マカオの戦い
初代総督のフランシスコ・マスカレニャス(ポルトガル語版)(在任:1623年 - 1626年)はゴアからの命令で広東の地方官僚に賄賂を渡し、マカオの要塞化を実行してオランダの再度の侵攻を防いだ。
1622年、オランダ艦隊は澎湖に到着した。クーンの意見では、澎湖はマカオよりも戦略的に重要であった。そのため、クーンはレイエルセンに中国船攻撃を命令した。これは中国に貿易を強制させるためであり、成功すれば澎湖はマカオとマニラに取って代わってシルクの中継貿易の中心となるはずだったが、中国はこの無差別攻撃とマカオ侵攻でオランダ人を海賊や殺人者として扱い、1623年から1624年までの中蘭紛争(英語版)でオランダを撃退した。オランダは1624年に澎湖から台湾への撤退を余儀なくされた。この2年間で、マカオはこのオランダの自業自得でさらに潤った。
マカオ防衛の成功は、ポルトガルが日中貿易を引き続き支配することを意味した。このときにはすっかり衰退したポルトガルにとって、この交易路は唯一利益を出し続けたものだった。この状況は30年後、日本が1639年にポルトガル人を追い出し、さらに1641年にポルトガル領マラッカが陥落(英語版)したことで終わった。
この戦闘は極東におけるオランダとポルトガルの戦闘ではオランダ最大の敗北であり、オランダの死傷者はポルトガルのそれを大きく上回った。ポルトガル側の記録は最小のものでも敵を300人殺したというものであり、ほとんどの記録はオランダ側が600人から800人の死者を出したとしている。オランダの正式記録は死者136人、負傷126人だったが、これはオランダ人のみ計算に入れたものだった。歴史家のC・R・ボクサーはオランダ側のオランダ人以外の死者も計算に入れた場合、死者は300人程度になるとしている。オランダ人武官は多くが死傷し、7人の大尉、4人の中尉、7人の少尉が死亡した。またオランダは大砲、軍旗、装備を全て失った。一方、ポルトガル側の死者はポルトガル人4人、スペイン人2人、奴隷数人にとどまり、負傷者は20人程度であった。バタヴィアでは、ヤン・ピーテルスゾーン・クーンがこの結果に凄く失望した。彼は「屈辱的にも、私たちは艦隊で最良の人々と一緒に武器の大半を失った」と記した。
クーンはポルトガルの守備について、「ポルトガル人は奴隷を使って私たちをマカオから追い出した。兵士を使ってのことではなかった。それはマカオに兵士がいなかったからだ。