スカイライナー
10月30日:「モーニングライナー」「イブニングライナー」をそれぞれ1本増発。
2006年(平成18年)12月10日:下り早朝2列車を除き京成船橋駅に全列車停車開始。
2007年(平成19年) 1月28日:「開運号」のリバイバル運転を実施(京成上野 - 京成成田間1往復)。 7月31日:「スカイライナー」の利用者数が営業開始29年目にして1億人を突破。これを記念して成田空港駅で記念式典を実施した。また、当該列車となった「スカイライナー」20号の乗客全員にオリジナルうちわと1億人突破記念オリジナルハンカチをプレゼントした。その後、AE100形全編成に1億人乗車記念ステッカーが貼付された。
2008年(平成20年)4月26日:AE100形AE128編成を使用した「成田屋号」を運転。特製のステッカーも貼付された。なお、この編成は同年5月28日まで「成田山開基1070周年記念号」として運転された。
2010年(平成22年)3月1日:「スカイライナーチケットレスサービス」を開始。
印旛日本医大駅 - 千葉ニュータウン中央駅 - 青砥駅 - 日暮里駅 - 京成上野駅 京成上野行きのみ運転。所要時間は46分と最速のスカイライナーの京成上野 - 成田空港間よりも時間がかかる。 印旛日本医大・千葉ニュータウン中央は乗車のみ、青砥・日暮里・京成上野は降車のみ取扱。 青砥始発の京成押上線列車に接続。
2020年(令和2年)、新型コロナウイルス感染症(COVID-19)流行の影響で、5月1日より日中時間帯の半数を運休する一方、4月11日からスカイライナーの一部が青砥駅に臨時停車をしており、青砥駅では浅草線発着列車と相互に接続する。成田空港行きは乗車のみ、京成上野行きは降車のみ取り扱う。ドアが開く号車も最後部車両に限定され、青砥から成田空港行きスカイライナーに乗車する場合は座席未指定で、空席に着席する形を取っていた。当初は成田空港行早朝便と京成上野行深夜便各6本(3・5・7・9・11・13・72・74・76・78・80・82号)のみだったが、6月1日以降は日中の一部も対象に加わり、追加分と合わせて計14往復が青砥に停車していた。減便は2021年(令和3年)10月29日、臨時停車は2022年(令和4年)2月25日をもって終了した。
2022年2月26日より、スカイライナーの一部列車について、青砥駅が正式な停車駅となる。これにより、青砥駅発着のスカイライナー券においても、座席指定、券売機での購入、Web予約およびチケットレスサービスの利用が可能となったほか、成田空港行きについては4号車からの乗車も可能となった。また、京成上野行きについては全ての号車からの降車が可能となった。
2022年11月26日より、新鎌ヶ谷駅での停車を開始(上下列車とも乗降可能)。成田空港行きは4・6号車から、京成上野行きは全号車からの乗降が可能。
毎年12月31日(下り)および1月1日(上り)には初詣臨時列車として深夜時間帯に京成上野駅 - 京成成田駅間にて臨時「シティライナー」(成田スカイアクセス線開業前は「スカイライナー」)が運転されている。「シティライナー」では定期列車時代はAE100形が使用されていたが、この深夜の臨時「シティライナー」では新AE形で運転されている。
成田山新勝寺と縁が深い歌舞伎の市川家(成田屋)が成田山で襲名披露を実施する場合は、京成上野駅 - 京成成田駅間をスカイライナーに乗車して移動することが通例となっており、その際は「團十郎号」「海老蔵号」「成田屋号」として運転され記念ヘッドマークの掲出などが行われているが、スカイライナー運転開始前は一般車両で運転していたこともあった。
その他、過去にはスカイライナー1億人記念や京成電鉄100周年記念でのヘッドマーク掲出、エティハド航空のラッピング広告などが行われたことがある。
また、2005年3月9日にパク・ヨンハファンクラブの企画として団体列車『ヨンハライナー』が、2006年5月27日に成田空港第一ターミナルビルのグランドオープン記念として「まるごと体験教室」参加者輸送の団体列車『クウタン号』が運行された。