魚類分類表

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## 無頜總綱 Agnatha（並系群）

- †昆明魚目 Myllokunmingiida?
- †昆明魚科 Myllokunmingiidae
- 圓口綱 Cyclostomata
- 七鰓鰻亞綱 Petromyzonida
- †科 Hardistiellidae
- †科 Mayomyzonidae
- †科 Pipisciidae
- †普利斯鰻屬 Priscomyzon
- †中生鰻屬 Mesomyzon
- 七鰓鰻目 Petromyzontiformes
- 七鰓鰻科 Petromyzontidae
- 囊口七鰓鰻科 Geotriidae
- 袋七鰓鰻科 Mordaciidae
- 盲鰻亞綱 Myxini
- 盲鰻目 Myxiniformes
- 盲鰻科 Myxinidae
- †甲冑魚類 Ostracoderms
- †鰭甲魚綱 Pteraspidomorphi
- †屬 Anatolepis
- †阿蘭達甲魚亞綱 Arandaspida
- †阿蘭達甲魚科 Arandaspididae
- †異甲亞綱 Heterostracomorphi
- †星甲魚目 Astraspida
- †目 Eriptychiida
- †異甲類 Heterostraci
- †杯甲魚目 Cyathaspidiformes
- †亞目 Cyathaspidida
- †科 Cyathaspidae
- †科 Ctenaspididae
- †科 Ariaspidae
- †亞目 Amphiaspidida
- †下目 Amphiaspidoidei
- †科 Edaphaspididae
- †科 Amphiaspididae
- †科 Gabreyaspididae
- †科 Olbiaspididae
- †下目 Hibernaspidoidei
- †科 Hibernaspididae
- †科 Eglonaspididae
- †科 Aphataspididae
- †下目 Siberiaspidoidei
- †科 Siberiaspididae
- †科 Tuxeraspididae
- †鰭甲魚目 Pteraspidiformes
- †科 Anchipteraspididae
- †總科 Psammosteida
- ?†科 Weigeltaspididae
- †科 Psammosteidae
- †科 Drepanaspididae
- †科 Guerichosteidae
- †科 Pycnosteidae
- †科 Psammolepididae
- †科 Obrucheviidae
- †科 "Protopteraspididae"
- †鰭甲魚亞目 Pteraspidoidei
- †鰭甲魚科 Pteraspididae
- †科 Gigantaspididae
- †科 Protaspididae
- 地位未定 incertae sedis
- †屬 Palanasaspis
- †目 Cardipeltida
- †科 Cardipeltidae
- †目 Lepidaspidida
- †目 Corvaspidida
- †目 Tolypelepidida
- †科 Tolypelepididae
- †目 Tesseraspidida
- †目 Traquairaspidiformes
- †科 Traquairaspididae
- †花鱗魚綱 Thelodonti
- †科 Oeseliidae
- †花鱗魚目 Thelodontiformes
- †科 Coelolepidae
- †科 Eestilepididae
- †科 Helenolepididae
- †科 Loganelliidae
- †科 Longodidae
- †科 Palaeodontidae
- †科 Phlebolepididae
- †科 Shieliidae
- †科 Talivaliidae
- †都靈魚科 Turiniidae
- †叉尾花鱗魚目 Furcacaudiformes
- †科 Apalolepididae
- †科 Barlowodidae
- †科 Drepanolepididae
- †叉尾花鱗魚科 Furcacaudidae
- †椎鱗魚科 Lanarkiidae
- †尼考里維魚科 Nikoliviidae
- †科 Pezopallichthyidae
- †目 Archipelepidiformes
- †科 Archipelepididae
- †科 Boothialepididae
- †缺甲魚綱 Anaspida
- †Endeiolepidiformes
- †Endeiolepididae
- †長鱗魚目 Birkeniiformes
- †科 Pharyngolepididae
- †科 Pterygolepididae
- †科 Rhyncholepididae
- †科 Tahulalepididae
- †科 Lasaniidae
- †科 Ramsaasalepididae
- †長鱗魚科 Birkeniidae
- †科 Septentrioniidae
- †盔甲魚綱 Galeaspida
- †漢陽魚科 Hanyangaspididae
- †修水魚科 Xiushuiaspididae
- †大庸魚科 Dayongaspididae
- †真盔甲魚目 Eugaleaspidiformes
- †盾魚屬 Dunyu
- †曙魚屬 Shuyu
- †土家魚屬 Tujiaaspis
- †靈動土家魚Tujiaaspis vividus
- †科 Tridensaspididae
- †中華盔甲魚科 Sinogaleaspididae
- †真盔甲魚科 Eugaleaspididae
- †多鰓魚總目 Polybranchiaspidida
- †昭通魚科 Zhaotongaspididae
- †多鰓魚目 Polybranchiaspidiformes
- †古木魚科 Gumuaspididae
- †秀甲魚科 Geraspididae
- †五窗魚科 Pentathyraspididae
- †都勻魚科 Duyunolepididae
- †科 Hyperaspididae
- †多鰓魚科 Polybranchiaspididae
- †華南魚目 Huananaspidiformes
- †三歧魚科 Sanqiaspididae
- †三岔魚科 Sanchaspididae
- †鴨吻魚科 Gantarostraspididae
- †華南魚科 Huananaspidae
- †大窗魚亞科 Macrothyraspinae
- †茄甲魚綱 Pituriaspida
- †茄甲魚屬 Pituriaspis
- †尼亞巴魚屬 Neeyambaspis
- †骨甲魚綱 Osteostraci
- †目 Atelaspidiformes
- †科 Ateleaspididae
- †目 Cephalaspidida
- †科 Cephalaspidae
- †禪甲魚目 Zenaspidida
- †對稱天國魚科 Parameteoraspididae
- †禪甲魚科 Zenaspididae
- †目 Benneviaspidida
- †科 Boreaspididae
- †目 Thyestiida
- †科 Tannuaspididae
- †科 Thyestiidae
- †萌甲魚科 Tremataspididae
- 有頷類 Gnathostomata

## 有頜下門 Gnathostomata

### †盾皮魚綱 Placodermi

- †史天秀魚目 Stensioella
- †史天秀魚科 Stensioellidae
- †假瓣甲魚目 Pseudopetalichthyida
- †假瓣甲魚科 Paraplesiobatidae
- †布林達貝拉魚目 Brindabellaspis
- †棘胸魚目 Acanthothoraci（並系群）
- †科 Weejasperaspididae
- †科 Hagiangellidae
- †古棘甲魚科 Palaeacanthaspidae（並系群）
- †硬鮫目 Rhenanida
- 星骨魚科 Asterosteidae
- †胴甲魚目 Antiarchi
- †中華魚科 Sinolepidae
- †雲南魚類 Yunnanolepiformes
- †雲南魚科 Yunnanolepididae
- †曲靖魚科 Chuchinolepidae
- †真胴甲魚類 Euantiarcha
- †星鱗魚亞目 Asterolepidoidei
- †星鱗魚科 Asterolepidae
- †格爾達鱗魚科 Gerdalepidae
- †帕布鱗魚科 Pambulaspidae
- †溝鱗魚亞目 Bothriolepidoidei
- †溝鱗魚科 Bothriolepididae
- †江西魚科 Jiangxilepididae
- †小肢魚科 Microbrachiidae
- †瓣甲魚目 Macropetalichthyida
- †瓣甲魚科 Macropetalichthyidae
- †擬瓣甲魚科 Quasipetalichthyidae
- †褶齒魚目 Ptyctodontida
- †褶齒魚科 Ptyctodontidae
- †節頸魚目 Arthrodira
- †輻紋魚亞目 Actinolepidoidei（並系群）
- †輻紋魚科 Actinolepidae（並系群）
- †科 Antarctaspidae（並系群）
- †葉鱗魚目 Phyllolepida
- †葉鱗魚科 Phyllolepididae
- †科 Gavinaspididae
- †烏塔古納魚科 Wuttagoonaspidae
- †菲里克特魚亞目 Phlyctaenioidei（並系群）
- †菲里克特魚科 Phlyctaenididae
- †科 Arctaspididae
- †科 Arctolepididae
- †戈爾蘭魚科 Groenlandaspididae
- †威氏魚科 Williamsaspididae
- †短胸魚亞目 Brachythoraci
- †異骨魚科 Heterostiidae
- †科 Holonematidae
- †等骨魚科 Homosteidae
- †巴坎魚科 Buchanosteidae
- †真短胸魚類 Eubrachythoraci
- †粒骨魚類 Coccosteomorphi
- †科 Camuropiscidae
- †粒骨魚科 Coccosteidae
- †科 Incisoscutidae
