尾久車両センター
キハ80系気動車
特急「白鳥」用として配置されていた。
キハ181系気動車
特急「つばさ」用として配置されていた。
24系客車(3両)
寝台特急「北斗星」で運用されていた2両(オハネフ25 14、スシ24 506)と、寝台特急「出雲」で使用された1両(オシ24 701)が車籍を残され敷地内に留置されている。
「北斗星」用のオロハネ25 501と「出雲」用のオロネ25 7は、2021年3月1日付で廃車された。
E26系客車(13両)
12両編成1本と、予備用の電源車(カヤ27形)1両が配置されている。寝台特急「カシオペア」で運用されていた。
2016年6月以降は団体臨時列車「カシオペア紀行・カシオペアクルーズ」として東北・北海道方面を周遊するツアーで使用されており、同年9月には長野行きのツアーも運行された。
2022年現在は「カシオペア紀行」を中心に運転され上野 - 秋田・青森間、上野 - 長野間といずれも上野発で東日本エリアのみでの運行となっている。
皇室用客車(8両)
御料車4両、供奉車4両の計8両が配置されている。
後述のEF58 61と同様に、E655系(皇室用は特別車両のE655-1)にお召し列車・御乗用列車の運用が引き継がれたため、全車が保留車となっており、東京総合車両センター内で保管されている。