已測序的生物

已測序的生物指其基因組已經被完全測序的生物。其中部分生物的DNA序列已經被完全註釋，功能性的片段（如基因等）已作圖。

藉助於基因組研究及高通量處理等技術，越來越多的生物的全部基因被人們獲得。自從1995年以來已經有150個基因組被解密，將近每個星期有新的物種添加進來。

## 已測序的生物列表

下表是目前爲止已經被相當完全測序的生物。

### 細菌

- Agrobacterium tumefaciens - Pflanzenes Bakterium, tumorbildend
- Aquifex aeolicus - Hyperthermophiles Meeresbakterium
- Bacillus anthracis - Anthrax-Erreger
- Bacillus cereus - Erreger einer Lebensmittelvergiftung
- Bacillus halodurans - Enzymproduzierendes Bakterium（Industriell genutzt）
- Bacillus subtilis - Enzymproduzierendes Bakterium（Industriell genutzt）
- Bacteroides thetaiotaomicron - Darmbakterium
- Bifidobacterium longum - Darmbakterium
- Blochmannia floridanus - Bakterium in Symbiose mit
- - Erreger chronischer Infektionen der Atemwege
- - Erreger von mildem Keuchhusten
- Bordetella pertussis - Erreger von Keuchhusten
- Borrelia burgdorferi - -Erreger
- Bradyrhizobium japonicum - Knöllchenbakterium der Sojabohne
- - Erreger des Maltafiebers
- Brucella suis - potentielle Biowaffe der USA, wirkt abtreibend
- Buchnera aphidicola - Bakterium in Symbiose mit Blattläusen
- Burkholderia mallei - Erreger des es bei Huftieren, auch humanpathogen（Einsatz als Biowaffe）
- Burkholderia pseudomallei - Erreger der Melioidose, vor allem in Südostasien
- Campylobacter jejuni - Erreger einer Lebensmittelvergiftung
- Caulobacter crescentus - Süßwasserbakterium
- Chlamydia muridarum - Atemwegsinfektionen bei Maus und Meerschweinchen
- Chlamydophila caviae - Augenentzündungen bei Meerschweinchen
- Chlamydia trachomatis - Erreger der Harnröhrenentzündung
- - Erreger einer Bronchitis
- Chlorobium tepidum - Grünes Schwefelbakterium
- Chromobacterium violaceum - humanpathogenes Bakterium（Diarrhoe und andere Erkrankungen）
- Clostridium acetobutylicum - Aceton- und Butanol-produzierendes Bakterium
- Clostridium perfringens - Erreger Diarrhoe etc.
- Clostridium tetani - Tetanus-Erreger
- Corynebacterium diphtheriae - Erreger der Diphtherie
- - nosokomial pathogener Hautbewohner
- Corynebacterium efficiens - Bakterium zur Produktion von Aminosäuren u. a.
- - Erreger des Q-Fieber
- Deinococcus radiodurans - extrem strahlungstolerantes Bakterium
- Desulfotalea psychrophila - extrem kältetolerantes Bakterium des arktischen es
- Desulfovibrio vulgaris - Bakterium aus Ölfeldern, wirtschaftlicher Schädling
- - , Modellorganismus
- Escherichia coli - , Modellorganismus
- Fusobacterium nucleatum - Verbreitetes Bakterium im Zahnbelag
- Haemophilus ducreyi - Erreger des
- Haemophilus influenzae - Erreger einer Erkältung
- Helicobacter hepaticus - Erreger chronischer Hepatis und von Lebergeschwüren bei Mäusen.
- Helicobacter pylori - Erreger von Magengeschwüren
- - Milchsäurebakterium
- Lactococcus lactis - Käsebakterium
- Legionella pneumophila - Erreger der Legionärskrankheit
- Leifsonia xyli - ein pflanzenpathogenes Bakterium
- Leptospira interrogans - Erreger der Leptospirosis
- Listeria innocua - nicht pathogene Listeria-Art
- Listeria monocytogenes - Erreger einer Lebensmittelvergiftung
- Mannheimia succiniciproducens - symbiotisches Bakterium im Magen von Kühen
- Mesoplasma florum - Bakterium mit extrem kleinen Genom
- Mesorhizobium loti - Knöllchenbakterium bei Lotus-Arten
- Mycobacterium leprae - Erreger der Lepra
- - Erreger der
- - Erreger der Rinderkrankheit Johne's Desease
- Mycobacterium tuberculosis - Erreger der Tuberkulose
- Mycoplasma gallisepticum - Erreger einer chronischen Atemwegserkrankung bei Geflügel
- Mycoplasma genitalium - Erreger von Infektionen des Genitaltraktes
