double chainScoreBlock(char *q, char *t, int size, int matrix[256][256]) {
  double score = 0;
  int i;
  for (i = 0; i < size; ++i)
    score += matrix[(int)q[i]][(int)t[i]];
  return score;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<chainScoreBlock>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %edx,-0x14(%rbp)
mov    %rcx,-0x20(%rbp)
xorps  %xmm0,%xmm0
movsd  %xmm0,-0x28(%rbp)
movl   $0x0,-0x2c(%rbp)
mov    -0x2c(%rbp),%eax
cmp    -0x14(%rbp),%eax
jge    1174 <chainScoreBlock+0x74>
mov    -0x20(%rbp),%rax
mov    -0x8(%rbp),%rcx
movslq -0x2c(%rbp),%rdx
movsbl (%rcx,%rdx,1),%ecx
movslq %ecx,%rcx
shl    $0xa,%rcx
add    %rcx,%rax
mov    -0x10(%rbp),%rcx
movslq -0x2c(%rbp),%rdx
movsbl (%rcx,%rdx,1),%ecx
movslq %ecx,%rcx
cvtsi2sdl (%rax,%rcx,4),%xmm0
addsd  -0x28(%rbp),%xmm0
movsd  %xmm0,-0x28(%rbp)
mov    -0x2c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
jmp    1122 <chainScoreBlock+0x22>
movsd  -0x28(%rbp),%xmm0
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<chainScoreBlock>:
test   %edx,%edx
jle    1114 <chainScoreBlock+0x14>
mov    %edx,%r8d
cmp    $0x1,%edx
jne    1118 <chainScoreBlock+0x18>
xorpd  %xmm0,%xmm0
xor    %edx,%edx
jmp    1177 <chainScoreBlock+0x77>
xorps  %xmm0,%xmm0
ret
mov    %r8d,%r9d
and    $0xfffffffe,%r9d
xorpd  %xmm0,%xmm0
xor    %edx,%edx
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nop
movsbq (%rdi,%rdx,1),%rax
movsbq (%rsi,%rdx,1),%r10
shl    $0xa,%rax
add    %rcx,%rax
xorps  %xmm1,%xmm1
cvtsi2sdl (%rax,%r10,4),%xmm1
addsd  %xmm0,%xmm1
movsbq 0x1(%rdi,%rdx,1),%rax
movsbq 0x1(%rsi,%rdx,1),%r10
shl    $0xa,%rax
add    %rcx,%rax
xorps  %xmm0,%xmm0
cvtsi2sdl (%rax,%r10,4),%xmm0
addsd  %xmm1,%xmm0
add    $0x2,%rdx
cmp    %rdx,%r9
jne    1130 <chainScoreBlock+0x30>
test   $0x1,%r8b
je     119a <chainScoreBlock+0x9a>
movsbq (%rdi,%rdx,1),%rax
movsbq (%rsi,%rdx,1),%rdx
shl    $0xa,%rax
add    %rax,%rcx
xorps  %xmm1,%xmm1
cvtsi2sdl (%rcx,%rdx,4),%xmm1
addsd  %xmm1,%xmm0
ret

LLVM IR (-O0):
define double @chainScoreBlock(i8* %0, i8* %1, i32 %2, [256 x i32]* %3) {
%5 = alloca i8*
%6 = alloca i8*
%7 = alloca i32
%8 = alloca [256 x i32]*
%9 = alloca double
%10 = alloca i32
store i8* %0, i8** %5
store i8* %1, i8** %6
store i32 %2, i32* %7
store [256 x i32]* %3, [256 x i32]** %8
store double 0.000000e+00, double* %9
store i32 0, i32* %10
br label %11
11: ; preds = %37, %4
%12 = load i32, i32* %10
%13 = load i32, i32* %7
%14 = icmp slt i32 %12, %13
br i1 %14, label %15, label %40
15: ; preds = %11
%16 = load [256 x i32]*, [256 x i32]** %8
%17 = load i8*, i8** %5
%18 = load i32, i32* %10
%19 = sext i32 %18 to i64
%20 = getelementptr inbounds i8, i8* %17, i64 %19
%21 = load i8, i8* %20
%22 = sext i8 %21 to i32
%23 = sext i32 %22 to i64
