清澄丸 (特設巡洋艦)
第二輸送隊は2月19日にパラオを出発し、同日アメリカ潜水艦「ランナー」の攻撃を受けるも被害はなく、2月22日にウェワクに着いた。「清澄丸」の輸送内容は人員1350名、車両17両、物件10476梱であった。
以後しばらくの間は日本本土と南方各地との間で輸送任務に従事し、3月10日午後には北緯22度12分 東経120度31分 / 北緯22.200度 東経120.517度 / 22.200; 120.517の地点を航行中にアメリカ潜水艦「キングフィッシュ」に発見され、魚雷を3本発射されたが回避した。夏から秋にかけては航空機輸送などを行った。
秋に入り、「清澄丸」は第十七師団(酒井康中将)をラバウルに輸送する丁二号輸送に「護国丸」、水上機母艦「秋津洲」および特設潜水母艦「平安丸」(日本郵船、11,616トン)などとともに加わり、9月24日に上海を出撃。この間の10月1日付で特設運送船に類別変更される。任務終了で呉淞に戻ったあと、今度は第十七師団の残余兵力を輸送する丁四号輸送に「護国丸」および第十四戦隊(伊藤賢三少将)の軽巡洋艦2隻(那珂、五十鈴)と第二輸送隊を編成して参加。10月21日に上海を出撃後、アメリカ潜水艦「シャード」の雷撃をかわし、トラック諸島を経てラバウルに向かう。しかし、11月3日にカビエン北北東の海域でB-24の爆撃を受けた。「清澄丸」は至近弾で機械室が浸水し、やがて機械と舵が故障して航行不能となった。「清澄丸」は「五十鈴」に曳航されてカビエンに到着し、輸送物資や人員を他の艦船に移した。カビエン停泊中の11月16日に国際汽船が大阪商船に合併され、「清澄丸」も書類上は大阪商船に移籍した。 12月29日、南東方面艦隊は「清澄丸」の護衛として駆逐艦「夕凪」を指定する。12月30日、カビエンに「夕凪」が到着。