#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
int /*<<< orphan*/ isalpha(char);
scalar_t__ isdigit(char);
int strlen(char *);
char *strrchr(char *, char);
int RU_NextResidueFromRedEnd(char *pattern, char *residue, char *linkages) {
  int patternlen, linkCnt, resCnt, branched = 0;
  char *resPos;
  patternlen = strlen(pattern);
  linkCnt = 0;
  if (patternlen < 2) {
    return (0);
  }
  if (strlen(residue) == 0) {
    if (pattern[patternlen - 1] != '$' || !isalpha(pattern[patternlen - 2])) {
      return (0);
    } else {
      pattern[patternlen - 1] = 0;
      patternlen--;
    }
  }
  resPos = strrchr(pattern, ')');
  if (resPos != 0) {
    if (isdigit(*(resPos - 1))) {
      linkages[linkCnt++] = *(resPos - 1);
    }
    resPos++;
    if (*resPos == ']') {
      branched = 1;
      resPos++;
    } else if (*resPos == '[') {
      resPos++;
    }
  } else {
    resPos = pattern;
  }
  resCnt = 0;
  for (; resPos <= pattern + patternlen; resPos++) {
    residue[resCnt++] = *resPos;
  }
  resPos = strrchr(pattern, '(');
  if (resPos) {
    *resPos = 0;
  } else {
    pattern[0] = 0;
  }
  if (branched == 1) {
    while (branched == 1 && linkCnt < 6) {
      branched = 0;
      while (*(--resPos) != ')' && resPos >= pattern) {
      }
      if (isdigit(*(resPos - 1))) {
        linkages[linkCnt++] = *(resPos - 1);
      }
      if (*resPos == ']') {
        branched = 1;
      }
    }
    while (*(--resPos) != '(' && resPos >= pattern) {
    }
    if (*resPos == '(') {
      *resPos = 0;
    }
  }
  linkages[linkCnt] = 0;
  if (strlen(linkages) == 0) {
    return (0);
  }
  return (1);
}


x86 assembly (clang, -O0):
<RU_NextResidueFromRedEnd>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x40,%rsp
mov    %rdi,-0x10(%rbp)
mov    %rsi,-0x18(%rbp)
mov    %rdx,-0x20(%rbp)
movl   $0x0,-0x30(%rbp)
mov    -0x10(%rbp),%rdi
call   1040 <strlen@plt>
mov    %eax,-0x24(%rbp)
movl   $0x0,-0x28(%rbp)
cmpl   $0x2,-0x24(%rbp)
jge    1184 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x44>
movl   $0x0,-0x4(%rbp)
jmp    148f <RU_NextResidueFromRedEnd+0x34f>
mov    -0x18(%rbp),%rdi
call   1040 <strlen@plt>
cmp    $0x0,%eax
jne    11fa <RU_NextResidueFromRedEnd+0xba>
mov    -0x10(%rbp),%rax
mov    -0x24(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
cmp    $0x24,%eax
jne    11cf <RU_NextResidueFromRedEnd+0x8f>
mov    -0x10(%rbp),%rax
mov    -0x24(%rbp),%ecx
sub    $0x2,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%edi
call   1060 <isalpha@plt>
cmp    $0x0,%eax
jne    11db <RU_NextResidueFromRedEnd+0x9b>
movl   $0x0,-0x4(%rbp)
jmp    148f <RU_NextResidueFromRedEnd+0x34f>
mov    -0x10(%rbp),%rax
mov    -0x24(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movb   $0x0,(%rax,%rcx,1)
mov    -0x24(%rbp),%eax
add    $0xffffffff,%eax
mov    %eax,-0x24(%rbp)
jmp    11fa <RU_NextResidueFromRedEnd+0xba>
mov    -0x10(%rbp),%rdi
mov    $0x29,%esi
call   1050 <strrchr@plt>
mov    %rax,-0x38(%rbp)
cmpq   $0x0,-0x38(%rbp)
je     12a4 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x164>
mov    -0x38(%rbp),%rax
movsbl -0x1(%rax),%edi
call   1030 <isdigit@plt>
cmp    $0x0,%rax
je     124a <RU_NextResidueFromRedEnd+0x10a>
mov    -0x38(%rbp),%rax
mov    -0x1(%rax),%dl
mov    -0x20(%rbp),%rax
mov    -0x28(%rbp),%ecx
mov    %ecx,%esi
add    $0x1,%esi
mov    %esi,-0x28(%rbp)
movslq %ecx,%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
mov    -0x38(%rbp),%rax
add    $0x1,%rax
mov    %rax,-0x38(%rbp)
mov    -0x38(%rbp),%rax
movsbl (%rax),%eax
cmp    $0x5d,%eax
jne    127e <RU_NextResidueFromRedEnd+0x13e>
movl   $0x1,-0x30(%rbp)
mov    -0x38(%rbp),%rax
add    $0x1,%rax
mov    %rax,-0x38(%rbp)
jmp    129f <RU_NextResidueFromRedEnd+0x15f>
mov    -0x38(%rbp),%rax
movsbl (%rax),%eax
cmp    $0x5b,%eax
jne    129a <RU_NextResidueFromRedEnd+0x15a>
mov    -0x38(%rbp),%rax
add    $0x1,%rax
mov    %rax,-0x38(%rbp)
jmp    129f <RU_NextResidueFromRedEnd+0x15f>
