長崎県公立大学法人
2005年(平成17年) - 長崎県立大学と県立長崎シーボルト大学の設置者が長崎県から長崎県公立大学法人に移管。
2008年(平成20年)4月 - 長崎県立大学と県立長崎シーボルト大学を統合し、新たに「長崎県立大学」を設置。 分離キャンパス(2キャンパス制)をとる。- 佐世保校、シーボルト校 本部は佐世保校に置く。 学校の英語名をNagasaki Prefectural University から University of Nagasaki に変更。
2011年(平成23年)3月 - 旧長崎県立大学、県立長崎シーボルト大学が最後の卒業生を送り出し、閉学。キャンパスとしては存続。