温州市龙湾区人民法院
民 事 判 决 书
（2014）温龙永民初字第146号
原告：温州市成套防腐建设公司。
法定代表人：黄略。
委托代理人（特别授权）：邱秘，浙江中坚律师事务所律师。
委托代理人（特别授权）：黄成志。
被告：温州广源建设有限公司。
法定代表人：林德巩。
委托代理人（特别授权）：周庆春、邵俊彦，浙江浙南律师事务所律师。
原告温州市成套防腐建设公司与被告温州广源建设有限公司建设工程合同纠纷一案，于2014年8月19日向本院起诉。本院于同日受理后，依法由审判员管和平独任审判，后转为普通程序审理，依法组成合议庭。于法定期限内向双方当事人送达了开庭传票和举证通知，并分别于2014年10月23日、2015年5月27日二次公开开庭进行了审理，原告温州市成套防腐建设公司及其委托代理人邱秘、黄成志，被告温州广源建设有限公司及其委托代理人邵俊彦到庭参加诉讼。本案现已审理终结。
原告温州市成套防腐建设公司诉称：原、被告分别系“温州市成套防腐建设公司车间、配电房、传达室”工程项目的发包方（甲方）和承包方（乙方），双方分别于2011年5月9日、2012年1月3日签订两份《建筑工程承包合同》，约定：1、工程承包价为3931391元；2、总工期为300天（试桩到竣工，打桩期90天，其余210天）；3、乙方原因给甲方造成经济损失由乙方负责；4、乙方延误工期的，每天罚款500元；5、办理房产证和档案馆所需的备案材料由乙方负责提供；6、工程竣工预备验收后15天内付至90%，余10%待竣工验收合格之日起一月内办理决算并扣留3%保修金外其他一次性付清。合同签订后，被告方于2011年6月30日开始打桩，至2014年竣工验收，共耗时928日，比原合同约定工期延期628日，其中因被告方各项原因共计延误435日（2011.11.17-2012.3.22，桩基整改延误125日；2012.8.7-10.18，主体工程整改延期72天；2012.11.25-2012.12.25，资料整理延误30天；2013.2.20-2013.3.25，聘请施工员延误33日；2013.7.14-2013.8.13，楼梯整改延误30日；2013.9.1-2013.1.24，工程竣工后，无故拖延工期145日）。工程竣工验收后，被告无故拒不进行工程决算，也不肯配合原告办理竣工备案，致使原告至今无法办理产权证，损失严重。原告于2011年5月17日至8月12日付被告进度款50万元、于2012年3月21日至2012年9月27日付被告进度款2018031元，合计付进度款2518031元，被告向原告递交的主体工程实际施工工程量结算进度款2446134元，期间已超付工程进度款71897元；2013年春节前，因被告要求超付进度款，以便工人过春节，原告为了工程顺利施工，超付进度款194062元，后期装修工程期间，2013年4月至工程竣工验收时，原告合计付被告进度款752528元。以上合计共付进度款3464321元。依据双方签订的合同条款，鉴于被告的违约行为，原告主张如下赔偿和损失共计886800元：1、由于被告拖延工期，应当按照500元/日的标准向原告支付违约金，共计217500元（500元/日*435日）。2、由于被告延误工期，致使原告损失从2013年9月1日至2014年1月24日期间的租赁收益，共计48万元（10万元/月*4.8月），该租赁收益属原告方的既得利益，现因被告的违约行为受损，理应由被告赔偿。3、因被告违约致使原告无法按期办理产权、办理抵押贷款，原告向案外人借款153万元，产生了189315元的利息损失（自2012年12月11日至2014年7月31日止，原告向案外人借款利息为1.65%，同期人民银行贷款利率为0.6%，按照利息差1.05%计算）。4、依据2012年9月25日被告出具的承诺书，承诺今后不再出现质量问题，且无条件配合原告办理竣工验收、备案等事宜，但实际上被告不但在之后的施工上仍出现楼梯整改、返工情况，且至今仍不配合原告进行决算。