Β-カテニン
E-カドヘリンの細胞質側のテール領域も同様にARMドメインと結合することが発見された。足場タンパク質のアキシン(2つの近縁パラログのアキシン1とアキシン2)には、ディスオーダーした長い中央部の領域に同様の相互作用モチーフが含まれている。アキシン1分子にはβ-カテニン結合モチーフは1つしか含まれていないが、その結合パートナーであるAPCは1分子あたり11個のモチーフがタンデムに存在しており、一度に複数のβ-カテニン分子と相互作用することができる。ARMドメインは一般的には一度に1つのペプチドモチーフとしか結合できないため、これらのタンパク質はすべてβ-カテニン分子の細胞内プールをめぐって競合する。この競合は、Wntシグナル伝達経路がどのように機能しているかを理解するために重要である。
しかし、このARMドメインの「主」結合部位は唯一の結合部位ではない。ARMドメインの最初のヘリックスは、さらに特別なタンパク質間相互作用ポケットを形成する。この部位は、Wntシグナル伝達に関与する転写コアクチベーターのBCL9(とBCL9L(英語版))に存在する、ヘリックスを形成するlinear motifを収容する。その詳細は明らかではないものの、β-カテニンがアドへレンスジャンクションに局在した際に、同一の部位がα-カテニンによって利用されるようである。このポケットはARMドメインの主結合部位とは異なる位置にあるため、α-カテニンとE-カドヘリンや、TCF1とBCL9の間では競合は起こらない。一方、BCL9とBCL9Lはβ-カテニン分子への結合をめぐってα-カテニンと競合する。
ある人の脳がストレスに効率的に対処できるかどうか、すなわち抑うつに対する感受性の程度は、その人の脳のβ-カテニンに依存しているという研究報告が2014年になされている。高レベルのβ-カテニンシグナルの伝達は行動の柔軟性を増加させるのに対し、β-カテニンシグナル伝達の欠陥は抑うつやストレス管理能力の低下をもたらす。
GSK3が基質に対して高効率なキナーゼとなるためには上述したプライミングだけでは十分ではなく、MAPKの場合と同様、基質が高親和性のドッキングモチーフを介して酵素と結合している必要がある。β-カテニンにはそうしたモチーフは存在しないが、アキシンがその役割を果たしている。アキシンのGSK3ドッキングモチーフはβ-カテニン結合モチーフの直近に存在する。アキシンは足場タンパク質として機能し、酵素(GSK3)と基質(β-カテニン)を物理的に近接させている。
しかし、アキシンも単独で機能しているわけではない。アキシンはN末端のRGS(英語版)(regulator of G protein signaling)ドメインを介してAPCタンパク質をリクルートする。APCには多数(1分子に11個)のβ-カテニン結合モチーフが存在し、できるだけ多くのβ-カテニン分子を集めている可能性がある。APCにはアキシンのRGSドメインと結合するSAMP(Ser-Ala-Met-Pro)モチーフが3つ存在し、複数のアキシン分子と同時に相互作用することもできる。さらに、アキシンはC末端のDIXドメインを介してオリゴマー化する能力を持つ。こうした相互作用の結果、多数のタンパク質による巨大な集合体がβ-カテニンのリン酸化のために形成される。この複合体は通常β-カテニン分解複合体(β-catenin destruction complex)と呼ばれているが、実際にβ-カテニンの分解を担うプロテアソームとは別物である。この複合体はβ-カテニンに対し分解のための標識をつけるだけである。