#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
int /*<<< orphan*/ exit(int);
int /*<<< orphan*/ fprintf(int /*<<< orphan*/, char *, char *, int, int, int,
                           int);
int /*<<< orphan*/ stderr;
void validate_novel_aa(int *xascii, int p_nsq, int dnaseq) {
  int isq, err_p_nsq_limit;
  if (dnaseq != 1 && dnaseq != 3) {
    if (xascii['O'] > p_nsq || xascii['o'] > p_nsq) {
      xascii['O'] = xascii['K'];
      xascii['o'] = xascii['k'];
    }
    if (xascii['U'] > p_nsq || xascii['u'] > p_nsq) {
      xascii['U'] = xascii['C'];
      xascii['u'] = xascii['c'];
    }
    if (xascii['J'] > p_nsq || xascii['j'] > p_nsq) {
      xascii['J'] = xascii['L'];
      xascii['j'] = xascii['l'];
    }
  }
  err_p_nsq_limit = 0;
  for (isq = 'A'; isq <= 'Z'; isq++) {
    if (xascii[isq] < 123 && xascii[isq] > p_nsq) {
      fprintf(stderr, "*** ERROR [%s:%d] xascii['%c']:%d > %d\n",
              "/scratch/repos/new/home/jordi_armengol_estape/c-scraper/outputs/"
              "2022-01-22/02-19-57/repos/uwbmrb/BMRB-API/refs/heads/master/"
              "server/wsgi/bmrbapi/submodules/fasta36/src/apam.c",
              471, isq, xascii[isq], p_nsq);
      err_p_nsq_limit = 1;
    }
  }
  if (err_p_nsq_limit) {
    exit(1);
  }
}


x86 assembly (clang, -O0):
<validate_novel_aa>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x20,%rsp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %esi,-0xc(%rbp)
mov    %edx,-0x10(%rbp)
cmpl   $0x1,-0x10(%rbp)
je     1235 <validate_novel_aa+0x115>
cmpl   $0x3,-0x10(%rbp)
je     1235 <validate_novel_aa+0x115>
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    0x13c(%rax),%eax
cmp    -0xc(%rbp),%eax
jg     116c <validate_novel_aa+0x4c>
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    0x1bc(%rax),%eax
cmp    -0xc(%rbp),%eax
jle    1194 <validate_novel_aa+0x74>
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    0x12c(%rax),%ecx
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    %ecx,0x13c(%rax)
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    0x1ac(%rax),%ecx
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    %ecx,0x1bc(%rax)
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    0x154(%rax),%eax
cmp    -0xc(%rbp),%eax
jg     11ba <validate_novel_aa+0x9a>
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    0x1d4(%rax),%eax
cmp    -0xc(%rbp),%eax
jle    11e2 <validate_novel_aa+0xc2>
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    0x10c(%rax),%ecx
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    %ecx,0x154(%rax)
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    0x18c(%rax),%ecx
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    %ecx,0x1d4(%rax)
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    0x128(%rax),%eax
cmp    -0xc(%rbp),%eax
jg     1208 <validate_novel_aa+0xe8>
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    0x1a8(%rax),%eax
cmp    -0xc(%rbp),%eax
jle    1230 <validate_novel_aa+0x110>
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    0x130(%rax),%ecx
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    %ecx,0x128(%rax)
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    0x1b0(%rax),%ecx
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    %ecx,0x1a8(%rax)
jmp    1235 <validate_novel_aa+0x115>
movl   $0x0,-0x18(%rbp)
movl   $0x41,-0x14(%rbp)
cmpl   $0x5a,-0x14(%rbp)
jg     12c4 <validate_novel_aa+0x1a4>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x14(%rbp),%rcx
cmpl   $0x7b,(%rax,%rcx,4)
jge    12b1 <validate_novel_aa+0x191>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x14(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
