スーパーサイエンスハイスクール
終了経過措置期間は2006年(平成18年)度、2007年(平成19年)度の2年間で、既に終了済み。なお、広島大学附属高等学校は1年の終了経過措置を経て、2007年(平成19年)度に新規指定されている。また、秋田県立大館鳳鳴高等学校、新潟県立新潟南高等学校、福井県立高志高等学校、愛知県立一宮高等学校は2008年(平成20年)度に新規指定されている。
北海道 私立 学校法人札幌日本大学学園 札幌日本大学高等学校
山形県 公立 山形県立米沢興譲館高等学校
京都府 公立 京都府立嵯峨野高等学校
大阪府 公立 大阪府立天王寺高等学校
奈良県 公立 奈良県立奈良高等学校