#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */
typedef int pop;

/* Variables and functions */
double drand();
int /*<<< orphan*/ printf(char *, int);
void expandNewpop1D(double *Pops, double *AF, double *Propagule, int pop,
                    int nSNP, int Ne, int ke, int admixture) {
  int l, i, count;
  printf("Expand new pop: %i\n", pop + 1);
  for (l = 0; l < nSNP; l++) {
    count = 0;
    if (admixture) {
      for (i = 0; i < ke; i++)
        if (drand() < Propagule[l])
          count++;
      Propagule[l] = (double)count / ke;
      for (i = ke; i < Ne; i++)
        if (drand() < Pops[nSNP * (pop) + l])
          count++;
      Pops[nSNP * pop + l] = (double)count / Ne;
    } else {
      for (i = 0; i < ke; i++)
        if (drand() < Pops[nSNP * (pop - 1) + l])
          count++;
      Pops[nSNP * pop + l] = (double)count / ke;
    }
  }
}


x86 assembly (clang, -O0):
<expandNewpop1D>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x30,%rsp
mov    0x18(%rbp),%eax
mov    0x10(%rbp),%eax
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %rdx,-0x18(%rbp)
mov    %ecx,-0x1c(%rbp)
mov    %r8d,-0x20(%rbp)
mov    %r9d,-0x24(%rbp)
mov    -0x1c(%rbp),%esi
add    $0x1,%esi
lea    0xeae(%rip),%rdi
call   1040 <printf@plt>
movl   $0x0,-0x28(%rbp)
mov    -0x28(%rbp),%eax
cmp    -0x20(%rbp),%eax
jge    12fc <expandNewpop1D+0x1dc>
movl   $0x0,-0x30(%rbp)
cmpl   $0x0,0x18(%rbp)
je     1267 <expandNewpop1D+0x147>
movl   $0x0,-0x2c(%rbp)
mov    -0x2c(%rbp),%eax
cmp    0x10(%rbp),%eax
jge    11cb <expandNewpop1D+0xab>
mov    $0x0,%al
call   1030 <drand@plt>
movaps %xmm0,%xmm1
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
movsd  (%rax,%rcx,8),%xmm0
ucomisd %xmm1,%xmm0
jbe    11b8 <expandNewpop1D+0x98>
mov    -0x30(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x30(%rbp)
jmp    11bd <expandNewpop1D+0x9d>
mov    -0x2c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
jmp    1182 <expandNewpop1D+0x62>
cvtsi2sdl -0x30(%rbp),%xmm0
cvtsi2sdl 0x10(%rbp),%xmm1
divsd  %xmm1,%xmm0
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
movsd  %xmm0,(%rax,%rcx,8)
mov    0x10(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
mov    -0x2c(%rbp),%eax
cmp    -0x24(%rbp),%eax
jge    123e <expandNewpop1D+0x11e>
mov    $0x0,%al
call   1030 <drand@plt>
movaps %xmm0,%xmm1
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    -0x20(%rbp),%ecx
imul   -0x1c(%rbp),%ecx
add    -0x28(%rbp),%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsd  (%rax,%rcx,8),%xmm0
ucomisd %xmm1,%xmm0
jbe    122b <expandNewpop1D+0x10b>
mov    -0x30(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x30(%rbp)
jmp    1230 <expandNewpop1D+0x110>
mov    -0x2c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
jmp    11ec <expandNewpop1D+0xcc>
cvtsi2sdl -0x30(%rbp),%xmm0
cvtsi2sdl -0x24(%rbp),%xmm1
divsd  %xmm1,%xmm0
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    -0x20(%rbp),%ecx
imul   -0x1c(%rbp),%ecx
