曳舟駅
東武スカイツリーライン ■特急「けごん」・■特急「りょうもう」・■特急「リバティけごん」「リバティきぬ」「リバティりょうもう」一部停車駅、■特急「スカイツリーライナー」「アーバンパークライナー」停車駅 ■急行・■準急 押上駅 (TS 03) - 曳舟駅 (TS 04) - 北千住駅 (TS 09) 押上方面へは普通列車の設定はない。 ■区間急行・■区間準急・■普通 とうきょうスカイツリー駅 (TS 02) - 曳舟駅 (TS 04) - 東向島駅 (TS 05)
亀戸線 曳舟駅 (TS 04) - 小村井駅 (TS 41)
伊勢崎線ホーム(1 - 4番線)では2010年10月28日より導入された。伊勢崎線内の中間駅で導入されたのは、西新井駅に次いで2駅目である。亀戸線ホーム(5番線)では「PASSENGER」が使用されている。
東向島方に渡り線が設けられ、亀戸線用車両の回送や半蔵門線・田園都市線直通運転中止の際の折り返し(北千住から当駅までは回送)に使用される。2007年の構内改良工事により渡り線が両渡り線化され、直通運転中止時の折り返し能力向上が図られた。
早朝と深夜を除いて、浅草発着の列車と半蔵門線・田園都市線直通列車の接続がとられる。
2003年3月の改正までは当駅で10両編成の準急浅草行きの切り離し作業を行っていた。10両のうち切り離された4両は伊勢崎線と亀戸線の間にあったガーター橋の引き込み線まで行き、そこの引き込み線で切り離された4両同士を再連結し折返し回送にさせて運行していた。現在はガーター橋と車止め付近のレールのみが残されている。
夜間は3番線にて回送列車の停泊が行われている。
浅草方面の次駅はとうきょうスカイツリー、半蔵門線方面は押上で、両駅とも東京スカイツリーの最寄駅であるため、浅草方面・半蔵門線方面のどちらの電車に乗っても次の駅で降りれば東京スカイツリーへ行くことができる。なお、東京スカイツリータウンにおける位置としては前者は西側、後者は東側にあるため、目的に応じて使い分ける必要がある。