细菌分类表

本表以原核生物标准命名列表（LPSN）的分类为基础（当前版本2024年1月13日），此分类代表原核生物分类的权威杂志IJSEM的分类系统，同时参考美国国家生物技术信息中心分类（NCBI Taxonomy）。但目前其它中文维基分类表可能依照其它标准，请注意其区别。

中文名称采用惯例（包括网上搜索途径）以及拉丁名直接意译，部分参考《细菌名称》第二版以及中国典型培养物保藏中心（CCTCC），拉丁文意译参考 原核生物名称(英文)网站。翻译问题欢迎在原文中添加或者在讨论页中提出。一些分类单元已经更名，但是中文名称却没有更新，本表将沿用其旧名称直至有新名称发布。

本表仅列至科级。

## 遥远杆状菌门（Abditibacteriota）

### 遥远杆状菌纲（Abditibacteriia）

- 遥远杆状菌目（Abditibacteriales）
- 遥远杆状菌科（Abditibacteriaceae）

## 酸杆菌门（Acidobacteriota）

### 出芽小链菌纲（Blastocatellia）

- 出芽小链菌目（Blastocatellales）
- 沙质土微菌科（Arenimicrobiaceae）
- 出芽小链菌科（Blastocatellaceae）
- 栖火山单胞菌科（Pyrinomonadaceae）
- 目未定
- 科未定

### 全噬菌纲（Holophagae）

- 石鳖杆菌目（Acanthopleuribacterales）
- 石鳖杆菌科（Acanthopleuribacteraceae）
- 全噬菌目（Holophagales）
- 全噬菌科（Holophagaceae）
- 嗜热香肠状菌目（Thermotomaculales）
- 嗜热香肠状菌科（Thermotomaculaceae）
- 目未定
- 科未定

### 酸杆菌纲（Terriglobia）

- 藓杆菌目（Bryobacterales）
- 藓杆菌科（Bryobacteraceae）
- 酸杆菌目（Terriglobales）
- 酸杆菌科（Acidobacteriaceae）
- 科未定

### 嗜热厌氧杆状菌纲（Thermoanaerobaculia）

- 嗜热厌氧杆状菌目（Thermoanaerobaculales）
- 嗜热厌氧杆状菌科（Thermoanaerobaculaceae）
- 目未定

### 嗜邻聚杆菌纲（Vicinamibacteria）

- 嗜邻聚杆菌目（Vicinamibacterales）
- 嗜邻聚杆菌科（Vicinamibacteraceae）

## 放线菌门（Actinobacteria）

### 酸微菌纲（Acidimicrobiia）

- 酸微菌目（Acidimicrobiales）
- 酸微菌科（Acidimicrobiaceae）
- 东大应微所菌科（Iamiaceae）
- 萤光杆菌科（Ilumatobacteraceae）
- 目未定

### 放线菌纲（Actinomycetes）（高G+C革兰氏阳性菌）

- 热酸菌目（Acidothermales）
- 热酸菌科（Acidothermaceae）
- 放线菌目（Actinomycetales）
- 放线菌科（Actinomycetaceae）
- 科未定
- 双歧杆菌目（Bifidobacteriales）
- 双歧杆菌科（Bifidobacteriaceae）
- 细链孢菌目（Catenulisporales）
- 丛生放线菌科（Actinospicaceae）
- 细链孢菌科（Catenulisporaceae）
- 隐孢囊菌目（Cryptosporangiales）
- 隐孢囊菌科（Cryptosporangiaceae）
- 弗兰克氏菌目（Frankiales）
- 弗兰克氏菌科（Frankiaceae）
- Vallicoccaceae
- 地嗜皮菌目（Geodermatophilales）
- 天然洞穴球菌科（Antricoccaceae）
- 地嗜皮菌科（Geodermatophilaceae）
- 糖霉菌目（Glycomycetales）
- 糖霉菌科（Glycomycetaceae）
- 居麻疯树菌目（Jatrophihabitantales）
- 居麻疯树菌科（Jatrophihabitantaceae）
- 姜氏菌目（Jiangellales）
- 姜氏菌科（Jiangellaceae）
- 动孢菌目（Kineosporiales）
- 动孢菌科（Kineosporiaceae）
- 北里孢菌目（Kitasatosporales）
- 链霉菌科（Streptomycetaceae）
- 微球菌目（Micrococcales）
- 获山氏菌科（Beutenbergiaceae）
- 博戈里亚湖菌科（Bogoriellaceae）
- 短杆菌科（Brevibacteriaceae）
- 纤维单胞菌科（Cellulomonadaceae）
- 去甲基醌菌科（Demequinaceae）
- 皮杆菌科（Dermabacteraceae）
- 皮生球菌科（Dermacoccaceae）
- 嗜皮菌科（Dermatophilaceae）
- 间孢囊菌科（Intrasporangiaceae）
- 琼斯氏菌科（Jonesiaceae）
- 皮球菌科（Kytococcaceae）
- 微杆菌科（Microbacteriaceae）
- 微球菌科（Micrococcaceae）
- 鸟氨酸微菌科（Ornithinimicrobiaceae）
- 原小单孢菌科（Promicromonosporaceae）
- 稀有杆菌科（Rarobacteraceae）
- 阮氏菌科（Ruaniaceae）
- 科未定
- 小单孢菌目（Micromonosporales）
- 小单孢菌科（Micromonosporaceae）
- 运动杆菌目（Motilibacterales）
- 运动杆菌科（Motilibacteraceae）
- 分枝杆菌目（Mycobacteriales）
- 棒状杆菌科（Corynebacteriaceae）
- 迪茨氏菌科（Dietziaceae）
- 戈登氏菌科（Gordoniaceae）
- 保罗劳森菌科（Lawsonellaceae）
- 分枝杆菌科（Mycobacteriaceae）
- 诺卡氏菌科（Nocardiaceae）
- 慢反应脂肪酸菌科（Segniliparaceae）
- 冢村氏菌科（Tsukamurellaceae）
- 中村氏菌目（Nakamurellales）
- 中村氏菌科（Nakamurellaceae）
- 丙酸杆菌目（Propionibacteriales）
- 放线多形菌科（Actinopolymorphaceae）
- 克里布所菌科（Kribbellaceae）
- 类诺卡氏菌科（Nocardioidaceae）
- 丙酸杆菌科（Propionibacteriaceae）
- 伪诺卡氏菌目（Pseudonocardiales）
- 伪诺卡氏菌科（Pseudonocardiaceae）
- 孢鱼菌目（Sporichthyales）
- 孢鱼菌科（Sporichthyaceae）
- 孢囊菌目（Streptosporangiales）
- 拟诺卡氏菌科（Nocardiopsidaceae）
- 孢囊菌科（Streptosporangiaceae）
- 高温单孢菌科（Thermomonosporaceae）
- 特热邦菌科（Treboniaceae）
- 科未定

