#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
int characterscore(int, int);
int gappedscore(int, int);
int max(int, int);
int /*<<< orphan*/ max4(int, int /*<<< orphan*/, int, int);
int /*<<< orphan*/ printf(char *, ...);
int transposescore(int, int);
int fillmatrix(int *dpmatrix, int xsize, int ysize, char *xstring,
               char *ystring) {
  int result = 0;
  int currentxchar = 0;
  int currentychar = 0;
  int gapscore = 0;
  int charscore = 0;
  int currentindex = 0;
  int indexdiag = 0;
  int indexleft = 0;
  int indexabove = 0;
  if (0)
    printf("\n");
  for (int y = 0; y < ysize; ++y) {
    for (int x = 0; x < xsize; ++x) {
      currentxchar = xstring[x - 1];
      currentychar = ystring[y - 1];
      if ((x > 0) & (y > 0)) {
        gapscore = gappedscore(currentxchar, currentychar);
        charscore = characterscore(currentxchar, currentychar);
        currentindex = (y * xsize) + x;
        indexdiag = ((y - 1) * xsize) + (x - 1);
        indexleft = (y * xsize) + (x - 1);
        indexabove = ((y - 1) * xsize) + x;
        dpmatrix[currentindex] = max4(dpmatrix[indexdiag] + charscore, 0,
                                      dpmatrix[indexabove] + gapscore,
                                      dpmatrix[indexleft] + gapscore) +
                                 0;
        if ((dpmatrix[indexabove] > dpmatrix[indexdiag]) &&
            (dpmatrix[indexleft] > dpmatrix[indexdiag])) {
          dpmatrix[indexdiag] = max(dpmatrix[indexabove], dpmatrix[indexleft]);
          dpmatrix[currentindex] = max(
              dpmatrix[indexdiag] + transposescore(currentxchar, currentychar),
              dpmatrix[currentindex]);
        }
      }
      if (0) {
        if ((x == 0) || (y == 0)) {
          if ((x == 0) && (y == 0)) {
            printf("  ");
          }
          if ((x != 0) && (y == 0)) {
            printf("_%c_ ", currentxchar);
          }
          if ((x == 0) && (y != 0)) {
            printf("%c ", currentychar);
          }
        } else {
          printf("%3d ", dpmatrix[currentindex]);
        }
      }
    }
    if (0)
      printf("\n");
  }
  if (0)
    printf("\n");
  return result;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<fillmatrix>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x50,%rsp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %esi,-0xc(%rbp)
mov    %edx,-0x10(%rbp)
mov    %rcx,-0x18(%rbp)
mov    %r8,-0x20(%rbp)
movl   $0x0,-0x24(%rbp)
movl   $0x0,-0x28(%rbp)
movl   $0x0,-0x2c(%rbp)
movl   $0x0,-0x30(%rbp)
movl   $0x0,-0x34(%rbp)
movl   $0x0,-0x38(%rbp)
movl   $0x0,-0x3c(%rbp)
movl   $0x0,-0x40(%rbp)
movl   $0x0,-0x44(%rbp)
movl   $0x0,-0x48(%rbp)
mov    -0x48(%rbp),%eax
cmp    -0x10(%rbp),%eax
jge    1382 <fillmatrix+0x232>
movl   $0x0,-0x4c(%rbp)
mov    -0x4c(%rbp),%eax
cmp    -0xc(%rbp),%eax
jge    136f <fillmatrix+0x21f>
mov    -0x18(%rbp),%rax
mov    -0x4c(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
mov    %eax,-0x28(%rbp)
mov    -0x20(%rbp),%rax
mov    -0x48(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
cmpl   $0x0,-0x4c(%rbp)
setg   %al
and    $0x1,%al
movzbl %al,%eax
cmpl   $0x0,-0x48(%rbp)
setg   %cl
and    $0x1,%cl
movzbl %cl,%ecx
and    %ecx,%eax
cmp    $0x0,%eax
je     135c <fillmatrix+0x20c>
mov    -0x28(%rbp),%edi
mov    -0x2c(%rbp),%esi
call   1040 <gappedscore@plt>
mov    %eax,-0x30(%rbp)
