共同運行
のちに南国交通の路線に市営バスが相互乗り入れを行っており、さらに、同じラピカグループであるJR九州バスとも相互乗り入れの協議を行っている。
沖縄県内路線 20番・名護西線(琉球バス交通・沖縄バス) 28番・読谷(楚辺)線(琉球バス交通・沖縄バス) 29番・読谷(喜名)線(琉球バス交通・沖縄バス) 65番・本部半島(渡久地)線(琉球バス交通・沖縄バス) 66番・本部半島(今帰仁)線(琉球バス交通・沖縄バス) 67番・辺土名線(琉球バス交通・沖縄バス) 70番・備瀬線(琉球バス交通・沖縄バス) 72番・屋我地線(琉球バス交通・沖縄バス) 73番・川田線(琉球バス交通・沖縄バス) 76番・瀬底線(琉球バス交通・沖縄バス) 78番・名護東部線(琉球バス交通・沖縄バス) 89番・糸満線(琉球バス交通・沖縄バス) 111番・高速バス(琉球バス交通・沖縄バス・那覇バス・東陽バス) 120番・名護西空港線(琉球バス交通・沖縄バス) 228番・読谷おもろまち線(琉球バス交通・沖縄バス) ダイヤは両社で完全に共通化され、運行時刻表も1つにまとめられている。これらの路線に対しては、共同運行路線用の回数券・定期券が発行されており、統一化が図られている。 沖縄本島においては同じ金額ならばどの会社でも使用できる各社共通回数券を導入しており、一部券種・路線を除いては、全路線(一部区間が競合している路線を含む)において、1種の回数券にて乗車・支払いができる。 特に、111番・高速バスを除く琉球バス交通・沖縄バス共同運行の各路線については、道路運送法第18条に基づく独占禁止法の適用除外対象として国土交通大臣に認可を受けたものである。
阪神 - 淡路島・徳島間 JR系バス会社を中心とするグループ「BLUEネットワーク」(西日本JRバス・JR四国バス・本四海峡バス)と、大手私鉄系バス会社を中心とするグループ(阪急バス・阪神バス・南海バス・神姫バス・神戸山陽バス・淡路交通・徳島バス)がある。なお、阪神-淡路島のみに限れば前述両グループのいずれにも属さない独立系バス会社(みなと観光バス、フットバス)が、また阪神-徳島のみに限れば旧都市間ツアーバス系事業者である海部観光も加わる。 この区間は競合運行と運賃プール精算制が入り乱れているため、乗客は乗車券の購入誤りや誤乗が多い。
松山 - 高知間 ホエールエクスプレス(伊予鉄バス・とさでん交通)・なんごくエクスプレス(JR四国バス) ダイヤのみ調整しているが別路線扱いで「ダブルトラック」に近い。
路線バス
神奈川県内路線 船05系統(神奈川中央交通)・船05系統(江ノ電バス) 上大岡駅 - 大船駅間では、両社とも同じ系統番号に統一されている。 共通定期券の設定はない。また土休日の昼間に神奈中の船05系統の運行はなく、代わりに神奈川中央交通側はおもに船20系統の運行となる。 同区間では他に、江ノ電バスがA21系統も運行している。