ドノバン・マクナブ
司令塔を失ったチームは14-3で敗れ去り3年連続でスーパーボウル出場をあと1歩で逃すこととなった。こうしてスーパーボウルへあと一歩のところで3年連続チームは敗れたが同一先発QBが3年連続カンファレンスチャンピオンシップゲームで敗れたのは1980年から1982年までダラス・カウボーイズのダニー・ホワイトが敗れて以来のことであった。カンファレンスチャンピオンシップゲーム3試合での彼のQBレイティングは50.5とリーグ最低の成績に終わったQBのシーズン成績より低いものであり大舞台に弱いQBとレッテルが貼られた。一方彼を擁護する意見としてワイドレシーバーの人材がいないという意見もあった。
2004年シーズン、パス成功率64%、31TDパス(ランでも3TDをあげた)、わずか8インターセプトの成績を残した。QBレイティングは104.7でNFL史上初めて30TDパス以上を投げインターセプト一桁で終えたQBとなった。この成績の影にはテレル・オーウェンスの加入があり彼は14TDレシーブをあげた。チーム史上初めて開幕から7連勝を果たし、歴代3位タイとなる残り5試合を残した時点で地区優勝を決めた。地区2位に7ゲーム差、レギュラーシーズンが16試合制になってからフランチャイズ史上最高の13勝3敗でシーズンを終えた。足首の負傷でエースレシーバーのオーウェンスを欠いたものの、プレーオフではミネソタ・バイキングスを27-14、アトランタ・ファルコンズを27-10で破り第15回スーパーボウル以来24年ぶりとなる2度目のスーパーボウルにチームを導き、アフリカ系アメリカ人QBとしては第22回スーパーボウルでのダグ・ウィリアムズ、第34回スーパーボウルのスティーブ・マクネアに次いで史上3人目の出場となった。
イーグルスのQBが300ヤード以上をマークしたのは1997年のボビー・ホイング以来のことであった。11月26日のワシントン・レッドスキンズ戦ではパス成功率90.7%及びQBとしては1972年にシカゴ・ベアーズのボビー・ダグラスが127ヤード走った記録以来となる125ヤードをランで獲得した。12月10日のクリーブランド・ブラウンズ戦では自己ベストの390ヤードを獲得した。彼はチームを4年ぶりのプレーオフに導き、タンパベイ・バッカニアーズを21-3で破ったが、翌週ニューヨーク・ジャイアンツに敗れてシーズンを終えた。AP通信が選ぶMVP投票でセントルイス・ラムズのRBマーシャル・フォークに次いで2位の票を獲得した。この年カート・ワーナーが負傷のため辞退したプロボウルに初出場を果たした。またQBとしてはNFLトップの642ヤードを走り(QB記録としては1972年のボビー・ダグラスの968ヤード、1990年のランドール・カニンガムの942ヤード、1997年のスティーブ・マクネアの674ヤードに次ぐ当時歴代4位、その後マイケル・ヴィックが3度これより上回る成績を残している。)6TDラン(イーグルスのQBとしては1988年のカニンガム以来の記録)をあげた。シーズン通して560回のパス試投330回のパス成功記録を残したがこれは1988年にカニンガムが作った記録を12年ぶりに塗り替えた。CBSラジオの年間最優秀選手、NFL on FOXのテリー賞、オール・マッデンチーム(ジョン・マッデンが選ぶオールスター)に選ばれた。