ヨハネス8世パレオロゴス
バーゼル公会議(1431年)に使節を派遣して下交渉を続けていたヨハネスは、自ら代表団を結成・引率して次のフェラーラ・フィレンツェ公会議(1438年-1439年)に乗り込んだ。
この教会会議には皇帝ヨハネスの他、コンスタンディヌーポリ総主教ヨセフ2世、皇弟ディミトリオス専制公、高名な学者であったゲオルギオス・ゲミストス・プリソン、ゲオルギオス・スコラリオス、後にカトリック枢機卿となったヨハンネス・ベッサリオンらが加わっていた。会議では教義上、儀礼及び教会慣行上の諸問題が長々と論じられた後、曖昧な十字軍の約束を取り付けて漸く東西教会の合同が成立した。
しかし、3年間もの不在の後、帰国(1440年2月)後に待っていたのは非難の嵐と幻滅であった。代表団に加わっていた高名な府主教マルコス・エウゲニコスは決議への署名自体を拒否して帰国の途に就き、署名には同意したスコラリオスも帰国後すぐにこれを撤回し、多くのものがこれに倣った。
更には同行していた皇子ディミトリオスは会議の途上ヴェネツィアに引き揚げていたが、帰国後間もなく、首都に於ける反対派の支持を背景に、東西キリスト教徒の同盟に懸念を抱くムラト2世の軍事的支援も取り付けてコンスタンティノポリスを包囲する挙に出た(1442年)。これはモレアスから長駆救援に駆けつけたコンスタンティノス専制公の働きでどうにか撤兵と和平に持ち込んだものの、合同反対派の皇帝政府への反感は拭いようもなかった。
ヨハネス8世は三度結婚したが、いずれに於いても子供は生まれなかった。
アンナ・パレオロギナ(Άννα Παλαιολογίνα, ローマ字転写: Anna Palaiologina, 1403年 - 1417年8月) - 幼名アンナ・ヴァシリエーヴナ(Анна Василиевна, ローマ字転写: Anna Vasil'evna)、モスクワ大公ヴァシーリー1世ディミトリエーヴィチの娘、ドミトリイ・ドンスコイの孫娘。生年に関しては諸説あり。1414年に結婚。1416年 - 1417年にかけてコンスタンティノポリス一帯を襲ったペストにより死去し、リプス修道院に葬られた。
ソフィア(Σοφία, ローマ字転写: Sophia di Monferrato, 生年不詳 - 1434年8月21日) - モンフェラート侯テオドーロ2世パレオロゴの娘。1421年1月19日に結婚。ヨハネス・ソフィアの結婚式は共治帝の戴冠式とを併せて行われ、壮大な祭礼になったと記されている。しかし歴史家ドゥカスによると、彼女は容貌がすぐれなかった為、ヨハネス8世はこれを愛さず、父マヌエル2世の死後早々に離婚してしまったという。