日本有 100 種以上的哺乳類，其中約 30% 為特有種。



食蟲目 Insectivora


* 蝟科 Erinaceidae
1. 刺蝟 - _Erinaceus europaeus_ (ナミハリネズミ，並針鼠) ※移入種

* 鼩鼱科 Soricidae
1. 本州鼩鼱 - _Sorex hosonoi_ (アズミトガリネズミ，安曇尖鼠) ※固有種
  1. _S. h. hosonoi_ (アズミトガリネズミ，安曇尖鼠)
  2. _S. h. shiroumanus_ (シロウマトガリネズミ，白馬尖鼠)
2. 姬鼩鼱 - _Sorex minutissimus_ (チビトガリネズミ，禿尖鼠)
  1. _S. m. hawkeri_ (トウキョウトガリネズミ，東京尖鼠)
3. 細鼩鼱 - _Sorex gracillimus_ (ヒメトガリネズミ，姫尖鼠)
4. 中鼩鼱 - _Sorex caecutiens_ (トガリネズミ，尖鼠)
  1. _S. c. shikokensis_ (シコクトガリネズミ，四國尖鼠) ※固有亜種
  2. 日本鼩鼱 - _S. c. shinto_ (ホンシュウトガリネズミ，本州尖鼠) ※固有亜種
  3. _S. c. saevus_ (エゾトガリネズミ，蝦夷尖鼠)
5. 佐渡鼩鼱 - _Sorex sadonis_ (サドトガリネズミ，佐渡尖鼠) ※固有種
6. 長爪鼩鼱 - _Sorex unguiculatus_ (オオアシトガリネズミ，大足尖鼠)
7. 西南水鼩 - _Chimarrogale platycephala_ (カワネズミ，川鼠) ※固有種
8. 小麝鼩 - _Crocidura suaveolens_ (コジネズミ，小地鼠)
  1. _C. s. shantungensis_ (チョウセンコジネズミ，朝鮮小地鼠)
9. 長尾小麝鼩 - _Crocidura horsfieldii_ (オナガジネズミ，尾長地鼠)
  1. _C. h. watasei_ (ワタセジネズミ，渡瀬地鼠) ※固有亜種
10. 德氏麝鼩 - _Crocidura dsinezumi_ (ジネズミ，地鼠) ※固有種
  1. _C. d. chisai_ (ホンシュウジネズミ，本州地鼠)
  2. _C. d. dsinezumi_ (サイゴクジネズミ，西國地鼠)
  3. _C. d. intermedia_ (タネジネズミ，種地鼠)
  4. _C. d. okinoshimae_ (オキノシマジネズミ，沖ノ島地鼠)
  5. _C. d. umbrina_ (ヤクジネズミ，屋久地鼠)
11. 奧里麝鼩 - _Crocidura orii_ (オリイジネズミ，折居地鼠) ※固有種
12. 臭鼩 - _Suncus murinus_ (ジャコウネズミ，麝香鼠)
  1. _S. m. riukiuana_ (リュウキュウジャコウネズミ，琉球麝香鼠)

* 鼴科 Talpidae
1. 毛吻鼩鼴 - _Dymecodon pilirostris_ (ヒメヒミズ，姫日不見) ※固有種
2. 日本鼩鼴 - _Urotrichus talpoides_ (ヒミズ，日不見) ※固有種
  1. _U. t. adversus_ (ツシマヒミズ，対馬日不見)
  2. _U. t. centralis_ (シコクヒミズ，四國日不見)
  3. _U. t. hondonis_ (ホンシュウヒミズ，本州日不見)
  4. _U. t. minutus_ (オキヒミズ，隠岐日不見)
  5. _U. t. talpoides_ (キュウシュウヒミズ，九州日不見)
3. 本州鼴 - _Euroscaptor mizura_ (ミズラモグラ，髻土竜) ※固有種
  1. _E. m. hiwaensis_ (ヒワミズラモグラ，ひわ髻土竜)
  2. _E. m. mizura_ (フジミズラモグラ，富士髻土竜)
  3. _E. m. ohtai_ (シナノミズラモグラ，信濃髻土竜)
4. 尖閣鼴鼠 - _Nesoscaptor uchidai_ (センカクモグラ，尖閣土竜) ※固有種 / 1976 年採取、1991 年新種認定。
5. _Mogera imaizumii_ (アズマモグラ，東土竜) ※固有種
  1. _M. i. imaizumii_ (コモグラ，小土竜)
  2. 本州缺齒鼴 - _M. i. minor_ (コモグラ，小土竜)
6. 佐渡缺齒鼴 - _Mogera tokudae_ (サドモグラ，佐渡土竜) ※固有種
  1. 倭缺齒鼴 - _M. t. etigo_ (エチゴモグラ，越後土竜)
  2. 佐渡缺齒鼴 - _M. t. tokudae_ (サドモグラ，佐渡土竜)
7. 小缺齒鼴 - _Mogera wogura_ (コウベモグラ，神戸土竜)
  1. _M. w. coreana_ (コウライモグラ，高麗土竜)
  2. _M. w. kanai_ (ヤクシマモグラ，屋久島土竜)
  3. 日本缺齒鼴 - _M. w. kobeae_ (コウベモグラ，神戸土竜)
  4. _M. w. wogura_ (コウベモグラ，神戸土竜)



