有村産業
2008年6月、航路維持のため旧経営陣が中心となり「琉球フェリー」を設立し、45億円の資金を調達してフェリー1隻を競売で買い取り就航させる計画が明らかになった が、資金調達ができず宙に浮いた形となっている。このほか、琉球海運による救済合併をはじめ、いくつかの航路再建案が示された が、いずれも実現することはなく、所有していた全ての船舶が売却されて再開の道は断たれた。
有村産業の破綻で沖縄本島と台湾との旅客航路が途絶えたが、フェリー航路の開設は現在も実現していない。2014年10月7日には台湾の華岡グループが花蓮と石垣島を結ぶ貨客船の運航を計画している事を発表している。2023年6月、石垣市長の中山義隆は、同市と台湾の基隆市を結ぶ定期航路の開設を検討する委員会を設置すると発表した。7月から月1回程度の会議を開催し、早ければ年内に報告書を取りまとめる予定。
南州丸 1953年就航、1957年売船、300総トン。那覇 - 宮古 - 石垣航路に就航。
八汐丸 1958年9月就航、1975年6月売船、680総トン。那覇 - 宮古 - 石垣航路に就航。