#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */
typedef int /*<<< orphan*/ FILE;

/* Variables and functions */
long EOF;
int /*<<< orphan*/ exit(int);
char *fgets(char *, int, int /*<<< orphan*/ *);
int /*<<< orphan*/ fseek(int /*<<< orphan*/ *, long, int /*<<< orphan*/);
long ftell(int /*<<< orphan*/ *);
long getc(int /*<<< orphan*/ *);
scalar_t__ isalpha(char);
scalar_t__ strncmp(char *, char *, int);
int /*<<< orphan*/ ungetc(long, int /*<<< orphan*/ *);
int getseqsize(FILE *fpi) {
  char line[1000];
  long int i, c, seqlen, fpi_save_pos;
  char *ptrRet;
  line[0] = '\0';
  seqlen = 0;
  fpi_save_pos = ftell(fpi);
  if (fgets(line, 1000, fpi) == NULL) {
    return 0;
  } else if (line[0] == ';') {
    if (line[1] != ' ') {
      while ((c = getc(fpi)) == ';')
        ptrRet = fgets(line, 1000, fpi);
      ungetc(c, fpi);
      while ((c = getc(fpi)) != ';' && c != EOF)
        if (isalpha(c)) {
          seqlen++;
        }
    } else if (line[1] == ' ') {
      while ((c = getc(fpi)) == ';')
        ptrRet = fgets(line, 1000, fpi);
      ungetc(c, fpi);
      ptrRet = fgets(line, 1000, fpi);
      while ((c = getc(fpi)) != ';' && c != EOF)
        if (isalpha(c)) {
          seqlen++;
        }
    }
  } else if (line[0] == '>') {
    while ((c = getc(fpi)) != '>' && c != EOF)
      if (isalpha(c))
        seqlen++;
  } else {
    while (strncmp(line, "LOCUS", 5) != 0)
      if (fgets(line, 1000, fpi) == NULL)
        exit(1);
    while (strncmp(line, "ORIGIN", 6) != 0)
      if (fgets(line, 1000, fpi) == NULL)
        exit(1);
    ptrRet = fgets(line, 1000, fpi);
    while (strncmp(line, "//", 2) != 0) {
      for (i = 0; line[i] != '\n'; i++)
        if (isalpha(line[i])) {
          seqlen++;
        }
      ptrRet = fgets(line, 1000, fpi);
    }
  }
  fseek(fpi, fpi_save_pos, 0);
  return seqlen;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<getseqsize>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x430,%rsp
mov    %rdi,-0x10(%rbp)
movb   $0x0,-0x400(%rbp)
movq   $0x0,-0x418(%rbp)
mov    -0x10(%rbp),%rdi
call   1050 <ftell@plt>
mov    %rax,-0x420(%rbp)
lea    -0x400(%rbp),%rdi
mov    -0x10(%rbp),%rdx
mov    $0x3e8,%esi
call   1040 <fgets@plt>
cmp    $0x0,%rax
jne    11dc <getseqsize+0x5c>
movl   $0x0,-0x4(%rbp)
jmp    161f <getseqsize+0x49f>
movsbl -0x400(%rbp),%eax
cmp    $0x3b,%eax
jne    13e0 <getseqsize+0x260>
movsbl -0x3ff(%rbp),%eax
cmp    $0x20,%eax
je     12d3 <getseqsize+0x153>
jmp    1201 <getseqsize+0x81>
mov    -0x10(%rbp),%rdi
call   10a0 <getc@plt>
mov    %rax,-0x410(%rbp)
cmp    $0x3b,%rax
jne    123c <getseqsize+0xbc>
lea    -0x400(%rbp),%rdi
mov    -0x10(%rbp),%rdx
mov    $0x3e8,%esi
call   1040 <fgets@plt>
mov    %rax,-0x428(%rbp)
jmp    1201 <getseqsize+0x81>
mov    -0x410(%rbp),%rdi
mov    -0x10(%rbp),%rsi
call   1060 <ungetc@plt>
mov    -0x10(%rbp),%rdi
call   10a0 <getc@plt>
mov    %rax,%rcx
mov    %rcx,-0x410(%rbp)
xor    %eax,%eax
cmp    $0x3b,%rcx
mov    %al,-0x429(%rbp)
je     128b <getseqsize+0x10b>
mov    -0x410(%rbp),%rax
mov    0x2d69(%rip),%rcx
cmp    (%rcx),%rax
setne  %al
mov    %al,-0x429(%rbp)
mov    -0x429(%rbp),%al
test   $0x1,%al
jne    129e <getseqsize+0x11e>
jmp    12ce <getseqsize+0x14e>
