void getStructure(int seqlength, const int thepairs[], char *structure) {
  int i;
  for (i = 0; i < seqlength; i++) {
    if (thepairs[i] != -1) {
      if (thepairs[i] > i) {
        structure[i] = '(';
      } else {
        structure[i] = ')';
      }
    } else {
      structure[i] = '.';
    }
  }
  structure[seqlength] = '\0';
}


x86 assembly (clang, -O0):
<getStructure>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    %edi,-0x4(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %rdx,-0x18(%rbp)
movl   $0x0,-0x1c(%rbp)
mov    -0x1c(%rbp),%eax
cmp    -0x4(%rbp),%eax
jge    1189 <getStructure+0x89>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
cmpl   $0xffffffff,(%rax,%rcx,4)
je     116a <getStructure+0x6a>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
cmp    -0x1c(%rbp),%eax
jle    1159 <getStructure+0x59>
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
movb   $0x28,(%rax,%rcx,1)
jmp    1165 <getStructure+0x65>
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
movb   $0x29,(%rax,%rcx,1)
jmp    1176 <getStructure+0x76>
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
movb   $0x2e,(%rax,%rcx,1)
jmp    117b <getStructure+0x7b>
mov    -0x1c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
jmp    1116 <getStructure+0x16>
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x4(%rbp),%rcx
movb   $0x0,(%rax,%rcx,1)
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<getStructure>:
test   %edi,%edi
jle    1146 <getStructure+0x46>
mov    %edi,%r8d
xor    %ecx,%ecx
jmp    111d <getStructure+0x1d>
nopl   0x0(%rax,%rax,1)
movb   $0x2e,(%rdx,%rcx,1)
add    $0x1,%rcx
cmp    %rcx,%r8
je     1146 <getStructure+0x46>
movslq (%rsi,%rcx,4),%rax
cmp    $0xffffffffffffffff,%rax
je     1110 <getStructure+0x10>
cmp    %rax,%rcx
jge    1140 <getStructure+0x40>
movb   $0x28,(%rdx,%rcx,1)
jmp    1114 <getStructure+0x14>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   0x0(%rax)
movb   $0x29,(%rdx,%rcx,1)
jmp    1114 <getStructure+0x14>
movslq %edi,%rax
movb   $0x0,(%rdx,%rax,1)
ret

LLVM IR (-O0):
define void @getStructure(i32 %0, i32* %1, i8* %2) {
%4 = alloca i32
%5 = alloca i32*
%6 = alloca i8*
%7 = alloca i32
store i32 %0, i32* %4
store i32* %1, i32** %5
store i8* %2, i8** %6
store i32 0, i32* %7
br label %8
8: ; preds = %44, %3
%9 = load i32, i32* %7
%10 = load i32, i32* %4
%11 = icmp slt i32 %9, %10
br i1 %11, label %12, label %47
12: ; preds = %8
%13 = load i32*, i32** %5
%14 = load i32, i32* %7
%15 = sext i32 %14 to i64
%16 = getelementptr inbounds i32, i32* %13, i64 %15
%17 = load i32, i32* %16
%18 = icmp ne i32 %17, -1
br i1 %18, label %19, label %38
19: ; preds = %12
%20 = load i32*, i32** %5
%21 = load i32, i32* %7
%22 = sext i32 %21 to i64
%23 = getelementptr inbounds i32, i32* %20, i64 %22
%24 = load i32, i32* %23
%25 = load i32, i32* %7
%26 = icmp sgt i32 %24, %25
br i1 %26, label %27, label %32
27: ; preds = %19
%28 = load i8*, i8** %6
%29 = load i32, i32* %7
%30 = sext i32 %29 to i64
%31 = getelementptr inbounds i8, i8* %28, i64 %30
store i8 40, i8* %31
br label %37
32: ; preds = %19
%33 = load i8*, i8** %6
%34 = load i32, i32* %7
%35 = sext i32 %34 to i64
%36 = getelementptr inbounds i8, i8* %33, i64 %35
store i8 41, i8* %36
br label %37
37: ; preds = %32, %27
br label %43
38: ; preds = %12
%39 = load i8*, i8** %6
%40 = load i32, i32* %7
%41 = sext i32 %40 to i64
%42 = getelementptr inbounds i8, i8* %39, i64 %41
store i8 46, i8* %42
br label %43
43: ; preds = %38, %37
br label %44
44: ; preds = %43
%45 = load i32, i32* %7
%46 = add nsw i32 %45, 1
store i32 %46, i32* %7
br label %8
47: ; preds = %8
%48 = load i8*, i8** %6
%49 = load i32, i32* %4
%50 = sext i32 %49 to i64
%51 = getelementptr inbounds i8, i8* %48, i64 %50
store i8 0, i8* %51
ret void
}

LLVM IR (-O2):
define void @getStructure(i32 %0, i32* nocapture %1, i8* nocapture writeonly %2) {
%4 = icmp sgt i32 %0, 0
br i1 %4, label %5, label %23
5: ; preds = %3
%6 = zext i32 %0 to i64
br label %7
7: ; preds = %5, %20
%8 = phi i64 [ 0, %5 ], [ %21, %20 ]
%9 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %8
%10 = load i32, i32* %9
%11 = icmp eq i32 %10, -1
br i1 %11, label %18, label %12
12: ; preds = %7
%13 = sext i32 %10 to i64
%14 = icmp slt i64 %8, %13
%15 = getelementptr inbounds i8, i8* %2, i64 %8
br i1 %14, label %16, label %17
16: ; preds = %12
store i8 40, i8* %15
br label %20
17: ; preds = %12
store i8 41, i8* %15
br label %20
18: ; preds = %7
%19 = getelementptr inbounds i8, i8* %2, i64 %8
store i8 46, i8* %19
br label %20
20: ; preds = %18, %17, %16
%21 = add nuw nsw i64 %8, 1
%22 = icmp eq i64 %21, %6
br i1 %22, label %23, label %7
23: ; preds = %20, %3
%24 = sext i32 %0 to i64
%25 = getelementptr inbounds i8, i8* %2, i64 %24
store i8 0, i8* %25
ret void
}