標†者爲已滅絕的分類群



多孔動物門 Porifera

海綿動物門 Spongiatia 或 Spongia


* 鈣質海綿綱 Calcarea
  
* 石灰海綿亞綱 Calcinea
    
* 簍海綿目 Clathorinida
    
* 目 Murrayonida
  
* 鈣質海綿亞綱 Calcaronea
    
* 目 Baerida
    
* 白枝海綿目 Leucosolenida
    
* 網海綿目 Lithonida
    
* 樽壺目 Sycettida
    
* †目 Pharetronida

* 六放海綿綱 Hexactinellida
  
* †網針海綿目 Reticulosa
  
* 雙盤海綿亞綱 Amphidiscophora
    
* 雙盤海綿目 Amphidiscosida
  
* 六放海綿亞綱 Hexasterophora
    
* 松盾海綿目 Lyssacinosida
    
* 燈網海綿目 Lychniscosida
    
* 權杖海綿目 Sceptrulophora

* 尋常海綿綱 Demospongiae
  
* †目 Protomonaxonida
  
* 亞綱 Heteroscleromorpha
    
* 群海綿目 Agelasida
    
* 小軸海綿目 Axinelida
    
* 目 Biemnida
    
* 目 Bubarida
    
* 目 Clionaida
    
* 目 Desmacellida
    
* 簡骨海綿目 Haplosclerida
    
* 目 Merliida
    
* 繁骨海綿目 Poecilosclerida
    
* 目 Polymastiida
    
* 目 Scopalinida
    
* 目 Sphaerocladina
    
* 目 Spongillida
    
* 目 Suberitida
    
* 目 Tethyida
    
* 目 Tetractinellida
      
* 星骨海綿亞目 Astrophorina
      
* 旋星海綿亞目 Spirophorina
    
* 目 Trachycladida
  
* 亞綱 Keratosa
    
* 枝角海綿目 Dendroceratida
    
* 網角海綿目 Dictyoceratida
  
* 亞綱 Verongimorpha
    
* 目 Chonrillida
    
* 砂皮海綿目 Chondrosida
    
* 真海綿目 Verongida

* 同骨海綿綱 Homoscleromorpha
  
* 同骨海綿目 Homoscleromorhida

* †層孔蟲綱 Stromatoporoidea (有些分類系統的層孔蟲全部屬於尋常海綿綱層孔蟲亞綱)
  
* †獨體層孔蟲目 Idiostromatida
  
* †拉貝希層孔蟲目 Labechiida
  
* †冠毛層孔蟲目 Lophiostromatida
  
* †放射層孔蟲目 Actinoslromatida
  
* †網格層孔蟲目 Clathrodictyida
  
* †小層孔蟲目 Stromatoporellida
  
* †層孔蟲目 Stromatoporoida
  
* †目 Sphaeractinoidea



†古杯動物門 Archaeocyatha

Rowland, 2001:


* †目 Hetairacyathida (地位未定)

* †規則古杯綱 Regulares (Archaeocyatha)
  
* †單古杯目 Monocyathida
  
* †目 Capsulocyathida
  
* †阿雅斯古杯目 Ajacicyathida
  
* †目 Acanthinocyathida
  
* †目 Tabulacyathida

* †不規則古杯綱 Irregulares
  
* †海綠古杯目 Thalassocyathida
  
* †原古杯目 Archaeocyathida
  
* †哈薩克斯坦古杯目 Kazakhstanicyathida



†花瓣動物門 Petalonamae

葉形動物門 Frondomorpha


* †倫吉形綱 Rangeomorpha

* †厄尼艾塔形綱 Erniettomorpha

* †樹形綱 Arboreomorpha

* 地位未定
  
* †春光蟲屬 _Stromatoveris_



真後生動物亞界 Eumetazoa

下列各真後生動物均為格式起見而另起段落 (包含基礎真後生動物及兩側對稱動物)



基礎真後生動物

櫛水母動物門 Ctenophora

有櫛動物門、櫛板動物門


* 觸手綱 Tentaculata
  
* 盲體腔亞綱 Typhlocoela
    
* 球櫛水母目 Cydippida
    
* 扁櫛水母目 Platyctenida
  
* 環體腔亞綱 Cyclocoela
    
* 目 Cambojiida
    
* 美光水母目 Ganeisha
    
* 目 Cryptolobiferida
    
* 海萼水母目 Thalassocalycida
    
* 帶節水母目 Cestida
    
* 兜水母目 Lobata

* 無觸手綱 Nuda
  
* 瓜水母目 Beroida

* †硬骨綱 Scleroctenophora

†三葉動物門 Trilobozoa

三裂動物門


* †白海蟲科 Albumaresidae

* †三腕蟲科 Tribrachididae

* ?†阿納巴爾管科 Anabaritidae

* 地位未定
  
* †屬 _Gastreochrea_
  
* †哈利戴蟲屬 _Hallidaya_
  
* †屬 _Kotuites_
  
* †屬 _Lobiochrea_
  
* †屬 _Longiocrea_
  
* †擬球管螺屬 _Paragloborilus_
  
* †屬 _Rugoconites_
  
* †屬 _Tinsitheca_
  
* †屬 _Triforillonia_

扁盤動物門 Placozoa

平板動物門、板狀動物門、有板動物門


* 絲盤蟲綱 Trichoplacoidea
  
* 絲盤蟲目 Trichoplacida
    
* 絲盤蟲科 Trichoplacidae
      
* 絲盤蟲屬 _Trichoplax_
      
* 屬 _Hoilungia_

* 地位未定
  
* 屬 _Polyplacotoma_

刺胞動物門 Cnidaria

舊名腔腸動物門，又名刺絲胞動物門、刺細胞動物門。


* 珊瑚綱 Anthozoa
  
* †目 Kilbuchophyllida
  
* †目 Numidiaphyllida
  
* †異珊瑚目 Heterocorallia
  
* †目 Cothoniida
  
* †目 Tabuloconida
  
* †床板珊瑚亞綱 Tabulata
    
* †喇叭孔珊瑚目 Auloporida
    
* †日射珊瑚目 Heliolitida
    
* †蜂巢珊瑚目 Favositida
  
* 六放珊瑚亞綱 Hexaradiata
    
* 海葵目 Actiniaria
      
* 本海葵亞目 Enthemonae
      
* 非本海葵亞目 Anenthemonae
    
* 黑角珊瑚目 Antipatharia
    
* 類珊瑚目 Corallimorpharia
    
* †皺紋珊瑚目 Rugosa
      
* †柱珊瑚亞目 Columnariina
      
* †泡沫珊瑚亞目 Cystiphyllina
      
* †扭心珊瑚亞目 Streptelasmatina
    
* 石珊瑚目 Scleractinia
    
* 六放珊瑚目 Zoantharia
  
* 八放珊瑚亞綱 Octocorallia (= 軟珊瑚亞綱 Alcyonaria)
    
* 海雞冠目 Alcyonacea (= 軟珊瑚目)
      