- †科 Plourdosteidae
- †托羅魚科 Torosteidae
- †厚甲魚類 Pachyosteomorphi
- †科 Brachydeiridae
- †薄骨魚科 Leptosteidae
- †科 Rachiosteidae
- †演化支 Aspinothoracidi
- †科 Bungartiidae
- †恐魚科 Dinichthyidae
- †厚頜魚科 Hadrosteidae
- †科 Leiosteidae
- †科 Mylostomatidae
- †月骨魚科 Selenosteidae
- †霸魚科 Titanichthyidae
- †鄧氏魚總科 Dunkleosteoidea
- †盤溪魚科 Panxiosteidae
- †鄧氏魚科 Dunkleosteidae
- 秀山魚屬 Xiushanosteus
- 奇蹟秀山魚 Xiushanosteus mirabilis

### 軟骨魚綱 Chondrichthyes

- †棘魚綱 Acanthodii（並系群）
- †柵棘魚目 Climatiiformes
- †柵棘魚亞目 Climatiida
- †巨棘魚科 Gyracanthidae
- †柵棘魚科 Climatiidae
- †柵棘魚屬 Climatius
- †梵淨山魚屬 Fanjingshania
- †復興梵淨山魚 Fanjingshania renovata
- †雙棘魚目 Diplacanthiformes
- †科 Gladiobranchidae
- †雙棘魚科 Diplacanthidae
- †科 Culmacanthidae
- †科 Tetanopsyridae
- †銼棘魚目 Ischnacanthiformes
- †枝棘魚屬 Xylacanthus
- †銼棘魚科 Ischnacanthidae
- †多棘魚科 Poracanthidae
- †棘魚目 Acanthodiformes
- †棘魚科 Acanthodidae
- †掌棘魚科 Cheiracanthidae
- †豪伊特棘魚科 Howittacanthidae
- †中棘魚科 Mesacanthidae
- 軟骨魚綱 Chondrichthyes
- 黔齒魚屬 Qianodus
- 雙列黔齒魚 Qianodus duplicis
- 板鰓亞綱 Elasmobranchii
- †?蒙古魚目 Mongolepidida
- †近鯊屬 Plesioselachus
- †南極鼠鯊屬 Antarctilamna
- †似扁鯊目 Squatinactiformes
- †原尖齒鯊目 Protacrodontiformes
- †異棘鯊下綱 Xenacanthimorpha
- †異棘鯊目 Xenacanthiformes
- 未定屬 incertae sedis
- †無齒棘鯊屬 Anodontacanthus
- †提基齒鯊屬 Tikiodontus
- †雙梁鯊科 Diplodoselachidae
- †垂棘鯊科 Orthacanthidae
- †異棘鯊科 Xenacanthidae
- 鯊鰩下綱 Euselachii
- †櫛棘鯊目 Ctenacanthiformes
- †屬 Acandylacanthus
- †屬 Arauzia
- †櫛棘鯊超科 Ctenacanthoidea
- †星褶鯊屬 Asteroptychius
- †長吻鯊科 Bandringidae
- †卡林棘鯊屬 Carinacanthus
- †屬 Pyknotylacanthus
- †菱棘鯊屬 Rhombacanthus
- †塔姆鯊科 Tamiobatidae
- †窩鯊屬 Wodnika
- †櫛棘鯊科 Ctenacanthidae
- †科 Heslerodidae
- †古氏鯊屬 Goodrichthys
- †凱貝伯獵手鯊屬 Kaibabvenator
- †莫亞棘鯊屬 Moyacanthus
- †侏劍鯊屬 Nanoskalme
- †新薩維齒鯊屬 Neosaivodus
- †屬 Pororhiza
- †薩維齒鯊屬 Saivodus
- †亮齒鯊目 Phoebodontiformes
- †屬 Jalodus
- †亮齒鯊科 Phoebodontidae
- †弓鮫目 Hybodontiformes
- †北極棘鯊屬 Arctacanthus
- †屬 Dolophonodus
- †屬 Hamatus
- †三鋒鮫屬 Tristychius
- †蹄棘鯊屬 Hopleacanthus
- †指鰭鯊屬 Onychoselache
- †弓鮫超科 Hybodontoidea
- †屬 Steinbachodus
- †平齒鯊科 Homalodontidae
- †無尖齒魚科 Acrodontidae
- †弓鮫科 Hybodontidae
- †矛鮫科 Lonchidiidae
- †多尖齒魚科 Polyacrodontidae
- †?皺齒鯊科 Ptychodontidae
- 新鯊類 Neoselachii
- †?異時鯊科 Anachronistidae
- †連齒鯊目 Synechodontiformes
- 未定屬 Incertae sedis
- †屬 Rhomphaiodon
- †屬 Mucrovenator
- †屬 Safrodus
- †屬 Polyfaciodus
- †楔齒鯊科 Orthacodontidae
- †古棘鯊科 Palaeospinacidae
- †偽南喙哈那鯊科 Pseudonotidanidae
- †副楔齒鯊科 Paraorthacodontidae
- 鯊總目 Selachimorpha
- 六鰓鯊目 Hexanchiformes
- 六鰓鯊科 Hexanchidae
- 皺鰓鯊科 Chlamydoselachidae
- †科 Crassonotidae
- ?†馬克默多鯊科 Mcmurdodontidae
- 虎鯊目 Heterodontiformes
- 虎鯊科 Heterodontidae
- 鬚鮫目 Orectolobiformes
- 喉須鮫科 Parascylliidae
- 鯨鯊科 Rhincodontidae
- 鬚鯊科 Orectolobidae
- 天竺鯊科 Hemiscylliidae
- 絞口鯊科 Ginglymostomatidae
- 豹紋鯊科 Stegostomatidae
- 長鬚鯊科 Brachaeluridae
- 鼠鯊目 Lamniformes
- 長尾鯊科 Alopiidae
- 象鮫科 Cetorhinidae
- 鼠鯊科 Lamnidae
- 劍吻鯊科 Mitsukurinidae
- 巨口鯊科 Megachasmdae
- 錐齒鯊科 Odontaspididae
- 糙齒鯊科 Pseudicarchariidae
- †鷹鼠鯊科 Aquilolamnidae
- †阿納渡鴉鯊科 Anacoracidae
- †始鼠鯊科 Eoptolamnidae（並系群）
- †加勒比鯊科 Cardabiodontidae
- †白堊尖吻鯊科 Cretoxyrhinidae
- †耳齒鯊科 Otodontidae
- †擬鏟吻鯊科 Pseudoscapanorhynchidae
- 真鯊目 Carcharhiniformes
- 真鯊科 Carcharhinidae
- 皺唇鯊科 Triakidae
- 雙髻鯊科 Sphyrnidae
- 貓鯊科 Scyliorhinidae
- 擬皺唇鯊科 Pseudotriakidae
- 原鯊科 Proscylliidae
- 沙條鮫科 Hemigaleidae
- 鬚狗鮫科 Leptochariidae
- 角鯊目 Squaliformes
- 笠鱗鮫科 Echinorhinidae
- 棘鮫科 Squalidae
- 尖鰭鮫科 Centrophoridae
- 燈籠棘鮫科 Etmopteridae
- 夢棘鮫科 Somniosidae
- 粗皮棘鮫科 Oxynotidae
- 黑棘鮫科 Dalatiidae
- 扁鯊目 Squatiniformes
- 扁鯊科 Squatinidae
- 鋸鯊目 Pristiophoriformes
- 鋸鯊科 Pristiophoridae
- †原棘鯊目 Protospinaciformes
- 鰩總目 Batoidea
- †化石鰩目 Apolithabatiformes
- †史帕斯鰩科 Spathobatidae
- 鰩目 Rajiformes
- 鰩科 Rajidae
- 無鰭鰩科 Anacanthobatidae
- 單鰭鰩科 Arhynchobatidae
- 吞鰩科 Gurgesiellidae
- †硬吻鰩亞目 Sclerorhynchoidei
- †硬吻鰩科 Sclerorhynchidae
- †褶鰩科 Ptychotrygonidae
- †髖鋸鰩科 Ischyrhizidae
- †帆鋸鰩科 Onchopristidae
- †裂根鰩科 Schizorhizidae
- 電鰩目 Torpediniformes
- 澳洲睡電鰩科 Hypnidae
- 雙鰭電鰩科 Narcinidae
- 單鰭電鰩科 Narkidae
- 電鰩科 Torpedinidae
- 犁頭鰩目 Rhinopristiformes
- 犁頭鰩科 Rhinobatidae
- 藍吻犁頭鰩科 Glaucostegidae
- 圓犁頭鰩科 Rhinidae
- 南犁頭鰩科 Trygonorrhinidae
- 鋸鰩科 Pristidae
- ?團扇鰩科 Platyrhinidae
- ?梳板鰩科 Zanobatidae
- 燕魟目 Myliobatiformes
- ?團扇鰩亞目 Platyrhinoidei
- ?團扇鰩科 Platyrhinidae
- ?梳板鰩亞目 Zanobatoidei
- ?梳板鰩科 Zanobatidae
- 燕魟亞目 Myliobatoidei
- 六鰓魟總科 Hexatrygonoidea
- 六鰓魟科 Hexatrygonidae
- 扁魟總科 Hexatrygonoidea
- 近魟科 Plesiobatidae
- 扁魟科 Urolophidae
- 巨尾魟總科 Urotrygonoidea
- 巨尾魟科 Urotrygonidae
- 魟總科 Dasyatoidea
- 魟科 Dasyatidae
- 江魟科 Potamotrygonidae
- 燕魟科 Gymnuridae
- 鱝科 Myliobatidae
- 蝠鱝科 Mobulidae
- 鷂鱝科 Aetobatidae
- 牛鼻鱝科 Rhinopteridae
- 全頭亞綱 Holocephali
- †西莫利鯊目 Symmoriida
