山东省济南市中级人民法院
民 事 判 决 书
（2015）济民五终字第780号
上诉人（原审被告、反诉原告）济南市历下区燕山工业小区开发建设总公司，住所地济南市。
法定代表人张凯，董事长。
委托代理人刘世军，男，1979年4月30日出生，汉族，该单位员工，住商河县。
委托代理人王明军，北京大成（济南）律师事务所律师。
被上诉人（原审原告、反诉被告）山东省建设建工集团第六有限公司，住所地商河县。
法定代表人蔡文滋，董事长。
委托代理人崔东方，男，1980年12月25日出生，汉族，该公司员工，住济南市。
委托代理人赵兴勐，男，1986年8月22日出生，汉族，该公司员工，住济南市。
上诉人济南市历下区燕山工业小区开发建设总公司（以下简称历下燕山开发总公司）因与被上诉人山东省建设建工集团第六有限公司（以下简称省建六公司）建设工程施工合同纠纷一案，不服济南市历下区人民法院（2015）历民初字第513号民事判决，向本院提起上诉。本院依法组成合议庭审理了本案，现已审理终结。
原审法院认定：2010年4月27日，省建六公司与历下燕山开发总公司签订《建设工程施工合同》，约定由省建六公司承建历下燕山开发总公司发包的济南市龙泉山庄F组团4号、5号楼，承包范围为总承包，约定工期总天数为411天，从实际开工日计算，合同价款暂定1600万元，合同还约定了通用条款和专用条款，并附有合同附件计6件，《建设工程施工合同》还约定了工程进度款及支付方式、时间，同时对承包人违约的具体责任也做了约定，在合同附件1《房屋建筑工程质量保证书》约定质量保证期的起算时间等。其中，《建设工程施工合同》专用条款10.3约定，所有工程必须在2010年6月15日前竣工（以竣工验收报告为准）。如因客观原因，不能及时按计划完成的，经发包人同意，可作适当调整，但各节点及总工期保持不变；《建设工程施工合同》专用条款35.2关于承包人违约的具体责任约定：因承包人原因不能按合同约定的时间（以质监站备案验收且达到合同约定质量标准为准）竣工，延期15天以内，工期每延误一天，承包人向发包人支付合同价款万分之一的违约金；延期15天以上（含15天），每延误一天按照合同价款的万分之二向发包人支付违约金，拖期罚款最高不超过合同价款的3%；《建设工程施工合同》专用条款第26工程款（进度款）支付第⑩项约定：“工程竣工后，承包人报结算，发包人三个月内结算审计完成后，并工程竣工备案完成三个月后，付至结算审计值的95%，发包人留取工程结算值的5%作为工程质量保修金，保修金不计利息，保修期满一年后，扣除维修费用付至保修金的40%，满两年后扣除维修费用付至保修金的80%，满五年后扣除维修费用付清保修金（14日内）”。合同附件1《房屋建筑工程质量保修书》约定质量保证期为：自工程验收合格之日起计算，属于保修范围、内容的项目，承包人应当在接到通知当日派人维修，承包人不在约定的期限内派人维修的，发包人可以委托他人修理。
上述合同签订后，5#楼开工时间为2010年11月18日，竣工时间为2012年10月12日；4#楼开工时间为2011年3月1日，竣工时间为2012年10月30日；两栋楼竣工备案时间均为2014年10月31日。
2013年12月11日，历下燕山开发总公司委托审计的涉案工程审核报告载明，涉案工程济南市历下区龙泉山庄F组团4#、5#楼工程总造价为22558626.93元，甲方供材4959398.14元，应付款为17599228.79元，已付16719267.35元，余款879961.44元为质保金至今未付。庭审中，省建六公司与历下燕山开发总公司对上述事实予以共同确认。
