マウトハウゼン強制収容所
マウトハウゼンでも囚人を使った様々な人体実験が行われた。マウトハウゼン強制収容所の医師長はエドゥアルト・クレープスバッハ親衛隊少佐が務めていた。恣意的な囚人の人体組織摘出が行われた。所内には解剖室が存在し、そこには人体組織が瓶詰にされていたという。
この収容所で拷問と殺人を行ったとされるオーストリア人医師アリベルト・ハイム(Aribert Heim、1914 - 1992)は、1962年にドイツから南米に逃亡し、逃亡中のナチス戦犯を追跡しているユダヤ人組織によると、存命するとされるナチス戦犯の中では最も重要な追跡対象となっていた。しかし2009年2月、ZDFとニューヨーク・タイムズの共同調査により、ハイムはエジプトのカイロに潜伏し、イスラム教に改宗してタレク・ファリド・フセインという偽名を用いて30年近く生活していたが、1992年8月に直腸がんで死亡していたことが明らかになった。
(しかし第二次世界大戦後期・末期、ドイツの戦況が悪化するにつれ、どこの収容所も大量の死亡者を出し、劣悪な生活環境という点ではマウトハウゼンとあまり変わらない状況に陥った。)
大戦中の「夜と霧の布告」で連れ去られた者たちが送られたのは主にこの収容所であった。
この収容所は絶滅収容所ではなかったが、ガス室が設置されていた。ここでガス殺された囚人の数は、後のヴェストファーレンでのハーゲン裁判などの調査によると3500人程という。また付属収容所のグーゼン強制収容所にもガス室が設置されていた。絶滅収容所ではないので、ユダヤ人やロマなど人種を理由にしたガス殺は少なく、ガス室に送られた者は主にソ連軍の捕虜やチェコ人・ポーランド人などの反体制分子、病人、労働できなくなった者などだった。
大戦末期、東部の閉鎖された収容所から続々と囚人が移送されてきて1945年1月には約85,000人の収容者がいた。強制収容所設立から1945年5月5日にアメリカ軍による解放までの総収容者数は205,273人、死者は102,795人だとされる。同地は、連合軍によって解放された最後の基幹強制収容所である。