藤原忠実
保元元年(1156年)7月2日、鳥羽法皇が崩御すると事態は急変する。7月5日、「上皇左府同心して軍を発し、国家を傾け奉らんと欲す」という風聞に対応するため、検非違使が召集されて京中の武士の動きを停止する措置が取られた(『兵範記』7月5日条)。法皇の初七日の7月8日には、忠実・頼長が荘園から軍兵を集めることを停止する後白河天皇の御教書(綸旨)が諸国に下されると同時に、蔵人・高階俊成と源義朝の随兵が東三条殿に乱入して邸宅を没官するに至った。没官は謀反人に対する財産没収の刑であり、頼長に謀反の罪がかけられたことを意味する。忠実・頼長は追い詰められ、もはや兵を挙げて局面を打開する以外に道はなくなった。
謀反人の烙印を押された頼長は崇徳上皇と共に白河北殿に立てこもるが、天皇方の夜襲により敗北する。頼長の敗北を知った忠実は宇治から南都に逃れた。重傷を負った頼長は忠実に対面を望むが、頼長に連座して罪人になる事を避けるため忠実は苦渋の末これを拒み、頼長は失意の内に死去。15日、南都の忠実から忠通に書状が届き、朝廷に提出された。摂関家の事実上の総帥(大殿)だった忠実の管理する所領は膨大なものであり、没収されることになれば摂関家の財政基盤は崩壊の危機に瀕するため、忠通は父の赦免を申し入れたと思われる。
寛治2年(1088年) 1月21日:元服し、正五位下に叙位。禁色を許される。 1月28日:侍従に任官 2月18日:右近衛権少将に転任 6月5日:右近衛中将に転任
寛治3年(1089年) 1月5日:従四位下に昇叙し、右近衛中将如元 1月11日:正四位下に昇叙し、右近衛中将如元 1月28日:伊予権守を兼任
寛治5年(1091年) 1月13日:従三位に昇叙し、右近衛中将・伊予権守如元 4月27日:正三位に昇叙し、右近衛中将・伊予権守如元
寛治6年(1092年)1月26日:権中納言に転任し、右近衛中将如元
寛治7年(1093年)1月5日:従二位に昇叙し、権中納言・右近衛中将如元
寛治8年(1094年)3月28日:左近衛大将を兼任し、右近衛中将を止む
嘉保2年(1095年)4月15日:正二位に昇叙し、権中納言・左近衛大将如元
永長2年(1097年)3月24日:権大納言に転任し、左近衛大将如元
承徳3年(1099年)10月6日:藤原氏長者宣下