### 红蝽菌纲（Coriobacteriia）

- Anaerosomatales
- Anaerosomataceae
- 红蝽菌目（Coriobacteriales）
- 奇异菌科（Atopobiaceae）
- 红蝽菌科（Coriobacteriaceae）
- 科未定
- 伊格尔兹氏菌目（Eggerthellales）
- 伊格尔兹氏菌科（Eggerthellaceae）

### 腈基降解菌纲（Nitriliruptoria）

- 生地所杆菌目（Egibacterales）
- 生地所杆菌科（Egibacteraceae）
- 生地所球菌目（Egicoccales）
- 生地所球菌科（Egicoccaceae）
- 尤泽比氏菌目（Euzebyales）
- 尤泽比氏菌科（Euzebyaceae）
- 腈基降解菌目（Nitriliruptorales）
- 腈基降解菌科（Nitriliruptoraceae）
- Salsipaludibacterales
- Salsipaludibacteraceae

### 红色杆菌纲（Rubrobacteria）

- 红色杆菌目（Rubrobacterales）
- 红色杆菌科（Rubrobacteraceae）

### 嗜热油菌纲（Thermoleophilia）

- 盖亚女神菌目（Gaiellales）
- 盖亚女神菌科（Gaiellaceae）
- Miltoncostaeales
- Miltoncostaeaceae
- 土壤红杆菌目（Solirubrobacterales）
- 长白山菌科（Baekduiaceae）
- Capillimicrobiaceae
- 束缚菌科（Conexibacteraceae）
- 副束缚菌科（Paraconexibacteraceae）
- 小土壤杆菌科（Parviterribacteraceae）
- 扩展杆菌科（Patulibacteraceae）
- 土壤红杆菌科（Solirubrobacteraceae）
- 嗜热油菌目（Thermoleophilales）
- 嗜热油菌科（Thermoleophilaceae）

### 纲未定

- 目未定
- 科未定

## 产水菌门（Aquificota）

### 产水菌纲（Aquificia）

- 产水菌目（Aquificales）
- 产水菌科（Aquificaceae）
- 热产水菌科（Hydrogenothermaceae）
- 硫还原小杆菌目（Desulfurobacteriales）
- 硫还原小杆菌科（Desulfurobacteriaceae）

## 装甲菌门（Armatimonadota）

### 装甲菌纲（Armatimonadia）

- 装甲菌目（Armatimonadales）
- 装甲菌科（Armatimonadaceae）
- 荚膜单胞菌目（Capsulimonadales）
- 荚膜单胞菌科（Capsulimonadaceae）

### 土地单胞菌纲（Chthonomonadia）

- 土地单胞菌目（Chthonomonadales）
- 土地单胞菌科（Chthonomonadaceae）

### 伞单胞菌纲（Fimbriimonadia）

- 伞单胞菌目（Fimbriimonadales）
- 伞单胞菌科（Fimbriimonadaceae）

### 纲未定

- 目未定
- 科未定

## 暗黑菌门（Atribacterota）

### 暗黑菌纲（Atribacteria）

- 暗黑菌目（Atribacterales）
- 暗黑菌科（Atribacteraceae）

## 芽孢杆菌门（Bacillota）

### 芽孢杆菌纲（Bacilli）

- 核衣细菌目（Caryophanales）
- 脂环酸芽孢杆菌科（Alicyclobacillaceae）
- 芽孢杆菌科（Bacillaceae）
- 核衣细菌科（Caryophanaceae）
- 脱硫芽胞杆菌科（Desulfuribacillaceae）
- 李斯特菌科（Listeriaceae）
- 类芽孢杆菌科（Paenibacillaceae）
- 巴斯德氏菌科（Pasteuriaceae）
- 芽孢乳杆菌科（Sporolactobacillaceae）
- 葡萄球菌科（Staphylococcaceae）
- 热放线菌科（Thermoactinomycetaceae）
- 科未定
- 乳杆菌目（Lactobacillales）
- 气球菌科（Aerococcaceae）
- 肉杆菌科（Carnobacteriaceae）
- 肠球菌科（Enterococcaceae）
- 乳杆菌科（Lactobacillaceae）
- 链球菌科（Streptococcaceae）
- 目未定
- 科未定

### 梭菌纲（Clostridia）

- 真细菌目（Eubacteriales）
- Aristaeellaceae
- 热粪杆菌科（Caldicoprobacteraceae）
- 克里斯滕森氏菌科（Christensenellaceae）
- 梭菌科（Clostridiaceae）
- 废水杆菌科（Defluviitaleaceae）
- 脱亚硫酸菌科（Desulfitobacteriaceae）
- 真细菌科（Eubacteriaceae）
- 纤细杆菌科（Gracilibacteraceae）
- 太阳杆菌科（Heliobacteriaceae）
- 毛螺菌科（Lachnospiraceae）
- 颤螺菌科（Oscillospiraceae）
- 消化球菌科（Peptococcaceae）
- 嗜胨菌科（Peptoniphilaceae）
- 消化链球菌科（Peptostreptococcaceae）
- 噬蛋白质菌科（Proteinivoracaceae）
- 共生小杆菌科（Symbiobacteriaceae）
- 互营单胞菌科（Syntrophomonadaceae）
- 溪谷杆菌科（Vallitaleaceae）
- 解木聚糖杆状菌科（Xylanivirgaceae）
- 科未定
- 盐厌氧菌目（Halanaerobiales）
- 盐厌氧菌科（Halanaerobiaceae）
- 盐拟杆菌科（Halobacteroidaceae）
- 科未定
- Koleobacterales
- Koleobacteraceae
- 盐碱厌氧菌目（Natranaerobiales）
- 盐碱厌氧菌科（Natranaerobiaceae）
- Natranaerofabaceae
- 热厌氧菌目（Thermoanaerobacterales）
- 热厌氧菌科（Thermoanaerobacteraceae）
- 热脱硫菌科（Thermodesulfobiaceae）
- 赵一章菌科（Zhaonellaceae）
- 科未定
- 热沉积物菌目（Thermosediminibacterales）
- 温暖厌氧杆菌科（Tepidanaerobacteraceae）
- 热沉积物菌科（Thermosediminibacteraceae）
- 蒂西耶氏菌目（Tissierellales）
- Acidilutibacteraceae
- 戈特沙尔克氏菌科（Gottschalkiaceae）
- 蒂西耶氏菌科（Tissierellaceae）
- 目未定
- 科未定

