float score_ij_transitions(char **aseqs, int nseq, int M, int i, int j,
                           float transij[3][3]) {
  float score;
  int idx;
  int inscount;
  int pos;
  score = 0.0;
  for (idx = 0; idx < nseq; idx++) {
    if (i > 0 && aseqs[idx][i - 1] == ',')
      continue;
    if (j < M + 1 && aseqs[idx][j - 1] == ',')
      continue;
    inscount = 0;
    for (pos = i + 1; pos < j; pos++)
      if (!((aseqs[idx][pos - 1]) == ' ' || (aseqs[idx][pos - 1]) == '.' ||
            (aseqs[idx][pos - 1]) == '_' || (aseqs[idx][pos - 1]) == '-'))
        inscount++;
    if (inscount > 0) {
      score +=
          (i > 0 && ((aseqs[idx][i - 1]) == ' ' || (aseqs[idx][i - 1]) == '.' ||
                     (aseqs[idx][i - 1]) == '_' || (aseqs[idx][i - 1]) == '-'))
              ? transij[2][1]
              : transij[0][1];
      score += (j < M + 1 &&
                ((aseqs[idx][j - 1]) == ' ' || (aseqs[idx][j - 1]) == '.' ||
                 (aseqs[idx][j - 1]) == '_' || (aseqs[idx][j - 1]) == '-'))
                   ? transij[1][2]
                   : transij[1][0];
      score += transij[1][1] * (inscount - 1);
    } else {
      if (i > 0 && ((aseqs[idx][i - 1]) == ' ' || (aseqs[idx][i - 1]) == '.' ||
                    (aseqs[idx][i - 1]) == '_' || (aseqs[idx][i - 1]) == '-'))
        score += (j < M + 1 &&
                  ((aseqs[idx][j - 1]) == ' ' || (aseqs[idx][j - 1]) == '.' ||
                   (aseqs[idx][j - 1]) == '_' || (aseqs[idx][j - 1]) == '-'))
                     ? transij[2][2]
                     : transij[2][0];
      else
        score += (j < M + 1 &&
                  ((aseqs[idx][j - 1]) == ' ' || (aseqs[idx][j - 1]) == '.' ||
                   (aseqs[idx][j - 1]) == '_' || (aseqs[idx][j - 1]) == '-'))
                     ? transij[0][2]
                     : transij[0][0];
    }
  }
  return score;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<score_ij_transitions>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %esi,-0xc(%rbp)
mov    %edx,-0x10(%rbp)
mov    %ecx,-0x14(%rbp)
mov    %r8d,-0x18(%rbp)
mov    %r9,-0x20(%rbp)
xorps  %xmm0,%xmm0
movss  %xmm0,-0x24(%rbp)
movl   $0x0,-0x28(%rbp)
mov    -0x28(%rbp),%eax
cmp    -0xc(%rbp),%eax
jge    165c <score_ij_transitions+0x55c>
cmpl   $0x0,-0x14(%rbp)
jle    1165 <score_ij_transitions+0x65>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x14(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x2c,%eax
jne    1165 <score_ij_transitions+0x65>
jmp    164e <score_ij_transitions+0x54e>
mov    -0x18(%rbp),%eax
mov    -0x10(%rbp),%ecx
add    $0x1,%ecx
cmp    %ecx,%eax
jge    119d <score_ij_transitions+0x9d>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x2c,%eax
jne    119d <score_ij_transitions+0x9d>
jmp    164e <score_ij_transitions+0x54e>
movl   $0x0,-0x2c(%rbp)
mov    -0x14(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x30(%rbp)
mov    -0x30(%rbp),%eax
cmp    -0x18(%rbp),%eax
jge    125d <score_ij_transitions+0x15d>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x30(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x20,%eax
je     124a <score_ij_transitions+0x14a>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x30(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x2e,%eax
je     124a <score_ij_transitions+0x14a>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x30(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x5f,%eax
je     124a <score_ij_transitions+0x14a>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x30(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x2d,%eax
je     124a <score_ij_transitions+0x14a>
mov    -0x2c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
jmp    124f <score_ij_transitions+0x14f>
mov    -0x30(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x30(%rbp)
jmp    11ad <score_ij_transitions+0xad>
cmpl   $0x0,-0x2c(%rbp)
jle    141c <score_ij_transitions+0x31c>
cmpl   $0x0,-0x14(%rbp)
jle    130c <score_ij_transitions+0x20c>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x14(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x20,%eax
je     12f9 <score_ij_transitions+0x1f9>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x14(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x2e,%eax
je     12f9 <score_ij_transitions+0x1f9>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x14(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x5f,%eax
je     12f9 <score_ij_transitions+0x1f9>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x14(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x2d,%eax
jne    130c <score_ij_transitions+0x20c>
mov    -0x20(%rbp),%rax
movss  0x1c(%rax),%xmm0
movss  %xmm0,-0x34(%rbp)
jmp    131a <score_ij_transitions+0x21a>
mov    -0x20(%rbp),%rax
movss  0x4(%rax),%xmm0
movss  %xmm0,-0x34(%rbp)
movss  -0x34(%rbp),%xmm0
addss  -0x24(%rbp),%xmm0
movss  %xmm0,-0x24(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%eax
mov    -0x10(%rbp),%ecx
add    $0x1,%ecx
