#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
int /*<<< orphan*/ free_ivector(int *, int /*<<< orphan*/, int);
int *ivector(int /*<<< orphan*/, int);
int /*<<< orphan*/ resample_shuffle(int *, int, int, long *);
void permut_indiv_between_2pop(int n, int *popi, int p1, int p2, int *popimix,
                               long *seed) {
  int i, Ni;
  int *ind;
  ind = ivector(0, n);
  Ni = 0;
  for (i = 1; i <= n; i++) {
    popimix[i] = popi[i];
    if (popi[i] == p1 || popi[i] == p2) {
      Ni++;
      ind[Ni] = i;
    }
  }
  resample_shuffle(ind, 1, Ni, seed);
  Ni = 0;
  for (i = 1; i <= n; i++) {
    if (popi[i] == p1 || popi[i] == p2) {
      Ni++;
      popimix[i] = popi[ind[Ni]];
    }
  }
  free_ivector(ind, 0, n);
}


x86 assembly (clang, -O0):
<permut_indiv_between_2pop>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x40,%rsp
mov    %edi,-0x4(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %edx,-0x14(%rbp)
mov    %ecx,-0x18(%rbp)
mov    %r8,-0x20(%rbp)
mov    %r9,-0x28(%rbp)
mov    -0x4(%rbp),%esi
xor    %edi,%edi
call   1040 <ivector@plt>
mov    %rax,-0x38(%rbp)
movl   $0x0,-0x30(%rbp)
movl   $0x1,-0x2c(%rbp)
mov    -0x2c(%rbp),%eax
cmp    -0x4(%rbp),%eax
jg     11dd <permut_indiv_between_2pop+0xad>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x2c(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%edx
mov    -0x20(%rbp),%rax
movslq -0x2c(%rbp),%rcx
mov    %edx,(%rax,%rcx,4)
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x2c(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
je     11b3 <permut_indiv_between_2pop+0x83>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x2c(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
cmp    -0x18(%rbp),%eax
jne    11ca <permut_indiv_between_2pop+0x9a>
mov    -0x30(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x30(%rbp)
mov    -0x2c(%rbp),%edx
mov    -0x38(%rbp),%rax
movslq -0x30(%rbp),%rcx
mov    %edx,(%rax,%rcx,4)
jmp    11cf <permut_indiv_between_2pop+0x9f>
mov    -0x2c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
jmp    1169 <permut_indiv_between_2pop+0x39>
mov    -0x38(%rbp),%rdi
mov    -0x30(%rbp),%edx
mov    -0x28(%rbp),%rcx
mov    $0x1,%esi
call   1050 <resample_shuffle@plt>
movl   $0x0,-0x30(%rbp)
movl   $0x1,-0x2c(%rbp)
mov    -0x2c(%rbp),%eax
cmp    -0x4(%rbp),%eax
jg     126e <permut_indiv_between_2pop+0x13e>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x2c(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
je     1234 <permut_indiv_between_2pop+0x104>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x2c(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
cmp    -0x18(%rbp),%eax
jne    125b <permut_indiv_between_2pop+0x12b>
mov    -0x30(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x30(%rbp)
mov    -0x10(%rbp),%rax
mov    -0x38(%rbp),%rcx
movslq -0x30(%rbp),%rdx
movslq (%rcx,%rdx,4),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%edx
mov    -0x20(%rbp),%rax
movslq -0x2c(%rbp),%rcx
mov    %edx,(%rax,%rcx,4)
jmp    1260 <permut_indiv_between_2pop+0x130>
mov    -0x2c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
jmp    1200 <permut_indiv_between_2pop+0xd0>
mov    -0x38(%rbp),%rdi
mov    -0x4(%rbp),%edx
xor    %esi,%esi
call   1030 <free_ivector@plt>
add    $0x40,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<permut_indiv_between_2pop>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
