#define NULL ((void *)0)
typedef unsigned long size_t; // Customize by platform.
typedef long intptr_t;
typedef unsigned long uintptr_t;
typedef long scalar_t__; // Either arithmetic or pointer type.
/* By default, we understand bool (as a convenience). */
typedef int bool;
#define false 0
#define true 1

/* Forward declarations */

/* Type definitions */

/* Variables and functions */
int max2(int, int);
int min2(int, int);
void crm_faster_2motifs_allt(char ***motif_counts, int **init_bin_boundary,
                             int **finit_bin_boundary, int **crm_positions,
                             int max_crm_positions, int m1, int m2, int N,
                             int window_bins, int n_transcripts,
                             int max_n_transcripts,
                             int **occurrences_per_transcript, int report_all,
                             int *crm_output) {
  int errorcode = 0;
  int transcript;
  int n_tr = 0;
  int n_crm_init;
  int bin_init1, bin_init2, bin_init3, bin_init4, bin_init;
  int bin_finit1, bin_finit2, bin_finit3, bin_finit4, bin_finit;
  int bin;
  int n_crm = 0;
  int n1, n2;
  int n_cooc;
  int total_n1, total_n2;
  if (max_n_transcripts < 0)
    max_n_transcripts = n_transcripts;
  transcript = 0;
  while ((transcript < n_transcripts) & (n_tr <= max_n_transcripts)) {
    transcript++;
    total_n1 = occurrences_per_transcript[m1][transcript];
    total_n2 = occurrences_per_transcript[m2][transcript];
    if ((total_n1 + total_n2) >= N) {
      bin_init1 = init_bin_boundary[m1][transcript];
      bin_init2 = init_bin_boundary[m2][transcript];
      bin_init = min2(bin_init1, bin_init2);
      bin_finit1 = finit_bin_boundary[m1][transcript];
      bin_finit2 = finit_bin_boundary[m2][transcript];
      bin_finit = max2(bin_finit1, bin_finit2);
      bin = bin_init;
      n_crm_init = n_crm;
      if (report_all == 1) {
        while (bin <= bin_finit) {
          n_cooc = motif_counts[m1][bin][transcript] +
                   motif_counts[m2][bin][transcript];
          if (n_cooc >= N) {
            n_crm++;
            if (n_crm > max_crm_positions) {
              errorcode++;
            } else {
              crm_positions[n_crm][1] = transcript;
              crm_positions[n_crm][2] = bin;
              crm_positions[n_crm][3] = n_cooc;
            }
            bin += window_bins;
          } else {
            bin++;
          }
        }
      } else {
        while (bin <= bin_finit) {
          n_cooc = motif_counts[m1][bin][transcript] +
                   motif_counts[m2][bin][transcript];
          if (n_cooc >= N) {
            n_crm++;
            bin += window_bins;
          } else {
            bin++;
          }
        }
      }
      if (n_crm > n_crm_init)
        n_tr++;
    }
  }
  crm_output[0] = n_crm;
  crm_output[1] = n_tr;
  crm_output[2] = errorcode;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<crm_faster_2motifs_allt>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
sub    $0x80,%rsp
mov    0x48(%rbp),%rax
mov    0x40(%rbp),%eax
mov    0x38(%rbp),%rax
mov    0x30(%rbp),%eax
mov    0x28(%rbp),%eax
mov    0x20(%rbp),%eax
mov    0x18(%rbp),%eax
mov    0x10(%rbp),%eax
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %rdx,-0x18(%rbp)
mov    %rcx,-0x20(%rbp)
mov    %r8d,-0x24(%rbp)
mov    %r9d,-0x28(%rbp)
movl   $0x0,-0x2c(%rbp)
movl   $0x0,-0x34(%rbp)
movl   $0x0,-0x68(%rbp)
