東円坊
保延元年(1135年)、河野為澄の次男・妙尊が役小角の法を学び河野一族の婦人たちの支持を得て社辺に一宇の寺塔を建立した。その妙尊の子が東円坊を名乗ったのがはじまりである。その後、神社に属して仏事を行う供僧の監督的な立場の検校職は代々当坊が任じられていた。
当坊は、神仏習合時にあった神宮寺24坊の1つで、24坊のうち8坊は正治年間(1199年 - 1201年)に四国本土の別宮に移転し、残った16坊も近世初頭の天文5年(1577年)の記録には4坊になっていた。なお、明治の神仏分離の際には当坊のみが残った。また、それまで、大三島の坊は仁和寺の系統の御室派であった。
江戸時代の万治年間(1658年~61年)当坊は光林寺の末寺となる。
明治初年の神仏分離令により、当坊は大山祇神社より離れ、その際、大通智勝如来が当坊に移された。
2019年、本堂を取り壊し再建され、2020年5月15日に完成、大通智勝如来が鎮座していた本堂脇の堂の仏像たちも本堂に移された。