植物の種
日本語ではイヌハッカと呼ばれる植物のこと)といったように単語を複数繋げた長い名前で呼ばれていた。『植物の種』では、このような煩雑な名前を、1語の属名と1語の種小名からなる命名に変更し、上記の2例はそれぞれPlantago mediaとNepeta catariaとなった。二名法の使用は、もともと牛が食べる植物についての学生プロジェクトにおいて、略語として考案されたものであった。
リンネは、種小名の後にそれぞれの種の短い説明とシノニムを与えた。その記述は丁寧かつ簡潔で、小さな属では少ない単語で構成された。例えばカンゾウ属では3種(それぞれGlycyrrhiza echinata、Glycyrrhiza glabra、Glycyrrhiza hirsuta)が「leguminibus echinatis」「leguminibus glabris」「leguminibus hirsutis」として記述されていた。