void pq_complement(char *codon) {
  int bp;
  for (bp = 0; bp < 3; bp++) {
    switch (codon[bp]) {
    case 'A':
      codon[bp] = 'T';
      break;
    case 'T':
      codon[bp] = 'A';
      break;
    case 'G':
      codon[bp] = 'C';
      break;
    case 'C':
      codon[bp] = 'G';
      break;
    case 'a':
      codon[bp] = 't';
      break;
    case 't':
      codon[bp] = 'a';
      break;
    case 'g':
      codon[bp] = 'c';
      break;
    case 'c':
      codon[bp] = 'g';
      break;
    default:
      codon[bp] = codon[bp];
    }
  }
}


x86 assembly (clang, -O0):
<pq_complement>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
movl   $0x0,-0xc(%rbp)
cmpl   $0x3,-0xc(%rbp)
jge    11fc <pq_complement+0xfc>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0xc(%rbp),%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
add    $0xffffffbf,%eax
mov    %eax,%ecx
mov    %rcx,-0x18(%rbp)
sub    $0x33,%eax
ja     11d3 <pq_complement+0xd3>
mov    -0x18(%rbp),%rax
lea    0xebe(%rip),%rcx
movslq (%rcx,%rax,4),%rax
add    %rcx,%rax
jmp    *%rax
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0xc(%rbp),%rcx
movb   $0x54,(%rax,%rcx,1)
jmp    11e9 <pq_complement+0xe9>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0xc(%rbp),%rcx
movb   $0x41,(%rax,%rcx,1)
jmp    11e9 <pq_complement+0xe9>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0xc(%rbp),%rcx
movb   $0x43,(%rax,%rcx,1)
jmp    11e9 <pq_complement+0xe9>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0xc(%rbp),%rcx
movb   $0x47,(%rax,%rcx,1)
jmp    11e9 <pq_complement+0xe9>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0xc(%rbp),%rcx
movb   $0x74,(%rax,%rcx,1)
jmp    11e9 <pq_complement+0xe9>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0xc(%rbp),%rcx
movb   $0x61,(%rax,%rcx,1)
jmp    11e9 <pq_complement+0xe9>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0xc(%rbp),%rcx
movb   $0x63,(%rax,%rcx,1)
jmp    11e9 <pq_complement+0xe9>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0xc(%rbp),%rcx
movb   $0x67,(%rax,%rcx,1)
jmp    11e9 <pq_complement+0xe9>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0xc(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,1),%dl
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0xc(%rbp),%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
jmp    11ee <pq_complement+0xee>
mov    -0xc(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0xc(%rbp)
jmp    110f <pq_complement+0xf>
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<pq_complement>:
movsbl (%rdi),%ecx
add    $0xffffffbf,%ecx
cmp    $0x33,%ecx
ja     1139 <pq_complement+0x39>
mov    $0x54,%al
lea    0xeec(%rip),%rdx
movslq (%rdx,%rcx,4),%rcx
add    %rdx,%rcx
jmp    *%rcx
mov    $0x47,%al
jmp    1137 <pq_complement+0x37>
mov    $0x43,%al
jmp    1137 <pq_complement+0x37>
mov    $0x41,%al
jmp    1137 <pq_complement+0x37>
mov    $0x74,%al
jmp    1137 <pq_complement+0x37>
mov    $0x67,%al
