int cluster_score(int no_of_res, int *selected, int **neighbors,
                  double *score) {
  int i, j, dist;
  int size;
  double sum;
  size = no_of_res;
  sum = 0.0;
  for (i = 0; i < size - 1; i++) {
    if (!selected[i])
      continue;
    for (j = i + 1; j < size; j++) {
      if (selected[j] && neighbors[i][j]) {
        dist = j - i;
        sum += dist;
      }
    }
  }
  *score = sum;
  return 0;
}


x86 assembly (clang, -O0):
<cluster_score>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    %edi,-0x4(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %rdx,-0x18(%rbp)
mov    %rcx,-0x20(%rbp)
mov    -0x4(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x30(%rbp)
xorps  %xmm0,%xmm0
movsd  %xmm0,-0x38(%rbp)
movl   $0x0,-0x24(%rbp)
mov    -0x24(%rbp),%eax
mov    -0x30(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
cmp    %ecx,%eax
jge    11cf <cluster_score+0xcf>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x24(%rbp),%rcx
cmpl   $0x0,(%rax,%rcx,4)
jne    1150 <cluster_score+0x50>
jmp    11c1 <cluster_score+0xc1>
mov    -0x24(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x28(%rbp)
mov    -0x28(%rbp),%eax
cmp    -0x30(%rbp),%eax
jge    11bc <cluster_score+0xbc>
mov    -0x10(%rbp),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
cmpl   $0x0,(%rax,%rcx,4)
je     11a9 <cluster_score+0xa9>
mov    -0x18(%rbp),%rax
movslq -0x24(%rbp),%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rax
movslq -0x28(%rbp),%rcx
cmpl   $0x0,(%rax,%rcx,4)
je     11a9 <cluster_score+0xa9>
mov    -0x28(%rbp),%eax
sub    -0x24(%rbp),%eax
mov    %eax,-0x2c(%rbp)
cvtsi2sdl -0x2c(%rbp),%xmm0
addsd  -0x38(%rbp),%xmm0
movsd  %xmm0,-0x38(%rbp)
jmp    11ae <cluster_score+0xae>
mov    -0x28(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x28(%rbp)
jmp    1159 <cluster_score+0x59>
jmp    11c1 <cluster_score+0xc1>
mov    -0x24(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x24(%rbp)
jmp    1128 <cluster_score+0x28>
movsd  -0x38(%rbp),%xmm0
mov    -0x20(%rbp),%rax
movsd  %xmm0,(%rax)
xor    %eax,%eax
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<cluster_score>:
push   %rbp
push   %rbx
xorpd  %xmm0,%xmm0
cmp    $0x2,%edi
jl     1179 <cluster_score+0x79>
mov    %edi,%r10d
add    $0xffffffff,%edi
xorpd  %xmm0,%xmm0
mov    $0x1,%r8d
xor    %r9d,%r9d
jmp    1129 <cluster_score+0x29>
add    $0x1,%r8
cmp    %rdi,%r9
je     1179 <cluster_score+0x79>
mov    %r9,%r11
add    $0x1,%r9
cmpl   $0x0,(%rsi,%r11,4)
je     1120 <cluster_score+0x20>
cmp    %r10,%r9
jae    1120 <cluster_score+0x20>
mov    $0x1,%ebp
mov    %r8,%rbx
jmp    115c <cluster_score+0x5c>
cs nopw 0x0(%rax,%rax,1)
add    $0x1,%rbx
add    $0x1,%ebp
cmp    %rbx,%r10
je     1120 <cluster_score+0x20>
cmpl   $0x0,(%rsi,%rbx,4)
je     1150 <cluster_score+0x50>
mov    (%rdx,%r11,8),%rax
cmpl   $0x0,(%rax,%rbx,4)
je     1150 <cluster_score+0x50>
xorps  %xmm1,%xmm1
cvtsi2sd %ebp,%xmm1
addsd  %xmm1,%xmm0
jmp    1150 <cluster_score+0x50>
movsd  %xmm0,(%rcx)
xor    %eax,%eax
pop    %rbx
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define i32 @cluster_score(i32 %0, i32* %1, i32** %2, double* %3) {
%5 = alloca i32
%6 = alloca i32*
%7 = alloca i32**
%8 = alloca double*
%9 = alloca i32
%10 = alloca i32
%11 = alloca i32
%12 = alloca i32
%13 = alloca double
store i32 %0, i32* %5
store i32* %1, i32** %6
store i32** %2, i32*** %7
store double* %3, double** %8
%14 = load i32, i32* %5
store i32 %14, i32* %12
store double 0.000000e+00, double* %13
store i32 0, i32* %9
br label %15
15: ; preds = %66, %4
%16 = load i32, i32* %9
%17 = load i32, i32* %12
%18 = sub nsw i32 %17, 1
