新潟空港
旭川空港、女満別空港、丘珠空港、千歳空港、函館空港、いわて花巻空港、秋田空港、仙台空港、東京国際空港(羽田空港)、成田国際空港、佐渡空港、富山空港、小松空港、中部国際空港、広島西飛行場
これらのうち羽田線は1982年11月15日の上越新幹線開通以降に利用者が減少したため、1983年8月31日をもって定期路線としての運航が休止されたが、災害時に臨時便として運航された実績が2例ある。
1例目は2004年10月23日に発生した新潟県中越地震の影響で新幹線が不通になった際、同年10月24日より2005年1月4日までの間、日本航空と全日空の2社が計1119便を運航し、約21万3000人が利用した。2例目は2007年7月16日に発生した新潟県中越沖地震の影響で新幹線が設備点検のため一時運転見合わせとなった際、同日および翌日に日本航空と全日空が各1往復の計4便を運航し、232人が利用した。
韓国:ソウル/仁川
台湾:台北/桃園
中国:上海/浦東、ハルビン(2024年1月15日より運航再開予定)
かつての定期運航路線
ロシア:ウラジオストク、ハバロフスク、イルクーツク
アメリカ合衆国:ホノルル、グアム
中国:西安
香港:香港
この他にもチャーター便の誘致を進めており、過去に済州国際空港や、中華人民共和国の北京・天津・大連・青島・広州(深圳)などの直轄市・副省級市・経済特区などへの運航実績がある。県と新潟市ではチャーター便の運航実績づくりを通じて、東アジア方面を中心とした定期路線の誘致と、国内線も含めたLCC路線の誘致を進めている。