#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
int encode_basepairs(char *, int);
void high_index(unsigned char *dhigh, char *s, int n) {
  int i, j;
  unsigned char k, bit;
  i = encode_basepairs(s, n);
  if (i >= 0) {
    j = i / 8;
    k = i % 8;
    bit = 1 << k;
    dhigh[j] = dhigh[j] | bit;
  }
}


x86 assembly (clang, -O0):
<high_index>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x20,%rsp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %edx,-0x14(%rbp)
mov    -0x10(%rbp),%rdi
mov    -0x14(%rbp),%esi
call   1030 <encode_basepairs@plt>
mov    %eax,-0x18(%rbp)
cmpl   $0x0,-0x18(%rbp)
jl     1187 <high_index+0x77>
mov    -0x18(%rbp),%eax
mov    $0x8,%ecx
cltd
idiv   %ecx
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%eax
mov    $0x8,%ecx
cltd
idiv   %ecx
mov    %dl,%al
mov    %al,-0x1d(%rbp)
movzbl -0x1d(%rbp),%ecx
mov    $0x1,%eax
shl    %cl,%eax
mov    %al,-0x1e(%rbp)
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
movzbl (%rax,%rcx,1),%eax
movzbl -0x1e(%rbp),%ecx
or     %ecx,%eax
mov    %al,%dl
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
add    $0x20,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<high_index>:
push   %rbx
mov    %rdi,%rbx
mov    %rsi,%rdi
mov    %edx,%esi
call   1030 <encode_basepairs@plt>
test   %eax,%eax
js     1137 <high_index+0x27>
mov    %eax,%edx
and    $0x7,%al
mov    $0x1,%esi
mov    %eax,%ecx
shl    %cl,%esi
shr    $0x3,%rdx
or     %sil,(%rbx,%rdx,1)
pop    %rbx
ret

LLVM IR (-O0):
define void @high_index(i8* %0, i8* %1, i32 %2) {
%4 = alloca i8*
%5 = alloca i8*
%6 = alloca i32
%7 = alloca i32
%8 = alloca i32
%9 = alloca i8
%10 = alloca i8
store i8* %0, i8** %4
store i8* %1, i8** %5
store i32 %2, i32* %6
%11 = load i8*, i8** %5
%12 = load i32, i32* %6
%13 = call i32 @encode_basepairs(i8* %11, i32 %12)
store i32 %13, i32* %7
%14 = load i32, i32* %7
%15 = icmp sge i32 %14, 0
br i1 %15, label %16, label %40
16: ; preds = %3
%17 = load i32, i32* %7
%18 = sdiv i32 %17, 8
store i32 %18, i32* %8
%19 = load i32, i32* %7
%20 = srem i32 %19, 8
%21 = trunc i32 %20 to i8
store i8 %21, i8* %9
%22 = load i8, i8* %9
%23 = zext i8 %22 to i32
%24 = shl i32 1, %23
%25 = trunc i32 %24 to i8
store i8 %25, i8* %10
%26 = load i8*, i8** %4
%27 = load i32, i32* %8
%28 = sext i32 %27 to i64
%29 = getelementptr inbounds i8, i8* %26, i64 %28
%30 = load i8, i8* %29
%31 = zext i8 %30 to i32
%32 = load i8, i8* %10
%33 = zext i8 %32 to i32
%34 = or i32 %31, %33
%35 = trunc i32 %34 to i8
%36 = load i8*, i8** %4
%37 = load i32, i32* %8
%38 = sext i32 %37 to i64
%39 = getelementptr inbounds i8, i8* %36, i64 %38
store i8 %35, i8* %39
br label %40
40: ; preds = %16, %3
ret void
}

LLVM IR (-O2):
define void @high_index(i8* nocapture %0, i8* %1, i32 %2) {
%4 = tail call i32 @encode_basepairs(i8* %1, i32 %2)
%5 = icmp sgt i32 %4, -1
br i1 %5, label %6, label %15
6: ; preds = %3
%7 = lshr i32 %4, 3
%8 = and i32 %4, 7
%9 = shl nuw nsw i32 1, %8
%10 = zext i32 %7 to i64
%11 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %10
%12 = load i8, i8* %11
%13 = trunc i32 %9 to i8
%14 = or i8 %12, %13
store i8 %14, i8* %11
br label %15
15: ; preds = %6, %3
ret void
}