void revcomp(unsigned char *seq, int n, int *c_nt) {
  unsigned char tmp;
  int i, ni;
  for (i = 0, ni = n - 1; i < n / 2; i++, ni--) {
    tmp = c_nt[seq[i]];
    seq[i] = c_nt[seq[ni]];
    seq[ni] = tmp;
  }
  if ((n % 2) == 1) {
    i = n / 2;
    seq[i] = c_nt[seq[i]];
  }
  seq[n] = 0;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<revcomp>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %esi,-0xc(%rbp)
mov    %rdx,-0x18(%rbp)
movl   $0x0,-0x20(%rbp)
mov    -0xc(%rbp),%eax
sub    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x24(%rbp)
mov    -0x20(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x28(%rbp)
mov    -0xc(%rbp),%eax
mov    $0x2,%ecx
cltd
idiv   %ecx
mov    %eax,%ecx
mov    -0x28(%rbp),%eax
cmp    %ecx,%eax
jge    1198 <revcomp+0x98>
mov    -0x18(%rbp),%rax
mov    -0x8(%rbp),%rcx
movslq -0x20(%rbp),%rdx
movzbl (%rcx,%rdx,1),%ecx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %al,-0x19(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%rax
mov    -0x8(%rbp),%rcx
movslq -0x24(%rbp),%rdx
movzbl (%rcx,%rdx,1),%ecx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %al,%dl
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
mov    -0x19(%rbp),%dl
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x24(%rbp),%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
mov    -0x20(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x20(%rbp)
mov    -0x24(%rbp),%eax
add    $0xffffffff,%eax
mov    %eax,-0x24(%rbp)
jmp    111f <revcomp+0x1f>
mov    -0xc(%rbp),%eax
mov    $0x2,%ecx
cltd
idiv   %ecx
cmp    $0x1,%edx
jne    11da <revcomp+0xda>
mov    -0xc(%rbp),%eax
mov    $0x2,%ecx
cltd
idiv   %ecx
mov    %eax,-0x20(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%rax
mov    -0x8(%rbp),%rcx
movslq -0x20(%rbp),%rdx
movzbl (%rcx,%rdx,1),%ecx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %al,%dl
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0xc(%rbp),%rcx
movb   $0x0,(%rax,%rcx,1)
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<revcomp>:
push   %rbp
push   %r14
push   %rbx
mov    %esi,%eax
shr    $0x1f,%eax
add    %esi,%eax
mov    %eax,%r9d
sar    %r9d
and    $0xfffffffe,%eax
mov    %esi,%r10d
sub    %eax,%r10d
cmp    $0x2,%esi
jl     11bd <revcomp+0xbd>
mov    %esi,%ecx
mov    %r9d,%r8d
mov    %esi,%eax
and    $0xfffffffe,%eax
cmp    $0x2,%eax
jne    113f <revcomp+0x3f>
xor    %eax,%eax
test   $0x1,%r8b
jne    11a5 <revcomp+0xa5>
jmp    11bd <revcomp+0xbd>
mov    %r8d,%r11d
and    $0xfffffffe,%r11d
neg    %r11
mov    $0x1,%eax
xchg   %ax,%ax
movzbl -0x1(%rdi,%rax,1),%ebx
movzbl (%rdx,%rbx,4),%ebp
movzbl -0x1(%rdi,%rcx,1),%ebx
movzbl (%rdx,%rbx,4),%ebx
mov    %bl,-0x1(%rdi,%rax,1)
mov    %bpl,-0x1(%rdi,%rcx,1)
movzbl (%rdi,%rax,1),%ebx
movzbl (%rdx,%rbx,4),%r14d
movzbl -0x2(%rdi,%rcx,1),%ebp
movzbl (%rdx,%rbp,4),%ebx
mov    %bl,(%rdi,%rax,1)
mov    %r14b,-0x2(%rdi,%rcx,1)
add    $0xfffffffffffffffe,%rcx
lea    (%r11,%rax,1),%rbx
