卵菌
養殖海藻であるアマノリ(紅藻)に寄生して被害を与える卵菌がいくつか知られており、Pontisma porphyrae (= Olpidiopsis porphyrae) は壺状菌病を、Pythium porphyrae はあかぐされ病を、それぞれ引き起こす。
ミズカビ属やワタカビ属、Aphanomyces(ミズカビ目)などの卵菌は、淡水養殖魚(特にサケ)に寄生して大きな被害を与えることがある。また、Pythium flevoense(ツユカビ目)は、アユ仔魚の内臓真菌症を引き起こすことが報告されている。
ザリガニに寄生する北米産の Aphanomyces astaci(ミズカビ目)は抵抗性をもたない他地域のザリガニに水カビ症(ザリガニペストともよばれる)を引き起こし(下図9a)、スウェーデンでは在来ザリガニ個体群の99%が消失したともされる。そのため、この卵菌は国際自然保護連合(IUCN)が定める「世界の侵略的外来種ワースト100」にも選定されている。この卵菌は日本でも確認されており、在来ニホンザリガニへの影響が懸念されている。
フハイカビ属の Pythium insidiosum(ツユカビ目)は、ヒトを含む哺乳類に対する日和見的な寄生菌となり、ピシウム症 (pythiosis) とよばれる皮膚病を引き起こす(上図9b)。また、Paralagenidium karlingii(ツユカビ目)も、イヌに寄生して皮膚炎 (paralagenidiosis) を引き起こす。