* 海雞冠亞目 Alcyoniina
      
* 鈣軸珊瑚亞目 Calcaxonia
      
* 全軸珊瑚亞目 Holaxonia
      
* 原海雞冠亞目 Protoalcyonaria
      
* 骨軸珊瑚亞目 Scleraxonia
      
* 匍匐珊瑚亞目 Stolonifera
    
* 蒼珊瑚目 Helioporacea
    
* 海鰓目 Pennatulacea
      
* 亞目 Sessiliflorae
      
* 亞目 Subselliflorae
  
* 角海葵亞綱 Ceriantharia
    
* 角海葵目 Cerianthria
    
* 目 Penicillaria
    
* 目 Spirularia

* 水母亞門 Medusozoa
  
* 立方水母綱 Cubozoa
    
* 立方水母目 = 箱形水母目 Chirodropida
    
* 燈水母目 Carybdeida
  
* 水螅綱 Hydrozoa
    
* 軟水母亞綱 Hydroidolina
      
* 花水母目 Anthoathecata
        
* 亞目 Aplanulata
        
* 頭螅水母亞目 Capitata
        
* 絲螅水母亞目 Filifera
      
* 軟水母目 Leptothecata
      
* 管水母目 Siphonophorae
        
* 鐘泳亞目 Calycophorae
        
* 胞泳亞目 Physonectae
        
* 囊泳亞目 Cystonectae
    
* 硬水母亞綱 Trachylinae
      
* 輻射水母目 Actinulida
      
* 淡水水母目 Limnomedusae
      
* 剛水母目 Narcomedusae
      
* 硬水母目 Trachymedusae
  
* 缽水母綱 Scyphozoa
    
* †目 Byroniida
    
* 冠水母亞綱 Coronamedusae
      
* 冠水母目 Coronatae
    
* 圓盤水母亞綱 Discomedusae
      
* 旗口水母目 Semaeostomeae
      
* 根口水母目 Rhizostomeae
        
* 指環水母亞目 Daktyliophorae
        
* 輪環水母亞目 Kolpophorae
  
* 十字水母綱 Staurozoa
    
* †錐石目 Conulatae
    
* 十字水母目 Stauromedusae
  
* 胞內寄生水螅蟲綱 Polypodiozoa
    
* 胞內寄生水螅蟲目 Polypodiidea

* 黏體動物綱 Myxozoa — 非常進化的刺絲胞動物門成員，而水母是其最近緣。
  
* 粘孢子蟲亞綱 Myxosporea
    
* 雙殻目 Bivalvulida
      
* 雙極蟲亞目 Bipolarina
      
* 闊孢亞目 Eurysporina
      
* 扁孢亞目 Platysporina
    
* 多殻目 Multivalvulida
  
* 軟孢子蟲亞綱 Malacosporea



兩側對稱動物 Bilateria

異無腔動物門 Xenacoelomorpha


* 異渦蟲亞門 Xenoturbellida

* 無腔動物亞門 Acoelomorpha
  
* 無腸目 Acoela
  
* 紐皮目 Nemertodermatida

†前分節動物門 Proarticulata

盾狀動物門


* †文德形綱 Vendiamorpha

* †雙側水母綱 Dipleurozoa

* †頭水母綱 Cephalozoa

下列各兩側對稱動物均為格式起見而另起段落 (包含原口動物及後口動物)



原口動物 Protostomia

下列各原口動物均為格式起見而另起段落 (包含蛻皮動物總門及螺旋動物)



蛻皮動物總門 Ecdysozoa

下列各蛻皮動物均為格式起見而另起段落 (包含線蟲動物、有棘動物及泛節肢動物)



