直仁親王
延文2年(1357年)2月になると、光厳上皇、崇光上皇と共に金剛寺より京都に帰還するが、京都では既に崇光天皇の実弟である後光厳天皇が尊氏によって擁立された後であり、崇光天皇と皇太子直仁親王の復位要求は拒絶された。
直仁親王は失意のうちに出家して父の御所であった萩原殿に隠退し、南北朝合一後に薨去した。『本朝皇胤紹運録』には掲載されていないものの、『看聞日記』などの記事によって親王には周高西堂(応永26年8月13日没)と任西堂(永享3年没)の2皇子、尊立と称される1皇女が存在したのが知られている。だが、全員出家しておりその子孫は伝わっていない。
なお、直仁親王の出家によって長講堂領などの持明院統の所領を彼とその子孫が継承する予定は取り消され、光厳法皇は改めて、長講堂領などの主要な所領は崇光上皇に、室町院領は直仁親王に一期分として与えることにしたが、応永元年正月に崇光上皇が、5月に直仁親王が相次いで亡くなった。崇光上皇の崩御後に後小松天皇(後光厳天皇の孫)は栄仁親王(崇光上皇の皇子)から長講堂領などを没収したために紛争になっていたが、足利義満の仲介によって直仁親王亡き後の室町院領を栄仁親王に与えることで事態を収拾させた。ところが、栄仁親王の後を継いだ貞成親王が室町院領以外の直仁親王の所領も室町院領であると称して直仁の皇子・皇女から没収しようとしたことから双方の間で紛争になったが、直仁の子孫が断絶したことによりそのほとんどが伏見宮領に編入された。