ベニー・ムルダニ
カトリックとしてのムルダニのバックグラウンドが前面に出たのは、1984年、第5地域軍管区(ジャヤ師団)司令官トリ・ストリスノとともに、ジャカルタのタンジュンプリオク港に集まったイスラーム系の抗議集団に対する鎮圧を命じた時だった。これによって死者が出た。抗議行動に参加した人々は扇動されており、平和的な統制は失われていた、その結果、鎮圧を命じたのである、とムルダニは釈明した。ムルダニは彼自身決してムスリムを迫害したいのではないのだ、ジャワ中のムスリム学校を訪問して、彼自身のムスリム観を改善していくつもりだ、と主張した。
この時期のムルダニは、国軍司令官として、国内政治においてもインドネシア社会においても、スハルトに次ぐ事実上のナンバー2であることに間違いはなかった。スハルトを除いて、もっとも権力のある人物となっていた。
ムルダニの外交官としての経歴はマラリ事件発生によって突然終った。事件発生から1週間内にムルダニはジャカルタへ戻った。すぐにスハルト大統領はムルダニに数々の地位を与えて、多くの権限を持たせた。ムルダニは、国防治安大臣の情報担当補佐官、治安秩序回復作戦司令部 (Kopkamtib) 情報担当補佐官、国軍戦略情報センター (Pusat Intelijen Stratesis, 略称 Pusintelstrat) 長官、国家情報調整庁 (Badan Koordinasi Inteligen Negara, 略称 Bakin) 副長官に就任した。
1975年、ムルダニは東ティモールの脱植民地化問題に深く関与することになった。1975年8月、東ティモール潜入を開始するため、ムルダニはボランティアを偽装して、インドネシア兵を送り始めた。ムルダニの任務は東ティモール内のインドネシア統合派を支援するための情報工作だったが、1975年11月28日に東ティモール独立革命戦線 (Fretilin) が東ティモールの独立を宣言したことによって、状況は緊迫した。それまでの情報工作は停止され、軍事作戦 (Operation Seroja) 開始に切り替えられた。ムルダニは情報戦ではなく、その後は軍事介入作戦の立案者として東ティモールへの関与を続けることになった。彼の手法は同僚の怒りを買った。