jmp    12ac <RU_NextResidueFromRedEnd+0x16c>
mov    -0x10(%rbp),%rax
mov    %rax,-0x38(%rbp)
movl   $0x0,-0x2c(%rbp)
mov    -0x38(%rbp),%rax
mov    -0x10(%rbp),%rcx
movslq -0x24(%rbp),%rdx
add    %rdx,%rcx
cmp    %rcx,%rax
ja     12f7 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x1b7>
mov    -0x38(%rbp),%rax
mov    (%rax),%dl
mov    -0x18(%rbp),%rax
mov    -0x2c(%rbp),%ecx
mov    %ecx,%esi
add    $0x1,%esi
mov    %esi,-0x2c(%rbp)
movslq %ecx,%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
mov    -0x38(%rbp),%rax
add    $0x1,%rax
mov    %rax,-0x38(%rbp)
jmp    12b3 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x173>
mov    -0x10(%rbp),%rdi
mov    $0x28,%esi
call   1050 <strrchr@plt>
mov    %rax,-0x38(%rbp)
cmpq   $0x0,-0x38(%rbp)
je     1320 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x1e0>
mov    -0x38(%rbp),%rax
movb   $0x0,(%rax)
jmp    1327 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x1e7>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movb   $0x0,(%rax)
cmpl   $0x1,-0x30(%rbp)
jne    145e <RU_NextResidueFromRedEnd+0x31e>
jmp    1336 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x1f6>
xor    %eax,%eax
cmpl   $0x1,-0x30(%rbp)
mov    %al,-0x39(%rbp)
jne    134f <RU_NextResidueFromRedEnd+0x20f>
cmpl   $0x6,-0x28(%rbp)
setl   %al
mov    %al,-0x39(%rbp)
mov    -0x39(%rbp),%al
test   $0x1,%al
jne    135f <RU_NextResidueFromRedEnd+0x21f>
jmp    13f9 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x2b9>
movl   $0x0,-0x30(%rbp)
mov    -0x38(%rbp),%rax
mov    %rax,%rcx
add    $0xffffffffffffffff,%rcx
mov    %rcx,-0x38(%rbp)
movsbl -0x1(%rax),%ecx
xor    %eax,%eax
cmp    $0x29,%ecx
mov    %al,-0x3a(%rbp)
je     1395 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x255>
mov    -0x38(%rbp),%rax
cmp    -0x10(%rbp),%rax
setae  %al
mov    %al,-0x3a(%rbp)
mov    -0x3a(%rbp),%al
test   $0x1,%al
jne    13a5 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x265>
jmp    13aa <RU_NextResidueFromRedEnd+0x26a>
jmp    1366 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x226>
mov    -0x38(%rbp),%rax
movsbl -0x1(%rax),%edi
call   1030 <isdigit@plt>
cmp    $0x0,%rax
je     13dd <RU_NextResidueFromRedEnd+0x29d>
mov    -0x38(%rbp),%rax
mov    -0x1(%rax),%dl
mov    -0x20(%rbp),%rax
mov    -0x28(%rbp),%ecx
mov    %ecx,%esi
add    $0x1,%esi
mov    %esi,-0x28(%rbp)
movslq %ecx,%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
mov    -0x38(%rbp),%rax
movsbl (%rax),%eax
cmp    $0x5d,%eax
jne    13f4 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x2b4>
movl   $0x1,-0x30(%rbp)
jmp    1336 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x1f6>
jmp    13fe <RU_NextResidueFromRedEnd+0x2be>
mov    -0x38(%rbp),%rax
mov    %rax,%rcx
add    $0xffffffffffffffff,%rcx
mov    %rcx,-0x38(%rbp)
movsbl -0x1(%rax),%ecx
xor    %eax,%eax
cmp    $0x28,%ecx
mov    %al,-0x3b(%rbp)
je     142d <RU_NextResidueFromRedEnd+0x2ed>
mov    -0x38(%rbp),%rax
cmp    -0x10(%rbp),%rax
setae  %al
mov    %al,-0x3b(%rbp)
mov    -0x3b(%rbp),%al
test   $0x1,%al
jne    143d <RU_NextResidueFromRedEnd+0x2fd>
jmp    1442 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x302>
jmp    13fe <RU_NextResidueFromRedEnd+0x2be>
mov    -0x38(%rbp),%rax
movsbl (%rax),%eax
cmp    $0x28,%eax
jne    1459 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x319>
mov    -0x38(%rbp),%rax
movb   $0x0,(%rax)
jmp    145e <RU_NextResidueFromRedEnd+0x31e>
mov    -0x20(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
movb   $0x0,(%rax,%rcx,1)
mov    -0x20(%rbp),%rdi
call   1040 <strlen@plt>
cmp    $0x0,%eax
jne    1488 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x348>
movl   $0x0,-0x4(%rbp)
jmp    148f <RU_NextResidueFromRedEnd+0x34f>
movl   $0x1,-0x4(%rbp)
mov    -0x4(%rbp),%eax
add    $0x40,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<RU_NextResidueFromRedEnd>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
push   %rax
