体細胞超変異
B細胞は抗原を認識すると分裂および増殖を始める。この増殖の間に、B細胞受容体の遺伝子座は通常の頻度と比べて10倍から10倍の極めて高い頻度の突然変異を起こす。変異は主に単一塩基置換の形であり、挿入と削除は一般的にはあまり起こらない。これらの変異は、DNA上の「ホットスポット」と呼ばれる箇所で重に発生するが、これらは超可変領域(英語版)に集中する。この領域は、免疫グロブリンの抗原認識に関与する部位である相補性決定領域に対応する。体細胞超変異の「ホットスポット」は、変異している塩基によって異なり、Gの場合はRGYW、Cの場合はWRCY、Aの場合はWA、Tの場合はTWである。超変異は、error-prone修復と高忠実度修復のバランスによって実現される。この指向性のある超変異により、特定の外来抗原を認識して結合する能力の高い免疫グロブリン受容体を発現したB細胞の選択が可能となる。