中國的水產種質資源保護區，是指為保護和合理利用水產種質資源及其生存環境，在保護物件的產卵場、索餌場、越冬場、洄游通道等主要生長繁育區域依法劃出一定面積的水域灘塗和必要的土地，予以特殊保護和管理的區域。水產種質資源保護區分為國家級和省級，其中國家級水產種質資源保護區是指在國內、國際有重大影響，具有重要經濟價值、遺傳育種價值或特殊生態保護和科研價值，保護物件為重要的、洄游性的共用水產種質資源或保護物件分佈區域跨省（自治區、直轄市）際行政區劃或海域管轄許可權的，經國務院或農業部批准並公佈的水產種質資源保護區。 迄今全國共有 464 處國家級水產種質資源保護區。 國家級水產種質資源保護區列表 河北省 阜平中華鱉國家級水產種質資源保護區 衡水湖國家級水產種質資源保護區 白洋淀國家級水產種質資源保護區 秦皇島海域國家級水產種質資源保護區 昌黎海域國家級水產種質資源保護區 南戴河海域國家級水產種質資源保護區 南大港國家級水產種質資源保護區 灤河特有魚類國家級水產種質資源保護區 柳河特有魚類國家級水產種質資源保護區 柏坡湖國家級水產種質資源保護區 沙漳河紅鰭原鮊青蝦國家級水產種質資源保護區 永年窪黃鱔泥鰍國家級水產種質資源保護區 山海關海域國家級水產種質資源保護區 永定河中華鱉青蝦黃顙魚國家級水產種質資源保護區 沽源閃電河水系壩上高背鯽國家級水產種質資源保護區 遷西栗香湖鯉黃顙魚國家級水產種質資源保護區 曹妃甸中華絨螯蟹國家級水產種質資源保護區 山西省 聖天湖鯰魚黃河鯉國家級水產種質資源保護區 沁河特有魚類國家級水產種質資源保護區 黃河中游禹門口至三門峽段國家級水產種質資源保護區 內蒙古自治區 黃河鄂爾多斯段黃河鯰國家級水產種質資源保護區 額爾古納河根河段哲羅魚國家級水產種質資源保護區 呼倫湖紅鰭鮊國家級水產種質資源保護區 達裡諾爾湖雅羅魚國家級水產種質資源保護區 胡列也吐湖國家級水產種質資源保護區 甘河哲羅魚細鱗魚國家級水產種質資源保護區 霍林河黃顙魚國家級水產種質資源保護區 綽爾河扎蘭屯市段哲羅鮭細鱗鮭國家級水產種質資源保護區 大雁河國家級水產種質資源保護區 遼寧省 雙臺子河口海蜇中華絨螯蟹國家級水產種質資源保護區 三山島海域國家級水產種質資源保護區 海洋島國家級水產種質資源保護區 大連圓島海域國家級水產種質資源保護區 大連獐子島海域國家級水產種質資源保護區 吉林省 密江河大麻哈魚國家級水產種質資源保護區 鴨綠江集安段石川氏哲羅魚國家級水產種質資源保護區 嫩江大安段烏蘇裡擬鱨國家級水產種質資源保護區 鴨綠江雲峰段斑鱖茴魚國家級水產種質資源保護區 牡丹江上游黑斑狗魚國家級水產種質資源保護區 琿春河大麻哈魚國家級水產種質資源保護區 松花江頭道江特有魚類國家級水產種質資源保護區 松花江寧江段國家級水產種質資源保護區 二龍湖國家級水產種質資源保護區 西北岔河特有魚類國家級水產種質資源保護區 嫩江鎮賚段國家級水產種質資源保護區 小石河冷水魚國家級水產種質資源保護區 月亮湖國家級水產種質資源保護區 大黃泥河唇䱻國家級水產種質資源保護區 哈泥河東北七鰓鰻國家級水產種質資源保護區 鴨綠江臨江段馬口魚國家級水產種質資源保護區 松原松花江銀鯝國家級水產種質資源保護區 