ナルコス:メキシコ編
フェリクスの逮捕後、フェリクスの予想通りに各カルテルはバラバラの行動をとりメキシコ麻薬戦争は激化する。NAFTAが影響を与え始める。
国境越しにテキサス州のエルパソと接するチワワ州のフアレスでは、アマドが逮捕されるも3か月後に釈放される。服役中に娘アナを失う。フアレス・カルテル内のライバルの指導者アギラルを殺す。パブロ・エスコバルが殺されてコロンビアのメデジン・カルテルが壊滅した機会をとらえ、パチョを通じメデジン・カルテルのライバルであるカリ・カルテルと同盟する。
フアレスの警官ビクトルは行方不明の少女テレサを探す。ウォルトはエルパソの支局に勤務し、フアレス・カルテルへの潜入捜査をはかるも失敗する。妻が仕事を得たシカゴへの異動を申し出ながら、アマドの情報を得るためにビクトルに接近する。テレサの遺体が発見され、ビクトルは遺体に残ったDNAの検査と引き換えにアマド逮捕を狙うDEAに協力する。
しかしNAFTA加盟後の経済危機のためにビクトルは人員整理の対象となり、アマドの弟ビセンテの店の用心棒となりながらテレサ殺人犯を探して射殺するも、女性の連続殺人は止まらない。そんな中でビクトルはDEAへの内通が露見して殺される。
国境越しにカリフォルニア州のサンディエゴに接するバハ・カリフォルニア州のティフアナでは、新聞「ラ・ボス(声)」の若手記者のアンドレアがティフアナ・カルテルを取材し、アレジャノ兄弟と与党「PRI」の政治家ハンク・ゴンザレスとの密接な関係を知る。
アマドに命じてカリ・カルテルの大量のコカインを中古のボーイング727を使いアメリカに空輸する。ウォルトはアマドの飛行機に追跡装置をつけるが、囮に騙されてチームのほとんどはカルテルに殺され、ウォルトは閑職に左遷される。
フェリクスの密告により、1987年にロサンゼルスでカリ・カルテルの大量の麻薬と金が押収されたため、輸送費を払えなくなったカリ・カルテルはフェリクスにアメリカでの販売権を分け与える。フェリクスはパルマを赦す代わりにその妻子を殺して見せしめとし、マリアは再びフェリクスから去る。
フェリクスは各プラサを集めて会合を開くが、フェリクスに反発したアルジャーノ・フェリクス兄弟のティフアナ・カルテル、エル・チャポのシナロア・カルテル、そしてアマドのフアレス・カルテルはすべて連合から抜ける。フアレス・カルテルはカリ・カルテルのアメリカへの麻薬輸送を請け負う。またティフアナ・カルテルはイサベラをティフアナから追い出す。
1988年に、裏ではカルテルと密接な関係を保ちつつ、汚職追放を推し進めることを公約し、さらに選挙管理委員会の不正行為に助けられたカルロス・サリナス・デ・ゴルタリが大統領となった。メキシコは、アメリカのビル・クリントン大統領が中心となったNAFTAへの加盟を望む。
これにより「目に見える浄化」を求めたメキシコ政府からも見切られたフェリクスは、1989年4月にカルデローニに逮捕される。現場に復帰したウォルトに刑務所で会ったフェリクスは、「プラサ」崩壊に伴うカルテル間の抗争によるメキシコ麻薬戦争の激化を予想する。