ロックマンゼロ2
攻撃力★☆☆☆ / 防御力★★★★ / 機動力★★☆☆
ゼロの防御力が2倍になり(前作のサイバーエルフ「マンネン」と同じ効果)、ダメージを受けた際のノックバックが消失する(サイバーエルフ「フンバッファ」と同じ効果)。シールドブーメランの攻撃力が増加する。ゼットセイバーの連続斬りはノーマルと同じく1段目→2段目→3段目だが、攻撃力は大幅に減少する(チャージセイバーを除く)。
フォームチェンジシステムが導入された。
ゼロのレベルが高いときにボスが使うEX技を使用できるEXスキルが導入された。
ゲームオーバーとミッション失敗の方式が逆になった。前作ではミスをしても残機が残っていればゲームオーバーであり、残機がなくなればミッション失敗であった。
ゲームオーバー時の画面でステージの最初からやり直すことが可能となった。
前作ではエスケープユニットはミッションを途中でリタイアするためのものであったが、今作以降では一度クリアしたステージから抜け出すものとなった。
コードネームは前作では1単語のみであったが、ミッション中一番使用した武器や行動をより具体的に表す(間に「の」を挟む)3単語で主に表示されるようになった(例:「ケンゴウ(剣豪)」が無くなり、「ケンシ(剣士)」「ケンキャク(剣客)」「「ケンセイ(剣聖)」の三種になった)。
サイバーエルフを入手した際、そのサイバーエルフの名前が表示されるようになった。