JR九州787系電車
1993年 - 2000年は「にちりんシーガイア」のみに充当されていた。1993年3月のダイヤ改正で南宮崎駅発着の2往復に新製した当形式を投入した際、従来の485系と異なる愛称「にちりんシーガイア」を与えたのが始まり。その後2000年に787系は一時撤退し783系に変更されたが、2011年に一部「にちりんシーガイア」に復帰した(24号のみ、1往復は引き続き783系が充当)のち、2021年に再び全列車が787系で運転されるようになった(下り便への充当は21年ぶり)。
「ひゅうが」(2011年3月 - ):全列車 1・5・12・16号は6両編成、他は4両編成で運転。
「きりしま」(2011年3月 - ):全列車 すべて4両編成で運転。
「36ぷらす3」(2020年10月 - ):専用車両で運転
一部の宮崎空港線の普通列車(宮崎駅 - 宮崎空港駅)(2011年3月 - )
日豊本線・佐伯駅 - 延岡駅間の普通列車の一部(2018年3月 - ) 4両編成で運転。乗降は先頭車のみ可能。