mov    %rdx,%r14
mov    %rsi,%r15
mov    %rdi,%rbx
call   1040 <strlen@plt>
xor    %r12d,%r12d
cmp    $0x2,%eax
jl     1327 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x1e7>
mov    %eax,%ebp
mov    %r15,%rdi
call   1040 <strlen@plt>
mov    %ebp,%r13d
test   %eax,%eax
je     11ac <RU_NextResidueFromRedEnd+0x6c>
mov    %rbx,%rdi
mov    $0x29,%esi
call   1050 <strrchr@plt>
test   %rax,%rax
je     11d6 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x96>
mov    %rax,%r12
movsbl -0x1(%rax),%edi
call   1030 <isdigit@plt>
mov    %r13,%rcx
test   %rax,%rax
je     11e3 <RU_NextResidueFromRedEnd+0xa3>
mov    -0x1(%r12),%al
mov    %al,(%r14)
mov    $0x1,%r13d
jmp    11e6 <RU_NextResidueFromRedEnd+0xa6>
lea    -0x1(%rbp),%r13d
cmpb   $0x24,(%rbx,%r13,1)
jne    1327 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x1e7>
add    $0xfffffffe,%ebp
movsbl (%rbx,%rbp,1),%edi
call   1060 <isalpha@plt>
test   %eax,%eax
je     1327 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x1e7>
movb   $0x0,(%rbx,%r13,1)
jmp    1176 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x36>
mov    %r13,%rcx
xor    %r13d,%r13d
xor    %ebp,%ebp
mov    %rbx,%r12
jmp    1208 <RU_NextResidueFromRedEnd+0xc8>
xor    %r13d,%r13d
mov    0x1(%r12),%al
cmp    $0x5b,%al
je     11fc <RU_NextResidueFromRedEnd+0xbc>
cmp    $0x5d,%al
jne    1202 <RU_NextResidueFromRedEnd+0xc2>
add    $0x2,%r12
mov    $0x1,%bpl
jmp    1208 <RU_NextResidueFromRedEnd+0xc8>
add    $0x2,%r12
jmp    1206 <RU_NextResidueFromRedEnd+0xc6>
add    $0x1,%r12
xor    %ebp,%ebp
mov    %ecx,%ecx
lea    (%rbx,%rcx,1),%rax
cmp    %rax,%r12
ja     1273 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x133>
lea    (%rbx,%rcx,1),%r8
add    $0x1,%r8
lea    0x1(%r12),%r9
cmp    %r9,%r8
mov    %r9,%rdi
cmova  %r8,%rdi
sub    %r12,%rdi
cmp    $0x8,%rdi
jb     1255 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x115>
cmp    %r9,%r8
mov    %r9,%rcx
cmova  %r8,%rcx
cmp    %r15,%rcx
jbe    1339 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x1f9>
sub    %r12,%rcx
add    %r15,%rcx
cmp    %rcx,%r12
jae    1339 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x1f9>
xor    %edx,%edx
mov    %r12,%rsi
add    %rdx,%r15
nopl   (%rax)
movzbl (%rsi),%ecx
mov    %cl,(%r15)
add    $0x1,%rsi
add    $0x1,%r15
cmp    %rax,%rsi
jbe    1260 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x120>
mov    %rbx,%rdi
mov    $0x28,%esi
call   1050 <strrchr@plt>
test   %rax,%rax
mov    %rax,%rcx
cmove  %rbx,%rcx
movb   $0x0,(%rcx)
test   %bpl,%bpl
je     130e <RU_NextResidueFromRedEnd+0x1ce>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   0x0(%rax)
add    $0xffffffffffffffff,%rax
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
xchg   %ax,%ax
lea    -0x1(%rax),%rbp
cmpb   $0x29,(%rax)
je     12c1 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x181>
cmp    %rbx,%rax
mov    %rbp,%rax
jae    12b0 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x170>
movsbl 0x0(%rbp),%edi
call   1030 <isdigit@plt>
mov    %rax,%rcx
lea    0x1(%rbp),%rax
test   %rcx,%rcx
je     12e4 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x1a4>
mov    0x0(%rbp),%cl
movslq %r13d,%rdx
add    $0x1,%r13d
mov    %cl,(%r14,%rdx,1)
cmpb   $0x5d,(%rax)
jne    12f0 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x1b0>
cmp    $0x6,%r13d
jl     12a0 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x160>
nop
movzbl 0x0(%rbp),%ecx
lea    -0x1(%rbp),%rax
cmp    $0x28,%cl
je     1305 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x1c5>
cmp    %rbx,%rbp
mov    %rax,%rbp
jae    12f0 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x1b0>
cmp    $0x28,%cl
jne    130e <RU_NextResidueFromRedEnd+0x1ce>
movb   $0x0,0x1(%rax)
movslq %r13d,%rax
movb   $0x0,(%r14,%rax,1)
mov    %r14,%rdi
call   1040 <strlen@plt>
xor    %r12d,%r12d
test   %eax,%eax
setne  %r12b
mov    %r12d,%eax
add    $0x8,%rsp
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret
