#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */
typedef int uint32_t;

/* Variables and functions */
int packkmer(const char *s, uint32_t *kmer, int k) {
  *kmer = 0;
  uint32_t nt;
  while (k--) {
    switch (s[k]) {
    case 'a':
    case 'A':
      nt = 0;
      break;
    case 'c':
    case 'C':
      nt = 1;
      break;
    case 'g':
    case 'G':
      nt = 2;
      break;
    case 't':
    case 'T':
      nt = 3;
      break;
    default:
      return 0;
    }
    *kmer = (*kmer << 2) | nt;
  }
  return 1;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<packkmer>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    %rdi,-0x10(%rbp)
mov    %rsi,-0x18(%rbp)
mov    %edx,-0x1c(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%rax
movl   $0x0,(%rax)
mov    -0x1c(%rbp),%eax
mov    %eax,%ecx
add    $0xffffffff,%ecx
mov    %ecx,-0x1c(%rbp)
cmp    $0x0,%eax
je     11b2 <packkmer+0xb2>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
add    $0xffffffbf,%eax
mov    %eax,%ecx
mov    %rcx,-0x28(%rbp)
sub    $0x33,%eax
ja     118f <packkmer+0x8f>
mov    -0x28(%rbp),%rax
lea    0xeaa(%rip),%rcx
movslq (%rcx,%rax,4),%rax
add    %rcx,%rax
jmp    *%rax
movl   $0x0,-0x20(%rbp)
jmp    119b <packkmer+0x9b>
movl   $0x1,-0x20(%rbp)
jmp    119b <packkmer+0x9b>
movl   $0x2,-0x20(%rbp)
jmp    119b <packkmer+0x9b>
movl   $0x3,-0x20(%rbp)
jmp    119b <packkmer+0x9b>
movl   $0x0,-0x4(%rbp)
jmp    11b9 <packkmer+0xb9>
mov    -0x18(%rbp),%rax
mov    (%rax),%ecx
shl    $0x2,%ecx
or     -0x20(%rbp),%ecx
mov    -0x18(%rbp),%rax
mov    %ecx,(%rax)
jmp    1119 <packkmer+0x19>
movl   $0x1,-0x4(%rbp)
mov    -0x4(%rbp),%eax
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<packkmer>:
movl   $0x0,(%rsi)
test   %edx,%edx
je     1178 <packkmer+0x78>
movslq %edx,%rax
lea    (%rax,%rdi,1),%r8
add    $0xffffffffffffffff,%r8
neg    %edx
xor    %eax,%eax
lea    0xee0(%rip),%r9
xor    %ecx,%ecx
xor    %r10d,%r10d
jmp    1145 <packkmer+0x45>
nopw   0x0(%rax,%rax,1)
mov    $0x3,%r11d
lea    (%r11,%r10,4),%r10d
mov    %r10d,(%rsi)
add    $0xffffffffffffffff,%rcx
cmp    %ecx,%edx
je     1178 <packkmer+0x78>
movsbl (%r8,%rcx,1),%edi
add    $0xffffffbf,%edi
cmp    $0x33,%edi
ja     117d <packkmer+0x7d>
movslq (%r9,%rdi,4),%rdi
add    %r9,%rdi
xor    %r11d,%r11d
jmp    *%rdi
mov    $0x1,%r11d
jmp    1136 <packkmer+0x36>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
mov    $0x2,%r11d
jmp    1136 <packkmer+0x36>
mov    $0x1,%eax
ret

LLVM IR (-O0):
define i32 @packkmer(i8* %0, i32* %1, i32 %2) {
%4 = alloca i32
%5 = alloca i8*
%6 = alloca i32*
%7 = alloca i32
%8 = alloca i32
store i8* %0, i8** %5
store i32* %1, i32** %6
store i32 %2, i32* %7
%9 = load i32*, i32** %6
store i32 0, i32* %9
br label %10
10: ; preds = %26, %3
%11 = load i32, i32* %7
%12 = add nsw i32 %11, -1
store i32 %12, i32* %7
%13 = icmp ne i32 %11, 0
br i1 %13, label %14, label %33
14: ; preds = %10
%15 = load i8*, i8** %5
%16 = load i32, i32* %7
%17 = sext i32 %16 to i64
%18 = getelementptr inbounds i8, i8* %15, i64 %17
%19 = load i8, i8* %18
%20 = sext i8 %19 to i32
switch i32 %20, label %25 [
i32 97, label %21
i32 65, label %21
i32 99, label %22
i32 67, label %22
i32 103, label %23
i32 71, label %23
i32 116, label %24
i32 84, label %24
]
21: ; preds = %14, %14
store i32 0, i32* %8
br label %26
22: ; preds = %14, %14
store i32 1, i32* %8
br label %26
23: ; preds = %14, %14
store i32 2, i32* %8
br label %26
24: ; preds = %14, %14
store i32 3, i32* %8
br label %26
25: ; preds = %14
store i32 0, i32* %4
br label %34
26: ; preds = %24, %23, %22, %21
%27 = load i32*, i32** %6
%28 = load i32, i32* %27
%29 = shl i32 %28, 2
%30 = load i32, i32* %8
%31 = or i32 %29, %30
%32 = load i32*, i32** %6
store i32 %31, i32* %32
br label %10
33: ; preds = %10
store i32 1, i32* %4
br label %34
34: ; preds = %33, %25
%35 = load i32, i32* %4
ret i32 %35
}

LLVM IR (-O2):
define i32 @packkmer(i8* nocapture %0, i32* nocapture %1, i32 %2) {
store i32 0, i32* %1
%4 = icmp eq i32 %2, 0
br i1 %4, label %23, label %5
5: ; preds = %3
%6 = sext i32 %2 to i64
br label %7
7: ; preds = %5, %17
%8 = phi i64 [ %6, %5 ], [ %10, %17 ]
%9 = phi i32 [ 0, %5 ], [ %20, %17 ]
%10 = add nsw i64 %8, -1
%11 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %10
%12 = load i8, i8* %11
%13 = sext i8 %12 to i32
switch i32 %13, label %23 [
i32 97, label %17
i32 65, label %17
i32 99, label %14
i32 67, label %14
i32 103, label %15
i32 71, label %15
i32 116, label %16
i32 84, label %16
]
14: ; preds = %7, %7
br label %17
15: ; preds = %7, %7
br label %17
16: ; preds = %7, %7
br label %17
17: ; preds = %7, %7, %16, %15, %14
%18 = phi i32 [ 3, %16 ], [ 2, %15 ], [ 1, %14 ], [ 0, %7 ], [ 0, %7 ]
%19 = shl i32 %9, 2
%20 = or i32 %18, %19
store i32 %20, i32* %1
%21 = trunc i64 %10 to i32
%22 = icmp eq i32 %21, 0
br i1 %22, label %23, label %7
23: ; preds = %7, %17, %3
%24 = phi i32 [ 1, %3 ], [ 1, %17 ], [ 0, %7 ]
ret i32 %24
}