ジョン・ブレッキンリッジ
9月にブレッキンリッジは南西バージニアにおいて軍を指揮した。そこでは連合国軍は非常に混乱していた。彼は部隊を再編し、北東テネシーの攻撃を行った。ソルトビルの戦い(英語版)に勝利した後、ブレッキンリッジは何名かの連合国軍兵士が何十人もの合衆国軍の黒人兵を戦闘後に殺害したのを発見し、これに衝撃を受けた。彼はこの事件に責任を負うフェリクス・ヒューストン・ロバートソンを逮捕し裁判にかけようとしたが、連合国は崩壊しこれを達成することはできなかった。
1865年1月にブレッキンリッジは陸軍長官に就任した。1865年4月上旬、リッチモンド陥落に伴う混乱の中ブレッキンリッジは、南部連合の政府と軍隊が破壊されずむしろ合衆国軍から無傷で占領されるように尽力した。そうすることによって彼は、南部同盟の戦争の顛末が歴史の中に保存されるよう保証した。連合国が崩壊すると、ブレッキンリッジはデイヴィス大統領と共に脱出し、ジョセフ・ジョンストン将軍と共にベネット・プレイスでのウィリアム・シャーマン将軍との降伏交渉を行った。ブレッキンリッジは、更なる抵抗がより多くの死に通じるだけであるとデイヴィスを説得しようとし続けたが、一方彼は大統領を危険から守る義務があると感じていた。結局二人は逃亡途中の混乱で別れてしまうこととなった。