荻野秋清
直正による秋清殺害の理由については、朝日城主となっていた直正自身による黒井城乗っ取りの野心や、直正を黒井城主にしようという父・赤井時家や兄・家清による策略などが考えられる。
秋清殺害の際、家臣たちが抵抗した様子も見られないことから、秋清に不満を抱いていた荻野同名中や黒井城の重臣たちの協力があった可能性もある。家臣らが秋清に不信をもった原因として、円通寺への領地の寄進により荻野氏の経済力・軍事力を弱めたことや、天文20年(1551年)に黒井城の支城・長谷城の城主である秋山修理太夫が波多野元秀に滅ぼされたのに対し、何の手立ても講じなかったことが挙げられる。
また、直正による荻野氏の家督継承について、秋清は了承していたものの荻野同名中には異論も出ていたらしく、「家督継承を反故にするならこちらにも覚悟がある」と威嚇する赤井時家の書状が残っている。このことから、秋清を殺害して荻野氏の実権を握ることで、直正の家督継承に反対する勢力を封じようという赤井氏の意図があったとも推測される。
天文22年(1553年)9月、三好氏と結ぶ丹波守護代・内藤国貞が戦死し、その跡を継いだ松永長頼に忠節を尽くすよう、細川氏綱が丹波国人らに通達していた。赤井系図には「外舅荻野某謀叛を企てるにより」直正が討ち取ったとあり、秋清がこの通達に応じたことを「謀叛」と表した可能性も考えられる。