野崎島
森林の多くが天然林で、イスノキ、スダシイ、ヤブツバキ等の樹木等で成り立っている。北部にある沖ノ神島神社周辺には原生林が残る。
現在、島には400頭ほどの野生の鹿(キュウシュウジカ)が生息している。過疎化によって耕作地が放棄されたため害獣とされた鹿の駆除が行われなくなり、天敵となる動物が存在しないため一時は700~900頭ほどまで増加したが、自然淘汰により現在の数まで減少したとされる。
鳥類では、長崎県で普通に見られる種の他、天然記念物であるカラスバトが生息する。
島内を南北に貫く山道は、1970年代に九州自然歩道の一部として整備されている。(但し、2015年現在、北部の道は荒廃しており通行は推奨されていない。)この内、舟森~野首集落間を結ぶ区間は野首教会が完成するまでは、1882年(明治15年)に舟森に建てられた瀬戸脇教会(現存せず)へ礼拝に向かう「信仰の道」として世界遺産の構成資産となっている。