待労院
二度目の危機は1963年に発生した病院火災である。1963年(昭和38年)6月18日早朝に火災が発生、漏電により管理棟、病棟、治療室などを焼失したが、人的被害はなかった。他のハンセン病療養所と異なり、市街地にあることから住民の一部から再建反対の声もあったが、関係者の努力により再建された。鉄筋コンクリート造2階建の病院管理棟、病棟、治療棟が新築され、1964年(昭和39年)8月22日に落成、落成式には秩父宮妃の臨席を賜った。
百年の間に病院の危機がいくつかあった。一度目の危機は第二次世界大戦中によるものである。創立以来外国人が院長であり、外国から寄付を頼っていた。1941年頃より外国人に対する警察の目が光り、終戦直前には外国人修道女たちは英彦山に強制疎開となり、残された日本人修道女によって運営が継続された。創立以来他の事業を閉鎖してでも患者の面倒を最後の一人までみるとした。乳牛大小11頭を飼い、乳搾り、兎60羽、羊8頭、鶏30羽、親豚8、子豚20頭、米80俵、麦、みそ、野菜、果物も自給自足とした。