四川省峨眉山市人民法院
民 事 判 决 书
(2014)峨眉民初字第2105号
本诉原告（反诉被告）：峨眉山温泉度假区投资有限公司，住所地：四川省峨眉山市温泉大道1号。组织机构代码证号：70902651-5。
法定代表人：游铁鹰，董事长。
委托诉讼代理人：贺正钊，该公司员工。
委托诉讼代理人：张戈，四川守诚律师事务所律师。
本诉被告（反诉原告）：四川华西鲁艺建筑工程有限公司，住所地：成都市城区大道青羊工业总部。
法定代表人：蒋兴铭，董事长。
委托诉讼代理人：黄建平，四川同鼎益律师事务所律师。
委托诉讼代理人：曹蕾，四川同鼎益律师事务所律师。
本院于2013年1月17日立案受理本诉原告（反诉被告）峨眉山温泉度假区投资有限公司（以下简称温泉公司）诉本诉被告（反诉原告）四川华西鲁艺建筑工程有限公司（以下简称华西鲁艺公司）合同纠纷一案后，依法适用普通程序于2014年7月7日作出（2013）峨眉民初字第261号民事判决。双方当事人对该判决不服均提起上诉，乐山市中级人民法院于2014年11月21日作出（2014）乐民终字第1029号发回重审的民事裁定。本院于2014年12月11日重新立案后，组成合议庭于2015年3月19日、4月15日、4月28日、5月13日、9月8日和2016年1月11日、4月5日、4月27日和2017年12月8日公开开庭进行了审理。期间，双方当事人均申请补充鉴定，本院审查后准许对部分事项进行了补充鉴定。温泉公司委托诉讼代理人贺正钊、张戈，华西鲁艺公司委托诉讼代理人黄建平、曹蕾到庭参加了诉讼。本案现已审理终结。
本诉原告峨眉山温泉度假区投资有限公司向本院提出诉讼请求：1.被告华西鲁艺公司承担逾期完工的违约金180万元;2.办理工程决算;3.诉讼费用由被告承担。事实和理由：原、被告于2009年12月10日签订了峨眉天颐温泉公寓三标段《建筑装饰施工合同》，合同约定原告将该项目约8000平方米（117套）的商品房发包给被告施工，竣工日期为2010年3月31日。但被告延误至2010年11月29日才完工，给原告造成了巨大的损失。再是工程完工后被告迟迟不按合同约定办理决算，在我方多次催促后才提交了部分竣工资料，且长期拒不派员进行工程量价核对，致使工程决算延误至今无法办理，严重影响了我方对开发项目的核算等工作。因再三催告无果，具状诉来你院。
本诉被告华西鲁艺公司辩称，1.涉案工程于2010年11月29日完工并移交，已经逾期，但逾期责任完全在于本诉原告，体现为温泉公司未及时移交工地现场；温泉公司未及时提交甲供材料，未及时完成未计价材料品牌、价格的审核；温泉公司未及时完成图纸的审核；工程量大量增加；温泉公司未按合同约定每十五天支付工程进度款；其他配合单位的影响；工地现场经常停水、停电。2.未办理工程决算与事实不符，我方提供的是1800万的决算金额，但温泉公司认可的只有1300万，未按约定计价，也没有按实际施工的情况来计算工程量，双方未就决算达成一致，故未办理工程决算的原因在于温泉公司。3.关于工期延误违约金的诉讼时效问题，合同约定工期为2010年3月10日，实际完工时间为2010年11月29日，无论按合同约定完工的时间即2010年3月10日还是按实际完工的时间起算，温泉公司于2013年才起诉，该主张已超过了两年的诉讼时效。
