#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */
typedef int /*<<< orphan*/ FILE;

/* Variables and functions */
scalar_t__ fclose(int /*<<< orphan*/ *);
int /*<<< orphan*/ fgets(char *, int, int /*<<< orphan*/ *);
int /*<<< orphan*/ *fopen(char *, char *);
int /*<<< orphan*/ printf(char *, ...);
size_t strcspn(char *, char *);
int strlen(char *);
int main(void) {
  FILE *fp = fopen("rosalind_hamm.txt", "r");
  if (fp == NULL) {
    printf("File open failed!");
    return 1;
  }
  char s[1001];
  char t[1001];
  fgets(s, 1001, fp);
  fgets(t, 1001, fp);
  s[strcspn(s, "\n")] = '\0';
  t[strcspn(t, "\n")] = '\0';
  int mismatch = 0;
  for (int i = 0, j = strlen(s); i < j; i++) {
    if (s[i] != t[i]) {
      mismatch += 1;
    }
  }
  printf("%d", mismatch);
  if (fclose(fp) != 0) {
    printf("File close failed!");
    return 1;
  }
  return 0;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<main>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x800,%rsp
movl   $0x0,-0x4(%rbp)
lea    0xe87(%rip),%rdi
lea    0xe92(%rip),%rsi
call   1080 <fopen@plt>
mov    %rax,-0x10(%rbp)
cmpq   $0x0,-0x10(%rbp)
jne    11ae <main+0x4e>
lea    0xe79(%rip),%rdi
mov    $0x0,%al
call   1050 <printf@plt>
movl   $0x1,-0x4(%rbp)
jmp    12dc <main+0x17c>
lea    -0x400(%rbp),%rdi
mov    -0x10(%rbp),%rdx
mov    $0x3e9,%esi
call   1070 <fgets@plt>
lea    -0x7f0(%rbp),%rdi
mov    -0x10(%rbp),%rdx
mov    $0x3e9,%esi
call   1070 <fgets@plt>
lea    -0x400(%rbp),%rdi
lea    0xe40(%rip),%rsi
call   1060 <strcspn@plt>
movb   $0x0,-0x400(%rbp,%rax,1)
lea    -0x7f0(%rbp),%rdi
lea    0xe25(%rip),%rsi
call   1060 <strcspn@plt>
movb   $0x0,-0x7f0(%rbp,%rax,1)
movl   $0x0,-0x7f4(%rbp)
movl   $0x0,-0x7f8(%rbp)
lea    -0x400(%rbp),%rdi
call   1040 <strlen@plt>
mov    %eax,-0x7fc(%rbp)
mov    -0x7f8(%rbp),%eax
cmp    -0x7fc(%rbp),%eax
jge    1294 <main+0x134>
movslq -0x7f8(%rbp),%rax
movsbl -0x400(%rbp,%rax,1),%eax
ff
movslq -0x7f8(%rbp),%rcx
movsbl -0x7f0(%rbp,%rcx,1),%ecx
ff
cmp    %ecx,%eax
je     127b <main+0x11b>
mov    -0x7f4(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x7f4(%rbp)
jmp    1280 <main+0x120>
mov    -0x7f8(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x7f8(%rbp)
jmp    1234 <main+0xd4>
mov    -0x7f4(%rbp),%esi
lea    0xd87(%rip),%rdi
mov    $0x0,%al
call   1050 <printf@plt>
mov    -0x10(%rbp),%rdi
call   1030 <fclose@plt>
cmp    $0x0,%rax
je     12d5 <main+0x175>
lea    0xd69(%rip),%rdi
mov    $0x0,%al
call   1050 <printf@plt>
movl   $0x1,-0x4(%rbp)
jmp    12dc <main+0x17c>
movl   $0x0,-0x4(%rbp)
mov    -0x4(%rbp),%eax
add    $0x800,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<main>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %rbx
sub    $0x7e8,%rsp
lea    0xe9c(%rip),%rdi
lea    0xea7(%rip),%rsi
call   1080 <fopen@plt>
test   %rax,%rax
je     1203 <main+0xa3>
mov    %rax,%r14
lea    0x3f0(%rsp),%r15
mov    %r15,%rdi
mov    $0x3e9,%esi
mov    %rax,%rdx
call   1070 <fgets@plt>
mov    %rsp,%rbx
mov    %rbx,%rdi
mov    $0x3e9,%esi
mov    %r14,%rdx
call   1070 <fgets@plt>
lea    0xe7c(%rip),%rbp
mov    %r15,%rdi
