福江港
九州本島からは博多港及び長崎港からフェリーが、長崎港からジェットフォイルが就航している。また、五島市に属する近隣離島との間に旅客船・フェリーが就航している。
野母商船フェリー「太古」:博多港 - 宇久平港(宇久島・佐世保市宇久町) - 小値賀港(小値賀島・小値賀町) - 青方港(中通島・新上五島町) - 若松港(若松島・新上五島町) - 奈留港(奈留島・五島市) - 福江港
五島旅客船「フェリーオーシャン」:福江港 - 奈留港 - 若松港
五島旅客船「ニューたいよう」:福江港 - 奈留港 - 土井浦港(若松島・新上五島町) - 郷の首港(中通島・新上五島町) - 若松港
九州商船フェリー「フェリー長崎」・「万葉」:長崎港 - 福江港 ※奈良尾港(中通島・新上五島町)、奈留港寄港便あり。
九州商船ジェットフォイル「ぺがさす」・「ぺがさす2」:長崎港 - 福江港 ※奈良尾港寄港便あり。
五島産業汽船「ありかわ8号」:佐世保港 - 福江港
木口汽船「フェリーひさか」・「シーガル」:福江港 - 久賀島(五島市)
木口汽船「ソレイユ」:福江港 - 椛島(五島市)
黄島海運「おうしま」:福江港 - 赤島(五島市) - 黄島(五島市)
この他、五島汽船が長崎港との間に貨物航路を運航している。