#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
int *calloc(int, int);
int /*<<< orphan*/ free(int *);
int nussinov(int n, char *p) {
  int l = n * n;
  int i;
  int j;
  int k;
  int at;
  int cur;
  int new;
  int *mat = calloc(l, sizeof(int));
  for (i = n - 1; i >= 0; i--)
    for (j = i; j < n; j++) {
      at = i * (n - 1) + j;
      if (i == j) {
        cur = 0;
      }
      if (i < j) {
        new = mat[(i + 1) * (n - 1) + j];
        if (cur < new)
          cur = new;
      };
      if (i < j) {
        new = mat[i * (n - 1) + j - 1];
        if (cur < new)
          cur = new;
      };
      if (i < j) {
        new = i + 1 >= j ? 0 : mat[(i + 1) * (n - 1) + j - 1];
        switch (p[i]) {
        case 'C':
          new += p[j] == 'G' ? 1 : -999999;
          break;
        case 'G':
          new += p[j] == 'C' || p[j] == 'U' ? 1 : -999999;
          break;
        case 'A':
          new += p[j] == 'U' ? 1 : -999999;
          break;
        case 'U':
          new += p[j] == 'A' || p[j] == 'G' ? 1 : -999999;
          break;
        default:
          new = -999999;
        };
        if (cur < new)
          cur = new;
      };
      for (k = i + 1; k < j; k++) {
        new = mat[i * (n - 1) + k] + mat[(k + 1) * (n - 1) + j];
        if (cur < new)
          cur = new;
      };
      mat[at] = cur;
    };
  free(mat);
  return cur;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<nussinov>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x50,%rsp
mov    %edi,-0x4(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    -0x4(%rbp),%eax
imul   -0x4(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x14(%rbp)
mov    -0x14(%rbp),%edi
mov    $0x4,%esi
call   1040 <calloc@plt>
mov    %rax,-0x38(%rbp)
mov    -0x4(%rbp),%eax
sub    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x18(%rbp)
cmpl   $0x0,-0x18(%rbp)
jl     143e <nussinov+0x31e>
mov    -0x18(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
mov    -0x1c(%rbp),%eax
cmp    -0x4(%rbp),%eax
jge    142b <nussinov+0x30b>
mov    -0x18(%rbp),%eax
mov    -0x4(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
imul   %ecx,%eax
add    -0x1c(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x24(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%eax
cmp    -0x1c(%rbp),%eax
jne    1194 <nussinov+0x74>
movl   $0x0,-0x28(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%eax
cmp    -0x1c(%rbp),%eax
jge    11d6 <nussinov+0xb6>
mov    -0x38(%rbp),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
add    $0x1,%ecx
mov    -0x4(%rbp),%edx
sub    $0x1,%edx
imul   %edx,%ecx
add    -0x1c(%rbp),%ecx
movslq %ecx,%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
mov    -0x28(%rbp),%eax
cmp    -0x2c(%rbp),%eax
jge    11d1 <nussinov+0xb1>
mov    -0x2c(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x28(%rbp)
jmp    11d6 <nussinov+0xb6>
mov    -0x18(%rbp),%eax
cmp    -0x1c(%rbp),%eax
jge    1218 <nussinov+0xf8>
mov    -0x38(%rbp),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
mov    -0x4(%rbp),%edx
sub    $0x1,%edx
imul   %edx,%ecx