有棘動物 Scalidophora

動吻動物門 Kinorhyncha

棘頸動物門 Echinoderida


* 圓裂綱 Cyclorhagida
  
* 目 Echinorhagata
  
* 目 Kentrorhagata
  
* 目 Xenosomata

* 綱 Allomalorhagida

鰓曳動物門 Priapulida

曳鰓動物門、肢吻動物門


* ?†古蠕蟲綱 Palaeoscolecida

* †始曳鰓綱 Archaeopriapulida
  
* †目 Ancalagonida

* 曳鰓綱 Priapulimorpha
  
* 曳鰓目 Priapulimorphida

* 海蟲鰓蟲綱 Halicryptomorpha
  
* 目 Halicryptomorphida

* 刺冠曳鰓綱 Seticoronaria
  
* 刺冠曳鰓目 Seticoronarida



線蟲動物 Nematozoa

線蟲動物門 Nematoda

Nemata


* 色矛綱 Chromadorea
  
* 色矛亞綱 Chromadoria
    
* 薄咽目 Araeolaimida
    
* 色矛目 Chromadorida
    
* 鏈環目 Desmodorida
    
* 帶矛目 Desmocolecida
    
* 單宮目 Monhysterida
    
* 目 Plectida
    
* 小杆目 Rhabditida
    
* 圓線蟲目 Strongylida

* 刺嘴綱 Enoplea
  
* 刺嘴亞綱 Enoplia
    
* 刺嘴目 Enoplida
    
* 目 Trefusiida
    
* 三矛目 Triplonchida
  
* 矛線亞綱 Dorylaimia
    
* 矛線目 Dorylaimida
    
* 索蟲目 Mermithida
    
* 單齒目 Monochida
    
* 膨結目 Dioctophymida
    
* 毛首目 Trichocephalida
    
* 等咽目 Isolaimida
    
* 目 Muspiceida
    
* 目 Marimermithida

* 胞管腎綱 Secernentea
  
* 旋尾亞綱 Spiruria
    
* 蛔蟲目 Ascaridida
    
* 駝形目 Camallanida
    
* 蚓線目 Drilonematida
    
* 尖尾目 Oxyurida
    
* 里崗目 Rhigonematida
    
* 旋尾目 Spirurida
  
* 雙胃亞綱 Diplogasteria
    
* 雙胃目 Diplogasterida
  
* 墊刃亞綱 Tylenchia
    
* 滑刃目 Aphelenchida
    
* 墊刃目 Tylenchida

線形動物門 Nematomorpha

類線形動物門、針金動物門、鐵線蟲門 Gordiacea


* 鐵線蟲綱 Gordioidea
  
* 鐵線蟲目 Gordioidea

* 游線蟲綱 Nectonematoida
  
* 游線蟲目 Nectonematoidea



鎧甲動物門 Loricifera

有甲動物門、兜甲動物門、胴甲動物門



泛節肢動物 Panarthropoda


* 未定屬 _Incertae sedis_
  
* †西伯利亞蟲屬 _Siberion_ 以及近親
  
* †鹿角蟲屬 _Hadranax_

有爪動物門 Onychophora

爪足動物門


* 有爪綱 Onychophorida = Udeonychophora
  
* 真有爪目 Euonychophora
  
* †主有爪目 Ontonychophora

* †異蟲綱 Xenusia
  
* †始有爪目 Archonychophora
  
* †原有爪目 Protonychophora
  
* †堅有爪目 Scleronychophora
  
* †等有爪目 Paronychophora

緩步動物門 Tardigrada


* 真緩步綱 Eutardigrada
  
* 近爪目 Parachela
  
* 遠爪目 Apochela

* 異緩步綱 Heterotardigrada
  
* 趾緩步目 Arthrotardigrada
  
* 端爪目 Echiniscoidea

* 中緩步綱 Mesotardigrada
  
* 中緩步目 Thermozodia

節肢動物門 Arthropoda

節足動物門


* †恐蝦綱 Dinocaridida
  
* †放射齒目 Radiodonta

* 地位未定 _Incertae sedis_
  
* †未定屬 _Camptophyllia_
  
* †刺節蟲屬 _Acanthomeridion_
  
* †魅音蟲屬 _Thelxiope_
  
* †加拿分蟲屬 _Carnarvonia_
  
* †馬爾拉蟲綱 Marrellomorpha
    
* †澳大利亞馬爾拉蟲屬 _Austromarrella_（地位未定）
    
* †馬爾拉蟲目 Marrellida
    
* †目 Acercostraca
  
* †直蝦綱 Euthycarcinoidea
    
* †直蝦目 Euthycarcinida

* 蛛形類 Arachnomorpha
  
* †三葉形亞門 Trilobitomorpha
    
* ?†馬爾拉蟲綱 Marrellomorpha
    
* ?†艷綠蟲類 Emeraldellida
    
* ?†網面蟲類 Retifaciida
    
* †核心三葉形類 Core trilobitomorphs
      
* †赫爾梅蒂蟲科 Helmetiidae
      
* †科 Tegopeltidae
      
* ?†游盾目 Nektaspida
      
* †海怪蟲類 Xandarellida
      
* †三葉蟲綱 Trilobita
        
* ?†游盾目 Nektaspida
        
* †球接子目 Agnostida
        
* †萊得利基蟲目 Redlichiida
        
* †褶頰蟲目 Ptychopariida
        
* †櫛蟲目 Asaphida
        
* †縱棒頭蟲目 Corynexochida
        
* †鐮蟲目 Harpetida
        
* †裂肋蟲目 Lichida
        
* †齒肋蟲目 Odontopleurida
        
* †鏡眼蟲目 Phacopida
        
* †蚜頭蟲目 Proetida
  
* 未命名演化支
    
* †大附肢綱 Megacheira
      
* 地位未定 _Incertae sedis_
        
* †螳螂蟲屬 _Tanglangia_
        
* †庫特奈爪蟲科 Kootenichelidae
      
* †尖峰蟲類 Jianfengiids
        
* †尖峰蟲科 Jianfengiidae
      
* †臂蟲類 Cheiromorpha
        
* †幽鶴蟲目 Yohoiida
          
* †海口蝦屬 _Haikoucaris_
          
* †幽鶴蟲科 Yohoiidae
        
* †林喬利蟲目 Leanchoiliida
          
* †林喬利蟲科 Leanchoiliidae
          
* †阿克泰烏斯蟲科 Actaeidae
          
* †海鞭蟲科 Enaliktidae
    
* †眯眼蟲目 Strabopida
    
* †目 Limulavida
    
* †光楯目 Aglaspidida
    
* †演化支 Cheloniellida
    
* 螯肢亞門 Cheliceriformes
      
* †多須蟲科 Sanctacarididae
      
* 海蜘蛛綱 Pycnogonida
        
* 海蜘蛛目 Pantopoda
      
* 真螯肢類 Euchelicerata
        
* †雙足秘蟲屬 _Dibasterium_ （地位未定）
        
* †奧法蟲科 Offacolidae
        
* 演化支 Prosomapoda
          
* †未定屬 _Andarella_
          
* ?†未定屬 _Borchgrevinkium_
          
* †未定屬 _Camanchia_
          
* †未定屬 _Legrandella_
          
* †未定屬 _Venustulus_
          
* †溫伯格鱟屬 _Weinbergina_
          
* 劍尾目 Xiphosura
          
* 演化支 Planaterga
            
* †未定屬 _Bembicosoma_
            
* ?†未定屬 _Bunaia_
            
* †未定屬 _Pasternakevia_
            
* †科 Bunodidae
            
* †科 Pseudoniscidae
            
* 演化支 Dekatriata
              
* †鱟蟲屬 _Houia_
              
* †溫妮莎鱟屬 _Winneshiekia_
              
* †淵盾鱟目 Chasmataspidida
                
* †基埃爾鱟屬 _Kiaeria_
                
* †淵盾鱟科 Chasmataspididae
                
* †雙盾鱟科 Diploaspididae
              
* 硬器類 Sclerophorata
                
* †板足鱟目 Eurypterida
                
* 蛛形綱 Arachnida
                  
* †古怖目 Phalangiotarbida
                  
* 盲蛛目 Opiliones
                  
* 蠍目 Scorpiones
                  
* 擬蠍目 Pseudoscorpionida
                  
* 避日目 Solifugae
                  
* 鬚腳目 Palpigradi
                  
* †聯足目 Haptopoda
                  
* †角怖目 Trigonotarbida
                  
* †烏拉爾蛛目 Uraraneida
                  
* 蜘蛛目 Araneae
                  
* 無鞭目 Amblypygi
                  
* 有鞭目 Uropygi
                  
* 裂盾目 Schizomida
                  
* 節腹目 Ricinulei
                  
* 蜱蟎亞綱 Acari

* 有顎類 Mandibulata
  
* 多足亞門 Myriapoda
    
