大悪臭
テムズの北側は人口稠密で、ロンドンの人口の3分の2の住宅があり、そして工事は人口過密な街路を進まねばならず、そして運河、橋、そして鉄道線のような都市のハードルを乗り越えねばならなかった。システムの工事は1859年1月31日に始まったが、しかし建設業者は建設中に1859年-60年の労働者のストライキ、冬の硬い霜(hard frosts)、そして平年以上の降雨をふくむ、無数の問題に遭遇した。1862年6月の雨はあまりに激しかったので、フリート下水道を再建築する工事で事故が起きたほどである。深い掘削がメトロポリタン鉄道(現メトロポリタン線(Metropolitan line))のためのクラーケンウェル(Clerkenwell)で開鑿の掘削と平行に走っていて、そして2つの壕を分ける8+1⁄2-フート (2.6 m)の壁が崩壊してフリートの水がヴィクトリア・ストリートに流れ出て、ガスおよび水道の本管に損傷を与えた。
高-層下水道は - 工事のうち最北のもの - ハムステッド・ヒース(Hampstead Heath)からストーク・ニューイントン(Stoke Newington)まで走り、またヴィクトリア・パーク(Victoria Park)を横切るが、そこでそれは中-層下水道の東端と接続した。中-層下水道は西部のベイズウォーターから始まり、オックスフォード・ストリート(Oxford Street)に沿って走り、クラーケンウェルおよびベスナル・グリーン(Bethnal Green)を通り、そして接続に至った。
この結合された下水管本管は、ストラットフォードのアビー・ミルズ・ポンピング・ステーションまで走り、そこでそれは低-層下水管の東端と接続した。アビー・ミルズの複数のポンプは低-層下水管から流出水を下水管本管に36フィート (11 m)上げた。この下水道本管は、ベックトン(Beckton)の下水の落ち口まで - いまグリーンウェー(Greenway)として知られるものに沿って - 5マイル (8 km)走った。
クロスネス・ポンピング・ステーションのように、アビー・ミルズはバゾルゲットとドライヴァーの共同設計であった。機関室の中央の上方には華やかなドームがあったが、ドブラツキは、このために建物は「ビザンチンの教会に - ...見かけは似ている」("superficial resemblance - ... to a Byzantine church")と考えている。建築史家ニコラウス・ペヴズナー(Nikolaus Pevsner)はその『Pevsner Architectural Guides』で、建物は「きわめて汚い目的に適用されたわくわくさせる建築術」("exciting architecture applied to the most foul purposes")を示していると考えた。
1866年に、ロンドンでコレラが発生し、5,596人の人命を奪ったが、ただしそれはオルドゲート(Aldgate)とボー(Bow)の間のイースト・エンドに限られた。そのとき、それはバゾルゲットのシステムと結びつけられていなかったロンドンの一部で、死者の93パーセントはその地域内で発生した。過失はイースト・ロンドン・ウォーター会社(East London Water Company)にあり、会社は貯留池から下水を半マイル(800 m)下流に排出した。下水は上げ潮で上流の貯留池に上げられ、地域の飲料水を汚染した。発生、そして原因の診断は、コレラは瘴気によって伝染するのではなく水から発生するという承認につながった。『The Lancet』は、ドクター・ウィリアム・ファー(Dr William Farr)による事象の詳細な調査を述べながら、彼の報告「は、彼が流行の因果関係における給水の影響に関して到達した結論を反論し得なくするであろう」("will render irresistible the conclusions at which he has arrived in regard to the influence of the water-supply in causation of the epidemic")と述べた。これが首都におけるこの病気の最後の発生であった。