#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */
typedef int int32_t;

/* Variables and functions */
float sqrt(float);
float r_unphased(int32_t *a_gts, int32_t *b_gts, float f, int32_t n_samples) {
  float vA, vB, vAB, cov, nsqr;
  int suma = 0, sumb = 0, sumaa = 0, sumbb = 0, sumab = 0;
  int i, n = 0, a, b;
  for (i = 0; i < n_samples; i++) {
    a = a_gts[i];
    if (a == 3)
      continue;
    b = b_gts[i];
    if (b == 3)
      continue;
    n += 1;
    suma += a;
    sumb += b;
    sumaa += a * a;
    sumbb += b * b;
    sumab += a * b;
  }
  nsqr = (double)n * (n - 1);
  cov = (n * sumab - suma * sumb) / nsqr;
  vA = (n * sumaa - suma * suma) / nsqr;
  vB = (n * sumbb - sumb * sumb) / nsqr;
  vAB = vA * vB;
  if (vAB > 0) {
    return cov / sqrt(vAB);
  }
  return 0.0;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<r_unphased>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x60,%rsp
mov    %rdi,-0x10(%rbp)
mov    %rsi,-0x18(%rbp)
movss  %xmm0,-0x1c(%rbp)
mov    %edx,-0x20(%rbp)
movl   $0x0,-0x38(%rbp)
movl   $0x0,-0x3c(%rbp)
movl   $0x0,-0x40(%rbp)
movl   $0x0,-0x44(%rbp)
movl   $0x0,-0x48(%rbp)
movl   $0x0,-0x50(%rbp)
movl   $0x0,-0x4c(%rbp)
mov    -0x4c(%rbp),%eax
cmp    -0x20(%rbp),%eax
jge    11ef <r_unphased+0xdf>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x4c(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x54(%rbp)
cmpl   $0x3,-0x54(%rbp)
jne    1182 <r_unphased+0x72>
jmp    11e1 <r_unphased+0xd1>
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x4c(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x58(%rbp)
cmpl   $0x3,-0x58(%rbp)
jne    119f <r_unphased+0x8f>
jmp    11e1 <r_unphased+0xd1>
mov    -0x50(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x50(%rbp)
mov    -0x54(%rbp),%eax
add    -0x38(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x38(%rbp)
mov    -0x58(%rbp),%eax
add    -0x3c(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x3c(%rbp)
mov    -0x54(%rbp),%eax
imul   -0x54(%rbp),%eax
add    -0x40(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x40(%rbp)
mov    -0x58(%rbp),%eax
imul   -0x58(%rbp),%eax
add    -0x44(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x44(%rbp)
mov    -0x54(%rbp),%eax
imul   -0x58(%rbp),%eax
add    -0x48(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x48(%rbp)
mov    -0x4c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x4c(%rbp)
jmp    1159 <r_unphased+0x49>
cvtsi2sdl -0x50(%rbp),%xmm0
mov    -0x50(%rbp),%eax
sub    $0x1,%eax
cvtsi2sd %eax,%xmm1
mulsd  %xmm1,%xmm0
cvtsd2ss %xmm0,%xmm0
movss  %xmm0,-0x34(%rbp)
mov    -0x50(%rbp),%eax
imul   -0x48(%rbp),%eax
mov    -0x38(%rbp),%ecx
imul   -0x3c(%rbp),%ecx
sub    %ecx,%eax
cvtsi2ss %eax,%xmm0
divss  -0x34(%rbp),%xmm0
movss  %xmm0,-0x30(%rbp)
mov    -0x50(%rbp),%eax
imul   -0x40(%rbp),%eax
mov    -0x38(%rbp),%ecx
imul   -0x38(%rbp),%ecx
sub    %ecx,%eax
cvtsi2ss %eax,%xmm0
divss  -0x34(%rbp),%xmm0
movss  %xmm0,-0x24(%rbp)
mov    -0x50(%rbp),%eax
imul   -0x44(%rbp),%eax
