#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
int const GapChar(int);
scalar_t__ IsStop(int const, int const);
int /*<<< orphan*/ IsValidBase(int const, int, int const);
int /*<<< orphan*/ IsValidGencode(int const);
int /*<<< orphan*/ abort();
int /*<<< orphan*/ assert(int /*<<< orphan*/);
int CodonToQcoord(const int codon, const int gencode) {
  int mod;
  assert(IsValidGencode(gencode));
  assert(IsValidBase(codon, 2, gencode));
  if (GapChar(2) == codon)
    return codon;
  if (IsStop(codon, gencode))
    return -1;
  mod = 0;
  switch (gencode) {
  case 0:
    if (codon >= 48)
      mod--;
    if (codon >= 50)
      mod--;
    if (codon >= 56)
      mod--;
    return (codon + mod);
  case 1:
    if (codon >= 8)
      mod--;
    if (codon >= 10)
      mod--;
    if (codon >= 48)
      mod--;
    if (codon >= 50)
      mod--;
    return (codon + mod);
  }
  abort();
  return -1;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<CodonToQcoord>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x20,%rsp
mov    %edi,-0x8(%rbp)
mov    %esi,-0xc(%rbp)
mov    -0xc(%rbp),%edi
call   1050 <IsValidGencode@plt>
mov    %eax,%edi
call   1040 <assert@plt>
mov    -0x8(%rbp),%edi
mov    -0xc(%rbp),%edx
mov    $0x2,%esi
call   1060 <IsValidBase@plt>
mov    %eax,%edi
call   1040 <assert@plt>
mov    $0x2,%edi
call   1070 <GapChar@plt>
cmp    -0x8(%rbp),%eax
jne    11b2 <CodonToQcoord+0x52>
mov    -0x8(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x4(%rbp)
jmp    12a6 <CodonToQcoord+0x146>
mov    -0x8(%rbp),%edi
mov    -0xc(%rbp),%esi
call   1080 <IsStop@plt>
cmp    $0x0,%rax
je     11d3 <CodonToQcoord+0x73>
movl   $0xffffffff,-0x4(%rbp)
jmp    12a6 <CodonToQcoord+0x146>
movl   $0x0,-0x10(%rbp)
mov    -0xc(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x14(%rbp)
test   %eax,%eax
je     11fe <CodonToQcoord+0x9e>
jmp    11ed <CodonToQcoord+0x8d>
mov    -0x14(%rbp),%eax
sub    $0x1,%eax
je     1245 <CodonToQcoord+0xe5>
jmp    129f <CodonToQcoord+0x13f>
cmpl   $0x30,-0x8(%rbp)
jl     1211 <CodonToQcoord+0xb1>
mov    -0x10(%rbp),%eax
add    $0xffffffff,%eax
mov    %eax,-0x10(%rbp)
cmpl   $0x32,-0x8(%rbp)
jl     1224 <CodonToQcoord+0xc4>
mov    -0x10(%rbp),%eax
add    $0xffffffff,%eax
mov    %eax,-0x10(%rbp)
cmpl   $0x38,-0x8(%rbp)
jl     1237 <CodonToQcoord+0xd7>
mov    -0x10(%rbp),%eax
add    $0xffffffff,%eax
mov    %eax,-0x10(%rbp)
mov    -0x8(%rbp),%eax
add    -0x10(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x4(%rbp)
jmp    12a6 <CodonToQcoord+0x146>
cmpl   $0x8,-0x8(%rbp)
jl     1258 <CodonToQcoord+0xf8>
mov    -0x10(%rbp),%eax
add    $0xffffffff,%eax
mov    %eax,-0x10(%rbp)
cmpl   $0xa,-0x8(%rbp)
jl     126b <CodonToQcoord+0x10b>
mov    -0x10(%rbp),%eax
add    $0xffffffff,%eax
mov    %eax,-0x10(%rbp)
cmpl   $0x30,-0x8(%rbp)
jl     127e <CodonToQcoord+0x11e>
mov    -0x10(%rbp),%eax
add    $0xffffffff,%eax
mov    %eax,-0x10(%rbp)
