ムヨウラン属
タブガワムヨウラン Lecanorchis tabugawaensis Suetsugu & Fukunaga, 2016 (琉球) ムロトムヨウランによく似るが、蕊柱や唇弁の形や色が異なる。
トサノクロムヨウラン Lecanorchis nigricans var. patipetala Y.Sawa, 1980 (日本本土、琉球) クロムヨウランの変種で、ヤクムヨウランとよく似る。
ミドリムヨウラン Lecanorchis virella T.Hashim. (1989) (日本本土、琉球:台湾) 絶滅危惧IA類(CR)(2017年、環境省)
ムヨウラン Lecanorchis japonica Blume (1856)(日本本土、琉球:朝鮮半島、台湾、中国福建省、湖南省) ホクリクムヨウラン Lecanorchis hokurikuensis Masam.(1963)は本種のシノニム。しかしYListでは独立種と認めている。
ムロトムヨウラン Lecanorchis taiwaniana S.S.Ying, 1987 (日本本土、琉球:台湾、ラオス、インド・アッサム) L. amethystea Y.Sawa, Fukunaga & Y.Sawa (2006)はシノニム。
ヤクムヨウラン Lecanorchis nigricans var. yakusimensis T.Hashim., 1990. (琉球:台湾、インドネネシア・ジャワ) 絶滅危惧IA類(CR)(2017年、環境省) クロムヨウランの変種で、トサノクロムヨウランとよく似る。