豪豬亞目（學名：Hystricomorpha）在歷史上曾有過許多含義。廣義上是指所有具有豪豬型顴弓－咬肌結構（Zygomasseteric system）的齧齒目動物（跳鼠類除外），包括豪豬下目（Hystricognathi）、櫛趾鼠科（Ctenodactylidae）、鱗尾松鼠科（Anomaluridae）、跳兔科（Pedetidae）。分子及形態學研究表明，將鱗尾松鼠科與跳兔科列入其中是有爭議的。根據 Carleton 與 Musser 的研究 Carleton and Musser 2005，這兩科被分為鱗尾松鼠亞目（Anomaluromorpha）。 豪豬亞目（又被稱為 Entodacrya 或 Ctenohystrica）的現代定義是指將櫛趾鼠與豪豬下目聯絡起來的分類學假設。支援這一說法有很多形態學以及分子系統發生學的證據。如果此假說是真實的，那傳統觀點中的松鼠形亞目將被推翻，成為一個並系群。 豪豬類動物，或至少是豚鼠小目中的成員，有時會被認為是非齧齒類。Graur et al 1991DErchia et al 1996Reyes et al 2000 不過大多數分子與遺傳學研究都表明齧齒動物是單系群。Cao et al 1994Kuma and Miyata 1994Sullivan and Swofford 1997RobinsonRechavi et al 2000Lin et al 2002Reyes et al 2004 而支援齧齒類為多系群的證據被認為是源自長枝吸引（long branch attraction）的現象。Bergsten 2005 豪豬類動物於漸新世早期出現於南美洲 Flynn et al 2003，這裡此前的陸地哺乳動物只有後獸下綱、貧齒總目、南蹄目。豪豬類是從非洲橫渡大西洋到達南美洲的。同一型別的遷徙還發生在靈長目中，這些都發生於南北美洲生物大遷徙之前。不過這些說法至今尚存爭議。 分類 以下的分類是根據 Marivaux 等人對早期齧齒類化石進行的支序分類學分析而來的。Marivaux et al 2002Marivaux et al 2004 他們的研究支援豪豬亞目假說，並表明 McKenna 與 Bell 定義的先松鼠亞目（Sciuravida）McKenna and Bell 1997 是多系群，因而並不成立。 豪豬亞目 Hystricomorpha 梳齒鼠總科 Ctenodactyloidea 梳齒鼠科 Ctenodactylidae 科 Tammquammyidae 矽藻鼠科 Diatomyidae 豫鼠科 Yuomyidae 饢鼠科 Chapattimyidae 演化支 Hystricognathiformes 查干鼠科 Tsaganomyidae 豪豬下目 Hystricognathi 俾路支鼠科 Baluchimyinae 豪豬科 Hystricidae 菲奧鼠小目（非洲豪豬類）Phiomorpha 長尾菲奧鼠科 Myophiomyidae 鑽石鼠科 Diamantomyidae 菲奧鼠科 Phiomyidae 肯亞鼠科 Kenyamyidae 巖鼠科 Petromuridae 蔗鼠科 Thryonomyidae 濱鼠科 Bathyergidae 似濱鼠科 Bathyergoididae 豚鼠小目（南美豪豬類）Caviomorpha 美洲豪豬總科 Erethizontoidea 美洲豪豬科 Erethizontidae 豚鼠總科 Cavioidea 頭刺豚鼠科 Cephalomyidae 刺豚鼠科 Dasyproctidae 兔豚鼠科 Cuniculidae 始豚鼠科 Eocardiidae 花背豚鼠科 Dinomyidae 豚鼠科 Caviidae 八齒鼠總科 Octodontoidea 八齒鼠科 Octodontidae 櫛鼠科 Ctenomyidae 棘鼠科 Echimyidae 海狸鼠科 Myocastoridae 硬毛鼠科 Capromyidae 海地島鼠科 Heptaxodontidae 毛絲鼠總科 Chinchilloidea 毛絲鼠科 Chinchillidae 新絨鼠科 Neoepiblemidae 華毛鼠科 Abrocomidae 參考文獻 Bergsten J 2005 A review of longbranch attraction Cladistics 21163193 Cao Y Adachi J Yano T and Hasegawa M 1994 Phylogenetic place of guinea pigs No support of the rodentpolyphyly hypothesis from maximumlikelihood analyses of multiple protein sequences Molecular Biology and Evolution 11 593604 Carleton M D and G G Musser 2005 Order Rodentia Pp745752 in Mammal Species of the World A Taxonomic and Geographic Reference D E Wilson and D M Reeder eds Baltimore Johns Hopkins University Press DErchia A Gissi C Pesole G Saccone C and Arnason U 1996 The guineapig is not a rodent Nature 381 6583 597600 Flynn J J Wyss A R Croft D A and Charrier R 2003 The Tinguiririca Fauna Chile biochronology paleoecology biogeography and a new earliest Oligocene South American Land Mammal Age Palaeogeography Palaeoclimatology Palaeoecology 195229259 Graur D Hide W and Li W 1991 Is the guineapig a rodent Nature 351 649652 Huchon D E J P Douzery 2001 From the Old World to the New World A molecular chronicle of the phylogeny and biogeography of hystricognath rodents Molecular Phylogenetics and Evolution 20238251 Kuma K and Miyata T 1994 Mammalian phylogeny inferred from multiple protein data Japanese Journal of Genetics 69 5 55566 Landry S O J 1999 A proposal for a new classification and nomenclature for the glires Mitt Mus Nat Kd Berl Zool Reihe 75283316 Lin YH et al 2002 Four new mitochondrial genomes and the increased stability of evolutionary trees of mammals from improved taxon sampling Molecular Biology and Evolution 19 20602070 Marivaux L M VianeyLiaud and JJ Jaeger 2004 Highlevel phylogeny of early Tertiary rodents dental evidence Zoological Journal of the Linnean Society 142105134 Marivaux L J L Welcomme M VianeyLiaud and JJ Jaeger 2002 The role of Asia in the origin and diversification of hystricognathous rodents Zoologica Scripta 31225239 McKenna Malcolm C and Bell Susan K 1997 Classification of Mammals Above the Species Level Columbia University Press New York 631 pp ISBN 0231110138 Reyes A Pesole G and Saccone C 2000 Longbranch attraction phenomenon and the impact of amongsite rate variation on rodent phylogeny Gene 259 12 17787 Reyes A Gissi C Catzeflis F Nevo E Pesole G and Saccone C 2004 Congruent mammalian trees from mitochondrial and nuclear genes using Bayesian methods Molecular Biology and Evolution 21 2 397403 RobinsonRechavi M Ponger L and Mouchiroud D 2000 Nuclear gene LCAT supports rodent monophyly Molecular Biology and Evolution 17 14101412 Sullivan J and Swofford DL 1997 Are guinea pigs rodents the importance of adequate models in molecular phylogenetics Journal of Mammalian Evolution 4 7786 Category 齧齒目