cmp    -0xc(%rbp),%eax
jle    12b1 <validate_novel_aa+0x191>
mov    0x2d66(%rip),%rax
mov    (%rax),%edi
mov    -0x14(%rbp),%r8d
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x14(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%r9d
mov    -0xc(%rbp),%eax
lea    0xd6a(%rip),%rsi
lea    0xd8b(%rip),%rdx
mov    $0x1d7,%ecx
mov    %eax,(%rsp)
call   1030 <fprintf@plt>
movl   $0x1,-0x18(%rbp)
jmp    12b6 <validate_novel_aa+0x196>
mov    -0x14(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x14(%rbp)
jmp    1243 <validate_novel_aa+0x123>
cmpl   $0x0,-0x18(%rbp)
je     12d8 <validate_novel_aa+0x1b8>
mov    $0x1,%edi
call   1040 <exit@plt>
add    $0x20,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<validate_novel_aa>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
push   %rax
mov    %esi,%r14d
mov    %rdi,%rbx
and    $0xfffffffd,%edx
cmp    $0x1,%edx
je     11b7 <validate_novel_aa+0x97>
cmp    %r14d,0x13c(%rbx)
jg     114b <validate_novel_aa+0x2b>
cmp    %r14d,0x1bc(%rbx)
jle    1163 <validate_novel_aa+0x43>
mov    0x12c(%rbx),%eax
mov    0x1ac(%rbx),%ecx
mov    %eax,0x13c(%rbx)
mov    %ecx,0x1bc(%rbx)
cmp    %r14d,0x154(%rbx)
jg     1175 <validate_novel_aa+0x55>
cmp    %r14d,0x1d4(%rbx)
jle    118d <validate_novel_aa+0x6d>
mov    0x10c(%rbx),%eax
mov    0x18c(%rbx),%ecx
mov    %eax,0x154(%rbx)
mov    %ecx,0x1d4(%rbx)
cmp    %r14d,0x128(%rbx)
jg     119f <validate_novel_aa+0x7f>
cmp    %r14d,0x1a8(%rbx)
jle    11b7 <validate_novel_aa+0x97>
mov    0x130(%rbx),%eax
mov    0x1b0(%rbx),%ecx
mov    %eax,0x128(%rbx)
mov    %ecx,0x1a8(%rbx)
mov    $0x1,%al
mov    $0x41,%ebp
mov    0x2e1b(%rip),%r13
lea    0xe34(%rip),%r15
lea    0xe55(%rip),%r12
jmp    11ea <validate_novel_aa+0xca>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nop
add    $0x1,%rbp
cmp    $0x5b,%rbp
je     1225 <validate_novel_aa+0x105>
mov    (%rbx,%rbp,4),%r9d
cmp    $0x7a,%r9d
jg     11e0 <validate_novel_aa+0xc0>
cmp    %r14d,%r9d
jle    11e0 <validate_novel_aa+0xc0>
mov    0x0(%r13),%edi
mov    %r14d,(%rsp)
mov    %r15,%rsi
mov    %r12,%rdx
mov    $0x1d7,%ecx
mov    %ebp,%r8d
call   1030 <fprintf@plt>
lea    0x1(%rbp),%rcx
xor    %eax,%eax
cmp    $0x5a,%rbp
mov    %rcx,%rbp
jne    11ea <validate_novel_aa+0xca>
jmp    1238 <validate_novel_aa+0x118>
test   $0x1,%al
je     1238 <validate_novel_aa+0x118>
add    $0x8,%rsp
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret
mov    $0x1,%edi
call   1040 <exit@plt>

LLVM IR (-O0):
@stderr = global i32 0
@.str = [40 x i8] c"*** ERROR [%s:%d] xascii['%c']:%d > %d\0A\00"
@.str.1 = [174 x i8] c"/scratch/repos/new/home/jordi_armengol_estape/c-scraper/outputs/2022-01-22/02-19-57/repos/uwbmrb/BMRB-API/refs/heads/master/server/wsgi/bmrbapi/submodules/fasta36/src/apam.c\00"
define void @validate_novel_aa(i32* %0, i32 %1, i32 %2) {
%4 = alloca i32*
%5 = alloca i32
%6 = alloca i32
%7 = alloca i32
%8 = alloca i32
store i32* %0, i32** %4
store i32 %1, i32* %5
store i32 %2, i32* %6
%9 = load i32, i32* %6
%10 = icmp ne i32 %9, 1
br i1 %10, label %11, label %84
11: ; preds = %3
%12 = load i32, i32* %6
%13 = icmp ne i32 %12, 3
br i1 %13, label %14, label %84
14: ; preds = %11
%15 = load i32*, i32** %4
%16 = getelementptr inbounds i32, i32* %15, i64 79
%17 = load i32, i32* %16
%18 = load i32, i32* %5
%19 = icmp sgt i32 %17, %18
br i1 %19, label %26, label %20
20: ; preds = %14
%21 = load i32*, i32** %4
%22 = getelementptr inbounds i32, i32* %21, i64 111
%23 = load i32, i32* %22
%24 = load i32, i32* %5
%25 = icmp sgt i32 %23, %24
br i1 %25, label %26, label %37
