ノーチラス (潜水艦)
8時30分ごろ、周囲の駆逐艦が直ちに反撃してきたので、ノーチラスはそのうちの1隻である駆逐艦嵐に向けて魚雷を1本発射したが回避された。9時00分ごろ、再度潜望鏡深度に戻ると、駆逐艦の攻撃にノーチラスは深く潜航して爆雷攻撃がおさまるのを待った。ノーチラスが海中でじっとしている頃、海上では一大ターニングポイントが起こっていた。ほとぼりが冷める頃、ノーチラスは浮上して新たな敵を求めた。
12時53分ごろ、ノーチラスは3隻の炎上する艦船を発見した。この3隻はクラレンス・マクラスキー少佐率いる空母エンタープライズ (USS Enterprise, CV-6) 所属のSBD ドーントレス隊の奇襲で被弾炎上した空母赤城、加賀、蒼龍である。ノーチラスは、一旦は無傷の戦艦か巡洋艦を攻撃しようとも考えたが、結局は自艦に近い手負いの三空母のうち、一番手前の空母を攻撃することとした。ノーチラスは空母に向けて距離2,700メートルから魚雷4本を発射。2本は空母をかすめ去り、1本は発射できなかった。残る1本は空母に命中したが爆発しなかった。護衛の駆逐艦萩風と巻雲が爆雷を投下し、ノーチラスを追い払った。ノーチラスは長い爆雷攻撃から逃れることに成功した。6月7日、ノーチラスは15日間の行動を終えてミッドウェー島に一旦帰投。
10時を過ぎ、日本の航空機が守備隊の援護と奇襲部隊の撃滅で飛来してきたのを見てノーチラスは潜航。その後浮上したが11時30分と12時55分にも攻撃を受けた。陸上ではカールソン中佐が航空機の飛来と住民情報で日本の増援部隊がやってくると判断して17日中の撤退を開始。しかし、荒天と隊員の疲労で撤退はままならず、7隻のゴムボートおよび100名弱の隊員がノーチラスとアルゴノートにたどり着いただけであり、ノーチラスとアルゴノートは島の隊員に激励信号を送るのみであった。
翌8月18日にも撤退作業は続けられたが、零式水上偵察機の攻撃で潜航を余儀なくされたので日没後まで中断された。この間、島に残ったカールソンらは、自分たちは見殺しにされたと勘違いして降伏の用意をしたが、ここに来てようやくマキン守備隊がいなくなっていたことに気づいて、物資の破壊や重要資料の捜索などを行った。はぐれた9名の隊員を除く隊員は残存のゴムボートを使ってマキン島を脱出、収容された。カールソン隊の損害は戦死・不明30名だった。8月25日、ノーチラスは18日間の行動を終えてアルゴノートとともに真珠湾に帰投。作戦は日本軍守備隊を壊滅させて戦術的勝利をおさめたが、対空砲など設備の破壊は不十分で、暗号書や捕虜の獲得にも失敗し、日本軍の目をそらす狙いも果たせなかった。しかも日本側は教訓によりこの方面の防備を著しく強化したため、のちのガルヴァニック作戦、特にタラワの戦いでアメリカ軍は大いに苦しめられることとなる。
ブロックマン艦長は海戦での戦闘行為が評価され、海軍十字章が授与された。
なお、ノーチラスが雷撃した空母は、かつては蒼龍であるとされ、JANAC(英語版)の調査で蒼龍撃沈はノーチラスと航空機による共同戦果として扱われた。しかし、のちにノーチラスが攻撃した空母は加賀であるという見方が出てきた。実際、加賀の乗組員が雷跡を目撃しており、乗組員の中にはあわてて海に飛び込む者もいた。JANAC の認定は、蒼龍が加賀である可能性以外は一応は受け入れられている。ただし、不発魚雷だったためか他の理由か、『機動部隊戦闘詳報』と『第一航空艦隊戦闘詳報』ではこの被雷撃については触れられていない。
2日後の6月9日、補給を終えたノーチラスは哨戒を再開し、日本近海に針路を向けた。出撃前、ブロックマン艦長のところに太平洋艦隊潜水部隊司令官ロバート・H・イングリッシュ少将から次のような秘密命令が届いた。「相模湾に侵入し、6インチ砲で葉山御用邸を砲撃せよ」。イングリッシュ少将は思いつきでドーリットル空襲の向こうを張る派手な作戦を海軍でも行って、面目を保とうとしただけの無謀な命令であった。日本の国力の衰微につけこんで我が物顔に日本の海岸にまで踏み込んで行動した戦争末期とは事情が異なっており「この作戦はほとんど自殺行為である」と判断したブロックマン艦長は、命令は受領したものの、結局はこの命令を独断で握りつぶした。
ノーチラスはアベママ方面に移動し、同島に第7歩兵特別部隊とオーストラリア陸軍特殊部隊の混成部隊78名を上陸させることとなった。11月20日深夜から11月21日にかけて、ノーチラスはアベママに接近し、部隊を無事上陸させた。15時過ぎに一旦島から離れ、翌11月22日に火力支援のため島に再接近。砲台を攻撃してアベママ守備隊のうち14名が戦死し、残りは自決したと考えられた。アベママは11月26日に本隊が到着するまで確保され、のちに同島にはマーシャル諸島攻略のための航空基地が建設された。12月4日、ノーチラスは27日間の行動を終えて真珠湾に帰投した。
1944年1月27日、ノーチラスは8回目の哨戒でマリアナ諸島方面に向かった。3月6日早朝、ノーチラスは1隻の輸送船と3隻の護衛艦を発見。輸送船はサイパン島からの引揚者を乗せていた元病院船あめりか丸(大阪商船、6,070トン)だった。ノーチラスはあめりか丸に魚雷2本を命中させて撃沈した。3月21日、ノーチラスは57日間の行動を終えて真珠湾に帰投。艦長がジョージ・A・シャープ(アナポリス1929年組)に代わった。その後、ノーチラスはフィリピン方面でのゲリラ支援活動に使用されるため、4月26日にブリスベンに向けて出港し、5月14日に到着した。