アイザック・シェルビー
部隊の中から陪審員を集めたがこれはノースカロライナの判事が居たので合法だった。植民地人は任意に捕虜を選りだし、窃盗から放火殺人までの罪で告発した。その夜までに陪審員は36人の捕虜を有罪とし、絞首刑を宣告した。しかし、最初の9人が刑に処せられた後で、シェルビーはその停止を命じた。その命令について理由を述べなかったが、それでも命令は守られ、残った「死刑囚」は仲間の捕虜の所に戻った。
キングスマウンテンの勝者と捕虜達は10月10日朝早くにマクドウェルの領地に戻った。そこからは何人かの指揮官とその部隊が別々の道に進んだ。シェルビーとその部隊はダニエル・モーガン将軍の部隊とサウスカロライナのニュープロビデンスで合流した。そこにいる間にシェルビーはモーガンにナインティシックス砦とオーガスタを占領するよう進言した。というのも、そこにいるイギリス軍がチェロキー族インディアンに武器を供与し開拓者達を襲わせていると考えたからだった。モーガンはその作戦に同意し、その地域の植民地軍最高指揮官のホレイショ・ゲイツも同意した。シェルビーはその作戦が実行されることを確信し、翌年春に300名の部隊を連れて戻ってくると約束して家に戻った。モーガンはナインティシックス砦に向かう途中で、イギリス軍バナスター・タールトンに攻撃され、カウペンスの戦いで決定的な勝利を奪った。シェルビーは後に、シェルビーが家に帰った数日後にゲイツを解任したナサニエル・グリーン将軍がカウペンスでの最大の功績を主張したという事実を悔やんだ。モーガンにその作戦を始めるようにしたのはシェルビーの作戦だった。
新しい憲法の下で有権者が選挙人を選び、選挙人が知事とケンタッキー州議会上院議員を選出した。シェルビーは積極的に知事職を求めた兆候は無いが、1791年5月17日に選挙人の全員一致で知事に選ばれた。シェルビーは1792年6月4日に知事に就任したが、この日はケンタッキー州がアメリカ合衆国の州として認められた日だった。シェルビーは積極的に党派活動をしてはいないが、民主共和党員だと認識された。その任期の大半は基本法、軍事的な組織および税構造の設立に献げられた。
シェルビーの主要な関心の一つは辺境を守るために連邦政府の援助を仰ぐことだった。ケンタッキー州人はオハイオ川の北にいるアメリカ・インディアンと宣戦布告なき戦争をしており(北西インディアン戦争)、アメリカ合衆国陸軍長官ヘンリー・ノックスからはインディアンに対して攻撃的軍事行動を採らないよう命令されていた。さらに、州民兵の徴兵期間を30日間に制限する連邦規定の制約を受けており、あまりに短すぎて有効なものにはならなかった。新生間もない州の貧弱な資源ではインディアンの攻撃から最も脆弱な地域を守るだけで精一杯だった。一方、ケンタッキー州人はインディアンがイギリスに扇動され物資の補給を受けていると疑っていた。
シェルビーはワシントン大統領に援助を訴えた。ワシントンは"マッド"・アンソニー・ウェイン将軍を指名して、北西部領土からインディアンを追い出すように命令することで反応した。ウェインは1793年5月にワシントン砦(今日のオハイオ州シンシナティ)に到着したが、連邦政府のコミッショナー達が依然としてインディアンとの条約を結ぶべく交渉中だったので、即座の行動を執れなかった。
アラバマ州シェルビー郡
イリノイ州シェルビー郡
インディアナ州シェルビー郡
アイオワ州シェルビー郡
ケンタッキー州シェルビー郡
ミズーリ州シェルビー郡
オハイオ州シェルビー郡
テネシー州シェルビー郡
テキサス州シェルビー郡
9つの州の郡がアイザック・シェルビーの栄誉を称えて名付けられた。また多くの都市や軍事施設も同様である。