26: ; preds = %20, %14
%27 = load i32*, i32** %4
%28 = getelementptr inbounds i32, i32* %27, i64 75
%29 = load i32, i32* %28
%30 = load i32*, i32** %4
%31 = getelementptr inbounds i32, i32* %30, i64 79
store i32 %29, i32* %31
%32 = load i32*, i32** %4
%33 = getelementptr inbounds i32, i32* %32, i64 107
%34 = load i32, i32* %33
%35 = load i32*, i32** %4
%36 = getelementptr inbounds i32, i32* %35, i64 111
store i32 %34, i32* %36
br label %37
37: ; preds = %26, %20
%38 = load i32*, i32** %4
%39 = getelementptr inbounds i32, i32* %38, i64 85
%40 = load i32, i32* %39
%41 = load i32, i32* %5
%42 = icmp sgt i32 %40, %41
br i1 %42, label %49, label %43
43: ; preds = %37
%44 = load i32*, i32** %4
%45 = getelementptr inbounds i32, i32* %44, i64 117
%46 = load i32, i32* %45
%47 = load i32, i32* %5
%48 = icmp sgt i32 %46, %47
br i1 %48, label %49, label %60
49: ; preds = %43, %37
%50 = load i32*, i32** %4
%51 = getelementptr inbounds i32, i32* %50, i64 67
%52 = load i32, i32* %51
%53 = load i32*, i32** %4
%54 = getelementptr inbounds i32, i32* %53, i64 85
store i32 %52, i32* %54
%55 = load i32*, i32** %4
%56 = getelementptr inbounds i32, i32* %55, i64 99
%57 = load i32, i32* %56
%58 = load i32*, i32** %4
%59 = getelementptr inbounds i32, i32* %58, i64 117
store i32 %57, i32* %59
br label %60
60: ; preds = %49, %43
%61 = load i32*, i32** %4
%62 = getelementptr inbounds i32, i32* %61, i64 74
%63 = load i32, i32* %62
%64 = load i32, i32* %5
%65 = icmp sgt i32 %63, %64
br i1 %65, label %72, label %66
66: ; preds = %60
%67 = load i32*, i32** %4
%68 = getelementptr inbounds i32, i32* %67, i64 106
%69 = load i32, i32* %68
%70 = load i32, i32* %5
%71 = icmp sgt i32 %69, %70
br i1 %71, label %72, label %83
72: ; preds = %66, %60
%73 = load i32*, i32** %4
%74 = getelementptr inbounds i32, i32* %73, i64 76
%75 = load i32, i32* %74
%76 = load i32*, i32** %4
%77 = getelementptr inbounds i32, i32* %76, i64 74
store i32 %75, i32* %77
%78 = load i32*, i32** %4
%79 = getelementptr inbounds i32, i32* %78, i64 108
%80 = load i32, i32* %79
%81 = load i32*, i32** %4
%82 = getelementptr inbounds i32, i32* %81, i64 106
store i32 %80, i32* %82
br label %83
83: ; preds = %72, %66
br label %84
84: ; preds = %83, %11, %3
store i32 0, i32* %8
store i32 65, i32* %7
br label %85
85: ; preds = %114, %84
%86 = load i32, i32* %7
%87 = icmp sle i32 %86, 90
br i1 %87, label %88, label %117
88: ; preds = %85
%89 = load i32*, i32** %4
%90 = load i32, i32* %7
%91 = sext i32 %90 to i64
%92 = getelementptr inbounds i32, i32* %89, i64 %91
%93 = load i32, i32* %92
%94 = icmp slt i32 %93, 123
br i1 %94, label %95, label %113
95: ; preds = %88
%96 = load i32*, i32** %4
%97 = load i32, i32* %7
%98 = sext i32 %97 to i64
%99 = getelementptr inbounds i32, i32* %96, i64 %98
%100 = load i32, i32* %99
%101 = load i32, i32* %5
%102 = icmp sgt i32 %100, %101
br i1 %102, label %103, label %113
103: ; preds = %95
%104 = load i32, i32* @stderr
%105 = load i32, i32* %7
%106 = load i32*, i32** %4
%107 = load i32, i32* %7
%108 = sext i32 %107 to i64
%109 = getelementptr inbounds i32, i32* %106, i64 %108
%110 = load i32, i32* %109
%111 = load i32, i32* %5
%112 = call i32 @fprintf(i32 %104, i8* getelementptr inbounds ([40 x i8], [40 x i8]* @.str, i64 0, i64 0), i8* getelementptr inbounds ([174 x i8], [174 x i8]* @.str.1, i64 0, i64 0), i32 471, i32 %105, i32 %110, i32 %111)
store i32 1, i32* %8
br label %113
113: ; preds = %103, %95, %88
br label %114
114: ; preds = %113
%115 = load i32, i32* %7
%116 = add nsw i32 %115, 1
store i32 %116, i32* %7
br label %85
117: ; preds = %85
%118 = load i32, i32* %8