add    -0x1c(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
mov    -0x28(%rbp),%eax
cmp    -0x2c(%rbp),%eax
jge    1213 <nussinov+0xf3>
mov    -0x2c(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x28(%rbp)
jmp    1218 <nussinov+0xf8>
mov    -0x18(%rbp),%eax
cmp    -0x1c(%rbp),%eax
jge    139d <nussinov+0x27d>
mov    -0x18(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
cmp    -0x1c(%rbp),%eax
jl     123d <nussinov+0x11d>
xor    %eax,%eax
mov    %eax,-0x3c(%rbp)
jmp    125f <nussinov+0x13f>
mov    -0x38(%rbp),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
add    $0x1,%ecx
mov    -0x4(%rbp),%edx
sub    $0x1,%edx
imul   %edx,%ecx
add    -0x1c(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x3c(%rbp)
mov    -0x3c(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x18(%rbp),%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
add    $0xffffffbf,%eax
mov    %eax,%ecx
mov    %rcx,-0x48(%rbp)
sub    $0x14,%eax
ja     137f <nussinov+0x25f>
mov    -0x48(%rbp),%rax
lea    0xd72(%rip),%rcx
movslq (%rcx,%rax,4),%rax
add    %rcx,%rax
jmp    *%rax
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%edx
mov    $0xfff0bdc1,%eax
mov    $0x1,%ecx
cmp    $0x47,%edx
cmove  %ecx,%eax
add    -0x2c(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
jmp    1386 <nussinov+0x266>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%ecx
mov    $0x1,%al
cmp    $0x43,%ecx
mov    %al,-0x49(%rbp)
je     12ed <nussinov+0x1cd>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x55,%eax
sete   %al
mov    %al,-0x49(%rbp)
mov    -0x49(%rbp),%dl
mov    $0xfff0bdc1,%eax
mov    $0x1,%ecx
test   $0x1,%dl
cmovne %ecx,%eax
add    -0x2c(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
jmp    1386 <nussinov+0x266>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%edx
mov    $0xfff0bdc1,%eax
mov    $0x1,%ecx
cmp    $0x55,%edx
cmove  %ecx,%eax
add    -0x2c(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
jmp    1386 <nussinov+0x266>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%ecx
mov    $0x1,%al
cmp    $0x41,%ecx
mov    %al,-0x4a(%rbp)
je     1361 <nussinov+0x241>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x47,%eax
sete   %al
mov    %al,-0x4a(%rbp)
mov    -0x4a(%rbp),%dl
mov    $0xfff0bdc1,%eax
mov    $0x1,%ecx
test   $0x1,%dl
cmovne %ecx,%eax
add    -0x2c(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
jmp    1386 <nussinov+0x266>
movl   $0xfff0bdc1,-0x2c(%rbp)
mov    -0x28(%rbp),%eax
cmp    -0x2c(%rbp),%eax
jge    1398 <nussinov+0x278>
mov    -0x2c(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x28(%rbp)
jmp    139d <nussinov+0x27d>
mov    -0x18(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x20(%rbp)
mov    -0x20(%rbp),%eax
cmp    -0x1c(%rbp),%eax
jge    140f <nussinov+0x2ef>
mov    -0x38(%rbp),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
mov    -0x4(%rbp),%edx
sub    $0x1,%edx
imul   %edx,%ecx
add    -0x20(%rbp),%ecx
movslq %ecx,%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    -0x38(%rbp),%rcx
mov    -0x20(%rbp),%edx
add    $0x1,%edx
mov    -0x4(%rbp),%esi
sub    $0x1,%esi
imul   %esi,%edx
