医師団陰謀事件
シオニストの陰謀という体裁を維持するために、リューミンと、アバクーモフの後任としてMGB長官となったセミョーン・イグナチェフは、その多くがエッチンゲルによる供述が元になったと思われるユダヤ人医師も逮捕リストに加えさせた。彼らの多くは、ミロン・ボフシ(英語版)のようにクレムリンの医療部門と連携していたのである。一連の逮捕は1952年9月に始まった。ヴラシクはスターリンの警備責任者から解任され、最終的にはティマシュクの手紙を無視した件で逮捕された。
当初の逮捕者は37人だった。陰謀疑惑の捜査で捕えられた容疑者らは、拷問によって自分とその仲間に不利な証拠を提示するよう強要された。
スターリンはイグナチェフを叱咤激励し、MGBの無能ぶりを非難した。彼は、既に逮捕されている医師たちの取り調べを加速するよう要求した。スターリンはシオニスト陰謀の明確な全体像がなく、特にユダヤ人の医師が有罪であるという確固たる証拠がないと不満を述べた。
新たに公開されたソ連国家保安委員会の資料により、スターリンが収集した尋問資料をマレンコフ、フルシチョフ、およびその他の「医師団陰謀事件の潜在的な犠牲者」に転送していたことが判明している。
ソ連の他の少数民族の強制移送同様、医師団陰謀事件はユダヤ人に対する大規模な弾圧と強制移送の引き金になることを意図していたという見解が、様々な回顧録や二次的な証拠に基づき存在する。しかし、この計画はスターリンの突然の死によって達成されなかった。
ルイス・ラポポート(英語版)によれば、投獄された医師たちの公開処刑から始まった大量虐殺は、その後、次のように計画されていたという。
1953年のスターリンの死の直前、シベリア南部とシベリア西部に4つの大きな収容所が建設されたが、それらはユダヤ人のための物だと噂された。これらの収容所にユダヤ人を強制移送する計画を立てるため特別に「強制移送委員会」が作られたとされている。数年後、「委員会」の秘書だったニコライ・ポリャコフは、スターリンの最初の計画によれば、1953年2月中旬には強制移送が開始される予定だったが、まだ、対象となるユダヤ人をリストアップするという大作業が完了していなかったと述べている。まず、「純血」のユダヤ人が追放され、次に 「混血」(英語版)が追放されることになっていた。