鶴岡市立加茂水族館
秋田県男鹿水族館(現・男鹿水族館GAO)および新潟市立新潟水族館(現・新潟市水族館 マリンピア日本海)といった大型水族館が国道7号沿道かつ羽越本線沿線でどちらも鶴岡市から約150kmの隣県に開館した1967年(昭和42年)、市の意向で、湯野浜温泉一帯の観光開発を目的とする第三セクターの株式会社庄内観光公社に売却され「庄内浜加茂水族館」となった。翌年度には入館者数が過去最高の「21万7372人」となった。
しかし、庄内観光公社の湯野浜温泉地区にある他施設の経営失敗により、水族館の利益は他施設の赤字穴埋めに使われ、当館は1971年(昭和46年)末を以って閉鎖、従業員も全員解雇された。自主的に残った元従業員4人が自らの住居を担保にしたり、生命保険を解約したりするなど金策をして、水族館の生き物の餌代などを捻出しては世話をしていた。その窮状が『荘内日報』で伝えられると市民からの寄付も受けるようになり、翌1972年(昭和47年)3月には経営問題が未解決のまま再開館した。
同年6月には地元出身者が経営する佐藤商事(東京都)が負債1億4000万円を含めて経営を引き継いだ。それでも経営は上向かず、1976年(昭和51年)10月29日の酒田大火の日には強風と高波により当館は大きな被害を受け、さらに日本経済が安定成長期に入ったため入館者数は長期低落傾向を示した。
『クラゲ 世にも美しい浮遊生活』(PHP新書 2014年)
5月 - クラゲ展示室の名称を募集し、「クラネタリウム」と命名。命名者は、鶴岡市立黄金小学校2年生の児童。
2002年(平成14年) 4月1日 - 市が買い戻し、財団法人鶴岡市開発公社が管理業務を行うことになった。「鶴岡市立加茂水族館」に改称。 夏 - 人工海浜「加茂レインボービーチ」が隣接地に完成。 9月 第1回クラゲサミット開催。
2003年(平成15年)7月5日 - 国道112号加茂坂トンネル(Google マップ)が開通し、山形自動車道・鶴岡ICや鶴岡市中心部との間のアクセスが改善した。
2005年(平成17年)3月 - クラゲ展示室リニューアル。アメリカ合衆国・モントレー水族館(17種)を抜き、クラゲ展示種類数世界一となった(21種)。
2006年(平成18年) - 鶴岡市開発公社が指定管理者となった。
2007年(平成19年)9月 - 第2回クラゲサミット開催。
2008年(平成20年)5月14日 - 日本動物園水族館協会より「オキクラゲ、その他クラゲの累代繁殖」を授賞理由に第22回「古賀賞」を受賞。
2010年(平成22年) 3月27日 - 入館者数が1968年度の「21万7372人」を突破し、21万7373人目の入館者には榎本政規鶴岡市長と村上龍男館長から記念品が贈られた。 4月2日 - オワンクラゲで当館と縁がある2008年ノーベル化学賞受賞者の下村脩が初めて来館し、一日名誉館長を務めた。
2011年(平成23年) 3月10日 - 当館が監修したiPhone/iPod touch向けアプリケーション「癒しのクラネタリウム」が発売開始。 3月11日 - 東北地方太平洋沖地震(東日本大震災)が発生。