ジェイアールバス関東館山支店
砂山線(館山駅 - 砂山 - 安房自然村) 東光寺前 - 安房神戸間は南房州本線に編入され存続。
豊房線(館山駅 - 豊房 - 安房白浜駅)
千倉線(安房白浜駅 - 千倉駅)
外房急行線「急行くろしお号」(安房白浜駅 - 亀田病院)
定期観光バス「南房号」
定期観光バス「ポピー&ストロベリー号」(季節運行)
白浜町内循環バス(安房白浜駅 - 乙浜 - 野島埼灯台 - フラワーパーク - 安房白浜駅)
ドリーム松山号(東京駅 - 松山駅)
東京 - 吉川・松伏線
新宿君津号
館山市街地循環バス(実証運行)
千葉県館山市北条2200-2 JR東日本館山駅東口
それらの中古車両が全廃されて以降は中古車両の配置が途切れたが、2020年から横浜市営バスからのエアロスターと国際興業バスからのエルガが配置されており、このうちエルガは順調に台数を増やし主力車種となった。JRバス関東の支店の記述でも触れているように、車両購入の決定権が支店にあるため、このようなことも支店レベルの決議事項で行うことが可能であることを示す実例である。
現在運用についている車両は全て大型車である。中型車を購入していた時期もあったが、2009年(平成21年)に全車廃車となり、在籍していない。中型車は2000年から2002年まで運行された白浜町内循環バスにも使用された。
高速車は2013年(平成25年)より2020年(令和2年)までにトイレ付き44席仕様のハイデッカー車の日野・セレガと三菱ふそう・エアロエースに置き換えられた。東京支店の乗務員も房総なのはな号では館山支店の車両に乗務することから、通し乗務になっている吉川・松伏号へも当支店の車両が使用される。2013年(平成25年)12月11日から2014年(平成26年)2月17日まで東京支店所属の復刻デザインバス「赤つばめ」も房総なのはな号で運行した。
2020年に白河支店より三菱ふそう・ローザのボンネットバスが転入、11月に「館山市ぐるっとボンネットバスの旅」に使用された。
好調な高速バスとは対照的に、路線バスは自家用車の増加などによる利用客離れで赤字の状況にあり、国・県・沿線自治体(館山市・南房総市)が赤字分を補助金で補填して運行を維持しているのが現状である。2011年(平成23年)2月には同支店と館山市の連名で沿線住民に対し、路線バスの利用を呼びかける文書での回覧を実施した。 その一方で意見交換会を開き、沿線住民から意見を募るなどして、買い物バスの運行を始めるなど利便性向上を図っている。
同支店管内では運行区間毎に系統番号を設定し、同支店作成の路線図にも明記しているが、行先表示に明示はしていない。 。 南房州本線、洲の崎線ともJR東日本が発売する南房総フリー乗車券のフリーエリアに含まれていた。
南房州本線(館山駅 - 安房神戸 - 安房白浜駅)
[1] 館山駅 - 上真倉 - 安房神戸 - 布良崎神社 - 白浜の屏風岩 - 安房白浜駅
[32] 館山駅 - 上真倉 - 安房神戸 - 東光寺前 - 布良崎神社 - 白浜の屏風岩 - 安房白浜駅
[50] 安房白浜駅 - 安房自然村 - 小塚大師
[66] 小塚大師 - 上真倉 - 館山駅