新幹線総合指令所
同時にそれぞれの会社の組織に属しており、JR東海新幹線鉄道事業本部、JR西日本山陽新幹線統括本部、JR九州本社鉄道事業本部新幹線部の所属にある。
平時は当指令所で東海道・山陽新幹線の指令業務・運行管理と九州新幹線博多駅 - 新鳥栖駅間の運行管理を行っている。また、地震被災時などの緊急時に備えて第二総合指令所が大阪に設置されており、通常時から異常時訓練や東京から最新のダイヤグラムを転送して、早期に対応可能な体勢をとっている。
国鉄時代から民営化初期は、住所・所在地も公開され、一般からの見学も受け付けていたが、その後の社会情勢の変化により、現在は詳細な場所を非公開扱いとしている。
指令所内の正面には、東海道・山陽・九州新幹線の東京駅 - 新鳥栖駅間における運行状況を示す総合表示盤が設置されており、どの列車がどの位置に存在するかが一目で分かる仕組みになっている。博多駅 - 新鳥栖駅間の表示は、九州新幹線開通と博多駅の拡張にあわせて追加されたもので、それまでの表示盤に継ぎ足しされて作られている。なお、九州新幹線の新鳥栖駅 - 鹿児島中央駅間の表示盤は正面の総合表示盤に向かって右側に別途設けられている。