- †杜依卡鯊屬 Dwykaselachus
- †屬 Ferromirum
- †卡烏鯊屬 Kawichthys
- †西莫利鯊科 Symmoriidae
- †胸脊鯊科 Stethacanthidae
- †鐮鰭鯊科 Falcatidae
- †裂口鯊科 Cladoselachidae
- †偽鮫總目 Paraselachimorpha
- †口鯊目 Orodontiformes
- †口鯊科 Orodontidae
- †瓣齒鯊目 Petalodontiformes
- †朱那鮫科 Janassidae
- †扁齒鮫科 Pristodontidae
- †瓣齒鯊科 Petalodontidae
- †貝蘭特希鮫科 Belantseidae
- †單疣鮫目 Helodontiformes
- †單疣鮫科 Helodontidae
- †枕鰭鯊目 Iniopterygiformes
- †西布長吻鮫科 Sibyrhinchidae
- †枕鰭鯊科 Iniopterygidae
- †戴爾比斯鯊目 Debeeriiformes
- †戴爾比斯鯊科 Debeeriidae
- †尤金齒目 Eugeneodontida
- †剪齒鯊總科 Edestoidea
- †旋齒鯊科 Edestidae
- †剪齒鯊科 Helicoprionidae
- †卡士尼鯊總科 Caseodontoidea
- †坎普鯊屬 Campodus
- †屬 Chiastodus
- †卡士尼鯊科 Caseodontidae
- †尤金齒鯊科 Eugeneodontidae
- 全頭總目 Holocephalimorpha
- †砂齒鯊目 Psammodontiformes
- †砂齒鯊科 Psammodontidae
- †寇氏鯊目 Copodontiformes
- †寇氏鯊科 Copodontidae
- †似鮫目 Squalorajiformes
- †似鮫科 Squalorajidae
- †軟鱔鮫目 Chondrenchelyiformes
- †軟鱔鮫科 Chondrenchelyidae
- †頰甲鮫目 Menaspiformes
- †三角褶鮫科 Deltoptychiidae
- †頰甲鮫科 Menaspidae
- †特拉奎爾鮫科 Traquairiidae
- †殼齒鮫目 Cochliodontiformes
- †科 Psephodontidae
- †殼齒鮫科 Cochliodontidae
- 銀鮫目 Chimaeriformes
- †棘托銀鮫亞目 Echinochimaeroidei
- †棘托銀鮫科 Echinochimaeridae
- †多棘鮫亞目
- †多棘鮫科 Myriacanthidae
- †科 Chimaeropsidae
- †原銀鮫亞目 Protochimaeroidei
- †原銀鮫科 Protochimaeridae
- 短鼻銀鮫亞目 Chimaeroidei
- †屬 Eomanodon
- 葉吻銀鮫總科 Callorhynchoidea (Callorhinchoidea)
- 葉吻銀鮫科 Callorhynchidae
- 短鼻銀鮫總科 Chimaeroidea
- 短鼻銀鮫科 Chimaeridae
- 長吻銀鮫科 Rhinochimaeridae

### 硬骨魚總綱 Osteichthyes

- 輻鰭魚綱 Actinopterygii
- ?†阿薩羅魚目 Asarotiformes
- ?†目 Discordichthyiformes
- ?†目 Paphosisciformes
- ?†目 Scanilepiformes
- †鱈鱗魚目 Cheirolepiformes
- †目 Paramblypteriformes
- †目 Rhadinichthyiformes
- †古鱈目 Palaeonisciformes
- †古鱈科 Palaeoniscidae
- 地位未定 incertae sedis（曾一度被歸為古鱈目）
- †科 Acropholidae
- †科 Atherstoniidae
- †巴西魚科 Brazilichthyidae
- †中鱗魚科 Centrolepididae
- †粒鱗魚科 Coccolepididae
- †科 Commentryidae
- †科 Cryphiolepididae
- †杜依卡魚科 Dwykiidae
- †科 Holuridae
- †伊戈恩魚科 Igornichthyidae
- †科 Irajapintoseidae
- †科 Monesedeiphidae
- †科 Rhabdolepididae
- †科 Stegotrachelidae
- †科 Thrissonotidae
- †科 Tienshaniscidae
- †科 Turseodontidae
- †科 Uighuroniscidae
- †科 Urosthenidae
- †鰻鱈目 Tarrasiiformes
- †鰻鱈科 Tarrasiidae
- †褶鱗魚目 Ptycholepiformes
- †錐體魚科 Boreosomidae
- †重慶魚科 Chungkingichthyidae
- †褶鱗魚科 Ptycholepididae
- †雷氏魚目 Redfieldiiformes
- †屬 Atopocephala
- †屬 Brookvalia
- †屬 Calaichthys
- †喬恩魚屬 Cionichthys
- †屬 Daedalichthys
- †?登伍德魚屬 Denwoodichthys
- †屬 Dictyopyge
- †?屬 Endemichthys
- †屬 Geitonichthys
- †屬 Helichthys
- †雷氏魚屬 Hiascoactinus
- †硬鱗魚屬 Ischnolepis
- †拉薩爾魚屬 Lasalichthys
- †?雷氏魚屬 Leighiscus
- †毛里塔魚屬 Mauritanichthys
- †鉬魚屬 Molybdichthys
- †?帕科爾魚屬 Pacorichthys
- †屬 Phlyctaenichthys
- †雷氏魚屬 Redfieldius
- †?薩卡曼魚屬 Sakamenichthys
- †裂網魚屬 Schizurichthys
- †?新疆魚屬 Sinkiangichthys (疑難名)
- †?屬 Synorichthys
- †疏鰭魚目 Haplolepidiformes
- †目 Aeduelliformes
- †科 Aeduellidae
- †扁體魚目 Platysomiformes
- †寧夏扁體魚屬 Ningxiaplatysomus
- †扁體魚科 Platysomidae
- †古鯧目 Bobasatraniiformes
- †古鯧科 Bobasatraniidae
- †槍鰭魚科 Dorypteridae
- †目 Eurynotiformes
- 腕鰭亞綱 Cladistia
- †吉爾戴魚目 Guildayichthyiformes
- †吉爾戴魚科 Guildayichthyidae
- 多鰭魚目 Polypteriformes
- 多鰭魚科 Polypteridae
- 演化支 Actinopteri
- †目 Elonichthyiformes
- †顯吻魚目 Phanerorhynchiformes
- †龍魚目 Saurichthyiformes
- †夜郎魚科 Yelangichthyidae
- †龍魚科 Saurichthyidae
- 軟骨硬鱗亞綱 Chondrostei
- †比耶魚目 Birgeriiformes
- †比耶魚科 Birgeriidae
- 鱘形目 Acipenseriformes
- †屬 Hesperopsephurus
- †新查拉魚屬 Neochallaia
- †擬白鱘屬 Psephuroides
- †迷鱘科 Errolichthyidae
- †?軟骨硬鱗亞目 Chondrosteoidei
- †?軟骨硬鱗魚科 Chondrosteidae
- †北票鱘亞目 Peipiaosteoidei
- †北票鱘科 Peipiaosteidae
- †屬 Gualolepis
- †蝶鱘亞科 Spherosteinae
- †北票鱘亞科 Peipiaosteinae
- 鱘亞目 Acipenseroidei
- 匙吻鱘科 Polyodontidae
- †原白鱘亞科 Protopsephurinae
- †古白鱘亞科 Paleopsephurinae
- 匙吻鱘亞科 Polyodontinae
- 鱘科 Acipenseridae
- †屬 Dinectus
- †原鏟鱘屬 Protoscaphirhynchus
- 鱘亞科 Acipenserinae
- 鏟鱘亞科 Scaphirhynchinae
- †扁鱘亞科 Priscosturioninae
- 新鰭亞綱 Neopterygii
- †側鱗魚目 Pholidopleuriformes
- †側鱗魚科 Pholidopleuridae
- †肋鱗魚目 Peltopleuriformes
- †肋鱗魚科 Peltopleuridae
- †胸鰭魚科 Thoracopteridae
- †裂齒魚目 Perleidiformes
- †匙鱗魚科 Cleithrolepididae
- †頭異魚亞目 Cephaloxenoidei
- †頭異魚科 Cephaloxenidae
- †裂齒魚亞目 Perleidoidei
- †科 Polzbergiidae
- †科 Gabanellidae
- †異齒魚科 Aethodontidae
- †科 Colobodontidae
- †科 Pseudobeaconiidae
- †裂齒魚科 Perleididae
- †目 Platysiagiformes
- †科 Platysiagidae
- †硬齒魚目 Pycnodontiformes
- ?†屬 Acrorhinichthys
- ?†古硬齒魚屬 Archaeopycnodon
- ?†屬 Athrodon
- ?†屬 Callodus
- ?†屬 Cosmodus
- ?†屬 Ellipsodus
- ?†鉤齒魚屬 Grypodon
- ?†屬 Mercediella
- ?†噬中齒魚屬 Piranhamesodon
- ?†偽硬齒魚屬 Pseudopycnodus
- ?†屬 Tergestinia
- ?†屬 Thurmondella
- ?†屬 Uranoplosus
- ?†屬 Woodthropea
- ?†科 Hadrodontidae
- ?†科 Gebrayelichthyidae
- ?†科 Gladiopycnodontidae
