黒井駅 (新潟県)
2015年3月14日改正現在、停車列車は高速貨物列車のみである。発着する列車の本数は、南長岡駅方面へ向かう下り列車が1日3本(南長岡駅行きが1本、新潟貨物ターミナル駅行きが2本)、当駅終着の上り列車が1日1本である。富山貨物駅方面へ向かう列車の停車設定はない。
専用貨物列車も発着していたが、2008年3月15日のダイヤ改正ですべて廃止された。
貨物入れ替え機として直江津運輸区に東新潟機関区所属のDE10が配置され、長らく駅構内で入れ替え作業に従事していたが、2014年3月のダイヤ改正で貨物駅構内にも架線が張られ、電気機関車の入線が可能となったため、DE10による入れ替え作業は廃止された。
黒井駅周辺地区は信越本線が南北を分断しており、特に駅西側の西福島踏切では朝と夕方の通勤通学時間帯1時間あたりの遮断時間が15分前後に及び、周辺道路は道幅が狭隘な上に自転車歩行者道の整備も進捗していない。また北西側に設けられていた旧駅舎は駅前広場や駐輪場などの整備が進んでおらず、特に頸城区方面など駅東側からの利便性の確保が大きな課題となっていた。
上越市に編入合併する前の旧頸城村では、第4次総合計画の公共交通主要施策の一つとして黒井駅周辺の整備と南口の新設を根幹事業に位置付けていた。これを受けて合併後の上越市でも合併建設計画のひとつに黒井駅周辺整備を盛り込み、2005年(平成17年)度から計画の策定に着手した 。
そして駅周辺整備事業は2010年(平成22年)度から事業を開始し、同年6月1日に着工した。旧駅舎南西側に自由通路を新設し、前掲の新黒井駅跡には新たに南口が整備された。現在の駅舎と自由通路は2012年(平成24年)3月に竣工して供用が開始され、ホームの直江津寄りには待合室が新設された。
島式ホーム1面2線を持つ地上駅で橋上駅舎を有する。ホームに面する上下本線のみJR東日本の管轄で、北側にある線路(後述)はすべてJR貨物の管轄となっている。無人駅で、長岡駅が管理する。北陸新幹線金沢延伸までは直江津駅が管理していた。 直江津駅が前述の北陸新幹線金沢延伸開業に伴う在来線経営分離により、えちごトキめき鉄道の管轄になったため、JR東日本新潟支社並びに、日本海沿岸のJR東日本管轄の在来線の駅ではもっとも西(有人駅では犀潟駅)に位置する駅となった。
駅舎内の設備は自由通路上の改札口横に乗車駅証明書発行機・お知らせ標が設置されており、自由通路とホームには連絡階段で連絡している。ホーム上には屋内待合室が設置されている。
自由通路(黒井駅自由通路)は所在地である上越市が管理しており、延長52.5m・幅員3mを有する。