地方隊
1956年(昭和31年)3月5日と5月29日に2隻が就役した。地方隊では両艦とも呉地方隊に所属し、1977年(昭和52年)3月15日に最後の同型艦が除籍された。
人事部を管理部に改称。第1~第4幕僚班を幕僚室に改称し、第5幕僚室を新設。補給監理官、技術監理官、衛生監理官、監察官を新設。 10月1日:舞鶴及び大湊地方総監部に幕僚長を設置。
1974年(昭和49年)4月11日:横須賀地方隊隷下に音楽隊を新編。
1976年(昭和51年)5月11日:呉、佐世保、舞鶴、大湊地方隊に音楽隊を新編。
1987年(昭和62年)7月1日:各地方隊隷下の警備隊を改編し、基地業務隊を新編。
1998年(平成10年)12月8日:補給整備部門の組織改編。
造修所と補給所を統合し造修補給所に改編。
水雷整備所と誘導弾整備所が統合され弾薬整備補給所に改編。
木更津航空補給所、鹿屋、八戸、下総航空工作所を廃止。
総監部の技術管理官と補給管理官を廃止し、技術補給管理官を設置。
2002年(平成14年)3月22日:各地方隊隷下の通信隊がシステム通信隊に改編されシステム通信隊群隷下に編成替え。
2006年(平成18年)4月3日:最後の連絡所(警備隊の指揮・監督を受け、警備・補給等の連絡、救難業務の支援を担当する。)である徳山連絡所が閉鎖された。
2007年(平成19年)3月28日:衛生監理官を管理部衛生監理官に改組。
2017年(平成29年)4月1日:横須賀及び佐世保地方総監部の政策補佐官を参事官に改組。
2022年(令和4年)3月17日:自衛隊病院(大湊・舞鶴・佐世保)廃止に伴い、衛生隊を改編。部隊長の職名を司令に改称するとともに、大湊・舞鶴・佐世保衛生隊に診療部(診療所)を新設。