cmp    $0x20,%rdi
jae    1346 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x206>
xor    %edx,%edx
jmp    143d <RU_NextResidueFromRedEnd+0x2fd>
mov    %ebp,%r11d
mov    %rdi,%rdx
and    $0xffffffffffffffe0,%rdx
lea    -0x20(%rdx),%rcx
mov    %rcx,%rsi
shr    $0x5,%rsi
add    $0x1,%rsi
mov    %esi,%r10d
and    $0x3,%r10d
cmp    $0x60,%rcx
jae    1370 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x230>
xor    %ecx,%ecx
jmp    13e8 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x2a8>
and    $0xfffffffffffffffc,%rsi
xor    %ecx,%ecx
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
movups (%r12,%rcx,1),%xmm0
movups 0x10(%r12,%rcx,1),%xmm1
movups %xmm0,(%r15,%rcx,1)
movups %xmm1,0x10(%r15,%rcx,1)
movups 0x20(%r12,%rcx,1),%xmm0
movups 0x30(%r12,%rcx,1),%xmm1
movups %xmm0,0x20(%r15,%rcx,1)
movups %xmm1,0x30(%r15,%rcx,1)
movups 0x40(%r12,%rcx,1),%xmm0
movups 0x50(%r12,%rcx,1),%xmm1
movups %xmm0,0x40(%r15,%rcx,1)
movups %xmm1,0x50(%r15,%rcx,1)
movups 0x60(%r12,%rcx,1),%xmm0
movups 0x70(%r12,%rcx,1),%xmm1
movups %xmm0,0x60(%r15,%rcx,1)
movups %xmm1,0x70(%r15,%rcx,1)
sub    $0xffffffffffffff80,%rcx
add    $0xfffffffffffffffc,%rsi
jne    1380 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x240>
test   %r10,%r10
je     142b <RU_NextResidueFromRedEnd+0x2eb>
lea    (%r15,%rcx,1),%rsi
add    $0x10,%rsi
add    %r12,%rcx
add    $0x10,%rcx
shl    $0x5,%r10
xor    %ebp,%ebp
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   0x0(%rax)
movups -0x10(%rcx,%rbp,1),%xmm0
movups (%rcx,%rbp,1),%xmm1
movups %xmm0,-0x10(%rsi,%rbp,1)
movups %xmm1,(%rsi,%rbp,1)
add    $0x20,%rbp
cmp    %rbp,%r10
jne    1410 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x2d0>
cmp    %rdx,%rdi
mov    %r11d,%ebp
je     1273 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x133>
test   $0x18,%dil
je     147f <RU_NextResidueFromRedEnd+0x33f>
cmp    %r9,%r8
cmova  %r8,%r9
mov    %rdx,%rcx
sub    %r12,%r9
mov    %r9,%rdx
and    $0xfffffffffffffff8,%rdx
lea    (%r12,%rdx,1),%rsi
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nop
mov    (%r12,%rcx,1),%rdi
mov    %rdi,(%r15,%rcx,1)
add    $0x8,%rcx
cmp    %rcx,%rdx
jne    1460 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x320>
cmp    %rdx,%r9
jne    125a <RU_NextResidueFromRedEnd+0x11a>
jmp    1273 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x133>
add    %rdx,%r12
jmp    1257 <RU_NextResidueFromRedEnd+0x117>

LLVM IR (-O0):
define i32 @RU_NextResidueFromRedEnd(i8* %0, i8* %1, i8* %2) {
%4 = alloca i32
%5 = alloca i8*
%6 = alloca i8*
%7 = alloca i8*
%8 = alloca i32
%9 = alloca i32
%10 = alloca i32
%11 = alloca i32
%12 = alloca i8*
store i8* %0, i8** %5
store i8* %1, i8** %6
store i8* %2, i8** %7
store i32 0, i32* %11
%13 = load i8*, i8** %5
%14 = call i32 @strlen(i8* %13)
store i32 %14, i32* %8
store i32 0, i32* %9
%15 = load i32, i32* %8
%16 = icmp slt i32 %15, 2
br i1 %16, label %17, label %18
17: ; preds = %3
store i32 0, i32* %4
br label %201
18: ; preds = %3
%19 = load i8*, i8** %6
%20 = call i32 @strlen(i8* %19)
%21 = icmp eq i32 %20, 0
br i1 %21, label %22, label %50
22: ; preds = %18
%23 = load i8*, i8** %5
%24 = load i32, i32* %8
%25 = sub nsw i32 %24, 1
%26 = sext i32 %25 to i64
%27 = getelementptr inbounds i8, i8* %23, i64 %26
%28 = load i8, i8* %27
%29 = sext i8 %28 to i32
%30 = icmp ne i32 %29, 36
br i1 %30, label %40, label %31
31: ; preds = %22
%32 = load i8*, i8** %5
%33 = load i32, i32* %8
%34 = sub nsw i32 %33, 2
%35 = sext i32 %34 to i64
%36 = getelementptr inbounds i8, i8* %32, i64 %35
%37 = load i8, i8* %36
%38 = call i32 @isalpha(i8 signext %37)
%39 = icmp ne i32 %38, 0
br i1 %39, label %41, label %40
40: ; preds = %31, %22
store i32 0, i32* %4
br label %201
41: ; preds = %31
%42 = load i8*, i8** %5
%43 = load i32, i32* %8
%44 = sub nsw i32 %43, 1
%45 = sext i32 %44 to i64
%46 = getelementptr inbounds i8, i8* %42, i64 %45
store i8 0, i8* %46
%47 = load i32, i32* %8
