雲南・大理遠征
ようやく首都の大理に到着したクビライは部下に殺戮を厳禁させた上で大理に対し降伏勧告を出し(『集史』ではクビライの漢人ブレーンの一人の姚枢が北宋の太祖の部将の曹彬が南唐を無血開城させたことを故事にひいた進言があったといわれる)、1254年に大理国はモンゴル帝国に降伏した。
当時の国王段興智は一旦昆明に逃亡した後に捕らえられたが、モンケによって南詔以来の「摩訶羅嵯(マハーラージャ)」の称号を与えられて大理総管に任ぜられ、雲南西部の統治に関わり続けた。また、段氏は旧大理国内で「爨僰軍」と呼ばれる部隊を編成し、ベトナムへの侵攻やビルマのパガン王国との戦いにもモンゴル軍の一部として参加することとなる。
このように多大な犠牲を払って雲南を征服したモンゴル軍であったが、当時雲南は世界有数の金・銀の産地であったこと、また南宋を攻める上で絶好の戦略的位置にあることなどから軍事・経済を重視するモンゴル帝国にとって大理国の屈服はそれに見合うだけの意味を持った。