* ?†直蝦綱 Euthycarcinoidea
      
* †直蝦目 Euthycarcinida
    
* 唇足綱 Chilopoda
      
* 地蜈蚣目 Geophilomorpha
      
* 蜈蚣目 Scolopendromorpha
      
* 杯蜈蚣目 Craterostigmomorpha
      
* 石蜈蚣目 Lithobiomorpha
      
* 蚰蜒目 Scutigeromorpha
    
* 倍足綱 Diplopoda
      
* 毛尾馬陸亞綱 Penicillata
        
* 毛馬陸目 Polyxenida
      
* †節肋亞綱 Arthropleurida
        
* †節肋目 Arthropleurida
        
* †始節肋目 Eoarthropleurida
        
* †目 Microdecemplicida
      
* 唇顎亞綱 Chilognatha
        
* †帶狀線馬陸目 Zosterogrammida
        
* 五帶馬陸下綱 Pentazonia
          
* 蚌形總目 Limacomorpha
            
* 扁形馬陸目 Glomeridesmida
          
* 蟠形總目 Oniscomorpha
            
* 球馬陸目 Glomerida
            
* 圓馬陸目 Sphaerotheriida
            
* †阿米尼利斯蟲目 Amynilyspedida
        
* 蠕形馬陸下綱 Helminthomorpha
          
* †原多足總目 Archipolypoda
            
* †原馬陸目 Archidesmida
            
* †考伊馬陸目 Cowiedesmida
            
* †目 Euphoberiida
            
* †目 Palaeosomatida
          
* †近馬陸目 Pleurojulida
          
* 畸顎馬陸類 Colobognatha
            
* 平馬陸目 Platydesmida
            
* 多板馬陸目 Polyzoniida
            
* 目 Siphonocryptida
            
* 管馬陸目 Siphonophorida
          
* 真顎馬陸類 Eugnatha
            
* 馬陸總目 Juliformia
              
* 姬馬陸目 Julida
              
* 山蛩目 Spirobolida
              
* 異蛩目 Spirostreptida
              
* †食木馬陸總科 Xyloiuloidea
            
* 刺馬陸總目 Nematophora
              
* 目 Siphoniulida
              
* 美肢馬陸目 Callipodida
              
* 泡馬陸目 Chordeumatida
              
* 斯特馬陸目 Stemmiulida
            
* 總目 Merocheta
              
* 帶馬陸目 Polydesmida
    
* 少腳綱 Pauropoda
      
* 四少足目 Tetramerocerata
      
* 六少足目 Hexamerocerata
    
* 綜合綱 Symphyla
  
* 泛甲殼動物 Pancrustacea
    
* ?†袋頭綱 Thylacocephala
      
* †目 Concavicarida
      
* †目 Conchyliocarida
    
* 總綱 Oligostraca
      
* 介形綱 Ostracoda
        
* 壯肢亞綱 Myodocopa
          
* 壯肢目 Myodocopida
          
* 海介蟲目 Halocyprida
        
* 尾肢亞綱 Podocopa
          
* 簡肢目 Platycopida
          
* 尾肢目 Podocopida
      
* 鬚蝦綱 Mystacocarida
      
* 鰓尾綱 Branchiura
        
* 鯴目 Arguloida
        
* †旋輪蟹目 Cyclida
      
* 五口綱 Pentastomida
        
* 目 Raillietiellida
        
* 目 Reighardiida
        
* 頭行目 Cephalobaenida
        
* 孔頭舌蟲目 Porocephalida
    
* 演化支 Vericrustacea
      
* 軟甲綱 Malacostraca
        
* 葉蝦亞綱 Phyllocarida
          
* †古介形蟲目 Archaeostraca
          
* †目 Hoplostraca
          
* †加拿大蟲目 Canadaspidida
          
* †膜蝦蟲目 Hymenostraca
          
* 薄甲目 Leptostraca
        
* 掠蝦亞綱 Hoplocarida
          
* †奇泳目 Aeschronectida
          
* †古口足目 Archaeostomatopoda
          
* 口足目 Stomatopoda
        
* 真軟甲亞綱 Eumalacostraca
          
* 原蝦總目 Syncarida
            
* †古蝦目 Palaeocaridacea
            
* 地蝦目 Bathynellacea
            
* 山蝦目 Anaspidacea
          
* 囊蝦總目 Peracarida
            
* †臀頭蝦目 Pygocephalomorpha
            
* 洞蝦目 Spelaeogriphacea
            
* 溫泉蝦目 Thermosbaenacea
            
* 疣背糠蝦目 Lophogastrida
            
* 糠蝦目 Mysida
            
* 混足目 Mictacea
            
* 端足目 Amphipoda
            
* 等足目 Isopoda
            
* 原足目 Tanaidacea
            
* 漣蟲目 Cumacea
          
* 真蝦總目 Eucarida
            
* †狹齒蝦目 Angustidontida
            
* 磷蝦目 Euphausiacea
            
* 異蝦目 Amphionides
            
* 十足目 Decapoda（根據最新研究，磷蝦目和異蝦目可併入十足目。）
      
* 鰓足綱 Branchiopoda
        
* 薩甲亞綱 Sarsostraca
          
* 無甲目 Anostraca
        
* 鰓足亞綱 Phyllopoda
          
* †脂甲目 Lipostraca
          
* †哈薩克鱟蟲目 Kazacharthra
          
* 背甲目 Notostraca
          
* 雙甲下綱 Diplostraca
            
* 光尾目 Laevicaudata
            
* 棘尾目 Spinicaudata
            
* 圓蚌蟲目 Cyclestherida
            
* 枝角目 Cladocera
      
* 鞘甲綱 Thecostraca Gruvel, 1905
        
* 帶甲亞綱 Facetotecta Grygier, 1985
        
* 囊胸亞綱 Ascothoracida Lacaze-Duthiers, 1880
          
* 長囊虱目 Laurida Grygier, 1987
          
* 樹囊虱目 Dendrogastrida Grygier, 1987
        
* 蔓足亞綱 Cirripedia Burmeister, 1834
          
* 尖胸總目 Acrothoracica Gruvel, 1905
            
* 有肛目 Pygophora Berndt, 1907
            
* 無肛目 Apygophora Berndt, 1907
          
* 根頭總目 Rhizocephala Müller, 1862
            
* 有刺胞幼體目 Kentrogonida Delage, 1884
            
* 無刺胞幼體目 Akentrogonida Häfele, 1911
          
* 圍胸總目 Thoracica Darwin, 1854
            
* 有柄目 Pedunculata Lamarck, 1818
            
* 無柄目 Sessilia Lamarck, 1818
      
* 橈足綱 Copepoda
        
* 哲水蚤目 Calanoida
        
* 劍水蚤目 Cyclopoida
        
* 隱水蚤目 Gelyelloida
        
* 猛水蚤目 Harpacticoida
        
* 異水蚤目 Misophrioida
        
* 怪水蚤目 Monstrilloida
        
* 摩門水蚤目 Mormonilloida
        
* 平角目 Platycopioida
        
* 杯口水蚤目 Poecilostomatoida
        
* 管口目 Siphonostomatoida
      
* 微蝦綱 Tantulocarida
    
* 演化支 Miracrustacea
      
* 演化支 Xenocarida
        
* 頭蝦綱 Cephalocarida
          
* 短足目 Brachypoda
        
* 槳足綱 Remipedia
          
* †反足目 Enantiopoda
          
* 泳足目 Nectiopoda
      
* 六足亞門 Hexapoda
        
* 內口綱 Entognatha
          
* 原尾目 Protura
          
* 雙尾目 Diplura
          
* 彈尾亞綱 Collembola
            
* 長角跳蟲目 Entomobryomorpha
            
* 原跳蟲目 Poduromorpha
            
* 癒腹跳蟲目 Symphypleona
            
* 短角圓跳蟲目 Neelipleona
        
* 昆蟲綱 Insecta (參見昆蟲分類表)
          
