#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
scalar_t__ malloc(int);
int *aggregate(double *reads, int n_reads, int *num_pos) {
  int *reads_dist, pos_min, pos_max, size;
  int i, j;
  pos_min = (int)reads[0];
  pos_max = (int)reads[n_reads - 1];
  size = (n_reads < pos_max - pos_min + 1) ? n_reads : pos_max - pos_min + 1;
  reads_dist = (int *)malloc(sizeof(int) * (size * 2 + 10));
  j = 0;
  i = 0;
  reads_dist[2 * j] = (int)reads[i];
  reads_dist[2 * j + 1] = 1;
  for (i = 1; i < n_reads; i++) {
    if ((int)reads[i] == reads_dist[2 * j]) {
      reads_dist[2 * j + 1]++;
    } else {
      j++;
      reads_dist[2 * j] = (int)reads[i];
      reads_dist[2 * j + 1] = 1;
    }
  }
  *num_pos = j + 1;
  return reads_dist;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<aggregate>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x40,%rsp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %esi,-0xc(%rbp)
mov    %rdx,-0x18(%rbp)
mov    -0x8(%rbp),%rax
cvttsd2si (%rax),%eax
mov    %eax,-0x24(%rbp)
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    -0xc(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
cvttsd2si (%rax,%rcx,8),%eax
mov    %eax,-0x28(%rbp)
mov    -0xc(%rbp),%eax
mov    -0x28(%rbp),%ecx
sub    -0x24(%rbp),%ecx
add    $0x1,%ecx
cmp    %ecx,%eax
jge    1162 <aggregate+0x52>
mov    -0xc(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x38(%rbp)
jmp    116e <aggregate+0x5e>
mov    -0x28(%rbp),%eax
sub    -0x24(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x38(%rbp)
mov    -0x38(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
mov    -0x2c(%rbp),%eax
shl    $0x1,%eax
add    $0xa,%eax
cltq
shl    $0x2,%rax
mov    %eax,%edi
call   1030 <malloc@plt>
mov    %rax,-0x20(%rbp)
movl   $0x0,-0x34(%rbp)
movl   $0x0,-0x30(%rbp)
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x30(%rbp),%rcx
cvttsd2si (%rax,%rcx,8),%edx
mov    -0x20(%rbp),%rax
mov    -0x34(%rbp),%ecx
shl    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
mov    %edx,(%rax,%rcx,4)
mov    -0x20(%rbp),%rax
mov    -0x34(%rbp),%ecx
shl    $0x1,%ecx
add    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movl   $0x1,(%rax,%rcx,4)
movl   $0x1,-0x30(%rbp)
mov    -0x30(%rbp),%eax
cmp    -0xc(%rbp),%eax
jge    1274 <aggregate+0x164>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x30(%rbp),%rcx
cvttsd2si (%rax,%rcx,8),%eax
mov    -0x20(%rbp),%rcx
mov    -0x34(%rbp),%edx
shl    $0x1,%edx
movslq %edx,%rdx
cmp    (%rcx,%rdx,4),%eax
jne    1224 <aggregate+0x114>
mov    -0x20(%rbp),%rax
mov    -0x34(%rbp),%ecx
shl    $0x1,%ecx
add    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%edx
add    $0x1,%edx
mov    %edx,(%rax,%rcx,4)
jmp    1261 <aggregate+0x151>
mov    -0x34(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x34(%rbp)
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x30(%rbp),%rcx
cvttsd2si (%rax,%rcx,8),%edx
mov    -0x20(%rbp),%rax
mov    -0x34(%rbp),%ecx
shl    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
mov    %edx,(%rax,%rcx,4)
mov    -0x20(%rbp),%rax
mov    -0x34(%rbp),%ecx
shl    $0x1,%ecx
add    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movl   $0x1,(%rax,%rcx,4)
jmp    1266 <aggregate+0x156>
mov    -0x30(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x30(%rbp)
jmp    11d7 <aggregate+0xc7>
mov    -0x34(%rbp),%ecx
add    $0x1,%ecx
mov    -0x18(%rbp),%rax
mov    %ecx,(%rax)
mov    -0x20(%rbp),%rax
add    $0x40,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<aggregate>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r12
