マルコガタノゲンゴロウ
東北地方 - 青森県(Cランク)・岩手県(Aランク)・宮城県
関東地方
甲信越地方 - 新潟県
近畿地方 - 三重県[絶滅種(EX)]・和歌山県[絶滅種(EX)]・大阪府[絶滅種(EX)]・兵庫県(Aランク)
中国地方 - 岡山県(絶滅危惧I類)・広島県[絶滅種(EX)]・島根県[絶滅危惧I類(CR+EN)]
四国地方
九州地方 - 福岡県(絶滅種)・佐賀県・宮崎県[絶滅危惧IA類(CR-r)(rare)]
2011年(平成23年)4月1日付でフチトリゲンゴロウ・シャープゲンゴロウモドキ・ヨナグニマルバネクワガタ・ヒョウモンモドキとともに「国内希少野生動植物種」(種の保存法)として指定され、捕獲・採取・譲渡(販売など)が原則として禁止されている。また、石川県では「種の保存法」指定に先立ち2006年(平成18年)5月1日付で「石川県指定希少野生動植物種」に指定され、生きている個体の捕獲・採取・殺傷・損傷が原則として禁止されている。