アヴィス騎士団
その後、カラトラバ騎士団の総長ゴンサロ・デ・グスマンがアヴィス騎士団を訪問したが、アヴィス騎士たちは彼を厚くもてなしはしたが、新たな総長とは認めなかった。グスマンは抗議し、論争は1431年のバーゼル公会議でポルトガル側の非が宣言されるまで続いた。しかし、カラトラバ騎士団の権利は結局行使されず、次のアヴィス騎士団総長ロドリゲス・デ・シケイラは自らの地位を守り続けた。
ポルトガルがムーア人を駆逐し、レコンキスタが終結するとともに騎士団の布教活動も終わると思われたが、ポルトガルの海外進出によって新たな役目を担うことになる。ジョアン1世による1415年のセウタ攻略、その子ドゥアルテ1世の1437年のタンジール攻撃などにおいても、騎士団はその宗教精神と、教皇の認可に基づいて活躍した。ともにテンプル騎士団を元祖とするアヴィス騎士団やキリスト騎士団はその武勇によって大きな功績を残した。前者はフェルナンド王子、後者はエンリケ王子に率いられており、ともにドゥアルテ1世の弟であるフェルナンドはムーア人に捕われ、6年間監禁された後死去したが、彼は殉教したとみなされて列聖された。
しかし、この様な情熱も次第に失われていった。海外進出による富の蓄積によって国内は潤い、アフリカの十字軍は単なる商業組織へと変わっていった。教会の支持は金銭調達のための建前に利用され、1551年には騎士団の権限を国王が全て握るようになった。騎士団の収入は国王の手に渡り、陸軍、海軍の費用に利用されることになる。騎士団の宗教精神は消え、修道生活を送る者も少なくなった。1502年、教皇アレクサンデル6世は騎士たちに妻帯を許し、1551年にはユリウス3世が財産所有を認めた。