#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */
typedef int /*<<< orphan*/ FILE;

/* Variables and functions */
scalar_t__ calloc(short, int);
int /*<<< orphan*/ *fgets(char *, int, int /*<<< orphan*/ *);
int /*<<< orphan*/ printf(char *, unsigned int);
scalar_t__ realloc(char **, unsigned short);
int /*<<< orphan*/ strcmp(char *, char *);
int /*<<< orphan*/ strcpy(char *, char *);
int strlen(char *);
char *strsep(char **, char *);
unsigned short readProteinList(FILE *inputfile, char ***protein_list) {
  char line[80], *line_ptr, *node_left, *node_right;
  short x, y, last_node = 0, node_left_length, node_right_length;
  unsigned short left_found = 0, right_found = 0, n_nodes = 0;
  char **alloc_nodes = NULL;
  unsigned int n_edges = 0;
  while (fgets(line, 80, inputfile) != NULL) {
    line_ptr = line;
    node_left = strsep(&line_ptr, " \t\n");
    node_left_length = strlen(node_left) + 1;
    node_right = strsep(&line_ptr, " \t\n");
    node_right_length = strlen(node_right) + 1;
    if ((node_left != NULL) && (node_right != NULL)) {
      if (n_nodes == 0) {
        alloc_nodes =
            (char **)realloc(alloc_nodes, (n_nodes + 1) * sizeof(char *));
        alloc_nodes[n_nodes] = (char *)calloc(node_left_length, sizeof(char));
        strcpy(alloc_nodes[n_nodes], node_left);
        left_found = 1;
        n_nodes++;
        alloc_nodes =
            (char **)realloc(alloc_nodes, (n_nodes + 1) * sizeof(char *));
        alloc_nodes[n_nodes] = (char *)calloc(node_right_length, sizeof(char));
        strcpy(alloc_nodes[n_nodes], node_right);
        right_found = 1;
        n_nodes++;
      } else {
        if (!strcmp(alloc_nodes[last_node], node_left)) {
          right_found = 0;
          for (x = 0; x < n_nodes; x++) {
            if (!strcmp(alloc_nodes[x], node_right)) {
              right_found = 1;
              break;
            } else if (x == (n_nodes - 1)) {
              alloc_nodes =
                  (char **)realloc(alloc_nodes, (n_nodes + 1) * sizeof(char *));
              alloc_nodes[n_nodes] =
                  (char *)calloc(node_right_length, sizeof(char));
              strcpy(alloc_nodes[n_nodes], node_right);
              right_found = 1;
              n_nodes++;
            }
          }
        } else {
          left_found = 0;
          right_found = 0;
          for (x = 0; x < n_nodes; x++) {
            if (!strcmp(alloc_nodes[x], node_left) && !left_found)
              left_found = 1;
            if (!strcmp(alloc_nodes[x], node_right) && !right_found)
              right_found = 1;
            if (left_found && right_found)
              break;
            if (x == (n_nodes - 1)) {
              if (!left_found) {
                alloc_nodes = (char **)realloc(alloc_nodes,
                                               (n_nodes + 1) * sizeof(char *));
                alloc_nodes[n_nodes] =
                    (char *)calloc(node_left_length, sizeof(char));
                strcpy(alloc_nodes[n_nodes], node_left);
                last_node = n_nodes;
                n_nodes++;
              }
              if (!right_found) {
                alloc_nodes = (char **)realloc(alloc_nodes,
                                               (n_nodes + 1) * sizeof(char *));
                alloc_nodes[n_nodes] =
                    (char *)calloc(node_right_length, sizeof(char));
                strcpy(alloc_nodes[n_nodes], node_right);
                n_nodes++;
              }
            }
          }
        }
      }
      n_edges++;
    }
  }
  printf("\tProteins: %d\n", n_nodes);
  printf("\tInteractions: %d\n", n_edges / 2);
  *protein_list = alloc_nodes;
  return n_nodes;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<readProteinList>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0xa0,%rsp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
movw   $0x0,-0x7e(%rbp)
movw   $0x0,-0x84(%rbp)
movw   $0x0,-0x86(%rbp)
movw   $0x0,-0x88(%rbp)
movq   $0x0,-0x90(%rbp)
movl   $0x0,-0x94(%rbp)
lea    -0x60(%rbp),%rdi
mov    -0x8(%rbp),%rdx
mov    $0x50,%esi
call   1060 <fgets@plt>
