徳島運転所
2000番台9両 (2107, 2108, 2110, 2142 - 2145, 2147, 2148) が配置されている。なお全車がワンマン運転に対応しているが、トイレは改造時に撤去されている。
高徳線・牟岐線(徳島 - 阿南間)・鳴門線で運用されている。以前には、阿佐海岸鉄道阿佐東線でも運用されている時があった。
2019年3月31日付で2146が、2020年1月31日付で2109が、それぞれ廃車された。