本文主要講述嚴重急性呼吸綜合症冠狀病毒 2 變異株及其發生的錯義突變。 引發 2019 冠狀病毒病的嚴重急性呼吸綜合徵冠狀病毒 2（SARSCoV2 冠狀病毒）容易發生突變而產生變異株，關鍵病毒蛋白的突變即可能意味著其出現，目前已有多個變異株在世界各地形成並傳播。由於病毒的核酸序列變異有可能導致抗原漂移，而使得病毒得以逃避宿主的免疫應答，並影響疫苗的效力，這種現象稱為免疫逃避。 已有五種被世界衛生組織認定為值得關注的變異株，它們分別為 Alpha 變異株、Beta 變異株、Gamma 變異株、Delta 變異株以及 Omicron 變異株。 變異株對照表 最初檢出 最初檢出 代號 代號 代號 代號 重要突變 傳播 相對於武漢首次發現變體的臨床變化 相對於武漢首次發現變體的臨床變化 相對於武漢首次發現變體的臨床變化 地區 日期 WHO 標籤 PANGO 譜系 變種 分化枝 重要突變 傳播 傳播力 致命性 抗原性 B11207 P681H 多國 Alpha B117 VOC20DEC01 20I V1 N501Y 6970del P681H 全球 Alpha VOC21FEB02 20I V1 N501Y 6970del P681H E484K 多國 Y453F 可能滅絕 Beta B1351 VOC20DEC02 20H V2 N501Y K417N E484K 多國 Gamma P1 譜系 VOC21JAN02 20J V3 N501Y E484K K417TVoloch Carolina M et al 2020 Genomic characterization of a novel SARSCoV2 lineage from Rio de Janeiro Brazil full text see figure 5 Retrieved 15 January 2021 via MedRxiv 美國、巴西等 68 國 Delta B16172 VOC21APR02 21A T478K L452R P681R 多國 Epsilon B1427，B1429Lineage B1429 covlineagesorg accessed 19 March 2021 Graphic shows B1429 detected in the USA Mexico Canada the UK France Denmark Australia Taiwan Japan South Korea Australia New Zealand Guadeloupe and Aruba 21C L452R 多國 Zeta P2 VUI21JAN01 20BS484K E484K，D614G，V1176F 多國 Eta B1525 VUI21FEB03 21D E484K F888L 加拿大、美國、德國等 69 國 Theta P3 VUI21MAR02 21E E484K，N501Y，P681H，141143del 菲律賓、美國等 17 國 Kappa B16171 VUI21APR01 21B E484Q L452R P681R 多國 Lambda C37 VUI21JUN01 21G G75V，T76I，247253del，L452Q，F490S，D614G，T859N 智利、美國、秘魯等 44 國 2021 年 1 月 Mu B1621 VUI21JUL1 21H T95I、Y144S、Y145N、R346K、E484KN501Y、D614G、P681H、D950N 哥倫比亞、美國等 60 國 2021 年 11 月 Omicron B11529 VUI21NOV1 21K A67V、Δ6970、T95I、G142D、Δ143145、Δ211L212I、ins214EPE、G339D、S371L、S373P、S375FK417N、N440K、G446S、S477N、T478K、E484AQ493K、G496S、Q498R、N501Y、Y505H、T547KD614G、H655Y、N679K、P681H、N764K 波札那、南非等數國 命名法 目前嚴重急性呼吸綜合徵冠狀病毒 2 之變異株有三個常用的命名系統，分別由 GISAID、和 PANGO 建立。 2021 年 5 月 31 日，世界衛生組織宣佈為重要變種病毒提供希臘字母標籤，為免首先發現變種病毒的國家遭受歧視及汙名化。 