クロムウェルのアイルランド侵略
)」と主張している。ある歴史家はこれを「(1641年の大虐殺は) クロムウェルの大虐殺行為と土地処分を正当化する理由となっていた (It [the 1641 massacres] was to be the justification for Cromwell's genocidal campaign and settlement.)」とまで言い放った。
戦争が進んでいくと、残虐行為はいたるところで見られるようになった。モンロー将軍率いるスコットランド国民盟約軍(1642年にスコットランド議会によりアイルランドへ派兵)の兵士は、1642年1月9日マギー島において最大3,000人のカトリック教徒を虐殺した。議会軍の司令官であった第6代インチクィン男爵(後の初代インチクィン伯爵)マロー・オブライエン(英語版)は、1647年のキャセルの略奪(英語版)の中、コークにおいて駐屯軍とカトリック聖職者(その中にはシーオボルト・ステープルトン(英語版)も含まれていた)を虐殺し、「苛烈なマーロウ(Murrough of the Burnings)」とあだ名された(その後インチクィン男爵は1648年に寝返って国王派軍の指揮官になっている)。ダンガンズ・ヒルの戦い(英語版)やスキャリフフォリスの戦いを経て、イングランド議会軍はアイルランド人カトリック教徒の捕虜を殺害した。同様にカトリック同盟の将軍であるタラ子爵トマス・プレストン(英語版)はメイヌースを落とした際、カトリック教徒の守備兵を背教者としてくくり首に処した。