コンプティーク
.hack//黄昏の腕輪伝説(原作:浜崎達也 / 漫画:依澄れい)2002年1月号 - 2003年11月号
D.C. 〜ダ・カーポ〜(原案:CIRCUS / 作画:たにはらなつき)2003年3月号 - 2004年5月号
Piaキャロットへようこそ!!3 〜恋愛メニュー始めました〜(原作:F&C・FC02、漫画:渡瀬のぞみ)2003年9月号 - 2004年3月号
SHUFFLE! -DAYS IN THE BLOOM-(原作:Navel / 漫画:日下皓)2003年12月号 - 2006年12月号
ファントム・ブレイブ イヴォワール物語(原案:日本一ソフトウェア / 作画:道満晴明)2004年2月号 - 7月号
D.C.S.G. 〜ダ・カーポ セカンドグラデュエーション〜(原案:CIRCUS / 作画:Cherish)2004年9月号 - 2006年8月号
IZUMO -猛き剣の閃記-(シナリオ:高橋直樹 / 作画:山本和枝 / 制作協力:UTATA)2004年 - 2005年
英雄伝説ガガーブトリロジー 白き魔女(シナリオ:森瀬繚 / 作画:永倉由紀)2004年 - 2005年
機神咆吼デモンベイン(原作:ニトロプラス / シナリオ:種子島貴 / 作画:たなか友基)2004年 - 2006年
AIR(桂遊生丸)2004年9月号 - 2006年3月号
2003年9月号から「MediaMix Game Magazine」と称してメディアミックスを押し進め、それまでのゲーム紹介記事中心の構成からギャルゲーを原作とする漫画を大幅に取り入れた構成に変革。2003年は『D.C. 〜ダ・カーポ〜』、2005年は『SHUFFLE!』を度々特集し、2006年からは『Fate/stay night』などTYPE-MOON作品を大きく取り扱うようになる。また、2004年1月号から始まった『らき☆すた』の連載は十年以上続く長期連載となり、TVアニメ化された2007年には4ヶ月連続で表紙を飾った。
このころから付録を付けることが多くなり、大きい付録が付いた場合は値段もそれに応じて高くなるが、付録をつけた方が売り上げは良いようである。
2002年4月号では、別冊として『コミックコンプ』(内容は新規の漫画誌)が付録されており、一部ではコミックコンプ復刊とも言われたが、結果としては2005年に『月刊コンプエース』を創刊することになった。