cmpl   $0x32,-0x8(%rbp)
jl     1291 <CodonToQcoord+0x131>
mov    -0x10(%rbp),%eax
add    $0xffffffff,%eax
mov    %eax,-0x10(%rbp)
mov    -0x8(%rbp),%eax
add    -0x10(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x4(%rbp)
jmp    12a6 <CodonToQcoord+0x146>
mov    $0x0,%al
call   1030 <abort@plt>
mov    -0x4(%rbp),%eax
add    $0x20,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<CodonToQcoord>:
push   %rbp
push   %rbx
push   %rax
mov    %esi,%ebp
mov    %edi,%ebx
mov    %esi,%edi
call   1050 <IsValidGencode@plt>
mov    %eax,%edi
call   1040 <assert@plt>
mov    %ebx,%edi
mov    $0x2,%esi
mov    %ebp,%edx
call   1060 <IsValidBase@plt>
mov    %eax,%edi
call   1040 <assert@plt>
mov    $0x2,%edi
call   1070 <GapChar@plt>
cmp    %ebx,%eax
jne    119c <CodonToQcoord+0x3c>
mov    %ebx,%eax
jmp    11b2 <CodonToQcoord+0x52>
mov    %ebx,%edi
mov    %ebp,%esi
call   1080 <IsStop@plt>
mov    %rax,%rcx
mov    $0xffffffff,%eax
test   %rcx,%rcx
je     11b9 <CodonToQcoord+0x59>
add    $0x8,%rsp
pop    %rbx
pop    %rbp
ret
cmp    $0x1,%ebp
je     11e4 <CodonToQcoord+0x84>
test   %ebp,%ebp
jne    1210 <CodonToQcoord+0xb0>
xor    %eax,%eax
cmp    $0x30,%ebx
setge  %al
mov    %eax,%ecx
neg    %ecx
cmp    $0x32,%ebx
not    %eax
cmovl  %ecx,%eax
xor    %ecx,%ecx
cmp    $0x38,%ebx
setge  %cl
sub    %ecx,%ebx
add    %eax,%ebx
jmp    1198 <CodonToQcoord+0x38>
xor    %eax,%eax
cmp    $0x8,%ebx
setge  %al
mov    %eax,%ecx
neg    %ecx
cmp    $0xa,%ebx
not    %eax
cmovl  %ecx,%eax
xor    %ecx,%ecx
cmp    $0x30,%ebx
setge  %cl
xor    %edx,%edx
cmp    $0x32,%ebx
setge  %dl
sub    %ecx,%ebx
sub    %edx,%ebx
add    %eax,%ebx
jmp    1198 <CodonToQcoord+0x38>
xor    %eax,%eax
call   1030 <abort@plt>

LLVM IR (-O0):
define i32 @CodonToQcoord(i32 %0, i32 %1) {
%3 = alloca i32
%4 = alloca i32
%5 = alloca i32
%6 = alloca i32
store i32 %0, i32* %4
store i32 %1, i32* %5
%7 = load i32, i32* %5
%8 = call i32 @IsValidGencode(i32 %7)
%9 = call i32 @assert(i32 %8)
%10 = load i32, i32* %4
%11 = load i32, i32* %5
%12 = call i32 @IsValidBase(i32 %10, i32 2, i32 %11)
%13 = call i32 @assert(i32 %12)
%14 = call i32 @GapChar(i32 2)
%15 = load i32, i32* %4
%16 = icmp eq i32 %14, %15
br i1 %16, label %17, label %19
17: ; preds = %2
%18 = load i32, i32* %4
store i32 %18, i32* %3
br label %79
19: ; preds = %2
%20 = load i32, i32* %4
%21 = load i32, i32* %5
%22 = call i64 @IsStop(i32 %20, i32 %21)
%23 = icmp ne i64 %22, 0
br i1 %23, label %24, label %25
24: ; preds = %19
store i32 -1, i32* %3
br label %79
25: ; preds = %19
store i32 0, i32* %6
%26 = load i32, i32* %5
switch i32 %26, label %77 [
i32 0, label %27
i32 1, label %49
]
27: ; preds = %25
%28 = load i32, i32* %4
%29 = icmp sge i32 %28, 48
br i1 %29, label %30, label %33
30: ; preds = %27
%31 = load i32, i32* %6
%32 = add nsw i32 %31, -1
store i32 %32, i32* %6
br label %33
33: ; preds = %30, %27
%34 = load i32, i32* %4
%35 = icmp sge i32 %34, 50