push   %rbx
mov    %esi,%r15d
mov    %rdi,%r12
cvttsd2si (%rdi),%eax
movslq %esi,%rbp
cvttsd2si -0x8(%rdi,%rbp,8),%ecx
mov    %rdx,%r14
sub    %eax,%ecx
lea    0x1(%rcx),%eax
cmp    %ebp,%ecx
cmovge %esi,%eax
lea    0x28(,%rax,8),%edi
call   1030 <malloc@plt>
cvttsd2si (%r12),%ecx
mov    %ecx,(%rax)
movl   $0x1,0x4(%rax)
xor    %ecx,%ecx
cmp    $0x2,%ebp
jl     11b5 <aggregate+0xa5>
mov    %r15d,%edx
xor    %ecx,%ecx
mov    $0x1,%esi
jmp    1198 <aggregate+0x88>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
lea    (%rcx,%rcx,1),%ebp
add    $0x2,%ebp
lea    (%rcx,%rcx,1),%ebx
add    $0x3,%ebx
add    $0x1,%ecx
movslq %ebp,%rbp
mov    %edi,(%rax,%rbp,4)
movslq %ebx,%rdi
movl   $0x1,(%rax,%rdi,4)
add    $0x1,%rsi
cmp    %rsi,%rdx
je     11b5 <aggregate+0xa5>
cvttsd2si (%r12,%rsi,8),%edi
lea    (%rcx,%rcx,1),%ebp
movslq %ebp,%rbx
cmp    %edi,(%rax,%rbx,4)
jne    1170 <aggregate+0x60>
or     $0x1,%ebp
movslq %ebp,%rdi
addl   $0x1,(%rax,%rdi,4)
jmp    118f <aggregate+0x7f>
add    $0x1,%ecx
mov    %ecx,(%r14)
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define i32* @aggregate(double* %0, i32 %1, i32* %2) {
%4 = alloca double*
%5 = alloca i32
%6 = alloca i32*
%7 = alloca i32*
%8 = alloca i32
%9 = alloca i32
%10 = alloca i32
%11 = alloca i32
%12 = alloca i32
store double* %0, double** %4
store i32 %1, i32* %5
store i32* %2, i32** %6
%13 = load double*, double** %4
%14 = getelementptr inbounds double, double* %13, i64 0
%15 = load double, double* %14
%16 = fptosi double %15 to i32
store i32 %16, i32* %8
%17 = load double*, double** %4
%18 = load i32, i32* %5
%19 = sub nsw i32 %18, 1
%20 = sext i32 %19 to i64
%21 = getelementptr inbounds double, double* %17, i64 %20
%22 = load double, double* %21
%23 = fptosi double %22 to i32
store i32 %23, i32* %9
%24 = load i32, i32* %5
%25 = load i32, i32* %9
%26 = load i32, i32* %8
%27 = sub nsw i32 %25, %26
%28 = add nsw i32 %27, 1
%29 = icmp slt i32 %24, %28
br i1 %29, label %30, label %32
30: ; preds = %3
%31 = load i32, i32* %5
br label %37
32: ; preds = %3
%33 = load i32, i32* %9
%34 = load i32, i32* %8
%35 = sub nsw i32 %33, %34
%36 = add nsw i32 %35, 1
br label %37
37: ; preds = %32, %30
%38 = phi i32 [ %31, %30 ], [ %36, %32 ]
store i32 %38, i32* %10
%39 = load i32, i32* %10
%40 = mul nsw i32 %39, 2
%41 = add nsw i32 %40, 10
%42 = sext i32 %41 to i64
%43 = mul i64 4, %42
%44 = trunc i64 %43 to i32
%45 = call i64 @malloc(i32 %44)
%46 = inttoptr i64 %45 to i32*
store i32* %46, i32** %7
store i32 0, i32* %12
store i32 0, i32* %11
%47 = load double*, double** %4
%48 = load i32, i32* %11
%49 = sext i32 %48 to i64
%50 = getelementptr inbounds double, double* %47, i64 %49
%51 = load double, double* %50
%52 = fptosi double %51 to i32
%53 = load i32*, i32** %7
%54 = load i32, i32* %12
%55 = mul nsw i32 2, %54
%56 = sext i32 %55 to i64
%57 = getelementptr inbounds i32, i32* %53, i64 %56
store i32 %52, i32* %57
%58 = load i32*, i32** %7
%59 = load i32, i32* %12
%60 = mul nsw i32 2, %59
%61 = add nsw i32 %60, 1
%62 = sext i32 %61 to i64
%63 = getelementptr inbounds i32, i32* %58, i64 %62
store i32 1, i32* %63
store i32 1, i32* %11
br label %64
64: ; preds = %112, %37
%65 = load i32, i32* %11
%66 = load i32, i32* %5
%67 = icmp slt i32 %65, %66
br i1 %67, label %68, label %115
68: ; preds = %64
%69 = load double*, double** %4
%70 = load i32, i32* %11
%71 = sext i32 %70 to i64
%72 = getelementptr inbounds double, double* %69, i64 %71
%73 = load double, double* %72
%74 = fptosi double %73 to i32
%75 = load i32*, i32** %7