cmpl   $0x0,0x30(%rbp)
jge    1182 <crm_faster_2motifs_allt+0x62>
mov    0x28(%rbp),%eax
mov    %eax,0x30(%rbp)
movl   $0x0,-0x30(%rbp)
mov    -0x30(%rbp),%eax
cmp    0x28(%rbp),%eax
setl   %al
and    $0x1,%al
movzbl %al,%eax
mov    -0x34(%rbp),%ecx
cmp    0x30(%rbp),%ecx
setle  %cl
and    $0x1,%cl
movzbl %cl,%ecx
and    %ecx,%eax
cmp    $0x0,%eax
je     13f6 <crm_faster_2motifs_allt+0x2d6>
mov    -0x30(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x30(%rbp)
mov    0x38(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x30(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x78(%rbp)
mov    0x38(%rbp),%rax
movslq 0x10(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x30(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x7c(%rbp)
mov    -0x78(%rbp),%eax
add    -0x7c(%rbp),%eax
cmp    0x18(%rbp),%eax
jl     13f1 <crm_faster_2motifs_allt+0x2d1>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x30(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x3c(%rbp)
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq 0x10(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x30(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x40(%rbp)
mov    -0x3c(%rbp),%edi
mov    -0x40(%rbp),%esi
call   1040 <min2@plt>
mov    %eax,-0x4c(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x30(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x50(%rbp)
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq 0x10(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x30(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,4),%eax
mov    %eax,-0x54(%rbp)
mov    -0x50(%rbp),%edi
mov    -0x54(%rbp),%esi
call   1030 <max2@plt>
mov    %eax,-0x60(%rbp)
mov    -0x4c(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x64(%rbp)
mov    -0x68(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x38(%rbp)
cmpl   $0x1,0x40(%rbp)
jne    1353 <crm_faster_2motifs_allt+0x233>
jmp    1284 <crm_faster_2motifs_allt+0x164>
mov    -0x64(%rbp),%eax
cmp    -0x60(%rbp),%eax
jg     134e <crm_faster_2motifs_allt+0x22e>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x64(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x30(%rbp),%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
mov    -0x8(%rbp),%rcx
movslq 0x10(%rbp),%rdx
mov    (%rcx,%rdx,8),%rcx
movslq -0x64(%rbp),%rdx
mov    (%rcx,%rdx,8),%rcx
movslq -0x30(%rbp),%rdx
movsbl (%rcx,%rdx,1),%ecx
add    %ecx,%eax
mov    %eax,-0x74(%rbp)
mov    -0x74(%rbp),%eax
cmp    0x18(%rbp),%eax
jl     1340 <crm_faster_2motifs_allt+0x220>
mov    -0x68(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x68(%rbp)
mov    -0x68(%rbp),%eax
cmp    -0x24(%rbp),%eax
jle    12fc <crm_faster_2motifs_allt+0x1dc>
mov    -0x2c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
jmp    1332 <crm_faster_2motifs_allt+0x212>
mov    -0x30(%rbp),%ecx
mov    -0x20(%rbp),%rax
movslq -0x68(%rbp),%rdx
mov    (%rax,%rdx,8),%rax
mov    %ecx,0x4(%rax)
mov    -0x64(%rbp),%ecx
mov    -0x20(%rbp),%rax
movslq -0x68(%rbp),%rdx
mov    (%rax,%rdx,8),%rax
mov    %ecx,0x8(%rax)
mov    -0x74(%rbp),%ecx
mov    -0x20(%rbp),%rax
movslq -0x68(%rbp),%rdx
mov    (%rax,%rdx,8),%rax
mov    %ecx,0xc(%rax)
mov    0x20(%rbp),%eax
add    -0x64(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x64(%rbp)
jmp    1349 <crm_faster_2motifs_allt+0x229>
mov    -0x64(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x64(%rbp)
jmp    1284 <crm_faster_2motifs_allt+0x164>
jmp    13d7 <crm_faster_2motifs_allt+0x2b7>