mov    %rbp,%rsi
call   1060 <strcspn@plt>
movb   $0x0,0x3f0(%rsp,%rax,1)
mov    %rbx,%rdi
mov    %rbp,%rsi
call   1060 <strcspn@plt>
movb   $0x0,(%rsp,%rax,1)
mov    %r15,%rdi
call   1040 <strlen@plt>
xor    %ebp,%ebp
mov    $0x0,%esi
test   %eax,%eax
jle    139c <main+0x23c>
mov    %eax,%ecx
cmp    $0x8,%eax
jae    120f <main+0xaf>
xor    %eax,%eax
xor    %esi,%esi
jmp    1380 <main+0x220>
lea    0xe1a(%rip),%rdi
jmp    13be <main+0x25e>
mov    %ecx,%eax
and    $0xfffffff8,%eax
lea    -0x8(%rax),%rsi
mov    %rsi,%rdx
shr    $0x3,%rdx
add    $0x1,%rdx
test   %rsi,%rsi
je     13da <main+0x27a>
mov    %rdx,%rdi
and    $0xfffffffffffffffe,%rdi
pxor   %xmm0,%xmm0
xor    %esi,%esi
pcmpeqd %xmm2,%xmm2
movdqa 0xdbb(%rip),%xmm3
pxor   %xmm1,%xmm1
nopl   0x0(%rax)
movdqa 0x3f0(%rsp,%rsi,1),%xmm5
movd   0x3f4(%rsp,%rsi,1),%xmm6
movd   0x4(%rsp,%rsi,1),%xmm4
pcmpeqb %xmm6,%xmm4
pcmpeqb (%rsp,%rsi,1),%xmm5
pxor   %xmm2,%xmm5
punpcklbw %xmm5,%xmm5
punpcklwd %xmm5,%xmm5
pand   %xmm3,%xmm5
paddd  %xmm0,%xmm5
pxor   %xmm2,%xmm4
punpcklbw %xmm4,%xmm4
punpcklwd %xmm4,%xmm4
pand   %xmm3,%xmm4
paddd  %xmm1,%xmm4
movq   0x3f8(%rsp,%rsi,1),%xmm1
movd   0x3fc(%rsp,%rsi,1),%xmm6
movq   0x8(%rsp,%rsi,1),%xmm0
pcmpeqb %xmm1,%xmm0
movd   0xc(%rsp,%rsi,1),%xmm1
pcmpeqb %xmm6,%xmm1
pxor   %xmm2,%xmm0
punpcklbw %xmm0,%xmm0
punpcklwd %xmm0,%xmm0
pand   %xmm3,%xmm0
paddd  %xmm5,%xmm0
pxor   %xmm2,%xmm1
punpcklbw %xmm1,%xmm1
punpcklwd %xmm1,%xmm1
pand   %xmm3,%xmm1
paddd  %xmm4,%xmm1
add    $0x10,%rsi
add    $0xfffffffffffffffe,%rdi
jne    1250 <main+0xf0>
test   $0x1,%dl
je     1353 <main+0x1f3>
movq   0x3f0(%rsp,%rsi,1),%xmm2
movd   0x3f4(%rsp,%rsi,1),%xmm3
movq   (%rsp,%rsi,1),%xmm4
pcmpeqb %xmm2,%xmm4
movd   0x4(%rsp,%rsi,1),%xmm2
pcmpeqb %xmm3,%xmm2
pcmpeqd %xmm3,%xmm3
pxor   %xmm3,%xmm4
punpcklbw %xmm4,%xmm4
punpcklwd %xmm4,%xmm4
movdqa 0xcc9(%rip),%xmm5
pand   %xmm5,%xmm4
paddd  %xmm4,%xmm0
pxor   %xmm3,%xmm2
punpcklbw %xmm2,%xmm2
punpcklwd %xmm2,%xmm2
pand   %xmm5,%xmm2
paddd  %xmm2,%xmm1
paddd  %xmm1,%xmm0
pshufd $0xee,%xmm0,%xmm1
paddd  %xmm0,%xmm1
pshufd $0x55,%xmm1,%xmm0
paddd  %xmm1,%xmm0
movd   %xmm0,%esi
cmp    %rcx,%rax
je     139c <main+0x23c>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   0x0(%rax)
movzbl 0x3f0(%rsp,%rax,1),%edx
xor    %edi,%edi
cmp    (%rsp,%rax,1),%dl
setne  %dil
add    %edi,%esi
add    $0x1,%rax
cmp    %rax,%rcx
jne    1380 <main+0x220>
lea    0xc95(%rip),%rdi
xor    %eax,%eax
call   1050 <printf@plt>
mov    %r14,%rdi
call   1030 <fclose@plt>
test   %rax,%rax
je     13ca <main+0x26a>
lea    0xc7d(%rip),%rdi
xor    %eax,%eax
call   1050 <printf@plt>
mov    $0x1,%ebp
mov    %ebp,%eax
add    $0x7e8,%rsp
pop    %rbx
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret
pxor   %xmm0,%xmm0
xor    %esi,%esi
pxor   %xmm1,%xmm1
test   $0x1,%dl
jne    12fa <main+0x19a>
jmp    1353 <main+0x1f3>

LLVM IR (-O0):
@.str = [18 x i8] c"rosalind_hamm.txt\00"
@.str.1 = [2 x i8] c"r\00"
@.str.2 = [18 x i8] c"File open failed!\00"
@.str.3 = [2 x i8] c"\0A\00"
@.str.4 = [3 x i8] c"%d\00"
@.str.5 = [19 x i8] c"File close failed!\00"
