1564年
1月4日(永禄6年12月20日) - 細川氏綱、室町幕府最後の管領(* 1514年)
2月18日 - ミケランジェロ、イタリアルネサンス期の彫刻家、画家、建築家、詩人(* 1475年)
5月27日 - ジャン・カルヴァン、フランスの神学者(* 1509年)
7月27日 - フェルディナント1世、神聖ローマ皇帝、オーストリア大公、ボヘミア王、ハンガリー王(* 1503年)
8月30日 - ザビーナ・フォン・バイエルン、ヴュルテンベルク公ウルリヒの妃(* 1492年)
9月7日 - ジャン・ド・トゥルヌ、フランスの印刷・出版業者(* 1504年)
10月5日 - ピエール・ド・マンシクール、フランドル楽派の作曲家(* 1510年?)
10月15日 - アンドレアス・ヴェサリウス、オランダの解剖学者、医師(* 1514年)
シャルル・エチエンヌ、フランスの医学博士、作家、出版業者(* 1504年)