横浜市立南高等学校・附属中学校
原則として、中高合同の行事に関しては高等学校の生徒会組織が企画立案の中心となっているが、その他の活動や委員会は中高別に活動している。
高等学校
毎年6月・11月に生徒会本部役員選挙が行われ、南高祭(9月)終了後または新年度に生徒会役員がそれぞれ半数交代する仕組みとなっている。
生徒会本部役員は1年後半~2年時までの約1年間活動する。その他、各委員会の委員長は2年生から選出される。
附属中学校
毎年11月に高等学校と合同で生徒会本部役員選挙が行われ、新2年生と新3年生から選出される。任期は翌年度の1年間であり、こちらは一年毎に総交代となる。各委員会の委員長は3年生から選出される。附属中学校3学年のみで独自のレクリエーション活動が展開されることもある。
学びへの飽くなき探求心を持つ人材の育成
自ら考え、自ら行動する力の育成
未来を切り拓く力の育成