ハネモ目
ハネモ目は基本的に沿岸域に生育し、特に熱帯域で多様性が高い (サンゴ礁やラグーン)。岩などに付着するものもいるが、砂泥地に定着しているものも多い。緑藻の海藻としては比較的深い水深に生育するものが多く、青緑色光を吸収するカロテノイド (シフォナキサンチンとシフォネイン) の存在がそれに関係していると考えられている。チョウチンミドロ属 (チョウチンミドロ科) のみは淡水域から知られており、湧水地などに生育する。
ウミウシの嚢舌類は海藻食であるが、その葉緑体をしばらく保持して光合成によって生きるものがいることが知られている (盗色素体化)。種によってほぼ決まった種の海藻を利用するが、その多くはハネモ目の種を利用する (右図4)。
ミル (ミル科) には窒素固定菌が共生していることがある。ミルはグルコースを分泌して共生細菌に与え、固定された窒素栄養分を得ると考えられている。
サボテングサなどの藻体表面は石灰化しており、熱帯海域における石灰堆積物の主要構成要素となる (右図5)。グレート・バリア・リーフなどではその厚さは 50 m に達し、堆積速度は 6 m/1000年ほどであると推定されている。