#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
char *malloc(int);
char *rm_gaps(char *consensus, int cons_len) {
  char *output = malloc(sizeof(char) * cons_len + 1);
  int i;
  int j = 0;
  for (i = 0; i < cons_len; i++) {
    if (consensus[i] != '-') {
      output[j] = consensus[i];
      j++;
    }
  }
  output[j] = '\0';
  return output;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<rm_gaps>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x20,%rsp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %esi,-0xc(%rbp)
movslq -0xc(%rbp),%rax
shl    $0x0,%rax
add    $0x1,%rax
mov    %eax,%edi
call   1030 <malloc@plt>
mov    %rax,-0x18(%rbp)
movl   $0x0,-0x20(%rbp)
movl   $0x0,-0x1c(%rbp)
mov    -0x1c(%rbp),%eax
cmp    -0xc(%rbp),%eax
jge    1197 <rm_gaps+0x87>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x2d,%eax
je     1184 <rm_gaps+0x74>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,1),%dl
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
mov    -0x20(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x20(%rbp)
jmp    1189 <rm_gaps+0x79>
mov    -0x1c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
jmp    1144 <rm_gaps+0x34>
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
movb   $0x0,(%rax,%rcx,1)
mov    -0x18(%rbp),%rax
add    $0x20,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<rm_gaps>:
push   %r14
push   %rbx
push   %rax
mov    %esi,%r14d
mov    %rdi,%rbx
lea    0x1(%r14),%edi
call   1030 <malloc@plt>
test   %r14d,%r14d
jle    114e <rm_gaps+0x3e>
mov    %r14d,%r8d
cmp    $0x1,%r14d
jne    115f <rm_gaps+0x4f>
xor    %esi,%esi
xor    %ecx,%ecx
test   $0x1,%r8b
je     1150 <rm_gaps+0x40>
mov    (%rbx,%rsi,1),%dl
cmp    $0x2d,%dl
je     1150 <rm_gaps+0x40>
movslq %ecx,%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
add    $0x1,%ecx
jmp    1150 <rm_gaps+0x40>
xor    %ecx,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movb   $0x0,(%rax,%rcx,1)
add    $0x8,%rsp
pop    %rbx
pop    %r14
ret
mov    %r8d,%edi
and    $0xfffffffe,%edi
xor    %esi,%esi
xor    %ecx,%ecx
jmp    1179 <rm_gaps+0x69>
nopl   0x0(%rax,%rax,1)
add    $0x2,%rsi
cmp    %rsi,%rdi
je     1135 <rm_gaps+0x25>
movzbl (%rbx,%rsi,1),%edx
cmp    $0x2d,%dl
je     118b <rm_gaps+0x7b>
movslq %ecx,%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
add    $0x1,%ecx
movzbl 0x1(%rbx,%rsi,1),%edx
cmp    $0x2d,%dl
je     1170 <rm_gaps+0x60>
movslq %ecx,%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
add    $0x1,%ecx
jmp    1170 <rm_gaps+0x60>

LLVM IR (-O0):
define i8* @rm_gaps(i8* %0, i32 %1) {
%3 = alloca i8*
%4 = alloca i32
%5 = alloca i8*
%6 = alloca i32
%7 = alloca i32
store i8* %0, i8** %3
store i32 %1, i32* %4
%8 = load i32, i32* %4
%9 = sext i32 %8 to i64
%10 = mul i64 1, %9
%11 = add i64 %10, 1
%12 = trunc i64 %11 to i32
%13 = call i8* @malloc(i32 %12)
store i8* %13, i8** %5
store i32 0, i32* %7
store i32 0, i32* %6
br label %14
14: ; preds = %39, %2
%15 = load i32, i32* %6
%16 = load i32, i32* %4
%17 = icmp slt i32 %15, %16
br i1 %17, label %18, label %42
