スターイクシオン
謎の高度知的文明。当作品において初登場である。『』形状の国旗らしき徽章を象徴とする、人類とよく似た文明を持つ種族。機体のフォルムなども人類側と共通するところが多い。小型機の性能が極めて高いところが特徴である。
大きなものでは全長10kmを越える生物。巨大な2本の触手を持ち、多数の寄生生物を従え、大出力の生体レーザー、熱量弾、重力も操り宇宙をも航行できる。人類との初遭遇は24世紀。本作ではCOMMANDモードのみにて出現する。
サウンドトラックのライナーノーツによると、企画段階ではゼビウスのガンプも敵種族として登場し、地球でファードラウトが起きる予定だったと言う。
一定の時間毎に5種類の敵が侵攻して来るモード。5種族全てのボスを倒さない限り真のエンディングとはならない。また、クリア時に「マーシャル・オブ・フォース・パラゴン」の称号を獲得出来ると、次回スタート時の選択肢にSUPERモードが出現する。SUPERモードの敵はHARDしか存在せず、侵攻速度も速い。
このモードでは、出現条件を満たした場合に限りドラグーンJ2、タイクーンが新型機体としてロールアウトする。