二乗平均平方根誤差
RMSDをIQRで分けると、正規化された値は対照となる変数の極端な値に対する感度が低くなる。
R M S D I Q R = R M S D I Q R {\displaystyle \mathrm {RMSDIQR} ={\frac {\mathrm {RMSD} }{IQR}}} (ここで I Q R = Q 3 − Q 1 {\displaystyle IQR=Q_{3}-Q_{1}} )
Q 1 = CDF − 1 ( 0.25 ) {\displaystyle Q_{1}={\text{CDF}}^{-1}(0.25)} であり Q 3 = CDF − 1 ( 0.75 ) {\displaystyle Q_{3}={\text{CDF}}^{-1}(0.75)} である。CDFは分位点関数(英語版)である。
測定値の平均値で正規化する場合、曖昧さを避けるためにRMSDの変動係数(coefficient of variation of the RMSD, CV(RMSD)) という用語を使用することがある。これは、標準偏差の代わりにRMSDを用いた変動係数に類似する。
C V ( R M S D ) = R M S D y ̄ . {\displaystyle \mathrm {CV(RMSD)} ={\frac {\mathrm {RMSD} }{\bar {y}}}.}
気象学において、大気の挙動を予測する数学的モデルの効果を確認するために使用される。
バイオインフォマティクスにおいて、原子位置の二乗平均平方根偏差は重ね合わせたタンパク質の原子間の平均距離の尺度である。
構造に基づく医薬品設計では、RMSDはリガンドの結晶コンフォメーションとドッキング予測との間の差を示す尺度である。
経済学において、RMSDは経済モデルが経済指標に適合しているか否かを決定するために使用される。専門家の中には、RMSDは相対絶対誤差よりも信頼性が低いと主張する者もいる。
実験心理学において、RMSDは行動に関する数学または計算モデルが経験的に観察された行動をどの程度説明できるかを評価するために使用される。
地理情報システムにおいて、RMSDは空間分析やリモートセンシングの精度を評価するための指標の1つである。
水文地質学において、RMSDとNRMSDは、地下水モデルのキャリブレーションを評価するために使用される。