アクアライナー (高速バス)
8月に開催される木更津港まつり期間中は、木更津駅の乗降場所は東口に変更される。
10月に開催される ちばアクアラインマラソン 開催当日は減便した臨時ダイヤが組まれ、一部の便が東関東自動車道・館山自動車道経由で迂回運行する。
台風に伴う暴風や濃霧発生時に東京湾アクアラインが通行止めになったり、積雪がある際などには運休する場合がある。
貸切バス事業者の 房総エキスプレス(本社:木更津市)は、かつて東京駅 - 木更津駅・君津駅間で、ほぼ同名のツアーバス「東京アクアライナー」(2013年7月31日運行休止)を運行していたが、当路線とは関係がない。なお房総エキスプレスは、2013年の新高速乗合バス制度開始によりツアーバスから撤退。現在は貸切バスツアー「アクアツアー」 を催行している。