マルケータ・ラザロヴァー
父とアレクサンドラとの間で板挟みになったクリスティアンは発狂しており、アレクサンドラは彼を殺してしまう。その後、アレクサンドラは伯爵に捕らえられ、クリスティアンを殺した罪で連行される。
マルケータはミコラーシュを愛するようになっていたが、彼に諭されて父ラザルの元に戻るが、ラザルは未婚の身でありながら男に身体を許したマルケータを拒絶する。父の元を去ったマルケータは修道院に向かい、修道女になるための誓いを立てようとするが、ミコラーシュを愛することを知った彼女は修道院長たちの言葉に疑念を抱き、誓いを拒む。同じころ、母カテリーナたちと合流したミコラーシュは父を救出するためムラダー・ボレスラフの牢獄に向かい、兵士たちと戦闘になる。子供に腕を採られながら修道院を後にしたマルケータはムラダー・ボレスラフに向かい、そこで瀕死の重傷を負ったミコラーシュと再会する。ピヴォ隊長はマルケータにミコラーシュへの愛を確認し、2人を夫婦として認めた後、ミコラーシュの死体とコズリークを連れて立ち去っていく。荒れ地でマルケータを見かけたベルナルドは、彼女を旅の同行者として誘うが、新たな相棒になった羊を追いかける間にマルケータは立ち去ってしまう。後にマルケータとアレクサンドラは息子を出産し、マルケータが2人の男児を育てたことが語られ、物語は幕を閉じる。
伯爵は連れ去られた息子クリスティアンの救出を訴えるため、ボヘミア宮廷を訪れる。彼の訴えを聞いた貴族たちは、コズリークに対して積極的な態度を示さなかったヴァーツラフ1世を批判する。その後、シーンは事件の発生から2年前にさかのぼり、そこでは王子オタカルが貴族たちから父王を倒すように説得されている。オタカルは、父王が狩猟の途中で負傷して宮廷に戻り、息子たちに会った時のことを思い出すが、そこで彼が父王を恐れている姿が描かれる。時系列は一連の事件の後へと進み、ピヴォ隊長が伯爵とアレクサンドラをヴァーツラフ1世のもとに連れて来る。アレクサンドラはクリスティアン殺害の罪で有罪判決を受けるが、伯爵は彼女がクリスティアンの子供を身籠っていることを理由に恩赦を求める。次に、ヴァーツラフ1世はオタカルを宮廷に呼び出し、王に対する反乱を計画した罪で投獄する。その中で、ピヴォ隊長はコズリークとの戦闘を思い出す。やがて、ヴァーツラフ1世とオタカルの対立は統治概念を巡る対立へと発展する。ヴァーツラフ1世はアレクサンドラへの関心を失っていき、彼女の恩赦について伯爵に一任する。
『マルケータ・ラザロヴァー』は、キリスト教徒が異教徒を完全に駆逐できていない時代のボヘミア王国を舞台としている。この宗派対立は地方権力と中央王権の対立を反映したものであり、映画の主要なテーマとなっている。映画に登場する勢力のうちコズリーク一族は異教徒、王の連隊はキリスト教と王権の象徴としてそれぞれ描かれている。一方、ラザル一族は表面上はキリスト教徒だが、政治的には中立派であり、ラザルはコズリークからの協力要請を拒否して王権に与したことで報復され、娘マルケータを奪われることになる。
連れ去られたマルケータはミコラーシュに強姦されるが、後にミコラーシュから愛情を注がれることになる。2人のロマンスは純潔と世俗的暴力の出会いを描いたものであり、ミコラーシュの凶暴性と自由さが映画の注目点となっている。2人のロマンスはアレクサンドラとクリスティアンのロマンスと相互作用を起こすが、後者の場合はその立場が前者と逆転している。