add    -0x28(%rbp),%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsd  %xmm0,(%rax,%rcx,8)
jmp    12e9 <expandNewpop1D+0x1c9>
movl   $0x0,-0x2c(%rbp)
mov    -0x2c(%rbp),%eax
cmp    0x10(%rbp),%eax
jge    12c5 <expandNewpop1D+0x1a5>
mov    $0x0,%al
call   1030 <drand@plt>
movaps %xmm0,%xmm1
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    -0x20(%rbp),%ecx
mov    -0x1c(%rbp),%edx
sub    $0x1,%edx
imul   %edx,%ecx
add    -0x28(%rbp),%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsd  (%rax,%rcx,8),%xmm0
ucomisd %xmm1,%xmm0
jbe    12b2 <expandNewpop1D+0x192>
mov    -0x30(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x30(%rbp)
jmp    12b7 <expandNewpop1D+0x197>
mov    -0x2c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
jmp    126e <expandNewpop1D+0x14e>
cvtsi2sdl -0x30(%rbp),%xmm0
cvtsi2sdl 0x10(%rbp),%xmm1
divsd  %xmm1,%xmm0
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    -0x20(%rbp),%ecx
imul   -0x1c(%rbp),%ecx
add    -0x28(%rbp),%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsd  %xmm0,(%rax,%rcx,8)
jmp    12ee <expandNewpop1D+0x1ce>
mov    -0x28(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x28(%rbp)
jmp    115e <expandNewpop1D+0x3e>
add    $0x30,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<expandNewpop1D>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
sub    $0x38,%rsp
mov    %r9d,(%rsp)
mov    %r8d,%r15d
mov    %ecx,%r12d
mov    %rdx,%rbp
mov    %rdi,%r13
lea    0x1(%r12),%esi
lea    0xeb6(%rip),%rdi
call   1040 <printf@plt>
test   %r15d,%r15d
jle    12c6 <expandNewpop1D+0x1a6>
mov    0x70(%rsp),%edx
cvtsi2sd %edx,%xmm0
movsd  %xmm0,0x10(%rsp)
mov    %r15d,%eax
mov    (%rsp),%ecx
xorps  %xmm0,%xmm0
cvtsi2sd %ecx,%xmm0
movsd  %xmm0,0x28(%rsp)
imul   %r12d,%eax
add    $0xffffffff,%r12d
imul   %r15d,%r12d
movslq %r12d,%rsi
mov    %rsi,0x18(%rsp)
cltq
mov    %rax,0x8(%rsp)
mov    %r15d,%eax
mov    %rax,0x30(%rsp)
sub    %edx,%ecx
mov    %ecx,0x4(%rsp)
xor    %r14d,%r14d
mov    %rbp,0x20(%rsp)
jmp    11cc <expandNewpop1D+0xac>
nopl   0x0(%rax)
divsd  0x28(%rsp),%xmm0
movsd  %xmm0,0x0(%r13,%r15,8)
add    $0x1,%r14
cmp    0x30(%rsp),%r14
je     12c6 <expandNewpop1D+0x1a6>
cmpl   $0x0,0x78(%rsp)
je     1260 <expandNewpop1D+0x140>
xor    %r12d,%r12d
test   %edx,%edx
jle    11ff <expandNewpop1D+0xdf>
mov    %edx,%ebx
xor    %eax,%eax
call   1030 <drand@plt>
movsd  0x0(%rbp,%r14,8),%xmm1
xor    %eax,%eax
ucomisd %xmm0,%xmm1
seta   %al
add    %eax,%r12d
add    $0xffffffff,%ebx
jne    11e0 <expandNewpop1D+0xc0>
xorps  %xmm0,%xmm0
cvtsi2sd %r12d,%xmm0
mov    0x8(%rsp),%rax
lea    (%r14,%rax,1),%r15
movapd %xmm0,%xmm1
divsd  0x10(%rsp),%xmm1
movsd  %xmm1,0x0(%rbp,%r14,8)
mov    0x70(%rsp),%edx
cmp    (%rsp),%edx
jge    11b0 <expandNewpop1D+0x90>
mov    0x4(%rsp),%ebx
xchg   %ax,%ax
xor    %eax,%eax
call   1030 <drand@plt>
movsd  0x0(%r13,%r15,8),%xmm1
xor    %eax,%eax
ucomisd %xmm0,%xmm1
seta   %al
add    %eax,%r12d
add    $0xffffffff,%ebx
