MARVEL VS. CAPCOM CLASH OF SUPER HEROES
声:モーリス・ディーン・ウィント
原作と同じく、かつてプロフェッサーXがマグニートーに精神攻撃をしかけた際に繋がりあった二人の精神の暗黒面が結合したことから誕生した存在という設定。より強大な2段階目の姿を持つのも原作同様。キャプテン・アメリカのエンディングにおいて、プロフェッサーXの精神がオンスロートを生み出す一方で、自らを止めるべく次元のひずみを作り出しカプコン側のキャラクターを呼び出したことが語られている。
第一形態では、サイクロップス、ジャガーノート、マグニートーに似た技を使い、スペシャルパートナーとしてセンチネルを飛ばしてくる他、一定の時間が経つとプレイヤーキャラクター以外のキャラクターを呼び出して、戦わせてくる(その際オンスロートは画面奥にいる)。スーパーアーマー状態なので一定のコンボや技で仰け反るものの回復が早く、追い討ちをかけると手痛い反撃を受ける。
第二形態では巨大になり、弱点は顔と腕だけとなる。キャプテンコレダー風のレーザーをメインにパンチに特攻など接近戦を行ってくる。センチネルも飛ばしてくるがこちらは小センチネルである。第一形態とは違い画面を縦横無尽に動き回り、通常の攻撃の届かない高い位置に来る場合もある。両方に共通している技としてハイパーグラビテーションがあり、こちらは防御不可能でホーミング性能を持つ。飛び道具で消すことができるものの、三発同時に発射される。
家庭用では使用条件こそ違うがドリームキャスト版、PlayStation版ともに使用可能だが、プレイヤー版にはハイパーコンボゲージがありいくつかの技がハイパーコンボ仕様となっている(CPU版はゲージがなく全ての技が必殺技扱いである)。
キャラクターに関しては、マーヴル側の使用キャラクターはガンビットが復帰し、新たにベノムとウォーマシンが参戦した。カプコン側は今作からタイトルが社名になったことにより、キャプテンコマンドーやロックマンなど元々格闘ゲームではないゲームのキャラクターが参戦。これまで連続出演していたケン、ダルシム、ベガ、豪鬼がプレイヤーキャラクターから外されるなど大幅な入れ替えが行われた。
最終ボスに複数の形態が存在するようになったという特徴もある。本作では最終ボス「オンスロート」を一度倒した後にデモが挿入され、その後第1形態を倒したときの状態を引き継いで第2形態と戦うことになる。このシステムは『MARVEL VS. CAPCOM 2 NEW AGE OF HEROES』の最終ボス「アビス」にも引き継がれた(こちらは3つの形態がある)。
当初はボスキャラクターとしてギャラクタスが候補にあがっていた。しかしマーヴル側から「ヒーローたちが殴りあって倒せるような相手ではない」と却下された。なお、ギャラクタスは後に『MARVEL VS. CAPCOM 3』にて、ボスキャラクターとして登場している。
その他、ライナーノーツやシークレットファイルによれば、ハワード・ザ・ダックや『ファイナルファイト』のマイク・ハガーがプレイヤーキャラクターの候補に挙がっていた。