U.S.S.ヴォイジャー
2377年に地球に帰還したヴォイジャーは2382年までのどこかの時点で退役する。清掃と整備が行われた後にU.S.S.セリトスNCC-75567によって地球まで運搬され、可能性の未来と同様に船自体がミュージアムとして展示されることになった(LD31話「Twovix」)。
2401年時点では、ジョーディ・ラ=フォージ准将が館長を務めるエイサン・プライム軌道上の宇宙艦隊ミュージアムにU.S.S.エンタープライズNCC-1701-AやU.S.S.ディファイアントNX-74205らとともに展示されている(PIC26話「バウンティ」)。宇宙艦隊のどの艦よりも、遥か遠くまでその名を轟かせた艦として、静かに眠っている。PIC最終話にてエンタープライズD同様、ディファイアントとともに稼働する案もあったものの実現はしなかった。
VOY最終話に登場した可能性の未来においては、2393年に帰還、2403年時点においてサンフランシスコのプレシディオに展示され船自体がミュージアムになっていた。
S.S.ドーントレスと、劇場版第10作のU.S.S.エンタープライズEなど限られた場所のみ。一方で、操舵席は古めかしい操縦桿やレバー、アナログメーターなどのトム・パリス中尉の「パネルをタップするだけの操縦はつまらない」という趣味が反映されたディティールもあり、これまでのシャトルとは一線を画す愛嬌のある内装となっている。
従来のシャトルと比較してすべての面において強力ではあるが、特にシールドとセンサー、機動力が強力で以後のエピソードで頻繁に運用されるようになり、第103話「水の惑星に消えた夢」ではモニアン海洋国の深海に潜り、第110話「ボーグ暗黒フロンティア計画(後編)」では危険なボーグ本拠地であるユニマトリックス01に潜入した。第148話「セブンの涙」ではディファイアント級を思わせる鋭い機動力でボーグ艦の残骸デブリが大量に浮かぶ宙域で敵小型艇をかわし、第149話「愛の危機」では亜光速限定のラリーレースに参加し、強化されたインパルスエンジンでその機動力をいかんなく発揮した。なお、同エピソードエピローグでは船体に「Just married」と書かれ、トム・パリス中尉とベラナ・トレス中尉のブライダルカーとしても使われた。
なお、1号機は第146話「聖域ユニマトリックス・ゼロ(前編)」でボーグのクラス4戦略キューブへの侵入の際に破壊されており、第148話「セブンの涙」から登場している2号機は格納式のインパルスエンジンが追加されている他、内装もマイナーチェンジされている。