原审另查明，历下燕山开发总公司自述，2009年9月-2014年5月期间，因反诉被告省建六公司竣工延期，导致反诉原告向购房业主延期交房并引起购房业主索赔，反诉原告被迫向部分业主支付延期交房违约金累计195940元，为此，提交了历下燕山开发总公司与39位购房业主签订的逾期交房违约补偿协议一宗；同时，历下燕山开发总公司自述，2013年6月-2014年4月期间，省建六公司交付房产之后，因其对后续出现的质量瑕疵未能按约及时修复，导致历下燕山开发总公司另行委托他人修复并支付费用累计132886元，为此，提供了维修费发票和收据一宗。
原审法院认为：双方当事人争议的问题是：1、原告省建六公司主张的质保金879961.44元的付款条件是否已满足？2、涉案工程逾期竣工的责任方是谁？反诉原告历下燕山开发总公司主张的逾期竣工违约金676758.8元是否成立？逾期竣工违约金的主张是否已超过诉讼时效？3、反诉原告历下燕山开发总公司要求反诉被告省建六公司赔偿损失：（1）逾期交房违约金195940元，（2）因反诉被告省建六公司未及时修复房屋导致反诉原告历下燕山开发总公司委托他人修复并支付修复费用146386元，（3）现还有部分设施仍需要维修，预计损失为57674元，上述三项损失有无事实及法律依据？该反诉请求是否超出诉讼时效？
关于双方当事人争议的问题1、原告省建六公司主张的质保金879961.44元的付款条件是否已满足？原审法院认为，省建六公司与历下燕山开发总公司签订的涉案《建设工程施工合同》系双方当事人的真实意思表示，内容不违反法律法规的规定，合法有效。双方当事人均应按合同约定，全面履行各自的义务。鉴于双方对涉案工程审计报告及质保金879961.44元的数额无异议，原审法院对该证据及事实予以采信。《建设工程施工合同》专用条款第26条约定，“工程竣工后，承包人报结算，发包人三个月内结算审计完成后，并工程竣工备案完成三个月后，付至结算审计值的95%，发包人留取工程结算值的5%作为工程质量保证金，保证金不计利息，保修期满一年后，扣除维修费用付至保修金的40%，满两年后扣除维修费用付至保修金的80%，满五年后扣除维修费用付清保修金（14日内）”，本案建设工程完成竣工备案登记的时间虽为2014年10月31日，但根据该备案登记，涉案工程4#楼开工时间为2011年3月1日，竣工验收时间为2012年10月30日，5#楼开工时间为2010年11月18日，竣工验收时间为2012年10月12日；根据上述约定，工程竣工备案完成三个月后，发包人付至结算审计值的95%，该付款义务历下燕山开发总公司已履行，剩余的质保金879961.44元应在“保修期满一年后，扣除维修费用付至保修金的40%，满两年后扣除维修费用付至保修金的80%，满五年后扣除维修费用付清保修金（14日内）”，历下燕山开发总公司理解的“剩余5%的质保金879961.44元应在完成工程竣工备案三个月之后一至五年支付，因此，本案目前尚不具备付款条件”与合同的真实意思不符，从合同文意理解角度，原审法院认为，“工程竣工备案完成三个月后，付至结算审计值的95%”的约定，系对工程款付款时间的约定，而非对质保金支付时间的约定，双方当事人约定的“发包人留取工程结算值的5%作为工程质量保证金，保证金不计利息，保修期满一年后，扣除维修费用付至保修金的40%，满两年后扣除维修费用付至保修金的80%，满五年后扣除维修费用付清保修金（14日内）”的条款，系对质保金返还时间及返还时有无利息的具体约定，即开始返还质保金的时间为“保修期满一年后”，具体返还日期为“保修期满一年后，扣除维修费用付至保修金的40%，满两年后扣除维修费用付至保修金的80%，满五年后扣除维修费用付清保修金（14日内）”，在此，问题的关键演变为如何界定“保修期”的起算时间，关于“保修期”起算时间的问题，涉案合同附件1《房屋建筑工程质量保修书》约定的质量保证期为：“自工程验收合格之日起计算”，而涉案竣工验收报告记载的涉案工程5#楼竣工验收时间为2012年10月12日，4#楼竣工验收时间为2012年10月30日，竣工验收日期应视为验收合格日期，这既符合合同约定，也符合法律规定，故合同约定的保修期应分别从2012年10月12日、2012年10月30日起算。