マルチトロニック
その滑らかさと向上した燃費にもかかわらず、世界中の所有者から、特に2006年前後に製造された6枚プレートのクラッチパックを使用したモデルでマルチトロニックトランスミッションが電子的な誤作動と機械的問題を起こしやすいという膨大な報告が上がっている。典型的な症状はダッシュボード上の点滅するギアセレクター(PRNDSインジケーター)、加速中の抵抗と振動の両方またはいずれか一方、後退ギアを選択できなくなることなどである。アウディは5万5千キロメートルと11万5千メートルでのトランスミッションオイル(英語版)交換を推奨しているものの、推奨された期間でオイル交換してもなお起こるトランスミッション不具合の事例が存在する。
米国では、アウディ所有者が集団訴訟で勝訴し、10年以内にトランスミッションが故障した場合に新品と交換される。