グローバル距離テスト
GDTスコアは、2つの構造を重ね合わせた後、実験構造内で位置が定義された距離カットオフ内に収まるような、モデル構造におけるアミノ酸残基のα炭素原子の最大集合として計算される。独自の設計により、GDTアルゴリズムは20個のGDTスコア、すなわち20個の連続した距離カットオフ (0.5Å、1.0Å、1.5Å、...10.0Å) のそれぞれについて計算する。構造類似性評価では、いくつかのカットオフ距離からのGDTスコアを使用することを意図しており、スコアは一般的にカットオフ距離の増加に伴って増加する。この増加の変動が少ない状態( プラトー)は、実験構造と予測構造の間に極端な相違があることを示している可能性があり、妥当な距離の任意のカットオフ内に追加の原子が含まれていないことを示唆する (GDTプロットを参照)。CASPにおける従来のGDT_TSの合計スコアは、1、2、4、8Åのカットオフの平均値である。
オリジナルのGDT_TSは、Local Global Alignment (LGA)プログラムを用いて生成された重ね合わせとGDTスコアに基づいて計算される。