ミトコンドリア膜間腔
ミトコンドリアの内膜は、一般的にマトリックス側に大きく突出したクリステという構造を取っている。そのため膜間腔も、外膜と内膜に挟まれた周縁部と内膜のみに挟まれたクリステ内腔とに分けられ、両者の内容物には差がある。構造上も、周縁部の厚みが内膜や外膜を構成する脂質二重層と同程度(およそ6nm)であるのに対し、クリステ内腔はおよそ2倍の厚さがある。