int BCHECK_SCORE(const unsigned char *A, const unsigned char *B, int M, int N,
                 int *S, int **w, int g, int h, int *nres) {
  register int i, j, op, nc;
  int *Ssave;
  int score;
  score = i = j = op = nc = 0;
  Ssave = S;
  while (i < M || j < N) {
    op = *S++;
    if (op == 0) {
      score = w[A[++i]][B[++j]] + score;
      nc++;
    } else if (op > 0) {
      score = score - (g + op * h);
      j += op;
      nc += op;
    } else {
      score = score - (g - op * h);
      i -= op;
      nc -= op;
    }
  }
  *nres = nc;
  return score;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<BCHECK_SCORE>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    0x20(%rbp),%rax
mov    0x18(%rbp),%eax
mov    0x10(%rbp),%eax
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %edx,-0x14(%rbp)
mov    %ecx,-0x18(%rbp)
mov    %r8,-0x20(%rbp)
mov    %r9,-0x28(%rbp)
movl   $0x0,-0x38(%rbp)
movl   $0x0,-0x34(%rbp)
movl   $0x0,-0x30(%rbp)
movl   $0x0,-0x2c(%rbp)
movl   $0x0,-0x44(%rbp)
mov    -0x20(%rbp),%rax
mov    %rax,-0x40(%rbp)
mov    -0x2c(%rbp),%ecx
mov    $0x1,%al
cmp    -0x14(%rbp),%ecx
mov    %al,-0x45(%rbp)
jl     116c <BCHECK_SCORE+0x6c>
mov    -0x30(%rbp),%eax
cmp    -0x18(%rbp),%eax
setl   %al
mov    %al,-0x45(%rbp)
mov    -0x45(%rbp),%al
test   $0x1,%al
jne    117c <BCHECK_SCORE+0x7c>
jmp    124a <BCHECK_SCORE+0x14a>
mov    -0x20(%rbp),%rax
mov    %rax,%rcx
add    $0x4,%rcx
mov    %rcx,-0x20(%rbp)
mov    (%rax),%eax
mov    %eax,-0x34(%rbp)
cmpl   $0x0,-0x34(%rbp)
jne    11e1 <BCHECK_SCORE+0xe1>
mov    -0x28(%rbp),%rax
mov    -0x8(%rbp),%rcx
mov    -0x2c(%rbp),%edx
add    $0x1,%edx
mov    %edx,-0x2c(%rbp)
movslq %edx,%rdx
movzbl (%rcx,%rdx,1),%ecx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
mov    -0x10(%rbp),%rcx
mov    -0x30(%rbp),%edx
add    $0x1,%edx
mov    %edx,-0x30(%rbp)
movslq %edx,%rdx
movzbl (%rcx,%rdx,1),%ecx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
add    -0x44(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x44(%rbp)
mov    -0x38(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x38(%rbp)
jmp    1245 <BCHECK_SCORE+0x145>
cmpl   $0x0,-0x34(%rbp)
jle    1216 <BCHECK_SCORE+0x116>
mov    -0x44(%rbp),%eax
mov    0x10(%rbp),%ecx
mov    -0x34(%rbp),%edx
imul   0x18(%rbp),%edx
add    %edx,%ecx
sub    %ecx,%eax
mov    %eax,-0x44(%rbp)
mov    -0x34(%rbp),%eax
add    -0x30(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x30(%rbp)
mov    -0x34(%rbp),%eax
add    -0x38(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x38(%rbp)
jmp    1240 <BCHECK_SCORE+0x140>
mov    -0x44(%rbp),%eax
mov    0x10(%rbp),%ecx
mov    -0x34(%rbp),%edx
imul   0x18(%rbp),%edx
sub    %edx,%ecx
sub    %ecx,%eax
mov    %eax,-0x44(%rbp)
mov    -0x34(%rbp),%ecx
mov    -0x2c(%rbp),%eax
sub    %ecx,%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
mov    -0x34(%rbp),%ecx
mov    -0x38(%rbp),%eax
sub    %ecx,%eax
mov    %eax,-0x38(%rbp)
jmp    1245 <BCHECK_SCORE+0x145>
jmp    114f <BCHECK_SCORE+0x4f>
mov    -0x38(%rbp),%ecx
mov    0x20(%rbp),%rax
mov    %ecx,(%rax)
mov    -0x44(%rbp),%eax
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<BCHECK_SCORE>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
mov    0x48(%rsp),%r10
