ヴィルシーナ
優駿牝馬の後は、北海道に移動して夏休みを過ごした。8月10日に帰厩し、秋は秋華賞が目標に、2着で足踏みして届いていないGIタイトル奪取を目指した。春に二度立ち塞がったジェンティルドンナもまた、牝馬三冠を懸けて秋華賞を目指していた。そのためヴィルシーナは、自身の三度目の正直成就と、最終戦での偉業阻止に挑む機会に恵まれることとなった。9月16日、トライアル競走であるローズステークス(GII)で始動となる。ジェンティルドンナもまたローズステークスで始動しており、前哨戦からの連続対決が実現した。10頭立てとなる中、人気は三度目の対決の2頭に集中しジェンティルドンナが単勝オッズ1.5倍、ヴィルシーナが3.8倍という信頼だった。
スタートからジェンティルドンナに後れを取った。ジェンティルドンナが先行して逃げ馬の背後2番手を追走する一方、ヴィルシーナは、ジェンティルドンナの背後4番手でマークする形だった。スローペースを追走した後、直線の末脚でビハインドを取り戻そうと試みた。しかしジェンティルドンナの末脚が勝り、反対に突き放されていた。独走を許して1馬身半差及ばず、ジェンティルドンナに次ぐ再三の2着となった。
続いて本番である牝馬三冠最終戦、10月14日の秋華賞(GI)に参戦する。夏の間に出世した上がり馬や、古馬相手のクイーンステークスを優勝したアイムユアーズなどが出走していたが、注目は、春のワンツーであるジェンティルドンナとヴィルシーナの四度目の対決だった。ただし同格では扱われず、牝馬三冠が懸かるジェンティルドンナが、単勝オッズ1.3倍という抜けた1番人気となる。直接対決で3戦全敗のヴィルシーナは6.1倍、大きく突き放された2番人気だった。
外から来るであろう脅威ジェンティルドンナと併せ馬の形を取り、直接負かそうと画策していた。その通りジェンティルドンナは、中団外から末脚を使って追い込み、ヴィルシーナの真横まで迫り来ていた。ヴィルシーナは抵抗して2頭横並びに持ち込んで、共にチェリーメデューサを追いかけて、残り30メートルで差し切った。それから始まった2頭による先頭争いでは、ヴィルシーナは、これまでのようにジェンティルドンナに突き放されず、抵抗した。一度はジェンティルドンナに先を譲る形となったが盛り返し、横並びの状態で決勝線に到達していた。2頭の優劣は、目視では判別できないほどの小差であり、写真判定に委ねられた。このとき佐々木は、既に勝利を確信しており、妻の榎本も確信して泣いてまでいたという。
しかし、写真判定によりジェンティルドンナのハナ差先着が判明する。最終戦でジェンティルドンナを最も追い詰めていたが、約7センチメートルという微差でまたもジェンティルドンナに敵わなかった。これにより史上初めてとなる牝馬三冠競走ですべて2着を果たしたと同時に、ジェンティルドンナに史上4頭目となる牝馬三冠を許した。総合して史上初めてとなる牝馬三冠競走すべてで同じワンツーフィニッシュとなっていた。内田は「相手を負かすにはあれしかなかった。(中略)あそこまでジェンティルを追い詰めたのはえらい。同時にあらためて相手の強さを思い知らされた。」と回顧している。この時点でジェンティルドンナは、牡馬牝馬問わず中央競馬史上10頭目の三冠馬となったが、1986年に牝馬三冠を達成したメジロラモーヌの半馬身を上回る最も薄氷の勝利による達成だった。翻ってヴィルシーナは、三冠阻止に最も接近しながら叶わなかった。