ミサイルコマンド
後年、アメリカやヨーロッパでは3DCG風のアップデート版『ミサイルコマンド3D(英語版)』やiPhone/iPod Touch用アプリがリリースされたほか、日本では1990年代後半にWindows向けとしてフリーソフト化されていたこともある。
『スペースタクティクス』(セガ)
『フューチャーフラッシュ』(ホーエイ→今のバンプレスト)
『LUNER CITY SOS!』(PC-8001投稿ゲーム)
『SDI』(セガ)
『サクラ大戦2 〜君、死にたもうことなかれ〜』(セガ) ミニゲームとして、トマト畑を狙って襲来するカラスをかんしゃく玉で撃墜する、ミサイルコマンドクローンが収録されている。
『ゲームセンターあらし』 すがやみつるの漫画。主人公が本当の核戦争を本ゲームを用いて防ぐエピソードが存在する。
『ターミネーター2』(1991年公開映画)のワンシーンに、ゲームセンターで主人公のジョン・コナーが本作をプレイしているシーンがある。
『CHUCK/チャック』(原題:Chuck)アメリカ合衆国のテレビドラマ シーズン2エピソード5
『アリス・ギア・アイギス』 2019年エイプリルフール限定ミニゲーム「CITY DEFENDER」という類似ゲームとして登場していた時期があった。