%76 = load i32, i32* %12
%77 = mul nsw i32 2, %76
%78 = sext i32 %77 to i64
%79 = getelementptr inbounds i32, i32* %75, i64 %78
%80 = load i32, i32* %79
%81 = icmp eq i32 %74, %80
br i1 %81, label %82, label %91
82: ; preds = %68
%83 = load i32*, i32** %7
%84 = load i32, i32* %12
%85 = mul nsw i32 2, %84
%86 = add nsw i32 %85, 1
%87 = sext i32 %86 to i64
%88 = getelementptr inbounds i32, i32* %83, i64 %87
%89 = load i32, i32* %88
%90 = add nsw i32 %89, 1
store i32 %90, i32* %88
br label %111
91: ; preds = %68
%92 = load i32, i32* %12
%93 = add nsw i32 %92, 1
store i32 %93, i32* %12
%94 = load double*, double** %4
%95 = load i32, i32* %11
%96 = sext i32 %95 to i64
%97 = getelementptr inbounds double, double* %94, i64 %96
%98 = load double, double* %97
%99 = fptosi double %98 to i32
%100 = load i32*, i32** %7
%101 = load i32, i32* %12
%102 = mul nsw i32 2, %101
%103 = sext i32 %102 to i64
%104 = getelementptr inbounds i32, i32* %100, i64 %103
store i32 %99, i32* %104
%105 = load i32*, i32** %7
%106 = load i32, i32* %12
%107 = mul nsw i32 2, %106
%108 = add nsw i32 %107, 1
%109 = sext i32 %108 to i64
%110 = getelementptr inbounds i32, i32* %105, i64 %109
store i32 1, i32* %110
br label %111
111: ; preds = %91, %82
br label %112
112: ; preds = %111
%113 = load i32, i32* %11
%114 = add nsw i32 %113, 1
store i32 %114, i32* %11
br label %64
115: ; preds = %64
%116 = load i32, i32* %12
%117 = add nsw i32 %116, 1
%118 = load i32*, i32** %6
store i32 %117, i32* %118
%119 = load i32*, i32** %7
ret i32* %119
}

LLVM IR (-O2):
define i32* @aggregate(double* nocapture %0, i32 %1, i32* nocapture writeonly %2) {
%4 = load double, double* %0
%5 = fptosi double %4 to i32
%6 = add nsw i32 %1, -1
%7 = sext i32 %6 to i64
%8 = getelementptr inbounds double, double* %0, i64 %7
%9 = load double, double* %8
%10 = fptosi double %9 to i32
%11 = sub nsw i32 %10, %5
%12 = icmp slt i32 %11, %1
%13 = add nsw i32 %11, 1
%14 = select i1 %12, i32 %13, i32 %1
%15 = shl i32 %14, 3
%16 = add i32 %15, 40
%17 = tail call i64 @malloc(i32 %16)
%18 = inttoptr i64 %17 to i32*
%19 = load double, double* %0
%20 = fptosi double %19 to i32
store i32 %20, i32* %18
%21 = getelementptr inbounds i32, i32* %18, i64 1
store i32 1, i32* %21
%22 = icmp sgt i32 %1, 1
br i1 %22, label %23, label %54
23: ; preds = %3
%24 = zext i32 %1 to i64
br label %25
25: ; preds = %23, %50
%26 = phi i64 [ 1, %23 ], [ %52, %50 ]
%27 = phi i32 [ 0, %23 ], [ %51, %50 ]
%28 = getelementptr inbounds double, double* %0, i64 %26
%29 = load double, double* %28
%30 = fptosi double %29 to i32
%31 = shl nsw i32 %27, 1
%32 = sext i32 %31 to i64
%33 = getelementptr inbounds i32, i32* %18, i64 %32
%34 = load i32, i32* %33
%35 = icmp eq i32 %34, %30
br i1 %35, label %36, label %42
36: ; preds = %25
%37 = or i32 %31, 1
%38 = sext i32 %37 to i64
%39 = getelementptr inbounds i32, i32* %18, i64 %38
%40 = load i32, i32* %39
%41 = add nsw i32 %40, 1
store i32 %41, i32* %39
br label %50
42: ; preds = %25
%43 = add nsw i32 %27, 1
%44 = shl nsw i32 %43, 1
%45 = sext i32 %44 to i64
%46 = getelementptr inbounds i32, i32* %18, i64 %45
store i32 %30, i32* %46
%47 = or i32 %44, 1
%48 = sext i32 %47 to i64
%49 = getelementptr inbounds i32, i32* %18, i64 %48
store i32 1, i32* %49
br label %50
50: ; preds = %36, %42
%51 = phi i32 [ %27, %36 ], [ %43, %42 ]
%52 = add nuw nsw i64 %26, 1
%53 = icmp eq i64 %52, %24
br i1 %53, label %54, label %25
54: ; preds = %50, %3
%55 = phi i32 [ 0, %3 ], [ %51, %50 ]
%56 = add nsw i32 %55, 1
store i32 %56, i32* %2
ret i32* %18
}