mov    -0x410(%rbp),%rax
movsbl %al,%edi
call   1080 <isalpha@plt>
cmp    $0x0,%rax
je     12c9 <getseqsize+0x149>
mov    -0x418(%rbp),%rax
add    $0x1,%rax
mov    %rax,-0x418(%rbp)
jmp    124c <getseqsize+0xcc>
jmp    13db <getseqsize+0x25b>
movsbl -0x3ff(%rbp),%eax
cmp    $0x20,%eax
jne    13d6 <getseqsize+0x256>
jmp    12e8 <getseqsize+0x168>
mov    -0x10(%rbp),%rdi
call   10a0 <getc@plt>
mov    %rax,-0x410(%rbp)
cmp    $0x3b,%rax
jne    1323 <getseqsize+0x1a3>
lea    -0x400(%rbp),%rdi
mov    -0x10(%rbp),%rdx
mov    $0x3e8,%esi
call   1040 <fgets@plt>
mov    %rax,-0x428(%rbp)
jmp    12e8 <getseqsize+0x168>
mov    -0x410(%rbp),%rdi
mov    -0x10(%rbp),%rsi
call   1060 <ungetc@plt>
lea    -0x400(%rbp),%rdi
mov    -0x10(%rbp),%rdx
mov    $0x3e8,%esi
call   1040 <fgets@plt>
mov    %rax,-0x428(%rbp)
mov    -0x10(%rbp),%rdi
call   10a0 <getc@plt>
mov    %rax,%rcx
mov    %rcx,-0x410(%rbp)
xor    %eax,%eax
cmp    $0x3b,%rcx
mov    %al,-0x42a(%rbp)
je     138e <getseqsize+0x20e>
mov    -0x410(%rbp),%rax
mov    0x2c66(%rip),%rcx
cmp    (%rcx),%rax
setne  %al
mov    %al,-0x42a(%rbp)
mov    -0x42a(%rbp),%al
test   $0x1,%al
jne    13a1 <getseqsize+0x221>
jmp    13d1 <getseqsize+0x251>
mov    -0x410(%rbp),%rax
movsbl %al,%edi
call   1080 <isalpha@plt>
cmp    $0x0,%rax
je     13cc <getseqsize+0x24c>
mov    -0x418(%rbp),%rax
add    $0x1,%rax
mov    %rax,-0x418(%rbp)
jmp    134f <getseqsize+0x1cf>
jmp    13d6 <getseqsize+0x256>
jmp    13db <getseqsize+0x25b>
jmp    15fe <getseqsize+0x47e>
movsbl -0x400(%rbp),%eax
cmp    $0x3e,%eax
jne    147c <getseqsize+0x2fc>
jmp    13f5 <getseqsize+0x275>
mov    -0x10(%rbp),%rdi
call   10a0 <getc@plt>
mov    %rax,%rcx
mov    %rcx,-0x410(%rbp)
xor    %eax,%eax
cmp    $0x3e,%rcx
mov    %al,-0x42b(%rbp)
je     1434 <getseqsize+0x2b4>
mov    -0x410(%rbp),%rax
mov    0x2bc0(%rip),%rcx
cmp    (%rcx),%rax
setne  %al
mov    %al,-0x42b(%rbp)
mov    -0x42b(%rbp),%al
test   $0x1,%al
jne    1447 <getseqsize+0x2c7>
jmp    1477 <getseqsize+0x2f7>
mov    -0x410(%rbp),%rax
movsbl %al,%edi
call   1080 <isalpha@plt>
cmp    $0x0,%rax
je     1472 <getseqsize+0x2f2>
mov    -0x418(%rbp),%rax
add    $0x1,%rax
mov    %rax,-0x418(%rbp)
jmp    13f5 <getseqsize+0x275>
jmp    15f9 <getseqsize+0x479>
jmp    1481 <getseqsize+0x301>
lea    -0x400(%rbp),%rdi
lea    0xb71(%rip),%rsi
mov    $0x5,%edx
call   1030 <strncmp@plt>
cmp    $0x0,%rax
je     14d1 <getseqsize+0x351>
lea    -0x400(%rbp),%rdi
mov    -0x10(%rbp),%rdx
mov    $0x3e8,%esi
call   1040 <fgets@plt>
cmp    $0x0,%rax
jne    14cc <getseqsize+0x34c>
mov    $0x1,%edi
call   1090 <exit@plt>
jmp    1481 <getseqsize+0x301>
jmp    14d6 <getseqsize+0x356>
lea    -0x400(%rbp),%rdi
lea    0xb22(%rip),%rsi
mov    $0x6,%edx
call   1030 <strncmp@plt>
cmp    $0x0,%rax
je     1526 <getseqsize+0x3a6>
lea    -0x400(%rbp),%rdi
mov    -0x10(%rbp),%rdx
mov    $0x3e8,%esi
call   1040 <fgets@plt>
cmp    $0x0,%rax
jne    1521 <getseqsize+0x3a1>
mov    $0x1,%edi
call   1090 <exit@plt>
jmp    14d6 <getseqsize+0x356>
lea    -0x400(%rbp),%rdi
mov    -0x10(%rbp),%rdx
mov    $0x3e8,%esi
call   1040 <fgets@plt>
mov    %rax,-0x428(%rbp)
lea    -0x400(%rbp),%rdi
lea    0xabd(%rip),%rsi
mov    $0x2,%edx
call   1030 <strncmp@plt>
cmp    $0x0,%rax
