int ga_compare_chromosomes_unsigned(const unsigned *k1, const unsigned *k2,
                                    const unsigned size) {
  int count = 0;
  for (int i = 0; i < size; i++) {
    for (int j = 0; j < size; j++) {
      if (k1[i] == k2[j]) {
        count++;
        break;
      }
    }
  }
  return size - count;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<ga_compare_chromosomes_unsigned>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %edx,-0x14(%rbp)
movl   $0x0,-0x18(%rbp)
movl   $0x0,-0x1c(%rbp)
mov    -0x1c(%rbp),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
jae    118c <ga_compare_chromosomes_unsigned+0x8c>
movl   $0x0,-0x20(%rbp)
mov    -0x20(%rbp),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
jae    1179 <ga_compare_chromosomes_unsigned+0x79>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    -0x10(%rbp),%rcx
movslq -0x20(%rbp),%rdx
cmp    (%rcx,%rdx,4),%eax
jne    1166 <ga_compare_chromosomes_unsigned+0x66>
mov    -0x18(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x18(%rbp)
jmp    1179 <ga_compare_chromosomes_unsigned+0x79>
jmp    116b <ga_compare_chromosomes_unsigned+0x6b>
mov    -0x20(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x20(%rbp)
jmp    1130 <ga_compare_chromosomes_unsigned+0x30>
jmp    117e <ga_compare_chromosomes_unsigned+0x7e>
mov    -0x1c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
jmp    111d <ga_compare_chromosomes_unsigned+0x1d>
mov    -0x14(%rbp),%eax
sub    -0x18(%rbp),%eax
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<ga_compare_chromosomes_unsigned>:
mov    %edx,%eax
test   %edx,%edx
je     1136 <ga_compare_chromosomes_unsigned+0x36>
mov    %eax,%r11d
cmp    $0x1,%eax
jne    113d <ga_compare_chromosomes_unsigned+0x3d>
xor    %r10d,%r10d
xor    %r8d,%r8d
test   $0x1,%r11b
je     1132 <ga_compare_chromosomes_unsigned+0x32>
mov    (%rdi,%r10,4),%edx
xor    %edi,%edi
cmp    (%rsi,%rdi,4),%edx
je     11b0 <ga_compare_chromosomes_unsigned+0xb0>
add    $0x1,%rdi
cmp    %rdi,%r11
jne    1120 <ga_compare_chromosomes_unsigned+0x20>
sub    %r8d,%eax
ret
xor    %r8d,%r8d
sub    %r8d,%eax
ret
mov    %r11d,%r9d
and    $0xfffffffe,%r9d
xor    %r10d,%r10d
xor    %r8d,%r8d
jmp    115d <ga_compare_chromosomes_unsigned+0x5d>
nopl   0x0(%rax)
add    $0x1,%r8d
add    $0x2,%r10
cmp    %r9,%r10
je     1114 <ga_compare_chromosomes_unsigned+0x14>
mov    (%rdi,%r10,4),%edx
xor    %ecx,%ecx
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   (%rax)
cmp    (%rsi,%rcx,4),%edx
je     1180 <ga_compare_chromosomes_unsigned+0x80>
add    $0x1,%rcx
cmp    %rcx,%r11
jne    1170 <ga_compare_chromosomes_unsigned+0x70>
jmp    1184 <ga_compare_chromosomes_unsigned+0x84>
add    $0x1,%r8d
lea    0x0(,%r10,4),%rcx
or     $0x4,%rcx
mov    (%rdi,%rcx,1),%edx
xor    %ecx,%ecx
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nop
cmp    (%rsi,%rcx,4),%edx
je     1150 <ga_compare_chromosomes_unsigned+0x50>
add    $0x1,%rcx
cmp    %rcx,%r11
jne    11a0 <ga_compare_chromosomes_unsigned+0xa0>
jmp    1154 <ga_compare_chromosomes_unsigned+0x54>
add    $0x1,%r8d
sub    %r8d,%eax
ret

LLVM IR (-O0):
define i32 @ga_compare_chromosomes_unsigned(i32* %0, i32* %1, i32 %2) {
%4 = alloca i32*
%5 = alloca i32*
%6 = alloca i32
%7 = alloca i32
%8 = alloca i32
%9 = alloca i32
store i32* %0, i32** %4
store i32* %1, i32** %5
store i32 %2, i32* %6
store i32 0, i32* %7
store i32 0, i32* %8
br label %10
10: ; preds = %39, %3
%11 = load i32, i32* %8
%12 = load i32, i32* %6
%13 = icmp ult i32 %11, %12
br i1 %13, label %14, label %42