cmp    $0x0,%rax
je     16b7 <readProteinList+0x537>
lea    -0x60(%rbp),%rax
mov    %rax,-0x68(%rbp)
lea    -0x68(%rbp),%rdi
lea    0xe08(%rip),%rsi
call   1090 <strsep@plt>
mov    %rax,-0x70(%rbp)
mov    -0x70(%rbp),%rdi
call   1040 <strlen@plt>
add    $0x1,%eax
mov    %ax,-0x80(%rbp)
lea    -0x68(%rbp),%rdi
lea    0xde4(%rip),%rsi
call   1090 <strsep@plt>
mov    %rax,-0x78(%rbp)
mov    -0x78(%rbp),%rdi
call   1040 <strlen@plt>
add    $0x1,%eax
mov    %ax,-0x82(%rbp)
cmpq   $0x0,-0x70(%rbp)
je     16b2 <readProteinList+0x532>
cmpq   $0x0,-0x78(%rbp)
je     16b2 <readProteinList+0x532>
movzwl -0x88(%rbp),%eax
cmp    $0x0,%eax
jne    1364 <readProteinList+0x1e4>
mov    -0x90(%rbp),%rdi
movzwl -0x88(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
cltq
shl    $0x3,%rax
movzwl %ax,%esi
call   10a0 <realloc@plt>
mov    %rax,-0x90(%rbp)
mov    $0x1,%esi
movswl -0x80(%rbp),%edi
call   1070 <calloc@plt>
mov    %rax,%rdx
mov    -0x90(%rbp),%rax
movzwl -0x88(%rbp),%ecx
mov    %rdx,(%rax,%rcx,8)
mov    -0x90(%rbp),%rax
movzwl -0x88(%rbp),%ecx
mov    (%rax,%rcx,8),%rdi
mov    -0x70(%rbp),%rsi
call   1030 <strcpy@plt>
movw   $0x1,-0x84(%rbp)
mov    -0x88(%rbp),%ax
add    $0x1,%ax
mov    %ax,-0x88(%rbp)
mov    -0x90(%rbp),%rdi
movzwl -0x88(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
cltq
shl    $0x3,%rax
movzwl %ax,%esi
call   10a0 <realloc@plt>
mov    %rax,-0x90(%rbp)
mov    $0x1,%esi
movswl -0x82(%rbp),%edi
call   1070 <calloc@plt>
mov    %rax,%rdx
mov    -0x90(%rbp),%rax
movzwl -0x88(%rbp),%ecx
mov    %rdx,(%rax,%rcx,8)
mov    -0x90(%rbp),%rax
movzwl -0x88(%rbp),%ecx
mov    (%rax,%rcx,8),%rdi
mov    -0x78(%rbp),%rsi
call   1030 <strcpy@plt>
movw   $0x1,-0x86(%rbp)
mov    -0x88(%rbp),%ax
add    $0x1,%ax
mov    %ax,-0x88(%rbp)
jmp    16a3 <readProteinList+0x523>
mov    -0x90(%rbp),%rax
movswq -0x7e(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rdi
mov    -0x70(%rbp),%rsi
call   1080 <strcmp@plt>
cmp    $0x0,%eax
jne    1490 <readProteinList+0x310>
movw   $0x0,-0x86(%rbp)
movw   $0x0,-0x7a(%rbp)
movswl -0x7a(%rbp),%eax
movzwl -0x88(%rbp),%ecx
cmp    %ecx,%eax
jge    148b <readProteinList+0x30b>
mov    -0x90(%rbp),%rax
movswq -0x7a(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rdi
mov    -0x78(%rbp),%rsi
call   1080 <strcmp@plt>
cmp    $0x0,%eax
jne    13d8 <readProteinList+0x258>
movw   $0x1,-0x86(%rbp)
jmp    148b <readProteinList+0x30b>
movswl -0x7a(%rbp),%eax
movzwl -0x88(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
cmp    %ecx,%eax
jne    1470 <readProteinList+0x2f0>
mov    -0x90(%rbp),%rdi
movzwl -0x88(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
cltq
shl    $0x3,%rax
movzwl %ax,%esi
call   10a0 <realloc@plt>
mov    %rax,-0x90(%rbp)
mov    $0x1,%esi
movswl -0x82(%rbp),%edi
call   1070 <calloc@plt>
mov    %rax,%rdx
mov    -0x90(%rbp),%rax
movzwl -0x88(%rbp),%ecx
mov    %rdx,(%rax,%rcx,8)
mov    -0x90(%rbp),%rax
movzwl -0x88(%rbp),%ecx
mov    (%rax,%rcx,8),%rdi
mov    -0x78(%rbp),%rsi
call   1030 <strcpy@plt>
movw   $0x1,-0x86(%rbp)
mov    -0x88(%rbp),%ax
add    $0x1,%ax
mov    %ax,-0x88(%rbp)
jmp    1475 <readProteinList+0x2f5>
jmp    147a <readProteinList+0x2fa>
mov    -0x7a(%rbp),%ax
add    $0x1,%ax
mov    %ax,-0x7a(%rbp)
jmp    1395 <readProteinList+0x215>
jmp    169e <readProteinList+0x51e>
movw   $0x0,-0x84(%rbp)
movw   $0x0,-0x86(%rbp)
movw   $0x0,-0x7a(%rbp)
movswl -0x7a(%rbp),%eax
movzwl -0x88(%rbp),%ecx
cmp    %ecx,%eax
jge    1699 <readProteinList+0x519>
mov    -0x90(%rbp),%rax
movswq -0x7a(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rdi
mov    -0x70(%rbp),%rsi
call   1080 <strcmp@plt>
cmp    $0x0,%eax
jne    14f4 <readProteinList+0x374>
cmpw   $0x0,-0x84(%rbp)
jne    14f4 <readProteinList+0x374>
movw   $0x1,-0x84(%rbp)
mov    -0x90(%rbp),%rax
movswq -0x7a(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rdi
mov    -0x78(%rbp),%rsi
call   1080 <strcmp@plt>
cmp    $0x0,%eax
jne    152d <readProteinList+0x3ad>
cmpw   $0x0,-0x86(%rbp)
jne    152d <readProteinList+0x3ad>
movw   $0x1,-0x86(%rbp)
movzwl -0x84(%rbp),%eax
cmp    $0x0,%eax
je     1552 <readProteinList+0x3d2>
movzwl -0x86(%rbp),%eax
