ダウンフォール作戦
一方で、司令官横山の自信に対して、「第16方面軍会戦指導構想」によれば陸、空、海にわたるアメリカ軍の強大な侵攻兵力と随時四周からの同時攻撃に対して日本軍は兵力装備面で多くの問題点を有しており、対上陸防御という受動的態勢が作戦準備を困難にしていたと指摘している。
九州方面の視察に赴いた参謀本部第1部長の真田穣一郎少将は第2総軍総司令官の畑元帥に対して「十二分な装備、海軍の戦略、そして好ましい地形を鑑みれば、敵軍の第一派を確実に海へ押しのけることが出来ると思います。しかしながら、敵軍が第二第三の上陸を試みた場合それを完全に撃退できるかはきわめて疑わしいと思います」と語り畑も「我が方に第二・第三の防衛線が欠けている以上、敵の第二波・第三波を防ぐのは難しい」と返答している。
戦力比の日本軍側の分析としては、第2総軍作戦課長だった井本熊男大佐が「九州の第16方面軍は、師団14・混成旅団8・戦車旅団3で重点は南九州。米軍は第二次輸送を含めて約14個師団で、師団数はほぼ同数であるが、日米の師団の戦力比は1対10くらいである。すなわち日本の140個師団に相当する。また、我が方の航空機は特攻機を含めて約1万機。米軍の海・空軍は絶対優勢で、その比はやはり日本の10倍くらいである。このように両軍の戦力比から観察すると、上陸後の侵攻を挫折させたり大打撃を与えることは、非常に困難ではないか。結局、我が方は決死敢闘、玉砕戦法あるのみ。それで敵にある程度の打撃を与える事ができるであろう」と戦力において連合軍が10倍以上優勢であったと証言している。
総司令官ダグラス・マッカーサー元帥
陸軍
第1軍 (司令官 コートニー・ホッジス大将)九十九里浜
九十九里浜 第24軍団(英語版) 第7歩兵師団 第27歩兵師団(英語版) 第96歩兵師団(英語版)上陸後5日以内に合流 第3海兵上陸軍団 第1海兵師団 第4海兵師団 第6海兵師団 上陸後5日以内に合流
第8軍 (司令官 ロバート・アイケルバーガー中将)相模湾
相模湾 第10軍団(英語版) 第24歩兵師団 第31歩兵師団(英語版) 第37歩兵師団(英語版) 第13軍団(英語版) 上陸後10日以内に合流 第13機甲師団(英語版) 第20機甲師団(英語版) 第14軍団(英語版) 第6歩兵師団(英語版) 第32歩兵師団 第38歩兵師団(英語版) 太平洋陸軍予備部隊 第97歩兵師団(英語版)
兵力 上陸部隊兵員 575,000名 支援要員を含めた合計 1,171,646名 車両195,000輌 航空機6,000機以上
陸軍再配備計画ではヨーロッパ戦線から部隊を移動させて、後続部隊や予備部隊を編成し、順次日本本土に投入する予定であった。
後続部隊 第1軍後続部隊 第5歩兵師団(英語版) 第44歩兵師団(英語版) 第86歩兵師団(英語版) 第8軍後続部隊 第4歩兵師団 第8歩兵師団(英語版) 第87歩兵師団(英語版) 太平洋予備部隊 第11空挺師団 第2歩兵師団 第28歩兵師団(英語版) 第35歩兵師団(英語版) 戦略予備部隊 第91歩兵師団(英語版) 第95歩兵師団(英語版) 第104歩兵師団(英語版)
兵力 ヨーロッパから直接太平洋に移動する兵力 395,900名 ヨーロッパからアメリカ本土を経由して太平洋に移動する兵力 408,200名
また上陸に成功しても、東京に至るまでには江戸川と荒川を渡河しなければならず、特に先にあたる江戸川においては空襲である程度焼失したとはいえ東京外縁の住宅地が広がっており、上陸軍は渡河しながらの市街戦を戦わねばならず、困難な事態に直面する可能性が大きいというのも、相模湾を主戦場にするという判断に繋がった。また相模湾近辺には厚木基地などの重要な軍事拠点が多数存在していることと、また交通の要衝で、日本西部からの増援の経路になる可能性が高く、日本軍の防備が最も堅固であるはずという分析もあって相模湾が重視されることとなった。
マッカーサーは「上陸部隊の直接指揮に当たり、本土での集団作戦を指導する」と明言しており、上陸作戦では最高司令官自ら部隊を直卒するつもりであった。マッカーサーに率いられる戦力は、アメリカ軍の後方支援部隊を含まない戦闘人員のみで575,000人にもなり、これはかつて行われたどんな作戦をもしのぐ兵力であった。上陸に先立っては、これも前代未聞となる180日にも及ぶ艦砲射撃と空爆が海岸の防御陣地に叩き込まれ、森林に潜む陣地は枯葉剤を散布して丸裸にしたのちに砲爆撃を加える予定であった。艦砲射撃を加える艦船は、史上最大であったオリンピック作戦の艦艇数を更に上回る規模で、空爆はこれまで日本本土爆撃を行ってきた太平洋戦略空軍(英語版)(司令官カール・スパーツ大将・カーチス・ルメイ中将)指揮下の第20空軍(司令官ネーサン・ファラガット・トワイニング少将)「B-29」1,000機以上に加えて、ドイツ本土を瓦礫の山にした第8空軍(司令官ジミー・ドーリットル少将)も「B-17 フライングフォートレス」を「B-29」に機種転換して加わり、さらに極東空軍(英語版)(司令官ジョージ・ケニー(英語版)中将)の「B-24 リベレーター」と新型機「B-32 ドミネーター」も加わる予定であった。