コルシカ独立戦争
4ヶ月後、新たな増援4,000名と共に新司令官として武名名高いマイユボワ侯爵が到着すると、フランス軍は巻き返し、ゲリラ戦で抵抗するコルシカ勢は次第に鎮圧され、コルテに追い詰められた。コルテは降伏し、摂政たちは捕らえられたが、ジェノヴァへは引き渡さずに、ナポリへの追放が命じられた。
1740年、オーストリア継承戦争が起こると、フランスの関心はコルシカを離れた。マイユボワ元帥もイタリア戦線に向かった。フランスとジェノヴァの支配は沿岸部のみに限られ、コルテはジョヴァン・ペトル・ガッフォーリが率いる独立派によって支配された。この間隙を突いてリヴァローラというコルシカ人の導きで、1745年、イギリス・サルデーニャ・オーストリア連合軍がバスティアを占領した。リヴァローラはサルデーニャ王に仕えていたので、ガッフォーリは警戒して共闘しなかった。しばらくして連合軍が撤兵するとジェノヴァはバスティアを奪回した。ジェノヴァは再び激しい弾圧を行った。しかし1746年からジェノヴァ市は二度に渡ってオーストリア軍によって包囲され、本国が危機に陥った。この好機にガッフォーリらは蜂起(第3次蜂起)して各地を解放した。1751年、ガッフォーリは全権を掌握して、事実上の元首となる「将軍」という地位に就任したが、1753年にジェノヴァが送った刺客によって暗殺された。
1755年、パスクワーレ・パオリが亡命先から帰国した。パオリは将軍の地位を継承し、コルテ評議会に憲法草案を承認させた。この憲法はルソーを大いに刺激し、パオリの側近の依頼で別の憲法草案を執筆するに至る。