シェナンドー軍 (南軍)
シェナンドー軍は、バージニア州(現在のウェストバージニア州)ハーパーズ・フェリーを確保・防衛するために派遣された多くの民兵や志願兵大隊を組織して結成された。これら大隊の組織と訓練のため、バージニア州司令官であったロバート・E・リーは、当初トーマス・(ストーンウォール)・ジャクソンを司令官に任命した。ジャクソンは中隊を再編して、歩兵5個連隊と1個砲兵中隊を組織したが、これが後のストーンウオール旅団(Stonewall Brigade)の基礎となった。5月15日、ジャクソンに代わってジョセフ・ジョンストンがハーパーズ・フェリーの司令官となり、アメリカ連合国各地から幾つかの旅団を受け入れた。最終的には4個歩兵旅団、J・E・B・スチュアートが指揮する1個独立騎兵連隊(第1バージニア騎兵連隊)を有することとなった。
6月中旬、ロバート・パターソンを司令官とする北軍ペンシルバニア軍管区の部隊がハーパーズ・フェリーに向かって南下を開始した。街の周囲の地形から防衛不能と恐れたジョンストンは、橋と街の設備を破壊して、南方のウィンチェスターに後退した。パターソンはジョンストンを追撃せず、ポトマック川沿いに部隊を留めた。