国立感染症研究所
戸山庁舎:〒162-8640 東京都新宿区戸山1-23-1 厚生労働省戸山研究庁舎内(北緯35度42分15.02秒 東経139度43分2.56秒 / 北緯35.7041722度 東経139.7173778度 / 35.7041722; 139.7173778 (国立感染症研究所戸山庁舎)) 陸軍軍医学校跡地に建設された厚生省戸山研究庁舎へ1992年(平成4年)10月に移転。
村山庁舎:〒208-0011 東京都武蔵村山市学園4-7-1(北緯35度44分41.16秒 東経139度24分6.11秒 / 北緯35.7447667度 東経139.4016972度 / 35.7447667; 139.4016972 (国立感染症研究所村山庁舎)) 国立病院機構村山医療センター(旧:国立療養所村山病院)に近接。
ハンセン病研究センター:〒189-0002 東京都東村山市青葉町4-2-1(北緯35度46分6.96秒 東経139度29分59.58秒 / 北緯35.7686000度 東経139.4998833度 / 35.7686000; 139.4998833 (ハンセン病研究センター)) 旧:国立らい研究所→国立多摩研究所。
戸山庁舎の敷地内では、陸軍軍医学校時代のものと思われる人骨が1989年に発見され、敷地内の設備で保管されている。
2023年、戸山庁舎の一般公開に反ワクチン活動家が来場し、脇田隆字所長の意見は自分と同じだとSNSで無断発信した。所長はその無断発信を否定するプレスリリースを数日後に発表した。