CTCF
CTCF自身はホモ二量体を形成する。この活性はCTCFがループを形成する機構としての可能性の1つである。
CTCFはYボックス結合タンパク質1(英語版)と相互作用することが示されている。また、CTCFはコヒーシンと共局在し、CTCFによって組織された抑制ループ構造が安定化される。