緊急SOS!池の水ぜんぶ抜く大作戦
掻い掘り実施中の井の頭恩賜公園のボート池(2018年2月13日撮影)
掻い掘り実施中の深大寺の弁天池(2018年2月13日撮影)
後述する「絶滅危惧種を探せ」など、一部には掻い掘りとは別の企画も時折挟みつつ構成されている。特に第3回となる2017年6月25日放送では掻い掘りは1つだけにとどまっている。この回ではその他に、『住民を守れ!日本全国 駆除の達人』(以下、『駆除の達人』と表記)でも放送されている防除研究所(防研)による有害動物駆除、開墾に支障のある巨大岩の撤去、原因不明の巨大穴の発掘調査、MCがトークを行った筑波山ロープウェイつつじヶ丘駅近くの遊戯施設(ガマランド)の補修を行う旨の告知で構成された。当番組内で不定期に行われているカミツキガメの捕獲についても、元々は『駆除の達人』でとりあげられていたものである。
後述する2018年12月23日放送のスピンオフ「日本のお宝ぜんぶ掘る」からは、水を抜くことができない川などに生息する外来種駆除にも対象を拡げ、後述する山根ブラザーズによる釣りでの外来種駆除も行われるようになった。