* †萊尼蟲屬 _Rhyniognatha_
          
* 無翅亞綱 Monocondylia
            
* 石蛃目 Archaeognatha
            
* †目 Cercopoda
            
* †單尾目 Monura
            
* 衣魚目 Zygentoma
          
* 有翅亞綱 Pterygota
            
* 古翅下綱 Palaeoptera
              
* 蜻蜓總目 Odonatoptera
                
* †魁翅目 Meganisoptera
                
* †科 Lapeyriidae
                
* †目 Campylopterodea
                
* †原差翅目 Protanisoptera
                
* †目 Triadophlebioptera
                
* †原束翅目 Protozygoptera
                
* †目 Tarsophlebioptera
                
* 蜻蜓目 Odonata
              
* †古網翅總目 Palaeodictyopteroidea
                
* †古網翅目 Palaeodictyoptera
                
* †古蜻蜓目 Archodonata
                
* †透翅目 Diaphanopterodea
                
* †疏翅目 Megasecoptera
              
* 泛蜉蝣總目 Panephemeroptera
                
* †長基蜉蝣目 Coxoplectoptera
                
* 蜉蝣目 Ephemeroptera
            
* 新翅下綱 Neoptera
              
* 復新生翅類 Polyneoptera
                
* 網翅總目 Dictyoptera
                  
* 蜚蠊目 Blattaria
                  
* 螳螂目 Mantodea
                  
* †奇翅目 Alienoptera
                
* 直翅總目 Orthopterida
                  
* †目 Geraroptera
                  
* †華脈目 Caloneurodea
                  
* †巨翅目 Titanoptera
                  
* 直翅目 Orthoptera
                  
* 竹節蟲目 Phasmatodea
                  
* 未定科
                    
* †科 Cacurgidae
                    
* ?†科 Chresmodidae
                    
* †科 Permostridulidae
                    
* †原竹節蟲科 Protophasmatidae
                
* †總目 Perlidea
                  
* †目 Cnemidolestida
                
* 未分類的群組
                  
* †原直翅目 Protorthoptera
                  
* 革翅目 Dermaptera
                  
* 紡足目 Embioptera
                  
* †目 Eoblattida
                  
* 目 Notoptera (由蛩蠊目 Grylloblattodea 以及螳䗛目 Mantophptera 合併建立的新分類)
                  
* 缺翅目 Zoraptera
                  
* 襀翅目 Plecoptera
              
* 完全變態類 Eumetabola
                
* 准新翅類 Paraneoptera
                  
* 囓蟲總目 Psocodea
                    
* 囓蟲目 Psocoptera
                    
* 虱毛目 Phthiraptera
                  
* 髁顎總目 Condylognatha
                    
* 纓翅目 Thysanoptera
                    
* 半翅目 Hemiptera
                
* 內翅類 Endopterygota
                  
* ?†小翅目 Miomoptera
                  
* ?†舌鞘目 Glosselytrodea
                  
* 膜翅目 Hymenoptera
                  
* 脈翅總目 Neuropterida
                    
* 廣翅目 Megaloptera
                    
* 蛇蛉目 Raphidioptera
                    
* 脈翅目 Neuroptera
                  
* 鞘翅目 Coleoptera
                  
* 捻翅目 Strepsiptera
                  
* 蠍蛉總目 Panorpida
                    
* 吸吻類 Antliophora
                      
* †原雙翅目 Protodiptera
                      
* 雙翅目 Diptera
                      
* 長翅目 Mecoptera
                      
* 雪蠍蛉科 Boreidae
                      
* 蚤目 Siphonaptera
                    
* 類脈類 Amphiesmenoptera
                      
* †科 Eocoronidae
                      
* †目 Tarachoptera
                      
* 毛翅目 Trichoptera
                      
* 鱗翅目 Lepidoptera



螺旋動物 Spiralia

下列各螺旋動物均為格式起見而另起段落 (包含有顎動物、扁輪動物)



有顎動物 Gnathifera

顎胃動物門 Gnathostomulida

顎咽動物門、顎口動物門


* 囊道目 Bursovaginoidea
  
* 硬囊道亞目 Seleroperalia
  
* 軟囊道亞目 Conophoralia

* 絲精目 Filospermoidea

微顎動物門 Micrognathozoa


* 微顎綱 Micrognathozoa
  
* 顎蟲目 Limnognathida

輪形動物門 Rotifera

輪毛動物門 Syndermata


* 真輪形動物 Eurotatoria
  
* 單巢綱 Monogonta
    
* 簇輪蟲目 Flosculariacea
    
* 膠鞘輪蟲目 Collothecacea
    
* 游泳輪蟲目 Ploima
  
* 雙巢綱 Digononta
    
* 蛭態輪蟲目 Bdelloidea

* 擬輪形動物 Pararotatoria
  
* 尾盤綱 Seisonoidea
    
* 搖輪蟲目 Seisonidea

棘頭動物門 Acanthocephala

鉤頭動物門


* 古棘頭蟲綱 Palaeacanthocephala
  
* 棘吻目 Echinorhynchida
  
* 多形目 Polymorphida
  
* 目 Heteramorphida

* 原棘頭蟲綱 Archiacanthocephala
  
* 無孔目 Apororhynchida
  
* 巨吻目 Gigantorhynchida
  
* 鏈珠目 Moniliformida
  
* 寡棘吻目 Oligacanthorhynchida

* 始棘頭蟲綱 Eoacanthocephala
  
* 圓棘頭目 Gyracanthocephala
  
* 新棘吻目 Neoechinorhynchida

* 綱 Polyacanthocephala
  
* 目 Polyacanthorhynchida

毛顎動物門 Chaetognatha


* ?†古箭蟲綱 Archisagittoidea
  
* ?†古箭蟲科 Amiskwiidae
    
* ?†阿米斯克毛顎蟲屬 _Amiskwia_

* 箭蟲綱 Sagittoidea
  
* 腹橫肌目 Phragmophora
  
* 無橫肌目 Aphragmophora



扁輪動物 Platytrochozoa

下列各扁輪動物均為格式起見而另起段落 (包含中生動物、扁蟲動物總門及冠輪動物總門)



中生動物 Mesozoa

包括直泳動物門、菱形動物門和單胚動物門

直泳動物門 Orthonectida

菱形動物門 Rhombozoa

單胚動物門 Monoblastozoa



扁蟲動物總門 Platyzoa

扁形動物門 Platyhelminthes

詳細分類請見「扁形動物門」條目

腹毛動物門 Gastrotricha


* 大鼬目 Macrodasyida

* 鼬蟲目 Chaetonotida



冠輪動物總門 Lophotrochozoa

下列各冠輪動物均為格式起見而另起段落 (包含環口動物門、環節動物門、軟體動物門、紐形動物門及觸手冠動物)



