void rev_comp(char *sLmer, int L) {
  char RC[5] = {3, 2, 1, 0, 4};
  int c, i, j;
  for (i = 0, j = L - 1; i < j; i++, j--) {
    c = RC[(unsigned char)sLmer[i]];
    sLmer[i] = RC[(unsigned char)sLmer[j]];
    sLmer[j] = c;
  }
  if (i == j) {
    sLmer[i] = RC[(unsigned char)sLmer[j]];
  }
}


x86 assembly (clang, -O0):
<rev_comp>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %esi,-0xc(%rbp)
mov    0xeef(%rip),%eax
mov    %eax,-0x11(%rbp)
mov    0xeea(%rip),%al
mov    %al,-0xd(%rbp)
movl   $0x0,-0x1c(%rbp)
mov    -0xc(%rbp),%eax
sub    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x20(%rbp)
mov    -0x1c(%rbp),%eax
cmp    -0x20(%rbp),%eax
jge    118f <rev_comp+0x8f>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
movzbl (%rax,%rcx,1),%eax
movsbl -0x11(%rbp,%rax,1),%eax
mov    %eax,-0x18(%rbp)
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
movzbl (%rax,%rcx,1),%eax
mov    -0x11(%rbp,%rax,1),%dl
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
mov    -0x18(%rbp),%eax
mov    %al,%dl
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
mov    -0x1c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x1c(%rbp)
mov    -0x20(%rbp),%eax
add    $0xffffffff,%eax
mov    %eax,-0x20(%rbp)
jmp    112d <rev_comp+0x2d>
mov    -0x1c(%rbp),%eax
cmp    -0x20(%rbp),%eax
jne    11b6 <rev_comp+0xb6>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x20(%rbp),%rcx
movzbl (%rax,%rcx,1),%eax
mov    -0x11(%rbp,%rax,1),%dl
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x1c(%rbp),%rcx
mov    %dl,(%rax,%rcx,1)
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<rev_comp>:
cmp    $0x2,%esi
jl     1152 <rev_comp+0x52>
mov    %esi,%ecx
add    $0xffffffffffffffff,%rcx
xor    %eax,%eax
lea    0xeec(%rip),%r8
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
xchg   %ax,%ax
movzbl (%rdi,%rax,1),%edx
movzbl (%rdx,%r8,1),%r9d
movzbl (%rdi,%rcx,1),%edx
movzbl (%rdx,%r8,1),%edx
mov    %dl,(%rdi,%rax,1)
mov    %r9b,(%rdi,%rcx,1)
add    $0x1,%rax
add    $0xffffffffffffffff,%rcx
cmp    %rcx,%rax
jl     1120 <rev_comp+0x20>
mov    %eax,%ecx
not    %ecx
add    %ecx,%esi
cmp    %esi,%eax
je     115b <rev_comp+0x5b>
jmp    1171 <rev_comp+0x71>
add    $0xffffffff,%esi
xor    %eax,%eax
cmp    %esi,%eax
jne    1171 <rev_comp+0x71>
movslq %eax,%rcx
movzbl (%rdi,%rcx,1),%ecx
lea    0xe97(%rip),%rdx
mov    (%rcx,%rdx,1),%cl
mov    %eax,%eax
mov    %cl,(%rdi,%rax,1)
ret