test   %edx,%edx
jg     1123 <BCHECK_SCORE+0x23>
xor    %r11d,%r11d
mov    $0x0,%eax
test   %ecx,%ecx
jle    11a9 <BCHECK_SCORE+0xa9>
mov    0x40(%rsp),%r14d
mov    0x38(%rsp),%r15d
xor    %eax,%eax
xor    %r11d,%r11d
xor    %r12d,%r12d
xor    %r13d,%r13d
nopl   0x0(%rax,%rax,1)
mov    (%r8),%ebx
test   %ebx,%ebx
je     1160 <BCHECK_SCORE+0x60>
mov    %ebx,%ebp
imul   %r14d,%ebp
test   %ebx,%ebx
jle    1190 <BCHECK_SCORE+0x90>
add    %r15d,%ebp
sub    %ebp,%eax
add    %ebx,%r12d
add    %ebx,%r11d
jmp    119b <BCHECK_SCORE+0x9b>
xchg   %ax,%ax
movslq %r13d,%r13
movzbl 0x1(%rdi,%r13,1),%ebx
add    $0x1,%r13
mov    (%r9,%rbx,8),%rbx
movslq %r12d,%r12
movzbl 0x1(%rsi,%r12,1),%ebp
add    $0x1,%r12
add    (%rbx,%rbp,4),%eax
add    $0x1,%r11d
jmp    119b <BCHECK_SCORE+0x9b>
nopw   0x0(%rax,%rax,1)
sub    %r15d,%eax
add    %ebp,%eax
sub    %ebx,%r13d
sub    %ebx,%r11d
add    $0x4,%r8
cmp    %edx,%r13d
jl     1140 <BCHECK_SCORE+0x40>
cmp    %ecx,%r12d
jl     1140 <BCHECK_SCORE+0x40>
mov    %r11d,(%r10)
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define i32 @BCHECK_SCORE(i8* %0, i8* %1, i32 %2, i32 %3, i32* %4, i32** %5, i32 %6, i32 %7, i32* %8) {
%10 = alloca i8*
%11 = alloca i8*
%12 = alloca i32
%13 = alloca i32
%14 = alloca i32*
%15 = alloca i32**
%16 = alloca i32
%17 = alloca i32
%18 = alloca i32*
%19 = alloca i32
%20 = alloca i32
%21 = alloca i32
%22 = alloca i32
%23 = alloca i32*
%24 = alloca i32
store i8* %0, i8** %10
store i8* %1, i8** %11
store i32 %2, i32* %12
store i32 %3, i32* %13
store i32* %4, i32** %14
store i32** %5, i32*** %15
store i32 %6, i32* %16
store i32 %7, i32* %17
store i32* %8, i32** %18
store i32 0, i32* %22
store i32 0, i32* %21
store i32 0, i32* %20
store i32 0, i32* %19
store i32 0, i32* %24
%25 = load i32*, i32** %14
store i32* %25, i32** %23
br label %26
26: ; preds = %98, %9
%27 = load i32, i32* %19
%28 = load i32, i32* %12
%29 = icmp slt i32 %27, %28
br i1 %29, label %34, label %30
30: ; preds = %26
%31 = load i32, i32* %20
%32 = load i32, i32* %13
%33 = icmp slt i32 %31, %32
br label %34
34: ; preds = %30, %26
%35 = phi i1 [ true, %26 ], [ %33, %30 ]
br i1 %35, label %36, label %99
36: ; preds = %34
%37 = load i32*, i32** %14
%38 = getelementptr inbounds i32, i32* %37, i32 1
store i32* %38, i32** %14
%39 = load i32, i32* %37
store i32 %39, i32* %21
%40 = load i32, i32* %21
%41 = icmp eq i32 %40, 0
br i1 %41, label %42, label %66
42: ; preds = %36
%43 = load i32**, i32*** %15
%44 = load i8*, i8** %10
%45 = load i32, i32* %19
%46 = add nsw i32 %45, 1
store i32 %46, i32* %19
%47 = sext i32 %46 to i64
%48 = getelementptr inbounds i8, i8* %44, i64 %47
%49 = load i8, i8* %48
%50 = zext i8 %49 to i64
%51 = getelementptr inbounds i32*, i32** %43, i64 %50
%52 = load i32*, i32** %51
%53 = load i8*, i8** %11
%54 = load i32, i32* %20
%55 = add nsw i32 %54, 1
store i32 %55, i32* %20
%56 = sext i32 %55 to i64
%57 = getelementptr inbounds i8, i8* %53, i64 %56
%58 = load i8, i8* %57
%59 = zext i8 %58 to i64
%60 = getelementptr inbounds i32, i32* %52, i64 %59
%61 = load i32, i32* %60
%62 = load i32, i32* %24
%63 = add nsw i32 %61, %62
store i32 %63, i32* %24
%64 = load i32, i32* %22
%65 = add nsw i32 %64, 1
store i32 %65, i32* %22
br label %98
66: ; preds = %36
