#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
double drand();
int /*<<< orphan*/ printf(char *, int);
void expandNewpop2D(double *Pops, double *AF, int pop, int nSNP, int n1, int n2,
                    int Ne, int ke, int admixture) {
  int p1, l, i, count;
  printf("Expand new pops in row: %i\n", pop + 1);
  for (p1 = 0; p1 < n1; p1++) {
    for (l = 0; l < nSNP; l++) {
      count = 0;
      for (i = 0; i < ke; i++)
        if (drand() < Pops[nSNP * ((pop - 1) * n1 + p1) + l])
          count++;
      if (admixture) {
        for (i = ke; i < Ne; i++)
          if (drand() < Pops[nSNP * (pop * n1 + p1) + l])
            count++;
      }
      Pops[nSNP * (pop * n1 + p1) + l] = (double)count / ke;
      if (admixture)
        Pops[nSNP * (pop * n1 + p1) + l] = (double)count / Ne;
    }
  }
}


x86 assembly (clang, -O0):
<expandNewpop2D>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x30,%rsp
mov    0x20(%rbp),%eax
mov    0x18(%rbp),%eax
mov    0x10(%rbp),%eax
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %edx,-0x14(%rbp)
mov    %ecx,-0x18(%rbp)
mov    %r8d,-0x1c(%rbp)
mov    %r9d,-0x20(%rbp)
mov    -0x14(%rbp),%esi
add    $0x1,%esi
lea    0xeac(%rip),%rdi
call   1040 <printf@plt>
movl   $0x0,-0x24(%rbp)
mov    -0x24(%rbp),%eax
cmp    -0x1c(%rbp),%eax
jge    12e5 <expandNewpop2D+0x1c5>
movl   $0x0,-0x28(%rbp)
mov    -0x28(%rbp),%eax
cmp    -0x18(%rbp),%eax
jge    12d2 <expandNewpop2D+0x1b2>
movl   $0x0,-0x30(%rbp)
movl   $0x0,-0x2c(%rbp)
mov    -0x2c(%rbp),%eax
cmp    0x18(%rbp),%eax
jge    11eb <expandNewpop2D+0xcb>
mov    $0x0,%al
call   1030 <drand@plt>
movaps %xmm0,%xmm1
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
mov    -0x14(%rbp),%edx
sub    $0x1,%edx
imul   -0x1c(%rbp),%edx
add    -0x24(%rbp),%edx
imul   %edx,%ecx
add    -0x28(%rbp),%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsd  (%rax,%rcx,8),%xmm0
ucomisd %xmm1,%xmm0
jbe    11d8 <expandNewpop2D+0xb8>
mov    -0x30(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x30(%rbp)
jmp    11dd <expandNewpop2D+0xbd>
mov    -0x2c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
jmp    118d <expandNewpop2D+0x6d>
cmpl   $0x0,0x20(%rbp)
je     125b <expandNewpop2D+0x13b>
mov    0x18(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
mov    -0x2c(%rbp),%eax
cmp    0x10(%rbp),%eax
jge    1256 <expandNewpop2D+0x136>
mov    $0x0,%al
call   1030 <drand@plt>
movaps %xmm0,%xmm1
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
mov    -0x14(%rbp),%edx
imul   -0x1c(%rbp),%edx
add    -0x24(%rbp),%edx
imul   %edx,%ecx
add    -0x28(%rbp),%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsd  (%rax,%rcx,8),%xmm0
ucomisd %xmm1,%xmm0
jbe    1243 <expandNewpop2D+0x123>
mov    -0x30(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x30(%rbp)