故理应按照承诺书的约定向原告支付5万元诚信金。被告之所以长期延误工期，主要原因有二，一是被告项目负责人金庆友长期在别处上班，未尽到工期监管的职责，致使工程无人监管，乱作一片，工程无法正常推进。二是原告按期支付工程款后，被告未做到专款专用，致使长期拖欠材料款、工人工资，工期被一再拖延。期间，由于负责人一再挪用进度款，致使工程延期。故原被告约定，后期工程进度款由原告方员工黄成志代为掌握工程款，由被告委托的员工王某负责支配，每笔支出都由其签字确认，再由黄成志付款。后期工程开始后，被告分别汇款194062元至原告账户、汇款696778元至原告员工黄成志账户，委托黄成志掌握，其中194062元用于支付工人工资，696778元用于后期工程的各项开支，每笔开支均得到原告方确认，且单据齐全，可以证明均为工程所用，至工程竣工验收止，原告需支付总工程款的90%，现原告已超付。请求判令：1、被告依据《建筑工程承包合同》的有关规定配合原告进行工程决算；2、被告向原告补足完整合格的竣工备案材料，并无条件配合原告办理竣工备案；3、被告向原告支付违约金、经济损失共计人民币886800元；4、本案诉讼费由被告承担。在审理中，原告增加诉讼请求：5、被告按照工程竣工审计决算造价向原告提供全额建筑专用发票。
原告在举证期限内，提供了证据：
1、建筑工程承包合同及附件，证明1、工程承包有关约定；2、合同第二项第5条规定延误工期，每天罚款500元。因质量返工和擅自停工延误工期435天，按合同约定，酌情给被告罚款217500元的事实；
2、工程项目部岗位人员备案表；
3、现场管理技术人员登记表；
4、工程项目实际情况证明；证据2、3、4共同证明工程项目部是个虚构机构，备案人员不到位，造成工程管理不善，质量返工，擅自停工，致使工期严重拖延；
5、试打桩记录；
6、基础中间验收报告；证据5、6共同证明桩基工程施工工期59天（2011年6月30日至2011年8月28日）；
7、设计变更联系单（桩位偏差整改）；
8、监理月报（2011年9月-2012年3月），证据7、8共同证明桩位验收不合格，整改延误工期125天。（2011年11月17日至2012年3月22日）；
9、混凝土发货单（主体工程开工和竣工日期）；
10、2012年7月份完成工程量月报表（7月24日竣工）；证据9、10共同证明主体工程施工工期124天，（2012年3月23日至2012年7月24日）；
11、监理公司责令返工整改通知；
12、屋面工程整改联系单；
13、气亭柱配筋返工整改通知和记录；
14、气亭竣工、砼发货单（10月8日竣工）；
15、工程施工证明；
16、监理月报（2012年8月-10月），证据11、12、13、14、15、16共同证明屋面泛水梁和气亭质量返工，整改延误工期72天，（2012年8月7日至2012年10月18日）；
17、工程施工证明（共二份）（查对4号和15号证据）、主体中间验收会议既要及主体中间验收报告，证明工程整改施工完毕，因前期桩基工程资料整理延误工期30天，（2012年11月25日至12月25日）；
18、监理月报（2013年2月-3月）；
19、工程施工协调会议纪要（2013年3月25日）；证据18、19共同证明施工单位因聘请不到施工员擅自停工，延误工期33天（2013年2月20日-3月25日）；
20、监理月报（2013年7月-8月）；
21、后期工程工期证明；
22、承诺书（楼梯踏步返工承诺）；证据20、21、22共同证明1、后期工程施工期123天。（2013年4月1日-2013年8月31日），2、楼梯踏步施工质量返工、整改延误工期30天（2013年7月14日-8月13日）；
23、工程竣工验收会议纪要；
24、工程竣工验收总结报告（2013-9-10）；证据23、24共同证明工程施工竣工后，被告故意拖延工期145天，（2013年9月1日-2014年1月24日）；
