贵州省大方县人民法院
民 事 判 决 书
（2011）黔方民初字第697号
原告（反诉被告）贵州省织金县市政建设工程有限责任公司，住所地：贵州省毕节市织金县城北开发区。
法定代表人周荣贵，董事长。
委托（特别授权）代理人路英、邓维义，贵州本芳律师事务所律师。
被告（反诉原告）大方县水利水电工程移民局，住所地：贵州省毕节市大方县大方镇新民路98号。
法定代表人龙诗荣，局长。
委托（特别授权）代理人杜德文，大方县水利水电工程移民局职工。
委托（特别授权）代理人徐贵，贵州黔鹰律师事务所律师。
原告贵州省织金县市政工程建设有限公司诉被告大方县水利水电工程移民局建设工程施工合同纠纷一案，本院受理后，依法组成合议庭，公开开庭进行了审理。原告（反诉被告）贵州省织金县市政工程建设有限公司（以下至判决主文前简称织金市政公司）委托代理人路英、邓维义，被告（反诉原告）大方县水利水电工程移民局（以下至判决主文前称大方移民局）委托代理人杜德文、徐贵到庭参加了诉讼。本案现已审理终结。
织金市政公司本诉称，2006年9月1日，织金市政公司与大方移民局（原名称为大方县水库移民局）签订《大方县大渡口至九洞天新建公路中的三座桥梁工程施工合同协议书》，约定由织金市政公司承建大方县大渡口到至九洞天新建公路中的三座桥梁，合同总价为1053962.70元，工期120天。合同订立后，织金市政公司向大方移民局交纳了工程质量保证金50000.00元。织金市政公司在施工过程中，发现九洞天岸基坑与设计地质不符，地基应力不均衡，桥台正处于河道内。双方于2006年11月28日与设计代表、监理单位在工地召开现场会议，作出将桥梁项目K5＋887.723桥九洞天岸桥台及基础全部变更为片石混凝土，取消原设计浆砌片（块）石桥台的变更意见。同时，设计代表还对其他桥的桥台及基础作出从基底起一、二台做片石混凝土，第三台起做浆砌片（块）石的要求。2007年1月5日，监理单位下达了工程变更令，估计变更金额为141345.41元；2007年1月8日，桥梁项目K5＋887.723小桥桥空心板按设计孔径N17#钢筋保护层不能满足规范要求，监理单位下达了板孔径处理工程变更令，估计变更金额为3403.50元；2007年3月15日，桥梁项目K3＋283.15小桥桥空心板按设计孔径N16#钢筋C2.5砼保护层不能满足规范要求，监理单位下达了板孔径处理工程变更令，估计变更金额2953.00元；2007年4月28日，桥梁项目K5＋887.723小桥大渡口岸桥台左侧砌体沉降不均匀出现小裂纹，监理单位下达了拆除、重砌、勾缝的工程变更令，估计金额24285.24元；2007年7月20日，因工地村民阻工、破坏施工道路及施工现场停电等人为和自然因素，监理单位下达了处理干扰工程变更令，估计变更金额为20340.79元；2007年11月26日，桥梁项目K2＋981.178小桥开挖至设计高程后的基底为冲积的砾石，不能满足设计基础强度，监理单位下达了基础加深工程变更令，估计变更金额为70496.00元；施工期间，三号桥钢管体被山洪冲走三次，水毁工程材料损失及人工费用共306865.07元。2009年12月1日，织金市政公司向大方移民局提交了交工验收报告和工程竣工文件，次日，驻地监理工程师办公室在终期支付申请单上签署同意支付终期计量款的意见。2010年3月6日，大方移民局对织金市政公司承建的大渡口至九洞天新建公路中三座桥梁工程进行了竣工验收，认定工程合格。工程施工过程中，大方移民局仅支付工程款925733.00元，织金市政公司因此要求大方移民局办理工程决算，大方移民局则以未审计为由予以拒绝。上述工程造价，经监理单位毕节地区交通建设工程监理站审定为1301745.03元，经贵州亚信会计师事务所有限公司鉴定为2746978.23元。请求判决大方移民局立即偿付工程款余额1846558.52元及利息，诉讼费用由大方移民局负担。诉讼中，织金市政公司将诉讼请求变更、增加为判决大方移民局立即偿付工程款余额和退还工程质量保证金共计2794072.71元及利息，诉讼费用由大方移民局负担。辩论终结时，织金市政公司将诉讼请求确定为：一、大方移民局支付织金市政公司工程款2764978.23元，扣除已支付工程款925733.00元，尚欠1839245.23元；二、大方移民局支付织金市政公司欠款金额从2010年1月14日起至实际履行之日止的利息（按照中国人民银行发布的同期贷款利率计算）；三、大方移民局退还织金市政公司工程质量保证金50000.00元；四、大方移民局承担工程造价鉴定费100000.00元和负担本诉案件受理费36075.00元。
