京都先端科学大学附属中学校・高等学校
1946年(昭和21年)辻本光楠(設立者・初代理事長)が財団法人京都学園を設置。
1951年(昭和26年)辻本一郎(第2代理事長)が学校法人京都学園を設置。
2014年(平成26年)学校法人京都学園(現、学校法人永守学園)から学校法人京都光楠学園が分離独立。
京都学園大学(現:京都先端科学大学)と、京都がくえん幼稚園・京都がくえん保育園(現:京都先端科学大学附属みどりの丘幼稚園・みどりの丘保育園)は学校法人京都学園(現、学校法人永守学園)に、京都学園中学高等学校(現:京都先端科学大学附属中学校高等学校)は学校法人京都光楠学園となる。
2018年(平成30年)第14代理事長に日本電産創業者の永守重信が就任。
2019年(平成31年)学校法人京都学園から学校法人永守学園に法人名変更。
2021年(令和3年)学校法人永守学園が学校法人京都光楠学園と再合併。
2015年度入学生以降、国際・特進・進学から、国際・特進ADVANCED・特進BASICへと名称変更
国際コース 高校国際コースにつながるコース 研修旅行は、カナダ・カルガリーでのホームステイを実施
特進ADVANCEDコース 高校特進ADVANCEDコースにつながる中高一貫コース 高校科目を先取りすることで大学受験に備え、近畿圏の難関国公立・難関私大への現役合格を目指す 研修旅行は、2015年度入学生はイングランド南部、2016年度入学生はカナダ・ノバスコシア州でのホームステイ
特進BASICコース 高校特進BASICコース・進学コースにつながるコース 高い学力を身につける且つ部活動に積極的に参加することで文武両道を目指す 研修旅行は、2015年度入学生はイングランド南部、2016年度入学生はカナダ・ノバスコシア州でのホームステイ
学校法人永守学園 京都先端科学大学 京都先端科学大学附属みどりの丘幼稚園
元は同一法人であったが、学校法人京都学園(大学・幼稚園・保育園)と学校法人光楠学園(中学・高等学校)に分離。
学校法人京都学園が学校法人永守学園となり、その後2021年4月より、学校法人光楠学園も学校法人永守学園に吸収合併。