je     15f4 <getseqsize+0x474>
movq   $0x0,-0x408(%rbp)
mov    -0x408(%rbp),%rax
movsbl -0x400(%rbp,%rax,1),%eax
ff
cmp    $0xa,%eax
je     15d3 <getseqsize+0x453>
mov    -0x408(%rbp),%rax
movsbl -0x400(%rbp,%rax,1),%edi
ff
call   1080 <isalpha@plt>
cmp    $0x0,%rax
je     15b7 <getseqsize+0x437>
mov    -0x418(%rbp),%rax
add    $0x1,%rax
mov    %rax,-0x418(%rbp)
jmp    15bc <getseqsize+0x43c>
mov    -0x408(%rbp),%rax
add    $0x1,%rax
mov    %rax,-0x408(%rbp)
jmp    156f <getseqsize+0x3ef>
lea    -0x400(%rbp),%rdi
mov    -0x10(%rbp),%rdx
mov    $0x3e8,%esi
call   1040 <fgets@plt>
mov    %rax,-0x428(%rbp)
jmp    1542 <getseqsize+0x3c2>
jmp    15f9 <getseqsize+0x479>
jmp    15fe <getseqsize+0x47e>
jmp    1603 <getseqsize+0x483>
mov    -0x10(%rbp),%rdi
mov    -0x420(%rbp),%rsi
xor    %edx,%edx
call   1070 <fseek@plt>
mov    -0x418(%rbp),%rax
mov    %eax,-0x4(%rbp)
mov    -0x4(%rbp),%eax
add    $0x430,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<getseqsize>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
sub    $0x3f8,%rsp
mov    %rdi,%r15
movb   $0x0,0x10(%rsp)
call   1050 <ftell@plt>
mov    %rax,%rbp
lea    0x10(%rsp),%rdi
mov    $0x3e8,%esi
mov    %r15,%rdx
call   1040 <fgets@plt>
test   %rax,%rax
je     122d <getseqsize+0xad>
mov    0x10(%rsp),%al
cmp    $0x3b,%al
mov    %rbp,0x8(%rsp)
je     1234 <getseqsize+0xb4>
cmp    $0x3e,%al
jne    12fd <getseqsize+0x17d>
mov    %r15,%rdi
call   10a0 <getc@plt>
xor    %ebx,%ebx
cmp    $0x3e,%rax
je     14a8 <getseqsize+0x328>
mov    0x2e00(%rip),%rbp
cmp    0x0(%rbp),%rax
je     14a8 <getseqsize+0x328>
xor    %ebx,%ebx
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
xchg   %ax,%ax
movsbl %al,%edi
call   1080 <isalpha@plt>
cmp    $0x1,%rax
sbb    $0xffffffffffffffff,%rbx
mov    %r15,%rdi
call   10a0 <getc@plt>
cmp    $0x3e,%rax
je     14a8 <getseqsize+0x328>
cmp    0x0(%rbp),%rax
jne    1200 <getseqsize+0x80>
jmp    14a8 <getseqsize+0x328>
xor    %ebx,%ebx
jmp    14b7 <getseqsize+0x337>
mov    0x11(%rsp),%bl
mov    %r15,%rdi
call   10a0 <getc@plt>
cmp    $0x20,%bl
jne    141e <getseqsize+0x29e>
cmp    $0x3b,%rax
jne    127e <getseqsize+0xfe>
lea    0x10(%rsp),%rbx
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
xchg   %ax,%ax
mov    %rbx,%rdi
mov    $0x3e8,%esi
mov    %r15,%rdx
call   1040 <fgets@plt>
mov    %r15,%rdi
call   10a0 <getc@plt>
cmp    $0x3b,%rax
je     1260 <getseqsize+0xe0>
mov    %rax,%rdi
mov    %r15,%rsi
call   1060 <ungetc@plt>
lea    0x10(%rsp),%rdi
mov    $0x3e8,%esi
mov    %r15,%rdx
call   1040 <fgets@plt>
mov    %r15,%rdi
call   10a0 <getc@plt>
xor    %ebx,%ebx
cmp    $0x3b,%rax
je     14a8 <getseqsize+0x328>
mov    0x2d32(%rip),%rbp
cmp    0x0(%rbp),%rax
je     14a8 <getseqsize+0x328>
xor    %ebx,%ebx
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   0x0(%rax)
movsbl %al,%edi
call   1080 <isalpha@plt>
cmp    $0x1,%rax
sbb    $0xffffffffffffffff,%rbx
mov    %r15,%rdi
call   10a0 <getc@plt>
cmp    $0x3b,%rax
je     14a8 <getseqsize+0x328>
cmp    0x0(%rbp),%rax
jne    12d0 <getseqsize+0x150>
jmp    14a8 <getseqsize+0x328>
lea    0xcfc(%rip),%r12
lea    0x10(%rsp),%rbx
nopl   0x0(%rax)
mov    %rbx,%rdi
mov    %r12,%rsi
mov    $0x5,%edx
call   1030 <strncmp@plt>
test   %rax,%rax
je     133c <getseqsize+0x1bc>