jmp    1137 <pq_complement+0x37>
mov    $0x63,%al
jmp    1137 <pq_complement+0x37>
mov    $0x61,%al
mov    %al,(%rdi)
movsbl 0x1(%rdi),%ecx
add    $0xffffffbf,%ecx
cmp    $0x33,%ecx
ja     1174 <pq_complement+0x74>
mov    $0x67,%al
lea    0xf82(%rip),%rdx
movslq (%rdx,%rcx,4),%rcx
add    %rdx,%rcx
jmp    *%rcx
mov    $0x54,%al
jmp    1171 <pq_complement+0x71>
mov    $0x47,%al
jmp    1171 <pq_complement+0x71>
mov    $0x43,%al
jmp    1171 <pq_complement+0x71>
mov    $0x41,%al
jmp    1171 <pq_complement+0x71>
mov    $0x74,%al
jmp    1171 <pq_complement+0x71>
mov    $0x63,%al
jmp    1171 <pq_complement+0x71>
mov    $0x61,%al
mov    %al,0x1(%rdi)
movsbl 0x2(%rdi),%ecx
add    $0xffffffbf,%ecx
cmp    $0x33,%ecx
ja     11af <pq_complement+0xaf>
mov    $0x67,%al
lea    0x1017(%rip),%rdx
movslq (%rdx,%rcx,4),%rcx
add    %rdx,%rcx
jmp    *%rcx
mov    $0x54,%al
jmp    11ac <pq_complement+0xac>
mov    $0x47,%al
jmp    11ac <pq_complement+0xac>
mov    $0x43,%al
jmp    11ac <pq_complement+0xac>
mov    $0x41,%al
jmp    11ac <pq_complement+0xac>
mov    $0x74,%al
jmp    11ac <pq_complement+0xac>
mov    $0x63,%al
jmp    11ac <pq_complement+0xac>
mov    $0x61,%al
mov    %al,0x2(%rdi)
ret

LLVM IR (-O0):
define void @pq_complement(i8* %0) {
%2 = alloca i8*
%3 = alloca i32
store i8* %0, i8** %2
store i32 0, i32* %3
br label %4
4: ; preds = %65, %1
%5 = load i32, i32* %3
%6 = icmp slt i32 %5, 3
br i1 %6, label %7, label %68
7: ; preds = %4
%8 = load i8*, i8** %2
%9 = load i32, i32* %3
%10 = sext i32 %9 to i64
%11 = getelementptr inbounds i8, i8* %8, i64 %10
%12 = load i8, i8* %11
%13 = sext i8 %12 to i32
switch i32 %13, label %54 [
i32 65, label %14
i32 84, label %19
i32 71, label %24
i32 67, label %29
i32 97, label %34
i32 116, label %39
i32 103, label %44
i32 99, label %49
]
14: ; preds = %7
%15 = load i8*, i8** %2
%16 = load i32, i32* %3
%17 = sext i32 %16 to i64
%18 = getelementptr inbounds i8, i8* %15, i64 %17
store i8 84, i8* %18
br label %64
19: ; preds = %7
%20 = load i8*, i8** %2
%21 = load i32, i32* %3
%22 = sext i32 %21 to i64
%23 = getelementptr inbounds i8, i8* %20, i64 %22
store i8 65, i8* %23
br label %64
24: ; preds = %7
%25 = load i8*, i8** %2
%26 = load i32, i32* %3
%27 = sext i32 %26 to i64
%28 = getelementptr inbounds i8, i8* %25, i64 %27
store i8 67, i8* %28
br label %64
29: ; preds = %7
%30 = load i8*, i8** %2
%31 = load i32, i32* %3
%32 = sext i32 %31 to i64
%33 = getelementptr inbounds i8, i8* %30, i64 %32
store i8 71, i8* %33
br label %64
34: ; preds = %7
%35 = load i8*, i8** %2
%36 = load i32, i32* %3
%37 = sext i32 %36 to i64
%38 = getelementptr inbounds i8, i8* %35, i64 %37
store i8 116, i8* %38
br label %64
39: ; preds = %7
%40 = load i8*, i8** %2
%41 = load i32, i32* %3
%42 = sext i32 %41 to i64
%43 = getelementptr inbounds i8, i8* %40, i64 %42
store i8 97, i8* %43
br label %64
44: ; preds = %7
%45 = load i8*, i8** %2
%46 = load i32, i32* %3
%47 = sext i32 %46 to i64
