ヴェネツィア領クレタ
このような修道院領の接収は大きな反発を呼んだため、14世紀以降には緩和され、修道院領の保全が図られるようになっていく。
一方でカンディア及びその周辺の平野部からはなれた山間部では状況が異なった。クレタ島の東端部および西部には山岳地帯とそれに挟まれた狭い平地からなる地域が広がっていたが、このような地域にはギリシア人のアルコンたちが割拠していた。この山間部に対するヴェネツィアの支配方針は街道沿いや海沿いの拠点のみを城塞を築いて維持し、その他の内陸地方は封建契約を結んだ自立的なアルコンや教会を媒介にして間接的な支配下に置くというものであった。しかし、ヴェネツィアの統治が比較的順調に進行した平野部と異なり、山間部ではアルコンの指導の下激しい抵抗が繰り広げられ、安定するまでには100年以上の歳月を要した。
これは統治初期において、実際にヴェネツィア人入植者が現地に根を下ろしギリシア人との間に社会関係を構築したことで当局がその連絡経路を利用できた都市部・農村部に対し、入植者がほとんど存在しなかった山間部では当局との間の連絡手段自体が乏しく、紛争の解決を求めたり不満を当局に表明したりする方法が武力による実力行使しか存在しなかったことや、ヴェネツィアが想定した封建契約による間接支配という支配形態がアルコンたちにとって経験したことのないものであり、彼らの理解が得られなかったことが要因であるとも考えられる。
公と補佐官たちは共にクレタ島のシニョーリア(英語版)体制を構成した。また、2名、後には3名の、会計業務にあたる侍従(camerlenghi)がおり、各地区にはそれぞ独自の財務局(camera)があった。ヴェネツィアにとって格別の軍事的重要性を持つ地域の常として、軍の指揮権は提督(capitano)に属していた。序列の下層は裁判官(giudici)と警察官(Signori di notte)、城主(castellani)、そしてgrand chancellor(cancelliere grande)が補完した。危機や戦争の時にはprovveditore generale(provveditore generale [del regno] di Candia)が任命され、島内の民政と軍政の双方において最高の権力が与えられた。1569年以降のオスマン帝国の脅威の増大のために、provveditore generaleは2年任期で常任されるようになり、この地位はヴェネツィアで最も高位の政治家たちによって保持された。1578年からは島内の騎兵隊の指揮、および現地の艦隊指揮を担う「クレタ防衛(艦隊)司令官(Capitano alla guardia di Candia)」としてprovveditore generaleの地位が増設され、任命されるようになった。
ヴェネツィア本国のように(英語版)、この「東のヴェネツィア」は当初6つの県(セスティエーリ)に分割された。