SCF複合体
βTrCP(β-transducin repeat-containing protein)は、有糸分裂初期にWee1と、APC-Cdh1(英語版)の阻害因子であるEmi1(英語版)を分解の標的とするFBPである。βTrCPは、これらがPlk1またはサイクリンB-CDK1によってリン酸化された後に基質として認識を行う。
Fbw7(英語版)は酵母Cdc4のヒトホモログであり、サイクリンE、Myc、Notch、c-Jun(英語版)を分解の標的とするFBPである。Fbw7は細胞周期を通じて安定であり、核局在化配列が存在するため核に局在している。SCF-Fbw7はSwi5とSic1(p27、9つのリン酸化部位のうち少なくとも6つがリン酸化されている場合)を分解の標的とする。Sic1は通常サイクリンB-CDK1を阻害することでS期への移行を防いでおり、Sic1が分解の標的となることでS期への移行が促進される。Fbw7はいくつかの散発性の癌腫においてハプロ不全(英語版)型のがん抑制因子であることが示唆されており、すなわち野生型の表現型の破壊には1つのアレルの変異で十分である。
Fbxo4(英語版)は、ヒトの癌腫においてがん抑制因子であることが示唆されている他のFBPである。SCF-Fbxo4はサイクリンD1を分解標的とすることで細胞周期の制御に関与している。
サイクリンFは筋萎縮性側索硬化症(ALS)と前頭側頭型認知症(FTD)と関係しているFBPである。サイクリンFのリン酸化を阻害する変異はSCF-サイクリンFの活性を変化させ、ALSとFTDでの神経細胞の変性と関係した下流の過程に影響を与えている可能性が高い。通常、サイクリンFはE2f1を分解の標的とする。
SCF複合体はさまざまなF-boxタンパク質と3つのコアサブユニットが含まれる。
F-boxタンパク質(FBP)– FBPは、まずSCF複合体非依存的に標的タンパク質に結合し、SCF複合体の基質特異性に寄与する。各FBP(Skp2(英語版)など)はそれぞれいくつかの異なる基質を認識するが、認識はリン酸化やグリコシル化などの翻訳後修飾に依存している。その後、FBPはF-boxモチーフを利用してSCF複合体のSkp1に結合し、標的タンパク質を機能的なE2ユビキチン結合酵素の近傍へと運ぶ。また、FBPは細胞周期の各段階におけるSCFの活性の調節にも必要不可欠である。SCF複合体のタンパク質レベルは細胞周期を通じて一定であるが、FBPのタンパク質基質に対する親和性はサイクリン-CDKを介した標的タンパク質のリン酸化によって調節されている。
Skp1(英語版)– Skp1はF-boxタンパク質の認識と結合に必要不可欠なアダプタータンパク質である。
Cullin(英語版)(CUL1(英語版))– CullinはSCF複合体の主要な構造的足場を形成し、Skp1とRbx1を連結させる。CullinとFBPのさまざまな組み合わせによって、さまざまな基質を標的とする約100種類のE3ユビキチンリガーゼが形成される。
Rbx1(英語版)– Rbx1は亜鉛を結合する小さなRINGフィンガードメイン(英語版)を含んでおり、E2ユビキチン結合酵素を結合する。この結合によって、E2酵素から標的タンパク質のリジン残基へユビキチンの転移が行われる。