カスパーゼ-9
カスパーゼ-9は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。
APAF1
BIRC2(英語版)
BIRC3(英語版)
CASP8
NLRP1(英語版)
XIAP
アイソフォーム2(カスパーゼ-9β)にはエクソン3、4、5、6が含まれず、140番から289番のアミノ酸を欠く。カスパーゼ-9βには触媒ドメインが存在せず、そのためアポトソームに結合してカスパーゼ-9αの阻害因子として機能し、カスパーゼカスケードとアポトーシスを抑制する。このように、カスパーゼ-9βは内因性のドミナントネガティブ型アイソフォームとされる。