jmp    1358 <crm_faster_2motifs_allt+0x238>
mov    -0x64(%rbp),%eax
cmp    -0x60(%rbp),%eax
jg     13d2 <crm_faster_2motifs_allt+0x2b2>
mov    -0x8(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x64(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x30(%rbp),%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
mov    -0x8(%rbp),%rcx
movslq 0x10(%rbp),%rdx
mov    (%rcx,%rdx,8),%rcx
movslq -0x64(%rbp),%rdx
mov    (%rcx,%rdx,8),%rcx
movslq -0x30(%rbp),%rdx
movsbl (%rcx,%rdx,1),%ecx
add    %ecx,%eax
mov    %eax,-0x74(%rbp)
mov    -0x74(%rbp),%eax
cmp    0x18(%rbp),%eax
jl     13c4 <crm_faster_2motifs_allt+0x2a4>
mov    -0x68(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x68(%rbp)
mov    0x20(%rbp),%eax
add    -0x64(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x64(%rbp)
jmp    13cd <crm_faster_2motifs_allt+0x2ad>
mov    -0x64(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x64(%rbp)
jmp    1358 <crm_faster_2motifs_allt+0x238>
jmp    13d7 <crm_faster_2motifs_allt+0x2b7>
mov    -0x68(%rbp),%eax
cmp    -0x38(%rbp),%eax
jle    13ec <crm_faster_2motifs_allt+0x2cc>
mov    -0x34(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x34(%rbp)
jmp    13f1 <crm_faster_2motifs_allt+0x2d1>
jmp    1189 <crm_faster_2motifs_allt+0x69>
mov    -0x68(%rbp),%ecx
mov    0x48(%rbp),%rax
mov    %ecx,(%rax)
mov    -0x34(%rbp),%ecx
mov    0x48(%rbp),%rax
mov    %ecx,0x4(%rax)
mov    -0x2c(%rbp),%ecx
mov    0x48(%rbp),%rax
mov    %ecx,0x8(%rax)
add    $0x80,%rsp
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<crm_faster_2motifs_allt>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
sub    $0x48,%rsp
mov    %rdx,0x40(%rsp)
mov    %rsi,0x38(%rsp)
mov    %rdi,0x20(%rsp)
mov    0x98(%rsp),%eax
mov    0xa0(%rsp),%esi
test   %esi,%esi
cmovs  %eax,%esi
xor    %r11d,%r11d
test   %esi,%esi
js     1386 <crm_faster_2motifs_allt+0x266>
mov    $0x0,%ebp
mov    $0x0,%r12d
test   %eax,%eax
jle    138b <crm_faster_2motifs_allt+0x26b>
mov    0xa8(%rsp),%rbx
mov    0x88(%rsp),%r14d
movslq %r9d,%r13
movslq 0x80(%rsp),%r10
mov    %eax,%edi
xor    %r15d,%r15d
xor    %r12d,%r12d
xor    %ebp,%ebp
xor    %r11d,%r11d
mov    %esi,0x18(%rsp)
mov    %r13,0x10(%rsp)
mov    %r10,0x8(%rsp)
mov    %rcx,0x28(%rsp)
mov    %rdi,0x30(%rsp)
xchg   %ax,%ax
mov    (%rbx,%r13,8),%rax
mov    (%rbx,%r10,8),%rdx
mov    0x4(%rdx,%r15,4),%edx
add    0x4(%rax,%r15,4),%edx
add    $0x1,%r15
cmp    %r14d,%edx
jl     130f <crm_faster_2motifs_allt+0x1ef>
mov    %ebp,0x1c(%rsp)
mov    %r12d,(%rsp)
mov    %r11d,0x4(%rsp)
mov    %r8d,%ebx
mov    0x38(%rsp),%rcx
mov    (%rcx,%r13,8),%rax
mov    (%rax,%r15,4),%edi
mov    (%rcx,%r10,8),%rax
mov    (%rax,%r15,4),%esi
mov    %r10,%r12
call   1040 <min2@plt>
mov    %eax,%ebp
mov    0x40(%rsp),%rcx
mov    (%rcx,%r13,8),%rax
mov    (%rax,%r15,4),%edi
mov    (%rcx,%r12,8),%rax
mov    (%rax,%r15,4),%esi
call   1030 <max2@plt>
cmpl   $0x1,0xb0(%rsp)
01
jne    12d0 <crm_faster_2motifs_allt+0x1b0>
cmp    %eax,%ebp
mov    %ebx,%r8d
mov    0x28(%rsp),%rcx
mov    0x4(%rsp),%r11d
jg     12dc <crm_faster_2motifs_allt+0x1bc>
mov    0x20(%rsp),%rdx
mov    0x10(%rsp),%rsi
mov    (%rdx,%rsi,8),%r9
mov    0x8(%rsp),%rsi
mov    (%rdx,%rsi,8),%r10
mov    %r11d,%edi
mov    (%rsp),%r12d
mov    0x90(%rsp),%r13d
jmp    127a <crm_faster_2motifs_allt+0x15a>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
nopl   (%rax)
mov    %edi,%esi
add    %ebx,%ebp
mov    %esi,%edi
cmp    %eax,%ebp