環口動物門 Cycliophora

微輪動物門、有輪動物門、口環動物門


* 真微輪動物綱 Eucycliophora
  
* 共生蟲目 Symbiida



環節動物門 Annelida

參見環節動物分類表


* †短劍綱 Machaeridia

* 多毛綱 Polychaeta
  
* 基礎和地位未定組
    
* 科 Diurodrilidae
    
* 科 Histriobdellidae
    
* 科 Nerillidae
    
* 科 Parergodrilidae
    
* 科 Potamodrilidae
    
* 科 Psammodrilidae
    
* 科 Spintheridae
    
* 科 Protodriloididae
    
* 囊鬚蟲科 Saccocirridae
    
* 原始環蟲類 Haplodrili
    
* 吸口蟲目 Myzostomida
  
* 亞綱 Palpata
    
* 科 Protodrilidae
    
* 科 Polygordiidae
  
* 足刺亞綱 Errantia
    
* 科 Levidoridae：現在被合併入葉鬚蟲目的裂蟲科
    
* 仙女蟲目 Amphinomida
    
* 磯沙蠶目 Eunicida
    
* 葉鬚蟲目 Phyllodocida
  
* 隱居亞綱 Sedentaria
    
* 磷沙蠶科 Chaetopteridae
    
* 管觸鬚下綱 Canalipalpata
      
* 纓鰓蟲目 Sabellida
      
* 海稚蟲目 Spionida
      
* 蟄龍介目 Terebellida
    
* 頭結蟲下綱 Scolecida
  
* 螠蟲亞綱 Echiura
    
* 螠蟲目 Echiuroidea
    
* 目 Bonelliida

* 環帶綱 Clitellata
  
* 棘蛭目 Acanthobdellida
  
* 蛭蚓亞綱 Branchiobdellae
    
* 蛭蚓目 Branchiobdellida
  
* 蛭亞綱 Hirudinea
    
* 下綱 Acanthobdellidea
    
* 下綱 Euhirudinea
      
* 吻蛭目 Rhynchobdellida
      
* 原蛭目 Arhynchobdellida
  
* 寡毛亞綱 Oligochaeta
    
* 帶絲蚓目 Lumbriculida
    
* 顫蚓目 Tubificida
    
* 單向蚓目 Haplotaxida

* †綱 Machaeridia

星蟲動物 Sipuncula


* 革囊星蟲綱 Phascolosomatidea
  
* 盾管星蟲目 Aspidosiphoniformes
  
* 革囊星蟲目 Phascolosomatiformes

* 方格星蟲綱 Sipunculidea
  
* 戈芬星蟲目 Golfingiiformes



軟體動物門 Mollusca

請參見軟體動物分類表


* †哈瓦亞蟲類 Halwaxiida
  
* †科 Halkieriidae
  
* †黎鐮蟲科 Orthrozanclidae
  
* †威瓦亞蟲科 Wiwaxiidae

* †目 Hemithecellitina

* 無板類 Aplacophora
  
* 尾腔綱 Caudofoveata（毛皮貝類 Chaetodermomorpha）
  
* 溝腹綱 Solenogastres
    
* 總目 Aplotegumentaria
      
* 目 Folidoscepia
      
* 新月貝目 Neomeniomorpha
    
* 總目 Pachytegumentaria
      
* 目 Sterrofustia
      
* 目 Cavibelonia

* 始軟體類 Eumollusca
  
* 多板綱 Polyplacophora
    
* †古石鱉亞綱 Paleoloricata
      
* †目 Chelodida
      
* †目 Septemchitonida
      
* †目 Ischnochitonina
    
* †復多板亞綱 Multiplacophora
      
* †目 Strobilepida
    
* 新石鱉亞綱 Neoloricata
      
* 鱗側石鰵目 Lepidopleurida
        
* 亞目 Cymatochitonina
        
* 鱗側石鰵亞目 Lepidopleurina
      
* 石鰵目 Chitonida
        
* 石鰵亞目 Chitonina
        
* 毛膚石鱉亞目 Acanthochitonina
  
* †馬特殼綱 Mattheva

* 單板類 Monoplacophora
  
* †始單板綱 Eomonoplacophora
  
* †太陽女神螺綱 Helcionelloida
    
* †古鰓亞綱 Archaeobranchia
      
* †太陽女神螺目 Helcionellida
      
* †目 Pelagiellida
    
* †亞綱 Divasibranchia
      
* †目 Khairkhaniifomes
    
* †右鰓亞綱 Dextrobranchia
      
* †目 Onychochiliformes
  
* 罩螺綱 Tryblidiida
    
* 罩螺目 Tryblidioidea
  
* ?†窄殼綱 Stenothecoida
  
* †喙殼綱 Rostroconchia
    
* †利培殼目 Ribeirioida
    
* †強壯殼目 Ischyrinioida
    
* †錐鳥殼目 Conocardioida

* 類 Pleistomollusca
  
* 掘足綱 Scaphopoda
    
* 角貝目 Dentaliida
    
* 管角貝目 Gadilida
  
* 雙殼綱 Bivalvia
    
* †真原鰓類 Euprotobranchia
      
* †目 Fordillida
      
* †目 Tuarangiida
    
* 異齒亞綱 Heterodonta
      
* 始異齒下綱 Archiheterodonta
        
* 心蛤目 Carditoida
      
* 真異齒下綱 Euheterodonta
        
* 真異齒類 Euheterodonta
        
* 異韌帶目 Anomalodesmata
        
* 海螂目 Myoida
        
* 滿月蛤目 Lucinoida
        
* 簾蛤目 Veneroida
    
* 古異齒亞綱 Palaeoheterodonta
      
* 三角蛤目 Trigonioida
      
* 蚌目 Unionoida
    
* 原鰓亞綱 Protobranchia
      
* †目 Praecardioida
      
* 彎錦蛤目 Nuclanoida
      
* 銀錦蛤目 Nuculida
      
* 蟶螂目 Solemyoida
    
* 翼形亞綱 Pteriomorphia
      
* 蚶目 Arcoida
      
* †目 Praecardioida
      
* 真翼形下綱 Eupteriomorphia
        
* 牡蠣目 Ostreoida
        
* 海扇蛤目 Pectinoida
        
* 狐蛤目 Limoida
        
* 貽貝目 Mytiloida
        
* 鶯蛤目 Pterioida
  
* 腹足綱 Gastropoda
    
* 下屬分類參見腹足綱的譜系學分類

* 頭足綱 Cephalopoda
  
* 鸚鵡螺亞綱 Nautiloidea
    
* †短棒角石目 Plectronocerida
    
* †愛麗斯木角石目 Ellesmerocerida
    
* †內角石目 Endocerida
    
* †珠角石目 Actinocerida
    
* †觸環角石目 Tarphycerida
    
* †箭鉤角石目 Oncocerida
    
* 鸚鵡螺目 Nautilida
    
* †桿石目 Bactritida
  
* †直角石亞綱 Orthoceratoidea
    
* †袋角石目 Ascocerida
    
* †直角石目 Orthocerida
    
* †疊盤角石目 Discosorida
    
* †假直角石目 Pseudorthocerida
    
* †喇叭角石目 Lituitida
  
* †菊石亞綱 Ammonoidea
    
* †擬古菊石目 Agoniatitida
    
* †海神石目 Clymeniida
    
* †棱菊石目 Goniatitida
    
* †前碟菊石目 Prolecanitida
    
* †齒菊石目 Ceratitida
    
* †菊石目 Ammonitida
  
* 蛸亞綱 Coleoidea
    
* †奧斯泰諾蛸科 Ostenoteuthidae
    
* †箭石下綱 Belemnoidea
      
* †血箭石目 Hematitida
      
* †溝箭石目 Aulacocerida
      
* †閉箭石目 Phragmoteuthida
      
* †箭石目 Belemnitida
    
* 新蛸下綱 Neocoleoidea
      
* †總目 Palaeoteuthomorpha
        
* †目 Boletzkyida
      
* 十腕總目 Decapodiformes
        
* 旋烏賊目 Spirulida
        
* 烏賊目 Sepiida
        
* 耳烏賊目 Sepiolida
        
* 槍形目 Teuthida
      
* 八腕總目 Octopodiformes
        
* †粗沙鱗科 Trachyteuthididae
        
* 幽靈蛸目 Vampyromorphida
        
* 八腕目 Octopoda

* ?†竹節石綱 Tentaculita
  
* †竹節石目 Tentaculitida
  
* †角管蟲目 Cornulitida
  
* †小殼蟲目 Microconchida
  
* †鑽管蟲目 Trypanoporida
  
* †未定屬 _Anticalyptraea_



紐形動物門 Nemertea

吻腔動物門 Rhynchocoela


* 無刺綱 Anopla
  
* 古紐目 Paleonemertea
  
* 異紐目 Heteronemertea

* 有刺綱 Enopla
  
* 針紐目 Hoplonemertea
  
* 蛭紐目 Bdellonemertea



觸手冠動物 Lophophorata


* †托莫特殼類 "Tommotiida"

