パラッシ・ラージャ
この動きは、チラッカル軍にとっては背後からパラッシの軍勢に攻撃される危険が生じたことを意味した。チラッカル軍は退却を開始したが、パラッシはこれを追撃して壊滅させ、そのままコッタヤムまで進軍してマイソール占領軍を撃破し、コッタヤム西部一帯を制圧するに至る。ただ一方で、タラッセリーの商館は、総督からハイダル・アリーとの形式上の和平を揺るがすことのないようにと指示されていた。このため、イギリスは反乱軍との共同戦線によってマラバールのマイソール軍を根絶やしにする好機を活かしきることができなかった。
このイギリスの判断は、マイソール王国によって逆に利用された。バルワント・ラーオ率いるマイソール軍の支援を受けたチラッカル軍は、コッタヤムに進軍する。パラッシは、引き続き東インド会社から秘密裏に武器と弾薬を供給されていたが、この巨大な軍勢を前に持ちこたえることができず、戦いの末に軍勢は散り散りになった。その後、マイソールおよびチラッカル軍はカダッタナードゥを占領し、マイソールと手を結んだ傀儡のラージャを擁立した。1779年、マイソール、チラッカル、カダッタナードゥの大軍がタラッセリー要塞を包囲した。パラッシ・ラージャは2,000人のナーヤルの軍勢を送ってイギリスのタラッセリー防衛を支援した。これにより、商館側は抵抗を継続することができた。
1779年の終わりまでには、マイソール王国の将軍サルダル・カーンが、包囲戦を速やかに完遂するために1万の軍勢と30の重砲を携えてタラッセリーに派遣された。
パラッシの家の修復が命じられ(ただし宝物は返還されなかった)、彼の恩赦もボンベイ政府および総督府によって確認された。ただし、政府の命令はヴィラ・ヴァルマを通じてパラッシに伝えられることとなった。叔父はイギリスが要求に同意したことを、甥のパラッシに報告しないようにした。ヴィラ・ヴァルマはイギリスとパラッシの戦争状態から利益を得られる立場であったため、イギリスの傀儡として動きつつ、パラッシら反乱軍とイギリスとの対立を煽るという二枚舌の戦略をとったのである。ヴィラ・ヴァルマはまた、パラッシが目をかけていた貴族で将軍のカイセリ・アンブーをコッタヤムの内政から排除した。アンブーは仲間とともにカンナヴァム村に赴いて、民衆の支持を得て大規模な抵抗運動を計画・実行し、ヴィラ・ヴァルマがコッタヤムで税を徴収できなくなるように仕向けた。この行動の裏には、アンブーの追放が叔父による謀略の一つであると感じ取ったパラッシによる指示があったとされ、実際アンブーは後にパラッシの反乱軍に参加している。
ヴィラ・ヴァルマがイギリス側の休戦提案を握り潰していたため、パラッシは逮捕を恐れ、ワヤナードゥの奥地まで退却した。ワヤナードゥでのイギリスの兵力が増強されていたことも、彼の疑念を増幅させた。しかし、まだ戦争を回避する方法を模索していたパラッシは、1796年12月27日、1,500人の武装したナーヤルの護衛を伴って北部監督官に会いに行った。ヴィラ・ヴァルマも同席した。パラッシの主な要求は、コッタヤムの支配者としてヴィラ・ヴァルマではなく自分を承認することであったが、この要求は受け入れられず、交渉は決裂、両者の対立がさらに深まる結果となった。