大方移民局辩称，2006年9月1日，经招、投标，大方移民局与织金市政公司签订《大方县大渡口至九洞天新建公路中的三座桥梁工程施工合同协议书》事实存在，由织金市政公司承建大方县大渡口到至九洞天新建公路中的三座桥梁，约定合同总价为1053962.70元，工期120天。施工中的六次工程变更均没有得到大方移民局领导的认可或加盖单位的印章确认。大方移民局已支付织金市政公司工程款925733.00元。2010年3月6日进行的工程验收双方都参与的事实存在。在工程招、投标前，织金市政公司进行了现场勘查，其应当充分估计到应承担的责任和风险。施工过程中是否发生水毁工程大方移民局不知情，即使发生水毁工程的事实，其风险也应由织金市政公司承担。织金市政公司提出的其它主张，因其作为有资质的施工单位，能够预见这些责任和风险。因此，织金市政公司的诉讼请求按合同约定依法不能成立，请求驳回织金市政公司的所有诉讼请求。
大方移民局反诉称，双方的权利义务由招标、投标文件及建设施工合同、合同通用条款、合同专用条款确定。织金市政公司在约定工期内两次向大方移民局提出工程变更请求，在工程变更申请中的业主单位领导意见或盖章处均未得到大方移民局领导认可或加盖单位印章。该工程变更实属与真实情况不一致的工程变更，且不必然导致工程延期。织金市政公司未按规定程序告知监理方和大方移民局，也未在合同约定的时间内完成工程。织金市政公司在合同逾期后的工程变更为不合规的工程变更，并擅自停工。2008年5月9日，在各方共同参与的复工协调会中，指出织金市政公司已违约超期450天，其必须在50天内完工。其后，织金市政公司又提出变更处理申请，导致工程无限度拖延。工程施工中，大方移民局共支付织金市政公司工程款925733.00元，共支付毕节地区交通建设工程监理站监理费60000.00元。因织金市政公司在施工过程中违约，违规变更工程，造成业主方重大损失，工程经云南规划建筑工程司法鉴定中心鉴定，存在质量问题和安全隐患。请求判令织金市政公司赔偿损失及违约金共计752766.60元，诉讼费用由织金市政公司负担。辩论终结时，大方移民局将反诉请求确定为：一、织金市政公司返还工程款925733.00元；二、织金市政公司赔偿增加工程量损失585600.00元和延期监理费损失190000.00元；三、织金市政公司支付违约金52698.13元；四、织金市政公司承担工程质量鉴定费100000.00元和负担反诉案件受理费5600.00元。
织金市政公司辩称，织金市政公司不存在延误工期的行为，履行合同中，客观上的工期超过了合同约定的期限，原因是业主方的施工场地与条件不具备，没有施工便道和施工场地，按照合同的约定，应是业主方的责任；由于设计不具备地质条件，监理单位作了工程变更，织金市政公司的工期应该得到延长；当地农民堵工，不是织金市政公司所能处理的。根据双方的合同专用条款第十四条的规定，拖延损失赔偿金限额是合同价款的5%，大方移民局的反诉主张明显超过了合同约定的限额。大方移民局提供的云南规划建筑工程司法鉴定中心作出的鉴定意见，没有一条表明三座桥梁不合格的结论。请求驳回大方移民局的反诉请求。
围绕诉、辩主张，织金市政公司和大方移民局提供以下证据进行质证：
（一）、织金市政公司提供的证据有：
1、招标文件、投标文件、通用合同条款、施工合同协议书及附件、安全生产合同、廉政建设合同。证明：（1）双方经过招、投标签订建设施工合同，招、投标文件系合同的组成部分，施工合同协议书及附件、合同通用条款、合同专用条款对双方具有法律约束力；（2）工程量清单所列的预计数量和单价计算的合同总价为人民币1053962.70元。
大方移民局认为：（1）织金市政公司拟派往本招标工程技术人员简历与其出具的竣工报告中的工程管理人员不一致，没有按合同约定的要求派人管理；（2）通用合同条款未在施工合同协议中作为阅读理解主合同的内容。
2、验收会议纪要。证明：2010年3月6日，大方县大渡口至九洞天公路桥梁经大方县人民政府组织的验收组进行验收，认为三座桥梁基本达到设计要求，同意作为合格工程验收，大方移民局应按施工合同的约定支付工程款。
大方移民局认为工程在验收时存在质量缺陷，明确从验收之日起，两年作为施工方的缺陷修复期，施工方应当予以维护，纪要与质量鉴定意见相吻合，表明三座桥梁一直存在质量问题。
3、工程施工竣工文件。证明：（1）2009年12月1日，织金市政公司向大方移民局提交工程验收申请报告；（2）2007年1月7日至2009年7月20日，监理工程师多次下达工程变更令，对原合同约定的工程量进行变更，双方应按合同的约定，以实际完工的工程量和工期进行决算；（3）2009年12月2日，监理工程师签署同意支付终期计量款1301745.03元意见。