翼手目 Chiroptera


* 狐蝠科 Pteropidae
1. 琉球狐蝠 - _Pteropus dasymallus_ (クビワオオコウモリ，首輪大蝙蝠)
  1. _P. d. daitoensis_ (ダイトウオオコウモリ，大東大蝙蝠) ※天然記念物
  2. _P. d. dasymallus_ (エラブオオコウモリ，永良部大蝙蝠) ※天然記念物
  3. _P. d. inopinatus_ (オリイオオコウモリ，折居大蝙蝠)
  4. _P. d. yayeyamae_ (ヤエヤマオオコウモリ，八重山大蝙蝠)
2. _Pteropus loochoensis_ (オキナワオオコウモリ，沖縄大蝙蝠) ※絶滅種
3. 小笠原狐蝠 - _Pteropus pselaphon_ (オガサワラオオコウモリ，小笠原大蝙蝠) ※固有種 / 天然記念物

* 菊頭蝠科 Rhinolophidae
1. 馬鐵菊頭蝠 - _Rhinolophus ferrumequinum_ (キクガシラコウモリ，菊頭蝙蝠)
  1. _R. f. nippon_ (ニホンキクガシラコウモリ，日本菊頭蝙蝠)
  2. _R. f. mikadoi_ (ミカドキクガシラコウモリ)
2. 角菊頭蝠 - _Rhinolophus cornutus_ (コキクガシラコウモリ，小菊頭蝙蝠)
  1. _R. c. cornutus_ (ニホンコキクガシラコウモリ，日本小菊頭蝙蝠)
  2. _R. c. orii_ (オリイコキクガシラコウモリ，折居小菊頭蝙蝠)
3. _Rhinolophus pumilus_ (オキナワコキクガシラコウモリ，沖縄小菊頭蝙蝠) ※固有種
  1. _R. p. miyakonis_ (ミヤココキクガシラコウモリ，宮古小菊頭蝙蝠)
  2. _R. p. pumilus_ (オキナワコキクガシラコウモリ，沖縄小菊頭蝙蝠)
4. _Rhinolophus perditus_ (ヤエヤマコキクガシラコウモリ，八重山小菊頭蝙蝠) ※固有種
  1. 伊氏菊頭蝠 - _R. p. imaizumii_ (イリオモテコキクガシラコウモリ，西表小菊頭蝙蝠)
  2. _R. p. perditus_ (ヤエヤマコキクガシラコウモリ，八重山小菊頭蝙蝠)

* 蹄蝠科 Hipposideridae
1. 丑蹄蝠 - _Hipposideros turpis_ (カグラコウモリ，神楽蝙蝠)

