エピクロエ属
1849年、エリーアス・フリースはノムシタケ属(Cordyceps)の亜属としてエピクロエという名称を用いた。彼はこのとき、クリスティアーン・ヘンドリク・ペルズーンが発見したCordyceps typhinaを基準種に設定した。1865年、シャルル・テュラーヌとエドモン・テュラーヌの兄弟は亜属を属に格上げした。これにより、ノムシタケ属だった基準種はEpichloë typhinaとなった。当初はエピクロエ属の種はこの基準種のみだったが、1970から1980年代に、畜産動物の中毒症状の原因菌として牧草から新種が発見された。1998年、Parepichloë属の一部がエピクロエ属に再分類された。2002年、日本特産のEpichloë sasaeと東南アジア産のEpichloë bambusaeが新設されたHeteroepichloë属へ移された。
現在、エピクロエ属の多くは無性および有性生殖の形態両方(それぞれ無性世代、有性世代)を持ち、さらにいくつかの種は無性世代しか持たない。
しかし、かつて、両世代を有する種について、無性世代と有性世代は異なる菌種として認識されていた。無性世代はエピクロエ属とは異なる分類群に分類されていた。
1982年、ギャレス・モーガン=ジョーンズ(Gareth Morgan-Jones)とヴァルター・ガムスにより、無性世代はアクレモニウム属のAlbo-lanosa節に再分類された。1996年、Glennと共同研究者は分子系統解析により当時のアクレモニウム属が多系統群であることを知った(通常、多系統群であることが明らかとなった場合、異なる系統群を異なる分類群に分離するため再分類が行われる)。彼らは新しくネオティホディウム属を作り、エピクロエ属に関連する無性世代をこの新属の分類することを提案した。2014年、 Leuchtmannと共同研究者はネオティホディウム属のほとんどがエピクロエ属の無性世代であることを確認し、これらをエピクロエ属に再分類した。なぜなら、国際藻類・菌類・植物命名規約は2011年から無性世代と有性世代で異なる名前を付けないようにし、全ての世代で同一の名前を付けるように求めているためである。