大方移民局认为：（1）织金市政公司自己编写的施工、竣工文件与设计不符。2006年11月27日提出的工程变更申请表中原设计数量558立方米，而工程变更申请单中的数量是588立方米，比应有的工程量多30立方米；2007年11月12日提出的工程变更申请表中原设计数量是911立方米，而工程变更申请单中的数量是991立方米，比应有的工程量多80立方米。（2）竣工文件中织金市政公司提出工程经过验收合格的结论与后来的质量鉴定意见不一致。（3）竣工文件中的工程变更情况均没有得到大方移民局法定代表人认可和盖章确认。
4、不能正常施工报告、同心村委会及村民证明、大方县移民局方移函（2011）01号文件。证明：（1）大方移民局未完成“三通一平”工程，未落实工程用地和施工临时用地，未修通进场施工道路，导致织金市政公司无法正常施工和村民阻工的事实；（2）鼎新乡大渡口至九洞天公路工程至今未完工，织金市政公司施工大型机械设备及材料不能运至施工现场，被迫中途停工；（3）施工过程中产生的土地补偿款、施工过路费，根据合同通用条款应属于业主应增加的费用。
大方移民局认为：（1）织金市政公司进行过现场勘测，不能正常施工不是大方移民局的责任；（2）同心村委会及村民证明的事实，在竣工报告中没有这方面的记载；（3）方移函（2011）01号文件只能说明大方移民局向审计局发过函，不能达到织金市政公司的证明目的。
5、水毁工程报告、照片、水毁工程误工清单。证明织金市政公司在施工过程中受自然灾害产生水毁工程的事实，根据合同通用条款应属业主方承担的风险。
大方移民局认为织金市政公司在施工过程中没有提出，其有责任、有能力预见在施工过程中可能发生的灾害，不能达到织金市政公司的证明目的。
6、工程结算书及索赔费用明细表。证明织金市政公司承建的大方县大渡口至九洞天公路桥梁工程项目的结算总价为3619072.71元，其中原监理单位审定金额为1301745.03元，织金市政公司在监理单位审定外的索赔金额为2317327.68元，扣除大方移民局已经拨付的工程款925733.00元，尚欠工程款为2693339.71元。
大方移民局认为监理单位审定金额1301745.03元和已经拨付款工程款925733.00元是事实，提出工程结算书和索赔费用明细表仅仅是织金市政公司自行编制的材料，不具备法律文件的证明效力，不能证明大方移民局所与织金市政公司所涉工程款的结算项目和数额。
7、收据。证明大方移民局收取织金市政公司工程质量保证金50000.00元，应予以退还。
大方移民局认为织金市政公司承建的工程质量不合格，依合同交纳的工程质量保证金不应退还。
8、亚会审鉴字（2011）第290号《工程造价鉴定报告》。证明：（1）经织金市政公司申请，法院委托贵州亚信会计师事务有限公司对涉案三座桥梁工程造价进行鉴定。（2）鉴定报告鉴定结果为：①三座桥梁清单内项目审定金额为1058115.70元；②涉及设计变更部分审定金额为1706862.53元；③工程造价合计2764978.23元。（3）织金市政公司为大方移民局建设的三座桥梁的造价总计为2764978.23元。
大方移民局认为：（1）贵州亚信会计师事务有限公司是以织金市政公司单方提供的依据进行鉴定，大方移民局提出的两次工程变更与设计方量有变化的Ｋ5号桥与Ｋ2号桥，鉴定单位没有采信；（2）工程变更中未得到业主签字认可的相关费用却计算在内；（3）鉴定单位采信织金市政公司提供的清单和施工、竣工文件，作出的鉴定结论不符合客观事实；（4）鉴定结果中的清单内项目工程款与变更部分工程款均少于起诉时主张的索赔金额，表明织金市政公司的诉讼主张不是事实。
9、鉴定费发票2张。证明因对三座桥梁进行工程造价鉴定，织金市政公司已支付的鉴定费用100000.00元，应由大方移民局负担。
大方移民局认为所支付的鉴定费应当由织金市政公司负担。
（二）、大方移民局提供的证据有：
1、事业单位法人证书。证明大方县水利水电工程移民局经国家事业单位登记管理局登记，具有事业单位法人资格，2011年前单位名称为大方县水库移民局。
织金市政公司无异议。
2、大方县大渡口至九洞天新建公路中三座桥梁工程招投标情况报告。证明：（1）大方县大渡口至九洞天新建公路中的三座桥梁工程是严格按照《中华人民共和国招标投标法》招投标程序进行招投标；（2）织金市政公司取得招标文件后，对现场进行了踏勘，对大方移民局提供的招标文件，在规定的时间内未提出疑问。
织金市政公司认为招投标情况报告不能证明本公司到现场进行了踏勘，应提供现场签到表或现场中期照片或视听资料，报告系大方移民局委托制作，不能证明本公司未向大方移民局或招标中介机构提出疑问，不能对抗合同条款中关于遗漏、增补项目计价的约定。
