スペースゴジラ
口から吐くビーム。ゴジラの放射熱線を上回る威力を持つ。さらに光線を曲げることによりさまざまな角度からの攻撃が可能であるが、肩の結晶体を破壊されて以降は曲げることが不可能となった。飛行形態でも使用可能。
一方、結晶体を破壊された後には、前作では描かれなかった肉弾戦の迫力を強調している。
スペースゴジラが浮遊しながら攻撃する描写は、前作のスーパーメカゴジラと同様に天井に設けられたレールで操演している。光線を吐きながら横移動するシーンは台車に乗せて撮影しているが、勢い余って転倒し、以後の撮影では下半身を固定している。肩の結晶体が破壊されるシーンでは、火薬が強すぎて火が消えなかったが、播谷は慌てることなく演技を続けていたという。
バース島での戦いは、脚本初稿では火山の噴火により、準備稿ではエネルギー不足により、スペースゴジラはゴジラにとどめをさせなかったという理由付けがなされていたが、尺の都合などからこの点については省略された。バース島の撮影時には、リトルをいじめ抜く様からスタッフに「イジメッコ怪獣」と呼ばれていた。
神戸上空でのスペースゴジラ飛行形態とGフォースのF-15による空中戦が予定されていたが撮影は行われなかった。スペースゴジラが倒された後は、その体細胞や結晶体が煙となって昇天するという描写も存在し、ドライアイスの煙と銀粉を上から振らせ逆回転で撮影していたがカットされた。