int getAdjNum(int **adj, int num_genes) {
  int i, j;
  int num;
  int k;
  num = 2 * num_genes;
  k = 0;
  for (i = 1; i <= num; i++)
    for (j = 1; j <= num; j++)
      k += adj[i][j];
  k /= 2;
  return (k);
}


x86 assembly (clang, -O0):
<getAdjNum>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %esi,-0xc(%rbp)
mov    -0xc(%rbp),%eax
shl    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x18(%rbp)
movl   $0x0,-0x1c(%rbp)
movl   $0x1,-0x10(%rbp)
mov    -0x10(%rbp),%eax
cmp    -0x18(%rbp),%eax
jg     117b <getAdjNum+0x7b>
movl   $0x1,-0x14(%rbp)
mov    -0x14(%rbp),%eax
cmp    -0x18(%rbp),%eax
jg     1168 <getAdjNum+0x68>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x10(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x14(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
add    -0x1c(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
mov    -0x14(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x14(%rbp)
jmp    1135 <getAdjNum+0x35>
jmp    116d <getAdjNum+0x6d>
mov    -0x10(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x10(%rbp)
jmp    1122 <getAdjNum+0x22>
mov    -0x1c(%rbp),%eax
mov    $0x2,%ecx
cltd
idiv   %ecx
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
mov    -0x1c(%rbp),%eax
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<getAdjNum>:
push   %r15
push   %r14
push   %r12
push   %rbx
test   %esi,%esi
jle    1291 <getAdjNum+0x191>
add    %esi,%esi
cmp    $0x2,%esi
mov    $0x1,%r15d
cmovge %esi,%r15d
lea    0x1(%r15),%rcx
lea    -0x8(%r15),%r10
mov    %r10,%r8
shr    $0x3,%r8
add    $0x1,%r8
mov    %r15d,%r11d
and    $0x7ffffff8,%r11d
lea    0x1(%r11),%r9
mov    %r8d,%r14d
and    $0x3,%r14d
and    $0xfffffffffffffffc,%r8
xor    %edx,%edx
mov    $0x1,%r12d
jmp    116d <getAdjNum+0x6d>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
xchg   %ax,%ax
add    $0x1,%r12
cmp    %rcx,%r12
je     1293 <getAdjNum+0x193>
mov    (%rdi,%r12,8),%rbx
cmp    $0x8,%r15d
jae    1190 <getAdjNum+0x90>
mov    $0x1,%eax
jmp    1280 <getAdjNum+0x180>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   0x0(%rax,%rax,1)
movd   %edx,%xmm0
pxor   %xmm1,%xmm1
cmp    $0x18,%r10
jae    11b0 <getAdjNum+0xb0>
xor    %edx,%edx
jmp    121a <getAdjNum+0x11a>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   0x0(%rax)
mov    %r8,%rax
xor    %edx,%edx
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nop
movdqu 0x4(%rbx,%rdx,4),%xmm2
paddd  %xmm0,%xmm2
movdqu 0x14(%rbx,%rdx,4),%xmm0
paddd  %xmm1,%xmm0
movdqu 0x24(%rbx,%rdx,4),%xmm1
movdqu 0x34(%rbx,%rdx,4),%xmm3
movdqu 0x44(%rbx,%rdx,4),%xmm4
paddd  %xmm1,%xmm4
paddd  %xmm2,%xmm4
movdqu 0x54(%rbx,%rdx,4),%xmm2
paddd  %xmm3,%xmm2
paddd  %xmm0,%xmm2
movdqu 0x64(%rbx,%rdx,4),%xmm0
paddd  %xmm4,%xmm0
movdqu 0x74(%rbx,%rdx,4),%xmm1
paddd  %xmm2,%xmm1
add    $0x20,%rdx
add    $0xfffffffffffffffc,%rax
jne    11c0 <getAdjNum+0xc0>
test   %r14,%r14
je     1259 <getAdjNum+0x159>
mov    %r14,%rax
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   0x0(%rax)
lea    0x0(,%rdx,4),%rsi
or     $0x4,%rsi
movdqu (%rbx,%rsi,1),%xmm2
paddd  %xmm2,%xmm0
movdqu 0x10(%rbx,%rsi,1),%xmm2
paddd  %xmm2,%xmm1
add    $0x8,%rdx
add    $0xffffffffffffffff,%rax
