戦国自衛隊 (劇画)
兵糧が底をついてきた事もあり、ここで降伏すれば一揆に参加した民衆の命は助かるのではないかと四郎は考えた。飛助は「数々の奇跡は全てタネがあったもので、実は奇跡でも何でもなかったと教えてやれば、お前(四郎)を殺して降伏するかもしれん」と言ったところ、四郎は笑みを浮かべ、「人々が助かるならばそれも良い」と返した。そんな四郎に飛助は、幕府が本気で約束を守るわけがないと切り捨て、お前には皆をこの地へ導いた責任があると言い聞かせる。四郎が一揆を起こしたのは藩の圧制と切支丹弾圧を正すためだった。世話になった村人や幼馴染の少女美加を助けるため、数々の奇跡(実際は全て大賀に教わったトリックや「現代」の知識)を民衆に見せる事で人心を掌握し、扇動して代官所を集団で襲い、乱が始まった。飛助から話を聞いた三田村と大賀はそれが「島原の乱」だと感じ取り、四郎の一揆軍に加入した。それまでのいきさつを回想しながら、二人は、自分たちは「天草四郎時貞」を作り上げるためだけにこの地に集められた気がすると語り合った。「島原の乱」を起こした事で、三田村は「時が自分たちに歴史を修正させた」と漏らすが、大賀はかつての大坂の陣の終盤で、有利士長が遺した言葉から、「ここは全く別の世界で、自分たちが新しい歴史を作っているのだ」と、それを否定した。
前作同様にタイムスリップの理由が、元の世界とは違う方向に歴史が進んでいく別世界を、元の世界に類似する方向へ転換していく「歴史の修正」となっている。前作ではタイムスリップした自衛隊を率いる伊庭義明三尉が織田信長の役割を演じることとなったが、続編では関ヶ原における島左近・大坂の陣における真田幸村の役を演じることとなる。だが、アメリカ軍の介入によって元の世界との歴史の乖離が激しくなり、自衛隊員の一人、有利海士長は終盤に戦死する際「歴史の修正なんかできない。新しい世界を創造するための起爆剤(きっかけ)」ではないかとの台詞を口にする。しかし、自衛隊員の生き残りとその息子が島原の乱に介入し、天草四郎や史実における島原の乱の「首謀者」を演じる事で、再び「歴史の修正」へと動き出して物語は終幕する。
タイムスリップ発生日は西暦200X年(文庫版等では20XX年)6月20日、日本海舞鶴沖。海上自衛隊の輸送艦「おおすみ」、及びアメリカ海軍の強襲揚陸艦「エセックス」が1600年へ飛ばされるが、「エセックス」は「おおすみ」より1週間早い時間軸へ流れ着いていた。作中、「エセックス」に乗り込んでいたアメリカ海兵隊がアメリカ陸軍が採用しているAH-64Dを使用することになるが、当初はフィクション作品としての演出(コンビニコミック版)とされていた。後の外伝では、陸軍の装備を特別に海軍が輸送中にタイムスリップし、海兵隊が使用することになったと描かれている。
越後の支配者。無能どころか戦では役に立たない占いの結果を押し付けてむざむざ勝機を逃すなど景虎の足を引っ張る有様で、クーデターにより殺される。
結局この戦闘で幕府軍は三の丸、二の丸を制圧し、女子供の別なく半数以上の一揆兵を虐殺した。その夜、四郎は翌日の決戦のため民衆を鼓舞し、その姿を見た大賀は「やはり親父(島)に似てる。」と言った後「育ての親に失礼だったか?」と飛助に聞いたが、飛助は「ここまで育ってくれて、友江殿にも島殿にも胸が張れる。」と否定した。四郎は決戦の時に側にいると言う美加に、敵の刃から守れなくなった事を詫び、共にハライソで会おうと語りかけた。一方三田村は飛助に「長きに渡り世話になった。」と礼を言い、大賀には「大賀1曹」と声を掛けて敬礼した。大賀の方もその呼び方を懐かしがり、無帽に敬礼はいらんと言いながらも、自分も「三田村海曹」と呼んで敬礼を返した。翌朝、元自衛官含む一揆軍は全員で総攻撃をかけ、玉砕した。一揆勢は命乞いもせず、むしろ喜んで殺されていったという。時は流れ寛永二十年、肥後の国、金峰山の麓、霊厳洞では、晩年に差し掛かった宮本武蔵が「五輪の書」を書き終えていた。そこには「地・水・火・風・空」の各巻の後に、史実にはない「時の巻」が加えられていた。書き終えながら武蔵は「御伽衆」の事を思い出して、あの者たちは一体何者であったのか?と考えながら洞窟の外を眺めていた。その間に、後の台に置いていた島の形見のコンパスが、武蔵の気付かぬうちに発生した小さな時空の歪みに吸い込まれ、消えて行った。