截止到省建六公司2015年2月13日起诉主张权利保修期已满两年不满五年，按合同约定，历下燕山开发总公司应在扣除维修费用后付至质保金879961.44元的80%，庭审中，双方对所欠的质保金总额879961.44元无异议，对此原审法院予以采信，基于上述分析，历下燕山开发总公司目前应付省建六公司质保金879961.44元的80%部分即703969.15元，其余20%部分目前不符合合同约定的付款条件，对原告的该部分诉讼请求不予支持。关于利息问题，原审法院认为，按照《建设工程施工合同》专用条款第26工程款（进度款）支付第⑩项“发包人留取工程结算值的5%作为工程质量保证金，保证金不计利息，保修期满一年后，扣除维修费用付至保修金的40%，满两年后扣除维修费用付至保修金的80%，满五年后扣除维修费用付清保修金（14日内）”的约定，历下燕山开发总公司应向省建六公司支付质保金的逾期付款利息，具体计算方法为：以所欠质保金879961.44元为基数，分别从保修期满一年、满两年的第二日开始，按照同期银行贷款利率计算至判决书生效之日止。鉴于双方均未提供证据证明涉案工程4#、5#楼各自的结算值，无法分别计算相应的逾期付款利息，故，原审法院酌定质保金逾期付款利息的起算时间从最后验收的4#楼竣工验收时间（2012年10月30日）分别后推一年、两年，参照合同约定，第一期质保金的逾期利息的计算方法为：以所欠质保金879961.44元的40%计351984.58元为基数，按同期银行贷款利率计算，自2013年10月31日起计算至判决书生效之日止；第二期质保金的逾期利息的计算方法为：以所欠质保金879961.44元的40%计351984.58元为基数，按同期银行贷款利率计算，自2014年10月31日起计算至判决书生效之日止。历下燕山开发总公司以质保金全部不具备付款条件为由拒绝支付，不符合合同约定，原审法院对该辩称不予采信。
关于双方当事人争议的问题2，涉案工程逾期竣工的责任方是谁？历下燕山开发总公司主张的逾期竣工违约金676758.8元是否成立？逾期竣工违约金的主张是否已超过诉讼时效？原审法院认为，省建六公司对延期竣工的事实未提出异议，其抗辩的观点是认为工程逾期竣工不是因自己的原因造成。主要理由为，涉案工程因为建设单位准备不足，导致迟迟不能开工，直至2011年3月1日才开工，已经给自己造成了很大的损失。工程仓促开工后，甲方指定分包的工程范围较多且配合不到位，严重影响了工程进展，也造成了自己更大的窝工损失；涉案工程存在设计变更、工程变更等情况，势必也会造成工期延长，并且在施工过程中，建设单位配合不到位，也是造成工期拖延的原因等等，原审法院认为，在逾期竣工的情形存在时，省建六公司作为承包人有义务举证证明造成逾期竣工的责任不在自己，其针对自己的辩称，虽然也提供了4-8号证据，但这些证据只能证明历下燕山开发总公司延误工程验收备案，而不能证明延期竣工的原因；省建六公司提供的证据10，大部分证据为省建六公司单方作出的证据，同时，也不能证明系因历下燕山开发总公司存在拨款不及时、分包工程影响了施工及设计变更甲方供材不到位等。从省建六公司现有证据分析，省建六公司不能证明造成逾期竣工的责任不在自己，故原审法院认定省建六公司对造成逾期竣工应承担违约责任；根据合同约定，历下燕山开发总公司主张的逾期竣工违约金676758.8元（22558626.93×3%）符合合同约定，原审法院予以采信和认定。
