日琉語族
日琉祖語の母音体系には*i, *u, *e, *ə, *o, *aを再建する6母音説が有力である。上代特殊仮名遣におけるo2(オ段乙類)は*əに遡る。上代日本語と琉球祖語、上代東国方言などとの比較から、日琉祖語の*eと*oのうちの一部は、上代日本語(中央語)でそれぞれi1とuへ合流したとみられる。また上代日本語にはアマ/アメ乙(雨)、ウハ/ウヘ乙(上)のようなaとe2(エ段乙類)の母音交替が多数あり、e2の由来として*aiが再建されている。同様にi2(イ段乙類)の由来として*əi、*oi、*uiといった二重母音も再建されている。
日琉祖語の子音には、*p, *t, *k, *m, *n, *s, *r, *w, *jが再建されている。日本語の濁音は、鼻音+阻害音の子音連続に由来すると考えられている。
『三国史記』に記された地名とその意味から、古代には日琉祖語の姉妹にあたる言語が朝鮮半島でも話されていたという説がある。