統合基本航空機訓練システム計画
こうして空軍と海軍で同一機種を導入することとなったが、空軍と海軍が求める練習機は必ずしも同じ設計ではなかった。空軍がT-37と同じ並列複座を希望したのに対し、海軍はT-34Cと同じタンデム複座を希望した。また、基本練習機の前に飛行適正検査機による飛行がある空軍は、ターボファンエンジンを搭載する純ジェット機を希望したのに対し、最初から基本練習機による飛行を行う海軍はターボプロップエンジン搭載のプロペラ機を希望した。
1994年5月18日にJPATS計画の提案依頼書が公表され、業者の公募が始まった。700機以上もの大口受注が見込まれることから、提案依頼書には8社が応じ、うち7社はアメリカ国外の練習機を米空海軍向けに改修した機体を提案した。
アライドシグナル/アエロ・ヴォドフォディ(英語版) - アライドシグナル L-139アルバトロス2000
ビーチクラフト(レイセオン傘下)/ピラタス - ビーチクラフトPC-9 Mk.II
セスナ - セスナ 526(英語版)
ノースロップ(応札後、合併してノースロップ・グラマン)/エンブラエル - ノースロップEMB-312H
業者選定には14ヶ月が費やされ、実機とコックピットのモックアップ、さらに数千ページに及ぶ各社の提案に対する評価書を元に、1995年6月22日、ビーチクラフトが提案したピラタスPC-9 Mk.IIが選定された。ピラタスPC-9 Mk.IIはT-6テキサンIIの制式名が与えられ、空軍の航空教育・訓練軍団と海軍の海軍航空訓練軍団(英語版)に配備されたほか、カナダ空軍などアメリカ国外の空軍にも採用され、850機以上が製造されている。T-6テキサンIIの試作機は、パタクセント・リバー海軍航空博物館(英語版)で展示されている。
落選した機体のうち、EMB-312Hはブラジル空軍の軽攻撃機(ALX)に再提案され、エンブラエル EMB-314の名で採用された。EMB-314は10ヶ国以上で採用されたほか、アメリカの民間軍事会社ブラックウォーターUSA社もアメリカ海軍の特殊部隊Navy SEALsを支援する機体として採用した。さらに、アメリカ空軍がアフガニスタン空軍に供与する軽航空支援(LAS)計画に選定され、A-29の名で製造されている。L-139は、L-159の技術を取り入れた改良型L-39NGに発展し、アメリカやチェコの民間軍事会社に改良キットとして採用され、アメリカ空軍やチェコ空軍の訓練支援に用いられている。