ウイルス定量
PCRは、完全な感染性ウイルス粒子(ビリオン)、壊れたウイルス粒子、溶液中の遊離核酸を含む、すべての標的核酸を増幅する。このため、qPCRの結果(ゲノムコピー/mLで表される)は、TEMの結果よりも通常大きな値になる。ウイルスの定量化では、核酸のコピー数に対するビリオンの比率が1対1になることは稀である。これは、ウイルス複製中に、核酸とウイルスタンパク質が常に1:1の比率で生成されるとは限らず、ウイルスの組み立てプロセスにより、完全なビリオン、空のキャプシドや、過剰な遊離ウイルスゲノムが生じることによる。口蹄疫ウイルスの例では、活発に複製している宿主細胞内の全ビリオンとRNAコピーの比率は約1:1000である。qPCRベースのウイルス定量用の製品は、多くの企業から市販されている(例:Invitrogen、Roche、Qiagenなど)。 qPCRによる定量の利点には、迅速な分析時間(1〜4時間)と感度(他の方法よりもはるかに低い濃度のウイルスを検出できる)などがある。