cmp    $0x0,%eax
je     1552 <readProteinList+0x3d2>
jmp    1699 <readProteinList+0x519>
movswl -0x7a(%rbp),%eax
movzwl -0x88(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
cmp    %ecx,%eax
jne    1683 <readProteinList+0x503>
cmpw   $0x0,-0x84(%rbp)
jne    15f7 <readProteinList+0x477>
mov    -0x90(%rbp),%rdi
movzwl -0x88(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
cltq
shl    $0x3,%rax
movzwl %ax,%esi
call   10a0 <realloc@plt>
mov    %rax,-0x90(%rbp)
mov    $0x1,%esi
movswl -0x80(%rbp),%edi
call   1070 <calloc@plt>
mov    %rax,%rdx
mov    -0x90(%rbp),%rax
movzwl -0x88(%rbp),%ecx
mov    %rdx,(%rax,%rcx,8)
mov    -0x90(%rbp),%rax
movzwl -0x88(%rbp),%ecx
mov    (%rax,%rcx,8),%rdi
mov    -0x70(%rbp),%rsi
call   1030 <strcpy@plt>
mov    -0x88(%rbp),%ax
mov    %ax,-0x7e(%rbp)
mov    -0x88(%rbp),%ax
add    $0x1,%ax
mov    %ax,-0x88(%rbp)
cmpw   $0x0,-0x86(%rbp)
jne    167e <readProteinList+0x4fe>
mov    -0x90(%rbp),%rdi
movzwl -0x88(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
cltq
shl    $0x3,%rax
movzwl %ax,%esi
call   10a0 <realloc@plt>
mov    %rax,-0x90(%rbp)
mov    $0x1,%esi
movswl -0x82(%rbp),%edi
call   1070 <calloc@plt>
mov    %rax,%rdx
mov    -0x90(%rbp),%rax
movzwl -0x88(%rbp),%ecx
mov    %rdx,(%rax,%rcx,8)
mov    -0x90(%rbp),%rax
movzwl -0x88(%rbp),%ecx
mov    (%rax,%rcx,8),%rdi
mov    -0x78(%rbp),%rsi
call   1030 <strcpy@plt>
mov    -0x88(%rbp),%ax
add    $0x1,%ax
mov    %ax,-0x88(%rbp)
jmp    1683 <readProteinList+0x503>
jmp    1688 <readProteinList+0x508>
mov    -0x7a(%rbp),%ax
add    $0x1,%ax
mov    %ax,-0x7a(%rbp)
jmp    14a8 <readProteinList+0x328>
jmp    169e <readProteinList+0x51e>
jmp    16a3 <readProteinList+0x523>
mov    -0x94(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x94(%rbp)
jmp    11c9 <readProteinList+0x49>
movzwl -0x88(%rbp),%esi
lea    0x93f(%rip),%rdi
call   1050 <printf@plt>
mov    -0x94(%rbp),%esi
shr    $0x1,%esi
lea    0x939(%rip),%rdi
call   1050 <printf@plt>
mov    -0x90(%rbp),%rcx
mov    -0x10(%rbp),%rax
mov    %rcx,(%rax)
movzwl -0x88(%rbp),%eax
add    $0xa0,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<readProteinList>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
sub    $0xa8,%rsp
mov    %rsi,0x38(%rsp)
mov    %rdi,%r12
lea    0x50(%rsp),%rbp
mov    %rbp,%rdi
mov    $0x50,%esi
mov    %r12,%rdx
call   1060 <fgets@plt>
test   %rax,%rax
je     14c2 <readProteinList+0x342>
xor    %eax,%eax
mov    %rax,0x10(%rsp)
xor    %eax,%eax
mov    %rax,(%rsp)
xor    %r15d,%r15d
xor    %eax,%eax
mov    %rax,0x30(%rsp)
mov    %r12,0x40(%rsp)
jmp    126e <readProteinList+0xee>
mov    (%rsp),%rdi
mov    $0x8,%esi
call   10a0 <realloc@plt>
mov    %rax,%rbx
mov    0xc(%rsp),%edi
mov    $0x1,%esi
call   1070 <calloc@plt>
mov    %rax,(%rbx)
mov    %rax,%rdi
mov    0x20(%rsp),%rsi
call   1030 <strcpy@plt>
mov    %rbx,%rdi
mov    $0x10,%esi
call   10a0 <realloc@plt>
mov    %rax,%rbx
mov    %r13d,%edi
mov    $0x1,%esi
call   1070 <calloc@plt>
mov    %rbx,(%rsp)
mov    %rax,0x8(%rbx)
mov    %rax,%rdi
mov    0x18(%rsp),%rsi
call   1030 <strcpy@plt>
mov    $0x2,%r15w
mov    0x10(%rsp),%rax
add    $0x1,%eax
mov    %rax,0x10(%rsp)
mov    0x40(%rsp),%r12
lea    0x50(%rsp),%rbp
mov    %rbp,%rdi
mov    $0x50,%esi
mov    %r12,%rdx
call   1060 <fgets@plt>
test   %rax,%rax
je     14d2 <readProteinList+0x352>
mov    %rbp,0x48(%rsp)
lea    0x48(%rsp),%r14
mov    %r14,%rdi
lea    0xd7e(%rip),%rbp
mov    %rbp,%rsi
call   1090 <strsep@plt>
mov    %rax,%r13
mov    %rax,%rdi
call   1040 <strlen@plt>
mov    %eax,%ebx
mov    %r14,%rdi
mov    %rbp,%rsi
call   1090 <strsep@plt>
mov    %rax,%rbp
mov    %rax,%rdi
call   1040 <strlen@plt>
mov    %r13,0x20(%rsp)
test   %r13,%r13
je     1250 <readProteinList+0xd0>
mov    %rbp,0x18(%rsp)
test   %rbp,%rbp
je     1250 <readProteinList+0xd0>
add    $0x1,%ebx
add    $0x1,%eax
movswl %bx,%ecx
mov    %ecx,0xc(%rsp)
movswl %ax,%r13d
test   %r15w,%r15w
je     11d8 <readProteinList+0x58>
movswq 0x30(%rsp),%rax
mov    (%rsp),%rbp
mov    0x0(%rbp,%rax,8),%rdi
mov    0x20(%rsp),%rsi
call   1080 <strcmp@plt>
movzwl %r15w,%r14d
test   %eax,%eax
