和学講談所
保己一の死(1821年)の後、和学講談所は子の忠宝に継承された。出版事業は停滞するも、講談会、「史料」「武家名目抄」の編纂が続けられた。幕末の1863年、忠宝が尊攘派(伊藤博文、山尾庸三とされる)によって暗殺された。忠宝の子・忠韶が跡を継いだが、「史料」の編纂事業も停止し、江戸幕府が崩壊した1868年(慶応4年)には和学講談所も廃止された。
1869年(明治2年)、新政府によって講談所跡に史料編輯国史校正局が設置された。和学講談所の蔵書は正院、修史局を経て東京大学史料編纂所に引き継がれた。史料編纂事業は『大日本史料』の編纂と刊行という形で継承されている。
1978年、「群書類従」の版木は浅草文庫に移され、その後内務省などを経て帝国大学に移管された。忘れられた存在だった版木は1909年に発見された。その後保己一の曾孫にあたる塙忠雄らによって温故学会が設立され、帝国大学から版木が下付された。