- †屬 Paramesturus
- †小硬齒魚屬 Micropycnodon
- †屬 Arduafrons
- †始中齒魚屬 Eomesodon
- †擬鋸脂鯉科 Serrasalmimidae
- †科 Mesturidae
- †環角魚科 Gyrodontidae
- †布倫德齒魚科 Brembodontidae
- †壓齒魚科 Coccodontidae
- †硬齒魚科 Pycnodontidae
- †盧加諾魚目 Luganoiiformes
- †盧加諾魚科 Luganoiidae
- 全骨下綱 Holostei
- 近鯡形類 Halecomorphi
- †副半椎魚目 Parasemionotiformes
- †裴氏魚屬 Peia
- †副半椎魚科 Parasemionidae
- †科 Promecosominidae
- †盤縣魚目 Panxianichthyiformes
- †盤縣魚科 Panxianichthyidae
- †預言魚目 Ionoscopiformes
- †亞洲鱗齒魚屬 Asialepidotus
- †屬 Placidichthys
- †屬 Subortichthys
- †科 Ophiopsidae
- †預言魚科 Ionoscopidae
- †科 Oshuniidae
- 弓鰭魚目 Amiiformes
- †貴州弓鰭魚屬 Guizhouamia
- †斯特莫弓鰭魚屬 Stromerichthys
- †金尾魚總科 Caturoidea
- †科 Liodesmidae
- †金尾魚科 Caturidae
- 弓鰭魚總科 Amioidea
- ?†屬 Amiidarum
- ?†費爾干納弓鰭魚屬 Ferganamia
- ?†雷曼弓鰭魚屬 Lehmanamia
- †中華弓鰭魚科 Sinamiidae
- 弓鰭魚科 Amiidae
- 弓鰭魚亞科 Amiinae
- †亞科 Amiopsinae
- †索倫霍芬弓鰭魚亞科 Solnhofenamiinae
- †維氏弓鰭魚亞科 Vidalamiinae
- 鉸齒魚類 Ginglymodi
- †提契諾鱗魚屬 Ticinolepis
- †聖喬治魚屬 Sangiorgioichthys
- †?平齒魚目 Dapediiformes
- †平齒魚科 Dapediidae
- †拱魚目 Kyphosichthyiformes
- †臘山魚科 Lashanichthyidae
- †拱魚科 Kyphosichthyidae
- 新鉸齒魚類 Neoginglymodi
- †半椎魚目 Semionotiformes
- ?†屬 Orthurus
- †屬 Aphanepygus
- †側鱗魚科 Pleurolepididae
- ?†巨半椎魚科 Macrosemiidae
- †半椎魚科 Semionotidae
- †科 Callipurbeckiidae
- 雀鱔目 Lepisosteiformes
- †北渡魚屬 Beiduyu
- †阿德里亞娜魚屬 Adrianaichthys
- †呵叻魚屬 Khoratichthys
- †瀾滄魚屬 Lanxangichthys
- †新半椎魚屬 Neoseminotus
- †鱗齒魚科 Lepidotidae
- 雀鱔亞目 Lepisosteoidei
- †阿拉里佩雀鱔屬 Araripelepidotes
- †泰雀鱔屬 Thaiichthys
- †屬 Pliodetes
- 雀鱔總科 Lepisosteoidea
- 雀鱔科 Lepisosteidae
- †奧巴魚科 Obaichthyidae
- 真骨形類 Teleosteomorpha
- †目 Prohaleciteiformes
- †科 Prohaleciteidae
- †針吻魚目 Aspidorhynchiformes
- †針吻魚科 Aspidorhynchidae
- †厚莖魚目 Pachycormiformes
- †古臘魚科 Archaeomaenidae
- †昆瓦拉魚科 Koonwarriidae
- †厚莖魚科 Pachycormidae
- 真骨下綱 Teleostei
- ?†阿勒萊皮鱖目 Araripichthyiformes
- †阿勒萊皮鱖科 Araripichthyidae
- ?†目 Ligulelliiformes
- ?†塞納命運魚目 Tselfatiiformes
- †始滿齒魚科 Eoplethodidae
- †滿齒魚科 Plethodidae
- †始烏魴科 Protobramidae
- †叉鱗魚目 Pholidophoriformes
- †叉鱗魚科 Pholidophoridae
- †目 Dorsetichthyiformes
- †科 Dorsetichthyidae
- †薄鱗魚目 Leptolepidiformes
- †叉頜魚目 Crossognathiformes
- †叉頜魚亞目 Crossognathoidei
- †叉頜魚科 Crossognathidae
- †厚根齒魚亞目 Pachyrhizodontoidei
- †諾特魚科 Notelopidae
- †科 Raphiosauridae
- †厚根齒魚科 Pachyrhizodontidae
- †乞丐魚目 Ichthyodectiformes
- †乞丐魚亞目 Ichthyodectoidei
- †乞丐魚科 Ichthyodectidae
- †楚雄魚科 Chuhsiungichthyidae
- †異梭鯷科 Allothrissopidae
- 海鰱高群 Elopocephalai
- 海鰱目 Elopiformes
- †阿納魚科 Anaethaliidae
- 海鰱亞目 Elopoidei
- †原海鰱科 Protelopidae
- 海鰱科 Elopidae
- 大眼海鰱科 Megalopidae
- 北梭魚目 Albuliformes
- †葉齒魚科 Phyllodontidae
- 北梭魚科 Albulidae
- 長背魚亞科 Pterothrissinae
- 背棘魚目 Notacanthiformes
- 海蜥魚科 Halosauridae
- 背棘魚科 Notacanthidae
- 鰻鱺目 Anguilliformes
- 原鰻鱺亞目 Protanguilloidei
- 原鰻鱺科 Protanguillidae
- 通鰓鰻亞目 Synaphobranchoidei
- 通鰓鰻科 Synaphobranchidae
- 鯙亞目 Muraenoidei
- 異蝮鯙科 Heterenchelyidae
- 軟糯鰻科 Myrocongridae
- 鯙科 Muraenidae
- 鯙亞科 Muraeninae
- 鰭尾鯙亞科 Uropteryginae
- 擬鯙亞目 Chlopsoidei
- 擬鯙科 Chlopsidae
- 康吉鰻亞目 Congroidei
- 康吉鰻科 Congridae
- 康吉鰻亞科 Congrinae
- 淵油鰻亞科 Bathymyrinae
- 異康吉鰻亞科 Heterocongrinae
- 長頸鰻科 Derichthyidae
- 海鰻科 Muraenesocidae
- 鴨嘴鰻科 Nettastomatidae
- 蛇鰻科 Ophichthidae
- 油鰻亞科 Myrophinae
- 蛇鰻亞科 Ophichthinae
- 倭糯鰻科 Colocongridae
- 蚓鰻亞目 Moringuoidei
- 蚓鰻科 Moringuidae
- 鰻鱺亞目 Anguilloidei
- 鰻鱺科 Anguillidae
- 線鰻科 Nemichthyidae
- 鋸鋤鰻科 Serrivomeridae
- 囊鰓鰻亞目 Saccopharyngoidei
- 月尾鰻科 Cyematidae
- 寬咽魚科 Eurypharyngidae
- 單頜鰻科 Monognathidae
- 囊鰓鰻科 Saccopharyngidae
- 骨舌魚高群 Osteoglossocephalai
- 骨舌魚總群 Osteoglossocephala
- †狼鰭魚目 Lycopteriformes
- †狼鰭魚科 Lycopteridae
- 月眼魚目 Hiodontiformes
- 月眼魚科 Hiodontidae
- 骨舌魚目 Osteoglossiformes
- 齒蝶魚亞目 Pantodontoidei
- 齒蝶魚科 Pantodontidae
- 骨舌魚亞目 Osteoglossoidei
- 巴西骨舌魚科 Arapaimidae
- 骨舌魚科 Osteoglossidae
- †科 Singidididae
- †科 Phareodontidae
- 弓背魚亞目 Notopteroidei
- †科 Ostariostomidae
- †基帕拉魚科 Kipalaichthyidae
- †瓦金魚科 Wakinoichthyidae
- 弓背魚科 Notopteridae
- 光背魚亞科 Xenomystinae
- 弓背魚亞科 Notopterinae
- 象鼻魚總科 Mormyroidea
- 裸臀魚科 Gymnarchidae
- 象鼻魚科 Mormyridae
- 長頜魚亞科 Mormyrinae
- 岩頭長頜魚亞科 Petrocephalinae
- 鯡頭魚總群 Clupeocephala
- 骨鯡群 Otomorpha
- 鯡形亞群 Clupei
- †埃笠姆鯡目 Ellimmichthyiformes
- †副鱭魚科 Paraclupeidae
- †科 Armigatidae
- 鯡形目 Clupeiformes
- 齒鯡亞目 Denticipitoidei
- 齒頭鯡科 Denticipitidae
- 鯡亞目 Clupeoidei
- 鯷科 Engraulidae
- 鯷亞科 Engraulinae
- 鱭亞科 Coiliinae
- 鋸腹鰳科 Pristigasteridae
- 寶刀魚科 Chirocentridae
- 鯡科 Clupeidae
- 西鯡亞科 Alosinae
- 鯡亞科 Clupeinae
- 真鰶亞科 Dorosomatinae
- 多棱圓鯡亞科 Ehiravinae
- 銀帶鯡科 Spratelloididae
- 圓腹鯡科 Dussumieriidae
- 黑頭魚亞群 Alepocephali
- 黑頭魚目 Alepocephaliformes
- 黑頭魚科 Alepocephalidae
- 管肩魚科 Platytroctidae
- 骨鰾亞群 Ostariophysi
- 非耳鰾派 Anotophysa
- †目 Sorbininardiformes
- †科 Sorbininardidae
- 鼠鱚目 Gonorynchiformes
