忍 -SHINOBI-
水忍スキューバ
砲忍バズーカ
蜘蛛忍スパイダー - ブルースパイダーと名称を変更。
狂忍ジャンキーヘッド - ブルースパイダーの色違いでグリーンスパイダーとして登場する。
道化忍スカル
カラス天狗ルーク
僧忍ボーズ
ブラックタートル
「SEGA AGES」シリーズ全体統括のリードプロデューサー兼ディレクター・小玉理恵子(セガ所属)から「SYSTEM16(が原典のゲーム作品)から何か入れましょう」というオーダーがあり、本作および『ゴールデンアックス』『獣王記』という候補から、最終的には全世界同時期配信で、「SHINOBI」シリーズの海外での知名度から本作が選ばれた。
開発(移植)期間は約8 - 10ヶ月。最終的な仕様が確定するには紆余曲折があった。 付加価値要素の一つとして、TSS版ジョー・ムサシそのものでプレイ出来る構想もあったが、TSS版ムサシの象徴的な忍術(体術)である「八双手裏剣」は本作のゲームデザインにそぐわないため、お蔵入りとなった。 忍シリーズの別作『シャドーダンサー』のお供キャラ(忍犬)「ヤマト」をジョーに帯同出来るようにするという案もあった。ヤマトは見た目も可愛く、世界観を壊さず、難易度も下がるナイスアイデアかと思われたが、「(ヤマトは犬なので)手裏剣をどこから出すのか?」といった問題を解決できず、これもお蔵入り。。
付加価値要素のひとつ「シークレットナビ」はセガ側チェックスタッフから出たアイデアを小玉が採用、開発企業であるエムツー社に「ぜひ、この機能を入れてほしい」とお願いしたことで実現した。
「キャビネット」モードはSwitchのスペックを生かし操作感を悪くしない様にデザインされ、日本版と海外版を合わせて2台分を作るのに1ヶ月半ほどかかった。なお海外版のキャビネットは開発スタッフである駒林貴行(エムツー所属)がアメリカに出張の際、シカゴのゲームセンターで発見、この時に撮った写真を元に作られた。
屋敷が舞台となっている。このミッションのみコンティニュー不可となっている。