文獻管理軟體比較

以下列表比較文獻管理軟體，比較對象包括可能已不再受支持的舊版應用程式以及正在維護的軟體。

## 常用

在「備註」一欄，有以下分類：

- 基於網頁的應用程式，指安裝在網頁伺服器上的應用程式（通常要求MySQL或其他資料庫作後段，以及使用PHP、Perl、Python或者其他網頁程式語言以供前段存取程式使用）
- 中央託管網站

軟體｜開發者｜首次公開發行｜最新穩定版本推出日期｜最新穩定版本｜價錢（美元）｜是否為免費軟體｜協議｜備註

Bebop (software)｜ALaRI研究所｜2007-11-08｜2009-11-10｜1.1｜免費｜是｜BSD｜基於網頁的BibTeX前端（Apache、PHP、MySQL）

BibBase｜Christian Fritz｜2005｜2013-07｜v3｜免費｜否｜專有｜中央託管網站，用於發布網頁

BibDesk｜BibDesk開發者｜2002-04｜免費｜是｜BSD｜BibTeX前端+資源庫；基於Cocoa；與Spotlight集成

BibSonomy｜卡塞爾大學｜2006-01｜2024-01-08｜4.1.0｜免費｜是｜AGPL, GPL, LGPL｜中央託管網站

Bookends｜桑尼軟體｜1988 (Mac) / 1983 (Apple II+)｜2023-05-06｜14.2｜US$59.99｜否｜專有｜通過iCloud同步桌面和iOS、集成網路搜索、PDF下載、Word插件、支持BibTex、將PDF注釋存儲為注釋

Citavi｜Lumivero｜2006-02-13｜2023-08-15｜6.17.0.0｜US$89-1947｜否｜專有｜數據可保存在本地電腦上，也可保存在Citavi雲或內網Microsoft SQL Server中，以便團隊訪問；通過界面搜索資料庫

EndNote｜科睿唯安｜1988｜nonfree|US$299.95｜否｜專有｜網路版EndNote basic EndNote basic （前身為EndNote Web）免費

JabRef｜JabRef開發者｜2003-11-29｜2023-10-21｜5.11｜免費｜是｜MIT許可證｜Java編寫的BibTeX及BibLaTeX管理器

KBibTeX｜KBibTeX開發者｜2005-08｜2020-04-26｜0.9.2｜免費｜是｜GNU GPL｜BibTeX前端，使用KDE軟體編譯器

Mendeley｜愛思唯爾｜2008-08｜2020｜1.19.8｜免費/免費在線存儲空間最高為2 GB/可提供額外存儲空間｜否｜專有軟體 (存在作業系統API客戶端)｜需要註冊帳戶、安裝桌面和網路組件，提供Windows、Linux、macOS（非 macOS 11 Big Sur）客戶端

Paperpile｜Stefan Washietl, Gregorgy Jordan, Andreas Gruber｜2013｜持續在線更新｜學術類US$2.99/月，其他US$9.99/月｜否｜專有｜網路應用程式，與Google Docs集成，具有協作和共享功能，目前僅支持Google Chrome瀏覽器

Papers (software)｜ReadCube｜2011-10｜2023-04-04｜v.4.35.2224｜nonfree|學生US$3/月，學者US$5/月｜否｜專有｜網路應用程式、桌面（MacOS、Windows）、手機（iOS和Android）。Microsoft Word和Google文檔插件。瀏覽器擴展（Chrome、Firefox、Edge、Safari）

Pybliographer｜Pybliographer開發者｜1998-10-30 (0.2)｜2018-04-03｜1.4.0｜免費｜是｜GNU GPL｜Python/GTK2

refbase｜refbase開發者｜2003-06-03｜2014-02-28｜0.9.6｜免費｜是｜GNU GPL｜基於網路的機構資料庫/自我存檔

RefDB｜refdb開發者｜2001-04-25｜免費｜是｜GNU GPL｜透明網絡；XML/SGML文獻目錄

RefWorks｜Ex Libris / ProQuest｜2001｜2022｜4.6｜機構訂閱｜否｜專有｜基於網路、瀏覽器訪問、Word和Google文檔

Wikindx｜Mark Grimshaw, Stéphane Aulery｜2003-02｜2024-04-13｜6.9.1｜免費｜是｜ISC license｜基於網路，適用於PHP和MySQL/MariaDB

