#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
int strlen(char *);
size_t trinucleotide_pep(char, char, char);
void get_protein(char *dna, char *protein, int strand) {
  int i;
  char codon_code[65] = {'K', 'N', 'K', 'N', 'T', 'T', 'T', 'T', 'R', 'S', 'R',
                         'S', 'I', 'I', 'M', 'I', 'Q', 'H', 'Q', 'H', 'P', 'P',
                         'P', 'P', 'R', 'R', 'R', 'R', 'L', 'L', 'L', 'L', 'E',
                         'D', 'E', 'D', 'A', 'A', 'A', 'A', 'G', 'G', 'G', 'G',
                         'V', 'V', 'V', 'V', '*', 'Y', '*', 'Y', 'S', 'S', 'S',
                         'S', '*', 'C', 'W', 'C', 'L', 'F', 'L', 'F', 'X'};
  char anti_codon_code[65] = {
      'F', 'V', 'L', 'I', 'C', 'G', 'R', 'S', 'S', 'A', 'P', 'T', 'Y',
      'D', 'H', 'N', 'L', 'V', 'L', 'M', 'W', 'G', 'R', 'R', 'S', 'A',
      'P', 'T', '*', 'E', 'Q', 'K', 'F', 'V', 'L', 'I', 'C', 'G', 'R',
      'S', 'S', 'A', 'P', 'T', 'Y', 'D', 'H', 'N', 'L', 'V', 'L', 'I',
      '*', 'G', 'R', 'R', 'S', 'A', 'P', 'T', '*', 'E', 'Q', 'K', 'X'};
  int dna_len = strlen(dna);
  int protein_len = dna_len / 3;
  if (strand == 1) {
    for (i = 0; i < dna_len; i += 3) {
      protein[i / 3] =
          codon_code[trinucleotide_pep(dna[i], dna[i + 1], dna[i + 2])];
    }
  } else {
    if (dna_len % 3 == 2) {
      dna_len -= 2;
    } else if (dna_len % 3 == 1) {
      dna_len -= 1;
    }
    for (i = 0; i < dna_len; i += 3) {
      protein[(dna_len - i) / 3 - 1] =
          anti_codon_code[trinucleotide_pep(dna[i], dna[i + 1], dna[i + 2])];
      protein_len--;
    }
  }
}


x86 assembly (clang, -O0):
<get_protein>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0xe0,%rsp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %edx,-0x14(%rbp)
lea    -0x60(%rbp),%rdi
lea    0xeaf(%rip),%rsi
mov    $0x41,%edx
call   1050 <memcpy@plt>
lea    -0xb0(%rbp),%rdi
lea    0xee7(%rip),%rsi
mov    $0x41,%edx
call   1050 <memcpy@plt>
mov    -0x8(%rbp),%rdi
call   1040 <strlen@plt>
mov    %eax,-0xb4(%rbp)
mov    -0xb4(%rbp),%eax
mov    $0x3,%ecx
cltd
idiv   %ecx
mov    %eax,-0xb8(%rbp)
cmpl   $0x1,-0x14(%rbp)
jne    1237 <get_protein+0x107>
movl   $0x0,-0x18(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%eax
cmp    -0xb4(%rbp),%eax
jge    1232 <get_protein+0x102>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x18(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,1),%sil
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
add    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
mov    (%rax,%rcx,1),%dl
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
add    $0x2,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl %sil,%edi
movsbl %dl,%esi
movsbl (%rax,%rcx,1),%edx
call   1030 <trinucleotide_pep@plt>
mov    -0x60(%rbp,%rax,1),%al
mov    %al,-0xc1(%rbp)
mov    -0x10(%rbp),%rax
mov    %rax,-0xc0(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%eax
mov    $0x3,%ecx
cltd
idiv   %ecx
mov    -0xc1(%rbp),%dl
mov    %eax,%ecx
mov    -0xc0(%rbp),%rax
movslq %ecx,%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
mov    -0x18(%rbp),%eax
add    $0x3,%eax
mov    %eax,-0x18(%rbp)
jmp    11a7 <get_protein+0x77>
jmp    133f <get_protein+0x20f>
mov    -0xb4(%rbp),%eax
