青梅線
1987年(昭和62年)4月1日:国鉄分割民営化により東日本旅客鉄道(JR東日本)が継承。日本貨物鉄道(JR貨物)が全線の第二種鉄道事業者となる。
1988年(昭和63年) 8月24日:八王子駅 - 奥多摩駅間でトロッコ列車「冒険王」を運転。 12月1日:東京駅 - 青梅駅間で「青梅特快」を運転開始。
1991年(平成3年)3月16日:新宿駅 - 青梅駅間で「おはようライナー青梅」「ホームライナー青梅」が運転開始(車両は当初183系6両編成で、後に9両編成に変更)。
1995年(平成7年)10月:初めての特急列車「ホリデー特急奥多摩・鎌倉号」が185系で運転。
1996年(平成8年)3月16日:八高線八王子駅 - 高麗川駅間の電化に伴い、立川駅まで209系3000番台や103系3000番台が乗り入れ(1999年11月に廃止)。
1998年(平成10年) 4月1日:JR東日本八王子支社の発足により、全線の管轄がこれまでの同社東京地域本社(現在の同社東京支社)から八王子支社に変更される。 5月4日:八王子支社設立を記念して、八王子駅 - 青梅駅間でクモハ40形が運転。 8月13日:石灰石輸送貨物列車がこの日限りで運転終了。
1999年(平成11年)3月25日:JR貨物の第二種鉄道事業(拝島駅 - 奥多摩駅間 30.3km)が廃止。
2000年(平成12年)5月27日:南武線川崎駅 - 奥多摩駅間で南武線と青梅線を直通運転をする快速「川崎-奥多摩ハイキング号」が運転。
2001年(平成13年) 3月20日:東川井信号場が廃止。 8月4日:201系改造の展望型電車が営業運転開始。11月に「四季彩」の愛称が付く。