23SリボソームRNA
ペプチジルtRNAとアミノアシルtRNAはどちらもタンパク質合成とペプチド転移反応において非常に重要であり、そのためにはリボソームとの結合が必要である。サイトPのこれらの位置のヌクレオチドの修飾は、ペプチジルtRNAの結合を阻害する可能性があり、U2555修飾は、ペプチジルtRNAのピューロマイシンへの転移に介入する。さらに、G2251、G2253、A2439、及びU2584の化学修飾では、tRNAの結合を防ぐことはできない。 P部位に結合する50SサブユニットのペプチジルtRNAは、23SrRNAの8つの位置を化学修飾から保護する。一方、23S rRNAは、細胞増殖の変異に影響を与える。変異A1912G、A1919G及びΨ1917Cは強力な成長表現型を持ち、翻訳を妨げるが、変異A1916Gは単純な成長表現型を持ち、50Sサブユニットの欠陥につながる。