原田左之助
事件直後に近江屋に駆けつけた田中光顕によると、後から伊東甲子太郎が近江屋に訪れ、その場に落ちていた鞘を見てこれは新選組のものだと証言したというが、伊東がこの時近江屋に駆けつけ、さらにそのような重大な証言をしたという記録はこの田中光顕のもののみである。同じく事件直後に近江屋を訪れた土佐藩士の谷干城は、後述する油小路事件の残党の御陵衛士達に鞘の鑑定を依頼したとしている。御陵衛士達は考案の上、原田左之助の鞘だと証言したというが、実際に証言をしたうちの一人の阿部十郎は、土佐の者たちが声音から新選組に違いないということで調査に来た、としている。もっとも、彼らが鞘を見たところで、よほどの特徴がなければそれが左之助のものだとわかるはずがないのである。やはり当時一番手がかりとして使用されたのは襲われた張本人である中岡の証言にあった、「中国・四国訛の声」であろう。阿部は続いて、その声音が左之助によく似ていたので左之助であろうということになった、と語っている。声が再現できるはずはないので、これは左之助が伊予弁を話していたことから繋げた話だと思われる。谷達はおそらく鞘も提示したのだろうが、阿部の記憶に残っていたのは「声」だった。その理由は、鞘に証拠能力がなく、左之助にたどり着いたのが声音だったからに違いない。谷があくまでも鞘を証拠としたのは、声音という実体のない証拠の脆弱性を承知していたためでなかったろうか。
そこへ、公卿門前の日野資宗邸に長州藩兵潜伏との情報がもたらされたため近藤は井上、永倉、そして左之助に隊士20名を従わせ日野邸に向かわせた。戦いは小一時間ほどかかったが、4、5人斬り倒すと残りは逃げていった。この戦闘で左之助は左の肩へ軽傷を蒙った。新選組はそのまま公卿門前に宿陣し、翌日会津藩兵と共に天王山に立て籠ったま真木和泉らのために出陣した。新選組は池田屋事件の時と同じく、近藤隊と土方隊の2つに分かれたが、永倉の手記によると左之助は参加していない。
同年の9月になって間もなくの事である。左之助は永倉や齋藤と共に、近藤の「非行五ヶ条」を公用人の小森久太郎に示した。この五ヶ条の内容は不明である。届いた小森が取り次ぐと、松平容保は左之助ら6人を居間に呼び説得し、その場に近藤を呼び出し彼らに酒を振舞って一件を落着させた。左之助たちは切腹を覚悟でこのような局長批判をしたが、結局切腹になったのは葛山武八郎のみで、左之助たち幹部は謹慎という結果になった。