道南いさりび鉄道
連絡運輸区間は原則として函館駅 - 五稜郭駅間のみとし、定期券のみ五稜郭駅 - 森駅間も対象としている。
JR北海道函館本線との乗継割引の導入が検討され、以下の通りの設定となった(運賃はいずれも大人運賃による。金額は2019年10月1日現在)。
普通運賃については、道南いさりび鉄道線各駅(五稜郭駅を除く)と函館駅との間で乗継割引を設定。函館駅と七重浜 - 上磯の各駅の間を利用する場合は、五稜郭駅と七重浜 - 上磯の各駅の間の道南いさりび鉄道線運賃に120円を加算する。函館駅と茂辺地 - 木古内の各駅の間を利用する場合は、五稜郭駅と茂辺地 - 木古内の各駅の間の道南いさりび鉄道線運賃に190円を加算する(函館駅 - 五稜郭駅の通常の運賃は250円)。
定期運賃については、連絡運輸を行う全区間(上述)で乗継割引を設定。
社名は沿線で見られるイカ釣り漁船の幻想的な漁火(いさりび)が由来となっており、「海や風、星といったキーワードを含んだ名称が多数寄せられ、この地域を表すワードで最も強い推薦があった『いさりび』に集約された」ことが選定理由とされている。
2015年(平成27年)3月22日には会社ロゴマークが決定し、正式発表された。コンセプトは「海沿いを走る列車の車窓に広がる、津軽海峡と函館を望む雄大な景色」をモチーフに、「青い海」と、社名のシンボルである「いさりび」を表現しており、鉄道が「ひと」をつなぎ、地域とともに力強く未来へ伸びていくという思いが込められている。
北海道における第三セクター鉄道の運行は、北海道ちほく高原鉄道ふるさと銀河線(旧国鉄池北線)が2006年(平成18年)4月に廃止されて以来10年ぶり。北海道ちほく高原鉄道が2008年(平成20年)に解散して以降、北海道における唯一の第三セクター鉄道事業者となっている。