void cb_swa_fw_init(long *dbl, long dbllen, long *dbs, long dbslen,
                    long *sslookup, long *swtab, long *gaph, long *gapv) {
  register int i, i1, j, dbsi;
  for (j = 0; j < dbslen + 1; j++)
    swtab[j] = 0;
  for (i = 1; i < dbllen + 1; i++) {
    dbsi = (dbslen + 1) * i;
    i1 = 0x1F & ((char *)dbl)[i - 1];
    swtab[(dbslen + 1) * i] = 0;
    for (j = 1; j < dbslen + 1; j++)
      swtab[dbsi + j] = sslookup[(32 * (0x1F & ((char *)dbs)[j - 1])) + i1];
  }
}


x86 assembly (clang, -O0):
<cb_swa_fw_init>:
push   %rbp
mov    %rsp,%rbp
mov    0x18(%rbp),%rax
mov    0x10(%rbp),%rax
mov    %rdi,-0x8(%rbp)
mov    %rsi,-0x10(%rbp)
mov    %rdx,-0x18(%rbp)
mov    %rcx,-0x20(%rbp)
mov    %r8,-0x28(%rbp)
mov    %r9,-0x30(%rbp)
movl   $0x0,-0x3c(%rbp)
movslq -0x3c(%rbp),%rax
mov    -0x20(%rbp),%rcx
add    $0x1,%rcx
cmp    %rcx,%rax
jge    115e <cb_swa_fw_init+0x5e>
mov    -0x30(%rbp),%rax
movslq -0x3c(%rbp),%rcx
movq   $0x0,(%rax,%rcx,8)
mov    -0x3c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x3c(%rbp)
jmp    112b <cb_swa_fw_init+0x2b>
movl   $0x1,-0x34(%rbp)
movslq -0x34(%rbp),%rax
mov    -0x10(%rbp),%rcx
add    $0x1,%rcx
cmp    %rcx,%rax
jge    1233 <cb_swa_fw_init+0x133>
mov    -0x20(%rbp),%rax
add    $0x1,%rax
movslq -0x34(%rbp),%rcx
imul   %rcx,%rax
mov    %eax,-0x40(%rbp)
mov    -0x8(%rbp),%rax
mov    -0x34(%rbp),%ecx
sub    $0x1,%ecx
movslq %ecx,%rcx
movsbl (%rax,%rcx,1),%eax
and    $0x1f,%eax
mov    %eax,-0x38(%rbp)
mov    -0x30(%rbp),%rax
mov    -0x20(%rbp),%rcx
add    $0x1,%rcx
movslq -0x34(%rbp),%rdx
imul   %rdx,%rcx
movq   $0x0,(%rax,%rcx,8)
movl   $0x1,-0x3c(%rbp)
movslq -0x3c(%rbp),%rax
mov    -0x20(%rbp),%rcx
add    $0x1,%rcx
cmp    %rcx,%rax
jge    1220 <cb_swa_fw_init+0x120>
mov    -0x28(%rbp),%rax
mov    -0x18(%rbp),%rcx
mov    -0x3c(%rbp),%edx
sub    $0x1,%edx
movslq %edx,%rdx
movsbl (%rcx,%rdx,1),%ecx
and    $0x1f,%ecx
shl    $0x5,%ecx
add    -0x38(%rbp),%ecx
movslq %ecx,%rcx
mov    (%rax,%rcx,8),%rdx
mov    -0x30(%rbp),%rax
mov    -0x40(%rbp),%ecx
add    -0x3c(%rbp),%ecx
movslq %ecx,%rcx
mov    %rdx,(%rax,%rcx,8)
mov    -0x3c(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x3c(%rbp)
jmp    11c7 <cb_swa_fw_init+0xc7>
jmp    1225 <cb_swa_fw_init+0x125>
mov    -0x34(%rbp),%eax
add    $0x1,%eax
mov    %eax,-0x34(%rbp)
jmp    1165 <cb_swa_fw_init+0x65>
pop    %rbp
ret

x86 assembly (clang, -O2):
<cb_swa_fw_init>:
push   %rbp
push   %r15
push   %r14
push   %r13
push   %r12
push   %rbx
sub    $0x18,%rsp
mov    %r9,%r14
mov    %r8,%r12
mov    %rcx,%r15
mov    %rdx,%rbx
mov    %rsi,0x8(%rsp)
mov    %rdi,0x10(%rsp)
