御崎駅
相対式ホーム2面2線を有する複線区間の地上駅。転轍機を持たない棒線駅となっている。線路東側の駅舎側ホームが上り1番線、対向側ホームが下り2番線となっている。互いのホームは両ホーム南側を結んだ跨線橋で連絡している。
かつては単式ホーム・島式ホーム複合型の2面3線の配線であった。対向側のホームが島式で、西側に上下線共用で使用されていた副本線の3番線が存在し、そこから駅構内西側の貨物線、付近の日通埠頭や日本製鋼所への専用線が分岐し、旅客よりも貨物の取り扱いをメインとする駅であった。これら多数の貨物線、専用線は、共に遅くとも1993年(平成5年)までに全て撤去された。
現在は無人駅となっている。駅舎は構内の東側(室蘭方面に向かって左側)に位置し単式ホーム中央部に接している。駅舎は1989年(平成元年)築のもので、駅舎内にトイレを有する。またかつては駅舎内に売店も存在し(1993年(平成5年)時点では営業中であった)、閉店後その部分にはシャッターが降りている。2017年3月31日までは、駅前の商店で乗車券を販売する簡易委託駅となっていた(営業時間:7時00分から21時00分まで。日曜日は休み)。
有人駅時代には「室蘭線発祥の地」と記載された駅スタンプが存在した。
そのほか、構内には「室蘭線発祥の地」碑がある。