古菌分类表

本表参照基因组分类学数据库（GTDB）之分类（版本：v232，2026年4月15日）。此版本共涵盖24个古菌门、2669个古菌属，共计10122个古菌物种。本表依照各分类阶层字首字母排序，顺序非反映古菌间亲缘关系。

中文名称采用惯例以及拉丁名直接意译，拉丁文意译参考 原核生物名称(英文)网站。

本表采用基因组分类学数据库架构，列举盐杆菌门（Halobacteriota）、热原体门（Thermoplasmatota）、甲烷杆菌门（Methanobacteriota）为三个独立门，在原核生物标准命名列表（LPSN）架构下则三者皆为甲烷杆菌门（Methanobacteriota）的异模式异名。

## 迷古菌门（Aenigmatarchaeota）

### 迷古菌纲（Aenigmatarchaeia）

- 迷古菌目（Aenigmatarchaeales）

## 深古菌门（Altiarchaeota）

### 深古菌纲（Altiarchaeia）

- 深谷菌目（Altiarchaeales）

## 阿斯加德古菌门（Asgardarchaeota）

### 阿斯加德古菌纲（Asgardarchaeia）

- 阿斯加德古菌目（Asgardarchaeales）

### 阿塔贝古菌纲（Atabeyarchaeia）

- 阿塔贝古菌目（Atabeyarchaeales）

### 巴德尔古菌纲（Baldrarchaeia）

- 巴尔德古菌目（Baldrarchaeales）

### 海姆达尔古菌纲（Heimdallarchaeia）

- 海姆达尔古菌目（Heimdallarchaeales）
- 霍德古菌目（Hodarchaeales）

### 埃尔默德古菌纲（Hermodarchaeia）

- 埃尔默德古菌目（Hermodarchaeales）

### 乔尔迪古菌纲（Jordiarchaeia）

- 乔尔迪古菌目（Jordiarchaeales）

### 洛基古菌纲（Lokiarchaeia）

- 海拉古菌目（Helarchaeales）
- 希格恩古菌目（Sigynarchaeales）
- 普罗米修斯古菌科（Promethearchaeia）

### 尼奥尔德古菌纲（Njordarchaeia）

- 尼奥尔德古菌目（Njordarchaeales）

### 奥丁古菌纲（Odinarchaeia）

- 奥丁古菌目（Odinarchaeales）

### 西芙古菌纲（Sifarchaeia）

- 博尔古菌目（Borrarchaeales）
- 西芙古菌目（Sifarchaeales）

### 索尔古菌纲（Thorarchaeia）

- 索尔古菌目（Thorarchaeales）

### 悟空古菌纲（Wukongarchaeia）

- 悟空古菌目（Wukongarchaeales）

## 哈德古菌门（Hadarchaeota）

### 哈德古菌纲（Hadarchaeia）

- 哈德古菌目（Hadarchaeales）

## 盐杆菌门（Halobacteriota）

### 盐杆菌纲（Halobacteria）

- 盐杆菌目（Halobacteriales）
- 阿法古菌科（Afararchaeaceae）
- 盐适应古菌科（Haladaptataceae）
- 盐嗜碱球菌科（Halalkalicoccaceae）
- 海环古菌科（Haloarculaceae）
- 盐杆菌科（Halobacteriaceae）
- 盐厌氧古菌属（Halanaeroarchaeum）
- 盐古菌属（Halarchaeum）
- 盐杆菌属（Halobacterium）
- 盐算菌属（Halocalculus）
- 盐硫还古菌属（Halodesulfurarchaeum）
- 盐貌菌属（Halospeciosus）
- 海盐古菌属（Salarchaeum）
- 盐球菌科（Halococcaceae）
- 盐富饶菌科（Haloferacaceae）
- 盐鲁提古菌科（Halorutilaceae）
- 希克古菌科（Hikarchaeaceae）
- 盐无色菌科（Natrialbaceae）
- 盐古菌科（Natronoarchaeaceae）
- 萨琳古菌科（Salinarchaeaceae）

### 甲烷微菌纲（Methanomicrobia）

- 甲烷微菌目（Methanomicrobiales）

### 甲烷八叠球菌纲（Methanosarcinia）

- 甲烷八叠球菌目（Methanosarcinales）
- 嗜甲烷古菌科（Methanocomedenaceae）
- 嗜甲烷古菌科（Methanocomedens）
- 海洋甲烷菌属（Methanomarinus）
- 甲烷胃古菌科（Methanogasteraceae）
- 甲烷胃古菌属（Methanogaster）
- 甲烷吞噬古菌科（Methanoperedenaceae）
- 甲烷吞噬古菌属（Methanoperedens）
- 甲烷八叠球菌科（Methanosarcinaceae）
- 甲烷微球菌属（Methanimicrococcus）
- 甲烷拟球菌属（Methanococcoides）
- 甲烷碎屑菌属（Methanofrustulum）
- 甲烷盐菌属（Methanohalobium）
- 甲烷嗜盐菌属（Methanohalophilus）
- 甲烷叶菌属（Methanolobus）
- 甲烷食甲基菌属（Methanomethylovorans）
- 甲烷咸菌属（Methanosalsum）
- 甲烷八叠球菌属（Methanosarcina）
- 食甲烷菌属（Methanovorans）
- 甲烷丝菌目（Methanotrichales）
- 甲烷丝菌科（Methanotrichaceae）
- 目未定（DSM-18856）
- 甲烷热球菌科（Methermicoccaceae）
- 甲烷热球菌属（Methermicoccus）

