国際原生生物学会
また国外の学会を傘下組織とする制度があり、1962年に傘下となったイギリスを始めとして、世界各国の国内学会が参加している。しかしこのような方針は、たとえば日本の原生動物学者からは当初反発を持って迎えられている。また国際原生動物学会議(International Congress of Protozoology)の運営のため国際生物科学連合(英語版)に置かれた国際原生動物学委員会(International Commision on Protozoology)においては、SOPがアメリカ合衆国を代表することとなっており、国内学会と国際学会の性格を併せ持った組織となった。
2005年にInternational Society of Protistologists (ISOP)に改称した。また2007年には、それまでEast Coast sectionと呼ばれていた地域部会を、北アメリカ大陸全体を対象とするNorth American sectionに改称し、これによって国内学会と国際学会の性格を分離した。