void makecomat2D_2T(int *input1, int *mask1, int xi1, int yi1, int *input2,
                    int *mask2, int xi2, int yi2, int *coords, int levels1,
                    int levels2, int *output) {
  int x, y, xval, yval, i, j;
  for (x = 0; x < xi1; x++) {
    for (y = 0; y < yi1; y++) {
      if (mask1[x * yi1 + y] == 1) {
        i = input1[x * yi1 + y];
        xval = x + coords[0];
        yval = y + coords[1];
        if ((xval >= 0) && (xval < xi1) && (yval >= 0) && (yval < yi1)) {
          if (mask2[xval * yi2 + yval] == 1) {
            j = input2[xval * yi2 + yval];
            if (i >= 0 && i < levels1 && j >= 0 && j < levels2) {
              output[i * levels2 + j]++;
            }
          }
        }
      }
    }
  }
}


x86 assembly (clang, -O0):
<makecomat2D_2T>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    0x38(%rbp),%rax
mov    0x30(%rbp),%eax
mov    0x28(%rbp),%eax
mov    0x20(%rbp),%rax
mov    0x18(%rbp),%eax
mov    0x10(%rbp),%eax
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %edx,-0x14(%rbp)
mov    %ecx,-0x18(%rbp)
mov    %r8,-0x20(%rbp)
mov    %r9,-0x28(%rbp)
movl   $0x0,-0x2c(%rbp)
mov    -0x2c(%rbp),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
jge    1278 <makecomat2D_2T+0x178>
movl   $0x0,-0x30(%rbp)
mov    -0x30(%rbp),%eax
cmp    -0x18(%rbp),%eax
jge    1265 <makecomat2D_2T+0x165>
mov    -0x10(%rbp),%rax
mov    -0x2c(%rbp),%ecx
imul   -0x18(%rbp),%ecx
add    -0x30(%rbp),%ecx
movslq %ecx,%rcx
cmpl   $0x1,(%rax,%rcx,4)
jne    1252 <makecomat2D_2T+0x152>
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    -0x2c(%rbp),%ecx
imul   -0x18(%rbp),%ecx
add    -0x30(%rbp),%ecx
movslq %ecx,%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x3c(%rbp)
mov    -0x2c(%rbp),%eax
mov    0x20(%rbp),%rcx
add    (%rcx),%eax
mov    %eax,-0x34(%rbp)
mov    -0x30(%rbp),%eax
mov    0x20(%rbp),%rcx
add    0x4(%rcx),%eax
mov    %eax,-0x38(%rbp)
cmpl   $0x0,-0x34(%rbp)
jl     124d <makecomat2D_2T+0x14d>
mov    -0x34(%rbp),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
jge    124d <makecomat2D_2T+0x14d>
cmpl   $0x0,-0x38(%rbp)
jl     124d <makecomat2D_2T+0x14d>
mov    -0x38(%rbp),%eax
cmp    -0x18(%rbp),%eax
jge    124d <makecomat2D_2T+0x14d>
mov    -0x28(%rbp),%rax
mov    -0x34(%rbp),%ecx
imul   0x18(%rbp),%ecx
add    -0x38(%rbp),%ecx
movslq %ecx,%rcx
cmpl   $0x1,(%rax,%rcx,4)
jne    1248 <makecomat2D_2T+0x148>
mov    -0x20(%rbp),%rax
mov    -0x34(%rbp),%ecx
imul   0x18(%rbp),%ecx
add    -0x38(%rbp),%ecx
movslq %ecx,%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x40(%rbp)
cmpl   $0x0,-0x3c(%rbp)
jl     1243 <makecomat2D_2T+0x143>
mov    -0x3c(%rbp),%eax
cmp    0x28(%rbp),%eax
jge    1243 <makecomat2D_2T+0x143>
cmpl   $0x0,-0x40(%rbp)
jl     1243 <makecomat2D_2T+0x143>
mov    -0x40(%rbp),%eax
cmp    0x30(%rbp),%eax
jge    1243 <makecomat2D_2T+0x143>
mov    0x38(%rbp),%rax
mov    -0x3c(%rbp),%ecx
imul   0x30(%rbp),%ecx
add    -0x40(%rbp),%ecx
movslq %ecx,%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%edx
add    $0x1,%edx
