#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
scalar_t__ malloc(int);
char *NormalizeSeqName(char *name, int mode) {
  char c, *newname;
  int i, n;
  n = 0;
  while (name[n] != '\0')
    n++;
  newname = (char *)malloc((n + 1) * sizeof(char));
  i = 0;
  n = 0;
  while ((c = name[n++]) != '\0') {
    if ((c >= '0' && c <= '9') || (c >= 'A' && c <= 'Z') ||
        (c >= 'a' && c <= 'z'))
      newname[i++] = c;
    else if (mode != 0) {
      if (mode == 1) {
        if (i == 0 || newname[(i - 1)] != '_')
          newname[i++] = '_';
      } else if (c >= '!' && c <= '~')
        newname[i++] = c;
    }
  }
  newname[i] = '\0';
  return newname;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<NormalizeSeqName>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x20,%rsp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %esi,-0xc(%rbp)
movl   $0x0,-0x20(%rbp)
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x0,%eax
je     1149 <NormalizeSeqName+0x39>
mov    -0x20(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x20(%rbp)
jmp    1126 <NormalizeSeqName+0x16>
mov    -0x20(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
cltq
shl    $0x0,%rax
mov    %eax,%edi
call   1030 <malloc@plt>
mov    %rax,-0x18(%rbp)
movl   $0x0,-0x1c(%rbp)
movl   $0x0,-0x20(%rbp)
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    -0x20(%rbp),%ecx
mov    %ecx,%edx
add    $0x1,%edx
mov    %edx,-0x20(%rbp)
movslq %ecx,%rcx
mov    (%rax,%rcx,1),%al
mov    %al,-0xd(%rbp)
movsbl %al,%eax
cmp    $0x0,%eax
je     1296 <NormalizeSeqName+0x186>
movsbl -0xd(%rbp),%eax
cmp    $0x30,%eax
jl     11ac <NormalizeSeqName+0x9c>
movsbl -0xd(%rbp),%eax
cmp    $0x39,%eax
jle    11e0 <NormalizeSeqName+0xd0>
movsbl -0xd(%rbp),%eax
cmp    $0x41,%eax
jl     11c6 <NormalizeSeqName+0xb6>
movsbl -0xd(%rbp),%eax
cmp    $0x5a,%eax
jle    11e0 <NormalizeSeqName+0xd0>
movsbl -0xd(%rbp),%eax
cmp    $0x61,%eax
jl     11fd <NormalizeSeqName+0xed>
movsbl -0xd(%rbp),%eax
cmp    $0x7a,%eax
jg     11fd <NormalizeSeqName+0xed>
mov    -0xd(%rbp),%dl
mov    -0x18(%rbp),%rax
mov    -0x1c(%rbp),%ecx
mov    %ecx,%esi
add    $0x1,%esi
mov    %esi,-0x1c(%rbp)
movslq %ecx,%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
jmp    1291 <NormalizeSeqName+0x181>
cmpl   $0x0,-0xc(%rbp)
je     128c <NormalizeSeqName+0x17c>
cmpl   $0x1,-0xc(%rbp)
jne    1250 <NormalizeSeqName+0x140>
cmpl   $0x0,-0x1c(%rbp)
je     1235 <NormalizeSeqName+0x125>
mov    -0x18(%rbp),%rax
mov    -0x1c(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x5f,%eax
je     124b <NormalizeSeqName+0x13b>
mov    -0x18(%rbp),%rax
mov    -0x1c(%rbp),%ecx
mov    %ecx,%edx
add    $0x1,%edx
mov    %edx,-0x1c(%rbp)
