int countGapOpens(char *a, char *b, int size) {
  int i, count = 0;
  int inGap = 0;
  for (i = 0; i < size; ++i) {
    if (a[i] == '-' || b[i] == '-') {
      if (!inGap) {
        ++count;
        inGap = 1;
      }
    } else {
      inGap = 0;
    }
  }
  return count;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<countGapOpens>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %edx,-0x14(%rbp)
movl   $0x0,-0x1c(%rbp)
movl   $0x0,-0x20(%rbp)
movl   $0x0,-0x18(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
jge    1193 <countGapOpens+0x93>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x18(%rbp),%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x2d,%eax
je     115a <countGapOpens+0x5a>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x18(%rbp),%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x2d,%eax
jne    1179 <countGapOpens+0x79>
cmpl   $0x0,-0x20(%rbp)
jne    1174 <countGapOpens+0x74>
mov    -0x1c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
movl   $0x1,-0x20(%rbp)
jmp    1180 <countGapOpens+0x80>
movl   $0x0,-0x20(%rbp)
jmp    1185 <countGapOpens+0x85>
mov    -0x18(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x18(%rbp)
jmp    1124 <countGapOpens+0x24>
mov    -0x1c(%rbp),%eax
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<countGapOpens>:
test   %edx,%edx
jle    112d <countGapOpens+0x2d>
mov    %edx,%r8d
cmp    $0x1,%edx
jne    1130 <countGapOpens+0x30>
xor    %edx,%edx
xor    %r10d,%r10d
xor    %eax,%eax
test   $0x1,%r8b
je     112c <countGapOpens+0x2c>
cmpb   $0x2d,(%rdi,%rdx,1)
je     1125 <countGapOpens+0x25>
cmpb   $0x2d,(%rsi,%rdx,1)
jne    112c <countGapOpens+0x2c>
cmp    $0x1,%r10d
adc    $0x0,%eax
ret
xor    %eax,%eax
ret
mov    %r8d,%r9d
and    $0xfffffffe,%r9d
xor    %edx,%edx
xor    %r10d,%r10d
xor    %eax,%eax
jmp    1151 <countGapOpens+0x51>
add    %ecx,%eax
mov    $0x1,%r10d
add    $0x2,%rdx
cmp    %rdx,%r9
je     1113 <countGapOpens+0x13>
cmpb   $0x2d,(%rdi,%rdx,1)
je     1162 <countGapOpens+0x62>
mov    $0x1,%ecx
cmpb   $0x2d,(%rsi,%rdx,1)
jne    116b <countGapOpens+0x6b>
cmp    $0x1,%r10d
adc    $0x0,%eax
xor    %ecx,%ecx
cmpb   $0x2d,0x1(%rdi,%rdx,1)
je     1140 <countGapOpens+0x40>
xor    %r10d,%r10d
cmpb   $0x2d,0x1(%rsi,%rdx,1)
je     1140 <countGapOpens+0x40>
jmp    1148 <countGapOpens+0x48>

LLVM IR (-O0):
define i32 @countGapOpens(i8* %0, i8* %1, i32 %2) {
%4 = alloca i8*
%5 = alloca i8*
%6 = alloca i32
%7 = alloca i32
%8 = alloca i32
%9 = alloca i32
store i8* %0, i8** %4
store i8* %1, i8** %5
store i32 %2, i32* %6
store i32 0, i32* %8
store i32 0, i32* %9
store i32 0, i32* %7
br label %10
10: ; preds = %39, %3
%11 = load i32, i32* %7
%12 = load i32, i32* %6
%13 = icmp slt i32 %11, %12
br i1 %13, label %14, label %42
14: ; preds = %10
%15 = load i8*, i8** %4
%16 = load i32, i32* %7
%17 = sext i32 %16 to i64
%18 = getelementptr inbounds i8, i8* %15, i64 %17
%19 = load i8, i8* %18
%20 = sext i8 %19 to i32
%21 = icmp eq i32 %20, 45
br i1 %21, label %30, label %22
22: ; preds = %14
%23 = load i8*, i8** %5
%24 = load i32, i32* %7