mov    %rbx,%rdi
mov    $0x3e8,%esi
mov    %r15,%rdx
call   1040 <fgets@plt>
test   %rax,%rax
jne    1310 <getseqsize+0x190>
jmp    137d <getseqsize+0x1fd>
lea    0xcc3(%rip),%r12
lea    0x10(%rsp),%r13
nopl   0x0(%rax,%rax,1)
mov    %r13,%rdi
mov    %r12,%rsi
mov    $0x6,%edx
call   1030 <strncmp@plt>
mov    %rax,%rbx
mov    %r13,%rdi
mov    $0x3e8,%esi
mov    %r15,%rdx
call   1040 <fgets@plt>
test   %rbx,%rbx
je     1387 <getseqsize+0x207>
test   %rax,%rax
jne    1350 <getseqsize+0x1d0>
mov    $0x1,%edi
call   1090 <exit@plt>
lea    0xc7f(%rip),%rsi
lea    0x10(%rsp),%rdi
mov    $0x2,%edx
call   1030 <strncmp@plt>
test   %rax,%rax
je     14a6 <getseqsize+0x326>
lea    0x11(%rsp),%r14
xor    %ebx,%ebx
lea    0x10(%rsp),%r12
lea    0xc54(%rip),%r13
jmp    13e9 <getseqsize+0x269>
nopl   0x0(%rax,%rax,1)
mov    %r12,%rdi
mov    $0x3e8,%esi
mov    %r15,%rdx
call   1040 <fgets@plt>
mov    %r12,%rdi
mov    %r13,%rsi
mov    $0x2,%edx
call   1030 <strncmp@plt>
test   %rax,%rax
je     14a8 <getseqsize+0x328>
mov    0x10(%rsp),%al
cmp    $0xa,%al
je     13c0 <getseqsize+0x240>
mov    %r14,%rbp
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
xchg   %ax,%ax
movsbl %al,%edi
call   1080 <isalpha@plt>
cmp    $0x1,%rax
sbb    $0xffffffffffffffff,%rbx
movzbl 0x0(%rbp),%eax
add    $0x1,%rbp
cmp    $0xa,%al
jne    1400 <getseqsize+0x280>
jmp    13c0 <getseqsize+0x240>
cmp    $0x3b,%rax
jne    144e <getseqsize+0x2ce>
lea    0x10(%rsp),%rbx
nopl   0x0(%rax)
mov    %rbx,%rdi
mov    $0x3e8,%esi
mov    %r15,%rdx
call   1040 <fgets@plt>
mov    %r15,%rdi
call   10a0 <getc@plt>
cmp    $0x3b,%rax
je     1430 <getseqsize+0x2b0>
mov    %rax,%rdi
mov    %r15,%rsi
call   1060 <ungetc@plt>
mov    %r15,%rdi
call   10a0 <getc@plt>
xor    %ebx,%ebx
cmp    $0x3b,%rax
je     14a8 <getseqsize+0x328>
mov    0x2b78(%rip),%rbp
cmp    0x0(%rbp),%rax
je     14a8 <getseqsize+0x328>
xor    %ebx,%ebx
nopl   0x0(%rax,%rax,1)
movsbl %al,%edi
call   1080 <isalpha@plt>
cmp    $0x1,%rax
sbb    $0xffffffffffffffff,%rbx
mov    %r15,%rdi
call   10a0 <getc@plt>
cmp    $0x3b,%rax
je     14a8 <getseqsize+0x328>
cmp    0x0(%rbp),%rax
jne    1480 <getseqsize+0x300>
jmp    14a8 <getseqsize+0x328>
xor    %ebx,%ebx
mov    %r15,%rdi
mov    0x8(%rsp),%rsi
xor    %edx,%edx
call   1070 <fseek@plt>
mov    %ebx,%eax
add    $0x3f8,%rsp
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
@EOF = global i64 0
@.str = [6 x i8] c"LOCUS\00"
@.str.1 = [7 x i8] c"ORIGIN\00"
@.str.2 = [3 x i8] c"//\00"
define i32 @getseqsize(i32* %0) {
%2 = alloca i32
%3 = alloca i32*
%4 = alloca [1000 x i8]
%5 = alloca i64
%6 = alloca i64
%7 = alloca i64
%8 = alloca i64
%9 = alloca i8*
store i32* %0, i32** %3
%10 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %4, i64 0, i64 0
store i8 0, i8* %10
store i64 0, i64* %7
%11 = load i32*, i32** %3
%12 = call i64 @ftell(i32* %11)
store i64 %12, i64* %8
%13 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %4, i64 0, i64 0
%14 = load i32*, i32** %3
%15 = call i8* @fgets(i8* %13, i32 1000, i32* %14)
%16 = icmp eq i8* %15, null
br i1 %16, label %17, label %18
17: ; preds = %1
store i32 0, i32* %2
br label %197
18: ; preds = %1
%19 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %4, i64 0, i64 0