mov    -0x28(%rbp),%edi
mov    -0x2c(%rbp),%esi
call   1070 <characterscore@plt>
mov    %eax,-0x34(%rbp)
mov    -0x48(%rbp),%eax
imul   -0xc(%rbp),%eax
add    -0x4c(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x38(%rbp)
mov    -0x48(%rbp),%eax
sub    $0x1,%eax
imul   -0xc(%rbp),%eax
mov    -0x4c(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
add    %ecx,%eax
mov    %eax,-0x3c(%rbp)
mov    -0x48(%rbp),%eax
imul   -0xc(%rbp),%eax
mov    -0x4c(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
add    %ecx,%eax
mov    %eax,-0x40(%rbp)
mov    -0x48(%rbp),%eax
sub    $0x1,%eax
imul   -0xc(%rbp),%eax
add    -0x4c(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x44(%rbp)
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x3c(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%edi
add    -0x34(%rbp),%edi
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x44(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%edx
add    -0x30(%rbp),%edx
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x40(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%ecx
add    -0x30(%rbp),%ecx
xor    %esi,%esi
call   1030 <max4@plt>
mov    %eax,%edx
add    $0x0,%edx
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x38(%rbp),%rcx
mov    %edx,(%rax,%rcx,4)
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x44(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    -0x8(%rbp),%rcx
movslq -0x3c(%rbp),%rdx
cmp    (%rcx,%rdx,4),%eax
jle    1357 <fillmatrix+0x207>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x40(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    -0x8(%rbp),%rcx
movslq -0x3c(%rbp),%rdx
cmp    (%rcx,%rdx,4),%eax
jle    1357 <fillmatrix+0x207>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x44(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%edi
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x40(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%esi
call   1050 <max@plt>
mov    %eax,%edx
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x3c(%rbp),%rcx
mov    %edx,(%rax,%rcx,4)
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x3c(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x50(%rbp)
mov    -0x28(%rbp),%edi
mov    -0x2c(%rbp),%esi
call   1060 <transposescore@plt>
mov    -0x50(%rbp),%edi
add    %eax,%edi
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x38(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%esi
call   1050 <max@plt>
mov    %eax,%edx
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x38(%rbp),%rcx
mov    %edx,(%rax,%rcx,4)
jmp    135c <fillmatrix+0x20c>
jmp    1361 <fillmatrix+0x211>
mov    -0x4c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x4c(%rbp)
jmp    11c3 <fillmatrix+0x73>
jmp    1374 <fillmatrix+0x224>
mov    -0x48(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x48(%rbp)
jmp    11b0 <fillmatrix+0x60>
mov    -0x24(%rbp),%eax
add    $0x50,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<fillmatrix>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
sub    $0x48,%rsp
mov    %r8,0x40(%rsp)
mov    %rcx,0x38(%rsp)
mov    %esi,0x14(%rsp)
mov    %rdi,0x8(%rsp)
test   %edx,%edx
jle    12b8 <fillmatrix+0x168>
movslq 0x14(%rsp),%rsi
mov    %edx,%eax
mov    %rax,0x28(%rsp)
mov    %esi,%r14d
mov    %rsi,%rax
not    %rax
mov    0x8(%rsp),%rcx
lea    (%rcx,%rax,4),%rax
mov    %rax,0x18(%rsp)
