大和新庄藩
譜代 1万石
永井直圓
永井直亮
永井直国
永井直温
永井直方
永井直養
永井直幹
永井直壮
(大和櫛羅藩へ)
これより先の延宝8年(1680年)6月に丹後宮津藩主永井尚長と志摩鳥羽藩主内藤忠勝との間で刃傷事件が起こり、共に改易された。この事件は尚長と忠勝の不仲が原因ではあるが、事件の際に内藤忠勝が一方的に斬りつけたとされ、同年8月に永井尚長の弟の直円に大和国葛上郡などにおいて1万石を与えられ、永井家の家名再興が許された。しかしこの時期にはまだ同地に桑山家が存続しているため、永井家の再興・入封時期に疑問が残るところがある。
桑山家の陣屋は改易時に破却され、また、永井家時代の陣屋は新庄から2km離れた葛上郡松本村(現在の御所市)に存在していたため、城下町としての政治的役割を失った新庄の町は高野街道の宿場町へと転換されていった、とする指摘もある。
永井家の歴代藩主の多くは幕府の職制において大番頭や大坂定番を務めている。第8代藩主永井直壮は文久3年(1863年)に幕府による文久の改革の余波を受ける形で陣屋を櫛羅に移転し、以後の永井家は櫛羅藩として存続した。