セイコーマート
東京都内に店舗は進出していないが、地区事務所と配送センターが存在し、セコマ商品をセイコーマートや関東の他社スーパー、ウエルシアに配送している。
茨城県では、かつては関東発祥の旧ホットスパーコンビニエンスネットワークス(後のココストアイースト、現在はファミリーマートに吸収合併)と競合していて、酒販の充実さや店内調理の「コ・コ・デ・キッチン」の提供をはじめ、出店地域(茨城・埼玉)と立地位置(郊外住宅地・ロードサイド)がセイコーマートと酷似していた。2016年8月まであったセコマ傘下の「北海道スパー」と2008年3月まで関東に存在した「ホットスパー」では、店舗面積などの条件が異なっており、看板ロゴ以外の共通項は無い。
2003年(平成15年)までは滋賀県、京都府、兵庫県南西部、鳥取県東部にも別会社によって店舗を展開していたが、これらの店舗は一部の例外を除き、ファミリーマートへ譲渡された。
取扱商品や店舗レイアウトは北海道店舗と殆ど同じであるが、一部商品(デザート類、北海道限定商品など)は取り扱っておらず、弁当類は土浦市に所在する北燦食品関東工場で製造されたものが販売されているなど、細部では異なる。
この他にも2013年11月に同業他社であるセーブオンの新店舗にホットシェフ導入 やダイマル乳品・京極製氷 の製品取扱いを公式に明らかにしている。
1971年(昭和46年) 8月10日 1号店「コンビニエンスストア萩中」が札幌市北区に開店。
1972年(昭和47年) 初のセイコーマートの名称の店鋪「セイコーマート はせべ」開店。
1974年(昭和49年) 6月14日 丸ヨ西尾の負担金を完済し、株式会社セイコーマート設立
1976年(昭和51年) 1月 全米コンビニエンスストア協会(NACS)に加盟する。
1977年(昭和52年) 8月 北海道スパー株式会社設立。 新店舗デザイン「ネオンタイプ」展開開始。
1979年(昭和54年) 東部食品株式会社設立。
1981年(昭和56年) 5月店舗数が100店到達。 米:CDI社との提携開発による新店舗デザイン「オレンジタイプ」展開開始。
1984年(昭和59年) 7月「ネットワークシステム開発株式会社」(現:セイコーシステムエンジニアリング社)を設立
1985年(昭和60年) 東部物流株式会社設立。 店舗数が200店到達。
1987年(昭和62年) 埼玉県酒類販売とエリアフランチャイズ契約を結び、「埼玉セイコーマート株式会社」設立。 12月 宮崎商店と合弁で、兵庫セイコーマート設立。 「セイコーマートシステムサービス株式会社」設立。
1988年(昭和63年) マミーチェーンとエリアフランチャイズ契約を結ぶ。 新店舗デザイン「88タイプ」展開開始する。
1989年(平成元年) 7月1日 マミーチェーンを「茨城セイコーマート株式会社」に社名変更。 11月 滋賀酒販とエリアフランチャイズ契約を結び、近江八幡市に滋賀県1号店を開店。 北海道内の店舗数が300店到達。 本社を現在地に移転。
株式会社セイコーフレッシュフーズ - セイコーマート創業者である西尾長光が営んでいた1895年(明治28年)創業の卸売業。旧社名:丸ヨ西尾。かつては北海道ファミリーマートの株式の51パーセントを保有する親会社でもあった。札幌市白石区の大谷地配送センターが代表的な拠点の一つ。セコマグループ店舗向けの取引が大半であることを理由に、2009年(平成21年)3月よりセイコーフレッシュフーズに社名を戻す(2002年(平成14年)に丸ヨ西尾と同社名の企業が合併したが、元の社名に戻す)。ワインの輸入者。2015年(平成27年)に協立乳品(株)のフローズン物流事業を統合。この統合により3温度帯のフルライン物流化を達成。2016年から北海道スパーを引き継いだハマナスクラブのボランタリー本部となる。
北燦食品株式会社 - 総菜・サンドウィッチ類の日販品製造発売会社。
北香 - 漬物類製造・青果加工
北嶺 - 水産物加工
シェフグランノール - 洋菓子の製造
株式会社ハセガワストア 株式会社タイエー
セイコーシステムエンジニアリング - システム保守・開発
セイコーリテールサービス株式会社 - 直営店舗の運営。以前はファミリーマートの道内一部店舗を運営していたが、セコマグループとの提携解消により全店舗セイコーマートに転換している。
株式会社セコマキャッシュサービス(旧・協立乳品株式会社) - レンタル事業
株式会社豊富牛乳公社 - 牛乳・乳製品製造
ダイマル乳品 - 冷菓製造
京極製氷 - 水・氷製造
丸吉梅沢製麺 - 麺類製造
北菱フォト - 写真プリント・現像
株式会社北栄ファーム - 野菜生産
2017年(平成29年)、北海道循環器病院と共同で心臓病や糖尿病の患者向けのメニューの商品化を開始。第1弾の商品は、低カロリー、低塩分のカレールー。
30%バイオマス原料を使用したレジ袋を採用することで、ルール順守の上で無料配布を継続する。