淀ちゃん
そして19日、別の船に曳航される形で淀川河口付近から出港し、紀伊水道に沈められた。死骸に約30トンの重しを付け、作業船の船底を開いて海に落とすという方法が取られた。大阪港湾局によると、淀ちゃんの死骸処分までに要した費用は合計8019万円だった。
1月20日、大阪市立自然史博物館は淀ちゃんの標本化について大阪市博物館機構を介して大阪市の関係部局に申請していた旨を明かし、遺骸を巡っての経緯を発表した。後日、松井は引き取り希望が無かったという先述の説明を撤回し、同館から骨格標本作成の申し出があったことを明かした。博物館に対応しなかった根拠として、松井は標本作成の工程や手段が博物館側から開示されなかったことを挙げた。大阪市の担当部署はクジラの腐敗が進行していること、および博物館側の申し出が埋設処分という条件に依存していたことを根拠とし、標本作成の意向を松井に伝達しなかったという。
2023年1月時点での遺骸の調査には国立科学博物館も参加していた。同館の田島木綿子によれば、死因は不明ながら、大型船舶との衝突やサメによる捕食といった外傷は認められなかった。加えて田島は、成獣のマッコウクジラが餌の深追いや海流の影響で河口付近まで迷い込むことの蓋然性を低く評価し、何らかの原因で方向感覚を失った可能性があるとした。同年2月22日に同館は研究結果を発表しており、淀ちゃんの死亡時の年齢は歯の成長層から46歳と推定された。マッコウクジラの寿命は約70年であり、死因として老衰は棄却された。大阪湾に進入した理由の断定には至っていない。
海底に沈降した淀ちゃんの遺骸には、今後鯨骨生物群集が形成されると予想される。その後、骨格は長期の時間スケールを経て分解を受け、最後には砂となって海へ還るとされる。