其中，命名規則在 Mu 變異株後跳過了希臘字母「Nu」和「Xi」這兩個字母。據俄羅斯官方電視臺《RT》報導，有不具名的 WHO 官員透露跳過「Nu」是為避免與發音相同的「New」混淆，至於跳過「Xi」則是由於這個字母的姓氏很普遍，為了避免「對區域的汙名化」。 支序演化樹 以下為嚴重急性呼吸綜合徵冠狀病毒 2 主要變種的支序演化樹簡化示意圖。 關注度之基準 世界衛生組織將變異株分為三個等級。    現階段的主流變異株 需要關注的變異株（VOC） 病毒變異是一個自然隨機過程，並引發關切的程度取決於其導致的傳染性、發病率、死亡率，及逃避檢測、免疫與治療的風險。目前在世界的主要變異株為最早發現於非洲南部由希臘字母「Omicron」標記。 Omicron（B11529 譜系） B11529 變異株（WHO 命名為 Omicron）是目前變異最多的嚴重特殊傳染性肺炎病毒。據媒體簡報會上釋出：這個變異株有超過 50 個突變，而單單在刺突蛋白的突變也有 32 種。 於 2021 年 11 月，在非洲南部的波札那和南非發現。 2021 年 11 月 24 日，升級為「VUM」等級。 2021 年 11 月 26 日，再升級為「VOC」等級。 目前變種分支亞型：BA1（標準亞型）、BA2、BA3、BA4、BA5，總共超過千種以上的「次分支」、「子代」及「重組」變異株。 目前「VOCVOI」等級（需要留意）變異株 JN1 目前「VOCVUM」等級（監視）變異株 KP2 KP3 KP311 JN118 LB1 XEC 過去的主流變異株 需要關注的變異株（Previous VOC） Alpha（B117 譜系） B117 譜系，WHO 命名為 Alpha，又稱 VOC 20201201，並稱 501YV1 變種。部分與「N501Y」突變有關。有 23 個病毒基因變異點。 在 2020 年 9 月，首次從英國東南方的肯特郡（Kent）所發現採集的樣本中發現。 2020 年 12 月 18 日，升級為「VOC」等級。 2022 年 3 月 9 日，降級為「Previous VOC」等級。 Beta（B1351 譜系） B1351 譜系，WHO 命名為「Beta」，又稱 501YV2 變種。與「N501Y」、「K417N」、「E484K」突變有關，與先前的新冠病毒變種相比，501YV2 變種的傳染率增加約 50。有證據表明，501YV2 變種的刺突蛋白突變 E484K 可能會影響一些多克隆抗體和單克隆抗體的中和作用。當前尚未有證據表明該變種影響嚴重特殊傳染性肺炎的嚴重程度。。 2020 年 5 月，在南非東開普省的納爾遜曼德拉灣發現。 2020 年 12 月 18 日，被南非科學家和衛生官員報道。 2020 年 12 月 18 日，升級為「VOC」等級。 2022 年 3 月 9 日，降級為「Previous VOC」等級。 Gamma（P1 譜系） P1 譜系，WHO 命名為「Gamma」，又稱 501YV3 變種。包括三個相關突變：「N501Y」、「E484K」和「K417T」。 2020 年 11 月，在巴西發現。 2021 年 1 月 2 日，在東京國際機場從四名巴西飛抵日本的旅客發現，由日本國立感染症研究所報道。 2021 年 1 月 11 日，升級為「VOC」等級。 2022 年 3 月 9 日，降級為「Previous VOC」等級。 Delta（B16172 譜系） B1617 譜系是 2020 年 10 月於印度發現的一種雙突變變異株。直到 2021 年 1 月前，該變異株的感染人數都寥寥無幾。4 月時該變異株已經蔓延至超過 20 個國家，遍及南極洲和南美洲以外的所有大洲。 在該變異株約 15 個譜系定義突變中包括刺突蛋白突變 D111D、G142D、P681R、E484Q、L452R，其中後兩個突變可能會影響恢復期血漿和單克隆抗體的中和作用。Haseltine WA An Indian SARSCoV2 Variant Lands In California More Danger Ahead Forbescom Apr 12 2021 accessed 14 April 2021 於 5 月 7 日將 B16172 列為 ，命名為 VOC21APR02。 5 月 10 日 WHO 稱，因為 B1617 較高的傳染性，該變異正被列為全球範圍內受關切變種 WHO classifies India variant as being of global concern。