#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
unsigned int encode_basepairs(char *, int);
void index_string(int *index, char *s, int n) {
  unsigned int i, offset;
  int j;
  offset = 0;
  for (j = 1; j <= n; j++) {
    i = encode_basepairs(s, j);
    index[i + offset]++;
    offset++;
    offset = offset << 2;
  }
}


x86 assembly (clang, -O0):
<index_string>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x20,%rsp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %edx,-0x14(%rbp)
movl   $0x0,-0x1c(%rbp)
movl   $0x1,-0x20(%rbp)
mov    -0x20(%rbp),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
jg     1181 <index_string+0x71>
mov    -0x10(%rbp),%rdi
mov    -0x20(%rbp),%esi
call   1030 <encode_basepairs@plt>
mov    %eax,-0x18(%rbp)
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
add    -0x1c(%rbp),%ecx
mov    %ecx,%ecx
mov    (%rax,%rcx,4),%edx
add    $0x1,%edx
mov    %edx,(%rax,%rcx,4)
mov    -0x1c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
mov    -0x1c(%rbp),%eax
shl    $0x2,%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
mov    -0x20(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x20(%rbp)
jmp    1131 <index_string+0x21>
add    $0x20,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<index_string>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r12
push   %rbx
test   %edx,%edx
jle    115a <index_string+0x4a>
mov    %edx,%r12d
mov    %rsi,%r14
mov    %rdi,%r15
neg    %r12d
xor    %ebp,%ebp
mov    $0x1,%ebx
nop
mov    %r14,%rdi
mov    %ebx,%esi
call   1030 <encode_basepairs@plt>
add    %ebp,%eax
addl   $0x1,(%r15,%rax,4)
shl    $0x2,%ebp
or     $0x4,%ebp
lea    (%r12,%rbx,1),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %ebx,%ecx
add    $0x1,%ecx
mov    %ecx,%ebx
cmp    $0x1,%eax
jne    1130 <index_string+0x20>
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define void @index_string(i32* %0, i8* %1, i32 %2) {
%4 = alloca i32*
%5 = alloca i8*
%6 = alloca i32
%7 = alloca i32
%8 = alloca i32
%9 = alloca i32
store i32* %0, i32** %4
store i8* %1, i8** %5
store i32 %2, i32* %6
store i32 0, i32* %8
store i32 1, i32* %9
br label %10
10: ; preds = %30, %3
%11 = load i32, i32* %9
%12 = load i32, i32* %6
%13 = icmp sle i32 %11, %12
br i1 %13, label %14, label %33
14: ; preds = %10
%15 = load i8*, i8** %5
%16 = load i32, i32* %9
%17 = call i32 @encode_basepairs(i8* %15, i32 %16)
store i32 %17, i32* %7
%18 = load i32*, i32** %4
%19 = load i32, i32* %7
%20 = load i32, i32* %8
%21 = add i32 %19, %20
%22 = zext i32 %21 to i64
%23 = getelementptr inbounds i32, i32* %18, i64 %22
%24 = load i32, i32* %23
%25 = add nsw i32 %24, 1
store i32 %25, i32* %23
%26 = load i32, i32* %8
%27 = add i32 %26, 1
store i32 %27, i32* %8
%28 = load i32, i32* %8
%29 = shl i32 %28, 2
store i32 %29, i32* %8
br label %30
30: ; preds = %14
%31 = load i32, i32* %9
%32 = add nsw i32 %31, 1
store i32 %32, i32* %9
br label %10
33: ; preds = %10
ret void
}

LLVM IR (-O2):
define void @index_string(i32* nocapture %0, i8* %1, i32 %2) {
%4 = icmp slt i32 %2, 1
br i1 %4, label %18, label %5
5: ; preds = %3, %5
%6 = phi i32 [ %16, %5 ], [ 1, %3 ]
%7 = phi i32 [ %15, %5 ], [ 0, %3 ]
%8 = tail call i32 @encode_basepairs(i8* %1, i32 %6)
%9 = add i32 %8, %7
%10 = zext i32 %9 to i64
%11 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 %10
%12 = load i32, i32* %11
%13 = add nsw i32 %12, 1
store i32 %13, i32* %11
%14 = shl i32 %7, 2
%15 = or i32 %14, 4
%16 = add nuw i32 %6, 1
%17 = icmp eq i32 %6, %2
br i1 %17, label %18, label %5
18: ; preds = %5, %3
ret void
}