アブグレイブ刑務所における捕虜虐待
米ブッシュ大統領は「一部の者たちの行為は、軍全体の行動を反映するものではない」と主張して組織的関与を否定したが、アラブ連盟事務局長は戦争犯罪と非難。さらに5月5日には、ブッシュ大統領は「不快感を持っていることを知ってほしい」と個人的な感想を述べたが、同時に「民主主義は完全なものではない」とも言い、謝罪はなかった。
また、ハーシュの記事では、虐待を行ったとして、最終的に禁固8年の上、不名誉除隊に処せられたイヴァン・フレデリック軍曹が、家族への手紙やメールで、アブグレイブ刑務所内でCIA職員や民間の軍事企業の社員を含む軍情報チームが支配的であると語っていたことも述べられている。
2月の内部調査報告書をまとめたアントニオ・タグーバ少将は、5月11日、米議会の上院軍事委員会の公聴会に呼ばれた際に、アブグレイブでの虐待に軍の情報部門が関与している証拠を集めたと述べ、少将が行った刑務所の運営方法に関する調査だけでなく、情報収集や尋問方法に関する調査を別途行うよう勧告したことを明らかにした。少将は2007年1月1日に退役を余儀なくされた後、米軍による虐待に関する活動を行っている。
5月7日に議会で宣誓の上、「アブグレイブであのようなことが起きているとは知らなかった」との証言を行ったラムズフェルド国防長官は、その前日の6日にタグバ少将を呼び出した際、報告書のリーク元について特に気にしており、心当たりはないかと質問していたという。
2005年3月8日、AP通信は米軍はこの刑務所を手放すらしいと報じた。だが、これは当分の間は行われなかった。AP通信などは、2005年4月2日夕方に「イラク聖戦アルカイダ組織」の武装グループ40-60人が刑務所を攻撃し、少なくとも米兵44人と収容者13人が負傷したと報じる。
2006年2月15日、オーストラリアのSBSテレビはイラク人に対して行われた拷問、暴行を示す新たな写真や映像を公開したが、SBSは「露骨すぎて放映できないものもあった」として一部の性的虐待の写真の放映を見送った。
米政府は2006年3月9日、アブグレイブ刑務所に拘束している約4500人の収容者をバグダッド空港近くに新設する収容所に移し、2~3か月以内にイラク政府に移管と発表した。しかしこれも時間がかかった。「イスラム・メモ」は2006年7月25日昼12時30分の速報で獄中9ヶ月になる女性収容者が謎の死をとげたと報じ、イスラム・メモ通信員は、アブグレイブでは毎月4、5人の収容者が死んでいると伝えた。
2006年8月29日、英紙タイムズはイラクの人権省幹部の話を伝え、米軍は2006年8月15日に最後の収容者をバグダッド国際空港近くに新設された施設に移送し、旧アブグレイブ刑務所をイラク側に返還したと伝える。