守矢氏
「丸に左十字」を使用している。島津氏の家紋と似ているが、由来は不明であり、先代が功績を挙げて島津氏から頂いたという説や、守矢氏へ養子入りしたといわれる平忠度の末子の重実が使用した紋という説などが上げられる。なお諏訪藩の隣にある高遠藩の内藤家も同じ家紋を使用したことがある。
「第II期古墳」と呼ばれる古墳は横穴式石室を持つことと、それまではなかった馬関連の副葬品が多量にみられるのが特徴で、明らかに第I期古墳文化の勢力とは性質の異なる文化である。この時代に馬飼集団が伊那谷から天竜川を遡って諏訪へ移動したと推測される。
第I期・第II期古墳を造営した勢力については以下の3通りの解釈が挙げられている。
第I期古墳は土着の守矢氏を征服した神氏のもので、第II期古墳文化は金刺氏(科野国造家の一派、後に諏訪下社の社家)がもたらしたもの
第I期古墳は熟成した土着文化(守矢氏)が作ったもので、6世紀には神氏と金刺氏の流入とともに第II期古墳文化が出現した(ただ、神氏と金刺氏は同族とするか別族とするかで見方は異なる)
第I期古墳は神氏や金刺氏以前に外部から進入してきた守矢氏のもの
なお、中野市(北信地方)にはフネ古墳と類似している同時期の古墳が見つかっている。当時ヤマト王権中枢で採用されていた割竹形木棺がみられることも含めて、フネ古墳を在地の首長の墓とする説には無理があるという見解もある。この説においては、フネ古墳の存在は5世紀の諏訪が既にヤマト王権にとって重要な地域だったことを表している。
諏訪地方に伝わる伝承によると、諏訪大社の祭神・建御名方神(諏訪明神)が諏訪に侵入した際に地主神の洩矢神と相争った。戦いは建御名方神の勝利に終わるが、敗北した洩矢神は諏訪の統治権を譲り、建御名方神に忠誠を誓いそのもとに祭政を司ることとなった。この神話は守矢氏が諏訪盆地にやって来た外来勢力(のちの神氏)に征服された事を反映していると考えられる。
この説話をもとに守矢氏を土着の勢力集団と考えるのが一般的だが、外部から流入してきたという説もある。また、上記の通りに物部氏とは何らかの繋がりがあるのではないかと思われる。
洩矢神の血筋の千鹿頭神が諏訪を出て、その跡を継いだのは建御名方神の孫神という『守矢氏系譜』に書かれている内容を、土着部族が諏訪から離れた(あるいは追われた)後に神氏の一派が先住民の祭祀を肩代わりして守矢氏となったことを意味するという見方がある。一方で、寺田・鷲尾の説では守矢氏は神氏よりも前に上伊那にある藤沢川流域から杖突峠経由で諏訪に入り、土着民を征服・駆逐した後に(千鹿頭神の離脱伝承はここから来ているという)その鉄鐸祭祀を占有した氏族とされている。
この神話を史実と結びつける説は現在ほぼ定説となっているが、中世に流布していた聖徳太子と物部守屋の争い(丁未の乱)にまつわる伝承に影響された、あるいはその説話をもとにして創作されたという見解もある。また、この神話自体は諏訪の神に「軍神」という新たな性格が追加された際(平安末期以降)に造作されたものであって、考古学的知見と結びつけるべきではないという意見もある。