三四郎
美禰子は、漱石の弟子である森田草平と心中未遂事件を起こした、婦人運動家平塚雷鳥がモデルである。野々宮のモデルは、同じく弟子である、物理学者の寺田寅彦である。広田のモデルは、一高教授の岩元禎、若しくは二高教授の粟野健次郎だといわれている。深見画伯という、浅井忠をモデルにした人物もいる。
三四郎の故郷は「熊本」と誤解されることが多いが、熊本は高校の所在地であり、故郷は福岡県京都郡(旧豊前小倉藩〈豊津藩〉領)の農村、という設定である。三四郎は、熊本の高校時代のみならず、上京後も、長い休暇のたびに母やお光さんのいる国に帰省している(第11章)。このため、冬休み中に開かれた美禰子の結婚披露宴にも出席できなかった(第13章)。
作中で三四郎と美禰子が出会った東京大学の心字池(育徳園心字池)は、本作品にちなんで「三四郎池」と呼ばれるようになった。
助川徳是によれば、『三四郎』の各章ごとの時間的構造は、次の通りである。
一 8月中旬か下旬の2日間
二 9月上旬の10日間
三 9月中旬から10月中旬の35日間
四 10月下旬から11月3日の13日間
五 11月上旬の2日間
六 11月上旬の2日間
七 11月上旬のいちにち
八 11月下旬の2日間
九 12月上旬の10日間
十 12月上旬のいちにち
十一 12月上旬の10日間
十二 12月上旬の9日間
十三 翌年2月か3月の7日間
三四郎の同郷の先輩(三四郎より7歳ほど年上 - 第2章)。理科大(東京帝国大学理科大学)で光線の圧力の研究をする。大学からの月給五十五円。独身。いずこからか豊多摩郡大久保(新宿区)に転居(第3章)。