視交叉上核
概日リズム形成の分子的メカニズムは、時計遺伝子のネガティブフィードバックループに基づいている。哺乳類の代表的な時計遺伝子としては、Bmal1、Clock、period 遺伝子(Per1、Per2、Per3)、Cry (Cryptochrome) 1、Cry2などが知られる。まず、BMAL1とCLOCKの複合体がPerやCryの発現を増加させ、発現され複合体を形成したPERやCRYはBMAL1とCLOCKの複合体に相互作用し自らの転写を抑制する。Rev-erbやRorからなる二次的なネガティブフードバックループも存在する。またこれらの時計遺伝子の分解速度を調節するCK1 (Casein kinase 1)などのリン酸化酵素も周期の調節において重要な役割を果たしている。