movslq %ecx,%rcx
movb   $0x5f,(%rax,%rcx,1)
jmp    1287 <NormalizeSeqName+0x177>
movsbl -0xd(%rbp),%eax
cmp    $0x21,%eax
jl     1282 <NormalizeSeqName+0x172>
movsbl -0xd(%rbp),%eax
cmp    $0x7e,%eax
jg     1282 <NormalizeSeqName+0x172>
mov    -0xd(%rbp),%dl
mov    -0x18(%rbp),%rax
mov    -0x1c(%rbp),%ecx
mov    %ecx,%esi
add    $0x1,%esi
mov    %esi,-0x1c(%rbp)
movslq %ecx,%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
jmp    1287 <NormalizeSeqName+0x177>
jmp    128c <NormalizeSeqName+0x17c>
jmp    1291 <NormalizeSeqName+0x181>
jmp    116e <NormalizeSeqName+0x5e>
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
movb   $0x0,(%rax,%rcx,1)
mov    -0x18(%rbp),%rax
add    $0x20,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<NormalizeSeqName>:
push   %rbp
push   %rbx
push   %rax
mov    %esi,%ebp
mov    %rdi,%rbx
xor    %edi,%edi
nopw   0x0(%rax,%rax,1)
cmpb   $0x0,(%rbx,%rdi,1)
lea    0x1(%rdi),%rdi
jne    1120 <NormalizeSeqName+0x10>
call   1030 <malloc@plt>
mov    (%rbx),%dl
test   %dl,%dl
je     1195 <NormalizeSeqName+0x85>
add    $0x1,%rbx
xor    %ecx,%ecx
jmp    1154 <NormalizeSeqName+0x44>
nopl   (%rax)
movslq %ecx,%rsi
add    $0x1,%ecx
mov    %dl,(%rax,%rsi,1)
movzbl (%rbx),%edx
add    $0x1,%rbx
test   %dl,%dl
je     1197 <NormalizeSeqName+0x87>
lea    -0x30(%rdx),%esi
cmp    $0xa,%sil
jb     1140 <NormalizeSeqName+0x30>
lea    -0x41(%rdx),%esi
cmp    $0x1a,%sil
jb     1140 <NormalizeSeqName+0x30>
lea    -0x61(%rdx),%esi
cmp    $0x1a,%sil
jb     1140 <NormalizeSeqName+0x30>
test   %ebp,%ebp
je     1149 <NormalizeSeqName+0x39>
cmp    $0x1,%ebp
jne    118a <NormalizeSeqName+0x7a>
mov    $0x5f,%dl
test   %ecx,%ecx
je     1140 <NormalizeSeqName+0x30>
movslq %ecx,%rsi
cmpb   $0x5f,-0x1(%rsi,%rax,1)
jne    1140 <NormalizeSeqName+0x30>
jmp    1149 <NormalizeSeqName+0x39>
lea    -0x21(%rdx),%esi
cmp    $0x5d,%sil
jbe    1140 <NormalizeSeqName+0x30>
jmp    1149 <NormalizeSeqName+0x39>
xor    %ecx,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movb   $0x0,(%rax,%rcx,1)
add    $0x8,%rsp
pop    %rbx
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define i8* @NormalizeSeqName(i8* %0, i32 %1) {
%3 = alloca i8*
%4 = alloca i32
%5 = alloca i8
%6 = alloca i8*
%7 = alloca i32
%8 = alloca i32
store i8* %0, i8** %3
store i32 %1, i32* %4
store i32 0, i32* %8
br label %9
9: ; preds = %17, %2
%10 = load i8*, i8** %3
%11 = load i32, i32* %8
%12 = sext i32 %11 to i64
%13 = getelementptr inbounds i8, i8* %10, i64 %12
%14 = load i8, i8* %13
%15 = sext i8 %14 to i32
%16 = icmp ne i32 %15, 0
br i1 %16, label %17, label %20
17: ; preds = %9
%18 = load i32, i32* %8
%19 = add nsw i32 %18, 1
store i32 %19, i32* %8
br label %9
