高千穂神社
また社伝によれば、源頼朝が天下泰平祈願のために畠山重忠を代参に派遣して多くの神宝を奉納、この時重忠によって現存する重要文化財の鉄製鋳造狛犬1対が献納され、境内にある「秩父杉」(高千穂町指定天然記念物)も重忠自らが植えたものといい、文永・弘安の役には敵国降伏祈願のために勅使が差遣されたという。鎌倉時代中頃からは高知尾庄に北条氏被官の安東氏の勢力が進出して来る一方で、熊野別当の後胤を称す浦上氏も預所職を務めるなど当神社を含めた一帯の支配を強めるようになった。また、鎌倉時代末から高知尾氏に代わり島津氏が地頭となる一方、高知尾氏も三田井氏を称して三田井郷の地頭職を所持するなど、この頃から社領や神事を巡る相論が頻出しだし、南北朝時代にはこれに加えて南朝方に与する阿蘇氏の勢力も進出、社伝によれば征西将軍懐良親王による祈願のための神宝が奉納されたというが、以後阿蘇氏支配の下、「高千穂郷総鎮守」として崇められた。
近世には寛永年間(1624-44年)に延岡藩主有馬氏から200石の寄進を受け、元禄10年(1697年)に同藩主三浦明敬による親拝、内藤氏も例祭に代参を差遣し神事料を寄進するなど、歴代延岡藩主から崇敬を受けた。
1871年(明治4年)7月に延岡県の県社、11月に美々津県の県社とされたが、宮崎県に改組されると1873年(明治6年)に村社とされた。戦後は神社本庁に参加し、1971年(昭和46年)に別表神社となった。
高千穂峡
十社大明神大明神市ノ正森 - 当神社前にある町指定史跡。市之神社が鎮座する。
鬼八塚 - 十社大明神に退治された鬼八が埋葬後に再生し、再び早霜を降すなどの害をなしたため、その体を3つに切り、3所に分けて再葬した跡であると伝える。字神殿にあるものが「首塚」、徳玄寺横の自然石墓が「胴塚」、高千穂高校にあるものが「手足塚」であるという。ちなみに高千穂峡にも鬼八が投げた石と伝える「鬼八の力石」があり、高千穂町大字上野字鬼切畑には鬼八を切った場所とされる「鬼切石」が、同大字向山字竹之迫には鬼八が膝を付いて十社大明神へ弓を射た場所と伝える「鬼八の膝付き石」がある。