細菌の翻訳
ポリペプチド鎖の伸長反応では、鎖のカルボキシル末端にアミノ酸が付加される。成長するポリペプチド鎖はリボソーム50Sサブユニットの exit tunnel を通ってリボソーム外へ出てゆく。
翻訳伸長は、fMet-tRNAi がP部位に結合してコンフォメーション変化を引き起こし、新しいアミノアシルtRNAが結合できるようA部位を開いたところで始まる。このアミノアシルtRNAの結合は、GTPアーゼである翻訳伸長因子EF-Tuによって行われる。正しいtRNAを速く正確に認識するため、リボソームは50Sサブユニットのコンフォメーション変化を利用する (立体配座選択)。いま、コードされるタンパク質のペプチド鎖の始まりがP部位にあり、次にペプチド鎖に加えられるアミノ酸がA部位に位置している。P部位のtRNAに結合しているアミノ酸はtRNAから切り離され、A部位のtRNAに結合しているアミノ酸との間にペプチド結合が形成される。この peptide bond formation として知られる過程は、リボザイム(50Sサブユニット中の23S rRNA)によって触媒される。いまA部位には新しく形成されたペプチドがあり、P部位にはアミノ酸が付加されていないtRNAがある。A部位のtRNAに新しく形成されたペプチドはジペプチド (dipeptide) として知られ、tRNAも含めた全体ではジペプチジルtRNA (dipeptidyl-tRNA) と呼ばれる。P部位のアミノ酸がないtRNAは デアシル化(脱アシル化)tRNAとして知られる。