珠爾多河洛氏鱥國家級水產種質資源保護區 和龍紅旗河馬蘇大麻哈魚陸封型國家級水產種質資源保護區 通化哈尼河國家級水產種質資源保護區 嫩江前郭段國家級水產種質資源保護區 輝南輝發河瓦氏雅羅魚國家級水產種質資源保護區 黑龍江省 黑龍江蘿北段烏蘇裡白鮭國家級水產種質資源保護區 盤古河細鱗魚江鱈國家級水產種質資源保護區 黑龍江嘉蔭段黑斑狗魚雅羅魚國家級水產種質資源保護區 松花江烏蘇裡擬鱨細鱗斜頜鯝國家級水產種質資源保護區 黑龍江李家島翹嘴鮊國家級水產種質資源保護區 黑龍江呼瑪灣特有魚類國家級水產種質資源保護區 海浪河特有魚類國家級水產種質資源保護區 松花江肇東段國家級水產種質資源保護區 黑龍江同江段國家級水產種質資源保護區 松花江木蘭段國家級水產種質資源保護區 黑龍江遜克段國家級水產種質資源保護區 黑龍江撫遠段鱘鰉魚國家級水產種質資源保護區 綏芬河東寧段灘頭魚大馬哈魚國家級水產種質資源保護區 牤牛河國家級水產種質資源保護區 嫩江臥都河茴魚哲羅鮭國家級水產種質資源保護區 松花江肇源段花䱻國家級水產種質資源保護區 松花江雙城段鱖銀鯝國家級水產種質資源保護區 興凱湖翹嘴鮊國家級水產種質資源保護區 烏蘇里江四排段哲羅魚魴國家級水產種質資源保護區 黃泥河方正銀鯽國家級水產種質資源保護區 法別拉河鱖國家級水產種質資源保護區 黑龍江同江段達氏鰉國家級水產種質資源保護區 歐根河黑斑狗魚國家級水產種質資源保護區 上海市 長江刀鱭國家級水產種質資源保護區 江蘇省 海州灣中國對蝦國家級水產種質資源保護區 太湖銀魚翹嘴紅鮊秀麗白蝦國家級水產種質資源保護區 洪澤湖青蝦河蜆國家級水產種質資源保護區 陽澄湖中華絨螯蟹國家級水產種質資源保護區 長江靖江段中華絨螯蟹鱖魚國家級水產種質資源保護區 蔣家沙竹根沙泥螺文蛤國家級水產種質資源保護區 長江大勝關長吻鮠銅魚國家級水產種質資源保護區 固城湖中華絨螯蟹國家級水產種質資源保護區 高郵湖大銀魚湖鱭國家級水產種質資源保護區 長江揚州段四大家魚國家級水產種質資源保護區 白馬湖泥鰍沙塘鱧國家級水產種質資源保護區 駱馬湖國家級水產種質資源保護區 滆湖國家級水產種質資源保護區 長蕩湖國家級水產種質資源保護區 邵伯湖國家水產種質資源保護區 長漾湖國家級水產種質資源保護區 射陽湖國家級水產種質資源保護區 寶應湖國家級水產種質資源保護區 長江如皋段刀鱭國家級水產種質資源保護區 太湖青蝦中華絨螯蟹國家級水產種質資源保護區 如東大竹蟶西施舌國家級水產種質資源保護區 洪澤湖銀魚國家級水產種質資源保護區 駱馬湖青蝦國家級水產種質資源保護區 太湖梅鱭河蜆國家級水產種質資源保護區 澱山湖河蜆翹嘴紅鮊國家級水產種質資源保護區 長江刀鱭國家級水產種質資源保護區 滆湖鮊類國家級水產種質資源保護區 高郵湖河蜆秀麗白蝦國家級水產種質資源保護區 長江揚中段暗紋東方魨刀鱭國家級水產種質資源保護區 宜興團氿東氿翹嘴鮊國家級水產種質資源保護區 洪澤湖秀麗白蝦國家級水產種質資源保護區 浙江省 樂清灣泥蚶國家級水產種質資源保護區 千島湖國家級水產種質資源保護區 東西苕溪國家級水產種質資源保護區 象山港藍點馬鮫國家級水產種質資源保護區 慶元大鯢國家級水產種質資源保護區 安徽省 