void init_weights(int **weights, int num_genes) {
  int i, j;
  int lim;
  lim = 2 * num_genes;
  for (i = 0; i < lim; i++) {
    for (j = i + 1; j < lim; j++) {
      if ((j == i + num_genes) || (i == j + num_genes)) {
        weights[i][j] = -3000;
        weights[j][i] = -3000;
      } else {
        weights[i][j] = 3;
        weights[j][i] = 3;
      }
    }
  }
  for (i = 0; i < lim; i++)
    weights[i][i] = 3000;
  return;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<init_weights>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %esi,-0xc(%rbp)
mov    -0xc(%rbp),%eax
shl    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x18(%rbp)
movl   $0x0,-0x10(%rbp)
mov    -0x10(%rbp),%eax
cmp    -0x18(%rbp),%eax
jge    11e5 <init_weights+0xe5>
mov    -0x10(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x14(%rbp)
mov    -0x14(%rbp),%eax
cmp    -0x18(%rbp),%eax
jge    11d2 <init_weights+0xd2>
mov    -0x14(%rbp),%eax
mov    -0x10(%rbp),%ecx
add    -0xc(%rbp),%ecx
cmp    %ecx,%eax
je     115e <init_weights+0x5e>
mov    -0x10(%rbp),%eax
mov    -0x14(%rbp),%ecx
add    -0xc(%rbp),%ecx
cmp    %ecx,%eax
jne    1191 <init_weights+0x91>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x10(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x14(%rbp),%rcx
movl   $0xfffff448,(%rax,%rcx,4)
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x14(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x10(%rbp),%rcx
movl   $0xfffff448,(%rax,%rcx,4)
jmp    11bf <init_weights+0xbf>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x10(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x14(%rbp),%rcx
movl   $0x3,(%rax,%rcx,4)
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x14(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x10(%rbp),%rcx
movl   $0x3,(%rax,%rcx,4)
jmp    11c4 <init_weights+0xc4>
mov    -0x14(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x14(%rbp)
jmp    1130 <init_weights+0x30>
jmp    11d7 <init_weights+0xd7>
mov    -0x10(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x10(%rbp)
jmp    111b <init_weights+0x1b>
movl   $0x0,-0x10(%rbp)
mov    -0x10(%rbp),%eax
cmp    -0x18(%rbp),%eax
jge    121d <init_weights+0x11d>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x10(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x10(%rbp),%rcx
movl   $0xbb8,(%rax,%rcx,4)
mov    -0x10(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x10(%rbp)
jmp    11ec <init_weights+0xec>
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<init_weights>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
test   %esi,%esi
jle    1215 <init_weights+0x115>
lea    (%rsi,%rsi,1),%eax
movslq %eax,%r9
cmp    $0x2,%r9d
mov    $0x1,%r8d
cmovge %r9d,%r8d
mov    %r9d,%r14d
lea    0x1(%rsi),%r15d
add    $0xffffffffffffffff,%r14
xor    %r10d,%r10d
mov    $0xfffff448,%r12d
mov    %esi,%r11d
jmp    1149 <init_weights+0x49>
nop
add    $0x1,%r11d
cmp    %r8,%r10
je     119e <init_weights+0x9e>
mov    %r10,%rcx
add    $0x1,%r10
cmp    %r9,%r10
jge    1140 <init_weights+0x40>
mov    %r11d,%r13d
add    $0xffffffffffffffff,%r13
mov    (%rdi,%rcx,8),%rax
mov    %rcx,%rbx
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   (%rax)
lea    (%r15,%rbx,1),%ebp
cmp    %rbp,%rcx
mov    $0x3,%ebp
cmove  %r12d,%ebp
cmp    %rbx,%r13
cmove  %r12d,%ebp
mov    %ebp,0x4(%rax,%rbx,4)
mov    0x8(%rdi,%rbx,8),%rdx
mov    %ebp,(%rdx,%rcx,4)
add    $0x1,%rbx
cmp    %rbx,%r14
jne    1170 <init_weights+0x70>
