FF USVイェーナ
クラブ名の通り、大学のサッカーチームが母体となって結成されたクラブである。ドイツ再統一後の1991年、東ドイツ連邦リーグ優勝クラブだったUSVイェーナの女子部門としてブンデスリーガに参戦するも1年でアマチュアリーグに降格、それ以降アマチュアリーグに所属する状態が長く続いた。
2003年に女子サッカークラブとして再結成され、2004年より新設されたツヴァイテ・ブンデスリーガ(2部相当)に参加。2007-08シーズンにツヴァイテ・ブンデスリーガ南区で優勝、ブンデスリーガに昇格する。2009-2010シーズンの女子DFBポカールでは決勝まで勝ち進んだものの、決勝でFCR2001デュースブルクに敗れ準優勝に終わっている。
現在、イェーナ最大のスタジアムであるエルンスト・アッベ・スポーツフィールド(英語版)をホームスタジアムとして使用している。
2020年5月26日、同年7月1日にFCカールツァイス・イェーナ(ドイツ語版)にチームを譲渡すると発表された。