jne    1230 <expandNewpop1D+0x110>
xorps  %xmm0,%xmm0
cvtsi2sd %r12d,%xmm0
mov    0x70(%rsp),%edx
jmp    11b0 <expandNewpop1D+0x90>
test   %edx,%edx
jle    12a0 <expandNewpop1D+0x180>
mov    0x18(%rsp),%rax
lea    (%r14,%rax,1),%r15
xor    %ebx,%ebx
mov    %edx,%ebp
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   0x0(%rax,%rax,1)
xor    %eax,%eax
call   1030 <drand@plt>
movsd  0x0(%r13,%r15,8),%xmm1
xor    %eax,%eax
ucomisd %xmm0,%xmm1
seta   %al
add    %eax,%ebx
add    $0xffffffff,%ebp
jne    1280 <expandNewpop1D+0x160>
jmp    12a2 <expandNewpop1D+0x182>
xor    %ebx,%ebx
xorps  %xmm0,%xmm0
cvtsi2sd %ebx,%xmm0
divsd  0x10(%rsp),%xmm0
mov    0x8(%rsp),%rax
lea    (%r14,%rax,1),%r15
mov    0x20(%rsp),%rbp
mov    0x70(%rsp),%edx
jmp    11b6 <expandNewpop1D+0x96>
add    $0x38,%rsp
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
@.str = [20 x i8] c"Expand new pop: %i\0A\00"
define void @expandNewpop1D(double* %0, double* %1, double* %2, i32 %3, i32 %4, i32 %5, i32 %6, i32 %7) {
%9 = alloca double*
%10 = alloca double*
%11 = alloca double*
%12 = alloca i32
%13 = alloca i32
%14 = alloca i32
%15 = alloca i32
%16 = alloca i32
%17 = alloca i32
%18 = alloca i32
%19 = alloca i32
store double* %0, double** %9
store double* %1, double** %10
store double* %2, double** %11
store i32 %3, i32* %12
store i32 %4, i32* %13
store i32 %5, i32* %14
store i32 %6, i32* %15
store i32 %7, i32* %16
%20 = load i32, i32* %12
%21 = add nsw i32 %20, 1
%22 = call i32 @printf(i8* getelementptr inbounds ([20 x i8], [20 x i8]* @.str, i64 0, i64 0), i32 %21)
store i32 0, i32* %17
br label %23
23: ; preds = %138, %8
%24 = load i32, i32* %17
%25 = load i32, i32* %13
%26 = icmp slt i32 %24, %25
br i1 %26, label %27, label %141
27: ; preds = %23
store i32 0, i32* %19
%28 = load i32, i32* %16
%29 = icmp ne i32 %28, 0
br i1 %29, label %30, label %98
30: ; preds = %27
store i32 0, i32* %18
br label %31
31: ; preds = %47, %30
%32 = load i32, i32* %18
%33 = load i32, i32* %15
%34 = icmp slt i32 %32, %33
br i1 %34, label %35, label %50
35: ; preds = %31
%36 = call double (...) @drand()
%37 = load double*, double** %11
%38 = load i32, i32* %17
%39 = sext i32 %38 to i64
%40 = getelementptr inbounds double, double* %37, i64 %39
%41 = load double, double* %40
%42 = fcmp olt double %36, %41
br i1 %42, label %43, label %46
43: ; preds = %35
%44 = load i32, i32* %19
%45 = add nsw i32 %44, 1
store i32 %45, i32* %19
br label %46
46: ; preds = %43, %35
br label %47
47: ; preds = %46
%48 = load i32, i32* %18
%49 = add nsw i32 %48, 1
store i32 %49, i32* %18
br label %31
50: ; preds = %31
%51 = load i32, i32* %19
%52 = sitofp i32 %51 to double
%53 = load i32, i32* %15
%54 = sitofp i32 %53 to double
%55 = fdiv double %52, %54
%56 = load double*, double** %11
%57 = load i32, i32* %17
%58 = sext i32 %57 to i64
%59 = getelementptr inbounds double, double* %56, i64 %58
store double %55, double* %59
%60 = load i32, i32* %15
store i32 %60, i32* %18
br label %61