* 蝙蝠科 Vespertilionidae
1. 菲氏鼠耳蝠 - _Myotis formosus_ (クロアカコウモリ，黒赤蝙蝠)
  1. _M. f. tsuensis_ (ツシマクロアカコウモリ，対馬黒赤蝙蝠) ※固有亜種
2. 大趾鼠耳蝠 - _Myotis macrodactylus_ (モモジロコウモリ，腿白蝙蝠)
3. 水鼠耳蝠 - _Myotis daubentonii_ (ドーベントンコウモリ，ドーベントン蝙蝠)
  1. _M. d. ussuriensis_ (ウスリドーベントンコウモリ，ウスリドーベントン蝙蝠)
4. 須鼠耳蝠 - _Myotis mystacinus_ (ホオヒゲコウモリ，頬髭蝙蝠)
  1. _M. m. gracilis_ (ウスリホオヒゲコウモリ，ウスリ頬髭蝙蝠)
5. 伊氏鼠耳蝠 - _Myotis ikonnikovi_ (ヒメホオヒゲコウモリ，姫頬髭蝙蝠)
  1. _M. i. fujiensis_ (フジホオヒゲコウモリ，富士頬髭蝙蝠)
  2. 日本鼠耳蝠 - _M. i. hosonoi_ (シナノホオヒゲコウモリ，信濃頬髭蝙蝠)
  3. 伊氏鼠耳蝠 - _M. i. ikonnikovi_ (ヒメホオヒゲコウモリ，姫頬髭蝙蝠)
  4. 本州鼠耳蝠 - _M. i. ozensis_ (オゼホオヒゲコウモリ，尾瀬頬髭蝙蝠)
  5. _M. i. yesoensis_ (エゾホオヒゲコウモリ，蝦夷頬髭蝙蝠)
6. 霜白鼠耳蝠 - _Myotis pruinosus_ (クロホオヒゲコウモリ，黒頬髭蝙蝠)
7. _Myotis yanbarensis_ (クロホオヒゲコウモリ，黒頬髭蝙蝠) ※固有種 / 1997 年発見、1998 年新種認定。
8. 福建鼠耳蝠 - _Myotis frater_ (カグヤコウモリ，加久矢蝙蝠)
  1. _M. f. kaguyae_ (カグヤコウモリ，加久矢蝙蝠) ※固有亜種
9. 納氏鼠耳蝠 - _Myotis nattereri_ (ノレンコウモリ，暖簾蝙蝠)
  1. 嗡聲鼠耳蝠 - _M. n. bombinus_ (ホンドノレンコウモリ，本土暖簾蝙蝠)
10. 普通伏翼 - _Pipistrellus abramus_ (アブラコウモリ，油蝙蝠)
11. 本州伏翼 - _Pipistrellus endoi_ (モリアブラコウモリ，森油蝙蝠) ※固有種
12. 薩氏伏翼 - _Pipistrellus savii_ (オオアブラコウモリ，大油蝙蝠) ※迷行種
  1. _P. s. velox_ (クロオオアブラコウモリ，黒大油蝙蝠)
  2. _P. s. coreensis_ (コウライオオアブラコウモリ，高麗大油蝙蝠)
13. 斯氏伏翼 - _Pipistrellus sturdeei_ (オガサワラアブラコウモリ，小笠原油蝙蝠) ※絶滅種
14. 北棕蝠 - _Eptesicus nilssonii_ (キタクビワコウモリ，姫堀川蝙蝠)
  1. _E. n. parvus_ (ヒメホリカワコウモリ，姫堀川蝙蝠)
15. _Eptesicus japonensis_ (クビワコウモリ，首輪蝙蝠) ※固有種
16. 日本山蝠 - _Nyctalus aviator_ (ヤマコウモリ，山蝙蝠)
17. _Nyctalus furvus_ (コヤマコウモリ，小山蝙蝠)
18. 大蝙蝠 - _Vespertilio superans_ (ヒナコウモリ，雛蝙蝠)
19. 普通蝙蝠 - _Vespertilio murinus_ (ヒメヒナコウモリ，姫雛蝙蝠) ※迷行種
20. 亞洲寬耳蝠 - _Barbastella leucomelas_ (チチブコウモリ，秩父蝙蝠)
  1. _B. l. darjelingensis_ (チチブコウモリ，秩父蝙蝠)
21. 大耳蝠 - _Plecotus auritus_ (ウサギコウモリ，兎蝙蝠)
  1. _P. a. sacrimontis_ (ニホンウサギコウモリ，日本兎蝙蝠) ※固有亜種
22. 亞洲長翼蝠 - _Miniopterus fuliginosus_ (ユビナガコウモリ，指長蝙蝠)
23. 長翼蝠 - _Miniopterus fuscus_ (リュウキュウユビナガコウモリ，琉球指長蝙蝠)
24. 白腹管鼻蝠 - _Murina leucogaster_ (テングコウモリ，天狗蝙蝠)
  1. _M. l. hilgendorfi_ (ニホンテングコウモリ，日本天狗蝙蝠)
25. _Murina ryukyuana_ (リュウキュウテングコウモリ，琉球天狗蝙蝠) ※固有種 / 1997 年発見、1998 年新種認定。
26. 烏蘇里管鼻蝠 - _Murina ussuriensis_ (コテングコウモリ，小天狗蝙蝠)
  1. 林管鼻蝠 - _M. u. silvatica_ (ニホンコテングコウモリ，日本小天狗蝙蝠)
27. 對馬管鼻蝠 - _Murina tenebrosa_ (クチバテングコウモリ，口羽天狗蝙蝠) ※固有種 / 1962 年発見、1970 年新種記載。

