國家重點保護濕地名錄，是中國國家環境保護總局為在中國一些重點地區先行開展濕地生態保護工作，而於 1994 年 11 月 4 日發布的一份濕地保護名單。


* 天津
  
* 北大港濕地

* 河北
  
* 白洋淀濕地

* 內蒙古
  
* 呼倫湖濕地
  
* 淖爾河濕地
  
* 居延海濕地

* 遼寧
  
* 遼河三角洲濕地
  
* 鴨綠江口濕地

* 吉林
  
* 向海濕地
  
* 莫莫格濕地

* 黑龍江
  
* 小興凱湖濕地
  
* 烏裕爾河（扎龍）濕地
  
* 濃江 —— 沃里蘭河（洪河）濕地

* 山東
  
* 黃河三角洲濕地
  
* 微山湖濕地

* 江蘇
  
* 鹽城沿海濕地

* 上海
  
* 崇明島東灘濕地

* 江西
  
* 鄱陽湖濕地

* 福建
  
* 深瀘灣濕地
  
* 九龍江口濕地

* 湖北
  
* 洪湖濕地

* 湖南
  
* 洞庭湖濕地

* 廣西
  
* 北海紅樹林濕地

* 海南
  
* 東寨港紅樹林濕地
  
* 西沙群島東島濕地

* 四川
  
* 若爾蓋高原濕地

* 貴州
  
* 威寧草海濕地

* 雲南
  
* 騰衝北海濕地

* 西藏
  
* 瑪芳雍錯和拉昂錯地區濕地

* 青海
  
* 隆寶灘濕地
  
* 長江河源濕地
  
* 黃河河源濕地

* 新疆
  
* 博斯騰湖濕地
  
* 巴音布魯克濕地

上述國家重點保護濕地之大部實已併入經於 2000 年公布的《中國重要濕地名錄》中，下為國家林業局等 17 部委編制的《中國濕地保護行動計劃・中國重要濕地名錄》中確定的國家重要濕地：