mov    $0x3,%ecx
cltd
idiv   %ecx
cmp    $0x2,%edx
jne    1262 <get_protein+0x132>
mov    -0xb4(%rbp),%eax
sub    $0x2,%eax
mov    %eax,-0xb4(%rbp)
jmp    128d <get_protein+0x15d>
mov    -0xb4(%rbp),%eax
mov    $0x3,%ecx
cltd
idiv   %ecx
cmp    $0x1,%edx
jne    1288 <get_protein+0x158>
mov    -0xb4(%rbp),%eax
sub    $0x1,%eax
mov    %eax,-0xb4(%rbp)
jmp    128d <get_protein+0x15d>
movl   $0x0,-0x18(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%eax
cmp    -0xb4(%rbp),%eax
jge    133a <get_protein+0x20a>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x18(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,1),%sil
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
add    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
mov    (%rax,%rcx,1),%dl
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
add    $0x2,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl %sil,%edi
movsbl %dl,%esi
movsbl (%rax,%rcx,1),%edx
call   1030 <trinucleotide_pep@plt>
mov    -0xb0(%rbp,%rax,1),%al
mov    %al,-0xd1(%rbp)
mov    -0x10(%rbp),%rax
mov    %rax,-0xd0(%rbp)
mov    -0xb4(%rbp),%eax
sub    -0x18(%rbp),%eax
mov    $0x3,%ecx
cltd
idiv   %ecx
mov    -0xd1(%rbp),%dl
mov    %eax,%ecx
mov    -0xd0(%rbp),%rax
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
mov    -0xb8(%rbp),%eax
add    $0xffffffff,%eax
mov    %eax,-0xb8(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%eax
add    $0x3,%eax
mov    %eax,-0x18(%rbp)
jmp    1294 <get_protein+0x164>
jmp    133f <get_protein+0x20f>
add    $0xe0,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<get_protein>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
push   %rax
mov    %edx,%r15d
mov    %rsi,%r13
mov    %rdi,%r14
call   1040 <strlen@plt>
mov    %eax,%r12d
cmp    $0x1,%r15d
jne    1190 <get_protein+0x70>
test   %r12d,%r12d
jle    1226 <get_protein+0x106>
xor    %ebx,%ebx
lea    0xeac(%rip),%rbp
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
xchg   %ax,%ax
movsbl (%r14,%rbx,1),%edi
movsbl 0x1(%r14,%rbx,1),%esi
movsbl 0x2(%r14,%rbx,1),%edx
call   1030 <trinucleotide_pep@plt>
movzbl (%rax,%rbp,1),%eax
mov    %al,0x0(%r13)
add    $0x3,%rbx
add    $0x1,%r13
cmp    %ebx,%r12d
jg     1160 <get_protein+0x40>
jmp    1226 <get_protein+0x106>
movslq %r12d,%rax
imul   $0x55555556,%rax,%rax
mov    %rax,%rcx
shr    $0x3f,%rcx
shr    $0x20,%rax
add    %ecx,%eax
lea    (%rax,%rax,2),%ecx
mov    %r12d,%eax
sub    %ecx,%eax
cmp    $0x1,%eax
je     11c4 <get_protein+0xa4>
cmp    $0x2,%eax
jne    11bd <get_protein+0x9d>
add    $0xfffffffe,%r12d
test   %r12d,%r12d
jg     11cd <get_protein+0xad>
jmp    1226 <get_protein+0x106>
add    $0xffffffff,%r12d
test   %r12d,%r12d
jle    1226 <get_protein+0x106>
xor    %ebp,%ebp
lea    0xe7a(%rip),%r15
mov    %r12d,%ebx
nopl   0x0(%rax)
movsbl (%r14,%rbp,1),%edi
movsbl 0x1(%r14,%rbp,1),%esi
movsbl 0x2(%r14,%rbp,1),%edx
call   1030 <trinucleotide_pep@plt>
movzbl (%rax,%r15,1),%eax
movslq %ebx,%rbx
imul   $0x55555556,%rbx,%rcx
mov    %rcx,%rdx
shr    $0x3f,%rdx
shr    $0x20,%rcx
add    %edx,%ecx
movslq %ecx,%rcx
mov    %al,-0x1(%rcx,%r13,1)
add    $0x3,%rbp
add    $0xfffffffd,%ebx
cmp    %ebp,%r12d
jg     11e0 <get_protein+0xc0>
add    $0x8,%rsp
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