20: ; preds = %9
%21 = load i32, i32* %8
%22 = add nsw i32 %21, 1
%23 = sext i32 %22 to i64
%24 = mul i64 %23, 1
%25 = trunc i64 %24 to i32
%26 = call i64 @malloc(i32 %25)
%27 = inttoptr i64 %26 to i8*
store i8* %27, i8** %6
store i32 0, i32* %7
store i32 0, i32* %8
br label %28
28: ; preds = %111, %20
%29 = load i8*, i8** %3
%30 = load i32, i32* %8
%31 = add nsw i32 %30, 1
store i32 %31, i32* %8
%32 = sext i32 %30 to i64
%33 = getelementptr inbounds i8, i8* %29, i64 %32
%34 = load i8, i8* %33
store i8 %34, i8* %5
%35 = sext i8 %34 to i32
%36 = icmp ne i32 %35, 0
br i1 %36, label %37, label %112
37: ; preds = %28
%38 = load i8, i8* %5
%39 = sext i8 %38 to i32
%40 = icmp sge i32 %39, 48
br i1 %40, label %41, label %45
41: ; preds = %37
%42 = load i8, i8* %5
%43 = sext i8 %42 to i32
%44 = icmp sle i32 %43, 57
br i1 %44, label %61, label %45
45: ; preds = %41, %37
%46 = load i8, i8* %5
%47 = sext i8 %46 to i32
%48 = icmp sge i32 %47, 65
br i1 %48, label %49, label %53
49: ; preds = %45
%50 = load i8, i8* %5
%51 = sext i8 %50 to i32
%52 = icmp sle i32 %51, 90
br i1 %52, label %61, label %53
53: ; preds = %49, %45
%54 = load i8, i8* %5
%55 = sext i8 %54 to i32
%56 = icmp sge i32 %55, 97
br i1 %56, label %57, label %68
57: ; preds = %53
%58 = load i8, i8* %5
%59 = sext i8 %58 to i32
%60 = icmp sle i32 %59, 122
br i1 %60, label %61, label %68
61: ; preds = %57, %49, %41
%62 = load i8, i8* %5
%63 = load i8*, i8** %6
%64 = load i32, i32* %7
%65 = add nsw i32 %64, 1
store i32 %65, i32* %7
%66 = sext i32 %64 to i64
%67 = getelementptr inbounds i8, i8* %63, i64 %66
store i8 %62, i8* %67
br label %111
68: ; preds = %57, %53
%69 = load i32, i32* %4
%70 = icmp ne i32 %69, 0
br i1 %70, label %71, label %110
71: ; preds = %68
%72 = load i32, i32* %4
%73 = icmp eq i32 %72, 1
br i1 %73, label %74, label %93
74: ; preds = %71
%75 = load i32, i32* %7
%76 = icmp eq i32 %75, 0
br i1 %76, label %86, label %77
77: ; preds = %74
%78 = load i8*, i8** %6
%79 = load i32, i32* %7
%80 = sub nsw i32 %79, 1
%81 = sext i32 %80 to i64
%82 = getelementptr inbounds i8, i8* %78, i64 %81
%83 = load i8, i8* %82
%84 = sext i8 %83 to i32
%85 = icmp ne i32 %84, 95
br i1 %85, label %86, label %92
86: ; preds = %77, %74
%87 = load i8*, i8** %6
%88 = load i32, i32* %7
%89 = add nsw i32 %88, 1
store i32 %89, i32* %7
%90 = sext i32 %88 to i64
%91 = getelementptr inbounds i8, i8* %87, i64 %90
store i8 95, i8* %91
br label %92
92: ; preds = %86, %77
br label %109
93: ; preds = %71
%94 = load i8, i8* %5
%95 = sext i8 %94 to i32
%96 = icmp sge i32 %95, 33
br i1 %96, label %97, label %108
97: ; preds = %93
%98 = load i8, i8* %5
%99 = sext i8 %98 to i32
%100 = icmp sle i32 %99, 126
