SARSコロナウイルス2-オミクロン株
オミクロン株の亜系統として、2022年7月時点でBA.1/B.1.1.529.1やBA.2/B.1.1.529.2、BA.3/B.1.1.529.3、BA.4/B.1.1.529.4、BA.5/B.1.1.529.5などがある。それらは多くの変異を共有しているが、その内容は有意に異なる。
BA.1とBA.2は32の変異を共有しているが、28の相違がある。これにより、他のいくつかの主要な変異株とは異なり、BA.2はギリシャ文字に基づいて独自の名前を付ける必要があることが示唆されている。BA.2は2022年2月から5月頃にかけて世界中で流行した。
多種類に分岐したオミクロン株亜系統がデルタ株などの既存変異株をほぼ置き換えたことなどから、WHOは2023年3月に「懸念される変異株 (VOC)」「注目すべき変異株 (VOI) 」「監視すべき変異株 (VUM)」をより具体的に指定できるよう定義を見直した。2023年5月17日時点で指定されているVOI (2種)とVUM (7種)はいずれもオミクロン株亜系統である。
BA.2.12.1は2021年12月にアメリカで検出され、L452Q変異などを有している。2022年3月中旬以降、同国のニューヨーク州など東海岸を中心に流行し、6月頃にかけて同国全体や中南米の一部の国などで主流の系統となっている。
WHOは、多数の変異が過去に感染またはワクチン接種を受けた人々の免疫を弱める可能性に懸念を示している。また、以前の変異株に比べてオミクロン株には免疫が効果的に働かない可能性もある。変異の効果は、もし存在するとしても、2021年11月末時点では未解明である。WHOは特にワクチン接種率が低い国で医療崩壊が起こる可能性を警告している。ワクチン接種率が低い場所では死亡率と罹患率が極めて高くなる可能性があるからである。WHOはすべての国にCOVID-19ワクチン接種率を上げるように促している。
カーディフ大学の疫学者Paul Morgan教授もワクチン接種を推奨しており、次のように述べている。
「免疫力の完全な喪失ではなく鈍化が最も可能性が高い結果です。ウイルスは、その表面のすべてのエピトープを喪失する可能性はありません。なぜならそれが起こった場合、スパイクタンパク質はそれ以上は機能しなくなるからです。
11月29日午後、30日午前0時から全世界を対象に外国人の入国を禁止すると発表した。また、オミクロン株が確認された国からの日本人の帰国については、10日間の隔離を求める。
フィリピン
11月27日、南アフリカ共和国、ボツワナ、エスワティニ、レソト、モザンビーク、ナミビア、ジンバブエからの入国を直ちに中断した。過去2週間の滞在歴がある場合も入国禁止とした。
11月28日、入国禁止対象国にオーストリア、チェコ、ハンガリー、オランダ、スイス、ベルギー、イタリアの欧州7カ国を追加した。12月15日までの間、入国禁止とする。
シンガポール
11月27日午後11時59分以降、ボツワナ、エスワティニ、レソト、モザンビーク、ナミビア、ジンバブエからの入国者に10日間、南アフリカ共和国からの帰国者に7日間の専用施設での隔離を求める。
韓国
アフリカ8カ国を対象として、28日午前0時から対象国から入国する自国民に10日間の隔離を義務づけ、対象国からの外国人の入国を禁止した。
中国
マカオ 11月28日午前0時以降、直近21日以内に南アフリカ共和国、ボツワナ、ジンバブエ、ナミビア、レソト、エスワニティ、モザンビーク、マラウイに滞在歴がある人のマカオ行き民間航空機への搭乗を禁止し、水際対策を強化した。