@__const.get_protein.codon_code = [65 x i8] c"KNKNTTTTRSRSIIMIQHQHPPPPRRRRLLLLEDEDAAAAGGGGVVVV*Y*YSSSS*CWCLFLFX"
@__const.get_protein.anti_codon_code = [65 x i8] c"FVLICGRSSAPTYDHNLVLMWGRRSAPT*EQKFVLICGRSSAPTYDHNLVLI*GRRSAPT*EQKX"
define void @get_protein(i8* %0, i8* %1, i32 %2) {
%4 = alloca i8*
%5 = alloca i8*
%6 = alloca i32
%7 = alloca i32
%8 = alloca [65 x i8]
%9 = alloca [65 x i8]
%10 = alloca i32
%11 = alloca i32
store i8* %0, i8** %4
store i8* %1, i8** %5
store i32 %2, i32* %6
%12 = bitcast [65 x i8]* %8 to i8*
%13 = bitcast [65 x i8]* %9 to i8*
%14 = load i8*, i8** %4
%15 = call i32 @strlen(i8* %14)
store i32 %15, i32* %10
%16 = load i32, i32* %10
%17 = sdiv i32 %16, 3
store i32 %17, i32* %11
%18 = load i32, i32* %6
%19 = icmp eq i32 %18, 1
br i1 %19, label %20, label %55
20: ; preds = %3
store i32 0, i32* %7
br label %21
21: ; preds = %51, %20
%22 = load i32, i32* %7
%23 = load i32, i32* %10
%24 = icmp slt i32 %22, %23
br i1 %24, label %25, label %54
25: ; preds = %21
%26 = load i8*, i8** %4
%27 = load i32, i32* %7
%28 = sext i32 %27 to i64
%29 = getelementptr inbounds i8, i8* %26, i64 %28
%30 = load i8, i8* %29
%31 = load i8*, i8** %4
%32 = load i32, i32* %7
%33 = add nsw i32 %32, 1
%34 = sext i32 %33 to i64
%35 = getelementptr inbounds i8, i8* %31, i64 %34
%36 = load i8, i8* %35
%37 = load i8*, i8** %4
%38 = load i32, i32* %7
%39 = add nsw i32 %38, 2
%40 = sext i32 %39 to i64
%41 = getelementptr inbounds i8, i8* %37, i64 %40
%42 = load i8, i8* %41
%43 = call i64 @trinucleotide_pep(i8 signext %30, i8 signext %36, i8 signext %42)
%44 = getelementptr inbounds [65 x i8], [65 x i8]* %8, i64 0, i64 %43
%45 = load i8, i8* %44
%46 = load i8*, i8** %5
%47 = load i32, i32* %7
%48 = sdiv i32 %47, 3
%49 = sext i32 %48 to i64
%50 = getelementptr inbounds i8, i8* %46, i64 %49
store i8 %45, i8* %50
br label %51
51: ; preds = %25
%52 = load i32, i32* %7
%53 = add nsw i32 %52, 3
store i32 %53, i32* %7
br label %21
54: ; preds = %21
br label %110
55: ; preds = %3
%56 = load i32, i32* %10
%57 = srem i32 %56, 3
%58 = icmp eq i32 %57, 2
br i1 %58, label %59, label %62
59: ; preds = %55
%60 = load i32, i32* %10
%61 = sub nsw i32 %60, 2
store i32 %61, i32* %10
br label %70
62: ; preds = %55
%63 = load i32, i32* %10
%64 = srem i32 %63, 3
%65 = icmp eq i32 %64, 1
br i1 %65, label %66, label %69
66: ; preds = %62
%67 = load i32, i32* %10
%68 = sub nsw i32 %67, 1
store i32 %68, i32* %10
br label %69
69: ; preds = %66, %62
br label %70
70: ; preds = %69, %59
store i32 0, i32* %7
br label %71
71: ; preds = %106, %70
%72 = load i32, i32* %7
%73 = load i32, i32* %10
%74 = icmp slt i32 %72, %73
br i1 %74, label %75, label %109
75: ; preds = %71
%76 = load i8*, i8** %4
%77 = load i32, i32* %7
%78 = sext i32 %77 to i64
%79 = getelementptr inbounds i8, i8* %76, i64 %78
%80 = load i8, i8* %79
%81 = load i8*, i8** %4
%82 = load i32, i32* %7
%83 = add nsw i32 %82, 1
%84 = sext i32 %83 to i64
%85 = getelementptr inbounds i8, i8* %81, i64 %84
%86 = load i8, i8* %85
%87 = load i8*, i8** %4
%88 = load i32, i32* %7
%89 = add nsw i32 %88, 2
%90 = sext i32 %89 to i64
%91 = getelementptr inbounds i8, i8* %87, i64 %90
%92 = load i8, i8* %91
