転写因子
上流転写因子に似るが、機能発現のために活性化/抑制を必要とする。
アミノ酸7つごとにロイシンあるいはイソロイシンが配置された特徴的なαヘリックス構造を持ち、転写因子の二量体形成に関わる。形成された二量体の塩基性領域がDNAを認識する。
他にWinged helix(WH)、ETSなどいくつかのモチーフが知られている。また、DNA結合領域を持たないために転写因子とは分類されないものの、転写調節に決定的な役割を持つタンパク質が存在する。補助活性化因子、クロマチン再構成複合体(Chromatin Structure Remodeling; RSC)、ヒストンアセチル基転移酵素、リン酸化酵素、メチル化酵素などが当てはまる。