mov    -0x3c(%rbp),%ecx
imul   -0x3c(%rbp),%ecx
sub    %ecx,%eax
cvtsi2ss %eax,%xmm0
divss  -0x34(%rbp),%xmm0
movss  %xmm0,-0x28(%rbp)
movss  -0x24(%rbp),%xmm0
mulss  -0x28(%rbp),%xmm0
movss  %xmm0,-0x2c(%rbp)
movss  -0x2c(%rbp),%xmm0
xorps  %xmm1,%xmm1
ucomiss %xmm1,%xmm0
jbe    12af <r_unphased+0x19f>
movss  -0x30(%rbp),%xmm0
movss  %xmm0,-0x5c(%rbp)
movss  -0x2c(%rbp),%xmm0
call   1030 <sqrt@plt>
movaps %xmm0,%xmm1
movss  -0x5c(%rbp),%xmm0
divss  %xmm1,%xmm0
movss  %xmm0,-0x4(%rbp)
jmp    12b7 <r_unphased+0x1a7>
xorps  %xmm0,%xmm0
movss  %xmm0,-0x4(%rbp)
movss  -0x4(%rbp),%xmm0
add    $0x60,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<r_unphased>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %rbx
push   %rax
test   %edx,%edx
jle    117b <r_unphased+0x6b>
mov    %edx,%eax
xor    %ebx,%ebx
xor    %r10d,%r10d
xor    %r11d,%r11d
xor    %r8d,%r8d
xor    %r14d,%r14d
xor    %r15d,%r15d
xor    %r9d,%r9d
jmp    1149 <r_unphased+0x39>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   (%rax)
add    $0x1,%rbx
cmp    %rbx,%rax
je     118d <r_unphased+0x7d>
mov    (%rdi,%rbx,4),%ecx
cmp    $0x3,%ecx
je     1140 <r_unphased+0x30>
mov    (%rsi,%rbx,4),%edx
cmp    $0x3,%edx
je     1140 <r_unphased+0x30>
add    $0x1,%r11d
add    %ecx,%r10d
add    %edx,%r9d
mov    %ecx,%ebp
imul   %ecx,%ebp
add    %ebp,%r15d
mov    %edx,%ebp
imul   %edx,%ebp
add    %ebp,%r14d
imul   %ecx,%edx
add    %edx,%r8d
jmp    1140 <r_unphased+0x30>
xor    %r9d,%r9d
xor    %r15d,%r15d
xor    %r14d,%r14d
xor    %r8d,%r8d
xor    %r11d,%r11d
xor    %r10d,%r10d
cvtsi2sd %r11d,%xmm0
lea    -0x1(%r11),%eax
cvtsi2sd %eax,%xmm1
mulsd  %xmm0,%xmm1
cvtsd2ss %xmm1,%xmm1
imul   %r11d,%r15d
mov    %r10d,%eax
imul   %r10d,%eax
sub    %eax,%r15d
cvtsi2ss %r15d,%xmm2
divss  %xmm1,%xmm2
imul   %r11d,%r14d
mov    %r9d,%eax
imul   %r9d,%eax
sub    %eax,%r14d
xorps  %xmm0,%xmm0
cvtsi2ss %r14d,%xmm0
divss  %xmm1,%xmm0
mulss  %xmm2,%xmm0
xorps  %xmm2,%xmm2
ucomiss %xmm2,%xmm0
jbe    1219 <r_unphased+0x109>
imul   %r8d,%r11d
imul   %r9d,%r10d
sub    %r10d,%r11d
xorps  %xmm2,%xmm2
cvtsi2ss %r11d,%xmm2
divss  %xmm1,%xmm2
xorps  %xmm1,%xmm1
ucomiss %xmm1,%xmm0
jb     1204 <r_unphased+0xf4>
sqrtss %xmm0,%xmm0
jmp    1215 <r_unphased+0x105>
movss  %xmm2,0x4(%rsp)
call   1030 <sqrt@plt>
movss  0x4(%rsp),%xmm2
divss  %xmm0,%xmm2
movaps %xmm2,%xmm0
add    $0x8,%rsp
pop    %rbx
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define float @r_unphased(i32* %0, i32* %1, float %2, i32 %3) {
%5 = alloca float
%6 = alloca i32*
%7 = alloca i32*
%8 = alloca float
%9 = alloca i32
%10 = alloca float
%11 = alloca float
%12 = alloca float
%13 = alloca float
%14 = alloca float
%15 = alloca i32
%16 = alloca i32
%17 = alloca i32
%18 = alloca i32
%19 = alloca i32
%20 = alloca i32
%21 = alloca i32
%22 = alloca i32
%23 = alloca i32
store i32* %0, i32** %6
store i32* %1, i32** %7
store float %2, float* %8
store i32 %3, i32* %9
store i32 0, i32* %15
store i32 0, i32* %16
store i32 0, i32* %17
store i32 0, i32* %18