Zotero｜喬治梅森大學羅伊·羅森茨維格歷史與新媒體中心｜2006｜免費/在線存儲免費，最大為300 MB/可提供額外存儲空間｜是｜AGPL｜多平台桌面版，擁有Firefox、Google Chrome和Safari的客戶端。還可通過Zotero.org或使用者電腦上的個人云資料庫文件夾（Google Drive、Dropbox等）訪問基於網路的參考資料庫。

## 作業系統支持

對於網路應用程式，此段描述了伺服器作業系統。對於專有的集中託管網站，則不適用。除非腳註中另有說明，否則任何客戶端-伺服器架構的作業系統都可以連接到Web服務。

軟體｜Windows｜macOS｜Linux｜ChromeOS｜BSD｜Unix｜iOS｜Android｜Windows App

Bebop｜是｜是｜是｜未知｜是｜是｜否｜否｜否

BibBase｜不適用｜不適用｜不適用｜不適用｜不適用｜不適用｜未知｜未知｜未知

BibDesk｜否｜是｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否

BibSonomy｜不適用｜不適用｜不適用｜不適用｜不適用｜不適用｜未知｜未知｜未知

Bookends｜否｜是｜否｜未知｜否｜否｜是｜未知｜未知

Citavi｜是｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否

EndNote｜是｜是｜否｜否｜否｜否｜是｜否｜否

JabRef｜是｜是｜是｜否｜否｜是｜否｜否｜否

KBibTeX｜是｜未知｜是｜是｜否｜否｜否

Mendeley｜是｜是｜是｜否｜否｜否｜否 （自2021年3月15日起逐步取消）｜否 （自2021年3月15日起逐步取消）｜否

Paperpile｜是｜是｜是｜是｜否 （需要Chromium）｜否 （需要Chromium）｜是｜是｜否

Papers｜是｜是｜否｜是｜否｜否｜是｜是｜是

Pybliographer｜部分｜部分｜是｜未知｜是｜是｜否｜否｜否

refbase｜是｜是｜是｜未知｜是｜是｜否｜否｜否

RefDB｜是｜是｜是｜未知｜是｜是｜否｜否｜否

RefWorks｜是｜是｜否｜是｜是｜未知｜否｜未知｜否

Wikindx｜不適用｜不適用｜不適用｜不適用｜不適用｜不適用｜不適用｜不適用｜不適用

Zotero｜是｜是｜是｜僅Intel平台｜否｜是｜是｜第三方｜否

## 輸出文件格式

本表列出了可從參考資料管理器導出的機器可讀文件格式。這些格式通常用於與其他參考資料管理器或使用參考資料管理器的其他人共享數據。要從一個程序向另一個程序交換數據，第一個程序必須能夠導出為第二個程序可以導入的格式。導入文件格式見下表。

軟體｜BibTeX｜Endnote/refer (software)/BibIX｜Medline｜MODS XML｜RIS (file format)｜其它支持類型

Bebop｜是｜否｜否｜否｜否｜unAPI

BibBase｜是｜否｜否｜否｜否｜無

BibDesk｜是｜否｜是｜是｜是｜Endnote XML，使用者可自定義

BibSonomy｜是｜是｜否｜否｜是｜多種格式

Bookends｜是｜是｜是｜否｜是｜多種使用者自定義格式

Citavi｜是｜是｜是｜是｜是｜NVivo及其他多種軟體

EndNote｜是｜是｜是｜否｜是｜多種格式

JabRef｜是｜是｜否｜是｜是｜BibTeXML、DocBook、HTML、用於OOo的ODF、RTF、SQL 資料庫、使用者自定義

KBibTeX｜是｜是｜否｜視情況｜是｜PDF、PostScript、HTML、XML、RTF

Mendeley｜是｜是｜否｜否｜是｜XML尾注

Paperpile｜是｜否｜否｜否｜是｜CSV、JSON

Papers｜是｜是｜否｜否｜是

Pybliographer｜是｜是｜是｜否｜否｜Ovid Technologies

refbase｜是｜是｜否｜是｜是｜COinS、用於OOo的ODF、通過SRU的Search/Retrieve Web ServiceXML、unAPI、Word XML

