護国丸 (特設巡洋艦)
護衛として駆逐艦山雲と巻波および響が同行した。 この間の10月1日付で特設運送船に類別変更される。トラック諸島を経て10月5日から6日までラバウルに停泊。任務終了で呉淞に戻ったあと、今度は第十七師団の残余兵力を輸送する丁四号輸送に、清澄丸および第十四戦隊(伊藤賢三少将・海兵41期)軽巡洋艦那珂と五十鈴と第二輸送隊を編成して参加した。10月21日に上海を出撃後、アメリカ潜水艦シャードの魚雷をかわし、トラック諸島を経てラバウルに向かうが11月3日に空襲を受け清澄丸が航行不能となる被害を受けた。護国丸は被害なく11月4日にラバウルに入港し、翌11月5日のラバウルへの空襲にも遭遇するが、ここでも被害はなかった。二度の任務を終えて呉に帰投後、呉海軍工廠で特設巡洋艦としての兵装や装備品などを取り外す転換工事を行い、護国丸は名実ともに特設運送船となった。この時、デリックポストの数が4基となり、姉妹船と同じ配置となった。
護国丸の特設運送船としての初任務は、マーシャル諸島方面への輸送任務が予定されていた。セメントなどの資材を搭載して12月27日朝に、特設運送船君川丸(川崎汽船、6,863トン)とともに由良内を出港して横須賀に向かう。しかし、昼ごろに潮岬沖を東航中、君川丸がアメリカ潜水艦トートグの雷撃を受け、発射された6本の魚雷のうち1本が命中し大破する被害を受けて後落、護国丸はそのまま航行を続けたが、深夜になってアメリカ潜水艦ガーナードの雷撃を受けた。ガーナードは魚雷を4本発射し、うち1本が護国丸の一番船倉に命中した。