ジェイアールバス関東
JRの周遊券での高速バス利用については、周遊券の廃止に伴い、この制度自体がなくなった。 早期購入割引、得割、トク特割、往復割引、大人の休日会員割引については「お得なきっぷを取り揃えています」に詳細が記載されている。
2016年6月1日より、京阪神線、草津温泉線、佐久・小諸線、佐野線、伊勢崎線、長野~関西線、箱根線、館山線、御殿場アウトレット線、金沢線、知多半田線、吉川・松伏線において、高速バスの乗車券(指定席)にQRコードを添付することにより、乗車時の乗務員による乗車券チェックを簡素化、よりスムーズに乗車できるようにするとともに、高速バスネットWEBサイトでの乗車変更や払戻しの出来る時期を拡大している。
2021年4月より、バスと旅先のアクティビティのチケットのセットなどをWEBアプリで購入することが可能となる新たなシステム「高速バスネットプラス」を運用開始した。高速バス往復チケットと周遊券や施設利用券などのセットを格安で販売している。
2023年7月5日より、高速バスネットにおいて、モバイル決済導入した。対応ブランドはau PAY、d払い、楽天ペイ、PayPay。乗車券購入時のWEB決済におけるQRコードによるモバイル決済方式となっている。
東京駅八重洲南口のJRバス窓口では、昼行便の座席指定制及び予約定員制の便の乗車日当日のキャンセル待ちの受付も行なっている。但し、東京駅発車後にも乗車停留所がある便や一部の路線は除く。
市町村のコミュニティバスについては、当社所有のものと市町村が所有しているものとがある。また、以前に他事業者が運行していた車両をそのまま引き継いで運行しているものも存在する(伊那市、佐野市、古河市などの一部の車両)。 大半は小型車の日野・ポンチョや日野・リエッセ、三菱ふそう・ローザではあるが、三菱ふそう・ローザのボンネットバスやトヨタ・ハイエースなどのワゴンタイプも配置されている。塗装はワゴンタイプに真っ白なものも存在するが、大半が各市町村の独自のカラーに塗られている。 小諸支店では当社初のEVバスとして小諸市と共同で中国BYD社製小型EVバスを1台購入し、2023年2月より「e-ミライ(いいみらい)号」として市巡回バスで運行している。 中型車では佐野支店や白河支店にいすゞ・エルガミオや日野・レインボーが当社標準色で配置されている。白河支店には木目調の内装や特注のフロントグリル取り付けなどのカスタマイズを施した独自のカラーの日野・レインボーの新車も1台配置されている。
同社の高速バスが利用できる企画乗車券には次のようなものがある。
高速バス&サブウェイパス あぶくま号/いわき号/マロニエ号/ひたち号/なのはな号/佐久・小諸号
筑波山ストーリー つくば号
清水港まぐろきっぷ しみずライナー号
航空科学博物館企画乗車券 東京 - 富里・多古線
パシフィック・ストーリー(東京・札幌連絡きっぷ) みと号
富士急ハイランド得Qpack 東京 - 河口湖線
草津WEB周遊券 新宿・東京 - 草津温泉線
12月1日 - 「しみずライナー」1号を世界遺産三保松原まで延伸。水都西線(宇都宮支店担当)の芳賀温泉ロマンの湯 - 芳賀町役場間を延伸。
2016年(平成28年) 4月4日 - 新宿駅発着各路線の発着場所を「バスタ新宿(新宿駅新南口)」に変更。 5月9日 - 「東京河口湖号」(東京 - 河口湖線)を富士急山梨バス・富士急行観光が運行している「東京駅(鉄鋼ビル) - 富士五湖・富士急ハイランド線」と統合の上、中央道経由に変更。 7月1日 - 霞ヶ浦線(土浦支店担当)の土浦駅西口 - 阿見坂下間で関東鉄道との共通乗車化を実施。 7月13日 - 「つくば号」で交通系ICカードでの運賃の支払いが可能となる。 7月15日 - 「青春ドリーム信州号」を小諸駅まで延伸。 7月16日 - 圏央道北東エリア連携交流協議会からの委託により、阿見・稲敷エリア~成田空港間において、高速バスの実験運行を開始。関東鉄道との共同運行で2017年1月15日までの運行予定。この実験運行は当初の予定より繰り上げで2016年12月25日で終了することとなった。 7月30日 - 水都西線(宇都宮支店担当)の宇都宮~茂木間で土休日限りにサシバの里いちかい、道の駅もてぎに停車する便を運行開始。 12月1日 - 「グランドリーム金沢号」運行開始。佐野支店古河営業所にて古河市コミュニティバス「ぐるりん号」の通勤通学コース、市役所本庁・病院コースを運行開始(市より運行受託)。