store i32 0, i32* %19
store i32 0, i32* %21
store i32 0, i32* %20
br label %24
24: ; preds = %70, %4
%25 = load i32, i32* %20
%26 = load i32, i32* %9
%27 = icmp slt i32 %25, %26
br i1 %27, label %28, label %73
28: ; preds = %24
%29 = load i32*, i32** %6
%30 = load i32, i32* %20
%31 = sext i32 %30 to i64
%32 = getelementptr inbounds i32, i32* %29, i64 %31
%33 = load i32, i32* %32
store i32 %33, i32* %22
%34 = load i32, i32* %22
%35 = icmp eq i32 %34, 3
br i1 %35, label %36, label %37
36: ; preds = %28
br label %70
37: ; preds = %28
%38 = load i32*, i32** %7
%39 = load i32, i32* %20
%40 = sext i32 %39 to i64
%41 = getelementptr inbounds i32, i32* %38, i64 %40
%42 = load i32, i32* %41
store i32 %42, i32* %23
%43 = load i32, i32* %23
%44 = icmp eq i32 %43, 3
br i1 %44, label %45, label %46
45: ; preds = %37
br label %70
46: ; preds = %37
%47 = load i32, i32* %21
%48 = add nsw i32 %47, 1
store i32 %48, i32* %21
%49 = load i32, i32* %22
%50 = load i32, i32* %15
%51 = add nsw i32 %50, %49
store i32 %51, i32* %15
%52 = load i32, i32* %23
%53 = load i32, i32* %16
%54 = add nsw i32 %53, %52
store i32 %54, i32* %16
%55 = load i32, i32* %22
%56 = load i32, i32* %22
%57 = mul nsw i32 %55, %56
%58 = load i32, i32* %17
%59 = add nsw i32 %58, %57
store i32 %59, i32* %17
%60 = load i32, i32* %23
%61 = load i32, i32* %23
%62 = mul nsw i32 %60, %61
%63 = load i32, i32* %18
%64 = add nsw i32 %63, %62
store i32 %64, i32* %18
%65 = load i32, i32* %22
%66 = load i32, i32* %23
%67 = mul nsw i32 %65, %66
%68 = load i32, i32* %19
%69 = add nsw i32 %68, %67
store i32 %69, i32* %19
br label %70
70: ; preds = %46, %45, %36
%71 = load i32, i32* %20
%72 = add nsw i32 %71, 1
store i32 %72, i32* %20
br label %24
73: ; preds = %24
%74 = load i32, i32* %21
%75 = sitofp i32 %74 to double
%76 = load i32, i32* %21
%77 = sub nsw i32 %76, 1
%78 = sitofp i32 %77 to double
%79 = fmul double %75, %78
%80 = fptrunc double %79 to float
store float %80, float* %14
%81 = load i32, i32* %21
%82 = load i32, i32* %19
%83 = mul nsw i32 %81, %82
%84 = load i32, i32* %15
%85 = load i32, i32* %16
%86 = mul nsw i32 %84, %85
%87 = sub nsw i32 %83, %86
%88 = sitofp i32 %87 to float
%89 = load float, float* %14
%90 = fdiv float %88, %89
store float %90, float* %13
%91 = load i32, i32* %21
%92 = load i32, i32* %17
%93 = mul nsw i32 %91, %92
%94 = load i32, i32* %15
%95 = load i32, i32* %15
%96 = mul nsw i32 %94, %95
%97 = sub nsw i32 %93, %96
%98 = sitofp i32 %97 to float
%99 = load float, float* %14
%100 = fdiv float %98, %99
store float %100, float* %10
%101 = load i32, i32* %21
%102 = load i32, i32* %18
%103 = mul nsw i32 %101, %102
%104 = load i32, i32* %16
%105 = load i32, i32* %16
%106 = mul nsw i32 %104, %105
%107 = sub nsw i32 %103, %106
%108 = sitofp i32 %107 to float
%109 = load float, float* %14
%110 = fdiv float %108, %109
store float %110, float* %11
%111 = load float, float* %10
%112 = load float, float* %11
%113 = fmul float %111, %112
store float %113, float* %12
%114 = load float, float* %12