add    -0x1c(%rbp),%edx
movslq %edx,%rdx
add    (%rcx,%rdx,4),%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
mov    -0x28(%rbp),%eax
cmp    -0x2c(%rbp),%eax
jge    13fc <nussinov+0x2dc>
mov    -0x2c(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x28(%rbp)
jmp    1401 <nussinov+0x2e1>
mov    -0x20(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x20(%rbp)
jmp    13a6 <nussinov+0x286>
mov    -0x28(%rbp),%edx
mov    -0x38(%rbp),%rax
movslq -0x24(%rbp),%rcx
mov    %edx,(%rax,%rcx,4)
mov    -0x1c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
jmp    1163 <nussinov+0x43>
jmp    1430 <nussinov+0x310>
mov    -0x18(%rbp),%eax
add    $0xffffffff,%eax
mov    %eax,-0x18(%rbp)
jmp    1153 <nussinov+0x33>
mov    -0x38(%rbp),%rdi
call   1030 <free@plt>
mov    -0x28(%rbp),%eax
add    $0x50,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<nussinov>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
sub    $0x88,%rsp
mov    %rsi,(%rsp)
mov    %edi,%r15d
imul   %edi,%edi
mov    $0x4,%esi
call   1040 <calloc@plt>
test   %r15d,%r15d
jle    140c <nussinov+0x2ec>
mov    %r15d,%edx
add    $0xffffffff,%r15d
lea    0x0(,%r15,4),%rbp
lea    -0x1(%rdx),%rcx
lea    (%rax,%rdx,4),%r11
add    $0xfffffffffffffffc,%r11
lea    0x0(,%r15,8),%r14
imul   %r15,%rcx
lea    (%rax,%rcx,4),%rsi
add    $0x4,%rsi
mov    %rbp,0x30(%rsp)
neg    %rbp
mov    %rbp,0x18(%rsp)
mov    %r15,0x10(%rsp)
mov    %rdx,0x8(%rsp)
mov    %rdx,%r10
mov    %rax,0x60(%rsp)
jmp    11c4 <nussinov+0xa4>
xchg   %ax,%ax
mov    0x20(%rsp),%r15
add    $0xffffffffffffffff,%r15
mov    0x28(%rsp),%r11
add    $0xfffffffffffffffc,%r11
add    0x18(%rsp),%rsi
cmp    $0x1,%r10
mov    %rdi,%r10
jle    140c <nussinov+0x2ec>
lea    -0x1(%r10),%rdi
cmp    0x8(%rsp),%r10
mov    %r11,0x28(%rsp)
mov    %r15,0x20(%rsp)
jg     11a0 <nussinov+0x80>
mov    %rdi,%r8
mov    0x10(%rsp),%r9
imul   %r9,%r8
mov    %r10,%rbx
imul   %r9,%rbx
mov    $0xffffffff,%edx
mov    %rbx,%rcx
mov    %rbx,0x58(%rsp)
lea    (%rbx,%rdx,1),%rcx
mov    %rcx,0x50(%rsp)
mov    %r8,0x68(%rsp)
lea    (%r10,%r8,1),%rcx
mov    %rcx,0x48(%rsp)
lea    0x1(%r10),%rcx
mov    %rcx,0x40(%rsp)
imul   %r9,%rcx
mov    %rcx,0x38(%rsp)
xor    %r8d,%r8d
mov    %rdi,%r9
mov    %r10,0x78(%rsp)
mov    %rdi,0x70(%rsp)
jmp    1278 <nussinov+0x158>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
xchg   %ax,%ax
mov    %r12d,%ebp
mov    0x60(%rsp),%rax
mov    0x80(%rsp),%rcx
mov    %ebp,(%rax,%rcx,4)
add    $0x1,%r9
add    $0x1,%r8d
add    $0x1,%r15
add    $0x4,%r11
cmp    0x8(%rsp),%r9
mov    0x78(%rsp),%r10
mov    0x70(%rsp),%rdi
je     11a0 <nussinov+0x80>
mov    0x68(%rsp),%rcx
lea    (%r9,%rcx,1),%rdx
cmp    %rdi,%r9
mov    %ebp,%r12d
mov    $0x0,%ecx
cmove  %ecx,%r12d
cmp    %r9,%r10
mov    %rdx,0x80(%rsp)
jg     1369 <nussinov+0x249>
mov    0x58(%rsp),%rcx
add    %r9,%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%ecx
cmp    %ecx,%r12d
cmovl  %ecx,%r12d
mov    -0x4(%rax,%rdx,4),%ecx
cmp    %ecx,%r12d
cmovl  %ecx,%r12d
xor    %ebp,%ebp
cmp    %r9,%r10
jge    12d3 <nussinov+0x1b3>
mov    0x50(%rsp),%rcx
add    %r9d,%ecx