* 犬吻蝠科 Molossidae
1. 寬耳犬吻蝠 - _Tadarida insignis_ (オヒキコウモリ，尾曳蝙蝠)
  1. _T. i. latouchei_ (スミイロオヒキコウモリ，墨色尾曳蝙蝠)



靈長目 Primate


* 猴科 Cercopithecidae
1. 日本猴 - _Macaca fuscata_ (ニホンザル，日本猿) ※固有種 / 天然記念物
  1. _M. f. fuscata_ (ホンドザル，本土猿)
  2. _M. f. yakui_ (ヤクシマザル，屋久島猿)
2. 台灣猴 - _Macaca cyclopis_ (タイワンザル，台灣猿) ※移入種
3. 獼猴 - _Macaca mulatta_ (アカゲザル，赤毛猿) ※移入種



兔形目 Lagomorpha


* 鼠兔科 Ochotonidae
1. 極北鼠兔 - _Ochotona hyperborea_ (ナキウサギ，鳴兎)
  1. _O. h. yesoensis_ (エゾナキウサギ，蝦夷鳴兎)

* 兔科 Leporidae
1. 琉球兔 - _Pentalagus furnessi_ (アマミノクロウサギ，奄美野黒兎) ※固有種 / 特別天然記念物
2. 雪兔 - _Lepus timidus_ (ユキウサギ，雪兎)
  1. _L. t. ainu_ (エゾユキウサギ，蝦夷雪兎)
3. 短尾兔 - _Lepus brachyurus_ (ノウサギ，野兎) ※固有種
  1. _L. b. angustidens_ (トウホクノウサギ，東北野兎)
  2. _L. b. brachyurus_ (キュウシュウノウサギ，九州野兎)
  3. _L. b. lyoni_ (サドノウサギ，佐渡野兎)
  4. _L. b. okiensis_ (オキノウサギ，隠岐野兎)
4. 穴兔 - _Oryctolagus cuniculus_ (アナウサギ，穴兎) ※移入種



嚙齒目 Rodentia


* 松鼠科 Sciuridae
1. 赤腹麗松鼠 - _Callosciurus erythraeus_ (タイワンリス，台灣栗鼠) ※移入種
  1. _C. e. thaiwanensis_ (タイワンリス，台灣栗鼠)
2. 松鼠 - _Sciurus vulgaris_ (キタリス，北栗鼠)
  1. _S. v. orientis_ (エゾリス，蝦夷栗鼠)
3. 日本松鼠 - _Sciurus lis_ (ニホンリス，日本栗鼠) ※固有種
4. 花鼠 - _Tamias sibiricus_ (シマリス，縞栗鼠)
  1. _T. s. barberi_ (チョウセンシマリス，朝鮮縞栗鼠) ※移入種
  2. _T. s. lineatus_ (エゾシマリス，蝦夷縞栗鼠)
5. 日本飛鼠 - _Pteromys momonga_ (ホンドモモンガ，本土モモンガ) ※固有種
6. 飛鼠 - _Pteromys volans_ (タイリクモモンガ，大陸モモンガ)
  1. _P. v. orii_ (エゾモモンガ，蝦夷モモンガ) ※固有亜種
7. 白頰鼯鼠 - _Petaurista leucogenys_ (ムササビ，鼯鼠・鼺鼠) ※固有種
  1. _P. l. leucogenys_ (キュウシュウムササビ，九州鼯鼠)
  2. _P. l. nikkonis_ (ニッコウムササビ)
  3. _P. l. oreas_ (ワカヤマムササビ，和歌山鼯鼠)

