プロ野球スピリッツ
1チームの指揮官となり自チームを優勝・日本一へと導くモード。監督パートでは1軍決め、オーダー、投手のローテーション、また新戦力の補強等を考え、試合では全員操作、1人だけ操作(フィールドプレイと呼ばれる。投手の場合自分が登板時のみ、野手の場合は自分が打席に立った時のみ操作する。設定でベンチに居る時やネクストバッターの時も観戦したり守備や走塁も操作可能だが、自動操作もできる全員操作と違って守備・走塁も全て手動で操作する為、走塁時には打球判断、守備時にはアウトカウントとランナーの場所といった状況判断が不可欠となる)、監督操作、観戦、スキップから選択可能。ちなみに同社のアーケードゲーム『BASEBALL HEROES』では監督操作の方法を採用している。『プロ野球スピリッツ2013』からは、コンバートも可能になった。
試合オーダー時、選手の調子を表す四角いマーク。絶好調→好調→普通→不調→絶不調と毎回プレイ時に選手の調子によってマークの色が変わる。
シリーズ当初は実況パワフルプロ野球シリーズで使われた丸型の調子マークが使われていた。