对逾期竣工违约金的主张是否已超过诉讼时效的问题，历下燕山开发总公司认为，《建设工程施工合同》专用条款35.2关于承包人违约的具体责任中“因承包人原因不能按合同约定的时间（以质监站备案验收且达到合同约定质量标准为准）竣工，延期15天以内，工期每延误一天，承包人向发包人支付合同价款万分之一的违约金；延期15天以上（含15天），每延误一天按照合同价款的万分之二向发包人支付违约金，拖期罚款最高不超过合同价款的3%”的约定，系双方当事人对竣工日期界定的约定，应当予以尊重，本案涉案工程的竣工时间应以当事人约定的质监站备案验收时间即2014年10月31日为准，该日至本案提出关于工期违约金的反诉请求，并未超出诉讼时效，因此，省建六公司有关超出诉讼时效的辩称不成立。原审法院认为，《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第十四条第一款第一项规定，当事人对建设工程实际竣工日期有争议的，按照以下情形分别处理：（一）建设工程经竣工验收合格的，以竣工验收合格之日为竣工日期。由此可以看出，竣工日期为竣工验收合格之日，而不是竣工验收备案完成之日。工程竣工验收之日，承包人已经将涉案工程交付给建设单位使用，建设单位也已经实际使用了涉案工程。自此日起，发包人就应知道承包人已逾期竣工构成违约，自己的权利因此受到侵害，根据法律规定，诉讼时效从知道或应当知道权利受到侵害之日起算，因此，竣工验收合格之日应作为诉讼时效的起算点，结合本案，从2012年10月30日4号楼验收合格至历下燕山开发总公司提出反诉已超过两年，历下燕山开发总公司未能举证证明期间存在诉讼时效中止、中断的情形，故其主张逾期竣工违约金确已超出2年的诉讼时效，对该反诉请求不予支持。
关于双方当事人争议的问题3，历下燕山开发总公司逾期交工造成的损失：（1）逾期交房违约金195940元，（2）因反诉被告未及时修复房屋导致反诉原告委托他人修复并支付修复费用146386元，（3）现还有部分设施仍需要维修，预计损失为57674元，上述三项损失有无事实及法律依据的问题及该反诉请求是否超出诉讼时效的问题，原审法院认为，从历下燕山开发总公司提供的证据分析，其主张的逾期交房违约金及修复费用损失，有部分损失确实超过2年的诉讼时效，退一步讲，即使该三项损失赔偿请求未超出诉讼时效，从现有证据分析，其反诉请求因证据不足也不能得到支持。其一，仅凭历下燕山开发总公司提供的其与39位购房业主签订的逾期交房违约补偿协议，不能证明系因省建六公司竣工延期，导致反诉原告延期交房并因此造成购房业主索赔，更不能证明其向部分业主确实实际支付了逾期交房违约金累计195940元，故该主张证据不足，原审法院不予支持；其二，关于历下燕山开发总公司主张的省建六公司未及时修复房屋导致反诉原告委托他人修复并支付修复费用146386元问题，原审法院认为，按涉案合同附件1《房屋建筑工程质量保修书》约定质量保证期为：自工程验收合格之日起计算，属于保修范围、内容的项目，承包人应当在接到通知当日派人维修，承包人不在约定的期限内派人维修的，发包人可以委托他人修理。本案中，历下燕山开发总公司未提供证据证明因省建六公司施工范围内出现了质量问题，且不能证明其所找人维修的工程属于承包人的保修范围、内容的项目，还不能证明在出现质量问题后在诉讼前确实通知了承包人而承包人未在约定的期限内予以维修；也无法确定是否是由于承包方原因造成的及因维修支付的实际费用问题；其提供的在诉讼期间内发给省建六公司维修函的特快专递不能证明确已送达到承包人，故对其主张的该维修费用因证据不足，不予支持；其三，关于历下燕山开发总公司主张的现还有部分设施仍需要维修，预计损失为57674元，原审法院认为，照片不能确定涉案房屋存在质量问题，也不能证明确需维修及维修相关费用，对此请求同样因证据不足，原审法院不予支持。
