#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
int /*<<< orphan*/ bring_atoms(long, long, long, char **, long *, long *);
void all_bring_atoms(long num_residue, long *RY, long **seidx, char **AtomName,
                     long *num_ring, long **ring_atom) {
  long i, j, nmatch;
  for (i = 1; i <= num_residue; i++) {
    if (RY[i] < 0) {
      ring_atom[i][10] = -1;
      continue;
    }
    j = (RY[i] == 1) ? 9 : 6;
    bring_atoms(seidx[i][1], seidx[i][2], j, AtomName, &nmatch, ring_atom[i]);
    if (nmatch == j) {
      ring_atom[i][10] = j;
      ++*num_ring;
    }
  }
}


x86 assembly (clang, -O0):
<all_bring_atoms>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x50,%rsp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %rdx,-0x18(%rbp)
mov    %rcx,-0x20(%rbp)
mov    %r8,-0x28(%rbp)
mov    %r9,-0x30(%rbp)
movq   $0x1,-0x38(%rbp)
mov    -0x38(%rbp),%rax
cmp    -0x8(%rbp),%rax
jg     1218 <all_bring_atoms+0x108>
mov    -0x10(%rbp),%rax
mov    -0x38(%rbp),%rcx
cmpq   $0x0,(%rax,%rcx,8)
jge    1172 <all_bring_atoms+0x62>
mov    -0x30(%rbp),%rax
mov    -0x38(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movq   $0xffffffffffffffff,0x50(%rax)
ff
jmp    1207 <all_bring_atoms+0xf7>
mov    -0x10(%rbp),%rax
mov    -0x38(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rdx
mov    $0x6,%eax
mov    $0x9,%ecx
cmp    $0x1,%rdx
cmove  %ecx,%eax
cltq
mov    %rax,-0x40(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%rax
mov    -0x38(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    0x8(%rax),%rdi
mov    -0x18(%rbp),%rax
mov    -0x38(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    0x10(%rax),%rsi
mov    -0x40(%rbp),%rdx
mov    -0x20(%rbp),%rcx
mov    -0x30(%rbp),%rax
mov    -0x38(%rbp),%r8
mov    (%rax,%r8,8),%r9
lea    -0x48(%rbp),%r8
call   1030 <bring_atoms@plt>
mov    -0x48(%rbp),%rax
cmp    -0x40(%rbp),%rax
jne    1202 <all_bring_atoms+0xf2>
mov    -0x40(%rbp),%rcx
mov    -0x30(%rbp),%rax
mov    -0x38(%rbp),%rdx
mov    (%rax,%rdx,8),%rax
mov    %rcx,0x50(%rax)
mov    -0x28(%rbp),%rax
mov    (%rax),%rcx
add    $0x1,%rcx
mov    %rcx,(%rax)
jmp    1207 <all_bring_atoms+0xf7>
mov    -0x38(%rbp),%rax
add    $0x1,%rax
mov    %rax,-0x38(%rbp)
jmp    1138 <all_bring_atoms+0x28>
add    $0x50,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<all_bring_atoms>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
sub    $0x18,%rsp
mov    %r8,(%rsp)
mov    %rcx,0x8(%rsp)
test   %rdi,%rdi
jle    11bf <all_bring_atoms+0xaf>
mov    %r9,%rbx
mov    %rdx,%r12
mov    %rsi,%r13
mov    %rdi,%rbp
xor    %r15d,%r15d
jmp    1166 <all_bring_atoms+0x56>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   0x0(%rax,%rax,1)
mov    0x8(%rbx,%r15,8),%rax
movq   $0xffffffffffffffff,0x50(%rax)
ff
add    $0x1,%r15
cmp    %r15,%rbp
je     11bf <all_bring_atoms+0xaf>
mov    0x8(%r13,%r15,8),%rax
test   %rax,%rax
js     1150 <all_bring_atoms+0x40>
xor    %ecx,%ecx
cmp    $0x1,%rax
sete   %cl
lea    (%rcx,%rcx,2),%r14
add    $0x6,%r14
mov    0x8(%r12,%r15,8),%rax
mov    0x8(%rax),%rdi
mov    0x10(%rax),%rsi
mov    0x8(%rbx,%r15,8),%r9
mov    %r14,%rdx
mov    0x8(%rsp),%rcx
lea    0x10(%rsp),%r8
call   1030 <bring_atoms@plt>
cmp    %r14,0x10(%rsp)
jne    115d <all_bring_atoms+0x4d>
mov    0x8(%rbx,%r15,8),%rax
mov    %r14,0x50(%rax)
mov    (%rsp),%rax
addq   $0x1,(%rax)
jmp    115d <all_bring_atoms+0x4d>
add    $0x18,%rsp
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define void @all_bring_atoms(i64 %0, i64* %1, i64** %2, i8** %3, i64* %4, i64** %5) {
%7 = alloca i64
%8 = alloca i64*
%9 = alloca i64**
%10 = alloca i8**
%11 = alloca i64*
%12 = alloca i64**
%13 = alloca i64
%14 = alloca i64
%15 = alloca i64
store i64 %0, i64* %7
store i64* %1, i64** %8
store i64** %2, i64*** %9
store i8** %3, i8*** %10