3、织金市政公司大方县大渡口至九洞天公路桥梁项目工程施工竣工文件。证明：（1）施工合同工程款为1053962.70元，工期为120天，承包人按时完工及缺陷修复，业主支付合同价款；（2）施工方在工期内的两次工程变更和超期后的几次工程变更未得到业主方法定代表人认可或加盖单位印章，延期理由不成立；（3）2008年4月5日，施工方擅自停工；（4）2008年5月9日召开的复工协调会，要求50天内必须完成工程，但仍未按期完工；（5）2009年4月25日，施工方才提出变更处理申请，同年7月18日又提出工程变更申请，其延期理由不成立；（6）施工方未履行2010年3月6日验收会议纪要提出的六个整改意见，未按约定协商处理拖期所产生的监理费用，未完善竣工验收资料进行审计决算；（7）工程尚未进行验收，施工方提前要求支付终期款，与施工程序相矛盾；（8）伪造资料，提前计算工程变更量，再发工程变更令，验收记录无相关人员签名，未进行终期验收即计算出终期工程款。
织金市政公司认为：（1）施工合同的决算条款、工期延误条款等对工程款及工期均作出了相应的变更，应以决算为准；（2）工程量及工期延展均有工程变更令及会议纪要记录，不存在未按监理要求施工及工期延误事实；（3）2009年9月2日，监理单位已经在终期支付申请单上签注同意支付终期款1301745.03元的意见，业主方驻工代表左建越也签署建议支付的意见，不存在工期延误及伪造工程量的事实。
4、工程变更和设计概算资料。证明2006年11月27日和2007年11月12日提出的工程变更申请中织金市政公司编写的变更前工程方量与设计概算中记载的工程方量不符。
织金市政公司认为设计单位没有设计资质，工程设计概算不能作为实际决算的依据，不能作为衡量业主方损失的依据，所有工程变更均有业主方代表左建越签名和监理工程师认可。
5、大方县审计局国家建设项目投资审计中心情况说明。证明：2010年5月20日，审计单位对大方县移民局委托审计的大方县大渡口至九洞天新建公路中三座桥梁建设项目作出说明，认为1号桥中心轴线偏位大，未按设计进行施工；3号桥大渡口岸桥台在施工过程中左侧砌体沉降不均匀出现裂缝，若按合格工程审计，则1号桥及3号桥的变更为不合理变更不予同意，否则此工程不具备审计条件。
织金市政公司认为：（1）审计的对象为工程款及工程量，不是工程质量，审计机构履行了建设工程质量监督职责，不具有合法性；（2）大方移民局委托的设计单位不具有设计资质，无地质勘查报告说明及设计变更图纸，所产生法律后果均应由业主方承担；（3）未通过国家审计不是施工方的过错，不能将责任转嫁给织金市政公司。
6、专用合同条款。证明织金市政公司超期违约，应当支付大方移民局拖期损失赔偿金52698.13元和违约金52698.13元。
织金市政公司认为本工程项目工期延长系设计图纸与实际地质状况不相符、业主方未征用工程长期用地、未修通施工场地道路、未给予临时用地补偿和发生水毁灾害等因素造成，应当依照合同通用条款明确责任主体。
7、施工监理合同附件Ｃ。证明本工程项目约定监理费为20000.00元，因施工方延期38个月，导致监理费增为190000.00元，大方移民局已实际支付60000.00元。
织金市政公司认为与本案争议无关，且并未实际全额支付。
8、验收会议纪要及照片9张。证明：（1）1号桥（中心桩号Ｋ2＋981.178）不符合规定工程变更，中心轴线偏位大，未按设计进行施工，增加引道路线建设的工程量和施工难度，引道偏离原设计，长度相差较大，经业主方邀请相关专家到现场进行实地检测，挖土方需45.56万元，填方需0.65万元，浆砌档墙需11.35万元，违规变更加大工程量；（2）织金市政公司未按验收会议纪要要求进行整改处理，不能进行终期验收。
织金市政公司认为会议纪要及照片表明：（1）织金市政公司承建的三座桥为合格工程；（2）业主方未修通公路，施工方大型施工设备无法抵达施工场地；（3）设计单位、监理单位未补充完善变更资料客观存在。
9、借款单及电汇凭证。证明大方移民局已向织金市政公司支付工程款共计925733.00元的事实。
织金市政公司予以认可。
10、（2012）司鉴字第Q12461J号司法鉴定意见书。证明：（1）经大方移民局申请，法院委托云南规划建筑工程司法鉴定中心对贵州省大方县大渡口至九洞天1﹟、2﹟、3﹟桥梁质量进行司法鉴定；（2）织金市政公司在施工过程中未按设计图纸进行施工，偷工减料，桥台身侧墙开裂，栏杆、栅板开裂，引导板开裂、下陷，2﹟、3﹟桥已被周边村民私自通车投入运行，存在安全隐患，三座桥梁存在质量问题。