sub    $0x18,%rsp
mov    %r9,0x8(%rsp)
mov    %r8,%r12
mov    %ecx,%r13d
mov    %edx,%ebp
mov    %rsi,%rbx
mov    %edi,%r15d
xor    %r14d,%r14d
xor    %edi,%edi
mov    %r15d,%esi
call   1040 <ivector@plt>
mov    %rax,%rdi
test   %r15d,%r15d
jle    11fb <permut_indiv_between_2pop+0xcb>
mov    %r15,0x10(%rsp)
add    $0x1,%r15d
mov    $0x1,%eax
mov    0x8(%rsp),%rcx
jmp    1194 <permut_indiv_between_2pop+0x64>
nop
movslq %r14d,%rdx
add    $0x1,%r14d
mov    %eax,0x4(%rdi,%rdx,4)
add    $0x1,%rax
cmp    %rax,%r15
je     11a9 <permut_indiv_between_2pop+0x79>
mov    (%rbx,%rax,4),%edx
mov    %edx,(%r12,%rax,4)
mov    (%rbx,%rax,4),%edx
cmp    %ebp,%edx
je     1180 <permut_indiv_between_2pop+0x50>
cmp    %r13d,%edx
jne    118b <permut_indiv_between_2pop+0x5b>
jmp    1180 <permut_indiv_between_2pop+0x50>
mov    $0x1,%esi
mov    %r14d,%edx
mov    %rdi,%r14
call   1050 <resample_shuffle@plt>
mov    %r14,%rdi
mov    0x10(%rsp),%rdx
test   %edx,%edx
jle    1215 <permut_indiv_between_2pop+0xe5>
mov    %r15d,%eax
add    $0xffffffffffffffff,%r15
cmp    $0x2,%eax
jne    122a <permut_indiv_between_2pop+0xfa>
xor    %ecx,%ecx
mov    $0x1,%eax
test   $0x1,%r15b
je     1215 <permut_indiv_between_2pop+0xe5>
mov    (%rbx,%rax,4),%esi
cmp    %ebp,%esi
je     11ea <permut_indiv_between_2pop+0xba>
cmp    %r13d,%esi
jne    1215 <permut_indiv_between_2pop+0xe5>
movslq %ecx,%rcx
movslq 0x4(%rdi,%rcx,4),%rcx
mov    (%rbx,%rcx,4),%ecx
mov    %ecx,(%r12,%rax,4)
jmp    1215 <permut_indiv_between_2pop+0xe5>
mov    $0x1,%esi
xor    %edx,%edx
mov    0x8(%rsp),%rcx
mov    %rdi,%rbx
call   1050 <resample_shuffle@plt>
mov    %rbx,%rdi
mov    %r15,%rdx
xor    %esi,%esi
add    $0x18,%rsp
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
jmp    1030 <free_ivector@plt>
mov    %r15,%r8
and    $0xfffffffffffffffe,%r8
neg    %r8
xor    %ecx,%ecx
mov    $0x1,%eax
jmp    1269 <permut_indiv_between_2pop+0x139>
nopl   (%rax)
movslq %ecx,%rsi
add    $0x1,%ecx
movslq 0x4(%rdi,%rsi,4),%rsi
mov    (%rbx,%rsi,4),%esi
mov    %esi,0x4(%r12,%rax,4)
lea    (%r8,%rax,1),%rsi
add    $0x2,%rsi
add    $0x2,%rax
cmp    $0x1,%rsi
je     11d8 <permut_indiv_between_2pop+0xa8>
mov    (%rbx,%rax,4),%esi
cmp    %ebp,%esi
je     1275 <permut_indiv_between_2pop+0x145>
cmp    %r13d,%esi
jne    1287 <permut_indiv_between_2pop+0x157>
movslq %ecx,%rsi
add    $0x1,%ecx
movslq 0x4(%rdi,%rsi,4),%rsi
mov    (%rbx,%rsi,4),%esi
mov    %esi,(%r12,%rax,4)
mov    0x4(%rbx,%rax,4),%esi
cmp    %ebp,%esi
je     1240 <permut_indiv_between_2pop+0x110>
cmp    %r13d,%esi
jne    1253 <permut_indiv_between_2pop+0x123>
jmp    1240 <permut_indiv_between_2pop+0x110>

LLVM IR (-O0):
define void @permut_indiv_between_2pop(i32 %0, i32* %1, i32 %2, i32 %3, i32* %4, i64* %5) {
%7 = alloca i32
%8 = alloca i32*
%9 = alloca i32
%10 = alloca i32
%11 = alloca i32*
%12 = alloca i64*
%13 = alloca i32
%14 = alloca i32
%15 = alloca i32*
store i32 %0, i32* %7
store i32* %1, i32** %8
store i32 %2, i32* %9
store i32 %3, i32* %10
store i32* %4, i32** %11
store i64* %5, i64** %12
%16 = load i32, i32* %7
%17 = call i32* @ivector(i32 0, i32 %16)
store i32* %17, i32** %15
store i32 0, i32* %14
store i32 1, i32* %13
br label %18
18: ; preds = %56, %6
%19 = load i32, i32* %13
%20 = load i32, i32* %7
%21 = icmp sle i32 %19, %20
br i1 %21, label %22, label %59
