超頭脳シルバーウルフ
瀕死の重傷を負った耕助は再び「銀髪の耕助」となり、遺跡の謎を解き始める。それ以降、小早川家は数々の古代遺跡の秘密を狙う数多くの機関の争いに巻き込まれてゆく。戦いの中で「銀髪の耕助」は「シルバーウルフ」と呼ばれるようになり、耕助の父を抹殺した天才児選民組織「ローレンツ財団」との戦いに発展する。
一方、耕助自身の体もまた「銀髪の耕助」と「普通の耕助」とのアンバランスに蝕まれていた。耕助自身の体が「銀髪の耕助」の能力についていけず、最終的にそれは肉体と頭脳の酷使という形で寿命を削る結果を招くことになる。そして「ローレンツ財団」は最終作戦を展開。彼らは超古代の最終兵器を蘇らせて人類絶滅を企みだしたのだ。耕助は友を救うために財団の本拠へと乗り込み、犠牲を成しながらも財団の主を倒す。全てが終わった後、「銀髪の耕助」はいつ果てるともない永き眠りについた。しかし、再び彼の愛する者たちに危機が訪れた時、耕助の銀髪は再び輝き出すだろう。