後光厳天皇
陵(みささぎ)は、宮内庁により京都府京都市伏見区深草坊町にある深草北陵(ふかくさきたのみささぎ)に治定されている。宮内庁上の形式は方形堂。深草北陵には持明院統歴代が葬られており、「深草十二帝陵」とも称される。また、天龍寺(金剛院)・四天王寺・高野山・泉涌寺(雲龍院)・安楽光院などにも分骨されている。
また皇居では、皇霊殿(宮中三殿の1つ)において他の歴代天皇・皇族とともに天皇の霊が祀られている。
帰京後の10月28日に鬼間議定を始め、12月27日に即位礼を挙行し、翌文和3年(1354年)11月16日に大嘗祭を挙行する。同年12月にまたもや南朝軍が京都に迫り、24日に後光厳は義詮に伴われて近江国武佐寺に逃れたが、翌文和4年(1355年)3月28日に御所に還幸した。
延文元年(1356年)6月11日、18番目の勅撰和歌集にあたる『新千載和歌集』の撰進を二条為定に命じた。足利尊氏の執奏であり、武家執奏による下命は史上初のことであった。延文2年(1357年)2月に、光厳法皇・崇光上皇・直仁親王が帰京したが、とりわけ光厳法皇は後光厳と頗る不仲であり、法皇は『新千載和歌集』の企画に強い不快の意を示し、入集を拒否した。この不仲の背景には、後光厳が持明院統の伝統歌風である京極派から二条派に鞍替えしたことや、同じく持明院統の伝統である琵琶の修得を避けて笙を修得したことが指摘されている。法皇らの帰京により、更に後光厳の正統性は動揺することになり、室町幕府は自己の正当性を保つために直接朝廷に介入してでもその権威の維持・上昇を図る必要が生じ、後の幕府による王朝権力の吸収の遠因となる。