サマンサ・モルダー
1973年、シンジケートはエイリアンの地球入植を防ぐべく、彼らと同盟を結んだ。その際、エイリアン側はシンジケートのメンバーの子供を人質として提供するように求めてきたのである。シンジケートのメンバーでもあったビルは子供のどちらを差し出すべきか苦悩した。このことを知らされたティナは考えること自体を拒絶した。最終的に、ビルはモルダーを人質に差し出すことを決めたが、スモーキング・マンの命令でサマンサの方を差し出すことになったのであった。スモーキング・マンが人質として最低一人は女の子を差し出す必要があると考えていたためである。
霊媒師の助けで、モルダーはサマンサの古い日記を発見することができた。そこには、サマンサが誘拐後にエイリアンの実験台として苦痛を味わってきたこと、あらかたの実験を終えたサマンサがもうすぐ家に帰される予定であったことが書かれていた。その後、サマンサはカリフォルニア州にあるエイプリル空軍基地に軟禁されることになった。そこで、彼女はジェフリー・スペンダーと共に育てられ、今度はシンジケートが行う実験の被験者になった。スモーキング・マンはサマンサを洗脳し、自分を父親だと思い込ませた。エイリアンと人間のハイブリッドを生み出すための実験は苦痛に満ちたもので、サマンサは実験とそれに従事する科学者たちを憎悪するようになった。1979年、ついに苦痛に耐えきることができなくなったサマンサは、施設から逃走した。実験のせいで過去の記憶のほとんどを失っていたサマンサだったが、自分の父親の顔は朧気ながらも覚えていた。高速道路に迷い込んだサマンサは、警察に保護されて病院に搬送された。その病院の医師は彼女をパラノイアと診断した。サマンサは治療を受けることや個人情報を提供することを拒絶したが、ERの看護師であるアビュータス・レイには僅かながら心を開いたようだった。