ヒューマン・メタボローム・テクノロジーズ
5月 - 米Agilent Technologies社と「Agilent-HMT CE-TOFMSメタボロームソリューションシステム」の販売を開始。
2007年 4月 - 慶應義塾大学との共同研究 大腸菌オーム解析の論文がサイエンス誌に掲載。 6月 - 枯草菌の胞子形成期における集団不均一性のメカニズムを解明。 9月 - 無料測定キャンペーンを展開。メタボローム技術への門戸を広げる。 12月 - 史上最大級のメタボロームマップにより微生物の飢餓応答の仕組みを解明。
2008年 2月 - 代表取締役社長に菅野隆二をアジレント・テクノロジーより招聘。 3月 - 「タンパク質リン酸化ディスプレイ法の開発」が科学技術振興機構(JST)育成研究として採択。 5月 - 「遺伝子産物の機能同定方法及び結合物質同定方法」が特許庁の特許原簿に登録。 6月 - 米Agilent Technologies社と「Agilent-HMT CE-TOFMSメタボロームソリューションシステム」の新製品を発売。 8月 - 創立5周年を記念し地元鶴岡の児童を対象とした「こども科学実験教室」の実施を開始。
2009年 5月 - 若手研究者育成のための助成事業を開始。 5月 - 経済産業省が行った 「大学発ベンチャーに関する基礎調査」 で大学発ベンチャー20選に選出。