末梢性免疫寛容
樹状細胞以外にも、抗原特異的T細胞寛容を誘導することができる細胞集団が同定されている。これらは主にリンパ節ストローマ細胞(英語版)(LNSC)のメンバーである。LNSCは一般的に、gp38(PDPN(英語版))やCD31(英語版)表面マーカーの発現に基づいていくつかの下位集団へと分類される。それらの中でも、細網線維芽細胞(fibroblastic reticular cell、FRC)とリンパ管内皮細胞(lymphatic endothelial cell、LEC)のみが末梢寛容に関与していることが示されている。これらはいずれも、内因性抗原をMHCクラスI分子(MHCI)に提示することでCD8T細胞寛容を誘導することができる。LNSCはAIRE(英語版)の発現を欠いており、内因性抗原の産生は転写因子DEAF1(英語版)に依存している。LECはPD-L1を発現してCD8T細胞上のPD-1を結合し、自己反応性を制限する。LNSCは樹状細胞から得られたペプチド-MHCII複合体を提示することでCD4T細胞寛容を駆動することもできる。一方、LECは自己抗原の貯蔵庫として機能し、自己抗原を樹状細胞へ輸送してCD4T細胞に対する自己ペプチド-MHCIIの提示へ差し向けることができる。腸間膜リンパ節(mLN)では、LNSCはTGF-βの分泌によって直接的に、もしくはmLN常在性樹状細胞のインプリンティングによって間接的にTregを誘導することができる。
ナイーブT細胞は胸腺から出た時には、静止状態となっている。このことは、細胞周期はG0期であり、代謝、転写、翻訳活性が低いことを意味する。静止状態は、トニックシグナル後のナイーブT細胞の活性化を妨げることができる。抗原曝露と共刺激後にナイーブT細胞は静止状態からの脱出を開始し、増殖とエフェクター分化が引き起こされる。