反诉原告华西鲁艺公司向本院提出诉讼请求：1.温泉公司支付工程款6248060元；2.温泉公司支付逾期付款违约金(自2010年12月31日起按合同9.5条约定计算至实际履行之日止）；3.退还保证金100万元及利息（自2010年12月7日至实际履行之日止按中国人民银行同期贷款利率计算）；4.承担逾期退还保证金的违约金937403元;5.温泉公司承担本案全部诉讼费用。事实和理由：2009年12月10日，双方签订了《建筑装饰工程施工合同》，由华西鲁艺公司承建温泉公司的峨眉山天颐温泉公寓项目2号楼三标段装饰装修工程。在履行过程中，由于工程量增加及温泉公司不及时支付工程款等原因致使工期一再延误，最终于2010年11月29日移交给温泉公司。后温泉公司以种种理由推托和胡乱压价，致使结算至今未完成。经华西鲁艺公司结算，该工程总价约为18748060元，扣除温泉公司已经支付的款约12500000元，尚欠6248060元。另华西鲁艺公司缴纳的1000000元保证金至今未退还。温泉公司的违约行为给华西鲁艺公司造成了巨大的经济损失。
反诉被告温泉公司辩称，1.反诉原告主张的工程款严重背离实际，工程款我方按进度支付，且有提前支付给华西鲁艺公司的情形，付款不存在违约。工程结算迟迟未办理的原因在华西鲁艺公司。2.保证金的缴纳我方认可，但不应计算利息和违约金，且已超过诉讼时效，不应得到支持。对鉴定结论认为存在洞石计价不合理等情形，应予以调整。
当事人围绕诉讼请求依法提交了证据，本院组织当事人进行了证据交换和质证。对当事人无异议的证据，本院予以确认并在卷佐证。双方针对原一审诉讼过程中由四川廉正工程咨询有限公司做出的工程造价鉴定意见书存有异议的事项提出了补充鉴定申请。温泉公司补充鉴定申请事项为：1.对四川廉正工程咨询有限公司《关于峨眉山天颐温泉公寓项目工程造价鉴定报告》关于洞石面砖、吉耐板、防滑砖、锈片石、亚细亚仿古砖、钥匙取电器、T8/T5灯管、地漏、阳台水景安装、客厅方格计价进行补充鉴定或通过审判纠正，调减工程造价644095.89元；2.四川廉正工程咨询有限公司把温泉公司购买的开关面板错误地计入华西鲁艺公司的工程造价，应当调减工程造价180484.38元。华西鲁艺公司补充鉴定申请事项为：1.没有计取室内踢脚线玻璃胶的费用；2.没有计取石材及钢架拆除部分的费用；3.没有按2010年3月25日的约定调整人工费；4.部分未计价材料价格未按双方的认价计取；5.建筑面积的计算有误，导致该项目的取费等级计算错误；6.甲供材未计入工程总造价，导致该项目的取费等级计算错误。
本院针对双方提出有异议的补充鉴定事项组织了证据交换和听取理由说明，向四川廉正工程咨询有限公司致函询问当事人异议，向乐山市天平房地产测绘有限责任公司调取了涉案房屋的面积实测报告。合议庭评议后形成如下意见。针对温泉公司的申请，1.温泉公司主张华西鲁艺公司虚增工程造价，应对相关材料的价格进行调减，其提出华西鲁艺公司存在恶意串通，应提供实际供应商的名称来核定价格，按照第一标段的来计价，本院认为，在具体的施工工程中，双方在未计价材料认价表上已确认了采购价格，温泉公司提出补充鉴定的计价操作违反了合同相对性原则，与实际情况不符，不予准许；2.关于开关面板不计入工程造价的请求，四川廉正工程咨询有限公司在报告中说明尽管温泉公司出示代为付款发票，但根据建设工程计价原则，全部开关面板计入工程总价，其代为支付的购货款在办理财务决算时由温泉公司扣回，本院认为，该说明符合鉴定规范，温泉公司要求在工程造价鉴定总额中扣除的申请，不予准许。针对华西鲁艺公司的申请：1.关于没有计算贴脚线玻璃胶的请求，因华西鲁艺公司提供的签证为复印件，其称原件被温泉公司收走并出示了收条，但在温泉公司出示收走的技术核定单和经济签证单原件时，华西鲁艺公司查找后当庭表示并未找到其持有证据的原件，故对于是否做了玻璃胶的事实无法确定，故对该项请求不予准许；2.关于石材和钢架没有计算的请求，因拆除石材和钢架系温泉公司通知，事由可以确定，故对该项请求予以准许，但拆除的量无法确定，可由鉴定机构在规范允许的前提下依靠技术手段确定；3.