プロクロロン
プロクロロンは単細胞球形、直径7–25マイクロメートル (μm)、緑色をしている。チラコイドは重なってラメラを形成し、細胞中で同心円状またはやや不規則に配置している。チラコイドの一部が膨潤して液胞状になることがある。液胞状構造の分布様式や特異な顆粒の有無には以下のようなタイプがあり、宿主内での共生部位と対応していることが報告されている
グループI:細胞中に多数の小さな液胞状構造が存在する(ホヤの表面または被嚢中に見られる)
グループII:細胞中央に1個の大きな液胞状構造が存在する(総排出腔に見られる)
グループIII:特異な顆粒を多数含む(チャツボボヤの総排出腔のみ)
二分裂によって増殖する。
クロロフィル a に加えてクロロフィル b をもつ。プロクロロンにおけるクロロフィル b 結合タンパク質は Pcb であり、緑色植物がもつ LHC とは異なる。またクロロフィル c 類似色素であるジビニルプロトクロロフィリド (Mg-3,8-divinyl pheoporphyrin a5 monomethyl ester; MgDVP) をもつ。フィコビリンをもたず、チラコイド表面にはフィコビリソームが存在しない。カロテノイドとして、ゼアキサンチンとβ-カロテンが存在する。