18: ; preds = %14
%19 = load i8*, i8** %3
%20 = load i32, i32* %6
%21 = sext i32 %20 to i64
%22 = getelementptr inbounds i8, i8* %19, i64 %21
%23 = load i8, i8* %22
%24 = sext i8 %23 to i32
%25 = icmp ne i32 %24, 45
br i1 %25, label %26, label %38
26: ; preds = %18
%27 = load i8*, i8** %3
%28 = load i32, i32* %6
%29 = sext i32 %28 to i64
%30 = getelementptr inbounds i8, i8* %27, i64 %29
%31 = load i8, i8* %30
%32 = load i8*, i8** %5
%33 = load i32, i32* %7
%34 = sext i32 %33 to i64
%35 = getelementptr inbounds i8, i8* %32, i64 %34
store i8 %31, i8* %35
%36 = load i32, i32* %7
%37 = add nsw i32 %36, 1
store i32 %37, i32* %7
br label %38
38: ; preds = %26, %18
br label %39
39: ; preds = %38
%40 = load i32, i32* %6
%41 = add nsw i32 %40, 1
store i32 %41, i32* %6
br label %14
42: ; preds = %14
%43 = load i8*, i8** %5
%44 = load i32, i32* %7
%45 = sext i32 %44 to i64
%46 = getelementptr inbounds i8, i8* %43, i64 %45
store i8 0, i8* %46
%47 = load i8*, i8** %5
ret i8* %47
}

LLVM IR (-O2):
define noalias i8* @rm_gaps(i8* nocapture %0, i32 %1) {
%3 = add i32 %1, 1
%4 = tail call i8* @malloc(i32 %3)
%5 = icmp sgt i32 %1, 0
br i1 %5, label %6, label %51
6: ; preds = %2
%7 = zext i32 %1 to i64
%8 = and i64 %7, 1
%9 = icmp eq i32 %1, 1
br i1 %9, label %38, label %10
10: ; preds = %6
%11 = and i64 %7, 4294967294
br label %12
12: ; preds = %33, %10
%13 = phi i64 [ 0, %10 ], [ %35, %33 ]
%14 = phi i32 [ 0, %10 ], [ %34, %33 ]
%15 = phi i64 [ 0, %10 ], [ %36, %33 ]
%16 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %13
%17 = load i8, i8* %16
%18 = icmp eq i8 %17, 45
br i1 %18, label %23, label %19
19: ; preds = %12
%20 = sext i32 %14 to i64
%21 = getelementptr inbounds i8, i8* %4, i64 %20
store i8 %17, i8* %21
%22 = add nsw i32 %14, 1
br label %23
23: ; preds = %12, %19
%24 = phi i32 [ %22, %19 ], [ %14, %12 ]
%25 = or i64 %13, 1
%26 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %25
%27 = load i8, i8* %26
%28 = icmp eq i8 %27, 45
br i1 %28, label %33, label %29
29: ; preds = %23
%30 = sext i32 %24 to i64
%31 = getelementptr inbounds i8, i8* %4, i64 %30
store i8 %27, i8* %31
%32 = add nsw i32 %24, 1
br label %33
33: ; preds = %29, %23
%34 = phi i32 [ %32, %29 ], [ %24, %23 ]
%35 = add nuw nsw i64 %13, 2
%36 = add i64 %15, 2
%37 = icmp eq i64 %36, %11
br i1 %37, label %38, label %12
38: ; preds = %33, %6
%39 = phi i32 [ undef, %6 ], [ %34, %33 ]
%40 = phi i64 [ 0, %6 ], [ %35, %33 ]
%41 = phi i32 [ 0, %6 ], [ %34, %33 ]
%42 = icmp eq i64 %8, 0
br i1 %42, label %51, label %43
43: ; preds = %38
%44 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %40
%45 = load i8, i8* %44
%46 = icmp eq i8 %45, 45
br i1 %46, label %51, label %47
47: ; preds = %43
%48 = sext i32 %41 to i64
%49 = getelementptr inbounds i8, i8* %4, i64 %48
store i8 %45, i8* %49
%50 = add nsw i32 %41, 1
br label %51
51: ; preds = %38, %47, %43, %2
%52 = phi i32 [ 0, %2 ], [ %39, %38 ], [ %50, %47 ], [ %41, %43 ]
%53 = sext i32 %52 to i64
%54 = getelementptr inbounds i8, i8* %4, i64 %53
store i8 0, i8* %54
ret i8* %4
}