JR西日本ホテルズ
原則として株式会社ジェイアール西日本ホテル開発(京都府京都市下京区)が運営しているが、奈良ホテルはJR西日本の子会社である株式会社奈良ホテル(奈良県奈良市)が運営し、同ホテルの歴史的経緯から近鉄・都ホテルズ(近畿日本鉄道系)とも提携している(2018年8月末までは近鉄グループホールディングスも出資していた)。
シティホテルの「ホテルグランヴィア」シリーズをメインブランドとしてJR西日本管内のターミナル駅で展開している。グランヴィアブランドのホテルのうち、最初から「グランヴィア」として開業したのは京都と岡山(ただし、岡山は現ホテルに建て替えられる前に岡山ターミナルホテルと呼ばれる前身ホテルがあった)のみで、その他はそれぞれ「○○ターミナルホテル(○○には地名が入る)」と称していた。他にも、宿泊特化型の「ホテルヴィスキオ by GRANVIA 」ブランドも展開している。JR西日本グループのビジネスホテルチェーン「ヴィアイン」はジェイアール西日本デイリーサービスネットとJR西日本ヴィアインが運営しており、JR西日本ホテルズ及びJRホテルグループには属していない。
大阪ステーションホテル(THE OSAKA STATION HOTEL, Autograph Collection.) - 大阪駅西地区に開発されている「JPタワー大阪」内に新ブランドホテルを2024年夏に開業予定。同社としては初のマリオット・インターナショナルのオートグラフコレクションに加盟予定。
ホテルグランヴィア京都
ホテルグランヴィア大阪
ホテルグランヴィア岡山
ホテルグランヴィア広島
奈良ホテル
梅小路ポテル京都
前述の通り、ビジネスホテルチェーンの「ヴィアイン」は同じJR西日本系列ではあるが、別企業であるジェイアール西日本デイリーサービスネットの運営であり、またJRホテルグループとはならない。但し、広告出稿やキャンペーンについては共同で実施することがある。 また、同じくJR西日本米子メンテック→JR西日本中国メンテックが運営するビジネスホテル「グリーンホテル米子」やジェイアール西日本ウェルネットが運営する「JRくろしお荘」、JR西日本ファーストキャビンが運営するファーストキャビンステーションもJR西日本ホテルズ・JRホテルグループには属していない。