プロテオパチー
いくつかのプロテオパチーにおける異常なタンパク質は、複数の3次元形状に折りたたまれることが示されている。これらの変性タンパク質構造は、それらの異なる病原性、生化学的、およびコンフォメーション特性によって定義される。これらはプリオン病に関して最も徹底的に研究されており、タンパク質株と呼ばれている。
プロテオパチーが発症する可能性は、タンパク質の自己組織化を促進する特定の危険因子によって増加する。これらは、タンパク質の一次アミノ酸配列の不安定化変化、翻訳後修飾 (過剰リン酸化(英語版)など)、温度やpHの変化、タンパク質の生産量の増加、またはその除去 (クリアランス) の減少が含まれている。加齢は、外傷性脳損傷と同様に、強い危険因子である。老化した脳では、複数のプロテオパチーが重畳する可能性がある。例えば、タウオパチーとAβアミロイドーシス (アルツハイマー病の重要な病理学的特徴として共存する) に加えて、多くのアルツハイマー病患者は脳内にシヌクレイノパチー (レビー小体) を併発している。
シャペロンやコ・シャペロン (タンパク質のフォールディングを助けるタンパク質) が、加齢や蛋白質ミスフォールディング病において、タンパク質の毒性に拮抗し、タンパク質恒常性(英語版)を維持しているのではないかという仮説が立てられている。
免疫グロブリン軽鎖アミロイドーシス(ALアミロイドーシス)では、化学療法により、様々な体の臓器でアミロイドを形成する軽鎖タンパク質を作る血球の数を減らすことができる。トランスサイレチン (TTR) アミロイドーシス (ATTR) は、ミスフォールドされたTTRが複数の臓器に沈着することに起因する。TTRは主に肝臓で産生されるため、TTRアミロイドーシスは、一部の遺伝性症例では、肝移植により進行を遅らせられる可能性がある。TTRアミロイドーシスはまた、タンパク質の正常な集合体 (4つのTTR分子が結合して構成されているため、テトラマーと呼ばれる) を安定化させることによって治療できる。安定化により、個々のTTR分子が逃げたり、ミスフォールディングしたり、アミロイドに凝集するのを防ぐことができる。プロテオパチーのための他のいくつかの治療戦略が研究されているが、これには、低分子 (small molecule) および低分子干渉RNA (siRNA)、アンチセンスオリゴヌクレオチド、ペプチド、および人工免疫細胞などの生物学的医薬品が含まれる。場合によっては、複数の治療薬を組み合わせて効果を高めることもある。