軍事参議院
野津道貫大将(1904年1月14日 - 1906年1月31日):薩摩藩
黒木為楨大将(1904年1月14日 - 1909年3月16日):薩摩藩
奥保鞏大将(1904年1月14日 - 1906年7月30日):小倉藩
山口素臣大将(1904年3月17日 - 8月7日):長州藩
伏見宮貞愛親王・大将(1905年1月19日 - 1915年1月9日)
桂太郎大将(1906年1月7日 - 1908年7月14日):長州藩
乃木希典大将(1906年1月26日 - 1912年9月13日):長州藩
川村景明大将(1906年1月26日 - 8月30日、1908年12月21日 - 1915年1月9日):薩摩藩
長谷川好道大将(1908年12月21日 - 1912年1月20日):岩国藩
西寛二郎大将(1908年12月21日 - 1911年3月10日):薩摩藩
大島久直大将(1911年9月6日 - 1913年9月5日):秋田藩
寺内正毅大将(1911年9月6日 - 1916年10月9日):長州藩
大島義昌大将(1912年4月26日 - 1915年8月15日):長州藩
閑院宮載仁親王・大将:(1912年11月27日 - 1919年12月12日)
浅田信興大将(1914年4月22日 - 1916年10月12日):川越藩
上原勇作大将(1915年2月15日 - 12月17日):陸士旧3期
一戸兵衛中将(1915年2月15日 - 12月17日、(兼)大将:1915年12月17日 - 、1919年8月26日- 1920年6月20日):津軽藩
軍事参議院の構想は1901年(明治34年)4月には陸軍大臣の児玉源太郎による談話に現れている。児玉の構想には陸海軍の合議機関の必要性のほか、都督部廃止による都督の新たな処遇の必要性、元帥府改革(元帥府を取り込んで多数決制とすることで介入を抑える)などの意図があったとされる。しかし、児玉らの軍事参議院条例案は、行政整理案自体がとん挫し、「最上諮詢府」の設置に否定的で海軍将官会議や海軍技術会議など独自の機関が行政整理の対象になっていた海軍の強い反対にあって裁可には至らなかった。
1903年(明治36年)9月に海軍大臣の山本権兵衛から海軍軍令部の海軍参謀本部への名称変更案が出された。首相の桂太郎と元帥の山縣有朋が協議した結果、海軍軍令部を存置して山縣を委員長とする臨時会議で改正を審議することになった。そこで参謀次長に就任していた児玉が山本の大本営条例改正に同調しつつ軍事参議院の設置を推進した。
こうして軍事参議院は明治36年勅令第294号に基づいて設置された。