彦根藩
近江国 愛知郡のうち - 53村 犬上郡のうち - 122村(残部は寺社領でありほぼ全域) 坂田郡のうち - 130村(大部分) 浅井郡のうち - 18村(うち10村を朝日山藩に編入) 伊香郡のうち - 26村
下野国 安蘇郡のうち - 15村
武蔵国 荏原郡のうち - 10村 多摩郡のうち - 9村
上記のほか、明治維新後に千島国択捉郡および日高国沙流郡の一部を管轄した。また、蒲生郡7村、神崎郡1村(以上は大津県に編入)、愛知郡21村(うち11村を大津県に編入)、坂田郡5村、浅井郡24村(うち19村を朝日山藩に編入)、伊香郡13村(大津県に編入)の幕府領を預かり、他の藩・県に編入された村以外は本藩に編入された。