%48 = add nsw i32 %47, -1
store i32 %48, i32* %8
br label %49
49: ; preds = %41
br label %50
50: ; preds = %49, %18
%51 = load i8*, i8** %5
%52 = call i8* @strrchr(i8* %51, i8 signext 41)
store i8* %52, i8** %12
%53 = load i8*, i8** %12
%54 = icmp ne i8* %53, null
br i1 %54, label %55, label %90
55: ; preds = %50
%56 = load i8*, i8** %12
%57 = getelementptr inbounds i8, i8* %56, i64 -1
%58 = load i8, i8* %57
%59 = call i64 @isdigit(i8 signext %58)
%60 = icmp ne i64 %59, 0
br i1 %60, label %61, label %70
61: ; preds = %55
%62 = load i8*, i8** %12
%63 = getelementptr inbounds i8, i8* %62, i64 -1
%64 = load i8, i8* %63
%65 = load i8*, i8** %7
%66 = load i32, i32* %9
%67 = add nsw i32 %66, 1
store i32 %67, i32* %9
%68 = sext i32 %66 to i64
%69 = getelementptr inbounds i8, i8* %65, i64 %68
store i8 %64, i8* %69
br label %70
70: ; preds = %61, %55
%71 = load i8*, i8** %12
%72 = getelementptr inbounds i8, i8* %71, i32 1
store i8* %72, i8** %12
%73 = load i8*, i8** %12
%74 = load i8, i8* %73
%75 = sext i8 %74 to i32
%76 = icmp eq i32 %75, 93
br i1 %76, label %77, label %80
77: ; preds = %70
store i32 1, i32* %11
%78 = load i8*, i8** %12
%79 = getelementptr inbounds i8, i8* %78, i32 1
store i8* %79, i8** %12
br label %89
80: ; preds = %70
%81 = load i8*, i8** %12
%82 = load i8, i8* %81
%83 = sext i8 %82 to i32
%84 = icmp eq i32 %83, 91
br i1 %84, label %85, label %88
85: ; preds = %80
%86 = load i8*, i8** %12
%87 = getelementptr inbounds i8, i8* %86, i32 1
store i8* %87, i8** %12
br label %88
88: ; preds = %85, %80
br label %89
89: ; preds = %88, %77
br label %92
90: ; preds = %50
%91 = load i8*, i8** %5
store i8* %91, i8** %12
br label %92
92: ; preds = %90, %89
store i32 0, i32* %10
br label %93
93: ; preds = %108, %92
%94 = load i8*, i8** %12
%95 = load i8*, i8** %5
%96 = load i32, i32* %8
%97 = sext i32 %96 to i64
%98 = getelementptr inbounds i8, i8* %95, i64 %97
%99 = icmp ule i8* %94, %98
br i1 %99, label %100, label %111
100: ; preds = %93
%101 = load i8*, i8** %12
%102 = load i8, i8* %101
%103 = load i8*, i8** %6
%104 = load i32, i32* %10
%105 = add nsw i32 %104, 1
store i32 %105, i32* %10
%106 = sext i32 %104 to i64
%107 = getelementptr inbounds i8, i8* %103, i64 %106
store i8 %102, i8* %107
br label %108
108: ; preds = %100
%109 = load i8*, i8** %12
%110 = getelementptr inbounds i8, i8* %109, i32 1
store i8* %110, i8** %12
br label %93
111: ; preds = %93
%112 = load i8*, i8** %5
%113 = call i8* @strrchr(i8* %112, i8 signext 40)
store i8* %113, i8** %12
%114 = load i8*, i8** %12
%115 = icmp ne i8* %114, null
br i1 %115, label %116, label %118
116: ; preds = %111
%117 = load i8*, i8** %12
store i8 0, i8* %117
br label %121
118: ; preds = %111
%119 = load i8*, i8** %5
%120 = getelementptr inbounds i8, i8* %119, i64 0
store i8 0, i8* %120
br label %121
121: ; preds = %118, %116
%122 = load i32, i32* %11
%123 = icmp eq i32 %122, 1
br i1 %123, label %124, label %191
124: ; preds = %121
br label %125
125: ; preds = %168, %124
%126 = load i32, i32* %11
%127 = icmp eq i32 %126, 1
br i1 %127, label %128, label %131
128: ; preds = %125
%129 = load i32, i32* %9
%130 = icmp slt i32 %129, 6
br label %131
131: ; preds = %128, %125
%132 = phi i1 [ false, %125 ], [ %130, %128 ]
br i1 %132, label %133, label %169
133: ; preds = %131
store i32 0, i32* %11
br label %134
134: ; preds = %146, %133
%135 = load i8*, i8** %12
%136 = getelementptr inbounds i8, i8* %135, i32 -1
store i8* %136, i8** %12
%137 = load i8, i8* %136
%138 = sext i8 %137 to i32
%139 = icmp ne i32 %138, 41
br i1 %139, label %140, label %144
140: ; preds = %134
%141 = load i8*, i8** %12
%142 = load i8*, i8** %5
%143 = icmp uge i8* %141, %142
br label %144
144: ; preds = %140, %134
%145 = phi i1 [ false, %134 ], [ %143, %140 ]
br i1 %145, label %146, label %147
146: ; preds = %144
br label %134
147: ; preds = %144
%148 = load i8*, i8** %12
%149 = getelementptr inbounds i8, i8* %148, i64 -1
