レアル・ベティス
その後も3シーズンをセグンダ・ディビシオンで過ごし、ロレンソ・セラ・フェレール監督に率いられた1993-94シーズン終了後にプリメーラ・ディビシオンに復帰した。1994-95シーズンは昇格組ながら3位となり、翌シーズンのUEFAカップの出場権を獲得した。UEFAカップではフェネルバフチェSK(トルコ)に2試合合計4-1、1.FCカイザースラウテルン(ドイツ)に2試合合計4-1で勝利したが、準優勝したFCジロンダン・ボルドー(フランス)に2試合合計2-3で敗れた。コパ・デル・レイ初優勝から20年後の1996-97シーズンには、優勝以来初めて決勝に進出した。決勝は20年前と同じくマドリードで行われたが、今回はビセンテ・カルデロンではなくエスタディオ・サンティアゴ・ベルナベウで行われた。バルセロナとの試合は延長戦にもつれ込んだが、結局2-3で敗れて準優勝に終わった。1997年夏、偶然にもフェレール監督はバルセロナ監督に就任し、後任監督には選手としてベティスでプレーした経験があるルイス・アラゴネスが就任した。アラゴネス監督は結局1997-98シーズンを指揮しただけでチームを去ったが、リーグ戦では8位となり、UEFAカップウィナーズカップではベスト8となった。準々決勝まで勝ち進んだが、チェルシーFC(イングランド)に2試合合計2-5で敗れた。
1998年にはハビエル・クレメンテ監督が就任したが、ファンと口論になった際にアンダルシアのことを「異国」とほのめかしたことで論争を呼んだ。1998-99シーズンは順位表を滑り落ちて11位となり、UEFAカップでは3回戦でボローニャFC(イタリア)に敗れた。
セビージャのメルセデス・アラージャ裁判官は、デ・ロペーラが所有する会社とベティスとの繋がりを調査し、正式にデ・ロペーラを詐欺行為で告発した。予備訴訟開始の一週間前の2010年7月7日、デ・ロペーラは所有する株式(株式総額の51%)のうちの94%を、ルイス・オリーベルが代表を務めるビットン・スポルトに売却した。売却価格は1600万ユーロと意外なほど低く、これによってデ・ロペーラは一般株主にすぎなくなった。オリーベルはすでに、破産の縁にあるカルタヘナFCとヘレスCDの2つのクラブを所有していると報道されていたが、売却前にアジャラがデ・ロペラ所有の株式を凍結することが公式に承認された。手付金が100万ユーロに減額されたにもかかわらず、オリーベルはすぐさま第三者から多額の記名株式を購入した。オリーベルは取締役会(すべてデ・ロペラ派)の投票により経営陣に加えられ、クラブ経営への参加が認められた。これに際して、裁判官はゴルディージョを指名し、デ・ロペーラの株式を管理し、デ・ロペーラがもはやクラブ運営に携わっていないことを保証する仕事、また判決が経営陣個人の利益ではなくクラブの利益となるようにする仕事にあたらせた。ゴルディージョはかつてベティスで長らくプレーし、レアル・マドリードとスペイン代表でもレジェンドとして大いに尊敬されていた。