- Mycoplasma penetrans - Erreger von Entzündungen des Harn- und Genitaltraktes sowie der Atemwege, evtl. assoziiert mit dem HI-Virus（AIDS）
- Mycoplasma pneumoniae - Erreger einer Bronchitis
- Mycoplasma pulmonis - Erreger von Infektionen des Harn- und Genitaltraktes sowie der Atemwege bei Mäusen
- Neisseria meningitidis - Erreger der Meningitis（Hirnhautentzündung）
- Nitrisomonas europaea - Nitratbakterium
- Oceanobacillus iheyensis - Tiefseebakterium
- - Erreger von Vogelcholera, Ansteckender Kaninchenschnupfen, Hämorrhagischem Fieber bei Weidevieh und Arthritis bei Schweinen und Menschen u.a.
- Photorabdus luminescens - Bakterium in Symbiose mit insektenen Fadenwürmern
- Porphyromonas gingivalis - Erreger von Parodontose
- - Meeresbakterium
- Pseudomonas aeruginosa - als bei geschwächtem Immunsystem pathogen
- Pseudomonas putida - Bodenbakterium zum Abbau von en
- Pseudomonas syringae - Pflanzenpathogenes Bakterium, u. a. Tomatenschädling
- Ralstonia solanacearum - Pflanzenpathogenes Bakterium, bei Hunderten verschiedener Pflanzenarten
- Rhodopirellula baltica - Rotes Meeresbakterium
- Rhodopseudomonas palustris - Purpurbakterium
- Rickettsia conorii - Erreger des Mittelmeer-Fleckfieber
- Rickettsia prowazekii - Erreger des Typhus
- Rickettsia sibirica - Erreger von Zeckenfieber in Nordasien
- Rickettsia typhi - Erreger des Mäusetyphus（auch humanpathogen）
- - Erreger des Typhusfieber
- - Erreger des Typhusfieber bei der Maus
- Shewanella oneidensis - Metallabbauendes Bodenbakterium
- Shigella flexneria - evtl. Ursache von Plötzlichem Kindstod
- - Knöllchenbakterium des
- Staphylococcus aureus - Erreger von Scharlachfieber und Toxinschocks
- Staphylococcus epidermidis - Hautbakterium, pathogen bei Wunden
- - Erreger von schweren ninfektionen, Meningitis u. a.
- - Erreger von Karies
- Streptococcus pneumoniae - Erreger von Lungenentzündungen, Menigitis und en
- Streptococcus pyogenes - Erreger von Rheumatischem Fieber, Toxinschocks u. a.
- - Antibiotikaproduzierendes Bakterium（industriell genutzt）
- - Antibiotikaproduzierendes Bakterium（industriell genutzt）
- Thermoanaerobacter tengcongensis - Bakterium aus heißen Quellen in Volksrepublik China
- Thermotoga maritima - sehr säureliebendes Bakterium, reinigt Bergwerkshalden u. a.
- Thermus thermophilus - hitzeliebendes Bakterium aus Japan, findet Einsatz in der PCR und anderswo.
- Treponema pallidum - Erreger der Syphilis
- Tropheryma whippley - Erreger der
- Ureaplasma urealyticum - Erreger von Infektionen des Harn- und Genitaltraktes
- Vibrio cholerae - Erreger der Cholera
- Vibrio fischeri - Leuchtbakterium, das im Meer lebt und für die Qualitätsbestimmung von Abwasser verwendet wird
- Vibrio parahaemolyticus - Erreger schwerer Magen-Darm-Entzündungen
- Vibrio vulnificus - Meeresbakterium, kann zu Erkrankungen durch Verzehr von rohen Meeresorganismen führen.
- Wigglesworthia glossinidia - Erreger der
- Wolinella succinogenes - Bakterium im Kuhmagen
- Xanthomonas axonopodis - Pflanzenpathogenes Bakterium, erzeugt Zitronenkrebs bei Zitrusfrüchten
- Xanthomonas campestris - Pflanzenpathogenes Bakterium, erzeugt Schwarzfäule bei Kreuzblütern
- Xylella fastidiosa - Pflanzenpathogenes Bakterium, schwerer Schädling in Obst-, - und Kaffee-Plantagen in Nord- und Südamerika
- Yersinia pestis - Erreger der Pest

#### 藍藻

- Anabaena spec. - Fadenblaualge
- Gloeobacter violaceus - primitive Blaualge
- Synechococcus spec. - Meeres-Blaualge
- Synechocystis spec. - Meeres-Blaualge
- Thermosynechococcus elongatus - Thermophile Blaualge