jg     12e3 <crm_faster_2motifs_allt+0x1c3>
movslq %ebp,%rsi
mov    (%r9,%rsi,8),%rdx
movsbl (%rdx,%r15,1),%ebx
mov    (%r10,%rsi,8),%rdx
movsbl (%rdx,%r15,1),%edx
add    %ebx,%edx
mov    $0x1,%ebx
cmp    %r14d,%edx
jl     1270 <crm_faster_2motifs_allt+0x150>
lea    0x1(%rdi),%esi
cmp    %r8d,%edi
jge    12c0 <crm_faster_2motifs_allt+0x1a0>
movslq %esi,%rdi
mov    (%rcx,%rdi,8),%rdi
mov    %r15d,0x4(%rdi)
mov    %ebp,0x8(%rdi)
mov    %edx,0xc(%rdi)
jmp    12c4 <crm_faster_2motifs_allt+0x1a4>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
add    $0x1,%r12d
mov    %r13d,%ebx
jmp    1272 <crm_faster_2motifs_allt+0x152>
nopl   0x0(%rax)
cmp    %eax,%ebp
mov    %ebx,%r8d
mov    0x4(%rsp),%r11d
jle    131e <crm_faster_2motifs_allt+0x1fe>
mov    %r11d,%esi
mov    (%rsp),%r12d
xor    %eax,%eax
cmp    %r11d,%esi
setg   %al
mov    0x1c(%rsp),%ebp
add    %eax,%ebp
mov    %esi,%r11d
mov    0x18(%rsp),%esi
mov    0xa8(%rsp),%rbx
mov    0x10(%rsp),%r13
mov    0x8(%rsp),%r10
mov    0x30(%rsp),%rdi
cmp    %esi,%ebp
jg     138b <crm_faster_2motifs_allt+0x26b>
cmp    %rdi,%r15
jb     11b0 <crm_faster_2motifs_allt+0x90>
jmp    138b <crm_faster_2motifs_allt+0x26b>
mov    0x20(%rsp),%rdx
mov    0x10(%rsp),%rsi
mov    (%rdx,%rsi,8),%r9
mov    0x8(%rsp),%rsi
mov    (%rdx,%rsi,8),%r10
mov    %r11d,%esi
mov    (%rsp),%r12d
mov    0x90(%rsp),%r13d
jmp    135b <crm_faster_2motifs_allt+0x23b>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
mov    %dl,%dil
add    %edi,%esi
add    %ebx,%ebp
cmp    %eax,%ebp
jg     12e3 <crm_faster_2motifs_allt+0x1c3>
movslq %ebp,%rdx
mov    (%r9,%rdx,8),%rdi
movsbl (%rdi,%r15,1),%edi
mov    (%r10,%rdx,8),%rdx
movsbl (%rdx,%r15,1),%edx
add    %edi,%edx
xor    %edi,%edi
mov    $0x1,%ebx
cmp    %r14d,%edx
setge  %dl
jl     1350 <crm_faster_2motifs_allt+0x230>
mov    %r13d,%ebx
jmp    1350 <crm_faster_2motifs_allt+0x230>
xor    %ebp,%ebp
xor    %r12d,%r12d
mov    0xb8(%rsp),%rax
mov    %r11d,(%rax)
mov    %ebp,0x4(%rax)
mov    %r12d,0x8(%rax)
add    $0x48,%rsp
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define void @crm_faster_2motifs_allt(i8*** %0, i32** %1, i32** %2, i32** %3, i32 %4, i32 %5, i32 %6, i32 %7, i32 %8, i32 %9, i32 %10, i32** %11, i32 %12, i32* %13) {
%15 = alloca i8***
%16 = alloca i32**
%17 = alloca i32**
%18 = alloca i32**
%19 = alloca i32
%20 = alloca i32
%21 = alloca i32
%22 = alloca i32
%23 = alloca i32
%24 = alloca i32
%25 = alloca i32
%26 = alloca i32**
%27 = alloca i32
%28 = alloca i32*
%29 = alloca i32
%30 = alloca i32
%31 = alloca i32
%32 = alloca i32
%33 = alloca i32
%34 = alloca i32
%35 = alloca i32
%36 = alloca i32
%37 = alloca i32
%38 = alloca i32
%39 = alloca i32
%40 = alloca i32
%41 = alloca i32
%42 = alloca i32
%43 = alloca i32
%44 = alloca i32
%45 = alloca i32
%46 = alloca i32
%47 = alloca i32
%48 = alloca i32
%49 = alloca i32
store i8*** %0, i8**** %15
store i32** %1, i32*** %16
store i32** %2, i32*** %17
store i32** %3, i32*** %18
store i32 %4, i32* %19
store i32 %5, i32* %20
store i32 %6, i32* %21
store i32 %7, i32* %22
store i32 %8, i32* %23
store i32 %9, i32* %24
store i32 %10, i32* %25
store i32** %11, i32*** %26
store i32 %12, i32* %27
store i32* %13, i32** %28
store i32 0, i32* %29
store i32 0, i32* %31
store i32 0, i32* %44
%50 = load i32, i32* %25
%51 = icmp slt i32 %50, 0
br i1 %51, label %52, label %54
52: ; preds = %14
%53 = load i32, i32* %24
store i32 %53, i32* %25
br label %54
54: ; preds = %52, %14
