南禅寺
方丈前庭「虎の子渡しの庭」(国の名勝) - 方丈の前にある枯山水庭園は小堀遠州の作といわれる。
小方丈庭園「如心庭」 - 1966年(昭和41年)に当時の管長柴山全慶老師による作庭。
庭園「蓬莱神仙庭」
庭園「六道庭」
庭園「鳴滝庭」
庭園「還源庭」
庭園「華厳庭」
土蔵
茶室「不識庵」 - 1954年(昭和29年)に茶道宗徧流8世山田宗有宗匠から寄進。
庭園「龍吟庭」
茶室「窮心亭(きゅうしんてい)」 - 1968年(昭和43年)に宗徧流一門から寄進。
龍渕閣 - 坐禅会などが行われる。
本坊 庫裏 大玄関 書院
瑞宝殿 - 収蔵庫。
琵琶湖疏水「水路閣」 - 1888年(明治21年)築。レンガ造りのアーチ橋。写真撮影の有名なスポットでもある。
鐘楼 - 塔頭・南禅院と琵琶湖疎水の横の高台にある。
三門(重要文化財) - 歌舞伎の『楼門五三桐』(さんもんごさんのきり)の二幕目返しで石川五右衛門が「絶景かな!絶景かな!」という名科白を廻す「南禅寺山門」がこれである。ただし実際の三門は五右衛門の死後30年以上経った寛永5年(1628年)に、津藩主・藤堂高虎が大坂夏の陣で戦死した一門の武士たちの冥福を祈るために寄進したものである。別名「天下竜門」と呼ばれる。創建当時の三門は永仁3年(1295年)に西園寺実兼の寄進によって建てられたものだが、応安年間(1368年 - 1375年)に新たな三門へ建て替えられた。
湯豆腐は南禅寺周辺参道の精進料理が起源とされている。
山形県酒田市、鶴岡市では「南禅寺豆腐」というほぼ半球の形をした豆腐が名産。江戸時代に北前船に乗って京都から西廻り航路で伝わったといわれている。5月から8月中旬までの間の期間限定販売。