关于未按约定调整人工费的问题，华西鲁艺公司提供了联系函，温泉公司在该联系函上注明在保证按合同约定的施工质量和工期完工的前提下可进行人工费调整，由此可见人工费调整附条件，能够确定的是工期确有延误，故对该项请求不予准许；4.关于柚木面板、实木踢脚板、深色花砖三种材料的价格不按双方认价计取的请求，因四川廉正工程咨询有限公司在报告中说明按照2010年10月12日双方《专题会议纪要》“三、对竣工、验收过程中发现的材料质价差异等未尽事宜，双方约定在工程决算过程中按实事求是的原则处理”，对能提供进一步价格依据，参照进一步的价格，它们是柚木面板、实木踢脚板、深色花砖，由此可见，鉴定机构通过询价的方式确定的价格符合公允原则，且鉴定机构在2014年6月8日回复中“材料价格”一栏中对该问题的进行了详细的说明，本院认为其说明内容符合有理有据原则，故对该项请求不予准许；5.建筑面积的计算明显有误，导致该项目的取费等级计算错误的请求，本院组织双方当事人对温泉公司提交的测绘面积汇总材料进行了证据交换，该汇总材料系原一审提交鉴定的依据，经双方质证可知该测绘面积汇总材料并非完全意义的测绘报告，故本院到该测绘面积汇总材料的出具单位乐山市天平房地产测绘有限责任公司调取了完整的测绘面积报告，双方对该测绘面积均无异议，故对该请求予以准许，以乐山市天平房地产测绘有限责任公司出具的测绘面积报告为送检材料；6.甲供材未计入工程总造价，导致该项目取费等级计算错误的请求，四川廉正工程咨询有限公司回函表明甲供材应计入定额，且其在鉴定过程中因直到鉴定结束时也未能获取由施工方施工的甲供材价格清单导致无法将甲供材计入工程总造价，故对该项请求予以准许，甲供材范围根据温泉公司提交的甲供材采购合同和现场勘查的情况予以确定。据此，本院将华西鲁艺公司异议成立的三项补充鉴定申请委托四川建业工程咨询有限公司进行鉴定。四川建业工程咨询有限公司做出鉴定意见后，温泉公司以“建筑面积按照测绘报告计算”的鉴定事项申请重新鉴定，本院审查后认为涉案工程本属无施工图和竣工图的工程，施工范围亦是双方在庭审中认可的，采用测绘报告中建筑面积计算工程量本就属针对涉案工程无施工图和竣工图的特点而做出的可操作性鉴定方案，温泉公司重新鉴定的理由不充分，不予准许。
根据当事人陈述和经审查确认的证据，本院认定事实如下：
2009年12月10日，温泉公司与华西鲁艺公司签订了《建筑装饰工程施工合同》，由华西鲁艺公司承建温泉公司的峨眉山天颐温泉公寓项目2号楼三标段装饰装修工程。合同主要约定：1.5工程规模：建筑面积约8000平方米，合同总价暂定1350万元，实际以结算为准；2.1本工程全面竣工并交付温泉公司使用的时间约定为：2010年3月31日；5.1华西鲁艺公司所承担的装饰工程必须按照合同工期完工并提交温泉公司使用。…由于温泉公司原因（包括延期支付进度款）推延的工期不计华西鲁艺公司延误，经双方现场确认后工期应顺延；5.2华西鲁艺公司须按合同总工期的要求，编制详细的施工进度计划，…华西鲁艺公司编制温泉公司审定的施工进度计划作为本合同必须的附件，是结付工程款的依据；6.1所有现场签证须由甲、乙双方约定的代表签字后，报温泉公司工程部负责人审签、单位盖章确认，否则无效；6.2温泉公司收到华西鲁艺公司所递交的变更申请、技术核定单应在24小时内，现场签证（工期、费用）应在2日内予以答复或确认，逾期即视为认可；9.1华西鲁艺公司按温泉公司审定批准的施工组织方案和施工进度计划按时完成了规定的工程量和进度任务后，2010年1月30日华西鲁艺公司申报实际完成工程量及费用，温泉公司在3个工作日内完成审核后按华西鲁艺公司此前实际完成的合格工程价款的80%支付首笔进度款；之后的进度款华西鲁艺公司按每15天时间段申报实际完成工程量及费用，温泉公司在3个工作日内审核并按该时间段华西鲁艺公司实际完成的合格工程价款的80%支付进度款。