フレゼリク・クリスチャン2世
夫妻はしばらくクリスチャンスボー城で暮らしたが、1794年にフレゼリク・クリスチャンの父フレゼリク・クリスチャン1世が亡くなると、アウグステンボー城に移った。
フレゼリク・クリスチャンとルイーセ王女の間には3人の子供が生まれた。
カロリーネ・アマーリエ(1796年 - 1881年) - デンマーク王クリスチャン8世と結婚
クリスチャン・アウグスト2世(1798年 - 1869年) - アウグステンボー公
フレゼリク・エミール・アウグスト(1800年 - 1865年) - ノアー(ネア)侯、シュレースヴィヒ=ホルシュタイン総督
後に、フレゼリク・クリスチャンはスナボー周辺に所有する分領(デンマーク王が統治するシュレースヴィヒ=ホルシュタイン公国の内部にあった)の領有権をめぐり、妻ルイーセの兄(異父兄)のデンマーク王フレゼリク6世との間で争うようになった。ルイーセは夫と兄の争いのあいだ、兄の側を支持していた。
1810年、フレゼリク・クリスチャンの弟カール・アウグストが子供のないスウェーデン王カール13世の養嗣子に迎えられ、スウェーデン王太子となったが、まもなく急死した。フレゼリク・クリスチャンは自分が弟に代わってスウェーデンの王位継承者に指名されるよう運動したが、実現しなかった。