25、银行汇款单（本票、转账回单凭证）共13张，金额：2518031元，2012年7月份完成工程量月报表；证明1、主体工程施工进度款：2518031元，2、主体工程实际施工完成工程量月报表的进度款：2446134元，3、超付进度款71897元；
26、证明（春节前超付进度款营作）；
27、银行汇款单（本票）；
28、春节前施工人员领奖凭证（共9份，计194062元）；
29、证明（春节前领款经过）；
30、2013年春节前超付进度款的情况说明，证据26、27、28、29、30共同证明2013年春节前超付工程进度款194062元，系经协调会议后，是被告公司领导怕项目挪用，特热切要求由原告掌握同项目部金庆友、刘某一起支付春节进度款的事实；
31、后期装修工程进度款营作说明；
32、银行汇款单凭证（共8张，金额：752528元）；
33、监理公司证明（工程施工协调会议纪要送达后）；
34；委托书（金庆友委托王某）；
35、证明（后期工程进度款资金营作）；
36、证明（及税单）（脚手架钢管租金领款营作）；
37、砂石购销合同；
38、工程总进度款双方核实明细单；
39、龙湾国税税单；
40、后期工程进度款付款单据凭证，证据31-40共同证明后期装修工程，被告公司领导要求原告公司黄成志协助掌握资金，由项目部委托人王某经办签支付的进度款752528元(随后均由项目部负责人金庆友审核、签字)，已付工程进度款合计2518031+194062+752528=3464621元，已付工程进度款97.3%；
41、温州市伟业造价师事务所（工程结算书），证明原告工程竣工决算3558962元；
42、厂房租赁协议书，证明因工期延误给原告造成厂房租金损失，索赔48万元；
43、借款协议书；
44、银行汇款单凭证（汇单4张，计153万元）；
45、借款收据（借据4张，计153万元）；
46、收款收据（付借款利息，共7张）；
47、银行贷款利息证据（抵押贷款）；证据42-47共同证明被告因延误原告产权证办理，原告无法向银行抵押贷款，特向青田润达阀门铸造有限公司先后借款153万元，增加利息损失金额189315元的事实；
48、承诺书（工程质量、工期、竣工等），证明被告承诺违约，造成原告经济损失，酌情给被告罚款5万元整的事实；
49、厂房租金付款证明（及银行汇款单5张、收据4张），证明因工期延误给原告造成租金损失，索赔48万元；
50、建设工程施工合同（龙湾建设局备案），证明温州广源建设有限公司是本案工程施工承包人；
51、温州广源建设有限公司（催收函）；
52、厂房车间工程施工证明；
53、各工种施工工程承包合同与协议书（共5份）；证据52、52、53共同证明本案后期装修工程是被告公司项目部施工完毕；
54、建设工程造价咨询成果报告书，证明经鉴定结果；
55、工程款审计鉴定报告书；证据55证明证明原告工程款支付情况；
56、温州市龙湾区建设工程施工直接发包备案表；
57、温州市龙湾区直接发包工程造价确定书，证据56、57共同证明备案的建设工程合同约定工程造价为3700160元；
58、龙湾区建设局函件、备案合同，证明合同造价3700160元。
59、证人王某、刘某当庭证言，证明因被告原因造成工程延误、违约，工程质量不合格而返工及工程款支付的事实。
被告温州广源建设有限公司辩称：一、答辩人系本案所涉工程的挂靠单位，实际承包人为金庆友。原告明知金庆友系实际承包人，应将其列为被告。1、答辩人与金庆友于2011年6月1日签订《项目承包合同》，约定本案所涉工程由金庆友承包施工，独立核算盈亏自负。2、原告证据《工程施工协调会议纪要》第3条第2项也已明确约定：“本工程前期材料货款和债权债务及材料发票提供等有关事项，仍由该项目负责人金庆友负责承担。”证明原告对金庆友承包本案工程的事实是认可的。因此，答辩人仅系本案工程的被挂靠单位，金庆友才是实际承包人。原告就本案所涉纠纷，应将金庆友而非答辩人列为被告。二、本案后期装修工程由原告负责施工，与答辩人无关。1、原告称已向答辩人支付后期装修工程进度款752528元，与事实不符。