#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
unsigned int getMax(int /*<<< orphan*/, unsigned int);
unsigned long long getReverse(unsigned long long);
scalar_t__ malloc(unsigned int);
unsigned long long int *
createReverseCompliment(unsigned long long int *sequence, unsigned int length) {
  unsigned int endNucleotidePosition = getMax(0, (length - 1));
  unsigned int endNucleotideIndex = endNucleotidePosition / 32;
  unsigned int extraBases = (32 - length) % 32;
  unsigned long long int reverse;
  unsigned long long int *reverseCompliment = (unsigned long long int *)malloc(
      (endNucleotideIndex + 1) * sizeof(unsigned long long int *));
  for (int i = 0; i <= endNucleotideIndex; i++) {
    reverse = getReverse(sequence[endNucleotideIndex - i]);
    reverseCompliment[i] = ~(reverse);
  }
  for (int i = 0; i <= endNucleotideIndex; i++) {
    reverseCompliment[i] = reverseCompliment[i] << (extraBases * 2);
    if (i < endNucleotideIndex && extraBases > 0) {
      reverseCompliment[i] = reverseCompliment[i] | (reverseCompliment[i + 1] >>
                                                     ((32 - extraBases) * 2));
    }
  }
  return reverseCompliment;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<createReverseCompliment>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x30,%rsp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %esi,-0xc(%rbp)
mov    -0xc(%rbp),%esi
sub    $0x1,%esi
xor    %edi,%edi
call   1050 <getMax@plt>
mov    %eax,-0x10(%rbp)
mov    -0x10(%rbp),%eax
shr    $0x5,%eax
mov    %eax,-0x14(%rbp)
mov    $0x20,%eax
sub    -0xc(%rbp),%eax
and    $0x1f,%eax
mov    %eax,-0x18(%rbp)
mov    -0x14(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,%eax
shl    $0x3,%rax
mov    %eax,%edi
call   1040 <malloc@plt>
mov    %rax,-0x28(%rbp)
movl   $0x0,-0x2c(%rbp)
mov    -0x2c(%rbp),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
ja     11cb <createReverseCompliment+0x9b>
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    -0x14(%rbp),%ecx
sub    -0x2c(%rbp),%ecx
mov    %ecx,%ecx
mov    (%rax,%rcx,8),%rdi
call   1030 <getReverse@plt>
mov    %rax,-0x20(%rbp)
mov    -0x20(%rbp),%rdx
xor    $0xffffffffffffffff,%rdx
mov    -0x28(%rbp),%rax
movslq -0x2c(%rbp),%rcx
mov    %rdx,(%rax,%rcx,8)
mov    -0x2c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
jmp    1184 <createReverseCompliment+0x54>
movl   $0x0,-0x30(%rbp)
mov    -0x30(%rbp),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
ja     1268 <createReverseCompliment+0x138>
mov    -0x28(%rbp),%rax
movslq -0x30(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rdx
mov    -0x18(%rbp),%eax
shl    $0x1,%eax
mov    %eax,%eax
mov    %eax,%ecx
shl    %cl,%rdx
mov    -0x28(%rbp),%rax
movslq -0x30(%rbp),%rcx
mov    %rdx,(%rax,%rcx,8)
mov    -0x30(%rbp),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
jae    1255 <createReverseCompliment+0x125>
cmpl   $0x0,-0x18(%rbp)
jbe    1255 <createReverseCompliment+0x125>
mov    -0x28(%rbp),%rax
movslq -0x30(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rdx
mov    -0x28(%rbp),%rax
mov    -0x30(%rbp),%ecx
add    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    $0x20,%ecx
sub    -0x18(%rbp),%ecx
shl    $0x1,%ecx
mov    %ecx,%ecx
shr    %cl,%rax
or     %rax,%rdx
