大都市近郊区間 (JR)
加えて東京駅 - 熱海駅間(東海道新幹線)が条文上除外されるようになったことで、前月の東京近郊区間の拡大により解釈上東京近郊区間に含まれていた小田原駅 - 熱海駅間(東海道新幹線)が、東京近郊区間から除外されることとなる。これにより、東京近郊区間縮小(東海道新幹線:小田原 - 熱海)
2004年 3月13日 - 本庄早稲田駅開業に伴い東京近郊区間縮小(東北新幹線:東京 - 宇都宮、上越新幹線:大宮 - 高崎)。これにより、東京近郊区間から新幹線区間が消滅する。 10月16日 - Suica利用エリア拡大に合わせて東京近郊区間拡大(伊東線、中央本線:大月 - 韮崎、東北本線:宇都宮 - 黒磯、常磐線:勝田 - 日立、上越線:新前橋 - 渋川、外房線:茂原 - 大原) 11月27日 - 新潟圏在来線の自動改札機導入に伴い新潟近郊区間新設 新潟近郊区間 羽越本線:新津 - 新発田、白新線、信越本線:東三条 - 新潟、越後線:吉田 - 新潟、弥彦線
2008年 3月15日 - Suica利用エリア拡大に合わせて東京近郊区間拡大(常磐線:日立 - 高萩、日光線)、新潟近郊区間拡大(磐越西線:五泉 - 新津、信越本線:長岡 - 東三条)、新線開業に伴い大阪近郊区間拡大(おおさか東線:放出 - 久宝寺)
2009年 3月14日 - Suica利用エリア拡大に合わせて東京近郊区間拡大(常磐線:高萩 - いわき、上越線:渋川 - 水上、烏山線、信越本線:高崎 - 横川、総武本線:成東 - 銚子、外房線:大原 - 安房鴨川、内房線:君津 - 安房鴨川、成田線:成田 - 松岸、鹿島線、久留里線)