### 吸血蠓杆菌纲（Culicoidibacteria）

- 吸血蠓杆菌目（Culicoidibacterales）
- 吸血蠓杆菌科（Culicoidibacteraceae）

### 丹毒丝菌纲（Erysipelotrichia）

- 丹毒丝菌目（Erysipelotrichales）
- 粪杆菌科（Coprobacillaceae）
- 丹毒丝菌科（Erysipelotrichaceae）
- 苏黎世杆菌科（Turicibacteraceae）

### 湖线菌纲（Limnochordia）

- 湖线菌目（Limnochordales）
- 湖线菌科（Limnochordaceae）

### 厚壁菌纲（Negativicutes）

- 氨基酸球菌目（Acidaminococcales）
- 氨基酸球菌科（Acidaminococcaceae）
- 月形单孢菌目（Selenomonadales）
- 月形单孢菌科（Selenomonadaceae）
- 香蕉孢菌科（Sporomusaceae）
- 韦荣氏菌目（Veillonellales）
- 韦荣氏菌科（Veillonellaceae）

### 热石杆菌纲（Thermolithobacteria）

- 热石杆菌目（Thermolithobacterales）
- 热石杆菌科（Thermolithobacteraceae）

### 纲未定

- 目未定
- 科未定

## 拟杆菌门（Bacteroidota）

### 拟杆菌纲（Bacteroidia）

- 拟杆菌目（Bacteroidales）
- 拟杆菌科（Bacteroidaceae）
- 浴室胞菌科（Balneicellaceae）
- 巴恩斯氏菌科（Barnesiellaceae）
- 营发酵单胞菌科（Dysgonomonadaceae）
- 慢生微菌科（Lentimicrobiaceae）
- 海丝菌科（Marinifilaceae）
- 海滑菌科（Marinilabiliaceae）
- 鼠杆状菌科（Muribaculaceae）
- 臭气杆菌科（Odoribacteraceae）
- 栖泥沼杆菌科（Paludibacteraceae）
- 紫单胞菌科（Porphyromonadaceae）
- 普雷沃氏菌科（Prevotellaceae）
- 伸长杆菌科（Prolixibacteraceae）
- 理研菌科（Rikenellaceae）
- 盐分枝菌科（Salinivirgaceae）
- 坦纳氏菌科（Tannerellaceae）
- Tenuifilaceae
- 威廉惠特曼菌科（Williamwhitmaniaceae）
- 科未定

### 噬几丁质菌纲（Chitinophagia）

- 噬几丁质菌目（Chitinophagales）
- 噬几丁质菌科（Chitinophagaceae）

### 噬纤维菌纲（Cytophagia）

- 噬纤维菌目（Cytophagales）
- 贝尔纳代氏菌科（Bernardetiaceae）
- 卡特琳娜岛单胞菌科（Catalinimonadaceae）
- 印科工杆菌科（Cesiribacteraceae）
- 圆杆菌科（Cyclobacteriaceae）
- 噬纤维菌科（Cytophagaceae）
- 火色杆菌科（Flammeovirgaceae）
- 屈挠杆菌科（Flexibacteraceae）
- 黄褐杆菌科（Fulvivirgaceae）
- 薄层杆菌科（Hymenobacteraceae）
- Mangrovivirgaceae
- 居海杆状菌科（Marivirgaceae）
- 微颤菌科（Microscillaceae）
- 戈登摩尔基金菌科（Mooreiaceae）
- 桃色杆菌科（Persicobacteraceae）
- 雷尼氏菌科（Raineyaceae）
- 赖兴巴赫氏菌科（Reichenbachiellaceae）
- 粉红杆状菌科（Roseivirgaceae）
- Shiellaceae
- 螺状菌科（Spirosomataceae）
- 热屈挠杆菌科（Thermoflexibacteraceae）
- 栖热线菌（Thermonemataceae）
- 科未定

### 黄杆菌纲（Flavobacteriia）

- 黄杆菌目（Flavobacteriales）
- 蟑螂杆状体科（Blattabacteriaceae）
- 藏红花黄色线菌科（Crocinitomicaceae）
- 冷形菌科（Cryomorphaceae）
- 黄杆菌科（Flavobacteriaceae）
- 鱼杆菌科（Ichthyobacteriaceae）
- Parvicellaceae
- 施莱费尔氏菌科（Schleiferiaceae）
- 威克斯氏菌科（Weeksellaceae）
- 科未定
- 目未定
- 科未定

### 腐败螺旋菌纲（Saprospiria）

- 腐败螺旋菌目（Saprospirales）
- 赖文氏菌科（Lewinellaceae）
- 腐败螺旋菌科（Saprospiraceae）

### 鞘氨醇杆菌纲（Sphingobacteriia）

- 鞘氨醇杆菌目（Sphingobacteriales）
- Aurantibacillaceae
- 线杆状菌科（Filobacteriaceae）
- 鞘氨醇杆菌科（Sphingobacteriaceae）
- 科未定

### 纲未定

- 目未定
- 科未定

## 巴纽尔斯菌门（Balneolota）

### 巴纽尔斯菌纲（Balneolia）

- 巴纽尔斯菌目（Balneolales）
- 巴纽尔斯菌科（Balneolaceae）
- Cyclonatronaceae
- 苏尔特菌科（Soortiaceae）

## 暖丝菌门（Caldisericota）

### 暖丝菌纲（Caldisericia）

- 暖丝菌目（Caldisericales）
- 暖丝菌科（Caldisericaceae）

## 暖发菌门（Calditrichota）

### 暖发菌纲（Calditrichia）

- 暖发菌目（Calditrichales）
- 暖发菌科（Calditrichaceae）

### 纲未定

- 目未定
- 科未定

## 衣原体门（Chlamydiota）

### 衣原体纲（Chlamydiia）

- 衣原体目（Chlamydiales）
- 衣原体目（Chlamydiaceae）
- 副衣原体科（Parachlamydiaceae）
- 芯卡体科（Simkaniaceae）
- 华诊体科（Waddliaceae）
- 科未定