6 月 1 日 WHO 將受關切變種限定為 B1617 譜系當中的 B16172（Delta）變種。 稍後 WHO 將 B16172 命名為「Delta」。 5 月 21 日，越南宣佈發現一種傳播性更高，由 Delta 變異株加上 Alpha 變異株上突變的病毒株。6 月 3 日，WHO 澄清該病毒株不符合新混合變種的定義，並將其列為帶有突變的 Delta 變種。 據報道，Delta 變異株基本傳染數 R0 大約為 6（有說法稱其高達 8 或 9），是嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒 2 型原始毒株基本傳染數的 2 倍以上。 2021 年 4 月 4 日，為升級為「VOI」等級。 2021 年 5 月 11 日，為升級為「VOC」等級。 2022 年 6 月 7 日，降級為「Previous VOC」等級。 需要留意的變異株 Previous VOI Epsilon（B1427 譜系、B1429 譜系） B1427 譜系、B1429 譜系，WHO 命名為「Epsilon」，於 2020 年 3 月在美國加州首次發現。 2021 年 3 月 5 日，升級為「VOI」等級。 2021 年 7 月 6 日，降級為「Previous VOI」等級。 Zeta（P2 譜系） P2 譜系，WHO 命名為「Zeta」，於 2020 年 4 月在巴西里約熱內盧首次發現。 2021 年 3 月 17 日，升級為「VOI」等級。 2021 年 7 月 6 日，降級為「Previous VOI」等級。 Eta（B1525 譜系） B1525 譜系，WHO 命名為「Eta」，於 2020 年 12 月在奈及利亞首次發現。 2021 年 3 月 17 日，升級為「VOI」等級。 2021 年 9 月 20 日，降級為「Previous VOI」等級。 Iota（B1526 譜系） B1526 譜系，WHO 命名為「Iota」，於 2020 年 11 月在美國紐約首次發現。 2021 年 3 月 20 日，升級為「VOI」等級。 2021 年 9 月 20 日，降級為「Previous VOI」等級。 Theta（P3 譜系） P3 譜系，WHO 命名為「Theta」，於 2021 年 1 月在菲律賓首次發現。 2021 年 3 月 24 日，升級為「VOI」等級。 2021 年 7 月 6 日，降級為「Previous VOI」等級。 Kappa（B16171） B1617 譜系的三個子譜系之一當中的「B16171」，WHO 命名為「Kappa」，於 2020 年 10 月在印度首次發現。 2021 年 4 月 4 日，升級為「VOI」等級。 2021 年 9 月 20 日，降級為「Previous VOI」等級。 Lambda（C37 譜系） C37 譜系，WHO 命名為「Lambda」，於 2020 年 8 月在秘魯首次發現。 2021 年 6 月 14 日，升級為「VOI」等級。 2022 年 3 月 9 日，降級為「Previous VOI」等級。 Mu（B1621 譜系） B1621 譜系，WHO 命名為「Mu」，於 2021 年 1 月在哥倫比亞首次發現。 2021 年 8 月 30 日，升級為「VOI」等級。 2022 年 3 月 9 日，降級為「Previous VOI」等級。 備註 參見 嚴重急性呼吸綜合徵冠狀病毒 2 變種 突變 錯義突變 參考文獻 外部連結 WHO Tracking SARSCoV2 variants Science Brief Emerging SARSCoV2 Variants CDC SARSCoV2 Variant Classifications and Definitions CDC Variants of concern or under investigation data up to 5 May 2021 PHE SARSCoV2 variants of concern as of 11 May 2021 ECDC Living Evidence SARSCoV2 variants Coronavirus Variants and Mutations Category2019 冠狀病毒病疫情相關列表