void SortSequences(int *seqsizes, int *sortedseqs, int numseqs) {
  int i, j, k, minsize, minseq;
  for (i = 0; i < numseqs; i++)
    sortedseqs[i] = i;
  for (i = 0; i < numseqs; i++) {
    k = sortedseqs[i];
    minseq = i;
    minsize = seqsizes[k];
    for (j = (i + 1); j < numseqs; j++) {
      k = sortedseqs[j];
      if (seqsizes[k] < minsize) {
        minsize = seqsizes[k];
        minseq = j;
      }
    }
    k = sortedseqs[minseq];
    sortedseqs[minseq] = sortedseqs[i];
    sortedseqs[i] = k;
  }
}


x86 assembly (clang, -O0):
<SortSequences>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %edx,-0x14(%rbp)
movl   $0x0,-0x18(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
jge    113e <SortSequences+0x3e>
mov    -0x18(%rbp),%edx
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x18(%rbp),%rcx
mov    %edx,(%rax,%rcx,4)
mov    -0x18(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x18(%rbp)
jmp    1116 <SortSequences+0x16>
movl   $0x0,-0x18(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
jge    1211 <SortSequences+0x111>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x18(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x20(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x28(%rbp)
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x24(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
mov    -0x1c(%rbp),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
jge    11d1 <SortSequences+0xd1>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x20(%rbp)
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
cmp    -0x24(%rbp),%eax
jge    11be <SortSequences+0xbe>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x24(%rbp)
mov    -0x1c(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x28(%rbp)
jmp    11c3 <SortSequences+0xc3>
mov    -0x1c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
jmp    117c <SortSequences+0x7c>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x20(%rbp)
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x18(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%edx
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    %edx,(%rax,%rcx,4)
mov    -0x20(%rbp),%edx
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x18(%rbp),%rcx
mov    %edx,(%rax,%rcx,4)
mov    -0x18(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x18(%rbp)
jmp    1145 <SortSequences+0x45>
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<SortSequences>:
push   %r14
push   %rbx
test   %edx,%edx
jle    12ea <SortSequences+0x1ea>
mov    %edx,%r11d
cmp    $0x8,%edx
jae    111b <SortSequences+0x1b>
xor    %r10d,%r10d
jmp    1270 <SortSequences+0x170>
mov    %r11d,%r10d
and    $0xfffffff8,%r10d
lea    -0x8(%r10),%rax
mov    %rax,%r9
shr    $0x3,%r9
add    $0x1,%r9
mov    %r9d,%r8d
and    $0x3,%r8d
cmp    $0x18,%rax
jae    114d <SortSequences+0x4d>
movdqa 0xeba(%rip),%xmm0
xor    %ecx,%ecx
jmp    1218 <SortSequences+0x118>
and    $0xfffffffffffffffc,%r9
movdqa 0xea7(%rip),%xmm0
xor    %ecx,%ecx
movdqa 0xeac(%rip),%xmm8
movdqa 0xeb3(%rip),%xmm9
movdqa 0xeba(%rip),%xmm10
movdqa 0xec2(%rip),%xmm4
movdqa 0xeca(%rip),%xmm5
movdqa 0xed2(%rip),%xmm6
movdqa 0xeda(%rip),%xmm7
movdqa 0xee2(%rip),%xmm1
xchg   %ax,%ax
movdqa %xmm0,%xmm2
paddd  %xmm8,%xmm2
movdqu %xmm0,(%rsi,%rcx,4)
movdqu %xmm2,0x10(%rsi,%rcx,4)
movdqa %xmm0,%xmm2
paddd  %xmm9,%xmm2
movdqa %xmm0,%xmm3
paddd  %xmm10,%xmm3