- 鼠鱚亞目 Gonorynchoidei
- †科 Apulichthyidae
- 鼠鱚科 Gonorynchidae
- 虱目魚亞目 Chanoidei
- †屬 Aethalinopsis
- 虱目魚科 Chanidae
- 尼羅魚亞目 Knerioidei
- 尼羅魚科 Kneriidae
- 堅喉魚科 Phractolaemidae
- 耳鰾派 Otophysa
- 鯉形目 Cypriniformes
- 鯉亞目 Cyprinoidei
- 鯉科 Cyprinidae
- 鱊亞科 Acheilognathinae
- 鯉亞科 Cyprininae
- (魚丹)亞科 Danioninae
- 鮈亞科 Gobioninae
- ?野鯪亞科 Labeoninae
- 細須魮亞科 Leptobarbinae
- 雅羅魚亞科 Leuciscinae
- 原䰾亞科 Probarbinae
- 亞科 Smiliogastrinae
- 亞科 Tanichthyinae
- 丁鱖亞科 Tincinae
- 亞科 Torinae
- 鯝亞科 Xenocyprinae
- 鰍亞目 Cobitoidei
- 亞口魚總科 Catostomoidea
- 亞口魚科 Catostomidae
- 亞口魚亞科 Catostominae
- 長背亞口魚亞科 Cycleptinae
- 牛胭脂魚亞科 Ictiobinae
- 胭脂魚亞科 Myxocyprininae
- 雙孔魚總科 Gyrinocheiloidea
- 雙孔魚科 Gyrinocheilidae
- 鰍總科 Cobitoidea
- 頰鬚鰍科 Barbuccidae
- 蛇鰍科 Serpenticobitidae
- 沙鰍科 Botiidae
- 梵條鰍科 Vaillantellidae
- 鰍科 Cobitidae
- 爬鰍科 Balitoridae
- 腹吸鰍科 Gastromyzontidae
- 低唇魚科 Ellopostomatidae
- 條鰍科 Nemacheilidae
- 裸吻魚科 Psilorhynchidae
- 脂鯉目 Characiformes
- 琴脂鯉亞目 Citharinoidei
- 二列齒琴脂鯉科 Distichodontidae
- 琴脂鯉科 Citharinidae
- 脂鯉亞目 Characoidei
- 頂器脂鯉總科 Crenuchoidea
- 頂器脂鯉科 Crenuchidae
- 溪脂鯉亞科 Characidiinae
- 鋸唇脂鯉亞科 Crenuchinae
- 鮭脂鯉總科 Alestioidea
- 鱤脂鯉科 Hepsetidae
- 鮭脂鯉科 Alestidae
- 虎脂鯉總科 Erythrinoidea
- 塔河脂鯉科 Tarumaniidae
- 虎脂鯉科 Erythrinidae
- 鋸脂鯉科 Serrasalmidae
- 犬齒脂鯉科 Cynodontidae
- 露斯塔脂鯉亞科 Roestinae
- 犬齒脂鯉亞科 Cynodontinae
- 半齒脂鯉科 Hemiodontidae
- 下口半脂鯉科 Parodontidae
- 原唇齒脂鯉科 Prochilodontidae
- 唇齒脂鯉科 Chilodontidae
- 無齒脂鯉科 Curimatidae
- 上口脂鯉科 Anostomidae
- 脂鯉總科 Characoidea
- 魣脂鯉科 Ctenoluciidae
- 鱂脂鯉科 Lebiasinidae
- 大鱗脂鯉科 Chalceidae
- 蜥形脂鯉科 Iguanodectidae
- 狼牙脂鯉科 Acestrorhynchidae
- 石斧脂鯉科 Triporthidae
- 石脂鯉科 Bryconidae
- 胸斧魚科 Gasteropelecidae
- 脂鯉科 Characidae
- 細脂鯉亞科 Aphyocharacinae
- 紋吸魚亞科 Aphyoditeinae
- 石脂鯉亞科 Bryconinae
- 桂脂鯉亞科 Characinae
- 寶蓮燈魚亞科 Cheirodontinae
- 裸脂鯉亞科 Gymnocharacinae
- 蜥形脂鯉亞科 Iguanodectinae
- 玫瑰脂鯉亞科 Rhoadsiinae
- 小脂鯉亞科 Salmininae
- 鋸胸脂鯉亞科 Stethaprioninae
- 亞科 Stevardiinae
- 大眼脂鯉亞科 Tetragonopterinae
- 電鰻目 Gymnotiformes
- 裸背電鰻亞目 Gymnotoidei
- 裸背電鰻科 Gymnotidae
- 線鰭電鰻亞目 Sternopygoidei
- 大吻電鰻總科 Rhamphichthyoidea
- 大吻電鰻科 Rhamphichthyidae
- 短吻電鰻科 Hypopomidae
- 線翎電鰻總科 Apteronotoidea
- 線鰭電鰻科 Sternopygidae
- 線翎電鰻科 Apteronotidae
- 鯰形目 Siluriformes
- †安第斯鯰科 Andinichthyidae
- 甲鯰亞目 Loricaroidei
- 絲鼻鯰科 Nematogenyidae
- 毛鼻鯰科 Trichomycteridae
- 槳齒鯰亞科 Copionodontinae
- 鰻形腺鰭鯰亞科 Glanapteryginae
- 肉鼻鯰亞科 Sarcoglanidinae
- 喜蓋鯰亞科 Stegophilinae
- 鼻須鯰亞科 Trichogeninae
- 毛鼻鯰亞科 Trichomycterinae
- 叉齒毛鼻鯰亞科 Tridentinae
- 寄生鯰亞科 Vandelliinae
- 美鯰科 Callichthyidae
- 美鯰亞科 Callichthyinae
- 兵鯰亞科 Corydoradinae
- 視星鯰科 Astroblepidae
- 甲鯰科 Loricariidae
- 三角下口鯰亞科 Delturinae
- 下口蜻鯰亞科 Hypoptopomatinae
- 下口鯰亞科 Hypostominae
- 石星鯰亞科 Lithogeneinae
- 甲鯰亞科 Loricariinae
- 新吸口鯰亞科 Neoplecostominae
- 耳孔鯰亞科 Otothyrinae
- 二須鯰亞目 Diplomystoidei
- 二須鯰科 Diplomystidae
- †巴赫曼鯰科 Bachmanniidae
- 鯰亞目 Siluroidei
- †高劍鯰總科 Hypsidoroidea
- †高劍鯰科 Hypsidoridae
- 鯨形鯰總科 Cetopsoidea
- 鯨形鯰科 Cetopsidae
- 鯨鯰亞科 Cetopsinae
- 澤鯰亞科 Helogeneinae
- 鯰總科 Siluroidea
- 鯰科 Siluridae
- 巨鯰科 Pangasiidae
- 倒立鯰科 Mochokidae
- 脂鱨科 Claroteidae
- 北美鯰總科 Ictaluroidea
- 鰻鯰科 Plotosidae
- 北美鯰科 Ictaluridae
- 塘虱魚總科 Clarioidea
- 塘虱魚科 Clariidae
- 鮡總科 Sisoroidea
- 科 Ailiidae
- 鮡科 Sisoridae
- 真鮡亞科 Sisorinae
- 紋胸鮡亞科 Glyptosterninae
- 鱨科 Bagridae
- 骨鮡科 Erethistidae
- 陶樂鯰總科 Doradoidea
- 蝌蚪鯰科 Aspredinidae
- 蝌蚪鯰亞科 Aspredininae
- 丘頭鯰亞科 Bunocephalinae
- 棘鰻鯰亞科 Hoplomyzontinae
- 陶樂鯰科 Doradidae
- 項鰭鯰科 Auchenipteridae
- 項鰭鯰亞科 Auchenipterinae
- 棘杆鮠亞科 Centromochlinae
- 長鬚鯰總科 Pimelodoidea
- 鼬鯰科 Heptapteridae
- 擬長鬚鯰科 Pseudopimelodidae
- 長鬚鯰科 Pimelodidae
- 地位未定 incertae sedis
- 矮甲鯰科 Scoloplacidae
- 粒鯰科 Akysidae
- 粒鯰亞科 Akysinae
- 副粒鯰亞科 Parakysinae
- 鈍頭鮠科 Amblycipitidae
- 准海鯰科 Anchariidae
- 海鯰科 Ariidae
- 海鯰亞科 Ariinae
- 雅首海鯰亞科 Galeichthyinae
- 海鱨亞科 Bagreinae
- 平鰭鮠科 Amphiliidae
- 平鰭鮠亞科 Amphiliinae
- 細鱨亞科 Leptoglanidinae
- 杜鰍鯰亞科 Doumeinae
- 澳岩鱨科 Austroglanididae
- 連尾鮡科 Chacidae
- 錐吻鯰屬 Conorhynchos
- 扁頭鯰科 Cranoglanididae
- 囊鰓鯰科 Heteropneustidae
- 下眼鱨科 Horabagridae
- 秘鯰科 Kryptoglanidae
- 石狗鯰科 Lacantuniidae
- 電鯰科 Malapteruridae
- 科 Phreatobiidae
- 屬 Rita
- 北非鯰科 Schilbeidae
- 正真骨魚群 Euteleosteomorpha
- 鱗南乳魚亞群 Lepidogalaxii
- 鱗南乳魚目 Lepidogalaxiiformes
- 原棘鰭亞群 Protacanthopterygii
- 水珍魚目 Argentiniformes
- 水珍魚科 Argentinidae
- 深海鮭科 Bathylagidae
- 小口兔鮭科 Microstomatidae
- 後肛魚科 Opisthoproctidae
- 南乳魚目 Galaxiiformes
- 南乳魚科 Galaxiidae
- 鮭形目 Salmoniformes
- 鮭科 Salmonidae
- 白鮭亞科 Coregoninae
- 茴魚亞科 Thymallinae
- 鱒亞科 Salmoninae
- 狗魚目 Esociformes
- †古狗魚科 Palaeoesocidae
- 狗魚科 Esocidae
- 泥狗魚科 Umbridae
- 巨口魚亞群 Stomiati
- 胡瓜魚目 Osmeriformes
- †科 Spaniodontidae
- 後鰭魚亞目 Retropinnoidei
- 後鰭魚科 Retropinnidae
- 胡瓜魚亞目 Osmeroidei
- 胡瓜魚科 Osmeridae
- 香魚科 Plecoglossidae
- 銀魚科 Salangidae
- 巨口魚目 Stomiiformes
- 鑽光魚亞目 Gonostomatoidei
