海野平の戦い
村上氏と武田氏が佐久郡で争っている間、小県郡や佐久郡では滋野三家を中心とする滋野一族が、上野国の関東管領・山内上杉氏を後ろ盾としていまだ一定の勢力を保持していた。翌年の天文10年5月、甲斐の武田信虎は諏訪頼重・村上義清と同盟を結び、佐久郡・小県郡侵攻を行う。武田氏は佐久郡へ、諏訪・村上氏は小県郡へ侵攻する。海野棟綱ら滋野一族は抵抗するが尾野山城(上田城)が落城し、海野平・矢沢などにおいて三氏の連合軍に敗退し、棟綱の嫡男・海野幸義は5月13日から14日にかけての葛尾進撃の際の戦いで討死している。
滋野一族は5月25日に総崩れとなると、海野棟綱・真田幸綱・根津政直ら滋野一族は関東管領の上杉憲政を頼り、上野国へ亡命する。海野棟綱はこれ以降の動向が不明で、上野で死去したと考えられている。
戦後に武田・諏訪・村上氏は滋野領の分割を行う。『神使御頭之日記』によれば、海野平合戦で降伏した人物に「矢沢殿」がおり、これは真田幸綱の弟とされる矢沢綱頼(頼綱)にあたると考えられている。