原告将该款分批转入答辩人公司账户，答辩人均依照原告的要求，在扣留8%作为发票税费后将余款696778元汇给原告，由原告直接负责后期装修工程的施工。2、原告在其《装修工程进度款营作事实证据》第二条中也已确认，装修工程进度款系由该公司前法定代表人黄成志掌握。三、原告向答辩人支付的工程款金额仅为2573781元，仅占工程总承包造价的65.47%，违反原告与答辩人订立的《建筑工程承包合同》。1、根据原告与答辩人于2012年1月3日签订的《建筑工程承包合同》第二条第2款的约定：“总承包造价为3931391元，除了有设计变更外，其余一次性包干，不留活口（以工程造价咨询书为依据，工程量不管有无漏项，均不准调整）”。故本案工程的总承包造价为3931391元。2、原告向答辩人支付的工程款为：（1）主体工程款2518031元；（2）后期装修进度款的暂扣税费55750元后，也没有替被告支付工人工资。上述两笔工程款金额合计为2573781元，仅占工程款总承包造价的65.47%，明显违反合同的约定。四、原告与答辩人签订的《建筑工程承包合同》约定本案工程的总承包造价为3931391元，除设计变更外，采取一次性包干，原告提交的工程结算价格仅为3558962元，明显与合同约定固定造价不一致。工程至今未进行竣工决算，系原告与答辩人之间就工程量的认定未达成一致所致。五、原告要求答辩人赔偿所谓的经济损失886800元，没有事实与法律依据。1、原告要求答辩人支付延期竣工罚款217500元，没有事实依据。（1）2013年4月起，后期装修工程由原告负责实施，故此后的工期延误应由原告负责。（2）原告未依约支付工程款，根据《建设工程施工合同》专用条款第35.1第二款的约定，原告应承担违约责任，工期顺延。（3）根据《建设工程施工合同》专用条款第35.2条的约定，承包人因工期延误承担罚款限额为工程合同造价的2%。即答辩人存在工期延误，原告要求答辩人支付的罚款217500元也早已超出合同约定的罚款最高限额。2、原告要求答辩人赔偿租金损失48万元，没有事实与法律依据。（1）原告除《厂房租赁协议书》外，没有其他任何证据能够证明租赁关系的成立，无法证明租赁关系的真实性。（2）原告提交的《厂房租赁协议书》中，协议签订日期为2013年7月2日，此时本案所涉工程的后期装修工程尚未完工，正由原告负责施工。原告明知无法在2013年8月1日前完工，仍与第三方签订租赁合同，相应责任应由原告自行承担。因此，原告要求答辩人赔偿租金损失，没有事实依据。（3）原告要求答辩人赔偿的所谓租金损失，系原告单方主张的预期利益，并非已由原告承担的实际损失。原告要求答辩人赔偿该项损失，没有法律依据。3、原告要求答辩人赔偿借款利息费用损失189315元。该笔费用与本案没有关联，原告的该请求也没有相应事实与法律依据。故原告的该项诉请不应得到支持。4、原告诉称答辩人至今拒不办理竣工备案资料，影响原告产权证办理，要求处罚5万元，于法无据。（1）原告与答辩人至今尚未办结工程竣工结算，故答辩人不可能单方提交完整的竣工备案资料。（2）原告要求答辩人支付罚款5万元，没有证据与法律依据。要求驳回原告的诉讼请求。
被告在超过举证期限后，提供了证据：项目承包合同复印件，证明与金庆友之间的承包关系。
原告的证据1-59经质证。被告质证如下：
一、1、针对建筑工程承包合同（2012.1.3）：真实性、合法性没有异议。证明对象有异议：（1）备案建筑工程承包合同约定逾期违约金的上限为工程造价的2%；（2）停工并非被告原因造成，系原告未依约支付足额工程款。2、针对建筑工程承包合同（2011.5.9）：真实性、合法性没有异议，关联性有异议：该份合同已由2012年1月3日的建筑工程承包合同所替代。3、针对建筑工程承包合同附件（2011.5.11）：真实性、合法性没有异议，关联性有异议：合同已由2012年1月3日的建筑工程承包合同所替代。4、针对建筑工程承包合同补充纪要、建筑工程承包合同补充纪要，没有被告公司公章，仅有项目部技术专用章，对真实性、合法性、关联性均有异议，与本案没有关联；