jmp    1248 <expandNewpop2D+0x128>
mov    -0x2c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
jmp    11fb <expandNewpop2D+0xdb>
jmp    125b <expandNewpop2D+0x13b>
cvtsi2sdl -0x30(%rbp),%xmm0
cvtsi2sdl 0x18(%rbp),%xmm1
divsd  %xmm1,%xmm0
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
mov    -0x14(%rbp),%edx
imul   -0x1c(%rbp),%edx
add    -0x24(%rbp),%edx
imul   %edx,%ecx
add    -0x28(%rbp),%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsd  %xmm0,(%rax,%rcx,8)
cmpl   $0x0,0x20(%rbp)
je     12bf <expandNewpop2D+0x19f>
cvtsi2sdl -0x30(%rbp),%xmm0
cvtsi2sdl 0x10(%rbp),%xmm1
divsd  %xmm1,%xmm0
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    -0x18(%rbp),%ecx
mov    -0x14(%rbp),%edx
imul   -0x1c(%rbp),%edx
add    -0x24(%rbp),%edx
imul   %edx,%ecx
add    -0x28(%rbp),%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsd  %xmm0,(%rax,%rcx,8)
jmp    12c4 <expandNewpop2D+0x1a4>
mov    -0x28(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x28(%rbp)
jmp    1173 <expandNewpop2D+0x53>
jmp    12d7 <expandNewpop2D+0x1b7>
mov    -0x24(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x24(%rbp)
jmp    1160 <expandNewpop2D+0x40>
add    $0x30,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<expandNewpop2D>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
sub    $0x58,%rsp
mov    %r8d,%r14d
mov    %ecx,0xc(%rsp)
mov    %edx,%ebp
mov    %rdi,%r15
lea    0x1(%rbp),%esi
lea    0xebc(%rip),%rdi
call   1040 <printf@plt>
test   %r14d,%r14d
jle    12e7 <expandNewpop2D+0x1c7>
mov    0x98(%rsp),%ebx
mov    0x90(%rsp),%esi
lea    -0x1(%rbp),%eax
imul   %r14d,%eax
cmp    %esi,%ebx
setge  %cl
imul   %r14d,%ebp
cmpl   $0x0,0xa0(%rsp)
sete   %dl
cltq
mov    %rax,0x30(%rsp)
movslq 0xc(%rsp),%rax
movslq %ebp,%rdi
mov    %rdi,0x20(%rsp)
mov    %r14d,%edi
mov    %rdi,0x38(%rsp)
mov    %rax,0x28(%rsp)
mov    %eax,%eax
mov    %rax,0x48(%rsp)
cmove  %ebx,%esi
mov    %esi,0x1c(%rsp)
or     %cl,%dl
mov    %dl,0xb(%rsp)
xor    %eax,%eax
mov    %rax,0x10(%rsp)
jmp    11dc <expandNewpop2D+0xbc>
nopl   0x0(%rax)
mov    0x10(%rsp),%rcx
add    $0x1,%rcx
mov    %rcx,%rax
mov    %rcx,0x10(%rsp)
cmp    0x38(%rsp),%rcx
je     12e7 <expandNewpop2D+0x1c7>
cmpl   $0x0,0xc(%rsp)
jle    11c0 <expandNewpop2D+0xa0>
mov    0x30(%rsp),%rax
mov    0x10(%rsp),%rdx
lea    (%rdx,%rax,1),%rcx
mov    0x28(%rsp),%rax
imul   %rax,%rcx
mov    %rcx,0x40(%rsp)
mov    0x20(%rsp),%rcx
add    %rdx,%rcx
imul   %rax,%rcx
mov    %rcx,0x50(%rsp)
xor    %r13d,%r13d
jmp    1253 <expandNewpop2D+0x133>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nop
mov    0x1c(%rsp),%eax
mov    0x98(%rsp),%ebx
xorps  %xmm0,%xmm0
cvtsi2sd %r14d,%xmm0
xorps  %xmm1,%xmm1
cvtsi2sd %eax,%xmm1
divsd  %xmm1,%xmm0
movsd  %xmm0,(%r15,%r12,8)
add    $0x1,%r13
cmp    0x48(%rsp),%r13
je     11c0 <expandNewpop2D+0xa0>