%150 = load i8, i8* %149
%151 = call i64 @isdigit(i8 signext %150)
%152 = icmp ne i64 %151, 0
br i1 %152, label %153, label %162
153: ; preds = %147
%154 = load i8*, i8** %12
%155 = getelementptr inbounds i8, i8* %154, i64 -1
%156 = load i8, i8* %155
%157 = load i8*, i8** %7
%158 = load i32, i32* %9
%159 = add nsw i32 %158, 1
store i32 %159, i32* %9
%160 = sext i32 %158 to i64
%161 = getelementptr inbounds i8, i8* %157, i64 %160
store i8 %156, i8* %161
br label %162
162: ; preds = %153, %147
%163 = load i8*, i8** %12
%164 = load i8, i8* %163
%165 = sext i8 %164 to i32
%166 = icmp eq i32 %165, 93
br i1 %166, label %167, label %168
167: ; preds = %162
store i32 1, i32* %11
br label %168
168: ; preds = %167, %162
br label %125
169: ; preds = %131
br label %170
170: ; preds = %182, %169
%171 = load i8*, i8** %12
%172 = getelementptr inbounds i8, i8* %171, i32 -1
store i8* %172, i8** %12
%173 = load i8, i8* %172
%174 = sext i8 %173 to i32
%175 = icmp ne i32 %174, 40
br i1 %175, label %176, label %180
176: ; preds = %170
%177 = load i8*, i8** %12
%178 = load i8*, i8** %5
%179 = icmp uge i8* %177, %178
br label %180
180: ; preds = %176, %170
%181 = phi i1 [ false, %170 ], [ %179, %176 ]
br i1 %181, label %182, label %183
182: ; preds = %180
br label %170
183: ; preds = %180
%184 = load i8*, i8** %12
%185 = load i8, i8* %184
%186 = sext i8 %185 to i32
%187 = icmp eq i32 %186, 40
br i1 %187, label %188, label %190
188: ; preds = %183
%189 = load i8*, i8** %12
store i8 0, i8* %189
br label %190
190: ; preds = %188, %183
br label %191
191: ; preds = %190, %121
%192 = load i8*, i8** %7
%193 = load i32, i32* %9
%194 = sext i32 %193 to i64
%195 = getelementptr inbounds i8, i8* %192, i64 %194
store i8 0, i8* %195
%196 = load i8*, i8** %7
%197 = call i32 @strlen(i8* %196)
%198 = icmp eq i32 %197, 0
br i1 %198, label %199, label %200
199: ; preds = %191
store i32 0, i32* %4
br label %201
200: ; preds = %191
store i32 1, i32* %4
br label %201
201: ; preds = %200, %199, %40, %17
%202 = load i32, i32* %4
ret i32 %202
}

LLVM IR (-O2):
define i32 @RU_NextResidueFromRedEnd(i8* %0, i8* %1, i8* %2) {
%4 = ptrtoint i8* %0 to i64
%5 = tail call i32 @strlen(i8* %0)
%6 = icmp slt i32 %5, 2
br i1 %6, label %232, label %7
7: ; preds = %3
%8 = tail call i32 @strlen(i8* %1)
%9 = icmp eq i32 %8, 0
br i1 %9, label %10, label %24
10: ; preds = %7
%11 = add nsw i32 %5, -1
%12 = zext i32 %11 to i64
%13 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %12
%14 = load i8, i8* %13
%15 = icmp eq i8 %14, 36
br i1 %15, label %16, label %232
16: ; preds = %10
%17 = add nsw i32 %5, -2
%18 = zext i32 %17 to i64
%19 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %18
%20 = load i8, i8* %19
%21 = tail call i32 @isalpha(i8 signext %20)
%22 = icmp eq i32 %21, 0
br i1 %22, label %232, label %23
23: ; preds = %16
store i8 0, i8* %13
br label %24
24: ; preds = %23, %7
%25 = phi i32 [ %11, %23 ], [ %5, %7 ]
%26 = tail call i8* @strrchr(i8* dereferenceable(1) %0, i8 signext 41)
%27 = icmp eq i8* %26, null
br i1 %27, label %43, label %28
28: ; preds = %24
%29 = getelementptr inbounds i8, i8* %26, i64 -1
%30 = load i8, i8* %29
%31 = tail call i64 @isdigit(i8 signext %30)
%32 = icmp eq i64 %31, 0
br i1 %32, label %35, label %33
33: ; preds = %28
%34 = load i8, i8* %29
store i8 %34, i8* %2
br label %35
35: ; preds = %33, %28
%36 = phi i32 [ 1, %33 ], [ 0, %28 ]
%37 = getelementptr inbounds i8, i8* %26, i64 1
%38 = load i8, i8* %37
switch i8 %38, label %43 [
i8 93, label %39
i8 91, label %41
]
39: ; preds = %35
%40 = getelementptr inbounds i8, i8* %26, i64 2
br label %43
41: ; preds = %35
%42 = getelementptr inbounds i8, i8* %26, i64 2
br label %43
43: ; preds = %24, %35, %39, %41
%44 = phi i32 [ %36, %39 ], [ %36, %41 ], [ %36, %35 ], [ 0, %24 ]
%45 = phi i1 [ true, %39 ], [ false, %41 ], [ false, %35 ], [ false, %24 ]
%46 = phi i8* [ %40, %39 ], [ %42, %41 ], [ %37, %35 ], [ %0, %24 ]
%47 = ptrtoint i8* %46 to i64
