コウマクノウキン門
淡水産藻類に寄生する単心性の菌類である Sanchytrium や Amoeboradix はツボカビ類に似ているが、鞭毛が運動能を欠くなど特異な点もある。この菌群は発見当初はサヤミドロモドキ綱に分類されたが、二核菌(担子菌+子嚢菌)などに近縁である可能性も示唆された。その後大量の分子データに基づき、この菌群はコウマクノウキン門の姉妹群であることが示されているが、コウマクノウキン門とは分けて別門の Sanchytriomycota とすることが提唱されている(下図5)。
デボン紀の地層(スコットランドのライニーなど)からは、Paleoblastocladia milleri など現生のコウマクノウキンン類に似た生物の化石が見つかっており、コウマクノウキン類の起源は少なくともこの時代に遡ると考えられている。
コウマクノウキン門が設立された当初は、コウマクノウキン綱(Blastocladiomycetes)、コウマクノウキン目(Blastocladiales)のみが設けられ、その中に5科ほどが分類されていた。その後、コウマクノウキン門の中の最初期分岐群であるフィソデルマ科をフィソデルマ綱(Physodermatomycetes)として他と分けることが提唱されている。2020年現在では、19属、215種ほどが知られているが、Sorochytrium などいくつかの属については分子情報が得られていない。以下にコウマクノウキン目の系統仮説の1つ(下図5)と属までの分類体系例を示す。
コウマクノウキン門()(学名: Blastocladiomycota)は菌界に属する門の1つであり、215種ほどが知られている。「コウマクノウキン」の名は「厚膜嚢菌」を意味しており、この門の生物が厚い細胞壁で覆われた休眠胞子嚢をつくることに由来する。後方へ伸びる鞭毛を1本もつ遊走子を形成し、この特徴から21世紀初頭まではツボカビ門に分類されていたが、分子系統学的研究から系統的にやや異なることが示され、独立の門として扱われるようになった。
単細胞のものから発達した菌糸をもつものまである。腐生性(植物遺体などを分解)で淡水や土壌に生育しているものが多いが、ボウフラなど動物に寄生するものもおり、また植物寄生性で農作物に被害を与えるものもいる。基本的に単相の配偶体と複相の胞子体の間で世代交代を行う点で、菌類の中では特異である。