基地業務隊
従来、警備隊が行っていた後方支援や隊員に対する福利厚生等のサービス部門を専任する部隊として1987年(昭和62年)7月1日に各地方隊隷下に新編された。これに伴い、警備隊は警備部門専任部隊に改編された。基地業務隊の長は、基地業務隊司令といい、1等海佐をもって充てる。司令は、地方総監の指揮監督を受け、基地業務隊の隊務を統括する。
なお、市ヶ谷地区には、海上幕僚監部及び東京都(特別区に限る)に所在する海上自衛隊の防衛大臣直轄部隊及び機関等の業務を支援する組織として海上自衛隊東京業務隊(防衛大臣直轄部隊)が置かれている。また、海上自衛隊の航空基地には同等の業務を行う航空基地隊が置かれている。