jmp    1140 <init_weights+0x40>
test   %esi,%esi
jle    1215 <init_weights+0x115>
lea    -0x1(%r8),%rax
mov    %r8d,%ecx
and    $0x3,%ecx
cmp    $0x3,%rax
jae    11b6 <init_weights+0xb6>
xor    %eax,%eax
jmp    11fb <init_weights+0xfb>
and    $0x7ffffffc,%r8d
xor    %eax,%eax
nop
mov    (%rdi,%rax,8),%rdx
movl   $0xbb8,(%rdx,%rax,4)
mov    0x8(%rdi,%rax,8),%rdx
movl   $0xbb8,0x4(%rdx,%rax,4)
mov    0x10(%rdi,%rax,8),%rdx
movl   $0xbb8,0x8(%rdx,%rax,4)
mov    0x18(%rdi,%rax,8),%rdx
movl   $0xbb8,0xc(%rdx,%rax,4)
add    $0x4,%rax
cmp    %rax,%r8
jne    11c0 <init_weights+0xc0>
test   %rcx,%rcx
je     1215 <init_weights+0x115>
mov    (%rdi,%rax,8),%rdx
movl   $0xbb8,(%rdx,%rax,4)
add    $0x1,%rax
add    $0xffffffffffffffff,%rcx
jne    1200 <init_weights+0x100>
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define void @init_weights(i32** %0, i32 %1) {
%3 = alloca i32**
%4 = alloca i32
%5 = alloca i32
%6 = alloca i32
%7 = alloca i32
store i32** %0, i32*** %3
store i32 %1, i32* %4
%8 = load i32, i32* %4
%9 = mul nsw i32 2, %8
store i32 %9, i32* %7
store i32 0, i32* %5
br label %10
10: ; preds = %72, %2
%11 = load i32, i32* %5
%12 = load i32, i32* %7
%13 = icmp slt i32 %11, %12
br i1 %13, label %14, label %75
14: ; preds = %10
%15 = load i32, i32* %5
%16 = add nsw i32 %15, 1
store i32 %16, i32* %6
br label %17
17: ; preds = %68, %14
%18 = load i32, i32* %6
%19 = load i32, i32* %7
%20 = icmp slt i32 %18, %19
br i1 %20, label %21, label %71
21: ; preds = %17
%22 = load i32, i32* %6
%23 = load i32, i32* %5
%24 = load i32, i32* %4
%25 = add nsw i32 %23, %24
%26 = icmp eq i32 %22, %25
br i1 %26, label %33, label %27
27: ; preds = %21
%28 = load i32, i32* %5
%29 = load i32, i32* %6
%30 = load i32, i32* %4
%31 = add nsw i32 %29, %30
%32 = icmp eq i32 %28, %31
br i1 %32, label %33, label %50
33: ; preds = %27, %21
%34 = load i32**, i32*** %3
%35 = load i32, i32* %5
%36 = sext i32 %35 to i64
%37 = getelementptr inbounds i32*, i32** %34, i64 %36
%38 = load i32*, i32** %37
%39 = load i32, i32* %6
%40 = sext i32 %39 to i64
%41 = getelementptr inbounds i32, i32* %38, i64 %40
store i32 -3000, i32* %41
%42 = load i32**, i32*** %3
%43 = load i32, i32* %6
%44 = sext i32 %43 to i64
%45 = getelementptr inbounds i32*, i32** %42, i64 %44
%46 = load i32*, i32** %45
%47 = load i32, i32* %5
%48 = sext i32 %47 to i64
%49 = getelementptr inbounds i32, i32* %46, i64 %48
store i32 -3000, i32* %49
br label %67
50: ; preds = %27
%51 = load i32**, i32*** %3
%52 = load i32, i32* %5
%53 = sext i32 %52 to i64
%54 = getelementptr inbounds i32*, i32** %51, i64 %53
%55 = load i32*, i32** %54
%56 = load i32, i32* %6
%57 = sext i32 %56 to i64
%58 = getelementptr inbounds i32, i32* %55, i64 %57
store i32 3, i32* %58
%59 = load i32**, i32*** %3
%60 = load i32, i32* %6
%61 = sext i32 %60 to i64
%62 = getelementptr inbounds i32*, i32** %59, i64 %61
%63 = load i32*, i32** %62
%64 = load i32, i32* %5
%65 = sext i32 %64 to i64
%66 = getelementptr inbounds i32, i32* %63, i64 %65
store i32 3, i32* %66
br label %67
67: ; preds = %50, %33
br label %68
68: ; preds = %67
%69 = load i32, i32* %6
%70 = add nsw i32 %69, 1
store i32 %70, i32* %6
br label %17
71: ; preds = %17
br label %72
72: ; preds = %71
%73 = load i32, i32* %5
%74 = add nsw i32 %73, 1
store i32 %74, i32* %5
br label %10
75: ; preds = %10
store i32 0, i32* %5
br label %76
76: ; preds = %89, %75
%77 = load i32, i32* %5
%78 = load i32, i32* %7
%79 = icmp slt i32 %77, %78
br i1 %79, label %80, label %92
