高屋城
しかし、またしても翌永禄4年(1561年)に高政が高屋城を奪回、翌永禄5年(1562年)に高政が教興寺の戦いで敗れると長慶の甥の三好義継が城主となった。三好三人衆と仲違いした義継は高屋城を離れ、永禄10年(1567年)に義継と松永久秀が東大寺大仏殿の戦いで三好三人衆に勝利、翌永禄11年(1568年)に隙をつき三好康長が入城したが、同年9月28日に芥川山城が織田信長によって落城すると、康長は阿波に落ち延びていった。
畠山高政は永禄8年(1565年)に足利義輝が永禄の変で殺されたのを機に、家督を弟の畠山秋高に譲って自らは足利義昭の将軍擁立に奔走していた事もあり、当然義昭・信長派であった。こうして河内半国守護は義昭・信長に認められ、秋高は高屋城に復帰した。しかし、義昭と信長が仲違いする元亀4年(1573年)、秋高は信長派に転じると、義昭派の重臣遊佐信教によって攻められ自害した。
信教は同じく反信長派の三好康長を天正2年(1574年)4月2日に城に引き入れて籠城を行うも天正3年(1575年)4月8日、織田軍の攻撃を受け、ついに開城した。康長は信長の家臣となったが遊佐信教は大坂本願寺と共に以後も信長と闘った。
以後、城としては利用されなかったようで、この時に廃城になったと思われる。
この城の文献上の初見は応永年間(1394年 - 1428年)に畠山基国が築いたとされていることから、一部では南北朝時代の城として紹介されている。しかしこの時期の文献には高屋城との記載は見受けられず、古市城や誉田城との名称の混乱があり、羽曳野市教育委員会では出土遺物の検討から、応仁の乱後文明11年(1479年)ごろの築城が推定できるとしている。この場合、築城主は畠山義就とされる。
高屋城の城主は河内の守護を兼ねていた人物が多く、10名前後、30回以上入れ替わっており、平安の時は少なく交替が頻繁におこる。特に畠山義英、畠山尚順、畠山稙長の畠山氏の家督騒動の50年間は、それぞれで4、5回城主が交替しており、交代後畠山義英は誉田城、交野城へ、畠山尚順、稙長父子は広城(和歌山県広川町)、大和に退避していた。
永禄元年(1558年)に安見宗房が専横を極めて守護の畠山高政を追放したが、高政に援軍を頼まれた三好長慶が永禄2年(1559年)に高屋城を落城させて宗房を追放し、高政を高屋城に復帰させた。そのうえ長慶は三好方の湯川直光を河内に送り込んできた。しかし、長慶に救援してもらったにもかかわらず畠山高政は湯川直光を遠ざけて、安見宗房を復権させた。これに憤慨した長慶は翌永禄3年(1560年)に再び高屋城を落城させ高政・宗房を追放し、河内の支配を手中にすると、弟の三好実休を高屋城に据えた。
高屋城は河内国守護の象徴のような城となり、激しい攻城戦が繰り返され、その戦いの多さは和泉、摂津、そして河内の中でもっとも多い。