movslq %ecx,%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%ebp
mov    (%rsp),%rcx
movsbl (%rcx,%rdi,1),%ebx
mov    $0xfff0bdc1,%ecx
add    $0xffffffbf,%ebx
cmp    $0x14,%ebx
ja     1362 <nussinov+0x242>
lea    0xd11(%rip),%rdx
movslq (%rdx,%rbx,4),%rbx
add    %rdx,%rbx
jmp    *%rbx
lea    -0xf423f(%rbp),%ecx
add    $0x1,%ebp
mov    (%rsp),%rdx
cmpb   $0x55,(%rdx,%r9,1)
jmp    131e <nussinov+0x1fe>
lea    -0xf423f(%rbp),%ecx
add    $0x1,%ebp
mov    (%rsp),%rdx
cmpb   $0x47,(%rdx,%r9,1)
cmovne %ecx,%ebp
mov    %ebp,%ecx
jmp    1362 <nussinov+0x242>
mov    (%rsp),%rcx
mov    (%rcx,%r9,1),%bl
cmp    $0x55,%bl
mov    $0xfff0bdc1,%ecx
mov    $0x1,%edx
cmove  %edx,%ecx
cmp    $0x43,%bl
jmp    135d <nussinov+0x23d>
mov    (%rsp),%rcx
mov    (%rcx,%r9,1),%bl
cmp    $0x47,%bl
mov    $0xfff0bdc1,%ecx
mov    $0x1,%edx
cmove  %edx,%ecx
cmp    $0x41,%bl
cmove  %edx,%ecx
add    %ebp,%ecx
cmp    %ecx,%r12d
cmovl  %ecx,%r12d
cmp    %r9,%r10
jge    1240 <nussinov+0x120>
test   $0x1,%r8b
jne    13b0 <nussinov+0x290>
mov    0x38(%rsp),%rcx
add    %r9,%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%ebp
mov    0x48(%rsp),%rcx
add    (%rax,%rcx,4),%ebp
cmp    %ebp,%r12d
cmovge %r12d,%ebp
mov    0x40(%rsp),%rcx
mov    %ebp,%r12d
cmp    $0x2,%r8d
je     1243 <nussinov+0x123>
jmp    13bd <nussinov+0x29d>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
mov    %r10,%rcx
cmp    $0x2,%r8d
je     1243 <nussinov+0x123>
lea    0x2(%rcx),%r10
mov    0x30(%rsp),%rax
imul   %rax,%r10
lea    0x1(%rcx),%rbx
imul   %rax,%rbx
mov    %r11,%r13
mov    %r12d,%ebp
nopl   0x0(%rax,%rax,1)
mov    0x0(%r13,%rbx,1),%edx
add    -0x4(%rsi,%rcx,4),%edx
cmp    %edx,%ebp
cmovge %ebp,%edx
mov    0x0(%r13,%r10,1),%ebp
add    (%rsi,%rcx,4),%ebp
add    $0x2,%rcx
cmp    %ebp,%edx
cmovge %edx,%ebp
add    %r14,%r13
cmp    %ecx,%r15d
jne    13e0 <nussinov+0x2c0>
jmp    1243 <nussinov+0x123>
mov    %rax,%rdi
call   1030 <free@plt>
mov    %ebp,%eax
add    $0x88,%rsp
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define i32 @nussinov(i32 %0, i8* %1) {
%3 = alloca i32
%4 = alloca i8*
%5 = alloca i32
%6 = alloca i32
%7 = alloca i32
%8 = alloca i32
%9 = alloca i32
%10 = alloca i32
%11 = alloca i32
%12 = alloca i32*
store i32 %0, i32* %3
store i8* %1, i8** %4
%13 = load i32, i32* %3
%14 = load i32, i32* %3
%15 = mul nsw i32 %13, %14
store i32 %15, i32* %5
%16 = load i32, i32* %5
%17 = call i32* @calloc(i32 %16, i32 4)
store i32* %17, i32** %12
%18 = load i32, i32* %3
%19 = sub nsw i32 %18, 1
store i32 %19, i32* %6
br label %20
20: ; preds = %240, %2
%21 = load i32, i32* %6
%22 = icmp sge i32 %21, 0
br i1 %22, label %23, label %243
23: ; preds = %20
%24 = load i32, i32* %6
store i32 %24, i32* %7
br label %25
25: ; preds = %236, %23
%26 = load i32, i32* %7
%27 = load i32, i32* %3
%28 = icmp slt i32 %26, %27
br i1 %28, label %29, label %239
29: ; preds = %25
%30 = load i32, i32* %6
%31 = load i32, i32* %3
%32 = sub nsw i32 %31, 1
%33 = mul nsw i32 %30, %32
%34 = load i32, i32* %7
%35 = add nsw i32 %33, %34
store i32 %35, i32* %9
%36 = load i32, i32* %6
%37 = load i32, i32* %7
%38 = icmp eq i32 %36, %37