%25 = sext i32 %24 to i64
%26 = getelementptr inbounds i8, i8* %23, i64 %25
%27 = load i8, i8* %26
%28 = sext i8 %27 to i32
%29 = icmp eq i32 %28, 45
br i1 %29, label %30, label %37
30: ; preds = %22, %14
%31 = load i32, i32* %9
%32 = icmp ne i32 %31, 0
br i1 %32, label %36, label %33
33: ; preds = %30
%34 = load i32, i32* %8
%35 = add nsw i32 %34, 1
store i32 %35, i32* %8
store i32 1, i32* %9
br label %36
36: ; preds = %33, %30
br label %38
37: ; preds = %22
store i32 0, i32* %9
br label %38
38: ; preds = %37, %36
br label %39
39: ; preds = %38
%40 = load i32, i32* %7
%41 = add nsw i32 %40, 1
store i32 %41, i32* %7
br label %10
42: ; preds = %10
%43 = load i32, i32* %8
ret i32 %43
}

LLVM IR (-O2):
define i32 @countGapOpens(i8* nocapture %0, i8* nocapture %1, i32 %2) {
%4 = icmp sgt i32 %2, 0
br i1 %4, label %5, label %64
5: ; preds = %3
%6 = zext i32 %2 to i64
%7 = and i64 %6, 1
%8 = icmp eq i32 %2, 1
br i1 %8, label %46, label %9
9: ; preds = %5
%10 = and i64 %6, 4294967294
br label %11
11: ; preds = %40, %9
%12 = phi i64 [ 0, %9 ], [ %43, %40 ]
%13 = phi i32 [ 0, %9 ], [ %42, %40 ]
%14 = phi i32 [ 0, %9 ], [ %41, %40 ]
%15 = phi i64 [ 0, %9 ], [ %44, %40 ]
%16 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %12
%17 = load i8, i8* %16
%18 = icmp eq i8 %17, 45
br i1 %18, label %23, label %19
19: ; preds = %11
%20 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %12
%21 = load i8, i8* %20
%22 = icmp eq i8 %21, 45
br i1 %22, label %23, label %27
23: ; preds = %19, %11
%24 = icmp eq i32 %13, 0
%25 = zext i1 %24 to i32
%26 = add nsw i32 %14, %25
br label %27
27: ; preds = %23, %19
%28 = phi i32 [ %26, %23 ], [ %14, %19 ]
%29 = phi i32 [ 0, %23 ], [ 1, %19 ]
%30 = or i64 %12, 1
%31 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %30
%32 = load i8, i8* %31
%33 = icmp eq i8 %32, 45
br i1 %33, label %38, label %34
34: ; preds = %27
%35 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %30
%36 = load i8, i8* %35
%37 = icmp eq i8 %36, 45
br i1 %37, label %38, label %40
38: ; preds = %34, %27
%39 = add nsw i32 %28, %29
br label %40
40: ; preds = %38, %34
%41 = phi i32 [ %39, %38 ], [ %28, %34 ]
%42 = phi i32 [ 1, %38 ], [ 0, %34 ]
%43 = add nuw nsw i64 %12, 2
%44 = add i64 %15, 2
%45 = icmp eq i64 %44, %10
br i1 %45, label %46, label %11
46: ; preds = %40, %5
%47 = phi i32 [ undef, %5 ], [ %41, %40 ]
%48 = phi i64 [ 0, %5 ], [ %43, %40 ]
%49 = phi i32 [ 0, %5 ], [ %42, %40 ]
%50 = phi i32 [ 0, %5 ], [ %41, %40 ]
%51 = icmp eq i64 %7, 0
br i1 %51, label %64, label %52
52: ; preds = %46
%53 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %48
%54 = load i8, i8* %53
%55 = icmp eq i8 %54, 45
br i1 %55, label %60, label %56
56: ; preds = %52
%57 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %48
%58 = load i8, i8* %57
%59 = icmp eq i8 %58, 45
br i1 %59, label %60, label %64
60: ; preds = %56, %52
%61 = icmp eq i32 %49, 0
%62 = zext i1 %61 to i32
%63 = add nsw i32 %50, %62
br label %64
64: ; preds = %46, %60, %56, %3
%65 = phi i32 [ 0, %3 ], [ %47, %46 ], [ %63, %60 ], [ %50, %56 ]
ret i32 %65
}