ヤコウチュウ
日本近海で大発生するいわゆるヤコウチュウはNoctiluca scintillansである。別にN. miliarisの名が頻繁に用いられるが、これらは同種であると考えられている。近縁属のPronoctilucaの分類も併せて掲載するが、この属の生物発光に関しては不明。分子系統解析によれば、渦鞭毛植物門におけるヤコウチュウの分岐は非常に早く、従って綱レベル(Noctiluciphyceae)で他の渦鞭毛藻と区別されている。
Noctiluca Suriray 1836
N. scintillans (Makartney 1810)Kofoid&Swezy 1921 (=N. miliaris) タイプ種。
Pronoctiluca Fabre-Domergue 1889 (syn. Protodinifer Kofoid&Swezy 1921)
P. acuta (=Rhynchomonas acuta)
P. marinus (=Pelagorhynchus marinus)
P. pelagica Fabre-Domergue 1889 タイプ種。
P. rostrata
P. spinifera