取って代わられた科学理論
視覚の放出理論(英語版) – 視覚は目から出ている光線により引き起こされるという信念は、イントロミッションのアプローチとより複雑な視覚理論により置き換えられた。
アリストテレス物理学(英語版) –ニュートン物理学により取って代わられた。
プトレマイオスの屈折法則 - スネルの法則に取って代わられた
エーテル – 十分に感度の高いマイケルソン・モーリーの実験により検出することができず、アインシュタインの研究により時代遅れになった。
カロリック説 – ラヴォアジエによりフロギストンの後に出たもの。ランフォードやジュールの業績により信じられなくなった。
Contact tension – 電気の源に関する理論
活力(en:Vis viva) – ゴットフリート・ライプニッツによるエネルギー保存則の初等および限定的初期の定式化
電圧差発生の「純粋に静電的」な理論
Emitter理論(英語版) – 現在では時代遅れの光伝播理論
自然の均衡(英語版) – カタストロフィー理論やカオス理論により取って代わられた
原子論の進展 原理論の創始者であるデモクリトスは、全てのものが不滅の原子で構成されていると考えた。原子が不滅であるという彼の主張は、後に科学者たちが粒子を含む原子の概念を同定し、また、不滅でないことが示されたからではない。
デモクリトスの理論は、数種類の原子が水や鉄のような純粋な物質を説明するという立場と、科学は不滅の一次粒子ではなく分子と同一であるという特徴ゆえ取って代わられている。また、デモクリトスは原子の間に原子とは異なる性質の空の場所があり、原子が動くことを許容しているという考えを持っていた。この空間と物質に関する見解はアインシュタインが時空は相対的であり物質と結びついていると表現するまで続いた。 ジョン・ドルトンの原子モデルは、原子は不可分で不滅であり(核物理学に取って代わられる)、与えられた元素の全ての原子は質量が同じ質量である(原子同位体の発見に取って代わられる)とする。 原子のブドウパンモデル—陽子と電子が単一の質量で一緒に混合されたと仮定する。 ラザフォードモデルは、原子は電子が周回する入り込めない核を持つとした。 ボーアモデルは量子化した軌道を持つ。 1925年の量子力学の発展に続く電子雲モデルと水素原子に対する量子力学的解から導き出された最終的な原子軌道モデル
ニュートン物理学含む古典物理学の全ては、相対論的物理学と量子物理学に取って代わられた。しかし、古典物理学は後者2つの理論の限定的な場合であり、しばしば非常に良い近似である。