スーパーサイエンスハイスクール
終了経過措置期間は2005年(平成17年)度、2006年(平成18年)度の2年間で、既に終了済み。なお、筑波大学附属駒場高等学校、愛知県立岡崎高等学校、高知県立高知小津高等学校、西大和学園高等学校は2007年(平成19年)度に、岡山県立岡山一宮高等学校は2009年(平成21年)度に新規指定されている。
年度ごとの指定校数は以下の通り。
2002年(平成14年)度 - 26校
2003年(平成15年)度 - 26校
2004年(平成16年)度 - 20校
2005年(平成17年)度 - 22校(2002年(平成14年)度指定校の新規指定10校含む)
2006年(平成18年)度 - 31校(2003年(平成15年)度指定校の新規指定12校含む)
2007年(平成19年)度 - 31校(2002年(平成14年)度~2004年(平成16年)度指定校の新規指定18校含む)
2008年(平成20年)度 - 13校(2003年(平成15年)度~2004年(平成16年)度指定校の新規指定5校含む)
2009年(平成21年)度 - 9校(2006年(平成18年)度指定校の新規指定2校含む)
2010年(平成22年)度 - 36校
2011年(平成23年)度 - 38校(2006年(平成18年)度指定校の新規指定18校含む)
2012年(平成24年)度 - 73校(2007年(平成19年)度指定校の新規指定38校含む)
2013年(平成25年)度 - 43校
2014年(平成26年)度 - 9校
2015年(平成27年)度 - 新規25校(内・開発型1校、実践型24校)、科学技術人材育成重点枠5校