イレギュラーハンターX
声 - 下崎紘史
カメレオン型レプリロイド。第9特殊部隊「別名:レンジャー部隊」の元副隊長。「にににに」という口癖がある。
いかなる場所にも適応可能な保護色能力を持つ部隊きっての実力者だが、任務遂行のためには手段を選ばず、その行き過ぎた合理主義思想から卑怯者扱いを受けていた。シグマにその実力を純粋に買われ協力を持ちかけられたことから、シグマの反乱軍へ身を投じることとなる。密林の前線基地の警備を担当していた。
オリジナル版から新たに地上でカメレオンスティングを撃つ攻撃が追加された。また、戦闘時にあった天井のトゲは降らせる時だけ発生し、降らせ方も異なっている。
VAVAモードにて、ヴァヴァを一応は尊敬していたらしいが、ヴァヴァは「お調子者」と一蹴する会話が見られる。
オリジナル版にも登場した、特定の条件(オリジナル版とは微妙に異なる)を満たすと習得できる『ストリートファイターII』の必殺技。ライフエネルギー満タン時のみ、地上で +攻撃ボタン(右向き時)で発射(空中では使用不可)。ステージ中の敵にはエックスバスター通常弾の32倍の破壊力を発揮し、各種ボス(本作では最終ボスであるウルフシグマも含む)は一撃で葬ることができる。威力とエフェクト以外の特性はエックスバスターと大差無いため、バスターを弾く特性の敵には同様に弾かれてしまう。オリジナル版と比べて発生が非常に早くなり、強化された。オリジナル版ではパスワードで記録できないが、本作ではセーブで記録できる。
入手時に登場するライト博士はオリジナル版同様、普段の白衣ではなく格闘家のような格好をしており、普段と同じくシリアスな表情で「波動を感じるんじゃ」とエックスに語った後、自らの波動で背景を揺らすなど、ホログラムらしからぬ演出を見せる。
通常 - 追尾ミサイルを発射する。オリジナルとは違い、6発まで連射可能。 チャージ - 魚型追尾ミサイルを5発発射する。通常版ほどの追尾性能は無いが、通常版よりも攻撃力が高くて弾速も速い。
巨大な狼型のメカニロイドで、本編の最終ボス。巨大な狼型メカニロイドで、額部分にシグマの頭パーツが合体する。下半身は未完成であるものの、口から吐く炎や電撃、両手から放つ稲妻は非常に強力。シグマはこれが完成したら一気に世界を我が物にする計画を立てていたらしい。
オリジナル版からデザインが細かくなりパーツが増えた。大きな変更が腕部パーツと頭部のシグマ本体で、原作は手が空中を浮遊するようになっていたが、本作では腕の部分も存在し、それにともなって「浮遊する腕をぶつける」攻撃が「渾身の力で殴りかかる」に変化した。頭部は原作ではシグマウルフ額の覗き穴からシグマの顔が覗くようになっていたが、本作では頭部に液体の充填したカプセルがあり、そこから伸びたアームがシグマの頭部を回収し、カプセル中に頭部が浮かぶ構造となっている。
オリジナル版から口から光弾を吐く攻撃がなくなり、代わりに腕の真下を除く部屋全体にレーザーを降らせる攻撃と床に電撃を流す攻撃が追加されている。