柏尾川
水質汚濁によって一時魚が見られなくなっていた柏尾川だが、工場廃水・生活廃水の減少にともない、まずコイやフナ(下流部にはハゼ・ボラ)といった、比較的水質汚染に耐性のある魚が多く繁殖した。長年にわたるメダカやオイカワなどの放流によってこれらの魚も次第に定着し、近年ではさらなる水質の改善に伴ってアユ、スズキの遡上も見られるようになった。 他にウナギ、ナマズ、モツゴ(モロコ、クチボソ)、ドジョウなどが魚類では確認されている。 甲殻類では、アメリカザリガニ、スジエビ、ヌマエビ、テナガエビなどがいる。 両生類・爬虫類としては、ウシガエル、アマガエル、ミシシッピーアカミミガメ、クサガメなどが繁殖している。
水質の改善によって魚が生息するようになると、それらをエサにする鳥達も集まるようになった。柏尾川では1990年代頃からサギ類やカモ類などの水鳥が頻繁に見られるようになり、少数ながらカワセミも見られる。河口部ではカモメなども数多く見られる。
絶滅危惧II類に指定され、千葉、神奈川、高知、宮崎の4県のみに生育するアカバナ科の多年草「ミズキンバイ」の自生地となっている。ミズキンバイが自生する都市河川は、全国でも柏尾川のみである。