define i32 @main() {
%1 = alloca i32
%2 = alloca i32*
%3 = alloca [1001 x i8]
%4 = alloca [1001 x i8]
%5 = alloca i32
%6 = alloca i32
%7 = alloca i32
store i32 0, i32* %1
%8 = call i32* @fopen(i8* getelementptr inbounds ([18 x i8], [18 x i8]* @.str, i64 0, i64 0), i8* getelementptr inbounds ([2 x i8], [2 x i8]* @.str.1, i64 0, i64 0))
store i32* %8, i32** %2
%9 = load i32*, i32** %2
%10 = icmp eq i32* %9, null
br i1 %10, label %11, label %13
11: ; preds = %0
%12 = call i32 (i8*, ...) @printf(i8* getelementptr inbounds ([18 x i8], [18 x i8]* @.str.2, i64 0, i64 0))
store i32 1, i32* %1
br label %60
13: ; preds = %0
%14 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %3, i64 0, i64 0
%15 = load i32*, i32** %2
%16 = call i32 @fgets(i8* %14, i32 1001, i32* %15)
%17 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %4, i64 0, i64 0
%18 = load i32*, i32** %2
%19 = call i32 @fgets(i8* %17, i32 1001, i32* %18)
%20 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %3, i64 0, i64 0
%21 = call i64 @strcspn(i8* %20, i8* getelementptr inbounds ([2 x i8], [2 x i8]* @.str.3, i64 0, i64 0))
%22 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %3, i64 0, i64 %21
store i8 0, i8* %22
%23 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %4, i64 0, i64 0
%24 = call i64 @strcspn(i8* %23, i8* getelementptr inbounds ([2 x i8], [2 x i8]* @.str.3, i64 0, i64 0))
%25 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %4, i64 0, i64 %24
store i8 0, i8* %25
store i32 0, i32* %5
store i32 0, i32* %6
%26 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %3, i64 0, i64 0
%27 = call i32 @strlen(i8* %26)
store i32 %27, i32* %7
br label %28
28: ; preds = %48, %13
%29 = load i32, i32* %6
%30 = load i32, i32* %7
%31 = icmp slt i32 %29, %30
br i1 %31, label %32, label %51
32: ; preds = %28
%33 = load i32, i32* %6
%34 = sext i32 %33 to i64
%35 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %3, i64 0, i64 %34
%36 = load i8, i8* %35
%37 = sext i8 %36 to i32
%38 = load i32, i32* %6
%39 = sext i32 %38 to i64
%40 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %4, i64 0, i64 %39
%41 = load i8, i8* %40
%42 = sext i8 %41 to i32
%43 = icmp ne i32 %37, %42
br i1 %43, label %44, label %47
44: ; preds = %32
%45 = load i32, i32* %5
%46 = add nsw i32 %45, 1
store i32 %46, i32* %5
br label %47
47: ; preds = %44, %32
br label %48
48: ; preds = %47
%49 = load i32, i32* %6
%50 = add nsw i32 %49, 1
store i32 %50, i32* %6
br label %28
51: ; preds = %28
%52 = load i32, i32* %5
%53 = call i32 (i8*, ...) @printf(i8* getelementptr inbounds ([3 x i8], [3 x i8]* @.str.4, i64 0, i64 0), i32 %52)
%54 = load i32*, i32** %2
%55 = call i64 @fclose(i32* %54)
%56 = icmp ne i64 %55, 0
br i1 %56, label %57, label %59
57: ; preds = %51
%58 = call i32 (i8*, ...) @printf(i8* getelementptr inbounds ([19 x i8], [19 x i8]* @.str.5, i64 0, i64 0))
store i32 1, i32* %1
br label %60
59: ; preds = %51
store i32 0, i32* %1
br label %60
60: ; preds = %59, %57, %11
%61 = load i32, i32* %1
ret i32 %61
}

LLVM IR (-O2):
@.str = [18 x i8] c"rosalind_hamm.txt\00"
@.str.1 = [2 x i8] c"r\00"
