バンカー・ヒル (ミサイル巡洋艦)
翌年、中華人民共和国の青島への訪問を行った。
1996年3月に中国人民解放軍が行ったミサイル発射実験を台湾南部で監視した(第三次台湾海峡危機)。
1998年7月に横須賀からサンディエゴへ母港を変更し、原子力空母エイブラハム・リンカーン戦闘グループに参加した。バンカー・ヒルは再びオペレーション・サザン・ウォッチに参加し、加えてイラクに対する国連制裁の臨検に参加した。その後東ティモールで人道支援を行う強襲揚陸艦タラワ揚陸即応グループの護衛と、クウェート沖での訓練演習に参加した。バンカー・ヒルは防空指揮艦の役割を果たし、揚陸即応グループへのミサイル巡洋艦の革新的な参加を実践した。
2000年に米艦コール襲撃事件が発生すると、バンカー・ヒルはバーレーンから展開し7隻の海軍艦艇に対して支援と護衛を行った。配備は67日間に渡って行われ、2001年2月に帰港した。
就役以来バンカー・ヒルはペルシャ湾へ6回展開し、8度の Battle "E" を受章し、そのうち1996年には5度の連続受賞により Golden Battle "E" を受賞した。
2006年3月にロッキード・マーティンは22隻の艦艇に対してイージスシステムの改良を行うことを発表した。これは、巡洋艦近代化計画の一環として行なわれるもので、バンカー・ヒルは改良の一番目であった。改修は2010年に終了し、これにより、本艦のイージスシステムはベースライン 8 CR2 / ACB08仕様に更新された。
2023年9月22日、バンカー・ヒルはサンディエゴで退役式典を行った。