二、1、对证据2、3真实性、合法性无异议，对关联性有异议，与本案没有关联。2、对证明的三性有异议，证人没有出庭。证明对象异议，无法证明工期拖延系被告原因；
三、证据5、6三性无异议；
四、对证据7、8，真实性、合法性无异议，证明对象有异议：1、桩基工程存在设计变更，且变更系业主要求，并非被告施工原因造成工期延误。2、工期是否延误应按总工程施工期限而定，不应单个工程项目单列工期进行累加。原告认为，证据8明确注明系被告方质量原因致使工程延期；
五、1、对证据9真实性、合法性有异议，无发货公司章，证明对象有异议，无法证明开工和竣工日期。2、证据10，真实、合法性没有异议，关联性有异议，与本案被告是否违约没有关联；
六、1、对证据11真实性合法性有异议，关联性有异议，与本案被告最终是否违约没有关联。2、对证据12真实性、合法性无异议，证明对象有异议，不能待证事实。3、对证据13-15真实性、合法性有异议，证明对象有异议。没有被告公章确认，与本案被告最终是否违约没有关联。4、对证据16，真实性、合法性无异议，关联性、证明对象有异议，无法证明被告最终是否违约。原告认为，11、12证明系被告施工质量问题致使返工，相关证据均有被告项目部章确认，至此工期已超300天，被告根本违约；
七、对证据17真实性、合法性无异议，证明对象有异议，会议纪要认定中间验收已合格；
八、1、对证据18真实性、合法性无异议；证明对象，无法证明工程逾期系被告责任，原告未依约足额支付工程款。2、对证据19，真实性、合法性有异议，没有被告单位公章。证明对象有异议，原告认可工程在2013年5月10日前竣工，竣工日期应予以顺延；
九、1、对证据20真实性、合法性无异议，证明对象有异议。原告未足额支付工程款，工程逾期并非被告责任。2、对证据21真实性、合法性、关联性有异议。没有被告公章，同时未办理竣工验收及竣工决算也是基于原告未依约支付工程款所致。3、对证据22真实性、合法性有异议，没有被告公章。证明对象有异议，无法证明待证事实；
十、对证据23、24真实性、合法性无异议，证明对象有异议。无法证明被告故意拖延工期，无法按时竣工验收是由于原告未依约足额支付工程款；
十一、对证据25真实性、合法性、关联性均无异议，被告认可已收到2518031元工程款。同时确认工程款均是汇入被告公司对公账户；
十二、1、对证据26真实性、合法性、关联性均有异议。（1）没有被告单位公章，仅有施工技术资料章。（2）款项没有汇入被告对公账户。2、证据27真实性、合法性没有异议，证明对象有异议，无法证明该款是用于支付工人工资。3、证据28真实性、合法性有异议，并非原件，无法证明工人已领款。4、证据29、30，真实性、合法性、关联性有异议，没有被告盖章确认。
十三、1、对证据31，系原告出具的证据，合法性、关联性有异议。（1）被告收到该款后按原告要求将696778元汇给原告，实际仅收到原告支付的税费55750元。（2）该部分款项砂、石购销合同及发票是为了冲抵材料发票，并非真实用于采购砂石。因款项由原告掌控，具体用途原告应提供相应依据。2、证据32真实、合法性无异议，证明对象有异议，应原告要求，被告收到款项后仅扣留税款后将工程款汇给原告。3、对证据33真实性、合法性无异议，证明对象有异议。该款系原告掌控，无法证明原告已支付该款的事实。4、对证据34合法性、关联性有异议，工程监管和材料采购的委托没有被告盖公章，委托无效。5、对证据35真实性、合法性、关联性均有异议，无法证明原告就其掌控的69万元后期装修款已对外支付。6、对证据36、37真实性、合法性、关联性有异议。证明人没有出庭作证，证据36没有证明效力。原告已承认签订的砂、石采购合同及相应发票系用于冲抵发票，故证明37也无法证明原告已对外支付装修款等款项。7、对证据38真实性、合法、关联性有异议，没有被告公章。证明对象异议：（1）后期装修进度款75万余元，被告应原告要求已汇返69万元，该部分款项不能视为被告已收到。（2）19万元所为工人工资发放，没有相应依据。8、对证据39真实性、合法性无异议，证明对象有异议。该部分发票并非真实发生用于采购砂、石，而仅用于冲抵发票金额。9、对证据40真实性、合法性、关联性均有异议：（1）该明细系原告单方出具，没有其他证据应证。（2）砂、石等材料、人工费发票，原告已承认系开具用于冲抵工程款发票金额，并非实际发生；
