遊☆戯☆王 THE DARK SIDE OF DIMENSIONS
本作と連動して2016年4月11日発売の『週刊少年ジャンプ』19号、18日発売の20号にて、2号連続の読み切り漫画『TRANSCEND・GAME 遊☆戯☆王』(トランセンド・ゲーム ゆうぎおう)が掲載された。同誌への掲載は、連載が終了した04年3月以来、12年ぶりとなる。
漫画の内容は、原作の最終話となる第343話から劇場版の物語をつなぐエピソードが展開される。