専用鉄道
青森県
青森県公用臨港線 - 東北本線青森駅より分岐(1980年代廃止)
在日米軍三沢飛行場専用線 - 東北本線三沢駅より分岐(2006年頃休止、その後廃止)
岩手県
日本専売公社盛岡工場専用線 - 山田線上盛岡駅より分岐
宮城県
丸昭工業専用線 - 東北本線岩沼駅より分岐(2007年度廃止)
秋田県
小坂製錬専用線 - 小坂線小坂駅より分岐(1983年12月廃止)
秋田製錬飯島製錬所専用線 - 秋田臨海鉄道秋田北港駅より分岐(2008年3月15日廃止)
東北肥料秋田工場専用線 - 羽越本線羽後牛島駅より分岐(1994年3月廃止)
十條製紙秋田工場専用線 - 羽越本線新屋駅より分岐(1986年11月1日廃止)
日本製紙事業本部秋田工場専用線 - 秋田臨海鉄道向浜駅より分岐(2021年3月13日廃止)
山形県
花王酒田工場専用線 - 羽越本線酒田港駅より分岐
三菱鉱業油戸炭鉱専用線 - 羽越本線羽前大山駅より分岐(1957年廃止)
ラサ工業五十川鉱業所専用線 - 羽越本線五十川駅より分岐
福島県
昭和電工東長原工場専用線 - 磐越西線東長原駅より分岐
住友大阪セメント田村工場専用線 - 磐越東線大越駅より分岐(2000年3月廃止)
三菱製紙白河工場専用線 - 東北本線新白河駅より分岐(1994年頃廃止)
保土谷化学工業郡山工場専用線 - 東北本線郡山駅より分岐(2001年9月廃止)
日東紡績富久山事業センター専用線 - 東北本線郡山駅より分岐(1980年代廃止)
呉羽化学工業錦工場専用線 - 常磐線勿来駅より分岐(2003年3月廃止)
日鉄鉱業東鹿越鉱業所専用線 - 根室本線東鹿越駅より分岐(1997年3月廃止)
ホクレン中斜里製糖工場専用線 - 釧網本線中斜里駅より分岐(1997年3月廃止)
日本製紙旭川工場専用線 - 宗谷本線新旭川駅より分岐(1997年10月廃止)
国策パルプ工業勇払工場専用線 - 日高本線勇払駅より分岐(1982年11月15日廃止)
帯広市産業開発公社専用線 - 根室本線帯広貨物駅より分岐(2012年6月廃止) 日本甜菜製糖芽室製糖所専用線 - 上記公社線より分岐)(2012年5月廃止)
日本製紙白老工場専用線 - 室蘭本線萩野駅より分岐(2008年3月15日廃止)
室蘭開発専用線 - 室蘭本線陣屋町駅より分岐
JX日鉱日石エネルギー室蘭製造所専用線 - 室蘭本線本輪西駅より分岐(2014年5月廃止)
苫小牧市営公共臨港線 - 室蘭本線苫小牧駅より分岐(1991年3月廃止)
日本オイルターミナル旭川営業所専用線 - 宗谷本線北旭川駅より分岐(2012年5月廃止)
東洋レーヨン名古屋事業所第1工場専用線 - 名古屋鉄道築港線名電築港駅より分岐(書類上は東名古屋港駅より分岐)
東洋レーヨン名古屋事業所第2工場専用線 - 名古屋鉄道名電築港駅より分岐(上記と同様の扱い)
日本車輌製造大江製作所専用線 - 名古屋鉄道築港線東名古屋港駅より分岐
三菱倉庫大江倉庫専用線 - 名古屋鉄道築港線東名古屋港駅より分岐
大協石油名古屋油槽所専用線 - 名古屋鉄道築港線東名古屋港駅より分岐
農林省大江食糧倉庫専用線 - 名古屋鉄道築港線東名古屋港駅より分岐
中部電力名古屋火力発電所専用線 - 名古屋鉄道築港線東名古屋港駅より分岐
東洋レーヨン岡崎工場専用線 - 名古屋鉄道名古屋本線矢作橋駅より分岐
愛知製鋼知多工場専用線 - 名古屋鉄道常滑線聚楽園駅より分岐 (1983年廃止)
愛知紡績安城工場専用線 - 名古屋鉄道名古屋本線今村駅(現・新安城駅)より分岐 (1966年廃止)
トヨタ自動車工業元町工場専用線 - 名古屋鉄道三河線土橋駅より分岐 (1984年廃止)
航空自衛隊小牧基地専用線 - 名古屋鉄道小牧線豊山駅(貨物駅)より分岐
三興製紙祖父江工場専用線 - 名古屋鉄道尾西線森上駅より分岐(1978年廃止)
三重県
三菱ガス化学四日市工場専用線 - 関西本線南四日市駅より分岐
JSR四日市工場専用線 - 関西本線南四日市駅より分岐
紀州製紙紀州工場専用線 - 紀勢本線鵜殿駅より分岐(2013年3月16日休止・2016年3月31日廃止)
国見山石灰鉱業専用線
石原産業四日市工場専用鉄道 - 関西本線塩浜駅より分岐
三菱化学四日市事業所専用線 - 関西本線塩浜駅より分岐
ダイヘン三重事業所専用線 - 紀勢本線多気駅より分岐