デンマーク＝ノルウェーの宗教改革
ハーザースレゥ規約にはすでに各教区の監督(Superintends)を決めており、前述の逮捕劇により支配領域全域におけるルター派の監督を任命することとなった。
逮捕劇の後、クリスチャン3世はルターとヨハン・ブーゲンハーゲンと接触、彼らはクリスチャン3世勝利に祝意を示した。クリスチャン3世はザクセン選帝侯ヨハン・フリードリヒ1世に対して、フィリップ・メランヒトンないしブーゲンハーゲンをデンマークに招聘することを望んだものの、選帝侯は拒否してしまった。
クリスチャン3世はペーダー・パラディウス(デンマーク語版)、ヨルゲン・サドリン(デンマーク語版)、ハンス・タウセン、Frans Vormordsenといったルター派の神学者—彼らはすべてドイツのヴィッテンブルク大学で神学の研究をしていた—を用いて宗教改革を行った。教会法の草稿を決める第1回委員会がオーデンセで開かれその後の作業はハーザースレゥで行われた。この草稿はハーザースレゥ規約、ザクセンのUtrerrricht der Visitatoren (Visitators' lessons)、ブーゲンハーゲン著のVan menigherleie chistliken saken (Of several Christian matters)を元にしている。1537年4月、完成した草稿はルターがいるヴィッテンブルクに送られ、その後、ザクセン選帝侯はブーゲンハーゲンをデンマークに派遣した。
1534年1月、ルンド大司教がマルメーからルター派牧師を追放せよという命令に対し、ヨーアン・コックは拒絶した。マルメーはすでにルター派の布教活動の中心となっていたからである。ヨーアン・コックはマルメ城(英語版)を占拠、マルメーを統括するモーエン・ギュレンスチャーナを逮捕・拘束、他の貴族も拘束、あるいは子弟を人質に取るなどして、ルンド大司教に対抗した。5月には、コペンハーゲン、マルメー、リューベックがクリスチャン2世復位を名目に白羽の矢を立てたオルデンブルク伯クリストファがホルシュタイン公国を攻撃したことから、伯爵戦争の火蓋が切られた。オルデンブルク伯クリストファはフュン島、シェラン島といったデンマーク東部を支配下に入れた。
オルデンブルク伯クリストファの動きに対し、1534年7月、宮廷長官モーエンス・ゴイェはユラン半島の貴族、司教を招集し参事会を開催した。参事会では下級貴族に押し切られる形でクリスチャンの国王即位が決定、8月18日にはクリスチャン3世としてホーセンスで国王に即位した。
その後、スウェーデンやプロシア公領を巻き込み、戦火はユラン半島、フュン島、シェラン島、スコーネ、ハッランドにまで広がった。1536年4月6日にマルメーは降伏したものの、特権やルター派の教義を喪失することはなかった。7月29日には長期間の包囲により、市民が飢餓で苦しんだコペンハーゲンも降伏したが、マルメーと同様の措置が取られることとなり、伯爵戦争は終結した(コペンハーゲン市長のアンブロシウス・ボービナー(デンマーク語版)は自殺)。
1517年にマルティン・ルターが「95ヶ条の論題」を発表し、宗教改革が始まり、その動きは1520年代にはデンマークにも達した(勿論、デンマーク内にも人文主義者のPoul Helgesenはルターと同様に長い間、ローマ・カトリック内部からの宗教改革を試みる動きはあった)。1525年にはAntrvorskovの司教であるハンス・タウセンはヴィボーでルター派の布教を開始した。数年後には現在のデンマーク王国領域に当たるユラン半島、フュン島、シェラン島といった地域にルター派の教えが広まっていった。フレゼリク1世は即位憲章(デンマーク語版)でルター派を弾圧することを誓約したものの、息子クリスチャンがルター派布教を領内で容認していたこと並びに嫁に新教徒であるドロテア・フォン・ザクセン=ラウエンブルクを迎えていたこと、娘のドロテア(en)をルター派のプロシア公アルブレヒトに嫁がせていたこともあり、弾圧には消極的であった。そのため、1526年、フレゼリク1世はヴィボーの市民にハンス・タウセンの庇護を命令していた。また、フレゼリク1世は、クリスチャン2世復位の動きに対抗するために、1526年、諸侯会議を開催し、宗教面ではデンマーク領内における司教などの高位聖職者の任命権者が従来のローマ教皇からルンド大司教(英語版)に変更され、ローマに拠出した聖職者承認の諸費用は国防費に転換することを決定し、ローマ教皇との関係を断絶し、「国家教会体制」を構築した。
1520年代後半になると、フレゼリク1世がルター派を弾圧することに消極的な態度をとったことから、市民が修道僧を攻撃するようになった。