村上世彰
その後の2006年6月23日、証券取引法のインサイダー取引容疑で起訴される(村上ファンド事件)。東京地検特捜部の主張によると、一連の取引で得た利益は30億円で、インサイダー取引としては過去最高額である。
2006年6月26日に保釈が東京地裁に認められ、保釈保証金5億円を小切手で支払って保釈された。村上本人は、「家族や社員が心配だから」として早期の保釈を望んでいたとされている。
2006年9月15日、東京地検、東京地裁、村上の弁護人の三者により公判前整理手続が行なわれた。村上は当初、ライブドアによるニッポン放送株大量買い占め情報を堀江貴文前社長から聞いてニッポン放送株193万株を買い付けたというインサイダー取引の容疑の起訴事実について、「聞いちゃったかと言われれば・・・聞いちゃってるんですねぇ」と認めていたという。しかし、この日には、村上は買い占め情報を知った時期を「ライブドアが取締役会で正式決定した後」と述べ、起訴事実を一転、全面否認した。
2006年11月30日に初公判。村上は起訴事実を否認、その後も一貫して無罪を主張し続けた。しかし、2007年6月12日に結審し、村上は「反省すべき点は多かったが、意図的に法を犯すことはしていない」と改めて否認した。
東京地裁(高麗邦彦裁判長)は同年7月19日、村上に対して、懲役2年、罰金300万円、追徴金11億4900万円(求刑:懲役3年、罰金300万円、追徴金11億4900万円)の実刑判決を言い渡した。
また、村上自身は震災後すぐに南三陸町へ行き、炊き出しボランティアとして、1000個ほどのハンバーグを自ら焼き、また、友人知人に声を掛けて現地への支援物資の収集や運搬のサポートを行うなど、積極的な支援活動を行った。 一方では、2008年10月に村上ファンド関係者が入手したレノの共同経営に参加。
2009年2月3日、東京高裁は、懲役2年・執行猶予3年を言い渡した。罰金300万円と追徴金約11億4900万円はそのままとした。なお、法人として同罪に問われた投資顧問会社「MACアセットマネジメント」は、一審判決で罰金3億円だったところを2億円とした。村上・MACアセットマネジメント各被告側は即日上告の手続きを取った。
2010年、レノは自社株買いにより村上との資本関係を解消した。法的整理を検討していたゼクスから、入居者救済と実父が入居していたこともあり、高級老人ホーム3箇所を約100億円で買収した。
2011年6月7日、最高裁第1小法廷(桜井龍子裁判長)は上告を棄却し、懲役2年・執行猶予3年、罰金300万円と追徴金約11億4900万円の有罪判決が確定した。ただ、後に裁判長の「利益至上主義はビジネスと言えどもやり過ぎではないか」という発言に対し「ビジネスは安く買って高く売るもの。その考えは間違っている」と持論を展開した。一方、村上は同年5月、シンガポールに新会社「CARON」を設立、兄の世博(元三菱商事勤務)が永住権を取得して役員に就任した。