黒田長政
この期に及んでは穏便に事を修めることが不可能と悟った長政は城井谷を攻撃したが、地の利のある鎮房のゲリラ戦術に苦戦した。そこで黒田父子は付け城を築いて兵站を断つ持久戦法をとり、他の国人勢力を各個攻め下していった。これが功を奏し形勢は逆転し、鎮房は12月下旬に13歳になる娘・鶴姫を人質に差し出すことを条件に和議を申し出、それが受け入れられ鎮房は恭順を誓った。しかし、秀吉の承認を得ることは出来なかった。秀吉の承認を得ることができないと知った長政は、城井一族の誅伐を決心した。
天正16年(1588年)4月20日、長政は鎮房を中津城に招いたが、家臣団は城下の合元寺に留め置かれた。わずかな共の者と中津城に入った鎮房は、長政の手によって酒宴の席で謀殺された。そして黒田勢が合元寺に差し向けられ、斬り合いの末に城井の家臣団は全員が討ち取られた。さらに黒田勢は城井谷城に攻め寄せて陥落させ、鎮房の父・城井長房を殺害した。また、鎮房の嫡男・城井朝房は、黒田孝高に従い一揆鎮圧のため出陣していたが肥後国で孝高によって暗殺された。こうして城井氏の勢力の殲滅に成功した長政は、人質の鶴姫を13人の侍女と共に、山国川の畔、広津の千本松河原で磔にして処刑した。
天正17年(1589年)、父が隠居したために家督相続を許され、同時に従五位下、甲斐守に叙任した。
父:黒田孝高(1546/47-1604)
母:櫛橋光(1553-1627)、幸圓、照福院 - 小寺政職の養女、櫛橋伊定の娘
正室:糸姫(1571-1645) - 豊臣秀吉の養女、蜂須賀正勝の娘 長女:菊子 - 井上庸名室
継室:栄姫(1585-1635)、ねね姫、大凉院 - 徳川家康の養女、保科正直の娘 長男:黒田忠之(1602-1654) - 始め忠長、忠政、次代当主(嫡男) 次女:徳(1606-1625) - 榊原忠次正室 三男:黒田長興(1610-1665) 四男:黒田高政(1612-1639) 三女:亀子(1616-1645) - 池田輝興正室
側室:長徳院 - 筑紫広門の娘 次男:黒田政冬(1605-1625) - 甚四郎、早逝:当初8000石