store i32 0, i32* %30
br label %55
55: ; preds = %274, %54
%56 = load i32, i32* %30
%57 = load i32, i32* %24
%58 = icmp slt i32 %56, %57
%59 = zext i1 %58 to i32
%60 = load i32, i32* %31
%61 = load i32, i32* %25
%62 = icmp sle i32 %60, %61
%63 = zext i1 %62 to i32
%64 = and i32 %59, %63
%65 = icmp ne i32 %64, 0
br i1 %65, label %66, label %275
66: ; preds = %55
%67 = load i32, i32* %30
%68 = add nsw i32 %67, 1
store i32 %68, i32* %30
%69 = load i32**, i32*** %26
%70 = load i32, i32* %20
%71 = sext i32 %70 to i64
%72 = getelementptr inbounds i32*, i32** %69, i64 %71
%73 = load i32*, i32** %72
%74 = load i32, i32* %30
%75 = sext i32 %74 to i64
%76 = getelementptr inbounds i32, i32* %73, i64 %75
%77 = load i32, i32* %76
store i32 %77, i32* %48
%78 = load i32**, i32*** %26
%79 = load i32, i32* %21
%80 = sext i32 %79 to i64
%81 = getelementptr inbounds i32*, i32** %78, i64 %80
%82 = load i32*, i32** %81
%83 = load i32, i32* %30
%84 = sext i32 %83 to i64
%85 = getelementptr inbounds i32, i32* %82, i64 %84
%86 = load i32, i32* %85
store i32 %86, i32* %49
%87 = load i32, i32* %48
%88 = load i32, i32* %49
%89 = add nsw i32 %87, %88
%90 = load i32, i32* %22
%91 = icmp sge i32 %89, %90
br i1 %91, label %92, label %274
92: ; preds = %66
%93 = load i32**, i32*** %16
%94 = load i32, i32* %20
%95 = sext i32 %94 to i64
%96 = getelementptr inbounds i32*, i32** %93, i64 %95
%97 = load i32*, i32** %96
%98 = load i32, i32* %30
%99 = sext i32 %98 to i64
%100 = getelementptr inbounds i32, i32* %97, i64 %99
%101 = load i32, i32* %100
store i32 %101, i32* %33
%102 = load i32**, i32*** %16
%103 = load i32, i32* %21
%104 = sext i32 %103 to i64
%105 = getelementptr inbounds i32*, i32** %102, i64 %104
%106 = load i32*, i32** %105
%107 = load i32, i32* %30
%108 = sext i32 %107 to i64
%109 = getelementptr inbounds i32, i32* %106, i64 %108
%110 = load i32, i32* %109
store i32 %110, i32* %34
%111 = load i32, i32* %33
%112 = load i32, i32* %34
%113 = call i32 @min2(i32 %111, i32 %112)
store i32 %113, i32* %37
%114 = load i32**, i32*** %17
%115 = load i32, i32* %20
%116 = sext i32 %115 to i64
%117 = getelementptr inbounds i32*, i32** %114, i64 %116
%118 = load i32*, i32** %117
%119 = load i32, i32* %30
%120 = sext i32 %119 to i64
%121 = getelementptr inbounds i32, i32* %118, i64 %120
%122 = load i32, i32* %121
store i32 %122, i32* %38
%123 = load i32**, i32*** %17
%124 = load i32, i32* %21
%125 = sext i32 %124 to i64
%126 = getelementptr inbounds i32*, i32** %123, i64 %125
%127 = load i32*, i32** %126
%128 = load i32, i32* %30
%129 = sext i32 %128 to i64
%130 = getelementptr inbounds i32, i32* %127, i64 %129
%131 = load i32, i32* %130
store i32 %131, i32* %39
%132 = load i32, i32* %38
%133 = load i32, i32* %39
%134 = call i32 @max2(i32 %132, i32 %133)
store i32 %134, i32* %42
%135 = load i32, i32* %37
store i32 %135, i32* %43
%136 = load i32, i32* %44
store i32 %136, i32* %32
%137 = load i32, i32* %27
%138 = icmp eq i32 %137, 1
br i1 %138, label %139, label %217
139: ; preds = %92
br label %140
140: ; preds = %215, %139
%141 = load i32, i32* %43
%142 = load i32, i32* %42
%143 = icmp sle i32 %141, %142
br i1 %143, label %144, label %216
144: ; preds = %140
%145 = load i8***, i8**** %15
%146 = load i32, i32* %20
%147 = sext i32 %146 to i64
%148 = getelementptr inbounds i8**, i8*** %145, i64 %147
%149 = load i8**, i8*** %148
%150 = load i32, i32* %43
%151 = sext i32 %150 to i64
%152 = getelementptr inbounds i8*, i8** %149, i64 %151