华西鲁艺公司若在相应时间段内未按施工进度计划完成相应的施工任务或工程量或实际未达到施工进度计划规定的时间节点的，温泉公司有权不予办理该时间段的工程进度款结付或相应推迟办理并不承担由此引起的不利后果；9.2工程竣工验收合格并提交完竣工资料后30个工作日内，双方办理完工程竣工结算手续，温泉公司向华西鲁艺公司支付工程款至双方办理的工程结算初步手续认定总价额的90%；9.5因温泉公司原因延期支付款或工程款的，每延期一天，温泉公司按应付款的万分之二支付华西鲁艺公司滞纳金，并承担由此给华西鲁艺公司造成的损失；13.1双方应严格遵守本合同约定，若任何一方违约，应支付对方违约金，双方约定违约金为已结算总价款的5%；违约方除承担违约金外，还须承担合同约定的罚款并赔偿给对方造成的经济损失；14.2本合同签订5个工作日内，华西鲁艺公司向温泉公司缴纳100万元工程质量、工期和安全保证金。在未发生质量、安全事故和按时完工验收合格交付温泉公司后，温泉公司在5个工作日内一次性退还华西鲁艺公司。
合同履行过程中，华西鲁艺公司于2010年1月29日向温泉公司申请延期15天，次日温泉公司工程部回复同意延期15天。2010年3月16日华西鲁艺公司以工地经常停水为由申请延期5天，温泉公司答复不予以同意。2010年3月31日华西鲁艺公司以方案未得到认可为由申请顺延20天，温泉公司代表同意工期延至4月30日，并加盖温泉公司工程部公章。2010年8月4日，温泉公司与华西鲁艺公司召开会议并形成会议纪要，鉴于施工进度严重滞后，施工单位承诺加班、加点，确保8月15日前将承建装饰的用房交付给温泉公司；并将此前的有关工程的技术和经济等工程签证资料交温泉公司完善确认手续等。2010年10月12日温泉公司与华西鲁艺公司召开会议并形成会议纪要，华西鲁艺公司保证在2010年10月15日前全面完成收尾工程，并尽快提交竣工资料；对施工、验收过程中发现的材料质价差异等未尽事宜，双方约定在工程决算过程中按实事求是的原则核定处理。2010年11月29日，双方对工程进行验收移交。后双方因结算金额相差过大，至诉讼前仍未办理工程结算。
2009年12月23日，由四川华西建筑装饰工程有限公司代华西鲁艺公司支付保证金100万元。2011年12月12日，华西鲁艺公司通过公证方式，确认保证金的支付主体为华西鲁艺公司，并将要求支付保证金100万元的《确认函》送达至温泉公司。
本诉原告温泉公司向本院提出诉讼请求：1.被告华西鲁艺公司承担逾期完工的违约金180万元;2.办理工程决算;3.诉讼费用由被告承担。反诉原告华西鲁艺公司向本院提出诉讼请求：1.温泉公司支付工程款6248060元；2.温泉公司支付逾期付款违约金(自2010年12月31日起按合同9.5条约定计算至实际履行之日止）；3.退还保证金100万元及利息（自2010年12月7日至实际履行之日止按中国人民银行同期贷款利率计算）；4.承担逾期退还保证金的违约金937403元;5.温泉公司承担本案全部诉讼费用。
本案于2013年1月17日立案受理后，本院于2014年7月7日作出（2013）峨眉民初字第261号民事判决。双方当事人对该判决不服均提起上诉，乐山市中级人民法院于2014年11月21日作出（2014）乐民终字第1029号发回重审的民事裁定。乐山市中级人民法院就《专题会议纪要》（2010年9月15日）下方乙方代表处的签名字迹“鲜劲松”进大笔迹形成方式鉴定，四川福森特司法鉴定所于2014年11月7日作出鉴定意见：送检材料《专题会议纪要》（2010年9月15日）下方乙方代表处的签名字迹“鲜劲松”系非硬笔书写形成，为复制形成字迹。
