過去に存在した長崎屋の店舗
新長野店(長野市高田、1998年(平成10年)3月12日開店→2代目長野店) →2009年(平成21年)にMEGAドン・キホーテ長野店に業態転換 した。 長野駅前にあった旧・長野店を閉店して地元企業が開設した駐車場付の郊外型ショッピングセンターの核店舗として1998年(平成10年)3月12日に開店した。売り場面積約13,600m。
隣地にある名豊ビル・木島ビル・狭間児童公園を含めた1.5haの駅前大通2丁目地区市街地再開発事業計画を地権者などでつくる準備組合と豊橋市で協議中である。 なお長崎屋は、当店閉店から37年後の2017年10月13日に「MEGAドン・キホーテ豊橋店」を出店、豊橋市へ再進出している。
豊田店(豊田市喜多町2-38、1971年(昭和46年)9月18日開店 - 1991年(平成3年) 8月25日閉店) 豊田市駅前の地下1階地上6階(一部7階)建、延べ床面積約9,900mの『豊田中央開発』の再開発ビルの核店舗として地上1階から地上6階までで出店していた。 地下1階にはヤマナカが入居して食料品売り場を担当し、7階には映画館のアート座があった。店舗面積約3,531m。 閉店後、跡地には1階においでん横町が開業したが振るわず僅か数年で撤退、その後も建物自体は使われないままそれから25年近く残ったままになっていた。2015年の再開発工事時に周辺の廃墟と共に取り壊され、2017年には跡地にKiTARAが開業した。
(初代)八戸店(八戸市八日町44、1970年(昭和45年)11月6日開店 - 1990年(平成2年)x月閉店(後に同年11月に八戸ラピアの核テナントとして郊外移転)、その後パチンコ店「オメガ」とゲームセンター「ギガパレス」(いずれも「ユニコム」運営)が入居したが、2006年(平成18年)3月末で営業許可を返上し閉店。以降空店舗状態が続きビルは不動産会社が所得し売却。) 約1,650mの敷地に建てられた8階建て一部10階建ての店舗で、開業時の地下の食品売り場は地元のスーパーの「中央スーパー」が運営していた。 店舗面積約5,491m。 店舗跡は2006年(平成18年)春から空きビルとなり、2012年(平成24年)1月27日付で地元八戸市に本拠を置く建設業の田名部組が取得し、2013年(平成25年)春にも解体工事に着手して2015年(平成27年)中の開業を目指して 自社の本社を含む事務所 や商業施設と賃貸マンションなどで構成される16階建ての複合施設を建設する計画が進められている。 跡地には2020年(令和2年)に地上13階建てのマンションと商業・オフィス(1階部分)の複合施設として「DEVELD八日町」が竣工した。
三沢店(三沢市大町二丁目6-2、1981年(昭和56年)10月29日開店 - 2001年(平成13年)1月21日閉店) 店舗面積約3,851m。 長崎屋100店目としてオープンした。 建物は3階建てであり、開業当時は三沢市内で最大の売場面積であった。 三沢市のスーパー・佐藤食料品店と長崎屋の共同出資により「サンドール青森」が設立され、1階に入居し総合食料品を取り扱っていた。 閉店後に建物は解体され、現在はマックスバリュ三沢大町店。
小田急線祖師ヶ谷大蔵駅から約200mの祖師谷商店街の中ほどにあった3階建てで店舗面積約2,088mだった。
北千住店(足立区千住3-72、1970年(昭和45年)9月30日開店) 「白亜ビル」に出店していた。 店舗面積約3,459m、延べ床面積約5,962m。
赤羽店(北区赤羽町1-11-4、1963年(昭和38年)開店 - 2002年(平成14年)1月閉店) 店舗面積約2,399m。 1997年(平成9年)2月に子会社清算に伴う特別損失を補うために土地と建物が売却され、その後はリースバックして営業した 後に閉店した。
