スロバキア民衆蜂起
蜂起軍部隊とパルチザンは、カルパティア山脈の山中に籠もって抵抗活動を続けた。ドイツ国防軍は報復として、蜂起軍を支援した容疑で多くのスロバキア人を処刑し、93村を破壊した。その後の調査によると、ドイツ国防軍の報復行為による死者はスロバキア人住民、ユダヤ人、ロマ人およびパルチザンの合わせて5304人に上り、処刑者を埋葬した共同墓地が211カ所で発見されている。
このうちフロン県(現・バンスカー・ビストリツァ県)内のバンスカー・ビストリツァ郡クレムニチュカ村(現・バンスカー・ビストリツァ市クレムニチュカ街区)では747人(うち女性211人、6歳から14歳までの子供58人)が、ブレズノ・ナド・フロン郡(現ブレズノ郡)ネメツカー村では約400人(または800~900人)が処刑された。ネメツカー村ではドイツ国防軍の特殊部隊によって村民の遺体が村の石灰窯で焼却処分されたため、正確な犠牲者の数は現在も不明である。
ドイツ国防軍は11月3日、蜂起軍司令部のゴリアンとヴィエストをバンスカー・ビストリツァ東方約15キロのブレズノ・ナド・フロン郡ポフロンスキー・ブコベッツ村で逮捕。尋問したあと銃殺刑に処した。蜂起軍に同行した英軍特別作戦部と米軍戦略諜報局の隊員は合流し、連合国軍に対して早急な支援を求めたが、ドイツ国防軍は12月25日に隊員たちを逮捕。数人を即決裁判で処刑したほか、残りの隊員を拷問や処刑が行われていたマウトハウゼン強制収容所に連行した。
スロバキアにおけるドイツ国防軍の蜂起鎮圧は、スロバキアの親独政権の崩壊をわずかに先送りしただけに終わった。
このためドイツ国防軍は10月末までに蜂起軍勢力圏の大半を取り戻し、蜂起軍を包囲した。この間の戦闘で双方に少なくとも1万人の死傷者が出た。
追いつめられた蜂起軍は10月27日、バンスカー・ビストリツァから撤退した。蜂起軍に加わっていた英軍特別作戦部員および米軍戦略諜報局員も蜂起軍と行動を共にした。蜂起軍は戦術をゲリラ戦に転換することになり、司令官のヴィエストは10月28日、ロンドンの亡命政府に対して蜂起の終結を報告した。
10月30日、ドイツ国防軍とスロバキア共和国政府はバンスカー・ビストリツァで蜂起鎮圧の祝賀会を開き、ティソは鎮圧に功績があったドイツ国防軍兵士に勲章を授与した。ティソのこの行為については、ドイツ国防軍に捕らえられ強制収容所に送られた蜂起軍兵士の処刑阻止やドイツ国防軍によるスロバキアの主要3都市爆撃阻止の狙いがあったのではないかとする説もある。