ゴーマニズム宣言
上杉聰が執筆した『脱ゴーマニズム宣言』の題名で出版された「ゴー宣」批判本において、作品内の絵を大量に「無断引用」されたとして、小林は著作権法違反および不正競争行為(小林の著書と誤認させる恐れがあると主張)として民事訴訟を起こした。小林によれば、自分自身への批判は問題ではなく自分の絵を許可なく使用されたことを問題視して訴訟へ踏み切った。 一審は上杉のほぼ全面勝訴となったが、それについて小林は「悪質で一方的なこじつけ裁判だ」と語っている。二審では、必要以上に改変されているとして一箇所の著作権侵害を認めたが、引用自体の差し止めなどは棄却となった(墨塗りも止むを得ない改変であり、合法との判断)。全体的に上杉寄りの判決自体には少なからず不満を示すも出版差し止め自体は認められた事で「最初から出版差し止めが要求であり、目的は果たされた」と表明。その後、上杉のみ上告したが、棄却され出版差し止めを認めた高裁判決が確定する。
前記の著作権裁判の高裁判決後、上杉は小林に対して名誉毀損(作中で『ドロボー』呼ばわりされた事なども加えて)を理由に民事訴訟を起こしたが、二転三転の末に最高裁で小林側の勝訴が確定した。
インターネット上での無責任な小林自身への批判・誹謗中傷に対し激しく批判を行っていたが、2007年3月『SAPIO』誌上で一転して立場を翻し、いわゆる「ネット保守」に共闘をもちかける。情報番組などに出演し、東京裁判史観を押し付けるマスコミの報道姿勢を批判した。作品内では「わしの『ゴー宣』は、描き始めてから発表に3週間かかる。あえて批判してきたネット保守に共闘をもちかけたい。今後、同調圧力をかけるマスコミがいたら、直ちに批判してくれ!わしの力の限界を超えてくれ!」と、「ネット保守」に共闘を呼びかけている。しかし、それまでネットを厳しく批判していた小林の急変に、不信や疑問の声が上がっている。一方、「共通の敵」(主に日本のサヨク・中国・韓国の反日)と戦うと言う名目で、共闘に賛成する意見もある。『ゴー宣・暫』1巻のスタッフとの「幕間ばなし」では、これに関して、「ネットの連中と、ちょっと遊んでやろうと思ったが、何の成果もなかったというだけのことだね」と語り、さらに鈴木邦男に、異様な様子で「ネットなんかに協力求めちゃだめですよ!」と批判され、「どうでもいいとしか思ってないのに」と語った。
本家(『WiLL』にて連載) 『本家ゴーマニズム宣言』(2010年・ワック) ISBN 9784898311493 『本家ゴーマニズム宣言2』(2011年・ワック) ISBN 9784898311691
よしりん辻説法(『FLASH』にて連載、光文社) 『よしりん辻説法1』2018年3月10日発行 ISBN 9784334979843 『皮肉な悟り よしりん辻説法2』2019年4月10日発行 ISBN 9784334950866 『十二人の語るべき人類 よしりん辻説法3』2020年3月13日発行 ISBN 9784334951450 『美女の箱舟 よしりん辻説法4』2021年3月13日発行 ISBN 9784334951450 『恋愛論 よしりん辻説法5』2022年4月11日発行 ISBN 9784334953027 『恋愛論・完 よしりん辻説法6』2023年6月26日発行 ISBN 9784334953867
2012年2月刊行。グローバリズムへの批判とTPP(環太平洋パートナーシップ協定)の問題点を書き下ろしも含めたマンガで構成したもの。後述の『大東亜論』で描かれた来島恒喜について初めてとりあげている。