IBM PC DOS
0がアセンブリ言語で4,000行だったのに対して、2.0は20,000行になっている。2.0は1983年3月に正式発表された。1984年3月、IBM PCjrが登場。PCjrの持つROMカートリッジと若干差異のあったディスクコントローラに対応したPC DOS 2.1が動作した。
1984年8月、インテルの80286プロセッサを搭載したIBM PC/ATが登場。より大きなハードディスクドライブと高密度のフロッピーディスク (1.2MB) に対応したPC DOS 3.0が動作した。
1985年8月、IBMとマイクロソフトは新たに一からオペレーティングシステムを共同で開発する契約を結んだ。当初Advanced DOS()と呼ばれていたが、1987年4月2日、OS/2がその共同開発の最初の成果として発表された。同時にIBMは次世代のパーソナルコンピュータ IBM Personal System/2 をリリースした。1988年7月に出荷された4.0はIBM主導で開発され、名称はIBM DOS 4.0となり、DOSシェルが標準となった。
なおデジタルリサーチはDR DOS 5.0をリリースし、マイクロソフトに対抗しようとした。それに対してマイクロソフトはまだ存在しない5.0を発表し、急ピッチで開発を進めて対抗した。IBM DOS 5.0およびMS-DOS 5.0はIBMとマイクロソフトがコード全体を共有した最後のDOSであり、OS/2 2.0にも組み込まれ、後にWindows NTの仮想DOSマシンのベースとなった。
IBMとマイクロソフトのOS共同開発契約の期限切れ後は、両者はOS開発では決別することになった。