根生院
創建は寛永13年(1636年)、三代将軍徳川家光公が、その乳母、春日局の発願により、大和の国(奈良県)長谷寺小池坊より栄誉(1674年没)を招き開山とし、神田白壁町に堂宇を建立し、薬師瑠璃光如来像を本尊とし、号を「金剛寶山延壽寺根生院」と称したのが、その歴史の始まりである。
正保2年(1645年)、第二世栄専の時、下谷二長町に移り、江戸城西の丸祈願所として寺領250石を賜った。貞享4年7月(1687年)新義真言宗江戸四ヶ寺の一ヶ寺となった。同年8月、仁和寺御堂光明院の院室を兼務して院家となり、歴代の住職は幕府の命によって選ばれる寺となった。
この四ヶ役寺は、始めは関東以北の新義真言宗三千ヶ寺の触頭であったが、この頃、新義真言宗が幕府より信を受け、やがて全国の新義真言宗寺院をその支配下におき、一時は地域的に担任区域を定め、また、一時は一年間を四季に分け四ヶ寺の当番月を定めその任に当たった。
元禄元年(1688年)、本郷湯島切通し(文京区)の知足院跡に移転した。
元禄3年8月(1690年)、幕府の命によって江戸城に観音経を講じ、将軍綱吉公より寺領百石を加増された。