shl    $0x2,%rsi
mov    %rsi,0x30(%rsp)
xor    %ebp,%ebp
jmp    11ce <fillmatrix+0x7e>
nopl   0x0(%rax)
add    $0x1,%rbp
mov    0x30(%rsp),%rax
add    %rax,0x18(%rsp)
add    %rax,0x8(%rsp)
cmp    0x28(%rsp),%rbp
je     12b8 <fillmatrix+0x168>
cmpl   $0x0,0x14(%rsp)
jle    11b0 <fillmatrix+0x60>
xor    %r13d,%r13d
jmp    11e9 <fillmatrix+0x99>
nopw   0x0(%rax,%rax,1)
add    $0x1,%r13
cmp    %r13,%r14
je     11b0 <fillmatrix+0x60>
test   %rbp,%rbp
je     11e0 <fillmatrix+0x90>
test   %r13,%r13
je     11e0 <fillmatrix+0x90>
mov    0x38(%rsp),%rax
movsbl -0x1(%rax,%r13,1),%ebx
mov    0x40(%rsp),%rax
movsbl -0x1(%rax,%rbp,1),%r12d
mov    %ebx,%edi
mov    %r12d,%esi
call   1040 <gappedscore@plt>
mov    %eax,%r15d
mov    %ebx,0x24(%rsp)
mov    %ebx,%edi
mov    %r12d,0x20(%rsp)
mov    %r12d,%esi
call   1070 <characterscore@plt>
mov    0x18(%rsp),%rbx
add    (%rbx,%r13,4),%eax
mov    0x4(%rbx,%r13,4),%edx
add    %r15d,%edx
mov    %r14,%r12
mov    0x8(%rsp),%r14
add    -0x4(%r14,%r13,4),%r15d
mov    %eax,%edi
xor    %esi,%esi
mov    %r15d,%ecx
call   1030 <max4@plt>
mov    %eax,(%r14,%r13,4)
mov    %r12,%r14
mov    (%rbx,%r13,4),%eax
mov    0x4(%rbx,%r13,4),%edi
cmp    %eax,%edi
jle    11e0 <fillmatrix+0x90>
mov    0x8(%rsp),%rcx
mov    -0x4(%rcx,%r13,4),%esi
cmp    %eax,%esi
jle    11e0 <fillmatrix+0x90>
call   1050 <max@plt>
mov    %eax,%r15d
mov    0x18(%rsp),%rax
mov    %r15d,(%rax,%r13,4)
mov    0x24(%rsp),%edi
mov    0x20(%rsp),%esi
call   1060 <transposescore@plt>
add    %eax,%r15d
mov    0x8(%rsp),%rbx
mov    (%rbx,%r13,4),%esi
mov    %r15d,%edi
call   1050 <max@plt>
mov    %eax,(%rbx,%r13,4)
jmp    11e0 <fillmatrix+0x90>
xor    %eax,%eax
add    $0x48,%rsp
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define i32 @fillmatrix(i32* %0, i32 %1, i32 %2, i8* %3, i8* %4) {
%6 = alloca i32*
%7 = alloca i32
%8 = alloca i32
%9 = alloca i8*
%10 = alloca i8*
%11 = alloca i32
%12 = alloca i32
%13 = alloca i32
%14 = alloca i32
%15 = alloca i32
%16 = alloca i32
%17 = alloca i32
%18 = alloca i32
%19 = alloca i32
%20 = alloca i32
%21 = alloca i32
store i32* %0, i32** %6
store i32 %1, i32* %7
store i32 %2, i32* %8
store i8* %3, i8** %9
store i8* %4, i8** %10
store i32 0, i32* %11
store i32 0, i32* %12
store i32 0, i32* %13
store i32 0, i32* %14
store i32 0, i32* %15
store i32 0, i32* %16
store i32 0, i32* %17
store i32 0, i32* %18
store i32 0, i32* %19
store i32 0, i32* %20
br label %22
22: ; preds = %176, %5
%23 = load i32, i32* %20
%24 = load i32, i32* %8
%25 = icmp slt i32 %23, %24
br i1 %25, label %26, label %179
26: ; preds = %22
store i32 0, i32* %21
br label %27
27: ; preds = %172, %26
%28 = load i32, i32* %21
%29 = load i32, i32* %7
%30 = icmp slt i32 %28, %29
br i1 %30, label %31, label %175
31: ; preds = %27
%32 = load i8*, i8** %9
%33 = load i32, i32* %21
%34 = sub nsw i32 %33, 1
%35 = sext i32 %34 to i64
%36 = getelementptr inbounds i8, i8* %32, i64 %35
%37 = load i8, i8* %36
%38 = sext i8 %37 to i32
store i32 %38, i32* %12
%39 = load i8*, i8** %10
%40 = load i32, i32* %20
%41 = sub nsw i32 %40, 1
%42 = sext i32 %41 to i64
%43 = getelementptr inbounds i8, i8* %39, i64 %42
%44 = load i8, i8* %43
%45 = sext i8 %44 to i32
store i32 %45, i32* %13
%46 = load i32, i32* %21
%47 = icmp sgt i32 %46, 0
%48 = zext i1 %47 to i32
%49 = load i32, i32* %20
%50 = icmp sgt i32 %49, 0
%51 = zext i1 %50 to i32
