東日本大震災による鉄道への影響
当初は京阪神地区でも4月11日から実施される予定だったが、こちらは間引き運転実施前に中止となった。 JR西日本では上記の山陽新幹線と九州新幹線鹿児島ルートとの相互直通運転開始に伴うダイヤ改正を3月12日に控えており、ダイヤ改正前日限りで引退する485系「雷鳥」のさよなら式典や、改正により北近畿地区での本格運用が始まる287系の出発式典が行われる予定だったが、すべて中止された。
九州旅客鉄道(JR九州)では、大分・宮崎・鹿児島に発表された津波警報により日豊本線が杵築 - 鹿児島中央間で、日南線が全線にわたって運休し、警報が解除される12日まで続いた。JR九州では上記の九州新幹線鹿児島ルート全線開通に伴うダイヤ改正を3月12日に控えており、改正前日限りで引退する485系のさよなら式典や、改正により宮崎地区での本格運用が始まる787系の出発式典が行われる予定だったが、すべて中止された。改正と同時に指宿枕崎線で運行開始される予定であった「指宿のたまて箱」も津波警報により3月12日は運休し、翌13日から運行開始した。なお、九州新幹線全線開業から100日後にあたる6月19日に、九州新幹線4駅で「百日祝出発式」と称した出発式を実施した。
山田線では宮古駅 - 磯鶏駅間で第34閉伊川橋梁が流出した。地震後、3月18日に盛岡駅 - 上米内駅間が再開、同26日に上米内駅 - 宮古駅間が再開。残る宮古駅 - 釜石駅間は復旧工事後に三陸鉄道へ移管されることとなり、2019年3月23日に三陸鉄道リアス線として再開した。
只見線は、3月30日に会津若松駅 - 会津坂下駅間が再開、4月8日に会津坂下駅 - 会津川口駅間が再開、同12日に会津川口駅 - 只見駅間が再開、同14日に全線再開した。