lea    0x1(%rcx),%r13
test   %rcx,%rcx
js     1158 <cb_swa_fw_init+0x48>
cmp    $0x2,%r13
mov    $0x1,%edx
cmovge %r13,%rdx
shl    $0x3,%rdx
mov    %r14,%rdi
xor    %esi,%esi
call   1030 <memset@plt>
cmpq   $0x0,0x8(%rsp)
jle    124c <cb_swa_fw_init+0x13c>
cmp    $0x3,%r13
mov    $0x2,%r9d
cmovge %r13,%r9
add    $0xffffffffffffffff,%r9
lea    0x8(%r14),%r8
mov    %r9,%rdx
and    $0xfffffffffffffffe,%rdx
neg    %rdx
mov    $0x1,%edi
mov    %r13d,%r11d
jmp    11a5 <cb_swa_fw_init+0x95>
xchg   %ax,%ax
lea    0x1(%rdi),%rax
add    %r13d,%r11d
cmp    0x8(%rsp),%rdi
mov    %rax,%rdi
je     124c <cb_swa_fw_init+0x13c>
mov    %rdi,%r10
imul   %r13,%r10
mov    0x10(%rsp),%rax
movzbl -0x1(%rdi,%rax,1),%ecx
movq   $0x0,(%r14,%r10,8)
test   %r15,%r15
jle    1190 <cb_swa_fw_init+0x80>
and    $0x1f,%ecx
mov    $0x1,%ebp
cmp    $0x3,%r13
jl     1220 <cb_swa_fw_init+0x110>
movslq %r11d,%rax
lea    (%r8,%rax,8),%rax
mov    $0x1,%ebp
nopl   (%rax)
movzbl -0x1(%rbx,%rbp,1),%esi
and    $0x1f,%esi
shl    $0x5,%rsi
or     %rcx,%rsi
mov    (%r12,%rsi,8),%rsi
mov    %rsi,-0x8(%rax,%rbp,8)
movzbl (%rbx,%rbp,1),%esi
and    $0x1f,%esi
shl    $0x5,%rsi
or     %rcx,%rsi
mov    (%r12,%rsi,8),%rsi
mov    %rsi,(%rax,%rbp,8)
lea    (%rdx,%rbp,1),%rsi
add    $0x2,%rsi
add    $0x2,%rbp
cmp    $0x1,%rsi
jne    11e0 <cb_swa_fw_init+0xd0>
test   $0x1,%r9b
je     1190 <cb_swa_fw_init+0x80>
movslq %r10d,%rax
movzbl -0x1(%rbp,%rbx,1),%esi
and    $0x1f,%esi
shl    $0x5,%rsi
or     %rcx,%rsi
mov    (%r12,%rsi,8),%rcx
add    %rbp,%rax
mov    %rcx,(%r14,%rax,8)
jmp    1190 <cb_swa_fw_init+0x80>
add    $0x18,%rsp
pop    %rbx
pop    %r12
pop    %r13
pop    %r14
pop    %r15
pop    %rbp
ret

LLVM IR (-O0):
define void @cb_swa_fw_init(i64* %0, i64 %1, i64* %2, i64 %3, i64* %4, i64* %5, i64* %6, i64* %7) {
%9 = alloca i64*
%10 = alloca i64
%11 = alloca i64*
%12 = alloca i64
%13 = alloca i64*
%14 = alloca i64*
%15 = alloca i64*
%16 = alloca i64*
%17 = alloca i32
%18 = alloca i32
%19 = alloca i32
%20 = alloca i32
store i64* %0, i64** %9
store i64 %1, i64* %10
store i64* %2, i64** %11
store i64 %3, i64* %12
store i64* %4, i64** %13
store i64* %5, i64** %14
store i64* %6, i64** %15
store i64* %7, i64** %16
store i32 0, i32* %19
br label %21
21: ; preds = %32, %8
%22 = load i32, i32* %19
%23 = sext i32 %22 to i64
%24 = load i64, i64* %12
%25 = add nsw i64 %24, 1
%26 = icmp slt i64 %23, %25
br i1 %26, label %27, label %35
27: ; preds = %21
%28 = load i64*, i64** %14
%29 = load i32, i32* %19
%30 = sext i32 %29 to i64
%31 = getelementptr inbounds i64, i64* %28, i64 %30
store i64 0, i64* %31
