瑞鶴 (空母)
1名は大淀に救助され、8名は初月に救助された。しかし、救助できず溺死した複数の搭乗員も大淀から目撃されている。
13時頃から始まった第三波攻撃では、小沢艦隊の他の空母が既に大破・沈没したこともあって、攻撃は瑞鶴に集中した。速力低下を来たしたことが致命傷に繋がり、左舷に4本、右舷2本の魚雷を受けた。また爆弾も5-7発命中し、揮発油タンクなどに引火して火災が発生した。左舷に20度傾斜し、「1325 艦内浸水・火災猛烈 處置ノ手段ナシ」という状態となった。対空火器は爆撃によって破壊されるか、動力を絶たれて使用不能となった。辛うじて残った右舷の高角砲が最期まで射撃を継続していたが、砲身が過加熱して焼けるなどして迎撃継続が困難となり、最終的に傾斜が増して旋回不能になり沈黙した。
13時27分、瑞鶴の貝塚艦長は「総員発着甲板ニアガレ」を下令した。
13時55-58分頃「軍艦旗降下」に至り、総員退艦が発令された後、傾斜は増していった。瑞鳳は14時7分に「瑞鶴左ニ傾斜発着甲板水際ニ浸」と報告している。直後の14時14分、瑞鶴は直立するように沈没していった。大淀記録(戦闘詳報)14時20分。瑞鶴の沈没時にはアメリカ軍の攻撃は終了しており、総員退艦時に撮影された瑞鶴の飛行甲板での写真は有名である。沈没地点は北緯19度57分、東経126度34分と記録されている。
艦底近くで敵信傍受を担当する特信班員だった近藤恭造は沈没後、駆逐艦若月に救助された。
第一航空戦隊は機材と搭乗員の一部を第二航空戦隊(隼鷹、飛鷹)に移載し、整備・修理のため内地帰投が決まる。 5月3日、第一航空戦隊(瑞鶴、瑞鳳)は軽巡洋艦「阿賀野」、駆逐艦「雪風」、「夕雲」、「秋雲」に護衛されてトラック泊地を出発。瑞鶴隊は5月8日呉到着。瑞鳳隊(瑞鳳、嵐、漣)は佐世保に回航された。
この時期に瑞鶴は21号電探を装備、艦橋周辺などに機銃を追加した。アメリカ軍のアッツ島来攻(アッツ島の戦い)に伴い、連合艦隊水上部隊主力は東京湾に集結し、北方作戦に備える。
5月18日、修理を終えた翔鶴と共に呉を出発。5月21日、機動部隊(空母3隻《翔鶴、瑞鶴、瑞鳳》、巡洋艦5隻《熊野、鈴谷、最上、大淀、阿賀野》、駆逐艦3隻《浜風、嵐、雪風》)は横須賀に到着した。だが翔鶴状況は「四月末人員整備個艦教育ヲ漸ク終了」、瑞鶴の状況は「人員補充漸ク終ッタバカリ、大兵力ヲ以テルス演練不足」であり、連合艦隊司令部としても作戦に自信を持てなかったという。 5月29日(報告30日)、アッツ島守備隊(指揮官山崎保代陸軍大佐)は玉砕。有力な米水上部隊の不在、燃料不足、守備隊玉砕という観点より、機動部隊の北方作戦参加は中止。各艦・各部隊は横須賀を経由して内海西部へ回航された。
第一航空戦隊(瑞鶴、翔鶴、瑞鳳)と巡洋艦2隻(最上、大淀)は秋月型駆逐艦3隻(涼月、初月、新月)および第27駆逐隊(時雨、有明、夕暮)に護衛されて内海西部に移動した。
6月20日、瑞鶴艦長は菊池朝三大佐に交代。
6月30日、アメリカ軍がレンドバ島に来攻。機動部隊はトラック進出となった。これは兵力増強によりレンドバ島奪還を図ろうというものであったが、戦況から結局奪還作戦は実施に至らなかった。