je     1438 <readProteinList+0x2b8>
mov    %r13d,0x2c(%rsp)
xor    %r12d,%r12d
xor    %ebp,%ebp
xor    %r13d,%r13d
jmp    1325 <readProteinList+0x1a5>
add    $0x1,%r12d
movswl %r12w,%r12d
movzwl %r15w,%r14d
cmp    %r14d,%r12d
jge    123e <readProteinList+0xbe>
movslq %r12d,%rax
mov    (%rsp),%rcx
mov    (%rcx,%rax,8),%rbx
mov    %rbx,%rdi
mov    0x20(%rsp),%rsi
call   1080 <strcmp@plt>
test   %r13w,%r13w
mov    $0x1,%ecx
cmovne %r13d,%ecx
test   %eax,%eax
cmovne %r13d,%ecx
mov    %ecx,%r13d
mov    %rbx,%rdi
mov    0x18(%rsp),%rsi
call   1080 <strcmp@plt>
test   %bp,%bp
mov    $0x1,%ecx
cmovne %ebp,%ecx
test   %eax,%eax
cmovne %ebp,%ecx
mov    %ecx,%ebp
test   %r13w,%r13w
je     1381 <readProteinList+0x201>
test   %bp,%bp
jne    123e <readProteinList+0xbe>
add    $0xffffffff,%r14d
cmp    %r12d,%r14d
jne    1310 <readProteinList+0x190>
test   %r13w,%r13w
je     139b <readProteinList+0x21b>
test   %bp,%bp
jne    1310 <readProteinList+0x190>
jmp    13f1 <readProteinList+0x271>
lea    0x8(,%r15,8),%eax
movzwl %ax,%esi
mov    (%rsp),%rdi
call   10a0 <realloc@plt>
mov    %rax,%rbx
mov    0xc(%rsp),%edi
mov    $0x1,%esi
call   1070 <calloc@plt>
movzwl %r15w,%ecx
mov    %rbx,(%rsp)
mov    %rax,(%rbx,%rcx,8)
mov    %rax,%rdi
mov    0x20(%rsp),%rsi
call   1030 <strcpy@plt>
mov    %r15d,%eax
mov    %rax,0x30(%rsp)
lea    0x1(%r15),%eax
mov    %eax,%r15d
test   %bp,%bp
jne    1310 <readProteinList+0x190>
lea    0x8(,%r15,8),%eax
movzwl %ax,%esi
mov    (%rsp),%rdi
call   10a0 <realloc@plt>
mov    %rax,%rbx
mov    0x2c(%rsp),%edi
mov    $0x1,%esi
call   1070 <calloc@plt>
movzwl %r15w,%ecx
mov    %rbx,(%rsp)
mov    %rax,(%rbx,%rcx,8)
mov    %rax,%rdi
mov    0x18(%rsp),%rsi
call   1030 <strcpy@plt>
add    $0x1,%r15d
jmp    1310 <readProteinList+0x190>
xor    %ebx,%ebx
mov    0x18(%rsp),%r12
jmp    145f <readProteinList+0x2df>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   0x0(%rax,%rax,1)
add    $0x1,%ebx
movswl %bx,%ebx
movzwl %r15w,%r14d
cmp    %r14d,%ebx
jge    14b9 <readProteinList+0x339>
movslq %ebx,%rax
mov    0x0(%rbp,%rax,8),%rdi
mov    %r12,%rsi
call   1080 <strcmp@plt>
test   %eax,%eax
je     14b9 <readProteinList+0x339>
add    $0xffffffff,%r14d
cmp    %ebx,%r14d
jne    1450 <readProteinList+0x2d0>
lea    0x8(,%r15,8),%eax
movzwl %ax,%esi
mov    %rbp,%rdi
call   10a0 <realloc@plt>
mov    %rax,%rbp
mov    %r13d,%edi
mov    $0x1,%esi
call   1070 <calloc@plt>
movzwl %r15w,%ecx
mov    %rax,0x0(%rbp,%rcx,8)
mov    %rax,%rdi
mov    %r12,%rsi
call   1030 <strcpy@plt>
add    $0x1,%r15d
jmp    1450 <readProteinList+0x2d0>
mov    %rbp,(%rsp)
jmp    123e <readProteinList+0xbe>
xor    %r15d,%r15d
xor    %eax,%eax
mov    %rax,(%rsp)
xor    %eax,%eax
mov    %rax,0x10(%rsp)
movzwl %r15w,%ebx
lea    0xb27(%rip),%rdi
mov    %ebx,%esi
call   1050 <printf@plt>
mov    0x10(%rsp),%rsi
shr    %esi
lea    0xb21(%rip),%rdi
call   1050 <printf@plt>
mov    0x38(%rsp),%rax
mov    (%rsp),%rcx
mov    %rcx,(%rax)
mov    %ebx,%eax
add    $0xa8,%rsp
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
@.str = [4 x i8] c" \09\0A\00"
@.str.1 = [15 x i8] c"\09Proteins: %d\0A\00"
@.str.2 = [19 x i8] c"\09Interactions: %d\0A\00"
define zeroext i16 @readProteinList(i32* %0, i8*** %1) {
%3 = alloca i32*
%4 = alloca i8***
%5 = alloca [80 x i8]
%6 = alloca i8*
%7 = alloca i8*
%8 = alloca i8*
%9 = alloca i16
%10 = alloca i16
%11 = alloca i16
%12 = alloca i16
%13 = alloca i16
%14 = alloca i16
%15 = alloca i16
%16 = alloca i16
%17 = alloca i8**
%18 = alloca i32
store i32* %0, i32** %3
store i8*** %1, i8**** %4
store i16 0, i16* %11
store i16 0, i16* %14
store i16 0, i16* %15
store i16 0, i16* %16
store i8** null, i8*** %17
store i32 0, i32* %18
br label %19
19: ; preds = %279, %2
%20 = getelementptr inbounds [80 x i8], [80 x i8]* %5, i64 0, i64 0
%21 = load i32*, i32** %3
%22 = call i32* @fgets(i8* %20, i32 80, i32* %21)
%23 = icmp ne i32* %22, null
br i1 %23, label %24, label %280
24: ; preds = %19
%25 = getelementptr inbounds [80 x i8], [80 x i8]* %5, i64 0, i64 0
store i8* %25, i8** %6
%26 = call i8* @strsep(i8** %6, i8* getelementptr inbounds ([4 x i8], [4 x i8]* @.str, i64 0, i64 0))