br i1 %38, label %39, label %40
39: ; preds = %29
store i32 0, i32* %10
br label %40
40: ; preds = %39, %29
%41 = load i32, i32* %6
%42 = load i32, i32* %7
%43 = icmp slt i32 %41, %42
br i1 %43, label %44, label %62
44: ; preds = %40
%45 = load i32*, i32** %12
%46 = load i32, i32* %6
%47 = add nsw i32 %46, 1
%48 = load i32, i32* %3
%49 = sub nsw i32 %48, 1
%50 = mul nsw i32 %47, %49
%51 = load i32, i32* %7
%52 = add nsw i32 %50, %51
%53 = sext i32 %52 to i64
%54 = getelementptr inbounds i32, i32* %45, i64 %53
%55 = load i32, i32* %54
store i32 %55, i32* %11
%56 = load i32, i32* %10
%57 = load i32, i32* %11
%58 = icmp slt i32 %56, %57
br i1 %58, label %59, label %61
59: ; preds = %44
%60 = load i32, i32* %11
store i32 %60, i32* %10
br label %61
61: ; preds = %59, %44
br label %62
62: ; preds = %61, %40
%63 = load i32, i32* %6
%64 = load i32, i32* %7
%65 = icmp slt i32 %63, %64
br i1 %65, label %66, label %84
66: ; preds = %62
%67 = load i32*, i32** %12
%68 = load i32, i32* %6
%69 = load i32, i32* %3
%70 = sub nsw i32 %69, 1
%71 = mul nsw i32 %68, %70
%72 = load i32, i32* %7
%73 = add nsw i32 %71, %72
%74 = sub nsw i32 %73, 1
%75 = sext i32 %74 to i64
%76 = getelementptr inbounds i32, i32* %67, i64 %75
%77 = load i32, i32* %76
store i32 %77, i32* %11
%78 = load i32, i32* %10
%79 = load i32, i32* %11
%80 = icmp slt i32 %78, %79
br i1 %80, label %81, label %83
81: ; preds = %66
%82 = load i32, i32* %11
store i32 %82, i32* %10
br label %83
83: ; preds = %81, %66
br label %84
84: ; preds = %83, %62
%85 = load i32, i32* %6
%86 = load i32, i32* %7
%87 = icmp slt i32 %85, %86
br i1 %87, label %88, label %191
88: ; preds = %84
%89 = load i32, i32* %6
%90 = add nsw i32 %89, 1
%91 = load i32, i32* %7
%92 = icmp sge i32 %90, %91
br i1 %92, label %93, label %94
93: ; preds = %88
br label %107
94: ; preds = %88
%95 = load i32*, i32** %12
%96 = load i32, i32* %6
%97 = add nsw i32 %96, 1
%98 = load i32, i32* %3
%99 = sub nsw i32 %98, 1
%100 = mul nsw i32 %97, %99
%101 = load i32, i32* %7
%102 = add nsw i32 %100, %101
%103 = sub nsw i32 %102, 1
%104 = sext i32 %103 to i64
%105 = getelementptr inbounds i32, i32* %95, i64 %104
%106 = load i32, i32* %105
br label %107
107: ; preds = %94, %93
%108 = phi i32 [ 0, %93 ], [ %106, %94 ]
store i32 %108, i32* %11
%109 = load i8*, i8** %4
%110 = load i32, i32* %6
%111 = sext i32 %110 to i64
%112 = getelementptr inbounds i8, i8* %109, i64 %111
%113 = load i8, i8* %112
%114 = sext i8 %113 to i32
switch i32 %114, label %183 [
i32 67, label %115
i32 71, label %127
i32 65, label %149
i32 85, label %161
]
115: ; preds = %107
%116 = load i8*, i8** %4
%117 = load i32, i32* %7
%118 = sext i32 %117 to i64
%119 = getelementptr inbounds i8, i8* %116, i64 %118
%120 = load i8, i8* %119
%121 = sext i8 %120 to i32
%122 = icmp eq i32 %121, 71
%123 = zext i1 %122 to i64
%124 = select i1 %122, i32 1, i32 -999999
%125 = load i32, i32* %11
%126 = add nsw i32 %125, %124
store i32 %126, i32* %11
br label %184
127: ; preds = %107
%128 = load i8*, i8** %4
%129 = load i32, i32* %7
%130 = sext i32 %129 to i64
%131 = getelementptr inbounds i8, i8* %128, i64 %130
