国民社会主義地下組織
1998年1月26日(土曜日)に警察はイェーナで極右勢力とものと目される7軒の住居とガレージを家宅捜索したとき、イェーナのロベダ(ドイツ語版)にある「浄化装置ガレージ協会」の第5・第6ガレージも捜査対象であった。当局はベアーテ・チェーペが借りていた第6ガレージで爆弾製造装置を押収した。ウーヴェ・ベーンハルトは最初から捜査に居合わせたが、8時半から9時のあいだに自分の車で逃走した。この捜査で、4個の完成しているが信管のないパイプ爆弾と合計1.4キロのTNTが押収された。爆薬として合計で38キログラムのTNTが見つかっている。これらは、旧東ドイツ国家人民軍の地下武器庫第22統括陣営(ドイツ語版)から盗んできたものであった。ガレージでは、「トルコの豚野郎(Türkenschwein)」についての悪口が描かれたフロッピーディスクも発見された。「泥豚のアリ、俺たちはおまえが嫌いだ」とも書かれていた。後に、ツヴィッカウの家の瓦礫にハードディスクが埋まっていて、「消えろ、アリ」という信奉者のビデオの断片が見つかった。パイプ爆弾は、2003年に時効と訴訟手続の中止により、処分された。
当時捜査に関わっていた刑事のマリオ・メルツァーは、2013年4月のレポート・ミュンヘン(ドイツ語版)の放送で次のように伝えている。「当時、自分は捜査で邪魔を受けて」いて、それについて何度も憲法調査擁護庁の上司に苦情を伝えていた。当時のチューリンゲン郷土保全運動のリーダーは擁護庁の雇われスパイであったので、「擁護庁の監視下で」爆弾の調書が作られた。
数週間前のアイゼナッハでの銀行強盗で盗まれた2万3千ユーロの札束と、3個の弾丸カートリッジが内ポケットから出てきた。1か月後の12月1日、調書によると警察はリュックサックの内ポケットに6枚のDVDを発見した。どのように犯行グループがそのDVDについて考えていたかは、まだ説明されていない。
さらに捜査員たちは、USBメモリに入った88人のアドレスリストを発見した。そのリストには、2人のドイツ国会議員(ドイツ語版)と、トルコ・イスラム系組織の代表者の名前も含まれていた。別のデータファイルにもアドレスリストがあり、政治家や教会関係者、政党の地方支部、反極右組織などの1万件のアドレスが記載されていた。ツヴィッカウの住宅にあった火災で壊れたコンピュータのハードディスクから、別のビデオが復元された。そのビデオは2001年に作成されたものであった。Şimşekの殺害を祝ったもので、BGMにはアーティストノイエ・ヴェルテ(ドイツ語版)の曲が使われていた。殺害されたÖzüdoğru、Taşköprü、Kılıçを嘲笑するビデオも発見された。15の欄のうち5つに日付が書かれたものが見つかった。その5つの日付は、4人の殺害と2001年1月19日のケルンの食料品店の爆弾事件で重症になったイラン人女性の日付であった。