cmp    %ecx,%eax
jge    13d5 <score_ij_transitions+0x2d5>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x20,%eax
je     13c2 <score_ij_transitions+0x2c2>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x2e,%eax
je     13c2 <score_ij_transitions+0x2c2>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x5f,%eax
je     13c2 <score_ij_transitions+0x2c2>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x2d,%eax
jne    13d5 <score_ij_transitions+0x2d5>
mov    -0x20(%rbp),%rax
movss  0x14(%rax),%xmm0
movss  %xmm0,-0x38(%rbp)
jmp    13e3 <score_ij_transitions+0x2e3>
mov    -0x20(%rbp),%rax
movss  0xc(%rax),%xmm0
movss  %xmm0,-0x38(%rbp)
movss  -0x38(%rbp),%xmm0
addss  -0x24(%rbp),%xmm0
movss  %xmm0,-0x24(%rbp)
mov    -0x20(%rbp),%rax
movss  0x10(%rax),%xmm0
mov    -0x2c(%rbp),%eax
sub    $0x1,%eax
cvtsi2ss %eax,%xmm2
movss  -0x24(%rbp),%xmm1
mulss  %xmm2,%xmm0
addss  %xmm1,%xmm0
movss  %xmm0,-0x24(%rbp)
jmp    1649 <score_ij_transitions+0x549>
cmpl   $0x0,-0x14(%rbp)
jle    157c <score_ij_transitions+0x47c>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x14(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x20,%eax
je     14ae <score_ij_transitions+0x3ae>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x14(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x2e,%eax
je     14ae <score_ij_transitions+0x3ae>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x14(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x5f,%eax
je     14ae <score_ij_transitions+0x3ae>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x14(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x2d,%eax
jne    157c <score_ij_transitions+0x47c>
mov    -0x18(%rbp),%eax
mov    -0x10(%rbp),%ecx
add    $0x1,%ecx
cmp    %ecx,%eax
jge    155a <score_ij_transitions+0x45a>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x20,%eax
je     1547 <score_ij_transitions+0x447>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x2e,%eax
je     1547 <score_ij_transitions+0x447>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x5f,%eax
je     1547 <score_ij_transitions+0x447>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x2d,%eax
jne    155a <score_ij_transitions+0x45a>
mov    -0x20(%rbp),%rax
movss  0x20(%rax),%xmm0
movss  %xmm0,-0x3c(%rbp)
jmp    1568 <score_ij_transitions+0x468>
mov    -0x20(%rbp),%rax
movss  0x18(%rax),%xmm0
movss  %xmm0,-0x3c(%rbp)
movss  -0x3c(%rbp),%xmm0
addss  -0x24(%rbp),%xmm0
movss  %xmm0,-0x24(%rbp)
jmp    1644 <score_ij_transitions+0x544>
mov    -0x18(%rbp),%eax
mov    -0x10(%rbp),%ecx
add    $0x1,%ecx
cmp    %ecx,%eax
jge    1628 <score_ij_transitions+0x528>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x20,%eax
je     1615 <score_ij_transitions+0x515>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x2e,%eax
je     1615 <score_ij_transitions+0x515>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x5f,%eax
je     1615 <score_ij_transitions+0x515>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x2d,%eax
jne    1628 <score_ij_transitions+0x528>
mov    -0x20(%rbp),%rax
movss  0x8(%rax),%xmm0
movss  %xmm0,-0x40(%rbp)
jmp    1635 <score_ij_transitions+0x535>
mov    -0x20(%rbp),%rax
movss  (%rax),%xmm0
movss  %xmm0,-0x40(%rbp)
movss  -0x40(%rbp),%xmm0
addss  -0x24(%rbp),%xmm0
movss  %xmm0,-0x24(%rbp)
jmp    1649 <score_ij_transitions+0x549>
jmp    164e <score_ij_transitions+0x54e>
mov    -0x28(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x28(%rbp)
jmp    1128 <score_ij_transitions+0x28>
movss  -0x24(%rbp),%xmm0
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<score_ij_transitions>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
test   %esi,%esi
jle    1488 <score_ij_transitions+0x388>
mov    %edx,%r15d
lea    -0x1(%rcx),%edx
movslq %r8d,%r11
lea    0x1(%rcx),%r14d
lea    0x20(%r9),%rax
mov    %rax,-0x30(%rsp)
lea    0x18(%r9),%rax
mov    %rax,-0x50(%rsp)
lea    0x8(%r9),%rax
mov    %rax,-0x38(%rsp)
lea    0x14(%r9),%rax
mov    %rax,-0x40(%rsp)
lea    0xc(%r9),%rax
mov    %rax,-0x28(%rsp)
mov    %esi,%esi
mov    %ecx,%ebp
not    %ebp
add    %r8d,%ebp
mov    %r11d,%eax
sub    %ecx,%eax
add    $0xfffffffe,%eax
mov    %eax,-0x54(%rsp)
mov    %ebp,%eax
and    $0x3,%eax
mov    %eax,-0x64(%rsp)
mov    %r14,%rax
shl    $0x20,%rax
mov    %rax,-0x20(%rsp)
and    $0xfffffffc,%ebp
neg    %ebp
xorps  %xmm0,%xmm0
xor    %r13d,%r13d
movabs $0x8000000000006001,%r12
mov    %r9,-0x10(%rsp)
mov    %rdi,-0x18(%rsp)
mov    %r15d,-0x58(%rsp)
mov    %r11,-0x8(%rsp)
mov    %r14,-0x48(%rsp)
mov    %rsi,-0x60(%rsp)
jmp    11c4 <score_ij_transitions+0xc4>
mov    %r9,%rax
addss  (%rax),%xmm0
mov    -0x60(%rsp),%rsi
add    $0x1,%r13
cmp    %rsi,%r13
je     148b <score_ij_transitions+0x38b>
test   %ecx,%ecx
jle    11d2 <score_ij_transitions+0xd2>
mov    (%rdi,%r13,8),%rax
cmpb   $0x2c,(%rax,%rdx,1)
je     11b7 <score_ij_transitions+0xb7>
cmp    %r8d,%r15d
jl     11e3 <score_ij_transitions+0xe3>
mov    (%rdi,%r13,8),%rax
cmpb   $0x2c,-0x1(%rax,%r11,1)