mov    -0x28(%rbp),%rax
movslq -0x30(%rbp),%rcx
mov    %rdx,(%rax,%rcx,8)
jmp    125a <createReverseCompliment+0x12a>
mov    -0x30(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x30(%rbp)
jmp    11d2 <createReverseCompliment+0xa2>
mov    -0x28(%rbp),%rax
add    $0x30,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<createReverseCompliment>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
push   %rax
mov    %esi,%r15d
mov    %rdi,%r12
lea    -0x1(%r15),%esi
xor    %edi,%edi
call   1050 <getMax@plt>
mov    %eax,%r14d
shr    $0x5,%r14d
neg    %r15d
lea    0x8(,%r14,8),%edi
call   1040 <malloc@plt>
mov    %rax,%rbx
lea    0x1(%r14),%r13
mov    %rax,%rbp
mov    %r14,(%rsp)
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   0x0(%rax,%rax,1)
mov    %r14d,%eax
mov    (%r12,%rax,8),%rdi
call   1030 <getReverse@plt>
not    %rax
mov    %rax,0x0(%rbp)
add    $0x8,%rbp
add    $0xffffffffffffffff,%r14
jb     1180 <createReverseCompliment+0x50>
and    $0x1f,%r15d
lea    (%r15,%r15,1),%eax
mov    $0x40,%r8d
sub    %eax,%r8d
xor    %esi,%esi
mov    (%rsp),%r9
jmp    11c5 <createReverseCompliment+0x95>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
cmp    %rsi,%r13
je     11f7 <createReverseCompliment+0xc7>
mov    %rsi,%rdi
mov    (%rbx,%rsi,8),%rbp
mov    %eax,%ecx
shl    %cl,%rbp
add    $0x1,%rsi
mov    %rbp,(%rbx,%rdi,8)
test   %r15d,%r15d
je     11c0 <createReverseCompliment+0x90>
cmp    %r9,%rdi
jae    11c0 <createReverseCompliment+0x90>
mov    0x8(%rbx,%rdi,8),%rdx
mov    %r8d,%ecx
shr    %cl,%rdx
or     %rbp,%rdx
mov    %rdx,(%rbx,%rdi,8)
jmp    11c0 <createReverseCompliment+0x90>
mov    %rbx,%rax
add    $0x8,%rsp
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define i64* @createReverseCompliment(i64* %0, i32 %1) {
%3 = alloca i64*
%4 = alloca i32
%5 = alloca i32
%6 = alloca i32
%7 = alloca i32
%8 = alloca i64
%9 = alloca i64*
%10 = alloca i32
%11 = alloca i32
store i64* %0, i64** %3
store i32 %1, i32* %4
%12 = load i32, i32* %4
%13 = sub i32 %12, 1
%14 = call i32 @getMax(i32 0, i32 %13)
store i32 %14, i32* %5
%15 = load i32, i32* %5
%16 = udiv i32 %15, 32
store i32 %16, i32* %6
%17 = load i32, i32* %4
%18 = sub i32 32, %17
%19 = urem i32 %18, 32
store i32 %19, i32* %7
%20 = load i32, i32* %6
%21 = add i32 %20, 1
%22 = zext i32 %21 to i64
%23 = mul i64 %22, 8
%24 = trunc i64 %23 to i32
%25 = call i64 @malloc(i32 %24)
%26 = inttoptr i64 %25 to i64*
store i64* %26, i64** %9
store i32 0, i32* %10
br label %27
27: ; preds = %46, %2
%28 = load i32, i32* %10
%29 = load i32, i32* %6
%30 = icmp ule i32 %28, %29
br i1 %30, label %31, label %49
31: ; preds = %27
%32 = load i64*, i64** %3
%33 = load i32, i32* %6
%34 = load i32, i32* %10
%35 = sub i32 %33, %34
%36 = zext i32 %35 to i64
%37 = getelementptr inbounds i64, i64* %32, i64 %36
%38 = load i64, i64* %37
%39 = call i64 @getReverse(i64 %38)
store i64 %39, i64* %8
%40 = load i64, i64* %8
%41 = xor i64 %40, -1
%42 = load i64*, i64** %9
%43 = load i32, i32* %10
%44 = sext i32 %43 to i64
%45 = getelementptr inbounds i64, i64* %42, i64 %44
store i64 %41, i64* %45
br label %46
46: ; preds = %31
%47 = load i32, i32* %10
%48 = add nsw i32 %47, 1
store i32 %48, i32* %10
br label %27
49: ; preds = %27
store i32 0, i32* %11
br label %50
