マンガ・アニメミュージアム
広島市民球場の跡地問題でアニメーションミュージアムを整備する案が出ており、経産省から支援されている。なお広島では世界4大アニメ映画祭の1つ、広島国際アニメーションフェスティバルが開催されている。
タンペレ市立美術館ムーミン谷美術館 (日本語WEBあり) フィンランド タンペレ
ベルギー漫画センター(Centre belge de la bande dessinée--Belgisch centrum van het beeldverhaal) ベルギー ブリュッセル。ベルギーの漫画に関する博物館。
ミュゼ・エルジェ(Musée Hergé) ベルギー オッティニールーヴァンラヌーヴ。ベルギー発の漫画、冒険物語「タンタンの冒険」の博物館
国際バンド・デシネおよびイメージ都市(la Cité international de la bande dessinée et de l'image)(CIBDI)フランス アングレーム。毎年アングレーム国際漫画祭が開かれる
トミー・アンゲラー美術館 国際イラストセンター(Musée Tomi Ungerer/Centre international de l’illustration)フランス ストラスブール
The Museum of Comic and Cartoon Art(MoCCA)米国 ニューヨーク
漫画博物館(Cartoon Art Museum) 米国 サンフランシスコ(カリフォルニア州)
The Ohio State University Billy Ireland Cartoon Library & Museum 米国 チリコシー(オハイオ州)
Charles M. Schulz Museum and Research Center 米国 サンタローザ(カリフォルニア州)スヌーピーなどを展示
東京都三鷹市に「三鷹の森ジブリ美術館(正式名称:三鷹市立アニメーション美術館)」が開館。運営は財団法人徳間記念アニメーション文化財団が行っている。
2002年(平成14年) 高知県高知市の高知市文化プラザかるぽーと内に「横山隆一記念まんが館」が開館。
2003年(平成15年) 東京都練馬区の東映アニメーション大泉スタジオ内に「東映アニメーションギャラリー」が開館。主に東映アニメーション作品のPRスペースとして展示。 鳥取県境港市に「水木しげる記念館」が開館。2007年(平成19年)にテーマパーク『ゲゲゲの妖怪楽園』もオープン。 東京都青梅市に「青梅赤塚不二夫会館」が開館。
2005年(平成17年) 東京都杉並区に「杉並アニメーションミュージアム」が開館。
2006年(平成18年) 京都府京都市中京区の龍池小学校跡地に「京都国際マンガミュージアム」が開館。国内外の漫画に関する資料を集める総合的な漫画ミュージアムである。明治時代の雑誌や戦後の貸本などの貴重な歴史資料も展示。運営は京都市と京都精華大学が共同で行っている。 東京都千代田区(秋葉原)の秋葉原UDX内に「東京アニメセンター」が開館。 神奈川県横浜市に「横浜アンパンマンこどもミュージアム」が開業。
2007年(平成19年) 鳥取県北栄町に「青山剛昌ふるさと館」が開館。
2009年(平成21年) 石川県輪島市に「永井豪記念館」が開館。 東京都千代田区に「米沢嘉博記念図書館」が開館。運営は明治大学が行っている。
2011年(平成23年) 宮城県仙台市宮城野区に「仙台アンパンマンこどもミュージアム&モール」が開業。 神奈川県川崎市生田区の生田緑地敷地(向ヶ丘遊園跡地)内に「藤子・F・不二雄ミュージアム」が開館。
福島県只見町 - 昭和漫画館青虫(2006年開館、2017年度(平成29年度)文化庁メディア芸術祭功労賞、2022年7月24日閉館)
埼玉県幸手市 - きまぐれスタジオ 美水かがみギャラリー幸手
茨城県龍ケ崎市 - 市街地活力センター「まいん」
千葉県千葉市 - 東映ヒーローワールド
東京都港区 - スヌーピーミュージアム(2016年4月23日〜2018年9月24日の期間限定開館。 その後2019年12月14日に町田市に移転開館)
東京都青梅市 - 青梅赤塚不二夫会館
静岡県伊豆市 - 内藤ルネ館(内藤ルネ人形美術館)
山梨県河口湖町 - すずき大和漫画館
山梨県南都留郡 - いがらしゆみこ美術館・山中湖
富山県南砺市 - 富永一朗とが漫画館
京都府京都市 - KYOTO手塚治虫ワールド
広島県尾道市 - アンクル船長の館
熊本県荒尾市 - ウルトラマンランド