mov    %edx,(%rax,%rcx,4)
jmp    1248 <makecomat2D_2T+0x148>
jmp    124d <makecomat2D_2T+0x14d>
jmp    1252 <makecomat2D_2T+0x152>
jmp    1257 <makecomat2D_2T+0x157>
mov    -0x30(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x30(%rbp)
jmp    1148 <makecomat2D_2T+0x48>
jmp    126a <makecomat2D_2T+0x16a>
mov    -0x2c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
jmp    1135 <makecomat2D_2T+0x35>
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<makecomat2D_2T>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
mov    %r8,-0x8(%rsp)
mov    %ecx,-0xc(%rsp)
test   %edx,%edx
jle    11e6 <makecomat2D_2T+0xe6>
mov    0x48(%rsp),%r12
mov    0x40(%rsp),%r15d
mov    -0xc(%rsp),%ecx
mov    %ecx,%eax
movslq %ecx,%r13
mov    %edx,%ecx
shl    $0x2,%r13
xor    %r8d,%r8d
jmp    1153 <makecomat2D_2T+0x53>
nopl   0x0(%rax)
add    $0x1,%r8
add    %r13,%rsi
add    %r13,%rdi
cmp    %rcx,%r8
je     11e6 <makecomat2D_2T+0xe6>
cmpl   $0x0,-0xc(%rsp)
jle    1140 <makecomat2D_2T+0x40>
xor    %r10d,%r10d
jmp    1169 <makecomat2D_2T+0x69>
nop
add    $0x1,%r10
cmp    %r10,%rax
je     1140 <makecomat2D_2T+0x40>
cmpl   $0x1,(%rsi,%r10,4)
jne    1160 <makecomat2D_2T+0x60>
mov    (%r12),%r11d
mov    %r11d,%ebx
add    %r8d,%ebx
js     1160 <makecomat2D_2T+0x60>
cmp    %edx,%ebx
jge    1160 <makecomat2D_2T+0x60>
mov    0x4(%r12),%r14d
lea    (%r10,%r14,1),%rbx
test   %ebx,%ebx
js     1160 <makecomat2D_2T+0x60>
cmp    %eax,%ebx
jge    1160 <makecomat2D_2T+0x60>
add    %r8d,%r11d
imul   %r15d,%r11d
add    %r10d,%r14d
add    %r11d,%r14d
movslq %r14d,%rbx
cmpl   $0x1,(%r9,%rbx,4)
jne    1160 <makecomat2D_2T+0x60>
mov    (%rdi,%r10,4),%r11d
test   %r11d,%r11d
js     1160 <makecomat2D_2T+0x60>
cmp    0x50(%rsp),%r11d
jge    1160 <makecomat2D_2T+0x60>
mov    -0x8(%rsp),%rbp
mov    0x0(%rbp,%rbx,4),%ebx
test   %ebx,%ebx
js     1160 <makecomat2D_2T+0x60>
cmp    0x58(%rsp),%ebx
jge    1160 <makecomat2D_2T+0x60>
imul   0x58(%rsp),%r11d
add    %r11d,%ebx
movslq %ebx,%rbx
mov    0x60(%rsp),%rbp
addl   $0x1,0x0(%rbp,%rbx,4)
jmp    1160 <makecomat2D_2T+0x60>
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define void @makecomat2D_2T(i32* %0, i32* %1, i32 %2, i32 %3, i32* %4, i32* %5, i32 %6, i32 %7, i32* %8, i32 %9, i32 %10, i32* %11) {
%13 = alloca i32*
%14 = alloca i32*
%15 = alloca i32
%16 = alloca i32
%17 = alloca i32*
%18 = alloca i32*
%19 = alloca i32
%20 = alloca i32
%21 = alloca i32*
%22 = alloca i32
%23 = alloca i32
%24 = alloca i32*
%25 = alloca i32
%26 = alloca i32
%27 = alloca i32
%28 = alloca i32
%29 = alloca i32
%30 = alloca i32
store i32* %0, i32** %13
store i32* %1, i32** %14
store i32 %2, i32* %15
store i32 %3, i32* %16
store i32* %4, i32** %17
store i32* %5, i32** %18
store i32 %6, i32* %19
store i32 %7, i32* %20
store i32* %8, i32** %21
store i32 %9, i32* %22
store i32 %10, i32* %23
store i32* %11, i32** %24
store i32 0, i32* %25
br label %31
31: ; preds = %137, %12
%32 = load i32, i32* %25
%33 = load i32, i32* %15
%34 = icmp slt i32 %32, %33
br i1 %34, label %35, label %140