诉讼中，华西鲁艺公司申请对工程造价进行鉴定，四川廉正工程咨询有限公司作出工程造价鉴定意见书，确定涉案工程总造价为14803330元，鉴定费为443400元（由华西鲁艺公司垫付），其中开关面板计入工程总价，温泉公司提交的开关面板发票总价为165484.67元。本院依华西鲁艺公司补充鉴定的申请委托鉴定，四川建业工程咨询有限公司按照本院的鉴定要求于2017年11月24日作出工程造价鉴定意见书，提及石材和钢架拆除部分费用，由于存在证据不充分而无法判定，故分别做出两种计算结果，提交给法院作为参考：1.若不包含石材和钢架拆除部分费用，本工程总造价金额为15574736元；2.若包含石材和钢架拆除部分费用，本工程总造价金额为16311037元。鉴定人张某、莫某出庭作证，提及甲供材费用应在计算建设方实际支付承包费工程款时予以扣除，税费若是由承包方支付的，则由建设方予以支付，鉴定费为10万元（华西鲁艺公司垫付），鉴定人出庭费用为1000元（温泉公司垫付）。
另查明：华西鲁艺公司认可收到工程款10825644.67元。2010年9月15日，鲜劲松出具收条并加盖四川华西鲁艺建筑工程有限责任公司峨眉山天颐温泉公寓项目室内装饰装修工程项目经理部公章载明申请预支工程款50万元，结合温泉公司提供的记账凭证和结算业务申请书可知，实际支付473200元。温泉公司出具委托书五份，均有鲜劲松签名和四川华西鲁艺建筑工程有限责任公司峨眉山天颐温泉公寓项目室内装饰装修工程项目经理部公章，按照五份委托书载明的收到款项总金额为809923元。对于温泉公司于2010年11月12日缴纳的税金445142.01元和2011年7月25日缴纳的税金212212.28元，共计657354.29元，温泉公司持有的完税证上载明纳税人为华西鲁艺公司。
本院认为,双方签订的《建筑装饰工程施工合同》合法有效。根据双方的诉、辩主张，本案的争议焦点在于：一、本案的工程款总价和已付工程款数额的确定；二、工期延误的责任应由谁承担；三、温泉公司是否存在逾期支付工程款的违约行为；四、温泉公司是否存在逾期支付保证金的违约行为；五、本案的鉴定费用如何分摊。
一、关于本案的工程款总价和已付工程款数额的确定问题。
对于温泉公司提出办理结算的诉讼请求，已由本院通过委托鉴定机构进行工程造价鉴定而实际进行。涉案工程的工程款总价经四川廉正工程咨询有限公司初次鉴定，针对双方对初次鉴定存疑的事项，本院通过组织双进行证据交换、理由说明后明确需补充鉴定的事项，并委托四川建业工程咨询有限公司进行了补充鉴定。鉴于双方对石材和钢架拆除部分工程量的确定存在较大争议，四川建业工程咨询有限公司根据本院的要求区分是否包含石材和钢架拆除部分的费用做出了两个意见。因石材和钢架的拆除事由明确是基于温泉公司通知而为，但对拆除石材和钢架的工程量，应由主张事实成立的华西鲁艺公司承担举证责任，其出示的现有证据均为复印件，且通过当庭核对温泉公司收取的原件，华西鲁艺公司仍未找寻到复印件的原件，故华西鲁艺公司应对此承担不利后果。本院依法确认涉案工程总造价为不包含石材和钢架拆除部分费用的鉴定意见即15574736元。