%20 = load i8, i8* %19
%21 = sext i8 %20 to i32
%22 = icmp eq i32 %21, 59
br i1 %22, label %23, label %104
23: ; preds = %18
%24 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %4, i64 0, i64 1
%25 = load i8, i8* %24
%26 = sext i8 %25 to i32
%27 = icmp ne i32 %26, 32
br i1 %27, label %28, label %61
28: ; preds = %23
br label %29
29: ; preds = %33, %28
%30 = load i32*, i32** %3
%31 = call i64 @getc(i32* %30)
store i64 %31, i64* %6
%32 = icmp eq i64 %31, 59
br i1 %32, label %33, label %37
33: ; preds = %29
%34 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %4, i64 0, i64 0
%35 = load i32*, i32** %3
%36 = call i8* @fgets(i8* %34, i32 1000, i32* %35)
store i8* %36, i8** %9
br label %29
37: ; preds = %29
%38 = load i64, i64* %6
%39 = load i32*, i32** %3
%40 = call i32 @ungetc(i64 %38, i32* %39)
br label %41
41: ; preds = %59, %37
%42 = load i32*, i32** %3
%43 = call i64 @getc(i32* %42)
store i64 %43, i64* %6
%44 = icmp ne i64 %43, 59
br i1 %44, label %45, label %49
45: ; preds = %41
%46 = load i64, i64* %6
%47 = load i64, i64* @EOF
%48 = icmp ne i64 %46, %47
br label %49
49: ; preds = %45, %41
%50 = phi i1 [ false, %41 ], [ %48, %45 ]
br i1 %50, label %51, label %60
51: ; preds = %49
%52 = load i64, i64* %6
%53 = trunc i64 %52 to i8
%54 = call i64 @isalpha(i8 signext %53)
%55 = icmp ne i64 %54, 0
br i1 %55, label %56, label %59
56: ; preds = %51
%57 = load i64, i64* %7
%58 = add nsw i64 %57, 1
store i64 %58, i64* %7
br label %59
59: ; preds = %56, %51
br label %41
60: ; preds = %49
br label %103
61: ; preds = %23
%62 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %4, i64 0, i64 1
%63 = load i8, i8* %62
%64 = sext i8 %63 to i32
%65 = icmp eq i32 %64, 32
br i1 %65, label %66, label %102
66: ; preds = %61
br label %67
67: ; preds = %71, %66
%68 = load i32*, i32** %3
%69 = call i64 @getc(i32* %68)
store i64 %69, i64* %6
%70 = icmp eq i64 %69, 59
br i1 %70, label %71, label %75
71: ; preds = %67
%72 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %4, i64 0, i64 0
%73 = load i32*, i32** %3
%74 = call i8* @fgets(i8* %72, i32 1000, i32* %73)
store i8* %74, i8** %9
br label %67
75: ; preds = %67
%76 = load i64, i64* %6
%77 = load i32*, i32** %3
%78 = call i32 @ungetc(i64 %76, i32* %77)
%79 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %4, i64 0, i64 0
%80 = load i32*, i32** %3
%81 = call i8* @fgets(i8* %79, i32 1000, i32* %80)
store i8* %81, i8** %9
br label %82
82: ; preds = %100, %75
%83 = load i32*, i32** %3
%84 = call i64 @getc(i32* %83)
store i64 %84, i64* %6
%85 = icmp ne i64 %84, 59
br i1 %85, label %86, label %90
86: ; preds = %82
%87 = load i64, i64* %6
%88 = load i64, i64* @EOF
%89 = icmp ne i64 %87, %88
br label %90
90: ; preds = %86, %82
%91 = phi i1 [ false, %82 ], [ %89, %86 ]
br i1 %91, label %92, label %101
92: ; preds = %90
%93 = load i64, i64* %6
%94 = trunc i64 %93 to i8
%95 = call i64 @isalpha(i8 signext %94)
%96 = icmp ne i64 %95, 0
br i1 %96, label %97, label %100
97: ; preds = %92
%98 = load i64, i64* %7
%99 = add nsw i64 %98, 1
store i64 %99, i64* %7
br label %100
100: ; preds = %97, %92
br label %82
101: ; preds = %90
br label %102
102: ; preds = %101, %61
br label %103
103: ; preds = %102, %60
br label %190
104: ; preds = %18
