int viterbiLoopHelper(double *delta_t, double *psi_t, double *delta_t_minus_one,
                      double *A_log, int n) {
  int i = 0;
  int j = 0;
  for (j = 0; j < n; j++) {
    for (i = 0; i < n; i++) {
      if (delta_t[j] < delta_t_minus_one[i] + A_log[i + j * n]) {
        delta_t[j] = delta_t_minus_one[i] + A_log[i + j * n];
        psi_t[j] = i;
      }
    }
  }
  return 1;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<viterbiLoopHelper>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %rdx,-0x18(%rbp)
mov    %rcx,-0x20(%rbp)
mov    %r8d,-0x24(%rbp)
movl   $0x0,-0x28(%rbp)
movl   $0x0,-0x2c(%rbp)
movl   $0x0,-0x2c(%rbp)
mov    -0x2c(%rbp),%eax
cmp    -0x24(%rbp),%eax
jge    11f2 <viterbiLoopHelper+0xf2>
movl   $0x0,-0x28(%rbp)
mov    -0x28(%rbp),%eax
cmp    -0x24(%rbp),%eax
jge    11df <viterbiLoopHelper+0xdf>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x2c(%rbp),%rcx
movsd  (%rax,%rcx,8),%xmm1
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
movsd  (%rax,%rcx,8),%xmm0
mov    -0x20(%rbp),%rax
mov    -0x28(%rbp),%ecx
mov    -0x2c(%rbp),%edx
imul   -0x24(%rbp),%edx
add    %edx,%ecx
movslq %ecx,%rcx
addsd  (%rax,%rcx,8),%xmm0
ucomisd %xmm1,%xmm0
jbe    11cc <viterbiLoopHelper+0xcc>
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
movsd  (%rax,%rcx,8),%xmm0
mov    -0x20(%rbp),%rax
mov    -0x28(%rbp),%ecx
mov    -0x2c(%rbp),%edx
imul   -0x24(%rbp),%edx
add    %edx,%ecx
movslq %ecx,%rcx
addsd  (%rax,%rcx,8),%xmm0
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x2c(%rbp),%rcx
movsd  %xmm0,(%rax,%rcx,8)
cvtsi2sdl -0x28(%rbp),%xmm0
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x2c(%rbp),%rcx
movsd  %xmm0,(%rax,%rcx,8)
jmp    11d1 <viterbiLoopHelper+0xd1>
mov    -0x28(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x28(%rbp)
jmp    1140 <viterbiLoopHelper+0x40>
jmp    11e4 <viterbiLoopHelper+0xe4>
mov    -0x2c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
jmp    112d <viterbiLoopHelper+0x2d>
mov    $0x1,%eax
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<viterbiLoopHelper>:
test   %r8d,%r8d
jle    1160 <viterbiLoopHelper+0x60>
mov    %r8d,%r9d
lea    0x0(,%r9,8),%r8
xor    %r10d,%r10d
jmp    112c <viterbiLoopHelper+0x2c>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nop
add    $0x1,%r10
add    %r8,%rcx
cmp    %r9,%r10
je     1160 <viterbiLoopHelper+0x60>
xor    %eax,%eax
jmp    1139 <viterbiLoopHelper+0x39>
add    $0x1,%rax
cmp    %rax,%r9
je     1120 <viterbiLoopHelper+0x20>
movsd  (%rdx,%rax,8),%xmm0
addsd  (%rcx,%rax,8),%xmm0
ucomisd (%rdi,%r10,8),%xmm0
jbe    1130 <viterbiLoopHelper+0x30>
movsd  %xmm0,(%rdi,%r10,8)
xorps  %xmm0,%xmm0
cvtsi2sd %eax,%xmm0
movsd  %xmm0,(%rsi,%r10,8)
jmp    1130 <viterbiLoopHelper+0x30>
mov    $0x1,%eax
ret

LLVM IR (-O0):
define i32 @viterbiLoopHelper(double* %0, double* %1, double* %2, double* %3, i32 %4) {
%6 = alloca double*
%7 = alloca double*
%8 = alloca double*
%9 = alloca double*
%10 = alloca i32
%11 = alloca i32
%12 = alloca i32
store double* %0, double** %6
store double* %1, double** %7
store double* %2, double** %8
store double* %3, double** %9
store i32 %4, i32* %10
store i32 0, i32* %11
store i32 0, i32* %12
store i32 0, i32* %12
br label %13
13: ; preds = %75, %5
%14 = load i32, i32* %12
%15 = load i32, i32* %10
%16 = icmp slt i32 %14, %15
br i1 %16, label %17, label %78
17: ; preds = %13
store i32 0, i32* %11
