鴨大神御子神主玉神社
現在は別雷命、大田々根子命、主玉神の三座を祭神とするが、歴史的には諸説ある。
賀茂大明神
常陸二十八社考は、「相伝此社、祭賀茂大明神」とし、賀茂大明神を祀るとする社伝を記載している。
水府志料に、「水戸の神應寺もこの社をうつせしなり云々」とあり、神應寺及びその鎮守社であった別雷皇大神(水戸市元山町)の本宮とする伝承が記されている。ただし、神應寺の縁起及び別雷皇大神の社伝とは相反する。
大田々根子命
神社覈録は、「鎮座に、在中郡庄鴨毛辺村、今賀茂村也、所祭大田々根子命と云り」とし、大田々根子命を祀るとする社伝を記載している。
常陸二十八社考は、賀茂大明神を祀るとする社伝を踏まえつつ、崇神紀の記事から、「御子神主」が大田々根子命であることは疑うべきでないとしている。崇神紀に、大物主大神の神託に基づき、大物主大神と活玉依毘賣の子と称する大田々根子命(意富多多泥古命)を大神神社(意富美和之大神)を神主としたところ、疫病が止んだという記事がある。また、古事記に大田々根子命は神君(みわのきみ)、鴨君(かものきみ)の祖と記されている。
郡郷考は、常陸二十八考に補足して「近地に太田村あるは此社の由にや太田は新編鎌倉志明徳2年(1391年)足利基氏の文書に見ゆ今犬田に改む」とし、「太田々根子命」の「太田」が加茂部村の西方にある太田村(現在の桜川市犬田)に転じたのではないかとしている。
大田々根子命、別雷命
特選神名牒は、「社伝に祭神大田田根子命別雷命と云る」とし、大田々根子命と別雷命の二柱を祀るとする社伝を記載している。
御自覚祭(おめざめさい)(1月1日)
建国記念祭(2月11日)
祇園祭(7月24日 - 26日)
例大祭(11月14日・15日)
新嘗祭(11月23日)
冬至祭(12月22日頃)
御寝祭(おやすみさい)及び初開扉(12月31日)
1985年(昭和60年)頃までは1月16日まで初開扉を行わず、1月17日に御自覚祭を行っていた。
古くは1月17日、4月中酉日、7月28日、9月19日、10月10日に祭礼を行い、11月19日に例祭を行っていた(特選神名牒、新編常陸国誌、明治神社誌料)。