%119 = icmp ne i32 %118, 0
br i1 %119, label %120, label %122
120: ; preds = %117
%121 = call i32 @exit(i32 1)
unreachable
122: ; preds = %117
ret void
}

LLVM IR (-O2):
@stderr = global i32 0
@.str = [40 x i8] c"*** ERROR [%s:%d] xascii['%c']:%d > %d\0A\00"
@.str.1 = [174 x i8] c"/scratch/repos/new/home/jordi_armengol_estape/c-scraper/outputs/2022-01-22/02-19-57/repos/uwbmrb/BMRB-API/refs/heads/master/server/wsgi/bmrbapi/submodules/fasta36/src/apam.c\00"
define void @validate_novel_aa(i32* nocapture %0, i32 %1, i32 %2) {
%4 = and i32 %2, -3
%5 = icmp eq i32 %4, 1
br i1 %5, label %48, label %6
6: ; preds = %3
%7 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 79
%8 = load i32, i32* %7
%9 = icmp sgt i32 %8, %1
br i1 %9, label %14, label %10
10: ; preds = %6
%11 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 111
%12 = load i32, i32* %11
%13 = icmp sgt i32 %12, %1
br i1 %13, label %14, label %20
14: ; preds = %10, %6
%15 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 75
%16 = load i32, i32* %15
store i32 %16, i32* %7
%17 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 107
%18 = load i32, i32* %17
%19 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 111
store i32 %18, i32* %19
br label %20
20: ; preds = %14, %10
%21 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 85
%22 = load i32, i32* %21
%23 = icmp sgt i32 %22, %1
br i1 %23, label %28, label %24
24: ; preds = %20
%25 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 117
%26 = load i32, i32* %25
%27 = icmp sgt i32 %26, %1
br i1 %27, label %28, label %34
28: ; preds = %24, %20
%29 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 67
%30 = load i32, i32* %29
store i32 %30, i32* %21
%31 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 99
%32 = load i32, i32* %31
%33 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 117
store i32 %32, i32* %33
br label %34
34: ; preds = %28, %24
%35 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 74
%36 = load i32, i32* %35
%37 = icmp sgt i32 %36, %1
br i1 %37, label %42, label %38
38: ; preds = %34
%39 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 106
%40 = load i32, i32* %39
%41 = icmp sgt i32 %40, %1
br i1 %41, label %42, label %48
42: ; preds = %38, %34
%43 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 76
%44 = load i32, i32* %43
store i32 %44, i32* %35
%45 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 108
%46 = load i32, i32* %45
%47 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 106
store i32 %46, i32* %47
br label %48
48: ; preds = %38, %42, %3
br label %49
49: ; preds = %48, %62
%50 = phi i64 [ %66, %62 ], [ 65, %48 ]
%51 = phi i1 [ false, %62 ], [ true, %48 ]
br label %52
52: ; preds = %49, %59
%53 = phi i64 [ %60, %59 ], [ %50, %49 ]
%54 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 %53
%55 = load i32, i32* %54
%56 = icmp slt i32 %55, 123
%57 = icmp sgt i32 %55, %1
%58 = and i1 %56, %57
br i1 %58, label %62, label %59
59: ; preds = %52
%60 = add nuw nsw i64 %53, 1
%61 = icmp eq i64 %60, 91
br i1 %61, label %68, label %52
62: ; preds = %52
%63 = load i32, i32* @stderr
%64 = trunc i64 %53 to i32
%65 = tail call i32 @fprintf(i32 %63, i8* getelementptr inbounds ([40 x i8], [40 x i8]* @.str, i64 0, i64 0), i8* getelementptr inbounds ([174 x i8], [174 x i8]* @.str.1, i64 0, i64 0), i32 471, i32 %64, i32 %55, i32 %1)
%66 = add nuw nsw i64 %53, 1
%67 = icmp eq i64 %66, 91
br i1 %67, label %69, label %49
68: ; preds = %59
br i1 %51, label %71, label %69
69: ; preds = %62, %68
%70 = tail call i32 @exit(i32 1)
unreachable
71: ; preds = %68
ret void
}