2006年の日本
桐生と郷田が一騎討ちで郷田が敗れて、抗争が終結する。(ゲーム『龍が如く2』)
テログループ・ローズダストによるお台場崩壊テロが発生。(小説『Op.ローズダスト』)
フェンダーミラーの宇宙要塞内でフィリップが老人化光線銃を浴び死亡。(アニメ『秘密結社鷹の爪』)
強烈な地殻変動によって日本列島が沈没する。(映画『日本沈没』)
ウルトラ兄弟の活躍によって地球に平和が戻って25年が経過していたが、何者かが怪獣を呼び出し25年ぶりに怪獣が出現する。さらに25年ぶりにウルトラマンも現れる。(特撮テレビ番組『ウルトラマンメビウス』)
直島諸島荒神島でクリプトビオシス状態にあった旧支配者たる史上最大級の怪獣「クトウリュウ」が復活。神戸に上陸し、神戸ポートピアランドで少女型怪獣「ヒメ」と激突する。(小説『MM9』)
ミッドウェー諸島・テグ島近海に「奇妙な魚」が複数発生。その後、全島民が一夜にして失踪する。これが地球外生命体「進化侵略体」による人類への初攻撃と見られている。(漫画・アニメ『ノブナガン』)
当時4歳の春野はるか(後のキュアフローラ)、異世界国家「ホープキングダム」の王子プリンス・ホープ・グランド・カナタと出会い、「ドレスアップキー」をもらう。(アニメ『Go!プリンセスプリキュア』第1話「私がプリンセス? キュアフローラ誕生!」)
3月10日 - 本田技研工業が「パートナー」をモデルチェンジ(7月13日には「ストリーム」をモデルチェンジ)。
3月16日 - 北九州空港が「北九州空港」として開港。
3月18日 ソフトバンクが、携帯電話業界大手のボーダフォンを1兆7500億円で買収する契約を結んだことを発表。 東日本旅客鉄道と東武鉄道の日光・鬼怒川方面行き直通特急、「日光」「きぬがわ」「スペーシア日光」「スペーシアきぬがわ」が運行開始。
3月20日 - 日本国外務省、非接触型ICチップが内蔵された新型パスポート「IC旅券」を導入。
3月24日 - 石川県志賀町の住民らが、北陸電力志賀原発2号機の運転差し止めを求めていた裁判で、金沢地裁は原発の耐震性に問題があると原告側の求めに応じる判決。原発の運転差し止めが認められた判決は全国初。北陸電力側は即日控訴。
3月26日 - 古川康佐賀県知事が、玄海町の九州電力玄海原発での国内初のプルサーマル受け入れを表明。
3月27日 近鉄けいはんな線が開業。 東京臨海新交通臨海線(ゆりかもめ)が、有明駅から豊洲駅間の2.7km延伸。 参議院本会議で、平成18年度予算案が可決・成立。 東京高裁が、オウム真理教の松本智津夫被告について控訴を棄却する決定を出す。 統合幕僚会議及び同事務局を廃止され、統合幕僚監部が新設された。長は統合幕僚長となり、統幕議長時代よりも権限が強化された。
3月31日 NTT東日本およびNTT西日本のICカード公衆電話とICテレホンカードが廃止される。 神戸市中央区の神戸ポートピアランド閉園。 堀江メール問題で民主党は、前原誠司代表および執行部が総退陣。永田寿康は議員辞職。
9月1日 - 酒類小売業者経営改善等緊急措置法の失効により、酒類販売免許が全面的に自由化される。
9月6日 - 秋篠宮文仁親王に男児が誕生。皇室では41年ぶりに男児が誕生、12日に「悠仁(ひさひと)」と命名された(=現在の悠仁親王)。
9月11日 - JAXA、H-IIAロケットで政府の情報収集衛星光学2号機の打ち上げに成功。
9月12日 - 民主党代表に小沢一郎が無投票当選。
9月15日 オウム真理教元代表・松本智津夫の控訴が棄却され、事実上死刑判決が決定。 竹中平蔵総務相が、参議院議員辞職を表明。女子プロレスラー神取忍が繰り上げ当選へ。
9月17日 - 台風13号が長崎県に上陸し、死者9名、負傷者200人超の被害が出たほか、JR日豊本線で特急「にちりん9号」が脱線。
9月18日 - 吉野家が、アメリカ合衆国産牛肉の輸入停止で販売を中止していた牛丼を、この日のみ全国100万食限定で販売した。
9月19日 レクサスのフラッグシップとなる「LS460」(「セルシオ」後継)が発売開始。 東京、大阪、名古屋の三大都市圏の基準地価が16年ぶりに上昇したと国土交通省が発表。
9月20日 - 自由民主党総裁選挙。安倍晋三が、新総裁に選出される。
9月24日 - 北陸本線の長浜駅〜敦賀駅間、及び湖西線の永原駅〜近江塩津駅間を交流電化から直流電化に変更。