%105 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %4, i64 0, i64 0
%106 = load i8, i8* %105
%107 = sext i8 %106 to i32
%108 = icmp eq i32 %107, 62
br i1 %108, label %109, label %130
109: ; preds = %104
br label %110
110: ; preds = %128, %109
%111 = load i32*, i32** %3
%112 = call i64 @getc(i32* %111)
store i64 %112, i64* %6
%113 = icmp ne i64 %112, 62
br i1 %113, label %114, label %118
114: ; preds = %110
%115 = load i64, i64* %6
%116 = load i64, i64* @EOF
%117 = icmp ne i64 %115, %116
br label %118
118: ; preds = %114, %110
%119 = phi i1 [ false, %110 ], [ %117, %114 ]
br i1 %119, label %120, label %129
120: ; preds = %118
%121 = load i64, i64* %6
%122 = trunc i64 %121 to i8
%123 = call i64 @isalpha(i8 signext %122)
%124 = icmp ne i64 %123, 0
br i1 %124, label %125, label %128
125: ; preds = %120
%126 = load i64, i64* %7
%127 = add nsw i64 %126, 1
store i64 %127, i64* %7
br label %128
128: ; preds = %125, %120
br label %110
129: ; preds = %118
br label %189
130: ; preds = %104
br label %131
131: ; preds = %142, %130
%132 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %4, i64 0, i64 0
%133 = call i64 @strncmp(i8* %132, i8* getelementptr inbounds ([6 x i8], [6 x i8]* @.str, i64 0, i64 0), i32 5)
%134 = icmp ne i64 %133, 0
br i1 %134, label %135, label %143
135: ; preds = %131
%136 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %4, i64 0, i64 0
%137 = load i32*, i32** %3
%138 = call i8* @fgets(i8* %136, i32 1000, i32* %137)
%139 = icmp eq i8* %138, null
br i1 %139, label %140, label %142
140: ; preds = %135
%141 = call i32 @exit(i32 1)
unreachable
142: ; preds = %135
br label %131
143: ; preds = %131
br label %144
144: ; preds = %155, %143
%145 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %4, i64 0, i64 0
%146 = call i64 @strncmp(i8* %145, i8* getelementptr inbounds ([7 x i8], [7 x i8]* @.str.1, i64 0, i64 0), i32 6)
%147 = icmp ne i64 %146, 0
br i1 %147, label %148, label %156
148: ; preds = %144
%149 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %4, i64 0, i64 0
%150 = load i32*, i32** %3
%151 = call i8* @fgets(i8* %149, i32 1000, i32* %150)
%152 = icmp eq i8* %151, null
br i1 %152, label %153, label %155
153: ; preds = %148
%154 = call i32 @exit(i32 1)
unreachable
155: ; preds = %148
br label %144
156: ; preds = %144
%157 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %4, i64 0, i64 0
%158 = load i32*, i32** %3
%159 = call i8* @fgets(i8* %157, i32 1000, i32* %158)
store i8* %159, i8** %9
br label %160
160: ; preds = %184, %156
%161 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %4, i64 0, i64 0
%162 = call i64 @strncmp(i8* %161, i8* getelementptr inbounds ([3 x i8], [3 x i8]* @.str.2, i64 0, i64 0), i32 2)
%163 = icmp ne i64 %162, 0
br i1 %163, label %164, label %188
164: ; preds = %160
store i64 0, i64* %5
br label %165
165: ; preds = %181, %164
%166 = load i64, i64* %5
%167 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %4, i64 0, i64 %166
%168 = load i8, i8* %167
%169 = sext i8 %168 to i32
%170 = icmp ne i32 %169, 10
br i1 %170, label %171, label %184
171: ; preds = %165
%172 = load i64, i64* %5
%173 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %4, i64 0, i64 %172
%174 = load i8, i8* %173