東北地區


* 三江平原東北部濕地

* 七星河和撓力河流域濕地

* 七虎林河和阿布沁河中下游濕地

* 鏡泊湖濕地

* 長吉崗濕地

* 穆稜河下游月牙湖和虎口濕地

* 湯旺河流域濕地

* 興凱湖濕地

* 嫩江源頭區濕地

* 烏裕爾河流域濕地

* 呼瑪河濕地

* 龍江哈拉海濕地

* 五大連池濕地

* 長白山熔岩台地沼澤區

* 松花湖濕地

* 龍沼沼澤

* 月亮泡濕地

* 查干湖濕地

* 向海濕地

* 莫莫格濕地

* 大布蘇自然保護區的濕地



華北地區


* 鴨綠江濕地

* 遼河三角洲濕地

* 密雲水庫濕地

* 昌黎黃金海岸濕地

* 天津古海岸濕地

* 天津北大港濕地

* 灤河河口濕地

* 白洋淀濕地

* 北戴河沿海濕地

* 滄州南大港濕地

* 張家口壩上濕地

* 衡水湖濕地

* 青銅峽庫區濕地

* 三門峽庫區濕地

* 豫北黃河故道沼澤區濕地

* 南四湖區濕地

* 北五湖濕地

* 榮成濕地

* 黃河三角洲和萊洲灣濕地

* 廟島群島濕地

* 黃壘河和乳山河河口濕地

* 大沽夾河河口和膠州灣濕地



華中地區


* 宿鴨湖濕地

* 鹽城濱海濕地

* 洪澤湖濕地

* 高郵湖濕地

* 崇明島濕地

* 金山三島濕地

* 長興島和橫沙島

* 太湖濕地

* 石臼湖濕地

* 揚子鱷自然保護區的濕地

* 巢湖濕地

* 升金湖濕地

* 太平湖濕地

* 網湖濕地

* 洪湖濕地

* 梁子湖群濕地

* 石首天鵝洲長江故道區濕地

* 洞庭湖濕地

* 鄱陽湖濕地

* 千島湖濕地

* 庵東沼澤區濕地

* 靈崑島東灘濕地

* 南麂列島自然保護區濕地

* 三都灣濕地

* 福清灣濕地

* 大瑤山自然保護區中的濕地



西南地區


* 洋縣朱䴉棲息區濕地

* 丹江口庫區濕地

* 紅楓湖濕地

* 威寧草海濕地

* 滇池濕地

* 撫仙湖濕地

* 異龍湖濕地

* 洱海濕地

* 程海濕地

* 瀘沽湖濕地

* 碧塔海濕地

* 納帕海濕地

* 麗江拉市海濕地

* 昭通大山包濕地

* 會澤黑頸鶴棲息區濕地



華南地區


* 晉江河口和泉州灣濕地

* 九龍江河口濕地

* 東山灣濕地

* 深滬灣濕地

* 深圳后海灣濕地

* 珠江三角洲濕地

* 東寨港濕地

* 清瀾港和文昌濕地

* 洋浦港濕地

* 三亞珊瑚礁自然保護區濕地

* 大洲島自然保護區濕地

* 西沙群島濕地

* 欽州灣濕地

* 澄碧河水庫濕地

* 山口紅樹林區濕地

* 北崙河口

* 淡水河河口濕地

* 蘭陽溪河口濕地

* 大肚溪河口濕地

* 台南北門濕地

* 台東大坡池濕地

* 日月潭濕地

* 米埔及深圳灣濕地

* 鎮海灣紅樹林濕地



內蒙古地區


* 烏梁素海濕地

* 岱海濕地

* 察干湖和安固里湖濕地

* 查干淖爾和巴哈湖濕地

* 達里諾爾濕地

* 烏拉蓋沼澤區濕地

* 科爾沁濕地

* 呼倫湖濕地

* 紅鹼淖濕地



西北地區


* 居延海濕地

* 阿牙克庫木湖濕地

* 塔里木河下游尉犁濕地

* 博斯騰湖濕地

* 巴里湖濕地

* 巴音布魯克濕地

* 賽里木湖濕地

* 艾比湖濕地

* 克拉瑪依湖濕地

* 瑪納斯湖濕地

* 喀納斯湖濕地

* 烏倫古湖和吉力湖濕地

* 阿爾泰山東南部濕地

* 布倫口湖群濕地

* 葉爾羌河流域濕地

* 阿克蘇濕地

* 渭干河流域濕地

* 伊犁河濕地

* 烏魯木齊河濕地



青藏地區


* 鯨魚湖濕地

* 阿其克庫勒湖濕地

* 若爾蓋高原沼澤濕地

* 尕海濕地

* 九寨溝濕地

* 青海湖濕地

* 茶卡鹽湖濕地

* 冬給措納湖濕地

* 鄂陵湖濕地

* 扎陵湖濕地

* 隆寶灘濕地

* 依然錯濕地

* 多爾改錯濕地

* 卓乃湖濕地

* 庫賽湖濕地

* 哈拉湖濕地

* 托素湖和克魯克湖濕地

* 柴達木盆地中的濕地

* 蘇干湖和小蘇干湖濕地

* 尕斯庫勒湖濕地

* 瑪多湖濕地

* 黃河源區崗納格瑪錯濕地

* 羌塘地區的湖泊濕地

* 美馬錯濕地

* 羊卓雍錯濕地

* 大加錯濕地

* 馬河沼澤區濕地

* 瑪芳雍錯和拉昂錯濕地

* 班公湖濕地

* 大竹卡河沼澤區濕地

* 聶榮、安多沼澤區濕地

* 那曲沼澤濕地

* 班戈湖群沼澤濕地

* 色林錯沼澤濕地

* 馬泉河流域沼澤濕地

* 烏馬曲沼澤濕地

* 羊八井沼澤濕地

* 納木錯沼澤濕地

比較兩份名錄，可知除騰衝北海濕地外，濃江 — 沃里蘭河（洪河）濕地已併入三江平原東北部濕地；小興凱湖濕地併入興凱湖濕地；微山湖濕地併入南四湖區濕地；西沙群島東島濕地併入西沙群島濕地。

《中國重要濕地名錄》除有中國內地之重要濕地，也將台灣、香港地區的重要濕地列入其中。台灣方面則於 2007 年 12 月劃定了 75 處「台灣國家重要濕地」，將台灣本島及金門、連江馬祖等地之重要濕地按重要性區分為國際級濕地（2 處）、國家級濕地（41 處）和地方級濕地（32 處），下為其中之國際級濕地和國家級濕地：


* 國際級濕地：曾文溪口濕地、四草濕地；

* 國家級濕地：夢幻湖濕地、關渡濕地、大漢新店濕地、挖子尾濕地、淡水河紅樹林濕地、五股濕地、桃園埤圳濕地、新豐濕地、鴛鴦湖濕地、香山濕地、七家灣溪濕地、高美濕地、大肚溪口濕地、鰲鼓濕地、好美寮濕地、布袋鹽田濕地、八掌溪口濕地、北門濕地、官田濕地、七股鹽田濕地、鹽水溪口濕地、楠梓仙溪濕地、大鬼湖濕地、洲仔濕地、南仁湖濕地、龍鑾潭濕地、新武呂溪濕地、大坡池濕地、卑南溪口濕地、小鬼湖濕地、花蓮溪口濕地、馬太鞍濕地、雙連埤濕地、蘭陽溪口濕地、五十二甲濕地、無尾港濕地、南澳濕地、青螺濕地、慈湖濕地、清水濕地、嘉南埤圳濕地。

據此分析，除《中國重要濕地名錄》中的日月潭濕地外其餘 5 處台灣濕地兩份名錄均有收錄。日月潭濕地已因水庫之興建而消亡，因此亦不見於「台灣國家重要濕地」中之地方級濕地。