マリオ&ルイージRPG
本作のメインモード。ストーリー本編を遊ぶ事が出来るモード。ゲームボーイプレーヤーで遊ぶとコントローラの振動機能を使う事が出来る。
マリオとルイージの家。ここでは作中で唯一キノピオを操作して進むことになる。奥の風呂場でマリオと遭遇してからは、視点がマリオに切り替わる。
東部の海、クスオーシャンに浮かぶ、神殿がそびえ建つ不思議な島。クス・ジーが住んでいる。ここから南へ進むとミニゲームが出来る島がある。
ルイージがマリオを後ろからハンマーで叩いて背丈を半分ほどに縮める。壁の穴などの隙間に潜り込める。この場合、2人は別行動となる。もう1回ハンマーで叩くか、敵に触れると元に戻る。この状態のみ、地面に物が埋まっている場合、マリオの頭上に「!」が現れる(大・小の2つがあり、大の場合は埋まっている場所の真上に、小の場合は埋まっている場所から周囲1マス以内にいると現れる)。後に『3!!!』と『4』でこのアクションは再登場した。
ウフ村に住むハンマー職人。ストーリーの途中でマメーリア王国の東のエリアに引っ越す。マリオブラザーズに「オホホブロック(『DX』ではオホホロック)」で作ったハンマーを授ける。ハンマー職人だけあって、ハンマーのような体をしている。ウフマウンテンのふもとではマリオブラザーズに自ら向かい、バトルでのハンマーの使い方についても教える。
『マリオ&ルイージRPG1 DX』の「クッパ軍団RPG」ではハンマーブロスと意気投合する。
ウフマウンテンの麓にある遺跡。怖ろしいモンスターが住み着いており、このモンスターに襲われると凄惨な目に遭うという噂がある。
マメ熱にかかったマリオを助けるために「クラピコ草」を求めてルイージが単独で向かう。クラピコ草を入手して遺跡から出ると、以降二度と入ることはできなくなる。
古代ウフ文明の子孫といわれている民族。ウフ村に住んでおり、サボテンとハニワを足して2で割ったような姿をしている。ウフ村以外にも、リトルキノコなどにも登場する。
南東部にある地形。リゾート地にもなっていて、観光客が訪れている。