半島方面作戦
マクレランの次の作戦は、4師団(フランクリン、ポーター、セジウィックおよびリチャードソン)を1つずつヨーク川を遡らせ、ウエストポイント近くのエルサムズ・ランディングに行かせて、ジョンストンの半島後退を遮らせることだった。ジョンストンはこの動きを察知して、G・W・スミスの師団を送り、最初に上陸したフランクリン師団を妨害させた。スミスは激しい戦いでフランクリンに戦術的勝利を挙げたので、マクレランは、リッチモンドへ向かう道路が引き続き悪い状態にあるにも拘わらず、水陸協働の作戦を諦めることになった。
5月9日、ノーフォークで孤立していた南軍の部隊が、ハンプトンローズを渡ってきた北軍の大部隊に直面し、ノーフォーク市と海軍基地を放棄した。5月11日、CSSバージニアはアメリカ海軍による捕獲を免れるために自爆した。リンカーン大統領は、陸軍長官エドウィン・M・スタントンと財務長官サーモン・チェイスと共に、財務省の密輸監視艇マイアミで5月6日にモンロー砦に到着しており、作戦のこの部分を目撃した。リンカーンはノーフォーク市が脆弱であり、ジェームズ川は支配可能と考えたが、マクレランは前線にあって忙しく、大統領に会えなかった。リンカーンはその総司令官としての直接権限を行使し、5月8日にその地域の南軍砲台への海軍艦砲射撃を命令し、個人的に岸の偵察を行うために2人の長官とともに小さな船で出発した。モンロー砦の上級指揮官ジョン・E・ウール少将の指揮する軍隊が、ほとんど抵抗されずに5月10日にノーフォーク市を占領した。
3月8日は、初めての鉄板装甲艦の戦闘となった。南軍海軍の新造艦CSSバージニアがチェサピーク湾からハンプトン・ローズに至る入り口を封鎖していた木製の北軍艦船の前に現れ、北軍艦船を徹底的に破壊した。しかし、翌3月9日、北軍のこれも新造の鉄板装甲艦USSモニターが現れた。2隻の鉄板装甲艦は決着の着かない戦いを交わし、その日が終わる頃にそれぞれ撤退した。
ハンプトン・ローズの結果、軍隊の輸送船がその経路で直接この新しい武器に襲われる可能性が生じたので、新たな心配を生んだ。またアメリカ海軍はジェームズ川でもヨーク川でもマクレランの作戦遂行を保護できると確信させられなかったので、マクレランのヨークタウンを取り囲む水陸協働作戦は放棄され、4月4日に半島を前進するよう命じた。4月5日に、マクレランはマクドウェエル軍団がモンロー砦で彼の軍隊に加わることはないと分かった。ジャクソンのバレー方面作戦の圧力に加えて、リンカーン大統領は、マクレランがワシントンを守るには不十分な軍隊を残し、部隊の勢力を報告するときに実際には他所に配置されているものをワシントン防衛分に数えて、マクレランが欺こうとしていると考えた。マクレランは約束された資源が無いままに主要な方面作戦を率いることを強いられていると抗議したが、ともかく前進することにした。