沖縄丸
佐世保帰還後、1月19日に船体を白く塗り直すなどの復旧工事が行われた。その後、開戦2日前の2月6日に、「沖縄丸」は再び「明石」に護衛されて木浦に進出、湾内の玉島に陸上電信所を設置した。対馬=馬山浦間の通信線も、2月6日から10日の工事で開通した。
開戦後は船体を再び黒く塗り替え、見張り台や無線通信機を設置するなどの軍用船としての改装を適宜受けながら使用された。海底ケーブルの敷設任務としては、佐世保から遼東半島まで、日本軍占領下の黄海沿岸の拠点を結ぶ電信線を敷設した。旅順要塞付近で軍艦による護衛を受けながらの危険な工事も含まれた。海底ケーブルの陸上通信所への揚陸がうまくいかず、「沖縄丸」自身を停泊させて端末とし、通信業務を行うこともあった。また、バルチック艦隊の来航に備えて、対馬海峡周辺の海軍望楼などを結ぶ海底電信線の敷設も行った。これにより構築された濃密な警戒網は、日本海海戦における日本海軍の勝利にも貢献した。
新たな海底ケーブルの敷設だけでなく、旅順=芝罘間にあったロシア所有の海底電信用ケーブルを回収する作業も行っている。
日露戦争が日本の勝利に終わると、戦時中の功績を称えるため、「沖縄丸」の船尾には日本海軍軍艦の艦首と同様に菊花紋章の飾りが取り付けられた。また、1905年の東京湾凱旋観艦式にも海軍艦船以外で唯一参加を認められた。
船齢40年を越えた「沖縄丸」の船体は老朽化が進み、機関も劣化して整備費用がかさむようになってきた。搭載している敷設装置も旧式化し、新型で重い搬送式鉛被紙ケーブルの運用が困難だった。そこで、代替船として「東洋丸」の新造が決まり、1938年(昭和13年)7月、竣工した「東洋丸」と交代する形で「沖縄丸」は廃船とされた。「沖縄丸」が退役までに敷設した海底ケーブルの総延長距離は6800海里(約12594km)にもおよび、これは日本が当時保有する海底ケーブル全体の6割を占める値であった。
逓信省を廃船となった「沖縄丸」は保管も検討されたが、最終的に解体船扱いでの売却が決定された。払い下げになった「沖縄丸」は、広南汽船により取得された。大阪の名村造船所で貨物船に改装され、1939年(昭和14年)10月に工事完了した。「沖縄丸」の総トン数は頻繁に変更されており、最終時の総トン数は2,256トンに変わっている。
「沖縄丸」は太平洋戦争後半の1944年(昭和19年)3月28日に日本海軍に徴傭された。「沖縄丸」は一般徴傭の雑用船であった。しばらくは国内輸送に使用された後、4月28日に松輸送の東松7号船団に参加して、5月6日にサイパン島へ到着した。さらに別の船団に加わってグアム島経由、ヤップ島に向かう途中、5月10日午前4時40分に北緯11度13分・東経143度44分付近の海上でアメリカ海軍潜水艦「シルバーサイズ」の雷撃を受け、沈没した。なお、船団の僚船「長安丸」および「第18御影丸」もともに撃沈された。