余市川
ヤナギ類を中心に、上流域ではミヤマハンノキ・ミズナラ・エゾイタヤ等、中流域ではケヤマハンノキ等の河畔林が広がっている。1993年(平成5年)度には建設省(当時)の「桜づつみモデル事業」(堤防強化とともにサクラの高木を植樹することで、河川緑化を推進する事業)に下流部の余市川桜づつみが認定され、毎年5月になると河川敷でサクラの植樹が行われている。
渓流においてはオショロコマ・ハナカジカが生息し、また中流域は河床がウグイの産卵場となっている。その他フクドジョウやワカサギも見られ、これらは流れの緩やかな下流域にも生息する。河口付近ではニシン・マサバ・ビリンゴ・マハゼなど、汽水域特有の種が生息する。特に有名なのがアユである。余市川はアユ生息地の北限で、アユ釣り大会も定番のイベントである。「さけ・ます増殖河川」にも位置付けられており、アユの他サケやマス等の放流が行われている。
水質も良好である。ちなみに余市川ではかつて田川橋付近で天然の製氷が行われていた。機械製氷が主流の時世においても、昭和30年代頃まで続けられたという。