%48 = zext i32 %25 to i64
%49 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %48
%50 = icmp ugt i8* %46, %49
br i1 %50, label %185, label %51
51: ; preds = %43
%52 = add i64 %4, %48
%53 = add i64 %52, 1
%54 = add i64 %47, 1
%55 = call i64 @llvm.umax.i64(i64 %53, i64 %54)
%56 = sub i64 %55, %47
%57 = icmp ult i64 %56, 8
br i1 %57, label %174, label %58
58: ; preds = %51
%59 = add i64 %4, %48
%60 = add i64 %59, 1
%61 = add i64 %47, 1
%62 = call i64 @llvm.umax.i64(i64 %60, i64 %61)
%63 = sub i64 %62, %47
%64 = getelementptr i8, i8* %1, i64 %63
%65 = getelementptr i8, i8* %46, i64 %63
%66 = icmp ugt i8* %65, %1
%67 = icmp ult i8* %46, %64
%68 = and i1 %66, %67
br i1 %68, label %174, label %69
69: ; preds = %58
%70 = icmp ult i64 %56, 32
br i1 %70, label %154, label %71
71: ; preds = %69
%72 = and i64 %56, -32
%73 = add i64 %72, -32
%74 = lshr exact i64 %73, 5
%75 = add nuw nsw i64 %74, 1
%76 = and i64 %75, 3
%77 = icmp ult i64 %73, 96
br i1 %77, label %129, label %78
78: ; preds = %71
%79 = and i64 %75, 1152921504606846972
br label %80
80: ; preds = %80, %78
%81 = phi i64 [ 0, %78 ], [ %126, %80 ]
%82 = phi i64 [ 0, %78 ], [ %127, %80 ]
%83 = getelementptr i8, i8* %46, i64 %81
%84 = bitcast i8* %83 to <16 x i8>*
%85 = load <16 x i8>, <16 x i8>* %84
%86 = getelementptr i8, i8* %83, i64 16
%87 = bitcast i8* %86 to <16 x i8>*
%88 = load <16 x i8>, <16 x i8>* %87
%89 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %81
%90 = bitcast i8* %89 to <16 x i8>*
store <16 x i8> %85, <16 x i8>* %90
%91 = getelementptr inbounds i8, i8* %89, i64 16
%92 = bitcast i8* %91 to <16 x i8>*
store <16 x i8> %88, <16 x i8>* %92
%93 = or i64 %81, 32
%94 = getelementptr i8, i8* %46, i64 %93
%95 = bitcast i8* %94 to <16 x i8>*
%96 = load <16 x i8>, <16 x i8>* %95
%97 = getelementptr i8, i8* %94, i64 16
%98 = bitcast i8* %97 to <16 x i8>*
%99 = load <16 x i8>, <16 x i8>* %98
%100 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %93
%101 = bitcast i8* %100 to <16 x i8>*
store <16 x i8> %96, <16 x i8>* %101
%102 = getelementptr inbounds i8, i8* %100, i64 16
%103 = bitcast i8* %102 to <16 x i8>*
store <16 x i8> %99, <16 x i8>* %103
%104 = or i64 %81, 64
%105 = getelementptr i8, i8* %46, i64 %104
%106 = bitcast i8* %105 to <16 x i8>*
%107 = load <16 x i8>, <16 x i8>* %106
%108 = getelementptr i8, i8* %105, i64 16
%109 = bitcast i8* %108 to <16 x i8>*
%110 = load <16 x i8>, <16 x i8>* %109
%111 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %104
%112 = bitcast i8* %111 to <16 x i8>*
store <16 x i8> %107, <16 x i8>* %112
%113 = getelementptr inbounds i8, i8* %111, i64 16
%114 = bitcast i8* %113 to <16 x i8>*
store <16 x i8> %110, <16 x i8>* %114
%115 = or i64 %81, 96
%116 = getelementptr i8, i8* %46, i64 %115
%117 = bitcast i8* %116 to <16 x i8>*
%118 = load <16 x i8>, <16 x i8>* %117
%119 = getelementptr i8, i8* %116, i64 16
%120 = bitcast i8* %119 to <16 x i8>*
%121 = load <16 x i8>, <16 x i8>* %120
%122 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %115
%123 = bitcast i8* %122 to <16 x i8>*
store <16 x i8> %118, <16 x i8>* %123
%124 = getelementptr inbounds i8, i8* %122, i64 16
%125 = bitcast i8* %124 to <16 x i8>*
store <16 x i8> %121, <16 x i8>* %125
%126 = add nuw i64 %81, 128
%127 = add i64 %82, 4
%128 = icmp eq i64 %127, %79
br i1 %128, label %129, label %80
129: ; preds = %80, %71
%130 = phi i64 [ 0, %71 ], [ %126, %80 ]
%131 = icmp eq i64 %76, 0
br i1 %131, label %148, label %132
132: ; preds = %129, %132
%133 = phi i64 [ %145, %132 ], [ %130, %129 ]
%134 = phi i64 [ %146, %132 ], [ 0, %129 ]
%135 = getelementptr i8, i8* %46, i64 %133
%136 = bitcast i8* %135 to <16 x i8>*
%137 = load <16 x i8>, <16 x i8>* %136
%138 = getelementptr i8, i8* %135, i64 16
%139 = bitcast i8* %138 to <16 x i8>*
%140 = load <16 x i8>, <16 x i8>* %139
%141 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %133
%142 = bitcast i8* %141 to <16 x i8>*