* 睡鼠科 Gliridae
1. 日本睡鼠 - _Glirulus japonicus_ (ヤマネ，山鼠) ※固有種 / 天然記念物

* 鼠科 Muridae

1. 棕背䶄 - _Clethrionomys rufocanus_ (タイリクヤチネズミ，大陸谷地鼠)
  1. _C. r. bedfordiae_ (エゾヤチネズミ，蝦夷谷地鼠)
  2. 庫頁䶄 - _C. r. sikotanensis_ (シコタンヤチネズミ，色丹谷地鼠)
2. _Clethrionomys rex_ (ムクゲネズミ，尨毛鼠)
  1. _C. r. montanus_ (ミヤマムクゲネズミ，御山尨毛鼠) ※固有亜種
  2. _C. r. rex_ (リシリムクゲネズミ，利尻尨毛鼠) ※固有亜種
3. 紅背䶄 - _Clethrionomys rutilus_ (ヒメヤチネズミ，姫谷地鼠)
  1. _C. r. mikado_ (ミカドネズミ，帝鼠) ※固有亜種
4. _Eothenomys andersoni_ (ヤチネズミ，谷地鼠) ※固有種
  1. _E. a. andersoni_ (トウホクヤチネズミ，東北谷地鼠)
  2. _E. a. niigatae_ (ニイガタヤチネズミ，新潟谷地鼠)
  3. _E. a. imaizumii_ (ワカヤマヤチネズミ，和歌山谷地鼠)
5. _Eothenomys smithii_ (スミスネズミ，スミス鼠) ※固有種
  1. _E. s. okiensis_ (オキスミスネズミ，隠岐スミス鼠)
  2. _E. s. smithii_ (スミスネズミ，スミス鼠)
  3. _E. s. kageus_ (カゲネズミ，鹿毛鼠)
6. 日本田鼠 - _Microtus montebelli_ (ハタネズミ，畑鼠) ※固有種
  1. _M. m. brevicorpus_ (サドハタネズミ，佐渡畑鼠)
  2. _M. m. montebelli_ (ハタネズミ，畑鼠)
7. 麝鼠 - _Ondatra zibethicus_ (マスクラット) ※移入種
8. 巢鼠 - _Micromys minutus_ (カヤネズミ，萱鼠)
  1. _M. m. aokii_ (ツシマカヤネズミ，対馬萱鼠)
  2. _M. m. japonicus_ (シコクカヤネズミ，四國萱鼠)
  3. _M. m. hondonis_ (ホンシュウカヤネズミ，本州萱鼠)
9. 黑線姬鼠 - _Apodemus agrarius_ (セスジネズミ，背筋鼠)
10. 日本姬鼠 - _Apodemus argenteus_ (ヒメネズミ，姫鼠) ※固有種
  1. _A. a. argenteus_ (ホンドヒメネズミ，本土姫鼠)
  2. _A. a. celatus_ (オキヒメネズミ，隠岐姫鼠)
  3. _A. a. hokkaidi_ (エゾヒメネズミ，蝦夷姫鼠)
  4. _A. a. sagax_ (ツシマヒメネズミ，対馬姫鼠)
  5. _A. a. tanei_ (タネヒメネズミ，種姫鼠)
  6. _A. a. yakui_ (ヤクシマヒメネズミ，屋久島姫鼠)
11. 朝鮮姬鼠 - _Apodemus peninsulae_ (ハントウアカネズミ，半島赤鼠)
  1. _A. p. giliacus_ (カラフトアカネズミ，樺太赤鼠)
12. 大林姬鼠 - _Apodemus speciosus_ (アカネズミ，赤鼠) ※固有種
  1. _A. s. ainu_ (エゾアカネズミ，蝦夷赤鼠)
  2. _A. s. dorsalis_ (セグロアカネズミ，背黒赤鼠)
  3. _A. s. insperatus_ (オオシマアカネズミ，大島赤鼠)
  4. _A. s. miyakensis_ (ミヤケアカネズミ，三宅赤鼠)
  5. _A. s. navigator_ (オキアカネズミ，隠岐赤鼠)
  6. _A. s. speciosus_ (ホンドアカネズミ，本土赤鼠)
  7. _A. s. sadoensis_ (サドアカネズミ，佐渡赤鼠)
  8. _A. s. tusimaensis_ (ツシマアカネズミ，対馬赤鼠)
13. 裔鼠 - _Tokudaia osimensis_ (トゲネズミ，棘鼠) ※固有種 / 天然記念物
  1. 明氏裔鼠 - _T. o. muenninki_ (オキナワトゲネズミ，沖縄棘鼠)
  2. _T. o. osimensis_ (アマミトゲネズミ，奄美棘鼠)
  3. 德之島刺鼠 - _T. o. tokunoshimensis_ (トクノシマトゲネズミ，徳之島棘鼠) ※2006 年新種記載（Endo and Tsuchiya, 2006）。
14. 褐家鼠 - _Rattus norvegicus_ (ドブネズミ，溝鼠)
  1. _R. n. caraco_ (ニホンドブネズミ，日本溝鼠)
  2. _R. n. norvegicus_ (ヨウシュウドブネズミ，揚州溝鼠)
15. 黑家鼠 - _Rattus rattus_ (クマネズミ，熊鼠)
  1. _R. r. diardi_ (マレーシアクマネズミ，マレーシア熊鼠)
  2. 達氏家鼠 - _R. r. tanezumi_ (ニホンクマネズミ，日本熊鼠)
16. 琉球鼠 - _Diplorthrix legata_ (ケナガネズミ，毛長鼠) ※固有種 / 天然記念物
17. 小家鼠 - _Mus musculus_ (ハツカネズミ，廿日鼠)
  1. _M. m. molossinus_ (ホンドハツカネズミ，本土廿日鼠)
  2. _M. m. musculus_ (ヨウシュウハツカネズミ，揚州廿日鼠)
18. 台灣小家鼠 - _Mus caroli_ (オキナワハツカネズミ，沖縄廿日鼠)