14: ; preds = %10
store i32 0, i32* %9
br label %15
15: ; preds = %35, %14
%16 = load i32, i32* %9
%17 = load i32, i32* %6
%18 = icmp ult i32 %16, %17
br i1 %18, label %19, label %38
19: ; preds = %15
%20 = load i32*, i32** %4
%21 = load i32, i32* %8
%22 = sext i32 %21 to i64
%23 = getelementptr inbounds i32, i32* %20, i64 %22
%24 = load i32, i32* %23
%25 = load i32*, i32** %5
%26 = load i32, i32* %9
%27 = sext i32 %26 to i64
%28 = getelementptr inbounds i32, i32* %25, i64 %27
%29 = load i32, i32* %28
%30 = icmp eq i32 %24, %29
br i1 %30, label %31, label %34
31: ; preds = %19
%32 = load i32, i32* %7
%33 = add nsw i32 %32, 1
store i32 %33, i32* %7
br label %38
34: ; preds = %19
br label %35
35: ; preds = %34
%36 = load i32, i32* %9
%37 = add nsw i32 %36, 1
store i32 %37, i32* %9
br label %15
38: ; preds = %31, %15
br label %39
39: ; preds = %38
%40 = load i32, i32* %8
%41 = add nsw i32 %40, 1
store i32 %41, i32* %8
br label %10
42: ; preds = %10
%43 = load i32, i32* %6
%44 = load i32, i32* %7
%45 = sub i32 %43, %44
ret i32 %45
}

LLVM IR (-O2):
define i32 @ga_compare_chromosomes_unsigned(i32* nocapture %0, i32* nocapture %1, i32 %2) {
%4 = icmp eq i32 %2, 0
br i1 %4, label %35, label %5
5: ; preds = %3
%6 = zext i32 %2 to i64
%7 = and i64 %6, 1
%8 = icmp eq i32 %2, 1
br i1 %8, label %17, label %9
9: ; preds = %5
%10 = and i64 %6, 4294967294
br label %11
11: ; preds = %63, %9
%12 = phi i64 [ 0, %9 ], [ %65, %63 ]
%13 = phi i32 [ 0, %9 ], [ %64, %63 ]
%14 = phi i64 [ 0, %9 ], [ %66, %63 ]
%15 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 %12
%16 = load i32, i32* %15
br label %40
17: ; preds = %63, %5
%18 = phi i32 [ undef, %5 ], [ %64, %63 ]
%19 = phi i64 [ 0, %5 ], [ %65, %63 ]
%20 = phi i32 [ 0, %5 ], [ %64, %63 ]
%21 = icmp eq i64 %7, 0
br i1 %21, label %35, label %22
22: ; preds = %17
%23 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 %19
%24 = load i32, i32* %23
br label %25
25: ; preds = %31, %22
%26 = phi i64 [ 0, %22 ], [ %30, %31 ]
%27 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %26
%28 = load i32, i32* %27
%29 = icmp eq i32 %24, %28
%30 = add nuw nsw i64 %26, 1
br i1 %29, label %33, label %31
31: ; preds = %25
%32 = icmp eq i64 %30, %6
br i1 %32, label %35, label %25
33: ; preds = %25
%34 = add nsw i32 %20, 1
br label %35
35: ; preds = %17, %31, %33, %3
%36 = phi i32 [ 0, %3 ], [ %18, %17 ], [ %34, %33 ], [ %20, %31 ]
%37 = sub i32 %2, %36
ret i32 %37
38: ; preds = %40
%39 = icmp eq i64 %45, %6
br i1 %39, label %48, label %40
40: ; preds = %11, %38
%41 = phi i64 [ 0, %11 ], [ %45, %38 ]
%42 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %41
%43 = load i32, i32* %42
%44 = icmp eq i32 %16, %43
%45 = add nuw nsw i64 %41, 1
br i1 %44, label %46, label %38
46: ; preds = %40
%47 = add nsw i32 %13, 1
br label %48
48: ; preds = %38, %46
%49 = phi i32 [ %47, %46 ], [ %13, %38 ]
%50 = or i64 %12, 1
%51 = getelementptr inbounds i32, i32* %0, i64 %50
%52 = load i32, i32* %51
br label %53
53: ; preds = %59, %48
%54 = phi i64 [ 0, %48 ], [ %58, %59 ]
%55 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %54
%56 = load i32, i32* %55
%57 = icmp eq i32 %52, %56
%58 = add nuw nsw i64 %54, 1
br i1 %57, label %61, label %59
59: ; preds = %53
%60 = icmp eq i64 %58, %6
br i1 %60, label %63, label %53
61: ; preds = %53
%62 = add nsw i32 %49, 1
br label %63
63: ; preds = %59, %61
%64 = phi i32 [ %62, %61 ], [ %49, %59 ]
%65 = add nuw nsw i64 %12, 2
%66 = add i64 %14, 2
%67 = icmp eq i64 %66, %10
br i1 %67, label %17, label %11
}