ミクトカリス目
体は細長く円筒形。体長は1 - 3ミリメートル、最大3.5ミリメートル。
小さな背甲が頭部と、胸部の第1または第2体節までを覆うとされるが、背甲を持たず代わりに頭楯が頭部と第1胸節を覆うとみなされることもある。視覚機能は持たないが、ミクトカリス科には眼柄がある(ヒルスチア科では眼柄もない)。鰓はない。
第1胸肢(胸部第1節の付属肢)は顎脚となり外肢を欠くが、残り7対の胸肢は二叉型で、遊泳に用いられる(最後の1対は二叉型でないとされることもある)。また第2胸肢も顎脚になることもある。腹肢は単肢型で、基本的に5対あるが、退化傾向にある。尾肢は二叉型で、内肢・外肢ともによく発達する。
フクロエビ上目に共通する特徴として、成熟した雌は胸肢に抱卵のための覆卵葉を持つ。覆卵葉は、ミクトカリス科では第2 - 6胸肢の底節から生じ刺毛はないが、ヒルスチア科では第3 - 7胸肢の底節に生じて刺毛を持つ。通常、フクロエビ類の覆卵葉は成熟個体にしか生じないが、ヒルスチア科の一種では未成熟個体が覆卵葉を持つことが知られ、これは呼吸に機能すると推定されている。