add    $0x2,%rbx
add    $0x2,%rax
cmp    $0x1,%rbx
jne    1150 <revcomp+0x50>
add    $0xffffffffffffffff,%rax
test   $0x1,%r8b
je     11bd <revcomp+0xbd>
movzbl (%rdi,%rax,1),%ebp
mov    (%rdx,%rbp,4),%r8b
movzbl -0x1(%rcx,%rdi,1),%ebp
mov    (%rdx,%rbp,4),%bl
mov    %bl,(%rdi,%rax,1)
mov    %r8b,-0x1(%rcx,%rdi,1)
cmp    $0x1,%r10d
jne    11d0 <revcomp+0xd0>
movslq %r9d,%rax
movzbl (%rdi,%rax,1),%ecx
mov    (%rdx,%rcx,4),%cl
mov    %cl,(%rdi,%rax,1)
movslq %esi,%rax
movb   $0x0,(%rdi,%rax,1)
pop    %rbx
pop    %r14
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define void @revcomp(i8* %0, i32 %1, i32* %2) {
%4 = alloca i8*
%5 = alloca i32
%6 = alloca i32*
%7 = alloca i8
%8 = alloca i32
%9 = alloca i32
store i8* %0, i8** %4
store i32 %1, i32* %5
store i32* %2, i32** %6
store i32 0, i32* %8
%10 = load i32, i32* %5
%11 = sub nsw i32 %10, 1
store i32 %11, i32* %9
br label %12
12: ; preds = %47, %3
%13 = load i32, i32* %8
%14 = load i32, i32* %5
%15 = sdiv i32 %14, 2
%16 = icmp slt i32 %13, %15
br i1 %16, label %17, label %52
17: ; preds = %12
%18 = load i32*, i32** %6
%19 = load i8*, i8** %4
%20 = load i32, i32* %8
%21 = sext i32 %20 to i64
%22 = getelementptr inbounds i8, i8* %19, i64 %21
%23 = load i8, i8* %22
%24 = zext i8 %23 to i64
%25 = getelementptr inbounds i32, i32* %18, i64 %24
%26 = load i32, i32* %25
%27 = trunc i32 %26 to i8
store i8 %27, i8* %7
%28 = load i32*, i32** %6
%29 = load i8*, i8** %4
%30 = load i32, i32* %9
%31 = sext i32 %30 to i64
%32 = getelementptr inbounds i8, i8* %29, i64 %31
%33 = load i8, i8* %32
%34 = zext i8 %33 to i64
%35 = getelementptr inbounds i32, i32* %28, i64 %34
%36 = load i32, i32* %35
%37 = trunc i32 %36 to i8
%38 = load i8*, i8** %4
%39 = load i32, i32* %8
%40 = sext i32 %39 to i64
%41 = getelementptr inbounds i8, i8* %38, i64 %40
store i8 %37, i8* %41
%42 = load i8, i8* %7
%43 = load i8*, i8** %4
%44 = load i32, i32* %9
%45 = sext i32 %44 to i64
%46 = getelementptr inbounds i8, i8* %43, i64 %45
store i8 %42, i8* %46
br label %47
47: ; preds = %17
%48 = load i32, i32* %8
%49 = add nsw i32 %48, 1
store i32 %49, i32* %8
%50 = load i32, i32* %9
%51 = add nsw i32 %50, -1
store i32 %51, i32* %9
br label %12
52: ; preds = %12
%53 = load i32, i32* %5
%54 = srem i32 %53, 2
%55 = icmp eq i32 %54, 1
br i1 %55, label %56, label %73
56: ; preds = %52
%57 = load i32, i32* %5
%58 = sdiv i32 %57, 2
store i32 %58, i32* %8
%59 = load i32*, i32** %6
%60 = load i8*, i8** %4
%61 = load i32, i32* %8
%62 = sext i32 %61 to i64
%63 = getelementptr inbounds i8, i8* %60, i64 %62
%64 = load i8, i8* %63
%65 = zext i8 %64 to i64
%66 = getelementptr inbounds i32, i32* %59, i64 %65
%67 = load i32, i32* %66
%68 = trunc i32 %67 to i8
%69 = load i8*, i8** %4
%70 = load i32, i32* %8
%71 = sext i32 %70 to i64
%72 = getelementptr inbounds i8, i8* %69, i64 %71
store i8 %68, i8* %72
br label %73
73: ; preds = %56, %52
%74 = load i8*, i8** %4
%75 = load i32, i32* %5