## 绿菌门（Chlorobiota）

### 绿菌纲（Chlorobiia）

- 绿菌目（Chlorobiales）
- 绿菌科（Chlorobiaceae）

### 懒杆菌纲（Ignavibacteria）

- 懒杆菌目（Ignavibacteriales）
- 懒杆菌科（Ignavibacteriaceae）
- 超杆菌科（Melioribacteraceae）

## 绿弯菌门（Chloroflexota）

### 厌氧绳菌纲（Anaerolineae）

- 聚集线菌目（Aggregatilineales）
- 聚集线菌科（Aggregatilineaceae）
- 厌氧绳菌目（Anaerolineales）
- 厌氧绳菌科（Anaerolineaceae）
- 科未定
- 目未定
- 科未定

### 热链菌纲（Ardenticatenia）

- 热链菌目（Ardenticatenales）
- 热链菌科（Ardenticatenaceae）

### 暖绳菌纲（Caldilineae）

- 暖绳菌目（Caldilineales）
- 暖绳菌科（Caldilineaceae）

### 绿弯菌纲（Chloroflexia）

- 绿弯菌目（Chloroflexales）
- 绿弯菌科（Chloroflexaceae）
- 颤绿菌科（Oscillochloridaceae）
- 红弯曲菌科（Roseiflexaceae）
- 科未定
- 爬管菌目（Herpetosiphonales）
- 爬管菌科（Herpetosiphonaceae）
- 细美菌目（Kallotenuales）
- 细美菌科（Kallotenuaceae）

### 脱卤球菌纲（Dehalococcoidia）

- 脱卤球菌目（Dehalococcoidales）
- 脱卤球菌科（Dehalococcoidaceae）
- 科未定

### 纤线杆菌纲（Ktedonobacteria）

- 纤线杆菌目（Ktedonobacterales）
- 网状杆菌科（Dictyobacteraceae）
- 纤线杆菌科（Ktedonobacteraceae）
- 细枝产孢菌科（Ktedonosporobacteraceae）
- Reticulibacteraceae
- 热孢丝菌科（Thermosporotrichaceae）
- 嗜热芽殖孢菌目（Thermogemmatisporales）
- 嗜热芽殖孢菌科（Thermogemmatisporaceae）

### 温美人菌纲（Tepidiformia）

- 温美人菌目（Tepidiformales）
- 温美人菌科（Tepidiformaceae）

### 热弯菌纲（Thermoflexia）

- 热弯菌目（Thermoflexales）
- 热弯菌科（Thermoflexaceae）

### 纲未定

- 目未定
- 科未定

## 产金菌门（Chrysiogenota）

### 产金菌纲（Chrysiogenia）

- 产金菌目（Chrysiogenales）
- 产金菌科（Chrysiogenaceae）

## 栖热粪杆菌门（Coprothermobacterota）

### 栖热粪杆菌纲（Coprothermobacteria）

- 栖热粪杆菌目（Coprothermobacterales）
- 栖热粪杆菌科（Coprothermobacteraceae）

## 蓝菌门（Cyanobacteriota）

汉语“藻”字可指多种水生光合产氧生物，包括多枝互不相关的原生生物甚至高等水生植物。但此处仍按照“藻”翻译此门的细菌，也可依据个人理念将名称定为“某菌”或“某蓝菌”，但应注意避免与其余细菌重名。

### 蓝菌纲（Cyanophyceae）

- Acaryochloridales
- Acaryochloridaceae
- 嗜热聚球藻菌科（Thermosynechococcaceae）
- 色球藻目（Chroococcales）
- 隐杆藻科（Aphanothecaceae）
- 色球藻科（Chroococcaceae）
- 石囊藻科（Entophysalidaceae）
- 双囊藻科（Geminocystaceae）
- 真囊球藻科（Gomphosphaeriaceae）
- 微囊藻科（Microcystaceae）
- Skujapeltaceae
- 科未定
- 拟色球藻目（Chroococcidiopsidales）
- 拟色球藻科（Chroococcidiopsidaceae）
- 科未定
- 束鞘藻目（Coleofasciculales）
- 束鞘藻科（Coleofasciculaceae）
- 威氏藻科（Wilmottiaceae）
- 沙丝藻目（Desertifilales）
- 沙丝藻科（Desertifilaceae）
- 盖丝藻目Geitlerinematales
- 盖丝藻科Geitlerinemataceae
- Gloeomargaritales
- Gloeomargaritaceae
- 戈芒藻目（Gomontiellales）
- 戈芒藻科（Gomontiellaceae）
- Konicacronemataceae
- 细鞘丝藻目（Leptolyngbyales）
- 细鞘丝藻科（Leptolyngbyaceae）
- 新聚球藻菌科（Neosynechococcaceae）
- Trichocoleaceae
- 节线藻目（Nodosilineales）
- Cymatolegaceae
- 节线藻科（Nodosilineaceae）
- 念珠藻目（Nostocales）
- 双线藻科（Borzinemataceae）
- 眉藻科（Calotrichaceae）
- 蒴链藻科（Capsosiraceae）
- 绿胶蓝菌科（Chlorogloeopsidaceae）
- Dapisostemonaceae
- Godleyaceae
- 软管藻科（Hapalosiphonaceae）
- Heteroscytonemataceae
- 节球藻科（Nodulariaceae）
- 念珠藻科（Nostocaceae）
- Rhizonemataceae
- 胶须藻科（Rivulariaceae）
- 伪枝藻科（Scytonemataceae）
- 真枝藻科（Stigonemataceae）
- 单歧藻科（Tolypotrichaceae）
- 科未定
- Oculatellales
- Oculatellaceae
- 颤藻目（Oscillatoriales）
- 气丝藻科（Aerosakkonemataceae）
- 博氏藻科（Borziaceae）
- 蓝藻科（Cyanothecaceae）
- 葛万藻科（Girvanellaceae）
- 须藻科（Homoeotrichaceae）
- Laspinemataceae
- 微鞘藻科（Microcoleaceae）
- 颤藻科（Oscillatoriaceae）
- 席藻科（Phormidiaceae）
- Sirenicapillariaceae
- Vermifilaceae
- 科未定
- 泥线菌目（Pelonematales）
- 泥线菌科（Pelonemataceae）
- 宽球藻目（Pleurocapsales）
- 水球藻科（Hydrococcaceae）
- 蓝枝藻科（Hyellaceae）
- Leuconemataceae
- 宽球藻科（Pleurocapsaceae）
- 异球藻科（Xenococcaceae）
- 科未定
- 螺旋藻目（Spirulinales）
- Lusitaniellaceae
- 螺旋藻科（Spirulinaceae）
- Thermostichales
- Thermostichaceae
- 目未定
- Alternantiaceae
- Camptotrichaceae
- 附枝藻科（Epiphytaceae）
- 科未定