泊湖秀麗白蝦青蝦國家級水產種質資源保護區 長江安慶江段長吻鮠大口鯰鱖魚國家級水產種質資源保護區 武昌湖中華鱉黃鱔國家級水產種質資源保護區 破罡湖黃顙魚國家級水產種質資源保護區 焦港湖芡實國家級水產種質資源保護區 徽水河特有魚類國家級水產種質資源保護區 長江安慶段四大家魚國家級水產種質資源保護區 閶江特有魚類國家級水產種質資源保護區 城西湖國家級水產種質資源保護區 秋浦河特有魚類國家級水產種質資源保護區 城東湖國家級水產種質資源保護區 嬉子湖國家級水產種質資源保護區 萬佛湖國家級水產種質資源保護區 淮河淮南段長吻鮠國家級水產種質資源保護區 青龍湖光倒刺䰾國家級水產種質資源保護區 龍窩湖細鱗斜頜鯝國家級水產種質資源保護區 池河翹嘴鮊國家級水產種質資源保護區 長江河寬鰭鱲馬口魚國家級水產種質資源保護區 懷洪新河太湖新銀魚國家級水產種質資源保護區 長江刀鱭國家級水產種質資源保護區 漫水河蒙古紅鮊國家級水產種質資源保護區 登源河特有魚類國家級水產種質資源保護區 黃姑河光唇魚國家級水產種質資源保護區 淮河荊塗峽鯉長吻鮠國家級水產種質資源保護區 黃湓河鰕虎魚青蝦國家級水產種質資源保護區 福建省 官井洋大黃魚國家級水產種質資源保護區 西溪中華鱉國家級水產種質資源保護區 漳港西施舌國家級水產種質資源保護區 汀江大刺鰍國家級水產種質資源保護區 九曲溪光倒刺䰾國家級水產種質資源保護區 湖洋溪黑脊倒刺䰾國家級水產種質資源保護區 羅口溪黃尾密鯝國家級水產種質資源保護區 建溪細鱗斜頜鯝國家級水產種質資源保護區 南浦溪半刺厚唇魚國家級水產種質資源保護區 江西省 鄱陽湖鱖魚翹嘴紅鮊國家級水產種質資源保護區 桃江刺䰾國家級水產種質資源保護區 廬山西海鱤國家級水產種質資源保護區 太泊湖彭澤鯽國家級水產種質資源保護區 瀘溪河大鰭鱯國家級水產種質資源保護區 撫河鱖魚國家級水產種質資源保護區 萍水河特有魚類國家級水產種質資源保護區 萬年河特有魚類國家級水產種質資源保護區 濊水特有魚類國家級水產種質資源保護區 信江特有魚類國家級水產種質資源保護區 定江河特有魚類國家級水產種質資源保護區 袁河上游特有魚類國家級水產種質資源保護區 贛江峽江段四大家魚國家級水產種質資源保護區 琴江細鱗斜頜鯝國家級水產種質資源保護區 上猶江特有魚類國家級水產種質資源保護區 東江源平胸龜國家級水產種質資源保護區 昌江刺䰾國家級水產種質資源保護區 贛江源斑鱧國家級水產種質資源保護區 修水源光倒刺䰾國家級水產種質資源保護區 德安縣博陽河翹嘴鮊黃顙魚國家級水產種質資源保護區 長江八里江段長吻鮠鯰國家級水產種質資源保護區 山東省 崆峒列島刺參國家級水產種質資源保護區 南四湖烏鱧青蝦國家級水產種質資源保護區 長島皺紋盤鮑光棘球海膽國家級水產種質資源保護區 海州灣大竹蟶國家級水產種質資源保護區 萊州灣單環刺螠近江牡蠣國家級水產種質資源保護區 靖海灣松江鱸魚國家級水產種質資源保護區 泰山赤鱗魚國家級水產種質資源保護區 馬頰河文蛤國家級水產種質資源保護區 蓬萊牙鮃黃蓋鰈國家級水產種質資源保護區 黃河口半滑舌鰨國家級水產種質資源保護區 靈山島皺紋盤鮑刺參國家級水產種質資源保護區 靖子灣國家級水產種質資源保護區 