十四、对证据41真实性、合法性、关联性有异议。该结算书系原告单方委托造价师事务所作出，与法院委托鉴定单位鉴定报告工程造价金额365万余元不符；
十五、对证据42真实性、合法性、关联性均有异议。原告要求被告承担所谓租金损失没有相应合同及法律依据。
十六、对证据43-47真实性、合法性、关联性有异议。原告要求被告承担所谓利息损失，没有相应合同及法律依据；
十七、对证据48真实性、合法性、关联性有异议。该份承诺书中所谓5万元诚信金系对合同的变更，承诺书没有被告单位公章，该约定对被告不具有约束力；
十八、对证据49，真实性、合法性、关联性有异议。1、原告所谓要求被告承担租金损失，没有合同及法律依据。2、即便厂房租赁合同系真实，原告在工程竣工前即与第三人签订租赁合同，属无效合同。对此原告指出，该租金收益系原告可预期收益，应当由被告赔偿；
十九、对证据50真实性有异议，与备案合同内容不一致；
二十、对证据51真实性、合法性无异议，关联性有异议。原告对该证据真实性、合法性、关联性无异议，证明被告欠款事实。对证据52真实性、合法性、关联性有异议，没有被告单位公章确认：（1）75万元进度款的支付与原告此前提供证据不符，实际被告仅收到5万元税费，（2）19万元所谓工人工资没有其他依据。对证据53真实性、合法性、关联性有异议，没有被告盖章确认；
二十一、对证据54真实、合法性无异议，证明对象有异议：（1）工程造价经鉴定为365万余元。（2）证明原告未依约支付工程款到位的事实。原告质证认为：造价鉴定应以备案合同为依据，原告对该鉴定造价有异议，同时证明原告已依约支付工程款至造价90%；
二十二、证据55真实、合法性无异议，证明对象有异议。结合原告提供的证据，后期装修工程进度款原告已提取69万元，19万元所谓工人工资也无证据证明支付到位。原告对证据55无异议；
二十三、对证据56、57真实、合法性无异议，对证明对象有异议；
二十四、对证据58关联性提出异议，并认为造价已经鉴定，应以鉴定的3654355元为准；
二十五、被告对证据59的真实性提出异议，认为二证人是金庆友聘用的，与被告无关。
原告对证据54认为造价鉴定应以备案合同为依据，原告对该鉴定造价有异议，同时证明原告已依约支付工程款至造价90%；原告对证据55、59无异议。
综合原告提供的的证据及原、被告的质证意见，本院认为，证据1-40、42、49-59，证据之间能相互印证，可以证明原、被告之间签订合同，变更合同内容、履行合同义务情况的事实，证据1-40、42、49-59符合证据三性要求，予以认定。原告的证据41的内容与证据54矛盾，应以证据54为准，故对证据41不予认定；原告的证据43-47与本案缺乏关联性，不属于合同法第113条规定的赔偿损失范围，不予认定；证据48属于对合同约定的违约条款变更，对此金庆友并没有经被告授权，证据不合法，本院不予认定。
被告提供的项目承包合同经原告质证，因超过举证期限，原告拒绝质证；本院认为，该证据没有提供原件核对，证据形式不合法，且证据已失权，不予认定。