## 脱铁杆菌门（Deferribacterota）

### 脱铁杆菌纲（Deferribacteres）

- 脱铁杆菌目（Deferribacterales）
- 脱铁杆菌科（Deferribacteraceae）
- Deferrivibrionaceae
- 地弧菌科（Geovibrionaceae）

## 异常球菌门（Deinococcota）

### 异常球菌纲（Deinococci）

- 异常球菌目（Deinococcales）
- 异常球菌科（Deinococcaceae）
- 栖热菌目（Thermales）
- 栖热菌科（Thermaceae）
- 特吕珀菌目（Trueperales）
- 特吕珀菌科（Trueperaceae）
- 目未定
- 科未定

## 网团菌门（Dictyoglomerota）

### 网团菌纲（Dictyoglomeria）

- 网团菌目（Dictyoglomerales）
- 网球菌科（Dictyoglomeraceae）

## 迷踪菌门（Elusimicrobiota）

### 迷踪菌纲（Elusimicrobia）

- 迷踪菌目（Elusimicrobiales）
- 迷踪菌科（Elusimicrobiaceae）
- 目未定
- 科未定

### 内生微菌纲（Endomicrobiia）

- 内生微菌目（Endomicrobiales）
- 内生微菌科（Endomicrobiaceae）
- 科未定

## 纤维杆菌门（Fibrobacterota）

### 几丁质螺菌纲（Chitinispirillia）

- 几丁质螺菌目（Chitinispirillales）
- 几丁质螺菌科（Chitinispirillaceae）

### 几丁质弧菌纲（Chitinivibrionia）

- 几丁质弧菌目（Chitinivibrionales）
- 几丁质弧菌科（Chitinivibrionaceae）

### 纤维杆菌纲（Fibrobacteria）

- 纤维杆菌目（Fibrobacterales）
- 纤维杆菌科（Fibrobacteraceae）

## 梭杆菌门（Fusobacteriota）

### 梭杆菌纲（Fusobacteriia）

- 梭杆菌目（Fusobacteriales）
- 梭杆菌科（Fusobacteriaceae）
- Haliovirgaceae
- 纤毛菌科（Leptotrichiaceae）

## 芽单胞菌门（Gemmatimonadota）

### 芽单胞菌纲（Gemmatimonadia）

- 芽单胞菌目（Gemmatimonadales）
- 芽单胞菌科（Gemmatimonadaceae）

### 长微菌纲（Longimicrobiia）

- 长微菌目（Longimicrobiales）
- 长微菌科（Longimicrobiaceae）

## 圣诞岛盐菌门（Kiritimatiellota）

### 圣诞岛盐菌（Kiritimatiellia）

- 圣诞岛盐菌（Kiritimatiellales）
- 圣诞岛盐菌（Kiritimatiellaceae）
- 黑海菌科（Pontiellaceae）
- 目未定
- 科未定

### 童第周菌纲（Tichowtungiia）

- 童第周菌目（Tichowtungiales）
- 童第周菌科（Tichowtungiaceae）

## 黏胶球形菌门（Lentisphaerota）

### 黏胶球形菌纲（Lentisphaeria）

- 黏胶球形菌目（Lentisphaerales）
- 黏胶球形菌科（Lentisphaeraceae）
- 食物谷菌目（Victivallales）
- 食物谷菌科（Victivallaceae）
- 目未定

### 寡球形菌纲（Oligosphaeria）

- 寡球形菌目（Oligosphaerales）
- 寡球形菌科（Oligosphaeraceae）

## 支原体门（Mycoplasmatota）

### 柔膜菌纲（Mollicutes）

- 无胆甾原体目（Acholeplasmatales）
- 无胆甾原体科（Acholeplasmataceae）
- 厌氧原体目（Anaeroplasmatales）
- 厌氧原体科（Anaeroplasmataceae）
- 盐浆体目（Haloplasmatales）
- 盐浆体科（Haloplasmataceae）
- 支原体目（Mycoplasmatales）
- 支原体科（Mycoplasmataceae）
- 螺原体科（Spiroplasmataceae）
- 拟支原体目（Mycoplasmoidales）
- 类支原体科（Metamycoplasmataceae）
- 拟支原体科（Mycoplasmoidaceae）
- 目未定
- 科未定

## 硝化刺菌门（Nitrospinota）

### 硝化刺菌纲（Nitrospinia）

- 硝化刺菌目（Nitrospinales）
- 硝化刺菌科（Nitrospinaceae）

### 纲未定

- 目未定
- 科未定

## 硝化螺旋菌门（Nitrospirota）

### 硝化螺旋菌纲Nitrospiria

- 硝化螺旋菌目Nitrospirales
- 硝化螺旋菌科Nitrospiraceae
- 科未定

### 热脱硫弧菌纲（Thermodesulfovibrionia）

- 热脱硫弧菌目（Thermodesulfovibrionales）
- Dissulfurispiraceae
- 热脱硫弧菌科（Thermodesulfovibrionaceae）

### 纲未定

- 目未定
- 科未定

## 浮霉菌门（Planctomycetota）

### 海藻球形菌纲（Phycisphaerae）

- 海藻球形菌目（Phycisphaerales）
- 海藻球形菌科（Phycisphaeraceae）
- 沉积物球形菌目（Sedimentisphaerales）
- 厌氧嗜盐球菌科（Anaerohalosphaeraceae）
- 沉积物球形菌科（Sedimentisphaeraceae）
- 中高温球形菌目（Tepidisphaerales）
- 中高温球形菌科（Tepidisphaeraceae）
- 科未定

### 浮霉菌纲（Planctomycetia）

- 出芽菌目（Gemmatales）
- 出芽菌科（Gemmataceae）
- 科未定
- 等球菌目（Isosphaerales）
- 等球菌科（Isosphaeraceae）
- 小梨形菌目（Pirellulales）
- 栖湖小梨形菌科（Lacipirellulaceae）
- 小梨形菌科（Pirellulaceae）
- 嗜热液口滴状菌科（Thermoguttaceae）
- 浮霉菌目（Planctomycetales）
- 浮霉菌科（Planctomycetaceae）
- 科未定

