仙岳院
これにより、明治政府の法令が仙台藩にも実質的に及ぶようになり、藩内で神仏分離・廃仏毀釈が広まり始める。
1869年1月19日(明治元年12月7日)、戊辰戦争において賊軍となった奥羽越列藩同盟諸藩に対する処分が行われ、仙台藩は62万石から28万石に減封される。
1869年(明治2年)4月、困窮した仙台藩が禄制改革を実施し、寺社の知行地および扶持米を廃止。寺社の困窮も始まる。
1871年8月29日(明治4年7月14日)、廃藩置県実施。これにより寺社は藩の後ろ盾を完全に失い、次々と廃寺となる。
1873年(明治6年)1月、当院が所蔵する神器を仙台東照宮に渡すよう、宮城県から命じられる。神器の引渡しにより、当院は仙台東照宮と分離され、別当寺ではなくなる。
1929年(昭和4年)9月29日開業の仙山東線(後の仙山線)の建設により、山門を移動。
1997年(平成9年)、本尊の釈迦三尊像が仙台市登録有形文化財に登録される。