RefDB｜是｜是｜否｜是｜是｜通過SRU網路服務的Search/Retrieve Web ServiceXML、DocBook、TEI

RefWorks｜是｜是｜否｜是｜是｜RIS、BibTeX、Tab delimited or XML metadata

Wikindx｜是｜是｜否｜否｜是｜COinS、HTML、PubMed、RTF

Zotero｜是｜是｜從4.0版起｜是｜是｜COinS、Csv、多個RDF格式標準、TEI、維基百科引文模板、Endnote XML、CSL JSON、Refer/BiblX、RefWorks標籤

## 輸入文件格式

下表列出了無需連接特定資料庫即可手動導入參考文獻管理器的檔案格式。許多資料庫公司使用的文件格式名稱與其資料庫名稱相同（包括Copac、Cambridge Scientific Abstracts、ISI、MEDLINE、Ovid、PubMed和SciFinder）。有關從特定資料庫（而非文件格式）檢索引文的功能，請參閱本表下方的資料庫連接表。

任何參考資料管理系統都不支持CSL YAML。

軟體｜BibTeX｜Copac｜Cambridge Scientific Abstracts｜EndNote/refer (software)/BibIX｜ISI｜MEDLINE｜MODS XML｜Ovid Technologies｜PubMed｜RIS (file format)｜SciFinder｜其它支持格式

Bebop｜是｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜無

BibBase｜是｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜無

BibDesk｜是｜是｜否｜是｜是｜是｜是｜否｜是｜是｜是｜MARC、JSTOR、Reference Miner

BibSonomy｜是｜否｜否｜是｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜Firefox瀏覽器書籤

Bookends｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜否｜是｜是｜是｜是｜多種使用者自定義格式

Citavi｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜多種格式

EndNote｜否｜否｜是｜是｜是｜是｜否｜是｜是｜是｜是｜多種格式

JabRef｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜BibTexML、Biomail、Inspec、JSTOR、MSBib、帶有XMP注釋的PDF、REPEC、SilverPlatter、SixPack

KBibTeX｜是｜否｜否｜是｜否｜否｜視情況｜否｜是｜是｜否｜無

Mendeley｜是｜否｜否｜是｜否｜否｜否｜否｜否｜是｜否｜瀏覽器書籤

Paperpile｜是｜否｜否｜是｜是｜是｜否｜否｜是｜是｜否｜PDF、MARC

Papers｜是｜否｜否｜是｜否｜否｜否｜否｜是｜是｜否｜PDF

Pybliographer｜是｜否｜否｜是｜是｜是｜否｜是｜否｜否｜否｜無

refbase｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜否｜是｜是｜是｜RefWorks

RefDB｜是｜是｜否｜是｜是｜是｜是｜否｜是｜是｜是｜MARC, risx

RefWorks｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜多種格式

Wikindx｜是｜否｜否｜是｜否｜否｜否｜是｜是｜否｜否｜BibReX LaTeX

Zotero｜是｜否｜否｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜是｜否｜COinS、MARC、RDF、unAPI、瀏覽器書籤、Endnote XML、其它格式

## 支持的引文格式

軟體｜APA｜Chicago/Turabian｜Harvard｜MLA_Handbook#MLA_Style_Manual｜其它格式｜擴展模式

Bebop｜否｜否｜否｜否｜否｜否

BibBase｜是｜否｜否｜否｜否｜否

BibDesk｜是｜是｜是｜是｜多種格式｜BibTeX樣式文件（使用面向CSL的Pandoc§CiteProc）或BibDesk導出模板

BibSonomy｜是｜否｜是｜否｜否｜否

Bookends｜是｜是｜是｜是｜多種格式｜未知

Citavi｜是｜是｜是｜是｜多種格式｜Citavi格式（通過GUI），包括條件和可編程組件；與LaTeX一起使用時，可使用BibTeX或Biber (LaTeX)（使用用於CSL的Pandoc§CiteProc）

