三鷹車両センター
この際に余剰となったB20〜B22のサハE230が廃車となった。 B22編成は、B5編成のサハE231-14と組成の上、2017年9月に京葉車両センターへ転属。 2017年11月から2020年9月までに、B1 - B4・B9・B13・B15・B18・B19・B23 - B25・B28 - B42・B57・B80 - B82・B901編成が短編成化され京葉車両センターへ、B5 - B8・B16・B17編成の一部車両が3000番台に改造され川越車両センターへそれぞれ転属。 転属などで編成から外された車両のうち、2018年度から2020年度までに付随車サハE230形とE231形計92両が廃車となっている。 B901編成は度々休車扱いされていたが、短編成化の上2020年7月9日付で京葉車両センターに転属。 2020年3月14日のダイヤ改正の前日、3月13日朝をもって、最後まで中央・総武線で運用されたB80・B82編成が運用を離脱し、日本国内での6扉車の営業運転が終了した。
1929年(昭和4年)6月 - 中野電車庫三鷹派出所として開設。
1929年(昭和4年)9月1日 - 三鷹電車庫へ改称。 当時の略号は「東ミツ」。
1966年(昭和41年)1月15日 - 営団地下鉄飯田橋検車区三鷹派出所が設置される。
1969年(昭和44年)3月1日 - 東京鉄道管理局分割に伴い、東京西鉄道管理局の管轄となる。略号は「西ミツ」。
1986年(昭和61年)3月3日 - 試作車以外の中央線快速用201系が他区へ転出し、中野電車区配置の中央・総武線緩行線用201系を当区へ移管。
1987年(昭和62年)4月1日 - 国鉄分割民営化に伴い、JR東日本へ承継。略号は「東ミツ」。
1998年(平成10年)4月1日 - 八王子支社発足に伴い、同支社の管轄となる。略号は「八ミツ」。
2003年(平成15年)12月 - 習志野電車区配置車両が転入。
2007年(平成19年)11月25日 - 三鷹電車区から改称。同時に三鷹電車区の動力車乗務員配置を新宿運輸区と新設された立川運転区へ移管