進化分類学
進化分類学は系統樹における枝分かれのパターンを考慮する(類縁関係が離れた枝を1つにまとめることはしない)一方で、伝統的な表現型の類似性による分け方も認めている。したがって側系統群をタクソンとして容認する。
しかし分岐分類学からの伝統的な分類学への批判、「派生形質を恣意的に選ぶことになる」および進化に関する「単純なものから複雑なものへ進歩する」という古典的誤解も助長しかねないという問題は残り続ける。
進化分類学の用語法で言えば、「側系統群はすべて、ある共通祖先の子孫だという意味で単系統群でもあるが、ただ完系統群(Holophyletic group:これは分岐分類学の用語法でいう単系統群)ではない」ということになる。
なお日本語では、進化分類学的な考え方を系統分類学と呼ぶことも多いが、分岐分類学のことを系統分類学(Phylogenetic taxonomy)ともいうので注意が必要である。