22: ; preds = %18
%23 = load i32*, i32** %8
%24 = load i32, i32* %13
%25 = sext i32 %24 to i64
%26 = getelementptr inbounds i32, i32* %23, i64 %25
%27 = load i32, i32* %26
%28 = load i32*, i32** %11
%29 = load i32, i32* %13
%30 = sext i32 %29 to i64
%31 = getelementptr inbounds i32, i32* %28, i64 %30
store i32 %27, i32* %31
%32 = load i32*, i32** %8
%33 = load i32, i32* %13
%34 = sext i32 %33 to i64
%35 = getelementptr inbounds i32, i32* %32, i64 %34
%36 = load i32, i32* %35
%37 = load i32, i32* %9
%38 = icmp eq i32 %36, %37
br i1 %38, label %47, label %39
39: ; preds = %22
%40 = load i32*, i32** %8
%41 = load i32, i32* %13
%42 = sext i32 %41 to i64
%43 = getelementptr inbounds i32, i32* %40, i64 %42
%44 = load i32, i32* %43
%45 = load i32, i32* %10
%46 = icmp eq i32 %44, %45
br i1 %46, label %47, label %55
47: ; preds = %39, %22
%48 = load i32, i32* %14
%49 = add nsw i32 %48, 1
store i32 %49, i32* %14
%50 = load i32, i32* %13
%51 = load i32*, i32** %15
%52 = load i32, i32* %14
%53 = sext i32 %52 to i64
%54 = getelementptr inbounds i32, i32* %51, i64 %53
store i32 %50, i32* %54
br label %55
55: ; preds = %47, %39
br label %56
56: ; preds = %55
%57 = load i32, i32* %13
%58 = add nsw i32 %57, 1
store i32 %58, i32* %13
br label %18
59: ; preds = %18
%60 = load i32*, i32** %15
%61 = load i32, i32* %14
%62 = load i64*, i64** %12
%63 = call i32 @resample_shuffle(i32* %60, i32 1, i32 %61, i64* %62)
store i32 0, i32* %14
store i32 1, i32* %13
br label %64
64: ; preds = %101, %59
%65 = load i32, i32* %13
%66 = load i32, i32* %7
%67 = icmp sle i32 %65, %66
br i1 %67, label %68, label %104
68: ; preds = %64
%69 = load i32*, i32** %8
%70 = load i32, i32* %13
%71 = sext i32 %70 to i64
%72 = getelementptr inbounds i32, i32* %69, i64 %71
%73 = load i32, i32* %72
%74 = load i32, i32* %9
%75 = icmp eq i32 %73, %74
br i1 %75, label %84, label %76
76: ; preds = %68
%77 = load i32*, i32** %8
%78 = load i32, i32* %13
%79 = sext i32 %78 to i64
%80 = getelementptr inbounds i32, i32* %77, i64 %79
%81 = load i32, i32* %80
%82 = load i32, i32* %10
%83 = icmp eq i32 %81, %82
br i1 %83, label %84, label %100
84: ; preds = %76, %68
%85 = load i32, i32* %14
%86 = add nsw i32 %85, 1
store i32 %86, i32* %14
%87 = load i32*, i32** %8
%88 = load i32*, i32** %15
%89 = load i32, i32* %14
%90 = sext i32 %89 to i64
%91 = getelementptr inbounds i32, i32* %88, i64 %90
%92 = load i32, i32* %91
%93 = sext i32 %92 to i64
%94 = getelementptr inbounds i32, i32* %87, i64 %93
%95 = load i32, i32* %94
%96 = load i32*, i32** %11
%97 = load i32, i32* %13
%98 = sext i32 %97 to i64
%99 = getelementptr inbounds i32, i32* %96, i64 %98
store i32 %95, i32* %99
br label %100
100: ; preds = %84, %76
br label %101
101: ; preds = %100
%102 = load i32, i32* %13
%103 = add nsw i32 %102, 1
store i32 %103, i32* %13
br label %64
104: ; preds = %64
%105 = load i32*, i32** %15
%106 = load i32, i32* %7
%107 = call i32 @free_ivector(i32* %105, i32 0, i32 %106)
ret void
}

LLVM IR (-O2):
define void @permut_indiv_between_2pop(i32 %0, i32* nocapture %1, i32 %2, i32 %3, i32* nocapture writeonly %4, i64* %5) {
%7 = tail call i32* @ivector(i32 0, i32 %0)
%8 = icmp slt i32 %0, 1
br i1 %8, label %9, label %11
9: ; preds = %6
%10 = tail call i32 @resample_shuffle(i32* %7, i32 1, i32 0, i64* %5)
br label %100
11: ; preds = %6
%12 = add nuw i32 %0, 1