35: ; preds = %31
store i32 0, i32* %26
br label %36
36: ; preds = %133, %35
%37 = load i32, i32* %26
%38 = load i32, i32* %16
%39 = icmp slt i32 %37, %38
br i1 %39, label %40, label %136
40: ; preds = %36
%41 = load i32*, i32** %14
%42 = load i32, i32* %25
%43 = load i32, i32* %16
%44 = mul nsw i32 %42, %43
%45 = load i32, i32* %26
%46 = add nsw i32 %44, %45
%47 = sext i32 %46 to i64
%48 = getelementptr inbounds i32, i32* %41, i64 %47
%49 = load i32, i32* %48
%50 = icmp eq i32 %49, 1
br i1 %50, label %51, label %132
51: ; preds = %40
%52 = load i32*, i32** %13
%53 = load i32, i32* %25
%54 = load i32, i32* %16
%55 = mul nsw i32 %53, %54
%56 = load i32, i32* %26
%57 = add nsw i32 %55, %56
%58 = sext i32 %57 to i64
%59 = getelementptr inbounds i32, i32* %52, i64 %58
%60 = load i32, i32* %59
store i32 %60, i32* %29
%61 = load i32, i32* %25
%62 = load i32*, i32** %21
%63 = getelementptr inbounds i32, i32* %62, i64 0
%64 = load i32, i32* %63
%65 = add nsw i32 %61, %64
store i32 %65, i32* %27
%66 = load i32, i32* %26
%67 = load i32*, i32** %21
%68 = getelementptr inbounds i32, i32* %67, i64 1
%69 = load i32, i32* %68
%70 = add nsw i32 %66, %69
store i32 %70, i32* %28
%71 = load i32, i32* %27
%72 = icmp sge i32 %71, 0
br i1 %72, label %73, label %131
73: ; preds = %51
%74 = load i32, i32* %27
%75 = load i32, i32* %15
%76 = icmp slt i32 %74, %75
br i1 %76, label %77, label %131
77: ; preds = %73
%78 = load i32, i32* %28
%79 = icmp sge i32 %78, 0
br i1 %79, label %80, label %131
80: ; preds = %77
%81 = load i32, i32* %28
%82 = load i32, i32* %16
%83 = icmp slt i32 %81, %82
br i1 %83, label %84, label %131
84: ; preds = %80
%85 = load i32*, i32** %18
%86 = load i32, i32* %27
%87 = load i32, i32* %20
%88 = mul nsw i32 %86, %87
%89 = load i32, i32* %28
%90 = add nsw i32 %88, %89
%91 = sext i32 %90 to i64
%92 = getelementptr inbounds i32, i32* %85, i64 %91
%93 = load i32, i32* %92
%94 = icmp eq i32 %93, 1
br i1 %94, label %95, label %130
95: ; preds = %84
%96 = load i32*, i32** %17
%97 = load i32, i32* %27
%98 = load i32, i32* %20
%99 = mul nsw i32 %97, %98
%100 = load i32, i32* %28
%101 = add nsw i32 %99, %100
%102 = sext i32 %101 to i64
%103 = getelementptr inbounds i32, i32* %96, i64 %102
%104 = load i32, i32* %103
store i32 %104, i32* %30
%105 = load i32, i32* %29
%106 = icmp sge i32 %105, 0
br i1 %106, label %107, label %129
107: ; preds = %95
%108 = load i32, i32* %29
%109 = load i32, i32* %22
%110 = icmp slt i32 %108, %109
br i1 %110, label %111, label %129
111: ; preds = %107
%112 = load i32, i32* %30
%113 = icmp sge i32 %112, 0
br i1 %113, label %114, label %129
114: ; preds = %111
%115 = load i32, i32* %30
%116 = load i32, i32* %23
%117 = icmp slt i32 %115, %116
br i1 %117, label %118, label %129
118: ; preds = %114
%119 = load i32*, i32** %24
%120 = load i32, i32* %29
%121 = load i32, i32* %23
%122 = mul nsw i32 %120, %121
%123 = load i32, i32* %30
%124 = add nsw i32 %122, %123
%125 = sext i32 %124 to i64
%126 = getelementptr inbounds i32, i32* %119, i64 %125