store i64* %4, i64** %11
store i64** %5, i64*** %12
store i64 1, i64* %13
br label %16
16: ; preds = %74, %6
%17 = load i64, i64* %13
%18 = load i64, i64* %7
%19 = icmp sle i64 %17, %18
br i1 %19, label %20, label %77
20: ; preds = %16
%21 = load i64*, i64** %8
%22 = load i64, i64* %13
%23 = getelementptr inbounds i64, i64* %21, i64 %22
%24 = load i64, i64* %23
%25 = icmp slt i64 %24, 0
br i1 %25, label %26, label %32
26: ; preds = %20
%27 = load i64**, i64*** %12
%28 = load i64, i64* %13
%29 = getelementptr inbounds i64*, i64** %27, i64 %28
%30 = load i64*, i64** %29
%31 = getelementptr inbounds i64, i64* %30, i64 10
store i64 -1, i64* %31
br label %74
32: ; preds = %20
%33 = load i64*, i64** %8
%34 = load i64, i64* %13
%35 = getelementptr inbounds i64, i64* %33, i64 %34
%36 = load i64, i64* %35
%37 = icmp eq i64 %36, 1
%38 = zext i1 %37 to i64
%39 = select i1 %37, i32 9, i32 6
%40 = sext i32 %39 to i64
store i64 %40, i64* %14
%41 = load i64**, i64*** %9
%42 = load i64, i64* %13
%43 = getelementptr inbounds i64*, i64** %41, i64 %42
%44 = load i64*, i64** %43
%45 = getelementptr inbounds i64, i64* %44, i64 1
%46 = load i64, i64* %45
%47 = load i64**, i64*** %9
%48 = load i64, i64* %13
%49 = getelementptr inbounds i64*, i64** %47, i64 %48
%50 = load i64*, i64** %49
%51 = getelementptr inbounds i64, i64* %50, i64 2
%52 = load i64, i64* %51
%53 = load i64, i64* %14
%54 = load i8**, i8*** %10
%55 = load i64**, i64*** %12
%56 = load i64, i64* %13
%57 = getelementptr inbounds i64*, i64** %55, i64 %56
%58 = load i64*, i64** %57
%59 = call i32 @bring_atoms(i64 %46, i64 %52, i64 %53, i8** %54, i64* %15, i64* %58)
%60 = load i64, i64* %15
%61 = load i64, i64* %14
%62 = icmp eq i64 %60, %61
br i1 %62, label %63, label %73
63: ; preds = %32
%64 = load i64, i64* %14
%65 = load i64**, i64*** %12
%66 = load i64, i64* %13
%67 = getelementptr inbounds i64*, i64** %65, i64 %66
%68 = load i64*, i64** %67
%69 = getelementptr inbounds i64, i64* %68, i64 10
store i64 %64, i64* %69
%70 = load i64*, i64** %11
%71 = load i64, i64* %70
%72 = add nsw i64 %71, 1
store i64 %72, i64* %70
br label %73
73: ; preds = %63, %32
br label %74
74: ; preds = %73, %26
%75 = load i64, i64* %13
%76 = add nsw i64 %75, 1
store i64 %76, i64* %13
br label %16
77: ; preds = %16
ret void
}

LLVM IR (-O2):
define void @all_bring_atoms(i64 %0, i64* nocapture %1, i64** nocapture %2, i8** %3, i64* nocapture %4, i64** nocapture %5) {
%7 = alloca i64
%8 = bitcast i64* %7 to i8*
%9 = icmp slt i64 %0, 1
br i1 %9, label %41, label %10
10: ; preds = %6, %38
%11 = phi i64 [ %39, %38 ], [ 1, %6 ]
%12 = getelementptr inbounds i64, i64* %1, i64 %11
%13 = load i64, i64* %12
%14 = icmp slt i64 %13, 0
br i1 %14, label %15, label %19
15: ; preds = %10
%16 = getelementptr inbounds i64*, i64** %5, i64 %11
%17 = load i64*, i64** %16
%18 = getelementptr inbounds i64, i64* %17, i64 10
store i64 -1, i64* %18
br label %38
19: ; preds = %10
%20 = icmp eq i64 %13, 1
%21 = select i1 %20, i64 9, i64 6
%22 = getelementptr inbounds i64*, i64** %2, i64 %11
%23 = load i64*, i64** %22
%24 = getelementptr inbounds i64, i64* %23, i64 1
%25 = load i64, i64* %24
%26 = getelementptr inbounds i64, i64* %23, i64 2
%27 = load i64, i64* %26
%28 = getelementptr inbounds i64*, i64** %5, i64 %11
%29 = load i64*, i64** %28
%30 = call i32 @bring_atoms(i64 %25, i64 %27, i64 %21, i8** %3, i64* %7, i64* %29)
%31 = load i64, i64* %7
%32 = icmp eq i64 %31, %21
br i1 %32, label %33, label %38
33: ; preds = %19
%34 = load i64*, i64** %28
%35 = getelementptr inbounds i64, i64* %34, i64 10
store i64 %21, i64* %35
%36 = load i64, i64* %4
%37 = add nsw i64 %36, 1
store i64 %37, i64* %4
br label %38
38: ; preds = %19, %33, %15
%39 = add nuw i64 %11, 1
%40 = icmp eq i64 %11, %0
br i1 %40, label %41, label %10
41: ; preds = %38, %6
ret void
}