組換えホットスポット
また、組換えホットスポットはDNA配列や染色体構造によってのみ引き起こされているわけではないようであり、組換えホットスポットの開始部位の規定はゲノムにコードされている場合もある。異なるマウス系統間での組換えの比較によって、Dsbc1遺伝子座がゲノム内の少なくとも2つの組換えホットスポットの開始部位の規定に寄与している遺伝子座として同定されている。さらなる乗換えマッピングによってマウス17番染色体の12.2–16.8 Mb領域にしぼられ、この領域にはPrdm9(英語版)遺伝子が含まれている。Prdm9遺伝子はヒストンメチルトランスフェラーゼをコードしており、マウスでの非ランダム的な組換え開始部位の遺伝的基礎の証拠となっている。PRDM9遺伝子の迅速な進化は、ヒトとチンパンジーが高い配列同一性を持つにもかかわらず、組換えホットスポットはほとんど共通していないことの説明となる。