アピコンプレックス門
アピコンプレックス門の下位分類として比較的安定的に受け入れられている分類群は以下の4つであり、これらを綱または亜綱にあてることが多い。ただしこれら4群の相互の関係や、各群の内部については分子系統解析による再検討が進められている段階である。2019年に右図のような系統関係が示されており、将来的にこれを反映するよう分類体系の変更が見込まれる。
アピコンプレックス門(Apicomplexa;またはアピコンプレクサ類)は原生生物界の門の1つ。アピコンプレクサ類は生活環のどこかでアピカルコンプレックス(apical complex、頂端複合構造)という構造を持つという点で特徴づけられる原生生物の大きなグループである。寄生性であり、配偶子の時期を例外として、鞭毛や仮足を持たない。