小形アメーバ
古典的には肉質虫亜門葉状仮足綱無殻アメーバ亜綱アメーバ目管形亜目エントアメーバ科の所属とされてきた。しかし分子系統解析に基づけば、アメーバ動物門アーケアメーバ綱ペロミクサ目マスチゴアメーバ科の所属となる。
Endolimax属には様々な宿主から10種以上が記載されているが、宿主特異性についての知見がほとんどないため実態は不明瞭である。