织金市政公司认为：（1）鉴定书仅以设计图纸来鉴定是不符合规定和错误的，设计单位不具备设计的资质，鉴定书没有以三方认可的实际工程变更量作为评判的标准；（2）设计单位没有资质，监理单位没有提供资料是业主方的责任；（3）鉴定意见没有说明三座桥梁有质量问题，仅对栏杆、栅板等进行检测；（4）鉴定意见根据原设计图纸作出，没有结合施工过程中的变更令、会议纪要等资料，是不客观的鉴定意见，不具有判断涉案工程质量是否合格的证明效力，不应影响工程决算。
11、鉴定费用票据。证明大方移民局为对大渡口至九洞天1﹟、2﹟、3﹟桥梁质量进行司法鉴定，支付鉴定费100000.00元，应由织金市政公司负担。
织金市政公司认为桥梁质量鉴定费应由大方移民局负担。
在诉讼过程中，本院依职权于2012年6月10日到现场拍摄1﹟、2﹟、3﹟桥梁照片11张。织金市政公司认为照片反映出直到拍摄时大方移民局仍没有提供进场施工的条件。大方移民局认为因工程进行了变更，不能说明现场不符合施工条件。
根据双方当事人的陈述及对所有证据发表的质证意见，本院认定下列事实：
根据乌江洪家渡水电站建设需要，大方县交通局于2003年7月完成洪家渡库区的大方县大渡口至九洞天新建移民公路中的三座桥梁设计工作，设计项目名称及地理位置为：K2＋981.178空心板桥（简称1号桥）、K3＋283.15空心板桥（简称2号桥）、K5＋887.723空心板桥（简称3号桥）。2003年10月，大方县人民政府、国家电力公司贵阳勘测设计研究院作出《乌江洪家渡水电站在大方县三期移民安置实施规划报告》，提出库周公路恢复规划设计建设大方县大渡口至九洞天公路桥梁三座。2004年，大方移民局向贵州省毕节地区水库移民局申请审查立项建设。2005年3月，贵州省毕节地区工程咨询中心作出《大方县大渡口至九洞天新建公路工程设计审查意见》，提出：桥梁设计应按国家规定进行设计，增加控制点坐标，补充桥梁荷载等，因未作地勘，桥台基础深挖不能确定，实际中设计应作现场深挖确定，原则上应保障挖深至本土（最好为基岩），同时桥面纵坡度不应超过3%，设计应作相应调整，桥面砼空心板应提高砼等级，改为C35。2005年3月30日，贵州省毕节地区水库移民局批复大方县大渡口至九洞天公路建设，要求按照地区工程咨询中心审查意见，做好相关工作，确保工程效益。
2006年7月14日，大方移民局与贵阳汇丰工程建设中介服务有限公司签订招标代理合同。2006年8月28日，织金市政公司中标。2006年9月1日，大方移民局与织金市政公司签订《大方县大渡口至九洞天新建公路中的三座桥梁工程施工合同协议书》（以下简称协议书）。协议书约定：1、本工程由三座桥梁以及其他构造物工程等组成；2、本合同由本合同协议书及附件、中标通知书、投标书及投标书附录、合同专用条款、合同通用条款、技术规范、图纸、标价的工程量清单、辅助资料表、资格审查表、构成本合同组成部分的其他文件构成并作为阅读和理解本协议的组成部分；3、本合同总价为人民币1053962.70元；4、本合同工程工期为120天，工期从开工期的最后一日起算。合同专用条款约定：（1）大方移民局业主代表为左建越；（2）履约担保金额为合同价格的5％；（3）发开工令的期限为签订合同协议书之日起14日内，开工期为开工令之日起7日内；（4）临时用地租地由业主与当地乡政府协商解决，租地费用由承包人摊入各相关工程细目的单价和费率之中，不单独计量；（5）拖期损失赔偿金为每日500.00元，限额为合同价格的5％；（6）缺陷责任期为二年；（7）支付期限为监理工程师签发中期支付证书后14日内和监理工程师签发最后支付证书后42日内；（5）违约金为合同价格的5％；（9）未付款额的利率按银行同期存款利率计算（不计复利）。
2006年9月4日，织金市政公司依照合同约定向大方移民局交纳工程质量保证金50000.00元。2006年9月26日，大方移民局与毕节地区交通建设工程监理站（以简称监理单位）订立施工监理合同。监理合同约定，监理服务期自2006年9月26日起至工程交工验收之日止。其中：2006年10月1日至2007年1月31日为正常监理服务，2007年1月31日后工程未完成为延期监理服务；正常监理服务费为20000.00元，延期监理服务费为每月5000.00元。
2006年10月1日，监理单位下达工程开工令，织金市政公司按合同约定开始施工。
2006年11月27日，织金市政公司首次申请，提出3号桥九洞天岸基坑与设计不相符，地基应力不均衡，请求对3号桥的部分工程进行变更处理。2007年1月7日，大方县大渡口至九洞天公路桥梁工程项目驻地监理工程师办公室（以下简称监理单位驻地工程师办公室）根据业主、设计、监理、施工单位代表对3号桥九洞天岸基坑检查意见，发出工程变更令，将挖基土方、挖基石方、片石混凝土分别由设计数量835立方米、209立方米、558立方米估计变更为4800立方米、1797.21立方米、749.66立方米，估计变更金额为141345.41元。
