Y 染色體亞當（Ychromosomal Adam），或稱 YMRCA，在遺傳學上，由人類 Y 染色體 DNA 單倍型類群推測出的所有現存男性在父系上的最近共同祖先，從他遺傳 Y 染色體。Y 染色體亞當相對於粒線體夏娃。與線粒體夏娃一樣，Y 染色體亞當 也不是永久固定的，而會隨父系血統的滅亡或發現而在人類史程序中進退。 隨著對現代人類遺傳學認識的加深，對 Y 染色體亞當生活時間的估計也在變化，例如 2013 年發現了新的 Y 染色體單倍群， primary source 使得 YMRCA 的年代略有調整。 YChromosomal Adam Lived 208300 Years Ago Says New Study SciNewscom 20140123 由定義，YMRCA 與 mtMRCA 不一定生活在同一時代。 截至 2014 年的估計表明這兩個個體很可能大致同時代。新 Y 染色體單倍群的發現將 YMRCA 的估計年齡前推到 20 萬到 30 萬年前，與早期現代人的出現時間大致吻合。 我們將非洲的 Y 染色體最近共祖（MRCA）定於 254（95 CI 192307）kya，在非洲以外的時間區間縮小到 4752 kya，這與非洲外瓶頸之後歐亞大陸和大洋洲的快速初始殖民模式一致。與基於線粒體 DNA 的人口重建不同，我們推斷 Y 染色體世系在最近 1 萬年出現了第二個大瓶頸期，我們假設這是源自影響男性生殖成功率差異的文化變遷。 西班牙 Sidrón 洞的尼安德特人身上的 Y 染色體資料顯示，尼安德特人和智人的 YTMRCA 約在 588 萬年前，是在 YMRCA 之前 275 萬年，稱作前亞當（ante Adam）。 定義 由於 YMRCA 是由目前在世的人群定義的，因此其身份是受時間影響的（取決於 目前 的時間）。YMRCA 至少要有兩個兒子，且血統不中斷地延續至今。任何特定人群的 YMRCA 都可能是擁有更遙遠 YMRCA 的人群的一部分。 Y 染色體亞當雖然是以《創世記》中的亞當來命名，但這個名稱並不是指 Y 染色體亞當是當時唯一的男性，而是指他的 Y 染色體流傳至今、是現代男性的父系最近共同祖先。事實上，其他同期男性的其他基因也流傳至今，只是他們的 Y 染色體沒有留傳到現代，也就是他們純粹的直系男嗣已經中斷，但透過女性後人繁衍下來的其他後代依然存在。 Y 染色體亞當在人類傳說中的亞當並非同一人，所有現今人類的 Y 染色體亞當有可能會與過去或未來人類的 Y 染色體亞當有所不同。如果其中一支較遠的 Y 染色體單倍群在後來失傳，一個較近期的人就會成為新的 Y 染色體亞當。在迅速人口增長的時代，父系分支對比人口瓶頸時較難消失。 根據最近共祖這概念的性質，在窮盡整個人群（所有活人）之前，估計值只能代表 不晚於的時間點（terminus ante quem）。 年代估計 對 YMRCA 年代的估計的關鍵是人群中已知最古老的單倍群。截至 2018 年，這是單倍群 A00（發現於 2013 年），根據 20142015 年公佈的這一資料估算的年代在距今 16 至 30 萬年間，與智人出現與早期擴散的時間相符。 方法 YMRCA 不僅可能在時間上移動，具體的 DNA 序列、在系譜中的位置、起源地估計等等都有可能在未來被修正。 YMRCA 的生活年代是由基於分子演化的分子鐘確定的。線粒體 DNA（mtDNA）很短，只有 16 萬個鹼基對、且突變頻繁；Y 染色體的序列有 6000 萬個鹼基對，且變異率較低。Y 染色體單這些特點減慢了對多型性的鑑定速度，從而降低了對 Y 染色體變異率估算的準確性。 下列事件會改變對 YMRCA 的估計： 對 Y 染色體更大規模的取樣可能發現新的單倍群，這樣 Y 染色體單倍群就會向更久遠的個體匯聚。 已知單倍群中發現更多的深層突變，可能使系譜要重新排列。 