武田科学振興財団
薬種抄 2巻 保元元年書写奥書
香要抄 2巻 保元元年書写奥書
穀類抄 保元元年書写奥書
香字鈔
宝要抄
古文孝経 仁治二年清原教隆書写奥書
春秋経伝集解残巻 4巻
性霊集 7巻
聖徳太子伝暦 4帖
春記 3巻
実躬卿記 自筆本 51巻
黄帝内経太素 巻第二十一、第二十七 2巻 仁安三年丹波頼基書写奥書
新修本草 巻第十五
啓迪集 8冊 曲直瀬道三自筆本 天正二年策彦周良題辞冊(附:啓迪集〈天正二年自序〉2冊)
典拠:2000年までの指定物件については『国宝・重要文化財大全 別巻』(所有者別総合目録・名称総索引・統計資料)(毎日新聞社、2000)による。財団公式サイトの「杏雨書屋」のページも参照。