モンゴルのチャンパー侵攻
一方、本国のクビライ・カアンの下でもソゲドゥ軍が苦戦していることは把握しており、至元20年(1283年)2月20日(乙巳)には早くもチャンパー遠征軍に糧食を届ける補給船を派遣することが決定され、また5月13日(丙寅)には漢軍7,000・新附軍8,000を徴発してソゲドゥへの援軍とするよう湖広のエリク・カヤに命じられている。5月18日(辛未)には占城港の戦いでの勝利と国主・太子プティの逃亡がクビライ・カアンに報ぜられ、これを受けて同月21日(甲戌)には日本遠征の重囚を、26日(己卯)には海南島4州の兵をそれぞれチャンパー遠征軍に充てることが決められ、また28日(辛巳)にはソゲドゥの下に弓矢・甲仗を補給することが命じられた。また、9月16日(丙寅)にはソゲドゥらの管轄する「占城行省」と援軍の編成を命じられていたエリク・カヤの管轄する「荊湖行省」の合併が命じられているが、これもチャンパー遠征軍増強策の一環であったようである。
しかし、同年10月17日(丁酉)には「チャンパーから逃れ帰った軍を罰した(誅占城逃回軍)」との記録があり、『元史』占城伝に記載のない至元20年3月以降にモンゴル軍は多くの脱走者を出すほど劣勢に陥っていたようである。同日、かねてより予定されていたチャンパーへの援軍をクトゥク(忽都忽)が率いるよう命じられたが、後に明らかになるようにこの時点で既にチャンパー遠征軍への援軍派遣は遅きに失したものであった。
モンゴル側がチャンパー国王自らの来朝を諦め、チャンパー側の求めるように形式的な朝貢関係を復活させたことは、むしろモンゴルの東南アジア・南アジア諸国への進出の追い風となった。これは、海上交通の要衝たるチャンパーとの関係が安定したことで使者の往来が容易となったこと、また南海諸国側にとってもモンゴル-チャンパー関係が安定化したことでモンゴルに対する態度を決めやすくなったことが影響していると考えられる。この結果、それまでの南海諸国招論の総決算という形で、至元23年(1286年)9月に馬八児・須門那・僧急里・南無力・馬蘭丹・那旺・丁呵児・来来・急闌亦帯・蘇木都剌10ヶ国が一斉にモンゴルに来朝した。多くの国で来朝は長続きしなかったものの、これまでのモンゴル政権による積極的な海上進出政策は東アジア~東南アジア~南アジア~西アジアを結ぶ海上交易路の隆盛をもたらしたと言える。
またモンゴルのチャンパー遠征がもたらした影響の一つとして、ソゲドゥ・蒲寿庚らそれまで南海進出を主導してきた者達が引退・死亡して代替わりが生じたことが挙げられる。ソゲドゥはチャンパー遠征に失敗した後に大越方面に進出してそこで戦死し、蒲寿庚も至元17年以降ほとんど史料上で言及されなくなる。これに代わって南海進出に登用されたのが福建行省の史弼・高興・イグミシュらであったが、彼等もまたジャワ出兵に失敗することで失脚することとなった。
一方、『元史』ソゲドゥ伝によると、クイニョンから北上したソゲドゥは大浪湖(恐らく承天/Thừa Thiên地方の湖沼のいずれかを指す)で再び占城軍に勝利した後、安南国境に近い「烏里・越里(現在の広治/Quảng Trị省中部以南から承天/Thừa Thiên省を経て広南/Quảng Nam省北部に至る一帯。)」を平定し糧食を確保することに成功していた。一方、『元史』世祖本紀の4月22日(庚子)条には湖広行省のエリク・カヤらが「占城から散り散りに逃れてきた軍(占城散軍)」を収集して再び南征に向かわせたとの記事があり、この頃までにソゲドゥ軍から逃亡した将兵がかなりの数中国本土に逃げ帰っていたようである。
更に、5月6日(癸丑)には「唆都潰軍(ソゲドゥ配下の潰走した軍)」のみならず「江淮・江西両省潰軍(=クトゥク配下の潰走した軍)」を収集したとの記事があり、この時すでにチャンパー遠征軍は壊滅状態にあったようである。そして5月30日(丁丑)にはクトゥクらの率いていた軍団は、「風のため船団が散り散りとなって潰走した(遇風船散、其軍皆潰)」との報告がクビライ・カアンになされた。『元史』占城伝は3月27日以降のチャンパー遠征軍の動向について全く言及しないため、クトゥク軍の壊滅は3月27日以降、4月中に起こった事件と考えられる。こうして、先に出発したソゲドゥ軍は補給不足により北方に撤退し、後に援軍として派遣されたクトゥク軍は風雨による艦隊の壊滅という形で姿を消すことで、モンゴル軍のチャンパー遠征は頓挫することとなった。
12月23日(丙申)、ソゲドゥが再度起用されて第二次南海招論が行われたものの、中央の枢密院・翰林院の官と議論した上で実施するよう命じられており、クビライの求める外交方針(親自来朝)が徹底されたようである。実際に、既にチャンパー国王インドラヴァルマン5世は使者を派遣して内附の意を示しているにもかかわらず、この時派遣された兵部侍郎教化的・総管孟慶元・万戸孫勝夫らには占城国主(インドラヴァルマン5世)が「親自来朝」するよう求めることが命じられていた。なお、この時派遣された使者の中で孫勝夫は蒲寿庚配下の人物で、教化的・孟慶元は中央の枢密院・翰林院から送り込まれた人物と考えられる。
至元17年(1280年)には2月・6月に占城国からの使者が到着し、貢物とともに臣下を称する「表(臣下が皇帝に奉る文書)」がクビライの下にもたらされた。これを受けて、同年11月には再び宣慰使教化・孟慶元らが派遣されて「国主の子弟あるいは大臣の入朝」を要求した。「国主自身の来朝」に比べると要求が緩和されているが、これはこの頃モンゴル朝廷で皇太子チンキムとその側近コルコスンの影響力が増大していたことが関係しているのではないかと推測されている。