#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
int Seqtype(char *);
int GuessAlignmentSeqtype(char **aseq, int nseq) {
  int idx;
  int nrna = 0;
  int ndna = 0;
  int namino = 0;
  int nother = 0;
  for (idx = 0; idx < nseq; idx++)
    switch (Seqtype(aseq[idx])) {
    case 2:
      nrna++;
      break;
    case 1:
      ndna++;
      break;
    case 3:
      namino++;
      break;
    default:
      nother++;
    }
  if (nother)
    return 0;
  if (namino == nseq)
    return 3;
  if (ndna == nseq)
    return 1;
  if (nrna == nseq)
    return 2;
  if (namino == 0)
    return 2;
  return 3;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<GuessAlignmentSeqtype>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x30,%rsp
mov    %rdi,-0x10(%rbp)
mov    %esi,-0x14(%rbp)
movl   $0x0,-0x1c(%rbp)
movl   $0x0,-0x20(%rbp)
movl   $0x0,-0x24(%rbp)
movl   $0x0,-0x28(%rbp)
movl   $0x0,-0x18(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
jge    11da <GuessAlignmentSeqtype+0xca>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x18(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rdi
call   1030 <Seqtype@plt>
mov    %eax,%ecx
mov    %ecx,-0x2c(%rbp)
sub    $0x1,%eax
je     11a2 <GuessAlignmentSeqtype+0x92>
jmp    1172 <GuessAlignmentSeqtype+0x62>
mov    -0x2c(%rbp),%eax
sub    $0x2,%eax
je     1194 <GuessAlignmentSeqtype+0x84>
jmp    1183 <GuessAlignmentSeqtype+0x73>
mov    -0x2c(%rbp),%eax
sub    $0x3,%eax
je     11b0 <GuessAlignmentSeqtype+0xa0>
jmp    11be <GuessAlignmentSeqtype+0xae>
mov    -0x1c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
jmp    11c7 <GuessAlignmentSeqtype+0xb7>
mov    -0x20(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x20(%rbp)
jmp    11c7 <GuessAlignmentSeqtype+0xb7>
mov    -0x24(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x24(%rbp)
jmp    11c7 <GuessAlignmentSeqtype+0xb7>
mov    -0x28(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x28(%rbp)
jmp    11cc <GuessAlignmentSeqtype+0xbc>
mov    -0x18(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x18(%rbp)
jmp    1142 <GuessAlignmentSeqtype+0x32>
cmpl   $0x0,-0x28(%rbp)
je     11f0 <GuessAlignmentSeqtype+0xe0>
movl   $0x0,-0x4(%rbp)
jmp    1255 <GuessAlignmentSeqtype+0x145>
mov    -0x24(%rbp),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
jne    1208 <GuessAlignmentSeqtype+0xf8>
movl   $0x3,-0x4(%rbp)
jmp    1255 <GuessAlignmentSeqtype+0x145>
mov    -0x20(%rbp),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
jne    1220 <GuessAlignmentSeqtype+0x110>
movl   $0x1,-0x4(%rbp)
jmp    1255 <GuessAlignmentSeqtype+0x145>
mov    -0x1c(%rbp),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
jne    1238 <GuessAlignmentSeqtype+0x128>
movl   $0x2,-0x4(%rbp)
jmp    1255 <GuessAlignmentSeqtype+0x145>
cmpl   $0x0,-0x24(%rbp)
jne    124e <GuessAlignmentSeqtype+0x13e>
movl   $0x2,-0x4(%rbp)
