がんばれゴエモン2 奇天烈将軍マッギネス
前作までは町人の大半が敵キャラクター扱いとなっていたが、本作以降、町ステージにはスリや泥棒を除き敵キャラクターが配置されなくなった。前作までの癖で町人を攻撃するとBGMが一変すると共に、マップ上から町人が全て居なくなる代わりに役人が現れてゴエモン達に襲い掛かってくる。役人は通常の雑魚キャラと同様に攻撃で倒せるが見返りなどは何もなく、マップを切り替える、建物に入る、体力がなくなるまで無限に出現する。
攻撃しても役人は現れない代わりに、目を見開いて斬りかかってくる。
特定エリアの最後に存在する、巨大からくりメカ「ゴエモン・いんぱくと」を操作して挑むアクションステージ。
戦闘準備を整えるための「強制横スクロール高速アクションステージ」と巨大メカボス戦に挑む「巨大からくりメカ戦闘ステージ」の二部構成となっている。
こちらもクリア後の再戦は不可。
この内、1度クリアした道中ステージと出口から出た町ステージは、アイテム「手形」を所持している時に限りポーズ中にセレクトボタンを押すことですぐにステージの外に出られるようになる。また、中間地点アイテムの「これぞうくん」取得後はミスすると取得地点からの再開となるが、ゲームオーバー時にコンティニューを選んだ場合のみ、効果が持続する(取得後にセーブした場合はこれぞうくんの効果は取得したステージをクリアするまで記録される)。
十字キーで攻撃を当てたい位置に照準を移動させ、各種ボタンを使い分けることで敵の攻撃をうまく防ぎつつダメージを与えていく。 小判ビーム(A) 鼻から小判弾を打ち出す。弾数は有限だが連射が効く。敵の放つ弾を破壊すると1発に突き5両が補充される。 強パンチ(B) 威力が高く敵の突進攻撃をカウンターで弾き返すことが可能だが、出が遅く隙も大きい。 弱パンチ(Y) 威力は弱いが出が速く、連打が効く。突進攻撃は防げない。 キセルボム(X) 相手がどこにいても着弾地点に強制的に引き寄せて大ダメージを与える強力な爆弾をキセルから打ち出す。強力な攻撃だが戦闘中の補充は効かない。 左右ガード(L、R) 左右からの攻撃をガードする。突進攻撃などの一部の強力な攻撃はガードしてもエネルギーを消費する。
エリア1のインパクト戦ボス。マーブル・レッドが開発した力士型巨大からくりメカ。インパクトのこばんビームを張り手で跳ね返すことがある。エネルギーが少なくなると頭部が壊れるが、それでも構わず攻撃を繰り出して来る。主な攻撃方向が張り手なのは、開発者のマーブル・レッドが相撲ファンの割に大した技を知らないため。
後の『がんばれゴエモン〜大江戸大回転〜』に登場する巨大メカ「千秋楽R」は、本機の強化型に当たる。