国道39号
国道333号(旭川市4条通8丁目・4条通8丁目交点 - 上川郡上川町日東・上川町日東交点)
国道273号(上川郡上川町日東・上川町日東交点 - 上川郡上川町層雲峡・大雪湖交点)
国道242号(北見市留辺蘂町旭)
国道240号・国道243号(網走郡美幌町仲町2丁目・仲町2交点 - 網走市大曲1丁目・大曲1交点)
国道240号・国道242号・国道243号(網走市大曲1丁目・大曲1交点 - 網走市南4条東1丁目・南4東1(終点))
北海道道101号下川愛別線:本町
北海道道140号愛別当麻旭川線:本町 → 旭川紋別自動車道愛別IC
北海道道640号中愛別上川線:中央
旭川紋別自動車道愛山上川IC:愛山
北海道道223号愛山渓上川線:愛山
1952年(昭和27年)12月4日 - 一級国道39号(旭川市 - 網走市)として指定施行。
1960年(昭和35年) - 上川町から留辺蘂町(現北見市)間のルートが、それまでの石北本線に沿うように遠軽町を経由するルートから現在の石北峠を経由するルートに変更された。
1965年(昭和40年)4月1日 - 道路法改正により一級・二級区分が廃止されて一般国道39号となる。