神社合祀
氏子・崇敬者の側としては、反対集会を開くこともあったが、主として大きな運動もできず、合祀によって廃された神社の祭神が祟りを起こしたなどと語る形でしか不満を示すことはできなかった。
とはいうものの、この合祀政策は、博物学者・民俗学者で粘菌の研究で知られる南方熊楠ら知識人が言論によって強い反対を示した。南方は、合祀によって1敬神思想を弱める、2民の和融を妨げる、3地方を衰微する、4民の慰安を奪い、人情を薄くし、風俗を害する、5愛国心を損なう、6土地の治安と利益に大害がある、7史跡と古伝を滅却する、8天然風景と天然記念物を亡滅すると批判した。こうした反対運動によって次第に収束して、帝国議会での答弁などを通して、1910年(明治43年)以降には急激な合祀は一応収まった。しかし、時既に遅く、この合祀政策が残した爪跡は大きく、多数の祭礼習俗が消えてしまい、宗教的信仰心に損傷を与える結果となった。
社格を上げる条件は由緒・縁起の格式だけでなく、財政面でもクリアしなければならなかった。
第一条 左項の一に当り、境内地六百坪以上にして、本殿、拝殿(但し同一建物にして本殿、拝殿を区画したるものを含む)、鳥居及社務所(社殿の構造、境内の風致等、其府県内の壮観にして最も有名なるもの)を具へ、現金五千円以上若くは之に相当する国債証書又は土地、及弐千戸以上の氏子を有する神社は府社若くは県社に列することを得。 第一 延喜式若くは六国史所載の神社 第二 一国の総社たりしもの 第三 祭神の功績、史上(乗)に顕著ニシテ其地方に縁故あるもの又は特別由緒ある神社 第二条 左項の一に当り、境内地五百坪以上にして、......現金参千円以上若くは......、及千戸以上の氏子を有する神社は郷社に列することを得。 第一 延喜式若くは六国史所載の...... 第三条 無格社にして境内地参百坪以上を有し、......現金弐千円以上若くは......、及弐百戸以上の氏子を有する神社は村社に列することを得。
寛文5年(1665年)、岡山藩主池田光政は荒神や淫祠とされた10,528神社を寄宮71社へ合祀、大社・産土社含め638社のみ存続させ、1,036カ寺のうち約6割の寺院を破却した。熊沢蕃山は排仏論を唱えた。