乳山灣國家級水產種質資源保護區 前三島海域國家級水產種質資源保護區 小石島刺參國家級水產種質資源保護區 桑溝灣國家級水產種質資源保護區 榮成灣國家級水產種質資源保護區 套爾河口海域國家級水產種質資源保護區 千里巖海域國家級水產種質資源保護區 日照海域西施舌國家級水產種質資源保護區 東平湖國家級水產種質資源保護區 廣饒海域竹蟶國家級水產種質資源保護區 黃河口文蛤國家級水產種質資源保護區 長島許氏平鮋國家級水產種質資源保護區 五龍河鯉國家級水產種質資源保護區 榮成楮島藻類國家級水產種質資源保護區 日照中國對蝦國家級水產種質資源保護區 無棣中國毛蝦國家級水產種質資源保護區 月湖長蛸國家級水產種質資源保護區 泗水桃花水母國家級水產種質資源保護區 黃河魯豫交界段國家級水產種質資源保護區 泰安黃尾密鯝國家級水產種質資源保護區 得月湖花䱻翹嘴鮊國家級水產種質資源保護區 馬頰河翹嘴鮊大鱗副泥鰍國家級水產種質資源保護區 雲蒙湖大銀魚國家級水產種質資源保護區 沂河鯉青蝦國家級水產種質資源保護區 京杭運河臺兒莊段黃顙魚國家級水產種質資源保護區 清水河河蜆國家級水產種質資源保護區 淄河鯰魚國家級水產種質資源保護區 河南省 黃河鄭州段黃河鯉國家級水產種質資源保護區 光山青蝦國家級水產種質資源保護區 宿鴨湖褶紋冠蚌國家級水產種質資源保護區 南灣湖國家級水產種質資源保護區 丹江特有魚類國家級水產種質資源保護區 沙河特有魚類國家級水產種質資源保護區 潑河特有魚類國家級水產種質資源保護區 伊河特有魚類國家級水產種質資源保護區 洛河鯉魚國家級水產種質資源保護區 老鴉河花䱻國家級水產種質資源保護區 鴨河口水庫蒙古紅鮊國家級水產種質資源保護區 黃河中游禹門口至三門峽段國家級水產種質資源保護區 小潢河中華鱉國家級水產種質資源保護區 汝河黃顙魚國家級水產種質資源保護區 淇河鶴壁段淇河鯽魚國家級水產種質資源保護區 黃河魯豫交界段國家級水產種質資源保護區 板橋湖國家級水產種質資源保護區 湖北省 梁子湖武昌魚國家級水產種質資源保護區 西涼湖鱖魚黃顙魚國家級水產種質資源保護區 淤泥湖團頭魴國家級水產種質資源保護區 長湖鮊類國家級水產種質資源保護區 長江黃石段四大家魚國家級水產種質資源保護區 漢江沙洋段長吻鮠瓦氏黃顙魚國家級水產種質資源保護區 漢江鍾祥段鱤䲘鯮魚國家級水產種質資源保護區 太白湖國家級水產種質資源保護區 長江監利段四大家魚國家級水產種質資源保護區 丹江鮊類國家級水產種質資源保護區 皤河特有魚類國家級水產種質資源保護區 上津湖國家級水產種質資源保護區 花馬湖國家級水產種質資源保護區 洪湖國家級水產種質資源保護區 漢江漢川段國家級水產種質資源保護區 沮漳河特有魚類國家級水產種質資源保護區 玉泉河特有魚類國家級水產種質資源保護區 保安湖鱖魚國家級水產種質資源保護區 魯湖鱖鮊國家級水產種質資源保護區 五湖黃鱔國家級水產種質資源保護區 赤東湖鯿國家級水產種質資源保護區 清江白甲魚國家級水產種質資源保護區 惠亭水庫中華鱉國家級水產種質資源保護區 王母湖團頭魴短頜鱭國家級水產種質資源保護區 武湖黃顙魚國家級水產種質資源保護區 觀音湖鱖國家級水產種質資源保護區 漢北河瓦氏黃顙魚國家級水產種質資源保護區 