弥生町遺跡
1884年(明治17年)に有坂鉊蔵が発見した弥生土器第1号(本郷弥生町出土壺形土器)は、東京大学総合研究博物館が保管し、国の重要文化財に指定されている。本土器は弥生時代後期のもので、現存高さ22.0センチメートル、胴部径最大22.7センチメートルを測る。頸部には羽状縄文が施され、縄文の上部には3個1組の円形貼付文が計6単位ある。頸部から上の口縁部は欠失している。本土器のような、イチジク形を呈する器形で、胴の下半部に接合痕のみられるものは、東海地方の土器に多い形式になる。本土器の内面には「ハケ目調整」と呼ばれる調整痕があるが、これは弥生後期の南関東系の土器にはみられないものである。頸部の羽状縄文の施文には、ほどけないように端を結んだ縄が使用され、端の結び目がS字状の文様として表れている。このような施文は東海地区の土器にみられる。以上のように、南関東系よりは伊豆半島以西の、駿河湾沿岸の東海地方の特色を多く備えた土器になる。
1923年(大正12年)、発掘からおよそ40年経ち、有坂鉊蔵は件の土器についての文章を『人類学雑誌』に発表した。その中で、貝塚の位置について「(大学の)裏門の筋向ひには陸軍の射的場があって、其の西北の方に貝塚が根津の裏の高い丘の上にあった」として、坪井正五郎とほぼ同内容のことを述べている。ただし、有坂は「向ヶ岡と云ふ場所は、大学の裏の道を矩てた通りの向ひ側で、根津の街を眼下に見る丘であるが、今日では弥生町の街が建って、遺跡の正確な位置は解りません」とも述べており、この時点で貝塚の所在は失われている。有坂の回想によれば、土器発見時の遺跡周辺は、家など1軒もない淋しい場所で、ウサギやキツネの出没する野原であったという。有坂鉊蔵はその後も回顧談を残しているが、その中で証言が変化していることが注意される。
その後、江坂輝弥・杉原荘介・斎藤忠・太田博太郎らが土器出土地点を推定して地点論争が展開したが、確定には至っていない。また「弥生」の地名を巡って、1964年(昭和39年)に向ヶ岡弥生町の弥生1丁目・弥生2丁目・根津1丁目への再編が決定されたことで、弥生土器発見推定地が「根津」の所属となり、それに反対する地名保存住民運動が生じている(弥生町名問題)。運動の結果、1967年(昭和42年)に根津1丁目編入地域は弥生2丁目に再編入されている。