銚子丸
10月9日、東京都江戸川区「南小岩店」においてクドア・セプテンプンクタータ(魚に寄生する虫)を原因とする食中毒事故が発生。同店舗は江戸川保健所より2015年10月10日から1日間の営業停止処分を受けた。
2016年9月14日、東京都三鷹市「三鷹店」でアニサキスを原因とする食中毒事故が発生したと発表。同店舗は9月14日から1日間の営業停止処分を受けた。
2017年8月26日、千葉県船橋市「西船橋店」でカツオやアジなどの握り寿司を食べた30代の男性が腹痛を訴え、医療機関を受診した結果、胃からアニサキスが見つかり入院。船橋市保健所は店で出された握り寿司が原因の食中毒と断定し、9月1日から3日間の営業停止処分にした。
2021年12月29日、東京都練馬区「大泉インター店」にて客41人を巻き込む食中毒事故。客、調理を担当する従業員からノロウイルス検出。保健所は店を3日間の営業停止処分にした。
2023年 3月、銚子丸は同月27日から開催予定のキャンペーン企画で「爆盛り!こぼれ寿司」という商品を販売すると発表していた。しかし、「こぼれ寿司」の名称を同業の回転寿司チェーンを運営しているジャンティーズサプライが2012年6月に商標登録していたことが判明したため、キャンペーン企画開催当日に名称や関連の広告を全て「爆盛り寿司」に変更した上で謝罪した。 7月7日、神奈川県横浜市「横浜都筑店」でアニサキスを原因とする食中毒事故が発生。同店舗は横浜市保健所から営業停止処分を受けた。