ヴィルヘルム・カナリス
ドイツ海軍はカナリスのこの脱走劇を高く評価し、カナリスをスパイとして一級の素材と判断した。1915年11月にカナリスは海軍大尉に昇進するとともに中立国スペインへ派遣され、ここにUボート補給基地を作る工作任務を与えられた。マドリードについたカナリスは「キーカ」なる偽名で工作を開始した。スペインの人士に様々なコネクションを作り、Uボートの秘密補給基地を作りあげた。この補給基地から出る漁船に偽装した補給船からUボートは弾薬や食糧、燃料を受け取り、活動の場を地中海西岸にも広げることが可能となった。またカナリスは連合軍船舶の正確な位置情報などをアドリア海ポーラにあるドイツ海軍Uボート基地に伝達した。なおこのスペイン滞在中にスペイン陸軍将校フランシスコ・フランコ(後のスペイン独裁者)と親しくなっている。
1916年に入るとドイツ海軍本部からキール軍港で魚雷艇の訓練を受けよとの命令を受けた。カナリスはドイツへ帰国するため、再度チリ人になり済まして、敵国のフランスと北イタリアを列車で通過して中立国スイスへ入ろうとしたが、スイスに入る前にイタリア警察に捕まってしまい、ジェノヴァの刑務所へ送られた。この後、スペインのマドリードに戻った(その経緯は諸説あり定かではない。脱走ともイタリアに送還されたともいわれる)。スペインからUボートでドイツへ帰国した。1917年に潜水艦隊に異動となり、大戦の後期二年はUボートに勤務した。終戦時にはUボートの艦長となっていた。
カナリスは大戦中に「マタ・ハリ」ことマルガレータ・ヘールトロイダ・ツェレとの交際があり、恋人でもあった。
名誉十字章前線戦士章
1918年版Uボート戦闘徽章
一級及び二級剣付戦功十字章
鉄十字勲章 1914年版二級鉄十字章 1939年版二級鉄十字章略章 1914年版一級鉄十字章 1939年版一級鉄十字章略章
ドイツ十字章銀章
カナリスは他の多くのドイツ軍人と同様、ドイツ革命とヴァイマル共和政に反対し、フライコール(義勇軍)に参加した。エアハルト海兵旅団(コンスル(執政官組織)の前身)の指導者ヘルマン・エアハルトと仲間と見られる。
1919年にカナリスは、ローザ・ルクセンブルク ならびにカール・リープクネヒト殺害で告発された同義勇軍メンバーの軍法会議に関与した。被告の大部分は釈放された。カナリスの手回しによるところが大きかった。同年彼はエリカ・ヴァークと結婚した。カナリス夫妻は二人の娘をもうけた。
その後、カナリスはグスタフ・ノスケ国防相の副官の一人となったが、1920年のカップ一揆に関与したために一時逮捕された。しかし無罪となりすぐに釈放されて、結局、キール軍港へ左遷されるのみで済んだ。
カナリスは1923年にブレーメン級小型巡洋艦「ベルリン」の艦長となり、ここで海軍に入隊したばかりのラインハルト・ハイドリヒと知り合う。ハイドリヒを引き立てて彼を海軍士官学校へと進ませた。ハイドリヒとカナリスは年齢は離れていたが、親密な交友関係を持つようになった。しかしハイドリヒは結局、1931年に女性問題のもつれから海軍を不名誉除隊することになる。