test   %ebx,%ebx
jle    1290 <expandNewpop2D+0x170>
mov    0x40(%rsp),%rax
lea    (%rax,%r13,1),%rbp
xor    %r14d,%r14d
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   (%rax)
xor    %eax,%eax
call   1030 <drand@plt>
movsd  (%r15,%rbp,8),%xmm1
xor    %eax,%eax
ucomisd %xmm0,%xmm1
seta   %al
add    %eax,%r14d
add    $0xffffffff,%ebx
jne    1270 <expandNewpop2D+0x150>
jmp    1293 <expandNewpop2D+0x173>
xor    %r14d,%r14d
mov    0x50(%rsp),%rax
lea    (%rax,%r13,1),%r12
cmpb   $0x0,0xb(%rsp)
jne    1220 <expandNewpop2D+0x100>
mov    0x98(%rsp),%ebx
mov    0x90(%rsp),%ebp
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nop
xor    %eax,%eax
call   1030 <drand@plt>
movsd  (%r15,%r12,8),%xmm1
xor    %eax,%eax
ucomisd %xmm0,%xmm1
seta   %al
add    %eax,%r14d
add    $0x1,%ebx
cmp    %ebx,%ebp
jne    12c0 <expandNewpop2D+0x1a0>
mov    %ebp,%eax
jmp    1224 <expandNewpop2D+0x104>
add    $0x58,%rsp
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
@.str = [28 x i8] c"Expand new pops in row: %i\0A\00"
define void @expandNewpop2D(double* %0, double* %1, i32 %2, i32 %3, i32 %4, i32 %5, i32 %6, i32 %7, i32 %8) {
%10 = alloca double*
%11 = alloca double*
%12 = alloca i32
%13 = alloca i32
%14 = alloca i32
%15 = alloca i32
%16 = alloca i32
%17 = alloca i32
%18 = alloca i32
%19 = alloca i32
%20 = alloca i32
%21 = alloca i32
%22 = alloca i32
store double* %0, double** %10
store double* %1, double** %11
store i32 %2, i32* %12
store i32 %3, i32* %13
store i32 %4, i32* %14
store i32 %5, i32* %15
store i32 %6, i32* %16
store i32 %7, i32* %17
store i32 %8, i32* %18
%23 = load i32, i32* %12
%24 = add nsw i32 %23, 1
%25 = call i32 @printf(i8* getelementptr inbounds ([28 x i8], [28 x i8]* @.str, i64 0, i64 0), i32 %24)
store i32 0, i32* %19
br label %26
26: ; preds = %140, %9
%27 = load i32, i32* %19
%28 = load i32, i32* %14
%29 = icmp slt i32 %27, %28
br i1 %29, label %30, label %143
30: ; preds = %26
store i32 0, i32* %20
br label %31
31: ; preds = %136, %30
%32 = load i32, i32* %20
%33 = load i32, i32* %13
%34 = icmp slt i32 %32, %33
br i1 %34, label %35, label %139
35: ; preds = %31
store i32 0, i32* %22
store i32 0, i32* %21
br label %36
36: ; preds = %61, %35
%37 = load i32, i32* %21
%38 = load i32, i32* %17
%39 = icmp slt i32 %37, %38
br i1 %39, label %40, label %64
40: ; preds = %36
%41 = call double (...) @drand()
%42 = load double*, double** %10
%43 = load i32, i32* %13
%44 = load i32, i32* %12
%45 = sub nsw i32 %44, 1
%46 = load i32, i32* %14
%47 = mul nsw i32 %45, %46
%48 = load i32, i32* %19
%49 = add nsw i32 %47, %48
%50 = mul nsw i32 %43, %49
%51 = load i32, i32* %20
%52 = add nsw i32 %50, %51
%53 = sext i32 %52 to i64
%54 = getelementptr inbounds double, double* %42, i64 %53
%55 = load double, double* %54
%56 = fcmp olt double %41, %55
