メディパルホールディングス
2%も譲渡して、オリエンタル薬品工業は2009年6月に日医工の子会社2社と合併して日医工ファーマとなり、2012年6月に日医工本体に吸収合併される。
2006年 4月1日 - アトルの一般用医薬品卸子会社アルコスを吸収分割で子会社にし、同時にパルタックが吸収合併する。 7月13日 - 三菱商事との包括的業務提携の一環として、三菱商事の子会社「日本ホスピタルサービス」の株式34%を取得して、SPD (Supply Processing & Distribution) 事業を強化。
2007年 1月1日 - 北海道で動物用医薬品卸売事業を営む丸善薬品を、株式交換により子会社とする。 10月1日 - (新)クラヤ三星堂の医薬分業コンサルタント事業子会社「本郷薬品」を吸収分割により子会社にして吸収合併する。
2008年 1月1日 - 小林製薬の卸売子会社コバショウを株式交換により子会社にし、4月にパルタックと合併してパルタックKSとする。 10月10日 - アルフレッサ ホールディングスと2009年4月1日に合併する基本合意書を締結する。 12月9日 - 佐世保市の東七と業務提携する。
2009年 1月9日 - アルフレッサとの合併契約を撤回する。 10月1日 - 医療用医薬品等卸売事業を会社分割で(新)クラヤ三星堂へ承継し、(新)クラヤ三星堂はグループ会社の千秋薬品・潮田クラヤ三星堂・やまひろクラヤ三星堂・平成薬品・井筒クラヤ三星堂の5社を吸収合併する。メディセオ・パルタックホールディングスは純粋持株会社のメディパルホールディングスとなり、事業譲受と合併を行った(新)クラヤ三星堂は卸売事業会社のメディセオとなる。メディセオメディカルはMMコーポレーションに商号を変更した。
11月30日 - 連結対象で子会社の千曲市のクラヤ化成の全株式を、金沢市の三谷産業へ譲渡する。
2010年 1月29日 - 当社株式を保有するクオール及びイオングループのハピコムの一員であるグローウェルホールディングスと業務提携する。 2月17日 - グローウェルHDと同じくハピコムに属するメディカル一光と資本・業務提携する。 3月18日 - 子会社のPaltacが東京証券取引所第一部、大阪証券取引所第一部に再上場する。 5月6日 - 当社とクオールとグローウェルHDの3社の共同出資により、超高齢社会に対応した新業態薬局の企画、運営、薬剤師教育などを行うジーエムキュー株式会社を設立する。
2012年2月16日 - メディカル一光との業務提携に付随する資本提携を解消するも、業務提携は維持する。
2013年 6月1日 - 医療材料データベースの構築や提供を行うメディエを簡易株式交換により子会社にする。 11月18日 - 医薬品の臨床試験や製造販売後調査 (postmarketing surveillance, PMS) などのデータ収集支援事業を行うメディスケットを子会社にしてPMS事業を開始する。
2014年12月25日 - 北海道を中心に食品原材料や食品添加物などの専門卸を行う桜井通商を簡易株式交換により子会社にする(桜井通商は2016年4月1日にMPアグロから食品事業を会社分割(吸収分割)により承継し、メディパルフーズに商号変更する)
2016年 3月29日 - グループ内の連結売上高が、総合商社を除く国内卸売業として初めて3兆円を越えたと発表する。