经审理本院认定：原、被告分别系“温州市成套防腐建设公司车间、配电房、传达室”工程项目的发包方（甲方）和承包方（乙方），2011年5月9日原、被告签订了一份《建筑工程承包合同》，双方约定工程价款390万元等；2011年5月11日，原、被告签订了《建设工程施工合同》，双方签署了工程造价确定书，并提交龙龙湾建设局备案，重行约定合同价款等；2012年1月3日原、被告就合同约定的内容进行变更，以原告为甲方、被告为乙方又签订了一份《建筑工程承包合同》，约定：工程建筑面积4497.26平方米，承包造价3931391元，除设计变更，其余一次性包干，不留活口；总工期300天（试桩到竣工，打桩期90天，其余210天）；乙方原因给甲方造成经济损失由乙方负责；乙方派金庆友为驻工地负责人；乙方延误工期的，每天罚款500元；办理房产证和档案馆所需的备案材料由乙方负责提供；工程竣工预备验收后15天内付至90%，余10%待竣工验收合格之日起一月内办理决算并扣留3%保修金外其他一次性付清；本合同为甲乙双方唯一合法办理工程造价结算的依据；并就工程质量、施工规范等做出约定。工程委托青州广大工程监理有限公司监理。合同签订后，被告指派金庆友为驻工地负责人。后招用刘某为施工员、王某为管理人员。于2011年6月30日被告开始打桩施工，2013年8月31日，工程竣工。2014年1月24日，工程竣工验收合格，共耗时928日，期间至竣工日扣除约定延期天数，被告共计延误290日，其中包括竣工验收延误145日。期间，原告于2011年5月17日至2012年9月27日付被告工程款2518031元；2013年春节前，替被告支付工人工资194062元；后期装修工程期间至工程竣工验收时，原告支付被告工程款752528元；被告收到后为工程材料款顺利支付，扣除管理费等55750元后，将其余696778元汇款给原告方黄成志，并委托黄成志支付材料款，后黄成志将该款支付完毕。上述原告合计共付工程款3464621元。工程竣工验收后，被告因故拒不进行工程决算、不配合办理竣工备案，致使原告无法完成办理竣工备案，于是引起诉讼。
另原告考虑工程竣工验收后可以出租，于2013年7月2日与浙江益松机械有限公司签订了租赁合同，约定工程所涉厂房每年租金120万元，从2013年8月1日开始出租，并收取了承租方的预付款，因工程竣工验收延误，致租期推迟。被告已向原告开具1871800元的发票，尚应开具1592821元发票。
因工程部分设计变更等原因，案涉工程经温州东瓯会计师事务所有限责任公司鉴定，工程造价为3654355元。
本院认为，原、被告就案涉工程签订了三份建设工程施工合同，根据时间先后，合同的约定内容发生变更，因原、被告之间订立的并非法定招投标合同，应以变更后2012年1月3日签订的《建筑工程承包合同》为准，工程造价应以2012年1月3日签订的《建筑工程承包合同》为依据的鉴定结果3654355元为准，对原告申请以备案合同造价重新鉴定申请，本院不予准许。2012年1月3日签订的《建筑工程承包合同》合同不违反法律、法规强制性规定，合同有效。
关于原、被告哪方违约的认定。合同约定，原告应在工程竣工预备验收后15天内付至90%，余10%待竣工验收合格之日起一月内办理决算并扣留3%保修金外其他一次性付清。本案原、被告关于工程款争议的是：原告有无替被告支付的工人工资194062元、装修工程期间原告支付被告款项752528元中由被告汇给黄成志的696778元是否为原告替被告支付的工程款。根据建设部《建筑施工企业项目经理资质管理办法》第2条、第8条的规定，项目经理是指受企业法定代表人委托对工程项目施工过程全面负责的项目管理者，是建筑施工企业法定代表人在工程项目上的代表人，作为工程项目的管理者；其管理权力包括以企业法定代表人代表的身份处理与所承担的工程项目有关的外部关系，受委托签署有关合同，指挥工程项目建设的生产经营活动，调配并管理进入工程项目的人力、资金、物资、机械设备等生产要素等诸多内容。金庆友系被告的工地负责人、项目经理；刘某系被告方的施工员，2013年1、2月期间，因临近春节，由原告经金庆友、刘某签字确认向工人支付的194062元工资行为，其用途是用于工程建设，从公平原则考虑，该款应视为是原告支付了施工单位的工程款。原告支付被告的752528元工程款，虽被告将其中696778元汇款给原告方黄成志，但黄成志支付了相应金额的材料款，并经监理部门、金庆友、刘某、王某等人确认，其用途是用于工程建设；而且从被告将696778元汇款给原告方黄成志的行为来看，也应视为委托行为，故无论从公平原则考虑，还是从被告的行为来看，均应认定黄成志为被告支付材料款，原告支付被告的752528元应为工程款。