ルッケーゼ一家
カッソ追放後、アムーソは獄中からジョセフ・デフェデ(Joseph DeFede)、スティーブン・クレーア、ルイス・ダイドーネ(Louis Daidone)をボス代行に指名するが、デフェデはアムーソに疑われて情報提供者に転じ、クレーアとダイドーネは逮捕・収監されたため、2003年には幹部3人による運営に切り替えた。
2005年にはマフィア捜査を行っていたニューヨーク市警の元警官ルイス・エッポリトとスティーブン・カラカッパ(英語版)が警官時代にルッケーゼ一家のヒットマンとしてゴッティの部下らの暗殺を実行していたことが判明して逮捕され、一大スキャンダルとなった。彼ら二人は翌2006年に共に終身刑の判決を受けた。
2009年、クレーアが出所したことを受けて、マシュー・マドンナがボス代行、クレーアがアンダーボスとなった。しかし、2017年にギャング殺害の容疑で共に逮捕され、2020年に終身刑の判決を受けた。
2017年、アムーソが獄中からマドンナとクレーアに手紙を送り、二人の解任及び、マイケル・デサンティス(Michael DeSantis)をボス代行に指名することを命じた。アムーソは2023年現在もなお獄中からファミリーを支配しているが、88歳の彼自身含めて幹部の高齢化が著しくなっている(これは他の5大ファミリーでも同様である)。
ルッケーゼは1960年代後半に病床に伏すようになり、ガンビーノ主導のコミッションで後継ボス人事が取りざたされた。1967年ルッケーゼが死ぬと、カーマイン・トラムンティ、アンソニー・コラーロがボスとなり、麻薬取引にも手を染めた。
1978年、ポール・ヴァリオ配下のジミー・バーク、トーマス・デシモーネなどがルフトハンザ航空強奪事件を引き起こす。その後、同じくヴァリオ配下のヘンリー・ヒルが情報提供者となったことで、バーク、ヴァリオら関係者が多数逮捕された。この事件は『グッドフェローズ』として小説・映画化された。
1980年代に入ると、5大ファミリー壊滅を目的としてファミリーのボスや大幹部が多数起訴される。ルッケーゼ一家では、ボスのコラーロやポール・カステラーノと仲が良かったサルヴァトーレ・"トム・ミックス"・サントロなどが起訴された。
1986年には獄中のコラーロが指名した人物を殺害してヴィクター・アムーソがボスの座を奪った。アムーソは腹心のアンソニー・"ガスパイプ"・カッソと共にガンビーノ一家のボスの座を奪ったジョン・ゴッティに反発してフランク・デチッコら側近を殺害する。このため5大ファミリーの内部に緊張状態が生じ、ゴッティはアムーソらと話し合いを続けた。
1950年代後半、ルッケーゼは、ヴィト・ジェノヴェーゼと組んでニューヨーク・マフィア最大の実力者コステロの追い落としに加担した。更にカルロ・ガンビーノをアナスタシア一家のボスにつけた上でガンビーノと姻戚関係を結び連携を強化した。ボナンノ一家のボスのジョゼフ・ボナンノとプロファチ一家のボスのジョセフ・マリオッコによるニューヨーク・マフィア掌握の陰謀を未然に阻止し、ガンビーノと共にニューヨークを実質的に支配した。