br i1 %56, label %57, label %60
57: ; preds = %40
%58 = load i32, i32* %22
%59 = add nsw i32 %58, 1
store i32 %59, i32* %22
br label %60
60: ; preds = %57, %40
br label %61
61: ; preds = %60
%62 = load i32, i32* %21
%63 = add nsw i32 %62, 1
store i32 %63, i32* %21
br label %36
64: ; preds = %36
%65 = load i32, i32* %18
%66 = icmp ne i32 %65, 0
br i1 %66, label %67, label %97
67: ; preds = %64
%68 = load i32, i32* %17
store i32 %68, i32* %21
br label %69
69: ; preds = %93, %67
%70 = load i32, i32* %21
%71 = load i32, i32* %16
%72 = icmp slt i32 %70, %71
br i1 %72, label %73, label %96
73: ; preds = %69
%74 = call double (...) @drand()
%75 = load double*, double** %10
%76 = load i32, i32* %13
%77 = load i32, i32* %12
%78 = load i32, i32* %14
%79 = mul nsw i32 %77, %78
%80 = load i32, i32* %19
%81 = add nsw i32 %79, %80
%82 = mul nsw i32 %76, %81
%83 = load i32, i32* %20
%84 = add nsw i32 %82, %83
%85 = sext i32 %84 to i64
%86 = getelementptr inbounds double, double* %75, i64 %85
%87 = load double, double* %86
%88 = fcmp olt double %74, %87
br i1 %88, label %89, label %92
89: ; preds = %73
%90 = load i32, i32* %22
%91 = add nsw i32 %90, 1
store i32 %91, i32* %22
br label %92
92: ; preds = %89, %73
br label %93
93: ; preds = %92
%94 = load i32, i32* %21
%95 = add nsw i32 %94, 1
store i32 %95, i32* %21
br label %69
96: ; preds = %69
br label %97
97: ; preds = %96, %64
%98 = load i32, i32* %22
%99 = sitofp i32 %98 to double
%100 = load i32, i32* %17
%101 = sitofp i32 %100 to double
%102 = fdiv double %99, %101
%103 = load double*, double** %10
%104 = load i32, i32* %13
%105 = load i32, i32* %12
%106 = load i32, i32* %14
%107 = mul nsw i32 %105, %106
%108 = load i32, i32* %19
%109 = add nsw i32 %107, %108
%110 = mul nsw i32 %104, %109
%111 = load i32, i32* %20
%112 = add nsw i32 %110, %111
%113 = sext i32 %112 to i64
%114 = getelementptr inbounds double, double* %103, i64 %113
store double %102, double* %114
%115 = load i32, i32* %18
%116 = icmp ne i32 %115, 0
br i1 %116, label %117, label %135
117: ; preds = %97
%118 = load i32, i32* %22
%119 = sitofp i32 %118 to double
%120 = load i32, i32* %16
%121 = sitofp i32 %120 to double
%122 = fdiv double %119, %121
%123 = load double*, double** %10
%124 = load i32, i32* %13
%125 = load i32, i32* %12
%126 = load i32, i32* %14
%127 = mul nsw i32 %125, %126
%128 = load i32, i32* %19
%129 = add nsw i32 %127, %128
%130 = mul nsw i32 %124, %129
%131 = load i32, i32* %20
%132 = add nsw i32 %130, %131
%133 = sext i32 %132 to i64
%134 = getelementptr inbounds double, double* %123, i64 %133
store double %122, double* %134
br label %135
135: ; preds = %117, %97
br label %136
136: ; preds = %135
%137 = load i32, i32* %20
%138 = add nsw i32 %137, 1
store i32 %138, i32* %20
br label %31
139: ; preds = %31
