アントニオ・ルナ
アントニオは1898年8月13日、アメリカ軍がパシッグ川とマニラ湾に面したイントラムロス地区に上陸するのを目撃した。1898年6月からマニラは革命軍に完全に包囲されており、ルキアノ・サン・ミゲル大佐はマンダルヨンを制圧、ピオ・デル・ピラール(英語版)将軍はマカティを、マリアノ・ノリエル(英語版)将軍はパラニャーケを制圧し、グレゴリオ・デル・ピラール(英語版)はサンパロックを進軍した。アントニオはフィリピン軍はイントラムロス地区を占領すべきだと考えたが、アギナルドは、アメリカ海軍アジア方面戦隊司令官ジョージ・デューイの忠告に注意したため、アントニオを塹壕に派遣し、部隊を指示するよう命じた。アメリカ軍の占領の混乱が過ぎると、アントニオはアメリカ軍の無秩序についてアメリカ軍将校に不平を述べるようになった。
アギナルドはアントニオを1898年9月26日、軍事作戦長として准将に任命した。アントニオは官僚としての地位を得たという気休めよりも、熱気ある不幸な若者の部隊を正規軍として組織することに専念した。1898年10月には軍事学校アカデミア・ミリタールをマロロス市内に創設し、1896年のフィリピン独立革命で活躍した軍隊の訓練を行った。ホセ・アレヤンドリノ(英語版)将軍の協力もあり、また兄であるフアンは学校の制服であるラヤデロ(英語版)をデザインした。アントニオは厳しい規律を重視し、忠誠を重んじた。しかし、この学校は米比戦争の勃発によって活動の中断を余儀なくされた。
また、アントニオは民族意識の覚醒がフィリピン人の強化につながると考え、4ページの日刊紙新聞ラ・インデペンデンシアを1898年9月に刊行した。