阿母河等処行尚書省
ホラーサーンに到着しイランの統治を始めたチン・テムルらであったが、当時のイランの治安はかなり悪化しており、チョルマグンが設置したダルガチをジャラールッディーン・メングベルディーの配下の武将カラチャとヤガン・ソンコルが殺害するという事件が生じていた。これを聞いたオゴデイはインド方面に派遣していたタンマチの長官のダイル・バートルにイラン方面に移動するよう命じた。しかし、チン・テムルはダイルの到着以前に独力でカラチャらを討伐し、また部下のクル・ボラトをオゴデイの下に派遣してホラーサーン州の実情と自らの立場を主張させることとした。この時、チン・テムルはホラーサーン、マーザンダラン一帯の有力者も同行させたため、クル・ボラトを迎えたオゴデイは大いに喜んで「チョルマグンは出征以来、多くの国々を打従えたが,、未だ一人の国王も我等のもとに送ってこない。チン・テムルはその領域も狭く、資源も少いのに、このような忠勤を励んだ。彼を称讃する。ホラーサーンとマーザンダラーンの長官職を彼の名前で確認する。チョルマグン及び他の長官たちは干渉の手を引くように」と述べたという。 ここにおいて、初めてカラコルム中央政府の承認の下モンゴルのイラン統治期間(=イラン総督府)が成立したといえる。
チン・テムルの死後、オゴデイの命によって第2代イラン総督に任じられたノサルであったが、当時相当の高齢であったノサルが統治に携わることはほとんどなく、同じくジョチ家から出向してきたクルクズがイラン統治を取り仕切るようになった。ノサルが総督に就任した頃、マリク・バハーウッディーンが訴訟のためにカラコルムのオゴデイの下を訪れていたが、イランに戻るにあたってクルクズのカラコルム召還命令を携えてきた。ノサルとクル・ボラトはクルクズの召還を喜ばなかったものの最終的には同意し、クルクズはマリク・バハーウッディーンらホラーサーンの有力者たちとともにカラコルムのオゴデイの下を訪れた。
カラコルムでは財務官僚ダーニシュマンド・ハージブがクルクズを罷免してチン・テムルの子のエドグ・テムルをその後継者とせんと画策していたが、一方でクルクズに好意的なチンカイが「ホラーサーンの有力者たちはクルクズを望んでいる」とオゴデイに助言していた。そこでオゴデイは再びクルクズをイランに派遣して人口調査を行わせ、 その仕事ぶりを見極めるた上で処遇を決める、と命令した。この勅令を受けたクルクズは急ぎイランに帰国するとオゴデイの仮の任命書をたてにノサル、クル・ボラトから実権を奪ってイラン経営に取り組んだ。この頃のクルクズの業績は 『世界征服者史』に「民の間に正義と公正を広げた.
しかし、帰路のアルマリクにてアルグンがチャガタイ・ウルス君主イェス・モンケと面会している時、今度はモンケが新たなカーンとして選ばれ、即位式が行われるとの情報がもたらされた。そこでアルグンは再びカラコルムに向かい、1252年5月2日に新皇帝モンケに面会したアルグンは改めてイラン総督の地位を承認された。また、イラン統治の現況確認と同時にヤラワチがトランスオクシアナで実施したコプチュル税をイランでも導入することも決められた。
また、アルグンのイラン総督任命について、『元史』は「阿児渾(アルグン)を以て阿母河等処行尚書省事に充て、法合魯丁(ファフルッディーン)・匿只馬丁(ナジュムッディーン)に之を佐しむ」と表現しているが、これをモンケ即位年(1251年)のこととするのは誤りで、アルグンのイラン総督就任は1252年のことである。なお、「行尚書省」という名称はモンゴルの行政機関を漢人官僚が一方的に名付けたものに過ぎず、中華王朝伝統の官僚機構とは全く関係が無い。
アルグンは1年以上カラコルムに滞在した後、1253年8月にイランに向って出発した。イランに到着したアルグンはモンケより得た勅令をたてに官僚から誓紙を提出させ、コプチュル税の導入準備を始めた。その後、1255年にはフレグ率いる西アジア遠征軍をキシュで迎えて共にアム河を渡り、これ以後イラン総督府はフレグの統制下に入ることとなった。しかし、1260年にモンケが急死し、カーンの地位を巡ってクビライとアリクブケの間で帝位継承戦争が勃発すると、フレグはイランの地で自立することを選んだ(フレグ・ウルスの建国)。フレグの統制下に入った時点で実質的には解散されたも同然のイラン総督府は、東方の燕京等処行尚書省が大元ウルスに吸収されたように、これ以後完全にフレグ・ウルスに吸収・併合されることとなった。