對 Y 染色體突變率的修訂（下詳）會改變對生活時間的估計。 人 Y 染色體在減數分裂中不會與 X 染色體重組，而會完整地由父親傳給兒子，不過可能在 Y 染色體末端的假常染區與 X 染色體發生重組。Y 染色體會定期發生突變，會遺傳給男性後代，可視作共同父系關係的標記。共享特定變異的 Y 染色體系譜就是 Y 染色體單倍型類群，一般假定其中所有 Y 染色體有共同的父系祖先，共祖也是第一個攜帶定義該突變的個體（這種假設可能是錯誤的，因為相同的變異可在不相關的個體發生）。以變異為分支點，可構建出 Y 染色體系譜，YMRCA 位於根部。 可將突變的 DNA 片段回恢復到原始狀態，來重建原 Y 染色體 DNA 序列。比較人類與非人靈長類（通常是黑猩猩、大猩猩等）DNA 序列可以確定最可能的原始狀態。一般要找到差異最大的 Y 染色體世系，其共祖也就是所有世系的共祖。 估計歷史 20 世紀 90 年代發表的早期 YMRCA 年齡估計在距今 20 到 30 萬年前。 後來被大幅下調，如 Thomson et al 2000 估計約為 59 萬年。 這個日期是線上粒體夏娃（母系最近共祖，距今 1520 萬年）之後大約 84 萬年。 這也意味著 Y 染色體亞當的年代可能在出非洲（距今 58 萬年前）後一段時間。對父系與母系血統的時間差異，一種比較流行的解釋是，由於一夫多妻制，女性比男性更容易留下後代：男性個體有多個妻子時，便有效阻止了族群中其他男性繁衍後代；而一夫多妻制並不妨礙女性將染色體 DNA 傳給後代。這種繁殖成功率差異，會使更少的雄性血統延續下來，並對突變漂移更敏感，更可能共聚到更近的共祖上。 2010 年代初的研究再次向上修正了明顯低於 10 萬年的 超新 估計，到距今 1216 萬年，這是對單倍群 A 重新測序後的結果。 2013 年，Francalacci et al 報告了 1204 名撒丁島男性的雄性特異性單核苷酸 Y 染色體多型性（MSYSNPs）的測序結果，表明由父系血統，所有人類的共同起源估計為距今 1820 萬年前。 同年，Poznik et al 根據對 9 個人群 69 名男性的全基因組測序，報告 YMRCA 生活在距今 12156 萬年前；同一項研究估計線粒體夏娃的年代約為距今 99148 萬年前。這些範圍有 28 萬年左右的重合，所以這研究的結果被大眾媒體報道為 基因亞當與夏娃在地球上同時行走 的可能性。 2013 年，Mendez et al 宣佈發現了一個此前未知的單倍群 A00，導致 Y 染色體亞當的年代估計再次發生變化，約是距今 338 萬年前（95 置信區間為 237581 kya），後來 Elhaik et al（2014）確定為距今 1639 至 2602 萬年前（95 置信區間），Karmin et al （2015）確定為距今 192 至 307 萬年前（95 置信區間）。同一份報告指出，非洲以外的人群在接近 5 萬年的視窗期匯聚成一群，在 1 萬年前還有另一個瓶頸期，解釋為反映了新石器時代文化變遷增加了男性生殖成功率的差異（即社會階層分化）。 譜系 人類 Y 染色體的初步測序（Karafet et al 2008）表明，兩個最基本的 Y 染色體類群是單倍群 A 和單倍群 BT。前者在某些採獵群體中常見，後者代表了大多數非洲 Y 染色體譜系和幾乎所有非洲外 Y 染色體譜系。Y 染色體亞當是它們的共祖，代表了 Y 染色體亞當本人和他一個兒子的世系，後者有新的 SNP。 Cruciani et al 2011 確定，Y 染色體譜系最深的分支在單倍群 A 的兩亞支之間，而非 A 與 BT 之間。