サギソウ
以下の自治体でその花の指定を受けている。括弧表記の自治体は以前に指定を受けていた自治体。
姫路市 - 兵庫県
世田谷区 - 東京都
浅川町、猪苗代町 - 福島県 (河内町 - 栃木県) (今田町 - 兵庫県) (池田町 - 徳島県) (七山村 - 佐賀県)
日本では環境省により、レッドリストの準絶滅危惧(NT)の指定を受けている。ゴルフ場や宅地開発などによる湿地の消滅、栽培目的の人為的な採集、自然遷移に伴う湿地の乾燥化などにより、絶滅した自生地が多く個体数は減少している。
準絶滅危惧(NT)(環境省レッドリスト)

また以下の都道府県で、レッドリストの指定を受けている。瀬戸内海国立公園、「岡山県自然保護条例」、「鳥取県自然保護条例」などの指定植物でその採集は禁止されている。
絶滅(EX) - 東京都、福井県、徳島県、高知県
野生絶滅(EW) - 山梨県
絶滅危惧IA類(CR)- 秋田県、山形県、茨城県、長野県、和歌山県、福岡県、長崎県 最重要保護生物(A) - 千葉県 絶滅寸前種 - 京都府、奈良県
絶滅危惧I類(CRまたはEN) - 宮城県、栃木県、新潟県、富山県、石川県、鳥取県、島根県、香川県、鹿児島県 Aランク - 岩手県
絶滅危惧IB類(EN)- 愛媛県、宮崎県
絶滅危惧II類(VU) - 岐阜県、静岡県、愛知県、三重県、岡山県、広島県、佐賀県、熊本県 Bランク - 兵庫県
準絶滅危惧(NT) - 福島県 希少種 - 滋賀県