国立国際医療研究センター
1979年(昭和54年)7月、国立身体障害者更生指導所が国立身体障害者リハビリテーションセンターに統合され埼玉県所沢市に移転し、跡地には1984年に全国身体障害者総合福祉センター(戸山サンライズ)が建設された。
東京第一病院・国立病院医療センターでは、歴代院長のうち坂口康蔵(第2代、内分泌・代謝学)、栗山重信(第3代、小児科学)、市川篤二(第4代、泌尿器科学)、織田敏次(第7代、消化器内科学)、高久史麿(第8代、血液内科学)はいずれも東京大学医学部からの転任者で、同名誉教授である。また第5代院長・小山善之は東京帝大第三内科在職当時、坂口の下で内科学講師を務めている。
なお「国立東京第一病院」の名称は、目黒区にある国立病院機構東京医療センターの旧称「国立東京第二病院」に対するものだが、本病院は大日本帝国海軍由来の東京医療センターとは歴史的にも別組織である。
退職した総長はいずれも名誉総長・名誉理事長の称号を受けている。
1993年10月 - 1996年3月 高久史麿 (元東京大学医学部長・国立病院医療センター病院長(第9代、1990年-1993年)、研究所長事務取扱(1993年-1994年)、前自治医科大学学長、東京大学名誉教授、地域医療振興協会会長。血液内科学)
1996年4月 - 2000年3月 鴨下重彦(元東京大学医学部長・国立国際医療センター病院長(第2代、1994年-1996年)、東京大学名誉教授、小児科学)
2000年4月 - 2004年3月 矢崎義雄(国際医療福祉大学総長、元東京大学医学部長・国立国際医療センター病院長(第4代、1999年-2000年)、前独立行政法人国立病院機構理事長、東京大学名誉教授、循環器内科学)
2004年4月 - 2008年3月 笹月健彦(元九州大学生体防御医学研究所長、国立国際医療センター研究所長(第3代、2001年10月-2004年3月、2005年(事務取扱))、免疫学・遺伝子学、九州大学名誉教授)
2008年4月 - 2012年3月 桐野高明(元東京大学副学長、前研究所長(第5代、2005年-2008年)、脳神経外科学。2010年4月より理事長)
2012年4月 - 2017年3月 春日雅人(元神戸大学医学部附属病院長、前研究所長(第6代、2008年-2012年)、内科学・糖尿病代謝学。2018年4月より公益財団法人朝日生命成人病研究所所長)
2017年4月 – 現職 國土典宏 (元東京大学大学院医学系研究科教授、東京大学名誉教授、消化器外科学)