void simd_find_position(int depth, int index, char *q, int q_len, char *r,
                        int r_len, float *H, int cols, int rows, float score,
                        int *q_pos, int *r_pos) {
  *r_pos = 0;
  *q_pos = 0;
  int i, ii = 0;
  for (int j = 0; j < r_len; j++) {
    i = j * cols * depth;
    for (int k = 0; k < q_len; k++) {
      ii = i + (k * depth) + index;
      if (H[ii] == score) {
        *r_pos = j;
        *q_pos = k;
        return;
      }
    }
  }
}


x86 assembly (clang, -O0):
<simd_find_position>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    0x30(%rbp),%rax
mov    0x28(%rbp),%rax
mov    0x20(%rbp),%eax
mov    0x18(%rbp),%eax
mov    0x10(%rbp),%rax
mov    %edi,-0x4(%rbp)
mov    %esi,-0x8(%rbp)
mov    %rdx,-0x10(%rbp)
mov    %ecx,-0x14(%rbp)
mov    %r8,-0x20(%rbp)
mov    %r9d,-0x24(%rbp)
movss  %xmm0,-0x28(%rbp)
mov    0x30(%rbp),%rax
movl   $0x0,(%rax)
mov    0x28(%rbp),%rax
movl   $0x0,(%rax)
movl   $0x0,-0x30(%rbp)
movl   $0x0,-0x34(%rbp)
mov    -0x34(%rbp),%eax
cmp    -0x24(%rbp),%eax
jge    11eb <simd_find_position+0xeb>
mov    -0x34(%rbp),%eax
imul   0x18(%rbp),%eax
imul   -0x4(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
movl   $0x0,-0x38(%rbp)
mov    -0x38(%rbp),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
jge    11d8 <simd_find_position+0xd8>
mov    -0x2c(%rbp),%eax
mov    -0x38(%rbp),%ecx
imul   -0x4(%rbp),%ecx
add    %ecx,%eax
add    -0x8(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x30(%rbp)
mov    0x10(%rbp),%rax
movslq -0x30(%rbp),%rcx
movss  (%rax,%rcx,4),%xmm0
ucomiss -0x28(%rbp),%xmm0
jne    11c5 <simd_find_position+0xc5>
jp     11c5 <simd_find_position+0xc5>
mov    -0x34(%rbp),%ecx
mov    0x30(%rbp),%rax
mov    %ecx,(%rax)
mov    -0x38(%rbp),%ecx
mov    0x28(%rbp),%rax
mov    %ecx,(%rax)
jmp    11eb <simd_find_position+0xeb>
jmp    11ca <simd_find_position+0xca>
mov    -0x38(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x38(%rbp)
jmp    1173 <simd_find_position+0x73>
jmp    11dd <simd_find_position+0xdd>
mov    -0x34(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x34(%rbp)
jmp    1152 <simd_find_position+0x52>
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<simd_find_position>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %rbx
mov    0x48(%rsp),%r10
mov    0x40(%rsp),%r8
movl   $0x0,(%r10)
movl   $0x0,(%r8)
test   %r9d,%r9d
jle    1183 <simd_find_position+0x83>
mov    0x28(%rsp),%r14
mov    %ecx,%edx
mov    0x30(%rsp),%r11d
imul   %edi,%r11d
xor    %r15d,%r15d
jmp    114c <simd_find_position+0x4c>
nopl   0x0(%rax,%rax,1)
add    $0x1,%r15d
add    %r11d,%esi
cmp    %r9d,%r15d
je     1183 <simd_find_position+0x83>
test   %ecx,%ecx
jle    1140 <simd_find_position+0x40>
mov    %esi,%ebp
xor    %eax,%eax
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
xchg   %ax,%ax
movslq %ebp,%rbx
movss  (%r14,%rbx,4),%xmm1
ucomiss %xmm0,%xmm1
jne    1170 <simd_find_position+0x70>
jnp    117d <simd_find_position+0x7d>
add    $0x1,%rax
add    %edi,%ebp
cmp    %rax,%rdx
jne    1160 <simd_find_position+0x60>
jmp    1140 <simd_find_position+0x40>
mov    %r15d,(%r10)
mov    %eax,(%r8)
pop    %rbx
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define void @simd_find_position(i32 %0, i32 %1, i8* %2, i32 %3, i8* %4, i32 %5, float* %6, i32 %7, i32 %8, float %9, i32* %10, i32* %11) {
%13 = alloca i32
%14 = alloca i32
