台湾鉄路管理局
1999年(民国88年) - 台湾省の機能凍結に伴い、中央政府(交通部)の管轄下に。
2001年(民国90年) - EMU600型電車を導入。
2003年(民国92年) - 北廻線電化複線化。
2007年(民国96年) - 台湾初の振り子式電車であるTEMU1000型電車と台湾初の内製電車であるEMU700型電車をそれぞれ導入。
2013年(民国102年) - 台湾初の空気ばね式車体傾斜電車であるTEMU2000型電車が運行開始。
2014年(民国103年) - 1月に新型通勤型電車EMU800型電車が運行開始。6月には台東線が全線電化。
2020年(民国109年) - 12月23日に南廻線の全線電化開業により種別として普快車が廃止。
2021年(民国110年) - 4月2日現地時間午前9時28分頃に台湾花蓮県秀林郷の清水トンネルで、特急列車 太魯閣号(タロコ号)が工場用車両と衝突し脱線する事故が発生した。乗員乗客50名が死亡、218名が負傷した。過去50年間で最悪の事故となった(北廻線太魯閣号脱線事故)。4月4日より新型通勤電車EMU900型電車が運行開始された。
2024年 (民国113年) -1月1日民営化予定(台湾鉄路有限公司 中国語)
簡易站: 三坑、百福、五堵、汐科、浮洲、南樹林、北新竹、三姓橋、豐富、泰安、大慶、烏日、嘉北、水上、柳營、南科、大橋、仁徳、左營(舊城)、內惟、美術館、鼓山、三塊厝、民族、科工館、正義、後庄、竹田、平溪、菁桐、林榮新光、豐田、千甲、新莊、集集、車埕、長榮大學...計34駅
甲種簡易站: 北湖、香山、大山、新埔、日南、花壇、南靖、後壁、林鳳營、佳冬、大里、龜山、竹中...計14駅
乙種簡易站: 栗林、頭家厝、松竹、太原、精武、五權、大慶、烏日、大村、瀧溪、康楽、三民、東竹、南平、貢寮、四城、景美、海端、山里、九讚頭、內灣、六家、水里、沙崙...計25駅
丙種簡易站: 十分、濁水...計2駅
招呼站 (無人駅): 新富、崎頂、談文、龍港、造橋、南勢、永靖、石榴、石龜、拔林、六塊厝、歸來、麟洛、崁頂、鎮安、東海、內獅、枋山、暖暖、牡丹、大溪、石城、外澳、頂埔、中里、新馬、武塔、平和、大富、瑞和、大華、望古、嶺腳、上員、榮華、橫山、合興、富貴、源泉、龍泉、海科館、八斗子...計42駅
号誌站 (信号場): 談文南、大肚溪南、中央、古莊、...計4駅
貨運站 (貨物駅): 五堵(貨)、新竹(貨)...計2駅
特等站の台北駅駅舎
一等站の台南駅駅舎
三等站の枋野信号場構内
丙種簡易站の十分駅構内