PixelJunk
ステージによって姿形が違う。中には特定の攻撃を無効にするボスもいるので注意が必要である。
また、一部モンスターの中には色が付いているものがいる。そのモンスターは特定の攻撃を無効にするので注意が必要である。
黒の相棒の車に近づくと両方の車の速度が速くなる(近づくほど上昇)のを使い、5周をできるだけ早く完走することを競う。
順路にそってステージを攻略するモード。難易度はカジュアル、レギュラー(スコアアタック対象難易度)、エキスパートの3段階だが、進行度は全て同じのためカジュアルで全ステージクリア後、レギュラーでスコアアタックをしたり、エキスパートに挑戦することも可能。
ステージは道に沿って進むが、途中分かれ道があり、中には一定の条件を満たすことで解放される場所もある。
全10の特別ステージ(アンコール購入後は14ステージ)に挑むモード。ストーリーモードで獲得した能力も引き継がれる。(一部特定のステージをクリアしていないと獲得不可能、ないし獲得困難なステージもあり。)
各ステージには条件が設定されており、その条件を満たした上でクリアするとトロフィー獲得となる。条件を満たしてもクリア出来なかった場合は失敗となるので注意する必要がある。
DELUXEで追加されたモード
空を飛ぶ敵にレーザーを発射する。レーザーは画面端まで届く。威力、範囲ともに申し分なく対空最強とだけあって後半の対空対策の中心になる。
全車最高速度の状態で走り、白のアザーカーを全て抜くことを目指す。プレイヤーは最後尾からスタートする。10周回った時点での順位を競う(全て抜けば1位、1台抜かし残しがある度に1ランクずつ下がる)。ゴーストアタックでは10周のタイムを競う。