Traitement automatique de la langue biomédicale au LIMSI (Biomedical language processing at LIMSI ) (2017)

Abstract: Nous proposons des démonstrations de trois outils développés par le LIMSI en traitement automatique des langues appliqué au domaine biomédical : la détection de concepts médicaux dans des textes courts, la catégorisation d’articles scientifiques pour l’assistance à l’écriture de revues systématiques, et l’anonymisation de textes cliniques.

## détection de concepts dans des textes courts nous présentons un système qui effectue de la détection de concepts dans des textes courts @xcite . il est spécialisé dans la détermination de codes diagnostiques de la classification internationale des maladies (cim-10) de l'oms pour des certificats de décès. il combine deux techniques classiques : l'application d'un dictionnaire spécialisé et un apprentissage supervisé, entraîné sur plus de 300 000 exemples de diagnostics. la démonstration montre la détection de diagnostics dans des textes courts, ainsi que l'apport comparé de différentes méthodes d'hybridation entre dictionnaire et apprentissage supervisé : les revues systématiques de la littérature dans le domaine biomédical reposent essentiellement sur le travail bibliographique manuel d'experts. nous présentons un système de classification automatique d'articles présélectionnés à l'aide d'une requête soumise à un moteur de recherche @xcite . le système propose un ordonnancement des articles par ordre de pertinence par rapport aux critères d'inclusion définis par un corpus d'entraînement. la mise en oeuvre ainsi que les résultats de cet outil de classification peuvent être exploités au travers de diverses interfaces graphiques. à titre d'exemple, nous présentons l'interface bibreview, utilisée dans le cadre du yearbook of medical informatics @xcite qui rapporte chaque année les résultats de revues de la littérature dans seize sous-domaines de l'informatique biomédicale. cet outil permet de visualiser les articles de la préselection dans l'ordre proposé par le classifieur, de valider et de visualiser la sélection d'articles pour inclusion dans une revue de la littérature. la démonstration proposée consiste à présenter les différentes étapes du système à base de règles et de lexiques pour anonymiser des documents cliniques.