%153 = load i8*, i8** %152
%154 = load i32, i32* %30
%155 = sext i32 %154 to i64
%156 = getelementptr inbounds i8, i8* %153, i64 %155
%157 = load i8, i8* %156
%158 = sext i8 %157 to i32
%159 = load i8***, i8**** %15
%160 = load i32, i32* %21
%161 = sext i32 %160 to i64
%162 = getelementptr inbounds i8**, i8*** %159, i64 %161
%163 = load i8**, i8*** %162
%164 = load i32, i32* %43
%165 = sext i32 %164 to i64
%166 = getelementptr inbounds i8*, i8** %163, i64 %165
%167 = load i8*, i8** %166
%168 = load i32, i32* %30
%169 = sext i32 %168 to i64
%170 = getelementptr inbounds i8, i8* %167, i64 %169
%171 = load i8, i8* %170
%172 = sext i8 %171 to i32
%173 = add nsw i32 %158, %172
store i32 %173, i32* %47
%174 = load i32, i32* %47
%175 = load i32, i32* %22
%176 = icmp sge i32 %174, %175
br i1 %176, label %177, label %212
177: ; preds = %144
%178 = load i32, i32* %44
%179 = add nsw i32 %178, 1
store i32 %179, i32* %44
%180 = load i32, i32* %44
%181 = load i32, i32* %19
%182 = icmp sgt i32 %180, %181
br i1 %182, label %183, label %186
183: ; preds = %177
%184 = load i32, i32* %29
%185 = add nsw i32 %184, 1
store i32 %185, i32* %29
br label %208
186: ; preds = %177
%187 = load i32, i32* %30
%188 = load i32**, i32*** %18
%189 = load i32, i32* %44
%190 = sext i32 %189 to i64
%191 = getelementptr inbounds i32*, i32** %188, i64 %190
%192 = load i32*, i32** %191
%193 = getelementptr inbounds i32, i32* %192, i64 1
store i32 %187, i32* %193
%194 = load i32, i32* %43
%195 = load i32**, i32*** %18
%196 = load i32, i32* %44
%197 = sext i32 %196 to i64
%198 = getelementptr inbounds i32*, i32** %195, i64 %197
%199 = load i32*, i32** %198
%200 = getelementptr inbounds i32, i32* %199, i64 2
store i32 %194, i32* %200
%201 = load i32, i32* %47
%202 = load i32**, i32*** %18
%203 = load i32, i32* %44
%204 = sext i32 %203 to i64
%205 = getelementptr inbounds i32*, i32** %202, i64 %204
%206 = load i32*, i32** %205
%207 = getelementptr inbounds i32, i32* %206, i64 3
store i32 %201, i32* %207
br label %208
208: ; preds = %186, %183
%209 = load i32, i32* %23
%210 = load i32, i32* %43
%211 = add nsw i32 %210, %209
store i32 %211, i32* %43
br label %215
212: ; preds = %144
%213 = load i32, i32* %43
%214 = add nsw i32 %213, 1
store i32 %214, i32* %43
br label %215
215: ; preds = %212, %208
br label %140
216: ; preds = %140
br label %266
217: ; preds = %92
br label %218
218: ; preds = %264, %217
%219 = load i32, i32* %43
%220 = load i32, i32* %42
%221 = icmp sle i32 %219, %220
br i1 %221, label %222, label %265
222: ; preds = %218
%223 = load i8***, i8**** %15
%224 = load i32, i32* %20
%225 = sext i32 %224 to i64
%226 = getelementptr inbounds i8**, i8*** %223, i64 %225
%227 = load i8**, i8*** %226
%228 = load i32, i32* %43
%229 = sext i32 %228 to i64
%230 = getelementptr inbounds i8*, i8** %227, i64 %229
%231 = load i8*, i8** %230
%232 = load i32, i32* %30
%233 = sext i32 %232 to i64
%234 = getelementptr inbounds i8, i8* %231, i64 %233
%235 = load i8, i8* %234
%236 = sext i8 %235 to i32
%237 = load i8***, i8**** %15
%238 = load i32, i32* %21
%239 = sext i32 %238 to i64
%240 = getelementptr inbounds i8**, i8*** %237, i64 %239
%241 = load i8**, i8*** %240
%242 = load i32, i32* %43
%243 = sext i32 %242 to i64
%244 = getelementptr inbounds i8*, i8** %241, i64 %243
%245 = load i8*, i8** %244
%246 = load i32, i32* %30
%247 = sext i32 %246 to i64
%248 = getelementptr inbounds i8, i8* %245, i64 %247