### 纲未定

- 目未定
- 科未定

## 变形菌门（Pseudomonadota）

### 酸硫杆状菌纲（Acidithiobacillia）

- 酸硫杆状菌目（Acidithiobacillales）
- 酸硫杆状菌科（Acidithiobacillaceae）
- 热硫杆状菌科（Thermithiobacillaceae）

### α-变形菌纲（Alphaproteobacteria）

- 柄杆菌目（Caulobacterales）
- 柄杆菌科（Caulobacteraceae）
- 生丝单胞菌科（Hyphomonadaceae）
- 海茎状菌科（Maricaulaceae）
- 科未定
- 海洋菌保杆菌目（Emcibacterales）
- 海洋菌保杆菌科（Emcibacteraceae）
- 全孢螺菌目（Holosporales）
- 全孢螺菌科（Holosporaceae）
- 生丝微菌目（Hyphomicrobiales）
- 河口短杆菌科（Aestuariivirgaceae）
- 阿菲夫氏菌科（Afifellaceae）
- 阿伦斯氏菌科（Ahrensiaceae）
- 林杆菌科（Alsobacteraceae）
- 无形杆菌科（Amorphaceae）
- 臂微菌科（Ancalomicrobiaceae）
- 橙单胞菌科（Aurantimonadaceae）
- 巴通体科（Bartonellaceae）
- 拜叶林克氏菌科（Beijerinckiaceae）
- 芽生绿菌科（Blastochloridaceae）
- 博斯氏菌科（Boseaceae）
- 布罗汉菌科（Breoghaniaceae）
- 布鲁氏菌科（Brucellaceae）
- 螯合球菌科（Chelatococcaceae）
- 黏着杆菌科（Cohaesibacteraceae）
- 德沃斯氏菌科（Devosiaceae）
- 生丝微菌科（Hyphomicrobiaceae）
- 凯斯特亚菌科（Kaistiaceae）
- 地衣杆菌科（Lichenibacteriaceae）
- 栖地衣菌科（Lichenihabitantaceae）
- 甲基杆菌科（Methylobacteriaceae）
- 甲基孢囊菌科（Methylocystaceae）
- 硝化杆菌科（Nitrobacteraceae）
- 背尖贝杆菌科（Notoacmeibacteraceae）
- 细小棒菌科（Parvibaculaceae）
- 水箱杆菌科（Phreatobacteraceae）
- 叶杆菌科（Phyllobacteriaceae）
- 多形单胞菌科（Pleomorphomonadaceae）
- 假黄杆菌科（Pseudoxanthobacteraceae）
- 好气杆菌科（Rhabdaerophilaceae）
- 根瘤菌科（Rhizobiaceae）
- 红菌科（Rhodobiaceae）
- 粉色弓形菌科（Roseiarcaceae）
- 盐矿单胞科（Salinarimonadaceae）
- 慢生苍白杆菌科（Segnochrobactraceae）
- 斯塔普氏菌科（Stappiaceae）
- 温暖无形杆菌科（Tepidamorphaceae）
- 黄色杆菌科（Xanthobacteraceae）
- 科未定
- 碘化物单胞菌目（Iodidimonadales）
- 碘化物单胞菌科（Iodidimonadaceae）
- 柯迪单胞菌目（Kordiimonadales）
- 柯迪单胞菌科（Temperatibacteraceae）
- 磁球菌目（Magnetococcales）
- 磁球菌科（Magnetococcaceae）
- 深海弯曲杆菌目（Mariprofundales）
- 深海弯曲杆菌科（Mariprofundaceae）
- 科未定
- 微消化菌目（Micropepsales）
- 微消化菌科（Micropepsaceae）
- 吴敏菌目（Minwuiales）
- 吴敏菌科（Minwuiaceae）
- 红细菌目（Rhodobacterales）
- 新巨大线菌科（Neomegalonemataceae）
- 副球菌科（Paracoccaceae）
- 玫瑰杆菌科（Roseobacteraceae）
- 红螺菌目（Rhodospirillales）
- 醋杆菌科（Acetobacteraceae）
- 固氮螺菌科（Azospirillaceae）
- 双生球菌科（Geminicoccaceae）
- 基尔螺菌科（Kiloniellaceae）
- 莱朗杆菌科（Reyranellaceae）
- 红螺菌科（Rhodospirillaceae）
- 红弧菌科（Rhodovibrionaceae）
- 星状菌科（Stellaceae）
- 寺崎氏菌科（Terasakiellaceae）
- 深海杆状菌科（Thalassobaculaceae）
- 海旋菌科（Thalassospiraceae）
- 扎瓦尔津氏菌科（Zavarziniaceae）
- 科未定
- 红海菌目（Rhodothalassiales）
- 红海菌科（Rhodothalassiaceae）
- 立克次体目（Rickettsiales）
- 埃里希氏体科（Ehrlichiaceae）
- 立克次体科（Rickettsiaceae）
- 科未定
- 斯尼斯氏菌目（Sneathiellales）
- 斯尼斯氏菌科（Sneathiellaceae）
- 鞘脂单胞菌目（Sphingomonadales）
- 赤杆菌科（Erythrobacteraceae）
- 鞘脂单胞菌科（Sphingomonadaceae）
- 鞘氨醇胞菌科（Sphingosinicellaceae）
- 发酵单胞菌科（Zymomonadaceae）
- 科未定
- 目未定
- 科未定

### β-变形菌纲（Betaproteobacteria）

- 伯克氏菌目（Burkholderiales）
- 产碱菌科（Alcaligenaceae）
- 伯克氏菌科（Burkholderiaceae）
- 丛毛单胞菌科（Comamonadaceae）
- 草酸杆菌科（Oxalobacteraceae）
- 萨特氏菌科（Sutterellaceae）
- 科未定
- 奈瑟菌目（Neisseriales）
- 色杆菌科（Chromobacteriaceae）
- 奈瑟菌科（Neisseriaceae）
- 亚硝化单胞菌目（Nitrosomonadales）
- 嘉利翁氏菌科（Gallionellaceae）
- 嗜甲基菌科（Methylophilaceae）
- 亚硝化单胞菌科（Nitrosomonadaceae）
- 螺菌科（Spirillaceae）
- 甾醇杆菌科（Sterolibacteriaceae）
- 硫胞菌科（Sulfuricellaceae）
- 硫杆菌科（Thiobacillaceae）
- Usitatibacteraceae
- 红环菌目（Rhodocyclales）
- 固氮卷菌科（Azonexacea）
- 河水杆菌科（Fluviibacteraceae）
- 红环菌科（Rhodocyclaceae）
- 动胶菌科（Zoogloeaceae）
- 目未定
- 中科院微菌科（Casimicrobiaceae）
- 科未定

