本別駅
2面3線の単式および島式ホームがある地上駅。廃止時は3番のりばを使用していなかった。
社員配置駅(土日祝休業、7時05分から15時30分まで営業、駅長1名配置、駅員不足のときは足寄駅から助勤)だった。廃止前1ヶ月程度(2006年3月18日以降、ただし3月20日を除く)の期間は土日祝も営業していた。
駅窓口でJR北海道管内の乗車券・特急券・指定券を発売していた。またJR北海道ツインクル商品の取次ぎも行っていた。
「本別町コミュニティーセンターステラプラザ」と併設しており、銀河線本別駅内簡易郵便局なども入居している。