据此，原审法院依照《中华人民共和国民法通则》第一百三十五条、第一百三十七条，《中华人民共和国合同法》第六十条、第一百零七条、第一百零九条、第一百一十四条、第二百七十九条、第二百八十二条、第二百八十六条，《中华人民共和国民事诉讼法》第六十四条之规定判决：一、被告济南市历下区燕山工业小区开发建设总公司于判决书生效之日起十日内支付原告山东省建设建工集团第六有限公司质保金879961.44元的80%部分即703969.15元。二、被告济南市历下区燕山工业小区开发建设总公司于判决书生效之日起十日内支付原告山东省建设建工集团第六有限公司质保金逾期付款利息（以所欠质保金879961.44元的40%计351984.58元为基数，按同期银行贷款利率计算，自2013年10月31日起计算至判决书生效之日止；以所欠质保金879961.44元的40%计351984.58元为基数，按同期银行贷款利率计算，自2014年10月31日起计算至判决书生效之日止）。三、驳回原告山东省建设建工集团第六有限公司的其他诉讼请求。四、驳回反诉原告济南市历下区燕山工业小区开发建设总公司的全部反诉请求。案件受理费人民币12820元，由原告山东省建设建工集团第六有限公司负担2560元，由被告济南市历下区燕山工业小区开发建设总公司负担10260元；反诉费用人民币7245元，由反诉原告济南市历下区燕山工业小区开发建设总公司负担。
上诉人历下燕山开发总公司不服原审判决上诉称：1、根据《建设工程施工合同》的约定，质保金在工程竣工备案三个月后一至五年内支付，涉案工程竣工登记时间为2014年10月31日，即上诉人在三个月后的2015年1月31日前付清95%的工程款，而质保金的支付时间则为2015年2月1日之后，原审法院违背合同约定，判决上诉人立即支付该款项并承担利息是错误的。2、《建设工程施工合同》中对逾期完工违约责任有明确约定：“因承包人原因不能按合同约定的时间（以质监站备案验收且达到合同约定质量标准为准）竣工，延期15天以内，工期每延误一天，承包人向发包人支付合同价款万分之一的违约金；延期15天以上（含15天），每延误一天按照合同价款的万分之二向发包人支付违约金，拖期罚款最高不超过合同价款的3%”。本案中，5号楼开工时间为2010年11月18日，4号楼开工时间为2011年3月1日，两栋楼竣工备案时间均为2014年10月31日。原审法院无视该约定，以竣工验收时间代替双方当事人约定的质监站备案时间，从而判令超过诉讼时效驳回上诉人的该项诉讼请求是错误的。3、因被上诉人逾期完工导致上诉人延期交房，因此上诉人向业主支付的违约金195940元，以及因交房后出现的质量瑕疵而产生的维修费用均应由被上诉人承担，且现仍有部分设施需进一步维修，而原审法院在此情况下仍以超过诉讼时效且证据不足为由驳回上诉人的反诉请求，且剥夺了上诉人补充证据再次起诉的诉权显然不当。综上，请求：1、撤销原审判决，改判驳回被上诉人省建六公司诉讼请求，支持上诉人历下燕山开发总公司的反诉请求；2、一、二审诉讼费均由被上诉人省建六公司承担。
被上诉人省建六公司答辩称：一、针对本诉部分：1、欠付的质保金数额：省建六公司向上诉人历下燕山开发总公司提供的承诺显示：结算数额（审计报告）的95%已付清，5%质保金。合同专用条款第26条约定，质保金为合同总价的5%。通过以上两点都可以看出，质保金数额为审计报告中结算总额乘以5%，而不是历下燕山开发总公司主张的879961.44元。2、质保金的支付条件是否满足：根据双方签订的合同专用条款第26条：保修期满一年后，扣除维修费用付至保修金的40%，满两年后扣除维修费用付至保修金的80%，满五年后扣除维修费用付清保修金。因此，质保金的支付条件只有一个，即质保期所满时间，即便按上诉人认为的工程验收备案完成条件也已满足，截止到目前，已经备案完成三个月，且95%工程款支付时间和质保金的支付时间即便交叉亦不冲突。3、工程验收备案完成时间较晚系建设单位直接分包的自来水、电、消防等工程迟迟达不到验收备案的条件及其他非承包人原因造成，此原因可通过济南市城建档案及《建设工程竣工验收消防通知书》等相关材料证实。二、针对反诉部分：1、工程逾期竣工非我方原因造成。