对于已付工程款金额的确定，双方存有争议的费用为2010年9月16日的50万元，2011年1月31日的809923元，代扣的税费657354.29元，代扣的水电费76435.47元。2010年9月16日的50万元，结合华西鲁艺公司的代表鲜劲松出具的收条和温泉公司提供的记账凭证和结算业务申请书，可确认实际已付473200元。2011年1月31日的809923元，有五份委托书可予以证实属已付款。代扣的税费657354.29元，因双方在合同中未约定缴纳税费的主体，故应由负有法定缴纳税费义务的一方即华西鲁艺公司来承担。现温泉公司持有税费缴纳凭证的原件，应合理相信温泉公司实际代华西鲁艺公司缴纳了税费，可在本案中予以抵扣。代扣的水电费76435.47元，因温泉公司提供的证据不足以证明华西鲁艺公司负有支付水电费的义务及实际支付水电费的金额，本院不予认可。综上，结合华西鲁艺公司认可收到的工程款10825644.67元和温泉公司直接支付的开关面板价款165484.67元，已付工程款为10825644.67元+165484.67元+473200元+809923元+657354.29元=12931606.63元，剔除甲供材和税费771405.53元温泉公司还需支付华西鲁艺公司工程款1871724元。
二、关于工期延误的责任应由谁承担的问题。
本案中合同约定开工日期以实际进场施工的日期为开工日期，双方约定本工程的开工日期为2009年12月20日，完工时间2010年3月31日。实际完工时间为2010年11月29日。华西鲁艺公司提交的工作联系单能够证明工期未按期确实存在温泉公司同意工期顺延的事由，但结合2010年8月4日和2010年10月12日的专题会议纪要内容，华西鲁艺公司确实存在延误工期的事实，且即使假定华西鲁艺公司提供的最后日期即2010年9月9日工作联系单内容成立，合理顺延时间也绝非持续至2010年11月29日，故应认定华西鲁艺公司需承担工期延误的违约责任。根据双方签订合同的13.1条约定“甲乙双方应严格遵守本合同约定，若任何一方违约，应支付对方违约金，双方约定违约金为已结算总价款的5%；违约方除承担违约金外，还须承担合同约定的罚款并赔偿给对方造成的经济损失”，本案中，温泉公司对于工期延误造成的具体损失并未实际举证，且违约责任的设置是以损失填平为原则以适度惩罚为补充的，意味着双方约定的违约责任承担方式无论以违约金、罚款、赔偿损失等不同表述方式约定，都应以实际损失来确定最终违约责任的界限，故应认定华西鲁艺承担工期延误违约金为15574736元的5%即778737元。
对于华西鲁艺公司主张工期延误违约金的请求已超过诉讼时效的辩称，本院认为温泉公司在工程移交后多次向华西鲁艺公司致函要求其提交工程款结算书，直至2012年12月都还在发函催促，本案中对于违约责任的范围是建立在当事人对工程结算款确认为前提计算比例的，温泉公司对于违约责任如何量化尚不明确的情况下，其主张权利的诉讼时效起算时间不能以实际交付工程之日来定，应认定温泉公司主张工期延误违约金的请求未超过诉讼时效。
三、关于温泉公司是否存在逾期支付工程款的违约行为的问题。
从华西鲁艺公司陈述来看，其认为双方因结算价差异过大致使无法完成最终的结算，以鉴定价格超出温泉公司审核的价格为由主张温泉公司没有按合同约定进行结算而存在逾期付款的违约行为。本案中，工程款未形成最终结算的原因不能单方归责于温泉公司，若未在合同约定的结算时间内完成，作为权利享有者的承包方是可以通过诉讼的方式来解决双方的结算问题的。既然工程款支付数额尚未确定，就意味着工程款支付的时间亦没有确定，则不存在逾期付款的问题。加之温泉公司在2011年1月31日前就已完成了按照现今鉴定价格的80%付款比例，应综合认定温泉公司不存在逾期支付工程款的违约行为。
四、关于温泉公司是否存在逾期支付保证金的违约行为的问题。