楊柴湖沙塘鱧刺鰍國家級水產種質資源保護區 漢江潛江段四大家魚國家級水產種質資源保護區 溳水翹嘴鮊國家級水產種質資源保護區 崇湖黃顙魚國家級水產種質資源保護區 廟湖翹嘴鮊國家級水產種質資源保護區 野豬湖鮊類國家級水產種質資源保護區 策湖黃顙魚烏鱧國家級水產種質資源保護區 南海湖短頜鱭國家級水產種質資源保護區 牛浪湖鱖國家級水產種質資源保護區 豬婆湖花䱻國家級水產種質資源保護區 府河細鱗鯝國家級水產種質資源保護區 錢河鯰國家級水產種質資源保護區 洈水鱖國家級水產種質資源保護區 王家河鮊類國家級水產種質資源保護區 堵河鱖國家級水產種質資源保護區 金家湖花䱻國家級水產種質資源保護區 王家大湖絹絲麗蚌國家級水產種質資源保護區 紅旗湖泥鰍黃顙魚國家級水產種質資源保護區 龍潭湖蒙古鮊國家級水產種質資源保護區 先覺廟漂水支流細鱗鯝國家級水產種質資源保護區 龍賽湖細鱗鯝翹嘴鮊國家級水產種質資源保護區 沙灘河烏鱧國家級水產種質資源保護區 望天湖翹嘴鮊國家級水產種質資源保護區 天堂湖鮊類國家級水產種質資源保護區 聖水湖黃顙魚國家級水產種質資源保護區 琵琶湖細鱗斜頜鯝國家級水產種質資源保護區 富水湖鮊類國家級水產種質資源保護區 金沙湖魴國家級水產種質資源保護區 胭脂湖黃顙魚國家級水產種質資源保護區 東港湖黃鱔國家級水產種質資源保護區 南湖黃顙魚烏鱧國家級水產種質資源保護區 漢江襄陽段長春鯿國家級水產種質資源保護區 府河支流徐家河水域銀魚國家級水產種質資源保護區 長江鄖縣段翹嘴鮊國家級水產種質資源保護區 清江宜都段中華倒刺䰾國家級水產種質資源保護區 湖南省 東洞庭湖鯉鯽黃顙國家級水產種質資源保護區 南洞庭湖銀魚三角帆蚌國家級水產種質資源保護區 湘江湘潭段野鯉國家級水產種質資源保護區 南洞庭湖大口鯰青蝦中華鱉國家級水產種質資源保護區 南洞庭湖草龜中華鱉國家級水產種質資源保護區 沅水特有魚類國家級水產種質資源保護區 澧水源特有魚類國家級水產種質資源保護區 湘江衡陽段四大家魚國家級水產種質資源保護區 瀏陽河特有魚類國家級水產種質資源保護區 洞庭湖口銅魚短頜鱭國家級水產種質資源保護區 湘江刺䰾厚唇魚華鯿國家級水產種質資源保護區 沅水辰谿段鮊類黃顙魚國家級水產種質資源保護區 沅水鼎城段褶紋冠蚌國家級水產種質資源保護區 東洞庭湖中國圓田螺國家級水產種質資源保護區 資水新化段鱖鮊國家級水產種質資源保護區 湘江株洲段鯝魚國家級水產種質資源保護區 耒水斑鱧國家級水產種質資源保護區 洣水茶陵段中華倒刺䰾國家級水產種質資源保護區 資水益陽段黃顙魚國家級水產種質資源保護區 酉水湘西段翹嘴紅鮊國家級水產種質資源保護區 澧水石門段黃尾密鯝國家級水產種質資源保護區 安鄉楊家河段短河鱭國家級水產種質資源保護區 永順司城河吻鮈大眼鱖國家級水產種質資源保護區 沅水桃源段黃顙魚黃尾鯝國家級水產種質資源保護區 沅水武陵段青蝦中華鱉國家級水產種質資源保護區 浙水資興段大刺鰍條紋二須䰾國家級水產種質資源保護區 龍山洗車河大鰭鱯吻鮈國家級水產種質資源保護區 廣東省 西江廣東魴國家級水產種質資源保護區 上下川島中國龍蝦國家級水產種質資源保護區 石窟河斑鱯國家級水產種質資源保護區 流溪河光倒刺䰾國家級水產種質資源保護區 