LLVM IR (-O0):
@__const.rev_comp.RC = [5 x i8] c"\03\02\01\00\04"
define void @rev_comp(i8* %0, i32 %1) {
%3 = alloca i8*
%4 = alloca i32
%5 = alloca [5 x i8]
%6 = alloca i32
%7 = alloca i32
%8 = alloca i32
store i8* %0, i8** %3
store i32 %1, i32* %4
%9 = bitcast [5 x i8]* %5 to i8*
store i32 0, i32* %7
%10 = load i32, i32* %4
%11 = sub nsw i32 %10, 1
store i32 %11, i32* %8
br label %12
12: ; preds = %44, %2
%13 = load i32, i32* %7
%14 = load i32, i32* %8
%15 = icmp slt i32 %13, %14
br i1 %15, label %16, label %49
16: ; preds = %12
%17 = load i8*, i8** %3
%18 = load i32, i32* %7
%19 = sext i32 %18 to i64
%20 = getelementptr inbounds i8, i8* %17, i64 %19
%21 = load i8, i8* %20
%22 = zext i8 %21 to i64
%23 = getelementptr inbounds [5 x i8], [5 x i8]* %5, i64 0, i64 %22
%24 = load i8, i8* %23
%25 = sext i8 %24 to i32
store i32 %25, i32* %6
%26 = load i8*, i8** %3
%27 = load i32, i32* %8
%28 = sext i32 %27 to i64
%29 = getelementptr inbounds i8, i8* %26, i64 %28
%30 = load i8, i8* %29
%31 = zext i8 %30 to i64
%32 = getelementptr inbounds [5 x i8], [5 x i8]* %5, i64 0, i64 %31
%33 = load i8, i8* %32
%34 = load i8*, i8** %3
%35 = load i32, i32* %7
%36 = sext i32 %35 to i64
%37 = getelementptr inbounds i8, i8* %34, i64 %36
store i8 %33, i8* %37
%38 = load i32, i32* %6
%39 = trunc i32 %38 to i8
%40 = load i8*, i8** %3
%41 = load i32, i32* %8
%42 = sext i32 %41 to i64
%43 = getelementptr inbounds i8, i8* %40, i64 %42
store i8 %39, i8* %43
br label %44
44: ; preds = %16
%45 = load i32, i32* %7
%46 = add nsw i32 %45, 1
store i32 %46, i32* %7
%47 = load i32, i32* %8
%48 = add nsw i32 %47, -1
store i32 %48, i32* %8
br label %12
49: ; preds = %12
%50 = load i32, i32* %7
%51 = load i32, i32* %8
%52 = icmp eq i32 %50, %51
br i1 %52, label %53, label %66
53: ; preds = %49
%54 = load i8*, i8** %3
%55 = load i32, i32* %8
%56 = sext i32 %55 to i64
%57 = getelementptr inbounds i8, i8* %54, i64 %56
%58 = load i8, i8* %57
%59 = zext i8 %58 to i64
%60 = getelementptr inbounds [5 x i8], [5 x i8]* %5, i64 0, i64 %59
%61 = load i8, i8* %60
%62 = load i8*, i8** %3
%63 = load i32, i32* %7
%64 = sext i32 %63 to i64
%65 = getelementptr inbounds i8, i8* %62, i64 %64
store i8 %61, i8* %65
br label %66
66: ; preds = %53, %49
ret void
}

LLVM IR (-O2):
@__const.rev_comp.RC = [5 x i8] c"\03\02\01\00\04"
define void @rev_comp(i8* nocapture %0, i32 %1) {
%3 = add nsw i32 %1, -1
%4 = icmp sgt i32 %1, 1
br i1 %4, label %5, label %27
5: ; preds = %2
%6 = zext i32 %1 to i64
%7 = add nsw i64 %6, -1
br label %8
8: ; preds = %5, %8
%9 = phi i64 [ 0, %5 ], [ %21, %8 ]
%10 = phi i64 [ %7, %5 ], [ %22, %8 ]
%11 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %9
%12 = load i8, i8* %11
%13 = zext i8 %12 to i64
%14 = getelementptr inbounds [5 x i8], [5 x i8]* @__const.rev_comp.RC, i64 0, i64 %13
%15 = load i8, i8* %14
%16 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %10
%17 = load i8, i8* %16
%18 = zext i8 %17 to i64
%19 = getelementptr inbounds [5 x i8], [5 x i8]* @__const.rev_comp.RC, i64 0, i64 %18
%20 = load i8, i8* %19
store i8 %20, i8* %11
store i8 %15, i8* %16
%21 = add nuw nsw i64 %9, 1
%22 = add nsw i64 %10, -1
%23 = icmp slt i64 %21, %22
br i1 %23, label %8, label %24
24: ; preds = %8
%25 = trunc i64 %21 to i32
%26 = trunc i64 %22 to i32
br label %27
27: ; preds = %24, %2
%28 = phi i32 [ 0, %2 ], [ %25, %24 ]
%29 = phi i32 [ %3, %2 ], [ %26, %24 ]
%30 = icmp eq i32 %28, %29
br i1 %30, label %31, label %40
31: ; preds = %27
%32 = sext i32 %28 to i64
%33 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %32
%34 = load i8, i8* %33
%35 = zext i8 %34 to i64
%36 = getelementptr inbounds [5 x i8], [5 x i8]* @__const.rev_comp.RC, i64 0, i64 %35
%37 = load i8, i8* %36
%38 = zext i32 %28 to i64
%39 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %38
store i8 %37, i8* %39
br label %40
40: ; preds = %31, %27
ret void
}