br label %32
32: ; preds = %27
%33 = load i32, i32* %19
%34 = add nsw i32 %33, 1
store i32 %34, i32* %19
br label %21
35: ; preds = %21
store i32 1, i32* %17
br label %36
36: ; preds = %98, %35
%37 = load i32, i32* %17
%38 = sext i32 %37 to i64
%39 = load i64, i64* %10
%40 = add nsw i64 %39, 1
%41 = icmp slt i64 %38, %40
br i1 %41, label %42, label %101
42: ; preds = %36
%43 = load i64, i64* %12
%44 = add nsw i64 %43, 1
%45 = load i32, i32* %17
%46 = sext i32 %45 to i64
%47 = mul nsw i64 %44, %46
%48 = trunc i64 %47 to i32
store i32 %48, i32* %20
%49 = load i64*, i64** %9
%50 = bitcast i64* %49 to i8*
%51 = load i32, i32* %17
%52 = sub nsw i32 %51, 1
%53 = sext i32 %52 to i64
%54 = getelementptr inbounds i8, i8* %50, i64 %53
%55 = load i8, i8* %54
%56 = sext i8 %55 to i32
%57 = and i32 31, %56
store i32 %57, i32* %18
%58 = load i64*, i64** %14
%59 = load i64, i64* %12
%60 = add nsw i64 %59, 1
%61 = load i32, i32* %17
%62 = sext i32 %61 to i64
%63 = mul nsw i64 %60, %62
%64 = getelementptr inbounds i64, i64* %58, i64 %63
store i64 0, i64* %64
store i32 1, i32* %19
br label %65
65: ; preds = %94, %42
%66 = load i32, i32* %19
%67 = sext i32 %66 to i64
%68 = load i64, i64* %12
%69 = add nsw i64 %68, 1
%70 = icmp slt i64 %67, %69
br i1 %70, label %71, label %97
71: ; preds = %65
%72 = load i64*, i64** %13
%73 = load i64*, i64** %11
%74 = bitcast i64* %73 to i8*
%75 = load i32, i32* %19
%76 = sub nsw i32 %75, 1
%77 = sext i32 %76 to i64
%78 = getelementptr inbounds i8, i8* %74, i64 %77
%79 = load i8, i8* %78
%80 = sext i8 %79 to i32
%81 = and i32 31, %80
%82 = mul nsw i32 32, %81
%83 = load i32, i32* %18
%84 = add nsw i32 %82, %83
%85 = sext i32 %84 to i64
%86 = getelementptr inbounds i64, i64* %72, i64 %85
%87 = load i64, i64* %86
%88 = load i64*, i64** %14
%89 = load i32, i32* %20
%90 = load i32, i32* %19
%91 = add nsw i32 %89, %90
%92 = sext i32 %91 to i64
%93 = getelementptr inbounds i64, i64* %88, i64 %92
store i64 %87, i64* %93
br label %94
94: ; preds = %71
%95 = load i32, i32* %19
%96 = add nsw i32 %95, 1
store i32 %96, i32* %19
br label %65
97: ; preds = %65
br label %98
98: ; preds = %97
%99 = load i32, i32* %17
%100 = add nsw i32 %99, 1
store i32 %100, i32* %17
br label %36
101: ; preds = %36
ret void
}

LLVM IR (-O2):
define void @cb_swa_fw_init(i64* nocapture %0, i64 %1, i64* nocapture %2, i64 %3, i64* nocapture %4, i64* nocapture writeonly %5, i64* nocapture readnone %6, i64* nocapture readnone %7) {
%9 = icmp slt i64 %3, 0
br i1 %9, label %10, label %12
10: ; preds = %8
%11 = add nsw i64 %3, 1
br label %17
12: ; preds = %8