br i1 %100, label %101, label %108
101: ; preds = %97
%102 = load i8, i8* %5
%103 = load i8*, i8** %6
%104 = load i32, i32* %7
%105 = add nsw i32 %104, 1
store i32 %105, i32* %7
%106 = sext i32 %104 to i64
%107 = getelementptr inbounds i8, i8* %103, i64 %106
store i8 %102, i8* %107
br label %108
108: ; preds = %101, %97, %93
br label %109
109: ; preds = %108, %92
br label %110
110: ; preds = %109, %68
br label %111
111: ; preds = %110, %61
br label %28
112: ; preds = %28
%113 = load i8*, i8** %6
%114 = load i32, i32* %7
%115 = sext i32 %114 to i64
%116 = getelementptr inbounds i8, i8* %113, i64 %115
store i8 0, i8* %116
%117 = load i8*, i8** %6
ret i8* %117
}

LLVM IR (-O2):
define i8* @NormalizeSeqName(i8* nocapture %0, i32 %1) {
br label %3
3: ; preds = %3, %2
%4 = phi i64 [ %8, %3 ], [ 0, %2 ]
%5 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %4
%6 = load i8, i8* %5
%7 = icmp eq i8 %6, 0
%8 = add nuw i64 %4, 1
br i1 %7, label %9, label %3
9: ; preds = %3
%10 = trunc i64 %4 to i32
%11 = add nuw nsw i32 %10, 1
%12 = tail call i64 @malloc(i32 %11)
%13 = inttoptr i64 %12 to i8*
%14 = load i8, i8* %0
%15 = icmp eq i8 %14, 0
br i1 %15, label %51, label %16
16: ; preds = %9, %45
%17 = phi i64 [ %47, %45 ], [ 1, %9 ]
%18 = phi i8 [ %49, %45 ], [ %14, %9 ]
%19 = phi i32 [ %46, %45 ], [ 0, %9 ]
%20 = add i8 %18, -48
%21 = icmp ult i8 %20, 10
%22 = add i8 %18, -65
%23 = icmp ult i8 %22, 26
%24 = or i1 %21, %23
%25 = add i8 %18, -97
%26 = icmp ult i8 %25, 26
%27 = select i1 %24, i1 true, i1 %26
br i1 %27, label %40, label %28
28: ; preds = %16
switch i32 %1, label %37 [
i32 0, label %45
i32 1, label %29
]
29: ; preds = %28
%30 = icmp eq i32 %19, 0
br i1 %30, label %40, label %31
31: ; preds = %29
%32 = add nsw i32 %19, -1
%33 = sext i32 %32 to i64
%34 = getelementptr inbounds i8, i8* %13, i64 %33
%35 = load i8, i8* %34
%36 = icmp eq i8 %35, 95
br i1 %36, label %45, label %40
37: ; preds = %28
%38 = add i8 %18, -33
%39 = icmp ult i8 %38, 94
br i1 %39, label %40, label %45
40: ; preds = %37, %29, %31, %16
%41 = phi i8 [ %18, %16 ], [ 95, %31 ], [ 95, %29 ], [ %18, %37 ]
%42 = add nsw i32 %19, 1
%43 = sext i32 %19 to i64
%44 = getelementptr inbounds i8, i8* %13, i64 %43
store i8 %41, i8* %44
br label %45
45: ; preds = %40, %28, %37, %31
%46 = phi i32 [ %19, %31 ], [ %19, %37 ], [ %19, %28 ], [ %42, %40 ]
%47 = add nuw i64 %17, 1
%48 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %17
%49 = load i8, i8* %48
%50 = icmp eq i8 %49, 0
br i1 %50, label %51, label %16
51: ; preds = %45, %9
%52 = phi i32 [ 0, %9 ], [ %46, %45 ]
%53 = sext i32 %52 to i64
%54 = getelementptr inbounds i8, i8* %13, i64 %53
store i8 0, i8* %54
ret i8* %13
}