ゼヤ川
流域であるアムール川北岸(アムール州南部)は、小興安嶺山脈が連なる中国領の南岸とは違い、アムールゼヤ平原など比較的平坦な地形である。11月から5月にかけて凍結するが、残りの時期はこれらの都市を結ぶ重要な航路となる。
おもな支流に、右岸側はトク川(ロシア語版)(Ток)、ムリムガ川(ロシア語版)(Мульмуга)、ブリャンタ川(ロシア語版)(Брянта)、ギリウイ川(Гилюй)、ウルカン川(ロシア語版)(Уркан)、左岸側はクプリ川(ロシア語版)(Купури)、アルギ川(ロシア語版)(Арги)、デプ川(Деп)、セレムジャ川(Селемджа)、トミ川(ロシア語版)(Томь)などがある。
ブレヤ川を含む一帯の広大な氾濫原には三日月湖、湿地、河岸段丘、草地、フェン、オークの森林などがあり、1994年にラムサール条約登録地となった。