## 胡伯古菌门（Huberarchaeota）

### 胡伯古菌纲（Huberarchaeia）

- 胡伯古菌目（Huberarchaeales）

## 热泉古菌门（Hydrothermarchaeota）

### 热泉古菌纲（Hydrothermarchaeales）

- 热泉古菌目（Hydrothermarchaeales）

## 伊恩古菌门（Iainarchaeota）

### 伊恩古菌纲（Iainarchaeia）

- 伊恩古菌目（Iainarchaeales）

## 初古菌门（Korarchaeota）

### 初古菌纲（Korarchaeia）

- 初古菌目（Korarchaeales）

## 甲烷杆菌门（Methanobacteriota）

### 甲烷杆菌纲（Methanobacteria）

- 甲烷杆菌目（Methanobacteriales）
- 甲烷杆菌科（Methanobacteriaceae）
- Methanacia
- Methanarmilla
- 甲烷杆菌属（Methanobacterium）
- 甲烷小杆菌属（Methanobaculum）
- Methanobinarius
- 甲烷短杆菌属（Methanobrevibacter）
- Methanocatella
- 甲烷柔菌属（Methanoflexus）
- Methanorudis
- 甲烷球型菌属（Methanosphaera）
- 甲烷螺旋菌属（Methanovirga）
- 甲烷热杆菌科（Methanothermobacteraceae）
- 甲烷热杆菌属（Methanothermobacter）
- 目未定（DSM-2088）
- 甲烷嗜热菌科（Methanothermaceae）
- 甲烷嗜热菌属（Methanothermus）

### 热球菌纲（Thermococci）

- 甲烷难养菌目（Methanofastidiosales）
- 甲烷难养菌科（Methanofastidiosaceae）
- 热球菌目（Thermococcales）
- 热球菌科（Thermococcaceae）
- 古球菌属（Palaeococcus）
- 火球菌属（Pyrococcus）
- 热球菌属（Thermococcus）

## 微古菌门（Micrarchaeota）

### 微古菌纲（Micrarchaeia）

- 安斯顿古菌目（Anstonellales）
- 布拉古菌目（Buraarchaeales）
- 微古菌目（Micrarchaeales）
- 诺荣加古菌目（Norongarragalinales）

## 纳盐古菌门（Nanohalarchaeota）

### 纳盐古菌纲（Nanosalinia）

- 纳盐古菌目（Nanosalinales）

## 热原体门（Thermoplasmatota）

### 热原体纲（Thermoplasmata）

- 盐古原体目（Halarchaeoplasmatales）
- 酸土原体目（Lutacidiplamatales）
- 甲烷马赛球菌目（Methanomassiliicoccales）
- 甲烷马赛球菌科（Methanomassiliicoccaceae）
- 甲烷嗜甲基菌科（Methanomethylophilaceae）
- 中山原体目（Sysuiplasmatales）
- 热原体目（Thermoplasmatales）
- 热原体科（Thermoplasmataceae）
- 酸原体属（Acidiplasma）
- 穴原体属（Cuniculiplasma）
- 铁原体属（Ferroplasma）
- 氧原体属（Oxyplasma）
- 嗜酸菌属（Picrophilus）
- 热裸单胞菌属（Thermogymnomonas）
- 热原体属（Thermoplasma）

## 热变形菌门（Thermoproteota）

### 热变形菌纲（Thermoprotei）

- 地古菌目（Gearchaeales）
- 热丝菌目（Thermofilales）
- 热变形菌目（Thermoproteales）

### 热变形菌纲_A（Thermoprotei_A）

- 火星古菌目（Marsarchaeales）
- 硫化叶菌目（Sulfolobales）
- 酸叶菌科（Acidilobaceae）
- 硫还原球菌科（Desulfurococcaceae）
- 费尔维迪球菌科（Fervidicoccaceae）
- 燃球菌科（Ignicoccaceae）
- 燃球体科（Ignispheraceae）
- 热网菌科（Pyrodictiaceae）
- 硫化叶菌科（Sulfolobaceae）

## 温蒂古菌门（Undinarchaeota）

### 温蒂古菌纲（Undinarchaeia）

- 温蒂古菌目（Undinarchaeales）

## 未定门

### 甲烷嗜高热菌纲（Methanopyri）

- 甲烷嗜高热菌目（Methanopyrales）
- 甲烷嗜高热菌科（Methanopyraceae）
- 甲烷嗜高热菌属（Methanopyrus）