高井悌三郎
1956年(昭和31年)から1958年(昭和33年)の間に4次の調査が、高井と藤田清、上野武臣らにより行われた。報告書は『常陸国新治群上代遺跡の研究II』(1988年、甲陽史学会)として発行された。
小野窯遺跡(茨城県新治郡新治村(現・土浦市)
八幡瓦窯跡(茨城県結城市)
1953年(昭和28年)に高井他、藤田清、中村盛吉率いる常総古文化研究会らの協力で調査が行われた。報告書は『常陸台渡里廃寺跡・下総結城八幡瓦窯跡』(1964年、茨城県教育委員会)。
富谷薬師台瓦窯跡(茨城県岩瀬町)
1951年(昭和26年)に高井、藤田清らにより2期に分けての調査が行われた。報告書は『常陸富谷薬師台瓦窯址の調査(甲陽史学会研究報告1)』(1954年、甲陽史学会)。
伊丹廃寺跡(兵庫県伊丹市)
高井を調査主任として、1958年(昭和33年)12月から調査が始まり、1965年(昭和40年)の第23次調査までの調査成果が高井の執筆により『摂津伊丹廃寺跡 : 発掘調査報告書』(1966年、伊丹市教育委員会)として刊行された。この発掘成果により伊丹廃寺跡は1966年(昭和41年)3月22日に国史跡指定された。
三ッ塚遺跡(兵庫県丹波市)
1972年(昭和47年)の第1次調査から1975年(昭和50年)の第4次調査までを総括責任者として主導した。当時この発掘作業に関わっていた五十川伸矢は、高井が学生達に混じり一緒に汗をかきながら発掘調査をしていたと、述べている。三ッ塚遺跡は1976年(昭和51年)に国の史跡に指定された。
広渡廃寺跡(兵庫県小野市)