滋賀刑務所
所長の下に2部1課を持つ2部制である。
総務部(庶務課、会計課、用度課)
処遇部(処遇担当、企画担当)
医務課
YA級
A級
刑期10年未満の犯罪傾向が進んでいない男性受刑者を受け入れる。2018年度の調査では知的障害や発達障害の受刑者に関する統計はなく、その時点は入所時の調査が十分に行われていないと考えられる。外国籍の受刑者はいるものの、日本語が不自由な刑者は受け入れておらず、代わりに大阪刑務所や京都刑務所に収容される。
拘置区画には女性の未決囚も収容され、女性の刑務官も配置されている。廃庁に伴い、拘置区画は京都刑務所の下部機関の滋賀拘置支所となった。