後來又發現的 A00 更在現有樹之外，重排後的 Y 染色體譜系表明單倍群 A 並不是單系群，Fulvio Cruciani Beniamino Trombetta Andrea Massaia Giovanni DestroBiso Daniele Sellitto y Rosaria Scozzari 2011 A Revised Root for the human Ychromosomal Phylogenetic Tree The Origin of Patrilineal Diversity in Africa 而是不具有單倍群 BT 標記突變的集合。 M91、P97 突變將單倍群 BT 與單倍群 A 區別開來。單倍群 A 染色體中，M91 標記由一段 8T 鹼基組成，單倍群 BT 和黑猩猩染色體中，該標記是 9T 鹼基，說明單倍群 BT 保留了較早的序列。單倍群 A1b 和 A1a 的 M91 標記都是 8T，於是也屬於單倍群 A。 不過據 Cruciani et al 2011，M91 標記附近是突變的熱點區域，因此單倍群 A 的 8T 也可能是祖先狀態，單倍群 BT 才發生了突變。這可以解釋為什麼單倍群 A 最深的分支 A1b、A1aT 都是 8T。另外，Cruciani et al 2011 確定，P97 標記同樣在單倍群 A 中保持祖先狀態，單倍群 BT 則發生突變。 可能地理起源 由於目前對 TMRCA 的估計與對早期現代人解剖學年齡的估計趨於一致，且遠早於遷出非洲的時間，因此地理起源仍在非洲內。 據 Cruciani et al 2011，非洲中部、西部、西北部檢測到了最基本的世系，表明 Y 染色體亞當生活在 非洲中部 西北部。在 2204 個非洲 Y 染色體樣本中，有 8 條屬於單倍群 A1a、A1b。2 名摩洛哥柏柏爾人、1 名富爾貝人、1 名尼日圖阿雷格人身上發現了單倍群 A1a；喀麥隆南部的 3 個 Bakola 俾格米人和 1 名阿爾及利亞柏柏爾人身上發現了單倍群 A1b。Cruciani et al 2011 Scozzari et al （2012）同意將單倍群 A1b 的起源置於 非洲大陸西北部。 這證明了 A1b 單倍群源於非洲大陸西北部的假設，並與最近在非洲中西部發現的古代 Y 染色體系譜儀器，為人類 MSY 多樣性的地理起源提供了新證據。 2013 年發現的單倍群 A00 是在今日喀麥隆的中測出的，也符合這一情景。 2011 年以來對 Y 染色體系統發育的修訂影響對 YMRCA 的地理起源與時間深度的估計。根據同樣的推理，未來在現有人群中發現未知的古單倍群也會導致這類修訂。特別是，歐亞人基因組中存在 1 到 4 的尼安德特人基因，意味著若發現具有尼安德特血統的在世男性（可能性不大），便會立即將 TMRCA（距 MRCA 的時間）推到目前值的至少兩倍。不過，Mendez et al 發現的尼安德特人 Y 染色體表明尼安德特父系已滅絕，因為從尼安德特人序列推斷出的血統超出了當代人類遺傳變異的範圍。那樣，地理起源問題將成為尼安德特人進化歷程問題的一部分。 參考文獻 引用 來源 外部連結 Documentary Redraws Humans Family Tree from National Geographic DNA Mysteries The Search for Adam from National Geographic Channel Mitochondrial Eve and Ychromosomal Adam Diagrams YChromosome Biallelic Haplogroups Most European males descended from farmers Why study the Y Chromosome reveals path of ancestral humans Category 系統發生學 Category 遺傳學 Category 人類演化 Category 亞當與夏娃