日本国政府専用機
政府専用機とほぼ同時期に購入して陸上自衛隊が運用する、フランス製のアエロスパシアルAS332Lヘリコプターが近・中距離移動に用いられ、のちにユーロコプター EC225LPへ更新された。航空自衛隊の多用途支援機のガルフストリーム・エアロスペースのU-4が日本国内の高速移動に用いられている。
福田康夫首相が北京オリンピック開会式に出席のために北京市へ2008年8月8日に赴き、8月9日の長崎原爆の日の平和式典に出席する日程であったことから、深夜の日中両国間を移動する手段にU-4が用いられた。
1994年2月の小笠原行幸啓で、目的地に飛行場が無く船舶では時間がかかるため海上自衛隊のUS-1Aが使用された。
2013年8月に、前述の通り2018年度末に現用の2機を退役させる方針が明らかにされている。新たな政府専用機の候補としては、複数の報道によりボーイング777・787、エアバスA350 XWBが挙がっており、2019年の導入に向け機種を選定するとしていた 。2014年4月になって飛行性能に加えて日米同盟の関係強化に向けた姿勢などを重視し、導入後のメンテナンス委託先も確保しやすいことからボーイング777を導入する方向で最終調整していることが報道された。選定候補に挙がっていたボーイング787は機内空間の狭さ、エアバスは現行機がボーイング製という継続性と日米安保同盟という外交的政治判断によって、選定から外れている。
2014年8月12日、日本国政府はボーイング747-400の後継機として、ボーイング777-300ERを選定し、機体整備は全日本空輸に委託されることを明らかにした。
2018年8月1日、航空幕僚監部は政府専用機(ボーイング747-400)の運用終了を前に、この機材の処分に関する情報提供の募集を開始した。
2018年8月17日、新型のボーイング777-300ERが北海道の航空自衛隊千歳基地に到着し、2019年4月1日にボーイング747-400は退役した。
従来は保安のために非公開であったが、退役後に1機の調度品を浜松広報館に展示、もう1機分は一般公開展示を条件に小松市の石川県立航空プラザへ無償で譲渡され、リサイクル業者へ引き渡す前の2019年5月24日に内部が報道関係者に初公開された。
一般客席に搭乗する同行記者らは、民間航空会社運航便と同程度の航空券運賃を支払う。
2階部分は、通信室や運航要員の座席(25席)とその休憩室が設けられている。運航要員用の座席はエコノミークラス用シートの3-3アブレストとなっているが、前方左側の4席は1階の一般客室と同じ座席が設置されているため2-3アブレストとなっている。運航要員の空間を2階に集約して、1階に搭乗する要人の間を通り抜けることなく業務の遂行を可能としている。
旧式の機体で遮音性が優れず、機内の会話に大声を要した。
747-400の乗客数は416から524名であるが、本機は約140人である。
同行者らも機内サービスが提供され、機内食は和食、洋食、肉、魚を選ぶことができる。食材は日本から持ち込んだ物と現地調達がある。アメニティグッズは航空自衛隊のロゴが入った特注品である。映画上映時は前方のスクリーンへ投影する。栄養ドリンクも搭載されて要人の警護官に好評である。
操縦室天井窓から機外に掲げられた日本国旗
L1ドアにある航空自衛隊マーク
記者会見席(小泉純一郎首相・安倍晋三内閣官房副長官)
会議室
貴賓室(鳩山由紀夫首相)