增江光倒刺䰾大刺鰍國家級水產種質資源保護區 海陵灣近江牡蠣國家級水產種質資源保護區 西江赤眼鱒海南紅鮊國家級水產種質資源保護區 西江肇慶段國家級水產種質資源保護區 北江英德段國家級水產種質資源保護區 榕江特有魚類國家級水產種質資源保護區 凌江特有魚類國家級水產種質資源保護區 新豐江國家級水產種質資源保護區 鑑江口尖紫蛤國家級水產種質資源保護區 潭江廣東魴國家級水產種質資源保護區 汕尾碣石灣鯔魚長毛對蝦國家級水產種質資源保護區 柚樹河斑鱧國家級水產種質資源保護區 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芙蓉江大口鯰國家級水產種質資源保護區 雲南省 彌苴河大理裂腹魚國家級水產種質資源保護區 南捧河四須䰾國家級水產種質資源保護區 元江鯉國家級水產種質資源保護區 檳榔江黃斑褶鮡擬鰋國家級水產種質資源保護區 瀾滄江短鬚𩷶中華刀鯰叉尾鯰國家級水產種質資源保護區 滇池國家級水產種質資源保護區 撫仙湖特有魚類國家級水產種質資源保護區 白水江特有魚類國家級水產種質資源保護區 怒江中上游特有魚類國家級水產種質資源保護區 程海湖特有魚類國家級水產種質資源保護區 南臘河特有魚類國家級水產種質資源保護區 谷拉河特有魚類國家級水產種質資源保護區 普文河特有魚類國家級水產種質資源保護區 官寨河特有魚類國家級水產種質資源保護區 南汀河下游段國家級水產種質資源保護區 西藏自治區 巴松措特有魚類國家級水產種質資源保護區 尼洋河特有魚類國家級水產種質資源保護區 西藏亞東鮭國家級水產種質資源保護區 陝西省 黑河多鱗鏟頜魚國家級水產種質資源保護區 黃河洽川段烏鱧國家級水產種質資源保護區 嘉陵江源特有魚類家級水產種源保護區 輞川河特有魚類國家級水產種質資源保護區 庫峪河特有魚類國家級水產種質資源保護區 漢江西鄉段國家級水產種質資源保護區 渭河國家級水產種質資源保護區 黃河灘中華鱉國家級水產種質資源保護區 褒河特有魚類國家級水產種質資源保護區 黃河中游禹門口至三門峽段國家級水產種質資源保護區 沮河上游國家級水產種質資源保護區 丹江源國家級水產種質資源保護區 千河國家級水產種質資源保護區 湑水河國家級水產種質資源保護區 甘峪河秦嶺細鱗鮭國家級水產種質資源保護區 任河多鱗鏟頜魚國家級水產種質資源保護區 寶雞通關河秦嶺細鱗鮭國家級水產種質資源保護區 渭河眉縣段國家級水產種質資源保護區 西流河國家級水產種質資源保護區 甘肅省 黃河劉家峽蘭州鯰國家級水產種質資源保護區 黃河上游特有魚類國家級水產種質資源保護區 白水江重口裂腹魚國家級水產種質資源保護區 洮河扁咽齒魚國家級水產種質資源保護區 大夏河裸裂尻魚國家級水產種質資源保護區 永寧河特有魚類國家級水產種質資源保護區 白龍江特有魚類國家級水產種質資源保護區 洮河特有魚類國家級水產種質資源保護區 黃河黑山峽段國家級水產種質資源保護區 疏勒河特有魚類國家級水產種質資源保護區 洮河定西特有魚類國家級水產種質資源保護區 黃河景泰段特有魚類國家級水產種質資源保護區 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