ダライ・ラマ13世
ダライ・ラマ13世はヤートンの処置が気に入らなかった。1895年(19歳の頃)、13世は摂政とその弟が呪詛を働いたとして逮捕した。ダライ・ラマ8世以降はダライ・ラマの実権は摂政に奪われていた形だったが、この事件をきっかけに再びダライ・ラマの手に戻った。その元摂政は1899年に自室で謎の死を遂げ、13世は摂政が持っていた化身ラマの名跡を廃止している。
13世はヤートンの道を塞いでイギリスとの交易を拒んだ。13世はロシアの恐ろしさを知らず、イギリスに対抗するため接近し、チベットに住むロシア国籍の僧侶(ブリヤート人)アグワン・ドルジェフにロシア皇帝ニコライ2世との仲介を依頼し、ドルジェフは1900年にロシア皇帝と面会した。1901年にはロシア人のゴンボジャブ・ツィビコフ(英語版)がラサを訪れている。一方で、13世はフランスとの協力も模索したが、東チベットでフランス人宣教師とチベット人との対立が頻発しており、これは成功しなかった。イギリスはボーア戦争のため、当初ロシアとの対立の可能性があるチベットへの介入には消極的だったが、ロシアがチベットの保護領化を画策し、1902年にボーア戦争が終結したため、インドの安全保障上の理由からチベットに侵略を開始した。なお、日本人として史上初めてチベット入国を果たした仏教僧・河口慧海が、チベット人僧侶に扮して(一部の人に対しては実は支那人僧侶であると偽り)ラサに滞在したのはこの頃(1901年-1902年)である。