%24 = getelementptr inbounds [256 x i32], [256 x i32]* %16, i64 %23
%25 = load i8*, i8** %6
%26 = load i32, i32* %10
%27 = sext i32 %26 to i64
%28 = getelementptr inbounds i8, i8* %25, i64 %27
%29 = load i8, i8* %28
%30 = sext i8 %29 to i32
%31 = sext i32 %30 to i64
%32 = getelementptr inbounds [256 x i32], [256 x i32]* %24, i64 0, i64 %31
%33 = load i32, i32* %32
%34 = sitofp i32 %33 to double
%35 = load double, double* %9
%36 = fadd double %35, %34
store double %36, double* %9
br label %37
37: ; preds = %15
%38 = load i32, i32* %10
%39 = add nsw i32 %38, 1
store i32 %39, i32* %10
br label %11
40: ; preds = %11
%41 = load double, double* %9
ret double %41
}

LLVM IR (-O2):
define double @chainScoreBlock(i8* nocapture %0, i8* nocapture %1, i32 %2, [256 x i32]* nocapture %3) {
%5 = icmp sgt i32 %2, 0
br i1 %5, label %6, label %56
6: ; preds = %4
%7 = zext i32 %2 to i64
%8 = and i64 %7, 1
%9 = icmp eq i32 %2, 1
br i1 %9, label %40, label %10
10: ; preds = %6
%11 = and i64 %7, 4294967294
br label %12
12: ; preds = %12, %10
%13 = phi i64 [ 0, %10 ], [ %37, %12 ]
%14 = phi double [ 0.000000e+00, %10 ], [ %36, %12 ]
%15 = phi i64 [ 0, %10 ], [ %38, %12 ]
%16 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %13
%17 = load i8, i8* %16
%18 = sext i8 %17 to i64
%19 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %13
%20 = load i8, i8* %19
%21 = sext i8 %20 to i64
%22 = getelementptr inbounds [256 x i32], [256 x i32]* %3, i64 %18, i64 %21
%23 = load i32, i32* %22
%24 = sitofp i32 %23 to double
%25 = fadd double %14, %24
%26 = or i64 %13, 1
%27 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %26
%28 = load i8, i8* %27
%29 = sext i8 %28 to i64
%30 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %26
%31 = load i8, i8* %30
%32 = sext i8 %31 to i64
%33 = getelementptr inbounds [256 x i32], [256 x i32]* %3, i64 %29, i64 %32
%34 = load i32, i32* %33
%35 = sitofp i32 %34 to double
%36 = fadd double %25, %35
%37 = add nuw nsw i64 %13, 2
%38 = add i64 %15, 2
%39 = icmp eq i64 %38, %11
br i1 %39, label %40, label %12
40: ; preds = %12, %6
%41 = phi double [ undef, %6 ], [ %36, %12 ]
%42 = phi i64 [ 0, %6 ], [ %37, %12 ]
%43 = phi double [ 0.000000e+00, %6 ], [ %36, %12 ]
%44 = icmp eq i64 %8, 0
br i1 %44, label %56, label %45
45: ; preds = %40
%46 = getelementptr inbounds i8, i8* %0, i64 %42
%47 = load i8, i8* %46
%48 = sext i8 %47 to i64
%49 = getelementptr inbounds i8, i8* %1, i64 %42
%50 = load i8, i8* %49
%51 = sext i8 %50 to i64
%52 = getelementptr inbounds [256 x i32], [256 x i32]* %3, i64 %48, i64 %51
%53 = load i32, i32* %52
%54 = sitofp i32 %53 to double
%55 = fadd double %43, %54
br label %56
56: ; preds = %45, %40, %4
%57 = phi double [ 0.000000e+00, %4 ], [ %41, %40 ], [ %55, %45 ]
ret double %57
}