- 鑽光魚科 Gonostomatidae
- 巨口魚亞目 Stomiatoidei
- 光器魚科 Phosichthyidae
- 褶胸魚科 Sternoptychidae
- 穆氏暗光魚亞科 Maurolicinae
- 褶胸魚亞科 Sternoptychinae
- 巨口魚科 Stomiidae
- 新真骨魚亞群 Neoteleostei
- 辮魚下群 Ateleopodia
- 辮魚目 Ateleopodiformes
- 辮魚科 Ateleopodidae
- 寬鰭下群 Eurypterygia
- 圓鱗派 Cyclosquamata
- 仙女魚目 Aulopiformes
- 帆蜥魚亞目 Alepisauroidei
- 帆蜥魚科 Alepisauridae
- 法老魚科 Anotopteridae
- 齒口魚科 Evermannellidae
- 錘頜魚科 Omosudidae
- 魣蜥魚科 Paralepididae
- 珠目魚科 Scopelarchidae
- †多椎魚科 Polymerichthyidae
- 青眼魚亞目 Chlorophthalmoidei
- 深海似蜥魚科 Bathysauroididae
- 深海九棍魚科 Bathysauropsidae
- 青眼魚科 Chlorophthalmidae
- 爐眼魚科 Ipnopidae
- 大鱗蜥魚科 Notosudidae
- †矛齒魚亞目 Enchodontoidei
- †甘松王魚屬 Nardorex
- †塞里鱗魚屬 Serrilepis
- †耶卜魯德魚屬 Yabrudichthys
- †迷鱗魚科 Apateopholidae
- †白堊魚科 Cimolichthyidae
- †鯨咽魚科 Dercetidae
- †層齒魚科 Stratodontidae
- †矛齒魚科 Enchodontidae
- †科 Halecidae
- †科 Ichthyotringidae
- †鋸鱗魚科 Prionolepididae
- 巨尾魚亞目 Giganturoidei
- 深海蜥魚科 Bathysauridae
- 巨尾魚科 Giganturidae
- 合齒魚亞目 Synodontoidei
- 仙女魚科 Aulopidae
- 副仙女魚科 Paraulopidae
- 擬毛背魚科 Pseudotrichonotidae
- 合齒魚科 Synodontidae
- 櫛鱗派 Ctenosquamata
- 燈籠魚亞派 Scopelomorpha
- 燈籠魚目 Myctophiformes
- 燈籠魚科 Myctophidae
- 新燈籠魚科 Neoscopelidae
- 棘鰭亞派 Acanthomorphata
- 月魚類 Lampridacea
- 月魚目 Lampriformes
- †屬 Bathysoma
- †巴哈魚屬 Bajaichthys
- †甘松旗月魚屬 Nardovelifer
- †屬 Palaeocentrotus
- †土庫曼魚科 Turkmenidae
- 旗月魚科 Veliferidae
- 月魚科 Lamprididae
- 亞目 Taeniosomi
- 冠帶魚科 Lophotidae
- 異尾帶魚科 Radiicephalidae
- 粗鰭魚科 Trachipteridae
- 皇帶魚科 Regalecidae
- 須鰃類 Polymixiacea
- †目 Pattersonichthyiformes
- †櫛棱鯷目 Ctenothrissiformes
- †管鱗魚科 Aulolepidae
- †櫛棱鯷科 Ctenothrissidae
- 須鰃目 Polymixiiformes
- †屬 Cumbaaichthys
- †科 Boreiohydriidae
- †科 Digoriidae
- 須鰃科 Polymixiidae
- 副棘鰭類 Paracanthomorphacea
- 鮭鱸目 Percopsiformes
- †屬 Percopsiformorum
- †屬 Lateopisciculus
- 鮭鱸亞目 Percopsoidei
- †科 Libotoniidae
- 鮭鱸科 Percopsidae
- 奇肛鱸亞目 Aphredoderoidei
- 奇肛鱸科 Aphredoderidae
- 洞穴魚科 Amblyopsidae
- †楔頭鱸目 Sphenocephaliformes
- †楔頭鱸科 Sphenocephalidae
- 海魴目 Zeiformes
- 科 Cyttidae
- 菱的鯛科 Grammicolepididae
- 高的鯛科 Oreosomatidae
- 準的鯛科 Parazenidae
- †科 Sorbinipercidae
- 鯛科 Zeidae
- 甲眼的鯛科 Zeniontidae
- 鞭尾魚目 Stylephoriformes
- 鞭尾魚科 Stylephoridae
- 鱈形目 Gadiformes
- 海鰗鰍科 Bregmacerotidae
- 多絲真鱈科 Euclichthyidae
- 鱈科 Gadidae
- 江鱈科 Lotidae
- 鼠尾鱈科 Macrouridae
- 底尾鱈亞科 Bathygadinae
- 鼠尾鱈亞科 Macrourinae
- 卵頭鱈亞科 Macrouroidinae
- 顳孔鱈亞科 Trachyrincinae
- 黑鱈科 Melanonidae
- 梭鱈科 Merlucciidae
- 稚鱈科 Moridae
- 南極鱈科 Muraenolepididae
- 褐鱈科 Phycidae
- 真棘鰭類 Euacanthomorphacea
- 金眼鯛亞類 Berycimorphaceae
- 金眼鯛目 Beryciformes
- 金眼鯛亞目 Berycoidei
- 金眼鯛科 Berycidae
- 大鱗鯛科 Melamphaidae
- 奇鯛亞目 Stephanoberycoidei
- 須仿鯨科 Barbourisiidae
- 仿鯨科 Cetomimidae
- 紅口仿鯨科 Rondeletiidae
- 奇鯛科 Stephanoberycidae
- 吉伯鯛科 Gibberichthyidae
- 粗鱗鯛科 Hispidoberycidae
- 燧鯛目 Trachichthyiformes
- 狼牙鯛科 Anoplogastridae
- 黑銀眼鯛科 Diretmidae
- 燈眼魚科 Anomalopidae
- 松球魚科 Monocentridae
- 燧鯛科 Trachichthyidae
- 金鱗魚亞類 Holocentrimorphaceae
- 金鱗魚目 Holocentriformes
- 金鱗魚科 Holocentridae
- 鱸形亞類 Percomorphaceae
- 鼬魚系 Ophidiimopharia
- 鼬魚目 Ophidiiformes
- 鼬魚亞目 Ophidioidei
- 隱魚科 Carapidae
- 鼬魚科 Ophidiidae
- 深海鼬魚亞目 Bythitoidei
- 深海鼬魚科 Bythitidae
- 裸鼬魚科 Aphyonidae
- 副鬚鼬魚科 Parabrotulidae
- 蟾魚系 Batrachoidimopharia
- 蟾魚目 Batrachoidiformes
- 蟾魚科 Batrachoididae
- 蟾魚亞科 Batrachoidinae
- 小孔蟾魚亞科 Halophryninae
- 光蟾魚亞科 Porichthyinae
- 海蟾魚亞科 Thalassophryninae
- 蝦虎魚系 Gobiomopharia
- 鉤頭魚目 Kurtiformes
- 鉤頭魚科 Kurtidae
- 天竺鯛科 Apogonidae
- 天竺鯛亞科 Apogoninae
- 擬天竺鯛亞科 Pseudaminae
- 蝦虎魚目 Gobiiformes
- 絲鰭鱚亞目 Trichonotoidei
- 絲鰭鱚科 Trichonotidae
- 蝦虎魚亞目 Gobioidei
- 溪鱧科 Rhyacichthyidae
- 沙塘鱧科 Odontobutidae
- 澳洲大口塘鱧科 Milyeringidae
- 塘鱧科 Eleotridae（包含舊有的扁頭鰕虎科 Xenisthmidae）
- 海塘鱧科 Thalasseleotrididae
- 背眼蝦虎魚科 Oxudercidae
- 背眼蝦虎魚亞科 Oxudercinae
- 近盲蝦虎魚亞科 Amblyopinae
- 擬蝦虎魚亞科 Gobionellinae
- 雙盤蝦虎魚亞科 Sicydiinae
- 蝦虎魚科 Gobiidae（包含原有的蚓鰕虎科 Microdesmidae、沙鰕虎科 Kraemeriidae及辛氏魚科 Schindleriidae）
- 瘤蝦虎魚亞科 Benthophilinae
- 蝦虎魚亞科 Gobiinae
- 鯖形系 Scombrimopharia
- 海龍魚目 Syngnathiformes
- 海龍魚亞目 Syngnathoidei
- 溝口魚科 Solenostomidae
- 海龍科 Syngnathidae
- 海馬亞科 Hippocampinae
- 海龍亞科 Syngnathinae
- 管口魚科 Aulostomidae
- 煙管魚科 Fistulariidae
- 蝦魚科 Centriscidae
- 鷸嘴魚科 Macroramphosidae
- 䲗亞目 Callionymoidei
- 蜥䲗科 Draconettidae
- 䲗科 Callionymidae
- 須鯛亞目 Mulloidei
- 須鯛科 Mullidae
- 飛角魚亞目 Dactylopteroidei
- 飛角魚科 Dactylopteridae
- 海蛾魚科 Pegasidae
- 鯖形目 Scombriformes
- 澳洲鮭鱸科 Arripidae
- 烏魴科 Bramidae
- 鬣魚科 Caristiidae
- 叉齒鱚科 Chiasmodontidae
- 蛇鯖科 Gempylidae
- 貧骨魚科 Icosteidae
- 扁鰺科 Pomatomidae
- 長鰭帶鰆科 Scombrolabracidae
- 帶魚科 Trichiuridae
- 等鰭叉尾帶魚亞科 Aphanopodinae
- 叉尾帶魚亞科 Lepidopodinae
- 帶魚亞科 Trichiurinae
- 鯖科 Scombridae
- 腹翼鯖亞科 Gasterochismatinae
- 鯖亞科 Scombrinae
- 鯥科 Scombropidae
- 阿瑪鯧科 Amarsipidae
- 長鯧科 Centrolophidae
- 圓鯧科 Nomeidae
- 無齒鯧科 Ariommatidae