jmp    1255 <GuessAlignmentSeqtype+0x145>
movl   $0x3,-0x4(%rbp)
mov    -0x4(%rbp),%eax
add    $0x30,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<GuessAlignmentSeqtype>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
push   %rax
test   %esi,%esi
jle    1193 <GuessAlignmentSeqtype+0x83>
mov    %rdi,%rbx
mov    %esi,0x4(%rsp)
mov    %esi,%ebp
xor    %r14d,%r14d
xor    %r15d,%r15d
xor    %r12d,%r12d
xor    %r13d,%r13d
movl   $0x0,(%rsp)
jmp    114d <GuessAlignmentSeqtype+0x3d>
nopl   (%rax)
add    $0x1,%r15d
add    $0x1,%r14
cmp    %r14,%rbp
je     1186 <GuessAlignmentSeqtype+0x76>
mov    (%rbx,%r14,8),%rdi
call   1030 <Seqtype@plt>
cmp    $0x1,%eax
je     1170 <GuessAlignmentSeqtype+0x60>
cmp    $0x3,%eax
je     1180 <GuessAlignmentSeqtype+0x70>
cmp    $0x2,%eax
jne    1140 <GuessAlignmentSeqtype+0x30>
addl   $0x1,(%rsp)
jmp    1144 <GuessAlignmentSeqtype+0x34>
nopl   0x0(%rax,%rax,1)
add    $0x1,%r13d
jmp    1144 <GuessAlignmentSeqtype+0x34>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
add    $0x1,%r12d
jmp    1144 <GuessAlignmentSeqtype+0x34>
xor    %eax,%eax
test   %r15d,%r15d
mov    0x4(%rsp),%esi
jne    11ca <GuessAlignmentSeqtype+0xba>
jmp    11a0 <GuessAlignmentSeqtype+0x90>
xor    %r12d,%r12d
xor    %r13d,%r13d
movl   $0x0,(%rsp)
mov    $0x3,%eax
cmp    %esi,%r12d
je     11ca <GuessAlignmentSeqtype+0xba>
mov    $0x1,%eax
cmp    %esi,%r13d
je     11ca <GuessAlignmentSeqtype+0xba>
mov    $0x2,%eax
cmp    %esi,(%rsp)
je     11ca <GuessAlignmentSeqtype+0xba>
cmp    $0x1,%r12d
mov    $0x3,%eax
sbb    $0x0,%eax
add    $0x8,%rsp
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define i32 @GuessAlignmentSeqtype(i8** %0, i32 %1) {
%3 = alloca i32
%4 = alloca i8**
%5 = alloca i32
%6 = alloca i32
%7 = alloca i32
%8 = alloca i32
%9 = alloca i32
%10 = alloca i32
store i8** %0, i8*** %4
store i32 %1, i32* %5
store i32 0, i32* %7
store i32 0, i32* %8
store i32 0, i32* %9
store i32 0, i32* %10
store i32 0, i32* %6
br label %11
11: ; preds = %35, %2
%12 = load i32, i32* %6
%13 = load i32, i32* %5
%14 = icmp slt i32 %12, %13
br i1 %14, label %15, label %38
15: ; preds = %11
%16 = load i8**, i8*** %4
%17 = load i32, i32* %6
%18 = sext i32 %17 to i64
%19 = getelementptr inbounds i8*, i8** %16, i64 %18
%20 = load i8*, i8** %19
%21 = call i32 @Seqtype(i8* %20)
switch i32 %21, label %31 [
i32 2, label %22
i32 1, label %25
i32 3, label %28
]
22: ; preds = %15
%23 = load i32, i32* %7
%24 = add nsw i32 %23, 1
store i32 %24, i32* %7
br label %34
25: ; preds = %15
%26 = load i32, i32* %8
%27 = add nsw i32 %26, 1
store i32 %27, i32* %8
br label %34
28: ; preds = %15
%29 = load i32, i32* %9
%30 = add nsw i32 %29, 1
store i32 %30, i32* %9
br label %34
31: ; preds = %15
%32 = load i32, i32* %10
%33 = add nsw i32 %32, 1
store i32 %33, i32* %10
br label %34
34: ; preds = %31, %28, %25, %22
br label %35
35: ; preds = %34