2007年1月8日，织金市政公司第二次申请，提出3号桥桥空心板设计孔径N17＃钢筋保护层不能满足规范要求，请求对桥板孔径进行处理。2007年1月8日，监理单位驻地工程师办公室发出工程变更令，将空心板工程量由设计数52.74立方米估计变更为59.547立方米，估计变更金额为3403.50元。
2007年3月12日，织金市政公司第三次申请，提出1号桥、2号桥桥空心板设计孔径N16＃钢筋保护层不能满足规范要求，请求对桥板孔径进行处理。2007年3月15日，监理单位驻地工程师办公室发出工程变更令将空心板工程量由设计数各34.28立方米估计变更为各40.186立方米，估计变更金额各为2953.00元。
2007年11月12日，织金市政公司第四次申请，提出1号桥九洞天岸基础开挖到设计高程后，基底为冲积砾石，不能满足设计基础强度要求，请求对1号桥的基础工程进行加深处理。2007年11月27日，监理单位驻地工程师办公室发出工程变更令，将挖基土方、挖基石方、片石砼基础分别由设计数量911立方米、425立方米、427立方米估计变更为1315.5立方米、1072.5立方米、646.3立方米，估计变更金额为70496.00元。
2008年4月5日，织金市政公司停工。
2008年5月9日，业主方、施工方、监理方共同就拖延工期有关问题召开会议，形成如下意见：1、由织金市政公司安排一名项目经理进驻现场组织施工；2、工程从2008年5月10日起50天内全面完工；3、工程承建方必须把民工工资发放清楚；4、承建方将未完工的两个桥面钢筋布好经验收合格后，（业主方）借款10万元给承建方；5、由承建方排出工程复工进度倒计时间表。
2009年4月25日，织金市政公司第五次申请，提出3号桥大渡口岸桥台左侧砌体沉降不匀出现较小裂纹，应拆除部分重砌、勾缝，请求费用由业主方负责。2009年4月27日，监理单位驻地工程师办公室发出工程变更令，变更项目估计为拆除砌体126立方米、重砌桥台1**立方米、重砌桥台勾缝42米、脚手架73.5米，估计变更金额合计为24285.24元。
2009年7月18日，织金市政公司第六次申请，提出1号桥、2号桥、3号桥因当地居民阻工、破坏施工通道及停电等人为和自然因素，造成的施工干扰费用请求由业主方支付。2009年7月20日，监理单位驻地工程师办公室发出工程变更令，变更项目为施工干扰费，估计变更金额为20340.79元。
上述六次工程变更，有监理单位驻地工程师办公室和织金市政公司加盖印章确认，其中：与设计有关联的部分经驻地监理工程师彭义、业主方代表左建越、设计方代表李定军、承建方代表丁厚源签名确认；与设计无关联的部分经驻地监理工程师彭义、业主方代表左建越、承建方代表丁厚源签名确认；移民局领导意见栏内无移民局法定代表人签署意见或加盖单位印章。
2009年12月1日，织金市政公司编制完成施工总结，向大方移民局提交工程施工竣工文件、交工验收申请报告、终期支付申请单，请求支付终期计量款1301745.03元（其中：1号桥423232.05元、2号桥226986.20元、3号桥651526.78元）即合同总价款1053962.70元，施工中变更工程增加价款247782.33元。2009年12月2日，驻地监理工程师彭义在终期支付申请单上签署“经审核，同意支付终期计量款人民币大写壹佰叁拾万零壹仟柒佰肆拾伍元零叁分整（￥：1301745.03元）”的意见，并加盖监理单位驻地工程师办公室印章。2009年12月29日，大方移民局驻地代表左建越在终期支付申请单上签署“经核实，建议支付”的意见。
2010年3月6日，根据织金市政公司的申请，县人民政府委托县政协副主席李富军组织大方移民局、织金市政公司、监理单位、大方县交通局、鼎新乡人民政府、猫场镇人民政府有关人员组成验收组，对大渡口至九洞天公路三座桥梁进行竣工验收。其验收意见纪要为：
一、经过实地查看和丈量，三座桥梁桥基稳固，没有变形，验收组人员一致认为三座桥基本达到设计要求，同意作为合格工程验收。
二、存在的问题：
（一）、1号桥（中心桩号为K2＋981.178）、2号桥（中心桩号为K3＋283.15）、3号桥（中心桩号为K5＋887.723）施工工艺较为粗糙，整体外观一般。
（二）、1号桥中心轴线偏位大，未按设计进行施工，增加了引道路线建设的工程量和施工难度，两头引道偏离原设计，长度相差较大；2号桥两头引道长度也不足；3号桥各项指标基本符合要求。