### δ-变形菌纲（Deltaproteobacteria）

- 慢生单胞菌目（Bradymonadales）
- 慢生单胞菌科（Bradymonadaceae）
- Microvenatoraceae
- 铁还原体目（Deferrisomatales）
- 铁还原体科（Deferrisomataceae）
- 脱硫盒菌目（Desulfarculales）
- 脱硫盒菌科（Desulfarculaceae）
- 脱硫杆菌目（Desulfobacterales）
- 脱硫杆菌科（Desulfobacteraceae）
- 脱硫葱状菌科（Desulfobulbaceae）
- Desulfosudaceae
- Thiovibrionaceae
- 科未定
- 脱硫弧菌目（Desulfovibrionales）
- 脱硫盐菌科（Desulfohalobiaceae）
- 脱硫微菌科（Desulfomicrobiaceae）
- 脱硫盐碱杆菌科（Desulfonatronaceae）
- 脱硫弧菌科（Desulfovibrionaceae）
- 硫还原菌目（Desulfurellales）
- 硫还原菌科（Desulfurellaceae）
- 除硫单胞菌目（Desulfuromonadales）
- 除硫单胞菌科（Desulfuromonadaceae）
- 地杆菌科（Geobacteraceae）
- Syntrophotaleaceae
- 硫歧化杆菌目（Dissulfuribacterales）
- 硫歧化杆菌科（Dissulfuribacteraceae）
- 黏球菌目（Myxococcales）
- 厌氧黏杆菌科（Anaeromyxobacteraceae）
- 原囊黏菌科（Archangiaceae）
- 克夫勒氏菌科（Kofleriaceae）
- 黏球菌科（Myxococcaceae）
- 侏囊菌科（Nannocystaceae）
- 多囊菌科（Polyangiaceae）
- 橙色菌科（Sandaracinaceae）
- 流行杆菌科（Vulgatibacteraceae）
- 科未定
- 互营杆菌目（Syntrophobacterales）
- 互营菌科（Syntrophaceae）
- 互营杆菌科（Syntrophobacteraceae）
- 互养棍状菌目（Syntrophorhabdales）
- 互养棍状菌科（Syntrophorhabdaceae）
- 目未定
- 科未定

### ε-变形菌（Epsilonproteobacteria）

- 弯曲菌目（Campylobacterales）
- 弓形菌科（Arcobacteraceae）
- 弯曲菌科（Campylobacteraceae）
- 螺杆菌科（Helicobacteraceae）
- 氢单胞菌科（Hydrogenimonadaceae）
- 鹦鹉螺菌目（Nautiliales）
- 鹦鹉螺菌科（Nautiliaceae）
- 目未定
- 反硝化菌科（Nitratiruptoraceae）
- 科未定

### γ-变形菌纲（Gammaproteobacteria）

- 嗜酸铁氧化杆菌目（Acidiferrobacterales）
- 嗜酸铁氧化杆菌科（Acidiferrobacteraceae）
- 气单胞菌目（Aeromonadales）
- 气单胞菌科（Aeromonadaceae）
- 琥珀酸弧菌科（Succinivibrionaceae）
- 交替单胞菌目（Alteromonadales）
- 交替单胞菌科（Alteromonadaceae）
- 快泳动单胞菌科（Celerinatantimonadaceae）
- 科尔韦氏菌科（Colwelliaceae）
- 铁还原单胞菌科（Ferrimonadaceae）
- 海源菌科（Idiomarinaceae）
- 摩替亚氏菌科（Moritellaceae）
- 假交替单胞菌科（Pseudoalteromonadaceae）
- 冷单胞菌科（Psychromonadaceae）
- 希瓦氏菌科（Shewanellaceae）
- 科未定
- 砂胞菌目（Arenicellales）
- 砂胞菌科（Arenicellaceae）
- 科未定
- 贝日阿托氏菌目（Beggiatoales）
- 无色菌科（Achromatiaceae）
- 贝日阿托氏菌科（Beggiatoaceae）
- 苛求杆菌科（Fastidiosibacteraceae）
- 弗朗西斯菌科（Francisellaceae）
- 亮发菌科（Leucotrichaceae）
- 鱼立克次氏体科（Piscirickettsiaceae）
- 心杆菌目（Cardiobacteriales）
- 心杆菌科（Cardiobacteriaceae）
- 依格纳季氏菌科（Ignatzschineriaceae）
- 牡蛎杆菌科（Ostreibacteriaceae）
- 纤维弧菌目（Cellvibrionales）
- 纤维弧菌科（Cellvibrionaceae）
- 海仙菌科（Halieaceae）
- 微泡菌科（Microbulbiferaceae）
- 港口球菌科（Porticoccaceae）
- 海绵杆菌科（Spongiibacteraceae）
- 着色菌目（Chromatiales）
- 着色菌科（Chromatiaceae）
- 外硫红螺旋菌科（Ectothiorhodospiraceae）
- 颗粒状球菌科（Granulosicoccaceae）
- 盐红螺旋菌科（Halorhodospiraceae）
- 盐硫杆状菌科（Halothiobacillaceae）
- 硫喜碱杆菌科（Thioalkalibacteraceae）
- 硫碱螺旋菌科（Thioalkalispiraceae）
- 深海硫氧化菌科（Thioprofundaceae）
- 向文洲菌科（Wenzhouxiangellaceae）
- 伍斯氏菌科（Woeseiaceae）
- 肠杆菌目（Enterobacterales）
- 布杰约维采菌科（Budviciaceae）
- 肠杆菌科（Enterobacteriaceae）
- 欧文氏菌科（Erwiniaceae）
- 哈夫尼亚菌科（Hafniaceae）
- 摩根氏菌科（Morganellaceae）
- 溶果胶菌科（Pectobacteriaceae）
- 耶尔森氏菌科（Yersiniaceae）
- 不净土杆菌目（Immundisolibacterales）
- 不净土杆菌科（Immundisolibacteraceae）
- 军团菌目（Legionellales）
- 柯克斯体科（Coxiellaceae）
- 军团菌科（Legionellaceae）
- 科未定
- 溶杆菌目（Lysobacterales）
- 溶杆菌科（Lysobacteraceae）
- 罗丹诺杆菌科（Rhodanobacteraceae）
- 甲基球菌目（Methylococcales）
- 泉发菌科（Crenotrichaceae）
- 甲基球菌科（Methylococcaceae）
- 甲基热菌科（Methylothermaceae）
- 科未定
- 涅瓦菌目（Nevskiales）
- 嗜藻菌科（Algiphilaceae）
- 涅瓦菌科（Nevskiaceae）
- 咸水球形菌科（Salinisphaeraceae）
- 类固醇杆菌科（Steroidobacteraceae）
- 海洋螺菌目（Oceanospirillales）
- 泥沼杆菌科（Aestuariirhabdaceae）
- 食烷菌科（Alcanivoracaceae）
- 巴氏丝杆菌科（Balneatricaceae）
- 动物内生单胞菌科（Endozoicomonadaceae）
- 庆尚大学菌科（Gynuellaceae）
- 霍氏菌科（Hahellaceae）
- 盐单胞菌科（Halomonadaceae）
- 康氏菌科（Kangiellaceae）
- Litorivicinaceae
- 嗜苏打小螺菌科（Natronospirillaceae）
- 海洋螺菌科（Oceanospirillaceae）
- 嗜油菌科（Oleiphilaceae）
- 糖螺菌科（Saccharospirillaceae）
- 科未定
- 孤菌目（Orbales）
- 孤菌科（Orbaceae）
- 科未定
- 巴斯德氏菌目（Pasteurellales）
- 巴斯德氏菌科（Pasteurellaceae）
- 鹦鹉菌科（Psittacicellaceae）
- 假单胞菌目（Pseudomonadales）
- 莫拉氏菌科（Moraxellaceae）
- 假单胞菌科（Pseudomonadaceae）
- 多变单胞菌科（Ventosimonadaceae）
- 科未定
- 嗜盐硫杆菌目（Thiohalobacterales）
- 嗜盐硫杆菌科（Thiohalobacteraceae）
- 硫盐杆菌目（Thiohalorhabdales）
- 硫盐杆菌科（Thiohalorhabdaceae）
- 目未定
- 托赛尔氏菌科（Thorselliaceae）
- 科未定

