#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
int **init_votes(int);
int toupper(char);
int **get_votes_simple(char *align[], int n_seqs, int seq_len) {
  int **votes = init_votes(seq_len);
  int i, j;
  for (i = 0; i < n_seqs; i++) {
    for (j = 0; j < seq_len; j++) {
      switch (toupper(align[i][j])) {
      case 'A':
        votes[j][0]++;
        break;
      case 'C':
        votes[j][1]++;
        break;
      case 'G':
        votes[j][2]++;
        break;
      case 'T':
        votes[j][3]++;
        break;
      case 'N':
        votes[j][4]++;
        break;
      case '-':
        votes[j][5]++;
        break;
      }
    }
  }
  return votes;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<get_votes_simple>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x30,%rsp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %esi,-0xc(%rbp)
mov    %edx,-0x10(%rbp)
mov    -0x10(%rbp),%edi
call   1040 <init_votes@plt>
mov    %rax,-0x18(%rbp)
movl   $0x0,-0x1c(%rbp)
mov    -0x1c(%rbp),%eax
cmp    -0xc(%rbp),%eax
jge    125e <get_votes_simple+0x13e>
movl   $0x0,-0x20(%rbp)
mov    -0x20(%rbp),%eax
cmp    -0x10(%rbp),%eax
jge    124b <get_votes_simple+0x12b>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%edi
call   1030 <toupper@plt>
add    $0xffffffd3,%eax
mov    %eax,%ecx
mov    %rcx,-0x28(%rbp)
sub    $0x27,%eax
ja     1238 <get_votes_simple+0x118>
mov    -0x28(%rbp),%rax
lea    0xe66(%rip),%rcx
movslq (%rcx,%rax,4),%rax
add    %rcx,%rax
jmp    *%rax
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    (%rax),%ecx
add    $0x1,%ecx
mov    %ecx,(%rax)
jmp    1238 <get_votes_simple+0x118>
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    0x4(%rax),%ecx
add    $0x1,%ecx
mov    %ecx,0x4(%rax)
jmp    1238 <get_votes_simple+0x118>
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    0x8(%rax),%ecx
add    $0x1,%ecx
mov    %ecx,0x8(%rax)
jmp    1238 <get_votes_simple+0x118>
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    0xc(%rax),%ecx
add    $0x1,%ecx
mov    %ecx,0xc(%rax)
jmp    1238 <get_votes_simple+0x118>
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    0x10(%rax),%ecx
add    $0x1,%ecx
mov    %ecx,0x10(%rax)
jmp    1238 <get_votes_simple+0x118>
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    0x14(%rax),%ecx
add    $0x1,%ecx
mov    %ecx,0x14(%rax)
jmp    123d <get_votes_simple+0x11d>
mov    -0x20(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x20(%rbp)
jmp    1158 <get_votes_simple+0x38>
jmp    1250 <get_votes_simple+0x130>
mov    -0x1c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
jmp    1145 <get_votes_simple+0x25>
mov    -0x18(%rbp),%rax
add    $0x30,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<get_votes_simple>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
sub    $0x18,%rsp
mov    %esi,%r15d
mov    %rdi,%r13
mov    %edx,0xc(%rsp)
mov    %edx,%edi
call   1040 <init_votes@plt>
mov    %rax,%r12
test   %r15d,%r15d
jle    11ea <get_votes_simple+0xca>
mov    %r15d,%eax
mov    %rax,0x10(%rsp)
mov    0xc(%rsp),%ebp
xor    %ebx,%ebx
lea    0xea0(%rip),%r14
jmp    117b <get_votes_simple+0x5b>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   0x0(%rax)
add    $0x1,%rbx
cmp    0x10(%rsp),%rbx
je     11ea <get_votes_simple+0xca>