@.str.2 = [18 x i8] c"File open failed!\00"
@.str.3 = [2 x i8] c"\0A\00"
@.str.4 = [3 x i8] c"%d\00"
@.str.5 = [19 x i8] c"File close failed!\00"
define i32 @main() {
%1 = alloca [1001 x i8]
%2 = alloca [1001 x i8]
%3 = tail call i32* @fopen(i8* getelementptr inbounds ([18 x i8], [18 x i8]* @.str, i64 0, i64 0), i8* getelementptr inbounds ([2 x i8], [2 x i8]* @.str.1, i64 0, i64 0))
%4 = icmp eq i32* %3, null
br i1 %4, label %5, label %7
5: ; preds = %0
%6 = tail call i32 (i8*, ...) @printf(i8* dereferenceable(1) getelementptr inbounds ([18 x i8], [18 x i8]* @.str.2, i64 0, i64 0))
br label %131
7: ; preds = %0
%8 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %1, i64 0, i64 0
%9 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %2, i64 0, i64 0
%10 = call i32 @fgets(i8* %8, i32 1001, i32* %3)
%11 = call i32 @fgets(i8* %9, i32 1001, i32* %3)
%12 = call i64 @strcspn(i8* %8, i8* getelementptr inbounds ([2 x i8], [2 x i8]* @.str.3, i64 0, i64 0))
%13 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %1, i64 0, i64 %12
store i8 0, i8* %13
%14 = call i64 @strcspn(i8* %9, i8* getelementptr inbounds ([2 x i8], [2 x i8]* @.str.3, i64 0, i64 0))
%15 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %2, i64 0, i64 %14
store i8 0, i8* %15
%16 = call i32 @strlen(i8* %8)
%17 = icmp sgt i32 %16, 0
br i1 %17, label %18, label %110
18: ; preds = %7
%19 = zext i32 %16 to i64
%20 = icmp ult i32 %16, 8
br i1 %20, label %107, label %21
21: ; preds = %18
%22 = and i64 %19, 4294967288
%23 = add nsw i64 %22, -8
%24 = lshr exact i64 %23, 3
%25 = add nuw nsw i64 %24, 1
%26 = and i64 %25, 1
%27 = icmp eq i64 %23, 0
br i1 %27, label %75, label %28
28: ; preds = %21
%29 = and i64 %25, 4611686018427387902
br label %30
30: ; preds = %30, %28
%31 = phi i64 [ 0, %28 ], [ %72, %30 ]
%32 = phi <4 x i32> [ zeroinitializer, %28 ], [ %70, %30 ]
%33 = phi <4 x i32> [ zeroinitializer, %28 ], [ %71, %30 ]
%34 = phi i64 [ 0, %28 ], [ %73, %30 ]
%35 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %1, i64 0, i64 %31
%36 = bitcast i8* %35 to <4 x i8>*
%37 = load <4 x i8>, <4 x i8>* %36
%38 = getelementptr inbounds i8, i8* %35, i64 4
%39 = bitcast i8* %38 to <4 x i8>*
%40 = load <4 x i8>, <4 x i8>* %39
%41 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %2, i64 0, i64 %31
%42 = bitcast i8* %41 to <4 x i8>*
%43 = load <4 x i8>, <4 x i8>* %42
%44 = getelementptr inbounds i8, i8* %41, i64 4
%45 = bitcast i8* %44 to <4 x i8>*
%46 = load <4 x i8>, <4 x i8>* %45
%47 = icmp ne <4 x i8> %37, %43
%48 = icmp ne <4 x i8> %40, %46
%49 = zext <4 x i1> %47 to <4 x i32>
%50 = zext <4 x i1> %48 to <4 x i32>
%51 = add <4 x i32> %32, %49
%52 = add <4 x i32> %33, %50
%53 = or i64 %31, 8
%54 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %1, i64 0, i64 %53
%55 = bitcast i8* %54 to <4 x i8>*
%56 = load <4 x i8>, <4 x i8>* %55
%57 = getelementptr inbounds i8, i8* %54, i64 4
%58 = bitcast i8* %57 to <4 x i8>*
%59 = load <4 x i8>, <4 x i8>* %58
%60 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %2, i64 0, i64 %53
%61 = bitcast i8* %60 to <4 x i8>*
