土壌微生物
植物の生育に影響する作用は、人間にとって有利なものと有害なものに分けることもできる。
有用な面は養分吸収を助けて植物が利用できない形態の栄養分を利用できる形にし、粗大有機物を分解することにより土壌の物理性・化学性の改善に寄与する点である。また、一部の微生物は、病原菌を抑え、ある種のホルモン様物質を生産し、植物の生育を促しひいては農薬の分解・無害化や微生物体内での養分貯蔵を行う。
有害な面は肥料成分を無効化したり、植物同化産物を奪ったり、植物の生育にとって有害な物質の生成や植物の病気を引き起こすといった問題も多々ある。