安土駅
単式ホーム1面1線と島式ホーム1面2線、計2面3線のホームを持つ地上駅(橋上駅)である。
かつては米原駅 - 京都駅間で最後まで残った木造の地上駅舎であったが、2017年11月19日より橋上駅舎の使用が開始された。新駅舎は延床面積400mの鉄骨造りで、南北を結ぶ長さ58mの自由通路が併設されており、北口・南口と各ホームにエレベーター、エスカレーターを備えている。みどりの券売機プラスが設置されている。トイレは改札外に移設されている。また、北側自由通路下の1階部分に観光案内所が新たに設置された。北口側は安土城の天守閣をイメージして朱色を配した八角形の塔を設け、安土山を展望できるようになっている。大河ドラマ『麒麟がくる』の放送開始前に、2019年(令和元年)に安土城が描かれた縦13 m、横4mのグラフィック用フィルムが駅舎の北口に設置された。
日中時間帯は1時間あたり2本が停車する。なお、朝と夕方以降は本数が増える時間帯がある。また、朝には当駅始発(平日、土曜・休日ともに各1本。※本数は2022年時点)の設定がある。