共同統治国ボスニア・ヘルツェゴビナ
自立したセルビア王国では「大セルビア主義」が拡大し、この実現のため海への出口を求めてセルビア人住民が多く住むボスニア・ヘルツェゴビナを狙った。
エーレンタールはこうした動きに危機感を覚え、セルビア王国への打撃を模索した。セルビア王国をオーストリア=ハンガリー帝国とブルガリア公国で分割するという計画も挙がったがこれは採用されず、実践的な計画としてボスニア・ヘルツェゴビナの併合が挙げられた。しかし行政権が移って以来のオーストリア=ハンガリー帝国による統治の利益は、近代化の不徹底故に大きくはなかった。そこで併合肯定派はこの不徹底こそボスニア・ヘルツェゴビナがオーストリア=ハンガリー帝国領でないが故のものであると主張し、併合によって施策はより徹底されるものと考えた。
こうしてオーストリア=ハンガリー帝国はボスニア・ヘルツェゴビナ併合を選択し、エーレンタールは1908年9月に併合の前段階としてロシア帝国と交渉を行った。ロシア帝国外相イズヴォリスキーが日露戦争で傷ついたロシア帝国の威信の回復を考慮して素早い交渉の実現にも気を配っていたこの交渉において、ロシア帝国がボスニア・ヘルツェゴビナの併合を承認し、見返りにオーストリア=ハンガリー帝国はロシア帝国海軍のボスポラス・ダーダネルス両海峡通過を支持することが約された。こうしてロシア帝国による賛成を取りつけた上で、1908年10月5日、ボスニア・ヘルツェゴビナは併合された。
またこの際、主権国であったオスマン帝国には、ノヴィ・パザルからの撤兵と250万ポンドの償金によって併合を承諾させた。
第一次世界大戦は、ボスニア・ヘルツェゴビナにも甚大な影響を及ぼした。大戦期間を通じて、当時のボスニア・ヘルツェゴビナの人口の5分の1にあたる36万人もの犠牲者が出たという。
1917年5月30日、開戦以来停止されていた帝国議会が復活し、帝国諸民族の希望が述べられた。ここでスロヴェニア人を中心とする南スラヴ人議員からなる「ユーゴスラヴィア・クラブ」が、帝国内の南スラヴ地域を統一された政治単位として帝国を二重制から三重制へと改組するという旨の「五月宣言」を表明した。この宣言は翌18年10月16日に「ハンガリーの聖なる王冠に属する諸国の保全を決して侵害しない」という文言付きで認められた。しかし敗色濃厚となっていた当時、もはや南スラヴ人はオーストリア=ハンガリー帝国の枠組みに残ろうとはしておらず、8月には既に南スラヴ人の自決権行使の動きが始まって10月6日にはザグレブで「スロヴェニア人・クロアチア人・セルビア人民族会議」が創設されていた。
こうして10月29日、この民族会議を権力機関とするスロヴェニア人・クロアチア人・セルビア人国の独立が宣言され、共同統治領は事実上消滅した。独立が国際的承認を受けられなかったため名目上はまだオーストリア=ハンガリー帝国領として扱われていたが、11月3日にオーストリア=ハンガリー帝国が休戦協定に調印し、最後の皇帝カール1世が11日にオーストリア帝国の、13日にハンガリー王国の権利を放棄したことで、共同統治領は帝国とともに完全に消滅した。
ボスニア・ヘルツェゴビナは15世紀にボスニア王国が滅亡して以来400年以上にわたってオスマン帝国の支配下にあり、ムスリムが進出して民族的・宗教的多様性を増したが、その間ボスニア、ズヴォルニク、ヘルツェゴヴィナという3つの県(サンジャク)が1つの州(ベイレルベイリクまたはヴィラーエト)を成すことで領土的一体性を保持し続けていた。
しかしオスマン帝国が衰退していく中、1875年にヘルツェゴヴィナを起点にしてオスマン帝国への反乱(ヘルツェゴヴィナ蜂起)が発生してボスニア・ヘルツェゴビナ全土へと広がった上、反乱援助のためセルビア公国とモンテネグロ公国がオスマン帝国に宣戦布告するほどになる。
この動乱がバルカン方面に対して消極的であったロシア帝国を動かし、東方問題が再燃。目下の動乱に危機感を覚えたオーストリア=ハンガリー帝国外相アンドラーシはロシア帝国の中立とオスマン帝国の改革を試みるが努力虚しく、ロシア帝国もまたオスマン帝国改革を目指して戦争を決心し、1877年に露土戦争が勃発した。戦争はオスマン帝国の敗北に終わり、翌78年にベルリン会議が開かれた。