マルエーフェリー
2015年に韓国の大仁フェリーへ売却し、仁川-大連間の韓中航路に就航。
たかちほ(RO-RO船、東京航路) 3,891総トン、全長131.16m、幅20.0m、型深出力8.99m、13,500PS、航海速力19.9ノット。ヤマニシ建造。 2007年5月1日、「フェリーたかちほ」から船名変更。運航業務は(株)新日本海事の委託。2015年11月15日引退。
琉球エキスプレス(阪神 - 沖縄航路) 旅客定員240名(1等、2等寝台、2等洋室、2等)。 積載数:トラック94台、乗用車72台、コンテナ(10ft)92個。 鉄道建設・運輸施設整備支援機構と共有。2017年10月9日引退。 バリアフリー対応船。供食設備は自動販売機(レトルト・インスタント食品などを販売)のみとなっている。 旅客定員は前船「ニューあかつき」から70%削減された。
琉球エキスプレス 6(RO-RO船、大阪航路) 元北星海運所属、日藤海運運航の内航RO-RO船旧「日龍丸」(2001年竣工)。鉄道建設・運輸施設整備支援機構、南西海運と共有船。 2019年3月9日大阪南港発より就航。同船就航により阪神航路全体で2隻体制に拠る定曜日サービスを開始。大阪 - 志布志 - 那覇と北九州航路で土曜大阪発、月曜那覇発/火曜北九州発、木曜那覇発として定期運航。2022年12月末引退。
第八太洋丸 - 貨物船(鹿児島航路/与論まで)
第十一太洋丸 - (鹿児島航路)
興島丸 - 貨物船
波之上丸(初代) - (鹿児島航路)
あまみ丸(初代) - (鹿児島航路)
晴海丸 - 貨物船
にしき丸 - 貨物船
太平丸 - 貨物船