%115 = fcmp ogt float %114, 0.000000e+00
br i1 %115, label %116, label %121
116: ; preds = %73
%117 = load float, float* %13
%118 = load float, float* %12
%119 = call float @sqrt(float %118)
%120 = fdiv float %117, %119
store float %120, float* %5
br label %122
121: ; preds = %73
store float 0.000000e+00, float* %5
br label %122
122: ; preds = %121, %116
%123 = load float, float* %5
ret float %123
}

LLVM IR (-O2):
define float @r_unphased(i32* nocapture %0, i32* nocapture %1, float %2, i32 %3) {
%5 = icmp sgt i32 %3, 0
br i1 %5, label %6, label %42
6: ; preds = %4
%7 = zext i32 %3 to i64
br label %8
8: ; preds = %6, %33
%9 = phi i64 [ 0, %6 ], [ %40, %33 ]
%10 = phi i32 [ 0, %6 ], [ %39, %33 ]
%11 = phi i32 [ 0, %6 ], [ %38, %33 ]
%12 = phi i32 [ 0, %6 ], [ %37, %33 ]
%13 = phi i32 [ 0, %6 ], [ %36, %33 ]
%14 = phi i32 [ 0, %6 ], [ %35, %33 ]
%15 = phi i32 [ 0, %6 ], [ %34, %33 ]
%16 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 %9
%17 = load i32, i32* %16
%18 = icmp eq i32 %17, 3
br i1 %18, label %33, label %19
19: ; preds = %8
%20 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %9
%21 = load i32, i32* %20
%22 = icmp eq i32 %21, 3
br i1 %22, label %33, label %23
23: ; preds = %19
%24 = add nsw i32 %11, 1
%25 = add nsw i32 %17, %10
%26 = add nsw i32 %21, %15
%27 = mul nsw i32 %17, %17
%28 = add nsw i32 %27, %14
%29 = mul nsw i32 %21, %21
%30 = add nsw i32 %29, %13
%31 = mul nsw i32 %21, %17
%32 = add nsw i32 %31, %12
br label %33
33: ; preds = %19, %8, %23
%34 = phi i32 [ %15, %8 ], [ %15, %19 ], [ %26, %23 ]
%35 = phi i32 [ %14, %8 ], [ %14, %19 ], [ %28, %23 ]
%36 = phi i32 [ %13, %8 ], [ %13, %19 ], [ %30, %23 ]
%37 = phi i32 [ %12, %8 ], [ %12, %19 ], [ %32, %23 ]
%38 = phi i32 [ %11, %8 ], [ %11, %19 ], [ %24, %23 ]
%39 = phi i32 [ %10, %8 ], [ %10, %19 ], [ %25, %23 ]
%40 = add nuw nsw i64 %9, 1
%41 = icmp eq i64 %40, %7
br i1 %41, label %42, label %8
42: ; preds = %33, %4
%43 = phi i32 [ 0, %4 ], [ %34, %33 ]
%44 = phi i32 [ 0, %4 ], [ %35, %33 ]
%45 = phi i32 [ 0, %4 ], [ %36, %33 ]
%46 = phi i32 [ 0, %4 ], [ %37, %33 ]
%47 = phi i32 [ 0, %4 ], [ %38, %33 ]
%48 = phi i32 [ 0, %4 ], [ %39, %33 ]
%49 = sitofp i32 %47 to double
%50 = add nsw i32 %47, -1
%51 = sitofp i32 %50 to double
%52 = fmul double %49, %51
%53 = fptrunc double %52 to float
%54 = mul nsw i32 %47, %44
%55 = mul nsw i32 %48, %48
%56 = sub nsw i32 %54, %55
%57 = sitofp i32 %56 to float
%58 = fdiv float %57, %53
%59 = mul nsw i32 %47, %45
%60 = mul nsw i32 %43, %43
%61 = sub nsw i32 %59, %60
%62 = sitofp i32 %61 to float
%63 = fdiv float %62, %53
%64 = fmul float %58, %63
%65 = fcmp ogt float %64, 0.000000e+00
br i1 %65, label %66, label %74
66: ; preds = %42
%67 = mul nsw i32 %47, %46
%68 = mul nsw i32 %48, %43
%69 = sub nsw i32 %67, %68
%70 = sitofp i32 %69 to float
%71 = fdiv float %70, %53
%72 = tail call float @sqrt(float %64)
%73 = fdiv float %71, %72
br label %74
74: ; preds = %42, %66
%75 = phi float [ %73, %66 ], [ 0.000000e+00, %42 ]
ret float %75
}