double calc_meanMFS(int nsites, int *mfs, int snp) {
  int csite;
  double aver;
  aver = 0;
  for (csite = 0; csite < nsites; csite++) {
    aver += mfs[csite];
  }
  if (snp > 0)
    return aver / (double)snp;
  else
    return 0;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<calc_meanMFS>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    %edi,-0xc(%rbp)
mov    %rsi,-0x18(%rbp)
mov    %edx,-0x1c(%rbp)
xorps  %xmm0,%xmm0
movsd  %xmm0,-0x28(%rbp)
movl   $0x0,-0x20(%rbp)
mov    -0x20(%rbp),%eax
cmp    -0xc(%rbp),%eax
jge    114e <calc_meanMFS+0x4e>
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
cvtsi2sdl (%rax,%rcx,4),%xmm0
addsd  -0x28(%rbp),%xmm0
movsd  %xmm0,-0x28(%rbp)
mov    -0x20(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x20(%rbp)
jmp    111d <calc_meanMFS+0x1d>
cmpl   $0x0,-0x1c(%rbp)
jle    1170 <calc_meanMFS+0x70>
movsd  -0x28(%rbp),%xmm0
cvtsi2sdl -0x1c(%rbp),%xmm1
divsd  %xmm1,%xmm0
movsd  %xmm0,-0x8(%rbp)
jmp    1178 <calc_meanMFS+0x78>
xorps  %xmm0,%xmm0
movsd  %xmm0,-0x8(%rbp)
movsd  -0x8(%rbp),%xmm0
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<calc_meanMFS>:
xorpd  %xmm0,%xmm0
xorpd  %xmm1,%xmm1
test   %edi,%edi
jle    11a5 <calc_meanMFS+0xa5>
mov    %edi,%ecx
lea    -0x1(%rcx),%rdi
mov    %ecx,%eax
and    $0x3,%eax
cmp    $0x3,%rdi
jae    1129 <calc_meanMFS+0x29>
xorpd  %xmm1,%xmm1
xor    %edi,%edi
jmp    117c <calc_meanMFS+0x7c>
and    $0xfffffffc,%ecx
xorpd  %xmm1,%xmm1
xor    %edi,%edi
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   0x0(%rax)
xorps  %xmm2,%xmm2
cvtsi2sdl (%rsi,%rdi,4),%xmm2
addsd  %xmm1,%xmm2
xorps  %xmm3,%xmm3
cvtsi2sdl 0x4(%rsi,%rdi,4),%xmm3
addsd  %xmm2,%xmm3
xorps  %xmm2,%xmm2
cvtsi2sdl 0x8(%rsi,%rdi,4),%xmm2
xorps  %xmm1,%xmm1
cvtsi2sdl 0xc(%rsi,%rdi,4),%xmm1
addsd  %xmm3,%xmm2
addsd  %xmm2,%xmm1
add    $0x4,%rdi
cmp    %rdi,%rcx
jne    1140 <calc_meanMFS+0x40>
test   %rax,%rax
je     11a5 <calc_meanMFS+0xa5>
lea    (%rsi,%rdi,4),%rcx
xor    %esi,%esi
nopw   0x0(%rax,%rax,1)
xorps  %xmm2,%xmm2
cvtsi2sdl (%rcx,%rsi,4),%xmm2
addsd  %xmm2,%xmm1
add    $0x1,%rsi
cmp    %rsi,%rax
jne    1190 <calc_meanMFS+0x90>
test   %edx,%edx
jle    11b8 <calc_meanMFS+0xb8>
xorps  %xmm0,%xmm0
cvtsi2sd %edx,%xmm0
divsd  %xmm0,%xmm1
movapd %xmm1,%xmm0
ret

LLVM IR (-O0):
define double @calc_meanMFS(i32 %0, i32* %1, i32 %2) {
%4 = alloca double
%5 = alloca i32
%6 = alloca i32*
%7 = alloca i32
%8 = alloca i32
%9 = alloca double
store i32 %0, i32* %5
store i32* %1, i32** %6
store i32 %2, i32* %7
store double 0.000000e+00, double* %9
store i32 0, i32* %8
br label %10
10: ; preds = %23, %3
%11 = load i32, i32* %8
%12 = load i32, i32* %5
%13 = icmp slt i32 %11, %12
br i1 %13, label %14, label %26
14: ; preds = %10
%15 = load i32*, i32** %6
%16 = load i32, i32* %8
%17 = sext i32 %16 to i64
%18 = getelementptr inbounds i32, i32* %15, i64 %17
