離宮八幡宮
関大明神社
妙喜庵 待庵
アサヒビール大山崎山荘美術館
大山崎町歴史資料館
大念寺
宝積寺
サントリー山崎蒸溜所
このように、江戸時代前期は「西の日光」と呼ばれるほどの壮大な社殿を構えて繁栄していたが、次第に荏胡麻油に代わって菜種油が大量に生産されるようになると市場を奪われていき、徐々に衰退していった。
当社は修理の要請を幕府に行う際、社名である「石清水八幡宮」と「源家の宗廟」という立場を強調していたが、遂に男山の石清水八幡宮と「石清水八幡宮」の社号を巡っての争いが起きて当社は敗北し、元禄10年(1697年)9月18日の裁許状で「石清水八幡宮」の名称の使用を禁止された。以降、当社は離宮八幡宮を正式の名称とした。
元治元年(1864年)に禁門の変(蛤御門の変)が勃発すると、離宮八幡宮に長州藩の屯所が置かれたり、真木保臣らが天王山に立て籠もったこともあり、会津藩や新撰組などの幕府軍の攻撃を受け、多くの商家とともに離宮八幡宮は惣門と東門を残してほとんど焼失した。
明治時代になると、神仏分離によって神宮寺が廃寺となり、当宮の境内の西側が大阪府に割譲された。その後、府社に列せられている。1876年(明治9年)、今度は国策による鉄道事業・東海道本線の建設のために境内の北側を収公され、境内はさらに縮小した。
1879年(明治12年)に大阪油商山崎講と地元の崇敬者の寄進により社殿が再建される。1929年(昭和4年)には東海道本線の複々線化の工事に合わせ、かつて拝殿が建てられていた場所に移して本殿、幣殿、拝殿を繋げる様式に改築された。
1986年(昭和61年)に製油メーカーを中心として「油祖離宮八幡宮崇敬会」が設立されている。