栽培漁業
アイナメ 香川県
アカアマダイ 京都府・島根県・山口県・宮崎県
アカハタ
アユ 岩手県・山形県・茨城県・石川県・福井県・愛知県・滋賀県・岡山県・広島県・山口県・徳島県・福岡県・大分県・宮崎県
イサキ 和歌山県・高知県・大分県
イシガキダイ
イシダイ
ウスメバル
ウナギ 島根県
ウマヅラハギ 香川県
オオニベ(英語版)
オニオコゼ 大阪府・兵庫県・島根県・岡山県・広島県・香川県・高知県・長崎県・鹿児島県
オヒョウ
カサゴ 三重県・和歌山県・兵庫県・島根県・広島県・山口県・香川県・高知県・長崎県・鹿児島県
カワハギ 宮崎県
カンパチ 宮崎県
キジハタ 大阪府・兵庫県・鳥取県・島根県・広島県・山口県・香川県・愛媛県
キツネメバル 青森県
キュウセン 香川県
キンメダイ 静岡県
クエ 静岡県・和歌山県・愛媛県・高知県・長崎県
クロソイ 北海道・宮城県・秋田県・山形県・茨城県
クロダイ 山形県・神奈川県・富山県・愛知県・大阪府・香川県・高知県
クロマグロ
サケ(種を問わず) 北海道・福島県・石川県(シロザケ)
サワラ 兵庫県・香川県・愛媛県
シマアジ 高知県・宮崎県
シロクラベラ
スギ 沖縄県
スジアラ(英語版) 鹿児島県
一般的に親と同じ形になる全長2 - 3センチメートルの稚魚期まで育てることを種苗生産という。種苗生産では親魚(英語版)と呼ばれる、卵をとる為の親の魚を用意する。親魚には天然の成魚を捕獲して用いる場合と、天然の幼魚を捕獲し飼育下で成熟させたものを用いる場合がある。卵をとる方法は自然採卵と人工採卵がある。自然採卵は飼育環境下であるものの魚自身に抱卵・放精を行わせ受精卵を得る方法で、人工採卵は成熟した親の腹部を圧縮することにより得た卵と精子から受精卵を得る方法である。人工採卵ではしばしば成熟ホルモンを用いる。得られた受精卵は適切に管理され孵化させる。孵化した仔魚が最初に食べる餌は重要でその魚にあった大きさのものでなければならない。海産魚の場合、多くの魚種で初めは小さい生きた生物を好み、種苗生産現場では大量に培養可能なシオミズツボワムシを与える。ワムシの次はアルテミアを与え、次に細かい配合餌料を与えるというのが、代表的な餌の順番であるが、魚種によって大きく異なる。
安定した種苗生産の技術開発と共に、ワムシやアルテミアを安価に大量生産する技術開発も必要不可欠であった。