movdqu %xmm2,0x20(%rsi,%rcx,4)
movdqu %xmm3,0x30(%rsi,%rcx,4)
movdqa %xmm0,%xmm2
paddd  %xmm4,%xmm2
movdqa %xmm0,%xmm3
paddd  %xmm5,%xmm3
movdqu %xmm2,0x40(%rsi,%rcx,4)
movdqu %xmm3,0x50(%rsi,%rcx,4)
movdqa %xmm0,%xmm2
paddd  %xmm6,%xmm2
movdqa %xmm0,%xmm3
paddd  %xmm7,%xmm3
movdqu %xmm2,0x60(%rsi,%rcx,4)
movdqu %xmm3,0x70(%rsi,%rcx,4)
add    $0x20,%rcx
paddd  %xmm1,%xmm0
add    $0xfffffffffffffffc,%r9
jne    11a0 <SortSequences+0xa0>
test   %r8,%r8
je     1260 <SortSequences+0x160>
lea    (%rsi,%rcx,4),%rcx
add    $0x10,%rcx
shl    $0x5,%r8
xor    %eax,%eax
movdqa 0xddd(%rip),%xmm1
movdqa 0xde5(%rip),%xmm2
nopl   0x0(%rax,%rax,1)
movdqa %xmm0,%xmm3
paddd  %xmm1,%xmm3
movdqu %xmm0,-0x10(%rcx,%rax,1)
movdqu %xmm3,(%rcx,%rax,1)
paddd  %xmm2,%xmm0
add    $0x20,%rax
cmp    %rax,%r8
jne    1240 <SortSequences+0x140>
cmp    %r11,%r10
je     127d <SortSequences+0x17d>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nop
mov    %r10d,(%rsi,%r10,4)
add    $0x1,%r10
cmp    %r10,%r11
jne    1270 <SortSequences+0x170>
test   %edx,%edx
jle    12ea <SortSequences+0x1ea>
mov    $0x1,%r10d
xor    %r14d,%r14d
jmp    12ad <SortSequences+0x1ad>
nopl   0x0(%rax)
mov    %r14d,%ecx
movslq %ecx,%rax
mov    (%rsi,%rax,4),%ecx
mov    %r9d,(%rsi,%rax,4)
mov    %ecx,(%rsi,%r14,4)
add    $0x1,%r10
mov    %r8,%r14
cmp    %r11,%r8
je     12ea <SortSequences+0x1ea>
mov    (%rsi,%r14,4),%r9d
lea    0x1(%r14),%r8
cmp    %r11,%r8
jae    1290 <SortSequences+0x190>
movslq %r9d,%rax
mov    (%rdi,%rax,4),%eax
mov    %r10,%rbx
mov    %r14d,%ecx
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
movslq (%rsi,%rbx,4),%rdx
mov    (%rdi,%rdx,4),%edx
cmp    %eax,%edx
cmovl  %edx,%eax
cmovl  %ebx,%ecx
add    $0x1,%rbx
cmp    %rbx,%r11
jne    12d0 <SortSequences+0x1d0>
jmp    1293 <SortSequences+0x193>
pop    %rbx
pop    %r14
ret

LLVM IR (-O0):
define void @SortSequences(i32* %0, i32* %1, i32 %2) {
%4 = alloca i32*
%5 = alloca i32*
%6 = alloca i32
%7 = alloca i32
%8 = alloca i32
%9 = alloca i32
%10 = alloca i32
%11 = alloca i32
store i32* %0, i32** %4
store i32* %1, i32** %5
store i32 %2, i32* %6
store i32 0, i32* %7
br label %12
12: ; preds = %22, %3
%13 = load i32, i32* %7
%14 = load i32, i32* %6
%15 = icmp slt i32 %13, %14
br i1 %15, label %16, label %25
16: ; preds = %12
%17 = load i32, i32* %7
%18 = load i32*, i32** %5
%19 = load i32, i32* %7
%20 = sext i32 %19 to i64
%21 = getelementptr inbounds i32, i32* %18, i64 %20
store i32 %17, i32* %21
br label %22
22: ; preds = %16
%23 = load i32, i32* %7
%24 = add nsw i32 %23, 1
store i32 %24, i32* %7
br label %12
25: ; preds = %12
store i32 0, i32* %7
br label %26
26: ; preds = %92, %25
%27 = load i32, i32* %7
%28 = load i32, i32* %6
%29 = icmp slt i32 %27, %28
br i1 %29, label %30, label %95
30: ; preds = %26
%31 = load i32*, i32** %5
%32 = load i32, i32* %7
%33 = sext i32 %32 to i64
%34 = getelementptr inbounds i32, i32* %31, i64 %33
%35 = load i32, i32* %34
store i32 %35, i32* %9
%36 = load i32, i32* %7
store i32 %36, i32* %11
%37 = load i32*, i32** %4
%38 = load i32, i32* %9
%39 = sext i32 %38 to i64
%40 = getelementptr inbounds i32, i32* %37, i64 %39
%41 = load i32, i32* %40
store i32 %41, i32* %10
%42 = load i32, i32* %7
%43 = add nsw i32 %42, 1
store i32 %43, i32* %8
br label %44
44: ; preds = %69, %30
%45 = load i32, i32* %8
%46 = load i32, i32* %6
%47 = icmp slt i32 %45, %46
br i1 %47, label %48, label %72
