イェフエカウケラトプス
2016年の分岐分析で、イェフエカウケラトプスはアヴァケラトプス、ナストケラトプスと共にセントロサウルス亜科の基盤的位置に属するナストケラトプス族に位置付けられた。確かにイェフエカウケラトプスとアヴァケラトプスは多くの特徴を共有している。以下に分析結果から導かれた系統樹を示す。
イェフエカウケラトプスの鱗状骨の独特の粗い突起は、以前アリゾナのフォートクリッテンデン累層から発見された NMMNH P-25052 (クリッテンデンケラトプス)とニューメキシコ州のメネフィー累層の頭骨(NMMNH P-34906)のセントロサウルス亜科(メネフィーケラトプス)の間でのみ見られる。 しかしこれらの標本は100万年以上の時間の経過によりバラバラに分離されているので、それらが同じ属に属しているかどうかはわからず、可能性としては低い。さらに「ニップル・ビュート・スカル」Nipple Bute skull と呼ばれる標本 UMNH VP16704 は、この特異な突起がない一方で扇形の後頭骨を有し、イェフエカウケラトプスおよびNMMNH P-25052に類似している 。