je     11b7 <score_ij_transitions+0xb7>
cmp    %r8d,%r14d
jge    13c0 <score_ij_transitions+0x2c0>
xor    %r10d,%r10d
mov    (%rdi,%r13,8),%r11
mov    %r14,%rsi
mov    %ecx,%r14d
cmpl   $0x3,-0x54(%rsp)
jb     131d <score_ij_transitions+0x21d>
xor    %eax,%eax
mov    %rcx,%rdi
mov    -0x20(%rsp),%r15
mov    %edi,%r14d
xor    %r10d,%r10d
movabs $0x100000000,%rdi
jmp    124d <score_ij_transitions+0x14d>
add    $0x1,%r10d
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
xchg   %ax,%ax
add    $0x4,%r14d
add    $0xfffffffffffffffc,%rax
movabs $0x400000000,%rsi
add    %rsi,%r15
cmp    %eax,%ebp
je     1306 <score_ij_transitions+0x206>
movslq %r14d,%rbx
movzbl (%r11,%rbx,1),%r9d
add    $0xe0,%r9b
cmp    $0x3f,%r9b
ja     12e0 <score_ij_transitions+0x1e0>
movzbl %r9b,%ebx
bt     %rbx,%r12
jae    12e0 <score_ij_transitions+0x1e0>
mov    %r15,%rsi
sar    $0x20,%rsi
movzbl (%r11,%rsi,1),%ebx
add    $0xe0,%bl
cmp    $0x3f,%bl
ja     12f0 <score_ij_transitions+0x1f0>
movzbl %bl,%esi
bt     %rsi,%r12
jae    12f0 <score_ij_transitions+0x1f0>
lea    (%r15,%rdi,1),%rsi
sar    $0x20,%rsi
movzbl (%r11,%rsi,1),%ebx
add    $0xe0,%bl
cmp    $0x3f,%bl
ja     1300 <score_ij_transitions+0x200>
movzbl %bl,%esi
bt     %rsi,%r12
jae    1300 <score_ij_transitions+0x200>
movabs $0x200000000,%rsi
add    %r15,%rsi
sar    $0x20,%rsi
movzbl (%r11,%rsi,1),%ebx
add    $0xe0,%bl
cmp    $0x3f,%bl
ja     1220 <score_ij_transitions+0x120>
movzbl %bl,%esi
bt     %rsi,%r12
jb     1230 <score_ij_transitions+0x130>
jmp    1220 <score_ij_transitions+0x120>
nopl   0x0(%rax)
add    $0x1,%r10d
jmp    126d <score_ij_transitions+0x16d>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
add    $0x1,%r10d
jmp    128a <score_ij_transitions+0x18a>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
add    $0x1,%r10d
jmp    12a8 <score_ij_transitions+0x1a8>
mov    -0x48(%rsp),%rsi
sub    %rax,%rsi
mov    -0x10(%rsp),%r9
mov    -0x58(%rsp),%r15d
mov    -0x18(%rsp),%rdi
cmpl   $0x0,-0x64(%rsp)
je     1370 <score_ij_transitions+0x270>
mov    -0x64(%rsp),%eax
jmp    1349 <score_ij_transitions+0x249>
nopw   0x0(%rax,%rax,1)
add    $0x1,%r10d
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
xchg   %ax,%ax
lea    0x1(%r14),%esi
add    $0xffffffff,%eax
je     1370 <score_ij_transitions+0x270>
mov    %r14d,%ebx
movslq %r14d,%rbx
mov    %esi,%r14d
movzbl (%r11,%rbx,1),%ebx
add    $0xe0,%bl
cmp    $0x3f,%bl
ja     1330 <score_ij_transitions+0x230>
movzbl %bl,%esi
bt     %rsi,%r12
jb     1340 <score_ij_transitions+0x240>
jmp    1330 <score_ij_transitions+0x230>
nopw   0x0(%rax,%rax,1)
test   %r10d,%r10d
mov    -0x8(%rsp),%r11
mov    -0x48(%rsp),%r14
jle    13c0 <score_ij_transitions+0x2c0>
mov    %r9,%rax
test   %ecx,%ecx
jle    13a9 <score_ij_transitions+0x2a9>
mov    (%rdi,%r13,8),%rax
mov    (%rax,%rdx,1),%bl
add    $0xe0,%bl
mov    %r9,%rax
cmp    $0x3f,%bl
ja     13a9 <score_ij_transitions+0x2a9>
movzbl %bl,%eax
bt     %rax,%r12
mov    %r9,%rax
jae    13a9 <score_ij_transitions+0x2a9>
mov    -0x50(%rsp),%rax
cmp    %r8d,%r15d
jge    143d <score_ij_transitions+0x33d>
mov    -0x28(%rsp),%rsi
jmp    1464 <score_ij_transitions+0x364>
nopl   0x0(%rax)
test   %ecx,%ecx
jle    13eb <score_ij_transitions+0x2eb>
mov    (%rdi,%r13,8),%rax
mov    (%rax,%rdx,1),%bl
add    $0xe0,%bl
cmp    $0x3f,%bl
ja     13eb <score_ij_transitions+0x2eb>
movzbl %bl,%esi
bt     %rsi,%r12
jae    13eb <score_ij_transitions+0x2eb>
cmp    %r8d,%r15d
jge    141e <score_ij_transitions+0x31e>
mov    -0x50(%rsp),%rax
jmp    11ae <score_ij_transitions+0xae>
cmp    %r8d,%r15d
jl     11ab <score_ij_transitions+0xab>
mov    (%rdi,%r13,8),%rax
mov    -0x1(%rax,%r11,1),%al
add    $0xe0,%al
cmp    $0x3f,%al
ja     11ab <score_ij_transitions+0xab>
movzbl %al,%eax
bt     %rax,%r12
mov    -0x38(%rsp),%rax
jb     11ae <score_ij_transitions+0xae>
jmp    11ab <score_ij_transitions+0xab>
mov    -0x1(%rax,%r11,1),%al
add    $0xe0,%al
cmp    $0x3f,%al
ja     13e1 <score_ij_transitions+0x2e1>
movzbl %al,%eax
bt     %rax,%r12
mov    -0x30(%rsp),%rax
jb     11ae <score_ij_transitions+0xae>
jmp    13e1 <score_ij_transitions+0x2e1>
mov    (%rdi,%r13,8),%rsi
mov    -0x1(%rsi,%r11,1),%bl
add    $0xe0,%bl
cmp    $0x3f,%bl
ja     13b2 <score_ij_transitions+0x2b2>
movzbl %bl,%esi
bt     %rsi,%r12
mov    -0x40(%rsp),%rsi
jae    13b2 <score_ij_transitions+0x2b2>
addss  0x4(%rax),%xmm0
addss  (%rsi),%xmm0
add    $0xffffffff,%r10d
xorps  %xmm1,%xmm1
cvtsi2ss %r10d,%xmm1
mulss  0x10(%r9),%xmm1
addss  %xmm1,%xmm0
jmp    11b2 <score_ij_transitions+0xb2>
xorps  %xmm0,%xmm0
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define float @score_ij_transitions(i8** %0, i32 %1, i32 %2, i32 %3, i32 %4, [3 x float]* %5) {
%7 = alloca i8**
%8 = alloca i32
%9 = alloca i32
%10 = alloca i32
%11 = alloca i32
%12 = alloca [3 x float]*
%13 = alloca float
%14 = alloca i32
%15 = alloca i32
%16 = alloca i32
store i8** %0, i8*** %7
store i32 %1, i32* %8
store i32 %2, i32* %9
store i32 %3, i32* %10
store i32 %4, i32* %11
