愛知大学野球連盟
大学野球の歴史的な成り立ちの関係で他の地域では同一地区内で複数の大学野球連盟が乱立気味なのに対して、中京地区は愛知大学野球連盟のみが単一で存在している。そのため全国の他の連盟に比べて加盟校数が多く、現在ではその数において最大の26大学が加盟するに至っている。近年は1、2部リーグの実力差はなくなっており、有力校も降格を経験したり2部リーグ経験者からもプロ入りして活躍する選手が出ている。
明治神宮大会へ繋がる秋季リーグ戦では指名打者制を採用していない。
交流試合などにも積極的で、中京地区の社会人野球とも古くから交流試合を実施している。
同一の対戦校に対して2戦行いを対戦を終了する。
(注8):明治神宮野球大会に出場したのはリーグ2位で代表決定戦に出場し、出場権を獲得した愛知大学。
(注9):明治神宮野球大会に出場したのはリーグ2位で代表決定戦に出場し、出場権を獲得した名城大学。
(注10):来シーズンより1チーム減となるのに伴い降格なしとなったため最下位決定戦は行われなかった。
(注11):2部が来季より1チーム減となることから優勝した名古屋経済大学が自動昇格した。
(注12):入れ替え戦は実施せず、各部優勝チームは上位リーグへ自動昇格した。
(注13):入れ替え戦を実施しないため最下位決定戦は行われなかった。
(注14):A・B分かれず12チームでリーグ戦を行った。
(注15):入れ替え戦は実施せず、各部の昇降格はなし。
星城大学
愛知東邦大学
愛知大学
至学館大学(旧:中京女子大学)
名古屋産業大学
同朋大学(旧:東海同朋大学、1957年春季に一度脱退するものの、1972年春季より準加盟、1974年春季より再加盟)
1999年暮れ頃、1部の常連校の中から、人気と実力の両面で陰りの傾向が見えていた連盟の運営と実情に不満が噴出。特に下部所属校の一部に対して運営に積極性がないとする批判がだされ、連盟活性化の足かせとなっているという強硬な意見が表面化し、1つの巨大連盟であることの是非が問われ再編案が出された。
その内容は、愛知大学野球連盟内を「愛知六大学野球連盟」「愛知学生野球連盟」「中京学生野球連盟」(いずれも草案時の仮称)に分け再編し、前者2つはそれぞれ6大学で構成、残りを1つにまとめるという構想で、分割することによる運営のスリム化と 将来的な愛知からの代表枠増を狙った準備再編であった。草案としての構成校は、愛知六大学が1部所属の5大学と名古屋大学(この編成は明らかに東京六大学野球連盟、関西学生野球連盟を意識したものと考えられる。)、愛知学生は1部所属の1校と2部所属の中から5校と発表されたが、構成校の選択内容とその理由が独善的であると多くの加盟校の反発を招き、結局この提案は支持を得られずに多数でもって否決されてしまった。
連盟内調停に失敗した再編支持派の愛知大学、愛知工業大学、中京大学、名古屋大学、名城大学の5大学は、2000年2月に愛知大学野球連盟からの脱退を強行し、再編派の離脱5大学は新連盟の承認の打診を全日本大学野球連盟に求めた。しかし、分裂騒動に不快感を示した全日本大学野球連盟は、離脱した5大学グループに対して強硬路線の沈静化要求とともに、全日本大学野球選手権への出場枠は与えない(新連盟は承認しない)旨を回答する。離脱側はこの決定に対して独立は断念し、同年3月には愛知連盟に復帰を求めることになった。