苔蘚動物門 Bryozoa

外肛動物門 Ectoprocta 、Polyzoa


* 被唇綱 Phylactolaemata
  
* 羽苔目 Plumatellida

* 窄唇綱 Stenolaemata
  
* 環口目 Cyclostomatida
  
* †變口目 Trepostomatida
  
* †胞孔目 Cystoporida
  
* †目 Cystoporata
  
* †隱口目 Cryptostomida
  
* †目 Cryptostomata
  
* †窗格目 Fenestrida

* 裸唇綱 Gymnolaemata
  
* 唇口目 Cheilostomata
  
* 櫛口目 Ctenostomata

內肛動物 Entoprocta


* 斜體節蟲科 Loxosomatidae

* 海花柄科 Pedicellinidae

* 節蟲科 Urnatellidae

* 彎萼蟲科 Loxokalypodidae

泛腕足動物 Brachiozoa

†軟舌螺動物門 Hyolitha


* †有唇軟舌螺目 Hyolithida

* †直管螺目 Orthothecida

帚蟲動物門 Phoronida

帚形動物門


* 帚蟲屬 _Phoronis_

* 領帚蟲屬 _Phoronopsis_

* ?†屬 _Diversipora_

* ?†屬 _Hederella_

* ?†屬 _Cytosporella_

* ?†類 Hederellids

* ?†屬 _Hernodia_

腕足動物門 Brachiopoda


* 舌形貝亞門 Linguliformea
  
* 舌形貝綱 Lingulata
    
* †乳房貝目 Acrotretida
    
* 舌形貝目 Lingulida
    
* †管洞貝目 Siphonotretida
  
* †神父貝綱 Paterinata
    
* †神父貝目 Paterinida

* 骷髏貝亞門 Craniiformea
  
* 骷髏貝綱 Craniata
    
* 骷髏貝目 Craniida
    
* †擬骷髏貝目 Craniopsida
    
* †三分貝目 Trimerellida

* 小嘴貝亞門 Rhynchonelliformea
  
* 小嘴貝綱 Rhynchonellata
    
* †前正形貝目 Protorthida
    
* †正形貝目 Orthida
    
* †五房貝目 Pentamerida
    
* †無洞貝目 Atrypida，已廢棄的並系群分類
    
* 小嘴貝目 Rhynchonellida
    
* †石燕貝目 Spiriferida
    
* †無窗貝目 Athyridida
    
* †莢采貝目 Spiriferinida
    
* 穿孔貝目 Terebratulida
    
* 鞘貝目 Thecideida
  
* †扭月貝綱 Strophomenata
    
* †扭月貝目 Strophomenida
    
* †長身貝目 Productida
    
* †伯靈貝目 Billingselloidea
    
* †直形貝目 Orthotetida
  
* †智利貝綱 Chileata
    
* †智利貝目 Chileida
    
* †目 Dictyonellida
  
* †庫圖貝綱 Kutorginata
    
* †庫圖貝目 Kutorginida
  
* †小圓貨貝綱 Obolellata
    
* †小圓貨貝目 Obolellida
    
* †目 Naukatida



後口動物總門 Deuterostomia

棘皮動物門 Echinodermata


* †海扁果亞門 Homalozoa
  
* †櫛海林檎綱 Ctenocystoidea
  
* †海筆綱 Homostelea
  
* †海箭綱 Homoiostelea
    
* †目 Syringocrinida
    
* †目 Dendrocystitida
  
* †海樁綱 Stylophora
    
* †角海果目 Cornuta
    
* †鐘海果目 Mitrata

* †海蕾亞門 Blastozoa
  
* †始海百合綱 Eocrinoidea
    
* †目 Gogiida
  
* †擬海蕾綱 Parablastoidea
    
* †擬海蕾目 Parablastida
  
* †菱孔綱 Rhombifera
  
* †雙孔綱 Diploporita
  
* †海蕾綱 Blastoidea
    
* †隙管海蕾目 Fissiculata
    
* †噴管海蕾目 Spiraculata
    
* †未定屬 _Macurdablastus_
  
* †擬海百合綱 Paracrinoidea
    
* †目 Comarocystitida
    
* †目 Platycystitida

* 海百合亞門 Crinozoa
  
* 海百合綱 Crinoidea
    
* †類 Protocrinoidea
    
* †圓頂海百合亞綱 Camerata
      
* †單杯圓頂海百合目 Monobathrida
      
* †雙杯圓頂海百合目 Diplobathrida
    
* 游離海百合類 Inadunata
      
* †類 Disparida
      
* 幼枝海百合類 Cladida
        
* †類 Porocrinoidea
        
* †可曲海百合亞綱 Flexibilia
          
* †櫛海百合目 Taxocrinida
          
* †網海百合目 Sagenocrinida
        
* 真幼枝海百合類 Eucladida
          
* †類 Cyathoformes
          
* 關節海百合亞綱 Articulata
            
* †目 Holocrinida
            
* †石蓮海百合目 Encrinida
            
* †猶因他海百合目 Uintacrinida
            
* †無柄海百合目 Roveacrinida
            
* 弓海百合目 Cyrtocrinida
            
* 目 Hyocrinida
            
* 等節海百合目 Isocrinida
            
* 深海海百合目 Bourgeticrinida
            
* 櫛羽星目 Comatulida
            
* 多腕目 Millericrinida
  
* †海林檎綱 Cystoidea
    
* †目 Aristocystitida
    
* †目 Asteroblastida
    
* †目 Glyptosphaeritida
    
* †目 Sphaeronitida
  
* †海座星綱 Edrioasteroidea
    
* †海蒲團目 Camptostroma
    
* †目 Isorophida

* 海星亞門 Asterozoa
  
* †體海星綱 Somasteroidea
  
* 海星綱 Asteroidea
    
* †科 Calliasterellidae
    
* †目 Trichasteropsida
    
* 有緣目 Velatida
    
* 同心亞綱 Concentricycloidea
      
* 車輪海星目 Peripodida
    
* 鉗棘亞綱 Forcipulatacea
      
* 項鏈海星目 Brisingida
      
* 鉗棘目 Forcipulatida
    
* 有棘亞綱 Spinulosacea
      
* 有棘目 Spinulosida
    
* 瓣海星亞綱 Valvatacea
      
* 樁海星目 Paxillosida
      
* 目 Notomyotida
      
* 瓣海星目 Valvatida
  
* 蛇尾綱 Ophiuroidea
    
* 亞綱 Myophiuroidea
      
* 下綱 Metophiurida
        
* 總目 Euryophiurida
          
* 蔓蛇尾目 Euryalida
          
* 真蛇尾目 Ophiurida
        
* 總目 Ophintegrida
          
* 目 Amphilepidida
          
* 皮蛇尾目 Ophiodermatina
          
* 目 Ophioleucida
          
* 目 Ophioscolecida