EndNote｜是｜是｜是｜是｜多種格式｜EndNote格式（通過GUI）

JabRef｜是｜是｜是｜是｜多種格式｜BibTeX樣式文件或Biber (LaTeX)（使用用於CSL的Pandoc§CiteProc)

KBibTeX｜是｜是｜是｜是｜多種格式｜BibTeX樣式文件（使用用於CSL的Pandoc§CiteProc)

Mendeley｜是｜是｜是｜是｜多種格式｜CSL

Paperpile｜是｜是｜是｜是｜多種格式｜CSL

Papers｜是｜是｜是｜是｜多種格式｜CSL、BibTeX或Biber (LaTeX)與LaTeX一起使用

Pybliographer｜是｜否｜否｜否｜無｜Pybliographer XML

refbase｜是｜是｜是｜是｜各種極地和海洋期刊｜PHP

RefDB｜是｜是｜是｜是｜21種生物醫學和法律期刊｜XML（citestylex.dtd）、交互式腳本

RefWorks｜是｜是｜是｜是｜多種格式｜RefWorks格式（通過GUI）；CSL

Wikindx｜是｜是｜是｜是｜ABNT, BMJ, IEEE｜Wikindx格式（通過GUI）

Zotero｜是｜是｜是｜是｜多種格式｜CSL；與LaTeX一起使用時，可使用BibTeX或Biber (LaTeX)

## 參考列表文件格式

Endnote與LaTeX不兼容。

軟體｜HTML｜LaTeX｜RTF｜Plain text｜RSS｜其它格式

Bebop｜是｜否｜否｜否｜是｜unAPI

BibBase｜是｜否｜否｜否｜是｜否

BibDesk｜是｜是｜是｜是｜是｜Atom、DOC、PDF、XML

BibSonomy｜是｜否｜是｜是｜是｜CSV

Bookends｜是｜否｜是｜是｜否｜剪貼板

Citavi｜是｜是｜是｜是｜否｜剪貼板, DOC, ODT, PDF, HTML

EndNote｜是｜否｜是｜是｜否｜剪貼板, XML

JabRef｜是｜是｜是｜是｜否｜剪貼板

KBibTeX｜是｜否｜是｜否｜否｜PDF、PostScript

Mendeley｜是｜是｜是｜是｜是｜剪貼板、可嵌入的HTML部件、RSS

Paperpile｜是｜是｜是｜是｜否｜剪貼板

Papers｜是｜否｜否｜否｜否｜PDF

Pybliographer｜是｜未知｜否｜是｜否｜否

refbase｜是｜是｜是｜是｜是｜Markdown、PDF、unAPI

RefDB｜是｜未知｜是｜是｜否｜DocBook, TEI

RefWorks｜是｜否｜是｜是｜否｜DOC, ODT

Wikindx｜是｜是｜是｜否｜是｜通過BibUtils插件實現多重功能

Zotero｜是｜可通過插件實現｜是｜可通過插件實現｜是｜剪貼板

## 與文字處理器的集成

一些參考文獻管理軟體支持在Word處理程序中自動嵌入和（重新）格式化參考文獻。本表列出了Microsoft Word、Pages、Apache OpenOffice / LibreOffice Writer、LaTeX編輯器Kile和LyX以及Google Docs的此類支持。其他程序能夠掃描RTF或其他文本格式，以查找隨後格式化的插入占位符。大多數參考文獻管理程序都支持將參考文獻複製/粘貼或拖放到任何文本編輯器中，但在此不作介紹。

軟體｜Windows版Word｜Mac版Word｜在線版Word｜Pages｜Apache OpenOffice / LibreOffice｜Kile/LyX｜Google Docs｜RTF scan｜其它

