神道系大学
皇學館大学ではこの官立大学であった時期を「国立大学時代」としている。
しかし、1945年(昭和20年)の敗戦によって、同年12月15日に連合国軍最高司令官総司令部(GHQ)より神道指令が発出。国公立の学校において神道教育およびその調査研究を行うことを禁止する条項が出され、1946年(昭和21年)3月31日をもって神宮皇學館大學は廃学となった。
その後1962年(昭和37年)、神宮皇學館の精神を継承する私立の皇學館大学が再興。文学部、教育学部、現代日本社会学部の3学部を擁し、このうち文学部神道学科と神道学専攻科が神社本庁の神職養成の一翼を担う。皇學館大学学則1条では教育目的を「わが国民族の歴史と伝統とに基づく文化を究明し、洋の東西に通ずる道義の確立を図り、祖国愛の精神を教育培養するとともに、社会有為の人材を育成すること」としている。なお皇學館大学には國學院大學のような神殿はないが、創立の経緯からも現在でも神宮(伊勢神宮)との繋がりが強い。