潜水艦X-1号
1943年、イギリスの潜水艦が、ドイツ軍の戦艦リンデンドルフに撃沈され、ボルトン少佐、ペニグトン、バーキスト、クエンティン、デイヴィスの5人が命からがら潜水艦が脱出する。 ボルトンは多くの乗組員を失った責任をデイヴィスから指摘されるもおとがめなしとなり、レッドメイン中将から新たな潜水艦X級潜水艦の乗組員の指導を任された。
これら小さいながらも3隻は大量の爆薬を積むことができるため、そこでの生活に慣れてもらうのと、防潜網を切断できるようにしたちと考えたボルトンは、彼らに厳しい訓練を始めた。訓練中にクエンティンがおぼれる騒ぎがきっかけで、ボルトンは部下たちから敵視されてしまう。
ある日、偵察機が基地の近くに出現したことで、訓練が当初の予定よりも繰り上げられ、中身もさらに厳しくなった。
その後、ドイツ軍のパラシュート兵6名が基地に侵入し、うち1人に潜水艦を見られた。6人全員殺すことで機密は保たれたものの、訓練のさらなる短縮は免れなかった。
ここにきて、レッドメインは初めてボルトンに訓練の目標があのリンデンドルフであることを明かす。 そして、3隻の小型潜水艦はリンデンドルフに接近するも、X-2が撃沈される。X-1も負傷して乗員が捕らえられる。そこへ、X-3が爆薬を発射し、リンデンドルフを撃破する。