- 方尾鯧科 Tetragonuridae
- 鯧科 Stromateidae
- 鰺形系 Carangimopharia
- 攀鱸亞系 Anabantaria
- 攀鱸目 Anabantiformes
- 南鱸亞目 Nandoidei
- 棕鱸科 Badidae
- 南鱸科 Nandidae
- 鋸鱗鱸科 Pristolepididae
- 鱧亞目 Channoidei
- 鱧科 Channidae
- 攀鱸亞目 Anabantoidei
- 攀鱸科 Anabantidae
- 沼口魚科 Helostomatidae
- 絲足鱸科 Osphronemidae
- 格鬥魚亞科 Belontiinae
- 梭頭鱸亞科 Luciocephalinae
- 鬥魚亞科 Macropodinae
- 絲足鱸亞科 Osphroneminae
- 合鰓目 Synbranchiformes
- 甲棘背魚亞目 Indostomoidei
- 甲棘背魚科 Indostomidae
- 棘鰍亞目 Mastacembeloidei
- 裸鰍科 Chaudhuriidae
- 棘鰍科 Mastacembelidae
- 合鰓魚亞目 Synbranchoidei
- 合鰓魚科 Synbranchidae
- 鰺形亞系 Carangaria
- 鰺形目 Carangiformes（並系群）
- 鰺科 Carangidae
- 鱰科 Coryphaenidae
- 鮣科 Echeneidae
- 絲帆魚科 Nematistiidae
- 海鱺科 Rachycentridae
- 旗魚目 Istiophoriformes
- 劍旗魚科 Xiphiidae
- 旗魚科 Istiophoridae
- †海明威魚科 Hemingwayidae
- †古喙魚科 Palaeorhynchidae
- †波氏魚科 Blochiidae
- 鰈形目 Pleuronectiformes
- 鰜亞目 Psettodoidei
- 鰜科 Psettodidae
- 鰈亞目 Pleuronectoidei
- 棘鮃總科 Citharoidea
- 棘鮃科 Citharidae
- 鰈總科 Pleuronectoidea
- 菱鮃科 Scophthalmidae
- 牙鮃科 Paralichthyidae
- 鰈科 Pleuronectidae
- 鮃科 Bothidae
- 鰨總科 Soleoidea
- 牙鰈科 Pleuronectidae
- 瓦鰈科 Poecilopsettidae
- 菱鰈科 Rhombosoleidae
- 無臂鮃科 Achiropsettidae
- 冠鰈科 Samaridae
- 無臂鰨科 Achiridae
- 鰨科 Soleidae
- 舌鰨科 Cynoglossidae
- 地位未定 incertae sedis
- 金梭魚科 Sphyraenidae
- 鋸蓋魚科 Centropomidae
- 乳香魚科 Lactariidae
- 濱鮭科 Leptobramidae
- 眼眶魚科 Menidae
- 馬鮁科 Polynemidae
- 射水魚科 Toxotidae
- 卵附亞系 Ovalentaria
- 銀漢魚總目 Atherinomorphae
- 銀漢魚目 Atheriniformes
- 銀漢魚科 Atherinidae
- 擬銀漢魚科 Atherinopsidae
- 皮杜銀漢魚科 Bedotiidae
- 牙銀漢魚科 Dentatherinidae
- 虹銀漢魚科 Melanotaeniidae
- 浪花魚科 Notocheiridae
- 精器魚科 Phallostethidae
- 似鯔銀漢魚科 Pseudomugilidae
- 沼銀漢魚科 Telmatherinidae
- 鱂形目 Cyprinodontiformes
- 單唇鱂亞目 Aplocheiloidei
- 單唇鱂科 Aplocheilidae（包含假鰓鱂科 Nothobranchiidae、溪鱂科 Rivulidae）
- 鯉齒亞目 Cyprinodontoidei
- 底鱂總科 Funduloidea
- 深鱂科 Profundulidae
- 谷鱂科 Goodeidae
- 底鱂科 Fundulidae
- 瓦倫鱂總科 Valencioidea
- 瓦倫鱂科 Valenciidae
- 鯉齒鱂總科 Cyprinodontoidea
- 鯉齒鱂科 Cyprinodontidae
- 花鱂總科 Poecilioidea
- 四眼魚科 Anablepidae。
- 花鱂科 Poeciliidae
- 鶴鱵目 Beloniformes
- 異鱂亞目 Adrianichthyoidei
- 異鱂科 Adrianichthyidae
- 鶴鱵亞目 Belonoidei
- 秋刀魚總科 Scomberesocoidea
- 鶴鱵科 Belonidae
- 秋刀魚科 Scomberesocidae
- 飛魚總科 Exocoetoidea
- 飛魚科 Exocoetidae
- 鱵科 Hemiramphidae
- 異鱗鱵科 Zenarchopteridae
- 鯔形總目 Mugilomorphae
- 鯔形目 Mugiliformes
- 鯔科 Mugilidae
- 慈鯛總目 Cichlomorphae
- 慈鯛目 Cichliformes
- 慈鯛科 Cichlidae
- 裸鰻䲁科 Pholidichthyidae
- 䲁形總目 Blenniimorphae
- 䲁形目 Blenniiformes
- 䲁科 Blenniidae
- 旗䲁科 Chaenopsidae
- 磯䲁科 Clinidae
- 柄眼魚科 Dactyloscopidae
- 新磯䲁科 Labrisomidae
- 三鰭䲁科 Tripterygiidae
- 喉盤魚目 Gobiesociformes
- 喉盤魚科 Gobiesocidae
- 地位未定 incertae sedis
- 雙邊魚科 Ambassidae
- 鰻鯛科 Congrogadidae
- 海鯽科 Embiotocidae
- 藍紋鱸科 Grammatidae
- 後頜魚科 Opistognathidae
- 鮗科 Plesiopidae
- 葉鱸科 Polycentridae
- 雀鯛科 Pomacentridae
- 擬雀鯛科 Pseudochromidae
- 真鱸形系 Eupercaria
- 銀鱸目 Gerreiformes
- 銀鱸科 Gerreidae
- 鰧形目 Uranoscopiformes
- 玉筋魚科 Ammodytidae
- 冬鱚科 Cheimarrhichthyidae
- 虎鱚科 Pinguipedidae
- 鰧科 Uranoscopidae
- 隆頭魚目 Labriformes
- 隆頭魚科 Labridae
- 狼鱸目 Moroniformes
- 白鯧目 Ephippiformes
- 簾鯛科 Drepaneidae
- 白鯧科 Ephippidae
- 蝴蝶魚目 Chaetodontiformes
- 蝴蝶魚科 Chaetodontidae
- 鰏科 Leiognathidae
- 刺尾鯛目 Acanthuriformes
- 刺尾鯛科 Acanthuridae
- 鯕鯖科 Luvaridae
- 鐮魚科 Zanclidae
- 笛鯛目 Lutjaniformes
- 石鱸科 Haemulidae
- 笛鯛科 Lutjanidae（包含烏尾鮗科 Caesionidae）
- 松鯛目 Lobotiformes
- 擬松鯛科 Datnioididae
- 髭鯛科 Hapalogenyidae
- 松鯛科 Lobotidae
- 鯛形目 Spariformes
- 龍占魚科 Lethrinidae
- 金線魚科 Nemipteridae
- 鯛科 Sparidae（包含長身鯛科 Centracanthidae）
- 金錢魚目 Scatophagiformes
- 金錢魚科 Scatophagidae
- 大眼鯛目 Priacanthiformes
- 大眼鯛科 Priacanthidae
- 赤刀魚科 Cepolidae
- 菱鯛目 Caproiformes
- 菱鯛科 Caproidae
- 鮟鱇目 Lophiiformes
- 鮟鱇亞目 Lophioidei
- 鮟鱇科 Lophiidae
- 躄魚亞目 Antennarioidei
- 躄魚科 Antennariidae
- 四臂躄魚科 Tetrabrachiidae
- 鱇躄魚科 Lophichthyidae
- 臂鉤躄魚科 Brachionichthyidae
- 單棘躄魚亞目 Chaunacoidei
- 單棘躄魚科 Chaunacidae
- 棘茄魚亞目 Ogcocephalioidei
- 棘茄魚科 Ogcocephalidae
- 角鮟鱇亞目 Ceratioidei
- 刺鮟鱇科 Centrophrynidae
- 角鮟鱇科 Ceratiidae
- 鞭冠鮟鱇科 Himantolophidae
- 雙角鮟鱇科 Diceratiidae
- 黑角鮟鱇科 Melanocetidae
- 奇鮟鱇科 Thaumatichthyidae
- 夢角鮟鱇科 Oneirodidae
- 新角鮟鱇科 Neoceratiidae
- 長鰭鮟鱇科 Caulophrynidae
- 巨棘角鮟鱇科 Gigantactinidae
- 須角鮟鱇科 Linophrynidae
- 魨形目 Tetraodontiformes
- †刺箱魨亞目 Plectocretacicoidei
- †白堊三刺魨科 Cretatriacanthidae
- †刺箱魨科 Plectocretacicidae
- †原三刺魨科 Protriacanthidae
- 三齒魨亞目 Triodontoidei
- 三齒魨科 Triodontidae
- 三棘魨亞目 Triacanthoidei
- 擬三棘魨科 Triacanthodidae
- 三棘魨科 Triacanthidae
- 箱魨亞目 Ostracioidea
- †棘刺魨科 Spinacanthidae
- 六稜箱魨科 Aracanidae
- 箱魨科 Ostraciidae
- 鱗魨亞目 Balistoidei
- †波卡鱗魨科 Bolcabalistidae
- †Moclaybalistidae科
- 鱗魨科 Balistidae
- 單棘魨科 Monacanthidae
- 四齒魨亞目 Tetraodontoidei
- †Avitoplectidae科
- †Balkariidae科
- †始辮魨科 Eoplectidae
- 翻車魨科 Molidae
- 四齒魨科 Tetraodontidae
- 二齒魨科 Diodontidae
