うちはサスケ
異空間にあった大筒木カグヤの遺跡にて大筒木モモシキ・キンシキと遭遇し、入手した巻物を持って離脱する。調査報告のため里に帰っていた所をボルトから弟子入りを請われ、紆余曲折ありながらも承諾し中忍選抜試験まで修業をつけた。その中で目先の物事に囚われがちなボルトに対し遠回しに説教をしていたが彼には理解されず、モモシキが試験に乱入しナルトが拉致された後には厳しい言葉を浴びせつつも、ナルト同様の「ウスラトンカチ」として認め、モモシキとの戦いの場に彼を連れて行った。
モモシキ戦後は大筒木の次なる動向に警戒しつつも、ボルトの右掌に現れた「楔」の印を含め調査を続けていた。アニメではその後大筒木ウラシキの情報を手にして一尾の守鶴を守るべく我愛羅と共に交戦したが、チャクラを奪われてしまい時空間忍術で飛ばされてしまう。チャクラが回復すると自身の時空間忍術で脱出し、ウラシキに追い詰められたボルトとシンキを助けた。ウラシキが再度襲撃した際はボルトの考えを聞いてウラシキの元に向かいそこで宝具であるカラスキによってボルトと共にサスケが里を出た直後の過去へと飛ばされる。ウラシキの目的がまだ実力の低いナルトから九尾のチャクラを奪う事だと知ると過去のナルトや自来也と共闘して戦うがチャクラが回復しきっておらず捨て身で時間を稼いだ後川に落ちて気絶する。そこへ過去のサクラが駆けつけ彼女の医療忍術によって復活し、再度ボルト達と共にウラシキと交戦し、自来也と共に隙を作った。その後過去の人物達の記憶を消して元の時代へ戻った。
調査を続けた結果大筒木の遺跡にたどり着き、さらには「殻」のジゲンや十尾を発見する。
木ノ葉暗部が行っていた薬物売買事件の際には「自分が動かずとも解決するだろう」とナルトたちを信じ直接介入を避けていたが、里から逃げようとしていたキドの部下たちを無力化してそのまま去った(小説『サクラ秘伝』)。ナルトとヒナタの結婚式にも里を出ていたため欠席したが、当日鷹を使って簡潔な祝いの手紙を送った(『疾風伝』最終話)。
小説『サスケ真伝・来光編』では主人公を務め、木ノ葉・霧・雲で起こったテロ事件の解決に奔走した。この出来事で「圧倒的な力を持つはずのカグヤが、なぜ大量の白ゼツ軍団を用意しようとしていたのか」という疑問を抱き、贖罪の旅の傍ら独自に調査を始めている。また、事件を通じて自分の「繋がり」の大切さを感じ、それまで帰らなかった木ノ葉隠れに時々戻るようになる。一時期はサクラを伴い旅をしており、その最中に彼女との間に娘・サラダを儲けている。この頃には髪を少し伸ばし前髪で左目を隠している(『暁秘伝』で子供に輪廻写輪眼を見咎められ、不自然にならない程度に隠そうとしたのがきっかけ)他、黒いマントを羽織っている。
外伝『七代目火影と緋色の花つ月』では、ナルトを含む五影やサクラにカグヤに関する疑惑を打ち明け、彼らの許可を得て長期に渡り単独で調査を行っていた。そのせいで父への恋しさを募らせたサラダの訪問を受け、親子間のトラブルを抱えながらうちはシンと対峙する事態に発展するものの、「お前がいるから家族は繋がっている」と諭し、共に事件を終息させた。一時帰還し出立する際には寂しがるサラダに対し、かつてサクラにしたように額を小突いていった。
カカシが四代目火影の「螺旋丸」に影響を受けて考案し、後にサスケに伝授された雷遁系の忍術。片手に電撃を溜め、突進して対象を貫く。「チッ、チッ、チッ...」と鳥の鳴き声に似た独特の攻撃音を発するため、まるで千の鳥が地鳴きしているようであることから千鳥という名が付いた。またカカシの使用する千鳥は、第三次忍界大戦末期に敵の忍が放った大規模な雷遁を真っ二つにした経緯から「雷切」とも呼ばれている。作中では片手に電撃を溜め、肉体活性による高速移動を併用し相手に突進攻撃を行う。基本的かつ最も威力のある攻撃形態。
しかし、全力で加速し一点集中する「ただの突き」であるため、いくら雷遁の術と体術が優れていてもカウンターの格好の餌食となる欠点があり、それを補うだけのタイミングの見極めがあって初めて成立する術である。開発した当初のカカシもミナトにそれを指摘され術を封印していたが、後にオビトから譲られた写輪眼を自身に移植することで高い動体視力を獲得し、術として完成させた。以上のことから、この術の会得・使用は「ある程度熟達した写輪眼の保有者」に限定されている。
木ノ葉を抜けて大蛇丸のもとに身を寄せてからは、全身から威力を弱めた状態で雷遁を放出する「千鳥流し」、千本のように針状に形態変化させて放つ「千鳥千本」など、独自の応用術を編み出している。なお、当初より利き腕の左手で発動していたが、第四次忍界大戦終結間際のナルトとの決闘で左手を失ってからは、残った右手を使っている。
その後、再会したイタチに戦いを挑むもまったく相手にされず、昔から一向に縮まっていない自分と兄の実力差を痛感させられる。「千鳥」もあっさり破られ、深い絶望感で復讐を焦り始める。イタチの「月読」による昏睡状態から目覚めた後、病院の屋上でナルトに戦いを挑み「千鳥」と「螺旋丸」が激突しそうになるが、カカシによって止められる。その際に2人が貯水タンクに空けた穴の大きさで自分の力がナルトより劣っていたことを痛感し、さらに劣等感を強くする。
その日の夜、音の四人衆に大蛇丸の元への誘いを受ける。仲間の顔を思い浮かべ迷うが、力を遵奉するようになったため、里を抜け大蛇丸の下に行くことを決意。制止しようとするサクラの想いを拒絶し、彼女を気絶させ里を去る。ナルト、シカマル、チョウジ、ネジ、キバらの追跡を受け、最終的に終末の谷で呪印解放し龍人のような姿となり、ナルトと対峙する。当初は九尾の力を解放したナルトの動きに付いていけず、劣勢を強いられるが戦闘の最中、写輪眼が三つ巴に変化し動体視力が向上、彼の動きを見切り徐々に優勢になっていく。激闘の果てに千鳥と螺旋丸の激突の末、勝利を収める。その後、「万華鏡写輪眼を会得するためには最も親しい友を殺さなければならない」というイタチの言葉を思い出すが、結局ナルトを殺すという選択はせず、イタチに言われるままではなく、自らのやり方で復讐のための「力」を手に入れることを決意し、ナルトに傷を付けられた木ノ葉の額当てを残し大蛇丸の元へ向かう。