スーパーマリオサンシャイン
ポンプの水を補給できる。小さいものはポンプ容量の半分、大きいものは容量満タンまで回復する。少しレアなアイテム。ポンプの水が少ない時にプチプチなどを踏みつけると出現する場合が多い。
北米版には声の追加など、様々な微調整が行われている。
マリオのボイスが追加された。一例としてはステージクリアしてドルピックタウンに戻った時に帽子をとるアクションをするが、その時に溜め息のようなボイスが追加されている。
一部日本版と効果音が異なる場面がある。
新たなSEが追加された。一部は上記の異なるSEが鳴る場所で使用されている。
アスレチック面などで、コース外に落ちてミスになった際の「MISS!」が「TOO BAD!」になっている(これは後の3Dマリオシリーズや「スーパーマリオブラザーズ ワンダー」にも引き継がれている)。
シャインを取得した時の「SHINE GET!」が「SHINE!」になっている。
シャインそのものは「SHINE SPRITE」という名称になっている。
ポンプが「FLUDD」という名称になっている。
オヤ・マーサイエンス社が「Gadd Science」という名称になっている。
一部ステージの名称が変更されている。 ドルピックタウン → Delfino Plaza エアポート → Delfino Airstrip マンマビーチ → Gelato Beach マーレのいりえ → Noki Bay モンテのむら → Pianta Village
オプションでムービー内の字幕表示の有無の変更機能が追加されている(日本版にない機能の1つ)。
各ステージ内のストーリー番号である「STORY ○」(ストーリー○)の表記が「EPISODE ○」となっている。
各ステージにおける「MY SCORE」(マイスコア)の表記が「SCORE」となっている。
その後に発売された欧州版にも同様になっており、日本後期版ディスクにも一部取り入れられている。
多くのステージに登場し、上空を飛び回る鳥。一定時間飛び回った後に着地する。一定量の水をかけると倒すことができ、鳥の色に応じたアイテムを落とす。緑色はコイン、青色は青コイン、赤色は赤コイン、黄色は隠しシャイン。
レースやヒミツコースのSTORYでは、クリア後にもう一度挑むと違ったクリア条件が指定されるので、これをクリアするとエクストラシャインが入手できる。残りの1個はどのSTORYでもよいので100枚のコインを集めると出現する、STORYクリアに関係のない隠しシャイン。
シャイン全120個の内訳は、ドルピックタウンで41個(青コイン引き換え分の24個、コロナマウンテンのクッパ初回撃破を含む)、7ステージで計77枚(1ステージあたり11個)、エアポートで2個となっている。
最初のエアポートの1個+全ステージのSTORY7をクリアする事(つまりこの間に、ドルピックタウンなどSTORY以外をプレイしない)によりコロナマウンテンへの道が開かれ、さらにラスボスのクッパを倒して出現するシャイン(ここまでで計51個)を取得すればゲーム自体はクリアで通常エンディングとなるので、残りの69個は実質『やりこみ要素』(このうち7個はSTORY8のシャインであるので、やりこみとしては62個)として集めていく事になる。
120個すべてを集めるとデータ選択画面で太陽マークが付く。すべて集めた後にもう一度クッパを倒す、もしくはクッパを倒した時点で120個になると、プレイヤーへのご褒美としてハッピーエンディングになる。
2020年9月18日に任天堂からNintendo Switch専用ソフトとして、本作(後期版)と『スーパーマリオ64』、『スーパーマリオギャラクシー』の3本を収録して2021年3月末までの期間限定で発売された。
多言語対応しており全言語において北米版及び日本後期版の変更点が取り入れられている他、ボタンの割り当てやHD解像度への対応や画面比率が4:3から16:9へ変更するなど、Nintendo Switchで遊びやすいように少しずつリニューアルされており、2020年11月17日に配信された更新データでゲームキューブ コントローラに対応した。このデータによりカメラのリバース化が可能になるなどで操作方法は概ねゲームキューブ版と同じになったがボタンの表示は前のままで、ゲームキューブ版の表示になっていない。
また、3本のソフトのサウンドトラックの曲が聴ける。サウンドトラックには本作のステージ曲の他、北米版や後期版で使用されたモンテマンレース専用BGMや、各ムービーのイントロ、差分などが収録されている。また、全曲音源化されたのは初めてである。
ピンナビーチに出現する、タマゴ柄の甲羅を持った敵。ビーチに生息するひまわりを食べつくしてしまい、おおひまわり達の力を奪ってしまっていた。ヨッシーの卵を被っており、放水を続けると現れてはヒップドロップを仕掛けてくる。 デンキノコノコ ピンナパークのザコ敵。青と赤の2種類あり、青は電気を帯びた甲羅を飛ばしてくる。 デンノコキング ピンナパークに出現する巨大なデンキノコノコ。パークの観覧車付近で居眠りを始めたことで観覧車が超速度で回転を始めてしまった。
灰色のノズルボックスに入っている。ドルピックタウンではヨッシーを出現させた状態で、一定数のシャインを集めるとこのノズルを持ったニセマリオが出現し、倒すと使用可能になる。汚れを消すことには向いておらず、前方移動に特化したノズル。
数秒間パワーをチャージした後、後方へ勢いよく水を噴射し続ける。これにより地上、水上を問わず高速ダッシュができる。水上のほうがやや操作性がよく、常に水を補給しながらダッシュするためポンプメーターが減らない。作中ではこれを使うことを前提としたステージも存在する。水中に潜った状態でも使用可能で普通に泳ぐより遥かに早く推進する事が可能。ダッシュ中にジャンプすれば通常より大きなジャンプが可能。通常ホバー滞空でも届かない場所に行けるほか、ボディアタック等では壊せない扉を突き破る事もできるが、水の消費量がノーマルより多い。
本作初登場のクッパの息子。ニセマリオに変装してはドルピック島を汚し回って混乱に陥れ、マリオに冤罪を着せると同時にピーチ姫の奪還作戦に乗り出したが、ピンナパークでのメカクッパ戦であえなく正体を現すことになり、気球でコロナマウンテンへと逃走した。最終的にマリオに風呂場を壊され敗れたが、クッパは息子の頼もしさを称賛していた。コロナマウンテンでの最終決戦では、玩具の船に乗りながらキラーを発射してくるが、水をかけることで怯ませることが可能。
所持している絵筆はオヤ・マーサイエンス社が開発した「マジックブラシ」と呼ばれ、オヤ・マー博士がクッパJr.に与えたもの。この筆で描くと願いが叶うと言われており、描いたものは実体化する。作中では、ラクガキによりドロドロやステージの入り口を生み出していた。生み出したドロドロは木や建造物などの物体、更には生物まで封印してしまうが、水をかけることで解決可能。
以降は次作「スーパーマリオギャラクシー」や「Newスーパーマリオブラザーズ」などのスーパーマリオシリーズやパーティゲーム作品等に登場しており、「大乱闘スマッシュブラザーズ」シリーズにおいても『for』からコクッパ一族と共に本格参戦。加えて、「スーパーマリオ3Dワールド + フューリーワールド」ではある事情でマリオとタッグを組み、おたすけ(アシスト)キャラやプレイアブルキャラとして登場する他、本作の事件を助長した「マジックブラシ」を攻撃アクションとして用いることが可能となっている。