涉案工程因为建设单位准备不足，直至2011年3月1日才开工，且仓促开工后，甲方指定分包的工程范围较多且配合不到位，而且该工程存在设计变更、工程变更等情况，亦会造成工期延长。2、对方关于逾期竣工违约金的主张已超过诉讼时效。计算工期延误的截止期限是工程竣工验收之日，而非竣工验收备案完成之日，此举符合法律规定的，也是公平合理的，合同也明确写明因承包人原因延期才承担违约责任。按照竣工验收之日作为诉讼时效的起算点，已超过两年。3、上诉人主张逾期交房损失无法律和事实依据，逾期给业主交房的原因不是被上诉人造成的，也无证据证明其实际已产生了损失，该追偿的诉讼时效为1年，该主张也已超出诉讼时效。4、上诉人主张的保修费用不应由被上诉人承担。被上诉人积极尽了保修责任，且至今仍有维修人员在现场保修，上诉人未尽到其应尽的通知义务，所谓质量问题无法确定是被上诉人施工的范围，也无法确定是被上诉人施工原因所造成，更无法确定应由被上诉人维修及维修相关费用。综上，依法驳回上诉人的上诉请求，维持原判。
经审理本院认定：原审法院认定的事实属实，本院予以确认。
本院认为：上诉人历下燕山开发总公司与被上诉人省建六公司于2010年4月27日签订的《建设工程施工合同》系双方当事人的真实意思表示，内容不违反法律法规的规定，合法有效，双方均应按合同约定履行各自的权利义务。本案双方争议的焦点问题为：一、省建六公司主张的涉案质保金是否已符合支付条件及应支付的数额；二、省建六公司是否应承担逾期竣工违约责任及历下燕山开发总公司向省建六公司主张逾期竣工违约金是否已超过诉讼时效；三、历下燕山开发总公司向业主支付逾期交房违约金及第三人的维修费用的事实是否存在及应否由省建六公司承担。
关于焦点问题一，上诉人历下燕山开发总公司与被上诉人省建六公司对涉案质保金的数额并无争议，双方争议的是涉案工程质保期的起算点。虽然历下燕山开发总公司主张根据涉案《建设工程施工合同》专用条款第26条约定，涉案工程质保期应在工程竣工备案完成三个月后起算，但其主张并不符合该合同的文意，也不符合常理，而且与涉案合同附件1《房屋建筑工程质量保修书》约定的质量保证期起算时间“自工程验收合格之日起计算”明显相矛盾。故涉案工程质保期的起算时间应为涉案工程验收合格之日。根据涉案工程竣工验收报告的记载，涉案5#楼竣工验收时间为2012年10月12日，4#楼竣工验收时间为2012年10月30日，故合同约定的保修期应分别从2012年10月12日、2012年10月30日起算。结合双方约定的“发包人留取工程结算值的5%作为工程质量保证金，保证金不计利息，保修期满一年后，扣除维修费用付至保修金的40%，满两年后扣除维修费用付至保修金的80%，满五年后扣除维修费用付清保修金（14日内）”，截止到省建六公司2015年2月13日起诉主张权利保修期已满两年不满五年，故原审法院判决历下燕山开发总公司向省建六公司支付涉案质保金的80%并分段计算逾期利息，并无不当，本院予以确认。
关于焦点问题二，被上诉人省建六公司对逾期竣工的事实并无异议，但主张涉案工程逾期竣工的原因与其无关。本院认为，省建六公司作为承包人对其主张的涉案工程逾期竣工的原因与其无关应承担举证责任，而本案中省建六公司提供的证据并不充分，既不能证明其与涉案工程逾期竣工无因果关系，也不能证明历下燕山开发总公司应对涉案工程逾期竣工负责，故其应承担举证不能的责任。原审法院认定省建六公司应对涉案工程逾期竣工承担违约责任，历下燕山开发总公司主张的逾期竣工违约金676758.8元（22558626.93×3%）符合合同约定，并无不当，本院予以确认。关于历下燕山开发总公司向省建六公司主张逾期竣工违约金是否已超过诉讼时效的问题。双方合同中仅约定了逾期竣工违约金的起算时间是以质监站备案验收且达到合同约定质量标准为准的竣工时间为准，并无约定违约金的履行期限，虽然涉案4号、5号楼的竣工时间分别为2012年10月30日、2012年10月12日，但该两栋楼竣工备案时间均为2014年10月31日。