Y-SAPIX
以前はNEXUS(ネクサス)の名称で、中学生・高校生を対象に大学受験指導を行っていた。渋谷(現・渋谷本部、東京都渋谷区桜丘町)の1校舎のみで指定校制でなくして東大(2006年71名)等の難関大学に多数合格者を出している実績があり、特に英語の評価が高いといわれていた。
その後、横浜校開校は断念したものの、比較的渋谷に近いたまプラーザに、SAPIX中学部と校舎を共用する形で新校を開校した。
SAPIXとの中高一貫を前面に打ち出し、人材や資料を一本化するという観点から、2007年2月にグループの組織を改変し、サピックス高校部NEXUS渋谷に名称変更した。さらに、明大前、浦和等の新校を開校したほか、Y-SAPIXの全国展開化により、一時期は38校(高校生コース/中高一貫・中学生コース併設校、高校生コースと中高一貫・中学生コースが近隣エリア内に点在する校舎は1校とみなす)を展開していた。
2009年9月、代々木ゼミナールの関連会社である日本入試センターがSAPIX中学部・高校部を運営するサピエンス研究所の全株式を取得し、子会社化。翌10月に代々木ゼミナールとの共同開発により、東大現役合格を目指した「Y-SAPIX東大館」を開設(日本入試センターが運営)。2011年3月には医学館と京大館を開設するとともに、従来のSAPIX高校部はY-SAPIX高校部に、中高一貫校を対象とした「R-SAPIX」(旧NEXUS)はY-SAPIX中学部にそれぞれ改められた。