80: ; preds = %76
%81 = load i32**, i32*** %3
%82 = load i32, i32* %5
%83 = sext i32 %82 to i64
%84 = getelementptr inbounds i32*, i32** %81, i64 %83
%85 = load i32*, i32** %84
%86 = load i32, i32* %5
%87 = sext i32 %86 to i64
%88 = getelementptr inbounds i32, i32* %85, i64 %87
store i32 3000, i32* %88
br label %89
89: ; preds = %80
%90 = load i32, i32* %5
%91 = add nsw i32 %90, 1
store i32 %91, i32* %5
br label %76
92: ; preds = %76
ret void
}

LLVM IR (-O2):
define void @init_weights(i32** nocapture %0, i32 %1) {
%3 = shl i32 %1, 1
%4 = icmp sgt i32 %1, 0
br i1 %4, label %5, label %79
5: ; preds = %2
%6 = sext i32 %3 to i64
%7 = call i32 @llvm.smax.i32(i32 %3, i32 1)
%8 = zext i32 %7 to i64
%9 = zext i32 %3 to i64
br label %20
10: ; preds = %31, %20
%11 = add nuw nsw i64 %22, 1
%12 = icmp eq i64 %23, %8
br i1 %12, label %13, label %20
13: ; preds = %10
br i1 %4, label %14, label %79
14: ; preds = %13
%15 = add nsw i64 %8, -1
%16 = and i64 %8, 3
%17 = icmp ult i64 %15, 3
br i1 %17, label %67, label %18
18: ; preds = %14
%19 = and i64 %8, 2147483644
br label %46
20: ; preds = %5, %10
%21 = phi i64 [ 0, %5 ], [ %23, %10 ]
%22 = phi i64 [ 1, %5 ], [ %11, %10 ]
%23 = add nuw nsw i64 %21, 1
%24 = icmp slt i64 %23, %6
br i1 %24, label %25, label %10
25: ; preds = %20
%26 = trunc i64 %21 to i32
%27 = add nsw i32 %26, %1
%28 = getelementptr inbounds i32*, i32** %0, i64 %21
%29 = zext i32 %27 to i64
%30 = load i32*, i32** %28
br label %31
31: ; preds = %25, %31
%32 = phi i64 [ %22, %25 ], [ %44, %31 ]
%33 = trunc i64 %32 to i32
%34 = icmp eq i64 %32, %29
%35 = add nsw i32 %33, %1
%36 = zext i32 %35 to i64
%37 = icmp eq i64 %21, %36
%38 = select i1 %34, i1 true, i1 %37
%39 = getelementptr inbounds i32, i32* %30, i64 %32
%40 = select i1 %38, i32 -3000, i32 3
store i32 %40, i32* %39
%41 = getelementptr inbounds i32*, i32** %0, i64 %32
%42 = load i32*, i32** %41
%43 = getelementptr inbounds i32, i32* %42, i64 %21
store i32 %40, i32* %43
%44 = add nuw nsw i64 %32, 1
%45 = icmp eq i64 %44, %9
br i1 %45, label %10, label %31
46: ; preds = %46, %18
%47 = phi i64 [ 0, %18 ], [ %64, %46 ]
%48 = phi i64 [ 0, %18 ], [ %65, %46 ]
%49 = getelementptr inbounds i32*, i32** %0, i64 %47
%50 = load i32*, i32** %49
%51 = getelementptr inbounds i32, i32* %50, i64 %47
store i32 3000, i32* %51
%52 = or i64 %47, 1
%53 = getelementptr inbounds i32*, i32** %0, i64 %52
%54 = load i32*, i32** %53
%55 = getelementptr inbounds i32, i32* %54, i64 %52
store i32 3000, i32* %55
%56 = or i64 %47, 2
%57 = getelementptr inbounds i32*, i32** %0, i64 %56
%58 = load i32*, i32** %57
%59 = getelementptr inbounds i32, i32* %58, i64 %56
store i32 3000, i32* %59
%60 = or i64 %47, 3
%61 = getelementptr inbounds i32*, i32** %0, i64 %60
%62 = load i32*, i32** %61
%63 = getelementptr inbounds i32, i32* %62, i64 %60
store i32 3000, i32* %63
%64 = add nuw nsw i64 %47, 4
%65 = add i64 %48, 4
%66 = icmp eq i64 %65, %19
br i1 %66, label %67, label %46
67: ; preds = %46, %14
%68 = phi i64 [ 0, %14 ], [ %64, %46 ]
%69 = icmp eq i64 %16, 0
br i1 %69, label %79, label %70
70: ; preds = %67, %70
%71 = phi i64 [ %76, %70 ], [ %68, %67 ]
%72 = phi i64 [ %77, %70 ], [ 0, %67 ]
%73 = getelementptr inbounds i32*, i32** %0, i64 %71
%74 = load i32*, i32** %73
%75 = getelementptr inbounds i32, i32* %74, i64 %71
store i32 3000, i32* %75
%76 = add nuw nsw i64 %71, 1
%77 = add i64 %72, 1
%78 = icmp eq i64 %77, %16
br i1 %78, label %79, label %70
79: ; preds = %67, %70, %2, %13
ret void
}