長岡車両センター
DD14形ディーゼル機関車
ロータリー式除雪車で、2020年4月1日時点で1両(327)が配置されていた。2017年稼働実績なし
327号機は、2020年9月7日に秋田総合車両センターに配給輸送され、同年9月9日付で廃車となった。
DD51形ディーゼル機関車
磐越西線の客車列車や貨物列車の牽引に使用された。
DE15形ディーゼル機関車
2020年4月1日時点で1両(1538)が配置されていた。ラッセル式除雪車であるが貨車などを牽引することもあった。2017年稼働実績なし
2019年12月25日、1537号機が秋田総合車両センターに配給輸送され、同年12月27日付で廃車となった。
2020年10月2日、1538号機が譲渡のため、秋田港駅に配給輸送され、同年10月4日付で廃車となった。
115系電車
かつては弥彦線用Y編成(2両編成×3本)以外は当センターに配置していたが、1999年に上沼垂運転区(現在の新潟車両センター)に転籍した。
クモニ143形・クモユニ143形電車
国鉄時代に行われていた上越線や信越本線の荷物輸送で、115系と併結して運行された。
チキ5200形貨車
2020年4月1日時点で4両が配置されていた。レール輸送用長物車。
2020年8月20日から21日にかけて秋田総合車両センターへ廃車の為配給輸送され、同年8月22日付で4両とも廃車となった。