2017年(平成29年) 3月31日 - 東京と大阪を結ぶ夜行高速バス「ドリーム号」に最上級のプレシャスクラス(2列シートエリア4席)とアドバンスクラス(3列シートエリア14席)を併せ持つ「ドリーム ルリエ(Relier)」を新規投入。
廃止路線
伊那〜木曽連絡バスごんべい号 木曽福島駅 - 伊那市駅 おんたけ交通とJRバス関東との共同運行だった。2009年4月廃止。
「白棚線1日フリーきっぷ」 白河市と棚倉町を結ぶバス「白棚線」全区間が1日間乗り降り自由 高速バスネットプラスにて発売
「塩原渓谷フリーきっぷ」 那須塩原駅~塩原温泉バスターミナルの往復+千本松~塩原バスターミナル間が二日間乗り降り自由 高速バスネットプラスとバス車内にて発売
「塩原温泉郷周遊きっぷ」 那須塩原市が運行する「ゆ~バス」と塩原渓谷を走るバスが二日間乗り放題 バス車内にて発売
「航空科学博物館フリー乗車券」 成田駅~さくらの山~三里塚~航空科学博物館の間が1日間乗り降り自由 成田駅構内成田市観光協会と高速バスネットプラスにて発売
「デイタイムフリー乗車券」 成田空港~空の駅風和里しばやま~ひこうきの丘~さくらの山が指定時間乗り放題 多古本線バス車内にて発売
「南房総・館山地域スマホ1日乗車券」 南房州本線、洲の崎線と日東交通の館山市内線、館山鴨川線、白浜千倉館山線、豊房線、丸線および館山市街地循環バスが1日間乗り放題 高速バスネットプラスにて発売(2023年8月1日~2024年3月31日の間)
「ぐんまワンデーパス」 期間限定発売 ジェイアールバス関東の長野原草津口駅~草津温泉間と横川駅~軽井沢駅間の路線バスも利用可能 フリーエリア内のJR東日本の主な駅の指定席券売機、みどりの窓口、主な旅行会社で発売するが、軽井沢駅・草津温泉バスターミナルなど一部、取扱いしていない箇所もある。
サンキュー♥ちばフリーパス 期間限定発売 ジェイアールバス関東の館山駅~汐留橋~安房神戸~布良崎神社~白浜の屛風岩~長尾橋~野島崎灯台口~安房白浜、館山駅~城山公園前~西岬~洲の崎~伊戸~南房パラダイス~相の浜、八日市場駅~航空科学博物館~JR成田駅、成田空港~JR成田駅、多古台BT~佐原駅のの路線バスも利用可能 JR東日本の千葉県内の主な駅と久里浜駅(指定席券売機のみ)で発売するが、一部、取扱いしていない箇所もある。
ふらっと両毛(東武フリーパス) 佐野市生活路線バス(運行:ジェイアールバス関東)も利用可能 東武鉄道の浅草~川俣間、杉戸高野台~南栗橋間、小村井~亀戸間、船橋~大宮間各駅の駅窓口(押上、大師前は除く)、浅草駅旅行センターで発売
「塩原温泉・野岩鉄道満喫切符(1日フリー)」
「塩原温泉・野岩鉄道満喫切符(鉄道片道券+ゆーバスフリー1日)」
「塩原温泉・野岩鉄道満喫切符(鉄道往復券+ゆーバスフリー2日)」
観光型MaaS「NASU-Ways」にて、ゆーバス・ゆータク1日乗車券(電子チケット)のオンライン販売
[諏訪市] かりんちゃんバス・スワンバス 1日券
[岡谷市] シルキーバス 1日フリーパス券
[下諏訪町] あざみ号 1日券
[佐野市] 生活路線バス「さーのって号」 1日乗車券
[佐野市] 生活路線バス「さーのって号」 キャッシュレス1日乗車券
[古河市] 循環バス「ぐるりん号」 1日乗車券
[匝瑳市] 市内循環バス 一日自由乗車券
[那須塩原市] ゆーバス・ゆータク 1日乗車券
[那須町・那須塩原市] 那須町民バス、ゆーバス・ゆータク共通1日乗車券
[大田原市・那須塩原市] 大田原市営バス、ゆーバス・ゆータク共通1日乗車券
JR東日本 <JR竹芝 水素シャトルバス> (東京支店)