幽霊電車
今作のみ窓から飛び降りても車内に戻ってしまい、途中下車は不可能。また男を連れて行くために同乗していた部下の切符には三途の川の渡し銭である「六文」と書かれている。本作のみねずみ男は冒頭のワンシーンしか登場せず、代わりに猫娘が、スマートホンのお経の着信音で男を脅す訳と、途中駅の「骨壷駅」の駅員役として登場する。後に猫娘が、玉藻前と戦う鬼太郎への加勢に犬山まなと向かう際、地獄へ行く手段の一つに挙げていた(敵に見つかる可能性が高いため別の方法を採用)。
妖怪千物語:ねずみ男から不思議な力が使えるネックレスを買った地味な少年はマジカル王子として人気を得るが、その力は自らの寿命と引き換えだった。鬼太郎に幽霊列車に乗せられ、終着駅までにネックレスを手放すように警告されるが、栄光を失うことを恐れた彼は警告を無視し手放さぬまま終着駅に降り自分の寿命の蝋燭の炎が燃え尽きようとするのを見る。鬼太郎に助けを求めるも愛想を尽かされ、咄嗟に隣の蝋燭に炎を移し強制的に生き長らえる。しかし、その蝋燭は彼の母親のもので母親が身代わりに交通事故で死亡してしまった。
その他、ポプラ社から刊行された『水木しげるのお化け学校』にも原作エピソードを基にした「ゆうれい電車」というエピソードが存在するが、タイトルこそ電車と銘打ってるものの該当車両は蒸気機関車である。
なお、起点の新宿駅と終点の多磨霊園駅以外の駅は全て架空の駅(駅名は死と葬式の過程)である。
またシリーズによっては臨終駅が無くなり火葬場駅から始まっていたり、終点が多磨霊園駅ではなく奥多摩霊園駅、村山霊園駅といった架空の名前になったり、地獄駅、墓場駅に変わる事がある。