年) 2月1日:7両編成の運転を開始。 3月16日:中野 - 高田馬場間 (3.9 km)・九段下 - 竹橋間 (1.0 km) 開業。後者は竹橋駅に折り返し設備がないことから、九段下駅の中野駅寄りにある両渡り分岐器を使用して、単線並列運転を行った。終日5分間隔運転を行った。 4月28日:国鉄中央本線荻窪駅まで直通運転開始(当初は営団からの片乗り入れ)。 10月1日:竹橋 - 大手町間 (1.0 km) 開業。国鉄301系が投入され相互直通運転開始。終日5分間隔運転を行った。この区間は5月の開業予定であったが、東京オリンピック開催の影響で建設工事が遅延したため、10月に繰り下げられた。 12月7日:東陽町 - 西船橋間 (15.0 km) 起工式。
1967年(昭和42年) 9月14日:大手町 - 東陽町間 (5.1 km) 開業。朝夕混雑時は2分30秒間隔、それ以外は5分間隔で運転した。この区間は大手町 - 茅場町、茅場町 - 東陽町へ順次延伸開業する予定であった。しかし、大手町 - 日本橋間の国鉄線横断部が難工事であり、苦肉の策として同年8月に日本橋 - 東陽町間を先行開業させ、12月に大手町 - 日本橋間を開業させる計画となっていた。その後、国鉄線横断部は突貫工事を行うことで、計画を前倒した同年9月の東陽町までの一括開業に間に合わせた。