void mat_2_per(int ngenes, int vc, int *mate, int *per) {
  int i, h;
  i = h = 0;
  do {
    i = mate[i];
    if (i == vc - 1)
      return;
    if ((i % 2) == 1) {
      per[h] = (i + 1) / 2;
      i++;
    } else {
      per[h] = -(i) / 2;
      i--;
    }
    h++;
  } while (1);
}


x86 assembly (clang, -O0):
<mat_2_per>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    %edi,-0x4(%rbp)
mov    %esi,-0x8(%rbp)
mov    %rdx,-0x10(%rbp)
mov    %rcx,-0x18(%rbp)
movl   $0x0,-0x20(%rbp)
movl   $0x0,-0x1c(%rbp)
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
mov    -0x1c(%rbp),%eax
mov    -0x8(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
cmp    %ecx,%eax
jne    1144 <mat_2_per+0x44>
jmp    11bc <mat_2_per+0xbc>
mov    -0x1c(%rbp),%eax
mov    $0x2,%ecx
cltd
idiv   %ecx
cmp    $0x1,%edx
jne    1181 <mat_2_per+0x81>
mov    -0x1c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    $0x2,%ecx
cltd
idiv   %ecx
mov    %eax,%edx
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
mov    %edx,(%rax,%rcx,4)
mov    -0x1c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
jmp    11a4 <mat_2_per+0xa4>
xor    %eax,%eax
sub    -0x1c(%rbp),%eax
mov    $0x2,%ecx
cltd
idiv   %ecx
mov    %eax,%edx
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
mov    %edx,(%rax,%rcx,4)
mov    -0x1c(%rbp),%eax
add    $0xffffffff,%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
mov    -0x20(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x20(%rbp)
mov    $0x1,%al
test   $0x1,%al
jne    1120 <mat_2_per+0x20>
jmp    11bc <mat_2_per+0xbc>
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<mat_2_per>:
add    $0xffffffff,%esi
mov    (%rdx),%r9d
jmp    1128 <mat_2_per+0x28>
nopl   0x0(%rax,%rax,1)
sar    %edi
neg    %edi
add    $0xffffffff,%r9d
mov    %r9d,%r8d
mov    %edi,(%rcx)
movslq %r8d,%rax
mov    (%rdx,%rax,4),%r9d
add    $0x4,%rcx
cmp    %esi,%r9d
je     1160 <mat_2_per+0x60>
mov    %r9d,%edi
shr    $0x1f,%edi
add    %r9d,%edi
mov    %edi,%r8d
and    $0xfffffffe,%r8d
mov    %r9d,%eax
sub    %r8d,%eax
cmp    $0x1,%eax
jne    1110 <mat_2_per+0x10>
mov    %r9d,%r8d
add    $0x1,%r8d
mov    %r8d,%eax
shr    $0x1f,%eax
lea    (%r9,%rax,1),%edi
add    $0x1,%edi
sar    %edi
jmp    111b <mat_2_per+0x1b>
ret

LLVM IR (-O0):
define void @mat_2_per(i32 %0, i32 %1, i32* %2, i32* %3) {
%5 = alloca i32
%6 = alloca i32
%7 = alloca i32*
%8 = alloca i32*
%9 = alloca i32
%10 = alloca i32
store i32 %0, i32* %5
store i32 %1, i32* %6
store i32* %2, i32** %7
store i32* %3, i32** %8
store i32 0, i32* %10
store i32 0, i32* %9
br label %11
11: ; preds = %49, %4
%12 = load i32*, i32** %7
%13 = load i32, i32* %9
%14 = sext i32 %13 to i64
%15 = getelementptr inbounds i32, i32* %12, i64 %14
%16 = load i32, i32* %15
store i32 %16, i32* %9
%17 = load i32, i32* %9
%18 = load i32, i32* %6
%19 = sub nsw i32 %18, 1
%20 = icmp eq i32 %17, %19
br i1 %20, label %21, label %22
21: ; preds = %11
br label %50
22: ; preds = %11
%23 = load i32, i32* %9
%24 = srem i32 %23, 2
%25 = icmp eq i32 %24, 1
br i1 %25, label %26, label %36
26: ; preds = %22
%27 = load i32, i32* %9
%28 = add nsw i32 %27, 1
%29 = sdiv i32 %28, 2
%30 = load i32*, i32** %8
%31 = load i32, i32* %10
%32 = sext i32 %31 to i64
%33 = getelementptr inbounds i32, i32* %30, i64 %32
store i32 %29, i32* %33
%34 = load i32, i32* %9
%35 = add nsw i32 %34, 1
store i32 %35, i32* %9
br label %46
36: ; preds = %22
%37 = load i32, i32* %9
%38 = sub nsw i32 0, %37
%39 = sdiv i32 %38, 2
%40 = load i32*, i32** %8
%41 = load i32, i32* %10
%42 = sext i32 %41 to i64
%43 = getelementptr inbounds i32, i32* %40, i64 %42
store i32 %39, i32* %43
%44 = load i32, i32* %9
%45 = add nsw i32 %44, -1
store i32 %45, i32* %9
br label %46
46: ; preds = %36, %26
%47 = load i32, i32* %10
%48 = add nsw i32 %47, 1
store i32 %48, i32* %10
br label %49
49: ; preds = %46
br i1 true, label %11, label %50
50: ; preds = %21, %49
ret void
}

LLVM IR (-O2):
define void @mat_2_per(i32 %0, i32 %1, i32* nocapture %2, i32* nocapture writeonly %3) {
%5 = add nsw i32 %1, -1
%6 = load i32, i32* %2
%7 = icmp eq i32 %6, %5
br i1 %7, label %8, label %9
8: ; preds = %20, %4
ret void
9: ; preds = %4, %20
%10 = phi i64 [ %24, %20 ], [ 0, %4 ]
%11 = phi i32 [ %27, %20 ], [ %6, %4 ]
%12 = srem i32 %11, 2
%13 = icmp eq i32 %12, 1
br i1 %13, label %14, label %17
14: ; preds = %9
%15 = add nsw i32 %11, 1
%16 = sdiv i32 %15, 2
br label %20
17: ; preds = %9
%18 = sdiv i32 %11, -2
%19 = add nsw i32 %11, -1
br label %20
20: ; preds = %17, %14
%21 = phi i32 [ %16, %14 ], [ %18, %17 ]
%22 = phi i32 [ %15, %14 ], [ %19, %17 ]
%23 = getelementptr inbounds i32, i32* %3, i64 %10
store i32 %21, i32* %23
%24 = add nuw i64 %10, 1
%25 = sext i32 %22 to i64
%26 = getelementptr inbounds i32, i32* %2, i64 %25
%27 = load i32, i32* %26
%28 = icmp eq i32 %27, %5
br i1 %28, label %8, label %9
}