26人のバクー・コミッサール
記念碑は2008年7月からフェンスで囲まれていたが、2009年1月にバクー当局は記念碑の解体を開始した。解体は地元の左翼勢力、特に共産党(英語版)によって反対された。だが、コミッサールの遺体はキリスト教、イスラーム教、ユダヤ教の聖職者らの協力を得て改葬され、同月26日にホヴサン(アゼルバイジャン語版)の墓地に葬られた。アルメニア側はこの改葬について、ナゴルノ・カラバフ戦争の最中にアルメニア人の遺体がアゼルバイジャンの中心に埋まっていることに対する拒否感からの行動である、として不快感を表明した。
この時、とあるスキャンダルが持ち上がっている。改葬のために地面を掘り起こしたところ、遺体は23体しか確認できなかった。そして消えた3体の中にはシャウミャンのものも含まれていた。アゼルバイジャンのメディアは、これをシャウミャンらアルメニア人のコミッサールが逃亡した証拠であると報道した。この疑惑についてモスクワ在住のシャウミャンの孫娘は、1930年代と1980年代にアゼルバイジャン共産党の指導層がシャウミャンを「アゼルバイジャン人民の敵」と見なして何かしら行った可能性を示唆した。