全日本空手道連盟
一般財団法人国際空手道連盟極真会館
協力団体は一流派一団体のみ加入という原則がある。各流派が流派全体を統括する団体を作りJKFに加盟している。 なお、松濤館流の場合はこれまで日本空手協会となっていたが、天皇杯・皇后杯の下賜を巡り全空連と対立、2014年3月に除名処分となる。 2014年6月にJKF主導で組織された全日本空手道松涛館が新たに協力団体として承認され、翌7月にはJKFホームページに掲載された。 しかし、2014年10月24日に東京地方裁判所より日本空手協会が協力団体の地位にある仮処分が決定した。 その後2014年11月12日の理事会において協力関係解消を改めて決議するも、2016年3月16日、和解の上、訴訟取り消し後に改めて協力関係を結ぶ旨が全空連・空手協会双方から発表される。 また、フルコンタクトルールを採用する団体とは、友好団体として協力する覚書を交わした。
林派糸東流会
国際玄制流空手道連盟武徳会
日本空手道道場会
全日本空手道一友会
全日本空手道剛柔会
国際松濤館空手道連盟
沖縄劉衛流
日本空手道糸洲会
糸東流修交会空手道連合
草野派糸東流拳法空手道会
国際沖縄剛柔流空手道連盟
TSUWAMONO
日本空手松涛連盟
日本空手道制護会