61: ; preds = %81, %50
%62 = load i32, i32* %18
%63 = load i32, i32* %14
%64 = icmp slt i32 %62, %63
br i1 %64, label %65, label %84
65: ; preds = %61
%66 = call double (...) @drand()
%67 = load double*, double** %9
%68 = load i32, i32* %13
%69 = load i32, i32* %12
%70 = mul nsw i32 %68, %69
%71 = load i32, i32* %17
%72 = add nsw i32 %70, %71
%73 = sext i32 %72 to i64
%74 = getelementptr inbounds double, double* %67, i64 %73
%75 = load double, double* %74
%76 = fcmp olt double %66, %75
br i1 %76, label %77, label %80
77: ; preds = %65
%78 = load i32, i32* %19
%79 = add nsw i32 %78, 1
store i32 %79, i32* %19
br label %80
80: ; preds = %77, %65
br label %81
81: ; preds = %80
%82 = load i32, i32* %18
%83 = add nsw i32 %82, 1
store i32 %83, i32* %18
br label %61
84: ; preds = %61
%85 = load i32, i32* %19
%86 = sitofp i32 %85 to double
%87 = load i32, i32* %14
%88 = sitofp i32 %87 to double
%89 = fdiv double %86, %88
%90 = load double*, double** %9
%91 = load i32, i32* %13
%92 = load i32, i32* %12
%93 = mul nsw i32 %91, %92
%94 = load i32, i32* %17
%95 = add nsw i32 %93, %94
%96 = sext i32 %95 to i64
%97 = getelementptr inbounds double, double* %90, i64 %96
store double %89, double* %97
br label %137
98: ; preds = %27
store i32 0, i32* %18
br label %99
99: ; preds = %120, %98
%100 = load i32, i32* %18
%101 = load i32, i32* %15
%102 = icmp slt i32 %100, %101
br i1 %102, label %103, label %123
103: ; preds = %99
%104 = call double (...) @drand()
%105 = load double*, double** %9
%106 = load i32, i32* %13
%107 = load i32, i32* %12
%108 = sub nsw i32 %107, 1
%109 = mul nsw i32 %106, %108
%110 = load i32, i32* %17
%111 = add nsw i32 %109, %110
%112 = sext i32 %111 to i64
%113 = getelementptr inbounds double, double* %105, i64 %112
%114 = load double, double* %113
%115 = fcmp olt double %104, %114
br i1 %115, label %116, label %119
116: ; preds = %103
%117 = load i32, i32* %19
%118 = add nsw i32 %117, 1
store i32 %118, i32* %19
br label %119
119: ; preds = %116, %103
br label %120
120: ; preds = %119
%121 = load i32, i32* %18
%122 = add nsw i32 %121, 1
store i32 %122, i32* %18
br label %99
123: ; preds = %99
%124 = load i32, i32* %19
%125 = sitofp i32 %124 to double
%126 = load i32, i32* %15
%127 = sitofp i32 %126 to double
%128 = fdiv double %125, %127
%129 = load double*, double** %9
%130 = load i32, i32* %13
%131 = load i32, i32* %12
%132 = mul nsw i32 %130, %131
%133 = load i32, i32* %17
%134 = add nsw i32 %132, %133
%135 = sext i32 %134 to i64
%136 = getelementptr inbounds double, double* %129, i64 %135
store double %128, double* %136
br label %137
137: ; preds = %123, %84
br label %138
138: ; preds = %137
%139 = load i32, i32* %17
%140 = add nsw i32 %139, 1
store i32 %140, i32* %17
br label %23
141: ; preds = %23
ret void
}

LLVM IR (-O2):
@.str = [20 x i8] c"Expand new pop: %i\0A\00"
define void @expandNewpop1D(double* nocapture %0, double* nocapture readnone %1, double* nocapture %2, i32 %3, i32 %4, i32 %5, i32 %6, i32 %7) {
