クロアチア航空
ベルリン(ブランデンブルク) (BER)(2012年6月3日から) - スプリト (SPU)、ドゥブロヴニク (DBV)
デュッセルドルフ (DUS) - スプリト (SPU)、ドゥブロヴニク (DBV)
ギリシャ
アテネ (ATH) - ザグレブ (ZAG)、ドゥブロヴニク (DBV)
イタリア
ローマ (FCO) - ザグレブ (ZAG)、スプリト (SPU)、ドゥブロヴニク (DBV)
イスラエル
テルアビブ (TLV) - ザグレブ (ZAG)、ドゥブロヴニク (DBV)
北マケドニア
スコピエ (SKP) - ザグレブ (ZAG)
モンテネグロ
ポドゴリツァ (TGD) - ザグレブ (ZAG)
オランダ
アムステルダム (AMS) - ザグレブ (ZAG)
スペイン
バルセロナ (BCN) - ザグレブ (ZAG)
スイス
チューリッヒ (ZRH) - ザグレブ (ZAG)
トルコ
イスタンブール (IST)- ザグレブ (ZAG)、ドゥブロヴニク (DBV)
ザグレブ (ZAG) - スプリト (SPU)、ドゥブロヴニク (DBV)、サダール (ZAD)、プーラ (PUY)
ドゥブロヴニク (DBV) - スプリト (SPU)
2019年8月現在、クロアチア航空の機材は以下の通りである。