ニーア ゲシュタルト/レプリカント
5年後。エミールがカイネを救出するために、人間兵器にされていた自らの姉ハルアの力を吸収し、その力でカイネを石化から解放する。復活したカイネ、そして主人公とエミールは、デボル・ポポルに魔王と石の神殿の関係を示唆され、再び各地を巡ってそこにいくための鍵を獲得する。
すべての鍵を集め、石の神殿の扉を開いた主人公たち。その前にデボル・ポポルが立ちふさがる。白の書が双子に「おまえたちは人間にあらず」と語りかけると、双子は「ここにいる全ての者が人間に作られた人間もどき」であるということを明かす。実は主人公たちはこの時代から約1400年/1300年前に実行された「ゲシュタルト計画」によって生み出された「いずれ人類を復活させる際に魂を入れる器として作られた肉体(レプリカント体)」であり、自身らがマモノと呼称して倒していた存在こそが「いずれ復活する人類の魂(ゲシュタルト体)」だった。
主人公たちとの戦闘でデボルを失ったポポルは暴走し、エミールは主人公たちを逃がすため、ポポルと相打ちとなる。主人公とカイネは魔王と対峙し、ヨナを連れ戻すために戦う。眠っていたヨナが目覚め、傷ついた魔王に歩み寄り「私の体の中にいる子(レプリカント体のヨナ)が、お兄ちゃん/お父さんに会いたいと泣いている。この子に体を返す」と魔王に語る。ヨナは魔王の制止も構わず、自ら日光を浴びることでゲシュタルト体である自身を消滅させる。妹を失った絶望で暴走する魔王に対し、主人公は自分と魔王が同じ立場であることを感じながらも彼を打ち倒す。
意識を失っていたヨナだったが、主人公の呼びかけにより無事に目覚める。カイネは2人の再会を見届けて「個人的に片付ける問題がある」と去っていく。
住んでいた村の丘でなぜか5年前の主人公とヨナが寝そべり、青空を見上げている様子が映る。
白い背景に変わり、5年後のヨナが魔王の手をとり顔を見上げている姿で幕を閉じる。
声 - 安元洋貴(ver.1.22474487139...)