目黒川
北沢川と烏山川の合流点より記載。
東仲橋(跡)
大橋 - 国道246号(玉川通り)および首都高速3号渋谷線。これより上流は暗渠化及び緑道化されている。
常盤橋
万代橋
氷川橋
東山橋
目黒橋 - 東京都道317号環状六号線(山手通り)
中の橋
南部橋
柳橋
千歳橋
天神橋
朝日橋
宿山橋(しゅくやまばし)
桜橋
別所橋
(鉄道橋) - 東急東横線および日比谷線中目黒駅(ホーム東端が川直上にかかる)
日の出橋
宝来橋
皀樹橋(さいかちばし) - 東京都道416号古川橋二子玉川線(駒沢通り)
田楽橋
なかめ公園橋
中里橋
田道橋(でんどうばし)
ふれあい橋
目黒新橋 - 東京都道312号白金台町等々力線(目黒通り)
太鼓橋
(鉄道橋) - 東急目黒線
亀の甲橋
市場橋
谷山橋 - 東京都道418号北品川四谷線及び首都高速2号目黒線 東急池上線の鉄橋
本村橋
五反田大橋 - 国道1号(桜田通り)
大崎橋 - 東京都道317号環状六号線(山手通り)。目黒川みんなのイルミネーションのコースのひとつで、ゴール地点
(鉄道橋) - 東急池上線
東京都世田谷区三宿の東仲橋付近で北沢川と烏山川が合流して目黒川となり南東へ流れ、品川区の天王洲アイル駅付近で東京湾に注ぐ。
起点(北沢川と烏山川の合流点)から国道246号の大橋までの600m強の区間は暗渠化され、それと併せて地表部分には人工のせせらぎを抱いた緑道(目黒川緑道)が整備されており、カルガモやコイ、ザリガニなど様々な生物が住み着いている。大橋より下流は開渠となっている。
北沢川や烏山川が暗渠化され下水道に転用されて以降は水量が枯渇していたが、1995年(平成7年)以降、「清流復活事業」として、目黒川を流れる水の大部分は新宿区の東京都下水道局落合水再生センターで下水を高度処理したものを導いている。これにより水量が復活し、スミウキゴリなど魚類が増え、東京湾からマハゼやアユ、ボラが遡上するようになった。子供達によるイベント「いきもの発見隊」で採取された魚などは12種類(2017年時点)であった。
目黒区の辺りでは岸に桜並木があり、花見の時期には多くの見物客で賑わう。
下流部の地下には首都高速中央環状線の山手トンネルが建設された。
かつての河口河道は現在の新品川橋付近より北へ湾曲し流れ、その東岸は北へ延びた細長い砂州で(洲崎)、北品川橋付近が河口であった(品川湊)。途中には品海橋が架かっていた。また、荏原神社の北側を蛇行して流れていたが、直線化された。