cmpl   $0x0,0xc(%rsp)
jle    1170 <get_votes_simple+0x50>
xor    %r15d,%r15d
jmp    119c <get_votes_simple+0x7c>
mov    (%r12,%r15,8),%rax
add    $0x14,%rax
nop
addl   $0x1,(%rax)
add    $0x1,%r15
cmp    %r15,%rbp
je     1170 <get_votes_simple+0x50>
mov    0x0(%r13,%rbx,8),%rax
movsbl (%rax,%r15,1),%edi
call   1030 <toupper@plt>
add    $0xffffffd3,%eax
cmp    $0x27,%eax
ja     1193 <get_votes_simple+0x73>
movslq (%r14,%rax,4),%rax
add    %r14,%rax
jmp    *%rax
mov    (%r12,%r15,8),%rax
jmp    1190 <get_votes_simple+0x70>
mov    (%r12,%r15,8),%rax
add    $0x4,%rax
jmp    1190 <get_votes_simple+0x70>
mov    (%r12,%r15,8),%rax
add    $0x8,%rax
jmp    1190 <get_votes_simple+0x70>
mov    (%r12,%r15,8),%rax
add    $0x10,%rax
jmp    1190 <get_votes_simple+0x70>
mov    (%r12,%r15,8),%rax
add    $0xc,%rax
jmp    1190 <get_votes_simple+0x70>
mov    %r12,%rax
add    $0x18,%rsp
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define i32** @get_votes_simple(i8** %0, i32 %1, i32 %2) {
%4 = alloca i8**
%5 = alloca i32
%6 = alloca i32
%7 = alloca i32**
%8 = alloca i32
%9 = alloca i32
store i8** %0, i8*** %4
store i32 %1, i32* %5
store i32 %2, i32* %6
%10 = load i32, i32* %6
%11 = call i32** @init_votes(i32 %10)
store i32** %11, i32*** %7
store i32 0, i32* %8
br label %12
12: ; preds = %91, %3
%13 = load i32, i32* %8
%14 = load i32, i32* %5
%15 = icmp slt i32 %13, %14
br i1 %15, label %16, label %94
16: ; preds = %12
store i32 0, i32* %9
br label %17
17: ; preds = %87, %16
%18 = load i32, i32* %9
%19 = load i32, i32* %6
%20 = icmp slt i32 %18, %19
br i1 %20, label %21, label %90
21: ; preds = %17
%22 = load i8**, i8*** %4
%23 = load i32, i32* %8
%24 = sext i32 %23 to i64
%25 = getelementptr inbounds i8*, i8** %22, i64 %24
%26 = load i8*, i8** %25
%27 = load i32, i32* %9
%28 = sext i32 %27 to i64
%29 = getelementptr inbounds i8, i8* %26, i64 %28
%30 = load i8, i8* %29
%31 = call i32 @toupper(i8 signext %30)
switch i32 %31, label %86 [
i32 65, label %32
i32 67, label %41
i32 71, label %50
i32 84, label %59
i32 78, label %68
i32 45, label %77
]
32: ; preds = %21
%33 = load i32**, i32*** %7
%34 = load i32, i32* %9
%35 = sext i32 %34 to i64
%36 = getelementptr inbounds i32*, i32** %33, i64 %35
%37 = load i32*, i32** %36
%38 = getelementptr inbounds i32, i32* %37, i64 0
%39 = load i32, i32* %38
%40 = add nsw i32 %39, 1
store i32 %40, i32* %38
br label %86
41: ; preds = %21
%42 = load i32**, i32*** %7
%43 = load i32, i32* %9
%44 = sext i32 %43 to i64
%45 = getelementptr inbounds i32*, i32** %42, i64 %44
%46 = load i32*, i32** %45
%47 = getelementptr inbounds i32, i32* %46, i64 1
%48 = load i32, i32* %47
%49 = add nsw i32 %48, 1
store i32 %49, i32* %47
br label %86
50: ; preds = %21
%51 = load i32**, i32*** %7
%52 = load i32, i32* %9
%53 = sext i32 %52 to i64
%54 = getelementptr inbounds i32*, i32** %51, i64 %53
%55 = load i32*, i32** %54
%56 = getelementptr inbounds i32, i32* %55, i64 2
%57 = load i32, i32* %56
%58 = add nsw i32 %57, 1
store i32 %58, i32* %56
br label %86
59: ; preds = %21
%60 = load i32**, i32*** %7
%61 = load i32, i32* %9
%62 = sext i32 %61 to i64
%63 = getelementptr inbounds i32*, i32** %60, i64 %62
%64 = load i32*, i32** %63
%65 = getelementptr inbounds i32, i32* %64, i64 3