%249 = load i8, i8* %248
%250 = sext i8 %249 to i32
%251 = add nsw i32 %236, %250
store i32 %251, i32* %47
%252 = load i32, i32* %47
%253 = load i32, i32* %22
%254 = icmp sge i32 %252, %253
br i1 %254, label %255, label %261
255: ; preds = %222
%256 = load i32, i32* %44
%257 = add nsw i32 %256, 1
store i32 %257, i32* %44
%258 = load i32, i32* %23
%259 = load i32, i32* %43
%260 = add nsw i32 %259, %258
store i32 %260, i32* %43
br label %264
261: ; preds = %222
%262 = load i32, i32* %43
%263 = add nsw i32 %262, 1
store i32 %263, i32* %43
br label %264
264: ; preds = %261, %255
br label %218
265: ; preds = %218
br label %266
266: ; preds = %265, %216
%267 = load i32, i32* %44
%268 = load i32, i32* %32
%269 = icmp sgt i32 %267, %268
br i1 %269, label %270, label %273
270: ; preds = %266
%271 = load i32, i32* %31
%272 = add nsw i32 %271, 1
store i32 %272, i32* %31
br label %273
273: ; preds = %270, %266
br label %274
274: ; preds = %273, %66
br label %55
275: ; preds = %55
%276 = load i32, i32* %44
%277 = load i32*, i32** %28
%278 = getelementptr inbounds i32, i32* %277, i64 0
store i32 %276, i32* %278
%279 = load i32, i32* %31
%280 = load i32*, i32** %28
%281 = getelementptr inbounds i32, i32* %280, i64 1
store i32 %279, i32* %281
%282 = load i32, i32* %29
%283 = load i32*, i32** %28
%284 = getelementptr inbounds i32, i32* %283, i64 2
store i32 %282, i32* %284
ret void
}

LLVM IR (-O2):
define void @crm_faster_2motifs_allt(i8*** nocapture %0, i32** nocapture %1, i32** nocapture %2, i32** nocapture %3, i32 %4, i32 %5, i32 %6, i32 %7, i32 %8, i32 %9, i32 %10, i32** nocapture %11, i32 %12, i32* nocapture writeonly %13) {
%15 = icmp slt i32 %10, 0
%16 = select i1 %15, i32 %9, i32 %10
%17 = icmp sgt i32 %9, 0
%18 = icmp sgt i32 %16, -1
%19 = and i1 %18, %17
br i1 %19, label %20, label %142
20: ; preds = %14
%21 = sext i32 %5 to i64
%22 = getelementptr inbounds i32*, i32** %11, i64 %21
%23 = sext i32 %6 to i64
%24 = getelementptr inbounds i32*, i32** %11, i64 %23
%25 = getelementptr inbounds i32*, i32** %1, i64 %21
%26 = getelementptr inbounds i32*, i32** %1, i64 %23
%27 = getelementptr inbounds i32*, i32** %2, i64 %21
%28 = getelementptr inbounds i32*, i32** %2, i64 %23
%29 = icmp eq i32 %12, 1
%30 = getelementptr inbounds i8**, i8*** %0, i64 %21
%31 = getelementptr inbounds i8**, i8*** %0, i64 %23
%32 = zext i32 %9 to i64
br label %33
33: ; preds = %20, %135
%34 = phi i64 [ 0, %20 ], [ %38, %135 ]
%35 = phi i32 [ 0, %20 ], [ %138, %135 ]
%36 = phi i32 [ 0, %20 ], [ %137, %135 ]
%37 = phi i32 [ 0, %20 ], [ %136, %135 ]
%38 = add nuw nsw i64 %34, 1
%39 = load i32*, i32** %22
%40 = getelementptr inbounds i32, i32* %39, i64 %38
%41 = load i32, i32* %40
%42 = load i32*, i32** %24
%43 = getelementptr inbounds i32, i32* %42, i64 %38
%44 = load i32, i32* %43
%45 = add nsw i32 %44, %41
%46 = icmp slt i32 %45, %7
br i1 %46, label %135, label %47
47: ; preds = %33
%48 = load i32*, i32** %25
%49 = getelementptr inbounds i32, i32* %48, i64 %38
%50 = load i32, i32* %49
%51 = load i32*, i32** %26
%52 = getelementptr inbounds i32, i32* %51, i64 %38
%53 = load i32, i32* %52
%54 = tail call i32 @min2(i32 %50, i32 %53)
%55 = load i32*, i32** %27
%56 = getelementptr inbounds i32, i32* %55, i64 %38
%57 = load i32, i32* %56
%58 = load i32*, i32** %28
%59 = getelementptr inbounds i32, i32* %58, i64 %38
%60 = load i32, i32* %59
%61 = tail call i32 @max2(i32 %57, i32 %60)
%62 = icmp sgt i32 %54, %61
