大塚製薬
ミュージックステーション(2009年度 - )
大塚製薬工場 オロナインH軟膏 OS-1
大鵬薬品工業 チオビタ ソルマック ハルンケア ゼノール ウレパールプラス(2008年9月に当社から譲受。製造販売元:大塚製薬工場) 新ポリカイン(製造販売元:大塚製薬工場)
大塚化学 オロナミンCドリンク
大塚食品 ボンカレーシリーズ マッチ - 旧大塚ベバレジ製品 マンナンヒカリ
大塚電子 UBIT-1(ヘリコバクター・ピロリ感染診断機) - 当社との共同開発品。専用呼気採取バッグ及び試薬「ユービット」は当社製造。 サンメディオン(電位治療器)
アース製薬 ごきぶりホイホイ アースノーマット バスロマン モンダミン
白元アース パラゾール ミセスロイド ノンスメル アイスノン わらべ
大塚オーミ陶業 名画電報(NTT電報)
2代目の大塚正士から大塚製薬工場の株式を買い受け、大塚製薬工場の親会社となる。
2000年 - 樋口達夫が代表取締役社長に就任。「野菜の戦士」「オロナミンCロイヤルポリス」発売。
2002年 - 中国に四川錫成大塚製薬、天津大塚飲料が、ベトナムに大塚OPV社が設立される。イーエヌ大塚製薬株式会社が設立される。ビーンスターク・スノー株式会社に資本参加。「スゴイダイズ」「カロリーメイトゼリー」発売。
2003年 - 中国に大塚臨床医薬研発、大塚(中国)投資、浙江大塚製薬が、タイに大塚サハ商品開発研究所が設立される。輸液に関する四国以外の販売権を大塚製薬工場に委譲。オロナイン液を発売。
2006年 - ソイジョイを発売。
2007年 - 新CIを導入。
2008年 岩本太郎が代表取締役社長に就任。 7月8日 - 大塚ホールディングス株式会社設立により同社の子会社となる。 9月3日 - 一般用医薬品の「ウレパールプラス」の販売を大鵬薬品工業へ譲渡。 9月9日 - 男性向けスキンケアブランド「UL・OS(ウル・オス)」を発売。
2015年 2月9日 - 岩本太郎代表取締役社長が死去。 2月12日 - 大塚ホールディングス株式会社代表取締役社長の樋口達夫が大塚製薬株式会社代表取締役社長を兼務。
2022年 - 大阪創薬研究所(仮称)を大阪府箕面市に開設。