char get_gap_qual(int *window) {
  int score_sum = 0;
  int weight_sum = 0;
  int weight = 1;
  int i;
  for (i = 0; i < 4 * 2; i++) {
    if (window[i] != -1) {
      score_sum += window[i] * weight;
      weight_sum += weight;
    }
    if (i < 4 - 1) {
      weight++;
    } else if (i > 4 - 1) {
      weight--;
    }
  }
  if (weight_sum > 0) {
    return (char)(score_sum / weight_sum);
  } else {
    return '\0';
  }
}


x86 assembly (clang, -O0):
<get_gap_qual>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    %rdi,-0x10(%rbp)
movl   $0x0,-0x14(%rbp)
movl   $0x0,-0x18(%rbp)
movl   $0x1,-0x1c(%rbp)
movl   $0x0,-0x20(%rbp)
cmpl   $0x8,-0x20(%rbp)
jge    11a1 <get_gap_qual+0xa1>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
cmpl   $0xffffffff,(%rax,%rcx,4)
je     115e <get_gap_qual+0x5e>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
imul   -0x1c(%rbp),%eax
add    -0x14(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x14(%rbp)
mov    -0x1c(%rbp),%eax
add    -0x18(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x18(%rbp)
cmpl   $0x3,-0x20(%rbp)
jge    1176 <get_gap_qual+0x76>
mov    -0x1c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
jmp    118e <get_gap_qual+0x8e>
cmpl   $0x3,-0x20(%rbp)
jle    1189 <get_gap_qual+0x89>
mov    -0x1c(%rbp),%eax
add    $0xffffffff,%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
jmp    118e <get_gap_qual+0x8e>
jmp    1193 <get_gap_qual+0x93>
mov    -0x20(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x20(%rbp)
jmp    1124 <get_gap_qual+0x24>
cmpl   $0x0,-0x18(%rbp)
jle    11ba <get_gap_qual+0xba>
mov    -0x14(%rbp),%eax
cltd
idivl  -0x18(%rbp)
mov    %al,-0x1(%rbp)
jmp    11be <get_gap_qual+0xbe>
movb   $0x0,-0x1(%rbp)
movsbl -0x1(%rbp),%eax
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<get_gap_qual>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r12
push   %rbx
mov    (%rdi),%eax
mov    0x4(%rdi),%r8d
xor    %ecx,%ecx
cmp    $0xffffffff,%eax
setne  %cl
xor    %edx,%edx
cmp    $0xffffffff,%r8d
setne  %dl
lea    (%rcx,%rdx,2),%ecx
mov    0x8(%rdi),%r9d
xor    %edx,%edx
cmp    $0xffffffff,%r9d
setne  %dl
lea    (%rdx,%rdx,2),%edx
add    %ecx,%edx
mov    0xc(%rdi),%r10d
xor    %ecx,%ecx
cmp    $0xffffffff,%r10d
setne  %cl
lea    (%rdx,%rcx,4),%ecx
mov    0x10(%rdi),%r14d
xor    %edx,%edx
cmp    $0xffffffff,%r14d
setne  %dl
lea    (%rcx,%rdx,4),%ecx
mov    0x14(%rdi),%r15d
xor    %edx,%edx
cmp    $0xffffffff,%r15d
setne  %dl
lea    (%rdx,%rdx,2),%esi
add    %ecx,%esi
mov    0x18(%rdi),%edx
xor    %ecx,%ecx
cmp    $0xffffffff,%edx
setne  %cl
lea    (%rsi,%rcx,2),%ebx
mov    0x1c(%rdi),%esi
xor    %edi,%edi
cmp    $0xffffffff,%esi
setne  %dil
xor    %ecx,%ecx
add    %ebx,%edi
jle    11f4 <get_gap_qual+0xf4>
cmp    $0xffffffff,%esi
cmove  %ecx,%esi
lea    (%rdx,%rdx,1),%r11d
cmp    $0xffffffff,%edx
cmove  %ecx,%r11d
cmp    $0xffffffff,%r15d
lea    (%r15,%r15,2),%r15d
cmove  %ecx,%r15d
lea    0x0(,%r14,4),%r12d
cmp    $0xffffffff,%r14d
cmove  %ecx,%r12d
lea    0x0(,%r10,4),%ebp
cmp    $0xffffffff,%r10d
cmove  %ecx,%ebp
cmp    $0xffffffff,%r9d
lea    (%r9,%r9,2),%ebx
cmove  %ecx,%ebx
lea    (%r8,%r8,1),%edx
cmp    $0xffffffff,%r8d
cmove  %ecx,%edx
cmp    $0xffffffff,%eax
cmove  %ecx,%eax
add    %edx,%eax
add    %ebx,%eax
add    %ebp,%eax
add    %r12d,%eax
add    %r15d,%eax
add    %r11d,%eax
add    %esi,%eax
cltd
idiv   %edi
mov    %eax,%ecx
mov    %ecx,%eax
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define signext i8 @get_gap_qual(i32* %0) {
%2 = alloca i8
%3 = alloca i32*
%4 = alloca i32
%5 = alloca i32
%6 = alloca i32
%7 = alloca i32
store i32* %0, i32** %3
store i32 0, i32* %4
store i32 0, i32* %5
store i32 1, i32* %6
store i32 0, i32* %7
br label %8
8: ; preds = %45, %1
%9 = load i32, i32* %7
%10 = icmp slt i32 %9, 8
br i1 %10, label %11, label %48
