シュラクサイ包囲戦 (紀元前397年)
ディオニュシオスはシケリアのカルタゴ領に直ちに兵を進めることはしなかった。おそらくは必要以上にカルタゴを刺激することを好まなかったものと思われる。紀元前405年の条約でカルタゴの支配下とされたシケリアのギリシア都市は、カルタゴの厳しい支配を受けていたため、多かれ少なかれシュラクサイには好意的であった。ソルスは反乱したため紀元前396年に略奪された。後日、ディオニュシオスが傭兵部隊の指揮官であったスパルタ人のアリストテレスを逮捕すると、10,000の傭兵が反乱した。彼らの怒りはアリストテレスが裁判のためにスパルタに送られたことでようやく沈静化し、傭兵達にはレオンティノイが与えられ自治が認められた。次にディオニュシオスは、破壊されたメッセネにイタリアとギリシア本土からドーリア人を入植させて再建し、続いて元のメッセネの住民と共にティンダリス(en、現在のパッティの一部)を建設した。紀元前394年にはタウロメニオンを包囲した。それに対抗するためにカルタゴは翌紀元前393年にマゴに陸軍を率いさせてメッセネに送り、戦争が再燃した。
ペストの蔓延は紀元前429年の「アテナイのペスト」(ただし最近の研究では天然痘または発疹チフスと考えられている)と同様に、湿地での衛生維持が不十分なことと、マラリアも原因となったと考えられる。感染で死亡した兵の数は膨大で、当初は死体はすぐに埋葬されたが、やがて埋葬が追いつかなくなり、腐敗した遺体の悪臭が漂った。感染に対する恐怖から、罹患者への治療も適切に行えなくなった。
この悲劇の原因は、ギリシアの神殿と墓を冒涜したためと考えられた。アクラガス包囲戦において、ヒミルコは同様の事態に対処するために子供と各種の動物を生贄としてささげている。しかし、ヒミルコがどのような手段を講じたとしても、ペストに対しては効果がなかった。カルタゴ軍の兵力は大幅に縮小し、戦闘可能な軍船も大幅に減った。ヒミルコとカルタゴ軍はそれでも頑固に野営地にとどまったが、カルタゴ軍の士気も戦闘力も低下した。