横浜港駅
山下埠頭への貨物輸送のみが継続されていたが、この輸送も1986年(昭和61年)11月1日に廃止となり、高島信号場より南の路線が全廃となった。ただし、書類手続き上は横浜港信号場までの旅客営業が残存しており、翌1987年(昭和62年)3月31日の国鉄最後の日に書類上の処理が行われて旅客営業も正式に廃止となっている。
廃止後は横浜みなとみらい21計画にしたがって跡地の開発がすすめられた。一方、市制100周年・開港130周年を記念して1989年(平成元年)に行われた横浜博覧会の会場ともなり、この際にまだ線路の残されていた横浜港駅付近の臨港線を利用してレトロ気動車の運行が行われた。
博覧会終了後は、1996年(平成8年)7月20日に旧旅客ホームが復元・保存されて赤レンガパーク内で一般公開された。このホームは、長さ55mほどが残されて、Y字の屋根柱は新製されたものである。1997年(平成9年)7月19日には、旧東横浜駅から横浜港駅へ通じる線路を通していた細長い人工島とその間に架かる3つの橋の遊歩道としての整備が完了して一般に公開され、汽車道となった。また、2000年(平成12年)には山下埠頭までの貨物線のうち山下公園内の区間の撤去が完了し、2002年(平成14年)3月2日には新港橋梁から山下公園までの区間が遊歩道として整備され山下臨港線プロムナードとして公開された。2001年(平成13年)には「横浜トリエンナーレ2001」にてオノ・ヨーコのアート作品『貨物車(Freight Train)』がすぐ横の元•軌道上にて展示され、その後市民団体によって2002年(平成14年)7月15日まで展示された。