佐世保線
1943年(昭和18年)8月30日:佐世保駅 - 北佐世保駅間が松浦線に編入される。
1945年(昭和20年)5月15日:大塔信号場が大塔駅に変更。
1949年(昭和24年)1月15日:永尾信号場が永尾駅に変更。
1973年(昭和48年)10月29日:電化工事に着手。
1975年(昭和50年)6月19日:武雄駅を武雄温泉駅に改称。
1976年(昭和51年)6月6日:肥前山口駅 - 佐世保駅間電化。
1979年(昭和54年)3月30日:西有田信号場を新設。
1985年(昭和60年)3月14日:早岐駅 - 佐世保駅間の貨物営業を廃止。
1987年(昭和62年)4月1日:国鉄分割民営化により、九州旅客鉄道(全線・第1種)と日本貨物鉄道(肥前山口駅 - 有田駅間・第2種) が継承。有田駅 - 早岐駅間は貨物営業廃止。
2002年(平成14年)3月23日:全線でワンマン運転を開始。
2016年(平成28年)12月22日:全線で列車情報提供システムの提供開始。
2020年(令和2年)3月14日:この日のダイヤ改正をもって松浦鉄道への直通運転を廃止。
2022年(令和4年) 2月27日:大町駅 - 高橋駅間を複線化。 9月23日:肥前山口駅を江北駅に改称。JR貨物の肥前山口駅 - 有田駅間の第2種鉄道事業が廃止され、当路線におけるJR貨物の事業区間がなくなる。
2024年(令和6年)春:ICカード「SUGOCA」を導入(予定)。
新幹線のルートから外れたものの、佐世保市は長崎県の拠点都市としてとして人口や産業が集積しており、輸送改善の必要があることから、長崎県、佐世保市およびJR九州で構成する「佐世保線等整備検討委員会」を設置し、輸送改善策の検討が行われた。佐世保方面への輸送改善として、2019年3月には、有田 - 佐世保間で高速化工事を行うとともに、西九州新幹線 武雄温泉 - 長崎間の開業と同時期に振子型車両の導入を行うことで合意し、工事が進められている。高速化事業は長崎県が事業主体となってレールやまくらぎの改良を行い、事業費は約14億円とされている。また、JR九州は「白いかもめ」などで使用されている885系を博多 - 佐世保間に導入する。これにより博多 - 佐世保間の所要時間は8分程度短縮されると見込んでいる。2022年6月に発表されたダイヤでは、博多 - 佐世保間の所要時間が最大9分間短縮される便がある一方、現行より所要時間が遅い便が生じており、佐世保市長や長崎県知事は十分な効果があるとは言えないとして改善を求めている。