%132 = load i8, i8* %131
%133 = sext i8 %132 to i32
%134 = icmp eq i32 %133, 67
br i1 %134, label %143, label %135
135: ; preds = %127
%136 = load i8*, i8** %4
%137 = load i32, i32* %7
%138 = sext i32 %137 to i64
%139 = getelementptr inbounds i8, i8* %136, i64 %138
%140 = load i8, i8* %139
%141 = sext i8 %140 to i32
%142 = icmp eq i32 %141, 85
br label %143
143: ; preds = %135, %127
%144 = phi i1 [ true, %127 ], [ %142, %135 ]
%145 = zext i1 %144 to i64
%146 = select i1 %144, i32 1, i32 -999999
%147 = load i32, i32* %11
%148 = add nsw i32 %147, %146
store i32 %148, i32* %11
br label %184
149: ; preds = %107
%150 = load i8*, i8** %4
%151 = load i32, i32* %7
%152 = sext i32 %151 to i64
%153 = getelementptr inbounds i8, i8* %150, i64 %152
%154 = load i8, i8* %153
%155 = sext i8 %154 to i32
%156 = icmp eq i32 %155, 85
%157 = zext i1 %156 to i64
%158 = select i1 %156, i32 1, i32 -999999
%159 = load i32, i32* %11
%160 = add nsw i32 %159, %158
store i32 %160, i32* %11
br label %184
161: ; preds = %107
%162 = load i8*, i8** %4
%163 = load i32, i32* %7
%164 = sext i32 %163 to i64
%165 = getelementptr inbounds i8, i8* %162, i64 %164
%166 = load i8, i8* %165
%167 = sext i8 %166 to i32
%168 = icmp eq i32 %167, 65
br i1 %168, label %177, label %169
169: ; preds = %161
%170 = load i8*, i8** %4
%171 = load i32, i32* %7
%172 = sext i32 %171 to i64
%173 = getelementptr inbounds i8, i8* %170, i64 %172
%174 = load i8, i8* %173
%175 = sext i8 %174 to i32
%176 = icmp eq i32 %175, 71
br label %177
177: ; preds = %169, %161
%178 = phi i1 [ true, %161 ], [ %176, %169 ]
%179 = zext i1 %178 to i64
%180 = select i1 %178, i32 1, i32 -999999
%181 = load i32, i32* %11
%182 = add nsw i32 %181, %180
store i32 %182, i32* %11
br label %184
183: ; preds = %107
store i32 -999999, i32* %11
br label %184
184: ; preds = %183, %177, %149, %143, %115
%185 = load i32, i32* %10
%186 = load i32, i32* %11
%187 = icmp slt i32 %185, %186
br i1 %187, label %188, label %190
188: ; preds = %184
%189 = load i32, i32* %11
store i32 %189, i32* %10
br label %190
190: ; preds = %188, %184
br label %191
191: ; preds = %190, %84
%192 = load i32, i32* %6
%193 = add nsw i32 %192, 1
store i32 %193, i32* %8
br label %194
194: ; preds = %227, %191
%195 = load i32, i32* %8
%196 = load i32, i32* %7
%197 = icmp slt i32 %195, %196
br i1 %197, label %198, label %230
198: ; preds = %194
%199 = load i32*, i32** %12
%200 = load i32, i32* %6
%201 = load i32, i32* %3
%202 = sub nsw i32 %201, 1
%203 = mul nsw i32 %200, %202
%204 = load i32, i32* %8
%205 = add nsw i32 %203, %204
%206 = sext i32 %205 to i64
%207 = getelementptr inbounds i32, i32* %199, i64 %206
%208 = load i32, i32* %207
%209 = load i32*, i32** %12
%210 = load i32, i32* %8
%211 = add nsw i32 %210, 1
%212 = load i32, i32* %3
%213 = sub nsw i32 %212, 1
%214 = mul nsw i32 %211, %213
%215 = load i32, i32* %7
%216 = add nsw i32 %214, %215
%217 = sext i32 %216 to i64
%218 = getelementptr inbounds i32, i32* %209, i64 %217
%219 = load i32, i32* %218
%220 = add nsw i32 %208, %219
store i32 %220, i32* %11
%221 = load i32, i32* %10
%222 = load i32, i32* %11
