過去に存在したイトーヨーカ堂の店舗
23区
(初代)小岩店(江戸川区南小岩7-23-20) 1963年(昭和38年)5月1日開店 - 1982年(昭和57年)3月閉店 小岩駅前店(売場面積約7,146m)が1980年4月に開店し、(2代目)小岩店となった。
(初代)曳舟店×(墨田区京島1-27-3) 1967年(昭和42年)7月開店 - 2010年(平成22年)11月7日閉店 売場面積約2,540m。 3階建ての建物に食料品や衣料・雑貨売場が配置された店舗で、当社で初めて食品のマーチャンダイジングを行った店舗である。 2010年10月24日に2階・3階部分を閉店、完全閉店までは食料品売場のみの営業となった。 2010年(平成22年)11月27日に曳舟駅前再開発事業「イーストコア曳舟」II街区に(2代目)曳舟店を開店。 店舗跡はマンション「BRANZ曳舟」となっている。
(初代)亀有店×(葛飾区亀有3-13-15) 1971年(昭和46年)6月開店 - 1996年(平成8年)1月7日閉店 開店当時の店名は亀有駅前店で、数か月後に亀有店に改称した。 閉店後はジャパンホームバリューが営業していたが、現在は建物解体されてマンション「ラヴィアンコート亀有」となっている。
南砂町店×(江東区南砂6-7-15) 1977年(昭和52年)7月29日開店 - 2000年(平成12年)8月閉店 売場面積約2,842m。 トピレックプラザのテナントとしてオープンしたが、1990年代後半のリニューアルに伴い建物は解体されている。 現在のトピレックプラザはイオン南砂店、ドイトを核としている。
大井店(品川区東大井5-2-3) 1969年(昭和44年)4月10日開店 - 1997年(平成9年)4月6日閉店 売場面積約4,176m。
地下1階・地上4階建て・延べ床面積約2,200坪の「第15かんべビル」の全館を借り切って開業した 1997年(平成9年)4月18日に2代目となる大井町店が近隣に開業し、2代目となる大井町店の直営売場面積は約12,000m。 ヨークショッピングスクエア大井店として開業し、売場面積4,176mの店舗であった。 当社初のテナントを導入したショッピングセンター形式の店舗であり、初代店舗と2代目店舗ともオーナー同一であった。 店舗跡は肉のハナマサ等が入居する「おおい元気館」となっている。
(初代)大森店(大田区山王2丁目4-1) 1985年(昭和60年)9月14日開店 - 2000年(平成12年)3月閉店 売場面積約9,750m。 旧:大森京成百貨店。1979年に傘下に入れ、「オーモリ京成」を経てイトーヨーカドー大森店に業態変更。 店舗跡はオオゼキ大森店などが入居する複合商業ビル。 (2代目)大森店(大田区大森北2-13-1、売り場面積約14,980m)は2004年(平成16年)12月8日開店。(大森海岸駅近くのアサヒビール東京工場跡地)
蒲田店(大田区西蒲田7-61-1、東京蒲田文化会館内) 1964年(昭和39年)4月24日開店 - 2004年(平成16年)2月29日閉店 1969年(昭和44年)当時は、東京蒲田文化会館内の地下1階から3階に入居していた。 1969年(昭和44年)5月1日に建物に隣接して野積みされていた段ボールなどの紙類で出火し、外壁の開口部から2階に延焼して3階にも広がり、2,129m(各階1,064.5m)のうち、1,782mが焼失する火災が発生した。
蕨店×(蕨市塚越1-7−9) イトーヨーカドー(1970年(昭和45年)6月開店 - 2009年(平成21年)4月12日閉店) ザ・プライス(2009年(平成28年)4月17日変更 - 2016年(平成28年)10月閉店) IY時代の売場面積約7,382m(直営売場面積約7,105m)、延床面積約20,870m。 ザ・プライスの売場面積約6,780m。 店舗跡には2018年6月27日にライフ蕨駅前店が開店した。
東松山店×(東松山市箭弓町1-15-13) イトーヨーカドー(1977年6月開店 - 2009年(平成21年)4月19日閉店) ザ・プライス(2009年4月24日変更- 2016年(平成28年)10月閉店) IY時代の売場面積約7,382m(直営売場面積約7,105m)、延床面積約20,870m。 ザ・プライスの売場面積約6,780m。 店舗跡は集合住宅「ハイムスイート東松山」となっている。
奈良店(奈良県奈良市二条大路南1-3-1) 2003年(平成15年)7月10日開店 - 2017年(平成29年)9月10日閉店 店舗面積約35,000m。 奈良県唯一の店舗で、関西6店舗目として、奈良そごう跡地に開業。長屋王の邸宅の跡地に立地していた。 閉店後は東京都に本社を置く商業コンサルタント会社「やまき」に土地と建物を売却し、同社の運営により、2018年4月24日に観光型複合商業施設「ミ・ナーラ」としてグランドオープンし、奈良をテーマにしたテーマパークやアミューズメント施設とし「ROUND1」がオープンする。 なお、旧そごう跡に出店したイトーヨーカドー店舗は他に南大沢店(ガレリア・ユギ内、東京都八王子市、旧柚木そごう)が現存する。
いわき植田店×(いわき市植田町中央3丁目3-1(旧・八郷4-1)) 1975年(昭和50年)4月28日開店 - 2006年9月18日閉店 売場面積約6,335m。 植田小学校跡地に地元商業者が設立した「勿来商業振興(協)」が開設した植田ショッピングセンター(地下1階・地上5階建て、延べ床面積約13,760m)の核店舗だった。 2002年に一旦は閉店して撤退することになったが、この時は閉店せずに終わった。 店舗跡のテナントには藤越等が入居したが、藤越は2008年8月末に撤退し、同年9月に運営母体の協同組合植田ショッピングセンターが民事再生法の適用を申請して事実上倒産した。2009年に全館閉館し解体して更地にしてヨークベニマルに引き渡し、その代金で清算することになった。 2023年1月現在、跡地はミニストップいわき植田駅前店等となっている。
平店×(いわき市平六町目6-2) 1971年(昭和46年)4月28日開店 - 2021年(令和3年)2月28日閉店