store i8* %26, i8** %7
%27 = load i8*, i8** %7
%28 = call i32 @strlen(i8* %27)
%29 = add nsw i32 %28, 1
%30 = trunc i32 %29 to i16
store i16 %30, i16* %12
%31 = call i8* @strsep(i8** %6, i8* getelementptr inbounds ([4 x i8], [4 x i8]* @.str, i64 0, i64 0))
store i8* %31, i8** %8
%32 = load i8*, i8** %8
%33 = call i32 @strlen(i8* %32)
%34 = add nsw i32 %33, 1
%35 = trunc i32 %34 to i16
store i16 %35, i16* %13
%36 = load i8*, i8** %7
%37 = icmp ne i8* %36, null
br i1 %37, label %38, label %279
38: ; preds = %24
%39 = load i8*, i8** %8
%40 = icmp ne i8* %39, null
br i1 %40, label %41, label %279
41: ; preds = %38
%42 = load i16, i16* %16
%43 = zext i16 %42 to i32
%44 = icmp eq i32 %43, 0
br i1 %44, label %45, label %96
45: ; preds = %41
%46 = load i8**, i8*** %17
%47 = load i16, i16* %16
%48 = zext i16 %47 to i32
%49 = add nsw i32 %48, 1
%50 = sext i32 %49 to i64
%51 = mul i64 %50, 8
%52 = trunc i64 %51 to i16
%53 = call i64 @realloc(i8** %46, i16 zeroext %52)
%54 = inttoptr i64 %53 to i8**
store i8** %54, i8*** %17
%55 = load i16, i16* %12
%56 = call i64 @calloc(i16 signext %55, i32 1)
%57 = inttoptr i64 %56 to i8*
%58 = load i8**, i8*** %17
%59 = load i16, i16* %16
%60 = zext i16 %59 to i64
%61 = getelementptr inbounds i8*, i8** %58, i64 %60
store i8* %57, i8** %61
%62 = load i8**, i8*** %17
%63 = load i16, i16* %16
%64 = zext i16 %63 to i64
%65 = getelementptr inbounds i8*, i8** %62, i64 %64
%66 = load i8*, i8** %65
%67 = load i8*, i8** %7
%68 = call i32 @strcpy(i8* %66, i8* %67)
store i16 1, i16* %14
%69 = load i16, i16* %16
%70 = add i16 %69, 1
store i16 %70, i16* %16
%71 = load i8**, i8*** %17
%72 = load i16, i16* %16
%73 = zext i16 %72 to i32
%74 = add nsw i32 %73, 1
%75 = sext i32 %74 to i64
%76 = mul i64 %75, 8
%77 = trunc i64 %76 to i16
%78 = call i64 @realloc(i8** %71, i16 zeroext %77)
%79 = inttoptr i64 %78 to i8**
store i8** %79, i8*** %17
%80 = load i16, i16* %13
%81 = call i64 @calloc(i16 signext %80, i32 1)
%82 = inttoptr i64 %81 to i8*
%83 = load i8**, i8*** %17
%84 = load i16, i16* %16
%85 = zext i16 %84 to i64
%86 = getelementptr inbounds i8*, i8** %83, i64 %85
store i8* %82, i8** %86
%87 = load i8**, i8*** %17
%88 = load i16, i16* %16
%89 = zext i16 %88 to i64
%90 = getelementptr inbounds i8*, i8** %87, i64 %89
%91 = load i8*, i8** %90
%92 = load i8*, i8** %8
%93 = call i32 @strcpy(i8* %91, i8* %92)
store i16 1, i16* %15
%94 = load i16, i16* %16
%95 = add i16 %94, 1
store i16 %95, i16* %16
br label %276
96: ; preds = %41
%97 = load i8**, i8*** %17
%98 = load i16, i16* %11
%99 = sext i16 %98 to i64
%100 = getelementptr inbounds i8*, i8** %97, i64 %99
%101 = load i8*, i8** %100
%102 = load i8*, i8** %7
%103 = call i32 @strcmp(i8* %101, i8* %102)
%104 = icmp ne i32 %103, 0
br i1 %104, label %161, label %105
105: ; preds = %96
store i16 0, i16* %15
store i16 0, i16* %9
br label %106
106: ; preds = %157, %105
%107 = load i16, i16* %9
%108 = sext i16 %107 to i32
%109 = load i16, i16* %16
%110 = zext i16 %109 to i32
%111 = icmp slt i32 %108, %110
br i1 %111, label %112, label %160
112: ; preds = %106
%113 = load i8**, i8*** %17
%114 = load i16, i16* %9
%115 = sext i16 %114 to i64
%116 = getelementptr inbounds i8*, i8** %113, i64 %115
%117 = load i8*, i8** %116
%118 = load i8*, i8** %8
%119 = call i32 @strcmp(i8* %117, i8* %118)
%120 = icmp ne i32 %119, 0
br i1 %120, label %122, label %121
121: ; preds = %112
store i16 1, i16* %15
br label %160
122: ; preds = %112
%123 = load i16, i16* %9
%124 = sext i16 %123 to i32
%125 = load i16, i16* %16
%126 = zext i16 %125 to i32
%127 = sub nsw i32 %126, 1
%128 = icmp eq i32 %124, %127
br i1 %128, label %129, label %155
129: ; preds = %122
%130 = load i8**, i8*** %17
%131 = load i16, i16* %16
%132 = zext i16 %131 to i32
%133 = add nsw i32 %132, 1
%134 = sext i32 %133 to i64
%135 = mul i64 %134, 8
%136 = trunc i64 %135 to i16
%137 = call i64 @realloc(i8** %130, i16 zeroext %136)
%138 = inttoptr i64 %137 to i8**
store i8** %138, i8*** %17
%139 = load i16, i16* %13
%140 = call i64 @calloc(i16 signext %139, i32 1)
%141 = inttoptr i64 %140 to i8*
%142 = load i8**, i8*** %17
%143 = load i16, i16* %16
