学校法人フェリス女学院
このように、ブースは1922年(大正11年)まで校長としてフェリス女学院の発展に尽くす。
1922年(大正11年)、アメリカ・オランダ改革派教会の婦人宣教師J・M・M・カイパーが第3代目校長になる。1923年(大正12年)関東大震災に被災し校舎は壊滅し、カイパー校長は殉職する。
殉職したカイパーの代務者として明治学院のアルバート・オルトマンスがフェリスの院長を一時的に兼務する。1924年にルーマン・シェーファー (Luman J. Shafer) が校長になる。そして、中等教育を中心に行う。1927年(昭和2年)には専門学校入学者検定規定による指定校になる。1929年シェーファーが辞任する。
日中戦争中の1940年(昭和15年)都留仙次が校長になる。対英米戦中には英語名を避けて「横浜山手女学院」に校名を変更する。戦後校名をフェリス女学院に戻す。1951年には都留が口語訳聖書の翻訳に専念するために院長を辞任する。
なお女子学院中学校・高等学校と共に、日本初のキリスト教主義学校女学校である。当初は受け継ぎの関係で男女共学であり、女子教育に専念したのは1871年の9月からである。