カリブ海地域への疫病流入
インフルエンザは、コロンブス到来の翌年である1493年に、イスパニョーラ島に築かれたスペインのラ・イサベラ植民地北部で初めてエピデミックを起こした。始まりは、1493年12月10日に2000人のスペイン人を乗せたコロンブスの船団が入渠してきたときだった。1494年にコロンブスがこの植民地に戻ってきてみると、入植者たちが疫病に苦しんでいる以上に、先住民たちが壊滅的な被害を被っていた。1506年には、先住民の数は疫病と虐殺により元の3分の1にまで減少していた。コロンブスと接触する前のタイノ族は6万人から800万人いたとも言われているが、彼らは接触から約50年で事実上絶滅した。主要因は、感染症であったと考えられている。
ヨーロッパ人との接触が始まってから、先住民は社会の崩壊や感染症の流行によって人口を減らしていった。タイノ族をはじめとする先住民社会は、感染症を知らなかったために、感染症が引き起こす社会的影響に対処する術を持っていなかった。膨大な数の人々が感染したことで、それまで行われていた農業や狩猟のサイクルが崩壊し、先住民社会は持続できなくなっていった。それに伴い先住民はヨーロッパ人への依存を強めざるを得なくなり、ますますヨーロッパ人の侵略に抵抗できなくなっていった。最終的にタイノ族がヨーロッパ人に奴隷化されてしまったのは、感染症により彼らの社会が衰退したためでもある。