裸鰓類的譜系學分類仍在研究中。一般來說，本支序的物種大致可以分為有角鰓類和無角鰓類兩大類，但若以物種的豐盛度來看，則以海牛類 (裸鰓類) 及簑海牛類兩大分類最豐富。不同的文獻對這兩大分類所包含的物種有所出入。以下為最新的分類及過往歷史上曾經出現的主流分類。



概說

裸鰓目原是後鰓目的成員，其科學分類到現在仍在研究中，仍不時會有改動。從 18S 核醣體 DNA 的資料顯示，裸鰓類應該是一個單系群。傳統上，裸鰓類的分類如下：


* 花鰓類 Anthobranchia
  
* 海牛總科 Doridoidea：又名隱鰓類
  
* Doridoxoidea
  
* Onchidoridoidea
  
* 多角總科 Polyceroidea

* 枝鰓類 Cladobranchia
  
* 蓑海牛總科 Aeolidioidea
  
* 片鰓海蛞蝓總科 Arminoidea
  
* 枝背海牛總科 Dendronotoidea
  
* 後片鰓海蛞蝓總科 Metarminoidea

另一項 2001 年的研究卻發現裸鰓類應該分為兩個主要分支：


* Anthobranchia（只包括 Bathydoridoidea 及海牛總科 Doridoidea）

* Dexiarchia nom. nov.（Doridoxoidea、Dendronotoidea、Aeolidoidea 及 Arminoidea）

2005 年分類

裸鰓類是異鰓類內物種分類最複雜的：單單是總科以上的就有六個支序。根據 2005 年的《布歇特和洛克羅伊的腹足類分類》，裸鰓類裸鰓類亞支序（Nudibranchia）大致可以分為下列三個部份：


* 有角鰓類支序（Euctinidiacea）

* 無角鰓類支序（Dexiarchia）

* 總科地位未定
  
* Family Rhodopidae

總科與科


* 枝背海牛總科 Dendronotina
  
* 三歧海牛科 Tritoniidae Lamarck, 1809
  
* Marianinidae
  
* Lomanotidae
  
* Scyllaeidae
  
* Hancockiidae
  
* 枝背海牛科 Dendronotidae
  
* 二列鰓海牛科 Bornellidae
  
* Tethyidae
  
* Dotoidae
  
* Phylliroidae

* 片鰓海蛞蝓總科 Arminoidea
  
* Pachygnatha
    
* Madrellidae
    
* Dironidae
    
* Zephyrinidae
  
* Leptognatha
    
* Goniaeolididae
    
* Charcotiidae
    
* Heroidae
  
* Euarminiacea
    
* Heterodorididae
    
* Doridomorphidae
    
* 片鰓海蛞蝓科 Arminidae
    
* Lemindidae

* 蓑海牛總科 Aeolidioidea
  
* Pleuroprocta
    
* Notaeolidiidae
    
* Coryphellidae
    
* Nossidae
    
* 扇羽鰓科 Flabellinidae Bergh, 1889
    
* Protaeolidiellidae
    
* Pleurolidiidae
  
* Acleioprocta
    
* Pseudovermidae
    
* Tergipedidae
    
* 菲納鰓科 Fionidae Gray, 1857
    
* Calmidae
    
* Eubranchidae
      
* Cumanotinae
      
* Eubranchinae
  
* Cleioprocta
    
* 蓑海牛科 Aeolidiidae
    
* Myrrhinidae
    
* 海神鰓科 Glaucidae
      
* Babakininae
      
* 灰翼亞科 Facelininae
      
* Favorininae
      
* Pteraeolidiinae
      
* Glaucinae
      
* Crateninae
      
* Herviellinae

2017 年分類

根據 2017 年 12 月出版的最新分類，裸鰓類從原來的不分等支序改為目級分類單元，依然是裸側類支序的成員，而裸側類亦升為總目級分類單元；但在本分類裸側類不再是直接隸屬直神經類，而是與露齒螺總目共同組成 Ringipleura Subterclass 這個新成立的分類單元。裸鰓類依然分為枝鰓亞目和海牛亞目兩個亞目：


* 枝鰓亞目 Cladobranchia
  
* ?
    
* Marianinidae
    
* Hancockiidae
  
* 蓑海牛總科 Aeolidioidea Gray, 1827
  
* 片鰓海蛞蝓總科 Arminoidea Iredale & O'Donoghue, 1923 (1841)
  
* 枝背海牛總科 Dendronotoidea Allman, 1845：原來的枝背海牛類（Dendronotina）
    
* 枝背海牛科 Dendronotidae Allman, 1845
    
* Dotidae Gray, 1853
    
* Hancockiidae MacFarland, 1923
    
* Lomanotidae Bergh, 1890
    
* Scyllaeidae Alder & Hancock, 1855
    
* Tethydidae Rafinesque, 1815
  
* Superfamily Doridoxoidea Bergh, 1899
  
* 菲納鰓總科 Fionoidea Gray, 1857
  
* 扇羽鰓總科 Flabellinoidea Bergh, 1889
  
* Superfamily Proctonotoidea Gray, 1853
  
* 三歧海牛總科 Tritonioidea Lamarck, 1809
  
* 總科地位未定
    
* 二列鰓海牛科 Bornellidae

* 海牛亞目 Doridina
  
* Infraorder Bathydoridoidei
    
* Superfamily Bathydoridoidea Bergh, 1891
  
* 海牛下目 Doridoidei
    
* 海牛總科 Doridoidea Rafinesque, 1815
      
* Family Actinocyclidae O'Donoghue, 1929
      
* Family Cadlinidae Bergh, 1891
      
* 多彩海麒麟科 Chromodorididae Bergh, 1891
      
* Family Discodorididae Bergh, 1891
      
* Family Dorididae Rafinesque, 1815
      
* Subfamily Miamirinae Bergh, 1891
    
* Superfamily Onchidoridoidea Gray, 1827（= Phanerobranchiata Suctoria）
      
* Family Akiodorididae Millen & Martynov, 2005
      
* Family Calycidorididae Roginskaya, 1972
      
* Family Corambidae Bergh, 1871
      
* Family Goniodorididae H. Adams & A. Adams, 1854
      
* Family Onchidorididae Gray, 1827
    
* 葉海牛總科 Phyllidioidea Rafinesque, 1814
      
* 枝鰓海麒麟科 Dendrodorididae O'Donoghue, 1924 (1864)
      
* Family Mandeliidae Valdés & Gosliner, 1999
      
* 葉海牛科 Phyllidiidae Rafinesque, 1814
    
* 多角總科 Polyceroidea Alder & Hancock, 1845（= Phanerobranchiata Non Suctoria）
      
* Family Aegiridae
      
* 六鰓海麒麟科 Hexabranchidae：又名六鰓海牛科
      
* 優美海麒麟科 Okadaiidae
      
* 多角海牛科 Polyceridae Alder & Hancock, 1845：又名多角海麒麟科)，併入了 Gymnodorididae Odhner, 1941。



參考文獻



參看


* 腹足綱的譜系學分類