50: ; preds = %97, %49
%51 = load i32, i32* %11
%52 = load i32, i32* %6
%53 = icmp ule i32 %51, %52
br i1 %53, label %54, label %100
54: ; preds = %50
%55 = load i64*, i64** %9
%56 = load i32, i32* %11
%57 = sext i32 %56 to i64
%58 = getelementptr inbounds i64, i64* %55, i64 %57
%59 = load i64, i64* %58
%60 = load i32, i32* %7
%61 = mul i32 %60, 2
%62 = zext i32 %61 to i64
%63 = shl i64 %59, %62
%64 = load i64*, i64** %9
%65 = load i32, i32* %11
%66 = sext i32 %65 to i64
%67 = getelementptr inbounds i64, i64* %64, i64 %66
store i64 %63, i64* %67
%68 = load i32, i32* %11
%69 = load i32, i32* %6
%70 = icmp ult i32 %68, %69
br i1 %70, label %71, label %96
71: ; preds = %54
%72 = load i32, i32* %7
%73 = icmp ugt i32 %72, 0
br i1 %73, label %74, label %96
74: ; preds = %71
%75 = load i64*, i64** %9
%76 = load i32, i32* %11
%77 = sext i32 %76 to i64
%78 = getelementptr inbounds i64, i64* %75, i64 %77
%79 = load i64, i64* %78
%80 = load i64*, i64** %9
%81 = load i32, i32* %11
%82 = add nsw i32 %81, 1
%83 = sext i32 %82 to i64
%84 = getelementptr inbounds i64, i64* %80, i64 %83
%85 = load i64, i64* %84
%86 = load i32, i32* %7
%87 = sub i32 32, %86
%88 = mul i32 %87, 2
%89 = zext i32 %88 to i64
%90 = lshr i64 %85, %89
%91 = or i64 %79, %90
%92 = load i64*, i64** %9
%93 = load i32, i32* %11
%94 = sext i32 %93 to i64
%95 = getelementptr inbounds i64, i64* %92, i64 %94
store i64 %91, i64* %95
br label %96
96: ; preds = %74, %71, %54
br label %97
97: ; preds = %96
%98 = load i32, i32* %11
%99 = add nsw i32 %98, 1
store i32 %99, i32* %11
br label %50
100: ; preds = %50
%101 = load i64*, i64** %9
ret i64* %101
}

LLVM IR (-O2):
define i64* @createReverseCompliment(i64* nocapture %0, i32 %1) {
%3 = add i32 %1, -1
%4 = tail call i32 @getMax(i32 0, i32 %3)
%5 = lshr i32 %4, 5
%6 = sub i32 0, %1
%7 = shl nuw nsw i32 %5, 3
%8 = add nuw nsw i32 %7, 8
%9 = tail call i64 @malloc(i32 %8)
%10 = inttoptr i64 %9 to i64*
%11 = zext i32 %5 to i64
%12 = add nuw nsw i32 %5, 1
%13 = zext i32 %12 to i64
br label %22
14: ; preds = %22
%15 = and i32 %6, 31
%16 = shl nuw nsw i32 %15, 1
%17 = zext i32 %16 to i64
%18 = icmp ne i32 %15, 0
%19 = mul nsw i32 %15, -2
%20 = add nsw i32 %19, 64
%21 = zext i32 %20 to i64
br label %35
22: ; preds = %2, %22
%23 = phi i64 [ 0, %2 ], [ %32, %22 ]
%24 = trunc i64 %23 to i32
%25 = sub i32 %5, %24
%26 = zext i32 %25 to i64
%27 = getelementptr inbounds i64, i64* %0, i64 %26
%28 = load i64, i64* %27
%29 = tail call i64 @getReverse(i64 %28)
%30 = xor i64 %29, -1
%31 = getelementptr inbounds i64, i64* %10, i64 %23
store i64 %30, i64* %31
%32 = add nuw nsw i64 %23, 1
%33 = icmp eq i64 %32, %13
br i1 %33, label %14, label %22
34: ; preds = %48
ret i64* %10
35: ; preds = %14, %48
%36 = phi i64 [ 0, %14 ], [ %42, %48 ]
%37 = getelementptr inbounds i64, i64* %10, i64 %36
%38 = load i64, i64* %37
%39 = shl i64 %38, %17
store i64 %39, i64* %37
%40 = icmp ult i64 %36, %11
%41 = and i1 %18, %40
%42 = add nuw nsw i64 %36, 1
br i1 %41, label %43, label %48
43: ; preds = %35
%44 = getelementptr inbounds i64, i64* %10, i64 %42
%45 = load i64, i64* %44
%46 = lshr i64 %45, %21
%47 = or i64 %46, %39
store i64 %47, i64* %37
br label %48
48: ; preds = %35, %43
%49 = icmp eq i64 %42, %13
br i1 %49, label %34, label %35
}