%67 = load i32, i32* %21
%68 = icmp sgt i32 %67, 0
br i1 %68, label %69, label %83
69: ; preds = %66
%70 = load i32, i32* %24
%71 = load i32, i32* %16
%72 = load i32, i32* %21
%73 = load i32, i32* %17
%74 = mul nsw i32 %72, %73
%75 = add nsw i32 %71, %74
%76 = sub nsw i32 %70, %75
store i32 %76, i32* %24
%77 = load i32, i32* %21
%78 = load i32, i32* %20
%79 = add nsw i32 %78, %77
store i32 %79, i32* %20
%80 = load i32, i32* %21
%81 = load i32, i32* %22
%82 = add nsw i32 %81, %80
store i32 %82, i32* %22
br label %97
83: ; preds = %66
%84 = load i32, i32* %24
%85 = load i32, i32* %16
%86 = load i32, i32* %21
%87 = load i32, i32* %17
%88 = mul nsw i32 %86, %87
%89 = sub nsw i32 %85, %88
%90 = sub nsw i32 %84, %89
store i32 %90, i32* %24
%91 = load i32, i32* %21
%92 = load i32, i32* %19
%93 = sub nsw i32 %92, %91
store i32 %93, i32* %19
%94 = load i32, i32* %21
%95 = load i32, i32* %22
%96 = sub nsw i32 %95, %94
store i32 %96, i32* %22
br label %97
97: ; preds = %83, %69
br label %98
98: ; preds = %97, %42
br label %26
99: ; preds = %34
%100 = load i32, i32* %22
%101 = load i32*, i32** %18
store i32 %100, i32* %101
%102 = load i32, i32* %24
ret i32 %102
}

LLVM IR (-O2):
define i32 @BCHECK_SCORE(i8* nocapture %0, i8* nocapture %1, i32 %2, i32 %3, i32* nocapture %4, i32** nocapture %5, i32 %6, i32 %7, i32* nocapture writeonly %8) {
%10 = icmp sgt i32 %2, 0
%11 = icmp sgt i32 %3, 0
%12 = or i1 %10, %11
br i1 %12, label %13, label %60
13: ; preds = %9, %52
%14 = phi i32 [ %56, %52 ], [ 0, %9 ]
%15 = phi i32* [ %19, %52 ], [ %4, %9 ]
%16 = phi i32 [ %55, %52 ], [ 0, %9 ]
%17 = phi i32 [ %54, %52 ], [ 0, %9 ]
%18 = phi i32 [ %53, %52 ], [ 0, %9 ]
%19 = getelementptr inbounds i32, i32* %15, i64 1
%20 = load i32, i32* %15
%21 = icmp eq i32 %20, 0
br i1 %21, label %22, label %39
22: ; preds = %13
%23 = add nsw i32 %18, 1
%24 = sext i32 %23 to i64
%25 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %24
%26 = load i8, i8* %25
%27 = zext i8 %26 to i64
%28 = getelementptr inbounds i32*, i32** %5, i64 %27
%29 = load i32*, i32** %28
%30 = add nsw i32 %17, 1
%31 = sext i32 %30 to i64
%32 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %31
%33 = load i8, i8* %32
%34 = zext i8 %33 to i64
%35 = getelementptr inbounds i32, i32* %29, i64 %34
%36 = load i32, i32* %35
%37 = add nsw i32 %36, %14
%38 = add nsw i32 %16, 1
br label %52
39: ; preds = %13
%40 = icmp sgt i32 %20, 0
%41 = mul nsw i32 %20, %7
br i1 %40, label %42, label %47
42: ; preds = %39
%43 = add i32 %41, %6
%44 = sub i32 %14, %43
%45 = add nsw i32 %20, %17
%46 = add nsw i32 %20, %16
br label %52
47: ; preds = %39
%48 = sub i32 %14, %6
%49 = add i32 %48, %41
%50 = sub nsw i32 %18, %20
%51 = sub nsw i32 %16, %20
br label %52
52: ; preds = %42, %47, %22
%53 = phi i32 [ %23, %22 ], [ %18, %42 ], [ %50, %47 ]
%54 = phi i32 [ %30, %22 ], [ %45, %42 ], [ %17, %47 ]
%55 = phi i32 [ %38, %22 ], [ %46, %42 ], [ %51, %47 ]
%56 = phi i32 [ %37, %22 ], [ %44, %42 ], [ %49, %47 ]
%57 = icmp slt i32 %53, %2
%58 = icmp slt i32 %54, %3
%59 = select i1 %57, i1 true, i1 %58
br i1 %59, label %13, label %60
60: ; preds = %52, %9
%61 = phi i32 [ 0, %9 ], [ %55, %52 ]
%62 = phi i32 [ 0, %9 ], [ %56, %52 ]
store i32 %61, i32* %8
ret i32 %62
}