store [3 x float]* %5, [3 x float]** %12
store float 0.000000e+00, float* %13
store i32 0, i32* %14
br label %17
17: ; preds = %473, %6
%18 = load i32, i32* %14
%19 = load i32, i32* %8
%20 = icmp slt i32 %18, %19
br i1 %20, label %21, label %476
21: ; preds = %17
%22 = load i32, i32* %10
%23 = icmp sgt i32 %22, 0
br i1 %23, label %24, label %38
24: ; preds = %21
%25 = load i8**, i8*** %7
%26 = load i32, i32* %14
%27 = sext i32 %26 to i64
%28 = getelementptr inbounds i8*, i8** %25, i64 %27
%29 = load i8*, i8** %28
%30 = load i32, i32* %10
%31 = sub nsw i32 %30, 1
%32 = sext i32 %31 to i64
%33 = getelementptr inbounds i8, i8* %29, i64 %32
%34 = load i8, i8* %33
%35 = sext i8 %34 to i32
%36 = icmp eq i32 %35, 44
br i1 %36, label %37, label %38
37: ; preds = %24
br label %473
38: ; preds = %24, %21
%39 = load i32, i32* %11
%40 = load i32, i32* %9
%41 = add nsw i32 %40, 1
%42 = icmp slt i32 %39, %41
br i1 %42, label %43, label %57
43: ; preds = %38
%44 = load i8**, i8*** %7
%45 = load i32, i32* %14
%46 = sext i32 %45 to i64
%47 = getelementptr inbounds i8*, i8** %44, i64 %46
%48 = load i8*, i8** %47
%49 = load i32, i32* %11
%50 = sub nsw i32 %49, 1
%51 = sext i32 %50 to i64
%52 = getelementptr inbounds i8, i8* %48, i64 %51
%53 = load i8, i8* %52
%54 = sext i8 %53 to i32
%55 = icmp eq i32 %54, 44
br i1 %55, label %56, label %57
56: ; preds = %43
br label %473
57: ; preds = %43, %38
store i32 0, i32* %15
%58 = load i32, i32* %10
%59 = add nsw i32 %58, 1
store i32 %59, i32* %16
br label %60
60: ; preds = %120, %57
%61 = load i32, i32* %16
%62 = load i32, i32* %11
%63 = icmp slt i32 %61, %62
br i1 %63, label %64, label %123
64: ; preds = %60
%65 = load i8**, i8*** %7
%66 = load i32, i32* %14
%67 = sext i32 %66 to i64
%68 = getelementptr inbounds i8*, i8** %65, i64 %67
%69 = load i8*, i8** %68
%70 = load i32, i32* %16
%71 = sub nsw i32 %70, 1
%72 = sext i32 %71 to i64
%73 = getelementptr inbounds i8, i8* %69, i64 %72
%74 = load i8, i8* %73
%75 = sext i8 %74 to i32
%76 = icmp eq i32 %75, 32
br i1 %76, label %119, label %77
77: ; preds = %64
%78 = load i8**, i8*** %7
%79 = load i32, i32* %14
%80 = sext i32 %79 to i64
%81 = getelementptr inbounds i8*, i8** %78, i64 %80
%82 = load i8*, i8** %81
%83 = load i32, i32* %16
%84 = sub nsw i32 %83, 1
%85 = sext i32 %84 to i64
%86 = getelementptr inbounds i8, i8* %82, i64 %85
%87 = load i8, i8* %86
%88 = sext i8 %87 to i32
%89 = icmp eq i32 %88, 46
br i1 %89, label %119, label %90
90: ; preds = %77
%91 = load i8**, i8*** %7
%92 = load i32, i32* %14
%93 = sext i32 %92 to i64
%94 = getelementptr inbounds i8*, i8** %91, i64 %93
%95 = load i8*, i8** %94
%96 = load i32, i32* %16
%97 = sub nsw i32 %96, 1
%98 = sext i32 %97 to i64
%99 = getelementptr inbounds i8, i8* %95, i64 %98
%100 = load i8, i8* %99
%101 = sext i8 %100 to i32
%102 = icmp eq i32 %101, 95
br i1 %102, label %119, label %103
103: ; preds = %90
%104 = load i8**, i8*** %7
%105 = load i32, i32* %14
%106 = sext i32 %105 to i64
%107 = getelementptr inbounds i8*, i8** %104, i64 %106
%108 = load i8*, i8** %107
%109 = load i32, i32* %16
%110 = sub nsw i32 %109, 1
%111 = sext i32 %110 to i64
%112 = getelementptr inbounds i8, i8* %108, i64 %111
%113 = load i8, i8* %112
%114 = sext i8 %113 to i32
%115 = icmp eq i32 %114, 45
br i1 %115, label %119, label %116
116: ; preds = %103
%117 = load i32, i32* %15
%118 = add nsw i32 %117, 1
store i32 %118, i32* %15
br label %119
119: ; preds = %116, %103, %90, %77, %64
br label %120
120: ; preds = %119
%121 = load i32, i32* %16
%122 = add nsw i32 %121, 1
store i32 %122, i32* %16
br label %60
123: ; preds = %60
%124 = load i32, i32* %15
%125 = icmp sgt i32 %124, 0
br i1 %125, label %126, label %274
126: ; preds = %123
%127 = load i32, i32* %10
%128 = icmp sgt i32 %127, 0
br i1 %128, label %129, label %186
129: ; preds = %126
%130 = load i8**, i8*** %7
%131 = load i32, i32* %14
%132 = sext i32 %131 to i64
%133 = getelementptr inbounds i8*, i8** %130, i64 %132
%134 = load i8*, i8** %133
%135 = load i32, i32* %10
%136 = sub nsw i32 %135, 1
%137 = sext i32 %136 to i64
%138 = getelementptr inbounds i8, i8* %134, i64 %137
%139 = load i8, i8* %138
%140 = sext i8 %139 to i32
%141 = icmp eq i32 %140, 32
br i1 %141, label %181, label %142
142: ; preds = %129
%143 = load i8**, i8*** %7
%144 = load i32, i32* %14
%145 = sext i32 %144 to i64
%146 = getelementptr inbounds i8*, i8** %143, i64 %145
%147 = load i8*, i8** %146
%148 = load i32, i32* %10
%149 = sub nsw i32 %148, 1
%150 = sext i32 %149 to i64
%151 = getelementptr inbounds i8, i8* %147, i64 %150
%152 = load i8, i8* %151
%153 = sext i8 %152 to i32
%154 = icmp eq i32 %153, 46
br i1 %154, label %181, label %155
155: ; preds = %142
%156 = load i8**, i8*** %7
%157 = load i32, i32* %14
%158 = sext i32 %157 to i64
%159 = getelementptr inbounds i8*, i8** %156, i64 %158
%160 = load i8*, i8** %159
%161 = load i32, i32* %10
%162 = sub nsw i32 %161, 1
%163 = sext i32 %162 to i64
%164 = getelementptr inbounds i8, i8* %160, i64 %163
