トーマス・ホジキン
帰国したホジキンは検死に携わりながら、1825年にボランティア職員として、翌1826年には付属博物館の学芸員としてガイ病院(英語版)で働き始めた。彼自身は仕事について、このポストのおかげで病態解剖(英: morbid anatomy)が学べると喜んでいたという。なおこの病態解剖とは、現在の病理解剖(英語版)にあたるものである。
しかしながらホジキンの病院でのキャリアは、1837年に、横暴な病院理事ベンジャミン・ハリソン(英語版)と衝突したことで終わりを告げる。ハリソンはホジキンの進歩的な視点と、新設されたユニヴァーシティ・カレッジ・ロンドンへの支援を嫌って立腹した(下記参照)。正反対の内容である2つのインタビューが出され、ハリソンはホジキンを「アシスタント・フィジシャン」(英: Assistant Physician)に昇格させないことについて、彼が直前に病気を患っていたことを理由に弁解した。一方ホジキンの友人たちはこの問題を理事会に提起したが、理事会の意見は辛辣で、待遇改善は望み薄だった。結局、対抗馬のベンジャミン・ガイ・バビントン(英語版)がこの地位を手に入れ、ホジキンは病気治癒後渋々個人医院に移った。1840年には先住民保護協会(英語版)代表として、世界反奴隷制度大会(英語版)に参加している。
ホジキンは1850年に、未亡人だったサラ・フランシス・スケイフ(英: Sarah Frances Scaife)と結婚した。2人の間に子供はいなかった。レディ・モンテフィオーレが1862年に死去する直前、ホジキンは、これから彼女の夫モージズ・モンテフィオーレ(英語版)が旅行する際には同行することを約束している。1866年には、モージズ・モンテフィオーレのパレスチナ旅行へ同行している。ホジキンはそこで赤痢にかかり、1866年4月5日に客死した。彼の遺体はヤッファに埋葬されている。