* 河狸鼠科 Myocastoridae
1. 河狸鼠 - _Myocastor coypus_ (ヌートリア，海狸鼠・沼狸) ※移入種



食肉目 Carnivora


* 熊科 Ursidae
1. 北極熊 - _Ursus maritimus_ (ホッキョクグマ，北極熊) ※迷行種
2. 棕熊 - _Ursus arctos_ (ヒグマ，羆)
  1. _U. a. yesoensis_ (エゾヒグマ，蝦夷羆)
3. 亞洲黑熊 - _Ursus thibetanus_ (ツキノワグマ，月輪熊)
  1. 日本黑熊 - _U. t. japonicus_ (ニホンツキノワグマ，日本月輪熊)

* 浣熊科 Procyonidae
1. 浣熊 - _Procyon lotor_ (アライグマ) ※移入種
2. 食蟹浣熊 - _Procyon cancrivorus_ (カニクイアライグマ) ※移入種

* 犬科 Canidae

1. 貉 - _Nyctereutes procyonoides_ (タヌキ，狸)
  1. _N. p. albus_ (エゾタヌキ，蝦夷狸)
  2. _N. p. viverrinus_ (ホンドタヌキ，本土狸) ※天然記念物
2. 赤狐 - _Vulpes vulpes_ (キツネ，狐)
  1. _V. v. japonica_ (ホンドキツネ，本土狐)
  2. _V. v. schrencki_ (キタキツネ，北狐)
3. 狼 - _Canis lupus_ (オオカミ，狼)
  1. 北海道狼 - _C. l. hattai_ (エゾオオカミ，蝦夷狼) ※絶滅種
  2. 日本狼 - _C. l. hodophilax_ (ニホンオオカミ，日本狼) ※絶滅種

* 貂科 Mustelidae

1. 日本貂 - _Martes melampus_ (テン，貂)
  1. _M. m. melampus_ (ホンドテン，本土貂)
  2. 對馬貂 - _M. m. tsuensis_ (ツシマテン，対馬貂) ※天然記念物
2. 紫貂 - _Martes zibellina_ (クロテン，黒貂)
  1. _M. z. brachyura_ (エゾクロテン，蝦夷黒貂)
3. 日本鼬 - _Mustela itatsi_ (イタチ，鼬) ※固有種
  1. _M. i. asaii_ (オオシマイタチ)
  2. _M. i. itatsi_ (ホンドイタチ，本土鼬)
  3. 琉球鼬 - _M. i. sho_ (コイタチ，小鼬)
4. 黃鼬 - _Mustela sibirica_ (チョウセンイタチ，朝鮮鼬)
  1. 朝鮮鼬 - _M. s. coreana_ (チョウセンイタチ，朝鮮鼬)
5. 伶鼬 - _Mustela nivalis_ (イイズナ，飯綱)
  1. _M. n. namiyei_ (ニホンイイズナ，日本飯綱) ※固有種
6. 白鼬 - _Mustela erminea_ (オコジョ)
  1. 日本白鼬 - _M. e. nippon_ (ホンドオコジョ，本土オコジョ) ※固有亜種
  2. 北海道白鼬 - _M. e. orientalis_ (エゾオコジョ，蝦夷オコジョ)
7. 北美水貂 - _Mustela vison_ (ミンク) ※移入種
8. 獾 - _Meles meles_ (アナグマ，穴熊)
  1. 日本獾 - _M. m. anakuma_ (ニホンアナグマ，日本穴熊)
9. 水獺 - _Lutra lutra_ (カワウソ，川獺)
  1. 日本水獺 - _L. l. whiteleyi_ (ニホンカワウソ，日本川獺) ※特別天然記念物 ※絶滅種
10. 海獺 - _Enhydra lutris_ (ラッコ，海獺・猟虎)