%13 = bitcast i64* %5 to i8*
%14 = add nuw i64 %3, 1
%15 = call i64 @llvm.smax.i64(i64 %14, i64 1)
%16 = shl nuw i64 %15, 3
br label %17
17: ; preds = %10, %12
%18 = phi i64 [ %11, %10 ], [ %14, %12 ]
%19 = icmp slt i64 %1, 1
br i1 %19, label %87, label %20
20: ; preds = %17
%21 = bitcast i64* %0 to i8*
%22 = icmp slt i64 %3, 1
%23 = bitcast i64* %2 to i8*
%24 = call i64 @llvm.smax.i64(i64 %18, i64 2)
%25 = add nsw i64 %24, -1
%26 = and i64 %25, 1
%27 = icmp slt i64 %18, 3
%28 = and i64 %25, -2
%29 = icmp eq i64 %26, 0
br label %30
30: ; preds = %20, %84
%31 = phi i64 [ 1, %20 ], [ %85, %84 ]
%32 = mul nsw i64 %31, %18
%33 = add nsw i64 %31, -1
%34 = getelementptr inbounds i8, i8* %21, i64 %33
%35 = load i8, i8* %34
%36 = and i8 %35, 31
%37 = zext i8 %36 to i64
%38 = getelementptr inbounds i64, i64* %5, i64 %32
store i64 0, i64* %38
br i1 %22, label %84, label %39
39: ; preds = %30
%40 = shl i64 %32, 32
%41 = ashr exact i64 %40, 32
br i1 %27, label %70, label %42
42: ; preds = %39, %42
%43 = phi i64 [ %67, %42 ], [ 1, %39 ]
%44 = phi i64 [ %68, %42 ], [ 0, %39 ]
%45 = add nsw i64 %43, -1
%46 = getelementptr inbounds i8, i8* %23, i64 %45
%47 = load i8, i8* %46
%48 = and i8 %47, 31
%49 = zext i8 %48 to i64
%50 = shl nuw nsw i64 %49, 5
%51 = or i64 %50, %37
%52 = getelementptr inbounds i64, i64* %4, i64 %51
%53 = load i64, i64* %52
%54 = add nsw i64 %43, %41
%55 = getelementptr inbounds i64, i64* %5, i64 %54
store i64 %53, i64* %55
%56 = add nuw nsw i64 %43, 1
%57 = getelementptr inbounds i8, i8* %23, i64 %43
%58 = load i8, i8* %57
%59 = and i8 %58, 31
%60 = zext i8 %59 to i64
%61 = shl nuw nsw i64 %60, 5
%62 = or i64 %61, %37
%63 = getelementptr inbounds i64, i64* %4, i64 %62
%64 = load i64, i64* %63
%65 = add nsw i64 %56, %41
%66 = getelementptr inbounds i64, i64* %5, i64 %65
store i64 %64, i64* %66
%67 = add nuw nsw i64 %43, 2
%68 = add i64 %44, 2
%69 = icmp eq i64 %68, %28
br i1 %69, label %70, label %42
70: ; preds = %42, %39
%71 = phi i64 [ 1, %39 ], [ %67, %42 ]
br i1 %29, label %84, label %72
72: ; preds = %70
%73 = add nsw i64 %71, -1
%74 = getelementptr inbounds i8, i8* %23, i64 %73
%75 = load i8, i8* %74
%76 = and i8 %75, 31
%77 = zext i8 %76 to i64
%78 = shl nuw nsw i64 %77, 5
%79 = or i64 %78, %37
%80 = getelementptr inbounds i64, i64* %4, i64 %79
%81 = load i64, i64* %80
%82 = add nsw i64 %71, %41
%83 = getelementptr inbounds i64, i64* %5, i64 %82
store i64 %81, i64* %83
br label %84
84: ; preds = %72, %70, %30
%85 = add nuw nsw i64 %31, 1
%86 = icmp eq i64 %31, %1
br i1 %86, label %87, label %30
87: ; preds = %84, %17
ret void
}