十条店(北区十条仲原1-21-1、1974年(昭和49年)8月30日開店 - 1994年(平成6年)8月閉店) 十条銀座商店街に隣接する工場跡地に、当初はボウリング場を建設する計画だったが、地域住民の反対に遭い、商業施設に変更。売場面積が周辺商店街全体の売場面積を大幅に上回ることから商店街が反発。行政が介入し、長崎屋が譲歩して売場面積を縮小して開業した。現在は取り壊され、マンションが建っている。 店舗面積約3,125m。
野方店(中野区野方5-18-11、1967年(昭和42年)5月28日開店 - 2002年(平成14年)2月閉店) 店舗面積1,386m→1,379m。
立石店(葛飾区立石7-2、1977年(昭和52年)3月開店 - 2008年(平成20年)8月閉店) 1977年(昭和52年)3月に京成立石駅北口に開店。
店舗跡はポポロ帯広(売り場面積4,973m)として営業していたが、中心商店街の集客力の低下による売り上げ低迷で2002年(平成14年)9月29日に鈴丹が撤退して1階の大半が空き店舗となるなど空洞化が進み、2003年(平成15年)11月末まででビルを所有するいせきグループが同ビル内で経営していたキネマ館も閉館になって 解体され、サルのいる映画館として知られたキネマ館を記念したサルのモニュメントのある駐車場になった。
(2代目)帯広店(帯広市西4条南12丁目3、1990年(平成2年)11月22日開店 - 2023年7月31日閉店) 2011年(平成23年)11月5日に食品売り場を、直営から地元スーパーマーケットの「フクハラ」の店舗に変更した。 地上5階建て・塔屋2階。敷地面積25,500m、延べ床面積80,615.5m、売場面積12,830m(直営8,980m、テナント3,850m)。駐車台数約1,600台。 1階と5階が駐車場となった建物で、2階から4階の一部には関連会社のサンファンタジーが運営する屋内遊園地「ファンタジードームおびひろ」が併設されて同時に開業した。 2023年(令和5年)6月14日に店舗の土地・建物を地元企業の「登寿ホールディングス」が取得した。 2023年(令和5年)9月30日、売り上げが低迷していた食品スーパー「フクハラ」が閉店。 長崎屋直営売り場が閉店後に営業継続するテナントも2024年(令和6年)3月末をもって閉店する方針が示されている。
名寄店(1980年(昭和55年)10月開店 - 2001年(平成13年)1月閉店) 店舗面積約1,749m。
伊達店(伊達市末永町42-1、1978年(昭和53年)3月開店 - 2001年(平成13年)1月閉店) 売場面積1,520m。
岐阜店(岐阜市日の出町1-21-23、1975年(昭和50年)4月26日開店-2002年(平成14年)2月11日閉店) 鉄筋コンクリート造り地上9階地下1階建てのビル。店舗面積約4,174m → 約4,211m。 閉店後、店舗跡の前にある広場で柳ヶ瀬の活性化を目指した「夜空カフェ」が2012年(平成24年)から毎月第1金曜日に開催され、2015年(平成27年)12月には店舗跡の1階を開放してその会場となった。 約20年間遊休不動産になっていたが、2022年3月1日に岐阜市都市計画審議会で都市計画決定案が承認され、ビルを解体して広場として整備される見通しになった。
日本ライン可児店(1985年(昭和60年)3月開店 - 2002年(平成14年)閉店) 跡地はミドリ電化(現・エディオン)とバロー今渡店が2002年(平成14年)4月に開店 売場面積約8,462m(可児サンショッピングセンター全体では13,853m)
美濃店(美濃市 下長之瀬、1981年(昭和56年)9月開店 - 2002年(平成14年)閉店) 店舗面積約1,139m。 閉店後に地場スーパーマーケット「食品館mino」が入るものの2010年代初めに閉店。建物は取り壊され、跡地は葬儀会社駐車場となった。