東京駅
対して、新幹線の構内はあまり広くなく、商業施設はホーム上にほぼ限られている。
「グランスタ」開業に合わせて、八重洲地下中央口の改札内にある待ち合わせ場所として有名な「銀の鈴」のリニューアルが行われ、1階と地下1階を結ぶエスカレーターが新設された。
駅長(兼 常務執行役員)・助役配置の直営駅で、京葉線の八丁堀駅と越中島駅を管理する。新幹線乗換口(中央・南とも。乗換窓口・精算所業務を含む)、丸の内地下北口、京葉地下丸の内口、日本橋口の業務はJR東日本ステーションサービスに委託している。なお、丸の内地下南口と京葉地下八重洲口はお客さまサポートコールシステム導入により、終日無人となっている。
日本橋口改札(2021年11月)
新幹線北乗換改札(2021年9月)
新幹線南乗換改札(2021年10月)
丸の内北口改札(2021年9月)
丸の内中央口改札(2021年9月)
丸の内南口改札(2021年9月)
八重洲北口改札(2021年11月)
八重洲中央口改札(2021年9月)
八重洲南口改札(2021年9月)
丸の内地下北口改札(2021年11月)
丸の内地下中央口改札(2021年10月)
丸の内地下南口改札(2021年10月)
グランスタ地下北口改札(2021年11月)
八重洲地下中央口改札(2021年11月)
京葉地下丸の内改札(2021年10月)
京葉地下八重洲口改札(2021年10月)
北側自由通路(2021年9月)
石碑(2007年5月)
当駅では直流600 V(東京メトロ丸ノ内線)、直流1500 V(在来線)、単相交流25000 V/50 Hz(東北・上越・北陸新幹線)、単相交流25000 V/60 Hz(東海道・山陽新幹線)と4種類の電化方式が存在する。なお現在は非電化用の車両(気動車・蓄電池車・CDC車の気動車モード)と機関車(電気・ディーゼル・蒸気とも)は営業列車として入線していない。現在は営業全車両がVVVF(可変電圧可変周波数制御)かつ回生ブレーキ車である。
3階張出部を支えていた装飾付きの鉄骨支柱は、RCで補強され円柱にかわったために、全体としては機能的な装飾のない意匠となった。ドームに施されたレリーフは南北のドームで全く同じである。
工事による一時解体に伴い、それまで使用していた雄勝石の屋根材65,000枚は産地でもある宮城県石巻市雄勝町の業者に送られて、選別・清掃・補修した上で倉庫に保管されていた が、東日本大震災による津波で塩害を蒙った。このため、使用可能と判断された45,000枚のみが復原駅舎でも再利用され、不足した2万枚はスペイン産のスレートで補われた。なお、工事全体では約457,000枚のスレートが必要とされていたため、再利用分を除いた残りのうち15,000枚は石巻市の業者が製作したものを使用し、残りはスペイン産で補う計画であったが、この業者の工場も津波によって壊滅し、出荷前の天然石スレートも津波に流された。震災後、流されたスレートは回収・洗浄・検品され、使用可能な7000枚が東京に送られた。
ドーム部分の屋根は、建設当時の銅板葺きに戻され、0.4 mmの銅板が合計1トン使用された。時計下の外壁レリーフは2メートル四方の銅板3枚を使って叩き出されたものを使用した。線路側の中央部の屋根はガラス化して、屋根裏をホテルのゲストラウンジにした。
八重洲中央北口改札(2021年9月)
八重洲中央南口改札(2021年9月)
八重洲北口改札(2022年9月)
八重洲南口改札(2021年9月)
日本橋口改札(2021年9月)
新幹線中央乗換改札(2021年9月)
新幹線南乗換改札(2021年10月)
JR東海・東日本間の新幹線乗換改札(2021年9月)
島式3面6線の高架ホームである。このうち14番線は23番線のすぐ東にある。14・15番線は神田寄りが丸の内側へ湾曲しているが、これは後述するホームの変遷表でもわかるように、14・15番線は、かつて東海道本線のホームとして使用されていたためであり、在来線ホーム時代は、一部特急など、東北本線方面への旅客列車も乗り入れていた。前述したが、コンコースでは改良工事が行われている。
東海道新幹線開業にあたり、14・15番線は東海道新幹線ホームに転用されることとなったが、旧来の構造を活かし、将来的には東北新幹線との共用使用や、東北新幹線との直通運転も想定されていたとされる。
0キロポストの他、記念モニュメントも複数ある。18・19番線の8号車乗車位置付近のホーム中央床面には起点と方位を示すレリーフが、同ホーム南端には十河信二のレリーフと座右の銘「一花開天下春」があしらわれた建設碑が、同ホームの下、中央乗換口(新幹線改札内)の東端壁面には「東海道新幹線 この鉄道は日本国民の叡智と努力によって完成された」と記された銘版がある。
なお、同線の代々木駅 - 新宿駅間も同様の扱いである。
運転系統では、JR東日本の新幹線ホームには、以下の路線の列車が乗り入れている。
東北新幹線
北海道新幹線:当駅 - 新青森駅間で東北新幹線に乗り入れている。
山形新幹線:当駅 - 福島駅間で東北新幹線に乗り入れている。福島駅 - 新庄駅間は奥羽本線を走行する。
秋田新幹線:当駅 - 盛岡駅間で東北新幹線に乗り入れている。盛岡駅 - 大曲駅間は田沢湖線を、大曲駅 - 秋田駅間は奥羽本線をそれぞれ走行する。
上越新幹線:当駅 - 大宮駅間で東北新幹線に乗り入れている。
北陸新幹線:当駅 - 大宮駅間は東北新幹線に、大宮駅 - 高崎駅間は上越新幹線に乗り入れている。
また在来線に関しても多岐に渡る運転系統が発着する。これらの在来線各線のうち、宇都宮線・高崎線・常磐線と京葉線・武蔵野線が同一の線路を共有している。それ以外は、各系統ごとに専用の線路が割り当てられている。
東海道線:駅番号「JT 01」/ 宇都宮線・高崎線:駅番号「JU 01」/常磐線。東海道本線(および伊東線)と東北本線の列車線を走行する中距離電車および特急列車。長い間、当駅は東海道本線列車線の起点であったが、2015年3月14日より新設された「上野東京ライン」の運転系統として上野駅からの東北本線列車線が直結し、多くの列車が東北本線列車線を走行する宇都宮線・高崎線・常磐線へ直通運転をするようになった。
京浜東北線:駅番号「JK 26」。