jne    1230 <getAdjNum+0x130>
paddd  %xmm1,%xmm0
pshufd $0xee,%xmm0,%xmm1
paddd  %xmm0,%xmm1
pshufd $0x55,%xmm1,%xmm0
paddd  %xmm1,%xmm0
movd   %xmm0,%edx
mov    %r9,%rax
cmp    %r11,%r15
je     1160 <getAdjNum+0x60>
nop
add    (%rbx,%rax,4),%edx
add    $0x1,%rax
cmp    %rax,%rcx
jne    1280 <getAdjNum+0x180>
jmp    1160 <getAdjNum+0x60>
xor    %edx,%edx
mov    %edx,%eax
shr    $0x1f,%eax
add    %edx,%eax
sar    %eax
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r14
pop    %r15
ret

LLVM IR (-O0):
define i32 @getAdjNum(i32** %0, i32 %1) {
%3 = alloca i32**
%4 = alloca i32
%5 = alloca i32
%6 = alloca i32
%7 = alloca i32
%8 = alloca i32
store i32** %0, i32*** %3
store i32 %1, i32* %4
%9 = load i32, i32* %4
%10 = mul nsw i32 2, %9
store i32 %10, i32* %7
store i32 0, i32* %8
store i32 1, i32* %5
br label %11
11: ; preds = %36, %2
%12 = load i32, i32* %5
%13 = load i32, i32* %7
%14 = icmp sle i32 %12, %13
br i1 %14, label %15, label %39
15: ; preds = %11
store i32 1, i32* %6
br label %16
16: ; preds = %32, %15
%17 = load i32, i32* %6
%18 = load i32, i32* %7
%19 = icmp sle i32 %17, %18
br i1 %19, label %20, label %35
20: ; preds = %16
%21 = load i32**, i32*** %3
%22 = load i32, i32* %5
%23 = sext i32 %22 to i64
%24 = getelementptr inbounds i32*, i32** %21, i64 %23
%25 = load i32*, i32** %24
%26 = load i32, i32* %6
%27 = sext i32 %26 to i64
%28 = getelementptr inbounds i32, i32* %25, i64 %27
%29 = load i32, i32* %28
%30 = load i32, i32* %8
%31 = add nsw i32 %30, %29
store i32 %31, i32* %8
br label %32
32: ; preds = %20
%33 = load i32, i32* %6
%34 = add nsw i32 %33, 1
store i32 %34, i32* %6
br label %16
35: ; preds = %16
br label %36
36: ; preds = %35
%37 = load i32, i32* %5
%38 = add nsw i32 %37, 1
store i32 %38, i32* %5
br label %11
39: ; preds = %11
%40 = load i32, i32* %8
%41 = sdiv i32 %40, 2
store i32 %41, i32* %8
%42 = load i32, i32* %8
ret i32 %42
}

LLVM IR (-O2):
define i32 @getAdjNum(i32** nocapture %0, i32 %1) {
%3 = icmp slt i32 %1, 1
br i1 %3, label %115, label %4
4: ; preds = %2
%5 = shl nuw i32 %1, 1
%6 = call i32 @llvm.smax.i32(i32 %5, i32 1)
%7 = add nuw nsw i32 %6, 1
%8 = zext i32 %7 to i64
%9 = add nsw i64 %8, -1
%10 = add nsw i64 %8, -9
%11 = lshr i64 %10, 3
%12 = add nuw nsw i64 %11, 1
%13 = icmp ult i64 %9, 8
%14 = and i64 %9, -8
%15 = or i64 %14, 1
%16 = and i64 %12, 3
%17 = icmp ult i64 %10, 24
%18 = and i64 %12, 4611686018427387900
%19 = icmp eq i64 %16, 0
%20 = icmp eq i64 %9, %14
br label %21
21: ; preds = %111, %4
%22 = phi i64 [ 1, %4 ], [ %113, %111 ]
%23 = phi i32 [ 0, %4 ], [ %112, %111 ]
%24 = getelementptr inbounds i32*, i32** %0, i64 %22
%25 = load i32*, i32** %24
br i1 %13, label %100, label %26
26: ; preds = %21
%27 = insertelement <4 x i32> <i32 poison, i32 0, i32 0, i32 0>, i32 %23, i64 0
br i1 %17, label %72, label %28
28: ; preds = %26, %28
%29 = phi i64 [ %69, %28 ], [ 0, %26 ]
%30 = phi <4 x i32> [ %67, %28 ], [ %27, %26 ]
%31 = phi <4 x i32> [ %68, %28 ], [ zeroinitializer, %26 ]
%32 = phi i64 [ %70, %28 ], [ 0, %26 ]
%33 = or i64 %29, 1
%34 = getelementptr inbounds i32, i32* %25, i64 %33
%35 = bitcast i32* %34 to <4 x i32>*
%36 = load <4 x i32>, <4 x i32>* %35
