今治藩
譜代 3万石→4万石→3万5千石 (1635年 - 1871年)
定房 3万石→加増により4万石
定時
定陳 分知により3万5千石
定基
定郷
定休
定剛
定芝
勝道
定法
慶長5年(1600年)、豊臣時代に伊予国板島(後の宇和島市)で7万石を領有していた藤堂高虎は、関ヶ原の戦いの戦功により20万石に加増された。同時に今治市内にあった国分山城に移り今治藩が立藩した。しかし、国分山城は中世山城で城下町造営が不便なため、慶長7年(1602年)、今張浦に近世城郭建設と翌年に城下町建設に着手、慶長9年(1604年)、現在の今治市街地となる城と城下町が完成した。
高虎は、慶長13年(1608年)、伊賀国・伊勢国にて22万石に加増の上、領地替えとなり津藩に転出した。しかし、越智郡2万石が残されたので養子である高吉が今治城主となり残った。のち、寛永12年(1635年)、伊賀国名張に領地替えとなり藤堂氏の支配は終了した。
同年、伊勢国桑名藩より松平定行が伊予松山藩15万石に転封となり、同時にその弟定房が伊勢長島城7千石より3万石に加増され今治に入った。寛文5年(1665年)、定房は江戸城大御留守居役に任ぜられた。役料として武蔵国・下総国・常陸国から1万石を加増され、4万石となる。
2代藩主・定時は、嗣子・定陳に遺言として、定陳の弟・定直に関東領地のうち5千石を分知するよう残した。このため石高は3万5千石となった。