籠池泰典
籠池泰典と日本会議との関係を指摘する報道に対して、日本会議は公式サイト上に日本会議事務総局名で2018年3月13日付の「籠池氏は過去に日本会議の会員であったものの2011年に退会しており、籠池氏が用いていた「日本会議大阪代表・運営委員」との名刺は虚偽の役職を記載したものである」という趣旨の文書を掲載している。
日本会議と関係の深い谷口雅春先生を学ぶ会はかつて塚本幼稚園で複数回講演会を行っていることを認めながらも、森友学園と自分たちには何の関係もないとしている。
一連の流れを受けて日本会議会長の田久保忠衛は「もう(籠池と)関係は絶っている」「生長の家がらみの内紛に巻き込まれるのが私は嫌」とコメントしている。