ジャノメチョウ亜科
種多様性に反して、本亜科の分類にかんしては未整理の部分が多く残されており、タテハチョウ科内における本亜科の系統分類学的地位や亜科内の下位分類は長らく混乱した状態にあった。このような混乱は近年の分子系統学的研究の進展によって徐々に解決されつつあり、それに伴い、従来の分類体系とあたらしい分類体系との間に差異が生じる場合がある。たとえば、上述したように、モルフォチョウ族 Morphini、フクロウチョウ族 Brassolini、ワモンチョウ族 Amathusiini の3族は伝統的に本亜科とは独立した亜科に含められてきたが、近年は分子系統学的知見を反映し、本亜科に含めることが多くなっている。また、ヒカゲチョウ属 Lethe は、従来マネシヒカゲ族 Elymniini に含められることが多かったが、近年はジャノメチョウ族の属と見なされる場合が多い。
本項では Wahlberg (2019) による亜族までの分類と、Peña et al. (2006) による狭義の本亜科の下位分類の変遷を示した表を紹介する。族和名は 相樂, 森 & 福崎 (2016) に準拠したが、亜族や属の和名は表記しない。