加上原告在2011年5月17日至2012年9月27日期间支付的工程款2518031元，原告已合计支付工程款3464621元。因被告拒绝决算，经鉴定工程造价3654355元，该金额应视为决算造价。至合同约定的付款期间，原告支付的工程款，已超过90%，原告不违约。被告收取相应的工程款后，没有按约定的时间总工期300天完工，行为已违约，应承担相应责任。
关于被告应承担的违约责任问题。2012年1月3日签订的《建筑工程承包合同》约定的延误工期每天罚款500元，该约定系违约金性质，至竣工日被告共计延误290日，相应需支付原告违约金500元/日*290日=145000元。合同法第一百一十三条规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定，给对方造成损失的，损失赔偿额应当相当于因违约所造成的损失，包括合同履行后可以获得的利益，但不得超过违反合同一方订立合同时预见到或者应当预见到的因违反合同可能造成的损失。合同法第一百一十四条规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。约定的违约金低于造成的损失的，当事人可以请求人民法院或者仲裁机构予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，当事人可以请求人民法院或者仲裁机构予以适当减少。被告延误竣工验收时间145天，造成原告合同履行后可以获得的利益即租金的损失，该损失金额为145/365*1200000元=476712元，该损失是被告应当预见到的因违反合同可能造成的损失，该损失被告应予以赔偿；延误竣工验收145天期间因已计算超过违约金损失的赔偿，该期间的违约金不应再计算。原告请求的其他损失，没有法律依据，本院不予支持。
关于工程资料备案、开具发票等问题。合同约定了办理档案馆所需的备案材料由被告负责提供。现工程决算造价已经鉴定，具备工程资料备案条件，按约定被告应配合原告办理竣工备案。被告作为纳税人，在建设工程中开具建筑专用发票是其法定义务，也是合同的附随义务，被告应向原告开具已支付工程款的建筑专用发票，被告已开具1871800元的发票，原告已支付工程款3464621元，被告还应开具1592821元的发票。
综上，本院认为，原告的其他诉讼请求，缺乏事实与法律依据，本院不予支持；被告的其余辩驳意见，证据不足，本院不予采纳。依照《中华人民共和国合同法》第五条、第六十条、第一百零七条、第一百一十三条、第一百一十四条、第二百六十九条、《中华人民共和国民事诉讼法》第六十四条、《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第九十条之规定，判决如下：
一、被告温州广源建设有限公司在本判决生效后10日内协助并配合原告温州市成套防腐建设公司办理竣工备案。
二、被告温州广源建设有限公司在本判决生效后10日内支付原告温州市成套防腐建设公司违约金145000元、并赔偿原告损失476712元。
如果未按本判决指定的期间履行给付金钱义务，应当按照《中华人民共和国民事诉讼法》第二百五十三条之规定，加倍支付迟延履行期间的债务利息。
三、被告温州广源建设有限公司在本判决生效后10日内向原告温州市成套防腐建设公司开具并交付1592821元的建筑专用发票。
四、驳回原告温州市成套防腐建设公司的其他诉讼请求。
案件受理费12668元，鉴定费35000元，由原告负担12668元，由被告负担35000元。
如不服本判决，可在判决书送达之日起十五日内向本院递交上诉状，并按对方当事人的人数提出副本，上诉于温州市中级人民法院。
审 判 长 管和平
代理审判员 许德圣
人民陪审员 王军启
二〇一五年八月四日
书 记 员 谷顺乾