Bebop｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜無

BibBase｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜無

BibDesk｜否｜否｜否｜否｜否｜是｜否｜是｜ 使用者自定義腳本

BibSonomy｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜無

Bookends｜是｜是｜否｜是｜是｜否｜否｜是｜Mellel、Nisus

Citavi｜是｜是｜否｜否｜僅適用於6.0之前的版本｜是｜否｜僅適用於6.0之前的版本｜LaTeX編輯器Texmaker、TeXnicCenter、TeXstudio、TeXworks、WinEdt、WinShell

EndNote｜是｜是｜否｜是｜否｜否｜否｜是｜否

JabRef｜是｜未知｜未知｜未知｜是｜是｜否｜未知｜Emacs、Texmaker、TeXstudio、Vim、WinEdt

KBibTeX｜否｜未知｜未知｜未知｜否｜是｜否｜未知｜無

Mendeley｜是｜部分｜是｜否｜是｜否｜否｜未知｜NeoOffice

Paperpile｜是｜是｜否｜否｜否｜否｜是｜否｜否

Papers｜是｜是｜是｜是｜是｜否｜是｜否｜ Manuscripts app、Scrivener、Ulysses

Pybliographer｜否｜未知｜未知｜未知｜是｜是｜否｜未知｜無

refbase｜否｜未知｜未知｜未知｜是｜否｜否｜是｜ PIRA、MediaWiki、SPIP

RefDB｜否｜未知｜未知｜未知｜否｜否｜否｜否｜無

RefWorks｜是｜是｜否｜否｜否｜否｜是｜是｜無

Wikindx｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜否｜集成式所見即所得文字處理器（HTML和RTF輸出）

Zotero｜是｜是｜否｜否｜是｜(與LyZ）｜是｜是｜多種格式

## 資料庫連接性

本表列出了參考資料管理器可以導入的學術資料庫和搜尋引擎。在某些情況下，可以直接在參考資料管理器中進行搜索和檢索。在其他情況下，小書籤或Firefox擴展程序將允許對網站進行Data_scraping#Screen_scraping。

軟體｜ArXiv｜CiteSeer｜IEEE Xplore｜PubMed｜Unpaywall｜其它

Bebop｜否｜否｜否｜否｜否｜否

BibBase｜否｜否｜否｜否｜否｜DBLP、Zotero、BibSonomy、Mendeley

BibDesk｜是｜是｜否｜是｜否｜ACM、JSTOR、DBLP、Google Scholar、Web of Science、任何Z39.50或Entrez等。

BibSonomy｜是｜是｜是｜是｜否｜多種格式

Bookends｜是｜否｜否｜是｜否｜Web of Science、亞馬遜、谷歌學術、Z39.50

Citavi｜是｜是｜是｜是｜否｜WorldCat/OCLC、Ovid Technologies、EBSCO Industries、ProQuest、Web of Science、Z39.50(4500+在線資源)、Search/Retrieve via URL。根據要求還將添加更多目錄。瀏覽器插件（Firefox、Chrome、Internet Explorer）支持DOI查找、ISBN查找、PubMed ID查找、PMCID查找、arXiv ID查找、COinS以及從維基百科導入。.

EndNote｜是｜否｜是｜是｜否｜多種格式任何Z39.50

JabRef｜是｜是｜是｜是｜是｜ACM、Crossref、DBLP、Directory of Open Access Journals、DOI、GVK、Google Scholar、INSPIRE-HEP、MEDLINE、MathSciNet、Astrophysics Data System、Springer Publishing和Zentralblatt MATH

KBibTeX｜是｜是｜是｜是｜否｜BibSonomy、CiteBase、Collection of Computer Science Bibliographies、DBLP、Google Scholar、ScienceDirect、INSPIRE-HEP、Z MATH、Z39.50