%144 = zext i16 %143 to i64
%145 = getelementptr inbounds i8*, i8** %142, i64 %144
store i8* %141, i8** %145
%146 = load i8**, i8*** %17
%147 = load i16, i16* %16
%148 = zext i16 %147 to i64
%149 = getelementptr inbounds i8*, i8** %146, i64 %148
%150 = load i8*, i8** %149
%151 = load i8*, i8** %8
%152 = call i32 @strcpy(i8* %150, i8* %151)
store i16 1, i16* %15
%153 = load i16, i16* %16
%154 = add i16 %153, 1
store i16 %154, i16* %16
br label %155
155: ; preds = %129, %122
br label %156
156: ; preds = %155
br label %157
157: ; preds = %156
%158 = load i16, i16* %9
%159 = add i16 %158, 1
store i16 %159, i16* %9
br label %106
160: ; preds = %121, %106
br label %275
161: ; preds = %96
store i16 0, i16* %14
store i16 0, i16* %15
store i16 0, i16* %9
br label %162
162: ; preds = %271, %161
%163 = load i16, i16* %9
%164 = sext i16 %163 to i32
%165 = load i16, i16* %16
%166 = zext i16 %165 to i32
%167 = icmp slt i32 %164, %166
br i1 %167, label %168, label %274
168: ; preds = %162
%169 = load i8**, i8*** %17
%170 = load i16, i16* %9
%171 = sext i16 %170 to i64
%172 = getelementptr inbounds i8*, i8** %169, i64 %171
%173 = load i8*, i8** %172
%174 = load i8*, i8** %7
%175 = call i32 @strcmp(i8* %173, i8* %174)
%176 = icmp ne i32 %175, 0
br i1 %176, label %181, label %177
177: ; preds = %168
%178 = load i16, i16* %14
%179 = icmp ne i16 %178, 0
br i1 %179, label %181, label %180
180: ; preds = %177
store i16 1, i16* %14
br label %181
181: ; preds = %180, %177, %168
%182 = load i8**, i8*** %17
%183 = load i16, i16* %9
%184 = sext i16 %183 to i64
%185 = getelementptr inbounds i8*, i8** %182, i64 %184
%186 = load i8*, i8** %185
%187 = load i8*, i8** %8
%188 = call i32 @strcmp(i8* %186, i8* %187)
%189 = icmp ne i32 %188, 0
br i1 %189, label %194, label %190
190: ; preds = %181
%191 = load i16, i16* %15
%192 = icmp ne i16 %191, 0
br i1 %192, label %194, label %193
193: ; preds = %190
store i16 1, i16* %15
br label %194
194: ; preds = %193, %190, %181
%195 = load i16, i16* %14
%196 = zext i16 %195 to i32
%197 = icmp ne i32 %196, 0
br i1 %197, label %198, label %203
198: ; preds = %194
%199 = load i16, i16* %15
%200 = zext i16 %199 to i32
%201 = icmp ne i32 %200, 0
br i1 %201, label %202, label %203
202: ; preds = %198
br label %274
203: ; preds = %198, %194
%204 = load i16, i16* %9
%205 = sext i16 %204 to i32
%206 = load i16, i16* %16
%207 = zext i16 %206 to i32
%208 = sub nsw i32 %207, 1
%209 = icmp eq i32 %205, %208
br i1 %209, label %210, label %270
210: ; preds = %203
%211 = load i16, i16* %14
%212 = icmp ne i16 %211, 0
br i1 %212, label %240, label %213
213: ; preds = %210
%214 = load i8**, i8*** %17
%215 = load i16, i16* %16
%216 = zext i16 %215 to i32
%217 = add nsw i32 %216, 1
%218 = sext i32 %217 to i64
%219 = mul i64 %218, 8
%220 = trunc i64 %219 to i16
%221 = call i64 @realloc(i8** %214, i16 zeroext %220)
%222 = inttoptr i64 %221 to i8**
store i8** %222, i8*** %17
%223 = load i16, i16* %12
%224 = call i64 @calloc(i16 signext %223, i32 1)
%225 = inttoptr i64 %224 to i8*
%226 = load i8**, i8*** %17
%227 = load i16, i16* %16
%228 = zext i16 %227 to i64
%229 = getelementptr inbounds i8*, i8** %226, i64 %228
store i8* %225, i8** %229
%230 = load i8**, i8*** %17
%231 = load i16, i16* %16
%232 = zext i16 %231 to i64
%233 = getelementptr inbounds i8*, i8** %230, i64 %232
%234 = load i8*, i8** %233
%235 = load i8*, i8** %7
%236 = call i32 @strcpy(i8* %234, i8* %235)
%237 = load i16, i16* %16
store i16 %237, i16* %11
%238 = load i16, i16* %16
%239 = add i16 %238, 1
store i16 %239, i16* %16
br label %240
240: ; preds = %213, %210
%241 = load i16, i16* %15
%242 = icmp ne i16 %241, 0
br i1 %242, label %269, label %243
243: ; preds = %240
%244 = load i8**, i8*** %17
%245 = load i16, i16* %16
%246 = zext i16 %245 to i32
%247 = add nsw i32 %246, 1
%248 = sext i32 %247 to i64
%249 = mul i64 %248, 8
%250 = trunc i64 %249 to i16
%251 = call i64 @realloc(i8** %244, i16 zeroext %250)
%252 = inttoptr i64 %251 to i8**
store i8** %252, i8*** %17
%253 = load i16, i16* %13
%254 = call i64 @calloc(i16 signext %253, i32 1)
%255 = inttoptr i64 %254 to i8*
