RNA活性化
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RNAaの分子メカニズムは完全には解明されていない。RNAiと同様に、哺乳類のRNAaは、アルゴノートタンパク質のAgoクレードのメンバー(特にAgo2)を必要とするが、RNAiとは異なる動態を持つことが明らかになっている。RNAiとは対照的に、プロモーターを標的としたsaRNAは、エピジェネティックな変化に伴う遺伝子発現の長期的な活性化を誘導する。現在のところ、saRNAは最初にAgoタンパク質によってロードされ、処理されてAgo-RNA複合体を形成し、次にRNAによってプロモーター標的に誘導されると考えられている。その標的は、プロモーターまたは染色体DNAと重複する非コード転写物の可能性がある。RNAをロードしたAgoは、次に、核DNAヘリカーゼIIとしても知られるRHA(英語版)や、CTR9(英語版)などの他のタンパク質を動員して、RNA誘導転写活性化(RITA)複合体を形成する。RITAはRNAP IIと直接相互作用することで転写開始を促進し、H2Bのユビキチン化を刺激することで有効な転写伸長を促進する。