豊肥久大鉄道事業部
1999年(平成11年)6月1日 - 大分鉄道事業部から一部管轄路線を分離・改名のうえ発足。
2006年(平成18年)3月18日 - 車両部門を大分鉄道事業部大分運輸センター隣接地に移転統合し大分鉄道事業部大分車両センターとなった。運転士基地は大分鉄道事業部豊肥久大運輸センターに改組。
2012年(平成24年)3月 - 大分鉄道事業部豊肥久大運輸センターが大分鉄道事業部大分乗務センターに統合され、大分乗務センターの気動車部門となった。