%93 = call i64 @trinucleotide_pep(i8 signext %80, i8 signext %86, i8 signext %92)
%94 = getelementptr inbounds [65 x i8], [65 x i8]* %9, i64 0, i64 %93
%95 = load i8, i8* %94
%96 = load i8*, i8** %5
%97 = load i32, i32* %10
%98 = load i32, i32* %7
%99 = sub nsw i32 %97, %98
%100 = sdiv i32 %99, 3
%101 = sub nsw i32 %100, 1
%102 = sext i32 %101 to i64
%103 = getelementptr inbounds i8, i8* %96, i64 %102
store i8 %95, i8* %103
%104 = load i32, i32* %11
%105 = add nsw i32 %104, -1
store i32 %105, i32* %11
br label %106
106: ; preds = %75
%107 = load i32, i32* %7
%108 = add nsw i32 %107, 3
store i32 %108, i32* %7
br label %71
109: ; preds = %71
br label %110
110: ; preds = %109, %54
ret void
}

LLVM IR (-O2):
@__const.get_protein.codon_code = [65 x i8] c"KNKNTTTTRSRSIIMIQHQHPPPPRRRRLLLLEDEDAAAAGGGGVVVV*Y*YSSSS*CWCLFLFX"
@__const.get_protein.anti_codon_code = [65 x i8] c"FVLICGRSSAPTYDHNLVLMWGRRSAPT*EQKFVLICGRSSAPTYDHNLVLI*GRRSAPT*EQKX"
define void @get_protein(i8* %0, i8* nocapture writeonly %1, i32 %2) {
%4 = tail call i32 @strlen(i8* %0)
%5 = icmp eq i32 %2, 1
br i1 %5, label %6, label %26
6: ; preds = %3
%7 = icmp sgt i32 %4, 0
br i1 %7, label %8, label %57
8: ; preds = %6, %8
%9 = phi i64 [ %23, %8 ], [ 0, %6 ]
%10 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %9
%11 = load i8, i8* %10
%12 = add nuw nsw i64 %9, 1
%13 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %12
%14 = load i8, i8* %13
%15 = add nuw nsw i64 %9, 2
%16 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %15
%17 = load i8, i8* %16
%18 = tail call i64 @trinucleotide_pep(i8 signext %11, i8 signext %14, i8 signext %17)
%19 = getelementptr inbounds [65 x i8], [65 x i8]* @__const.get_protein.codon_code, i64 0, i64 %18
%20 = load i8, i8* %19
%21 = udiv i64 %9, 3
%22 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %21
store i8 %20, i8* %22
%23 = add nuw i64 %9, 3
%24 = trunc i64 %23 to i32
%25 = icmp sgt i32 %4, %24
br i1 %25, label %8, label %57
26: ; preds = %3
%27 = srem i32 %4, 3
switch i32 %27, label %32 [
i32 2, label %28
i32 1, label %30
]
28: ; preds = %26
%29 = add nsw i32 %4, -2
br label %32
30: ; preds = %26
%31 = add nsw i32 %4, -1
br label %32
32: ; preds = %26, %30, %28
%33 = phi i32 [ %29, %28 ], [ %31, %30 ], [ %4, %26 ]
%34 = icmp sgt i32 %33, 0
br i1 %34, label %35, label %57
35: ; preds = %32, %35
%36 = phi i64 [ %54, %35 ], [ 0, %32 ]
%37 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %36
%38 = load i8, i8* %37
%39 = add nuw nsw i64 %36, 1
%40 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %39
%41 = load i8, i8* %40
%42 = add nuw nsw i64 %36, 2
%43 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %42
%44 = load i8, i8* %43
%45 = tail call i64 @trinucleotide_pep(i8 signext %38, i8 signext %41, i8 signext %44)
%46 = getelementptr inbounds [65 x i8], [65 x i8]* @__const.get_protein.anti_codon_code, i64 0, i64 %45
%47 = load i8, i8* %46
%48 = trunc i64 %36 to i32
%49 = sub nsw i32 %33, %48
%50 = sdiv i32 %49, 3
%51 = add nsw i32 %50, -1
%52 = sext i32 %51 to i64
%53 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %52
store i8 %47, i8* %53
%54 = add nuw i64 %36, 3
%55 = trunc i64 %54 to i32
%56 = icmp sgt i32 %33, %55
br i1 %56, label %35, label %57
57: ; preds = %35, %8, %32, %6
ret void
}