### 嗜氢菌纲（Hydrogenophilia）

- 嗜氢菌目（Hydrogenophilales）
- 嗜氢菌科（Hydrogenophilaceae）
- 目未定
- 科未定

### 寡弯曲菌纲（Oligoflexia）

- 贪食杆菌目（Bacteriovoracales）
- 贪食杆菌科（Bacteriovoracaceae）
- 盐贪食杆菌科（Halobacteriovoracaceae）
- 蛭弧菌目（Bdellovibrionales）
- 蛭弧菌科（Pseudobdellovibrionaceae）
- 寡弯曲菌目（Oligoflexales）
- 寡弯曲菌科（Oligoflexaceae）
- 假贪食小杆菌科（Pseudobacteriovoracaceae）
- 施瓦茨瓦尔德菌目（Silvanigrellales）
- 施瓦茨瓦尔德菌目（Silvanigrellaceae）

## 红嗜热盐菌门（Rhodothermota）

### 红嗜热盐菌纲（Rhodothermia）

- 红嗜热盐菌目（Rhodothermales）
- 红嗜热盐菌科（Rhodothermaceae）
- 淡红色球菌科（Rubricoccaceae）
- 盐场杆菌科（Salinibacteraceae）
- 盐刚毛菌科（Salisaetaceae）

## 螺旋体门（Spirochaetota）

### 螺旋体纲（Spirochaetia）

- 短螺旋体目（Brachyspirales）
- 短螺旋体科（Brachyspiraceae）
- Brevinematales
- Brevinemataceae
- Thermospiraceae
- 钩端螺旋体目（Leptospirales）
- 钩端螺旋体科（Leptospiraceae）
- 螺旋体目（Spirochaetales）
- 疏螺旋体科（Borreliaceae）
- Breznakiellaceae
- 球形发丝菌科（Sphaerochaetaceae）
- 螺旋体科（Spirochaetaceae）
- 密螺旋体科（Treponemataceae）
- 目未定
- 科未定

### 纲未定

- 目未定
- 科未定

## 互养菌门（Synergistota）

### 互养菌纲（Synergistia）

- 互养菌目（Synergistales）
- 嗜胺菌科（Aminiphilaceae）
- Aminithiophilaceae
- 脱硫代硫酸盐弧菌科（Dethiosulfovibrionaceae）
- 互养菌科（Synergistaceae）

### 纲未定

- 目未定
- Thermosynergistaceae

## 热脱硫杆菌门（Thermodesulfobacteriota）

### 热脱硫杆菌纲（Thermodesulfobacteria）

- 热脱硫杆菌目（Thermodesulfobacteriales）
- 热脱硫杆菌科（Thermodesulfobacteriaceae）

### 纲未定

- 目未定
- 科未定

## 热微菌门（Thermomicrobiota）

### 热微菌纲（Thermomicrobia）

- 球形杆菌目（Sphaerobacterales）
- 球形杆菌科（Sphaerobacteraceae）
- 热微菌目（Thermomicrobiales）
- 热微菌科（Thermomicrobiaceae）
- 目未定
- 科未定

## 热袍菌门（Thermotogota）

### 热袍菌纲（Thermotogae）

- 广宇袍菌目（Kosmotogales）
- 广宇袍菌科（Kosmotogaceae）
- 中度嗜酸袍菌目（Mesoaciditogales）
- 中度嗜酸袍菌科（Mesoaciditogaceae）
- 石袍菌目（Petrotogales）
- 石袍菌科（Petrotogaceae）
- 热袍菌目（Thermotogales）
- 高温杆菌科（Fervidobacteriaceae）
- 热袍菌科（Thermotogaceae）

## 疣微菌门（Verrucomicrobiota）

### 丰祐菌纲（Opitutia）

- 丰祐菌目（Opitutales）
- 丰祐菌科（Opitutaceae）
- 科未定
- 紫红球菌目（Puniceicoccales）
- 紫红球菌科（Puniceicoccaceae）
- 目未定
- 科未定

### 土生微菌纲（Terrimicrobiia）

- 土生微菌目（Terrimicrobiales）
- 土生微菌科（Terrimicrobiaceae）

### 疣微菌纲（Verrucomicrobiia）

- 疣微菌目（Verrucomicrobiales）
- 阿克曼氏菌科（Akkermansiaceae）
- 海生红杆菌科（Rubritaleaceae）
- 疣微菌科（Verrucomicrobiaceae）

### 纲未定

- 淤泥球菌目（Limisphaerales）
- Fontisphaeraceae
- 淤泥球菌科（Limisphaeraceae）
- 目未定
- 科未定