第一次星間大戦
第118基幹艦隊(ボドル基幹艦隊)司令長官ボドルザーは、地球人捕虜を尋問した際に、地球人はプロトカルチャーではないかとの疑念を抱いていた。彼らの知るプロトカルチャーの定義とは「文化を持ったマイクローン」であり、地球人類はその定義に当てはまったからである。その疑念はブリタイやスパイからの報告によりますます大きくなり、ブリタイ艦隊とラプラミズ艦隊の離反によって確信へと変わる。これ以上のカルチャーショックによる自軍の体制崩壊を恐れたボドルザーは、基幹艦隊の全戦力をもって地球人類の駆逐を決定する。
西暦2010年2月11日 マクロス標準時間 午前10時30分、地球圏全域に計測限界を越える約480万隻(4,790,122隻)の大規模艦隊が出現。
ここに至り、ようやく統合軍上層部は事態の深刻さを悟り、統合宇宙軍の総戦力を結集するが、アームド級6隻、宇宙駆逐艦125隻を戦闘配備できたにすぎなかった。地上のアラスカ総司令部では、基幹艦隊への通信の呼びかけと同時にグランドキャノンの発射準備が急ピッチで進められたが、通信は完全に無視され、基幹艦隊は軌道爆撃を開始する。
西暦2012年9月、第1次超長距離移民船団メガロード-01が出航。遂に地球人類の永劫の夢であった宇宙進出が開始される。以降も定期的にメガロード級を旗艦とする超長距離移民船団が地球を出航、2030年からは新マクロス級超長距離移民船団が地球や移民惑星エデンから出航する。
作品世界では大戦終結後も数々の事件、反乱、戦役が勃発しており、小太刀右京による『マクロスF』の小説版『マクロスフロンティア』では、本大戦後の戦乱期を総じて「第二次星間大戦」と表記する歴史学者もいるとされている。
ゼントラーディ軍内部にも、スパイによって持ち込まれた情報や鹵獲品によって地球文化に対するカルチャーショックによる混乱が広がり、とうとうブリタイ艦隊の一部の兵士らがマクロスへ亡命、または出撃命令拒否という、暴動寸前までの騒動となる。これ以上の戦闘継続が困難と判断した艦隊司令官ブリタイ・クリダニクは、マクロスと単独で停戦交渉を打診する事態となる。
一方、マクロスも囮として発進した以上、統合軍からの援軍も期待できる状況ではなく、自衛のため、マクロス艦内の民間人の安全を確保するために独断で停戦交渉の申し入れを受託、了承する。
ゼントラーディからの交渉の使者として、ゼム一級記録参謀エキセドル・フォルモがマイクローン化してマクロスに来艦。双方の状況説明と情報交換を行い、停戦交渉を開始する。 その頃ブリタイは、自分と同様に地球圏に派遣されていたラプラミズに停戦交渉状況を説明するも、その話の際にボドル基幹艦隊総攻撃移動を知り文化に触れた自分達も地球人と共に消されると判断しゼントラーディ軍からの離反を決意。