### 真核生物

#### 原生生物

- Leishmania infantum - 一種利什曼原蟲
- Leishmania major - 一種利什曼原蟲
- Plasmodium falciparum - 惡性瘧原蟲
- Plasmodium yoelii yoelii - 約氏瘧原蟲，引起嚙齒動物瘧疾
- Thalassiosira pseudonana - 一種海洋硅藻
- Trypanosoma brucei - 一種錐體蟲
- Trypanosoma congolense - 一種錐體蟲
- Trypanosoma cruci - 一種錐體蟲
- Trypanosoma vivax - 一種錐體蟲

#### 真菌

- Ashbya gossypii - 感染柑橘類和棉花的真菌
- Aspergillus fumigatus - 煙麴黴，人類致病菌
- Aspergillus nidulans - 構巢麴黴
- Debaryomyces hansenii - 耐鹽的酵母
- Encephalitozoon cuniculi - 一種單細胞微孢子蟲
- Kluyveromyces lactis - 具有潛在藥用生産價值的酵母
- Kluyveromyces waltii - 一種酵母
- Magnaporthe grisea - 稻熱病菌
- Neurospora crassa - 粗糙脈孢菌，橙色的麫包黴，模式生物
- Phanerochaete chrysosporium - 白腐病病菌
- Saccharomyces cerevisiae - 釀酒酵母，模式生物
- Schizosaccharomyces pombe - 粟酒裂殖酵母
- Trichoderma reesei = Hypocrea jecorina - 一種木黴
- Yarrowia lipolytica - 一種酵母
- Candida albicans - 白色唸珠菌，人類致病菌

#### 植物

物種	基因組大小和開放閱讀框	文獻

Sesamum indicum L. Sesame芝麻（2n = 26）	293.7 Mb, 10,656 orfs	1

Oryza brachyantha短藥野生稻	261 Mb, 32,038 orfs	2

Chondrus crispus Red seaweed愛爾蘭海藻	105 Mb, 9,606 orfs	3

Pyropia yezoensis susabi-nori海苔	43 Mb, 10,327 orfs	4

Prunus persica Peach桃	226.6 of 265 Mb 27,852 orfs	5

Aegilops tauschii山羊草（DD）	4.23 Gb (97% of the 4.36), 43,150 orfs	6

Triticum urartu烏拉爾圖小麥（AA）	4.66 Gb (94.3 % of 4.94 Gb, 34,879 orfs	7

moso bamboo (Phyllostachys heterocycla)毛竹	2.05 Gb (95%) 31,987 orfs	8

Cicer arietinum Chickpea 鷹嘴豆	~738-Mb，28,269 orfs 9 520 Mb (70% of 740 Mb), 27,571 orfs	10

Prunus mume梅	280 Mb, 31,390 orfs	11

Gossypium hirsutum L.陸地棉	2.425 Gb	12

Gossypium hirsutum L.雷蒙德氏棉	761.8 Mb	13

Citrus sinensis甜橙	87.3% of ~367 Mb, 29,445 orfs	14

甜橙	367 Mb	15

Citrullus lanatus watermelon西瓜	353.5 of ~425 Mb (83.2%) 23,440 orfs	16

Betula nana dwarf birch，矮樺	450 Mb	17

Nannochloropsis oceanica CCMP1779微綠球藻（產油藻類之一）	28.7 Mb，11,973 orfs	18

Triticum aestivum bread wheat普通小麥	17 Gb, 94,000 and 96,000 orfs	19

Hordeum vulgare L. barley大麥	1.13 Gb of 5.1 Gb，26,159 high confidence orfs，53,000 low confidence orfs	20

Gossypium raimondii cotton雷蒙德氏棉	D subgenome,88% of 880 Mb 40,976 orfs	21

Linum usitatissimum flax亞麻	302 mb (81%), 43,384 orfs	22

Musa acuminata banana香蕉	472.2 of 523 Mb, 36,542 orfs	23

Cucumis melo L. melon甜瓜	375 Mb（83.3%）27,427 orfs	24

Pyrus bretschneideri Rehd. cv. Dangshansuli梨（碭山酥梨）	512.0 Mb (97.1%), 42,812 orfs	25,26