%165 = load i8, i8* %164
%166 = sext i8 %165 to i32
%167 = icmp eq i32 %166, 95
br i1 %167, label %181, label %168
168: ; preds = %155
%169 = load i8**, i8*** %7
%170 = load i32, i32* %14
%171 = sext i32 %170 to i64
%172 = getelementptr inbounds i8*, i8** %169, i64 %171
%173 = load i8*, i8** %172
%174 = load i32, i32* %10
%175 = sub nsw i32 %174, 1
%176 = sext i32 %175 to i64
%177 = getelementptr inbounds i8, i8* %173, i64 %176
%178 = load i8, i8* %177
%179 = sext i8 %178 to i32
%180 = icmp eq i32 %179, 45
br i1 %180, label %181, label %186
181: ; preds = %168, %155, %142, %129
%182 = load [3 x float]*, [3 x float]** %12
%183 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %182, i64 2
%184 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %183, i64 0, i64 1
%185 = load float, float* %184
br label %191
186: ; preds = %168, %126
%187 = load [3 x float]*, [3 x float]** %12
%188 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %187, i64 0
%189 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %188, i64 0, i64 1
%190 = load float, float* %189
br label %191
191: ; preds = %186, %181
%192 = phi float [ %185, %181 ], [ %190, %186 ]
%193 = load float, float* %13
%194 = fadd float %193, %192
store float %194, float* %13
%195 = load i32, i32* %11
%196 = load i32, i32* %9
%197 = add nsw i32 %196, 1
%198 = icmp slt i32 %195, %197
br i1 %198, label %199, label %256
199: ; preds = %191
%200 = load i8**, i8*** %7
%201 = load i32, i32* %14
%202 = sext i32 %201 to i64
%203 = getelementptr inbounds i8*, i8** %200, i64 %202
%204 = load i8*, i8** %203
%205 = load i32, i32* %11
%206 = sub nsw i32 %205, 1
%207 = sext i32 %206 to i64
%208 = getelementptr inbounds i8, i8* %204, i64 %207
%209 = load i8, i8* %208
%210 = sext i8 %209 to i32
%211 = icmp eq i32 %210, 32
br i1 %211, label %251, label %212
212: ; preds = %199
%213 = load i8**, i8*** %7
%214 = load i32, i32* %14
%215 = sext i32 %214 to i64
%216 = getelementptr inbounds i8*, i8** %213, i64 %215
%217 = load i8*, i8** %216
%218 = load i32, i32* %11
%219 = sub nsw i32 %218, 1
%220 = sext i32 %219 to i64
%221 = getelementptr inbounds i8, i8* %217, i64 %220
%222 = load i8, i8* %221
%223 = sext i8 %222 to i32
%224 = icmp eq i32 %223, 46
br i1 %224, label %251, label %225
225: ; preds = %212
%226 = load i8**, i8*** %7
%227 = load i32, i32* %14
%228 = sext i32 %227 to i64
%229 = getelementptr inbounds i8*, i8** %226, i64 %228
%230 = load i8*, i8** %229
%231 = load i32, i32* %11
%232 = sub nsw i32 %231, 1
%233 = sext i32 %232 to i64
%234 = getelementptr inbounds i8, i8* %230, i64 %233
%235 = load i8, i8* %234
%236 = sext i8 %235 to i32
%237 = icmp eq i32 %236, 95
br i1 %237, label %251, label %238
238: ; preds = %225
%239 = load i8**, i8*** %7
%240 = load i32, i32* %14
%241 = sext i32 %240 to i64
%242 = getelementptr inbounds i8*, i8** %239, i64 %241
%243 = load i8*, i8** %242
%244 = load i32, i32* %11
%245 = sub nsw i32 %244, 1
%246 = sext i32 %245 to i64
%247 = getelementptr inbounds i8, i8* %243, i64 %246
%248 = load i8, i8* %247
%249 = sext i8 %248 to i32
%250 = icmp eq i32 %249, 45
br i1 %250, label %251, label %256
251: ; preds = %238, %225, %212, %199
%252 = load [3 x float]*, [3 x float]** %12
%253 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %252, i64 1
%254 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %253, i64 0, i64 2
%255 = load float, float* %254
br label %261
256: ; preds = %238, %191
%257 = load [3 x float]*, [3 x float]** %12
%258 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %257, i64 1
%259 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %258, i64 0, i64 0
%260 = load float, float* %259
br label %261
261: ; preds = %256, %251
%262 = phi float [ %255, %251 ], [ %260, %256 ]
%263 = load float, float* %13
%264 = fadd float %263, %262
store float %264, float* %13
%265 = load [3 x float]*, [3 x float]** %12
%266 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %265, i64 1
%267 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %266, i64 0, i64 1
%268 = load float, float* %267
%269 = load i32, i32* %15
%270 = sub nsw i32 %269, 1
%271 = sitofp i32 %270 to float
%272 = load float, float* %13
%273 = call float @llvm.fmuladd.f32(float %268, float %271, float %272)
store float %273, float* %13
br label %472
274: ; preds = %123
%275 = load i32, i32* %10
%276 = icmp sgt i32 %275, 0
br i1 %276, label %277, label %400
277: ; preds = %274
%278 = load i8**, i8*** %7
%279 = load i32, i32* %14
%280 = sext i32 %279 to i64
%281 = getelementptr inbounds i8*, i8** %278, i64 %280
%282 = load i8*, i8** %281
%283 = load i32, i32* %10
%284 = sub nsw i32 %283, 1
%285 = sext i32 %284 to i64
%286 = getelementptr inbounds i8, i8* %282, i64 %285
%287 = load i8, i8* %286
%288 = sext i8 %287 to i32
%289 = icmp eq i32 %288, 32
br i1 %289, label %329, label %290
290: ; preds = %277
%291 = load i8**, i8*** %7
%292 = load i32, i32* %14
%293 = sext i32 %292 to i64
%294 = getelementptr inbounds i8*, i8** %291, i64 %293
