第三青函丸
1938年(昭和13年)10月12日 - 起工
1939年(昭和14年)10月10日 - 竣工
1939年(昭和14年)11月25日 - 就航
1945年(昭和20年)7月14日 - 青森第3岸壁定刻2時30分発のところ、遅れ293便として2時55分函館へ向け出航、5時10分頃大湊地方空襲警報あり総員配置警戒態勢をとりつつ針路は維持、その後津軽海峡、北海道西南部空襲警報あり、5時33分頃福島錨地へ退避のため北西やや西へ転針。6時頃、下北半島方面より4機のアメリカ軍機襲来し主として船橋を機銃掃射したが、応戦した警戒隊員により1機を撃退した。この戦闘で無線は使えなくなったが、死傷者はなかった。6時10分頃6機編隊が来襲し甲板室とボイラー室を攻撃し左舷煙突付近で蒸気管破裂し電灯も消え、船体は左舷前方に傾斜し、操舵不能となり速力低下、負傷者続出。引き続き約50機が反復攻撃を加え、警戒隊員は全弾撃ちつくし応戦不能となり、船長は退船命令を発した。その後投下された魚雷らしきものが右舷中央部に命中し6時30分頃、矢越岬南南東3.8海里で沈没。沈没後もなお漂流者に銃撃が加えられた。乗組員77名中64名が戦死し、生存者は付近を航行中の三井近海機帆船会社所属の機帆船第一朝日丸に救助された。
1941年(昭和16年)8月16日 - 起工
1943年(昭和18年)2月25日 - 竣工
1943年(昭和18年)3月6日 - 就航
1945年(昭和20年)7月14日 - 函館第3岸壁定刻4時00分発のところ、遅れ194便として5時08分青森へ向け出航するも、離岸のための右舷揚錨作業中警戒警報のサイレン吹鳴あった。しかし揚錨作業の騒音でサイレン音聞こえず、桟橋からの連絡もないまま離岸し、5時23分防波堤南口通過したが、万一に備え防空準備を開始。5時31分穴澗岬通過後針路を10度西に変針、5時40分無線で空襲警報発令を受け、防空準備完了直後の5時41分アメリカ軍機2機の爆撃を船尾右舷に受けた。この爆弾は船尾車両甲板を貫通し車軸室上の第二甲板馬匹付添人用雑居室で炸裂し火災発生、操舵不能となった。5時50分頃にはさらに第2弾、第3弾を受け、船橋、無線室、士官食堂は四散した。6時頃には左舷側船橋後部に被弾し、これが車両甲板で炸裂し、車両甲板を損傷し積載貨車の破片や貨車積載石炭がその下のボイラーを損傷し、蒸気噴出で焚火不能となった。6時05分には船首揚錨機付近にも被弾し、船首船員居住区も破壊された。さらに6時20分頃急降下してきた1機の投下した爆弾が船橋前部の船橋楼甲板、車両甲板を貫通し船艙内で炸裂したため、水線下に大破孔を生じ急速に浸水し、6時25分葛登支岬東南東3.9海里で船尾を直立させ沈没した。葛登支見張所からの要請で出動した陸軍舟艇が漂流者を救助、乗組員78名中54名が戦死した。
2020年(令和2年)7月13日 - NHKと海洋調査会社・ウインディーネットワーク(静岡県下田市)の共同調査によって発見。
この反証や、その後の戦局の悪化もあり、1942年(昭和17年)10月の閣議決定を経て、第四青函丸の建造続行と第四青函丸を徹底的に簡易化した戦時型車両渡船3隻の建造が12月にようやく正式承認された。これがW型戦時標準船(第五青函丸型)で、「W」はWAGON、貨車の意味であった。