br label %18
18: ; preds = %71, %17
%19 = load i32, i32* %11
%20 = load i32, i32* %10
%21 = icmp slt i32 %19, %20
br i1 %21, label %22, label %74
22: ; preds = %18
%23 = load double*, double** %6
%24 = load i32, i32* %12
%25 = sext i32 %24 to i64
%26 = getelementptr inbounds double, double* %23, i64 %25
%27 = load double, double* %26
%28 = load double*, double** %8
%29 = load i32, i32* %11
%30 = sext i32 %29 to i64
%31 = getelementptr inbounds double, double* %28, i64 %30
%32 = load double, double* %31
%33 = load double*, double** %9
%34 = load i32, i32* %11
%35 = load i32, i32* %12
%36 = load i32, i32* %10
%37 = mul nsw i32 %35, %36
%38 = add nsw i32 %34, %37
%39 = sext i32 %38 to i64
%40 = getelementptr inbounds double, double* %33, i64 %39
%41 = load double, double* %40
%42 = fadd double %32, %41
%43 = fcmp olt double %27, %42
br i1 %43, label %44, label %70
44: ; preds = %22
%45 = load double*, double** %8
%46 = load i32, i32* %11
%47 = sext i32 %46 to i64
%48 = getelementptr inbounds double, double* %45, i64 %47
%49 = load double, double* %48
%50 = load double*, double** %9
%51 = load i32, i32* %11
%52 = load i32, i32* %12
%53 = load i32, i32* %10
%54 = mul nsw i32 %52, %53
%55 = add nsw i32 %51, %54
%56 = sext i32 %55 to i64
%57 = getelementptr inbounds double, double* %50, i64 %56
%58 = load double, double* %57
%59 = fadd double %49, %58
%60 = load double*, double** %6
%61 = load i32, i32* %12
%62 = sext i32 %61 to i64
%63 = getelementptr inbounds double, double* %60, i64 %62
store double %59, double* %63
%64 = load i32, i32* %11
%65 = sitofp i32 %64 to double
%66 = load double*, double** %7
%67 = load i32, i32* %12
%68 = sext i32 %67 to i64
%69 = getelementptr inbounds double, double* %66, i64 %68
store double %65, double* %69
br label %70
70: ; preds = %44, %22
br label %71
71: ; preds = %70
%72 = load i32, i32* %11
%73 = add nsw i32 %72, 1
store i32 %73, i32* %11
br label %18
74: ; preds = %18
br label %75
75: ; preds = %74
%76 = load i32, i32* %12
%77 = add nsw i32 %76, 1
store i32 %77, i32* %12
br label %13
78: ; preds = %13
ret i32 1
}

LLVM IR (-O2):
define i32 @viterbiLoopHelper(double* nocapture %0, double* nocapture writeonly %1, double* nocapture %2, double* nocapture %3, i32 %4) {
%6 = icmp sgt i32 %4, 0
br i1 %6, label %7, label %34
7: ; preds = %5
%8 = zext i32 %4 to i64
%9 = zext i32 %4 to i64
br label %10
10: ; preds = %31, %7
%11 = phi i64 [ 0, %7 ], [ %32, %31 ]
%12 = getelementptr inbounds double, double* %0, i64 %11
%13 = mul nsw i64 %11, %8
%14 = getelementptr inbounds double, double* %1, i64 %11
br label %15
15: ; preds = %10, %28
%16 = phi i64 [ 0, %10 ], [ %29, %28 ]
%17 = load double, double* %12
%18 = getelementptr inbounds double, double* %2, i64 %16
%19 = load double, double* %18
%20 = add nuw nsw i64 %16, %13
%21 = getelementptr inbounds double, double* %3, i64 %20
%22 = load double, double* %21
%23 = fadd double %19, %22
%24 = fcmp olt double %17, %23
br i1 %24, label %25, label %28
25: ; preds = %15
store double %23, double* %12
%26 = trunc i64 %16 to i32
%27 = sitofp i32 %26 to double
store double %27, double* %14
br label %28
28: ; preds = %15, %25
%29 = add nuw nsw i64 %16, 1
%30 = icmp eq i64 %29, %9
br i1 %30, label %31, label %15
31: ; preds = %28
%32 = add nuw nsw i64 %11, 1
%33 = icmp eq i64 %32, %9
br i1 %33, label %34, label %10
34: ; preds = %31, %5
ret i32 1
}