%295 = load i8*, i8** %294
%296 = load i32, i32* %10
%297 = sub nsw i32 %296, 1
%298 = sext i32 %297 to i64
%299 = getelementptr inbounds i8, i8* %295, i64 %298
%300 = load i8, i8* %299
%301 = sext i8 %300 to i32
%302 = icmp eq i32 %301, 46
br i1 %302, label %329, label %303
303: ; preds = %290
%304 = load i8**, i8*** %7
%305 = load i32, i32* %14
%306 = sext i32 %305 to i64
%307 = getelementptr inbounds i8*, i8** %304, i64 %306
%308 = load i8*, i8** %307
%309 = load i32, i32* %10
%310 = sub nsw i32 %309, 1
%311 = sext i32 %310 to i64
%312 = getelementptr inbounds i8, i8* %308, i64 %311
%313 = load i8, i8* %312
%314 = sext i8 %313 to i32
%315 = icmp eq i32 %314, 95
br i1 %315, label %329, label %316
316: ; preds = %303
%317 = load i8**, i8*** %7
%318 = load i32, i32* %14
%319 = sext i32 %318 to i64
%320 = getelementptr inbounds i8*, i8** %317, i64 %319
%321 = load i8*, i8** %320
%322 = load i32, i32* %10
%323 = sub nsw i32 %322, 1
%324 = sext i32 %323 to i64
%325 = getelementptr inbounds i8, i8* %321, i64 %324
%326 = load i8, i8* %325
%327 = sext i8 %326 to i32
%328 = icmp eq i32 %327, 45
br i1 %328, label %329, label %400
329: ; preds = %316, %303, %290, %277
%330 = load i32, i32* %11
%331 = load i32, i32* %9
%332 = add nsw i32 %331, 1
%333 = icmp slt i32 %330, %332
br i1 %333, label %334, label %391
334: ; preds = %329
%335 = load i8**, i8*** %7
%336 = load i32, i32* %14
%337 = sext i32 %336 to i64
%338 = getelementptr inbounds i8*, i8** %335, i64 %337
%339 = load i8*, i8** %338
%340 = load i32, i32* %11
%341 = sub nsw i32 %340, 1
%342 = sext i32 %341 to i64
%343 = getelementptr inbounds i8, i8* %339, i64 %342
%344 = load i8, i8* %343
%345 = sext i8 %344 to i32
%346 = icmp eq i32 %345, 32
br i1 %346, label %386, label %347
347: ; preds = %334
%348 = load i8**, i8*** %7
%349 = load i32, i32* %14
%350 = sext i32 %349 to i64
%351 = getelementptr inbounds i8*, i8** %348, i64 %350
%352 = load i8*, i8** %351
%353 = load i32, i32* %11
%354 = sub nsw i32 %353, 1
%355 = sext i32 %354 to i64
%356 = getelementptr inbounds i8, i8* %352, i64 %355
%357 = load i8, i8* %356
%358 = sext i8 %357 to i32
%359 = icmp eq i32 %358, 46
br i1 %359, label %386, label %360
360: ; preds = %347
%361 = load i8**, i8*** %7
%362 = load i32, i32* %14
%363 = sext i32 %362 to i64
%364 = getelementptr inbounds i8*, i8** %361, i64 %363
%365 = load i8*, i8** %364
%366 = load i32, i32* %11
%367 = sub nsw i32 %366, 1
%368 = sext i32 %367 to i64
%369 = getelementptr inbounds i8, i8* %365, i64 %368
%370 = load i8, i8* %369
%371 = sext i8 %370 to i32
%372 = icmp eq i32 %371, 95
br i1 %372, label %386, label %373
373: ; preds = %360
%374 = load i8**, i8*** %7
%375 = load i32, i32* %14
%376 = sext i32 %375 to i64
%377 = getelementptr inbounds i8*, i8** %374, i64 %376
%378 = load i8*, i8** %377
%379 = load i32, i32* %11
%380 = sub nsw i32 %379, 1
%381 = sext i32 %380 to i64
%382 = getelementptr inbounds i8, i8* %378, i64 %381
%383 = load i8, i8* %382
%384 = sext i8 %383 to i32
%385 = icmp eq i32 %384, 45
br i1 %385, label %386, label %391
386: ; preds = %373, %360, %347, %334
%387 = load [3 x float]*, [3 x float]** %12
%388 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %387, i64 2
%389 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %388, i64 0, i64 2
%390 = load float, float* %389
br label %396
391: ; preds = %373, %329
%392 = load [3 x float]*, [3 x float]** %12
%393 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %392, i64 2
%394 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %393, i64 0, i64 0
%395 = load float, float* %394
br label %396
396: ; preds = %391, %386
%397 = phi float [ %390, %386 ], [ %395, %391 ]
%398 = load float, float* %13
%399 = fadd float %398, %397
store float %399, float* %13
br label %471
400: ; preds = %316, %274
%401 = load i32, i32* %11
%402 = load i32, i32* %9
%403 = add nsw i32 %402, 1
%404 = icmp slt i32 %401, %403
br i1 %404, label %405, label %462
405: ; preds = %400
%406 = load i8**, i8*** %7
%407 = load i32, i32* %14
%408 = sext i32 %407 to i64
%409 = getelementptr inbounds i8*, i8** %406, i64 %408
%410 = load i8*, i8** %409
%411 = load i32, i32* %11
%412 = sub nsw i32 %411, 1
%413 = sext i32 %412 to i64
%414 = getelementptr inbounds i8, i8* %410, i64 %413
%415 = load i8, i8* %414
%416 = sext i8 %415 to i32
%417 = icmp eq i32 %416, 32
br i1 %417, label %457, label %418
418: ; preds = %405
%419 = load i8**, i8*** %7
%420 = load i32, i32* %14
%421 = sext i32 %420 to i64
%422 = getelementptr inbounds i8*, i8** %419, i64 %421
%423 = load i8*, i8** %422
%424 = load i32, i32* %11
%425 = sub nsw i32 %424, 1
%426 = sext i32 %425 to i64
%427 = getelementptr inbounds i8, i8* %423, i64 %426
%428 = load i8, i8* %427
%429 = sext i8 %428 to i32
%430 = icmp eq i32 %429, 46
br i1 %430, label %457, label %431
431: ; preds = %418
%432 = load i8**, i8*** %7
%433 = load i32, i32* %14
%434 = sext i32 %433 to i64
%435 = getelementptr inbounds i8*, i8** %432, i64 %434
