希少野生動植物種
緊急指定種には、2021年(令和3年)7月1日にリュウジンオオムカデ、ウスオビルリゴキブリ、ベニエリルリゴキブリの3種が、2022年(令和4年)5月21日にチョウセングンバイトンボが指定されている。
2017年(平成29年)にはケラマトカゲモドキが、2008年(平成20年)にはタカネルリクワガタが、1994年(平成6年)にはワシミミズク、イリオモテボタル、クメジマボタルが指定されており、このうちケラマトカゲモドキ、ワシミミズクが国内希少野生動植物種に指定されている。
ミズスマシ科 Gyrinus ryukyuensis リュウキュウヒメミズスマシ 令和2年(2020年)指定
クワガタムシ科 Neolucanus insulicola donan ヨナグニマルバネクワガタ 平成23年(2011年)指定 Neolucanus okinawanus オキナワマルバネクワガタ 平成28年(2016年)指定 Neolucanus protogenetivus hamaii ウケジママルバネクワガタ 平成28年(2016年)指定
ハナノミ科 Hoshihananomia kusuii クスイキボシハナノミ 平成27年(2015年)指定 Hoshihananomia ochrothorax キムネキボシハナノミ 平成27年(2015年)指定 Hoshihananomia trichopalpis オガサワラムキボシハナノミ 平成27年(2015年)指定 Tomoxia relicta オガサワラモンハナノミ 平成27年(2015年)指定
コガネムシ科 Cheirotonus jambar ヤンバルテナガコガネ 平成8年(1996年)指定 Oryctes hisamatsui ヒサマツサイカブト 平成31年(2019年)指定
ホタル科 Luciola owadai クメジマボタル 平成29年(2017年)指定
stellatum ホシザキカンアオイ* 平成30年(2018年)指定 同年特定第一種国内希少野生動植物種指定 Asarum satsumense サツマアオイ* 平成30年(2018年)指定 同年特定第一種国内希少野生動植物種指定 Asarum yaeyamense ヤエヤマカンアオイ* 平成30年(2018年)指定 同年特定第一種国内希少野生動植物種指定
チャセンシダ科 Asplenium formosae マキノシダ 平成28年(2016年)指定 Asplenium griffithianum フササジラン 平成28年(2016年)指定 Asplenium oligophlebium var. iezimaense イエジマチャセンシダ 平成29年(2017年)指定 Asplenium tenerum オトメシダ 平成30年(2018年)指定 Hymenasplenium cardiophyllum ヒメタニワタリ 平成20年(2008年)指定 Hymenasplenium subnormale ウスイロホウビシダ 平成29年(2017年)指定
サンショウウオ科 Hynobius abei アベサンショウウオ 平成7年(1995年)指定 Hynobius abuensis アブサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius akiensis アキサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius amakusaensis アマクササンショウウオ 平成27年(2015年)指定 Hynobius bakan ヤマグチサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius boulengeri オオダイガハラサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius dunni オオイタサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius fossigenus ヒガシヒダサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius guttatus マホロバサンショウウオ 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius hidamontanus ハクバサンショウウオ 令和4年(2022年)指定 Hynobius ikioi ベッコウサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius iwami イワミサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius katoi アカイシサンショウウオ 令和4年(2022年)指定 Hynobius kuishiensis イヨシマサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius kunibiki イズモサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius naevius ブチサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius nebulosus カスミサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius okiensis オキサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius osumiensis オオスミサンショウウオ 平成27年(2015年)指定 Hynobius oyamai チクシブチサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius sematonotos チュウゴクブチサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius setoi サンインサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius setouchi セトウチサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius shinichisatoi ソボサンショウウオ 平成27年(2015年)指定 Hynobius stejnegeri コガタブチサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius tokyoensis トウキョウサンショウウオ** 令和2年(2020年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius tosashimizuensis トサシミズサンショウウオ 平成31年(2019年)指定 Hynobius tsurugiensis ツルギサンショウウオ 令和4年(2022年)指定 Hynobius utsunomiyaorum ヒバサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Hynobius vandenburghi ヤマトサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Onychodactylus kinneburi シコクハコネサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Onychodactylus pyrrhonotus ホムラハコネサンショウウオ ** 令和5年(2023年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定 Onychodactylus tsukubaensis ツクバハコネサンショウウオ 平成27年(2015年)指定 Salamandrella keyserlingii キタサンショウウオ** 令和4年(2022年)指定 同年特定第二種国内希少野生動植物種指定