遠別駅
廃止時点で、1面2線の島式ホームを有する地上駅で、列車交換が可能な交換駅であった。ホームは短い上屋を有し、駅舎側(西側)が下り線、外側(東側)が上下線共用のホームとなっていた(番線表示なし)。そのほか下り線と駅舎との間に貨物側線と貨物ホームを有し、構内の外側にも数本の側線を有していた(1983年(昭和58年)時点で副本線1線とそこから分岐した側線4線)。
職員配置駅となっており、駅舎は鉄筋製で構内の南西側に位置し、ホーム南側とを結ぶ構内踏切で連絡した。
また、保線班の拠点となっていた。