陸地測量部
前身は、1871年(明治4年)7月兵部省に陸軍参謀局が設置された時まで遡り、直前の組織は参謀本部測量局(地図課及び測量課が昇格した)で、1888年(明治21年)5月14日に陸地測量部條例(明治21年5月勅令第25号)の公布とともに、参謀本部の一局であった位置付けから本部長直属の独立官庁として設置された。発足当初は参謀本部庁舎の3階を間借りしてのスタートであったが、参謀本部中枢が同庁舎北に新庁舎を建設・移転の後は、同庁舎を全面的に占用するに至った。現在もなお公的建築物として機能している日本水準原点は、当時の庁舎敷地内(東京三宅坂国会前庭付近)に設置されたものである。
発足時には三角・地形・製図の三科及び修技所(後の国土交通大学校の元となる組織。麹町区永田町(現在の千代田区永田町)陸軍省本省内の元陸軍軍医学舎跡に設置)が置かれ、初代部長には測量局長に引き続いて小菅智淵工兵大佐が任命された。