%19 = icmp slt i32 %16, %18
br i1 %19, label %20, label %69
20: ; preds = %15
%21 = load i32*, i32** %6
%22 = load i32, i32* %9
%23 = sext i32 %22 to i64
%24 = getelementptr inbounds i32, i32* %21, i64 %23
%25 = load i32, i32* %24
%26 = icmp ne i32 %25, 0
br i1 %26, label %28, label %27
27: ; preds = %20
br label %66
28: ; preds = %20
%29 = load i32, i32* %9
%30 = add nsw i32 %29, 1
store i32 %30, i32* %10
br label %31
31: ; preds = %62, %28
%32 = load i32, i32* %10
%33 = load i32, i32* %12
%34 = icmp slt i32 %32, %33
br i1 %34, label %35, label %65
35: ; preds = %31
%36 = load i32*, i32** %6
%37 = load i32, i32* %10
%38 = sext i32 %37 to i64
%39 = getelementptr inbounds i32, i32* %36, i64 %38
%40 = load i32, i32* %39
%41 = icmp ne i32 %40, 0
br i1 %41, label %42, label %61
42: ; preds = %35
%43 = load i32**, i32*** %7
%44 = load i32, i32* %9
%45 = sext i32 %44 to i64
%46 = getelementptr inbounds i32*, i32** %43, i64 %45
%47 = load i32*, i32** %46
%48 = load i32, i32* %10
%49 = sext i32 %48 to i64
%50 = getelementptr inbounds i32, i32* %47, i64 %49
%51 = load i32, i32* %50
%52 = icmp ne i32 %51, 0
br i1 %52, label %53, label %61
53: ; preds = %42
%54 = load i32, i32* %10
%55 = load i32, i32* %9
%56 = sub nsw i32 %54, %55
store i32 %56, i32* %11
%57 = load i32, i32* %11
%58 = sitofp i32 %57 to double
%59 = load double, double* %13
%60 = fadd double %59, %58
store double %60, double* %13
br label %61
61: ; preds = %53, %42, %35
br label %62
62: ; preds = %61
%63 = load i32, i32* %10
%64 = add nsw i32 %63, 1
store i32 %64, i32* %10
br label %31
65: ; preds = %31
br label %66
66: ; preds = %65, %27
%67 = load i32, i32* %9
%68 = add nsw i32 %67, 1
store i32 %68, i32* %9
br label %15
69: ; preds = %15
%70 = load double, double* %13
%71 = load double*, double** %8
store double %70, double* %71
ret i32 0
}

LLVM IR (-O2):
define i32 @cluster_score(i32 %0, i32* nocapture %1, i32** nocapture %2, double* nocapture writeonly %3) {
%5 = icmp sgt i32 %0, 1
br i1 %5, label %6, label %48
6: ; preds = %4
%7 = add nsw i32 %0, -1
%8 = zext i32 %0 to i64
%9 = zext i32 %7 to i64
%10 = zext i32 %0 to i64
br label %11
11: ; preds = %6, %44
%12 = phi i64 [ 0, %6 ], [ %18, %44 ]
%13 = phi i64 [ 1, %6 ], [ %46, %44 ]
%14 = phi double [ 0.000000e+00, %6 ], [ %45, %44 ]
%15 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %12
%16 = load i32, i32* %15
%17 = icmp ne i32 %16, 0
%18 = add nuw nsw i64 %12, 1
%19 = icmp ult i64 %18, %8
%20 = select i1 %17, i1 %19, i1 false
br i1 %20, label %21, label %44
21: ; preds = %11
%22 = getelementptr inbounds i32*, i32** %2, i64 %12
%23 = trunc i64 %12 to i32
br label %24
24: ; preds = %21, %40
%25 = phi i64 [ %13, %21 ], [ %42, %40 ]
%26 = phi double [ %14, %21 ], [ %41, %40 ]
%27 = getelementptr inbounds i32, i32* %1, i64 %25
%28 = load i32, i32* %27
%29 = icmp eq i32 %28, 0
br i1 %29, label %40, label %30
30: ; preds = %24
%31 = load i32*, i32** %22
%32 = getelementptr inbounds i32, i32* %31, i64 %25
%33 = load i32, i32* %32
%34 = icmp eq i32 %33, 0
br i1 %34, label %40, label %35
35: ; preds = %30
%36 = trunc i64 %25 to i32
%37 = sub nsw i32 %36, %23
%38 = sitofp i32 %37 to double
%39 = fadd double %26, %38
br label %40
40: ; preds = %24, %30, %35
%41 = phi double [ %39, %35 ], [ %26, %30 ], [ %26, %24 ]
%42 = add nuw nsw i64 %25, 1
%43 = icmp eq i64 %42, %10
br i1 %43, label %44, label %24
44: ; preds = %40, %11
%45 = phi double [ %14, %11 ], [ %41, %40 ]
%46 = add nuw nsw i64 %13, 1
%47 = icmp eq i64 %18, %9
br i1 %47, label %48, label %11
48: ; preds = %44, %4
%49 = phi double [ 0.000000e+00, %4 ], [ %45, %44 ]
store double %49, double* %3
ret i32 0
}