br i1 %29, label %67, label %63
63: ; preds = %47
br i1 %62, label %129, label %64
64: ; preds = %63
%65 = load i8**, i8*** %30
%66 = load i8**, i8*** %31
br label %107
67: ; preds = %47
br i1 %62, label %129, label %68
68: ; preds = %67
%69 = load i8**, i8*** %30
%70 = load i8**, i8*** %31
%71 = trunc i64 %38 to i32
br label %72
72: ; preds = %68, %101
%73 = phi i32 [ %35, %68 ], [ %104, %101 ]
%74 = phi i32 [ %37, %68 ], [ %103, %101 ]
%75 = phi i32 [ %54, %68 ], [ %105, %101 ]
%76 = sext i32 %75 to i64
%77 = getelementptr inbounds i8*, i8** %69, i64 %76
%78 = load i8*, i8** %77
%79 = getelementptr inbounds i8, i8* %78, i64 %38
%80 = load i8, i8* %79
%81 = sext i8 %80 to i32
%82 = getelementptr inbounds i8*, i8** %70, i64 %76
%83 = load i8*, i8** %82
%84 = getelementptr inbounds i8, i8* %83, i64 %38
%85 = load i8, i8* %84
%86 = sext i8 %85 to i32
%87 = add nsw i32 %86, %81
%88 = icmp slt i32 %87, %7
br i1 %88, label %101, label %89
89: ; preds = %72
%90 = add nsw i32 %74, 1
%91 = icmp slt i32 %74, %4
br i1 %91, label %94, label %92
92: ; preds = %89
%93 = add nsw i32 %73, 1
br label %101
94: ; preds = %89
%95 = sext i32 %90 to i64
%96 = getelementptr inbounds i32*, i32** %3, i64 %95
%97 = load i32*, i32** %96
%98 = getelementptr inbounds i32, i32* %97, i64 1
store i32 %71, i32* %98
%99 = getelementptr inbounds i32, i32* %97, i64 2
store i32 %75, i32* %99
%100 = getelementptr inbounds i32, i32* %97, i64 3
store i32 %87, i32* %100
br label %101
101: ; preds = %72, %92, %94
%102 = phi i32 [ %8, %94 ], [ %8, %92 ], [ 1, %72 ]
%103 = phi i32 [ %90, %94 ], [ %90, %92 ], [ %74, %72 ]
%104 = phi i32 [ %73, %94 ], [ %93, %92 ], [ %73, %72 ]
%105 = add nsw i32 %102, %75
%106 = icmp sgt i32 %105, %61
br i1 %106, label %129, label %72
107: ; preds = %64, %107
%108 = phi i32 [ %37, %64 ], [ %126, %107 ]
%109 = phi i32 [ %54, %64 ], [ %127, %107 ]
%110 = sext i32 %109 to i64
%111 = getelementptr inbounds i8*, i8** %65, i64 %110
%112 = load i8*, i8** %111
%113 = getelementptr inbounds i8, i8* %112, i64 %38
%114 = load i8, i8* %113
%115 = sext i8 %114 to i32
%116 = getelementptr inbounds i8*, i8** %66, i64 %110
%117 = load i8*, i8** %116
%118 = getelementptr inbounds i8, i8* %117, i64 %38
%119 = load i8, i8* %118
%120 = sext i8 %119 to i32
%121 = add nsw i32 %120, %115
%122 = icmp slt i32 %121, %7
%123 = select i1 %122, i32 1, i32 %8
%124 = xor i1 %122, true
%125 = zext i1 %124 to i32
%126 = add nsw i32 %108, %125
%127 = add nsw i32 %123, %109
%128 = icmp sgt i32 %127, %61
br i1 %128, label %129, label %107
129: ; preds = %107, %101, %63, %67
%130 = phi i32 [ %37, %67 ], [ %37, %63 ], [ %103, %101 ], [ %126, %107 ]
%131 = phi i32 [ %35, %67 ], [ %35, %63 ], [ %104, %101 ], [ %35, %107 ]
%132 = icmp sgt i32 %130, %37
%133 = zext i1 %132 to i32
%134 = add nsw i32 %36, %133
br label %135
135: ; preds = %129, %33
%136 = phi i32 [ %37, %33 ], [ %130, %129 ]
%137 = phi i32 [ %36, %33 ], [ %134, %129 ]
%138 = phi i32 [ %35, %33 ], [ %131, %129 ]
%139 = icmp ult i64 %38, %32
%140 = icmp sle i32 %137, %16
%141 = and i1 %140, %139
br i1 %141, label %33, label %142
142: ; preds = %135, %14
%143 = phi i32 [ 0, %14 ], [ %136, %135 ]
%144 = phi i32 [ 0, %14 ], [ %137, %135 ]
%145 = phi i32 [ 0, %14 ], [ %138, %135 ]
store i32 %143, i32* %13
%146 = getelementptr inbounds i32, i32* %13, i64 1
store i32 %144, i32* %146
%147 = getelementptr inbounds i32, i32* %13, i64 2
store i32 %145, i32* %147
ret void
}