%15 = alloca i8*
%16 = alloca i32
%17 = alloca i8*
%18 = alloca i32
%19 = alloca float*
%20 = alloca i32
%21 = alloca i32
%22 = alloca float
%23 = alloca i32*
%24 = alloca i32*
%25 = alloca i32
%26 = alloca i32
%27 = alloca i32
%28 = alloca i32
store i32 %0, i32* %13
store i32 %1, i32* %14
store i8* %2, i8** %15
store i32 %3, i32* %16
store i8* %4, i8** %17
store i32 %5, i32* %18
store float* %6, float** %19
store i32 %7, i32* %20
store i32 %8, i32* %21
store float %9, float* %22
store i32* %10, i32** %23
store i32* %11, i32** %24
%29 = load i32*, i32** %24
store i32 0, i32* %29
%30 = load i32*, i32** %23
store i32 0, i32* %30
store i32 0, i32* %26
store i32 0, i32* %27
br label %31
31: ; preds = %70, %12
%32 = load i32, i32* %27
%33 = load i32, i32* %18
%34 = icmp slt i32 %32, %33
br i1 %34, label %35, label %73
35: ; preds = %31
%36 = load i32, i32* %27
%37 = load i32, i32* %20
%38 = mul nsw i32 %36, %37
%39 = load i32, i32* %13
%40 = mul nsw i32 %38, %39
store i32 %40, i32* %25
store i32 0, i32* %28
br label %41
41: ; preds = %66, %35
%42 = load i32, i32* %28
%43 = load i32, i32* %16
%44 = icmp slt i32 %42, %43
br i1 %44, label %45, label %69
45: ; preds = %41
%46 = load i32, i32* %25
%47 = load i32, i32* %28
%48 = load i32, i32* %13
%49 = mul nsw i32 %47, %48
%50 = add nsw i32 %46, %49
%51 = load i32, i32* %14
%52 = add nsw i32 %50, %51
store i32 %52, i32* %26
%53 = load float*, float** %19
%54 = load i32, i32* %26
%55 = sext i32 %54 to i64
%56 = getelementptr inbounds float, float* %53, i64 %55
%57 = load float, float* %56
%58 = load float, float* %22
%59 = fcmp oeq float %57, %58
br i1 %59, label %60, label %65
60: ; preds = %45
%61 = load i32, i32* %27
%62 = load i32*, i32** %24
store i32 %61, i32* %62
%63 = load i32, i32* %28
%64 = load i32*, i32** %23
store i32 %63, i32* %64
br label %73
65: ; preds = %45
br label %66
66: ; preds = %65
%67 = load i32, i32* %28
%68 = add nsw i32 %67, 1
store i32 %68, i32* %28
br label %41
69: ; preds = %41
br label %70
70: ; preds = %69
%71 = load i32, i32* %27
%72 = add nsw i32 %71, 1
store i32 %72, i32* %27
br label %31
73: ; preds = %60, %31
ret void
}

LLVM IR (-O2):
define void @simd_find_position(i32 %0, i32 %1, i8* nocapture readnone %2, i32 %3, i8* nocapture readnone %4, i32 %5, float* nocapture %6, i32 %7, i32 %8, float %9, i32* nocapture writeonly %10, i32* nocapture writeonly %11) {
store i32 0, i32* %11
store i32 0, i32* %10
%13 = icmp sgt i32 %5, 0
br i1 %13, label %14, label %38
14: ; preds = %12
%15 = icmp sgt i32 %3, 0
%16 = zext i32 %3 to i64
br label %17
17: ; preds = %14, %35
%18 = phi i32 [ 0, %14 ], [ %36, %35 ]
%19 = mul nsw i32 %18, %7
br i1 %15, label %20, label %35
20: ; preds = %17, %32
%21 = phi i64 [ %33, %32 ], [ 0, %17 ]
%22 = trunc i64 %21 to i32
%23 = add i32 %19, %22
%24 = mul i32 %23, %0
%25 = add nsw i32 %24, %1
%26 = sext i32 %25 to i64
%27 = getelementptr inbounds float, float* %6, i64 %26
%28 = load float, float* %27
%29 = fcmp oeq float %28, %9
br i1 %29, label %30, label %32
30: ; preds = %20
%31 = trunc i64 %21 to i32
store i32 %18, i32* %11
store i32 %31, i32* %10
br label %38
32: ; preds = %20
%33 = add nuw nsw i64 %21, 1
%34 = icmp eq i64 %33, %16
br i1 %34, label %35, label %20
35: ; preds = %32, %17
%36 = add nuw nsw i32 %18, 1
%37 = icmp eq i32 %36, %5
br i1 %37, label %38, label %17
38: ; preds = %35, %12, %30
ret void
}