RNA結合タンパク質
mRNAの局在化は、タンパク質産生の空間的な調節を可能にする、遺伝子発現の重要な調節機構である。mRNAが局在化することで、細胞の特定の部位でタンパク質への翻訳が行われることとなる。このことは初期発生に特に重要であり、さまざまなmRNAが局在化した卵や初期胚で迅速な細胞分裂が起こることでさまざまな組み合わせのmRNAを含む細胞が生じ、その後それらの細胞は異なる運命をたどることとなる。RNA結合タンパク質はmRNAを局在化し、目的の領域でのみタンパク質への翻訳が行われるよう保証している。そのようなタンパク質の1つがZBP1(英語版)である。ZBP1は転写部位でβ-アクチン(英語版)のmRNAに結合し、mRNAとともに細胞質へ移動する。いくつかの非対称細胞種では、ZBP1はこのmRNAをラメリポディア(英語版)へ局在させ、そこで翻訳が行われる。FMRPはRNA局在に関与する他のRNA結合タンパク質である。FMRPはRNAの代謝に関する機能に加えて、特定のmRNAを刺激誘導的に神経細胞の樹状突起へ局在させる過程に関与している。
核内のRNAはRNAポリメラーゼによって合成され、RNA転写産物はRNA結合タンパク質によって即座に覆われる。これらのRNA結合タンパク質は、RNAの生合成、成熟、細胞内局在や安定性といった、RNAの代謝と機能のあらゆる側面を調節する。RNA結合タンパク質は異なるRNA配列に異なる親和性で結合し、その標的配列や機能と同様に多様である。RNA結合タンパク質の結合標的には、タンパク質をコードするmRNAや多数の機能性ノンコーディングRNAが含まれる。ノンコーディングRNAは、裸のRNAとしてではなく、ほぼ常にリボヌクレオタンパク質複合体として機能する。そうしたノンコーディングRNAには、miRNA、siRNA、snRNAなどがある。