村上水軍
2015年(平成27年)3月13日、村上水軍の村上武吉が1581年(天正9年)に雑賀衆の向井弾右衛門尉に発行した海上通行証「過所船旗(かしょせんき)天正九年三月廿八日」が重要文化財に指定された。なお通行証に書かれた「上」という文字は「村上」の上ではなく、「上(たてまつる)」と読む動詞であり、神への捧げ物という語義が含意されている。
かつて本拠地であった能島を見渡せる大島 (愛媛県今治市)海岸部には今治市村上海賊ミュージアム(旧称 村上水軍博物館) が開設されている。
広島県と愛媛県には村上水軍の末裔が多く存在し、一部地域では「村上」姓ばかりが居住している。愛媛を選挙区とする政治家の村上誠一郎(18代目)、サッカー選手の村上佑介、心理学者の村上宣寛、芸能人でも村上信五、村上ショージ、村上文香などが村上水軍の末裔だという。しかし、村上水軍は3つの軍に分かれており、さらに陸上で活躍する軍に比べると戦い以外の理由(水害、事故等)で死亡する事が多く、武家には珍しく、姓が途絶える事を危惧し島の住民にも「村上」を名乗らせた。また、戦いに負けた船に乗っていた女・子供は殺害せず、妻や養子に迎えていた。実際、村上武吉は小説『村上海賊の娘』で有名な実の娘と言われている主人公・景以外にも養女がいた。そのため、実際には村上水軍のトップや参謀などの血の繋がりがあるかは資料も少ないため不明である。