%36 = load i32, i32* %6
%37 = add nsw i32 %36, 1
store i32 %37, i32* %6
br label %11
38: ; preds = %11
%39 = load i32, i32* %10
%40 = icmp ne i32 %39, 0
br i1 %40, label %41, label %42
41: ; preds = %38
store i32 0, i32* %3
br label %62
42: ; preds = %38
%43 = load i32, i32* %9
%44 = load i32, i32* %5
%45 = icmp eq i32 %43, %44
br i1 %45, label %46, label %47
46: ; preds = %42
store i32 3, i32* %3
br label %62
47: ; preds = %42
%48 = load i32, i32* %8
%49 = load i32, i32* %5
%50 = icmp eq i32 %48, %49
br i1 %50, label %51, label %52
51: ; preds = %47
store i32 1, i32* %3
br label %62
52: ; preds = %47
%53 = load i32, i32* %7
%54 = load i32, i32* %5
%55 = icmp eq i32 %53, %54
br i1 %55, label %56, label %57
56: ; preds = %52
store i32 2, i32* %3
br label %62
57: ; preds = %52
%58 = load i32, i32* %9
%59 = icmp eq i32 %58, 0
br i1 %59, label %60, label %61
60: ; preds = %57
store i32 2, i32* %3
br label %62
61: ; preds = %57
store i32 3, i32* %3
br label %62
62: ; preds = %61, %60, %56, %51, %46, %41
%63 = load i32, i32* %3
ret i32 %63
}

LLVM IR (-O2):
define i32 @GuessAlignmentSeqtype(i8** nocapture %0, i32 %1) {
%3 = icmp sgt i32 %1, 0
br i1 %3, label %4, label %32
4: ; preds = %2
%5 = zext i32 %1 to i64
br label %6
6: ; preds = %4, %23
%7 = phi i64 [ 0, %4 ], [ %28, %23 ]
%8 = phi i32 [ 0, %4 ], [ %27, %23 ]
%9 = phi i32 [ 0, %4 ], [ %26, %23 ]
%10 = phi i32 [ 0, %4 ], [ %25, %23 ]
%11 = phi i32 [ 0, %4 ], [ %24, %23 ]
%12 = getelementptr inbounds i8*, i8** %0, i64 %7
%13 = load i8*, i8** %12
%14 = tail call i32 @Seqtype(i8* %13)
switch i32 %14, label %21 [
i32 2, label %15
i32 1, label %17
i32 3, label %19
]
15: ; preds = %6
%16 = add nsw i32 %11, 1
br label %23
17: ; preds = %6
%18 = add nsw i32 %10, 1
br label %23
19: ; preds = %6
%20 = add nsw i32 %9, 1
br label %23
21: ; preds = %6
%22 = add nsw i32 %8, 1
br label %23
23: ; preds = %15, %17, %19, %21
%24 = phi i32 [ %11, %21 ], [ %11, %19 ], [ %11, %17 ], [ %16, %15 ]
%25 = phi i32 [ %10, %21 ], [ %10, %19 ], [ %18, %17 ], [ %10, %15 ]
%26 = phi i32 [ %9, %21 ], [ %20, %19 ], [ %9, %17 ], [ %9, %15 ]
%27 = phi i32 [ %22, %21 ], [ %8, %19 ], [ %8, %17 ], [ %8, %15 ]
%28 = add nuw nsw i64 %7, 1
%29 = icmp eq i64 %28, %5
br i1 %29, label %30, label %6
30: ; preds = %23
%31 = icmp eq i32 %27, 0
br i1 %31, label %32, label %44
32: ; preds = %2, %30
%33 = phi i32 [ %26, %30 ], [ 0, %2 ]
%34 = phi i32 [ %25, %30 ], [ 0, %2 ]
%35 = phi i32 [ %24, %30 ], [ 0, %2 ]
%36 = icmp eq i32 %33, %1
br i1 %36, label %44, label %37
37: ; preds = %32
%38 = icmp eq i32 %34, %1
br i1 %38, label %44, label %39
39: ; preds = %37
%40 = icmp eq i32 %35, %1
br i1 %40, label %44, label %41
41: ; preds = %39
%42 = icmp eq i32 %33, 0
%43 = select i1 %42, i32 2, i32 3
br label %44
44: ; preds = %41, %39, %37, %32, %30
%45 = phi i32 [ 0, %30 ], [ 3, %32 ], [ 1, %37 ], [ 2, %39 ], [ %43, %41 ]
ret i32 %45
}