%223 = icmp slt i32 %221, %222
br i1 %223, label %224, label %226
224: ; preds = %198
%225 = load i32, i32* %11
store i32 %225, i32* %10
br label %226
226: ; preds = %224, %198
br label %227
227: ; preds = %226
%228 = load i32, i32* %8
%229 = add nsw i32 %228, 1
store i32 %229, i32* %8
br label %194
230: ; preds = %194
%231 = load i32, i32* %10
%232 = load i32*, i32** %12
%233 = load i32, i32* %9
%234 = sext i32 %233 to i64
%235 = getelementptr inbounds i32, i32* %232, i64 %234
store i32 %231, i32* %235
br label %236
236: ; preds = %230
%237 = load i32, i32* %7
%238 = add nsw i32 %237, 1
store i32 %238, i32* %7
br label %25
239: ; preds = %25
br label %240
240: ; preds = %239
%241 = load i32, i32* %6
%242 = add nsw i32 %241, -1
store i32 %242, i32* %6
br label %20
243: ; preds = %20
%244 = load i32*, i32** %12
%245 = call i32 @free(i32* %244)
%246 = load i32, i32* %10
ret i32 %246
}

LLVM IR (-O2):
define i32 @nussinov(i32 %0, i8* nocapture %1) {
%3 = mul nsw i32 %0, %0
%4 = tail call i32* @calloc(i32 %3, i32 4)
%5 = icmp sgt i32 %0, 0
br i1 %5, label %6, label %144
6: ; preds = %2
%7 = add nsw i32 %0, -1
%8 = zext i32 %0 to i64
%9 = zext i32 %7 to i64
br label %10
10: ; preds = %6, %140
%11 = phi i64 [ %8, %6 ], [ %14, %140 ]
%12 = phi i64 [ %8, %6 ], [ %143, %140 ]
%13 = phi i32 [ undef, %6 ], [ %141, %140 ]
%14 = add nsw i64 %11, -1
%15 = icmp sgt i64 %11, %8
br i1 %15, label %140, label %16
16: ; preds = %10
%17 = mul nsw i64 %14, %9
%18 = mul nsw i64 %11, %9
%19 = add i64 %18, 4294967295
%20 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %14
%21 = add nsw i64 %12, %17
%22 = getelementptr inbounds i32, i32* %4, i64 %21
%23 = add nsw i64 %12, 1
%24 = mul nsw i64 %23, %9
br label %25
25: ; preds = %16, %134
%26 = phi i32 [ 0, %16 ], [ %139, %134 ]
%27 = phi i64 [ %14, %16 ], [ %137, %134 ]
%28 = phi i32 [ %13, %16 ], [ %135, %134 ]
%29 = add nsw i64 %27, %17
%30 = icmp eq i64 %27, %14
%31 = select i1 %30, i32 0, i32 %28
%32 = icmp sgt i64 %11, %27
br i1 %32, label %87, label %33
33: ; preds = %25
%34 = add nsw i64 %27, %18
%35 = getelementptr inbounds i32, i32* %4, i64 %34
%36 = load i32, i32* %35
%37 = icmp slt i32 %31, %36
%38 = select i1 %37, i32 %36, i32 %31
%39 = add nsw i64 %29, -1
%40 = getelementptr inbounds i32, i32* %4, i64 %39
%41 = load i32, i32* %40
%42 = icmp slt i32 %38, %41
%43 = select i1 %42, i32 %41, i32 %38
%44 = icmp slt i64 %11, %27
br i1 %44, label %45, label %51
45: ; preds = %33
%46 = add i64 %19, %27
%47 = shl i64 %46, 32
%48 = ashr exact i64 %47, 32
%49 = getelementptr inbounds i32, i32* %4, i64 %48
%50 = load i32, i32* %49
br label %51
51: ; preds = %33, %45
%52 = phi i32 [ %50, %45 ], [ 0, %33 ]
%53 = load i8, i8* %20
%54 = sext i8 %53 to i32
switch i32 %54, label %83 [
i32 67, label %55
i32 71, label %61
i32 65, label %69
i32 85, label %75
]
55: ; preds = %51
%56 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %27
%57 = load i8, i8* %56
%58 = icmp eq i8 %57, 71
%59 = select i1 %58, i32 1, i32 -999999
%60 = add nsw i32 %59, %52
br label %83
61: ; preds = %51
%62 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %27