（三）、三座桥梁的伸缩缝没有用沥青进行处理，雨水对桥帽容易造成影响。桥台和引道部分勾缝不够完整，需要施工方进行完善。
（四）、栏杆不够美观，有的不符合要求，特别是1号桥左面，需要施工方进行处理。
（五）、在1号桥基础开挖过程中，造成大量泥沙淤积，改变河水流向，对桥基和附近耕地可能会造成影响，需要施工方进行清理。
（六）、关于工程变更，施工方提供的资料还不够完整和准确，待设计、监理及施工方补充完善相关变更手续资料，按合同约定及相关文件规定办理。
三、施工方要按照检查验收中提出的问题抓紧进行整改，整改结束后，书面通知业主、监理和设计现场复查。
四、关于监理方提出超工期，涉及超期监理费的问题，待业主方、施工方、监理方按照监理合同和施工合同约定进行协商解决。
五、按施工合同协议书附件有关条款约定，从验收之日起两年内为施工方的质量缺陷修复期，施工方要搞好管理维护工作。
六、要尽快完善竣工验收资料，以便审计部门进行审计决算，施工方要把民工工资支付清楚，不得拖欠民工工资。
七、业主方要尽快处理好大渡口至九洞天公路建设中的遗留问题，修通公路，尽快投入使用。
工程验收后，大方移民局将工程施工竣工资料报送大方县审计局进行竣工决算审计，送审工程款金额为1301745.03元。
2010年5月20日，大方县审计局致函大方移民局，告知送审工程项目经北京红日伟业工程造价咨询事务所有限责任公司贵州分公司2010年3月19日进行审计，发现以下问题：
第一、1号桥在验收报告中指出桥中心轴线偏位大，未按设计进行施工，两头引道偏离原设计，长度相差较大；施工单位在补报的变更资料中没有业主、监理、设计单位的盖章，无地质勘查报告说明及设计变更图纸；变更理由不充分，变更过程随意，变更结果无单位确认。
第二、3号桥大渡口岸桥台在施工过程中左侧砌体沉降不均匀出现裂缝，导致的补修工程及重复施工，其变更会议纪要中指出是由于桥台砌体较高，受力分布不均、桥台砌体尾部无支挡、填方不及时和填方不到位等因素造成的，更不属于施工单位在施工过程中造成的，发现情况后设计与施工就现场的地形、地貌、地质结构等情况不一致而提出来的工程变更。
审计部门认为，以上两个问题较为严重，若按合格工程审计，则1号桥及3号桥的变更为不合理变更不予同意，否则此工程不具备审计条件。
2011年1月14日，大方移民局致函大方县审计局，提出因施工方无法完善工程变更等相关送审资料，建议审计部门能认定的工程量按规定予以认定，并出具审计报告。
2011年1月20日，大方县审计局在大方移民局的上述函件上签署“因资料原因无法进行审计，建议报县人民政府妥善处理”的意见。
审计部门未予审计后，织金市政公司多次要求进行工程决算，大方移民局以工程项目未审计为由予以拒绝。
在工程项目施工过程中，织金市政公司到大方移民局共计领取工程款925733.00元。毕节地区交通建设工程监理站到大方移民局共计领取工程监理费60000.00元。织金市政公司向大方移民局交纳的工程质量保证金50000.00元未予退回。
2011年10月9日，依据织金市政公司申请，经本院委托，贵州亚信会计师事务有限公司对涉案三座桥梁工程作出亚会审鉴字（2011）第290号《工程造价鉴定报告》。鉴定意见为：
1、三座桥梁清单内项目审定金额为1058115.70元；
2、设计变更部分审定金额为1706862.53元（其中：K5＋887.723桥两岸挖基土、基石和片石砼基础、空心板144748.95元，K2＋981.178桥干处挖基土、基石和片石砼基础69301.00元，K3＋283.15桥空心板2953.00元，增加项目拆除砌体、重砌m5浆砌片块石桥台、重砌桥台勾缝、脚手架24285.24元，施工干扰费20340.79元，投标漏项文明、安全施工措施费53408.22元，道路及场所不能正常施工误工费674700.00元，招标漏项大型机械进出场费244352.12元，增加水毁工程费211317.84元，增加道路维修费93645.51元，工期延长材料费上涨调整167809.86元，合计1706862.53元。）；
3、三座桥梁工程造价合计2764978.23元。
织金市政公司支付桥梁造价鉴定费100000.00元。
2012年4月8日，北京红日伟业工程造价咨询事务所有限责任公司贵州分公司对该项目审计处理情况作出书面说明，内容与大方县审计局函告大方移民局的内容一致。
2012年6月27日，依据大方移民局申请，经本院委托，云南规划建筑工程司法鉴定中心对涉案三座桥梁作出（2012）司鉴字第Q12461J号司法鉴定意见书。鉴定意见为：
1、三座桥梁均没有岩土工程地质勘察报告，且在没有工程地质勘验报告的情况下就进行了设计、施工，不符合《建设工程质量管理条例》的相关规定。