* 靈貓科 Viverridae
1. 果子狸 - _Paguma larvata_ (ハクビシン，白鼻芯)

* 獴科 Herpestidae
1. 爪哇獴 - _Herpestes javanicus_ (ジャワマングース) ※移入種

* 貓科 Felidae

1. 豹貓 - _Prionailurus bengalensis_ (ベンガルヤマネコ，ベンガル山貓)
  1. _P. b. euptilura_ (ツシマヤマネコ，対馬山貓) ※天然記念物
  2. 西表山貓 - _P. b. iriomotensis_ (イリオモテヤマネコ，西表山貓) ※固有種 / 特別天然記念物 / 1967 年新種記載。

* 海獅科 Otariidae
1. 加州海獅 - _Zalophus californianus_ (アシカ，葦鹿)
  1. 日本海獅 -_Z. c. japonicus_ (ニホンアシカ，日本葦鹿) ※絶滅種
2. 北海獅 - _Eumetopias jubatus_ (トド，胡獱)
3. 海狗 - _Callorthinus ursinus_ (オットセイ，膃肭臍)

* 海象科 Odobenidae
1. 海象 - _Odobenus rosmarus_ (セイウチ，海象) ※迷行種

* 海豹科 Phocidae
1. 港海豹 - _Phoca vitulina_ (ゼニガタアザラシ，銭形海豹)
2. 斑海豹 - _Phoca largha_ (ゴマフアザラシ，胡麻斑海豹)
  1. _P. l. stejnegeri_ (ゴマフアザラシ，胡麻斑海豹)
3. 環斑海豹 - _Phoca hispida_ (ワモンアザラシ，輪紋海豹)
4. 環海豹 - _Histriophoca fasciata_ (クラカケアザラシ，鞍掛海豹)
5. 髯海豹 - _Erignathus barbatus_ (アゴヒゲアザラシ，顎鬚海豹)



偶蹄目 Artiodactyla


* 豬科 Suidae
1. 野豬 - _Sus scrofa_ (イノシシ，豬)
  1. 日本野豬 - _S. s. leucomystax_ (ニホンイノシシ，日本豬) ※固有亜種
  2. 琉球野豬 - _S. s. riukiuanus_ (リュウキュウイノシシ，琉球豬) ※固有亜種

* 鹿科 Cervidae

1. 梅花鹿 - _Cervus nippon_ (ニホンジカ，日本鹿)
  1. _C. n. keramae_ (ケラマジカ，慶良間鹿) ※固有亜種 / 天然記念物
  2. _C. n. nippon_ (ニホンジカ，日本鹿) ※固有亜種
  3. _C. n. pulchellus_ (ツシマジカ，対馬鹿) ※固有亜種
  4. _C. n. taiouanus_ (タイワンジカ，台灣鹿) ※移入種
  5. _C. n. yakushimae_ (ヤクシカ，屋久鹿) ※固有亜種
  6. _C. n. yesoensis_ (エゾジカ，蝦夷鹿) ※固有亜種
2. 小麂 - _Muntiacus reevesi_ (キョン，羌) ※移入種

* 牛科 Bovidae

1. 日本鬣羚 - _Capricornis crispus_ (ニホンカモシカ，日本氈鹿) ※固有種 / 特別天然記念物



海牛目 Sirenia


* 儒艮科 Dugongidae
1. 儒艮 - _Dugong dugon_ (ジュゴン，儒艮) ※天然記念物



鯨目 Cetacea


* 露脊鯨科 Balaenidae
1. 北極鯨 - _Balaena mysticetus_ (ホッキョククジラ，北極鯨)
2. 露脊鯨 - _Balaena glacialis_ (セミクジラ，背美鯨)

* 灰鯨科 Eschrichtiidae
1. 灰鯨 - _Eschrichtius robustus_ (コククジラ，克鯨)