br i1 %35, label %36, label %39
36: ; preds = %33
%37 = load i32, i32* %6
%38 = add nsw i32 %37, -1
store i32 %38, i32* %6
br label %39
39: ; preds = %36, %33
%40 = load i32, i32* %4
%41 = icmp sge i32 %40, 56
br i1 %41, label %42, label %45
42: ; preds = %39
%43 = load i32, i32* %6
%44 = add nsw i32 %43, -1
store i32 %44, i32* %6
br label %45
45: ; preds = %42, %39
%46 = load i32, i32* %4
%47 = load i32, i32* %6
%48 = add nsw i32 %46, %47
store i32 %48, i32* %3
br label %79
49: ; preds = %25
%50 = load i32, i32* %4
%51 = icmp sge i32 %50, 8
br i1 %51, label %52, label %55
52: ; preds = %49
%53 = load i32, i32* %6
%54 = add nsw i32 %53, -1
store i32 %54, i32* %6
br label %55
55: ; preds = %52, %49
%56 = load i32, i32* %4
%57 = icmp sge i32 %56, 10
br i1 %57, label %58, label %61
58: ; preds = %55
%59 = load i32, i32* %6
%60 = add nsw i32 %59, -1
store i32 %60, i32* %6
br label %61
61: ; preds = %58, %55
%62 = load i32, i32* %4
%63 = icmp sge i32 %62, 48
br i1 %63, label %64, label %67
64: ; preds = %61
%65 = load i32, i32* %6
%66 = add nsw i32 %65, -1
store i32 %66, i32* %6
br label %67
67: ; preds = %64, %61
%68 = load i32, i32* %4
%69 = icmp sge i32 %68, 50
br i1 %69, label %70, label %73
70: ; preds = %67
%71 = load i32, i32* %6
%72 = add nsw i32 %71, -1
store i32 %72, i32* %6
br label %73
73: ; preds = %70, %67
%74 = load i32, i32* %4
%75 = load i32, i32* %6
%76 = add nsw i32 %74, %75
store i32 %76, i32* %3
br label %79
77: ; preds = %25
%78 = call i32 (...) @abort()
unreachable
79: ; preds = %73, %45, %24, %17
%80 = load i32, i32* %3
ret i32 %80
}

LLVM IR (-O2):
define i32 @CodonToQcoord(i32 %0, i32 %1) {
%3 = tail call i32 @IsValidGencode(i32 %1)
%4 = tail call i32 @assert(i32 %3)
%5 = tail call i32 @IsValidBase(i32 %0, i32 2, i32 %1)
%6 = tail call i32 @assert(i32 %5)
%7 = tail call i32 @GapChar(i32 2)
%8 = icmp eq i32 %7, %0
br i1 %8, label %38, label %9
9: ; preds = %2
%10 = tail call i64 @IsStop(i32 %0, i32 %1)
%11 = icmp eq i64 %10, 0
br i1 %11, label %12, label %38
12: ; preds = %9
switch i32 %1, label %36 [
i32 0, label %13
i32 1, label %23
]
13: ; preds = %12
%14 = icmp sgt i32 %0, 47
%15 = sext i1 %14 to i32
%16 = icmp sgt i32 %0, 49
%17 = select i1 %14, i32 -2, i32 -1
%18 = select i1 %16, i32 %17, i32 %15
%19 = icmp sgt i32 %0, 55
%20 = sext i1 %19 to i32
%21 = add i32 %20, %0
%22 = add i32 %21, %18
br label %38
23: ; preds = %12
%24 = icmp sgt i32 %0, 7
%25 = sext i1 %24 to i32
%26 = icmp sgt i32 %0, 9
%27 = select i1 %24, i32 -2, i32 -1
%28 = select i1 %26, i32 %27, i32 %25
%29 = icmp sgt i32 %0, 47
%30 = sext i1 %29 to i32
%31 = icmp sgt i32 %0, 49
%32 = sext i1 %31 to i32
%33 = add i32 %30, %0
%34 = add i32 %33, %32
%35 = add i32 %34, %28
br label %38
36: ; preds = %12
%37 = tail call i32 (...) @abort()
unreachable
38: ; preds = %9, %2, %23, %13
%39 = phi i32 [ %35, %23 ], [ %22, %13 ], [ %0, %2 ], [ -1, %9 ]
ret i32 %39
}