%19 = load i32, i32* %18
%20 = sitofp i32 %19 to double
%21 = load double, double* %9
%22 = fadd double %21, %20
store double %22, double* %9
br label %23
23: ; preds = %14
%24 = load i32, i32* %8
%25 = add nsw i32 %24, 1
store i32 %25, i32* %8
br label %10
26: ; preds = %10
%27 = load i32, i32* %7
%28 = icmp sgt i32 %27, 0
br i1 %28, label %29, label %34
29: ; preds = %26
%30 = load double, double* %9
%31 = load i32, i32* %7
%32 = sitofp i32 %31 to double
%33 = fdiv double %30, %32
store double %33, double* %4
br label %35
34: ; preds = %26
store double 0.000000e+00, double* %4
br label %35
35: ; preds = %34, %29
%36 = load double, double* %4
ret double %36
}

LLVM IR (-O2):
define double @calc_meanMFS(i32 %0, i32* nocapture %1, i32 %2) {
%4 = icmp sgt i32 %0, 0
br i1 %4, label %5, label %54
5: ; preds = %3
%6 = zext i32 %0 to i64
%7 = add nsw i64 %6, -1
%8 = and i64 %6, 3
%9 = icmp ult i64 %7, 3
br i1 %9, label %38, label %10
10: ; preds = %5
%11 = and i64 %6, 4294967292
br label %12
12: ; preds = %12, %10
%13 = phi i64 [ 0, %10 ], [ %35, %12 ]
%14 = phi double [ 0.000000e+00, %10 ], [ %34, %12 ]
%15 = phi i64 [ 0, %10 ], [ %36, %12 ]
%16 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %13
%17 = load i32, i32* %16
%18 = sitofp i32 %17 to double
%19 = fadd double %14, %18
%20 = or i64 %13, 1
%21 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %20
%22 = load i32, i32* %21
%23 = sitofp i32 %22 to double
%24 = fadd double %19, %23
%25 = or i64 %13, 2
%26 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %25
%27 = load i32, i32* %26
%28 = sitofp i32 %27 to double
%29 = fadd double %24, %28
%30 = or i64 %13, 3
%31 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %30
%32 = load i32, i32* %31
%33 = sitofp i32 %32 to double
%34 = fadd double %29, %33
%35 = add nuw nsw i64 %13, 4
%36 = add i64 %15, 4
%37 = icmp eq i64 %36, %11
br i1 %37, label %38, label %12
38: ; preds = %12, %5
%39 = phi double [ undef, %5 ], [ %34, %12 ]
%40 = phi i64 [ 0, %5 ], [ %35, %12 ]
%41 = phi double [ 0.000000e+00, %5 ], [ %34, %12 ]
%42 = icmp eq i64 %8, 0
br i1 %42, label %54, label %43
43: ; preds = %38, %43
%44 = phi i64 [ %51, %43 ], [ %40, %38 ]
%45 = phi double [ %50, %43 ], [ %41, %38 ]
%46 = phi i64 [ %52, %43 ], [ 0, %38 ]
%47 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %44
%48 = load i32, i32* %47
%49 = sitofp i32 %48 to double
%50 = fadd double %45, %49
%51 = add nuw nsw i64 %44, 1
%52 = add i64 %46, 1
%53 = icmp eq i64 %52, %8
br i1 %53, label %54, label %43
54: ; preds = %38, %43, %3
%55 = phi double [ 0.000000e+00, %3 ], [ %39, %38 ], [ %50, %43 ]
%56 = icmp sgt i32 %2, 0
br i1 %56, label %57, label %60
57: ; preds = %54
%58 = sitofp i32 %2 to double
%59 = fdiv double %55, %58
br label %60
60: ; preds = %54, %57
%61 = phi double [ %59, %57 ], [ 0.000000e+00, %54 ]
ret double %61
}