Microsoft IME
Microsoft IME 97は大部分をマイクロソフトが自社で開発し、辞書や形態素解析を改善して変換精度を向上している。その後もWindowsやMicrosoft Officeなどに標準添付され、日本語入力システムにおけるシェアはこれらに伴って拡大した。
WindowsやMicrosoft Officeのメジャーバージョンアップに歩調を合わせるかたちでMicrosoft IMEのバージョンアップが続けられており、辞書の改良やプログラムの開発・改良など、変換精度や操作性の向上が進められてきたが、2007では変換エンジンの変更などから使い勝手に問題が生じ、「改悪されている」という不満の声も上がった(#課題を参照)。
2010年6月には2007の後継版Microsoft Office Input Method Editor 2010が正式リリースされたが、マイクロソフトは2010年4月22日、この最新版IMEを家庭用Office 2010の発売される6月17日から、Windows XP以降のMicrosoft Office正規ユーザー向けに無償提供することを発表した。
Windows 7までは、標準で付属しているIMEは、Officeに付属しているものに比べて若干機能が制限されていた。名称もOfficeに付属しているものとは異なり、Microsoft Input Method Editorとなっている。Windows 8からは日本語環境の標準コンポーネントとしてIME 2012が搭載され、機能と性能もOffice IMEを踏襲したものとなった。Office 2013以降にはIMEは付属しない。
Microsoft IME 2002にて、新しい入力方法として「ナチュラルインプット」が導入され、文節の区切りなどを意識せずに入力できるようになった。また、マイクをパソコンに接続することで音声認識により日本語文字入力をすることも可能となっている。ただし、これらの機能を完全にサポートするにはWindows XPから実装されたText Services Frameworkとそれに対応するアプリケーションが必要になり、実際はMicrosoft WordやMicrosoft Outlookなど一部製品に限られた。また、ナチュラルインプットでは自動的に前後の文字列を未確定に戻して変換を行うため、アプリケーションと共に再変換機能がサポートされていることを前提に実現した機能である。
ナチュラルインプットに対して従来の入力方法を受け継ぐインプットメソッドは「IME スタンダード」という名称になっていた。両者でキーボード操作が異なる事からナチュラルインプットはなじまないユーザーが多く、Microsoft IME 2003で操作性が改善されるも、Windows Vistaでは一部の補助機能を残しつつナチュラルインプットは廃止された。