有蹄類
伝統的な分類体系において、現生では偶蹄目、奇蹄目、長鼻目が含まれた他、多くの絶滅目が属すとされた。また広義には、不完全かつ原始的な蹄を持つイワダヌキ目、管歯目(ツチブタ目)、痕跡的な蹄を持つ海牛目(ジュゴン目)を含めた。このうち偶蹄類と奇蹄目が近縁であると言う説は古くから根強く、その2目をのみを(近縁な化石目と共に)有蹄上目としてまとめるか、有蹄目を置き偶蹄亜目・奇蹄亜目等をその下に置くことも多かった。
2000年代以降に発達した分子系統解析に基づく現在の哺乳類の大分類では、これらの分類群が2つの系統に大きく分かれることが判明している。
ローラシア獣類 - 偶蹄目、奇蹄目が含まれる
アフリカ獣類 - 長鼻目、イワダヌキ目、管歯目、海牛目が含まれる
アフリカ獣類に属する目のうち、長鼻目・イワダヌキ目・海牛目は近蹄類 (Paenungulata)、管歯目は原蹄類 (Protungulata) に(近縁な化石目と共に)分類され、共におそらく単系統である。