48: ; preds = %44
%49 = load i32*, i32** %5
%50 = load i32, i32* %8
%51 = sext i32 %50 to i64
%52 = getelementptr inbounds i32, i32* %49, i64 %51
%53 = load i32, i32* %52
store i32 %53, i32* %9
%54 = load i32*, i32** %4
%55 = load i32, i32* %9
%56 = sext i32 %55 to i64
%57 = getelementptr inbounds i32, i32* %54, i64 %56
%58 = load i32, i32* %57
%59 = load i32, i32* %10
%60 = icmp slt i32 %58, %59
br i1 %60, label %61, label %68
61: ; preds = %48
%62 = load i32*, i32** %4
%63 = load i32, i32* %9
%64 = sext i32 %63 to i64
%65 = getelementptr inbounds i32, i32* %62, i64 %64
%66 = load i32, i32* %65
store i32 %66, i32* %10
%67 = load i32, i32* %8
store i32 %67, i32* %11
br label %68
68: ; preds = %61, %48
br label %69
69: ; preds = %68
%70 = load i32, i32* %8
%71 = add nsw i32 %70, 1
store i32 %71, i32* %8
br label %44
72: ; preds = %44
%73 = load i32*, i32** %5
%74 = load i32, i32* %11
%75 = sext i32 %74 to i64
%76 = getelementptr inbounds i32, i32* %73, i64 %75
%77 = load i32, i32* %76
store i32 %77, i32* %9
%78 = load i32*, i32** %5
%79 = load i32, i32* %7
%80 = sext i32 %79 to i64
%81 = getelementptr inbounds i32, i32* %78, i64 %80
%82 = load i32, i32* %81
%83 = load i32*, i32** %5
%84 = load i32, i32* %11
%85 = sext i32 %84 to i64
%86 = getelementptr inbounds i32, i32* %83, i64 %85
store i32 %82, i32* %86
%87 = load i32, i32* %9
%88 = load i32*, i32** %5
%89 = load i32, i32* %7
%90 = sext i32 %89 to i64
%91 = getelementptr inbounds i32, i32* %88, i64 %90
store i32 %87, i32* %91
br label %92
92: ; preds = %72
%93 = load i32, i32* %7
%94 = add nsw i32 %93, 1
store i32 %94, i32* %7
br label %26
95: ; preds = %26
ret void
}

LLVM IR (-O2):
define void @SortSequences(i32* nocapture %0, i32* nocapture %1, i32 %2) {
%4 = icmp sgt i32 %2, 0
br i1 %4, label %5, label %116
5: ; preds = %3
%6 = zext i32 %2 to i64
%7 = icmp ult i32 %2, 8
br i1 %7, label %70, label %8
8: ; preds = %5
%9 = and i64 %6, 4294967288
%10 = add nsw i64 %9, -8
%11 = lshr exact i64 %10, 3
%12 = add nuw nsw i64 %11, 1
%13 = and i64 %12, 3
%14 = icmp ult i64 %10, 24
br i1 %14, label %51, label %15
15: ; preds = %8
%16 = and i64 %12, 4611686018427387900
br label %17
17: ; preds = %17, %15
%18 = phi i64 [ 0, %15 ], [ %47, %17 ]
%19 = phi <4 x i32> [ <i32 0, i32 1, i32 2, i32 3>, %15 ], [ %48, %17 ]
%20 = phi i64 [ 0, %15 ], [ %49, %17 ]
%21 = add <4 x i32> %19, <i32 4, i32 4, i32 4, i32 4>
%22 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %18
%23 = bitcast i32* %22 to <4 x i32>*
store <4 x i32> %19, <4 x i32>* %23
%24 = getelementptr inbounds i32, i32* %22, i64 4
%25 = bitcast i32* %24 to <4 x i32>*
store <4 x i32> %21, <4 x i32>* %25
%26 = or i64 %18, 8
%27 = add <4 x i32> %19, <i32 8, i32 8, i32 8, i32 8>
%28 = add <4 x i32> %19, <i32 12, i32 12, i32 12, i32 12>
%29 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %26
%30 = bitcast i32* %29 to <4 x i32>*
store <4 x i32> %27, <4 x i32>* %30
%31 = getelementptr inbounds i32, i32* %29, i64 4
%32 = bitcast i32* %31 to <4 x i32>*
store <4 x i32> %28, <4 x i32>* %32
%33 = or i64 %18, 16
%34 = add <4 x i32> %19, <i32 16, i32 16, i32 16, i32 16>
%35 = add <4 x i32> %19, <i32 20, i32 20, i32 20, i32 20>
%36 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %33
%37 = bitcast i32* %36 to <4 x i32>*
store <4 x i32> %34, <4 x i32>* %37
%38 = getelementptr inbounds i32, i32* %36, i64 4
