瑞梅寺川
事業費予算の上限撤廃及び都市基盤河川改修事業の取り入れのため、1997年(平成9年)から1998年(平成10年)にかけて支流の水崎川及び下の谷川が準用河川から二級河川へ昇格、2001年(平成13年)には周船寺川の中下流部が同じく二級河川へ昇格となった。2003年(平成15年)3月及び2005年(平成17年)11月に河川整備基本方針・河川整備計画を策定し、本流・周船寺川・水崎川・下の谷川の4河川を築堤・河床掘削等の河川工事の対象とした。瑞梅寺川は川原川合流地点より下流4.3km区間が対象となり、澪筋確保や植生回復等を図りつつ、概ね10年に1回発生する規模の降雨による洪水に対応する計画である。工事は下流部にあたる昭代橋付近より若宮橋までの2,330mにつき先行して進められている。また流域の高田地区は糸島市内の浸水対策重点地区の一つとして、河川改修事業に合わせる形で2016年(平成28年)度より2024年度までの予定で雨水幹線の水路改修が進められている。
一方、瑞梅寺ダムの有効貯水量は2,270,000m3で、福岡市が15,000m3/日・糸島市(前原市)が7,000m3/日の水利権を有するが、十分な貯水量を有しているとは言えず、ダム竣工翌年の1978年(昭和53年)5月には記録的な少雨が重なり夜間断水を開始するに至った。