明治の五大監獄
1901年(明治34年) 奈良監獄、現在地への移転着工。
1907年(明治40年) 長崎県北高来郡諫早村(現・諫早市野中町)に長崎監獄が竣工。 千葉、金沢監獄が竣工。
1908年(明治41年) 4月 長崎監獄が開設。 7月 奈良監獄、現在の建物が竣工。 鹿児島監獄、鹿児島県鹿児島郡伊敷村大字永吉(現・鹿児島市永吉)に設置。
1922年(大正11年)10月 各監獄、刑務所に改称。
1946年(昭和21年)7月 奈良刑務所、奈良少年刑務所と改称。
1985年(昭和60年) 鹿児島刑務所、移転。跡地の大半が鹿児島アリーナとなり、一部は鹿児島拘置支所として残る。
1988年(昭和63年)4月 長崎刑務所、移転計画決定
1992年(平成4年) 長崎刑務所、現在地(諫早市小川町)に移転。
2008年(平成20年) 奈良少年刑務所で100周年記念矯正展開催。
2016年(平成28年) 奈良少年刑務所が廃庁。未決勾留者は同地に設置された京都拘置所の下部機関、奈良拘置支所に移管。