赤穂藩
刃傷事件のあった元禄14年(1701年)に、代わって下野国烏山藩より永井直敬が3万2000石で入部する。しかし、5年後の宝永3年(1706年)には信濃国飯山藩へ転封となっている。
同年、備中国西江原藩より森長直が2万石で入部、廃藩置県までの12代165年間、赤穂藩主としては最も長く在封した。森家赤穂藩士の格式(席)は、藩主に御目見が許される士分(給人格)と徒士、御目見が出来ない下代(足軽・中間など)の大きく3つに分けられた。下代の多くは苗字を名乗れなかった。森家赤穂藩には大石氏(広島藩・浅野本家の大三郎系が絶家ののち、大石信清系が大石宗家の扱いで花岳寺にて大石氏の祭祀を継承している)など旧浅野家臣もみられる。
永井・森の両家は旧・浅野家臣の住居の多くを使用せず破却している。「安永播州赤穂城下図」(1777年)では享保14年(1729年)に全焼した三の丸の大石良雄邸ほか、かつて城下にあった赤穂義士邸も茶色く塗りつぶされている。一方、永井家では町屋の各屋敷主名と同居人詳細の調査がされ、森家では町屋を侍屋敷にしたり、西惣門周囲を田地に、大蓮寺西側を畑地にするなど土地の有効活用が見られる。
塩田については、浅野家時代は浜人(製塩業者)に銀子を貸し付け、藩は毎年その運上銀から利子を回収していた。ところが、長矩切腹を知ると浜人は元金を含めその大半を踏み倒している。(瑤泉院の化粧料(持参金)二千両も貸し付けていたが、六百九十両のみ回収した記録が残る) 元禄期には塩田の一割以上が荒浜化したため、浅野家では浜奉行(役料十石)・牧野太兵衛らを置き浜人の逃亡を取り締まった。それでも赤穂から人材と技術の流出は止まらなかった。周防の吉川家においては「元禄八年、赤穂浪人十数人来りて塩田工事を援け、故に総じて赤穂に模倣せるものの如し」と記されている。
森家家臣団は、86人が知行取で知行700石の家老が5人、知行取の石高計は1万2千石を超え藩政は困窮しており、時代を追うごとに悪化の一途を辿った。第5代藩主・忠洪は財政改革を断行。藩主自ら質素倹約を行い、貯蓄を奨励した。更に塩田開発や蝋燭の原料となる櫨の植林等殖産興業にも努めた。しかし、財政の再建はままならなかった。第10代藩主・忠徳は文化6年(1809年)、遂に塩を専売制とした。 森家時代には塩田開発が飛躍的に向上し、約二百町歩の塩田面積があり、塩一石=80匁として年1万6千貫の生産高に達した。これは浅野時代の約10倍にも及ぶ。それでもなお藩財政を潤すには至らなかった。