大泊郡
また、箱館奉行はオランダ式のストーブを作成、安政3年の冬、クシュンコタンに鉄製のストーブが7 器配置されたが、新築した越年用の家屋は室内が暖かく、結局西浦のクシュンナイ(久春内郡久春内村)に4機、東浦のマーヌイ(栄浜郡白縫村真縫)に3機が送られた。軍事施設では、クシュンコタンに大砲4基が設置された台場1カ所のみ存在。
亜庭湾沿岸部では新場西能登呂岬線、大泊国境線(シュシュヤ越)、大泊中知床岬線(本道)の前身に相当する道が通じ、通行屋・小休所では、「通行屋」8カ所と、その途中に「小休所」3カ所が存在。松浦武四郎は、弘化3年にエンルヲロ(千歳)とクシュンコタン(大泊町楠渓町)、幕吏として訪れた安政3年はクシュンコタンに宿泊。
幕末当時の宗教施設や漁場については下記のとおり。
アニワ湾岸の神社(西方より順次記載)
千歳村・・・泊恩内(三ノ沢)○(社名不明)、ウシユナイ・牛運内(一ノ沢の北)弁天社、ウンラ・雲羅(一ノ沢)弁天社
大泊町・・・クシュンコタン(運上屋勤番所等の所在地で大泊町楠渓町)弁天社・竜神・金比羅社・稲荷の社・金勢の社など6社、ホロアントマリ(栄町)弁天社、エントモカヲマナイ(円留)、ヲフヱ(ユ)トマリ・小冬泊・オホヘドマリ(雄吠泊)弁天社
大政奉還後の慶応4年(1868年)4月12日、箱館裁判所(閏4月24日に箱館府と改称)の管轄となり、6月末、岡本監輔、箱館府の行政官としてクシュンコタン(大泊町楠渓)に着任し公議所(裁判所)を置いた。 亜庭湾岸のベシャニ(小実、長浜)、東浦の東トンナイ(富内)・栄浜(もとシュシュウシナイ)・シララオロ(白浦)、西浦のシラヌシ(白主)・西トンナイ(真岡)・クシュンナイ(久春内)・ウショロ(鵜城)の八箇所に官員を派遣し、王政復古を布告して出張所を設けた。明治2年(1869年)北蝦夷地を樺太州(国)と改称。開拓使直轄領となった。この年、丸山作楽と谷元道之が樺太出張の命を受け着任。明治3年(1870年)樺太開拓使領となったが、明治4年(1871年)開拓使直轄領に復した。同年8月29日、廃藩置県を迎える。 開拓使は樺太の治安の維持のため、明治5年青森県出身の羅卒(巡査)10名を樺太に派遣。翌年の函泊出火を受け、荘内出身の旧士族の羅卒16人を増派したが、その目的は主にロシア兵や逃亡したロシア徒刑囚の暴行への対処だったという。羅卒たちは全員クシュンコタンに駐在し、ススヤ(千歳村貝塚)からポロアントマリ(大泊町栄町)までの区域を昼夜巡回。しかし武器は警棒のみであり被傷事件も発生。立田革が樺太問題の対応に当たった。このころ行われた文明開化期の事象としては、神仏分離令、壬申戸籍編製、散髪脱刀令、平民苗字必称義務令公布などが挙げられる。アイヌは百姓身分だったため、平民となった。明治8年(1875年)、樺太千島交換条約によりロシア領とされた。これにともない、経営困難となった栖原家が樺太から撤退。雇用関係にあったアイヌを中心に日本国籍を選択、シュシュヤやポロアントマリから北海道に移住する者がいた。