11: ; preds = %8
%12 = load i32*, i32** %3
%13 = load i32, i32* %7
%14 = sext i32 %13 to i64
%15 = getelementptr inbounds i32, i32* %12, i64 %14
%16 = load i32, i32* %15
%17 = icmp ne i32 %16, -1
br i1 %17, label %18, label %31
18: ; preds = %11
%19 = load i32*, i32** %3
%20 = load i32, i32* %7
%21 = sext i32 %20 to i64
%22 = getelementptr inbounds i32, i32* %19, i64 %21
%23 = load i32, i32* %22
%24 = load i32, i32* %6
%25 = mul nsw i32 %23, %24
%26 = load i32, i32* %4
%27 = add nsw i32 %26, %25
store i32 %27, i32* %4
%28 = load i32, i32* %6
%29 = load i32, i32* %5
%30 = add nsw i32 %29, %28
store i32 %30, i32* %5
br label %31
31: ; preds = %18, %11
%32 = load i32, i32* %7
%33 = icmp slt i32 %32, 3
br i1 %33, label %34, label %37
34: ; preds = %31
%35 = load i32, i32* %6
%36 = add nsw i32 %35, 1
store i32 %36, i32* %6
br label %44
37: ; preds = %31
%38 = load i32, i32* %7
%39 = icmp sgt i32 %38, 3
br i1 %39, label %40, label %43
40: ; preds = %37
%41 = load i32, i32* %6
%42 = add nsw i32 %41, -1
store i32 %42, i32* %6
br label %43
43: ; preds = %40, %37
br label %44
44: ; preds = %43, %34
br label %45
45: ; preds = %44
%46 = load i32, i32* %7
%47 = add nsw i32 %46, 1
store i32 %47, i32* %7
br label %8
48: ; preds = %8
%49 = load i32, i32* %5
%50 = icmp sgt i32 %49, 0
br i1 %50, label %51, label %56
51: ; preds = %48
%52 = load i32, i32* %4
%53 = load i32, i32* %5
%54 = sdiv i32 %52, %53
%55 = trunc i32 %54 to i8
store i8 %55, i8* %2
br label %57
56: ; preds = %48
store i8 0, i8* %2
br label %57
57: ; preds = %56, %51
%58 = load i8, i8* %2
ret i8 %58
}

LLVM IR (-O2):
define signext i8 @get_gap_qual(i32* nocapture %0) {
%2 = load i32, i32* %0
%3 = icmp eq i32 %2, -1
%4 = xor i1 %3, true
%5 = zext i1 %4 to i32
%6 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 1
%7 = load i32, i32* %6
%8 = icmp eq i32 %7, -1
%9 = select i1 %8, i32 0, i32 2
%10 = or i32 %9, %5
%11 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 2
%12 = load i32, i32* %11
%13 = icmp eq i32 %12, -1
%14 = select i1 %13, i32 0, i32 3
%15 = add nuw nsw i32 %14, %10
%16 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 3
%17 = load i32, i32* %16
%18 = icmp eq i32 %17, -1
%19 = select i1 %18, i32 0, i32 4
%20 = add nuw nsw i32 %19, %15
%21 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 4
%22 = load i32, i32* %21
%23 = icmp eq i32 %22, -1
%24 = select i1 %23, i32 0, i32 4
%25 = add nuw nsw i32 %24, %20
%26 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 5
%27 = load i32, i32* %26
%28 = icmp eq i32 %27, -1
%29 = select i1 %28, i32 0, i32 3
%30 = add nuw nsw i32 %29, %25
%31 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 6
%32 = load i32, i32* %31
%33 = icmp eq i32 %32, -1
%34 = select i1 %33, i32 0, i32 2
%35 = add nuw nsw i32 %34, %30
%36 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 7
%37 = load i32, i32* %36
%38 = icmp eq i32 %37, -1
%39 = xor i1 %38, true
%40 = zext i1 %39 to i32
%41 = add nsw i32 %35, %40
%42 = icmp sgt i32 %41, 0
br i1 %42, label %43, label %67
43: ; preds = %1
%44 = select i1 %38, i32 0, i32 %37
%45 = shl nsw i32 %32, 1
%46 = select i1 %33, i32 0, i32 %45
%47 = mul nsw i32 %27, 3
%48 = select i1 %28, i32 0, i32 %47
%49 = shl nsw i32 %22, 2
%50 = select i1 %23, i32 0, i32 %49
%51 = shl nsw i32 %17, 2
%52 = select i1 %18, i32 0, i32 %51
%53 = mul nsw i32 %12, 3
%54 = select i1 %13, i32 0, i32 %53
%55 = shl nsw i32 %7, 1
%56 = select i1 %8, i32 0, i32 %55
%57 = select i1 %3, i32 0, i32 %2
%58 = add nsw i32 %56, %57
%59 = add nsw i32 %54, %58
%60 = add nsw i32 %52, %59
%61 = add nsw i32 %50, %60
%62 = add nsw i32 %48, %61
%63 = add nsw i32 %46, %62
%64 = add nsw i32 %44, %63
%65 = sdiv i32 %64, %41
%66 = trunc i32 %65 to i8
br label %67
67: ; preds = %1, %43
%68 = phi i8 [ %66, %43 ], [ 0, %1 ]
ret i8 %68
}