穂積清軒
慶応4年(1868年)1月6日、鳥羽・伏見の戦いでの敗戦により大坂城が混乱する中、信古の前で重臣会議が行われ、強硬な佐幕論者であった清軒により、吉田藩は幕府方としての参戦することが決定された。その夜、徳川慶喜が大坂から脱出したのを聞きつけた信古は、密かに吉田へ帰還してしまう。翌朝それを知った清軒もまた江戸藩邸に戻った。
1月12日に吉田藩は新政府に恭順すること決め、江戸詰の藩士は谷中の下屋敷に集められて帰藩の命令を待つこととなった。5月15日、上野戦争が始まると彰義隊から支援を求める使者が来訪し、清軒が応対にあたった。恭順に納得していない数十人の藩士が脱藩して彰義隊に加わったため、清軒も加勢した嫌疑をかけられて5月中旬の帰藩後に入獄することになった。父・喜左衛門も連座して家禄を削減され、同年死去した。家督は弟の寅九郎が継ぎ、清軒は隠居蟄居となった。以来、肺患や背中の腫瘍に苦しめられつつ、英学や殖産の研究に励んだ。
維新後はたびたび仕官を求められたが応じることなく、明治4年(1871年)に中村道太、鈴木玄仲、関根録三郎と洋学塾好問社を旧吉田城内に設立し社主となっている。好問社は士族だけではなく、商家・農家の子弟も広く受け入れ、当時としては珍しく女子教育に取り組むなどの先進性で盛況であった。
翌明治5年(1872年)2月5日、妻・志毛が亡くなり、自身も頭部の腫瘍が悪化、病魔に侵されながらも教育に力を注いだが、明治7年(1874年)8月29日、大量に喀血して死去した。38歳であった。愛知県豊橋市上伝馬町の光明寺に葬られたが廃寺となり、墓所は豊橋市松葉町の称名院にある。