霊元天皇
中宮:藤原(鷹司)房子(新上西門院)(1653年 - 1712年) - 鷹司教平女 第三皇女:栄子内親王(1673年 - 1746年) - 二条綱平室
典侍:藤原(坊城)房子(権大納言典侍)(1652年 - 1676年) - 坊城俊広女 第二皇女:憲子内親王(1669年 - 1688年) - 近衛家熙室
典侍:藤原氏(中納言典侍)(1653年 - 1691年) - 小倉実起女 第一皇子:済深法親王(1671年 - 1701年) - 勧修寺
典侍:敬法門院(1658年 - 1732年) - 松木宗条女 第四皇子:朝仁親王(東山天皇)(1675年 - 1710年) - 現在の皇室の先祖に当たる。 第五皇女:福子内親王(1676年 - 1707年) - 邦永親王(伏見宮)室。旧皇族11宮家の共通先祖である邦家親王は、福子内親王の男子貞建親王の曾孫(霊元天皇・敬法門院夫妻の来孫)にあたる。 伏見宮系の皇族は男系のみに限る場合は室町時代の貞成親王(配偶者:庭田幸子)の代で現在の皇室から分離しているが、女系を含めた場合は福子内親王との血縁関係により、霊元天皇・敬法門院夫妻が最も近い共通祖先であると見なすことができる。