%52 = and i32 %48, %51
%53 = icmp ne i32 %52, 0
br i1 %53, label %54, label %171
54: ; preds = %31
%55 = load i32, i32* %12
%56 = load i32, i32* %13
%57 = call i32 @gappedscore(i32 %55, i32 %56)
store i32 %57, i32* %14
%58 = load i32, i32* %12
%59 = load i32, i32* %13
%60 = call i32 @characterscore(i32 %58, i32 %59)
store i32 %60, i32* %15
%61 = load i32, i32* %20
%62 = load i32, i32* %7
%63 = mul nsw i32 %61, %62
%64 = load i32, i32* %21
%65 = add nsw i32 %63, %64
store i32 %65, i32* %16
%66 = load i32, i32* %20
%67 = sub nsw i32 %66, 1
%68 = load i32, i32* %7
%69 = mul nsw i32 %67, %68
%70 = load i32, i32* %21
%71 = sub nsw i32 %70, 1
%72 = add nsw i32 %69, %71
store i32 %72, i32* %17
%73 = load i32, i32* %20
%74 = load i32, i32* %7
%75 = mul nsw i32 %73, %74
%76 = load i32, i32* %21
%77 = sub nsw i32 %76, 1
%78 = add nsw i32 %75, %77
store i32 %78, i32* %18
%79 = load i32, i32* %20
%80 = sub nsw i32 %79, 1
%81 = load i32, i32* %7
%82 = mul nsw i32 %80, %81
%83 = load i32, i32* %21
%84 = add nsw i32 %82, %83
store i32 %84, i32* %19
%85 = load i32*, i32** %6
%86 = load i32, i32* %17
%87 = sext i32 %86 to i64
%88 = getelementptr inbounds i32, i32* %85, i64 %87
%89 = load i32, i32* %88
%90 = load i32, i32* %15
%91 = add nsw i32 %89, %90
%92 = load i32*, i32** %6
%93 = load i32, i32* %19
%94 = sext i32 %93 to i64
%95 = getelementptr inbounds i32, i32* %92, i64 %94
%96 = load i32, i32* %95
%97 = load i32, i32* %14
%98 = add nsw i32 %96, %97
%99 = load i32*, i32** %6
%100 = load i32, i32* %18
%101 = sext i32 %100 to i64
%102 = getelementptr inbounds i32, i32* %99, i64 %101
%103 = load i32, i32* %102
%104 = load i32, i32* %14
%105 = add nsw i32 %103, %104
%106 = call i32 @max4(i32 %91, i32 0, i32 %98, i32 %105)
%107 = add nsw i32 %106, 0
%108 = load i32*, i32** %6
%109 = load i32, i32* %16
%110 = sext i32 %109 to i64
%111 = getelementptr inbounds i32, i32* %108, i64 %110
store i32 %107, i32* %111
%112 = load i32*, i32** %6
%113 = load i32, i32* %19
%114 = sext i32 %113 to i64
%115 = getelementptr inbounds i32, i32* %112, i64 %114
%116 = load i32, i32* %115
%117 = load i32*, i32** %6
%118 = load i32, i32* %17
%119 = sext i32 %118 to i64
%120 = getelementptr inbounds i32, i32* %117, i64 %119
%121 = load i32, i32* %120
%122 = icmp sgt i32 %116, %121
br i1 %122, label %123, label %170
123: ; preds = %54
%124 = load i32*, i32** %6
%125 = load i32, i32* %18
%126 = sext i32 %125 to i64
%127 = getelementptr inbounds i32, i32* %124, i64 %126
%128 = load i32, i32* %127
%129 = load i32*, i32** %6
%130 = load i32, i32* %17
%131 = sext i32 %130 to i64
%132 = getelementptr inbounds i32, i32* %129, i64 %131
%133 = load i32, i32* %132
%134 = icmp sgt i32 %128, %133
br i1 %134, label %135, label %170
135: ; preds = %123
%136 = load i32*, i32** %6
%137 = load i32, i32* %19
%138 = sext i32 %137 to i64
%139 = getelementptr inbounds i32, i32* %136, i64 %138
%140 = load i32, i32* %139
%141 = load i32*, i32** %6
%142 = load i32, i32* %18
%143 = sext i32 %142 to i64
%144 = getelementptr inbounds i32, i32* %141, i64 %143
%145 = load i32, i32* %144
%146 = call i32 @max(i32 %140, i32 %145)
%147 = load i32*, i32** %6
%148 = load i32, i32* %17
%149 = sext i32 %148 to i64
%150 = getelementptr inbounds i32, i32* %147, i64 %149
store i32 %146, i32* %150
%151 = load i32*, i32** %6
%152 = load i32, i32* %17
%153 = sext i32 %152 to i64