%37 = getelementptr inbounds i32, i32* %34, i64 4
%38 = bitcast i32* %37 to <4 x i32>*
%39 = load <4 x i32>, <4 x i32>* %38
%40 = add <4 x i32> %36, %30
%41 = add <4 x i32> %39, %31
%42 = or i64 %29, 9
%43 = getelementptr inbounds i32, i32* %25, i64 %42
%44 = bitcast i32* %43 to <4 x i32>*
%45 = load <4 x i32>, <4 x i32>* %44
%46 = getelementptr inbounds i32, i32* %43, i64 4
%47 = bitcast i32* %46 to <4 x i32>*
%48 = load <4 x i32>, <4 x i32>* %47
%49 = add <4 x i32> %45, %40
%50 = add <4 x i32> %48, %41
%51 = or i64 %29, 17
%52 = getelementptr inbounds i32, i32* %25, i64 %51
%53 = bitcast i32* %52 to <4 x i32>*
%54 = load <4 x i32>, <4 x i32>* %53
%55 = getelementptr inbounds i32, i32* %52, i64 4
%56 = bitcast i32* %55 to <4 x i32>*
%57 = load <4 x i32>, <4 x i32>* %56
%58 = add <4 x i32> %54, %49
%59 = add <4 x i32> %57, %50
%60 = or i64 %29, 25
%61 = getelementptr inbounds i32, i32* %25, i64 %60
%62 = bitcast i32* %61 to <4 x i32>*
%63 = load <4 x i32>, <4 x i32>* %62
%64 = getelementptr inbounds i32, i32* %61, i64 4
%65 = bitcast i32* %64 to <4 x i32>*
%66 = load <4 x i32>, <4 x i32>* %65
%67 = add <4 x i32> %63, %58
%68 = add <4 x i32> %66, %59
%69 = add nuw i64 %29, 32
%70 = add i64 %32, 4
%71 = icmp eq i64 %70, %18
br i1 %71, label %72, label %28
72: ; preds = %28, %26
%73 = phi <4 x i32> [ undef, %26 ], [ %67, %28 ]
%74 = phi <4 x i32> [ undef, %26 ], [ %68, %28 ]
%75 = phi i64 [ 0, %26 ], [ %69, %28 ]
%76 = phi <4 x i32> [ %27, %26 ], [ %67, %28 ]
%77 = phi <4 x i32> [ zeroinitializer, %26 ], [ %68, %28 ]
br i1 %19, label %95, label %78
78: ; preds = %72, %78
%79 = phi i64 [ %92, %78 ], [ %75, %72 ]
%80 = phi <4 x i32> [ %90, %78 ], [ %76, %72 ]
%81 = phi <4 x i32> [ %91, %78 ], [ %77, %72 ]
%82 = phi i64 [ %93, %78 ], [ 0, %72 ]
%83 = or i64 %79, 1
%84 = getelementptr inbounds i32, i32* %25, i64 %83
%85 = bitcast i32* %84 to <4 x i32>*
%86 = load <4 x i32>, <4 x i32>* %85
%87 = getelementptr inbounds i32, i32* %84, i64 4
%88 = bitcast i32* %87 to <4 x i32>*
%89 = load <4 x i32>, <4 x i32>* %88
%90 = add <4 x i32> %86, %80
%91 = add <4 x i32> %89, %81
%92 = add nuw i64 %79, 8
%93 = add i64 %82, 1
%94 = icmp eq i64 %93, %16
br i1 %94, label %95, label %78
95: ; preds = %78, %72
%96 = phi <4 x i32> [ %73, %72 ], [ %90, %78 ]
%97 = phi <4 x i32> [ %74, %72 ], [ %91, %78 ]
%98 = add <4 x i32> %97, %96
%99 = call i32 @llvm.vector.reduce.add.v4i32(<4 x i32> %98)
br i1 %20, label %111, label %100
100: ; preds = %21, %95
%101 = phi i64 [ 1, %21 ], [ %15, %95 ]
%102 = phi i32 [ %23, %21 ], [ %99, %95 ]
br label %103
103: ; preds = %100, %103
%104 = phi i64 [ %109, %103 ], [ %101, %100 ]
%105 = phi i32 [ %108, %103 ], [ %102, %100 ]
%106 = getelementptr inbounds i32, i32* %25, i64 %104
%107 = load i32, i32* %106
%108 = add nsw i32 %107, %105
%109 = add nuw nsw i64 %104, 1
%110 = icmp eq i64 %109, %8
br i1 %110, label %111, label %103
111: ; preds = %103, %95
%112 = phi i32 [ %99, %95 ], [ %108, %103 ]
%113 = add nuw nsw i64 %22, 1
%114 = icmp eq i64 %113, %8
br i1 %114, label %115, label %21
115: ; preds = %111, %2
%116 = phi i32 [ 0, %2 ], [ %112, %111 ]
%117 = sdiv i32 %116, 2
ret i32 %117
}