* 鬚鯨科 Balaenopteridae
1. 藍鯨 - _Balaenoptera musculus_ (シロナガスクジラ，白長須鯨)
2. 長鬚鯨 - _Balaenoptera physalus_ (ナガスクジラ，長須鯨)
3. 鰮鯨 - _Balaenoptera borealis_ (イワシクジラ，鰯鯨)
4. 鯷鯨 - _Balaenoptera edeni_ (ニタリクジラ，似鯨)
5. 小鰮鯨 - _Balaenoptera acutorostrata_ (ミンククジラ，小鰯鯨)
6. 角島鯨 - _Balaenoptera omurai_ (ツノシマクジラ，角島鯨) ※1998 年死體発見、2002 年新種発表。
7. 座頭鯨 - _Megaptera novaeangliae_ (ザトウクジラ，座頭鯨)

* 抹香鯨科 Physeteridae
1. 抹香鯨 - _Physeter marcrocephalus_ (マッコウクジラ，抹香鯨)

* 小抹香鯨科 Kogiidae
1. 小抹香鯨 - _Kogia breviceps_ (コマッコウ，小抹香)
2. 矮抹香鯨 - _Kogia simus_ (オガワマッコウ，小川小抹香)

* 喙鯨科 Ziphiidae
1. 古氏劍吻鯨 - _Ziphius carvirostris_ (アカボウクジラ，赤坊鯨)
2. 太平洋劍喙鯨 - _Indopacetus pacificus_ (タイヘイヨウアカボウモドキ，太平洋赤坊擬)
3. 斯氏喙鯨 - _Mesoplodon stejnegeri_ (オウギハクジラ，扇歯鯨)
4. 卡氏喙鯨 - _Mesoplodon carlhubbsi_ (ハッブスオウギハクジラ，ハッブス扇歯鯨)
5. 瘤齒喙鯨 - _Mesoplodon densirostris_ (コブハクジラ，瘤歯鯨)
6. 杏齒喙鯨 - _Mesoplodon ginkgodens_ (イチョウハクジラ，銀杏歯鯨)
7. 拜氏鯨 - _Berardius bairdii_ (ツチクジラ，槌鯨)

* 獨角鯨科 Monodontidae
1. 獨角鯨 - _Monodon monoceros_ (イッカク，一角) ※迷行種
2. 白鯨 - _Delphinapterus leucas_ (シロイルカ，白海豚)

* 海豚科 Delphinidae
1. 逆戟鯨 - _Orcinus orca_ (シャチ，鯱)
2. 大吻巨頭鯨 - _Globicephala macrorhynchus_ (コビレゴンドウ，小鰭巨頭)
3. 巨頭鯨 - _Globicephala melas_ (ヒレナガゴンドウ，鰭長巨頭) ※絶滅 (日本)
4. 偽虎鯨 - _Pseudorca crassidens_ (オキゴンドウ，沖巨頭)
5. 小逆戟鯨 - _Feresa attenuata_ (ユメゴンドウ，夢巨頭)
6. 瓜頭海豚 - _Peponocephala electra_ (カズハゴンドウ，數歯巨頭)
7. 灰海豚 - _Grampus griseus_ (ハナゴンドウ，花巨頭)
8. 短吻真海豚 - _Delphinus delphis_ (マイルカ，真海豚)
9. 長吻真海豚 - _Delphinus capensis_ (ハセイルカ)
10. 藍白海豚 - _Stenella coeruleoalba_ (スジイルカ，筋海豚)
11. 弱原海豚 - _Stenella attenuata_ (マダライルカ，斑海豚)
12. 長嘴海豚 - _Stenella longirostris_ (ハシナガイルカ，嘴長海豚)
13. 寬吻海豚 - _Tursiops truncatus_ (ハンドウイルカ，半道海豚)
14. 太平洋斑紋海豚 - _Lagenorhynchus obliquidens_ (カマイルカ，鎌海豚)
15. 北鯨豚 - _Lissodelphis borealis_ (セミイルカ，背美海豚)
16. 糙齒長吻海豚 - _Steno bredanensis_ (シワハイルカ，皺歯海豚)
17. 霍氏海豚 - _Lagenodelphis hosei_ (サラワクイルカ，サラワク海豚)

* 鼠海豚科 Phocoenidae
1. 大西洋鼠海豚 - _Phocoena phocoena_ (ネズミイルカ，鼠海豚)
2. 白腰鼠海豚 - _Phocoenoides dalli_ (イシイルカ)
3. 江豚 - _Neophocaena phocaenoides_ (スナメリ，砂滑) ※天然記念物



參考文獻


* 阿部永他，1994，『日本の哺乳類』。東海大學出版會。

* 小宮輝之，2002，『フィールド ベスト図鑑 日本の哺乳類』。學習研究社。

* 今泉吉典，1960，『原色日本哺乳類図鑑』。保育社。