* 海膽亞門 Echinozoa
  
* 未定屬 _Arkarua_
  
* †海旋板綱 Helicoplacoidea
  
* †海蛇函綱 Ophiocistioidea
  
* 海膽綱 Echinoidea
    
* 偽海膽亞綱 Perischoechinoidea
      
* 頭帕目 Cidaroida
      
* †溝頭帕目 Bothriocidaroida
      
* †棘囊海膽目 Echinocystitoidea
      
* †目 Megalopoda
      
* †古海膽目 Palaechinoida
    
* 真海膽亞綱 Euechinoidea
      
* 柔海膽目 Echinothurioida
      
* 下綱 Acroechinoidea
        
* 目 Aspidodiadematoida
        
* 目 Micropygoida
        
* 平海膽目 Pedinoida
        
* 冠海膽目 Diadematoida
      
* 下綱 Carinacea
        
* 總目 Calycina
          
* †疣海膽目 Phymosomatoida
          
* 沙棱海膽目 Salenioida
        
* 海膽總目 Echinacea
          
* 口鰓海膽目 Stomopneustoida
          
* 皇冠海膽目 Arbacioida
          
* 拱齒目 Camarodonta
      
* 不規則海膽下綱 Irregularia
        
* 全雕目 Holectypoida
        
* 斜海膽目 Echinoneoida
        
* 不全口總目 Atelostomata
          
* 全星海膽目 Holasteroida
          
* 心形目 Spatangoida
        
* 總目 Neognathostomata
          
* 盔海膽目 Cassiduloida
          
* 目 Echinolampadoida
          
* 楯形目 Clypeasteroida
  
* 海參綱 Holothuroidea
    
* 無足海參目 Apodida
    
* 枝手海參目 Dendrochirotida
    
* 平足海參目 Elasipodida
    
* 海參目 Holothuriida
    
* 芋參目 Molpadida
    
* 目 Persiculida
    
* 目 Synallactida

半索動物門 Hemichordata


* 浮球綱 Planctosphaeroidea

* 腸鰓綱 Enteropneusta

* 羽鰓綱 Pterobranchia
  
* 頭盤蟲目 Cephalodiscida
  
* 杆壁蟲目 Rhabdopleurida
  
* †筆石亞綱 Graptolithina
    
* †樹形筆石目 Dendroidea
    
* †正筆石目 Graptoloidea

†古蟲動物門 Vetulicolia

可能是脊索動物門的一個亞門


* †古蟲綱 Vetulicolida
  
* †古蟲目 Vetulicolida

* †異形蟲綱 Heteromorphida
  
* †班府蟲目 Banffiata

* ?†雲南蟲目 Yunnanozoa

脊索動物門 Chordata


* 頭索動物亞門 Cephalochordata
  
* ?†皮卡蟲科 Pikaiidae
  
* 頭索綱 Leptocardii
    
* †華夏鰻屬 _Cathaymyrus_
    
* †古文昌魚屬 _Palaeobranchiostoma_
    
* 文昌魚目 Amphioxiformes

* 嗅球類 Olfactores
  
* 尾索動物亞門 （被囊動物）Tunicata
    
* ?†未定屬 _Yarnemia_
    
* †山口海鞘屬 _Shankouclava_
    
* 海鞘綱 Ascidiacea
      
* ?†科 Ausiidae
      
* ?†未定屬 _Cheungkongella_
      
* 無管海鞘目 Aplousobranchia
      
* 扃鰓海鞘目 Phlebobranchia
      
* 褶鰓海鞘目 Stolidobranchia
    
* 樽海鞘綱 Thaliacea
      
* 磷海樽目 Pyrosomida
      
* 蕭皮達樽海鞘目 Salpida
      
* 大理瑤伊達樽海鞘目 Doliolida
    
* 尾海鞘綱 Appendicularia
      
* 目 Copelata
  
* 脊椎動物亞門 Vertebrata (參見魚類分類表)
    
* †昆明魚目 Myllokunmingiida
    
* 圓口綱 Cyclostomata
      
* 七鰓鰻目 Petromyzonida
      
* 盲鰻目 Myxini
    
* †牙形石綱 Conodonta
    
* 甲冑魚類 Ostracoderms
      
* †鰭甲魚綱 Pteraspidomorphi
        
* †阿蘭達魚亞綱 Arandaspida
        
* †異甲亞綱 Heterostracomorphi
      
* †花鱗魚綱 Thelodonti
      
* †缺甲魚綱 Anaspida
      
* †盔甲魚綱 Galeaspida
      
* †茄甲魚綱 Pituriaspida
      
* †骨甲魚綱 Osteostraci
      
* 有頷類 Gnathostomata
        
* †盾皮魚綱 Placodermi
        
* †棘魚綱 Acanthodii
          
* 軟骨魚綱 Chondrichthyes
        
* 硬骨魚高綱 Osteichthyes
          
* 輻鰭魚總綱 Actinopterygii
          
* 肉鰭魚總綱 Sarcopterygii
            
* 兩棲綱 Amphibia (參見兩棲動物分類表)
            
* 蜥形綱 Sauropsida (參見爬行動物分類表、恐龍分類表)
              
* 鳥類 Aves (參見 2014 年鳥類全基因組測序分類系統)
            
* 合弓綱 Synapsida (參見爬行動物分類表)
              
* 哺乳類 Mammalia (參見哺乳動物分類表)



地位未定 incertae sedis


* †科 Cloudinidae

* †阿納巴爾管科 Anabaritidae

* †腔骨綱 Coeloscleritophora
  
* †開腔骨目 Chancelloriida



參考資料

1. 無脊椎動物學 (上)(下)，任淑仙著，淑馨出版社，1995 年
2. 脊椎動物學 (上)(下)，楊安峰著，淑馨出版社，1991 年
3. https://web.archive.org/web/20120823111312/http://www.insecta.bio.pu.ru/z/nom/index.htm
4. http://paleodb.org/cgi-bin/bridge.pl?a=home （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
5. http://www2.tba.t-com.ne.jp/nakada/takashi/taxonomy/taxonomy.html （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
6. http://www.helsinki.fi （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
7. http://sn2000.taxonomy.nl/Main/Classification/
8. https://web.archive.org/web/20090824160507/http://taxonomicon.taxonomy.nl/
9. http://www.biolib.cz/en/taxon/ （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）
10. http://palaeos.com/metazoa/dendrogram.html#Shu\_et\_al01 （頁面存檔備份，存於網際網路檔案館）