海峡線
快速「海峡」(ED79形電気機関車 + 50系・51系客車または14系客車、青森駅 - 函館駅間) 1988年(昭和63年)3月13日に運行開始。2002年(平成14年)12月1日に特急「白鳥」・「スーパー白鳥」に置き換え。
特急「はつかり」(485系電車、盛岡駅 - 函館駅間) 1988年(昭和63年)3月13日に運行開始。2002年(平成14年)12月1日に特急「白鳥」・「スーパー白鳥」に置き換え。
寝台特急「日本海」1・4号(ED79形電気機関車 + 24系客車、大阪駅 - 函館駅間) 1988年(昭和63年)3月13日に運行開始。2006年(平成18年)3月18日に青森駅 - 函館駅間廃止。
寝台特急「北斗星」(ED79形電気機関車 + 24系客車、上野駅 - 札幌駅間) 1988年(昭和63年)3月13日に運行開始。2015年(平成27年)3月14日に定期運行終了。同年8月22日(上野発)・23日(札幌発)に臨時運行終了・廃止。
臨時特急「ドラえもん海底列車」(781系電車、吉岡海底駅 - 函館駅間) 2003年(平成15年)7月19日に運行開始。