2、设计单位设计资质情况不详，设计图纸未加盖勘察设计文件出图专用章，设计图纸未经过图纸审查就进行了三座桥梁的施工，不符合《建设工程质量管理条例》的相关规定。
3、本次鉴定的三座桥梁无监理单位提供的相关资料，竣工报告中也没有监理单位对桥梁现场施工方面的相关监理内容文件资料，不符合《建设工程质量管理条例》的相关要求。
4、工程竣工资料中没有材料进场报验申请表、未见见证取样记录、无隐蔽验收等相关记录，不符合《建设工程质量管理条例》的相关要求。
5、1＃（K2＋981.178）桥，桥台背填土选用材料与设计图纸要求不符；桥台身侧墙未按照设计图纸坡度要求放坡斜砌，不符合设计图纸要求；实测混凝土强度离散性较大，材料均质性较差，部分测点引道板混凝土强度等级不满足设计图纸要求。引道板实测厚度、长度不满足设计图纸要求。现场检测时台身侧墙有开裂情况，栏杆立柱、栅板有开裂情况，栏杆栅板脱落。
6、2＃（K3＋283.15）桥，桥台背填土与设计图纸要求不符；桥台身侧墙未按照设计图纸坡度要求放坡斜砌，不符合设计图纸要求；实测混凝土强度离散性较大，均质性较差，部分测点引道板、铺装层混凝土强度等级不满足设计图纸要求；引道板实测厚度、宽度、长度不满足设计图纸的要求；混凝土空心板实测宽度不满足设计图纸要求。现场检测时台身侧墙有开裂情况、引道板有开裂、下陷情况，栏板栅板有脱落、开裂情况。
7、3＃（K5＋887.723）桥，桥台背填土与设计图纸要求不符；桥台身侧墙未按照设计图纸坡度要求放坡斜砌，实测混凝土强度离散性较大，材料均质性较差，部分测点引道板、铺装层混凝土强度等级不满足设计图纸要求；引道板实测厚度不满足设计图纸要求；桥台身侧墙有开裂情况、引道板有开裂、下陷情况。
8、三座桥梁汽车荷载、人群荷载等关键信息不详，桥梁设计图纸所参照的图集标准低于桥梁建造时应采用的国家规范要求，而且施工质量不符合设计图纸要求。目前，2＃、3＃桥已被周边村民私自通车投入运行使用，存在安全隐患。
大方移民局支付桥梁质量鉴定费100000.00元。
2013年9月11日，本院就工程质量缺陷复修问题向双方释明对修复费用进行评估。大方移民局以涉案桥梁工程是不合格工程为由认为无评估必要性。2013年9月18日，织金市政公司提出对质量修复费用进行鉴定评估申请。2013年10月16日，织金市政公司在委托鉴定评估过程中撤回了鉴定评估申请。
本案当事人争议的焦点是：一、双方是否依照约定和法律规定全面履行合同义务；二、合同履行中的工程变更是否属实；三、所建桥梁是否存在质量问题；四、工程价款认定；五、工程质量缺陷处理。
本院认为，大方县大渡口至九洞天新建公路中的三座桥梁，属根据乌江洪家渡水电站建设后为恢复库周通道原有功能而建设的民生工程。工程项目业经规划设计、立项审查和报批程序后，原、被告经过招投标签订《大方县大渡口至九洞天新建公路中的三座桥梁工程施工合同协议书》，符合《中华人民共和国合同法》第四十四条“依法成立的合同，自成立时生效”规定的法定要件，应当认定该建设工程施工合同从2006年9月1日成立并生效，双方当事人应当依照《中华人民共和国合同法》第二百六十九条“建设工程合同是承包人进行工程建设，发包人支付价款的合同。建设工程合同包括工程勘查、设计、施工合同。”和第二百七十五条“施工合同的内容包括工程范围、建设工期、中间交工工程的开工和竣工时间、工程质量、工程造价、技术资料交付时间、材料和设备供应责任、拨款和结算、竣工验收、质量保修范围和质量保证期、双方相互协作等条款。”的规定和合同的约定全面履行义务。
关于双方是否依照约定和法律规定全面履行合同义务问题：
（一）关于工程超期是否违约、是否承担违约责任。合同约定工期为120天，而工程实际施工时间为三年零两个','2018-09-29
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《中华人民共和国合同法》 第一百零七条当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
第一百零九条当事人一方未支付价款或者报酬的，对方可以要求其支付价款或者报酬。
第二百三十七条融资租赁合同是出租人根据承租人对出卖人、租赁物的选择，向出卖人购买租赁物，提供给承租人使用，承租人支付租金的合同。 《中华人民共和国担保法》
第六条本法所称保证，是指保证人和债权人约定，当债务人不履行债务时，保证人按照约定履行债务或者承担责任的行为。
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