港川人
かつて港川人は縄文人の祖先ではないかと考えられてきた。
しかし、国立科学博物館等の研究チームが2009年(平成21年)に発表した分析結果によれば、港川人の顔立ちは、現在の人類では、オーストラリア先住民やニューギニアの集団に近いという。国立科学博物館研究主幹(当時)の海部陽介は、港川人は日本列島本土の縄文人とは異なる集団で、5万~1万年前の東南アジアやオーストラリアに広く分布していた集団から由来した可能性が高いと述べている。そして、その後に、農耕文化を持った人たちが東南アジアに広がり、港川人のような集団はオーストラリアなどに限定されたと考えられるとしている。
2021年(令和3年)には、男性人骨(港川1号)のミトコンドリアDNAの全塩基配列の解読が完了し、港川人はハプログループMの基盤的な系統に位置しており、現代の日本人や縄文人、弥生人に多く見られる祖先型の遺伝子を持つものの、そのいずれとも特徴が異なっていることが分かった。港川人は縄文人、弥生人、現代人の直接の先祖でなく、共通の祖先から枝分かれしたと考えられるという。