%256 = load i8**, i8*** %17
%257 = load i16, i16* %16
%258 = zext i16 %257 to i64
%259 = getelementptr inbounds i8*, i8** %256, i64 %258
store i8* %255, i8** %259
%260 = load i8**, i8*** %17
%261 = load i16, i16* %16
%262 = zext i16 %261 to i64
%263 = getelementptr inbounds i8*, i8** %260, i64 %262
%264 = load i8*, i8** %263
%265 = load i8*, i8** %8
%266 = call i32 @strcpy(i8* %264, i8* %265)
%267 = load i16, i16* %16
%268 = add i16 %267, 1
store i16 %268, i16* %16
br label %269
269: ; preds = %243, %240
br label %270
270: ; preds = %269, %203
br label %271
271: ; preds = %270
%272 = load i16, i16* %9
%273 = add i16 %272, 1
store i16 %273, i16* %9
br label %162
274: ; preds = %202, %162
br label %275
275: ; preds = %274, %160
br label %276
276: ; preds = %275, %45
%277 = load i32, i32* %18
%278 = add i32 %277, 1
store i32 %278, i32* %18
br label %279
279: ; preds = %276, %38, %24
br label %19
280: ; preds = %19
%281 = load i16, i16* %16
%282 = zext i16 %281 to i32
%283 = call i32 @printf(i8* getelementptr inbounds ([15 x i8], [15 x i8]* @.str.1, i64 0, i64 0), i32 %282)
%284 = load i32, i32* %18
%285 = udiv i32 %284, 2
%286 = call i32 @printf(i8* getelementptr inbounds ([19 x i8], [19 x i8]* @.str.2, i64 0, i64 0), i32 %285)
%287 = load i8**, i8*** %17
%288 = load i8***, i8**** %4
store i8** %287, i8*** %288
%289 = load i16, i16* %16
ret i16 %289
}

LLVM IR (-O2):
@.str = [4 x i8] c" \09\0A\00"
@.str.1 = [15 x i8] c"\09Proteins: %d\0A\00"
@.str.2 = [19 x i8] c"\09Interactions: %d\0A\00"
define zeroext i16 @readProteinList(i32* nocapture %0, i8*** nocapture writeonly %1) {
%3 = alloca [80 x i8]
%4 = alloca i8*
%5 = getelementptr inbounds [80 x i8], [80 x i8]* %3, i64 0, i64 0
%6 = bitcast i8** %4 to i8*
%7 = call i32* @fgets(i8* %5, i32 80, i32* %0)
%8 = icmp eq i32* %7, null
br i1 %8, label %155, label %9
9: ; preds = %2, %148
%10 = phi i32 [ %152, %148 ], [ 0, %2 ]
%11 = phi i8** [ %151, %148 ], [ null, %2 ]
%12 = phi i16 [ %150, %148 ], [ 0, %2 ]
%13 = phi i16 [ %149, %148 ], [ 0, %2 ]
store i8* %5, i8** %4
%14 = call i8* @strsep(i8** %4, i8* getelementptr inbounds ([4 x i8], [4 x i8]* @.str, i64 0, i64 0))
%15 = call i32 @strlen(i8* %14)
%16 = trunc i32 %15 to i16
%17 = add i16 %16, 1
%18 = call i8* @strsep(i8** %4, i8* getelementptr inbounds ([4 x i8], [4 x i8]* @.str, i64 0, i64 0))
%19 = call i32 @strlen(i8* %18)
%20 = trunc i32 %19 to i16
%21 = add i16 %20, 1
%22 = icmp ne i8* %14, null
%23 = icmp ne i8* %18, null
%24 = and i1 %22, %23
br i1 %24, label %25, label %148
25: ; preds = %9
%26 = icmp eq i16 %12, 0
br i1 %26, label %27, label %39
27: ; preds = %25
%28 = call i64 @realloc(i8** %11, i16 zeroext 8)
%29 = inttoptr i64 %28 to i8**
%30 = call i64 @calloc(i16 signext %17, i32 1)
%31 = inttoptr i64 %30 to i8*
store i8* %31, i8** %29
%32 = call i32 @strcpy(i8* %31, i8* %14)
%33 = call i64 @realloc(i8** %29, i16 zeroext 16)
%34 = inttoptr i64 %33 to i8**
%35 = call i64 @calloc(i16 signext %21, i32 1)
%36 = inttoptr i64 %35 to i8*
%37 = getelementptr inbounds i8*, i8** %34, i64 1
store i8* %36, i8** %37
%38 = call i32 @strcpy(i8* %36, i8* %18)
br label %143
39: ; preds = %25
%40 = sext i16 %13 to i64
%41 = getelementptr inbounds i8*, i8** %11, i64 %40
%42 = load i8*, i8** %41
%43 = call i32 @strcmp(i8* dereferenceable(1) %42, i8* %14)
%44 = icmp eq i32 %43, 0
%45 = zext i16 %12 to i32
br i1 %44, label %46, label %78
46: ; preds = %39, %70
%47 = phi i32 [ %76, %70 ], [ %45, %39 ]
%48 = phi i32 [ %75, %70 ], [ 0, %39 ]
%49 = phi i8** [ %72, %70 ], [ %11, %39 ]
%50 = phi i16 [ %71, %70 ], [ %12, %39 ]
%51 = sext i32 %48 to i64
%52 = getelementptr inbounds i8*, i8** %49, i64 %51
%53 = load i8*, i8** %52
%54 = call i32 @strcmp(i8* dereferenceable(1) %53, i8* %18)
%55 = icmp eq i32 %54, 0
br i1 %55, label %143, label %56
56: ; preds = %46
%57 = add nsw i32 %47, -1
%58 = icmp eq i32 %57, %48
br i1 %58, label %59, label %70
59: ; preds = %56
%60 = shl i16 %50, 3
%61 = add i16 %60, 8
%62 = call i64 @realloc(i8** %49, i16 zeroext %61)
%63 = inttoptr i64 %62 to i8**
%64 = call i64 @calloc(i16 signext %21, i32 1)
%65 = inttoptr i64 %64 to i8*
