別府湾
一村一品に選ばれている特産物として、速見郡日出町の城下かれい(カレイ)、そして同町と杵築市の豊後別府湾ちりめん(カタクチイワシ)がある。
メバル、カサゴ、マゴチ、カワハギ、チヌ、マダイ、イワシ、コノシロ、タチウオ、マアナゴ、アオリイカのほか、関さば・関あじで知られる佐賀関に面していることもあり、サバ、アジも漁獲される。かつては帆船を利用しての漁が行われ、「海底の泥を掻くようなもの」であったために「ドロコギ漁」と呼ばれた。
明治時代までは、瀬戸内海や豊後水道に大型鯨類の周期的な回遊があったとされ、例えばコククジラやザトウクジラ等が別府湾にも来遊していたと思われる。2003年に子供のザトウクジラが短期間滞在し、「かんちゃん」という愛称が付けられるなど話題になった。「かんちゃん」は、小笠原諸島のデータベースでは「ベッピー」という個体名で登録されており、2004年に定置網に混獲された鯨は別個体だとされる。近年は、毎年ザトウクジラが別府湾や豊後水道で確認されている 。