愛媛大学
放送大学学園と単位互換協定を結んでおり、放送大学で取得した単位を卒業に要する単位として認定することができる
e-Knowledgeコンソーシアム四国(四国内の8つの国公私大が連携し、情報通信技術を活用して四国の人材の育成を目指す組織)
大学eラーニング協議会
JICA(JICA研修員受入れに関する覚書)
JICA四国(連携協力の推進に関する覚書)
国立環境研究所(教育・研究の連携・協力に関する協定)
徳島大学・鳴門教育大学・香川大学・高知大学 (四国地区大学間教育・研究交流協定)
山形大学・群馬大学・徳島大学・熊本大学(5大学間教育・研究の交流に関する協定)
島根大学・山口大学・高知大学(4大学間教育・研究交流協定)
鳥取大学・島根大学・岡山大学・広島大学・山口大学・徳島大学・鳴門教育大学・香川大学・高知大学(中国・四国地区の国立大学間連携による高等教育業務継続計画に関する協定)
愛媛県立医療技術大学・聖カタリナ大学・聖カタリナ大学短期大学部・松山東雲女子大学・松山東雲短期大学・松山大学・松山短期大学(中予地区大学間教学ネットワーク構成大学間における協同授業に関する協定)
今治明徳短期大学・聖カタリナ大学・聖カタリナ大学短期大学部・松山東雲女子大学・松山東雲短期大学(大学教育再生戦略費「地(知)の拠点大学による地域創生推進事業」に係る愛媛県内就職・定住の促進プログラムに関する協定)
岡山理科大学(包括的連携・協力に関する協定)
東京農工大学(特別研究学生交流に関する協定)
放送大学(単位互換に関する協定)
松山大学(単位互換に関する協定)
松山東雲女子大学(単位互換に関する協定)
松山短期大学(単位互換に関する協定)
愛媛県立松山南高等学校(スーパーサイエンスハイスクール)
新居浜工業高等専門学校(教育研究連携協力に関する協定) - 2005年2月2日締結。
香港大学現代言語及文化学院(中国) 法文学部
ジャワハルラール・ネルー大学(インド) 法文学部
連合王国INTOマンチェスター(イギリス) 法文学部
フィリピン大学教育学部(フィリピン) 教育学部
復旦大学高等教育研究所(中国) 教育学部
順天郷大学校人文科学部(韓国) 教育学部
ルンド大学理学部(スウェーデン) 理学部
マルタ大学理学部(マルタ) 理学部
清華大学理学院(中国) 理学部
オッフェンブルク工科大学(ドイツ) 工学部
国立交通大学理学院(台湾) 工学部
ハノイ科学技術大学工業物理研究所(ベトナム) 工学部
パジャジャラン大学医学部(インドネシア) 工学部
ベトナム国家大学科学大学(ベトナム) 理工学研究科
韓国交通大学校工科大学(韓国) 理工学研究科
デ・ラ・サール大学理学部(フィリピン) 理工学研究科
オーフス大学医学部(デンマーク) 医学部
泰山医学院(中国) 医学部
中国医科大学(中国) 医学部
廣東医学院(中国) 医学部
高雄医学大学(台湾) 医学部
シェラバングラ農科大学(バングラディシュ) 農学部
インドネシア科学院(インドネシア) 連合農学研究科
カリフォルニア大学アーバイン校(カリフォルニア大学協議会)(アメリカ)教育・学生支援機構
ワシントン大学シアトル校エデュケーショナル・アウトリーチ(アメリカ)教育・学生支援機構
ブリティッシュコロンビア大学ELI(カナダ)教育・学生支援機構
バンガー大学日本研究所(イギリス)教育・学生支援機構
オークランド大学(ニュージーランド)教育・学生支援機構
アヴェイロ大学環境海洋科学研究センター(ポルトガル) 沿岸環境科学研究センター
インドネシア技術評価応用庁海洋調査技術研究センター(インドネシア) 沿岸環境科学研究センター
井関農機
伊予銀行
愛媛銀行
愛媛県経済同友会
愛媛県商工会議所連合会(連携に関する協定) - 2016年9月20日締結。
愛媛県中小企業家同友会(連携に関する協定) - 2017年1月11日締結。
愛媛県法人会連合会・松山市
愛媛新聞社
愛媛信用金庫(連携協力協定) - 2007年4月12日締結。
四国森林管理局(連携協力協定) - 2014年6月23日締結。
四国総合研究所
四国総合通信局(大規模災害時における連携協力協定) - 2017年3月27日締結。
四国旅客鉄道(連携協力に関する協定) - 2017年9月11日締結。
ダイキ
東レ愛媛工場
西日本高速道路四国支社
三浦工業
ノバルティスファーマ株式会社 (産官学連携協定) -2020年7月28日締結。