フランツ・フェルディナント・フォン・エスターライヒ＝エステ
車が方向転換しようとした通りのカフェには、暗殺に失敗した黒手組のガヴリロ・プリンツィプが偶然居合わせ、彼は拳銃を取り出し車に近寄り発砲した。プリンツィプは1発目をゾフィーの腹部に、2発目はフランツ・フェルディナントの首に向けて発砲し、フランツ・フェルディナントは泣き叫ぶゾフィーの上に身を乗り出した。周囲の人々が夫妻に駆け寄った時にはフランツ・フェルディナントはまだ息があり、ゾフィーに「ゾフィー、死んではいけない。子供たちのために生きなくては」と語りかけていたという。総督官邸に入った側近たちはフランツ・フェルディナントの手当てを試みようとしたが、フランツ・フェルディナントは数分後に絶命し、ゾフィーも病院に向かう途中で死亡した。
暗殺者たちへの尋問で、彼らの所持していた武器は黒手組指導者でセルビア軍大佐のドラグーティン・ディミトリエビッチから提供されたものだと判明した。このサラエボ事件の後、オーストリア=ハンガリーは報復としてセルビア王国に宣戦布告し、第一次世界大戦が勃発することとなった。
フランツ・フェルディナント夫妻の葬儀は2人合同で行われた。貴賤結婚のために、ハプスブルク=ロートリンゲン家の人々が埋葬されるカプツィーナー納骨堂に入れないことを生前から悟っていた夫妻は、居城であったアルトシュテッテン城(ドイツ語版)内の納骨堂に埋葬された。