保健所政令市
都道府県及び特別区は、地域保健法第5条第1項の規定に基づき、自ら保健所を設置する義務がある。市については、同法に基づく政令で指定されている市のみが保健所を設置することができる。この政令で定められている市以外の市及び全ての町村は、自ら保健所を設置する権限がなく、当該市町村を包括する都道府県が設置した保健所の所管に属することとなる。このため、政令で指定されている市が周辺市町村と一部事務組合を組織して保健所を設置することはできない。
また都道府県は、保健所政令市以外の市及び全ての町村の区域の保健所業務を、保健所政令市が設置した保健所に委託することができる(茅ヶ崎市、鳥取市がこれに該当)。また、保健所政令市と都道府県が共同で保健所を設置することもできる(松江市がこれに該当)。
なお、この区分は産業廃棄物処理業の許可権者(廃棄物処理法政令市)と一致する(特別区を除く)。すなわち、産業廃棄物処理業の許可は、保健所政令市であれば当該市長に、それ以外であれば都道府県知事に申請して許可され、保健所政令市内での事業に関して都道府県知事の許可の効力は及ばない。