指揮幕僚課程
試験は「指揮幕僚課程及び幹部専攻科課程学生選抜試験」であり、1次(筆記・3日間)、2次(口述・3日間)に分けて実施される。受験回数は最大3回までに制限されている(年齢制限あり)。試験合格者は、指揮幕僚課程学生又は幹部専攻科課程学生に指定される。なお、両課程間に昇任等の人事における優劣はなく同列とされている。CS課程では、指揮官・幕僚になるための術科素養・戦略・戦術・指揮統率・国際法などの教育が行われる。海上自衛隊では当該課程の履修は将官へ昇進するための必須条件ではなく、実際のところはCS課程又はES課程に行けなかった者(合格できなかった者)も、部隊長等の推薦により入学できる幹部特別課程(約4週間)を修了すれば、事実上CS課程及びES課程修了者と同様に扱われる。そのため、CS課程及びES課程修了者ではない1等海佐の割合は陸自・空自と比べると圧倒的に高い。
航空自衛隊の指揮幕僚課程
幹部自衛官としての資質の向上、上級指揮官・幕僚として必要な基礎的知識・技能の修得を目的としている。教育期間は47週である。学生は幹部普通課程を修了もしくは同等の能力を有すると認められ、かつ、航空自衛隊英語技能検定総合4級以上を有し、さらに所属部隊等の長より推薦された37歳未満の3佐及び昇任後2年以上経過した1尉の志願者から試験によって選抜される。試験は1次(筆記)、2次(口述・身体検査)に分けて実施される。受験回数は4回までに制限されている。