薬師寺 (曖昧さ回避)
薬師寺 (各務原市) - 岐阜県各務原市にある法相宗の寺院、奈良市の薬師寺の別院
薬師寺 (岐阜市) - 岐阜県岐阜市にある寺院
薬師寺 (岐阜県垂井町) - 岐阜県不破郡垂井町にある曹洞宗の寺院
薬師寺 (名古屋市) - 愛知県名古屋市にある曹洞宗の寺院
薬師寺 (豊橋市牛川薬師町) - 愛知県豊橋市牛川薬師町にある天台宗の寺院
薬師寺 (豊橋市北島町) - 愛知県豊橋市北島町にある曹洞宗の寺院
一畑山薬師寺 - 愛知県岡崎市にある臨済宗妙心寺派の寺院
薬師寺 (犬山市) - 愛知県犬山市にある真言宗豊山派の寺院
薬師寺 (小牧市) - 愛知県小牧市北外山にある曹洞宗の寺院
薬師寺 (小牧市下末) - 愛知県小牧市下末にある臨済宗妙心寺派の寺院
薬師寺 (小牧市文津) - 愛知県小牧市文津にある曹洞宗の寺院
薬師寺 (清須市) - 愛知県清須市にある高野山真言宗の寺院
薬師寺 (北名古屋市) - 愛知県北名古屋市にある浄土宗の寺院
薬師寺 (弥富市) - 愛知県弥富市にある曹洞宗の寺院