根据双方合同约定14.2条“本合同签订后5个工作日内，乙方向甲方缴纳100万元工程质量、工期和安全保证金。在未发生质量、安全事故和按时完工验收合格交付甲方后，甲方应在5个工作日内一次性退还乙方”，保证金退还的前提是在未发生质量、安全事故和按时完工验收合格交付温泉公司后，现华西鲁艺公司的合同履行不符合约定中“按时完工验收合格”的条件，不符合保证金退还条件，即保证金退还的起算时间并未确立。结合合同约定内容和客观履行状态可知，温泉公司不存在逾期支付保证金的违约行为，华西鲁艺公司主张其承担违约金的请求于法无据，本院依法不予支持。对于保证金100万元，温泉公司应该予以返还，利息可从华西鲁艺公司向温泉公司主张权利之日即公证的《确认函》送达至温泉公司之次日起按照中国人民银行同期贷款利率计算，起算时间为2011年12月13日。
五、关于本案的鉴定费用如何分摊的问题。
鉴定费用包括四川廉正工程咨询有限公司收取443400元和四川建业工程咨询有限公司收取10.1万元。温泉公司审核工程款造价为13876812元，华西鲁艺公司审核工程款造价为18748060元，鉴定费用属于诉讼费用的类别，按照诉讼费由败诉方承担的原则，鉴定费应按照各方主张工程款造价与最终鉴定意见的差额比例进行分摊，以此确定温泉公司承担35%的鉴定费190540元，华西鲁艺公司承担65%的鉴定费353860元。
综上所述，依照《中华人民共和国合同法》第一百零七条、第一百零九条、第一百一十四条，判决如下：
一、本诉被告四川华西鲁艺建筑工程有限公司在本判决生效后十日内支付本诉原告峨眉山温泉度假区投资有限公司工期延误的违约金778737元；
二、反诉被告峨眉山温泉度假区投资有限公司在本判决生效后十日内支付反诉原告四川华西鲁艺建筑工程有限公司工程款1871724元；
前一、二项品迭后，由峨眉山温泉度假区投资有限公司在本判决生效后十日内支付四川华西鲁艺建筑工程有限公司1092987元；
三、反诉被告峨眉山温泉度假区投资有限公司在本判决生效后十日内退还反诉原告四川华西鲁艺建筑工程有限公司保证金100万元及利息(自2011年12月13日起至款清之日止按中国人民银行同期贷款利率计算）；
四、驳回峨眉山温泉度假区投资有限公司和四川华西鲁艺建筑工程有限公司的其他诉讼请求。
如果未按本判决指定的期间履行给付金钱义务，应当依照《中华人民共和国民事诉讼法》第二百五十三条之规定，加倍支付迟延履行期间的债务利息。
本诉案件受理费21000元，由峨眉山温泉度假区投资有限公司承担11915元，四川华西鲁艺建筑工程有限公司承担9085元；反诉案件受理费38615元，由峨眉山温泉度假区投资有限公司承担11568元，四川华西鲁艺建筑工程有限公司承担27047元；鉴定费544400元，由峨眉山温泉度假区投资有限公司承担190540元，四川华西鲁艺建筑工程有限公司承担353860元。
如不服本判决，可在判决书送达之日起十五日内向本院递交上诉状，并按对方当事人的人数提交副本，上诉于四川省乐山市中级人民法院。
审 判 长 谭 丽
审 判 员 易 君
人民陪审员 王树红
二〇一七年十二月八日
书 记 员 毛 霞
附：本案所适用的条文
《中华人民共和国合同法》
第一百零七条当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
第一百零九条当事人一方未支付价款或者报酬的，对方可以要求其支付价款或者报酬。
第一百一十四条当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
约定的违约金低于造成的损失的，当事人可以请求人民法院或者仲裁机构予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，当事人可以请求人民法院或者仲裁机构予以适当减少。
当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。