%62 = load <4 x i8>, <4 x i8>* %61
%63 = getelementptr inbounds i8, i8* %60, i64 4
%64 = bitcast i8* %63 to <4 x i8>*
%65 = load <4 x i8>, <4 x i8>* %64
%66 = icmp ne <4 x i8> %56, %62
%67 = icmp ne <4 x i8> %59, %65
%68 = zext <4 x i1> %66 to <4 x i32>
%69 = zext <4 x i1> %67 to <4 x i32>
%70 = add <4 x i32> %51, %68
%71 = add <4 x i32> %52, %69
%72 = add nuw i64 %31, 16
%73 = add i64 %34, 2
%74 = icmp eq i64 %73, %29
br i1 %74, label %75, label %30
75: ; preds = %30, %21
%76 = phi <4 x i32> [ undef, %21 ], [ %70, %30 ]
%77 = phi <4 x i32> [ undef, %21 ], [ %71, %30 ]
%78 = phi i64 [ 0, %21 ], [ %72, %30 ]
%79 = phi <4 x i32> [ zeroinitializer, %21 ], [ %70, %30 ]
%80 = phi <4 x i32> [ zeroinitializer, %21 ], [ %71, %30 ]
%81 = icmp eq i64 %26, 0
br i1 %81, label %101, label %82
82: ; preds = %75
%83 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %1, i64 0, i64 %78
%84 = bitcast i8* %83 to <4 x i8>*
%85 = load <4 x i8>, <4 x i8>* %84
%86 = getelementptr inbounds i8, i8* %83, i64 4
%87 = bitcast i8* %86 to <4 x i8>*
%88 = load <4 x i8>, <4 x i8>* %87
%89 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %2, i64 0, i64 %78
%90 = bitcast i8* %89 to <4 x i8>*
%91 = load <4 x i8>, <4 x i8>* %90
%92 = getelementptr inbounds i8, i8* %89, i64 4
%93 = bitcast i8* %92 to <4 x i8>*
%94 = load <4 x i8>, <4 x i8>* %93
%95 = icmp ne <4 x i8> %85, %91
%96 = icmp ne <4 x i8> %88, %94
%97 = zext <4 x i1> %95 to <4 x i32>
%98 = zext <4 x i1> %96 to <4 x i32>
%99 = add <4 x i32> %79, %97
%100 = add <4 x i32> %80, %98
br label %101
101: ; preds = %75, %82
%102 = phi <4 x i32> [ %76, %75 ], [ %99, %82 ]
%103 = phi <4 x i32> [ %77, %75 ], [ %100, %82 ]
%104 = add <4 x i32> %103, %102
%105 = call i32 @llvm.vector.reduce.add.v4i32(<4 x i32> %104)
%106 = icmp eq i64 %22, %19
br i1 %106, label %110, label %107
107: ; preds = %18, %101
%108 = phi i64 [ 0, %18 ], [ %22, %101 ]
%109 = phi i32 [ 0, %18 ], [ %105, %101 ]
br label %115
110: ; preds = %115, %101, %7
%111 = phi i32 [ 0, %7 ], [ %105, %101 ], [ %124, %115 ]
%112 = call i32 (i8*, ...) @printf(i8* dereferenceable(1) getelementptr inbounds ([3 x i8], [3 x i8]* @.str.4, i64 0, i64 0), i32 %111)
%113 = call i64 @fclose(i32* %3)
%114 = icmp eq i64 %113, 0
br i1 %114, label %129, label %127
115: ; preds = %107, %115
%116 = phi i64 [ %125, %115 ], [ %108, %107 ]
%117 = phi i32 [ %124, %115 ], [ %109, %107 ]
%118 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %1, i64 0, i64 %116
%119 = load i8, i8* %118
%120 = getelementptr inbounds [1001 x i8], [1001 x i8]* %2, i64 0, i64 %116
%121 = load i8, i8* %120
%122 = icmp ne i8 %119, %121
%123 = zext i1 %122 to i32
%124 = add nuw nsw i32 %117, %123
%125 = add nuw nsw i64 %116, 1
%126 = icmp eq i64 %125, %19
br i1 %126, label %110, label %115
127: ; preds = %110
%128 = call i32 (i8*, ...) @printf(i8* dereferenceable(1) getelementptr inbounds ([19 x i8], [19 x i8]* @.str.5, i64 0, i64 0))
br label %129
129: ; preds = %110, %127
%130 = phi i32 [ 1, %127 ], [ 0, %110 ]
br label %131
131: ; preds = %129, %5
%132 = phi i32 [ 1, %5 ], [ %130, %129 ]
ret i32 %132
}