長崎みなとメディカルセンター
2003年(平成15年)4月1日 - 地方公営企業法全部適用。
2012年(平成24年)4月1日 - 地方独立行政法人長崎市立病院機構による運営に変更。
2014年(平成26年)2月24日 - 新市立病院第I期棟が完成し、「長崎みなとメディカルセンター市民病院」として開院。 新病棟は地下2階・地上8階の10階建て。 旧病棟を解体し、第二期棟の建設を開始。
2016年(平成28年) 2月28日 - 第二棟が完成。 3月27日 - 統合のため、長崎みなとメディカルセンター成人病センターを廃止。 7月1日 - 一期棟の7階部分を100床分の病室に改築する工事が完了し、全面開院。一般病床数が500、結核病床数が13、計513となる。
2017年(平成29年) 1月28日 - 駐車場棟が完成。 4月1日 - 「長崎みなとメディカルセンター」に改称。
2020年(令和2年)2月1日 - 救命救急センターを開設。 長崎県内では国立病院機構長崎医療センター(大村市)、長崎大学病院(長崎市)、佐世保市総合医療センターに次ぐ4か所目の開設。長崎市内では長崎大学病院に次ぐ2か所目の開設となる。