ケベック協定
ケベック協定は必ずしも忠実に運用されたわけではない。1944年にイギリスがフランスとの間で原子炉・核開発分野における秘密協定を結んだ時が、この協定における最大の危機であった。フランスは原子炉開発において先進的であったため、その技術と引き換えに核関連情報を得るべくイギリスと秘密協定を結んだ。この秘密協定によって、フランス大学が有する原子炉に関連する多数の特許をイギリスに無償で提供する代わりにマンハッタン計画によって得られた核関連の情報がフランスに渡ることになっていた。これがアメリカの知るところとなると米国政府はイギリスに対してケベック協定の内容、具体的には、協定国の同意なく第三者に情報を提供することを禁止する条項に反すると強く反対した。ケベック協定に違反することでマンハッタン計画から排除されることを恐れたイギリスのチャーチルは、結局アメリカの要求を受け入れてフランスとの協定を破棄する政治判断を下した。
ケベック協定によってイギリスは戦後も引き続きマンハッタン計画に参加し続け核兵器開発に関する情報を蓄積したが、結局はアメリカの核兵器研究から締め出されたことから、再び独自の核兵器開発計画へと舵を切り、ケベック協定はその役割を終えた。
マクマーン法(英語版)は「秘密資料」(英: Restricted Data、RD)の管理を通じて、技術的な協力を終わらせた。1948年1月7日、ケベック協定は米国と英国、カナダの間で限定的な技術的情報の共有を定めた暫定協定に置き換えられた。