store <16 x i8> %137, <16 x i8>* %142
%143 = getelementptr inbounds i8, i8* %141, i64 16
%144 = bitcast i8* %143 to <16 x i8>*
store <16 x i8> %140, <16 x i8>* %144
%145 = add nuw i64 %133, 32
%146 = add i64 %134, 1
%147 = icmp eq i64 %146, %76
br i1 %147, label %148, label %132
148: ; preds = %132, %129
%149 = icmp eq i64 %56, %72
br i1 %149, label %185, label %150
150: ; preds = %148
%151 = getelementptr i8, i8* %46, i64 %72
%152 = and i64 %56, 24
%153 = icmp eq i64 %152, 0
br i1 %153, label %174, label %154
154: ; preds = %69, %150
%155 = phi i64 [ %72, %150 ], [ 0, %69 ]
%156 = add i64 %4, %48
%157 = add i64 %156, 1
%158 = add i64 %47, 1
%159 = call i64 @llvm.umax.i64(i64 %157, i64 %158)
%160 = sub i64 %159, %47
%161 = and i64 %160, -8
%162 = getelementptr i8, i8* %46, i64 %161
br label %163
163: ; preds = %163, %154
%164 = phi i64 [ %155, %154 ], [ %170, %163 ]
%165 = getelementptr i8, i8* %46, i64 %164
%166 = bitcast i8* %165 to <8 x i8>*
%167 = load <8 x i8>, <8 x i8>* %166
%168 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %164
%169 = bitcast i8* %168 to <8 x i8>*
store <8 x i8> %167, <8 x i8>* %169
%170 = add nuw i64 %164, 8
%171 = icmp eq i64 %170, %161
br i1 %171, label %172, label %163
172: ; preds = %163
%173 = icmp eq i64 %160, %161
br i1 %173, label %185, label %174
174: ; preds = %58, %51, %150, %172
%175 = phi i64 [ 0, %51 ], [ 0, %58 ], [ %72, %150 ], [ %161, %172 ]
%176 = phi i8* [ %46, %51 ], [ %46, %58 ], [ %151, %150 ], [ %162, %172 ]
br label %177
177: ; preds = %174, %177
%178 = phi i64 [ %181, %177 ], [ %175, %174 ]
%179 = phi i8* [ %183, %177 ], [ %176, %174 ]
%180 = load i8, i8* %179
%181 = add nuw i64 %178, 1
%182 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %178
store i8 %180, i8* %182
%183 = getelementptr inbounds i8, i8* %179, i64 1
%184 = icmp ugt i8* %183, %49
br i1 %184, label %185, label %177
185: ; preds = %177, %148, %172, %43
%186 = tail call i8* @strrchr(i8* dereferenceable(1) %0, i8 signext 40)
%187 = icmp eq i8* %186, null
%188 = select i1 %187, i8* %0, i8* %186
store i8 0, i8* %188
br i1 %45, label %189, label %225
189: ; preds = %185, %209
%190 = phi i8* [ %194, %209 ], [ %186, %185 ]
%191 = phi i32 [ %210, %209 ], [ %44, %185 ]
br label %192
192: ; preds = %189, %192
%193 = phi i8* [ %194, %192 ], [ %190, %189 ]
%194 = getelementptr inbounds i8, i8* %193, i64 -1
%195 = load i8, i8* %194
%196 = icmp ne i8 %195, 41
%197 = icmp uge i8* %194, %0
%198 = and i1 %196, %197
br i1 %198, label %192, label %199
199: ; preds = %192
%200 = getelementptr inbounds i8, i8* %193, i64 -2
%201 = load i8, i8* %200
%202 = tail call i64 @isdigit(i8 signext %201)
%203 = icmp eq i64 %202, 0
br i1 %203, label %209, label %204
204: ; preds = %199
%205 = load i8, i8* %200
%206 = add nsw i32 %191, 1
%207 = sext i32 %191 to i64
%208 = getelementptr inbounds i8, i8* %2, i64 %207
store i8 %205, i8* %208
br label %209
209: ; preds = %204, %199
%210 = phi i32 [ %206, %204 ], [ %191, %199 ]
%211 = load i8, i8* %194
%212 = icmp eq i8 %211, 93
%213 = icmp slt i32 %210, 6
%214 = select i1 %212, i1 %213, i1 false
br i1 %214, label %189, label %215
215: ; preds = %209, %215
%216 = phi i8* [ %217, %215 ], [ %194, %209 ]
%217 = getelementptr inbounds i8, i8* %216, i64 -1
%218 = load i8, i8* %217
%219 = icmp ne i8 %218, 40
%220 = icmp uge i8* %217, %0
%221 = and i1 %219, %220
br i1 %221, label %215, label %222
222: ; preds = %215
%223 = icmp eq i8 %218, 40
br i1 %223, label %224, label %225
224: ; preds = %222
store i8 0, i8* %217
br label %225
225: ; preds = %222, %224, %185
%226 = phi i32 [ %210, %224 ], [ %210, %222 ], [ %44, %185 ]
%227 = sext i32 %226 to i64
%228 = getelementptr inbounds i8, i8* %2, i64 %227
store i8 0, i8* %228
%229 = tail call i32 @strlen(i8* %2)
%230 = icmp ne i32 %229, 0
%231 = zext i1 %230 to i32
br label %232
232: ; preds = %225, %10, %16, %3
%233 = phi i32 [ 0, %3 ], [ 0, %16 ], [ 0, %10 ], [ %231, %225 ]
ret i32 %233
}