九十九里鉄道
また、2011年になって小湊鉄道からいすゞ自動車製の高速路線車、三菱ふそう製の貸切車(いずれも車体は富士重工業製を架装)が移籍し、長きにわたった日産ディーゼル製車両での統一が崩れた。2013年には急行バス用としていすゞ・エルガを、2015年には貸切車として三菱ふそう・エアロエース、2017年には高速車としていすゞ・ガーラをそれぞれ新車で導入した。
2018年からは、自社発注の急行路線用車両(トップドア仕様・西日本車体工業製ボディーの日産ディーゼル・UA/RA)を小湊鉄道に移籍させる代わりに、同社からハイデッカー車両(高速車)を譲受して自社の急行路線用車両を更新している。その過程で日野・セレガが1台移籍し、国産4メーカーの車両が揃うこととなった。また、九十九里から小湊へ移籍した車両は、主にスクールバスや企業送迎用として活躍している。
小湊鉄道の車両と異なり、九十九里鉄道の車両には車番がある。一般路線車については3桁の車番となっており、自社発注車は西暦年の下2桁+個別の番号1桁〈例:871(1987年導入)、911(1991年導入)など〉、小湊鉄道からの移籍車は移籍された年の和暦+個別の番号1桁〈例:211(平成21年=2009年移籍)、281(平成28年=2016年移籍)など〉で表されている。高速路線車や貸切車は現在は4桁の車番となっており、導入された年の和暦+個別の番号2桁〈例:1601(平成16年=2004年導入)、2501(平成25年=2013年導入)など〉で表されている。平成1桁の時代に導入された車両では、「301」など3桁の車番を持っていたものもあった。
コミュニティバスなど一部を除き、車両のメーカーは日産ディーゼル工業(現・UDトラックス)製が多数を占め、以前は同社製車両でほぼ統一されていた。
かつての小湊鉄道と同じく富士重工業製車体を架装した車両が多くなっている。富士重工業のバスボデー架装事業撤退後に導入された車両(貸切バスや急行路線バス用車両)では西日本車体工業製の車体を架装している。なお、路線車については1993年を最後に自社発注車の導入を中止し、その置き換えを目的に小湊鉄道から移籍した日産ディーゼル製車両も存在しており、現在では小湊鉄道からの移籍車が主力になっている。小湊鉄道の営業所のうち、塩田営業所管内と当社管内は同じ千葉ナンバーのため、ナンバーを変更せずに使用されている車両も存在する。小湊鉄道と異なり、当社のバス乗降方式は前乗り・前降り方式で、交通系ICカードは利用できないため、移籍車は後扉の整理券発行機を前扉に移設し、ICカードリーダーを撤去する改造を行っている。
以前は自社発注車、小湊鉄道からの移籍車ともに全車がツーステップ車であったが、2016年に小湊鉄道から移籍した281号車(西日本車体工業製ボディーの日産ディーゼル・UA)が九十九里鉄道初のワンステップ車、2017年に西武バスから移籍した291号車(西日本車体工業製ボディーの日産ディーゼル・UA)は九十九里鉄道初のノンステップ車となっており、車両の代替とともにバリアフリー化が行われている。
千葉東金道路を経由する。
2013年3月31日限りで、共同運行していたちばフラワーバスが同路線から撤退。翌4月1日にダイヤ改正を実施。九十九里鉄道の単独運行となる。京成千葉中央駅での降車扱いを廃止、また同路線の起・終点を、八坂台一・二丁目から東金駅西口に変更。同時に、一部便がレイクサイドヒル地区 東金駅西口経由 片貝駅始終着となった。
急行 蓮沼ウォーターガーデン線
直行 :JR千葉駅 - (無停車) - 蓮沼ウォーターガーデン
蓮沼ウォーターガーデンの営業期間(7月中旬 - 9月中旬)に限って運行される臨時の直行バス。乗車するには小湊鉄道バス千葉駅案内所にて事前にチケットを購入する必要がある。尚、九十九里ライナーの予約人数によっては、千葉駅を同刻に発車する九十九里ライナーと統合され、運休となる場合がある。
岩井町営軌道が当局に無認可で新造していた半鋼製両運転台気動車キハ104を、同線休止後の1944年に譲受、キハ301として入線させたもの。岩井町営の「モグリ」車両であることは戦時中の混乱に紛れて露見しなかった模様。1944年12月に提出された申請書には認可された規格を超過した数字が記入されていたが当局が勝手に誤記と判断し訂正を指示、1945年3月何事もなく認可された。機動性では単端式各車よりも勝っていたはずであるが、戦後比較的早期に客車化。