%9 = add nsw i32 %3, 1
%10 = tail call i32 @printf(i8* getelementptr inbounds ([20 x i8], [20 x i8]* @.str, i64 0, i64 0), i32 %9)
%11 = icmp sgt i32 %4, 0
br i1 %11, label %12, label %87
12: ; preds = %8
%13 = icmp eq i32 %7, 0
%14 = icmp sgt i32 %6, 0
%15 = sitofp i32 %6 to double
%16 = icmp slt i32 %6, %5
%17 = mul nsw i32 %4, %3
%18 = sitofp i32 %5 to double
%19 = add nsw i32 %3, -1
%20 = mul nsw i32 %19, %4
%21 = sext i32 %20 to i64
%22 = sext i32 %17 to i64
%23 = zext i32 %4 to i64
br label %24
24: ; preds = %12, %81
%25 = phi i64 [ 0, %12 ], [ %85, %81 ]
br i1 %13, label %29, label %26
26: ; preds = %24
br i1 %14, label %27, label %43
27: ; preds = %26
%28 = getelementptr inbounds double, double* %2, i64 %25
br label %33
29: ; preds = %24
br i1 %14, label %30, label %76
30: ; preds = %29
%31 = add nsw i64 %25, %21
%32 = getelementptr inbounds double, double* %0, i64 %31
br label %66
33: ; preds = %27, %33
%34 = phi i32 [ 0, %27 ], [ %40, %33 ]
%35 = phi i32 [ 0, %27 ], [ %41, %33 ]
%36 = tail call double (...) @drand()
%37 = load double, double* %28
%38 = fcmp olt double %36, %37
%39 = zext i1 %38 to i32
%40 = add nuw nsw i32 %34, %39
%41 = add nuw nsw i32 %35, 1
%42 = icmp eq i32 %41, %6
br i1 %42, label %43, label %33
43: ; preds = %33, %26
%44 = phi i32 [ 0, %26 ], [ %40, %33 ]
%45 = sitofp i32 %44 to double
%46 = fdiv double %45, %15
%47 = getelementptr inbounds double, double* %2, i64 %25
store double %46, double* %47
%48 = add nsw i64 %25, %22
br i1 %16, label %49, label %63
49: ; preds = %43
%50 = getelementptr inbounds double, double* %0, i64 %48
br label %51
51: ; preds = %49, %51
%52 = phi i32 [ %44, %49 ], [ %58, %51 ]
%53 = phi i32 [ %6, %49 ], [ %59, %51 ]
%54 = tail call double (...) @drand()
%55 = load double, double* %50
%56 = fcmp olt double %54, %55
%57 = zext i1 %56 to i32
%58 = add nuw nsw i32 %52, %57
%59 = add i32 %53, 1
%60 = icmp eq i32 %59, %5
br i1 %60, label %61, label %51
61: ; preds = %51
%62 = sitofp i32 %58 to double
br label %63
63: ; preds = %43, %61
%64 = phi double [ %62, %61 ], [ %45, %43 ]
%65 = fdiv double %64, %18
br label %81
66: ; preds = %30, %66
%67 = phi i32 [ 0, %30 ], [ %73, %66 ]
%68 = phi i32 [ 0, %30 ], [ %74, %66 ]
%69 = tail call double (...) @drand()
%70 = load double, double* %32
%71 = fcmp olt double %69, %70
%72 = zext i1 %71 to i32
%73 = add nuw nsw i32 %67, %72
%74 = add nuw nsw i32 %68, 1
%75 = icmp eq i32 %74, %6
br i1 %75, label %76, label %66
76: ; preds = %66, %29
%77 = phi i32 [ 0, %29 ], [ %73, %66 ]
%78 = sitofp i32 %77 to double
%79 = fdiv double %78, %15
%80 = add nsw i64 %25, %22
br label %81
81: ; preds = %63, %76
%82 = phi i64 [ %48, %63 ], [ %80, %76 ]
%83 = phi double [ %65, %63 ], [ %79, %76 ]
%84 = getelementptr inbounds double, double* %0, i64 %82
store double %83, double* %84
%85 = add nuw nsw i64 %25, 1
%86 = icmp eq i64 %85, %23
br i1 %86, label %87, label %24
87: ; preds = %81, %8
ret void
}