- †略魨科 Zignoichthyidae
- 擬金眼鯛目 Pempheriformes
- 發光鯛科 Acropomatidae
- 扁棘鯛科 Banjosidae
- 深海鯡科 Bathyclupeidae
- 鱷齒鱚科 Champsodontidae
- 無棘䲁科 Creediidae
- 深海天竺鯛科 Epigonidae
- 葉鯛科 Glaucosomatidae
- 尖棘鯛科 Howellidae
- 花鱸科 Lateolabracidae
- 巨棘鱸科 Ostracoberycidae
- 擬金眼鯛科 Pempheridae
- 五棘鯛科 Pentacerotidae
- 鱸鰧科 Percophidae〔此科為多系群，原模式屬鱸鰧屬（Perchophis）現被歸入鱸形目的南極魚亞目，還有許多屬被歸入雙犁魚科（屬於魨形目）及鯒狀魚科（屬於鱸形目），其餘的屬也將繼續歸入新的科。〕
- 多鋸鱸科 Polyprionidae
- 愈齒鯛科 Symphysanodontidae
- 雙犁魚科 Hemerocoetidae
- 狹視魚科 Leptoscopidae
- 日鱸目 Centrarchiformes
- 日鱸亞目 Centrarchoidei
- 太陽魚科 Centrarchidae
- 倭太陽魚科 Elassomatidae
- 姥鱸科 Enoplosidae
- 鱖科 Sinipercidae
- 䱵亞目 Cirrhitoidei（=䱵總科 Cirrhitoidea）
- 單指䱵科 Aplodactylidae
- 唇指䱵科 Cheilodactylidae
- 絲鰭䱵科 Chironemidae
- 䱵科 Cirrhitidae
- 婢䱵科 Latridae
- 真鱸亞目 Percichthyoidei
- 真鱸科 Percichthyidae
- 九斑鱸亞目 Percalatoidei
- 九斑鱸科 Percalatidae
- 鯻亞目 Terapontoidei
- 雙帆魚科 Dichistiidae
- 魢科 Girellidae
- 湯鯉科 Kuhliidae
- 舵魚科 Kyphosidae
- 石鯛科 Oplegnathidae
- 鯻科 Terapontidae
- 蠍魚科 Scorpididae
- 真鱸形目 Perciformes
- 鯒狀魚亞目 Bembropoidei
- 鯒狀魚科 Bembropidae
- 杜父魚亞目 Cottoidei
- 裸蓋魚下目 Anoplopomatales
- 裸蓋魚科 Anoplopomatidae
- 杜父魚下目 Cottales
- 八角魚科 Agonidae
- 杜父魚科 Cottidae
- 圓鰭魚科 Cyclopteridae
- 喬氏杜父魚科 Jordaniidae
- 獅子魚科 Liparidae
- 隱棘杜父魚科 Psychrolutidae
- 鉤吻杜父魚科 Rhamphocottidae（包含旋杜父魚科 Ereuniidae）
- 鮋杜父魚科 Scorpaenichthyidae
- 毛齒魚科 Trichodontidae
- 棘背魚下目 Gasterosteales
- 管吻魚科 Aulorhynchidae
- 棘背魚科 Gasterosteidae
- 裸玉筋魚科 Hypoptychidae
- 六線魚下目 Hexagrammales
- 六線魚科 Hexagrammidae
- 櫛鰭魚下目 Zaniolepidoales
- 櫛鰭魚科 Zaniolepididae
- 綿䲁下目 Zoarcales
- 狼䲁科 Anarhichadidae
- 深海䲁科 Bathymasteridae
- 隱棘䲁科 Cryptacanthodidae
- 錦䲁科 Pholidae
- 線䲁科 Stichaeidae
- 船首䲁科 Zaproridae
- 綿䲁科 Zoarcidae
- 美冠䲁科 Eulophiidae
- 翎䲁科 Ptilichthyidae
- 蝮䲁科 Scytalinidae
- 諾曼魚亞目 Normanichthyoidei
- 諾曼魚科 Normanichthyidae
- 鱸亞目 Percoidei
- 東洋鱸科 Niphonidae
- 河鱸科 Percidae
- 龍鰧科 Trachinidae
- 牛尾魚亞目 Platycephaloidei（=鯒亞目 Bembroidei）
- 赤鯒科 Bembridae
- 針鯒科 Hoplichthyidae
- 短鯒科 Parabembridae
- 牛尾魚科 Platycephalidae
- 平頭鮋科 Plectrogeniidae
- 鮋亞目 Scorpaenoidei
- 須蓑鮋科 Apistidae
- 絨皮鮋科 Aploactinidae
- 前鰭鮋科 Congiopodidae
- 埃氏絨鮋科 Eschmeyeridae
- 紅絨鮋科 Gnathanacanthidae
- 新平鮋科 Neosebastidae
- 奇矮鮋科 Pataecidae
- 大吻前鰭鮋科 Perryenidae
- 鮋科 Scorpaenidae
- 平鮋科 Sebastidae
- 囊頭鮋科 Setarchidae
- 毒鮋科 Synanceiidae
- 真裸皮鮋科 Tetrarogidae
- 鐮吻鮋科 Zanclorhynchidae
- 鮨亞目 Serranoidei
- 鮨科 Serranidae
- 南極魚亞目 Notothenioidei
- 阿氏龍鰧科 Artedidraconidae
- 淵龍鰧科 Bathydraconidae
- 牛魚科 Bovichtidae
- 鱷冰魚科 Channichthyidae
- 油南極魚科 Eleginopsidae
- 棘劫魚科 Harpagiferidae
- 南極魚科 Nototheniidae
- 擬牛魚科 Pseudaphritidae
- 鱸鰧科 Percophidae
- 魴鮄亞目 Triglioidei
- 黃魴鮄科 Peristediidae
- 魴鮄科 Triglidae
- 地位未定 incertae sedis
- 麗花鮨科 Callanthiidae
- 擬鮋鱸科 Centrogenyidae
- 諧魚科 Emmelichthyidae
- 弱棘魚科 Malacanthidae
- 銀鱗鯧科 Monodactylidae
- 狼鱸科 Moronidae
- 蓋刺魚科 Pomacanthidae
- 金錢魚科 Scatophagidae
- 石首魚科 Sciaenidae
- 藍子魚科 Siganidae
- 鱚科 Sillaginidae
- 長鰭天竺鯛科 Dinolestidae
- 洞鱸科 Dinopercidae
- 擬鱲科 Parascorpididae
- 肉鰭魚綱 Sarcopterygii
- †鬼魚屬 Guiyu
- †爪齒魚目 Onychodontiformes
- †爪齒魚科 Onychodontidae
- 腔棘魚亞綱 Actinistia
- †米瓜夏魚科 Miguashaiidae
- †重尾魚科 Diplocercidae
- †科 Hadronectoridae
- †科 Rhabdodermatidae
- †前鰭魚科 Laugiidae
- 腔棘魚目 Coelacanthiformes
- †蝶柱魚屬 Styloichthys
- †懷特魚科 Whiteiidae
- †叛逆腔棘魚科 Rebellatricidae
- †腔棘魚科 Coelacanthidae
- 矛尾魚亞目 Latimerioidei
- †馬索尼亞魚科 Mawsoniidae
- 矛尾魚科 Latimeriidae
- 扇鰭類 Rhipidistia
- 肺魚形類 Dipnomorpha
- †孔鱗魚目 Porolepiformes
- †孔鱗魚科 Porolepidae
- †全褶魚科 Holoptychiidae
- 肺魚亞綱 Dipnoi
- †惡魔魚科 Diabolichthyidae
- †總科 Uranolophina
- †科 Uranolophidae
- †科 Speonesydrionidae
- †喙肺魚科 Dipnorhynchidae
- †科 Stomiahykidae
- †科 Chirodipteridae
- †全齒魚科 Holodontidae
- †雙翼魚科 Dipteridae
- †科 Fleurantiidae
- †科 Rhynchodipteridae
- †科 Phaneropleuridae
- †櫛齒魚科 Ctenodontidae
- †科 Sagenodontidae
- †科 Gnathorhizidae
- 角齒魚目 Ceratodiformes
- †亞洲角齒魚科 Asiatoceratodontidae
- †褶角齒魚科 Ptychoceratodontidae
- 澳洲肺魚科 Neoceratodontidae
- 美洲肺魚目 Lepidosireniformes
- 美洲肺魚科 Lepidosirenidae
- 非洲肺魚科 Protopteridae
- 四足形類 Tetrapodomorpha
- †肯氏魚屬 Kenichthys
- †根齒魚目 Rhizodontidae
- †蜥翼魚科 Sauripteridae
- †根齒魚科 Rhizodontidae
- 骨鱗魚總目 Osteolepidida
- †卡南德拉魚科 Canowindridae
- †骨鱗魚目 Osteolepiformes（或 巨魚目 Megalichthyiformes）
- †格格納瑟斯魚屬 Gogonasus
- †屬 Gyroptychius
- †骨鱗魚科 Osteolepidae
- †屬 Medoevia
- †巨魚科 Megalichthyidae
- 始四足類 Eotetrapodiformes
- †三列鰭魚科 Tristichopteridae
- †提尼拉魚屬 Tinirau
- †扁頭魚屬 Platycephalichthys
- 希望螈類 Elpistostegalia
- †潘氏魚屬 Panderichthys
- 堅頭類 Stegocephalia
- †提塔利克魚屬 Tiktaalik
- †希望螈科 Elpistostegidae
- †散步魚屬 Elginerpeton
- †孔螈屬 Ventastega
- †棘石螈屬 Acanthostega
- †魚石螈屬 Ichthyostega
- †海納螈屬 Hynerpeton
- †瓦切螈科 Whatcheeriidae
- †圓螈科 Colosteidae
- †厚蛙螈屬 Crassigyrinus
- †斜眼螈總科 Baphetoidea
- 四足類 Tetrapoda