#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
double PairwiseIdentity(char *, char *);
void MakeIdentityMx(char **aseqs, int num, double **ret_imx) {
  int i, j;
  for (i = 0; i < num; i++)
    for (j = i + 1; j < num; j++)
      ret_imx[j][i] = PairwiseIdentity(aseqs[i], aseqs[j]);
  return;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<MakeIdentityMx>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x20,%rsp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %esi,-0xc(%rbp)
mov    %rdx,-0x18(%rbp)
movl   $0x0,-0x1c(%rbp)
mov    -0x1c(%rbp),%eax
cmp    -0xc(%rbp),%eax
jge    119e <MakeIdentityMx+0x8e>
mov    -0x1c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x20(%rbp)
mov    -0x20(%rbp),%eax
cmp    -0xc(%rbp),%eax
jge    118b <MakeIdentityMx+0x7b>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rdi
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rsi
call   1030 <PairwiseIdentity@plt>
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
movsd  %xmm0,(%rax,%rcx,8)
mov    -0x20(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x20(%rbp)
jmp    113f <MakeIdentityMx+0x2f>
jmp    1190 <MakeIdentityMx+0x80>
mov    -0x1c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
jmp    112a <MakeIdentityMx+0x1a>
add    $0x20,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<MakeIdentityMx>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
sub    $0x18,%rsp
test   %esi,%esi
jle    1191 <MakeIdentityMx+0x81>
mov    %rdx,%r12
mov    %rdi,%r14
mov    %esi,%eax
xor    %ebp,%ebp
mov    %rax,%r13
mov    %rdi,%rbx
mov    %rax,0x8(%rsp)
jmp    115b <MakeIdentityMx+0x4b>
nopl   0x0(%rax)
add    $0x8,%r12
add    $0x8,%rbx
add    $0xffffffffffffffff,%r13
mov    0x8(%rsp),%rax
mov    0x10(%rsp),%rbp
cmp    %rax,%rbp
je     1191 <MakeIdentityMx+0x81>
lea    0x1(%rbp),%rcx
mov    %rcx,0x10(%rsp)
cmp    %rax,%rcx
jae    1140 <MakeIdentityMx+0x30>
mov    $0x1,%r15d
nop
mov    (%r14,%rbp,8),%rdi
mov    (%rbx,%r15,8),%rsi
call   1030 <PairwiseIdentity@plt>
mov    (%r12,%r15,8),%rax
movsd  %xmm0,(%rax,%rbp,8)
add    $0x1,%r15
cmp    %r15,%r13
jne    1170 <MakeIdentityMx+0x60>
jmp    1140 <MakeIdentityMx+0x30>
add    $0x18,%rsp
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define void @MakeIdentityMx(i8** %0, i32 %1, double** %2) {
%4 = alloca i8**
%5 = alloca i32
%6 = alloca double**
%7 = alloca i32
%8 = alloca i32
store i8** %0, i8*** %4
store i32 %1, i32* %5
store double** %2, double*** %6
store i32 0, i32* %7
br label %9
9: ; preds = %44, %3
%10 = load i32, i32* %7
%11 = load i32, i32* %5
%12 = icmp slt i32 %10, %11
br i1 %12, label %13, label %47
13: ; preds = %9
%14 = load i32, i32* %7
%15 = add nsw i32 %14, 1
store i32 %15, i32* %8
br label %16
16: ; preds = %40, %13
%17 = load i32, i32* %8
%18 = load i32, i32* %5
%19 = icmp slt i32 %17, %18
br i1 %19, label %20, label %43
20: ; preds = %16
%21 = load i8**, i8*** %4
%22 = load i32, i32* %7
%23 = sext i32 %22 to i64
%24 = getelementptr inbounds i8*, i8** %21, i64 %23
%25 = load i8*, i8** %24
%26 = load i8**, i8*** %4
%27 = load i32, i32* %8
%28 = sext i32 %27 to i64
%29 = getelementptr inbounds i8*, i8** %26, i64 %28
%30 = load i8*, i8** %29
%31 = call double @PairwiseIdentity(i8* %25, i8* %30)
%32 = load double**, double*** %6
%33 = load i32, i32* %8
%34 = sext i32 %33 to i64
%35 = getelementptr inbounds double*, double** %32, i64 %34
%36 = load double*, double** %35
%37 = load i32, i32* %7
%38 = sext i32 %37 to i64
%39 = getelementptr inbounds double, double* %36, i64 %38
store double %31, double* %39
br label %40
40: ; preds = %20
%41 = load i32, i32* %8
%42 = add nsw i32 %41, 1
store i32 %42, i32* %8
br label %16
43: ; preds = %16
br label %44
44: ; preds = %43
%45 = load i32, i32* %7
%46 = add nsw i32 %45, 1
store i32 %46, i32* %7
br label %9
47: ; preds = %9
ret void
}

LLVM IR (-O2):
define void @MakeIdentityMx(i8** nocapture %0, i32 %1, double** nocapture %2) {
%4 = icmp sgt i32 %1, 0
br i1 %4, label %5, label %29
5: ; preds = %3
%6 = zext i32 %1 to i64
%7 = zext i32 %1 to i64
br label %11
8: ; preds = %18, %11
%9 = add nuw nsw i64 %13, 1
%10 = icmp eq i64 %14, %7
br i1 %10, label %29, label %11
11: ; preds = %5, %8
%12 = phi i64 [ 0, %5 ], [ %14, %8 ]
%13 = phi i64 [ 1, %5 ], [ %9, %8 ]
%14 = add nuw nsw i64 %12, 1
%15 = icmp ult i64 %14, %6
br i1 %15, label %16, label %8
16: ; preds = %11
%17 = getelementptr inbounds i8*, i8** %0, i64 %12
br label %18
18: ; preds = %16, %18
%19 = phi i64 [ %13, %16 ], [ %27, %18 ]
%20 = load i8*, i8** %17
%21 = getelementptr inbounds i8*, i8** %0, i64 %19
%22 = load i8*, i8** %21
%23 = tail call double @PairwiseIdentity(i8* %20, i8* %22)
%24 = getelementptr inbounds double*, double** %2, i64 %19
%25 = load double*, double** %24
%26 = getelementptr inbounds double, double* %25, i64 %12
store double %23, double* %26
%27 = add nuw nsw i64 %19, 1
%28 = icmp eq i64 %27, %7
br i1 %28, label %8, label %18
29: ; preds = %8, %3
ret void
}