%127 = load i32, i32* %126
%128 = add nsw i32 %127, 1
store i32 %128, i32* %126
br label %129
129: ; preds = %118, %114, %111, %107, %95
br label %130
130: ; preds = %129, %84
br label %131
131: ; preds = %130, %80, %77, %73, %51
br label %132
132: ; preds = %131, %40
br label %133
133: ; preds = %132
%134 = load i32, i32* %26
%135 = add nsw i32 %134, 1
store i32 %135, i32* %26
br label %36
136: ; preds = %36
br label %137
137: ; preds = %136
%138 = load i32, i32* %25
%139 = add nsw i32 %138, 1
store i32 %139, i32* %25
br label %31
140: ; preds = %31
ret void
}

LLVM IR (-O2):
define void @makecomat2D_2T(i32* nocapture %0, i32* nocapture %1, i32 %2, i32 %3, i32* nocapture %4, i32* nocapture %5, i32 %6, i32 %7, i32* nocapture %8, i32 %9, i32 %10, i32* nocapture %11) {
%13 = icmp sgt i32 %2, 0
br i1 %13, label %14, label %76
14: ; preds = %12
%15 = icmp sgt i32 %3, 0
%16 = getelementptr inbounds i32, i32* %8, i64 1
%17 = sext i32 %3 to i64
%18 = zext i32 %2 to i64
%19 = zext i32 %3 to i64
br label %20
20: ; preds = %14, %73
%21 = phi i64 [ 0, %14 ], [ %74, %73 ]
br i1 %15, label %22, label %73
22: ; preds = %20
%23 = mul nsw i64 %21, %17
%24 = trunc i64 %21 to i32
br label %25
25: ; preds = %22, %70
%26 = phi i64 [ 0, %22 ], [ %71, %70 ]
%27 = add nsw i64 %26, %23
%28 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %27
%29 = load i32, i32* %28
%30 = icmp eq i32 %29, 1
br i1 %30, label %31, label %70
31: ; preds = %25
%32 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 %27
%33 = load i32, i32* %32
%34 = load i32, i32* %8
%35 = add nsw i32 %34, %24
%36 = load i32, i32* %16
%37 = trunc i64 %26 to i32
%38 = add nsw i32 %36, %37
%39 = icmp sgt i32 %35, -1
br i1 %39, label %40, label %70
40: ; preds = %31
%41 = icmp slt i32 %35, %2
%42 = icmp sgt i32 %38, -1
%43 = select i1 %41, i1 %42, i1 false
%44 = icmp slt i32 %38, %3
%45 = select i1 %43, i1 %44, i1 false
br i1 %45, label %46, label %70
46: ; preds = %40
%47 = mul nsw i32 %35, %7
%48 = add nsw i32 %47, %38
%49 = sext i32 %48 to i64
%50 = getelementptr inbounds i32, i32* %5, i64 %49
%51 = load i32, i32* %50
%52 = icmp eq i32 %51, 1
br i1 %52, label %53, label %70
53: ; preds = %46
%54 = getelementptr inbounds i32, i32* %4, i64 %49
%55 = load i32, i32* %54
%56 = icmp sgt i32 %33, -1
br i1 %56, label %57, label %70
57: ; preds = %53
%58 = icmp slt i32 %33, %9
%59 = icmp sgt i32 %55, -1
%60 = select i1 %58, i1 %59, i1 false
%61 = icmp slt i32 %55, %10
%62 = select i1 %60, i1 %61, i1 false
br i1 %62, label %63, label %70
63: ; preds = %57
%64 = mul nsw i32 %33, %10
%65 = add nsw i32 %55, %64
%66 = sext i32 %65 to i64
%67 = getelementptr inbounds i32, i32* %11, i64 %66
%68 = load i32, i32* %67
%69 = add nsw i32 %68, 1
store i32 %69, i32* %67
br label %70
70: ; preds = %25, %46, %63, %57, %53, %40, %31
%71 = add nuw nsw i64 %26, 1
%72 = icmp eq i64 %71, %19
br i1 %72, label %73, label %25
73: ; preds = %70, %20
%74 = add nuw nsw i64 %21, 1
%75 = icmp eq i64 %74, %18
br i1 %75, label %76, label %20
76: ; preds = %73, %12
ret void
}