%63 = load i8, i8* %62
%64 = icmp eq i8 %63, 67
%65 = icmp eq i8 %63, 85
%66 = or i1 %64, %65
%67 = select i1 %66, i32 1, i32 -999999
%68 = add nsw i32 %67, %52
br label %83
69: ; preds = %51
%70 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %27
%71 = load i8, i8* %70
%72 = icmp eq i8 %71, 85
%73 = select i1 %72, i32 1, i32 -999999
%74 = add nsw i32 %73, %52
br label %83
75: ; preds = %51
%76 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %27
%77 = load i8, i8* %76
%78 = icmp eq i8 %77, 65
%79 = icmp eq i8 %77, 71
%80 = or i1 %78, %79
%81 = select i1 %80, i32 1, i32 -999999
%82 = add nsw i32 %81, %52
br label %83
83: ; preds = %51, %75, %69, %61, %55
%84 = phi i32 [ %82, %75 ], [ %74, %69 ], [ %68, %61 ], [ %60, %55 ], [ -999999, %51 ]
%85 = icmp slt i32 %43, %84
%86 = select i1 %85, i32 %84, i32 %43
br label %87
87: ; preds = %25, %83
%88 = phi i32 [ %86, %83 ], [ %31, %25 ]
%89 = icmp slt i64 %11, %27
br i1 %89, label %90, label %134
90: ; preds = %87
%91 = trunc i64 %27 to i32
%92 = and i32 %26, 1
%93 = icmp eq i32 %92, 0
br i1 %93, label %94, label %102
94: ; preds = %90
%95 = load i32, i32* %22
%96 = add nsw i64 %24, %27
%97 = getelementptr inbounds i32, i32* %4, i64 %96
%98 = load i32, i32* %97
%99 = add nsw i32 %98, %95
%100 = icmp slt i32 %88, %99
%101 = select i1 %100, i32 %99, i32 %88
br label %102
102: ; preds = %94, %90
%103 = phi i32 [ undef, %90 ], [ %101, %94 ]
%104 = phi i64 [ %12, %90 ], [ %23, %94 ]
%105 = phi i32 [ %88, %90 ], [ %101, %94 ]
%106 = icmp eq i32 %26, 2
br i1 %106, label %134, label %107
107: ; preds = %102, %107
%108 = phi i64 [ %124, %107 ], [ %104, %102 ]
%109 = phi i32 [ %131, %107 ], [ %105, %102 ]
%110 = add nsw i64 %108, %17
%111 = getelementptr inbounds i32, i32* %4, i64 %110
%112 = load i32, i32* %111
%113 = add nsw i64 %108, 1
%114 = mul nsw i64 %113, %9
%115 = add nsw i64 %114, %27
%116 = getelementptr inbounds i32, i32* %4, i64 %115
%117 = load i32, i32* %116
%118 = add nsw i32 %117, %112
%119 = icmp slt i32 %109, %118
%120 = select i1 %119, i32 %118, i32 %109
%121 = add nsw i64 %113, %17
%122 = getelementptr inbounds i32, i32* %4, i64 %121
%123 = load i32, i32* %122
%124 = add nsw i64 %108, 2
%125 = mul nsw i64 %124, %9
%126 = add nsw i64 %125, %27
%127 = getelementptr inbounds i32, i32* %4, i64 %126
%128 = load i32, i32* %127
%129 = add nsw i32 %128, %123
%130 = icmp slt i32 %120, %129
%131 = select i1 %130, i32 %129, i32 %120
%132 = trunc i64 %124 to i32
%133 = icmp eq i32 %132, %91
br i1 %133, label %134, label %107
134: ; preds = %102, %107, %87
%135 = phi i32 [ %88, %87 ], [ %103, %102 ], [ %131, %107 ]
%136 = getelementptr inbounds i32, i32* %4, i64 %29
store i32 %135, i32* %136
%137 = add nsw i64 %27, 1
%138 = icmp eq i64 %137, %8
%139 = add i32 %26, 1
br i1 %138, label %140, label %25
140: ; preds = %134, %10
%141 = phi i32 [ %13, %10 ], [ %135, %134 ]
%142 = icmp sgt i64 %11, 1
%143 = add nsw i64 %12, -1
br i1 %142, label %10, label %144
144: ; preds = %140, %2
%145 = phi i32 [ undef, %2 ], [ %141, %140 ]
%146 = tail call i32 @free(i32* %4)
ret i32 %145
}