%436 = load i8*, i8** %435
%437 = load i32, i32* %11
%438 = sub nsw i32 %437, 1
%439 = sext i32 %438 to i64
%440 = getelementptr inbounds i8, i8* %436, i64 %439
%441 = load i8, i8* %440
%442 = sext i8 %441 to i32
%443 = icmp eq i32 %442, 95
br i1 %443, label %457, label %444
444: ; preds = %431
%445 = load i8**, i8*** %7
%446 = load i32, i32* %14
%447 = sext i32 %446 to i64
%448 = getelementptr inbounds i8*, i8** %445, i64 %447
%449 = load i8*, i8** %448
%450 = load i32, i32* %11
%451 = sub nsw i32 %450, 1
%452 = sext i32 %451 to i64
%453 = getelementptr inbounds i8, i8* %449, i64 %452
%454 = load i8, i8* %453
%455 = sext i8 %454 to i32
%456 = icmp eq i32 %455, 45
br i1 %456, label %457, label %462
457: ; preds = %444, %431, %418, %405
%458 = load [3 x float]*, [3 x float]** %12
%459 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %458, i64 0
%460 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %459, i64 0, i64 2
%461 = load float, float* %460
br label %467
462: ; preds = %444, %400
%463 = load [3 x float]*, [3 x float]** %12
%464 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %463, i64 0
%465 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %464, i64 0, i64 0
%466 = load float, float* %465
br label %467
467: ; preds = %462, %457
%468 = phi float [ %461, %457 ], [ %466, %462 ]
%469 = load float, float* %13
%470 = fadd float %469, %468
store float %470, float* %13
br label %471
471: ; preds = %467, %396
br label %472
472: ; preds = %471, %261
br label %473
473: ; preds = %472, %56, %37
%474 = load i32, i32* %14
%475 = add nsw i32 %474, 1
store i32 %475, i32* %14
br label %17
476: ; preds = %17
%477 = load float, float* %13
ret float %477
}

LLVM IR (-O2):
define float @score_ij_transitions(i8** nocapture %0, i32 %1, i32 %2, i32 %3, i32 %4, [3 x float]* nocapture %5) {
%7 = icmp sgt i32 %1, 0
br i1 %7, label %8, label %178
8: ; preds = %6
%9 = icmp sgt i32 %3, 0
%10 = add nsw i32 %3, -1
%11 = zext i32 %10 to i64
%12 = icmp slt i32 %2, %4
%13 = add nsw i32 %4, -1
%14 = sext i32 %13 to i64
%15 = add i32 %3, 1
%16 = icmp slt i32 %15, %4
%17 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %5, i64 2, i64 2
%18 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %5, i64 2, i64 0
%19 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %5, i64 0, i64 2
%20 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %5, i64 0, i64 0
%21 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %5, i64 2
%22 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %5, i64 1, i64 2
%23 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %5, i64 1, i64 0
%24 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %5, i64 1, i64 1
%25 = zext i32 %15 to i64
%26 = zext i32 %1 to i64
%27 = xor i32 %3, -1
%28 = add i32 %27, %4
%29 = add i32 %4, -2
%30 = sub i32 %29, %3
%31 = and i32 %28, 3
%32 = icmp ult i32 %30, 3
%33 = and i32 %28, -4
%34 = icmp eq i32 %31, 0
br label %35
35: ; preds = %8, %174
%36 = phi i64 [ 0, %8 ], [ %176, %174 ]
%37 = phi float [ 0.000000e+00, %8 ], [ %175, %174 ]
br i1 %9, label %38, label %44
38: ; preds = %35
%39 = getelementptr inbounds i8*, i8** %0, i64 %36
%40 = load i8*, i8** %39
%41 = getelementptr inbounds i8, i8* %40, i64 %11
%42 = load i8, i8* %41
%43 = icmp eq i8 %42, 44
br i1 %43, label %174, label %44
44: ; preds = %38, %35
br i1 %12, label %51, label %45
45: ; preds = %44
%46 = getelementptr inbounds i8*, i8** %0, i64 %36
%47 = load i8*, i8** %46
%48 = getelementptr inbounds i8, i8* %47, i64 %14
%49 = load i8, i8* %48
%50 = icmp eq i8 %49, 44
br i1 %50, label %174, label %51
51: ; preds = %45, %44
br i1 %16, label %52, label %148
52: ; preds = %51
%53 = getelementptr inbounds i8*, i8** %0, i64 %36
%54 = load i8*, i8** %53
br i1 %32, label %98, label %55
55: ; preds = %52, %91
%56 = phi i64 [ %93, %91 ], [ %25, %52 ]
%57 = phi i32 [ %95, %91 ], [ %3, %52 ]
%58 = phi i32 [ %92, %91 ], [ 0, %52 ]
%59 = phi i32 [ %96, %91 ], [ 0, %52 ]
%60 = sext i32 %57 to i64
%61 = getelementptr inbounds i8, i8* %54, i64 %60
%62 = load i8, i8* %61
switch i8 %62, label %63 [
i8 32, label %65
i8 46, label %65
i8 95, label %65
i8 45, label %65
]
63: ; preds = %55
%64 = add nsw i32 %58, 1
br label %65
65: ; preds = %55, %55, %55, %55, %63
%66 = phi i32 [ %58, %55 ], [ %64, %63 ], [ %58, %55 ], [ %58, %55 ], [ %58, %55 ]
%67 = shl i64 %56, 32
%68 = ashr exact i64 %67, 32
%69 = getelementptr inbounds i8, i8* %54, i64 %68
%70 = load i8, i8* %69
switch i8 %70, label %71 [
i8 32, label %73
i8 46, label %73
i8 95, label %73
i8 45, label %73
]
71: ; preds = %65
%72 = add nsw i32 %66, 1
br label %73
73: ; preds = %71, %65, %65, %65, %65
%74 = phi i32 [ %66, %65 ], [ %72, %71 ], [ %66, %65 ], [ %66, %65 ], [ %66, %65 ]
%75 = shl i64 %56, 32
%76 = add i64 %75, 4294967296
%77 = ashr exact i64 %76, 32
%78 = getelementptr inbounds i8, i8* %54, i64 %77
%79 = load i8, i8* %78
switch i8 %79, label %80 [
i8 32, label %82
i8 46, label %82
i8 95, label %82
i8 45, label %82
]
80: ; preds = %73
