エリスロマイシン
下痢、吐き気、腹痛、嘔吐などの消化器系障害がよく見られる。これらの症状はエリスロマイシンが胃酸によって分解された際に生じる、ヘミケタルと言う物質が、消化管の蠕動運動を亢進するため発生するとされる。これが発生する理由は、消化管ホルモンの1つであるモティリンの代わりに作用し、すなわち、モティリン受容体を刺激して、結果として胃の運動を促進すると判明した。
このような問題が有る事も手伝って、エリスロマイシンを第1選択薬として処方する事は、あまり無い。しかしながら、このような運動性を誘発する効果をエリスロマイシンは持つため、胃不全麻痺 (gastroparesis) を処置する際には有効であるとされる。エリスロマイシンの静脈内投与が食道胃十二指腸鏡検査の際に、胃の内容物を排出させるために用いる場合もある。
聴覚障害などのより重大な副作用は稀である。アレルギー反応は一般的ではないが、蕁麻疹やアナフィラキシーが起こる場合がある。胆汁鬱帯、スティーブンス・ジョンソン症候群、中毒性表皮壊死症なども稀に見られる。
妊娠後期に母親がエリスロマイシンを摂取すると、子供の幽門狭窄症の可能性を増加させることが示されている。