%39 = bitcast i32* %38 to <4 x i32>*
store <4 x i32> %35, <4 x i32>* %39
%40 = or i64 %18, 24
%41 = add <4 x i32> %19, <i32 24, i32 24, i32 24, i32 24>
%42 = add <4 x i32> %19, <i32 28, i32 28, i32 28, i32 28>
%43 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %40
%44 = bitcast i32* %43 to <4 x i32>*
store <4 x i32> %41, <4 x i32>* %44
%45 = getelementptr inbounds i32, i32* %43, i64 4
%46 = bitcast i32* %45 to <4 x i32>*
store <4 x i32> %42, <4 x i32>* %46
%47 = add nuw i64 %18, 32
%48 = add <4 x i32> %19, <i32 32, i32 32, i32 32, i32 32>
%49 = add i64 %20, 4
%50 = icmp eq i64 %49, %16
br i1 %50, label %51, label %17
51: ; preds = %17, %8
%52 = phi i64 [ 0, %8 ], [ %47, %17 ]
%53 = phi <4 x i32> [ <i32 0, i32 1, i32 2, i32 3>, %8 ], [ %48, %17 ]
%54 = icmp eq i64 %13, 0
br i1 %54, label %68, label %55
55: ; preds = %51, %55
%56 = phi i64 [ %64, %55 ], [ %52, %51 ]
%57 = phi <4 x i32> [ %65, %55 ], [ %53, %51 ]
%58 = phi i64 [ %66, %55 ], [ 0, %51 ]
%59 = add <4 x i32> %57, <i32 4, i32 4, i32 4, i32 4>
%60 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %56
%61 = bitcast i32* %60 to <4 x i32>*
store <4 x i32> %57, <4 x i32>* %61
%62 = getelementptr inbounds i32, i32* %60, i64 4
%63 = bitcast i32* %62 to <4 x i32>*
store <4 x i32> %59, <4 x i32>* %63
%64 = add nuw i64 %56, 8
%65 = add <4 x i32> %57, <i32 8, i32 8, i32 8, i32 8>
%66 = add i64 %58, 1
%67 = icmp eq i64 %66, %13
br i1 %67, label %68, label %55
68: ; preds = %55, %51
%69 = icmp eq i64 %9, %6
br i1 %69, label %72, label %70
70: ; preds = %5, %68
%71 = phi i64 [ 0, %5 ], [ %9, %68 ]
br label %76
72: ; preds = %76, %68
br i1 %4, label %73, label %116
73: ; preds = %72
%74 = zext i32 %2 to i64
%75 = zext i32 %2 to i64
br label %82
76: ; preds = %70, %76
%77 = phi i64 [ %80, %76 ], [ %71, %70 ]
%78 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %77
%79 = trunc i64 %77 to i32
store i32 %79, i32* %78
%80 = add nuw nsw i64 %77, 1
%81 = icmp eq i64 %80, %6
br i1 %81, label %72, label %76
82: ; preds = %73, %109
%83 = phi i64 [ 0, %73 ], [ %87, %109 ]
%84 = phi i64 [ 1, %73 ], [ %114, %109 ]
%85 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %83
%86 = load i32, i32* %85
%87 = add nuw nsw i64 %83, 1
%88 = icmp ult i64 %87, %74
%89 = trunc i64 %83 to i32
br i1 %88, label %90, label %109
90: ; preds = %82
%91 = sext i32 %86 to i64
%92 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 %91
%93 = load i32, i32* %92
br label %94
94: ; preds = %90, %94
%95 = phi i64 [ %84, %90 ], [ %107, %94 ]
%96 = phi i32 [ %89, %90 ], [ %106, %94 ]
%97 = phi i32 [ %93, %90 ], [ %104, %94 ]
%98 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %95
%99 = load i32, i32* %98
%100 = sext i32 %99 to i64
%101 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 %100
%102 = load i32, i32* %101
%103 = icmp slt i32 %102, %97
%104 = select i1 %103, i32 %102, i32 %97
%105 = trunc i64 %95 to i32
%106 = select i1 %103, i32 %105, i32 %96
%107 = add nuw nsw i64 %95, 1
%108 = icmp eq i64 %107, %75
br i1 %108, label %109, label %94
109: ; preds = %94, %82
%110 = phi i32 [ %89, %82 ], [ %106, %94 ]
%111 = sext i32 %110 to i64
%112 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %111
%113 = load i32, i32* %112
store i32 %86, i32* %112
store i32 %113, i32* %85
%114 = add nuw nsw i64 %84, 1
%115 = icmp eq i64 %87, %75
br i1 %115, label %116, label %82
116: ; preds = %109, %3, %72
ret void
}