%81 = add nsw i32 %74, 1
br label %82
82: ; preds = %80, %73, %73, %73, %73
%83 = phi i32 [ %74, %73 ], [ %81, %80 ], [ %74, %73 ], [ %74, %73 ], [ %74, %73 ]
%84 = shl i64 %56, 32
%85 = add i64 %84, 8589934592
%86 = ashr exact i64 %85, 32
%87 = getelementptr inbounds i8, i8* %54, i64 %86
%88 = load i8, i8* %87
switch i8 %88, label %89 [
i8 32, label %91
i8 46, label %91
i8 95, label %91
i8 45, label %91
]
89: ; preds = %82
%90 = add nsw i32 %83, 1
br label %91
91: ; preds = %89, %82, %82, %82, %82
%92 = phi i32 [ %83, %82 ], [ %90, %89 ], [ %83, %82 ], [ %83, %82 ], [ %83, %82 ]
%93 = add nuw nsw i64 %56, 4
%94 = trunc i64 %56 to i32
%95 = add i32 %94, 3
%96 = add i32 %59, 4
%97 = icmp eq i32 %96, %33
br i1 %97, label %98, label %55
98: ; preds = %91, %52
%99 = phi i32 [ undef, %52 ], [ %92, %91 ]
%100 = phi i64 [ %25, %52 ], [ %93, %91 ]
%101 = phi i32 [ %3, %52 ], [ %95, %91 ]
%102 = phi i32 [ 0, %52 ], [ %92, %91 ]
br i1 %34, label %119, label %103
103: ; preds = %98, %113
%104 = phi i64 [ %115, %113 ], [ %100, %98 ]
%105 = phi i32 [ %116, %113 ], [ %101, %98 ]
%106 = phi i32 [ %114, %113 ], [ %102, %98 ]
%107 = phi i32 [ %117, %113 ], [ 0, %98 ]
%108 = sext i32 %105 to i64
%109 = getelementptr inbounds i8, i8* %54, i64 %108
%110 = load i8, i8* %109
switch i8 %110, label %111 [
i8 32, label %113
i8 46, label %113
i8 95, label %113
i8 45, label %113
]
111: ; preds = %103
%112 = add nsw i32 %106, 1
br label %113
113: ; preds = %111, %103, %103, %103, %103
%114 = phi i32 [ %106, %103 ], [ %112, %111 ], [ %106, %103 ], [ %106, %103 ], [ %106, %103 ]
%115 = add i64 %104, 1
%116 = trunc i64 %104 to i32
%117 = add i32 %107, 1
%118 = icmp eq i32 %117, %31
br i1 %118, label %119, label %103
119: ; preds = %113, %98
%120 = phi i32 [ %99, %98 ], [ %114, %113 ]
%121 = icmp sgt i32 %120, 0
br i1 %121, label %122, label %148
122: ; preds = %119
br i1 %9, label %123, label %129
123: ; preds = %122
%124 = getelementptr inbounds i8*, i8** %0, i64 %36
%125 = load i8*, i8** %124
%126 = getelementptr inbounds i8, i8* %125, i64 %11
%127 = load i8, i8* %126
switch i8 %127, label %129 [
i8 32, label %128
i8 46, label %128
i8 95, label %128
i8 45, label %128
]
128: ; preds = %123, %123, %123, %123
br label %129
129: ; preds = %122, %123, %128
%130 = phi [3 x float]* [ %21, %128 ], [ %5, %123 ], [ %5, %122 ]
%131 = getelementptr inbounds [3 x float], [3 x float]* %130, i64 0, i64 1
%132 = load float, float* %131
%133 = fadd float %37, %132
br i1 %12, label %139, label %134
134: ; preds = %129
%135 = getelementptr inbounds i8*, i8** %0, i64 %36
%136 = load i8*, i8** %135
%137 = getelementptr inbounds i8, i8* %136, i64 %14
%138 = load i8, i8* %137
switch i8 %138, label %139 [
i8 32, label %140
i8 46, label %140
i8 95, label %140
i8 45, label %140
]
139: ; preds = %134, %129
br label %140
140: ; preds = %134, %134, %134, %134, %139
%141 = phi float* [ %23, %139 ], [ %22, %134 ], [ %22, %134 ], [ %22, %134 ], [ %22, %134 ]
%142 = load float, float* %141
%143 = fadd float %133, %142
%144 = load float, float* %24
%145 = add nsw i32 %120, -1
%146 = sitofp i32 %145 to float
%147 = tail call float @llvm.fmuladd.f32(float %144, float %146, float %143)
br label %174
148: ; preds = %51, %119
br i1 %9, label %149, label %163
149: ; preds = %148
%150 = getelementptr inbounds i8*, i8** %0, i64 %36
%151 = load i8*, i8** %150
%152 = getelementptr inbounds i8, i8* %151, i64 %11
%153 = load i8, i8* %152
switch i8 %153, label %163 [
i8 32, label %154
i8 46, label %154
i8 95, label %154
i8 45, label %154
]
154: ; preds = %149, %149, %149, %149
br i1 %12, label %158, label %155
155: ; preds = %154
%156 = getelementptr inbounds i8, i8* %151, i64 %14
%157 = load i8, i8* %156
switch i8 %157, label %158 [
i8 32, label %159
i8 46, label %159
i8 95, label %159
i8 45, label %159
]
158: ; preds = %155, %154
br label %159
159: ; preds = %155, %155, %155, %155, %158
%160 = phi float* [ %18, %158 ], [ %17, %155 ], [ %17, %155 ], [ %17, %155 ], [ %17, %155 ]
%161 = load float, float* %160
%162 = fadd float %37, %161
br label %174
163: ; preds = %149, %148
br i1 %12, label %169, label %164
164: ; preds = %163
%165 = getelementptr inbounds i8*, i8** %0, i64 %36
%166 = load i8*, i8** %165
%167 = getelementptr inbounds i8, i8* %166, i64 %14
%168 = load i8, i8* %167
switch i8 %168, label %169 [
i8 32, label %170
i8 46, label %170
i8 95, label %170
i8 45, label %170
]
169: ; preds = %164, %163
br label %170
170: ; preds = %164, %164, %164, %164, %169
%171 = phi float* [ %20, %169 ], [ %19, %164 ], [ %19, %164 ], [ %19, %164 ], [ %19, %164 ]
%172 = load float, float* %171
%173 = fadd float %37, %172
br label %174
174: ; preds = %140, %170, %159, %45, %38
%175 = phi float [ %37, %38 ], [ %37, %45 ], [ %147, %140 ], [ %162, %159 ], [ %173, %170 ]
%176 = add nuw nsw i64 %36, 1
%177 = icmp eq i64 %176, %26
br i1 %177, label %178, label %35
178: ; preds = %174, %6
%179 = phi float [ 0.000000e+00, %6 ], [ %175, %174 ]
ret float %179
}