エミール・ゲルディ
博物館で働いた学者には植物学者のジャック・ユーベル(Jacques Huber)、動物学者のエミーリエ・スネトラーゲ(Emilie Snethlage)、地質学者のフリードリヒ・カツァー(Friedrich Katzer)、Alexander Karl von Kraatz-Koschla や昆虫学者のアドルフォ・デュッケ(Adolpho Ducke)などがいる。
1902年に博物館はゲルディの功績を称えて、Museu Paraense Emílio Goeldi(エミリオ・ゴエルジ・パラー博物館)と改名された。1905年に健康上の理由で職を辞し、スイスに帰国するとベルンで没した。エミリオ・ゴエルジ・パラー博物館の館長はヒューバーやスネトラーゲ、デュッケによって引き継がれた。
多くのブラジルの動植物にゲルディの名前が献名されている。例えば、ゲルディモンキー(Calloimico goeldii (Thomas, 1904) やアリドリ科の Goeldi's antbird Myrmeciza goeldii(和名、ブラジルアリドリ)がある。