東よか干潟
クロツラヘラサギ、ズグロカモメ、ツクシガモ等
シギ・チドリ類は春と秋に渡来するが、夏にシベリア・アラスカ方面、冬にオーストラリア方面で過ごしそれぞれ渡来する際の、東アジア周辺の中継地の1つになっている。環境省の「モニタリングサイト1000 シギ・チドリ類調査」において2007年度から2011年度の5年間で平均約7,000羽、2014年春期に11,665羽、2015年春季に12,127羽の渡来が確認されており、国内最多となっている。なお古い調査では、1979年春季に2千羽台、1980年春季と1981年春季に4千羽台、1982年春季に2千羽弱を記録している。
種別では、ダイゼン、ハマシギ、ダイシャクシギ、シロチドリ 、メダイチドリ、アオアシシギ、ソリハシシギ、キアシシギの国内屈指の渡来地、ズグロカモメやツクシガモの主要な越冬地となっている。特にズグロカモメは、東アジア地域の推定個体群総数の1%を超える750羽程度(2007年度から2011年度平均)が確認される重要な渡来地とされる。
中でも、クロツラヘラサギ(絶滅危惧IB類)、ズグロカモメ(同II類)、ツクシガモ(同II類)は環境省レッドリスト「絶滅危惧」掲載種。他に同リスト掲載のカラフトアオアシシギ(同IA類)、ヘラシギ(同IA類)、ホウロクシギ(同II類)などが確認されている。
有明海海底の地層は最上位から順に、有明粘土層(粘性土、完新世)、島原海湾層(砂質土、後期更新世)、阿蘇溶結凝灰岩の砂質土、その下は砂質土や粘性土の互層となる。「ガタ」「ヘドロ」などと呼ばれる有明海の干潟の泥は有明粘土層に相当し、粒子が細かくて柔らかく土質は軟弱という特徴を持つ。その厚さは平均15 - 20m、最深で30m程とみられる。
潮流は湾の奥(北)に行くほど遅く湾奥では1.5ノット程度となる。また前記のように大きな潮汐に伴い、河川からの土砂と粘土(浮泥)は、引き潮の時には沖合まで運ばれ、満ち潮の時には海岸まで戻る。有明海では満ち潮の時に反時計回りの大きな潮流があるので、大供給源である筑後川河口付近で浮泥の堆積が最も多く、そこから海岸を反時計回りに回るに従い堆積が少なく、また泥粒子は微細になっていく。ある調査によれば干潟の年間成長量(上昇量)は東与賀町地先で4.5cmといい、干潟は堆積を続けている。これにより、堤防内側の水田面より海岸の干潟のほうが標高が高くなる現象も生じている。