タイノ族
コロンブスはシバオ川流域の首長に納税を強制し、1497年にはグアリオネクスをはじめとする14人の首長がスペインへの攻撃を計画したが失敗し、グアリオネクスはコロンブスの弟バルトロメ・コロンブス(英語版)に捕らえられて死亡した。金鉱からは目的の量が採掘できなかったため、コロンブスの統治は失敗し、1500年にスペイン国王のイサベル2世はコロンブスと弟2人をスペインに送還した。
スペイン王室はコロンブスの失政を収拾して金を増産するために、1501年にニコラス・デ・オバンドを総督とした。オバンドはタイノ人を分配してスペイン人に与え、デモーラと呼ばれる強制労働に従事させた。オバンドに抵抗するタイノ人は虐殺された。オバンドの行為は1503年のエンコミエンダによって法制度化されて、スペイン人はタイノ人の保護とキリスト教化をする代わりに自己目的のために使用できるようになった。保護よりも使用が優先されたためにタイノ人は重労働、不衛生な環境、栄養不良のもとに置かれた。加えてヨーロッパからの病気によって人口が激減した。セラグアのアナカオナは、1503年に訪問してきたオバンドをもてなしたが、オバンドはアナカオナを捕らえて絞首刑とした。これによりイスパニョーラ島でタイノ人の独立した首長はいなくなった。
エスパニューラ島の人口激減で労働力が不足すると、オバンドは周辺の島に侵略した。1508年にプエルト・リコ島で砂金が発見されてスペイン人が押し寄せ、タイノ人は1511年に反乱を起こしたが鎮圧された。