モディボ・ケイタ
独立後、ケイタはアフリカ諸国連合に加盟し、ソビエト連邦や中華人民共和国と関係強化し、アフリカ社会主義を唱え、伝統的な農村共同体を基盤とした近代社会を築こうとしたが、セネガルとの断交と貿易禁止による輸出ルートの途絶や行政の未成熟、無理な国有化による生産の停滞などによって経済は混乱し、計画は失敗した。セネガルとの断交は1963年に両国が国交を回復するまで続き、以後もマリとセネガルの貿易量は回復せず、セネガルのダカール港に貿易の80%近くを依存していたマリ経済は混乱を続けた。またスーダン連合による一党独裁により、国内でも不満が蓄積していった。
1968年11月19日、国軍のムーサ・トラオレ大尉がクーデター(英語版)を起こし、ケイタ政権は崩壊した。ケイタは捕らえられ、サハラ砂漠の中にあるキダルの刑務所へと送られた。以後10年近くの獄中生活を送り、1977年5月16日に獄中にて死亡した。