清露国境紛争
1657年、サルフダは吉林で40隻以上の船を建造させた。1658年には、漢人造船者によりロシア軍の船に対抗できうる軍艦が建造され、清の水軍に利用された。サルフダは、再び朝鮮から援軍を出させ、 申瀏(英語版)率いる朝鮮軍を連れてアムールへ向かい、ステパノフ率いる少数の艦隊と戦闘した。この水上戦は7月10日に、松花江河口から数キロ離れた場所で行われた。ロシア軍は11隻を失い、生存者は残る1隻に乗って逃げ出した。ステパノフと220人ほどのコサックが戦死し、朝鮮兵も8名戦死、25名が負傷した。
ステパノフを破った清軍は、アムール川下流へも兵を出し、ロシア軍を破り、嫩江や牡丹江に強制移住させていた先住民族のオルチャ(ウリチ)やギリヤーク人を貢納民に加えた。こうしてアムール川沿岸からロシア人はいなくなり、清の勢力が広がった。
1655年、ツァーリ・アレクセイ・ミハイロヴィチ(在位1645年-1676年)治下のロシアは、二人の使節を清に送った。1669年に、ピョートル・ヤルィジキンとセイトクル・アブリンが北京入りし、貢使として扱われた。この使節によって、清側も「羅刹」がロシア人であると認知するようになった。 ロシアの大使は清側の近臣にツァーリ・アレクセイの勅書を手渡した。勅書は康熙帝(在位 1662年-1723年)に対し、ツァーリに服属するよう要求していた。清の官吏らは、康熙帝へ伝える際に、トラブルを恐れて、ロシアから清への服属要求を「友好願い」に書き換えた。 即位して間もない康熙帝は、使者のアブリンらを宴に招き、厚遇した。 清露間で貿易関係が結ばれる可能性が出てきたいっぽう、アムール川沿岸での紛争が再び問題になった。
清側はガンチムールの返還を強く要求した。 1669年、康熙帝はアブリンに口頭で、ガンチムールはじめ貢納民170名を引き渡すよう伝えた。ついで清は、使者4名をネルチンスク長官に送った。清の使者たちが持たされた勅書では、ロシアに対し、正式なロシア使節の派遣と、ガンチムールの返還を命じていた。文書はモスクワまで届けられた。ヤクーツクのロシア人たちには、満州語とモンゴル語で書かれた勅書を正確に理解するのは難しかったが、大意は通じていた。モスクワ政府は、ヤクーツクから康熙帝の勅書を届けた使者や、北京からモスクワに戻った使者らから、貢納民の返還要求を聞いたはずであったが、対策は取らなかった。
1638年、ロシア人は先住民から「チルコル川」近隣で、銀が採れるという噂を聞いた。コサックのイヴァン・モスクヴィチンが隊長となり、偵察に向かった。彼らはロシア人としてはじめてオホーツク海に到達した。「チルコル川」は、アムール河であった。だが、モスクヴィチンらがアムール河に到達したかどうかは不明である。
トムスク長官シチェルバトフは「チルコル川」遠征のためにふたたびイヴァン・モスクヴィチンを派遣しようとしたが、ヤクーツク長官ゴロヴィンが、先手を打ってコサックのヴァシリー・ポヤルコフ以下132名を送りだした。
1643年、ポヤルコフらはヤクーツクを出発、翌年にはアムール河を下ってウスリー河口に到達した。地元先住民との紛争や、食糧不足による飢餓で多数が死亡した。1646年にヤクーツクに生還したのは25名である。 この探検により、ヤクーツク長官は、アムール河河口付近のギリヤーク人(ニブフ人)はどこにもヤサクを納めていないこと、人口が多く、毛皮獣、穀物も豊かであることなどの報告を受けた。また、「ボルボイカン」がこの地に貢納を求めているが、彼らの支配が及んでいないことも明らかになった。「ボルボイカン」はモンゴル語で清朝皇帝である。だが、1644年は清の入関の年であり、順治帝らはロシア人に関わる余裕はなかった。