%48 = getelementptr inbounds i8, i8* %45, i64 %47
store i8 99, i8* %48
br label %64
49: ; preds = %7
%50 = load i8*, i8** %2
%51 = load i32, i32* %3
%52 = sext i32 %51 to i64
%53 = getelementptr inbounds i8, i8* %50, i64 %52
store i8 103, i8* %53
br label %64
54: ; preds = %7
%55 = load i8*, i8** %2
%56 = load i32, i32* %3
%57 = sext i32 %56 to i64
%58 = getelementptr inbounds i8, i8* %55, i64 %57
%59 = load i8, i8* %58
%60 = load i8*, i8** %2
%61 = load i32, i32* %3
%62 = sext i32 %61 to i64
%63 = getelementptr inbounds i8, i8* %60, i64 %62
store i8 %59, i8* %63
br label %64
64: ; preds = %54, %49, %44, %39, %34, %29, %24, %19, %14
br label %65
65: ; preds = %64
%66 = load i32, i32* %3
%67 = add nsw i32 %66, 1
store i32 %67, i32* %3
br label %4
68: ; preds = %4
ret void
}

LLVM IR (-O2):
define void @pq_complement(i8* nocapture %0) {
%2 = load i8, i8* %0
%3 = sext i8 %2 to i32
switch i32 %3, label %13 [
i32 65, label %11
i32 84, label %4
i32 71, label %5
i32 67, label %6
i32 97, label %7
i32 116, label %8
i32 103, label %9
i32 99, label %10
]
4: ; preds = %1
br label %11
5: ; preds = %1
br label %11
6: ; preds = %1
br label %11
7: ; preds = %1
br label %11
8: ; preds = %1
br label %11
9: ; preds = %1
br label %11
10: ; preds = %1
br label %11
11: ; preds = %1, %10, %9, %8, %7, %6, %5, %4
%12 = phi i8 [ 65, %4 ], [ 67, %5 ], [ 71, %6 ], [ 116, %7 ], [ 97, %8 ], [ 99, %9 ], [ 103, %10 ], [ 84, %1 ]
store i8 %12, i8* %0
br label %13
13: ; preds = %11, %1
%14 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 1
%15 = load i8, i8* %14
%16 = sext i8 %15 to i32
switch i32 %16, label %26 [
i32 65, label %23
i32 84, label %22
i32 71, label %21
i32 67, label %20
i32 97, label %19
i32 116, label %18
i32 103, label %17
i32 99, label %24
]
17: ; preds = %13
br label %24
18: ; preds = %13
br label %24
19: ; preds = %13
br label %24
20: ; preds = %13
br label %24
21: ; preds = %13
br label %24
22: ; preds = %13
br label %24
23: ; preds = %13
br label %24
24: ; preds = %13, %17, %18, %19, %20, %21, %22, %23
%25 = phi i8 [ 84, %23 ], [ 65, %22 ], [ 67, %21 ], [ 71, %20 ], [ 116, %19 ], [ 97, %18 ], [ 99, %17 ], [ 103, %13 ]
store i8 %25, i8* %14
br label %26
26: ; preds = %24, %13
%27 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 2
%28 = load i8, i8* %27
%29 = sext i8 %28 to i32
switch i32 %29, label %39 [
i32 65, label %36
i32 84, label %35
i32 71, label %34
i32 67, label %33
i32 97, label %32
i32 116, label %31
i32 103, label %30
i32 99, label %37
]
30: ; preds = %26
br label %37
31: ; preds = %26
br label %37
32: ; preds = %26
br label %37
33: ; preds = %26
br label %37
34: ; preds = %26
br label %37
35: ; preds = %26
br label %37
36: ; preds = %26
br label %37
37: ; preds = %26, %30, %31, %32, %33, %34, %35, %36
%38 = phi i8 [ 84, %36 ], [ 65, %35 ], [ 67, %34 ], [ 71, %33 ], [ 116, %32 ], [ 97, %31 ], [ 99, %30 ], [ 103, %26 ]
store i8 %38, i8* %27
br label %39
39: ; preds = %37, %26
ret void
}