%175 = call i64 @isalpha(i8 signext %174)
%176 = icmp ne i64 %175, 0
br i1 %176, label %177, label %180
177: ; preds = %171
%178 = load i64, i64* %7
%179 = add nsw i64 %178, 1
store i64 %179, i64* %7
br label %180
180: ; preds = %177, %171
br label %181
181: ; preds = %180
%182 = load i64, i64* %5
%183 = add nsw i64 %182, 1
store i64 %183, i64* %5
br label %165
184: ; preds = %165
%185 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %4, i64 0, i64 0
%186 = load i32*, i32** %3
%187 = call i8* @fgets(i8* %185, i32 1000, i32* %186)
store i8* %187, i8** %9
br label %160
188: ; preds = %160
br label %189
189: ; preds = %188, %129
br label %190
190: ; preds = %189, %103
br label %191
191: ; preds = %190
%192 = load i32*, i32** %3
%193 = load i64, i64* %8
%194 = call i32 @fseek(i32* %192, i64 %193, i32 0)
%195 = load i64, i64* %7
%196 = trunc i64 %195 to i32
store i32 %196, i32* %2
br label %197
197: ; preds = %191, %17
%198 = load i32, i32* %2
ret i32 %198
}

LLVM IR (-O2):
@EOF = global i64 0
@.str = [6 x i8] c"LOCUS\00"
@.str.1 = [7 x i8] c"ORIGIN\00"
@.str.2 = [3 x i8] c"//\00"
define i32 @getseqsize(i32* nocapture %0) {
%2 = alloca [1000 x i8]
%3 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %2, i64 0, i64 0
store i8 0, i8* %3
%4 = tail call i64 @ftell(i32* %0)
%5 = call i8* @fgets(i8* %3, i32 1000, i32* %0)
%6 = icmp eq i8* %5, null
br i1 %6, label %131, label %7
7: ; preds = %1
%8 = load i8, i8* %3
switch i8 %8, label %87 [
i8 59, label %15
i8 62, label %9
]
9: ; preds = %7
%10 = call i64 @getc(i32* %0)
%11 = icmp ne i64 %10, 62
%12 = load i64, i64* @EOF
%13 = icmp ne i64 %10, %12
%14 = select i1 %11, i1 %13, i1 false
br i1 %14, label %74, label %127
15: ; preds = %7
%16 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %2, i64 0, i64 1
%17 = load i8, i8* %16
%18 = icmp eq i8 %17, 32
%19 = call i64 @getc(i32* %0)
%20 = icmp eq i64 %19, 59
br i1 %18, label %22, label %21
21: ; preds = %15
br i1 %20, label %23, label %27
22: ; preds = %15
br i1 %20, label %48, label %52
23: ; preds = %21, %23
%24 = call i8* @fgets(i8* %3, i32 1000, i32* %0)
%25 = call i64 @getc(i32* %0)
%26 = icmp eq i64 %25, 59
br i1 %26, label %23, label %27
27: ; preds = %23, %21
%28 = phi i64 [ %19, %21 ], [ %25, %23 ]
%29 = call i32 @ungetc(i64 %28, i32* %0)
%30 = call i64 @getc(i32* %0)
%31 = icmp ne i64 %30, 59
%32 = load i64, i64* @EOF
%33 = icmp ne i64 %30, %32
%34 = select i1 %31, i1 %33, i1 false
br i1 %34, label %35, label %127
35: ; preds = %27, %35
%36 = phi i64 [ %43, %35 ], [ %30, %27 ]
%37 = phi i64 [ %42, %35 ], [ 0, %27 ]
%38 = trunc i64 %36 to i8
%39 = call i64 @isalpha(i8 signext %38)
%40 = icmp ne i64 %39, 0
%41 = zext i1 %40 to i64
%42 = add nuw nsw i64 %37, %41
%43 = call i64 @getc(i32* %0)
%44 = icmp ne i64 %43, 59
%45 = load i64, i64* @EOF
%46 = icmp ne i64 %43, %45
%47 = select i1 %44, i1 %46, i1 false
br i1 %47, label %35, label %127
48: ; preds = %22, %48
%49 = call i8* @fgets(i8* %3, i32 1000, i32* %0)
%50 = call i64 @getc(i32* %0)
%51 = icmp eq i64 %50, 59
br i1 %51, label %48, label %52
52: ; preds = %48, %22
%53 = phi i64 [ %19, %22 ], [ %50, %48 ]
%54 = call i32 @ungetc(i64 %53, i32* %0)
%55 = call i8* @fgets(i8* %3, i32 1000, i32* %0)
%56 = call i64 @getc(i32* %0)