历下燕山开发总公司主张逾期竣工违约金的诉讼时效应从2014年10月31日起算符合合同约定，本院予以支持。退而言之，即使合同中对此没有约定，也因涉案合同没有约定违约金的履行期限，历下燕山开发总公司作为债权人可以随时主张权利，其提起反诉请求，也没有超过法律规定的诉讼时效期间。故，历下燕山开发总公司主张的逾期竣工违约金676758.8元，据有事实和法律依据，本院予以支持。
关于焦点问题三，上诉人历下燕山开发总公司主张其向业主支付的逾期交房违约金195940元，该损失是由省建六公司逾期竣工所造成，应由省建六公司承担。本院认为，历下燕山开发总公司向业主支付的逾期交房违约金为实际损失，其向省建六公司主张的逾期竣工违约金本院已经支持，且足以补偿其向业主逾期交房违约金的损失，故其此项主张，本院不予支持。历下燕山开发总公司主张的第三人的维修费用，因其未提供证据证明是省建六公司施工范围内出现了质量问题，也未证明第三人维修的工程属于承包人的保修范围和内容，且省建六公司在本案诉讼期间仍有人员在涉案工程现场从事保修工作，故其此项主张证据不足，本院不予支持。
综上所述，上诉人历下燕山开发总公司的上诉请求和理由合理部分，本院予以支持。原审法院认定事实清楚，但判决结果有误，本院予以纠正。依照《中华人民共和国民事诉讼法》第六十四条、第一百六十九条、第一百七十条第一款第（二）项、第一百七十五条之规定，判决如下：
一、维持济南市历下区人民法院（2015）历民初字第513号民事判决第一、二、三项及本诉案件受理费，即：“一、被告济南市历下区燕山工业小区开发建设总公司于判决书生效之日起十日内支付原告山东省建设建工集团第六有限公司质保金879961.44元的80%部分即703969.15元。二、被告济南市历下区燕山工业小区开发建设总公司于判决书生效之日起十日内支付原告山东省建设建工集团第六有限公司质保金逾期付款利息（以所欠质保金879961.44元的40%计351984.58元为基数，按同期银行贷款利率计算，自2013年10月31日起计算至判决书生效之日止；以所欠质保金879961.44元的40%计351984.58元为基数，按同期银行贷款利率计算，自2014年10月31日起计算至判决书生效之日止）。三、驳回原告山东省建设建工集团第六有限公司的其他诉讼请求。案件受理费人民币12820元，由原告山东省建设建工集团第六有限公司负担2560元，由被告济南市历下区燕山工业小区开发建设总公司负担10260元”。
二、撤销济南市历下区人民法院（2015）历民初字第513号民事判决第四项及反诉案件受理费，即：“四、驳回反诉原告济南市历下区燕山工业小区开发建设总公司的全部反诉请求。反诉费用人民币7245元，由反诉原告济南市历下区燕山工业小区开发建设总公司负担”。
三、被上诉人山东省建设建工集团第六有限公司于本判决生效之日起十日内支付上诉人济南市历下区燕山工业小区开发建设总公司逾期竣工违约金676758.8元。
四、驳回上诉人济南市历下区燕山工业小区开发建设总公司的其他反诉请求。
如未能按照本判决指定的期间履行给付金钱义务，应当按照《中华人民共和国民事诉讼法》第二百五十三条之规定，加倍支付迟延履行期间的债务利息。
一审反诉案件受理费7245元，由上诉人济南市历下区燕山工业小区开发建设总公司负担2692元，被上诉人山东省建设建工集团第六有限公司负担4553元。二审案件受理费12820元，由上诉人济南市历下区燕山工业小区开发建设总公司负担8267元，被上诉人山东省建设建工集团第六有限公司负担4553元。
本判决为终审判决。
审 判 长 褚 飞
代理审判员 闫振华
代理审判员 黄宏伟
二〇一六年二月二十五日
书 记 员 姚 敏