マーヴル・スーパーヒーローズ VS. ストリートファイター
前作から「波動拳」が大きくなった反面、一定距離飛ぶと消える。また、「竜巻旋風脚」が斜め上に上昇する(ボタンによって軌道が異なる)ようになった。通常ヴァリアブルコンビネーションで出すハイパーコンボは各キャラクター1種類でケンの場合「昇龍裂破」だが、リュウとチームを組んだ場合のみ普段は出せない「真空波動拳」に変わる。本作より先に稼動していた『ストリートファイターIII』でのスーパーアーツ「疾風迅雷脚」がハイパーコンボとして追加されており、足に炎を纏っている。ただしリュウ同様、隠し技になっていてインストカードには記載されていない。エンディングは本作の戦いが修行時代に居眠り中のケンが見ていた夢という内容になっている。
担当声優は名前はクレジットされているものの、ナレーターと憲磨呂を除き役名はクレジットされていない。以下にクレジットされた順に記載する。
岩永哲哉
笹本優子
高木渉
西村知道
細井治
宮村優子
森川智之
山田義晴
Andrew Jackson
Cathal Dodd
Frank Perry
Jaimz Woolvet
Len Doncheff
Lorne Kenedy
Norman Spencer
Patric Chilvers
Tony Daniels(ナレーター)
木梨憲武(憲磨呂)
特定のコマンドによって使用可能。この3人は固有エンディングを持っていない。ブラックハートとメフィスト、キャプテン・アメリカとU.S.エージェントで擬似的な同キャラクターチームを作ることが可能だが、スパイダーマンとアーマースパイダーマンは出現コマンドの関係上チームを組むことができない(SS版はアーケードモードを1度クリアすれば同キャラクターでタッグを組めるようになるため可能)。
特定のコマンドによって使用可能。日本版のみキャラクター別エンディングが存在する。