水産学研究科
北海道大学院水産科学研究院・大学院水産科学院
東北大学大学院農学研究科 資源生物科学専攻 水圏生物生産科学講座
東京海洋大学大学院海洋科学技術研究科
東京大学大学院農学生命科学研究科水圏生物科学専攻や東京大学大気海洋研究所
三重大学大学院生物資源学研究科 生物圏生命科学専攻 海洋生物科学講座
福井大学大学院生物資源科学研究科
京都大学大学院農学研究科応用生物化学専攻 海洋生物環境学、海洋生物増殖学、海洋分子微生物学、海洋環境微生物学、海洋生物生産利用学、海洋生物機能学の各講座
高知大学大学院総合人間自然科学研究科 黒潮圏総合科学専攻
広島大学大学院生物圏科学研究科 環境循環系制御学専攻 環境評価論講座→広島大学大学院統合生命科学研究科 統合生命科学専攻
長崎大学大学院水産・環境科学総合研究科(旧生産科学研究科) 水産学専攻
九州大学大学院農学研究院 動物資源科学専攻・海洋生物生産学専攻(海洋生物学、水産増殖学)・アクアフィールド科学専攻(アクアフィールド科学)
宮崎大学大学院農学研究科 水産科学専攻
琉球大学大学院理工学研究科 海洋自然科学専攻、海洋環境学専攻