%76 = sext i32 %75 to i64
%77 = getelementptr inbounds i8, i8* %74, i64 %76
store i8 0, i8* %77
ret void
}

LLVM IR (-O2):
define void @revcomp(i8* nocapture %0, i32 %1, i32* nocapture %2) {
%4 = sdiv i32 %1, 2
%5 = srem i32 %1, 2
%6 = icmp sgt i32 %1, 1
br i1 %6, label %7, label %67
7: ; preds = %3
%8 = zext i32 %1 to i64
%9 = zext i32 %4 to i64
%10 = and i64 %9, 1
%11 = and i32 %1, -2
%12 = icmp eq i32 %11, 2
br i1 %12, label %49, label %13
13: ; preds = %7
%14 = and i64 %9, 4294967294
br label %15
15: ; preds = %15, %13
%16 = phi i64 [ 0, %13 ], [ %46, %15 ]
%17 = phi i64 [ %8, %13 ], [ %33, %15 ]
%18 = phi i64 [ 0, %13 ], [ %47, %15 ]
%19 = add nsw i64 %17, -1
%20 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %16
%21 = load i8, i8* %20
%22 = zext i8 %21 to i64
%23 = getelementptr inbounds i32, i32* %2, i64 %22
%24 = load i32, i32* %23
%25 = trunc i32 %24 to i8
%26 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %19
%27 = load i8, i8* %26
%28 = zext i8 %27 to i64
%29 = getelementptr inbounds i32, i32* %2, i64 %28
%30 = load i32, i32* %29
%31 = trunc i32 %30 to i8
store i8 %31, i8* %20
store i8 %25, i8* %26
%32 = or i64 %16, 1
%33 = add nsw i64 %17, -2
%34 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %32
%35 = load i8, i8* %34
%36 = zext i8 %35 to i64
%37 = getelementptr inbounds i32, i32* %2, i64 %36
%38 = load i32, i32* %37
%39 = trunc i32 %38 to i8
%40 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %33
%41 = load i8, i8* %40
%42 = zext i8 %41 to i64
%43 = getelementptr inbounds i32, i32* %2, i64 %42
%44 = load i32, i32* %43
%45 = trunc i32 %44 to i8
store i8 %45, i8* %34
store i8 %39, i8* %40
%46 = add nuw nsw i64 %16, 2
%47 = add i64 %18, 2
%48 = icmp eq i64 %47, %14
br i1 %48, label %49, label %15
49: ; preds = %15, %7
%50 = phi i64 [ 0, %7 ], [ %46, %15 ]
%51 = phi i64 [ %8, %7 ], [ %33, %15 ]
%52 = icmp eq i64 %10, 0
br i1 %52, label %67, label %53
53: ; preds = %49
%54 = add nsw i64 %51, -1
%55 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %50
%56 = load i8, i8* %55
%57 = zext i8 %56 to i64
%58 = getelementptr inbounds i32, i32* %2, i64 %57
%59 = load i32, i32* %58
%60 = trunc i32 %59 to i8
%61 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %54
%62 = load i8, i8* %61
%63 = zext i8 %62 to i64
%64 = getelementptr inbounds i32, i32* %2, i64 %63
%65 = load i32, i32* %64
%66 = trunc i32 %65 to i8
store i8 %66, i8* %55
store i8 %60, i8* %61
br label %67
67: ; preds = %53, %49, %3
%68 = icmp eq i32 %5, 1
br i1 %68, label %69, label %77
69: ; preds = %67
%70 = sext i32 %4 to i64
%71 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %70
%72 = load i8, i8* %71
%73 = zext i8 %72 to i64
%74 = getelementptr inbounds i32, i32* %2, i64 %73
%75 = load i32, i32* %74
%76 = trunc i32 %75 to i8
store i8 %76, i8* %71
br label %77
77: ; preds = %69, %67
%78 = sext i32 %1 to i64
%79 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %78
store i8 0, i8* %79
ret void
}