Solanum lycopersicum番茄	760/900 Mb，34727 orfs	27

S. pimpinellifolium LA1589野生番茄	739 Mb

Setaria狗尾草屬（穀子、青狗尾草）	400 Mb，25000-29000 orfs	28,29

Cajanus cajan pigeonpea木豆	833 Mb，48,680 orfs	30

Nannochloropis gaditana一種海藻	~29 Mb, 9,052 orfs	31

Medicago truncatula蒺藜苜蓿	350.2 Mb, 62,388 orfs	32

Brassica rapa白菜	485 Mb	33

Solanum tuberosum馬鈴薯（DM）	725 Mb,39031 orfs	34

Thellungiella parvula條葉藍芥	13.08 Mb 29,338 orfs	35

Arabidopsis lyrata lyrata玉山筷子芥?	183.7 Mb, 32670 orfs	36

Fragaria vesca野草莓	240 Mb，34,809 orfs	37

Theobroma cacao可可	76% of 430 Mb, 28,798 orfs	38

Aureococcus anophagefferens褐潮藻	32 Mb, 11501 orfs	39

Selaginella moellendorfii江南卷柏	208.5 Mb, 34782 orfs	40

Jatropha curcas Palawan麻瘋樹	285.9 Mb, 40929 orfs	41

Oryza glaberrima光稃稻（非洲栽培稻）	206.3 Mb (0.6x), 10 080 orfs（>70% coverage）	42

Phoenix dactylifera棕棗	380 Mb of 658 Mb, 25,059 orfs	43

Chlorella sp. NC64A小球藻屬	40000 Kb, 9791 orfs	44

Ricinus communis蓖麻 325 Mb, 31,237 orfs	45

Malus domestica (Malus x domestica) 蘋果	742.3 Mb	46

Volvox carteri f. nagariensis 69-1b 一種團藻	120 Mb, 14437 orfs	47

Brachypodium distachyon 短柄草	272 Mb，25,532 orfs	48

Glycine max cultivar Williams 82栽培大豆	1.1 Gb, 46430 orfs	49

Zea mays ssp. Mays Zea mays ssp. Parviglumis Zea mays ssp. Mexicana Tripsacum dactyloides var. meridionale	無法下載附表	50

Zea mays mays cv. B73玉米	2.06 Gb, 106046 orfs	51

Cucumis sativus 9930黃瓜	243.5 Mb, 63312 orfs	52

Micromonas pusilla金藻	21.7 Mb, 10248 orfs	53

Sorghum bicolor高粱	697.6 Mb, 32886 orfs	54

Phaeodactylum tricornutum三角褐指藻	24.6 Mb, 9479 orfs	55

Carica papaya L. papaya番木瓜	271 Mb (75%), 28,629 orfs	56

Physcomitrella patens patens小立碗蘚	454 Mb, 35805 orfs	57

Vitis vinifera L. Pinot Noir, clone ENTAV 115 葡萄	504.6 Mb, 29585 orfs	58

Vitis vinifera PN40024 葡萄	475 Mb	59

Ostreococcus lucimarinus 綠色鞭毛藻	13.2 Mb, 7640 orfs	60

Chlamydomonas reinhardtii 萊茵衣藻	100 Mb, 15256 orfs	61

Populus trichocarpa 黑三角葉楊	550 Mb, 45000 orfs	62

Ostreococcus tauri 綠藻	12.6 Mb, 7892 orfs	63

Oryza sativa ssp. japonica 粳稻	360.8 Mb, 37544 orfs	64

Thalassiosira pseudonana硅藻	25 Mb, 11242 orfs	65

Cyanidioschyzon merolae 10D紅藻	16.5 Mb, 5331 orfs	66

Oryza sativa ssp. japonica粳稻	420 Mb, 50000 orfs	67

Oryza sativa L. ssp. Indica秈稻 420 Mb, 59855 orfs	68

Guillardia theta 藍隱藻	551 Kb, 553 orfs	69

Arabidopsis thaliana Columbia 擬南芥	119.7 Mb, 31392 orfs	70

#### 動物

- Anopheles gambiae - 甘比亞按蚊
- Apis mellifera - 意蜂
- Bos taurus cattle - 牛
- Caenorhabditis briggsae - 一種線蟲
- Caenorhabditis elegans - 秀麗隱桿線蟲，模式生物
- Canis lupus familiaris dog- 狗
- Ciona intestinalis - 玻璃海鞘
- Ciona savignyi - 海鞘
- Drosophila melanogaster - 黑腹果蠅，模式生物
- Fugu rubripes - 河豚
- Gallus gallus - 雞
- Homo sapiens - 人
- Mus musculus - 小鼠，模式生物
- Pan troglodytes - 黑猩猩
- Rattus norvegicus - 大鼠
- Schistosoma haematobium - 埃及血吸蟲
- Culex quinquefasciatus - 庫蚊
- Solenopsis invicta - 火蟻
- Nasonia vitripennis - 金小蜂
- Linepithema humile - 阿根廷蟻

## 參考文獻

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