ポリ(A)結合タンパク質
細胞質型ポリ(A)結合タンパク質(PABPC)は、4つのRNA認識モチーフ(RRM)とPABPCドメインと呼ばれるC末端領域から構成される。RRMはRNAの認識に関わる最も一般的なモチーフであり、多くの場合90–100アミノ酸からなる。NMRとX線結晶構造解析によって、RRMは2本のαヘリックスに裏打ちされた4本の逆平行βシートによって構成される球状ドメインであることが示されている。各RRMの中心部の2本のβストランドは短いリンカーで連結されて細長い凹面を形成し、ポリ(A)オリゴヌクレオチドの結合を担うと考えられている。ポリアデニル化されたRNAは伸びたコンフォメーションとなってこの凹面に沿って結合する。アデニンの認識は、2つのRRMのRNPモチーフの保存された残基との接触によって主に媒介されている。In vitroでの研究からは、ポリ(A)への結合親和性は2–7 nMのオーダーであるが、ポリ(U)、ポリ(G)、ポリ(C)に対する親和性はもっと低いか検出できないレベルである。