#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
void *malloc(unsigned long);
char **get_kmers(char *seq, unsigned long kmer_len, long num_kmers) {
  long i = 0;
  unsigned long j = 0;
  char **kmers = malloc(num_kmers * sizeof(char *));
  for (i = 0; i < num_kmers; ++i) {
    char *kmer = malloc((kmer_len + 1) * sizeof(char));
    for (j = 0; j < kmer_len; ++j) {
      kmer[j] = seq[i + j];
    }
    kmer[j] = '\0';
    kmers[i] = kmer;
  }
  return kmers;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<get_kmers>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x40,%rsp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %rdx,-0x18(%rbp)
movq   $0x0,-0x20(%rbp)
movq   $0x0,-0x28(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%rdi
shl    $0x3,%rdi
call   1030 <malloc@plt>
mov    %rax,-0x30(%rbp)
movq   $0x0,-0x20(%rbp)
mov    -0x20(%rbp),%rax
cmp    -0x18(%rbp),%rax
jge    11de <get_kmers+0xce>
mov    -0x10(%rbp),%rdi
add    $0x1,%rdi
shl    $0x0,%rdi
call   1030 <malloc@plt>
mov    %rax,-0x38(%rbp)
movq   $0x0,-0x28(%rbp)
mov    -0x28(%rbp),%rax
cmp    -0x10(%rbp),%rax
jae    11b1 <get_kmers+0xa1>
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    -0x20(%rbp),%rcx
add    -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,1),%dl
mov    -0x38(%rbp),%rax
mov    -0x28(%rbp),%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
mov    -0x28(%rbp),%rax
add    $0x1,%rax
mov    %rax,-0x28(%rbp)
jmp    1178 <get_kmers+0x68>
mov    -0x38(%rbp),%rax
mov    -0x28(%rbp),%rcx
movb   $0x0,(%rax,%rcx,1)
mov    -0x38(%rbp),%rdx
mov    -0x30(%rbp),%rax
mov    -0x20(%rbp),%rcx
mov    %rdx,(%rax,%rcx,8)
mov    -0x20(%rbp),%rax
add    $0x1,%rax
mov    %rax,-0x20(%rbp)
jmp    114d <get_kmers+0x3d>
mov    -0x30(%rbp),%rax
add    $0x40,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<get_kmers>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
push   %rax
mov    %rdx,%r14
mov    %rsi,%rbx
mov    %rdi,(%rsp)
lea    0x0(,%rdx,8),%rdi
call   1040 <malloc@plt>
mov    %rax,%r12
test   %r14,%r14
jle    1197 <get_kmers+0x77>
lea    0x1(%rbx),%r13
xor    %r15d,%r15d
jmp    1172 <get_kmers+0x52>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   (%rax)
movb   $0x0,0x0(%rbp,%rbx,1)
mov    %rbp,(%r12,%r15,8)
add    $0x1,%r15
cmp    %r15,%r14
je     1197 <get_kmers+0x77>
mov    %r13,%rdi
call   1040 <malloc@plt>
mov    %rax,%rbp
test   %rbx,%rbx
je     1160 <get_kmers+0x40>
mov    (%rsp),%rax
lea    (%rax,%r15,1),%rsi
mov    %rbp,%rdi
mov    %rbx,%rdx
call   1030 <memcpy@plt>
jmp    1160 <get_kmers+0x40>
mov    %r12,%rax
add    $0x8,%rsp
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define i8** @get_kmers(i8* %0, i64 %1, i64 %2) {
%4 = alloca i8*
%5 = alloca i64
%6 = alloca i64
%7 = alloca i64
%8 = alloca i64
%9 = alloca i8**
%10 = alloca i8*
store i8* %0, i8** %4
store i64 %1, i64* %5
store i64 %2, i64* %6
store i64 0, i64* %7
store i64 0, i64* %8
%11 = load i64, i64* %6
%12 = mul i64 %11, 8
%13 = call i8* @malloc(i64 %12)
%14 = bitcast i8* %13 to i8**
store i8** %14, i8*** %9
store i64 0, i64* %7
br label %15
15: ; preds = %49, %3
%16 = load i64, i64* %7
%17 = load i64, i64* %6
%18 = icmp slt i64 %16, %17
br i1 %18, label %19, label %52
19: ; preds = %15
%20 = load i64, i64* %5
%21 = add i64 %20, 1
%22 = mul i64 %21, 1
%23 = call i8* @malloc(i64 %22)
store i8* %23, i8** %10
store i64 0, i64* %8
br label %24
24: ; preds = %38, %19
%25 = load i64, i64* %8
%26 = load i64, i64* %5
%27 = icmp ult i64 %25, %26
br i1 %27, label %28, label %41
28: ; preds = %24
%29 = load i8*, i8** %4
%30 = load i64, i64* %7
%31 = load i64, i64* %8
%32 = add i64 %30, %31
%33 = getelementptr inbounds i8, i8* %29, i64 %32
%34 = load i8, i8* %33
%35 = load i8*, i8** %10
%36 = load i64, i64* %8
%37 = getelementptr inbounds i8, i8* %35, i64 %36
store i8 %34, i8* %37
br label %38
38: ; preds = %28
%39 = load i64, i64* %8
%40 = add i64 %39, 1
store i64 %40, i64* %8
br label %24
41: ; preds = %24
%42 = load i8*, i8** %10
%43 = load i64, i64* %8
%44 = getelementptr inbounds i8, i8* %42, i64 %43
store i8 0, i8* %44
%45 = load i8*, i8** %10
%46 = load i8**, i8*** %9
%47 = load i64, i64* %7
%48 = getelementptr inbounds i8*, i8** %46, i64 %47
store i8* %45, i8** %48
br label %49
49: ; preds = %41
%50 = load i64, i64* %7
%51 = add nsw i64 %50, 1
store i64 %51, i64* %7
br label %15
52: ; preds = %15
%53 = load i8**, i8*** %9
ret i8** %53
}

LLVM IR (-O2):
define noalias i8** @get_kmers(i8* nocapture %0, i64 %1, i64 %2) {
%4 = shl i64 %2, 3
%5 = tail call i8* @malloc(i64 %4)
%6 = bitcast i8* %5 to i8**
%7 = icmp sgt i64 %2, 0
br i1 %7, label %8, label %21
8: ; preds = %3
%9 = add i64 %1, 1
%10 = icmp eq i64 %1, 0
br label %11
11: ; preds = %8, %16
%12 = phi i64 [ 0, %8 ], [ %19, %16 ]
%13 = tail call i8* @malloc(i64 %9)
br i1 %10, label %16, label %14
14: ; preds = %11
%15 = getelementptr i8, i8* %0, i64 %12
br label %16
16: ; preds = %14, %11
%17 = getelementptr inbounds i8, i8* %13, i64 %1
store i8 0, i8* %17
%18 = getelementptr inbounds i8*, i8** %6, i64 %12
store i8* %13, i8** %18
%19 = add nuw nsw i64 %12, 1
%20 = icmp eq i64 %19, %2
br i1 %20, label %21, label %11
21: ; preds = %16, %3
ret i8** %6
}