void compute_reaction_forces(double *R, double *F, double **K, double *D,
                             int DoF, int *r) {
  int i, j;
  for (i = 1; i <= DoF; i++) {
    R[i] = 0;
    if (r[i]) {
      R[i] = -F[i];
      for (j = 1; j <= DoF; j++)
        R[i] += K[i][j] * D[j];
    }
  }
}


x86 assembly (clang, -O0):
<compute_reaction_forces>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %rdx,-0x18(%rbp)
mov    %rcx,-0x20(%rbp)
mov    %r8d,-0x24(%rbp)
mov    %r9,-0x30(%rbp)
movl   $0x1,-0x34(%rbp)
mov    -0x34(%rbp),%eax
cmp    -0x24(%rbp),%eax
jg     11f7 <compute_reaction_forces+0xf7>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x34(%rbp),%rcx
xorps  %xmm0,%xmm0
movsd  %xmm0,(%rax,%rcx,8)
mov    -0x30(%rbp),%rax
movslq -0x34(%rbp),%rcx
cmpl   $0x0,(%rax,%rcx,4)
je     11e4 <compute_reaction_forces+0xe4>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x34(%rbp),%rcx
movsd  (%rax,%rcx,8),%xmm0
movq   %xmm0,%rax
movabs $0x8000000000000000,%rcx
xor    %rcx,%rax
movq   %rax,%xmm0
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x34(%rbp),%rcx
movsd  %xmm0,(%rax,%rcx,8)
movl   $0x1,-0x38(%rbp)
mov    -0x38(%rbp),%eax
cmp    -0x24(%rbp),%eax
jg     11df <compute_reaction_forces+0xdf>
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x34(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x38(%rbp),%rcx
movsd  (%rax,%rcx,8),%xmm0
mov    -0x20(%rbp),%rax
movslq -0x38(%rbp),%rcx
movsd  (%rax,%rcx,8),%xmm2
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x34(%rbp),%rcx
movsd  (%rax,%rcx,8),%xmm1
mulsd  %xmm2,%xmm0
addsd  %xmm1,%xmm0
movsd  %xmm0,(%rax,%rcx,8)
mov    -0x38(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x38(%rbp)
jmp    1189 <compute_reaction_forces+0x89>
jmp    11e4 <compute_reaction_forces+0xe4>
jmp    11e9 <compute_reaction_forces+0xe9>
mov    -0x34(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x34(%rbp)
jmp    1123 <compute_reaction_forces+0x23>
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<compute_reaction_forces>:
push   %r15
push   %r14
push   %rbx
test   %r8d,%r8d
jle    11d2 <compute_reaction_forces+0xd2>
mov    %r8d,%r8d
lea    0x1(%r8),%r10
mov    %r8d,%r11d
and    $0xfffffffe,%r11d
neg    %r11
mov    $0x1,%r15d
movapd 0xed3(%rip),%xmm0
jmp    113d <compute_reaction_forces+0x3d>
nop
add    $0x1,%r15
cmp    %r10,%r15
je     11d2 <compute_reaction_forces+0xd2>
movq   $0x0,(%rdi,%r15,8)
cmpl   $0x0,(%r9,%r15,4)
je     1130 <compute_reaction_forces+0x30>
movsd  (%rsi,%r15,8),%xmm1
xorpd  %xmm0,%xmm1
movlpd %xmm1,(%rdi,%r15,8)
mov    (%rdx,%r15,8),%r14
mov    $0x1,%ebx
cmp    $0x2,%r10d
je     11ae <compute_reaction_forces+0xae>
mov    $0x1,%ebx
movsd  (%r14,%rbx,8),%xmm2
mulsd  (%rcx,%rbx,8),%xmm2
addsd  %xmm1,%xmm2
movsd  %xmm2,(%rdi,%r15,8)
movsd  0x8(%r14,%rbx,8),%xmm1
mulsd  0x8(%rcx,%rbx,8),%xmm1
addsd  %xmm2,%xmm1
movsd  %xmm1,(%rdi,%r15,8)
lea    (%r11,%rbx,1),%rax
add    $0x2,%rax
add    $0x2,%rbx
cmp    $0x1,%rax
jne    1170 <compute_reaction_forces+0x70>
test   $0x1,%r8b
je     1130 <compute_reaction_forces+0x30>
movsd  (%r14,%rbx,8),%xmm2
mulsd  (%rcx,%rbx,8),%xmm2
addsd  %xmm1,%xmm2
movsd  %xmm2,(%rdi,%r15,8)
jmp    1130 <compute_reaction_forces+0x30>
pop    %rbx
pop    %r14
pop    %r15
ret

