コンパートメント席
新幹線700系電車「レールスター」 8号車の新大阪駅方に、簡易仕切り壁を設けた4人用個室が4室ある。交流電源が1つあり、旅客機のように照明の明るさが調整できる。運賃・指定席特急料金で利用することが可能だが、利用は原則として3名以上である(フルムーン夫婦グリーンパスでは2名利用が可能)。 小倉駅 - 博多駅間のみ運転の「こだま」と博多南線での運用時は自由席であったが、2012年3月17日のダイヤ改正から「ひかりレールスター」以外での運転の場合は締切扱いとなった。
JR東海373系電車 車端部に4人向かい合わせの座席があり、中央にテーブルがある。乗降口とは半透明の黒い衝立で仕切られ、他の客席からも離れている。2・3(・5・6・8・9)号車にあり特急「ふじかわ」や「伊那路」では、同じ車両の他の座席が自由席であっても、この区画のみ指定席として設定されている。 このため各車両側面の号車番号表示器には「自由席」の表記の下に「(一部指定席)」の表記があるほか、車内の座席指定表示器も別個に設置されている。なお、かつて運行されていた「東海」にはセミコンパートメントの自由席があった。 一部の臨時列車においては、この区画が車内展示や添乗員の控室といった定員外のスペースとして使用される。