侵華日軍南京大屠殺遇難同胞紀念館
紀念館は広場陳列、遺骨陳列、資料陳列からなる。広場には犠牲者名を記したものなどの様々な記念碑や虐殺を描いた彫刻などが置かれている(絵画彫刻は、証言や資料などを基に、資料館と芸術家が想像して制作した創作であると注意書きがある)。外形が中国の棺桶のような遺骨陳列室には虐殺後に遺骸が棄てられたとされる「万人坑」から掘り出された人骨の一部が展示されており、線香や花束を供える場所もある。資料館内には国民党軍が使用したトーチカが展示され、攻略戦当時の南京市が再現されている。資料館には旧日本軍の南京大虐殺や抗日戦争に関するパネル展示や資料展示がある。日本軍の弾薬など実物資料も多いが、南京で使われたものでない鹵獲兵器、南方戦線で米軍将兵が戦利品として持ち帰った軍刀、展示のため東京都で購入された軍装など、南京攻略戦とは関係のない資料も存在する。また日本側資料として展示されるものは、アサヒグラフや戦後発行された毎日新聞社の「不許可写真」など民間のもので占められている。ジョン・ラーベなどの一部の駐在外国人を英雄として扱っている。史料館の最期は南京攻略戦に参加した元日本兵の自省的証言を紹介している。
2007年12月の再オープン時に、日本の研究者らが南京事件と無関係であると指摘していた「連行される慰安婦たち」「置き去りにされ泣く赤ん坊」など3枚の写真について紀念館から撤去されていたことが確認された。
2008年1月16日、30万人という犠牲者数を多数表記するなど旧日本軍の「非人道性」を強調しているとして、上海の日本総領事館総領事が日本政府の「問題意識」として「事実関係に疑義がある展示がある」と南京市幹部らに見直しを求める申し入れを行った。しかし朱成山館長は「配慮すべきところは配慮し、良いものができたと思う」と答え、そのままの状態で公開するに至っている。
2008年12月17日に、『産経新聞』は3枚の写真が記念館から撤去されたと報道した。写真はアイリス・チャンの著書『ザ・レイプ・オブ・南京』や本多勝一の『中国の日本軍』等でも日本の残虐行為として紹介されるなど、国内外で誤用されてきたとしている。