LLVM IR (-O0):
define void @compute_reaction_forces(double* %0, double* %1, double** %2, double* %3, i32 %4, i32* %5) {
%7 = alloca double*
%8 = alloca double*
%9 = alloca double**
%10 = alloca double*
%11 = alloca i32
%12 = alloca i32*
%13 = alloca i32
%14 = alloca i32
store double* %0, double** %7
store double* %1, double** %8
store double** %2, double*** %9
store double* %3, double** %10
store i32 %4, i32* %11
store i32* %5, i32** %12
store i32 1, i32* %13
br label %15
15: ; preds = %71, %6
%16 = load i32, i32* %13
%17 = load i32, i32* %11
%18 = icmp sle i32 %16, %17
br i1 %18, label %19, label %74
19: ; preds = %15
%20 = load double*, double** %7
%21 = load i32, i32* %13
%22 = sext i32 %21 to i64
%23 = getelementptr inbounds double, double* %20, i64 %22
store double 0.000000e+00, double* %23
%24 = load i32*, i32** %12
%25 = load i32, i32* %13
%26 = sext i32 %25 to i64
%27 = getelementptr inbounds i32, i32* %24, i64 %26
%28 = load i32, i32* %27
%29 = icmp ne i32 %28, 0
br i1 %29, label %30, label %70
30: ; preds = %19
%31 = load double*, double** %8
%32 = load i32, i32* %13
%33 = sext i32 %32 to i64
%34 = getelementptr inbounds double, double* %31, i64 %33
%35 = load double, double* %34
%36 = fneg double %35
%37 = load double*, double** %7
%38 = load i32, i32* %13
%39 = sext i32 %38 to i64
%40 = getelementptr inbounds double, double* %37, i64 %39
store double %36, double* %40
store i32 1, i32* %14
br label %41
41: ; preds = %66, %30
%42 = load i32, i32* %14
%43 = load i32, i32* %11
%44 = icmp sle i32 %42, %43
br i1 %44, label %45, label %69
45: ; preds = %41
%46 = load double**, double*** %9
%47 = load i32, i32* %13
%48 = sext i32 %47 to i64
%49 = getelementptr inbounds double*, double** %46, i64 %48
%50 = load double*, double** %49
%51 = load i32, i32* %14
%52 = sext i32 %51 to i64
%53 = getelementptr inbounds double, double* %50, i64 %52
%54 = load double, double* %53
%55 = load double*, double** %10
%56 = load i32, i32* %14
%57 = sext i32 %56 to i64
%58 = getelementptr inbounds double, double* %55, i64 %57
%59 = load double, double* %58
%60 = load double*, double** %7
%61 = load i32, i32* %13
%62 = sext i32 %61 to i64
%63 = getelementptr inbounds double, double* %60, i64 %62
%64 = load double, double* %63
%65 = call double @llvm.fmuladd.f64(double %54, double %59, double %64)
store double %65, double* %63
br label %66
66: ; preds = %45
%67 = load i32, i32* %14
%68 = add nsw i32 %67, 1
store i32 %68, i32* %14
br label %41
69: ; preds = %41
br label %70
70: ; preds = %69, %19
br label %71
71: ; preds = %70
%72 = load i32, i32* %13
%73 = add nsw i32 %72, 1
store i32 %73, i32* %13
br label %15
74: ; preds = %15
ret void
}

LLVM IR (-O2):
define void @compute_reaction_forces(double* nocapture %0, double* nocapture %1, double** nocapture %2, double* nocapture %3, i32 %4, i32* nocapture %5) {
%7 = icmp slt i32 %4, 1
br i1 %7, label %58, label %8
8: ; preds = %6
%9 = add nuw i32 %4, 1
%10 = zext i32 %9 to i64
%11 = add nsw i64 %10, -1
%12 = and i64 %11, 1
%13 = icmp eq i32 %9, 2
%14 = and i64 %11, -2
%15 = icmp eq i64 %12, 0
br label %16
16: ; preds = %8, %55
%17 = phi i64 [ 1, %8 ], [ %56, %55 ]
%18 = getelementptr inbounds double, double* %0, i64 %17
store double 0.000000e+00, double* %18
%19 = getelementptr inbounds i32, i32* %5, i64 %17
%20 = load i32, i32* %19
%21 = icmp eq i32 %20, 0
br i1 %21, label %55, label %22
22: ; preds = %16
%23 = getelementptr inbounds double, double* %1, i64 %17
%24 = load double, double* %23
%25 = fneg double %24
store double %25, double* %18
%26 = getelementptr inbounds double*, double** %2, i64 %17
%27 = load double*, double** %26
br i1 %13, label %46, label %28
28: ; preds = %22, %28
%29 = phi double [ %42, %28 ], [ %25, %22 ]
%30 = phi i64 [ %43, %28 ], [ 1, %22 ]
%31 = phi i64 [ %44, %28 ], [ 0, %22 ]
%32 = getelementptr inbounds double, double* %27, i64 %30
%33 = load double, double* %32
%34 = getelementptr inbounds double, double* %3, i64 %30
%35 = load double, double* %34
%36 = tail call double @llvm.fmuladd.f64(double %33, double %35, double %29)
store double %36, double* %18
%37 = add nuw nsw i64 %30, 1
%38 = getelementptr inbounds double, double* %27, i64 %37
%39 = load double, double* %38
%40 = getelementptr inbounds double, double* %3, i64 %37
%41 = load double, double* %40
%42 = tail call double @llvm.fmuladd.f64(double %39, double %41, double %36)
store double %42, double* %18
%43 = add nuw nsw i64 %30, 2
%44 = add i64 %31, 2
%45 = icmp eq i64 %44, %14
br i1 %45, label %46, label %28
46: ; preds = %28, %22
%47 = phi double [ %25, %22 ], [ %42, %28 ]
%48 = phi i64 [ 1, %22 ], [ %43, %28 ]
br i1 %15, label %55, label %49
49: ; preds = %46
%50 = getelementptr inbounds double, double* %27, i64 %48
%51 = load double, double* %50
%52 = getelementptr inbounds double, double* %3, i64 %48
%53 = load double, double* %52
%54 = tail call double @llvm.fmuladd.f64(double %51, double %53, double %47)
store double %54, double* %18
br label %55
55: ; preds = %49, %46, %16
%56 = add nuw nsw i64 %17, 1
%57 = icmp eq i64 %56, %10
br i1 %57, label %58, label %16
58: ; preds = %55, %6
ret void
}