瀬々串駅
相対式ホーム2面2線を有する地上駅で、互いのホームは跨線橋で連絡している。無人駅となっている。以前はモルタルの駅舎であったが、2008年に取り壊され、簡素な駅舎に建て替えられた。
駅舎から手前側の1番ホームは、下り列車に使用されるが、上り側にも信号機(出発信号機)があり、稼働している。当駅折り返しの定期列車は設定されていないが、悪天候などによる運転規制の際には、当駅で折り返すことが可能となっている。このため、指宿枕崎線のキハ200系の行先表示板は瀬々串行きの表示が可能になっている。
IC乗車カード「SUGOCA」の利用が可能で(相互利用可能ICカードはSUGOCAの項を参照)、簡易SUGOCA改札機が設置されている。SUGOCAの販売、およびチャージの取り扱いは行っていない。
降車客のICカード以外の普通乗車券は駅の集札箱に投入、または車掌が回収する。集札箱、および簡易改札機は駅舎内と集落に面している2番のりば端(鹿児島中央駅寄り)の2箇所に設置されており、どちらからでも入出場することができる。この2番のりば出入り口前には、海岸に面した駅横という立地としては珍しく鹿児島市水道局の瀬々串第2水源地(水源は地下水)がある。これは当駅にかつて存在した蒸気機関車用の給水設備を転用したものである。
簡易自動券売機(ICカード非対応)が設置されている。トイレは設置されていないが、駅前のコンビニ店がある。