東部地区大学野球連盟
言い方を変えれば、全日本大学野球連盟側としては、地区の管理運営は地区連盟内の問題であり、代表決定方法がどのような形で行われるかは地区連盟側の事情によるもの(全チームによるトーナメントで代表を決定しようが、予選リーグと代表戦の組み合わせで実施しようが自由で、例えば、東部地区内の神奈川リーグは予選リーグであるという認識)という立場で地区連盟の管理は行われていた。(現在の全日本大学野球連盟における東海地区大学野球連盟とその内部で行われている各県別リーグの関係に酷似した状況。)
その後は、代表校の技量向上・各地区連盟からの要望・地方連盟の発展などの考慮から、地区内にあった既存のリーグの枠組が全日本大学野球選手権大会の出場枠拡大に伴う地区連盟の再編成により順次独立していった。1991年の再編(但し、向こう3年間の試験的な実施)では地区内の2連盟からそれぞれ代表を出すことになり代表決定戦を実施する必要がなくなったことから、同年には組織として実質的な役割を終え、その3年後のそれまで試験的な導入だった出場枠再編を以後も継続する決定をもって正式に消滅した。
1991年 全日本大学野球選手権大会の出場枠拡大に伴い地区連盟を再編成。東部地区から千葉大学野球連盟、北関東甲信越大学野球連盟が独立した。このことにより、東部地区大会の開催が必要なくなり、実質的には消滅したが、この措置は、当初向こう3年間の試験的措置として通達され、また、秋季リーグ戦後に行われる明治神宮大会の代表選出には形式的にそれまでの秋季東部地区大会として行われていた千葉県大学野球連盟と北関東甲信越大学野球連盟の間の代表決定戦が続いていたため、東部地区大学野球連盟あるいは東部地区大会の名称使用が続いた。
1993年 前回に採られた再編成が以後も継続することが正式に決定。曖昧だった地区名称や地区連盟の存在は、この年の秋季をもって正式に終了した。秋季における千葉県大学野球連盟と北関東甲信越大学野球連盟の間の代表決定戦と代表枠も、東部地区大会および東部地区代表から、「千葉・北関東甲信越」代表決定戦と改められた。