Mendeley｜是｜是｜是｜是｜否｜yes|多種格式

Paperpile｜是｜否｜是｜是｜是｜Google Scholar, INSPIRE-HEP, ACM, Jstor, Web of Science

Papers｜是｜否｜是｜是｜否｜微軟學術、谷歌學術

Pybliographer｜否｜否｜否｜是｜否｜無

refbase｜是｜否｜否｜是｜否｜DOI查詢

RefDB｜是｜否｜否｜是｜否｜任何Z39.50

RefWorks｜否｜否｜否｜是｜否｜多種格式

Wikindx｜否｜否｜否｜是｜否｜谷歌學術索引元數據

Zotero｜是｜是｜是｜是｜是｜多種格式

## 密碼「保護」和網路版本

有些參考管理器提供網路功能（N/A，不可用，表示產品沒有網路功能，而「否」表示產品有網路功能，但缺乏已實施的功能）。輕型目錄訪問協議（LDAP）是一種開放的、供應商中立的行業標準應用層，用於通過網際協議（IP）網路訪問和維護分布式目錄服務。

軟體｜密碼｜LDAP｜聯網

特定使用者權限｜同時寫入訪問

Bebop｜否｜未知｜不適用｜不適用

BibBase｜不適用｜未知｜不適用｜不適用

BibDesk｜是｜未知｜否｜否

BibSonomy｜是｜未知｜是｜是

Bookends｜未知｜未知｜未知｜未知

Citavi｜是｜未知｜是｜是

EndNote｜是｜未知｜否｜否

JabRef｜否｜未知｜否｜部分

KBibTeX｜否｜未知｜不適用｜不適用

Mendeley｜是｜未知｜是｜是

Paperpile｜是｜未知｜是｜是

Papers｜是｜未知｜是｜是

Pybliographer｜未知｜未知｜未知｜未知

refbase｜是｜未知｜是｜是

RefDB｜是｜未知｜是｜是

RefWorks｜是｜未知｜未知｜是

Wikindx｜是｜是｜是｜是

Zotero｜是｜未知｜是｜是

## 已停用軟體

軟體｜開發者｜首次公開發行｜最新穩定版發布日期｜最新穩定版本｜費用（美元）｜自由軟體｜許可｜備註

Biblioscape｜CG Information｜1997｜2015-06-22｜10.0.3.6｜US$79-299｜否｜專有｜ODBC；專業版中的網路訪問；可選的客戶端/伺服器；已停用？

Bibus｜Bibus開發者｜2004-06-03｜已停用｜1.5.1｜免費｜是｜GNU GPL

CiteULike｜Oversity Limited｜2004-11｜於2019-03-30關閉｜免費｜否｜Proprietary｜中央託管網站

colwiz｜colwiz Ltd｜2011｜2016-05-09｜免費 / 在線免費存儲空間最高達3GB / 可提供額外存儲空間｜否｜專有｜現在與wizdom.ai合併

Qiqqa｜Qiqqa｜2010-04｜2020-10-04｜v80｜免費｜是｜GNU GPL｜從2020年底開始開放原始碼

Reference Manager｜湯森路透｜1984｜2010｜12.0.3｜不再出售，2015年12月31日停止銷售｜否｜專有｜網路版；內置網路發布工具；已停用

Referencer｜Referencer開發者｜2008-03-15｜已停用｜1.2.2｜免費｜是｜GNU GPL｜BibTeX前端

RefME｜RefME｜2014｜2017年關閉｜免費｜否｜專有｜網路、iOS和安卓；提供Chrome和Safari擴展；已停用

SciRef｜Scientific Programs｜2012｜2020-07-30｜1.6.2｜US$38.90 / 免費試用版｜否｜專有

Sente｜Third Street Software, Inc.｜2004｜2017年關閉｜6.7.9｜US$60–80 / 免費提供給不超過 100 個參考資料的圖書館｜否｜專有｜台式機和iPad，集中備份/同步；已停用

WizFolio｜WizPatent｜2008-06｜2017年關閉｜Avatara｜US$25 / 免費基本版｜否｜專有｜中央託管網站；已停用

Papyrus｜Research Software Design｜1991年之前｜1997｜7.0.17 for DOS/Windows and 8.0.12 for Mac OS｜免費｜是｜未知｜自2004年1月起免費