摩砂雪
丁度その頃に「どんなに演出意図や動きの指示を絵コンテに書いても、それを編集が理解してくれないために、リズムがずれて、1カットとしては良くできていても、映像としては笑いも感動も迫力もない、全然面白くないものになってしまう」という制作現場そのものの問題に当たってしまい、『新世紀エヴァンゲリオン』制作序盤ではフィルム編集技師に頭を下げ、ネガ編集者への指示の出し方・ポジ編集の実務作業のやり方を教えてもらい、制作終盤の頃になると普通のアニメスタジオでは見ない機材が集まり、1室が編集室となり、そこで摩砂雪・庵野・鶴巻がフィルムをつないでいった。その頃から「作品のために作画・絵コンテを描くことが嫌になった」「他人の作画・家庭用デジタルビデオカメラで撮影した映像等の色々な素材を切り貼りしてからつないでいけば、もっと面白いことができる」と編集を主体にした演出作業にのめり込むようになった。
監督を務めた『新世紀エヴァンゲリオン劇場版 シト新生』『DEATH』編の制作後、仕事が残っていたにもかかわらず海で遊びほうけていたことに総監督であった庵野が激怒し、続編の『新世紀エヴァンゲリオン劇場版 Air/まごころを、君に』ではビジュアルウォーターアーチストとクレジットされた。ただし二人の関係は深く、1000カット以上はあると言う庵野の結婚式のビデオを摩砂雪が半年かけて編集を行っている。ガイナックス時代は、庵野とスタジオで延々とくだらない話をしているたびに赤井孝美から怒られていたという。