JR東日本クロスステーション
下記2社は、一部株式を旧東日本キヨスク時代に保有していたが、JR東日本の完全子会社となった後、2020年4月1日に株式会社JR東日本フーズとして統合された。 ジェイアール東日本フードビジネス株式会社(株式の10%を保有のち全株売却) 株式会社日本レストランエンタプライズ(株式の1.6%を保有のち全株売却)
東北キヨスクサービス株式会社(本社:宮城県仙台市青葉区) 東北主要駅への商品の配送など。 2009年10月物流機能を東北鉄道運輸株式会社に統合。
東日本駅配送サービス株式会社(本社:東京都台東区) 2007年2月1日に株式会社ジェイアール東日本物流が吸収合併。
株式会社アドレスト長野(本社:長野県長野市) 完全子会社。飲食店業、広告代理業など。2020年4月1日に当社に吸収合併され消滅。
株式会社ヤンレイ(本社:東京都台東区) CD・DVDの販売(CD GARDEN)、アパレルの卸売及び販売を行っていた。2020年4月1日に東京ステーション・サービスに吸収合併され消滅。
千葉弘食株式会社(本社:千葉県千葉市中央区)
2013年(平成25年)10月 - JR東日本との連携と店舗支援強化のため、首都圏に東京・新宿・上野・横浜・八王子・大宮・千葉の各支店を再設置。
2014年(平成26年) 4月 - JR東日本の事業再編計画により、東北・新潟エリアの土産物店等31店舗の営業を別会社に分割。 12月 - コンビニ事業の店舗ブランド表記を「NEWDAYS」から「NewDays」に変更。
2018年(平成30年)4月 - JR東日本グループ再編により、株式会社JR東日本ステーションリテイリングを吸収合併、株式会社JR東日本ウォータービジネスを完全子会社化。
2021年(令和3年) 4月1日 - JR東日本グループ再編により、株式会社JR東日本フーズ、株式会社JR東日本ウォータービジネス、株式会社鉄道会館を吸収合併。同日付で株式会社JR東日本クロスステーションへ商号変更。 4月7日 - 本社を新宿区西新宿2丁目3番1号から渋谷区千駄ヶ谷5丁目33番8号へ移転。
2022年(令和4年)4月1日 - 株式会社NRE高崎サービス(本社:群馬県高崎市栄町1-25)を吸収合併。
2023年(令和5年) 4月1日 - 株式会社日本ばし大増、株式会社大船軒を吸収合併。 8月31日 - 首都圏の駅構内に出店していたジューススタンド「ハニーズバー (HONEY'S BAR) 」を全店閉店。 11月22日 - 首都圏の駅構内等に出店していたBecker'sをブランドクローズ。