日本の小中一貫校
大分市立賀来小中学校
大分市立碩田学園
佐伯市立八幡小学校・佐伯市立彦陽中学校
佐伯市立東雲小学校・佐伯市立東雲中学校
佐伯市立本匠小学校・佐伯市立本匠中学校
佐伯市立宇目緑豊小学校・佐伯市立宇目緑豊中学校
佐伯市立直川小学校・佐伯市立直川中学校
佐伯市立松浦小学校・佐伯市立鶴見中学校
佐伯市立米水津小学校・佐伯市立米水津中学校
蒲江翔南学園 佐伯市立蒲江翔南小学校・佐伯市立蒲江翔南中学校
日田市立大明小学校・日田市立大明中学校(愛称・修明校)
日田市立津江小学校・日田市立津江中学校
日田市立大山小学校・日田市立大山中学校
豊後高田市立戴星学園 豊後高田市立都甲小学校・豊後高田市立都甲中学校
国東市立志成学園
日光市立栗山小中学校
日光市立湯西川小中学校
聖ステパノ学園小学校・中学校
郡山市立西田学園(義務教育学校)
郡山市立湖南小中学校(義務教育学校)
須賀川市立小中一貫教育校稲田学園
飯舘村立いいたて希望の里学園(義務教育学校)
檜枝岐村立檜枝岐小学校・檜枝岐村立檜枝岐中学校
大熊町立学び舎ゆめの森(義務教育学校)