赦律
元々江戸幕府の法令は戦国時代の三河松平氏の法令が、徳川家康の天下平定とともに全国規模の法令に発展したものであり、その内容も武断的で厳罰と威嚇をもって犯罪を抑圧する事に重点が置かれて結果責任によって犯罪の成立が論じられる客観主義的な要素が強かった。このため、江戸幕府の刑罰は厳格に傾きがちであった。しかも家康が用いた法令は祖法でありそれを改正する事自体が、家康と幕府を侮辱する反逆的行為であると考える儒教的・保守的な考え方もあり、公事方御定書制定時に一部は緩和されたものの、戦国時代の法体系がそのまま幕末にまで持ち込まれていた。阿部は改正を論じる自体が保守派の刺激をしかねない公事方御定書の改正を避け、恩赦という形式を用いて公事方御定書が定めた刑罰を減刑するという遠まわしな手法で結果的に公事方御定書の改正を図ろうとしたのである。
阿部の意向を受けた3人は「大赦律」などを参照にしつつも旧来の問題点を洗い出し、旧来の恩赦規定をそのまま残すものの、より儀式的なものとして手続の主体を評定所に置くとともに、旧来は縁座のケースも含めて15歳以下の未成年にも課されていた追放などの重罰については直ちに恩赦の対象とするなどの事実上の刑罰の緩和策が盛り込まれた。
ところが編纂の翌年の黒船来航などで内外の情勢が混乱して施行が先延ばしされ、続いて阿部や遠山が急死して保守派の大老井伊直弼が実権を握った事もあって「赦律」は事実上葬り去られてしまう。ところが、編纂から11年後の文久3年3月に突然施行が命じられたのである。これについては編纂に参加した脇坂安宅の老中就任との関係や当時のいわゆる文久の改革との関連性が指摘されるが、その経緯については不明のままである。