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新横崎市に暮らす少年・篝 燈八はどこからか聞こえる”鈴の音”に導かれ、10年前の事件によって隔離された"閉鎖特区"と呼ばれる地区に侵入してしまう。 そこで燈八が目にしたのは、呻き声を上げる大怪我をした男性だった。 様子を気にかけ近付く燈八を前に男は豹変。鈴の音とともに恐ろしい雄たけびを上げて襲いかかってきた。 事態を飲み込めず逃げ惑う燈八は大剣を操る小さな少女"Es"に窮地を救われる。 それは、世界を揺るがす非日常の始まりだった...