六甲学院中学校・高等学校
生徒の手で清掃が行われている。
掃除監督:ほとんどの掃除は、中3から高3の各クラスから選出された訓育生、クラス三役(委員長、副委員長、および書記)、高2の指導員が監督をし、許可をもらわないと終了することができない。
便番:冬季の極寒の中でも裸足、短パン1枚で行う便器清掃。清掃用手袋や洗剤などは使わずに素手で便器を磨く慣習となっている。2020年度より便所掃除は業者に委託となったが、2021年度11月より、生徒による便所掃除が再開された。なお、裸足・短パン1枚・素手での清掃は現在は行われていない。また、素手で便器を磨くのではなく、掃除器具を使用する場合が多い。
欠番作業:掃除を怠った者には罰則があり、通常は中間・期末試験の最終日に行われる。これも生徒指導の下、2時間半ほどの特殊区域(通常掃除区域外)の掃除をする。
標高差が150~200mあるきつい坂だが、遮るもののない神戸一円の景色、瀬戸内海が見える。
開学間もない1941年(昭和16年)、鉄筋コンクリート造の校舎が建てられた。この年は太平洋戦争開戦の年であり、統制により大規模建造物の建設は規制を受けていたため、学校関係者の苦心も相当なものであったという。
2012年(平成24年)の創立75周年の年、2037年の100周年を見据え、より安全で時代に即した利便性を目指した新校舎が完成した。2010年に旧校舎が取り壊されたが、校舎内廊下のタイル張りなどは旧校舎のデザインを踏襲したものとなっている。2013年4月には講堂棟(アトリウム)の改修工事が完了、宗教科教室と食堂が新設され音楽室と家庭科室の移転も完了した。また仮校舎が建っていた第二グランドは人工芝が整備され、75周年記念事業により校内は大きく様変わりしている。
2016年4月に、イエズス会教育の実現と深化を目的に、設置者である六甲学院を含む姉妹校の4つの学校法人栄光学園、広島学院、泰星学園は学校法人上智学院と合併した。また、同時に校名を「六甲学院中学校」「六甲学院高等学校」に改称。校章も変更された。合併後各学校法人は解散するが、各校は上智大学の附属校にはならず名称もそのままに独立経営が維持される。
上智大学(東京都千代田区)
上智大学短期大学部(神奈川県秦野市)
栄光学園中学校・高等学校(神奈川県鎌倉市)
広島学院中学校・高等学校(広島県広島市西区)
上智福岡中学校・高等学校(福岡県福岡市中央区)