流星のロックマン3
電波犯罪組織。ボスはミスター・キング。彼等のメンバーの名称はトランプの札の名前にちなんでいる。
ノイズを自らの力へと変えるプログラム。シドウ曰く「サテラポリスが管理していた最凶にして最悪のプログラム」。「レッドジョーカー」バージョンにてシドウからスバルに託される。
『ロックマンエグゼ5』で、熱斗らが水着に着替える際に使った「パンツやぶり」を、何百年前から伝わる秘技としてスバル達が水着に着替えるのに使っている。
今作に登場する「シーサーアイランド」は『ロックマンエグゼ4』に登場した五十嵐ランの出身地である。前作に登場した「八木ケン太」の出身地としても同じ名前が登場している。
パッケージのロックマンのポーズがそれぞれ、「ブラックエース」は『ロックマンエグゼ6 電脳獣グレイガ』・「レッドジョーカー」は『ロックマンエグゼ6 電脳獣ファルザー』と対応しているが、ディレクターの安間がTwitterにてファンからの質問に答える形で「意図的なデザイン」を否定した。
ウェーブロード上の "ACCESS" と表示されたポイントに立つとポップアップが表示され、それにタッチすることで電脳世界へ移動できる(サイバーイン)。電脳世界からはいつでもウェーブロード上に戻ることが可能(サイバーアウト)。
何らかの理由で電脳世界に入れない場合は、アクセスポントに立ったときにアクセス不能を示す赤いポップアップが表示される。
前作までに存在したロックマンエグゼシリーズとのダブルスロットインを利用したシステムは存在しない。なお、本作と同時期に発売されたニンテンドーDSiはダブルスロットインそのものが不可能。
ゲームクリア後に出現する。ブラックホールを操る事ができる。ロックマンを自分のコレクションにしようとした。背中の羽(ビットやジェネレーターパーツ等、呼び名は数種類)をカッターにしたり、ビームを発したりする。また、どこかのサーバーに記録されていた電波体を再構築することで「R(リビルド)」として復活させた。
「ジョーカープログラム」によってファイナライズした姿。パワー型のファイナライズで、専用のフォルダは炎・無属性のカードが出やすい。
発現する能力は以下の通りになる。NFBは背後の2機のジェネレーターと右手から発するノイズのレーザーでバトルフィールド全体をなぎ払い、大爆発を起こす「レッドガイアイレイザー」。 ウォーロックアタックでのカード攻撃力が2倍 バスターレベルMAX スーパーアーマー ステータスガード
レッドジョーカーには以下の設定が公開されている。 R.J.コントロールギア 頭部のパーツ。ノイズを制御する機能を持つ。 メテオノイズイレイディエイター 右腕のパーツ。蓄えたノイズを一気に放出して攻撃することができる。 メテオノイズジェネレーター 背中についている2機のジェネレーター。自らノイズを発生させることができる。 クラウドオブクリムゾン 肩と足のパーツ。ノイズが結晶化して身を守る鎧に変化したもの。敵の放つ状態異常を引き起こすプログラムを断ち切っていると考えられる。
トランスコード000。バトルウィザード。ジョーカーがジョーカープログラムで流星サーバーにアクセスしたことでファイナライズした姿。戦闘時は主に地面を叩いて柱を出現させ、敵を押し潰して攻撃するほか、瞬間移動しての連続攻撃、腕をロケットランチャーに変形させて誘導ミサイルを乱射、ノイズを極太のレーザーに変えて発射するGメテオレーザーなどの多彩な攻撃を使い分ける。無属性。