ロックマンワールド3
『3』と違い、敵をショートさせた状態で武器チェンジが可能となっており、『ロックマン』、および『ロックマンワールド』のアイススラッシャーと同様の使い方が可能。
ステージセレクトと決定デモのBGMは『4』のものが使用されており、その為ゲームボーイ作品では唯一のシリーズ伝統の決定BGMが使われた作品である。なお、ステージセレクトのボス配置はそれぞれナンバリング作品の位置を元に配置されているが、前半の『3』のボスのみ「スネークマン」と「ジェミニマン」の位置が異なる(前作の前半ボスの正攻法のルートと被ったためとみられる)。
パスワードのシステムは『2』および『ロックマンワールド』と同じ物が再び採用された(BGMはオリジナルだが、認証の成功と失敗では『4』のSEがそれぞれ使われている)。
カウントが0になると爆発する足場「カウントボム」が初登場し、本作以降のロックマンシリーズにも採用された。
前作では前半ステージをクリアすると、すべてのラッシュの変形パターン(コイル・ジェット・マリン)を入手できたが、今作からは前半ステージでラッシュコイル、後半ステージでラッシュジェットを入手するという仕様に変更された。
GB作品にてオリジナルボス撃破後にゲームオーバーになりステージ選択画面に行けば、オリジナルボスの特殊武器は没収されて再びオリジナルボスと戦って再び入手することになってしまう。しかし本作では、オリジナルボスの特殊武器は没収されず後半ステージに持ち越すことができるようになっている。それでも再度オリジナルボスのパンクと戦うことになるが、自身の特殊武器であるスクリュークラッシャーは効かない。
GB作品では唯一、宇宙へ行かない作品である。
ナンバリング作品準拠の楽曲は、オリジナルよりテンポがゆったりしたペースとなっている。
GB作品では、前半ステージで入手した特殊武器が後半ボスに通用することがあるが、今作のみ最低効果しか得られない(次作以降では、後半ステージの特殊武器で前半ボスにダメージを与えることが可能になった)。また今作のボスは全体的に防御力が高い傾向にある(それぞれのボスに与えられるダメージが0~3に固定されていることが原因と思われる。補足として、最大チャージショットの攻撃力は3である)。