プエルト・マルドナド
1901年、ペルー政府は国内の熱帯雨林探検のための委員会を設置した。ドン・フアン・ビジャルタ率いる探検隊は、サンディアからタンボパタ川沿いをさかのぼっていった。一隊は1902年7月10日、タンボパタ川とマドレ・デ・ディオス川の合流点に到達した。ビジャルタはそこを、1861年にマドレ・デ・ディオス川を探索し、マモレ川の急流で命を落としたタラポト出身のファウスティノ・マルドナドにちなみ、プエルト・マルドナドと命名した。
1912年12月26日にマードレ・デ・ディオス県が設置されるとその県都となり、1985年に市制施行された。