%66 = zext i16 %50 to i64
%67 = getelementptr inbounds i8*, i8** %63, i64 %66
store i8* %65, i8** %67
%68 = call i32 @strcpy(i8* %65, i8* %18)
%69 = add i16 %50, 1
br label %70
70: ; preds = %59, %56
%71 = phi i16 [ %69, %59 ], [ %50, %56 ]
%72 = phi i8** [ %63, %59 ], [ %49, %56 ]
%73 = shl nsw i32 %48, 16
%74 = add i32 %73, 65536
%75 = ashr exact i32 %74, 16
%76 = zext i16 %71 to i32
%77 = icmp slt i32 %75, %76
br i1 %77, label %46, label %143
78: ; preds = %39, %134
%79 = phi i32 [ %141, %134 ], [ %45, %39 ]
%80 = phi i32 [ %140, %134 ], [ 0, %39 ]
%81 = phi i8** [ %137, %134 ], [ %11, %39 ]
%82 = phi i16 [ %136, %134 ], [ %12, %39 ]
%83 = phi i16 [ %98, %134 ], [ 0, %39 ]
%84 = phi i16 [ %93, %134 ], [ 0, %39 ]
%85 = phi i16 [ %135, %134 ], [ %13, %39 ]
%86 = sext i32 %80 to i64
%87 = getelementptr inbounds i8*, i8** %81, i64 %86
%88 = load i8*, i8** %87
%89 = call i32 @strcmp(i8* dereferenceable(1) %88, i8* %14)
%90 = icmp ne i32 %89, 0
%91 = icmp ne i16 %84, 0
%92 = select i1 %90, i1 true, i1 %91
%93 = select i1 %92, i16 %84, i16 1
%94 = call i32 @strcmp(i8* dereferenceable(1) %88, i8* %18)
%95 = icmp ne i32 %94, 0
%96 = icmp ne i16 %83, 0
%97 = select i1 %95, i1 true, i1 %96
%98 = select i1 %97, i16 %83, i16 1
%99 = icmp ne i16 %93, 0
%100 = icmp ne i16 %98, 0
%101 = select i1 %99, i1 %100, i1 false
br i1 %101, label %143, label %102
102: ; preds = %78
%103 = add nsw i32 %79, -1
%104 = icmp eq i32 %103, %80
br i1 %104, label %105, label %134
105: ; preds = %102
%106 = icmp eq i16 %93, 0
br i1 %106, label %107, label %118
107: ; preds = %105
%108 = shl i16 %82, 3
%109 = add i16 %108, 8
%110 = call i64 @realloc(i8** %81, i16 zeroext %109)
%111 = inttoptr i64 %110 to i8**
%112 = call i64 @calloc(i16 signext %17, i32 1)
%113 = inttoptr i64 %112 to i8*
%114 = zext i16 %82 to i64
%115 = getelementptr inbounds i8*, i8** %111, i64 %114
store i8* %113, i8** %115
%116 = call i32 @strcpy(i8* %113, i8* %14)
%117 = add i16 %82, 1
br label %118
118: ; preds = %107, %105
%119 = phi i16 [ %85, %105 ], [ %82, %107 ]
%120 = phi i16 [ %82, %105 ], [ %117, %107 ]
%121 = phi i8** [ %81, %105 ], [ %111, %107 ]
%122 = icmp eq i16 %98, 0
br i1 %122, label %123, label %134
123: ; preds = %118
%124 = shl i16 %120, 3
%125 = add i16 %124, 8
%126 = call i64 @realloc(i8** %121, i16 zeroext %125)
%127 = inttoptr i64 %126 to i8**
%128 = call i64 @calloc(i16 signext %21, i32 1)
%129 = inttoptr i64 %128 to i8*
%130 = zext i16 %120 to i64
%131 = getelementptr inbounds i8*, i8** %127, i64 %130
store i8* %129, i8** %131
%132 = call i32 @strcpy(i8* %129, i8* %18)
%133 = add i16 %120, 1
br label %134
134: ; preds = %102, %123, %118
%135 = phi i16 [ %119, %118 ], [ %119, %123 ], [ %85, %102 ]
%136 = phi i16 [ %120, %118 ], [ %133, %123 ], [ %82, %102 ]
%137 = phi i8** [ %121, %118 ], [ %127, %123 ], [ %81, %102 ]
%138 = shl nsw i32 %80, 16
%139 = add i32 %138, 65536
%140 = ashr exact i32 %139, 16
%141 = zext i16 %136 to i32
%142 = icmp slt i32 %140, %141
br i1 %142, label %78, label %143
143: ; preds = %78, %134, %46, %70, %27
%144 = phi i16 [ %13, %27 ], [ %13, %70 ], [ %13, %46 ], [ %135, %134 ], [ %85, %78 ]
%145 = phi i16 [ 2, %27 ], [ %50, %46 ], [ %71, %70 ], [ %136, %134 ], [ %82, %78 ]
%146 = phi i8** [ %34, %27 ], [ %49, %46 ], [ %72, %70 ], [ %137, %134 ], [ %81, %78 ]
%147 = add i32 %10, 1
br label %148
148: ; preds = %143, %9
%149 = phi i16 [ %144, %143 ], [ %13, %9 ]
%150 = phi i16 [ %145, %143 ], [ %12, %9 ]
%151 = phi i8** [ %146, %143 ], [ %11, %9 ]
%152 = phi i32 [ %147, %143 ], [ %10, %9 ]
%153 = call i32* @fgets(i8* %5, i32 80, i32* %0)
%154 = icmp eq i32* %153, null
br i1 %154, label %155, label %9
155: ; preds = %148, %2
%156 = phi i16 [ 0, %2 ], [ %150, %148 ]
%157 = phi i8** [ null, %2 ], [ %151, %148 ]
%158 = phi i32 [ 0, %2 ], [ %152, %148 ]
%159 = zext i16 %156 to i32
%160 = call i32 @printf(i8* getelementptr inbounds ([15 x i8], [15 x i8]* @.str.1, i64 0, i64 0), i32 %159)
%161 = lshr i32 %158, 1
%162 = call i32 @printf(i8* getelementptr inbounds ([19 x i8], [19 x i8]* @.str.2, i64 0, i64 0), i32 %161)
store i8** %157, i8*** %1
ret i16 %156
}