武蔵小杉駅
ホームが1つとなることから、混雑緩和を目的に上り線と下り線で停車位置を2両分ずらしていた。
その後、東横線の複々線化工事に伴う改築により前述の通路と中間改札口が廃止され、同時に新丸子寄りにも改札口が新設された。
2000年8月6日の目黒線開業に伴い、専用の引き上げ線が敷設された。当初は1線のみだったが、2006年9月24日の東横線の当駅 - 日吉駅間の高架化および同年9月25日からの目黒線の急行運転に伴い2線に拡張された。これは元住吉駅高架化前の東横線の本線を使用してそのまま元住吉検車区へとつながっていたため、東横線・目黒線の当駅止まりの列車や当駅始発の出・入庫列車が使用していたが、2008年6月22日の目黒線の日吉延伸時に本線としての使用を開始した。なお、目黒線の日吉駅延伸後も元住吉検車区への入・出庫のために引き続き当駅始発・終点の列車が設定されている。
2006年9月25日のダイヤ改正で元住吉駅は南側に移転・高架化された。元住吉駅構内から検車区への出・入庫が不可能となったため、東横線の出・入庫列車は初電と終電を除き従来の元住吉駅始発・終点からすべて当駅発着に変更された。なお、出・入庫時は当駅から目黒線の線路を経て元住吉検車区に通じる車庫線を経由するが、横浜方面はそのほとんどが日吉始発となるため、元住吉検車区に設置されている日吉駅への「下り出庫線」を通る。
駅の立地の関係でバス停留所は4か所に分散した設置となっている。JRの北口と横須賀線口、JRの東口・東急の正面口(東口駅前広場)にバスターミナルが、東急の南口にバス停留所があり、川崎市交通局・川崎鶴見臨港バス・東急バスが周辺各方面への路線バスを運行している。停留所は北口(小杉駅前)・南口(東横線小杉駅)・横須賀線口(横須賀線小杉駅)・東口(小杉駅東口)の4か所に設けられているが、東口以外の3か所は互いに500メートル程度離れており、東口はその3か所を結んだ三角形の中央付近に位置する。
Jリーグ・川崎フロンターレの本拠地になっている等々力陸上競技場や川崎市市民ミュージアムのある等々力緑地へのバスも発着する。
同時にホームが川崎寄りに125m移動する。
1987年(昭和62年)4月1日:国鉄分割民営化により、国鉄の駅は東日本旅客鉄道(JR東日本)の駅となる。
1988年(昭和63年)11月27日:南武線連続立体交差事業に伴い武蔵中原方の下り線を高架に切り替え。
1990年(平成2年)12月20日:南武線連続立体交差事業に伴い武蔵中原方の上り線を高架に切り替え。
1993年(平成5年)12月16日:東横線複々線化工事に伴い、当駅の改良工事に着手
1994年(平成6年)3月15日:南武線改札口に自動改札機を設置。
1995年(平成7年)7月13日:東横線下り線を海側の仮ホームに移設。
1996年(平成8年)3月19日:東横線上り線を海側の仮ホームに移設。当駅は島式ホームとなり、同時に南武線との連絡改札口を廃止。
1997年(平成9年)8月31日:東横線上り線を本設線に移設(現行の4番線の位置)、新上り線ホーム使用開始。
1998年(平成10年)4月23日:東横線下り線を現在の3番線位置に仮移設。現在の1・2番線の場所にあった仮ホームは解体・新ホームを建設へ。
1999年(平成11年)5月15日:東横線下り線を本設線に移設(現行の1番線の位置)、新下り線ホーム使用開始。
2000年(平成12年) 8月6日:東急目黒線が誕生し、多摩川駅 - 武蔵小杉駅間が複々線化。東急のホームが2面4線となる。
※東日本旅客鉄道(JR東日本)の特急「成田エクスプレス」「踊り子・サフィール踊り子」の隣の停車駅は、各列車記事を参照のこと。