人喰いの大鷲トリコ
ある日「少年」が目を覚ますと、そこは見知らぬ洞窟だった。少年の体には身に覚えのない紋様が描かれている上に、目の前には「トリコ」と呼ばれる人喰いの大鷲が鎖に繋がれた状態で横たわっている。自身の置かれている状況に戸惑う少年だったが、ふとトリコが怪我をしていることに気づき、まずはトリコを介抱してやることにする。
傷を負ったトリコは気が立っており、介抱には手間を要した。しかしその甲斐もあり、翌朝には元気を取り戻していた。掛けられていた首輪も外され、自由になったトリコは少年の後をついて回るようになる。少年は「大鷲は人を食う」という話を思い出しながらも、自分に懐いてきたトリコのことを恐ろしいとは思えず、行動を共にすることにする。
だが、『大鷲の巣』にある荒れ果てた遺跡は、トリコの巨体に耐え切れずに崩落してしまう上に、謎の動力で動くヨロイと呼ばれる兵士によって守られていた。さらに、トリコよりも強くて獰猛な黒い大鷲が、少年とトリコたちを待ち受けており、何度も執拗に襲いかかってくる。
少年はトリコの力を借りながら、知恵を勇気を振り絞って、一人と一匹で『大鷲の巣』と呼ばれる谷からの脱出、そして村への帰還を目指すことになる。