さんふらわあ ぱーる
2009年10月21日、同型船の「さんふらわあ ごーるど」が大分港から神戸港へ航行中、油圧式可変ピッチ推進装置(プロペラ)の翼角が変わらなくなり、所定の速度で航行出来なくなった。原因は設計上の欠陥により、油圧式可変ピッチ推進装置のアウターオイルチューブおよびボスヘッド締付けボルトに亀裂が生じたためであった。本船でも同様の損傷が確認され、当該部は形状が変更された対策品と交換された。
2014年1月9日、18時33分ごろ、六甲アイランドフェリーターミナル第1バースで荷役中だった本船に、西側のバースに着岸しようとしていた貨物船が圧流され接触した。本船の左舷側に貨物船の後部が繰り返し衝突する形となり、 本船は船橋左舷下部に破口を生じるなど左舷外板が損傷した。本船は応急補修後、約2時間半遅れで運航された。
2017年12月15日、機関故障が発生し、MES-KHI由良ドックへ緊急入渠。原因は不明だが故障が深刻であったため9カ月間運休し、2018年8月29日の神戸発便より運行を再開。休航中の2018年5月から8月にかけては、本船の代替としてさんふらわあ さつま1が別府-神戸間を臨時運航した。