Plague Inc.
まずは伝染病タイプ(後述)を選択する。
次に難易度選択に移る。特定の条件を満たしていれば「チート」と呼ばれる特殊な特徴を伝染病に追加できる。
伝染病に名前をつける。デフォルトで名前が決まっているものもあるが、プレイヤーの好きな名前をつけることが可能。
遺伝コード(後述)を挿入もしくは変更し、ゲーム本編へと進む。
中級者向けの難易度。「半数以上の人が手を洗う」「研究医が週3日働く」「感染者は無視される」という設定となっている。クリアすると銀色のマークが表示される。
開始時にすでに致死性が高い為、難易度は高い。