エドマンド・アンドロス
1688年5月7日、ニューヨーク植民地と、東西ジャージー植民地が自治領に追加された。そこはアンドロスが居たボストンから遠かったので、副総督のフランシス・ニコルソンにニューヨーク市から運営させた。ニコルソンは陸軍の大尉であり、植民地担当大臣ウィリアム・ブラスウェイトの庇護者だった。1687年にアンドロスの衛兵としてボストンに来ており、その評議員に昇進していた。
1688年夏、アンドロスは初めてニューヨークに旅し、続いてジャージーに行って、その任務を確立した。ジャージーの自治領による統治は、そこの認証が撤回された領主がその土地を保持しており、アンドロスに伝統的な荘園領主権を請願したので複雑なものになった。ジャージーにおける自治領時代は権力の中枢から遠かったこともあって比較的事件が少なく、1689年に突然自治領が終わりを迎えた。
植民地におけるアンドロスの政敵は、ヨーク公にアンドロスに対する多くの告発を行っていた。その中にはオランダ人実業家を贔屓しているというもの、ヨーク公のためよりも自分の利益のために事業に関わっているという告発もあった。ヨーク公の収入が本来あるべきものよりも少ないと主張する告発もあった。これが他の苦情に加わって、ヨーク公がアンドロスを事態釈明のためにイングランドに呼び戻すことになった。アンドロスは1681年1月に植民地を離れ、ニューヨーク植民地政府の管理はアンソニー・ブロックホルズに任せた。このイングランド訪問は短くなると期待し、妻はニューヨークに残して行った。
アンドロスはニューヨークにいる間に管理能力の優秀さを示せたと考えられたが、そのマナーは植民地人の中でもその敵から横柄だと考えられ、総督である間に多くの敵を作った。
アンドロスの評議会は自治領に調和をもたらし、イングランドの法を適用させる長々しい手続きに関わった。この仕事は多くの時間を費やさせたので、1867年3月、アンドロスは既存の法が改定されるまでは有効であるという宣言を発した。マサチューセッツには既存の税法が無かったので、課税の計画が作られ、自治領全体に適用されることになった。土地所有者の委員会で策定された最初の提案は、関税、主にアルコールから歳入を得ていた。多くの議論が行われた後、異なる提案が突然出てきて採択され、基本的に以前のマサチューセッツ税法を復活させた。これらの法は農夫には不人気だった。農夫は家畜にかかる税金があまりに高いと感じていた。アンドロスは即座に歳入を得るために、アルコールにかかる関税を値上げする承認も得た。
歳入法を執行しようという最初の試みは、マサチューセッツの多くの町から頑強な抵抗に遭った。幾つかの町はその人口や資産を評価するコミッショナーを選定することを拒み、多くの町の役人がその結果逮捕されてボストンに連れて来られた。ある者は罰金を取られて釈放され、ある者はその任務を果たすと約束するまで収監されていた。イプスウィッチの指導者達はその法に対する反対を最も強く表明した者達だったが、裁判にかけられ、軽犯罪で有罪とされた。
他の植民地は新法の執行に反対しなかった。ロードアイランドの場合は税率が以前の植民地政府の時よりも高くなっていたが、それでも反抗は無かった。プリマスの比較的貧しい土地所有者は家畜に掛かる高い税率のために大きな打撃となり、かつては個々の町で利益源となっていた捕鯨から上がる基金が自治領政府に向けられることになった.。