ザルツブルク - チロル線
下記2つの系統に分かれる。
S3系統: バド・ライヒェンハル - ザルツブルク - シュヴァルツァハ - ザールフェルデン 1時間に1本の運行。ザルツブルク以北は独墺国境を越え、ドイツ国鉄954号線に直通する。なお、平日に限り、フライラッシンク - ザルツブルク - ゴリンク間の区間便が1時間間隔で運行され、この区間は両者合わせて30分間隔で運行されている。1時間に1本の運行はシュヴァルツァハ以北の運行で、平日・土曜日は2時間に1本、休日一日1.5往復がザールフェルデンまで直通する。 過去の運行形態 2016年以前は、S1系統を名乗っていた。また、ビショフスホフェン以南のみ運行する列車は、レギオナルバーン(R)の種別であった。レギオナルバーンの一部はザールフェルデン以西でSバーンとなり、ヴェルグルまで直通していた。シュヴァルツァハ以南は、全て合わせて一日7.5往復の運行であった。 2017年度に、S3系統に変更された。レギオナルバーンは早朝/深夜の南行のみとなり、ヴェルグルへの直通も取りやめられた。シュヴァルツァハ以南の本数は、平日・土曜日2時間に1本、休日一日1.5往復となった。
2022年度に限り、シュヴァルツァハ停車となった。 2023年度より、ヴェネツィア方面の車両とザグレブ方面の車両がザルツブルク以南で分離された。ビショフスホフェン停車、シュヴァルツァハ通過となった。
ミュンヘン - シュヴァルツァハ - ローマ/ミラノ ザルツブルク以北はドイツ国鉄951号線に、シュヴァルツァハ以南は220号線に直通する。ビショフスホフェンを通過する。 2016年末に運行を開始した。
グラーツ/ザグレブ - シュヴァルツァハ - ヴェルグル - チューリッヒ シュヴァルツァハ以南は250号線に、ヴェルグル以西は300号線に直通する。なお、ビショフスホフェンに停車する。ザグレブ方面の車両は、シュヴァルツァハで分割され、220号線経由でザグレブまで直通する。 2017年以前は、ザグレブ方面に限り、ヴェルグルに停車していた。