ルイス・クラーク探検隊
ところがジェファーソンは、ルイス率いる探検隊はミズーリ川を遡るよりセントルイスで冬を待った方がよいと考えていた。これはルイスがセントルイスで価値ある情報を入手し、且つそこにある軍の備品から必需品を引き出すことができると考えていたためだ。さらにジェファーソンはスペイン人がどれ程彼らの金銀鉱山に敏感であるか、また先方がルイスにサンタフェへ行かぬよう直接命令を発するだろうことも知っていた。そのためジェファーソンはこのルイスの判断に疑問を呈していた。しかしジェファーソンの心配むなしく、既にルイスはサンタフェへ向かうため時間を費やすよりも、春までに探検隊の出発の準備を整えるため、冬期間にセントルイスへ滞在して充分な備えを行うことで決定を下していた。
この決定が下された事実には様々な政治的理由があった。一つには、探検隊がスペインの領土外で滞在することが必須だったことが上げられる。ジェファーソンはルイスに、当時敵対していたスペインの領土には進行しないよう告げていた。より高緯度に留まることで、探検隊はスペインの領土を渡るのを避けられたのである。
この時代は1800年のサン・イルデフォンソ条約で、スペインがフランスにルイジアナを割譲する状況下に置かれていた。
ピーター・M・ウェイザー:デュボワ川で些細な問題を起こす。探検隊の終身メンバーであった。
ウィリアム・ワーナー:探検隊が出発して間もない、ミズーリ州セントチャールズでは不在だったことで罪に問われる。
アイザック・ホワイト:1804年6月12日に帰還した人物、または1805年にフォート・マンダンからの帰還隊の一員とみられる。
ジョセフ・ホワイトハウス:隊員の服の仕立て屋として活動。探検隊の物語を5か月ほど拡張した日誌をつけていた。
アレクサンダー・ハミルトン・ウィラード:蹄鉄工。ジョン・シールズの助手。見張り番をしていた際に居眠りをした罪に問われ、1804年6月12日に100回の鞭打ち刑に処された。
リチャード・ウィンザー:度々ハンターの義務を請け負った。
トゥーサン・シャルボノー:サカガウィアの夫。通訳者、時にコックを務めた。
サカガウィア:シャルボノーの妻となったインディアン娘。シャルボノーにショショーニ語をヒダーツァ語へ訳すなど、探検隊に多大な貢献をした隊員である。
ジーン・バプティスト・シャルボノー:シャルボノーとサカガウィアの息子。1805年2月11日に生まれる。彼の存在は軍隊であった探検隊という観念を一掃する一助となり、インディアンが住む土地の行く手を落ち着かせた。
ジョルジュ・ドロイヤール:インディアンの「指言葉(手話の一種)」に精通。また探検隊の中でも一番有能なハンターであった。
「シーマン」:ルイスが飼っていた黒いニューファンドランド犬。
メリウェザー・ルイス大尉:トーマス・ジェファーソン大統領個人秘書、ルイス・クラーク探検隊隊長
ウィリアム・クラーク大尉:探検隊大尉・指揮官、議会の正式な承認では砲兵隊少尉。
ヨーク:クラークの黒人使用人。旅の労苦を供にしたが、報酬は無かった。
チャールズ・フロイド軍曹:探検隊第四級指揮官。探検早期に逝去。悔しくも、探検隊の旅路で唯一死亡した人物である。
パトリック・ガス軍曹:主任大工。フロイドの死後軍曹へ昇格。
ジョン・オードウェイ:食糧供給、監視任務、探検記録責任者。
ナサニエル・ヘイル・プライヤー:第一分隊リーダー。ジョン・コリンズとヒュー・ホールの軍法会議で議長を務める。
リチャード・ウォーフィントン伍長:1805年にセントルイスへ帰還した隊を指揮。
ジョン・ボーリー:キャンプ・デュボワで懲戒、帰還隊に任命される。
ウィリアム・E・ブラットン:ハンター、蹄鉄工として参加。
ジョン・コリンズ:規律上常習的に問題を起こす。護衛に配られたウィスキーを盗み軍法会議にかけられる。
ジョン・コルター:ブラックフット族に捕まるも脱走に成功。後にイエローストーン川水源を発見したことで有名になる。
ピエール・クルザット:隻眼のフランス人。バイオリン奏者、ボート船頭。
ジョン・ダーム
ジョセフ・フィールド:熟練した狩人。ルーベンとは兄弟の間柄。
ルーベン・フィールド:熟練した狩人。ジョセフとは兄弟の間柄。
ロバート・フレイザー:日記を書くも出版されず。