中院家
通為の子の14代通勝は天正8年(1580年)正三位・権中納言のまま逐電するも、細川幽斎に学んで源氏学を構築し『源氏物語』の注釈書を集成した『岷江入楚』を執筆した。
江戸時代前期の15代通村は武家伝奏を務めて公武間の斡旋に尽力していたが、寛永6年(1629年)に後水尾天皇が突然明正天皇に譲位したことについて幕府から事前に報告しなかったと非難され、江戸へ呼び出された際に一時上野寛永寺に幽閉された。解放後帰京し内大臣に就任した。通村は近世前期の歌人・源氏学の学者としても著名であり、後水尾天皇や徳川家康に源氏物語講釈を行った。後水尾上皇が譲位した後には上皇側近の内々衆公家となり上皇から厚く信頼され、後水尾院歌壇において指導的立場に立った。
17代通茂・18代通躬父子は霊元院歌壇の中心となるが、特に通躬はその功績によって従一位・右大臣に昇った。また、通茂と通躬も通村と同様に武家伝奏に就任して公武間の斡旋に尽力した。
江戸時代の家禄は初め300石、幕末には500石。家臣に諸大夫として岡本家、小川家、伊藤家、侍に清水家。荒木家があった。家業は四箇の大事(節会・官奏・叙位・除目)・有職故実。菩提所は廬山寺。江戸時代の屋敷は京都烏丸下長者町にあった。明治19年(1886年)にはこの中院家の邸宅があった場所に明治天皇の勅命により和気清麻呂を祀る護王神社が建設され、現在に至っている。
15代通村の母が細川幽斎の娘だったことから、近世には武家との縁組が多かった。近世後期には男子に恵まれず、同じ村上源氏の久世家などから養嗣子を迎えた。