%66 = load i32, i32* %65
%67 = add nsw i32 %66, 1
store i32 %67, i32* %65
br label %86
68: ; preds = %21
%69 = load i32**, i32*** %7
%70 = load i32, i32* %9
%71 = sext i32 %70 to i64
%72 = getelementptr inbounds i32*, i32** %69, i64 %71
%73 = load i32*, i32** %72
%74 = getelementptr inbounds i32, i32* %73, i64 4
%75 = load i32, i32* %74
%76 = add nsw i32 %75, 1
store i32 %76, i32* %74
br label %86
77: ; preds = %21
%78 = load i32**, i32*** %7
%79 = load i32, i32* %9
%80 = sext i32 %79 to i64
%81 = getelementptr inbounds i32*, i32** %78, i64 %80
%82 = load i32*, i32** %81
%83 = getelementptr inbounds i32, i32* %82, i64 5
%84 = load i32, i32* %83
%85 = add nsw i32 %84, 1
store i32 %85, i32* %83
br label %86
86: ; preds = %21, %77, %68, %59, %50, %41, %32
br label %87
87: ; preds = %86
%88 = load i32, i32* %9
%89 = add nsw i32 %88, 1
store i32 %89, i32* %9
br label %17
90: ; preds = %17
br label %91
91: ; preds = %90
%92 = load i32, i32* %8
%93 = add nsw i32 %92, 1
store i32 %93, i32* %8
br label %12
94: ; preds = %12
%95 = load i32**, i32*** %7
ret i32** %95
}

LLVM IR (-O2):
define i32** @get_votes_simple(i8** nocapture %0, i32 %1, i32 %2) {
%4 = tail call i32** @init_votes(i32 %2)
%5 = icmp sgt i32 %1, 0
br i1 %5, label %6, label %53
6: ; preds = %3
%7 = icmp sgt i32 %2, 0
%8 = zext i32 %1 to i64
%9 = zext i32 %2 to i64
br label %10
10: ; preds = %6, %50
%11 = phi i64 [ 0, %6 ], [ %51, %50 ]
br i1 %7, label %12, label %50
12: ; preds = %10
%13 = getelementptr inbounds i8*, i8** %0, i64 %11
br label %14
14: ; preds = %12, %47
%15 = phi i64 [ 0, %12 ], [ %48, %47 ]
%16 = load i8*, i8** %13
%17 = getelementptr inbounds i8, i8* %16, i64 %15
%18 = load i8, i8* %17
%19 = tail call i32 @toupper(i8 signext %18)
switch i32 %19, label %47 [
i32 65, label %20
i32 67, label %23
i32 71, label %27
i32 84, label %31
i32 78, label %35
i32 45, label %39
]
20: ; preds = %14
%21 = getelementptr inbounds i32*, i32** %4, i64 %15
%22 = load i32*, i32** %21
br label %43
23: ; preds = %14
%24 = getelementptr inbounds i32*, i32** %4, i64 %15
%25 = load i32*, i32** %24
%26 = getelementptr inbounds i32, i32* %25, i64 1
br label %43
27: ; preds = %14
%28 = getelementptr inbounds i32*, i32** %4, i64 %15
%29 = load i32*, i32** %28
%30 = getelementptr inbounds i32, i32* %29, i64 2
br label %43
31: ; preds = %14
%32 = getelementptr inbounds i32*, i32** %4, i64 %15
%33 = load i32*, i32** %32
%34 = getelementptr inbounds i32, i32* %33, i64 3
br label %43
35: ; preds = %14
%36 = getelementptr inbounds i32*, i32** %4, i64 %15
%37 = load i32*, i32** %36
%38 = getelementptr inbounds i32, i32* %37, i64 4
br label %43
39: ; preds = %14
%40 = getelementptr inbounds i32*, i32** %4, i64 %15
%41 = load i32*, i32** %40
%42 = getelementptr inbounds i32, i32* %41, i64 5
br label %43
43: ; preds = %39, %35, %31, %27, %23, %20
%44 = phi i32* [ %22, %20 ], [ %26, %23 ], [ %30, %27 ], [ %34, %31 ], [ %38, %35 ], [ %42, %39 ]
%45 = load i32, i32* %44
%46 = add nsw i32 %45, 1
store i32 %46, i32* %44
br label %47
47: ; preds = %43, %14
%48 = add nuw nsw i64 %15, 1
%49 = icmp eq i64 %48, %9
br i1 %49, label %50, label %14
50: ; preds = %47, %10
%51 = add nuw nsw i64 %11, 1
%52 = icmp eq i64 %51, %8
br i1 %52, label %53, label %10
53: ; preds = %50, %3
ret i32** %4
}