%154 = getelementptr inbounds i32, i32* %151, i64 %153
%155 = load i32, i32* %154
%156 = load i32, i32* %12
%157 = load i32, i32* %13
%158 = call i32 @transposescore(i32 %156, i32 %157)
%159 = add nsw i32 %155, %158
%160 = load i32*, i32** %6
%161 = load i32, i32* %16
%162 = sext i32 %161 to i64
%163 = getelementptr inbounds i32, i32* %160, i64 %162
%164 = load i32, i32* %163
%165 = call i32 @max(i32 %159, i32 %164)
%166 = load i32*, i32** %6
%167 = load i32, i32* %16
%168 = sext i32 %167 to i64
%169 = getelementptr inbounds i32, i32* %166, i64 %168
store i32 %165, i32* %169
br label %170
170: ; preds = %135, %123, %54
br label %171
171: ; preds = %170, %31
br label %172
172: ; preds = %171
%173 = load i32, i32* %21
%174 = add nsw i32 %173, 1
store i32 %174, i32* %21
br label %27
175: ; preds = %27
br label %176
176: ; preds = %175
%177 = load i32, i32* %20
%178 = add nsw i32 %177, 1
store i32 %178, i32* %20
br label %22
179: ; preds = %22
%180 = load i32, i32* %11
ret i32 %180
}

LLVM IR (-O2):
define i32 @fillmatrix(i32* nocapture %0, i32 %1, i32 %2, i8* nocapture %3, i8* nocapture %4) {
%6 = icmp sgt i32 %2, 0
br i1 %6, label %7, label %20
7: ; preds = %5
%8 = icmp sgt i32 %1, 0
%9 = sext i32 %1 to i64
%10 = zext i32 %2 to i64
%11 = zext i32 %1 to i64
br label %12
12: ; preds = %7, %21
%13 = phi i64 [ 0, %7 ], [ %22, %21 ]
br i1 %8, label %14, label %21
14: ; preds = %12
%15 = add nsw i64 %13, -1
%16 = getelementptr inbounds i8, i8* %4, i64 %15
%17 = icmp ne i64 %13, 0
%18 = mul nsw i64 %13, %9
%19 = mul nsw i64 %15, %9
br label %24
20: ; preds = %21, %5
ret i32 0
21: ; preds = %64, %12
%22 = add nuw nsw i64 %13, 1
%23 = icmp eq i64 %22, %10
br i1 %23, label %20, label %12
24: ; preds = %14, %64
%25 = phi i64 [ 0, %14 ], [ %65, %64 ]
%26 = add nsw i64 %25, -1
%27 = getelementptr inbounds i8, i8* %3, i64 %26
%28 = load i8, i8* %27
%29 = sext i8 %28 to i32
%30 = load i8, i8* %16
%31 = sext i8 %30 to i32
%32 = icmp ne i64 %25, 0
%33 = and i1 %17, %32
br i1 %33, label %34, label %64
34: ; preds = %24
%35 = tail call i32 @gappedscore(i32 %29, i32 %31)
%36 = tail call i32 @characterscore(i32 %29, i32 %31)
%37 = add nsw i64 %25, %18
%38 = add nsw i64 %26, %19
%39 = add nsw i64 %26, %18
%40 = add nsw i64 %25, %19
%41 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 %38
%42 = load i32, i32* %41
%43 = add nsw i32 %42, %36
%44 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 %40
%45 = load i32, i32* %44
%46 = add nsw i32 %45, %35
%47 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 %39
%48 = load i32, i32* %47
%49 = add nsw i32 %48, %35
%50 = tail call i32 @max4(i32 %43, i32 0, i32 %46, i32 %49)
%51 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 %37
store i32 %50, i32* %51
%52 = load i32, i32* %44
%53 = load i32, i32* %41
%54 = icmp sgt i32 %52, %53
br i1 %54, label %55, label %64
55: ; preds = %34
%56 = load i32, i32* %47
%57 = icmp sgt i32 %56, %53
br i1 %57, label %58, label %64
58: ; preds = %55
%59 = tail call i32 @max(i32 %52, i32 %56)
store i32 %59, i32* %41
%60 = tail call i32 @transposescore(i32 %29, i32 %31)
%61 = add nsw i32 %60, %59
%62 = load i32, i32* %51
%63 = tail call i32 @max(i32 %61, i32 %62)
store i32 %63, i32* %51
br label %64
64: ; preds = %24, %58, %55, %34
%65 = add nuw nsw i64 %25, 1
%66 = icmp eq i64 %65, %11
br i1 %66, label %21, label %24
}