%57 = icmp ne i64 %56, 59
%58 = load i64, i64* @EOF
%59 = icmp ne i64 %56, %58
%60 = select i1 %57, i1 %59, i1 false
br i1 %60, label %61, label %127
61: ; preds = %52, %61
%62 = phi i64 [ %69, %61 ], [ %56, %52 ]
%63 = phi i64 [ %68, %61 ], [ 0, %52 ]
%64 = trunc i64 %62 to i8
%65 = call i64 @isalpha(i8 signext %64)
%66 = icmp ne i64 %65, 0
%67 = zext i1 %66 to i64
%68 = add nuw nsw i64 %63, %67
%69 = call i64 @getc(i32* %0)
%70 = icmp ne i64 %69, 59
%71 = load i64, i64* @EOF
%72 = icmp ne i64 %69, %71
%73 = select i1 %70, i1 %72, i1 false
br i1 %73, label %61, label %127
74: ; preds = %9, %74
%75 = phi i64 [ %82, %74 ], [ %10, %9 ]
%76 = phi i64 [ %81, %74 ], [ 0, %9 ]
%77 = trunc i64 %75 to i8
%78 = call i64 @isalpha(i8 signext %77)
%79 = icmp ne i64 %78, 0
%80 = zext i1 %79 to i64
%81 = add nuw nsw i64 %76, %80
%82 = call i64 @getc(i32* %0)
%83 = icmp ne i64 %82, 62
%84 = load i64, i64* @EOF
%85 = icmp ne i64 %82, %84
%86 = select i1 %83, i1 %85, i1 false
br i1 %86, label %74, label %127
87: ; preds = %7, %90
%88 = call i64 @strncmp(i8* %3, i8* getelementptr inbounds ([6 x i8], [6 x i8]* @.str, i64 0, i64 0), i32 5)
%89 = icmp eq i64 %88, 0
br i1 %89, label %95, label %90
90: ; preds = %87
%91 = call i8* @fgets(i8* %3, i32 1000, i32* %0)
%92 = icmp eq i8* %91, null
br i1 %92, label %93, label %87
93: ; preds = %90
%94 = call i32 @exit(i32 1)
unreachable
95: ; preds = %87, %99
%96 = call i64 @strncmp(i8* %3, i8* getelementptr inbounds ([7 x i8], [7 x i8]* @.str.1, i64 0, i64 0), i32 6)
%97 = icmp eq i64 %96, 0
%98 = call i8* @fgets(i8* %3, i32 1000, i32* %0)
br i1 %97, label %103, label %99
99: ; preds = %95
%100 = icmp eq i8* %98, null
br i1 %100, label %101, label %95
101: ; preds = %99
%102 = call i32 @exit(i32 1)
unreachable
103: ; preds = %95
%104 = call i64 @strncmp(i8* %3, i8* getelementptr inbounds ([3 x i8], [3 x i8]* @.str.2, i64 0, i64 0), i32 2)
%105 = icmp eq i64 %104, 0
br i1 %105, label %127, label %106
106: ; preds = %103, %122
%107 = phi i64 [ %123, %122 ], [ 0, %103 ]
%108 = load i8, i8* %3
%109 = icmp eq i8 %108, 10
br i1 %109, label %122, label %110
110: ; preds = %106, %110
%111 = phi i8 [ %120, %110 ], [ %108, %106 ]
%112 = phi i64 [ %117, %110 ], [ %107, %106 ]
%113 = phi i64 [ %118, %110 ], [ 0, %106 ]
%114 = call i64 @isalpha(i8 signext %111)
%115 = icmp ne i64 %114, 0
%116 = zext i1 %115 to i64
%117 = add nsw i64 %112, %116
%118 = add nuw nsw i64 %113, 1
%119 = getelementptr inbounds [1000 x i8], [1000 x i8]* %2, i64 0, i64 %118
%120 = load i8, i8* %119
%121 = icmp eq i8 %120, 10
br i1 %121, label %122, label %110
122: ; preds = %110, %106
%123 = phi i64 [ %107, %106 ], [ %117, %110 ]
%124 = call i8* @fgets(i8* %3, i32 1000, i32* %0)
%125 = call i64 @strncmp(i8* %3, i8* getelementptr inbounds ([3 x i8], [3 x i8]* @.str.2, i64 0, i64 0), i32 2)
%126 = icmp eq i64 %125, 0
br i1 %126, label %127, label %106
127: ; preds = %74, %35, %61, %122, %9, %27, %52, %103
%128 = phi i64 [ 0, %103 ], [ 0, %52 ], [ 0, %27 ], [ 0, %9 ], [ %123, %122 ], [ %68, %61 ], [ %42, %35 ], [ %81, %74 ]
%129 = call i32 @fseek(i32* %0, i64 %4, i32 0)
%130 = trunc i64 %128 to i32
br label %131
131: ; preds = %1, %127
%132 = phi i32 [ %130, %127 ], [ 0, %1 ]
ret i32 %132
}