%13 = zext i32 %12 to i64
br label %14
14: ; preds = %11, %29
%15 = phi i64 [ 1, %11 ], [ %31, %29 ]
%16 = phi i32 [ 0, %11 ], [ %30, %29 ]
%17 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %15
%18 = load i32, i32* %17
%19 = getelementptr inbounds i32, i32* %4, i64 %15
store i32 %18, i32* %19
%20 = load i32, i32* %17
%21 = icmp eq i32 %20, %2
%22 = icmp eq i32 %20, %3
%23 = or i1 %21, %22
br i1 %23, label %24, label %29
24: ; preds = %14
%25 = add nsw i32 %16, 1
%26 = sext i32 %25 to i64
%27 = getelementptr inbounds i32, i32* %7, i64 %26
%28 = trunc i64 %15 to i32
store i32 %28, i32* %27
br label %29
29: ; preds = %14, %24
%30 = phi i32 [ %25, %24 ], [ %16, %14 ]
%31 = add nuw nsw i64 %15, 1
%32 = icmp eq i64 %31, %13
br i1 %32, label %33, label %14
33: ; preds = %29
%34 = tail call i32 @resample_shuffle(i32* %7, i32 1, i32 %30, i64* %5)
br i1 %8, label %100, label %35
35: ; preds = %33
%36 = add nsw i64 %13, -1
%37 = and i64 %36, 1
%38 = icmp eq i32 %12, 2
br i1 %38, label %81, label %39
39: ; preds = %35
%40 = and i64 %36, -2
br label %41
41: ; preds = %76, %39
%42 = phi i64 [ 1, %39 ], [ %78, %76 ]
%43 = phi i32 [ 0, %39 ], [ %77, %76 ]
%44 = phi i64 [ 0, %39 ], [ %79, %76 ]
%45 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %42
%46 = load i32, i32* %45
%47 = icmp eq i32 %46, %2
%48 = icmp eq i32 %46, %3
%49 = or i1 %47, %48
br i1 %49, label %50, label %59
50: ; preds = %41
%51 = add nsw i32 %43, 1
%52 = sext i32 %51 to i64
%53 = getelementptr inbounds i32, i32* %7, i64 %52
%54 = load i32, i32* %53
%55 = sext i32 %54 to i64
%56 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %55
%57 = load i32, i32* %56
%58 = getelementptr inbounds i32, i32* %4, i64 %42
store i32 %57, i32* %58
br label %59
59: ; preds = %41, %50
%60 = phi i32 [ %51, %50 ], [ %43, %41 ]
%61 = add nuw nsw i64 %42, 1
%62 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %61
%63 = load i32, i32* %62
%64 = icmp eq i32 %63, %2
%65 = icmp eq i32 %63, %3
%66 = or i1 %64, %65
br i1 %66, label %67, label %76
67: ; preds = %59
%68 = add nsw i32 %60, 1
%69 = sext i32 %68 to i64
%70 = getelementptr inbounds i32, i32* %7, i64 %69
%71 = load i32, i32* %70
%72 = sext i32 %71 to i64
%73 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %72
%74 = load i32, i32* %73
%75 = getelementptr inbounds i32, i32* %4, i64 %61
store i32 %74, i32* %75
br label %76
76: ; preds = %67, %59
%77 = phi i32 [ %68, %67 ], [ %60, %59 ]
%78 = add nuw nsw i64 %42, 2
%79 = add i64 %44, 2
%80 = icmp eq i64 %79, %40
br i1 %80, label %81, label %41
81: ; preds = %76, %35
%82 = phi i64 [ 1, %35 ], [ %78, %76 ]
%83 = phi i32 [ 0, %35 ], [ %77, %76 ]
%84 = icmp eq i64 %37, 0
br i1 %84, label %100, label %85
85: ; preds = %81
%86 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %82
%87 = load i32, i32* %86
%88 = icmp eq i32 %87, %2
%89 = icmp eq i32 %87, %3
%90 = or i1 %88, %89
br i1 %90, label %91, label %100
91: ; preds = %85
%92 = add nsw i32 %83, 1
%93 = sext i32 %92 to i64
%94 = getelementptr inbounds i32, i32* %7, i64 %93
%95 = load i32, i32* %94
%96 = sext i32 %95 to i64
%97 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %96
%98 = load i32, i32* %97
%99 = getelementptr inbounds i32, i32* %4, i64 %82
store i32 %98, i32* %99
br label %100
100: ; preds = %81, %91, %85, %9, %33
%101 = tail call i32 @free_ivector(i32* %7, i32 0, i32 %0)
ret void
}