br label %140
140: ; preds = %139
%141 = load i32, i32* %19
%142 = add nsw i32 %141, 1
store i32 %142, i32* %19
br label %26
143: ; preds = %26
ret void
}

LLVM IR (-O2):
@.str = [28 x i8] c"Expand new pops in row: %i\0A\00"
define void @expandNewpop2D(double* nocapture %0, double* nocapture readnone %1, i32 %2, i32 %3, i32 %4, i32 %5, i32 %6, i32 %7, i32 %8) {
%10 = add nsw i32 %2, 1
%11 = tail call i32 @printf(i8* getelementptr inbounds ([28 x i8], [28 x i8]* @.str, i64 0, i64 0), i32 %10)
%12 = icmp sgt i32 %4, 0
br i1 %12, label %13, label %77
13: ; preds = %9
%14 = icmp sgt i32 %3, 0
%15 = icmp sgt i32 %7, 0
%16 = add nsw i32 %2, -1
%17 = mul nsw i32 %16, %4
%18 = icmp eq i32 %8, 0
%19 = icmp sge i32 %7, %6
%20 = mul nsw i32 %4, %2
%21 = sext i32 %17 to i64
%22 = sext i32 %3 to i64
%23 = sext i32 %20 to i64
%24 = zext i32 %4 to i64
%25 = zext i32 %3 to i64
%26 = or i1 %18, %19
%27 = select i1 %18, i32 %7, i32 %6
br label %28
28: ; preds = %13, %74
%29 = phi i64 [ 0, %13 ], [ %75, %74 ]
br i1 %14, label %30, label %74
30: ; preds = %28
%31 = add nsw i64 %29, %21
%32 = mul nsw i64 %31, %22
%33 = add nsw i64 %29, %23
%34 = mul nsw i64 %33, %22
br label %35
35: ; preds = %30, %65
%36 = phi i64 [ 0, %30 ], [ %72, %65 ]
br i1 %15, label %37, label %50
37: ; preds = %35
%38 = add nsw i64 %36, %32
%39 = getelementptr inbounds double, double* %0, i64 %38
br label %40
40: ; preds = %37, %40
%41 = phi i32 [ 0, %37 ], [ %47, %40 ]
%42 = phi i32 [ 0, %37 ], [ %48, %40 ]
%43 = tail call double (...) @drand()
%44 = load double, double* %39
%45 = fcmp olt double %43, %44
%46 = zext i1 %45 to i32
%47 = add nuw nsw i32 %41, %46
%48 = add nuw nsw i32 %42, 1
%49 = icmp eq i32 %48, %7
br i1 %49, label %50, label %40
50: ; preds = %40, %35
%51 = phi i32 [ 0, %35 ], [ %47, %40 ]
%52 = add nsw i64 %36, %34
br i1 %26, label %65, label %53
53: ; preds = %50
%54 = getelementptr inbounds double, double* %0, i64 %52
br label %55
55: ; preds = %53, %55
%56 = phi i32 [ %51, %53 ], [ %62, %55 ]
%57 = phi i32 [ %7, %53 ], [ %63, %55 ]
%58 = tail call double (...) @drand()
%59 = load double, double* %54
%60 = fcmp olt double %58, %59
%61 = zext i1 %60 to i32
%62 = add nuw nsw i32 %56, %61
%63 = add i32 %57, 1
%64 = icmp eq i32 %63, %6
br i1 %64, label %65, label %55
65: ; preds = %55, %50
%66 = phi i32 [ %27, %50 ], [ %6, %55 ]
%67 = phi i32 [ %51, %50 ], [ %62, %55 ]
%68 = sitofp i32 %67 to double
%69 = getelementptr inbounds double, double* %0, i64 %52
%70 = sitofp i32 %66 to double
%71 = fdiv double %68, %70
store double %71, double* %69
%72 = add nuw nsw i64 %36, 1
%73 = icmp eq i64 %72, %25
br i1 %73, label %74, label %35
74: ; preds = %65, %28
%75 = add nuw nsw i64 %29, 1
%76 = icmp eq i64 %75, %24
br i1 %76, label %77, label %28
77: ; preds = %74, %9
ret void
}