津田左右吉
『論語と孔子の思想』 (岩波書店、1946年、復刊1974年)
『歴史の矛盾性』(大洋出版社、1947年)
『日本上代史の研究』(岩波書店、1947年)
『ニホン人の思想的態度』(中央公論社、1948年)
『学問の本質と現代の思想』(岩波書店、1948年)
『日本古典の研究』 (岩波書店(上下)、1948-50年)
『日本の神道』(岩波書店、1949年) クレス出版〈神道研究選集第6巻〉、2014年)
『おもひだすまゝ』(岩波書店、1949年)
『必然・偶然・自由』(角川新書、1950年)
『儒教の研究』(岩波書店(全3巻)、1950-56年)
『諸民族における人間概念』 (国連出版社 1951年)
『日本の皇室』(早稲田大学出版部、1952年) 中央公論新社「中公クラシックス」、2019年。解説真辺将之
『日本文芸の研究』岩波書店、1953年)
『歴史の扱ひ方 歴史教育と歴史学』(中央公論社、1953年)
『シナ仏教の研究』(岩波書店、1957年)
『歴史学と歴史教育』(岩波書店、1959年)
『思想・文芸・日本語』(岩波書店、1961年)
1939年(昭和14年)、津田が記紀の文献学的考証を行い、記紀神話や『日本書紀』における聖徳太子関連記述についてその実在性を含めて批判的に考察した。特に問題になったのは『古事記及び日本書紀の研究』『神代史の研究』であった。この2冊は神典とされてきた記紀の文献的批判を行ったもので、津田が指摘したのは、おおよそ次の諸点である。
古事記と日本書紀の元になったのは、皇室系譜の「帝紀」と、宮廷で伝わってきた説話の集合体の「旧辞」である。
帝紀と旧辞が成立したのは、6世紀の継体天皇~欽明天皇の時期である。
帝紀の系譜は全て史実ではなく、少なくとも15代応神天皇より以前(14代仲哀天皇や13代成務天皇以前)の天皇は創作された非実在の人物である。
旧辞の大部分、特に神話の部分は、6世紀の宮廷官人が、上古より天皇が国土を治めていたことを説く為に造作されたもので、史実的な資料価値は全く無い。
このことについて、蓑田胸喜や三井甲之らが津田を「日本精神東洋文化抹殺論に帰着する悪魔的虚無主義の無比凶悪思想家」として不敬罪にあたるとして攻撃した。これを受けて政府は、1940年(昭和15年)2月10日に『古事記及び日本書紀の研究』『神代史の研究』『日本上代史研究』『上代日本の社会及思想』の4冊を発禁処分とした。同じ頃に津田は文部省の要求で早稲田大学教授も辞職させられ、3月に出版元の岩波茂雄と共に東京地方検事局の取り調べを受けた。検察側の起訴理由は以下の通りで、津田の主張を明確に表している。