char is_noncanonical(char *pos, int k) {
  int i;
  char base;
  for (i = 0; i < k; i++) {
    base = *(pos + i);
    if (base != 'A' && base != 'C' && base != 'G' && base != 'T')
      return 1;
  }
  return 0;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<is_noncanonical>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    %rdi,-0x10(%rbp)
mov    %esi,-0x14(%rbp)
movl   $0x0,-0x18(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
jge    117c <is_noncanonical+0x7c>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x18(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,1),%al
mov    %al,-0x19(%rbp)
movsbl -0x19(%rbp),%eax
cmp    $0x41,%eax
je     1169 <is_noncanonical+0x69>
movsbl -0x19(%rbp),%eax
cmp    $0x43,%eax
je     1169 <is_noncanonical+0x69>
movsbl -0x19(%rbp),%eax
cmp    $0x47,%eax
je     1169 <is_noncanonical+0x69>
movsbl -0x19(%rbp),%eax
cmp    $0x54,%eax
je     1169 <is_noncanonical+0x69>
movb   $0x1,-0x1(%rbp)
jmp    1180 <is_noncanonical+0x80>
jmp    116e <is_noncanonical+0x6e>
mov    -0x18(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x18(%rbp)
jmp    1112 <is_noncanonical+0x12>
movb   $0x0,-0x1(%rbp)
movsbl -0x1(%rbp),%eax
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<is_noncanonical>:
test   %esi,%esi
jle    1130 <is_noncanonical+0x30>
mov    %esi,%esi
xor    %edx,%edx
mov    $0x80045,%r8d
xchg   %ax,%ax
movzbl (%rdi,%rdx,1),%ecx
mov    $0x1,%al
add    $0xbf,%cl
cmp    $0x13,%cl
ja     1132 <is_noncanonical+0x32>
movzbl %cl,%ecx
bt     %rcx,%r8
jae    1132 <is_noncanonical+0x32>
add    $0x1,%rdx
cmp    %rdx,%rsi
jne    1110 <is_noncanonical+0x10>
xor    %eax,%eax
ret

LLVM IR (-O0):
define signext i8 @is_noncanonical(i8* %0, i32 %1) {
%3 = alloca i8
%4 = alloca i8*
%5 = alloca i32
%6 = alloca i32
%7 = alloca i8
store i8* %0, i8** %4
store i32 %1, i32* %5
store i32 0, i32* %6
br label %8
8: ; preds = %35, %2
%9 = load i32, i32* %6
%10 = load i32, i32* %5
%11 = icmp slt i32 %9, %10
br i1 %11, label %12, label %38
12: ; preds = %8
%13 = load i8*, i8** %4
%14 = load i32, i32* %6
%15 = sext i32 %14 to i64
%16 = getelementptr inbounds i8, i8* %13, i64 %15
%17 = load i8, i8* %16
store i8 %17, i8* %7
%18 = load i8, i8* %7
%19 = sext i8 %18 to i32
%20 = icmp ne i32 %19, 65
br i1 %20, label %21, label %34
21: ; preds = %12
%22 = load i8, i8* %7
%23 = sext i8 %22 to i32
%24 = icmp ne i32 %23, 67
br i1 %24, label %25, label %34
25: ; preds = %21
%26 = load i8, i8* %7
%27 = sext i8 %26 to i32
%28 = icmp ne i32 %27, 71
br i1 %28, label %29, label %34
29: ; preds = %25
%30 = load i8, i8* %7
%31 = sext i8 %30 to i32
%32 = icmp ne i32 %31, 84
br i1 %32, label %33, label %34
33: ; preds = %29
store i8 1, i8* %3
br label %39
34: ; preds = %29, %25, %21, %12
br label %35
35: ; preds = %34
%36 = load i32, i32* %6
%37 = add nsw i32 %36, 1
store i32 %37, i32* %6
br label %8
38: ; preds = %8
store i8 0, i8* %3
br label %39
39: ; preds = %38, %33
%40 = load i8, i8* %3
ret i8 %40
}

LLVM IR (-O2):
define signext i8 @is_noncanonical(i8* nocapture %0, i32 %1) {
%3 = icmp sgt i32 %1, 0
br i1 %3, label %4, label %13
4: ; preds = %2
%5 = zext i32 %1 to i64
br label %6
6: ; preds = %4, %10
%7 = phi i64 [ 0, %4 ], [ %11, %10 ]
%8 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %7
%9 = load i8, i8* %8
switch i8 %9, label %13 [
i8 84, label %10
i8 71, label %10
i8 67, label %10
i8 65, label %10
]
10: ; preds = %6, %6, %6, %6
%11 = add nuw nsw i64 %7, 1
%12 = icmp eq i64 %11, %5
br i1 %12, label %13, label %6
13: ; preds = %6, %10, %2
%14 = phi i8 [ 0, %2 ], [ 0, %10 ], [ 1, %6 ]
ret i8 %14
}